View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6135_low_2 (Length: 615)

Name: NF6135_low_2
Description: NF6135
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6135_low_2
NF6135_low_2
[»] chr7 (109 HSPs)
chr7 (18-586)||(2360827-2361397)
chr7 (18-554)||(34310597-34311142)
chr7 (18-554)||(29608483-29609023)
chr7 (33-559)||(4508584-4509116)
chr7 (18-435)||(6431713-6432133)
chr7 (18-559)||(4512268-4512815)
chr7 (38-537)||(48599235-48599740)
chr7 (18-554)||(2390024-2390571)
chr7 (33-559)||(4510426-4510958)
chr7 (19-554)||(3258739-3259280)
chr7 (59-586)||(8359165-8359703)
chr7 (18-435)||(22269717-22270135)
chr7 (18-539)||(22328287-22328825)
chr7 (18-282)||(6360073-6360338)
chr7 (219-453)||(27347761-27347997)
chr7 (219-453)||(47676124-47676360)
chr7 (230-453)||(14069821-14070047)
chr7 (230-453)||(14379849-14380075)
chr7 (219-450)||(31732960-31733193)
chr7 (219-453)||(8153286-8153522)
chr7 (219-453)||(41317422-41317658)
chr7 (219-453)||(36146396-36146633)
chr7 (219-422)||(48491523-48491728)
chr7 (231-453)||(30024720-30024945)
chr7 (219-438)||(43864188-43864409)
chr7 (230-453)||(47673932-47674157)
chr7 (219-453)||(4586105-4586341)
chr7 (219-453)||(48489375-48489611)
chr7 (219-453)||(1113601-1113837)
chr7 (219-453)||(18126588-18126824)
chr7 (307-575)||(32357916-32358190)
chr7 (219-453)||(38671210-38671446)
chr7 (219-453)||(41648999-41649234)
chr7 (220-438)||(26417261-26417480)
chr7 (220-475)||(495948-496206)
chr7 (217-453)||(23554982-23555221)
chr7 (230-435)||(31105399-31105607)
chr7 (219-435)||(35853859-35854077)
chr7 (219-453)||(12097855-12098083)
chr7 (318-574)||(6359812-6360077)
chr7 (219-453)||(29990999-29991234)
chr7 (225-433)||(23565069-23565280)
chr7 (301-453)||(2759185-2759339)
chr7 (233-383)||(31518752-31518905)
chr7 (219-453)||(4178719-4178954)
chr7 (219-453)||(19502122-19502359)
chr7 (220-435)||(25766965-25767180)
chr7 (219-431)||(4253538-4253754)
chr7 (279-453)||(25615857-25616034)
chr7 (219-435)||(48408747-48408967)
chr7 (347-453)||(24525490-24525596)
chr7 (283-433)||(31518911-31519063)
chr7 (219-347)||(4538636-4538764)
chr7 (235-430)||(23343934-23344130)
chr7 (219-451)||(39731321-39731548)
chr7 (219-435)||(36574522-36574740)
chr7 (219-347)||(24525992-24526121)
chr7 (275-435)||(20343897-20344059)
chr7 (275-421)||(43504174-43504323)
chr7 (219-306)||(2761439-2761526)
chr7 (367-438)||(30814530-30814601)
chr7 (224-433)||(3904624-3904837)
chr7 (119-366)||(1360226-1360479)
chr7 (275-435)||(24789841-24790004)
chr7 (296-407)||(5116625-5116739)
chr7 (18-91)||(32358189-32358262)
chr7 (296-435)||(18396338-18396481)
chr7 (120-246)||(23794024-23794149)
chr7 (219-339)||(5514113-5514234)
chr7 (275-435)||(6592345-6592509)
chr7 (275-435)||(18388765-18388929)
chr7 (275-435)||(18392201-18392365)
chr7 (219-292)||(24514912-24514984)
chr7 (275-435)||(6594563-6594727)
chr7 (275-421)||(32060342-32060493)
chr7 (154-233)||(37545121-37545199)
chr7 (359-435)||(1560671-1560749)
chr7 (18-193)||(5116377-5116551)
chr7 (397-438)||(42331000-42331041)
chr7 (91-192)||(43363667-43363766)
chr7 (455-554)||(1360054-1360154)
chr7 (163-239)||(2579030-2579105)
chr7 (397-441)||(20297607-20297651)
chr7 (280-347)||(26639326-26639392)
chr7 (287-381)||(27073828-27073925)
chr7 (287-381)||(27204388-27204485)
chr7 (397-438)||(1049299-1049340)
chr7 (397-438)||(3035969-3036010)
chr7 (397-438)||(7471983-7472024)
chr7 (397-438)||(11759372-11759413)
chr7 (286-347)||(13065494-13065555)
chr7 (397-438)||(13099477-13099518)
chr7 (397-438)||(20284096-20284137)
chr7 (397-438)||(20299705-20299746)
chr7 (397-438)||(20626283-20626324)
chr7 (397-438)||(20630174-20630215)
chr7 (397-438)||(20642593-20642634)
chr7 (397-438)||(21983291-21983332)
chr7 (397-438)||(35960823-35960864)
chr7 (397-438)||(38394231-38394272)
chr7 (397-438)||(40836746-40836787)
chr7 (397-438)||(40946573-40946614)
chr7 (295-381)||(43363531-43363622)
chr7 (397-438)||(44724824-44724865)
chr7 (397-438)||(44848733-44848774)
chr7 (397-438)||(48457898-48457939)
chr7 (275-346)||(1562103-1562173)
chr7 (397-441)||(7094460-7094504)
chr7 (219-286)||(30843389-30843457)
[»] chr3 (125 HSPs)
chr3 (18-554)||(30235867-30236411)
chr3 (18-554)||(6095482-6096025)
chr3 (18-575)||(47303994-47304564)
chr3 (18-554)||(49199347-49199897)
chr3 (18-554)||(54593447-54593992)
chr3 (18-453)||(34490955-34491392)
chr3 (19-554)||(46860214-46860760)
chr3 (18-586)||(41819371-41819947)
chr3 (18-554)||(43401679-43402216)
chr3 (18-438)||(4569693-4570118)
chr3 (18-554)||(43403622-43404159)
chr3 (18-554)||(36018593-36019134)
chr3 (18-559)||(55301848-55302391)
chr3 (220-586)||(46173311-46173678)
chr3 (20-282)||(40913082-40913350)
chr3 (219-453)||(40734442-40734678)
chr3 (219-453)||(44700467-44700703)
chr3 (18-365)||(5433952-5434304)
chr3 (219-453)||(29196374-29196612)
chr3 (219-438)||(44331489-44331710)
chr3 (230-451)||(40735337-40735561)
chr3 (219-453)||(5236445-5236680)
chr3 (219-453)||(29810812-29811048)
chr3 (230-453)||(51398768-51398994)
chr3 (219-453)||(29682303-29682539)
chr3 (219-453)||(760791-761027)
chr3 (219-433)||(22835010-22835226)
chr3 (219-453)||(31314389-31314625)
chr3 (219-453)||(39153349-39153585)
chr3 (218-453)||(9666454-9666693)
chr3 (219-453)||(19683876-19684113)
chr3 (230-451)||(16498984-16499207)
chr3 (205-374)||(31340268-31340439)
chr3 (230-453)||(29813017-29813243)
chr3 (219-453)||(23391897-23392133)
chr3 (219-453)||(9581227-9581463)
chr3 (230-433)||(53921511-53921717)
chr3 (230-435)||(7762220-7762428)
chr3 (219-448)||(45095109-45095339)
chr3 (219-453)||(37408403-37408639)
chr3 (221-433)||(32891049-32891264)
chr3 (230-453)||(7764422-7764645)
chr3 (219-453)||(5258131-5258368)
chr3 (230-453)||(23410317-23410543)
chr3 (219-451)||(23200127-23200360)
chr3 (219-453)||(5260310-5260547)
chr3 (230-435)||(9636131-9636340)
chr3 (219-451)||(23197928-23198161)
chr3 (278-453)||(32744424-32744600)
chr3 (59-384)||(35138762-35139091)
chr3 (134-394)||(26323120-26323385)
chr3 (334-516)||(40913352-40913544)
chr3 (59-229)||(1683270-1683440)
chr3 (467-577)||(31340081-31340191)
chr3 (278-421)||(7780024-7780168)
chr3 (275-435)||(801091-801255)
chr3 (83-227)||(34795677-34795819)
chr3 (150-342)||(39127421-39127614)
chr3 (260-402)||(51352150-51352293)
chr3 (233-327)||(26386597-26386692)
chr3 (120-407)||(20937501-20937790)
chr3 (18-144)||(28074359-28074484)
chr3 (275-435)||(6716500-6716662)
chr3 (275-435)||(54635125-54635287)
chr3 (243-390)||(5373198-5373351)
chr3 (275-421)||(45282983-45283134)
chr3 (275-435)||(3617449-3617613)
chr3 (275-435)||(25637426-25637590)
chr3 (309-402)||(33191866-33191960)
chr3 (219-322)||(2075177-2075281)
chr3 (280-410)||(4055796-4055926)
chr3 (225-381)||(8166516-8166677)
chr3 (367-435)||(2075081-2075149)
chr3 (297-390)||(25491018-25491114)
chr3 (294-381)||(24635276-24635366)
chr3 (29-170)||(36796164-36796306)
chr3 (323-380)||(40519258-40519317)
chr3 (275-435)||(4598528-4598693)
chr3 (275-435)||(10056217-10056382)
chr3 (275-435)||(10058439-10058604)
chr3 (275-435)||(10060661-10060826)
chr3 (275-435)||(10062883-10063048)
chr3 (275-435)||(10065105-10065270)
chr3 (275-435)||(10211393-10211558)
chr3 (374-432)||(27305719-27305777)
chr3 (18-72)||(31340448-31340502)
chr3 (295-347)||(28253363-28253416)
chr3 (280-410)||(4075503-4075636)
chr3 (397-453)||(25795773-25795829)
chr3 (290-377)||(3148054-3148144)
chr3 (453-575)||(5270557-5270680)
chr3 (332-386)||(54744304-54744359)
chr3 (172-229)||(36796692-36796749)
chr3 (120-178)||(50432840-50432898)
chr3 (397-438)||(458499-458540)
chr3 (397-438)||(1313624-1313665)
chr3 (397-438)||(1321694-1321735)
chr3 (397-438)||(1417529-1417570)
chr3 (397-438)||(1736344-1736385)
chr3 (397-438)||(3859742-3859783)
chr3 (468-516)||(4570153-4570202)
chr3 (397-438)||(5886413-5886454)
chr3 (397-438)||(5899886-5899927)
chr3 (397-438)||(6484575-6484616)
chr3 (397-438)||(7606589-7606630)
chr3 (397-438)||(8370525-8370566)
chr3 (397-438)||(10958324-10958365)
chr3 (397-438)||(18552922-18552963)
chr3 (397-438)||(21711230-21711271)
chr3 (397-438)||(25389120-25389161)
chr3 (397-438)||(25688161-25688202)
chr3 (397-438)||(26298995-26299036)
chr3 (397-438)||(27635659-27635700)
chr3 (397-438)||(27974991-27975032)
chr3 (397-438)||(27986485-27986526)
chr3 (397-438)||(30709829-30709870)
chr3 (347-376)||(31340242-31340271)
chr3 (397-438)||(35919116-35919157)
chr3 (397-438)||(41849274-41849315)
chr3 (397-438)||(42990519-42990560)
chr3 (397-438)||(42992485-42992526)
chr3 (397-438)||(43421416-43421457)
chr3 (397-438)||(53894058-53894099)
chr3 (397-437)||(26720762-26720802)
chr3 (397-441)||(48438218-48438262)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (18-586)||(7070-7646)
[»] chr1 (117 HSPs)
chr1 (18-575)||(13548861-13549426)
chr1 (18-537)||(37168039-37168565)
chr1 (18-586)||(13546943-13547515)
chr1 (18-554)||(11348440-11348986)
chr1 (18-554)||(29135990-29136533)
chr1 (23-512)||(19754238-19754737)
chr1 (18-586)||(42297823-42298401)
chr1 (18-554)||(37032951-37033499)
chr1 (18-537)||(34603318-34603830)
chr1 (18-577)||(47255196-47255760)
chr1 (18-552)||(7482114-7482657)
chr1 (51-575)||(31925569-31926099)
chr1 (19-435)||(193355-193773)
chr1 (20-516)||(19752430-19752930)
chr1 (21-557)||(47114917-47115461)
chr1 (18-347)||(37879007-37879337)
chr1 (219-453)||(28265542-28265778)
chr1 (20-271)||(28242133-28242385)
chr1 (230-453)||(28220214-28220440)
chr1 (230-453)||(31659192-31659418)
chr1 (219-453)||(44455104-44455340)
chr1 (235-453)||(49918309-49918530)
chr1 (230-453)||(37503545-37503768)
chr1 (230-453)||(3156820-3157045)
chr1 (219-453)||(834155-834391)
chr1 (219-453)||(3847109-3847345)
chr1 (219-453)||(28223409-28223645)
chr1 (219-453)||(50167163-50167399)
chr1 (219-453)||(50169198-50169434)
chr1 (18-226)||(34602557-34602765)
chr1 (230-453)||(4552625-4552851)
chr1 (220-418)||(1833467-1833667)
chr1 (219-458)||(196890-197132)
chr1 (230-453)||(8550774-8551001)
chr1 (230-453)||(46064872-46065098)
chr1 (230-451)||(13659326-13659550)
chr1 (219-453)||(10925167-10925406)
chr1 (230-453)||(37559855-37560083)
chr1 (230-452)||(45644343-45644569)
chr1 (219-453)||(3189275-3189511)
chr1 (219-453)||(3198092-3198328)
chr1 (219-453)||(3206931-3207167)
chr1 (219-438)||(41360859-41361079)
chr1 (83-415)||(6808254-6808595)
chr1 (221-453)||(13137964-13138196)
chr1 (220-453)||(40122184-40122421)
chr1 (219-453)||(30476434-30476672)
chr1 (217-431)||(15820249-15820465)
chr1 (219-432)||(23555275-23555489)
chr1 (219-453)||(20762616-20762853)
chr1 (219-435)||(927982-928202)
chr1 (347-559)||(37876644-37876860)
chr1 (239-432)||(16455585-16455780)
chr1 (275-435)||(13316357-13316520)
chr1 (93-417)||(22079140-22079461)
chr1 (61-378)||(41135605-41135926)
chr1 (279-432)||(36683694-36683839)
chr1 (230-451)||(51765349-51765576)
chr1 (231-429)||(8871074-8871259)
chr1 (122-381)||(25651931-25652195)
chr1 (218-440)||(44650163-44650389)
chr1 (275-435)||(9987202-9987364)
chr1 (275-435)||(20622242-20622406)
chr1 (275-435)||(40282377-40282540)
chr1 (497-586)||(194750-194839)
chr1 (350-552)||(28242382-28242589)
chr1 (275-435)||(9036417-9036579)
chr1 (234-403)||(37282729-37282901)
chr1 (125-229)||(3331403-3331505)
chr1 (275-435)||(21053958-21054121)
chr1 (61-201)||(12318725-12318864)
chr1 (287-397)||(3460707-3460821)
chr1 (325-402)||(5459956-5460035)
chr1 (275-435)||(44203631-44203795)
chr1 (58-229)||(4535684-4535861)
chr1 (280-410)||(13938143-13938273)
chr1 (260-378)||(12318585-12318706)
chr1 (26-232)||(16216709-16216911)
chr1 (209-381)||(1050503-1050678)
chr1 (218-346)||(44646881-44647010)
chr1 (295-380)||(4535541-4535629)
chr1 (324-401)||(9109459-9109539)
chr1 (312-404)||(2263011-2263106)
chr1 (18-165)||(9109680-9109827)
chr1 (397-453)||(19072920-19072976)
chr1 (397-453)||(19120810-19120866)
chr1 (173-232)||(33775808-33775866)
chr1 (280-381)||(16914234-16914338)
chr1 (292-390)||(32471478-32471578)
chr1 (397-446)||(3281707-3281756)
chr1 (397-438)||(12302510-12302551)
chr1 (469-505)||(193813-193849)
chr1 (289-346)||(918431-918487)
chr1 (154-196)||(6068471-6068512)
chr1 (172-230)||(41053193-41053250)
chr1 (397-459)||(47703985-47704046)
chr1 (397-438)||(2510330-2510371)
chr1 (397-438)||(6823249-6823290)
chr1 (397-438)||(10399833-10399874)
chr1 (397-438)||(13358808-13358849)
chr1 (397-438)||(13598405-13598446)
chr1 (397-438)||(15294839-15294880)
chr1 (397-438)||(17324641-17324682)
chr1 (397-438)||(26644946-26644987)
chr1 (397-438)||(27336945-27336986)
chr1 (397-438)||(28207073-28207114)
chr1 (397-438)||(28840914-28840955)
chr1 (397-438)||(28998258-28998299)
chr1 (397-438)||(29003974-29004015)
chr1 (397-438)||(29651818-29651859)
chr1 (397-438)||(31735526-31735567)
chr1 (397-438)||(37069777-37069818)
chr1 (397-438)||(39462754-39462795)
chr1 (397-438)||(50307551-50307592)
chr1 (397-438)||(51750274-51750315)
chr1 (397-438)||(51752598-51752639)
chr1 (453-505)||(12318454-12318506)
[»] chr5 (94 HSPs)
chr5 (18-516)||(40147003-40147508)
chr5 (18-577)||(27015274-27015831)
chr5 (18-554)||(213210-213754)
chr5 (18-563)||(27637486-27638041)
chr5 (18-441)||(38746747-38747173)
chr5 (18-435)||(28278057-28278478)
chr5 (18-586)||(5057790-5058367)
chr5 (230-451)||(13488157-13488381)
chr5 (219-451)||(533713-533947)
chr5 (230-453)||(42428418-42428644)
chr5 (219-453)||(28750643-28750879)
chr5 (230-453)||(32636778-32637004)
chr5 (220-453)||(537970-538205)
chr5 (220-453)||(42426223-42426458)
chr5 (219-453)||(39468537-39468773)
chr5 (230-451)||(33831634-33831858)
chr5 (219-453)||(31182917-31183151)
chr5 (121-554)||(16640821-16641263)
chr5 (230-438)||(8565949-8566160)
chr5 (219-453)||(25412706-25412941)
chr5 (230-435)||(16452035-16452242)
chr5 (219-453)||(13239696-13239932)
chr5 (230-453)||(30682911-30683134)
chr5 (18-525)||(316508-317020)
chr5 (219-453)||(13343005-13343241)
chr5 (219-453)||(19806328-19806543)
chr5 (219-453)||(30182533-30182769)
chr5 (219-435)||(3075664-3075882)
chr5 (219-453)||(36074030-36074268)
chr5 (219-453)||(37439078-37439322)
chr5 (220-429)||(9049354-9049565)
chr5 (18-381)||(35615914-35616278)
chr5 (20-435)||(33906035-33906452)
chr5 (230-407)||(42309969-42310149)
chr5 (22-334)||(4160380-4160690)
chr5 (219-370)||(5887487-5887640)
chr5 (275-435)||(16409475-16409638)
chr5 (225-431)||(13695700-13695910)
chr5 (275-435)||(26177883-26178045)
chr5 (275-435)||(9789229-9789392)
chr5 (275-435)||(18441653-18441816)
chr5 (18-233)||(14689622-14689833)
chr5 (290-407)||(10054850-10054969)
chr5 (275-435)||(29751165-29751328)
chr5 (20-223)||(21205873-21206076)
chr5 (275-435)||(22536295-22536457)
chr5 (275-435)||(26170774-26170925)
chr5 (275-435)||(29720364-29720527)
chr5 (275-435)||(29722524-29722687)
chr5 (275-435)||(10593258-10593421)
chr5 (347-435)||(42926965-42927053)
chr5 (288-390)||(22097877-22097980)
chr5 (220-290)||(42926838-42926908)
chr5 (275-435)||(25078120-25078284)
chr5 (275-435)||(25136089-25136253)
chr5 (487-560)||(40751195-40751268)
chr5 (142-417)||(10700674-10700950)
chr5 (22-111)||(16642211-16642298)
chr5 (295-402)||(3325933-3326043)
chr5 (275-435)||(40380090-40380254)
chr5 (275-435)||(40382301-40382465)
chr5 (319-374)||(42926911-42926968)
chr5 (18-110)||(10055040-10055132)
chr5 (396-453)||(5887422-5887479)
chr5 (289-378)||(30802843-30802934)
chr5 (487-560)||(40763200-40763273)
chr5 (152-246)||(8019464-8019557)
chr5 (330-435)||(16546684-16546794)
chr5 (397-438)||(27910685-27910726)
chr5 (33-117)||(30802698-30802782)
chr5 (316-404)||(8445756-8445847)
chr5 (397-453)||(10281743-10281799)
chr5 (63-110)||(30793025-30793073)
chr5 (376-519)||(4160702-4160850)
chr5 (275-435)||(16544407-16544572)
chr5 (312-378)||(32609572-32609641)
chr5 (397-438)||(2175153-2175194)
chr5 (397-438)||(2724128-2724169)
chr5 (397-438)||(9353381-9353422)
chr5 (397-438)||(10529102-10529143)
chr5 (397-438)||(17004009-17004050)
chr5 (397-438)||(18466919-18466960)
chr5 (397-438)||(21684455-21684496)
chr5 (397-438)||(24127091-24127132)
chr5 (397-438)||(25921476-25921517)
chr5 (397-438)||(26097966-26098007)
chr5 (397-438)||(27912771-27912812)
chr5 (397-438)||(34477056-34477097)
chr5 (397-438)||(34479421-34479462)
chr5 (397-438)||(36932399-36932440)
chr5 (397-438)||(40221758-40221799)
chr5 (289-347)||(6741941-6741998)
chr5 (398-438)||(20505846-20505886)
chr5 (334-393)||(35287139-35287199)
[»] chr2 (74 HSPs)
chr2 (18-554)||(42287993-42288535)
chr2 (18-559)||(45726672-45727217)
chr2 (18-575)||(35446745-35447310)
chr2 (18-559)||(1631611-1632158)
chr2 (18-560)||(17450333-17450868)
chr2 (20-433)||(24397801-24398219)
chr2 (18-550)||(33647911-33648454)
chr2 (219-453)||(36773506-36773742)
chr2 (219-453)||(29867813-29868049)
chr2 (230-453)||(17057357-17057583)
chr2 (230-453)||(17085340-17085566)
chr2 (219-453)||(723732-723968)
chr2 (217-453)||(33162438-33162676)
chr2 (219-453)||(34139758-34139995)
chr2 (230-453)||(36317997-36318223)
chr2 (219-453)||(38312184-38312420)
chr2 (219-469)||(14633796-14634050)
chr2 (219-453)||(11151579-11151815)
chr2 (219-453)||(42362296-42362528)
chr2 (219-453)||(11690445-11690681)
chr2 (219-453)||(11067249-11067485)
chr2 (219-453)||(2334405-2334641)
chr2 (219-453)||(36988063-36988299)
chr2 (219-469)||(5723226-5723478)
chr2 (219-453)||(45099699-45099935)
chr2 (219-403)||(13121712-13121897)
chr2 (219-453)||(4503120-4503356)
chr2 (229-453)||(6594993-6595221)
chr2 (219-453)||(36205652-36205887)
chr2 (219-451)||(4484319-4484554)
chr2 (219-451)||(30833290-30833525)
chr2 (219-414)||(14202439-14202631)
chr2 (217-435)||(17490154-17490368)
chr2 (219-375)||(24885605-24885763)
chr2 (269-435)||(26353178-26353346)
chr2 (219-403)||(7815311-7815498)
chr2 (219-435)||(11049493-11049716)
chr2 (324-554)||(7451167-7451404)
chr2 (68-525)||(30217956-30218410)
chr2 (275-435)||(32289565-32289727)
chr2 (219-319)||(39284829-39284929)
chr2 (219-381)||(12123644-12123809)
chr2 (275-435)||(6266691-6266854)
chr2 (18-229)||(42261826-42262035)
chr2 (367-438)||(39284930-39285001)
chr2 (19-134)||(7451043-7451158)
chr2 (275-435)||(13656037-13656200)
chr2 (275-435)||(12647391-12647555)
chr2 (119-223)||(43730991-43731093)
chr2 (296-402)||(42261524-42261633)
chr2 (219-294)||(5700271-5700347)
chr2 (324-407)||(42019904-42019992)
chr2 (295-381)||(34811281-34811370)
chr2 (324-399)||(24197946-24198023)
chr2 (364-417)||(28672022-28672075)
chr2 (324-365)||(4561137-4561180)
chr2 (397-453)||(31056036-31056092)
chr2 (197-246)||(16676146-16676196)
chr2 (295-381)||(41454254-41454343)
chr2 (372-418)||(42412117-42412162)
chr2 (397-438)||(3022383-3022424)
chr2 (397-438)||(5375349-5375390)
chr2 (397-438)||(6264151-6264192)
chr2 (397-438)||(11739562-11739603)
chr2 (397-438)||(13569335-13569376)
chr2 (397-438)||(13910048-13910089)
chr2 (397-438)||(14699056-14699097)
chr2 (397-438)||(19502014-19502055)
chr2 (397-438)||(20522227-20522268)
chr2 (397-438)||(23452240-23452281)
chr2 (397-438)||(27105008-27105049)
chr2 (335-390)||(16605654-16605710)
chr2 (336-368)||(28861131-28861163)
chr2 (295-339)||(41446159-41446203)
[»] chr8 (86 HSPs)
chr8 (18-516)||(40221487-40221992)
chr8 (18-586)||(42434837-42435417)
chr8 (18-554)||(11383728-11384270)
chr8 (72-554)||(4283320-4283809)
chr8 (19-554)||(40328522-40329061)
chr8 (121-554)||(18655246-18655688)
chr8 (24-406)||(44353540-44353926)
chr8 (230-459)||(27811232-27811464)
chr8 (218-516)||(10930118-10930424)
chr8 (219-453)||(15212730-15212966)
chr8 (219-453)||(43036367-43036603)
chr8 (219-453)||(4731602-4731838)
chr8 (219-453)||(33352094-33352330)
chr8 (219-453)||(30143286-30143520)
chr8 (217-453)||(40321022-40321260)
chr8 (219-434)||(18141764-18141981)
chr8 (217-453)||(1345359-1345597)
chr8 (217-453)||(5689213-5689451)
chr8 (219-453)||(3303658-3303894)
chr8 (219-453)||(6598916-6599152)
chr8 (219-453)||(6674369-6674605)
chr8 (219-453)||(30291549-30291788)
chr8 (219-453)||(9765693-9765924)
chr8 (219-449)||(12702626-12702862)
chr8 (248-554)||(3772164-3772477)
chr8 (231-453)||(42498149-42498375)
chr8 (219-434)||(1292471-1292687)
chr8 (221-435)||(8965697-8965914)
chr8 (219-438)||(19491702-19491922)
chr8 (219-453)||(4743202-4743427)
chr8 (220-453)||(41366603-41366837)
chr8 (219-453)||(17982597-17982834)
chr8 (230-453)||(34254318-34254543)
chr8 (230-435)||(4162454-4162658)
chr8 (219-453)||(31218201-31218438)
chr8 (230-453)||(34256494-34256719)
chr8 (230-453)||(19945346-19945574)
chr8 (219-439)||(18106083-18106302)
chr8 (219-453)||(44303798-44304036)
chr8 (219-453)||(1746206-1746442)
chr8 (230-390)||(10929753-10929905)
chr8 (219-362)||(41364926-41365071)
chr8 (219-429)||(8153705-8153914)
chr8 (275-441)||(2627735-2627905)
chr8 (351-453)||(4733784-4733886)
chr8 (18-132)||(22976276-22976389)
chr8 (18-221)||(40585467-40585669)
chr8 (313-435)||(10015119-10015241)
chr8 (20-233)||(3846032-3846241)
chr8 (20-165)||(9633816-9633959)
chr8 (120-346)||(33655402-33655628)
chr8 (275-435)||(25689955-25690117)
chr8 (335-435)||(3073880-3073981)
chr8 (99-229)||(10020272-10020398)
chr8 (275-433)||(3439504-3439664)
chr8 (309-417)||(7597648-7597759)
chr8 (290-417)||(32902197-32902327)
chr8 (265-405)||(1822282-1822425)
chr8 (265-405)||(1856727-1856870)
chr8 (180-382)||(10240061-10240264)
chr8 (120-245)||(10101351-10101475)
chr8 (18-141)||(2999823-2999946)
chr8 (309-417)||(11712024-11712135)
chr8 (150-256)||(40535713-40535819)
chr8 (280-407)||(29796354-29796485)
chr8 (47-245)||(3817538-3817729)
chr8 (397-438)||(18810998-18811039)
chr8 (453-516)||(2999723-2999786)
chr8 (296-390)||(30909389-30909484)
chr8 (275-435)||(15290522-15290687)
chr8 (275-435)||(15470891-15471056)
chr8 (275-435)||(42575329-42575494)
chr8 (397-438)||(22684656-22684697)
chr8 (324-390)||(38860414-38860482)
chr8 (217-377)||(3231859-3232023)
chr8 (324-393)||(11137074-11137149)
chr8 (397-438)||(3874301-3874342)
chr8 (397-438)||(4424309-4424350)
chr8 (455-504)||(11137213-11137262)
chr8 (397-438)||(14419193-14419234)
chr8 (397-438)||(14808052-14808093)
chr8 (397-438)||(26403279-26403320)
chr8 (397-438)||(27829587-27829628)
chr8 (397-438)||(30480506-30480547)
chr8 (364-400)||(38863949-38863985)
chr8 (289-347)||(42093131-42093188)
[»] chr4 (122 HSPs)
chr4 (20-525)||(54882764-54883278)
chr4 (20-586)||(35662186-35662758)
chr4 (18-559)||(12073135-12073683)
chr4 (18-551)||(50673733-50674272)
chr4 (18-512)||(8665149-8665651)
chr4 (19-554)||(41964160-41964699)
chr4 (18-554)||(8647880-8648429)
chr4 (19-554)||(379122-379666)
chr4 (18-516)||(6655698-6656203)
chr4 (18-554)||(50262578-50263124)
chr4 (18-516)||(27416886-27417377)
chr4 (18-505)||(46703243-46703738)
chr4 (18-554)||(2209450-2210004)
chr4 (165-559)||(40632334-40632735)
chr4 (18-364)||(55085442-55085791)
chr4 (205-586)||(41639356-41639746)
chr4 (18-554)||(33989605-33990131)
chr4 (18-541)||(12119282-12119817)
chr4 (219-453)||(26175624-26175860)
chr4 (219-453)||(9927446-9927681)
chr4 (262-553)||(26364223-26364522)
chr4 (219-453)||(5429623-5429859)
chr4 (217-451)||(36463379-36463615)
chr4 (230-453)||(48893626-48893856)
chr4 (230-438)||(36994478-36994689)
chr4 (219-453)||(47038399-47038633)
chr4 (18-232)||(26364007-26364222)
chr4 (219-453)||(34570402-34570638)
chr4 (219-453)||(12739538-12739774)
chr4 (219-453)||(52467342-52467579)
chr4 (219-453)||(54199895-54200130)
chr4 (45-539)||(26699339-26699845)
chr4 (219-438)||(37740570-37740790)
chr4 (219-453)||(56178624-56178860)
chr4 (219-453)||(5871764-5872000)
chr4 (264-453)||(46147379-46147570)
chr4 (219-453)||(29254438-29254674)
chr4 (213-438)||(21688186-21688414)
chr4 (221-435)||(31474096-31474313)
chr4 (219-453)||(52095350-52095586)
chr4 (219-453)||(48142986-48143224)
chr4 (236-453)||(3913408-3913627)
chr4 (219-475)||(45687147-45687407)
chr4 (220-409)||(12745468-12745659)
chr4 (219-399)||(24969055-24969238)
chr4 (18-170)||(40630726-40630878)
chr4 (219-431)||(37229731-37229947)
chr4 (219-435)||(6542185-6542405)
chr4 (219-405)||(12747792-12747980)
chr4 (219-435)||(4587902-4588121)
chr4 (288-453)||(12743913-12744080)
chr4 (288-453)||(12745302-12745469)
chr4 (18-403)||(33089641-33090009)
chr4 (230-435)||(29999811-30000019)
chr4 (18-174)||(46569816-46569972)
chr4 (219-383)||(52082715-52082881)
chr4 (219-453)||(13009432-13009655)
chr4 (18-400)||(22882791-22883178)
chr4 (18-400)||(22934455-22934842)
chr4 (219-361)||(41639207-41639351)
chr4 (230-435)||(51337018-51337226)
chr4 (220-435)||(5207848-5208066)
chr4 (221-453)||(5370070-5370308)
chr4 (219-453)||(13992280-13992509)
chr4 (295-409)||(12744079-12744195)
chr4 (121-377)||(32091324-32091583)
chr4 (120-404)||(35369482-35369763)
chr4 (18-221)||(3785833-3786034)
chr4 (275-435)||(31495321-31495485)
chr4 (217-404)||(48142412-48142605)
chr4 (129-233)||(41961264-41961368)
chr4 (453-553)||(55085325-55085425)
chr4 (57-203)||(34112392-34112538)
chr4 (120-342)||(35370449-35370661)
chr4 (219-408)||(29056301-29056494)
chr4 (275-435)||(8393394-8393557)
chr4 (275-435)||(8395603-8395766)
chr4 (248-386)||(53345189-53345331)
chr4 (280-409)||(44967861-44967992)
chr4 (289-378)||(5349924-5350016)
chr4 (295-379)||(44570427-44570514)
chr4 (295-405)||(21703871-21703985)
chr4 (209-407)||(52065530-52065730)
chr4 (18-67)||(10071627-10071676)
chr4 (18-70)||(10072013-10072065)
chr4 (459-552)||(46703739-46703833)
chr4 (275-435)||(5136063-5136228)
chr4 (275-435)||(5138288-5138453)
chr4 (296-390)||(34112838-34112935)
chr4 (219-400)||(6677412-6677597)
chr4 (275-419)||(7124901-7125048)
chr4 (397-438)||(31849602-31849643)
chr4 (295-365)||(34788851-34788923)
chr4 (494-554)||(21688471-21688531)
chr4 (309-407)||(37754994-37755095)
chr4 (323-390)||(1122866-1122937)
chr4 (397-438)||(4215595-4215636)
chr4 (397-438)||(5635479-5635520)
chr4 (397-438)||(6765133-6765174)
chr4 (397-438)||(7941612-7941653)
chr4 (397-438)||(8631422-8631463)
chr4 (397-438)||(10047386-10047427)
chr4 (397-438)||(14789431-14789472)
chr4 (397-438)||(16455531-16455572)
chr4 (397-438)||(16623342-16623383)
chr4 (397-438)||(17662248-17662289)
chr4 (397-438)||(22800865-22800906)
chr4 (397-438)||(22802737-22802778)
chr4 (397-438)||(24879279-24879320)
chr4 (397-438)||(24880741-24880782)
chr4 (397-438)||(24889085-24889126)
chr4 (397-438)||(36315278-36315319)
chr4 (397-438)||(36329487-36329528)
chr4 (397-438)||(37089375-37089416)
chr4 (397-438)||(38928180-38928221)
chr4 (397-438)||(39246001-39246042)
chr4 (397-438)||(40637363-40637404)
chr4 (197-245)||(43135583-43135632)
chr4 (526-575)||(54881561-54881610)
chr4 (397-453)||(3796568-3796624)
chr4 (395-435)||(24969787-24969827)
chr4 (289-347)||(37781951-37782008)
[»] chr6 (60 HSPs)
chr6 (18-435)||(21593408-21593826)
chr6 (18-554)||(26830003-26830550)
chr6 (18-552)||(5043370-5043912)
chr6 (18-431)||(2972949-2973365)
chr6 (18-516)||(603005-603506)
chr6 (18-557)||(17762729-17763280)
chr6 (18-539)||(3808601-3809135)
chr6 (18-554)||(22424706-22425253)
chr6 (257-554)||(21588913-21589216)
chr6 (219-453)||(9183019-9183255)
chr6 (219-429)||(28137420-28137632)
chr6 (219-453)||(5406187-5406422)
chr6 (219-453)||(5410512-5410747)
chr6 (219-450)||(26954277-26954509)
chr6 (219-449)||(33211177-33211409)
chr6 (247-552)||(17757994-17758308)
chr6 (219-418)||(3038926-3039127)
chr6 (219-435)||(2171537-2171754)
chr6 (230-453)||(30834523-30834750)
chr6 (230-453)||(31404662-31404887)
chr6 (219-433)||(5413401-5413616)
chr6 (230-453)||(16452316-16452543)
chr6 (18-187)||(17757824-17757995)
chr6 (217-407)||(4045364-4045558)
chr6 (219-453)||(33160339-33160577)
chr6 (279-453)||(16569037-16569202)
chr6 (318-554)||(26800630-26800873)
chr6 (172-402)||(25073463-25073698)
chr6 (275-435)||(3072764-3072928)
chr6 (275-435)||(412101-412265)
chr6 (275-435)||(6097456-6097608)
chr6 (38-140)||(26800533-26800634)
chr6 (349-433)||(5409076-5409161)
chr6 (114-255)||(5740978-5741120)
chr6 (275-435)||(27647861-27648023)
chr6 (275-435)||(16554869-16555032)
chr6 (275-435)||(16578523-16578686)
chr6 (275-435)||(16616694-16616857)
chr6 (275-435)||(16631425-16631588)
chr6 (275-435)||(16653112-16653275)
chr6 (275-435)||(25421305-25421469)
chr6 (120-243)||(11660452-11660574)
chr6 (275-435)||(6027246-6027410)
chr6 (230-343)||(16567160-16567265)
chr6 (465-554)||(2972818-2972908)
chr6 (275-435)||(13153913-13154078)
chr6 (275-435)||(33342110-33342275)
chr6 (275-435)||(34164856-34165021)
chr6 (397-438)||(1230252-1230293)
chr6 (397-438)||(4816234-4816275)
chr6 (397-438)||(5273219-5273260)
chr6 (397-438)||(5757527-5757568)
chr6 (397-438)||(11983032-11983073)
chr6 (397-438)||(14458770-14458811)
chr6 (397-438)||(14507179-14507220)
chr6 (397-438)||(19704570-19704611)
chr6 (397-438)||(20915359-20915400)
chr6 (18-168)||(25072928-25073076)
chr6 (364-400)||(2908550-2908586)
chr6 (350-401)||(9572667-9572719)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (18-554)||(17885-18427)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (18-386)||(80338-80709)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (18-435)||(11300-11720)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (230-451)||(149087-149311)
scaffold0006 (397-438)||(5690-5731)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (230-453)||(20403-20629)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (219-452)||(114547-114782)
[»] scaffold0002 (3 HSPs)
scaffold0002 (248-453)||(434504-434714)
scaffold0002 (18-229)||(490661-490870)
scaffold0002 (296-402)||(490359-490468)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (219-453)||(861-1096)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (219-451)||(11150-11385)
scaffold0491 (219-451)||(8724-8959)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (260-554)||(10475-10775)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (217-417)||(27466-27670)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (18-249)||(1591-1831)
scaffold0197 (453-539)||(1293-1379)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (209-381)||(24986-25162)
[»] scaffold0565 (1 HSPs)
scaffold0565 (275-435)||(2609-2773)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (275-435)||(3731-3895)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (275-435)||(6272-6436)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (397-438)||(1456-1497)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (397-438)||(8468-8509)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (397-438)||(45260-45301)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (397-438)||(29414-29455)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (397-438)||(69295-69336)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (397-441)||(10733-10777)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 532; Significance: 0; HSPs: 109)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 532; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 2361397 - 2360827
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2361397 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtggagagt 2361298  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgaggttagattctag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2361297 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgaggttagattctag 2361198  T
Q  218 agttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2361197 agttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 2361098  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2361097 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggatttgagatatcaatctctcccccagattaggt 2360998  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgtcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatatgcactt 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2360997 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgtcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatatgcactt 2360898  T
Q  516 ggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtgatttactttagttgttggttgcctttgctact 586  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  2360897 ggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtgatttactttggttgttggttgccattgatact 2360827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 34311142 - 34310597
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  34311142 agatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaaggttcatggggatggaaaacacatgagtggagagt 34311043  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgagg-ttagattcta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  34311042 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaaaggttggttctcttttgggggttagattcta 34310943  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34310942 gagttgggaaataattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 34310843  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  34310842 tgtgaaattgttgaagctaatttcttgtaacacatttgtatctttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 34310743  T
Q  415 tcaagtt-gaaccgaactgggtcaataacctttggtgtg----tcttttctttattctctttatcttgtttattcctt-ggttgaattgtggttttgata 508  Q
    ||||||| | |||||||||||| || || |||||||||     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  34310742 tcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttattcctttggttgaattgtggttttgcta 34310643  T
Q  509 tgcacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtg 554  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  34310642 tgcacttggtttatagactaggtctatattgttgttattgcttgtg 34310597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 554
Target Start/End: Original strand, 29608483 - 29609023
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29608483 agatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttgg-----attcatggggttgggaaacacatgagtggagagt 29608577  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattcta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  29608578 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaatagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattcta 29608677  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaa-atcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttct 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29608678 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgagagagcgaaacttcatgagtgtcttgttctttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttct 29608777  T
Q  316 ttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattag 413  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||    
T  29608778 ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatcactcctccagagtag 29608877  T
Q  414 gtcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg----tgtcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtgg-ttttgata 508  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||    ||||||    | |||||||| || |||||||||||||||||| | ||| ||  ||||||| ||||||||    
T  29608878 gtcaagttggaccgaactgagtgaatatttcttggtgttgttatcttttctctactctctttatcttgtttatcctttgcttagattgtggtttttgata 29608977  T
Q  509 tgcacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtg 554  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  29608978 tgcacttggtttctatattagatctagattgttgttgttgcttgtg 29609023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 33 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 4509116 - 4508584
Alignment:
Q  33 agaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagtcttttgtgagcaact 132  Q
    |||| |||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  4509116 agaaccaaaagagggagctcttgggaaa-gggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaact 4509018  T
Q  133 tgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgagg-ttagattctagagttgggaaacaat 231  Q
    | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  4509017 ttggtgagtcttgtgaaaccaaaagataagatccttagtgaaatcaaaggctaaggattggttctcttttatgggttagattctagagttgggaaacaat 4508918  T
Q  232 tgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaa 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  4508917 tgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttgattggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggttgttctttgtgagcttattgaa 4508818  T
Q  332 gctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaa 429  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||| ||||| |||||| ||||||    
T  4508817 gctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgagagtggattggagagatcaatctcttcttcagagtaggttaagttggaccgaa 4508718  T
Q  430 ctgggtcaataacctttggtg----tgtcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatatgcacttggtttctaga 525  Q
    |||||| || |    ||||||    | | ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  4508717 ctgggtgaacatttcttggtgttgttatattttctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttataga 4508618  T
Q  526 ctaggtctatattgatgttgttgcttgtgattta 559  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  4508617 ctaggtctatattgttgttattgcttgtggttta 4508584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 435
Target Start/End: Original strand, 6431713 - 6432133
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  6431713 agatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtgtagagt 6431812  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttga-ggttagattcta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6431813 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattcta 6431912  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6431913 gagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggttagattgggaaaatgggtagaaattaggattgttctt 6432012  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||    
T  6432013 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattggagagatcaatctctccttcagagtagg 6432112  T
Q  415 tcaagttgaaccgaactgggt 435  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  6432113 tcaagttggaccgaactgggt 6432133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 4512815 - 4512268
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  4512815 agatgtgaatcttagagaaccaaaagagggggctcttgggaaa-gggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaacacatgagtggagagt 4512717  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattcta 216  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||    
T  4512716 catttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttagttctcttttgggggttatattcta 4512617  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4512616 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgccttgttgattggtgagatttggaaaatgggtagaaattaaggttgttctt 4512517  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||| ||||    
T  4512516 tgtgagtttattgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttataagaactcattgatagtggattgaagaaatcaatctctcctgtagagtagg 4512417  T
Q  415 tcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg----tgtcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatatg 510  Q
    |||||||| |||| ||||||| || |    ||||||    | ||||||||||| |||||| ||||||||||| | || ||||||||||| ||||| ||||    
T  4512416 tcaagttggaccgtactgggtgaacatttcttggtgttgttatcttttctttactctcttgatcttgtttatccattagttgaattgtgtttttgctatg 4512317  T
Q  511 cacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtgattta 559  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  4512316 cacttgatttatagactaggtctatattgttgttattgcttgtggttta 4512268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 38 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 48599740 - 48599235
Alignment:
Q  38 caaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggt 137  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  48599740 caaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaaaacatgagtagagagtcttttgtgagcaacttgggt 48599641  T
Q  138 gagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattctagagttgggaaacaattgtaa 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48599640 gagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttatattctagagttgggaaacaattgtaa 48599541  T
Q  237 acaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaa 336  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48599540 acaccttggaggagtgaaaatcatgattgtcttgttcattggtgatattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaa 48599441  T
Q  337 tttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactggg 434  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  || |||||||| |||||||||||    
T  48599440 tttcttgtaactcatttgtatctctttggaagagctcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagcagatcaagttggaccgaactggg 48599341  T
Q  435 tcaataacctttggtg----tgtcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatatgcacttggtttctagactagg 530  Q
    | || |    ||| ||    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||| | || |||||||||    
T  48599340 tgaacatttcttgatgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttattccttggttggattgtagttttgctgtgcactt-gattatagactagg 48599242  T
Q  531 tctatat 537  Q
    |||||||    
T  48599241 tctatat 48599235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 18 - 554
Target Start/End: Original strand, 2390024 - 2390571
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||| | || |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||    
T  2390024 agatgtgaatcttggaaaaccaaaagagggggctattgcgaaaagggttggtggcttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggatagt 2390123  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattcta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  2390124 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattcta 2390223  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2390224 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagcgaaaatcataagtgtcttgttcattggtgaaattcgaaaaatgggtagaaattagggttgttctt 2390323  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  2390324 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaataactcatatatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 2390423  T
Q  415 tcaagttgaaccgaactgggtcaataacct-ttggtg-tgt------cttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttga 506  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||| || |||||| |||       |||||| || |||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||     
T  2390424 tcaagttggaccgaactaggtgaataatctcttggtgttgttgtttatttttctctactctctttatcttgtttatccttttgttggattgtggttttgc 2390523  T
Q  507 tatgcacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtg 554  Q
    ||| || ||| |||||||| ||| |||| |||| |||| ||| |||||    
T  2390524 tatacatttgttttctagattagatctagattgttgttattgattgtg 2390571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 33 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 4510958 - 4510426
Alignment:
Q  33 agaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagtcttttgtgagcaact 132  Q
    |||| |||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  4510958 agaaccaaaagagggagctcttgggaaa-gggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaact 4510860  T
Q  133 tgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgagg-ttagattctagagttgggaaacaat 231  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  4510859 ttggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaacgattggttctcttttatgggttagattctagagttgggaaacaat 4510760  T
Q  232 tgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaa 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  4510759 tgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgccttgttgattggtgagatttggaaaatgggtagaaattaaggttgttctttgtgagtttattgaa 4510660  T
Q  332 gctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaa 429  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||| |||||||||||| |||| |    
T  4510659 gctaatttcttgtaacccatttgtatctctttataagaactcattgatagtggattgaagaaatcaatctctcctgtagagtaggtcaagttggaccgta 4510560  T
Q  430 ctgggtcaataacctttggtg----tgtcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatatgcacttggtttctaga 525  Q
    |||||| || |    ||||||    | ||||||||||| |||||| ||||||||||| | || ||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||    
T  4510559 ctgggtgaacatttcttggtgttgttatcttttctttactctcttgatcttgtttatccattagttgaattgtgtttttgctatgcacttgatttataga 4510460  T
Q  526 ctaggtctatattgatgttgttgcttgtgattta 559  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  4510459 ctaggtctatattgttgttattgcttgtggttta 4510426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 19 - 554
Target Start/End: Original strand, 3258739 - 3259280
Alignment:
Q  19 gatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagtc 118  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  3258739 gatgtgaatcttggagaacaaaaagatggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatgggaaacatatgagtggagagtc 3258838  T
Q  119 ttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctc-ttttgaggttagattctag 217  Q
    |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  3258839 ttttattagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttag-gaaatcaaa-cctaagggttggttctcatttgggggttagattctag 3258936  T
Q  218 agttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaa-tcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3258937 agttgggaaacaattgtaaacaccttgggaaagtgaaaattcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaactagggttgttctt 3259036  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  3259037 tgtgagcttgtttaagctaatttattgtaactcatttgtatctctttgtaaaaacccattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 3259136  T
Q  415 tcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg----tgtcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatatg 510  Q
    ||||||||||||||||||||| || |     |||||    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  3259137 tcaagttgaaccgaactgggtgaacatttcctggtgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttattccttggttggattgtggttttgctatg 3259236  T
Q  511 cacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtg 554  Q
    | | || |||||||| ||| |||| |||| |||| |||||||||    
T  3259237 cccgtgttttctagattagatctagattgttgttattgcttgtg 3259280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 59 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 8359703 - 8359165
Alignment:
Q  59 aaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaaga 158  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  8359703 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttggatgagtcttgtgaaaccaaaaga 8359604  T
Q  159 gaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgagg--ttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaa 256  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8359603 gaaaatccttagtgaaatcaaaggctaagagttggttattttttgggggtttagattcttgagttggaaaacaattgtaaacaccttgagagagtgaaaa 8359504  T
Q  257 tcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac---atttgt 353  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    |||||    
T  8359503 tcatgagtgtcttgttcattggggagattgggaaaatgggtagaaattagggtttttctttgtgagcttgtttaaactaatttcttgtaacccattttgt 8359404  T
Q  354 atctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtca-agttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg-- 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||  |||| |||||||||||| || |    ||||||      
T  8359403 atctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaacatttcttggtgtt 8359304  T
Q  451 --tgtcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatatgcacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttg 548  Q
      | |||||||| || |||| ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  8359303 gttatcttttctctactctcattatcttgtttatcctttggttagattgtggttttgctatgcacttgttttctagattagatctagattgttgttgttg 8359204  T
Q  549 cttgtgatttactttag-ttgttggttgcctttgctact 586  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||    
T  8359203 cttgtgatttacttttgattgttggttgccattgatact 8359165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 18 - 435
Target Start/End: Original strand, 22269717 - 22270135
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  22269717 agatgtgaatcttggagaaccaaaagagggg-ctcttgggaaa-gagttggtgccttttggggaagattcatggggaggggaaacacatgagtggagagt 22269814  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattcta 216  Q
    || ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  22269815 ctattgagagaaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaatagaagatccttagtgaaatcataggctatgggttggttctcttttgggggttagattcta 22269914  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaa-tcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttct 315  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22269915 gagtt-ggaaacaattctaaacaccttgggagagtgaaaattcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttct 22270013  T
Q  316 ttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattag 413  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  22270014 ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactgattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtag 22270113  T
Q  414 gtcaagttgaaccgaactgggt 435  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  22270114 gtcaagttggaccgaactgggt 22270135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 18 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 22328825 - 22328287
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggat-gattcatggggttgggaaacacatgagtgaagag 116  Q
    |||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||    
T  22328825 agatgtaaatcttggagaaccaaaagagggggctcttaggaaaagagttggtgccttttggggagagattcatagggttgggaaaaacatgagtagagag 22328726  T
Q  117 tcttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt--gaggttagattc 214  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||| |    
T  22328725 tcatttgtgagcaacttgggtgaatcttgggaaactaaaagagaatatcctta-tgtaatcaaaagctaagggttggttctcttttggggggttagatcc 22328627  T
Q  215 tagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtc----ttgttcattggtgagattgggaa-aatgggtagaaattag-g 307  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||    ||||||||| | ||||||||||| || || |||||||||| |    
T  22328626 taaagttgggaaacaattgtaaacaccttgagggaatgaaaatcattgagtgtcttgtttgttcattagagagattgggaagaaaggttagaaattagag 22328527  T
Q  308 gttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagatatcaatctctccc 404  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  22328526 tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgcaaggaagtcattaatagtggatttgagagatcaatctctccc 22328427  T
Q  405 ccagattaggtca-agttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg----tgtcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtg 499  Q
    | ||| |||||||  |||| |||||||||||| ||||   |||||||    | |||||||| || |||||||||||||||||||| || |||  ||||||    
T  22328426 ctagagtaggtcattgttggaccgaactgggtaaatattttttggtgttgttatcttttctctactctctttatcttgtttattcttttgttcgattgtg 22328327  T
Q  500 gttttgatatgcacttggtttctagactaggtctatattg 539  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||| |||| ||||    
T  22328326 gttttgttatgcacttggtttctcgattagatctagattg 22328287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 6360338 - 6360073
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||  || ||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||    
T  6360338 agatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgagaaaaggaatggtgccttttgaagaagattcatggagttgaaaaacacatgagtggagagt 6360239  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattcta 216  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  6360238 catttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaatcaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattcta 6360139  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgag 282  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6360138 gagttgggaaacaattttaaacaccttgggagaatgaaaatcatgagtgacttgttcattggtgag 6360073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Original strand, 27347761 - 27347997
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27347761 gttgggaaaca-ttgtaaacacattgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggattgttcttt 27347859  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27347860 gtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattgcagagatcaatctctcccccagattaggt 27347959  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  27347960 caagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgt 27347997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 47676360 - 47676124
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47676360 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcaatgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 47676262  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  47676261 gtgaatttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcaatgatagtggaatggagagatcaatctctcccccatattaggt 47676162  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||    
T  47676161 caagttggaccgaactggatcaacaatctttggtgtgt 47676124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 230 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 14070047 - 14069821
Alignment:
Q  230 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgtt 328  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  14070047 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtc 14069948  T
Q  329 gaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaacc 426  Q
     ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  14069947 aaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaagttggacc 14069848  T
Q  427 gaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||||||||||| || |||||||||||    
T  14069847 gaactgggtcaacaatctttggtgtgt 14069821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 230 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 14380075 - 14379849
Alignment:
Q  230 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgtt 328  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  14380075 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtc 14379976  T
Q  329 gaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaacc 426  Q
     ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  14379975 aaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccctagattaggtcaagttggacc 14379876  T
Q  427 gaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||||||||||| || |||||||||||    
T  14379875 gaactgggtcaacaatctttggtgtgt 14379849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 219 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 31733193 - 31732960
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31733193 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagactgagaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 31733095  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  31733094 gtgagcttggtgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatactggattggagagatcaatctctcccccaaattaggt 31732995  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg 450  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  31732994 caagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtg 31732960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Original strand, 8153286 - 8153522
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8153286 gttgggaaaca-ttgtaaacacattgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggttgttcttt 8153384  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8153385 gtgagattgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaataactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggt 8153484  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||| || |||||||||||| || |||||||||||    
T  8153485 caagttggactgaactgggtcaacaatctttggtgtgt 8153522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 41317658 - 41317422
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41317658 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggatgagtgaaaatcattgagtctcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 41317560  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41317559 gtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaatccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggt 41317460  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  41317459 caagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgt 41317422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 36146633 - 36146396
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctt 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||    
T  36146633 gttgggaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtttgttatt 36146534  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  36146533 tgtgagcttgttgaagctaatttct-gtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggatttgagagatcaatctctcccccatattagg 36146435  T
Q  415 tcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||    
T  36146434 tcaagttggaccgaactaggtcaacaatctttggtgtgt 36146396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 219 - 422
Target Start/End: Original strand, 48491523 - 48491728
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48491523 gttgggaaaca-ttgtaaacactttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 48491621  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48491622 gtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgaaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggt 48491721  T
Q  416 caagttg 422  Q
    |||||||    
T  48491722 caagttg 48491728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 231 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 30024945 - 30024720
Alignment:
Q  231 ttgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttg 329  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  30024945 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttcattgtgagcttgttg 30024846  T
Q  330 aagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaaccg 427  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  30024845 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatcactcccccagagtaggtcaagttggaccg 30024746  T
Q  428 aactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||||| |||| || |||| ||||||    
T  30024745 aactggatcaacaatctttagtgtgt 30024720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 219 - 438
Target Start/End: Original strand, 43864188 - 43864409
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43864188 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaagtgggtagaaattagggttgttcttt 43864286  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  43864287 gtgaacttgttgaagctaatttcctgtaacccatttgtatctctttgtaaaaactaattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaggt 43864386  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  43864387 caagttggaccgaactgggtcaa 43864409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 230 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 47674157 - 47673932
Alignment:
Q  230 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgtt 328  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  47674157 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 47674058  T
Q  329 gaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaacc 426  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||    
T  47674057 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctct-ccccatattaagtcaagttggacc 47673959  T
Q  427 gaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||  |||| || |||||||||||    
T  47673958 gaactgaatcaacaatctttggtgtgt 47673932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Original strand, 4586105 - 4586341
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4586105 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgtaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 4586203  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||  |||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||    
T  4586204 gtgaacttgttgaagctaattttttgtaacccatttttatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattatgt 4586303  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||| ||| ||||||||||||| | || |||| ||||||    
T  4586304 caacttggaccgaactgggtcgacaatctttcgtgtgt 4586341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Original strand, 48489375 - 48489611
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgag-tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48489375 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaaatgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 48489473  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    |  |  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48489474 gaaaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgcaataactcattcatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggt 48489573  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||| |||||||||||| || || |||||||||||    
T  48489574 caagttggaccgaactgggtaaacaatctttggtgtgt 48489611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Original strand, 1113601 - 1113837
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1113601 gttgggaaaca-ttgtaaacaacttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgagaaaatggatagaaattagggttgttcttt 1113699  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  1113700 gtgagcttgttgaagctaatttcttataacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtagattggagagatcaatctctcccccatattaggt 1113799  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||  |||||| || ||||| || |||||||||||    
T  1113800 caagtttgaccgaattgagtcaacaatctttggtgtgt 1113837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Original strand, 18126588 - 18126824
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18126588 gttgggaaaca-ttgtaaacaacttgggtgagtgaaaatcattgagtgttttgttcattggtgagattggaaaaatgtgtagaaattagggttgttcttt 18126686  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||  ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  18126687 gtgaacttgttcaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggaggaatcaatctctcccccagactaggt 18126786  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||  ||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  18126787 caagtttgaccgacctgggtcaacaatctttggtgtgt 18126824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 307 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 32358190 - 32357916
Alignment:
Q  307 ggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctccc 404  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  32358190 ggttgtgctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcct 32358091  T
Q  405 ccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg----tgtcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtgg 500  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||| || |    ||||||    | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  32358090 ccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttggtgttgttatcttttctttactctctttaacttgtttattccttgcttgaattgtgg 32357991  T
Q  501 ttttgatatgcacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtgatttactttagttgttggttg 575  Q
    ||||| |||||| |||| || || ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  32357990 ttttgttatgcaattggattataaactaggtctatattattgttgttgcttgtggtttactttggttgttggttg 32357916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 38671446 - 38671210
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38671446 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagcgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 38671348  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgta--acatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||| | |||||    
T  38671347 gtgagcttgtttaagctaatttattgtaacacatttgtatcactttgtaagaactcattgatagtggattgaagagataaatctatcccccaaaataggt 38671248  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  38671247 caagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgt 38671210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 41649234 - 41648999
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  41649234 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtaagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattggaaaaattggtagaaattaggtttgttcttt 41649136  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  41649135 gtgagcttgttta-gctaatttcttgtaacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggt 41649037  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  41649036 caagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgt 41648999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 220 - 438
Target Start/End: Original strand, 26417261 - 26417480
Alignment:
Q  220 ttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttg 318  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26417261 ttgggaaaca-ttgtaaacaccttgagcgggtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttg 26417359  T
Q  319 tgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtc 416  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  26417360 tgagcttgttgaagataatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattggagagatcaatctct-ccccaggttaggtc 26417458  T
Q  417 aagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    || ||| ||| |||||||||||    
T  26417459 aaattggaccaaactgggtcaa 26417480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 220 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 496206 - 495948
Alignment:
Q  220 ttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatg-agtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttg 318  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  496206 ttgggaaaca-ttgtaaaaaccttgggtgagtgaaaatcatttagtgttttgttaatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtagttctttg 496108  T
Q  319 tgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtc 416  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||    
T  496107 tgagcttgttgaagctaatttcttgcaacccatttgtatctctttataagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccctatagtaggtc 496008  T
Q  417 aagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgtct-tttctttattctctttatct 475  Q
    |||||| || |||| ||||||| || ||||||||||| | |||||||  |||||||||||    
T  496007 aagttggacagaaccgggtcaacaatctttggtgtgtttgtttcttttctctctttatct 495948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 217 - 453
Target Start/End: Original strand, 23554982 - 23555221
Alignment:
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagggttgttc 314  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  23554982 gagttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttc 23555079  T
Q  315 tttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagatta 412  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||    
T  23555080 tttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacacttttgtacctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagta 23555179  T
Q  413 ggtcaag-ttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| || || ||||| |||||    
T  23555180 ggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttgatgtgt 23555221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 230 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 31105607 - 31105399
Alignment:
Q  230 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgtt 328  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||    
T  31105607 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagattttttctttgtgagcttgtt 31105508  T
Q  329 gaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaacc 426  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||    
T  31105507 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctttttgtaagaactcattgatggtggattggagagataaatctctccccaagagtagatcaagttggacc 31105408  T
Q  427 gaactgggt 435  Q
    |||||||||    
T  31105407 gaactgggt 31105399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 219 - 435
Target Start/End: Original strand, 35853859 - 35854077
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35853859 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggttgttcttt 35853956  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||  ||||  |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||    
T  35853957 gtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggt 35854056  T
Q  416 caag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    |||| ||| ||||||||||||    
T  35854057 caagtttggaccgaactgggt 35854077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 12098083 - 12097855
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12098083 gttgggaaaca-ttgtaaacatcttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggttagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcatt 12097985  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||       ||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  12097984 gtgagcttgttgaagttaatttcttgtaacccatttgtatctct-------aactctttg-tagtggattggagagatgaatctctcccccagattaggt 12097893  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||    
T  12097892 caagttggaccgaactaggtcaacaatctttggtgtgt 12097855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 318 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 6360077 - 6359812
Alignment:
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  6360077 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagttgattggagagatcaatctcttccccatattaggt 6359978  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacct-ttggtg----tgtcttttc-tttattctctttatcttgtttattcctt-ggttgaattgtggttttgata 508  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||  | ||||||    | ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||    
T  6359977 caagttggatcgaactgggtcaacaatttcttggtgttgttatcttttcatttgctttctttatcttgtttattccttaagttggattgtggttttgcta 6359878  T
Q  509 tgcacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtgatttactttagttgttggtt 574  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  6359877 tgcacttggtttatagactaggtatatattattgttgttgcttgtggtttactttggttgttggtt 6359812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Original strand, 29990999 - 29991234
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  29990999 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaa-ggatagaaattagggttgttattt 29991095  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||  ||||  ||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  29991096 gtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttctaataactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 29991195  T
Q  416 caag-ttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||| ||| |||||||||||| || || |||||||||||    
T  29991196 caagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgt 29991234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 225 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 23565280 - 23565069
Alignment:
Q  225 aaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaa--tgggtagaaattaggg-ttgttctttgtga 321  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||  |||||||||||||    
T  23565280 aaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaacatga--agtgtcttgttcattggtgagattaggaaaaaataggtagaaattaggtcttgttctttgtga 23565183  T
Q  322 gtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag 419  Q
    | |||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||    
T  23565182 gcttgttgaaactaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcctagagtaggtcaag 23565083  T
Q  420 ttgaaccgaactgg 433  Q
    ||| || |||||||    
T  23565082 ttggactgaactgg 23565069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 301 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 2759339 - 2759185
Alignment:
Q  301 aattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatc 398  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2759339 aattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttatatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatc 2759240  T
Q  399 tctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || | |||||||||    
T  2759239 tcttccccagattaggtcaagttggaccgaacttggtcaacaatcattggtgtgt 2759185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 233 - 383
Target Start/End: Original strand, 31518752 - 31518905
Alignment:
Q  233 gtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaa 331  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  31518752 gtaaacaccttgggtgagtgaaaatcatcgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaataggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttattgaa 31518851  T
Q  332 gctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtgga 383  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31518852 gctagtttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgacagtgga 31518905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Original strand, 4178719 - 4178954
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  4178719 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaggtagaaattagggttgttcttt 4178816  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||  |||   |||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||| |||||  ||||    
T  4178817 gtgaacttgggaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg-aagaactcattgatagtggattgaacagttcaatctctcctccagagcaggt 4178915  T
Q  416 caag-ttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||| ||||||| |||| ||| || || |||||||||||    
T  4178916 caagtttgaaccaaactaggtgaacaatctttggtgtgt 4178954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Original strand, 19502122 - 19502359
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggt-agaaattagggttgttctt 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||| |||||||| ||||||| ||    
T  19502122 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgagaatcattgagtgtcttgttcagtggtgagattgcgaaaaaaggttagaaattaaggttgttttt 19502219  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |    
T  19502220 tgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaag 19502319  T
Q  415 tcaag-ttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||| ||| | |||| ||||| || || |||||||||||    
T  19502320 tcaagtttggaacgaagtgggtgaacaatctttggtgtgt 19502359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 220 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 25767180 - 25766965
Alignment:
Q  220 ttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttg 318  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25767180 ttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattg---agattggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttg 25767086  T
Q  319 tgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca---tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    |||  ||||  ||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||    
T  25767085 tgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctcttttgaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggt 25766986  T
Q  416 caagttga-accgaactgggt 435  Q
    |||||| | ||||||||||||    
T  25766985 caagtttagaccgaactgggt 25766965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 219 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 4253754 - 4253538
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctt 316  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  4253754 gttggaaaacatttgtaaacaccttaggtgagtgaaaatcattgagtttcttgttcattggtgaaattggtaaaatgg-tagaaattagggtttgttctt 4253656  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattag 413  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||   ||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||| |||    
T  4253655 tgtgagcttgttgaagctaatttcatgtaacccttttatatctctttggaaagaactcattgataatggattagagagatcaatctctcccacagagtag 4253556  T
Q  414 gtcaagttgaaccgaact 431  Q
    ||||| ||| ||||||||    
T  4253555 gtcaatttggaccgaact 4253538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 279 - 453
Target Start/End: Original strand, 25615857 - 25616034
Alignment:
Q  279 tgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattga 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  25615857 tgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctatgtgcgcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcattttgtaagaactcattga 25615956  T
Q  377 tagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||  || || |||||||||||    
T  25615957 tagtggattagagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggcgaacaatctttggtgtgt 25616034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 219 - 435
Target Start/End: Original strand, 48408747 - 48408967
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  48408747 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattaatgttgttcttt 48408844  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa---catttgtatctc-tttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattag 413  Q
    || |  ||||  |||||||||||||||||   | |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||| ||     
T  48408845 gtaaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctcttttgaaataactcattgatagtggattggagagtttaatctctcctccagagtat 48408944  T
Q  414 gtcaagttga-accgaactgggt 435  Q
    |||||||| | ||||||||||||    
T  48408945 gtcaagtttagaccgaactgggt 48408967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 347 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 24525596 - 24525490
Alignment:
Q  347 catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaataaccttt 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  24525596 catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaagttggacggaactgggtcaataatcttt 24525497  T
Q  447 ggtgtgt 453  Q
    |||||||    
T  24525496 ggtgtgt 24525490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 283 - 433
Target Start/End: Original strand, 31518911 - 31519063
Alignment:
Q  283 attgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagt 380  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31518911 attgggaaaataggtagaaattaggtttgttctctgtgagcttattgaagctagtt-cttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgacagt 31519009  T
Q  381 ggattggagatatcaatctctc-ccccagattaggtcaagttgaaccgaactgg 433  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  31519010 ggattggagagatcaatctctctccccagagtaggtcaagttggaccgaactgg 31519063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 219 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 4538764 - 4538636
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4538764 gttgggaaa-aattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 4538666  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac 347  Q
     |||  || || ||||||||||||||||||    
T  4538665 atgaaattttttaagctaatttcttgtaac 4538636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 235 - 430
Target Start/End: Original strand, 23343934 - 23344130
Alignment:
Q  235 aaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttg-ttctttgtgagtttgttgaag 332  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||    
T  23343934 aaacaccttgggtgagtgaaaatcattgaatgtctagttcattggtgagatttggaaaa-gggtagaaattaaggtttattctttgtgagcttgttgaag 23344032  T
Q  333 ctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaac 430  Q
    ||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||| || |||||||  |||||| |||||||||||| |||||||    
T  23344033 ctaatttcttgtaaccctttagtatatctttgtgagaactcattgataatagattggagaaattaatctct--cccagagtaggtcaagttggaccgaac 23344130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 219 - 451
Target Start/End: Original strand, 39731321 - 39731548
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||       |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39731321 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattggaaaaa-gggtagaaattagggttgttcttt 39731410  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    ||||  ||||   | |||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||    
T  39731411 gtgaacttgtcagatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtagg 39731510  T
Q  415 tcaag-ttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgt 451  Q
    ||||| ||| |||||||||||| || || |||||||||    
T  39731511 tcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgt 39731548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 219 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 36574740 - 36574522
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctt 316  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||| |||  ||||||||||| | || ||||||    
T  36574740 gttggaaaacatttgtaaacaccttaggtgagtgaaaattatcgagtgtcttgtttattggagagattggggaaa--ggtagaaattaagatttgttctt 36574643  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattag 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |  ||| ||| |||    
T  36574642 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacccttttatatctctttgtaaagaactcattgatagtggtttggagagatcaatc-catccctagagtag 36574544  T
Q  414 gtcaagttgaaccgaactgggt 435  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||    
T  36574543 gtcaatttggaccaaactgggt 36574522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 219 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 24526121 - 24525992
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-gttgttctt 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  24526121 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaaattgggaaaatgggtagaaattaggttttgttctt 24526023  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac 347  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  24526022 tgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaac 24525992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 20343897 - 20344059
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacattt-gtatctcttt-gtaagaactc 371  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||  |||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||    
T  20343897 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc 20343994  T
Q  372 att-gatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggt 435  Q
    ||| ||||||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  20343995 atttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactgggt 20344059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 275 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 43504323 - 43504174
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca---tttgtatctcttt-gtaagaact 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||  || |||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||    
T  43504323 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaact 43504225  T
Q  371 cattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 421  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  43504224 cattgatagtgaattggagagttcaatctctcctccatagtaggtcaagtt 43504174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 219 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 2761526 - 2761439
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattag 306  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2761526 gttgggaaaca-ttgtaaacacattgggtgagtgaaaatcatcgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattag 2761439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 367 - 438
Target Start/End: Original strand, 30814530 - 30814601
Alignment:
Q  367 aactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30814530 aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaa 30814601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 224 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 3904837 - 3904624
Alignment:
Q  224 gaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgggtagaaattagg-gttgttctttgtg 320  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||| | ||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |    
T  3904837 gaaacatttgtaaacaccttgggcgagtg-aaatcattgagtctcttgttcttaggaagagattgggaaaat-ggtagaaattaggttttgttctttgag 3904740  T
Q  321 agtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtca 417  Q
    ||  | |||||  |||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||| |||| |||||||    
T  3904739 agcctattgaatgtaatttcttgtaacacttttgcatctctttgtaaagaactcattgatagt-gatcagagagatcaatctctccctcagagtaggtca 3904641  T
Q  418 -agttgaaccgaactgg 433  Q
      |||| ||||||||||    
T  3904640 ttgttggaccgaactgg 3904624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 119 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 1360479 - 1360226
Alignment:
Q  119 ttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt--gaggttagattcta 216  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||   |||||||||||||| ||  || | ||||||||||| || || |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  1360479 ttttgcgagcaacttgagtgagtcttggaaaaccaaaagagaatat-ttttgggaaatcaaaggatatggattggttctcttttggggggttagattcta 1360381  T
Q  217 gagttgggaaacaatt-gtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattg-gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgtt 313  Q
    ||||||  |||||||| | ||||||||| || ||||| |||||| ||||| |||||||||| |  ||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |    
T  1360380 gagttgaaaaacaattgggaaacacctttggtgagtg-aaatcattgagtctcttgttcatggaatgagattgggaaaa-aggtagaaattaggttttgt 1360283  T
Q  314 ctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac----atttgtatctctttgtaag 366  Q
    ||| | ||  |||||||||| |||||||||||||     ||||||||||||||||||    
T  1360282 cttggagaacttgttgaagcgaatttcttgtaacccttttttgtatctctttgtaag 1360226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 24789841 - 24790004
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacattt-gtatctcttt-gtaagaactc 371  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||  ||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||    
T  24789841 ttggtaagattgggaaaa-gggtaaaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacattttgtatcccttttgtaaaaactc 24789939  T
Q  372 attgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
     ||||||||||||||||||   | |||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  24789940 tttgatagtggattggagagtactatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 24790004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 296 - 407
Target Start/End: Original strand, 5116625 - 5116739
Alignment:
Q  296 gtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagata 392  Q
    |||||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||| ||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |    
T  5116625 gtagaaattaggtttgttcttggatagtttgttgaagataatttattgtaaaccttttgtatctctttgtaaagaactcattgatagtgaattggagaga 5116724  T
Q  393 tcaatctctccccca 407  Q
    | |||||||||||||    
T  5116725 taaatctctccccca 5116739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 32358262 - 32358189
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatgg 91  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  32358262 agatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggaaaattcatgg 32358189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 296 - 435
Target Start/End: Original strand, 18396338 - 18396481
Alignment:
Q  296 gtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacattt-gtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagata 392  Q
    |||||||||||| || |||||| | |||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||| |    
T  18396338 gtagaaattaggttttgttcttggagagtttgttgaacctatttttttgtaacattttgtatctctttataaagaattcattgatagaggattggagaga 18396437  T
Q  393 tcaatctctcccccagattaggtcaa-gttgaaccgaactgggt 435  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||| | || ||||||||||||    
T  18396438 tcaatctctcctcaagagtaggtcaatggtggaccgaactgggt 18396481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 120 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 23794149 - 23794024
Alignment:
Q  120 tttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgaggttagattctagag 219  Q
    ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  23794149 tttgtgagcaatttgggtgaatcgtaagagaccaaaagaggagatccttag-aaaatcaaaggctaatggttggttc-attttgtggttagattctagag 23794052  T
Q  220 ttgggaaacaa-ttgtaaacaccttggg 246  Q
    |||  |||||| |||||||||| |||||    
T  23794051 ttgaaaaacaatttgtaaacacattggg 23794024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 219 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 5514234 - 5514113
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctt 316  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||  |||| | |||||||||| | || ||||||    
T  5514234 gttgggaaacacttgtaaacaccttcgatgagtgaaaatcattgagtttcttgttcatttgagagattgaaaaaa-gagtagaaattatgttttgttctt 5514136  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaattt 339  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  5514135 tgtgagcttgttgaagctaattt 5514113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 6592509 - 6592345
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacat-ttgtatctcttt-gtaa-gaact 370  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||  ||||  |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||| |||||    
T  6592509 ttggtgagattgggaaa-tgggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaact 6592412  T
Q  371 catt-gatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    |||| ||||||||||||||||   ||| |||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  6592411 catttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 6592345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 18388929 - 18388765
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacat-ttgtatctcttt-gtaa-gaact 370  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||  ||||  |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||| |||||    
T  18388929 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaact 18388832  T
Q  371 catt-gatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    |||| ||||||||||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  18388831 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 18388765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 18392365 - 18392201
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacat-ttgtatctcttt-gtaa-gaact 370  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||  ||||  |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||| |||||    
T  18392365 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaact 18392268  T
Q  371 catt-gatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    |||| ||||||||||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  18392267 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 18392201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 219 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 24514984 - 24514912
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaa 292  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24514984 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaa 24514912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 6594727 - 6594563
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacat-ttgtatctcttt-gtaa-gaact 370  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||  ||||  |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||| |||||    
T  6594727 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaact 6594630  T
Q  371 catt-gatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    |||| ||||||||||||||||   ||| |||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  6594629 catttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 6594563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 32060493 - 32060342
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacat-ttgtat---ctctttgt-aagaa 368  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||  ||||  |||||||||||||||||| | ||||||   || ||||| |||||    
T  32060493 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtatcccctttttgtaaagaa 32060396  T
Q  369 ctca-ttgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 421  Q
    |||| ||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  32060395 ctcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtt 32060342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 37545199 - 37545121
Alignment:
Q  154 aaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgaggttagattctagagttgggaaacaattg 233  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  37545199 aaagagaagatccttacaaaaatcaaaggctaagagttggttct-tttttaggttagattacagagttaggaaacaattg 37545121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 359 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 1560749 - 1560671
Alignment:
Q  359 tttgtaagaactcatt-gatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  1560749 tttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 1560671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Original strand, 5116377 - 5116551
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggat-gattcatggggttgggaaacacatgagtgaagag 116  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||| || | |||| |||||||||||| ||  ||||||| || |||| |||||| | |    || |    
T  5116377 agatgtgaatctttgagaaccaaaagagggggctcttgggaga-gggtcggtgccttttggagagagattcattggattggtaaacacttcaaatgaggg 5116475  T
Q  117 tcttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttgg 193  Q
    || |||||||  ||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||    
T  5116476 tcatttgtgataaacttaggtgagtcttgggtaaccaaaagagaagatcctcag-gaaatcaaaggttaagagttgg 5116551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 42331041 - 42331000
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  42331041 tctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 42331000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 91 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 43363766 - 43363667
Alignment:
Q  91 gggttgggaaacacatgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggt 190  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||| || |||||||| |||||||| ||||  || |||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||    
T  43363766 gggttgagaaacacatgagatgagagtcctt-gtgagcaatttgggtgaatcttgagagaccaaaagagaagatctttag-gaaattaaatgctaagggt 43363669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 455 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 1360154 - 1360054
Alignment:
Q  455 ttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatatgcacttggtttctagactaggtct-atattgatgttgttgcttgt 553  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||  |||||||||||| | | ||||| |||| |||| ||| ||| | |||| |||||||||||||    
T  1360154 ttttctctattctctttatcttgtttcttcttttgttcgattgtggttttgctttacacttagtttttagattagatctaaaattgttgttgttgcttgt 1360055  T
Q  554 g 554  Q
    |    
T  1360054 g 1360054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 2579105 - 2579030
Alignment:
Q  163 atccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgaggttagattctagagttgggaaacaattgtaaaca 239  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| |  |||||  || || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2579105 atccttag-gaaattaaaggctaagggttgggttccttttcgggataaattctagggttgggaaacaattgtaaaca 2579030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 397 - 441
Target Start/End: Original strand, 20297607 - 20297651
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaataa 441  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  20297607 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaataa 20297651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 347
Target Start/End: Original strand, 26639326 - 26639392
Alignment:
Q  280 gagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac 347  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  26639326 gagattgtgaaaatgg-tagaaattaggtatgttcttggagagtttgttgatgttaatttcttgtaac 26639392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 287 - 381
Target Start/End: Original strand, 27073828 - 27073925
Alignment:
Q  287 ggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtg 381  Q
    ||||||| |||||||||  |  |||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  27073828 ggaaaattggtagaaatatgttttgttcgttatgagtttattgaagttaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaagaactcgttgacagtg 27073925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 287 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 27204485 - 27204388
Alignment:
Q  287 ggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtg 381  Q
    ||||||| |||||||||  |  |||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  27204485 ggaaaattggtagaaatatgttttgttcgttatgagtttattgaagttaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaagaactcgttgacagtg 27204388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 1049340 - 1049299
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  1049340 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 1049299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 3035969 - 3036010
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  3035969 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 3036010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 7472024 - 7471983
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  7472024 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 7471983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 11759372 - 11759413
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  11759372 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 11759413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 286 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 13065555 - 13065494
Alignment:
Q  286 gggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac 347  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  13065555 gggaaaaatggtagaaattaggattgcactttgagagtttgttgaaactaatttattgtaac 13065494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 13099518 - 13099477
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  13099518 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 13099477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 20284137 - 20284096
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  20284137 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 20284096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 20299705 - 20299746
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  20299705 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 20299746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 20626283 - 20626324
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  20626283 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 20626324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 20630174 - 20630215
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  20630174 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 20630215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 20642593 - 20642634
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  20642593 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 20642634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 21983332 - 21983291
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  21983332 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 21983291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 35960864 - 35960823
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  35960864 tctctcccccagattaggtcatattgaaccgaactcggtcaa 35960823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 38394231 - 38394272
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  38394231 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 38394272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 40836787 - 40836746
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  40836787 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 40836746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 40946573 - 40946614
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  40946573 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 40946614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 43363622 - 43363531
Alignment:
Q  295 ggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctc--tttgt-aagaactcattgatagtg 381  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||| ||||||  | ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||    
T  43363622 ggtagaaattaggtttgttcttggagagcttgttgaaactaatttattgtaactcttttgtatctctatttgtaaataactcattgatagtg 43363531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 44724824 - 44724865
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  44724824 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 44724865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 44848733 - 44848774
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  44848733 tctctcccccaggttaggtcatattgaaccgaactgggtcaa 44848774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 48457898 - 48457939
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  48457898 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 48457939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 275 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 1562173 - 1562103
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa 346  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||  ||||  |||||||||||||||||    
T  1562173 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa 1562103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 397 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 7094504 - 7094460
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaataa 441  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  7094504 tctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaataa 7094460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 219 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 30843457 - 30843389
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattg 286  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| |  |||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  30843457 gttgagaaacatttgtaaacaccttagatgagttaaaatcattgagtatcttgttcattggagagattg 30843389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 373; Significance: 0; HSPs: 125)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 554
Target Start/End: Original strand, 30235867 - 30236411
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  30235867 agatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggaatattcatggggttggaaaacacaagagtggagagt 30235966  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgagg-ttagattcta 216  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||    
T  30235967 catttgtgagcaagttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcgaaggctaatgattggttctcttttgggggttagattcta 30236066  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30236067 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggatagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgatgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 30236166  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30236167 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattagg 30236266  T
Q  415 tcaagttgaaccgaactgggtcaataacct-ttggtg----tgtcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatat 509  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||  | ||||||    | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  30236267 tcaagttggaccgaactaggtcaacaatttcttggtgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttataccttggttggattgtgtttttgttat 30236366  T
Q  510 gcacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtg 554  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30236367 gcacttggtttatagactaggtctatattgttgttgttgcttgtg 30236411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 6096025 - 6095482
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6096025 agatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttttgaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagt 6095926  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattcta 216  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  6095925 catttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaaaggttggttctcttttgggggttagattcta 6095826  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6095825 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttattcattggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggttgttctt 6095726  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    ||| |  || |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  6095725 tgtaaacttcttgaagttaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 6095626  T
Q  415 tcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg----tgtcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatatg 510  Q
    |||||||| ||||||||| || || |    ||||||    | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||     
T  6095625 tcaagttggaccgaactgtgtgaacatttcttggtgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttatgccttggttggattgtggttttgctata 6095526  T
Q  511 cacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtg 554  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  6095525 cacttcgtttatagactaggtctatattgttgttattgcttgtg 6095482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 575
Target Start/End: Original strand, 47303994 - 47304564
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47303994 agatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagt 47304093  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgagg-ttagattcta 216  Q
     ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  47304094 -ttttgtgagcaacttaggtgagtcttgtaaaaccaaaagagaatatccttagtgaaatcaaaaactaagggttggttctcttttgggggttagattcta 47304192  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47304193 gagttggaaaacaattttaaacaccctgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcatttgtgagattgagaaaatgggtagaaattatggttgttctt 47304292  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  47304293 tgtgagcttgttgaagttaatatcttgtaacccatctgtatctcttcgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccaagattagg 47304392  T
Q  415 tcaagttgaaccgaactgggtcaataacct-ttggtg----tgtcttttc------tttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttt 503  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||  | ||||||    | |||||||      |||  | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  47304393 tcaagtttgaccgaactgggtcaacaatttattggtgttgttatcttttcttttcttttgctttctttatcttgtttattccttagttggattgtggttt 47304492  T
Q  504 tgatatgcacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtgatttactttagttgttggttg 575  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47304493 tgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttgttgcttgtgatttactttggttgttggttg 47304564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 49199897 - 49199347
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  49199897 agatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctattgtgaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacatatgagtggagagt 49199798  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggt-gagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgagg-ttagattct 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||    
T  49199797 cttttgtgagcaacttgggttgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaatggttggttctcttttgggggttagattct 49199698  T
Q  216 agagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttct 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49199697 agagttgggaaacaattgtaaacactttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcgttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggttgttct 49199598  T
Q  316 ttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac---atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagatta 412  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||    
T  49199597 ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagattaatctctcctccagacta 49199498  T
Q  413 ggtca-agttgaaccgaactgggtcaataacct-ttggtg----tgtc---ttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttt 503  Q
    |||||  |||| |||||||||||| || || || ||||||    ||||   |||||| || |||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||    
T  49199497 ggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgttgttgtctatttttctctactctctttatcttgtttatcctttggttagattgtggttt 49199398  T
Q  504 tgatatgcacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtg 554  Q
    || |||||||||| |||||||| ||| |||| |||| |||| |||||||||    
T  49199397 tgctatgcacttgttttctagattagatctagattgttgttattgcttgtg 49199347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 554
Target Start/End: Original strand, 54593447 - 54593992
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  54593447 agatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtaccttttggggaagattcatggggatggaaaacacatgagtggagagt 54593546  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattcta 216  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  54593547 cttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaatagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggtt-gttctcttttgggggttagattcta 54593645  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  54593646 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgtgcagaaattagggttgttctt 54593745  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |    
T  54593746 tgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtatg 54593845  T
Q  415 tcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg----tgtcttttcttta--ttctctttatcttgtttattccttg-gttgaattgtggttttgat 507  Q
    |||||||| ||| |||||||| || |    ||||||    | |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |    
T  54593846 tcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgttatcttttctttagtctctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgct 54593945  T
Q  508 atgcacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtg 554  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||||  |||| |||||||||    
T  54593946 atgcacatggtttatagactatgtctatattcttgttattgcttgtg 54593992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 18 - 453
Target Start/End: Original strand, 34490955 - 34491392
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||    
T  34490955 agatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggagttgaaaaacacatgagtggagagt 34491054  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattcta 216  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  34491055 catttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattcta 34491154  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34491155 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaattc-tgagtgtgttattcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 34491253  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  34491254 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 34491353  T
Q  415 tcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||||||| |||||||||||| || || |||||||||||    
T  34491354 tcaagttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgt 34491392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 19 - 554
Target Start/End: Original strand, 46860214 - 46860760
Alignment:
Q  19 gatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagtc 118  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  46860214 gatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatagggatgggaaacacatgagtggagagtc 46860313  T
Q  119 ttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggcta--agggttggttctctttt-gaggttagattct 215  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  46860314 atttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttag-gaaatcaaagactaagagggttggttctcttttgggggttagattct 46860412  T
Q  216 agagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaat--catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgtt 313  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  46860413 agagttgagaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaattcaatgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattaggtttgtt 46860512  T
Q  314 ctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagatt 411  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |    
T  46860513 ctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaataactcattgatagtggattggagagatcaatctttcctccagagt 46860612  T
Q  412 aggtca-agttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg----tgtcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttga 506  Q
    ||||||  |||| |||||| ||| | || |   |||||||    | ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||     
T  46860613 aggtcattgttggaccgaattggatgaacattttttggtgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttatcctttggttagattgtggttttgc 46860712  T
Q  507 tatgcacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtg 554  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  46860713 tatgcacttggtttatagattaggtctatattgttgttgttgtttgtg 46860760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 18 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 41819947 - 41819371
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  41819947 agatgtgaatcttagagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttgggaa-gattcatggggttgggaaacacatgagtggagact 41819849  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattcta 216  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  41819848 catttgtgagcaacttgagtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatcttta-tgaaatcaaag-ctaagggttggttctcttttagcggttagattcta 41819751  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaat-catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttct 315  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41819750 gagttgggaaataattgtaaacaccttgggagagtgaaaattcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgtttt 41819651  T
Q  316 ttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac---atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagatta 412  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||    
T  41819650 ttgtgagcttgtctaagctaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcatt-atagtggattggagacatcaatctctcctccagagta 41819552  T
Q  413 ggtca-agttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgt-----gtcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttga 506  Q
    |||||  |||| ||| |||||||| || |    |||||||      | |||||| || | |||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||     
T  41819551 ggtcattgttggaccaaactgggtgaacatttattggtgttgttatttttttctctactttctttatcttgtttatcctttggttagattgtggttttgc 41819452  T
Q  507 tatgcacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtgatttac-tttagttgttggttgcctttgctact 586  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  41819451 tatgcacttggtttatggactaggtctatattgttgttgttgcttgtgatttacttttggttgttggttgccattgatact 41819371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 18 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 43402216 - 43401679
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  43402216 agatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgagaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagaat 43402117  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgaggttagattctag 217  Q
    | ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||           ||||    
T  43402116 catttgtgaacaacttgggtaagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctatgggttggttctctttt-----------ctag 43402028  T
Q  218 agttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43402027 agttgggaaacgattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 43401928  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac---atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||    
T  43401927 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacgcattttttatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagaaattaatctctcctccagagtagg 43401828  T
Q  415 tca-agttgaaccgaactgggtcaataacct-ttggtg----tgtc---ttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttg 505  Q
    |||  |||| |||||||||||| || || || ||||||    ||||   |||||| || |||||||||||||||||| | ||||||  |||||| |||||    
T  43401827 tcatggttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgttgttgtctatttttctctactctctttatcttgtttatcctttggttagattgtgattttg 43401728  T
Q  506 atatgcacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtg 554  Q
     |||||||||| |||||||| ||| |||| |||| |||| |||||||||    
T  43401727 ctatgcacttgttttctagattagatctagattgttgttattgcttgtg 43401679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 18 - 438
Target Start/End: Original strand, 4569693 - 4570118
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4569693 agatgtaaatcttggagaatcaaaagagggggctcttgggaaaagggggtgtgcctattggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagt 4569792  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattcta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  4569793 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagatgatctttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggtggttagattcta 4569892  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttct 315  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4569893 gagttggaaaacaattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgttttgttctttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttca 4569992  T
Q  316 ttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattag 413  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||    
T  4569993 ttgtgagcttattgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctactccagagtag 4570092  T
Q  414 gtcaag-ttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    || ||| ||| |||||||||||||||    
T  4570093 gtgaagtttggaccgaactgggtcaa 4570118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 18 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 43404159 - 43403622
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  43404159 agatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagt 43404060  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgaggttagattctag 217  Q
    | |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||           |||     
T  43404059 catttgggagcaacttgggtgagtcttgtgaaactaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctatgggttggttctctttt-----------ctaa 43403971  T
Q  218 agttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43403970 agttgggaaacaattgtaaacactttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggcttgttcttt 43403871  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--cat-ttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||    
T  43403870 gtgagcttgttgaagctcatttcttgtaactcatgttttatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagattaatctctcctccagagtagg 43403771  T
Q  415 tca-agttgaaccgaactgggtcaataacct-------ttggtgtgt-cttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttg 505  Q
    |||  |||| |||||||||||| || || ||       ||| ||| |  ||||||  | |||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||    
T  43403770 tcatggttggaccgaactgggtgaacaatctcttgatgttgttgtttatttttctccactctctttatcttgtttatcctttggttagattgtggttttg 43403671  T
Q  506 atatgcacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtg 554  Q
     |||||||||| |||||||| ||| |||| |||| | || |||||||||    
T  43403670 ctatgcacttgttttctagattagatctagattgttattattgcttgtg 43403622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 18 - 554
Target Start/End: Original strand, 36018593 - 36019134
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  36018593 agatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagcttttgggaaaagggttggtgccttttggggaagatccatggggatgggaaacacatgaatggagagt 36018692  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgagg-ttagattcta 216  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||    
T  36018693 catttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctatggattggttctcttttggggtttagattcta 36018792  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaa-tcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttct 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36018793 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaattaacgagtgacttgttcattggtgaaattgggaaaatgggttgaaattagggttgttct 36018892  T
Q  316 ttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac---atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagatta 412  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||    
T  36018893 ttgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaactcattttgtatctctttgtaagaactcatt-atagtggattggagaggtcaatctctcccccag--ta 36018989  T
Q  413 ggtcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg----tgtcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgata 508  Q
     ||   |||| |||||||||| | || |   |||||||    | |||||| | || |||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||    
T  36018990 tgt-ttgttggaccgaactggatgaacattttttggtgttgttatcttttttctactctctttatcttgtttatcctttggttagattgtggttttgtta 36019088  T
Q  509 tgcacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtg 554  Q
      |||||| |||||||| ||| |||| |||| | ||||||||||||    
T  36019089 aacacttgttttctagattagatctagattgttattgttgcttgtg 36019134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 18 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 55302391 - 55301848
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |    
T  55302391 agatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgggaaaagggttggtgccttttgggaaaaattcatgaggttggaaaacacatgagtggagatt 55302292  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttg-aggttagattcta 216  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  55302291 cttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaggggttggttctcttttgtaggttagattata 55302192  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||                |||||||||||||||||||||||||    
T  55302191 gagttgggaaacaattgtaaataccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcat----------------atgggtagaaattagggttgttctt 55302108  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagcta---------atttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccc 405  Q
    ||| |||||||||||||||         ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  55302107 tgtaagtttgttgaagctaatttcttgtatttcttgtaacctatttgtatctctttgtaagaattcattgatagtggattggagagatcaatctctcctc 55302008  T
Q  406 cagattaggtca-agttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg----tgtcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtgg 500  Q
    || | |||||||  |||| |||||||| ||| || |    || |||    | ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  55302007 catagtaggtcattgttggaccgaacttggtgaacatttcttagtgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtgg 55301908  T
Q  501 ttttgatatgcacttgg-tttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtgattta 559  Q
     |||| ||||||||||| |||||||| ||| |||| |||| | || ||||||||| ||||    
T  55301907 ctttgctatgcacttggttttctagattagatctagattgtttttattgcttgtggttta 55301848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 220 - 586
Target Start/End: Original strand, 46173311 - 46173678
Alignment:
Q  220 ttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgt 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46173311 ttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggt---------aaaattggtagaaattagggttgttctttgt 46173401  T
Q  320 gagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtca 417  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46173402 gagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaattcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtca 46173501  T
Q  418 agttgaaccgaactgggtcaataacct-ttggtg----tgtcttttc-tttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatatgc 511  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||  | ||||||    | ||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||    
T  46173502 agttggaccgaactagatcaacaatttcttggtgttgttatcttttcttttgctttctttatcttgtttatttcttagttggattgtggttttgctatgc 46173601  T
Q  512 acttggtttctagactagg--tctatattgatgttgttgcttgtgatttactttagttgttggttgcctttgctact 586  Q
    ||||||||| |||| ||||  | ||||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  46173602 acttggtttatagaataggtttatatattattgctgttgcttgtggtttactttggttgttggttgccattgatact 46173678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 20 - 282
Target Start/End: Original strand, 40913082 - 40913350
Alignment:
Q  20 atgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggg-gatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagtc 118  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40913082 atgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgcctttttggagaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtc 40913181  T
Q  119 ttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattctag 217  Q
     ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  40913182 atttgtgagcaaattgggtgagtcttgtgaaagcaaaagagaagatccttagtgaaattaaaggttaagggttggttctcttttgggggttagattctag 40913281  T
Q  218 agttgggaaacaattgtaaacaccttgggaga----gtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40913282 agttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtacgtgaaaattatgagtgtcttgttcattggtgag 40913350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Original strand, 40734442 - 40734678
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40734442 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 40734540  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgta--acatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  40734541 gtgagcttgttgaacctaatttcttgtaacacatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggt 40734640  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  40734641 caagttggaccgaactgggtcaacaatctttggagtgt 40734678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 44700703 - 44700467
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44700703 gttgggaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 44700604  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  44700603 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctctttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatctct-ccccacattaggt 44700505  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||| |||||||| |||||| || |||| ||||||    
T  44700504 caagttggaccgaactaggtcaacaatctttcgtgtgt 44700467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 5434304 - 5433952
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggat-gattcatggggttgggaaacacatgagtgaagag 116  Q
    |||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||  |||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5434304 agatgtaaatcttatagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttagtgttttttagggagagattcatggggttaggaaacacatgagtggagag 5434205  T
Q  117 tcttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattct 215  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| | ||| ||||||||| | ||||||||| |    
T  5434204 tcttttgtgagcaagttgggtgagtcttgggaaaccaaaagagaagatcctta-tgtaatcaaagactaaagattgattctcttttgggggttagattat 5434106  T
Q  216 agagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattggtgagattggga-aaatgggtagaaattaggg-ttgt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||    
T  5434105 agagttgggaaacaattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggagaaaatggtagaaattagggtttgt 5434007  T
Q  313 tctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaa 365  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  5434006 tctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaacccttttatatctctttgtaa 5433952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 29196612 - 29196374
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctt 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29196612 gttgggaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtttgttctt 29196513  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  29196512 tgtgagcttgtcaaagctaatttcttggaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattagg 29196413  T
Q  415 tcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  29196412 tcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgt 29196374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 219 - 438
Target Start/End: Original strand, 44331489 - 44331710
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44331489 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattaggaaaatgggtagaaattagggttgttcatt 44331587  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44331588 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaagccatttgtatctctttgtaagaacttattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggt 44331687  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  44331688 caagttggaccgaactgggtcaa 44331710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 230 - 451
Target Start/End: Original strand, 40735337 - 40735561
Alignment:
Q  230 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgtt 328  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40735337 attgtaaacaccttggaaaagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 40735436  T
Q  329 gaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaacc 426  Q
    ||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40735437 gaagctaatttattgtaaccagtttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggacc 40735536  T
Q  427 gaactgggtcaataacctttggtgt 451  Q
    |||||||||||  || |||||||||    
T  40735537 gaactgggtcagcaatctttggtgt 40735561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 5236680 - 5236445
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5236680 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 5236582  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| | |||||||||||||    
T  5236581 gtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgataatggattcgagagatcaatct-ttccccagattaggt 5236483  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  5236482 caatttggaccaaactgggtcaacaatctttggtgtgt 5236445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Original strand, 29810812 - 29811048
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  29810812 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgaatgtcttattcattggtgagattaggaaaatatgtagaaattagagttgttcttt 29810910  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29810911 gtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggt 29811010  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  29811011 caagttaaaccgaattgggtcaacaatctttggtgtgt 29811048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 230 - 453
Target Start/End: Original strand, 51398768 - 51398994
Alignment:
Q  230 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgtt 328  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  51398768 attgtaaacaccttggatgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgatgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttcttagtgaacttgtt 51398867  T
Q  329 gaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaacc 426  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  51398868 gaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatttatctctcccccagattaggtcaagttggacc 51398967  T
Q  427 gaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||    
T  51398968 gaacttggtcaacaatctttggtgtgt 51398994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Original strand, 29682303 - 29682539
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  29682303 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgtttatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattatgtttgttcttt 29682401  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  29682402 gtgagcttgtttaagctaatttcttgtcacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccctagattagat 29682501  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  29682502 caagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgt 29682539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Original strand, 760791 - 761027
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  760791 gttgggaaaca-ttataaacaccttggatgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtctgttcttt 760889  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  760890 gtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggt 760989  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||| || ||| ||||| || || |||||||||||    
T  760990 caagttggactgaaatgggttaacaatctttggtgtgt 761027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 219 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 22835226 - 22835010
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22835226 gttgggaaaca-ttgtaatcaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttcttt 22835128  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  22835127 gtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccgccatattaggt 22835028  T
Q  416 caagttgaaccgaactgg 433  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  22835027 caagttggaccgaactgg 22835010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Original strand, 31314389 - 31314625
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31314389 gttgggaaaca-ttgtaaacactttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcataggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttcatt 31314487  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  31314488 gtgatcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctttttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatatctcccccatattaggt 31314587  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  31314588 caagttggaccgaactgagtcaacaatctttggtgtgt 31314625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 39153585 - 39153349
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  39153585 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgaatgaaaatcattgagtgtcttgttcatgtgtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttcatt 39153487  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  39153486 gtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactcatttgtatccctttataagaactcattgatagtggattggagagaacaatctctcccccagattaggt 39153387  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||| || |||||||||||| || ||||| |||||    
T  39153386 caagttggactgaactgggtcaacaatctttgttgtgt 39153349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 218 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 9666693 - 9666454
Alignment:
Q  218 agttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttct 315  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||    
T  9666693 agttgggaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattggaaaaatgggtagaaattagattttgttct 9666594  T
Q  316 ttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattag 413  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  9666593 ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttatacctctttgtaagaattctttgatagtggattggagagattgatctctcccccagattag 9666494  T
Q  414 gtcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    || |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  9666493 gtaaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgt 9666454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 19684113 - 19683876
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19684113 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgaatgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 19684015  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||  ||||  |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||    
T  19684014 gtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccatagtaggt 19683915  T
Q  416 caag-ttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||| ||| |||||||||||| || || |||||||||||    
T  19683914 caagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgt 19683876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 230 - 451
Target Start/End: Original strand, 16498984 - 16499207
Alignment:
Q  230 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgtt 328  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  16498984 attgtaaacaccttggggtagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaacggatagaaattagggttgtt-tttgtaagcttgtt 16499082  T
Q  329 gaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaacc 426  Q
    |||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  16499083 gaagctaatttcttgttacccatttatatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggttaagttggacc 16499182  T
Q  427 gaactgggtcaataacctttggtgt 451  Q
    |||||||||||| || |||||||||    
T  16499183 gaactgggtcaacaatctttggtgt 16499207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 205 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 31340439 - 31340268
Alignment:
Q  205 ggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaatt 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31340439 ggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgttttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaatt 31340340  T
Q  305 agggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcatt 374  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31340339 gaggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcatgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcatt 31340268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 230 - 453
Target Start/End: Original strand, 29813017 - 29813243
Alignment:
Q  230 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgtt 328  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  29813017 attgtaaacacattgggtgagtgaaaatcattgaggggcttgttaattggtgagattggaaaaataggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 29813116  T
Q  329 gaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaacc 426  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  29813117 gaagctaatttcttgtaacccatttgcatctctttgtaagaactcatttatagtggattggagagatcaatctctcccccagatttggtcatgttggacc 29813216  T
Q  427 gaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||    
T  29813217 gaactgggtcaacaatctttgatgtgt 29813243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 23392133 - 23391897
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatg-agtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  23392133 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcatttagtgtctttttcattggtgagtttgggaaaatgagtagaaattaagtttgttcttt 23392035  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||    
T  23392034 gtgagcttgtttaagataatttcttgtaacccatttgtatcactttgcaagaactctttgatagtggattgtagagataaatctctcccccaaattaggt 23391935  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  23391934 caagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgt 23391897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Original strand, 9581227 - 9581463
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  9581227 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgggattcggaaa-tgggtagaaattaggtttgttcttt 9581324  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  9581325 gtgagcttgtttaagctaatttcttttaacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 9581424  T
Q  416 caag-ttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||| ||| |||||||||||| || || ||||| |||||    
T  9581425 caagtttggaccgaactgggtgaacaatctttgatgtgt 9581463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 230 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 53921717 - 53921511
Alignment:
Q  230 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgtt 328  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  53921717 attgtaaaaaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaggtttgttgtttgtgagcttgtt 53921618  T
Q  329 gaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaacc 426  Q
     |||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||  |||    
T  53921617 aaagctaatttcttgtaactcatttgtatcattttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccggagtagatcaagtttgacc 53921518  T
Q  427 gaactgg 433  Q
    |||||||    
T  53921517 gaactgg 53921511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 230 - 435
Target Start/End: Original strand, 7762220 - 7762428
Alignment:
Q  230 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgtt 328  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  7762220 attgtgaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttattcattggtgagattgagaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 7762318  T
Q  329 gaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaac 425  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||    
T  7762319 gaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggac 7762418  T
Q  426 cgaactgggt 435  Q
    ||||||||||    
T  7762419 cgaactgggt 7762428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 219 - 448
Target Start/End: Original strand, 45095109 - 45095339
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45095109 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggttgttcttt 45095205  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||  ||||  ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||    
T  45095206 gtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggt 45095305  T
Q  416 caag-ttgaaccgaactgggtcaataacctttgg 448  Q
    |||| ||| |||||||||||| || || ||||||    
T  45095306 caagtttggaccgaactgggtgaacaatctttgg 45095339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Original strand, 37408403 - 37408639
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37408403 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttagt-gagtgaaaattattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggttgttcttt 37408500  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||  ||||  |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  37408501 gtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggt 37408600  T
Q  416 caag-ttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||| ||| | |||||||||| || || |||||||||||    
T  37408601 caagtttggatcgaactgggtgaacaatctttggtgtgt 37408639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 221 - 433
Target Start/End: Original strand, 32891049 - 32891264
Alignment:
Q  221 tgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttg 318  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  32891049 tgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtaaaaatcattgagtgtcttgttcttcggtgagattgagaaaatgggtagaaattaagttttgttctttg 32891147  T
Q  319 tgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtc 416  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||||||    
T  32891148 tgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattggagagataaatctctcccccggagtaggtc 32891247  T
Q  417 aagttgaaccgaactgg 433  Q
    | |||| ||||||||||    
T  32891248 atgttggaccgaactgg 32891264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 230 - 453
Target Start/End: Original strand, 7764422 - 7764645
Alignment:
Q  230 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgtt 328  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  7764422 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga--gggaaaa-gggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 7764517  T
Q  329 gaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttga-ac 425  Q
     ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| || | ||    
T  7764518 aaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatgaatctctcctccagagtaggtcaaatttagac 7764617  T
Q  426 cgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||||||||| || || |||||||||||    
T  7764618 cgaactgggtgaacaatctttggtgtgt 7764645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 5258368 - 5258131
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat-gggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  5258368 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctt 5258271  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    |||||  ||||  ||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||| ||||    
T  5258270 tgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctcttctccagagtagg 5258171  T
Q  415 tcaag-ttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||| ||| |||||||| ||| || || |||||||||||    
T  5258170 tcaagtttggaccgaacttggtgaacaatctttggtgtgt 5258131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 230 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 23410543 - 23410317
Alignment:
Q  230 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgtt 328  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||    
T  23410543 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattagtgaaatttggaaaatgggtagaaattatgtttattctttgtgagcttgtt 23410444  T
Q  329 gaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaacc 426  Q
     ||||||||||| | ||||  ||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| | |    
T  23410443 taagctaatttcgtataacccatttgtatcactttgtaagaactcttagataatggattggagagataaatctctcccccaaattaggtcaagttggaac 23410344  T
Q  427 gaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||    
T  23410343 gaattgggtcaacaatctttggtgtgt 23410317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 219 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 23200360 - 23200127
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  23200360 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttc-ttggtgagattgggaaaaatggtagaaattagagttgttcttt 23200264  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||  ||||  ||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||| |||||    
T  23200263 gtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctttttgtaagaactcattgatagtgaattggagagttcaatctctcctccagagtaggt 23200164  T
Q  416 caag-ttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgt 451  Q
    |||| ||| |||||||||||| || || |||||||||    
T  23200163 caagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgt 23200127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 5260547 - 5260310
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat-gggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  5260547 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttggtcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctt 5260450  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    |||||  ||||  ||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||| | ||||    
T  5260449 tgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctcttctccaaagtagg 5260350  T
Q  415 tcaag-ttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||| ||| |||||||| ||| || || |||||||||||    
T  5260349 tcaagtttggaccgaacttggtgaacaatctttggtgtgt 5260310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 230 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 9636340 - 9636131
Alignment:
Q  230 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattggga-aaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgt 327  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  9636340 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttggtcattggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 9636242  T
Q  328 tgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaa 424  Q
      || |||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| | ||||||||| |||||    
T  9636241 caaaactaatttcttgtaacccttttgtatctttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccaaagtaggtcaagtttgaa 9636142  T
Q  425 ccgaactgggt 435  Q
    |||||||||||    
T  9636141 ccgaactgggt 9636131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 219 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 23198161 - 23197928
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||    
T  23198161 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttc-ttggtgagattgggaaaaatggtagaaattagagttgtttttt 23198065  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||  ||||  ||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||| |||||    
T  23198064 gtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctttttgtaagaactcattgatagtgaattggagagttcaatctctcctccagagtaggt 23197965  T
Q  416 caag-ttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgt 451  Q
    |||| ||| |||||||||||| || || |||||||||    
T  23197964 caagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgt 23197928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 278 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 32744600 - 32744424
Alignment:
Q  278 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattg 375  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||    
T  32744600 gtgagattgaaaaaatgggtagaaattagt-ttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactcatttgtatcactttgtaagaactctttg 32744502  T
Q  376 atagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  32744501 atagtggattgaagagataaatctatcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgt 32744424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 59 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 35139091 - 35138762
Alignment:
Q  59 aaagggttggtgccttttggggat-gattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaag 157  Q
    ||||||||| ||||||||| |||  |||||||| |||||| ||||| || |    |||||||||  |||||||||||  ||||||||  || |||||||     
T  35139091 aaagggttgatgccttttgaggagagattcatgaggttggaaaacaaatcaaatgagagtcttta-tgagcaacttgaatgagtcttgggagaccaaaat 35138993  T
Q  158 agaagatccttagtgaaatcaaag-gctaagggttggttctcttttgaggttagattctagagttgggaaacaattgt-aaacaccttgggagagtgaaa 255  Q
    ||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||  |||||||||| ||||| ||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35138992 agaagatccttag-gaaataaaaaagctaagggttaattctcttttggggttaaattttaaagttgg-aaacaattgtgaaacaccttgggagagtgaaa 35138895  T
Q  256 atca-tgagtgtcttgttcattg-gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--cattt 351  Q
    |||| |||||||||||||||| |   ||||||| | |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||  | |||    
T  35138894 atcattgagtgtcttgttcatggaaagagattgag-aaatgggtagaaattatgtttgttcttggtgagtttgttgaagttaatttcttgcaactctttt 35138796  T
Q  352 gtatctctttgt-aagaactcattgatagtggat 384  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35138795 gtatctctttgtaaagaactcattgatagtggat 35138762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 134 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 26323385 - 26323120
Alignment:
Q  134 gggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttga-ggttagattctagagttgggaaacaatt 232  Q
    |||||||||||  || ||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26323385 gggtgagtcttgggagaccaaaaaagaatatccttag-gaaatcaaaagctaagggttggttctcttttgagggttagattttagagttgggaaacaatt 26323287  T
Q  233 -gtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttg 329  Q
     | |||||||||| | ||||||| |||| | |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||   ||||||||||    
T  26323286 gggaaacaccttgagtgagtgaacatcattaagtgtcttgttcatgggatgagattgagaaaa-gggtaaaaattaggtttgtttttgaagagtttgttg 26323188  T
Q  330 aagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagatatc 394  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||| |||| || || ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  26323187 aagctaatttcttgtaacctttttgtatatcttggtaaaaaactcattgatagtgaagtggagatatc 26323120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 334 - 516
Target Start/End: Original strand, 40913352 - 40913544
Alignment:
Q  334 taatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaact 431  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40913352 taatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcatcgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaact 40913451  T
Q  432 gggtcaataacct-ttggtg----tgtc---ttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatatgcacttg 516  Q
    ||||||| || || ||||||    ||||   |||||| || |||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  40913452 gggtcaacaatctcttggtgttattgtctatttttctctaatctctttatcttgtttatcctttggttagattgtggttttgctatgcacttg 40913544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 59 - 229
Target Start/End: Original strand, 1683270 - 1683440
Alignment:
Q  59 aaagggttggtgccttttggggat-gattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaag 157  Q
    ||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  1683270 aaagggttggtgcattttgggaagagattcatggggttggaaaacacatgagtggataatcatttatgagcaactttggtgagtcttgtgagaccaaaag 1683369  T
Q  158 agaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgaggttagattctagagttgggaaaca 229  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  1683370 agaagatccttag-aaaatcaaaggctaagggttggttatcttttggggttagaatctagagttgggaaaca 1683440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 467 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 31340191 - 31340081
Alignment:
Q  467 tctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatatgcacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtgatttactttagt 566  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||    
T  31340191 tctttatcttgtttattccttagttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttgttgcttgtggtttactttggt 31340092  T
Q  567 tgttggttgcc 577  Q
    |||||||||||    
T  31340091 tgttggttgcc 31340081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 278 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 7780168 - 7780024
Alignment:
Q  278 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacattt-gtatctcttt-gtaagaactcattg 375  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||  || ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  7780168 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaaccttttgtatctcttttgtaagaactcattg 7780070  T
Q  376 atagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 421  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  7780069 atagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 7780024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 801091 - 801255
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca---tttgtatctcttt-gtaagaact 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||  || |||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||    
T  801091 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaact 801189  T
Q  371 cattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  801190 cattgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 801255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 83 - 227
Target Start/End: Original strand, 34795677 - 34795819
Alignment:
Q  83 gattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaagg 182  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |  | ||||| |||||| || ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  34795677 gattcatggggttgggatacacatcaaaggagagt-ttttgtaagaaacttgggtgagtcttgggagaccaaaagagaagatccttaga-aaatcaaagg 34795774  T
Q  183 ctaagggttggttctcttttgaggttagattctagagttgggaaa 227  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  34795775 ctaagggatggttctcttttgtggttaaattctaaagttgggaaa 34795819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 150 - 342
Target Start/End: Original strand, 39127421 - 39127614
Alignment:
Q  150 accaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgaggttagattctagagttgggaaacaatt-gtaaacaccttgggag 248  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||| ||    
T  39127421 accaaaagagaatacccttag-gaaatcaaaggctaagggttagttctcttttgtggttaaattctagagtttggaaacaattggaaaataccttggaag 39127519  T
Q  249 agtgaaaatca-tgagtgtcttgttcat-tggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttctt 342  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||  |  ||||||| | ||||  ||| |||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  39127520 agtgaaaatcattgagcgtcttattcatgagaagagattgag-aaataagtataaattatgtttgttcttggtgagcttgttgaagctaatttctt 39127614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 260 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 51352293 - 51352150
Alignment:
Q  260 tgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac-atttgtatct 357  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||| |||| ||||||| || || ||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  51352293 tgagtgtcttgtttattggtgagattaggaaaatga-tagaagttagggtttgttcattgtgagctttttaaagttaatttcttgtaaccatttgtattt 51352195  T
Q  358 ctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctc 402  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  51352194 ctttgtaataactcattgagagtggatttgagagatcaatctctc 51352150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 233 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 26386692 - 26386597
Alignment:
Q  233 gtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgt 327  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  26386692 gtaaatactttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgt 26386597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 120 - 407
Target Start/End: Original strand, 20937501 - 20937790
Alignment:
Q  120 tttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgaggttagattctagag 219  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  20937501 tttgtgacaaacttgggtgattcttgggagaccaaaagagaagattcttag-gaaatcaaaggataaaggttggttctcttttgggagtagattctagag 20937599  T
Q  220 ttgggaaacaatt-gtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattg-gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    ||| |||| |||| | ||||| ||| |  |||||  ||||| ||||| |||||||||| |   |||| | ||||||| ||||||||||| | ||||| ||    
T  20937600 ttgagaaataattggaaaacagcttagatgagtg-caatcattgagtctcttgttcatagaaagaga-tcggaaaataggtagaaattatgtttgttttt 20937697  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttg-taagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctccccca 407  Q
     | ||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||  |||||||    
T  20937698 ggagagcttgttgaagttaatttcttgtaacccttttgtatctctttgaaaagaactcattgata-tagattggagagatcaatcgttccccca 20937790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 144
Target Start/End: Original strand, 28074359 - 28074484
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||  | ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  28074359 agatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaatag-ttggtgcgttttggggaagattcatggggatgggaaacacatgagtggagagt 28074457  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtctt 144  Q
    || ||| ||| ||||| ||||||||||    
T  28074458 ctattgagagaaacttaggtgagtctt 28074484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 6716500 - 6716662
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacattt-gtatctcttt-gtaagaactc 371  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||  |||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||    
T  6716500 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc 6716597  T
Q  372 attgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
     ||||||||||||||||||   ||| |||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  6716598 tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 6716662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 54635125 - 54635287
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacattt-gtatctcttt-gtaagaactc 371  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||  |||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||    
T  54635125 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc 54635222  T
Q  372 attgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
     ||||||||||||||||||   ||| |||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  54635223 tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 54635287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 243 - 390
Target Start/End: Original strand, 5373198 - 5373351
Alignment:
Q  243 tgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat-gggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaattt 339  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  5373198 tgggtgagggaaaatcattgagtgtcttgttcattgaagagattgggaaaaaagggtagaaattaggctttgttctttttgagcttgttgaagctaattt 5373297  T
Q  340 cttgtaa--catttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggaga 390  Q
     ||||||  | ||| ||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||    
T  5373298 attgtaacccttttatatctctttgtaaggaactcattgccaatggattggaga 5373351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 421
Target Start/End: Original strand, 45282983 - 45283134
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa-catttgtatc----tctttgtaagaa 368  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||  ||||  ||||||||||||||||| | ||||||||    | ||||||||||    
T  45282983 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatccctttttttgtaagaa 45283080  T
Q  369 ctca-ttgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 421  Q
    |||| ||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  45283081 ctcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtt 45283134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 3617449 - 3617613
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacat-ttgtatctcttt-gtaa-gaact 370  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||  ||||  |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||| |||||    
T  3617449 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaact 3617546  T
Q  371 catt-gatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    |||| ||||||||||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  3617547 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 3617613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 25637426 - 25637590
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacat-ttgtatctcttt-gtaa-gaact 370  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||  ||||  |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||| |||||    
T  25637426 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaact 25637523  T
Q  371 catt-gatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    |||| ||||||||||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  25637524 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 25637590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 309 - 402
Target Start/End: Original strand, 33191866 - 33191960
Alignment:
Q  309 ttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagatatcaatctctc 402  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  33191866 ttgttcttagagagcttgttgaagctaagttcttgtaaccattttatgtctttgtaaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctc 33191960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 219 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 2075281 - 2075177
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctt 316  Q
    ||||||||||| || |||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||| ||| ||||||    
T  2075281 gttgggaaacatttataaacaccttgct-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgatattgggaaaaatggtagtaattagagttggttctt 2075183  T
Q  317 tgtgag 322  Q
    ||||||    
T  2075182 tgtgag 2075177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 280 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 4055926 - 4055796
Alignment:
Q  280 gagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacat---ttgtatctctttgtaagaa-ctcattg 375  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||  ||||  ||| |||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| |||||||    
T  4055926 gagattgggaaa-tgggtagaaattagg-ttgttcttggagaacttgtaaaagttaatttcttgtaacctcttttgtatctctttgtaagaaactcattg 4055829  T
Q  376 atagtggattggagatatcaatctctcccccagat 410  Q
    ||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||    
T  4055828 atagtggattgaagagatc--tctctcccccagat 4055796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 8166677 - 8166516
Alignment:
Q  225 aaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat---gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtga 321  Q
    ||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||   | ||||||||||||| |  |||||||  ||| || |||||||||||| |||||||| | ||    
T  8166677 aaacatttgtaaacacattgggtgggtgaaaatcattgagtgtgtcttgttcatggaagagattgataaa-tgagtagaaattaggtttgttcttggaga 8166579  T
Q  322 gtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtg 381  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||   ||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  8166578 gtttgttgaagttaatatcttataacctttttgtatctctttgtaaagaacttgttgatagtg 8166516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 367 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 2075149 - 2075081
Alignment:
Q  367 aactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggt 435  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  2075149 aactaattgatagtggatttgagagatcaatctctccccgagagtaggtcaagttggatcgaactgggt 2075081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 297 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 25491114 - 25491018
Alignment:
Q  297 tagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgta--acatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggaga 390  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||   | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||    
T  25491114 tagaaattaggtttgttctttgagagcttgttgaagctgatttcttatactccttttgtatctctttgtaaagaaatcattgatagtgaagtggaga 25491018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 294 - 381
Target Start/End: Original strand, 24635276 - 24635366
Alignment:
Q  294 gggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtg 381  Q
    |||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||| |||  || ||||||||||||    
T  24635276 gggtagaaattaagtttgttcttggagagtttgttgaagctaattttttgtaactattttgtatctctttataatcaattcattgatagtg 24635366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 29 - 170
Target Start/End: Original strand, 36796164 - 36796306
Alignment:
Q  29 ttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggat-gattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagtcttttgtgag 127  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||| |||||| ||| |||   |||||||||  |||||| ||||| |||| ||||| ||||| |||||| || || ||    
T  36796164 ttgaagaaccaaaagaggggactctt-tgaaaaaggtcggttgattttggggagagattcacggggtcgggagacacaagagtggagagtcattggttag 36796262  T
Q  128 caacttgggtgagtctt-atgaaaccaaaagagaagatccttag 170  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||||| | ||||||||||    
T  36796263 caacttgggtgaatcttaaggaaaccaaaagtgtagatccttag 36796306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 323 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 40519317 - 40519258
Alignment:
Q  323 tttgttgaagctaatttcttgtaaca-tttgtatctctttgt-aagaactcattgatagt 380  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40519317 tttgttgaagttaatttcttgtaatattttgtatctctttgtaaagaactcattgatagt 40519258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 4598693 - 4598528
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacat-ttgta-tctctttgt-aagaact 370  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||   |  | |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||| |||||||    
T  4598693 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaact 4598595  T
Q  371 ca-ttgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    || ||||||||||||||||||   ||| |||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  4598594 catttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 4598528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 10056217 - 10056382
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacat-ttgta-tctctttgt-aagaact 370  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||   |  | |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||| |||||||    
T  10056217 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaact 10056315  T
Q  371 ca-ttgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    || ||||||||||||||||||   ||| |||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  10056316 catttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 10056382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 10058439 - 10058604
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacat-ttgta-tctctttgt-aagaact 370  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||   |  | |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||| |||||||    
T  10058439 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaact 10058537  T
Q  371 ca-ttgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    || ||||||||||||||||||   ||| |||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  10058538 catttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 10058604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 10060661 - 10060826
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacat-ttgta-tctctttgt-aagaact 370  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||   |  | |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||| |||||||    
T  10060661 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaact 10060759  T
Q  371 ca-ttgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    || ||||||||||||||||||   ||| |||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  10060760 catttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 10060826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 10062883 - 10063048
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacat-ttgta-tctctttgt-aagaact 370  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||   |  | |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||| |||||||    
T  10062883 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaact 10062981  T
Q  371 ca-ttgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    || ||||||||||||||||||   ||| |||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  10062982 catttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 10063048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 10065105 - 10065270
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacat-ttgta-tctctttgt-aagaact 370  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||   |  | |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||| |||||||    
T  10065105 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaact 10065203  T
Q  371 ca-ttgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    || ||||||||||||||||||   ||| |||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  10065204 catttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 10065270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 10211393 - 10211558
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacat-ttgta-tctctttgt-aagaact 370  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||   |  | |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||| |||||||    
T  10211393 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaact 10211491  T
Q  371 ca-ttgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    || ||||||||||||||||||   ||| |||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  10211492 catttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 10211558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27305777 - 27305719
Alignment:
Q  374 tgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactg 432  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||| ||| |||||||||    
T  27305777 tgatagtggattggagagatcaatctctcctccaaagtaggtcaatttggaccgaactg 27305719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 31340502 - 31340448
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgcc 72  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  31340502 agatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaatggttggtgcc 31340448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 28253416 - 28253363
Alignment:
Q  295 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac 347  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  28253416 ggtagaaattagggttcgttcattgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaac 28253363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 4075636 - 4075503
Alignment:
Q  280 gagattgggaaaatgggtagaaattag--ggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacat---ttgtatctctttgtaagaa-ctcat 373  Q
    |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||| | ||  ||||  ||| |||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||| ||| |    
T  4075636 gagattgggaaa-tgggtagaaattattaggctgttcttagagaacttgtaaaagttaatttcttgtaacctcttttgtatcactttgtaagaaactctt 4075538  T
Q  374 tgatagtggattggagatatcaatctctcccccagat 410  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  4075537 tgatagtggattggagagatca--ctctcccccagat 4075503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 397 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 25795829 - 25795773
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||| || |||||||||||    
T  25795829 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctttggtgtgt 25795773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 3148144 - 3148054
Alignment:
Q  290 aaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacat--ttgtatctctttgtaagaa-ctcattgat 377  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||   ||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||| | |||||||||| |||||||||    
T  3148144 aaatggatagaaattaggtttcttcttgaagagcttgttgaagctaatttcttgtaaccttattgtatttgtttgtaagaatctcattgat 3148054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 453 - 575
Target Start/End: Original strand, 5270557 - 5270680
Alignment:
Q  453 tcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatatgcacttggtttctagactaggtctatat-tgatgttgttgctt 551  Q
    |||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||   | ||||||||| ||||| ||| |||| || |  |||||||||||    
T  5270557 tcttttctctactctctttatcatgtttattctttggttcgattgtggttttgcattacacttggttgctagattagatctagatctattgttgttgctt 5270656  T
Q  552 gtgatttactttagttgttggttg 575  Q
    ||| |||  ||| ||| |||||||    
T  5270657 gtggtttttttttgttattggttg 5270680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 332 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 54744359 - 54744304
Alignment:
Q  332 gctaatttcttgtaacatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattg 386  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  54744359 gctaatttattgtaacttttgtatctctttgtaaagaacttactgatagtggattg 54744304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 172 - 229
Target Start/End: Original strand, 36796692 - 36796749
Alignment:
Q  172 gaaatcaaaggctaagggttggttctcttttga-ggttagattctagagttgggaaaca 229  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  36796692 gaaatcaaaggctaagggttgatt-acttttgagggttagattcaagagttgggaaaca 36796749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 120 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 50432898 - 50432840
Alignment:
Q  120 tttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatca 178  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||  || ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  50432898 tttgtgagcaacttggttgaatcttgagagaccaaaaaaggagatccttagtgaaatca 50432840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 458499 - 458540
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  458499 tctctcccccagactaggtcaggttggaccgaactgggtcaa 458540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 1313624 - 1313665
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  1313624 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 1313665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 1321694 - 1321735
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  1321694 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 1321735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 1417529 - 1417570
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  1417529 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 1417570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 1736344 - 1736385
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  1736344 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 1736385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 3859742 - 3859783
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  3859742 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 3859783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 468 - 516
Target Start/End: Original strand, 4570153 - 4570202
Alignment:
Q  468 ctttatcttgtttattccttg-gttgaattgtggttttgatatgcacttg 516  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  4570153 ctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttg 4570202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 5886413 - 5886454
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  5886413 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 5886454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 5899886 - 5899927
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  5899886 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 5899927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 6484575 - 6484616
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  6484575 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 6484616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 7606630 - 7606589
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  7606630 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 7606589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 8370525 - 8370566
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  8370525 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 8370566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 10958365 - 10958324
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  10958365 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 10958324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 18552922 - 18552963
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  18552922 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 18552963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 21711271 - 21711230
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  21711271 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 21711230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 25389120 - 25389161
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  25389120 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 25389161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 25688202 - 25688161
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  25688202 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 25688161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 26299036 - 26298995
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  26299036 tctctcccccagattatgtcatattgaaccgaactgggtcaa 26298995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 27635700 - 27635659
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27635700 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 27635659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 27974991 - 27975032
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  27974991 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 27975032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 27986485 - 27986526
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  27986485 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 27986526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 30709829 - 30709870
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  30709829 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 30709870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 31340271 - 31340242
Alignment:
Q  347 catttgtatctctttgtaagaactcattga 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31340271 catttgtatctctttgtaagaactcattga 31340242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 35919157 - 35919116
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  35919157 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 35919116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 41849274 - 41849315
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  41849274 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 41849315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 42990519 - 42990560
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  42990519 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 42990560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 42992485 - 42992526
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  42992485 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 42992526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 43421457 - 43421416
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  43421457 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 43421416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 53894099 - 53894058
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  53894099 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 53894058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 397 - 437
Target Start/End: Original strand, 26720762 - 26720802
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtca 437  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  26720762 tctctcccctagattaggtcaatttggaccgaactgggtca 26720802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 397 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 48438262 - 48438218
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaataa 441  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||    
T  48438262 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaataa 48438218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 371; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 586
Target Start/End: Original strand, 7070 - 7646
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  7070 agatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagt 7169  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattcta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  7170 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtaaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattcta 7269  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7270 gagct-ggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaaggttgttctt 7368  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||| ||||    
T  7369 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggaaagatcaatctctcctctagagtagg 7468  T
Q  415 tcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg----tgtcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatatg 510  Q
    | |||||| |||||||||||| || |    ||||||    | ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  7469 ttaagttggaccgaactgggtgaacatttcttggtgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatg 7568  T
Q  511 cacttggtttctagactaggtc--tatattgatgttgttgcttgtgatttactttagttgttggttgcctttgctact 586  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  7569 cacttggtttatagactaggtctatatattattgttgttgcttgtggtttactttggttgttggttgccattgatact 7646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 362; Significance: 0; HSPs: 117)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 13549426 - 13548861
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||| | || |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  13549426 agatgtgaatcttggataaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggtcggtgccttttgaggaaaattcatggggttggaaaacacatgagtggagagt 13549327  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattcta 216  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  13549326 cttttgtgagcaacttgggtgaatcttgtgaaaccaaaagagaagatacttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattcta 13549227  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13549226 gatttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 13549127  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    |||||| ||||| || |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  13549126 tgtgagcttgttaaacctaatttcatgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 13549027  T
Q  415 tcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg----tgtcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatatg 510  Q
    |||||||| |||||||||||| || |    ||||||    | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  13549026 tcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttggtgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttattctttggttggattgtggttttgctatg 13548927  T
Q  511 cac-ttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtgatttactttagttgttggttg 575  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  13548926 cactttggtttatagactaggtctatattattgttgttgcttgtggtttactttggttgttggttg 13548861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 537
Target Start/End: Original strand, 37168039 - 37168565
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37168039 agatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagt 37168138  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattcta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  37168139 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaactaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaaaggttgattctcttttgggggttagattcta 37168238  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37168239 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgagagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 37168338  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac---atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattag 413  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  37168339 tgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtag 37168438  T
Q  414 gtcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg----tgtcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatat 509  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |    ||||||    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  37168439 gtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttggtgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttattccttggtttgattgtggttttgctat 37168538  T
Q  510 gcacttggtttctagactaggtctatat 537  Q
    |||||| | || ||||||||||||||||    
T  37168539 gcactt-gattatagactaggtctatat 37168565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 13547515 - 13546943
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||| | || |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  13547515 agatgtgaatcttggataaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggtcggtgccttttgaggaaaattcatggggttggaaaacacatgagtggagagt 13547416  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgagg-ttagattcta 216  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  13547415 cttttgtgagcaacttgggtgaatcttgtgaaaccaaaagagaagatacttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattcta 13547316  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13547315 gatttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 13547216  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  13547215 tgtgagcttgttgaagctattttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 13547116  T
Q  415 tcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg----tgtcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatatg 510  Q
    |||||||| |||||||||||| || |    ||||||    | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||     ||    
T  13547115 tcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttggtgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttattctttggttggattgtggttt-----tg 13547021  T
Q  511 cacttggtttctagac--taggtctatattgatgttgttgcttgtgatttactttagttgttggttgcctttgctact 586  Q
    |||||||||| || ||  ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  13547020 cacttggtttataaactataggtctatattattgttgttgcttgtggtttactttggttgttggttgccattgatact 13546943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 554
Target Start/End: Original strand, 11348440 - 11348986
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  11348440 agatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaaggtctggtgccttttggagaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagt 11348539  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattcta 216  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  11348540 catttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattcta 11348639  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11348640 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctt 11348739  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  11348740 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttctaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 11348839  T
Q  415 tcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg----tgtcttttcttta--ttctctttatcttgtttattccttg-gttgaattgtggttttgat 507  Q
    |||||||| ||||||||| || || |    ||| ||    | |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |    
T  11348840 tcaagttggaccgaactgagtgaacatttcttgatgttgttatcttttctttactctctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgct 11348939  T
Q  508 atgcacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtg 554  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  11348940 atgcacttggtttatagactaggtctatattgttgttattgcttgtg 11348986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 554
Target Start/End: Original strand, 29135990 - 29136533
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  29135990 agatgtgaatcttggagaaccaaaagaggggactcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaa-acatgagtggagagt 29136088  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgagg-ttagattcta 216  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  29136089 tttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttagttctcttttgggggttagattcta 29136188  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29136189 gagttgtgaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 29136288  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  29136289 tgtgagcttgttgaagctaatttcttggaacccatttgtatttctttgtaagaactcattgatcgtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 29136388  T
Q  415 tcaag-ttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg-tgtc---ttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatat 509  Q
    ||||| ||| |||||||| ||| || |    |||||| ||||   |||||| || |||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||| |||    
T  29136389 tcaagtttggaccgaactaggtgaacatttcttggtgctgtctatttttctctactctctttatcttgtttatcctttggttagattgtggttttgctat 29136488  T
Q  510 gcacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtg 554  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  29136489 gcacttggtttatagactaggtctattttgttgttattgcttgtg 29136533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 512
Target Start/End: Original strand, 19754238 - 19754737
Alignment:
Q  23 tgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagtctttt 122  Q
    ||||||||| | || ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19754238 tgaatcttggaaaaccaagagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtctttt 19754337  T
Q  123 gtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatcctt---agtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattctaga 218  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  19754338 gtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaaaatccttataagtgaaatcaaaggataatggttggttctcttttgggggttagattctaga 19754437  T
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattg-ggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19754438 gttgggaaacattcgtaaacaccttgagagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 19754537  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  19754538 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccgatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccctcagattaggt 19754637  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtg---tcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatatgca 512  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||  |||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||| ||||||    
T  19754638 caagttggaccgaagtgggtcaacaatttttggtgtgttatcttttctttactctctttatcttgtttatccttttgttggattgtggttttgctatgca 19754737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 42298401 - 42297823
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42298401 agatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagt 42298302  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattcta 216  Q
    | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  42298301 catttgcgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatcctaagtgaaatcaaaggctaagagttggttctcttttgggggttagattcta 42298202  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  42298201 gagttgtgaaacaattgtaaacaccttgggagagtaaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttttt 42298102  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  42298101 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattgaagagatcaatctctcctccagagtagg 42298002  T
Q  415 tca-agttgaaccgaactgggtcaataacct-ttggtg----tgtc---ttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttg 505  Q
    |||  |||| |||||||||||| || || || ||||||    ||||   ||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||    
T  42298001 tcatggttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgttgttgtctatttttctttactct-tttatcttgtttattatttggttggattgtgattttg 42297903  T
Q  506 atatgcacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtgatttactttagttgttggttgcctttgctact 586  Q
     |||||||||||||| |||||| ||| ||||||  |||| |||||| ||  ||| ||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  42297902 ctatgcacttggtttatagacttggtatatattattgttattgcttatg-gttaatttggttgttggttgccattgatact 42297823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 18 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 37033499 - 37032951
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  37033499 agatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttgaggaagattcatgaggttgggaaacacatgagtggagagt 37033400  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctc-ttttgaggttagattcta 216  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  37033399 catttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctatgggttggttctctttttggggttagattcta 37033300  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37033299 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 37033200  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--ca-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattag 413  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||| | |||    
T  37033199 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaatccattttgcatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagattaatctcttctccatagtag 37033100  T
Q  414 gtca-agttgaaccgaactgggtcaataacct-------ttggtgtgtcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttg 505  Q
    ||||  |||| |||||||||||| || || ||       ||| ||| | |||||| || |||||||||||||||||| | ||||||  | |||| |||||    
T  37033099 gtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctattcgtgttgttgtctattttctctactctctttatcttgtttatcctttggttagagtgtgattttg 37033000  T
Q  506 atatgcacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtg 554  Q
     |||||||||| |||||||| ||| |||| |||| |||| |||||||||    
T  37032999 ctatgcacttgttttctagattagatctagattgttgttattgcttgtg 37032951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 18 - 537
Target Start/End: Original strand, 34603318 - 34603830
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  34603318 agatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtgaaaagt 34603417  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattcta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34603418 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttag-gaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggaggttagattcta 34603516  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaa-tcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttct 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  34603517 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggaaagtgaaaattcatgagtgtcttgttcattggtgagattgaaaaaatgggtagaaattagggttgttct 34603616  T
Q  316 ttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac---atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagatta 412  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||    
T  34603617 ttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttttatctctttgtaagaactcattgatggtggattgaagagatcaatctctcctccagagta 34603716  T
Q  413 ggtcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgtcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatatgca 512  Q
    |||||||||| |||||||| |||         |||   | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  34603717 ggtcaagttggaccgaactaggt--------gttg--ttatcttttctttactctctttatcttgtttattccttggttggattgtggttttgctatgca 34603806  T
Q  513 cttggtttctagactaggtctatat 537  Q
    ||| | || ||||||||||||||||    
T  34603807 ctt-gattatagactaggtctatat 34603830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 18 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 47255760 - 47255196
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||| |||||    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  47255760 agatgtgaatcttggagaaccaaaagatggggctcttgggaaaa----tggtgccttttggggaagattcatggg-ttgggaaacacatgattggagagt 47255666  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgagg-ttagattcta 216  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  47255665 cttttgtgagcaacttag-tgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattcta 47255567  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47255566 gagttgggaaataattgtaaatgccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttctt 47255467  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  47255466 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 47255367  T
Q  415 tca-agttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg------tgtcttttc-tttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttga 506  Q
    |||  |||| |||||||||||| || |    ||||||      | | ||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||     
T  47255366 tcattgttggaccgaactgggtgaacatttcttggtgttgttattttttttcttttactctctttatcttgtttatcctttggttagattgtggttttgc 47255267  T
Q  507 tatgcacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtgatttactttagttgttggttgcc 577  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  47255266 tatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttgttgcttatggtttactttggttgttggttgcc 47255196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 18 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 7482657 - 7482114
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtggggg-ctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagag 116  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7482657 agatgtgaatcttggagaaccaaaagaggggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagag 7482558  T
Q  117 tcttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattct 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  7482557 tcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaacaaaaagagaagatccttag-gaaatcaaa-gctaagggttggttctcttttgggggttagattct 7482460  T
Q  216 agagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaa-tcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttc 314  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7482459 agagttgggaagcaattgtaaacaccttgggaaagtgaaaattcatgagtgtattgttcattggtgagattgggtaaatgggtagaaattagggttgttc 7482360  T
Q  315 tttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac---atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagatt 411  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||| |    
T  7482359 tttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcattgatagtgaattggagagatcaatctctccttcagagt 7482260  T
Q  412 aggtcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgt----gtcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgat 507  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| || |     |||| |     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  7482259 aggtcaagttggaccgaactaggtgaacatttcatggtattgtcatcttttctttactctctttatcttgtttattccttggttggattgtggttttgct 7482160  T
Q  508 atgcacttggtttctagactaggtc--tatattgatgttgttgcttg 552  Q
    |||||||| | || |||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  7482159 atgcactt-gattatagactaggtctatatattgttgttgttgcttg 7482114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 51 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 31926099 - 31925569
Alignment:
Q  51 tcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaa 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  31926099 tcttgtgaaaagggttggtgccttttggggaagattcatgggtttgggaaacacgtgagtggagaatcttttgtgagcaacttgggtgagacttgtgaaa 31926000  T
Q  151 ccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggaga 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  31925999 ccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaatggttggttctcttttgggggttagattctagagtt-ggaagcagttgtaaacaccttgggaga 31925901  T
Q  250 gtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--c 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  31925900 gtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagagtggaaaaatgggtagaaattagggatgttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccc 31925801  T
Q  348 atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttg 447  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||| ||| || |    |||    
T  31925800 atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaagttggaccgaactaggtgaacatttcttg 31925701  T
Q  448 gtg----tgtcttttctttattctctttatcttgt-ttattccttggttgaattgtggttttgatatgcacttggtttctagactaggtctatattgatg 542  Q
    |||    | | ||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  31925700 gtgttgttattttttctttactctcgttatcttgtattattctttggttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattg 31925601  T
Q  543 ttgttgcttgtgatttactttagttgttggttg 575  Q
    || |||||||||  ||| ||| |||||||||||    
T  31925600 ttattgcttgtg-gttaatttggttgttggttg 31925569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 19 - 435
Target Start/End: Original strand, 193355 - 193773
Alignment:
Q  19 gatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagtc 118  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  193355 gatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaaaggttggtgccttttgggaa-gattcatggggttgggaaacacatgtgtgaagagtc 193453  T
Q  119 ttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgagg-ttagattctag 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  193454 ttttgtgagcaacttggatgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctag 193553  T
Q  218 agttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193554 agttgggaaacaattgtaaacaccttgggagggtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 193653  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
     | || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| || ||    
T  193654 attagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaataactcattgatagtggattggagagatcaatctcttctccagagtatgt 193753  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggt 435  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  193754 caagttggaccgaactgggt 193773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 20 - 516
Target Start/End: Original strand, 19752430 - 19752930
Alignment:
Q  20 atgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagtct 119  Q
    |||||||||||| |||| ||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |    
T  19752430 atgtgaatcttggagaaccaaaagatggggctcttatgaaaagg-ttggtgccttttggggaagattcattgagttgggaaacacatgagtggagagtat 19752528  T
Q  120 tttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattctaga 218  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  19752529 tttgtgagcaacttagatgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaatgattggttctcttttgggggttagattctaga 19752628  T
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattg-ggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19752629 gttgggaaataatcgtaaacaccttgagagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgagtaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 19752728  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  19752729 gcgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccgatttgtatctctttgtaagaactcattgatagaggattggagagatcaatctctctcccatattaggt 19752828  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg-tgtcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatatgcact 514  Q
    ||||||| |||||||| |||||| || |||| ||| | |||||| |||| |||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||  ||||||||    
T  19752829 caagttggaccgaactaggtcaacaatcttttgtgttatcttttatttactctctttatcttgtttatccttttgttggattgtggttttactatgcact 19752928  T
Q  515 tg 516  Q
    ||    
T  19752929 tg 19752930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 21 - 557
Target Start/End: Original strand, 47114917 - 47115461
Alignment:
Q  21 tgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagtctt 120  Q
    ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  47114917 tgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaacagggttggtaccttttgggaa-gattcatggggttgggaaacacatgaatggagagtctt 47115015  T
Q  121 ttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgagg-ttagattctagag 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  47115016 ttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttaatgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagag 47115115  T
Q  220 ttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgt 319  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47115116 ttgggaaacaattgtaaacatcttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgt 47115215  T
Q  320 gagtttgttgaagctaatttcttgtaac---atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtc 416  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||    
T  47115216 gagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaaaaacccattgatagtggattggagagatcaatctctgctccagagtaggtc 47115315  T
Q  417 a-agttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg----tgtcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatatgc 511  Q
    |  |||| |||||||||||| || |    ||| ||    | |||||||| |  ||| |||||||||||||| | || |||  |||||||||||| |||||    
T  47115316 attgttggaccgaactgggtgaacatttcttgatgttgttatcttttctctgctctttttatcttgtttatccttttgttagattgtggttttgttatgc 47115415  T
Q  512 acttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtgatt 557  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||    
T  47115416 acttgttttctagattagatctagattgttgttattgcttgtgatt 47115461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 18 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 37879337 - 37879007
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37879337 agatgtgaatcttggagaacaaaaagagggggctcttgtgaaaaaggttggtgccttttggggaaaattcatggggttgggaaacacatgagtggagagt 37879238  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattcta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  37879237 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaatcaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaaggattggttctcttttgggggttagattcta 37879138  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37879137 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaataggtagaaattagggttgttctt 37879038  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac 347  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37879037 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaac 37879007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 28265778 - 28265542
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  28265778 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggcgagattgggaaaataggtagaaattagggttgttcatt 28265680  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28265679 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggt 28265580  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  28265579 caagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgt 28265542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 20 - 271
Target Start/End: Original strand, 28242133 - 28242385
Alignment:
Q  20 atgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagtct 119  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||     
T  28242133 atgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttgggaa-gattcataaggttgggaaacacatgagtggagagtca 28242231  T
Q  120 tttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattctaga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  28242232 tttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaatatccttagtgaaatcaaaggctatgggttggttctcttttaggggttagattctaga 28242331  T
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaa-tcatgagtgtcttgt 271  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  28242332 gttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaattcttgagtgtcttgt 28242385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 230 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 28220440 - 28220214
Alignment:
Q  230 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgtt 328  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  28220440 attgaaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttattcattggtgagattcggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 28220341  T
Q  329 gaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaacc 426  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28220340 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggacc 28220241  T
Q  427 gaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||||||||||| || |||||||||||    
T  28220240 gaactgggtcaacaatctttggtgtgt 28220214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 230 - 453
Target Start/End: Original strand, 31659192 - 31659418
Alignment:
Q  230 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgtt 328  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  31659192 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggctgttctttgtgagcttgtt 31659291  T
Q  329 gaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaacc 426  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  31659292 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaacttattgatagtggattggagagatcaatctctccctcagattaggtcaagttggacc 31659391  T
Q  427 gaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||||||||||| || |||||||||||    
T  31659392 gaactgggtcaacaatctttggtgtgt 31659418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Original strand, 44455104 - 44455340
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44455104 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaaccattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 44455202  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44455203 gtgaacttgttgaaactaatttcttgtaactcatttgtatctttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggt 44455302  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||  |||||||||||||||  | |||||||||||    
T  44455303 caagtttgaccgaactgggtcaacgatctttggtgtgt 44455340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 235 - 453
Target Start/End: Original strand, 49918309 - 49918530
Alignment:
Q  235 aaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagc 333  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  49918309 aaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagc 49918408  T
Q  334 taatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaact 431  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  49918409 taatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaact 49918508  T
Q  432 gggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
     |||||| || |||||||||||    
T  49918509 aggtcaacaatctttggtgtgt 49918530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 230 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 37503768 - 37503545
Alignment:
Q  230 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgtt 328  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||    
T  37503768 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 37503669  T
Q  329 gaagctaatttcttgtaacatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaaccga 428  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||    
T  37503668 gaagctaatttcttgtaacctt-gtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattatgtcaagttggatcga 37503570  T
Q  429 actgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||| |||||| || |||||||||||    
T  37503569 actaggtcaacaatctttggtgtgt 37503545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 230 - 453
Target Start/End: Original strand, 3156820 - 3157045
Alignment:
Q  230 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgtt 328  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  3156820 attgtaaacaccctggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 3156918  T
Q  329 gaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaacc 426  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  3156919 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaagttggacc 3157018  T
Q  427 gaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||||||||||| || |||||||||||    
T  3157019 gaactgggtcaacaatctttggtgtgt 3157045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 834391 - 834155
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  834391 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgcgtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatggatagaaattagggttgttcttt 834293  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  834292 gtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatctatctctcccccagagtaggt 834193  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  834192 caagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgt 834155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 3847345 - 3847109
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3847345 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 3847247  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  3847246 gtgagtttgtttaagctaaatttttgtaacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatccatctcttccccagattaggt 3847147  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||    
T  3847146 caagttggaccgaacttggtcaacaatctttggtgtgt 3847109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 28223645 - 28223409
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  28223645 gttgggaaaca-ttgaagacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggttgatcttt 28223547  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
     |||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  28223546 ctgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggt 28223447  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  28223446 caagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgt 28223409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 50167399 - 50167163
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||    
T  50167399 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattagtagaaattagggttgttattt 50167301  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  50167300 gtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaaaaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattagct 50167201  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||    
T  50167200 caagttggaccgaactaggtcaacaatctttggtgtgt 50167163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 50169434 - 50169198
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50169434 gttgggaaaca-ttgtaaataccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 50169336  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  50169335 gtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagtactcattgatagtggattgaagagatcaatctctcccctagattaggt 50169236  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||    
T  50169235 caagttggaccgaactggatcaacaatctttggtgtgt 50169198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 34602765 - 34602557
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  34602765 agatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttggtaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtgaaaagt 34602666  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattcta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34602665 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttag-gaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggaggttagattcta 34602567  T
Q  217 gagttgggaa 226  Q
    ||||||||||    
T  34602566 gagttgggaa 34602557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 230 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 4552851 - 4552625
Alignment:
Q  230 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgtt 328  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  4552851 attgtaaacaccttgggtgagggaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattaggtttgtcctttgtgagcttgtt 4552752  T
Q  329 gaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaacc 426  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||    
T  4552751 gaagctaatttcttgtaacccctttgtatccctttgtaagaactcattgataatggattggagagatcaatctctccctcagagtaggtcaagttggacc 4552652  T
Q  427 gaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||||||||||| || |||||||||||    
T  4552651 gaactgggtcaacaatctttggtgtgt 4552625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 220 - 418
Target Start/End: Original strand, 1833467 - 1833667
Alignment:
Q  220 ttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttg 318  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1833467 ttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttg 1833565  T
Q  319 tgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtc 416  Q
    ||| | | |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  1833566 tgaatctattgaagctaaattcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccaccagattaggtc 1833665  T
Q  417 aa 418  Q
    ||    
T  1833666 aa 1833667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 219 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 197132 - 196890
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  197132 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgagaaaattggtagaaattagggttgttcttt 197034  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctct-cccccagattagg 414  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||    
T  197033 gtgagcttgtttaagttaatttcttgtaactcatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatttatctctccccccagattagg 196934  T
Q  415 tcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgtctttt 458  Q
    |||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||| ||||    
T  196933 tcaagttggaccgaactggatcaacaatctttggtgtgtttttt 196890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 230 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 8551001 - 8550774
Alignment:
Q  230 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgtt 328  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  8551001 attgtaaacacattgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtt 8550902  T
Q  329 gaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaac 425  Q
     |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||    
T  8550901 taagctaatttcttgtaactcatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggac 8550802  T
Q  426 cgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||||||||| || || |||||||||||    
T  8550801 cgaactgggtgaacaatctttggtgtgt 8550774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 230 - 453
Target Start/End: Original strand, 46064872 - 46065098
Alignment:
Q  230 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgtt 328  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| | |||    
T  46064872 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatggataaaaattaggtttgttctttgtgagctcgtt 46064971  T
Q  329 gaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaacc 426  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |    
T  46064972 gaagctaatttcttgtaactcatgtgtatctctttgtaagaactcattcatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggtcaagttggatc 46065071  T
Q  427 gaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||||| || || |||||||||||    
T  46065072 gaactgggtaaacaatctttggtgtgt 46065098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 230 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 13659550 - 13659326
Alignment:
Q  230 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgtt 328  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  13659550 attgtaaacaccttggggtagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaacggatagaaattagggttgttttttgtaagcttgtt 13659451  T
Q  329 gaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaacc 426  Q
    |||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  13659450 gaagctaatttcttgttacccatttatatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggttaagttggacc 13659351  T
Q  427 gaactgggtcaataacctttggtgt 451  Q
    |||||||||||| || |||||||||    
T  13659350 gaactgggtcaacaatctttggtgt 13659326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Original strand, 10925167 - 10925406
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  10925167 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgaaaaaatggatagaaattatggttgttcttt 10925265  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgt---aagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagatta 412  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  10925266 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaagaattcattgatagtggattggagaaatcaatctctcccctagatta 10925365  T
Q  413 ggtcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||| |||||| | ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  10925366 ggtaaagttggatcgaactgggtcaacaatctttgatgtgt 10925406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 230 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 37560083 - 37559855
Alignment:
Q  230 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgtt 328  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  37560083 attgtaaacacattaggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattaggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 37559984  T
Q  329 g-aagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctccccc-agattaggtcaagttgaa 424  Q
    | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  37559983 gaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtgaattggagagatcaatctctccccctagattaggtcaagttgga 37559884  T
Q  425 ccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||||    
T  37559883 ccgaacttggtcaacaatctttggtgtgt 37559855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 230 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 45644569 - 45644343
Alignment:
Q  230 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgt 327  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||    
T  45644569 attgtaaacatcttgggtgagtgaaaatcattaagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatggatagaaattaagttttgttctttgtgagcttgt 45644470  T
Q  328 tgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaac 425  Q
      |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  45644469 caaagctaatttcttgcaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatatctcccccagattaggtcaagttggac 45644370  T
Q  426 cgaactgggtcaataacctttggtgtg 452  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||    
T  45644369 cgaactgggtcaacaatctttggtgtg 45644343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Original strand, 3189275 - 3189511
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  3189275 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcactgagtgtcttgttcattggtgagatttggaaaaagggtataaattagggttgttcttt 3189372  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||  ||||||||||||||||| |||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||    
T  3189373 gtgaacttgttgaagctaatttcctgtaactcttttgtatctttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcatccagagtaggt 3189472  T
Q  416 caag-ttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||| ||| |||||||||||| || || |||||||||||    
T  3189473 caagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgt 3189511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Original strand, 3198092 - 3198328
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  3198092 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcactgagtgtcttgttcattggtgagatttggaaaaagggtataaattagggttgttcttt 3198189  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||  ||||||||||||||||| |||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||    
T  3198190 gtgaacttgttgaagctaatttcctgtaactcttttgtatctttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcatccagagtaggt 3198289  T
Q  416 caag-ttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||| ||| |||||||||||| || || |||||||||||    
T  3198290 caagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgt 3198328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Original strand, 3206931 - 3207167
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  3206931 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcactgagtgtcttgttcattggtgagatttggaaaaagggtataaattagggttgttcttt 3207028  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||  ||||||||||||||||| |||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||    
T  3207029 gtgaacttgttgaagctaatttcctgtaactcttttgtatctttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcatccagagtaggt 3207128  T
Q  416 caag-ttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||| ||| |||||||||||| || || |||||||||||    
T  3207129 caagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgt 3207167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 219 - 438
Target Start/End: Original strand, 41360859 - 41361079
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttg 318  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41360859 gttgggaaaca-tcgtaaacatcttgggtgagtgaaaatattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttg 41360957  T
Q  319 tgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtc 416  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||| ||||||||| | ||||||    
T  41360958 tgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattaaagagatcaatatctcccccatagtaggtc 41361057  T
Q  417 aagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    |  ||| |||||||| ||||||    
T  41361058 atattggaccgaactaggtcaa 41361079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 83 - 415
Target Start/End: Original strand, 6808254 - 6808595
Alignment:
Q  83 gattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaagg 182  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |   |||||||||||||||||| ||| || ||||||||     
T  6808254 gattcatggggttggaaaacacatgaatgaagagtcatttgtgagcaactagggtgagtaatggaaaaccaaaagagaagatcatta-tgtaatcaaaga 6808352  T
Q  183 ctaagggttggttctcttttgaggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattggt-g 280  Q
    |  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | | |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||  || |    
T  6808353 cggaaggttggttctctttcgaggttagattctagagttgagaaacattgggaaacactttgggagagtgaaaattattgagtgtcttgttcatgagtag 6808452  T
Q  281 agattgggaaaatgggtagaa------attagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgt-aagaactc 371  Q
    ||||| || |||| |||||||      |||||| |||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||    
T  6808453 agattagggaaat-ggtagaaattaggattaggtttgttcttggagagcttgttgaagctaacttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaagaactc 6808551  T
Q  372 attgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||| |||||    
T  6808552 atttatagtggattggagagatcaatctcttcctcagagtaggt 6808595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 221 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 13138196 - 13137964
Alignment:
Q  221 tgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgt 319  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  13138196 tgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattga-aaaatggatagaaattagg-tcgttctttgt 13138100  T
Q  320 gagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtca 417  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||| |||||||    
T  13138099 gagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgcatctctttgtaagaacacattgatagtggattgaagagagcaatctctcccctagagtaggtca 13138000  T
Q  418 agttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
      ||| ||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  13137999 tattggaccgaactgggtcaacaatctttgatgtgt 13137964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 220 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 40122421 - 40122184
Alignment:
Q  220 ttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttg 318  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  40122421 ttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtaaaaatcattgaatgtcttgttcatttgtgagattggaaaaatgggtcgaaattagatttgttctttg 40122323  T
Q  319 tgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattg--atagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  40122322 tgagcttgtttaagctaatttcttataactcatttgtatcactttgtaagaactctttgatatagtggattagagagatcaatctctcccccatattagg 40122223  T
Q  415 tcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||    
T  40122222 tcaagttggaccgaactaggtcaacaatctttggtgtgt 40122184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 30476672 - 30476434
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttca---ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttc 314  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30476672 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgggtgaaaatcattgagt-tcttgttcaatattggtgagattgggaaaataggtagaaattagggttgttc 30476575  T
Q  315 tttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagatta 412  Q
    ||| |||  ||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||| || |    
T  30476574 tttatgaacttgttgaagataatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatactggattggacagatcaatctctaccccatatga 30476475  T
Q  413 ggtcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  30476474 ggttaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgt 30476434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 217 - 431
Target Start/End: Original strand, 15820249 - 15820465
Alignment:
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttct 315  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||| |||||||| |||||||    
T  15820249 gagttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttctttggtgatattggaaagatgggtaaaaattaggtttgttct 15820347  T
Q  316 ttgtgagtttgttgaagctaatttcttgta--acatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattag 413  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||  ||||| |||    
T  15820348 ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacacatttgtatctctttttaagaactcattgatagtgcattgaagagataaatctctcatccagagtag 15820447  T
Q  414 gtcaagttgaaccgaact 431  Q
    ||||||||| | ||||||    
T  15820448 gtcaagttggatcgaact 15820465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 219 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 23555489 - 23555275
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23555489 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgaatgaaaattattgagtgtcttattctttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 23555391  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||  |||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||||    
T  23555390 gtgaacttgttgaaactaatttcttataactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctct-ccccatagtaggt 23555292  T
Q  416 caagttgaaccgaactg 432  Q
    ||||||| | |||||||    
T  23555291 caagttggatcgaactg 23555275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Original strand, 20762616 - 20762853
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat-gggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20762616 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtatcttgttcattggtgagattgagaaaaaagggtagaaattagggttgttctt 20762713  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    |||||  ||||  ||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||    
T  20762714 tgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttcgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctacagagtagg 20762813  T
Q  415 tcaag-ttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||| ||| |||||||| ||| |  || |||||||||||    
T  20762814 tcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctttggtgtgt 20762853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 219 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 928202 - 927982
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctt 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||  | |||||||||||||| ||||||    
T  928202 gttgggaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcaatgagtgtcttgttctttggtgatattggaaaaaatgatagaaattagggtttgttctt 928103  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| | ||| |||| |||||   ||||    
T  928102 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttggatctctttgtaaaaactcattaatagtggattagagagaccaacctcttccccaaggtagg 928003  T
Q  415 tcaagttgaaccgaactgggt 435  Q
    |||||||  ||||||||||||    
T  928002 tcaagttagaccgaactgggt 927982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 347 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 37876860 - 37876644
Alignment:
Q  347 catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaataaccttt 446  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||| || |    ||    
T  37876860 catttgtatctctttgtaataactcattgatagtggattgcagagatcaatctctcctccagagtacatcaagttgaaccgaactgggtgaacatttctt 37876761  T
Q  447 ggtgtg----tcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatatgcacttggtttctagactaggtctatattgatg 542  Q
    |||||     ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||    
T  37876760 ggtgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttatcatttggttgaattgtggtttttctatgcacttggtttatagactaggtctatagtgttg 37876661  T
Q  543 ttgttgcttgtgattta 559  Q
    || ||||||||| ||||    
T  37876660 tttttgcttgtggttta 37876644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 239 - 432
Target Start/End: Original strand, 16455585 - 16455780
Alignment:
Q  239 accttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaat 337  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||  || ||||  ||||| ||||||||||||||    
T  16455585 accttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggtaaaatggtgagaaattagattttttcta-gtgagcttgttgaagctaat 16455683  T
Q  338 ttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactg 432  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | | |||||| ||| ||| |||||    
T  16455684 ttcttgtaacccatttgtatctctgtgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccatagtcggtcaaattggaccaaactg 16455780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 13316520 - 13316357
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaagaactca 372  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||    
T  13316520 ttggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactca 13316421  T
Q  373 ttgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  13316420 ttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 13316357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 93 - 417
Target Start/End: Original strand, 22079140 - 22079461
Alignment:
Q  93 gttgggaaacacatgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg 192  Q
    |||||||||||||| |  | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||   ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||| |||    
T  22079140 gttgggaaacacatcaagggagagtcttt-gtgagcaacttaggtgagtcttggcaaaccaaaatataagatgctta-tgaaatcaaaggctaaggattg 22079237  T
Q  193 gttctcttttgagg-ttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttg-ggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggt-gagattggga 289  Q
     |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||  || | |||  || ||||||||  |||     |||||||||| ||  |||||||| |    
T  22079238 -ttctcttttgggggttagattctagagttgagaaacaattgggaaaaacttcaggtgagtgaaac-catt----tcttgttcatgggaagagattggaa 22079331  T
Q  290 aaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattg 386  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  22079332 aaatgg-tagaaattatgtttgttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaaccattttgtatctctttgtaaagaactcattgatattggattg 22079430  T
Q  387 gagatatcaatctctcccccagattaggtca 417  Q
    |||| |||||| ||||| ||| | |||||||    
T  22079431 gagagatcaatttctcctccaaagtaggtca 22079461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 61 - 378
Target Start/End: Original strand, 41135605 - 41135926
Alignment:
Q  61 agggttggtgccttttggggat-gattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagag 159  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41135605 agggttggtgccttttagggagagattcatggggttgggaaacacatcaaaggagagtcttt-gtgagaaacttgggtgagtcttaggaaaccaaaagag 41135703  T
Q  160 aagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattctagagttgggaaacaattg-taaacaccttgggagagtgaaaat 257  Q
    |||||| || | ||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||| ||| | ||||    
T  41135704 aagatcatttg-gaaattaaaggctaaggattggttctcttttgggggttagattctagagttgagaaacatttgaaaaacaccttgggtgag-ggaaat 41135801  T
Q  258 ca-tgagtgtcttgttcat-tggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgt 353  Q
    || ||||| |||||||| | ||  |||| |  ||||| |||||||||||||  ||||||||   ||  || |||||| |||||||||||||  | |||||    
T  41135802 cattgagtctcttgttcctgtgaggagaat-agaaaaagggtagaaattagatttgttcttgaagaactttttgaagttaatttcttgtaaaccttttgt 41135900  T
Q  354 atctctttgt-aagaactcattgata 378  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||    
T  41135901 atctatttgtaaagaactcgttgata 41135926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 279 - 432
Target Start/End: Original strand, 36683694 - 36683839
Alignment:
Q  279 tgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacatttgtatctctttgtaagaactcattgata 378  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||  ||||||||||||||||||||    
T  36683694 tgagattgggaaaataggtagaaattaggtttattctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac-------tc-atttgtaagaactcattgata 36683785  T
Q  379 gtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactg 432  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  36683786 gtggattgtagaaatcaatctctcccccagagtaggtcaagttagaccgaactg 36683839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 230 - 451
Target Start/End: Original strand, 51765349 - 51765576
Alignment:
Q  230 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattggga-aaatgggtagaaattagggttgttc-tttgtgagtttg 326  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||  |||    
T  51765349 attgtaaacaccttggt-gagtgtaaatcattgagtgtcttgttc-ttggtttgattgggagaaaagggtagaaattagggttgtacctttgtgaacttg 51765446  T
Q  327 ttgaagctaatttcttgtaaca---tttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-tt 421  Q
    |  ||||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||| |||| ||    
T  51765447 tcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggacaagttt 51765546  T
Q  422 gaaccgaactgggtcaataacctttggtgt 451  Q
    | |||||||||||| || || |||||||||    
T  51765547 ggaccgaactgggtgaacaatctttggtgt 51765576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 231 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 8871259 - 8871074
Alignment:
Q  231 ttgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttg 329  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  8871259 ttgtaaacaccttggatgagcgaaaatcat-agtgtcttgttcttttgtgagatttggaaaatgg-tagaaattagggtttgttctttgtgagttcgttg 8871162  T
Q  330 aagctaatttcttgtaacatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaa 429  Q
    ||||||||||||||||||        |  |||||   ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||    
T  8871161 aagctaatttcttgtaac--------cattttgt---aactc-ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccatagtaggccaagttggaccgaa 8871074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 122 - 381
Target Start/End: Original strand, 25651931 - 25652195
Alignment:
Q  122 tgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt--gaggttagattctagag 219  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||| |||||| ||||||||||||  ||||||||   ||||  |||||||||||||  || | ||||||||||||    
T  25651931 tgtgagcaacttgggtgaatcttgggaaagcaaaagtgaagatccttaga-aaatcaaatattaagaattggttctcttttatgaaggtagattctagag 25652029  T
Q  220 ttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcat-tggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||| ||||| | ||||||||  |   | |||| | |||| ||||||||||| |  |||| |||    
T  25652030 ttgggaaacaattgtaaacaccttaagtgtgtgaaaatcattgagtattttgttcatgagaaaatattgag-aaattggtagaaattaagtgtgttattt 25652128  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtg 381  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  25652129 gagagtttgttgaagctaatttcttgtaactctcttgtatctctttgtaaagaactctttgatagtg 25652195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 218 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 44650389 - 44650163
Alignment:
Q  218 agttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttct 315  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||  | || |||||| |||| |||||    
T  44650389 agttggaaaacatttgtaaacactttgggtgagtgaaaattattgagtgtcttgttcattggagagattgagaaaaatg-taaaaattatggtttgttct 44650291  T
Q  316 ttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaag-aactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagatta 412  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||  | ||| |||||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||| | | ||    
T  44650290 ttgtgagtttgttaacgctaatttattgtaaatcttttatatctctttgtaaataattcattaatagtggattgaagagatcaatctcttcccaaaagta 44650191  T
Q  413 ggtcaagttgaaccgaactgggtcaata 440  Q
    |||||| ||| |||||||| ||| ||||    
T  44650190 ggtcaatttggaccgaactaggtaaata 44650163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 9987202 - 9987364
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacattt-gtatctcttt-gtaagaactca 372  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||  || ||||||||||| ||| ||| ||||| |||| | |||||||||    
T  9987202 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggttgttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgcaaccttttgtatcccttttgcaagaactca 9987300  T
Q  373 ttgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  9987301 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 9987364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 20622406 - 20622242
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacattt-gtatctcttt---gtaagaact 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||  || ||||||||||||||| ||| ||||| ||||   |||||||||    
T  20622406 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttttgtaagaact 20622308  T
Q  371 cattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    | ||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  20622307 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 20622242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 40282377 - 40282540
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacattt-gtatctcttt-gtaagaactc 371  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||  || ||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||    
T  40282377 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc 40282475  T
Q  372 attgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
     ||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  40282476 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 40282540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 497 - 586
Target Start/End: Original strand, 194750 - 194839
Alignment:
Q  497 gtggttttgatatgcacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtgatttactttagttgttggttgcctttgctact 586  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  194750 gtggttttgatatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttgttgcttgtggtttactttggttgttggttgccattgatact 194839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 350 - 552
Target Start/End: Original strand, 28242382 - 28242589
Alignment:
Q  350 ttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtca-agttgaaccgaactgggtcaataacctttgg 448  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||  |||| |||||||||||| || |    ||||    
T  28242382 ttgtatctctttgtaagaactcatt-atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaacatttcttgg 28242480  T
Q  449 tg----tgtcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtgg-ttttgatatgcacttggtttctagactaggtctatattgatgt 543  Q
    ||    | |||||||| || ||||||||||||||||||   || |||  ||||||| ||||| ||| ||||||||||||| | ||| |||| |||| |||    
T  28242481 tgttgttatcttttctctactctctttatcttgtttatcattttgttagattgtggtttttgctattcacttggtttctaaattagatctagattgttgt 28242580  T
Q  544 tgttgcttg 552  Q
    |||||||||    
T  28242581 tgttgcttg 28242589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 9036417 - 9036579
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacattt-gtatctcttt-gtaagaactc 371  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||  |||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||    
T  9036417 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc 9036514  T
Q  372 attgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
     |||||||||||||| |||   |||||||||| | ||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  9036515 tttgatagtggattgaagagtacaatctctcctcgagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 9036579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 234 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 37282901 - 37282729
Alignment:
Q  234 taaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaa 331  Q
    |||||||||||   ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||  |||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  37282901 taaacaccttgtatgagtgaaaaccattgagtgtcttgttcattggagagattg--aaaaatggtataaattagggtttgttccttgtgagcttgttgaa 37282804  T
Q  332 gctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcc 403  Q
    |||||||| | |||||   |||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| || |||||||||    
T  37282803 gctaatttatggtaacccttttgcatctctttgtaaagaactcattagtagtggattggagagataaatctctcc 37282729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 125 - 229
Target Start/End: Original strand, 3331403 - 3331505
Alignment:
Q  125 gagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgaggttagattctagagttggg 224  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  3331403 gagcaacttaggtgaatcttagggtaccaaaagaggagatccttag-gaaatcaaaggctaagggtttgtt-tcttttggggttggattctagagttggg 3331500  T
Q  225 aaaca 229  Q
    |||||    
T  3331501 aaaca 3331505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 21053958 - 21054121
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacattt-gtatctcttt-gtaagaactc 371  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||  ||||  || ||||||||||| ||| ||| ||||| |||| ||||||||||    
T  21053958 ttggtgagattgggaaaa-gtgtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgcaaccttttgtatcccttttgtaagaactc 21054056  T
Q  372 attgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
     ||||||||||||||||||   ||| |||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  21054057 tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 21054121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12318864 - 12318725
Alignment:
Q  61 agggttggtgccttttggggatga-ttcatggggttgggaaacacatgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagag 159  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||| || ||| ||||||||| |  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||  || ||||||| ||    
T  12318864 agggttggtgccttttggggagaagttcataggattgagaaacacatcaaaggagagt-ttttatgagcaacttgggtgagtcttgggagaccaaaatag 12318766  T
Q  160 aagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 201  Q
    || ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12318765 aaaatcttttg-gaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 12318725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 287 - 397
Target Start/End: Original strand, 3460707 - 3460821
Alignment:
Q  287 ggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtgg 382  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  | ||||||| ||||||| ||||||  ||||||||| |    
T  3460707 ggaaaaagggtagaaattagagtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccttttgtatatctttgtaaagaacatattgatagtcg 3460806  T
Q  383 attggagatatcaat 397  Q
    |||||||| ||||||    
T  3460807 attggagagatcaat 3460821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 325 - 402
Target Start/End: Original strand, 5459956 - 5460035
Alignment:
Q  325 tgttgaagctaatttcttgtaacatttg-tatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagatatcaatctctc 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  5459956 tgttgaagctaatttcttgtaacattttatatttctttgtaaagaactcattgatagtagattggagagatcaatctctc 5460035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 44203631 - 44203795
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacat-ttgtatctcttt-gtaa-gaact 370  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||  ||||  |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||| |||||    
T  44203631 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaact 44203728  T
Q  371 catt-gatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    |||| ||||||||||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  44203729 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 44203795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 58 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4535861 - 4535684
Alignment:
Q  58 aaaagggttggtgccttttggggat-gattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagtcttttgtgagcaac-------ttgggtgagtcttatgaa 149  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| ||||||||||||       ||||||||   ||   ||    
T  4535861 aaaagggttggtgtcttttgggaatagattcatggggttgaaaaacacatgagtggatagtcgtttgtgagcaacttggcacttgggtgaaatttggtaa 4535762  T
Q  150 accaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgaggttagattctagagttgggaaaca 229  Q
    || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||| | |||||||||| | ||||||||||||    
T  4535761 actaaaagtgaagatccttag-gaaatcaaaggctaaaggttggtt-actttcggggttagattcaatagttgggaaaca 4535684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 280 - 410
Target Start/End: Original strand, 13938143 - 13938273
Alignment:
Q  280 gagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacattt---gtatctctttgtaagaa-ctcattg 375  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||  ||||  ||  |||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| |||||||    
T  13938143 gagattgggaaa-tgggtagaaattagg-ttgttcttggagaacttgtaaaatataatttcttgtaaccttttttgtatctctttgtaagaaactcattg 13938240  T
Q  376 atagtggattggagatatcaatctctcccccagat 410  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  13938241 atagtggattggagagatc--tctctcccccagat 13938273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 12318706 - 12318585
Alignment:
Q  260 tgagtgtcttgttcattggt-gagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatc 356  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||     
T  12318706 tgagtttcttgttcatgggtagagatttggaaa-tgggtagaaattaggtttgttcatggagagcttgttgaagctaatttcttgtaaccattttgtatg 12318608  T
Q  357 tctt-tgtaagaactcattgata 378  Q
    |||| | ||||||||||||||||    
T  12318607 tcttctttaagaactcattgata 12318585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16216911 - 16216709
Alignment:
Q  26 atcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatga-ttcatggggttgggaaacacatgagtgaagagtcttttgt 124  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||  |  | |||||| | |||| ||||||||||| | |||||| || ||    
T  16216911 atcttgaagaaccaaaagagggggctcttc-gaaaagggttggtgcattttggatagaaattcatgtg-ttggcaaacacatgagaggagagtcatt-gt 16216815  T
Q  125 gagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgaggttagattctagagttggg 224  Q
    |||||||||| |||| | ||   ||   |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||   ||| | |||||||||||||||||| |    
T  16216814 gagcaacttgagtgaattttgaaaacttaaaagagaagatccttag-gaaatcaaaggctacgagttggtttagtttag-ggttagattctagagttgag 16216717  T
Q  225 aaacaatt 232  Q
    ||||||||    
T  16216716 aaacaatt 16216709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 1050678 - 1050503
Alignment:
Q  209 agattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcat-tggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg 307  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||| |||| |||   |||||||| |  ||||| |||||||||| ||  |||||||||||| |||||  ||||||||    
T  1050678 agattcttgggttgggaaacatttgtacacacattgaatgagtgaaattattgagtctcttgttcatgtgaagagattgggaaa-tgggtgaaaattagg 1050580  T
Q  308 gttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtg 381  Q
      ||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| || ||||| |||||||||    
T  1050579 tgtgttcttcgagagcttattgaagctaatttcttgtaacatttttgtgtctctttgtaaataactcgttgatagtg 1050503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 218 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 44647010 - 44646881
Alignment:
Q  218 agttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttct 315  Q
    |||||| ||| | ||||||| || ||||  |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||  | || |||||| |||| |||||    
T  44647010 agttggaaaatatttgtaaatactttggatgagtgaaaattattgagtgtcttgttcattggagagattgagaaaaatg-taaaaattatggtttgttct 44646912  T
Q  316 ttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa 346  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  44646911 ttgtgagtttgttaacgctaatttattgtaa 44646881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 4535629 - 4535541
Alignment:
Q  295 ggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgt-aagaactcattgatagt 380  Q
    ||||||||||| | |||||||| | ||| || ||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4535629 ggtagaaattaagtttgttcttggagagcttattgaagtcaatttcttgtaacatttttgtatctctttgtaaagaactcattgatagt 4535541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 324 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 9109539 - 9109459
Alignment:
Q  324 ttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagatatcaatctct 401  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  9109539 ttgttgaagttaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaaagaacacgttgatagtgtattggagagatcaatctct 9109459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 2263106 - 2263011
Alignment:
Q  312 ttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagatatcaatctctccc 404  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||   ||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  2263106 ttcttggtgagcttgttgaagataatttcttgtaacccttttatatctttttgtaaagaacttattgatagtggattgaagagatcaatctttccc 2263011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 9109827 - 9109680
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggat-gattcatggggttgggaaacacatgagtgaagag 116  Q
    |||||||||||||| |||| |||||  |||| ||| || || | |||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| |    ||||    
T  9109827 agatgtgaatcttggagaaccaaaaaaggggactcatgggaga-gggttgatgtcttttggggagagattcatgaggttgggagacacatcaaatgagag 9109729  T
Q  117 tcttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatc 165  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||  |||| ||||| ||||||||    
T  9109728 tcttttgtgagcaatttggatgagtcttgggaaatcaaaatagaagatc 9109680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 397 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 19072976 - 19072920
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  19072976 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgt 19072920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 397 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 19120866 - 19120810
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  19120866 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgt 19120810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 173 - 232
Target Start/End: Original strand, 33775808 - 33775866
Alignment:
Q  173 aaatcaaaggctaagggttggttctcttttgaggttagattctagagttgggaaacaatt 232  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33775808 aaatcaaagactaagagtttgttc-cttttgaggttagattctagaattgggaaacaatt 33775866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 16914338 - 16914234
Alignment:
Q  280 gagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaa-tttcttgtaa--catttgtatctctttgt-aagaactcattg 375  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| | |||||||| | |||  |||||||||||| |||||| |||  | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16914338 gagattgggaaa-tgggtaaaaattatgtttgttcttggagagcctgttgaagctaagtttcttctaacccttttgtatctctttgtaaagaactcattg 16914240  T
Q  376 atagtg 381  Q
    ||||||    
T  16914239 atagtg 16914234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 390
Target Start/End: Original strand, 32471478 - 32471578
Alignment:
Q  292 atgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaag-aactcattgatagtggattgga 388  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||  | ||||||| |||||| ||| |||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  32471478 atgggtataaattaggtttgttctttgagaact-gttgaagttaatttattgcaactcttttgtatctctttgtaagaaactcattgatagtggattcga 32471576  T
Q  389 ga 390  Q
    ||    
T  32471577 ga 32471578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 397 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 3281756 - 3281707
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaataaccttt 446  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  3281756 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaataatcttt 3281707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 12302551 - 12302510
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  12302551 tctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 12302510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 469 - 505
Target Start/End: Original strand, 193813 - 193849
Alignment:
Q  469 tttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttg 505  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  193813 tttatcttgtttattccttggttggattgtggttttg 193849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 346
Target Start/End: Original strand, 918431 - 918487
Alignment:
Q  289 aaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa 346  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  918431 aaaatgggtagaaattatggtttgttctttgtgagtttgt--aagataatttcttgtaa 918487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 154 - 196
Target Start/End: Original strand, 6068471 - 6068512
Alignment:
Q  154 aaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttc 196  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  6068471 aaagagaagatccttag-gaaatcaaaggctaagagttggttc 6068512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 172 - 230
Target Start/End: Original strand, 41053193 - 41053250
Alignment:
Q  172 gaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgaggttagattctagagttgggaaacaa 230  Q
    |||||||||||| || ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  41053193 gaaatcaaaggccaatggttggttc-cttttagggttagattctagagttgggatacaa 41053250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 397 - 459
Target Start/End: Original strand, 47703985 - 47704046
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgtcttttc 459  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| || | ||||||||| |||||    
T  47703985 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc-ttggtgtgttttttc 47704046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 2510371 - 2510330
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  2510371 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 2510330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 6823249 - 6823290
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  6823249 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 6823290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 10399874 - 10399833
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  10399874 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 10399833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 13358808 - 13358849
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  13358808 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 13358849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 13598446 - 13598405
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  13598446 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 13598405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 15294880 - 15294839
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  15294880 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 15294839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 17324682 - 17324641
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  17324682 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 17324641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 26644946 - 26644987
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  26644946 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 26644987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 27336986 - 27336945
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27336986 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 27336945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 28207114 - 28207073
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  28207114 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 28207073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 28840914 - 28840955
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  28840914 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 28840955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 28998299 - 28998258
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  28998299 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 28998258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 29004015 - 29003974
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  29004015 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 29003974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 29651859 - 29651818
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  29651859 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 29651818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 31735567 - 31735526
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  31735567 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 31735526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 37069818 - 37069777
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  37069818 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 37069777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 39462754 - 39462795
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  39462754 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 39462795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 50307592 - 50307551
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  50307592 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 50307551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 51750274 - 51750315
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  51750274 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 51750315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 51752598 - 51752639
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  51752598 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 51752639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 453 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 12318506 - 12318454
Alignment:
Q  453 tcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttg 505  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||    
T  12318506 tcttttctttactccctttatcttgtttattctttggttcaattatgattttg 12318454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 358; Significance: 0; HSPs: 94)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 516
Target Start/End: Original strand, 40147003 - 40147508
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40147003 agatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaatggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagt 40147102  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattcta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  40147103 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattcta 40147202  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40147203 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtggaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 40147302  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  40147303 cgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 40147402  T
Q  415 tcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg----tgtcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatatg 510  Q
    |||||||| |||||||||||| || |   ||| |||    | ||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  40147403 tcaagttggaccgaactgggtgaacatttttttgtgtttttatcttttctttactctatttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgttatg 40147502  T
Q  511 cacttg 516  Q
    ||||||    
T  40147503 cacttg 40147508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 577
Target Start/End: Original strand, 27015274 - 27015831
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27015274 agatgtgaatcttgaagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggaagaatcatggggttgggaaacacatgagtggagagt 27015373  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattcta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  27015374 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtaaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattcta 27015473  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27015474 gagttgggaaacaattgtaaacatcttgggagagtgaaaatcatgagtgt-ttggtcattggtgagattgggaaaataggtagaaattagggttgttctt 27015572  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtc 416  Q
    |||||  ||||||||||||||  |      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||| | ||||||    
T  27015573 tgtgaacttgttgaagctaatacc------catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattgtacagatcaatctctcctccaaaataggtc 27015666  T
Q  417 aagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtg---tcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatatgcac 513  Q
    |||||| |||||||||||| || |   |||||||||   | ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27015667 aagttggaccgaactgggtgaacattttttggtgtgttattttttctttactctctttatcttgtttatgctttggttgaattgtggttttgatatgcac 27015766  T
Q  514 ttggtttctagactagg--tctatattgatgttgttgcttgtgatttactttagttgttggttgcc 577  Q
    || | || |||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  27015767 tt-gattatagactaggtatatatattgttgttgttgcttgtgatttactttggttgttgattgcc 27015831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 554
Target Start/End: Original strand, 213210 - 213754
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttga-agaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagag 116  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  213210 agatgtgaatcttgggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagag 213309  T
Q  117 tcttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgagg-ttagattct 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| || |||||||||    
T  213310 tcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggtt----ctcttttgggggttagattct 213405  T
Q  216 agagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttct 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  213406 agagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttct 213505  T
Q  316 ttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattag 413  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||    
T  213506 ttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccatagtag 213605  T
Q  414 gtcaag-ttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg----tgtcttttcttta--ttctctttatcttgtttattccttg-gttgaattgtggttttg 505  Q
    |||||| ||| |||||||||||| || |    ||||||    | ||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||    
T  213606 gtcaagtttggaccgaactgggtgaacatttcttggtgttgttatctttcctttactctctctttatcttgtttattccttgcttttgattgtggttttg 213705  T
Q  506 atatgcacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtg 554  Q
     ||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  213706 ctatgcacttagttaatagactaggtctatattgttgttattgcttgtg 213754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 18 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 27638041 - 27637486
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27638041 agatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgggaaaagggttggtgcattttgggaa-gattcatggggttaggaaacacatgagtgaagagt 27637943  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagaga--agatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgagg-ttagattc 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| || |||||| |    
T  27637942 cttttatgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagagaagatccttagtgaaatcaaagactaaaagtttgttctcttttgggggttagatgc 27637843  T
Q  215 tagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaat-catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgtt 313  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27637842 tagagttgggaaacaattgtgaacaccttggaagagtgaaaattcatgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgtt 27637743  T
Q  314 ctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac---atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagat 410  Q
    |||| |||| ||||| || |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||     
T  27637742 ctttatgagcttgtttaaactaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcatt-atagtggattggagagatcaatctctcctgcagag 27637644  T
Q  411 taggtca-agttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg----tgtcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttg 505  Q
    |||||||  |||| |||||||||||| ||||    ||||||    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  27637643 taggtcattgttggaccgaactgggtgaatatttcttggtgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttattccttagttggattgtggttttg 27637544  T
Q  506 atatgcacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtgatttacttt 563  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27637543 ctatgcacttggtttatagactaggtctatattgttgttgttgcttgtgatttacttt 27637486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 18 - 441
Target Start/End: Original strand, 38746747 - 38747173
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  38746747 agatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttaagaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacgtgagtggagagt 38746846  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattcta 216  Q
    | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  38746847 catttgcgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttattgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattcta 38746946  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38746947 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtatcttgttcattaatgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 38747046  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||    
T  38747047 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttggaaaaactcattgatagaggattggagagatcaatctctccctcagatcagg 38747146  T
Q  415 tcaagttgaaccgaactgggtcaataa 441  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  38747147 tcaagttggaccaaactgggtcaataa 38747173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 18 - 435
Target Start/End: Original strand, 28278057 - 28278478
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtggggg-ctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagag 116  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28278057 agatgtgaatcttggagaaccaaaagaggggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagag 28278156  T
Q  117 tcttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattct 215  Q
     || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  28278157 actattgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaatcaaaagagaagattgttagtgaaatcaaatgctaagggttggctctcttttaggggttagattct 28278256  T
Q  216 agagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttct 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28278257 agagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggttgttct 28278356  T
Q  316 ttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattag 413  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  28278357 ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaaaaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtag 28278456  T
Q  414 gtcaagttgaaccgaactgggt 435  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  28278457 gtcaagttggaccgaactgggt 28278478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 18 - 586
Target Start/End: Original strand, 5057790 - 5058367
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| |||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  5057790 agatgtgaatctttgagaaccaaaagagggg-cttttgggaaaaaggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagt 5057888  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattcta 216  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  5057889 catttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtaaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattcta 5057988  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  5057989 gagttggaaaacaattgtaaacaccttggaagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttc-- 5058086  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgta--acatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||    
T  5058087 tgtgagcttgttgaagctattttcttgtatcccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtagg 5058186  T
Q  415 tcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg----tgtcttttctttattctctttatcttgtttattccttg-gttgaattgtggttttgatat 509  Q
    |||||||| |||||||||||| || |    ||||||    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||  |||    
T  5058187 tcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttggtgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattatggttttactat 5058286  T
Q  510 gcacttggtttctagactaggtc--tatattgatgttgttgcttgtgatttac---tttagttgttggttgcctttgctact 586  Q
    |||||| | || |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| || ||   ||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  5058287 gcactt-gattatagactaggtctatatattgttgttgttgcttgtggttaacatttttggttgttggttgccattgatact 5058367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 230 - 451
Target Start/End: Original strand, 13488157 - 13488381
Alignment:
Q  230 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgtt 328  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  13488157 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaattattgagtgtcttgttcattggtaagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 13488256  T
Q  329 gaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaacc 426  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  13488257 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccgagattaggtcaagttggacc 13488356  T
Q  427 gaactgggtcaataacctttggtgt 451  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||    
T  13488357 gaactgggtcaataatcttttgtgt 13488381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 219 - 451
Target Start/End: Original strand, 533713 - 533947
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  533713 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgcgtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttggtcttt 533811  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  533812 gtgagcttgttgaagctaattttttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggaaagatcaatctctcccccatattaggt 533911  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgt 451  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||    
T  533912 caagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgt 533947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 230 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 42428644 - 42428418
Alignment:
Q  230 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgtt 328  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||    
T  42428644 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggtttttctttgtgaacttgtt 42428545  T
Q  329 gaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaacc 426  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  42428544 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaagttggacc 42428445  T
Q  427 gaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||    
T  42428444 gaactgggtcaacaatctttagtgtgt 42428418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 28750879 - 28750643
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28750879 gttgggaaaca-ttgaaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 28750781  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
     |||  ||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28750780 atgaaattgttgaagttaatttcctgtaacccatttgtatctttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggt 28750681  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  28750680 caagttggaccgaattgggtcaataatctttggtgtgt 28750643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 230 - 453
Target Start/End: Original strand, 32636778 - 32637004
Alignment:
Q  230 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgtt 328  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||     
T  32636778 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttattcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggttgttctttgtgaacttgtc 32636877  T
Q  329 gaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaacc 426  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32636878 aaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggacc 32636977  T
Q  427 gaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||||||||||| || |||||||||||    
T  32636978 gaactgggtcaacaatctttggtgtgt 32637004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 220 - 453
Target Start/End: Original strand, 537970 - 538205
Alignment:
Q  220 ttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttg 318  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  537970 ttgggaaaca-tcgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgcgtgtcttgttcattagtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggttgctctttg 538068  T
Q  319 tgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtc 416  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  538069 tgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtagattggagagatcaatctctcccccatattaggtc 538168  T
Q  417 aagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||||| |||||||||| |||| || |||||||||||    
T  538169 aagttggaccgaactggatcaacaatctttggtgtgt 538205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 220 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 42426458 - 42426223
Alignment:
Q  220 ttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttg 318  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42426458 ttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaattattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttg 42426360  T
Q  319 tgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtc 416  Q
    |||  |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  42426359 tgaaattgttgaagctaatttcttgcaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccctgattaggtc 42426260  T
Q  417 aagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||||| || ||||| |||||| || |||| ||||||    
T  42426259 aagttggactgaactaggtcaacaatcttttgtgtgt 42426223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 39468773 - 39468537
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39468773 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattagtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 39468675  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  39468674 gtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggt 39468575  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
     || ||| || |||||||||||| || |||| ||||||    
T  39468574 taaattggactgaactgggtcaacaatctttagtgtgt 39468537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 230 - 451
Target Start/End: Original strand, 33831634 - 33831858
Alignment:
Q  230 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgtt 328  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  33831634 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttattcatttgtgagattggaaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtt 33831733  T
Q  329 gaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaacc 426  Q
     ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||     
T  33831734 taagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattgaagagatcaatctctcccccatattaggtcaagttggact 33831833  T
Q  427 gaactgggtcaataacctttggtgt 451  Q
    |||||||||||| || |||||||||    
T  33831834 gaactgggtcaacaatctttggtgt 33831858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Original strand, 31182917 - 31183151
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31182917 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttaggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgg-aaaatgggtagaaattaggattgttcttt 31183014  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac-atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtc 416  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  31183015 gtgagtttgtttaagttaatttcttgtaaccatttgtatccctttgtaagaactcattgatactggattggagagatctatctctcccccatattaggtc 31183114  T
Q  417 aagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  31183115 aagttggaccgaactgggtcaacattctttggtgtgt 31183151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 121 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 16641263 - 16640821
Alignment:
Q  121 ttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgagg-ttagattctagag 219  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  16641263 ttgtgaacaactttggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatacttaaa-aaatcaaaggctaaaggttggttctcttttggggattagattctagag 16641165  T
Q  220 ttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatg--ggtagaaattagggtt-gttct 315  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| | |||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||    |||||||||||| ||| |||||    
T  16641164 ttggggaacatttgtaaacaccttgagtgagtgaaattcattaagtgtcttgttcattggcgagattgagaaaaaaatggtagaaattagtgtttgttct 16641065  T
Q  316 ttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattag 413  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||  ||||   ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  16641064 ttgtgagcttgttgaagctgatttctgataactcttttgtatctctttgtaagaact---tgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtag 16640968  T
Q  414 gtcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg----tgtcttttctttattctc--tttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgat 507  Q
    ||||||| |  ||||||||||| || |    ||||||    | ||||||||||  ||||  ||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||| |    
T  16640967 gtcaagtagggccgaactgggtaaacatttcttggtgttgttatcttttctttgctctctatttatcttgcttattctttagttaaattgtggttttgtt 16640868  T
Q  508 atgcacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtg 554  Q
    ||||| ||| |||||||| ||  |||| |||  ||||||||||||||    
T  16640867 atgcatttgatttctagattaaatctagatttttgttgttgcttgtg 16640821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 230 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 8566160 - 8565949
Alignment:
Q  230 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgtt 328  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  8566160 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgagaaaatgggtagaacttaggtttgttctttgtgagcttgtt 8566061  T
Q  329 gaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaacc 426  Q
     ||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  8566060 taagctaatttcttgtaacccatttgtatccctctgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcacccagattaggtcaagttggacc 8565961  T
Q  427 gaactgggtcaa 438  Q
    ||||| ||||||    
T  8565960 gaactaggtcaa 8565949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Original strand, 25412706 - 25412941
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25412706 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggttgttcttt 25412802  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||  ||||  ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  25412803 gtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 25412902  T
Q  416 caag-ttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||| ||| || ||||||||| || || |||||||||||    
T  25412903 caagtttggactgaactgggtgaacaatctttggtgtgt 25412941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 230 - 435
Target Start/End: Original strand, 16452035 - 16452242
Alignment:
Q  230 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgtt 328  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||    
T  16452035 attgtaaacaccttggta-agtgacaatcattgagtgtcttgttcattgatgagattggaaaaatgggtagaaattaagtttgttctttctgagcttgtt 16452133  T
Q  329 gaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaacc 426  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  16452134 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattcatagtggattggagagataaatctctcccccagagtaggtcaagttggacc 16452233  T
Q  427 gaactgggt 435  Q
    |||||||||    
T  16452234 gaactgggt 16452242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Original strand, 13239696 - 13239932
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  13239696 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaaatggtagaaattagggtttttcttt 13239793  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  13239794 gtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 13239893  T
Q  416 c-aagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    | || ||| |||||||||||| || ||  ||||||||||    
T  13239894 caaatttggaccgaactgggtgaacaatttttggtgtgt 13239932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 230 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 30683134 - 30682911
Alignment:
Q  230 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgtt 328  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||  |||||    
T  30683134 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt---ctttgtgaacttgtt 30683039  T
Q  329 gaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaagaa--ctcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaa 424  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30683038 gaagctaatttcttgtaacccttttgtatttctttgtaagaatactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttgga 30682939  T
Q  425 ccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||||    
T  30682938 ccgaact-ggtcaacaatctttggtgtgt 30682911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 525
Target Start/End: Original strand, 316508 - 317020
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggat-gattcatggggttgggaaacacatgagtgaagag 116  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||| |    ||||    
T  316508 agatgtgaatcttggagaaccaaaagggggggctcttgggaga-gggttggtgccttttggggagagattcataaggttgggaaacacatcaaaagagag 316606  T
Q  117 tcttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattct 215  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||  || |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |    
T  316607 tcttt-gtgagcaacttgg-tgaatcttgggagaccaaaagagaaaatcct-ag-gaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagatttt 316702  T
Q  216 agagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgtt 313  Q
    | |||||| |||||||||  || | || ||| ||||| |||||| || || ||||||| |  ||   |||||| |||||  ||||||||||||| |||||    
T  316703 aaagttggaaaacaattgggaaaaactcgggtgagtg-aaatcattgggtctcttgtttaggggaaaagattgagaaaa-aggtagaaattaggtttgtt 316800  T
Q  314 ctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagat 410  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||| |||     
T  316801 cttggagagcttgttgaagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttgtaaagaactcattgataatggatcggagggatcaatctctcccctagag 316900  T
Q  411 taggtca-agttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg----tgtcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttg 505  Q
    |||||||  |||| |||||||| ||| || ||   || |||    | |||||||  || ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  316901 taggtcattgttggaccgaacttggtaaacaattctttgtgttgttctcttttccctactctctttattttgtttattctttggttcaattgtggttttg 317000  T
Q  506 atatgcacttggtttctaga 525  Q
     | | ||||||||| |||||    
T  317001 ctttacacttggttgctaga 317020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Original strand, 13343005 - 13343241
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat-gggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  13343005 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctt 13343102  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||    
T  13343103 tgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtagg 13343201  T
Q  415 tcaag-ttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||| | ||| |||||||||||| || || ||||| |||||    
T  13343202 tcatgtttggaccgaactgggtgaacaatctttgatgtgt 13343241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Original strand, 19806328 - 19806543
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19806328 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaa-tcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaatta-ggttgttcttt 19806424  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtca 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||                 |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19806425 gtgagtttgttgaagctaatttcttctaa-----------------aagaactccttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtca 19806507  T
Q  418 agttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  19806508 agttggaccgaactgggtcaacaatctttggggtgt 19806543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Original strand, 30182533 - 30182769
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  30182533 gttgggaaaca-ttgcaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggttgttcttt 30182630  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||  ||||  |||||||||||||||||  | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||    
T  30182631 gtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttctatctctttggaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtatgt 30182730  T
Q  416 caag-ttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||| ||| |||||||||| | || || |||||||||||    
T  30182731 caagtttggaccgaactggatgaacaatctttggtgtgt 30182769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 219 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 3075882 - 3075664
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  3075882 gttgggaaaca-ttgtaaacacctttgatgagtgaaaatcattgagtgtctcgttcatttgtgagattgagaaaataggtagaaattaggtttgttcttt 3075784  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||| || | |||||    
T  3075783 gtgagcttgctgaatctaatttcttgtaacccatttgtatctttttgtaagaattcgttgatagtgaattggagagatcaatctctccctcatagtaggt 3075684  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggt 435  Q
    ||||||| ||| || |||||    
T  3075683 caagttggaccaaattgggt 3075664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 36074268 - 36074030
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat---gggtagaaattagggttgttc 314  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||    
T  36074268 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaaagggtagaaattagggttgttc 36074171  T
Q  315 tttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagatta 412  Q
    |||| ||  ||||  ||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| | ||    
T  36074170 tttgcgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccaaagta 36074072  T
Q  413 ggtcaag-ttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||| ||| |||||||||| | || || |||||||||||    
T  36074071 ggtcaagtttggaccgaactggatgaacaatctttggtgtgt 36074030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Original strand, 37439078 - 37439322
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaa--------aatgggtagaaattagggt 309  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||        ||  |||||||||||||||    
T  37439078 gttgggaaaca-ttgtaaacactttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttattcattggtgagattgggaaggaaaaataaaaggtagaaattagggt 37439175  T
Q  310 tgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctccccca 407  Q
    ||||||||||||  ||||  ||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  37439176 tgttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctcca 37439275  T
Q  408 gattaggtcaag-ttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    || ||||||||| ||| |||||||||||| || || |||||||||||    
T  37439276 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgt 37439322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 220 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 9049565 - 9049354
Alignment:
Q  220 ttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttg 318  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||  |||||||||| |||  | ||||    
T  9049565 ttgggaaacatttgtaaacactttgggtgagtaaaaatcactgagtgtcttgttgattagtgagtttgggaaaatga-tagaaattagtgtttgtttttg 9049467  T
Q  319 tgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtc 416  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||     
T  9049466 tgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccattttgtatctctttgtaagaactcattgacagtggattggagagatcaatatctcccccaaagtaggtg 9049367  T
Q  417 aagttgaaccgaa 429  Q
    |||||| ||||||    
T  9049366 aagttggaccgaa 9049354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 381
Target Start/End: Original strand, 35615914 - 35616278
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggat-gattcatggggttgggaaacacatgagtgaagag 116  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||| |||| |||| | |||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| |  ||||||    
T  35615914 agatgtgaatcttggagaaccaaaagaggggactcttgggaaaggggt-gatgccttttggggagagattcatggagttgagaaacacataaaagaagag 35616012  T
Q  117 tcttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgaggttagattcta 216  Q
    ||||| || | |||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||| | |  |||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  35616013 tcttt-gtaatcaactttggtgagtcttgggaaaccaaaagcgaagatcatcaa-gaaatcaaaggcta-gagttgattctcttttgtggttagattcta 35616109  T
Q  217 gagttgggaaacaatt-gtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgtt 313  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||  ||  ||||||| | ||||| |||||||||||| |||||    
T  35616110 gagtttggaaacaattaggaaacaccttgggtgagtg-aaatcattgagtctcttgttcacgggaagagattgag-aaatgagtagaaattaggtttgtt 35616207  T
Q  314 ctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtg 381  Q
    ||| | ||| | ||| ||| |||||||||||||  | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  35616208 cttggagagctcgtttaagttaatttcttgtaacccttttgtatttctttgtaaagaactcattgatagtg 35616278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 33906452 - 33906035
Alignment:
Q  20 atgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggat-gattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagtc 118  Q
    |||||||||||| |||| |||||  ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |  | |||| |    
T  33906452 atgtgaatcttgtagaaccaaaaaagggggctcttgggaga-gggttggtgccttttggggagagattcatggggttgagaaacacatcaaaggagagac 33906354  T
Q  119 ttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgaggt--tagattcta 216  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||   ||||||| ||   || ||||||    
T  33906353 tta-gtgagcaacttgggtgagtcttgggaaaccaaaagagaagatccttag-gaaatcaaaggctaatgactggcgttcttttggggggatatattcta 33906256  T
Q  217 gagttgggaaacaattgt-aaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggt-gagattgggaaaatgggtagaaattagggttgtt 313  Q
    |||||| ||||||| ||  |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    ||| ||  || |||| |||| |||||| |||||||| | ||     
T  33906255 gagttgtgaaacaaatgagaaacaccttgcgagagtgaacatcattgagtgtct----catgggaagaaattgtgaaa-tgggtataaattaggttagtg 33906161  T
Q  314 ctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagat 410  Q
    ||| | ||| |||| |||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||| |||     
T  33906160 cttggagagcttgtcgaagctaacttcttgtaatccttttgtatctctttgtaaagaactcattgatagtagattggaaagatcaatctcttccctagag 33906061  T
Q  411 taggtcaa-gttgaaccgaactgggt 435  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||    
T  33906060 taggtcaatgttggaccgagctgggt 33906035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 230 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 42310149 - 42309969
Alignment:
Q  230 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgtt 328  Q
    ||||||||||  |||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| | | ||| |||||||||| |||||    
T  42310149 attgtaaacattttgggtaagtgaaaatcattgagtgtcttgctcattggtgagattgagaaattgggtagaaatcaagtttgatctttgtgagcttgtt 42310050  T
Q  329 gaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctccccca 407  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  42310049 gaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaacttattgatagtggattagcgagatcaatctctccccca 42309969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 22 - 334
Target Start/End: Original strand, 4160380 - 4160690
Alignment:
Q  22 gtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggat-gattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagtctt 120  Q
    ||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || | ||||  ||| ||||||||||  ||||||| |||||||||| ||| | |||| |||||| |    
T  4160380 gtgaatcctggagaactaaaagagggggctcttgggaga-gggtaagtgtcttttggggagagattcatagggttgggaa-cacgtaagtggagagtcat 4160477  T
Q  121 ttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattctagag 219  Q
    |||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  4160478 ttgtgagcaactagggtgaatcttgggaaaccaaaagagaagatccttag-gtaattaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattc-agag 4160575  T
Q  220 ttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcat-tggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttg 318  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||   |||| ||| ||| ||||  |  |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |    
T  4160576 ttgagaaacaattgtaaacacattggttgagtgaaatcaatgaatgttttgctcatgagaggagatttggaaaat-ggtagaaattaggtttgttcttgg 4160674  T
Q  319 tgagtttgttgaagct 334  Q
     ||  |||||||||||    
T  4160675 agaacttgttgaagct 4160690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 219 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 5887640 - 5887487
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  5887640 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgaatgtcttgttcatttgtgagattgagaaaatggatagaaattagatttgttcttt 5887542  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaact 370  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||    
T  5887541 gtgagcttgtttaagctaatttcttgcaacccatttgtatcactttgtaagaact 5887487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 16409475 - 16409638
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctcttt-gtaagaactc 371  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||    
T  16409475 ttggtgagattggaaaaa-gggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactc 16409573  T
Q  372 attgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  16409574 attgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 16409638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 225 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 13695910 - 13695700
Alignment:
Q  225 aaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgag 322  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||| ||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  13695910 aaacatttgtaaacaccttgtgtgagtgaaaatcattgagtatctttttctttggagagattgggaaaa-gggtacaaattagggtttgttctttgtgag 13695812  T
Q  323 tttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag 419  Q
     ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| || | ||||||| ||| | ||||||||     
T  13695811 cttgttaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaaagaactcattaatagtggattagagagattattctctcctccatagtaggtcaac 13695712  T
Q  420 ttgaaccgaact 431  Q
    ||| ||| ||||    
T  13695711 ttggaccaaact 13695700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 26177883 - 26178045
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctcttt-gtaagaactc 371  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||    
T  26177883 ttggtgagattggaaaa--gggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactc 26177980  T
Q  372 attgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  26177981 attgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 26178045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 9789392 - 9789229
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctcttt-gtaagaactc 371  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||  ||||  || |||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||    
T  9789392 ttggtgagattggaaaaa-gggtagaaattaaggttgttccttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactc 9789294  T
Q  372 attgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  9789293 attgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 9789229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 18441816 - 18441653
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctcttt-gtaagaactc 371  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||  || |||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||    
T  18441816 ttggtgagattggaaaaa-gggtagaaattagggttgttccttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactc 18441718  T
Q  372 attgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  18441717 attgatagtggattggagagttcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 18441653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14689833 - 14689622
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || |  |||||||||||| |  | |||||    
T  14689833 agatgtgaattttggagaaccaaaagaaggggttcttgtgaaa-gggttggtgccttttggaga-gattcgtgagaatgggaaacacataaaaggagagt 14689736  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgaggttagattctag 217  Q
     ||| ||||||||||| | | ||||||  || ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  14689735 attt-gtgagcaacttagataagtcttgggacaccaaaagaaaagatccttaga-aaatcaaaggctaggggttggttctcttttggggatagattctag 14689638  T
Q  218 agttgggaaacaattg 233  Q
    ||||| ||||||||||    
T  14689637 agttgtgaaacaattg 14689622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 290 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 10054969 - 10054850
Alignment:
Q  290 aaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacattt-gtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattgg 387  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  10054969 aaatgggtagaaattatgtttgttcttgaagagtttgttgaagctaatttcttataaccttttgtatctctttgtaatgaactcattgatagtgtattgg 10054870  T
Q  388 agatatcaatctctccccca 407  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  10054869 agatatcaatatctccccca 10054850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 29751328 - 29751165
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacattt-gtatctcttt-gtaagaactc 371  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||  || ||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||    
T  29751328 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc 29751230  T
Q  372 attgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
     ||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  29751229 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 29751165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21206076 - 21205873
Alignment:
Q  20 atgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggat-gattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagtc 118  Q
    |||||||||||  |||| ||||||  |||| |||| || |||||||||||| |||||  |||  | ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  21206076 atgtgaatcttagagaaccaaaagatggggttctt-tggaaagggttggtgtctttttcggagaggttcatagggttgggaaacacatgagtgaggagtc 21205978  T
Q  119 ttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttga-ggttagattctag 217  Q
     ||||| || || |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  21205977 atttgtcagaaatttgggtgaattttaggaaactaaaagtgaagaacctta-tgaaatcaaagactaaggattggttctcttttgagggttagattatgg 21205879  T
Q  218 agttgg 223  Q
    ||||||    
T  21205878 agttgg 21205873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 22536457 - 22536295
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacattt-gtatctcttt-gtaagaactc 371  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||  |||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||    
T  22536457 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc 22536360  T
Q  372 attgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
     ||||||||||||||| ||   |||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  22536359 tttgatagtggattggggagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 22536295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 26170774 - 26170925
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacatttgtatctctttgtaagaactcatt 374  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||  ||||  || |||||||||||||||       ||| ||||||||||||||||    
T  26170774 ttggtgagattggaaaa--gggtagaaattaggattgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaac-------tct-tttgtaagaactcatt 26170863  T
Q  375 gatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  26170864 gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 26170925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 29720364 - 29720527
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacattt-gtatctcttt-gtaagaactc 371  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||  || ||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||    
T  29720364 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc 29720462  T
Q  372 attgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
     ||||||||||||||||||   |||||||||| | ||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  29720463 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 29720527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 29722524 - 29722687
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacattt-gtatctcttt-gtaagaactc 371  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||  || ||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||    
T  29722524 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc 29722622  T
Q  372 attgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtc-aagttgaaccgaactgggt 435  Q
     ||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||| || ||| ||||||||||||    
T  29722623 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaaatttggaccgaactgggt 29722687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 10593258 - 10593421
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacattt-gtatctcttt-gtaagaactc 371  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| | ||||  ||||  |||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||    
T  10593258 ttggtgagattgggagaa-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc 10593355  T
Q  372 att-gatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    ||| ||||||||||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  10593356 atttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 10593421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 347 - 435
Target Start/End: Original strand, 42926965 - 42927053
Alignment:
Q  347 catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggt 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||| | || | |||||||||||| ||||||||||||    
T  42926965 catttgtatctctttgtaagaactcattgacagtggattgaagaaataaatctctctctcatagtaggtcaagttggaccgaactgggt 42927053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 288 - 390
Target Start/End: Original strand, 22097877 - 22097980
Alignment:
Q  288 gaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattg 386  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||| ||||  |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||     
T  22097877 gaaaaagggtagaaattagggttgttcttggagaatttgttgaagttaatttcttataacccttgtatctatttgtaaaaaactcattgatagtggatta 22097976  T
Q  387 gaga 390  Q
    ||||    
T  22097977 gaga 22097980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 220 - 290
Target Start/End: Original strand, 42926838 - 42926908
Alignment:
Q  220 ttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattggtgagattgggaa 290  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42926838 ttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttctttggtgagattgggaa 42926908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 25078120 - 25078284
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacat-ttgtatctcttt-gtaa-gaact 370  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||  ||||  |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||| |||||    
T  25078120 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaact 25078217  T
Q  371 catt-gatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    |||| ||||||||||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  25078218 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 25078284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 25136089 - 25136253
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacat-ttgtatctcttt-gtaa-gaact 370  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||  ||||  |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||| |||||    
T  25136089 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaact 25136186  T
Q  371 catt-gatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    |||| ||||||||||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  25136187 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 25136253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 487 - 560
Target Start/End: Original strand, 40751195 - 40751268
Alignment:
Q  487 tggttgaattgtggttttgatatgcacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtgatttac 560  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  40751195 tggttaaattgtggttttgctatgcacttggtttatagattaggtctatattgttgttattgcttgtggtttac 40751268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 10700950 - 10700674
Alignment:
Q  142 cttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgaggttagattctagagttgggaaacaatt-gtaaacac 240  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||    ||| | || ||||||||| |  |||||||||||| | ||||||    
T  10700950 cttaggaaaccaaacgtgaagatcctcag-gaaataaaaggctaaggtttggtgacttttgggggctagattctaaaaatgggaaacaattaggaaacac 10700852  T
Q  241 cttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtg-agattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatt 338  Q
    |||||| | ||||||||||| |||| | ||||||||      ||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||| |    
T  10700851 cttgggtgcgtgaaaatcattgagtattttgttcatgaaaatagattggaaaaaagg-tagaaattaggtttgttcttagagagcttgttgaagctaa-t 10700754  T
Q  339 tcttgtaaca--tttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtca 417  Q
    |||| |||||  |||||||||||||   |||||||||||||||||| | |||||| |||  ||||||||||| | |||||||    
T  10700753 tcttataacatttttgtatctctttaaaaagaactcattgatagtgaagtggagagatc--tctctcccccatagtaggtca 10700674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 16642298 - 16642211
Alignment:
Q  22 gtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggat-gattcatggggttgggaaacacatgagtg 111  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16642298 gtgaatcttgaagaaccaaaagaggg--ctcttgggaaa-gggttggtgccttttggggacagattcatggggttaggaaacacatgagtg 16642211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 402
Target Start/End: Original strand, 3325933 - 3326043
Alignment:
Q  295 ggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa-catt-tgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagat 391  Q
    ||||||||||||  ||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||     
T  3325933 ggtagaaattagttttgttcttgaagagcttgttgaagctaatttcttgtaaccattgtgtatctctttgtaaagaactcaatgatggtggattagagag 3326032  T
Q  392 atcaatctctc 402  Q
    |||||| ||||    
T  3326033 atcaatatctc 3326043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 40380090 - 40380254
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacat-ttgtatctcttt-gtaa-gaact 370  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||  ||||  || ||||||||||||||| | ||||||| |||| |||| |||||    
T  40380090 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaaa-ctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaact 40380187  T
Q  371 catt-gatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||| |||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  40380188 catttgatagtggattggagagttcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 40380254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 40382301 - 40382465
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacat-ttgtatctcttt-gtaa-gaact 370  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||| | ||||  ||||  |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||| |||||    
T  40382301 ttggtgagattgggaaag-gggtagaagttagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaact 40382398  T
Q  371 catt-gatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||| |||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  40382399 catttgatagtggattggagagttcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 40382465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 319 - 374
Target Start/End: Original strand, 42926911 - 42926968
Alignment:
Q  319 tgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcatt 374  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  42926911 tgagattgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcatt 42926968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 10055132 - 10055040
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggat-gattcatggggttgggaaacacatgagt 110  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||| |||| || |||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  10055132 agatgtgaatcttggagaaccaaaagagagggctcttgggaaa-ggtttggtgccttatggggagagattcacggggttgggaaacacatgagt 10055040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 396 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 5887479 - 5887422
Alignment:
Q  396 atctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| || |||||||||||    
T  5887479 atctctcccccagattaggtcaagttggaccgaattggatcaacaatctttggtgtgt 5887422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 289 - 378
Target Start/End: Original strand, 30802843 - 30802934
Alignment:
Q  289 aaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgt-aagaactcattgata 378  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||  | ||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  30802843 aaaatgggtagaa-ttaggtttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttattgtaatccttttgtatctatttgtaaagaactcgttgata 30802934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 487 - 560
Target Start/End: Original strand, 40763200 - 40763273
Alignment:
Q  487 tggttgaattgtggttttgatatgcacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtgatttac 560  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||| || |||||    
T  40763200 tggttaaattatggttttgctatgcacttggtttatagattaggtctatattgttgttattgcttatggtttac 40763273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 152 - 246
Target Start/End: Original strand, 8019464 - 8019557
Alignment:
Q  152 caaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgaggttagattctagagttgggaaacaatt-gtaaacaccttggg 246  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | ||| | |||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  8019464 caaaagtgaagatccttaga-aaatcaaaggctaagg-ttggttatttttgggggttagattctatagttgggaaataattaggaaacaccttggg 8019557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 330 - 435
Target Start/End: Original strand, 16546684 - 16546794
Alignment:
Q  330 aagctaatttcttgtaacat-ttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaa 424  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||| |||||| ||||| ||||||||| ||| |    
T  16546684 aagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttgga 16546783  T
Q  425 ccgaactgggt 435  Q
    |||||||||||    
T  16546784 ccgaactgggt 16546794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 27910685 - 27910726
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27910685 tctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 27910726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 117
Target Start/End: Original strand, 30802698 - 30802782
Alignment:
Q  33 agaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggat-gattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||| |||||| || |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  30802698 agaaccaaaagaggaggctcttgggaaa-gggtttgtgccttttggggagagattcatggggttagaaaacacatgagtggagagt 30802782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 316 - 404
Target Start/End: Original strand, 8445756 - 8445847
Alignment:
Q  316 ttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctccc 404  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||| | ||||||| ||||||||| |||| || | || ||||||||||    
T  8445756 ttgtaagtttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatttctttataaagaactaattgatagtagattagaaagatgaatctctccc 8445847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 397 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 10281799 - 10281743
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  10281799 tctctcccccagatcaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgt 10281743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 63 - 110
Target Start/End: Original strand, 30793025 - 30793073
Alignment:
Q  63 ggttggtgccttttggggatg-attcatggggttgggaaacacatgagt 110  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  30793025 ggttggtgccttttggggagatattcatggggttgggaaacacatgagt 30793073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 376 - 519
Target Start/End: Original strand, 4160702 - 4160850
Alignment:
Q  376 atagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtca-agttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg----tgtcttttctttattctctt 470  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||| |||||||| ||||    || |||    | |||||||| | ||||| |    
T  4160702 atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccaaactgggtaaatatttattagtgttgttatcttttctatgttctcat 4160801  T
Q  471 tatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatatgcacttggtt 519  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||| |||||||| | | |||||||||    
T  4160802 tatcttgtttattctttggttcgattatggttttgctttacacttggtt 4160850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 16544407 - 16544572
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacat-ttgtatctcttt-gtaa-gaact 370  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||   |  | ||||||||||||  |||| | ||||||| |||| |||| |||||    
T  16544407 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttctcataacctcttgtatcccttttgtaaagaact 16544505  T
Q  371 catt-gatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    |||| ||||||||||||||||   ||| |||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  16544506 catttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 16544572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 378
Target Start/End: Original strand, 32609572 - 32609641
Alignment:
Q  312 ttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgt-aagaactcattgata 378  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  32609572 ttctttgagagtttgttgaagttaatttcttgtaactcttttgtatttctttgtaaagaacttattgata 32609641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 2175153 - 2175194
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  2175153 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 2175194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 2724128 - 2724169
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  2724128 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 2724169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 9353381 - 9353422
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  9353381 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 9353422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 10529143 - 10529102
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  10529143 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 10529102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 17004009 - 17004050
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  17004009 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 17004050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 18466919 - 18466960
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  18466919 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 18466960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 21684496 - 21684455
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  21684496 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 21684455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 24127091 - 24127132
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  24127091 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 24127132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 25921517 - 25921476
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  25921517 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 25921476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 26097966 - 26098007
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  26097966 tctctcctccagactaggtcaatttgaaccgaactgggtcaa 26098007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 27912771 - 27912812
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27912771 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 27912812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 34477097 - 34477056
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  34477097 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 34477056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 34479462 - 34479421
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  34479462 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 34479421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 36932399 - 36932440
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  36932399 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 36932440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 40221758 - 40221799
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  40221758 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 40221799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 6741998 - 6741941
Alignment:
Q  289 aaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac 347  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  6741998 aaaatgagtagaaattaggttttgttctttgtgagtttgc--aagctaatttcttgtaac 6741941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 398 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 20505886 - 20505846
Alignment:
Q  398 ctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  20505886 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 20505846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 334 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 35287199 - 35287139
Alignment:
Q  334 taatttcttgtaacatttgtatctctttgtaag-aactcattgatagtggattggagatat 393  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  35287199 taatttcttgtaacacttatatatctttgtaagaaactctttgatggtggattgaagatat 35287139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 353; Significance: 0; HSPs: 74)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 42288535 - 42287993
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42288535 agatgtgaatcttgaagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttgggaa-gattcatggggttgggaaacacatgagtggagagt 42288437  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgaggtt-agattcta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  42288436 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttcgggtttagattcta 42288337  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42288336 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcacgagtgtcttgtgcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggttgttctt 42288237  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  42288236 tgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatttctttgtaagagctcattgataatggattggagagatcaatctct-ccccagattagg 42288138  T
Q  415 tcaagttgaaccgaactgggtcaataacct-ttggtg----tgtcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatat 509  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||    | |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  42288137 tcaagttggaccgaactgggtcaataatttcttggtgctgttatcttttctttaccctctttaacttgtttattccttggttggattgtggtttttctat 42288038  T
Q  510 gcacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtg 554  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||| |||| |||| |||||||||    
T  42288037 gcacttgttttctagattagatctagattgttgttattgcttgtg 42287993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 559
Target Start/End: Original strand, 45726672 - 45727217
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  45726672 agatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgggaaa-gggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaacacatgagtggagagt 45726770  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgagg-ttagattcta 216  Q
    | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  45726771 catttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattcta 45726870  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45726871 gggttaggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttattcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctt 45726970  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  45726971 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 45727070  T
Q  415 tcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg----tgtcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatatg 510  Q
    |||||||| |||||||||||| || |   ||| |||    | ||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  45727071 tcaagttggaccgaactgggtgaacattttttagtgttgttatcttttctttactctctttatct--tttattctttggttggattgtggttttgctatg 45727168  T
Q  511 cacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtgattta 559  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  45727169 cacttagtttatagactaggtctatattattgttgttgcttgtggttta 45727217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 35447310 - 35446745
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttga-agaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagag 116  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35447310 agatgtgagtcttgagagaaccaaaagagggg-ctcttgtgaaaagggttggtgccttttgggaaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagag 35447212  T
Q  117 tcttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattct 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  35447211 tcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtaaaaccaaaagagaagatacttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattct 35447112  T
Q  216 agagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttct 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  35447111 agagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattggtaaaattggtagaaattagggttgttct 35447012  T
Q  316 ttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattag 413  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||    
T  35447011 ttgtgatcttgttgaatctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcactctctcctccagagtag 35446912  T
Q  414 gtcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg----tgtcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatat 509  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |    ||||||    | ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||    
T  35446911 gtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttggtgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttatgctttggttgaattgtggttttgctat 35446812  T
Q  510 gcacttggtttctagactaggtc--tatattgatgttgttgcttgtgatttactttagttgttggttg 575  Q
    |||||| | || |||||||| ||  ||||||| ||||||||  |||| |||||||| |||||||||||    
T  35446811 gcactt-gattatagactagatctatatattgttgttgttgagtgtggtttactttggttgttggttg 35446745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 1632158 - 1631611
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1632158 agatgtgaatcttggggaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgtcttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagt 1632059  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattcta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  1632058 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattcta 1631959  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1631958 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgagagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaggattgttctt 1631859  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  1631858 tgtgagcttgttgaagctaatatcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagaaatcaatctctcctccagagtagg 1631759  T
Q  415 tcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg----tgtcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatatg 510  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||    || |||    | ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||     
T  1631758 tcaagttggaccgaactgagtgaatatttcttagtgttgttatcttttccttgctctctttatcttgtttattcctt--ttggattgtggttttgctata 1631661  T
Q  511 cacttggtttctagactaggtc--tatattgatgttgttgcttgtgattta 559  Q
    |||||| || | |||||| |||  ||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  1631660 cacttgattac-agactaagtctatatattgttgttattgcttgtggttta 1631611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 18 - 560
Target Start/End: Original strand, 17450333 - 17450868
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaag-ag 116  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||| | | ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||    
T  17450333 agatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaa-gggttggtgccctttgtgaaagattcatggggatgggaaacacatgagcgaaggag 17450431  T
Q  117 tcttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgagg-ttagattct 215  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| || || ||||||    
T  17450432 tcaattgtgagaaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatcattag-gaaatcaaaggctaagggttgattctctattgggggttggattct 17450530  T
Q  216 agagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttc 314  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||    
T  17450531 agagttggcaaacatttgcaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagatttgaaaaatgggtagagattaggcttgttc 17450630  T
Q  315 tttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||        |  |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| ||||    
T  17450631 tttgtgagcttgttgaagctaattt-ttgtaac--------ccatttgt--gaactcattgatagtggattggagagatcaatctct-ccacagagtagg 17450718  T
Q  415 tcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg----tgtcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatatg 510  Q
    |||||||| |||||||| ||| || || ||||||||    | |||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||    
T  17450719 tcaagttggaccgaactaggtgaacaatctttggtgttgttatcttttctgtactctctttatcttgtttatcctttggttagattgtggttttgctatg 17450818  T
Q  511 cacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtgatttac 560  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  17450819 cacttggtttctagattaggtttagattgttgttgttgcttgtgatttac 17450868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 20 - 433
Target Start/End: Original strand, 24397801 - 24398219
Alignment:
Q  20 atgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggat-gattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagtc 118  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  24397801 atgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttagggagagactcatcgggctggtaaacacatgagtggagagtc 24397900  T
Q  119 ttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgaggttagattctaga 218  Q
     ||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||  || ||||| |||||||||||||  ||||| | ||||||||| ||||    
T  24397901 atttgtgaccaatttgggttagtcttgtgaaaccaaaagagaatatccttag-aaagtcaaa-gctaagggttggt--tctttgggggttagattataga 24397996  T
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacacc-ttgggagagtgaaaatc-atgagtgtcttgttcattggtgagattgggaa-aatgggtagaaatt-agggttgttc 314  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||    
T  24397997 gttgggaaacaattgtaaacacctttggaagagtgaaaatcaatgagtgtcttgttcattggtgagattgtgaagaaagggtagaagttaaggtttgttc 24398096  T
Q  315 tttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagatt 411  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |    
T  24398097 tttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaaagaactcattgataatggattggagagatcaatctctcccccatagt 24398196  T
Q  412 aggtca-agttgaaccgaactgg 433  Q
    ||||||  |||| ||||||||||    
T  24398197 aggtcattgttggaccgaactgg 24398219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 18 - 550
Target Start/End: Original strand, 33647911 - 33648454
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggat-gattcatggggttgggaaacacatgagtgaagag 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||| | |||||| ||||| ||||||  ||||    
T  33647911 agatgtgaatcttggagaatcaaaagaggaggctcttgggaaaagggttggtgccttttgaggagagattcacgaggttggaaaacatatgagtagagag 33648010  T
Q  117 tcttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattct 215  Q
    || ||||| ||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||  || |||||| | |||||||||||    
T  33648011 tcatttgttagctacttaggcgagtcttataaaaccaaaagagaagatccttagggaaatcaaag--caagggttaattatcttttgggggttagattct 33648108  T
Q  216 agagttgggaaacaattgt-aaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcat-tggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggg-ttg 311  Q
    |||||||||| | ||  || ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||  |  ||||||| |||||| |||| ||||||||| |||    
T  33648109 agagttgggacataaccgtaaaacatcttgggagagtgaaaataattgagtgtcttgtacatgagaggagattgagaaaat-ggtaaaaattagggtttg 33648207  T
Q  312 ttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccag 408  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  33648208 ttctttgtgagcttgttgaagctaatttcctgtaacccttttgtatttctttgtaaagaactcattgatagcggattggagagatcaatctctcctccag 33648307  T
Q  409 attaggtca-agttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg----tgtcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttt 503  Q
    | |||||||  |||| |||||||||||| || |    ||||||    |||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||    
T  33648308 agtaggtcattgttggaccgaactgggtaaacatttattggtgttgttgtcttttctctactctctttatcttgtttattctttagtttaattgtgattt 33648407  T
Q  504 tgatatgcacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgct 550  Q
    || ||||||||||| || |||| |||| ||| |||| ||||||||||    
T  33648408 tgctatgcacttggcttatagattaggcctagattgttgttgttgct 33648454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Original strand, 36773506 - 36773742
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  36773506 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggaataaattagggttgttcttt 36773604  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  36773605 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattatgt 36773704  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  36773705 caagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgt 36773742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Original strand, 29867813 - 29868049
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29867813 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 29867911  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||  ||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  29867912 gtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggt 29868011  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  29868012 caagttggaccgaactgggtcaataatctttgatgtgt 29868049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 230 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 17057583 - 17057357
Alignment:
Q  230 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgtt 328  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||    
T  17057583 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgcaagcttgtt 17057484  T
Q  329 gaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaacc 426  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  17057483 gaagctaattttttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagactaggtcaagttggacc 17057384  T
Q  427 gaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||||||||||| || |||||||||||    
T  17057383 gaactgggtcaacaatctttggtgtgt 17057357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 230 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 17085566 - 17085340
Alignment:
Q  230 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgtt 328  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||    
T  17085566 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgcaagcttgtt 17085467  T
Q  329 gaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaacc 426  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  17085466 gaagctaattttttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagactaggtcaagttggacc 17085367  T
Q  427 gaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||||||||||| || |||||||||||    
T  17085366 gaactgggtcaacaatctttggtgtgt 17085340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 723968 - 723732
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  723968 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattggaaaactgggtagaaattaggtttgttcttt 723870  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  723869 gtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggt 723770  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  723769 caagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgt 723732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 217 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 33162676 - 33162438
Alignment:
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttct 315  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33162676 gagttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgattgaaaatcatcgagtgtcttgttcattggtgaaattaggaaaatgggtagaaattagggttgttct 33162578  T
Q  316 ttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattag 413  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  33162577 ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctctgtaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcccctagattag 33162478  T
Q  414 gtcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||    
T  33162477 gtcaagttggaccgaactaggtcaacaatctttggtgtgt 33162438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 34139995 - 34139758
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34139995 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 34139897  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||  || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34139896 gtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatatgtatcccttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattagg 34139797  T
Q  415 tcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  34139796 tcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgt 34139758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 230 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 36318223 - 36317997
Alignment:
Q  230 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgtt 328  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36318223 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 36318124  T
Q  329 gaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaacc 426  Q
    ||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||    
T  36318123 gaaactaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccttagagtaggtcaagttggacc 36318024  T
Q  427 gaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||||||||||| || |||||||||||    
T  36318023 gaactgggtcaacaatctttggtgtgt 36317997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Original strand, 38312184 - 38312420
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38312184 gttgggaaaca-ttgtatacaccttgtgtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 38312282  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  38312283 gtgaacttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagatctcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattatgt 38312382  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  38312383 caagttggaccgaactgggtcaacaatctttgatgtgt 38312420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 219 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 14634050 - 14633796
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14634050 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattggtaaaatgggtagaaattaggattgttcttt 14633952  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14633951 gtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttttgtaagaactcatagatagtggattggagagatcaatctctcccccagattagg 14633852  T
Q  415 tcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgtct-tttctttattctct 469  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  14633851 tcaagttggaccgaactgagtcaacaatctttggtgtgtttgtttctctattctct 14633796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 11151815 - 11151579
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  11151815 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtctcttgttcattggtgaaattgggaaaatgggtagaaattagatttgttcttt 11151717  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  11151716 gtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcactttgtaagaactcttagatagtggattggagagatcaacctctcccccagattaggt 11151617  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  11151616 caagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgt 11151579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Original strand, 42362296 - 42362528
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42362296 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttcttt 42362394  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  42362395 gtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatctatctctcccccagattaggt 42362494  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||||||    || ||||||||| || |||||||||||    
T  42362495 caagttg----gacctgggtcaacaatctttggtgtgt 42362528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Original strand, 11690445 - 11690681
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11690445 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttcttt 11690543  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||    
T  11690544 gtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctttgtaagaaatcgttgatagtggattggagagatcaacctctcccccatattacgt 11690643  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||    
T  11690644 caagttggaccgaactggatcaacaatctttggtgtgt 11690681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Original strand, 11067249 - 11067485
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  11067249 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttattcattggtgaaattggaaaaatgggtagaaattagtgttgtacttt 11067347  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11067348 gtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcatttataatggattgaagagatcaatctctcccccagattaggt 11067447  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||    
T  11067448 caagttggaccgaactcggtcaacaatctttggtgtgt 11067485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 2334641 - 2334405
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2334641 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaataagggttgttcttt 2334544  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  2334543 gtgaacttgttgaagctaatttctagtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 2334444  T
Q  416 caag-ttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||| ||| |||||||||||  || || |||||||||||    
T  2334443 caagtttggaccgaactgggggaacaatctttggtgtgt 2334405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 36988299 - 36988063
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |    
T  36988299 gttgggaaaca-tagtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgggattggaaaaaagggtagaaattagggttgttctat 36988202  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||| ||||  || |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  36988201 gtgagcttgtcaaaactaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 36988102  T
Q  416 caag-ttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||| ||| |||||||||||| || || |||||||||||    
T  36988101 caagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgt 36988063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 219 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 5723478 - 5723226
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  5723478 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaa-gggtagaaattaggcttgttcttt 5723382  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacattt--gtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||  ||||  |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||    
T  5723381 gtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacctttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggt 5723282  T
Q  416 caag-ttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgtct-tttctttattctct 469  Q
     ||| ||| |||||||||||| || || ||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  5723281 taagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtttctctattctct 5723226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Original strand, 45099699 - 45099935
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat-gggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  45099699 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctt 45099796  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    |||||  ||||  ||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||    
T  45099797 tgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtagg 45099895  T
Q  415 tcaag-ttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||| ||| |||||||||||| || || |||||||||||    
T  45099896 tcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgt 45099935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 219 - 403
Target Start/End: Original strand, 13121712 - 13121897
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctt 316  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13121712 gttgggaaacatttgtaaacacattgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagactgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttctt 13121810  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcc 403  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  13121811 tgtgagcttgttgaagataatttcttgtaacctttgtatctctttgtagaaactcattgatagtggattgaagaaatcaatctctcc 13121897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 4503356 - 4503120
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  4503356 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggagagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctt 4503259  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    |||||  ||||  ||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||    
T  4503258 tgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtagg 4503160  T
Q  415 tcaag-ttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||| ||| |||||||||||| || || |||||||||||    
T  4503159 tcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgt 4503120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 229 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 6595221 - 6594993
Alignment:
Q  229 aattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagggttgttctttgtgagtttg 326  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  6595221 aattgtaaacactttgg-agagtgagaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattaggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttg 6595123  T
Q  327 ttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttga 423  Q
    |||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||     
T  6595122 ttgaagctaatttcttgtaacccttttgaatctctttgtaagaactcgttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgg 6595023  T
Q  424 accgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||||| || || || |||||||||||    
T  6595022 accgaactgagtgaacaatctttggtgtgt 6594993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 36205887 - 36205652
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  36205887 gttgggaaaca-tggtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggttgttcttt 36205790  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||  ||||  |||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| ||| ||||| |||||    
T  36205789 gtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg-aagaactcattgacagcggattggagagttcaatctatcctccagagtaggt 36205691  T
Q  416 caag-ttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||| ||| |||||||||||| || || |||||||||||    
T  36205690 caagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgt 36205652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 219 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 4484554 - 4484319
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattggga-aaatgggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  4484554 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgtaaatcattgagtgtcttgttc-ttggtgaaattgggagaaaagggtagaaattagggttgttctt 4484458  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattag 413  Q
    |||||  ||||  ||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||    
T  4484457 tgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtag 4484358  T
Q  414 gtcaag-ttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgt 451  Q
    |||||| ||| || ||||||||| || || |||||||||    
T  4484357 gtcaagtttggacagaactgggtgaacaatctttggtgt 4484319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 219 - 451
Target Start/End: Original strand, 30833290 - 30833525
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattggga-aaatgggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  30833290 gttgggaaaca-ttgtaaacactttggt-gagtgtaaatcattgagtgtcttgttc-ttggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggttgttctt 30833386  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattag 413  Q
    |||||  ||||  ||| ||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||    
T  30833387 tgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtag 30833486  T
Q  414 gtcaag-ttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgt 451  Q
    |||||| ||| || ||||||||| || || |||||||||    
T  30833487 gtcaagtttggactgaactgggtgaacaatctttggtgt 30833525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 219 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 14202631 - 14202439
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat---gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttct 315  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||   | ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14202631 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaattattgagtgtgtctttttcatttctgagattgggaaaatgggtagaaattatgtttgttct 14202533  T
Q  316 ttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||      ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  14202532 ttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaac----tcatc-ctttgtaagaactcattgatagtagattggagagatcaatctctccccaagattagg 14202439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 217 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 17490368 - 17490154
Alignment:
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttct 315  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||  |||| | ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    || ||||    
T  17490368 gagttggaaaaca-ttgcaaacacagtgggtgggtgaaaatcattgaatgtcttgttcattgttgagattgg-aaaatgg-tagaaatt----ttattct 17490276  T
Q  316 ttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattag 413  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||    
T  17490275 ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtaactctttgtaagaactcattgatagtggattgtagagatcaatctctcccctagagtag 17490176  T
Q  414 gtcaagttgaaccgaactgggt 435  Q
    ||||| ||| ||||||||||||    
T  17490175 gtcaatttggaccgaactgggt 17490154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 219 - 375
Target Start/End: Original strand, 24885605 - 24885763
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  24885605 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtaaaattgggaaaatgagtagaaattaggtttgttcttt 24885703  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattg 375  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | || |||||||||||||||    
T  24885704 gtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtacccctctgtaagaactcattg 24885763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 269 - 435
Target Start/End: Original strand, 26353178 - 26353346
Alignment:
Q  269 tgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaa 365  Q
    ||||| ||||||||||||  |||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  26353178 tgttctttggtgagattgaaaaaa-gtgtagaaattaaggtttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacacttttgtatctttttgtaa 26353276  T
Q  366 gaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggt 435  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  26353277 gtactcattgatagtggattggagagatcactctctcccttagagtaggtcaagttggaccgaaccgggt 26353346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 219 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 7815498 - 7815311
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctt 316  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| || | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||| ||||||    
T  7815498 gttgagaaacatttgtaaacaccttaggtgggtgaaaatcattgcgtgtcttgttcattggtgagattgagaaaaaggtt-gaaattagggtttgttctt 7815400  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcc 403  Q
    |   || ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||    
T  7815399 tagaagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcatttatagtggattggagagattaatctctcc 7815311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 219 - 435
Target Start/End: Original strand, 11049493 - 11049716
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttct- 315  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||     
T  11049493 gttgggaaacatttgtaaacaccttgggtaagtgaaaatcattgagtgtcttgttttttggtgagattaggaaaatgg-tataaattagggtttgttcta 11049591  T
Q  316 --ttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacattt---gtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagat 410  Q
      ||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||  || |     
T  11049592 atttgtgagcttgttgaagctaatttcttataacccttttagtatctctttgtaagaactcattgatagtagattgaaaagatcaatctctccttcataa 11049691  T
Q  411 taggtcaagttgaaccgaactgggt 435  Q
    |||||||| ||| || |||||||||    
T  11049692 taggtcaaattggactgaactgggt 11049716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 324 - 554
Target Start/End: Original strand, 7451167 - 7451404
Alignment:
Q  324 ttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 421  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | | | |||||||||||    
T  7451167 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaataactcattgatagtggattgcagagatcaatctctcctctacagtaggtcaagtt 7451266  T
Q  422 gaaccgaactgggtcaataacctttggtg-tgtc---ttttcttta--ttctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatatgcactt 515  Q
    | | |||||||||| || |    |||||| ||||   |||||| ||   |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  7451267 gga-cgaactgggtgaacatttattggtgttgtctatttttctctactctctctttatcttgtttattctttggttcgattgtggttttgttatgcactt 7451365  T
Q  516 ggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtg 554  Q
    | |||||||| ||| |||| |||| |||| |||||||||    
T  7451366 gttttctagattagatctagattgttgttattgcttgtg 7451404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 68 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 30218410 - 30217956
Alignment:
Q  68 gtgccttttggggat-gattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatcc 166  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |  | ||| ||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |  |||||    
T  30218410 gtgccttttggggagagattcatggggttgggaaacacaccaaaggagaatcttt-gtgagcaacttgagtgagtcttgcgaaaccaaaagggg-gatcc 30218313  T
Q  167 ttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgagg-ttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagt 264  Q
    |||| ||||||||| |||||   |||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||          |||||  |||||| ||||||| ||||    
T  30218312 ttag-gaaatcaaaagctaaatattggttctcttttgggggttaggctctagagttgggaaaca----------ccttgacagagtggaaatcattgagt 30218224  T
Q  265 gtcttgttcattggtg-agattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctcttt 361  Q
    ||||||||||| |  | |||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  30218223 gtcttgttcatggaaggagattgagaaa-tgggtagaagttaggtttgttcttggagagcttattgaagctaatttcttgtaaccattttgtatctcttt 30218125  T
Q  362 gt-aagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtca-agttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgtc---tt 456  Q
    || || || ||||||||||||| ||| | | ||||||| |||||||||| || ||||  |||| || ||||| ||| || |   ||||||||  |   ||    
T  30218124 gtaaataattcattgatagtgggttgaaaagatcaatcactcccccagagtaagtcattgttggactgaactcggtaaacattttttggtgtagctcttt 30218025  T
Q  457 ttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatatgcacttggtttctaga 525  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| || | | |||||||||||||||    
T  30218024 ttctctactctctttatcttgtttattctttggtttgattgtggttgtgttttacacttggtttctaga 30217956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 32289565 - 32289727
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctcttt-gtaagaactc 371  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||    
T  32289565 ttggtgagattggaaaa--gggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactc 32289662  T
Q  372 attgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    |||||||||  ||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  32289663 attgatagtaaattagagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 32289727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 219 - 319
Target Start/End: Original strand, 39284829 - 39284929
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39284829 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtatcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgctcttt 39284927  T
Q  318 gt 319  Q
    ||    
T  39284928 gt 39284929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 219 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 12123809 - 12123644
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  12123809 gttgggaaacatttataaacaccttggatgagtgaaaatcatcgagtgtcttgttcatttgagagattgg-aaaatgagtataaattagagttgttcttt 12123711  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtg 381  Q
     ||| |||||||||||| |||||||||||  | ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  12123710 atgattttgttgaagcttatttcttgtaactcttttgtatcattttgtaaagaactcaatgatagtg 12123644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 6266691 - 6266854
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacattt-gtatctcttt-gtaagaactc 371  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||  || ||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||    
T  6266691 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc 6266789  T
Q  372 attgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
     ||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  6266790 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 6266854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 42262035 - 42261826
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggat-gattcatggggttgggaaacacatgagtgaagag 116  Q
    |||||||||||||| |||| |||||  |||||||||| || | ||||||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||||||| |  | ||||    
T  42262035 agatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctctt-tggagagggttggtgcctttaggtgagagattcatgggattgggaaacacatcaaaggagag 42261937  T
Q  117 tcttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgaggttagattcta 216  Q
    | |||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||| | ||| |||| ||||||||| |||| || |||||||  ||| | ||||||| ||||    
T  42261936 t-ttttatgagcaacttgggcgagtcttacgagaccaaaagagtatatcattag-gaaatcaaaagctacggattggttccttttaggggttagaatcta 42261839  T
Q  217 gagttgggaaaca 229  Q
    |||||||||||||    
T  42261838 gagttgggaaaca 42261826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 367 - 438
Target Start/End: Original strand, 39284930 - 39285001
Alignment:
Q  367 aactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39284930 aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaa 39285001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 134
Target Start/End: Original strand, 7451043 - 7451158
Alignment:
Q  19 gatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagtc 118  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||  | ||||||||| || ||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  7451043 gatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctctttggtaaagggttgatgacttttggagaagatttatggggttggaaaacacatgagtggagagtc 7451142  T
Q  119 ttttgtgagcaacttg 134  Q
     |||||||||||||||    
T  7451143 atttgtgagcaacttg 7451158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 13656200 - 13656037
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacat-ttgtatctcttt-gtaagaactc 371  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||  ||||  |||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||    
T  13656200 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaagaactc 13656103  T
Q  372 att-gatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    ||| ||||||||||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  13656102 atttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 13656037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 12647555 - 12647391
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacat-ttgtatctcttt-gtaa-gaact 370  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||  ||||  |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||| |||||    
T  12647555 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaact 12647458  T
Q  371 catt-gatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    |||| ||||||||||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  12647457 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 12647391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 119 - 223
Target Start/End: Original strand, 43730991 - 43731093
Alignment:
Q  119 ttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgaggttagattctaga 218  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||| |||| |||| ||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  43730991 ttttgtgagcaatttgggtgaatcttgggaaaccaaaatagaatatccgtag-gaaatcaaagtctaaaggttggtt-tcttttggggttaaattctaga 43731088  T
Q  219 gttgg 223  Q
    |||||    
T  43731089 gttgg 43731093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 296 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 42261633 - 42261524
Alignment:
Q  296 gtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagata 392  Q
    |||||||||| | |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |  ||||| |    
T  42261633 gtagaaattaagtttgttcttggagagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatatctttgtaaagtactcattgatagtgaagcggagaga 42261534  T
Q  393 tcaatctctc 402  Q
    ||| ||||||    
T  42261533 tcattctctc 42261524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 5700347 - 5700271
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatg 294  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  5700347 gttgagaaacatttgtaaacactttgggtgaatgaaaaacattgagtgtcttgttcattggagagattgagaaaatg 5700271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 324 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 42019992 - 42019904
Alignment:
Q  324 ttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaagaa---ctcattgatagtggattggagatatcaatctctccccca 407  Q
    |||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||   ||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||    
T  42019992 ttgtagaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaaaaaaactcattgatagtgaatttgagagatcaatctcttcccca 42019904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 34811370 - 34811281
Alignment:
Q  295 ggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaag-aactcattgatagtg 381  Q
    ||||||||||| | ||| |||| | ||| |||||||||||||||| ||||||  | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34811370 ggtagaaattaagattgctcttagagagcttgttgaagctaatttattgtaactcttttatatctctttgtaagaaactcattgatagtg 34811281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 324 - 399
Target Start/End: Original strand, 24197946 - 24198023
Alignment:
Q  324 ttgttgaag-ctaatttcttgtaacatttgtatctctttgtaag-aactcattgatagtggattggagatatcaatct 399  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  24197946 ttgttgaaggctaatttcttgtaacccttgtatctctttgcaagaaactctttgataatggattggagagatctatct 24198023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 364 - 417
Target Start/End: Original strand, 28672022 - 28672075
Alignment:
Q  364 aagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtca 417  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||    
T  28672022 aagaactcactgacagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtca 28672075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 324 - 365
Target Start/End: Original strand, 4561137 - 4561180
Alignment:
Q  324 ttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaa 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4561137 ttgttgaagctaatttcttgtaacatttttgtatctctttgtaa 4561180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 397 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 31056092 - 31056036
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  31056092 tctctcccctagattaggtcatattgaaccgaactaggtcaacaatctttggtgtgt 31056036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 246
Target Start/End: Original strand, 16676146 - 16676196
Alignment:
Q  197 tcttttgaggttagattctagagttgggaaacaatt-gtaaacaccttggg 246  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  16676146 tcttttggggttagattctagagtttggaaacaattggaaaacaccttggg 16676196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 295 - 381
Target Start/End: Original strand, 41454254 - 41454343
Alignment:
Q  295 ggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtg 381  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| ||| |||||||||||||||||| | ||  | ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  41454254 ggtagaaattagatttgttttttgagagcttgttgaagctaatttctagcaactcttttgtatatatttgtaaagaactcattgatagtg 41454343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 372 - 418
Target Start/End: Original strand, 42412117 - 42412162
Alignment:
Q  372 attgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaa 418  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  42412117 attgatagtggattggagagatcaatctct-ccccagagtaggtcaa 42412162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 3022383 - 3022424
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  3022383 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 3022424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 5375390 - 5375349
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  5375390 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 5375349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 6264192 - 6264151
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  6264192 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 6264151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 11739603 - 11739562
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  11739603 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 11739562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 13569376 - 13569335
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  13569376 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 13569335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 13910089 - 13910048
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  13910089 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 13910048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 14699056 - 14699097
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  14699056 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 14699097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 19502055 - 19502014
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  19502055 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 19502014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 20522268 - 20522227
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  20522268 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 20522227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 23452281 - 23452240
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  23452281 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 23452240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 27105008 - 27105049
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27105008 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 27105049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 335 - 390
Target Start/End: Original strand, 16605654 - 16605710
Alignment:
Q  335 aatttcttgtaacatttgtatctctttgtaagaa-ctcattgatagtggattggaga 390  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  16605654 aatttcttgtaactcttgtatatctttataagaaactcattgataatggattggaga 16605710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 336 - 368
Target Start/End: Original strand, 28861131 - 28861163
Alignment:
Q  336 atttcttgtaacatttgtatctctttgtaagaa 368  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28861131 atttgttgtaacatttgtatctctttgtaagaa 28861163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 339
Target Start/End: Original strand, 41446159 - 41446203
Alignment:
Q  295 ggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaattt 339  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  41446159 ggtagaaattatgtttgttctttgagagcttgttgaagctaattt 41446203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 350; Significance: 0; HSPs: 86)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 516
Target Start/End: Original strand, 40221487 - 40221992
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||  |||| |||||  ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40221487 agatgtgaatcttcgagaaccaaaatagggggctcttgggaaaggggttagtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagt 40221586  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgagg-ttagattcta 216  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  40221587 cttttgtgagcaacttaggtgagtcttgtaaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaaaggttggttctcttttgggggttagattcta 40221686  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40221687 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttctttggtgagattggtaaaatgggtagaaattagggttgttctt 40221786  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40221787 tgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattagg 40221886  T
Q  415 tcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtg----tcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatatg 510  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||     |||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  40221887 tcaagttggaccgaactgggtcaataatctttggtgttgttatcttgtctttactctctttatcttgttcattctttggttggattgtggttttgctatg 40221986  T
Q  511 cacttg 516  Q
    ||||||    
T  40221987 cacttg 40221992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 42435417 - 42434837
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  42435417 agatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaaaggttggtgacttttggggaagattcatggggttgggaaacatatgaatggagagt 42435318  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttga-ggttagattcta 216  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42435317 cttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgagggttagattcta 42435218  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42435217 gagttggtaaacaattgtaaacactttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttctt 42435118  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  42435117 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagaaatcaatctctcctccagagtagg 42435018  T
Q  415 tcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg----tgtcttttctttattctctttatcttgtttattccttg-gttgaattgtggttttgatat 509  Q
    |||||||| |||||||||||| || |    ||||||    | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||    
T  42435017 tcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttggtgttgttatcttttctttactttctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctat 42434918  T
Q  510 gcacttggtttctagactaggtcta--tattgatgttgttgcttgtgatttac---tttagttgttggttgcctttgctact 586  Q
    |||||| | || |||||||||||||  ||||| |||||||||||||| || ||   ||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  42434917 gcactt-gattatagactaggtctatctattgttgttgttgcttgtggttaacatttttggttgttggttgccattgatact 42434837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 554
Target Start/End: Original strand, 11383728 - 11384270
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |||| | |||    
T  11383728 agatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctattgtgaaaagggttggtgccttttgaggaagattcatggggttgggaaatacataagtggaaagt 11383827  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattcta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  11383828 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattcta 11383927  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11383928 gagttgggaaataattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcatt-atgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttctt 11384026  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||    
T  11384027 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaacccattgatactggattggagacatcgatctctcctccagagtagg 11384126  T
Q  415 tcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg-tgtc---ttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatatg 510  Q
    | |||||| |||||||||||| || |   ||||||| ||||   ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||    
T  11384127 ttaagttggaccgaactgggtgaacattttttggtgttgtctatttttctttactctctttatcttgtttatcctttggttagattgtggttttgctatg 11384226  T
Q  511 cacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtg 554  Q
    |||||| |||||||| ||| |||| |||| |||| |||||||||    
T  11384227 cacttgttttctagattagatctagattgttgttattgcttgtg 11384270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 72 - 554
Target Start/End: Original strand, 4283320 - 4283809
Alignment:
Q  72 cttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagt 171  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4283320 cttttgggaaagattcatggggttgggaaacacatgagtggaaagtcttttgtgagaaacttggttgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagt 4283419  T
Q  172 gaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgagg-ttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttg 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4283420 gaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttaggagagtgaaaatcatgagtgtcttg 4283519  T
Q  271 ttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaa 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  4283520 ttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttttttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaa 4283619  T
Q  369 ctcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg----tgtcttttctttat 464  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||| |||||||||||| |||||||||||| || |    ||||||    | |||||||||||     
T  4283620 ctcattgatagtggattggagagatcaatctcccctctagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttggtgttgttatcttttctttac 4283719  T
Q  465 tctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatatgcacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtg 554  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  4283720 tctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattgttgttattgcttgtg 4283809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 19 - 554
Target Start/End: Original strand, 40328522 - 40329061
Alignment:
Q  19 gatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagtc 118  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  40328522 gatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggttcttgggaaaagggttggtgccttttagggaagattcatggggatgggaaacacatgagtgtagagtc 40328621  T
Q  119 ttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattctag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  40328622 ttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatctttagtgaaatcaaaggctatgagttggttctcttttgggggttagattctag 40328721  T
Q  218 agttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40328722 agttgggaaacaattgtaaacatcttgggagagtgaaaatcatgaatgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttcttt 40328821  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac---atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  40328822 gtgagcttgtttaaactaatttcttgtaactcattttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 40328921  T
Q  415 tcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg----tgtcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatatg 510  Q
    |    ||| || |||||| || || |    ||||||    | |||||||| || |||| || |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||    
T  40328922 t----ttggacggaactgagtgaacatttcttggtgttgttatcttttctctactctccttttcttgtttatcctttggttagattgtggttttgctatg 40329017  T
Q  511 cacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtg 554  Q
    |||||| |||||||| ||| |||| | || |||| |||||||||    
T  40329018 cacttgttttctagattagatctagactgttgttattgcttgtg 40329061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 121 - 554
Target Start/End: Original strand, 18655246 - 18655688
Alignment:
Q  121 ttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgaggttagattctagagt 220  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |    
T  18655246 ttgtgagcaacttcggtgagtcttgtgaaatcaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttgatactcttttggggttagattctagact 18655345  T
Q  221 tgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtg 320  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18655346 taggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgttttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattaaggttgttctttgtg 18655445  T
Q  321 agtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaa 418  Q
    || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| | ||||||||    
T  18655446 agcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcctccaaagtaggtcaa 18655545  T
Q  419 gttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg----tgtcttttcttta--ttctctttatcttgtttattccttg-gttgaattgtggttttgatatgc 511  Q
    |||| |||||||||||| || |   |||||||    | |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||    
T  18655546 gttggaccgaactgggtgaacattttttggtgttgttatcttttctttactctctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgc 18655645  T
Q  512 acttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtg 554  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  18655646 acttggtttatagactagatctatattgttgttattgcttgtg 18655688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 24 - 406
Target Start/End: Original strand, 44353540 - 44353926
Alignment:
Q  24 gaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagtcttttg 123  Q
    |||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |  |    
T  44353540 gaatcttggagaactaaaagagggggctcttgtgaagagggttggtgccttttggagaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcatcgg 44353639  T
Q  124 tgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattctagagttg 222  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  44353640 tgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttg 44353739  T
Q  223 ggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtga 321  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44353740 ggaaacaattgtaaacacattgggtgagtaaaaatcattgagtatcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtga 44353839  T
Q  322 gtttgttgaagctaatttcttgta--acatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctccccc 406  Q
      ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  44353840 acttgttgaagctaatttcttgtaacacatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattgaaaagatcaatctctccccc 44353926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 230 - 459
Target Start/End: Original strand, 27811232 - 27811464
Alignment:
Q  230 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgtt 328  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27811232 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 27811331  T
Q  329 gaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaacc 426  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27811332 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaacccattgatagtggattgaagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggacc 27811431  T
Q  427 gaactgggtcaataacctttggtgtgtcttttc 459  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  27811432 gaactgggtcaacaatctttggtgtgttttttc 27811464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 218 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 10930424 - 10930118
Alignment:
Q  218 agttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  10930424 agttgggaaacaattgtaaacattttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcatcggtgagattgggaaaatggatagaaattagggttgctcttt 10930325  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10930324 gtgagctcgttgaagctaatttcttgtaacccatttatatctctttgtaagaacacattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggt 10930225  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacct-ttggtg----tgtcttttc-tttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatat 509  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||  | ||||||    | ||||||| |||  || ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||    
T  10930224 caagttggaccgaactgggtcaacaatttcttggtgttgttatcttttcttttgctccctttatcttgtttattcttttgttggattgtggttttgctat 10930125  T
Q  510 gcacttg 516  Q
    |||||||    
T  10930124 gcacttg 10930118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Original strand, 15212730 - 15212966
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15212730 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgaatgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 15212828  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15212829 gtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgataatggattggagagatcaatctctcccccagattaggt 15212928  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  15212929 caagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgt 15212966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Original strand, 43036367 - 43036603
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43036367 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 43036465  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  43036466 gtgaacttgttgaaactaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggatttgagagatcaatctctcctccagattaggt 43036565  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  43036566 caagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgt 43036603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Original strand, 4731602 - 4731838
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4731602 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgctcttt 4731700  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  4731701 gtgagcttgttgaacctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcgatctctcccccagattcggt 4731800  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||    
T  4731801 caagttggaccgaattgggtcaacaatctttggtgtgt 4731838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Original strand, 33352094 - 33352330
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33352094 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgattgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtaaaaattagggttgttcttt 33352192  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33352193 gtgaacttgttgaacctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggt 33352292  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  33352293 caagttggaccgaactgggtcaacaatctttgatgtgt 33352330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Original strand, 30143286 - 30143520
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttg 318  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30143286 gttgggaaaca-ttgtaaacacattgggtgagtgaaaatcatt-gtgtcttgttcattggccagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttg 30143383  T
Q  319 tgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtc 416  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  30143384 tgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagataaggtc 30143483  T
Q  417 aagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||    
T  30143484 aagttgaactgaactgagtcaacaatctttggtgtgt 30143520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 217 - 453
Target Start/End: Original strand, 40321022 - 40321260
Alignment:
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttct 315  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  40321022 gagttgggaaaca-ttgtaaacaccttgagtgactgaaaatcattgagtgtcttgttcataggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttca 40321120  T
Q  316 ttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattag 413  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40321121 ttgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaacccattagtatctctttgtaaaaactctttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattag 40321220  T
Q  414 gtcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  40321221 gtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttgatgtgt 40321260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 219 - 434
Target Start/End: Original strand, 18141764 - 18141981
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18141764 gttgggaaacatttgtaaacaccttgggcgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgtgaaaatgggtagaaattagg-ttgttcttt 18141862  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  18141863 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatcactttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatctctcccctagattaggt 18141962  T
Q  416 caagttgaaccgaactggg 434  Q
    ||||||| ||| |||||||    
T  18141963 caagttggaccaaactggg 18141981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 217 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 1345597 - 1345359
Alignment:
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttct 315  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1345597 gagttgggaaata-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgaatgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgtgtagaaattagggttgttct 1345499  T
Q  316 ttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattag 413  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||    
T  1345498 ttgtgagtttattgaagctaatttcttgtaacccatatgtatctctttgaaagaactcattgatagtggattgaagagttcaatctctcccccagagtag 1345399  T
Q  414 gtcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||||  |||||||| |||||| || |||||||||||    
T  1345398 gtcaagttagaccgaactaggtcaacaatctttggtgtgt 1345359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 217 - 453
Target Start/End: Original strand, 5689213 - 5689451
Alignment:
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttct 315  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||    
T  5689213 gagtttggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattaatgagattggaaaaatgggtagaaattaaggtggtgct 5689311  T
Q  316 ttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattag 413  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  5689312 ttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagatttg 5689411  T
Q  414 gtcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  5689412 gtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttgatgtgt 5689451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 3303894 - 3303658
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  3303894 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgagtatcttgtttattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaagtttgttcttt 3303796  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||    
T  3303795 gtgagcttgtttaacctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattgaagagatcaatctctcccccacagtaggt 3303696  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||| |||||||||||| || || |||||||||||    
T  3303695 caagttggaccgaactgggtaaacaatctttggtgtgt 3303658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Original strand, 6598916 - 6599152
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  6598916 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattaagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaagtttgttcttt 6599014  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  6599015 gcgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatacttttgtaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggt 6599114  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  6599115 caagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgt 6599152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Original strand, 6674369 - 6674605
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  6674369 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattaagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaagtttgttcttt 6674467  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  6674468 gcgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatacttttgtaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggt 6674567  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  6674568 caagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgt 6674605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Original strand, 30291549 - 30291788
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-gttgttctt 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  30291549 gttgggaaacatttgtaaacaccttgggtgattgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattaggttttgttctt 30291648  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctccc-ccagattag 413  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  30291649 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatcactttgtaagaattctttgatagtggattggagagatcaatctctccctccagattat 30291748  T
Q  414 gtcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    | ||||||| |||||||||  |||| || |||||||||||    
T  30291749 gccaagttggaccgaactgaatcaacaatctttggtgtgt 30291788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Original strand, 9765693 - 9765924
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttg 318  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9765693 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaatt---gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttg 9765788  T
Q  319 tgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtc 416  Q
    |||| |||   |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||||||||||||    
T  9765789 tgagcttggcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagct-gctctctcccccagattaggtc 9765887  T
Q  417 aagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |  ||| ||||||||||||||| || | |||||||||    
T  9765888 atattggaccgaactgggtcaacaatcattggtgtgt 9765924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 219 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 12702862 - 12702626
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat-----gggtagaaattagggttgt 312  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||    
T  12702862 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattaagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaaaaagggtagaaattagggttgt 12702765  T
Q  313 tctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagat 410  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12702764 tctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtgtctctttgtaagaactcattgatattggattggagagatcaatctctcccctagat 12702665  T
Q  411 taggtcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggt 449  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  12702664 taggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggt 12702626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 248 - 554
Target Start/End: Original strand, 3772164 - 3772477
Alignment:
Q  248 gagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa 346  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  3772164 gagtgaaaatgattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaattgatagaaattaggtttgttctttgtgagcttatttaagctaatttcttgtaa 3772263  T
Q  347 --catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaataacct 444  Q
      ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || | |||| |||||||||||| ||| |||||| | ||||        
T  3772264 ctcatttgtatatctttgtaagaatttattgatagtggattggagagatcaatctatctctcagagtaggtcaagttggaccaaactggataaatatttc 3772363  T
Q  445 ttggtg----tgtcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatatgcacttggtttctagactaggtctatattga 540  Q
    ||||||    | |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||  |||| ||||     
T  3772364 ttggtggtgttatcttttctctactctctttatcttgtttattctttggttagattgtggttttgctatgcacttgatttctagattaaatctagattgt 3772463  T
Q  541 tgttgttgcttgtg 554  Q
    ||||||||||||||    
T  3772464 tgttgttgcttgtg 3772477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 231 - 453
Target Start/End: Original strand, 42498149 - 42498375
Alignment:
Q  231 ttgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgtt 328  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  42498149 ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaaggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 42498247  T
Q  329 gaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaac 425  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||    
T  42498248 gaagctaatttcttgtaacccttttgtatttctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggac 42498347  T
Q  426 cgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||||||||| || || |||||||||||    
T  42498348 cgaactgggtgaacaatctttggtgtgt 42498375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 219 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 1292687 - 1292471
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  1292687 gttgggaaacact-gtgaacaccttgggtgagtgaaaattattgagtgtcttgttctttggtgagattgagaaaatgggtagaaattaagtttgttcttt 1292589  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||| |||||    
T  1292588 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggatttgagaaataaatctct-ccccagagtaggt 1292490  T
Q  416 caagttgaaccgaactggg 434  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  1292489 caagttggaccgaactggg 1292471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 221 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 8965914 - 8965697
Alignment:
Q  221 tgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttg 318  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||     
T  8965914 tgggaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcttta 8965816  T
Q  319 tgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtc 416  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  8965815 tgagtttgttgaagttaatttcttataacccttttatatctctttgtaagaactcattgatagtgcatcggagagataaatctctcccccatattaggtc 8965716  T
Q  417 aagttgaaccgaactgggt 435  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  8965715 aagttggaccgaactgggt 8965697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 219 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 19491922 - 19491702
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttg 318  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19491922 gttgggaaaca-tcgtaaacatcttgggtgagtgaaaatattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttg 19491824  T
Q  319 tgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtc 416  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||| ||||||||| | ||||||    
T  19491823 tgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattaaagagatcaatatctcccccatagtaggtc 19491724  T
Q  417 aagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    |  ||| |||||||| ||||||    
T  19491723 atattggaccgaactaggtcaa 19491702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 4743427 - 4743202
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  4743427 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagcgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtag-aattaggtttgttcttt 4743330  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtca 417  Q
    ||| |||||||||||||||  |||||||||        |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  4743329 gtgtgtttgttgaagctaaaatcttgtaac--------ccatttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaagtaggtca 4743238  T
Q  418 agttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  4743237 agttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgt 4743202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 220 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 41366837 - 41366603
Alignment:
Q  220 ttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttg 318  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  41366837 ttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcaagactgagattgagaaaatgggtagaaattatgtttgttctttg 41366739  T
Q  319 tgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtc 416  Q
    | || ||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  41366738 taagcttgtttaagctaatttcttttaacctatttgtatccctttgtaagaactcatttatagtggattggagagatcaatctct-ccctagattaggtc 41366640  T
Q  417 aagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  41366639 aagttggaccgaactgggacaacaatctttggtgtgt 41366603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Original strand, 17982597 - 17982834
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat-gggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  17982597 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctt 17982694  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    |||||  ||||  ||| ||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||    
T  17982695 tgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtagg 17982794  T
Q  415 tcaag-ttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||| ||| |||||||||||| || || |||||||||||    
T  17982795 tcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgt 17982834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 230 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 34254543 - 34254318
Alignment:
Q  230 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgtt 328  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  34254543 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtc 34254446  T
Q  329 gaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaac 425  Q
     ||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||| ||| ||    
T  34254445 aaagttaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaacttattgatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggac 34254346  T
Q  426 cgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||||||||| || || |||||||||||    
T  34254345 cgaactgggtgaacaatctttggtgtgt 34254318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 230 - 435
Target Start/End: Original strand, 4162454 - 4162658
Alignment:
Q  230 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgtt 328  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||  |||||    
T  4162454 attgtaaacaccttgagcgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattagtgaga---ggaaaatgggtagaagttaggtttgttctttgagaacttgtt 4162550  T
Q  329 gaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaacc 426  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||    
T  4162551 gaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatag-ggattggagatatcaatctctccccaagagtaggtcaagttggacc 4162649  T
Q  427 gaactgggt 435  Q
    ||| |||||    
T  4162650 gaattgggt 4162658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Original strand, 31218201 - 31218438
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  31218201 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctt 31218298  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    |||||  ||||  ||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||    
T  31218299 tgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtagg 31218398  T
Q  415 tcaag-ttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||| ||| |||||||||||| || || |||||||||||    
T  31218399 tcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgt 31218438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 230 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 34256719 - 34256494
Alignment:
Q  230 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgtt 328  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  34256719 attgtaaacaccttggt-gtgtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgg-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtc 34256622  T
Q  329 gaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaac 425  Q
     ||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||| ||| ||    
T  34256621 aaagttaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggac 34256522  T
Q  426 cgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||||||||| || || |||||||||||    
T  34256521 cgaactgggtgaacaatctttggtgtgt 34256494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 230 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 19945574 - 19945346
Alignment:
Q  230 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat-gggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgt 327  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||  ||||    
T  19945574 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattatggttgttctttgtgaacttgt 19945476  T
Q  328 tgaagctaatttcttgtaaca---tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttga 423  Q
      ||||||||||||||||||    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||    
T  19945475 caaagctaatttcttgtaaccacttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctcgagagtaggtcaagtttga 19945376  T
Q  424 accgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||    
T  19945375 accgaactgggtgaacaatctttggtgtgt 19945346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 219 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 18106302 - 18106083
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||  ||||||||||    
T  18106302 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaattgttgagtgtcttgttcatcggtgagattggaaaaatggatagaaactatagttgttcttt 18106204  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  18106203 gcgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatct-tttgtaagaactcattgatagt-gtttggagagatcaatctct-ccccagaataggt 18106107  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaat 439  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  18106106 caagttggaccgaactgggtcaat 18106083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Original strand, 44303798 - 44304036
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaattagggttgttct 315  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||    
T  44303798 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaagggtagaaattaaggttgttct 44303895  T
Q  316 ttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattag 413  Q
    ||||||  ||||  |||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||    
T  44303896 ttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttttaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtag 44303995  T
Q  414 gtcaag-ttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||||| ||| | |||||| ||| || || |||||||||||    
T  44303996 gtcaagtttggatcgaactaggtgaacaatctttggtgtgt 44304036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 1746442 - 1746206
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||||||||||||||    
T  1746442 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgaaaaaaaaaggtagaaattagggttgttctt 1746345  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    |||||  ||||  ||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| | ||||    
T  1746344 tgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccatagtagg 1746246  T
Q  415 tcaag-ttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||| ||| |||||||||||| || || | |||||||||    
T  1746245 tcaagtttggaccgaactgggtgaacaatcgttggtgtgt 1746206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 230 - 390
Target Start/End: Original strand, 10929753 - 10929905
Alignment:
Q  230 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgtt 328  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  10929753 attgtaaacaccttggattagtgaaaatcattgagtgtcttgttctttggtgagatatggaaaatgggtagaaattatgtttgttctttgtgagcttgtt 10929852  T
Q  329 gaagctaatttcttgtaacatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggaga 390  Q
    ||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10929853 gaagctaatttcttgtaa---------ctctttgtaagaactcattgatagtggattggaga 10929905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 219 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 41365071 - 41364926
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  41365071 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcaagactgagattgggaaaattggtagaaattaggtttgttcttt 41364973  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgta--acatttgtatctctttg 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  41364972 gtgagtttgtttaagctaatttcttgtaacacatttgtatccctttg 41364926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 219 - 429
Target Start/End: Original strand, 8153705 - 8153914
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat---gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttct 315  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||         
T  8153705 gttgggaaacatttgtatacaccttggatgagtgaaaatcattgagtgtgtcatgttcattggtgagattgagaaaatgg-tagaaattagggtt----- 8153798  T
Q  316 ttgtgag-tttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagatta 412  Q
     | |||| |||||||||||||| ||| ||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||| ||    
T  8153799 -tctgagctttgttgaagctaaattcgtgtaactcttttgtatatctttgtaagaactcattgatagttgattggagagatcaatctcttcctcagagta 8153897  T
Q  413 ggtcaagttgaaccgaa 429  Q
    |||||||||| ||||||    
T  8153898 ggtcaagttggaccgaa 8153914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 275 - 441
Target Start/End: Original strand, 2627735 - 2627905
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca---tttgtatctctt-tgtaagaact 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||  || ||||||||||| |||    |||||||||||| ||||||||||    
T  2627735 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgcaactctttttgtatctcttgtgtaagaact 2627833  T
Q  371 cattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggtcaataa 441  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  2627834 cattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaataa 2627905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 351 - 453
Target Start/End: Original strand, 4733784 - 4733886
Alignment:
Q  351 tgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg 450  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||    
T  4733784 tgtatctctttgtaagaattcattgatagtggattggagagatcgatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacagtctttggtg 4733883  T
Q  451 tgt 453  Q
    |||    
T  4733884 tgt 4733886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 132
Target Start/End: Original strand, 22976276 - 22976389
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22976276 agatgtgaatcttggagaaccaaaagaggaggctcttggaaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtt-gaaaacacatgagtgaagagt 22976374  T
Q  118 cttttgtgagcaact 132  Q
    || ||||||||||||    
T  22976375 ctattgtgagcaact 22976389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 40585467 - 40585669
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggat-gattcatggggttgggaaacacatgagtgaagag 116  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||| | |||||||| || | ||||||| || ||||||| ||  ||||||||||||| | |||||||| |  | ||||    
T  40585467 agatgtgaatatttgagaatcaaaagagtgggctcttttggagagggttgatgtcttttggtgagagattcatggggtttgaaaacacatcaaaggagag 40585566  T
Q  117 tcttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgaggttagattcta 216  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||   | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  40585567 tcttt-gtgagcaatttgggtgagtattggtagaccaaaagagaagatccttag-gaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggtagattcta 40585664  T
Q  217 gagtt 221  Q
     ||||    
T  40585665 aagtt 40585669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 313 - 435
Target Start/End: Original strand, 10015119 - 10015241
Alignment:
Q  313 tctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagat 410  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||| |     
T  10015119 tctttgtgtgcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-taggaactcattgatagtggattggagagataaatctct-ctccatag 10015216  T
Q  411 taggtcaagttgaaccgaactgggt 435  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  10015217 taggtcaagttggaccgaactgggt 10015241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 3846241 - 3846032
Alignment:
Q  20 atgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggat-gattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagtc 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  | | |||||| |||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  3846241 atgtgaatcttgaagaaccaaaagaagag-ctcttg-gaaaagagttggtgtcttttggggagagattcatggggttgggaaacacatgagagaagattc 3846144  T
Q  119 ttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgaggttagattctaga 218  Q
     ||||||||||| |||||| | ||||  || ||||||||||| |||| || | |||||||||||  || |||||||||  ||||| ||||||| ||||||    
T  3846143 -tttgtgagcaaattgggtaaatctttggataccaaaagagacgatcttttg-gaaatcaaaggtaaatggttggttc-attttggggttagaatctaga 3846047  T
Q  219 gttgggaaacaattg 233  Q
    ||  | |||||||||    
T  3846046 gtcagaaaacaattg 3846032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 9633959 - 9633816
Alignment:
Q  20 atgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagtct 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||  || |||||||  |||| ||||||| |||||||||   |||| |||||||||| |||||||| ||   ||||||     
T  9633959 atgtgaatcttgaataatcaaaagatggcgctcttg--aaaaaggttggtaccttttgggagagattaatggggttggtaaacacataagatgagagtca 9633862  T
Q  120 tttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatc 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  9633861 tttgtgagcaacttgggtgaatcttaggaaaccaaacgagaagatc 9633816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 120 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 33655628 - 33655402
Alignment:
Q  120 tttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttga-ggttagattctaga 218  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||| ||| ||||    
T  33655628 tttgtgagcaatttgggtgaatcttaggagaacaaaagagaagatccttag-aaaatcaaaggttaagggttggttctctttcaagggttaaattttaga 33655530  T
Q  219 gttgggaaacaa-ttgtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    ||||| ||| || ||| ||||| |||||  ||||| |||||| |||||||||||||||| |  || |||  | |||| | ||||||||||  ||||||||    
T  33655529 gttggaaaataatttgaaaacatcttggatgagtg-aaatcattgagtgtcttgttcatggaagatattaag-aaatagatagaaattagatttgttctt 33655432  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa 346  Q
     | ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  33655431 agagagtttgttgaagctgatttctcgtaa 33655402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 25689955 - 25690117
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacattt-gtatctcttt-gtaagaactc 371  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||  ||||  |||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||    
T  25689955 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc 25690052  T
Q  372 attgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
     ||||||||||||||||||   ||| |||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  25690053 tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 25690117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 335 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 3073981 - 3073880
Alignment:
Q  335 aatttcttgtaacattt--gtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactg 432  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||  ||||||||    
T  3073981 aatttcttgtaacatttttgtatctctttgtaagaactcattgataatggcttggagagatcaatctct-ccccatagtaggtcaagttgggccgaactg 3073883  T
Q  433 ggt 435  Q
    |||    
T  3073882 ggt 3073880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 99 - 229
Target Start/End: Original strand, 10020272 - 10020398
Alignment:
Q  99 aaacacatgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctc 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||| |||||| ||||| ||||| |  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||    
T  10020272 aaacacatgagagaagagtctt--gtgaacaacttaggtgaatcttagggtaccaaaagaggagatccttag-gaaatcaaaggctaagggtttgtt-tc 10020367  T
Q  199 ttttgaggttagattctagagttgggaaaca 229  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  10020368 tttttgggttggattctagagttgggaaaca 10020398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 275 - 433
Target Start/End: Original strand, 3439504 - 3439664
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacattt-gtatctcttt-gtaagaactc 371  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||  |||   |||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||    
T  3439504 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattatgaacttggc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc 3439601  T
Q  372 attgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgg 433  Q
     ||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  3439602 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 3439664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 309 - 417
Target Start/End: Original strand, 7597648 - 7597759
Alignment:
Q  309 ttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccc 405  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7597648 ttgttcttggagagcttgttgaagctaatttcttataatccttttgtatctctttgtaaagaatgcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 7597747  T
Q  406 cagattaggtca 417  Q
    || | |||||||    
T  7597748 catagtaggtca 7597759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 290 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 32902327 - 32902197
Alignment:
Q  290 aaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacattt--gtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattg 386  Q
    |||||||||||||||| | |||||| | | || | ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||     
T  32902327 aaatgggtagaaattatgtttgttcatggagactctgttgaagctaatttcttgtaacttttttgtatctctttctaaagaattcattgatagtgaattt 32902228  T
Q  387 gagatatcaatctctcccccagattaggtca 417  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  32902227 gagagatcaatctctccccctgagtaggtca 32902197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 265 - 405
Target Start/End: Original strand, 1822282 - 1822425
Alignment:
Q  265 gtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctcttt 361  Q
    |||||||||||| | |||||||  |||| || ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||| ||||| |||    
T  1822282 gtcttgttcatttgagagattgcaaaaa-ggatagaaattatggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttatatctattt 1822380  T
Q  362 gt-aagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccc 405  Q
    || || |||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  1822381 gtaaataactcactaatagtgaattggagagatcaatctctcccc 1822425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 265 - 405
Target Start/End: Original strand, 1856727 - 1856870
Alignment:
Q  265 gtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctcttt 361  Q
    |||||||||||| | |||||||  |||| || ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||| ||||| |||    
T  1856727 gtcttgttcatttgagagattgcaaaaa-ggatagaaattatggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttatatctattt 1856825  T
Q  362 gt-aagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccc 405  Q
    || || |||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  1856826 gtaaataactcactaatagtgaattggagagatcaatctctcccc 1856870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 180 - 382
Target Start/End: Original strand, 10240061 - 10240264
Alignment:
Q  180 aggctaagggttggttctcttttgaggttagattctagagttgggaaacaattgt-aaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgg 278  Q
    |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||| || ||| |||| ||  |||| |||||||| | ||    
T  10240061 aggctaagagttggttctctttgg-ggttagattctagatttgggaaacaattgagaaacatcttaggtgagcgaaa-tc--gagtctcttgttcttggg 10240156  T
Q  279 tg-agattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa-cat-ttgtatctctttgt-aagaactcat 373  Q
     | ||||||||| || |  |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  10240157 aggagattgggacaaaga-tagaaatttgggtttgttctttgtgagcttgttgaatctaatttcttgtaaccatgttggatctctttgtaaagaactcat 10240255  T
Q  374 tgatagtgg 382  Q
    |||||||||    
T  10240256 tgatagtgg 10240264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 120 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 10101475 - 10101351
Alignment:
Q  120 tttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgaggttagattctagag 219  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| || | |||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |  ||||| ||||||||||||| |    
T  10101475 tttgtgagcaacttggatgaatcttaggagatcaaaagaggagatcctta-ttaaatcaaagtctaagggttggtac-gttttggggttagattctagtg 10101378  T
Q  220 ttgggaaacaa-ttgtaaacaccttgg 245  Q
    || ||||| || |||||||||||||||    
T  10101377 ttaggaaataatttgtaaacaccttgg 10101351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 2999946 - 2999823
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggat-gattcatggggttgggaaacacatgagtgaagag 116  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| || | || |||||| ||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||  ||||    
T  2999946 agatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggttcttgggatatgg-ttggtgtcttttggggaaagattcatggggatgagaaacacatgagtagagag 2999848  T
Q  117 tcttttgtgagcaacttgggtgagt 141  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||    
T  2999847 tcaattgtgagcaacttgggcgagt 2999823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 309 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 11712135 - 11712024
Alignment:
Q  309 ttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaag-aactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccc 405  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||   ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||     
T  11712135 ttgttccttgagagcttgttgaagctaatttcttgaaacccttttatatctctttgtaaataactcattgatagtggattgaagagatcaatctctccct 11712036  T
Q  406 cagattaggtca 417  Q
    || | |||||||    
T  11712035 caaagtaggtca 11712024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 256
Target Start/End: Original strand, 40535713 - 40535819
Alignment:
Q  150 accaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgaggttagattctagagttgggaaacaatt-gtaaacaccttgggag 248  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||  ||  | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||| ||      
T  40535713 accaaaagagaagatcctaagagaaatcaaagtttatcgattggtt-tcttttgaggttagattatagagttggaaaacaattaggaaacacctttgggt 40535811  T
Q  249 agtgaaaa 256  Q
    ||||||||    
T  40535812 agtgaaaa 40535819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 280 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 29796485 - 29796354
Alignment:
Q  280 gagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacattt--gtatctctttgtaagaa--ctcatt 374  Q
    ||||||||||||| | |||||||| | |||| |||||| | ||  ||||||||||| ||||||||||||||||  ||| || ||||||| ||  ||||||    
T  29796485 gagattgggaaaa-gagtagaaatcaaggtttgttcttggagaacttgttgaagctgatttcttgtaacatttttgtacctatttgtaaaaaaactcatt 29796387  T
Q  375 gatagtggattggagatatcaatctctccccca 407  Q
     ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29796386 tataatggattggagagatcaatctctccccca 29796354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 3817729 - 3817538
Alignment:
Q  47 gggctcttgtgaaaagggttggtgccttttgg-ggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtctta 145  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||| |||| || ||||| || ||||||||||| |||||  | | ||     
T  3817729 gggctcttg-gaaaagggttggtgccttttggagaaagattcatggggttggaaaatacataagagaagattc-tttgtgagcaaattgggcaaatattt 3817632  T
Q  146 tgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgaggttagattctagagttgggaaacaattg-taaacaccttg 244  Q
     || |||||| ||||||||| || | |||||||||||  ||||||| |      |||| ||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||    
T  3817631 ggagaccaaacgagaagatcttttg-gaaatcaaaggtcaagggttag------tttggggttagattctagagtcaggaaacaattgagaaacaccttg 3817539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 18810998 - 18811039
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18810998 tctctcccccagattaggtcaatttgaaccgaactgggtcaa 18811039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 453 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 2999786 - 2999723
Alignment:
Q  453 tcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatatgcacttg 516  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||| ||||||||||    
T  2999786 tcttttctctactctctttatcttgtttattctttggttagattgtgattttgctatgcacttg 2999723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 296 - 390
Target Start/End: Original strand, 30909389 - 30909484
Alignment:
Q  296 gtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggaga 390  Q
    |||||||||||| ||  |||| | ||| ||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||    
T  30909389 gtagaaattaggtttactcttggagagcttgtttaaactaatttcttgtaactctttgtatctctttgtaatgactcgttgatagtgaattggaga 30909484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 15290522 - 15290687
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacat-ttgta-tctctttgt-aagaact 370  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||   |  | |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||| |||||||    
T  15290522 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaact 15290620  T
Q  371 ca-ttgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    || ||||||||||||||||||   ||| |||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  15290621 catttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 15290687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 15470891 - 15471056
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacat-ttgta-tctctttgt-aagaact 370  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||   |  | |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||| |||||||    
T  15470891 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaact 15470989  T
Q  371 ca-ttgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    || ||||||||||||||||||   ||| |||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  15470990 catttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 15471056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 42575494 - 42575329
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggg-ttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacat-ttgta-tctctttgt-aagaact 370  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| | ||||   |  | |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||| |||||||    
T  42575494 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggattgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaact 42575396  T
Q  371 ca-ttgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    || ||||||||||||||||||   ||| |||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  42575395 catttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 42575329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 22684697 - 22684656
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  22684697 tctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 22684656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 324 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 38860482 - 38860414
Alignment:
Q  324 ttgttgaag-ctaatttcttgtaacatttgtatctctttgtaag-aactcattgatagtggattggaga 390  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  38860482 ttgttgaaggctaatttcttataactattgtatctctttgtaagaaactatttgatagtggattggaga 38860414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 3232023 - 3231859
Alignment:
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggt-gagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gtt 313  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||  |||| |||| |||||||| | ||  ||||||| |||||  | ||||||||||| || |||    
T  3232023 gagttgggaaacattagtaaacaccttgggtgggtgaat-tcattgagtctcttgttcttaggaagagattgagaaaaatg-tagaaattaggctttgtt 3231926  T
Q  314 ctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgt-aagaactcattgat 377  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||| || ||||   ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  3231925 cttcgtgagcttgttgaagctaattttttttaaccattttgtatctctttgtaaagaacttattgat 3231859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 393
Target Start/End: Original strand, 11137074 - 11137149
Alignment:
Q  324 ttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaagaa----ctcattgatagtggattggagatat 393  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| ||    ||||||||||||| |||||||||||    
T  11137074 ttgttgaagctaatttcttataaccgttttgtatctctttgtaaaaaaaaactcattgatagtgaattggagatat 11137149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 3874301 - 3874342
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  3874301 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 3874342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 4424309 - 4424350
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  4424309 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 4424350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 455 - 504
Target Start/End: Original strand, 11137213 - 11137262
Alignment:
Q  455 ttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggtttt 504  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  11137213 ttttctctactctctttatcttgtttattcattggttcgattgtggtttt 11137262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 14419234 - 14419193
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  14419234 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 14419193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 14808052 - 14808093
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  14808052 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 14808093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 26403279 - 26403320
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  26403279 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 26403320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 27829587 - 27829628
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27829587 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 27829628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 30480547 - 30480506
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  30480547 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 30480506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 364 - 400
Target Start/End: Original strand, 38863949 - 38863985
Alignment:
Q  364 aagaactcattgatagtggattggagatatcaatctc 400  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  38863949 aagaactcgttgatagtggattggagagatcaatctc 38863985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Original strand, 42093131 - 42093188
Alignment:
Q  289 aaaatgggtagaaattagggt-tgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac 347  Q
    ||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  42093131 aaaataggtagaaattatgatatgttctttgtgagtttgt--aagctaatttcttgtaac 42093188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 347; Significance: 0; HSPs: 122)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 525
Target Start/End: Original strand, 54882764 - 54883278
Alignment:
Q  20 atgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagtct 119  Q
    |||||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54882764 atgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttatgaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacacatgagtgtagagtct 54882863  T
Q  120 tttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattctaga 218  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  54882864 tttgtgagaaacttgggtgagtctcgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctaga 54882963  T
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttg 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54882964 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttttttg 54883063  T
Q  319 tgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtc 416  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||    
T  54883064 tgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagggatcaatctctcctccagattaagtc 54883163  T
Q  417 aagttgaaccgaactgggtcaataacct-ttggtg-tgt----cttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatatg 510  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  | |||||| |||     ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||    
T  54883164 aagttggaccgaactgggtcaacaatttcttggtgttgttatctttttctttactctctttatcttatttattctttggttgaattgtggttttgctctg 54883263  T
Q  511 cacttggtttctaga 525  Q
    || ||||||| ||||    
T  54883264 catttggtttataga 54883278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 586
Target Start/End: Original strand, 35662186 - 35662758
Alignment:
Q  20 atgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagtct 119  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||||      
T  35662186 atgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttaggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgaatggagagttc 35662285  T
Q  120 tttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgag-gttagattctaga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  35662286 tttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttag-gaaatcaaa-gctaagggttggttctcttttgggtgttagattctaga 35662383  T
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtg-aaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35662384 gttgggaaacaattgtaaacaccttgagagtgtgaaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgaaaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 35662483  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||| |||||    
T  35662484 atgagtttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatatctcctcaagagtaggt 35662583  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg----tgtcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatatgc 511  Q
    ||||||| |||||||||  | || |   |||||||    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  35662584 caagttggaccgaactgaatgaacattttttggtgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttattccttggttggattgtggttttgctatgc 35662683  T
Q  512 acttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtgatttactttagttgttggttgcctttgctact 586  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| || || | ||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  35662684 acttggtttatagactatgtctatattgttgttgttgcttatggttaattttggttgttggttgccattgatact 35662758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 559
Target Start/End: Original strand, 12073135 - 12073683
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaa-gggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagag 116  Q
    |||||| ||||||| |||| |||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12073135 agatgtaaatcttggagaaccaaaagagggg-ctcttgggaaaaagggttggtgccttttgggaa-gattcatggggttggaaaacacatgagtgaagag 12073232  T
Q  117 tcttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgagg-ttagattct 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  12073233 tcttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgggggttagattct 12073332  T
Q  216 agagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttct 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12073333 agagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagtgtgaaaatcatgagtgtcttgcttattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttct 12073432  T
Q  316 ttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattag 413  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||    
T  12073433 ttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcttccagagtag 12073532  T
Q  414 gtca-agttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg----tgtcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgata 508  Q
    ||||  |||| |||||||| ||| || |    ||||||    | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||    
T  12073533 gtcattgttggaccgaactaggtgaacatttcttggtgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttattctttggttagattgtggttttgtta 12073632  T
Q  509 tgcacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtgattta 559  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  12073633 tgcacttggtttctagattagatctagattgttgttgttgcttgtggttta 12073683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 50674272 - 50673733
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50674272 agatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctctaatgaaaagggttggtgccttatgggaaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagt 50674173  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattcta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  50674172 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattcta 50674073  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  50674072 gagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcgtgttcatttgtgagattgagaaaatgagtagaaattaggattg-tctt 50673974  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  50673973 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 50673874  T
Q  415 tcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg----tgtcttttctttattctctttatcttgtttattccttg-gttgaattgtggttttgatat 509  Q
    |||||||| |||||||| ||| || |    ||||||    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||    
T  50673873 tcaagttggaccgaactaggtgaacatttcttggtgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctat 50673774  T
Q  510 gcacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgctt 551  Q
    |||||| | || |||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  50673773 gcactt-gattatagactagatctatattgttgttattgctt 50673733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 18 - 512
Target Start/End: Original strand, 8665149 - 8665651
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  8665149 agatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacaggagtggagagt 8665248  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattcta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||| | |||||||||||     
T  8665249 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggttatgtgttggttttcttttgggggttagattctg 8665348  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaa-tcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttct 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8665349 gagttgggaaacaattgtaaacaccttggaagagtgaaaattcatgagtgtcttgttcattggtgagaatgggaaaatgggtagaaattagggttgttct 8665448  T
Q  316 ttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattag 413  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  8665449 ttgagagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtag 8665548  T
Q  414 gtcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg----tgtcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatat 509  Q
    ||||||||| ||| |||| |||  | |    ||||||    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  8665549 gtcaagttggaccaaactaggtgtacatttcttggtgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttattccttggttggattgtggttttgctat 8665648  T
Q  510 gca 512  Q
    |||    
T  8665649 gca 8665651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 19 - 554
Target Start/End: Original strand, 41964160 - 41964699
Alignment:
Q  19 gatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagtc 118  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  41964160 gatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttagt--cttttgggaaagattcatggggttgggaaacacatgagtagagagtc 41964257  T
Q  119 ttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgaggttagattctaga 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41964258 ttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggggttagattctaga 41964357  T
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaa-tcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41964358 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggaaagtgaaaattcatgagtgtcttgttcgttggtgaaattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 41964457  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac---atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  41964458 gtgagcttgtttaagctaatttattgtaacccattttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 41964557  T
Q  415 tcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg----tgtcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatatg 510  Q
    |||||||| |||||||||||| |  |    ||||||    | |||||||||||  |||| |||||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||    
T  41964558 tcaagttggaccgaactgggtgagcatttcttggtgttgttatcttttcttta--ctctctatcttgtttatcctttggttagattgtggttttgctatg 41964655  T
Q  511 cacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtg 554  Q
    |||||| |||||||| ||| |||| |||| |||| |||||||||    
T  41964656 cacttgttttctagattagatctagattgttgttattgcttgtg 41964699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 18 - 554
Target Start/End: Original strand, 8647880 - 8648429
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  8647880 agatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacaggagtggagagt 8647979  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattcta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||| | |||||||||||     
T  8647980 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaatcaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgttatgtgttggttctcttttgggggttagattctg 8648079  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaa-tcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttct 315  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  8648080 gagttaggaaacaactgtaaacaccttggaagagtgaaaattcatgagtgtcttgttcattggtgagaatgggaaaatggatagaaattagggttgttca 8648179  T
Q  316 ttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattag 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  8648180 ttgtgagtttgttgaagctaatttcttataacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatattggattggagagatcaatctctcctccagagtag 8648279  T
Q  414 gtcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg----tgtcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatat 509  Q
    ||||||||| ||| |||||||| || |    ||||||    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  8648280 gtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttattccttggttggattgtggttttgctat 8648379  T
Q  510 gcacttggtt---tctagactaggtc--tatattgatgttgttgcttgtg 554  Q
    ||| ||| ||     |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  8648380 gcatttgattatagatagactaggtctatatattgttgttgttgcttgtg 8648429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 19 - 554
Target Start/End: Original strand, 379122 - 379666
Alignment:
Q  19 gatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagtc 118  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||    
T  379122 gatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggtcggtgccttttggggaagattcatgagaatgggaaacacatgagtggagagtc 379221  T
Q  119 ttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttg-aggttagattctag 217  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  379222 atttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaatcaaaagagaagatccttag-gaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgtgggttagattctag 379320  T
Q  218 agttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaat--catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttct 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  379321 agttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaattcaattagtatcttgttcatttgtgagattgagaaaatgggtagaaattaggtttgttct 379420  T
Q  316 ttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattag 413  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  379421 ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatcgctttgtaagaactaattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtag 379520  T
Q  414 gtca-agttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg----tgtcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgata 508  Q
    ||||  |||| |||||||||| | || |    ||||||    | ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||    
T  379521 gtcattgttggaccgaactggatgaacatttcttggtgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttatcctttggttagattgtggttttgtta 379620  T
Q  509 tgcacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtg 554  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  379621 tgcacttggtttatagactaggtctatattgttgttgttgtttgtg 379666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 18 - 516
Target Start/End: Original strand, 6655698 - 6656203
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6655698 agatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagt 6655797  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctc-ttttgaggttagattcta 216  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  6655798 catttctgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatcattagtaaaatcaaaggctaaaggttgtttctctttttggggttagattcta 6655897  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6655898 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcacttgtgagattgaaaaaatgggtagaaattaaggttgttctt 6655997  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||    
T  6655998 tgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcatccagagtagg 6656097  T
Q  415 tcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg----tgtcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatatg 510  Q
    |||||||| |||||| ||||| || |    ||||||    | ||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||| ||||    
T  6656098 tcaagttggaccgaattgggtgaacatttcttggtgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttatccttttgttggattgtggttttgctatg 6656197  T
Q  511 cacttg 516  Q
    ||||||    
T  6656198 cacttg 6656203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 18 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 50263124 - 50262578
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50263124 agatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggaaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagt 50263025  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattcta 216  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  50263024 cttttgtgagcaacctcggtgactcttgtgaaaccaaaagagaagacccttagtgaaatcaaaggctaatggttggttctcttttgggggttagattcta 50262925  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  50262924 gagttgggaaacaattgtaaataccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgtttat---tgagattgggaaaatggatcgaaattacggttgttctt 50262828  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  50262827 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagttgattggagatatcaatctttcctccagagtagg 50262728  T
Q  415 tca-agttgaaccgaactgggtcaataacct-ttggtg----tgtc---ttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttg 505  Q
    |||  |||| |||||||||||| || || || ||||||    ||||   |||||| || ||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  50262727 tcattgttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgttgttgtctatttttctctactctttttatcttgtttattccttacttggattgtggttttg 50262628  T
Q  506 atatgcacttggtttctagactaggtc--tatattgatgttgttgcttgtg 554  Q
      ||||||||| || | | ||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  50262627 ccatgcacttgattac-atactaggtctatatattgttgttgttgcttgtg 50262578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 18 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 27417377 - 27416886
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27417377 agatgtgaatcttggagaaccaaaagaaggggctcttgggaaaggggttggtgtcttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagt 27417278  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgagg-ttagattcta 216  Q
    |||||          |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  27417277 ctttt----------tgggtgagtcttgtaaaaccaaaaaagaagatccttagtgaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattctt 27417188  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    |||||  ||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  27417187 gagttttgaaacaattgtaaaca----gggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattggtaaaatgtgtagaaattagggttgttctt 27417092  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27417091 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaaaaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattagg 27416992  T
Q  415 tcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtg----tcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatatg 510  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||     |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||    
T  27416991 tcaagttggaccgaactgagtcaacaatctttggtgttgttatcttgtctttactctctttatcttgtttattctttggttggattgtggttttgccatg 27416892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 18 - 505
Target Start/End: Original strand, 46703243 - 46703738
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| || |||||    
T  46703243 agatgtgaatcttcgagaatcaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatgggaaa-acatgaatggagagt 46703341  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgagg-ttagattcta 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||| ||    
T  46703342 cttttgtcagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaaaatccttag-gaaatcaaaggctaaaagttggttctcttttgggggttagattata 46703440  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaat-catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttct 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46703441 gtgttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaattcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggttgttct 46703540  T
Q  316 ttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac---atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagatta 412  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||    
T  46703541 ttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcatttatagtggattggagagatcaatctctcctccagagta 46703640  T
Q  413 ggtca-agttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg----tgtcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttg 505  Q
    |||||  |||| |||||| ||||| || |    ||||||    | ||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||  ||||||||||||    
T  46703641 ggtcattgttggaccgaattgggtgaacatttcttggtgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttatcatttggttagattgtggttttg 46703738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 18 - 554
Target Start/End: Original strand, 2209450 - 2210004
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||| |||| |||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2209450 agatgtgaatcttggagaaccaaacgaggggactcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagt 2209549  T
Q  118 ct-----tttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgagg-ttaga 211  Q
    |      | || |       |  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  2209550 caaaggctatgggttggttctcagcgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctatgggttggttctcttttgggggttaga 2209649  T
Q  212 ttctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttg 311  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2209650 ttctagagttgggaaataattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgttgagattgggaaaatgggtagaaattagggttt 2209749  T
Q  312 ttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac---atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccag 408  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  2209750 ttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagattaatctctcctccag 2209849  T
Q  409 attaggtca-agttgaaccgaactgggtcaataacct-ttggtg----tgtc---ttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtg 499  Q
    | |||||||  |||| |||||||||||| || || || ||||||    ||||   |||||| || ||||||||||||||||||   ||||||  ||||||    
T  2209850 agtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgttgttgtctatttttctctactctctttatcttgtttatcatttggttagattgtg 2209949  T
Q  500 gttttgatatgcacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtg 554  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| ||| |||| |||| |||| ||| |||||    
T  2209950 gttttgctatgcacttgttttctagattagatctagattgttgttattgtttgtg 2210004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 165 - 559
Target Start/End: Original strand, 40632334 - 40632735
Alignment:
Q  165 ccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgagg-ttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgag 263  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40632334 ccttagtgaaatcaaatgttaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgagaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgag 40632433  T
Q  264 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctcttt 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  40632434 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctcttt 40632533  T
Q  362 gtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg----tgtcttt 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | | || ||||||||| |||||||||||| || |    ||||||    | |||||    
T  40632534 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctctaaagtaagtcaagttggaccgaactgggtaaacatttcttggtgttgttatcttt 40632633  T
Q  458 tctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatatgcacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtgatt 557  Q
    | |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  40632634 tttttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgccatgcacttggtatatagactaggtctatattgttgttattgcttgtggtt 40632733  T
Q  558 ta 559  Q
    ||    
T  40632734 ta 40632735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 18 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 55085791 - 55085442
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  55085791 agatgtaaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagt 55085692  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttct-cttttgaggttagattcta 216  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||    
T  55085691 catttgtgagcaacttgtgtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttgattctcctttgggggttagattcta 55085592  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttct 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  55085591 gagttcggaaacaattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgactgtcttgttcattggtgagatt-ggaaaataggtagaaattaaggttgttct 55085493  T
Q  316 ttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgta 364  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  55085492 ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaaccatttgtatctctttgta 55085442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 205 - 586
Target Start/End: Original strand, 41639356 - 41639746
Alignment:
Q  205 ggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaatt 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41639356 ggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttaggagagtgaaaatcacgagtgtcttgtttattggtaagattgggaaaatgggtagaaatt 41639455  T
Q  305 agggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctc 402  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  41639456 agggttgttctttgtgaactttttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctatttgtaagaactcatcgatagtggattggagagatcaatctctc 41639555  T
Q  403 ccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg----tgtcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgt 498  Q
    | ||||| |||||||||||| ||||||||| || || |    ||||||    | || |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  41639556 ctccagagtaggtcaagttggaccgaactgagtgaacatttcttggtgttgttatcgtttctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgt 41639655  T
Q  499 ggttttgatatgcacttggtttctagactaggtctatat-tga--tgttgttgcttgtgatttac-tttagttgttggttgcctttgctact 586  Q
    ||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||| | |  |||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||| ||| ||||    
T  41639656 ggttttgctatgcactt-gattatagactaggtctatatatcatttgttgttgcttgtggtttacatttggttattggttgccattgatact 41639746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 18 - 554
Target Start/End: Original strand, 33989605 - 33990131
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| || |||| |||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  33989605 agatgtgaatcttgaagaaccaaaatagggggctcttgggagaagg-ttggtgccttttgggagagattcatgggattgggaaacacatgagtggagagt 33989703  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattcta 216  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  33989704 catttgtgagcaacttgggtgagtcttttgaaaccaaaagagaagatccttag-gtaatcaaaggctaaggatttgttctcttttggaggttagattcta 33989802  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttct 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||| | ||||||| ||||||                  ||||| ||||| |||| |||||||    
T  33989803 gagttgggaaacaactgtaaacaccttggttgagtaaaaattattgagtgttttgttc------------------atgggaagaaactaggtttgttct 33989884  T
Q  316 ttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagatta 412  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||    
T  33989885 tagagagtttgttgaagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttgtaaataactcgttaatagtggattggagagatcaatctctccaccagagta 33989984  T
Q  413 ggtca-agttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg----tgtcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgat 507  Q
    |||||   ||| |  ||||||||| || |    ||||||    | | |||| | || |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||| |    
T  33989985 ggtcattcttggattgaactgggtaaacatttcttggtgttattatattttttctactctctttatcttgtttattctttggttcaattctggatttgct 33990084  T
Q  508 atgcacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtg 554  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  33990085 atgcacttggtttctagattagatctagattgttgttgttgcttgtg 33990131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 541
Target Start/End: Original strand, 12119282 - 12119817
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||  |||  |||||| |||| |||||||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||  || |    
T  12119282 agatatgaatcttggagaattaaaaaagggaactcttgggaaa-gggttggttcccttttgggaagattcatggggttgcgaaacacattagtggtgaat 12119380  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattcta 216  Q
    | ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||    
T  12119381 catttgtgagcaatttgggtgtgtcttgtgaaaccaaaagagaagatcctta-agaaatcgaa-gttaagggttggttctcttttgggggttagattata 12119478  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatc-atgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaatta-gggttgttc 314  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||    
T  12119479 gagttgggaaacaattgtaaataccttgggagagtgaaaatcaatgagtgtcttgttcataggtgagattggaaaaaagagtagaaattatggtttgttc 12119578  T
Q  315 tttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagatt 411  Q
    |||||||  || ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |    
T  12119579 tttgtgaactttttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaaagaactcatttatagtggattggagagatcaatctct-cccaagagt 12119677  T
Q  412 aggtca-agttgaaccgaactgggtcaataacct-ttggtg-tgtc-------ttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggt 501  Q
    ||||||  |||| |||||||| ||| || ||  | |||||| ||||       |||||| || ||||||||||||||||| || |||||   ||||||||    
T  12119678 aggtcattgttggaccgaactaggtgaacaatttcttggtgttgtcatctattttttctctactctctttatcttgtttagtctttggtccgattgtggt 12119777  T
Q  502 tttgatatgcacttggtttctagactaggtctatattgat 541  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||    
T  12119778 tttgctatgcacttagtttctagattagatctagattgat 12119817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 26175860 - 26175624
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26175860 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatggggagaaattagggttgttcttt 26175762  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26175761 gtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggt 26175662  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  26175661 caagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgt 26175624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 9927681 - 9927446
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9927681 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcactgagtgtcttattcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 9927584  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9927583 gtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggt 9927484  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  9927483 caagttggaccgaactgagtcaacaatctttggtgtgt 9927446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 262 - 553
Target Start/End: Original strand, 26364223 - 26364522
Alignment:
Q  262 agtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctct 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26364223 agtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctct 26364322  T
Q  360 ttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaataacct-ttggtg----tgtc 454  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||  | ||||||    | ||    
T  26364323 ttgtaagaactcattaatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtttgactgaactgggtcaacaatttcttggtgttgttatc 26364422  T
Q  455 ttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatatgcacttggtttctagactaggtc--tatattgatgttgttgcttg 552  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||   || |||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  26364423 ttttctttactctctttatcttgtttattccttgcttggattgtggttttgctatacactt-aattatagactaggtctatatattgttgttgttgcttg 26364521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Original strand, 5429623 - 5429859
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||     
T  5429623 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggttattcttc 5429721  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5429722 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctatttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggt 5429821  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
     |||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  5429822 taagttggaccgaactgggtcaacaatctttgatgtgt 5429859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 217 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 36463615 - 36463379
Alignment:
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttct 315  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  36463615 gagttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaattcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatggatagaaattagggctgttca 36463517  T
Q  316 ttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattag 413  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36463516 ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactctttgacagtggattggagagatcaatctctcccccagattag 36463417  T
Q  414 gtcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgt 451  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||    
T  36463416 gtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgt 36463379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 230 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 48893856 - 48893626
Alignment:
Q  230 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttc----tttgtgagtt 324  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    |||||||| |    
T  48893856 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttcattgtttgtgagct 48893757  T
Q  325 tgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttg 422  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48893756 tgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttg 48893657  T
Q  423 aaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
     ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  48893656 gaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgt 48893626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 230 - 438
Target Start/End: Original strand, 36994478 - 36994689
Alignment:
Q  230 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgtt 328  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  36994478 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggttgttctttgtgagcttgtt 36994577  T
Q  329 gaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaacc 426  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  36994578 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattagatcaagttggacc 36994677  T
Q  427 gaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||    
T  36994678 gaactgggtcaa 36994689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 47038633 - 47038399
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47038633 gttgggaaaca-ttataaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatgggtagaaattagggttgttcttt 47038536  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa-catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtc 416  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||    
T  47038535 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaatcatttgtatctgtttgtaaggactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaagtc 47038436  T
Q  417 aagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  47038435 aagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgt 47038399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 232
Target Start/End: Original strand, 26364007 - 26364222
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26364007 agatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggggccttttggagaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagt 26364106  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattcta 216  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||    
T  26364107 catttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttggtggttagatttta 26364206  T
Q  217 gagttgggaaacaatt 232  Q
    ||||||||||||||||    
T  26364207 gagttgggaaacaatt 26364222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 34570638 - 34570402
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34570638 gttgggaaaca-ttgaaaacatcttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaataggtagaaattagggttgttcttt 34570540  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34570539 gtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccaattgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggt 34570440  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
     |||||| | ||||||||||||| || |||||||||||    
T  34570439 taagttggatcgaactgggtcaacaatctttggtgtgt 34570402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 12739774 - 12739538
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12739774 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttaggtgagtggaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatggatagaaattagggttgttcttt 12739676  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||  ||||  ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12739675 gtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctatttgtatgaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggt 12739576  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  12739575 caagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgt 12739538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 52467579 - 52467342
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  52467579 gttgggaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgaggttgggaaaatgggtagaaattaggtttgttcttt 52467480  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  52467479 gtgagcttgttgaagctaatatcttgtaacccatttgtatcactttgtaataactttttgatagtggattggagagatcaatctctccccgagattaggt 52467380  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  52467379 caagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgt 52467342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 54200130 - 54199895
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54200130 gttgggaaaca-ttgtaaacacattgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 54200032  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  54200031 gtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtgaattagagagatcattctctcccccagattaggt 54199932  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  54199931 caagttgga-cgaactgggtcaacaatttttggtgtgt 54199895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 45 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 26699845 - 26699339
Alignment:
Q  45 gggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggat-gattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtct 143  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||||  | |  |||||||||||| |||| | ||||||||| ||| || || |||| |||||  | |||||||    
T  26699845 gggggatcttggaaaaagggttggtgccttttcagaagagattcatggggtcgggagatacatgagtggagattcattagtgaacaactcagatgagtct 26699746  T
Q  144 tatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacct 242  Q
    ||  |||| |||||||| |||| ||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |    
T  26699745 tagaaaactaaaagagatgatcttta-tgtaatcaaaggttaaaggttggttctcttttaggggttagattataaagttgggaaacaattgtaaacactt 26699647  T
Q  243 tgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattggtgagattgggaa-aatgggtagaaattaggg-ttgttctttgtgagtttgttgaagctaattt 339  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||  ||| || ||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26699646 tgggtgagtgaaaatcattgaatgtcttgtttattagagagattcagaagaaagggtatagattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaattt 26699547  T
Q  340 cttgtaa--catttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtca-agttgaaccgaactgggt 435  Q
    |||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||  |||| ||||||||||||    
T  26699546 cttgtaactcttttgtatctctttgtaaagaactcatttataatggattggagagatcaatctctatcccagagtaggtcattgttggaccgaactgggt 26699447  T
Q  436 caataacctttggtg----tgtcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatatgcacttggtttctagactaggt 531  Q
     || |    || |||    | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |    
T  26699446 aaaaatttcttagtgccgttatcttttctttactctctttatcttgtttattctttggttcaattatggttttgctatgcacttggattctagattagat 26699347  T
Q  532 ctatattg 539  Q
    ||| ||||    
T  26699346 ctagattg 26699339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 219 - 438
Target Start/End: Original strand, 37740570 - 37740790
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  37740570 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcactgagtgtcttgttcattggtgagatttggaaaaagggtataaattagggttgttcttt 37740667  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  37740668 gtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagatttggt 37740767  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  37740768 caagttggaccgaactgtgtcaa 37740790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 56178860 - 56178624
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  56178860 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggttgttcttt 56178763  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  56178762 gtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 56178663  T
Q  416 caag-ttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||| ||| |||||||||||| || || |||||||||||    
T  56178662 caagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgt 56178624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Original strand, 5871764 - 5872000
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5871764 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaggtttgttcttt 5871862  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||  ||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5871863 gtgagcttgtttaagcaaatttcttgtaacccatttttatcactttgcaagaactctttgatagtggattagagagatcaatctctcccccagattaggt 5871962  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  5871963 caagtttgaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgt 5872000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 264 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 46147570 - 46147379
Alignment:
Q  264 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctcttt 361  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  46147570 tgtcttgttcatcggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt 46147471  T
Q  362 gtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  46147470 gtaagaactctttgatagtggattggagacatcaatctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgt 46147379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Original strand, 29254438 - 29254674
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  29254438 gttgggaaaca-ttgtaaacacattgggtgaatgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaattgggtagaaattagagttgtttttt 29254536  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
     |||| ||||||||| |||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  29254537 atgagcttgttgaagttaatttcttgcaacccatttgtgtctctttgtaagaactcgttgatagtggattggagagatcaatctctctcccaaattaggt 29254636  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  29254637 caagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgt 29254674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 213 - 438
Target Start/End: Original strand, 21688186 - 21688414
Alignment:
Q  213 tctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattg-ggaaaatgggtagaaattagggttg 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  21688186 tctagagttgggaaacaattctaaacaccttgggggagtgaaaatcatgagtgtcttgttcatcggtgagattgagaaaaatgggtagaaattagggttg 21688285  T
Q  312 ttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccaga 409  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||| |||    
T  21688286 ttctttgtgagcttgttgaaactaattttttgtaactcatttgtatctcttcggaagaactcattgataatgaattggagagatcaatccctcccctaga 21688385  T
Q  410 ttaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||  |||||| || |||||    
T  21688386 ttaggtcaagttagaccgaattgagtcaa 21688414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 221 - 435
Target Start/End: Original strand, 31474096 - 31474313
Alignment:
Q  221 tgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggg-ttgttctttg 318  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||     
T  31474096 tgggaaaca-ttgtaaacactttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattaggtcttgttctttt 31474194  T
Q  319 tgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtc 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| ||| ||    
T  31474195 tgagtttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagttgattggagagataaatctctccaccagagtagatc 31474294  T
Q  417 aagttgaaccgaactgggt 435  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  31474295 aagttggaccgaactgggt 31474313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 52095586 - 52095350
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52095586 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 52095488  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||  ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||     
T  52095487 gtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaaatctttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg- 52095389  T
Q  416 caag-ttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||| ||| |||||||||||| || ||  ||||||||||    
T  52095388 caagtttggaccgaactgggtgaacaatttttggtgtgt 52095350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Original strand, 48142986 - 48143224
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  48142986 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaaggtagaaattagggttgttctt 48143084  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  48143085 tgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttcataagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 48143184  T
Q  415 tcaag-ttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||| ||| ||| |||||||| || || |||||||||||    
T  48143185 tcaagtttggaccaaactgggtgaacaatctttggtgtgt 48143224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 236 - 453
Target Start/End: Original strand, 3913408 - 3913627
Alignment:
Q  236 aacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagct 334  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  3913408 aacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgagtagaaattagagctgttctttgtgagtttgttgaagct 3913507  T
Q  335 aatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactg 432  Q
    |||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| || || |||||| | |||||||    
T  3913508 aatttcttttaacccatttgtatatctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctct-ccctagagtatgtaaagttgtatcgaactg 3913606  T
Q  433 ggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||||| || |||||||||||    
T  3913607 ggtcaacaatctttggtgtgt 3913627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 219 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 45687407 - 45687147
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctt 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  45687407 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaattttttgattgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggaagaaattaggttttgttctt 45687309  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||| |    
T  45687308 tgtgagcttgtcaaagctaatttcttataactcatttgtatctatttgtaagaactcattgatagtggattggagagatctatctctcctccatattatg 45687209  T
Q  415 tcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgtct-tttctttattctctttatct 475  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||  |||||||||||    
T  45687208 tcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtttcttttctctctttatct 45687147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 220 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 12745659 - 12745468
Alignment:
Q  220 ttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttg 318  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12745659 ttgggaaacaat-gtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggcgagattaggaaaatgggtagaaattagggttgttctttg 12745561  T
Q  319 tgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccaga 409  Q
    |||  ||||  || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  12745560 tgaacttgtcaaaactaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctcttccccaga 12745468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 219 - 399
Target Start/End: Original strand, 24969055 - 24969238
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  24969055 gttgggaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagagtcttgttctttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagatttgttcttt 24969154  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatct 399  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  24969155 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactaattgatagtggattggagagataaatct 24969238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 170
Target Start/End: Original strand, 40630726 - 40630878
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40630726 agatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagcttttgtgaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagt 40630825  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttag 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40630826 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttag 40630878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 219 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 37229947 - 37229731
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggt-tgttctt 316  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  37229947 gttggaaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcaatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtgtgttctt 37229849  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca---tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattag 413  Q
    |||||| ||||| |||| ||||| |||||||    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||    
T  37229848 tgtgagcttgttaaagcaaatttgttgtaaccctttttatatctctttgtaagaactcatttatagtggattggagagatcaatctctccctcatagtag 37229749  T
Q  414 gtcaagttgaaccgaact 431  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  37229748 gtcaagttggaccgaact 37229731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 219 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 6542405 - 6542185
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagggtt-gttct 315  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||| || |||||    
T  6542405 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaattattgagtgtcttgttcattggggagattgggaaaaaatggtagaaattaggatttgttct 6542307  T
Q  316 ttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattag 413  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  6542306 ttgtgagcttgttgaaactaatttcttgttagccttttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagggtag 6542207  T
Q  414 gtcaagttgaaccgaactgggt 435  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  6542206 gtcaagttggaccgaactgggt 6542185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 219 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 12747980 - 12747792
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12747980 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttaggtgagtggaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatggatagaaattagggttgttcttt 12747882  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccc 405  Q
    ||||  ||||  |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12747881 gtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctatttgtatgaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 12747792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 219 - 435
Target Start/End: Original strand, 4587902 - 4588121
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctt 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| | || ||||||    
T  4587902 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcatgttcattggtgaaattgggaaaaaaggtagaaattaagatttgttctt 4588000  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||    
T  4588001 tgtaagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagaacaatctctcccccataatagg 4588100  T
Q  415 tcaagttgaaccgaactgggt 435  Q
    | |||||| ||| ||||||||    
T  4588101 tgaagttggaccaaactgggt 4588121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 288 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 12744080 - 12743913
Alignment:
Q  288 gaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggatt 385  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12744080 gaaaataggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggatt 12743981  T
Q  386 ggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  12743980 ggagagatcaatctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgt 12743913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 288 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 12745469 - 12745302
Alignment:
Q  288 gaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggatt 385  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12745469 gaaaataggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggatt 12745370  T
Q  386 ggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  12745369 ggagagatcaatctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgt 12745302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 403
Target Start/End: Original strand, 33089641 - 33090009
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggat-gattcatggggttgggaaacacatgagtgaagag 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||  |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||    
T  33089641 agatgtgaatcttggagaatcaaaagagggggctcttgggaga-gggttggtgtcttttggagagagattcatggggtcgaaaaacacatgagtggagag 33089739  T
Q  117 tcttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattct 215  Q
    || ||||||||||||||||           || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  33089740 tcatttgtgagcaacttgg-----------gagaccaaaagagaagatccttag-aaaatcaaaggctaaaggttggttctcttttggaggttagattat 33089827  T
Q  216 agagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgtt 313  Q
    |||||||||          ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||| | | |||  ||||||||| | |||||    
T  33089828 agagttggg----------aaacaccttggaagagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatgggaagagattgag-agatgaatagaaattatgtttgtt 33089916  T
Q  314 ctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcc 403  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||| || ||||   ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  33089917 cttggagagcttgttgaagctaatttattataaccattttgtatctctctgtaaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcc 33090009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 230 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 30000019 - 29999811
Alignment:
Q  230 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgtt 328  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||     
T  30000019 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcgttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggttgttctttgtgaacatgtc 29999922  T
Q  329 gaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaa 424  Q
     ||||||||||||||||||   ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |    
T  29999921 aaagctaatttcttgtaactcttttgtatcttttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 29999822  T
Q  425 ccgaactgggt 435  Q
    |||||||||||    
T  29999821 ccgaactgggt 29999811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 46569972 - 46569816
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  46569972 agatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaaggattggtgccttttgggaaagattcatggggttgggaaacaaatgagtggaaagt 46569873  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaa 174  Q
    ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  46569872 cttttgtgaacaacttaggtgaatcttatgaaaccaaaagagaaggtccttattgaa 46569816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 219 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 52082881 - 52082715
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52082881 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgactgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaactagggttgttcttt 52082783  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtgga 383  Q
    ||||  ||||  || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  52082782 gtgaacttgtcaaaactaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaaatctttgatagtgga 52082715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 13009655 - 13009432
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||     
T  13009655 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgtgaaaatgggtagaaattaggtttgttcttc 13009557  T
Q  318 gtgag-tttgttgaagctaatttcttgtaacatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtc 416  Q
    ||||| ||| |||    |||        |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||    
T  13009556 gtgagctttcttg----taa--------aacatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcgatctctcctccaaattaggtc 13009469  T
Q  417 aagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||||  ||||||||| ||||| || |||||| ||||    
T  13009468 aagttagaccgaactgtgtcaacaatctttggcgtgt 13009432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 22883178 - 22882791
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggat-gattcatggggttgggaaacacatgagtgaagag 116  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| || | ||| || | |||||||| ||  || |||| ||||| |||||||||| |    ||||    
T  22883178 agatgtgaatcttggagaacaaaaagagggggctcttgggaga-gggctgataccttttggagagagactcatagggttaggaaacacatcaaatgagag 22883080  T
Q  117 tcttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt--gaggttagattc 214  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||  | ||||||||||    
T  22883079 tcttt-gtgagcaatttgggcgagtcttaggagaccaaaagagaagatccttag-aaaatcaaaggataatggttggttctcttttggggggttagattc 22882982  T
Q  215 tagagttgggaaacaatt-gtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattg-gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttg 311  Q
    |||| |||| |||||||| |  ||| | ||| || ||||||||||| |||||| ||||||||| |   |||||| | ||||||| || |||||||| |||    
T  22882981 tagaattggaaaacaattaggtaacgctttgagaaagtgaaaatcattgagtgccttgttcatggaaagagatt-gaaaaatggataaaaattaggtttg 22882883  T
Q  312 ttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagatatcaatctc 400  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  22882882 ttcttggagagtttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttcgtaaagaactcattggtagtggattagagaaatcaatctc 22882791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 22934842 - 22934455
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggat-gattcatggggttgggaaacacatgagtgaagag 116  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| || | ||| || | |||||||| ||  || |||| ||||| |||||||||| |    ||||    
T  22934842 agatgtgaatcttggagaacaaaaagagggggctcttgggaga-gggctgataccttttggagagagactcatagggttaggaaacacatcaaatgagag 22934744  T
Q  117 tcttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt--gaggttagattc 214  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||  | ||||||||||    
T  22934743 tcttt-gtgagcaatttgggcgagtcttaggagaccaaaagagaagatccttag-aaaatcaaaggataatggttggttctcttttggggggttagattc 22934646  T
Q  215 tagagttgggaaacaatt-gtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattg-gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttg 311  Q
    |||| |||| |||||||| |  ||| | ||| || ||||||||||| |||||| ||||||||| |   |||||| | ||||||| || |||||||| |||    
T  22934645 tagaattggaaaacaattaggtaacgctttgagaaagtgaaaatcattgagtgccttgttcatggaaagagatt-gaaaaatggataaaaattaggtttg 22934547  T
Q  312 ttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagatatcaatctc 400  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  22934546 ttcttggagagtttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttcgtaaagaactcattggtagtggattagagaaatcaatctc 22934455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 219 - 361
Target Start/End: Original strand, 41639207 - 41639351
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttg 318  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41639207 gttgggtaacaattgtaaacaccttaggagagtgaaaatcacgagtgtcttgtttattggtaagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttg 41639306  T
Q  319 tgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctcttt 361  Q
    | |  || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  41639307 taaactttttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 41639351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 230 - 435
Target Start/End: Original strand, 51337018 - 51337226
Alignment:
Q  230 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggg--ttgttctttgtgagtttg 326  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||| ||     
T  51337018 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcctgttcattggtgagattgagaaaaagggtagaaattacggatttgttctttgtgagcttt 51337117  T
Q  327 ttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaa 424  Q
    |  ||| |||||| || ||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  51337118 t--aagataatttattataacccttttgtatctctttttaagaactcattgatagtgtattagagagatcaatctctcccacacattaggtcaagttgga 51337215  T
Q  425 ccgaactgggt 435  Q
    |||||||||||    
T  51337216 ccgaactgggt 51337226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 220 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 5208066 - 5207848
Alignment:
Q  220 ttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatg-agtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttcttt 317  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  5208066 ttgggaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcatttagtgacttgttcattggagtgattggaaaaa-gggtagaaattagggtttgttcttt 5207968  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacatttgtatctct--ttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||  |||||||||||||||| ||| |||  |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||    
T  5207967 gtgaacttgttgaagctaatttattgcaacccttgtatatctatttgtaagaactcattgatagtggattggaaagatcaatctctctcccagagtaggt 5207868  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggt 435  Q
    ||| ||| || ||| |||||    
T  5207867 caatttggactgaattgggt 5207848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 221 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 5370308 - 5370070
Alignment:
Q  221 tgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatg---ggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||||||||||||||||    
T  5370308 tgggaaaca-ttgtaaacactttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaaaaagaggtagaaattagggttgttctt 5370211  T
Q  317 tgtgagtttgttgaa-gctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattag 413  Q
    |||||  ||||  || ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||| |||    
T  5370210 tgtgaacttgtcaaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggactagagagatcaatctctcctccagagtag 5370111  T
Q  414 gtcaag-ttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||||| ||| ||||||||| || || || ||||| |||||    
T  5370110 gtcaagtttggaccgaactgagtgaacaatctttgatgtgt 5370070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 13992509 - 13992280
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat-gggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||       |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  13992509 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctt 13992419  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    |||||  ||||  || |||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||    
T  13992418 tgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctctt-gtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtagg 13992320  T
Q  415 tcaag-ttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||| ||| |||||||| ||| || || |||||||||||    
T  13992319 tcaagtttggaccgaactaggtgaacaatctttggtgtgt 13992280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 295 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 12744195 - 12744079
Alignment:
Q  295 ggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagata 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12744195 ggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagaga 12744096  T
Q  393 tcaatctctcccccaga 409  Q
    ||||||||| |||||||    
T  12744095 tcaatctcttccccaga 12744079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 121 - 377
Target Start/End: Original strand, 32091324 - 32091583
Alignment:
Q  121 ttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgaggttagattctagagt 220  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||  || |||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||| |||    
T  32091324 ttgtgaacaacttgggtaagttttgggagaccagaggagaagatccttag-gaaatcaaaggcaaagtgttggttcttttttggggtaagattctaaagt 32091422  T
Q  221 tgggaaacaattgt-aaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtga-gattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    | |||||||||||  |||||| ||||| ||| |||| |||| |||| |||||||||| || || |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||     
T  32091423 ttggaaacaattgagaaacacattgggtgagcgaaa-tcattgagtctcttgttcatgggagaagattgggaaaatgc-tagaaattaggtttgttcttg 32091520  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgt-aagaactcattgat 377  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  32091521 gagagtttgttgaaactaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaagaacacattgat 32091583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 120 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 35369763 - 35369482
Alignment:
Q  120 tttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgaggttagattctagag 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||   || | ||||| |||||||| || |   |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||     
T  35369763 tttgtaagcaacttgggtgagtctatggatagcaaaatagaagatctttggg--aatcaaaggctaagggttggttctcttttggggttggattatagaa 35369666  T
Q  220 ttgggaaacaatt-gtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattg-gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||   || |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  35369665 ttgggaaacaattgggaaacacctt-gtagagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgcaagacattggg-aaatgagtagaaattaggtttgttctt 35369568  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctccc 404  Q
     ||||| ||| |||| ||||||||||  |||   | ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||  || |||||||||    
T  35369567 ggtgagcttgatgaaactaatttcttaaaac---tctatctctttgtaaagaactcattgatggtgaattgaagaggtcgatctctccc 35369482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 3785833 - 3786034
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggat-gattcatggggttgggaaacacatgagtgaagag 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  || | ||||||| | | ||||| | |  | ||||    
T  3785833 agatgtgaatcttgaagaaccaaaagagggggctcttg-gaaaagggttggtgccttttgaggagagaattatggggtcgaggaacacttcaaaggagag 3785931  T
Q  117 tcttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgaggttagattcta 216  Q
    ||||| |||||||| ||| | |||||||  || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||    
T  3785932 tcttt-gtgagcaaattgtgcgagtcttgggagaccaaaagagaatatccttag-gaaatcaaaggctaagagttggttctcttttgggggtagattcta 3786029  T
Q  217 gagtt 221  Q
    |||||    
T  3786030 gagtt 3786034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 31495485 - 31495321
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca---tttgtatctcttt-gtaagaact 370  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||  ||||  || |||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||    
T  31495485 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattaggattgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaact 31495387  T
Q  371 cattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  31495386 cattgatagttgattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 31495321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 217 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 48142605 - 48142412
Alignment:
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttc 314  Q
    ||||||||||||| || ||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||    
T  48142605 gagttgggaaacatttttaaacacttcgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgcccattgatgagattgggaacatga-tagaaattagggtttgttc 48142507  T
Q  315 tttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacatttg--tatctctttgt-aagaactcattg--atagtggattggagatatcaatctctccc 404  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||  ||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| || | |||||||||||||    
T  48142506 tttgtgagcttgttgaagctagtttcttgtaacccttgtatatctctttgtaaagaactcattgatatagtagatttgaaagatcaatctctccc 48142412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 129 - 233
Target Start/End: Original strand, 41961264 - 41961368
Alignment:
Q  129 aacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttga-ggttagattctagagttgggaaa 227  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41961264 aacttgggtgagtcttgggagaccaaaaaagaatatccttag-gaaatcaaaagctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgggaaa 41961362  T
Q  228 caattg 233  Q
    ||||||    
T  41961363 caattg 41961368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 453 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 55085425 - 55085325
Alignment:
Q  453 tcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatatgcacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttg 552  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||| |||| |||| |||||||    
T  55085425 tcttttctttactctctttatcttgtttattccttggttggattgtggttttgctatgcacttggtttctaaattagatctagattgttgttattgcttg 55085326  T
Q  553 t 553  Q
    |    
T  55085325 t 55085325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 57 - 203
Target Start/End: Original strand, 34112392 - 34112538
Alignment:
Q  57 gaaaagggttggtgccttttggggat-gattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaa 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||| ||||   ||| ||||    
T  34112392 gaaaagggttggtgccttttggggagaggttcacggggttggaaaacacatgagtggagagtcatctgtgagcaacttggatgaatcttggaaaaacaaa 34112491  T
Q  156 agagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttg 203  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  34112492 actgaagatccttag-gaaatcaaaggctaaagtttggttctcttttg 34112538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 120 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 35370661 - 35370449
Alignment:
Q  120 tttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgaggttagattctagag 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||   || ||||||| |||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||     
T  35370661 tttgtaagcaacttgggtgagtctatggataccaaaatagaagatctttgg-gaaatcaaaggctaatggttggttctcttttggagttagattatagaa 35370563  T
Q  220 ttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattg-gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    |||||          ||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||   || |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||     
T  35370562 ttggg----------aaacaccttgtaagagtgaaaattattgagtgtcttgttcattgcaagacattggg-aaatgagtagaaattaggtttgttcttg 35370474  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttctt 342  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||    
T  35370473 gtgagcttgatgaaactaatttctt 35370449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 408
Target Start/End: Original strand, 29056301 - 29056494
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattag-ggttgttctt 316  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||    
T  29056301 gttgggaaacatttggaaacaccttgggtgagtaaaaatcattgagtgttttgttcattagagagattgggaaaat-ggtaggaattagagtttgttctt 29056399  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaa-ctcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccag 408  Q
    |||| | |||||  | ||||||||||| ||  | ||| ||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||| | | ||||||| |||||    
T  29056400 tgtgtgcttgttagaactaatttcttgcaatccttttatatctctttgtaacaacctcattgataatggattagagagacctatctctcacccag 29056494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 8393394 - 8393557
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacattt-gtatctcttt-gtaagaactc 371  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||   |||  |||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||    
T  8393394 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacatgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc 8393491  T
Q  372 att-gatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    ||| ||||||||||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  8393492 atttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 8393557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 8395603 - 8395766
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacattt-gtatctcttt-gtaagaactc 371  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||   |||  |||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||    
T  8395603 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacatgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc 8395700  T
Q  372 att-gatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    ||| ||||||||||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  8395701 atttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 8395766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 248 - 386
Target Start/End: Original strand, 53345189 - 53345331
Alignment:
Q  248 gagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttg-ttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgta 345  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||| |||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  53345189 gagtgaaaatcattgagtgtcttgtttatcggagagattgagaaaatga-tagaaattaaggttgattctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgta 53345287  T
Q  346 a--catttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattg 386  Q
    |  | ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  53345288 acccttttatatctttttgtaaagaactcattaatattggattg 53345331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 280 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 44967992 - 44967861
Alignment:
Q  280 gagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac-atttgtatctctttgtaagaa-ctcattga 376  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || | |||| | ||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  44967992 gagattgggaaaatgg-tagaaattaggttttgctcttggagagcttgctgaagccaatttcttgtaaccatttgtatctctttgtaaaaaactcgttga 44967894  T
Q  377 tagtggattggagatatcaatctctcccccaga 409  Q
     ||| |||| |||  ||||||||||||||||||    
T  44967893 gagtagattagagggatcaatctctcccccaga 44967861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 378
Target Start/End: Original strand, 5349924 - 5350016
Alignment:
Q  289 aaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgta--acatttgtatctctttgt-aagaactcattgata 378  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||   | ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  5349924 aaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgaacttgtcgaagctaattccttgtagctcgtttgtatctctttgtaaagaactcgttgata 5350016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 295 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 44570514 - 44570427
Alignment:
Q  295 ggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgt-aagaactcattgatag 379  Q
    ||||||||||| | ||||| || | ||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44570514 ggtagaaattatgtttgttgttggagagcttgttgaaactaatttcttgtaacatttttgtatctctttgtaaagaactcattgatag 44570427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 21703985 - 21703871
Alignment:
Q  295 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacattt--gtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggaga 390  Q
    ||||||||||||| || |||||| |  || ||||||||| | |||||||||| | |||  |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  21703985 ggtagaaattaggttttgttcttagaaagcttgttgaagatgatttcttgtaccctttttgtatctttttgtaaagaactcattgacagtggattggaga 21703886  T
Q  391 tatcaatctctcccc 405  Q
    ||||||||| |||||    
T  21703885 tatcaatctatcccc 21703871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 407
Target Start/End: Original strand, 52065530 - 52065730
Alignment:
Q  209 agattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgggtagaaattag 306  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||  ||  || |||||| |||  |||||||||||     
T  52065530 agattcttgggttgggaaacaattgtgaaccccttgggtgagtgaaaatcatcgagtctcttgatcaacggaagatattggg-aaacaggtagaaatta- 52065627  T
Q  307 ggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa---catttgtatctctttgtaag-aactcattgatagtggattggagatatcaatctctc 402  Q
    |||||||||| | ||| || ||||||||| |||  |||||   | ||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||| |||  ||||||    
T  52065628 ggttgttcttagagagcttattgaagctatttttctgtaaccccttttgtatctctttgttagaaactcattgatagtgaagtggagagatc--tctctc 52065725  T
Q  403 cccca 407  Q
    |||||    
T  52065726 cccca 52065730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 67
Target Start/End: Original strand, 10071627 - 10071676
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttg 67  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10071627 agatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttg 10071676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 70
Target Start/End: Original strand, 10072013 - 10072065
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtg 70  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10072013 agatgtgaatcttggagaactaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtg 10072065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 459 - 552
Target Start/End: Original strand, 46703739 - 46703833
Alignment:
Q  459 ctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatatgcacttggtttctagactaggtc--tatattgatgttgttgcttg 552  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||| | || |||| ||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  46703739 ctttactctctttatcttgtttatcctttggttagattgtggttttgctatgcactt-gattatagaataggtctatatattgttgttgttgcttg 46703833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 5136063 - 5136228
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacat-ttgta-tctctttgt-aagaact 370  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||   |  | |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||| |||||||    
T  5136063 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaact 5136161  T
Q  371 ca-ttgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    || ||||||||||||||||||   ||| |||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  5136162 catttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 5136228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 5138288 - 5138453
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacat-ttgta-tctctttgt-aagaact 370  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||   |  | |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||| |||||||    
T  5138288 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaact 5138386  T
Q  371 ca-ttgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    || ||||||||||||||||||   ||| |||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  5138387 catttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 5138453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 296 - 390
Target Start/End: Original strand, 34112838 - 34112935
Alignment:
Q  296 gtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggaga 390  Q
    |||||||||| | |||||||  | ||| ||||||||||||||||| |||||  | |||| |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  34112838 gtagaaattatgtttgttctaggagagcttgttgaagctaatttcatgtaacccttttgcatctctttgtaaagaactcattgatagtgaagtggaga 34112935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 219 - 400
Target Start/End: Original strand, 6677412 - 6677597
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggt-gagattgggaaaatgggtagaaattagggttgtt--ct 315  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||    ||||| |||||||| | ||  || ||||| ||||||| ||||||||||| || ||  ||    
T  6677412 gttgggaaacatttgtaaacacattggatgagtgaaataattgagtctcttgttcttgggaagaaattgg-aaaatgg-tagaaattaggttttttttct 6677509  T
Q  316 ttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagatatcaatctc 400  Q
    | | ||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| ||||| || |||||| |||||| |||| |||||||||    
T  6677510 tggagagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatatctttgtaaagaagtctttgataatggatttgagagatcaatctc 6677597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 275 - 419
Target Start/End: Original strand, 7124901 - 7125048
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacat-ttgtatctcttt-gtaa-gaact 370  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||  ||||  || ||||||||||||||| | ||||||  |||| |||| |||||    
T  7124901 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaaa-ctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaact 7124998  T
Q  371 catt-gatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag 419  Q
    |||| ||||||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||||||    
T  7124999 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaag 7125048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 31849643 - 31849602
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  31849643 tctctcccccagactaggtcaatttgaaccgaactgggtcaa 31849602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 34788923 - 34788851
Alignment:
Q  295 ggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaa 365  Q
    ||||||||||||| ||| |||| | ||| ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  34788923 ggtagaaattaggattgctcttggagagcttgttgaagttaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaa 34788851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 494 - 554
Target Start/End: Original strand, 21688471 - 21688531
Alignment:
Q  494 attgtggttttgatatgcacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtg 554  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  21688471 attgtggttttgttatgcatttgatttatagactagatctatattattgttgttgcttgtg 21688531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 309 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 37755095 - 37754994
Alignment:
Q  309 ttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacatttgt--atctctttgtaagaa-ctcattgatagtggattggagatatcaatctctcccc 405  Q
    |||||||| | || |||| ||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||| ||| || |||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  37755095 ttgttcttagagaatttggtgaagataatttcttgtaacctttttttatctctttctaaaaaactcattgataatggtttgaagagatcaatctctcccc 37754996  T
Q  406 ca 407  Q
    ||    
T  37754995 ca 37754994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 1122937 - 1122866
Alignment:
Q  323 tttgttgaagctaatttcttgtaacattt---gtatctctttgtaag-aactcattgatagtggattggaga 390  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  1122937 tttgttgaagttaatttatagtaacattttttgtatctctttgtaagaaactcattgatagtagatttgaga 1122866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 4215595 - 4215636
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  4215595 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 4215636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 5635520 - 5635479
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  5635520 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 5635479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 6765133 - 6765174
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  6765133 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 6765174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 7941612 - 7941653
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  7941612 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 7941653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 8631463 - 8631422
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  8631463 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 8631422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 10047427 - 10047386
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  10047427 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 10047386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 14789472 - 14789431
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  14789472 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 14789431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 16455531 - 16455572
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16455531 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 16455572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 16623342 - 16623383
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16623342 tctctcctccagattaggtcatattgaaccgaactgggtcaa 16623383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 17662289 - 17662248
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  17662289 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 17662248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 22800906 - 22800865
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  22800906 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 22800865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 22802778 - 22802737
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  22802778 tctctcccccagactaggtcaatttgaaccgaactaggtcaa 22802737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 24879279 - 24879320
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  24879279 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 24879320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 24880741 - 24880782
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  24880741 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 24880782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 24889085 - 24889126
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  24889085 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 24889126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 36315278 - 36315319
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  36315278 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 36315319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 36329487 - 36329528
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  36329487 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 36329528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 37089416 - 37089375
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  37089416 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 37089375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 38928221 - 38928180
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  38928221 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 38928180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 39246042 - 39246001
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  39246042 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 39246001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 40637363 - 40637404
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  40637363 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 40637404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 43135632 - 43135583
Alignment:
Q  197 tcttttgaggttagattctagagttgggaaacaattg-taaacaccttgg 245  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  43135632 tctttggagtttagattctagagttgggaaacaattgagaaacaccttgg 43135583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 526 - 575
Target Start/End: Original strand, 54881561 - 54881610
Alignment:
Q  526 ctaggtctatattgatgttgttgcttgtgatttactttagttgttggttg 575  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  54881561 ctaggtctatattgttgttattgcttgtggtttattttggttgttggttg 54881610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 397 - 453
Target Start/End: Original strand, 3796568 - 3796624
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||| || |||||||||||| || |||||||||||    
T  3796568 tctctcccccatattaggtcatattggacggaactgggtcaacaatctttggtgtgt 3796624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 395 - 435
Target Start/End: Original strand, 24969787 - 24969827
Alignment:
Q  395 aatctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggt 435  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  24969787 aatctatcccccagagtaggtcaagttggaccgaactgggt 24969827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 37782008 - 37781951
Alignment:
Q  289 aaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac 347  Q
    ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  37782008 aaaatgggtagaaattaagatttgttctttgtgagttttt--aagctaatttcttgtaac 37781951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 60)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 18 - 435
Target Start/End: Original strand, 21593408 - 21593826
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  21593408 agatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagt 21593507  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgagg-ttagattcta 216  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  21593508 catttttgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttag-gaaatcaaag-ctaagggttggttctcttttgggggttagattcta 21593605  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21593606 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 21593705  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  21593706 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 21593805  T
Q  415 tcaagttgaaccgaactgggt 435  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  21593806 tcaagttggaccgaactgggt 21593826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 18 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 26830550 - 26830003
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| || | |||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||    
T  26830550 agatgtgaatcttggagaaccaaaagaggagtctcttgggaaaaaggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgagcgcagagt 26830451  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattcta 216  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  26830450 catttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattcta 26830351  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcatt-ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttct 315  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  26830350 gagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttct 26830251  T
Q  316 ttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattag 413  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||    
T  26830250 ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaatccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccaaagtag 26830151  T
Q  414 gtcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg----tgtcttttcttta--ttctctttatcttgtttattccttg-gttgaattgtggttttga 506  Q
    ||||||||  || ||||||||| || |    ||||||    | |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||     
T  26830150 gtcaagtttgactgaactgggtgaacatttcttggtgttgttatcttttctttactctctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgc 26830051  T
Q  507 tatgcacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtg 554  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  26830050 tatgcacttggtttatagactaggtttatattgttgttattgcttgtg 26830003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 18 - 552
Target Start/End: Original strand, 5043370 - 5043912
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5043370 agatgagaatcttggagaaccaaaagagagggctcttgggaaaagggttggtgccttttgggaa-gattcatggggttgggaaacacatgagtggagagt 5043468  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgagg-ttagattcta 216  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  5043469 cttttgtgagcaatttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtggaatcaaaggctaagagttggttctcttttgggggttagattcta 5043568  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  5043569 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgtgagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattcgtgagattgagaaaatgagtagaaattaggtttgttctt 5043668  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | ||||    
T  5043669 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtagattggagagatcaatctctcctccatagtagg 5043768  T
Q  415 tca-agttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg----tgtcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatat 509  Q
    |||  |||| |||||||||||| || |    ||||||    | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  5043769 tcattgttggaccgaactgggtgaacatttcttggtgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttatttcttggttggattgtggttttgctat 5043868  T
Q  510 gcacttggtttctagactaggtc--tatattgatgttgttgcttg 552  Q
    |||||| | || |||| ||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  5043869 gcactt-gattatagaataggtctatatattgttgttgttgcttg 5043912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 18 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 2973365 - 2972949
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  2973365 agatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgcttttttgggaagattcatggggttgggaaacacatgaatgcagagt 2973266  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattcta 216  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  2973265 catttgtgaacaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttagggattagattcta 2973166  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2973165 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcataagtgtcgtgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctt 2973066  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||    
T  2973065 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctcaagagtagg 2972966  T
Q  415 tcaagttgaaccgaact 431  Q
    |||||||  ||||||||    
T  2972965 tcaagttcgaccgaact 2972949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 18 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 603506 - 603005
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  603506 agatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgaggaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagtgt 603407  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattcta 216  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  603406 cctttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaatggttggttctcttttgggggttagattcta 603307  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||| | |||||||||    
T  603306 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggatagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagat--------tgggtagaaatttgtgttgttctt 603215  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  603214 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattggagaaatcaatctctccccaagattagg 603115  T
Q  415 tcaagttgaaccgaactgggtcaataacct-ttggtg----tgtc---ttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttga 506  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || || ||| ||    ||||   |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||      
T  603114 tcaagttggaccgaactgggtcaacaatctcttgatgttgttgtctatttttctctactctctttatcttgtttatgccttggttggattgtggttttac 603015  T
Q  507 tatgcacttg 516  Q
    ||||||||||    
T  603014 tatgcacttg 603005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 18 - 557
Target Start/End: Original strand, 17762729 - 17763280
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggat--gattcatggggttgggaaacacatgagtgaaga 115  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17762729 agatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaaggtttggtgccttttgggggttagattcatggggttgggaaacacatgagtggaga 17762828  T
Q  116 gtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattc 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  17762829 gtcttttgggagcaacttgggtgagtcttgtgaaacaaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattc 17762928  T
Q  215 tagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaa-tcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgtt 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17762929 tagagttgggaaacaattgtaaacactttgagagagtgaaaattcatgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgtt 17763028  T
Q  314 ctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagatt 411  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |    
T  17763029 ctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctttttggaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagt 17763128  T
Q  412 aggtcaag-ttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg----tgtcttttc-tttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttg 505  Q
    || ||||| ||| |||||||| ||| || |    ||||||    | ||||||| |||| ||||||||||||||| || | ||||||  ||||| ||||||    
T  17763129 agatcaagtttggaccgaactaggtgaacatttcttggtgttgttatcttttcttttactctctttatcttgttcatcctttggttagattgtagttttg 17763228  T
Q  506 atatgcacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtgatt 557  Q
     |||||||||| | |||||| ||| |||| |||| |||| ||| ||||||||    
T  17763229 ctatgcacttgttatctagattagatctagattgttgttattgtttgtgatt 17763280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 18 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 3809135 - 3808601
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtggggg-ctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagag 116  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3809135 agatgtgaatcttggagaaccaaaagaggggggctcttgtgaaaagggttggttccttttggagaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagag 3809036  T
Q  117 tcttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgaggttagattcta 216  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  3809035 tcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtaaaaccaaaagagaaaatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctttttgggggttagattcta 3808936  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3808935 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcacaagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaataggtagaaattagggttgttctt 3808836  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac---atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattag 413  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  3808835 tgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtag 3808736  T
Q  414 gtcaag-ttgaaccgaactgggtcaataacct-ttggtg----tgtc---ttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggtttt 504  Q
    |||| | ||| |||||||| ||| || || || |||| |    ||||   |||||| || |||||||||||||||||| | ||||||  ||| |||||||    
T  3808735 gtcatgattggaccgaactaggtgaacaatctcttggggttgttgtctatttttctctactctctttatcttgtttatcctttggttagattatggtttt 3808636  T
Q  505 gatatgcacttggtttctagactaggtctatattg 539  Q
    | |||||| ||| |||||||| ||| |||| ||||    
T  3808635 gctatgcatttgttttctagattagatctagattg 3808601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 18 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 22425253 - 22424706
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtggggg--ctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaaga 115  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  22425253 agatgtgaatcttggagaaccaaaagaggggggcctcttgggataagggttggtgcattttggggaagattcatggggttgtgaaacacatgggtgaaga 22425154  T
Q  116 gtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgaggttagattct 215  Q
    ||| |||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  22425153 gtcatttaagagcaacttcggttagtcttgtgaaaccaaaagagaatatccttag-gaaatcaaag-ctaagggttggttctcttttggggttagattat 22425056  T
Q  216 agagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaat-catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttc 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22425055 agagttgggaaacaattgtaaacactttgggagagtgaaaattcatgagtgtcttgttcgttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttc 22424956  T
Q  315 tttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac----atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagat 410  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||     
T  22424955 tttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttttgtatctctttgtaagaactcatt-atagtggattggagagatcaatctctccttcagag 22424857  T
Q  411 taggtca-agttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg----tgtcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttg 505  Q
    |||||||  |||| |||| ||||||| || |    ||||||    | |||||||| || |||||||||||||||||| | | ||||  |||||||||||     
T  22424856 taggtcattgttggaccgtactgggtgaacatttcttggtgttgttatcttttctctactctctttatcttgtttatccttaggttagattgtggttttt 22424757  T
Q  506 at--atgcacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtg 554  Q
     |  |||||||||||||||| | ||| |||| |||| |||||||| |||||    
T  22424756 ttcaatgcacttggtttctatattagatctagattgttgttgttgtttgtg 22424706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 257 - 554
Target Start/End: Original strand, 21588913 - 21589216
Alignment:
Q  257 tcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgta 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  21588913 tcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 21589012  T
Q  355 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg---- 450  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| || |    ||||||        
T  21589013 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttggtgttgt 21589112  T
Q  451 tgtcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatatgcacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgct 550  Q
    | ||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  21589113 tatcttttctttactttccttatcttgtttattccttagttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattgttgttattgct 21589212  T
Q  551 tgtg 554  Q
    ||||    
T  21589213 tgtg 21589216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 9183255 - 9183019
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9183255 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 9183157  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  9183156 gtgaatttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagattatgt 9183057  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  9183056 caagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgt 9183019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 219 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 28137632 - 28137420
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28137632 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagaatgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 28137534  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  28137533 gtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatttctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggt 28137434  T
Q  416 caagttgaaccgaa 429  Q
    ||||||| ||||||    
T  28137433 caagttggaccgaa 28137420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 5406422 - 5406187
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5406422 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggttgttcttt 5406326  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||  ||||  ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  5406325 gtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 5406226  T
Q  416 caag-ttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||| |||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  5406225 caagtttgaaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgt 5406187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 5410747 - 5410512
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5410747 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggttgttcttt 5410651  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||  ||||  ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  5410650 gtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 5410551  T
Q  416 caag-ttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||| |||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  5410550 caagtttgaaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgt 5410512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 219 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 26954509 - 26954277
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  26954509 gttgggaaaca-ttgtaaacacctttggggagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatatgtgagattgggaaattgg-tataaattagggttgttcttt 26954412  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||    
T  26954411 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatctgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaagtaggt 26954312  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg 450  Q
    ||||||| |||||||| |||||| || ||||||||    
T  26954311 caagttggaccgaactaggtcaacaatctttggtg 26954277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 219 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 33211409 - 33211177
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  33211409 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtcactgaaaatcattgagtgttttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattatggttgttcttt 33211311  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  33211310 gtgagcttgatgaagttaatttcttgtagctcatttgtatctctttgtaagaactcatttataatggattggagagatcaatctctcccccagagtaggt 33211211  T
Q  416 caagttgaaccgaactgggtcaataacctttggt 449  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  33211210 caagttggaccgaactgggtcaacaatctttggt 33211177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 247 - 552
Target Start/End: Original strand, 17757994 - 17758308
Alignment:
Q  247 agagtgaaaat-catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgta 345  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17757994 agagtgaaaattcatgagtgtcttcttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgta 17758093  T
Q  346 a--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggtcaataac 442  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||| ||| ||||| ||| |||||||| ||| || |      
T  17758094 acccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctcccctctagagtagttcaagtttggaccgaactaggtgaacatt 17758193  T
Q  443 ctttggtg----tgtcttttc-tttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatatgcacttggtttctagactaggtctatat 537  Q
      ||||||    | ||||| | ||||  ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||| ||    
T  17758194 tcttggtgttgttatctttccttttacgctctttatcttgtttatcctttggttagattgtggttttgctatgcacttgttttctagattagatctagat 17758293  T
Q  538 tgatgttgttgcttg 552  Q
    || |||| |||||||    
T  17758294 tgttgttattgcttg 17758308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 219 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 3039127 - 3038926
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  3039127 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgaatgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcatt 3039029  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  3039028 gtgagctttttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactctttaatagtggattggagagattaatctctcccccagattaggt 3038929  T
Q  416 caa 418  Q
    |||    
T  3038928 caa 3038926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 219 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 2171754 - 2171537
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  2171754 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggttgttcttt 2171657  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa-catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtc 416  Q
    ||||  ||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  2171656 gtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccctttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtc 2171557  T
Q  417 aag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    ||| ||| ||||||||||||    
T  2171556 aagtttggaccgaactgggt 2171537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 230 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 30834750 - 30834523
Alignment:
Q  230 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat-gggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgt 327  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  30834750 attgtaaacacctcggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 30834652  T
Q  328 tgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaa 424  Q
      ||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |    
T  30834651 caaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 30834552  T
Q  425 ccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  30834551 ccgaactgggtgaataatctttggtgtgt 30834523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 230 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 31404887 - 31404662
Alignment:
Q  230 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgtt 328  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  31404887 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatcagtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtc 31404790  T
Q  329 gaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaac 425  Q
     ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||| ||| ||    
T  31404789 aaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggccaagtttggac 31404690  T
Q  426 cgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||||||||| || || |||||||||||    
T  31404689 cgaactgggtgaacaatctttggtgtgt 31404662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 219 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 5413616 - 5413401
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  5413616 gttgggaaaca-ttgtaaacacattggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggttgttcttt 5413520  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    | ||  ||||  ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  5413519 gcgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 5413420  T
Q  416 caag-ttgaaccgaactgg 433  Q
    |||| ||| ||||||||||    
T  5413419 caagtttggaccgaactgg 5413401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 230 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 16452543 - 16452316
Alignment:
Q  230 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat-gggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgt 327  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  16452543 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 16452445  T
Q  328 tgaagctaatttcttgtaacatttg--tatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaa 424  Q
      ||||||||||||||||||  ||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |    
T  16452444 caaagctaatttcttgtaaccctttcatatctctttggaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 16452345  T
Q  425 ccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||    
T  16452344 ccgaactgggtgaacaatctttggtgtgt 16452316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 187
Target Start/End: Original strand, 17757824 - 17757995
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggat--gattcatggggttgggaaacacatgagtgaaga 115  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17757824 agatgtgaatgttggagaaccaaaatagggggctcttgtgaaaagggttggtgcattttgggggttagattcatggggttgggaaacacatgagtggaga 17757923  T
Q  116 gtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaag 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  17757924 gtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaacaaaaagagaagatcatcagtgaaatcaaaggctaag 17757995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 217 - 407
Target Start/End: Original strand, 4045364 - 4045558
Alignment:
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggg-ttgttc 314  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  4045364 gagttgggaaacatttgtaaacacctagggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgtttattggagagattgggaaaat-ggtagaaattagggtttgttc 4045462  T
Q  315 tttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa-ca-tttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctccccca 407  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  4045463 tttatgagcttgttgaagctaatttcttgtaatcattttatatctctttgtaaataactcattgatagtggattggagagatcaatttctacccca 4045558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 33160577 - 33160339
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaa-tcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagggttgttct 315  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||    
T  33160577 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaaatcattgagtgtcttattcattggtgagattgggaaaaaaaggtagaaattagagttgttct 33160480  T
Q  316 ttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattag 413  Q
    ||||||  ||||  ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||     
T  33160479 ttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatggtggattggagagatcaatctctcctccagagtat 33160380  T
Q  414 gtcaag-ttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
     ||||| ||| ||| |||||||| || || |||||||||||    
T  33160379 ttcaagtttggaccaaactgggtgaacaatctttggtgtgt 33160339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 279 - 453
Target Start/End: Original strand, 16569037 - 16569202
Alignment:
Q  279 tgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacatttgtatctctttgtaagaactcattgat 377  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||    
T  16569037 tgagattgagaaaatgggtagaaattaggttttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaac----------ctttgtaagaactcattgat 16569126  T
Q  378 agtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16569127 agtggattggagagatcaatctctcctccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgt 16569202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 318 - 554
Target Start/End: Original strand, 26800630 - 26800873
Alignment:
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca---tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  26800630 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactaattttgtatctctttgtaagaactcatt-atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 26800728  T
Q  415 tca-agttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg----tgtcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatat 509  Q
    |||  |||| |||||||||| | || |    ||||||    | |||||||| || ||| ||||||||||||||   ||||||  |||||||||||| |||    
T  26800729 tcattgttggaccgaactggatgaacatttcttggtgttgttatcttttctctactctttttatcttgtttatcttttggttagattgtggttttgctat 26800828  T
Q  510 gcacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtg 554  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||    
T  26800829 gcacttgttttctagactagatctagattgttgttattgcttgtg 26800873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 172 - 402
Target Start/End: Original strand, 25073463 - 25073698
Alignment:
Q  172 gaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgagg-ttagattctagagttgggaaacaattgt-aaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtct 268  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||| |||| |||| |||    
T  25073463 gaaattaaaggctaagggttgattctcttttgggggttagattctagagttgggaaacaattgggaaacatcttgggtgagtgaaa-tcattgagtatct 25073561  T
Q  269 tgttcattggtg-agattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctctttgtaa 365  Q
    ||||||| || | ||||||  ||||||| ||||||||||  || ||||| ||||| ||||| |||||| ||| |||||||   ||||||||||| |||||    
T  25073562 tgttcatgggaggagattgaaaaaatgg-tagaaattagatttattcttcgtgagcttgttaaagctattttattgtaacccttttgtatctctatgtaa 25073660  T
Q  366 -gaactcattgatagtggattggagatatcaatctctc 402  Q
     |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  25073661 agaactcattgatagtggattagagaaatcaatctctc 25073698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 3072928 - 3072764
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca---tttgtatctcttt-gtaagaact 370  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||  || |||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||    
T  3072928 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaact 3072830  T
Q  371 cattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  3072829 cattgatagtgaattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 3072764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 412101 - 412265
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca---tttgtatctcttt-gtaagaact 370  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||  || |  || |||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||    
T  412101 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggttgttcattgtgaacttatcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaact 412199  T
Q  371 cattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  412200 cattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 412265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 6097608 - 6097456
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacatttgtatctctttgtaagaactcatt 374  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||  || |||||||||||||||       ||| ||||||||||||||||    
T  6097608 ttggtgagattggaaaaatgg-tagaaattaggattgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaac-------tct-tttgtaagaactcatt 6097518  T
Q  375 gatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  6097517 gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 6097456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 140
Target Start/End: Original strand, 26800533 - 26800634
Alignment:
Q  38 caaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggt 137  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  26800533 caaaagagggggctcttgggaaaaaggttggtgccttttggggaagattcat-gggatgggaaacacatgagtggagagtctattgagagcaacttgggt 26800631  T
Q  138 gag 140  Q
    |||    
T  26800632 gag 26800634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 349 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 5409161 - 5409076
Alignment:
Q  349 tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgg 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  5409161 tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 5409076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 114 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 5741120 - 5740978
Alignment:
Q  114 gagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggtt-ctcttttgaggttagat 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||    
T  5741120 gagtcttttgtgagcaatttgggtgaatcttgagaaacaaaaagtgaagatccttagt-aaatcaaaggctaagggttggttacttttggggggttagat 5741022  T
Q  213 tctagagttgggaaacaatt-gtaaacaccttgggagagtgaaa 255  Q
    |||| |||||| |||||||| | ||||||||| || ||||||||    
T  5741021 tctaaagttggaaaacaattggaaaacaccttcggtgagtgaaa 5740978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 27647861 - 27648023
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacattt-gtatctcttt-gtaagaactc 371  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||  |||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||    
T  27647861 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc 27647958  T
Q  372 attgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
     ||||||||||||||||||   ||| |||||| ||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  27647959 tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtagatcaagtttggaccgaactgggt 27648023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 16554869 - 16555032
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacattt-gtatctcttt-gtaagaactc 371  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||  |||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||    
T  16554869 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc 16554966  T
Q  372 att-gatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    ||| ||||||||||||||||   ||| |||||| ||| | ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  16554967 atttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccaaagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 16555032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 16578686 - 16578523
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacattt-gtatctcttt-gtaagaactc 371  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||  ||||  |||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||    
T  16578686 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgctcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc 16578589  T
Q  372 att-gatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    ||| ||||||||||||||||   ||| |||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  16578588 atttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 16578523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 16616694 - 16616857
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacattt-gtatctcttt-gtaagaactc 371  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||  ||||  |||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||    
T  16616694 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgctcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc 16616791  T
Q  372 att-gatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    ||| ||||||||||||||||   ||| |||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  16616792 atttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 16616857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 16631425 - 16631588
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacattt-gtatctcttt-gtaagaactc 371  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||  |||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||    
T  16631425 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc 16631522  T
Q  372 att-gatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    ||| ||||||||||||||||   ||| |||||| ||| | ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  16631523 atttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccaaagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 16631588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 16653112 - 16653275
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacattt-gtatctcttt-gtaagaactc 371  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||  ||||  |||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||    
T  16653112 ttggtgagattgggaaaa-gggtaaaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc 16653209  T
Q  372 att-gatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    ||| ||||||||||||||||   ||| |||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  16653210 atttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 16653275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 25421305 - 25421469
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacat-ttgtatctcttt-gtaa-gaact 370  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||  ||||  |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||| |||||    
T  25421305 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaact 25421402  T
Q  371 catt-gatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    |||| ||||||||||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  25421403 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 25421469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 243
Target Start/End: Original strand, 11660452 - 11660574
Alignment:
Q  120 tttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgaggttagattctagag 219  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||  || |||||||||| | | || ||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  11660452 tttgtgagcaatttggatgaatcttgggagaccaaaagaggataaccatag-gaattcaaaggctaagggttggttca-ttttggggttagattctagag 11660549  T
Q  220 ttgggaaacaa-ttgtaaacacctt 243  Q
    || |||||||| |||||||||||||    
T  11660550 ttcggaaacaatttgtaaacacctt 11660574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 6027246 - 6027410
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacat-ttgtatctcttt-gtaa-gaact 370  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||  ||||  |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||| |||||    
T  6027246 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaact 6027343  T
Q  371 catt-gatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    |||| ||||||||||||||||   |||||||||| ||||| || |||||| ||| ||||||||||||    
T  6027344 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtatgtcaagtttggaccgaactgggt 6027410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 230 - 343
Target Start/End: Original strand, 16567160 - 16567265
Alignment:
Q  230 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-gttgttctttgtgagtttgt 327  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||          ||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  16567160 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg----------agattgggaaaatggttagaaattaggttttgttttttgtgagcttgt 16567249  T
Q  328 tgaagctaatttcttg 343  Q
    | ||||||||||||||    
T  16567250 ttaagctaatttcttg 16567265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 465 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 2972908 - 2972818
Alignment:
Q  465 tctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttga-tatgcacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtg 554  Q
    ||||| ||||||||||||   ||||||  |||||||||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  2972908 tctctatatcttgtttatcatttggttagattgtggttttttctatgcacttagtttatagactaggtctatattgttgttgttgtttgtg 2972818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 13153913 - 13154078
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacat-ttgta-tctctttgt-aagaact 370  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||   |  | |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||| |||||||    
T  13153913 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaact 13154011  T
Q  371 ca-ttgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    || ||||||||||||||||||   ||| |||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  13154012 catttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 13154078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 33342275 - 33342110
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacat-ttgta-tctctttgt-aagaact 370  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||   |  | |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||| |||||||    
T  33342275 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtactccttttgtaaagaact 33342177  T
Q  371 ca-ttgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    || ||||||||||||||||||   ||| |||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  33342176 catttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 33342110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 34164856 - 34165021
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacat-ttgta-tctctttgt-aagaact 370  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||   |  | |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||| |||||||    
T  34164856 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaact 34164954  T
Q  371 ca-ttgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    || ||||||||||||||||||   ||| |||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  34164955 catttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 34165021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 1230293 - 1230252
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  1230293 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 1230252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 4816275 - 4816234
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  4816275 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 4816234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 5273260 - 5273219
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  5273260 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 5273219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 5757527 - 5757568
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  5757527 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 5757568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 11983073 - 11983032
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  11983073 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 11983032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 14458811 - 14458770
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  14458811 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 14458770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 14507220 - 14507179
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  14507220 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 14507179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 19704611 - 19704570
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  19704611 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 19704570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 20915400 - 20915359
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  20915400 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 20915359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 25072928 - 25073076
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggat-gattcatggggttgggaaacacatgagtgaagag 116  Q
    |||||||||||||  |||| | |||| ||||||||||| |||||||| | |||||| ||||| |  ||||||| ||||| |||||||||| |  | ||||    
T  25072928 agatgtgaatctttgagaacccaaag-gggggctcttg-gaaaagggattgtgcctcttgggaagagattcatagggtttggaaacacatcaaaggagag 25073025  T
Q  117 tcttt-tgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatcctt 168  Q
    ||||| |||||  ||||||| |  |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25073026 tctttatgtga--aacttggataggtcttgggaaaccaaaagagaagatcctt 25073076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 364 - 400
Target Start/End: Original strand, 2908550 - 2908586
Alignment:
Q  364 aagaactcattgatagtggattggagatatcaatctc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  2908550 aagaactcattgatagtggattgaagaaatcaatctc 2908586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 350 - 401
Target Start/End: Original strand, 9572667 - 9572719
Alignment:
Q  350 ttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagatatcaatctct 401  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  9572667 ttgtaactctttgttaagaacccattgatagtggattgcagagatcaatctct 9572719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 18 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 18427 - 17885
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttgggg-atgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagag 116  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||  ||||||||||||| ||||    
T  18427 agatgtgaatcttggagaacaaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttgggggaagattcatgaggttga-aaacacatgagtggagag 18329  T
Q  117 tcttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgaggttagattcta 216  Q
    |  ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  18328 ttatttgtgagcaacttgagtgagtcttgtaaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaagactaagagttggttctcttttggggttagattata 18229  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  18228 gagttgg-aaacaattgtaaacactttgggagagtgaaaatcatgagtgttttgttcattggtgagagtgggaaaattggtagaaattagggttgttcat 18130  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||    
T  18129 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaa-aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagggtagg 18031  T
Q  415 tcaag-ttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg----tgtcttttctttattctctttatcttgtttattcc-ttggttgaattgtggttttgata 508  Q
    ||||| ||| | |||||||||| || |    ||||||    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||    
T  18030 tcaagtttggatcgaactgggtgaacatttcttggtgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttattcctttggttagattgtggttttgcta 17931  T
Q  509 tgcacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtg 554  Q
    |||| ||| |||||||| ||| |||| |||| |||| |||||||||    
T  17930 tgcatttgttttctagattagatctagattgttgttattgcttgtg 17885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 265; Significance: 1e-147; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 18 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 80709 - 80338
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  80709 agatttgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttatgaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagcggagagt 80610  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattcta 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  80609 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttgggaaactaaaagagtagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctattttgggggttagattcta 80510  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80509 gagttaggaaacaattgtgaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgctgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 80410  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattg 386  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  80409 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgcaacccatttgtatctttttgtaagaactcatagatagtgaattg 80338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 18 - 435
Target Start/End: Original strand, 11300 - 11720
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtgaagagt 117  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11300 agatgtgaatcttggagaaccaaaagatggggctcttggggaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagt 11399  T
Q  118 cttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctc-ttttgaggttagattcta 216  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  11400 catttctgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatcattagtaaaatcaaaggctaaaggttgtttctctttttggggttagattcta 11499  T
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttct 315  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  11500 gagttgggaaac-attgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggttgttct 11597  T
Q  316 ttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattag 413  Q
    ||||||  ||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||    
T  11598 ttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtag 11697  T
Q  414 gtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    |||||| ||| ||||||||||||    
T  11698 gtcaagtttggaccgaactgggt 11720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 142; Significance: 3e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 230 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 149311 - 149087
Alignment:
Q  230 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgtt 328  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  149311 attgtaaacaccttggggtagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaacggatagaaattagggttgttttttgtaagcttgtt 149212  T
Q  329 gaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaacc 426  Q
    |||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  149211 gaagctaatttcttgttacccatttatatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggttaagttggacc 149112  T
Q  427 gaactgggtcaataacctttggtgt 451  Q
    |||||||||||| || |||||||||    
T  149111 gaactgggtcaacaatctttggtgt 149087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 5731 - 5690
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  5731 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 5690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 140; Significance: 5e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 230 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 20629 - 20403
Alignment:
Q  230 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgtt 328  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||  |||||    
T  20629 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtttattattcattggtgagattgggaaaatgagcagaaattaggtttgttttttgtgaacttgtt 20530  T
Q  329 gaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaacc 426  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20529 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactctttgatattggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggacc 20430  T
Q  427 gaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||    
T  20429 gaactgggtcaacaatttttggtgtgt 20403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 127; Significance: 3e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 219 - 452
Target Start/End: Original strand, 114547 - 114782
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  114547 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattaaggttgttcttt 114644  T
Q  318 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggt 415  Q
    ||||  ||||  |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  114645 gtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacgcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 114744  T
Q  416 caagttga-accgaactgggtcaataacctttggtgtg 452  Q
     ||||| | |||||||||| | || || ||||||||||    
T  114745 taagtttagaccgaactggatgaacaatctttggtgtg 114782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 116; Significance: 1e-58; HSPs: 3)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 248 - 453
Target Start/End: Original strand, 434504 - 434714
Alignment:
Q  248 gagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattggg-aaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgta 345  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||    
T  434504 gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggggaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgta 434603  T
Q  346 aca--tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggtcaataac 442  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||| || ||     
T  434604 acccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 434703  T
Q  443 ctttggtgtgt 453  Q
     ||||||||||    
T  434704 atttggtgtgt 434714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 490870 - 490661
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggat-gattcatggggttgggaaacacatgagtgaagag 116  Q
    |||||||||||||| |||| |||||  |||||||||| || | ||||||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||||||| |  | ||||    
T  490870 agatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctctt-tggagagggttggtgcctttaggtgagagattcatgggattgggaaacacatcaaaggagag 490772  T
Q  117 tcttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgaggttagattcta 216  Q
    | |||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||| | ||| |||| ||||||||| |||| || |||||||  ||| | ||||||| ||||    
T  490771 t-ttttatgagcaacttgggcgagtcttacgagaccaaaagagtatatcattag-gaaatcaaaagctacggattggttccttttaggggttagaatcta 490674  T
Q  217 gagttgggaaaca 229  Q
    |||||||||||||    
T  490673 gagttgggaaaca 490661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 296 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 490468 - 490359
Alignment:
Q  296 gtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagata 392  Q
    |||||||||| | |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |  ||||| |    
T  490468 gtagaaattaagtttgttcttggagagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatatctttgtaaagtactcattgatagtgaagcggagaga 490369  T
Q  393 tcaatctctc 402  Q
    ||| ||||||    
T  490368 tcattctctc 490359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 109; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 219 - 453
Target Start/End: Original strand, 861 - 1096
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat-gggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  861 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttc-ttggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctt 957  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa--catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattagg 414  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||||||  | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||    
T  958 tgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg-aacaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtagg 1056  T
Q  415 tcaag-ttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 453  Q
    ||||| ||| |||||||||||| || || |||||||||||    
T  1057 tcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgt 1096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 100; Significance: 4e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 219 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 11385 - 11150
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattggga-aaatgggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  11385 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgtaaatcattgagtgtcttgttc-ttggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggttgttctt 11289  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattag 413  Q
    |||||  ||||  || |||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||    
T  11288 tgtgaacttgtaaaatctaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgtaagaactcgttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtag 11189  T
Q  414 gtcaag-ttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgt 451  Q
    |||||| ||| |||||||||||| || || |||||||||    
T  11188 gtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgt 11150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 219 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 8959 - 8724
Alignment:
Q  219 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattggga-aaatgggtagaaattagggttgttctt 316  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  8959 gttgggaaaca-ttgtaaagaccttggt-gagtgtaaaccattgagtgtcttgttc-ttggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggttgttctt 8863  T
Q  317 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattag 413  Q
    |||||  || |  || |||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||    
T  8862 tgtgaacttataaaatctaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgtaagaactcgttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtag 8763  T
Q  414 gtcaag-ttgaaccgaactgggtcaataacctttggtgt 451  Q
    |||||| ||| |||||||||||| || || |||||||||    
T  8762 gtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgt 8724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 260 - 554
Target Start/End: Original strand, 10475 - 10775
Alignment:
Q  260 tgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaaca--tttgtatc 356  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||  | || ||||||||||| |||||||||||| |  |||  |||||||| |||||||   ||||||||    
T  10475 tgagtgtcttgttcatttgtgagattggaaaaaaagatataaattagggtttgttctttgtgagctc-ttgt-gctaatttattgtaaccattttgtatc 10572  T
Q  357 tctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg----tg 452  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| || |    ||||||    |     
T  10573 tctttgtaagaactcgttgatagtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtaaacatttcttggtgttgtta 10672  T
Q  453 tcttttctttattctc-tttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatatgcacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgctt 551  Q
    ||||| || || |||| |||||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||| |||| |||||||||||    
T  10673 tctttcctctactctcttttatcttgtttattctttgattagattgtagttttactatacacttgatttctagattaaatctagattgttgttgttgctt 10772  T
Q  552 gtg 554  Q
    |||    
T  10773 gtg 10775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 217 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 27670 - 27466
Alignment:
Q  217 gagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggt-gagattgggaaaatgggtagaaattaggg-ttgttc 314  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    ||||| ||||||||   ||  ||||||| ||||| | |||||||||| |  ||||||    
T  27670 gagttgggaaacatttgtaaacaccttggatgagtgaaatctttgagtctcttgttctagggaagagattgtgaaaa-gagtagaaattatgtattgttc 27572  T
Q  315 tttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgtaag-aactcattgatagtggattggagatatcaatctctcccccagatt 411  Q
    ||   ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |    
T  27571 ttgaagagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaaataacttattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatagt 27472  T
Q  412 aggtca 417  Q
    ||||||    
T  27471 aggtca 27466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 1831 - 1591
Alignment:
Q  18 agatgtgaatcttgaagaatcaaaagtgggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggat-gattcatggggttgggaaacacatgagtgaagag 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |  | || |||||| |||||| |||  ||||||||  |||| ||||||||| |    ||||    
T  1831 agatgtgaatcttgaagaaccaaaagaggggactcttgggcga-ggcttggtgtcttttgtggagagattcatgtagttgagaaacacatcatatgagag 1733  T
Q  117 tcttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggct----------aagggttggttctcttttgagg 206  Q
    || || |||||||||||||| |||||||  || | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||          ||| ||||||||||||||| ||    
T  1732 tcatt-gtgagcaacttgggcgagtcttgggagatcaaaagagaagatccttag-gaaatcaaaagcttataacttataagtgttggttctcttttgggg 1635  T
Q  207 ttagattctagagttgggaaacaatt-gtaaacaccttgggaga 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  1634 ttagattctagagttgggaaacaattagaaaacaccttgggaga 1591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 453 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 1379 - 1293
Alignment:
Q  453 tcttttctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatatgcacttggtttctagactaggtctatattg 539  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||  | | ||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  1379 tcttctctttactctctttatcttatttattttttggtttgattgtggttttactttacacttggtttctagattagatctagattg 1293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 56; Significance: 7e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 209 - 381
Target Start/End: Original strand, 24986 - 25162
Alignment:
Q  209 agattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcat-tggtgagatt-gggaaaatgggtagaaatta 305  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||| |||  ||   ||||| |||||||||| |||||| ||    
T  24986 agattcttgggtttggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaa-tcattgagtctgttgatcacatgacaagattcgggaaaatgg-tagaaacta 25083  T
Q  306 gggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac--atttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtg 381  Q
    |  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25084 gttttgttctttgagagtttgttgaaggtaatttcttgtaacctttttgtatctctttgtaaagaactcattgatagtg 25162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 2773 - 2609
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacat-ttgtatctcttt-gtaa-gaact 370  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||  ||||  |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||| |||||    
T  2773 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaact 2676  T
Q  371 catt-gatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    |||| ||||||||||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  2675 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 2609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 3895 - 3731
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacat-ttgta-tctctttgt-aagaact 370  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||   |||  |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||| |||||||    
T  3895 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacatgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaact 3798  T
Q  371 ca-ttgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    || ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  3797 catttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 3731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 6272 - 6436
Alignment:
Q  275 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaa-catttgtatctc-tttgt-aagaact 370  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||  ||||  ||||||||||||||||| |  ||||||| | ||||| |||||||    
T  6272 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaagcccttgtatcccttttgtaaagaact 6369  T
Q  371 ca-ttgatagtggattggagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 435  Q
    || ||||||||||||||||||   ||| |||||| ||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  6370 catttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggttaagtttggaccgaactgggt 6436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 1497 - 1456
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  1497 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 1456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 8468 - 8509
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  8468 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 8509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 45301 - 45260
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  45301 tctctcccccagattaggtcatattgaaccgaactgagtcaa 45260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 29414 - 29455
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  29414 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 29455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 69336 - 69295
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaa 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  69336 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 69295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 397 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 10777 - 10733
Alignment:
Q  397 tctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaataa 441  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  10777 tctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaataa 10733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University