View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6178_low_37 (Length: 381)

Name: NF6178_low_37
Description: NF6178
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6178_low_37
NF6178_low_37
[»] chr5 (34 HSPs)
chr5 (123-311)||(13661807-13661996)
chr5 (123-310)||(35132521-35132708)
chr5 (124-312)||(34650830-34651018)
chr5 (124-310)||(35504240-35504426)
chr5 (124-310)||(11957966-11958153)
chr5 (124-286)||(6283562-6283724)
chr5 (124-286)||(12506296-12506458)
chr5 (123-310)||(8787338-8787526)
chr5 (125-284)||(20175228-20175387)
chr5 (122-310)||(40564403-40564590)
chr5 (156-309)||(21547394-21547548)
chr5 (123-309)||(10054353-10054539)
chr5 (127-286)||(11846075-11846234)
chr5 (156-277)||(9721640-9721761)
chr5 (123-282)||(31909631-31909784)
chr5 (124-248)||(10069969-10070092)
chr5 (123-256)||(13470150-13470283)
chr5 (127-248)||(19647720-19647841)
chr5 (157-309)||(40057340-40057493)
chr5 (127-283)||(19436865-19437019)
chr5 (121-310)||(10955948-10956138)
chr5 (150-272)||(39066973-39067096)
chr5 (125-232)||(2619635-2619742)
chr5 (123-236)||(4837257-4837369)
chr5 (117-273)||(39069374-39069527)
chr5 (182-279)||(4268620-4268716)
chr5 (150-221)||(6284821-6284892)
chr5 (123-215)||(21944954-21945048)
chr5 (124-225)||(40608619-40608722)
chr5 (261-310)||(10070086-10070136)
chr5 (252-286)||(10955975-10956009)
chr5 (178-272)||(22973739-22973832)
chr5 (151-215)||(6042142-6042207)
chr5 (168-215)||(5302374-5302422)
[»] chr8 (56 HSPs)
chr8 (123-311)||(27988498-27988686)
chr8 (123-311)||(28045800-28045988)
chr8 (123-309)||(11112638-11112825)
chr8 (124-309)||(34228682-34228868)
chr8 (123-310)||(4537743-4537931)
chr8 (123-286)||(33357153-33357316)
chr8 (123-312)||(168465-168655)
chr8 (123-310)||(9063051-9063238)
chr8 (125-309)||(16888544-16888728)
chr8 (121-302)||(36730442-36730622)
chr8 (124-309)||(16394061-16394247)
chr8 (126-309)||(20831553-20831737)
chr8 (124-308)||(30675574-30675758)
chr8 (124-311)||(2805258-2805446)
chr8 (121-309)||(43119214-43119402)
chr8 (124-279)||(37373206-37373360)
chr8 (157-309)||(7304518-7304671)
chr8 (127-310)||(13643015-13643198)
chr8 (127-310)||(13743440-13743623)
chr8 (114-286)||(16785077-16785248)
chr8 (127-310)||(29444139-29444323)
chr8 (122-283)||(12203853-12204013)
chr8 (122-283)||(12448281-12448441)
chr8 (155-307)||(16890482-16890635)
chr8 (119-310)||(3930232-3930423)
chr8 (156-306)||(28626800-28626950)
chr8 (137-310)||(42034980-42035154)
chr8 (124-310)||(32113908-32114096)
chr8 (125-283)||(21595848-21596005)
chr8 (151-304)||(9253907-9254060)
chr8 (123-310)||(4648194-4648381)
chr8 (156-309)||(9537824-9537978)
chr8 (124-309)||(29235235-29235421)
chr8 (123-309)||(40831280-40831463)
chr8 (127-258)||(17467606-17467737)
chr8 (196-309)||(24843280-24843393)
chr8 (187-307)||(39406905-39407024)
chr8 (123-229)||(9278211-9278317)
chr8 (168-303)||(42433550-42433685)
chr8 (156-267)||(10870384-10870495)
chr8 (127-229)||(10618021-10618123)
chr8 (158-248)||(34192809-34192899)
chr8 (124-201)||(12652630-12652707)
chr8 (168-310)||(22956749-22956893)
chr8 (175-257)||(22451835-22451916)
chr8 (178-256)||(30933376-30933453)
chr8 (218-285)||(14191035-14191102)
chr8 (123-310)||(42655276-42655464)
chr8 (196-257)||(36057904-36057967)
chr8 (104-191)||(36923782-36923869)
chr8 (124-285)||(39751496-39751658)
chr8 (156-233)||(33124570-33124648)
chr8 (242-315)||(35695620-35695694)
chr8 (132-177)||(2270658-2270703)
chr8 (273-322)||(20822397-20822446)
chr8 (123-221)||(4811556-4811656)
[»] chr3 (58 HSPs)
chr3 (123-310)||(40362579-40362767)
chr3 (123-309)||(46352633-46352820)
chr3 (123-310)||(52520680-52520868)
chr3 (124-310)||(4168183-4168370)
chr3 (124-310)||(48725271-48725458)
chr3 (121-309)||(272217-272406)
chr3 (123-311)||(858588-858777)
chr3 (124-310)||(43786871-43787058)
chr3 (122-309)||(49893329-49893517)
chr3 (124-310)||(39074419-39074605)
chr3 (128-309)||(7468417-7468595)
chr3 (120-304)||(41304001-41304184)
chr3 (124-314)||(10617279-10617469)
chr3 (126-316)||(43269732-43269923)
chr3 (124-306)||(20923992-20924173)
chr3 (122-286)||(41553964-41554127)
chr3 (125-283)||(42964276-42964434)
chr3 (124-309)||(52246582-52246768)
chr3 (151-303)||(22248913-22249066)
chr3 (124-286)||(53489848-53490012)
chr3 (123-310)||(18014671-18014859)
chr3 (123-310)||(13159896-13160083)
chr3 (124-302)||(28139309-28139488)
chr3 (151-309)||(50359186-50359345)
chr3 (124-286)||(2505350-2505511)
chr3 (123-311)||(11308209-11308397)
chr3 (124-286)||(38852216-38852379)
chr3 (130-310)||(50395562-50395742)
chr3 (156-310)||(41993619-41993773)
chr3 (157-284)||(42548128-42548255)
chr3 (176-308)||(33140937-33141070)
chr3 (181-309)||(6842676-6842805)
chr3 (156-311)||(2938038-2938194)
chr3 (151-308)||(24488393-24488551)
chr3 (155-277)||(29241668-29241790)
chr3 (157-308)||(49529269-49529422)
chr3 (175-282)||(50298973-50299080)
chr3 (151-272)||(2119458-2119577)
chr3 (162-300)||(31514829-31514966)
chr3 (174-248)||(2362882-2362955)
chr3 (199-309)||(52552549-52552658)
chr3 (123-209)||(52718167-52718252)
chr3 (157-296)||(53054834-53054975)
chr3 (151-205)||(2391634-2391688)
chr3 (151-205)||(2393395-2393449)
chr3 (168-255)||(21010041-21010124)
chr3 (168-282)||(25743854-25743967)
chr3 (185-223)||(6842604-6842642)
chr3 (138-215)||(36953207-36953285)
chr3 (119-184)||(2362796-2362861)
chr3 (118-203)||(23925274-23925359)
chr3 (259-310)||(2362947-2362999)
chr3 (175-282)||(17752736-17752842)
chr3 (175-282)||(19054056-19054162)
chr3 (168-215)||(26966540-26966588)
chr3 (124-215)||(27994394-27994486)
chr3 (125-215)||(16990728-16990818)
chr3 (175-255)||(31436313-31436393)
[»] chr4 (59 HSPs)
chr4 (123-310)||(43202383-43202570)
chr4 (123-309)||(43944506-43944692)
chr4 (124-310)||(32217045-32217231)
chr4 (123-309)||(789530-789717)
chr4 (123-309)||(12356243-12356430)
chr4 (123-312)||(33108670-33108859)
chr4 (123-300)||(47231881-47232059)
chr4 (124-309)||(54897308-54897494)
chr4 (123-310)||(16536047-16536235)
chr4 (122-310)||(55882682-55882869)
chr4 (124-310)||(3783497-3783687)
chr4 (122-309)||(4268822-4269010)
chr4 (123-310)||(29591188-29591376)
chr4 (163-310)||(36395138-36395286)
chr4 (122-310)||(4089140-4089329)
chr4 (117-317)||(28755614-28755812)
chr4 (123-310)||(7768937-7769125)
chr4 (151-307)||(54655879-54656035)
chr4 (127-310)||(50619089-50619272)
chr4 (122-310)||(18067878-18068067)
chr4 (114-279)||(52533816-52533981)
chr4 (156-310)||(4220227-4220381)
chr4 (151-309)||(6164121-6164279)
chr4 (124-310)||(32202480-32202666)
chr4 (124-282)||(24679671-24679827)
chr4 (123-270)||(15186242-15186389)
chr4 (151-309)||(30154163-30154321)
chr4 (125-278)||(19503137-19503289)
chr4 (122-280)||(42898774-42898934)
chr4 (129-277)||(39843912-39844060)
chr4 (156-310)||(37987967-37988122)
chr4 (118-309)||(5091612-5091802)
chr4 (173-311)||(30387132-30387271)
chr4 (150-300)||(53655887-53656038)
chr4 (151-309)||(54945780-54945937)
chr4 (123-283)||(46148940-46149098)
chr4 (151-310)||(50603254-50603415)
chr4 (124-248)||(54054548-54054672)
chr4 (123-314)||(41265458-41265648)
chr4 (176-310)||(31517217-31517352)
chr4 (168-280)||(53268764-53268875)
chr4 (188-309)||(39877247-39877371)
chr4 (127-306)||(31680468-31680645)
chr4 (184-311)||(16820912-16821040)
chr4 (122-266)||(49915157-49915301)
chr4 (122-248)||(42815108-42815234)
chr4 (123-248)||(46688267-46688397)
chr4 (156-288)||(52697084-52697215)
chr4 (151-303)||(1432554-1432701)
chr4 (203-310)||(53003955-53004063)
chr4 (199-280)||(8133782-8133862)
chr4 (118-303)||(10110007-10110194)
chr4 (122-216)||(50167589-50167681)
chr4 (127-315)||(34151124-34151313)
chr4 (268-316)||(11893394-11893442)
chr4 (118-308)||(16572488-16572680)
chr4 (168-283)||(17344686-17344800)
chr4 (156-312)||(28119903-28120061)
chr4 (260-310)||(54054665-54054716)
[»] chr1 (66 HSPs)
chr1 (124-310)||(5694321-5694508)
chr1 (123-310)||(18043161-18043349)
chr1 (122-310)||(29657769-29657958)
chr1 (123-310)||(15227738-15227926)
chr1 (123-310)||(47009992-47010180)
chr1 (127-311)||(12072060-12072245)
chr1 (123-310)||(51065747-51065935)
chr1 (124-310)||(17333283-17333467)
chr1 (117-316)||(42769983-42770183)
chr1 (123-309)||(9266728-9266915)
chr1 (119-311)||(3784711-3784904)
chr1 (124-308)||(38162850-38163035)
chr1 (122-313)||(13961210-13961401)
chr1 (131-312)||(6770344-6770522)
chr1 (118-309)||(30294381-30294573)
chr1 (123-309)||(30657607-30657788)
chr1 (124-310)||(3097659-3097843)
chr1 (123-309)||(47532671-47532856)
chr1 (119-311)||(19031813-19032006)
chr1 (123-310)||(14350278-14350464)
chr1 (124-309)||(24178463-24178649)
chr1 (126-310)||(38701936-38702117)
chr1 (123-309)||(41730304-41730494)
chr1 (119-286)||(45431274-45431440)
chr1 (157-310)||(50128171-50128325)
chr1 (123-284)||(12306917-12307077)
chr1 (121-309)||(48071480-48071667)
chr1 (124-272)||(38335170-38335317)
chr1 (123-286)||(35985645-35985807)
chr1 (123-283)||(29683194-29683355)
chr1 (156-310)||(8472913-8473068)
chr1 (121-248)||(29210410-29210537)
chr1 (123-285)||(51368810-51368972)
chr1 (127-283)||(43286725-43286881)
chr1 (126-283)||(36446352-36446508)
chr1 (127-309)||(48383111-48383294)
chr1 (156-312)||(45449241-45449398)
chr1 (125-309)||(30217763-30217946)
chr1 (156-310)||(15282518-15282668)
chr1 (168-286)||(52431625-52431743)
chr1 (168-278)||(37315300-37315409)
chr1 (156-309)||(23473464-23473618)
chr1 (156-279)||(52749634-52749757)
chr1 (157-247)||(39497340-39497430)
chr1 (123-231)||(26228194-26228300)
chr1 (124-311)||(28481844-28482030)
chr1 (156-283)||(35700679-35700804)
chr1 (174-272)||(37503264-37503361)
chr1 (219-309)||(19010687-19010778)
chr1 (124-309)||(38595752-38595939)
chr1 (150-257)||(3838831-3838937)
chr1 (124-282)||(39081803-39081958)
chr1 (125-198)||(19011108-19011180)
chr1 (123-286)||(28725929-28726093)
chr1 (157-226)||(39912363-39912432)
chr1 (125-204)||(10976008-10976087)
chr1 (260-313)||(29210530-29210584)
chr1 (203-253)||(14881036-14881086)
chr1 (175-257)||(16590269-16590349)
chr1 (182-216)||(19011061-19011095)
chr1 (260-313)||(21112677-21112731)
chr1 (260-313)||(21117419-21117473)
chr1 (151-216)||(49867456-49867522)
chr1 (130-163)||(12326107-12326140)
chr1 (127-255)||(33644390-33644517)
chr1 (118-190)||(14881086-14881158)
[»] chr6 (50 HSPs)
chr6 (124-316)||(392096-392289)
chr6 (124-309)||(12145117-12145303)
chr6 (123-310)||(23402137-23402325)
chr6 (123-309)||(1391178-1391364)
chr6 (123-315)||(32929502-32929695)
chr6 (124-309)||(35043890-35044074)
chr6 (156-310)||(25165412-25165567)
chr6 (124-310)||(29978233-29978418)
chr6 (127-311)||(32985191-32985376)
chr6 (151-310)||(13416959-13417121)
chr6 (122-286)||(29451139-29451302)
chr6 (123-309)||(3515765-3515952)
chr6 (123-310)||(4215694-4215882)
chr6 (156-315)||(26467118-26467278)
chr6 (126-303)||(2350654-2350832)
chr6 (123-278)||(7851191-7851346)
chr6 (123-315)||(3026004-3026194)
chr6 (156-316)||(2580984-2581145)
chr6 (122-310)||(27433490-27433679)
chr6 (123-312)||(12525718-12525908)
chr6 (151-309)||(18276612-18276774)
chr6 (124-310)||(28225221-28225407)
chr6 (166-279)||(961051-961164)
chr6 (123-248)||(20897947-20898072)
chr6 (124-313)||(21878349-21878533)
chr6 (120-309)||(31280317-31280501)
chr6 (123-239)||(34396598-34396714)
chr6 (151-317)||(1840239-1840406)
chr6 (128-283)||(34851876-34852030)
chr6 (151-248)||(34477612-34477709)
chr6 (151-286)||(11115121-11115254)
chr6 (124-279)||(23629607-23629761)
chr6 (157-286)||(5323433-5323562)
chr6 (126-258)||(9660988-9661120)
chr6 (16-123)||(9524661-9524768)
chr6 (122-223)||(13529453-13529554)
chr6 (313-364)||(9524615-9524666)
chr6 (234-286)||(22417303-22417355)
chr6 (157-285)||(24227413-24227546)
chr6 (157-233)||(11633951-11634028)
chr6 (123-313)||(34706719-34706911)
chr6 (123-195)||(14559921-14559993)
chr6 (168-215)||(10431780-10431827)
chr6 (126-215)||(22021633-22021724)
chr6 (174-286)||(1127866-1127978)
chr6 (157-233)||(11616208-11616285)
chr6 (125-216)||(28562682-28562772)
chr6 (250-311)||(34494278-34494340)
chr6 (119-165)||(34712271-34712317)
chr6 (260-309)||(20898065-20898114)
[»] chr2 (53 HSPs)
chr2 (124-310)||(20552931-20553118)
chr2 (123-307)||(561520-561705)
chr2 (118-309)||(22887744-22887936)
chr2 (118-310)||(34442532-34442723)
chr2 (123-313)||(26387060-26387251)
chr2 (124-310)||(31438646-31438833)
chr2 (123-308)||(2898071-2898256)
chr2 (123-309)||(31390011-31390198)
chr2 (127-310)||(4381798-4381982)
chr2 (119-286)||(1859157-1859324)
chr2 (123-309)||(30486209-30486396)
chr2 (123-311)||(22068318-22068506)
chr2 (121-309)||(32360869-32361058)
chr2 (114-301)||(38590883-38591070)
chr2 (119-309)||(44587897-44588088)
chr2 (150-310)||(22567628-22567789)
chr2 (123-310)||(27856395-27856583)
chr2 (127-310)||(3668112-3668295)
chr2 (122-286)||(6580187-6580351)
chr2 (156-308)||(27584770-27584922)
chr2 (123-283)||(32860101-32860260)
chr2 (124-310)||(5093539-5093724)
chr2 (151-310)||(28600994-28601153)
chr2 (127-283)||(25782860-25783012)
chr2 (127-277)||(5881221-5881374)
chr2 (156-310)||(35851749-35851905)
chr2 (124-310)||(8969406-8969591)
chr2 (123-308)||(4022480-4022665)
chr2 (123-273)||(11021259-11021408)
chr2 (124-303)||(43637165-43637343)
chr2 (122-248)||(26891725-26891851)
chr2 (156-308)||(13574031-13574183)
chr2 (125-282)||(25772112-25772269)
chr2 (121-303)||(34123033-34123213)
chr2 (119-264)||(38296173-38296317)
chr2 (168-309)||(39531868-39532008)
chr2 (123-280)||(29102313-29102469)
chr2 (168-257)||(15079012-15079100)
chr2 (175-282)||(15146683-15146789)
chr2 (168-272)||(10820528-10820630)
chr2 (123-309)||(20252739-20252928)
chr2 (150-286)||(20431463-20431600)
chr2 (127-309)||(30834366-30834545)
chr2 (126-215)||(16807318-16807409)
chr2 (126-215)||(16846599-16846690)
chr2 (126-215)||(44331741-44331832)
chr2 (156-221)||(30217652-30217718)
chr2 (124-257)||(28012007-28012140)
chr2 (119-202)||(44854305-44854387)
chr2 (168-202)||(35506740-35506774)
chr2 (127-309)||(31782565-31782749)
chr2 (114-163)||(35470367-35470416)
chr2 (123-215)||(44854434-44854527)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (123-313)||(22960-23151)
[»] chr7 (55 HSPs)
chr7 (124-309)||(24438477-24438663)
chr7 (119-311)||(34606256-34606449)
chr7 (117-316)||(12218430-12218629)
chr7 (123-309)||(24798403-24798589)
chr7 (123-309)||(29993487-29993674)
chr7 (124-283)||(43594063-43594222)
chr7 (127-308)||(11686324-11686507)
chr7 (119-304)||(1736975-1737160)
chr7 (122-278)||(5239283-5239439)
chr7 (124-278)||(8754617-8754771)
chr7 (123-286)||(7689224-7689387)
chr7 (125-280)||(28587911-28588065)
chr7 (151-286)||(30810682-30810817)
chr7 (123-308)||(5729345-5729531)
chr7 (122-311)||(23363165-23363354)
chr7 (164-313)||(42044290-42044439)
chr7 (123-310)||(18485960-18486148)
chr7 (123-310)||(34333283-34333470)
chr7 (125-304)||(47656981-47657158)
chr7 (123-309)||(4628565-4628752)
chr7 (156-286)||(45045802-45045932)
chr7 (145-311)||(47083076-47083242)
chr7 (127-310)||(18117147-18117329)
chr7 (122-304)||(28262029-28262207)
chr7 (121-286)||(47839490-47839654)
chr7 (174-310)||(37674105-37674240)
chr7 (151-309)||(525076-525234)
chr7 (119-249)||(27456174-27456303)
chr7 (124-284)||(13064902-13065061)
chr7 (151-285)||(33636479-33636613)
chr7 (128-310)||(46716642-46716825)
chr7 (122-286)||(23357734-23357895)
chr7 (123-248)||(34546376-34546501)
chr7 (122-251)||(37631601-37631730)
chr7 (156-278)||(29835735-29835858)
chr7 (151-285)||(22739851-22739985)
chr7 (156-278)||(4100557-4100678)
chr7 (156-255)||(36437409-36437507)
chr7 (124-257)||(18469993-18470126)
chr7 (174-257)||(20116940-20117022)
chr7 (168-286)||(18220695-18220812)
chr7 (125-310)||(4087626-4087808)
chr7 (199-262)||(47118037-47118100)
chr7 (126-310)||(19434495-19434680)
chr7 (126-193)||(22973600-22973667)
chr7 (156-234)||(3021923-3022000)
chr7 (114-321)||(34556881-34557086)
chr7 (156-255)||(18220495-18220592)
chr7 (124-310)||(38128291-38128479)
chr7 (186-266)||(13556474-13556553)
chr7 (168-216)||(18220625-18220673)
chr7 (127-163)||(48256749-48256785)
chr7 (124-179)||(47118095-47118150)
chr7 (119-230)||(30924069-30924182)
chr7 (121-255)||(45842827-45842962)
[»] scaffold0524 (1 HSPs)
scaffold0524 (124-286)||(825-987)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (124-309)||(14896-15082)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (118-286)||(116198-116366)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (125-310)||(6109-6295)
[»] scaffold1152 (1 HSPs)
scaffold1152 (121-278)||(675-832)
[»] scaffold0045 (2 HSPs)
scaffold0045 (124-284)||(50548-50708)
scaffold0045 (150-308)||(53358-53506)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (123-309)||(68290-68477)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (122-310)||(53684-53873)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (123-310)||(146905-147092)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (124-310)||(25719-25905)
[»] scaffold0263 (1 HSPs)
scaffold0263 (156-309)||(19585-19739)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (157-309)||(40952-41105)
[»] scaffold0050 (2 HSPs)
scaffold0050 (151-310)||(69253-69412)
scaffold0050 (124-283)||(33709-33866)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (185-309)||(10771-10896)
[»] scaffold0325 (1 HSPs)
scaffold0325 (161-279)||(17502-17619)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (151-248)||(7959-8056)
[»] scaffold0549 (2 HSPs)
scaffold0549 (151-248)||(7315-7412)
scaffold0549 (260-311)||(7405-7457)
[»] scaffold1266 (1 HSPs)
scaffold1266 (122-282)||(291-450)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (127-279)||(95616-95767)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (120-248)||(11032-11158)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (189-309)||(233918-234039)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (124-257)||(74526-74659)
[»] scaffold0533 (1 HSPs)
scaffold0533 (156-221)||(5071-5136)
[»] scaffold1128 (1 HSPs)
scaffold1128 (168-215)||(1415-1462)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (152-280)||(66426-66555)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (126-310)||(508986-509173)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 146; Significance: 8e-77; HSPs: 34)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 123 - 311
Target Start/End: Original strand, 13661807 - 13661996
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13661807 agggaaatgctaaccggtgcccccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 13661906  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggacccta 311  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  13661907 aaagtcagaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaggacccta 13661996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 123 - 310
Target Start/End: Original strand, 35132521 - 35132708
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  35132521 agggaaatgctaaccggtgcccccgggacactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataat 35132620  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||    
T  35132621 aaagtcaaaaacagttttc-tttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccaatgccccgggggcaccggttagcaggaccct 35132708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 124 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 34651018 - 34650830
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34651018 gggaaatgctaaccggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 34650920  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccctaa 312  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  34650919 atgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggaccctaa 34650830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 124 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 35504426 - 35504240
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35504426 gggaaatgctaaccggtgcccccgggacactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 35504327  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    | |||||||||||||  ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  35504326 atgtcaaaaacagttcccttttatggcaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgtccgggggcaccggttagcaggaccct 35504240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 124 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11958153 - 11957966
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11958153 gggaaatgctaaccggtgcccccggggcacaggttaaagatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcaatgaaattgtgtaattaattgataata 11958054  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  11958053 aagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggcatgcttaaccagtgccccaggggcaccggttagcaggaccct 11957966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 124 - 286
Target Start/End: Original strand, 6283562 - 6283724
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6283562 gggaaatgctaaccggtgcctccggggcactagttaaagatatgaaaaagaaaattatataataattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 6283661  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 286  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  6283662 aagtcaaaaacaattttcttttatggtaataattcatttttatggtatgcttaaccagtgccc 6283724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 124 - 286
Target Start/End: Original strand, 12506296 - 12506458
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12506296 gggaaatgctaaccggtgcctctggagcactcgttaagagtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 12506395  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 286  Q
    | |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12506396 atgtcaaaaacagtttccttttatagtaataattctcttttatggaatgcttaaccagtgccc 12506458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 123 - 310
Target Start/End: Original strand, 8787338 - 8787526
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  || | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8787338 agggaaatgctaaccggtgtccccggggcattggttaagggtatgaaaaatgaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 8787437  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  8787438 aatatcaaaaacagtttccttttatgataataattccattttatggtatgcttaacctgtgccccgggggcaccggttagcaggaccct 8787526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 125 - 284
Target Start/End: Original strand, 20175228 - 20175387
Alignment:
Q  125 ggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataa 224  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20175228 ggaaatgctaaccggtgtctccgagacactggttaaaaatataaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataa 20175327  T
Q  225 agtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgc 284  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||    
T  20175328 agtcaaaaacaattttcttttatgataataattcccttttataatatgcttaactagtgc 20175387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 122 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 40564590 - 40564403
Alignment:
Q  122 tagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 221  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40564590 tagggaaatgctaaccggtg--tccgggacatcgattaaggatttgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 40564493  T
Q  222 taaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccgga-agcaccggttagcaggaccct 310  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |  ||||||||||||||||||||    
T  40564492 taaagtcaaaaacaatttttttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccaataccccaagggcaccggttagcaggaccct 40564403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 156 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 21547548 - 21547394
Alignment:
Q  156 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 255  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||    
T  21547548 gttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttcattttaagttaataa 21547449  T
Q  256 ttctcttttatggtatgcttaaccagt-gcccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||    
T  21547448 ttctcatttatggtatgcttaaccagtaccccggagacaccggttagcaggaccc 21547394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 123 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 10054539 - 10054353
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10054539 agggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatataataattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 10054440  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    || ||| |||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||| ||| |||||  | |||||||||||||||||    
T  10054439 aatgtc-aaaacagtttccttttatggtaataattcctttttatggtatgtttaacccgtgccccgggggtaccggttagcaggaccc 10054353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 127 - 286
Target Start/End: Original strand, 11846075 - 11846234
Alignment:
Q  127 aaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaag 226  Q
    ||||||||| ||||| | |||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11846075 aaatgctaagcggtgtccccgggacactagctaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataataaag 11846174  T
Q  227 tcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 286  Q
    ||||||  ||||| |||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  11846175 tcaaaagtagtttccttttatggtaataaatcccttttatagtatgcttaaccagtgccc 11846234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 156 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 9721761 - 9721640
Alignment:
Q  156 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 255  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9721761 gttaagaatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtttaattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 9721662  T
Q  256 ttctcttttatggtatgcttaa 277  Q
    ||| ||||||||||||| ||||    
T  9721661 ttcccttttatggtatgtttaa 9721640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 123 - 282
Target Start/End: Original strand, 31909631 - 31909784
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  31909631 agggaaatgttaaccggtgcctccggat-actggttaaggatattaaaagggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattgatttataat 31909729  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagt 282  Q
    ||||||||||||||||| |     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31909730 aaagtcaaaaacagtttcc-----tgataataattttcttttatggtatgcttaaccagt 31909784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 124 - 248
Target Start/End: Original strand, 10069969 - 10070092
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10069969 gggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaa-tgataata 10070067  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatg 248  Q
    ||||||||||||||||  |||||||    
T  10070068 aagtcaaaaacagtttctttttatg 10070092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 123 - 256
Target Start/End: Original strand, 13470150 - 13470283
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||  |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  13470150 agggaaatgctaaccggtgcctatggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaataatatagtagtcaatgcattgaaattgtataattaatttataat 13470249  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataat 256  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  13470250 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataat 13470283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 127 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 19647841 - 19647720
Alignment:
Q  127 aaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaag 226  Q
    ||||||||||||||  ||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19647841 aaatgctaaccggtatctccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaattgataataaag 19647742  T
Q  227 tcaaaaacagttttcttttatg 248  Q
    ||| ||||||||| ||||||||    
T  19647741 tcataaacagtttccttttatg 19647720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 157 - 309
Target Start/End: Original strand, 40057340 - 40057493
Alignment:
Q  157 ttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataat 256  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||| |    
T  40057340 ttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttagtgcattgaaatagtataattaatttataataaaatcaaaagcagttttcttttatagtaatatt 40057439  T
Q  257 tctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    || |||||||| | || |||||||||| ||  || |||||||||||||||||||    
T  40057440 tcccttttatgatgtgtttaaccagtgacctcgaggcaccggttagcaggaccc 40057493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 127 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19437019 - 19436865
Alignment:
Q  127 aaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaag 226  Q
    ||||| |||||| || ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  19437019 aaatgttaaccgatgtctctgggacactcgttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtggttaaagcattgaaattgtataattaatttat-ataaag 19436921  T
Q  227 tcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg 283  Q
    | ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  19436920 ttaaaaatagtttt-ttttatggtaataattctcttttatggtatgtttcaccagtg 19436865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 121 - 310
Target Start/End: Original strand, 10955948 - 10956138
Alignment:
Q  121 ttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaaga-aattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgat 219  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||  |||| |||||| |||  | |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  10955948 ttagggaaatgctaactgttgcctccggggcactggttaagcataccataaaagggaattataaagtagttaatgcattgaaattgt-taattaatttat 10956046  T
Q  220 aataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaa-gcaccggttagcaggaccct 310  Q
    || ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||| ||||||    
T  10956047 aacaaagtcaaaaacaatttccttttatggtaataatttccttttatgatatgcttaaccagtaccccgaatgtaccggttagcaagaccct 10956138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 150 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 39067096 - 39066973
Alignment:
Q  150 acactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagt-agttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatg 248  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  39067096 acactggttaaggatatgaaaaaagaaattatataattagttaatatattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaacaatatccttttatg 39066997  T
Q  249 ataataattctcttttatggtatg 272  Q
     |||||||||||||||||| ||||    
T  39066996 gtaataattctcttttatgttatg 39066973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 125 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 2619742 - 2619635
Alignment:
Q  125 ggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataa 224  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2619742 ggaaatgctaactggtgtctccgggacacttgttaaggatatgaaaaagaaaattatttagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataa 2619643  T
Q  225 agtcaaaa 232  Q
    ||| ||||    
T  2619642 agttaaaa 2619635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 123 - 236
Target Start/End: Original strand, 4837257 - 4837369
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||  |||  |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4837257 agggaaatgttaaccggtgcc-ccggggcaccggttaagaatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 4837355  T
Q  223 aaagtcaaaaacag 236  Q
    ||||||||| ||||    
T  4837356 aaagtcaaatacag 4837369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 117 - 273
Target Start/End: Original strand, 39069374 - 39069527
Alignment:
Q  117 aattttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatt 216  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |  |||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  39069374 aatttaagggaaatgctaaccggtgcttccagggcactggttaagggtatgaaaag-gaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattatat 39069472  T
Q  217 gataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgc 273  Q
     |||||   || ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  39069473 aataat--tgtgaaaaacaatttccttttatggtaataattctcttttatgatatgc 39069527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 182 - 279
Target Start/End: Original strand, 4268620 - 4268716
Alignment:
Q  182 atagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaacc 279  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  4268620 atagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataaaaaa-taaaaaacagtttccttttatggtaataattttcttttttggtatgcttaacc 4268716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 221
Target Start/End: Original strand, 6284821 - 6284892
Alignment:
Q  150 acactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 221  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  6284821 acactggttaaggatactaaaaaggaaattatatagtaattaatgtattgaaattgtataattaatttataa 6284892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21945048 - 21944954
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaag-aaattatatagtagttaatgcatt-gaaattgtgtaattaat 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||  ||||| | |||||||||| || ||| ||||||  ||||||| ||||||||    
T  21945048 agggaaatgctaaccggtgcctccggggcactggttaaggataataaaaaggaaaattatatattaattattgcattaaaaattgtttaattaat 21944954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 124 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 40608722 - 40608619
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggat-atgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattg-aaattgtgtaattaattgataa 221  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||| || ||||  ||||||||||  || ||| ||||||| ||||||| ||||||||  ||||    
T  40608722 gggaaatgctaaccggtgctcccgggacactggttaaggataataaaaagggaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatccataa 40608623  T
Q  222 taaa 225  Q
    ||||    
T  40608622 taaa 40608619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 310
Target Start/End: Original strand, 10070086 - 10070136
Alignment:
Q  261 ttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||    
T  10070086 ttttatggtatgcttaaccaatgtcccaggagcaccggttagcaggaccct 10070136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 10956009 - 10955975
Alignment:
Q  252 ataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 286  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10956009 ataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccc 10955975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 272
Target Start/End: Original strand, 22973739 - 22973832
Alignment:
Q  178 ttatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatg 272  Q
    ||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||| || | |||||  |||| ||||| ||||||||||||||| | || ||| |||||||    
T  22973739 ttatatagtaactaatgaattaaaattgtgtaattaatttatca-aaagtataaaagagtttccttttatgataataaatttcatttttggtatg 22973832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 6042207 - 6042142
Alignment:
Q  151 cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattg-aaattgtgtaattaat 215  Q
    |||| ||||| ||||  |||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  6042207 cactggttaaagatactaaaaaaaaaattatatagtaattattgcattgaaaattgtgtaattaat 6042142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 5302422 - 5302374
Alignment:
Q  168 aaaaaagaaattatatagtagttaatgcattg-aaattgtgtaattaat 215  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  5302422 aaaaaagaaattatataatagttattgtattgaaaattgtgtaattaat 5302374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 56)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 123 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 27988686 - 27988498
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27988686 agggaaatgctaaccggtgcctccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 27988587  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggttagcaggacccta 311  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  27988586 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgcccgggggcaccggttagcaggacccta 27988498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 123 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 28045988 - 28045800
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28045988 agggaaatgctaaccggtgcctccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 28045889  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggttagcaggacccta 311  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  28045888 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgcccgggggcaccggttagcaggacccta 28045800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 123 - 309
Target Start/End: Original strand, 11112638 - 11112825
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11112638 agggaaatgctaactggtgcatccgggacactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 11112737  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc-ggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||  |||| ||||||||||||||    
T  11112738 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattcacttttatggtatgcttaacctgtgccctgggggcactggttagcaggaccc 11112825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 124 - 309
Target Start/End: Original strand, 34228682 - 34228868
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    |||||||||||||||||||| | ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34228682 gggaaatgctaaccggtgccccgggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 34228781  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  34228782 aagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggaccc 34228868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 123 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 4537931 - 4537743
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4537931 agggaaatgctaaccggtgcctccggggcactggttaaggatataaaataggaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaattgataat 4537832  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  4537831 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacctgtgccccagaggcaccggttagcaggaccct 4537743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 123 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 33357316 - 33357153
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33357316 agggaaatgctaactggtgcccccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 33357217  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 286  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33357216 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaactagtgccc 33357153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 123 - 312
Target Start/End: Original strand, 168465 - 168655
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  168465 agggaaatgctaaccggtgcctccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 168564  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccctaa 312  Q
    || |||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  168565 aatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattccattttatggtatgcttaaccaatgccccgggggcaccggttagcaggaccctaa 168655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 123 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 9063238 - 9063051
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  9063238 agggaaatgctaaccggtgtc-ccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaatcgtgcaattaatttataat 9063140  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9063139 aaagtcaaaaacaattttcttttatggtaataattcccttttgtgatatgcttaaccagtgccccggaagcaccggttagcaggaccct 9063051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 125 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 16888728 - 16888544
Alignment:
Q  125 ggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataa 224  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16888728 ggaaatgctaaccggtgcccccggg-cacaggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataa 16888630  T
Q  225 agtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||    
T  16888629 agtcaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttgtggtatgcttaaccaatgccccgggggcaccggttagcaggaccc 16888544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 121 - 302
Target Start/End: Original strand, 36730442 - 36730622
Alignment:
Q  121 ttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgata 220  Q
    |||||| ||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36730442 ttaggggaatgctaactggtgccccagga-cactagttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttata 36730540  T
Q  221 ataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggttagc 302  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |  ||||||||||||    
T  36730541 ataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatagtatgcttaacctgtgccccgtggcaccggttagc 36730622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 124 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 16394247 - 16394061
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16394247 gggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggatgtgaaaaagaaaattatataatagttaatgcattgaaataatgtaattaattgataata 16394148  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||    
T  16394147 aagtcaaaaacagtttccttttatgctaataattctcttttatggtatgcttaaccaatgccccgggggcaccggttagcaggaccc 16394061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 126 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 20831737 - 20831553
Alignment:
Q  126 gaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaa 225  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  20831737 gaaatgctaaccggtgcccccgggacactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaatagtataattaatttataataaa 20831638  T
Q  226 gtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg--cccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| | ||||||||||||||||||    
T  20831637 gtcaaaagcagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaatcagtgctcccggga-caccggttagcaggaccc 20831553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 124 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 30675758 - 30675574
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30675758 gggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 30675659  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggacc 308  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||    
T  30675658 atgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtgccccggggacaccggttagcaggacc 30675574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 124 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 2805446 - 2805258
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  2805446 gggaaatgttaaccagtgcccccgggacactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaacctataata 2805347  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggacccta 311  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  2805346 aagtcaaaagcagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccggaggcaccggttagccggacccta 2805258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 121 - 309
Target Start/End: Original strand, 43119214 - 43119402
Alignment:
Q  121 ttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgata 220  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||  ||||  |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  43119214 ttagggaaatgctaaccggtgccctcggggcactgattaaagatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttata 43119313  T
Q  221 ataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || || |  |||||||||||||||||||    
T  43119314 ataaagtcaaaaacagttttcttttatggtgataattctcttttatggtatgcttaaccaatggcccggggcaccggttagcaggaccc 43119402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 124 - 279
Target Start/End: Original strand, 37373206 - 37373360
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37373206 gggaaatgctaaccggtgcccccgga-cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 37373304  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaacc 279  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  37373305 aagtcgaaaacagttttcttttatggtaataattccctttcatggtatgcttaacc 37373360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 157 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 7304671 - 7304518
Alignment:
Q  157 ttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataat 256  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  7304671 ttaaggatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatgaaaataat 7304572  T
Q  257 tctcttttatggtatgcttaaccagtgc-ccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||    
T  7304571 tctcttttatggtatgcttaaccagtgctccgggggcaccggttagtaggaccc 7304518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 127 - 310
Target Start/End: Original strand, 13643015 - 13643198
Alignment:
Q  127 aaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaag 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  13643015 aaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggatacgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaag 13643114  T
Q  227 tcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc-ggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    ||||||| |  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  13643115 tcaaaaa-aaattccttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccctaggagcaccggttagcaggaccct 13643198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 127 - 310
Target Start/End: Original strand, 13743440 - 13743623
Alignment:
Q  127 aaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaag 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  13743440 aaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggatacgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaag 13743539  T
Q  227 tcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc-ggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    ||||||| |  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  13743540 tcaaaaa-aaattccttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccctaggagcaccggttagcaggaccct 13743623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 114 - 286
Target Start/End: Original strand, 16785077 - 16785248
Alignment:
Q  114 ataaattttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaatta 213  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  16785077 ataattttaagggaaatgctaaccggtgc-tccagggcactggttaaggatatgaaaaaagaaattatatagcagttaatgtattgaaattgtgtaatta 16785175  T
Q  214 attgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 286  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  16785176 atttataataaagtcaaaaacagtttccttttataataataattctcttttatggtatgattaacccgtgccc 16785248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 127 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 29444323 - 29444139
Alignment:
Q  127 aaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaag 226  Q
    ||||| ||||||||||  ||||  ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29444323 aaatgttaaccggtgctcccggggcactgattaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaacgcattgaaattgtgtaattaatttataataaag 29444224  T
Q  227 tcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  29444223 tcaaaaacagttttcttttatggtaataattcccttttatggtatgtttaaccagtgtcccggaggcaccgattaacaggaccct 29444139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 122 - 283
Target Start/End: Original strand, 12203853 - 12204013
Alignment:
Q  122 tagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 221  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||   ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12203853 tagggaaatgctaaccggtgcccccgggt-accggttaagggtatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 12203951  T
Q  222 taaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg 283  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  12203952 taatgtcaaaaacagtttccttttatgataataattcccttttatggtatgctgaaccagtg 12204013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 122 - 283
Target Start/End: Original strand, 12448281 - 12448441
Alignment:
Q  122 tagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 221  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||   ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12448281 tagggaaatgctaaccggtgcccccgggt-accggttaagggtatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 12448379  T
Q  222 taaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg 283  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  12448380 taatgtcaaaaacagtttccttttatgataataattcccttttatggtatgctgaaccagtg 12448441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 155 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 16890635 - 16890482
Alignment:
Q  155 agttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataata 254  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  16890635 agttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaata 16890536  T
Q  255 attctcttttatggtatgcttaaccagtgcc-cggaagcaccggttagcaggac 307  Q
    ||||  ||||||||||||||||||| ||||| | |  |||||||||||||||||    
T  16890535 attcctttttatggtatgcttaaccggtgcctccggggcaccggttagcaggac 16890482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 119 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3930423 - 3930232
Alignment:
Q  119 ttttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattga 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3930423 ttttagggaaatgctaatcggtgcccccggg-cactagttaataatatgaaagaggaaattatatagtagttaatgcattgaagttgtgtaattaattga 3930325  T
Q  219 taataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | |||| || |||||||||||||    
T  3930324 taataaagtcaaaaacagtttccttttttgataataatttccttttatgatatgcttaaccagtgccccaggagcatcgattagcaggaccct 3930232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 156 - 306
Target Start/End: Original strand, 28626800 - 28626950
Alignment:
Q  156 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 255  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  28626800 gttaaggatgtgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtgattaatttataataaagtcaaaaacagtttctttttatgataataa 28626899  T
Q  256 ttctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggttagcagga 306  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  28626900 ttcccttttatggtatgcttaatcagtgtccgggagcaccggttagcagga 28626950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 137 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 42035154 - 42034980
Alignment:
Q  137 cggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacag 236  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  42035154 cggtgcccccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaa 42035055  T
Q  237 ttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| ||  ||||||||||| |||||||    
T  42035054 ttttcttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacacgtgccccagagacaccggttagcgggaccct 42034980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 124 - 310
Target Start/End: Original strand, 32113908 - 32114096
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||  | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  32113908 gggagatgctaaccggtgtctccggagtattggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtttaattaatttataata 32114007  T
Q  224 aagtcaaaaacagttt-tcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgc-ccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||    
T  32114008 aagtaaaaaacagtttcccttttatgataataattcccttttatagtatgtttaaccagtgctccagagccaccggttagcaggaccct 32114096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 125 - 283
Target Start/End: Original strand, 21595848 - 21596005
Alignment:
Q  125 ggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataa 224  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21595848 ggaaatgctaaccggtgcccccggg-cactggttaagggtatgaaaaaggaaattatataggagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataa 21595946  T
Q  225 agtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg 283  Q
     |||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21595947 tgtcaaaaacagtttccttttatggtattaattcccttttatggtatgcttaaccagtg 21596005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 151 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 9254060 - 9253907
Alignment:
Q  151 cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgat 250  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |    
T  9254060 cactggttaaggatatgaaaaatgaaattttatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaat-gataataaagtcaaaaacagtttccttttatagt 9253962  T
Q  251 aataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcag 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |  ||||||||||||||    
T  9253961 aataattctcttttatggtatgcttaaccaatgtcccaggggcaccggttagcag 9253907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 123 - 310
Target Start/End: Original strand, 4648194 - 4648381
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  4648194 agggaaatgctaaccggtgtc-ccggggcactgattaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataat 4648292  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagt-gcccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    || ||||||||||||||  ||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |  || |||||||||||||| ||||||    
T  4648293 aatgtcaaaaacagtttcttttgatggtaataattcccttttatgatatgcttaaccagtatcttgggagcaccggttagcatgaccct 4648381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 9537978 - 9537824
Alignment:
Q  156 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 255  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||  ||||||  ||||||    
T  9537978 gttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataataaattcaaaaggagtttctttttatagtaataa 9537879  T
Q  256 ttctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  9537878 tttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccggagacaccggttagcaggaccc 9537824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 124 - 309
Target Start/End: Original strand, 29235235 - 29235421
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    ||||||||||||||||||   ||||| || |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  29235235 gggaaatgctaaccggtgttcccggagcattgattaaggatataaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattaaatttgtgtaattaatttataata 29235334  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    || ||||||| || || |||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||    
T  29235335 aaatcaaaaataggttccttttatgataataatttccttttataggatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcatgaccc 29235421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 123 - 309
Target Start/End: Original strand, 40831280 - 40831463
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  40831280 agggaaatgctaaccagtgcc--cgg--cactggttaaagatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataat 40831375  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc-ggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||| | || ||| |||  ||||||||||||||||||    
T  40831376 aaagtcaaaaacaattttcttttatggtaataattttcttttatagtatgcataatctgtaccctggagacaccggttagcaggaccc 40831463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 127 - 258
Target Start/End: Original strand, 17467606 - 17467737
Alignment:
Q  127 aaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaag 226  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17467606 aaatgctaaccggtacccccgaaacactagttaatgatatgaaaaaggaaattatgcagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaaa 17467705  T
Q  227 tcaaaaacagttttcttttatgataataattc 258  Q
    ||||||||| ||| ||||||  ||||||||||    
T  17467706 tcaaaaacaatttccttttactataataattc 17467737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 196 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 24843393 - 24843280
Alignment:
Q  196 attgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcacc 295  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||| ||||||    
T  24843393 attgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaatcagtttccttttatgacaataattctcttttatggtatgcttaatcagtattcgggagcacc 24843294  T
Q  296 ggttagcaggaccc 309  Q
    ||||||||||||||    
T  24843293 ggttagcaggaccc 24843280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 187 - 307
Target Start/End: Original strand, 39406905 - 39407024
Alignment:
Q  187 agttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 286  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  39406905 agttaatgcgttaaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatgataataattcccttttatggtatgtttaactagtgccc 39407004  T
Q  287 ggaagcaccggttagcaggac 307  Q
     |  |||||||||||||||||    
T  39407005 cg-ggcaccggttagcaggac 39407024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 123 - 229
Target Start/End: Original strand, 9278211 - 9278317
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9278211 agggaaatgctaactggtgcctcagggacactcgttaaagatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 9278310  T
Q  223 aaagtca 229  Q
    |||||||    
T  9278311 aaagtca 9278317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 168 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 42433685 - 42433550
Alignment:
Q  168 aaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatg 267  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||    
T  42433685 aaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa-aaagtcaaaaacagttttcttttatggtaataatttccttttttg 42433587  T
Q  268 gtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagca 303  Q
    |||| ||| |   ||| |||||| |||||||||||||    
T  42433586 gtatacttcatttgtgccccggaggcaccggttagca 42433550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 156 - 267
Target Start/End: Original strand, 10870384 - 10870495
Alignment:
Q  156 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 255  Q
    ||||| ||||| |||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  10870384 gttaatgatataaaaaagaaaattatataatagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataataaaatcaaaaacagtttccttttatggtaataa 10870483  T
Q  256 ttctcttttatg 267  Q
    ||| ||||||||    
T  10870484 ttcccttttatg 10870495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 127 - 229
Target Start/End: Original strand, 10618021 - 10618123
Alignment:
Q  127 aaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaag 226  Q
    |||||||||||||||||||  |  |||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  10618021 aaatgctaaccggtgcctctagggcacaggttaaggatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcaattaaattgtgtaattaattgataataaag 10618120  T
Q  227 tca 229  Q
    |||    
T  10618121 tca 10618123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 158 - 248
Target Start/End: Original strand, 34192809 - 34192899
Alignment:
Q  158 taaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatg 248  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  34192809 taagaatatgaaaaaggaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaataattttattttatg 34192899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 124 - 201
Target Start/End: Original strand, 12652630 - 12652707
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaa 201  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12652630 gggaaatgctaaccggtgcccctggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaa 12652707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 168 - 310
Target Start/End: Original strand, 22956749 - 22956893
Alignment:
Q  168 aaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataatt--ctctttta 265  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||  || |||||    
T  22956749 aaaaaaggaatcatatggtagttaatacattaaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaaaaattccctttttta 22956848  T
Q  266 tggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    ||||||| ||||  |||||||| |  ||||||||| |||||||||    
T  22956849 tggtatgtttaataagtgcccgaagacaccggttaacaggaccct 22956893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 175 - 257
Target Start/End: Original strand, 22451835 - 22451916
Alignment:
Q  175 aaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataatt 257  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||||    
T  22451835 aaattatatagcagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa-aaagtcaaaaatagcttccttttatggtaataatt 22451916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 178 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 30933453 - 30933376
Alignment:
Q  178 ttatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataat 256  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  30933453 ttatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa-aaagttaaaaacatttttcttttacgataataat 30933376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 218 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 14191102 - 14191035
Alignment:
Q  218 ataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcc 285  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  14191102 ataataaaatcaaaaacagttttattttatgataataattctcttttatagtatttttaaccagtgcc 14191035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 42655464 - 42655276
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggat-atgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattg-aaattgtgtaattaattgata 220  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||   |||||||||  || ||| ||||||| ||||||| ||||||||  |||    
T  42655464 agggaaatgctaagtggtgcctccggagcacttgttaaggataatgaaaaggtaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatccata 42655365  T
Q  221 ataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    |  ||||||| || |  ||  |||||| |||| ||||  ||||| | |||||||||||| |||||| |  ||||||||||||| ||||||    
T  42655364 aataagtcaacaa-aacttcattttataataagaatttcctttttttgtatgcttaaccggtgccctggggcaccggttagcatgaccct 42655276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 196 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 36057967 - 36057904
Alignment:
Q  196 attgaaattgtgtaattaattgataataa--agtcaaaaacagttttcttttatgataataatt 257  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36057967 attgaaattgtataattaatttataaaaagtagtcaaaaaaagttttcttttatgataataatt 36057904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 36923869 - 36923782
Alignment:
Q  104 aatgttgtggataaattttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagtta 191  Q
    |||| |||| ||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||   ||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  36923869 aatgatgtgaataaagtttggggaaatactaaccgctgcctccgaggcactgattaaggatatgaaaaaggaaattatataatagtta 36923782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 39751658 - 39751496
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaag-aaattatatagtagttaatgcatt-gaaattgtgtaattaattgataa 221  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||  ||||| | |||||||||| || ||| ||||||  ||||||| ||||||||  ||||    
T  39751658 gggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggataataaaaaggaaaattatatattatttattgcattaaaaattgtttaattaatctataa 39751559  T
Q  222 taaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcc 285  Q
      ||||||| || |  || |||||||| ||| ||||  ||||| | ||||||||||||||||||    
T  39751558 ataagtcaacaa-aacttccttttatggtaagaatttcctttttttgtatgcttaaccagtgcc 39751496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 33124648 - 33124570
Alignment:
Q  156 gttaaggata-tgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattg-aaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaa 233  Q
    |||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  33124648 gttaaggatacttaaaaaggaagttatatagtagttattgcattgaaaattgtgtaatcaatttataa-aaagtcaaaaa 33124570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 315
Target Start/End: Original strand, 35695620 - 35695694
Alignment:
Q  242 ttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgc-ccggaagcaccggttagcaggaccctaaatt 315  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||| ||| |||||  ||||||| ||||||| ||||||||    
T  35695620 ttttatgataataattttcttttatgatatctttaaccaatgctccggagacaccggtcagcaggatcctaaatt 35695694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 2270703 - 2270658
Alignment:
Q  132 ctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaa 177  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||    
T  2270703 ctaaccggtgcctccggagcactcgttaagcatataaaaaaagaaa 2270658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 20822446 - 20822397
Alignment:
Q  273 cttaaccagtgcccggaagcaccggttagcaggaccctaaattttaattt 322  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  20822446 cttaaccagtgccccggagcaccggttaataggaccctaaatttttattt 20822397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 221
Target Start/End: Original strand, 4811556 - 4811656
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaa-ttatatagtagttaatgcattg-aaattgtgtaattaattgata 220  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |  |||  |||||| |||  |||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  4811556 agggaaatgctaatcggtgcctcaagggcaccggttaagaatactaaaaaagaaaattatatagtaattattgcattgaaaattgtataattaattcata 4811655  T
Q  221 a 221  Q
    |    
T  4811656 a 4811656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 58)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 123 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 40362767 - 40362579
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40362767 agggaaatgctaacccgtgcctccggggcactgattaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaattgataat 40362668  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||| |||||||||||||    
T  40362667 aaagtcaaaaacagttttcttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggtaccgattagcaggaccct 40362579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 123 - 309
Target Start/End: Original strand, 46352633 - 46352820
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46352633 agggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatacagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 46352732  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  46352733 aaagtcagaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaggaccc 46352820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 123 - 310
Target Start/End: Original strand, 52520680 - 52520868
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52520680 agggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 52520779  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    || |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  52520780 aatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattctattttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggaccct 52520868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 124 - 310
Target Start/End: Original strand, 4168183 - 4168370
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4168183 gggaaatgctaaccggtgcctccggggaactggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataata 4168282  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagt-gcccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||  ||||||||||||||||||||    
T  4168283 aagtcaaaaacagttttcttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaacccgtaccccgggggcaccggttagcaggaccct 4168370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 124 - 310
Target Start/End: Original strand, 48725271 - 48725458
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    |||||||||||||||||||| | ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48725271 gggaaatgctaaccggtgccccgggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 48725370  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||    
T  48725371 aagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggaccacgggttagcaggaccct 48725458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 121 - 309
Target Start/End: Original strand, 272217 - 272406
Alignment:
Q  121 ttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgata 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  272217 ttagggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttata 272316  T
Q  221 ataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  272317 ataaagtcaaaaatagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaatcggtgccccgggggcaccggttagcaggaccc 272406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 123 - 311
Target Start/End: Original strand, 858588 - 858777
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    |||||||||| |||||||||| || |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  858588 agggaaatgcaaaccggtgcccccagtgcactagttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 858687  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggacccta 311  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||| ||||||||    
T  858688 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataatttccttttatggtatgcttaacccgtgccccgggggcaccggttagccggacccta 858777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 124 - 310
Target Start/End: Original strand, 43786871 - 43787058
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43786871 gggaaatgctaaccggtgcctccggggcactggttaatggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 43786970  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    |  ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  43786971 atatcaaaaacagtttccttttatggtaataattctattttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggaccct 43787058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 122 - 309
Target Start/End: Original strand, 49893329 - 49893517
Alignment:
Q  122 tagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 221  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  49893329 tagggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatctataa 49893428  T
Q  222 taaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||||    
T  49893429 taaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaatcagtgccccgggggcaccggttagccggaccc 49893517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 124 - 310
Target Start/End: Original strand, 39074419 - 39074605
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39074419 gggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 39074518  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    | ||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  39074519 atgtc-aaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccaggggcaccggttagcaggaccct 39074605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 128 - 309
Target Start/End: Original strand, 7468417 - 7468595
Alignment:
Q  128 aatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagt 227  Q
    ||||||||||||  || |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  7468417 aatgctaaccgg--cccccgggacactggttaaggaaatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaagt 7468514  T
Q  228 caaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  7468515 caaaagcagttttcttttatgataataa-tcccttttatggtatgcttaatcagtgccccggagcaccggttagcaggaccc 7468595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 120 - 304
Target Start/End: Original strand, 41304001 - 41304184
Alignment:
Q  120 tttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  41304001 tttagggaaatgctaaccggtgcctccggggcagtggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaat--tgtaattaattgat 41304098  T
Q  220 aataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcag 304  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||    
T  41304099 aataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataatttccttttatggtatgcttaaccaatgccccggagacaccggttagcag 41304184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 124 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 10617469 - 10617279
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  10617469 gggaaatgttaaccggtgcccccgga-cactgattaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataata 10617371  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccctaaat 314  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  10617370 aagtcaaaaacaatttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccgggggcaccggttagcaggacccaaaat 10617279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 126 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 43269923 - 43269732
Alignment:
Q  126 gaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaa 225  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  43269923 gaaatgttaaccggtgccttcggagcactggttaaggatatgaaaagggaaattacatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaa 43269824  T
Q  226 gtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccctaaattt 316  Q
     ||||| ||||||| |||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  43269823 atcaaacacagtttccttttatagtaataattatcctttatggtatgcttaaccagtgccccggaggcaccggttagcaggaccctatattt 43269732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 124 - 306
Target Start/End: Original strand, 20923992 - 20924173
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20923992 gggaaatgctaaccggtgcttccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaattcattgaaattgtgtaattaatttataata 20924091  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggttagcagga 306  Q
    |  ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  20924092 atatcaaaaacagtttccttttaaggtaataattctcttttatggtatacttaaccagtgtcctg-agcaccggttagcagga 20924173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 122 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 41554127 - 41553964
Alignment:
Q  122 tagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 221  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41554127 taggaaaatgctaactggtgcc-ccggtgcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 41554029  T
Q  222 taaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 286  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  41554028 taaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattattttttatggtatgcttaacaagtgccc 41553964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 125 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 42964434 - 42964276
Alignment:
Q  125 ggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataa 224  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42964434 ggaaatgttaactggtgcttccggggcactggttaaggatatgaaaaatgaaattttatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataa 42964335  T
Q  225 agtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  42964334 agtcaaaaacagttttcttttatagtaataattcacttttatgatatgcttaaccagtg 42964276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 124 - 309
Target Start/End: Original strand, 52246582 - 52246768
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  52246582 gggaaatgctaactggtgcctccggggcactggttaaggatatgaaaaatgaaattatatagttgttaatgcattgaaattgtataattaatttataata 52246681  T
Q  224 aagtcaaaaac-agttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  52246682 aagtcaaaaacaattttttttttatagtaataatttccttttatggtatgcttaactagtgcccgagagcaccagttagcaggaccc 52246768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 151 - 303
Target Start/End: Original strand, 22248913 - 22249066
Alignment:
Q  151 cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgat 250  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22248913 cactagttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttattgtattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatggt 22249012  T
Q  251 aataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc-ggaagcaccggttagca 303  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| |||| | |||  ||||||||||||||||    
T  22249013 aataattcccttttatagtatgcttgaccaataccctagaagcaccggttagca 22249066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 124 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 53490012 - 53489848
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctcc--ggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 221  Q
    |||||||||||| ||||||| ||  ||  |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  53490012 gggaaatgctaatcggtgcccccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataa 53489913  T
Q  222 taaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 286  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  53489912 taatgtcaaaaacagtttccttttatgataataattctattttatggtatgcttaaccaatgccc 53489848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 123 - 310
Target Start/End: Original strand, 18014671 - 18014859
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||  ||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||    
T  18014671 agggaaatgctaactggtgcccccggggcactgattaaggatatgaaaaagtaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaaactataat 18014770  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||| ||||||| ||||||    
T  18014771 aaagttaaaaacagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaatcagtgccccgggggcaccagttagcaagaccct 18014859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 123 - 310
Target Start/End: Original strand, 13159896 - 13160083
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13159896 agggaaatgctaaccggtgctcctggggttctagttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatacattgaaattgtgtaattaattgataat 13159995  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||   ||||||||||||||||| ||||  ||   ||||||||||||||| |||||    
T  13159996 aaagtcaaaaacagttttctattacggtaataatttctttttatggtatgcttaatcagtatccacgagcaccggttagcagaaccct 13160083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 124 - 302
Target Start/End: Original strand, 28139309 - 28139488
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    ||||||||||||| |||||| ||   ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  28139309 gggaaatgctaactggtgcccccaagacactggttaaggatatgaaaaaagaaattaaatagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataata 28139408  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaag-caccggttagc 302  Q
    ||||||||| ||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| | |||| |||||||||||    
T  28139409 aagtcaaaagcagattccttttatggtaataattcccttttatggtatacttaaacagtgctctgaagacaccggttagc 28139488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 151 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 50359345 - 50359186
Alignment:
Q  151 cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgat 250  Q
    |||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  50359345 cactggttaaggttaagaaaaaaaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgggtaattaatatataataaagtcaaaaacagttttcttttgtggt 50359246  T
Q  251 aataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  50359245 aataattatcttctatggtatgcttaaccagtgtcccggaagcaccggttaaccggaccc 50359186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 124 - 286
Target Start/End: Original strand, 2505350 - 2505511
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| | ||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2505350 gggaaatgctaaccgctgc-tcctggacattggttaaagatatgaaaaaggaaattatatagtagttagtgcattgaaattgtgtaattaattcataata 2505448  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 286  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  2505449 aagtcaaaaatagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgtttaaccagtgccc 2505511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 123 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 11308397 - 11308209
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||  |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  11308397 agggaaatgctaaccggtgtttccgggacactgattaaggatgtgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaataatgtaattaattgataat 11308298  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggacccta 311  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |  |||||| ||||||||||||||    
T  11308297 aaaatcaaaaatagtttccttttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccaatgccccaggggcaccgattagcaggacccta 11308209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 124 - 286
Target Start/End: Original strand, 38852216 - 38852379
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagt---taatgcattgaaattgtgtaattaattgata 220  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||| ||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38852216 gggaaatgctaaccggtccc--cgggacattcgttaaggatataaaaaatgaaattatatagtagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttata 38852313  T
Q  221 ataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 286  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  38852314 ataaagtcaaaaacagttttattttatgataataattcacttttatggtatgtttaacccgtgccc 38852379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 130 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 50395742 - 50395562
Alignment:
Q  130 tgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtca 229  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  50395742 tgctaaccggtgcccccgggacactggttagggatatgaaaaagaaaattatacagtagttaatgcatagaaattgtgtaattaattgataataaagtc- 50395644  T
Q  230 aaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgc-ccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||| | |||||  ||||| |||||||||||||    
T  50395643 aaaacaatttccttttatggtaataattctcttttatgatatgattaatcagtacaccggagacaccgattagcaggaccct 50395562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 41993773 - 41993619
Alignment:
Q  156 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 255  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  41993773 gttaagtatattaaaaatgaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagttaaaaacagtttccttttat-ataataa 41993675  T
Q  256 ttctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaa-gcaccggttagcaggaccct 310  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||||||||| |||||    
T  41993674 ttctcttttatggtatgcttaactagtaccctaaaggcaccggttagcagaaccct 41993619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 157 - 284
Target Start/End: Original strand, 42548128 - 42548255
Alignment:
Q  157 ttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataat 256  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||  ||||||| |||||||    
T  42548128 ttaaagatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaataatttcattttatggtaataat 42548227  T
Q  257 tctcttttatggtatgcttaaccagtgc 284  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  42548228 tcccttttatggtatgcttaaccagtgc 42548255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 176 - 308
Target Start/End: Original strand, 33140937 - 33141070
Alignment:
Q  176 aattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgctt 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  33140937 aattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaagtcaaaagcagttttcttttatggtaataattcccttttatgatatgctt 33141036  T
Q  276 aaccagt-gcccggaagcaccggttagcaggacc 308  Q
    || ||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  33141037 aatcagtaccccggaagcaccggttagcaagacc 33141070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 181 - 309
Target Start/End: Original strand, 6842676 - 6842805
Alignment:
Q  181 tatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaacca 280  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  6842676 tataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccatttatggtatgcttaacca 6842775  T
Q  281 gtg-cccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    ||| |||||  ||| |||||||||||||||    
T  6842776 gtgccccgggggcagcggttagcaggaccc 6842805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 156 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 2938194 - 2938038
Alignment:
Q  156 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 255  Q
    ||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||    
T  2938194 gttaaagatataaaaaagaaaattatatagtagttaatgcactgaaattgtgtgattaatttataataaagtcaaaaacaatttcattttatggtaataa 2938095  T
Q  256 ttctcttttatggtatgcttaaccagtgcccgga-agcaccggttagcaggacccta 311  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  2938094 ttcacttttatggtatgcttaacgagtaccccgagggcaccggttagcaggacccta 2938038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Original strand, 24488393 - 24488551
Alignment:
Q  151 cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgat 250  Q
    |||| |||||| || | ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |    
T  24488393 cactggttaagaatgtaaaaaaggaaattatataatagttaatgcatggaaatagtgtaattaattgataataaaatcaaaaacagtttctttttatggt 24488492  T
Q  251 aataattctcttttatggtatgcttaaccagtgc-ccggaagcaccggttagcaggacc 308  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  24488493 aataattctcttttatgatatgctgaactagtgctccgggagcaccggttaacaggacc 24488551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 155 - 277
Target Start/End: Original strand, 29241668 - 29241790
Alignment:
Q  155 agttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataata 254  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  29241668 agttaaggatatgaaaatggaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaacagattctttttatgataata 29241767  T
Q  255 attctcttttatggtatgcttaa 277  Q
    ||||  |||||| ||||||||||    
T  29241768 attccgttttatagtatgcttaa 29241790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 157 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 49529422 - 49529269
Alignment:
Q  157 ttaaggatatgaaaaaagaaattatata---gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataat 253  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  49529422 ttaaggatatgaaaaagaaaattatatactagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaacattttccttttatggtaat 49529323  T
Q  254 aattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggttagcaggacc 308  Q
    ||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||    
T  49529322 aatttccttttatggtatgtttaaccagtg-ccgggggcaccggttagcaagacc 49529269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 175 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 50299080 - 50298973
Alignment:
Q  175 aaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgct 274  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  50299080 aaattatatagtagttaatgcactgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttctttttatgataataattcactcttatggtatact 50298981  T
Q  275 taaccagt 282  Q
    ||||||||    
T  50298980 taaccagt 50298973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 151 - 272
Target Start/End: Original strand, 2119458 - 2119577
Alignment:
Q  151 cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgat 250  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  2119458 cactggttaaagatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgagtaattaatttataataaagtcaaaaacaatttccttttatg-t 2119556  T
Q  251 aataattctcttttatggtatg 272  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  2119557 aataattc-cttttatggtatg 2119577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 162 - 300
Target Start/End: Original strand, 31514829 - 31514966
Alignment:
Q  162 gatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctct 261  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||  ||||||||  ||    
T  31514829 gatatgaaaaataaaattatatagtagttaatgtattaaaattgtgtaattaatttataataaaatcaaaaacaatttt-ttttatagtaataatttcct 31514927  T
Q  262 tttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggtta 300  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  31514928 tttatagtatacttaaccagtacccagaagtaccggtta 31514966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 174 - 248
Target Start/End: Original strand, 2362882 - 2362955
Alignment:
Q  174 gaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatg 248  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2362882 gaaattatata-tagttaatgcattgaaatagtgtaattaattgataataaaatcaaaaacagttttcttttatg 2362955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 199 - 309
Target Start/End: Original strand, 52552549 - 52552658
Alignment:
Q  199 gaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggt 298  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||   || ||||    
T  52552549 gaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacag-tatcttttatggtaataattctcttttatggtatatttaaccagtgtccggggacatcggt 52552647  T
Q  299 tagcaggaccc 309  Q
    ||||| |||||    
T  52552648 tagcatgaccc 52552658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 123 - 209
Target Start/End: Original strand, 52718167 - 52718252
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgta 209  Q
    |||||||| |||| ||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  52718167 agggaaatactaatcggtgctcccgga-cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatacattaaaattgtgta 52718252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 157 - 296
Target Start/End: Original strand, 53054834 - 53054975
Alignment:
Q  157 ttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagtt---aatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataat 253  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||| ||   |||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||| |||||| ||||   |||||  |||||    
T  53054834 ttaatgatatgaataatgaaattatatagtaattcttaatgcattgagattgtgtaatttatctataataaagccaaaaatagttca-ttttacaataat 53054932  T
Q  254 aattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccg 296  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||||    
T  53054933 aattctcttttatagtatgtttaaccaatgcccgagagcaccg 53054975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Original strand, 2391634 - 2391688
Alignment:
Q  151 cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattg 205  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2391634 cactggttaaggataagaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattg 2391688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Original strand, 2393395 - 2393449
Alignment:
Q  151 cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattg 205  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2393395 cactggttaaggataagaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattg 2393449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 168 - 255
Target Start/End: Original strand, 21010041 - 21010124
Alignment:
Q  168 aaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 255  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||  ||||||| ||||||    
T  21010041 aaaaaggaaattatatagtagttaa--cattgaaattgtataattaatttataa-aaagtcaaaaa-agtttctttttatggtaataa 21010124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 282
Target Start/End: Original strand, 25743854 - 25743967
Alignment:
Q  168 aaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttat 266  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||  |||| |  ||||||||  ||||| |    
T  25743854 aaaaaggaaattatatagtaattattgcattaaaaattgtgtaattaattcataa-aaagtcaaaatc-gtttcattttttagtaataatttcctttttt 25743951  T
Q  267 ggtatgcttaaccagt 282  Q
    ||||||||||||||||    
T  25743952 ggtatgcttaaccagt 25743967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 223
Target Start/End: Original strand, 6842604 - 6842642
Alignment:
Q  185 gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6842604 gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 6842642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 36953285 - 36953207
Alignment:
Q  138 ggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattg-aaattgtgtaattaat 215  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||   || ||||| || ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  36953285 ggtgcctccggagcactagttaaggatgctaagaaagagataatataatagttattgcattgaaaattgtgtaattaat 36953207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 119 - 184
Target Start/End: Original strand, 2362796 - 2362861
Alignment:
Q  119 ttttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatata 184  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||  || | ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2362796 tttttgggaaatgctaaccggtgctcccggtgcaatggttaaggatatgaaaaaggaaattatata 2362861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 203
Target Start/End: Original strand, 23925274 - 23925359
Alignment:
Q  118 attttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaat 203  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| || ||||   ||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  23925274 atttttgggaaatgctaactggtacccccggggaactggttaagaatataaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattaaaat 23925359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 310
Target Start/End: Original strand, 2362947 - 2362999
Alignment:
Q  259 tcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  2362947 tcttttatggtatgcttaatcagtgccccggaaacatcggttagcaggaccct 2362999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 282
Target Start/End: Original strand, 17752736 - 17752842
Alignment:
Q  175 aaattatatagtagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgc 273  Q
    |||| |||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||| |||| || |||| ||  ||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||    
T  17752736 aaatcatatagtatttattgcgttgaaaattgtgtaattaatttataa-aatgtcataat-agttttcttttacaataataattcccttttttggtatgc 17752833  T
Q  274 ttaaccagt 282  Q
    |||| ||||    
T  17752834 ttaatcagt 17752842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 282
Target Start/End: Original strand, 19054056 - 19054162
Alignment:
Q  175 aaattatatagtagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgc 273  Q
    |||| |||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||| |||| || |||| ||  ||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||    
T  19054056 aaatcatatagtatttattgcgttgaaaattgtgtaattaatttataa-aatgtcataat-agttttcttttacaataataattcccttttttggtatgc 19054153  T
Q  274 ttaaccagt 282  Q
    |||| ||||    
T  19054154 ttaatcagt 19054162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 215
Target Start/End: Original strand, 26966540 - 26966588
Alignment:
Q  168 aaaaaagaaattatatagtagttaatgcattg-aaattgtgtaattaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  26966540 aaaaaagaaattatatagtagttattgcattgaaaattgtttaattaat 26966588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 27994486 - 27994394
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattg-aaattgtgtaattaat 215  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||  |||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||| | || ||||| ||||||||||    
T  27994486 gggaaatgttaaccgatgcccccggggcactggttaaggatactaaaaaagaaattttatagtaattaatgtagtgaaaattatgtaattaat 27994394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 125 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16990818 - 16990728
Alignment:
Q  125 ggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggat-atgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaat 215  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||  ||||||||| || ||||| ||||||| ||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  16990818 ggaaatgctaaccggtacctacagaacacg-gttaaggatgataaaaaaggaaattagataatagttattgcattaaaaatgtgtaattaat 16990728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 255
Target Start/End: Original strand, 31436313 - 31436393
Alignment:
Q  175 aaattatatagtagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 255  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||  ||||||| || | |||||||||||| ||||||    
T  31436313 aaattatatagtaattattgcattaaaaattgtgtaattaattcataaataagtcaacaa-aattttcttttatggtaataa 31436393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 136; Significance: 7e-71; HSPs: 59)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 123 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 43202570 - 43202383
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  43202570 agggaaatgctaaccggtgcccccggggcactagttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattaaaattgtgtaattaatttataat 43202471  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  43202470 aatgtcaaaaacagttttcttttatggtaataattctcttttatggtaagcttaaccagtgcccgggggcaccggttagcaggaccct 43202383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 123 - 309
Target Start/End: Original strand, 43944506 - 43944692
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43944506 agggaaatgctaaccggtgcctccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 43944605  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    || |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||    
T  43944606 aatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttgtatggtatgcttaaccagtgcccgagggcaccggttagcaagaccc 43944692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 124 - 310
Target Start/End: Original strand, 32217045 - 32217231
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||  |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32217045 gggaaatgctaactggtgcccccggggcactggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 32217144  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  32217145 aagtcaaaaacagtttt-ttttatgataataattcccttttatggtatgcttaacctgtgccccggaggcaccggttaacaggaccct 32217231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 123 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 789717 - 789530
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  789717 agggaaatgctaaccggtgcccccggggcacgggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 789618  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagt-gcccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    || |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||    
T  789617 aatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtagcccagaggcaccggttagcgggaccc 789530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 123 - 309
Target Start/End: Original strand, 12356243 - 12356430
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||||||||||||||| | |  | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||    
T  12356243 agggaaatgctaaccggtgcccctgagatactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatacattgaaattatataattaatttataat 12356342  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||    
T  12356343 aaagtcaaaaacagtttccttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgttccgggggcaccggttagcaggaccc 12356430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 123 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 33108859 - 33108670
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  33108859 agggaaatgttaaccggtgcctccggggcactggttaag-atatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaatagtataattaattgataat 33108761  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccctaa 312  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33108760 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcctttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaggaccctaa 33108670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 123 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 47232059 - 47231881
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  47232059 agggaaatgctaaccggtgcccccggagcactggttaaggatgtgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaataatgtaattaattgataat 47231960  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagt-gcccggaagcaccggtta 300  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||    
T  47231959 aaagtcaaaaacagtttccttttatgataataattcccttttatggtatgtttaaccaataccccggaagcaccggtta 47231881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 124 - 309
Target Start/End: Original strand, 54897308 - 54897494
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  54897308 gggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggatatgagaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataata 54897407  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  54897408 aagtcaaaaacaatttccttttatggtaataatttccttttatggtatgtttaaccagtgtcccggaggcaccggttagcaggaccc 54897494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 123 - 310
Target Start/End: Original strand, 16536047 - 16536235
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||   |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16536047 agggaaatgctaaccggtgcccccggggcacggattaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 16536146  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    || |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  16536147 aatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattctattttatggtattcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggaccct 16536235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 122 - 310
Target Start/End: Original strand, 55882682 - 55882869
Alignment:
Q  122 tagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 221  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  55882682 tagggaaatgctaaccggtgtctccggggcactcgttaaggatatgaaaaaa-aaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 55882780  T
Q  222 taaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcc-cggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||||||||||| ||||||||    
T  55882781 taaagtcaaaaacagttttcttttatggtaa-aattcacttttatggtatacttaacccgtgcctcgggggcaccggttagtaggaccct 55882869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 124 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3783687 - 3783497
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||  |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  3783687 gggaaatgctaaccggtgcctccggggcaccggttaaacatatgaaaaatgaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtttaattaattgataata 3783588  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgctta---accagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||   || |||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  3783587 aagtcaaaaacagttttcttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaagtactagtgccccgggagcaccggttaacaggaccct 3783497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 122 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 4269010 - 4268822
Alignment:
Q  122 tagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 221  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  4269010 tagggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataa 4268911  T
Q  222 taaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccgga-agcaccggttagcaggaccc 309  Q
    ||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  4268910 taatgtcaaaaacagtttctttttatggtaataattcccttttatggtatgattaaccagtgccccgagggcaccggttagcaggaccc 4268822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 123 - 310
Target Start/End: Original strand, 29591188 - 29591376
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||  |||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  29591188 agggaaatgctaactggtgcccccggggcactggttaagaatatgaataaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtacttaatttataat 29591287  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  29591288 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattaccttttatggtatgcttaactagtgccccgggggcaccggttagcaggaccct 29591376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 163 - 310
Target Start/End: Original strand, 36395138 - 36395286
Alignment:
Q  163 atatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctctt 262  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36395138 atatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagttttcttttatgataataattccctt 36395237  T
Q  263 ttatggtatgcttaaccagtgccc-ggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||    
T  36395238 ttatggtatgcttaaccagtgccctgggggcaccagttagcaggaccct 36395286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 122 - 310
Target Start/End: Original strand, 4089140 - 4089329
Alignment:
Q  122 tagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 221  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||  ||||  |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4089140 tagggaaatgctaaccggtgcccctggggcactgattaagggtatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 4089239  T
Q  222 taaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |  ||||| ||||||||||||||    
T  4089240 taatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgccccaggggcaccagttagcaggaccct 4089329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 117 - 317
Target Start/End: Original strand, 28755614 - 28755812
Alignment:
Q  117 aattttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatt 216  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | | ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28755614 aatttttgggaaatgctaaccggtgtcccaggg-cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatt 28755712  T
Q  217 gataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggttagcaggaccctaaattt 316  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||  ||||| ||  ||||||||||||||||| ||| |||    
T  28755713 gataataaagttagaaacagtttccttttatgataatacttc-cttttatagtatgcttaacccatgccccgagacaccggttagcaggaccttaatttt 28755811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 123 - 310
Target Start/End: Original strand, 7768937 - 7769125
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||  |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  7768937 agggaaatgctaatcggtacccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataat 7769036  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  7769037 aatgttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggcatacttaacccgtgccccgggggcaccggttagcaggaccct 7769125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 151 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 54656035 - 54655879
Alignment:
Q  151 cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgat 250  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  54656035 cactggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaattttcttttaggat 54655936  T
Q  251 aataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggttagcaggac 307  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||    
T  54655935 aataattctctcttatgatatgcttaaccagtgtcccggggcaccggttagcaggac 54655879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 127 - 310
Target Start/End: Original strand, 50619089 - 50619272
Alignment:
Q  127 aaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaag 226  Q
    |||||||||| |||||  ||||  ||||  ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  50619089 aaatgctaactggtgctcccggggcactgattaagaatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtacttaatttataataaag 50619188  T
Q  227 tcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    | ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||    
T  50619189 taaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgcccaggggcaccggttagcgggaccct 50619272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 122 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18068067 - 18067878
Alignment:
Q  122 tagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 221  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  18068067 tagggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttatca 18067968  T
Q  222 taaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccag-tgcccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| | | |||||  ||||||||||||| ||||||    
T  18067967 taatgtcaaaaatagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgtttaacccgttccccgggggcaccggttagcaagaccct 18067878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 114 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 52533981 - 52533816
Alignment:
Q  114 ataaattttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaatta 213  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  52533981 ataaattaaagggaaatgttaaccggtgcctccaggacactggttaagaatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcactgaaattgaataatta 52533882  T
Q  214 attgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaacc 279  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  52533881 attgataataaagtcgaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgtttaacc 52533816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 4220227 - 4220381
Alignment:
Q  156 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 255  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  4220227 gttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaattttcttttatg-taataa 4220325  T
Q  256 ttctcttttatggtatgcttaaccagtgc-ccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    ||| |||||||||||||||||||  |||| ||| | ||||||||||||| ||||||    
T  4220326 ttcccttttatggtatgcttaacatgtgctccgtaggcaccggttagcatgaccct 4220381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 151 - 309
Target Start/End: Original strand, 6164121 - 6164279
Alignment:
Q  151 cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgat 250  Q
    |||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||| |    
T  6164121 cactggttaaggatatcaaaaga-aaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagcaaaaaacagtttccttttatggt 6164219  T
Q  251 aataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaag-caccggttagcaggaccc 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||    
T  6164220 aataattctcttttatggtatgcttaaccagtaccccgaggacaccggttagcaggaccc 6164279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 124 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 32202666 - 32202480
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||  |||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32202666 gggaaatgttaaccggtgtccccggggcacgggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 32202567  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || || ||| || ||||| |||| |||||||||    
T  32202566 aagtcaaaaacagtttccttttatgataataattc-cttttatgatatgcttaatcaatgtcccagaggcaccagttaacaggaccct 32202480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 124 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 24679827 - 24679671
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24679827 gggaaatgctaaccggtgtctcgggg-cactggttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataata 24679729  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagt 282  Q
    |||| |||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24679728 aagttaaaaaca-atttcctttatggtaataattctcttttatggtatgcttaatcagt 24679671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 123 - 270
Target Start/End: Original strand, 15186242 - 15186389
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  15186242 agggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatccattgaaattgtgtaattaatttataat 15186341  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggta 270  Q
    || |||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  15186342 aatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattccattttatggta 15186389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 151 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 30154321 - 30154163
Alignment:
Q  151 cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgat 250  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||    
T  30154321 cactagttaag-atatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattatgtaattaatttataataaaatcaaaaacaatttccttatatgat 30154223  T
Q  251 aataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||||||||||    
T  30154222 aataattctcttttatggtgtgcttaaccagtgccccgaaaacatcggttagcaggaccc 30154163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 125 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 19503289 - 19503137
Alignment:
Q  125 ggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataa 224  Q
    ||||||||||||||||||  ||||   ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19503289 ggaaatgctaaccggtgctcccgggt-actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatactagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataataa 19503191  T
Q  225 agtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaac 278  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19503190 agtcaaaaacagtttccttttattgtaataattcccttttatggtatgcttaac 19503137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 122 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 42898934 - 42898774
Alignment:
Q  122 tagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 221  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||| |  |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42898934 tagggaaatgttaatcggtgcttccagggcactggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 42898835  T
Q  222 taaagtcaaaaacagttttctttta--tgataataattctcttttatggtatgcttaacca 280  Q
    |||||||||||| |||||  |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42898834 taaagtcaaaaatagtttctttttatgtggtaataattctcttttatggtatgcttaacca 42898774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 129 - 277
Target Start/End: Original strand, 39843912 - 39844060
Alignment:
Q  129 atgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtc 228  Q
    ||||||| |||||||| | || || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  39843912 atgctaatcggtgccttcagagcattggttaaggatatgaaaaatgaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagtc 39844011  T
Q  229 aaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaa 277  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||    
T  39844012 aaaaacagtttccttttatggtaataattcctttttagggtatgcttaa 39844060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 37987967 - 37988122
Alignment:
Q  156 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 255  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||  ||||||    
T  37987967 gttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataatgttaaaaacagtttccttttattgtaataa 37988066  T
Q  256 ttctcttttatggtatgcttaaccagt-gcccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  37988067 ttctcttttatagtatgcttaaccaatcccccgaaagcaccggttagtaggaccct 37988122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 118 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 5091802 - 5091612
Alignment:
Q  118 attttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattg 217  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |  ||||  |||| |||||| ||||||||||  |||||||||| || |||||  ||| |||||||||||||||||     
T  5091802 atttaagggaaatactaaccggtactcccggggcactggttaagaatatgaaaaataaaattatataataattaatatattaaaattgtgtaattaattt 5091703  T
Q  218 ataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  5091702 ataataaagtcataaacagtttccttttatagtaataattcccttttat-gtatgcttaaccagtgtccgggagcaccggttagcaggaccc 5091612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 173 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 30387271 - 30387132
Alignment:
Q  173 agaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatg 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||| ||||    
T  30387271 agaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcctttttatgatatg 30387172  T
Q  273 cttaaccagtgccc-ggaagcaccggttagcaggacccta 311  Q
    ||||| || | ||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  30387171 cttaatcaataccctggaaacaccggttagcagaacccta 30387132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 150 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 53656038 - 53655887
Alignment:
Q  150 acactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatga 249  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||| |||||||     
T  53656038 acacttgttaaggatatgaaaaaagaaattatataatagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagttaaaaataattttattttatgg 53655939  T
Q  250 taataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcc-cggaagcaccggtta 300  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  53655938 taataatttcattttatggtatgcttaatcagtgcctcggaggcaccggtta 53655887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 151 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 54945937 - 54945780
Alignment:
Q  151 cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgat 250  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||| |    
T  54945937 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagcagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaatttcgttttatggt 54945838  T
Q  251 aataattctcttttatggtatgcttaaccagtgc-ccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
     |||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  54945837 -ataattcctttttatggtatacttaaccagtgctccggaa-caccggttagcaggaccc 54945780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 123 - 283
Target Start/End: Original strand, 46148940 - 46149098
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  || | | |||| |||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  46148940 agggaaatgctaaccggtgccccggg--catttgataagaatatgaaaaaggaaattatataataattaatacattgaaattgtgtaattaatttataat 46149037  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg 283  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46149038 aaagtcaaaaacaatttctttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg 46149098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 151 - 310
Target Start/End: Original strand, 50603254 - 50603415
Alignment:
Q  151 cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacag-ttttcttttatga 249  Q
    |||| ||||||| | || |||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  50603254 cactggttaagggtgtggaaaaggaaattgtataataattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagttttttttttatga 50603353  T
Q  250 taataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccgga-agcaccggttagcaggaccct 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||| ||||||||||||||    
T  50603354 taataattctcttttatggtatgcttaaccagtaccccgagaacaccagttagcaggaccct 50603415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 124 - 248
Target Start/End: Original strand, 54054548 - 54054672
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    |||||||||||||||||||| | ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54054548 gggaaatgctaaccggtgccccgggggcaccggttaaggatatgaaaaaagaaattatataatagttaatgcattgaaatagtgtaattaattgataata 54054647  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatg 248  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||    
T  54054648 aagtcaaaaacaatttccttttatg 54054672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 123 - 314
Target Start/End: Original strand, 41265458 - 41265648
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||| ||| ||||| | |||| |||||||||||| |||  ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  41265458 agggaaatgttaatcggtgtccccgggacactagttaagcatactaaaatgaaaattatatagtagttaatgcagtgaaattgtgtaattaatttataa- 41265556  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggttagcaggaccctaaat 314  Q
    ||| |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| | | ||||| |||||| |||| |||||    
T  41265557 aaaatcaaaaacagttttcttttattgtaataattttcttttttggtatgtttaaccagtgcccaggaacaccgtttagcatgaccataaat 41265648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 176 - 310
Target Start/End: Original strand, 31517217 - 31517352
Alignment:
Q  176 aattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagt-tttcttttatgataataattctcttttatggtatgct 274  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  31517217 aattatataatagttaatgcattgaaatagtgtaattaattgataataaagtcaaaaataatgttttttttatggtaataattctcttatatggtatgct 31517316  T
Q  275 taaccagtgcccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    ||||||||||| ||  |||||| |||| ||||||||    
T  31517317 taaccagtgcctgggggcaccgattagaaggaccct 31517352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 168 - 280
Target Start/End: Original strand, 53268764 - 53268875
Alignment:
Q  168 aaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatg 267  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  53268764 aaaaaagaaattatatattagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataa-aaagtcaaaaacaattttcttttataataataattttcttttttg 53268862  T
Q  268 gtatgcttaacca 280  Q
    |||||||||||||    
T  53268863 gtatgcttaacca 53268875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 188 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 39877371 - 39877247
Alignment:
Q  188 gttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatgg--tatgcttaaccagtg-c 284  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |    
T  39877371 gttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttcattttatagtaataattctcttttatggtatatgcttaaccagtgcc 39877272  T
Q  285 ccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||    
T  39877271 ccggaggcacgggttagcaggaccc 39877247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 127 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 31680645 - 31680468
Alignment:
Q  127 aaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaag 226  Q
    |||| ||||||| || ||||||| |||| ||||||| |||||||||  || ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  31680645 aaatactaaccgctgtctccgga-cactggttaagggtatgaaaaagaaagttacataatagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaag 31680547  T
Q  227 tcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcagga 306  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||  ||||||| |||| |||||| ||| ||||||  |||| ||||||||||    
T  31680546 tcaaaaacaatttccttttatggtaataattcatttttatgatatgtttaacccgtgtcccgga--cacctgttagcagga 31680468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 184 - 311
Target Start/End: Original strand, 16820912 - 16821040
Alignment:
Q  184 agtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg 283  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |  |||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16820912 agtaattaatgcattgaaattctgtaattaacttataataaagtcatacgcagtttccttttatggtaataatttccttttatggtatgcttaaccagtg 16821011  T
Q  284 -cccggaagcaccggttagcaggacccta 311  Q
     |||||  |||||||||||||||||||||    
T  16821012 ccccgggggcaccggttagcaggacccta 16821040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 122 - 266
Target Start/End: Original strand, 49915157 - 49915301
Alignment:
Q  122 tagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 221  Q
    ||||||||||| |||||| ||| | ||  ||||  ||||||||||||||||  || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  49915157 tagggaaatgcaaaccggcgcccctggtgcactgattaaggatatgaaaaagaaatttatatagtaattaatgtattgaaattgtgtaattaatttataa 49915256  T
Q  222 taaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttat 266  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||    
T  49915257 taaagtaaaaaacagtttccttttataataataatttccttttat 49915301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 122 - 248
Target Start/End: Original strand, 42815108 - 42815234
Alignment:
Q  122 tagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 221  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  42815108 taggaaaatgctaaccggtgc-tctggagtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatcatagttaatgtattgaaattatgtaattaatttataa 42815206  T
Q  222 taaagtcaaaaacagttt-tcttttatg 248  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  42815207 taaagtcaaaaacagtttctcttttatg 42815234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 123 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 46688397 - 46688267
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaa----aaag-aaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattg 217  Q
    |||||||||||||| |||||| |||   |||| |||||||||||||||    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  46688397 agggaaatgctaactggtgcccccgaggcactggttaaggatatgaaaaattaaagaaaattatacagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattt 46688298  T
Q  218 ataataaagtcaaaaacagttttcttttatg 248  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  46688297 ataataaagtcaaaagcagtttccttttatg 46688267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 156 - 288
Target Start/End: Original strand, 52697084 - 52697215
Alignment:
Q  156 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 255  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||| |||| |||||||||||||||| | ||||| |||||  ||||||    
T  52697084 gttaaggatatgaaaaacaaaattatatagtagttaatacattaaaattatataat-aatttataataaagtcaaaaataattttcctttattgtaataa 52697182  T
Q  256 ttctcttttatggtatgcttaaccagtgcccgg 288  Q
    |||||||||||| |||| ||||| |||| ||||    
T  52697183 ttctcttttatgatatgtttaacgagtgtccgg 52697215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 151 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 1432701 - 1432554
Alignment:
Q  151 cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgat 250  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||      || |||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  1432701 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatacattg------tg-aattaatttataataaaataaaaaacagttt-cttttatgat 1432610  T
Q  251 aataa--ttctcttttatggtatgcttaaccagtgcc-cggaagcaccggttagca 303  Q
    |||||  |||||||||||  |||||||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  1432609 aataaaattctcttttataatatgcttaaccagtacctcagaagcaccggttagca 1432554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 203 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 53004063 - 53003955
Alignment:
Q  203 ttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg--cccggaagcaccggtta 300  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| | ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||| | |||||||||    
T  53004063 ttgtgtaattaatgtataataaagtcaaaaataatttccttttaaaataataattctcttttatgatatgcttaatcagtgtccccggga-caccggtta 53003965  T
Q  301 gcaggaccct 310  Q
    ||||||||||    
T  53003964 gcaggaccct 53003955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 199 - 280
Target Start/End: Original strand, 8133782 - 8133862
Alignment:
Q  199 gaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaacca 280  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  8133782 gaaaatgtgtaattaatttataataaagtcaaaaatagttttcttttatggtaataattatcttttat-gtatgtttaacca 8133862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 118 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 10110194 - 10110007
Alignment:
Q  118 attttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggat-atgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattg---aaattgtgtaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| || ||||  ||||||||||  || ||| |||||||   ||||||| ||||||    
T  10110194 attttagggaaatgctaaccggtgcctccgggacactgattaaggataataaaaagggaaattatatgttaattattgcattgaaaaaattgtttaatta 10110095  T
Q  214 attgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggttagca 303  Q
    ||  ||||  ||||||| || |  ||||||||||| ||| |||  |||||| | |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  10110094 atctataaataagtcaacaa-aactttcttttatggtaagaatcttctttttttgtatgcttaacccgtgcccgg-ggcaccggttagca 10110007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 216
Target Start/End: Original strand, 50167589 - 50167681
Alignment:
Q  122 tagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatt 216  Q
    ||||||||||||||||||||    |||  |||| ||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50167589 tagggaaatgctaaccggtgttctcggggcactggttaaagatatgaaaaagaaaattata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatt 50167681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 315
Target Start/End: Original strand, 34151124 - 34151313
Alignment:
Q  127 aaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaa-ttatatagtagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaattgataataa 224  Q
    |||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| ||||||  || ||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||  |    
T  34151124 aaatgctaaccgatgcc-ccggggcactggttaaggataataaaaaggaaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatccataaata 34151222  T
Q  225 agtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatg-gtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggttagcaggaccctaaatt 315  Q
    |||||| || | ||| |||||||| ||| |||| |||||| |  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  34151223 agtcaacaaaacttt-cttttatggtaagaattttcttttttttgtatgcttaacccgtgcccgggagcaccggttagcatgacccttaatt 34151313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 268 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 11893442 - 11893394
Alignment:
Q  268 gtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggttagcaggaccctaaattt 316  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  11893442 gtatgcttaaccagtgccccggagcaccggttagcatgaccctaaattt 11893394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 16572680 - 16572488
Alignment:
Q  118 attttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggat-atgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattg-aaattgtgtaattaat 215  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||   |||| ||||||||| || |||| |||||||||||  || ||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  16572680 atttaaggaaaatgctaaccggtgcctccgaggcactggttaaggataataaaaagagaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaat 16572581  T
Q  216 tgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggacc 308  Q
      ||||  ||||||| || | || | ||||||| ||| ||||  ||||| | |||| ||||| ||||| |||||  ||||||||||||| ||||    
T  16572580 ccataaataagtcaacaaaacttct-ttttatggtaagaatttcctttttttgtatacttaatcagtgccccgggggcaccggttagcatgacc 16572488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17344800 - 17344686
Alignment:
Q  168 aaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatg 267  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||| | |||| ||| | ||||| |||||  ||||||| |||||| | |||||| |     
T  17344800 aaaaatgaaattatataatagttaatgcatttaaattatataattaaattataa-aaatttaaaaaaagtttctttttatggtaataactttcttttctt 17344702  T
Q  268 gtatgcttaaccagtg 283  Q
    |||| ||||| |||||    
T  17344701 gtatccttaaacagtg 17344686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 28120061 - 28119903
Alignment:
Q  156 gttaaggatatgaaaaa-agaaattatatagtagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataat 253  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||||  || ||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||  ||||||| || | ||  |||||||| |||     
T  28120061 gttaaggataataaaaagagaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatccataaataagtcaacaaaacttc-cttttatggtaag 28119963  T
Q  254 aattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccctaa 312  Q
    ||||  ||||| | |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  28119962 aatttcctttttttgtatgcttaaccagtgccccggagacaccggttagcatgaccctaa 28119903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 260 - 310
Target Start/End: Original strand, 54054665 - 54054716
Alignment:
Q  260 cttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||    
T  54054665 cttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttggcaggaccct 54054716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 136; Significance: 7e-71; HSPs: 66)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 124 - 310
Target Start/End: Original strand, 5694321 - 5694508
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5694321 gggaaatgctaaccggtgcctccggggcactggttaaggatataaaaagggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 5694420  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgc-ccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  5694421 aagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgctccgggggcaccggttagcaggaccct 5694508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 123 - 310
Target Start/End: Original strand, 18043161 - 18043349
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18043161 agggaaatgctaaccggtgcctccggggcactggttaagggtataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 18043260  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  18043261 aatgtcaaaaacagttttcttttatggtaataattctattttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggaccct 18043349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 122 - 310
Target Start/End: Original strand, 29657769 - 29657958
Alignment:
Q  122 tagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 221  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29657769 tagggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaattgataa 29657868  T
Q  222 taaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc-ggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  29657869 taaagtcaaaaacagtttccttttttggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccctgggggcaccggttagcaggaccct 29657958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 123 - 310
Target Start/End: Original strand, 15227738 - 15227926
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    |||||||||||||||||| || | ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15227738 agggaaatgctaaccggtaccccgggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 15227837  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  15227838 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccggaggcaccggttagcaagaccct 15227926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 123 - 310
Target Start/End: Original strand, 47009992 - 47010180
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  47009992 agggaaatgctaatcggtgcatccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataat 47010091  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgc-ccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||    
T  47010092 aaattcaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgctccaggggcaccggttagcaggaccct 47010180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 127 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 12072245 - 12072060
Alignment:
Q  127 aaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaag 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12072245 aaatgctaaccggtgcccccggggcaccggttaaggatatgaaaaaggaaattatgtagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaag 12072146  T
Q  227 tcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggacccta 311  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||    
T  12072145 tcaaaaacagttttcttttatggtaataattcctttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcagcacccta 12072060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 123 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 51065935 - 51065747
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  51065935 agggaaatgctaaccggtgtccccgggacactggttaaggatatgaaaaagtaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataat 51065836  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  51065835 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccaggggcaccggttagcaggaccct 51065747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 124 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 17333467 - 17333283
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17333467 gggaaatgctaaccggtgcccccggg-cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattcataata 17333369  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  17333368 aagtcaaaaacagtttccttttatgataatacttcccttttatggta--cttaaccaatgccccggaggcaccggttagcaggaccct 17333283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 117 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 42770183 - 42769983
Alignment:
Q  117 aattttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatt 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42770183 aatttaagggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaatggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatt 42770084  T
Q  217 gataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccctaaatt 315  Q
     |||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||| ||||    
T  42770083 tataataatatcaaaaacagtttccttttatggtaataattctattttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcagaacccttaatt 42769984  T
Q  316 t 316  Q
    |    
T  42769983 t 42769983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 123 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 9266915 - 9266728
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||   |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9266915 agggaaatgttaaccggtgtccccgcggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtatttaatgcattgaaattgtgtaattaattcataat 9266816  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgc-ccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  9266815 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcgcttttatggtatacttaaccagtgctccagaagcaccggttagcaggaccc 9266728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 119 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 3784904 - 3784711
Alignment:
Q  119 ttttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattga 218  Q
    |||| ||||||||| || ||||||| || |  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3784904 tttttgggaaatgcaaatcggtgcccccagtgcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattga 3784805  T
Q  219 taataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggacccta 311  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||| ||||||||    
T  3784804 taataaagtcaaaaacaattttcttttatggtaataatttccttttatggtatgcttaacccgtgtcccgggggcaccggttagccggacccta 3784711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 124 - 308
Target Start/End: Original strand, 38162850 - 38163035
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38162850 gggaaatgttaaccggtgcctccggggcactggttaagggtatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 38162949  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggacc 308  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  38162950 atgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccgggggcaccggttagcaggacc 38163035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 122 - 313
Target Start/End: Original strand, 13961210 - 13961401
Alignment:
Q  122 tagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 221  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13961210 tagggaaatgctaaccggtgcccccggggcacgggttaaggatataaaaaaa-aaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 13961308  T
Q  222 taaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgc-ccggaagcaccggttagcaggaccctaaa 313  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||| ||||    
T  13961309 taaagtcaaaaacagtttcattttatggtaataattttcttttatggtatgcttaaccagtgctccaagggcaccggttagcaggaccataaa 13961401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 131 - 312
Target Start/End: Original strand, 6770344 - 6770522
Alignment:
Q  131 gctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaa 230  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6770344 gctaaccggtgcctccggggcactaattaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaa 6770443  T
Q  231 aaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggttagcaggaccctaa 312  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||    ||||||||||||||||||||||    
T  6770444 aaacagtttcattttatgataataattcccttttatgatatgcttaaccagtatcc---cgcaccggttagcaggaccctaa 6770522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 30294573 - 30294381
Alignment:
Q  118 attttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattg 217  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| | ||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30294573 atttttgggaaatgctaatcggtgtccccggagcattggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattt 30294474  T
Q  218 ataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgc-ccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||   ||||||||||||||||||    
T  30294473 ataataatgtcaaaaacagtttctttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacctgtgctccggggacaccggttagcaggaccc 30294381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 123 - 309
Target Start/End: Original strand, 30657607 - 30657788
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  30657607 agggaaatgctaaccggtgctcccggggcactagttaagcatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataat 30657706  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagt-gcccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    ||||||||||||||      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||    
T  30657707 aaagtcaaaaacag------tttatgataataattcccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccgattagcaggaccc 30657788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 124 - 310
Target Start/End: Original strand, 3097659 - 3097843
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||   || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  3097659 gggaaatgctaattggtgcccccggagtcctggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataata 3097758  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||||||    
T  3097759 aagtcaaaaacagttttcttttatggtaataatttccttttatggtatgcttaaccagtacgggga--caccggttagcaggaccct 3097843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 123 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 47532856 - 47532671
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47532856 agggaaatgctaaccggtgtctccggagtact-gttaaggatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaa-tgataat 47532759  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaag-caccggttagcaggaccc 309  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  47532758 aaagtcaaaaataatttccttttataataataattcccttttatggtatgcttaaccaatgccccgaagacaccggttagcaagaccc 47532671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 119 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 19032006 - 19031813
Alignment:
Q  119 ttttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  19032006 ttttagggaaatgctaaccggtgctccgggggcattagttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaaaacattgaaattgtgtaattaattta 19031907  T
Q  219 taataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagt-gcccggaagcaccggttagcaggacccta 311  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||| ||  ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  19031906 taataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataatttccttttatgatatgcttaacccgtaccccggagacaccggttagcaggacccta 19031813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 123 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14350464 - 14350278
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  14350464 agggaaatgctaaccggtgcccccggagcaccggttaagggtatgaaaaaggaaattatattgtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataat 14350365  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    || |||||||||| ||| |||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  14350364 aatgtcaaaaacaatttccttttatggtaataattc-ccttaatggtatgcttaaccagtgccccggggcaccggttagcaggaccct 14350278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 124 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 24178649 - 24178463
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  24178649 gggaaatgctaaccgatgcccccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatctataata 24178550  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||    
T  24178549 aagtcaaaagcagtttccttttatggtaataatttcattttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagccggaccc 24178463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 126 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 38702117 - 38701936
Alignment:
Q  126 gaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaa 225  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  38702117 gaaatgctaaccggtgctcccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataat 38702018  T
Q  226 gtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccgga-agcaccggttagcaggaccct 310  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  38702017 gtcaaaaacagttttcttttatggtaataattc----ttatggtatgcttaaccagtgccccgagggcaccggttagcaggaccct 38701936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 123 - 309
Target Start/End: Original strand, 41730304 - 41730494
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagt---taatgcattgaaattgtgtaattaattgat 219  Q
    ||||||||  ||||||||||| | ||  |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  41730304 agggaaatcttaaccggtgccccaggggcacgggttaagaatatgaaaaaagaaattatatagtagtaattaatgcattgaaattgtttaattaatttat 41730403  T
Q  220 aataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  41730404 aataaagtcaaaaacagtttccttttatgataataattcccttttatggtatgcttaacaagtgccccagaagcactggttagcaggaccc 41730494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 119 - 286
Target Start/End: Original strand, 45431274 - 45431440
Alignment:
Q  119 ttttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |  | ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  45431274 ttttagggaaatgctaaccggtgcccccagggc-ctgattaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaattta 45431372  T
Q  219 taataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 286  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  45431373 taataaagtcaaaaatagtttccttttatggtaataattctcttttatgatatacttaaccagtgccc 45431440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 157 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 50128325 - 50128171
Alignment:
Q  157 ttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataat 256  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||  ||||||| |||||||    
T  50128325 ttaaggatatgaaaaagaaaattacatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagttaaaagcagtttcattttatggtaataat 50128226  T
Q  257 tctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  50128225 tctcttttatggtatgcttaaccagtgtcccagaaacaccggttagcaggaccct 50128171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 123 - 284
Target Start/End: Original strand, 12306917 - 12307077
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||| |||| ||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  12306917 agggaaatgctaaccggtgcctctggggctctagttaatgatacgaaaaagaaaattatat-gtagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataat 12307015  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgc 284  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12307016 aaagtcaaaaacagattccttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgc 12307077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 121 - 309
Target Start/End: Original strand, 48071480 - 48071667
Alignment:
Q  121 ttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgata 220  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||   ||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  48071480 ttagggaaatgctaaccgatgc-tccggggtactggttaaggatatgtaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttata 48071578  T
Q  221 ataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgc-ccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||| ||||||| ||||||||||    
T  48071579 ataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattatcttttatagtatgcttaaccggtgctccagaa-caccggtcagcaggaccc 48071667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 124 - 272
Target Start/End: Original strand, 38335170 - 38335317
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  38335170 gggaaatgctaaccggtgtcttggga-cactggttaaagatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgtaattgtgtaattaatttataata 38335268  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38335269 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattcacttttatggtatg 38335317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 123 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 35985807 - 35985645
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35985807 agggaaatgttaaccggtgcc-ccggatcactgtttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 35985709  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 286  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||    
T  35985708 aaagtgaaaaacagtttccttttatggtaataattcccatttatagtatacttaaccagtgccc 35985645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 123 - 283
Target Start/End: Original strand, 29683194 - 29683355
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaag-aaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 221  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  29683194 agggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaagatataaaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaatcgtataattaatttataa 29683293  T
Q  222 taaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg 283  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29683294 taaagtcaaaaacagtttcattttatagtaataattcacttttatggtatgcttaaccagtg 29683355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 8473068 - 8472913
Alignment:
Q  156 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 255  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  8473068 gttaaggatataaaaaaggaaattatataatagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttcattttataataataa 8472969  T
Q  256 ttctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaag-caccggttagcaggaccct 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||||||||    
T  8472968 ttctcttttatggtatacttaaccagtgtcccgaggataccggttagcaggaccct 8472913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 121 - 248
Target Start/End: Original strand, 29210410 - 29210537
Alignment:
Q  121 ttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgata 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29210410 ttagggaaatgctaaccggtgcctccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttata 29210509  T
Q  221 ataaagtcaaaaacagttttcttttatg 248  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  29210510 ataatgtcaaaaacagtttccttttatg 29210537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 123 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 51368972 - 51368810
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |   ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  51368972 agggaaatgctaaccggtacctccagggtactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtagttaatttataat 51368873  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcc 285  Q
    || |||||||| ||||| |||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  51368872 aatgtcaaaaatagtttccttttatagtaataattccattttatggtatgcttaaccagtgcc 51368810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 127 - 283
Target Start/End: Original strand, 43286725 - 43286881
Alignment:
Q  127 aaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaag 226  Q
    |||||||||||| || | | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  43286725 aaatgctaaccgatgtccctgggacactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgttttgaaattatgtaattaatttataataaag 43286824  T
Q  227 tcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg 283  Q
    ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43286825 tcaaaaatagtttccttttatagtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtg 43286881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 36446508 - 36446352
Alignment:
Q  126 gaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaa 225  Q
    |||||| |||| |||||| |||   |||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36446508 gaaatgttaactggtgcccccgaggcactggttaagaatat-aaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaa 36446410  T
Q  226 gtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg 283  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  36446409 gtcaaaaacagtttccttttatagtaataattcccttttatggtatgtttaaccagtg 36446352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 127 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 48383294 - 48383111
Alignment:
Q  127 aaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaag 226  Q
    ||||||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| |||||||  |||||||||   |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  48383294 aaatgctaaccggtgctcccggggcactggttaaggatgtgaaaaagaaaattatatgaaagttaatgtattgaaataatgtaattaattgataataaag 48383195  T
Q  227 tcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcc-cggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |  |||| ||||||||||||||    
T  48383194 tcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccaatgcctcaggggcactggttagcaggaccc 48383111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 156 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 45449398 - 45449241
Alignment:
Q  156 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 255  Q
    ||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  45449398 gttaaagatataaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattaaaatagtgtaattaaattataataaagtcaaaagcagtttccttttatggtaataa 45449299  T
Q  256 ttctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccctaa 312  Q
    ||  ||||||||||||| |||||||||| ||| |  ||| ||||||||||||||||||    
T  45449298 ttgccttttatggtatgtttaaccagtgccccaggggcatcggttagcaggaccctaa 45449241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 125 - 309
Target Start/End: Original strand, 30217763 - 30217946
Alignment:
Q  125 ggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaa--gaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    |||||||||||||| ||| |||||  |||| | ||||||||||||||||  | ||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||    
T  30217763 ggaaatgctaaccgatgc-tccggg-cactggctaaggatatgaaaaaaagggaattagagagtagttaatgcatttaaattatttaattaatttataat 30217860  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  30217861 aaagtcaaaaatagttttcttttatggtaataatttctttttatggtatgcttaa-cagtgccccgaggcacctgttagcaggaccc 30217946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15282668 - 15282518
Alignment:
Q  156 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 255  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    |  |||||||||||||    
T  15282668 gttaaggatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatatattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaaaa----taatttatgataataa 15282573  T
Q  256 ttctcttttatggtatgcttaaccagtgccc-ggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    ||| || |||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  15282572 ttccctattattgtatgcttaa-cagtgccctggaaacaccggttagcagaaccct 15282518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 168 - 286
Target Start/End: Original strand, 52431625 - 52431743
Alignment:
Q  168 aaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa-ttctcttttat 266  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| || |||||||||||| |||||| |||  |||| |    
T  52431625 aaaaaaaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa-aatgtcaaaagcaattttcttttatggtaataatttccttttttt 52431723  T
Q  267 ggtatgcttaaccagtgccc 286  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  52431724 ggtatgcttaaccagtgccc 52431743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 168 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 37315409 - 37315300
Alignment:
Q  168 aaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatg 267  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||   |||| ||    
T  37315409 aaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataa-aaagtcaaagacagttttcttttatgctaataatttctttttttg 37315311  T
Q  268 gtatgcttaac 278  Q
    |||||||||||    
T  37315310 gtatgcttaac 37315300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 156 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 23473618 - 23473464
Alignment:
Q  156 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 255  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| |||||| |||||||| ||||||    
T  23473618 gttaaggatatgaaaaaggagattatatagcagttaatgtattgaaattgtataattaatttataataaagtttaaagcagtttccttttatggtaataa 23473519  T
Q  256 ttctcttttatggtatgcttaaccagtgc-ccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    ||   ||||||  ||||||||||| |||| |||   | |||||||||||||||||    
T  23473518 tttctttttataatatgcttaacctgtgctccgagggtaccggttagcaggaccc 23473464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 156 - 279
Target Start/End: Original strand, 52749634 - 52749757
Alignment:
Q  156 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 255  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || | |||| | |||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  52749634 gttaaagatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgtattgaaattgtatactaaatttacaataaagttaaaaacaatttttttttatggtaataa 52749733  T
Q  256 ttctcttttatggtatgcttaacc 279  Q
    |||  |||||||||||| ||||||    
T  52749734 ttcctttttatggtatgtttaacc 52749757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 157 - 247
Target Start/End: Original strand, 39497340 - 39497430
Alignment:
Q  157 ttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttat 247  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  39497340 ttaaggatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattaaaattatataattaatttataataaagtcaaaaataattttcttttat 39497430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Original strand, 26228194 - 26228300
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    |||| ||||||||||||  || ||| | |||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  26228194 agggtaatgctaaccgg--cccccgaagcactggttaaggagataaaaaatgaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataat 26228291  T
Q  223 aaagtcaaa 231  Q
    ||| |||||    
T  26228292 aaaatcaaa 26228300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 124 - 311
Target Start/End: Original strand, 28481844 - 28482030
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    ||||||||||||||||||||||  |  | || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  28481844 gggaaatgctaaccggtgcctcttgggccctggttaaggatatgaaaaaggaaattatacagta----atgcattaaaattgtgtaattaatttataata 28481939  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttctttta-----tgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggttagcaggacccta 311  Q
    || | |||||||||||| |  ||     | ||| ||||||  ||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||| |||||||||    
T  28481940 aaat-aaaaacagttttatggtattaatttatagtaattcctttttatggtatgcttaacccgtacccgg-ggcaccggttagtaggacccta 28482030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 156 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 35700804 - 35700679
Alignment:
Q  156 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 255  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  ||| ||||||||||||||    
T  35700804 gttaaggatactaaaaaggaaattatacagtagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataa-aaagtcaaaaaaaaattt-ttttatgataataa 35700707  T
Q  256 ttctcttttatggtatgcttaaccagtg 283  Q
     |  ||||| || ||| |||||||||||    
T  35700706 cttccttttttgatatccttaaccagtg 35700679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 174 - 272
Target Start/End: Original strand, 37503264 - 37503361
Alignment:
Q  174 gaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatg 272  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| | ||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||    
T  37503264 gaaattatatagtagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataa-aaaatcaaaaatattttccttttatggtaacaattgtcttttttggtatg 37503361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 219 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 19010778 - 19010687
Alignment:
Q  219 taataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc--ggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||    
T  19010778 taataaagtcaaaaatagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgattaaccagtgccccaggaa-caccggttagtaggaccc 19010687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 38595939 - 38595752
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggat-atgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattg-aaattgtgtaattaattgataa 221  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| || ||||  ||||||||||  || ||| ||||||| ||||||| ||||||||  ||||    
T  38595939 gggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggataataaaaagggaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatccataa 38595840  T
Q  222 taaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
      ||||||| || |  || |||||||| ||| |||| |||||| | | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  38595839 ataagtcaacaa-aacttccttttatggtaagaattttctttttttgcatgcttaaccagtgccccggaggcaccggttagcatgaccc 38595752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 150 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 3838937 - 3838831
Alignment:
Q  150 acactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatga 249  Q
    ||||| |||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||| || |||| |||||||     
T  3838937 acactggttaagcatactaaaaaggaaattatataatagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataa-aatgtcaaaagcaatttttttttatgg 3838839  T
Q  250 taataatt 257  Q
     |||||||    
T  3838838 caataatt 3838831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 282
Target Start/End: Original strand, 39081803 - 39081958
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    ||||||||||||||||||  |||||  |||| |||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| |    
T  39081803 gggaaatgctaaccggtgt-tccggg-cactggttaagcatactaaaaatgaaattatatactagttaatgtattgaaattttataattaatttataa-a 39081899  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagt 282  Q
    |  | |||| ||||||  |||||||||||||||| |||||| |  ||||||||| ||||    
T  39081900 atattaaaagcagtttcattttatgataataattttcttttttaatatgcttaatcagt 39081958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 125 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 19011180 - 19011108
Alignment:
Q  125 ggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcatt 198  Q
    ||||||||||||||||| | ||||  |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19011180 ggaaatgctaaccggtgtc-ccggggcacgggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcatt 19011108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 28726093 - 28725929
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggat-atgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattg-aaattgtgtaattaattgata 220  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| || ||||| ||||||||||  || ||| ||||||| ||||||| ||||||||  |||    
T  28726093 agggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggataataaaaaaggaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatccata 28725994  T
Q  221 ataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 286  Q
    |  ||||||| || |  || |||||||| ||| ||||  ||||| | |||||||||||||||||||    
T  28725993 aataagtcaacaa-aacttccttttatggtaagaatttccttttttcgtatgcttaaccagtgccc 28725929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 157 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 39912432 - 39912363
Alignment:
Q  157 ttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaag 226  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  39912432 ttaaggatataaaaagggaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtgattaatttataaaaaag 39912363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 10976087 - 10976008
Alignment:
Q  125 ggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaatt 204  Q
    |||||||||| |||||| ||| |   |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  10976087 ggaaatgctagccggtgtctctgaggcacttgttaaggatatgaaaaaggagattatatagtagttaatgcattaaaatt 10976008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 260 - 313
Target Start/End: Original strand, 29210530 - 29210584
Alignment:
Q  260 cttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccctaaa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  29210530 cttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggaccctaaa 29210584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 14881086 - 14881036
Alignment:
Q  203 ttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataat 253  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  14881086 ttgtataattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaat 14881036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16590349 - 16590269
Alignment:
Q  175 aaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataatt 257  Q
    ||||||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16590349 aaattatataacaattaatgtatt-aaattgtgtaattaatttataa-aatgtcagaaacaattttcttttatgataataatt 16590269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19011095 - 19011061
Alignment:
Q  182 atagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19011095 atagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatt 19011061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 21112731 - 21112677
Alignment:
Q  260 cttttatggtatgcttaaccagtgcccggaag-caccggttagcaggaccctaaa 313  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  21112731 cttttatggtatgcttaactagtgccccgagggcaccggttagcaggaccctaaa 21112677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 21117473 - 21117419
Alignment:
Q  260 cttttatggtatgcttaaccagtgcccggaag-caccggttagcaggaccctaaa 313  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  21117473 cttttatggtatgcttaacttgtgccccgagggcaccggttagcaggaccctaaa 21117419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 216
Target Start/End: Original strand, 49867456 - 49867522
Alignment:
Q  151 cactagttaaggatatgaaaaaagaaa-ttatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatt 216  Q
    |||| ||||| ||||  |||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  49867456 cactggttaatgatactaaaaaagaaagttatatagtaattaatgttttgaaattgtgtaattaatt 49867522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 163
Target Start/End: Original strand, 12326107 - 12326140
Alignment:
Q  130 tgctaaccggtgcctccggaacactagttaagga 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12326107 tgctaaccggtgcctccggaacactaattaagga 12326140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 33644517 - 33644390
Alignment:
Q  127 aaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaattgataataaa 225  Q
    ||||||||||| |||| || ||| |||  ||||||| ||| |||||  |||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||  |     
T  33644517 aaatgctaaccagtgc-tctggagcacaggttaaggctataaaaaagaaaattatataataattattgcattgaaaattgtgtaattaattcataaatat 33644419  T
Q  226 gtcaaaaacagttttcttttatgataataa 255  Q
    ||||  || ||||| |||||||||||||||    
T  33644418 gtcatcaa-agtttccttttatgataataa 33644390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 14881158 - 14881086
Alignment:
Q  118 attttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagtt 190  Q
    ||||| || ||||| |||| |||||| |||  | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  14881158 atttttggaaaatgttaactggtgcccccgtgatactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagtt 14881086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 50)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 124 - 316
Target Start/End: Original strand, 392096 - 392289
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  392096 gggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 392195  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccctaaattt 316  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  392196 atgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggacccttaattt 392289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 124 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 12145303 - 12145117
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    |||||||||||||||||||| || |  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12145303 gggaaatgctaaccggtgcccccagtgcacttgttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 12145204  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgc-ccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12145203 aagtcaaaaacagtttccttttatgataataatttccttttatagtatgcttaaccagtgctccggaggcaccggttagcaggaccc 12145117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 123 - 310
Target Start/End: Original strand, 23402137 - 23402325
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  23402137 agggaaatgctaactggtgcctccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgaaattaatttataat 23402236  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  23402237 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattaccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaggaccct 23402325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 123 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 1391364 - 1391178
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    |||||||||||||||||||| |||||   |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  1391364 agggaaatgctaaccggtgc-tccggggtactgattaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataat 1391266  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg--cccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||    
T  1391265 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattcccttttatggtatgcttaaccagtgttccaggaa-caccggttagcaggaccc 1391178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 123 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 32929695 - 32929502
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32929695 agggaaatgctaaccggtgcccccggggcaatggttaagggtatgaaaaaggaaattatatattaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 32929596  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccctaaatt 315  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  32929595 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggacccttaatt 32929502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 124 - 309
Target Start/End: Original strand, 35043890 - 35044074
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    ||||||||||||| |||| |  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  35043890 gggaaatgctaactggtgtccacgggacactggttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaattcattgaaattgtgta-ttaatttataata 35043988  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| || |||||    
T  35043989 aagtcaaaaacagttttcttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccccggggcaccggttaacatgaccc 35044074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 25165567 - 25165412
Alignment:
Q  156 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25165567 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatatattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 25165468  T
Q  256 ttctcttttatggtatgcttaaccagtgccc-ggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  25165467 ttctcttttacgatatgcttaaccaatgccctgggagcaccggttagcaggaccct 25165412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 124 - 310
Target Start/End: Original strand, 29978233 - 29978418
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||||    
T  29978233 gggaaatgctaaccggtgcctccgga-cactagttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtatttaatgtattgaaattatgtaatatatttataata 29978331  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||    
T  29978332 aagtcaaaaacagtttaattttatggtaataattcccttttatgatatgcttaaccagcgccctggaacaccggttagcaggaccct 29978418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 127 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 32985376 - 32985191
Alignment:
Q  127 aaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaag 226  Q
    |||||| ||||||||||  |||  || | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32985376 aaatgcaaaccggtgccctcggggcattggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaag 32985277  T
Q  227 tcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggacccta 311  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||    
T  32985276 tcaaaaacagtttccttttatgataataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcagaacccta 32985191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 151 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13417121 - 13416959
Alignment:
Q  151 cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataa---agtcaaaaacagttttcttttat 247  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  13417121 cactagttaaggatatgaaaaaggaaattatatattagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataataaagtcaaaaacagttttcttttat 13417022  T
Q  248 gataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  13417021 ggtaataattctcttttataatatgcttaaccagtgcccggaggcaccggttagctggaccct 13416959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 122 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 29451302 - 29451139
Alignment:
Q  122 tagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 221  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  29451302 tagggaaatgctaactggtgcctccggg-caccggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaaattataa 29451204  T
Q  222 taaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 286  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  29451203 taaagtcaaacacagtttccttttatgataataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccc 29451139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 123 - 309
Target Start/End: Original strand, 3515765 - 3515952
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||||||||||||||| || |  |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3515765 agggaaatgctaaccggtgcccccagggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 3515864  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    || |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||| |  |||||||||||||||||||    
T  3515865 aatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgtttaacctgtgccccaggggcaccggttagcaggaccc 3515952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 123 - 310
Target Start/End: Original strand, 4215694 - 4215882
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||  |||| ||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4215694 agggaaatgttaaccggtgcccccggggcactggttaagagtatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 4215793  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    || |||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||    
T  4215794 aatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataatttccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcatcggttagcaggaccct 4215882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 156 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 26467278 - 26467118
Alignment:
Q  156 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 255  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  26467278 gttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaatagtttccttttatggtaataa 26467179  T
Q  256 ttctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccctaaatt 315  Q
    ||| |||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  26467178 ttcccttttatggtatgtctaaccagtgccccggaggcaccggttagcatgacccttaatt 26467118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 126 - 303
Target Start/End: Original strand, 2350654 - 2350832
Alignment:
Q  126 gaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaa 225  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2350654 gaaatgctaaccggtgctcccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaa 2350753  T
Q  226 gtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagt-gcccggaagcaccggttagca 303  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||    
T  2350754 gtcaaaaatagtttccttttatggtaataattcccttttatgatatgcttaaccagtaccccggagacaccggttagca 2350832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 123 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 7851346 - 7851191
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||||||||||||||| || |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  7851346 agggaaatgctaaccggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaagaaaattatatagtaattaatgcattaaaattgtgtaattaatttataat 7851247  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaac 278  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7851246 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaac 7851191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 123 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 3026194 - 3026004
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||  |||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  3026194 agggaaatgctaactggtgccccggg--cactggttaagggtatgaaaaatgaaattatacagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataat 3026097  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccctaaatt 315  Q
    || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||   ||||||||||||||| |||||||||    
T  3026096 aatgtcaaaaacagttttcttttatcgtaataattctcttttatggtatgcttaatcagtgtcccgagggcaccggttagcagg-ccctaaatt 3026004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 156 - 316
Target Start/End: Original strand, 2580984 - 2581145
Alignment:
Q  156 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 255  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||    
T  2580984 gttaatgatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaataatttccttttatggtaataa 2581083  T
Q  256 ttctcttttatggtatgcttaaccagt-gcccggaagcaccggttagcaggaccctaaattt 316  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2581084 ttcccttttatggtatgcttaaccaataccccgggagcaccggttagcaggaccctaaattt 2581145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 122 - 310
Target Start/End: Original strand, 27433490 - 27433679
Alignment:
Q  122 tagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 221  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  27433490 tagggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttatca 27433589  T
Q  222 taaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccag-tgcccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| | | |||||  ||||||||||||| ||||||    
T  27433590 taatgtcaaaaatagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgtttaacccgttccccgggggcaccggttagcaagaccct 27433679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 123 - 312
Target Start/End: Original strand, 12525718 - 12525908
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  12525718 agggaaatgctaaccggtgcctccggggtactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatacattgaaaatgtgtaattaatttataat 12525817  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc--ggaagcaccggttagcaggaccctaa 312  Q
    || |||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||  || |  ||||||||||||||||||||    
T  12525818 aatgtcaaacacagtttcattttatggtaataattcccttttatgatatgcttaactagtgccccaggga-taccggttagcaggaccctaa 12525908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 151 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 18276774 - 18276612
Alignment:
Q  151 cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgat 250  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  18276774 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaatttgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatggt 18276675  T
Q  251 aataattctcttttatgg---tatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    |||||||  |||||||||   ||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||    
T  18276674 aataatttccttttatggtattatgcttaaccagtgcccctggggcaccggttagcaggaccc 18276612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 124 - 310
Target Start/End: Original strand, 28225221 - 28225407
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    ||||||||||||| |||||||| || | ||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28225221 gggaaatgctaactggtgcctctgggatacgggttaaggatatgaaaaaggaa-ttatatagtaattaatgtattgaaattgtgtaattaatttataata 28225319  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||| | |||| |||||| ||||||||    
T  28225320 aagtcaaaaacaattttcttttatggtaataattcccttttatggtatccttaaacagtgacccgaaggcacaggttagtaggaccct 28225407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 166 - 279
Target Start/End: Original strand, 961051 - 961164
Alignment:
Q  166 tgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctctttta 265  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  961051 tgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaattgataataaagtcagaaacaatttccttttatgataataattctctttta 961150  T
Q  266 tggtatgcttaacc 279  Q
    ||||||||||||||    
T  961151 tggtatgcttaacc 961164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 123 - 248
Target Start/End: Original strand, 20897947 - 20898072
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||||||||||||||| || |  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20897947 agggaaatgctaaccggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 20898046  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatg 248  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  20898047 aaagtcagaaacagtttccttttatg 20898072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 124 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 21878533 - 21878349
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  21878533 gggaaatgctaaccggtgcctcccgggcacgggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattatttaattaatttataata 21878434  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc--ggaagcaccggttagcaggaccctaaa 313  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||      ||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  21878433 aagtcaaaaacagtttctttttatggtaataattccct------gtatgtttaaccagtgccccaggaa-caccggttagcaggaccctaaa 21878349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 120 - 309
Target Start/End: Original strand, 31280317 - 31280501
Alignment:
Q  120 tttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||   ||||  |||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  31280317 tttagggaaatgctaaccggtgctcccgaggcactgattaagagaatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttat 31280416  T
Q  220 aataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||  |||||||||     ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31280417 aataatgtcaaaaacggtttccttttatagtaataattc-----tatggtatgcttaacgagtgcccggaggcaccggttagcaggaccc 31280501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 34396714 - 34396598
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||||||||||||||| || | ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34396714 agggaaatgctaaccggtgcccccaggacacaggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 34396615  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttt 239  Q
    |||||||||||||||||    
T  34396614 aaagtcaaaaacagttt 34396598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 151 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 1840406 - 1840239
Alignment:
Q  151 cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgat 250  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||| |    
T  1840406 cactggttaaggatataaaaaaagaaattatataataattaatgtattaaaattgtgtaattaatttataataaagttaaaaacagtttcctttcatggt 1840307  T
Q  251 aataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc-ggaagcaccggttagcaggaccctaaatttt 317  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  1840306 aataattcccttttatgatatgtttaaccagtgccctagaaacaccggttagcaagacccttaatttt 1840239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 128 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 34852030 - 34851876
Alignment:
Q  128 aatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagt 227  Q
    |||||||||||||||  | || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  34852030 aatgctaaccggtgctcctgggacact-gttaaagatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattgatttataataaagt 34851932  T
Q  228 caaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg 283  Q
    |||||| | ||| |||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  34851931 caaaaataatttccttttatagtaataattctcttttataatatgcttaaccagtg 34851876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 151 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 34477709 - 34477612
Alignment:
Q  151 cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatg 248  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  34477709 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcagaaacagtttccttttatg 34477612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 151 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 11115254 - 11115121
Alignment:
Q  151 cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgat 250  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||| |    
T  11115254 cactggttaaggatataaaaaaggaaattatataatagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataataa--tcaaaaatagttttcttttatggt 11115157  T
Q  251 aataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 286  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  11115156 aataattcccttttatgatatgtttaaccagtgccc 11115121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 124 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 23629761 - 23629607
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||  ||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  23629761 gggaaatgttaaccgatgcc-ccggggcactgattaaggatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattactttataata 23629663  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaacc 279  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  23629662 aagtcaaaaacaatttccttttatgacaataattttcttttatgttatacttaacc 23629607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 157 - 286
Target Start/End: Original strand, 5323433 - 5323562
Alignment:
Q  157 ttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataat 256  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  5323433 ttaagaatataaaaaaggaaattatatagtaattaaagcattaaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaacaatttccttttatggtaataat 5323532  T
Q  257 tctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 286  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  5323533 tcccttttatggtatgcgtaaccggtgccc 5323562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 126 - 258
Target Start/End: Original strand, 9660988 - 9661120
Alignment:
Q  126 gaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaa 225  Q
    ||||||||||||||||||  ||   ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  9660988 gaaatgctaaccggtgccctcgtggcaccagttaaggatatgaaaaaagaaattacataatagttaatgcattgaaattgtataattaatttaaaataaa 9661087  T
Q  226 gtcaaaaacagttttcttttatgataataattc 258  Q
    || |||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  9661088 gttaaaagcagtttccttttatggtaataattc 9661120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 9524768 - 9524661
Alignment:
Q  16 attagaaccgtccttatataaaattatgattgtttcattatgattctgatcacaatcgcttgtgatatcaaatatacactaaactgataatgttgtggat 115  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9524768 attagaatcatccttatataaaatgatgattgtttcattatgactctgatcacaatcaactgtgatatcaaatatacactaaactgataatgctgtggat 9524669  T
Q  116 aaatttta 123  Q
    | ||||||    
T  9524668 agatttta 9524661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 122 - 223
Target Start/End: Original strand, 13529453 - 13529554
Alignment:
Q  122 tagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 221  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||  |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13529453 tagggaaatgctaacttgtgccttcggggcactggttaaggatgtgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 13529552  T
Q  222 ta 223  Q
    ||    
T  13529553 ta 13529554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 313 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 9524666 - 9524615
Alignment:
Q  313 attttaatttatccttagtgcctgctctgagtgcaccacttatacatatggt 364  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9524666 attttaattaatccttagtgcctgctctgagtgcaccacttatacatatggt 9524615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 234 - 286
Target Start/End: Original strand, 22417303 - 22417355
Alignment:
Q  234 cagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 286  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22417303 cagtttccttttatgctaataattctcttttatggtatgcttaatcagtgccc 22417355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 157 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 24227546 - 24227413
Alignment:
Q  157 ttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaa-----tgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaaca-gttttcttttatgat 250  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||     ||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  24227546 ttaaggatactaaaaaagaaattatatagtatataaattcatgcattgaatttatgtaattaatttataa-aaagtcaaaaaaaagttttcttttatgat 24227448  T
Q  251 aataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcc 285  Q
    ||||| |  ||||| |||||  ||||| |||||||    
T  24227447 aataacttccttttttggtacccttaaacagtgcc 24227413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 233
Target Start/End: Original strand, 11633951 - 11634028
Alignment:
Q  157 ttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattg-aaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaa 233  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||| || ||||||||    
T  11633951 ttaaggatactaaaaaagtaattatatagtagttattgcattgaaaattgtgtaattaatacataaaaatgtcaaaaa 11634028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 313
Target Start/End: Original strand, 34706719 - 34706911
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaag-aaattatatagtagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaattgata 220  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  |||  ||||||||||  ||||| | |||||||||  || ||| |||||||||| |||| ||||||||  |||    
T  34706719 agggaaatgctaaccggtgccccgggggcaccggttaaggataataaaaagggaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatccata 34706818  T
Q  221 ataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccctaaa 313  Q
    |  ||||||| || | ||  |||||||| ||| ||||  ||||| | |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  34706819 aataagtcaacaaaacttc-cttttatggtaagaatttccttttttcgtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaagaccctaaa 34706911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 195
Target Start/End: Original strand, 14559921 - 14559993
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgc 195  Q
    |||||||||||||||||||||| |||   |||  |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  14559921 agggaaatgctaaccggtgccttcggggaactgattaaagatatgaaaaaagaaaatatataatagttaatgc 14559993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 215
Target Start/End: Original strand, 10431780 - 10431827
Alignment:
Q  168 aaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaat 215  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  10431780 aaaaaagaaattatataatagttattacattgaaattgtgtaattaat 10431827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 215
Target Start/End: Original strand, 22021633 - 22021724
Alignment:
Q  126 gaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggata-tgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaat 215  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||  |||||||||||| || | ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  22021633 gaaatgttaatcggtgcccccggggcactagttaaggttactaaaaaaagaatttatatagtaattattgcattgaaacttgtgtaattaat 22021724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 286
Target Start/End: Original strand, 1127866 - 1127978
Alignment:
Q  174 gaaattatatagtagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatg 272  Q
    ||||||||||  || ||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||  ||||||| || | |||| ||||||| ||| |||| |||||| | |||||    
T  1127866 gaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatttataaataagtcaacaaaactttt-ttttatggtaagaattttctttttttgtatg 1127964  T
Q  273 cttaaccagtgccc 286  Q
    ||||||||||||||    
T  1127965 cttaaccagtgccc 1127978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 11616285 - 11616208
Alignment:
Q  157 ttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattg-aaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaa 233  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||  |||| || ||||||||    
T  11616285 ttaaggatactaaaaaagtaattatatagtagttattgcattgaaaattgtataattaatacataaaaatgtcaaaaa 11616208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 125 - 216
Target Start/End: Original strand, 28562682 - 28562772
Alignment:
Q  125 ggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatt 216  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||| ||||||||| |||| | ||| ||||| |||||||||||    
T  28562682 ggaaatgctaatcggtgcc-ccgggacaccggttaatgatattaaaatagaaactatatagtaattaacgtattaaaattctgtaattaatt 28562772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 250 - 311
Target Start/End: Original strand, 34494278 - 34494340
Alignment:
Q  250 taataattctcttttatggtatgcttaaccagt-gcccggaagcaccggttagcaggacccta 311  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  34494278 taataattctcttttgttgtatgcttaaccaataccccggaggcaccggttagcagaacccta 34494340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 34712317 - 34712271
Alignment:
Q  119 ttttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggata 165  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  34712317 tttttgggaaatgctaaccggtgcctccggggcactggttaaggata 34712271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 309
Target Start/End: Original strand, 20898065 - 20898114
Alignment:
Q  260 cttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||| ||||||    
T  20898065 cttttatggtatgcttaacctgtgccccggggcaccggttagccggaccc 20898114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 53)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 124 - 310
Target Start/End: Original strand, 20552931 - 20553118
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    |||||||||||||||||||| | ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20552931 gggaaatgctaaccggtgccccgggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 20553030  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  20553031 aagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggaccct 20553118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 123 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 561705 - 561520
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  561705 agggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 561606  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagt-gcccggaagcaccggttagcaggac 307  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  561605 aaagtcaaaatcagtttccttttataataataattctcttttatggtatgcttaatcagtaccccggaggcaccggttagcaggac 561520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 118 - 309
Target Start/End: Original strand, 22887744 - 22887936
Alignment:
Q  118 attttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  22887744 attttagggaaatgctaaccgatgcctccggggcagtggttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaattt 22887843  T
Q  218 ataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgc-ccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||| |||||    
T  22887844 ataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgctccgggggcaccgattagcatgaccc 22887936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 118 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 34442723 - 34442532
Alignment:
Q  118 attttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattg 217  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34442723 atttaagggaaatgctaaccggtgcc-ccggggcacatgttaaggatatgaaaaagaagattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattt 34442625  T
Q  218 ataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  34442624 ataataaagtcaaaaacagttttcttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgcccgggggcatcggttagcaggaccct 34442532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 123 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 26387251 - 26387060
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26387251 agggaaatgctaactggtgcctccgaagtacttgttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 26387152  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcc-cggaagcaccggttagcaggaccctaaa 313  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||    
T  26387151 aaagtcaaaaacaattttcttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccttgggggcaccggttaacaggaccctaaa 26387060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 124 - 310
Target Start/End: Original strand, 31438646 - 31438833
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    |||||||||||||||||||  ||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31438646 gggaaatgctaaccggtgctcccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatacagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 31438745  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||    
T  31438746 aagtcaaaaacagtttccttttatgataataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccggggacaccggttagcaggaccct 31438833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 123 - 308
Target Start/End: Original strand, 2898071 - 2898256
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2898071 agggaaatgttaaccggtgtc-ccggaacactggttaaggatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 2898169  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggacc 308  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  2898170 aaagtcaaaaacagttttcttctatcataataattctcttttatggtatgtttaatcagtgtcccggaggcaccggttagcaggacc 2898256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 123 - 309
Target Start/End: Original strand, 31390011 - 31390198
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  31390011 agggaaatgctaactggtgcctccggggcactagttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattatgtaattaatttataat 31390110  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgc-ccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||| ||||||||||||    
T  31390111 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgctccgggggcaccgattagcaggaccc 31390198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 127 - 310
Target Start/End: Original strand, 4381798 - 4381982
Alignment:
Q  127 aaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaag 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  4381798 aaatgctaaccggtgcccccggtgcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatg 4381897  T
Q  227 tcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  4381898 tcaaaaacagtttccttttatggtaataattccattttatggtatgcttaaccagtgccccgggagcactggttagcaggaccct 4381982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 119 - 286
Target Start/End: Original strand, 1859157 - 1859324
Alignment:
Q  119 ttttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattga 218  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||   | | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  1859157 ttttagggaaatgctaactggtgcccccggggtaatggttaaggatataaaaaaagaaattgtatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaattta 1859256  T
Q  219 taataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1859257 taataaagtcaaaaacagttttcttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 1859324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 123 - 309
Target Start/End: Original strand, 30486209 - 30486396
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||    
T  30486209 agggaaatgctaactggtgcccccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataat 30486308  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  30486309 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggaccc 30486396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 123 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 22068506 - 22068318
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22068506 agggaaatgctaacaagtgcccccggggcactggttaaggatatgaaaaagggaattatatagtagtta-tgcattgaaattgtataattaattgataat 22068408  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggacccta 311  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||    
T  22068407 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccgattagcaggacccta 22068318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 121 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 32361058 - 32360869
Alignment:
Q  121 ttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgata 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  32361058 ttagggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggatgtgaaaaagaaaattatataatagttaatgcattgaaataatataattaattgata 32360959  T
Q  221 ataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||    
T  32360958 ataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccaatgccccgggggcaccggttagcaggaccc 32360869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 114 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 38591070 - 38590883
Alignment:
Q  114 ataaattttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaatta 213  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||| | | ||  |||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  38591070 ataaaattaagggaaatgctaaccggtgtccctggggcactggttaagaatatgaaaaaggaaattatacagtagttaatgtattaaaattgtgtaatta 38590971  T
Q  214 attgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggttag 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||    
T  38590970 attgataataaagtcaaaaacagttttcttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccaataccccgaggcaccggttag 38590883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 119 - 309
Target Start/End: Original strand, 44587897 - 44588088
Alignment:
Q  119 ttttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattga 218  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||  |||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  44587897 tttttgggaaatgctaaccggtgcccccggggcaccggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatacattgaaattgtgtaattaattta 44587996  T
Q  219 taataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||  | |||||||||||||||||    
T  44587997 taataaagtaaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacaagtgccccgggggtaccggttagcaggaccc 44588088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 150 - 310
Target Start/End: Original strand, 22567628 - 22567789
Alignment:
Q  150 acactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatga 249  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||     
T  22567628 acactggttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaataatttccttttatgg 22567727  T
Q  250 taataattctcttttatggtatgcttaaccagtgc-ccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||    
T  22567728 taataattctcttttatggtatgcttaacccgtgctccaggggcaccggttagcaggaccct 22567789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 123 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 27856583 - 27856395
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||  |||| ||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27856583 agggaaatgttaaccggtgcccccggggcactggttaagagtatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 27856484  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    || |||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||    
T  27856483 aatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataatttccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcatcggttagcaggaccct 27856395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 127 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3668295 - 3668112
Alignment:
Q  127 aaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaag 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  3668295 aaatgctaaccggtgcccccgga-cactggttaagggtatggaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatg 3668197  T
Q  227 tcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccgga-agcaccggttagcaggaccct 310  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||    
T  3668196 tcaaaaacagtttccttttatggtaataatttccttttatagtatgtttaaccagtgccccgagggcaccggttagcaagaccct 3668112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 122 - 286
Target Start/End: Original strand, 6580187 - 6580351
Alignment:
Q  122 tagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 221  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||  |||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  6580187 tagggaaatgctaaccagtgccccgggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataa 6580286  T
Q  222 taaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 286  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6580287 taatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccc 6580351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 308
Target Start/End: Original strand, 27584770 - 27584922
Alignment:
Q  156 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 255  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  27584770 gttaaggatatgaaaagggaaattatatagtagttaaagcattgaaattgtgtaattaatttataataaaatcaaaagcagtttccttttatggtaataa 27584869  T
Q  256 ttctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggttagcaggacc 308  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27584870 ttctcattcatggtatacttaaccagtgcccggaagcagcggttagcaggacc 27584922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 123 - 283
Target Start/End: Original strand, 32860101 - 32860260
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||  |||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32860101 agggaaatgttaaccggtgccccgggggcacgggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtatttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 32860200  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg 283  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32860201 aaagtcaaaaacagtttccttttatg-taataattctcttttatggtatgcttaaccagtg 32860260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 124 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 5093724 - 5093539
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    ||||||||||||| |||  ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  5093724 gggaaatgctaactggtttctc-ggagcactagttaaggatatgaaaaaggaaattaaatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataata 5093626  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    ||||||||| || ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  5093625 aagtcaaaagcaatttccttttatgataataatttccttttatggtatgtttaactagtgccccggggcaccggttaacaggaccct 5093539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 151 - 310
Target Start/End: Original strand, 28600994 - 28601153
Alignment:
Q  151 cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgat 250  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |    
T  28600994 cactggttaaggatatgaaaaagggaattataaagtagtta-tgcattgaaattgtataattaattgataataaagttaaaaacagtttctttttatggt 28601092  T
Q  251 aataattctcttttatggtatgcttaaccagtgc-ccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  28601093 aataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcactgggagcaccggttagcaggaccct 28601153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 127 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 25783012 - 25782860
Alignment:
Q  127 aaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaag 226  Q
    ||||||||||||||||| |  || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  25783012 aaatgctaaccggtgccccaaga-cactagttaagaatatgaaaaaggaaattatatagt---taatgcattgaaattgtgtaattattttataataaag 25782917  T
Q  227 tcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg 283  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25782916 tcaaaaacaattttcttttatgataataattcccttttatggtatgcttaaccagtg 25782860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 127 - 277
Target Start/End: Original strand, 5881221 - 5881374
Alignment:
Q  127 aaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgc----attgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||    
T  5881221 aaatgctaaccggtgtc-ccggagcacaggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 5881319  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaa 277  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5881320 aaagtcaaaaagagtttccttttatgataataattatcttttatggtatgcttaa 5881374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 35851905 - 35851749
Alignment:
Q  156 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 255  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  35851905 gttaaggatgtgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaataatgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcattttatggtaataa 35851806  T
Q  256 ttctcttttatggtatgcttaaccagtgccc--ggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||   ||  ||||||||||||||||||||    
T  35851805 ttctcttttatggtatgcttaaccaatgcctcggggggcaccggttagcaggaccct 35851749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 124 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 8969591 - 8969406
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  8969591 gggaaatgctaaccagtgccccggg--cactagttaaggatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaatagtgtaattaatttataata 8969494  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||| |||| ||| |  |||||||||||||| |||||    
T  8969493 aagtcaaaagcagtttccttttatggtaataatttccttttatagtatgcttaactagtgcccctggggcaccggttagcagtaccct 8969406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 123 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 4022665 - 4022480
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||| | |||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  4022665 agggaaatgctaactggtgcccacgggatactgattaagaatatgaaaaaagaaatta-atagtagttaatgtattgaaattctgtaattaatttataat 4022567  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggacc 308  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  4022566 aaagtcagaaacagtttccttttatgataataatttccttttatgatatgtttaaccagtgtcccgggggcaccggttagcaggacc 4022480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 123 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 11021408 - 11021259
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  11021408 agggaaatgttaactggtgcctc-ggagcactgattaaagatatgaaaaaagaaattatatggtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatatataat 11021310  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgc 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  11021309 aaagtcaaaaacagttttcttttgtggtaataattcccttttatggtatgc 11021259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 124 - 303
Target Start/End: Original strand, 43637165 - 43637343
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43637165 gggaaatgctaaccggtgcc-ccgagacactggttaaggatatgaataaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 43637263  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggttagca 303  Q
    |||||||||||| |||  ||||||| ||||||||  ||||||  ||||| |||||| |||| | |  |||||||||||||    
T  43637264 aagtcaaaaacaatttctttttatggtaataatttccttttacagtatgtttaacccgtgctccggggcaccggttagca 43637343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 122 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 26891851 - 26891725
Alignment:
Q  122 tagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 221  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26891851 tagggaaatgctaaccggtgcccccgggacactgattaaggatataaaaaaggaaattatatattagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 26891752  T
Q  222 taaagtcaaaaacagttttcttttatg 248  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  26891751 taaagtcaaaaatagtttccttttatg 26891725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 156 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 13574183 - 13574031
Alignment:
Q  156 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 255  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  13574183 gttaaggatatgaaaaaggaaaatatataaaaattaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttctttttatggtaataa 13574084  T
Q  256 ttctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggttagcaggacc 308  Q
    ||  |||||||||||||||||||| ||||||  |  |||||||||||||||||    
T  13574083 tttccttttatggtatgcttaacccgtgccctaagacaccggttagcaggacc 13574031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 125 - 282
Target Start/End: Original strand, 25772112 - 25772269
Alignment:
Q  125 ggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatag-tagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  25772112 ggaaatgttaatcggtgtctccg-aacactagttaagaatatgaaaaaggaaattataaaaataattaatgcaatgaaattgtgtaattaatttataata 25772210  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagt 282  Q
    |||||||||| | ||| | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  25772211 aagtcaaaaataatttccctttatgataataattcccttttatggtatacttaatcagt 25772269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 121 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 34123213 - 34123033
Alignment:
Q  121 ttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgata 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||| || |||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  34123213 ttagggaaatgctaaccggtgcctccggggtactggttgagcatactaaaaaagaaattatataatagttaatgctttgaatttgtgtaattaatttata 34123114  T
Q  221 ataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggttagca 303  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||| |  ||||||||| |||| | | | ||||||||||||||    
T  34123113 a-aaagtcaaaaacagtttccttttatggtcataattttcttttttaatatgcttaa-cagtactccggagcaccggttagca 34123033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 119 - 264
Target Start/End: Original strand, 38296173 - 38296317
Alignment:
Q  119 ttttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattga 218  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  ||  |||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  38296173 tttttgggaaatgctaaccggtgtcttgggg-cactggttaaagatatgaaaaagaaaattatatagtaattaatacattgaaattgtgtaattaattta 38296271  T
Q  219 taataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctctttt 264  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||    
T  38296272 taataaagtcaaaaacagtttctttttatggtaataattttctttt 38296317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 168 - 309
Target Start/End: Original strand, 39531868 - 39532008
Alignment:
Q  168 aaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatg 267  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||  |    
T  39531868 aaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa-agagtcaaaaccagttttcttttatggtaat-attttctttttcg 39531965  T
Q  268 gtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
     ||||||||||||||| | | || ||||||||||||| |||||    
T  39531966 atatgcttaaccagtgtctcagaggcaccggttagcatgaccc 39532008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 29102469 - 29102313
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||||| ||||||  | |||| ||| | |||||| |||| |||||  |||||||||||  |||||| |||||||||| | ||||||||| |||||    
T  29102469 agggaaatgctgaccggtatc-ccgggacattggttaagaatatcaaaaagaaaattatatagcggttaatacattgaaattttataattaatttataat 29102371  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaacca 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  29102370 aaagtcaaaaacagttttcttttatagtaataattatcttttatgatatgtttaacca 29102313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 168 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15079100 - 15079012
Alignment:
Q  168 aaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataatt 257  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  15079100 aaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataa-aaagtcaaaaacaatttccttttatgataataatt 15079012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 175 - 282
Target Start/End: Original strand, 15146683 - 15146789
Alignment:
Q  175 aaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgct 274  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |    
T  15146683 aaattatataatagttaatacattgaaattgtataattaatttataa-aaagtcaaaaataatttccttttatgataataattttcctttttggtatgtt 15146781  T
Q  275 taaccagt 282  Q
    ||||||||    
T  15146782 taaccagt 15146789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 168 - 272
Target Start/End: Original strand, 10820528 - 10820630
Alignment:
Q  168 aaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatg 267  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||    
T  10820528 aaaaaagaaattataaaatagttaatacattgagattgt-taattaatttataa-aaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattttcttttttg 10820625  T
Q  268 gtatg 272  Q
    |||||    
T  10820626 gtatg 10820630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 309
Target Start/End: Original strand, 20252739 - 20252928
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaa-aaaagaaattatatagtagttaatgcattg-aaattgtgtaattaattgata 220  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| ||| | || ||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    |    
T  20252739 agggaaatgctaactggtgcctccgtgacactggttaaagatgtcaagaaaggaaattatattgtagttattgcattgaaaactgtgtaattaatactaa 20252838  T
Q  221 ataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa-ttctcttttatggtatgcttaaccagtgc-ccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    | ||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||  |||| ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||| |||||    
T  20252839 aaaaaatcaaaaata-ttttcttttatgataataatttcctttttttggcatacttaaccaatgctccggaggcaccggtttgcatgaccc 20252928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 286
Target Start/End: Original strand, 20431463 - 20431600
Alignment:
Q  150 acactagttaaggatatgaaaaaa-gaaattatatagtagttaatgcattg-aaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttat 247  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    || |||||| ||||  ||| ||||||||    
T  20431463 acactagttaaggatgtcaaaaaaggaaattatattgtagttattgcattgaaaactgtgtaattaatactaaaaaaagtc-aaaagtgttatcttttat 20431561  T
Q  248 gataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 286  Q
    ||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||    
T  20431562 gataataatttccttttttggcatacttaaccagtgccc 20431600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 127 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 30834545 - 30834366
Alignment:
Q  127 aaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaag-aaattatatagtagttaatgcattgaaat-tgtgtaattaattgataataa 224  Q
    ||||||||||| ||||||| ||  ||| ||||||||||   ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||   ||| ||    
T  30834545 aaatgctaaccagtgcctctggg-cacaagttaaggatgctaaaaaaggaaattatataatagttattgcattgaaaactgtgtaattaatac-taaaaa 30834448  T
Q  225 agtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    | | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||| |||| | | ||| |||||||||||| |||||    
T  30834447 aataaaaaaca-ttttcttttatgataataattttctttt-tggcattcttaatcagtacacagaa-caccggttagcatgaccc 30834366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16807409 - 16807318
Alignment:
Q  126 gaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaa-ttatatagtagttaatgcattg-aaattgtgtaattaat 215  Q
    ||||||||||||||||||||||   || | ||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  16807409 gaaatgctaaccggtgcctccgaggcattggttaaggatgtttaaaaagaaaattatatagtagttattgcattgaaaactgtgtaattaat 16807318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16846690 - 16846599
Alignment:
Q  126 gaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaa-ttatatagtagttaatgcattg-aaattgtgtaattaat 215  Q
    ||||||||||||||||||||||   || | ||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  16846690 gaaatgctaaccggtgcctccgaggcattggttaaggatgtttaaaaagaaaattatatagtagttattgcattgaaaactgtgtaattaat 16846599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 215
Target Start/End: Original strand, 44331741 - 44331832
Alignment:
Q  126 gaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggata-tgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaat 215  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||  |||||||||||| || | ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  44331741 gaaatgttaatcggtgcccccggggcactagttaaggttactaaaaaaagaatttatatagtaattattgcattgaaacttgtgtaattaat 44331832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 30217718 - 30217652
Alignment:
Q  156 gttaaggatatgaaaaaagaaa-ttatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 221  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  30217718 gttaaggatactaaaaaagaaaattatatagtatttattgcattgaaattgtgtaatcaatcgataa 30217652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 124 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 28012140 - 28012007
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaa-ttatatagtagttaatgcatt-gaaattgtgtaattaattgataa 221  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| | ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||| ||||||  |||||||| |||||||  ||||    
T  28012140 gggaaatgataaccggtgcc-ccgggatactggttaaggatattaaaaaggaaaattatatagtaattattgcattcaaaattgtggaattaatctataa 28012042  T
Q  222 taaagtcaaaaacagttttcttttatgataataatt 257  Q
      ||||||| || |||||  ||||||||||| ||||    
T  28012041 ataagtcaacaa-agtttctttttatgataagaatt 28012007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 119 - 202
Target Start/End: Original strand, 44854305 - 44854387
Alignment:
Q  119 ttttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaa 202  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||  | || ||||||||||  ||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  44854305 tttttgggaaatgctaaccggtgcccccgggtc-ctggttaaggataataaaaaggaaattatatattaattattgcattgaaa 44854387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 202
Target Start/End: Original strand, 35506740 - 35506774
Alignment:
Q  168 aaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaa 202  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35506740 aaaaaagaaattatatagtagttattgcattgaaa 35506774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 31782749 - 31782565
Alignment:
Q  127 aaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaa-agaaattatatagtagttaatgcattg-aaattgtgtaattaattgataataa 224  Q
    ||||||||||||||| | ||||  |||   |||||||||  ||||| |||||||||||| || ||| ||||||| ||||||| ||||||||  ||||  |    
T  31782749 aaatgctaaccggtgtccccggggcacggattaaggataataaaaagagaaattatatattaattattgcattgaaaattgtttaattaatccataaata 31782650  T
Q  225 agtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcc-cggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    |||||| || | || | ||||||| ||| ||||  ||||| | |||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||| |||||    
T  31782649 agtcaacaaaacttct-ttttatggtaaaaatttcctttttttgtatgcttaacccgtgcctcgggggcaccggttagcatgaccc 31782565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 35470416 - 35470367
Alignment:
Q  114 ataaattttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaagga 163  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  35470416 ataatttttagggaaatgttaaccggtgcctccggggcactggttaagga 35470367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 44854527 - 44854434
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattg-aaattgtgtaattaat 215  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||  |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||  || ||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  44854527 agggaaatgctaaccggtactcccggggcactggttaaggataataaaaaggaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaat 44854434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 123 - 313
Target Start/End: Original strand, 22960 - 23151
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  22960 agggaaatgctaaccggtgcccccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatacattgaaattgtgtaattaatttataat 23059  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaag-caccggttagcaggaccctaaa 313  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | | |||||||||||| |||||||||    
T  23060 aaagtcaaaaacagtttccttttatgttaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgccccaaggacaccggttagcaagaccctaaa 23151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 55)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 124 - 309
Target Start/End: Original strand, 24438477 - 24438663
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  24438477 gggaaatgctaaccggtgcccccggggcactagttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataata 24438576  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  24438577 atgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggaccc 24438663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 119 - 311
Target Start/End: Original strand, 34606256 - 34606449
Alignment:
Q  119 ttttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattga 218  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  34606256 ttttggggaaatgctaactggtgcctccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgaaattaattta 34606355  T
Q  219 taataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggacccta 311  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34606356 taataaagtcaaaagcagtttccttttatggtaataattaccttttatggtatgcttaacccgtgccccgggagcaccggttagcaggacccta 34606449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 117 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 12218629 - 12218430
Alignment:
Q  117 aattttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatt 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12218629 aatttaagggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggataagtatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatt 12218530  T
Q  217 gataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggttagcaggaccctaaattt 316  Q
     |||||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| |||||    
T  12218529 tataataaaataaaaaatagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgccccgggacaccggttagcaggacccttaattt 12218430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 123 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 24798589 - 24798403
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24798589 agggaaatgctaaccggtgcccccggg-cacttgttgaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 24798491  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||    
T  24798490 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatagtatgcttaaccagtgccccgggggcaccagttagcaggaccc 24798403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 123 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 29993674 - 29993487
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29993674 agggaaatgctaacgggtgcccccggggcaccggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 29993575  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    |||||||||| || ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  29993574 aaagtcaaaatcaatttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgtcccggaggcatcggttagcaggaccc 29993487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 124 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 43594222 - 43594063
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  43594222 gggaaatgctaaccggtgtccccggaacactggttaaggatataaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtataattaatttataata 43594123  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg 283  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43594122 aagtcaaaaacagtttcctcttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg 43594063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 127 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 11686507 - 11686324
Alignment:
Q  127 aaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaag 226  Q
    |||||||||| ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11686507 aaatgctaactggtgcttccgggatactggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaag 11686408  T
Q  227 tcaaaaacag--ttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggttagcaggacc 308  Q
    ||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  11686407 tcaaaaacagtttttttttttatggtaataattctcttttatgatatgcttaacctgtacccggaggcaccggttagcaggacc 11686324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 119 - 304
Target Start/End: Original strand, 1736975 - 1737160
Alignment:
Q  119 ttttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattga 218  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || ||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1736975 tttttgggaaatgctaaccggtgcttctggggcactggttaaggatatgaaaaatgaaattatataatagttaatgcattgaaatagtgtaattaattga 1737074  T
Q  219 taataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcag 304  Q
    ||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1737075 taataaagttaaaaacattttccatttatgataataattc-attttatggtatgcttaaccagtgccccggaagcaccggttagcag 1737160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 122 - 278
Target Start/End: Original strand, 5239283 - 5239439
Alignment:
Q  122 tagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5239283 tagggaaatgctaaccggtgcctccggagcactggttaatggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 5239382  T
Q  222 taaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaac 278  Q
    ||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5239383 taatgtcaaaaacagtttctttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaac 5239439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 124 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 8754771 - 8754617
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    ||||||||||||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8754771 gggaaatgctaaccggtgccctgggagcactggttaaggatatgaaaaatgaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 8754672  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaac 278  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  8754671 aagtcaaaaacagttttgttttatggtaataatttccttttatggtatgcttaac 8754617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 123 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 7689387 - 7689224
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| || |||||  |||||||||| ||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7689387 agggaaatgttaaccggtgtctctgggacactgattaaggatataaaaaaggaaattttacagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 7689288  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7689287 aaagtcaaaaacagttttcttttatggtaataattctcttttatggtatacttaaccagtgccc 7689224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 125 - 280
Target Start/End: Original strand, 28587911 - 28588065
Alignment:
Q  125 ggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataa 224  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28587911 ggaaatgctaaccggtgcccccgga-cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagtcaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataa 28588009  T
Q  225 agtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaacca 280  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  28588010 agtcaaaaacaattttcttttatggtaataattcccttttatggtatgtttaacca 28588065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 151 - 286
Target Start/End: Original strand, 30810682 - 30810817
Alignment:
Q  151 cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgat 250  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30810682 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttatggt 30810781  T
Q  251 aataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 286  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  30810782 aataattttcttttatggtatgtttaaccaatgccc 30810817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 123 - 308
Target Start/End: Original strand, 5729345 - 5729531
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  5729345 agggaaatgttaaccggtgttcccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgtattgaaataatgtaattaattgataat 5729444  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcc-cggaagcaccggttagcaggacc 308  Q
    ||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  5729445 aaagtcaaaaataattttcttttatagtaataattctcttttatggcatgcttaaccagtgcctcggaggcacaggttagcaggacc 5729531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 122 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 23363354 - 23363165
Alignment:
Q  122 tagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 221  Q
    |||| ||||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23363354 taggaaaatgttaaccggtgtc-ccggagcactcgttaaggataagaaaaaggaaattgtatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 23363256  T
Q  222 taaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggacccta 311  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||    
T  23363255 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaatatttctcttttatggtatgtttaaccagtgccccgaaaacaccgattagcaggacccta 23363165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 164 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 42044439 - 42044290
Alignment:
Q  164 tatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  42044439 tatgaaaaaagaaattatatagtagttaatagattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagttttcttttatggtaataattcccttt 42044340  T
Q  264 tatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggttagcaggaccctaaa 313  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||    
T  42044339 tatggtatgtttaaccagtgccccggggcaccggttagcatgaccctaaa 42044290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 123 - 310
Target Start/End: Original strand, 18485960 - 18486148
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  18485960 agggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggatattgaaaaggaaattatatagtaattaatgtattgaaattgtgtaattaatttataat 18486059  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaag-caccggttagcaggaccct 310  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  18486060 aaagttaaaaacagtttccttttatggtaataatttcattttatggtatgcttaacccgtgccccgaagacaccggttagcagggccct 18486148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 123 - 310
Target Start/End: Original strand, 34333283 - 34333470
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34333283 agggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 34333382  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    || ||| |||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  34333383 aatgtc-aaaacagtttccttttatggtaataattcctttttatggtatgtttaacccgtgccccgggggcaccggttagcaggaccct 34333470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 125 - 304
Target Start/End: Original strand, 47656981 - 47657158
Alignment:
Q  125 ggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataa 224  Q
    |||||||||||||||||| || ||  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47656981 ggaaatgctaaccggtgcttcgggggcactggttaaggatatgaaaaagaaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataa 47657080  T
Q  225 agtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggttagcag 304  Q
    ||| |||| ||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  47657081 agttaaaagcagttt--ttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaatcagtgcctcgaagcaccggttagcag 47657158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 123 - 309
Target Start/End: Original strand, 4628565 - 4628752
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||  |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  4628565 agggaaatgctaaccgatgcccctggggcaccggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatacattgaaattgtttaattaatttataat 4628664  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcc-cggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||    
T  4628665 aaagtcagaaacagtttacttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccttaggggcaccggttagcaggaccc 4628752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 156 - 286
Target Start/End: Original strand, 45045802 - 45045932
Alignment:
Q  156 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 255  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45045802 gttaagggtatgaaaaatgaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatgataataa 45045901  T
Q  256 ttctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 286  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45045902 ttcccttttatggtatgcttaaccagtgccc 45045932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 145 - 311
Target Start/End: Original strand, 47083076 - 47083242
Alignment:
Q  145 ccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttt 244  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  47083076 ccggaacaccggttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaattgataataaagttaaaaacagtttccttt 47083175  T
Q  245 tatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggttagcaggacccta 311  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||| | |  ||||||||||| || ||||||    
T  47083176 tatggtaataattcccttttatgatatgtttaaccaatgctccggggcaccggttagtagaacccta 47083242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 127 - 310
Target Start/End: Original strand, 18117147 - 18117329
Alignment:
Q  127 aaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaag 226  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||| | |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18117147 aaatgctaaccgatgc-tccgggacatttgttaagtatatgaaagaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaag 18117245  T
Q  227 tcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||   |||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||    
T  18117246 tcaaaaacagtttttttttatagtaataatttcattttatggtatgcttaaccagtgccctggagcaccagttagtaggaccct 18117329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 122 - 304
Target Start/End: Original strand, 28262029 - 28262207
Alignment:
Q  122 tagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 221  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     |||||||| ||||||||||||||||    
T  28262029 taggaaaatgctaaccggtgcctccgggtcaccggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagtta-----ttgaaattatgtaattaattgataa 28262123  T
Q  222 taaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc-ggaagcaccggttagcag 304  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  28262124 taaaatcaaaaacagtttccttttatagtaataattcttttttatggtatgcttaaccaatgccctggaagcaccggtcagcag 28262207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 121 - 286
Target Start/End: Original strand, 47839490 - 47839654
Alignment:
Q  121 ttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgata 220  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||   ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  47839490 ttagggaaatgctaaccggtgtc-ccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaatttatataatagttaatacattgaaattgtgtaattaatttata 47839588  T
Q  221 ataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 286  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  47839589 ataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgaataaccagtgccc 47839654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 174 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 37674240 - 37674105
Alignment:
Q  174 gaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgc 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || | |||||||||||||    
T  37674240 gaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttatgatataattttttttttatggtatgc 37674141  T
Q  274 ttaaccagtgcccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  37674140 ttaaccagtgtccgg-ggcaccggttagcaggaccct 37674105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 151 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 525234 - 525076
Alignment:
Q  151 cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgat 250  Q
    |||| ||||| |||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| |    
T  525234 cactggttaaagatatgaaaaagaaaagtatacagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaaatcaaaaacagtttccttttatggt 525135  T
Q  251 aataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| | | | ||||||||||||||||||||    
T  525134 aataattctcttttatgatatgtttaaccagtactccggagcaccggttagcaggaccc 525076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 119 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 27456303 - 27456174
Alignment:
Q  119 ttttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattga 218  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27456303 ttttagggaaatgctaactggtgcccccggg-cactggttaaggatatggaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattta 27456205  T
Q  219 taataaagtcaaaaacagttttcttttatga 249  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  27456204 taataaagtcaaaagcagtttccttttatga 27456174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 124 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 13065061 - 13064902
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |   | ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13065061 gggaaatgctaaccggtgcccacggtat--tggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatatttaatgtattgaatttgtgtaattaatttataata 13064964  T
Q  224 aagtca-aaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgc 284  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13064963 aagtcaaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgc 13064902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 151 - 285
Target Start/End: Original strand, 33636479 - 33636613
Alignment:
Q  151 cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgat 250  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||  ||||||| |    
T  33636479 cactagttaagaatatgaaaaagaaaattatataataattaattcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtaaaaaatagtttatttttatggt 33636578  T
Q  251 aataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcc 285  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33636579 aataattctattttatggtatgcttaaccagtgcc 33636613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 128 - 310
Target Start/End: Original strand, 46716642 - 46716825
Alignment:
Q  128 aatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagt 227  Q
    ||||||||| ||||||  |||| || | ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  46716642 aatgctaactggtgccctcggagcattggttaaagatataaaaaaggaaattatataatacttaatgcactgaaattatgtaattaatttataataaagt 46716741  T
Q  228 caaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaag-caccggttagcaggaccct 310  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| | ||||   |||||||||||||||||    
T  46716742 caaaaatattttccttttatgataataattcccttttatggtatgtttaaccggtgctccgaagatcccggttagcaggaccct 46716825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 122 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 23357895 - 23357734
Alignment:
Q  122 tagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 221  Q
    |||||||||| |||||||| |||| |||  ||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||  |   || ||||||||| ||||    
T  23357895 tagggaaatgttaaccggttcctctggagtactcgttaaggatatgaaaaagaaaattgtatagtagttaatgcatttca---gtataattaatttataa 23357799  T
Q  222 taaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 286  Q
     ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  23357798 aaaagtcaaaaacagtttccatttatgataataattctcttctatgatatgcttaaccagtgccc 23357734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 123 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 34546501 - 34546376
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    |||||||||||||||| |||| |||    ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  34546501 agggaaatgctaaccgatgcccccgaggtaccggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttatagt 34546402  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatg 248  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  34546401 aaagtcaaaaacagtttacttttatg 34546376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 122 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 37631730 - 37631601
Alignment:
Q  122 tagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 221  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||  |||  ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  37631730 tagggaaatgttaaccggtgcttccggggcacgggttaaggatataaaaaaggaaattatataataattaatgcattaaaattatgtaattaatttataa 37631631  T
Q  222 taaagtcaaaaacagttttcttttatgata 251  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  37631630 taaaatcaaaaacagtttccttttatgata 37631601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 156 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 29835858 - 29835735
Alignment:
Q  156 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacag-ttttcttttatgataata 254  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||    
T  29835858 gttaaagatatgaaaaaggaagttatatactagttaatgtattaaaattgcgtaattaatttgtaataaagttaaaaacagttttttttttatggtaata 29835759  T
Q  255 attctcttttatggtatgcttaac 278  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  29835758 attctattttatggtatgcttaac 29835735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 151 - 285
Target Start/End: Original strand, 22739851 - 22739985
Alignment:
Q  151 cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgat-aataaagtcaaaaacagttttcttttatga 249  Q
    |||||||||||||||  ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| | ||||||||||||||||||||     
T  22739851 cactagttaaggatactaaaag-gaaagtatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataaaaaaaattaaaaacagttttcttttatgg 22739949  T
Q  250 taataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcc 285  Q
    |||||||| | |||| | ||||||||| | ||||||    
T  22739950 taataattttatttttttgtatgcttagctagtgcc 22739985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 156 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 4100678 - 4100557
Alignment:
Q  156 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 255  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  4100678 gttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgtattaaaattatgttattaatttataatcaaatcaaaaacagtttt-atttatgataataa 4100580  T
Q  256 ttctcttttatggtatgcttaac 278  Q
    |||  |||||| |||||| ||||    
T  4100579 ttcatttttatagtatgcctaac 4100557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 156 - 255
Target Start/End: Original strand, 36437409 - 36437507
Alignment:
Q  156 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 255  Q
    ||||||||||  ||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36437409 gttaaggatactaaaaaggtaattatatagtaggtaattcattgaaattgtttaattaatttataa-aaagtcaaaaatagttttcttttatgataataa 36437507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 124 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 18470126 - 18469993
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaa-cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    |||||||||||||||||||| ||||   |||  |||||| |||  ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |     
T  18470126 gggaaatgctaaccggtgcccccgggggcaccggttaagcatactaaaaaggaaattatatagcagttaatacattgaaattgtgtaattaatttatga- 18470028  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataatt 257  Q
    ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||    
T  18470027 aaagtcaaaaacagttacattttatggtaataatt 18469993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 174 - 257
Target Start/End: Original strand, 20116940 - 20117022
Alignment:
Q  174 gaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataatt 257  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||  ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20116940 gaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtagtaaatttttaa-aaggccaaaaacagttttcttttatgataataatt 20117022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 168 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 18220812 - 18220695
Alignment:
Q  168 aaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatg 267  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||| || | |||||| |||||||||||||| |||||| |  ||||| ||    
T  18220812 aaaaaggaaattatatagtaattaatgtatagaaattgtgtaattaatttataa-aatggcaaaaatagttttcttttatggtaataaattccttttttg 18220714  T
Q  268 gtatgcttaaccagtgccc 286  Q
    |||| ||||| | ||||||    
T  18220713 gtatccttaatcggtgccc 18220695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 125 - 310
Target Start/End: Original strand, 4087626 - 4087808
Alignment:
Q  125 ggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataa 224  Q
    |||||||||||| |||| |||   |||||| |||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |     
T  4087626 ggaaatgctaactggtgtctca--aacactggttaagcatactaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaatagtgtgattaatttataa-ag 4087722  T
Q  225 agtcaaaaacagttttcttttatgataat--aattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
      |||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||||| ||||| |||| | || |||| |||||| || ||||||    
T  4087723 tttcaaaaacag-tttcttttatggtaataaaattc-cttttttggtatgtttaactagtgtctgggagcatcggttaacatgaccct 4087808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 199 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 47118100 - 47118037
Alignment:
Q  199 gaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctctt 262  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  47118100 gaaattgtgtaattaatttataataaagtcaagagcagtttccttttatggtaataattctctt 47118037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 310
Target Start/End: Original strand, 19434495 - 19434680
Alignment:
Q  126 gaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaag-aaattatatagtagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaattgataata 223  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||  |||||||||  ||||| | |||||||||  || ||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||      
T  19434495 gaaatgttaaccggtgcctccggggcactgattaaggataataaaaagggaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatccataaat 19434594  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    ||||||| || | ||  |||||||| ||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||    
T  19434595 aagtcaacaaaacttc-cttttatggtaagaattttctttttttgtatgcttaaccagtgcccgggggcaccggtcagcatgaccct 19434680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 193
Target Start/End: Original strand, 22973600 - 22973667
Alignment:
Q  126 gaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaat 193  Q
    |||||||||||  ||||||||||  |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22973600 gaaatgctaactagtgcctccggggcactggttaatgatataaaaaaagaaattatatagtagttaat 22973667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 234
Target Start/End: Original strand, 3021923 - 3022000
Alignment:
Q  156 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaac 234  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  3021923 gttaagcatattaaaaaggaaattatatactagttaatacattgaaattgtataattaatttataa-aaagtcataaac 3022000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 34557086 - 34556881
Alignment:
Q  114 ataaattttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaag-aaattatatagtagttaatgcattgaaa-ttgtgtaat 211  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||  || | ||||||||||  ||||| | |||||||||  || ||| |||||||||| |||| ||||    
T  34557086 ataattttaagggaaatgctaactggtgcc-ccggggcattggttaaggataataaaaagggaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaat 34556988  T
Q  212 taattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggttagcaggacccta 311  Q
    ||||  ||||  ||||||| || | ||| |||||| | ||| ||||  ||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||     
T  34556987 taatccataaataagtcaacaaaacttt-cttttagggtaagaatttcctttttttgtatgcttaaccagtgcccgg-ggcaccggttagcatgaccct- 34556891  T
Q  312 aattttaatt 321  Q
    ||||||||||    
T  34556890 aattttaatt 34556881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 18220592 - 18220495
Alignment:
Q  156 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 255  Q
    ||||||||||  |||||  ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  18220592 gttaaggatactaaaaagaaaattatatagtaattaatgtattaaaattgtgtaattaatttataa-attgtcaaaaaca-atttcttttataataataa 18220495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 310
Target Start/End: Original strand, 38128291 - 38128479
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaa-ttatatagtagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaattgataa 221  Q
    |||||| | ||| ||||||| |||| ||||  ||||||||||  ||||| |||| ||||||  || ||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  38128291 gggaaaggttaatcggtgcccccgggacaccggttaaggataataaaaaggaaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatctataa 38128390  T
Q  222 taaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
      ||||||| || | ||  |||||||| ||| ||||  ||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  38128391 ataagtcaacaaaacttc-cttttatggtaagaatttcctttttttgtatgcttaaccagtgccccggaggcaccggttagcatgaccct 38128479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 266
Target Start/End: Original strand, 13556474 - 13556553
Alignment:
Q  186 tagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttat 266  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| | |  ||||||| ||||||||  |||||||    
T  13556474 tagtcaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa-aaagtcaataacaatatctttttatggtaataatttccttttat 13556553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18220673 - 18220625
Alignment:
Q  168 aaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatt 216  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  18220673 aaaaaggaaattatatagtaattactgtattgaaattgtgtaattaatt 18220625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 48256785 - 48256749
Alignment:
Q  127 aaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaagga 163  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48256785 aaatgttaaccggtgcctccggaacactagttaagga 48256749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 124 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 47118150 - 47118095
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaatt 179  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  47118150 gggaaatgctaactggtgcctccggggcactggttaaagatatgaaaaaggaaatt 47118095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 30924182 - 30924069
Alignment:
Q  119 ttttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggat-atgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattg-aaattgtgtaattaatt 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||  ||||||||| || ||||  ||||||||||  || ||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  30924182 ttttaggaaaatgctaaccggtgcccccggggcacgggttaaggataataaaaagggaaattatatgttaattagtgcattgaaaattgtttaattaatt 30924083  T
Q  217 gataataaagtcaa 230  Q
     ||||  |||||||    
T  30924082 cataaataagtcaa 30924069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 45842962 - 45842827
Alignment:
Q  121 ttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaag-aaattatatagtagttaatgcatt-gaaattgtgtaattaattga 218  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||| |||| |||||  ||||||| |||||||||  || ||| ||||||  ||||| | ||||||||| |    
T  45842962 ttagggaaatgctaaccggtg-ctctggggcactggttagggataataaaaaagaaaattatatgttaattattgcattaaaaattatttaattaattca 45842864  T
Q  219 taataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 255  Q
    |||  ||||||| || | |||| ||||||||||||||    
T  45842863 taaataagtcaacaaaactttttttttatgataataa 45842827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0524 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0524
Description:

Target: scaffold0524; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 124 - 286
Target Start/End: Original strand, 825 - 987
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  825 gggaaatgctagccggtgcttccggagcactagttaaggatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 924  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 286  Q
    ||||||||| || ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  925 aagtcaaaatcaatttccttttatagtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 124 - 309
Target Start/End: Original strand, 14896 - 15082
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    |||||||||||||||||| | ||||  |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  14896 gggaaatgctaaccggtgtccccggggcactggttaaagatataaaaaaagaaattatatagtagttaatgcactgaaattgtgtagttaatttataata 14995  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||    
T  14996 aagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccggaggcactggttaacaggaccc 15082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 286
Target Start/End: Original strand, 116198 - 116366
Alignment:
Q  118 attttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattg 217  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| ||||  |||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  116198 atttaaggaaaatgctaaccggtgcccccggggcacaggttaaagatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattg 116297  T
Q  218 ataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 286  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  116298 ataataaagtcagaaacagtttccttttatgataataattcccttttatggtatgtttaacccgtgccc 116366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 125 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 6295 - 6109
Alignment:
Q  125 ggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataa 224  Q
    ||||||||||||||||||| | ||  |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  6295 ggaaatgctaaccggtgcccctggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattggaattgtgtaattaaattataataa 6196  T
Q  225 agtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  6195 agtcaaaaacagtttccttttatggtaataatccccttttatggtatgtttaacccgtgccccgggggcaccggttagcaggaccct 6109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1152 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold1152
Description:

Target: scaffold1152; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 121 - 278
Target Start/End: Original strand, 675 - 832
Alignment:
Q  121 ttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgata 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || || |||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  675 ttagggaaatgctaatcggtgcccccagagcacgggttaaagatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatccattgaaattgtgtaattaatttata 774  T
Q  221 ataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaac 278  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  775 ataaagtcaaaaactgttttcttttatggtgataattctcttttatggtatgcttaac 832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 124 - 284
Target Start/End: Original strand, 50548 - 50708
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  50548 gggaaatgttaaccggtgcctccggggcactggttaaagatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgttttgaaattgtataattaatttataata 50647  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgc 284  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  50648 aagtcaaaatcaattttcttttatgataataattctcttttatagtatgtttaaccagtgc 50708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 150 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 53506 - 53358
Alignment:
Q  150 acactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatga 249  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||               
T  53506 acactggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaagtcaaaaacaatt----------- 53418  T
Q  250 taataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggacc 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  53417 taataattctcttttatggtatgcttaactagtgccccggaggcaccggttagcaggacc 53358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 104; Significance: 9e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 123 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 68477 - 68290
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||    
T  68477 agggaaatgctaactggtgcccccggggcactggttaaggatatgaaaaatgaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaaataaattataat 68378  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaa-gcaccggttagcaggaccc 309  Q
    ||||| |||| |||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  68377 aaagttaaaatcagtttccttttaaggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtaccccgaaggcatcggttagcaggaccc 68290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 122 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 53873 - 53684
Alignment:
Q  122 tagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 221  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  53873 tagggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttatca 53774  T
Q  222 taaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccag-tgcccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| | | |||||  ||||||||||||| ||||||    
T  53773 taatgtcaaaaatagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgtttaacccgttccccgggggcaccggttagcaagaccct 53684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 123 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 147092 - 146905
Alignment:
Q  123 agggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  147092 agggaaatgctaaccggtgctcctggggttctagttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatacattgaaattgtgtaattaattgataat 146993  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||   ||||||||||||||||| ||||  ||   ||||||||||||||| |||||    
T  146992 aaagtcaaaaacagttttctattacggtaataatttctttttatggtatgcttaatcagtatccacgagcaccggttagcagaaccct 146905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 124 - 310
Target Start/End: Original strand, 25719 - 25905
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    ||||||||||||| |||||||| || | ||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25719 gggaaatgctaactggtgcctctgggatacgggttaaggatatgaaaaaggaa-ttatatagtaattaatgtattgaaattgtgtaattaatttataata 25817  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||| | |||| |||||| ||||||||    
T  25818 aagtcaaaaacaattttcttttatggtaataattcccttttatggtatccttaaacagtgacccgaaggcacaggttagtaggaccct 25905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0263 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0263
Description:

Target: scaffold0263; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 156 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 19739 - 19585
Alignment:
Q  156 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataa 255  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||     
T  19739 gttaagcatatgaaaaaagaaattatataataattaatgcattgaaattgtgtaatgaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttacgataatag 19640  T
Q  256 ttctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  19639 ttctcttttatgatatgattaatcagtgtcccggaaactccggttagcaggaccc 19585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 94; Significance: 9e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 157 - 309
Target Start/End: Original strand, 40952 - 41105
Alignment:
Q  157 ttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataat 256  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40952 ttaagaatatgaaaaatgaaattatataatagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataatgaagtcaaaaacagtttccttttatgataataat 41051  T
Q  257 tctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    |  |||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||    
T  41052 ttccttttatgatatgcttaaccagtgtcccggagacaccggttggcaggaccc 41105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 151 - 310
Target Start/End: Original strand, 69253 - 69412
Alignment:
Q  151 cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgat 250  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| | |    
T  69253 cactcgttaaggatatgaaaaagtaaattatatagtagttaatacattaaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttttttttaaggt 69352  T
Q  251 aataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcc-cggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  69353 aataatt-tcttttatggtatgcttaaccagtgcctcgggagcaccggttagaaggaccct 69412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 124 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 33866 - 33709
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    |||||||||||| |  |||||| ||| |||| |||||| |||| ||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  33866 gggaaatgctaatccatgcctc-ggagcacttgttaagtatattaaaatggaaattatataatagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataa-a 33769  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg 283  Q
    |  | ||||| |||||||||||||| |||||||| ||| || || |||||||||| ||||    
T  33768 agataaaaaatagttttcttttatgctaataattttctcttttgatatgcttaactagtg 33709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 185 - 309
Target Start/End: Original strand, 10771 - 10896
Alignment:
Q  185 gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgc 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  10771 gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccatttatggtatgcttaaccagtgc 10870  T
Q  285 c-cggaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    | |||  ||| |||||||||||||||    
T  10871 ctcgggggcagcggttagcaggaccc 10896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0325 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0325
Description:

Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 161 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 17619 - 17502
Alignment:
Q  161 ggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctc 260  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  17619 ggatatgaaaaagaaaattatatagtagctaatgcattgaaattgtg-aattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattcct 17521  T
Q  261 ttttatggtatgcttaacc 279  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  17520 ttttatggtatgtttaacc 17502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 151 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 8056 - 7959
Alignment:
Q  151 cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatg 248  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  8056 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcagaaacagtttccttttatg 7959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0549 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0549
Description:

Target: scaffold0549; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 151 - 248
Target Start/End: Original strand, 7315 - 7412
Alignment:
Q  151 cactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatg 248  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  7315 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcagaaacagtttccttttatg 7412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0549; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 311
Target Start/End: Original strand, 7405 - 7457
Alignment:
Q  260 cttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggacccta 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  7405 cttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggtaccggttagcaggacccta 7457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1266 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold1266
Description:

Target: scaffold1266; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 122 - 282
Target Start/End: Original strand, 291 - 450
Alignment:
Q  122 tagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 221  Q
    ||||||||| |||||||||||| | ||  |||| |||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  291 tagggaaatcctaaccggtgccccaggg-cactggttaagcatatgaaaaagaaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaataaatttataa 389  T
Q  222 taaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagt 282  Q
    |||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  390 taaagtcaaaaacagtttccttctacggtaataattctcttttatgatatgattaatcagt 450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 127 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 95767 - 95616
Alignment:
Q  127 aaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaag 226  Q
    ||||||||||||||||| |||    ||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  95767 aaatgctaaccggtgcccccgaggtactggttaagaatatgaaaaaggaaattatataataattaatgaattgaaattatgtaattaatttataataaag 95668  T
Q  227 tcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaacc 279  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  95667 tc-aaaacagttttcttttatggtaataattcccttttatggtatgtttaacc 95616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 120 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 11158 - 11032
Alignment:
Q  120 tttagggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgat 219  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  11158 tttagggaaatgctaactggtgcc-ccgga-cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatattagttaatgcattgaaattgtgtaattaaactat 11061  T
Q  220 aataaagtcaaaaacagttttcttttatg 248  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  11060 aataaagtcaaaaacagtttcattttatg 11032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 189 - 309
Target Start/End: Original strand, 233918 - 234039
Alignment:
Q  189 ttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgc-ccg 287  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||| || | |||    
T  233918 ttaattcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgaaaataatttccttttatggtatgtttaaccggtactccg 234017  T
Q  288 gaagcaccggttagcaggaccc 309  Q
    |  |||||||||||||||||||    
T  234018 ggggcaccggttagcaggaccc 234039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 124 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 74659 - 74526
Alignment:
Q  124 gggaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtag-ttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 222  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||| |||  |||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  74659 gggaaatactaaccggtacc-ccggaatactgattaaagatatgaaaaaaaaaattatatagtaaattaatgtagtgaaattgtataattaattgataat 74561  T
Q  223 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataatt 257  Q
    ||| | |||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  74560 aaattaaaaaacaaatttcttttatggtaataatt 74526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0533 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0533
Description:

Target: scaffold0533; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 156 - 221
Target Start/End: Original strand, 5071 - 5136
Alignment:
Q  156 gttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 221  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  5071 gttaagaatattaaaaaaaaaattatatagtagttaatttattgaaattgtgtaattaatttataa 5136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1128 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1128
Description:

Target: scaffold1128; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 215
Target Start/End: Original strand, 1415 - 1462
Alignment:
Q  168 aaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaat 215  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1415 aaaaaagaaattatataatagttattgcattgaaattgtgtaattaat 1462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 280
Target Start/End: Original strand, 66426 - 66555
Alignment:
Q  152 actagttaaggatatgaaaaaa-gaaattatatagtagttaatgcattg-aaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatga 249  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||| ||| | ||||| |||| | |||| | |    
T  66426 actagttaaggatacgaaaaaatgaagttatataatagttattgcattgaaaattgtgtaattaatccataa-aaaataaaaaaaagttatattttttaa 66524  T
Q  250 taataattctcttttatggtatgcttaacca 280  Q
    |||||| | |||||| || ||| ||||||||    
T  66525 taataactttcttttttgttatccttaacca 66555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 509173 - 508986
Alignment:
Q  126 gaaatgctaaccggtgcctccggaacactagttaaggat-atgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattg-aaattgtgtaattaattgataata 223  Q
    |||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||| || ||||  ||||||||||  || ||| || |||| ||||||| ||||||||| ||||      
T  509173 gaaatgctaaccggtgcccccgg-atattagttaaggataataaaaatggaaattatatgttaattattgaattgaaaattgtttaattaattcataaat 509075  T
Q  224 aagtcaaaaacagttttcttttatgataataatt--ctcttttatggtatgcttaaccagtg-cccggaagcaccggttagcaggaccct 310  Q
    ||||||| || |  ||||||||||| ||| ||||  || |||| | |||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  509074 aagtcaacaa-aactttcttttatggtaaaaatttcctttttttttgtatgcttaaacggtgccccggaggcaccggttagcatgaccct 508986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University