View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6187_low_17 (Length: 240)

Name: NF6187_low_17
Description: NF6187
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6187_low_17
NF6187_low_17
[»] chr8 (31 HSPs)
chr8 (14-229)||(23967740-23967950)
chr8 (14-229)||(42062014-42062224)
chr8 (14-229)||(44938999-44939209)
chr8 (14-229)||(6301826-6302036)
chr8 (14-229)||(14080182-14080397)
chr8 (14-229)||(41975889-41976104)
chr8 (14-229)||(37028394-37028604)
chr8 (14-229)||(19396698-19396913)
chr8 (14-230)||(22357797-22358014)
chr8 (14-229)||(33425607-33425822)
chr8 (14-229)||(44598196-44598411)
chr8 (14-229)||(30824874-30825091)
chr8 (20-229)||(19246603-19246812)
chr8 (20-229)||(19319787-19319996)
chr8 (12-229)||(45295402-45295619)
chr8 (14-217)||(36603420-36603623)
chr8 (15-229)||(12758925-12759139)
chr8 (14-218)||(41155073-41155277)
chr8 (14-229)||(41627323-41627538)
chr8 (14-229)||(29432742-29432957)
chr8 (14-229)||(38960989-38961204)
chr8 (14-229)||(38991334-38991549)
chr8 (14-223)||(42812302-42812511)
chr8 (14-229)||(41906280-41906494)
chr8 (14-229)||(44384292-44384507)
chr8 (14-229)||(39203063-39203277)
chr8 (14-136)||(20664280-20664402)
chr8 (131-229)||(23627163-23627260)
chr8 (14-136)||(30549646-30549768)
chr8 (14-136)||(44214396-44214518)
chr8 (46-85)||(27629246-27629285)
[»] chr7 (36 HSPs)
chr7 (14-229)||(6912711-6912921)
chr7 (14-229)||(47574689-47574899)
chr7 (14-229)||(3794193-3794408)
chr7 (14-229)||(27736416-27736631)
chr7 (14-229)||(31899147-31899362)
chr7 (14-230)||(23767804-23768020)
chr7 (14-229)||(17169740-17169955)
chr7 (14-229)||(47164925-47165140)
chr7 (14-229)||(47173170-47173385)
chr7 (14-229)||(9148072-9148287)
chr7 (14-228)||(33640053-33640267)
chr7 (14-229)||(19518704-19518920)
chr7 (14-228)||(19519276-19519494)
chr7 (14-228)||(19519850-19520068)
chr7 (14-229)||(5961380-5961594)
chr7 (14-229)||(17481067-17481282)
chr7 (14-229)||(17571932-17572147)
chr7 (14-229)||(17476621-17476836)
chr7 (14-229)||(17512264-17512479)
chr7 (14-229)||(17540735-17540950)
chr7 (14-229)||(17576378-17576593)
chr7 (14-229)||(39650307-39650522)
chr7 (14-229)||(42686249-42686464)
chr7 (12-229)||(11499312-11499529)
chr7 (41-229)||(14307601-14307791)
chr7 (14-229)||(8927259-8927476)
chr7 (15-229)||(48529119-48529333)
chr7 (14-229)||(9227589-9227803)
chr7 (14-229)||(42916539-42916745)
chr7 (14-229)||(42245950-42246154)
chr7 (14-136)||(19035014-19035136)
chr7 (14-136)||(20719500-20719622)
chr7 (14-136)||(20764170-20764292)
chr7 (14-136)||(29489748-29489870)
chr7 (14-136)||(33231314-33231436)
chr7 (14-136)||(34283457-34283579)
[»] chr6 (28 HSPs)
chr6 (14-229)||(13458084-13458294)
chr6 (14-229)||(1074635-1074850)
chr6 (14-229)||(18600358-18600573)
chr6 (14-229)||(7221404-7221619)
chr6 (14-229)||(25531929-25532144)
chr6 (14-229)||(9980418-9980633)
chr6 (14-229)||(24444641-24444856)
chr6 (14-229)||(34854616-34854831)
chr6 (14-229)||(1219238-1219453)
chr6 (14-229)||(4423058-4423273)
chr6 (14-229)||(14889310-14889525)
chr6 (14-230)||(3052151-3052367)
chr6 (14-229)||(2519817-2520032)
chr6 (14-229)||(33977630-33977845)
chr6 (14-229)||(34319750-34319966)
chr6 (14-229)||(15274263-15274478)
chr6 (14-229)||(1080962-1081176)
chr6 (15-229)||(7220166-7220380)
chr6 (14-228)||(11937158-11937363)
chr6 (14-159)||(17938253-17938397)
chr6 (14-136)||(248681-248803)
chr6 (14-136)||(12581150-12581272)
chr6 (14-129)||(3089402-3089517)
chr6 (93-228)||(11269271-11269408)
chr6 (93-196)||(11517944-11518047)
chr6 (14-90)||(11517746-11517822)
chr6 (181-229)||(22375250-22375298)
chr6 (49-82)||(11269536-11269569)
[»] chr5 (30 HSPs)
chr5 (14-229)||(19394131-19394346)
chr5 (14-229)||(31296894-31297104)
chr5 (14-229)||(12589635-12589850)
chr5 (14-229)||(34716302-34716517)
chr5 (14-229)||(20997300-20997515)
chr5 (14-229)||(41689989-41690204)
chr5 (14-229)||(25697878-25698092)
chr5 (14-229)||(34375763-34375978)
chr5 (14-229)||(3027101-3027316)
chr5 (14-229)||(19446786-19447001)
chr5 (14-230)||(20348627-20348843)
chr5 (14-229)||(26322435-26322651)
chr5 (14-229)||(33612501-33612717)
chr5 (14-229)||(2193429-2193644)
chr5 (12-229)||(27064544-27064761)
chr5 (14-229)||(12420359-12420574)
chr5 (14-229)||(21028850-21029065)
chr5 (15-210)||(35541223-35541418)
chr5 (14-229)||(1853280-1853493)
chr5 (14-229)||(4880927-4881142)
chr5 (14-229)||(30141217-30141432)
chr5 (14-229)||(289251-289465)
chr5 (15-229)||(3398696-3398910)
chr5 (14-229)||(3151966-3152188)
chr5 (14-229)||(3211559-3211773)
chr5 (14-229)||(7284337-7284534)
chr5 (131-229)||(9701545-9701642)
chr5 (14-136)||(37463135-37463257)
chr5 (118-229)||(18039615-18039720)
chr5 (14-122)||(18037376-18037476)
[»] chr4 (38 HSPs)
chr4 (14-229)||(15519548-15519758)
chr4 (14-229)||(741657-741867)
chr4 (14-229)||(575383-575598)
chr4 (14-229)||(17738737-17738952)
chr4 (14-229)||(33504366-33504581)
chr4 (14-229)||(52799740-52799955)
chr4 (14-229)||(14830889-14831104)
chr4 (14-229)||(19589542-19589757)
chr4 (14-229)||(35496893-35497111)
chr4 (14-229)||(35713485-35713700)
chr4 (14-229)||(39715876-39716091)
chr4 (14-229)||(16903967-16904185)
chr4 (14-229)||(7645490-7645705)
chr4 (14-229)||(23477599-23477814)
chr4 (14-217)||(56000078-56000281)
chr4 (14-229)||(34057943-34058158)
chr4 (14-229)||(1943194-1943409)
chr4 (14-229)||(5275124-5275339)
chr4 (14-229)||(39746224-39746439)
chr4 (12-229)||(15656188-15656404)
chr4 (14-197)||(28971820-28972003)
chr4 (14-229)||(36855826-36856040)
chr4 (14-229)||(53341104-53341319)
chr4 (14-202)||(19832765-19832953)
chr4 (14-229)||(13626746-13626962)
chr4 (14-229)||(28136434-28136649)
chr4 (113-228)||(40618504-40618619)
chr4 (14-229)||(47721443-47721656)
chr4 (118-229)||(41984705-41984816)
chr4 (93-228)||(16891728-16891863)
chr4 (14-136)||(10260686-10260808)
chr4 (14-136)||(21563647-21563769)
chr4 (14-136)||(26925628-26925750)
chr4 (14-136)||(43331168-43331290)
chr4 (14-136)||(51451234-51451356)
chr4 (14-136)||(24078756-24078878)
chr4 (14-91)||(40620979-40621056)
chr4 (14-82)||(16891991-16892059)
[»] chr2 (33 HSPs)
chr2 (14-229)||(6344077-6344287)
chr2 (14-229)||(14324561-14324771)
chr2 (14-229)||(1994289-1994499)
chr2 (14-229)||(9918052-9918267)
chr2 (14-229)||(10049348-10049563)
chr2 (14-229)||(4292000-4292215)
chr2 (14-229)||(21096412-21096627)
chr2 (14-229)||(28500998-28501208)
chr2 (14-229)||(26826240-26826454)
chr2 (14-229)||(33905008-33905223)
chr2 (14-229)||(42884104-42884319)
chr2 (15-229)||(19168982-19169196)
chr2 (14-229)||(9544978-9545193)
chr2 (14-229)||(16882644-16882859)
chr2 (14-229)||(17040334-17040549)
chr2 (14-229)||(28607935-28608150)
chr2 (14-229)||(36634440-36634655)
chr2 (14-229)||(18094077-18094291)
chr2 (14-229)||(30568219-30568434)
chr2 (14-229)||(45206320-45206535)
chr2 (14-229)||(26820341-26820546)
chr2 (14-229)||(14751883-14752097)
chr2 (114-228)||(4810281-4810395)
chr2 (93-228)||(7360626-7360762)
chr2 (14-136)||(3709715-3709837)
chr2 (14-136)||(11867579-11867701)
chr2 (14-136)||(35358972-35359094)
chr2 (131-224)||(17091144-17091236)
chr2 (131-224)||(17024959-17025051)
chr2 (131-224)||(17036636-17036728)
chr2 (14-82)||(4810407-4810475)
chr2 (14-90)||(7360882-7360958)
chr2 (14-60)||(33665128-33665174)
[»] chr1 (29 HSPs)
chr1 (14-229)||(18110407-18110617)
chr1 (14-229)||(43255904-43256114)
chr1 (14-229)||(50396318-50396528)
chr1 (14-229)||(29842036-29842251)
chr1 (14-229)||(42681081-42681296)
chr1 (14-229)||(10695540-10695755)
chr1 (14-229)||(4890814-4891029)
chr1 (14-229)||(18812903-18813118)
chr1 (14-229)||(29187458-29187673)
chr1 (14-229)||(33360416-33360631)
chr1 (14-229)||(41964280-41964495)
chr1 (14-229)||(28567068-28567283)
chr1 (14-229)||(41831405-41831619)
chr1 (12-229)||(51967080-51967296)
chr1 (14-229)||(31618373-31618589)
chr1 (14-229)||(34690810-34691025)
chr1 (14-229)||(34686272-34686487)
chr1 (14-229)||(50559735-50559950)
chr1 (14-225)||(52308524-52308735)
chr1 (15-229)||(13663767-13663981)
chr1 (14-229)||(38846574-38846789)
chr1 (14-223)||(18095503-18095712)
chr1 (14-229)||(48339079-48339293)
chr1 (14-228)||(52522919-52523122)
chr1 (104-229)||(10700519-10700644)
chr1 (37-213)||(17709792-17709972)
chr1 (84-229)||(21729435-21729580)
chr1 (14-229)||(49224970-49225177)
chr1 (14-90)||(15314077-15314153)
[»] chr3 (35 HSPs)
chr3 (14-229)||(39797694-39797904)
chr3 (14-229)||(5253606-5253816)
chr3 (14-229)||(6105478-6105693)
chr3 (14-229)||(11952641-11952856)
chr3 (14-229)||(16340350-16340565)
chr3 (14-229)||(31370381-31370596)
chr3 (14-229)||(35089199-35089414)
chr3 (14-229)||(40828291-40828507)
chr3 (14-229)||(50772559-50772774)
chr3 (14-225)||(21700922-21701133)
chr3 (14-229)||(52841886-52842101)
chr3 (14-229)||(54794318-54794533)
chr3 (14-229)||(48975359-48975574)
chr3 (14-229)||(18742152-18742367)
chr3 (14-229)||(22476394-22476604)
chr3 (14-229)||(52854805-52855020)
chr3 (14-229)||(54648874-54649089)
chr3 (14-229)||(50740079-50740295)
chr3 (14-208)||(8241403-8241597)
chr3 (15-229)||(16494557-16494771)
chr3 (15-229)||(35435652-35435866)
chr3 (12-229)||(23192208-23192425)
chr3 (14-229)||(17911115-17911329)
chr3 (14-224)||(49111759-49111964)
chr3 (14-229)||(12169298-12169514)
chr3 (14-223)||(2846111-2846323)
chr3 (14-161)||(51247115-51247262)
chr3 (14-229)||(36168816-36169035)
chr3 (118-229)||(52463389-52463500)
chr3 (116-224)||(11327299-11327407)
chr3 (14-111)||(11327006-11327103)
chr3 (14-93)||(55296143-55296222)
chr3 (14-136)||(917468-917590)
chr3 (14-136)||(44074074-44074196)
chr3 (161-229)||(55296220-55296288)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (14-229)||(8605-8820)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (14-229)||(19737-19952)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (14-229)||(27723-27938)
[»] scaffold1884 (1 HSPs)
scaffold1884 (14-229)||(506-721)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (14-229)||(12484-12699)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (14-229)||(16694-16909)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (14-229)||(14210-14424)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (14-229)||(65991-66206)
scaffold0006 (15-229)||(153532-153746)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (14-229)||(5617-5832)
scaffold0032 (14-229)||(12066-12281)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (14-229)||(59294-59509)
scaffold0010 (14-229)||(118718-118933)
[»] scaffold0051 (2 HSPs)
scaffold0051 (14-229)||(48743-48959)
scaffold0051 (14-229)||(64128-64344)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 31)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 23967740 - 23967950
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23967740 caattgttacatatatttgggttgccaatgactacaaaatggaag-----aactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttccc 23967834  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23967835 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 23967934  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  23967935 gaaaataatacctttt 23967950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 42062014 - 42062224
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42062014 caattgttacatatatttgggttgccaatgactacaaaatggaag-----aactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttccc 42062108  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42062109 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 42062208  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  42062209 gaaaataatacctttt 42062224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 44939209 - 44938999
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44939209 caattgttacatatatttgggttgccaatgactacaaaatggaag-----aactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttccc 44939115  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44939114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 44939015  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
     |||||||||||||||    
T  44939014 aaaaataatacctttt 44938999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 6301826 - 6302036
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  6301826 caattgttacatatatttgggttgccaatgactacaaaatggaag-----aactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacagagtatttttccc 6301920  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6301921 atagtgttacatcaactatattcccactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgacgttgacaaatta 6302020  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  6302021 gaaaataatacctttt 6302036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 14080182 - 14080397
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  14080182 caattgttacatatatttgggttgtcattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacggagtatttttccc 14080281  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14080282 atagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaagacatttttcgggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaaata 14080381  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  14080382 gaaaataatacctttt 14080397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 41976104 - 41975889
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |    
T  41976104 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatgttaaatgataaagctacggaatatttttccc 41976005  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||    
T  41976004 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcatgtcattatcaaacttatacaaaatcatatcatcttatgctgacaaatta 41975905  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  41975904 gaaaataatacctttt 41975889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 37028604 - 37028394
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  37028604 caattgttacatatatttgggttgccaatgactataaaatggaag-----aactcaagataaatagatggtaaatgatcaagctacggagtattttttcc 37028510  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37028509 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaagaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 37028410  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
     |||||||||||||||    
T  37028409 aaaaataatacctttt 37028394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 19396698 - 19396913
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |    
T  19396698 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacgaaatatttttccc 19396797  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||    
T  19396798 atagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaagacatctttcgggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatccgatgctgacaaaata 19396897  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  19396898 gaaaataatacctttt 19396913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 230
Target Start/End: Original strand, 22357797 - 22358014
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  22357797 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaagaattcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacggagtatttttttc 22357896  T
Q  114 -atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatt 212  Q
     ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  22357897 catagtgttacatcaactatatttccactacataaggaaagacatctttcgggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatctgatgttgacaaaat 22357996  T
Q  213 agaaaataataccttttt 230  Q
    | ||||||||||||||||    
T  22357997 ataaaataataccttttt 22358014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 33425607 - 33425822
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |    
T  33425607 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaggaactcaagttaaatagatggtaaatgataaagctacgaagtatttttccc 33425706  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33425707 atagtgttacatcaactatattcccactatataaggaaaaacatttttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaaata 33425806  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||| ||||    
T  33425807 gaaaataatacatttt 33425822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 44598411 - 44598196
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  44598411 caattgttacatatatttgggttgacattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacggagtatttttccc 44598312  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  44598311 atagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaagacattattcgggtcattatcaaacttatacaaaattctaacatctgatgctgacaaaata 44598212  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    |||||||||| |||||    
T  44598211 gaaaataatatctttt 44598196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 30825091 - 30824874
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttct- 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |     
T  30825091 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaagacctcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacagagtatttttttt 30824992  T
Q  113 -catagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaat 211  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  30824991 ccatagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaagatatttttcgggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgagaaaa 30824892  T
Q  212 tagaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||||    
T  30824891 tagaaaataatacctttt 30824874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19246812 - 19246603
Alignment:
Q  20 ttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctcatagtg 119  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||| |||||||    
T  19246812 ttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagtaaagaactcaaggtaaatagatggtaaattataaagctacggaatatatttcccatagtg 19246713  T
Q  120 ttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaattagaaaat 219  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  19246712 ttacatcaaccatattcccactgcataagaaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatctgatgctgataaattagaaaat 19246613  T
Q  220 aatacctttt 229  Q
    ||||||||||    
T  19246612 aatacctttt 19246603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19319996 - 19319787
Alignment:
Q  20 ttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctcatagtg 119  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||| |||||||    
T  19319996 ttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagtaaagaactcaaggtaaatagatggtaaattataaagctacggaatatatttcccatagtg 19319897  T
Q  120 ttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaattagaaaat 219  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  19319896 ttacatcaaccatattcccactgcataagaaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatctgatgctgataaattagaaaat 19319797  T
Q  220 aatacctttt 229  Q
    ||||||||||    
T  19319796 aatacctttt 19319787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Original strand, 45295402 - 45295619
Alignment:
Q  12 atcaattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttc 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  | ||||||||    
T  45295402 atcaattgttacatatatttgggttgtcattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatgataaatgataaagctacaaaatatttttc 45295501  T
Q  112 tcatagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaat 211  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  45295502 ccatagtgttacatcaactatattcccactacataagaaaagacatctttcagatcattatcaaacttatacaaaatcctatcatctgatgctgataaat 45295601  T
Q  212 tagaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||||    
T  45295602 tagaaaataatacctttt 45295619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 36603420 - 36603623
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  36603420 caattgttacatatatttgggttgccattgactataaaatggaagcaaagaactcaagctaaatagatggtaaatgataaagctacggagtatttttccc 36603519  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  36603520 atagtgttacatcaactatattcccattacataaggaaagacatttttcgggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgctgacaaaata 36603619  T
Q  214 gaaa 217  Q
    ||||    
T  36603620 gaaa 36603623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12759139 - 12758925
Alignment:
Q  15 aattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctca 114  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||    
T  12759139 aattgttatatatatttgggttgtcattgactataaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacgtaatatttttccca 12759040  T
Q  115 tagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaattag 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||     
T  12759039 tagtgttatatcaactatattctcactgcataaggaaagacatcttttaggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatcttatgctgacaaattat 12758940  T
Q  215 aaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||| |||||    
T  12758939 aaaataatatctttt 12758925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 41155277 - 41155073
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | || ||||| |    
T  41155277 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagtaaggaactcaaggtaaatagatggtaaatgaaaaagctacgaaatagttttccc 41155178  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||     
T  41155177 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcaccttatgctgacaaattt 41155078  T
Q  214 gaaaa 218  Q
    |||||    
T  41155077 gaaaa 41155073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 41627538 - 41627323
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    ||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||      
T  41627538 caattgttacatatatttgagttgtcattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacagagtatttttcct 41627439  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||    
T  41627438 atagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaagacatctttcgggtcatcatcaaacttatacaaaatcctatcatctgatgctgacaaaata 41627339  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
     |||||||||| ||||    
T  41627338 aaaaataatacatttt 41627323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 29432957 - 29432742
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    ||||||||  |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  29432957 caattgttgtatatatttaggttgtcattgactacgaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatggtaaagctacgaagtatttttctc 29432858  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    |||||||||||||||| |||||   |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  29432857 atagtgttacatcaaccatatttctactgcataaggaaatacatctttcagatcattatcaaacttatacaaaattttatcatctgatgctaacaaatta 29432758  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||| ||||    
T  29432757 gaaaataatacatttt 29432742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 38961204 - 38960989
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||  ||||||||||||    
T  38961204 caattgttacatatatttgggttgccattgactataaaatggatgcaaagaactcaaggtaaatagatgttaaatgataaagttacaaagtatttttctc 38961105  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||    
T  38961104 atagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaagacatctttcggatcattaccaaacttatacaaaatcctatcatctaatgctgacaaaata 38961005  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  38961004 gaaaataatacctttt 38960989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 38991549 - 38991334
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||  ||||||||||||    
T  38991549 caattgttacatatatttgggttgccattgactataaaatggatgcaaagaactcaaggtaaatagatgttaaatgataaagttacaaagtatttttctc 38991450  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||    
T  38991449 atagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaagacatctttcggatcattaccaaacttatacaaaatcctatcatctaatgctgacaaaata 38991350  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  38991349 gaaaataatacctttt 38991334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 223
Target Start/End: Original strand, 42812302 - 42812511
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |    
T  42812302 caattattacatatatttgggttgtcattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctatggcgtatttttccc 42812401  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||    
T  42812402 atagtgttacatcaactatatttccactacattaggaaagacatctttcgggtaattatcaaacttatacaaaatcctatcatctgatgctgacaaaata 42812501  T
Q  214 gaaaataata 223  Q
    ||||||||||    
T  42812502 gaaaataata 42812511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 41906494 - 41906280
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||| |    
T  41906494 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaagtactcagggtaaatatatggtaaatgataaagctacgaaatatttttc-c 41906396  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  41906395 atagtgtcacatcaaccatattcccactgcataagtaaatacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaatcttatcatctgatgctgacaaatta 41906296  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
     |||||||||||||||    
T  41906295 aaaaataatacctttt 41906280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 44384292 - 44384507
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||  |    
T  44384292 caattgttacatatatttgggttgtcattaactgcaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgacaaagctacgaaatattttttcc 44384391  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  44384392 atagtgttacatcaactatatcctcactacataagaaaagacattttttaggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatcttatgctgacaaatta 44384491  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  44384492 gaaaataatacctttt 44384507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 39203277 - 39203063
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| | |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |    
T  39203277 caattgttacatatattttgattgttattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacaaagtatttttccc 39203178  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    |||||||||   |||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||    
T  39203177 atagtgttaatccaaccatattcccactgcataaggaaatacatatttcagatcattatcaaacttatacaaaatt-tatcttctaatgctgacaaatta 39203079  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  39203078 gaaaataatacctttt 39203063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 136
Target Start/End: Original strand, 20664280 - 20664402
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||| | |    
T  20664280 caattgttacatctatttgcgttgtcattgactacaaaatagaagcaaagaattcaaggtaaataaatggtaaatgataaagctacaaagtattttaccc 20664379  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattc 136  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  20664380 ataatgttacatcaactatattc 20664402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 131 - 229
Target Start/End: Original strand, 23627163 - 23627260
Alignment:
Q  131 atattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaattagaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  23627163 atattctca-tgcataaggaaatacatcttttaggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatttgatgctgacaaattagaaaataatacatttt 23627260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 136
Target Start/End: Original strand, 30549646 - 30549768
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||| | |    
T  30549646 caattgttacatctatttgcgttgtcattgactacaaaatagaagcaaagaattcaaggtaaataaatggtaaatgataaagctacaaagtattttaccc 30549745  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattc 136  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  30549746 ataatgttacatcaactatattc 30549768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 136
Target Start/End: Original strand, 44214396 - 44214518
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||| | |    
T  44214396 caattgttacatctatttgcgttgtcattgactacaaaatagaagcaaagaattcaaggtaaataaatggtaaatgataaagctacaaagtattttaccc 44214495  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattc 136  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  44214496 ataatgttacatcaactatattc 44214518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 27629285 - 27629246
Alignment:
Q  46 tacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggta 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27629285 tacaaaatggaagcaaagaactcaagataaatagatggta 27629246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 36)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 6912711 - 6912921
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6912711 caattgttacatatatttgggttgccaatgactacaaaatggaag-----aactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttccc 6912805  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6912806 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 6912905  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  6912906 gaaaataatacctttt 6912921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 47574689 - 47574899
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47574689 caattgttacatatatttgggttgccaatgactacaaaatggaag-----aactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttccc 47574783  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47574784 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 47574883  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  47574884 gaaaataatacctttt 47574899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3794408 - 3794193
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    ||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |    
T  3794408 caattgttacatatatttgagttgtcattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacggaatatttttccc 3794309  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  3794308 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaagtcattatcaaacttatacaaaattctatcatcttatgctgacaaatta 3794209  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  3794208 gaaaataatacctttt 3794193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 27736416 - 27736631
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||      
T  27736416 caattgttacatatattttggttgccattgactataaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacgaaatatttttcca 27736515  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  27736516 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatcttatgctgacaaatta 27736615  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  27736616 gaaaataatacctttt 27736631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 31899147 - 31899362
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  31899147 caattgttacatatatttaggttgccattgactacaaaatggaagcaaagaactcgaggtaaatagatggtaaatgataaagctacgaaatatttttctc 31899246  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |    
T  31899247 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaatacatctttcaagtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatcttatgctgacaaataa 31899346  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  31899347 gaaaataatacctttt 31899362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 230
Target Start/End: Original strand, 23767804 - 23768020
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  23767804 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaggaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacggagtatttttccc 23767903  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23767904 atagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaagatatttttcgggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaaata 23768003  T
Q  214 gaaaataataccttttt 230  Q
    ||||||||||| |||||    
T  23768004 gaaaataatacattttt 23768020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17169955 - 17169740
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |    
T  17169955 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaagaactcgaggtaaatagatggtaaatgataaagctacgaaatatttttccc 17169856  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |    
T  17169855 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaatacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatcttatgctgacaaataa 17169756  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  17169755 gaaaataatacctttt 17169740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 47164925 - 47165140
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |    
T  47164925 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacgaagtatttttccc 47165024  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    || ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47165025 atggtgttacatcagccatattcccactgcataaggaaatacatcttttagatcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgctgacaaatta 47165124  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  47165125 gaaaataatacctttt 47165140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 47173385 - 47173170
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  47173385 caattgttttatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacagagtatttttccc 47173286  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  47173285 atagtgttacatcaactatattcccactccataaggaaagacatctttcaagtcattattaaacttatacaaaattctatcatctgatgctgaaaaatta 47173186  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  47173185 gaaaataatacctttt 47173170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9148287 - 9148072
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||  |    
T  9148287 caattgttacataaatttgggttgtcattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagcttcgaaatatttttacc 9148188  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||    
T  9148187 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatcttatgctggcaaatta 9148088  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  9148087 gaaaataatacctttt 9148072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 228
Target Start/End: Original strand, 33640053 - 33640267
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||| |    
T  33640053 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacaaaatatttttccc 33640152  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  33640153 atagtgttacatcaactatattctcgctgcataagaaaagacatctttcaggtcattattaaacttatacaaaatcctatcatcttatgctgacaaatta 33640252  T
Q  214 gaaaataataccttt 228  Q
    || ||||||||||||    
T  33640253 gacaataataccttt 33640267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19518920 - 19518704
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaa-tagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttct 112  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||      
T  19518920 caatttttacatatatttgggttgccattgaatacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaaatagatggtaaatgataaagctacggaatattttttc 19518821  T
Q  113 catagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19518820 catagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaagacatctttcgggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaaat 19518721  T
Q  213 agaaaataatacctttt 229  Q
    | |||||||||||||||    
T  19518720 aaaaaataatacctttt 19518704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19519494 - 19519276
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaa-tagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttct 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  19519494 caattgttacatatatttgggttgccattgaatacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaaatagatggtaaatgataaagctacggagtattttttt 19519395  T
Q  113 ---catagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaa 209  Q
       |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19519394 ttccatagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaagacatctttcgggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgctgacaa 19519295  T
Q  210 attagaaaataataccttt 228  Q
    | |||||||||||||||||    
T  19519294 aatagaaaataataccttt 19519276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19520068 - 19519850
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaa-tagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttct 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  19520068 caattgttacatatatttgggttgccattgaatacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaaatagatggtaaatgataaagctacggagtattttttt 19519969  T
Q  113 ---catagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaa 209  Q
       |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19519968 ttccatagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaagacatctttcgggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgctgacaa 19519869  T
Q  210 attagaaaataataccttt 228  Q
    | |||||||||||||||||    
T  19519868 aatagaaaataataccttt 19519850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5961594 - 5961380
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |    
T  5961594 caattgttacatgtatttgggttgtcattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacatagtatttttccc 5961495  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||    
T  5961494 atagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatctgatgctgacaaaata 5961395  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    | ||||||||||||||    
T  5961394 g-aaataatacctttt 5961380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17481282 - 17481067
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  17481282 caattgttacatatatttgggttgacattgactacaaaatggaagcaaagaacacaaggtaaatagatagtaaatgataaagctacggagtatttttccc 17481183  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||    
T  17481182 atagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaagacatctttcgggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatctgatgctggcaaaata 17481083  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    |||||||||| |||||    
T  17481082 gaaaataatatctttt 17481067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 17571932 - 17572147
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  17571932 caattgttacatatatttgggttgacattgactacaaaatggaagcaaagaacacaaggtaaatagatagtaaatgataaagctacggagtatttttccc 17572031  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||    
T  17572032 atagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaagacatctttcgggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatctgatgctggcaaaata 17572131  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    |||||||||| |||||    
T  17572132 gaaaataatatctttt 17572147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17476836 - 17476621
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  17476836 caattgttacatatatttgggttgacattgactacaaaatggaagcaaagaacacaaggtaaatagatagtaaatgataaagctacggagtatttttccc 17476737  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||    
T  17476736 atagtgttacatcaactatattcccactacataagaaaagacatctttcgggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatctgatgctggcaaaata 17476637  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    |||||||||| |||||    
T  17476636 gaaaataatatctttt 17476621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17512479 - 17512264
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  17512479 caattgttacatatatttgggttgagattgactacaaaatggaagcaaagaacacaaggtaaatagatagtaaatgataaagctacggagtatttttccc 17512380  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||    
T  17512379 atagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaagacatctttcgggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatctgatgctggcaaaata 17512280  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    |||||||||| |||||    
T  17512279 gaaaataatatctttt 17512264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 17540735 - 17540950
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  17540735 caattgttacatatatttgggttgagattgactacaaaatggaagcaaagaacacaaggtaaatagatagtaaatgataaagctacggagtatttttccc 17540834  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||    
T  17540835 atagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaagacatctttcgggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatctgatgctggcaaaata 17540934  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    |||||||||| |||||    
T  17540935 gaaaataatatctttt 17540950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 17576378 - 17576593
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  17576378 caattgttacatatatttgggttgacattgactacaaaatggaagcaaagaacacaaggtaaatagatagtaaatgataaagctacggagtatttttccc 17576477  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||    
T  17576478 atagtgttacatcaactatattcccactacataagaaaagacatctttcgggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatctgatgctggcaaaata 17576577  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    |||||||||| |||||    
T  17576578 gaaaataatatctttt 17576593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 39650307 - 39650522
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |    
T  39650307 caattgttatatatatttgggttgccatttactacaaaatggaagcaaataactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacgaaatatttttccc 39650406  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  || |||||||| |    
T  39650407 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatatttcaggtcattaacaaacttatacaaaatcctatcatcttctgctgacaaataa 39650506  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  39650507 gaaaataatacctttt 39650522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 42686464 - 42686249
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    ||||| |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||    
T  42686464 caattattacatatatttggattgtcattgactacaaaatggaagcaaataactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacgaaatagttttctc 42686365  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||| ||    
T  42686364 atagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaagacatctttcgggtcattatcaaacttataaaaaaacctatcatctgatgctgacaaaata 42686265  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  42686264 gaaaataatacctttt 42686249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11499529 - 11499312
Alignment:
Q  12 atcaattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttc 111  Q
    |||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  11499529 atcaattgttacatatatttgggctgtcattgactacaaaatggaaacaaataactcaaggtaaataaatggtaaatgataaagctacgtagtatttttc 11499430  T
Q  112 tcatagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaat 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||     
T  11499429 tcatagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaagatatctttcggatcattatcaaacttatacaaaatcctatcatctgctgctgacaaaa 11499330  T
Q  212 tagaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  11499329 tagaaaataatacatttt 11499312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 41 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14307791 - 14307601
Alignment:
Q  41 atgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc--atagtgttacatcaactatattctc 138  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |    
T  14307791 atgactacaaaatggaagcaaggaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacggagtatttttttcccatagtgttacatcaactatattccc 14307692  T
Q  139 actgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaattagaaaataatacctttt 229  Q
    | | ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14307691 attacataagggaagacatttttcgggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaaatagaaaataatacctttt 14307601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 8927259 - 8927476
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  8927259 caattgttacatatatttgggttgccattgactataaaatggaagcaagaaactcaaggtaaatagatgataaatgataaagctacagagtatttttttc 8927358  T
Q  114 --atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaat 211  Q
      |||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  8927359 ccatagtgttgcatcaactatattcccactacataagaaaagacatttttcgggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgtttacaaaa 8927458  T
Q  212 tagaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||||    
T  8927459 tagaaaataatacctttt 8927476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 229
Target Start/End: Original strand, 48529119 - 48529333
Alignment:
Q  15 aattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctca 114  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | |||||||  ||    
T  48529119 aattgttacatatatttgggttgtcattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaggctacgaaatattttttcca 48529218  T
Q  115 tagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaattag 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||   |||||| ||    
T  48529219 tagtgttacatcaactatattctcactgcataagaaaagacatctttcagatcattatcaaaattatacaaaatcctataatcttatgccaacaaataag 48529318  T
Q  215 aaaataatacctttt 229  Q
    |||||||||||||||    
T  48529319 aaaataatacctttt 48529333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 9227589 - 9227803
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |    
T  9227589 caattgttacatatatttgggttgtcattgactacaaaatg-aagcaaagaactcaatgtatatagatggtaaatgataaagctacgaagtattttttcc 9227687  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||| ||||||    
T  9227688 acagtgttacatcaaccatattcccactgcataagtaaatacatctttcaggtcattatcaaacttatataaaattatatcatctgattctgaaaaatta 9227787  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
     |||||||||||||||    
T  9227788 taaaataatacctttt 9227803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 42916745 - 42916539
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttct- 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||| |||||||  | ||| ||| |     
T  42916745 caattgttacatatatttgggttgtcattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaat-----------gataaagctacataatatatttttt 42916657  T
Q  113 -catagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaat 211  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  42916656 ccatagtgttacatcaactatattcccactgcataagaaaagacatctttcaggtcattatcaaatttatacaaaatcctatcatctgatgctgataaat 42916557  T
Q  212 tagaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||||    
T  42916556 tagaaaataatacctttt 42916539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 42245950 - 42246154
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    ||||||       |||||| ||||||||||||    
T  42245950 caattgttgcatatatttgggttgcaattgactacgaaatggaagcaaaggactcaaggtaaat----ggtaaa-------gctacgaagtatttttctc 42246038  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    |||||||||||||||| |||||   |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  42246039 atagtgttacatcaaccatatttctactgcataaggaaatacatctttcagatcattatcaaacttatacaaaattttatcatctgatgctaacaaatta 42246138  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||| ||||    
T  42246139 gaaaataatacatttt 42246154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 136
Target Start/End: Original strand, 19035014 - 19035136
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||| | |    
T  19035014 caattgttacatctatttgcgttgtcattgactacaaaatagaagcaaagaattcaaggtaaataaatggtaaatgataaagctacaaagtattttaccc 19035113  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattc 136  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  19035114 ataatgttacatcaactatattc 19035136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 20719622 - 20719500
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||| | |    
T  20719622 caattgttacatctatttgcgttgtcattgactacaaaatagaagcaaagaattcaaggtaaataaatggtaaatgataaagctacaaagtattttaccc 20719523  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattc 136  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  20719522 ataatgttacatcaactatattc 20719500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 20764292 - 20764170
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||| | |    
T  20764292 caattgttacatctatttgcgttgtcattgactacaaaatagaagcaaagaattcaaggtaaataaatggtaaatgataaagctacaaagtattttaccc 20764193  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattc 136  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  20764192 ataatgttacatcaactatattc 20764170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 29489870 - 29489748
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||| | |    
T  29489870 caattgttacatctatttgcgttgtcattgactacaaaatagaagcaaagaattcaaggtaaataaatggtaaatgataaagctacaaagtattttaccc 29489771  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattc 136  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  29489770 ataatgttacatcaactatattc 29489748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 136
Target Start/End: Original strand, 33231314 - 33231436
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||| | |    
T  33231314 caattgttacatctatttgcgttgtcattgactacaaaatagaagcaaagaattcaaggtaaataaatggtaaatgataaagctacaaagtattttaccc 33231413  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattc 136  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  33231414 ataatgttacatcaactatattc 33231436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 136
Target Start/End: Original strand, 34283457 - 34283579
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||| | |    
T  34283457 caattgttacatctatttgcgttgtcattgactacaaaatagaagcaaagaattcaaggtaaataaatggtaaatgataaagctacaaagtattttaccc 34283556  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattc 136  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  34283557 ataatgttacatcaactatattc 34283579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 28)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 13458084 - 13458294
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13458084 caattgttacatatatttgggttgccaatgactacaaaatggaag-----aactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttccc 13458178  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13458179 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 13458278  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  13458279 gaaaataatacctttt 13458294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 1074635 - 1074850
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  1074635 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacggagtatttttccc 1074734  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1074735 atagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaagacatttttcgggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaaata 1074834  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  1074835 gaaaataatacctttt 1074850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 18600358 - 18600573
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  18600358 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacggagtatttttccc 18600457  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18600458 atagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaagacatttttcgggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaaata 18600557  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  18600558 gaaaataatacctttt 18600573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7221619 - 7221404
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |    
T  7221619 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacgaagtatttttccc 7221520  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||    
T  7221519 atagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaagacatctttcgggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatctgatgctgacaaaata 7221420  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  7221419 gaaaataatacctttt 7221404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25532144 - 25531929
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  25532144 caattgttacatatatttgggttgtcattgactacaaaatggatgcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacgaaatatttttctc 25532045  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  25532044 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatttttcaggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatctgatgctaacaaatta 25531945  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  25531944 gaaaataatacctttt 25531929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 9980418 - 9980633
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |    
T  9980418 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaagaactcgaggtaaatagatggtaaatgataaagctacgaaatatttttccc 9980517  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |    
T  9980518 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaatacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatcttatgctgacaaataa 9980617  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  9980618 gaaaataatacctttt 9980633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24444856 - 24444641
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |    
T  24444856 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaagaactcgaggtaaatagatggtaaatgataaagctacgaaatatttttccc 24444757  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |    
T  24444756 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaatacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatcttatgctgacaaataa 24444657  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  24444656 gaaaataatacctttt 24444641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 34854831 - 34854616
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  34854831 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaggaactcaaggtaaatagacggtaaatgataaagctacggagtatttttccc 34854732  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34854731 atagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaaggcatttttcgggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaaata 34854632  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  34854631 gaaaataatacctttt 34854616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 1219453 - 1219238
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |    
T  1219453 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagccaagaactcgaggtaaatagatggtaaatgataaagctacgaaatatttttccc 1219354  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |    
T  1219353 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaatacatctttaaggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatcttatgctgacaaataa 1219254  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  1219253 gaaaataatacctttt 1219238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4423273 - 4423058
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  4423273 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacggagtatttttccc 4423174  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    | |||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||    
T  4423173 acagtgttacatcaactagatttccactacataaggaaagacatctttcgggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatctgatgctgacaaaata 4423074  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||| ||||    
T  4423073 gaaaataatacatttt 4423058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 14889310 - 14889525
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||      
T  14889310 caattgttacatatatttgggttgacattgactacaaaatggaagcaaggaactcaaagtaaatagatggtaaatgataaatctacggagtatttttcct 14889409  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14889410 atagtgttacatcaactatattcccacttcataaggaaagacatttttcgggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaaata 14889509  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  14889510 gaaaataatacctttt 14889525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 230
Target Start/End: Original strand, 3052151 - 3052367
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||| |    
T  3052151 caattgttacatatattttggttgtcattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacaaaatatttttccc 3052250  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  3052251 atagtgttacatcaaccatattcccactgcataaggaaagacatctttcatgtcattatcaaacttatacaaaatcttaccatctgatgttgacaaatta 3052350  T
Q  214 gaaaataataccttttt 230  Q
     |||||||||| |||||    
T  3052351 aaaaataatactttttt 3052367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2520032 - 2519817
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  2520032 caattgttacatatatctgggttgccattgactacaaaatggaagcaaggaactcaaggtaaataaatggtaaatgataaagctacggagtatttttccc 2519933  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  2519932 atagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaagagatttttcgggtcattattaaacttatacaaaattctatcatctgatgttaacaaaata 2519833  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||| ||||    
T  2519832 gaaaataatacatttt 2519817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 33977845 - 33977630
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| | |    
T  33977845 caattgttacatctatttgggttaccattgactacaaaatggaagcaaagaattcaaggtaaataaatggtaaatgataaagctacagagtattttaccc 33977746  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  33977745 atagtgttacatcaactatattaccactgcataagaaaggacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatctgatgctgacaaatta 33977646  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  33977645 gaaaataatacctttt 33977630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 34319966 - 34319750
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||| | |    
T  34319966 caattcttacatatatttgggttaccattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagattgtaaatgataaagctacgaaatattttaccc 34319867  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataag-gaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatt 212  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  34319866 atagtgttacatcgactatattcccactgcataagagaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatctgatgctgacaaatt 34319767  T
Q  213 agaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||| |||||    
T  34319766 agaaaataatatctttt 34319750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15274478 - 15274263
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| | |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  15274478 caattgttacatatattttgtttgttattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacggagtatttttccc 15274379  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||| ||    
T  15274378 atagtgttacatcaactatattcctactacataaggaaagacatctttcgggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatttaatgctgacaaaata 15274279  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||| ||||    
T  15274278 gaaaataatacatttt 15274263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 1080962 - 1081176
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |    
T  1080962 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaggaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagttacggagtattttttcc 1081061  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    |||||||| ||| ||||||| || |||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1081062 atagtgttgcattaactata-tcccactacatatggaaagacatttttcgggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaaata 1081160  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||| ||||    
T  1081161 gaaaataatacatttt 1081176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 229
Target Start/End: Original strand, 7220166 - 7220380
Alignment:
Q  15 aattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctca 114  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||    
T  7220166 aattgttacatatatttggtttgtctttgactacaatatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctactgagtatttttccca 7220265  T
Q  115 tagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaattag 214  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||    
T  7220266 tagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaaaacatctttcgggtcattattaaacttatataaaatcctatcatctgatgctgacaaaatag 7220365  T
Q  215 aaaataatacctttt 229  Q
    |||||||||| ||||    
T  7220366 aaaataatacatttt 7220380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 228
Target Start/End: Original strand, 11937158 - 11937363
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||| |    
T  11937158 caattgttacatatatttgggttttcattgactacaaaatggaagcaa---------ggtaaatagatggtaaatgataaagatacagattatttttccc 11937248  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  11937249 atagtgttacatcaattatattcccactatataaggaaagacatttttcgggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctaatgttgacaaaata 11937348  T
Q  214 gaaaataataccttt 228  Q
     ||||| ||| ||||    
T  11937349 taaaatgatatcttt 11937363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 17938397 - 17938253
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   | |||||||| |    
T  17938397 caattgttacatatatttgggttgtcattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatagtaaatgataaagctataaaatatttttc-c 17938299  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatct 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  17938298 atagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaagacatct 17938253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 248803 - 248681
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||| | |    
T  248803 caattgttacatctatttgcgttgtcattgactacaaaatagaagcaaagaattcaaggtaaataaatggtaaatgataaagctacaaagtattttaccc 248704  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattc 136  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  248703 ataatgttacatcaactatattc 248681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 136
Target Start/End: Original strand, 12581150 - 12581272
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||| | |    
T  12581150 caattgttacatctatttgcgttgtcattgactacaaaatagaagcaaagaattcaaggtaaataaatggtaaatgataaagctacaaagtattttaccc 12581249  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattc 136  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  12581250 ataatgttacatcaactatattc 12581272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 129
Target Start/End: Original strand, 3089402 - 3089517
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||      
T  3089402 caattgttacatttatttgtgttgtcattgactacaaaatagaagcaaagaattcaaggtaaatatatggtaaatgataaagttacgaagtatttttcct 3089501  T
Q  114 atagtgttacatcaac 129  Q
    ||||||||||||||||    
T  3089502 atagtgttacatcaac 3089517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 93 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11269408 - 11269271
Alignment:
Q  93 aagctacggagtatttttctcatagtgttacatcaactatattctcactg-cataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattct 191  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||| ||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  11269408 aagctacggagtatttttcccattgtgttacatcaatcatattgtcattggcataagaaaagacatctttcaagtcattatcaaacctatacaaaatcct 11269309  T
Q  192 atcatctgatgttga-caaattagaaaataataccttt 228  Q
    ||||| ||||  |||  || ||||||||||||||||||    
T  11269308 atcatttgatactgatgaatttagaaaataataccttt 11269271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 93 - 196
Target Start/End: Original strand, 11517944 - 11518047
Alignment:
Q  93 aagctacggagtatttttctcatagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattcta 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||  || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  11517944 aagctacggagtatttttcccattgtgttacatcaatcatattgccattgcataagaaaagacatctttcaagtcattatcaaacctatacaaaatccta 11518043  T
Q  193 tcat 196  Q
    ||||    
T  11518044 tcat 11518047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 90
Target Start/End: Original strand, 11517746 - 11517822
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatga 90  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |  ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11517746 caattgttacatatatttggcttgccattttctttaaaatggaagcaaataactcaaggtaaatagatggtaaatga 11517822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 229
Target Start/End: Original strand, 22375250 - 22375298
Alignment:
Q  181 tacaaaattctatcatctgatgttgacaaattagaaaataatacctttt 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  22375250 tacaaaatcctatcatctgatgttaacaaaatagaaaataatacatttt 22375298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 49 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 11269569 - 11269536
Alignment:
Q  49 aaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatg 82  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11269569 aaaatggaagcaaataactcaaggtaaatagatg 11269536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 30)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19394346 - 19394131
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |    
T  19394346 caattgttacatatatttgggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaataaatggtaaataatcaagctacagagtatttttccc 19394247  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19394246 ataatgttacatcaactatattcccactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 19394147  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  19394146 gaaaataatacctttt 19394131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 31296894 - 31297104
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31296894 caattgttacatatatttgggttgccaatgactataaaatggaag-----aactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttccc 31296988  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31296989 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 31297088  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
     ||||||||| |||||    
T  31297089 aaaaataatatctttt 31297104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 12589635 - 12589850
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |    
T  12589635 caattgttacatatatttgggttgtcattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacggaatatttttccc 12589734  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  12589735 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaagtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatcttatgctgacaaatta 12589834  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||| ||||||||||||    
T  12589835 gaagataatacctttt 12589850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 34716517 - 34716302
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |    
T  34716517 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaagaactcgaggtaaatagatggtaaatgataaagctacgaaatatttttccc 34716418  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |    
T  34716417 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaatacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatcttatgttgacaaataa 34716318  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  34716317 gaaaataatacctttt 34716302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 20997300 - 20997515
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  20997300 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacggagtatttttccc 20997399  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  20997400 atagtgttacatcaactatatttccactacataaggaaatacatttttcgggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgctgacaaaata 20997499  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  20997500 gaaaataatacctttt 20997515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 41690204 - 41689989
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |    
T  41690204 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaagaactcgaggtaaatagatggtaaatgataaagctacgaaatatttttccc 41690105  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |    
T  41690104 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaatacatctttcagatcattatcaaacttatacaaaatcctatcatcttatgctgacaaataa 41690005  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  41690004 gaaaataatacctttt 41689989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 25697878 - 25698092
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  25697878 caattgttacatatatttaggttgccattgactacacaatggaagcaaagaactcgaggtaaatagatggtaaatgataaagctacgaaatatttttctc 25697977  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |    
T  25697978 atagtgttacatcaactatattctaac-gcataaggaaatacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatcttatgctgacaaataa 25698076  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  25698077 gaaaataatacctttt 25698092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 34375763 - 34375978
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |    
T  34375763 caattgttacatatatttgggttgacattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacgtagtatttttccc 34375862  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  34375863 atagtgttacatcaactatattgccactacataaggaaagacatttttcgggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgctgacaaaata 34375962  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||| ||||    
T  34375963 gaaaataatacatttt 34375978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3027316 - 3027101
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  3027316 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacgaagtattttcctc 3027217  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||    
T  3027216 atagtgttacatcaactatattcccactacataagaaaatacatctttcgggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatctgatgctgccaaaata 3027117  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
     |||||||||||||||    
T  3027116 taaaataatacctttt 3027101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19447001 - 19446786
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |    
T  19447001 caattgttacatatatttgggttgtcattgacttcaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacggagtattttttcc 19446902  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||    
T  19446901 atagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaatacatctttcgggtcattataaaacttatacaaaatcctatcatctgatgctgacaaaata 19446802  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  19446801 gaaaataatacctttt 19446786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20348843 - 20348627
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| |    
T  20348843 caattgttacatatatttgggttgtcattgactacaaaatggaagcaaagaacacaaggtaaatagatagtaaatgataaagctacgaagtatttttccc 20348744  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||    
T  20348743 atagtgttacatcaaatatattctcactacataaggaaagacatctttcgggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatctgatgctggcaaaata 20348644  T
Q  214 gaaaataataccttttt 230  Q
    |||||||||| ||||||    
T  20348643 gaaaataatatcttttt 20348627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 26322435 - 26322651
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtattttt-ct 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |     
T  26322435 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatgcaagaaaggaactcaaggtaaatagatagtaaatgataaagttacggagtattttttcc 26322534  T
Q  113 catagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26322535 catagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaagacatttttcgggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaaat 26322634  T
Q  213 agaaaataatacctttt 229  Q
    |||||||||||||||||    
T  26322635 agaaaataatacctttt 26322651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 33612501 - 33612717
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  33612501 caattgttatatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaagaaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacggagtatttttttc 33612600  T
Q  114 -atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatt 212  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33612601 catagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaagacatttttcgggtcattatcaaacttattcaaaattctatcatctgatgttgacaaaat 33612700  T
Q  213 agaaaataatacctttt 229  Q
    |||||||||||| ||||    
T  33612701 agaaaataatacatttt 33612717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2193644 - 2193429
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |    
T  2193644 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaaggaaggaacttaaggtaaatagatggtaaacgataaagctacggagtatttttccc 2193545  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2193544 atagtgttacatcagctatattcccactacataagaaaagacattttttgggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaaata 2193445  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  2193444 gaaaataatacctttt 2193429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27064761 - 27064544
Alignment:
Q  12 atcaattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttc 111  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||     
T  27064761 atcaattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatggtaaagctacggagtatttttt 27064662  T
Q  112 tcatagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaat 211  Q
     ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |     
T  27064661 ccatagtgttacatcagctatattcccactacataaggaaagacatcttccgggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatctaatgctgacacaa 27064562  T
Q  212 tagaaaataatacctttt 229  Q
    || ||||||||| |||||    
T  27064561 tataaaataataactttt 27064544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 12420359 - 12420574
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||  |    
T  12420359 caattgttacatatatttgggattccattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacataatattttttcc 12420458  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||    
T  12420459 atagtgttacatcaattatattctcactgcataaggaaagacatctttcagcttattatcaaacttatacaaaatcatatcatctaatgctgacaaatta 12420558  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||| ||||    
T  12420559 gaaaataatacatttt 12420574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21029065 - 21028850
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||| |    
T  21029065 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaagaattcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacatattatttttccc 21028966  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||    
T  21028965 atagtgttacatcaactatattcccactacataagaaaaaacatctttcgggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatatgatgttgataaaata 21028866  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||| ||||||    
T  21028865 gaaaataattcctttt 21028850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 15 - 210
Target Start/End: Original strand, 35541223 - 35541418
Alignment:
Q  15 aattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctca 114  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||    
T  35541223 aattgttacatatatttgggttgacattgactacaaaatggaagcaaagaactcaagataaatagatggtaaatgataaagctacggaatattttttcca 35541322  T
Q  115 tagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35541323 tagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaagacatttttcgggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgctgacaaa 35541418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 1853280 - 1853493
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||| | |    
T  1853280 caattgttaca-atatttgggttgtcattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagacgataaatgataaagctacgaagtattttcc-c 1853377  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1853378 ataatgttacatcaactatattcccactgcataaggaaagacatatttcgggtcattatcaaacttatacacaattctatcatctgatgttgacaaaata 1853477  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    |||||||||| |||||    
T  1853478 gaaaataatatctttt 1853493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4881142 - 4880927
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||    
T  4881142 caattgttacatatatttgggttatcattgactacaaaatgaaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatataactacgaagtatttttctc 4881043  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||    
T  4881042 atagtgttacatcaactatattcttattacataaggaaagatatctttcgggttattatcaaacttatacaaaatcttatcatctgatggtgacaaaata 4880943  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  4880942 gaaaataatacctttt 4880927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 30141432 - 30141217
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |    
T  30141432 caattattatatatatttgggttgccatttactacaaaatggaagcaaataactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacgaaatatttttccc 30141333  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  ||  ||||||| |    
T  30141332 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatatttcaggtcattaacaaacgtatacaaaatcctatcatcttctgccgacaaataa 30141233  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  30141232 gaaaataatacctttt 30141217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 289465 - 289251
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||  |    
T  289465 caattgttacatatattt-ggttgccattgactacaaaatggaagcaaagaactcaatgtatatagatggtaaatgataaagccacgaagtattttttcc 289367  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||| ||||||    
T  289366 ataatgttacatcaaccatattcccactgcataagtaaatacatctttcaggtcattatcaaacttatataaaattatatcatctgatcctgaaaaatta 289267  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  289266 gaaaataatacctttt 289251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 229
Target Start/End: Original strand, 3398696 - 3398910
Alignment:
Q  15 aattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctca 114  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  3398696 aattgttacatatatttggattgtcgttgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagaaggtaaatgataaagctacggagtatttttccca 3398795  T
Q  115 tagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaattag 214  Q
    |||||||||||||||||||||  |||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||     
T  3398796 tagtgttacatcaactatatttacacaacataaggaaatacatctttcgggtcattatcaaacttaaacaaaatcctatcatctgatgctgacaaaatat 3398895  T
Q  215 aaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||| |||||    
T  3398896 aaaataatatctttt 3398910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 3151966 - 3152188
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |    
T  3151966 caattgttacatatatttggattgtcattgactacaaaatagaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacgaagtattttttcc 3152065  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatc-------tttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttga 206  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  3152066 atagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaagacatctttcgggtttcgggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatttgatgctga 3152165  T
Q  207 caaattagaaaataatacctttt 229  Q
    |||| ||||||||||||| ||||    
T  3152166 caaaatagaaaataatacatttt 3152188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 3211559 - 3211773
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||| |    
T  3211559 caattgttacatatatttggattgtcattgactacaaaatggaagcaaagaactcaatgtaaatatatggtaaaagataaagctacgaagtatttttccc 3211658  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||    
T  3211659 atagtgttacatcaaccatattcccactacataaggaaatacatatttcaggtcattattaaacttatacaaaatt-tatcttctaatgctgacaaatta 3211757  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||| ||||    
T  3211758 gaaaataatacatttt 3211773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7284534 - 7284337
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7284534 caattgttacatatatttgggttgccatttactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacggagtatttttctc 7284435  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    |||||||||||||||||||                  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  7284434 atagtgttacatcaactat------------------aagacatttttcgggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatccgatgttgacaaaata 7284353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 131 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9701642 - 9701545
Alignment:
Q  131 atattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaattagaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  9701642 atattctca-tgcataaggaaatacatcttttaggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatttgatgctgacaaattagaaaataatacatttt 9701545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 37463257 - 37463135
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||  |||||||| | |    
T  37463257 caattgttacatctatttgcgttgtcattgactacaaaatagaagcaaagaattcaagataaataaatggtaaatgataaagctacaaagtattttaccc 37463158  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattc 136  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  37463157 ataatgttacatcaactatattc 37463135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 118 - 229
Target Start/End: Original strand, 18039615 - 18039720
Alignment:
Q  118 tgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaattagaaa 217  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||    
T  18039615 tgttacatcaaccatattcccactgcataaggaaagacatctttcaa------atcaaacttatacaaaatcttaccatctgatgttgacaaattaaaaa 18039708  T
Q  218 ataatacctttt 229  Q
    ||||||| ||||    
T  18039709 ataatacttttt 18039720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 122
Target Start/End: Original strand, 18037376 - 18037476
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||| |||||| ||        ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||| |    
T  18037376 caattgttacatatatttgggttgtcattgactataaaatagaagcacag--------gtaaatagatgataaatgataaaactacgaagtatttttccc 18037467  T
Q  114 atagtgtta 122  Q
    |||||||||    
T  18037468 atagtgtta 18037476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 38)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15519758 - 15519548
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15519758 caattgttacatatatttgggttgccaatgactacaaaatggaag-----aactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttccc 15519664  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15519663 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 15519564  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  15519563 gaaaataatacctttt 15519548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 741657 - 741867
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  741657 caattgttacatatatttgggttgcgaatgactacaaaatggaag-----aactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttccc 741751  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  741752 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaacta 741851  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  741852 gaaaataatacctttt 741867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 575383 - 575598
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |    
T  575383 caattgttacatatatttgggttgtcattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacgaaatatttttccc 575482  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  575483 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaagtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatcttatgttgacaaatta 575582  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
     |||||||||||||||    
T  575583 aaaaataatacctttt 575598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17738952 - 17738737
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  17738952 caattgttacatatatttgggtttccattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacgaaatatttttctc 17738853  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  17738852 atagtgtttcatcaactatattctcactgcataagaaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatcttatgctgacaaatta 17738753  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  17738752 gaaaataatacctttt 17738737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 33504366 - 33504581
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33504366 caattgttacatatatttgggttgtcattgactacaaaatggaaggaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacggagtatttttctc 33504465  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||    
T  33504466 atagtgttacatcatctatattcccactacataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatctgatgctgacaaaata 33504565  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||| ||||    
T  33504566 gaaaataatacatttt 33504581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 52799955 - 52799740
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |    
T  52799955 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaagaactcgaggtaaatagatggtaaatgataaagctacgaaatatttttccc 52799856  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |    
T  52799855 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaatacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatcttatgctgacaaataa 52799756  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  52799755 gaaaataatacctttt 52799740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 14830889 - 14831104
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  14830889 caattgttacatatatttgggttgtcattgactacaaaatggaagtaaggaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacggagtatttttccc 14830988  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  14830989 atagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaagacatttttcgagtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttcacaaaata 14831088  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  14831089 gaaaataatacctttt 14831104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19589757 - 19589542
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |    
T  19589757 caattgttacatctatttgggttaccattgactacaaaatggaagcaaagaattcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacagagtattttaccc 19589658  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  19589657 atagtgttacatcaactgtattcccactgcataaggaaggacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatctgatgctgacaaatta 19589558  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  19589557 gaaaataatacctttt 19589542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 35496893 - 35497111
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||    
T  35496893 caattgttacatatatttgggttgtcattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacgaaatatttttttc 35496992  T
Q  114 -atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatct--gatgttgacaaa 210  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||| |||||||    
T  35496993 catagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatcttatatgctgacaaa 35497092  T
Q  211 ttagaaaataatacctttt 229  Q
    |||||||||||||||||||    
T  35497093 ttagaaaataatacctttt 35497111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 35713485 - 35713700
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    ||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |    
T  35713485 caattgttacatatatttgtgttgtcattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacagaatatttttccc 35713584  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||| ||||||||||    
T  35713585 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaagtcattatcaaacttctacaaaatcatatcatcttatgctgacaaatta 35713684  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  35713685 gaaaataatacctttt 35713700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 39715876 - 39716091
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |    
T  39715876 caattgttacatatatttaggttgccattgactacaaaatggaagcaaagaactcgatgtaaatagatggtaaatgataaagctacgaaatatttttccc 39715975  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||| |    
T  39715976 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaatacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaatcatatcatcttatgctgacaaataa 39716075  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||| ||||    
T  39716076 gaaaataatacttttt 39716091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16904185 - 16903967
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |    
T  16904185 caattgttacatatctttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacagaatatttttccc 16904086  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgc---ataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  16904085 atagtgttacatcaactatattctcactgcataataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaatcatatcatcttatgctgacaaa 16903986  T
Q  211 ttagaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  16903985 ttagaaaataatatctttt 16903967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 7645490 - 7645705
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  7645490 caattgttacatatatttgggttggcattgactacaaaatggaagtaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctatggagtatttttcac 7645589  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||    
T  7645590 atagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaagacatctttcgggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatcttatgctgacaaaata 7645689  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||| ||||    
T  7645690 gaaaataatacatttt 7645705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23477814 - 23477599
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |    
T  23477814 caattgttacatatatttgggttgtcattgactacaaaatggaagcaaggaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacggagtattttttcc 23477715  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23477714 atagtgttacatcaacaatattcccactacataaggaatgacattttttgggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaaata 23477615  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  23477614 gaaaataatacctttt 23477599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 56000078 - 56000281
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  56000078 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacggagtatttttccc 56000177  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||    
T  56000178 atagtgttacatcaactatattcctactacataaggaaagacatctttcgggtcattatcaaacttatacaaaatcatatcatctgatgctgacaaaata 56000277  T
Q  214 gaaa 217  Q
    ||||    
T  56000278 gaaa 56000281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 34057943 - 34058158
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  34057943 caattgttacatatatttgggttgtcattgactacaaaatggaagcaaggaactcgaggtaaatagatggtaaatgataaagctacggagtatttttccc 34058042  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||    
T  34058043 atagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaagacatttttcgggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgtctataaaata 34058142  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||| ||||    
T  34058143 gaaaataatacatttt 34058158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 1943409 - 1943194
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||  |    
T  1943409 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcatagaactcaaggtaaatagatggtaaataataaagctacgaagtattttttcc 1943310  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  1943309 attgtgttacatcaaccatattcccactgcataaggaaatacatctttcagatcattatcaaacttatataaaattctatcatatgatgctgacaaatta 1943210  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||| ||||    
T  1943209 gaaaataatacttttt 1943194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 5275124 - 5275339
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||| |    
T  5275124 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaggaactcaaggtaaatagatagtaaatgataaagttacgaagtatttttccc 5275223  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5275224 atagtgttgcatcaactatattcccactacataaggaaagacatttttcgaatcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaaata 5275323  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||| ||||    
T  5275324 gaaaataatacatttt 5275339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 39746224 - 39746439
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||  |    
T  39746224 caattgttacatatatttgggttgtcattgactacaaaatggaaccaaataacccaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacaaagtattttttcc 39746323  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||    
T  39746324 atagtgttacatcaactatattcccactacataagaaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatctgatgctgacaaaata 39746423  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  39746424 gaaaataatacctttt 39746439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Original strand, 15656188 - 15656404
Alignment:
Q  12 atcaattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttc 111  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  15656188 atcaattattacatatatttgggtttcca-tgactacaaaatggaagcaaggaactcaaggtaaatagatgggaaatgataaagctacggagtatttttc 15656286  T
Q  112 tcatagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaat 211  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  15656287 ccatagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaagacatttttcggatctttatcaaacttatacaaaactatatcatctgatgttgacaaaa 15656386  T
Q  212 tagaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15656387 tagaaaataatacctttt 15656404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 28972003 - 28971820
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  28972003 caattgttacatatatttgggttgacattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacggagtatttttccc 28971904  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatc 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28971903 atagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaagacatttttcggatcattatcaaacttatacaaaattctatcatc 28971820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 36856040 - 36855826
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |    
T  36856040 caattgttacatgtattagggttgccattgactacaaaatggaagaaaagaactcgaggtaaatagatggtaaatgataaagctacgaagtattttcc-c 36855942  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||    
T  36855941 atagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaagacatttttcgggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgctgataaaata 36855842  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  36855841 gaaaataatacctttt 36855826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 53341319 - 53341104
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||  |    
T  53341319 caattattacatatatttgggttgtcattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatgaagctagagagtattttttcc 53341220  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  53341219 atactgttacatcaattatattcccactacataaggaaatacatctttcgggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgctgacaaaata 53341120  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||| ||||    
T  53341119 gaaaataatacatttt 53341104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 202
Target Start/End: Original strand, 19832765 - 19832953
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  19832765 caattgttacatatatttgggttgtcattgactacaaaatggaaggaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagttacggagtatttttccc 19832864  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19832865 atagtgttacatcaactatattcccacttaataaggaaagacatctttcgggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatctgatg 19832953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13626962 - 13626746
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaa-gaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttct 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||     
T  13626962 caattgttacatatatttgggttgccatttacttcaaaatggaagcaaaagaacttaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacatagtatttttcc 13626863  T
Q  113 catagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |    
T  13626862 catagtgttacatcaactatattcccactacacaaggaaagacctctttcgggtcattaccaaacttatacaaaatcctatcatatgatgctgacaaaat 13626763  T
Q  213 agaaaataatacctttt 229  Q
    |||||||||||||||||    
T  13626762 agaaaataatacctttt 13626746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 28136434 - 28136649
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |    
T  28136434 caattgttacatatatttgggttgttattgactacaaaatggaagcaaagaactcaagaaaaatagatggtaaatgataaagctacgaagtatttttccc 28136533  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||| ||    
T  28136534 atagtgttgcatcaactatattcccactacataaggaaagacatctttcgagtcatcatcaaatttatacaaaatcttatcatctgatggtgaaaaaata 28136633  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||| ||||    
T  28136634 gaaaataatacatttt 28136649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 113 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 40618619 - 40618504
Alignment:
Q  113 catagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatt 212  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  40618619 catagtgttacatgaactatattctcactgcataaggaaagacatatttcatgtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatctgatgctgacaaatt 40618520  T
Q  213 agaaaataataccttt 228  Q
    ||||||||||||||||    
T  40618519 agaaaataataccttt 40618504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 47721443 - 47721656
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||  ||||||||| ||    
T  47721443 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatagaagcaaataactcaatgtatatagatagtaaatgataaagctacaaagtatttttttc 47721542  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    |     |||  ||||| |||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||  ||| ||||||    
T  47721543 aggtcatta--tcaaccatattcccactgtataagtaaatacatctttcaggtcattatcaaacttatataaaattgtatcacctgatcctgaaaaatta 47721640  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||| ||||    
T  47721641 gaaaataatacttttt 47721656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 118 - 229
Target Start/End: Original strand, 41984705 - 41984816
Alignment:
Q  118 tgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaattagaaa 217  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  41984705 tgttacatcaactatattcctactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaatcatatcatctgatgctgacaaattagaaa 41984804  T
Q  218 ataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||    
T  41984805 ataatacctttt 41984816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 93 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16891863 - 16891728
Alignment:
Q  93 aagctacggagtatttttctcatagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattcta 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  16891863 aagctacggagtatttttcccatagtgttacatcaatcatatttccattgcataagaaaagacatctttcaggtcattatcaaacctatacaaaatccaa 16891764  T
Q  193 tcatctgatgttgacaaattagaaaataataccttt 228  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16891763 taatttgatgctgacaaattagaaaataataccttt 16891728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 136
Target Start/End: Original strand, 10260686 - 10260808
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||| | |    
T  10260686 caattgttacatctatttgcgttgtcattgactacaaaatagaagcaaagaattcaaggtaaataaatggtaaatgataaagctacaaagtattttaccc 10260785  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattc 136  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  10260786 ataatgttacatcaactatattc 10260808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 21563769 - 21563647
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||| | |    
T  21563769 caattgttacatctatttgcgttgtcattgactacaaaatagaagcaaagaattcaaggtaaataaatggtaaatgataaagctacaaagtattttaccc 21563670  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattc 136  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  21563669 ataatgttacatcaactatattc 21563647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 136
Target Start/End: Original strand, 26925628 - 26925750
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||| | |    
T  26925628 caattgttacatctatttgcgttgtcattgactacaaaatagaagcaaagaattcaaggtaaataaatggtaaatgataaagctacaaagtattttaccc 26925727  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattc 136  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  26925728 ataatgttacatcaactatattc 26925750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 43331290 - 43331168
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||| | |    
T  43331290 caattgttacatctatttgcgttgtcattgactacaaaatagaagcaaagaattcaaggtaaataaatggtaaatgataaagctacaaagtattttaccc 43331191  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattc 136  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  43331190 ataatgttacatcaactatattc 43331168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 51451356 - 51451234
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||| | |    
T  51451356 caattgttacatctatttgcgttgtcattgactacaaaatagaagcaaagaattcaaggtaaataaatggtaaatgataaagctacaaagtattttaccc 51451257  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattc 136  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  51451256 ataatgttacatcaactatattc 51451234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 136
Target Start/End: Original strand, 24078756 - 24078878
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||| | |    
T  24078756 caattgttacatctatttgcgttgtcattgactacaaaatagaagcaaagaattcaaggtaaataaatggtaaatgataaagctacaaagtattttaccc 24078855  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattc 136  Q
    |||  ||||||||||||||||||    
T  24078856 ataaggttacatcaactatattc 24078878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 40621056 - 40620979
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgat 91  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40621056 caattgttacatatatttgggttgtcattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatgataaatgat 40620979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 16892059 - 16891991
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatg 82  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16892059 caattgttacatatatttggcttgccattttctataaaatggaagcaaataactcaaggtaaatagatg 16891991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 33)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 6344077 - 6344287
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6344077 caattgttacatatatttgggttgccaatgactacaaaatggaag-----aactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttccc 6344171  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6344172 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 6344271  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  6344272 gaaaataatacctttt 6344287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 14324561 - 14324771
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14324561 caattgttacatatatttgggttgccaatgactacaaaatggaag-----aactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttccc 14324655  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14324656 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 14324755  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  14324756 gaaaataatacctttt 14324771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 1994289 - 1994499
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  1994289 caattgttacttatatttgggttgccaatgactacaaaatggaag-----aactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctccggagtatttttccc 1994383  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1994384 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 1994483  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  1994484 gaaaataatacctttt 1994499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 9918052 - 9918267
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |    
T  9918052 caattgttacatatatttgggttgtcaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacggaatatttttccc 9918151  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  9918152 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaagtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatcttatgctgacaaatta 9918251  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  9918252 gaaaataatacctttt 9918267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 10049348 - 10049563
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||  |    
T  10049348 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacgaaatattttttcc 10049447  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |    
T  10049448 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcatgtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatcttatgctgacaaataa 10049547  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  10049548 gaaaataatacctttt 10049563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 4292000 - 4292215
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |    
T  4292000 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaagaactcgaggtaaatagatggtaaatgataaagctacgaaatatttttccc 4292099  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||| |    
T  4292100 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaatacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaatcctattatcttatgctgacaaataa 4292199  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  4292200 gaaaataatacctttt 4292215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21096627 - 21096412
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  21096627 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaggaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacggagtatttttccc 21096528  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  21096527 atagtgttgcatcaactatattcccactacataaggaaagatatttttcgggtcattatcaaacttatacaaaatactatcatctgatgttgacaaaata 21096428  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  21096427 gaaaataatacctttt 21096412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 28501208 - 28500998
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  28501208 caattgttacatatatttgggttgccaatgactataaaatggaag-----aactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacgaagtatttttgcc 28501114  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28501113 atagtgttacatcaattatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacgaaattctatcatctgatgttgacaaatta 28501014  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
     |||||||||||||||    
T  28501013 aaaaataatacctttt 28500998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26826454 - 26826240
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  26826454 caattgttacatatatttgggttgacattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacggagtatttttc-c 26826356  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  26826355 atagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaagatatttttttggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgctgacaaaata 26826256  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  26826255 gaaaataatacctttt 26826240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 33905223 - 33905008
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  33905223 caattgttacatatatttgggttgacattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagttacggagtatttttccc 33905124  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||    
T  33905123 atagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaagacatttttcgggtcattatcaaacttatacaaaattttatcatctgatactgacaaaata 33905024  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  33905023 gaaaataatacctttt 33905008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 42884319 - 42884104
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  42884319 caattgttacatatatttgggttgtcattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacgaaatatttttctc 42884220  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  42884219 atagtgttacatcaactatatttccactacataaggaaagacatttttcgggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatctgatgttgacaaaata 42884120  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||| ||||    
T  42884119 gaaaataatacatttt 42884104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 229
Target Start/End: Original strand, 19168982 - 19169196
Alignment:
Q  15 aattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctca 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  19168982 aattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacggagtatttttccca 19169081  T
Q  115 tagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaattag 214  Q
    || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||     
T  19169082 tattgttacatcaactatattcccactacataaggaaatacatctttcgggtcattatcaaacttctacaaaatcctatcatctgatgctgacaaaatat 19169181  T
Q  215 aaaataatacctttt 229  Q
    |||||||||||||||    
T  19169182 aaaataatacctttt 19169196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 9544978 - 9545193
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| | |||||||| |    
T  9544978 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaagaactaaaggtaaatagatggtaaatgataaggctacgaaatatttttccc 9545077  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||   |||||| |    
T  9545078 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaatcctataatcttatgccaacaaataa 9545177  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  9545178 gaaaataatacctttt 9545193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16882859 - 16882644
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||| |    
T  16882859 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaattggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgacaaaactacgaagtatttttccc 16882760  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  16882759 atagtgttacatcaatcatattttcactgcataagaaaatacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatctgatgctgacaaatta 16882660  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  16882659 gaaaataatacctttt 16882644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17040549 - 17040334
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||| |    
T  17040549 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaattggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgacaaaactacgaagtatttttccc 17040450  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  17040449 atagtgttacatcaatcatattttcactgcataagaaaatacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatctgatgctgacaaatta 17040350  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  17040349 gaaaataatacctttt 17040334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 28608150 - 28607935
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||| |    
T  28608150 caattgttacatatatttgggttgtcattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatatatggtaaatgataaagctacgaaatatttttccc 28608051  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |    
T  28608050 atagtgttacatcaactatattctcactacataaggaaaaacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatcttatgctgacaaataa 28607951  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||| ||||||||    
T  28607950 gaaaatattacctttt 28607935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 36634440 - 36634655
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  36634440 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacggagtatttttccc 36634539  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  36634540 atagtgttacatcaactatattcctactacataaggaaatacatttctcgggtctttatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgctgacaaaata 36634639  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    |||||||||| |||||    
T  36634640 gaaaataatatctttt 36634655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 18094077 - 18094291
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||| |||    
T  18094077 caattgttacatatatttgggttgtcattgactacaaaattgaagcaaagaactcaaggtaaataaatggtaaatgattaagctacgaaatatttt-ctc 18094175  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||    
T  18094176 atagtgttacgtcaactatattgtcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatcttatgccgacaaatta 18094275  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  18094276 gaaaataatacctttt 18094291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 30568219 - 30568434
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30568219 caattgttacatatatttgggttgtcattaactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacggagtatttttctc 30568318  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||   | ||||||| ||    
T  30568319 atagtgttacatcaattatattcccactacataaggaaagacatctttcgggtcattatcaaatttatacaaaatcctatcatctatagctgacaaaata 30568418  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  30568419 gaaaataatacctttt 30568434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 45206320 - 45206535
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| || || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  45206320 caattgttacatatatttgggctgtcattaactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacggagtatttttccc 45206419  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||    
T  45206420 atagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaaaacatctttcgggtcattattaaacttatataaaatcctatcatctgatgctgacaaaata 45206519  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  45206520 gaaaataatacctttt 45206535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26820546 - 26820341
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  26820546 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaggaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagttacggagtatttttccc 26820447  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    |||||||||||          || |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26820446 atagtgttaca----------tcccactacataaggaaagacatttttcgggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaaata 26820357  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  26820356 gaaaataatacctttt 26820341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14752097 - 14751883
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||  |||||||||  |    
T  14752097 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaagaactcaatgtatatagagggtaaatgataaagctacaaagtattttttcc 14751998  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||| ||||||    
T  14751997 atagtgttacatcaaccatattc-cactgcataagtaaatacatctttcaggtcattatcaaacttatataaaattatatcatctgatcctgaaaaatta 14751899  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  14751898 gaaaataatacctttt 14751883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 114 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4810395 - 4810281
Alignment:
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |    
T  4810395 atagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaagacatatttcatgtcattatcaaacttatataaaatcctatcatctgatgctgacaaatga 4810296  T
Q  214 gaaaataataccttt 228  Q
    |||||||||||||||    
T  4810295 gaaaataataccttt 4810281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 93 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7360762 - 7360626
Alignment:
Q  93 aagctacggagtatttttctcatagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattcta 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||  || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  7360762 aagctacggagtatttttcccattgtgttacatcaatcatattgccattgcataagaaaagacatctttcaagtcattatcaaacctatacaaaatccta 7360663  T
Q  193 tcatctgatgttgacaaa-ttagaaaataataccttt 228  Q
    |||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  7360662 tcatttgatactgacaaatttagaaaataataccttt 7360626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 3709837 - 3709715
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||| | |    
T  3709837 caattgttacatctatttgcgttgtcattgactacaaaatagaagcaaagaattcaaggtaaataaatggtaaatgataaagctacaaagtattttaccc 3709738  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattc 136  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  3709737 ataatgttacatcaactatattc 3709715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 136
Target Start/End: Original strand, 11867579 - 11867701
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||| | |    
T  11867579 caattgttacatctatttgcgttgtcattgactacaaaatagaagcaaagaattcaaggtaaataaatggtaaatgataaagctacaaagtattttaccc 11867678  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattc 136  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  11867679 ataatgttacatcaactatattc 11867701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 136
Target Start/End: Original strand, 35358972 - 35359094
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||| | |    
T  35358972 caattgttacatctatttgcgttgtcattgactacaaaatagaagcaaagaattcaaggtaaataaatggtaaatgataaagctacaaagtattttaccc 35359071  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattc 136  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  35359072 ataatgttacatcaactatattc 35359094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 131 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17091236 - 17091144
Alignment:
Q  131 atattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaattagaaaataatac 224  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  17091236 atattctca-tgcataaggaaatacatcttttaggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatttgatgctgacaaattagaaaataatac 17091144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 131 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17025051 - 17024959
Alignment:
Q  131 atattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaattagaaaataatac 224  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  17025051 atattctca-tgcataaggaaatacatcatttaggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatttgatgctgacaaattagaaaataatac 17024959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 131 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17036728 - 17036636
Alignment:
Q  131 atattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaattagaaaataatac 224  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  17036728 atattctca-tgcataaggaaatacatcttttaggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatttgatactgacaaattagaaaataatac 17036636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 4810475 - 4810407
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatg 82  Q
    ||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4810475 caattgtcacatatatttggattgccattgactacaaaatggtagcaaagaactcaagataaattgatg 4810407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 7360958 - 7360882
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatga 90  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |  ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  7360958 caattgttacatatatttggcttgccattttctttaaaatggaagcaaataactcaaggtaaatagatggtagatga 7360882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 60
Target Start/End: Original strand, 33665128 - 33665174
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagca 60  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  33665128 caattgttacatatatttgggttaccattgactacaaaatggaagca 33665174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 29)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18110617 - 18110407
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18110617 caattgttacatatatttgggttgccaatgactacaaaatggaag-----aactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttccc 18110523  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18110522 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 18110423  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  18110422 gaaaataatacctttt 18110407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 43255904 - 43256114
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43255904 caattgttacatatatttgggttgccaatgactacaaaatggaag-----aactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttccc 43255998  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43255999 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 43256098  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  43256099 gaaaataatacctttt 43256114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 50396318 - 50396528
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50396318 caattgttacatatatttgggttgccaatgactacaaaatggaag-----aactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttccc 50396412  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50396413 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 50396512  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  50396513 gaaaataatacctttt 50396528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 29842036 - 29842251
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |    
T  29842036 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacggaatatttttccc 29842135  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  29842136 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaagtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatcttatgctgacaaatta 29842235  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  29842236 gaaaataatacctttt 29842251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 42681296 - 42681081
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |    
T  42681296 caattgttacatatatttgggttgtcattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacggaatatttttccc 42681197  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  42681196 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaagtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatcttatgctgacaaatta 42681097  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  42681096 gaaaataatacctttt 42681081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 10695540 - 10695755
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    ||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||| |    
T  10695540 caattgttacatatatttgagttttcattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatatatggtaaatgataaagctacagaatatttttccc 10695639  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10695640 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagatatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 10695739  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  10695740 gaaaataatacctttt 10695755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4891029 - 4890814
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |    
T  4891029 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaagaactcgaggtaaatagatggtaaatgataaagctacgaaatatttttccc 4890930  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |    
T  4890929 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaatacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatcttatgctgacaaataa 4890830  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  4890829 gaaaataatacctttt 4890814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18813118 - 18812903
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  18813118 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaggaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacggagtatttttccc 18813019  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18813018 atagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaagacattttttgggttattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaaata 18812919  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  18812918 gaaaataatacctttt 18812903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 29187458 - 29187673
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |    
T  29187458 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaagaactcgaggtaaatagatggtaaatgataaagctacgaaatatttttccc 29187557  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |    
T  29187558 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaatacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatcttatgctgacaaataa 29187657  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  29187658 gaaaataatacctttt 29187673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 33360631 - 33360416
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||  |    
T  33360631 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaagaactcgaggtaaatagatggtaaatgataaagctacgaaatattttttcc 33360532  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |    
T  33360531 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaatacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatcttatgctgacaaataa 33360432  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  33360431 gaaaataatacctttt 33360416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 41964280 - 41964495
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  41964280 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaggaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacggagtatttttccc 41964379  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41964380 atagtgttacatcaattatattcccactacataaggaaagacatttttcgggttattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaaata 41964479  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    || |||||||||||||    
T  41964480 gagaataatacctttt 41964495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 28567068 - 28567283
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |    
T  28567068 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacgaagtatttttccc 28567167  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  28567168 atagtgttacatcagccatattcccactacataagggaatacatctttcaggtcattaccaaacttatacaaaatcctatcatctgatgctgacaaatta 28567267  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  28567268 gaaaataatacctttt 28567283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 41831405 - 41831619
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    
T  41831405 caattgttacatatatttgggttgc-attgactacaaaatggaagcaaggaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaatctacggagtatttttccc 41831503  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  41831504 atagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaagacatttttcgggtcattatcaaacttatacaaaattatatcatctgatgttgacaaaata 41831603  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  41831604 gaaaataatacctttt 41831619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Original strand, 51967080 - 51967296
Alignment:
Q  12 atcaattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttc 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  51967080 atcaattgttacatatatttgggttgtcattgactacaaaatggaagcaaagaacgcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacgaaatatttttc 51967179  T
Q  112 tcatagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaat 211  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  51967180 ccatagtgttacatcaattatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattat-aaacttatacaaaatcctatcatcttatgctgacaaat 51967278  T
Q  212 tagaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  51967279 tagaaaataatacatttt 51967296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 31618589 - 31618373
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  31618589 caattgttacatatatttgggttgtcattgactacaaaatggaagcaaggaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacgaagtatttttttc 31618490  T
Q  114 -atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatt 212  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31618489 catagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaagacatttttcgagtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaaat 31618390  T
Q  213 agaaaataatacctttt 229  Q
    |||||||||||||||||    
T  31618389 agaaaataatacctttt 31618373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 34691025 - 34690810
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  34691025 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaggaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagttacggagtatttttccc 34690926  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  34690925 atagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaagacattttttgggtcattatcaaacttatccaaaattctatcatttgatgttgacaaaata 34690826  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||| ||||    
T  34690825 gaaaataatacatttt 34690810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 34686487 - 34686272
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  34686487 caattgttacatatatttgggttgtcattgactacaaaatggaagcaaggaactcgaggtaaatagatggtaaatgataaagctacggagtatttttccc 34686388  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||    
T  34686387 atagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaagacatttttcgggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgtctataaaata 34686288  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||| ||||    
T  34686287 gaaaataatacatttt 34686272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 50559950 - 50559735
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||| |    
T  50559950 caattgttacatatatttgggttgtcattgactacaaaatgaaaacaaataactcaaggtaaatatatggcaaatgataaagctacggaatatttttccc 50559851  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  50559850 atagtgttacatcaactatattctcactgcataagaaaagacatctttcatgtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatcttatgctgacaaatta 50559751  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||| ||||    
T  50559750 gaaaataatacatttt 50559735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 52308735 - 52308524
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||  | |||||||| |    
T  52308735 caattgctacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaaaaactcaaggtaaatagatgataaatgacaaagctacaaaatatttttccc 52308636  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  52308635 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatattccaggtcattatcaaatttatacaaaatcctatcatcttatgctgacaaatta 52308536  T
Q  214 gaaaataatacc 225  Q
    ||||||||||||    
T  52308535 gaaaataatacc 52308524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 15 - 229
Target Start/End: Original strand, 13663767 - 13663981
Alignment:
Q  15 aattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctca 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||    
T  13663767 aattgttacatatatttgggttgccgttgactataaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagttacgaagtatttttccca 13663866  T
Q  115 tagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaattag 214  Q
    ||||||| ||| | | |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  13663867 tagtgttgcattagccatattcccactacataaggaaatacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatttgatgctgacaaattag 13663966  T
Q  215 aaaataatacctttt 229  Q
    |||||||||||||||    
T  13663967 aaaataatacctttt 13663981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 38846574 - 38846789
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |    
T  38846574 caattgttacatatatttggattgccgttgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtatctagatggtaaatgataaagctacatagtatttttccc 38846673  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||    
T  38846674 atagtgttacatcaactatattcccactacataaagaaagacatctttcgggtcattatcaaacttatacaaaattctatcgtctaatgctgacaaaata 38846773  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||| ||||    
T  38846774 gaaaataatacatttt 38846789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18095712 - 18095503
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    ||||||||| |||||| | | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||| |    
T  18095712 caattgttaaatatatctggcttgccattgtctacaaaatggaagcaaagaactcaaggcaaatagatggtagatgataaagctacgatgtatttttccc 18095613  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  18095612 ataatgttacatcaaccatattctcactgcataaggaaagacatttttcaggtcattatcaaacctatacaaaatcctatcatctgacgctgacaaatta 18095513  T
Q  214 gaaaataata 223  Q
    ||||||||||    
T  18095512 gaaaataata 18095503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 48339293 - 48339079
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| || || || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |    
T  48339293 caattgttacatatatttgggctgtcattaactataaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctatggagtattttcc-c 48339195  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||    
T  48339194 atagtgttacatcaactatattcccactacataatgaaaaacatctttcgggtcattattaaacttatataaaatcctatcatctgatgctgacaaaata 48339095  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    |||||||| |||||||    
T  48339094 gaaaataacacctttt 48339079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 228
Target Start/End: Original strand, 52522919 - 52523122
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||           ||| ||||||||||||||||||| |    
T  52522919 caattgttacatatatttgggtttccattaactacaaaatggaagcaaggaactcaaggtaaat-----------gataaagctacggagtatttttccc 52523007  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  52523008 atagtgttacatcaattatattcccactacatatggaaagacatttttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaaata 52523107  T
Q  214 gaaaataataccttt 228  Q
    |||||||| ||||||    
T  52523108 gaaaataacaccttt 52523122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 104 - 229
Target Start/End: Original strand, 10700519 - 10700644
Alignment:
Q  104 tatttttctcatagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgt 203  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10700519 tatttttcccatagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagatatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgt 10700618  T
Q  204 tgacaaattagaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  10700619 tgacaaattagaaaataatacctttt 10700644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 213
Target Start/End: Original strand, 17709792 - 17709972
Alignment:
Q  37 gccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttct-----catagtgttacatcaacta 131  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |     |||||||||||||||||||    
T  17709792 gccattgactacaaa-tggaagtaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacgaagtattttttttgtttcatagtgttacatcaacta 17709890  T
Q  132 tattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||    
T  17709891 tattcccactgcataaggaaagacatctttcatgtcattatcaaacttatacaaaatcctatcctctgataatgacaaatta 17709972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 84 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21729580 - 21729435
Alignment:
Q  84 taaatgatcaagctacggagtatttttctcatagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatac 183  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21729580 taaatgataaagctacggagtatttttcccatagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaagacatatttcaggtcattatcaaacttatac 21729481  T
Q  184 aaaattctatcatctgatgttgacaaattagaaaataatacctttt 229  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  21729480 aaaatcctatcatctgatgctaacaaattagaaaataatacatttt 21729435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 49225177 - 49224970
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  49225177 caattgttacatatatttgggttgacgttgactacaaaaaggtagcaaagaactcaaggtaaatagaaggtaaatgataaagctacagagtatttttccc 49225078  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     ||  ||||||||||    
T  49225077 atagtgttacatcaactaaatttccactacata---aaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaatcctatc-----attctgacaaatta 49224986  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    |||||||||| |||||    
T  49224985 gaaaataatatctttt 49224970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 15314153 - 15314077
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatga 90  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  15314153 caattgttacatatatttaggttgccattgactaaaaaatggaatcaaagaacttaatgtaaatagatggcaaatga 15314077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 35)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 39797694 - 39797904
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  39797694 caattgttacatatatttgggttgccaatgactacaaaatggaag-----aactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacgaagtatttttccc 39797788  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39797789 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 39797888  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  39797889 gaaaataatacctttt 39797904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 5253606 - 5253816
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5253606 caattgttacatatatttgggttgccaatgactataaaatggaag-----aactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttccc 5253700  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5253701 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 5253800  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
     |||||||||||||||    
T  5253801 aaaaataatacctttt 5253816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 6105478 - 6105693
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  6105478 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaggaactcaaggtaaataaatggtaaatgataaagctacggagtatttttccc 6105577  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6105578 aaagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaagacatttttcgggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaaata 6105677  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  6105678 gaaaataatacctttt 6105693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 11952641 - 11952856
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |    
T  11952641 caattgttacatatatttcggttgtcattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacggaatattttttcc 11952740  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||    
T  11952741 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaagtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatcttaagctgacaaatta 11952840  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  11952841 gaaaataatacctttt 11952856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16340565 - 16340350
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  16340565 caattgttacatatattttggttgacattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacggagtatttttccc 16340466  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16340465 atagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaggacatttttcgggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgctgacaaaata 16340366  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  16340365 gaaaataatacctttt 16340350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 31370381 - 31370596
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  31370381 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaggaacttaaggtaaatagatggtaaatgataaaggtacggagtatttttccc 31370480  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31370481 atagtgttacatcaactatattcccactacataaagaaagacatttttcgggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaaata 31370580  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  31370581 gaaaataatacctttt 31370596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 35089199 - 35089414
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  35089199 caattgttacatatatttggattgccattgactacaaaatggaagcaaggaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagttacggagtatttttccc 35089298  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35089299 atagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaagacatttttcgagtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaaata 35089398  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  35089399 gaaaataatacctttt 35089414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 40828291 - 40828507
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||      
T  40828291 caattgttacatatatttgggttgtcattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagttacggaatatttttcct 40828390  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgac-aaatt 212  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||    
T  40828391 gtagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatcttatgctgacaaaatt 40828490  T
Q  213 agaaaataatacctttt 229  Q
    |||||||||||||||||    
T  40828491 agaaaataatacctttt 40828507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 50772559 - 50772774
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  50772559 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaggaacacaaggtaaatagatggtaaatgataaagttacggagtatttttccc 50772658  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |     
T  50772659 atagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaagacatctttcgggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttggcaaaatg 50772758  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    |||||||||| |||||    
T  50772759 gaaaataatatctttt 50772774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Original strand, 21700922 - 21701133
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  21700922 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaagtaaaaagatggtaaatgataaagctacggagtatttttccc 21701021  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||    
T  21701022 atagtgttacatcaattatattcccactacataaggaaagacatctttcgcgtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatctgatgctgacaaaata 21701121  T
Q  214 gaaaataatacc 225  Q
    ||||||||||||    
T  21701122 gaaaataatacc 21701133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 52841886 - 52842101
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |    
T  52841886 caattgttacatatattttggttgcaattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacgaagtattttttcc 52841985  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||    
T  52841986 atagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaagatatctttcgggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatctgatgctgacaaaata 52842085  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    |||||||||| |||||    
T  52842086 gaaaataatatctttt 52842101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 54794318 - 54794533
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |    
T  54794318 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacgaagtatttttcac 54794417  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  54794418 atagtgttacatctaccatattcccactacatagggaaatacatctttcgggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatctgatgctaacaaatta 54794517  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  54794518 gaaaataatacctttt 54794533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 48975574 - 48975359
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||  |    
T  48975574 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacgaaatattttttcc 48975475  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||    
T  48975474 atagtgttacatcaaccatattcccactacataaggaaaaacatctttcaagtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatctgatgctgacaaaata 48975375  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||| ||||    
T  48975374 gaaaataatacatttt 48975359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 18742152 - 18742367
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    ||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  18742152 caattgttacatatatttgtgttgtcattgactacaaaatggaaccaaagaactcgaggtaaatagatggtaaatgataaagctacagagtatttttctc 18742251  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||    
T  18742252 atagtgttacatcaaccatatttccactacataaggaaagacatctttcgggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatctgatgctgacaaaata 18742351  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||| ||||    
T  18742352 gaaaataatacatttt 18742367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22476604 - 22476394
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||| || |||||||| |    
T  22476604 caattgttacatatatttgggttgtcattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaat-----agctacagaatatttttccc 22476510  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||    
T  22476509 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaaatcattatcaaacttatacaaaatcatatcatcttatgctgacaaatta 22476410  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  22476409 gaaaataatacctttt 22476394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 52854805 - 52855020
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |    
T  52854805 caattgttacataaatttgggtttccattgactacaaaatggaagcaaagaaatcaaggtaaataaatggtaaatgataaagctacggaatatttttccc 52854904  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  52854905 atagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaagacatatttcgggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatatgatgctgacaaaata 52855004  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||| ||||    
T  52855005 gaaaataatacatttt 52855020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 54648874 - 54649089
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||  |    
T  54648874 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaagaactcaagctaaatagatggtaaatgataaagctatgaagtattttttcc 54648973  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||    
T  54648974 atagtgttacaccaactatattcccactacatacggaaagacatctttcgggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatctgatgctgacaaaata 54649073  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    |||||||||| |||||    
T  54649074 gaaaataatatctttt 54649089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 50740295 - 50740079
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  50740295 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaagaacacaaggtaaatagatagtaaatgataaagctacgaagtatttttttc 50740196  T
Q  114 -atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatt 212  Q
     || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |    
T  50740195 catggtgttacatcaactatattcccactacataaggaaagacatctttcgggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatctgatgttggcaaaat 50740096  T
Q  213 agaaaataatacctttt 229  Q
     |||||||||| |||||    
T  50740095 ggaaaataatatctttt 50740079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 8241597 - 8241403
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  8241597 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggtagcaaagaactcaaagtaaatagatggtaaatgataaagctacaaagtatttttctc 8241498  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgaca 208  Q
    ||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  8241497 ataatgctacatcaactatattcccactacataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatctgatgctgaca 8241403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 15 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16494771 - 16494557
Alignment:
Q  15 aattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctca 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||    
T  16494771 aattgttacatatatttgggttgccgttgactataaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagttacgaagtatttttccca 16494672  T
Q  115 tagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaattag 214  Q
    ||||||| ||| | | |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  16494671 tagtgttgcattagccatattcccactacataaggaaatacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatttgatgctgacaaattag 16494572  T
Q  215 aaaataatacctttt 229  Q
    |||||||||||||||    
T  16494571 aaaataatacctttt 16494557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 15 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 35435866 - 35435652
Alignment:
Q  15 aattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctca 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||  ||    
T  35435866 aattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaagaactcaatgtatatagatggtaaatgataaagccacgaagtattttttcca 35435767  T
Q  115 tagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaattag 214  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||| |||||||    
T  35435766 taatgttacatcaactatattcccactgcataagtaaatacatctttcaggtcattatcaaacttatataaaattatatcatctgatcctgaaaaattag 35435667  T
Q  215 aaaataatacctttt 229  Q
    |||||||||||||||    
T  35435666 aaaataatacctttt 35435652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23192425 - 23192208
Alignment:
Q  12 atcaattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttc 111  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  23192425 atcaattgttacatatatttgggtttccattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacggagtacttttc 23192326  T
Q  112 tcatagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaat 211  Q
     |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||  ||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||     
T  23192325 ccataatgttacatcaactatattcccactacataaggaaaaacatatttcgggtcattactaaacttatataaaatcatatcatctgatgctgacaaaa 23192226  T
Q  212 tagaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  23192225 tagaaaataatacatttt 23192208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 17911115 - 17911329
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  17911115 caattgttacatttatttgggttgtcattgactacaaaacggaagcaaagaactcaaggtatatagatggtaaatgataaagctacggagtatttttccc 17911214  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||| ||| ||||| |||||||||| | | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  17911215 ataatgtaacatctactatattct-attacataaggaaagacatttttcgggtcattatcaaacttatacaaaattcaatcatctgatgctgacaaaata 17911313  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  17911314 gaaaataatacctttt 17911329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 49111964 - 49111759
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    ||||||||||||||||||     |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| |    
T  49111964 caattgttacatatattt-----gccattgactacaaaatggatgcaaagaactcaaggtaaatagatagtaaatgataaagctacgaagtatttttccc 49111870  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||| ||    
T  49111869 atagtgtcacatcaactatattcccactacataaggaaagacatctttcgggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatctaaaattgacaaaata 49111770  T
Q  214 gaaaataatac 224  Q
    |||||||||||    
T  49111769 gaaaataatac 49111759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 12169298 - 12169514
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  12169298 caattgttacatatatttgggttgtcattgaatacaaaatagaagcaaagaactcaatgtatatagatggtaaatgataaagctacgaagtatttttttc 12169397  T
Q  114 -atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatt 212  Q
     |||||||||||||||| |||| | ||||| ||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||| |||||    
T  12169398 tatagtgttacatcaaccatatgcccactgtataagtaaatacttctttcatgtcattatcaaacttatataaaattatatcatctgatcctgaaaaatt 12169497  T
Q  213 agaaaataatacctttt 229  Q
    |||||||||||||||||    
T  12169498 agaaaataatacctttt 12169514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 223
Target Start/End: Original strand, 2846111 - 2846323
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagta----tttt 109  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||  ||||    ||||    
T  2846111 caattgttacatatatttgggctgccattaactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaataataaagccacaaagtatgcctttt 2846210  T
Q  110 tctcatagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaa 209  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| || | |    
T  2846211 tcccatagtgttacatcaactatattcccggtgcataaggaaagacatctttcaggtcattattaaatgtatacaaaattctatcatctgatgctg-cta 2846309  T
Q  210 attagaaaataata 223  Q
    | ||||||||||||    
T  2846310 aatagaaaataata 2846323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 51247262 - 51247115
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  51247262 caattgttacatatatttggattgccattgactacaaaatggaagcaaataactcaaggtaaatagacggtaaatgataaagctacgaagtatttttctc 51247163  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatcttt 161  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  51247162 atagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaagacatcttt 51247115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 36168816 - 36169035
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttct- 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||  || |||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |     
T  36168816 caattgttacatatatttgggtttacattgac-acaaaatggaagcaaataactcaatgtatatagatggtaaataatcaagctacgaagtttttttttt 36168914  T
Q  113 ----catagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgaca 208  Q
        ||||||||||||||||| |||||| |||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||    
T  36168915 tttccatagtgttacatcaaccatattcccactacatatgtaaatacatctttcaggtcattatcaaacttatataaaattatatcatctgatcctgaca 36169014  T
Q  209 aattagaaaataatacctttt 229  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  36169015 aattagaaaataatacctttt 36169035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 118 - 229
Target Start/End: Original strand, 52463389 - 52463500
Alignment:
Q  118 tgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaattagaaa 217  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  52463389 tgttacatcaactatattcccactgcataaagaaagacatctttcaggtcattaccaaacttatacaaaatcctatcatctgatgctgacaaataagaaa 52463488  T
Q  218 ataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||    
T  52463489 ataatacctttt 52463500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 116 - 224
Target Start/End: Original strand, 11327299 - 11327407
Alignment:
Q  116 agtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaattaga 215  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  11327299 agtgttacatcaactatattccaactacataaggaaatacatctttcgggtcattataaaacttatacaaaatcctatcatctgatgctgacaaaataga 11327398  T
Q  216 aaataatac 224  Q
    |||||||||    
T  11327399 aaataatac 11327407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 111
Target Start/End: Original strand, 11327006 - 11327103
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttc 111  Q
    |||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  11327006 caattgttacatatatttgggttttcattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaataaatggtaaatgataaagctacagagtatttttc 11327103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Original strand, 55296143 - 55296222
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatca 93  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  55296143 caattgttacatatatttgggttgccattgactataaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaattatca 55296222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 917590 - 917468
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||| | |    
T  917590 caattgttacatctatttgcgttgtcattgactacaaaatagaagcaaagtattcaaggtaaataaatggtaaatgataaagctacaaagtattttaccc 917491  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattc 136  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  917490 ataatgttacatcaactatattc 917468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 136
Target Start/End: Original strand, 44074074 - 44074196
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||  |||||||| | |    
T  44074074 caattgttacatctatttgcgttgtcattgactacaaaatagaagcaaagaattcaaggtaaataaatggtaaatgataaaggtacaaagtattttaccc 44074173  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattc 136  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  44074174 ataatgttacatcaactatattc 44074196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 161 - 229
Target Start/End: Original strand, 55296220 - 55296288
Alignment:
Q  161 tcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaattagaaaataatacctttt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  55296220 tcaggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatcttatgttgacaaattagaaaataatacatttt 55296288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8820 - 8605
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  8820 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaggaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacggagtatttttccc 8721  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8720 atagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaagacatttttcgggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaaata 8621  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  8620 gaaaataatacctttt 8605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 19737 - 19952
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |    
T  19737 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcaaagaactcgaggtaaatagatggtaaatgataaagctacgaaatatttttccc 19836  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |    
T  19837 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaatacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatcttatgctgacaaataa 19936  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  19937 gaaaataatacctttt 19952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 27723 - 27938
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  27723 caattgttacatatatttgggttgtcattgactacaaaatggaagtaaggaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacggagtatttttccc 27822  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  27823 atagtgttacatcaactatattcccactacataaggaaagacatttttcgagtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttcacaaaata 27922  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  27923 gaaaataatacctttt 27938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1884 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold1884
Description:

Target: scaffold1884; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 721 - 506
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |    
T  721 caattgttacatatatttgggttgacattgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacgtagtatttttccc 622  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  621 atagtgttacatcaactatattcccacaacataaggaaagacatttttcgggtcattatcaaacttatataaaattctatcatttgatgctgacaaaata 522  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  521 gaaaataatacctttt 506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12699 - 12484
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |    
T  12699 caattgttacatatatttaggttgtcattgactacaaaatggaagtaaagaactcgaggtaaatagatggtaaatgataaagctacgaaatatttttccc 12600  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |    
T  12599 atagtgttacatcaactatattctcacttcataagtaaatacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatcttatgctgacaaataa 12500  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  12499 gaaaataatacctttt 12484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 16694 - 16909
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  16694 caattgttacatatatttggattgccgttgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacagagtatttttccc 16793  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||    
T  16794 atagtgttacatcaactatattcccactacataaagaaagacatctttcgggtcattatcaaacttatacaaaattctatcgtctaatgctgacaaaata 16893  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||| ||||    
T  16894 gaaaataatacatttt 16909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 14210 - 14424
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  14210 caattgttacat-tatttgggttgtcattgactacaaaatagaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacggaatatttttctc 14308  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| | ||||    
T  14309 atagtgttatatcaactatattctcactgcataaggaaagacatatttcaagtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatctgatcctgaaatatta 14408  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  14409 gaaaataatacctttt 14424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 65991 - 66206
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||  |    
T  65991 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatggaagcatagaactcaaggtaaatagatggtaaataataaagctacgaagtattttttcc 66090  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  66091 attgtgttacatcaaccatattcccactgcataaggaaatacatctttcagatcattatcaaacttatataaaattctatcatatgatgctgacaaatta 66190  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||| ||||    
T  66191 gaaaataatacttttt 66206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 15 - 229
Target Start/End: Original strand, 153532 - 153746
Alignment:
Q  15 aattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctca 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||    
T  153532 aattgttacatatatttgggttgccgttgactataaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgataaagttacgaagtatttttccca 153631  T
Q  115 tagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaattag 214  Q
    ||||||| ||| | | |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  153632 tagtgttgcattagccatattcccactacataaggaaatacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaatcctatcatttgatgctgacaaattag 153731  T
Q  215 aaaataatacctttt 229  Q
    |||||||||||||||    
T  153732 aaaataatacctttt 153746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 5617 - 5832
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||      
T  5617 caattgttacatatatttgggttgccattcactaccaaatggaagcaaataactcaaggtaaagagatggtaaaagataaagctacggaatatttttccg 5716  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||| ||||||||||    
T  5717 atagtgttacaacaactatattctcactgcataaggaaagatatctttcaggtcattatcaaacttatataaaatcctgtcatcttatgctgacaaatta 5816  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||| ||||    
T  5817 gaaaataatacgtttt 5832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 12066 - 12281
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||      
T  12066 caattgttacatatatttgggttgccattcactaccaaatggaagcaaataactcaaggtaaagagatggtaaaagataaagctacggaatatttttccg 12165  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||| ||||||||||    
T  12166 atagtgttacaacaactatattctcactgcataaggaaagatatctttcaggtcattatcaaacttatataaaatcctgtcatcttatgctgacaaatta 12265  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
    ||||||||||| ||||    
T  12266 gaaaataatacgtttt 12281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 59509 - 59294
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    ||||||||  |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |    
T  59509 caattgttttatatatttgggttgtcattgactacaaaatggaagcaaagaacttaaggtaaatagatggtaaatgataaagctacagactatttttccc 59410  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  59409 ataatgttacatcaactatattcccaccacataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttacacaaaatcctatcatctgatgctgacaaatta 59310  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
     |||||||||| ||||    
T  59309 aaaaataatacatttt 59294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 118933 - 118718
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    ||||||||  |||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  | |||||||| |    
T  118933 caattgttttatatatttgggttgtcattgactataaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaataataaagctacatactatttttccc 118834  T
Q  114 atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatta 213  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  118833 ataatgttacatcaactatattcccactgcataaggaatgacatctttcaggtcattatcaaacttacacaaaatcctatcatctgatgcttacaaatta 118734  T
Q  214 gaaaataatacctttt 229  Q
     |||||||||| ||||    
T  118733 aaaaataatacatttt 118718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 48959 - 48743
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||    
T  48959 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatagaagcaaagaactcaatgtatatagatggtaaatgataaagctacgaagtacttttttc 48860  T
Q  114 -atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatt 212  Q
     |||||||||||||||| |||| | ||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  48859 catagtgttacatcaaccatatgcccactgtataagtaaatacatcattcaggtcattatcaaacttatataaaattatatcatctgatcttgaaaaatt 48760  T
Q  213 agaaaataatacctttt 229  Q
    |||||||||||||||||    
T  48759 agaaaataatacctttt 48743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 64344 - 64128
Alignment:
Q  14 caattgttacatatatttaggttgccaatgactacaaaatggaagcaaagaactcaaggtaaatagatggtaaatgatcaagctacggagtatttttctc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||    
T  64344 caattgttacatatatttgggttgccattgactacaaaatagaagcaaagaactcaatgtatatagatggtaaatgataaagctacgaagtacttttttc 64245  T
Q  114 -atagtgttacatcaactatattctcactgcataaggaaagacatctttcaggtcattatcaaacttatacaaaattctatcatctgatgttgacaaatt 212  Q
     |||||||||||||||| |||| | ||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  64244 catagtgttacatcaaccatatgcccactgtataagtaaatacatcattcaggtcattatcaaacttatataaaattatatcatctgatcttgaaaaatt 64145  T
Q  213 agaaaataatacctttt 229  Q
    |||||||||||||||||    
T  64144 agaaaataatacctttt 64128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University