View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6144_low_4 (Length: 329)

Name: NF6144_low_4
Description: NF6144
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6144_low_4
NF6144_low_4
[»] chr5 (94 HSPs)
chr5 (22-317)||(10463737-10464032)
chr5 (22-317)||(8336843-8337137)
chr5 (22-317)||(8313209-8313503)
chr5 (22-317)||(27307819-27308114)
chr5 (22-317)||(37103032-37103327)
chr5 (22-317)||(34785250-34785544)
chr5 (22-315)||(1683165-1683458)
chr5 (22-317)||(4426022-4426317)
chr5 (22-317)||(24636938-24637234)
chr5 (22-317)||(27335630-27335925)
chr5 (22-317)||(40158265-40158559)
chr5 (22-313)||(621626-621917)
chr5 (22-317)||(8404394-8404690)
chr5 (22-317)||(17742333-17742621)
chr5 (22-317)||(4462756-4463051)
chr5 (22-317)||(42877612-42877905)
chr5 (25-317)||(41139025-41139318)
chr5 (75-317)||(2003952-2004194)
chr5 (22-317)||(13920063-13920358)
chr5 (29-317)||(41192983-41193272)
chr5 (22-317)||(8218011-8218293)
chr5 (22-317)||(34527030-34527313)
chr5 (22-215)||(38693466-38693659)
chr5 (22-317)||(31211187-31211484)
chr5 (22-214)||(34010025-34010217)
chr5 (146-322)||(22023191-22023367)
chr5 (25-317)||(2005023-2005316)
chr5 (25-317)||(30394080-30394372)
chr5 (22-200)||(9687531-9687710)
chr5 (22-317)||(43440873-43441155)
chr5 (22-202)||(28456624-28456803)
chr5 (22-214)||(42852826-42853018)
chr5 (21-317)||(4461961-4462245)
chr5 (74-317)||(18261230-18261471)
chr5 (22-286)||(37446436-37446695)
chr5 (22-317)||(26865706-26865975)
chr5 (25-158)||(21837098-21837231)
chr5 (22-310)||(10674648-10674936)
chr5 (22-126)||(22023097-22023201)
chr5 (71-308)||(22166923-22167161)
chr5 (234-317)||(9687715-9687798)
chr5 (35-310)||(43210639-43210914)
chr5 (25-191)||(3548350-3548514)
chr5 (72-157)||(9924401-9924486)
chr5 (74-310)||(2262845-2263081)
chr5 (109-315)||(40272459-40272665)
chr5 (183-296)||(9924280-9924393)
chr5 (25-212)||(30733927-30734113)
chr5 (22-166)||(14049755-14049899)
chr5 (174-317)||(16965878-16966021)
chr5 (22-112)||(18950869-18950959)
chr5 (25-212)||(30698685-30698872)
chr5 (74-310)||(19332468-19332704)
chr5 (102-188)||(9168631-9168717)
chr5 (108-212)||(24334012-24334117)
chr5 (229-317)||(6365421-6365508)
chr5 (25-210)||(27280258-27280445)
chr5 (22-212)||(28616025-28616218)
chr5 (72-298)||(36875874-36876099)
chr5 (108-212)||(6450138-6450243)
chr5 (108-212)||(14711580-14711685)
chr5 (108-212)||(19928521-19928626)
chr5 (248-317)||(26865232-26865301)
chr5 (108-184)||(5597738-5597814)
chr5 (108-212)||(22981985-22982089)
chr5 (113-212)||(27432463-27432563)
chr5 (112-277)||(43209932-43210097)
chr5 (108-212)||(7234513-7234618)
chr5 (108-212)||(7572982-7573087)
chr5 (252-317)||(8217510-8217575)
chr5 (108-212)||(8315563-8315668)
chr5 (108-212)||(18404367-18404471)
chr5 (108-212)||(27189067-27189172)
chr5 (276-317)||(28456585-28456626)
chr5 (108-212)||(34818914-34819019)
chr5 (108-212)||(41906859-41906964)
chr5 (108-212)||(42992488-42992593)
chr5 (113-212)||(4291691-4291790)
chr5 (231-278)||(42852775-42852822)
chr5 (108-212)||(4034668-4034773)
chr5 (108-212)||(4123195-4123300)
chr5 (108-212)||(20453030-20453135)
chr5 (108-212)||(24090058-24090163)
chr5 (108-212)||(2567415-2567519)
chr5 (231-310)||(32537608-32537687)
chr5 (108-212)||(33010407-33010511)
chr5 (230-310)||(37812678-37812757)
chr5 (262-317)||(38693676-38693731)
chr5 (232-286)||(14049943-14049997)
chr5 (108-212)||(18740683-18740788)
chr5 (108-192)||(19000586-19000671)
chr5 (108-212)||(22670979-22671083)
chr5 (22-50)||(2004211-2004239)
chr5 (273-317)||(37446329-37446373)
[»] chr1 (105 HSPs)
chr1 (22-317)||(30719479-30719775)
chr1 (15-317)||(51561340-51561642)
chr1 (15-317)||(13501206-13501506)
chr1 (22-317)||(19791239-19791533)
chr1 (22-315)||(26020399-26020692)
chr1 (22-317)||(52493528-52493824)
chr1 (22-317)||(33708945-33709240)
chr1 (72-296)||(47008697-47008920)
chr1 (22-322)||(35530781-35531081)
chr1 (80-317)||(28700954-28701192)
chr1 (22-317)||(30982382-30982677)
chr1 (22-317)||(36367890-36368185)
chr1 (22-317)||(26805491-26805786)
chr1 (22-313)||(11999722-12000013)
chr1 (25-317)||(43504775-43505059)
chr1 (22-314)||(10041240-10041532)
chr1 (22-209)||(46517172-46517359)
chr1 (22-313)||(12368243-12368521)
chr1 (25-317)||(31400219-31400512)
chr1 (22-317)||(46596776-46597070)
chr1 (22-317)||(36248333-36248619)
chr1 (71-317)||(15053640-15053873)
chr1 (24-317)||(21091051-21091342)
chr1 (25-215)||(39681895-39682087)
chr1 (32-212)||(7565189-7565370)
chr1 (71-315)||(33707419-33707663)
chr1 (22-147)||(37986744-37986869)
chr1 (25-179)||(2059484-2059636)
chr1 (93-310)||(12251439-12251656)
chr1 (25-311)||(31024058-31024345)
chr1 (229-314)||(21794413-21794498)
chr1 (93-310)||(49767693-49767910)
chr1 (74-210)||(12897143-12897280)
chr1 (22-140)||(21794511-21794629)
chr1 (109-310)||(27550800-27551001)
chr1 (22-211)||(48410250-48410439)
chr1 (230-317)||(37986902-37986989)
chr1 (102-212)||(52881692-52881803)
chr1 (74-212)||(52882360-52882499)
chr1 (74-188)||(27551561-27551675)
chr1 (242-315)||(2059078-2059151)
chr1 (93-310)||(11397039-11397256)
chr1 (25-212)||(5430567-5430754)
chr1 (109-255)||(49768495-49768642)
chr1 (93-188)||(25352083-25352178)
chr1 (29-124)||(42972161-42972256)
chr1 (108-212)||(4574069-4574173)
chr1 (248-317)||(12367703-12367772)
chr1 (71-188)||(35188303-35188419)
chr1 (108-212)||(47632647-47632752)
chr1 (93-188)||(52009992-52010087)
chr1 (112-212)||(4486934-4487035)
chr1 (108-212)||(10383083-10383188)
chr1 (108-212)||(14421270-14421375)
chr1 (108-212)||(17964112-17964217)
chr1 (108-212)||(31861617-31861722)
chr1 (108-212)||(34076052-34076157)
chr1 (108-212)||(35767019-35767124)
chr1 (108-212)||(45336445-45336550)
chr1 (108-212)||(48624258-48624363)
chr1 (108-212)||(48723525-48723630)
chr1 (231-315)||(13083446-13083529)
chr1 (231-315)||(42971953-42972036)
chr1 (262-317)||(29231884-29231939)
chr1 (114-212)||(36796033-36796132)
chr1 (108-212)||(4647182-4647287)
chr1 (248-317)||(15054418-15054487)
chr1 (82-211)||(18996977-18997104)
chr1 (108-212)||(25136942-25137047)
chr1 (108-212)||(26451181-26451286)
chr1 (108-212)||(26507607-26507712)
chr1 (249-314)||(36249086-36249151)
chr1 (248-317)||(37986209-37986278)
chr1 (171-213)||(2059154-2059196)
chr1 (119-212)||(14007043-14007137)
chr1 (22-56)||(29231368-29231402)
chr1 (235-277)||(48410160-48410202)
chr1 (108-212)||(2207588-2207693)
chr1 (108-212)||(10371577-10371682)
chr1 (108-212)||(14410934-14411039)
chr1 (108-212)||(46667617-46667722)
chr1 (117-212)||(15358344-15358440)
chr1 (80-132)||(20357120-20357172)
chr1 (80-132)||(20562783-20562835)
chr1 (108-195)||(52526859-52526947)
chr1 (231-310)||(25351963-25352041)
chr1 (108-194)||(26136191-26136278)
chr1 (231-310)||(48218060-48218138)
chr1 (108-194)||(52760518-52760604)
chr1 (175-212)||(1297017-1297055)
chr1 (29-63)||(6216382-6216416)
chr1 (119-212)||(14743945-14744039)
chr1 (232-286)||(26207493-26207547)
chr1 (25-63)||(28479931-28479969)
chr1 (119-212)||(31266968-31267062)
chr1 (116-212)||(48468233-48468331)
chr1 (262-315)||(1297104-1297156)
chr1 (108-212)||(4008803-4008908)
chr1 (108-212)||(7603718-7603823)
chr1 (108-212)||(10658611-10658716)
chr1 (108-212)||(26911163-26911268)
chr1 (108-212)||(32037258-32037363)
chr1 (108-212)||(45583556-45583660)
chr1 (25-61)||(33707619-33707655)
chr1 (108-168)||(42972086-42972146)
[»] chr4 (104 HSPs)
chr4 (22-317)||(53323774-53324070)
chr4 (22-317)||(30331278-30331573)
chr4 (22-317)||(33177421-33177716)
chr4 (15-317)||(19522712-19523014)
chr4 (22-317)||(47309434-47309729)
chr4 (22-317)||(22068097-22068392)
chr4 (22-315)||(28448391-28448677)
chr4 (83-317)||(38114273-38114507)
chr4 (22-310)||(31316547-31316836)
chr4 (29-322)||(43937996-43938291)
chr4 (25-317)||(3873155-3873468)
chr4 (22-310)||(55938075-55938362)
chr4 (22-317)||(25422067-25422361)
chr4 (22-317)||(33689293-33689588)
chr4 (25-317)||(51876007-51876302)
chr4 (22-317)||(4850094-4850389)
chr4 (80-322)||(20177934-20178175)
chr4 (22-317)||(53423563-53423859)
chr4 (22-317)||(51395612-51395907)
chr4 (22-308)||(7490707-7490988)
chr4 (22-317)||(10321695-10321990)
chr4 (22-283)||(1870140-1870400)
chr4 (22-317)||(53571542-53571824)
chr4 (22-317)||(11670119-11670401)
chr4 (25-317)||(44289677-44289970)
chr4 (107-317)||(13718060-13718271)
chr4 (29-317)||(10085485-10085772)
chr4 (22-272)||(42972734-42972983)
chr4 (22-317)||(44209495-44209777)
chr4 (21-317)||(47379177-47379471)
chr4 (25-317)||(48082443-48082736)
chr4 (22-317)||(23473478-23473773)
chr4 (71-317)||(35060875-35061120)
chr4 (22-212)||(47463469-47463661)
chr4 (111-317)||(37329487-37329695)
chr4 (22-140)||(7617418-7617536)
chr4 (72-313)||(35821128-35821357)
chr4 (241-317)||(7617535-7617611)
chr4 (80-316)||(48219945-48220180)
chr4 (29-315)||(52947767-52948054)
chr4 (25-139)||(3862491-3862606)
chr4 (25-139)||(3871248-3871363)
chr4 (93-277)||(38499327-38499512)
chr4 (74-212)||(44452189-44452328)
chr4 (22-315)||(13603785-13604077)
chr4 (74-310)||(34513070-34513305)
chr4 (25-212)||(55283212-55283399)
chr4 (22-184)||(20650504-20650666)
chr4 (74-188)||(28163777-28163891)
chr4 (242-316)||(50824407-50824481)
chr4 (108-212)||(8949622-8949727)
chr4 (108-212)||(29445636-29445741)
chr4 (109-272)||(44452893-44453056)
chr4 (93-209)||(35351735-35351853)
chr4 (108-212)||(343918-344023)
chr4 (108-212)||(6203170-6203275)
chr4 (248-317)||(11670860-11670929)
chr4 (22-63)||(13717994-13718035)
chr4 (108-212)||(19320816-19320921)
chr4 (108-212)||(22515662-22515767)
chr4 (108-212)||(24281869-24281974)
chr4 (108-212)||(28756315-28756420)
chr4 (108-212)||(31312146-31312251)
chr4 (108-212)||(38698827-38698932)
chr4 (108-212)||(39269759-39269864)
chr4 (108-212)||(42931154-42931259)
chr4 (108-212)||(52224544-52224649)
chr4 (108-212)||(52788856-52788960)
chr4 (22-62)||(38114237-38114277)
chr4 (108-212)||(9428068-9428172)
chr4 (108-212)||(15636919-15637024)
chr4 (108-212)||(25768018-25768123)
chr4 (108-212)||(34680329-34680434)
chr4 (108-212)||(53237972-53238077)
chr4 (108-188)||(10386696-10386776)
chr4 (108-195)||(11152325-11152413)
chr4 (113-212)||(47016247-47016347)
chr4 (262-317)||(31470962-31471017)
chr4 (108-212)||(4553373-4553478)
chr4 (108-212)||(23708873-23708978)
chr4 (108-212)||(28540858-28540963)
chr4 (108-192)||(35015448-35015533)
chr4 (108-212)||(42642996-42643100)
chr4 (108-212)||(47500210-47500315)
chr4 (108-212)||(50642603-50642708)
chr4 (108-212)||(53231213-53231317)
chr4 (108-195)||(1776634-1776722)
chr4 (108-194)||(18092735-18092821)
chr4 (114-212)||(29246903-29247002)
chr4 (25-60)||(37437230-37437265)
chr4 (25-63)||(45557893-45557932)
chr4 (114-212)||(47875938-47876036)
chr4 (22-60)||(8770669-8770707)
chr4 (119-212)||(16618859-16618953)
chr4 (248-317)||(53571008-53571078)
chr4 (108-212)||(6488525-6488629)
chr4 (229-310)||(6818007-6818087)
chr4 (108-212)||(23064058-23064163)
chr4 (108-192)||(23624507-23624592)
chr4 (108-212)||(28706115-28706219)
chr4 (108-212)||(34509756-34509861)
chr4 (249-317)||(53569155-53569224)
chr4 (25-61)||(20177849-20177885)
chr4 (232-312)||(47939788-47939867)
[»] chr7 (81 HSPs)
chr7 (22-317)||(43597484-43597779)
chr7 (22-317)||(4926372-4926670)
chr7 (22-317)||(22378458-22378753)
chr7 (22-317)||(38158948-38159247)
chr7 (22-317)||(47791838-47792133)
chr7 (22-317)||(6588687-6588982)
chr7 (22-317)||(7238576-7238871)
chr7 (25-317)||(18059006-18059296)
chr7 (22-317)||(1961897-1962193)
chr7 (22-317)||(35482059-35482351)
chr7 (22-313)||(14990548-14990837)
chr7 (22-313)||(15420159-15420448)
chr7 (22-310)||(46044291-46044580)
chr7 (22-217)||(6330995-6331191)
chr7 (22-315)||(15652796-15653085)
chr7 (25-317)||(43574239-43574532)
chr7 (26-317)||(38199062-38199340)
chr7 (47-317)||(46330799-46331069)
chr7 (22-294)||(10620520-10620793)
chr7 (22-317)||(4899864-4900158)
chr7 (22-317)||(43083855-43084137)
chr7 (22-316)||(11396958-11397252)
chr7 (22-318)||(3495655-3495938)
chr7 (22-277)||(27727226-27727485)
chr7 (22-317)||(44167794-44168074)
chr7 (25-317)||(1544478-1544769)
chr7 (71-217)||(36019811-36019957)
chr7 (25-317)||(38598967-38599260)
chr7 (128-317)||(21109452-21109642)
chr7 (184-317)||(4883775-4883908)
chr7 (22-317)||(29155962-29156260)
chr7 (22-317)||(44080958-44081253)
chr7 (22-168)||(33624936-33625080)
chr7 (22-252)||(37539849-37540081)
chr7 (109-310)||(1066490-1066691)
chr7 (72-168)||(15130859-15130955)
chr7 (93-315)||(1260142-1260363)
chr7 (80-212)||(1065795-1065928)
chr7 (22-315)||(9633169-9633461)
chr7 (39-203)||(10463312-10463475)
chr7 (25-188)||(47139739-47139903)
chr7 (232-317)||(36020005-36020090)
chr7 (74-310)||(12621625-12621861)
chr7 (22-111)||(45958726-45958815)
chr7 (74-212)||(8832813-8832952)
chr7 (74-188)||(37107808-37107922)
chr7 (235-317)||(33624788-33624869)
chr7 (74-188)||(38594642-38594756)
chr7 (74-310)||(8081814-8082048)
chr7 (262-315)||(27727998-27728051)
chr7 (229-317)||(45958865-45958953)
chr7 (107-212)||(2510672-2510778)
chr7 (108-212)||(9900532-9900637)
chr7 (108-212)||(23023517-23023622)
chr7 (108-212)||(39035838-39035943)
chr7 (80-308)||(42974165-42974394)
chr7 (262-318)||(38199808-38199864)
chr7 (114-212)||(45986190-45986289)
chr7 (107-212)||(7207993-7208099)
chr7 (108-212)||(11620047-11620152)
chr7 (108-212)||(21202276-21202380)
chr7 (108-212)||(34651581-34651686)
chr7 (22-111)||(16080779-16080868)
chr7 (108-212)||(23064446-23064552)
chr7 (232-310)||(38593281-38593358)
chr7 (108-212)||(5029205-5029310)
chr7 (108-212)||(28642485-28642590)
chr7 (262-317)||(3496423-3496478)
chr7 (98-189)||(17018437-17018528)
chr7 (248-315)||(37537487-37537553)
chr7 (25-209)||(28924600-28924784)
chr7 (229-310)||(16080975-16081055)
chr7 (232-317)||(17018571-17018656)
chr7 (108-212)||(17314701-17314806)
chr7 (108-212)||(33772380-33772484)
chr7 (108-212)||(46158057-46158162)
chr7 (281-317)||(15131588-15131624)
chr7 (109-211)||(37108485-37108589)
chr7 (148-180)||(41571631-41571663)
chr7 (262-317)||(43083327-43083383)
chr7 (149-212)||(45983628-45983692)
[»] chr8 (104 HSPs)
chr8 (22-320)||(38706441-38706739)
chr8 (22-320)||(36470823-36471121)
chr8 (22-317)||(25101960-25102255)
chr8 (22-317)||(5250388-5250684)
chr8 (22-317)||(44265446-44265741)
chr8 (22-317)||(5695911-5696205)
chr8 (71-317)||(17498541-17498787)
chr8 (22-317)||(21135321-21135616)
chr8 (22-322)||(27875445-27875745)
chr8 (22-322)||(28015626-28015926)
chr8 (22-317)||(33322531-33322826)
chr8 (22-317)||(6590263-6590559)
chr8 (22-317)||(24451482-24451777)
chr8 (22-317)||(41590337-41590631)
chr8 (22-317)||(42499379-42499673)
chr8 (22-317)||(43622789-43623087)
chr8 (22-317)||(6018037-6018332)
chr8 (22-317)||(35369188-35369483)
chr8 (22-317)||(37967533-37967830)
chr8 (22-317)||(8784576-8784871)
chr8 (22-317)||(35863039-35863334)
chr8 (22-317)||(18839916-18840211)
chr8 (22-317)||(41281300-41281593)
chr8 (22-310)||(37706722-37707009)
chr8 (22-317)||(17842463-17842756)
chr8 (85-320)||(21159841-21160077)
chr8 (22-317)||(39336991-39337273)
chr8 (72-299)||(17062413-17062639)
chr8 (72-299)||(17585719-17585945)
chr8 (22-211)||(23483448-23483637)
chr8 (22-317)||(36063434-36063718)
chr8 (137-317)||(6413383-6413563)
chr8 (87-317)||(9252645-9252874)
chr8 (25-317)||(5765717-5766012)
chr8 (22-252)||(18304664-18304896)
chr8 (109-317)||(30658524-30658731)
chr8 (25-317)||(28755176-28755469)
chr8 (22-307)||(30968670-30968957)
chr8 (22-317)||(16472990-16473276)
chr8 (22-317)||(16477561-16477847)
chr8 (107-317)||(13323634-13323845)
chr8 (225-317)||(14121946-14122038)
chr8 (22-191)||(43936514-43936683)
chr8 (22-277)||(32514042-32514299)
chr8 (24-215)||(43988155-43988347)
chr8 (22-317)||(36018109-36018406)
chr8 (22-277)||(42024251-42024504)
chr8 (74-310)||(3865698-3865934)
chr8 (35-315)||(32244411-32244690)
chr8 (35-277)||(3866405-3866647)
chr8 (74-212)||(6243575-6243715)
chr8 (102-188)||(6244252-6244338)
chr8 (113-212)||(34050586-34050685)
chr8 (93-212)||(28701739-28701859)
chr8 (22-154)||(10410010-10410142)
chr8 (263-317)||(41255335-41255389)
chr8 (108-212)||(7637046-7637151)
chr8 (108-212)||(28174241-28174346)
chr8 (74-310)||(44894464-44894698)
chr8 (74-310)||(32243684-32243920)
chr8 (22-114)||(36126455-36126548)
chr8 (249-317)||(39337745-39337813)
chr8 (231-277)||(2826919-2826965)
chr8 (107-212)||(11385567-11385673)
chr8 (22-60)||(30658453-30658491)
chr8 (115-212)||(41219667-41219765)
chr8 (108-212)||(2060974-2061079)
chr8 (108-212)||(4517044-4517149)
chr8 (108-212)||(18365254-18365359)
chr8 (108-212)||(27923717-27923822)
chr8 (108-212)||(34058759-34058864)
chr8 (108-212)||(36765595-36765700)
chr8 (108-212)||(42219315-42219420)
chr8 (108-212)||(44090484-44090589)
chr8 (231-307)||(10409789-10409864)
chr8 (112-206)||(27000886-27000980)
chr8 (262-317)||(35369929-35369984)
chr8 (147-213)||(1663854-1663920)
chr8 (22-60)||(12469454-12469492)
chr8 (108-212)||(4136983-4137088)
chr8 (108-212)||(7419829-7419934)
chr8 (108-212)||(13082866-13082971)
chr8 (108-212)||(24541845-24541950)
chr8 (108-212)||(30378191-30378296)
chr8 (108-212)||(35209551-35209656)
chr8 (108-212)||(36051920-36052025)
chr8 (108-212)||(41724881-41724986)
chr8 (108-195)||(22849500-22849588)
chr8 (114-212)||(16729111-16729210)
chr8 (25-60)||(31185724-31185759)
chr8 (114-212)||(42175204-42175303)
chr8 (119-212)||(8076328-8076422)
chr8 (108-212)||(12616480-12616586)
chr8 (108-212)||(13699506-13699609)
chr8 (108-212)||(27519670-27519775)
chr8 (108-212)||(39106860-39106964)
chr8 (116-212)||(41315451-41315548)
chr8 (108-212)||(43470555-43470660)
chr8 (167-215)||(2826981-2827029)
chr8 (24-60)||(2827065-2827101)
chr8 (108-176)||(17918802-17918870)
chr8 (229-297)||(28694963-28695031)
chr8 (97-161)||(28695091-28695155)
chr8 (136-184)||(36333227-36333275)
[»] chr6 (52 HSPs)
chr6 (22-317)||(15721062-15721360)
chr6 (22-317)||(26356528-26356826)
chr6 (22-317)||(10915301-10915598)
chr6 (22-317)||(5974309-5974604)
chr6 (22-317)||(8709836-8710130)
chr6 (25-317)||(30660778-30661071)
chr6 (22-312)||(17697386-17697676)
chr6 (22-317)||(5087190-5087485)
chr6 (22-317)||(1820983-1821274)
chr6 (22-317)||(844106-844402)
chr6 (22-316)||(29691911-29692205)
chr6 (22-316)||(938845-939139)
chr6 (26-317)||(861362-861655)
chr6 (71-314)||(33518406-33518648)
chr6 (93-317)||(2087438-2087661)
chr6 (22-317)||(22731997-22732293)
chr6 (22-317)||(5079506-5079802)
chr6 (22-266)||(30492761-30493004)
chr6 (22-317)||(18502992-18503274)
chr6 (71-317)||(20510491-20510725)
chr6 (22-317)||(14256151-14256440)
chr6 (25-317)||(33744665-33744958)
chr6 (25-270)||(12481801-12482047)
chr6 (22-317)||(28476187-28476486)
chr6 (22-212)||(20977467-20977658)
chr6 (22-180)||(17245717-17245875)
chr6 (22-212)||(20977101-20977292)
chr6 (22-159)||(34046544-34046682)
chr6 (22-212)||(3375394-3375585)
chr6 (80-317)||(11400126-11400364)
chr6 (22-156)||(20897811-20897947)
chr6 (74-310)||(3914474-3914709)
chr6 (74-310)||(21108119-21108355)
chr6 (148-317)||(20898115-20898275)
chr6 (107-310)||(289005-289207)
chr6 (22-147)||(30353126-30353252)
chr6 (233-317)||(17244540-17244624)
chr6 (103-310)||(289438-289647)
chr6 (108-212)||(12783434-12783539)
chr6 (108-212)||(13400275-13400380)
chr6 (114-212)||(16270286-16270385)
chr6 (262-317)||(17246321-17246376)
chr6 (25-150)||(24958886-24959012)
chr6 (93-176)||(30916772-30916855)
chr6 (108-212)||(19693146-19693251)
chr6 (25-61)||(16736655-16736691)
chr6 (108-195)||(31280029-31280117)
chr6 (114-212)||(2857444-2857543)
chr6 (98-211)||(8235252-8235365)
chr6 (115-212)||(15053905-15054003)
chr6 (108-212)||(945850-945955)
chr6 (262-315)||(5079000-5079053)
[»] chr3 (98 HSPs)
chr3 (15-317)||(25250016-25250316)
chr3 (22-317)||(38173902-38174197)
chr3 (22-317)||(45419785-45420078)
chr3 (22-317)||(53517784-53518079)
chr3 (22-317)||(29348275-29348567)
chr3 (22-317)||(44808839-44809135)
chr3 (72-317)||(21749566-21749811)
chr3 (22-310)||(23883390-23883678)
chr3 (22-317)||(40762600-40762895)
chr3 (22-317)||(27492313-27492609)
chr3 (22-317)||(37178941-37179237)
chr3 (22-317)||(23917328-23917615)
chr3 (42-317)||(32146996-32147271)
chr3 (22-317)||(50615084-50615366)
chr3 (30-315)||(11045404-11045691)
chr3 (22-317)||(117447-117729)
chr3 (29-317)||(19669699-19669988)
chr3 (22-317)||(45235344-45235641)
chr3 (22-317)||(11293800-11294089)
chr3 (71-317)||(53397095-53397343)
chr3 (25-311)||(39562552-39562839)
chr3 (25-291)||(45406701-45406955)
chr3 (22-317)||(32943000-32943281)
chr3 (71-317)||(53439324-53439556)
chr3 (25-317)||(46295051-46295345)
chr3 (22-278)||(44557579-44557822)
chr3 (89-317)||(19601549-19601777)
chr3 (22-169)||(23921075-23921220)
chr3 (123-320)||(28685303-28685495)
chr3 (99-315)||(54268922-54269138)
chr3 (84-212)||(9018125-9018253)
chr3 (80-310)||(31991074-31991304)
chr3 (25-284)||(34995564-34995823)
chr3 (22-286)||(44287768-44288027)
chr3 (109-315)||(33475471-33475677)
chr3 (102-310)||(41927919-41928126)
chr3 (109-315)||(44555919-44556125)
chr3 (74-310)||(52701168-52701404)
chr3 (74-310)||(8575953-8576191)
chr3 (161-315)||(15772003-15772157)
chr3 (74-277)||(25232695-25232900)
chr3 (74-213)||(41927361-41927501)
chr3 (232-315)||(3173719-3173802)
chr3 (229-317)||(37481262-37481351)
chr3 (80-153)||(53377430-53377503)
chr3 (74-310)||(33476241-33476477)
chr3 (163-280)||(45387449-45387566)
chr3 (81-279)||(26268629-26268826)
chr3 (74-169)||(44556687-44556782)
chr3 (229-313)||(53377326-53377412)
chr3 (102-212)||(28055253-28055364)
chr3 (102-212)||(28065678-28065789)
chr3 (248-317)||(116924-116993)
chr3 (108-212)||(869446-869551)
chr3 (108-212)||(3078374-3078479)
chr3 (108-212)||(4994099-4994204)
chr3 (108-212)||(10182227-10182332)
chr3 (108-212)||(30778753-30778858)
chr3 (108-212)||(34226026-34226131)
chr3 (108-212)||(36777869-36777974)
chr3 (248-317)||(44555364-44555433)
chr3 (108-212)||(45454337-45454442)
chr3 (108-212)||(50362393-50362498)
chr3 (248-317)||(50614546-50614615)
chr3 (108-212)||(51324695-51324800)
chr3 (108-212)||(53328515-53328620)
chr3 (29-122)||(8575373-8575466)
chr3 (113-212)||(16644630-16644729)
chr3 (108-191)||(53658005-53658088)
chr3 (108-212)||(1486948-1487053)
chr3 (108-212)||(15490756-15490861)
chr3 (108-212)||(31269587-31269692)
chr3 (108-212)||(40126885-40126990)
chr3 (108-212)||(47198987-47199092)
chr3 (108-212)||(49612279-49612384)
chr3 (22-63)||(54268854-54268895)
chr3 (113-212)||(45344025-45344125)
chr3 (108-212)||(23878600-23878706)
chr3 (115-212)||(55006152-55006250)
chr3 (108-212)||(24342668-24342773)
chr3 (108-212)||(33391028-33391133)
chr3 (108-212)||(43127682-43127787)
chr3 (108-212)||(43660412-43660517)
chr3 (108-212)||(43729766-43729870)
chr3 (108-212)||(50133524-50133629)
chr3 (108-212)||(53947560-53947664)
chr3 (108-195)||(32245747-32245835)
chr3 (108-184)||(32799933-32800008)
chr3 (108-191)||(4735774-4735857)
chr3 (119-211)||(34442130-34442224)
chr3 (108-212)||(37126874-37126980)
chr3 (25-58)||(9018280-9018313)
chr3 (22-55)||(15771903-15771936)
chr3 (108-208)||(16128533-16128634)
chr3 (108-212)||(19878390-19878494)
chr3 (108-212)||(30786571-30786676)
chr3 (108-212)||(42367748-42367853)
chr3 (25-61)||(20078100-20078136)
[»] scaffold0445 (1 HSPs)
scaffold0445 (22-314)||(5917-6209)
[»] chr2 (85 HSPs)
chr2 (22-314)||(10357318-10357610)
chr2 (22-317)||(7439220-7439515)
chr2 (25-317)||(42274304-42274596)
chr2 (22-317)||(3043361-3043656)
chr2 (22-317)||(33832124-33832418)
chr2 (73-317)||(25666038-25666282)
chr2 (22-314)||(8737811-8738104)
chr2 (22-317)||(31771316-31771611)
chr2 (38-317)||(41120738-41121016)
chr2 (22-317)||(43932734-43933029)
chr2 (22-310)||(31436045-31436332)
chr2 (22-317)||(25100585-25100879)
chr2 (22-317)||(30784185-30784470)
chr2 (80-317)||(6457266-6457504)
chr2 (22-317)||(40364884-40365179)
chr2 (22-317)||(44286684-44286978)
chr2 (22-317)||(20721229-20721511)
chr2 (22-317)||(44492883-44493179)
chr2 (80-317)||(37592937-37593171)
chr2 (22-194)||(13371995-13372167)
chr2 (72-315)||(36512025-36512269)
chr2 (22-317)||(42487668-42487963)
chr2 (22-317)||(21439832-21440114)
chr2 (22-203)||(33031165-33031345)
chr2 (22-317)||(20719949-20720236)
chr2 (137-317)||(35498588-35498768)
chr2 (22-306)||(44879718-44879995)
chr2 (93-259)||(29809401-29809567)
chr2 (22-315)||(14200964-14201260)
chr2 (71-317)||(34073621-34073865)
chr2 (22-166)||(18672342-18672486)
chr2 (73-286)||(33000913-33001125)
chr2 (237-315)||(33031087-33031165)
chr2 (102-310)||(32318223-32318432)
chr2 (25-317)||(8392337-8392622)
chr2 (229-317)||(20719238-20719326)
chr2 (74-310)||(3117981-3118216)
chr2 (80-310)||(32319001-32319232)
chr2 (22-188)||(19058643-19058808)
chr2 (25-210)||(23496666-23496852)
chr2 (235-317)||(7654925-7655007)
chr2 (25-310)||(13027445-13027735)
chr2 (109-315)||(9111571-9111777)
chr2 (243-317)||(20701256-20701330)
chr2 (108-211)||(9737488-9737593)
chr2 (108-212)||(12620337-12620442)
chr2 (108-212)||(13803289-13803394)
chr2 (108-212)||(16709142-16709247)
chr2 (108-212)||(20973247-20973352)
chr2 (252-317)||(23787773-23787838)
chr2 (22-96)||(29809254-29809328)
chr2 (22-63)||(35498806-35498847)
chr2 (108-212)||(45301262-45301367)
chr2 (113-212)||(35516308-35516408)
chr2 (226-315)||(4327812-4327898)
chr2 (114-212)||(41178709-41178808)
chr2 (108-212)||(7401657-7401762)
chr2 (108-212)||(14542151-14542256)
chr2 (108-212)||(36218630-36218735)
chr2 (108-212)||(37850322-37850427)
chr2 (29-122)||(3118639-3118732)
chr2 (108-188)||(3854934-3855014)
chr2 (262-317)||(21439296-21439351)
chr2 (29-157)||(36881180-36881308)
chr2 (97-310)||(32319595-32319809)
chr2 (108-212)||(3201797-3201900)
chr2 (108-212)||(10214809-10214914)
chr2 (108-212)||(17614941-17615046)
chr2 (108-212)||(18549513-18549618)
chr2 (264-317)||(18672259-18672312)
chr2 (108-212)||(31653361-31653466)
chr2 (24-57)||(37592894-37592927)
chr2 (262-301)||(36881116-36881155)
chr2 (102-212)||(39670399-39670510)
chr2 (118-212)||(44713106-44713200)
chr2 (172-210)||(25100388-25100426)
chr2 (108-212)||(38063070-38063176)
chr2 (108-212)||(37741919-37742024)
chr2 (108-212)||(42520911-42521016)
chr2 (235-275)||(13890872-13890912)
chr2 (235-275)||(14030997-14031037)
chr2 (235-267)||(18917280-18917312)
chr2 (281-317)||(20720809-20720845)
chr2 (244-316)||(24951214-24951285)
chr2 (113-212)||(39375071-39375171)
[»] scaffold1160 (1 HSPs)
scaffold1160 (22-315)||(1159-1455)
[»] scaffold1191 (1 HSPs)
scaffold1191 (22-317)||(669-964)
[»] scaffold0651 (1 HSPs)
scaffold0651 (22-310)||(6862-7151)
[»] scaffold0562 (1 HSPs)
scaffold0562 (25-317)||(3974-4287)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (22-315)||(17377-17669)
[»] scaffold0707 (1 HSPs)
scaffold0707 (71-314)||(6950-7192)
[»] scaffold0148 (2 HSPs)
scaffold0148 (22-317)||(35273-35568)
scaffold0148 (252-317)||(38609-38674)
[»] scaffold0097 (4 HSPs)
scaffold0097 (22-317)||(25057-25339)
scaffold0097 (22-317)||(23787-24074)
scaffold0097 (229-317)||(23076-23164)
scaffold0097 (281-317)||(24647-24683)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (22-217)||(158028-158222)
[»] scaffold0514 (1 HSPs)
scaffold0514 (45-317)||(6197-6470)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (22-317)||(240012-240294)
scaffold0003 (248-317)||(239492-239561)
[»] scaffold1190 (1 HSPs)
scaffold1190 (22-317)||(202-486)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (22-317)||(6931-7227)
[»] scaffold0640 (1 HSPs)
scaffold0640 (25-317)||(3895-4188)
[»] scaffold0385 (2 HSPs)
scaffold0385 (22-317)||(9960-10245)
scaffold0385 (249-317)||(9424-9491)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (22-158)||(21750-21886)
[»] scaffold0571 (2 HSPs)
scaffold0571 (22-173)||(8596-8748)
scaffold0571 (171-317)||(8430-8575)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (31-212)||(47860-48041)
[»] scaffold0734 (2 HSPs)
scaffold0734 (136-310)||(3260-3436)
scaffold0734 (25-133)||(2854-2962)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (231-317)||(48967-49053)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (93-188)||(283308-283403)
scaffold0005 (174-310)||(282940-283076)
[»] scaffold0199 (2 HSPs)
scaffold0199 (229-317)||(6204-6292)
scaffold0199 (147-211)||(6298-6361)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (22-154)||(52512-52645)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (35-188)||(123198-123351)
[»] scaffold0618 (1 HSPs)
scaffold0618 (108-212)||(9319-9424)
[»] scaffold0493 (1 HSPs)
scaffold0493 (108-212)||(6864-6969)
[»] scaffold0991 (1 HSPs)
scaffold0991 (108-212)||(883-988)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (108-212)||(48160-48265)
scaffold0029 (108-212)||(42042-42147)
[»] scaffold0245 (2 HSPs)
scaffold0245 (175-212)||(24927-24965)
scaffold0245 (262-315)||(25014-25066)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 94)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 10464032 - 10463737
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10464032 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 10463933  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||        
T  10463932 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgcgacaattt 10463833  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10463832 tttgcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 10463737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 8337137 - 8336843
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8337137 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgatttttt-gagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 8337039  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||        
T  8337038 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaactgcaaaagttaaagataaaattaacaaaatctagacgtagaaatcaaattttgcgacaattt 8336939  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8336938 tttgcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtcagtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 8336843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 8313503 - 8313209
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8313503 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgaggcaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaattcagaattt 8313404  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||        
T  8313403 tt-aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaaaataaaattaacaaaatatggacgtagaaatcaaattttgcgacaattt 8313305  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8313304 tttgcataagaacttttaataatgttcttaacacgtatgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 8313209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 27308114 - 27307819
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  27308114 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaaaactatgaaagattcatttaccacaatttagaattt 27308015  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||        
T  27308014 tttaacatgaaacaaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatcttgacgtagaaatcaaattttgcgacaattt 27307915  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27307914 tttgcatagaaactttcagtaatgtttttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 27307819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 37103327 - 37103032
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37103327 aagtttatttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttttttagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 37103228  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    | ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |        
T  37103227 tctaacatgaaacgaattaaaaatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaattaaattttgagataattt 37103128  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  37103127 tttgcagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtttgtaaaaaattattcaaaaattcaagagtttatgcataaattaaacaaatttgaattga 37103032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 34785250 - 34785544
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||        ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  34785250 aagtttgtttaattatccttaaattcttaaattttttaacgattttttttagacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttaaatttt 34785349  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        
T  34785350 tttaacataaaacgaattaaatataaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtaaaaatcaaattttgcgacaattt 34785449  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34785450 tttgcaaaggaacttttagtaatattcttaacacgtctg-aaaaaattgtacaaaaactcaaaagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 34785544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 22 - 315
Target Start/End: Original strand, 1683165 - 1683458
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1683165 aagtttgtttaactatccttaaactcttaaatttttgaacgatttctttaagacaagtttagaacactatgaaaagttcatttactaaaatttagaattt 1683264  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||        
T  1683265 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaatgataaaagtaataaaatatggacgtataaatcaaattttgtgacaattt 1683364  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaatt 315  Q
       |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  1683365 tttgcataggagcttttagtaatgttgttaacatgtctgcaaaaaattatccaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaatt 1683458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 4426317 - 4426022
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  4426317 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagataagtttagaacactatgaaatattcatttactaaaatttagaattt 4426218  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||| |||| ||||||||| |||        
T  4426217 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaatttaactaaatctagacgtaaaaattaaattttgcaacaattt 4426118  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4426117 tgcgcataggaacttttagtaatgttcttaagacgtatgtaaaaaattattcaaaaactcagaagtttaaacataaattaaacaaaattgaattga 4426022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 24636938 - 24637234
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnng-agacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24636938 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttttagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatt 24637037  T
Q  121 ttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 220  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| |       
T  24637038 ttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaatggcaaaacttaaagataaaagtaataaaatctggaagtagaaatcaaattttgcgataatt 24637137  T
Q  221 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
        ||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  24637138 ttttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaatcaaatttgaattga 24637234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 27335925 - 27335630
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |        ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  27335925 aagtttatttaattatccttaaactcttaaatttttgaacaatttttttaagacaagtttaaaacattatgaaaggttcatttaccaaaatttatatttt 27335826  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||        
T  27335825 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatatgggcgtaaaaatcaaattttgcgacaattt 27335726  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
        || ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27335725 tttacagaggaacttttagtaatgttcttaacacatatgcaaaaaattgtttaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 27335630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 40158559 - 40158265
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40158559 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttatgacaagtttataac-ctatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 40158461  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |        
T  40158460 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaatgacaaaagttaaagataaaattaacaaattatggacgtagatatcaaattttgcgaaatttt 40158361  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       | | |||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  40158360 tttgtagaggaactttttgtaatgttcttaacacgtatgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattga 40158265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 22 - 313
Target Start/End: Original strand, 621626 - 621917
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||       ||||||   |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  621626 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttagaacgatttttatgagacagatttagaacactataaaaggttcatttactagaatttacaattt 621725  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||        
T  621726 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaacttaaagataaaattaacaaaatctggatgtagaaatcacattttgcgacaattt 621825  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaa 313  Q
       ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||    
T  621826 tttgcagaggaacttttagtaatgtttttaacacgtctgccaaaaattgttcaaaaactcaaaagtttaagcataaattaaagaaatttgaa 621917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 8404394 - 8404690
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  8404394 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttaagacaagtttagaacactaaaaaaggttcatttaccaaaatttagatttt 8404493  T
Q  122 ttt-aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 220  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||       
T  8404494 ttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaataaaatttgaacttaaaaatcaaattttgcgacaact 8404593  T
Q  221 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
        ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  8404594 ttttgcagatgaatttttagtaatgttcttaacacgtctgcaaaaaattgtttaaaaattcaagagtttaagcataaattaaacaaacttgaattga 8404690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 17742621 - 17742333
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||    
T  17742621 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttaagataagtttagaacactatgaaaggttcatttaccaaaacttagatttt 17742522  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaatttttt-aaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 220  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||       
T  17742521 tttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgcgacaata 17742422  T
Q  221 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
         || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||        |||||||||||||||||||||||    
T  17742421 ttttacagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcaaaaaatcgtttaaaaactcaagag--------taaattaaacaaatttgaattga 17742333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 4463051 - 4462756
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||| |||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  4463051 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgtacgattttttcgagacaagtttagagtactatgaaagattcattgactaaaatttagaattt 4462952  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
     |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||        
T  4462951 gttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttaaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatcaggatgtagaaatcaaattttgcaacaattt 4462852  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       | | ||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||    
T  4462851 tttgtagagggactattaataatgttcttaacacgtctgcaaataattgttcaaaaactcaagagttaaagcataaatgaaacaaatttgaattga 4462756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 42877612 - 42877905
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||        ||||||| ||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||   |||    
T  42877612 aagtttgtttaattattcttaaactcttaaatttttgaaggatatttttaagacaagtttagaatgccatgaaaggttcatttaccaaaatttaattttt 42877711  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||        
T  42877712 tttaagatgaaacgaattaaatatgaatttt-taaaacgacaaaagataaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaataaaattttgcgacaattt 42877810  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  42877811 tttgcagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtct-acaaaaattgtttaaaaactcaagagtttaagcatgaattaaacaaatttgaattga 42877905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 25 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 41139318 - 41139025
Alignment:
Q  25 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 124  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       |||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41139318 tttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacattgtgaaaggttcaattactaaaatttagaatttttt 41139219  T
Q  125 aat-atgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnn 223  Q
     || |||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||||| |          
T  41139218 tatcatgaaatgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcgataattttt 41139119  T
Q  224 ngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
     ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41139118 tgcggaggaacttttagtaatgttcttaacatgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagattaagcataaattaaacaaatttgaattga 41139025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 75 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 2004194 - 2003952
Alignment:
Q  75 caaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaaga 174  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2004194 caagtttagaacactatgaaaggttcattttctacaatttagaattgttaaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaaga 2004095  T
Q  175 taaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttca 274  Q
    |||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||       ||| | |||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||    
T  2004094 taaagttaacaaaatctggacataaaaatcaaattttgcgacaattttttgcagatgaacttttagtaatgttcttaacacgtacgcaaaaagttgttca 2003995  T
Q  275 aaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2003994 aaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 2003952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 13920358 - 13920063
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  13920358 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaatgttcaattattaaaatttagaattt 13920259  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||  ||||| |||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |        
T  13920258 tttaacatgaaattaattaaatatgaatatttgaaaatgataaaagttaaagataaaagtaataaaatttggacatataaatcaaattttgcgataattt 13920159  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13920158 tttgcggaggaacttttattaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaatagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 13920063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 29 - 317
Target Start/End: Original strand, 41192983 - 41193272
Alignment:
Q  29 tttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaata 128  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |        ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  41192983 tttaactatccttaagctcttaaacttttgaactatttttgttagacaagtttagaacactatcaaaggttcatttacaaaaatttagaattttttaaca 41193082  T
Q  129 tgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcat 228  Q
    | |||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |       |||     
T  41193083 taaaacgaattgaatatgaattttttaaaacggtaaaagttaaagataaaattaactaaatctggacgtagaattcaaattttgcgataattttttgcag 41193182  T
Q  229 aggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaa-ttgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41193183 aggaacttttagcaacattcttaacacggctgtaaaaaagttgttcaaaaaatcaaaagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 41193272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 8218011 - 8218293
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8218011 aagtttgtttaattatccttaaagtcttaaatttttgaacgatttttttgagataagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttagaattt 8218110  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||             ||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||| | |        
T  8218111 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaac-------------gataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcaataattt 8218197  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       ||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8218198 tttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 8218293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 34527313 - 34527030
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  34527313 aagtttgtttaattatccttaaattcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataaaatttagaattt 34527214  T
Q  122 ttt-aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 220  Q
    ||| || ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||| |        
T  34527213 ttttaacatgaaacaaattaaatatgaatttttaaaaacaataaaagttaaagataaaagtaataaaatatggacatataaatcaaattttgcggc---- 34527118  T
Q  221 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
             ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||| |||||  |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  34527117 ---------ggaacatttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaacaacttaagagtataagaataaattaaacaaatttgaattga 34527030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 215
Target Start/End: Original strand, 38693466 - 38693659
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  38693466 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaatactatgaaaggttcaattactaaaatttataattt 38693565  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcga 215  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  38693566 tttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaatgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcga 38693659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 31211484 - 31211187
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnng-agacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         | ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||    
T  31211484 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttttaaacaagtttagaacaatatgaaaggtttatttacaaaaatttagattt 31211385  T
Q  121 ttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 220  Q
    |||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||  ||||||||||||||| || ||| |||||  |||||||||||||||||||||| | |       
T  31211384 ttttaatatgaaacgaattcaataggagttttttaaaacagcaaaagttaaagatataagtaataaaatcgggacgtagaaatcaaattttgcaataatt 31211285  T
Q  221 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtct-gtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
        ||| |||||||||||||||||||||||||   |||   ||||||||||||||||||| ||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  31211284 ttatgcagaggaacttttagtaatgttcttaactaatctacaaaaaaattgttcaaaaacttaagaatttaagtataaattaaacaaatttaaattga 31211187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 34010217 - 34010025
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |       |||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34010217 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgtactatttttttgagacaagtttagaatactaagaaaggttcattaactaaaatttagaattt 34010118  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcg 214  Q
    ||||  || |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  34010117 tttaccataaaacaaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagtttaagataaaattaacaaaatctgaacgtagaaatcaaattttgcg 34010025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 146 - 322
Target Start/End: Original strand, 22023191 - 22023367
Alignment:
Q  146 gaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatg 245  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        |  |||||||||||||||||    
T  22023191 gaattttttaaaacgaaaaaagttaaagctaaaattaacaaaattcggacgtagaaatcaaattttgcgacaattttttaccgaggaacttttagtaatg 22023290  T
Q  246 ttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattgatgatg 322  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22023291 ttcttaacacgtctacaaaaaattgttcaaaaattcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattgaggatg 22023367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 2005316 - 2005023
Alignment:
Q  25 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 124  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| || ||        | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  2005316 tttgcttaattatctttaaactcttaaattttttaaagattctttttatacaagattataacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatttttt 2005217  T
Q  125 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaa-caaaatttggacgtagaaatcaaa-ttttgcgacannnnn 222  Q
    || ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |         
T  2005216 aacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaagaaaaatatggacgtagaaatcaaatttttgcgatattttt 2005117  T
Q  223 nngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       |  |||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  2005116 tt-cggaggacctttaaataacgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttgaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttggattga 2005023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 30394372 - 30394080
Alignment:
Q  25 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 124  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||        | ||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  30394372 tttgcttaattatccttaaactcttaacttttttaacgattctttttatacaagtttataacactatgaa-ggttcatttgctaaaatctataatttttt 30394274  T
Q  125 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaa-ttttgcgacannnnn 222  Q
    || ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |         
T  30394273 aacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttttgcgatattttt 30394174  T
Q  223 nngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       |  |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  30394173 tt-cggaggaccttttaataacgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttgaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttggattga 30394080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 200
Target Start/End: Original strand, 9687531 - 9687710
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||       || | ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9687531 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttaatcgatttttttgatataagtttagaacactataaaaggttcgtttactaaaatttagaattt 9687630  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacg-acaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtaga 200  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  9687631 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgaaaaaaagttaaagataaaattaataaaattttgacgtaga 9687710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 43440873 - 43441155
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||       |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  43440873 aagtttgtttgattatccttaaattcttaaatttttgaatgatttttttgagataagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttataattt 43440972  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||             ||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||||| |        
T  43440973 tttaacatgaaacgaattcaatatgaatttttgaaaac-------------gataaaagtaataaaatatggacatataaatcaaattttgcgataattt 43441059  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       ||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43441060 tttgcggaggaacttttaataatgttcttaacacatctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 43441155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 28456803 - 28456624
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||   |||    
T  28456803 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgtacgatttttgtgagacaagtttagaatactatgaaaagttcattaactaaaatttacttttt 28456704  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaa 202  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28456703 tttaacatgaaactaattaaatatgaatttttt-aaacgaaaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaa 28456624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 42853018 - 42852826
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||        |||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  42853018 aagtttgtttaattattcttaaattcttgaatttttgaacgttttttatgagataagtttagaacaatatgaaagattcatttactaaaatttaaaattt 42852919  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcg 214  Q
    || ||  |||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42852918 ttcaacgtgaaacgaatttaaaatgaattttttaaaacgactaaagttaaaaataaaagtaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgcg 42852826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 317
Target Start/End: Original strand, 4461961 - 4462245
Alignment:
Q  21 gaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaa-ggttcatttactaaaatttagaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| |||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||     
T  4461961 gaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttt-gagacaagtttaatacactataaaaaggttcatttactaaaatttagaac 4462059  T
Q  120 tttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacann 219  Q
    ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||              |||  |||||||| |||| ||||||||| |||||| ||| |      
T  4462060 tttctaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgac--------------aaagcaacaaaatctggatgtagaaatctaattttacgataag 4462145  T
Q  220 nnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacg--tctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
         ||  ||||||||||||||||||||| ||||||  | || ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  4462146 tttttgcggaggaacttttagtaatgttctaaacacgtatatgcaaaaaattgttcaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacacatttgaattga 4462245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 74 - 317
Target Start/End: Original strand, 18261230 - 18261471
Alignment:
Q  74 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 173  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || || |   |||||| |||||||||||||| |||    
T  18261230 acaagtttataacactatgaaaggtccatttactaaaatttagaattttttaacatgaaatgaacta-attt---tttttttaaacgacaaaagttcaag 18261325  T
Q  174 ataaaattaacaaaatt-tggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnn--gcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattg 270  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |         ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  18261326 ataaaactaacaaaaatctggacgtagaaatcaaattttgcgataattttttttgcagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtttgtaaaagaatg 18261425  T
Q  271 ttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    ||  |||||| ||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  18261426 tttgaaaacttaagaatttaagcat-aattaaacaaatttgaattga 18261471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 37446695 - 37446436
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||        | ||||| |||||||  ||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  37446695 aagtttgtttaattatccttgaactcttaaattgttgaaagattttttaaa-acaagtttagaaccatataaatggttcacttactaaaatttagaattt 37446597  T
Q  122 ttt-aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 220  Q
    ||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |     ||| || | | |||||||||||||||| | |       
T  37446596 ttttaatgtgaaacgaattaaatataaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaagt-----aatctgtatgcagaaatcaaattttgcaataaaa 37446502  T
Q  221 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagag 286  Q
        ||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37446501 ctttgcgaaggaacttttagtaacgttcttaacatgtctgtaaaaaattgttcaaaaacttaagag 37446436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 26865706 - 26865975
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||        ||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| | |||    
T  26865706 aagtttgtttaattatccttaagctcttaaatttttgaatgaatttttttagacaagtttagaacactatgaaaggtccaattaataaaatttaaatttt 26865805  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||             || ||||| ||||| || ||||||||||||||| |         
T  26865806 tttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacaataaaagt-------------aataaaatatggacatataaatcaaattttgcggc----- 26865887  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  26865888 --------ggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattga 26865975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 21837231 - 21837098
Alignment:
Q  25 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 124  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||       || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21837231 tttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaatgattttttcgatacaagtttagaacactataaaaggttcatttactaaaatttagaattttct 21837132  T
Q  125 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaa 158  Q
    || ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  21837131 aacatgaaacgaattaaatatgaatttcttaaaa 21837098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10674936 - 10674648
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||| ||| |||||       |||||||| ||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10674936 aagtttctctaattatccttaaacttttaaatctttaaacgatttttttgagacaagtttagaacaccacaaaaggttcgtttactaaaatttagaattt 10674837  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 220  Q
     |||| || ||| |||||| |||||||| |||| |||  || |||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||  |||||||| ||         
T  10674836 attaacataaaatgaattaaatatgaatatttttaaaataccaaagttcaagataaaagtaacaaaaatatggacgtagaaacaaaattttgagatgatt 10674737  T
Q  221 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 310  Q
        | ||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| || || || |||| ||| ||||| ||||||||    
T  10674736 ttttgtatatgaacttttagtaatgtttttaacacttttgtaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattatacaaattt 10674648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 126
Target Start/End: Original strand, 22023097 - 22023201
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22023097 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttaaaacaccatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 22023196  T
Q  122 tttaa 126  Q
    |||||    
T  22023197 tttaa 22023201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 71 - 308
Target Start/End: Original strand, 22166923 - 22167161
Alignment:
Q  71 gagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaa-ttttttaaaacgacaaaagtt 169  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| || ||  ||||||| |||||| ||| || |||| ||    
T  22166923 gagacaaatttagaacactacgaaaggttcatttagtaaaatttagaattttttaacaagaaatgagtttaatatgaattttttttaaatgaaaaaattt 22167022  T
Q  170 aaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaat 268  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||  | |        |  | |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  22167023 caagataaaattaacaaaaatatggacatagaaatcaaattttgaaataattttttacggatgaacttttagtaatgttcttaatacgtctacaaaaaat 22167122  T
Q  269 tgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaat 308  Q
    ||||||||| |  ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  22167123 tgttcaaaagcataagagtttaaacat-aattaaacaaat 22167161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 234 - 317
Target Start/End: Original strand, 9687715 - 9687798
Alignment:
Q  234 cttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9687715 cttttagtaatgttcttaacacgtctgcaaaaaattgttcaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 9687798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Original strand, 43210639 - 43210914
Alignment:
Q  35 tatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaac 134  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||        | ||||| |||||||| ||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||     
T  43210639 tatccttaaactctaaaatttttcaacgattttttttatacaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactaaaatttaaaattttttaacatgaaat 43210738  T
Q  135 gaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaa 233  Q
     ||||| ||||||||||||  ||  |||||||||| || |||||| |||| ||||| |||||| |||||| |||||||| || |       ||||| |||    
T  43210739 aaattaaatatgaatttttctaagagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaaatctggacgaagaaataaaattttgagataattttttgcataagaa 43210838  T
Q  234 cttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 310  Q
    |||||  ||||||||||||||| | |  |||||||||||||||| || || || |||| ||| ||||||||||||||    
T  43210839 cttttcttaatgttcttaacacttgtacaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 43210914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 191
Target Start/End: Original strand, 3548350 - 3548514
Alignment:
Q  25 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||        ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  3548350 tttgtttaattatccttaaacacttaaacatttgaacgatttattttagacaaatttagaacattatgaaaggttcatttactaaaattta-aattattt 3548448  T
Q  125 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaattt 191  Q
    ||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  3548449 aatgtgaaatgaattaaatatgaatttttt-aaatgccaaaagttcaagataaaagtaaccaaattt 3548514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 9924486 - 9924401
Alignment:
Q  72 agacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaa 157  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  9924486 agacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaaaatgaaacaaattaaatatgaaatttttaaa 9924401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 74 - 310
Target Start/End: Original strand, 2262845 - 2263081
Alignment:
Q  74 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 173  Q
    ||||| |||||||| ||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||| ||| |||||||||| ||     
T  2262845 acaagtttagaacattataaaaacttcgtttactaaaatttagaattttttaatatgaaataaattaaatataaatttttttaaaagacaaaagttcaaa 2262944  T
Q  174 ataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgtt 272  Q
    |||||| |||| ||||| || ||| | |||| |||||||| || |       ||| | |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  2262945 ataaaagtaacaaaaatctgtacgcataaataaaattttgagataattttttgcagatgaactttttgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgtt 2263044  T
Q  273 caaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 310  Q
    |||||  | || || |||| ||| ||||||||||||||    
T  2263045 caaaattttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 2263081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 109 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 40272665 - 40272459
Alignment:
Q  109 aaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatt-tggacgtagaaatcaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| ||  |||||||||| || |||||| |||||||||| |||||| |||||| |||    
T  40272665 aaatttagaattttttaatatgaaataaattaaatatggatttttttaatagacaaaagtttaaaataaaagtaacaaaattctggacgcagaaataaaa 40272566  T
Q  208 ttttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaa 307  Q
    ||||| || |       | | | |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| || || || |||| ||| |||||||||||    
T  40272565 ttttgagataattttttgtagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaa 40272467  T
Q  308 tttgaatt 315  Q
    ||| ||||    
T  40272466 tttaaatt 40272459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 183 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 9924393 - 9924280
Alignment:
Q  183 acaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactca 282  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||       ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9924393 acaaaatctagacgtagaattcaaattttgtgacaatattttgcagaggaactttaagtaatgttcttaacaagtctgtaaaaaattgttcaaaaactca 9924294  T
Q  283 agagcttaaacata 296  Q
    |||| |||||||||    
T  9924293 agagtttaaacata 9924280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Original strand, 30733927 - 30734113
Alignment:
Q  25 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 124  Q
    ||||||||||||  ||| || |||||||||||||||| |       |||||| | |||||||| ||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  30733927 tttgtttaattactcttgaattcttaaatttttgaacaattttttggagacatgtttagaacattataaaatgttcatttactaaaaaatagaatttttt 30734026  T
Q  125 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 212  Q
    || |||| | |||||| ||||||||||||  ||||| |||||||| |||| || | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30734027 aacatgacaagaattaaatatgaattttt--aaacgtcaaaagttcaagaaaagagtaacaaaaatctggacgtagaaatcaaattttg 30734113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 166
Target Start/End: Original strand, 14049755 - 14049899
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        | ||| | |||||||| || |||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  14049755 aagtttgtttaatcatccttaaactcttaaatttttgaacgattttcttaatacacgtttagaacattacgaaaagttcatttactaatatttaaaattt 14049854  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaa 166  Q
    ||||| || ||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  14049855 tttaacatcaaatgaattaaatataaatttttttaaacgacaaaa 14049899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 174 - 317
Target Start/End: Original strand, 16965878 - 16966021
Alignment:
Q  174 ataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttc 273  Q
    |||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||||| |       ||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||     
T  16965878 ataaaagtaataaaatctggacataaaaatcaaattttgcgataattttttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaatattgtta 16965977  T
Q  274 aaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    ||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16965978 aaaaacgtaagactttaaacataaattaaacaaatttaaattga 16966021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 112
Target Start/End: Original strand, 18950869 - 18950959
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||        ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18950869 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttctgaacgattttttttagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaat 18950959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Original strand, 30698685 - 30698872
Alignment:
Q  25 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 124  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||       |||||| | |||||||| ||| ||| |||||||||||||||  || ||||||||    
T  30698685 tttgtttaattattcttgaattcttaaatttttgaacgattttttggagacatgtttagaacattataaaatgttcatttactaaaaaatataatttttt 30698784  T
Q  125 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaatta-acaaaatttggacgtagaaatcaaattttg 212  Q
    || | || | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||| || | ||   ||||| || |||||||||||||||||||    
T  30698785 aacaggagaagaattaaatatgaatttttt-aaacgacaaaaattcaagaaaagagtagtaaaaatctgaacgtagaaatcaaattttg 30698872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 74 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 19332704 - 19332468
Alignment:
Q  74 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 173  Q
    ||||| |||||||| ||  |||||||| |||||||||| |||||||| ||||  ||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||     
T  19332704 acaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactaaaagttagaattatttagcatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaa 19332605  T
Q  174 ataaaa-ttaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgtt 272  Q
    |||||| | || ||||| |||||| |||||| |||||||| || |         | | |||||||| |||||||||||||||| | |  |||||||| ||    
T  19332604 ataaaagtaaaaaaaatctggacgcagaaataaaattttgagataattttttcgagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtacaaaaaattatt 19332505  T
Q  273 caaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 310  Q
    ||||| || || || |||| ||| ||||||||||||||    
T  19332504 caaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 19332468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 188
Target Start/End: Original strand, 9168631 - 9168717
Alignment:
Q  102 tttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaa 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| || |||||||||| ||| |||||||||| || |||||| ||||||||    
T  9168631 tttactaaaatttagaattttttaacatgaaataaattaaatttgaatttttttaaaagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaa 9168717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24334117 - 24334012
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||| ||| || |||| ||    
T  24334117 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatatgaattttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttagacctaaaaataaa 24334018  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  24334017 attttg 24334012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 229 - 317
Target Start/End: Original strand, 6365421 - 6365508
Alignment:
Q  229 aggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||  |||||| ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6365421 aggaacttttactaatgttcttaacgcatctgcgaaaaat-gttcaaaaacttaatagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 6365508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 27280445 - 27280258
Alignment:
Q  25 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  27280445 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttaaa---ttttttttagacaagtttagaacattattaaaggttcatttactaaaattcggaatttttt 27280349  T
Q  125 aatatgaaacgaattagatatgaa-----ttttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaaca-aaatttggacgtagaaatcaaattt 210  Q
     | |||||| |||||| ||||  |     ||||||||||| | |||| || ||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  27280348 gacatgaaatgaattaaatatatatttttttttttaaaac-aaaaaatttcaagttaaaagtaacagaaatttggatgtagaaatcaaattt 27280258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 212
Target Start/End: Original strand, 28616025 - 28616218
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacact-atgaaaggttcatttactaaaatttagaatt 120  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||         || |||  |||||||| | ||||||||||||||||||| | || ||| ||    
T  28616025 aagtttgttttattatccttaaactcttaaatctttgaacggatttttttaggcaaatttagaacatttatgaaaggttcatttactagagttaagattt 28616124  T
Q  121 ttttaatatgaaacgaattagatatgaa-ttttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 212  Q
    |||||| ||||||  ||||| ||||||| |||||| ||| ||||||| || || |||||| || | |||||  | |||||||||||||||||||    
T  28616125 ttttaaaatgaaataaattaaatatgaattttttttaaatgacaaaacttcaacataaaagtagcaaaaatcagaacgtagaaatcaaattttg 28616218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 36876099 - 36875874
Alignment:
Q  72 agacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaa 171  Q
    ||||||| || ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||| |||| |||| | |||| ||||    
T  36876099 agacaagtttggaacattattaaaggtttatttactaaaattcagaattttttaacatgaaataaattaaatat-aatctttttaaacaaaaaaatttaa 36876001  T
Q  172 agataaaattaacaaa-atttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctg-taaaaaatt 269  Q
     | ||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||         |    ||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||    
T  36876000 -gttaaaagtaacaaatatttggatgta-aaatcaaattttgagatgattttttgtggtggaacttttagtagtgttcttaacacatctgcaaaaaaatt 36875903  T
Q  270 gttcaaaaactcaagagcttaaacataaa 298  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  36875902 gttcaaaaacttaagagtttaaccataaa 36875874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 6450243 - 6450138
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  6450243 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 6450144  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  6450143 attttg 6450138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 14711685 - 14711580
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  14711685 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaatttaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 14711586  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  14711585 attttg 14711580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 19928521 - 19928626
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | ||||||||||||  |||| || |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||    
T  19928521 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgcaaaaaattcaagataaaattaacgaaaatttggacctaaaaataaa 19928620  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  19928621 attttg 19928626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 248 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 26865301 - 26865232
Alignment:
Q  248 cttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    |||||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26865301 cttaacacatctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 26865232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 184
Target Start/End: Original strand, 5597738 - 5597814
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac 184  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5597738 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaagttcaagataaaattaac 5597814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22982089 - 22981985
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaa 207  Q
    |||| |||||||||||||| | | || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||||||||| || |||| |||    
T  22982089 aaaaattagaattttttaacacgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaatttaagataaaactaacgaaatttggacttaaaaataaaa 22981990  T
Q  208 ttttg 212  Q
    |||||    
T  22981989 ttttg 22981985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 212
Target Start/End: Original strand, 27432463 - 27432563
Alignment:
Q  113 ttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaatttt 211  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| |||||||    
T  27432463 ttagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 27432562  T
Q  212 g 212  Q
    |    
T  27432563 g 27432563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 43210097 - 43209932
Alignment:
Q  112 tttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaatttt 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||  | | ||| | |  ||||| |||||| |||||| |||||||    
T  43210097 tttagaattttttaacatgaaataaattaaatatgattttttttaaaagacaaaagttcgaaaaaaagtaagaaaaatctggacgaagaaataaaatttt 43209998  T
Q  212 gcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaa 277  Q
    | || |       ||||| |||||||| ||||||||||||| || | || ||||||||||||||||    
T  43209997 gagataattttttgcataagaacttttggtaatgttcttaatacttgtgcaaaaaattgttcaaaa 43209932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 7234513 - 7234618
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | ||||||||||||  |||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  7234513 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgcaaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 7234612  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  7234613 attttg 7234618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 7572982 - 7573087
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||  ||    
T  7572982 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttggacctaaaaacaaa 7573081  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  7573082 attttg 7573087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 8217575 - 8217510
Alignment:
Q  252 acacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    ||||||||  || |||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8217575 acacgtctacaagaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 8217510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 8315563 - 8315668
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | ||||| |||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  8315563 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataattttttaaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 8315662  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  8315663 attttg 8315668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18404471 - 18404367
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||| || |||| ||    
T  18404471 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatat-aattttttaaaatgccaaaaattaaagataaaactaacaaaaatttagacctaaaaataaa 18404373  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  18404372 attttg 18404367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 27189172 - 27189067
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||| ||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  27189172 aaaaattagaactttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaatttcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 27189073  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  27189072 attttg 27189067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 276 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 28456626 - 28456585
Alignment:
Q  276 aaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28456626 aaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 28456585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 34819019 - 34818914
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||| | |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  34819019 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaatcaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 34818920  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  34818919 attttg 34818914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 41906964 - 41906859
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||||||| || || |||| ||    
T  41906964 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttgtacctaaaaataaa 41906865  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  41906864 attttg 41906859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 42992593 - 42992488
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaa-caaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||  ||||||||||| || |||| ||    
T  42992593 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgtcaaaaatttaagataaaactaatgaaaatttggacctaaaaataaa 42992494  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  42992493 attttg 42992488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 113 - 212
Target Start/End: Original strand, 4291691 - 4291790
Alignment:
Q  113 ttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaatttt 211  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| |||||||    
T  4291691 ttagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacg-caaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 4291789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 42852822 - 42852775
Alignment:
Q  231 gaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaa 278  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  42852822 gaacttttagtaacgttcttaacacgtatgcaaaaaattgttcaaaaa 42852775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 4034773 - 4034668
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||| ||| || |||| ||    
T  4034773 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataattttttttaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttagacctaaaaataaa 4034674  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  4034673 attttg 4034668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 4123300 - 4123195
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||  ||||| |||| | |||||||||| | ||||| || ||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||| ||    
T  4123300 aaaaattagaattttttaacatgtaatcaattaaatataatttttttaaaatgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttagacctagaaataaa 4123201  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  4123200 attttg 4123195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20453135 - 20453030
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||||||  || |||||| |||| | ||| |||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||| ||||||| || |||| ||    
T  20453135 aaaaattagaattttttaatatataatgaattaaatataattttattaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaattttggacctaaaaataaa 20453036  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  20453035 attttg 20453030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 24090058 - 24090163
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | ||||||||||||  |||| || ||||||||| |||| ||||||||||  || |||| ||    
T  24090058 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgtaaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggatctaaaaataaa 24090157  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  24090158 attttg 24090163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 2567415 - 2567519
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaa 207  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||  ||||| || ||||||||| |||| ||||||  || || |||| |||    
T  2567415 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacaccaaaaatttaagataaaactaacgaaatttaaacttaaaaataaaa 2567514  T
Q  208 ttttg 212  Q
    |||||    
T  2567515 ttttg 2567519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 310
Target Start/End: Original strand, 32537608 - 32537687
Alignment:
Q  231 gaacttttagtaatgttc-ttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 310  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||| ||||||||||| ||||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  32537608 gaacttttagtaatgttctttaacacttttgcaaaacattgttcaaaatctcaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 32537687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 33010511 - 33010407
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaa 207  Q
    |||| |||||||||||| | | | || || ||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||||| |||||| |||| |||    
T  33010511 aaaaattagaattttttgacacgtaatgagttaaatataatttttttaaaacgccaaaaatttaagataaaactaacgaaatttagacgtaaaaataaaa 33010412  T
Q  208 ttttg 212  Q
    |||||    
T  33010411 ttttg 33010407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 37812757 - 37812678
Alignment:
Q  230 ggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 310  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| || || || |||| ||| ||||||||||||||    
T  37812757 ggaaattttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 37812678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 262 - 317
Target Start/End: Original strand, 38693676 - 38693731
Alignment:
Q  262 aaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  38693676 aaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagtataaattaaacaaatatgaattga 38693731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 286
Target Start/End: Original strand, 14049943 - 14049997
Alignment:
Q  232 aacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagag 286  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |   |||||||||||||||||| |||||    
T  14049943 aacttttagtaatgttcttaacatgtgttccaaaaattgttcaaaaacttaagag 14049997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 18740683 - 18740788
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaa-caaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||| ||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||| ||||| |||  ||||||||||| || |||| ||    
T  18740683 aaaaattagaagtttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagttaaaactaatgaaaatttggacctaaaaataaa 18740782  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  18740783 attttg 18740788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 192
Target Start/End: Original strand, 19000586 - 19000671
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttg 192  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||  ||||| || ||||||||| |||| ||||||||    
T  19000586 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacaccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttg 19000671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22671083 - 22670979
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| |||||||| ||||| ||||| || || |||||  |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  22671083 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatat-aatttttttaaacgccaaaaattcaaaataaacctaacgaaaatttggacttaaaaataaa 22670985  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  22670984 attttg 22670979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 2004239 - 2004211
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactctta 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2004239 aagtttgtttaattatccttaaactctta 2004211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 273 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 37446373 - 37446329
Alignment:
Q  273 caaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  37446373 caaaaacttaagagttaaaacataaattaaacatatttgaattga 37446329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 105)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 30719775 - 30719479
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30719775 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 30719676  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  30719675 tttaacatgaatcgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacaattt 30719576  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtc-tgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30719575 tttgcatagaaacttttagtaatgttcttaacacgtcttgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 30719479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 15 - 317
Target Start/End: Original strand, 51561340 - 51561642
Alignment:
Q  15 tcaattgaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaattt 114  Q
    |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51561340 tcaattcaaatttgttaaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaattt 51561439  T
Q  115 agaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcg 214  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51561440 agaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaatggcaaaagttaaaaataaaataaacaaaatttgaacgtagaaatcaaattttgcg 51561539  T
Q  215 acannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaat 314  Q
    |||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  51561540 acaattttttgcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaagtaaacaaatttgaat 51561639  T
Q  315 tga 317  Q
    |||    
T  51561640 tga 51561642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 15 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 13501506 - 13501206
Alignment:
Q  15 tcaattgaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaattt 114  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  13501506 tcaattcaaatttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacaatttttttgagacaagtttagaacact--gaaaggttcatttactaaaattt 13501409  T
Q  115 agaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcg 214  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13501408 agaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaaaataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgcg 13501309  T
Q  215 acannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaat 314  Q
    |||       ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13501308 acaattttttgcataggaacttttagtaatgttattaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaat 13501209  T
Q  315 tga 317  Q
    |||    
T  13501208 tga 13501206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 19791533 - 19791239
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||         | |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19791533 aagtttgtttaattatctttaaactcttaaatttttgaacgatttttttatg-caagtttataacactatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 19791435  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||        
T  19791434 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttataacgacaaaagttaaagataaaattaacaaattttggaggtagaaatcaaattttgcgacaattt 19791335  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       | | | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19791334 tttgtagatgaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 19791239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 22 - 315
Target Start/End: Original strand, 26020399 - 26020692
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||       | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26020399 aagtttgtttaattatcattaaactcttgaatttttgaacgatttttttgtgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 26020498  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||        
T  26020499 tttaacattaaatgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaatttaaagataaaattaacaaaatctgaacgtagaaatcaaattttgcgacaattt 26020598  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaatt 315  Q
       | | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  26020599 tatgtagaggagcttttagtaatgttcttaacacgtctgcaaaaaattgttcaaaaactcaagattttaagcataaattaaacaaatttgaatt 26020692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 52493824 - 52493528
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnng-agacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52493824 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttttagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatt 52493725  T
Q  121 ttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 220  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| |       
T  52493724 ttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaatggcaaaacttaaagataaaagtaataaaatctggaagtagaaatcaaattttgcgataatt 52493625  T
Q  221 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
        ||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  52493624 ttttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaatcaaatttgaattga 52493528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 33708945 - 33709240
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33708945 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttagaattt 33709044  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| || |||||||||||||||| |        
T  33709045 tttaatatgaaaagaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatttagacatataaatcaaattttgcgataattt 33709144  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| || ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  33709145 tttgcggaggaacttttaggaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaatcttaagagtttaagtataaattaaacaaatttgaattga 33709240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 72 - 296
Target Start/End: Original strand, 47008697 - 47008920
Alignment:
Q  72 agacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaa 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47008697 agacaagtttagaacactatgaaaggtttatttactaaaatttagaattttt-aacataaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaa 47008795  T
Q  172 agataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgt 271  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||       ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47008796 agataaaattaacaaaatgtggacgtagaaattaaattttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgt 47008895  T
Q  272 tcaaaaactcaagagcttaaacata 296  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  47008896 tcaaaaactcaagagtttaaacata 47008920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 22 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 35531081 - 35530781
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||    
T  35531081 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttta-agacaaatttagaacactatgaaatgttcatttaccaaaatttagatttt 35530983  T
Q  122 ttt-aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 220  Q
    ||| || | ||||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||       
T  35530982 ttttaacaagaaacgaattaaatataatttttttaaaatgataaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgcaacattt 35530883  T
Q  221 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattgatga 320  Q
        |||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35530882 ttttgcaggggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaagattgtttaaaagctcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattgatga 35530783  T
Q  321 tg 322  Q
    ||    
T  35530782 tg 35530781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 80 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 28701192 - 28700954
Alignment:
Q  80 ttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaa 179  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28701192 ttagaacactatgagaggttcatttactaaaatttagaactttttaacataaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaa 28701093  T
Q  180 ttaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctg-taaaaaattgttcaaaaa 278  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||       ||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||  |||||||||||||||||    
T  28701092 ttaacaaaatctggacgtggaaatcaaattttgctacaatttttcgcagaggaacttttagtaatattcttaacacatttgcaaaaaaattgttcaaaaa 28700993  T
Q  279 ctcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28700992 ctcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 28700954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 30982382 - 30982677
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||       |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30982382 aagtttgtttaaatatccttaaaatcttaaatttttgaacgattttttcgagacaagtttagaacaatatgaaaggttcaattactaaaatttagaattt 30982481  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||| || |        
T  30982482 tttaacatgaagcgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgtgataattt 30982581  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30982582 ttagcggaggaacttttagtaaagttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 30982677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 36367890 - 36368185
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  36367890 aagtttgtttaattatttttaaactcataaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggtttaattactaaaatttagaattt 36367989  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||| ||||||||||| |        
T  36367990 tttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaatttaaagataaaagtaataaaatctggacatataaattaaattttgcgataattt 36368089  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       ||  || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36368090 tttgcggagaaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 36368185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 26805491 - 26805786
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| | |||    
T  26805491 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaactatttttttaagacaagtttagaacactaagaaatgttcatttaccaaaatttatatttt 26805590  T
Q  122 ttt-aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 220  Q
    ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||         
T  26805591 ttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctgaacgtaaaaatcaaattttgtgaatttt 26805690  T
Q  221 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
        ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  26805691 ttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacacgtctacaaaaaattgtttaaaaattcaagagtttaagcat-aattaaacaaatttgaattga 26805786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 22 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 12000013 - 11999722
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       |||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12000013 aagtttgtttaattatccttaaagtcttaaatttttgaacgattattttgagacatgtttagaacactatgaaatgttcaattactaaaatttagaattt 11999914  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||  ||||| ||||| || |||||||||||||  | |        
T  11999913 tttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttaaaaacgataaaaattaaagataaaagtactaaaatctggacatataaatcaaattttgaaatatttt 11999814  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaa 313  Q
       ||  | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  11999813 tttgcggatgaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattattaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaa 11999722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 25 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 43505059 - 43504775
Alignment:
Q  25 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43505059 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaactgttttttttagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttggaatttttt 43504960  T
Q  125 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnn 224  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| | |||           
T  43504959 aacatgaaacgaattaaatatgaattttttagaacgacaaaagtt-------aaattaacaaaatctggacgtaaaaatcaaa-tttacaacaacttttt 43504868  T
Q  225 gcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    | | | |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43504867 gtagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttctgttaaaaattgttcaaaaactcaaaagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 43504775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 22 - 314
Target Start/End: Original strand, 10041240 - 10041532
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||        ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  10041240 aagtttgtttaattatctttaaactcttaaattttttaacgatttttttaagaaaagtttagaacaccatgaaaggttcatttaccaaaatttaaatttt 10041339  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| || | |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||        
T  10041340 tttaacattatacgaattaaatataaattttctaaaacggcaaaagttaaagataaaattaataaaatctgaacgtagaaattaaattttgcgacaattt 10041439  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaat 314  Q
       | | ||||||||||||||||||  |||||||  || |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  10041440 ttcgaagaggaacttttagtaatgtgtttaacacacctataaaaaattgtttaaaaactcaagaatttaaacataaattaaacaaatttgaat 10041532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 22 - 209
Target Start/End: Original strand, 46517172 - 46517359
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||       | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  46517172 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaaattttgatcgatttttttgggacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagacttt 46517271  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaatt 209  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46517272 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgaaaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaatt 46517359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 22 - 313
Target Start/End: Original strand, 12368243 - 12368521
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  12368243 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataaaatttagaattt 12368342  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| |||||||| |||| |||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| || || || ||||||||||||||| |         
T  12368343 tttaacatgaaacgtattaaatattaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaaagtaataaaatatgaacatataaatcaaattttgcggc----- 12368437  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaa 313  Q
            |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  12368438 --------ggaacttttaataatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaa 12368521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 25 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 31400512 - 31400219
Alignment:
Q  25 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 124  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||        | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  31400512 tttgcttaattatccttaaactcttaaatattttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatttttt 31400413  T
Q  125 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaa-ttttgcgacannnnn 222  Q
    |  ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |         
T  31400412 atcatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttttgcgatattttt 31400313  T
Q  223 nngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       |  |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31400312 tt-cggaggaccttttaataacgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttgaaaaacttaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 31400219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 46596776 - 46597070
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||         ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  46596776 aagtttgtttaattattcttaaactcttaaatttttgaacggttttttttagacaagtttagaacactgtgaaaggttcaattattaaaatttagatttt 46596875  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||  |||| ||||| ||  ||  ||||||||||| |        
T  46596876 tttaacataaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaa-taaatctggacatatcaactaaattttgcgataattt 46596974  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       ||  | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46596975 tttgcggatgaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 46597070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 36248619 - 36248333
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  36248619 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgaattttttgagacaagtttaaaacactatgaaaggttcaattaataaaatttaaaattt 36248520  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagata----aaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgaca 217  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    ||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  36248519 tttaacatgaaacaaattaaatatgaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaattaaagtaataaaatatggacatataaatcaaattttgcgac- 36248421  T
Q  218 nnnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
                ||||||||||||||| ||||||||| ||||  || |||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  36248420 ------------ggaacttttagtaatattcttaacatgtctacaagaaattgttaaaaaacttaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattga 36248333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 71 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 15053873 - 15053640
Alignment:
Q  71 gagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagtta 170  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||| | ||||||||    
T  15053873 gagacaagtttagaacactatgaaaggctcaatcaataaaatttagaatgttttaacatgaaacgaattaaatataaatttttgaaaacaataaaagtta 15053774  T
Q  171 aagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattg 270  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||| | |             ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  15053773 aagataaaagtaataaaatatggacatataaatcaaattttgtggc-------------ggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattg 15053687  T
Q  271 ttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    || ||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15053686 ttaaaaaacttaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattga 15053640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 21091342 - 21091051
Alignment:
Q  24 gtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttt 123  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||        ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  21091342 gtttgtttgattatcctcaaactcttaaatttttgaacgattttttttagacaagtttagaacactgtgaaaggttcatttattaaaatttataattttt 21091243  T
Q  124 taatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnn 223  Q
    |||   |||| |||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||| ||||| || || || ||||||||||||| || |          
T  21091242 taacgcgaaatgaattaaatatgaat-ttttaaaacatcaaaagttaaagattaaagtaataaaatctgaacatataaatcaaattttgagataatttat 21091144  T
Q  224 ngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
     |   | |||||||  ||||||||| ||||||||||  |||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21091143 tgtggatgaactttatgtaatgttcgtaacacgtctacaaaaaattgtt-taaaacttaagagtttaaacataaactaaacaaatttgaattga 21091051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 25 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 39682087 - 39681895
Alignment:
Q  25 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |        ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682087 tttgtttaattatccttaaactcttaagtttatgaacaatttttttaagacaagtttaaaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 39681988  T
Q  125 -aatatgaaa-cgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcga 215  Q
     || |||||| || |||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  39681987 taacatgaaaacggattaaataggatttttttaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctggatgtagaaatcaaattttgcga 39681895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 32 - 212
Target Start/End: Original strand, 7565189 - 7565370
Alignment:
Q  32 aattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatga 131  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||| |||||       |||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7565189 aattatcttcaaactcttaacttttttaacgatttttatgagacaagtttagaacattacgaaaggtacatttactaaaatttagaattttttaacatga 7565288  T
Q  132 aacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 212  Q
    || |||||  ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  7565289 aatgaatttaatatgaatttttttaaacgagaaaagttcaagataaaattaacaaaaatatggacatagaaatcaaattttg 7565370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 71 - 315
Target Start/End: Original strand, 33707419 - 33707663
Alignment:
Q  71 gagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagtta 170  Q
    |||||||| ||| |||| ||  |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||| |||| |||||||| |||||| |||||||     
T  33707419 gagacaagtttaaaacattacaaaagtttcatttactaaaatttaaatttttttaatatgaaatgtattaaatataaattttttcaaacgataaaagttc 33707518  T
Q  171 aagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaatt 269  Q
    |||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |       ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||    
T  33707519 aagataaaagcaacaaaaatttgaacgtagaaatcaaattttgagataattttttgcgaaggaacttttagtaatgttctcaacacgtctgcaaaagatt 33707618  T
Q  270 gttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaatt 315  Q
    ||||||||| | ||||| ||||  || |||||||||||||| ||||    
T  33707619 gttcaaaaaattaagagtttaagaat-aattaaacaaatttaaatt 33707663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 147
Target Start/End: Original strand, 37986744 - 37986869
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  37986744 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataaaatttagaattg 37986843  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatga 147  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  37986844 tttaacatgaaacgaattaaatatga 37986869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 2059636 - 2059484
Alignment:
Q  25 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 124  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2059636 tttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacgattttttt-agataagtttagaacattataaaaggttcatttactaaaatttagaatttgtt 2059538  T
Q  125 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaa 179  Q
    || ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2059537 aacatgaaacaaattaaatatgaatattttaaaacga-aaaagttaaagataaaa 2059484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 93 - 310
Target Start/End: Original strand, 12251439 - 12251656
Alignment:
Q  93 aaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatt-t 191  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| ||  |||||||||| || |||||| |||||||||| |    
T  12251439 aaaggttcgtttactaaaatttagaattttttaatatgaaataaattaaatatggatttttttaatagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaattct 12251538  T
Q  192 ggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaa 291  Q
    ||||| |||||| |||||||| || |       ||| | |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| || || || ||||    
T  12251539 ggacgcagaaataaaattttgagataattttttgcagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaa 12251638  T
Q  292 acataaattaaacaaattt 310  Q
     ||| ||||||||||||||    
T  12251639 gcat-aattaaacaaattt 12251656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 311
Target Start/End: Original strand, 31024058 - 31024345
Alignment:
Q  25 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 124  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||| ||||| |||||       | || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  31024058 tttgtataattatcctcaagctcttaacttttttaacgatttttatgggataagtttagaacactacgaaaggttcatttactaaaatctaggatttttt 31024157  T
Q  125 -aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnn 222  Q
     || |||||| | |||  ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||  || |         
T  31024158 taacatgaaatgtatttaatatgaatttttttaaacgaaaaaagttcaagataaaattaacaaaaatatgaacatagaaatcaaattttaagataatttg 31024257  T
Q  223 nngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttg 311  Q
       |  | ||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||  ||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  31024258 ttacggatgaacttttagtaatggtcttaacacgtctacaagaaattgttcaaaaacataagagtttaaacat-aattgaacaaatttg 31024345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 229 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 21794498 - 21794413
Alignment:
Q  229 aggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaat 314  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  21794498 aggaacttttattaatgttcttaacacgtgtgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaat 21794413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 93 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 49767910 - 49767693
Alignment:
Q  93 aaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaattt 191  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||| |||| ||||| |    
T  49767910 aaaggttcgtttactaaaatttagaattttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagtttaaaataaaagtaacaaaaatct 49767811  T
Q  192 ggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaa 291  Q
    ||||| |||||| || ||||| || |       ||| |  ||||||| || |||||||||| || | || |||||||||||||||| || || || ||||    
T  49767810 ggacgcagaaataaatttttgagataattttttgcagataaacttttcgtgatgttcttaatacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaa 49767711  T
Q  292 acataaattaaacaaattt 310  Q
     ||| ||||||||||||||    
T  49767710 gcat-aattaaacaaattt 49767693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 74 - 210
Target Start/End: Original strand, 12897143 - 12897280
Alignment:
Q  74 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 173  Q
    ||||| |||||||| ||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||| ||     
T  12897143 acaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactgaaatttagaattttttaacatgaaataaattaaatatgattttttttaaaagacaaaagttcaaa 12897242  T
Q  174 ataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattt 210  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  12897243 ataaaagtaacaaaaatttggacgcagaaataaaattt 12897280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 21794629 - 21794511
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||| |||||| | || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21794629 aagtttgcttaattatccttaaactcttaaatttttgtacgaattttttgagacaagtttagaatattaagaaaggttcattaactaaaatttagaattt 21794530  T
Q  122 tttaatatgaaacgaatta 140  Q
    ||||  || ||||||||||    
T  21794529 tttaccataaaacgaatta 21794511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 109 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 27551001 - 27550800
Alignment:
Q  109 aaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatt-tggacgtagaaatcaaa 207  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| ||||||| ||  |||||||||| || |||||| |||||||||| |||||| |||||| |||    
T  27551001 aaatttagaattttctaatatgaaataaattaaatatggatttttttaatagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaattctggacgcagaaataaaa 27550902  T
Q  208 ttttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaa 307  Q
    ||||| || |       ||| | |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| || || || ||||  || |||||||||||    
T  27550901 ttttgagataattttttgcagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagtat-aattaaacaaa 27550803  T
Q  308 ttt 310  Q
    |||    
T  27550802 ttt 27550800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 48410439 - 48410250
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||| ||| || | ||  ||||||||  | |||||||||||||||||    
T  48410439 aagtttctctaattatccttaaactcttaaatttttgaacagtctttttgagacaagtttaaaaaattacaaaaggttcggtcactaaaatttagaattt 48410340  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaatttt 211  Q
    ||||| |||||| | |||| |||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||| |||||||    
T  48410339 tttaacatgaaatggattaaatat-aatttttttaaaagacaaaagttcaagataaaagtaacaaaaatctggacgtataaattaaatttt 48410250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 230 - 317
Target Start/End: Original strand, 37986902 - 37986989
Alignment:
Q  230 ggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| | ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  37986902 ggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaatttaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattga 37986989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 52881803 - 52881692
Alignment:
Q  102 tttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtaga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||| |||| ||||| ||||||| ||    
T  52881803 tttactaaaatttagaattttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaaatctggacgtcga 52881704  T
Q  201 aatcaaattttg 212  Q
    ||| ||||||||    
T  52881703 aataaaattttg 52881692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 74 - 212
Target Start/End: Original strand, 52882360 - 52882499
Alignment:
Q  74 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 173  Q
    ||||| |||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||| ||| ||||||| || ||     
T  52882360 acaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactaaaatttagaattttttaacatgaaattaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaatttcaaa 52882459  T
Q  174 ataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 212  Q
    |||||| |||| ||||| |||| | |||||| ||||||||    
T  52882460 ataaaagtaacaaaaatctggaggcagaaataaaattttg 52882499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 74 - 188
Target Start/End: Original strand, 27551561 - 27551675
Alignment:
Q  74 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 173  Q
    ||||| |||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||     
T  27551561 acaagtttagaacattactaaaggttcgtttactaaaatttagaatttttttacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaa 27551660  T
Q  174 ataaaattaacaaaa 188  Q
    |||||| ||||||||    
T  27551661 ataaaagtaacaaaa 27551675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 242 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 2059151 - 2059078
Alignment:
Q  242 aatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaatt 315  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  2059151 aatgtgcttaacacgtatgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaatt 2059078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 93 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11397256 - 11397039
Alignment:
Q  93 aaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaattt 191  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||  ||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||  || |||||| |||| ||||| |    
T  11397256 aaaggttcgtttactaaattttagaattatttagcatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagtgcaaaataaaagtaacaaaaatat 11397157  T
Q  192 ggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaa 291  Q
    ||||| |||||| |||||||| || |       | | | |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| || ||  | ||||    
T  11397156 ggacgcagaaataaaattttgagataattttttggagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaatgtttaa 11397057  T
Q  292 acataaattaaacaaattt 310  Q
     ||| ||||||||||||||    
T  11397056 gcat-aattaaacaaattt 11397039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Original strand, 5430567 - 5430754
Alignment:
Q  25 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||         ||||||| ||| |||| ||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  5430567 tttgtttaattatccttaaacttgtaaatttttgaacggtttttctaagacaagtttataacattacaaaagattcatttactgaaatttagaatttttt 5430666  T
Q  125 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatt-tggacgtagaaatcaaattttg 212  Q
    || || ||| |||||| |||||| ||||||||| ||| |||| || | | |||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  5430667 aacataaaatgaattaaatatgatttttttaaa-cgataaaaattcatgttaaaagcaacaaaaaaatggacgtagaaatcaaattttg 5430754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 109 - 255
Target Start/End: Original strand, 49768495 - 49768642
Alignment:
Q  109 aaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatt-tggacgtagaaatcaaa 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| || |||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  49768495 aaatttagaattttttattatgaaataaattaaatatgaatttttttaatagacaaaagttcaaaataaaagtaataaaattctggacgtagaaataaaa 49768594  T
Q  208 ttttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacac 255  Q
    ||||| || |       ||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  49768595 ttttgagataattttttgcaaatgaacttttcgtaatgttcttaacac 49768642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 25352178 - 25352083
Alignment:
Q  93 aaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaa 188  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||| ||||||||    
T  25352178 aaaggttcgtttactaaaatttagaattatttagcatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttgaaaataaaagtaacaaaa 25352083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 42972256 - 42972161
Alignment:
Q  29 tttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||       ||||||   |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42972256 tttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatttttcggagacacttttagaagattataaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 42972161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 4574069 - 4574173
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  4574069 aaaaattagaattttttaatatgtaatgaattaaatat-aattttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 4574167  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  4574168 attttg 4574173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 248 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 12367772 - 12367703
Alignment:
Q  248 cttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    |||||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12367772 cttaacacatctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 12367703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 35188419 - 35188303
Alignment:
Q  71 gagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagtta 170  Q
    |||||||| ||| ||| || |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||| |||| | |||||| |||| |||||||||     
T  35188419 gagacaagtttaaaactctctgaaagattcatatactaaaatatagaattttttaacatgaaataaattaaatat-attttttttaaacaacaaaagttt 35188321  T
Q  171 aagataaaattaacaaaa 188  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  35188320 aagataaaagtaacaaaa 35188303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 47632647 - 47632752
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||    
T  47632647 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaattaacgaaaatttggacctaaaaataaa 47632746  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  47632747 attttg 47632752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 93 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 52010087 - 52009992
Alignment:
Q  93 aaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaa 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||  ||||| ||||||||||||| ||| || ||||||| || |||||| ||||||||    
T  52010087 aaaggttcatttactaaaatttagaaatatttagcatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagaaaaaagttcaaaataaaagtaacaaaa 52009992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 112 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 4487035 - 4486934
Alignment:
Q  112 tttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattt 210  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||||||    
T  4487035 tttagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgtcaaaaatttaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaattt 4486936  T
Q  211 tg 212  Q
    ||    
T  4486935 tg 4486934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 10383083 - 10383188
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  10383083 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 10383182  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  10383183 attttg 10383188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 14421375 - 14421270
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  14421375 aaaaattagaattttttaacatgtaaggaattaaatataatttttttaaaacgtcaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 14421276  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  14421275 attttg 14421270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 17964217 - 17964112
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  17964217 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttggacctaaaaataaa 17964118  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  17964117 attttg 17964112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 31861617 - 31861722
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| || |||| ||    
T  31861617 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaattaacgaaaatatggacctaaaaataaa 31861716  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  31861717 attttg 31861722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 34076052 - 34076157
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  34076052 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacttaaaaataaa 34076151  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  34076152 attttg 34076157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 35767019 - 35767124
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  35767019 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattacatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 35767118  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  35767119 attttg 35767124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 45336550 - 45336445
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || || |||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  45336550 aaaaattagaattttttaatatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaacataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 45336451  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  45336450 attttg 45336445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 48624258 - 48624363
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  48624258 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 48624357  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  48624358 attttg 48624363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 48723630 - 48723525
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  48723630 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacttaaaaataaa 48723531  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  48723530 attttg 48723525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 13083529 - 13083446
Alignment:
Q  231 gaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaatt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||  ||||  ||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  13083529 gaacttttagtaatgttcttaacacatctgaaaaaagttgttcaaaaacttgagagtataagcat-aattaaacaagtttgaatt 13083446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 42972036 - 42971953
Alignment:
Q  231 gaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaatt 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| ||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  42972036 gaacttttagtaatattcttaacacgtctacaaaagatttttctaaaacttaagagtttaaacat-aattaaacagatttgaatt 42971953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 317
Target Start/End: Original strand, 29231884 - 29231939
Alignment:
Q  262 aaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29231884 aaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 29231939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 36796132 - 36796033
Alignment:
Q  114 tagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 212  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||||||||    
T  36796132 tagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaagtaacgaaaatttggacctaaaaataaaattttg 36796033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 4647287 - 4647182
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||||||| || || |||| ||    
T  4647287 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttgcacctaaaaataaa 4647188  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  4647187 attttg 4647182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 317
Target Start/End: Original strand, 15054418 - 15054487
Alignment:
Q  248 cttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    |||||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15054418 cttaacacatctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaataaatttgaattga 15054487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 18997104 - 18996977
Alignment:
Q  82 agaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaatt 181  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||   |||||||||  ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||| || | |||||||| ||||||||  |    
T  18997104 agaacattataaaaggtttattttacaaaatttagt-ttttttaatgtgagatgaattaaatatgaattttttagaa-gccaaaagttcaagataaatgt 18997007  T
Q  182 aacaaaatttggacgtagaaatcaaatttt 211  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||||    
T  18997006 aacaaaatttggacctaaaaataaaatttt 18996977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 25136942 - 25137047
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||  || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  25136942 aaaaattagaattttttaacatataatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 25137041  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  25137042 attttg 25137047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26451286 - 26451181
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||  ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  26451286 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacaccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 26451187  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  26451186 attttg 26451181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26507712 - 26507607
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||  ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  26507712 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacaccaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttggacctaaaaataaa 26507613  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  26507612 attttg 26507607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 314
Target Start/End: Original strand, 36249086 - 36249151
Alignment:
Q  249 ttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaat 314  Q
    ||||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  36249086 ttaacacatctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaat 36249151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 37986278 - 37986209
Alignment:
Q  248 cttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    |||||||| |||  ||||||||||| ||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37986278 cttaacacatctacaaaaaattgttaaaaaatttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 37986209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 2059196 - 2059154
Alignment:
Q  171 aagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgc 213  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  2059196 aagataaaattaacaaaatcaggacgtagaaatcaaattttgc 2059154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 14007137 - 14007043
Alignment:
Q  119 ttttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 212  Q
    |||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||||||||    
T  14007137 ttttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaattttg 14007043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 29231402 - 29231368
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttt 56  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29231402 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttt 29231368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 48410202 - 48410160
Alignment:
Q  235 ttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaa 277  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  48410202 ttttagtaatgttcttaacacttctgcaaaaaattgttcaaaa 48410160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 2207588 - 2207693
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| ||| |||||||||| ||| || |||||| |||| | ||||||||||||  |||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  2207588 aaaaattataattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgcaaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 2207687  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  2207688 attttg 2207693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 10371577 - 10371682
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaa-caaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| ||  |||||||| |||  ||||||||||| || |||| ||    
T  10371577 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcgagataaaactaagaaaaatttggacctaaaaataaa 10371676  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  10371677 attttg 10371682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 14411039 - 14410934
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| ||||| |||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||  || |||| ||    
T  14411039 aaaaattagatttttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaatttaagataaaactaacgaaaatttggatctaaaaattaa 14410940  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  14410939 attttg 14410934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 46667722 - 46667617
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | ||||||||||||  |||| || ||||||||| |||| ||||||| ||| || |||| ||    
T  46667722 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgtaaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttagacctaaaaataaa 46667623  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  46667622 attttg 46667617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 212
Target Start/End: Original strand, 15358344 - 15358440
Alignment:
Q  117 aattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 212  Q
    |||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||| ||| || |||| ||||||||    
T  15358344 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgtcaaaaattcaagataaaactaacgaaaattttgacctaaaaataaaattttg 15358440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 20357172 - 20357120
Alignment:
Q  80 ttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaa 132  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  20357172 ttagaacattataaaaggtttatttaataaaatttagaattttttaacatgaa 20357120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 132
Target Start/End: Original strand, 20562783 - 20562835
Alignment:
Q  80 ttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaa 132  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  20562783 ttagaacattataaaaggtttatttaataaaatttagaattttttaacatgaa 20562835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 52526947 - 52526859
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggac 195  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | ||||||||||||  |||| || ||||||||| |||| |||||||||||    
T  52526947 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgcaaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggac 52526859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 25352041 - 25351963
Alignment:
Q  231 gaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 310  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| | || |||||||||||||||| || || || |||| ||| ||||||||||||||    
T  25352041 gaacttttcgtaatgtttttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 25351963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 108 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 26136278 - 26136191
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttgga 194  Q
    |||| ||||| |||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||    
T  26136278 aaaaattagatttttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttgga 26136191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 310
Target Start/End: Original strand, 48218060 - 48218138
Alignment:
Q  231 gaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 310  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||  | || |||| ||| ||||||||||||||    
T  48218060 gaactttttgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatctttaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 48218138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 108 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 52760604 - 52760518
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttgga 194  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||    
T  52760604 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacg-caaaaattcaagataaaactaacgaaaatttgga 52760518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 212
Target Start/End: Original strand, 1297017 - 1297055
Alignment:
Q  175 taaaattaacaaaa-tttggacgtagaaatcaaattttg 212  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1297017 taaaattaacaaaaatttggacgtagaaatcaaattttg 1297055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 63
Target Start/End: Original strand, 6216382 - 6216416
Alignment:
Q  29 tttaattatccttaaactcttaaatttttgaacga 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6216382 tttaattatccttaaactattaaatttttgaacga 6216416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 212
Target Start/End: Original strand, 14743945 - 14744039
Alignment:
Q  119 ttttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 212  Q
    |||||||| ||| || |||||| ||||   |||||||||| | ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  14743945 ttttttaacatgtaatgaattaaatatagtttttttaaaatgccaaaaattgaagataaaactaacgaaaatttggacctagaaataaaattttg 14744039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 26207547 - 26207493
Alignment:
Q  232 aacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagag 286  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||| |||||| |||||    
T  26207547 aacttttagtaatgttcttaacatgtttcgaaaaaattgttctaaaacttaagag 26207493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 28479969 - 28479931
Alignment:
Q  25 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacga 63  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  28479969 tttgtttaattatccttaaactattaagtttttgaacga 28479931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 212
Target Start/End: Original strand, 31266968 - 31267062
Alignment:
Q  119 ttttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 212  Q
    |||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| | ||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||||||||    
T  31266968 ttttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccgaaaattcaagataaaactaacaaaaatttggacctaaaaataaaattttg 31267062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 212
Target Start/End: Original strand, 48468233 - 48468331
Alignment:
Q  116 gaattttttaatatgaaacgaattagatatgaat-tttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 212  Q
    ||||||||||| ||| || |||||| |||| | | ||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||||||||    
T  48468233 gaattttttaacatgtaatgaattaaatataattatttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacataaaaataaaattttg 48468331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 315
Target Start/End: Original strand, 1297104 - 1297156
Alignment:
Q  262 aaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaatt 315  Q
    |||||||| |||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  1297104 aaaaaattattcaaaaatttaagagtttaaacataa-ttaaacaaatttgaatt 1297156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 4008803 - 4008908
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||| ||| ||| || |||||| |||| | |||||| ||| | ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  4008803 aaaaattagaattttgtaacatgtaatgaattaaatataattttttttaaatgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 4008902  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  4008903 attttg 4008908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7603823 - 7603718
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||  || |||||| |||| | ||||||||| ||  |||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  7603823 aaaaattagaattttttaacatataatgaattaaatataatttttttaaatcgctaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttggacctaaaaataaa 7603724  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  7603723 attttg 7603718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 10658611 - 10658716
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| |  |||||||||||  |||| || ||||||||| |||| ||||||||||  || |||| ||    
T  10658611 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatatttttaaaacgctaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggatataaaaataaa 10658710  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  10658711 attttg 10658716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 26911163 - 26911268
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| ||| |||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| || || || |||||||||  ||| ||||||||||| || |||| ||    
T  26911163 aaaaattataattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccagaaattcaagataaaacaaacgaaaatttggacctaaaaataaa 26911262  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  26911263 attttg 26911268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 32037258 - 32037363
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||| ||||||| ||||| || ||||||| | |||| ||||||||||  || |||| ||    
T  32037258 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttataaaacgccaaaatttgaagataagactaacgaaaatttggatctaaaaataaa 32037357  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  32037358 attttg 32037363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 45583556 - 45583660
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | | |||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||  || |||| ||    
T  45583556 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaatta-atataattattttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggatctaaaaataaa 45583654  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  45583655 attttg 45583660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 33707655 - 33707619
Alignment:
Q  25 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaac 61  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  33707655 tttgtttaattattcttaaactcttaattttttgaac 33707619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 42972146 - 42972086
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagt 168  Q
    |||| |||||||||||||| |||| | |||||| |||||| |||| | |||||||||||||    
T  42972146 aaaaattagaattttttaacatgagatgaattaaatatgatttttcttaaacgacaaaagt 42972086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 104)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 53324070 - 53323774
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53324070 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 53323971  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||        
T  53323970 tttaacatgaaatgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgtgacaattt 53323871  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgt-aaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53323870 tttgcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtatgtaaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 53323774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 30331278 - 30331573
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||       || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30331278 aagtttgtttaattattcttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgaaacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 30331377  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||        
T  30331378 tttaacataaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgcgacaattt 30331477  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30331478 tttgcataggaacttttagtaatgttcttaacacgcctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 30331573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 33177421 - 33177716
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33177421 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaatactatgaaaagttcatttactaaaatttagaattt 33177520  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||        
T  33177521 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaacgttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgagacaattt 33177620  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33177621 tttgcataggagcttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttaaattga 33177716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 15 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 19523014 - 19522712
Alignment:
Q  15 tcaattgaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaattt 114  Q
    |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||        ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19523014 tcaattcaaatttgtttaattattcttaaactcttaaatttttgaacgattttttttagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaattt 19522915  T
Q  115 agaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcg 214  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19522914 agaattttttaacatgaaacaaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaaaataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgcg 19522815  T
Q  215 acannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaat 314  Q
    |||       ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19522814 acaattttttgcataggactttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaat 19522715  T
Q  315 tga 317  Q
    |||    
T  19522714 tga 19522712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 47309729 - 47309434
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||       |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47309729 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttaaacgatttttttgagacaagtttagaacactgtgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 47309630  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||        
T  47309629 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaatggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatcttgacgtataaatcaaattttgctacaattt 47309530  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47309529 tttgcataggaacttttattaatgttcttaacatgtctgtaaataattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 47309434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 22068392 - 22068097
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  22068392 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagatatgtttagaacactatgaaaggttcattttctaaaatttagatttt 22068293  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||        
T  22068292 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagattaaattaacaaaattgggacgtaaaagtcaaattttgcgacaattt 22068193  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22068192 tttgcagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcagaaaactattcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 22068097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 22 - 315
Target Start/End: Original strand, 28448391 - 28448677
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28448391 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttacaattt 28448490  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||        
T  28448491 tttaacatgaaacaaattgaatatgaatttttcaaaacgacaaaacttaaagataaaattaacaaa------acgtagaaatcaaattttgcgacaattt 28448584  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaatt 315  Q
       ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  28448585 tttgcataggaacttttagtaatgttctcaacacgt-tgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaatt 28448677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 83 - 317
Target Start/End: Original strand, 38114273 - 38114507
Alignment:
Q  83 gaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaatta 182  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38114273 gaacgctaggaaatgttcatttactaaaatttaaaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaatta 38114372  T
Q  183 acaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactca 282  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  38114373 acaaaatctggacatataaatcaaattttgtgacaattttttgcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaatttgttaaaaaactca 38114472  T
Q  283 agagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38114473 agagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 38114507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 22 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 31316836 - 31316547
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31316836 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttctgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttagaattt 31316737  T
Q  122 ttt-aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 220  Q
    ||| || ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |       
T  31316736 ttttaacatgaaacaaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaaattaaagataaaaataataaaatttggacatataaatcaaattttgcgataatt 31316637  T
Q  221 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 310  Q
        ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  31316636 ttttgcagaggaacttttagtaatgtttttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaattt 31316547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 29 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 43938291 - 43937996
Alignment:
Q  29 tttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aat 127  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||       |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  43938291 tttaattatcctttaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagcttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttttaac 43938192  T
Q  128 atgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgac-annnnnnngc 226  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||| |       ||    
T  43938191 atgaaacgaattaaatatgaaaattttaaaacgaaaatagttcaagaaaaaattaacaaaatctgaacgtataaataaaattttgcgacaatttttttgc 43938092  T
Q  227 ataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattgatgatg 322  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43938091 agaggaacttttagtaatgttcttaacatgtctacaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattgaggatg 43937996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 317
Target Start/End: Original strand, 3873155 - 3873468
Alignment:
Q  25 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3873155 tttgtttaattatccttaaactcttacatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 3873254  T
Q  125 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnn 224  Q
    || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||           
T  3873255 aacatgaaacaaattaaatatgaattttttaaaacggaaaaagttaaagataaaattaacaaaacctgtacgtagaaatcaaattttgcgacaatttttt 3873354  T
Q  225 gcataggaact---------------------tttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaa 303  Q
    |||||||||||                     ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3873355 gcataggaacttttagtaattgcataggaacttttagtaatgttcttaacatgcctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaa 3873454  T
Q  304 caaatttgaattga 317  Q
    ||||||||||||||    
T  3873455 caaatttgaattga 3873468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 22 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 55938362 - 55938075
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||       || | ||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  55938362 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttaaacgatttttttgaaataagtttagaacactacgaaaggt-cgtttactagaatttagaattt 55938264  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| || |||||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||        
T  55938263 tttaacataaaacgaattaaatctgaattttttaaaacaacaaatgttaaagataaaattaacaaaatctgcacgtagaaatcaaattttgcgacaattt 55938164  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 310  Q
        || ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  55938163 ttcacagaggtacttttagtaatattcttaacacgtctgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaattt 55938075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 25422361 - 25422067
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||       |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25422361 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttaaacgatttttttgagacaagtttagaacactatcaaaggttcaattactaaaatttagaattt 25422262  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||||| |        
T  25422261 tttaacataaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaatgttaaagataaaagtaa-aaaatctggacatataaatcaaattttgcgataattt 25422163  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       ||  | || ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25422162 tttgcggatgatcttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaaatgttaaaaaacttaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 25422067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 33689293 - 33689588
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||       |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33689293 aagtttgtttaattattcttaaattcttaaatttttaaacgatttttttgagacaagtttagagcactatgaaaggttcaattactaaaatttagaattt 33689392  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||| |||||||||||| |        
T  33689393 tttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttaaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctggacatataaaccaaattttgcgataattt 33689492  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       ||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33689493 tttgcggaggaatttttagtaatgttcttaacacatctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 33689588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 51876302 - 51876007
Alignment:
Q  25 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttaga--atttt 122  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||        ||||||| ||| |||| | ||||| ||||||||| |||||||||||  | |||    
T  51876302 tttgattaattattcttaaactcttaaacttttgaacgaatttttttagacaagtttataacaatgtgaaatgttcatttattaaaatttagacaagttt 51876203  T
Q  123 ttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaa-gataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |        
T  51876202 ttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggtaaaagttaaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaaattttgtgataattt 51876103  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  51876102 tttgcagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctctaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattga 51876007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 4850389 - 4850094
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||       ||||||   |||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  4850389 aagtttgtttaattattcttaaactcttgaatttttgaacgattttattgagacacatttagaacaatatgaaagattcatttagtaatatttagaattt 4850290  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    || || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |        
T  4850289 ttcaacatgaaacgaatttaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaaataacaaaacttagacgtagaaatcaaattttgcgataattt 4850190  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       ||  || || |||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  4850189 tttgcggagaaatttttagtaacattcttaacacgtatgcaaaaaattgttcaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacatatttgaattga 4850094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 80 - 322
Target Start/End: Original strand, 20177934 - 20178175
Alignment:
Q  80 ttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaa 179  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20177934 ttagaacaatatggaaggttcatttactaaaattta-aattttttaacaagaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaa 20178032  T
Q  180 ttaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaac 279  Q
     ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||       | | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  20178033 gtaacaaaatctggacgtataaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacatgtatgtaaaaaattgttcaataac 20178132  T
Q  280 tcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattgatgatg 322  Q
     |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20178133 ccaagaatttaagcataaattaaacaaatttgaattgaggatg 20178175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 53423563 - 53423859
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53423563 aagtttgtttaactatccttaaactcttaaattttttaacaattcttttaagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 53423662  T
Q  122 ttt--aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacann 219  Q
    |||  || ||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||   || ||||||||||||||      
T  53423663 tttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttatagataaaagtaacaaaatatggacgtgtgaaacaaattttgcgacaat 53423762  T
Q  220 nnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
         ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  53423763 tttttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacatgtctgcaaaaaattgtccaaaaactcaagag-tttagtataaattaaacaaatttgaattga 53423859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 51395612 - 51395907
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| ||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  51395612 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttttttagacaagttta-aacactatgagtgattcatttactaaaatttagaattt 51395710  T
Q  122 ttt-aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 220  Q
    ||| || ||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||| |||||||||||||       
T  51395711 ttttaacatgaaacaaattaaatatgaatatttcaaaacgaaaaaagttaaagataaaattaacaaaatcaggatgtagtaattaaattttgcgacaata 51395810  T
Q  221 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
        | | ||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51395811 ttttgtacaggaacttttagtaatgtgtttaacacgtctgcaagaaattattcaaaaactcatgagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 51395907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 7490988 - 7490707
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaa-tttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |        ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  7490988 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaaatttttgaacaactttttttagacaagtttagaacactataaaaggttcaattactaaagtttagattt 7490889  T
Q  121 ttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 220  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||       
T  7490888 ttttaagatgaaacgaattaaatatgaatattttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaaatatgcgtcaatt 7490789  T
Q  221 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaat 308  Q
        ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||     |||||  ||||||||||||||||||||    
T  7490788 ttttgcagaggaa-ttttagtaatgtgcttaacacgtctgtgaaaaattgttcaaa-----aagagtgtaaacataaattaaacaaat 7490707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 10321990 - 10321695
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |       || ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  10321990 aagtttgtttaattatctttaaactcttaaatttttgaacaatttttttgacacaagtttagaacactgtgaaaggttcaattactaaaatttagaatat 10321891  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||  |||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||||| |        
T  10321890 tttatcatgaaaagaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcgataattt 10321791  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  10321790 tttgcggagggacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagtataaattaaacaaattttaattga 10321695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 22 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 1870400 - 1870140
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1870400 aagtttgtttaactatccttaaactattaaatttttgaacgatttttta-agacaagtttagaacactataaaatgttcatttactaaaatttagaattt 1870302  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||        
T  1870301 tttaacataaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaagtaacaaaatatggacgtataaatcaaattttgtgacaattt 1870202  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaa 283  Q
       ||  || |||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||  ||||||||||    
T  1870201 tttgccgagaaacttttagtaatgtttttaacatgtctacaaaaaattgtcgaaaaactcaa 1870140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 53571542 - 53571824
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  53571542 aagtttgtttaatcatccttaaactcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataaaatttagaattt 53571641  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| ||||| || || || ||||||||||||||| |         
T  53571642 tttaacatgaaacgaattaaatataaatttttgaaaataataaaagttaaagataaaagtaataaaatatgtacatataaatcaaattttgcggc----- 53571736  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
            |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  53571737 --------ggaacttttaataatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattga 53571824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 11670401 - 11670119
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||       |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  11670401 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaaattttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactacgaaaggttcaattaataaaatttagaattt 11670302  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||| |         
T  11670301 tttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaaagtaataaaatatggacatataaatcaaattttgcggc----- 11670207  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
            |||||||||| |||||||| |||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  11670206 --------ggaacttttaataatgttcctaacacatctacaaaaaattgttaaaaaacttaagcgtttaagaataaattaaacaaatttgaattga 11670119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 44289970 - 44289677
Alignment:
Q  25 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 124  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||        | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  44289970 tttgcttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatttttt 44289871  T
Q  125 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaa-ttttgcgacannnnn 222  Q
    || ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |         
T  44289870 aacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttttgcgatattttt 44289771  T
Q  223 nngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       |  | || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  44289770 tt-cggatgaccttttaataacgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttgaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttggattga 44289677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 107 - 317
Target Start/End: Original strand, 13718060 - 13718271
Alignment:
Q  107 taaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  13718060 taaaatttagagttttttaacatgaaacgcattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagatcaagataaaattaacaaaatcaggacgtagaaatcaa 13718159  T
Q  207 attttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtct-gtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaaca 305  Q
    |||||||||||       ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  13718160 attttgcgacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtctggaaaaaaattgttaaaaaactcaagagtttaagcataaattaaaca 13718259  T
Q  306 aatttgaattga 317  Q
    ||||| ||||||    
T  13718260 aatttaaattga 13718271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 29 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 10085772 - 10085485
Alignment:
Q  29 tttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaata 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||        | |||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  10085772 tttaattatccttaaactcttaaatttttgaacggtttttttgtgacaaatttagaacactatgaaatcttcatttactaaaatttagaat-ttttaaca 10085674  T
Q  129 tgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagat-aaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngca 227  Q
    |||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||  ||||||||||||||||||| |       ||     
T  10085673 tgaaacaaattaaat-taaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaaagtaacaaaatcaggatatagaaatcaaattttgcgataattttttgcg 10085575  T
Q  228 taggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
     ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||| ||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  10085574 gaggaacttttagtaatgttctaaacatgtctgcaaaaaattattcacaaacttaagagttttagcataaattaaacaaatttgaattga 10085485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 272
Target Start/End: Original strand, 42972734 - 42972983
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        |||| || |||||| |||||||||||||||||||  ||||   | | |||    
T  42972734 aagtttgtttaattatctttaaactcttaaatttttgaacgatttttttaagacgagtttagaatactatgaaaggttcatttatcaaaaaaaa-atttt 42972832  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaatttt-ttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 220  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||       
T  42972833 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttgttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttacgacaatt 42972932  T
Q  221 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgtt 272  Q
        |||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42972933 ttttgcagtggaac-tttagcaatgttcttaacacgtctgcaaaaaattgtt 42972983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 44209495 - 44209777
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |    
T  44209495 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaagattcaattactaaaatttagaatct 44209594  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| | |||| |||||| ||||| |||||| ||             || ||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||||| |        
T  44209595 tttaacacgaaaagaattaaatatgtatttttgaa-------------aaggataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcgataattt 44209681  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       || || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44209682 tttgcgtacgaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattattaaaaaacttaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 44209777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 317
Target Start/End: Original strand, 47379177 - 47379471
Alignment:
Q  21 gaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatt 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||| |||       |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47379177 gaagtttgtttaattatacttaaactctaaa--ttttgagcgaatattttgagacaagtttagaatactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatt 47379274  T
Q  121 ttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacann 219  Q
    ||| || |||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||  | ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |      
T  47379275 tttaaaaatgaaatgaattaaatatgtattttttaaaatgacaaaacgtcaagataaaagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaattttgcgataat 47379374  T
Q  220 nnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
         ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||   | ||| |||||| |||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  47379375 tttttgcggaggaacttttagtattgttcttaacacgtctgcaaaagcattttcgaaaacttaagagtataagcat-aattaaacaaatttgaattga 47379471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 48082736 - 48082443
Alignment:
Q  25 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 124  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||        | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  48082736 tttgcttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaacggttcatttacaaaaatctataatttttt 48082637  T
Q  125 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaa-ttttgcgacannnnn 222  Q
    || ||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |         
T  48082636 aacatgaaataaattaaatatgaattttataaaacgacaaaagtttaagatataaataacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttttgcgatattttt 48082537  T
Q  223 nngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       |  | || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  48082536 tt-cggatgaccttttaataacgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttgaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttggattga 48082443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 23473478 - 23473773
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||       |||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  23473478 aagtttgtttaattatcggtaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagataagtttagaacactgtgaaaggttcatt-actaaaatttaaaattt 23473576  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||| ||||| || ||| ||||| ||||||||| || ||| ||||| ||||| ||  ||||||||||||||| |        
T  23473577 tttaacatgaaacaaattaaatatgagtttttaaatacgtcaaaaattaaagatataagtaataaaatctggacataagaatcaaattttgcgataattt 23473676  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtct-gtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       ||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||   |||||||| |||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  23473677 tttgcagaggaacttttggtaacgttcttgacacgtctacaaaaaaattattcaaaaacttaagactttaagcataaattaaacaaatttgcattga 23473773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 71 - 317
Target Start/End: Original strand, 35060875 - 35061120
Alignment:
Q  71 gagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagtta 170  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  35060875 gagacaagtttagagcactttgaaatattcaattactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgattttttgaaaacgataaaagtta 35060974  T
Q  171 aagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattg 270  Q
    || |||||| ||| ||||| ||||  || |||||||||||||||| |       ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  35060975 aaaataaaagtaataaaatctggatatataaatcaaattttgcgataattttttgcggaggaacttttaataatgttcttaacacgtctacaaaaaattg 35061074  T
Q  271 ttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    || |||| || ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  35061075 tt-aaaatcttaagagttttagaataaattaaacaaatttgaattga 35061120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 47463661 - 47463469
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaaca---ctatgaaaggttcatttactaaaatttagaa 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||       |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||       
T  47463661 aagtttgtttaattatctttaaactcttaaattttttaacgatttttt-gagacaagtttagaacaacactatgaaaggttcatttactaaaatttaatt 47463563  T
Q  119 ttttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttg 212  Q
    |||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47463562 ttttttaacattaaacaaattaaatatgaattttttaaaacagtaaaaattaaagataaaattaacaaaatatggacgtagaaatcaaattttg 47463469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 111 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 37329695 - 37329487
Alignment:
Q  111 atttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtaga--aatcaaat 208  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||| ||||    
T  37329695 atttataattttttaaaatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctggatatatataaattaaat 37329596  T
Q  209 tttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaat 308  Q
    ||||| | |       ||  | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  37329595 tttgcaataattttttgcggatgaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaatttaagagtttaaacataaattaaacaaat 37329496  T
Q  309 ttgaattga 317  Q
    |||||||||    
T  37329495 ttgaattga 37329487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 140
Target Start/End: Original strand, 7617418 - 7617536
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7617418 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttaagacaagtttaaaacattatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 7617517  T
Q  122 tttaatatgaaacgaatta 140  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  7617518 tttaacatgaaacgaatta 7617536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 72 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 35821357 - 35821128
Alignment:
Q  72 agacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagtta 170  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| || |||||||  |||  ||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  35821357 agacaagtttagaacatcatgaaaggttcatatactagaatttacaatttttttaacatgaaacttattgaatatgaattttataaaacgacaaaactta 35821258  T
Q  171 aagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattg 270  Q
    || |||||||||| ||||| |||||||||  ||  ||||||             ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35821257 aaaataaaattaataaaatctggacgtagcgat--aatttt----------tttgcagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcaaaaaattg 35821170  T
Q  271 ttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaa 313  Q
    ||| |||| | ||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  35821169 ttc-aaaatttaagagtttaagtataaattaaacaaatttgaa 35821128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 241 - 317
Target Start/End: Original strand, 7617535 - 7617611
Alignment:
Q  241 taatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7617535 taatgttcttaacatgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 7617611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 80 - 316
Target Start/End: Original strand, 48219945 - 48220180
Alignment:
Q  80 ttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaa 179  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||||| || || ||||||    
T  48219945 ttagaacattatgaaaggttcatttgttaaaatttagaattttttaacaagaaattaattaaatatgaatgttttaaaatgacaaaa-ttcaatataaaa 48220043  T
Q  180 ttaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaa 278  Q
     |||| |||||||||| |||||||| ||||||| | | |       ||  ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| | |||| |||||    
T  48220044 gtaacaaaaatttggatgtagaaattaaattttacaataattttttgcggaggaatttttagtaatgttcttaacatatctgcaaaagaatgttaaaaaa 48220143  T
Q  279 ctcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattg 316  Q
    |  ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  48220144 cataagagtttaagcat-aattaaacaaatttgaattg 48220180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 315
Target Start/End: Original strand, 52947767 - 52948054
Alignment:
Q  29 tttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnng-agacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaa-ttttttaa 126  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||       | |||||   |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52947767 tttaattatccttaaactgttaaattttagaacgatttttttggagacacttttagaacattataaaaagttcatttactaaaatttagaatttttttaa 52947866  T
Q  127 tatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaa-tttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnng 225  Q
     |||| |  ||||| ||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||| |||||    |       |    
T  52947867 catgagataaattaaatatgaatttttt-aaatgacaaaatttcaagataaaagtcacaaaagtttggtcgtagaaatcaatttttgaactaatttttcg 52947965  T
Q  226 cataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaatt 315  Q
       || |||||||||||||||| | ||||| | | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  52947966 gggagcaacttttagtaatgttttgaacacatatataaaaaattgttcaaaaattcaagagtttaaacat-aattaaacaaatttgaatt 52948054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 139
Target Start/End: Original strand, 3862491 - 3862606
Alignment:
Q  25 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnn-gagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||        |||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3862491 tttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattttttttgagacaagtttagaatgcgatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttt 3862590  T
Q  124 taatatgaaacgaatt 139  Q
    ||| ||||||||||||    
T  3862591 taacatgaaacgaatt 3862606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 139
Target Start/End: Original strand, 3871248 - 3871363
Alignment:
Q  25 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnn-gagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||        |||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3871248 tttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattttttttgagacaagtttagaatgcgatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttt 3871347  T
Q  124 taatatgaaacgaatt 139  Q
    ||| ||||||||||||    
T  3871348 taacatgaaacgaatt 3871363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 93 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 38499512 - 38499327
Alignment:
Q  93 aaaggttcatttactaaaatttaga-attttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaattt 191  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||| |||||||| |||| ||| ||||  |||| ||||||||| ||| ||||| |    
T  38499512 aaaggttcgtttactaaaatttaaattttttttaacatgaaatgaattaaatatgaatatttttaaaagacatgagttcaagataaaagtaaaaaaatct 38499413  T
Q  192 ggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaa 277  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||         ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  38499412 ggacatagaaataaaattttgagattattttttgcagatgaacttttagtaatgttcttaacacttctgcaaaaaattgttcaaaa 38499327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 74 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 44452328 - 44452189
Alignment:
Q  74 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 173  Q
    ||||| |||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||     
T  44452328 acaagtttagaacattactaaaggttcgtttactaaaatttagaattttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaa 44452229  T
Q  174 ataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 212  Q
    |||||| |||| ||||| |||||| || ||| ||||||||    
T  44452228 ataaaagtaacaaaaatctggacgcaggaataaaattttg 44452189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 13604077 - 13603785
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttg-aacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||        ||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  13604077 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttttaatgatattttttagacaagtttataacattataaaaggttcatttactaaaattcataatt 13603978  T
Q  121 ttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaa-tttggacgtagaaatcaaattttgcgacann 219  Q
    ||| | | |||||  ||||| ||||||||| ||| |||||| |    |||||| ||||| |||||||| ||||||  || |||||| |||||| || |      
T  13603977 tttaact-tgaaataaattaaatatgaattcttttaaacgaaattttttaaagttaaaagtaacaaaaatttggatataaaaatcacattttgagataaa 13603879  T
Q  220 nnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaatt 315  Q
         ||  |||||||||||||||||||| ||| |  |||| |||||||||||| |||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13603878 tttttgcggaggaacttttagtaatgttcataaaatatctgcaaaaaattgttc-aaaacttaagagtttaagcat-aattaaacaaatttgaatt 13603785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 74 - 310
Target Start/End: Original strand, 34513070 - 34513305
Alignment:
Q  74 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 173  Q
    ||||| |||||||| ||  | |||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||     
T  34513070 acaagtttagaacattacaagaggttcgtttactaaaatttagaattatttagcatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagtttaa- 34513168  T
Q  174 ataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgtt 272  Q
    |||||| |||| ||||| |||||| |||||| |||||||| || |       | | | |||||||| ||||||||||| |||| | || |||||||||||    
T  34513169 ataaaagtaacaaaaatctggacgcagaaataaaattttgagataattttttggagatgaacttttcgtaatgttcttgacacttgtgcaaaaaattgtt 34513268  T
Q  273 caaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 310  Q
    ||||| || || || |||| ||| ||||||||||||||    
T  34513269 caaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 34513305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 55283399 - 55283212
Alignment:
Q  25 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 124  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||       |||||| | |||||||| ||| ||| |||||||| ||||||  |||| ||||||    
T  55283399 tttgtttaattattcttgaattcttaaatttttgaacgatttttaggagacatgtttagaacattataaaatgttcatttgctaaaaaatagattttttt 55283300  T
Q  125 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 212  Q
    |||| || | || ||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || | |||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  55283299 aataggagaagatttaaatatg-atttttttaaacgacaaaagttcaagaaaagagtaacaaaaatctgaacgtagaaatcaaattttg 55283212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 184
Target Start/End: Original strand, 20650504 - 20650666
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||| | |||       | |||||| || |||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20650504 aagtttgtttaattatctttaaaatcttaaaagttttagcgattttcttgggacaagtttggaacatcacgaaagattcatttactaaaatttagaattt 20650603  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac 184  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||| ||||||||| ||||    
T  20650604 tttaacatgaaatgaattaaatatgaattattttaatagacaaaagttcaagataaaagtaac 20650666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 74 - 188
Target Start/End: Original strand, 28163777 - 28163891
Alignment:
Q  74 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 173  Q
    ||||| |||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||  ||||  ||||||||||||| ||| |||||||||| ||     
T  28163777 acaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactaaaatttagaattatttagcatgaaataaatttaatatgaatttttttaaaagacaaaagttgaaa 28163876  T
Q  174 ataaaattaacaaaa 188  Q
    |||||| ||||||||    
T  28163877 ataaaagtaacaaaa 28163891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 242 - 316
Target Start/End: Original strand, 50824407 - 50824481
Alignment:
Q  242 aatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattg 316  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50824407 aatgttcttaacacgtctgaaaaatattgttcaaaaacttaagctattaagcataaattaaacaaatttgaattg 50824481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8949727 - 8949622
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||    
T  8949727 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaattaacgaaaatttggacctaaaaataaa 8949628  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  8949627 attttg 8949622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 29445741 - 29445636
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  29445741 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctagaaataaa 29445642  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  29445641 attttg 29445636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 109 - 272
Target Start/End: Original strand, 44452893 - 44453056
Alignment:
Q  109 aaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatt-tggacgtagaaatcaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| | |||||||||| || |||||| || ||||||| |||||| |||||  |||    
T  44452893 aaatttagaattttttaatatgaaataaattaaatatgaattttttaata-gacaaaagttcaaaataaaagtagcaaaattctggacgcagaaaaaaaa 44452991  T
Q  208 ttttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgtt 272  Q
      ||| || |       ||| | |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  44452992 aattgagataattttttgcagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgtt 44453056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 209
Target Start/End: Original strand, 35351735 - 35351853
Alignment:
Q  93 aaaggttcatttactaaaatttagaattttt-taatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaa-aatt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| || |||||| |||||||||||||  | | ||||||||| ||||||||| || ||| | ||    
T  35351735 aaaggttcatttactaaaatttaaaatttttgtaacatgtaatgaattaaatatgaatttttttcatcaacaaaagttcaagataaaagtatcaatactt 35351834  T
Q  191 tggacgtagaaatcaaatt 209  Q
    |  ||||||||||||||||    
T  35351835 tatacgtagaaatcaaatt 35351853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 344023 - 343918
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  344023 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 343924  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  343923 attttg 343918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 6203275 - 6203170
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  6203275 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaatttcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 6203176  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  6203175 attttg 6203170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 248 - 317
Target Start/End: Original strand, 11670860 - 11670929
Alignment:
Q  248 cttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    |||||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11670860 cttaacacatctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 11670929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 63
Target Start/End: Original strand, 13717994 - 13718035
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacga 63  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13717994 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacga 13718035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 19320816 - 19320921
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  19320816 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaatttcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 19320915  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  19320916 attttg 19320921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22515767 - 22515662
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  22515767 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 22515668  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  22515667 attttg 22515662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 24281869 - 24281974
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  24281869 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 24281968  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  24281969 attttg 24281974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 28756420 - 28756315
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  28756420 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 28756321  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  28756320 attttg 28756315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 31312251 - 31312146
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  31312251 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 31312152  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  31312151 attttg 31312146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 38698827 - 38698932
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  38698827 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgtcaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 38698926  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  38698927 attttg 38698932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 39269864 - 39269759
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||| ||  || |||| ||    
T  39269864 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattatatatgaattttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttagaactaaaaataaa 39269765  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  39269764 attttg 39269759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 42931154 - 42931259
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  42931154 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 42931253  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  42931254 attttg 42931259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 52224649 - 52224544
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | || ||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||    
T  52224649 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttgtttaaaacgccaaaaattcaagataaaattaacgaaaatttggacctaaaaataaa 52224550  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  52224549 attttg 52224544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 52788856 - 52788960
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| ||| |||||||||| ||| || |||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  52788856 aaaaattataattttttaacatgtaatgaattaaatat-aattttttaaaacgtcaaaagttcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 52788954  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  52788955 attttg 52788960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 62
Target Start/End: Original strand, 38114237 - 38114277
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacg 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38114237 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacg 38114277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9428172 - 9428068
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| ||||||||||||||  |||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  9428172 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatat-aattttttaaaacgcaaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 9428074  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  9428073 attttg 9428068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15637024 - 15636919
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| ||| |||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  15637024 aaaaattataattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 15636925  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  15636924 attttg 15636919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 25768018 - 25768123
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaa-ttaacaaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |||| | |||||||| ||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || |||| ||    
T  25768018 aaaaattagaattttttaacatgtaacgaattaaatataatttttttaatacgccaaaaattcaagataaaactaaagaaaatttggacctaaaaataaa 25768117  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  25768118 attttg 25768123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 34680329 - 34680434
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| || | | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  34680329 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatttaatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 34680428  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  34680429 attttg 34680434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 53237972 - 53238077
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaa-caaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||  ||||||||||| || |||| ||    
T  53237972 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgtcaaaaattcaagataaaactaatgaaaatttggacctaaaaataaa 53238071  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  53238072 attttg 53238077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 188
Target Start/End: Original strand, 10386696 - 10386776
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaa 188  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||    
T  10386696 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatatcatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacaaaa 10386776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 11152413 - 11152325
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggac 195  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||||||||||    
T  11152413 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggac 11152325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 113 - 212
Target Start/End: Original strand, 47016247 - 47016347
Alignment:
Q  113 ttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaatttt 211  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| |||||||    
T  47016247 ttagaattttttaacatgtaatgaattaaatataattttttttaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 47016346  T
Q  212 g 212  Q
    |    
T  47016347 g 47016347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 262 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 31471017 - 31470962
Alignment:
Q  262 aaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31471017 aaaaaattgttaaaaaacttacgagtttaaaaataaattaaacaaatttgaattga 31470962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 4553478 - 4553373
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| || | | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||  ||    
T  4553478 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatttaatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaagaaa 4553379  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  4553378 attttg 4553373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 23708873 - 23708978
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||||| | || || |||| ||    
T  23708873 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgtcaaaaattcaagataaaactaacgaaaattcgaacctaaaaataaa 23708972  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  23708973 attttg 23708978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 28540963 - 28540858
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaa-caaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| ||||||||||||||  || || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||  ||||||||||| || |||| ||    
T  28540963 aaaaattagaattttttaacttgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaaggaaaatttggacctaaaaataaa 28540864  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  28540863 attttg 28540858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 35015533 - 35015448
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttg 192  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||    
T  35015533 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttg 35015448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 42642996 - 42643100
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||| | ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  42642996 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaatgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggac-taaaaataaa 42643094  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  42643095 attttg 42643100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 47500210 - 47500315
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | ||||||||||||  |||| || ||||||||| |||| ||||||||||  || |||| ||    
T  47500210 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgcaaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggatctaaaaataaa 47500309  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  47500310 attttg 47500315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 50642603 - 50642708
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaa-ttaacaaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||| | |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || |||| ||    
T  50642603 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaatgaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaaagaaaatttggacttaaaaataaa 50642702  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  50642703 attttg 50642708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 53231213 - 53231317
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| |||||||| ||||  ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  53231213 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatat-aatttttttaaacaccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 53231311  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  53231312 attttg 53231317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 195
Target Start/End: Original strand, 1776634 - 1776722
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggac 195  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || ||| || |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||||||||||    
T  1776634 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaaataaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggac 1776722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 108 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18092821 - 18092735
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttgga 194  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||    
T  18092821 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacg-caaaaattcaagataaaactaacgaaaatttgga 18092735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 114 - 212
Target Start/End: Original strand, 29246903 - 29247002
Alignment:
Q  114 tagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 212  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||| ||||  ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||||||||    
T  29246903 tagaattttttaacatgtaatgaattaaatataattttttttaaacaccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaattttg 29247002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 60
Target Start/End: Original strand, 37437230 - 37437265
Alignment:
Q  25 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaa 60  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37437230 tttgtttaattatgcttaaactcttaaatttttgaa 37437265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 45557932 - 45557893
Alignment:
Q  25 tttgtttaattatccttaaactctt-aaatttttgaacga 63  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45557932 tttgtttaattatccttaaactcttaaaatttttgaacga 45557893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 114 - 212
Target Start/End: Original strand, 47875938 - 47876036
Alignment:
Q  114 tagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaa-caaaatttggacgtagaaatcaaattttg 212  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||  ||||||||||| || |||| ||||||||    
T  47875938 tagaattttttaacatgtaatgaattaaatat-atttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaatgaaaatttggacctaaaaataaaattttg 47876036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 8770707 - 8770669
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  8770707 aagtttgtttaattatccttaaactcatgaatttttgaa 8770669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 212
Target Start/End: Original strand, 16618859 - 16618953
Alignment:
Q  119 ttttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 212  Q
    |||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||  ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||||||||    
T  16618859 ttttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacaccaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttggacctaaaaataaaattttg 16618953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 53571078 - 53571008
Alignment:
Q  248 cttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaa-ctcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    |||||||| |||  ||||||||||| ||||| || || || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53571078 cttaacacatctacaaaaaattgttaaaaaaacttaacagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 53571008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 6488629 - 6488525
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||  ||||| || ||||||||| ||||  |||||||||| || |||| ||    
T  6488629 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaac-tcaaaaatttaagataaaactaacgtaaatttggacctaaaaataaa 6488531  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  6488530 attttg 6488525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Original strand, 6818007 - 6818087
Alignment:
Q  229 aggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 310  Q
    ||||||||| | | |||||||||| |||| |  |||||||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  6818007 aggaactttaatttatgttcttaaaacgtatacaaaaaattgttcaaaaatgtaagagtttaaacat-aattaaacaaattt 6818087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23064163 - 23064058
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaa-caaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| ||| |||||||||| ||| || | |||| |||| | |||||||||||| ||||| || |||||||| ||||  ||||||||||| || |||| ||    
T  23064163 aaaaattaaaattttttaacatgtaatgcattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaagttaatgaaaatttggacataaaaataaa 23064064  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  23064063 attttg 23064058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 23624592 - 23624507
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttg 192  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||    
T  23624592 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttgaaacgccaaaatttcaagataaaactaacgaaaatttg 23624507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 28706219 - 28706115
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||| ||||| ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  28706219 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatat-attttttttaaacgccaaaaattcaagataaacctaacgaaaatttggacttaaaaataaa 28706121  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  28706120 attttg 28706115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 34509861 - 34509756
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| ||||| |||||||| ||| || |||||| |||| | |||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||  ||||||||||| || |||| ||    
T  34509861 aaaaattagatttttttaacatgtaatgaattaaatataattttttttaaacgccaaaaattcaagataaaagtaatgaaaatttggacctaaaaataaa 34509762  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  34509761 attttg 34509756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 53569224 - 53569155
Alignment:
Q  249 ttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaa-ctcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    ||||||| |||  ||||||||||| ||||| || || || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53569224 ttaacacatctacaaaaaattgttaaaaaaacttaacagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 53569155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 61
Target Start/End: Original strand, 20177849 - 20177885
Alignment:
Q  25 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaac 61  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20177849 tttgtttaattattcttaatctcttaaatttttgaac 20177885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 312
Target Start/End: Original strand, 47939788 - 47939867
Alignment:
Q  232 aacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttga 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| | |||||   || || |||| ||| ||||||||||||||||    
T  47939788 aacttttagtaatgttcttaacatgtctacaaaaaattgcttaaaaagctaaaagtttaagcat-aattaaacaaatttga 47939867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 81)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 43597484 - 43597779
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43597484 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatttattttagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 43597583  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |        
T  43597584 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggaaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgcgataattt 43597683  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43597684 tttgcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 43597779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 4926670 - 4926372
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4926670 aagtttgtttaattatctttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagataagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 4926571  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||        
T  4926570 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcacaagttaaagataaaattaacaaaatctgaacgtagaaatcaaattttgcgacaattt 4926471  T
Q  222 nnngca---taggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4926470 tttgcatagtaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgtttaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 4926372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 22378458 - 22378753
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22378458 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactacgaaaggtacatttactaaaatttagaattt 22378557  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||        
T  22378558 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgcgacatttt 22378657  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  22378658 tttgcataggaacttttagtaacgttcttaacatgtctgtaaaaaactgttcaaaaactcaatagtttaagtataaattaaacaaatttaaattga 22378753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 38159247 - 38158948
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||       |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38159247 aagtttgtttaattatccttacactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 38159148  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||        
T  38159147 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagat-aaattaacaaaatctggaggtagaaatcaaattttgcgacaattt 38159049  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgt-aaaaaattgttcaaaaactcaagag----cttaaacataaattaaacaaatttgaattg 316  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38159048 tttgcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaaattgttcaaaaactcaagagttaatttaaacataaattaaacaaatttgaattg 38158949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 47792133 - 47791838
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||    
T  47792133 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacaatgtttttaagacaagtttagaacactatgaaaggttcatctaccaaaatttagatttt 47792034  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||        
T  47792033 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgcgacaattt 47791934  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47791933 tttgcagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcaaaaaattgtttaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 47791838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 6588982 - 6588687
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6588982 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttatgacaagtttataacactaggaaaggttcatttactaaaatttagaattt 6588883  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||        
T  6588882 tttaacatgaaacgaattaaatataaattttttaaaatgacaaaagttaaagataaaattaacaaattctggacgtagaaatcaaattttgcaacaattt 6588783  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       | | | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6588782 tttggagatgaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 6588687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 7238576 - 7238871
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7238576 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgatcgatttttttgagacaagtttagaacattatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 7238675  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||        
T  7238676 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgaaaaagtttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattatgcgacaattt 7238775  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       | | |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7238776 tttgtagaggaccttttaataatgttcttaacacgtctgcaaaaaattgttcaaaacctcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 7238871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 25 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 18059296 - 18059006
Alignment:
Q  25 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18059296 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttttgga--caagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 18059199  T
Q  125 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnn 224  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  || || ||||||||||||||||||           
T  18059198 aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaaattaaagataaaattaacaaaatctaaacataaaaatcaaattttgcgacaatttttt 18059099  T
Q  225 gcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    ||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18059098 gcagaggaacctttagtaactttcttaacacgtctgcaaaaatttgttcgaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 18059006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 1962193 - 1961897
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||  ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  1962193 aagttcgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatatttttgagacaagtatagaacactatgaaaggtcaatttattaaaatttagaattt 1962094  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaatttttta-aaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 220  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||       
T  1962093 tttaacatgaaacgaatgaaatatgtattttttttaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaattaaattttgcgacaatt 1961994  T
Q  221 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
        ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  1961993 ttttgcagatgaacttttagtaatgttctaaacacgtctgtgaaaaattgttcaaaaactcaaaaatttaagcataaatgaaacaaatttgaattga 1961897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 35482059 - 35482351
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35482059 aagtttgtttaattatctttaaactgttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 35482158  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    |||   || ||| |||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||        
T  35482159 ttt--cattaaatgaattaaatatgaatttttt-aaacgctaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttaggacaattt 35482255  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       ||| ||||||||||| |||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35482256 tttgcagaggaacttttaataattttcttaacatgtatgcaaaaaattgttcaaaaactcaatagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 35482351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 22 - 313
Target Start/End: Original strand, 14990548 - 14990837
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||       |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  14990548 aagtttgtttaattatccttaaactcttaagtttttgaatgatttttttgagagaagtttagaacactatgaaaggttcatt-actaaaatttataattt 14990646  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||| |        
T  14990647 tttaacatgaaatgaattaaatatgaattttttaaaa-ggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatctgaatgtagaaatcaaattttacgataattt 14990745  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaa 313  Q
       ||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  14990746 tttgcagaggaacttttagtaatgttcctaacacgtatgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaa 14990837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 22 - 313
Target Start/End: Original strand, 15420159 - 15420448
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||       |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  15420159 aagtttgtttaattatccttaaactcttaagtttttgaatgatttttttgagagaagtttagaacactatgaaaggttcatt-actaaaatttataattt 15420257  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||| |        
T  15420258 tttaacatgaaatgaattaaatatgaattttttaaaa-ggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatctgaatgtagaaatcaaattttacgataattt 15420356  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaa 313  Q
       ||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  15420357 tttgcagaggaacttttagtaatgttcctaacacgtatgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaa 15420448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 22 - 310
Target Start/End: Original strand, 46044291 - 46044580
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46044291 aagtttttttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttagaattt 46044390  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcga-cannn 220  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||| |||||||||||  |       
T  46044391 tttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttaaaaatgataaaagttaaagataaaagtaataaaatttggacatataaataaaattttgcgataaatt 46044490  T
Q  221 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 310  Q
         || | |||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  46044491 ttttacagatgaacatttagtaatgtttttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcattaattaaacaaattt 46044580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 22 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 6331191 - 6330995
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6331191 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttaaaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 6331092  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgaca 217  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  6331091 tttaacatgaaatgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaaatctggacatagaaatcaaattttacgaca 6330995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 22 - 315
Target Start/End: Original strand, 15652796 - 15653085
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||       |||| | | |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  15652796 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatttttttgagatacgtttagaacaatatgaaaggtttatttattaaaatttagatttt 15652895  T
Q  122 ttt--aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacann 219  Q
    |||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||      | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |      
T  15652896 tttttaatatgaaacaaattaaatatgaattttttaaaatgacaaaagttaaa------agtaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttacgataat 15652989  T
Q  220 nnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaatt 315  Q
         |   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  15652990 tttttgtggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtttgtaaaaaattgttcaaaaatttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaatt 15653085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 43574532 - 43574239
Alignment:
Q  25 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 124  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||       | |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  43574532 tttgtttaattattcttaaactctaaaatgtttgaacgatttttttgtgacaagtttagaacactataaaatgttcatttattaaaatttagaattttct 43574433  T
Q  125 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagat-aaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnn 223  Q
    ||  |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |          
T  43574432 aacttgaaacgaattaaatataaattttttaaaatgacaaaagttaaagataaaaagtaataaaatttagatgtagaaatcaaattttgcgataattttt 43574333  T
Q  224 ngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
     ||  || ||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43574332 tgcgaagtaacttatagtaatgttctaaacatgtctgcaaaaaattgttcaaaaacttaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 43574239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 38199340 - 38199062
Alignment:
Q  26 ttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttta 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| |||||| ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  38199340 ttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaatactatgaaaggttcaatcaataaaatttagaatttttta 38199241  T
Q  126 atatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnng 225  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||| |             
T  38199240 acatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacaaaaaaaattaaagataaaagtaataaaatatggacatataaatcaaattttgcggc--------- 38199150  T
Q  226 cataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
        ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38199149 ----ggaacttttaggaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattga 38199062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 47 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 46331069 - 46330799
Alignment:
Q  47 cttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatg 146  Q
    |||||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  46331069 cttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttagaattttttaacatgtaacgaattaaatatg 46330970  T
Q  147 aattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgt 246  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| | ||| || |||||||||||||||| |       ||  | ||||||||||||||||    
T  46330969 aatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctcgacatataaatcaaattttgcgataattttttgcggatgaacttttagtaatgt 46330870  T
Q  247 tcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||| |||||||  |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  46330869 tcttaacgcgtctacaaaaaattgttaaaaaacttgagagtttaagcataaattaaacatatttgaattga 46330799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 294
Target Start/End: Original strand, 10620520 - 10620793
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||        ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10620520 aagtttgtttaattattcttaaactcttaaatttttgaacgatttcattaagacaagttttgaacactatgaaaagttcatttactaaaatttagaattt 10620619  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgac-annn 220  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||  || |       
T  10620620 tttaacatgaaacgaattaaatatgatttttttaaaacgacaaaagttaatgataaaagtaacaaaatatggacgtataaatcaaattttgtaacaattt 10620719  T
Q  221 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaaca 294  Q
        ||| || | ||||||||||||||||||||| || |  |||| ||| | |||||||||||||| |||||||    
T  10620720 ttttgcagagaagcttttagtaatgttcttaacatgtatacaaaatattatccaaaaactcaagagattaaaca 10620793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 4899864 - 4900158
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||       |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4899864 aagtttatttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgatttttttgagacaaatttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaa-tt 4899962  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagat-aaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 220  Q
    | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |       
T  4899963 tctaacatgaaacaaattaaatatgaattttttcaaaccgcaaaacttaaagataaaaagtaacaaaatctggatgtagaaatcaaattttgcgataatt 4900062  T
Q  221 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
        ||  ||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  4900063 tttcgcgaaggaacttttattaatgttctaaacaagtctgcaaaaaattgtt-aaaaacttaagagtttaagtataaattaaacaaatttgaattga 4900158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 43083855 - 43084137
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  43083855 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataaaatttagaattt 43083954  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||  ||||| |||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||| ||| ||||| || |  || ||||||||||||||| |         
T  43083955 tttaacatgaaaaaaattaaatatgaatttttgaaaacaattaaagataaagataaaagtaataaaatatgaaaatataaatcaaattttgcggc----- 43084049  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
            || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  43084050 --------ggtacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattga 43084137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 316
Target Start/End: Original strand, 11396958 - 11397252
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||| | ||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  11396958 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttgtgtaagacaggtttataacactgtgaatggatcatttactaaaatttagaattt 11397057  T
Q  122 tttaata-tgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 220  Q
    ||| |   |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |  || ||||||||||||||| ||| |       
T  11397058 ttttagcgtgaaacaaattaaatatgaattttttaaaacgtcaaaagttaaagataaaagtaac-aaatctaaacatagaaatcaaattttccgatattt 11397156  T
Q  221 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattg 316  Q
         || |||||||||||| |||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  11397157 ttttacaaaggaacttttagcaatgtttttaacacgtatgcaaaagattgttcaaaaacttaagagtttgaacataaattaaacaaatttgaattg 11397252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 3495938 - 3495655
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       ||| |||| ||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||| | |||    
T  3495938 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgaattttttgaggcaagtttaaaacactatgaaagattcaattaataaaatttaaatttt 3495839  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||| | |         
T  3495838 tttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaaagtaataaaatatggacatataaatcaaattttgtggc----- 3495744  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattgat 318  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  3495743 --------ggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagcgtttaagaataaattaaacaaatttgaattgat 3495655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 277
Target Start/End: Original strand, 27727226 - 27727485
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||       |||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  27727226 aagtttgtttaattatctttaaactcttaaatttttgtacgatttttttgagacaagtttagaatactaagaaaggttcattaacttaaatttagaattt 27727325  T
Q  122 ttt--aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaa-ttaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacan 218  Q
    |||  |  || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  27727326 tttttaccataaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttcaagataaaatttaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgcgacaa 27727425  T
Q  219 nnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctg-taaaaaattgttcaaaa 277  Q
          | | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  27727426 ttttttgtagaggaatttttagtaatgttcttaacacgtgtgcaaaaaaattgttcaaaa 27727485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 44167794 - 44168074
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44167794 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttttttagacaagtttataacactatgaaaggttcaattactaaaatttagaattt 44167893  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||             ||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||| ||| |        
T  44167894 tttaacatgaaatgaattaaatatgaattttttaaaac-------------gataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttacgataattt 44167980  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       ||  ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44167981 tttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtc--tacaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 44168074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 317
Target Start/End: Original strand, 1544478 - 1544769
Alignment:
Q  25 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 124  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       ||| |||| ||||||||||||||||   |||||| |||| |||| |||||||||    
T  1544478 tttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacgatatttttgagtcaagtttagaacactatgaaaaactcatttgctaagattttgaatttttt 1544577  T
Q  125 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnn 224  Q
    ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| |||||||||||||||| ||| |           
T  1544578 aacttgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagatgaaagtaacaaaatcgggatgtagaaatcaaattttacgataagctttt 1544677  T
Q  225 gcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    |   || |||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||  | || |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  1544678 gtgaagtaacttttaataatgttcttaacacgtatg-gaaaaattgttcaacaactttaaagtttaagcataaatcaaacaaatttgaattga 1544769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 71 - 217
Target Start/End: Original strand, 36019811 - 36019957
Alignment:
Q  71 gagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagtta 170  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36019811 gagacaagtttataacattatgaaatgttcatttactaaaatttagaactttttaacatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacggcaaaagtta 36019910  T
Q  171 aagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgaca 217  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  36019911 aagataaaattaacaaaatctagacgtagaaatcaaattttgcgaca 36019957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 25 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 38599260 - 38598967
Alignment:
Q  25 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 124  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||        | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  38599260 tttgcttaattatctttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaagattcatttactaaaatctataatttttt 38599161  T
Q  125 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaa-ttttgcgacannnnn 222  Q
    || ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |         
T  38599160 aacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaattttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttttgcgatattttt 38599061  T
Q  223 nngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
          |||| | |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  38599060 tt-tggaggaccatttaataacgttcttaacacgtctgtgaaaaattgttgaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttggattga 38598967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 128 - 317
Target Start/End: Original strand, 21109452 - 21109642
Alignment:
Q  128 atgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaat-taacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngc 226  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| | || |||||||||||||||||| | |       ||    
T  21109452 atgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaaattaaagataaaaagtaacaaaatctcgatgtagaaatcaaattttgctataattttttgc 21109551  T
Q  227 ataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  21109552 agaggaacttttagtaatgttctaaacacgtatgcaaaaaattgttcaaaaatttaagagtttaagcataaatgaaacaaatttgaattga 21109642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 184 - 317
Target Start/End: Original strand, 4883775 - 4883908
Alignment:
Q  184 caaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaa 283  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4883775 caaaatctggacgtagaaatcaaattttgcgacaattttttgcataggaacgtttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattattcaaaaactcaa 4883874  T
Q  284 gagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4883875 gagtttaaacataaattaaacaaatttaaattga 4883908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 29155962 - 29156260
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactat----gaaaggttcatttactaaaatttaga 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |        | ||||| |||||||| |||    | | |||| |||||| ||||||||||    
T  29155962 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttatgaacaattttttttaaacaagtttagaacattatatatggacggtttatttacaaaaatttaga 29156061  T
Q  118 attttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgaca 217  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  || | ||| ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  29156062 attttttaatttgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagctaaaagcaatagaatctggacatagaaatcaaattttgcgata 29156161  T
Q  218 nnnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
           |   |||| |||||| |||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  29156162 attttttgtggaggacctttta-taatgttcataacatgtctacaagaaattgttcaaaaacttaagagtttaagcataaattatataaatttgaattga 29156260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 44081253 - 44080958
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||        ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44081253 aagtttgtttaattatacttaaattcttaaatttttgagcgaatttttttagacaaatttagaatactatgaaaggttcatttactaaaatttaaaattt 44081154  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 220  Q
    || ||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||         
T  44081153 ttaaaattgaaattaattaaatatgaattttttaaaacgactaaacatcaagataaaagtaacaaaaatatggacgtagaaattaaattttgcgatcatt 44081054  T
Q  221 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
        ||  |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||   ||||  |||||| ||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  44081053 ttttgcggaggaacttttagtattgttcttaacacgtttgcaaaagcatgtttgaaaacttaagagtttaagcat-aattaaacaagtttgaattga 44080958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 33625080 - 33624936
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||        | ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33625080 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttaga--gattttttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttagaattt 33624983  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagt 168  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  33624982 tttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagt 33624936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 37540081 - 37539849
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       |||| |   |||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37540081 aagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacgatttttccgagatatatttagaacatttcaaaaggttcatttactaaaatttagaattt 37539982  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaatt-ttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacann 219  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||  ||| |||| || ||| | |||||||||||||| || |      
T  37539981 tttaacatgaaatgaattaaatatgaattttttttaaacgacaaaagttcaagataaaagcaacaaaaaattagacttggaaatcaaattttgagataat 37539882  T
Q  220 nnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaa 252  Q
          || ||||||||||||||||||||||||    
T  37539881 tttttacagaggaacttttagtaatgttcttaa 37539849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 109 - 310
Target Start/End: Original strand, 1066490 - 1066691
Alignment:
Q  109 aaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatt-tggacgtagaaatcaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| ||  |||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||    
T  1066490 aaatttagaattttttaatatgaaataaattaaatatggatttttttaatagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaattctggacgtagaaataaaa 1066589  T
Q  208 ttttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaa 307  Q
    ||||| ||         ||||| |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| || || || |||| ||| |||||||||||    
T  1066590 ttttgagatcattttttgcatatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaa 1066688  T
Q  308 ttt 310  Q
    |||    
T  1066689 ttt 1066691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 72 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 15130955 - 15130859
Alignment:
Q  72 agacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagt 168  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15130955 agacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttagaatttttaaatattaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagt 15130859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 93 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 1260363 - 1260142
Alignment:
Q  93 aaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaattt 191  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||   || |||||||    
T  1260363 aaagattcatttattaaaatttagaattttttaatataaaatgaatta-atatgactttttttaaacaacaaaagttcaagataaaagccacaaaaattt 1260265  T
Q  192 ggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaa 291  Q
    | || ||||||| |||||| | || |       |   |||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||| | ||||||| || || ||||    
T  1260264 gaacatagaaattaaatttagagataattttttgtggaggaacttttagcaatgtttttaacacgtcttcaaaaaattgcttaaaaacttaaaagtttaa 1260165  T
Q  292 acataaattaaacaaatttgaatt 315  Q
    |||| |||||||||| ||||||||    
T  1260164 acat-aattaaacaattttgaatt 1260142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 80 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1065928 - 1065795
Alignment:
Q  80 ttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaa 179  Q
    |||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||    
T  1065928 ttagaacattactaaaggttcgtttactaaaatttagaattttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaaataaaa 1065829  T
Q  180 ttaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 212  Q
     |||| ||||| | ||||||| ||| ||||||||    
T  1065828 gtaacaaaaatctagacgtaggaataaaattttg 1065795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 315
Target Start/End: Original strand, 9633169 - 9633461
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttg-aacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||        ||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  9633169 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttttaatgatattttttagacaagtttataacattataaaaggttcatttactaaaattcataatt 9633268  T
Q  121 ttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaa-tttggacgtagaaatcaaattttgcgacann 219  Q
    ||| | | |||||  ||||| ||||||||| ||| |||||| |    |||||| ||||| |||||||| ||||||  || |||||| |||||| || |      
T  9633269 tttaact-tgaaataaattaaatatgaattcttttaaacgaaattttttaaagttaaaagtaacaaaaatttggatataaaaatcacattttgagataaa 9633367  T
Q  220 nnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaatt 315  Q
         ||  |||||||||||||||||||| ||| |  |||| |||||||||||| |||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  9633368 tttttgcggaggaacttttagtaatgttcataaaatatctgcaaaaaattgttc-aaaacttaagagtttaagcat-aattaaacaaatttgaatt 9633461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 203
Target Start/End: Original strand, 10463312 - 10463475
Alignment:
Q  39 cttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaat 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||       |||||||| ||| |||| ||  |||||||| ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||  |||    
T  10463312 cttaaactcttaaatttttgaacgatctttttgagacaagtttaaaacattacaaaaggttcgtttaccaa--tttagaattttttaaaatgaaattaat 10463409  T
Q  139 tagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaat 203  Q
    || ||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  10463410 taaatatgaatttttttaaaagacaaaaatttaagataaaagtaacaaaaatctggacgtagaaat 10463475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Original strand, 47139739 - 47139903
Alignment:
Q  25 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttag-aattttt 123  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||       |||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  47139739 tttgtttaattatccttaaacatttaaatttttgaatgatttttttgagacaagtttaaaacattatgcaaggttcatttactaaaatttagtatttttt 47139838  T
Q  124 taatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaa 188  Q
    | |||||||| |||||| ||||||||| ||| ||| |||| ||| |  | |||||| ||||||||    
T  47139839 ttatatgaaatgaattaaatatgaattgttttaaatgacagaaggtcgaaataaaaataacaaaa 47139903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 232 - 317
Target Start/End: Original strand, 36020005 - 36020090
Alignment:
Q  232 aacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  36020005 aacttttagtaatgttcttgacacatttgtaaaaaattgtttaaaaactcaagagtttaagtataaattaaacaaatttaaattga 36020090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 74 - 310
Target Start/End: Original strand, 12621625 - 12621861
Alignment:
Q  74 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 173  Q
    ||||| |||||||| ||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||| ||     
T  12621625 acaagtttagaacattactaaaggttcgtttactaaaatttaaaattttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacgaaagttcaaa 12621724  T
Q  174 ataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgtt 272  Q
    |||||| |||| ||||| |||||| || ||| |||||||| || |       ||| |  ||||||| || |||||||||| || | ||  ||||||||||    
T  12621725 ataaaagtaacaaaaatctggacgcaggaataaaattttgagataattttttgcagataaacttttcgtgatgttcttaatacttgtgctaaaaattgtt 12621824  T
Q  273 caaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 310  Q
    ||||| || || || |||| ||| ||||||||||||||    
T  12621825 caaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 12621861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 111
Target Start/End: Original strand, 45958726 - 45958815
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaa 111  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45958726 aagtttgtttaattatttttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaa 45958815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 74 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8832952 - 8832813
Alignment:
Q  74 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 173  Q
    ||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||  | ||||  ||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||     
T  8832952 acaagtttagaacattacaaaaggttcatttactaaaatttagacctatttagcatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagtttaaa 8832853  T
Q  174 ataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 212  Q
    |||||| |||| ||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  8832852 ataaaagtaacaaaaatctggacgcagaaataaaattttg 8832813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 74 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 37107922 - 37107808
Alignment:
Q  74 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 173  Q
    ||||| |||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||     
T  37107922 acaagtttagaacattactaaaggttcgtttactaaaatttagaatttttcaacatgaaataaattaaatataaattttttaaaaagacaaaagttcaaa 37107823  T
Q  174 ataaaattaacaaaa 188  Q
    ||||||  |||||||    
T  37107822 ataaaagcaacaaaa 37107808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 235 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 33624869 - 33624788
Alignment:
Q  235 ttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  33624869 ttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaa-ttgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattga 33624788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 74 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 38594756 - 38594642
Alignment:
Q  74 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 173  Q
    ||||| |||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||  ||| | ||||||||||||| ||| |||||||||| ||     
T  38594756 acaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactaaaatttagaattatttagcatgaaataaatcaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaa 38594657  T
Q  174 ataaaattaacaaaa 188  Q
    |||||| ||||||||    
T  38594656 ataaaagtaacaaaa 38594642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 74 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 8082048 - 8081814
Alignment:
Q  74 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 173  Q
    ||||| |||||||| ||  ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||  ||| ||     
T  8082048 acaagtttagaacattacaaaatgttcgtttactaaaatttagaattatttagcatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaa--gtttaaa 8081951  T
Q  174 ataaaattaacaaaatt-tggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgtt 272  Q
    ||||   |||||||| | |||||| |||||| |||||||| || |       | | | |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  8081950 ataattgtaacaaaaatatggacgcagaaataaaattttgagataattttttggagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgtt 8081851  T
Q  273 caaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 310  Q
    ||||| || || || |||| ||| ||||||||||||||    
T  8081850 caaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 8081814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 262 - 315
Target Start/End: Original strand, 27727998 - 27728051
Alignment:
Q  262 aaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaatt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  27727998 aaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaatt 27728051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 229 - 317
Target Start/End: Original strand, 45958865 - 45958953
Alignment:
Q  229 aggaacttttagtaatgttcttaacacgtct-gtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||| ||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  45958865 aggaacttttagtaatgttattaacacgtctacaaaaaaattgtt-aaaaacttaagagtttaagcagaaattaaacaaatttgaattga 45958953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 2510778 - 2510672
Alignment:
Q  107 taaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatca 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| |    
T  2510778 taaaatttagaattttttaacatgtaatgaattaaatataattttttttaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataa 2510679  T
Q  206 aattttg 212  Q
    |||||||    
T  2510678 aattttg 2510672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 9900532 - 9900637
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  9900532 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 9900631  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  9900632 attttg 9900637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 23023517 - 23023622
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  23023517 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 23023616  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  23023617 attttg 23023622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 39035838 - 39035943
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  39035838 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacttaaaaataaa 39035937  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  39035938 attttg 39035943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 80 - 308
Target Start/End: Original strand, 42974165 - 42974394
Alignment:
Q  80 ttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatga-attttttaaaacgacaaaagttaaagataaa 178  Q
    |||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||  ||||| ||||||  |||||| ||| ||||||||||  | |||||    
T  42974165 ttagaacattacaaaaggttcgtttactaaaatttagaattatttaacatggaataaattaaatatgatttttttttaaaagacaaaagtttgaaataaa 42974264  T
Q  179 attaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaa 277  Q
    | |||| ||||| |||||| |||||| |||||||| || |       | | | |||||||| ||||||||||| |||| | || ||||||||||| ||||    
T  42974265 agtaacaaaaatctggacgcagaaataaaattttgagataagtttttggagatgaacttttcgtaatgttcttgacacttgtgcaaaaaattgtttaaaa 42974364  T
Q  278 actcaagagcttaaacataaattaaacaaat 308  Q
     || || || |||| ||| ||||||||||||    
T  42974365 tcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaat 42974394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 262 - 318
Target Start/End: Original strand, 38199808 - 38199864
Alignment:
Q  262 aaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattgat 318  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38199808 aaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattgat 38199864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 212
Target Start/End: Original strand, 45986190 - 45986289
Alignment:
Q  114 tagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 212  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||||||||    
T  45986190 tagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaattttg 45986289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 212
Target Start/End: Original strand, 7207993 - 7208099
Alignment:
Q  107 taaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatca 205  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| ||  ||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| |    
T  7207993 taaaaattagaattttttaacatgtaataaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataa 7208092  T
Q  206 aattttg 212  Q
    |||||||    
T  7208093 aattttg 7208099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 11620152 - 11620047
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  11620152 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaagctaacgaaaatttggacataaaaataaa 11620053  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  11620052 attttg 11620047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 21202276 - 21202380
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  21202276 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatat-aatttttttaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 21202374  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  21202375 attttg 21202380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 34651581 - 34651686
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| | ||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  34651581 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccgaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 34651680  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  34651681 attttg 34651686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 111
Target Start/End: Original strand, 16080779 - 16080868
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||       |||| ||| |||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  16080779 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttttatgatttctttgagaaaagtttagaacattaagaaatgttcatttactaaaa 16080868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23064552 - 23064446
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatat-gaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatca 205  Q
    |||| |||||||||||||| || | || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| |    
T  23064552 aaaaattagaattttttaacattgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacttaaaaataa 23064453  T
Q  206 aattttg 212  Q
    |||||||    
T  23064452 aattttg 23064446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 38593358 - 38593281
Alignment:
Q  232 aacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 310  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| || || || |||| ||| ||||||||||||||    
T  38593358 aacttttcgtaatgttcttaacacttttgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 38593281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 5029205 - 5029310
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| ||| |||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || | || ||    
T  5029205 aaaaattataattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaatataaa 5029304  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  5029305 attttg 5029310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 28642590 - 28642485
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||  || |||||| |||| | ||||||||||||  |||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  28642590 aaaaattagaattttttaacatataatgaattaaatataatttttttaaaacgttaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttggacctaaaaataaa 28642491  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  28642490 attttg 28642485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 262 - 317
Target Start/End: Original strand, 3496423 - 3496478
Alignment:
Q  262 aaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  3496423 aaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcatgaattaaacaaatttaaattga 3496478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 98 - 189
Target Start/End: Original strand, 17018437 - 17018528
Alignment:
Q  98 ttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaat 189  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| |||| || || | ||||| |||||||  ||| |||||| ||||||||| | || |||||||||||||    
T  17018437 ttcatttacttaaatttataatttcttaacatcaatctaattaaatatgaaagtttaaaaacgccaaaagttagatatcaaattaacaaaat 17018528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 37537553 - 37537487
Alignment:
Q  248 cttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaatt 315  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  37537553 cttaacacgcatgcaaaaaattgttcaaaaacttaagagtttaagcat-aattaaccaaatttgaatt 37537487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 28924784 - 28924600
Alignment:
Q  25 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatt--tagaatttt 122  Q
    |||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||       |||||| | ||| |||| ||| ||| |||||||||||||||    || ||||||    
T  28924784 tttgtttaattatctttgaattcttaaagttttgaacgattttttggagacatgtttaaaacattataaaatgttcatttactaaaaaaaatataatttt 28924685  T
Q  123 ttaatatgaaacgaattagatatgaatttttta-aaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatt-tggacgtagaaatcaaatt 209  Q
    |||| | ||   |||| | |||||||||||||  |||||||||||||| |||| || | |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  28924684 ttaacaaga---gaataa-atatgaattttttttaaacgacaaaagttcaagaaaagagtaacaaaaatctggacgtagaaatcaaatt 28924600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Original strand, 16080975 - 16081055
Alignment:
Q  229 aggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 310  Q
    |||||||||||||||| || |||||| || |  ||| |||||||| |||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  16080975 aggaacttttagtaatatttttaacatgtatacaaataattgttcgaaaacttaagagtttaagcat-aattaaacaaattt 16081055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 317
Target Start/End: Original strand, 17018571 - 17018656
Alignment:
Q  232 aacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | ||| |||||   || ||||||||||||  |||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  17018571 aacttttaataatgttcttagcacatatgtcaaaaaccatttaaaaactcaagactttaatcataaattaaacaaatattaattga 17018656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 17314806 - 17314701
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||| ||| ||| || |||||| |||| | ||||||||||||  |||| || |||||||||  ||| ||||||||||| || |||| ||    
T  17314806 aaaaattagaattttctaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgcgaaaaattcaagataaaacaaacgaaaatttggacctaaaaataaa 17314707  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  17314706 attttg 17314701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 33772380 - 33772484
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| |||||||| ||| | ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  33772380 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatat-aatttttttaaatgccaaaaattcaagataaacctaacaaaaatttggacttaaaaataaa 33772478  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  33772479 attttg 33772484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 46158057 - 46158162
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || ||| || |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||| |||  | |||| ||    
T  46158057 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaaataaatataatttttttaaaacgtcaaaaatttaagataaaactaacgaaaatttagaccaaaaaataaa 46158156  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  46158157 attttg 46158162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 281 - 317
Target Start/End: Original strand, 15131588 - 15131624
Alignment:
Q  281 caagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15131588 caagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 15131624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 109 - 211
Target Start/End: Original strand, 37108485 - 37108589
Alignment:
Q  109 aaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatat-gaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatt-tggacgtagaaatcaa 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  |||||  ||| || |||||| ||  |||||||||| || |||||| |||||||||| |||||| | |||| ||    
T  37108485 aaatttagaattttttattatgaaataaattaactatggattttttttaatagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaattctggacggaaaaataaa 37108584  T
Q  207 atttt 211  Q
    |||||    
T  37108585 atttt 37108589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 41571663 - 41571631
Alignment:
Q  148 attttttaaaacgacaaaagttaaagataaaat 180  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41571663 attttttaaaacgacaaaagttcaagataaaat 41571631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 43083383 - 43083327
Alignment:
Q  262 aaaaaattgttcaaaaa-ctcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  43083383 aaaaaattgttaaaaaaacttaagagtttaagtataaattaaacaaatttgaattga 43083327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 149 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 45983692 - 45983628
Alignment:
Q  149 ttttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 212  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||||||||    
T  45983692 ttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacttaaaaataaaattttg 45983628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 104)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 22 - 320
Target Start/End: Original strand, 38706441 - 38706739
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||       |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38706441 aagtttgtttaattattcttaaacacttcaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacaatatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 38706540  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  38706541 tttaacatgaaacaaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacaattt 38706640  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattgatga 320  Q
       ||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38706641 tttgcacaagcacttttagtaacgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattgatga 38706739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 22 - 320
Target Start/End: Original strand, 36470823 - 36471121
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||        ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36470823 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgatttttttaagataagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 36470922  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  36470923 tttaacatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacagcgaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacaattt 36471022  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattgatga 320  Q
        ||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36471023 tttacataggaacttttggtaacgttcttaatacatctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattgatga 36471121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 25101960 - 25102255
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |       |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25101960 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaacttttgaacaatttttttgagacaagtttaaaacactatgaaaggttcacttactaaaatttagaattt 25102059  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||        
T  25102060 tttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttcaaaacggcaaaagttaaaaataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgtgacaattt 25102159  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25102160 tttgcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcgagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 25102255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 5250388 - 5250684
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||  | ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5250388 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaaattcagaacgctgcgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 5250487  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaa-gttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 220  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||       
T  5250488 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaaagttaaagataaaattaacaaaatctaaacgtagaaatcaaattttgcgacaatt 5250587  T
Q  221 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
        |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5250588 tttggcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtcagtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 5250684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 44265741 - 44265446
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||       |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44265741 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttaaacgattttttcgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttgctaaaatttagaattt 44265642  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||        
T  44265641 tttaacatgaaaagaattaaatatgagttttttaaaacgccaaaaattaaagataaaatcaacaaaatctggacttagaaatcaaattttgcaacaattt 44265542  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44265541 tttgcagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttaaattga 44265446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 5695911 - 5696205
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5695911 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgattttttcgagacaagtttaaaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 5696010  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||| ||||        
T  5696011 tttaatatgagatgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatctgaac-taaaaatcaaattttgtgacaattt 5696109  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5696110 tttgcagaggaactttcaataatgatcttaacacgtctgcaaaaaattgttcaaaaactgaagagtttaatcataaattaaacaaatttgaattga 5696205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 71 - 317
Target Start/End: Original strand, 17498541 - 17498787
Alignment:
Q  71 gagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagtta 170  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17498541 gagacaagtttagaacactataaaagattcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtta 17498640  T
Q  171 aagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattg 270  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||||||| ||||| | | ||||| |||||||||    
T  17498641 aagataaaattaacaaaatttgaacgtagaaatcaaattttgcgacaattttttgcagaggaacttttagtaattttctttatatgtctgcaaaaaattg 17498740  T
Q  271 ttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17498741 ttcaaaaactcaaaagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 17498787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 21135616 - 21135321
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21135616 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaaatttagaacattatgaaaggttcaattactaaaatttagaattt 21135517  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||||| |        
T  21135516 tttaaaatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcgataattt 21135417  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       ||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21135416 tttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 21135321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 22 - 322
Target Start/End: Original strand, 27875445 - 27875745
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||        ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27875445 aagtttgtttaattatttataaactcttaaatttttggacgattttttttagacaagtttagaacactattaaaggttcatttactaaaatttagaattt 27875544  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| || ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||        
T  27875545 tttaacattaaatgaattaaatatgaattttttaacacgacaaaagttaaagataaaataaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttacgacaattt 27875644  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattgatgat 321  Q
       ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||    
T  27875645 tttgcagaggaacttttagtaatgtttttaacacgtttgtaaaaaattgttcaaaagctcaagagtttaagcataaaataaacaaatttgaattgaggat 27875744  T
Q  322 g 322  Q
    |    
T  27875745 g 27875745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 22 - 322
Target Start/End: Original strand, 28015626 - 28015926
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||        ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28015626 aagtttgtttaattatttataaactcttaaatttttggacgattttttttagacaagtttagaacactattaaaggttcatttactaaaatttagaattt 28015725  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| || ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||        
T  28015726 tttaacattaaatgaattaaatatgaattttttaacacgacaaaagttaaagataaaataaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttacgacaattt 28015825  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattgatgat 321  Q
       ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||    
T  28015826 tttgcagaggaacttttagtaatgtttttaacacgtttgtaaaaaattgttcaaaagctcaagagtttaagcataaaataaacaaatttgaattgaggat 28015925  T
Q  322 g 322  Q
    |    
T  28015926 g 28015926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 33322826 - 33322531
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||        | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  33322826 aagtttgtttaattatctttaaactcttaaaattttgaacgattttttcaatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttaccaaaatttagatttt 33322727  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||        
T  33322726 tttaacatgaaacgaattaaatataaattttttaaaacgaaaaaagttaaagataaaattaacaaaatctagacgtaaaaatcaaattttgcgacaattt 33322627  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  33322626 tttgcagaggaacttttagtaatgtttttaacacgtctgcaaaaaattgtttgaaaactcatgagtttaagtataaattaaacaaatttgaattga 33322531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 6590559 - 6590263
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |       |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6590559 aagtttgtttaattattcttaaactcttaaatttttgaaccatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagatttt 6590460  T
Q  122 ttt-aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 220  Q
    ||| || ||||||  ||||| |||||| ||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||       
T  6590459 ttttaacatgaaaaaaattaaatatgatttttttaaaacgagaaaaataaaatataaaattaacaaaatctgagcctagaaatcaaattttgcgacaatt 6590360  T
Q  221 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
        ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6590359 ttttgcagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctccaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 6590263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 24451777 - 24451482
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||       |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24451777 aagtttgtttaattattcttaaactcttaaaattttgaatgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttagaattt 24451678  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||||| |        
T  24451677 tttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcgataattt 24451578  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       ||  |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24451577 tttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacacaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 24451482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 41590337 - 41590631
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |         |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41590337 aagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaatttttttatgacaagtttataacactatgaaaggttcatt-actaaaatttagaattt 41590435  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||        
T  41590436 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattctggaagtagaaatcaaattttgcgacaattt 41590535  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  41590536 tttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtatgcgaaaaattgttcaaaagctcaagagtttaagcacaaattaaacaaatttgaattga 41590631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 42499379 - 42499673
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||       |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42499379 aagtttgtttaattattcttaaactcttaaatttttgaacgatttttt-gagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 42499477  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||| |||| |||||||||||||        
T  42499478 tttaacataaaacgaattaaatatgaatttttaaaaacgacaaaagttaaagatacaattaaaacaatatggacgtaaaaattaaattttgcgacaattt 42499577  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       |||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || || |||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  42499578 tttgcatataagcttttagtaatgttcttaatacgtctgcaaaaaattgttcaaaaacttaatagtttatgcataaattaaacaaaattgaattga 42499673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 43622789 - 43623087
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttact-aaaatttagaatt 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||         |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  43622789 aagtttgtttaattatctttaaactcttaaatttttaaacgatttttttatgacaagtttataacactatgaaaggtgcatttacttaaaatttagaatt 43622888  T
Q  121 tttt-aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaatt-aacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacan 218  Q
    |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||     
T  43622889 tttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaatgacaaaagttaaagataaaattaaacaaattatggacgtagaaatcaaattttgcgacaa 43622988  T
Q  219 nnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
          | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43622989 ttttttgaagaggaacttttagtaatgtttttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 43623087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 6018332 - 6018037
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |       |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6018332 aagtttgtttaattattcttaaacttttaaatttttgaacaatttttatgagacaagtttagaacattatgaaaggttcatttactaaaatttataattt 6018233  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||        
T  6018232 tttaacatgaaacaaattaaatatgaatttattaaaacaacaaaagataaagataaaactaacaaaatctgaacgtaaaaattaaattttgcgacaattt 6018133  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  6018132 tttgcagaggaacttttagtaatgtttttaacatgtctgcaaaaaactgttcaaaaactcaagagtttatgcataaattaaacaaatttgaattga 6018037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 35369483 - 35369188
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       |||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  35369483 aagtttgtttaattatccttaaagtcttaaatttttgaacgatttttttgagataagtttagaacactatgaaaggttcaattgctaaaatttagaattt 35369384  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| | |        
T  35369383 tttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatttggacatataaatcaaattttgcaataattt 35369284  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       ||  || |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  35369283 tttgcggagtaacttttagtaatgttgttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagttgaagcataaattaaacaaatttgaattga 35369188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 37967830 - 37967533
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnnga-gacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatt 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||        | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  37967830 aagtttgtttaatcatccttaaactcttaaagttttgaacgattttttttaagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttaccaaaatttagatat 37967731  T
Q  121 ttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaa-cgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacann 219  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  37967730 ttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaatggaaaaaagttaaagataaaattaacaaaatatggacgtagaaatcaaattttgcgacaat 37967631  T
Q  220 nnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
         ||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  37967630 tttttgcggaggaagttttagtaatgttctttacacgtctgcgaaaaattgtttaaaagctcaagagtttatgcataaattaaacaaatttgaattga 37967533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 8784871 - 8784576
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |       || | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8784871 aagtttgtttaattatccgtaaactctcaaattttcgaacaatttttttgacataagtttagaacactataaaaggttcatttactaaaatttaaaattt 8784772  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||        
T  8784771 tttaacataaaaagaattaaatatgaattttttaaaacggctgaagttaaagataaaattaataaaatctgaacgtagaaatcaaattttgcgacaattt 8784672  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       ||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8784671 tttgcagagaaacttttagtaatgttcttaacacgtcagcaaaaacttgtttaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 8784576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 35863334 - 35863039
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |       |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  35863334 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaacttttgaacaatatttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttaaaattt 35863235  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||        
T  35863234 tttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaactataaaagttaaagataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcaacaattt 35863135  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       ||  || | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  35863134 tttgcggagaatcttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaataaatttgaattga 35863039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 18839916 - 18840211
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||         || | | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  18839916 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttcgaacgattttttttggatatgtttagaacactatgaaaggttcatctactaaaacttagaattt 18840015  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |        
T  18840016 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgaaaagagttaaagataaaagtaataaaatctggacatagaaatcaaattttgcgataattt 18840115  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       ||| |||||||| |||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||  |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18840116 tttgcagaggaacttctagtaatgttcttaacacatgtacaaaaaattgttcaaaaacttgagagtttaagtataaattaaacaaatttgaattga 18840211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 41281300 - 41281593
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||        ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  41281300 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttaaacgattttttttagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaagtttagaattt 41281399  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||  |||| ||||  || |||||||||||||||| |        
T  41281400 tttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaatgaaatctggatatataaatcaaattttgcgataattt 41281499  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41281500 tttgctgaggaacttttagtaatgttcttaagacgtct-acaaaaattgtt-aaaaaattaagagtttaaacataaattaaacaaatttaaattga 41281593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 22 - 310
Target Start/End: Original strand, 37706722 - 37707009
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  37706722 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttttt-agacaagattagaacactatgaaaggttcaattattaaaatttagaattt 37706820  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    | ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | | ||||| || || || |||||||||||||||| |        
T  37706821 tctaacatgaaacgaattaaatatgaatttttaaaaacgataaaagttaaagataaaagtgataaaatctgaacatataaatcaaattttgcgataattt 37706920  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 310  Q
       ||  ||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  37706921 tttgcggaggaacttttagtaatgttctcaatacgtctacaaaaaattgttaaaaaacataagagtttaagcataaattacacaaattt 37707009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 17842756 - 17842463
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||       | |||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17842756 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttccaaacgattttttgg-gacatgtttagaacactataaaaagttcatttactaaaatttagaattt 17842658  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |        
T  17842657 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaagtaataaaatctggacgtagaaatcaaaatttgcgata-ttt 17842559  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       ||  | | |||| |||||||||| |||||| || |  ||||||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17842558 tttgctgatgtacttctagtaatgtttttaacatgtatacaaaaaattgttgaaaaacttaagagtttaagtataaattaaacaaatttgaattga 17842463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 85 - 320
Target Start/End: Original strand, 21159841 - 21160077
Alignment:
Q  85 acactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttt-ttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaa 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  21159841 acactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttttaatatgaaacggattaaatataaattttttaaaatggcaaaagttaaagataaagttaa 21159940  T
Q  184 caaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaa 283  Q
    |||||| | || |||||||||||||| |||||||       ||  | ||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  21159941 caaaatctagatgtagaaatcaaattgtgcgacaactttttgcggatgaacttttagtgatgttcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaa 21160040  T
Q  284 gagcttaaacataaattaaacaaatttgaattgatga 320  Q
     ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21160041 aagtataagcataaattaaacaaatttgaattgatga 21160077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 39337273 - 39336991
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||    
T  39337273 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgaatcttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataaaatttaaatttt 39337174  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||| |         
T  39337173 tttaacattaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacaatagaagttaaagataaaagtaataaaatatggacatataaatcaaattttgcggc----- 39337079  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
            |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  39337078 --------ggaacttttagtaatgttcttaacacgtcaacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattga 39336991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 72 - 299
Target Start/End: Original strand, 17062413 - 17062639
Alignment:
Q  72 agacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaa 171  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  17062413 agacaagtttaaaacactatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaacatcaaacgaattaaatatgaattttttaaaatgagaaaagttaa 17062512  T
Q  172 agataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgt 271  Q
    |||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||       ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  17062513 agacgaaattaacaaaatctggacatagaaatcaaattttgcgaca-atttttgcagaagaacttttaataatgttcttaacacgtctatacaaaattgt 17062611  T
Q  272 tcaaaaactcaagagcttaaacataaat 299  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||    
T  17062612 tcaaaaactcaaaagtttaagcataaat 17062639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 72 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 17585945 - 17585719
Alignment:
Q  72 agacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaa 171  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  17585945 agacaagtttaaaacactatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaacatcaaacgaattaaatatgaattttttaaaatgagaaaagttaa 17585846  T
Q  172 agataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgt 271  Q
    |||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||       ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  17585845 agacgaaattaacaaaatctggacatagaaatcaaattttgcgaca-atttttgcagaagaacttttaataatgttcttaacacgtctatacaaaattgt 17585747  T
Q  272 tcaaaaactcaagagcttaaacataaat 299  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||    
T  17585746 tcaaaaactcaaaagtttaagcataaat 17585719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 23483637 - 23483448
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  23483637 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacaatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttattaaaatttagagttt 23483538  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaatttt 211  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  23483537 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaattgcaaaagttaaagatcaaattaaccaaatgtggacgtagaaatcaaatttt 23483448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 36063434 - 36063718
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36063434 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacattatgaaaggttcaattactaaaatttagaattt 36063533  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||             ||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||||| |        
T  36063534 tttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttaaaaac-------------gataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcgataattt 36063620  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtct--gtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36063621 tttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaaaattgttaaaaaacttaagaatttaaacataaattaaacaaatttgaattga 36063718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 137 - 317
Target Start/End: Original strand, 6413383 - 6413563
Alignment:
Q  137 attagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaactt 236  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||       | | ||||||||    
T  6413383 attaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggatgtaggaatcaaattttgcgacaattttttgaagaggaactt 6413482  T
Q  237 ttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6413483 ttagtgatgttcttaacacgtctgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 6413563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 87 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 9252874 - 9252645
Alignment:
Q  87 actatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaa 186  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| | |||||||| || |||| ||||| |||| ||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  9252874 actatgaaaggttcgttaacgaaaatttaaatttttttaacataaaacaaattaaatataaattttg-aaaacggtaaaagttaaagataaaattaacaa 9252776  T
Q  187 aatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagag 286  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||| ||       ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  9252775 aatctggaagtagaaatcaaattttgcggcaattttttgcaaaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagag 9252676  T
Q  287 cttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9252675 tttaagcataaattaaacaaatttgaattga 9252645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 317
Target Start/End: Original strand, 5765717 - 5766012
Alignment:
Q  25 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||        | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  5765717 tttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatttttt 5765816  T
Q  125 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaa-ttttgcgacannnnn 222  Q
    || ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |         
T  5765817 aacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttttgcgatattttt 5765916  T
Q  223 nngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgt--aaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       |  |||| |||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  5765917 tt-cgaaggaccttttaataacgttcttaacacgtctgtaaaaaaaattgttgaaaaacttcagagtttaagcataaattaaacaaatttggattga 5766012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 252
Target Start/End: Original strand, 18304664 - 18304896
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnng--agacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||          ||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  18304664 aagtttgattaattatccttaaactcttaaatttttgaatgatttttttttaagacatgtttagaacactatgaaaggttcattttccaaaatttagatt 18304763  T
Q  120 tttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacann 219  Q
    ||| |||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  18304764 tttgtaacttcaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaatttaaagataaaatcaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacaat 18304863  T
Q  220 nnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaa 252  Q
         ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18304864 tttttgcagaggaacttttagtaatgttcttaa 18304896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 109 - 317
Target Start/End: Original strand, 30658524 - 30658731
Alignment:
Q  109 aaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaat 208  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30658524 aaatttagatttttttaacatgaaacaaattaattatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaat 30658623  T
Q  209 tttgcgaca-nnnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaa 307  Q
    ||||| |||        | | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  30658624 tttgcaacattttttttgaagaggaacttttagtaatgttcttaatacgtctgcaaaaaattgtttaaaaactcaagag-ttaagcat-aattaaacaaa 30658721  T
Q  308 tttgaattga 317  Q
    ||||||||||    
T  30658722 tttgaattga 30658731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 317
Target Start/End: Original strand, 28755176 - 28755469
Alignment:
Q  25 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 124  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||        | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  28755176 tttgcttaattattgttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatttttt 28755275  T
Q  125 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaa-ttttgcgacannnnn 222  Q
    || ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| |         
T  28755276 aacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatgaacgtagaaatcaaatttttgcgatattttt 28755375  T
Q  223 nngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       |  |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  28755376 tt-cggaggaccttttaataacgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttgaaaaacttaagaatttaagcataaattaaacaaatttggattga 28755469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 30968957 - 30968670
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         ||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  30968957 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttaaacggttttttttagacaagtttagaacaatatgaaatgttcgtttactaaaatttagaattt 30968858  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagat-aaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 220  Q
    ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||| || | |||||||||| ||||||||| |       
T  30968857 tttaatatgtaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaatgataaaaagcaacaaaatctgaatgtagaaatcatattttgcgataatt 30968758  T
Q  221 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaa-aattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaa 307  Q
        | | || |||||||||||||||| | ||||||| || |||| ||||||| ||||||| ||||| |||  |||||||||||||||    
T  30968757 ttttgtagagaaacttttagtaatgttataaacacgtatgcaaaataattgtttaaaaacttaagagtttatgcataaattaaacaaa 30968670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 16473276 - 16472990
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaattta-gaatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    ||    
T  16473276 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgatttttttgagacaaatttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttatttttt 16473177  T
Q  121 ttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 220  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||||| |       
T  16473176 ttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaa-aaaatctggacatataaatcaaattttgcgataatt 16473078  T
Q  221 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
        ||| ||||||||||| |||   |||||||||||||  ||||||| ||| ||||||      | |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  16473077 ttttgcagaggaacttttaataa---tcttaacacgtctacaaaaaatggttaaaaaac------gtttaagcataaattaaacaaatttgtattga 16472990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 16477847 - 16477561
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaattta-gaatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    ||    
T  16477847 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgatttttttgagacaaatttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttatttttt 16477748  T
Q  121 ttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 220  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||||| |       
T  16477747 ttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaa-aaaatctggacatataaatcaaattttgcgataatt 16477649  T
Q  221 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
        ||| ||||||||||| |||   |||||||||||||  ||||||| ||| ||||||      | |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  16477648 ttttgcagaggaacttttaataa---tcttaacacgtctacaaaaaatggttaaaaaac------gtttaagcataaattaaacaaatttgtattga 16477561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 107 - 317
Target Start/End: Original strand, 13323634 - 13323845
Alignment:
Q  107 taaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| || || || |||||||    
T  13323634 taaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaatgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctgaacatataaatcaa 13323733  T
Q  207 attttgcgacannnnnnngcataggaac-ttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaaca 305  Q
    ||||||||| |       |   |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  13323734 attttgcgataattttttgtggaggaactttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaaca 13323833  T
Q  306 aatttgaattga 317  Q
    ||||||||||||    
T  13323834 aatttgaattga 13323845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 225 - 317
Target Start/End: Original strand, 14121946 - 14122038
Alignment:
Q  225 gcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14121946 gcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 14122038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 191
Target Start/End: Original strand, 43936514 - 43936683
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| || |||| ||||||||| || |||||| ||||||||   |||    
T  43936514 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttaagacaagttttgaacgctatgaaagatttatttaccaaaatttaattttt 43936613  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaattt 191  Q
    ||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43936614 tttaacatgaaacgaattaaaaataaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaattt 43936683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 277
Target Start/End: Original strand, 32514042 - 32514299
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||       |||||||| |||||||  ||  |||||||| |||||||||||||||| |||    
T  32514042 aagtttctctaattatccttaaactcttaaatttttaaacgattattttgagacaagtttagaacgttacaaaaggttcgtttactaaaatttagatttt 32514141  T
Q  122 ttt-aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatt-tggacgtagaaatcaaattttgcgacann 219  Q
    ||| || |||||| |||||| |||| |||||||  ||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||  || |      
T  32514142 ttttaacatgaaatgaattaaatataaatttttgtaaaggaaaaaagttaaagataaaagtaacaaaattctggacgtagatataaaattttcagataat 32514241  T
Q  220 nnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaa 277  Q
         ||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  32514242 tttttgcagatgaactattagtaatgttcttaacacttctgtaaaaaattgtttaaaa 32514299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Original strand, 43988155 - 43988347
Alignment:
Q  24 gtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttt 123  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||        |   ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  43988155 gtttgtttaattatacttaaactcttaaattttttagcgattttttttacctaagtttagaacactatgaaaggtttatatactaaaatttagaattttt 43988254  T
Q  124 taatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcga 215  Q
    ||| || ||| || ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  43988255 taacataaaatgagttaaatatgaattttttaaaacagcaaaagttaaagataaaagtaacaaaaatctggatgtaaaaatcaaattttgcga 43988347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 36018406 - 36018109
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |       |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||    
T  36018406 aagtttgtttaattattcttaaactcttaaatttcttaacaatttttttgagacaagttttgaacactataaaaggttcatttattaaaatctagatttt 36018307  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaa-ttttgcga-can 218  Q
    ||||| ||||||  ||| | ||||| ||||||| |||| | ||||||| ||||||||| |||| ||||| || | |||||||||||| ||||||||  |     
T  36018306 tttaacatgaaataaataaaatatgtatttttttaaaccaaaaaagtttaagataaaagtaacaaaaatatgaatgtagaaatcaaatttttgcgataat 36018207  T
Q  219 nnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
          ||  || |||||||| ||  |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  36018206 gtttttgcggagaaacttttaatagcgttcttaacacgtct-aaaaaaattgttgaaaaacttaagagtttaagcataaatgaaacaaatttggattga 36018109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 277
Target Start/End: Original strand, 42024251 - 42024504
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||        ||||||| |||||||| ||  ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  42024251 aagtttctctaattatctttaaactcttaaatttttgaacgatttttt--agacaagtttagaacattaccaaaagtttgtttactaaaatttagaattt 42024348  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 220  Q
    | ||  |||||| |  ||| |||||||||||||  || |||||||||| ||||||||| |||| ||||| | ||||||||||| |||||||| ||         
T  42024349 tataccatgaaatgggttaaatatgaatttttttgaaagacaaaagttcaagataaaagtaacaaaaatctcgacgtagaaataaaattttgaga-tttt 42024447  T
Q  221 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaa 277  Q
        ||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  42024448 tcttgcagatgaaattttagtaatgttcttaacacttctgcaaaaaattgtttaaaa 42024504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 74 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3865934 - 3865698
Alignment:
Q  74 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 173  Q
    ||||| |||||||| ||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||     
T  3865934 acaagtttagaacattactaaaggttcgtttactaaactttagaattttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaa 3865835  T
Q  174 ataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgtt 272  Q
    |||||| |||| ||||| |||||| || ||| |||||||| || |       | | |  ||||||| || |||||||||| || | || |||||||||||    
T  3865834 ataaaagtaacaaaaatctggacgcaggaataaaattttgagataattttttggagataaacttttcgtgatgttcttaatacttgtgcaaaaaattgtt 3865735  T
Q  273 caaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 310  Q
    ||||| || || || |||| ||| ||||||||||||||    
T  3865734 caaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 3865698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 35 - 315
Target Start/End: Original strand, 32244411 - 32244690
Alignment:
Q  35 tatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||        | ||||| |||||||| ||  || || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||     
T  32244411 tatccttaaactcttaaatttttcaatgattttttttatacaagtttagaacattacaaacggctcatttaataaa-tttagaattttttaatatgaaat 32244509  T
Q  135 gaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatt-tggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaa 233  Q
     ||||| ||||| ||||||| |   |||||||||| || |||||| |||||||||| |||||| | |||| |||||||| || |       | | | |||    
T  32244510 aaattaaatatggatttttttagtagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaattctggacgcataaataaaattttgagataattttttgtagatgaa 32244609  T
Q  234 cttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaatt 315  Q
    ||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| || || || |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  32244610 cttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaatttaaatt 32244690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 277
Target Start/End: Original strand, 3866405 - 3866647
Alignment:
Q  35 tatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||        | ||||| |||||||| ||  || || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||     
T  3866405 tatccttaaactcttaaatttttcaatgattttttttatacaagtttagaacattacaaacggctcatttaataaa-tttagaattttttaatatgaaat 3866503  T
Q  135 gaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatt-tggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaa 233  Q
     ||||| ||||| ||||||| ||  |||||||||| || |||||| |||||||||| || ||  |||||| |||||||| || |       ||||| |||    
T  3866504 aaattaaatatggatttttttaatagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaattctgaacacagaaataaaattttgagataattttttgcatatgaa 3866603  T
Q  234 cttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaa 277  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  3866604 cttttcgtaatattcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaa 3866647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 74 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 6243715 - 6243575
Alignment:
Q  74 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaa-tttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaa 172  Q
    ||||| |||||||| ||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||| || ||||||| ||    
T  6243715 acaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactaaaaatttagaattttttaacatgaaacaaattaaatatgaatttttttaaaagataaaagttcaa 6243616  T
Q  173 gataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 212  Q
     |||||| |||| ||||| |||| | |||||| ||||||||    
T  6243615 aataaaagtaacaaaaatatggatgcagaaattaaattttg 6243575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 188
Target Start/End: Original strand, 6244252 - 6244338
Alignment:
Q  102 tttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaa 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||| ||||||||    
T  6244252 tttactaaaatttagaattttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaa 6244338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 212
Target Start/End: Original strand, 34050586 - 34050685
Alignment:
Q  113 ttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttg 212  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  34050586 ttagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacaaaatttggacctaaaaataaaattttg 34050685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 93 - 212
Target Start/End: Original strand, 28701739 - 28701859
Alignment:
Q  93 aaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaattt 191  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||| |||| ||| |||| ||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||| |    
T  28701739 aaaggtttgtttactaaaatttggaatttattaacatgaaatgaattaaatataaatatttttaaaagactaaagtttaagataaaagtaacaaaaatat 28701838  T
Q  192 ggacgtagaaatcaaattttg 212  Q
    |||||||||||| ||| ||||    
T  28701839 ggacgtagaaataaaaatttg 28701859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 10410142 - 10410010
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||        ||| ||| ||| |||| ||  |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  10410142 aagtttctctaattatccttagagtcttaaatttttgaacgatttttttaagataagtttaaaacattacaaaagattcatttaccaaaatttagaattt 10410043  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaatttttt 154  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||| ||||||    
T  10410042 tttaacatgaaatgaattaaatatgattttttt 10410010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 263 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 41255389 - 41255335
Alignment:
Q  263 aaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  41255389 aaaaattgttcaaaaactcaagagattaaacactaattaaacaaatttgaattga 41255335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 7637046 - 7637151
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  7637046 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgtcaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 7637145  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  7637146 attttg 7637151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 28174241 - 28174346
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  28174241 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacttaaaaattaa 28174340  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  28174341 attttg 28174346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 74 - 310
Target Start/End: Original strand, 44894464 - 44894698
Alignment:
Q  74 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 173  Q
    ||||| |||||||| ||  ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||   |||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||  ||| ||     
T  44894464 acaagtttagaacattacaaaatgttcgtttactaaaatttagaattatttagcttgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaa--gtttaaa 44894561  T
Q  174 ataaaattaacaaaatt-tggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgtt 272  Q
    ||||   |||||||| | |||||| |||||| |||||||| || |       | | | |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  44894562 ataattgtaacaaaaatctggacgcagaaataaaattttgagataattttttggagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgtt 44894661  T
Q  273 caaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 310  Q
    ||||| || || || |||| ||| ||||||||||||||    
T  44894662 caaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 44894698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 32243920 - 32243684
Alignment:
Q  74 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 173  Q
    ||||| |||||||| ||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||  | ||| |||| | |||||| ||| |||||||||| ||     
T  32243920 acaagtttagaacattactaaaggttcgtttactaaaatttataattttttaacatgaaataatttaaatataattttttttaaaagacaaaagttcaaa 32243821  T
Q  174 ataaaa-ttaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgtt 272  Q
    |||||| | || ||||| | |||| || ||| |||||||| || |       ||| |  ||||||| || |||||||||| || | || |||||||||||    
T  32243820 ataaaagtaaaaaaaatctagacgcaggaataaaattttgagataattttttgcagataaacttttcgtgatgttcttaatacttgtgcaaaaaattgtt 32243721  T
Q  273 caaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 310  Q
    ||||| || || || |||| ||| ||||||||||||||    
T  32243720 caaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 32243684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 36126548 - 36126455
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttt-gaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaattt 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||        ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36126548 aagtttgtttaactatccttaaactattaaattttttgaacgatttttttaagacaagtttaaaacactataaaaggttcatttactaaaattt 36126455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 249 - 317
Target Start/End: Original strand, 39337745 - 39337813
Alignment:
Q  249 ttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    ||||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39337745 ttaacacatctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 39337813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 2826965 - 2826919
Alignment:
Q  231 gaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaa 277  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2826965 gaacttttagtaatgtttttaacacgtctgcaaaaaattgttcaaaa 2826919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 11385673 - 11385567
Alignment:
Q  107 taaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatca 205  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||| ||| || |||| |    
T  11385673 taaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaatttaagataaaactaacgaaaatttagacctaaaaataa 11385574  T
Q  206 aattttg 212  Q
    |||||||    
T  11385573 aattttg 11385567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 60
Target Start/End: Original strand, 30658453 - 30658491
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30658453 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaa 30658491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 41219765 - 41219667
Alignment:
Q  115 agaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 212  Q
    |||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||||||||    
T  41219765 agaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaatttcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaattttg 41219667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 2061079 - 2060974
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| || | ||||||||||| || |||| ||    
T  2061079 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactagcgaaaatttggacctaaaaataaa 2060980  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  2060979 attttg 2060974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 4517149 - 4517044
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | ||||||||||||  |||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  4517149 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgctaaaaatttaagataaaactaacgaaaatttggacttaaaaataaa 4517050  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  4517049 attttg 4517044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18365359 - 18365254
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||  ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  18365359 aaaaattagaattttttatcatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 18365260  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  18365259 attttg 18365254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 27923822 - 27923717
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| |  ||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  27923822 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatatttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 27923723  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  27923722 attttg 27923717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 34058864 - 34058759
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| |||||  | ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  34058864 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaaattaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 34058765  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  34058764 attttg 34058759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 36765700 - 36765595
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||||||| || || |||| ||    
T  36765700 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaacttcaagataaaactaacgaaaatttgaacctaaaaataaa 36765601  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  36765600 attttg 36765595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 42219315 - 42219420
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| ||| |||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  42219315 aaaaattaaaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgtcaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacataaaaataaa 42219414  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  42219415 attttg 42219420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 44090484 - 44090589
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||||||| || || |||| ||    
T  44090484 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttgcacctaaaaataaa 44090583  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  44090584 attttg 44090589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 231 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 10409864 - 10409789
Alignment:
Q  231 gaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaa 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||    
T  10409864 gaacttttagtaatgttcttaacacttccgcaagaaattgttcaaaatcttaaaagtttaaacat-aattaaacaaa 10409789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 27000980 - 27000886
Alignment:
Q  112 tttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||| |||| |  ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  27000980 tttataattttttaacatgagataaattaaatatgaattttttaaa-cgagaaaagttcaatataaaagtcacgaaaatttggacgtagaaatcaa 27000886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 262 - 317
Target Start/End: Original strand, 35369929 - 35369984
Alignment:
Q  262 aaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    |||||||| || ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35369929 aaaaaattattaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 35369984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 1663920 - 1663854
Alignment:
Q  147 aattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgc 213  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| || ||||||    
T  1663920 aattttgttaaaagacaaaagttaaagataaaagtaacaaaatctggacatagaaataaatttttgc 1663854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 12469492 - 12469454
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12469492 aagtttgtttaattatccttaaactcctaaatttttgaa 12469454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 4137088 - 4136983
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | ||||| |||||| || || || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  4137088 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataattttttaaaaacgccataaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 4136989  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  4136988 attttg 4136983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7419934 - 7419829
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||  ||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||||||| || || |||| ||    
T  7419934 aaaaattagaattttttaacatgtaataaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttgaacctaaaaataaa 7419835  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  7419834 attttg 7419829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13082971 - 13082866
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | ||||||||||||  |||| || | ||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  13082971 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgcaaaaaattcatgataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 13082872  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  13082871 attttg 13082866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 24541845 - 24541950
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | ||| |||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||  ||    
T  24541845 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataattttgttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttggacctaaaaacaaa 24541944  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  24541945 attttg 24541950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 30378296 - 30378191
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| ||| |||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||| ||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  30378296 aaaaattataattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaatacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 30378197  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  30378196 attttg 30378191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 35209551 - 35209656
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||   |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  35209551 aaaaattagaattttttaacaggtaatgaattaaatatattttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 35209650  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  35209651 attttg 35209656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 36052025 - 36051920
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaa-ttaacaaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||| | |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || |||| ||    
T  36052025 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaatgaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaaagaaaatttggacttaaaaataaa 36051926  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  36051925 attttg 36051920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 41724986 - 41724881
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||| ||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||||||| || || |||| ||    
T  41724986 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttataaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttgaacctaaaaataaa 41724887  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  41724886 attttg 41724881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 22849588 - 22849500
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggac 195  Q
    |||| ||||||| |||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||    
T  22849588 aaaaattagaatattttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaaaataaaattaacgaaaatttggac 22849500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 114 - 212
Target Start/End: Original strand, 16729111 - 16729210
Alignment:
Q  114 tagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 212  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||  ||||| || ||||||||| ||||  |||||||||| || |||| ||||||||    
T  16729111 tagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacaccaaaaattcaagataaaactaacggaaatttggacctaaaaataaaattttg 16729210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 31185759 - 31185724
Alignment:
Q  25 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaa 60  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31185759 tttgcttaattatccttaaactcttaaatttttgaa 31185724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 114 - 212
Target Start/End: Original strand, 42175204 - 42175303
Alignment:
Q  114 tagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaa-caaaatttggacgtagaaatcaaattttg 212  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||  |||||||| || || |||| ||||||||    
T  42175204 tagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaatgaaaatttgaacctaaaaataaaattttg 42175303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8076422 - 8076328
Alignment:
Q  119 ttttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 212  Q
    |||||||| ||| || || ||| |||| | |||||||||| | ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||    
T  8076422 ttttttaacatgtaatgagttaaatataatttttttaaaatgccaaaaattcaagataaaattaacgaaaatttggacctaaaaataaaattttg 8076328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12616586 - 12616480
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaatttttt-aaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatca 205  Q
    |||| ||| |||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||| |||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| |    
T  12616586 aaaaattaaaattttttaacatgtaatgaattaaatataattttttttaaaacgtcaaaatttcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataa 12616487  T
Q  206 aattttg 212  Q
    |||||||    
T  12616486 aattttg 12616480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13699609 - 13699506
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| ||||||| |||||| ||| || |||||| |||| |  ||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  13699609 aaaaattagaatattttaacatgtaatgaattaaatataa--tttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 13699512  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  13699511 attttg 13699506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 27519775 - 27519670
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| ||||| |||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||| ||  || |||| ||    
T  27519775 aaaaattagatttttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttcgatctaaaaataaa 27519676  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  27519675 attttg 27519670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 39106860 - 39106964
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| ||| |||||||||| ||| || |||| | |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  39106860 aaaaattaaaattttttaacatgtaatgaataa-atataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 39106958  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  39106959 attttg 39106964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 212
Target Start/End: Original strand, 41315451 - 41315548
Alignment:
Q  116 gaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 212  Q
    ||||||||||| ||| || |||||| |||| || |||||||| || ||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  41315451 gaattttttaacatgtaatgaattaaatataaaatttttaaatcgccaaaaattcaagataaaactaacaaaaatatggacctaaaaataaaattttg 41315548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 43470660 - 43470555
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| ||||   | |||||||||| ||||| || | ||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  43470660 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatatagttattttaaaacgtcaaaaattcatgataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 43470561  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  43470560 attttg 43470555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 2827029 - 2826981
Alignment:
Q  167 gttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcga 215  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || |  |||||||||||||||||||    
T  2827029 gttaaagataaaagtaacaaaatctgaatatagaaatcaaattttgcga 2826981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 2827101 - 2827065
Alignment:
Q  24 gtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaa 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  2827101 gtttgtttaattatcctcaaactcttaattttttgaa 2827065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 176
Target Start/End: Original strand, 17918802 - 17918870
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagata 176  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||    
T  17918802 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattgaagata 17918870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 28695031 - 28694963
Alignment:
Q  229 aggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataa 297  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||   |  |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  28695031 aggaacttttagtaatgctcttaatacacgtacaaaaaattgttcaaaaactctagagtttaagcataa 28694963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 28695155 - 28695091
Alignment:
Q  97 gttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacga 161  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||| |||| | |||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  28695155 gttcatttactaaaattttaaattgtttaagatgagatgaattaaataagaatttttttaaacga 28695091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 184
Target Start/End: Original strand, 36333227 - 36333275
Alignment:
Q  136 aattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac 184  Q
    ||||| |||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  36333227 aattaaatataaatattttaaaatgataaaagttaaagataaaattaac 36333275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 52)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 15721062 - 15721360
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnn--gagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15721062 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaattttagaat 15721161  T
Q  120 ttttt-aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacan 218  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  15721162 ttttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgcgacaa 15721261  T
Q  219 nnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
          ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15721262 ttttttgcataggaacttttagtaaagtttttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 15721360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 26356826 - 26356528
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26356826 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttaaaattt 26356727  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||        
T  26356726 tttaacatgaaatgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgtgacaattt 26356627  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgt---aaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26356626 tttgcatagaaacttttagtaatgttcttaacacgcgtgtaaaaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 26356528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 10915598 - 10915301
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10915598 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgatcgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 10915499  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||        
T  10915498 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgaaaaatgttaaagataaaattaacaaaatatggacgtagaaatcaaattatgcgacaattt 10915399  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctg--taaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       | | |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10915398 tttgtaaaggaccttttagtaatgttcttaacacgtctgcaaaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 10915301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 5974309 - 5974604
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  5974309 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgtacgatttttttcagacaagtttagaatactatgaaaggttcattaactaaaatttaaaattt 5974408  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        
T  5974409 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggaaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggatgtagaaatcaaattttgcgacaattt 5974508  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       | | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  5974509 tttgtagaggaacttttagtaatgtttttaacacgtctgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattga 5974604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 8710130 - 8709836
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8710130 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgtacgatttttttaagacaagtttagaatactatgaaaggttcattaactaaaatttagaattt 8710031  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  8710030 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggaaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacaattt 8709931  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       | | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  8709930 tttgtagaggaacttttagtaatattcttaacacgtctgcaaaaaattgttc-aaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattga 8709836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 25 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 30661071 - 30660778
Alignment:
Q  25 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 124  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30661071 tttgtttaattatacttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 30660972  T
Q  125 aatatgaaacgaattagatatgaatt-ttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnn 223  Q
    || || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||          
T  30660971 aacataaaacgaattaaatatgaatttttttaaaacgacaaaagttaatgataaaattaacaaaatctggatgtagaaatcaaattttgcgacaattttt 30660872  T
Q  224 ngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
     ||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  30660871 tgcagatgaacttttagtaatattcttaacatgtctgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattga 30660778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 22 - 312
Target Start/End: Original strand, 17697386 - 17697676
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||        ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17697386 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaacttttgaacgattttttttagaaaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 17697485  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
     |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||        
T  17697486 attaagatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttacgacaattt 17697585  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttga 312  Q
       | | |||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  17697586 tatgaaaaggagctttttgtaatgttcttaacacgtcttcaaaaaattgttcaaaaactcacgagtttaagcataaattaaacaaatttga 17697676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 5087190 - 5087485
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||         ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5087190 aagtttgtttaattatccttaaactcttaactttttgaacggttgtttttagacaagtttagaacactatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 5087289  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||| || ||||||||||        
T  5087290 tttaacatgaaacaaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatctgaatgtaaaaattaatttttgcgacaattt 5087389  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  5087390 tttgcagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttcaaaaagtcaagagtttaagcataaattaaacatatttgaattga 5087485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 1821274 - 1820983
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1821274 aagtttgtttaattatctttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttataacattatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 1821175  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| || ||| || ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||        
T  1821174 tttaacattaaatgagttaaatatgaattttttaaaacggtaaaagttaaagataaaat--acaaaatttggacgtagaaatcaaattttgtgacaactt 1821077  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       ||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  1821076 tttgcagaggaacttttagtaatgttcttaatacgtatgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaa--aaacaaatttgaattga 1820983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 844402 - 844106
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||       |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  844402 aagtttgtttaattattcttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 844303  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagat-aaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 220  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||| |       
T  844302 tttaacatgaaacaaattaaatatgaattttttaaaatggcaaaagttaaagataaaaagtaacaaaatctgaatgtagaaatcaaattttgcgataatt 844203  T
Q  221 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
        ||| ||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  844202 ttttgcagaggaacttttagtaatgttctaaatatgtctgcaaaaagttgttcaaaaacttaagagtttaaacataaattaagcaagtttgaattga 844106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 22 - 316
Target Start/End: Original strand, 29691911 - 29692205
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29691911 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaaacttaaaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 29692010  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
     |||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |        
T  29692011 attaacatgaaaagaattaaatatgaatttttcaaaacgacaaaagttaaagatataagtaacaaaatatggacgttgaaatcaaattttgtgagaattt 29692110  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattg 316  Q
       ||| |||||||||| ||||| |  |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29692111 tttgcagaggaactttttgtaatatgtttaacacgtctacaaaaaattgttgaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattg 29692205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 22 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 939139 - 938845
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||       |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  939139 aagtttgtttaattatcctcaaactcctaaattttcgaacgatttttttgagacatgtttagaacactttgaaaggttcatttactaaaatttaaatttt 939040  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |        
T  939039 tttaacatgaaatgaattaaatatgattttttttaaaagacaaaagttaaagataaaagcaacaaagtctggacgtagaattcaaattttgcgataattt 938940  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattg 316  Q
       ||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  938939 attgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattg 938845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 317
Target Start/End: Original strand, 861362 - 861655
Alignment:
Q  26 ttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttta 125  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||       |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  861362 ttgtttaattatttttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagaaaagttttgaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttta 861461  T
Q  126 atatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagat-aaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnn 224  Q
    | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |           
T  861462 acatgaaacaaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaaagtaacaaaatctggatgtagaaatcaaattttgcgataatttttt 861561  T
Q  225 gcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaa-cataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    ||  ||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  861562 gccgaggaacttttagtaatgttctaaatatgtctgcaaaaaattgttcaaaaacttaagagtttaaagcataaattaagcatatttgaattga 861655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 71 - 314
Target Start/End: Original strand, 33518406 - 33518648
Alignment:
Q  71 gagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagtta 170  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33518406 gagacaagtttagaacactatgaaaggtttattaactaaaatttagaattttt-aacctaaaatgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagtta 33518504  T
Q  171 aagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattg 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  33518505 aagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgtgacaattttttgcagatgaacttttagtaatgtttttaacacgtctgcaaaaaattg 33518604  T
Q  271 ttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaat 314  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||    
T  33518605 ttcaaaaactcaagagtataagcatacattaaacaaatttgaat 33518648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 93 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 2087661 - 2087438
Alignment:
Q  93 aaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttg 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2087661 aaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgagccgaattaaatatgaattttttaaaacgataaaagttaaagataaaattaacaaaatctg 2087562  T
Q  193 gacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaa 292  Q
    |||||||||||||||||||  ||||       ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||     
T  2087561 gacgtagaaatcaaattttatgacaattttttgcagatgaacttttagtaatgttcttaacatgtctgtaaaaatttgttcaaaaact-aagagtttaag 2087463  T
Q  293 cataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  2087462 cataaattaaacaaatttgaattga 2087438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 22731997 - 22732293
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaat-ttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatt 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||        ||||||| |||||||||| | | | |||||||||| |||||||||| ||    
T  22731997 aagtttgtttaattattcttaaactcttaaaaattttgaacgaattttttaagacaagtttagaacactgtaatatgttcatttaccaaaatttagattt 22732096  T
Q  121 tttt-aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacann 219  Q
    |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||      
T  22732097 tttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaatgttaaagataaaattaacaaagtctggccgtagaaatcaaattttgcgacaat 22732196  T
Q  220 nnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
         ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  22732197 tttttgcagaggaacttttagtaatgttcttaatacgtatgt-aaaaattgtttaaaaactcaagagtttaagcatagtttaaacaaatttgaattga 22732293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 5079506 - 5079802
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnn-gagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatt 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||        |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||    
T  5079506 aagtttgttaaattatccttaaagtcttaaatttttaaacgattttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttaatttt 5079605  T
Q  121 ttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 220  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||| | |       
T  5079606 ttttaacatgaaacaaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcaataact 5079705  T
Q  221 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
        ||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5079706 ttttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 5079802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 30493004 - 30492761
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  30493004 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttttttagacaagtttagaacactatgaagggttcatttactaaaatttataattt 30492905  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||| | |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||        
T  30492904 tttaacatgaaacgagttaaatataatttttttaaaatgaaaaaagttaaagataaaataaacaaaatctggacgtagaaat-aaattttgcgacaattt 30492806  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaa 266  Q
       ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30492805 ttagcagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgaaaaaa 30492761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 18502992 - 18503274
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||    
T  18502992 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataaaatttaaatttt 18503091  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    |||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||| |         
T  18503092 tttaacctgaaacgaattacatatgaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaaagtaataaaatatggacatataaatcaaattttgcggc----- 18503186  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  18503187 --------ggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagaataaattaaagaaatttgaattga 18503274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 71 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 20510725 - 20510491
Alignment:
Q  71 gagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagtta 170  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20510725 gagacaaatttagaacactatgaaaggttcattaactaaaatttagaattttttaacatgaatcgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtta 20510626  T
Q  171 aagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattg 270  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||       | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||              
T  20510625 aagataaaattaacaaaatctggacgtagaaattaaattttacgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacatctg---------- 20510536  T
Q  271 ttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
      |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  20510535 --caaaaactcaagagtttaagcataaaataaacaaatttgaattga 20510491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 14256151 - 14256440
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |       | |||||  |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14256151 aagtttgtttaattatccttaaattcttaaatttttgaac-aattttttgtgacaaactcgaaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 14256249  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
     |||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||      ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        
T  14256250 attaacatgaaaagaattaaatatgaatttttcaaaacgacaaaagt------taaaagtaacaaaatttggacgttgaaatcaaattttgcgacaattt 14256343  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgtt-caaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||   ||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  14256344 tttgcagaggaacttttagtaatgtttttaacatgtctaccaaaaattgttaaaaaaactcaagagtttaagcataaattaaataaatttgaattga 14256440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 317
Target Start/End: Original strand, 33744665 - 33744958
Alignment:
Q  25 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 124  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||        | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  33744665 tttgcttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattttttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatttttt 33744764  T
Q  125 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaa-caaaatttggacgtagaaatcaaa-ttttgcgacannnnn 222  Q
    || ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |         
T  33744765 aacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaataaaaatatggacgtagaaatcaaatttttgcgatattttt 33744864  T
Q  223 nngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       |  |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  33744865 tt-cggaggaccttttaataacgttcttaacacgtctgtaaaacattgttgaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttggattga 33744958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 25 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 12482047 - 12481801
Alignment:
Q  25 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12482047 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttttttagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttgctaaaatttagaatttttt 12481948  T
Q  125 -aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnn 223  Q
     || || |||  ||||| |||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||          
T  12481947 taacataaaataaattaaatataaatattttaaaacgaaagaagttaaagataaaattaacaaaatcaggacgtagaaatcaaattttgcgacaattttt 12481848  T
Q  224 ngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattg 270  Q
     | |  |||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  12481847 tgtagcggaatttttagtattgtgcttaacacgtctgcaaaaaattg 12481801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 28476187 - 28476486
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaat----ttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttaga 117  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||    ||||||||||       |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28476187 aagtttgtttaattattcttaaattcttaaataaatttttgaacgatttttttgagacaaacttaaaacactatgaaaggttcatttactaaaatttaga 28476286  T
Q  118 attttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgaca 217  Q
    |||| |||| |||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  28476287 atttattaacatgaaaagaattaaatataaatttttcaaaacgacaaaagttaaagatataagtaacaaaatatggacgttgaaatcaaattttgtgaca 28476386  T
Q  218 nnnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtct-gtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattg 316  Q
            || || ||| ||||||||| |  |||| || |||   ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28476387 atttttt-cagagaaacatttagtaatatgtttaatacatctaccaaaaaattgttgaaaaactcaaaagtttaaacataaattaaacaaatttaaattg 28476485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20977658 - 20977467
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||       
T  20977658 aagtttgtttaactatccttaaactcttaaatttttgaacgatattttttagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaatatttaaaaaaa 20977559  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag-ataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttg 212  Q
    ||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20977558 tttaacatgaaaagaattaaatgtgaattttttaaaacgacaaaaattaaagaataaaaataacaaaatctggacgtagaaatcaaattttg 20977467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 17245875 - 17245717
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  17245875 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataaaatttagaattt 17245776  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaat 180  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  17245775 tttaacatgaaacgaaataaatatgaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaaat 17245717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20977292 - 20977101
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||       
T  20977292 aagtttgtttaactatccttaaactcttaaatttttgaacgattgttttaagacaagtttagaacactatgaaaggttcattttctaatatttaaaaaca 20977193  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag-ataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttg 212  Q
     |||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  20977192 attaacatgaaaagaagtaaatatgaattttttaaaacgacaaaaattaaagaataaaaataacaaaatctagacgtagaaatcaaattttg 20977101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 34046682 - 34046544
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatt- 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  34046682 aagtttgtttaattatccttaaattcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataaaatttagaattt 34046583  T
Q  121 ttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaac 159  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  34046582 ttttaacatgaaacaaattaaatatgaatttttaaaaac 34046544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 3375585 - 3375394
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| |||||||| ||  ||| | || | ||||||||||| ||||||    
T  3375585 aagtttctctaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacattacaaaatgctcgtatactaaaatttggaattt 3375486  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 212  Q
    ||||| || ||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||| || |||||||||| ||||||||    
T  3375485 tttaacataaaatgaattaaatatgaatatttttaaacgacaaaagttcaagataaaattatcaaaaatctgaacgtagaaataaaattttg 3375394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 80 - 317
Target Start/End: Original strand, 11400126 - 11400364
Alignment:
Q  80 ttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaa 179  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  11400126 ttagaacactataaaacattcatttactaaaattaacaattttctaacatgaaactaattaaatataaattttttaaaacgccaaaagttacatataaaa 11400225  T
Q  180 ttaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcatag-gaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaa-ttgttcaaaa 277  Q
    |||||||||| ||||| |  |||| ||| ||| |||||        || ||  || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    || ||||    
T  11400226 ttaacaaaatctggacatttaaataaaagtttacgacaatttttt-caaagataatttttagtaatgttcttagcacgtatgtaaaaaaccatttaaaaa 11400324  T
Q  278 actcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11400325 actcaagagtttaatcataaattaaacaaatttgaattga 11400364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 156
Target Start/End: Original strand, 20897811 - 20897947
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnng-agacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaa-t 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20897811 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattattttttagacaagtttaagacgctatgaaaggttcatttactaaaatttagaatt 20897910  T
Q  120 tttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaa 156  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  20897911 tttttaacatgaaacgaattaaacatgaattttttaa 20897947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 74 - 310
Target Start/End: Original strand, 3914474 - 3914709
Alignment:
Q  74 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 173  Q
    ||||| |||||||| ||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||     
T  3914474 acaagtttagaacattacaaaaagttcgtttactaaaatttagaattttttaacatgaaataaattagatatgaaattttttaaaagacaaaagttcaaa 3914573  T
Q  174 ataaaattaaca-aaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgtt 272  Q
    |||||| ||||| |||| | ||||||||||| |||||||| || |       ||| | |||| ||| |||||||||||||||| | ||  ||||||| ||    
T  3914574 ataaaactaacagaaatctagacgtagaaataaaattttgagataattttttgcagatgaacattttgtaatgttcttaacacttgtg-caaaaattatt 3914672  T
Q  273 caaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 310  Q
    ||||| || || || |||||||| ||||||||||||||    
T  3914673 caaaatcttaaaagtttaaacat-aattaaacaaattt 3914709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 74 - 310
Target Start/End: Original strand, 21108119 - 21108355
Alignment:
Q  74 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 173  Q
    ||||| |||||||| ||  |||||||| |||||||||||||| |||| ||||  ||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||     
T  21108119 acaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactaaaatttataattatttagcatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaa 21108218  T
Q  174 ataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgtt 272  Q
    |||||| |||| ||||| |||||| |||||| |||||||| || |       | | | ||| |||| |||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  21108219 ataaaagtaacaaaaatctggacgcagaaataaaattttgagatatttttttggagatgaaattttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgtt 21108318  T
Q  273 caaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 310  Q
    ||||| || || || |||| ||| ||||||||||||||    
T  21108319 caaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 21108355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 148 - 317
Target Start/End: Original strand, 20898115 - 20898275
Alignment:
Q  148 attttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgtt 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||| ||          |  ||||| |||||||||||||    
T  20898115 attttttaaaacgacaaaagttaaagataaaatt---------tggacgtagaaatcaaattttgtgattttttttttcggaggaagttttagtaatgtt 20898205  T
Q  248 cttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    ||||| | ||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  20898206 cttaagaagtcttaaaaaaattgttcaaaaacttaagagtttaagcataaattaaaaaaatttgaattga 20898275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 289207 - 289005
Alignment:
Q  107 taaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatca 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||| | |||||||||| || |||||| |||| ||||| |||||| |||||| |    
T  289207 taaaatttagaattttttaatatgaaataaattaaatatggattttttaata-gacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaaatctggacgcagaaataa 289109  T
Q  206 aattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaaca 305  Q
    ||||||| || |       ||| | ||| |||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| || ||  | |||| ||| |||||||||    
T  289108 aattttgagataattttttgcagatgaagttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaatgtttaagcat-aattaaaca 289010  T
Q  306 aattt 310  Q
    |||||    
T  289009 aattt 289005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 147
Target Start/End: Original strand, 30353126 - 30353252
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttaga--at 119  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||        ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||   |    
T  30353126 aagtttatttaattatctttaaacacttaaatttttgaacgattttttt-agacaagtttagaacattatgaaaggttcacttactaaaatttagagttt 30353224  T
Q  120 tttttaatatgaaacgaattagatatga 147  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  30353225 tttttaacatgaaacgaattaaatatga 30353252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 233 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 17244624 - 17244540
Alignment:
Q  233 acttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  17244624 acttttagtaatgttcttaacacatctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagaataaattaaacatatttgaattga 17244540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 310
Target Start/End: Original strand, 289438 - 289647
Alignment:
Q  103 ttactaaaatttagaatttttt-aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac--aaaatttggacgtag 199  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||| ||||  ||||| |||||||||    
T  289438 ttactaaaaattagaatttttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaaaatctggacgtag 289537  T
Q  200 aaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaat 299  Q
    |||| |||||||  || |       ||| |  |||||||  | ||||||||||||| | || |||||||||||||||| || || || |||| ||| |||    
T  289538 aaataaaattttaagataattttttgcagataaacttttcatgatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aat 289636  T
Q  300 taaacaaattt 310  Q
    |||||||||||    
T  289637 taaacaaattt 289647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 12783434 - 12783539
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  12783434 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataacttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 12783533  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  12783534 attttg 12783539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13400380 - 13400275
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  13400380 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 13400281  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  13400280 attttg 13400275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16270385 - 16270286
Alignment:
Q  114 tagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 212  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||||||||    
T  16270385 tagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaattttg 16270286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 317
Target Start/End: Original strand, 17246321 - 17246376
Alignment:
Q  262 aaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17246321 aaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 17246376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 150
Target Start/End: Original strand, 24958886 - 24959012
Alignment:
Q  25 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaa--tttt 122  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||        ||||||| ||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||  ||||    
T  24958886 tttgtttaattatctttaaactcttaaattttt-aacgattttttttagacaagtttgtaacactacgaaagatttatttactaaaatttagaatttttt 24958984  T
Q  123 ttaatatgaaacgaattagatatgaatt 150  Q
    ||||  ||||| |||||| |||||||||    
T  24958985 ttaacctgaaatgaattaaatatgaatt 24959012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 176
Target Start/End: Original strand, 30916772 - 30916855
Alignment:
Q  93 aaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagata 176  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| || | | |||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  30916772 aaaggttcatttattaaaatttaaaattttataacataagatgaattaaatataaatttttttaaacgaaaaaagttaaagata 30916855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 19693146 - 19693251
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| ||| |||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  19693146 aaaaattataattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 19693245  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  19693246 attttg 19693251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 61
Target Start/End: Original strand, 16736655 - 16736691
Alignment:
Q  25 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaac 61  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16736655 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaac 16736691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 195
Target Start/End: Original strand, 31280029 - 31280117
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggac 195  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||| |||| | ||||||||||||  |||| || ||||||||| |||| |||||||||||    
T  31280029 aaaaattagaattttttaatatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgctaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggac 31280117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 2857543 - 2857444
Alignment:
Q  114 tagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 212  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||| ||| || |||| ||||||||    
T  2857543 tagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttagacctaaaaataaaattttg 2857444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 211
Target Start/End: Original strand, 8235252 - 8235365
Alignment:
Q  98 ttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaa-ttaacaaaatttggacg 196  Q
    |||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||  | ||     
T  8235252 ttcatttactaatatttataatctcttaatatgacatgaattaaacatgaatttttt-aaacatcaaaagttcaagataaaagtaaacaaaatcagaaca 8235350  T
Q  197 tagaaatcaaatttt 211  Q
    |||||||||||||||    
T  8235351 tagaaatcaaatttt 8235365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15054003 - 15053905
Alignment:
Q  115 agaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 212  Q
    |||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||  ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||||||||    
T  15054003 agaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacaccaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttggacctaaaaataaaattttg 15053905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 945850 - 945955
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | ||| ||||||||| |||| || ||||||||| |||| ||||||| ||| || |||| ||    
T  945850 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataattttgttaaaacgaaaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttagacctaaaaataaa 945949  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  945950 attttg 945955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 5079053 - 5079000
Alignment:
Q  262 aaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaatt 315  Q
    ||||||||||| ||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  5079053 aaaaaattgttaaaaacttaaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaatt 5079000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 98)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 15 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 25250316 - 25250016
Alignment:
Q  15 tcaattgaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaattt 114  Q
    |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||       |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25250316 tcaattcaaatttgttaaattatccttaaactcttaaatttttgaatgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaattt 25250217  T
Q  115 agaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcg 214  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25250216 agaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaaaataaaat--acaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcg 25250119  T
Q  215 acannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaat 314  Q
    |||       |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  25250118 acaattttttgcatagaaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattattcaaaaactcaagagtttaaatataaattaaacaaatttgaat 25250019  T
Q  315 tga 317  Q
    |||    
T  25250018 tga 25250016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 38174197 - 38173902
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||       || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||    
T  38174197 aagtttatttaattatctttaaactcttaaattattgaacgatttttttgaaacaagtttagaacactatgaaaggttcatatactaaaatttaaatttt 38174098  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||        
T  38174097 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacagaaaaagttaaagataaaattaacaaaatctagacgtagaaatcaaattttgcgacaattt 38173998  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38173997 tttgtataggaacttttagtaatgttcttaacacgcctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 38173902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 45419785 - 45420078
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45419785 aagtttgtttaattatctttaaactcttaaatttttgaacgattttttttagacaagtttagaacattatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 45419884  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| || ||| || ||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||        
T  45419885 tttaacattaaatgagttaaatatgaattttttaaaacggtaaaagttaaatataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgcgacaattt 45419984  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  45419985 tttgcagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtatgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaa--aaacaaatttgaattga 45420078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 53517784 - 53518079
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||         || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  53517784 aagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacgatttttttatgataagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaaatt 53517883  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||        
T  53517884 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaaagacaaaagttaaagataaatttaacaaattctggacgtagaaatcaaattttgcgacaattt 53517983  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       | | | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53517984 tttgtagatgaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaaaagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 53518079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 29348567 - 29348275
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||        ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29348567 aagtttgtttaattatatttaaactcttaaatttttgaacgattttttt-agacaaatttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 29348469  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||        
T  29348468 tttaacataaaacgaactaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtaaaaatcaaattttgcgacaattt 29348369  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29348368 tttgcaaaggaacttttagtaatattcttaacacttctgcaaaaaattgttcaaaaactca--agtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 29348275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 44808839 - 44809135
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnng-agacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatt 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44808839 aagtttgttcaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttttagacaggtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatt 44808938  T
Q  121 ttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 220  Q
    |||||| || ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||       
T  44808939 ttttaacataaaatgaattaaatatgaatttttaaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaattttgacgtaaaaatcaaattttgcgacaact 44809038  T
Q  221 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
        ||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44809039 ttttgcaaaggaacttttagtaatattcttaacacgtgtgcaaaaaattgtttaaaaactccagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 44809135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 72 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 21749811 - 21749566
Alignment:
Q  72 agacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaa 171  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21749811 agacaagtttagaatactgtgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattaaaaatgaattttttaaaacgacaaaagttaa 21749712  T
Q  172 agataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgt 271  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||       |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  21749711 agataaaattaacaaaatctggacgtagaaattaaattttaagacaattttttgcatagaaacttttagtaatgttcttaacacgttcgtaaaaaattgt 21749612  T
Q  272 tcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21749611 tcaaaaactcaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattga 21749566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 22 - 310
Target Start/End: Original strand, 23883390 - 23883678
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |        ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  23883390 aagtttgtttaattattcttaaactcttaaattttagaacaattttttttagacaagtttagaacactataaaaggttcatttactaatatttacaattt 23883489  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||        
T  23883490 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaacttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgtaacaattt 23883589  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 310  Q
       ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  23883590 tttgcagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtatgcaaaaaattgttcaaaaactccagagtttaagcataaattaaacaaattt 23883678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 40762600 - 40762895
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||        | ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  40762600 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaaattttgaacgattttttttaaacaagtttagaacactatgaaagattcaattactaaaatctagaattt 40762699  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |        
T  40762700 tttaacatgaaatgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagatgaaattaacaaaatcttgacgtagaaatcaaattttacgataatat 40762799  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       | | |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40762800 tttgtagaggagcttttagtaatgttcttaacacgtctatcaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 40762895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 27492609 - 27492313
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  27492609 aagtttgtttaattatccttaaactcccaaatttttgaacgatatttttgagacaagtttagaacactatgaaatgttcatttattaaaatttagaattt 27492510  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagat-aaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 220  Q
    | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |       
T  27492509 tctaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgaaaaaagttaaagataaaaagtaacaaaatttggatgtagaaatcaaattttgcgataatt 27492410  T
Q  221 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
        ||  || |||||||||||||||| | |||| || || ||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27492409 ttttgcggagaaacttttagtaatgttttaaacatgtatgcaaaaaattgttcaaaaacctaagaatttaaacataaattaaacaaatttgaattga 27492313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 37179237 - 37178941
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37179237 aagtttgtttaattatccttaaattcttaaaattttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttagaattt 37179138  T
Q  122 ttt-aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 220  Q
    ||| || || |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||| ||||| || |||||||||||||||| |       
T  37179137 ttttaacatcaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaatgtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcgataatt 37179038  T
Q  221 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
        ||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37179037 ttttgcggatgaacttttagtaatgttcttaacacgtctataaaaaattgttaaaaaatttaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 37178941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 23917615 - 23917328
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||   |||     ||    
T  23917615 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgtacgatttttttgagacaaatttagaatactatgaaaggttcattaactatttttt-----tt 23917521  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| |||||||||||   ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||        
T  23917520 tttaacatgaaacgaat---ataggaatttcttaaaacgacaaaagttaaaaataaaattaacacaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacaattt 23917424  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  23917423 tttgcagagaaacttttagtaatgttcttaacacgtttgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaacttgaattga 23917328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 42 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 32147271 - 32146996
Alignment:
Q  42 aaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattag 141  Q
    ||||||||||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  32147271 aaactcttaaatttttgaacgattttttggagacaagtttagaacactatgaaatgttcaattactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaa 32147172  T
Q  142 atatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagt 241  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||| ||||| || |||||||||||||||| |       ||  |||||||||||||    
T  32147171 atatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataagagtaataaaatatggacatataaatcaaattttgcgataattttttgcggaggaacttttagt 32147072  T
Q  242 aatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  32147071 aatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattagacaaatttgaattga 32146996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 50615084 - 50615366
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  50615084 aagtttgtttaattttccttaaactcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaaaaaaatttagaattt 50615183  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||| |         
T  50615184 tttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaaagtaataaaatatggacatataaatcaaattttgcggc----- 50615278  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
            ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  50615279 --------ggaacttttagtaatattcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattga 50615366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 30 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 11045691 - 11045404
Alignment:
Q  30 ttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||| |||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  11045691 ttaattatccttaaactcttaaatttttgtacgatttttttgagacaagtttagaatagtgagaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaccat 11045592  T
Q  130 gaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcata 229  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||       ||| |    
T  11045591 aaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttcaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgcgacaattttttgcaga 11045492  T
Q  230 ggaacttttagtaatgttcttaacacgtc-tgt-aaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaatt 315  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||| | |||  ||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  11045491 ggaacttttagcaattttcttaatacgacgtgtgcaaagaatgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaaattgaatt 11045404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 117447 - 117729
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||    
T  117447 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataaaatttaaatttt 117546  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||| |         
T  117547 tttaacatgaaacgaattaaaaatgaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaaagtaataaaatatggacatataaatcaaattttgcggc----- 117641  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
            |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  117642 --------ggaacttttagtaatgttcttaacacatctaaaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattga 117729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 29 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 19669988 - 19669699
Alignment:
Q  29 tttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aat 127  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||        ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||     
T  19669988 tttaattattcttgaactcttaaatttttgaacgattttttt-agacaagtttagaacactatcaaaggttcaattactaaaatttagaatttttttaac 19669890  T
Q  128 atgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngca 227  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||| | |       ||     
T  19669889 atgaaacgaattaaatacgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcaataactttttgcg 19669790  T
Q  228 taggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaac-tcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19669789 gaggaacatttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 19669699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 45235344 - 45235641
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||        |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  45235344 aagtttgtttaattatccataaactcttaaattttttaacggttttattgagacaagtttagaacactttgaaaggttcaattactaaaatttagaatat 45235443  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaa-gttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcga-cann 219  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||| || |||  |||| ||||| || |||| |||||||||||  |      
T  45235444 tttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttaaaaacgataaaattttaaagatacaagtaattaaatctggacatataaataaaattttgcgataaat 45235543  T
Q  220 nnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
         ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45235544 tttttgcggaggaacttttaataatgttcttaacacgtctataaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 45235641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 11294089 - 11293800
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11294089 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgacttcttttacacaagtttagaacactatgaaaagttcatttactaaaatttagaattt 11293990  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagtt-aaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 220  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||       
T  11293989 tttaagatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaatggtaaaagttaaaagataaaataaacaaaatctggacttagaaataaaattttgcaacaatt 11293890  T
Q  221 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaaca---cgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
        |||||||          |||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  11293889 ttttgcatagg----------aatgttcttaacacgtcgtctgcaaaaaattgttcaaaaattcaagagtttaagcatagattaaacagatttgaattga 11293800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 71 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 53397343 - 53397095
Alignment:
Q  71 gagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaata--tgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagt 168  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  53397343 gagaaaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttagaattttttaaaacatgaaacaaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagt 53397244  T
Q  169 taaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaat 268  Q
    |||||||| || ||| ||||| ||||| || |||||||||||||||| |       ||  ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  53397243 taaagatagaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcgataaatttttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtcgacaaaaaat 53397144  T
Q  269 tgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    |||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53397143 tgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 53397095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 311
Target Start/End: Original strand, 39562552 - 39562839
Alignment:
Q  25 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 124  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |        | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  39562552 tttgcttaattatccttaaactcttaaattttttaacaattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatttttt 39562651  T
Q  125 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaa-ttttgcgacannnnn 222  Q
    || ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |         
T  39562652 aacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataactaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttttgcgatattttt 39562751  T
Q  223 nngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttg 311  Q
       |  |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  39562752 tt-cggaggaccttttaataacgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttgaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttg 39562839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 45406955 - 45406701
Alignment:
Q  25 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45406955 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttataagaaaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttct 45406856  T
Q  125 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaaga-taaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnn 223  Q
    || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||             
T  45406855 aacatgaatcgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagattaaaagtaacaaaatctggatgtaaaaatcaaattttgcg--------- 45406765  T
Q  224 ngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaa 291  Q
         || |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  45406764 ----gagaaacttttagtaatgttctaaacatgtctgcaaaaaattgttcaaaaatttaagagtttaa 45406701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 32943281 - 32943000
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32943281 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagttttgaacactatgaaaggttcaattactaaaatttagaattt 32943182  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||| |||| |||| ||||||||     ||||||| ||         ||| || |||||||||||||||| |        
T  32943181 tttaatattaaaagaattaaatatgaat-ttttgaaacaacaaaagt----aataaaatcaa---------gacatataaatcaaattttgcgataattt 32943096  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       ||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32943095 tttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 32943000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 71 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 53439556 - 53439324
Alignment:
Q  71 gagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagtta 170  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  53439556 gagaaaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaa-tttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagtta 53439458  T
Q  171 aagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattg 270  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| || |||| ||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  53439457 aagataaaagtaataaaatttggacatataaataaaattttgcg-------------gaggaacttttagtaatgttcttaacacgtcgaaaaaaaattg 53439371  T
Q  271 ttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    || ||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53439370 ttaaaaaacgtaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 53439324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 46295345 - 46295051
Alignment:
Q  25 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 124  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||        | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  46295345 tttgcttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatttttt 46295246  T
Q  125 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgac-aaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaa-ttttgcgacannnn 221  Q
    || || |||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |        
T  46295245 aacattaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttttgcgatatttt 46295146  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
        |  |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  46295145 ttt-cggaggaccttttaataacgttcttaacacgtctgtaaaaatttgttgaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttggattga 46295051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 278
Target Start/End: Original strand, 44557579 - 44557822
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||   |||    
T  44557579 aagtttgtttaattatccttaatctcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataaaatttaattttt 44557678  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||              
T  44557679 tttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaataataaaagttaaagataaaagtaataaaatatggacatataaatcaaatttt---------- 44557768  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaa 278  Q
       |||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  44557769 ---gcagcggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaa 44557822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 89 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 19601777 - 19601549
Alignment:
Q  89 tatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaa 187  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||  ||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  19601777 tatgaaaggttcatttgctaaaatttagaattttttaacacgaaattaattaaatatgaatgttttaaaatgacaaaagttcaagataaaagtaacaaaa 19601678  T
Q  188 atttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagc 287  Q
    || |||| |||||||| ||||||||||| |       |   |||||||||||||||||||||||||| || || |||| | |||| ||||||  |||||     
T  19601677 atctggatgtagaaattaaattttgcgataattttttgtggaggaacttttagtaatgttcttaacatgtttgcaaaagaatgttaaaaaacataagagt 19601578  T
Q  288 ttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19601577 ttaaacat-aattaaacaaatttgaattga 19601549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 22 - 169
Target Start/End: Original strand, 23921075 - 23921220
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  23921075 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttttt-agataagtttataacactatgaaaggctcattttctaaaatttagaattt 23921173  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagtt 169  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23921174 tttaacatgaaa-gaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtt 23921220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 123 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 28685495 - 28685303
Alignment:
Q  123 ttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnn 222  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||              
T  28685495 ttaatattaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggtaaaagttaaagataaaattaataaaatttggacatataaattaaattttg-----atttt 28685401  T
Q  223 nngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattgatga 320  Q
       |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| || |||| |||||||||    
T  28685400 ttacggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcaaataattgttcaaaaacttaagagtttaagcataaattaatcacatttaaattgatga 28685303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 99 - 315
Target Start/End: Original strand, 54268922 - 54269138
Alignment:
Q  99 tcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgt 197  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||  ||| |||| |||||| |    
T  54268922 tcatttcctaaaatttagaattttttaacatgaaataaattaaatataaatttttttaaacgacaaaaaatcaagataaaagcaacaaaaaattggactt 54269021  T
Q  198 agaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataa 297  Q
    ||||||||||||||| || |        || ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |    
T  54269022 agaaatcaaattttgagataattttttacagaggaacttttagtaatgttcttaacacgcatgcaaaaaattgttcaaaaacttaagagtttaagcat-a 54269120  T
Q  298 attaaacaaatttgaatt 315  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  54269121 attaaccaaatttgaatt 54269138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 84 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9018253 - 9018125
Alignment:
Q  84 aacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaa 183  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  9018253 aacactgtgaaaggttcatttacaaaaatttagaattttttaacatgaaataaattcaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaataac 9018154  T
Q  184 caaaatttggacgtagaaatcaaattttg 212  Q
     ||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  9018153 aaaaatatggaagtaaaaatcaaattttg 9018125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 80 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 31991304 - 31991074
Alignment:
Q  80 ttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaa 179  Q
    |||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||| || ||||||    
T  31991304 ttagaacattacaaaaggtttgtttactaaaatttagaattttttaacatgaaataaattaaataagaatttttttaaaagacaaaagttcaaaataaaa 31991205  T
Q  180 ttaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaa 278  Q
     |||| |||||||||||| |||||| |||||||| || |       ||| |  ||||||| |||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||     
T  31991204 gtaacaaaaatttggacgcagaaataaaattttgagataagtttttgcaaataaacttttcgtaatgtttttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaat 31991105  T
Q  279 ctcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 310  Q
    || || || |||||||| ||||||||||||||    
T  31991104 cttaaaagtttaaacat-aattaaacaaattt 31991074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 34995823 - 34995564
Alignment:
Q  25 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnng-agacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttt 123  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||       | | |||   |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34995823 tttgtttaattatccttaaactattaaattttagaacgatttttttggaaacacttttagaacattataaaaggttcatttactaaaatttagaattttt 34995724  T
Q  124 taatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnn 223  Q
    ||| |||| | |||||| |||||| |||||| ||| ||||||| || ||||||||| | || ||  ||||||||||||||||| |||||    |          
T  34995723 taacatgagatgaattaaatatgattttttttaaatgacaaaatttcaagataaaagtcac-aagcttggacgtagaaatcaatttttgaactaattttt 34995625  T
Q  224 ngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaag 284  Q
     |   || |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34995624 cgtggagcaacttttagtaatgttttgaacacgtctataaaaaattgttcaaaaactcaag 34995564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 286
Target Start/End: Original strand, 44287768 - 44288027
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||       ||| |||  |||||| |  | | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44287768 aagtttgtttaattatccttaaattcataa-tttttgaacgatttttttgagtcaattttagaatatcacggaaggttcatttgctaaaatttagaattt 44287866  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 220  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||       | |       
T  44287867 tttaacatgaaatgaattaaatatgaatttttttaaacgacgaaggtttaagataaaagtaacaaaaaattggacgtagaattcaaa-------agataa 44287959  T
Q  221 nnnngcat--aggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagag 286  Q
        | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  44287960 ttttgtatggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtcaaaagttgttcaaaaacttaagag 44288027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 109 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 33475677 - 33475471
Alignment:
Q  109 aaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatt-tggacgtagaaatcaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| ||  |||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||    
T  33475677 aaatttagaattttttaatatgaaataaattaaatatggatttttttaatagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaattctggacgtagaaataaaa 33475578  T
Q  208 ttttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaa 307  Q
    ||||| || |       | | | |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| || || || |||| ||| |||||||||||    
T  33475577 ttttgtgataattttttgtagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaa 33475479  T
Q  308 tttgaatt 315  Q
    ||| ||||    
T  33475478 tttaaatt 33475471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 102 - 310
Target Start/End: Original strand, 41927919 - 41928126
Alignment:
Q  102 tttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtaga 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  |||||||||| || |||||| |||| |||||||||||| |||    
T  41927919 tttactaaaatttagaactttttaatatgaaataaattaaatatgaattttttaaa--gacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaaatttggacgcaga 41928016  T
Q  201 aatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttc-ttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaat 299  Q
    ||| ||||||||  | |       ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||| || || || |||| ||| |||    
T  41928017 aataaaattttgatataattttttgcatatgaacttttcgtaatgttctttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aat 41928115  T
Q  300 taaacaaattt 310  Q
    |||||||||||    
T  41928116 taaacaaattt 41928126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 109 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 44556125 - 44555919
Alignment:
Q  109 aaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatt-tggacgtagaaatcaaa 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| ||||||| ||  |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||    
T  44556125 aaatttagaattttttattatgaaataaattaaatatggatttttttaatagacaaaagttcaaaataaaattaacaaaattctggacgcagaaataaaa 44556026  T
Q  208 ttttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaa 307  Q
    ||||| || |       ||| | |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| || || || |||| ||| |||||||||||    
T  44556025 ttttgagataattttttgcagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaa 44555927  T
Q  308 tttgaatt 315  Q
    ||| ||||    
T  44555926 tttaaatt 44555919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 74 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 52701404 - 52701168
Alignment:
Q  74 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 173  Q
    ||||| |||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||     
T  52701404 acaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactaaaatttagaattatttagcatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaggacaaaagttcaaa 52701305  T
Q  174 ataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgtt 272  Q
    |||||| |||| ||||| | |||| | |||| |||||||| || |       | | | |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  52701304 ataaaagtaacaaaaatctagacgcataaataaaattttgagataattttttggagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtgtaaaaaattgtt 52701205  T
Q  273 caaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 310  Q
    ||||| || || || |||| ||| ||||||||||||||    
T  52701204 caaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 52701168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 74 - 310
Target Start/End: Original strand, 8575953 - 8576191
Alignment:
Q  74 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaa-ttttttaaaacgacaaaagttaaa 172  Q
    ||||| |||||||| ||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||    
T  8575953 acaagtttagaacattacaagaggttcgtttactaaaatttagaattttttaacatgaaatgaattaaatatgaattttttttaaaagacaaaagttcaa 8576052  T
Q  173 gataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagt-aatgttcttaacacgtctgtaaaaaattg 270  Q
     |||||| |||| ||||| | |||  |||||| |||||||| || |       ||||| ||||||||  | |||||||||||||| | || |||||||||    
T  8576053 aataaaagtaacaaaaatctagacacagaaataaaattttgagataattttttgcatatgaacttttcctaaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattg 8576152  T
Q  271 ttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 310  Q
    ||||||| || || || |||||||| ||||||||||||||    
T  8576153 ttcaaaatcttaaaagtttaaacat-aattaaacaaattt 8576191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 161 - 315
Target Start/End: Original strand, 15772003 - 15772157
Alignment:
Q  161 acaaaagttaaagataaaattaacaaaa-tttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtct 259  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |       ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15772003 acaaaagttcaagataaaagaaacaaaaatttcgacgtagaaatcaaattttgagataattttttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtct 15772102  T
Q  260 gtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaatt 315  Q
      ||||||||||| ||||||| ||||  |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  15772103 acaaaaaattgtttaaaaacttaagattttaagcat-aattaaacaaatttgaatt 15772157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 74 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 25232900 - 25232695
Alignment:
Q  74 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaa-ttttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaa 172  Q
    ||||| |||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||    
T  25232900 acaagtttagaacattagaaaaggttcgtttactaaaatttagaaattttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagtttaa 25232801  T
Q  173 gataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgt 271  Q
     |||||| |||| ||||| |||||| | |||| |||||||| || |       | | | ||| |||| |||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  25232800 aataaaagtaacaaaaatctggacgcataaataaaattttgagataattttttgtagatgaaattttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgt 25232701  T
Q  272 tcaaaa 277  Q
    ||||||    
T  25232700 tcaaaa 25232695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 74 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 41927501 - 41927361
Alignment:
Q  74 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 173  Q
    ||||| |||||||| ||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||     
T  41927501 acaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactgaaatttagaattttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaa 41927402  T
Q  174 ataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgc 213  Q
    |||||| |||| ||||| |||||| |||||| || ||||||    
T  41927401 ataaaagtaacaaaaatctggacgcagaaataaatttttgc 41927361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 232 - 315
Target Start/End: Original strand, 3173719 - 3173802
Alignment:
Q  232 aacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaatt 315  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  3173719 aacttatagtaatgttcttaacgcgtctgcaaaaaattgttcaaaaattcaagaatttaatcataaattaaacaaatttgaatt 3173802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 229 - 317
Target Start/End: Original strand, 37481262 - 37481351
Alignment:
Q  229 aggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaac-tcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  37481262 aggaacttttagtaatgttcttaacacatctataaaaaattgttaaaaaacattaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattga 37481351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 80 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 53377503 - 53377430
Alignment:
Q  80 ttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttt 153  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  53377503 ttagaacactctgaaaggttcatttactaaaatttagaattttctaacatggaacgaattaaatatgaattttt 53377430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 74 - 310
Target Start/End: Original strand, 33476241 - 33476477
Alignment:
Q  74 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 173  Q
    ||||| |||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||| |||||||| ||| |||||||||| ||     
T  33476241 acaagtttagaacattactaaaggttcgtttactaaaatttagaattttttaacatgaaataaattaaatataaatttttttaaaagacaaaagttcaaa 33476340  T
Q  174 ataaaa-ttaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgtt 272  Q
    |||||| | || ||||| |||||| |  ||| |||||||| || |       ||| |  ||||||| || |||||||||| || | || |||||||||||    
T  33476341 ataaaagtaaaaaaaatctggacgcatgaataaaattttgagataattttttgcagataaacttttcgtgatgttcttaatacctgtgcaaaaaattgtt 33476440  T
Q  273 caaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 310  Q
    ||||| || || || |||| ||| ||||||||||||||    
T  33476441 caaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 33476477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 163 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 45387566 - 45387449
Alignment:
Q  163 aaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgta 262  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||||| |       || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  45387566 aaaagtaaaagataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcgataattttttgcgtaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctaca 45387467  T
Q  263 aaaaattgttcaaaaact 280  Q
    |||||||||| |||||||    
T  45387466 aaaaattgttaaaaaact 45387449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 81 - 279
Target Start/End: Original strand, 26268629 - 26268826
Alignment:
Q  81 tagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaat 180  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||| |||    |||||||| || | | |||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||     
T  26268629 tagaacattatataaggttcatttactaaattttttttttttttaacataagatgaattaaatatgaattttttaa--cgacaaaagttcaagataaaag 26268726  T
Q  181 taa-caaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaac 279  Q
    |||  ||||| ||| |||||||||||||||||| |  |       ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||    
T  26268727 taataaaaatatgggcgtagaaatcaaattttgagctaattttttgcagagaaacttttagtaatgttcttaatacgtctacaaaaaattgttcgaaaac 26268826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 74 - 169
Target Start/End: Original strand, 44556687 - 44556782
Alignment:
Q  74 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagtt 169  Q
    ||||| |||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  44556687 acaagtttagaacattactaaaggttcgtttactaaaatttagaattttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagtt 44556782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 229 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 53377412 - 53377326
Alignment:
Q  229 aggaacttttagtaatgttctt--aacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaa 313  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  53377412 aggaacttttattaatgttcttttaacacgtctgcaaacaattgttcaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaa 53377326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 28055364 - 28055253
Alignment:
Q  102 tttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtaga 200  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |    
T  28055364 tttattaaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaa 28055265  T
Q  201 aatcaaattttg 212  Q
    ||| ||||||||    
T  28055264 aataaaattttg 28055253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 28065789 - 28065678
Alignment:
Q  102 tttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtaga 200  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |    
T  28065789 tttattaaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaa 28065690  T
Q  201 aatcaaattttg 212  Q
    ||| ||||||||    
T  28065689 aataaaattttg 28065678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 248 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 116993 - 116924
Alignment:
Q  248 cttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    |||||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  116993 cttaacacatctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 116924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 869446 - 869551
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  869446 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 869545  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  869546 attttg 869551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 3078374 - 3078479
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  3078374 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 3078473  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  3078474 attttg 3078479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 4994099 - 4994204
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  4994099 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatgtttttaaaacgccaaaaattaaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 4994198  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  4994199 attttg 4994204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10182332 - 10182227
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  10182332 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 10182233  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  10182232 attttg 10182227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 30778858 - 30778753
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  30778858 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 30778759  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  30778758 attttg 30778753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 34226131 - 34226026
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  34226131 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttggacctaaaaataaa 34226032  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  34226031 attttg 34226026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 36777869 - 36777974
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  36777869 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 36777968  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  36777969 attttg 36777974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 248 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 44555433 - 44555364
Alignment:
Q  248 cttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    |||||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44555433 cttaacacatctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 44555364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 45454337 - 45454442
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  45454337 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 45454436  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  45454437 attttg 45454442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 50362393 - 50362498
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  50362393 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 50362492  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  50362493 attttg 50362498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 248 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 50614615 - 50614546
Alignment:
Q  248 cttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    |||||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50614615 cttaacacatctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 50614546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 51324800 - 51324695
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||| |||| | ||||||||||| |||||| || ||||||||| |||| |||||||| || || |||| ||    
T  51324800 aaaaattagaattttttaatatgtaatgaattaaatataatttttttaaaactacaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttgaacctaaaaataaa 51324701  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  51324700 attttg 51324695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 53328515 - 53328620
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  53328515 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 53328614  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  53328615 attttg 53328620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 8575466 - 8575373
Alignment:
Q  29 tttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttt 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||       || ||||| |||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8575466 tttaactatccttaaactcttaaattttttaacgaattttttgatacaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactaaaatttagaatttt 8575373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 212
Target Start/End: Original strand, 16644630 - 16644729
Alignment:
Q  113 ttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttg 212  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||| ||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||||||||| || |||| ||||||||    
T  16644630 ttagaattttttaacatgtaatgaattaaatataattttttttaaacgccaaaaattcaagataaaactaagaaaatttggacctaaaaataaaattttg 16644729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 191
Target Start/End: Original strand, 53658005 - 53658088
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaattt 191  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  53658005 aaaaattagaattttttaacatttaacgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacaaaattt 53658088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1487053 - 1486948
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||| | |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  1487053 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaatcaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 1486954  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  1486953 attttg 1486948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15490861 - 15490756
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||  || |||| ||    
T  15490861 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgtcaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggatctaaaaataaa 15490762  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  15490761 attttg 15490756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 31269587 - 31269692
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaa-ttaacaaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| | |  ||||||||||| || |||| ||    
T  31269587 aaaaattagaattttttaatatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactgatgaaaatttggacctaaaaataaa 31269686  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  31269687 attttg 31269692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 40126990 - 40126885
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||| | ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  40126990 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaatgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 40126891  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  40126890 attttg 40126885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 47198987 - 47199092
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||  || |||| ||    
T  47198987 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggatctaaaaataaa 47199086  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  47199087 attttg 47199092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 49612279 - 49612384
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | ||||||||||||  |||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  49612279 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgctaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 49612378  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  49612379 attttg 49612384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 63
Target Start/End: Original strand, 54268854 - 54268895
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacga 63  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54268854 aagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacga 54268895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 113 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 45344125 - 45344025
Alignment:
Q  113 ttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaatttt 211  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | ||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  45344125 ttagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttataacgccaaaagttcaagataaaactaacgaaaatttgaacctaaaaataaaatttt 45344026  T
Q  212 g 212  Q
    |    
T  45344025 g 45344025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 23878600 - 23878706
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaatttt-ttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatca 205  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||| |||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| |    
T  23878600 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataattttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataa 23878699  T
Q  206 aattttg 212  Q
    |||||||    
T  23878700 aattttg 23878706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 55006250 - 55006152
Alignment:
Q  115 agaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 212  Q
    |||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||  ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||||||||    
T  55006250 agaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacaccaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttggacctaaaaataaaattttg 55006152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 24342668 - 24342773
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||| ||||| | ||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  24342668 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttgaaacgccgaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 24342767  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  24342768 attttg 24342773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 33391028 - 33391133
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | ||||| |||||| ||||| ||  |||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  33391028 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataattttttaaaaacgccaaaaatttgagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 33391127  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  33391128 attttg 33391133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 43127787 - 43127682
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaa-caaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||| ||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||  ||||||||||| || |||| ||    
T  43127787 aaaaattagaactttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaatgaaaatttggacctaaaaataaa 43127688  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  43127687 attttg 43127682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 43660412 - 43660517
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||  |||||||| | || |||| ||    
T  43660412 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgtaaatttggtcctaaaaataaa 43660511  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  43660512 attttg 43660517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 43729766 - 43729870
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || | ||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  43729766 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatat-atttttttaaaacgccaaaaattcatgataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 43729864  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  43729865 attttg 43729870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 50133629 - 50133524
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||  ||| ||    
T  50133629 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaatctaacgaaaatttggacttaagaataaa 50133530  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  50133529 attttg 50133524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 53947560 - 53947664
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| ||||||||||||   ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  53947560 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatat-aattttttaaaaacgcaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 53947658  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  53947659 attttg 53947664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 32245835 - 32245747
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggac 195  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || || |||||| |||| |||||||||||    
T  32245835 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaatataaaactaacgaaaatttggac 32245747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 32800008 - 32799933
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac 184  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||| |||    |||||||| ||||||||||||||    
T  32800008 aaaatttagaattttttaatatggaatgaattaagtatgaatttttgaaattt-caaaagtttaagataaaattaac 32799933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 108 - 191
Target Start/End: Original strand, 4735774 - 4735857
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaattt 191  Q
    |||| |||||||||||||| ||  || |||||| ||||  ||||||||||||| ||||| || || |||||| |||||||||||    
T  4735774 aaaaattagaattttttaacatctaatgaattaaatatatattttttaaaacgccaaaaattcaaaataaaactaacaaaattt 4735857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 34442224 - 34442130
Alignment:
Q  119 ttttttaatatgaaacgaattagatatgaatttttt-aaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaa-aatttggacgtagaaatcaaatttt 211  Q
    |||||||| ||| || |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||| || |||||| || || |||| |||||||    
T  34442224 ttttttaacatgtaatgaattaaatatgaatttttttaaaacgtcaaaattttaagataaaattaataagaatttgtacctaaaaattaaatttt 34442130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 37126874 - 37126980
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaatttt-ttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatca 205  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||| | |||| | |||| |||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| |    
T  37126874 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaatcaaatataattttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataa 37126973  T
Q  206 aattttg 212  Q
    |||||||    
T  37126974 aattttg 37126980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 9018313 - 9018280
Alignment:
Q  25 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttg 58  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9018313 tttgtttaattatacttaaactcttaaatttttg 9018280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 55
Target Start/End: Original strand, 15771903 - 15771936
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaattt 55  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15771903 aagtttgtttaattatccttaaactcttatattt 15771936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 208
Target Start/End: Original strand, 16128533 - 16128634
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||| |  |||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  16128533 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaatgcaaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 16128632  T
Q  207 at 208  Q
    ||    
T  16128633 at 16128634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 19878390 - 19878494
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||| ||||| ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  19878390 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataattttttttaaacgccaaaaattcaagataaacctaacgaaaatttggactta-aaataaa 19878488  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  19878489 attttg 19878494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 30786676 - 30786571
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||| ||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||  | ||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  30786676 aaaaattagaaatttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacatcgaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 30786577  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  30786576 attttg 30786571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 42367748 - 42367853
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||| ||||| ||||| || || |||||  |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  42367748 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataattttttttaaacgccaaaaattcaaaataaacctaacaaaaatttggacttaaaaataaa 42367847  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  42367848 attttg 42367853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 20078136 - 20078100
Alignment:
Q  25 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaac 61  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  20078136 tttgtttaattattcttaaactcttcaatttttgaac 20078100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0445 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0445
Description:

Target: scaffold0445; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 22 - 314
Target Start/End: Original strand, 5917 - 6209
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||       |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5917 aagtttgtttaattatccttaaactcttgattttttgaacgatttttttgagacaagtttggaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 6016  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||        
T  6017 tttaacatcaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggaaaaagttaaagataaaattaacaaaatctgaacgtagaaatcaaattttgcgacaattt 6116  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaat 314  Q
       |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6117 tttgcatagtaacttttagtaatgttcttaacacgtttgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaat 6209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 85)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 22 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 10357610 - 10357318
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10357610 aagtttgtttaattatctttaaactcttaaatttttgaacgattttttttagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 10357511  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    |||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||        
T  10357510 tttaaccttaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggtaaaagttaaagataaaattaacaaaatctgggcgtagaaatcaaatttttcgacaattt 10357411  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaat 314  Q
       ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  10357410 tttgcagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaat 10357318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 7439515 - 7439220
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||       |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7439515 aagtttgtttaattattcttaaactcttaaatttttaaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttagtaaaatttagaattt 7439416  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||        
T  7439415 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaattaaattttgcgacaattt 7439316  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       | | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  7439315 tttgtagaggaacttttagtaatgttcttgacacgtcagtaaaaaattgttcaaaaacacaagagtttaagcataaattaaaaaaaattgaattga 7439220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 25 - 317
Target Start/End: Original strand, 42274304 - 42274596
Alignment:
Q  25 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  42274304 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttaagacaagtttagaacattatgaaaggttcatttaccaaaatttagattttttt 42274403  T
Q  125 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnn 224  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||           
T  42274404 aatatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatctagacatagaaatcaaattttgcgacaatttttt 42274503  T
Q  225 gcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||  |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42274504 gcagaggaacttttagtaatgtttttaacacgtctgcaaaaatttgtttgaaaactcatgagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 42274596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 3043361 - 3043656
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||       |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  3043361 aagtttgtttaattatccttaaactcataaattttttaacgaattttttgagacaagtttagaacaatatgaaaggttcatttactaaaattcagaatat 3043460  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||        
T  3043461 tttaacataaaactaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgccacaattt 3043560  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       ||| || | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3043561 tttgcagagtagcttttagtaatgtttttaacacgtctgcaaaaaattgttcaataattcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 3043656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 33832124 - 33832418
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||         |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33832124 aagtctgtttaattatccttaaactcttaaatttttaaacgatttttttatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 33832223  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||        
T  33832224 tttaa-atgaaacgaattaaatatgaattttttaaaatgacaaaagtataagataaaattaacaaattctggacgtacaaatcaaattttgcgacaattt 33832322  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       | | |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33832323 tttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 33832418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 73 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 25666282 - 25666038
Alignment:
Q  73 gacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaa 172  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  25666282 gacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttaattttttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaaattaaa 25666183  T
Q  173 gataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgtt 272  Q
      ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25666182 agtaaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgcgacaatttttcgcataggaacttttagtaatgttcttaatacgtctgtaaaaaattgtt 25666083  T
Q  273 caaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  25666082 caaaaactcaagagtttaaatataaattaaataaatttgaattga 25666038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 22 - 314
Target Start/End: Original strand, 8737811 - 8738104
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||         ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||    
T  8737811 aagtttatttaattatccttaaaatcttaaatttttgaacggttttttttagaaaagtttagaacactatgaaaggttcgtttactaaaatttaaatttt 8737910  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgac-annn 220  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       
T  8737911 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacagcaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacaattt 8738010  T
Q  221 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaat 314  Q
        ||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  8738011 ttttgcagagaaacttttcgtaatgtttttaacacgtctgtataaaattgttcaaaaactcaagaatttaagcataaattaaacaaatttgaat 8738104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 31771611 - 31771316
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  31771611 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgacacaagtttagaacactatgaaagtttcatttactaaaatttaaaattt 31771512  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||| ||||||||| | |        
T  31771511 tttaacatgaaatgaattaaatatgaatttttgaaaacgacaaaagttaaagataaaagtaataaaatctggatgtagaaattaaattttgcaataattt 31771412  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  31771411 tttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtttacaaaaaattgttcaaaaacttaagagtttatgcatcaattaaacaaatttgaattga 31771316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 38 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 41121016 - 41120738
Alignment:
Q  38 ccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaa 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||        ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  41121016 ccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttaagacaagtttagaacactatgaaaagttcatttaccaaaatttagacttttttaacatgaaacgaa 41120917  T
Q  138 ttagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttt 237  Q
    ||| ||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||       ||| |||||||||    
T  41120916 ttaaataagaattttttaaa-cggcaaaaattaaagataaaattaacaaaatatggacgtagaaatcaaatttcacgacaattttttgcagaggaacttt 41120818  T
Q  238 tagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41120817 tagtaatgttcttaacacgtctgcaaaaaattgtttaaaaactcaaaagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 41120738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 43932734 - 43933029
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  43932734 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagagaagtttagaacaatatgaaaggttcaattattaaaatttagaattt 43932833  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||||| |        
T  43932834 tttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagtgaaagataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcgataattt 43932933  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       ||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43932934 tttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattattaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 43933029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 22 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 31436332 - 31436045
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||         |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31436332 aagtttgtttaattatccttaaacacttaaatttttgaacgatttttttatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 31436233  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||        
T  31436232 tttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttt-aaatgacaaaagttaaagataaaattaacaaattctgaacgtagaaatcaaattttgcaacaattt 31436134  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 310  Q
       | | | |||||||||||| ||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  31436133 tttgtagatgaacttttagtattgttcttagtacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaattt 31436045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 25100879 - 25100585
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||    
T  25100879 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttt-gagacaagtttagaacactatgaaaggttcacttactaaaatttaattttt 25100781  T
Q  122 tttaat-atgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 220  Q
    ||| |  |||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||       
T  25100780 ttttagcatgaaacgaaataaatatgaatcttttaaaacggcaaaagttaaagctaaaattaacaaaatctgaacgtaaaaatcaaatttagcgacaatt 25100681  T
Q  221 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  25100680 ttttgcagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaatattgttcaaaaacttaagagattaca-ataaattaaacaaatttgaattga 25100585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 30784470 - 30784185
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |       |||||||| |||||||||        |||||||||||||||||||||||||    
T  30784470 aagtttgtttaattatcctaaaattcttaaatttt-gaacaatatttttgagacaagtttagaacac--------gttcatttactaaaatttagaattt 30784380  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||        
T  30784379 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaatatggacgtagaaatcaaattttgcgacaatta 30784281  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       ||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30784280 tttgcagatgagcttttagtaatgttcttaacacgtctgcaaaaaattgttctaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 30784185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 80 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 6457504 - 6457266
Alignment:
Q  80 ttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaa 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6457504 ttagaacactatgaaaggttcatttactaaaacttagaatttttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaa 6457405  T
Q  179 attaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaa 278  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||         ||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  6457404 attaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttacgaattttttttgcagaggagcttttattaatgttctcaacacgtcttcaaaaaattgttcaaaaa 6457305  T
Q  279 ctcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6457304 ctcaagagtttaaccataaattaaacaaatttgaattga 6457266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 40364884 - 40365179
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||        ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40364884 aagtttgtttaactatcctcaaactcttaaatttttgaacgatttttttaagacaagtttagaacactattgaaggttcatttactaaaatttagaattt 40364983  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||        
T  40364984 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaagtaacaaaatatggacgtataaatcaaattttgtgacaattt 40365083  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagag-cttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       ||  | ||||||||||||||||||||||||  |  | ||||||||| || |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40365084 tttgccgatgaacttttagtaatgttcttaacatataagcaaaaaattg-tccaaaactcaagggttttaaacataaattaaacaaatttaaattga 40365179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 44286684 - 44286978
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||       |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  44286684 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaacttttgaacgatttttttgagacaaatttagaacactatgaaagattcatttactaaaatttacaattt 44286783  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| |||||||||||||    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||        
T  44286784 tttaacatgaaacgaatta----tgaattttttaaaacgccaaaacttaaagataaaattaacaaaatctgaacgtagaaatcaaatttagcgacaattt 44286879  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagctta---aacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
         | | |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||   |  ||||||||||||||||||||||||    
T  44286880 tttttaaatgaacttttagtaatgtgcttaacacgtccgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagtattataaattaaacaaatttgaattga 44286978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 20721229 - 20721511
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  20721229 aagtttgtttaattatcgttaaactcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataaaatttagaattt 20721328  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||| | |         
T  20721329 tttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaaagtaataaaatatggacatataaatcaaattttgtggc----- 20721423  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  20721424 --------ggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattga 20721511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 44493179 - 44492883
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  44493179 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttattgagataagtttagaactctatgaaaggttcaattactaaaatttataatat 44493080  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacg-acaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 220  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||||| |       
T  44493079 tttaacatcaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgaaaaaaagttaaagataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcgataatt 44492980  T
Q  221 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
        |||  | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  44492979 ttttgcagggaaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttcaacataacttaaacaaatttgaattga 44492883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 80 - 317
Target Start/End: Original strand, 37592937 - 37593171
Alignment:
Q  80 ttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaa 179  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  37592937 ttagaacaccatgaaaagttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacggattaaatatgaattt---aaaatgacaaaagttaaagataaaa 37593033  T
Q  180 ttaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaac 279  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||       ||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  37593034 ttaacaaaatttgaacgtaaaagtcaaattttgcggcaattttttgcaaaggaacttttagtaatattcttaacacagctgcaaaaaattgttcaaaaac 37593133  T
Q  280 tcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    ||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37593134 tcaggaatttaagcataaattaaacaaatttgaattga 37593171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 194
Target Start/End: Original strand, 13371995 - 13372167
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13371995 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttttttagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaaatt 13372094  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttgga 194  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  13372095 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaataaacaaaatctgga 13372167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 72 - 315
Target Start/End: Original strand, 36512025 - 36512269
Alignment:
Q  72 agacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaa 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||| || |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  36512025 agacaagtttagaacactatgaaatgtttattttctaaaatttagaattttgtaacataaaacaaattaaatatggattttttaaaacgacaaatgttaa 36512124  T
Q  172 agataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgt-ctgtaaaaaattg 270  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||        || || ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  36512125 agataaaattaataaaatctggatgtaaaaatcaaattttgcgacaattttttacagagaaacttttagtaatattcttaacacgtcctgcaaaaaattg 36512224  T
Q  271 ttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaatt 315  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  36512225 ttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaattagaatt 36512269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 42487668 - 42487963
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||       |||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| | |||    
T  42487668 aagtttgtttgattatctttaaactcttaaatttttgaatgatttttttgagacaagtttaaaacgctatgaaaggttcaattactaaaatttaaatttt 42487767  T
Q  122 ttt-aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 220  Q
    ||| || |||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||         
T  42487768 ttttaacatgaaatgaattcaatatgaattttttaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatatggacatataaatcaaattttgcgattatt 42487867  T
Q  221 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
        ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42487868 ttttgcagaggaacttttaataatgttcttaacacatctacaaaaaattgtt-aaaaaattaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 42487963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 21439832 - 21440114
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||    
T  21439832 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataaaatttaaatttt 21439931  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    |||||  |||||||||||| |||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||  | |         
T  21439932 tttaacttgaaacgaattaaatataaatttttaaaaacaataaaagttaaagataaaagtaataaaatatggacatataaatcaaattttatggc----- 21440026  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
            |||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21440027 --------ggaacttttagtaatgttcttaacacgattacaaaaaattgtttaaaaacttaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattga 21440114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 33031345 - 33031165
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  33031345 aagtttgtttaattatccttaaattcttaaatttttgaacgatttttttaagacaagtttagaacactataaaaggttcatttaccaaaatttagatttt 33031246  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaat 203  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  33031245 tttaacatgaaacgaatta-atatgaattttttaaaacggaaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtaaaaat 33031165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 20720236 - 20719949
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||       |||||||| |||||||||       |||||| |||||||||||||||||||    
T  20720236 aagtttgtttaattatttttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacac-------ggttcaattactaaaatttagaattt 20720144  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcga-cannn 220  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| || || || ||||||||||||||||  |       
T  20720143 tttaatttgaaatgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctgaacatataaatcaaattttgcgattattt 20720044  T
Q  221 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgt-aaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
        ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||    || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20720043 ttttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctataaaaaaattgttaaaaaact---tagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 20719949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 137 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 35498768 - 35498588
Alignment:
Q  137 attagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaactt 236  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||       | | || |||||    
T  35498768 attaaatatgaatttttaaaaatgacaaaagttaaagataaaattaacaaattctggacgtagaaatcaaatttcgcgacaattttttgtagagaaactt 35498669  T
Q  237 ttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35498668 ttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaacaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 35498588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 306
Target Start/End: Original strand, 44879718 - 44879995
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||        ||||||  |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||    
T  44879718 aagtttgtttaactatctctaaactcttaaatttttgaacgatttttttaagacaaatttagaacactatgaaaagttcatttaacaaaatttagatttt 44879817  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||        
T  44879818 tttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttt------tcaaaagttagagataaagttaagaaaatctggacata-aaatcaaattttgcgacaaatt 44879910  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaa 306  Q
       ||| |  |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  44879911 tttgcacataaacttttagtaatgatcttaacacatctgcaaaaaattgtttaaaaactcaaaagtttaagcataaattaaacaa 44879995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 93 - 259
Target Start/End: Original strand, 29809401 - 29809567
Alignment:
Q  93 aaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttg 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29809401 aaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaaggaattaaatatgatttttttaaaacgacaaaagttaatgataaaattaacaaaatttg 29809500  T
Q  193 gacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtct 259  Q
    || |||||||||| ||||||||| |       | | | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29809501 gatgtagaaatcagattttgcgataattttttgtagatgaacttttagtaatgttcttaacaagtct 29809567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 315
Target Start/End: Original strand, 14200964 - 14201260
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14200964 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacaatttttctgagacaagcttagaacattacaaaaggttcatttaataaaatttagaattt 14201063  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatat-gaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaa-ttaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgaca-- 217  Q
    ||||| |||||| |||||| |||| || |||||| ||| |||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||||| || |      
T  14201064 tttaacatgaaatgaattaaatatggattttttttaaatgacaaaagttcaagataaaagcaaaaaaaaattggacgtagaaatcaaattttgagataat 14201163  T
Q  218 nnnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaatt 315  Q
            |  | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||| ||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  14201164 tttttttacggatgaacttttagtaatgttcttaacacggctacaaaaaattattcacaaacttaagagtttaagcat-aattaaacaaatttgaatt 14201260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 71 - 317
Target Start/End: Original strand, 34073621 - 34073865
Alignment:
Q  71 gagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagtta 170  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34073621 gagacaagtttagaacactaagaaagattcatttaataaaatttagaattttctaacaagaaacgaattaaatatgaattttttaaaactacaaaagtta 34073720  T
Q  171 aagat-aaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaatt 269  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |           ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  34073721 aagataaaaagtaacaaaatatggatgtagaaattaaattttgcgataattttttatggaggaacttttagtaatgttctaaacatgtctgcaaaaaatt 34073820  T
Q  270 gttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    ||| |||||  |||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||    
T  34073821 gttgaaaaa--caagagtttaggcataaa-taaacaaatttaaattga 34073865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 18672486 - 18672342
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  18672486 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttataattt 18672387  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaa 166  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  18672386 tttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaagacgataaaa 18672342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 73 - 286
Target Start/End: Original strand, 33000913 - 33001125
Alignment:
Q  73 gacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaa 171  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  33000913 gacaagtttagaacaatatgaaatgttcaattactaaaatttagaatttttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaa 33001012  T
Q  172 agataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgt 271  Q
    ||| |||| | |  |||| ||||| ||  ||||||||||||||| |       ||  || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  33001013 agagaaaagt-attaaatctggacata-taatcaaattttgcgataattttttgcggagtaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgt 33001110  T
Q  272 tcaaaaactcaagag 286  Q
    | ||||||| |||||    
T  33001111 taaaaaacttaagag 33001125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 237 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 33031165 - 33031087
Alignment:
Q  237 ttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaatt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33031165 ttagtaatgttcttaacacgtctgcaaaaaattgtttaaaaattcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaatt 33031087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 102 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 32318432 - 32318223
Alignment:
Q  102 tttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtaga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| || |||||| |||| ||||| |||||| |||    
T  32318432 tttaataaaatttagaattttttaatatgaaataaattaaatatgaatttttttaatagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaaatctggacgcaga 32318333  T
Q  201 aatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctg-taaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaat 299  Q
    ||| |||||||| || |       ||| | |||||||| |||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||| || || || |||| ||| |||    
T  32318332 aataaaattttgagataatcatttgcagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aat 32318234  T
Q  300 taaacaaattt 310  Q
    |||||||||||    
T  32318233 taaacaaattt 32318223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 317
Target Start/End: Original strand, 8392337 - 8392622
Alignment:
Q  25 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggtt-agaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||          ||||||| || |||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  8392337 tttgtttaattatccttaaactcttaaacttttcaac----------agacaagttttagaacaatataaaaggttcatttaataaaatctagaattttt 8392426  T
Q  124 taatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgc-gacannnn 221  Q
    |||  |||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||| |||| ||||| |  || |||||||||| ||||   || |        
T  8392427 taacgtgaaataaattaaatatgaatttttgtaaacgacaaaagtttcagataaaagtaaccaaaatgtacacatagaaatcaattttttatgatattct 8392526  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
           || |||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  8392527 tttatggagaaacttttaataacattcttaacacgtttgtaaaaaattgttgaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttggattga 8392622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 229 - 317
Target Start/End: Original strand, 20719238 - 20719326
Alignment:
Q  229 aggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||  |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20719238 aggaacttttagtaatgttcttaacacgtcaacaaaaaattgttagaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 20719326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 74 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3118216 - 3117981
Alignment:
Q  74 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 173  Q
    ||||| |||||||| ||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||     
T  3118216 acaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactaaa-tttagaattttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaa 3118118  T
Q  174 ataaaa-ttaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgtt 272  Q
    |||||| | || ||||| | |||| |||||| |||||||| ||         ||| | |||||||| |||||||||||||||  | || || || |||||    
T  3118117 ataaaagtaaaaaaaatctagacgcagaaataaaattttgagattattttttgcagatgaacttttcgtaatgttcttaacatttgtgcaataatttgtt 3118018  T
Q  273 caaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 310  Q
    ||||| || || || |||||||| ||||||||||||||    
T  3118017 caaaatcttaaaagtttaaacat-aattaaacaaattt 3117981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 80 - 310
Target Start/End: Original strand, 32319001 - 32319232
Alignment:
Q  80 ttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaa 178  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  32319001 ttagaacattactaaaggttcatttactaaattttagaatttttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaaataaa 32319100  T
Q  179 attaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaa 277  Q
    | |||| ||||| |||||| || ||| || ||||| || |       ||| |  |||||||  | ||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  32319101 agtaacaaaaatctggacgcaggaataaatttttgagataattttttgcagataaacttttcatgatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaa 32319200  T
Q  278 actcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 310  Q
     || || || |||| ||| ||||||||||||||    
T  32319201 tcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 32319232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 188
Target Start/End: Original strand, 19058643 - 19058808
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |        |||||    ||||||| ||| |||| | |||||| |||||||||||||||    
T  19058643 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttaaacaatttttagtagacacatctagaacattataaaagatccatttattaaaatttagaattt 19058742  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaa 188  Q
    ||||| |||| |  || || |||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  19058743 tttaacatgagattaactaaatatgaatttgtttaaacgac-aaagtttaagataaaagtaacaaaa 19058808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23496852 - 23496666
Alignment:
Q  25 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 124  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||| |       |||||| | |  ||||| ||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  23496852 tttgttttattatccttaaacttttgaattttttaacaattttttggagacacgttatgaacattataaaatgttcatttactaaaatatataatttttt 23496753  T
Q  125 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattt 210  Q
    || |||| | |||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||| |||  |||| ||||| |||| ||| |||||||||||    
T  23496752 aacatgagatgaattaaatttgaatttttttaaacgacaaaagtttaagacaaagataacaaaaatgtggaagtataaatcaaattt 23496666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 235 - 317
Target Start/End: Original strand, 7654925 - 7655007
Alignment:
Q  235 ttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    |||||||||||||||||| | || || |||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  7654925 ttttagtaatgttcttaatatgtttgcaaaaaactattcaaaaactcaagagtttaaccataaattaaacaaatttaaattga 7655007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 310
Target Start/End: Original strand, 13027445 - 13027735
Alignment:
Q  25 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaat-tttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       |||||| | |||||||| ||| |||||||| |||||||||||| | | | ||||    
T  13027445 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacaatttttcggagacacgtttagaacattataaaaggttcgtttactaaaattgaaattctttt 13027544  T
Q  124 taatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnn 223  Q
    ||| |||| | ||||||  ||| ||  |||||||  |||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||| | ||||||||||| |             
T  13027545 taacatgagatgaattaagtataaaaattttaaat-gacaaaagtttaagataaaataacaaaaatttggacgtaaagatcaaattttgtgctttttttt 13027643  T
Q  224 ngcat------aggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 310  Q
        |      |||||||| |||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||| ||| | |||| ||| ||||||||||||||    
T  13027644 tttttttttggaggaacttatagtaatgttcttaacaaatgtataaaaaattgttcaaaaacttaagtgtttaagcat-aattaaacaaattt 13027735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 9111777 - 9111571
Alignment:
Q  109 aaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatt-tggacgtagaaatcaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| ||  |||||||||| || |||||| ||||||||||  ||| | | |||| |||    
T  9111777 aaatttagaattttttaatatgaaataaattaaatatggatttttttaatagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaattcgggatgcaaaaataaaa 9111678  T
Q  208 ttttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaa 307  Q
    ||||| || |       | | | |||||||| |||||||||||||||| | || ||||| |||||| ||| || || || |||| ||| |||||||||||    
T  9111677 ttttgagataattttttgtagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaagttgttctaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaa 9111579  T
Q  308 tttgaatt 315  Q
    ||| ||||    
T  9111578 tttaaatt 9111571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 20701330 - 20701256
Alignment:
Q  243 atgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20701330 atgttcttaatacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaaaagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 20701256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 211
Target Start/End: Original strand, 9737488 - 9737593
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaatttt-ttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatca 205  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || |||| |    
T  9737488 aaaacttagaattttttaacatgtaatgaattaaatataaatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaattaacgaaaatttggacctaaaaataa 9737587  T
Q  206 aatttt 211  Q
    ||||||    
T  9737588 aatttt 9737593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12620442 - 12620337
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  12620442 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 12620343  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  12620342 attttg 12620337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13803394 - 13803289
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  13803394 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 13803295  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  13803294 attttg 13803289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16709247 - 16709142
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  16709247 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaatttaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 16709148  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  16709147 attttg 16709142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20973352 - 20973247
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  20973352 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttggacctaaaaataaa 20973253  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  20973252 attttg 20973247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 252 - 317
Target Start/End: Original strand, 23787773 - 23787838
Alignment:
Q  252 acacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23787773 acacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 23787838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 96
Target Start/End: Original strand, 29809254 - 29809328
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaag 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||       |||||||| ||| |||||||||||||    
T  29809254 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttggaacgatttttttgagacaagtttaaaacactatgaaag 29809328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 35498847 - 35498806
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacga 63  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35498847 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacga 35498806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 45301262 - 45301367
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||| |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| || |||| ||    
T  45301262 aaaaattagaaatttttaacatgaaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataagattaacgaaaatttggacctaaaaataaa 45301361  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  45301362 attttg 45301367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 212
Target Start/End: Original strand, 35516308 - 35516408
Alignment:
Q  113 ttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaatttt 211  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||  || |||| |||||||    
T  35516308 ttagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaagttcaagataaaactaacgaaaatttggatctaaaaataaaatttt 35516407  T
Q  212 g 212  Q
    |    
T  35516408 g 35516408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 315
Target Start/End: Original strand, 4327812 - 4327898
Alignment:
Q  226 cataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaatt 315  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||   |||||||||| || || || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  4327812 cataggaatttttagtaatgttctaaatacgtctgcaaa---ttgttcaaaagcttaatagtttaagcataaattaaacaaatttgaatt 4327898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 41178808 - 41178709
Alignment:
Q  114 tagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 212  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||||||||    
T  41178808 tagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaattttg 41178709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7401762 - 7401657
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| || |||| ||    
T  7401762 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattacatataattttttttaaacgccaaaaattcaagataaacttaacaaaaatttggacttaaaaataaa 7401663  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  7401662 attttg 7401657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 14542151 - 14542256
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaa-ttaacaaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || |||| ||    
T  14542151 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaaagaaaatttggacctaaaaataaa 14542250  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  14542251 attttg 14542256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 36218735 - 36218630
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| ||| |||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  36218735 aaaaattataattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 36218636  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  36218635 attttg 36218630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 37850427 - 37850322
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||  || |||| ||    
T  37850427 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacggcaaaaatttaagataaaactaacgaaaatttggatctaaaaataaa 37850328  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  37850327 attttg 37850322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 122
Target Start/End: Original strand, 3118639 - 3118732
Alignment:
Q  29 tttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttt 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||       || ||||| |||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3118639 tttaactatccttaaactcttaaaatttttaacgaattttttgatacaagtttagaacattacaaaaggtttatttactaaaatttagaatttt 3118732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 3855014 - 3854934
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaa 188  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||    
T  3855014 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgtcaaaaattcaagataaaactaacaaaa 3854934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 262 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 21439351 - 21439296
Alignment:
Q  262 aaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  21439351 aaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaataaatttgaattga 21439296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 36881308 - 36881180
Alignment:
Q  29 tttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaata 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||         |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||   |||||||| |    
T  36881308 tttaattatccttaaactctaaaaattttgaatgatttttttttgacaagtttagaacgctatgaaaggttcaataactaaaatttaattttttttaaca 36881209  T
Q  129 tgaaacgaattagatatgaattttttaaa 157  Q
    | ||| |||||| || ||||| |||||||    
T  36881208 taaaatgaattaaatgtgaatgttttaaa 36881180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 310
Target Start/End: Original strand, 32319595 - 32319809
Alignment:
Q  97 gttcatttactaaaatttagaa-ttttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttgga 194  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||  ||||| |||||| |||||| ||| |  ||||||| || |||||| |||| ||||| ||||    
T  32319595 gttcgtttactaaaatttataatttttttaacatgaaataaattaaatatgattttttttaaaagtgaaaagttcaaaataaaagtaacaaaaatctgga 32319694  T
Q  195 cgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaaca 294  Q
    || || ||| |||||||| || |       ||| |  |||||||  | ||||||||||||| | || |||||||||||||||| |  || || |||||||    
T  32319695 cgcaggaataaaattttgagataattttttgcagataaacttttcatgatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcataaaagtttaaaca 32319794  T
Q  295 taaattaaacaaattt 310  Q
    | ||||||||||||||    
T  32319795 t-aattaaacaaattt 32319809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 3201900 - 3201797
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || || | ||    
T  3201900 aaaaattagaattttttaatatgcaatgaattaaatat-aatttttt-aaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaagtaaa 3201803  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  3201802 attttg 3201797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 10214809 - 10214914
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| ||||   |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||||||| || || |||| ||    
T  10214809 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatatattttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttgaacctaaaaataaa 10214908  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  10214909 attttg 10214914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 17615046 - 17614941
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| ||||| |||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||  || |||| ||    
T  17615046 aaaaattagatttttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggatctaaaaataaa 17614947  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  17614946 attttg 17614941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18549618 - 18549513
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | ||||| |||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||| ||| || |||| ||    
T  18549618 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataattttttaaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaattttgacctaaaaataaa 18549519  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  18549518 attttg 18549513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 18672312 - 18672259
Alignment:
Q  264 aaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  18672312 aaaattgttaaaaaacttaagagttcaagcataaattaaacaaatttgaattga 18672259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 31653466 - 31653361
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||||||| |||||||||| ||| || |||| | |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||| ||| || |||| ||    
T  31653466 aaaatttaaaattttttaacatgtaatgaatcaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttagacctaaaaatgaa 31653367  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  31653366 attttg 31653361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 57
Target Start/End: Original strand, 37592894 - 37592927
Alignment:
Q  24 gtttgtttaattatccttaaactcttaaattttt 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37592894 gtttgtttaattatccttaaactcttaaattttt 37592927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 262 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 36881155 - 36881116
Alignment:
Q  262 aaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaatta 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36881155 aaaaaattattcaaaaactcaagagattaaacataaatta 36881116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 102 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 39670510 - 39670399
Alignment:
Q  102 tttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtaga 200  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||| ||||| || || || ||||||||| |||| ||||||||||  || |    
T  39670510 tttacaaaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataattttttttaaacgccagaaattcaagataaaactaacgaaaatttggatctaaa 39670411  T
Q  201 aatcaaattttg 212  Q
    ||| ||||||||    
T  39670410 aataaaattttg 39670399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 118 - 212
Target Start/End: Original strand, 44713106 - 44713200
Alignment:
Q  118 attttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaatt-aacaaaatttggacgtagaaatcaaattttg 212  Q
    ||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||| || |||| |||||| || ||||||||||| || |||||||||||||    
T  44713106 attttttaaaatctaacgaattaaatatgaatttttt-aaatgccaaaatttcaagaaaaaattaaagaaaatttggacctaaaaatcaaattttg 44713200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 210
Target Start/End: Original strand, 25100388 - 25100426
Alignment:
Q  172 agataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattt 210  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  25100388 agataaaattagcaaaatctggacgtagaaatcaaattt 25100426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 38063176 - 38063070
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaatttttt-aaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatca 205  Q
    |||| |||||| ||||||| ||| || |||||| |||| | |||||| |||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| |    
T  38063176 aaaaattagaaatttttaacatgcaatgaattaaatataattttttttaaaacgtcaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttggacctaaaaataa 38063077  T
Q  206 aattttg 212  Q
    |||||||    
T  38063076 aattttg 38063070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 37741919 - 37742024
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| ||| |||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| |||||  | ||||||||| |||| |||||||| || || |||| ||    
T  37741919 aaaaattataattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaagtcaagataaaactaacgaaaatttgaacctaaaaataaa 37742018  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  37742019 attttg 37742024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 42520911 - 42521016
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| || | | |||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||| ||| || |||| ||    
T  42520911 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatgtaattttttttaaacgccaaaaattcaagataaacttaacgaaaatttagacttaaaaataaa 42521010  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  42521011 attttg 42521016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 275
Target Start/End: Original strand, 13890872 - 13890912
Alignment:
Q  235 ttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaa 275  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  13890872 ttttagtaatgtttttaacacgtctatataaaattgttcaa 13890912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 275
Target Start/End: Original strand, 14030997 - 14031037
Alignment:
Q  235 ttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaa 275  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  14030997 ttttagtaatgtttttaacacgtctatataaaattgttcaa 14031037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 18917312 - 18917280
Alignment:
Q  235 ttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaa 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18917312 ttttagtaatgttcttaacacgtctgcaaaaaa 18917280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 281 - 317
Target Start/End: Original strand, 20720809 - 20720845
Alignment:
Q  281 caagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20720809 caagagtttaaacataaattgaacaaatttgaattga 20720845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 244 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 24951285 - 24951214
Alignment:
Q  244 tgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattg 316  Q
    ||||||||||||||||  |||| | ||||| ||||||  |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24951285 tgttcttaacacgtctccaaaagaatgttcgaaaacttgagagtttaagcataa-ttaaacaaatttgaattg 24951214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 212
Target Start/End: Original strand, 39375071 - 39375171
Alignment:
Q  113 ttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaatttt 211  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | ||||||||||||  |||| || ||||||||  |||| ||||||||| | || |||| |||||||    
T  39375071 ttagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgtaaaaaattcaagataaatctaacgaaaatttgggcctaaaaataaaatttt 39375170  T
Q  212 g 212  Q
    |    
T  39375171 g 39375171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1160 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold1160
Description:

Target: scaffold1160; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 22 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 1455 - 1159
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1455 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgaggcaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 1356  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaatttttta---aaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacan 218  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    ||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  1355 tttaacatgaaacgaattaaatatgatttttttttttaaatggtaaaagctaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgcgacaa 1256  T
Q  219 nnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaatt 315  Q
          ||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  1255 ttttttgcaaagaaactttaagtaatgttcttaacacgtctgcaaaaaattgttcaaaaactcatgagtttaagcataaataaaacaaatttgaatt 1159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1191 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold1191
Description:

Target: scaffold1191; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 964 - 669
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnng-agacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatt 120  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||         ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  964 aagtttgtttgattattcttaaactcttaaatttttgaacgatttttttttagataagtttagaacactataaaaggttcatttactaaaatttagaatt 865  T
Q  121 ttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 220  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | |||||  | ||||||||||||||||||       
T  864 ttttaagatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaatgaaaaaagttaaagataaaattaacaaattctggactcaaaaatcaaattttgcgaca-at 766  T
Q  221 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
        ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  765 ttgtgcagatgaacttttagtaatgttcttatcacgtctgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0651 (Bit Score: 156; Significance: 7e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0651
Description:

Target: scaffold0651; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 22 - 310
Target Start/End: Original strand, 6862 - 7151
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6862 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttctgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttagaattt 6961  T
Q  122 ttt-aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 220  Q
    ||| || ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |       
T  6962 ttttaacatgaaacaaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaaattaaagataaaaataataaaatttggacatataaatcaaattttgcgataatt 7061  T
Q  221 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 310  Q
        ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  7062 ttttgcagaggaacttttagtaatgtttttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaattt 7151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0562 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0562
Description:

Target: scaffold0562; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 317
Target Start/End: Original strand, 3974 - 4287
Alignment:
Q  25 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3974 tttgtttaattatccttaaactcttacatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 4073  T
Q  125 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnn 224  Q
    || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||           
T  4074 aacatgaaacaaattaaatatgaattttttaaaacggaaaaagttaaagataaaattaacaaaacctgtacgtagaaatcaaattttgcgacaatttttt 4173  T
Q  225 gcataggaact---------------------tttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaa 303  Q
    |||||||||||                     ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4174 gcataggaacttttagtaattgcataggaacttttagtaatgttcttaacatgcctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaa 4273  T
Q  304 caaatttgaattga 317  Q
    ||||||||||||||    
T  4274 caaatttgaattga 4287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 22 - 315
Target Start/End: Original strand, 17377 - 17669
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       |||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  17377 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaaagatttttttgagacaagtttagaacaccatgatagattcatttactaaaatttagaattt 17476  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    || || ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||| | |        
T  17477 tt-aacatgaaacgaattaaatatgatttttttaaaacaacaaaagttaaagataaaagtaataaaatctggacttaaaaatcaaattttgcaataattt 17575  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaatt 315  Q
        |  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17576 tttacggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttcaaaaacttaagagtttaactataaattaaacaaatttgaatt 17669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0707 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0707
Description:

Target: scaffold0707; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 71 - 314
Target Start/End: Original strand, 6950 - 7192
Alignment:
Q  71 gagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagtta 170  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6950 gagacaagtttagaacactatgaaaggtttattaactaaaatttagaattttt-aacctaaaatgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagtta 7048  T
Q  171 aagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattg 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  7049 aagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgtgacaattttttgcagatgaacttttagtaatgtttttaacacgtctgcaaaaaattg 7148  T
Q  271 ttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaat 314  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||    
T  7149 ttcaaaaactcaagagtataagcatacattaaacaaatttgaat 7192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 35568 - 35273
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       || ||||| |||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35568 aagtttgtttaattatccttaaagtcttaaatttttgaacgatttttttgaaacaagtttagattattatgaaaggttcaattactaaaatttagaattt 35469  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||| | |        
T  35468 tttaacatgaaacgaattaaatataaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcaataattt 35369  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
       ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35368 tttgcggaggaacttttactaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 35273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 317
Target Start/End: Original strand, 38609 - 38674
Alignment:
Q  252 acacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  38609 acacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagttcaagcataaattaaacaaatttgaattga 38674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 4)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 25057 - 25339
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  25057 aagtttgtttaattatcgttaaactcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataaaatttagaattt 25156  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||| | |         
T  25157 tttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaaagtaataaaatatggacatataaatcaaattttgtggc----- 25251  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  25252 --------ggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattga 25339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 24074 - 23787
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||       |||||||| |||||||||       |||||| |||||||||||||||||||    
T  24074 aagtttgtttaattatttttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacac-------ggttcaattactaaaatttagaattt 23982  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcga-cannn 220  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| || || || ||||||||||||||||  |       
T  23981 tttaatttgaaatgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctgaacatataaatcaaattttgcgattattt 23882  T
Q  221 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgt-aaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
        ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||    || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23881 ttttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctataaaaaaattgttaaaaaact---tagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 23787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 229 - 317
Target Start/End: Original strand, 23076 - 23164
Alignment:
Q  229 aggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||  |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23076 aggaacttttagtaatgttcttaacacgtcaacaaaaaattgttagaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 23164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 281 - 317
Target Start/End: Original strand, 24647 - 24683
Alignment:
Q  281 caagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24647 caagagtttaaacataaattgaacaaatttgaattga 24683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 22 - 217
Target Start/End: Original strand, 158028 - 158222
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||       |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  158028 aagtttgtttaattctccttaaactcttcaatttttgaacgatttttt-gagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 158126  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgaca 217  Q
    ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  158127 tttaccatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaattaaattttgcgaca 158222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0514 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0514
Description:

Target: scaffold0514; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 45 - 317
Target Start/End: Original strand, 6197 - 6470
Alignment:
Q  45 ctcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatg--aaacgaattaga 142  Q
    |||||||||||||||||||       ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||| |    
T  6197 ctcttaaatttttgaacgattttttcgaggcaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaaaaaaaattaaa 6296  T
Q  143 tatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagta 242  Q
    ||||| ||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||       | | | ||||||||||||    
T  6297 tatgatttttttaaaaccagaaaaattaaagat-aaattaacaaagtttgggcctagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagatgaacttttagta 6395  T
Q  243 atgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6396 atgttcttaacacgtctccaaaaaattgttgaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 6470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 240012 - 240294
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  240012 aagtttgtttaattatccttcaactgttaaatttttgaacgacttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataaaatttagaattt 240111  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 221  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || | ||||||||||||| |         
T  240112 tttaacatgaaacgaattaaatatgaatatttgaaaacaataaaagttaaagataaaagtaataaaatatggacatatagatcaaattttgcggc----- 240206  T
Q  222 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
            |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  240207 --------ggaacttttagtaatgttcttaacacatctaaaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattga 240294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 248 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 239561 - 239492
Alignment:
Q  248 cttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    |||||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  239561 cttaacacatctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 239492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1190 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold1190
Description:

Target: scaffold1190; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 202 - 486
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  202 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttttcgagacaagttcagaacactacgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 301  T
Q  122 tttaatatg-aaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 220  Q
    ||||| ||| |||  ||||| |||| | ||||| |||||||||            |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||       
T  302 tttaaaatgaaaaaaaattaaatataattttttgaaaacgaca------------aaaattaacaaaatctgggcctagaaatcaaattttgtgacaatt 389  T
Q  221 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
        ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  390 ttttgcagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctccaaaaaattgttcaaaaactcatgtgtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 7227 - 6931
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||       |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7227 aagtttgtttaattatcattaaactcttaaattttttaatgatttttttgagacaagtttagaacaatatgaaaagttcatttactaaaatttagaattt 7128  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagat-aaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 220  Q
    | ||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |       
T  7127 tctaacacgaaacaaattaaatatgaattttttaaaaagataaaagttaaatataaaaattaacaaaatttggatgtagaaatcaaattttgctataatt 7028  T
Q  221 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
        ||  || |||||||||||||||||| |||| | | | |||||| | || ||||| | ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7027 ttttgcggagaaacttttagtaatgttctaaacatgccagcaaaaaactattaaaaaatttaagaatttaagcataaattaaacaaatttgaattga 6931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0640 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0640
Description:

Target: scaffold0640; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 25 - 317
Target Start/End: Original strand, 3895 - 4188
Alignment:
Q  25 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 124  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||        | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  3895 tttgcttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatttttt 3994  T
Q  125 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaa-ttttgcgacannnnn 222  Q
    || ||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || |         
T  3995 aacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatgaacgtagaaatcaaatttttgtgatattttt 4094  T
Q  223 nngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
          ||||  ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  4095 tt-tggaggacgttttaataacgttcttaacatgtctgtaaaaaattgttgaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttggattga 4188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0385 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0385
Description:

Target: scaffold0385; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 9960 - 10245
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnn-gagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaattta--gaa 118  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||        |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||         
T  9960 aagtttgtttaattattcttaaactcttaaattttttaatgaatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataaaatttaatttt 10059  T
Q  119 ttttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacan 218  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||  || ||||| ||||| || ||||||||||||||| |      
T  10060 ttttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaaaacaataaaatatggacatataaatcaaattttgcggc-- 10157  T
Q  219 nnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
               |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  10158 -----------ggaacttttaataatgttcttaacacgtctacaaaaaattgtaaaaaaacttaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattga 10245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0385; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 9491 - 9424
Alignment:
Q  249 ttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    ||||||| |||  ||||||||||| ||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9491 ttaacacatctacaaaaaattgttaaaaaacttaa-agtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 9424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 158
Target Start/End: Original strand, 21750 - 21886
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21750 aagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacgattttttcgagacaagtttagaacactataaaaggttcatttactaaaatttagaattt 21849  T
Q  122 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaa 158  Q
    | ||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  21850 tctaacatgaaacgaattaaatttgaatttcttaaaa 21886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0571 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0571
Description:

Target: scaffold0571; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 8748 - 8596
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaa-ggttcatttactaaaatttagaatt 120  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||        ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8748 aagtttgtttgattattcttaaattcttaaatttttgaacgattttttttagataaggttagaacactatgaaaaggttcatttactaaaatttagaatt 8649  T
Q  121 ttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 173  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||| |||||    
T  8648 ttttaagatgaaacgaattaaatatgaatttcttaaaacggaaaaaggtaaag 8596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0571; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 171 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 8575 - 8430
Alignment:
Q  171 aagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattg 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||       ||| | |||||||||| |||||| ||| || ||||  |||||||||    
T  8575 aagataaaattaacaaaatttggacgcaaaaatcaaattttgcgacaatttgt-gcagatgaacttttagcaatgttgttaccatgtctacaaaaaattg 8477  T
Q  271 ttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8476 ttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 8430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 212
Target Start/End: Original strand, 47860 - 48041
Alignment:
Q  31 taattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatg 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |       |||||||| |||||||| ||  | |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  47860 taattatccttaaactcttaaatttttgaacaattttcttgagacaagtttagaacattacaagaggttcgttttctaaaatttagaattttttaacatg 47959  T
Q  131 aaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaa-atttggacgtagaaatcaaattttg 212  Q
    ||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||  |||||||||||| ||||||||    
T  47960 aaatgaattaaatataaatttttt-aaacgacaaaagttcaagataaaagtaacaaatatccggacgtagaaataaaattttg 48041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0734
Description:

Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 136 - 310
Target Start/End: Original strand, 3260 - 3436
Alignment:
Q  136 aattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatt-tggacgtagaaatcaaatttt-gcgacannnnnnngcataggaa 233  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| | |||| |||||||||||||||| |||| |        |  ||||     
T  3260 aattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggatgtagaaatcaaatttttgcgatattttttt-cggaggat 3358  T
Q  234 cttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaa-aattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 310  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  3359 cttttaataacgttcttaacacgtctgtaaaaaaattgttgaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaattt 3436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 133
Target Start/End: Original strand, 2854 - 2962
Alignment:
Q  25 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 124  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||        | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  2854 tttgtttaattatcgttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagcacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatttttt 2953  T
Q  125 aatatgaaa 133  Q
    || ||||||    
T  2954 aacatgaaa 2962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 231 - 317
Target Start/End: Original strand, 48967 - 49053
Alignment:
Q  231 gaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  48967 gaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattga 49053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 93 - 188
Target Start/End: Original strand, 283308 - 283403
Alignment:
Q  93 aaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaa 188  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||| ||||||||    
T  283308 aaaggttcgtttactaaaatttagaattttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaa 283403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 283076 - 282940
Alignment:
Q  174 ataaaattaacaaaatt-tggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgtt 272  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||| || |       ||| | |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  283076 ataaaagtaacaaaattctggacgcagaaataaaattttgagataattttttgcagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgtt 282977  T
Q  273 caaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 310  Q
    ||||| || || || |||| ||| ||||||||||||||    
T  282976 caaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 282940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 229 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 6292 - 6204
Alignment:
Q  229 aggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  6292 aggaacttttagtaacgttcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaacttaaaagtttaagcataaattaaacatatttgaattga 6204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 6361 - 6298
Alignment:
Q  147 aattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaatttt 211  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  6361 aattttgttaaaagacaaaagttaaagataaaagtaacaaaatctggacatagaaat-aaatttt 6298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 52645 - 52512
Alignment:
Q  22 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnnga-gacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||         | || ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  52645 aagtttgtttaattatccttagactcgtaaattttggaacggttttttctaagataagtttagaacattataaaaggttcatttactaaaatttagattt 52546  T
Q  121 ttttaatatgaaacgaattagatatgaatttttt 154  Q
    ||||||  ||||| |||||| |||||||||||||    
T  52545 ttttaacttgaaatgaattaaatatgaatttttt 52512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 188
Target Start/End: Original strand, 123198 - 123351
Alignment:
Q  35 tatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaac 134  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||       ||||||   ||| |||| ||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||  ||| |     
T  123198 tatccttaaactcttaaaatttttaacgatttttccgagacacatttaaaacaatataaaagctgcatttactaaaatttaaaattttttaacttgagat 123297  T
Q  135 gaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaa 188  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||  |||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  123298 gaattaaatataaattttttcaaacagcaaatgtttaagataaaagtaacaaaa 123351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0618 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0618
Description:

Target: scaffold0618; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9424 - 9319
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||||||| || || |||| ||    
T  9424 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttgcacctaaaaataaa 9325  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  9324 attttg 9319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0493 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0493
Description:

Target: scaffold0493; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 6969 - 6864
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||| | ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  6969 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatattatttttttaaaaagccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 6870  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  6869 attttg 6864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0991 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0991
Description:

Target: scaffold0991; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 988 - 883
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| ||||||||||||||  || || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || || | ||    
T  988 aaaaattagaattttttaacttgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaactaaa 889  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  888 attttg 883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 48265 - 48160
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||  || |||||| |||| | |||||||||||| | ||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  48265 aaaaattagaattttttaacatttaatgaattaaatataatttttttaaaacgcccaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 48166  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  48165 attttg 48160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 42147 - 42042
Alignment:
Q  108 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||  || |||||| ||||   |||||||||||| | ||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  42147 aaaaattagaattttttaacatttaatgaattaaatatagtttttttaaaacgcccaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 42048  T
Q  207 attttg 212  Q
    ||||||    
T  42047 attttg 42042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0245 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0245
Description:

Target: scaffold0245; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 212
Target Start/End: Original strand, 24927 - 24965
Alignment:
Q  175 taaaattaacaaaa-tttggacgtagaaatcaaattttg 212  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24927 taaaattaacaaaaatttggacgtagaaatcaaattttg 24965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0245; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 315
Target Start/End: Original strand, 25014 - 25066
Alignment:
Q  262 aaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaatt 315  Q
    |||||||| |||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  25014 aaaaaattattcaaaaatttaagagtttaaacataa-ttaaacaaatttgaatt 25066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University