View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6145_low_2 (Length: 706)

Name: NF6145_low_2
Description: NF6145
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6145_low_2
NF6145_low_2
[»] chr4 (15 HSPs)
chr4 (8-706)||(3242298-3242996)
chr4 (8-706)||(54689924-54690622)
chr4 (8-706)||(54699355-54700053)
chr4 (8-706)||(3917545-3918243)
chr4 (8-706)||(26811987-26812685)
chr4 (8-706)||(26821454-26822152)
chr4 (8-706)||(37058566-37059263)
chr4 (8-706)||(15842909-15843605)
chr4 (470-706)||(20884460-20884694)
chr4 (470-706)||(50516509-50516742)
chr4 (470-706)||(11482257-11482491)
chr4 (532-702)||(23622919-23623088)
chr4 (139-369)||(18125754-18125981)
chr4 (531-702)||(18125427-18125595)
chr4 (532-609)||(16489947-16490025)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (8-706)||(94442-95140)
scaffold0028 (8-706)||(103883-104581)
[»] chr5 (29 HSPs)
chr5 (8-706)||(18568517-18569216)
chr5 (8-706)||(24412307-24413005)
chr5 (8-706)||(30454212-30454910)
chr5 (8-706)||(30459270-30459968)
chr5 (8-706)||(30444840-30445538)
chr5 (8-706)||(24421767-24422454)
chr5 (8-706)||(22488666-22489362)
chr5 (8-706)||(4635442-4636122)
chr5 (470-706)||(24244054-24244287)
chr5 (470-706)||(24290678-24290911)
chr5 (470-706)||(42732588-42732818)
chr5 (470-706)||(13815384-13815617)
chr5 (470-706)||(33955511-33955745)
chr5 (470-706)||(11223318-11223551)
chr5 (470-706)||(20035941-20036175)
chr5 (532-702)||(5600580-5600749)
chr5 (532-702)||(5610226-5610395)
chr5 (470-706)||(20834373-20834607)
chr5 (529-685)||(22118134-22118291)
chr5 (37-211)||(24278813-24278987)
chr5 (37-211)||(24383227-24383401)
chr5 (532-702)||(31150651-31150820)
chr5 (552-706)||(26652642-26652795)
chr5 (552-706)||(26924227-26924380)
chr5 (267-371)||(22118443-22118545)
chr5 (636-706)||(22448341-22448411)
chr5 (636-702)||(37514874-37514940)
chr5 (529-702)||(16110881-16111058)
chr5 (661-706)||(22457677-22457722)
[»] chr3 (25 HSPs)
chr3 (8-706)||(28367664-28368362)
chr3 (8-706)||(28375482-28376180)
chr3 (8-706)||(28383304-28384002)
chr3 (8-706)||(28351731-28352430)
chr3 (331-706)||(24794557-24794932)
chr3 (97-706)||(4951164-4951770)
chr3 (8-330)||(38529524-38529846)
chr3 (392-706)||(38529188-38529502)
chr3 (470-706)||(5385632-5385866)
chr3 (470-706)||(46305585-46305818)
chr3 (532-702)||(17529877-17530046)
chr3 (529-706)||(13328289-13328465)
chr3 (470-706)||(23486983-23487219)
chr3 (532-702)||(32877870-32878039)
chr3 (532-702)||(54624655-54624824)
chr3 (532-702)||(48978670-48978835)
chr3 (532-702)||(48988210-48988375)
chr3 (108-312)||(7784561-7784764)
chr3 (531-633)||(7784091-7784194)
chr3 (139-373)||(27168983-27169216)
chr3 (576-702)||(19388809-19388936)
chr3 (139-369)||(4361858-4362085)
chr3 (531-702)||(4361531-4361699)
chr3 (640-697)||(7784009-7784066)
chr3 (636-680)||(24285493-24285537)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (8-702)||(3012-3706)
[»] chr8 (26 HSPs)
chr8 (8-702)||(7789093-7789787)
chr8 (277-706)||(20713818-20714246)
chr8 (470-706)||(18883171-18883404)
chr8 (470-706)||(25051074-25051307)
chr8 (470-706)||(18232870-18233103)
chr8 (470-706)||(18242321-18242554)
chr8 (470-706)||(25037037-25037270)
chr8 (470-706)||(18251772-18252005)
chr8 (470-706)||(18143440-18143673)
chr8 (470-706)||(42712189-42712423)
chr8 (470-706)||(31575422-31575652)
chr8 (470-706)||(20044760-20044994)
chr8 (470-706)||(4843733-4843968)
chr8 (470-706)||(12925296-12925530)
chr8 (470-706)||(20030121-20030355)
chr8 (470-706)||(12767573-12767809)
chr8 (529-702)||(15833950-15834123)
chr8 (530-702)||(24096090-24096262)
chr8 (575-706)||(33592145-33592275)
chr8 (575-706)||(33601784-33601914)
chr8 (569-706)||(12915499-12915635)
chr8 (570-706)||(24634009-24634144)
chr8 (652-706)||(20714417-20714471)
chr8 (575-692)||(42896174-42896290)
chr8 (294-373)||(15833720-15833798)
chr8 (185-363)||(15827294-15827476)
[»] chr7 (17 HSPs)
chr7 (8-706)||(7592485-7593183)
chr7 (8-367)||(15172798-15173157)
chr7 (8-358)||(15202224-15202571)
chr7 (373-702)||(15174385-15174713)
chr7 (8-248)||(4118893-4119133)
chr7 (470-706)||(11634341-11634574)
chr7 (470-706)||(14634789-14635023)
chr7 (470-706)||(14644489-14644723)
chr7 (470-706)||(33292188-33292422)
chr7 (474-706)||(15947384-15947614)
chr7 (470-706)||(9736888-9737122)
chr7 (470-706)||(32817939-32818172)
chr7 (531-706)||(19352600-19352775)
chr7 (575-706)||(13874432-13874561)
chr7 (535-702)||(4306573-4306739)
chr7 (603-706)||(48710018-48710121)
chr7 (470-597)||(48711401-48711526)
[»] chr6 (14 HSPs)
chr6 (8-706)||(23895627-23896325)
chr6 (8-704)||(18420031-18420726)
chr6 (470-706)||(22066235-22066469)
chr6 (470-706)||(23884434-23884668)
chr6 (531-702)||(14102308-14102480)
chr6 (108-361)||(14101770-14102022)
chr6 (470-706)||(17512234-17512467)
chr6 (577-694)||(12173469-12173585)
chr6 (551-702)||(10259794-10259945)
chr6 (576-702)||(11421466-11421591)
chr6 (576-694)||(23110242-23110359)
chr6 (532-658)||(12415064-12415190)
chr6 (536-630)||(13218359-13218453)
chr6 (139-244)||(12173040-12173144)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (8-706)||(30834-31516)
scaffold0040 (41-706)||(9559-10218)
[»] chr2 (13 HSPs)
chr2 (8-706)||(31710477-31711162)
chr2 (12-706)||(24022753-24023445)
chr2 (444-702)||(14273121-14273377)
chr2 (73-363)||(14272600-14272889)
chr2 (470-706)||(35877458-35877692)
chr2 (470-706)||(35884947-35885181)
chr2 (470-706)||(36724660-36724894)
chr2 (470-706)||(3396865-3397099)
chr2 (532-702)||(1800493-1800662)
chr2 (532-702)||(22632402-22632571)
chr2 (532-702)||(1790999-1791164)
chr2 (551-694)||(18578707-18578850)
chr2 (636-705)||(16446670-16446739)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (8-529)||(26309-26812)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (8-317)||(412777-413086)
scaffold0001 (427-706)||(408226-408505)
[»] chr1 (13 HSPs)
chr1 (8-671)||(15810030-15810688)
chr1 (529-702)||(5378439-5378613)
chr1 (529-706)||(14272029-14272205)
chr1 (529-706)||(14281895-14282071)
chr1 (529-706)||(40999046-40999224)
chr1 (532-702)||(26906261-26906431)
chr1 (294-467)||(40999283-40999455)
chr1 (529-705)||(3470949-3471124)
chr1 (94-259)||(41000835-41001003)
chr1 (470-697)||(21633524-21633747)
chr1 (575-706)||(21919442-21919572)
chr1 (529-679)||(30676788-30676938)
chr1 (573-649)||(28310080-28310155)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (470-706)||(256901-257134)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (470-706)||(2051-2285)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (529-706)||(124047-124223)
scaffold0021 (470-597)||(143111-143237)
scaffold0021 (551-702)||(100002-100152)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (532-702)||(14830-14999)
[»] scaffold0247 (1 HSPs)
scaffold0247 (532-702)||(24593-24762)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (575-706)||(12559-12689)
[»] scaffold0223 (1 HSPs)
scaffold0223 (529-692)||(27078-27246)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (575-706)||(2272-2402)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 671; Significance: 0; HSPs: 15)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 671; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 3242996 - 3242298
Alignment:
Q  8 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3242996 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcatcacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttctaagtcaggcaaatcagaa 3242897  T
Q  108 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttct 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3242896 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 3242797  T
Q  208 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3242796 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 3242697  T
Q  308 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 407  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3242696 actacaaacaaagctcttcgcatacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 3242597  T
Q  408 aagatttgagtatttatttgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 507  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3242596 aagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 3242497  T
Q  508 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtg 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3242496 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtg 3242397  T
Q  608 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3242396 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 3242298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 667; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 54690622 - 54689924
Alignment:
Q  8 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54690622 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcatcacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttctaagtcaggcaaatcagaa 54690523  T
Q  108 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttct 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54690522 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 54690423  T
Q  208 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54690422 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgaaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 54690323  T
Q  308 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 407  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54690322 actacaaacaaagctcttcgcatacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 54690223  T
Q  408 aagatttgagtatttatttgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 507  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54690222 aagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 54690123  T
Q  508 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtg 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54690122 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtg 54690023  T
Q  608 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54690022 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 54689924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 667; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 54700053 - 54699355
Alignment:
Q  8 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54700053 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcatcacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttctaagtcaggcaaatcagaa 54699954  T
Q  108 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttct 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54699953 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 54699854  T
Q  208 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54699853 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgaaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 54699754  T
Q  308 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 407  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54699753 actacaaacaaagctcttcgcatacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 54699654  T
Q  408 aagatttgagtatttatttgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 507  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54699653 aagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 54699554  T
Q  508 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtg 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54699553 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtg 54699454  T
Q  608 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54699453 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 54699355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 659; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 706
Target Start/End: Original strand, 3917545 - 3918243
Alignment:
Q  8 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3917545 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcatcacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttctaagtcaggcaaatcagaa 3917644  T
Q  108 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttct 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3917645 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 3917744  T
Q  208 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3917745 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 3917844  T
Q  308 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 407  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3917845 actacaaacaaagctcttcgcatacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 3917944  T
Q  408 aagatttgagtatttatttgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 507  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3917945 aagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcaaacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagaaagaaaattc 3918044  T
Q  508 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtg 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3918045 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtaatg 3918144  T
Q  608 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3918145 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 3918243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 655; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 706
Target Start/End: Original strand, 26811987 - 26812685
Alignment:
Q  8 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26811987 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcatcacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttctaagtcaggcaaatcagaa 26812086  T
Q  108 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttct 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26812087 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 26812186  T
Q  208 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26812187 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 26812286  T
Q  308 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 407  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26812287 actacaaacaaagctcttcgcatacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 26812386  T
Q  408 aagatttgagtatttatttgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 507  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26812387 aagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcaaacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 26812486  T
Q  508 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtg 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26812487 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtg 26812586  T
Q  608 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26812587 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 26812685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 655; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 706
Target Start/End: Original strand, 26821454 - 26822152
Alignment:
Q  8 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26821454 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcatcacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttctaagtcaggcaaatcagaa 26821553  T
Q  108 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttct 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26821554 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 26821653  T
Q  208 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26821654 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 26821753  T
Q  308 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 407  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26821754 actacaaacaaagctcttcgcatacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 26821853  T
Q  408 aagatttgagtatttatttgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 507  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26821854 aagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcaaacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 26821953  T
Q  508 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtg 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26821954 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtg 26822053  T
Q  608 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26822054 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 26822152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 611; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 706
Target Start/End: Original strand, 37058566 - 37059263
Alignment:
Q  8 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 107  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37058566 gacatcatcagaagtgggcacaaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaaacaacagtgctttcaaagccaggcaaatcagaa 37058665  T
Q  108 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttct 207  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37058666 agaacattttgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttct 37058765  T
Q  208 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 307  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37058766 cccttgatcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctctaagtgaaaatcatc 37058865  T
Q  308 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 407  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37058866 actacaaacagagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcttctctcttgaatttg-ctcttgtaaaactcaaaca 37058964  T
Q  408 aagatttgagtatttatttgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37058965 aagatttgagtatttatttgatccaaacaaatctcatcatacaaagtgtgttgtatttctcaaagtctattgagcttaatagttttgagatagaaaattc 37059064  T
Q  508 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtg 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  37059065 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgtaacggactgatctggtgtgatcaagatcttgtagtg 37059164  T
Q  608 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37059165 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 37059263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 555; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 15843605 - 15842909
Alignment:
Q  8 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 107  Q
    ||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15843605 gacatcatcagcattgggcagcaaattatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaa-gcaacagtgctttcaaagccaggcaaatcagaa 15843507  T
Q  108 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttct 207  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  15843506 agaacattatgagaacgttatggctattttaaagaagaaaagagaaatcaattgagactttgaacagctataaaaaacgtgtccaacagctctattttct 15843407  T
Q  208 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 307  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15843406 cccttgatcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctctaagtgaaaatcatc 15843307  T
Q  308 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  15843306 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcttctctcttgaatttg-ctattgtaaaactcaaaca 15843208  T
Q  408 aagatttgagtatttatttgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15843207 aagatttgagtatttatttgatccaaacaaatctcatcatacaaagtgtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattt 15843108  T
Q  508 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtg 607  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  || || |||||||||| |||||||||||  || |||||    
T  15843107 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtagaagcctgcttaggttgataatacaggtgtaacagactgatctgatgtgatcaagatcttatagtg 15843008  T
Q  608 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  15843007 ctagtcagaagtttctgttagcaagacaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgagtttggtgaaccaagataactct 15842909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 470 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 20884694 - 20884460
Alignment:
Q  470 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 567  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20884694 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 20884598  T
Q  568 aggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 665  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20884597 tggttacggactgatctggtgtgatcaaaaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtg 20884501  T
Q  666 gggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20884500 gggactggaagtagccgggtttggggaaccaggataactct 20884460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 470 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 50516742 - 50516509
Alignment:
Q  470 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaga 568  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  || |  |  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||      
T  50516742 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaaagttccaacctttcttgagcgaaag--caaagaattgtaacagcctgctgaggttgataatacaag 50516646  T
Q  569 ggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 666  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || |||| |||||   | |||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50516645 ggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaaatttct---accaacggaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgg 50516549  T
Q  667 ggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  50516548 ggactggaagtagtcgggtttggggaaccaggataactct 50516509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 470 - 706
Target Start/End: Original strand, 11482257 - 11482491
Alignment:
Q  470 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 567  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  11482257 aagtctattcggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagccggctgaggttgataatacag 11482353  T
Q  568 aggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 665  Q
     |||||||||||||| ||||||||| ||||  || ||||| | || |||||||||   || |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11482354 gggttacggactgatatggtgtgataaagaccttatagtgttggttagaagtttc---taccaactgtatactatagtggataatctcacacgaagtgtg 11482450  T
Q  666 gggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    ||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  11482451 gggactagaagtagccgggtttggacaaccaggataactct 11482491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 532 - 702
Target Start/End: Original strand, 23622919 - 23623088
Alignment:
Q  532 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 630  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||| ||||     
T  23622919 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacagactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagc- 23623017  T
Q  631 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 702  Q
    || | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||| |||| || ||||||||||||    
T  23623018 aggatactatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagcc-ggttaggcgaaccaggataa 23623088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 18125981 - 18125754
Alignment:
Q  139 aagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttctcccttggtcaccaagacactcctcacctata 238  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||  ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||| | |||| |||| ||| |||||| ||  ||||    
T  18125981 aagaagaaaagtgaaaccaattgaagctttggacagctg-caaaaatgtgtccaacaactcttttttcacacttgatcactaagtcactccacatatata 18125883  T
Q  239 aatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaata-tctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcgcaaacaaagc 337  Q
    |||||||| |  ||| ||| |   ||  |||| ||||| |||| || | ||||||  ||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |    
T  18125882 aatacaagtggttttaaagcttcaaataaagaattttgaaagcaaacattctctc-tagtaaaaatcatcactacatac-aagctcttcacaaacaaa-c 18125786  T
Q  338 aaattccaagctctctcactatatctcttgga 369  Q
    |||| ||||||||||||| |||| || |||||    
T  18125785 aaataccaagctctctcattataccttttgga 18125754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 531 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 18125595 - 18125427
Alignment:
Q  531 aaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagc 629  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||  | || || || ||||||| |||||||||    ||  | |||| || |||||||| |||||||    
T  18125595 aaagaattgaagaagtctgctgaggttgataatacaaggtgtaacagaatgatctgttgtgatcaat---tttcaatgctggtaagaagtttttgttagc 18125499  T
Q  630 aagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 702  Q
    | || | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||| |||  |||||||||||||    
T  18125498 aggata-ctataatggataatctcacacgaggtgtggagaccgaaaataaccggatttaatgaaccaggataa 18125427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 532 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 16490025 - 16489947
Alignment:
Q  532 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgct 609  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||| || || ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||    
T  16490025 aagaatcgtagaagtctgctgaggttgataatactgagtgtaacagactgatatggtgtgatcaacaaattatagtgct 16489947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 663; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 663; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 95140 - 94442
Alignment:
Q  8 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  95140 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcatcacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttctaagtcaggcaaatcagaa 95041  T
Q  108 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttct 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  95040 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 94941  T
Q  208 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94940 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 94841  T
Q  308 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 407  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94840 actacaaacaaagctcttcgcatacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 94741  T
Q  408 aagatttgagtatttatttgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 507  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94740 aagatttgagtatctattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 94641  T
Q  508 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtg 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94640 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtg 94541  T
Q  608 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  94540 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttagtgaaccaggataactct 94442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 663; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 104581 - 103883
Alignment:
Q  8 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  104581 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcatcacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttctaagtcaggcaaatcagaa 104482  T
Q  108 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttct 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  104481 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 104382  T
Q  208 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  104381 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 104282  T
Q  308 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 407  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  104281 actacaaacaaagctcttcgcatacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 104182  T
Q  408 aagatttgagtatttatttgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 507  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  104181 aagatttgagtatctattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 104082  T
Q  508 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtg 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  104081 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtg 103982  T
Q  608 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  103981 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaattagccgggtttggtgaaccaggataactct 103883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 660; Significance: 0; HSPs: 29)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 660; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 706
Target Start/End: Original strand, 18568517 - 18569216
Alignment:
Q  8 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 107  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18568517 gacatcatcagaagtggactgcaagttacacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 18568616  T
Q  108 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttct 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18568617 agaacattctgagaacgttctggctatttttaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 18568716  T
Q  208 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18568717 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgaaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 18568816  T
Q  308 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 407  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18568817 actacaaacaaagctcttcgcatacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 18568916  T
Q  408 aagatttgagtatttatttgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatag-ttttgagatagaaaatt 506  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18568917 aagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagtttttgagatagaaaatt 18569016  T
Q  507 ccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagt 606  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18569017 ccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagt 18569116  T
Q  607 gctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18569117 gctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 18569216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 655; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 706
Target Start/End: Original strand, 24412307 - 24413005
Alignment:
Q  8 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24412307 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcatcacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttctaagtcaggcaaatcagaa 24412406  T
Q  108 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttct 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24412407 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 24412506  T
Q  208 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24412507 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 24412606  T
Q  308 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 407  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24412607 actacaaacaaagctcttcacatacaaagcaaattccaagctctctcactgtatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 24412706  T
Q  408 aagatttgagtatttatttgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 507  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24412707 aagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 24412806  T
Q  508 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtg 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24412807 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacagactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtg 24412906  T
Q  608 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24412907 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactct 24413005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 655; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 30454910 - 30454212
Alignment:
Q  8 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30454910 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 30454811  T
Q  108 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttct 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30454810 agaacattctgagaacgttctggctatttttaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 30454711  T
Q  208 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30454710 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgaaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 30454611  T
Q  308 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 407  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30454610 actacaaacaaagctcttcacatacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 30454511  T
Q  408 aagatttgagtatttatttgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 507  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30454510 aagatttgagtatttattctatccaaacaaatctcttcatacaaagtgtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 30454411  T
Q  508 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtg 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30454410 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtg 30454311  T
Q  608 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30454310 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 30454212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 651; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 30459968 - 30459270
Alignment:
Q  8 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30459968 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 30459869  T
Q  108 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttct 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30459868 agaacattctgagaacgttctggctatttttaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 30459769  T
Q  208 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30459768 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgaaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 30459669  T
Q  308 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 407  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30459668 actacaaacaaagctcttcacatacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 30459569  T
Q  408 aagatttgagtatttatttgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 507  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30459568 aagatttgagtatttattctatccaaacaaatctcttcatacaaagtgtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 30459469  T
Q  508 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtg 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30459468 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgccgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtg 30459369  T
Q  608 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30459368 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 30459270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 647; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 30445538 - 30444840
Alignment:
Q  8 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30445538 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 30445439  T
Q  108 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttct 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30445438 agaacattctgagaacgttctggctatttttaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 30445339  T
Q  208 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30445338 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgaaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 30445239  T
Q  308 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 407  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30445238 actacaaacaaagctcttcacatacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 30445139  T
Q  408 aagatttgagtatttatttgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 507  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30445138 aagatttgagtatttattctatccaaacaaatctcttcatacaaagtgtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 30445039  T
Q  508 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtg 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30445038 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttatggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtg 30444939  T
Q  608 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30444938 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaatcaggataactct 30444840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 617; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 706
Target Start/End: Original strand, 24421767 - 24422454
Alignment:
Q  8 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24421767 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcatcacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttctaagtcaggcaaatcagaa 24421866  T
Q  108 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttct 207  Q
    ||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  24421867 agaacattct-----------ggctattttaaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccagcagctctattttct 24421955  T
Q  208 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24421956 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 24422055  T
Q  308 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 407  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422056 actacaaacaaagctcttcacatacaaagcaaattccaagctctctcactgtatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 24422155  T
Q  408 aagatttgagtatttatttgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 507  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422156 aagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 24422255  T
Q  508 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtg 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422256 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtg 24422355  T
Q  608 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24422356 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactct 24422454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 579; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 706
Target Start/End: Original strand, 22488666 - 22489362
Alignment:
Q  8 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 107  Q
    ||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22488666 gacatcatcagcattaggcagcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgtgcaagcaa-gcaacagtgctttcaaagccaggcaaatcagaa 22488764  T
Q  108 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttct 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22488765 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 22488864  T
Q  208 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 307  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22488865 cccttgatcaccaagacactcctcacctataaatacaagggtctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctctaagtgaaaatcatc 22488964  T
Q  308 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  22488965 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcttctctcttgaatttg-ctattgtaaaactcaaaca 22489063  T
Q  408 aagatttgagtatttatttgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22489064 aagatttgagtatttatttgatccaaacaaatctcatcatacaaagtgtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 22489163  T
Q  508 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtg 607  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||  || |||||    
T  22489164 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtagaagtctgctgaggttgataatacaggtgtaacggactgatctggtgtgatcaagatcttatagtg 22489263  T
Q  608 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22489264 ctagtcataagtttctgttagcaagacaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 22489362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 442; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 706
Target Start/End: Original strand, 4635442 - 4636122
Alignment:
Q  8 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 107  Q
    ||||||||||| |||| ||  ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4635442 gacatcatcagcagtgcgcaacaagttatacaactcattacaactggttctctcacgcgcaagcaa-gcaatagtgctttcaaagccaggcaaatcagaa 4635540  T
Q  108 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttct 207  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  4635541 agaacattttgagaacattctagctattttaaagaagaaaagaaaaatcaattgagactttggacaactatcaaaaacgcatccaacagctctattttct 4635640  T
Q  208 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 307  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4635641 cccttgatcaccaagacactcctcacctataaatacaagggtctttgaaggtcataagctagagttttgcaagctaatatctctctaagtgaaaatcatc 4635740  T
Q  308 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 407  Q
    |||                |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| | ||||||||||||||||    
T  4635741 act----------------gcaaacaaagcaaattccaagctccctcactatatctcttggatcttctctttcgaatttgc-tattgtaaaactcaaaca 4635823  T
Q  408 aagatttgagtatttatttgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 507  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4635824 aagaattaagtatttatttgatccaaacaaatctcatcatacaaagtgtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 4635923  T
Q  508 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtg 607  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||| ||||||||||||||  || |||||    
T  4635924 caacatttcttttgctagtgtgcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgataaaacaggtgtaacggactgatatggtgtgatcaagatcttatagtg 4636023  T
Q  608 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4636024 ctggtcagaagtttctgttagcaagacaactatagtggataatctcacgtgaggtgtggggactgaaaatagccgggtttggtgaaccaggataactct 4636122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 470 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 24244287 - 24244054
Alignment:
Q  470 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtat-aagcctgctgaggttgataatacaga 568  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  24244287 aagtctattgggctgaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgctagtg--caaagaattgtaagaatcctgctgaggttgataatacaga 24244191  T
Q  569 ggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggg 668  Q
    ||||||  ||||||| |||||||||||||  |||||||| |  | |||||||||||  | |  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24244190 ggttacaaactgatcgggtgtgatcaagacgttgtagtgttgattagaagtttctgccaac-tgaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgggg 24244092  T
Q  669 actgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24244091 actggaagtagccggatttggtgaaccaggataactct 24244054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 470 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 24290911 - 24290678
Alignment:
Q  470 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtat-aagcctgctgaggttgataatacaga 568  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  24290911 aagtctattgggctgaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgctagtg--caaagaattgtaagaatcctgctgaggttgataatacaga 24290815  T
Q  569 ggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggg 668  Q
    ||||||  ||||||| |||||||||||||  |||||||| |  | |||||||||||  | |  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24290814 ggttacaaactgatcgggtgtgatcaagacgttgtagtgttgattagaagtttctgccaac-tgaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgggg 24290716  T
Q  669 actgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24290715 actggaagtagccggatttggtgaaccaggataactct 24290678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 470 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 42732818 - 42732588
Alignment:
Q  470 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaga 568  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||| ||    ||  ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  42732818 aagtctattgggcttaatagttt-gagatagaagagtttcaacctttcttgtg----tgatcaa-gaattgtagaagcctgttgaggttgataatacagg 42732725  T
Q  569 ggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggg 668  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||  ||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42732724 ggttctggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgctagttagaagtttctactagct-gaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgggg 42732626  T
Q  669 actgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42732625 actggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 42732588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 470 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 13815617 - 13815384
Alignment:
Q  470 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtat-aagcctgctgaggttgataatacaga 568  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||      
T  13815617 aagtttattgggcttaatagttta-agatagaaaattccaacctttcttttgctagtg--caaagaattgtaagaagcctgttgaggttgataatacaag 13815521  T
Q  569 ggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 666  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||  || ||||| | || |||||||||   || |||  ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  13815520 ggttacagaatgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttc---taccaactgaatactatagtggataatctcacatgaagtgtgg 13815424  T
Q  667 ggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13815423 ggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactct 13815384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 470 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 33955745 - 33955511
Alignment:
Q  470 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 567  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33955745 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 33955649  T
Q  568 aggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 665  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33955648 tggttacgtactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtg 33955552  T
Q  666 gggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33955551 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 33955511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 470 - 706
Target Start/End: Original strand, 11223318 - 11223551
Alignment:
Q  470 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 567  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11223318 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 11223414  T
Q  568 aggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca-agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 666  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| | || |||||||||   || ||  | | |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  11223415 gggttacagactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttc---taccactgtatactataatggataatctcacacgaagtgtgg 11223511  T
Q  667 ggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11223512 ggactggaagtagccgagtttggtgaaccaggataactct 11223551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 470 - 706
Target Start/End: Original strand, 20035941 - 20036175
Alignment:
Q  470 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 567  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   ||||||||||| || ||| |  |  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||    
T  20035941 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaaccttttttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctaaggttgataatatag 20036037  T
Q  568 aggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 665  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  20036038 tggttatggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgtatactatagtggataatctcacatgatgtgtg 20036134  T
Q  666 gggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20036135 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 20036175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 532 - 702
Target Start/End: Original strand, 5600580 - 5600749
Alignment:
Q  532 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 630  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||| ||||     
T  5600580 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagc- 5600678  T
Q  631 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 702  Q
    || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||| || ||||||||||||    
T  5600679 aggatactatagtggataatctcacacgtggtgtggggactggacgtagcc-ggttaggcgaaccaggataa 5600749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 532 - 702
Target Start/End: Original strand, 5610226 - 5610395
Alignment:
Q  532 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 630  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||| ||||     
T  5610226 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagc- 5610324  T
Q  631 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 702  Q
    || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||| || ||||||||||||    
T  5610325 aggatactatagtggataatctcacacgtggtgtggggactggacgtagcc-ggttaggcgaaccaggataa 5610395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 470 - 706
Target Start/End: Original strand, 20834373 - 20834607
Alignment:
Q  470 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 567  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  20834373 aagtctattgggcttaatagttt-gacataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattggagaagcctgctgaggttgattatacag 20834469  T
Q  568 aggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 665  Q
     ||||||| ||||||||||| |||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | |||||||||||||||||||||||  |||||    
T  20834470 tggttacgaactgatctggtatgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgcatactatagtggataatctcacacggagtgtg 20834566  T
Q  666 gggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20834567 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 20834607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 529 - 685
Target Start/End: Complemental strand, 22118291 - 22118134
Alignment:
Q  529 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag-aggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgtta 627  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||  || ||||| || ||||||||||||||||    
T  22118291 gcaaataattgtagaagcatgctgatgttgataatacaggatgtaacagactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttattcagaagtttctgtta 22118192  T
Q  628 gcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggt 685  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22118191 gcaagacaactataatggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagtcgggt 22118134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 37 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 24278987 - 24278813
Alignment:
Q  37 acagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattt 136  Q
    |||| |||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||| |||   |||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24278987 acagttcattacaactggtactctcatgcacaagcaa-gcaacaatgcaagcaaagttaggcaaatcagacacaacatt-tgagaacgttctggctattt 24278890  T
Q  137 t-aaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatca-aaaacgtgtccaacaactctattttctccct 211  Q
    | ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24278889 ttaaagaagaagagagaaatcaactgagattttggacagctatcaaaaaacgtgtccaacaactctattttctccct 24278813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 37 - 211
Target Start/End: Original strand, 24383227 - 24383401
Alignment:
Q  37 acagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattt 136  Q
    |||| |||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||| |||   |||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24383227 acagttcattacaactggtactctcatgcacaagcaa-gcaacaatgcaagcaaagttaggcaaatcagacacaacatt-tgagaacgttctggctattt 24383324  T
Q  137 t-aaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatc-aaaaacgtgtccaacaactctattttctccct 211  Q
    | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24383325 ttaaagaagaagagagaaatcaactgagattttggacagctatcaaaaaacgtgtccaacaactctattttctccct 24383401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 532 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 31150820 - 31150651
Alignment:
Q  532 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 630  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||| ||||     
T  31150820 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagc- 31150722  T
Q  631 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 702  Q
    || | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||| |||| || ||||||||||||    
T  31150721 aggatactatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagcc-ggttaggcgaaccaggataa 31150651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 552 - 706
Target Start/End: Original strand, 26652642 - 26652795
Alignment:
Q  552 gaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatc 651  Q
    |||||||||||||||  ||||  | |||||| ||||||||||||||  |  |||||||||| |||||||||| |||||  ||| |||||||||||| |||    
T  26652642 gaggttgataatacaagggttctgaactgatatggtgtgatcaagacctaatagtgctagttagaagtttctattagct-gaatactatagtggattatc 26652740  T
Q  652 tcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  26652741 tcacacgaagtgtggggactggaagtagtcaggtttggtgaaccagcataactct 26652795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 552 - 706
Target Start/End: Original strand, 26924227 - 26924380
Alignment:
Q  552 gaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatc 651  Q
    |||||||||||||||  ||||  | |||||| ||||||||||||||  |  |||||||||| |||||||||| |||||  ||| |||||||||||| |||    
T  26924227 gaggttgataatacaagggttctgaactgatatggtgtgatcaagacctaatagtgctagttagaagtttctattagct-gaatactatagtggattatc 26924325  T
Q  652 tcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  26924326 tcacacgaagtgtggggactggaagtagtcaggtttggtgaaccagcataactct 26924380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 267 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 22118545 - 22118443
Alignment:
Q  267 aagagttttgcaagctaatat-ctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctct 365  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  22118545 aagagttttgaaagcaaatattctctcaa-gtgaaaatcatcactacatacaaagctcttcacaaacaaatcaaattccaagc--tctcattatatctct 22118449  T
Q  366 tggatc 371  Q
    ||||||    
T  22118448 tggatc 22118443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 636 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 22448411 - 22448341
Alignment:
Q  636 actatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  22448411 actatagtggataatctcacacgaagtgtggggactggaagtagccggattgggtgaaccaggataactct 22448341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 636 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 37514940 - 37514874
Alignment:
Q  636 actatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 702  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  37514940 actatagtggataatctcacacaaggtgtggggactagaagtagccggctttgatgaaccagtataa 37514874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 529 - 702
Target Start/End: Original strand, 16110881 - 16111058
Alignment:
Q  529 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgtta 627  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  || || || || |||||||||||||||||  | ||||| || ||  |||||| || ||    
T  16110881 gcaaataattgtataaacctgttgatgttgataatacagaatgtaacagattggtctggtgtgatcaagaacatatagtgttattccaaagtttttgata 16110980  T
Q  628 gcaagaaaactatagtggat---aatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgg-gtttggtgaaccaggataa 702  Q
    | | || | ||||| |||||   |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  16110981 gtaggata-ctataatggatggtaatctcacacgaagtgtcgggactggaagtagccggcttttggtgaaccatgataa 16111058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 661 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 22457722 - 22457677
Alignment:
Q  661 gtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  22457722 gtgtggggactggaagtagccggattgggtgaacaaggataactct 22457677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 652; Significance: 0; HSPs: 25)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 652; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 28368362 - 28367664
Alignment:
Q  8 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28368362 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcatcacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttctaagtcaggcaaatcagaa 28368263  T
Q  108 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttct 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28368262 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 28368163  T
Q  208 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 307  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28368162 cccttggt-accaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 28368064  T
Q  308 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 407  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28368063 actacaaacaaagctcttcacaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 28367964  T
Q  408 aagatttgagtatttatttgatccaaa-caaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaatt 506  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28367963 aagatttgagtatttattcgatccaaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaatt 28367864  T
Q  507 ccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagt 606  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28367863 ccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagt 28367764  T
Q  607 gctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28367763 gctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 28367664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 652; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 28376180 - 28375482
Alignment:
Q  8 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28376180 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcatcacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttctaagtcaggcaaatcagaa 28376081  T
Q  108 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttct 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28376080 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 28375981  T
Q  208 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 307  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28375980 cccttggt-accaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 28375882  T
Q  308 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 407  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28375881 actacaaacaaagctcttcacaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 28375782  T
Q  408 aagatttgagtatttatttgatccaaa-caaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaatt 506  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28375781 aagatttgagtatttattcgatccaaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaatt 28375682  T
Q  507 ccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagt 606  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28375681 ccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagt 28375582  T
Q  607 gctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28375581 gctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 28375482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 652; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 28384002 - 28383304
Alignment:
Q  8 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28384002 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcatcacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttctaagtcaggcaaatcagaa 28383903  T
Q  108 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttct 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28383902 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 28383803  T
Q  208 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 307  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28383802 cccttggt-accaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 28383704  T
Q  308 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 407  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28383703 actacaaacaaagctcttcacaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 28383604  T
Q  408 aagatttgagtatttatttgatccaaa-caaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaatt 506  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28383603 aagatttgagtatttattcgatccaaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaatt 28383504  T
Q  507 ccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagt 606  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28383503 ccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagt 28383404  T
Q  607 gctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28383403 gctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 28383304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 648; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 28352430 - 28351731
Alignment:
Q  8 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28352430 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacaactcatcacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttctaagtcaggcaaatcagaa 28352331  T
Q  108 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttct 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28352330 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 28352231  T
Q  208 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28352230 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 28352131  T
Q  308 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 407  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28352130 actacaaacaaagctcttcacaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 28352031  T
Q  408 aagatttgagtatttatttgatcc-aaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaatt 506  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28352030 aagatttgagtatttattcgatccaaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaatt 28351931  T
Q  507 ccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagt 606  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28351930 ccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctaaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagt 28351831  T
Q  607 gctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28351830 gctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccagcataactct 28351731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 331 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 24794932 - 24794557
Alignment:
Q  331 acaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaacaaagatttgagtatttatttgatc 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24794932 acaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatc 24794833  T
Q  431 caaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgc 530  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24794832 caaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgc 24794733  T
Q  531 aaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 630  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24794732 aaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 24794633  T
Q  631 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24794632 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 24794557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 97 - 706
Target Start/End: Original strand, 4951164 - 4951770
Alignment:
Q  97 gcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacaa 196  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  4951164 gcaaatcagacataacattatgagaacgttcttcctatttttaagaagaaaagagaaatcaattgagactttagacagttatcaaaaacgtgtccaacaa 4951263  T
Q  197 ctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaaga-gttttgcaagctaatat-ctctcaa 294  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| | |||  ||| ||||||||||  ||||| |||||||    
T  4951264 ctctagtttctcccttgatcaccaagacactcctcacctataaatacaagtggttttgaaggtta-aagatagaagttttgcaagtaaatattctctcaa 4951362  T
Q  295 agtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttg 394  Q
     |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||| | |||    
T  4951363 -gtgaaaatcaccactacaaacaaaactctttgcaaacaaagcaaattccaagttctctcactatgtctcttggatcttctctttcgaatttgc-tattg 4951460  T
Q  395 taaaa-ctcaaacaaagatttgagtatttatttgatccaaac-aaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttt 492  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  4951461 taaaatctcaaacaaagtgttgagtatttatttgatccaaaccaaatctcattgtacaatg--tgttgtatttctcat-gtctatttggcttaatagttt 4951557  T
Q  493 tgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgat 592  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||     
T  4951558 -gagatagaaaatttcaacctttcttttgctagtgtgtaaagaattgtagaaggctgttgaggttgataatacaggtgtaacagactgatctggtgtgac 4951656  T
Q  593 caagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtga 692  Q
    ||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| || |||||||||    
T  4951657 caataccttgtagtgctagtcagaaatttctgttagcaagacaaatatagtggataatctcacacgaggtgtgaggacttgaagtagtcgagtttggtga 4951756  T
Q  693 accaggataactct 706  Q
    |||| |||||||||    
T  4951757 accaagataactct 4951770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 8 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 38529846 - 38529524
Alignment:
Q  8 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 107  Q
    ||||||||||  | |||||  ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  38529846 gacatcatcaacattgggcaacaagttaaacaactcattacagctggttctctcacgcgcaagcaa-gcaacagtgctttcaaagtcagacaattcagaa 38529748  T
Q  108 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaaga-gaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttc 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38529747 agaacattctgagaacggtctggctattttaaagaagaaaaaaagaaatcaattgagactttggacaactataaaaaacgtgtccaacaactctattttc 38529648  T
Q  207 tcccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcat 306  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38529647 tcccttgatcaccaagacactcctcgcctataaatacaagggcctttgaagattataagcaagagttttgcaagctaatatctctctaagtgaaaatcat 38529548  T
Q  307 cactacaaacaaagctcttcgcaa 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  38529547 cactacaaacaaagctcttcgcaa 38529524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 392 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 38529502 - 38529188
Alignment:
Q  392 ttgtaaaactcaaacaaagatttgagtatttatttgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagtt 491  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  38529502 ttgtaaaactaaaacaaagtattgagtatttatttgatccaaacaaatctcatcatacaaagtgtgttgtaattctcaaagtctattgggcttaatcgtt 38529403  T
Q  492 ttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtga 591  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||   || || |||| |||||||||||    
T  38529402 ttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtagaagcctactgaggttgataatacaagtgtaacagactcatctggtgtga 38529303  T
Q  592 tcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtg 691  Q
    ||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  38529302 tcaagatcttatagtgctagtcagaaatttctgttagcaagacaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggcactggaagtagccgggtttggtg 38529203  T
Q  692 aaccaggataactct 706  Q
    ||| | |||||||||    
T  38529202 aactatgataactct 38529188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 470 - 706
Target Start/End: Original strand, 5385632 - 5385866
Alignment:
Q  470 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 567  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  5385632 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgatgatacag 5385728  T
Q  568 aggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggg 667  Q
     ||||||  |||||||||||||||||||||  || ||||| | || |||||||||| | |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5385729 tggttacatactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctatcagct-gtatactatagtggataatctcacacgaagtgtggg 5385827  T
Q  668 gactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5385828 gactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 5385866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 470 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 46305818 - 46305585
Alignment:
Q  470 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 567  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46305818 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 46305722  T
Q  568 aggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 665  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| | || |||||||||   || |||  | | |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  46305721 tggttacagactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttc---taccaactgtatactaaagtggataatctca-acgaagtgtg 46305626  T
Q  666 gggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  46305625 gggactggaagtagccgggtttgatgaaccaagataactct 46305585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 532 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 17530046 - 17529877
Alignment:
Q  532 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 630  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||| ||||     
T  17530046 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagc- 17529948  T
Q  631 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 702  Q
    || | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||| |||| || ||||||||||||    
T  17529947 aggatactatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagcc-ggttaggcgaaccaggataa 17529877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 529 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 13328465 - 13328289
Alignment:
Q  529 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttag 628  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||| | || ||||||||||   |     
T  13328465 gcaaagaattgtagaagcttgctgaggttgataatacaagggttacggactgatctggtgtgatcaagacctaatagtgttggttagaagtttct---ac 13328369  T
Q  629 caa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  13328368 caactgtatactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactggaagtagtcgggtttggtgaaccaagataactct 13328289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 470 - 706
Target Start/End: Original strand, 23486983 - 23487219
Alignment:
Q  470 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 567  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||| ||||||| ||| |  |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  23486983 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaagctttcttgtgcaaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacaa 23487079  T
Q  568 aggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 665  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| | || |||||||||   || |||  ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  23487080 gggttacagactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttc---taccaactgaatactatagtggataatctcacacgaaatgtg 23487176  T
Q  666 gggac--tgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    |||||  || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  23487177 gggactgtggaagtaaccgggattggtgaaccaggataactct 23487219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 532 - 702
Target Start/End: Original strand, 32877870 - 32878039
Alignment:
Q  532 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 630  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||| || |||||    
T  32877870 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacagactgatctggtgtgatcaacaaattatagtgttattcagaagtttatgatagca 32877969  T
Q  631 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 702  Q
     || | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||| |||| || ||||||||||||    
T  32877970 tgata-ctatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagcc-ggttaggcgaaccaggataa 32878039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 532 - 702
Target Start/End: Original strand, 54624655 - 54624824
Alignment:
Q  532 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 630  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  54624655 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacagactgatctggtatgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagca 54624754  T
Q  631 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 702  Q
     || | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||| |||| || ||||||||||||    
T  54624755 ggata-ctatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagcc-ggttaggcgaaccaggataa 54624824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 532 - 702
Target Start/End: Original strand, 48978670 - 48978835
Alignment:
Q  532 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 630  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||     |    
T  48978670 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctg-----a 48978764  T
Q  631 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 702  Q
     | | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||| |||| || ||||||||||||    
T  48978765 tggatactatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagcc-ggttaggcgaaccaggataa 48978835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 532 - 702
Target Start/End: Original strand, 48988210 - 48988375
Alignment:
Q  532 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 630  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||     |    
T  48988210 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctg-----a 48988304  T
Q  631 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 702  Q
     | | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||| |||| || ||||||||||||    
T  48988305 tggatactatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagcc-ggttaggcgaaccaggataa 48988375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 108 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 7784764 - 7784561
Alignment:
Q  108 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttct 207  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||| |||||||||||| |||||||| |||  ||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||     
T  7784764 agaacattctaagaacattctgtctgttt-aaagaagaaaagtgaaatcaattgaagctttggaaagctgccaaaaacatgtccaacaacactattttca 7784666  T
Q  208 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaata-tctctcaaagtgaaaatcat 306  Q
    | |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| |  | |||||||   ||| |||||||||  |||| | || |||||| |||||||||||||    
T  7784665 ctcttgatcaccaaggcactgctcacctataaatacaagtggttatgaaggttgaaagtaagagttttaaaagcaagtattctctc-aagtgaaaatcat 7784567  T
Q  307 cactac 312  Q
    ||||||    
T  7784566 cactac 7784561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 531 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 7784194 - 7784091
Alignment:
Q  531 aaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagc 629  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  7784194 aaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacagggtgtaacagactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttagtcataagtttctgttagc 7784095  T
Q  630 aaga 633  Q
    ||||    
T  7784094 aaga 7784091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 373
Target Start/End: Original strand, 27168983 - 27169216
Alignment:
Q  139 aagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttctcccttggtcaccaagacactcctcacctata 238  Q
    ||||||||||| |||||||| |||  | ||||||||||     |||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  27168983 aagaagaaaagtgaaatcaattgaatcgttggacagctgcactaaacgtgtccaacacctctattttcactcttgatcaccaagtcactcctcacctata 27169082  T
Q  239 aatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaata-tctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcgcaaacaaagc 337  Q
    || ||||| |   | ||||||  ||   |||||||||| |||  |  | |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||      
T  27169083 aacacaagtggtctagaaggttctatataagagttttgaaagtaagcattctctc-aagtgaaaatcatcactacatacaaagttcttcacaaacaaa-a 27169180  T
Q  338 aaattccaagctctctcactatatctcttggatcat 373  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  27169181 aaatttcaagctctctcattatatcttttggatcat 27169216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 576 - 702
Target Start/End: Original strand, 19388809 - 19388936
Alignment:
Q  576 gactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgtta--gcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactga 673  Q
    ||||||| |||||| ||||| || || |||||||| |||||||||| || ||  ||  ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||      
T  19388809 gactgatatggtgtcatcaacaacttatagtgctattcagaagtttatgatatagct-gaatactatagtcgataatctcacacgaagtgtggggacttg 19388907  T
Q  674 aagtagccgggtttggtgaaccaggataa 702  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  19388908 aagtagccgattttggtgaaccaggataa 19388936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 4362085 - 4361858
Alignment:
Q  139 aagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttctcccttggtcaccaagacactcctcacctata 238  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||  ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||| | |||| |||| ||| |||||| ||  ||||    
T  4362085 aagaagaaaagtgaaaccaattgaagctttggacagctg-caaaaatgtgtccaacaactcttttttcacacttgatcactaagtcactccacatatata 4361987  T
Q  239 aatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaata-tctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcgcaaacaaagc 337  Q
    |||||||| |  ||| ||| |   ||  |||| ||||| |||| || | ||||||  ||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |    
T  4361986 aatacaagtggttttaaagcttcaaataaagaattttgaaagcaaacattctctc-tagtaaaaatcatcactacatac-aagctcttcacaaacaaa-c 4361890  T
Q  338 aaattccaagctctctcactatatctcttgga 369  Q
    |||| ||||||||||||| |||| || |||||    
T  4361889 aaataccaagctctctcattataccttttgga 4361858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 531 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 4361699 - 4361531
Alignment:
Q  531 aaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagc 629  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||  | || || || ||||||| |||||||||    ||  | |||| || |||||||| |||||||    
T  4361699 aaagaattgaagaagtctgctgaggttgataatacaaggtgtaacagaatgatctgttgtgatcaat---tttcaatgctggtaagaagtttttgttagc 4361603  T
Q  630 aagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 702  Q
    | || | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||| |||  |||||||||||||    
T  4361602 aggata-ctataatggataatctcacacgaggtgtggagaccgaaaataaccggatttaatgaaccaggataa 4361531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 640 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 7784066 - 7784009
Alignment:
Q  640 tagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccag 697  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||    
T  7784066 tagtggataatctcacatgtggtgtgggaactggaagtagtcaggtttggtgaaccag 7784009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 636 - 680
Target Start/End: Original strand, 24285493 - 24285537
Alignment:
Q  636 actatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagc 680  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||    
T  24285493 actatagtggataatctcacacgaagtgtagggagtggaagtagc 24285537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 647; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 647; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 702
Target Start/End: Original strand, 3012 - 3706
Alignment:
Q  8 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3012 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 3111  T
Q  108 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttct 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3112 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaaagatactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 3211  T
Q  208 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3212 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgtaagctaatatctgtcaaagtgaaaatcatc 3311  T
Q  308 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 407  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3312 actacaaacaaagctcttcacatacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 3411  T
Q  408 aagatttgagtatttatttgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 507  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3412 aagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 3511  T
Q  508 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtg 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3512 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacagactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtg 3611  T
Q  608 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 702  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3612 ctagtcagaagtttctgttagcaagacaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccagaataa 3706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 647; Significance: 0; HSPs: 26)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 647; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 7789787 - 7789093
Alignment:
Q  8 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7789787 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 7789688  T
Q  108 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttct 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7789687 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaaagatactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 7789588  T
Q  208 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7789587 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgtaagctaatatctgtcaaagtgaaaatcatc 7789488  T
Q  308 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 407  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7789487 actacaaacaaagctcttcacatacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 7789388  T
Q  408 aagatttgagtatttatttgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 507  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7789387 aagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 7789288  T
Q  508 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtg 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7789287 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacagactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtg 7789188  T
Q  608 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 702  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7789187 ctagtcagaagtttctgttagcaagacaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccagaataa 7789093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 277 - 706
Target Start/End: Original strand, 20713818 - 20714246
Alignment:
Q  277 caagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctc 376  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20713818 caagctaatatctctctaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcgcaaacaaagaaaattccaagctctctcactatatctcttggatcttctc 20713917  T
Q  377 tcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaacaaagatttgagtatttatttgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtcta 476  Q
    | | |||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||    
T  20713918 tttcgaatttgc-tattgtaaatctcaaacaaagaattgagtatttatttgatccaaacaaatctcctcataaaaagtgtgttgtatttctcaaagtata 20714016  T
Q  477 ttgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacgg 576  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || || |    
T  20714017 ttgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacaggtgtaacag 20714116  T
Q  577 actgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaag 676  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  20714117 actgatctggtgtgatcaagatcttatagtgctagtcagaagtttctgttagcaagacaactataatggataatgtcacacgaggtgtggggactggaag 20714216  T
Q  677 tagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20714217 tagccgggtttggtgaaccaggataactct 20714246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 470 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 18883404 - 18883171
Alignment:
Q  470 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtat-aagcctgctgaggttgataatacaga 568  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  18883404 aagtctattgggctgaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgctagtg--caaagaattgtaagaagcctgctgaggttgataatacaga 18883308  T
Q  569 ggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 666  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||  || ||||| | || |||| ||||   || |||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18883307 gggtacgaactgatctggtgtgatcaagactttatagtgttggttagaattttc---taccaactgaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgg 18883211  T
Q  667 ggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18883210 ggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactct 18883171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 470 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 25051307 - 25051074
Alignment:
Q  470 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtat-aagcctgctgaggttgataatacaga 568  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  25051307 aagtatattgggcttaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgctagtg--caaagaattgtaagaagcctgctgaggttgataatacaga 25051211  T
Q  569 ggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 666  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| | || |||||||||   || |||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25051210 ggttacagactgatctggtgtgatcaagacattatagtgttggttagaagtttc---taccaactgaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgg 25051114  T
Q  667 ggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    |||||| |||||||| | || ||||||||| |||||||||    
T  25051113 ggactggaagtagccagattgggtgaaccaagataactct 25051074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 470 - 706
Target Start/End: Original strand, 18232870 - 18233103
Alignment:
Q  470 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtat-aagcctgctgaggttgataatacaga 568  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  18232870 aagtctattgggctgaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgctagtg--caaagaattgtaagaatcctgctgaggttgataatacaga 18232966  T
Q  569 ggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggg 668  Q
    ||||||  ||||||| |||||||||||||  |||||||| |  | |||||||||||  | |  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18232967 ggttacaaactgatcgggtgtgatcaagacgttgtagtgttgattagaagtttctgccaac-tgaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgggg 18233065  T
Q  669 actgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18233066 actggaagtagccggatttggtgaaccaggataactct 18233103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 470 - 706
Target Start/End: Original strand, 18242321 - 18242554
Alignment:
Q  470 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtat-aagcctgctgaggttgataatacaga 568  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  18242321 aagtctattgggctgaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgctagtg--caaagaattgtaagaatcctgctgaggttgataatacaga 18242417  T
Q  569 ggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggg 668  Q
    ||||||  ||||||| |||||||||||||  |||||||| |  | |||||||||||  | |  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18242418 ggttacaaactgatcgggtgtgatcaagacgttgtagtgttgattagaagtttctgccaac-tgaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgggg 18242516  T
Q  669 actgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18242517 actggaagtagccggatttggtgaaccaggataactct 18242554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 470 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 25037270 - 25037037
Alignment:
Q  470 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtat-aagcctgctgaggttgataatacaga 568  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  25037270 aagtatattgggcttaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgctagtg--caaagaattgtaagaagcctgctgaggttgataatacaga 25037174  T
Q  569 ggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 666  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| | || |||||||||   || |||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25037173 ggttacagactgatctggtgtgatcaagactttatagtgttggttagaagtttc---taccaactgaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgg 25037077  T
Q  667 ggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    |||||| |||||||| | || ||||||||| |||||||||    
T  25037076 ggactggaagtagccagattgggtgaaccaagataactct 25037037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 470 - 706
Target Start/End: Original strand, 18251772 - 18252005
Alignment:
Q  470 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtat-aagcctgctgaggttgataatacaga 568  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  18251772 aagtctattgggctgaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgctagtg--caaagaattgtaagaatcctgctgaggttgataatacaga 18251868  T
Q  569 ggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggg 668  Q
    ||||||  ||||||| |||||||||||||  || ||||| | || |||||||||||  | |  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18251869 ggttacaaactgatcgggtgtgatcaagacgttatagtgttggttagaagtttctgccaac-tgaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgggg 18251967  T
Q  669 actgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  18251968 actggaagtagccggatttggtgaatcaggataactct 18252005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 470 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 18143673 - 18143440
Alignment:
Q  470 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtat-aagcctgctgaggttgataatacaga 568  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||      
T  18143673 aagtctattgggcttaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgctagtg--caaagaattgtaagaagcctactgaggttgataatacaag 18143577  T
Q  569 ggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 666  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||   ||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18143576 ggttacagactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagttt---ttaccaactgaatgctatagtggataatctcacacgaagtgtgg 18143480  T
Q  667 ggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  18143479 ggactggaagtagccggatttggtgaaccaagataactct 18143440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 470 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 42712423 - 42712189
Alignment:
Q  470 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 567  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42712423 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 42712327  T
Q  568 aggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 665  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42712326 tggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtg 42712230  T
Q  666 gggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42712229 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 42712189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 470 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 31575652 - 31575422
Alignment:
Q  470 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaga 568  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||    ||  ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  31575652 aagtctattgggcttaatagttt-gagatagaagagttccaacctttcttgtg----tgatcaa-gaattgtagaagcttgctgaggttgataatacagg 31575559  T
Q  569 ggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggg 668  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||  ||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31575558 ggttctggactgatttggtgtgatcaagaccttatagtgctagttagaagtttctactagct-gaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgggg 31575460  T
Q  669 actgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31575459 actggaagtagccggatttggtgaaccaggataactct 31575422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 470 - 706
Target Start/End: Original strand, 20044760 - 20044994
Alignment:
Q  470 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 567  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20044760 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 20044856  T
Q  568 aggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 665  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || |||||||||   || |||  | | ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  20044857 gggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttc---taccaactgtatactatcgtggataatctcacacgaagtgtg 20044953  T
Q  666 gggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20044954 gggactggatgtagccgggtttggtgaaccaggataactct 20044994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 470 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 4843968 - 4843733
Alignment:
Q  470 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgt-ataagcctgctgaggttgata--ataca 566  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||  |||||    
T  4843968 aagtctattggccttaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgcta--gtgcaaagaattgtaagaagcctgatgaggttgataatataca 4843872  T
Q  567 gaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgt 664  Q
      |||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||  | || |||| ||||   || |||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4843871 agggttacagactgatctggtgtgatcaagaccttatagtcttggttagaaatttc---taccaactgaatactatagtggataatctcacacgaagtgt 4843775  T
Q  665 ggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  4843774 ggggactggaagtagccggatttagtgaaccaggataactct 4843733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 470 - 706
Target Start/End: Original strand, 12925296 - 12925530
Alignment:
Q  470 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 567  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12925296 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaaa--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 12925392  T
Q  568 aggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 665  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || |||||||||   || |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12925393 tggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttc---taccaactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtg 12925489  T
Q  666 gggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  12925490 gggactggaagtagtcgggtttcgtgaaccaggataactct 12925530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 470 - 706
Target Start/End: Original strand, 20030121 - 20030355
Alignment:
Q  470 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 567  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20030121 aagtctatttggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 20030217  T
Q  568 aggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 665  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || |||||||| |   | |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20030218 ggattacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttat---accaactgtatactatagtggataatctcacacgaagtgtg 20030314  T
Q  666 gggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20030315 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 20030355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 470 - 706
Target Start/End: Original strand, 12767573 - 12767809
Alignment:
Q  470 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 567  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12767573 aagtctattgagcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 12767669  T
Q  568 aggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 665  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || |||||||||   || |||  ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  12767670 gggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttc---taccaactgaatactatagtggataatctcacacgaaatgtg 12767766  T
Q  666 gggac--tgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    |||||  || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  12767767 gggactgtggaagtaaccgggattggtgaaccaggataactct 12767809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 529 - 702
Target Start/End: Original strand, 15833950 - 15834123
Alignment:
Q  529 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgtta 627  Q
    ||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||| | || ||| ||| ||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  15833950 gcaaagaattgtagaaacctactgatgttgataatacagggagtaacgaacttatctggtatggtcaagaacttatagtgctagtcagaagtttcagtta 15834049  T
Q  628 gcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 702  Q
    ||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  15834050 gcatgata-ctataatggataatctcacacgaggtgtgtggactgaaagtagccggatttggtgaaccaagataa 15834123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 530 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 24096262 - 24096090
Alignment:
Q  530 caaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagc 629  Q
    |||||||||| | |||  || ||||||||||||||||  |   | |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24096262 caaagaattgaagaagtttgttgaggttgataatacaaggaaaatggactgatatggtgtaatcaagaacttgtagtgctagtcaaaagtttatgttagc 24096163  T
Q  630 aagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgt-ggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 702  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||    
T  24096162 aag-atactatagtggataatctcacacgaggtgtgggggactggaagtagtcgagtttggtgaaccagaataa 24096090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 575 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 33592275 - 33592145
Alignment:
Q  575 ggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaa 674  Q
    |||||||||| ||||||||||||  || ||||| | ||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  33592275 ggactgatctagtgtgatcaagaccttatagtgttggtcagaagtttctgtcaact-gaaaactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactgga 33592177  T
Q  675 agtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  33592176 agtagccggattgggtgaaccaggataactct 33592145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 575 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 33601914 - 33601784
Alignment:
Q  575 ggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaa 674  Q
    |||||||||| ||||||||||||  || ||||| | ||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  33601914 ggactgatctagtgtgatcaagaccttatagtgttggtcagaagtttctgtcaact-gaaaactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactgga 33601816  T
Q  675 agtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  33601815 agtagccggattgggtgaaccaggataactct 33601784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 569 - 706
Target Start/End: Original strand, 12915499 - 12915635
Alignment:
Q  569 ggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 666  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12915499 ggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtgg 12915595  T
Q  667 ggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12915596 ggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 12915635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 570 - 706
Target Start/End: Original strand, 24634009 - 24634144
Alignment:
Q  570 gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggga 669  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||  ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  24634009 gttatggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgctagttagaagtttctactagct-gaatactatagtggataatatcacacgaagtgtgggga 24634107  T
Q  670 ctgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    ||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  24634108 ctggaagtagtcgggtttgaggaaccaggataactct 24634144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 652 - 706
Target Start/End: Original strand, 20714417 - 20714471
Alignment:
Q  652 tcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20714417 tcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 20714471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 575 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 42896290 - 42896174
Alignment:
Q  575 ggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaa 674  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||||| | || |||||||||| | | |  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  42896290 ggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctatcaact-gaaatctatagtggataatctcacacgaagtgtggagactgga 42896192  T
Q  675 agtagccgggtttggtga 692  Q
    ||||||||| || |||||    
T  42896191 agtagccggattgggtga 42896174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 373
Target Start/End: Original strand, 15833720 - 15833798
Alignment:
Q  294 aagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcat 373  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  15833720 aagtgaaaatcatcactacatacaaagctcctcacaaacaaa-caaattgcaagccctctcattatatcttttggatcat 15833798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 363
Target Start/End: Original strand, 15827294 - 15827476
Alignment:
Q  185 cgtgtccaacaactctattttctcccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtc---at--aagcaagagttttgcaa 279  Q
    |||| ||||||| ||||||||| | |||| | | |||  ||||||||||||||||||||||| |   ||||||||    ||  |||||||||||||| ||    
T  15827294 cgtgaccaacaaatctattttcactcttgattaacaaatcactcctcacctataaatacaagtggtcttgaaggttgaaattaaagcaagagttttgaaa 15827393  T
Q  280 gctaatat-ctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatct 363  Q
    || |  || ||||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  15827394 gcaagcattctctcaa-gtgaaaatcatcactacatacaaagtttttcacaaacaaa-caaattccaagctatctcattatatct 15827476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 643; Significance: 0; HSPs: 17)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 643; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 706
Target Start/End: Original strand, 7592485 - 7593183
Alignment:
Q  8 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7592485 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcatcacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttctaagtcaggcaaatcagaa 7592584  T
Q  108 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttct 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7592585 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 7592684  T
Q  208 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7592685 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 7592784  T
Q  308 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 407  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7592785 actacaaacaaagctcttcgcatacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 7592884  T
Q  408 aagatttgagtatttatttgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 507  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7592885 aagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagtgtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 7592984  T
Q  508 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtg 607  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7592985 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtg 7593084  T
Q  608 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7593085 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactataatggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccaggtttggtgaaccaggataactct 7593183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 8 - 367
Target Start/End: Original strand, 15172798 - 15173157
Alignment:
Q  8 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 107  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15172798 gacatcatcagaagtgagcagcaagttatacagctcattatagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagccaggcaaatcagaa 15172897  T
Q  108 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttct 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15172898 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 15172997  T
Q  208 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 307  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15172998 cccttgatcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctctaagtgaaaatcatc 15173097  T
Q  308 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttg 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15173098 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagaaaattccatgctctctcactatatctcttg 15173157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 8 - 358
Target Start/End: Original strand, 15202224 - 15202571
Alignment:
Q  8 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 107  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  15202224 gacatcatcagaagtgggcagcaagttatacaactcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgcttttaaagccagacaaatcagaa 15202323  T
Q  108 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttct 207  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15202324 agaacattcatagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttct 15202423  T
Q  208 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 307  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||    
T  15202424 cccttgatcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaag---atatctctctaagtgaaaatcatc 15202520  T
Q  308 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcacta 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15202521 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaaggaaattccaagctctctcacta 15202571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 373 - 702
Target Start/End: Original strand, 15174385 - 15174713
Alignment:
Q  373 tctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaacaaagatttgagtatttatttgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaag 472  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15174385 tctctcttgaatttgc-tcttgtaaaactcaaacaaagatttgagtatttatttgatccaaacaaatctcttcatacaaagtgtgttgtatttctcaaag 15174483  T
Q  473 tctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggtt 572  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  15174484 tctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattatataagcctgctgaggttgataatacaggtgta 15174583  T
Q  573 acggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactg 672  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15174584 acggactgatctggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttttgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactg 15174683  T
Q  673 aaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 702  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15174684 gaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 15174713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 8 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 4119133 - 4118893
Alignment:
Q  8 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 107  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4119133 gacatcatcagaagtgagcaacaagttatacagctcattaaagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagccaggcaaatcagaa 4119034  T
Q  108 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttct 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4119033 agaacattctgagaacgttttggctattttaaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 4118934  T
Q  208 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaaggg 248  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4118933 cccttgatcaccaagacactcctcacctataaatacaaggg 4118893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 470 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 11634574 - 11634341
Alignment:
Q  470 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtat-aagcctgctgaggttgataatacaga 568  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  11634574 aagtctattgggctgaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgctagtg--caaagaattgtaagaagcctgctgaggttgataatacaga 11634478  T
Q  569 ggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggg 668  Q
    ||||||  ||||||| |||||||||||||  || ||||| | || |||||||||||  | |  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11634477 ggttacaaactgatcgggtgtgatcaagacgttatagtgttggttagaagtttctgccaac-tgaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgggg 11634379  T
Q  669 actgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11634378 actggaagtagccggatttggtgaaccaggataactct 11634341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 470 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 14635023 - 14634789
Alignment:
Q  470 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 567  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14635023 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaaaagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 14634927  T
Q  568 aggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggg 667  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14634926 tggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccagct-gcatactatagtggataatctcacacgaagtgtggg 14634828  T
Q  668 gactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14634827 gactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 14634789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 470 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 14644723 - 14644489
Alignment:
Q  470 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 567  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14644723 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaaaagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 14644627  T
Q  568 aggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 665  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14644626 tggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtg 14644530  T
Q  666 gggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14644529 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 14644489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 470 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 33292422 - 33292188
Alignment:
Q  470 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 567  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33292422 aagtctattgggctcaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 33292326  T
Q  568 aggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 665  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33292325 tggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtg 33292229  T
Q  666 gggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33292228 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 33292188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 474 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 15947614 - 15947384
Alignment:
Q  474 ctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggt 571  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15947614 ctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacagtggt 15947518  T
Q  572 tacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggga 669  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || |||||||||   || |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  15947517 tacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttc---taccaactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtggtga 15947421  T
Q  670 ctgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15947420 ctggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 15947384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 470 - 706
Target Start/End: Original strand, 9736888 - 9737122
Alignment:
Q  470 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 567  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9736888 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaaaagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 9736984  T
Q  568 aggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggg 667  Q
     || ||| |||||||||||||||||||||   || ||||| | || ||||||||||   | |  ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  9736985 gggctacagactgatctggtgtgatcaaggccttatagtgttggttagaagtttctacaaact-gaatactataatggataatctcacacgaagtgtggg 9737083  T
Q  668 gactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9737084 gactggaagtagccgggtttagtgaaccaggataactct 9737122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 470 - 706
Target Start/End: Original strand, 32817939 - 32818172
Alignment:
Q  470 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaga 568  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||| |||||||||| ||| |     |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||     
T  32817939 aagtctattgggcttaatagttta-agataggaaagttcgaacctttcttgtgcgaaaa--caaaaaattgtagaagcctgcggaggttgataatacagg 32818035  T
Q  569 ggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 666  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32818036 ggttacagactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgg 32818132  T
Q  667 ggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32818133 ggaccggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 32818172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 531 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 19352775 - 19352600
Alignment:
Q  531 aaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagc 629  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||| | || |||||  ||||||||||||||| ||| || |||| | ||||||||||||||||||||    
T  19352775 aaagaagtgtagaagcctgatgaggttcataatacagggtgtaacggaaagatctggtgtgatcaggaatttatagtacaagtcagaagtttctgttagc 19352676  T
Q  630 aagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    | || | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  19352675 aggaga-ctatagtggataatctcacacgaagtgtgaggactggaagtagccgaatttggtgaaccagtataactct 19352600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 575 - 706
Target Start/End: Original strand, 13874432 - 13874561
Alignment:
Q  575 ggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactg 672  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13874432 ggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgaaaactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactg 13874528  T
Q  673 aaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
     |||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  13874529 gaagtag-cggattgggtgaaccaggataactct 13874561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 535 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 4306739 - 4306573
Alignment:
Q  535 aattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggtta--cggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaag 632  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||| ||    |||||||| ||| ||||||||| |||   |    
T  4306739 aattgtagaagtctgctgaggttgataatacagagtgtaatcggactgatctggtgtgatcaacaa--catagtgctattcataagtttctgatag-ttg 4306643  T
Q  633 aaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 702  Q
     | |||||||| || |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||| || |||||||||| |||||||    
T  4306642 gatactatagtagaaaatctcactcgaagtgtgggaactggaagtagctggctttggtgaactaggataa 4306573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 603 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 48710121 - 48710018
Alignment:
Q  603 tagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgt-ggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggata 701  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  48710121 tagtgctagttagaagtttctactagct-gaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgggggactggaagtatccgagtttggtgaaccagaata 48710023  T
Q  702 actct 706  Q
     ||||    
T  48710022 tctct 48710018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 470 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 48711526 - 48711401
Alignment:
Q  470 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaga 568  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| ||  |  |  ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||      
T  48711526 aagtctattgtgcttaatagttt-gagatagaaaagttttaacctttcttgtgtgaaag--caaagaattatagaagcctgttgaggttgataatacatg 48711430  T
Q  569 ggttacggactgatctggtgtgatcaaga 597  Q
     ||| || |||||| ||||||||||||||    
T  48711429 tgttccgaactgatatggtgtgatcaaga 48711401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 639; Significance: 0; HSPs: 14)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 639; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 23896325 - 23895627
Alignment:
Q  8 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23896325 gacatcatcagaagtgggcagcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagccaggcaaatcagaa 23896226  T
Q  108 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttct 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23896225 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacaactatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 23896126  T
Q  208 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 307  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23896125 cccttgatcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgtaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 23896026  T
Q  308 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23896025 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcttctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 23895926  T
Q  408 aagatttgagtatttatttgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23895925 aagatttgagtatttatttgatccaaacaaatctcatcatacaaagtgtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 23895826  T
Q  508 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtg 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23895825 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgtaacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtg 23895726  T
Q  608 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23895725 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 23895627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 605; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 704
Target Start/End: Original strand, 18420031 - 18420726
Alignment:
Q  8 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18420031 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcatcacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttctaagtcaggcaaatcagaa 18420130  T
Q  108 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttct 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18420131 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 18420230  T
Q  208 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18420231 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 18420330  T
Q  308 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18420331 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattcaaagctctctcactatatctcttggatcttctcacttgaatttg-ctcttgtaaaactcaaaca 18420429  T
Q  408 aagatttgagtatttatttgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18420430 aagatttgagtatttatttgatccaaacaaatctcttcatacaaagtgtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagtttggagatagaaaattc 18420529  T
Q  508 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtg 607  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||  |  |||||    
T  18420530 caacctttcttttgctattgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgtaacggactgatctggtgtgatcaagatttgttagtg 18420629  T
Q  608 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataact 704  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18420630 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtgtataatctcacacgaggtgtcgggactggaagtagccgggttttgtgaaccaggataact 18420726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 470 - 706
Target Start/End: Original strand, 22066235 - 22066469
Alignment:
Q  470 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 567  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22066235 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaaaagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 22066331  T
Q  568 aggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 665  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22066332 tggttacggactgatctagtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtg 22066428  T
Q  666 gggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22066429 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 22066469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 470 - 706
Target Start/End: Original strand, 23884434 - 23884668
Alignment:
Q  470 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 567  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23884434 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 23884530  T
Q  568 aggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 665  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || |||||||||   || |||  | | ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  23884531 tggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttc---taccaactgcatactatagtggacaatctcacacgaagtgtg 23884627  T
Q  666 gggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23884628 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 23884668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 531 - 702
Target Start/End: Original strand, 14102308 - 14102480
Alignment:
Q  531 aaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagc 629  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| | || || | |||||||| |||||||||||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14102308 aaagaattgtagaagtctgctgaggttaataatacagggtgtaacaggctgatctgttgtgatcaagaccttacagtgctagtcaaaagtttctgttagc 14102407  T
Q  630 aagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 702  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14102408 aagacaactatagtggataatctcacaagaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 14102480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 108 - 361
Target Start/End: Original strand, 14101770 - 14102022
Alignment:
Q  108 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttct 207  Q
    |||||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||     
T  14101770 agaacattctgagaacgttcttcccgttttaatgaagaaaagtgaaatcaattgaagctttggacagctgccaaaaacgtatccaacaactctattttca 14101869  T
Q  208 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaata-tctctcaaagtgaaaatcat 306  Q
    | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |  |||||| || | | |||||||||||  |||| |||| | |||| |||||||||||||    
T  14101870 ctcttgatcaccaaggcactcctcacctataaatacaattggttttgaatgttaaatgcaagagtttttaaagcaaatattatctc-aagtgaaaatcat 14101968  T
Q  307 cactacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatat 361  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||  ||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  14101969 cactacatacaaaactcttcacaattaaaacaaactccaa-ctctctcactatat 14102022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 470 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 17512467 - 17512234
Alignment:
Q  470 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 567  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||  |||  ||   |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  17512467 aagtctattgggcttaatagtttt-agataggaaaagttccaacctttctcgtgc--gtaaacaaagaattgtagaagcctgctaaggttgataatacag 17512371  T
Q  568 aggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 665  Q
     |||||| ||||||||| ||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  17512370 -ggttacagactgatctagtgtgatcaagactttatagtgttggttagaagtttct---accaactgtatactatagtggataatctcacaagaagtgtg 17512275  T
Q  666 gggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17512274 gggactgaaagtagccgagtttggtgaaccaggataactct 17512234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 577 - 694
Target Start/End: Original strand, 12173469 - 12173585
Alignment:
Q  577 actgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaag 676  Q
    |||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  12173469 actgatctggtgtgatcaagaatttatggtgctagtcataagtttctgttagcatgata-ctatagtggataatcttacacaaggtgtggggactgaaag 12173567  T
Q  677 tagccgggtttggtgaac 694  Q
    |||||| |||||||||||    
T  12173568 tagccgagtttggtgaac 12173585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 551 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 10259945 - 10259794
Alignment:
Q  551 tgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataa 649  Q
    ||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||| ||    
T  10259945 tgaggtttataatacagggtgtaacggactgatctggtgtgatcaagaatttatagtgctagtcagaagtttctcttagc-aggatactatagtggagaa 10259847  T
Q  650 tctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 702  Q
    || ||||||| ||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  10259846 tcccacacgaagtgtgaggactggaagtagctggatttggtgaaccagaataa 10259794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 576 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 11421591 - 11421466
Alignment:
Q  576 gactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaa 675  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||| ||| ||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11421591 gactgatctggtgtgatcaagatcttatagtgttagtcagaattttttgttaacatgata-ctatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaa 11421493  T
Q  676 gtagccgggtttggtgaaccaggataa 702  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||||    
T  11421492 gtagccggatttgatgaactaggataa 11421466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 576 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 23110359 - 23110242
Alignment:
Q  576 gactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaa 675  Q
    |||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  23110359 gacttatctggtgtgatcaagaacatatagtgctagtcagaagtttctgttagc-cgaatactatagtggataatctaacacggggtgtggggactggaa 23110261  T
Q  676 gtagccgggtttggtgaac 694  Q
    ||||| || ||| ||||||    
T  23110260 gtagctggttttcgtgaac 23110242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 532 - 658
Target Start/End: Original strand, 12415064 - 12415190
Alignment:
Q  532 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 630  Q
    |||||| ||| |||||||||  |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||   ||| |||||||| | ||||||||||| ||       
T  12415064 aagaatcgtagaagcctgctatggttaataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacttattatagtgctattaagaagtttctgata-ag 12415162  T
Q  631 agaaaactatagtggataatctcacacg 658  Q
    || | |||||| ||||||||||||||||    
T  12415163 aggatactataatggataatctcacacg 12415190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 536 - 630
Target Start/End: Original strand, 13218359 - 13218453
Alignment:
Q  536 attgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 630  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || | || || |||| |||||||||||||| |  || |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  13218359 attgtataagcttgttgaggttgataatatagtgattccgaactggtctggtgtgatcaataccttatagttctagtcaaaagtttctgttagca 13218453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 244
Target Start/End: Original strand, 12173040 - 12173144
Alignment:
Q  139 aagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttctcccttggtcaccaagacactcctcacctata 238  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||| | |||| ||||| ||| |||||||||||||||||    ||  ||||||| ||||||| || |||||    
T  12173040 aagaagaaaagtgaaatcaattgaaactttggatatctat-aaaaatgtgcccaacaactctattttcatagtttatcaccaacacactccacatctata 12173138  T
Q  239 aataca 244  Q
    ||||||    
T  12173139 aataca 12173144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 574; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 574; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 31516 - 30834
Alignment:
Q  8 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31516 gacatcatcagaagtgggcagcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgtgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagccaggcaaatcagaa 31417  T
Q  108 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttct 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31416 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 31317  T
Q  208 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 307  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31316 cccttgttcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctctaagtgaaaatcatc 31217  T
Q  308 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 407  Q
    ||||||||||||||                |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31216 actacaaacaaagc----------------aaattccaagctctctcactatatctcttggatcttctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 31133  T
Q  408 aagatttgagtatttatttgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31132 aagatttgagtatttatttgatccaaacaaatctcatcatacaaagtgtgttgtatgtctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 31033  T
Q  508 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtg 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  31032 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttactgactgatctggtgtgatcaaaatattgtagtg 30933  T
Q  608 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30932 ttagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 30834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 41 - 706
Target Start/End: Original strand, 9559 - 10218
Alignment:
Q  41 ctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattttaaa 140  Q
    ||||||| |||||||| | |||  ||||||||| ||||||| ||   |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  9559 ctcattatagctggttctttcactcgcaagcaa-gcaacagagcaagcaaagctaggcaaatcagacagaacattctgagaacgttctagctatttttaa 9657  T
Q  141 gaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttctcccttggtcaccaagacactcctcacctataaa 240  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  9658 gaagaaaagtgaaaacaaatgagactttggacagctatcaaaaatgtgtccatcaactctattttcacccttgatcaccaagacactcctcacctatata 9757  T
Q  241 tacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaata-tctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaa 339  Q
    |||||     ||||||||| | | |||||||||||| |||  |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9758 tacaaatagttttgaaggttaaaggcaagagttttgaaagaaaatattctctc-aagtgaaaaacatcactacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaa 9856  T
Q  340 attccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaa-ctcaaacaaagatttgagtatttatttgatccaaa-caa 437  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |  ||||||  | |||||||| ||||||| | |  |||||||||||||||||||||| |||    
T  9857 atttcaagctctctcactatatcacttggatattctctttcaaatttg-ttattgtaaaatctcaaac-aggtgttgagtatttatttgatccaaaccaa 9954  T
Q  438 atctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaat 537  Q
    ||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||  |||||||||||    
T  9955 atctcattatacaaagtgtgttgtaattctc-aagtctattatgcttaatag-tttgagatagaaaattctaacatttatttttcta--gtgcaaagaat 10050  T
Q  538 tgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaac 637  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10051 tgtagaagcctattgaggttgataatacaggtgtaacagactgatctggtgtgatctagaccttatagtgctagtcagaagtttctgttagcaagacaac 10150  T
Q  638 tatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  10151 tatagtggataatctcacacggggtgtggggactggaa-tagccgtgtttggtgaaccaagataactct 10218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 497; Significance: 0; HSPs: 13)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 497; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 31711162 - 31710477
Alignment:
Q  8 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 107  Q
    ||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  31711162 gacatcatcagcattgggcaacaagttatacagctcattacaactggttctctcacgcgcaagcaa-gcaacagtgctttcaaagccaggaaaatcagaa 31711064  T
Q  108 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttct 207  Q
    |||||||||||           |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31711063 agaacattctg-----------gctatttttaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacaactatcaaaaacgcgtccaacaactctattttct 31710975  T
Q  208 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 307  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31710974 cacttgatcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagtaagagttttgcaagctaatatctctctaagtgaaaatcatc 31710875  T
Q  308 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||| | ||||||||||||||||    
T  31710874 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcttctctttcgagtttgc-tattgtaaaactcaaaca 31710776  T
Q  408 aagatttgagtatttatttgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 507  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31710775 aagaattgagtatttatttgatccaaacaaatctcatcatacaaagtgtgttgtatttctcaaagtctattgggcttactagttttgagatagaaaattc 31710676  T
Q  508 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtg 607  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||  || |||||    
T  31710675 caacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtagaagtctgctgaggttgataatacaggtgtaacggactgatctggtgtgatcaagatcttatagtg 31710576  T
Q  608 ctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31710575 ctagtcagaagtttctgttagcaagacaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaacaaggataactct 31710477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 487; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 24023445 - 24022753
Alignment:
Q  12 tcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaa 111  Q
    ||||||||| || ||  ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  24023445 tcatcagaattgagcgacaagttaaacagctcattacagttggttctctcacgcgcaag-aaagcaacagtgctttcaaagtaaggcaattcagacagaa 24023347  T
Q  112 cattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttctccct 211  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24023346 cattctaagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggatagctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttctccct 24023247  T
Q  212 tggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcacta 311  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24023246 tgatcactaagacactcctcacctataaatacaagggcttttgaaggttataaccaagacttttgcaagctaatatctctctaagtgaaaatcatcacta 24023147  T
Q  312 caaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaacaaaga 411  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||     
T  24023146 caaacaaagctcttcgcaaataaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcttctctttcgaatttg-ctattgtaaaactcaaacaaagt 24023048  T
Q  412 tttgagtatttatttgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaac 511  Q
     |||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24023047 attgagtatttatttgatccaaagaaatttcatcatacaaagtgtgttgtatttctcaaagtctattggggttaatagttttgagatagaaaatttcaac 24022948  T
Q  512 ctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctag 611  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  24022947 cttccttttgctagtgtgcaaagaattgtagaagcctgttgaggttgataatacaggtgtaacggactgatctggtgtgatcaagatcttatagtgctag 24022848  T
Q  612 tcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24022847 tcagaagtttctgttagcaagacaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggaattggaagtagccgggtttggtgaacgaggataactct 24022753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 444 - 702
Target Start/End: Original strand, 14273121 - 14273377
Alignment:
Q  444 tcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtata 543  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14273121 tcatacaaagtgtattgtatttctcaa-gtctattgggcttaatagttta-agatagaaaattccaacatttcttttgctagtgtgcaaagaattgtaga 14273218  T
Q  544 agcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagt 643  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  || || ||||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14273219 agcctgctgaggttgataatataggtgtaacagactgatatggtgtgattaagatcttatagtgctagtcagaagtttctgttagcaagacaactatagt 14273318  T
Q  644 ggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 702  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14273319 ggataatctcacacgaggtgtggagactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 14273377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 73 - 363
Target Start/End: Original strand, 14272600 - 14272889
Alignment:
Q  73 aagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggac 172  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14272600 aagcaacaatgctttcaaagttaggcaattcagacagaacattctgaaaacgttctggctatttataagtagaaaagagaaatcaattgagactttggac 14272699  T
Q  173 agctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttctcccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | | ||||||    
T  14272700 agctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttctcccttgatcaccaagacactcctcacctataaatacaagggtctttgaaggttaaaggtaagagt 14272799  T
Q  273 tttgcaagctaata-tctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatct 363  Q
    |||| |||| || | |||||  || ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14272800 tttgaaagcaaacattctcttgaa-tgaaaatcatcactacatacaaaactcttcacaaacaaaacaaactccaa-ctctctcactatatct 14272889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 470 - 706
Target Start/End: Original strand, 35877458 - 35877692
Alignment:
Q  470 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 567  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35877458 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 35877554  T
Q  568 aggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 665  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35877555 tggttacgaactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtg 35877651  T
Q  666 gggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35877652 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 35877692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 470 - 706
Target Start/End: Original strand, 35884947 - 35885181
Alignment:
Q  470 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 567  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35884947 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 35885043  T
Q  568 aggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 665  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35885044 tggttacgaactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtg 35885140  T
Q  666 gggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35885141 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 35885181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 470 - 706
Target Start/End: Original strand, 36724660 - 36724894
Alignment:
Q  470 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 567  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36724660 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 36724756  T
Q  568 aggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 665  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36724757 tggttacgaactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtg 36724853  T
Q  666 gggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36724854 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 36724894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 470 - 706
Target Start/End: Original strand, 3396865 - 3397099
Alignment:
Q  470 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 567  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||     
T  3396865 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattttagaagtctgctgaggttgataatacaa 3396961  T
Q  568 aggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 665  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || |||||||||   || |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3396962 tggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttc---taccaactgtatactatagtggataatctcacacgaagtgtg 3397058  T
Q  666 gggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    ||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  3397059 gggactagaagtagctgggtttggtgaaccatgataactct 3397099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 532 - 702
Target Start/End: Original strand, 1800493 - 1800662
Alignment:
Q  532 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 630  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||| ||||     
T  1800493 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagc- 1800591  T
Q  631 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 702  Q
    || | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||| |||| || ||||||||||||    
T  1800592 aggatactatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagcc-ggttaggcgaaccaggataa 1800662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 532 - 702
Target Start/End: Original strand, 22632402 - 22632571
Alignment:
Q  532 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 630  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||| ||||     
T  22632402 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgttagtcagaagtttctgatagc- 22632500  T
Q  631 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 702  Q
    || | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||| |||| || ||||||||||||    
T  22632501 aggatactatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagcc-ggttaggcgaaccaggataa 22632571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 532 - 702
Target Start/End: Original strand, 1790999 - 1791164
Alignment:
Q  532 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 630  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||     |    
T  1790999 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctg-----a 1791093  T
Q  631 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 702  Q
     | | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||| |||| || ||||||||||||    
T  1791094 tggatactatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagcc-ggttaggcgaaccaggataa 1791164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 551 - 694
Target Start/End: Original strand, 18578707 - 18578850
Alignment:
Q  551 tgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataa 649  Q
    ||||||||||||||||| | || || || || |||||||| |||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||| | || |  ||  ||| ||||    
T  18578707 tgaggttgataatacagggtgtaacagattggtctggtgttatcaagaacttatagtcctagtcaaaagtttctgttaggaggatat-tactgtgaataa 18578805  T
Q  650 tctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaac 694  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  18578806 tctcacacaaggtgtggggactgaaagtagtcgggtttgatgaac 18578850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 636 - 705
Target Start/End: Original strand, 16446670 - 16446739
Alignment:
Q  636 actatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactc 705  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||    
T  16446670 actatagtggataatctcacacgaaatgtggggactgaaagtagtcggatttagtgatccaggataactc 16446739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 369; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 26812 - 26309
Alignment:
Q  8 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 107  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26812 gacatcatcagcattgggcagcaagttatacagctcattacagctgattaactcatgcgcatacaa-gcaacagtgctttcaaagccagacaaatcagaa 26714  T
Q  108 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttct 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  26713 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggatagctatcaaaaatgtgtccaacatctctattttct 26614  T
Q  208 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 307  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26613 cccttgatcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagtaagagttttgcaagctaatatctctctaagtgaaaatcatc 26514  T
Q  308 actacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaaca 407  Q
    ||||||||||                ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26513 actacaaaca----------------aagcaaattccaagctctctcactatatcccttggatcttctctcttgaatttg-ctcttgtaaaactcaaaca 26431  T
Q  408 aagatttgagtatttatttgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 507  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26430 aagatttgagtatttattttatccaaacaaatctcatcatacaaagtgtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattc 26331  T
Q  508 caacctttcttttgctagtgtg 529  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  26330 caacctttcttttgctagtgtg 26309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 8 - 317
Target Start/End: Original strand, 412777 - 413086
Alignment:
Q  8 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  412777 gacatcatcagaagtgggcagcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgtgcaagcaaagcaatagtgctttcaaagtcagacaaatcagaa 412876  T
Q  108 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttct 207  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  412877 agaacattatgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaaagagtccaacaactctattttct 412976  T
Q  208 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 307  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  412977 cccttgatcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatc 413076  T
Q  308 actacaaaca 317  Q
    ||||||||||    
T  413077 actacaaaca 413086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 427 - 706
Target Start/End: Original strand, 408226 - 408505
Alignment:
Q  427 gatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagt 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  408226 gatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagt 408325  T
Q  527 gtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgtt 626  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  408326 gtgcaaagaattgtataagcctgaagaggttgataatacaggtgttacggactaatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgtt 408425  T
Q  627 agcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  408426 agcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagacgggtttggtgaaccaggataactct 408505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 272; Significance: 1e-151; HSPs: 13)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 8 - 671
Target Start/End: Complemental strand, 15810688 - 15810030
Alignment:
Q  8 gacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaa 107  Q
    ||||| ||||||| || ||  ||||| | |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||   |||||| | ||||||||||     
T  15810688 gacataatcagaattgagcaacaagtaaaacagctcattacagctggttctctcactcgcaagcaa-gcaacagtgcaagcaaagttatgcaaatcagac 15810590  T
Q  108 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttct 207  Q
    | |||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |     
T  15810589 ataacattctgagatcattctgtctatttttaagaagaaaaatgaaatcaattaggactttggacagctatcaaaaatgtgtccaacaactctatttgca 15810490  T
Q  208 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatat-ctctcaaagtgaaaatcat 306  Q
    || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||  | | | |||||||||||| |||  ||||| ||||||| ||||||| |||    
T  15810489 ccattgatcaccaagacactcatcacctataaatacaagtggttttgaattttaaaggcaagagttttgaaagaaaatattctctcaa-gtgaaaaacat 15810391  T
Q  307 cactacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaa-ctcaaa 405  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||| | |||||||| ||||||    
T  15810390 cactacaaacaaagctcctcgcaaacaaagcaaatttcaagctctctcactatatctcttgcatcttctctttcgaatttgc-tattgtaaaatctcaaa 15810292  T
Q  406 caaagatttgagtatttatttgatccaaac-aaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa 504  Q
    ||| |  |||||||||||||| |||||||| |||| || | |||||||| |||||||| ||||||| || | ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  15810291 caa-gtgttgagtatttattttatccaaaccaaatatcattatacaaagtgtgttgtaattctcaa-gtatgttgagcttaatagttt-gagatagaaaa 15810195  T
Q  505 ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgta 604  Q
    ||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  15810194 ttccaacctttcttttgctggtt--caaagaattgtagaagcatgccgaagttgataatacaggtgtaacggactgatctggtgtgatcaagaccttata 15810097  T
Q  605 gtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggact 671  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15810096 gtgctactcagaagtttctgttaccaagataattatagtggataatctcacacgaggtgtggggact 15810030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 529 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 5378613 - 5378439
Alignment:
Q  529 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgtta 627  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| || | || || ||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||    
T  5378613 gcaaagaattgtagaagtctgctgaggtttataatatagggtgtaacagactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgctagttagaagtttctgtta 5378514  T
Q  628 gcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 702  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5378513 gcaagacaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 5378439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 529 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 14272205 - 14272029
Alignment:
Q  529 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttag 628  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   |     
T  14272205 gcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacagtggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgtttgttagaagtttct---ac 14272109  T
Q  629 caa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14272108 caactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 14272029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 529 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 14282071 - 14281895
Alignment:
Q  529 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttag 628  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   |     
T  14282071 gcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacagtggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgtttgttagaagtttct---ac 14281975  T
Q  629 caa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14281974 caactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 14281895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 529 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 40999224 - 40999046
Alignment:
Q  529 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgtta 627  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  | || ||  ||||||||||||||||||| |  || |||||||||||| ||||||| ||||    
T  40999224 gcaaagaattgtagaagtctgttgaggttgataatacatggtgtaacaaactgatctggtgtgatcaaaaccttatagtgctagtcataagtttccgtta 40999125  T
Q  628 gcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  40999124 gcaagacaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagttgtcgggtttggtgaaccaggataactct 40999046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 532 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 26906431 - 26906261
Alignment:
Q  532 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 630  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26906431 aagaattgtaaaagtctgctgaggttgataatacagagtgtaacagactgatctggtgtgaccaagaacttatagtgctagtcagaagtttctgttaaca 26906332  T
Q  631 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 702  Q
    ||| |  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26906331 agatat-tataatggataatctcacacgaggtatggggactagaagtagcctggtttggtgaaccaggataa 26906261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 294 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 40999455 - 40999283
Alignment:
Q  294 aagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctctt 393  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||  |    
T  40999455 aagtgaaaaacatcactacatacaaagctcttcgcaaacaaagtaaattccaagctctctcactatatctcttggatcttctctttcgaatttg-cttat 40999357  T
Q  394 gtaaaactcaaacaaagatttgagtatttatttgatccaaa-caaatctcttcatacaaagagtgttgtatttct 467  Q
    ||||| ||||||| |||  ||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||||| || ||||| ||||    
T  40999356 gtaaatctcaaac-aagtgttgagaatttatttgatccaaaccaaatctcatcttacaaagtgtattgtaattct 40999283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 529 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 3471124 - 3470949
Alignment:
Q  529 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttag 628  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || || || | || |||||||||   ||     
T  3471124 gcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacagtggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttataatgttggttagaagtttc---tac 3471028  T
Q  629 caa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactc 705  Q
    |||  | | |||| |||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3471027 caattgtatactacagtggataatctcacatgaagtgtgggggctggaagtaaccgggtttggtgaaccaggataactc 3470949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 94 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 41001003 - 41000835
Alignment:
Q  94 caggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaa---cgtgtc 190  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| | ||||| | | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||    
T  41001003 caggcaaatcagacataacattctgagatctttctgcccaattttaagaagaaaagtgaaatcaaatgagactttggacatctataaaaaaaaacgtgtc 41000904  T
Q  191 caacaactctattttctcccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggt 259  Q
    ||||| |||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  41000903 caacatctctattttcactcttgatcaccaaggcactcctcacctataaatacaagtggttttgaaggt 41000835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 470 - 697
Target Start/End: Original strand, 21633524 - 21633747
Alignment:
Q  470 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacaga 568  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||  |  |  ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  21633524 aagtctattgggcataatagttt-gagatagaaaagttccaacatttcttgtgtgaaag--caaggaatt-tagaagcctgctgaggttgataatacagt 21633619  T
Q  569 ggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggg 668  Q
     ||| |||||||||||||||||| |||||  || || ||||||||||||||||||  |||  |||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  21633620 tgttccggactgatctggtgtgaccaagaccttataatgctagtcagaagtttctactag-tagaatactatagtggataatctcacaaaaagtgtgggg 21633718  T
Q  669 actgaaagtagccgggtttggtgaaccag 697  Q
    |||  | ||||||||||||||||||||||    
T  21633719 actagacgtagccgggtttggtgaaccag 21633747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 575 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 21919572 - 21919442
Alignment:
Q  575 ggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactg 672  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21919572 ggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgaaaactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactg 21919476  T
Q  673 aaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
     |||||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  21919475 gaagtagccggattgggtgaatcaggataactct 21919442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 529 - 679
Target Start/End: Original strand, 30676788 - 30676938
Alignment:
Q  529 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgtta 627  Q
    |||||||||| ||||||  || |||| |||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||  | |||||||| ||| ||||||||  ||    
T  30676788 gcaaagaattatataagtatgttgagattgataatacagagtgtaacagactgatcttgtgtgatcaagaacatatagtgctattcataagtttcttata 30676887  T
Q  628 gcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtag 679  Q
    ||  ||| | | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30676888 gc-tgaatattgtaatggataatctcacacgaagtgtggggactgaaagtag 30676938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 573 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 28310155 - 28310080
Alignment:
Q  573 acggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataa 649  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||| || || ||||||| || |||| || | ||||||||||||||    
T  28310155 acggactgatctggtgtgatcaacaacttatagtgttattcggaagtttttgatagc-aggatactatagtggataa 28310080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 470 - 706
Target Start/End: Original strand, 256901 - 257134
Alignment:
Q  470 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtat-aagcctgctgaggttgataatacaga 568  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  256901 aagtctattgggctgaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgctagtg--caaagaattgtaagaagcttgctgaggttgataatacaga 256997  T
Q  569 ggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 666  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||| | || |||||||||   || |||  ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  256998 ggttacgaactgatctggtgtgatcaagactttatagtgttggttagaagtttc---taccaactgaatactatagtggataatttcacacgaagtgtgg 257094  T
Q  667 ggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  257095 ggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactct 257134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 98; Significance: 7e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 470 - 706
Target Start/End: Original strand, 2051 - 2285
Alignment:
Q  470 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 567  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2051 aagtctatttggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 2147  T
Q  568 aggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 665  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || |||||||| |   | |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2148 ggattacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttat---accaactgtatactatagtggataatctcacacgaagtgtg 2244  T
Q  666 gggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2245 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 2285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 529 - 706
Target Start/End: Original strand, 124047 - 124223
Alignment:
Q  529 gcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttag 628  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || |||||||||   ||     
T  124047 gcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacagtggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttc---tac 124143  T
Q  629 caa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | || |||| |||||||||||||||||    
T  124144 caactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactggaagtaacaggatttgatgaaccaggataactct 124223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 470 - 597
Target Start/End: Original strand, 143111 - 143237
Alignment:
Q  470 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacag 567  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  143111 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 143207  T
Q  568 aggttacggactgatctggtgtgatcaaga 597  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  143208 tggttacggactgatctggtgtgatcaaga 143237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 551 - 702
Target Start/End: Original strand, 100002 - 100152
Alignment:
Q  551 tgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataa 649  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||| |||| || | |||||| |||||||    
T  100002 tgaggttgataatacagagtgtaacagactgatttggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagc-aggatactataatggataa 100100  T
Q  650 tctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 702  Q
    |||||||||  |||||||||||| |  ||||| |||| || ||||||||||||    
T  100101 tctcacacgtagtgtggggactggacatagcc-ggttaggcgaaccaggataa 100152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 80; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 532 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 14999 - 14830
Alignment:
Q  532 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 630  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||| ||||     
T  14999 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacagactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagc- 14901  T
Q  631 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 702  Q
    || | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||| |||| || ||||||||||||    
T  14900 aggatactatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagcc-ggttaggcgaaccaggataa 14830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 80; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 532 - 702
Target Start/End: Original strand, 24593 - 24762
Alignment:
Q  532 aagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 630  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||| ||||     
T  24593 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagc- 24691  T
Q  631 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataa 702  Q
    || | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||| | |||| || ||||||||||||    
T  24692 aggatactatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtag-ctggttaggcgaaccaggataa 24762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 56; Significance: 8e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 575 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 12689 - 12559
Alignment:
Q  575 ggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgaa 674  Q
    ||||| |||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | | | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  12689 ggactaatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccaacta-aaaactatagtggataatctcacacgaagtgtagggactgga 12591  T
Q  675 agtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  12590 agtagccggattgggtgaaccaggataactct 12559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0223 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0223
Description:

Target: scaffold0223; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 529 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 27246 - 27078
Alignment:
Q  529 gcaaagaattgta-taagcctgctgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgtt 626  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||| |||||||||||||  | ||||| || | ||||||||||| |    
T  27246 gcaaagaattgtaataagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacgaattgatctagtgtgatcaagaacatatagtgttattaagaagtttctgat 27147  T
Q  627 agcaagaaaactatag----tggataatctcacacgaggtgtggggactgaaagtagccgggtttggtga 692  Q
    ||   | | |||||||    ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  27146 ag-ttggatactatagtggatggataatctcacacgaagtatggggactggaagtagccgactttggtga 27078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 575 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 2402 - 2272
Alignment:
Q  575 ggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactg 672  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||     
T  2402 ggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgtatactatagtggataatctcacaagaagtgtggggacta 2306  T
Q  673 aaagtagccgggtttggtgaaccaggataactct 706  Q
     |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  2305 gaagtagccggattgggtgaaccaggataactct 2272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University