View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6155_high_7 (Length: 446)

Name: NF6155_high_7
Description: NF6155
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6155_high_7
NF6155_high_7
[»] chr1 (1 HSPs)
chr1 (1-446)||(34973148-34973593)
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (64-446)||(9440412-9440794)
chr8 (64-425)||(24594812-24595173)
[»] chr6 (4 HSPs)
chr6 (64-446)||(27875030-27875412)
chr6 (64-446)||(26977214-26977596)
chr6 (200-439)||(1472921-1473160)
chr6 (224-418)||(21965035-21965229)
[»] chr5 (2 HSPs)
chr5 (64-446)||(34355624-34356006)
chr5 (64-446)||(41722024-41722406)
[»] chr4 (4 HSPs)
chr4 (64-446)||(30946504-30946886)
chr4 (64-446)||(42269517-42269899)
chr4 (64-446)||(48698142-48698524)
chr4 (64-439)||(2002504-2002879)
[»] chr3 (5 HSPs)
chr3 (64-446)||(5819596-5819978)
chr3 (64-446)||(54544759-54545141)
chr3 (204-425)||(42588583-42588804)
chr3 (248-426)||(25877934-25878111)
chr3 (200-327)||(25880388-25880515)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (21-446)||(28303-28738)
[»] chr2 (3 HSPs)
chr2 (21-444)||(829095-829528)
chr2 (65-444)||(28714699-28715078)
chr2 (64-446)||(13841240-13841620)
[»] chr7 (3 HSPs)
chr7 (200-425)||(7506033-7506258)
chr7 (304-425)||(2324646-2324767)
chr7 (21-237)||(2324375-2324601)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 418; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 34973593 - 34973148
Alignment:
Q  1 ttgcaagtctgggtaactgccttggataatcaacttactactcctactgcaagtgtgaacacatagattttcttttattatgatcatctgcaaaatctga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34973593 ttgcaagtctgggtaactgccttggataatcaacttactactcctactgcaagtgtgaacacatagattttcttttattatgatcatctgcaaaatctga 34973494  T
Q  101 gtcgacataacccctaacaattaaatttgatcctccgaatcatattgcaacacatgaggttcctttattgtacctcataattctatcaacatcattttga 200  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34973493 atcgacataacccctaacagttaaatttgatcctccgaatcatattgcaacacctgaggttcctttattgtacctcataattctatcgacatcattttga 34973394  T
Q  201 tgctctttactaggatcctccacaaactgactaaccactcctgctgtttgttcaatgtcttgtcttgtacatataaagacatacttaaggcttctcattg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34973393 tgctctttactaggatcctccacaaactgactaaccactctcgctgtttgttcaatgtcttgtcttgtacatataaagacatacataaggcttctcattg 34973294  T
Q  301 ccgatgcatacggtactcaagacatttctaccctatccgcttcattgttaggactcatacatgaggataatttaaaactcactggaagtagggtagagat 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34973293 ccgatgcatacggtactcaagacatttctaccctatccgcttcattgttaggactcatacatgaggataatttaaaactcactggaagtagggtagagat 34973194  T
Q  401 tggattacagtcttgcatgttgaagtaccgtaagactttccttaga 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34973193 tggattacagtcttgcatgttgaagtaccgtaagactttccttaga 34973148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 64 - 446
Target Start/End: Original strand, 9440412 - 9440794
Alignment:
Q  64 tagattttcttttattatgatcatctgcaaaatctgagtcgacataacccctaacaattaaatttgatcctccgaatcatattgcaacacatgaggttcc 163  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||    
T  9440412 tagattttcttttatcatgatcacctgcaaaatctgaatcaacataacccctgacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcc 9440511  T
Q  164 tttattgtacctcataattctatcaacatcattttgatgctctttactaggatcctccacaaactgactaaccactcctgctgtttgttcaatgtcttgt 263  Q
    |||| |||||||||| ||||| | |||| ||||   |||||||||||  |||||| ||| |||| |||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||    
T  9440512 tttaatgtacctcatgattctcttaacagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggt 9440611  T
Q  264 cttgtacatataaagacatacttaaggcttctcattgccgatgcatacggtactcaagacatttctaccctatccgcttcattgttaggactcatacatg 363  Q
    ||||||||||| | | ||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||| ||    
T  9440612 cttgtacatatcatggcatacataaggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctg 9440711  T
Q  364 aggataatttaaaactcactggaagtagggtagagattggattacagtcttgcatgttgaagtaccgtaagactttccttaga 446  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  9440712 aggataatttaaaattcacaggaagtggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttaga 9440794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 425
Target Start/End: Original strand, 24594812 - 24595173
Alignment:
Q  64 tagattttcttttattatgatcatctgcaaaatctgagtcgacataacccctaacaattaaatttgatcctccgaatcatattgcaacacatgaggttcc 163  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||| || ||||||||  | ||||| || |   |||||| ||| |||| |||||||  | |||||||    
T  24594812 tagatcttcttttatcaagatcacctgcaaaatctgaatcaacataacctttgacaataaattccaatcctctgaaacataatgcaacatctaaggttcc 24594911  T
Q  164 tttattgtacctcataattctatcaacatcattttgatgctctttactaggatcctccacaaactgactaaccactcctgctgtttgttcaatgtcttgt 263  Q
    |||  | || ||||  ||||| | |||| |||    ||| | ||||| ||||||| ||| |||  |||||||| ||||  ||| |||| |||||||| |     
T  24594912 ttttatatatctcaggattctcttaacaacatcccaatgttttttaccaggatccgccataaatcgactaaccgctcccactgcttgtgcaatgtctggc 24595011  T
Q  264 cttgtacatataaagacatacttaaggcttctcattgccgatgcatacggtactcaagacatttctaccctatccgcttcattgttaggactcatacatg 363  Q
    |||||| |||| | | ||||| ||||||||| ||  || |||||||| ||||||| ||||||||| | ||| || ||||||||| ||||| ||||||  |    
T  24595012 cttgtaaatatcatggcatacataaggcttcccaccgctgatgcatagggtactcgagacatttccatcctctctgcttcattgctaggattcatactgg 24595111  T
Q  364 aggataatttaaaactcactggaagtagggtagagattggattacagtcttgcatgttgaag 425  Q
    || |||||||| || | |  |||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  24595112 agaataatttataattgataggaagtggggtagatattggcttacaatcttgcatgttgaag 24595173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 4)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 64 - 446
Target Start/End: Original strand, 27875030 - 27875412
Alignment:
Q  64 tagattttcttttattatgatcatctgcaaaatctgagtcgacataacccctaacaattaaatttgatcctccgaatcatattgcaacacatgaggttcc 163  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||    
T  27875030 tagattttcttttatcatgatcacctgcaaaatctgaatcaacataacccctgacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcc 27875129  T
Q  164 tttattgtacctcataattctatcaacatcattttgatgctctttactaggatcctccacaaactgactaaccactcctgctgtttgttcaatgtcttgt 263  Q
    |||| |||||||||| ||||| | |||| ||||   |||||||||||  |||||| ||| |||| |||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||    
T  27875130 tttaatgtacctcatgattctcttaacagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggt 27875229  T
Q  264 cttgtacatataaagacatacttaaggcttctcattgccgatgcatacggtactcaagacatttctaccctatccgcttcattgttaggactcatacatg 363  Q
    ||||||||||| | | ||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||| ||    
T  27875230 cttgtacatatcatggcatacataaggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctg 27875329  T
Q  364 aggataatttaaaactcactggaagtagggtagagattggattacagtcttgcatgttgaagtaccgtaagactttccttaga 446  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  27875330 aggataatttaaaattcacaggaagtggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttaga 27875412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 64 - 446
Target Start/End: Original strand, 26977214 - 26977596
Alignment:
Q  64 tagattttcttttattatgatcatctgcaaaatctgagtcgacataacccctaacaattaaatttgatcctccgaatcatattgcaacacatgaggttcc 163  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||    
T  26977214 tagattttcttttatcatgatcacctgcaaaatctgaatcaacataacccctgacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcc 26977313  T
Q  164 tttattgtacctcataattctatcaacatcattttgatgctctttactaggatcctccacaaactgactaaccactcctgctgtttgttcaatgtcttgt 263  Q
    |||| |||||||||| ||||| | |||| ||||   |||||||||||  |||||| ||| |||| |||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||    
T  26977314 tttaatgtacctcatgattctcttaacagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggt 26977413  T
Q  264 cttgtacatataaagacatacttaaggcttctcattgccgatgcatacggtactcaagacatttctaccctatccgcttcattgttaggactcatacatg 363  Q
    ||||||||||| | | ||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||| ||    
T  26977414 cttgtacatatcatggcatacataaggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctg 26977513  T
Q  364 aggataatttaaaactcactggaagtagggtagagattggattacagtcttgcatgttgaagtaccgtaagactttccttaga 446  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  26977514 aggataatttaaaattcacaggaagtggggtagagattggcttacaatcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttaga 26977596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 200 - 439
Target Start/End: Original strand, 1472921 - 1473160
Alignment:
Q  200 atgctctttactaggatcctccacaaactgactaaccactcctgctgtttgttcaatgtcttgtcttgtacatataaagacatacttaaggcttctcatt 299  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||  |||||||| ||||  ||| |||| ||||||||   ||||||||||| | | ||||| ||||||||| ||      
T  1472921 atgctctttaccaggatccgccataaatcgactaaccgctcccactgcttgtgcaatgtctgaccttgtacatatcatggcatacataaggcttcccacc 1473020  T
Q  300 gccgatgcatacggtactcaagacatttctaccctatccgcttcattgttaggactcatacatgaggataatttaaaactcactggaagtagggtagaga 399  Q
    || |||||||| ||||||| ||||||||| | ||| || ||||||||| ||||| ||||||  || ||||||||| || | |  |||||| ||||||| |    
T  1473021 gctgatgcatagggtactcgagacatttccatcctctctgcttcattgctaggattcataccggaagataatttataattgataggaagtggggtagata 1473120  T
Q  400 ttggattacagtcttgcatgttgaagtaccgtaagacttt 439  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  1473121 ttggcttacagtcttgcatgttgaagtgccgcaaaacttt 1473160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 224 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 21965229 - 21965035
Alignment:
Q  224 aaactgactaaccactcctgctgtttgttcaatgtcttgtcttgtacatataaagacatacttaaggcttctcattgccgatgcatacggtactcaagac 323  Q
    |||| ||||||| |||||  ||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | ||||||| |||||||||  |  ||  ||  ||||| ||||| ||||    
T  21965229 aaaccgactaactactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttttacatatcatgacatacataaggcttccaaccgcgaatatatacgatactcgagac 21965130  T
Q  324 atttctaccctatccgcttcattgttaggactcatacatgaggataatttaaaactcactggaagtagggtagagattggattacagtcttgcat 418  Q
    ||||  | ||| ||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  21965129 attttcatcctctcttcttcattgttaggactcataccgaaggataatttaaaattcacaagaagtggggtagagattggctaacaatcttgcat 21965035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 64 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 34356006 - 34355624
Alignment:
Q  64 tagattttcttttattatgatcatctgcaaaatctgagtcgacataacccctaacaattaaatttgatcctccgaatcatattgcaacacatgaggttcc 163  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||| |||| |||||||| | |||||||    
T  34356006 tagattttcttttatcatgatcacctgcaaaatctgaatcaacataacccctgacagttaactctgatcctccgaaacatactgcaacacctaaggttcc 34355907  T
Q  164 tttattgtacctcataattctatcaacatcattttgatgctctttactaggatcctccacaaactgactaaccactcctgctgtttgttcaatgtcttgt 263  Q
    |||| |||||||||| ||||| | |||| ||||   |||||||||||  |||||| ||| |||| |||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||    
T  34355906 tttaatgtacctcatgattctcttaacagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggt 34355807  T
Q  264 cttgtacatataaagacatacttaaggcttctcattgccgatgcatacggtactcaagacatttctaccctatccgcttcattgttaggactcatacatg 363  Q
    ||||||||||| | | ||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||| ||    
T  34355806 cttgtacatatcatggcatacataaggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctg 34355707  T
Q  364 aggataatttaaaactcactggaagtagggtagagattggattacagtcttgcatgttgaagtaccgtaagactttccttaga 446  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  34355706 aggataatttaaaattcacaggaagtggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttaga 34355624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 64 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 41722406 - 41722024
Alignment:
Q  64 tagattttcttttattatgatcatctgcaaaatctgagtcgacataacccctaacaattaaatttgatcctccgaatcatattgcaacacatgaggttcc 163  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||    
T  41722406 tagattttcttttatcatgatcacctgcaaaatctgaatcaacataacccctgacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcc 41722307  T
Q  164 tttattgtacctcataattctatcaacatcattttgatgctctttactaggatcctccacaaactgactaaccactcctgctgtttgttcaatgtcttgt 263  Q
    |||| |||||||||| ||||| | |||| ||||   |||||||||||  |||||| ||| |||| |||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||    
T  41722306 tttaatgtacctcatgattctcttaacagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggt 41722207  T
Q  264 cttgtacatataaagacatacttaaggcttctcattgccgatgcatacggtactcaagacatttctaccctatccgcttcattgttaggactcatacatg 363  Q
    ||||||||||| | | ||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||| ||    
T  41722206 cttgtacatatcatggcatacataaggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctg 41722107  T
Q  364 aggataatttaaaactcactggaagtagggtagagattggattacagtcttgcatgttgaagtaccgtaagactttccttaga 446  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  41722106 aggataatttaaaattcacaggaagtggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttaga 41722024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 4)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 64 - 446
Target Start/End: Original strand, 30946504 - 30946886
Alignment:
Q  64 tagattttcttttattatgatcatctgcaaaatctgagtcgacataacccctaacaattaaatttgatcctccgaatcatattgcaacacatgaggttcc 163  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||    
T  30946504 tagattttcttttatcatgatcacctgcaaaatctgaatcaacataacccctgacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcc 30946603  T
Q  164 tttattgtacctcataattctatcaacatcattttgatgctctttactaggatcctccacaaactgactaaccactcctgctgtttgttcaatgtcttgt 263  Q
    |||| |||||||||| ||||| | |||| ||||   |||||||||||  |||||| ||| |||| |||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||    
T  30946604 tttaatgtacctcatgattctcttaacagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggt 30946703  T
Q  264 cttgtacatataaagacatacttaaggcttctcattgccgatgcatacggtactcaagacatttctaccctatccgcttcattgttaggactcatacatg 363  Q
    ||||||||||| | | ||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||| ||    
T  30946704 cttgtacatatcatggcatacataaggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctg 30946803  T
Q  364 aggataatttaaaactcactggaagtagggtagagattggattacagtcttgcatgttgaagtaccgtaagactttccttaga 446  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  30946804 aggataatttaaaattcacaggaagtggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttaga 30946886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 64 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 42269899 - 42269517
Alignment:
Q  64 tagattttcttttattatgatcatctgcaaaatctgagtcgacataacccctaacaattaaatttgatcctccgaatcatattgcaacacatgaggttcc 163  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||    
T  42269899 tagattttcttttatcatgatcacctgcaaaatctgaatcaacataacccctgacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcc 42269800  T
Q  164 tttattgtacctcataattctatcaacatcattttgatgctctttactaggatcctccacaaactgactaaccactcctgctgtttgttcaatgtcttgt 263  Q
    |||| |||||||||| ||||| | |||| ||||   |||||||||||  |||||| ||| |||| |||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||    
T  42269799 tttaatgtacctcatgattctcttaacagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggt 42269700  T
Q  264 cttgtacatataaagacatacttaaggcttctcattgccgatgcatacggtactcaagacatttctaccctatccgcttcattgttaggactcatacatg 363  Q
    ||||||||||| | | ||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||| ||    
T  42269699 cttgtacatatcatggcatacataaggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctg 42269600  T
Q  364 aggataatttaaaactcactggaagtagggtagagattggattacagtcttgcatgttgaagtaccgtaagactttccttaga 446  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  42269599 aggataatttaaaattcacaggaagtggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttaga 42269517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 64 - 446
Target Start/End: Original strand, 48698142 - 48698524
Alignment:
Q  64 tagattttcttttattatgatcatctgcaaaatctgagtcgacataacccctaacaattaaatttgatcctccgaatcatattgcaacacatgaggttcc 163  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||    
T  48698142 tagattttcttttatcatgatcacctgcaaaatctgaatcaacataacccctgacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcc 48698241  T
Q  164 tttattgtacctcataattctatcaacatcattttgatgctctttactaggatcctccacaaactgactaaccactcctgctgtttgttcaatgtcttgt 263  Q
    |||| |||||||||| ||||| | |||| ||||   |||||||||||  |||||| ||| |||| |||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||    
T  48698242 tttaatgtacctcatgattctcttaacagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggt 48698341  T
Q  264 cttgtacatataaagacatacttaaggcttctcattgccgatgcatacggtactcaagacatttctaccctatccgcttcattgttaggactcatacatg 363  Q
    ||||||||||| | | ||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||| ||    
T  48698342 cttgtacatatcatggcatacataaggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctg 48698441  T
Q  364 aggataatttaaaactcactggaagtagggtagagattggattacagtcttgcatgttgaagtaccgtaagactttccttaga 446  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  48698442 aggataatttaaaattcacaggaagtggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttaga 48698524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 64 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 2002879 - 2002504
Alignment:
Q  64 tagattttcttttattatgatcatctgcaaaatctgagtcgacataacccctaacaattaaatttgatcctccgaatcatattgcaacacatgaggttcc 163  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||| || ||||||||  | ||||| || |   |||||| ||| |||| |||||||  | |||||||    
T  2002879 tagatcttcttttatcaagatcacctgcaaaatctgaatcaacataacctttgacaataaattccaatcctctgaaacataatgcaacatctaaggttcc 2002780  T
Q  164 tttattgtacctcataattctatcaacatcattttgatgctctttactaggatcctccacaaactgactaaccactcctgctgtttgttcaatgtcttgt 263  Q
    |||  | || ||||  ||||| | |||| |||    ||||||||||| ||||||| ||| |||  |||||||| ||||  ||| |||| |||||||| |     
T  2002779 ttttatatatctcaggattctcttaacagcatcccaatgctctttaccaggatccgccataaatcgactaaccgctcccactgcttgtgcaatgtctggc 2002680  T
Q  264 cttgtacatataaagacatacttaaggcttctcattgccgatgcatacggtactcaagacatttctaccctatccgcttcattgttaggactcatacatg 363  Q
    ||||||||||| | | ||||| ||||||||| ||   | |||||||| ||||||| ||||||||| | ||| || ||||||||| ||||| ||||||  |    
T  2002679 cttgtacatatcatggcatacataaggcttcccaccactgatgcatagggtactcgagacatttccatcctctctgcttcattgctaggattcatactgg 2002580  T
Q  364 aggataatttaaaactcactggaagtagggtagagattggattacagtcttgcatgttgaagtaccgtaagacttt 439  Q
    ||||||||||| || | |  |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  2002579 aggataatttataattgataggaagtggggtagatattggcttacagtcttgcatgttgaagtgccgcaaaacttt 2002504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 5)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 64 - 446
Target Start/End: Original strand, 5819596 - 5819978
Alignment:
Q  64 tagattttcttttattatgatcatctgcaaaatctgagtcgacataacccctaacaattaaatttgatcctccgaatcatattgcaacacatgaggttcc 163  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||    
T  5819596 tagattttcttttatcatgatcacctgcaaaatctgaatcaacataacccctgacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcc 5819695  T
Q  164 tttattgtacctcataattctatcaacatcattttgatgctctttactaggatcctccacaaactgactaaccactcctgctgtttgttcaatgtcttgt 263  Q
    |||| |||||||||| ||||| | |||| ||||   |||||||||||  |||||| ||| |||| |||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||    
T  5819696 tttaatgtacctcatgattctcttaacagcattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggt 5819795  T
Q  264 cttgtacatataaagacatacttaaggcttctcattgccgatgcatacggtactcaagacatttctaccctatccgcttcattgttaggactcatacatg 363  Q
    ||||||||||| | | ||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||| ||    
T  5819796 cttgtacatatcatggcatacataaggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctg 5819895  T
Q  364 aggataatttaaaactcactggaagtagggtagagattggattacagtcttgcatgttgaagtaccgtaagactttccttaga 446  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  5819896 aggataatttaaaattcacaggaagtggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttaga 5819978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 64 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 54545141 - 54544759
Alignment:
Q  64 tagattttcttttattatgatcatctgcaaaatctgagtcgacataacccctaacaattaaatttgatcctccgaatcatattgcaacacatgaggttcc 163  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||    
T  54545141 tagattttcttttatcatgatcacctgcaaaatctgaatcaacataacccctgacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctgaggttcc 54545042  T
Q  164 tttattgtacctcataattctatcaacatcattttgatgctctttactaggatcctccacaaactgactaaccactcctgctgtttgttcaatgtcttgt 263  Q
    |||| |||||||||| ||||| | |||| ||||   |||||||||||  |||||| ||| |||| |||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||    
T  54545041 tttaatgtacctcatgattctcttaacaacattccaatgctctttacccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggt 54544942  T
Q  264 cttgtacatataaagacatacttaaggcttctcattgccgatgcatacggtactcaagacatttctaccctatccgcttcattgttaggactcatacatg 363  Q
    ||||||||||| | | ||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||| ||    
T  54544941 cttgtacatatcatggcatacataaggcttcccaccgccgatgcatacggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacctg 54544842  T
Q  364 aggataatttaaaactcactggaagtagggtagagattggattacagtcttgcatgttgaagtaccgtaagactttccttaga 446  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  54544841 aggataatttaaaattcacaggaagtggggtagagattggcttacaatcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttaga 54544759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 204 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 42588804 - 42588583
Alignment:
Q  204 tctttactaggatcctccacaaactgactaaccactcctgctgtttgttcaatgtcttgtcttgtacatataaagacatacttaaggcttctcattgccg 303  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||  |||||||| ||||  ||| |||| |||||||| | ||||||||||| | | ||||| ||||||||| ||   | |    
T  42588804 tctttaccaggatccgccataaatcgactaaccgctcccactgcttgtgcaatgtctggccttgtacatatcatggcatacataaggcttcccaccactg 42588705  T
Q  304 atgcatacggtactcaagacatttctaccctatccgcttcattgttaggactcatacatgaggataatttaaaactcactggaagtagggtagagattgg 403  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| || | ||||||| ||||| ||||||  |||||||||||| || | |  |||||| ||||||| |||||    
T  42588704 atgcatagggtactcgagacatttctatcctctctgattcattgctaggattcatactggaggataatttataattgataggaagtggggtagatattgg 42588605  T
Q  404 attacagtcttgcatgttgaag 425  Q
     ||||| |||||||||||||||    
T  42588604 cttacaatcttgcatgttgaag 42588583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 248 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 25878111 - 25877934
Alignment:
Q  248 ttgttcaatgtcttgtcttgtacatataaagacatacttaaggcttctcattgccgatgcatacggtactcaagacatttctaccctatccgcttcattg 347  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| | | ||||| |||| |||| || ||| |||||||| ||||||  ||||||||  | ||| ||||||||||||    
T  25878111 ttgtgcaatgtctagtcttgtacatatcatgtcatacataagacttcccactgctgatgcatagggtacttgagacattttcatcctctccgcttcattg 25878012  T
Q  348 ttaggactcatacatgaggataatttaaaactcactggaagtagggtagagattggattacagtcttgcatgttgaagt 426  Q
     ||||| ||| || ||||||||||||| || | |  | || | ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25878011 ctaggattcagacttgaggataatttataattgatagaaaatggggtagatattggcttacagtcttg-atgttgaagt 25877934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 25880515 - 25880388
Alignment:
Q  200 atgctctttactaggatcctccacaaactgactaaccactcctgctgtttgttcaatgtcttgtcttgtacatataaagacatacttaaggcttctcatt 299  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||  ||||||  ||| |  ||| |||| |||||||| ||||||||||||| | | ||||| ||||||||| ||      
T  25880515 atgctctttaccaggatccgccataaatcgactaattacttccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatcatggcatacataaggcttcccacc 25880416  T
Q  300 gccgatgcatacggtactcaagacattt 327  Q
    || |||||||| ||||||| ||||||||    
T  25880415 gctgatgcataaggtactcgagacattt 25880388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 173; Significance: 7e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 446
Target Start/End: Original strand, 28303 - 28738
Alignment:
Q  21 cttggataatcaacttactactcctactgcaagtgtgaacacata----------gattttcttttattatgatcatctgcaaaatctgagtcgacataa 110  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||          ||||||||||||| ||||||| || |||||||||| || ||||||    
T  28303 cttggataaccaacttactgctcctcctgaaagtgtgaacacataatcagtagtagattttcttttatcatgatcacctacaaaatctgaatcaacataa 28402  T
Q  111 cccctaacaattaaatttgatcctccgaatcatattgcaacacatgaggttcctttattgtacctcataattctatcaacatcattttgatgctctttac 210  Q
    ||||| ||| |||| | |||||||| ||| ||||||||||||   |||||||||||| |||||||||| ||||| | |||| ||||   |||||||||||    
T  28403 cccctgacagttaactctgatcctctgaaacatattgcaacatccgaggttcctttaatgtacctcatgattctcttaacagcattccaatgctctttac 28502  T
Q  211 taggatcctccacaaactgactaaccactcctgctgtttgttcaatgtcttgtcttgtacatataaagacatacttaaggcttctcattgccgatgcata 310  Q
      |||||| ||| |||| |||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||||||||| | | ||||| ||||||||| ||  |||||||||||    
T  28503 ccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatcatggcatacataaggcttcccaccgccgatgcata 28602  T
Q  311 cggtactcaagacatttctaccctatccgcttcattgttaggactcatacatgaggataatttaaaactcactggaagtagggtagagattggattacag 410  Q
    |||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  28603 cggtactcgagacatttccatcctctccgcttcattgctaggactcatacatgaggataatttaaaattcacaagaagtggggtagagattggcttacag 28702  T
Q  411 tcttgcatgttgaagtaccgtaagactttccttaga 446  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  28703 tcttgcatgttgaagcggcgcaagactttccttaga 28738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 3)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 829528 - 829095
Alignment:
Q  21 cttggataatcaacttactactcctactgcaagtgtgaacacata----------gattttcttttattatgatcatctgcaaaatctgagtcgacataa 110  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||          |||||||||||||  |||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  829528 cttggataaccaacttactgctcctcctgcaagcgtgaacacataaccagtagtagattttcttttatcctgatcacctgcaaaatctgaatcaacataa 829429  T
Q  111 cccctaacaattaaatttgatcctccgaatcatattgcaacacatgaggttcctttattgtacctcataattctatcaacatcattttgatgctctttac 210  Q
    ||||| ||| |||| | |||||||||||| ||||  ||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||| | |||| ||||   |||||||||||    
T  829428 cccctgacagttaactctgatcctccgaaacataccgcaacacctggggttcctttaatgtacctcatgattctcttaacaacattccaatgctctttac 829329  T
Q  211 taggatcctccacaaactgactaaccactcctgctgtttgttcaatgtcttgtcttgtacatataaagacatacttaaggcttctcattgccgatgcata 310  Q
      |||||| ||| |||| |||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||||||||| | | ||||| ||||||||| ||  |||||||||||    
T  829328 ccggatccgccataaaccgactaaccactcccactgcttgtgcaatgtctggtcttgtacatatcatggcatacataaggcttcccaccgccgatgcata 829229  T
Q  311 cggtactcaagacatttctaccctatccgcttcattgttaggactcatacatgaggataatttaaaactcactggaagtagggtagagattggattacag 410  Q
    |||||||| ||||||||| | ||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  829228 cggtactcgagacatttccatcctctccacttcattgctaggactcatacctgaggataatttaaaattcacaggaagtggggtagagattggcttacag 829129  T
Q  411 tcttgcatgttgaagtaccgtaagactttcctta 444  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||||||    
T  829128 tcttgcatgttgaagcggcgcaagactttcctta 829095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 65 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 28715078 - 28714699
Alignment:
Q  65 agattttcttttattatgatcatctgcaaaatctgagtcgacataacccctaacaattaaatttgatcctccgaatcatattgcaacacatgaggttcct 164  Q
    ||||||||||| || ||||||| | ||||||||||| || ||||||||| | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28715078 agattttctttcatcatgatcaccggcaaaatctgaatcaacataacccatgacaattaactctgatcctccgaaacatattgcaacacatgaggttcct 28714979  T
Q  165 ttattgtacctcataattctatcaacatcattttgatgctctttactaggatcctccacaaactgactaaccactcctgctgtttgttcaatgtcttgtc 264  Q
    ||| |||||||||| ||||| | |||| ||||   ||||||||||  ||||||   || |||| |||||||||||||  ||  |||| |||| |||  ||    
T  28714978 ttaatgtacctcatgattctcttaacaacattccaatgctctttataaggatctgtcataaaccgactaaccactcccactaattgtgcaatctctgatc 28714879  T
Q  265 ttgtacatataaagacatacttaaggcttctcattgccgatgcatacggtactcaagacatttctaccctatccgcttcattgttaggactcatacatga 364  Q
    |||||||||| | | ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||||  | ||| || ||||||||| |||||||||||||||     
T  28714878 ttgtacatatcatggcatacataaggcttcccaccgccgatgcatacggtattcgagacatttacatcctctctgcttcattgctaggactcatacatgt 28714779  T
Q  365 ggataatttaaaactcactggaagtagggtagagattggattacagtcttgcatgttgaagtaccgtaagactttcctta 444  Q
    ||||| ||||||| |||  | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  28714778 ggatagtttaaaattcatagaaagtggggtagagattggcttacagtcttgcatgttgaagtgccgcaagactttcctta 28714699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 446
Target Start/End: Original strand, 13841240 - 13841620
Alignment:
Q  64 tagattttcttttattatgatcatctgcaaaatctgagtcgacataacccctaacaattaaatttgatcctccgaatcatattgcaacacatgaggttcc 163  Q
    |||||||| | |||| |||||||  || ||||||||| || ||||||||| |  || |||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |    
T  13841240 tagattttatattatcatgatcacttgtaaaatctgaatcaacataacccttgtcatttaactctgatcctccgaaacatattgcaacacttgaggtttc 13841339  T
Q  164 tttattgtacctcataattctatcaacatcattttgatgctctttactaggatcctccacaaactgactaaccactcctgctgtttgttcaatgtcttgt 263  Q
    |||  | || |||| |||||  | ||||  ||||  | | | ||||| |||||   ||| |||| |||||||||||||  || |||||  | ||||| ||    
T  13841340 tttgatatatctcaaaattcatttaaca-aatttaaaggatatttaccaggatatgccataaaccgactaaccactcccactatttgtgtagtgtctggt 13841438  T
Q  264 cttgtacatataaagacatacttaaggcttctcattgccgatgcatacggtactcaagacatttctaccctatccgcttcattgttaggactcatacatg 363  Q
    ||||||||||| | |  |||| ||||||||  ||    | ||||||||||||||| |||||| || | |||  |  |||||||  ||||||| |||| |     
T  13841439 cttgtacatatcatggaatacataaggctttccaccatcaatgcatacggtactcgagacatctccatcctcactacttcatttctaggactgataccta 13841538  T
Q  364 aggataatttaaaactcactggaagtagggtagagattggattacagtcttgcatgttgaagtaccgtaagactttccttaga 446  Q
     | ||||||||||| |||| ||||||  |||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||    
T  13841539 cgaataatttaaaattcacaggaagtgaggtagagattag-ttacaatcttgcatgttaaagtatcgcaagactttccataga 13841620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 3)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 200 - 425
Target Start/End: Original strand, 7506033 - 7506258
Alignment:
Q  200 atgctctttactaggatcctccacaaactgactaaccactcctgctgtttgttcaatgtcttgtcttgtacatataaagacatacttaaggcttctcatt 299  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||| || ||||  ||| |||| |||||||| | ||||||||||| | | ||||| ||||||||| ||      
T  7506033 atgctctttaccaggatccgccataaattgactagccgctcccactgcttgtgcaatgtctggccttgtacatatcatggcatacataaggcttcccacc 7506132  T
Q  300 gccgatgcatacggtactcaagacatttctaccctatccgcttcattgttaggactcatacatgaggataatttaaaactcactggaagtagggtagaga 399  Q
    || |||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||  |||||||| ||||| ||||||  |||||||||||| || | |  |||||| ||||||| |    
T  7506133 gctgatgcatagggtactcgagacatttccatcctatctacttcattgctaggattcatactagaggataatttataattgataggaagtggggtagata 7506232  T
Q  400 ttggattacagtcttgcatgttgaag 425  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||    
T  7506233 ttggcttacagttttgcatgttgaag 7506258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 304 - 425
Target Start/End: Original strand, 2324646 - 2324767
Alignment:
Q  304 atgcatacggtactcaagacatttctaccctatccgcttcattgttaggactcatacatgaggataatttaaaactcactggaagtagggtagagattgg 403  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| | ||| || ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||  |||    
T  2324646 atgcatacggtactcgagatatttccatcctctctgcttcattactaggactcatacttgaggataatttaaaattcaaaggaagtggggtagaggctgg 2324745  T
Q  404 attacagtcttgcatgttgaag 425  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  2324746 cttacagtcttgcatgttgaag 2324767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 237
Target Start/End: Original strand, 2324375 - 2324601
Alignment:
Q  21 cttggataatcaacttactactcctactgcaagtgtgaacacata----------gattttcttttattatgatcatctgcaaaatctgagtcgacataa 110  Q
    |||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||          ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || | | |     
T  2324375 cttggataactaacttacaactcctcctgcaagtgtgaacacataactagtagtagattttcttttatcatgatcacctgcaaaatctgactcaagaaat 2324474  T
Q  111 cccctaacaattaaatttgatcctccgaatcatattgcaacacatgaggttcctttattgtacctcataattctatcaacatcattttgatgctctttac 210  Q
    |||| |||  |||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  | ||| |||| ||||| | |||| ||||   |||||||||||    
T  2324475 cccccaacggttaactctgatcctccgaaacatattgcaacacctgaggttccttttatatacatcatgattctcttaacagcattccaatgctctttac 2324574  T
Q  211 taggatcctccacaaactgactaacca 237  Q
     | ||||| ||| |||| ||| |||||    
T  2324575 caagatccgccataaaccgaccaacca 2324601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University