View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF6174_high_1 (Length: 386)
Name: NF6174_high_1
Description: NF6174
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF6174_high_1 |
 | |
|
| [»] scaffold0029 (2 HSPs) |
| | |
|
Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 6 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 10254983 - 10254668
Alignment:
| Q |
6 |
aaataatactgggcattttattcctgagtatttttagaaaattgtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgg |
105 |
Q |
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| T |
10254983 |
aaataataatgggcatcttattcctgagtatttttagaaaattgtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgg |
10254884 |
T |
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| Q |
106 |
gtagttatttccattttagtaccatttacatgggaatcttttattcccgcccactttctttgggaataaaatcatgggtaagtggaagttannnnnnncc |
205 |
Q |
| |
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| T |
10254883 |
gtagttatttccattttagtaccatttacatgggaatcttttattcccgcccactttctttgggaataaaatcatgggtaagtggaagttatttttttcc |
10254784 |
T |
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| Q |
206 |
taggaattctttattcccgggagttannnnnnnaactttgtaacaaacataggaatctataattccaacctccatattcctgggaataattttttaaacc |
305 |
Q |
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| T |
10254783 |
taggaattctttattcccgggagttatttttttaactttgtaacaaacataggaatctataattccaacctccatgttcctgggaataattttttaaacc |
10254684 |
T |
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| Q |
306 |
aggaaacaaacacccc |
321 |
Q |
| |
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|||||||||||||||| |
|
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| T |
10254683 |
aggaaacaaacacccc |
10254668 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 6 - 321
Target Start/End: Original strand, 36371063 - 36371378
Alignment:
| Q |
6 |
aaataatactgggcattttattcctgagtatttttagaaaattgtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgg |
105 |
Q |
| |
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|
| T |
36371063 |
aaataataatgggcatcttattcctgagtatttttagaaaattgtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgg |
36371162 |
T |
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| Q |
106 |
gtagttatttccattttagtaccatttacatgggaatcttttattcccgcccactttctttgggaataaaatcatgggtaagtggaagttannnnnnncc |
205 |
Q |
| |
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|
|
| T |
36371163 |
gtagttatttccattttagtaccatttacatgggaatcttttattcccgcccactttctttgggaataaaatcatgggtaagtggaagttatttttttcc |
36371262 |
T |
|
| Q |
206 |
taggaattctttattcccgggagttannnnnnnaactttgtaacaaacataggaatctataattccaacctccatattcctgggaataattttttaaacc |
305 |
Q |
| |
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|
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| T |
36371263 |
taggaattctttattcccgggagttatttttttaactttgtaacaaacataggaatctataattccaacctccatgttcctgggaataattttttaaacc |
36371362 |
T |
|
| Q |
306 |
aggaaacaaacacccc |
321 |
Q |
| |
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| T |
36371363 |
aggaaacaaacacccc |
36371378 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 6 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 25990185 - 25989870
Alignment:
| Q |
6 |
aaataatactgggcattttattcctgagtatttttagaaaattgtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgg |
105 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
25990185 |
aaataataatgggcatcttattcctgagtatttttagaaaattgtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgg |
25990086 |
T |
|
| Q |
106 |
gtagttatttccattttagtaccatttacatgggaatcttttattcccgcccactttctttgggaataaaatcatgggtaagtggaagttannnnnnncc |
205 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
25990085 |
gtagttatttccattttagtaccatttacatgggaatcttttattcccgcccactttctttgggaataaaatcatgggtaagtggaagttatttttttcc |
25989986 |
T |
|
| Q |
206 |
taggaattctttattcccgggagttannnnnnnaactttgtaacaaacataggaatctataattccaacctccatattcctgggaataattttttaaacc |
305 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
25989985 |
taggaattctttattcccgggagttatttttttaactttgtaacaaacataggaatctataattccaacctccatattcctgggaataactttttaaacc |
25989886 |
T |
|
| Q |
306 |
aggaaacaaacacccc |
321 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
25989885 |
aggaaacaaacacccc |
25989870 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 6 - 321
Target Start/End: Original strand, 6469635 - 6469950
Alignment:
| Q |
6 |
aaataatactgggcattttattcctgagtatttttagaaaattgtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgg |
105 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6469635 |
aaataataatgggtatcttattcctgagtatttttagaaaattgtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgg |
6469734 |
T |
|
| Q |
106 |
gtagttatttccattttagtaccatttacatgggaatcttttattcccgcccactttctttgggaataaaatcatgggtaagtggaagttannnnnnncc |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
6469735 |
gtagttatttctattttagtaccatttacatgggaatcttttattcccgcccactttctttgggaataaaatcatgggtaagtggaagttatttttttcc |
6469834 |
T |
|
| Q |
206 |
taggaattctttattcccgggagttannnnnnnaactttgtaacaaacataggaatctataattccaacctccatattcctgggaataattttttaaacc |
305 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6469835 |
tagaaattctttattcccgggagttatttttttaactttgtaacaaacataggaatctataattccaacctccatgttcctgggaataattttttaaacc |
6469934 |
T |
|
| Q |
306 |
aggaaacaaacacccc |
321 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
6469935 |
aggaaacaaacacccc |
6469950 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 23435310 - 23435620
Alignment:
| Q |
9 |
taatactgggcattttattcctgagtatttttagaaaattgtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgggta |
108 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23435310 |
taataatgggcatcttatttctgagtatttttagaaaatggtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgggta |
23435409 |
T |
|
| Q |
109 |
gttatttccattttagtaccatttacatgggaatcttttattcccgcccactttctttgggaataaaatcatgggtaagtggaagttannnnnnncctag |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
23435410 |
gttatttccattttagtaccatttacatgggaatcttttattcccgtccactttctttgggaataaaatcatgggtaagtggaagttatttttttcctag |
23435509 |
T |
|
| Q |
209 |
gaattctttattcccgggagttannnnnnnaactttgtaacaaacataggaatctataattccaacctccatattcctgggaataattttttaaaccagg |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23435510 |
gaattctttattcccgggagttatttttttaactttgtaacaaacataggaatctataattccaacctccatgttcctgggaataattttttaaaccagg |
23435609 |
T |
|
| Q |
309 |
aaacaaacacc |
319 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
23435610 |
aaacaaacacc |
23435620 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 9 - 321
Target Start/End: Original strand, 15731516 - 15731827
Alignment:
| Q |
9 |
taatactgggcattttattcctgagtatttttagaaaattgtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgggta |
108 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15731516 |
taataatgggcatcttattcctgagtatttttagaaaatggtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgggta |
15731615 |
T |
|
| Q |
109 |
gttatttccattttagtaccatttacatgggaatcttttattcccgcccactttctttgggaataaaatcatgggtaagtggaagttannnnnnncctag |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
15731616 |
gttatttccattttagtaccatttacatgggaatcttttattcccgtccactttctttgggaataaaatcatgggtaagtggaagttatttttttcctag |
15731715 |
T |
|
| Q |
209 |
gaattctttattcccgggagttannnnnnnaactttgtaacaaacataggaatctataattccaacctccatattcctgggaataattttttaaaccagg |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15731716 |
gaattctttattcccgggaatta-ttttttaactttgtaacaaacataggaatctataattccaacctccatgttcctgggaataattttttaaaccagg |
15731814 |
T |
|
| Q |
309 |
aaacaaacacccc |
321 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
15731815 |
aaacaaacacccc |
15731827 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 9 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 50650472 - 50650160
Alignment:
| Q |
9 |
taatactgggcattttattcctgagtatttttagaaaattgtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgggta |
108 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50650472 |
taataatgggcatcttattcctgagtatttttagaaaacggtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgggta |
50650373 |
T |
|
| Q |
109 |
gttatttccattttagtaccatttacatgggaatcttttattcccgcccactttctttgggaataaaatcatgggtaagtggaagttannnnnnncctag |
208 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
50650372 |
gttatttccattttagtaccatttacatgagaatcttttattcccgtccactttctttgggaataaaatcatgggtaagtggaagttatttttttcctaa |
50650273 |
T |
|
| Q |
209 |
gaattctttattcccgggagttannnnnnnaactttgtaacaaacataggaatctataattccaacctccatattcctgggaataattttttaaaccagg |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50650272 |
aaattctttattaccggaagttatttttttaactttgtaacaaacataggaatctataattccaacctccatgttcctgggaataattttttaaaccagg |
50650173 |
T |
|
| Q |
309 |
aaacaaacacccc |
321 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
50650172 |
aaacaaacacccc |
50650160 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 6 - 231
Target Start/End: Original strand, 42927414 - 42927639
Alignment:
| Q |
6 |
aaataatactgggcattttattcctgagtatttttagaaaattgtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgg |
105 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42927414 |
aaataataatgggcatcttattcctgagtatttttagaaaattgtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgg |
42927513 |
T |
|
| Q |
106 |
gtagttatttccattttagtaccatttacatgggaatcttttattcccgcccactttctttgggaataaaatcatgggtaagtggaagttannnnnnncc |
205 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
42927514 |
gtagttatttccattttagtaccatttacatgggaatcttttattcccgcccactttctttgggaataaaatcatgggtaagtggaagttatttttttcc |
42927613 |
T |
|
| Q |
206 |
taggaattctttattcccgggagtta |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42927614 |
taggaattctttattcccgggagtta |
42927639 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 169 - 306
Target Start/End: Original strand, 15773641 - 15773779
Alignment:
| Q |
169 |
gaataaaatcatgggtaagtggaagtt-annnnnnncctaggaattctttattcccgggagttannnnnnnaactttgtaacaaacataggaatctataa |
267 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| | |||||| ||||||| |||||| || |||||||| | |
|
|
| T |
15773641 |
gaataaaatcatgggtaagtggaagtttattattttcctaagaattttttattcttgtgagttaattttttaactttgaaacaaatattggaatctacca |
15773740 |
T |
|
| Q |
268 |
ttccaacctccatattcctgggaataattttttaaacca |
306 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15773741 |
ttgcaacctccacattcctgggaataattttttaaacca |
15773779 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 273 - 321
Target Start/End: Original strand, 42927644 - 42927692
Alignment:
| Q |
273 |
acctccatattcctgggaataattttttaaaccaggaaacaaacacccc |
321 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
42927644 |
acctccatgttcctgggaataattttttaaaccagaaaacaaacacccc |
42927692 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 5)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 6 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 30155690 - 30155375
Alignment:
| Q |
6 |
aaataatactgggcattttattcctgagtatttttagaaaattgtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgg |
105 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30155690 |
aaataataatgggcatcttattcctgagtatttttagaaaatggtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgg |
30155591 |
T |
|
| Q |
106 |
gtagttatttccattttagtaccatttacatgggaatcttttattcccgcccactttctttgggaataaaatcatgggtaagtggaagttannnnnnncc |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
30155590 |
gtagttatttccattttagtaccatttacatgggaatcttttattcccgcccactttctttgggaataaaatcatgggtaagtggaagttatttttttcc |
30155491 |
T |
|
| Q |
206 |
taggaattctttattcccgggagttannnnnnnaactttgtaacaaacataggaatctataattccaacctccatattcctgggaataattttttaaacc |
305 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30155490 |
taggaattctttattcccgggagttatttttttaactttgtaacaaacataggaatctataattccaacctccatgttcctgggaataattttttaaacc |
30155391 |
T |
|
| Q |
306 |
aggaaacaaacacccc |
321 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
30155390 |
aggaaacaaacacccc |
30155375 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 6 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 26936678 - 26936364
Alignment:
| Q |
6 |
aaataatactgggcattttattcctgagtatttttagaaaattgtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgg |
105 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26936678 |
aaataataatgggcatcttattcctgagtatttttagaaaattgtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgg |
26936579 |
T |
|
| Q |
106 |
gtagttatttccattttagtaccatttacatgggaatcttttattcccgcccactttctttgggaataaaatcatgggtaagtggaagttannnnnnncc |
205 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
26936578 |
gtagctatttccattttagtaccatttacatgggaatcttttattcctgcccactttctttgggaataaaatcatgggtaagtggaagttatttttttcc |
26936479 |
T |
|
| Q |
206 |
taggaattctttattcccgggagttannnnnnnaactttgtaacaaacataggaatctataattccaacctccatattcctgggaataattttttaaacc |
305 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26936478 |
taggaattctttattcccgggatttatttttttaactttgtaacaaacataggaatctataattccaacctccatgttcctgggaataattttttaaacc |
26936379 |
T |
|
| Q |
306 |
aggaaacaaacaccc |
320 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
26936378 |
aggaaacaaacaccc |
26936364 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 283
Target Start/End: Original strand, 32793619 - 32793886
Alignment:
| Q |
15 |
tgggcattttattcctgagtatttttagaaaattgtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgggtagttatt |
114 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| || ||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||| |
|
|
| T |
32793619 |
tgggcatcttattcttgggtattctttaaaatttggatttggtaaataattgtcagattcatgggaattatttgtgatagtggttatatgagcagttatt |
32793718 |
T |
|
| Q |
115 |
tccattttagtaccatttacatgggaatcttttattcccgcccactttctttgggaataaaatcatgggtaagtggaagttannnnnnncctaggaattc |
214 |
Q |
| |
|
|| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
32793719 |
tcaattttattactatttacatgggaaccttttattcccatccac-ttccttgaaaataaaagtatggataagtggaagttattattttgctaggaattt |
32793817 |
T |
|
| Q |
215 |
tttattcccgggagttannnnnnnaactttgtaacaaacataggaatctataattccaacctccatatt |
283 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
32793818 |
tttattttaaggagtcaaattttgaactttgtaacaaacataagaatctataattacaacctccatatt |
32793886 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 29815710 - 29815656
Alignment:
| Q |
239 |
aactttgtaacaaacataggaatctataattccaacctccatattcctgggaata |
293 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | |||||| || ||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29815710 |
aactttgtaacaaacatagaagtctatatttgtaacttccatattcctgggaata |
29815656 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 278 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 44739480 - 44739442
Alignment:
| Q |
278 |
catattcctgggaataattttttaaaccaggaaacaaac |
316 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
44739480 |
catattcctgggaatgatttttaaaaccaggaaacaaac |
44739442 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 12)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 6 - 321
Target Start/End: Original strand, 6218262 - 6218577
Alignment:
| Q |
6 |
aaataatactgggcattttattcctgagtatttttagaaaattgtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgg |
105 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6218262 |
aaataataatgggcatcttattcctgagtatttttaaaaaattgtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgg |
6218361 |
T |
|
| Q |
106 |
gtagttatttccattttagtaccatttacatgggaatcttttattcccgcccactttctttgggaataaaatcatgggtaagtggaagttannnnnnncc |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
6218362 |
gtagttatttccattttagtaccatttacatgggaatcttttattcccgcccactttctttgggaataaaatcatgggtaagtggaagttatttttttcc |
6218461 |
T |
|
| Q |
206 |
taggaattctttattcccgggagttannnnnnnaactttgtaacaaacataggaatctataattccaacctccatattcctgggaataattttttaaacc |
305 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
6218462 |
taggaattctttattcccgggagttatttttttaactttgtaacaaacataggaatctataattccaacctccatattcctgggaataactttttaaacc |
6218561 |
T |
|
| Q |
306 |
aggaaacaaacacccc |
321 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
6218562 |
aggaaacaaacacccc |
6218577 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 6 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 11493739 - 11493424
Alignment:
| Q |
6 |
aaataatactgggcattttattcctgagtatttttagaaaattgtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgg |
105 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11493739 |
aaataataatgggcatcttattcctgagtatttttagaaaattgtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgg |
11493640 |
T |
|
| Q |
106 |
gtagttatttccattttagtaccatttacatgggaatcttttattcccgcccactttctttgggaataaaatcatgggtaagtggaagttannnnnnncc |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
11493639 |
gtagttatttccattttagtaccatttacatgggaatcttttattcccgcccactttctttgggaataaaatcatgggtaagtggaagttatttttttcc |
11493540 |
T |
|
| Q |
206 |
taggaattctttattcccgggagttannnnnnnaactttgtaacaaacataggaatctataattccaacctccatattcctgggaataattttttaaacc |
305 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11493539 |
taggaattctttattcccgggagttatttttttaactttgtaacagacataggaatctataattccaacctccatgttcctgggaataattttttaaacc |
11493440 |
T |
|
| Q |
306 |
aggaaacaaacacccc |
321 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
11493439 |
aggaaacaaacacccc |
11493424 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 6 - 320
Target Start/End: Original strand, 22965265 - 22965579
Alignment:
| Q |
6 |
aaataatactgggcattttattcctgagtatttttagaaaattgtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgg |
105 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22965265 |
aaataataatgggcatcttattcctgagtatttttagaaaattgtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgg |
22965364 |
T |
|
| Q |
106 |
gtagttatttccattttagtaccatttacatgggaatcttttattcccgcccactttctttgggaataaaatcatgggtaagtggaagttannnnnnncc |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
22965365 |
gtagttatttccattttagtaccatttacatgggaatcttttattcccgcccactttctttgggaataaaatcatgggtaagtggaagttatttttttcc |
22965464 |
T |
|
| Q |
206 |
taggaattctttattcccgggagttannnnnnnaactttgtaacaaacataggaatctataattccaacctccatattcctgggaataattttttaaacc |
305 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
22965465 |
taggaattctttattcccgggagttatttttttaactttgtaacaaacataggaatctataattccaacctccatgttcctgggaataactttttaaacc |
22965564 |
T |
|
| Q |
306 |
aggaaacaaacaccc |
320 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
22965565 |
aggaaacaaacaccc |
22965579 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 6 - 321
Target Start/End: Original strand, 1588524 - 1588839
Alignment:
| Q |
6 |
aaataatactgggcattttattcctgagtatttttagaaaattgtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgg |
105 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1588524 |
aaataataatgggcatcttattcctgagtatttttagaaaatggtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgg |
1588623 |
T |
|
| Q |
106 |
gtagttatttccattttagtaccatttacatgggaatcttttattcccgcccactttctttgggaataaaatcatgggtaagtggaagttannnnnnncc |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
1588624 |
gtagttatttccattttagtaccatttacatgggaatcttttattcccgcccactttctttgggaataaaatcatgggtaagtggaagttatttttttcc |
1588723 |
T |
|
| Q |
206 |
taggaattctttattcccgggagttannnnnnnaactttgtaacaaacataggaatctataattccaacctccatattcctgggaataattttttaaacc |
305 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1588724 |
taggaattctttattcccgggagttatttttttaactttgtaacaaacataggaatctataattccaacctcgatgttcctgggaataattttttaaacc |
1588823 |
T |
|
| Q |
306 |
aggaaacaaacacccc |
321 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
1588824 |
aggaaacaaacacccc |
1588839 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 6 - 321
Target Start/End: Original strand, 9476865 - 9477180
Alignment:
| Q |
6 |
aaataatactgggcattttattcctgagtatttttagaaaattgtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgg |
105 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9476865 |
aaataataatgggcatcttattcctgagtatttttagaaaatggtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgg |
9476964 |
T |
|
| Q |
106 |
gtagttatttccattttagtaccatttacatgggaatcttttattcccgcccactttctttgggaataaaatcatgggtaagtggaagttannnnnnncc |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
9476965 |
gtagttatttccattttagtaccatttacatgggaatcttttattcccgtccactttctttgggaataaaatcatgggtaagtggaagttatttttttcc |
9477064 |
T |
|
| Q |
206 |
taggaattctttattcccgggagttannnnnnnaactttgtaacaaacataggaatctataattccaacctccatattcctgggaataattttttaaacc |
305 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9477065 |
taggaattctttattcccgggagttatttttttaactttgtaacaaacataggaatctataattccaacctccatgttcctgggaataattttttaaacc |
9477164 |
T |
|
| Q |
306 |
aggaaacaaacacccc |
321 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
9477165 |
aggaaacaaacacccc |
9477180 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 6 - 321
Target Start/End: Original strand, 18253667 - 18253982
Alignment:
| Q |
6 |
aaataatactgggcattttattcctgagtatttttagaaaattgtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgg |
105 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18253667 |
aaataataatgggcatcttattcctgagtattttcagaaaattgtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgg |
18253766 |
T |
|
| Q |
106 |
gtagttatttccattttagtaccatttacatgggaatcttttattcccgcccactttctttgggaataaaatcatgggtaagtggaagttannnnnnncc |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
18253767 |
gtagttatttccattttagtaccatttacatgagaatcttttattcccgcccactttctttgggaataaaatcatgggtaagtggaagttatttttttcc |
18253866 |
T |
|
| Q |
206 |
taggaattctttattcccgggagttannnnnnnaactttgtaacaaacataggaatctataattccaacctccatattcctgggaataattttttaaacc |
305 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18253867 |
tatgaattctttatttccgggagttatttttttaactttgtaacaaacataggaatctataattccaacctccatgttcctgggaataattttttaaacc |
18253966 |
T |
|
| Q |
306 |
aggaaacaaacacccc |
321 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
18253967 |
aggaaacaaacacccc |
18253982 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 6 - 321
Target Start/End: Original strand, 32100022 - 32100337
Alignment:
| Q |
6 |
aaataatactgggcattttattcctgagtatttttagaaaattgtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgg |
105 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32100022 |
aaataataatgggcatcttattcctgagtatttttagaaaattgtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgg |
32100121 |
T |
|
| Q |
106 |
gtagttatttccattttagtaccatttacatgggaatcttttattcccgcccactttctttgggaataaaatcatgggtaagtggaagttannnnnnncc |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
32100122 |
gtagttatttccattttagtaccatttacatgggaatcttttattcccgcccactttctttgggaataaaatcatgggtaagtggaagttatttttttcc |
32100221 |
T |
|
| Q |
206 |
taggaattctttattcccgggagttannnnnnnaactttgtaacaaacataggaatctataattccaacctccatattcctgggaataattttttaaacc |
305 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
32100222 |
taggaattttttatttccgggagttatttttttaactttgtaacaaacataggaatctataattccaacctccatgttcctgggaataactttttaaacc |
32100321 |
T |
|
| Q |
306 |
aggaaacaaacacccc |
321 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||| |
|
|
| T |
32100322 |
atgaaacaaacacccc |
32100337 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 47 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 17078036 - 17077763
Alignment:
| Q |
47 |
ttgtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgggtagttatttc-cattttagtaccatttacatgggaatctt |
145 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
17078036 |
ttgtgtttggtaaataattgtcagattcatggcaattatttttgatagtgggtatatgggtagttatttcaaattttattacaatttacatgggaacctt |
17077937 |
T |
|
| Q |
146 |
ttattcccgcccactttctttgggaataaaatcatgggtaagtggaagttannnnnnncctaggaattctttattcccgggagttannnnnnnaactttg |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
17077936 |
ttattcccatccacttcctt--ggaataaaatcatgggtaagtggaagttattatttttctaggaattttttattttcgggagttgattttgtaactttg |
17077839 |
T |
|
| Q |
246 |
taacaaacataggaatctataattccaacctccatattcctgggaataattttttaaaccaggaaacaaacacccc |
321 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17077838 |
taacaaacataggaatctagaattacaacctccacattcctgggaataactttttaaaccaggaaacaaacacccc |
17077763 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 49 - 196
Target Start/End: Original strand, 9785047 - 9785190
Alignment:
| Q |
49 |
gtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgggtagttatttccattttagtaccatttacatgggaatctttta |
148 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||| ||| ||| ||||| |
|
|
| T |
9785047 |
gtgtttgataaataattgatagatttatggaaattatttgtgatagcgggtatatggatagttattttaatttt-gta---tttatatgagaacttttta |
9785142 |
T |
|
| Q |
149 |
ttcccgcccactttctttgggaataaaatcatgggtaagtggaagtta |
196 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
9785143 |
ttcccatccactttctttgagaataaaatcatgggtaaatggaagtta |
9785190 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 247 - 318
Target Start/End: Original strand, 9785279 - 9785350
Alignment:
| Q |
247 |
aacaaacataggaatctataattccaacctccatattcctgggaataattttttaaaccaggaaacaaacac |
318 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9785279 |
aacaaacaaaggaatttataattgctacctccacgtttctgggaataattttttaaaccaggaaacaaacac |
9785350 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 319
Target Start/End: Original strand, 36864752 - 36864832
Alignment:
| Q |
239 |
aactttgtaacaaacataggaatctataattccaacctccatattcctgggaataattttttaaaccaggaaacaaacacc |
319 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36864752 |
aacttggtaacaaacaaaggaatctataattgcaacgtccacattcctaaagataaatatttacaccaggaaacaaacacc |
36864832 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 19503216 - 19503150
Alignment:
| Q |
7 |
aataatactgggcattttattcctgagtatttttagaaaattgtgtttggtaaataattgtcagatt |
73 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||| || ||||||| | |||| |||||| ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
19503216 |
aataataatgggcatcttattcatgggtattttaaaaaaaatgtgttgggttaataattgtcagatt |
19503150 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 8)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 6 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 39151280 - 39150965
Alignment:
| Q |
6 |
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105 |
Q |
| |
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| T |
39151280 |
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39151181 |
T |
|
| Q |
106 |
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205 |
Q |
| |
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| T |
39151180 |
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39151081 |
T |
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305 |
Q |
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| T |
39151080 |
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39150981 |
T |
|
| Q |
306 |
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321 |
Q |
| |
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|||||||||||||||| |
|
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| T |
39150980 |
aggaaacaaacacccc |
39150965 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 6 - 321
Target Start/End: Original strand, 2552615 - 2552930
Alignment:
| Q |
6 |
aaataatactgggcattttattcctgagtatttttagaaaattgtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgg |
105 |
Q |
| |
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|
|
| T |
2552615 |
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2552714 |
T |
|
| Q |
106 |
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205 |
Q |
| |
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| T |
2552715 |
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2552814 |
T |
|
| Q |
206 |
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305 |
Q |
| |
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| T |
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2552914 |
T |
|
| Q |
306 |
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321 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
2552915 |
aggaaacaaacacccc |
2552930 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 9 - 320
Target Start/End: Original strand, 4087614 - 4087925
Alignment:
| Q |
9 |
taatactgggcattttattcctgagtatttttagaaaattgtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgggta |
108 |
Q |
| |
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||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
4087614 |
taataatgggcatcttattcctgagtatttttagaaaatggtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgggta |
4087713 |
T |
|
| Q |
109 |
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208 |
Q |
| |
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|
|
| T |
4087714 |
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4087813 |
T |
|
| Q |
209 |
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308 |
Q |
| |
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|
| T |
4087814 |
gaattctttattcccgggagttatttttttaactttgtaacaaacataggaatctataattccaacctccatattcctgggaataattttttaaaccagg |
4087913 |
T |
|
| Q |
309 |
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320 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
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| T |
4087914 |
aaacaaacaccc |
4087925 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 6 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 46107293 - 46106980
Alignment:
| Q |
6 |
aaataatactgggcattttattcctgagtatttttagaaaattgtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgg |
105 |
Q |
| |
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|
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| T |
46107293 |
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46107194 |
T |
|
| Q |
106 |
gtagttatttccattttagtaccatttacatgggaatcttttattcccgcccactttctttgggaataaaatcatgggtaagtggaagttannnnnnncc |
205 |
Q |
| |
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|
| T |
46107193 |
gtagttatttccattttagtaccatttacatgagaatcttttattcccgcccactttctttgggaataaaatcatgggtaagtggaagttatttttttcc |
46107094 |
T |
|
| Q |
206 |
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305 |
Q |
| |
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| T |
46107093 |
taggaattctttattcccgggagttatttttttaactttgtaacaaacataggaatctataattccaacctccatgttcctgggaataattttttaaacc |
46106994 |
T |
|
| Q |
306 |
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319 |
Q |
| |
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| T |
46106993 |
aggaaacaaacacc |
46106980 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 6 - 321
Target Start/End: Original strand, 39258766 - 39259081
Alignment:
| Q |
6 |
aaataatactgggcattttattcctgagtatttttagaaaattgtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgg |
105 |
Q |
| |
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| T |
39258766 |
aaataataatgggcatcttattcctgagtatttttagaaaatggtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatttgg |
39258865 |
T |
|
| Q |
106 |
gtagttatttccattttagtaccatttacatgggaatcttttattcccgcccactttctttgggaataaaatcatgggtaagtggaagttannnnnnncc |
205 |
Q |
| |
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|
|
| T |
39258866 |
gtagttatttccattttagtaccatttacatgggaatcttttattcccgtccactttctttgggaataaaatcatgggtaagtggaagttatttttttcc |
39258965 |
T |
|
| Q |
206 |
taggaattctttattcccgggagttannnnnnnaactttgtaacaaacataggaatctataattccaacctccatattcctgggaataattttttaaacc |
305 |
Q |
| |
|
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|
| T |
39258966 |
taggaattctttattcccgggagttatttttttaactttgtaacaaacataggaatctataattccaacctccatgttcctgggaataattttttaaacc |
39259065 |
T |
|
| Q |
306 |
aggaaacaaacacccc |
321 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
39259066 |
aggaaacaaacacccc |
39259081 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8240284 - 8240059
Alignment:
| Q |
6 |
aaataatactgggcattttattcctgagtatttttagaaaattgtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgg |
105 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
8240284 |
aaataataatgggcatcttattcctgagtatttttagaaaattgtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtggatatatgg |
8240185 |
T |
|
| Q |
106 |
gtagttatttccattttagtaccatttacatgggaatcttttattcccgcccactttctttgggaataaaatcatgggtaagtggaagttannnnnnncc |
205 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
8240184 |
gtagttatttccattttagtaccatttacatgggaatcttttattcccgcccactttctttgggaataaaatcatgggtaagtggaagttatttttttcc |
8240085 |
T |
|
| Q |
206 |
taggaattctttattcccgggagtta |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8240084 |
taggaattctttattcccgggagtta |
8240059 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 9737325 - 9737206
Alignment:
| Q |
6 |
aaataatactgggcattttattcctgagtatttttagaaaattgtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggt--atat |
103 |
Q |
| |
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|||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||| |
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| T |
9737325 |
aaataataataggcatcttattcctgggtatttttaaaaaaatatgttttgtaaataattgtcagatttatgggcattatttgtgatagtgggtatatat |
9737226 |
T |
|
| Q |
104 |
gggtagttatttccatttta |
123 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| |
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| T |
9737225 |
gggtagttatttcaatttta |
9737206 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 299
Target Start/End: Original strand, 42611671 - 42611724
Alignment:
| Q |
246 |
taacaaacataggaatctataattccaacctccatattcctgggaataattttt |
299 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
42611671 |
taacaaacatgagaatctatatttccaacttccagattcttgggaataattttt |
42611724 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 4)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 9 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 37550020 - 37549708
Alignment:
| Q |
9 |
taatactgggcattttattcctgagtatttttagaaaattgtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgggta |
108 |
Q |
| |
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||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37550020 |
taataatgggcatcttattcctgagtatttttagaaaattgtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgggta |
37549921 |
T |
|
| Q |
109 |
gttatttccattttagtaccatttacatgggaatcttttattcccgcccactttctttgggaataaaatcatgggtaagtggaagttannnnnnncctag |
208 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
37549920 |
gttatttccattttagtaccatttacatgggaatcttttattcccgcccactttctttgggaataaaatcatgggtaagtggaagttatttttttcctag |
37549821 |
T |
|
| Q |
209 |
gaattctttattcccgggagttannnnnnnaactttgtaacaaacataggaatctataattccaacctccatattcctgggaataattttttaaaccagg |
308 |
Q |
| |
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|
| T |
37549820 |
gaattctttattcccgggagttatttttttaactttgtaacaaacataggaatctataattccaacctccatgttcctgggaataactttttaaaccagg |
37549721 |
T |
|
| Q |
309 |
aaacaaacacccc |
321 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
37549720 |
aaacaaacacccc |
37549708 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 6 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 41851664 - 41851349
Alignment:
| Q |
6 |
aaataatactgggcattttattcctgagtatttttagaaaattgtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgg |
105 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41851664 |
aaataataatgggcatcttattcctgagtatttttagaaaattgtgtttgataaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgg |
41851565 |
T |
|
| Q |
106 |
gtagttatttccattttagtaccatttacatgggaatcttttattcccgcccactttctttgggaataaaatcatgggtaagtggaagttannnnnnncc |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
41851564 |
gtagttatttccattttagtaccatttacatgggaatcttttattcccgtccactttctttgggaataaaatcatgggtaagtggaagttatttttttcc |
41851465 |
T |
|
| Q |
206 |
taggaattctttattcccgggagttannnnnnnaactttgtaacaaacataggaatctataattccaacctccatattcctgggaataattttttaaacc |
305 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41851464 |
taggaattctttattcccgggagttatttttttaactttgtaacaaacataggaatctataattccaacctccatgttcctgggaataattttttaaacc |
41851365 |
T |
|
| Q |
306 |
aggaaacaaacacccc |
321 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
41851364 |
aggaaacaaacacccc |
41851349 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 6 - 321
Target Start/End: Original strand, 42883070 - 42883385
Alignment:
| Q |
6 |
aaataatactgggcattttattcctgagtatttttagaaaattgtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgg |
105 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42883070 |
aaataataatgggtatcttattcctgagtatttttagaaaattgtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgg |
42883169 |
T |
|
| Q |
106 |
gtagttatttccattttagtaccatttacatgggaatcttttattcccgcccactttctttgggaataaaatcatgggtaagtggaagttannnnnnncc |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
42883170 |
gtagttatttccattttagtaccatttacatgggaatcttttattcccgcccactttctttgggaataaaatcatgggtaagtggaagttatttttttcc |
42883269 |
T |
|
| Q |
206 |
taggaattctttattcccgggagttannnnnnnaactttgtaacaaacataggaatctataattccaacctccatattcctgggaataattttttaaacc |
305 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42883270 |
taggaattctttattcccaggagttatttttttaactttgtaacaaacataggaatctataattccaacctccatgttcctgggaataattttttaaacc |
42883369 |
T |
|
| Q |
306 |
aggaaacaaacacccc |
321 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
42883370 |
aggaaacaaacacccc |
42883385 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 239 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 35709051 - 35708968
Alignment:
| Q |
239 |
aactttgtaacaaacataggaatctataattccaacctccatattcctgggaataattttttaaaccaggaaacaaacacccca |
322 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35709051 |
aactttataacaaacatatgaatctataattacaaactccacatttctcggaataaatttttaaactaggaaacaaacacccca |
35708968 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 3)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 6 - 321
Target Start/End: Original strand, 32858675 - 32858990
Alignment:
| Q |
6 |
aaataatactgggcattttattcctgagtatttttagaaaattgtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgg |
105 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32858675 |
aaataataatgggcatcttattcctgagtatttttagaaaattgtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgg |
32858774 |
T |
|
| Q |
106 |
gtagttatttccattttagtaccatttacatgggaatcttttattcccgcccactttctttgggaataaaatcatgggtaagtggaagttannnnnnncc |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
32858775 |
gtagttatttccattttagtaccatttacatgggaatcttttattcccgcccactttctttgggagtaaaatcatgggtaagtggaagttatttttttcc |
32858874 |
T |
|
| Q |
206 |
taggaattctttattcccgggagttannnnnnnaactttgtaacaaacataggaatctataattccaacctccatattcctgggaataattttttaaacc |
305 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32858875 |
taggaattctttattttcgggagttatttttttaactttgtaacaaacataggaatctataattccaacctccatattcctgggaataattttttaaacc |
32858974 |
T |
|
| Q |
306 |
aggaaacaaacacccc |
321 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
32858975 |
aggaaacaaacacccc |
32858990 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 6 - 321
Target Start/End: Original strand, 2355236 - 2355552
Alignment:
| Q |
6 |
aaataatactgggcattttattcctgagtatttttagaaaattgtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgg |
105 |
Q |
| |
|
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|
| T |
2355236 |
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2355335 |
T |
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106 |
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205 |
Q |
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| T |
2355336 |
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2355435 |
T |
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304 |
Q |
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2355535 |
T |
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305 |
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321 |
Q |
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| T |
2355536 |
caggaaacaaacacccc |
2355552 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 9457635 - 9457324
Alignment:
| Q |
6 |
aaataatactgggcattttattcctgagtatttttagaaaattgtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgg |
105 |
Q |
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| T |
9457635 |
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9457537 |
T |
|
| Q |
106 |
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204 |
Q |
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| T |
9457536 |
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9457439 |
T |
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| Q |
205 |
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303 |
Q |
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| T |
9457438 |
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9457342 |
T |
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| Q |
304 |
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321 |
Q |
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| T |
9457341 |
ccaggaaacaaacacccc |
9457324 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 3)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 6 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 8436545 - 8436230
Alignment:
| Q |
6 |
aaataatactgggcattttattcctgagtatttttagaaaattgtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgg |
105 |
Q |
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| T |
8436545 |
aaataataatgggcatcttattcctgagtatttttagaaaatggtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgg |
8436446 |
T |
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| Q |
106 |
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205 |
Q |
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| T |
8436445 |
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8436346 |
T |
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| Q |
206 |
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305 |
Q |
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| T |
8436345 |
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8436246 |
T |
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| Q |
306 |
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321 |
Q |
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| T |
8436245 |
aggaaacaaacacccc |
8436230 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 6 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 732438 - 732123
Alignment:
| Q |
6 |
aaataatactgggcattttattcctgagtatttttagaaaattgtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatgg |
105 |
Q |
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| T |
732438 |
aaataataatgggcatcttattcctgagtatttttagaaaatggtgtttggtaaataattgtcagattcatgagaattgtttgtgatagtgggtatatgg |
732339 |
T |
|
| Q |
106 |
gtagttatttccattttagtaccatttacatgggaatcttttattcccgcccactttctttgggaataaaatcatgggtaagtggaagttannnnnnncc |
205 |
Q |
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| T |
732338 |
gtagttatttccattttagtaccatttacatgggaatcttttattcccgtccactttctttgggaataaaatcatgggtaagtggaagttatttttttcc |
732239 |
T |
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| Q |
206 |
taggaattctttattcccgggagttannnnnnnaactttgtaacaaacataggaatctataattccaacctccatattcctgggaataattttttaaacc |
305 |
Q |
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| T |
732238 |
taggaattctttattcccgggaattatttttttaactttgtaacaaacataggaatctataattccaacctccatgttcctgggaataattttttaaacc |
732139 |
T |
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| Q |
306 |
aggaaacaaacacccc |
321 |
Q |
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| T |
732138 |
aggaaacaaacacccc |
732123 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 322 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 46544558 - 46544509
Alignment:
| Q |
322 |
acatgtttttaatgggtagtattatatgcaaaaacatttatagtcaaacc |
371 |
Q |
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| T |
46544558 |
acatgtttttagtgggtagtattatatgcaaaaacatttatagtcaaacc |
46544509 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0029 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:
Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 46988 - 46807
Alignment:
| Q |
7 |
aataatactgggcattttattcctgagtatttttagaaaattgtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatggg |
106 |
Q |
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| T |
46988 |
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46889 |
T |
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| Q |
107 |
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189 |
Q |
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| T |
46888 |
tagttgtttcaattttattactatttacatgggaaccttttattcccacccac-ttccttaggaataaaattatggataagtg |
46807 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 39792 - 39611
Alignment:
| Q |
7 |
aataatactgggcattttattcctgagtatttttagaaaattgtgtttggtaaataattgtcagattcatgggaattgtttgtgatagtgggtatatggg |
106 |
Q |
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| T |
39792 |
aataataatgggcatcttattcctcggtatttttttaaaatcatatttcattaataattgtcaggttcatggtaattatttgtgatagtggctatatgag |
39693 |
T |
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| Q |
107 |
tagttatttccattttagtaccatttacatgggaatcttttattcccgcccactttctttgggaataaaatcatgggtaagtg |
189 |
Q |
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| T |
39692 |
tagttgtttcaattttattactatttacatgggaaccttttattcccacccac-ttccttaggaataaaattatggataagtg |
39611 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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