View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6176_high_20 (Length: 311)

Name: NF6176_high_20
Description: NF6176
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6176_high_20
NF6176_high_20
[»] chr1 (62 HSPs)
chr1 (5-290)||(12151129-12151409)
chr1 (105-290)||(39864052-39864249)
chr1 (92-290)||(12039023-12039233)
chr1 (86-240)||(28748994-28749148)
chr1 (105-234)||(917033-917162)
chr1 (91-240)||(44707726-44707875)
chr1 (86-240)||(31042800-31042954)
chr1 (91-240)||(9307630-9307779)
chr1 (108-240)||(10495842-10495973)
chr1 (90-290)||(6160424-6160627)
chr1 (106-290)||(37506065-37506264)
chr1 (109-240)||(13579605-13579736)
chr1 (127-290)||(20209842-20210017)
chr1 (111-240)||(24880876-24881008)
chr1 (86-240)||(24991614-24991768)
chr1 (108-210)||(34031510-34031612)
chr1 (120-290)||(7759156-7759338)
chr1 (105-210)||(26093427-26093532)
chr1 (132-290)||(3312060-3312222)
chr1 (105-290)||(33733243-33733439)
chr1 (105-240)||(16395027-16395161)
chr1 (105-240)||(38787344-38787479)
chr1 (96-210)||(23168964-23169078)
chr1 (136-229)||(49223997-49224090)
chr1 (136-240)||(8896343-8896447)
chr1 (116-240)||(44761522-44761646)
chr1 (97-235)||(6023621-6023759)
chr1 (116-234)||(27896964-27897082)
chr1 (130-240)||(36701924-36702034)
chr1 (130-240)||(36718028-36718138)
chr1 (136-229)||(15699136-15699229)
chr1 (106-235)||(52429352-52429481)
chr1 (120-240)||(37276464-37276584)
chr1 (105-240)||(2572472-2572606)
chr1 (127-290)||(40144849-40145024)
chr1 (105-187)||(43500764-43500846)
chr1 (141-234)||(14757610-14757703)
chr1 (125-228)||(32970567-32970670)
chr1 (105-235)||(5179379-5179509)
chr1 (130-234)||(9379240-9379345)
chr1 (108-240)||(11449888-11450018)
chr1 (127-208)||(45331376-45331457)
chr1 (154-210)||(29778425-29778481)
chr1 (136-208)||(35538678-35538750)
chr1 (135-219)||(41121835-41121919)
chr1 (238-290)||(43500865-43500917)
chr1 (127-210)||(42410027-42410110)
chr1 (106-176)||(21909987-21910057)
chr1 (136-233)||(6365641-6365738)
chr1 (105-210)||(32825972-32826076)
chr1 (116-181)||(35682796-35682861)
chr1 (128-220)||(49176940-49177032)
chr1 (90-229)||(41080613-41080751)
chr1 (141-208)||(51028509-51028576)
chr1 (141-208)||(17988574-17988643)
chr1 (154-236)||(24903978-24904060)
chr1 (236-290)||(34031650-34031704)
chr1 (236-290)||(41121946-41122000)
chr1 (163-240)||(22856275-22856352)
chr1 (91-152)||(26252497-26252558)
chr1 (164-240)||(32219700-32219776)
chr1 (196-240)||(37539130-37539174)
[»] chr4 (70 HSPs)
chr4 (105-290)||(42616886-42617083)
chr4 (86-240)||(7061628-7061782)
chr4 (87-240)||(47464330-47464483)
chr4 (85-240)||(32884804-32884959)
chr4 (120-290)||(52859797-52859974)
chr4 (86-240)||(16821295-16821449)
chr4 (86-225)||(34360673-34360812)
chr4 (91-225)||(2942614-2942747)
chr4 (86-240)||(17237260-17237414)
chr4 (91-240)||(22130046-22130199)
chr4 (105-240)||(38405085-38405220)
chr4 (86-240)||(43237246-43237400)
chr4 (91-240)||(6643629-6643778)
chr4 (106-229)||(6609775-6609898)
chr4 (105-228)||(49175917-49176040)
chr4 (91-290)||(49746901-49747112)
chr4 (127-290)||(47773024-47773199)
chr4 (120-290)||(11907597-11907779)
chr4 (96-224)||(40122828-40122956)
chr4 (105-240)||(33790714-33790849)
chr4 (105-240)||(49428325-49428460)
chr4 (126-240)||(21240708-21240822)
chr4 (86-240)||(35311187-35311341)
chr4 (105-290)||(5841410-5841608)
chr4 (125-290)||(35380336-35380514)
chr4 (91-208)||(46396852-46396969)
chr4 (108-234)||(2653429-2653553)
chr4 (142-229)||(26147635-26147722)
chr4 (105-235)||(52247411-52247541)
chr4 (105-234)||(3689571-3689700)
chr4 (91-208)||(4972595-4972712)
chr4 (135-240)||(36985789-36985894)
chr4 (127-227)||(17114456-17114556)
chr4 (105-228)||(38502465-38502588)
chr4 (141-240)||(53412111-53412210)
chr4 (106-240)||(18741458-18741592)
chr4 (127-229)||(25233195-25233297)
chr4 (105-280)||(54506739-54506926)
chr4 (149-224)||(7986993-7987068)
chr4 (105-240)||(30682179-30682314)
chr4 (106-228)||(11288614-11288735)
chr4 (136-214)||(30192234-30192312)
chr4 (106-240)||(47358933-47359067)
chr4 (123-204)||(3098757-3098838)
chr4 (91-208)||(52869107-52869224)
chr4 (125-229)||(35998825-35998929)
chr4 (94-234)||(38663420-38663559)
chr4 (86-181)||(8175544-8175639)
chr4 (105-187)||(51625139-51625221)
chr4 (87-204)||(27880207-27880323)
chr4 (109-225)||(461976-462092)
chr4 (92-208)||(29575143-29575259)
chr4 (92-235)||(44536166-44536309)
chr4 (236-290)||(28911282-28911336)
chr4 (144-210)||(50264102-50264168)
chr4 (91-240)||(18532182-18532331)
chr4 (108-208)||(32469934-32470034)
chr4 (105-189)||(35251943-35252027)
chr4 (162-210)||(37868638-37868686)
chr4 (130-174)||(54123710-54123754)
chr4 (236-287)||(2653364-2653415)
chr4 (247-290)||(16821469-16821512)
chr4 (106-208)||(49579162-49579264)
chr4 (129-175)||(31370312-31370358)
chr4 (236-268)||(3689525-3689557)
chr4 (124-208)||(16506236-16506319)
chr4 (246-290)||(25233123-25233167)
chr4 (106-234)||(39397353-39397481)
chr4 (108-180)||(41711442-41711514)
chr4 (141-240)||(43902254-43902356)
[»] chr7 (52 HSPs)
chr7 (91-234)||(22738717-22738860)
chr7 (105-290)||(34947448-34947645)
chr7 (94-290)||(11373401-11373609)
chr7 (92-234)||(5524396-5524538)
chr7 (86-240)||(28103743-28103897)
chr7 (109-290)||(759079-759272)
chr7 (105-240)||(83395-83530)
chr7 (98-240)||(7463223-7463365)
chr7 (86-240)||(24516254-24516408)
chr7 (105-290)||(40076266-40076460)
chr7 (108-240)||(3178191-3178323)
chr7 (105-290)||(21759968-21760165)
chr7 (105-290)||(43873871-43874068)
chr7 (91-234)||(8592410-8592553)
chr7 (105-234)||(26974042-26974174)
chr7 (107-240)||(30865977-30866110)
chr7 (105-290)||(9785936-9786133)
chr7 (109-290)||(16560558-16560742)
chr7 (109-290)||(16604920-16605104)
chr7 (117-229)||(19271729-19271841)
chr7 (91-229)||(34100517-34100655)
chr7 (110-240)||(41506054-41506184)
chr7 (105-210)||(2850865-2850970)
chr7 (93-240)||(21350600-21350744)
chr7 (108-290)||(28202296-28202490)
chr7 (86-234)||(23670502-23670649)
chr7 (105-240)||(21390305-21390440)
chr7 (86-240)||(29835379-29835532)
chr7 (106-240)||(38391758-38391892)
chr7 (109-234)||(13961975-13962100)
chr7 (85-209)||(7457385-7457509)
chr7 (98-240)||(2459481-2459621)
chr7 (105-229)||(17828336-17828459)
chr7 (127-229)||(27921009-27921111)
chr7 (125-235)||(33819229-33819339)
chr7 (142-235)||(35333058-35333151)
chr7 (125-228)||(32018716-32018819)
chr7 (105-290)||(48608815-48609007)
chr7 (109-210)||(12631345-12631446)
chr7 (105-210)||(42935701-42935806)
chr7 (91-240)||(46478263-46478412)
chr7 (150-234)||(6494963-6495047)
chr7 (85-240)||(37245700-37245857)
chr7 (125-234)||(32018919-32019029)
chr7 (105-187)||(44180268-44180350)
chr7 (105-206)||(46211472-46211576)
chr7 (236-290)||(36790686-36790742)
chr7 (117-213)||(39005458-39005554)
chr7 (160-221)||(21937826-21937887)
chr7 (171-240)||(25571429-25571498)
chr7 (249-290)||(33819160-33819201)
chr7 (246-290)||(44424093-44424137)
[»] chr2 (44 HSPs)
chr2 (106-290)||(17695269-17695467)
chr2 (86-240)||(8947008-8947162)
chr2 (91-221)||(16377617-16377747)
chr2 (105-280)||(43115777-43115964)
chr2 (116-290)||(43410367-43410553)
chr2 (105-290)||(14523347-14523544)
chr2 (108-228)||(16805896-16806016)
chr2 (108-228)||(16845177-16845297)
chr2 (107-290)||(34120416-34120609)
chr2 (106-240)||(39691493-39691627)
chr2 (91-178)||(27501499-27501586)
chr2 (105-234)||(16463698-16463827)
chr2 (85-290)||(5789603-5789819)
chr2 (125-240)||(17346358-17346472)
chr2 (91-240)||(35313890-35314040)
chr2 (141-229)||(15359098-15359186)
chr2 (136-208)||(34451341-34451413)
chr2 (105-229)||(36794298-36794422)
chr2 (105-240)||(37322431-37322567)
chr2 (84-208)||(45235616-45235740)
chr2 (94-181)||(3323250-3323337)
chr2 (105-240)||(31448668-31448803)
chr2 (105-240)||(18853175-18853311)
chr2 (142-240)||(35242309-35242407)
chr2 (105-229)||(39785599-39785726)
chr2 (125-290)||(36354438-36354614)
chr2 (141-208)||(41220957-41221024)
chr2 (135-228)||(19426470-19426564)
chr2 (108-234)||(25637490-25637615)
chr2 (136-208)||(1206709-1206781)
chr2 (236-290)||(34120639-34120693)
chr2 (108-234)||(34225599-34225725)
chr2 (127-213)||(34437998-34438084)
chr2 (90-240)||(39329621-39329773)
chr2 (108-240)||(28186217-28186348)
chr2 (236-290)||(9458384-9458437)
chr2 (89-149)||(7438865-7438925)
chr2 (160-228)||(19444161-19444229)
chr2 (120-208)||(27866527-27866614)
chr2 (193-240)||(3323335-3323382)
chr2 (239-290)||(16463628-16463681)
chr2 (236-290)||(19444087-19444141)
chr2 (114-167)||(15435447-15435500)
chr2 (163-203)||(10005157-10005197)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (91-290)||(50145-50356)
[»] chr8 (53 HSPs)
chr8 (91-290)||(39405703-39405914)
chr8 (91-240)||(21216065-21216214)
chr8 (86-240)||(11976895-11977049)
chr8 (91-240)||(45425630-45425779)
chr8 (108-240)||(7172917-7173049)
chr8 (110-240)||(27294042-27294172)
chr8 (105-290)||(10179925-10180122)
chr8 (99-210)||(1875564-1875675)
chr8 (106-290)||(13335158-13335353)
chr8 (106-240)||(34948666-34948800)
chr8 (105-187)||(39300919-39301001)
chr8 (105-234)||(17719236-17719365)
chr8 (105-290)||(26626090-26626287)
chr8 (86-240)||(39482618-39482772)
chr8 (171-290)||(32678357-32678475)
chr8 (135-240)||(44761502-44761607)
chr8 (91-234)||(31082628-31082771)
chr8 (105-228)||(31271036-31271159)
chr8 (105-240)||(32476290-32476425)
chr8 (136-243)||(34057627-34057734)
chr8 (127-290)||(396611-396786)
chr8 (90-174)||(1739709-1739793)
chr8 (105-229)||(10097969-10098093)
chr8 (130-229)||(5053156-5053255)
chr8 (108-210)||(51146-51247)
chr8 (149-234)||(17823930-17824015)
chr8 (116-209)||(41092028-41092121)
chr8 (127-210)||(2767291-2767374)
chr8 (130-229)||(31331422-31331521)
chr8 (141-228)||(42887015-42887102)
chr8 (236-290)||(50757-50811)
chr8 (127-290)||(31231671-31231846)
chr8 (109-207)||(33765696-33765794)
chr8 (164-225)||(4924104-4924165)
chr8 (96-173)||(6611767-6611844)
chr8 (136-240)||(4428360-4428464)
chr8 (92-240)||(9300078-9300226)
chr8 (126-210)||(40028549-40028632)
chr8 (236-290)||(39301077-39301131)
chr8 (106-240)||(40996344-40996478)
chr8 (127-208)||(34393954-34394035)
chr8 (120-240)||(43719228-43719349)
chr8 (125-169)||(8979172-8979216)
chr8 (117-240)||(5356603-5356725)
chr8 (106-290)||(22771814-22772010)
chr8 (239-290)||(29226652-29226702)
chr8 (236-290)||(17719379-17719433)
chr8 (108-174)||(29226212-29226278)
chr8 (173-210)||(1739576-1739613)
chr8 (109-170)||(39329370-39329430)
chr8 (125-201)||(39890663-39890739)
chr8 (150-210)||(44648555-44648615)
chr8 (128-220)||(45034490-45034582)
[»] chr5 (40 HSPs)
chr5 (86-240)||(8698312-8698466)
chr5 (105-290)||(1248579-1248776)
chr5 (86-234)||(40530180-40530328)
chr5 (86-240)||(4818554-4818708)
chr5 (103-228)||(27542810-27542935)
chr5 (91-240)||(31655056-31655205)
chr5 (108-290)||(8724987-8725181)
chr5 (125-290)||(6315772-6315949)
chr5 (106-234)||(7827902-7828030)
chr5 (105-290)||(21060572-21060768)
chr5 (109-290)||(40899859-40900052)
chr5 (86-211)||(32440173-32440298)
chr5 (85-205)||(9515784-9515904)
chr5 (92-240)||(29570395-29570543)
chr5 (94-229)||(41496094-41496229)
chr5 (116-229)||(6615866-6615979)
chr5 (105-234)||(6753634-6753762)
chr5 (136-240)||(4441024-4441128)
chr5 (111-290)||(19929887-19930078)
chr5 (92-221)||(29374364-29374493)
chr5 (106-234)||(29856056-29856182)
chr5 (136-213)||(41062166-41062243)
chr5 (109-213)||(37184058-37184162)
chr5 (135-234)||(27580609-27580708)
chr5 (142-234)||(11796179-11796271)
chr5 (110-209)||(15439299-15439398)
chr5 (105-240)||(2232048-2232179)
chr5 (136-240)||(6754032-6754135)
chr5 (108-240)||(42803598-42803730)
chr5 (91-209)||(38508148-38508266)
chr5 (86-171)||(843509-843594)
chr5 (100-234)||(15818450-15818586)
chr5 (130-210)||(18841512-18841592)
chr5 (127-174)||(3348122-3348169)
chr5 (240-290)||(3348252-3348302)
chr5 (164-229)||(38161446-38161511)
chr5 (105-157)||(42922842-42922894)
chr5 (94-240)||(22848348-22848494)
chr5 (86-156)||(31747969-31748039)
chr5 (245-290)||(4818491-4818536)
[»] chr3 (59 HSPs)
chr3 (86-240)||(1778646-1778799)
chr3 (86-235)||(43253821-43253970)
chr3 (91-290)||(37311890-37312102)
chr3 (105-235)||(30190637-30190767)
chr3 (105-290)||(29023943-29024134)
chr3 (86-290)||(44301502-44301719)
chr3 (108-240)||(28690762-28690894)
chr3 (108-240)||(19823014-19823146)
chr3 (96-240)||(30711076-30711220)
chr3 (96-240)||(36460384-36460528)
chr3 (105-240)||(37695642-37695778)
chr3 (130-290)||(48541002-48541166)
chr3 (105-235)||(14194564-14194693)
chr3 (106-240)||(37497495-37497629)
chr3 (86-210)||(50035175-50035299)
chr3 (108-240)||(5322919-5323049)
chr3 (91-240)||(11632084-11632232)
chr3 (136-229)||(45710864-45710957)
chr3 (105-240)||(8679031-8679166)
chr3 (105-235)||(24569077-24569207)
chr3 (86-240)||(27471338-27471492)
chr3 (103-290)||(36476525-36476724)
chr3 (109-235)||(51837940-51838066)
chr3 (136-240)||(12904867-12904972)
chr3 (107-290)||(37772943-37773140)
chr3 (105-290)||(10366619-10366823)
chr3 (106-240)||(11905825-11905959)
chr3 (91-240)||(23004346-23004494)
chr3 (120-225)||(53560235-53560340)
chr3 (109-229)||(34750510-34750630)
chr3 (133-225)||(54477464-54477556)
chr3 (91-158)||(33491046-33491113)
chr3 (106-224)||(19609318-19609436)
chr3 (91-240)||(38137406-38137558)
chr3 (92-234)||(38795353-38795495)
chr3 (105-210)||(49830162-49830268)
chr3 (136-240)||(3901157-3901261)
chr3 (116-228)||(12736560-12736672)
chr3 (141-240)||(19611912-19612010)
chr3 (93-240)||(3313257-3313400)
chr3 (127-229)||(54726499-54726601)
chr3 (143-240)||(24245109-24245205)
chr3 (105-234)||(17652761-17652886)
chr3 (149-240)||(39043775-39043869)
chr3 (108-214)||(30861424-30861529)
chr3 (236-290)||(43715247-43715301)
chr3 (85-174)||(51064775-51064864)
chr3 (247-290)||(30710590-30710633)
chr3 (136-235)||(43719275-43719373)
chr3 (91-157)||(23068286-23068352)
chr3 (130-208)||(30682068-30682146)
chr3 (92-234)||(38512034-38512176)
chr3 (240-290)||(41038517-41038567)
chr3 (127-225)||(52290911-52291009)
chr3 (236-290)||(3313193-3313249)
chr3 (125-169)||(44533774-44533819)
chr3 (236-280)||(11905774-11905817)
chr3 (153-240)||(38705178-38705267)
chr3 (246-290)||(51065143-51065187)
[»] chr6 (42 HSPs)
chr6 (91-235)||(3720203-3720347)
chr6 (86-234)||(31894167-31894315)
chr6 (86-240)||(15058120-15058274)
chr6 (105-290)||(11655922-11656120)
chr6 (91-240)||(181559-181707)
chr6 (105-290)||(6801871-6802069)
chr6 (105-275)||(32440621-32440803)
chr6 (105-240)||(29363309-29363444)
chr6 (107-210)||(7920272-7920374)
chr6 (116-234)||(13909433-13909551)
chr6 (106-204)||(27448133-27448231)
chr6 (107-228)||(1225062-1225183)
chr6 (136-224)||(1063610-1063698)
chr6 (93-240)||(1781806-1781952)
chr6 (105-228)||(3291744-3291867)
chr6 (141-240)||(13087533-13087632)
chr6 (116-227)||(21804516-21804626)
chr6 (125-240)||(24983445-24983560)
chr6 (127-229)||(5302365-5302467)
chr6 (86-240)||(23142670-23142824)
chr6 (160-234)||(33510149-33510222)
chr6 (151-229)||(34300009-34300087)
chr6 (141-210)||(1955991-1956060)
chr6 (148-229)||(11143606-11143687)
chr6 (127-228)||(30716915-30717016)
chr6 (130-234)||(17828949-17829053)
chr6 (140-188)||(28101370-28101418)
chr6 (160-210)||(8115069-8115119)
chr6 (103-171)||(7764213-7764281)
chr6 (238-290)||(27367220-27367272)
chr6 (238-290)||(27457567-27457619)
chr6 (236-275)||(6834487-6834526)
chr6 (108-240)||(21010176-21010312)
chr6 (193-240)||(34657626-34657673)
chr6 (240-290)||(5302292-5302342)
chr6 (136-246)||(17835381-17835491)
chr6 (115-157)||(27367422-27367464)
chr6 (115-157)||(27457769-27457811)
chr6 (236-288)||(1956097-1956150)
chr6 (120-213)||(6834360-6834453)
chr6 (236-290)||(21010112-21010168)
chr6 (236-290)||(29363245-29363301)
[»] scaffold0330 (1 HSPs)
scaffold0330 (106-240)||(5393-5527)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (86-240)||(16101-16255)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (86-234)||(135995-136143)
[»] scaffold0159 (1 HSPs)
scaffold0159 (85-290)||(33976-34192)
[»] scaffold0294 (1 HSPs)
scaffold0294 (96-181)||(17097-17182)
[»] scaffold0182 (1 HSPs)
scaffold0182 (117-240)||(20342-20465)
[»] scaffold0003 (4 HSPs)
scaffold0003 (106-204)||(39127-39225)
scaffold0003 (105-174)||(252506-252575)
scaffold0003 (171-240)||(252848-252916)
scaffold0003 (236-289)||(252924-252976)
[»] scaffold0583 (1 HSPs)
scaffold0583 (105-210)||(2058-2163)
[»] scaffold0110 (1 HSPs)
scaffold0110 (105-228)||(1719-1842)
[»] scaffold0328 (2 HSPs)
scaffold0328 (127-229)||(7980-8082)
scaffold0328 (245-290)||(8111-8156)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (107-240)||(105687-105820)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (108-244)||(6737-6872)
[»] scaffold0470 (1 HSPs)
scaffold0470 (96-173)||(1055-1132)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (105-179)||(6262-6336)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (91-133)||(84376-84418)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 62)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 5 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 12151409 - 12151129
Alignment:
Q  5 caaagggaattgggtgtttcttctatccttttccttttcttttgttcaaaactaattggaaaatgaaaagtaagttatgctcctctgtctcacaatattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| |||||||||||||    
T  12151409 caaagggaattgggtgtttcttctatccttttccttttcttttgttgaaaactaattggaaaatgaaaagt----tatgctcctct-tctcacaatattt 12151315  T
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  12151314 gtcgtttaaggtttgtgtatgattattaaggagattattaattatgttgatttcaatgataaaattagtatcatttactaaaatattgtaattaattgta 12151215  T
Q  205 gttagtagagcagttaagttggatgtaattctataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12151214 gttagtggagcagttaagttgggtggaattctataataatgaaaaataataataaatgctgcattgatattataaagtgacaatta 12151129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 39864249 - 39864052
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  39864249 gtcgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaatactcttattaattgta 39864150  T
Q  205 gttagtagagcagttaagttggatgtaattc------------tataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |||||            ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  39864149 gttagtggagtagttaagttggatgaaattcaataaataagggtataatagtggaaaaaaataataaatgttgcattgatattgtaaagtgacaatta 39864052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 92 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 12039233 - 12039023
Alignment:
Q  92 tctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatatt 191  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| || | | |    
T  12039233 tctcacaatattagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtaacatttactaatacact 12039134  T
Q  192 gttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattc------------tataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataa 279  Q
     |||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||            ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||    
T  12039133 cttattaattgtagttaatggagtatttaagttggatgtaattcaataaataagggtataatagtggaaaataataataaatgttgcattagtattgtaa 12039034  T
Q  280 actgacaatta 290  Q
    | |||||||||    
T  12039033 agtgacaatta 12039023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 86 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 28749148 - 28748994
Alignment:
Q  86 cctctgtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaa 185  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  28749148 cctccgtctcataatatttgtcatttaagatttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaa 28749049  T
Q  186 aatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    || |   |||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| |||| |||||    
T  28749048 aacacccttattaattgtaattagtagaattgttaagttggatgaaattttataa 28748994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 105 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 917162 - 917033
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||| ||||||   ||||||||||||    
T  917162 gtcgtttaaggtttgtgcacgattattaaataaatgattaattatgttgatttaaatggtaaaattaatatcatttactaaaatacccttattaattgta 917063  T
Q  205 gttagtagagcagttaagttggatgtaatt 234  Q
    |||||||||  |||||||||| ||| ||||    
T  917062 gttagtagattagttaagttgcatgaaatt 917033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 91 - 240
Target Start/End: Original strand, 44707726 - 44707875
Alignment:
Q  91 gtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatat 190  Q
    |||||| |||||| |||||||||  ||| |||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||| |||| |     
T  44707726 gtctcataatattagtcgtttaaagtttttgcacgattattatagaaatgattaattatattgatttcaatgataaaattagtagtatttactaaaacac 44707825  T
Q  191 tgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
      ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  44707826 atttattaattgtagttagtgaagcagttaagttggatgaaattcaataa 44707875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 86 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 31042954 - 31042800
Alignment:
Q  86 cctctgtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaa 185  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||       
T  31042954 cctccgtctcacaatattagtcatttaaggtttgtgcatgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtatcatttactgt 31042855  T
Q  186 aatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    ||||   ||||||||||||| ||||  || | |||||||| ||| ||||| ||||    
T  31042854 aatacccttattaattgtaggtagtgaagtaattaagttgaatgaaattcaataa 31042800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 91 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 9307779 - 9307630
Alignment:
Q  91 gtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatat 190  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||| ||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| |     
T  9307779 gtcttacaatattagtcgtttaaggtttgtacacgattattaaggaaatgattaactgtgttgatttcaatgataaaattaatagcatttactaaaacac 9307680  T
Q  191 tgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
      || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  9307679 ccttgttaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaattcaataa 9307630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 108 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 10495973 - 10495842
Alignment:
Q  108 gtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagtt 207  Q
    ||||||| ||| || | |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||| ||    
T  10495973 gtttaaggtttatgtaagattattaaaaaaattattaattttgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacact-ttattaattgtaatt 10495875  T
Q  208 agtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    ||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  10495874 agtggagtagttaagttggatgaaattcaataa 10495842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 90 - 290
Target Start/End: Original strand, 6160424 - 6160627
Alignment:
Q  90 tgtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaata 189  Q
    ||||||| |||| | |||||||| |  ||||| | |||| ||||  |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  6160424 tgtctcaaaataatagtcgtttacgacttgtgtacgatttttaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatgataaaattagtattatttactaaaata 6160523  T
Q  190 ttgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataataatgg--aaaataat-aataaatgctgcattgatattataaactgaca 286  Q
     | |||||||||||||||| | ||  |||||||||| ||||||||| ||||  | ||  | ||||||  ||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  6160524 ctcttattaattgtagttaatggaatagttaagttgaatgtaattcaataaacaagggtataataatgcataaatgttgcattgatattctaaaatgaca 6160623  T
Q  287 atta 290  Q
    ||||    
T  6160624 atta 6160627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 37506264 - 37506065
Alignment:
Q  106 tcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattag---tatcatttacaaaaatattgttattaattg 202  Q
    ||||||||| ||  |||| | ||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||   |||||||||| |||| | | ||||||||||    
T  37506264 tcgtttaaggttgatgcacggttattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatgataaaattagtactatcatttactaaaacacttttattaattg 37506165  T
Q  203 tagttagtagagcagttaagttggatgtaattc------------tataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||| |||||            ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  37506164 tagttagtggagtagttaagttgaatgaaattcaataaataagggtattataatggaaaaaaataataaatgttgcattgatattctaaagtgacaatta 37506065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 109 - 240
Target Start/End: Original strand, 13579605 - 13579736
Alignment:
Q  109 tttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagtta 208  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |    |||||||||||||||    
T  13579605 tttaaggtttatgcatgattattaaagaaatgattaattgtgttgattttgatgacaatattaatatcatttacaaaaacacccatattaattgtagtta 13579704  T
Q  209 gtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    || ||| | ||||||| |||| ||||| ||||    
T  13579705 gtggagtatttaagtttgatgaaattcaataa 13579736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 127 - 290
Target Start/End: Original strand, 20209842 - 20210017
Alignment:
Q  127 ttattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttgg 226  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  20209842 ttattaagaaaatgattaattatgttgattttgatagtaaaattagtatcatttactaaaacatccttattaattgtagttagtggagtagttaagttgg 20209941  T
Q  227 atgtaattctataa------------taatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    ||| | ||| ||||            |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  20209942 atgaagttcaataaataagggtattataatgggaaaaaataataaatgctgcattggtattctaaagtgacaatta 20210017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 111 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 24881008 - 24880876
Alignment:
Q  111 taagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagt 210  Q
    |||| ||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  24881008 taaggtttgtgcataattattacggaaatgattgattatgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaatacttttattaattgtagttagt 24880909  T
Q  211 agagcagt---taagttggatgtaattctataa 240  Q
     ||| |||   ||||||||||| ||||| ||||    
T  24880908 ggagtagttagtaagttggatgaaattcaataa 24880876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 86 - 240
Target Start/End: Original strand, 24991614 - 24991768
Alignment:
Q  86 cctctgtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaa 185  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| | | |||||||| ||  |||||| |     
T  24991614 cctccgtctcacaatattagtcgtttaaggtttgtacacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaacggtaaaattaatagtatttactac 24991713  T
Q  186 aatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    || |   |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||| ||||    
T  24991714 aacacctttattaattgtagttagtggaatagttaagttggatgaaattcaataa 24991768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 210
Target Start/End: Original strand, 34031510 - 34031612
Alignment:
Q  108 gtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagtt 207  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||| | ||| |||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  34031510 gtttaaggtttgtgcatgattattaaggaaatgattacttgtgttgattccaatggtaaaattaatatcatttactaaaataccgttattaattgtagtt 34031609  T
Q  208 agt 210  Q
    |||    
T  34031610 agt 34031612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 120 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 7759338 - 7759156
Alignment:
Q  120 tgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagtt 219  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||| | |||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||  ||||    
T  7759338 tgcacgattattaaaaaaataattaattgtgttgatttcaatggtgaaattaatatcatttactaaaatactcttattaattgtagttagtggaatagtt 7759239  T
Q  220 aagttggatgtaattc------------tataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    |||||| ||| |||||            ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| |||| |||||||||    
T  7759238 aagttgaatgaaattcaataaataagggtataataatggaaaaaaataataaatgatgcattattattgtaaagtgacaatta 7759156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 26093532 - 26093427
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||  |||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||  |||||||  ||||||||||||    
T  26093532 gtcgtttaagatttgtgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttattaaaatatccttattaattgta 26093433  T
Q  205 gttagt 210  Q
    ||||||    
T  26093432 gttagt 26093427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 132 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 3312222 - 3312060
Alignment:
Q  132 aaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagtta--agttggat- 228  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||  ||| | ||     
T  3312222 aaagaaatgattaattgtgttgattttaatgattaaattagtatcatttactataatattgatattaattgtagttagtggagtagataatagtggaata 3312123  T
Q  229 -gtaattctataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
      |||   ||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  3312122 aataagagtataatagtggaatataataataaatgttgtattgatattataaagtgacaatta 3312060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 105 - 290
Target Start/End: Original strand, 33733243 - 33733439
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||| ||||| |||| || |||||||||| ||| |||||||| || ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  33733243 gtcgtttaaagtttgtgcacgattattaaggaaatgatta-ttgtgttgatttcaatggtaaaattattaacatttactaaaatacttttattaattgta 33733341  T
Q  205 gttagtagagcagttaagttggatgtaattc------------tataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    ||||||||||  |||| || | ||| |||||            ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||    
T  33733342 gttagtagagtggttaggtagaatgaaattcaataaataagggtataataatggaaaagaataataaatgcttcattggtattctaaagtgacaatta 33733439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 105 - 240
Target Start/End: Original strand, 16395027 - 16395161
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||||  |||| ||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||   || |||||||||    
T  16395027 gtcgtttaaggtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttgattttgatagtaaaattagtatcatttactaaaata-cctttttaattgta 16395125  T
Q  205 gttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||| ||||| ||||    
T  16395126 gttagtggagtagttaagttagatgaaattcaataa 16395161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 105 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 38787479 - 38787344
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| | |||| ||  ||||||||| ||    
T  38787479 gtcgtttaaggtttatgcacgattattaaggaaatgattgattgtgttgattttgatggtaaaactagtatcatttgccaaaacatccttattaattata 38787380  T
Q  205 gttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||| ||||| ||||    
T  38787379 gttagtggagtagttaaattggatgaaattcaataa 38787344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 96 - 210
Target Start/End: Original strand, 23168964 - 23169078
Alignment:
Q  96 acaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgtta 195  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||  |||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||  |||    
T  23168964 acaatattagtcgtttaaagtttgtgcacgattattaagaaaataattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaacatcctta 23169063  T
Q  196 ttaattgtagttagt 210  Q
    |||||| ||||||||    
T  23169064 ttaattatagttagt 23169078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 136 - 229
Target Start/End: Original strand, 49223997 - 49224090
Alignment:
Q  136 aaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatg 229  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  49223997 aaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacacccttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatg 49224090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 136 - 240
Target Start/End: Original strand, 8896343 - 8896447
Alignment:
Q  136 aaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattc 235  Q
    |||| ||| ||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||    
T  8896343 aaatgattgattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaatatatttattaattgtagttagtggagtggttaagttggatgaaattc 8896442  T
Q  236 tataa 240  Q
     ||||    
T  8896443 aataa 8896447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 240
Target Start/End: Original strand, 44761522 - 44761646
Alignment:
Q  116 tttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagc 215  Q
    |||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||| ||      
T  44761522 tttgtgtatgattaataaaaaaatgattaattatgttaattttaatgataaaattaatatcatttactaaaatatctttattaattatagttagtggaat 44761621  T
Q  216 agttaagttggatgtaattctataa 240  Q
     ||||||||| ||| ||||| ||||    
T  44761622 ggttaagttgaatgaaattcaataa 44761646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 97 - 235
Target Start/End: Original strand, 6023621 - 6023759
Alignment:
Q  97 caatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttat 196  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||  ||||||||  |||||  |||||| |||||||||| ||| |||| |||||| | ||||| ||||||   ||||    
T  6023621 caatattagtcgtttaatgtttgtgcgcgattattacggaaatgtttaattgtgttgatttcaatggtaaatttagtagcttttactaaaatacctttat 6023720  T
Q  197 taattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattc 235  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||    
T  6023721 taattgtagttattggagtagttaagttggatgaaattc 6023759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 116 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27897082 - 27896964
Alignment:
Q  116 tttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagc 215  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| |||||   |||||||||  |||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||| |||||||| |||     
T  27897082 tttgtgcatgatttttaaggaaataattaaacgtgttgattttaatgataaaattagtataatttatcaaaatattcttattaattatagttagtggagt 27896983  T
Q  216 agttaagttggatgtaatt 234  Q
    | || ||||||||| ||||    
T  27896982 aatttagttggatgaaatt 27896964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 130 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 36702034 - 36701924
Alignment:
Q  130 ttaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatg 229  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||    
T  36702034 ttaaggaaatgattaattatgttgatttcaatggtaaaattagtatcatttactaaaatgcccttattaattgtagttagtggaatcgttaagtttgatg 36701935  T
Q  230 taattctataa 240  Q
     ||||| ||||    
T  36701934 aaattcaataa 36701924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 130 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 36718138 - 36718028
Alignment:
Q  130 ttaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatg 229  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||    
T  36718138 ttaaggaaatgattaattatgttgatttcaatggtaaaattagtatcatttactaaaatgcccttattaattgtagttagtggaatcgttaagtttgatg 36718039  T
Q  230 taattctataa 240  Q
     ||||| ||||    
T  36718038 aaattcaataa 36718028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 136 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15699229 - 15699136
Alignment:
Q  136 aaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatg 229  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||| |   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  15699229 aaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattaatatcatttactaaaacacccttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatg 15699136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 52429481 - 52429352
Alignment:
Q  106 tcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtag 205  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| || ||||| |||||||  ||||||| ||||| |||| ||| | |||||||  ||||||   |||||||||||||    
T  52429481 tcgtttaaggtttgtgcacgattatgaaggaaatgattaatttggttgattacgatggtaaatttaatgtcatttattaaaatacccttattaattgtag 52429382  T
Q  206 ttagtagagcagttaagttggatgtaattc 235  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||| |||||    
T  52429381 ttagtggagtagttaagttgaatgaaattc 52429352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 37276584 - 37276464
Alignment:
Q  120 tgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagtt 219  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||| |   |||||||||||||||||| ||  ||||    
T  37276584 tgcacgattattaaggaaatgattaactgtgttgattttgatggtaaaattagtatcgtttactaaaacacccttattaattgtagttagtggaatagtt 37276485  T
Q  220 aagttggatgtaattctataa 240  Q
    || ||||||| ||||| ||||    
T  37276484 aaattggatgaaattcaataa 37276464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 2572606 - 2572472
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||| | |||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||| ||   ||||||||||||    
T  2572606 gtcgtttaaagtttgtgtacgattattaaaataatgattaattgtattgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaa-tacaattattaattgta 2572508  T
Q  205 gttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||| ||||| ||||    
T  2572507 gttagtggagtagttaagttgaatgaaattcaataa 2572472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 290
Target Start/End: Original strand, 40144849 - 40145024
Alignment:
Q  127 ttattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttgg 226  Q
    |||||||  |||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||| |   |||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  40144849 ttattaagaaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattaatatcatttactaaaacacccttattaattgtagttaatggagtagttaagttgg 40144948  T
Q  227 atgtaattctataa------------taatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    ||| | ||| ||||            |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  40144949 atgaagttcaataaataagggtattataatgggaaaaaataataaatgttgcattgatattctaaagtgacaatta 40145024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 187
Target Start/End: Original strand, 43500764 - 43500846
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaa 187  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||||| ||||    
T  43500764 gtcgtttaaggtttatgcacgattattaaggaaattattaattgtgttgattttgatggtataattagtttcatttactaaaa 43500846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 141 - 234
Target Start/End: Original strand, 14757610 - 14757703
Alignment:
Q  141 attaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaatt 234  Q
    ||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||| | | ||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| ||||    
T  14757610 attaattgtgttgatttcaacgataaaattagtaacatttactaaaacactcttattaattgtagttagtgaagtagttaagttcgatgaaatt 14757703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 228
Target Start/End: Original strand, 32970567 - 32970670
Alignment:
Q  125 gattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagtt 224  Q
    |||||||||  |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||| |  |||||||||| ||||||| |  | |||||||    
T  32970567 gattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatgataaaattaatattatttactaaaatactcgtattaattgttgttagtaaaataattaagtt 32970666  T
Q  225 ggat 228  Q
    ||||    
T  32970667 ggat 32970670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 235
Target Start/End: Original strand, 5179379 - 5179509
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||||| ||||| || |||| ||||  |||| ||||||| |||||||||| ||   ||||| |||||||||||| ||| | ||  |||||||||||    
T  5179379 gtcgtttaaggtttgtacacgattcttaacaaaatgattaattgtgttgatttcaatagcaaaatgagtatcatttactaaagttttcatattaattgta 5179478  T
Q  205 gttagtagagcagttaagttggatgtaattc 235  Q
    |||||| ||| || ||| ||||||| |||||    
T  5179479 gttagtggagtagataaattggatgaaattc 5179509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9379345 - 9379240
Alignment:
Q  130 ttaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagt-agagcagttaagttggat 228  Q
    |||||||||| ||||||| |  ||||||  |||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||    
T  9379345 ttaaagaaatgattaattgtaatgattttaatgataaaattaatatcatttattaaaatatatttattaattgtagttagtgggagtagttaagtttgat 9379246  T
Q  229 gtaatt 234  Q
    | ||||    
T  9379245 gaaatt 9379240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 11450018 - 11449888
Alignment:
Q  108 gtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagtt 207  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||  || |||| | | || |   |||||||||||||||    
T  11450018 gtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatggttaattatgttgatttcaatggtaaaatta--ataattttctataacacatttattaattgtagtt 11449921  T
Q  208 agtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    | ||||| ||| || ||||||| ||||| ||||    
T  11449920 aatagagtagtaaaattggatgaaattcaataa 11449888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 45331457 - 45331376
Alignment:
Q  127 ttattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagtta 208  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||| |   ||||||||||||||||    
T  45331457 ttattaagaaaataattaattatgttgattttgatggtaaaattaatatcatttactaaaacacccttattaattgtagtta 45331376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 154 - 210
Target Start/End: Original strand, 29778425 - 29778481
Alignment:
Q  154 atttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagt 210  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  29778425 atttcaatggtaaaattagtatcatttactaaaatatcattattaattgtagttagt 29778481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 35538750 - 35538678
Alignment:
Q  136 aaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagtta 208  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||   ||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  35538750 aaattattaattgtgttgatttcaatgataaaatggatattatttactaaaatatccttattaattgtagtta 35538678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 219
Target Start/End: Original strand, 41121835 - 41121919
Alignment:
Q  135 gaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagtt 219  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||||   |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  41121835 gaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagcataatttactaaaatacccttattaattgtagttagtggagtagtt 41121919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 290
Target Start/End: Original strand, 43500865 - 43500917
Alignment:
Q  238 taataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||    
T  43500865 taataatggaaaataataataaatgctgcattagtattctaaagtgacaatta 43500917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 42410110 - 42410027
Alignment:
Q  127 ttattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagt 210  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||  |   ||||||||||||||||||    
T  42410110 ttattaaaaaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattaatatcatttactaaagcacccttattaattgtagttagt 42410027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 176
Target Start/End: Original strand, 21909987 - 21910057
Alignment:
Q  106 tcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatc 176  Q
    ||||||||| ||| ||||  |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  21909987 tcgtttaaggtttatgcacaattattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatc 21910057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 6365738 - 6365641
Alignment:
Q  136 aaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaat 233  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || || |||||||||| |||||  |||||||  || |||||||||||||||  |  ||||||||| ||||||||    
T  6365738 aaatgattaattgtgttgatttcaataatcaaattagtattatttattaaaatatcattgttaattgtagttagtgaattagttaagtttgatgtaat 6365641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 105 - 210
Target Start/End: Original strand, 32825972 - 32826076
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||||| ||  |||| | ||||||| ||||| ||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |   ||||||||||||    
T  32825972 gtcgtttaaggttgatgcacggttattaaggaaatgattaatg-tgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacacctttattaattgta 32826070  T
Q  205 gttagt 210  Q
     |||||    
T  32826071 attagt 32826076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 181
Target Start/End: Original strand, 35682796 - 35682861
Alignment:
Q  116 tttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcattta 181  Q
    |||||||| |||| |||| ||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  35682796 tttgtgcacgatttttaacgaaaagattaattgtgttgatttcaatgataacattagtatcattta 35682861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 49177032 - 49176940
Alignment:
Q  128 tattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagtta 220  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||| | | ||||||  || |||||||| |||||| | ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  49177032 tattaaggaaataattaataatgttgatttcaaaggtaaaatatgtgtcatttactaaaatactcttattaattatagttaatagagtagtta 49176940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 90 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 41080751 - 41080613
Alignment:
Q  90 tgtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaata 189  Q
    ||||||| |||| | |||| ||||| ||| ||||||| | ||||| |||| ||||||| |||||||||  ||  |||||||  |||||||||   |||||    
T  41080751 tgtctcaaaataatagtcgattaaggtttatgcatgaattttaaaaaaatgattaattgtgttgattttaatagtaaaatttatatcatttattgaaata 41080652  T
Q  190 ttgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatg 229  Q
    |  |||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||    
T  41080651 tctttattaattgtaattagtggag-aggtaagttggatg 41080613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 141 - 208
Target Start/End: Original strand, 51028509 - 51028576
Alignment:
Q  141 attaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagtta 208  Q
    ||||||| |||||||||  || ||||| |||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  51028509 attaattgtgttgattttaataataaagttagtagcatttattaaaatatttttattaattgtagtta 51028576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 208
Target Start/End: Original strand, 17988574 - 17988643
Alignment:
Q  141 attaattatgttgatttcgatgataaaattag--tatcatttacaaaaatattgttattaattgtagtta 208  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||  ||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  17988574 attaattgtgttgatttcaatgttaaaattagtatattatttactaaaatactcttattaattgtagtta 17988643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24904060 - 24903978
Alignment:
Q  154 atttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattct 236  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||   | |||||||||| ||| ||||||    
T  24904060 atttcaatgagaaaatttgtatcatttactaaaatatttttattaattataattagttaggtagttaagttgaatgaaattct 24903978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 290
Target Start/End: Original strand, 34031650 - 34031704
Alignment:
Q  236 tataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||    
T  34031650 tataataatggaaaaacataataaatgctgcattgatagtctaaaacgacaatta 34031704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 290
Target Start/End: Original strand, 41121946 - 41122000
Alignment:
Q  236 tataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||    
T  41121946 tataataatgaaaaaaaataataaatgttgtattgatattttaaagtgacaatta 41122000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 240
Target Start/End: Original strand, 22856275 - 22856352
Alignment:
Q  163 ataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||||   | |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||| ||||    
T  22856275 ataaaattaataccatttactaaaataccctaattaattgtagttagtggagtagttaagctggatgaaattcaataa 22856352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 152
Target Start/End: Original strand, 26252497 - 26252558
Alignment:
Q  91 gtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgtt 152  Q
    ||||||||||| | |||||||||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  26252497 gtctcacaatagtagtcgtttaaagtttttgcatgattattaaaaaaatgattaattgtgtt 26252558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 240
Target Start/End: Original strand, 32219700 - 32219776
Alignment:
Q  164 taaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    |||||||| |||||||||  |||||| | ||||||||| ||||| || |||  ||||||||||||| ||||| ||||    
T  32219700 taaaattaatatcatttattaaaatactcttattaattatagtttgtggagtggttaagttggatgaaattcaataa 32219776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 196 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 37539174 - 37539130
Alignment:
Q  196 ttaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||    
T  37539174 ttaattgtagttagtagagtagttaagtttgatgaaattcaataa 37539130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 70)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 105 - 290
Target Start/End: Original strand, 42616886 - 42617083
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  42616886 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaatgattaactgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaatatttttattaattgta 42616985  T
Q  205 gttagtagagcagttaagttggatgtaattc------------tataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    || ||| ||| |||||||| | ||| |||||            ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| |||||||||    
T  42616986 gtaagtggagtagttaagtcgaatgaaattcaataaataagtgtataataatggaaaataataataaatgttgcatttgtattctaaagtgacaatta 42617083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 86 - 240
Target Start/End: Original strand, 7061628 - 7061782
Alignment:
Q  86 cctctgtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaa 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |     
T  7061628 cctctgtctcacaatattagtcgtttaaggtttgtacacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtatcatttactat 7061727  T
Q  186 aatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||| ||||| ||||    
T  7061728 aatatctttattaattgtagttagtggattaattaagttgaatgaaattcaataa 7061782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 87 - 240
Target Start/End: Original strand, 47464330 - 47464483
Alignment:
Q  87 ctctgtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaa 186  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  47464330 ctctatctcacaatattagtcgtttaaggtttgagcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaa 47464429  T
Q  187 atattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    | | | ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  47464430 aaactcttattaattgtagttggtggagtagttaagttggatgaaattcaataa 47464483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 85 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 32884959 - 32884804
Alignment:
Q  85 tcctctgtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaa 184  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||  |||| ||||||| |||||||||| ||| || |||||||| ||||||  |    
T  32884959 tcctccgtctcacaatattagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatggtagaattagtagcatttagta 32884860  T
Q  185 aaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    ||| | | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  32884859 aaacactcttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatggaattcaataa 32884804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 120 - 290
Target Start/End: Original strand, 52859797 - 52859974
Alignment:
Q  120 tgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagtt 219  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  52859797 tgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacatccttattaattgtagttagtggagtagtt 52859896  T
Q  220 aagttggatgtaattc-------tataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    |||||| ||| |||||       ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  52859897 aagttgaatgaaattcaatagggtataataatgggaaaaaataataaatgttgcattggtattctaaagtgacaatta 52859974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 86 - 240
Target Start/End: Original strand, 16821295 - 16821449
Alignment:
Q  86 cctctgtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaa 185  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||| | ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |     
T  16821295 cctccgtctcacaaaattagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaatgcaatgattaattgtgttgatttcaatgataaaattagtatcatttactat 16821394  T
Q  186 aatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    |||||  ||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||| ||||| ||||    
T  16821395 aatatccttattaattatagttagtggagtatttaagttgaatgaaattcaataa 16821449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 86 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 34360812 - 34360673
Alignment:
Q  86 cctctgtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaa 185  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  34360812 cctccgtctcacaatattaatcgtttaaagtttgtgcacgattattaaagaaatgattaattgtattgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaa 34360713  T
Q  186 aatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttg 225  Q
    || | | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  34360712 aacactcttattaattgtagttagtggagtagttaagttg 34360673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 91 - 225
Target Start/End: Original strand, 2942614 - 2942747
Alignment:
Q  91 gtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatat 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||  | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |     
T  2942614 gtctcacaatattagtcgtttaaggtttgtataagattattaaagaaatgattaattgtgttgatttcgatgataaaattagtagcatttactaaaaca- 2942712  T
Q  191 tgttattaattgtagttagtagagcagttaagttg 225  Q
      |||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  2942713 ccttattaattgtagttagtggagtggttaagttg 2942747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 86 - 240
Target Start/End: Original strand, 17237260 - 17237414
Alignment:
Q  86 cctctgtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaa 185  Q
    |||| ||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  17237260 cctccgtctcacaatactagtcatttaaggtttgtgcatgattattaagaaaataattaattgtgttgattgcaatggtaaaattagtaacatttactaa 17237359  T
Q  186 aatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    || |   |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  17237360 aacaaccttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaattcaataa 17237414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 91 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22130199 - 22130046
Alignment:
Q  91 gtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattat----gttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaa 186  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| ||||||| |    ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  22130199 gtctcacaatattagtcgtttaaggtttgtgcacggttattaaggaaatgattaattgtatgtgttgatttcaatggtataattagtatcatttacaaaa 22130100  T
Q  187 atattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    | ||  |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||    
T  22130099 acatccttattaattgtagttagtggagtaattaagttggatgaaattcaataa 22130046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 105 - 240
Target Start/End: Original strand, 38405085 - 38405220
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||  ||| |||||||| |||||||||| ||||||   ||||||||||||    
T  38405085 gtcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattctgttgatttaaatggtaaaattaatatcatttactaaaatacccttattaattgta 38405184  T
Q  205 gttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    |||||| | | |||||||||||||| ||||| ||||    
T  38405185 gttagtggtgtagttaagttggatgaaattcaataa 38405220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 86 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 43237400 - 43237246
Alignment:
Q  86 cctctgtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaa 185  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||  |||||| ||    
T  43237400 cctccgtctcacaatattagtcgtttaaggtttatgcacgattattaaggaaatgattaattgtgtttatttcaatggtaaaattagtaatatttactaa 43237301  T
Q  186 aatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    || ||  ||||||||| ||||||||  || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  43237300 aaaatcattattaattatagttagtgaagtagttaagttggatgaaattcaataa 43237246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 91 - 240
Target Start/End: Original strand, 6643629 - 6643778
Alignment:
Q  91 gtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatat 190  Q
    ||||||||||||| || ||||||  |||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||    
T  6643629 gtctcacaatattagtagtttaatgtttgagcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaacat 6643728  T
Q  191 tgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
      |||||||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||| ||||    
T  6643729 ctttattaattgtagttagtggtatagttaagttggatgaaattcaataa 6643778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6609898 - 6609775
Alignment:
Q  106 tcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtag 205  Q
    ||||||||  ||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||     
T  6609898 tcgtttaaagtttatgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttacaaaaacatctttattaattgtaa 6609799  T
Q  206 ttagtagagcagttaagttggatg 229  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||    
T  6609798 ttattggagtagttaagttggatg 6609775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 228
Target Start/End: Original strand, 49175917 - 49176040
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||  |||| ||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||    
T  49175917 gtcgtttaaggtttgtgcatgatttttaagaaaatgattaattgtggagatttcaatgataaaattagtatcatttactaaaataaccttattaattgta 49176016  T
Q  205 gttagtagagcagttaagttggat 228  Q
    |||||  ||| |||||||||||||    
T  49176017 gttagcggagtagttaagttggat 49176040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 91 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 49747112 - 49746901
Alignment:
Q  91 gtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatat 190  Q
    ||||||||||||| ||| || |||  ||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||     
T  49747112 gtctcacaatattagtcattcaaggcttgtgcacgattattaaa-aaataattaattgtgttgatttcaatgataaaattagtagtatttactaaaatac 49747014  T
Q  191 tgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattc------------tataataatgg-aaaataataataaatgctgcattgatattat 277  Q
      | ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||            ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |    
T  49747013 cttcattaattatagttagttgagtagttaagttggatgaaattcaataaataagggtataataatggaaaaataataataaatgttgcattggtattgt 49746914  T
Q  278 aaactgacaatta 290  Q
    ||| |||||||||    
T  49746913 aaagtgacaatta 49746901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 127 - 290
Target Start/End: Original strand, 47773024 - 47773199
Alignment:
Q  127 ttattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttgg 226  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |   |||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  47773024 ttattaaggaaataattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacacccttattaattgtagttagtggagtagttaagttgg 47773123  T
Q  227 atgtaattc------------tataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    ||| | |||            ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  47773124 atgaagttcaataaataagggtattataatggaaaaaaataataaatgctgcattggtattctaaagtgacaatta 47773199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 120 - 290
Target Start/End: Original strand, 11907597 - 11907779
Alignment:
Q  120 tgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagtt 219  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |   |||||||||||||||| | ||| ||||    
T  11907597 tgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacacccttattaattgtagttattggagtagtt 11907696  T
Q  220 aagttggatg------------taattctataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    ||||||||||            ||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  11907697 aagttggatgaagttcaataaataaatgtattataatggaaaaaaataataaatgctgcattggtattctaaagtgacaatta 11907779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 96 - 224
Target Start/End: Original strand, 40122828 - 40122956
Alignment:
Q  96 acaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgtta 195  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||  ||||||||  ||| ||||||||||| ||||||| |||| |   |||    
T  40122828 acaatattagtcgtttaagctttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgcgttgattttaatgttaaaattagtagcatttactaaaacaccctta 40122927  T
Q  196 ttaattgtagttagtagagcagttaagtt 224  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||    
T  40122928 ttgattgtagttagtggagcagttaagtt 40122956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 240
Target Start/End: Original strand, 33790714 - 33790849
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||||  |||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||| | |||| |   ||||||||||||    
T  33790714 gtcgtttaaggtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtttcatttgctaaaacacccttattaattgta 33790813  T
Q  205 gttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  33790814 gttagtggagtagttaagttggatgaaattcaataa 33790849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 240
Target Start/End: Original strand, 49428325 - 49428460
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| |||| || |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||| ||||||   ||||||||||||    
T  49428325 gtcgtttaaggtttttgcacgattattaaggaaatgattatttgtgttgatttcaatggtaaaattaatataatttactaaaatacccttattaattgta 49428424  T
Q  205 gttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    |||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||    
T  49428425 gttagtggagtaattaagttggatgaaattcaataa 49428460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 240
Target Start/End: Original strand, 21240708 - 21240822
Alignment:
Q  126 attattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttg 225  Q
    |||||||| ||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || | ||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  21240708 attattaaggaaatgattaactgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaacacatccttattaattgtagttagttgagtagttaagttg 21240807  T
Q  226 gatgtaattctataa 240  Q
    |||| ||||| ||||    
T  21240808 gatgaaattcaataa 21240822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 86 - 240
Target Start/End: Original strand, 35311187 - 35311341
Alignment:
Q  86 cctctgtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaa 185  Q
    |||| |||| ||||||||   |||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||| |  ||||||| |     
T  35311187 cctccgtcttacaatattaagcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattatgttaatttcaatggtaaaattaattgcatttactag 35311286  T
Q  186 aatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    || | | |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||    
T  35311287 aacactcttattaattgtagttagtggagtaattaagttggatgaaattcaataa 35311341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 290
Target Start/End: Original strand, 5841410 - 5841608
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||||| ||||||||  | |||||| ||||| ||| |||  ||||||||  ||| |||||||| |||||||||| ||||||   ||||||||||||    
T  5841410 gtcgtttaaggtttgtgcacaactattaaggaaatgattgattgcgttgattttaatggtaaaattaatatcatttactaaaatacccttattaattgta 5841509  T
Q  205 gttagtagagcag-ttaagttggatgtaattc------------tataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    |||||| ||| || |||||||||||| |||||            |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  5841510 gttagtggagtagtttaagttggatgaaattcaataaataaaggtataataatggaaattaataataaatgatgcattgatattctaaagtgacaatta 5841608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 125 - 290
Target Start/End: Original strand, 35380336 - 35380514
Alignment:
Q  125 gattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagtt 224  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||  |||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  35380336 gattattaagaaaatgattaattatgttgattttaatggtaaaattagtagcatttactaaaacatcattattaattgtagttagtggagtggttaagtt 35380435  T
Q  225 ggatgtaattc------------tataataatgg-aaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    ||||| |||||            ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  35380436 ggatgaaattcaataaataagagtataataatggaaaaaaaataataaatgttgcattggtattataaagtgacaatta 35380514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 91 - 208
Target Start/End: Original strand, 46396852 - 46396969
Alignment:
Q  91 gtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatat 190  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||  |||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||| || ||||||| |||| |     
T  46396852 gtctcacaatatttgccgtttaaggtttgtgcacgatcattaagtaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatagcatttactaaaacac 46396951  T
Q  191 tgttattaattgtagtta 208  Q
    | ||||||||||||||||    
T  46396952 tcttattaattgtagtta 46396969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 108 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2653553 - 2653429
Alignment:
Q  108 gtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagtt 207  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||    
T  2653553 gtttaagatttgtgcatgattattaaa--aatgattaattgtgttgatttcaattgtaaaattagtatcatttattaaaatactcttattaattgtagtt 2653456  T
Q  208 agtagagcagttaagttggatgtaatt 234  Q
    |   ||| |||||| ||||||| ||||    
T  2653455 aaaggagtagttaaattggatgaaatt 2653429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 229
Target Start/End: Original strand, 26147635 - 26147722
Alignment:
Q  142 ttaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatg 229  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  26147635 ttaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacattcttattaattgtagttagtggagtaattaagttggatg 26147722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 235
Target Start/End: Original strand, 52247411 - 52247541
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||||  |||| ||||||| |||| ||||| ||| |||||||| ||  |||||| |||||||  ||||||||||||    
T  52247411 gtcgtttaaggattgtgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaatttcaatggtaaaattaatacaatttactaaaatatccttattaattgta 52247510  T
Q  205 gttagtagagcagttaagttggatgtaattc 235  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||| |||||    
T  52247511 gttagtggagtagttaagttgaatgaaattc 52247541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 3689700 - 3689571
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||||| ||| || | | ||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||| ||    
T  3689700 gtcgtttaaggtttatgtacggttattaaagaaatgattaattgtattgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacactcttattaattata 3689601  T
Q  205 gttagtagagcagttaagttggatgtaatt 234  Q
    |||||| |||  |||||||| |||| ||||    
T  3689600 gttagttgagttgttaagttagatgaaatt 3689571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 4972712 - 4972595
Alignment:
Q  91 gtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatat 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||   |||||| ||  ||||||| |||| |     
T  4972712 gtctcacaatattagtcgtttaagatttgtgcacgattattaatgaaatgattaattgtgttgatttcaattgaaaaattggtgacatttactaaaacac 4972613  T
Q  191 tgttattaattgtagtta 208  Q
    | ||||||||||||||||    
T  4972612 tcttattaattgtagtta 4972595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 135 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 36985894 - 36985789
Alignment:
Q  135 gaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaatt 234  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||    
T  36985894 gaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtatcatttactaaaatacccgtattaattgtagttagtagaataattaagttggatgaaatt 36985795  T
Q  235 ctataa 240  Q
    | ||||    
T  36985794 caataa 36985789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 127 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17114556 - 17114456
Alignment:
Q  127 ttattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttgg 226  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |   |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  17114556 ttattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacacccttattaattgtagttagtggagtagttaatttgg 17114457  T
Q  227 a 227  Q
    |    
T  17114456 a 17114456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 228
Target Start/End: Original strand, 38502465 - 38502588
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||||| ||  |||||  ||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||| ||    
T  38502465 gtcgtttaaggttgatgcatagttattaaggaaataattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttattaaaatacttttattaattata 38502564  T
Q  205 gttagtagagcagttaagttggat 228  Q
    |||| |  || |||||||||||||    
T  38502565 gttaatgtagtagttaagttggat 38502588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 141 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 53412210 - 53412111
Alignment:
Q  141 attaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    ||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| || ||  |||||||||||||| ||||| ||||    
T  53412210 attaattttattgatttcaatggtaaaattagtatcatttactaaaatatttttattaattatagtttgtggaatagttaagttggatgaaattcaataa 53412111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 106 - 240
Target Start/End: Original strand, 18741458 - 18741592
Alignment:
Q  106 tcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtag 205  Q
    ||||||| | |||||||| |||| |  || ||||| |||||||| |||||||| | | |||||||||| |||||||  |||||||  |||||||||||||    
T  18741458 tcgtttagggtttgtgcacgattttctaaaaaattgttaattatattgatttcaacggtaaaattagtgtcatttattaaaatatctttattaattgtag 18741557  T
Q  206 ttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    ||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  18741558 ttaatggagtagttaagttggatgaaattcaataa 18741592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25233297 - 25233195
Alignment:
Q  127 ttattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttgg 226  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||| | |  |||||||| ||||||||  || |||||||||||    
T  25233297 ttattaaagaaataattaattgtgttaattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacactagtattaattatagttagtgaagtagttaagttgg 25233198  T
Q  227 atg 229  Q
    |||    
T  25233197 atg 25233195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 54506926 - 54506739
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||||| |||||  | | |||||||  |||| ||||| | |||||||||| ||| |||||||| |||||||||  |||||||  |||| |||||||    
T  54506926 gtcgtttaagatttgtttacggttattaagaaaatgattaactgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttattaaaatatcattatcaattgta 54506827  T
Q  205 gttagtagagcagttaagttggatgtaattc------------tataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaa 280  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||| |||||            |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  54506826 gttagtggagtagttaagtttgatgaaattcaattaataagaatataataatgaaaaataataataaatgttgcatcgatattataaa 54506739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 149 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7987068 - 7986993
Alignment:
Q  149 tgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagtt 224  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  7987068 tgttgattttaatgataaaattagtatcatctactaaaatattattattaattattgttagtagagtagttaagtt 7986993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 240
Target Start/End: Original strand, 30682179 - 30682314
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||||| ||| |||| || ||||||| |||| ||||||| |||| ||||   || |||||||| |||||||||| | |||||  |||||| |||||    
T  30682179 gtcgtttaaggtttttgcacgactattaaaaaaatgattaattgtgttaattttattggtaaaattaatatcatttactataatatccttattagttgta 30682278  T
Q  205 gttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||    
T  30682279 gttagtagagtagttaatttgaatgaaattcaataa 30682314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 11288614 - 11288735
Alignment:
Q  106 tcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtag 205  Q
    ||||||||| ||| || | |||||||||  |||| ||||||| | |||||||| |||  ||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  11288614 tcgtttaaggtttatgtacgattattaagaaaatgattaattgtattgatttcaatggcaaaattaatatcatttactaaaatatc-ttattaattgtag 11288712  T
Q  206 ttagtagagcagttaagttggat 228  Q
    || || ||| |||||||||||||    
T  11288713 ttggtggagtagttaagttggat 11288735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 30192312 - 30192234
Alignment:
Q  136 aaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagag 214  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30192312 aaatgattaattgtgttgatttcaattataaaattaatgtcatttgctaaaatattcttattaattgtagttagtagag 30192234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 240
Target Start/End: Original strand, 47358933 - 47359067
Alignment:
Q  106 tcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtag 205  Q
    ||||||||  ||||||||||||   |||  |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| || |||| | |||||| | |||||||||||||    
T  47358933 tcgtttaatgtttgtgcatgatgtctaagaaaattattgattgtgttgatttcaatgataaaattagaataattttctaaaatacttttattaattgtag 47359032  T
Q  206 ttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    | ||| ||| | |||||||| ||| ||||| ||||    
T  47359033 tcagtggagtaattaagttgaatgaaattcaataa 47359067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 123 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 3098838 - 3098757
Alignment:
Q  123 atgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  3098838 atgattagtaaaaaaatgattaattatattgatttcaatgataaaattgatatcatttactaaaatatctttattaattgta 3098757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 91 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 52869224 - 52869107
Alignment:
Q  91 gtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatat 190  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||||||||  |||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||  ||| |||| |||| ||||  ||||||     
T  52869224 gtctcacattattagtcgtttaaggtttgtgcacaattattaaggaaataattaattgtgttgatttcaatagtaagattaatatcgtttattaaaatac 52869125  T
Q  191 tgttattaattgtagtta 208  Q
      ||||||||||||||||    
T  52869124 ctttattaattgtagtta 52869107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 35998929 - 35998825
Alignment:
Q  125 gattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagtt 224  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |   ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||||||||||||  | ||| |||||||||    
T  35998929 gattattaaaaaaattattatttatgttgattttaacagtaaaattagtaacatttattaaaatatcattattaattgtagttgatggagtagttaagtt 35998830  T
Q  225 ggatg 229  Q
    |||||    
T  35998829 ggatg 35998825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 234
Target Start/End: Original strand, 38663420 - 38663559
Alignment:
Q  94 tcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgt 193  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| || | |||||||| | |||   ||||||  |||| |||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| | | |    
T  38663420 tcacaatattagtcgtttaaggttt-tgaacgattattacaaaaacggttaattccgttgttttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaacacttt 38663518  T
Q  194 tattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaatt 234  Q
    ||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  38663519 tattaatcgtagttagtaaagtagttaagttggatgaaatt 38663559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 181
Target Start/End: Original strand, 8175544 - 8175639
Alignment:
Q  86 cctctgtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcattta 181  Q
    ||||||||||| |||| | || ||||| |  |||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  8175544 cctctgtctcaaaataatagttgtttatggcttgtgcatgattattaaaaaaatgaataattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcattta 8175639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 51625221 - 51625139
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaa 187  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||||  |||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  51625221 gtcgtttaaagtttgtgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtaacatttactaaaa 51625139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 204
Target Start/End: Original strand, 27880207 - 27880323
Alignment:
Q  87 ctctgtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaa 186  Q
    |||||| ||| |||| | |||||||||| |||||  |||||| ||||| |||| |||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |    
T  27880207 ctctgtttcaaaataatagtcgtttaaggtttgtatatgatttttaaataaatgatta-ttgtgttgatttcaatggtaaaattagtatcatttactaga 27880305  T
Q  187 atattgttattaattgta 204  Q
    ||| | |||| |||||||    
T  27880306 atactcttatcaattgta 27880323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 109 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 462092 - 461976
Alignment:
Q  109 tttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagtta 208  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||  |||| ||||||| | |||||||| ||| ||||| || ||| |||||| |||||||  |||||||||||| |||    
T  462092 tttaagatttgtgcataatttttaagaaaatgattaattgtattgatttcaatggtaaaagtaatattatttactaaaatatccttattaattgtaatta 461993  T
Q  209 gtagagcagttaagttg 225  Q
    |  ||| ||||||||||    
T  461992 gcggagtagttaagttg 461976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 92 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 29575259 - 29575143
Alignment:
Q  92 tctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatatt 191  Q
    ||||| |||||| |||||||||  ||||| || ||||| |||  |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||| || ||||||  |||||| |    
T  29575259 tctcataatattagtcgtttaaaatttgtacacgattactaagaaaatgattaattatgttaatttaaatgataaaattaataacatttattaaaatact 29575160  T
Q  192 gttattaattgtagtta 208  Q
     || |||||||||||||    
T  29575159 cttgttaattgtagtta 29575143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 235
Target Start/End: Original strand, 44536166 - 44536309
Alignment:
Q  92 tctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatatt 191  Q
    ||||||||||||  | ||||||  ||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||  ||| ||||||||| |  |||||  |||| |      
T  44536166 tctcacaatattaattgtttaaagtttatgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgattttaatggtaaaattagcaggatttattaaaacacc 44536265  T
Q  192 gttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattc 235  Q
     |||||||||||||||||| ||| || |||||| |||| |||||    
T  44536266 cttattaattgtagttagtggagtagctaagttagatgaaattc 44536309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 290
Target Start/End: Original strand, 28911282 - 28911336
Alignment:
Q  236 tataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||    
T  28911282 tataataatggaaaaaaataataaatgttgcattgatattctaaatcgacaatta 28911336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 210
Target Start/End: Original strand, 50264102 - 50264168
Alignment:
Q  144 aattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagt 210  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||  ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  50264102 aattgtgttgatttcaatgttaaaattaacatcatttactaaaatactcttattaattgtagttagt 50264168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18532331 - 18532182
Alignment:
Q  91 gtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatat 190  Q
    |||||| |||| | || ||||||| ||||||||||||| ||| | |||| ||||||||| |  ||||  ||| |||||||||||| |||||  ||||||     
T  18532331 gtctcaaaataatagttgtttaaggtttgtgcatgatttttacataaatgattaattatataaattttaatggtaaaattagtatgatttattaaaatag 18532232  T
Q  191 tgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    | ||||||||| |||| ||| |||  ||||| | ||||| ||||| ||||    
T  18532231 ttttattaattatagtaagtggagtggttaactaggatgaaattcaataa 18532182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 208
Target Start/End: Original strand, 32469934 - 32470034
Alignment:
Q  108 gtttaagttttgtgcatgattattaaagaaatt-attaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagt 206  Q
    ||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||| ||||||    
T  32469934 gtttaagatttatgcataatt-ttaaagaaaatgattaattgtgttgattttaatggtaaaattagtatcatttattaaaacattcttattaactgtagt 32470032  T
Q  207 ta 208  Q
    ||    
T  32470033 ta 32470034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 35252027 - 35251943
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaata 189  Q
    ||||||| || ||||||||||||| | ||  |||| ||||||| || | ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  35252027 gtcgtttgagatttgtgcatgattttcaagaaaataattaattgtggttatttcaatgataaaattaatatcatttactaaaata 35251943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 210
Target Start/End: Original strand, 37868638 - 37868686
Alignment:
Q  162 gataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagt 210  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  37868638 gataaaattaatatcatttactaaaatatttttattaattgtaattagt 37868686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 54123754 - 54123710
Alignment:
Q  130 ttaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagta 174  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  54123754 ttaaaaaaattattaattatgttgattttaatgataaaattagta 54123710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 236 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 2653415 - 2653364
Alignment:
Q  236 tataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaa 287  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  2653415 tataataatggaaaaagataataaatgttgcattgatattctaaagtgacaa 2653364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 247 - 290
Target Start/End: Original strand, 16821469 - 16821512
Alignment:
Q  247 aaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  16821469 aaaataataataaatgctgcattggtattctaaagtgacaatta 16821512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 208
Target Start/End: Original strand, 49579162 - 49579264
Alignment:
Q  106 tcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttga-tttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||| |||  |||||||||||| ||| | |||| |||| | | ||||||||||||    
T  49579162 tcgtttaaagtttgtgcatgatttttaaataaatgattaattgtgttgatttttaatgataaaattattatta-ttactaaaacacttttattaattgta 49579260  T
Q  205 gtta 208  Q
    ||||    
T  49579261 gtta 49579264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 175
Target Start/End: Original strand, 31370312 - 31370358
Alignment:
Q  129 attaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtat 175  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  31370312 attaaaaaaatgattaattatgttgatttcgttggtaaaattagtat 31370358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 236 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 3689557 - 3689525
Alignment:
Q  236 tataataatggaaaataataataaatgctgcat 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3689557 tataataatggaaaataataataaatgttgcat 3689525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 208
Target Start/End: Original strand, 16506236 - 16506319
Alignment:
Q  124 tgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagtta 208  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||||| ||||||| |||| |   ||||||||||||||||    
T  16506236 tgattcttaaataaattattaattatgttaatttcaatgatgcaa-tagtaacatttactaaaacacatttattaattgtagtta 16506319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 25233167 - 25233123
Alignment:
Q  246 gaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  25233167 gaaaaaaataataaatgttgcattgatattctaaagtgacaatta 25233123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 39397481 - 39397353
Alignment:
Q  106 tcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtag 205  Q
    ||||||||  |||||||| |||  |||| ||||| ||||||||||||||||||  || |||| ||| | |||||||| |||||     ||||||||||||    
T  39397481 tcgtttaaagtttgtgcacgatgtttaaggaaatgattaattatgttgatttcattggtaaatttaatgtcatttactaaaatccccatattaattgtag 39397382  T
Q  206 ttagtagagcagttaagttggatgtaatt 234  Q
    ||| ||||  ||||||  |||||| ||||    
T  39397381 ttactagattagttaaaatggatgaaatt 39397353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 180
Target Start/End: Original strand, 41711442 - 41711514
Alignment:
Q  108 gtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcattt 180  Q
    ||||||| ||||||||  ||| |||  ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  41711442 gtttaaggtttgtgcacaatttttatggaaatgattaattatgttgattttaatggtaaaattaatatcattt 41711514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 43902356 - 43902254
Alignment:
Q  141 attaattatgttgatttcgatgataaaat---tagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattcta 237  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||   || ||| |||||  |||||||| ||||||||  |||||||| ||| | |||||||| ||| ||||| |    
T  43902356 attaattatgttgattttaatgataaaattaatattattatttattaaaatattcttattaatcatagttagtggagtaattaagttgcatgaaattcaa 43902257  T
Q  238 taa 240  Q
    |||    
T  43902256 taa 43902254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 52)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 91 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22738860 - 22738717
Alignment:
Q  91 gtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatat 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  22738860 gtctcacaatattagtcgtttaaggtttatgcacgattattaaagaaatgattaattgtgtagatttcaatggtaaaattagtatcatttactaaaatat 22738761  T
Q  191 tgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaatt 234  Q
      | |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  22738760 cctcattaattgtagttagtagattagttaagttggatgaaatt 22738717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 34947645 - 34947448
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||| |   ||||||||||||    
T  34947645 gtcgtttaaggtttgtgcatgtttattaaagaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattattatcatttactaaaacacccttattaattgta 34947546  T
Q  205 gttagtagagcagttaagttggatgtaattc------------tataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |||||            ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  34947545 gttagtggagtagttaagttggatgaaattcaataaatgagggtataataatggaaaaaaataataaatgttgcattggtattctaaagtgacaatta 34947448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 94 - 290
Target Start/End: Original strand, 11373401 - 11373609
Alignment:
Q  94 tcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgt 193  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |   |    
T  11373401 tcacaatattagtcgtttaaggattgtgcacgattattaaggaaatgtttaattgtgttgatttcgatggtaaaattagtagcatttactaaaacaccct 11373500  T
Q  194 tattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattc------------tataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaac 281  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||            ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||     
T  11373501 tattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaattcaataaataagagtataatagtgggaaaaaataataaatgctgcattgatattgtaaag 11373600  T
Q  282 tgacaatta 290  Q
    | |||||||    
T  11373601 taacaatta 11373609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 92 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 5524538 - 5524396
Alignment:
Q  92 tctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatatt 191  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||  |||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||  |||| | |    
T  5524538 tctcacaatatttgtcgtttaaagtttgtgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtaacatttaataaaacact 5524439  T
Q  192 gttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaatt 234  Q
     ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  5524438 tttattaattatagttagttgagtagttaagttggatgaaatt 5524396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 86 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 28103897 - 28103743
Alignment:
Q  86 cctctgtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaa 185  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||| | ||||||| ||    
T  28103897 cctccgtctcacaatatttgtcgtttaaggtttgtgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagcagcatttaccaa 28103798  T
Q  186 aatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    || |   ||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||    
T  28103797 aacacccttattaattgtagttagtgaagtggttaagttggatgaaattcaataa 28103743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 109 - 290
Target Start/End: Original strand, 759079 - 759272
Alignment:
Q  109 tttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagtta 208  Q
    |||||| ||| ||||  |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  759079 tttaaggtttatgcacaattattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaactagtatcatttactaaaacatccttattaattgtagtta 759178  T
Q  209 gtagagcagttaagttggatgtaattc------------tataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    |  ||| |||||||||||||| |||||            ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  759179 gcggagtagttaagttggatgaaattcaataaataagggtataataatggaaaaaaataataaatgctgcattggtattctaaagtgacaatta 759272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 105 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 83530 - 83395
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||||| ||| ||||  |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  83530 gtcgtttaaggtttatgcacaattattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacattcttattaattgta 83431  T
Q  205 gttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    |||||  ||| ||||||||| |||| ||||| ||||    
T  83430 gttagcggagtagttaagtttgatgaaattcaataa 83395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 98 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 7463365 - 7463223
Alignment:
Q  98 aatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttatt 197  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||| | ||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||   | |||    
T  7463365 aatattagtcgtttaaggattgtgcacggttattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatgataaaattagtagcatttacttaaataccctcatt 7463266  T
Q  198 aattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  7463265 aattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaattcaataa 7463223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 86 - 240
Target Start/End: Original strand, 24516254 - 24516408
Alignment:
Q  86 cctctgtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaa 185  Q
    ||||||||||| ||| || |||||||||| ||| | || |||||||||  |||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  24516254 cctctgtctcataattttagtcgtttaaggtttatacacgattattaataaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtaacatttactaa 24516353  T
Q  186 aatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    || |   |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  24516354 aaaaaccttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaattcaataa 24516408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 40076460 - 40076266
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||    
T  40076460 gtcgtttaaggtttatgcacgattattaaagaaatgattaattgtgttaattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacactattattaattgta 40076361  T
Q  205 gttagtagagcagttaagttggatgtaattctata------------ataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
     ||||   |  |||||||||||||| ||||| |||            ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  40076360 cttag---attagttaagttggatgaaattcaataaataagggtgtgataatggaaaaaaataataaatgctgcattggtattataaagtgacaatta 40076266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 108 - 240
Target Start/End: Original strand, 3178191 - 3178323
Alignment:
Q  108 gtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagtt 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||| ||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||| |   |||||||||||||||    
T  3178191 gtttaaggtttgtgcatgattattaagtaaatgattgattgtgttgattttgatggtaaaattaatatcatttactaaaacacctttattaattgtagtt 3178290  T
Q  208 agtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    ||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  3178291 agtggagtagttaagttggatgaaattcaataa 3178323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 105 - 290
Target Start/End: Original strand, 21759968 - 21760165
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||| |   ||| ||||||||    
T  21759968 gtcgtttaaggtttgtgcatgattattaagaaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttaataaaacacccttactaattgta 21760067  T
Q  205 gttagtagagcagttaagttggatgtaattc------------tataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    |||| | ||| |||||||||||||| |||||            |||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  21760068 gttaatggagtagttaagttggatgaaattcaataattgagggtataataaaggaaaaatataataaatgttgcattgatattctaaagtgacaatta 21760165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 105 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 43874068 - 43873871
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||||| ||  |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||| |   ||||||| ||||    
T  43874068 gtcgtttaaggttgatgcatggttattaaagaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattaatatcatttactaaaacacccttattaaatgta 43873969  T
Q  205 gttagtagagcagttaagttggatg------------taattctataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||            ||| | ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  43873968 gttagtggagtagttaagttggatgaagtttaataaataaatgtattataatgggaaaaaataataaatgctgcattgatattctaaagtgacaatta 43873871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 91 - 234
Target Start/End: Original strand, 8592410 - 8592553
Alignment:
Q  91 gtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatat 190  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| | |||||||||  |||||  |||| |     
T  8592410 gtctcacaatattagccgtttaaggtttgtgcatgattattaaagaaatgattaattgtgttgatttcaatggttaaattagtagtatttaataaaacac 8592509  T
Q  191 tgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaatt 234  Q
      |||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||| ||||    
T  8592510 ccttattaattgtagttagtggagtagtaaagttagatgaaatt 8592553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26974174 - 26974042
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcat---ttacaaaaatattgttattaatt 201  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||   |||| |||||| | |||||||||    
T  26974174 gtcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatcatttactaaaatactcttattaatt 26974075  T
Q  202 gtagttagtagagcagttaagttggatgtaatt 234  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||    
T  26974074 gtagttagtggagtagttaagttgaatgaaatt 26974042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 30866110 - 30865977
Alignment:
Q  107 cgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagt 206  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||| || ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||| || |    
T  30866110 cgtttaaggtttgtgcacgattattaaagaaatgattaattgtgttaatttcaatggtataattaatatcatttactaaaatactcttattaattataat 30866011  T
Q  207 tagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    |||| ||| ||||||||| |||| ||||| ||||    
T  30866010 tagtggagtagttaagttagatgaaattcaataa 30865977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 105 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 9786133 - 9785936
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||||| |||| |   ||||||||||||    
T  9786133 gtcgtttaaggtctgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattaatttcatttactaaaacacgcttattaattgta 9786034  T
Q  205 gttagtagagcagttaagttggatgtaattc------------tataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    ||||||  || |||||||||||||  |||||            |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  9786033 gttagtgaagtagttaagttggataaaattcaataaataagggtataataaagaaaaataataataaatgctgcattaatattttaaagtgacaatta 9785936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 109 - 290
Target Start/End: Original strand, 16560558 - 16560742
Alignment:
Q  109 tttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagtta 208  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| |||| |||| |||| ||||| ||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  16560558 tttaagatttatgcacgattattaaggaaatgattaattgtgtttattttgatggtaaaactagtatcatttactaaaacatccttattaattgtagtta 16560657  T
Q  209 gtagagcagttaagttggatg----taattctataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    || | | ||||||||||||||    |||   ||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||| |||| | |||||||    
T  16560658 gtggggtagttaagttggatgagaataaggatataataatggaaaa-aataataaatactgcatttgtattctaaattaacaatta 16560742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 109 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 16605104 - 16604920
Alignment:
Q  109 tttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagtta 208  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| |||| |||| |||| ||||| ||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  16605104 tttaagatttatgcacgattattaaggaaatgattaattgtgtttattttgatggtaaaactagtatcatttactaaaacatccttattaattgtagtta 16605005  T
Q  209 gtagagcagttaagttggatg----taattctataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    || | | ||||||||||||||    |||   ||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||| |||| | |||||||    
T  16605004 gtggggtagttaagttggatgagaataaggatataataatggaaaa-aataataaatactgcatttgtattctaaattaacaatta 16604920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 117 - 229
Target Start/End: Original strand, 19271729 - 19271841
Alignment:
Q  117 ttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagca 216  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||  |||| || |||||| | |||||||||||||||||| ||| |    
T  19271729 ttgtgcacgattattaaaaaaatgattaattgtgttgatttcaatgatcaaattagtggcattgactaaaatacttttattaattgtagttagtggagta 19271828  T
Q  217 gttaagttggatg 229  Q
    |||||||||||||    
T  19271829 gttaagttggatg 19271841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 91 - 229
Target Start/End: Original strand, 34100517 - 34100655
Alignment:
Q  91 gtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatat 190  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||  | |||||||||  |||| ||||||| |||||||||| ||  ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  34100517 gtctcacaatattagttgtttaagatttgtcaacgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatagtaaaattagtagcatttactaaaatat 34100616  T
Q  191 tgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatg 229  Q
      |||||||||||||||| |  || ||||||||||||||    
T  34100617 ctttattaattgtagttactgaagtagttaagttggatg 34100655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 240
Target Start/End: Original strand, 41506054 - 41506184
Alignment:
Q  110 ttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttag 209  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||  ||| ||||||||||| ||||||| |||| | | |||||||||||||||||    
T  41506054 ttaaggtttatgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttaattttaatggtaaaattagtagcatttactaaaacactcttattaattgtagttag 41506153  T
Q  210 tagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    | ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  41506154 tggagtagttaagttggatgaaattcaataa 41506184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 210
Target Start/End: Original strand, 2850865 - 2850970
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||   | ||||||| ||    
T  2850865 gtcgtttatggtttgtgcatgattattaaggaaatgattaattatgttgatttcaatgataaaattaatattatttactaaaataccctcattaattata 2850964  T
Q  205 gttagt 210  Q
    ||||||    
T  2850965 gttagt 2850970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 93 - 240
Target Start/End: Original strand, 21350600 - 21350744
Alignment:
Q  93 ctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattg 192  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||   ||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||   |||||| |||| |       
T  21350600 ctcacaatattagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaa---attaattgtgttgatttcaatggtaaaaatagttgtatttactaaaacaccc 21350696  T
Q  193 ttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  21350697 ttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaattcaataa 21350744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 290
Target Start/End: Original strand, 28202296 - 28202490
Alignment:
Q  108 gtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagtt 207  Q
    ||||||| ||| |||| | |||||||  |||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||||| |||| ||  |||||||||||||||    
T  28202296 gtttaaggtttatgcacggttattaagaaaataattaattgtgttgattttgatggtaaaattaatgtcatttactaaaacatccttattaattgtagtt 28202395  T
Q  208 agtagagcagttaagttggatgtaattc------------tataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    ||| ||| ||| |||||||||| |||||            ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||    
T  28202396 agtggagtagtaaagttggatgaaattcaataaataagagtataataatggaaaaaaataataaatgctgtattggtattctaaagtgacaatta 28202490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 86 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23670649 - 23670502
Alignment:
Q  86 cctctgtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaa 185  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||  |||||||| | || |||||||| |||||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||    
T  23670649 cctccgtctcacaatattaatcgtttaaggtttgtgcacaattattaagggaa-tattaattgtgttgatttccatggtaaaattaatagcatttactaa 23670551  T
Q  186 aatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaatt 234  Q
    || | | |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||    
T  23670550 aacactcttattaatggtagttagtggagtagttaagtttgatgaaatt 23670502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 105 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 21390440 - 21390305
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| |||| |||| |||| ||||| || |||||||||| |||| ||  ||||| ||||||    
T  21390440 gtcgtttaaggtttatgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttaattttgatggtaaaactaatatcatttactaaaacatccttattgattgta 21390341  T
Q  205 gttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||| ||||| ||||    
T  21390340 gttagtggagtagttaagttagatgaaattcaataa 21390305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 86 - 240
Target Start/End: Original strand, 29835379 - 29835532
Alignment:
Q  86 cctctgtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaa 185  Q
    |||| ||||| |||||||  ||||||||| |||||||  | ||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  29835379 cctccgtctcgcaatattaatcgtttaaggtttgtgcgcgcttattaaggaaatgattaattatgttgatttaaatggtaaaattagtagcatttactaa 29835478  T
Q  186 aatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    || | | |||||||||| |||||   ||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  29835479 aacactcttattaattgcagttaacggagtagtt-agttggatgtaattcaataa 29835532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 106 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 38391892 - 38391758
Alignment:
Q  106 tcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtag 205  Q
    ||||||||| ||| ||||  ||||||||  |||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| | | || ||||||||||    
T  38391892 tcgtttaaggtttatgcacaattattaagaaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacactcttgttaattgtag 38391793  T
Q  206 ttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    ||||| ||  | |||||||||||| ||||| ||||    
T  38391792 ttagtggaataattaagttggatgaaattcaataa 38391758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 109 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13962100 - 13961975
Alignment:
Q  109 tttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagtta 208  Q
    |||||| ||| |||| | ||||||| ||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||| |||  |||||||  ||||||| ||||||||    
T  13962100 tttaaggtttatgcacgtttattaaggaaatgattaattgtgttgattttaatgataaaattaatatcacttaataaaatatccttattaagtgtagtta 13962001  T
Q  209 gtagagcagttaagttggatgtaatt 234  Q
    || ||| |||||||||||||| ||||    
T  13962000 gtggagtagttaagttggatgaaatt 13961975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 85 - 209
Target Start/End: Original strand, 7457385 - 7457509
Alignment:
Q  85 tcctctgtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaa 184  Q
    ||||| ||||||||||||| ||  |||||  |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||| |    
T  7457385 tcctccgtctcacaatattagttatttaatgtttgtgcacgattattaaaaaaatgattaattatgttgatttcaatggtaaaattagttacatttacta 7457484  T
Q  185 aaatattgttattaattgtagttag 209  Q
    ||| |   ||||||| |||||||||    
T  7457485 aaagacccttattaaatgtagttag 7457509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 98 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 2459621 - 2459481
Alignment:
Q  98 aatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttatt 197  Q
    |||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| | | ||||||||||  ||||||| | || |   |||||    
T  2459621 aatattagtcgtttaatgtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaacggtaaaattagt--catttactacaacacccttatt 2459524  T
Q  198 aattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| ||||    
T  2459523 aattgtagttagtggagtagttaagtaggatgaaattcaataa 2459481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 229
Target Start/End: Original strand, 17828336 - 17828459
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||  |||| || |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| || | |||| |||||||    
T  17828336 gtcgtttaaagtttgtgcacgat-attaaggaaacgattatttttgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttacaaaattactcttatcaattgta 17828434  T
Q  205 gttagtagagcagttaagttggatg 229  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||    
T  17828435 gttagtggagtaattaagttggatg 17828459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27921111 - 27921009
Alignment:
Q  127 ttattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttgg 226  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||  |||| | | ||||||||||||||||||  |  |||||||||||    
T  27921111 ttattaagaaaatgattaattatgttgattttaatggtaaaattagtatcatttattaaaacactcttattaattgtagttagtgcattagttaagttgg 27921012  T
Q  227 atg 229  Q
    |||    
T  27921011 atg 27921009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33819339 - 33819229
Alignment:
Q  125 gattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagtt 224  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||  | | ||||||||||| ||| || ||| ||| |||||    
T  33819339 gattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttacaaaatcactcttattaattgttgtttgtggagtagtgaagtt 33819240  T
Q  225 ggatgtaattc 235  Q
    | ||| |||||    
T  33819239 gaatgaaattc 33819229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 35333151 - 35333058
Alignment:
Q  142 ttaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattc 235  Q
    |||||| |||||||||| || ||| ||||| ||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||    
T  35333151 ttaattgtgttgatttcaattatataattaatattatttattaaaatattattattaattgtagttagtggagtagttaagttagatgaaattc 35333058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 228
Target Start/End: Original strand, 32018716 - 32018819
Alignment:
Q  125 gattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagtt 224  Q
    |||| |||| ||||| | ||||| |||||||||| ||  |||||||  |||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  32018716 gatttttaatgaaatgaataattgtgttgatttcaatagtaaaatttctatcatttactaaaatactcttattaattgtcgttagtagagtaattaagtt 32018815  T
Q  225 ggat 228  Q
    ||||    
T  32018816 ggat 32018819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 48609007 - 48608815
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    ||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||    ||| |||| ||  |||||||| |||    
T  48609007 gtcgtttgaggtttatgcatgattattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaactagtat----tactaaaacatccttattaatcgta 48608912  T
Q  205 gttagtagagcagttaagttggatgtaattc------------tataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    ||||||   | |||||||||||||| |||||            ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  48608911 gttagtgatgtagttaagttggatgaaattcaataaataagagtataataatggaaaa-aataataaatactgcattaatattttaaagtgacaatta 48608815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12631446 - 12631345
Alignment:
Q  109 tttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagtta 208  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||| | |||||||| ||  |||||||||||  |||||  |||| ||  ||||||||||||||||    
T  12631446 tttaaggtttgtgcacgattattaaggaaataattaattgtattgatttcaatagtaaaattagtagtatttatcaaaacatccttattaattgtagtta 12631347  T
Q  209 gt 210  Q
    ||    
T  12631346 gt 12631345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 42935806 - 42935701
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||||| ||  |||| | |||||||  |||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||| |   ||||||||||||    
T  42935806 gtcgtttaaggttgatgcacggttattaagaaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattaatatcatttactaaaacacccttattaattgta 42935707  T
Q  205 gttagt 210  Q
    ||||||    
T  42935706 gttagt 42935701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 240
Target Start/End: Original strand, 46478263 - 46478412
Alignment:
Q  91 gtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatat 190  Q
    |||||| |||||| |||||||||  ||  | || |||||||||  |||| ||||||| |||| ||||  ||  |||| |||||| ||||||| ||||||     
T  46478263 gtctcataatattagtcgtttaaagttcatacacgattattaattaaatgattaattgtgttaattttaatagtaaagttagtagcatttactaaaatac 46478362  T
Q  191 tgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
      |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  46478363 ccttattaattgtagttaattgagtagttaagttggatgaaattcaataa 46478412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 150 - 234
Target Start/End: Original strand, 6494963 - 6495047
Alignment:
Q  150 gttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaatt 234  Q
    |||||||| |||| |||||||||| | |||||| |||| | | |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||    
T  6494963 gttgattttgatggtaaaattagtgttatttactaaaacacttttattaattgtagttagtggagtagtaaagttggatgaaatt 6495047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 37245857 - 37245700
Alignment:
Q  85 tcctctgtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattatt---aaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcattta 181  Q
    |||||| || |||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||   ||  |||  ||||||| |||||||||| ||| |||| |||||| ||||||    
T  37245857 tcctctctcccacaatatttatggtttaaggtttgtgcacgattatttataagaaaaagattaattctgttgatttcaatggtaaa-ttagtagcattta 37245759  T
Q  182 caaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    | |||| | | |||||||||||| | ||| |||  ||||||||||||| ||||| ||||    
T  37245758 ctaaaacactcttattaattgtaataagtggagtggttaagttggatgaaattcaataa 37245700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 234
Target Start/End: Original strand, 32018919 - 32019029
Alignment:
Q  125 gattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatga-taaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagt 223  Q
    |||| |||| ||||| ||||||| ||||||||| ||  | |||||||  |||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||| ||| | ||||||    
T  32018919 gatttttaatgaaatgattaattgtgttgattttgaatagtaaaatttctatcatttactaaaatactcttattaattgttgttagtggagtaattaagt 32019018  T
Q  224 tggatgtaatt 234  Q
    |||||| ||||    
T  32019019 tggatgaaatt 32019029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 44180350 - 44180268
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaa 187  Q
    |||||||||| ||| | || |||||||||  |||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  44180350 gtcgtttaaggtttatacacgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtataatttactaaaa 44180268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 46211576 - 46211472
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagta---tcatttacaaaaatattgttattaatt 201  Q
    |||||||||| ||| ||||  |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||   |||||||| |||| ||  |||||||||    
T  46211576 gtcgtttaaggtttatgcacaattattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaactagtactatcatttactaaaacatccttattaatt 46211477  T
Q  202 gtagt 206  Q
    |||||    
T  46211476 gtagt 46211472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 236 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 36790742 - 36790686
Alignment:
Q  236 tataataatggaaaa--taataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  36790742 tataataatggaaaaaataataataaatgctgcattgctattctaaagtgacaatta 36790686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 39005554 - 39005458
Alignment:
Q  117 ttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtaga 213  Q
    ||||||||| || || | |||||||||| ||  |||||||   ||| ||||||||||||||||||| ||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  39005554 ttgtgcatggttcttgatgaaattattagttgagttgattaaaatggtaaaattagtatcatttactaaaatacctttaataattgtagttagtaga 39005458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 221
Target Start/End: Original strand, 21937826 - 21937887
Alignment:
Q  160 atgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaa 221  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||  | | |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  21937826 atgataaaattagtgtcatttactaaagcactcttattaattgtagttagtggagtagttaa 21937887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 25571498 - 25571429
Alignment:
Q  171 agtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    |||||||||||| ||||||   |||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||| ||||    
T  25571498 agtatcatttactaaaatacccttattagttgtagttagtggaatagttaagttggatgaaattcaataa 25571429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 33819201 - 33819160
Alignment:
Q  249 aataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  33819201 aataataataaatgctgcattggtattgtaaagtgacaatta 33819160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 44424137 - 44424093
Alignment:
Q  246 gaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  44424137 gaaaaaaataataaatgctgcattgatattttaaagtgataatta 44424093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 44)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 17695467 - 17695269
Alignment:
Q  106 tcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtag 205  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||| | |||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  17695467 tcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtattgatttcaatggtaaaattgatatcatttacaaaaatattcttattaattatag 17695368  T
Q  206 ttagtagagcagttaagttggatgtaattc------------tataataatgg--aaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||            ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  17695367 ttagtagagtagttaagttggatgaaattcaataaataagggtataatagtggaaaaaataataataaatgctgcattgatattctaaagtgacaatta 17695269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 86 - 240
Target Start/End: Original strand, 8947008 - 8947162
Alignment:
Q  86 cctctgtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaa 185  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||    
T  8947008 cctctatctcacaatattaatcgtttaaagtttgtgcataattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatgataaaattagtaatatttactaa 8947107  T
Q  186 aatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    || ||  ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  8947108 aacatccttattaattatagttagtggagtagttaagttggatgaaattcaataa 8947162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 91 - 221
Target Start/End: Original strand, 16377617 - 16377747
Alignment:
Q  91 gtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatat 190  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||| |||||||| |||||||||| ||||||     
T  16377617 gtctcacaatattaatcgtttaagatttgtgcacgattattaaagaaatgattaattgtgttgattacaatggtaaaattaatatcatttaccaaaataa 16377716  T
Q  191 tgttattaattgtagttagtagagcagttaa 221  Q
      |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  16377717 ccttattaattgtagttagtggagtagttaa 16377747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 105 - 280
Target Start/End: Original strand, 43115777 - 43115964
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||||  |||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||    
T  43115777 gtcgtttaaagtttgtgcgcgattattaaagaaatgattaattgtgttgatttcaatgataaagttagtagcatttactaaaatactcttatttattgta 43115876  T
Q  205 gttagtagagcagttaagttggatgtaattc------------tataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaa 280  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||| |||||            ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  43115877 gttagtggagtagttaagttgaatgaaattcaacgaataatggtataataatggaaaaaaataataaatgctacattgatattgtaaa 43115964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 116 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 43410553 - 43410367
Alignment:
Q  116 tttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagc 215  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||| | |||     
T  43410553 tttgtgcacgattattaaggaaattattaattgtgttgatatcaatgataaaattaatatcatttactaaaatatccttattaattgtagttaatggagt 43410454  T
Q  216 agttaagttggatgtaattc------------tataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    |||||||||| ||| |||||            ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| |||| |||||||||    
T  43410453 agttaagttgaatgaaattcaataaatgagagtataataatggaaaaaaataataaatgttgcattagtattctaaagtgacaatta 43410367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 105 - 290
Target Start/End: Original strand, 14523347 - 14523544
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||||  ||| |||| | ||||||| ||||| |||  || |||||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  14523347 gtcgtttaaagtttatgcaaggttattaaggaaatgattttttgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaatatccttattaattgta 14523446  T
Q  205 gttagtagagcagttaagttggatgtaattc------------tataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||| |||||            ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  14523447 gttagtggagtagttaagttagatgaaattcaattaataaggatataataatggaaaataataataaatgttgcattgatattctaaagtgacaatta 14523544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 108 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16806016 - 16805896
Alignment:
Q  108 gtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagtt 207  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||  ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  16806016 gtttaaggtttgtgcacgattattaaagaaatgattaattgtgttgattttaatagtaaaattagtatcatttactaaaatatccttattaattgtagtt 16805917  T
Q  208 agtagagcagttaagttggat 228  Q
    ||| |||  ||||||||||||    
T  16805916 agtggagttgttaagttggat 16805896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 108 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16845297 - 16845177
Alignment:
Q  108 gtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagtt 207  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||  ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  16845297 gtttaaggtttgtgcacgattattaaagaaatgattaattgtgttgattttaatagtaaaattagtatcatttactaaaatatccttattaattgtagtt 16845198  T
Q  208 agtagagcagttaagttggat 228  Q
    ||| |||  ||||||||||||    
T  16845197 agtggagttgttaagttggat 16845177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 290
Target Start/End: Original strand, 34120416 - 34120609
Alignment:
Q  107 cgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagt 206  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  34120416 cgtttaaagtttatgcatgattattaagaaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaactagtattatttactaaaatat--ttattaattgtagt 34120513  T
Q  207 tagtagagcagttaagttggatgtaattc------------tataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    |||| ||  |||||||||||||| |||||            ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  34120514 tagtggaatagttaagttggatgaaattcaataagtaagagtataataatggaaaaaaataataaatgctgcattggtattttaaagtgacaatta 34120609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 106 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 39691627 - 39691493
Alignment:
Q  106 tcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtag 205  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||  |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||| ||    
T  39691627 tcgtttaaggtttgtgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatgataaaattaatatcatttactaaaatactcttattaattgcag 39691528  T
Q  206 ttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    ||||| ||| ||| |||||| ||| ||||| ||||    
T  39691527 ttagtggagtagtaaagttgaatgaaattcaataa 39691493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 91 - 178
Target Start/End: Original strand, 27501499 - 27501586
Alignment:
Q  91 gtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcat 178  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27501499 gtctcacaatattcgtcgtttaaggtttgtgtatgattattaaggaaatgataaattatgttgatttcaatggtaaaattagtatcat 27501586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16463827 - 16463698
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |   ||||||||||||    
T  16463827 gtcgtttaaggtttatgcacggttattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacacccttattaattgta 16463728  T
Q  205 gttagtagagcagttaagttggatgtaatt 234  Q
    |||||| ||| ||| ||||| |||| ||||    
T  16463727 gttagtggagtagtaaagtttgatgaaatt 16463698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 85 - 290
Target Start/End: Original strand, 5789603 - 5789819
Alignment:
Q  85 tcctctgtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaa 184  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||| | |||| ||| ||  ||||||||||  ||||||| |    
T  5789603 tcctccgtctcacaatattagtcatttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtattgaattcaatagtaaaattagtggcatttacta 5789702  T
Q  185 aaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattc------------tataataatggaaaataataataaatgctgcattgat 272  Q
    ||| |   ||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| |||||            ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  5789703 aaacacccttattaattgtagttagtgaaatagttaagttggatgaaattcaataaataatggtataatagtggaaaa-aataataaatgatgcattgat 5789801  T
Q  273 attataaactgacaatta 290  Q
    ||| |||| |||||||||    
T  5789802 attgtaaagtgacaatta 5789819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 125 - 240
Target Start/End: Original strand, 17346358 - 17346472
Alignment:
Q  125 gattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagtt 224  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |   |||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  17346358 gattattaaagaaat-attaattattttgatttcaaaagtaaaattaatatcatttattaaaatatttttattaattgtagttagtggagtagttaagtt 17346456  T
Q  225 ggatgtaattctataa 240  Q
    ||| | ||||| ||||    
T  17346457 ggaagaaattcaataa 17346472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 91 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 35314040 - 35313890
Alignment:
Q  91 gtctcacaatatttgtcgtttaagttttg-tgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaata 189  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||  |||||  |||  |    
T  35314040 gtctcacaatattagtcgtttaaatattgatgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagtatttattaaagca 35313941  T
Q  190 ttgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
       |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||| ||||    
T  35313940 accttattaattgtagttagtggagtagttaagtttgatgaaattcaataa 35313890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 141 - 229
Target Start/End: Original strand, 15359098 - 15359186
Alignment:
Q  141 attaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatg 229  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  15359098 attaattgtgttgattttgatgataaaattaatatcatttactaaaacacccttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatg 15359186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 136 - 208
Target Start/End: Original strand, 34451341 - 34451413
Alignment:
Q  136 aaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagtta 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||| ||||||    
T  34451341 aaattattaattatgttgatttcgatgagaaaattagtattatttactaaaatattttcattaattctagtta 34451413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 36794422 - 36794298
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||||| ||  |||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||     ||||||| ||||    
T  36794422 gtcgtttaagattgatgcatggttattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcttttactaaaacgcccttattaactgta 36794323  T
Q  205 gttagtagagcagttaagttggatg 229  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||    
T  36794322 gttagtggagtagttaagttggatg 36794298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 37322567 - 37322431
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaatt-attaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgt 203  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||| |||| | ||| ||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||  ||||||   |||||||||||    
T  37322567 gtcgtttaaggtttatgcacgattattaaggaaaatgattgattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttattaaaatacccttattaattgt 37322468  T
Q  204 agttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    ||||||| ||| ||||||||| |||| ||||| ||||    
T  37322467 agttagtggagtagttaagttagatgaaattcaataa 37322431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 45235740 - 45235616
Alignment:
Q  84 ctcctctgtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttaca 183  Q
    |||||| |||||  |||| | |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||     
T  45235740 ctcctccgtctctaaataatagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattgattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttact 45235641  T
Q  184 aaaatattgttattaattgtagtta 208  Q
    |||| |   ||||||||||||||||    
T  45235640 aaaacacccttattaattgtagtta 45235616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 181
Target Start/End: Original strand, 3323250 - 3323337
Alignment:
Q  94 tcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcattta 181  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| | |||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  3323250 tcacaatattagtcgtttaaggtttgtgcacgattattataaaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtaacattta 3323337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 240
Target Start/End: Original strand, 31448668 - 31448803
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||  |||||||| |||| |   ||| |||||| |    
T  31448668 gtcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagagtcatttactaaaacacccttactaattgca 31448767  T
Q  205 gttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    ||||||  |  |||||||||||||| ||||| ||||    
T  31448768 gttagtgaaatagttaagttggatgaaattcaataa 31448803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 240
Target Start/End: Original strand, 18853175 - 18853311
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataa--aattagtatcatttacaaaaatattgttattaattg 202  Q
    |||||||||  |||||||| |||  |||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||| ||||||||||| |||||| | |||||| |||    
T  18853175 gtcgtttaaaatttgtgcacgatctttaaggaaataattaattgtgttgatttcaatgataattaatt-gtatcatttaccaaaatactcttattagttg 18853273  T
Q  203 tagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||| ||||| ||||    
T  18853274 tagttagtagagtaattaatttggatgaaattcaataa 18853311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 240
Target Start/End: Original strand, 35242309 - 35242407
Alignment:
Q  142 ttaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    |||||| |||||||||  ||| ||||||||| ||||||||| | |||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  35242309 ttaattgtgttgattttaatgttaaaattagaatcatttactagaatatatttattaattgtagttagttgagtagttaagttggatgaaattcaataa 35242407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 105 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 39785726 - 39785599
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattag---tatcatttacaaaaatattgttattaatt 201  Q
    |||||||||| ||  |||| | ||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||   |||||||||| |||| | | |||||||||    
T  39785726 gtcgtttaaggttgatgcacggttattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtactatcatttactaaaacactcttattaatt 39785627  T
Q  202 gtagttagtagagcagttaagttggatg 229  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  39785626 gtagttaatggagtagttaagttggatg 39785599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 125 - 290
Target Start/End: Original strand, 36354438 - 36354614
Alignment:
Q  125 gattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagtt 224  Q
    ||||||||| ||||| | || || ||||||||| |||| |||||||||||| |||||   ||| | | |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  36354438 gattattaaggaaatgactagttgtgttgattttgatggtaaaattagtattatttattgaaacactcttattaattgtagttagtggagtagttaagtt 36354537  T
Q  225 ggatgtaattc------------tataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    ||||| |||||            ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||    
T  36354538 ggatgaaattcaataaataatggtataataatggaaaa-aataataaattctgcattggtattctaaagtgacaatta 36354614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 208
Target Start/End: Original strand, 41220957 - 41221024
Alignment:
Q  141 attaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagtta 208  Q
    ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  41220957 attaattgtgttgatttcaattataaaattagtatcatttattaaaatatttttattaattgtagtta 41221024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19426564 - 19426470
Alignment:
Q  135 gaaattattaattatgttgattt-cgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggat 228  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||||  |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  19426564 gaaatgattaattgtgttgattttcaatgataaaattagcaacatttactaaaatatcattattaattgtagtaagtcgagtagttaagttggat 19426470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 25637615 - 25637490
Alignment:
Q  108 gtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagtt 207  Q
    ||||||| ||| |||| |||||| || ||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| |   |||||||||||||||    
T  25637615 gtttaaggtttatgcacgattat-aaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtgtcatttactaaaacacctttattaattgtagtt 25637517  T
Q  208 agtagagcagttaagttggatgtaatt 234  Q
    |   ||| |||||||||||||| ||||    
T  25637516 ataggagtagttaagttggatgaaatt 25637490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 208
Target Start/End: Original strand, 1206709 - 1206781
Alignment:
Q  136 aaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagtta 208  Q
    |||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  1206709 aaatgattaattatgttgatttcagtggtaaaattagtaacatttactaaaatatccttattaattgtagtta 1206781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 236 - 290
Target Start/End: Original strand, 34120639 - 34120693
Alignment:
Q  236 tataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  34120639 tataataatggaaaaaaataataaatgctgcattggtattttaaagtgacaatta 34120693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 34225725 - 34225599
Alignment:
Q  108 gtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagtt 207  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| ||||| | ||||||| |||||||  ||| |||| ||||||| |||||| |||| |   |||||||||||||||    
T  34225725 gtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgaataattatattgattttaatggtaaacttagtattatttactaaaacacccttattaattgtagtt 34225626  T
Q  208 agtagagcagttaagttggatgtaatt 234  Q
    | | ||| | |||||||| ||| ||||    
T  34225625 aatggagtatttaagttgaatgaaatt 34225599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 213
Target Start/End: Original strand, 34437998 - 34438084
Alignment:
Q  127 ttattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtaga 213  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||||||||  |||| |||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  34437998 ttattaaaaaaatgattaataatgttgattttaatgacaaaatatgtatcatttactaaaatattcttattaattatagatagtaga 34438084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 90 - 240
Target Start/End: Original strand, 39329621 - 39329773
Alignment:
Q  90 tgtctcacaatatttgtcgtttaa-gttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgt--tgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaa 186  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||  |||  |||| || |||| |||  ||||||| |||||||||||| || ||||||| |||    
T  39329621 tgtctcataatattagtcgtttaacgttttgtgcacgatttctaagaaaatgatcaattgtgtattgatttcaatgataaaattaatagcatttactaaa 39329720  T
Q  187 atattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    | | | |||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| ||||| ||||    
T  39329721 acactcttattaattgtagtta-tggagtagttaaattggatgaaattcaataa 39329773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 108 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 28186348 - 28186217
Alignment:
Q  108 gtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagtt 207  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||  |||| ||||| ||||||||| |  ||| ||||||||  ||||||||  |||||||  ||||| ||| |||||    
T  28186348 gtttaagttttgtggatgatttttaagaaaataattaa-tatgttgatattaatggtaaaattataatcatttattaaaatatccttattcattttagtt 28186250  T
Q  208 agtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    || |||| |||||||||| ||| ||||| ||||    
T  28186249 agcagagtagttaagttgaatgaaattcaataa 28186217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 290
Target Start/End: Original strand, 9458384 - 9458437
Alignment:
Q  236 tataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  9458384 tataataatggaaaa-aataataaatgctgcattggtattctaaagtgacaatta 9458437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 149
Target Start/End: Original strand, 7438865 - 7438925
Alignment:
Q  89 ctgtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattat 149  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  7438865 ctgtctcacaatattagttgtttaaggtttgagcacgattattaaggaaatgattaattat 7438925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19444229 - 19444161
Alignment:
Q  160 atgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggat 228  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||| || |||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||    
T  19444229 atgataaaattaatattatttactaaaatgttattattaattgtaattagtcgagtagttaagatggat 19444161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 27866614 - 27866527
Alignment:
Q  120 tgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagtta 208  Q
    |||| |||| |||| ||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||| |||| ||||  |||||||  ||||||||||||||||    
T  27866614 tgcacgatttttaaggaaatgattaataatgttgattttaatgataaaattaatatc-tttagtaaaatatccttattaattgtagtta 27866527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 240
Target Start/End: Original strand, 3323335 - 3323382
Alignment:
Q  193 ttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  3323335 ttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaattcaataa 3323382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 16463681 - 16463628
Alignment:
Q  239 aataatggaaaa--taataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  16463681 aataatggaaaaaataataataaatgctgcattggtattctaaagtgacaatta 16463628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 19444141 - 19444087
Alignment:
Q  236 tataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||    
T  19444141 tataataatgtaaaaaaataataaatgttgcattgatattttgaagtgacaatta 19444087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 15435500 - 15435447
Alignment:
Q  114 gttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaa 167  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  15435500 gttttgtgcatgatttttaagaaaataattaattgtgttgatttcaatgataaa 15435447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 203
Target Start/End: Original strand, 10005157 - 10005197
Alignment:
Q  163 ataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgt 203  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  10005157 ataaaattagtatcatttactaaaatatctttattaattgt 10005197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 91 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 50356 - 50145
Alignment:
Q  91 gtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatat 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  50356 gtctcacaatattagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttaatttcaatgataaaattagtatcatttactataatat 50257  T
Q  191 tgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaatt------------ctataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattata 278  Q
      |||||||||  ||||||| ||| | |||||||| ||| ||||             ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  50256 ctttattaattacagttagtggagtaattaagttgaatgaaattaaataaataagggtataatagtgaaaaataataataaatgctgcattgatattcta 50157  T
Q  279 aactgacaatta 290  Q
    || |||||||||    
T  50156 aagtgacaatta 50145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 53)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 91 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 39405914 - 39405703
Alignment:
Q  91 gtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatat 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  39405914 gtctcacaatattagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttaatttcaatgataaaattagtatcatttactataatat 39405815  T
Q  191 tgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaatt------------ctataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattata 278  Q
      |||||||||  ||||||| ||| | |||||||| ||| ||||             ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39405814 ctttattaattacagttagtggagtaattaagttgaatgaaattaaataaataagggtataatagtgaaaaataataataaatgctgcattgatattcta 39405715  T
Q  279 aactgacaatta 290  Q
    || |||||||||    
T  39405714 aagtgacaatta 39405703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 91 - 240
Target Start/End: Original strand, 21216065 - 21216214
Alignment:
Q  91 gtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatat 190  Q
    |||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  ||||||| |||| ||    
T  21216065 gtctcacaatgtcagtcgtttaaggtttgtgcatgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagttgcatttactaaaacat 21216164  T
Q  191 tgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
      |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  21216165 ccttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaattcaataa 21216214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 86 - 240
Target Start/End: Original strand, 11976895 - 11977049
Alignment:
Q  86 cctctgtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaa 185  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||| || ||| |||| ||||||| ||    
T  11976895 cctccgtctcataatattagtcgtttaaggtttgtgcatgattattatggaaatcattaattgtgttgatttcaatggtataatcagtagcatttactaa 11976994  T
Q  186 aatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||    
T  11976995 aatacccttattaattgtagttagtagagtagttaagttagatgaaattcaataa 11977049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 91 - 240
Target Start/End: Original strand, 45425630 - 45425779
Alignment:
Q  91 gtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatat 190  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||  ||| |||||||| || ||||||  |||| ||    
T  45425630 gtctcataatattagtcgtttaagttttatgcatgattattaagaaaatgattaattgtgttgattttaatggtaaaattaataacatttattaaaacat 45425729  T
Q  191 tgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    | |||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||||| ||||    
T  45425730 tcttattaattgtagttagtggagtaattaagttgtatgaaattcaataa 45425779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 108 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 7173049 - 7172917
Alignment:
Q  108 gtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagtt 207  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||  |||||||||||||||    
T  7173049 gtttaaggtttgtgtatcattattaaagaaatgattaattgtgttgatttcaatgataaaattagtagcatttactaaaacatatttattaattgtagtt 7172950  T
Q  208 agtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    | |  || |||||||||| ||| ||||| ||||    
T  7172949 aatgaagtagttaagttgaatgaaattcaataa 7172917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 240
Target Start/End: Original strand, 27294042 - 27294172
Alignment:
Q  110 ttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttag 209  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  27294042 ttaaggtttgtgcacgatttttaaagaagttattaattgtgttcatttgaatgataaaattagtatcttttactaaaatatatttattaattgcagttag 27294141  T
Q  210 tagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    | ||| | |||||||||||| ||||| ||||    
T  27294142 tggagtaattaagttggatgaaattcaataa 27294172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 105 - 290
Target Start/End: Original strand, 10179925 - 10180122
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||  |||| | || || | |||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||   ||||||||||||    
T  10179925 gtcgtttaaggtttgtgcacgattattaagaaaatgagtagttgtattgatttcaatggtaaaattagtataatttactaaaatacacttattaattgta 10180024  T
Q  205 gttagtagagcagttaagttggatgtaattc------------tataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||| |||||            ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  10180025 gttagtggagtagttaagttgaatgaaattcaattaataagtgtataataatagaaaataataataaatgttgcattggtattctaaagtgacaatta 10180122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 99 - 210
Target Start/End: Original strand, 1875564 - 1875675
Alignment:
Q  99 atatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttatta 198  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| |   ||||||    
T  1875564 atattagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaacacccttatta 1875663  T
Q  199 attgtagttagt 210  Q
    ||||||||||||    
T  1875664 attgtagttagt 1875675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 106 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 13335353 - 13335158
Alignment:
Q  106 tcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtag 205  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||  |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||| |   |||||||||| ||    
T  13335353 tcgtttaaggtttatgcacgattattaaggaaatggttaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttagtaaaacacatttattaattgcag 13335254  T
Q  206 ttagtagagcagttaagttggatgtaattc------------tataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |||||            ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  13335253 ttagtagagtagttaagtttgatgaaattcaataaatcagggtataataatggaaaa-aataataaatgttgcattggtattctaaagtgacaatta 13335158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 240
Target Start/End: Original strand, 34948666 - 34948800
Alignment:
Q  106 tcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtag 205  Q
    ||||||||| ||||| ||  |||||||| ||||| ||||||| |||||||||  ||  |||||||||||||||||||| ||| |   |||||||||||||    
T  34948666 tcgtttaagatttgtacacaattattaaggaaatgattaattgtgttgatttaaatagtaaaattagtatcatttacagaaacacatttattaattgtag 34948765  T
Q  206 ttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  34948766 ttagtggagtagttaagttggatgaaattcaataa 34948800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 187
Target Start/End: Original strand, 39300919 - 39301001
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaa 187  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  39300919 gtcgtttaagatttgtgtacgattattaaagaaatgattaattatgttgatttcgatggtaaaattaatatcatttactaaaa 39301001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 234
Target Start/End: Original strand, 17719236 - 17719365
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||| |  ||||||  ||| |||| ||||||| |||||| |||||||  ||||||||| ||    
T  17719236 gtcgtttaagatttgtgcacgattattaaaaaaatgattaattgtaatgattttaatggtaaagttagtattatttactaaaatatccttattaattata 17719335  T
Q  205 gttagtagagcagttaagttggatgtaatt 234  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  17719336 gttagtggagtagttaagttggatgaaatt 17719365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 105 - 290
Target Start/End: Original strand, 26626090 - 26626287
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||| || |||| ||||||| |||| |||||  |||||||  ||||||||||||    
T  26626090 gtcgtttaaggtttatgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgaatttgatggtaaaatttgtataatttattaaaatatccttattaattgta 26626189  T
Q  205 gttagtagagcagttaagttggatgtaattc------------tataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    |||||| ||| |||   |||| ||| |||||            ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  26626190 gttagtggagtagtccggttgaatgaaattcaataaataagggtataataatgggaaaaaataataaatgctgcattgatattttaaagtgacaatta 26626287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 86 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 39482772 - 39482618
Alignment:
Q  86 cctctgtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaa 185  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||  |||| ||||||| |||||||||| | | |||||||||||  |||||| ||    
T  39482772 cctccgtctcacaatattagtcgtttaagatttgtgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaagggtaaaattagtagaatttactaa 39482673  T
Q  186 aatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    || |   ||||||||| |||||||| ||  |||||||| | ||| ||||| ||||    
T  39482672 aacacccttattaattatagttagtggactagttaagtggaatgaaattcaataa 39482618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 171 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 32678475 - 32678357
Alignment:
Q  171 agtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctat-aataatggaaaataataataaatgctgcatt 269  Q
    |||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||  || |||||  ||| ||||||||||||| ||||||    
T  32678475 agtatcatttactaaaacatccttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaattaaataaataa--gaatataataataaatgatgcatt 32678378  T
Q  270 gatattataaactgacaatta 290  Q
    |||||| |||| |||||||||    
T  32678377 gatattttaaagtgacaatta 32678357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 135 - 240
Target Start/End: Original strand, 44761502 - 44761607
Alignment:
Q  135 gaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaatt 234  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| |   |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  44761502 gaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaacacccttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaatt 44761601  T
Q  235 ctataa 240  Q
    | ||||    
T  44761602 caataa 44761607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 91 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 31082771 - 31082628
Alignment:
Q  91 gtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatat 190  Q
    ||||||||||||| || ||||| | |||||||| ||| ||||| ||||| ||||||| | |||||||  ||||||||||||||   |||||| |||| |     
T  31082771 gtctcacaatattagttgtttatggtttgtgcacgataattaaggaaatgattaattgtcttgattttaatgataaaattagtggtatttactaaaacac 31082672  T
Q  191 tgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaatt 234  Q
      ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  31082671 ccttattaattatagttagtggagtagttaagttggatgaaatt 31082628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31271159 - 31271036
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||||  |||| ||| ||| |||||||||  ||| |||||||| |||||| ||| |||||| | ||||||||| ||    
T  31271159 gtcgtttaaggtttgtgtacgattattaagaaaatgattgattgtgttgattttaatggtaaaattaatatcatatactaaaatactcttattaattata 31271060  T
Q  205 gttagtagagcagttaagttggat 228  Q
    |||||| ||| |||||||||||||    
T  31271059 gttagtggagtagttaagttggat 31271036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 32476425 - 32476290
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||  |||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||   ||||||||||||    
T  32476425 gtcgtttaaggtttgtgcacggttattaagaaaatgattgattctgttgatttcaatgataaaattaatatcatttattaaaatacccttattaattgta 32476326  T
Q  205 gttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    |||| |  || ||||||||| |||| ||||| ||||    
T  32476325 gttaatgaagtagttaagtttgatgaaattcaataa 32476290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 243
Target Start/End: Original strand, 34057627 - 34057734
Alignment:
Q  136 aaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattc 235  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||  |  |||||||||||||| |||||    
T  34057627 aaataattaattatgttgatttcaataataaaactagtattatttactaaaatatcgttgttatttgtagttagtgaaatagttaagttggatgaaattc 34057726  T
Q  236 tataataa 243  Q
     |||||||    
T  34057727 aataataa 34057734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 290
Target Start/End: Original strand, 396611 - 396786
Alignment:
Q  127 ttattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttgg 226  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||| |  || |||||  ||||    
T  396611 ttattaaggaaatgattaattatgttgatttcaacggtaaaattagtatcatttactacaatatccttattaattgtagttaatgaagtagttatattgg 396710  T
Q  227 atgtaattc------------tataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    ||  |||||            |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  396711 ataaaattcaattaataagggtataataatgaaaaataataataaatgttgcattggtattctaaagtgacaatta 396786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 90 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 1739793 - 1739709
Alignment:
Q  90 tgtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagta 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||||| | ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  1739793 tgtctcacaatattagtcgtctaaggtttgtgtacgattattaaggaaataattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagta 1739709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 229
Target Start/End: Original strand, 10097969 - 10098093
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||||| ||  |||||| |||||||  |||| ||||||| | ||||||| |||| |||||||| |||||||||| | || |   ||||||||||||    
T  10097969 gtcgtttaaggttgatgcatggttattaagaaaatgattaattgtattgattttgatggtaaaattaatatcatttactataacacccttattaattgta 10098068  T
Q  205 gttagtagagcagttaagttggatg 229  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||    
T  10098069 gttagtggagtagttaagttggatg 10098093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 130 - 229
Target Start/End: Original strand, 5053156 - 5053255
Alignment:
Q  130 ttaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatg 229  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||| | | |||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||    
T  5053156 ttaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattaatatcatttactaaaacagtcttattaattgtagttagcggagtagttaaattggatg 5053255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 51247 - 51146
Alignment:
Q  108 gtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagtt 207  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||  |||| ||||||| |||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||||||||    
T  51247 gtttaaggtttgtgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttgattttaatg-taaaataagtatcatttacaaaaacacatttattaattgtagtt 51149  T
Q  208 agt 210  Q
    |||    
T  51148 agt 51146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 149 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17824015 - 17823930
Alignment:
Q  149 tgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaatt 234  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||   ||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||    
T  17824015 tgttgatttcaatgataaaattagtatcttttactagaatacctttattaattgtagttagtgaagtagttaagttggatgaaatt 17823930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 116 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 41092121 - 41092028
Alignment:
Q  116 tttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttag 209  Q
    |||||| | |||| |||||||||  ||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||  |||||| | |||||||||||||||||    
T  41092121 tttgtgaacgatttttaaagaaacgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttattaaaatactcttattaattgtagttag 41092028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 210
Target Start/End: Original strand, 2767291 - 2767374
Alignment:
Q  127 ttattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagt 210  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||| ||  |||||| |||||||||||    
T  2767291 ttattaaggaaataattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttattaaaacatccttattatttgtagttagt 2767374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 31331521 - 31331422
Alignment:
Q  130 ttaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatg 229  Q
    |||| ||||| ||||||| | |||||||| || ||||||||| ||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||  || | ||||||||||||    
T  31331521 ttaaggaaatgattaattgtattgatttcaattataaaattattattatttactaaaatatcattattaattgtagttagtgaagtaattaagttggatg 31331422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 42887102 - 42887015
Alignment:
Q  141 attaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggat 228  Q
    ||||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  42887102 attaattgtgttgatttcaatagcaaaattagtatcatttactaaaatacctttattaattgtagttagtggcgtagttaagttggat 42887015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 236 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 50811 - 50757
Alignment:
Q  236 tataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  50811 tataataatggaaaaagataataaatgctgcattgatattctaaagtgacaatta 50757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 31231846 - 31231671
Alignment:
Q  127 ttattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttgg 226  Q
    ||||||| ||||| || |||| ||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||  ||| |   |||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  31231846 ttattaaggaaatgatgaattgtgtcgattttgatggtaaaattaatatcatttactgaaacacccttattaattgtagttagtggagtagttaagttgg 31231747  T
Q  227 atgtaattc------------tataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    ||  | |||            ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  31231746 ataaagttcaataaataagggtattataatggaaaaaaataataaatgatgcattggtattataaaatgacaatta 31231671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 33765794 - 33765696
Alignment:
Q  109 tttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagtt 207  Q
    |||||| ||||||||  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||  ||  |||||||| |||||||||| || ||| | |||||||||||||||    
T  33765794 tttaaggtttgtgcacaatttttaaggaaatgattaattatgttgattttaatactaaaattactatcatttactaatatacttttattaattgtagtt 33765696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 225
Target Start/End: Original strand, 4924104 - 4924165
Alignment:
Q  164 taaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttg 225  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  4924104 taaaattagtattatttactaaaatatctttattaattgtagttaatagagtagttaagttg 4924165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 6611844 - 6611767
Alignment:
Q  96 acaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagt 173  Q
    |||||||| |||||||||| |||   || |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  6611844 acaatattagtcgtttaagatttacacacgattattaaaaaaatgattaattatgttgatttcaatggtaaaattagt 6611767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 240
Target Start/End: Original strand, 4428360 - 4428464
Alignment:
Q  136 aaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattc 235  Q
    |||| |||| || |||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||| |||||    
T  4428360 aaatgattatttgtgttgattttaatgataaaattattatcatttactaaaatacaattattaattgtagttagtgaattagttaagttagatgaaattc 4428459  T
Q  236 tataa 240  Q
     ||||    
T  4428460 aataa 4428464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 92 - 240
Target Start/End: Original strand, 9300078 - 9300226
Alignment:
Q  92 tctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatatt 191  Q
    ||||||||||||  | ||||||| ||| |||| |||||||||  |||| |||  || |||||||||  ||| |||||||| || ||||||| |||| |      
T  9300078 tctcacaatattgattgtttaaggtttatgcacgattattaagaaaatgattgtttgtgttgattttaatggtaaaattaatagcatttactaaaacacc 9300177  T
Q  192 gttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
     ||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||| ||||| ||||    
T  9300178 cttattaattttagttagtggagtagttaagttgaatgaaattcaataa 9300226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 126 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 40028632 - 40028549
Alignment:
Q  126 attattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagt 210  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||  |||||||  |||||||||||| |||||    
T  40028632 attattaaa-aaatgattaattatgttgatttcaatggtaaaattaatagcatttattaaaatatcattattaattgtatttagt 40028549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 290
Target Start/End: Original strand, 39301077 - 39301131
Alignment:
Q  236 tataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||| |||||||||    
T  39301077 tataataatggaaaataataataaacgattcattgatattctaaaatgacaatta 39301131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 240
Target Start/End: Original strand, 40996344 - 40996478
Alignment:
Q  106 tcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtag 205  Q
    ||||||||| ||| ||||  ||| |||| ||||| ||||||| ||||||||| ||   |||||||||| |||||||| |||| |   |||||||||||||    
T  40996344 tcgtttaaggtttatgcacaattgttaaggaaatgattaattgtgttgattttgaatgtaaaattagtttcatttactaaaacacccttattaattgtag 40996443  T
Q  206 ttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    |||||  |   ||||||||||||| ||||| ||||    
T  40996444 ttagtgaaatggttaagttggatgaaattcaataa 40996478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 127 - 208
Target Start/End: Original strand, 34393954 - 34394035
Alignment:
Q  127 ttattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagtta 208  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||| |   ||||||||| ||||||    
T  34393954 ttattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtataatttactaaaacacctttattaattatagtta 34394035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 240
Target Start/End: Original strand, 43719228 - 43719349
Alignment:
Q  120 tgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaatta-gtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagt 218  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||  || ||||||||| || |||||||  ||||||   ||||||||| |||||||| ||  | |    
T  43719228 tgcatggtttttaaataaattattaattatattgattttaattataaaattaggtgtcatttattaaaataacattattaattatagttagttgaataat 43719327  T
Q  219 taagttggatgtaattctataa 240  Q
    ||||||||||| ||||| ||||    
T  43719328 taagttggatgaaattcaataa 43719349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 8979216 - 8979172
Alignment:
Q  125 gattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaat 169  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  8979216 gattattaaagaaattattaataatgttgattttaatgataaaat 8979172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 117 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 5356725 - 5356603
Alignment:
Q  117 ttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagca 216  Q
    |||||||||| | || | ||||| |||| || |||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||  || | |||||||||||||||| | ||  |    
T  5356725 ttgtgcatgactttttaggaaatgattagttgtgttgattttaatgataaaattaatatcatttactaatgtact-ttattaattgtagttaatggaata 5356627  T
Q  217 gttaagttggatgtaattctataa 240  Q
     |||||||||||| ||||| ||||    
T  5356626 attaagttggatgaaattcaataa 5356603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 290
Target Start/End: Original strand, 22771814 - 22772010
Alignment:
Q  106 tcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtag 205  Q
    ||||||||| ||| ||||   ||||||| ||| | |||||||  |||||||| |||| |||||||||| |||||||  |||| |   |||||||||||||    
T  22771814 tcgtttaaggtttatgcacagttattaaggaattgattaattgggttgattttgatggtaaaattagtgtcatttattaaaacacccttattaattgtag 22771913  T
Q  206 ttagtagagcagttaagttggatgtaattc------------tataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    |||||  || | ||| |||||||| |||||            |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  22771914 ttagtgaagtaattatgttggatgaaattcaataaataagggtataataatgaaaagtaataataaatgttgcattggtattctaaagtgacaatta 22772010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 239 - 290
Target Start/End: Original strand, 29226652 - 29226702
Alignment:
Q  239 aataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  29226652 aataatgaaaaata-taataaatgctgcattgatattttaaagtgacaatta 29226702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 290
Target Start/End: Original strand, 17719379 - 17719433
Alignment:
Q  236 tataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  17719379 tataataatggaaaaagataataaatgttgcattggtattctaaagtgacaatta 17719433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 174
Target Start/End: Original strand, 29226212 - 29226278
Alignment:
Q  108 gtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagta 174  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||  |||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  29226212 gtttaagatttatgcataattattaagaaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagta 29226278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 1739613 - 1739576
Alignment:
Q  173 tatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagt 210  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  1739613 tatcatttaccaaaatattcttattaattgtagttagt 1739576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 39329430 - 39329370
Alignment:
Q  109 tttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaatt 170  Q
    |||||||||||||||  ||| |||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  39329430 tttaagttttgtgcacaatttttaa-gaaatgattaattgtgttgatttcaatgataaaatt 39329370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 125 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 39890739 - 39890663
Alignment:
Q  125 gattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaatt 201  Q
    |||| |||||||||| |||| ||  ||||| ||| || |||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||    
T  39890739 gatttttaaagaaatgattagttgagttgacttcaataataaaattagtagcatttactaaaacattcttattaatt 39890663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 210
Target Start/End: Original strand, 44648555 - 44648615
Alignment:
Q  150 gttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagt 210  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||| |||||    
T  44648555 gttgatttcaatggtaaaattagtatcatttactaaaacatacttactaattgtaattagt 44648615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 128 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 45034582 - 45034490
Alignment:
Q  128 tattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagtta 220  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||| ||  ||||||  || | |||||  |||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||    
T  45034582 tattaaagaaatgattaatgttgttgatttcaatagtaaaatatgttttatttattaaaatattattattaattataattagtagagtagtta 45034490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 40)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 86 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 8698466 - 8698312
Alignment:
Q  86 cctctgtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaa 185  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  ||||||| ||    
T  8698466 cctccgtctcacaatatttgttgtttaaggtttgtgcacgattattaaagaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagttgcatttaccaa 8698367  T
Q  186 aatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    || |   |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||||    
T  8698366 aacacccttattaattgtagttagtggagtggttaagttggatgaaattcaataa 8698312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 105 - 290
Target Start/End: Original strand, 1248579 - 1248776
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||   ||||||||||||    
T  1248579 gtcgtttaagatttgtgcacggttattaaggaaattattaattatgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaatacccttattaattgta 1248678  T
Q  205 gttagtagagcagttaagttggatgtaattc------------tataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    ||||||  || |||||||||| ||  |||||            |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  1248679 gttagtgaagtagttaagttgaataaaattcaattaataagggtataataatgaaaaataataataaatgttgcattgatattctaaagtgacaatta 1248776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 86 - 234
Target Start/End: Original strand, 40530180 - 40530328
Alignment:
Q  86 cctctgtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaa 185  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||  |||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  40530180 cctccgtctcacaatatttgtcgtttaaggtctgtgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaa 40530279  T
Q  186 aatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaatt 234  Q
    || |   |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||    
T  40530280 aacacccttattaattgtagttagtggagtggttaagttggatgaaatt 40530328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 86 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 4818708 - 4818554
Alignment:
Q  86 cctctgtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaa 185  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||  ||||||||||| ||||||| ||    
T  4818708 cctccgtctcacaatatttgtcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaataattaattgtgttgatttcaattgtaaaattagtagcatttactaa 4818609  T
Q  186 aatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    || |   |||||||||||||||||| |||   ||||||| |||| ||||| ||||    
T  4818608 aacacccttattaattgtagttagtggagtgattaagttagatgaaattcaataa 4818554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 103 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27542935 - 27542810
Alignment:
Q  103 ttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattg 202  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||| ||| |||||||| || ||||||| |||||| | ||||||||||    
T  27542935 ttgtcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattgattgtgttgatttcaatggtaaaattaataccatttactaaaatactcttattaattg 27542836  T
Q  203 tagttagtagagcagttaagttggat 228  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||    
T  27542835 tagttagtggagtagttaagttggat 27542810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 91 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 31655205 - 31655056
Alignment:
Q  91 gtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatat 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||| | |||||    
T  31655205 gtctcacaatattagtcgtttaaagtttgtgtacgattattaaagaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactataatat 31655106  T
Q  191 tgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
      |||||||||||||||||| ||| | ||| |||| ||| ||||| ||||    
T  31655105 ccttattaattgtagttagtggagtaattatgttgaatgaaattcaataa 31655056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 108 - 290
Target Start/End: Original strand, 8724987 - 8725181
Alignment:
Q  108 gtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagtt 207  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||| |   |||||||||||||||    
T  8724987 gtttaaggtttgtgcacgattattaaagaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaacacacttattaattgtagtt 8725086  T
Q  208 agtagagcagttaagttggatgtaattc------------tataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    ||| ||| |||||| ||| ||| |||||            |||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  8725087 agtggagtagttaacttgaatgaaattcaataaataatagtataataatgaaaaataataaaaactgctgcattgttattctaaaatgacaatta 8725181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 125 - 290
Target Start/End: Original strand, 6315772 - 6315949
Alignment:
Q  125 gattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagtt 224  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  6315772 gattattaaggaaatgattgattgtgttaatttcaatgataaaattaatatcatttactaaaatacccttattaattgtagttagtgaagtagttaagtt 6315871  T
Q  225 ggatgtaattc------------tataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    ||||| |||||            ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  6315872 ggatgaaattcaataaataagggtataataatggaaaataataataaatgttgcattggtattctaaagtgacaatta 6315949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 106 - 234
Target Start/End: Original strand, 7827902 - 7828030
Alignment:
Q  106 tcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtag 205  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||  |||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||   |||||||||||||    
T  7827902 tcgtttaaggtttgtacacgattattaagaaaataattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtatcatttattaaaatacccttattaattgtag 7828001  T
Q  206 ttagtagagcagttaagttggatgtaatt 234  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  7828002 ttagtggagtagttaagttggatgaaatt 7828030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 105 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 21060768 - 21060572
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||  ||||| ||||||| |||| |||| |||| |||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||||    
T  21060768 gtcgtttaaggtttatgcacggttattagggaaatgattaattgtgtttattttgatggtaaaattagtattatttactaaaatactcttattaattgta 21060669  T
Q  205 gttagtagagcagttaagttggatgtaattc------------tataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    |||||| ||| |||||||||||||  |||||            |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  21060668 gttagtggagtagttaagttggataaaattcaataaataatggtataataatggaaaataa-aataaatgatgcattgatattctaaagtgacaatta 21060572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 109 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 40900052 - 40899859
Alignment:
Q  109 tttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagtta 208  Q
    |||||| ||| |||| | ||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| |   ||||||||||||||||    
T  40900052 tttaaggtttatgcacggttattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggcaaaattagtatcatttactaaaacacccttattaattgtagtta 40899953  T
Q  209 gtagagcagttaagttggatgtaattc------------tataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    || ||| ||||||||| |||| |||||            |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||    
T  40899952 gtggagtagttaagttagatgaaattcaataaataagggtataataatggaaaataataataaatgctgcaatgttattctaaagtgacaatta 40899859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 86 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 32440298 - 32440173
Alignment:
Q  86 cctctgtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaa 185  Q
    |||| |||||| |||| | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||    
T  32440298 cctccgtctcaaaataatagtcgttaaaggtttgtgcatgatttttaaagaaatgattaattgtgttaatttcaatgataaaattaatatcatttactaa 32440199  T
Q  186 aatattgttattaattgtagttagta 211  Q
    ||||   |||||||||||| ||||||    
T  32440198 aatacccttattaattgtacttagta 32440173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 85 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 9515904 - 9515784
Alignment:
Q  85 tcctctgtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaa 184  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||   ||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |    
T  9515904 tcctccgtctcacaatattagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaagataatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtatcatttacta 9515805  T
Q  185 aaatattgttattaattgtag 205  Q
    ||| ||  |||||||| ||||    
T  9515804 aaacatccttattaatagtag 9515784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 92 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 29570543 - 29570395
Alignment:
Q  92 tctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatatt 191  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||| |||||||| ||  |||| | |||| |      
T  29570543 tctcacaatattagtcgtttaagatttgtgcacgattattaaagaaatgattaattgtgttgattttaatgttaaaattattagtatttgctaaaacacc 29570444  T
Q  192 gttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
     |||||||||||||||| | ||  |||||||||||||| ||||| ||||    
T  29570443 tttattaattgtagttaatggaatagttaagttggatgaaattcaataa 29570395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 94 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 41496229 - 41496094
Alignment:
Q  94 tcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgt 193  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||||| || |||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  ||||||  |||| ||  |    
T  41496229 tcacaatattagtcgattaaggtttgtacacgattattaaaaaaataattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagttgcatttagtaaaacatcat 41496130  T
Q  194 tattaattgtagttagtagagcagttaagttggatg 229  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  41496129 tattaattgtagttagtggagtagttaaattggatg 41496094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 116 - 229
Target Start/End: Original strand, 6615866 - 6615979
Alignment:
Q  116 tttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagc 215  Q
    |||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||  ||||||||| |||||||| |||     
T  6615866 tttgtgcacgattattaaataaataattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttaccaaaacatccttattaattttagttagtggagt 6615965  T
Q  216 agttaagttggatg 229  Q
     |||||||||||||    
T  6615966 ggttaagttggatg 6615979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 234
Target Start/End: Original strand, 6753634 - 6753762
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||||  |||| ||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||    
T  6753634 gtcgtttaaggtttatgcacgattattaagaaaatgattaatt-tattaatttcaatggtaaaattagtatcatttactaaaatacccttattaattgta 6753732  T
Q  205 gttagtagagcagttaagttggatgtaatt 234  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  6753733 gttagtggagtagttaagttggatgaaatt 6753762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 136 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 4441128 - 4441024
Alignment:
Q  136 aaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattc 235  Q
    |||| ||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||    
T  4441128 aaataattaattgtgttgattttaatgataaaattaatattatttactaaaatatttttattaattgtagttagtggagtagttaaattggatgaaattc 4441029  T
Q  236 tataa 240  Q
     ||||    
T  4441028 aataa 4441024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 111 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 19930078 - 19929887
Alignment:
Q  111 taagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagt 210  Q
    |||| ||| |||| |||||||||  |||| ||||||| ||||||||| |||| ||||| |||  |||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||    
T  19930078 taagatttatgcacgattattaagaaaatgattaattttgttgattttgatggtaaaactagcgtcatttactaaaacatccttattaattgtagttagt 19929979  T
Q  211 agagcagttaagttggatgtaattc------------tataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
      |  |||||||||||||| |||||            ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  19929978 gaaatagttaagttggatgaaattcaataaataagggtataataatggaaaataataataaatgttgcattggtattctaaagtgacaatta 19929887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 92 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 29374493 - 29374364
Alignment:
Q  92 tctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatatt 191  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| |  | | |||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| |      
T  29374493 tctcacaatattagtcgtttaaggtttatttaaggttattaagaaaatgattaattatgttgatttcaatgataaaattaatagcatttactaaaagacc 29374394  T
Q  192 gttattaattgtagttagtagagcagttaa 221  Q
     |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  29374393 tttattaattgtagttagtggagtagttaa 29374364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 29856182 - 29856056
Alignment:
Q  106 tcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtag 205  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |  ||||  ||||||||| |||||||||||| ||||| || | |||||| | |||||||||||||    
T  29856182 tcgtttaagatttgtgcacgattattaaggaaataa--aattgcgttgatttcaatgataaaattaatatcacttgctaaaatactcttattaattgtag 29856085  T
Q  206 ttagtagagcagttaagttggatgtaatt 234  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||| ||||    
T  29856084 ttagtggagtagttaagttgaatgcaatt 29856056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 136 - 213
Target Start/End: Original strand, 41062166 - 41062243
Alignment:
Q  136 aaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtaga 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |   |||||||||||||||||||||    
T  41062166 aaataattaattatgttgattttgatgataaaattagtatcatttactaaaacacccttattaattgtagttagtaga 41062243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 109 - 213
Target Start/End: Original strand, 37184058 - 37184162
Alignment:
Q  109 tttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagtta 208  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||  ||||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||    
T  37184058 tttaagttttgtgcaagatttttaaaaaaatgattaattgagttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaatatctttattcattgtagtta 37184157  T
Q  209 gtaga 213  Q
     ||||    
T  37184158 ataga 37184162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 135 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27580708 - 27580609
Alignment:
Q  135 gaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaatt 234  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||   |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||    
T  27580708 gaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaatacccttattaattgtagttagtggagtagttaagttgaatgaaatt 27580609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 234
Target Start/End: Original strand, 11796179 - 11796271
Alignment:
Q  142 ttaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaatt 234  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| ||||    
T  11796179 ttaattgtgttgattttaatgataaaattaatattatttactaaaatattattattaattgtagttagtgtagtagttaagttagatgaaatt 11796271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 209
Target Start/End: Original strand, 15439299 - 15439398
Alignment:
Q  110 ttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttag 209  Q
    |||||||||||||| |||  |||| ||||| ||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||    
T  15439299 ttaagttttgtgcacgatatttaaggaaatgattaattgtattaatttcaatggtaaaattagtatcatttactaaaatacttttattaattgtatttag 15439398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 240
Target Start/End: Original strand, 2232048 - 2232179
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||  |||| | ||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||  |||| | | |||||||||       
T  2232048 gtcgtttaaggtttgtgcacgattattaagaaaatgaataattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttattaaaaaactcttattaatt--- 2232144  T
Q  205 gttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
     ||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  2232145 -ttagtggagtagttaagttggatgaaattcaataa 2232179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 6754135 - 6754032
Alignment:
Q  136 aaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattc 235  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||  |||||||| | |||||||| |||| | | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  6754135 aaatgattaatt-tgttgatttcaatagtaaaattaatgtcatttactaaaacactcttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaattc 6754037  T
Q  236 tataa 240  Q
     ||||    
T  6754036 aataa 6754032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 240
Target Start/End: Original strand, 42803598 - 42803730
Alignment:
Q  108 gtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagtt 207  Q
    ||||||| ||| |||| |||||| |||||||| ||||||| |||| ||||| ||  |||||||||||  |||||| |||| |   |||||||||||||||    
T  42803598 gtttaaggtttatgcacgattatcaaagaaataattaattgtgttcatttcaattgtaaaattagtagtatttactaaaacaccattattaattgtagtt 42803697  T
Q  208 agtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    | | |||  ||||||||||||| ||||| ||||    
T  42803698 aatggagtggttaagttggatgaaattcaataa 42803730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 209
Target Start/End: Original strand, 38508148 - 38508266
Alignment:
Q  91 gtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatat 190  Q
    |||||| |||| | |||||||||| |||||||  |||| ||||  |||| ||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||| | |  ||||||     
T  38508148 gtctcaaaataatagtcgtttaagatttgtgctcgatttttaagaaaatgattaattgtgttaatttcaatggtaaaattagtatcactcattaaaatac 38508247  T
Q  191 tgttattaattgtagttag 209  Q
    | |||||||||||||||||    
T  38508248 tcttattaattgtagttag 38508266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 843594 - 843509
Alignment:
Q  86 cctctgtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaatta 171  Q
    |||| ||||||||||| |  | ||||||| |||||||| |||||||||  |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  843594 cctccgtctcacaataataattgtttaaggtttgtgcacgattattaagaaaatgattaattttgttgatttcaatgataaaatta 843509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 234
Target Start/End: Original strand, 15818450 - 15818586
Alignment:
Q  100 tatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatc--atttacaaaaatattgttatt 197  Q
    |||| |||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||  |||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |  |||||| |||| |   |||||    
T  15818450 tattagtcgtttaaggtttatgcacgattattaaggaaatgtttaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatatttactaaaacacctttatt 15818549  T
Q  198 aattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaatt 234  Q
    ||||||| | ||| ||| |||||| ||||||| ||||    
T  15818550 aattgtaatcagtggagtagttaaattggatgaaatt 15818586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 130 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18841592 - 18841512
Alignment:
Q  130 ttaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagt 210  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||||  ||| |||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||    
T  18841592 ttaaaaaaatgattaattatattgatttaaatggtaaaattaatatcatttaataaaataccgttattaattgtagttagt 18841512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 174
Target Start/End: Original strand, 3348122 - 3348169
Alignment:
Q  127 ttattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagta 174  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  3348122 ttattaaggaaattattaattatgttgattttgatggtaaaattagta 3348169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 240 - 290
Target Start/End: Original strand, 3348252 - 3348302
Alignment:
Q  240 ataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  3348252 ataatggaaaaaaataataaatgctgcattggtattctaaaatgacaatta 3348302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 229
Target Start/End: Original strand, 38161446 - 38161511
Alignment:
Q  164 taaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatg 229  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  38161446 taaaattcatatcatttactaaaatatccttattaatcgtagttagtggagtagttaagttggatg 38161511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 157
Target Start/End: Original strand, 42922842 - 42922894
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgattt 157  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||    
T  42922842 gtcgtttaagatttgtgcatgattattaagaaaatgattaattgtgttgattt 42922894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 240
Target Start/End: Original strand, 22848348 - 22848494
Alignment:
Q  94 tcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgt 193  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||| || ||||||||| |||   ||||||| |||||||||| ||  |||||||| ||  |||||  |||| |   |    
T  22848348 tcacaatattagtcgtttaaggcttgtacaagattattaaggaagcgattaattgtgttgatttcaatagtaaaattaatagtatttattaaaacaccct 22848447  T
Q  194 tattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||  ||||||| ||||| ||||    
T  22848448 tattaattgtagttaatggagtagttagattggatgaaattcaataa 22848494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 31748039 - 31747969
Alignment:
Q  86 cctctgtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatt 156  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||| ||| ||| | |||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  31748039 cctccgtctcacaatattattcgtttaagatttatgcgtcattattaaggaaatgattaattgtgttgatt 31747969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 4818536 - 4818491
Alignment:
Q  245 ggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  4818536 ggaaaaaaataataaatgctacattggtattataaagtgacaatta 4818491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 59)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 86 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 1778799 - 1778646
Alignment:
Q  86 cctctgtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaa 185  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |  ||||||| ||    
T  1778799 cctccgtctcacaatattagtcgtttaaggtttgtgcatgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatgataaaattaatgacatttactaa 1778700  T
Q  186 aatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    || ||  ||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||| ||||    
T  1778699 aacatccttatt-attgtagttagtggagtagataagttggatgaaattcaataa 1778646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 86 - 235
Target Start/End: Original strand, 43253821 - 43253970
Alignment:
Q  86 cctctgtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaa 185  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  43253821 cctccgtctcacaatattgatcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaa 43253920  T
Q  186 aatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattc 235  Q
    || |   |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||    
T  43253921 aacacccttattaattgtagttagtggagtagttaagtgggatgaaattc 43253970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 91 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 37312102 - 37311890
Alignment:
Q  91 gtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatat 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| |     
T  37312102 gtctcacaatattagtcgtttaaggtttatgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaaaac 37312003  T
Q  191 tgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattc------------tataataat-ggaaaataataataaatgctgcattgatattat 277  Q
      |||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||| |||||            ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37312002 ccttattaattgtagttagtggagtagttaaatttaatgaaattcaataaataagagtataataatagaaaaataataataaatgctgcattgatattgt 37311903  T
Q  278 aaactgacaatta 290  Q
    ||| |||||||||    
T  37311902 aaagtgacaatta 37311890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 105 - 235
Target Start/End: Original strand, 30190637 - 30190767
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||||| |||||||| | |||| || ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||    
T  30190637 gtcgtttaaggtttgtgcacggttatgaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtatcatttactaaaatacccttattaattgta 30190736  T
Q  205 gttagtagagcagttaagttggatgtaattc 235  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  30190737 gttagtggagtagttaagttggatgaaattc 30190767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 105 - 290
Target Start/End: Original strand, 29023943 - 29024134
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||    
T  29023943 gtcgtttaaggtttatgcacgattattaaaaaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaaca-tcttattaattgta 29024041  T
Q  205 gttagtagagcagttaagttggatgtaattctat-aataatgg-aaaataat-----aataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    |||||| ||| | |||||||||||| ||||| || |||||||| | ||||||     || ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  29024042 gttagtggagtaattaagttggatgaaattcaataaataatggtataataatggaaaaaaaaatgctacattgatattctaaagtgacaatta 29024134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 86 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 44301719 - 44301502
Alignment:
Q  86 cctctgtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaa 185  Q
    |||| |||||| |||| | |||||||||| |||||||  || | |||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  44301719 cctccgtctcaaaataatggtcgtttaaggtttgtgcccgacttttaaggaaatatttaattatgttgatttcaatgataaaattagtatcatttactaa 44301620  T
Q  186 aatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattc------------tataataatgg-aaaataataataaatgctgcattgat 272  Q
    ||||   |||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||            ||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  44301619 aatacccttatcaattgtaattagtggagtagttaagttggatgaaattcaataaataagagtataatagtggaaaaatattaataaatgttgcattgat 44301520  T
Q  273 attataaactgacaatta 290  Q
    |||||||| |||||||||    
T  44301519 attataaagtgacaatta 44301502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 108 - 240
Target Start/End: Original strand, 28690762 - 28690894
Alignment:
Q  108 gtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagtt 207  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | | |||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  28690762 gtttaaggtttgtgcacgattattaaagaaatgattaattgtgttgatttcaacggtaaaattaatatcatttactaaaatatctttattaattgtagtt 28690861  T
Q  208 agt-agagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    ||| |||  |||||||||||||| ||||| ||||    
T  28690862 agtgaga-tagttaagttggatgaaattcaataa 28690894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 108 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19823146 - 19823014
Alignment:
Q  108 gtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagtt 207  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||| |   |||||||||||||||    
T  19823146 gtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtagaattagtatcatttactaaaacacccttattaattgtagtt 19823047  T
Q  208 agtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    ||| ||  |||||||||||||| ||||| ||||    
T  19823046 agtggaatagttaagttggatgaaattcaataa 19823014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 96 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 30711220 - 30711076
Alignment:
Q  96 acaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgtta 195  Q
    |||||||| ||  |||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||| |   |||    
T  30711220 acaatattagtattttaaggtttgtgcattgttattaaagaaataattaattatgttgattttaatgataaaattaatatcatttactaaaacaccatta 30711121  T
Q  196 ttaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||| |||| ||||| ||||    
T  30711120 ttaattgtagttaatggagcaattaagttagatgaaattcaataa 30711076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 96 - 240
Target Start/End: Original strand, 36460384 - 36460528
Alignment:
Q  96 acaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgtta 195  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||  |||||||||||| |||| ||||| ||  ||||||||||| ||||||  |||||||| |||    
T  36460384 acaatattagtcgtttaaagtttgtgcacgattattaagaaaattattaattgtgttaatttcaatagtaaaattagtaacatttattaaaatattctta 36460483  T
Q  196 ttaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    ||||||||||||| | ||| | |||||||||||| ||||| ||||    
T  36460484 ttaattgtagttaatggagtaattaagttggatgaaattcaataa 36460528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 105 - 240
Target Start/End: Original strand, 37695642 - 37695778
Alignment:
Q  105 gtcgtttaag-ttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgt 203  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||| |   |||||||||||    
T  37695642 gtcgtttaaggttttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaacacccttattaattgt 37695741  T
Q  204 agttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    ||||||| ||| ||||||||| |||| ||||| ||||    
T  37695742 agttagtggagtagttaagttagatgaaattcaataa 37695778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 130 - 290
Target Start/End: Original strand, 48541002 - 48541166
Alignment:
Q  130 ttaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatg 229  Q
    |||| ||||| | |||||||||  ||||| || ||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||    
T  48541002 ttaaggaaatgactaattatgtcaatttctataataaaattaatatcatttattaaaatattcttattaattgtaattagttgagtagttaagttgaatg 48541101  T
Q  230 taattctataataatgg----aaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
     ||||| | ||||| ||    |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  48541102 aaattcaacaataagggtataaaaataataataaatgttgcactgatattataaaatgacaatta 48541166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14194693 - 14194564
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||||| |||||||| |||| |||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||     
T  14194693 gtcgtttaaggtttgtgcacgatttttaaagaaatgatcaattgtgttgatttcaatgataaaattagtaccatttactaaaatacttttatgaattgt- 14194595  T
Q  205 gttagtagagcagttaagttggatgtaattc 235  Q
    |||||| ||| | |||||||||||| |||||    
T  14194594 gttagtggagtaattaagttggatgaaattc 14194564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 37497629 - 37497495
Alignment:
Q  106 tcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtag 205  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |  ||| |||| |||||    
T  37497629 tcgtttaagatttatgcacgattattaaggaaatgatttattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacaccgttgttaactgtag 37497530  T
Q  206 ttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  37497529 ttagtggagtagttaagttggatgaaattcaataa 37497495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 50035175 - 50035299
Alignment:
Q  86 cctctgtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaa 185  Q
    |||| ||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||    
T  50035175 cctccgtctcacaatattagacttttaaggtttgtgcatgattattaagaaaatgaataattatgttgatttcaataataaaattagtagcatttaccaa 50035274  T
Q  186 aatattgttattaattgtagttagt 210  Q
    || |  ||| |||||||||||||||    
T  50035275 aacaccgttgttaattgtagttagt 50035299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 240
Target Start/End: Original strand, 5322919 - 5323049
Alignment:
Q  108 gtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagtt 207  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||   ||||||||| || ||    
T  5322919 gtttaaggtttgtgcacgattattaaa--aatgattaattatgttgatttcagtgataaaattaatatcatttactaaaatacacttattaattataatt 5323016  T
Q  208 agtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    |||| || ||||||||| |||| ||||| ||||    
T  5323017 agtaaagtagttaagtttgatgaaattcaataa 5323049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 91 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 11632232 - 11632084
Alignment:
Q  91 gtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatat 190  Q
    |||||| |||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||| | | |||||||||||  |||||| |||| |     
T  11632232 gtctcataatattagtcatttaagatttgtgcacgattattaaa-aaatgattaattgtgttgatttcaacggtaaaattagtagtatttactaaaacac 11632134  T
Q  191 tgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
      |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||| ||||    
T  11632133 ctttattaattgtagttagtggaaaagttaagttggatgaaattcaataa 11632084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 136 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 45710957 - 45710864
Alignment:
Q  136 aaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  45710957 aaatgattaattatgttgattttgatggtaaaattaatatcatttactaaaacacttttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatg 45710864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 105 - 240
Target Start/End: Original strand, 8679031 - 8679166
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||  ||||||||| ||    
T  8679031 gtcgtttaagatttatgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaagatccttattaattata 8679130  T
Q  205 gttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    ||||||  |  | |||||||||||| ||||| ||||    
T  8679131 gttagtgaattaattaagttggatgaaattcaataa 8679166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 235
Target Start/End: Original strand, 24569077 - 24569207
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||| ||||| ||| |||| |||||||||  |||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||| ||||||   ||||||||||||    
T  24569077 gtcgcttaagatttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatattatttactaaaatacccttattaattgta 24569176  T
Q  205 gttagtagagcagttaagttggatgtaattc 235  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||| |||||    
T  24569177 gttagtggagtagttaagttgaatgaaattc 24569207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 86 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 27471492 - 27471338
Alignment:
Q  86 cctctgtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaa 185  Q
    |||| ||||||||| |||  ||||||||| |||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||  ||||||| ||    
T  27471492 cctccgtctcacaacattaatcgtttaagatttgtgcacgattattaagaaaatgattaattatgttgatttcaatggtgaaattagttgcatttactaa 27471393  T
Q  186 aatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    || | | ||||||||| ||  |||| ||| |||||||||| ||| ||||| ||||    
T  27471392 aacactcttattaattataagtagtggagtagttaagttgaatgaaattcaataa 27471338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 103 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 36476724 - 36476525
Alignment:
Q  103 ttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattg 202  Q
    |||| ||||||| ||||| || | |||||||  |||| ||| ||| |||||||| | ||| |||||||| |||||||||| ||||||   ||||||||||    
T  36476724 ttgttgtttaaggtttgttcacggttattaagaaaataattgattgtgttgattgcaatggtaaaattaatatcatttactaaaatacccttattaattg 36476625  T
Q  203 tagttagtagagcagttaagttggatgtaattc------------tataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| |||||            ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  36476624 tagttagtagagtagttaagtttgatgaaattcaataaataagggtataataatagaaaaaagtaataaatgctgcattggtattctaaagtgacaatta 36476525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 109 - 235
Target Start/End: Original strand, 51837940 - 51838066
Alignment:
Q  109 tttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagtta 208  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||  |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||   |||||| |||||| ||    
T  51837940 tttaaggtttgtgcatgagtattaagtaaatgattaattgtgttgatttcaatgataaaattaatatcatttactaaaatacccttattagttgtagcta 51838039  T
Q  209 gtagagcagttaagttggatgtaattc 235  Q
    || ||| ||||| |||| ||| |||||    
T  51838040 gtggagtagttacgttgaatgaaattc 51838066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 136 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 12904972 - 12904867
Alignment:
Q  136 aaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatat-tgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaatt 234  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||  ||||||| | |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||    
T  12904972 aaataattaattatgttgatttcaattataaaattagtatgatttatcaaaatatcttttattaattgtagttagtggagtaattaagttggatgaaatt 12904873  T
Q  235 ctataa 240  Q
    | ||||    
T  12904872 caataa 12904867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 290
Target Start/End: Original strand, 37772943 - 37773140
Alignment:
Q  107 cgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagt 206  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||| | ||| |||||||| |||||||||| ||||||   ||||||||| ||||    
T  37772943 cgtttaaggtttgtgcatgattattaaggaaatgattaattgtattgattacaatggtaaaattaatatcatttactaaaatacccttattaattatagt 37773042  T
Q  207 tagtagagcagttaagttggatgtaattc------------tataataatggaaaataat--aataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
     ||| ||  |||||||||| ||| |||||            ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  37773043 cagtggaatagttaagttgaatgaaattcattaaataagggtataataatggaaaaaaataaaataaatgctgcattggtattgtaaagtgacaatta 37773140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 290
Target Start/End: Original strand, 10366619 - 10366823
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaa------tatt-gttatt 197  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||  |||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||      ||||  |||||    
T  10366619 gtcgtttaaggtttgtgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtatcatttattaaaacactcttattaattatt 10366718  T
Q  198 aattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattc------------tataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgac 285  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||| |||||            ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||    
T  10366719 aattgtagttagtgaagtagttaagttggatgaaattcaataaataagggtataataatgggaaaaaataataaatgttgcattggtattctaaagtgac 10366818  T
Q  286 aatta 290  Q
    |||||    
T  10366819 aatta 10366823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 106 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 11905959 - 11905825
Alignment:
Q  106 tcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtag 205  Q
    ||||||||  ||| |||| |||||||||  |||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||  |   |||||||||||||    
T  11905959 tcgtttaaagtttatgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtag 11905860  T
Q  206 ttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    ||| | |||  ||||||||||||| ||||| ||||    
T  11905859 ttaatggagttgttaagttggatgaaattcaataa 11905825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 240
Target Start/End: Original strand, 23004346 - 23004494
Alignment:
Q  91 gtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatat 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||   | |||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||  || ||| |||| |     
T  23004346 gtctcacaatattagtcgtttaaggtttgttact-attattaaggaaatgattaattgtgtcgatttcaatggtaaaattagtagtatatactaaaacac 23004444  T
Q  191 tgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
      |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||| ||||    
T  23004445 ccttattaattgtagttagtggagtagttaagttgtatgaaattcaataa 23004494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 120 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 53560340 - 53560235
Alignment:
Q  120 tgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagtt 219  Q
    |||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| |   ||||||| | |||||||||||| ||||    
T  53560340 tgcacgatgattaaggaaatgattaattatgttgattttgatggtaaaatttgtatcatttactaaaacacccttattaaatatagttagtagagtagtt 53560241  T
Q  220 aagttg 225  Q
    ||||||    
T  53560240 aagttg 53560235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 109 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 34750630 - 34750510
Alignment:
Q  109 tttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagtta 208  Q
    |||||| |||||||| |||| || | ||||| ||| ||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||     
T  34750630 tttaaggtttgtgcacgatttttgatgaaatgattgattgtgttgattttaatggtaaaattagtatcatttactaaaacatccttattaattgtagttg 34750531  T
Q  209 gtagagcagttaagttggatg 229  Q
    || ||| |||||| |||||||    
T  34750530 gtggagtagttaacttggatg 34750510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 225
Target Start/End: Original strand, 54477464 - 54477556
Alignment:
Q  133 aagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttg 225  Q
    |||||||  |||||| |||||||||  ||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  54477464 aagaaatggttaattgtgttgattttaatggtaaaattaatatcatttactaaaatatttttattaattgtagttaatggagtagttaagttg 54477556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 91 - 158
Target Start/End: Original strand, 33491046 - 33491113
Alignment:
Q  91 gtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttc 158  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  33491046 gtctcacaatattagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttc 33491113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19609436 - 19609318
Alignment:
Q  106 tcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtag 205  Q
    ||||||||| |||||| |||| | ||||  |||| |||| || |||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |    
T  19609436 tcgtttaagatttgtgtatgaattttaagaaaatgattatttgtgttgatttcaatcgtaaaattaatatcatttacaaaaatattcttattacttgttg 19609337  T
Q  206 ttagtagagcagttaagtt 224  Q
    ||||| ||| || ||||||    
T  19609336 ttagtggagtagataagtt 19609318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 240
Target Start/End: Original strand, 38137406 - 38137558
Alignment:
Q  91 gtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagta---tcatttacaaaaa 187  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||| ||| ||| |||||| ||  |||||||||||    ||| ||| ||||    
T  38137406 gtctcataatattagtcgtttaaggtttgtgcatgattataaatgaaataattcattgtgtcgatttcaatagtaaaattagtactgacatctactaaaa 38137505  T
Q  188 tattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    |||| ||||||| |||||||||| | | |||||| || |||| ||||| ||||    
T  38137506 tattcttattaactgtagttagtggggtagttaaattcgatgaaattcaataa 38137558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 38795495 - 38795353
Alignment:
Q  92 tctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatatt 191  Q
    ||||| |||| | |||||||||  |||||||| |||  |||| ||||| ||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||       
T  38795495 tctcaaaataatagtcgtttaatgtttgtgcacgatatttaaggaaatgattaattgtgtttatttcaatggtaaaattagtatcatttacccaaatgcc 38795396  T
Q  192 gttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaatt 234  Q
     ||||||||||||||| || |||  ||||||||||||| ||||    
T  38795395 cttattaattgtagttggtggagttgttaagttggatgaaatt 38795353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 49830268 - 49830162
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaatt-attaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgt 203  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||||| ||| | ||||||| |||||||||| ||  |||||||| |||||||||| ||||||   |||||||||||    
T  49830268 gtcgtttaacgtttgtgcacgattattaaaaaaaatgattaattgtgttgatttcaatagtaaaattaatatcatttactaaaataccattattaattgt 49830169  T
Q  204 agttagt 210  Q
    |||||||    
T  49830168 agttagt 49830162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 240
Target Start/End: Original strand, 3901157 - 3901261
Alignment:
Q  136 aaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattc 235  Q
    |||| ||||||| | || ||||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||| | | | |||||||||||| |||||    
T  3901157 aaatgattaattgtattaatttcaatgataaaattaatatcatttactaaaacattcttattagttgtagttagtggggtacttaagttggatgaaattc 3901256  T
Q  236 tataa 240  Q
     ||||    
T  3901257 aataa 3901261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 228
Target Start/End: Original strand, 12736560 - 12736672
Alignment:
Q  116 tttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagc 215  Q
    |||||||| |||| |||| ||||| ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||| | ||||   |||||||||||| |||||  ||     
T  12736560 tttgtgcacgatttttaaggaaatgattaattgtgttgattctaatgataaaattagtatcatttactacaatacccttattaattgtacttagtgtagt 12736659  T
Q  216 agttaagttggat 228  Q
    |||||| ||||||    
T  12736660 agttaatttggat 12736672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19612010 - 19611912
Alignment:
Q  141 attaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||| |||||||  ||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||| ||||| ||||    
T  19612010 attaattgtgttgatttcaatgttaaaatta-tataatttactaaaatatccttattaattgttgttagtggagtagttaagtttgatgaaattcaataa 19611912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 93 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 3313400 - 3313257
Alignment:
Q  93 ctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattg 192  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||  |||    | ||||||| |||||| ||| |||||||||||  ||| || |||| |       
T  3313400 ctcacaatattagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaagaaaa----tgattatgtcgatttcaatggtaaaattagtagaattaactaaaacaccc 3313305  T
Q  193 ttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    |||||||||||||||| | ||| | |||||||||||| ||||| ||||    
T  3313304 ttattaattgtagttaatggagtatttaagttggatgaaattcaataa 3313257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 54726601 - 54726499
Alignment:
Q  127 ttattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttgg 226  Q
    |||||||  |||| ||||| | ||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||| ||  |||||||||||||||| | ||| ||||||||| |    
T  54726601 ttattaagaaaatgattaaatgtgttgattttgatggtaaaattaatatcatttactaaaacatctttattaattgtagttaatggagtagttaagttag 54726502  T
Q  227 atg 229  Q
    |||    
T  54726501 atg 54726499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 240
Target Start/End: Original strand, 24245109 - 24245205
Alignment:
Q  143 taattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||| | | |||||||||||| |||||| || |||||| | ||||| ||||| ||||    
T  24245109 taattatgttgatttcaataataaaattagtattatttactaaaaca-tattattaattgtacttagtaaagtagttaaatcggatgcaattcaataa 24245205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 105 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17652886 - 17652761
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    ||||||| || ||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||    ||| |||| ||  ||||||||||||    
T  17652886 gtcgtttgaggtttatgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaactagtat----tactaaaacatccttattaattgta 17652791  T
Q  205 gttagtagagcagttaagttggatgtaatt 234  Q
    ||||||   | |||||||||||||| ||||    
T  17652790 gttagtgaggtagttaagttggatgaaatt 17652761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 149 - 240
Target Start/End: Original strand, 39043775 - 39043869
Alignment:
Q  149 tgttgatttcgatgataaaatta---gtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    |||||||||| ||| ||||||||   ||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||| ||||    
T  39043775 tgttgatttcaatggtaaaattaatagtatcatttactaaaatacctttattaattgtagttagtggagtagttaagttgaatgaaattcaataa 39043869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 30861529 - 30861424
Alignment:
Q  108 gtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagtt 207  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |  | | ||||   |||||||  ||||||||| |||||    
T  30861529 gtttaagatttgtgcatgatttttag-gaaattattaattgtgttgatttcaatgataaaaattatttaatttgttaaaatatccttattaattatagtt 30861431  T
Q  208 agtagag 214  Q
    |||||||    
T  30861430 agtagag 30861424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 43715301 - 43715247
Alignment:
Q  236 tataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||    
T  43715301 tataataatggaaaaaaataataaatgttacattgatattctaaagtgacaatta 43715247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 174
Target Start/End: Original strand, 51064775 - 51064864
Alignment:
Q  85 tcctctgtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagta 174  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||||  ||| |||| || ||||||| |||| ||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||    
T  51064775 tcctccgtctcataatattagtcgtttaaagtttatgcacgaatattaaaaaaatgattaattgtgttgctttcaatggtaaaattagta 51064864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 247 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 30710633 - 30710590
Alignment:
Q  247 aaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  30710633 aaaataataataaatgttgcattgatattctaaagtgacaatta 30710590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 43719373 - 43719275
Alignment:
Q  136 aaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattc 235  Q
    |||| ||||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||| ||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||    
T  43719373 aaatgattaattgtgttgattttaatggtaaaatta-tatcattcactgaaacatccttattaattgtagttagtggagtagttaaattggatggaattc 43719275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 23068352 - 23068286
Alignment:
Q  91 gtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgattt 157  Q
    |||||| |||||| ||| |||||  ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||    
T  23068352 gtctcataatattagtcatttaaagtttgtgcatgattatcaagaaaataattaattatgttgattt 23068286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 208
Target Start/End: Original strand, 30682068 - 30682146
Alignment:
Q  130 ttaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagtta 208  Q
    |||| ||||| ||||||| | || ||||  ||| |||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  30682068 ttaaggaaatgattaattgttttaattttaatgttaaaatgagtatcatttactaaaataatcttattaattgtagtta 30682146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 38512176 - 38512034
Alignment:
Q  92 tctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatatt 191  Q
    ||||| |||| | |||||||||  |||||| |||||| ||  | |||| ||||||| | |||||||  |||||||||||  |||||||||  |||||||     
T  38512176 tctcaaaataatagtcgtttaaagtttgtgtatgatttttttaaaaataattaattttattgattttaatgataaaattgatatcatttattaaaatata 38512077  T
Q  192 gttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaatt 234  Q
     ||||| |||||| ||| | ||| ||||||||| |||| ||||    
T  38512076 tttattgattgtaattattggagtagttaagtttgatggaatt 38512034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 290
Target Start/End: Original strand, 41038517 - 41038567
Alignment:
Q  240 ataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||    
T  41038517 ataatggaaaaaaataataaatgctgcatttgtattttaaagtgacaatta 41038567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 52291009 - 52290911
Alignment:
Q  127 ttattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttg 225  Q
    |||||||  |||| ||||||| | ||||||| |||| ||||||||||| ||||||  |||| |   ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  52291009 ttattaagaaaatgattaattgtattgattttgatggtaaaattagtaccatttattaaaacagccttattaattatagttagtggagtagttaagttg 52290911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 3313249 - 3313193
Alignment:
Q  236 tataataatggaaa--ataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  3313249 tataataatgaaaataataataataaatgctgcatttatattgtaaagtgacaatta 3313193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 169
Target Start/End: Original strand, 44533774 - 44533819
Alignment:
Q  125 gattattaaagaaattattaatt-atgttgatttcgatgataaaat 169  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  44533774 gattattaaagaaattattagttgatgttgatttcaatgataaaat 44533819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 236 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 11905817 - 11905774
Alignment:
Q  236 tataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaa 280  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  11905817 tataataatggaaaa-aataataaatgttgcattgatattctaaa 11905774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 38705267 - 38705178
Alignment:
Q  153 gatttcgatgataaaattagta---tcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    |||||| ||| |||||||||||   |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||| ||||| ||||    
T  38705267 gatttcaatggtaaaattagtactatcatttactaaa-tattcttattaattgtagttagttgagtaattaagttagatgaaattcaataa 38705178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 290
Target Start/End: Original strand, 51065143 - 51065187
Alignment:
Q  246 gaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  51065143 gaaaaaaataataaatgctgcattggtattgtaaaatgacaatta 51065187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 42)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 91 - 235
Target Start/End: Original strand, 3720203 - 3720347
Alignment:
Q  91 gtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatat 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| || |||||||| |||  ||||||||||| |     
T  3720203 gtctcacaatattagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaatgaaatgattaattgtgttgatttcaattataaaatttgtagtatttacaaaaacac 3720302  T
Q  191 tgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattc 235  Q
    | |||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||| |||||    
T  3720303 tcttattaattgtagttagtggaatagttaagttgaatgaaattc 3720347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 86 - 234
Target Start/End: Original strand, 31894167 - 31894315
Alignment:
Q  86 cctctgtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaa 185  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||  |||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  31894167 cctccgtctcacaatattaatcgtttaagatttgtgtatgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaa 31894266  T
Q  186 aatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaatt 234  Q
    ||  |  ||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||    
T  31894267 aacgtcattattaattgtagttagtgaagtagttaagttggatgaaatt 31894315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 86 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15058274 - 15058120
Alignment:
Q  86 cctctgtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaa 185  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||  |||| |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||  ||||||| ||    
T  15058274 cctctgtctcgcaatattagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaagaaaatgattaattaagttaatttcaatggtaaaattagtggcatttactaa 15058175  T
Q  186 aatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    ||||   ||||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||| ||||    
T  15058174 aatacccttattaattgtagttagtgaagtatttaagttggatgaaattcaataa 15058120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 105 - 290
Target Start/End: Original strand, 11655922 - 11656120
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||||| ||| |||| | |||||||  |||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| |   ||||||||||||    
T  11655922 gtcgtttaaggtttatgcacggttattaagaaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtgtcatttactaaaacacccttattaattgta 11656021  T
Q  205 gttagtagagcagttaagttggatgtaattc------------tataataat-ggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||| |||||            ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  11656022 gttagtggagtagtaaagttggatgaaattcaataaataagggtataataatgggaaaaaaataataaatgctgcattgatattctaaagtgacaatta 11656120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 91 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 181707 - 181559
Alignment:
Q  91 gtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatat 190  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||| |||||||||| |||| ||||||| | |||||||| ||  |||||||||||  |||||| |||| ||    
T  181707 gtctcacaatattagtcgtctaaggtttgagcacgattattaaaaaaat-attaattgtattgatttcaatagtaaaattagtagtatttactaaaacat 181609  T
Q  191 tgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
      ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  181608 cattattaattatagttagtggagtagttaagttggatgaaattcaataa 181559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 6802069 - 6801871
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||||| ||  |||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||     ||||||||||||    
T  6802069 gtcgtttaagattgatgcatggttattaagaaaatgattaattatgttgattttgatggtaaaattaatatcatttactaaaacgcccttattaattgta 6801970  T
Q  205 gttagtagagcagttaagttggatgtaattc------------tataataatgg-aaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| | |||            ||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  6801969 gttagtggagtagttaagttggatgaagttcgataaataagggtattataatggaaaaaaaataataaatgttgcattgatattataaagtgacaatta 6801871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 275
Target Start/End: Original strand, 32440621 - 32440803
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||| | ||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||| |   ||||||||||||    
T  32440621 gtcgtttaagatttatgcacggttatttaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtattatttactaaaacacccttattaattgta 32440720  T
Q  205 gttagtagagcagttaagttggatg------------taattctataataatggaaaataataataaatgctgcattgatatt 275  Q
     ||||||||| ||||||||||||||            |||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32440721 attagtagagtagttaagttggatgaaatgtaataaataaaggtacaataatggaaaataataataaatgctgcattgatatt 32440803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 105 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 29363444 - 29363309
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||||| ||| ||||  ||||||||  |||| ||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||    
T  29363444 gtcgtttaaggtttatgcacaattattaagaaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaactagtatcatttactaaaacatccttattaattgta 29363345  T
Q  205 gttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    |||||  ||  |||||||||||||| ||||| ||||    
T  29363344 gttagcggattagttaagttggatgaaattcaataa 29363309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 7920374 - 7920272
Alignment:
Q  107 cgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagt 206  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||  | ||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  7920374 cgtttaagatttgtgcacgatttttaaagaaatgattaattttgttgatttcaatggtaaaattaaaaccatttactaaaatatc-ttattaattgtagt 7920276  T
Q  207 tagt 210  Q
    ||||    
T  7920275 tagt 7920272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 116 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13909551 - 13909433
Alignment:
Q  116 tttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagc 215  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||||| | |||||||||| ||| ||||||||||  ||||||| ||||||   |||||||||||||||||| |||     
T  13909551 tttgtgcacgattattaaggaaatgattaaatgtgttgatttcaatggtaaaattagtgacatttactaaaatacccttattaattgtagttagtggagt 13909452  T
Q  216 agttaagttggatgtaatt 234  Q
    | ||||||| |||| ||||    
T  13909451 aattaagttagatgaaatt 13909433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 106 - 204
Target Start/End: Original strand, 27448133 - 27448231
Alignment:
Q  106 tcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    ||||||||| ||| ||||  |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||    
T  27448133 tcgtttaaggtttttgcacaattattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatgatgaaattagtatcatttactaaaacatcattattaattgta 27448231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1225183 - 1225062
Alignment:
Q  107 cgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagt 206  Q
    ||||||||  ||||||| || | |||||||||| ||||||| |||||||||  ||  |||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  1225183 cgtttaagagttgtgcacgagttttaaagaaatgattaattgtgttgatttaaatagtaaaattaatattatttactaaaatattcttattaattttagt 1225084  T
Q  207 tagtagagcagttaagttggat 228  Q
    ||||  || |||||||||||||    
T  1225083 tagtgaagaagttaagttggat 1225062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 136 - 224
Target Start/End: Original strand, 1063610 - 1063698
Alignment:
Q  136 aaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagtt 224  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| | | | |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  1063610 aaatgattaattgtgttgatttcaatgataaaattagtattatttactaaaatactctgagtaattgtagttagtggagtagttaagtt 1063698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 93 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 1781952 - 1781806
Alignment:
Q  93 ctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattg 192  Q
    ||||||||||   ||||||||| ||| |||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||| |||| |       
T  1781952 ctcacaatatcactcgtttaaggtttatgcacgattgttaagaaaatgattaattatgttgatctcaatggtaaaattagtagcatttactaaaacaccc 1781853  T
Q  193 ttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||| ||||| ||||    
T  1781852 ttattaattgtagttagtggag-tgttaagttgaatgaaattcaataa 1781806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 228
Target Start/End: Original strand, 3291744 - 3291867
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| | | |||||  ||| ||| |||||||| |||||| ||||||   ||||||||||||    
T  3291744 gtcgtttaaggtttttgcacgattattaaggaaatgattaattgtatcgattttaatggtaatattagtattatttactaaaatacctttattaattgta 3291843  T
Q  205 gttagtagagcagttaagttggat 228  Q
    ||||||  || |||||||||||||    
T  3291844 gttagtgaagtagttaagttggat 3291867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13087632 - 13087533
Alignment:
Q  141 attaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||| ||  ||||||||| ||||||||  || | |||||||||||| ||||| ||||    
T  13087632 attaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaacatccttattaattatagttagtgaagtaattaagttggatgaaattcaataa 13087533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 227
Target Start/End: Original strand, 21804516 - 21804626
Alignment:
Q  116 tttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagc 215  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||||| | || ||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||| ||      
T  21804516 tttgtgcataatttttaaagaaatgattaattgtattaatttcaattgtaaaattagtatcatttacttaaata-tcttattaattgtagttagtggaaa 21804614  T
Q  216 agttaagttgga 227  Q
    | ||||||||||    
T  21804615 aattaagttgga 21804626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 240
Target Start/End: Original strand, 24983445 - 24983560
Alignment:
Q  125 gattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagtt 224  Q
    |||| |||| ||||| |||| ||  ||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||| |   |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  24983445 gattcttaaggaaatgattagttgagttgatttcaatggtaaaattagtgtcatttactaaaacacccttattaattgtagttagtggagtagttaagtt 24983544  T
Q  225 ggatgtaattctataa 240  Q
    || || ||||| ||||    
T  24983545 gggtgaaattcaataa 24983560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5302467 - 5302365
Alignment:
Q  127 ttattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttgg 226  Q
    |||||||  |||| ||||| | ||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  5302467 ttattaagaaaatgattaaatgtgttgattttgatggtaaaattaatataatttaccaaaacatccttattaattgtagttaatggagtagttaagttgg 5302368  T
Q  227 atg 229  Q
    |||    
T  5302367 atg 5302365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 23142824 - 23142670
Alignment:
Q  86 cctctgtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaa 185  Q
    |||| ||||||||||||| ||  |||||| ||| | || |||||||||  |||| ||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||  ||||||| ||    
T  23142824 cctccgtctcacaatattagttatttaaggtttatccacgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaaatagtggcatttactaa 23142725  T
Q  186 aatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    || |   ||||||||||||| |||| ||| ||||||| | |||| ||||| ||||    
T  23142724 aacacccttattaattgtaggtagtggagtagttaagctagatgaaattcaataa 23142670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 33510222 - 33510149
Alignment:
Q  160 atgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaatt 234  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||| ||||    
T  33510222 atgataaaattagtat-atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtagttaagttggatgaaatt 33510149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 34300087 - 34300009
Alignment:
Q  151 ttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatg 229  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||    
T  34300087 ttgatttgaatgataaaattagtattatttactaaaatatccttattaattgtggttagtgaagtagttaagttggatg 34300009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 210
Target Start/End: Original strand, 1955991 - 1956060
Alignment:
Q  141 attaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagt 210  Q
    ||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||    
T  1955991 attaattgtattgatttcaatggtaaaattagtatcatttactaatatactcttattaattgtagttagt 1956060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 229
Target Start/End: Original strand, 11143606 - 11143687
Alignment:
Q  148 atgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatg 229  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |   ||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||    
T  11143606 atgttgattttgatgataaaattagtatcatttactaaatcacccttattaattatagttagtgaagtagttaagttggatg 11143687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 30717016 - 30716915
Alignment:
Q  127 ttattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttgg 226  Q
    ||||||| ||||| ||||||| | |||| || |||| |||||||||||||||||||  ||| |   |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  30717016 ttattaaggaaatgattaattttattgactttgatggtaaaattagtatcatttacttaaacacccttattaattgtagttagtggagtagtaaagttgg 30716917  T
Q  227 at 228  Q
    ||    
T  30716916 at 30716915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 130 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17829053 - 17828949
Alignment:
Q  130 ttaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatg 229  Q
    |||| ||||||||||||  |||| ||||| |   |||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||  || | ||||||||||||    
T  17829053 ttaaggaaattattaatagtgttaatttcaacagtaaaattaatatcatttactaaaatatctttattaattgtagttagtgaagtaattaagttggatg 17828954  T
Q  230 taatt 234  Q
     ||||    
T  17828953 aaatt 17828949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 188
Target Start/End: Original strand, 28101370 - 28101418
Alignment:
Q  140 tattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaat 188  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28101370 tatttattatgttgatttcaatgataaaattagtatcatttactaaaat 28101418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 210
Target Start/End: Original strand, 8115069 - 8115119
Alignment:
Q  160 atgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||    
T  8115069 atgataaaattagtatcatttactaaaatactcttattaattttagttagt 8115119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 171
Target Start/End: Original strand, 7764213 - 7764281
Alignment:
Q  103 ttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaatta 171  Q
    ||||||||||||  | |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  7764213 ttgtcgtttaagaatggtgcgtgatttttaatgaaattattaattatgttgattttaatggtaaaatta 7764281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 290
Target Start/End: Original strand, 27367220 - 27367272
Alignment:
Q  238 taataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  27367220 taataatgaaaaataataataaatgatgcattggtattctaaagtgacaatta 27367272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 290
Target Start/End: Original strand, 27457567 - 27457619
Alignment:
Q  238 taataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  27457567 taataatgaaaaataataataaatgatgcattggtattctaaagtgacaatta 27457619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 236 - 275
Target Start/End: Original strand, 6834487 - 6834526
Alignment:
Q  236 tataataatggaaaataataataaatgctgcattgatatt 275  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  6834487 tataataatggaaaaaaataataagtgctgcattgatatt 6834526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 108 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 21010312 - 21010176
Alignment:
Q  108 gtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtag-- 205  Q
    ||||||| ||| ||||  ||||||||  |||| ||||||| |||| |||| ||||  |||||||||||||||||| |||| |   |||| ||||||||      
T  21010312 gtttaaggtttatgcacaattattaagaaaatgattaattgtgttaattttgatggaaaaattagtatcatttactaaaacacccttataaattgtagtt 21010213  T
Q  206 --ttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
      ||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  21010212 aattagtggagtagttaagttggatgaaattcaataa 21010176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 240
Target Start/End: Original strand, 34657626 - 34657673
Alignment:
Q  193 ttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  34657626 ttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaattcaataa 34657673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 5302342 - 5302292
Alignment:
Q  240 ataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||    
T  5302342 ataatggaaaaaaataataaatgctgcattagtattctaaagtgacaatta 5302292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 17835491 - 17835381
Alignment:
Q  136 aaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattc 235  Q
    |||| ||||||| | |||||||  || ||||||||| | |||||||| ||||||   ||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||  ||||    
T  17835491 aaataattaattgtattgattttaataataaaattaatctcatttactaaaatacatttattaattgtagtttgtttagtagttaagttggatgatattc 17835392  T
Q  236 tataataatgg 246  Q
      |||||||||    
T  17835391 attaataatgg 17835381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 157
Target Start/End: Original strand, 27367422 - 27367464
Alignment:
Q  115 ttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgattt 157  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  27367422 ttttgtgcacgattattaaagaaatgattaattgtgttgattt 27367464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 157
Target Start/End: Original strand, 27457769 - 27457811
Alignment:
Q  115 ttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgattt 157  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  27457769 ttttgtgcacgattattaaagaaatgattaattgtgttgattt 27457811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 288
Target Start/End: Original strand, 1956097 - 1956150
Alignment:
Q  236 tataataatg-gaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaat 288  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  1956097 tataataatgagaaaaaaataataaatgttgcattgttattataaagtgacaat 1956150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 213
Target Start/End: Original strand, 6834360 - 6834453
Alignment:
Q  120 tgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtaga 213  Q
    |||| |||||||||  |||| ||||||| ||||||||| |||  | |||||| |||||||||| |||| |   ||||||||| |||||||||||    
T  6834360 tgcacgattattaagaaaataattaattgtgttgattttgatagtcaaattaatatcatttactaaaacacctttattaattatagttagtaga 6834453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 21010168 - 21010112
Alignment:
Q  236 tataataatggaaaataata--ataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    ||||||||||||||| || |  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  21010168 tataataatggaaaaaaaaattataaatgctgcattggtattataaagtgacaatta 21010112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 29363301 - 29363245
Alignment:
Q  236 tataataatggaaaa--taataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||    
T  29363301 tataataatggaaaaaataataataaatgctgcattggtattctgaagtgacaatta 29363245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0330 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0330
Description:

Target: scaffold0330; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 5527 - 5393
Alignment:
Q  106 tcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtag 205  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||  |||| ||||| | |||||| ||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||| |||    
T  5527 tcgtttaaggtttgtacatgattattaagaaaatgattaactgtgttgaattcaatggtaaaattaatatcatttactaaaatatccttattaattttag 5428  T
Q  206 ttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  5427 ttagtggagtagttaagttggatgaaattcaataa 5393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 86 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16255 - 16101
Alignment:
Q  86 cctctgtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaa 185  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||| ||||| || ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||| || ||||||| ||    
T  16255 cctccgtctcacaatattagtagtttaagatttgttcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgattttaatgataaaattaatagcatttactaa 16156  T
Q  186 aatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    || |   |||||||||||||||| |  |||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  16155 aacacacttattaattgtagttaatgaagcagttaagatggatgaaattcaataa 16101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 86 - 234
Target Start/End: Original strand, 135995 - 136143
Alignment:
Q  86 cctctgtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaa 185  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||    
T  135995 cctccgtctcacaatattagtcgtttaagatttatgcacgattattaaataaatgattaataatgttgatttcaatggtaaaattaatagcatttactaa 136094  T
Q  186 aatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaatt 234  Q
    || |   ||||||||| ||||||||  || ||||||||| |||| ||||    
T  136095 aacacccttattaattatagttagtgaagtagttaagtttgatgaaatt 136143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 85 - 290
Target Start/End: Original strand, 33976 - 34192
Alignment:
Q  85 tcctctgtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaa 184  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||| | |||| ||| ||  ||||||||||  ||||||| |    
T  33976 tcctccgtctcacaatattagtcatttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtattgaattcaatagtaaaattagtggcatttacta 34075  T
Q  185 aaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattc------------tataataatggaaaataataataaatgctgcattgat 272  Q
    ||| |   ||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| |||||            ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  34076 aaacacccttattaattgtagttagtgaaatagttaagttggatgaaattcaataaataatggtataatagtggaaaa-aataataaatgatgcattgat 34174  T
Q  273 attataaactgacaatta 290  Q
    ||| |||| |||||||||    
T  34175 attgtaaagtgacaatta 34192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0294 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0294
Description:

Target: scaffold0294; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 17182 - 17097
Alignment:
Q  96 acaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcattta 181  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  17182 acaatattagtcgtttaaggtttgtgcatgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcattta 17097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0182
Description:

Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 240
Target Start/End: Original strand, 20342 - 20465
Alignment:
Q  117 ttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagca 216  Q
    ||||||| |||||||||  |||| ||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||   |||||||||| |||||||  || |    
T  20342 ttgtgcaagattattaattaaatgattaattgtgttgattttgattgtaaaattagtatcatttagtaaaatacccttattaattgcagttagtgaagta 20441  T
Q  217 gttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||    
T  20442 gttaagttggatgaaattcaataa 20465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 4)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 106 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 39225 - 39127
Alignment:
Q  106 tcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    ||||||||| ||| ||||  |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||    
T  39225 tcgtttaaggtttttgcacaattattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatgatgaaattagtatcatttactaaaacatcattattaattgta 39127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 105 - 174
Target Start/End: Original strand, 252506 - 252575
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagta 174  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  252506 gtcgtttaaggtttgcgtatgattattaaagaaatgattaattatgttgattttaatggtaaaattagta 252575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 240
Target Start/End: Original strand, 252848 - 252916
Alignment:
Q  171 agtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || | ||| |||||||||| ||| ||||| ||||    
T  252848 agtatcatttactaaaatatcgttattaattgtag-tattggagtagttaagttgaatgaaattcaataa 252916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 289
Target Start/End: Original strand, 252924 - 252976
Alignment:
Q  236 tataataatggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatt 289  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  252924 tataataatgaaaaa-aataataaatgttgcattggtattataaagtgacaatt 252976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0583 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0583
Description:

Target: scaffold0583; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 105 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 2163 - 2058
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||||| ||  |||| ||||||||| ||| | ||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||||    
T  2163 gtcgtttaaggttcatgcacgattattaaggaagtgattaattgtgttaatttcaatgataaaattaatatcatttactaaaacatccttattaattgta 2064  T
Q  205 gttagt 210  Q
    ||||||    
T  2063 gttagt 2058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0110 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0110
Description:

Target: scaffold0110; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1842 - 1719
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgta 204  Q
    |||||||||| ||| | || | |||||||  |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||| |    |||||||||||    
T  1842 gtcgtttaagatttatacacggttattaagaaaatgattaattatgttgattttgatggtaaaattagtatcatttacttaaacacccgtattaattgta 1743  T
Q  205 gttagtagagcagttaagttggat 228  Q
    || ||| ||| |||||||||||||    
T  1742 gtcagtggagtagttaagttggat 1719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 229
Target Start/End: Original strand, 7980 - 8082
Alignment:
Q  127 ttattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagttagtagagcagttaagttgg 226  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| |||| |   |||||||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  7980 ttattaaggaaatgattaattttgttgatttggatggtaaaattaatattatttaccaaaacacccttattaattgtagttagtggagtaattaagttgg 8079  T
Q  227 atg 229  Q
    |||    
T  8080 atg 8082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 290
Target Start/End: Original strand, 8111 - 8156
Alignment:
Q  245 ggaaaataataataaatgctgcattgatattataaactgacaatta 290  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  8111 ggaaaaaaataataaatgctgcattggtattctaaagtgacaatta 8156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 107 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 105820 - 105687
Alignment:
Q  107 cgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagt 206  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||  |||| ||||||| |||| ||||| ||| |||||||| || | ||||| |||| |   ||||||||||||||    
T  105820 cgtttaagatttatgcatgattattaagtaaatgattaattgtgtttatttcaatggtaaaattaatagcgtttactaaaacacccttattaattgtagt 105721  T
Q  207 tagtagagcagttaagttggatgtaattctataa 240  Q
    ||||  || |||||||||| ||| ||||| ||||    
T  105720 tagtgaagtagttaagttgaatgaaattcgataa 105687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 6872 - 6737
Alignment:
Q  108 gtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatttacaaaaatattgttattaattgtagtt 207  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||| ||||| ||||||| | || ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |  ||||||||| |||||    
T  6872 gtttaaggtttgtgcgtgatttttaaggaaatgattaattgttttaatttcaatgataaaattagtattatttactaaaatgtctttattaatt-tagtt 6774  T
Q  208 agtagagcagttaagttggatgtaattctataataat 244  Q
    | ||||  ||||||||  |||| ||||  ||||||||    
T  6773 actagaatagttaagtatgatgaaatttaataataat 6737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0470 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0470
Description:

Target: scaffold0470; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 1132 - 1055
Alignment:
Q  96 acaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagt 173  Q
    |||||||| |||||||||| |||   || |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  1132 acaatattagtcgtttaagatttacacacgattattaaaaaaatgattaattatgttgatttcaatggtaaaattagt 1055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 179
Target Start/End: Original strand, 6262 - 6336
Alignment:
Q  105 gtcgtttaagttttgtgcatgattattaaagaaattattaattatgttgatttcgatgataaaattagtatcatt 179  Q
    |||||||||  |||||||| |||| |||| ||||| ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  6262 gtcgtttaaagtttgtgcacgatttttaacgaaatgattaattgtgttgattctaatgataaaattagtatcatt 6336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 133
Target Start/End: Original strand, 84376 - 84418
Alignment:
Q  91 gtctcacaatatttgtcgtttaagttttgtgcatgattattaa 133  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  84376 gtctcacaatattagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaa 84418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University