View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6193_low_11 (Length: 294)

Name: NF6193_low_11
Description: NF6193
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6193_low_11
NF6193_low_11
[»] scaffold0052 (3 HSPs)
scaffold0052 (1-282)||(1129-1410)
scaffold0052 (65-282)||(10087-10304)
scaffold0052 (65-282)||(56509-56726)
[»] chr7 (108 HSPs)
chr7 (1-282)||(18175854-18176135)
chr7 (1-282)||(18182526-18182807)
chr7 (1-282)||(18164748-18165029)
chr7 (1-286)||(9511087-9511371)
chr7 (1-286)||(60752-61037)
chr7 (1-286)||(12703484-12703768)
chr7 (1-282)||(40523436-40523717)
chr7 (1-286)||(11365942-11366229)
chr7 (1-282)||(16407370-16407651)
chr7 (1-286)||(49051117-49051401)
chr7 (1-286)||(13690838-13691123)
chr7 (1-282)||(15162896-15163177)
chr7 (1-282)||(20703064-20703346)
chr7 (1-282)||(32767425-32767707)
chr7 (1-286)||(13684207-13684492)
chr7 (1-282)||(15156245-15156526)
chr7 (1-282)||(44786550-44786831)
chr7 (1-282)||(44793191-44793472)
chr7 (1-263)||(14330555-14330816)
chr7 (1-263)||(14337139-14337400)
chr7 (1-282)||(14655492-14655773)
chr7 (32-286)||(1347239-1347493)
chr7 (32-282)||(11232404-11232654)
chr7 (65-282)||(15021857-15022074)
chr7 (32-282)||(11239091-11239341)
chr7 (65-282)||(21410-21627)
chr7 (65-282)||(8202235-8202452)
chr7 (21-263)||(9409698-9409942)
chr7 (21-253)||(13569655-13569887)
chr7 (21-263)||(20205-20448)
chr7 (21-263)||(6017283-6017528)
chr7 (23-282)||(4318655-4318915)
chr7 (21-263)||(18530998-18531241)
chr7 (23-252)||(7535947-7536177)
chr7 (65-286)||(8705728-8705950)
chr7 (65-287)||(18553683-18553906)
chr7 (23-286)||(12692232-12692490)
chr7 (23-286)||(14958900-14959158)
chr7 (65-263)||(23520114-23520313)
chr7 (23-286)||(26419736-26419994)
chr7 (23-286)||(11262065-11262323)
chr7 (23-286)||(11548377-11548636)
chr7 (23-286)||(11554973-11555232)
chr7 (21-234)||(32657-32874)
chr7 (21-234)||(12705000-12705217)
chr7 (21-234)||(71108-71325)
chr7 (21-234)||(75217-75434)
chr7 (21-234)||(12718216-12718433)
chr7 (21-234)||(12723127-12723344)
chr7 (21-234)||(16113789-16114006)
chr7 (21-234)||(16116942-16117159)
chr7 (21-234)||(18278951-18279168)
chr7 (21-234)||(18282914-18283131)
chr7 (115-262)||(8712423-8712571)
chr7 (153-263)||(10869221-10869332)
chr7 (153-263)||(10875301-10875412)
chr7 (153-287)||(18585512-18585647)
chr7 (192-282)||(20871301-20871391)
chr7 (161-286)||(14952961-14953086)
chr7 (35-234)||(15083719-15083912)
chr7 (35-234)||(18556779-18556973)
chr7 (161-260)||(44408554-44408653)
chr7 (106-234)||(1859261-1859382)
chr7 (169-286)||(15380554-15380671)
chr7 (35-234)||(13148963-13149155)
chr7 (133-234)||(18425208-18425307)
chr7 (133-234)||(26291920-26292019)
chr7 (135-234)||(14216732-14216829)
chr7 (135-234)||(15728132-15728229)
chr7 (106-234)||(39721789-39721911)
chr7 (106-234)||(45170467-45170589)
chr7 (138-234)||(12714436-12714530)
chr7 (138-234)||(7519531-7519623)
chr7 (135-234)||(8917235-8917331)
chr7 (162-234)||(13918981-13919053)
chr7 (106-234)||(25927678-25927799)
chr7 (57-234)||(13461568-13461738)
chr7 (164-234)||(16724858-16724928)
chr7 (164-234)||(17701872-17701942)
chr7 (135-230)||(2530616-2530708)
chr7 (23-159)||(14953061-14953192)
chr7 (162-234)||(16275323-16275395)
chr7 (23-159)||(44408448-44408579)
chr7 (21-156)||(16907576-16907718)
chr7 (138-234)||(16907675-16907769)
chr7 (169-234)||(35151448-35151513)
chr7 (65-156)||(10869301-10869393)
chr7 (65-156)||(10875381-10875473)
chr7 (65-156)||(18585451-18585543)
chr7 (35-234)||(9593155-9593345)
chr7 (35-233)||(16457463-16457652)
chr7 (35-234)||(16583065-16583256)
chr7 (161-234)||(20578-20650)
chr7 (161-234)||(6801021-6801093)
chr7 (109-234)||(14932954-14933072)
chr7 (109-234)||(15356389-15356507)
chr7 (109-234)||(15360503-15360621)
chr7 (21-183)||(26291996-26292162)
chr7 (161-230)||(2832682-2832750)
chr7 (21-156)||(12714487-12714629)
chr7 (164-234)||(12317934-12318006)
chr7 (22-128)||(18425333-18425448)
chr7 (164-216)||(13635696-13635747)
chr7 (164-234)||(9751984-9752056)
chr7 (65-119)||(8719312-8719366)
chr7 (164-233)||(14152229-14152300)
chr7 (164-234)||(15605497-15605570)
chr7 (33-70)||(42203954-42203991)
[»] chr4 (100 HSPs)
chr4 (1-286)||(14268531-14268815)
chr4 (1-286)||(14298905-14299189)
chr4 (1-282)||(23953897-23954178)
chr4 (1-282)||(23960559-23960840)
chr4 (4-282)||(19780367-19780645)
chr4 (1-286)||(15148202-15148487)
chr4 (1-286)||(15361877-15362162)
chr4 (1-286)||(16231918-16232203)
chr4 (1-286)||(22194364-22194649)
chr4 (1-286)||(36884811-36885096)
chr4 (1-282)||(40477898-40478180)
chr4 (1-282)||(15383569-15383849)
chr4 (1-282)||(386405-386687)
chr4 (1-282)||(6873452-6873734)
chr4 (1-282)||(12474768-12475049)
chr4 (1-282)||(12481398-12481679)
chr4 (1-282)||(26284982-26285265)
chr4 (1-263)||(4771865-4772126)
chr4 (1-282)||(18024504-18024785)
chr4 (1-286)||(18070913-18071198)
chr4 (1-282)||(18295374-18295655)
chr4 (1-263)||(8048572-8048833)
chr4 (1-263)||(8055185-8055446)
chr4 (21-263)||(23081341-23081583)
chr4 (21-263)||(27709498-27709740)
chr4 (52-282)||(40453669-40453899)
chr4 (21-263)||(9272267-9272509)
chr4 (21-263)||(19942265-19942507)
chr4 (65-282)||(8384562-8384779)
chr4 (65-282)||(14073558-14073775)
chr4 (65-282)||(15256336-15256553)
chr4 (65-282)||(17090139-17090356)
chr4 (65-282)||(29041060-29041277)
chr4 (21-263)||(16956762-16957004)
chr4 (1-282)||(51493893-51494165)
chr4 (65-282)||(8391217-8391434)
chr4 (65-282)||(17808141-17808358)
chr4 (23-282)||(7901283-7901542)
chr4 (23-282)||(15322205-15322464)
chr4 (21-263)||(53433126-53433371)
chr4 (34-263)||(12521835-12522065)
chr4 (65-286)||(12349725-12349947)
chr4 (1-156)||(14305529-14305683)
chr4 (66-286)||(55795182-55795403)
chr4 (21-234)||(4561675-4561883)
chr4 (21-234)||(5757280-5757488)
chr4 (65-263)||(12300049-12300248)
chr4 (21-234)||(14757763-14757985)
chr4 (65-282)||(17962485-17962703)
chr4 (1-166)||(20115007-20115172)
chr4 (23-286)||(23838170-23838428)
chr4 (23-260)||(41385856-41386088)
chr4 (23-260)||(14678726-14678957)
chr4 (21-234)||(9556078-9556295)
chr4 (21-234)||(17809822-17810039)
chr4 (21-234)||(33741928-33742145)
chr4 (162-286)||(14305662-14305786)
chr4 (23-260)||(14684934-14685165)
chr4 (22-234)||(15224590-15224805)
chr4 (23-159)||(35170484-35170621)
chr4 (106-234)||(14708810-14708933)
chr4 (34-159)||(35613796-35613921)
chr4 (35-234)||(12487233-12487427)
chr4 (162-286)||(35170384-35170508)
chr4 (35-234)||(45937957-45938149)
chr4 (106-234)||(14954628-14954750)
chr4 (35-232)||(19757706-19757896)
chr4 (35-232)||(19781910-19782100)
chr4 (35-234)||(2014587-2014779)
chr4 (35-234)||(9530243-9530435)
chr4 (35-234)||(26243770-26243962)
chr4 (162-260)||(35613722-35613820)
chr4 (106-234)||(42997626-42997749)
chr4 (134-234)||(23139080-23139177)
chr4 (21-128)||(20682040-20682147)
chr4 (135-234)||(18602932-18603029)
chr4 (162-234)||(25689417-25689489)
chr4 (138-234)||(18609507-18609601)
chr4 (135-234)||(3412606-3412703)
chr4 (162-234)||(10712403-10712475)
chr4 (162-234)||(10926173-10926245)
chr4 (162-234)||(28569646-28569718)
chr4 (161-231)||(1951985-1952054)
chr4 (135-231)||(27533528-27533621)
chr4 (35-233)||(16243505-16243696)
chr4 (161-234)||(18222602-18222674)
chr4 (135-234)||(18236700-18236796)
chr4 (203-263)||(30235277-30235337)
chr4 (161-234)||(17152710-17152782)
chr4 (205-260)||(21339968-21340023)
chr4 (1-58)||(40471449-40471507)
chr4 (214-263)||(13020537-13020586)
chr4 (161-234)||(18229077-18229149)
chr4 (169-234)||(36134180-36134247)
chr4 (187-234)||(20157706-20157752)
chr4 (188-234)||(22634653-22634698)
chr4 (35-155)||(27533624-27533742)
chr4 (33-70)||(11250681-11250718)
chr4 (33-70)||(15353428-15353465)
chr4 (33-70)||(16351972-16352009)
[»] chr2 (74 HSPs)
chr2 (1-286)||(23170783-23171068)
chr2 (1-286)||(23582040-23582325)
chr2 (1-286)||(29233275-29233559)
chr2 (1-286)||(29346574-29346858)
chr2 (1-286)||(27599009-27599293)
chr2 (1-282)||(22321061-22321342)
chr2 (1-282)||(22327214-22327495)
chr2 (1-282)||(1842832-1843112)
chr2 (1-286)||(27617043-27617327)
chr2 (1-282)||(24914040-24914322)
chr2 (1-286)||(26877643-26877927)
chr2 (1-282)||(12828821-12829103)
chr2 (1-282)||(16928105-16928386)
chr2 (1-282)||(16996799-16997080)
chr2 (1-282)||(17003432-17003713)
chr2 (1-282)||(10873287-10873568)
chr2 (21-263)||(13970480-13970722)
chr2 (21-263)||(24714465-24714707)
chr2 (65-286)||(27215790-27216011)
chr2 (21-263)||(41604843-41605085)
chr2 (21-263)||(41610740-41610982)
chr2 (21-263)||(45057536-45057778)
chr2 (65-282)||(9340011-9340228)
chr2 (65-282)||(9488645-9488862)
chr2 (65-282)||(9607906-9608123)
chr2 (65-282)||(16922260-16922477)
chr2 (65-282)||(19490085-19490302)
chr2 (65-282)||(28432073-28432290)
chr2 (42-282)||(10865922-10866162)
chr2 (65-282)||(13306750-13306967)
chr2 (65-282)||(16985672-16985889)
chr2 (23-263)||(37318029-37318269)
chr2 (21-263)||(30971091-30971336)
chr2 (23-263)||(11677200-11677441)
chr2 (23-259)||(21147404-21147638)
chr2 (23-263)||(24641075-24641316)
chr2 (65-286)||(27369035-27369257)
chr2 (65-286)||(44381352-44381574)
chr2 (23-286)||(24502847-24503105)
chr2 (65-286)||(27375545-27375767)
chr2 (65-286)||(44388022-44388244)
chr2 (21-234)||(10101994-10102211)
chr2 (21-234)||(12901857-12902074)
chr2 (21-234)||(24628820-24629037)
chr2 (21-234)||(24648903-24649120)
chr2 (21-234)||(27601340-27601557)
chr2 (21-234)||(27379773-27379990)
chr2 (21-234)||(27383819-27384036)
chr2 (21-161)||(24872519-24872660)
chr2 (21-161)||(24880404-24880545)
chr2 (1-128)||(10866274-10866401)
chr2 (35-234)||(19928607-19928799)
chr2 (162-263)||(24872634-24872736)
chr2 (162-263)||(24880519-24880621)
chr2 (35-234)||(30345381-30345574)
chr2 (35-234)||(18855564-18855756)
chr2 (106-232)||(41666759-41666879)
chr2 (106-234)||(31344685-31344807)
chr2 (162-260)||(27195507-27195605)
chr2 (146-234)||(60625-60711)
chr2 (162-234)||(1282936-1283008)
chr2 (162-234)||(41531491-41531563)
chr2 (133-234)||(26124992-26125090)
chr2 (135-234)||(23186884-23186980)
chr2 (135-234)||(23598147-23598243)
chr2 (198-263)||(30657567-30657632)
chr2 (35-234)||(22461295-22461485)
chr2 (106-159)||(27195581-27195634)
chr2 (164-234)||(24735201-24735273)
chr2 (32-88)||(27196813-27196869)
chr2 (33-70)||(24174759-24174796)
chr2 (33-70)||(24655459-24655496)
chr2 (33-70)||(24869839-24869876)
chr2 (33-70)||(40428422-40428459)
[»] chr6 (101 HSPs)
chr6 (1-286)||(27328132-27328417)
chr6 (1-286)||(27388872-27389157)
chr6 (1-282)||(2870211-2870492)
chr6 (1-282)||(2876826-2877107)
chr6 (1-282)||(26130217-26130497)
chr6 (1-282)||(30694112-30694392)
chr6 (1-282)||(8796941-8797222)
chr6 (1-286)||(20060395-20060680)
chr6 (1-286)||(6980406-6980690)
chr6 (1-280)||(20649867-20650145)
chr6 (1-282)||(12762453-12762733)
chr6 (1-286)||(20801503-20801787)
chr6 (1-286)||(27430359-27430644)
chr6 (1-282)||(30596976-30597249)
chr6 (1-282)||(28287105-28287387)
chr6 (1-282)||(28258529-28258811)
chr6 (1-282)||(28265153-28265435)
chr6 (1-282)||(28337278-28337560)
chr6 (1-282)||(28343902-28344184)
chr6 (21-263)||(24291156-24291398)
chr6 (21-263)||(31317196-31317438)
chr6 (21-263)||(24315184-24315426)
chr6 (21-263)||(25110594-25110836)
chr6 (21-263)||(25117197-25117439)
chr6 (21-263)||(3708592-3708834)
chr6 (65-282)||(8228616-8228833)
chr6 (65-282)||(18930805-18931022)
chr6 (65-282)||(29587840-29588057)
chr6 (65-282)||(29593981-29594198)
chr6 (65-286)||(30638290-30638511)
chr6 (21-263)||(4167676-4167920)
chr6 (21-263)||(4208356-4208600)
chr6 (69-282)||(28314303-28314516)
chr6 (69-282)||(27185442-27185655)
chr6 (69-282)||(27207278-27207491)
chr6 (69-282)||(27241737-27241950)
chr6 (69-282)||(27263585-27263798)
chr6 (23-282)||(1539055-1539314)
chr6 (23-282)||(1545154-1545413)
chr6 (21-263)||(34832407-34832652)
chr6 (23-241)||(17037444-17037662)
chr6 (23-286)||(19808256-19808520)
chr6 (23-260)||(25928051-25928289)
chr6 (23-263)||(22758604-22758844)
chr6 (23-263)||(34370086-34370327)
chr6 (18-259)||(20176697-20176941)
chr6 (1-156)||(4233574-4233729)
chr6 (65-286)||(32565393-32565615)
chr6 (65-286)||(16552171-16552393)
chr6 (65-286)||(16576560-16576782)
chr6 (65-286)||(16618598-16618820)
chr6 (65-286)||(16628727-16628949)
chr6 (18-259)||(5834591-5834835)
chr6 (18-259)||(22159050-22159294)
chr6 (65-263)||(17017073-17017272)
chr6 (23-286)||(34298734-34298992)
chr6 (151-282)||(14053784-14053915)
chr6 (21-234)||(11566410-11566627)
chr6 (21-234)||(12619183-12619400)
chr6 (21-234)||(19870138-19870355)
chr6 (21-234)||(23394616-23394833)
chr6 (162-282)||(4233708-4233828)
chr6 (131-282)||(14098335-14098486)
chr6 (21-234)||(8243381-8243598)
chr6 (21-234)||(23989468-23989685)
chr6 (21-234)||(22862494-22862711)
chr6 (35-234)||(16759817-16760011)
chr6 (22-234)||(31478326-31478542)
chr6 (35-234)||(27416292-27416484)
chr6 (106-234)||(25135847-25135970)
chr6 (35-234)||(23414453-23414646)
chr6 (21-183)||(14098461-14098624)
chr6 (106-234)||(22948631-22948753)
chr6 (106-234)||(22952587-22952709)
chr6 (106-234)||(23871075-23871197)
chr6 (106-234)||(23875031-23875153)
chr6 (133-234)||(1644058-1644157)
chr6 (133-234)||(14471761-14471860)
chr6 (133-234)||(16623902-16624001)
chr6 (35-234)||(5616920-5617113)
chr6 (135-234)||(1587932-1588029)
chr6 (21-128)||(25595462-25595569)
chr6 (57-232)||(9482421-9482588)
chr6 (161-234)||(12706498-12706571)
chr6 (106-234)||(27556211-27556333)
chr6 (35-234)||(16741016-16741206)
chr6 (134-234)||(12496117-12496214)
chr6 (146-234)||(21702095-21702181)
chr6 (135-234)||(20803755-20803852)
chr6 (35-234)||(19662579-19662769)
chr6 (161-234)||(2685542-2685614)
chr6 (1-70)||(14059692-14059761)
chr6 (162-234)||(18917895-18917967)
chr6 (164-234)||(27325854-27325923)
chr6 (22-133)||(16624022-16624142)
chr6 (22-128)||(1644183-1644298)
chr6 (21-75)||(18917775-18917829)
chr6 (164-234)||(22430255-22430327)
chr6 (188-234)||(17803995-17804040)
chr6 (33-70)||(23657531-23657568)
chr6 (33-70)||(27553692-27553729)
[»] chr8 (57 HSPs)
chr8 (1-282)||(8354841-8355122)
chr8 (1-282)||(17669645-17669926)
chr8 (1-286)||(22115796-22116082)
chr8 (1-286)||(22124604-22124890)
chr8 (1-282)||(17676297-17676578)
chr8 (1-286)||(22083576-22083861)
chr8 (1-286)||(21915645-21915929)
chr8 (3-282)||(5534516-5534795)
chr8 (1-282)||(16883246-16883528)
chr8 (1-282)||(22123461-22123742)
chr8 (1-286)||(22047690-22047975)
chr8 (1-282)||(29122836-29123118)
chr8 (1-282)||(19496138-19496419)
chr8 (1-282)||(19498186-19498467)
chr8 (1-263)||(20013939-20014200)
chr8 (1-263)||(20020016-20020277)
chr8 (1-282)||(18865079-18865361)
chr8 (1-282)||(19110976-19111256)
chr8 (1-282)||(19117267-19117547)
chr8 (21-263)||(23845873-23846115)
chr8 (21-263)||(20024039-20024281)
chr8 (65-286)||(28454495-28454716)
chr8 (21-263)||(26935288-26935533)
chr8 (23-260)||(19905252-19905490)
chr8 (21-263)||(3216014-3216259)
chr8 (23-286)||(20527186-20527444)
chr8 (65-286)||(18065063-18065286)
chr8 (153-282)||(18854711-18854840)
chr8 (21-234)||(22111479-22111696)
chr8 (21-234)||(43251359-43251576)
chr8 (1-156)||(18854810-18854966)
chr8 (21-234)||(21972922-21973139)
chr8 (21-234)||(21977013-21977230)
chr8 (35-234)||(15531697-15531890)
chr8 (35-234)||(15538256-15538449)
chr8 (106-234)||(21410473-21410595)
chr8 (106-234)||(21804965-21805087)
chr8 (35-233)||(24445611-24445803)
chr8 (35-234)||(23847120-23847312)
chr8 (35-234)||(17828687-17828880)
chr8 (106-234)||(18863106-18863228)
chr8 (106-234)||(21828475-21828597)
chr8 (106-234)||(30940538-30940660)
chr8 (106-230)||(17055555-17055673)
chr8 (175-263)||(20705896-20705984)
chr8 (135-234)||(32598486-32598583)
chr8 (135-234)||(32605018-32605115)
chr8 (35-234)||(22044693-22044884)
chr8 (135-234)||(30308954-30309050)
chr8 (35-234)||(16231581-16231771)
chr8 (133-234)||(14398308-14398406)
chr8 (161-234)||(23833982-23834054)
chr8 (162-234)||(15440393-15440465)
chr8 (106-234)||(21386881-21387003)
chr8 (21-154)||(19278628-19278767)
chr8 (162-233)||(19278748-19278821)
chr8 (33-70)||(20856545-20856582)
[»] chr5 (102 HSPs)
chr5 (1-282)||(37286857-37287137)
chr5 (1-282)||(37293560-37293840)
chr5 (1-282)||(22328239-22328519)
chr5 (1-282)||(34294627-34294908)
chr5 (1-282)||(41098297-41098578)
chr5 (1-282)||(22264694-22264975)
chr5 (1-286)||(27615091-27615375)
chr5 (1-282)||(27663864-27664145)
chr5 (1-286)||(17707005-17707289)
chr5 (1-282)||(19991633-19991912)
chr5 (1-286)||(27608485-27608769)
chr5 (1-286)||(41294510-41294794)
chr5 (1-286)||(15001755-15002040)
chr5 (1-282)||(22341678-22341958)
chr5 (1-282)||(23583888-23584169)
chr5 (1-282)||(24472322-24472602)
chr5 (1-282)||(18038743-18039024)
chr5 (1-282)||(27670504-27670784)
chr5 (1-286)||(1692512-1692797)
chr5 (1-282)||(25406174-25406456)
chr5 (1-263)||(41769011-41769273)
chr5 (1-263)||(41775585-41775847)
chr5 (1-282)||(33725607-33725888)
chr5 (1-286)||(14995112-14995397)
chr5 (1-282)||(22139439-22139721)
chr5 (1-282)||(29471432-29471715)
chr5 (1-282)||(17283817-17284099)
chr5 (1-282)||(22062957-22063238)
chr5 (1-282)||(22132747-22133029)
chr5 (1-282)||(22587845-22588127)
chr5 (1-286)||(27687404-27687689)
chr5 (1-286)||(37543785-37544070)
chr5 (1-263)||(23249707-23249968)
chr5 (1-282)||(40706871-40707152)
chr5 (1-282)||(40713513-40713794)
chr5 (1-282)||(29478027-29478310)
chr5 (1-282)||(27516501-27516782)
chr5 (1-282)||(27523138-27523419)
chr5 (21-263)||(19768101-19768343)
chr5 (21-263)||(19774697-19774939)
chr5 (65-282)||(16354573-16354790)
chr5 (65-282)||(16361232-16361449)
chr5 (65-282)||(34564566-34564783)
chr5 (65-282)||(34571221-34571438)
chr5 (21-263)||(24020037-24020279)
chr5 (65-282)||(25106512-25106729)
chr5 (65-282)||(25165605-25165822)
chr5 (21-263)||(22343248-22343493)
chr5 (21-263)||(22352648-22352893)
chr5 (21-263)||(22326038-22326282)
chr5 (65-263)||(22410750-22410948)
chr5 (65-282)||(20775616-20775834)
chr5 (23-286)||(14359931-14360195)
chr5 (23-286)||(15442068-15442332)
chr5 (65-286)||(21667957-21668179)
chr5 (65-286)||(29316151-29316373)
chr5 (23-286)||(21295374-21295632)
chr5 (65-263)||(22258632-22258831)
chr5 (34-263)||(23337413-23337643)
chr5 (1-156)||(23609778-23609933)
chr5 (1-156)||(23841174-23841329)
chr5 (35-286)||(25534725-25534971)
chr5 (23-260)||(24554294-24554529)
chr5 (151-286)||(27680912-27681047)
chr5 (21-234)||(15237176-15237393)
chr5 (21-234)||(19473059-19473276)
chr5 (162-282)||(23609679-23609799)
chr5 (162-282)||(23841075-23841195)
chr5 (21-234)||(20295395-20295612)
chr5 (22-234)||(10752738-10752954)
chr5 (35-234)||(40723977-40724174)
chr5 (35-234)||(33409036-33409229)
chr5 (106-234)||(11228680-11228802)
chr5 (106-234)||(11220271-11220393)
chr5 (106-234)||(11230669-11230791)
chr5 (106-234)||(11224857-11224979)
chr5 (106-234)||(11226690-11226812)
chr5 (106-234)||(21885365-21885487)
chr5 (135-234)||(25229607-25229704)
chr5 (135-234)||(25293763-25293860)
chr5 (133-234)||(20911394-20911492)
chr5 (53-234)||(17730531-17730705)
chr5 (135-234)||(4036026-4036123)
chr5 (106-234)||(18355765-18355887)
chr5 (106-234)||(26172272-26172394)
chr5 (35-234)||(16673961-16674153)
chr5 (35-234)||(21340872-21341064)
chr5 (35-234)||(26666236-26666426)
chr5 (35-234)||(26937833-26938023)
chr5 (161-234)||(18774013-18774085)
chr5 (161-234)||(18783856-18783928)
chr5 (35-234)||(20232361-20232551)
chr5 (35-234)||(42805230-42805420)
chr5 (35-234)||(26742852-26743042)
chr5 (161-234)||(24533271-24533343)
chr5 (161-234)||(24767786-24767858)
chr5 (172-235)||(23535799-23535861)
chr5 (33-70)||(123423-123460)
chr5 (33-70)||(12028685-12028722)
chr5 (33-70)||(17919263-17919300)
chr5 (33-70)||(22757085-22757122)
chr5 (33-70)||(24221836-24221873)
[»] chr3 (143 HSPs)
chr3 (1-282)||(31422627-31422908)
chr3 (1-282)||(53380425-53380706)
chr3 (1-282)||(53387077-53387358)
chr3 (1-282)||(5106958-5107239)
chr3 (1-286)||(26889202-26889486)
chr3 (1-282)||(37615143-37615424)
chr3 (1-282)||(5221155-5221435)
chr3 (1-282)||(10846358-10846639)
chr3 (1-282)||(10153809-10154090)
chr3 (1-282)||(23704840-23705122)
chr3 (1-282)||(23723296-23723578)
chr3 (1-282)||(23741752-23742034)
chr3 (1-282)||(6598469-6598750)
chr3 (1-282)||(6605149-6605430)
chr3 (1-282)||(10010033-10010314)
chr3 (1-282)||(16758645-16758926)
chr3 (1-282)||(41201870-41202152)
chr3 (1-282)||(10003386-10003667)
chr3 (1-282)||(417750-418031)
chr3 (1-282)||(20057479-20057760)
chr3 (1-263)||(26794469-26794731)
chr3 (1-282)||(10903976-10904257)
chr3 (1-282)||(10910648-10910929)
chr3 (1-282)||(16624129-16624410)
chr3 (1-282)||(16747913-16748194)
chr3 (1-286)||(3690365-3690650)
chr3 (1-282)||(13250469-13250750)
chr3 (1-282)||(13257115-13257396)
chr3 (1-282)||(14673275-14673556)
chr3 (21-263)||(13316294-13316536)
chr3 (1-282)||(15727004-15727286)
chr3 (1-282)||(20064117-20064398)
chr3 (1-282)||(16489745-16490020)
chr3 (21-263)||(8721266-8721508)
chr3 (21-263)||(9073153-9073395)
chr3 (21-263)||(15825419-15825661)
chr3 (21-263)||(19808781-19809023)
chr3 (22-263)||(10236503-10236744)
chr3 (21-263)||(410861-411103)
chr3 (21-263)||(1145662-1145904)
chr3 (22-263)||(15992212-15992453)
chr3 (21-263)||(15343715-15343957)
chr3 (21-263)||(15350359-15350601)
chr3 (21-263)||(15404605-15404847)
chr3 (65-282)||(16633580-16633797)
chr3 (65-282)||(16640190-16640407)
chr3 (65-282)||(43160855-43161072)
chr3 (65-282)||(43167092-43167309)
chr3 (21-263)||(15367040-15367282)
chr3 (65-282)||(1333220-1333437)
chr3 (65-282)||(48423097-48423314)
chr3 (65-282)||(48429875-48430092)
chr3 (32-263)||(17710712-17710943)
chr3 (21-263)||(4710054-4710296)
chr3 (23-282)||(5150078-5150337)
chr3 (23-282)||(41092456-41092715)
chr3 (69-282)||(6608210-6608424)
chr3 (1-220)||(15692350-15692570)
chr3 (21-263)||(30777335-30777578)
chr3 (21-263)||(12891155-12891400)
chr3 (21-263)||(17253168-17253413)
chr3 (21-263)||(13320726-13320970)
chr3 (65-263)||(15584871-15585069)
chr3 (65-263)||(15591529-15591727)
chr3 (23-263)||(7985458-7985699)
chr3 (65-286)||(12482162-12482384)
chr3 (23-263)||(10325604-10325844)
chr3 (65-263)||(5420456-5420655)
chr3 (65-263)||(5426863-5427062)
chr3 (23-252)||(16332935-16333165)
chr3 (65-286)||(5200960-5201182)
chr3 (23-286)||(55148715-55148973)
chr3 (23-252)||(20722772-20722996)
chr3 (23-286)||(24187514-24187772)
chr3 (21-156)||(22643426-22643560)
chr3 (1-156)||(26788879-26789034)
chr3 (21-234)||(7109247-7109464)
chr3 (21-234)||(7113182-7113399)
chr3 (21-234)||(27409985-27410202)
chr3 (21-234)||(55022416-55022633)
chr3 (21-233)||(30065500-30065716)
chr3 (23-286)||(838983-839242)
chr3 (21-234)||(4107740-4107957)
chr3 (21-234)||(4111592-4111809)
chr3 (21-234)||(11069619-11069836)
chr3 (21-234)||(11165870-11166087)
chr3 (21-234)||(28949273-28949490)
chr3 (21-156)||(15398014-15398149)
chr3 (32-234)||(15616925-15617131)
chr3 (21-234)||(14498876-14499093)
chr3 (138-263)||(15337213-15337338)
chr3 (21-234)||(22321215-22321432)
chr3 (21-234)||(22336270-22336487)
chr3 (162-282)||(22643539-22643659)
chr3 (22-234)||(16750684-16750899)
chr3 (162-263)||(26789013-26789114)
chr3 (138-253)||(15360481-15360596)
chr3 (21-156)||(15360551-15360686)
chr3 (141-286)||(28368673-28368819)
chr3 (141-286)||(28376491-28376637)
chr3 (141-286)||(28384313-28384459)
chr3 (169-263)||(29695943-29696037)
chr3 (32-156)||(15337293-15337417)
chr3 (153-263)||(15398119-15398229)
chr3 (35-234)||(3833482-3833675)
chr3 (35-234)||(38814192-38814385)
chr3 (106-234)||(15964495-15964617)
chr3 (106-234)||(15968419-15968541)
chr3 (106-234)||(15972343-15972465)
chr3 (134-234)||(16696593-16696690)
chr3 (35-234)||(1598584-1598777)
chr3 (35-234)||(5222873-5223065)
chr3 (133-234)||(19775118-19775217)
chr3 (135-234)||(15464650-15464746)
chr3 (35-234)||(15942009-15942202)
chr3 (23-145)||(28351277-28351399)
chr3 (135-234)||(12339251-12339347)
chr3 (162-234)||(4589399-4589471)
chr3 (162-234)||(37440123-37440195)
chr3 (35-234)||(17241782-17241972)
chr3 (217-282)||(15711579-15711644)
chr3 (135-234)||(16809082-16809177)
chr3 (138-234)||(8489652-8489745)
chr3 (164-234)||(15482473-15482542)
chr3 (161-230)||(31097779-31097847)
chr3 (135-220)||(16798255-16798336)
chr3 (35-183)||(11300871-11301017)
chr3 (22-128)||(19775243-19775358)
chr3 (22-156)||(4589289-4589420)
chr3 (204-263)||(4290920-4290979)
chr3 (164-234)||(7793586-7793658)
chr3 (78-178)||(11854332-11854429)
chr3 (164-234)||(20461736-20461808)
chr3 (188-234)||(327428-327473)
chr3 (188-234)||(14665202-14665247)
chr3 (188-234)||(14668358-14668403)
chr3 (106-187)||(12339322-12339396)
chr3 (188-234)||(14572385-14572431)
chr3 (33-70)||(11557505-11557542)
chr3 (33-70)||(11595259-11595296)
chr3 (33-70)||(42325901-42325938)
chr3 (164-234)||(2898058-2898131)
chr3 (190-234)||(14577112-14577156)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (1-282)||(9891-10172)
[»] chr1 (58 HSPs)
chr1 (1-286)||(20216003-20216287)
chr1 (1-282)||(18600181-18600462)
chr1 (1-286)||(41478653-41478938)
chr1 (1-286)||(44844959-44845244)
chr1 (1-282)||(47658963-47659244)
chr1 (1-282)||(21828463-21828744)
chr1 (1-282)||(41348927-41349208)
chr1 (1-286)||(16345850-16346135)
chr1 (1-282)||(41356364-41356645)
chr1 (1-282)||(51328754-51329035)
chr1 (1-282)||(51335388-51335669)
chr1 (1-286)||(16352498-16352784)
chr1 (21-263)||(21807311-21807553)
chr1 (21-263)||(21835119-21835361)
chr1 (21-263)||(33386334-33386576)
chr1 (21-263)||(33392979-33393221)
chr1 (65-282)||(43078168-43078385)
chr1 (65-282)||(46157481-46157698)
chr1 (21-263)||(8304894-8305138)
chr1 (21-263)||(50887864-50888109)
chr1 (23-286)||(19111138-19111402)
chr1 (23-260)||(19104507-19104745)
chr1 (23-263)||(20525328-20525569)
chr1 (65-286)||(27898810-27899032)
chr1 (65-286)||(43063427-43063649)
chr1 (65-286)||(44755838-44756060)
chr1 (65-286)||(49334305-49334527)
chr1 (60-286)||(18626430-18626657)
chr1 (67-286)||(33384803-33385023)
chr1 (23-286)||(23762948-23763206)
chr1 (21-234)||(1010271-1010488)
chr1 (21-234)||(52639089-52639306)
chr1 (21-234)||(21406904-21407120)
chr1 (21-234)||(16375798-16376016)
chr1 (180-282)||(21844037-21844139)
chr1 (1-118)||(21844140-21844257)
chr1 (133-234)||(41388478-41388577)
chr1 (35-234)||(1925519-1925712)
chr1 (35-234)||(20924533-20924726)
chr1 (133-233)||(20229466-20229564)
chr1 (134-234)||(39244380-39244477)
chr1 (134-234)||(39247935-39248032)
chr1 (135-234)||(20137892-20137988)
chr1 (135-234)||(33797067-33797163)
chr1 (161-234)||(19211677-19211749)
chr1 (22-161)||(39244237-39244382)
chr1 (22-161)||(39247792-39247937)
chr1 (162-234)||(46975299-46975371)
chr1 (35-234)||(12646680-12646870)
chr1 (161-234)||(18882200-18882273)
chr1 (23-127)||(21437686-21437789)
chr1 (164-234)||(36819536-36819605)
chr1 (22-128)||(41388337-41388452)
chr1 (164-234)||(21172810-21172882)
chr1 (164-234)||(21312926-21312998)
chr1 (164-234)||(16080645-16080712)
chr1 (32-128)||(20229335-20229440)
chr1 (33-70)||(18394085-18394122)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (1-282)||(67259-67539)
scaffold0028 (21-263)||(6759-7001)
scaffold0028 (21-263)||(13284-13526)
scaffold0028 (21-263)||(22812-23054)
scaffold0028 (35-282)||(56780-57027)
scaffold0028 (35-282)||(41273-41520)
scaffold0028 (21-234)||(59060-59277)
[»] scaffold0044 (6 HSPs)
scaffold0044 (1-282)||(30276-30558)
scaffold0044 (1-263)||(72973-73235)
scaffold0044 (1-282)||(7810-8092)
scaffold0044 (106-234)||(62068-62191)
scaffold0044 (35-234)||(12714-12904)
scaffold0044 (35-234)||(18998-19188)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (1-282)||(306847-307129)
[»] scaffold0029 (5 HSPs)
scaffold0029 (20-282)||(105980-106242)
scaffold0029 (20-282)||(126215-126476)
scaffold0029 (22-234)||(80090-80305)
scaffold0029 (21-234)||(65867-66082)
scaffold0029 (21-230)||(61951-62162)
[»] scaffold0061 (2 HSPs)
scaffold0061 (1-286)||(59536-59821)
scaffold0061 (21-234)||(67642-67859)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (1-286)||(138812-139097)
scaffold0017 (33-70)||(15331-15368)
scaffold0017 (33-70)||(19853-19890)
[»] scaffold0003 (4 HSPs)
scaffold0003 (1-286)||(56719-57004)
scaffold0003 (35-234)||(70877-71069)
scaffold0003 (35-234)||(139520-139712)
scaffold0003 (161-234)||(100880-100952)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (1-282)||(37790-38072)
scaffold0141 (106-234)||(14548-14670)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (1-282)||(76740-77022)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (21-263)||(12199-12441)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (21-263)||(77969-78211)
scaffold0004 (23-127)||(60878-60981)
[»] scaffold0109 (8 HSPs)
scaffold0109 (23-282)||(26376-26636)
scaffold0109 (106-234)||(38994-39117)
scaffold0109 (131-259)||(43015-43145)
scaffold0109 (21-186)||(43145-43311)
scaffold0109 (106-234)||(11477-11600)
scaffold0109 (135-234)||(6769-6865)
scaffold0109 (135-234)||(36451-36547)
scaffold0109 (35-156)||(36330-36449)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (21-263)||(73749-73991)
scaffold0009 (164-230)||(228598-228663)
[»] scaffold0572 (1 HSPs)
scaffold0572 (21-263)||(9607-9849)
[»] scaffold0744 (1 HSPs)
scaffold0744 (21-263)||(3782-4024)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (65-274)||(38440-38649)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (65-282)||(25098-25315)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (23-282)||(19688-19949)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (21-263)||(15101-15345)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (21-263)||(8963-9206)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (69-253)||(32473-32657)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (65-286)||(4229-4451)
[»] scaffold0553 (1 HSPs)
scaffold0553 (65-286)||(8522-8744)
[»] scaffold0013 (4 HSPs)
scaffold0013 (23-263)||(9092-9332)
scaffold0013 (175-234)||(73818-73877)
scaffold0013 (164-234)||(2899-2968)
scaffold0013 (180-234)||(81468-81521)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (21-234)||(4214-4427)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (65-263)||(21960-22159)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (23-286)||(241794-242052)
scaffold0010 (162-234)||(23026-23097)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (35-286)||(9905-10157)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (23-286)||(14651-14910)
[»] scaffold0242 (3 HSPs)
scaffold0242 (23-273)||(19325-19570)
scaffold0242 (111-273)||(25472-25634)
scaffold0242 (23-187)||(25585-25744)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (21-234)||(5440-5657)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (21-234)||(11970-12187)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (21-231)||(1-215)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (23-286)||(25087-25345)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (114-263)||(1-150)
[»] scaffold0229 (1 HSPs)
scaffold0229 (162-286)||(11988-12113)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (35-234)||(9711-9904)
[»] scaffold0656 (1 HSPs)
scaffold0656 (162-286)||(1089-1213)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (35-234)||(33050-33244)
[»] scaffold0371 (1 HSPs)
scaffold0371 (106-234)||(15144-15267)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (106-234)||(16839-16962)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (35-234)||(9229-9421)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (106-234)||(77347-77469)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (106-234)||(36547-36669)
scaffold0031 (164-234)||(53363-53435)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (169-259)||(14752-14842)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (35-234)||(36116-36307)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (35-234)||(189767-189960)
scaffold0012 (35-234)||(25075-25266)
[»] scaffold0780 (1 HSPs)
scaffold0780 (21-128)||(5-112)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (106-234)||(9144-9266)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (106-234)||(1684-1806)
[»] scaffold0546 (2 HSPs)
scaffold0546 (106-234)||(1707-1830)
scaffold0546 (135-234)||(6442-6538)
[»] scaffold0299 (1 HSPs)
scaffold0299 (35-234)||(6489-6681)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (106-234)||(20640-20762)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (106-233)||(8308-8429)
scaffold0111 (133-233)||(15428-15525)
[»] scaffold1852 (1 HSPs)
scaffold1852 (162-234)||(2-74)
[»] scaffold0560 (1 HSPs)
scaffold0560 (21-140)||(5907-6026)
[»] scaffold0486 (1 HSPs)
scaffold0486 (162-234)||(9400-9472)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (162-234)||(6226-6298)
scaffold0130 (162-234)||(8225-8297)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (133-234)||(208073-208171)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (161-234)||(9889-9961)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (35-233)||(18164-18355)
[»] scaffold1552 (1 HSPs)
scaffold1552 (139-234)||(176-269)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (162-230)||(11523-11591)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (35-234)||(63663-63855)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (135-234)||(29361-29456)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (57-234)||(16487-16654)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (164-234)||(18859-18928)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (161-234)||(10283-10355)
[»] scaffold0156 (2 HSPs)
scaffold0156 (34-128)||(2700-2793)
scaffold0156 (202-241)||(2655-2694)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (162-225)||(30725-30788)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (22-183)||(80871-81026)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (164-230)||(173106-173171)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (164-230)||(20243-20307)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (162-230)||(28880-28947)
[»] scaffold0697 (1 HSPs)
scaffold0697 (23-82)||(6551-6610)
[»] scaffold0036 (2 HSPs)
scaffold0036 (188-234)||(66678-66723)
scaffold0036 (33-70)||(68837-68874)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (200-234)||(4-38)
[»] scaffold0637 (1 HSPs)
scaffold0637 (33-70)||(8520-8557)
[»] scaffold0439 (2 HSPs)
scaffold0439 (33-70)||(2557-2594)
scaffold0439 (33-70)||(10417-10454)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (33-70)||(4346-4383)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (33-70)||(27243-27280)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (33-70)||(192438-192475)


Alignment Details
Target: scaffold0052 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 3)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 1129 - 1410
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1129 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcata 1228  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1229 gcatctcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 1328  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1329 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 1410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 65 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 10304 - 10087
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttatag 164  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10304 tgattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 10205  T
Q  165 gagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 264  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10204 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 10105  T
Q  265 ttaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10104 ttaagatgccttgttgat 10087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 65 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 56726 - 56509
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttatag 164  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  56726 tgattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagttttgtcctccgcacgttttatag 56627  T
Q  165 gagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 264  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56626 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 56527  T
Q  265 ttaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||    
T  56526 ttaagatgccttgttgat 56509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 108)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 18176135 - 18175854
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18176135 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcata 18176036  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18176035 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 18175936  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18175935 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgtcttgttgat 18175854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 18182807 - 18182526
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18182807 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttattcataagtgtccatgcata 18182708  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18182707 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 18182608  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18182607 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgtcttgttgat 18182526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 18164748 - 18165029
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  18164748 ttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcata 18164847  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18164848 gcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 18164947  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18164948 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 18165029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 9511087 - 9511371
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  9511087 ttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcata 9511185  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9511186 gcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 9511285  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9511286 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 9511371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 60752 - 61037
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  60752 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcata 60851  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  60852 gcatatcattgagctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 60951  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  60952 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 61037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 12703484 - 12703768
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  12703484 ttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcata 12703582  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12703583 gcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 12703682  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12703683 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcataattaagatgccttgttgatgatg 12703768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 40523436 - 40523717
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |    
T  40523436 ttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcaga 40523535  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40523536 gcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 40523635  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40523636 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccctgttgat 40523717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 11366229 - 11365942
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttt---gttcataagtgtccttgc 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||    
T  11366229 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagt-tagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgtgttcataagtgtccatgc 11366131  T
Q  98 atagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatatta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11366130 atagcatctcattgagcttagtcctcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatta 11366031  T
Q  198 atacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11366030 atacttatgatgacgattggtaccacatgcatatagggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccgtgttgatgatg 11365942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 16407370 - 16407651
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttg-ttcataagtgtccttgcat 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  16407370 ttaactaagtgcataagtttatgatgaagt-tagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttattcataagtgtccatgcat 16407468  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16407469 agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 16407568  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16407569 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 16407651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 49051401 - 49051117
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  49051401 ttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcata 49051303  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49051302 gcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 49051203  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  49051202 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgccatgattaagatgccttgttgatgatg 49051117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 13691123 - 13690838
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttt-gttcataagtgtccttgcat 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  13691123 ttaactaagtgcataagtttatgatgaagt-tagctccaatttaatggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttcataagtgtccatgcat 13691025  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13691024 agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacattttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 13690925  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13690924 acttatgatgacgattggtaccacatgcatatagggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 13690838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 15162896 - 15163177
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttt-gttcataagtgtccttgcat 99  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  15162896 ttaactaagtgcataagtttgtgatgaagt-tagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttcataagtgtccatgcat 15162994  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15162995 agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 15163094  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15163095 acttatgatgacgattggtaccacatgcatatagggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaaaatgccttgttgat 15163177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 20703064 - 20703346
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataag-tatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| |||||    
T  20703064 ttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat 20703163  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20703164 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 20703263  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20703264 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 20703346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 32767707 - 32767425
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataag-tatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| |||||    
T  32767707 ttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat 32767608  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32767607 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagttttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 32767508  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32767507 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 32767425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 13684492 - 13684207
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttt-gttcataagtgtccttgcat 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  13684492 ttaactaagtgcataagtttatgatgaagt-tagctccaatttaatggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttcacaagtgtccatgcat 13684394  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  13684393 agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaaacatattaat 13684294  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13684293 acttatgatgacgattggtaccacatgcatatagggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 13684207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 15156245 - 15156526
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttt-gttcataagtgtccttgcat 99  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  15156245 ttaactaagtgcataagtttgtgatgaagt-tagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttcataagtgtccatgcat 15156343  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | || ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15156344 agcatctcattgagcttagtcctcaccatgaataatagaagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 15156443  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15156444 acttatgatgacgattggtaccacatgcatatagggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaaaatgccttgttgat 15156526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 44786550 - 44786831
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||  |||| |||| |||||    
T  44786550 ttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcat 44786648  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44786649 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 44786748  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44786749 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 44786831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 44793191 - 44793472
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||  |||| |||| |||||    
T  44793191 ttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcat 44793289  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44793290 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 44793389  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44793390 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 44793472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 14330816 - 14330555
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  14330816 ttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaagttattggatgcatattgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcata 14330718  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14330717 gcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 14330618  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14330617 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 14330555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 14337400 - 14337139
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  14337400 ttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaagttattggatgcatattgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcata 14337302  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14337301 gcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 14337202  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14337201 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 14337139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 14655492 - 14655773
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||  |||| |||| |||||    
T  14655492 ttaactaagtgcataagtatatgataaggtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcat 14655590  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14655591 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgattactaggagctttgtcctccgcacgttatataggagctttgtcctccgaacgattaaagtatattaat 14655690  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14655691 acttatgatgacgattggtaccacatgcatttaaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 14655773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 32 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 1347493 - 1347239
Alignment:
Q  32 tagctccaaattattggatgcatgttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaa 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||  |||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  1347493 tagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttgttaagagttcatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgt 1347395  T
Q  131 ttattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcata 230  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1347394 ttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcata 1347295  T
Q  231 taaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1347294 taaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 1347239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 11232404 - 11232654
Alignment:
Q  32 tagctccaaattattggatgcatgttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaa 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||  |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  11232404 tagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgt 11232502  T
Q  131 ttattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcata 230  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11232503 ttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcata 11232602  T
Q  231 taaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11232603 taaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgat 11232654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 65 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 15022074 - 15021857
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttatag 164  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15022074 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 15021975  T
Q  165 gagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 264  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15021974 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 15021875  T
Q  265 ttaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15021874 ttaagatgccttgttgat 15021857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Original strand, 11239091 - 11239341
Alignment:
Q  32 tagctccaaattattggatgcatgttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaa 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||  |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  11239091 tagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgt 11239189  T
Q  131 ttattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcata 230  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11239190 ttattaggagctttgtcctccacacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcata 11239289  T
Q  231 taaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11239290 taaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgat 11239341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 65 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 21627 - 21410
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttatag 164  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21627 tgattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 21528  T
Q  165 gagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 264  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21527 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 21428  T
Q  265 ttaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||    
T  21427 ttaagatgccttgttgat 21410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 65 - 282
Target Start/End: Original strand, 8202235 - 8202452
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttatag 164  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8202235 tgattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 8202334  T
Q  165 gagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 264  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8202335 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 8202434  T
Q  265 ttaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||    
T  8202435 ttaagatgccttgttgat 8202452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 9409942 - 9409698
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagt 119  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9409942 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcattagcatttcattgagcttagt 9409843  T
Q  120 cctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttata-ggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggt 218  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9409842 cttcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttatttggagctttgtcctccgtacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggt 9409743  T
Q  219 acgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9409742 accacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 9409698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 13569887 - 13569655
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtc 120  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  13569887 atgatgacgtttagctccaaatttttggatgcatgtcgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgtatagcatctcattgagcttagtc 13569788  T
Q  121 ctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13569787 ctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgatttttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 13569688  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtca 253  Q
     ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  13569687 cacatgcataaaaggagtctaagagcattgtca 13569655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Original strand, 20205 - 20448
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagt 119  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20205 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 20303  T
Q  120 cctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttat-aggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggt 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20304 cctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggt 20403  T
Q  219 acgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  20404 accacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 20448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Original strand, 6017283 - 6017528
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagt 119  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  6017283 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 6017381  T
Q  120 cctcaccacaatt-attaggagctttttcctccgcacgttttat-aggagttttgtcctccacacgatt-aaagtatattaatacttatgatgacgattg 216  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6017382 cctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattg 6017481  T
Q  217 gtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6017482 gtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 6017528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Original strand, 4318655 - 4318915
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | || ||||||  |||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  4318655 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattatggtgatttgttgttaagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 4318753  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttat-aggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4318754 tcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatatttatacttatgatgacgattggtac 4318853  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  4318854 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaagatgctttgttgat 4318915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 18531241 - 18530998
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagt 119  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18531241 atgatgacgtttagctccaaattattggatgctcattgatatgttgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 18531143  T
Q  120 cctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttat-aggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggt 218  Q
     |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18531142 tctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggt 18531043  T
Q  219 acgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  18531042 accacatgcatataaggagtctaagagcattgttgcattgtcatg 18530998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 7536177 - 7535947
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||| ||||| || | ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  7536177 gatgacgtttagctccaaattattggatgcttattgatatgttgattacggtgatttgttgataagagttcatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 7536079  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttat-aggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7536078 tcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattgatac 7535979  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtc 252  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7535978 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtc 7535947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 65 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 8705950 - 8705728
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt-attaggagctttttcctccgcacgttttata 163  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||| ||  ||    
T  8705950 tgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatta 8705851  T
Q  164 ggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8705850 ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 8705751  T
Q  264 attaagatgccttgttgatgatg 286  Q
      ||  |||| ||||||||||||    
T  8705750 tctattatgctttgttgatgatg 8705728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 65 - 287
Target Start/End: Original strand, 18553683 - 18553906
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt-attaggagctttttcctccgcacgttttata 163  Q
    ||||||||||||||||||  |||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||| ||  ||    
T  18553683 tgattacgatgttttgttgttaagagtacatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatta 18553782  T
Q  164 ggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18553783 ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 18553882  T
Q  264 attaagatgccttgttgatgatgt 287  Q
     |||  ||||  ||||||||||||    
T  18553883 tttattatgctatgttgatgatgt 18553906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 12692490 - 12692232
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12692490 gatgacgtctagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgatttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 12692393  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacg 221  Q
    ||||||| ||    ||||||||| ||||| ||||| ||  |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12692392 tcaccacgat----aggagctttgtcctctgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 12692297  T
Q  222 acatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||  ||||||||  ||||| |||||    
T  12692296 acatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatg 12692232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 14959158 - 14958900
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14959158 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 14959061  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacg 221  Q
    ||||||  ||    ||||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14959060 tcaccatgat----aggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 14958965  T
Q  222 acatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||  ||||||||  ||||| |||||    
T  14958964 acatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatg 14958900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 65 - 263
Target Start/End: Original strand, 23520114 - 23520313
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt-attaggagctttttcctccgcacgttttata 163  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||| ||||||||||| ||  ||    
T  23520114 tgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggatctttgtcctccgcacgattatta 23520213  T
Q  164 ggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23520214 ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 23520313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 26419994 - 26419736
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26419994 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gcgtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 26419897  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacg 221  Q
    ||||||  ||    ||||||||| |||||| |||| ||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26419896 tcaccatgat----aggagctttgtcctccacacgattattaggagttttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 26419801  T
Q  222 acatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||  ||||||||  ||||| |||||    
T  26419800 acatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatg 26419736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 23 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 11262323 - 11262065
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  11262323 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 11262226  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacg 221  Q
    ||||||  ||    ||||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  11262225 tcaccatgat----aggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattgatacc 11262130  T
Q  222 acatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||  ||||||||  ||||| |||||    
T  11262129 acatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatg 11262065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 286
Target Start/End: Original strand, 11548377 - 11548636
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgca-tagcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  11548377 gatgacgtttagctccaaattgttggatgcatattgatatgaagattacgatgttttgttgata-gagtccatgcagtagcat-tcattgagcttagtcc 11548474  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgatt-aaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    ||||||  ||    ||||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11548475 tcaccatgat----aggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 11548570  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||  ||||||||  ||||| |||||    
T  11548571 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatg 11548636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 286
Target Start/End: Original strand, 11554973 - 11555232
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgca-tagcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  11554973 gatgacgtttagctccaaattgttggatgcatattgatatgaagattacgatgttttgttgata-gagtccatgcagtagcat-tcattgagcttagtcc 11555070  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgatt-aaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    ||||||  ||    ||||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555071 tcaccatgat----aggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 11555166  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||  ||||||||  ||||| |||||    
T  11555167 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatg 11555232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 32874 - 32657
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  32874 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 32775  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32774 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 32680  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  32679 gattggtaccacatgcatataag 32657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 12705000 - 12705217
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  12705000 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 12705099  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12705100 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 12705194  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  12705195 gattggtaccacatgcatataag 12705217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 71108 - 71325
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  71108 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 71207  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||  ||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  71208 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagccttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 71302  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  71303 gattggtaccacatgcatataag 71325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 75217 - 75434
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  75217 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 75316  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||  ||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  75317 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagccttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 75411  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  75412 gattggtaccacatgcatataag 75434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12718433 - 12718216
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  12718433 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 12718334  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    || || ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12718333 agttttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 12718239  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  12718238 gattggtaccacatgcatataag 12718216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12723344 - 12723127
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  12723344 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgctgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 12723245  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    ||||| ||||||||||   | |||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12723244 agctttgtcctcacca---tgattaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 12723150  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  12723149 gattggtaccacatgcatataag 12723127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16114006 - 16113789
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  16114006 atgatgacgtttagctccaagttattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 16113907  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16113906 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 16113812  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  16113811 gattggtaccacatgcatataag 16113789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16117159 - 16116942
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  16117159 atgatgacgtttagctccaagttattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 16117060  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16117059 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 16116965  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  16116964 gattggtaccacatgcatataag 16116942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18279168 - 18278951
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  18279168 atgatgacgtttaactccaaattattgaatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 18279069  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18279068 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagttttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 18278974  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  18278973 gattggtaccacatgcatataag 18278951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18283131 - 18282914
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  18283131 atgatgacgtttaactccaaattattgaatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 18283032  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18283031 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 18282937  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  18282936 gattggtaccacatgcatataag 18282914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 115 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 8712571 - 8712423
Alignment:
Q  115 ttagtcctcaccacaatt-attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacga 213  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8712571 ttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacga 8712472  T
Q  214 ttggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcat 262  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8712471 ttggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcaaattgtcat 8712423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 153 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 10869332 - 10869221
Alignment:
Q  153 cacgttttat-aggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgt 251  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10869332 cacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgt 10869233  T
Q  252 cacattgtcatg 263  Q
    ||||||||||||    
T  10869232 cacattgtcatg 10869221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 153 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 10875412 - 10875301
Alignment:
Q  153 cacgttttat-aggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgt 251  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10875412 cacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgt 10875313  T
Q  252 cacattgtcatg 263  Q
    ||||||||||||    
T  10875312 cacattgtcatg 10875301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 153 - 287
Target Start/End: Original strand, 18585512 - 18585647
Alignment:
Q  153 cacgttttat-aggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgt 251  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18585512 cacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgatgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgt 18585611  T
Q  252 cacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgt 287  Q
    |||||||||||| |||  ||||  ||||||||||||    
T  18585612 cacattgtcatgtttattatgctatgttgatgatgt 18585647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 192 - 282
Target Start/End: Original strand, 20871301 - 20871391
Alignment:
Q  192 atattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20871301 atattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 20871391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 161 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 14953086 - 14952961
Alignment:
Q  161 ataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtc 260  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  14953086 ataggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtc 14952987  T
Q  261 atgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
     ||  ||||||||  ||||| |||||    
T  14952986 gtgtctaagatgctatgttgttgatg 14952961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15083912 - 15083719
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||| | ||| ||||| ||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  15083912 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacgatt 15083815  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
    |   |||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15083814 a---ggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 15083721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18556973 - 18556779
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||| |||||||| |||||||||||  | || |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  18556973 ctccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaagatgttttgttgtttagcgtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacgatt 18556875  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
    |   |||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  18556874 a---ggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgataaagattggtaccacatgcatata 18556781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 161 - 260
Target Start/End: Original strand, 44408554 - 44408653
Alignment:
Q  161 ataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtc 260  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  44408554 ataggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtc 44408653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 106 - 234
Target Start/End: Original strand, 1859261 - 1859382
Alignment:
Q  106 tcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttat 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||   | |||||||||||| |||||||||||    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1859261 tcattgagctttgtcctcacca---tgattaggagctttgtcctccgcacg----ataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 1859353  T
Q  206 gatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1859354 gatgacgattggtaccacatgcatataag 1859382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 169 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 15380671 - 15380554
Alignment:
Q  169 tttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaa 268  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||  |||    
T  15380671 tttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaa 15380572  T
Q  269 gatgccttgttgatgatg 286  Q
    |||||  ||||| |||||    
T  15380571 gatgctatgttgttgatg 15380554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13149155 - 13148963
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||| |||||||||||  || | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||  ||     
T  13149155 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatgat- 13149059  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
       ||||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13149058 ---aggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 13148965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 133 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18425307 - 18425208
Alignment:
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18425307 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 18425210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 133 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26292019 - 26291920
Alignment:
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26292019 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 26291922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 135 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14216829 - 14216732
Alignment:
Q  135 taggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14216829 taggagctttgtcctccacacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 14216732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 135 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15728229 - 15728132
Alignment:
Q  135 taggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15728229 taggagctttgtcctccacacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 15728132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 39721911 - 39721789
Alignment:
Q  106 tcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttat 205  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||   |||||||| ||||||||||||||   ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39721911 tcattgagctttgtcctcactacgatta---ggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgttctccgcacgattaaagtatattaatacttat 39721818  T
Q  206 gatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39721817 gatgacgattggtaccacatgcatataag 39721789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 234
Target Start/End: Original strand, 45170467 - 45170589
Alignment:
Q  106 tcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttat 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||| ||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45170467 tcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 45170560  T
Q  206 gatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  45170561 gatgacgattggtaccacaagcatataag 45170589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 138 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12714530 - 12714436
Alignment:
Q  138 gagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12714530 gagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 12714436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 138 - 234
Target Start/End: Original strand, 7519531 - 7519623
Alignment:
Q  138 gagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||| |||||||||||    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7519531 gagctttgtcctccgcacg----ataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 7519623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 135 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 8917331 - 8917235
Alignment:
Q  135 taggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||||||  |||||| |||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8917331 taggagcttagtcctccacacgttt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 8917235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Original strand, 13918981 - 13919053
Alignment:
Q  162 taggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13918981 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 13919053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 106 - 234
Target Start/End: Original strand, 25927678 - 25927799
Alignment:
Q  106 tcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttat 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||   | |||||||||||| |||||| |||| ||   || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25927678 tcattgagctt-gtcctcacca---tgattaggagctttgtcctccacacgatt---agaagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 25927770  T
Q  206 gatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25927771 gatgacgattggtaccacatgcatataag 25927799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13461738 - 13461568
Alignment:
Q  57 tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcac 155  Q
    ||||| |||||||| | || |||||| || || |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    ||  |||||||||| |||||| |||    
T  13461738 tgataagttgattaaggtgatttgttgattagagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcacc----ttgataggagctttgtcctccacac 13461644  T
Q  156 gttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  13461643 gttt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgttttgtaccacatgcatataag 13461568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 164 - 234
Target Start/End: Original strand, 16724858 - 16724928
Alignment:
Q  164 ggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16724858 ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 16724928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 164 - 234
Target Start/End: Original strand, 17701872 - 17701942
Alignment:
Q  164 ggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17701872 ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 17701942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 135 - 230
Target Start/End: Original strand, 2530616 - 2530708
Alignment:
Q  135 taggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcata 230  Q
    |||||||||| |||||| |||||||   ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2530616 taggagctttgtcctccacacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcata 2530708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 14953192 - 14953061
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgca-tagcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || || |||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  14953192 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgat-agagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 14953095  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttt 159  Q
    ||||||    |  |||||||||| ||||||||||||||    
T  14953094 tcacca----tgataggagctttgtcctccgcacgttt 14953061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16275395 - 16275323
Alignment:
Q  162 taggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16275395 taggagctttgtcctctgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 16275323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 44408448 - 44408579
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgca-tagcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || || |||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  44408448 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgat-agagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 44408545  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttt 159  Q
    ||||||    |  |||||||||| ||||||||||||||    
T  44408546 tcacca----tgataggagctttgtcctccgcacgttt 44408579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Original strand, 16907576 - 16907718
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacga---------tgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||         |||||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  16907576 atgatgatgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 16907675  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacg 156  Q
    ||||| |||||||||||   | ||||||||||| |||||||||||    
T  16907676 agctttgtcctcaccac--gttttaggagctttgtcctccgcacg 16907718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 138 - 234
Target Start/End: Original strand, 16907675 - 16907769
Alignment:
Q  138 gagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||| |||||  |||||||||  |||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16907675 gagctttgtcctcaccacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatataaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 16907769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 169 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 35151513 - 35151448
Alignment:
Q  169 tttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  35151513 tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgatgattggtaccacatgcatataag 35151448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 65 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 10869393 - 10869301
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccac-aattattaggagctttttcctccgcacg 156  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||    
T  10869393 tgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacg 10869301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 65 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 10875473 - 10875381
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccac-aattattaggagctttttcctccgcacg 156  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||    
T  10875473 tgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacg 10875381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 65 - 156
Target Start/End: Original strand, 18585451 - 18585543
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccac-aattattaggagctttttcctccgcacg 156  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||    
T  18585451 tgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacg 18585543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9593345 - 9593155
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||| ||||||||||| ||| | |||| ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| ||     
T  9593345 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgata-gagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgatc 9593248  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
        |||||||| |||||| ||||    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  9593247 ----ggagctttgtcctccacacg----ataggagctttgtcctcccaacgattaaagtatattaatac-tatgatgatgattggtaccacatgcatata 9593157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Original strand, 16457463 - 16457652
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||| |||||||||||  || | | || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    |    
T  16457463 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagcccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcacca----t 16457556  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
     || |||||||| |||||| ||||    ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16457557 gttcggagctttgtcctccacacg----ataggagctttgacctccgcacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatata 16457651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16583256 - 16583065
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||| ||||||||| ||||||||||| ||| | |||| ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| |||    
T  16583256 ctccaaattattggatgtattagtgatttgttgattaagatgttttgttgata-gagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgatt 16583159  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
     |   ||||||| |||||  ||||    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  16583158 tt---gagctttgtcctcaccacg----atcggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacaattggtaccacatgcatgta 16583067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 234
Target Start/End: Original strand, 20578 - 20650
Alignment:
Q  161 ataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  20578 ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgatgattggtaccaaatgcatataag 20650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6801093 - 6801021
Alignment:
Q  161 ataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  6801093 ataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatttaag 6801021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 109 - 234
Target Start/End: Original strand, 14932954 - 14933072
Alignment:
Q  109 ttgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgat 208  Q
    |||||||| ||||||||||| ||    ||||||||| ||||||||||| ||   ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14932954 ttgagctttgtcctcaccacgat----aggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatac-tatgat 14933045  T
Q  209 ga-cgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||  ||||||||| |||||||||||||    
T  14933046 gagagattggtaccacatgcatataag 14933072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 109 - 234
Target Start/End: Original strand, 15356389 - 15356507
Alignment:
Q  109 ttgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgat 208  Q
    |||||||| ||||||||||| ||    ||||||||| ||||||||||| ||   ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15356389 ttgagctttgtcctcaccacgat----aggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatac-tatgat 15356480  T
Q  209 ga-cgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||  ||||||||| |||||||||||||    
T  15356481 gagagattggtaccacatgcatataag 15356507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 109 - 234
Target Start/End: Original strand, 15360503 - 15360621
Alignment:
Q  109 ttgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgat 208  Q
    |||||||| ||||||||||| ||    ||||||||| ||||||||||| ||   ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15360503 ttgagctttgtcctcaccacgat----aggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatac-tatgat 15360594  T
Q  209 ga-cgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||  ||||||||| |||||||||||||    
T  15360595 gagagattggtaccacatgcatataag 15360621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 26292162 - 26291996
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattac---------gatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||         ||||| |||||  |||| |||  |||||||||| ||||||    
T  26292162 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacgatgtcttgttgttaagagtcaatgcatagcatttcattg 26292063  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacg 183  Q
    ||||| |||||||||||   | ||||||||||| ||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||    
T  26292062 agctttgtcctcaccac--gttttaggagctttgtcctccgcacgat---taggagctttgtcctccgcacg 26291996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 161 - 230
Target Start/End: Original strand, 2832682 - 2832750
Alignment:
Q  161 ataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcata 230  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  2832682 ataggagccttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgaagattggtaccacatgcata 2832750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 12714629 - 12714487
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacga---------tgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||         |||||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  12714629 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 12714530  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacg 156  Q
    ||||| |||||  || ||  | ||||||||||| |||||||||||    
T  12714529 agctttgtcct--ccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacg 12714487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12318006 - 12317934
Alignment:
Q  164 ggagttttgtcctccacacgat---taaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||| |||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12318006 ggagctttgtcctccccacgatgcttaaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataag 12317934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 18425448 - 18425333
Alignment:
Q  22 tgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttt---------tgttcataagtgtccttgcatagcatctcattga 112  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||         ||||  |||| |||| |||||||||| |||||||    
T  18425448 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattatggtgtcttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga 18425349  T
Q  113 gcttagtcctcaccac 128  Q
    |||| |||||||||||    
T  18425348 gctttgtcctcaccac 18425333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 164 - 216
Target Start/End: Original strand, 13635696 - 13635747
Alignment:
Q  164 ggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattg 216  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13635696 ggagctttgtcctccccacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattg 13635747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 234
Target Start/End: Original strand, 9751984 - 9752056
Alignment:
Q  164 ggagttttgtcctccacacgat---taaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||| |||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  9751984 ggagctttgtcctccccacgatgcttaaagtatattaatact-atgatgacgattgataccacatgcatataag 9752056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 8719366 - 8719312
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagt 119  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  8719366 tgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagt 8719312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 233
Target Start/End: Original strand, 14152229 - 14152300
Alignment:
Q  164 ggagttttgtcctccacacgat---taaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataa 233  Q
    |||| |||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  14152229 ggagctttgtcctccccacgatgcttaaagtatattaatact-atgatgacaattggtaccacatgcatataa 14152300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 234
Target Start/End: Original strand, 15605497 - 15605570
Alignment:
Q  164 ggagttttgtcctccacacgat---taaagtatattaatacttatgatgacg-attggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||| |||||||||| ||||||   |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  15605497 ggagctttgtcctccccacgatgcttaaagtatattaatac-tatgatgacgtattggtaccacatgcatataag 15605570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 42203991 - 42203954
Alignment:
Q  33 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 70  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  42203991 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 42203954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 100)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 14268531 - 14268815
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14268531 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagt-tagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcata 14268629  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14268630 gcatctcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 14268729  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14268730 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 14268815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 14298905 - 14299189
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14298905 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagt-tagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcata 14299003  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14299004 gcatctcattgagcttagtcctcgccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 14299103  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14299104 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 14299189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 23954178 - 23953897
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  23954178 ttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcata 23954079  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23954078 gcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 23953979  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23953978 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 23953897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 23960840 - 23960559
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  23960840 ttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcata 23960741  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23960740 gcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 23960641  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23960640 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 23960559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 4 - 282
Target Start/End: Original strand, 19780367 - 19780645
Alignment:
Q  4 actaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagca 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  19780367 actaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagca 19780466  T
Q  104 tctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatactt 203  Q
    | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19780467 tatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatactt 19780566  T
Q  204 atgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19780567 atgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 19780645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 15148487 - 15148202
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  15148487 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcata 15148388  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15148387 gcatatcattgagctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 15148288  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15148287 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 15148202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 15362162 - 15361877
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  15362162 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcata 15362063  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15362062 gcatatcattgagctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 15361963  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15361962 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 15361877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 16231918 - 16232203
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  16231918 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcata 16232017  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16232018 gcatatcattgagctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 16232117  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232118 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 16232203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 22194649 - 22194364
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  22194649 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcata 22194550  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22194549 gcatatcattgagctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 22194450  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22194449 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 22194364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 36884811 - 36885096
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  36884811 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcata 36884910  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36884911 gcatatcattgagctttgtcctcaccacgaaaattaggagcgttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 36885010  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36885011 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 36885096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 40478180 - 40477898
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataag-tatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| |||||    
T  40478180 ttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat 40478081  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40478080 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagttttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 40477981  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40477980 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 40477898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 15383569 - 15383849
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  || |||||| ||||||    
T  15383569 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatacgttgattacg-tgttttgttgttatgtgtccatgcata 15383667  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15383668 gcatatcattgagctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 15383767  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15383768 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 15383849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 386405 - 386687
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataag-tatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| |||||    
T  386405 ttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat 386504  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  386505 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcatgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 386604  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  386605 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 386687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 6873452 - 6873734
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataag-tatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| |||||    
T  6873452 ttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat 6873551  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6873552 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 6873651  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6873652 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 6873734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 12475049 - 12474768
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||  |||| |||| |||||    
T  12475049 ttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcat 12474951  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12474950 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 12474851  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12474850 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 12474768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 12481679 - 12481398
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||  |||| |||| |||||    
T  12481679 ttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcat 12481581  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12481580 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 12481481  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12481480 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 12481398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 26284982 - 26285265
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataag-tatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttga-ttacgatgttttgttcataagtgtccttgca 98  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||| |||| ||||    
T  26284982 ttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgaattacggtgttttgttgttaagagtccatgca 26285081  T
Q  99 tagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaa 198  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26285082 tagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagccttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaa 26285181  T
Q  199 tacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26285182 tacttatgatgaggattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 26285265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 4772126 - 4771865
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  4772126 ttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcata 4772028  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4772027 gcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 4771928  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4771927 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 4771865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 18024504 - 18024785
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||  |||| |||| | |||    
T  18024504 ttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatacat 18024602  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18024603 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 18024702  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18024703 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 18024785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 18071198 - 18070913
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||| || |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  18071198 ttaactaagtgcatatgtttatgataaggtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcat 18071100  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18071099 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 18071000  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18070999 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 18070913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 18295655 - 18295374
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||  |||| |||| |||||    
T  18295655 ttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcat 18295557  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18295556 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 18295457  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18295456 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 18295374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 8048572 - 8048833
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  8048572 ttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaagttattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcata 8048670  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8048671 gcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagccttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 8048770  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8048771 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 8048833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 8055185 - 8055446
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  8055185 ttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaagttattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcata 8055283  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8055284 gcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagccttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 8055383  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8055384 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 8055446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 23081583 - 23081341
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtc 120  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23081583 atgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 23081484  T
Q  121 ctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23081483 ctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 23081384  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23081383 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 23081341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 27709740 - 27709498
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtc 120  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27709740 atgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 27709641  T
Q  121 ctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27709640 ctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 27709541  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27709540 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 27709498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 52 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 40453899 - 40453669
Alignment:
Q  52 catgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctcc 151  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  40453899 catgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctcc 40453800  T
Q  152 gcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40453799 gcacgttttataggagttttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgt 40453700  T
Q  252 cacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40453699 cacattgtcatgattaagatgccttgttgat 40453669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Original strand, 9272267 - 9272509
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtc 120  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  9272267 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgaatacggtgatttgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtc 9272366  T
Q  121 ctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9272367 ctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacaattggtac 9272466  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9272467 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 9272509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Original strand, 19942265 - 19942507
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtc 120  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19942265 atgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 19942364  T
Q  121 ctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    ||||||||  |||||| ||||||| ||||| ||||| ||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19942365 ctcaccacgtttattatgagctttgtcctctgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 19942464  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19942465 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 19942507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 65 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 8384779 - 8384562
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttatag 164  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8384779 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 8384680  T
Q  165 gagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 264  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8384679 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 8384580  T
Q  265 ttaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||    
T  8384579 ttaagatgccttgttgat 8384562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 65 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 14073775 - 14073558
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttatag 164  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14073775 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 14073676  T
Q  165 gagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 264  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14073675 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 14073576  T
Q  265 ttaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14073575 ttaagatgccttgttgat 14073558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 65 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 15256553 - 15256336
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttatag 164  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15256553 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 15256454  T
Q  165 gagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 264  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15256453 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 15256354  T
Q  265 ttaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15256353 ttaagatgccttgttgat 15256336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 65 - 282
Target Start/End: Original strand, 17090139 - 17090356
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttatag 164  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17090139 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 17090238  T
Q  165 gagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 264  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17090239 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 17090338  T
Q  265 ttaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17090339 ttaagatgccttgttgat 17090356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 65 - 282
Target Start/End: Original strand, 29041060 - 29041277
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttatag 164  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29041060 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 29041159  T
Q  165 gagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 264  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29041160 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 29041259  T
Q  265 ttaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||    
T  29041260 ttaagatgccttgttgat 29041277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Original strand, 16956762 - 16957004
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtc 120  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16956762 atgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttatgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 16956861  T
Q  121 ctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16956862 ctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagttttttcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 16956961  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
     |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16956962 cacatgcatataaagtgtctaagagcattgtcacattgtcatg 16957004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 51493893 - 51494165
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataag-tatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||  |||| |||| |||||    
T  51493893 ttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcat--tgatatgtttattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat 51493990  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51493991 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 51494090  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||        |||||||||||||||||||||||||    
T  51494091 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcatt--------gtcatgattaagatgccttgttgat 51494165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 65 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 8391434 - 8391217
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttatag 164  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8391434 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 8391335  T
Q  165 gagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 264  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8391334 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatagggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 8391235  T
Q  265 ttaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||    
T  8391234 ttaagatgccttgttgat 8391217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 65 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 17808358 - 17808141
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttatag 164  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17808358 tgattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 17808259  T
Q  165 gagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 264  Q
    ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17808258 gagctttgtcctccgcacgattgaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 17808159  T
Q  265 ttaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17808158 ttaagatgccttgttgat 17808141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Original strand, 7901283 - 7901542
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  7901283 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgattatgatgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcc 7901381  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacg 221  Q
    |||||||  |||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7901382 tcaccacgtttattaggagctttgttctctgcacgtttattaggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 7901481  T
Q  222 acatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7901482 acatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgat 7901542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Original strand, 15322205 - 15322464
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||| ||  |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  15322205 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttattgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcc 15322303  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacg 221  Q
    |||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  15322304 tcaccacgtttattacgagctttgtcctccgcacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtacc 15322403  T
Q  222 acatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15322404 acatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgat 15322464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 53433371 - 53433126
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagt 119  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  53433371 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 53433273  T
Q  120 cctcaccacaatt-attaggagctttttcctccgcacgttttat-aggagttttgtcctccacacgatt-aaagtatattaatacttatgatgacgattg 216  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53433272 cctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattg 53433173  T
Q  217 gtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53433172 gtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 53433126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 34 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 12522065 - 12521835
Alignment:
Q  34 gctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||| ||||| |||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  12522065 gctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagctcagtcctcaccacgatt 12521967  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttat-aggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatat 231  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12521966 attaggagctttgtcctccgcatgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 12521867  T
Q  232 aaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  12521866 aaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 12521835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 65 - 286
Target Start/End: Original strand, 12349725 - 12349947
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt-attaggagctttttcctccgcacgttttata 163  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||| ||  ||    
T  12349725 tgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatta 12349824  T
Q  164 ggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12349825 ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 12349924  T
Q  264 attaagatgccttgttgatgatg 286  Q
      ||  |||| ||||||||||||    
T  12349925 tctattatgctttgttgatgatg 12349947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 14305529 - 14305683
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14305529 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagt-tagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcata 14305627  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacg 156  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  14305628 gcatctcattgagcttagtcctcgccacgaatattaggagctttgtcctccgcacg 14305683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 66 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 55795403 - 55795182
Alignment:
Q  66 gattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt-attaggagctttttcctccgcacgttttatag 164  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||| ||  |||    
T  55795403 gattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattattag 55795304  T
Q  165 gagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 264  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  55795303 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcgcattgtcatgt 55795204  T
Q  265 ttaagatgccttgttgatgatg 286  Q
     ||  |||| ||||||||||||    
T  55795203 ctattatgctttgttgatgatg 55795182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 4561675 - 4561883
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtc 120  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||    
T  4561675 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtc 4561774  T
Q  121 ctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    ||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4561775 ctcaccac---gattaggagctttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 4561869  T
Q  221 gacatgcatataag 234  Q
     |||||||||||||    
T  4561870 cacatgcatataag 4561883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 5757280 - 5757488
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtc 120  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||    
T  5757280 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtc 5757379  T
Q  121 ctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    ||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5757380 ctcaccac---gattaggagctttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 5757474  T
Q  221 gacatgcatataag 234  Q
     |||||||||||||    
T  5757475 cacatgcatataag 5757488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 65 - 263
Target Start/End: Original strand, 12300049 - 12300248
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt-attaggagctttttcctccgcacgttttata 163  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||| ||  ||    
T  12300049 tgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatta 12300148  T
Q  164 ggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12300149 ggagctttgtcctccgcacgactaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 12300248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 14757763 - 14757985
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  14757763 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 14757862  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14757863 agcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 14757962  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  14757963 gattggtaccacatgcatataag 14757985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 65 - 282
Target Start/End: Original strand, 17962485 - 17962703
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt-attaggagctttttcctccgcacgttttata 163  Q
    |||||| |||||||||||  ||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||| ||  ||    
T  17962485 tgattaagatgttttgttgttaagaatccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatta 17962584  T
Q  164 ggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17962585 ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 17962684  T
Q  264 attaagatgccttgttgat 282  Q
      ||  |||||||||||||    
T  17962685 tctattatgccttgttgat 17962703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 20115172 - 20115007
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttt-gttcataagtgtccttgcat 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  20115172 ttaactaagtgcataagtttatgatgaagt-tagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttcataagtgtccatgcat 20115074  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttatagga 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  20115073 agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaataataggagttttgtcctccgcacgttttatagga 20115007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 23 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 23838428 - 23838170
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||| | |||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  23838428 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgacgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgaacttagtcc 23838331  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacg 221  Q
    ||||||  ||    ||||||||| ||||||||||| | | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23838330 tcaccatgat----aggagctttgtcctccgcacgatatttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 23838235  T
Q  222 acatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||  ||||||||  ||||| |||||    
T  23838234 acatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatg 23838170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 23 - 260
Target Start/End: Original strand, 41385856 - 41386088
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  41385856 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 41385953  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacg 221  Q
    ||||||  ||    ||||||||| || |||||||| ||  |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41385954 tcaccatgat----aggagctttgtcttccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 41386049  T
Q  222 acatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtc 260  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  41386050 acatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtc 41386088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14678957 - 14678726
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14678957 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgtg-ata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 14678861  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacg 221  Q
    ||||||  ||    ||||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14678860 tcaccatgat----aggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacatttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 14678765  T
Q  222 acatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtc 260  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  14678764 acatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtc 14678726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9556295 - 9556078
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  9556295 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 9556196  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9556195 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 9556101  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  9556100 gattggtaccacatgcatataag 9556078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17810039 - 17809822
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  17810039 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 17809940  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17809939 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 17809845  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  17809844 gattggtaccacatgcatataag 17809822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 33742145 - 33741928
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  33742145 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 33742046  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33742045 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 33741951  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  33741950 gattggtaccacatgcatataag 33741928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 162 - 286
Target Start/End: Original strand, 14305662 - 14305786
Alignment:
Q  162 taggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtca 261  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  14305662 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtca 14305761  T
Q  262 tgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  14305762 tgattaagatgccttgttgatgatg 14305786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14685165 - 14684934
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||  ||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14685165 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattaatatgatgattacgatgttttgtg-ata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 14685069  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacg 221  Q
    ||||||  ||    ||||||||| ||||||| ||| ||  |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  14685068 tcaccatgat----aggagctttgtcctccgtacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgatttgtacc 14684973  T
Q  222 acatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtc 260  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  14684972 acatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtc 14684934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15224805 - 15224590
Alignment:
Q  22 tgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattga 112  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| |||||||    
T  15224805 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga 15224706  T
Q  113 gcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacg 212  Q
    |||| |||||||||||     ||||||||||| ||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15224705 gctttgtcctcaccac---gtttaggagctttgtcctccgcacgat---taggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacg 15224612  T
Q  213 attggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  15224611 attggtaccacatgcatataag 15224590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 35170621 - 35170484
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||| ||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  35170621 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatttcattgagcttagtcc 35170522  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttt 159  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35170521 tcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgttt 35170484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 234
Target Start/End: Original strand, 14708810 - 14708933
Alignment:
Q  106 tcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttat 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||   | |||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14708810 tcattgagctttgtcctcacca---tgattaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 14708904  T
Q  206 gatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14708905 gatgacgattggtaccacatgcatataag 14708933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 34 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 35613921 - 35613796
Alignment:
Q  34 gctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  35613921 gctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgataagagtccatgtattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgatt 35613823  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttt 159  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  35613822 attaggagctttgtcctccgcacgttt 35613796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12487427 - 12487233
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||| | ||| ||||| ||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  12487427 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacgatt 12487330  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
    |   |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12487329 a---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 12487235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 162 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 35170508 - 35170384
Alignment:
Q  162 taggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtca 261  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  35170508 taggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcg 35170409  T
Q  262 tgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    ||  ||||||||  ||||| |||||    
T  35170408 tgtctaagatgctatgttgttgatg 35170384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 45938149 - 45937957
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatta 133  Q
    ||||||||||||||||| |   ||||| |||||||| |||||||||||  || | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||   | |    
T  45938149 ctccaaattattggatgtaatgtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcacca---tga 45938055  T
Q  134 ttaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataa 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  45938054 ttaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgataacgattggtaccacatgcatataa 45937958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 234
Target Start/End: Original strand, 14954628 - 14954750
Alignment:
Q  106 tcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttat 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||| ||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14954628 tcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 14954721  T
Q  206 gatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14954722 gatgacgattggtaccacatgcatataag 14954750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 35 - 232
Target Start/End: Original strand, 19757706 - 19757896
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||| |||||||| |||||||||||  || | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||  |||    
T  19757706 ctccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatgatt 19757803  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
        |||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19757804 ----ggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 19757896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 35 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 19782100 - 19781910
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||| |||||||| |||||||||||  || | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||  |||    
T  19782100 ctccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatgatt 19782003  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
        |||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19782002 ----ggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 19781910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2014779 - 2014587
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||| |||||||||||  || | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||  ||     
T  2014779 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatgat- 2014683  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
       ||||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2014682 ---aggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 2014589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9530435 - 9530243
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||| |||||||||||  |||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||  ||     
T  9530435 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgttaaa-gtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatgat- 9530339  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
       ||||||||| ||||||||||||||   ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9530338 ---aggagctttgtcctccgcacgttt---aggatctttgtcctccacacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 9530245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Original strand, 26243770 - 26243962
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||| |||||||||||  || | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    |    
T  26243770 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcacca----t 26243863  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |   ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26243864 gttaggagctttgtcctccgcacgtttaa---gagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 26243960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 162 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 35613820 - 35613722
Alignment:
Q  162 taggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtc 260  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  35613820 taggagctttgtcctccgcacgtttaaattatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtc 35613722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 234
Target Start/End: Original strand, 42997626 - 42997749
Alignment:
Q  106 tcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttat 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||   | |||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  42997626 tcattgagctttgtcctcacca---tgattaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttat 42997720  T
Q  206 gatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||    
T  42997721 gatgacgattggtatcacgtgcatataag 42997749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 134 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23139177 - 23139080
Alignment:
Q  134 ttaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataa 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23139177 ttaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 23139081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 20682147 - 20682040
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgca-tagcatctcattgagcttagt 119  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  20682147 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 20682049  T
Q  120 cctcaccac 128  Q
    |||||||||    
T  20682048 cctcaccac 20682040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 135 - 234
Target Start/End: Original strand, 18602932 - 18603029
Alignment:
Q  135 taggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  18602932 taggagatttgtcctccacacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgtttggtaccacatgcatataag 18603029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 25689489 - 25689417
Alignment:
Q  162 taggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25689489 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 25689417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 138 - 234
Target Start/End: Original strand, 18609507 - 18609601
Alignment:
Q  138 gagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||| |||||| |||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  18609507 gagctttgtcctccacacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgtttagtaccacatgcatataag 18609601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 135 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 3412703 - 3412606
Alignment:
Q  135 taggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  3412703 taggagctttgtcctccacatgtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgtttggtagcacatgcatataag 3412606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 10712475 - 10712403
Alignment:
Q  162 taggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10712475 taggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 10712403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 10926245 - 10926173
Alignment:
Q  162 taggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10926245 taggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 10926173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Original strand, 28569646 - 28569718
Alignment:
Q  162 taggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28569646 taggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 28569718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 161 - 231
Target Start/End: Original strand, 1951985 - 1952054
Alignment:
Q  161 ataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatat 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1951985 ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatat 1952054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27533621 - 27533528
Alignment:
Q  135 taggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatat 231  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||   ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27533621 taggagctttgtcctccgcatgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgataacgattggtaccacatgcatat 27533528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Original strand, 16243505 - 16243696
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||| |||||||||||  || | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||  ||     
T  16243505 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatgat- 16243601  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
       ||||||||  ||||||||||||||   ||||| |||||||||  |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  16243602 ---aggagcttagtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctctgcacgatgaaattatattaatacttacgatgacgattggtaccacatgcatata 16243695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 161 - 234
Target Start/End: Original strand, 18222602 - 18222674
Alignment:
Q  161 ataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18222602 ataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatataag 18222674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 135 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18236796 - 18236700
Alignment:
Q  135 taggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||||||| |||||| |||||||   ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  18236796 taggagctttgtcctccacacgttt---aggatctttgtcctccgcacgattaaagtatattaataattatgacgacgattggtaccacatgcatataag 18236700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 203 - 263
Target Start/End: Original strand, 30235277 - 30235337
Alignment:
Q  203 tatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30235277 tatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 30235337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 234
Target Start/End: Original strand, 17152710 - 17152782
Alignment:
Q  161 ataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17152710 ataggagctttgttctccacacgattaaagtatattaatac-tacgatgacgattggtactacatgcatataag 17152782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 260
Target Start/End: Original strand, 21339968 - 21340023
Alignment:
Q  205 tgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtc 260  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  21339968 tgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtc 21340023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 40471507 - 40471449
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataag-tatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttg 58  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40471507 ttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttg 40471449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 214 - 263
Target Start/End: Original strand, 13020537 - 13020586
Alignment:
Q  214 ttggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13020537 ttggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 13020586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 161 - 234
Target Start/End: Original strand, 18229077 - 18229149
Alignment:
Q  161 ataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  18229077 ataggagctttgtcttccgcacgattaaagtatattaatac-tatgatgacaattggtaccatatgcatataag 18229149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 169 - 234
Target Start/End: Original strand, 36134180 - 36134247
Alignment:
Q  169 tttgtcctccacacgat---taaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36134180 tttgtcctccccacgatgcttaaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataag 36134247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 234
Target Start/End: Original strand, 20157706 - 20157752
Alignment:
Q  187 aaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20157706 aaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataag 20157752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 234
Target Start/End: Original strand, 22634653 - 22634698
Alignment:
Q  188 aagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22634653 aagtatattaatactt-tgatgacgattggtaccacatgcatataag 22634698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 27533742 - 27533624
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||||| || |||||| ||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||        
T  27533742 ctccaaattattggatgtataagtgatacgttgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccac---g 27533647  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcac 155  Q
     ||||||||||| ||||||||||    
T  27533646 tttaggagctttgtcctccgcac 27533624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 70
Target Start/End: Original strand, 11250681 - 11250718
Alignment:
Q  33 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 70  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  11250681 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 11250718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 70
Target Start/End: Original strand, 15353428 - 15353465
Alignment:
Q  33 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 70  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  15353428 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 15353465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 70
Target Start/End: Original strand, 16351972 - 16352009
Alignment:
Q  33 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 70  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  16351972 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 16352009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 74)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 23171068 - 23170783
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  23171068 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattactggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgtccataagagtccatgcata 23170969  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23170968 gcatctcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 23170869  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23170868 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 23170783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 23582325 - 23582040
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  23582325 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattactggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgtccataagagtccatgcata 23582226  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23582225 gcatctcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 23582126  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23582125 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 23582040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 29233559 - 29233275
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29233559 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagt-tagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcata 29233461  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  29233460 gcatctcattgagcttagtcctcaccgcgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaattatattaata 29233361  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29233360 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 29233275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 29346858 - 29346574
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29346858 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagt-tagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcata 29346760  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  29346759 gcatctcattgagcttagtcctcaccgcgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaattatattaata 29346660  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29346659 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 29346574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 27599293 - 27599009
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27599293 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagt-tagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcata 27599195  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27599194 gcatctcattgagcttagtcctcaccatgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 27599095  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27599094 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagaggccttgttgatgatg 27599009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 22321061 - 22321342
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  22321061 ttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcata 22321160  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22321161 gcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 22321260  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22321261 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 22321342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 22327214 - 22327495
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  22327214 ttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcata 22327313  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22327314 gcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 22327413  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22327414 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 22327495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 1843112 - 1842832
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1843112 ttaactaagtgcataaatatatgatgaagt-tagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcata 1843014  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1843013 gcatctcattgagcttagtcctcgccacgaatattaggagctttgtcctccgcacattttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 1842914  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1842913 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccgtgttgat 1842832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 27617327 - 27617043
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  27617327 ttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcata 27617229  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27617228 gcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 27617129  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27617128 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 27617043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 24914040 - 24914322
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataag-tatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  24914040 ttaactaagtgcatatggtatacgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcat 24914139  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24914140 agcatctcattgagcttagtcctcaccacgatgattaggagttttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 24914239  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24914240 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 24914322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 26877643 - 26877927
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  26877643 ttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcata 26877741  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26877742 gcatatcattgagtttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcatgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 26877841  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26877842 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagaattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 26877927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 12829103 - 12828821
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataag-tatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| |||||    
T  12829103 ttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat 12829004  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  12829003 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagttttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatactaat 12828904  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12828903 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 12828821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16928386 - 16928105
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||  |||| |||| |||||    
T  16928386 ttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcat 16928288  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16928287 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 16928188  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16928187 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 16928105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16997080 - 16996799
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||  |||| |||| |||||    
T  16997080 ttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcat 16996982  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16996981 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 16996882  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16996881 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 16996799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 17003713 - 17003432
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||  |||| |||| |||||    
T  17003713 ttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcat 17003615  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17003614 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 17003515  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17003514 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 17003432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 10873568 - 10873287
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  10873568 ttaactaagtgcatatgtatatgataatgtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttctgttcataagtgtccatgcat 10873470  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10873469 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 10873370  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10873369 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 10873287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Original strand, 13970480 - 13970722
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtc 120  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13970480 atgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 13970579  T
Q  121 ctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13970580 ctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 13970679  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13970680 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 13970722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 24714707 - 24714465
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtc 120  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24714707 atgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 24714608  T
Q  121 ctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24714607 ctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 24714508  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24714507 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 24714465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 65 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 27216011 - 27215790
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttatag 164  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27216011 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 27215912  T
Q  165 gagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 264  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27215911 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 27215812  T
Q  265 ttaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27215811 ttaagatgccttgttgatgatg 27215790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Original strand, 41604843 - 41605085
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtc 120  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  41604843 atgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcataacatctcattgagcttagtc 41604942  T
Q  121 ctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41604943 ctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 41605042  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  41605043 cacatgcatataaggagtctaagagcattttcacattgtcatg 41605085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Original strand, 41610740 - 41610982
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtc 120  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  41610740 atgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcataacatctcattgagcttagtc 41610839  T
Q  121 ctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||  ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41610840 ctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattagaagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 41610939  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41610940 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 41610982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Original strand, 45057536 - 45057778
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtc 120  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45057536 atgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagattccatgcatagcatctcattgagcttagtc 45057635  T
Q  121 ctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45057636 ctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgatgattggtac 45057735  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45057736 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 45057778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 65 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 9340228 - 9340011
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttatag 164  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9340228 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 9340129  T
Q  165 gagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 264  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9340128 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 9340029  T
Q  265 ttaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9340028 ttaagatgccttgttgat 9340011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 65 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 9488862 - 9488645
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttatag 164  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9488862 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 9488763  T
Q  165 gagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 264  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9488762 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 9488663  T
Q  265 ttaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9488662 ttaagatgccttgttgat 9488645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 65 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 9608123 - 9607906
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttatag 164  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9608123 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 9608024  T
Q  165 gagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 264  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9608023 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 9607924  T
Q  265 ttaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9607923 ttaagatgccttgttgat 9607906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 65 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16922477 - 16922260
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttatag 164  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16922477 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 16922378  T
Q  165 gagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 264  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16922377 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 16922278  T
Q  265 ttaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16922277 ttaagatgccttgttgat 16922260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 65 - 282
Target Start/End: Original strand, 19490085 - 19490302
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttatag 164  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19490085 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 19490184  T
Q  165 gagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 264  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19490185 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 19490284  T
Q  265 ttaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19490285 ttaagatgccttgttgat 19490302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 65 - 282
Target Start/End: Original strand, 28432073 - 28432290
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttatag 164  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28432073 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 28432172  T
Q  165 gagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 264  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28432173 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 28432272  T
Q  265 ttaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||    
T  28432273 ttaagatgccttgttgat 28432290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 42 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 10866162 - 10865922
Alignment:
Q  42 ttattggatgcatgttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggag 140  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  10866162 ttattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttctgttcataagtgtccatgcataacatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggag 10866064  T
Q  141 ctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtct 240  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10866063 ctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtct 10865964  T
Q  241 aggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10865963 aagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 10865922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 65 - 282
Target Start/End: Original strand, 13306750 - 13306967
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttatag 164  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13306750 tgattatgatgttctgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 13306849  T
Q  165 gagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 264  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13306850 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 13306949  T
Q  265 ttaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13306950 ttaagatgccttgttgat 13306967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 65 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16985889 - 16985672
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttatag 164  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16985889 tgattatgatgttctgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 16985790  T
Q  165 gagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 264  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16985789 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 16985690  T
Q  265 ttaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16985689 ttaagatgccttgttgat 16985672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 23 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 37318269 - 37318029
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcct 122  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  37318269 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgtgcatatgagtccatgcatagcatttcattgagcttagtcct 37318170  T
Q  123 caccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacga 222  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  37318169 caccacgattattaggagctttgtcctccgcatgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttttgatgacgattggtacca 37318070  T
Q  223 catgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37318069 catgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 37318029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Original strand, 30971091 - 30971336
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagt 119  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  30971091 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 30971189  T
Q  120 cctcaccacaatt-attaggagctttttcctccgcacgttttat-aggagttttgtcctccacacgatt-aaagtatattaatacttatgatgacgattg 216  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30971190 cctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattg 30971289  T
Q  217 gtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30971290 gtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 30971336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 11677441 - 11677200
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  11677441 gatgacgtttagctccaaattattggatgcacattgatatgatggttacaatgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 11677343  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttat-aggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11677342 tcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 11677243  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  11677242 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 11677200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 23 - 259
Target Start/End: Original strand, 21147404 - 21147638
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21147404 gatgacgtttagctccaaattattggatgcttattgatatgttgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 21147502  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttat-aggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    ||||||| ||||||||   |||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21147503 tcaccacgattattag---ctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 21147599  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgt 259  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21147600 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgt 21147638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 263
Target Start/End: Original strand, 24641075 - 24641316
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| || |||||| ||||| || | ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  24641075 gatgacgtttagctccaaattattggatgtttattgatatgttgattacggtgatttgttgataagagtgcatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 24641173  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttat-aggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24641174 tcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgttctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 24641273  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  24641274 cacatgcatataaggagtctaagagcattatcgcattgtcatg 24641316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 65 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 27369257 - 27369035
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt-attaggagctttttcctccgcacgttttata 163  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||| ||  ||    
T  27369257 tgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatta 27369158  T
Q  164 ggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27369157 ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 27369058  T
Q  264 attaagatgccttgttgatgatg 286  Q
      ||  |||| ||||||||||||    
T  27369057 tctattatgctttgttgatgatg 27369035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 65 - 286
Target Start/End: Original strand, 44381352 - 44381574
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt-attaggagctttttcctccgcacgttttata 163  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||| ||  ||    
T  44381352 tgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatta 44381451  T
Q  164 ggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44381452 ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 44381551  T
Q  264 attaagatgccttgttgatgatg 286  Q
      ||  |||| ||||||||||||    
T  44381552 tctattatgctttgttgatgatg 44381574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 24503105 - 24502847
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  24503105 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatataatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 24503008  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacg 221  Q
    ||||||| ||    ||||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24503007 tcaccacgat----aggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 24502912  T
Q  222 acatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||| |||||    
T  24502911 atatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgtctaagatgctatgttgttgatg 24502847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 65 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 27375767 - 27375545
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt-attaggagctttttcctccgcacgttttata 163  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||| ||||||||||| ||  ||    
T  27375767 tgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctaaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatta 27375668  T
Q  164 ggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27375667 ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggattctaggagcattgtcacattgtcatg 27375568  T
Q  264 attaagatgccttgttgatgatg 286  Q
      ||  |||| ||||||||||||    
T  27375567 tctattatgctttgttgatgatg 27375545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 65 - 286
Target Start/End: Original strand, 44388022 - 44388244
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt-attaggagctttttcctccgcacgttttata 163  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||| ||  ||    
T  44388022 tgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcataacatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatta 44388121  T
Q  164 ggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44388122 ggagctttatcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacgaagtctaggagcattgtcacattgtcatg 44388221  T
Q  264 attaagatgccttgttgatgatg 286  Q
      ||  |||| ||||||||||||    
T  44388222 tctattatgctttgttgatgatg 44388244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 10101994 - 10102211
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  10101994 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 10102093  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10102094 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 10102188  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  10102189 gattggtaccacatgcatataag 10102211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 12901857 - 12902074
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  12901857 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 12901956  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12901957 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 12902051  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  12902052 gattggtaccacatgcatataag 12902074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 24628820 - 24629037
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  24628820 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 24628919  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24628920 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 24629014  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  24629015 gattggtaccacatgcatataag 24629037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24649120 - 24648903
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  24649120 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 24649021  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24649020 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 24648926  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  24648925 gattggtaccacatgcatataag 24648903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27601557 - 27601340
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  27601557 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 27601458  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27601457 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 27601363  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  27601362 gattggtaccacatgcatataag 27601340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 27379773 - 27379990
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  27379773 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 27379872  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  27379873 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttttgatgac 27379967  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  27379968 gattggtaccacatgcatataag 27379990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 27383819 - 27384036
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  27383819 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 27383918  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  27383919 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttttgatgac 27384013  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  27384014 gattggtaccacatgcatataag 27384036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 161
Target Start/End: Original strand, 24872519 - 24872660
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgca-tagcatctcattgagcttagt 119  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  24872519 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacaatgatttgttcataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 24872617  T
Q  120 cctcaccac-aattattaggagctttttcctccgcacgtttta 161  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24872618 cctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttta 24872660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 161
Target Start/End: Original strand, 24880404 - 24880545
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgca-tagcatctcattgagcttagt 119  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  24880404 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacaatgatttgttcataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 24880502  T
Q  120 cctcaccac-aattattaggagctttttcctccgcacgtttta 161  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24880503 cctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttta 24880545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 10866401 - 10866274
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  10866401 ttaactaagtgcatatgtatatgataatgtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttctgttcataagtgtccatgcat 10866303  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccac 128  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10866302 agcatatcattgagcttagtcctcaccac 10866274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Original strand, 19928607 - 19928799
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||| |||||||| |||||||||||  || | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||  ||     
T  19928607 ctccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatgat- 19928703  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
       ||||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19928704 ---aggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 19928797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 162 - 263
Target Start/End: Original strand, 24872634 - 24872736
Alignment:
Q  162 taggagttttgtcctccacacgatt-aaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtc 260  Q
    |||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24872634 taggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtc 24872733  T
Q  261 atg 263  Q
    |||    
T  24872734 atg 24872736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 162 - 263
Target Start/End: Original strand, 24880519 - 24880621
Alignment:
Q  162 taggagttttgtcctccacacgatt-aaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtc 260  Q
    |||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24880519 taggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtc 24880618  T
Q  261 atg 263  Q
    |||    
T  24880619 atg 24880621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Original strand, 30345381 - 30345574
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||| | ||| ||||| ||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  30345381 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacgatt 30345478  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
    |   |||||||| ||||||||||| ||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30345479 a---ggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 30345572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Original strand, 18855564 - 18855756
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||| |||||||||||  || | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    |    
T  18855564 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcacca----t 18855657  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18855658 gttaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcttccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 18855754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 41666879 - 41666759
Alignment:
Q  106 tcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttat 205  Q
    |||||||| || ||||||||||   | |||||||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  41666879 tcattgagttttgtcctcacca---tgattaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttat 41666786  T
Q  206 gatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  41666785 gatgacgattggtaccacatgcatata 41666759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 31344807 - 31344685
Alignment:
Q  106 tcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttat 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||   | ||||| |||||| ||||||||||| ||   || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31344807 tcattgagctttgtcctcacca---tgattagaagctttgtcctccgcacgatt---agaagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 31344714  T
Q  206 gatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31344713 gatgacgattggtaccacatgcatataag 31344685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 162 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 27195605 - 27195507
Alignment:
Q  162 taggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtc 260  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  27195605 taggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacctatgatgacgattggtaccacaagcatataaggagtctaagagcaatgtcgcattgtc 27195507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 146 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 60711 - 60625
Alignment:
Q  146 tcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||| |||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  60711 tcctccacacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 60625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1283008 - 1282936
Alignment:
Q  162 taggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1283008 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 1282936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Original strand, 41531491 - 41531563
Alignment:
Q  162 taggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41531491 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 41531563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 133 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26125090 - 26124992
Alignment:
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  26125090 attaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgacgaaagtatattaatacttgtgatgacgattggtaccacatgcatata 26124994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 135 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23186980 - 23186884
Alignment:
Q  135 taggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||||||| |||||| ||||||    ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23186980 taggagctttgtcctccacacgttg---aggagctttgtcgtccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 23186884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 135 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23598243 - 23598147
Alignment:
Q  135 taggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||||||| |||||| ||||||    ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23598243 taggagctttgtcctccacacgttg---aggagctttgtcgtccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 23598147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 198 - 263
Target Start/End: Original strand, 30657567 - 30657632
Alignment:
Q  198 atacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30657567 atacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 30657632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Original strand, 22461295 - 22461485
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||| |||||||||||  | |  |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    |    
T  22461295 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgtttaa-gtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcacca----t 22461388  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
     || |||||||| |||||| ||||    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22461389 gttcggagctttgtcctccacacg----atatgagctttgtcctccacacgattaaagtatattaaaac-tatgatgacgattggtaccacatgcatata 22461483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 27195634 - 27195581
Alignment:
Q  106 tcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttt 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27195634 tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgttt 27195581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24735273 - 24735201
Alignment:
Q  164 ggagttttgtcctccacacgat---taaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||| |||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24735273 ggagctttgtcctccccacgatgcttaaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataag 24735201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 27196869 - 27196813
Alignment:
Q  32 tagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataag 88  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| || |||||| |||||    
T  27196869 tagctccaaattattggatgcatattgatatgatgaatacggtgatttgttgataag 27196813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 24174796 - 24174759
Alignment:
Q  33 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 70  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  24174796 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 24174759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 70
Target Start/End: Original strand, 24655459 - 24655496
Alignment:
Q  33 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 70  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  24655459 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 24655496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 24869876 - 24869839
Alignment:
Q  33 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 70  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  24869876 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 24869839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 40428459 - 40428422
Alignment:
Q  33 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 70  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  40428459 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 40428422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 101)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 27328132 - 27328417
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27328132 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgctgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcata 27328231  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27328232 gcatctcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagttttgtcctccgcacattttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 27328331  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27328332 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 27328417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 27388872 - 27389157
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27388872 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgctgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcata 27388971  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27388972 gcatctcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagttttgtcctccgcacattttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 27389071  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27389072 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 27389157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 2870211 - 2870492
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  2870211 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatattgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcata 2870310  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2870311 gcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 2870410  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2870411 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 2870492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 2876826 - 2877107
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  2876826 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatattgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcata 2876925  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2876926 gcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 2877025  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2877026 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 2877107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 26130497 - 26130217
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26130497 ttaactaagtgtataagtatatgatgaagt-tagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcata 26130399  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26130398 gcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcccccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 26130299  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26130298 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgat 26130217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 30694392 - 30694112
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30694392 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagt-tagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgactacgatgttttgttcataagtgtccatgcata 30694294  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30694293 gaatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 30694194  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30694193 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgat 30694112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 8797222 - 8796941
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  8797222 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcata 8797123  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8797122 gcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 8797023  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8797022 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 8796941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 20060680 - 20060395
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  20060680 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcata 20060581  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20060580 gcatatcattgagctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 20060481  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20060480 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 20060395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 6980690 - 6980406
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  6980690 ttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcata 6980592  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6980591 gcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 6980492  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6980491 cttatgatgacgattggtaccacatgcatatgaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgcctcgttgatgatg 6980406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 20649867 - 20650145
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  20649867 ttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcata 20649965  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20649966 gcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagttttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 20650065  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttg 280  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20650066 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttg 20650145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 12762733 - 12762453
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  12762733 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcata 12762634  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12762633 gcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacg-tttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 12762535  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12762534 cttatgatgacgattggtaccacatgcataaaaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 12762453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 20801787 - 20801503
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||    
T  20801787 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgaagttttgtccatatgtgtccatgcata 20801689  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20801688 gcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 20801589  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20801588 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataatgagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 20801503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 27430359 - 27430644
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||| || |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  27430359 ttaactaagtgcatatgtttatgataaggtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcat 27430457  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27430458 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 27430557  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27430558 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 27430644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 30597249 - 30596976
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||        |||| ||||||    
T  30597249 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagttaagctccaaattattggatgcatgtcgataagttgattacgatgttttgt--------gtccatgcata 30597158  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30597157 gcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 30597058  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  30597057 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcacgattaagatgtcttgttgat 30596976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 28287387 - 28287105
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcat-gttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgca 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||| |||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  28287387 ttaactaagtgcatatgtatatgataaggtttagctccaaattattggacgcattgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgca 28287289  T
Q  99 tagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaa 198  Q
    |  ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28287288 ttacatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaa 28287189  T
Q  199 tacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28287188 tacttatgatgacgattggtaccacatgcatatatggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 28287105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 28258529 - 28258811
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcat-gttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgca 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||| |||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  28258529 ttaactaagtgcatatgtatatgataaggtttagctccaaattattggacgcattgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgca 28258627  T
Q  99 tagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaa 198  Q
    |  ||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28258628 ttacatatcattgagcttagtcttcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaa 28258727  T
Q  199 tacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28258728 tacttatgatgacgattggtaccacatgcatatatggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 28258811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 28265153 - 28265435
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcat-gttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgca 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||| |||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  28265153 ttaactaagtgcatatgtatatgataaggtttagctccaaattattggacgcattgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgca 28265251  T
Q  99 tagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaa 198  Q
    |  ||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28265252 ttacatatcattgagcttagtcttcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaa 28265351  T
Q  199 tacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28265352 tacttatgatgacgattggtaccacatgcatatatggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 28265435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 28337278 - 28337560
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcat-gttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgca 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||| |||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  28337278 ttaactaagtgcatatgtatatgataaggtttagctccaaattattggacgcattgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgca 28337376  T
Q  99 tagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaa 198  Q
    |  ||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28337377 ttacatatcattgagcttagtcttcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaa 28337476  T
Q  199 tacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28337477 tacttatgatgacgattggtaccacatgcatatatggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 28337560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 28343902 - 28344184
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcat-gttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgca 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||| |||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  28343902 ttaactaagtgcatatgtatatgataaggtttagctccaaattattggacgcattgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgca 28344000  T
Q  99 tagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaa 198  Q
    |  ||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28344001 ttacatatcattgagcttagtcttcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaa 28344100  T
Q  199 tacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28344101 tacttatgatgacgattggtaccacatgcatatatggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 28344184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Original strand, 24291156 - 24291398
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtc 120  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24291156 atgatgatgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 24291255  T
Q  121 ctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24291256 ctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 24291355  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24291356 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 24291398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Original strand, 31317196 - 31317438
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtc 120  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31317196 atgatgatgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 31317295  T
Q  121 ctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31317296 ctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 31317395  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31317396 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 31317438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Original strand, 24315184 - 24315426
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtc 120  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  24315184 atgatgatgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcataacatctcattgagcttagtc 24315283  T
Q  121 ctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24315284 ctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 24315383  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24315384 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 24315426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 25110836 - 25110594
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtc 120  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| || ||||||    
T  25110836 atgatgaagtttagctccaaattattagatgcatgttgatatgatgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatttcattaagtttagtc 25110737  T
Q  121 ctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25110736 ctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcatgattaaagtatattaatacttatgatgatgattggtac 25110637  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25110636 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 25110594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 25117439 - 25117197
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtc 120  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| || ||||||    
T  25117439 atgatgaagtttagctccaaattattagatgcatgttgatatgatgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatttcattaagtttagtc 25117340  T
Q  121 ctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25117339 ctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcatgattaaagtatattaatacttatgatgatgattggtac 25117240  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25117239 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 25117197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Original strand, 3708592 - 3708834
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtc 120  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  3708592 atgatgatgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtc 3708691  T
Q  121 ctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3708692 ctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttatcggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 3708791  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  3708792 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 3708834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 65 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 8228833 - 8228616
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttatag 164  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8228833 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 8228734  T
Q  165 gagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 264  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8228733 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 8228634  T
Q  265 ttaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||    
T  8228633 ttaagatgccttgttgat 8228616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 65 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 18931022 - 18930805
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttatag 164  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18931022 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 18930923  T
Q  165 gagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 264  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18930922 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 18930823  T
Q  265 ttaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18930822 ttaagatgccttgttgat 18930805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 65 - 282
Target Start/End: Original strand, 29587840 - 29588057
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttatag 164  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29587840 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 29587939  T
Q  165 gagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 264  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29587940 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 29588039  T
Q  265 ttaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||    
T  29588040 ttaagatgccttgttgat 29588057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 65 - 282
Target Start/End: Original strand, 29593981 - 29594198
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttatag 164  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29593981 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 29594080  T
Q  165 gagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 264  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29594081 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 29594180  T
Q  265 ttaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||    
T  29594181 ttaagatgccttgttgat 29594198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 65 - 286
Target Start/End: Original strand, 30638290 - 30638511
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttatag 164  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30638290 tgattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 30638389  T
Q  165 gagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 264  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30638390 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 30638489  T
Q  265 ttaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  30638490 ttaagatgccttgttgatgatg 30638511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 4167920 - 4167676
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagt 119  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4167920 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcattagcatttcattgagcttagt 4167821  T
Q  120 cctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttat-aggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggt 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4167820 cctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggt 4167721  T
Q  219 acgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  4167720 accacatgcatataaggattctaagagcattgtcacattgtcatg 4167676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 4208600 - 4208356
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagt 119  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4208600 atgatgacgtttagctccaaattattagatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcattagcatttcattgagcttagt 4208501  T
Q  120 cctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttat-aggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggt 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4208500 cctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggt 4208401  T
Q  219 acgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4208400 accacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 4208356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 69 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 28314516 - 28314303
Alignment:
Q  69 tacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagt 168  Q
    ||||||||||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  28314516 tacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagc 28314417  T
Q  169 tttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaa 268  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28314416 tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatatggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaa 28314317  T
Q  269 gatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||    
T  28314316 gatgccttgttgat 28314303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 69 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 27185655 - 27185442
Alignment:
Q  69 tacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagt 168  Q
    ||||||||||||||  | || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  27185655 tacgatgttttgttgttgagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagc 27185556  T
Q  169 tttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaa 268  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27185555 tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaa 27185456  T
Q  269 gatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||    
T  27185455 gatgccttgttgat 27185442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 69 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 27207491 - 27207278
Alignment:
Q  69 tacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagt 168  Q
    ||||||||||||||  | || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  27207491 tacgatgttttgttgttgagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagc 27207392  T
Q  169 tttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaa 268  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27207391 tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaa 27207292  T
Q  269 gatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||    
T  27207291 gatgccttgttgat 27207278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 69 - 282
Target Start/End: Original strand, 27241737 - 27241950
Alignment:
Q  69 tacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagt 168  Q
    ||||||||||||||  | || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  27241737 tacgatgttttgttgttgagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagc 27241836  T
Q  169 tttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaa 268  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27241837 tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaa 27241936  T
Q  269 gatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||    
T  27241937 gatgccttgttgat 27241950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 69 - 282
Target Start/End: Original strand, 27263585 - 27263798
Alignment:
Q  69 tacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagt 168  Q
    ||||||||||||||  | || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  27263585 tacgatgttttgttgttgagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagc 27263684  T
Q  169 tttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaa 268  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27263685 tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaa 27263784  T
Q  269 gatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||    
T  27263785 gatgccttgttgat 27263798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Original strand, 1539055 - 1539314
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||  |||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  1539055 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttgttaagagtccaggcatagcatatcattgagcttagtcc 1539153  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacg 221  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  1539154 tcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgtttattaggagttttgtcctccgcacgaataaagtatatttatacttatgatgacgattggtacc 1539253  T
Q  222 acatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1539254 acatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgat 1539314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Original strand, 1545154 - 1545413
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  1545154 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcc 1545252  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacg 221  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  1545253 tcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgtttattaggagctttgtcctccgcacgaataaagtatatttatacttatgatgacgattggtacc 1545352  T
Q  222 acatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1545353 acatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgat 1545413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 34832652 - 34832407
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagt 119  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  34832652 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcatttcattaagcttagt 34832553  T
Q  120 cctcaccacaatt-attaggagctttttcctccgcacgttttat-aggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 217  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34832552 cctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacaattgg 34832453  T
Q  218 tacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34832452 taccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 34832407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 23 - 241
Target Start/End: Original strand, 17037444 - 17037662
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcct 122  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  17037444 gatgacgtttagctccaaattattggatgcacattgatatgatgattacggtgttttgttgataagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcct 17037543  T
Q  123 caccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacga 222  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  17037544 caccacaattattaggagctttgtcctccgcacgtttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatatttatacttatgatgacgattggtacca 17037643  T
Q  223 catgcatataaggagtcta 241  Q
    |||||||||||||||||||    
T  17037644 catgcatataaggagtcta 17037662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 23 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 19808520 - 19808256
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||| ||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19808520 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 19808422  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttat-aggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19808421 tcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 19808322  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||  ||||||||  ||||| |||||    
T  19808321 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatg 19808256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 23 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 25928289 - 25928051
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||| ||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  25928289 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 25928191  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttat-aggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25928190 tcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 25928091  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtc 260  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  25928090 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtc 25928051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 22758844 - 22758604
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22758844 gatgacgtttagctccaaattattggatgcttattgatatgttgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 22758746  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttat-aggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22758745 tcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacg-ttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 22758647  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
     |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  22758646 cacatgcatataaggagtctaagagaattgtcgcattgtcatg 22758604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 23 - 263
Target Start/End: Original strand, 34370086 - 34370327
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||| ||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34370086 gatgacgtttagcttcaaattattggatgcatattgatatgatgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 34370184  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttat-aggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34370185 tcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaagtatattaatacttatgatgacgattgttac 34370284  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  34370285 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 34370327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 20176941 - 20176697
Alignment:
Q  18 tatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttt-gttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagctt 116  Q
    |||||||||| |  || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  20176941 tatatgatgacggttatctccaaattattggatgcacgttgatgtgttgattacggtgtttttgttgttaagagtccatgcatagcatctcattgagctt 20176842  T
Q  117 agtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacg-attaaagtatattaatactt-atgatgacgat 214  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20176841 agtcctcaccaagatttttaggagctttgtcctccgcacgaattataggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttaatgatgacgat 20176742  T
Q  215 tggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgt 259  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20176741 tggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgt 20176697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 4233574 - 4233729
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  4233574 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcata 4233673  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacg 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  4233674 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaaatattaggagctttgtcctccgcacg 4233729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 65 - 286
Target Start/End: Original strand, 32565393 - 32565615
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt-attaggagctttttcctccgcacgttttata 163  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||| ||  ||    
T  32565393 tgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatta 32565492  T
Q  164 ggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32565493 ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 32565592  T
Q  264 attaagatgccttgttgatgatg 286  Q
      ||  |||| ||||||||||||    
T  32565593 tctattatgctttgttgatgatg 32565615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 65 - 286
Target Start/End: Original strand, 16552171 - 16552393
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt-attaggagctttttcctccgcacgttttata 163  Q
    ||||||| ||||||||||  |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||| ||  ||    
T  16552171 tgattacaatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatta 16552270  T
Q  164 ggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16552271 ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 16552370  T
Q  264 attaagatgccttgttgatgatg 286  Q
      ||  |||| ||||||||||||    
T  16552371 tctattatgctttgttgatgatg 16552393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 65 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 16576782 - 16576560
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt-attaggagctttttcctccgcacgttttata 163  Q
    ||||||| ||||||||||  |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||| ||  ||    
T  16576782 tgattacaatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatta 16576683  T
Q  164 ggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16576682 ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 16576583  T
Q  264 attaagatgccttgttgatgatg 286  Q
      ||  |||| ||||||||||||    
T  16576582 tctattatgctttgttgatgatg 16576560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 65 - 286
Target Start/End: Original strand, 16618598 - 16618820
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt-attaggagctttttcctccgcacgttttata 163  Q
    ||||||| ||||||||||  |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||| ||  ||    
T  16618598 tgattacaatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatta 16618697  T
Q  164 ggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16618698 ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 16618797  T
Q  264 attaagatgccttgttgatgatg 286  Q
      ||  |||| ||||||||||||    
T  16618798 tctattatgctttgttgatgatg 16618820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 65 - 286
Target Start/End: Original strand, 16628727 - 16628949
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt-attaggagctttttcctccgcacgttttata 163  Q
    ||||||| ||||||||||  |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||| ||  ||    
T  16628727 tgattacaatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatta 16628826  T
Q  164 ggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16628827 ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 16628926  T
Q  264 attaagatgccttgttgatgatg 286  Q
      ||  |||| ||||||||||||    
T  16628927 tctattatgctttgttgatgatg 16628949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 259
Target Start/End: Original strand, 5834591 - 5834835
Alignment:
Q  18 tatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttt-gttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagctt 116  Q
    |||||||||| |  || |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||| |||  |||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  5834591 tatatgatgacggttatctccaaattattggatgcactttgatgtgttgattacggtgtttttgttgttaagagtccatgcatagtatctcattgagctt 5834690  T
Q  117 agtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacg-attaaagtatattaatactt-atgatgacgat 214  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5834691 agtcctcaccatgatttttaggagctttgtcctccgcacgaattataggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttaatgatgacgat 5834790  T
Q  215 tggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgt 259  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5834791 tggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgt 5834835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 259
Target Start/End: Original strand, 22159050 - 22159294
Alignment:
Q  18 tatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttt-gttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagctt 116  Q
    |||||||||| |  || |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||| |||  |||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  22159050 tatatgatgacggttaactccaaattattggatgcacattgatgtgttgattacggtgtttttgttgttaagagtccatgcatagaatctcattgagctt 22159149  T
Q  117 agtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacg-attaaagtatattaatactt-atgatgacgat 214  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22159150 agtcctcaccaagatttttaggagctttgtcctccgcacgaattataggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttaatgatgacgat 22159249  T
Q  215 tggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgt 259  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22159250 tggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgt 22159294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 65 - 263
Target Start/End: Original strand, 17017073 - 17017272
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt-attaggagctttttcctccgcacgttttata 163  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||| ||  ||    
T  17017073 tgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatta 17017172  T
Q  164 ggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17017173 ggagctttgtcctccgcacgactaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatatggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 17017272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 286
Target Start/End: Original strand, 34298734 - 34298992
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34298734 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 34298831  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacg 221  Q
    ||||||  ||    ||||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34298832 tcaccatgat----aggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 34298927  T
Q  222 acatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||  ||||||||  ||||| |||||    
T  34298928 acatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatg 34298992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 151 - 282
Target Start/End: Original strand, 14053784 - 14053915
Alignment:
Q  151 cgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattg 250  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14053784 cgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattg 14053883  T
Q  251 tcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14053884 tcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 14053915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 11566627 - 11566410
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  11566627 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 11566528  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11566527 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 11566433  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  11566432 gattggtaccacatgcatataag 11566410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 12619183 - 12619400
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  12619183 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 12619282  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12619283 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 12619377  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  12619378 gattggtaccacatgcatataag 12619400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19870355 - 19870138
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  19870355 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattatggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 19870256  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19870255 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 19870161  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  19870160 gattggtaccacatgcatataag 19870138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23394833 - 23394616
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  23394833 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 23394734  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23394733 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 23394639  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  23394638 gattggtaccacatgcatataag 23394616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 162 - 282
Target Start/End: Original strand, 4233708 - 4233828
Alignment:
Q  162 taggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtca 261  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4233708 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtca 4233807  T
Q  262 tgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  4233808 tgattaagatgccttgttgat 4233828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 131 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 14098486 - 14098335
Alignment:
Q  131 ttattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcata 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  14098486 ttattaggagctttgtcctccgcacgtttattaggagctttgtcctcctcacgattaaagtatatttatacttctgatgacgattggtaccacatgcata 14098387  T
Q  231 taaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  14098386 taaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgtctaagatgctttgttgat 14098335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 8243598 - 8243381
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  8243598 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 8243499  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||| |||||||||||||| |  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8243498 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttca--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 8243404  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  8243403 gattggtaccacatgcatataag 8243381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23989685 - 23989468
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttt---------tgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||         ||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  23989685 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtggtttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 23989586  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23989585 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 23989491  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  23989490 gattggtaccacatgcatataag 23989468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22862711 - 22862494
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||| ||| ||||||    
T  22862711 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcataacatttcattg 22862612  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    || || ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22862611 agttttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 22862517  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  22862516 gattggtaccacatgcatataag 22862494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16760011 - 16759817
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaatta 133  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||||| |||||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16760011 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta 16759912  T
Q  134 ttaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataa 233  Q
       |||||||| ||||||||||| ||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16759911 ---ggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 16759818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Original strand, 31478326 - 31478542
Alignment:
Q  22 tgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattga 112  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| |||||||    
T  31478326 tgatgacgtttagcttcaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga 31478425  T
Q  113 gcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacg 212  Q
    |||| |||||||||||     ||||||||||| |||| |||||||||  |||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31478426 gctttgtcctcaccac---gtttaggagctttgtccttcgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacg 31478520  T
Q  213 attggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||||| | |||||||||||    
T  31478521 attggtaccaaatgcatataag 31478542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Original strand, 27416292 - 27416484
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||| | ||| ||||| ||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||   |     
T  27416292 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcacca---tg 27416386  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
    |||||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27416387 attaggagctttgtcctccgcacg----ataggagttttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 27416482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 234
Target Start/End: Original strand, 25135847 - 25135970
Alignment:
Q  106 tcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttat 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||   | |||||||||||| ||||||||||| ||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25135847 tcattgagctttgtcctcacca---tgattaggagctttgtcctccgcacgattta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 25135941  T
Q  206 gatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25135942 gatgacgattggtaccacatgcatataag 25135970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23414646 - 23414453
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||| | ||| ||||| ||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||   |     
T  23414646 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcacca---tg 23414552  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23414551 attaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 23414455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 14098624 - 14098461
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagt 119  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  14098624 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgattacggtgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagt 14098526  T
Q  120 cctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgtttta-taggagttttgtcctccacacg 183  Q
    |||||||||  |||||| ||||||| ||||| ||||| |||| |||||| |||||||||| ||||    
T  14098525 cctcaccacgtttattaagagctttgtcctctgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacg 14098461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22948753 - 22948631
Alignment:
Q  106 tcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttat 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||| ||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22948753 tcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 22948660  T
Q  206 gatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22948659 gatgacgattggtaccacatgcatataag 22948631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22952709 - 22952587
Alignment:
Q  106 tcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttat 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||| ||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22952709 tcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 22952616  T
Q  206 gatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22952615 gatgacgattggtaccacatgcatataag 22952587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23871197 - 23871075
Alignment:
Q  106 tcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttat 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||| ||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23871197 tcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 23871104  T
Q  206 gatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23871103 gatgacgattggtaccacatgcatataag 23871075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23875153 - 23875031
Alignment:
Q  106 tcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttat 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||| ||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23875153 tcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 23875060  T
Q  206 gatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23875059 gatgacgattggtaccacatgcatataag 23875031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 133 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1644157 - 1644058
Alignment:
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1644157 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 1644060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 133 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14471860 - 14471761
Alignment:
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14471860 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 14471763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 133 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16624001 - 16623902
Alignment:
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16624001 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 16623904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Original strand, 5616920 - 5617113
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||| | |||||||||  || | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||  ||     
T  5616920 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatgat- 5617016  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
       ||||||||| |||||| |||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5617017 ---aggagctttgtcctccacacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 5617111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 135 - 234
Target Start/End: Original strand, 1587932 - 1588029
Alignment:
Q  135 taggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1587932 taggagctttgtcctccacacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 1588029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 128
Target Start/End: Original strand, 25595462 - 25595569
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgca-tagcatctcattgagcttagt 119  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  25595462 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 25595560  T
Q  120 cctcaccac 128  Q
    |||||||||    
T  25595561 cctcaccac 25595569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 57 - 232
Target Start/End: Original strand, 9482421 - 9482588
Alignment:
Q  57 tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcac 155  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||  || | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||  ||    ||||||||| ||||||||||    
T  9482421 tgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatgat----aggagctttctcctccgcac 9482514  T
Q  156 gttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
    ||||   ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9482515 gttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 9482588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 161 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12706571 - 12706498
Alignment:
Q  161 ataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12706571 ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 12706498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27556333 - 27556211
Alignment:
Q  106 tcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttat 205  Q
    ||||||||||| |||||||||   || |||||||||||| |||||| || | |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27556333 tcattgagctttgtcctcacc---atgattaggagctttgtcctccacatgat---taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 27556240  T
Q  206 gatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27556239 gatgacgattggtaccacatgcatataag 27556211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16741206 - 16741016
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||| ||||||||||| ||| | |||| ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| ||     
T  16741206 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgata-gagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgatc 16741109  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
        |||||||| |||||| ||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16741108 ----ggagctttgtcctccacacg----ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatata 16741018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 134 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12496214 - 12496117
Alignment:
Q  134 ttaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataa 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12496214 ttaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtccttcgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 12496118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 146 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21702181 - 21702095
Alignment:
Q  146 tcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||| |||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21702181 tcctccacacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 21702095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 135 - 234
Target Start/End: Original strand, 20803755 - 20803852
Alignment:
Q  135 taggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||  |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20803755 taggagctttgtcctctacacgtttta--ggagctttgtcctccgcatgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 20803852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19662769 - 19662579
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||| |||||||||||  | |  |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    |    
T  19662769 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgtttaa-gtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcacca----t 19662676  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
     || |||||||| |||||| ||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19662675 gttcggagctttgtcctccacacg----ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatata 19662581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 161 - 234
Target Start/End: Original strand, 2685542 - 2685614
Alignment:
Q  161 ataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2685542 ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatataag 2685614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 14059692 - 14059761
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 70  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14059692 ttaactaagtgcataagtatatggtaaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 14059761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Original strand, 18917895 - 18917967
Alignment:
Q  162 taggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18917895 taggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 18917967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 164 - 234
Target Start/End: Original strand, 27325854 - 27325923
Alignment:
Q  164 ggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27325854 ggagctttgttctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatataag 27325923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 16624142 - 16624022
Alignment:
Q  22 tgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacga---------tgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattga 112  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||         |||||||||  |||| |||| |||||||||| |||||||    
T  16624142 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga 16624043  T
Q  113 gcttagtcctcaccacaatta 133  Q
    |||| ||||||||||| ||||    
T  16624042 gctttgtcctcaccacgatta 16624022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 1644298 - 1644183
Alignment:
Q  22 tgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacga---------tgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattga 112  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||         |||||||||  |||| |||| |||||||||| |||||||    
T  1644298 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga 1644199  T
Q  113 gcttagtcctcaccac 128  Q
    |||| |||||||||||    
T  1644198 gctttgtcctcaccac 1644183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 75
Target Start/End: Original strand, 18917775 - 18917829
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 75  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18917775 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 18917829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 234
Target Start/End: Original strand, 22430255 - 22430327
Alignment:
Q  164 ggagttttgtcctccacacgat---taaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||| |||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22430255 ggagctttgtcctccccacgatgcttaaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataag 22430327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17804040 - 17803995
Alignment:
Q  188 aagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17804040 aagtatattaatactt-tgatgacgattggtaccacatgcatataag 17803995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 70
Target Start/End: Original strand, 23657531 - 23657568
Alignment:
Q  33 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 70  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  23657531 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 23657568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 70
Target Start/End: Original strand, 27553692 - 27553729
Alignment:
Q  33 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 70  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  27553692 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 27553729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 238; Significance: 1e-132; HSPs: 57)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 8354841 - 8355122
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  8354841 ttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcata 8354940  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8354941 gcatctcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 8355040  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8355041 cttatgatgacgattggcaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 8355122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 17669645 - 17669926
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  17669645 ttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcata 17669744  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17669745 gcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 17669844  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17669845 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccctgttgat 17669926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 22115796 - 22116082
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttt-gttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||    
T  22115796 ttaactaagtgcataagtatatgattaagtttagctccaaattactggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgtccataagagtccatgcat 22115895  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22115896 agcatctcattgagcttggtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 22115995  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22115996 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacactgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 22116082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 22124604 - 22124890
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttt-gttcataagtgtccttgcat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||    
T  22124604 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattactggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgtccataagagtccatgcat 22124703  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  22124704 agcatctcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagatttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcatgattaaagtatattaat 22124803  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22124804 acttatgatgacgattggtaccacgtgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 22124890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 17676297 - 17676578
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  17676297 ttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcata 17676396  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17676397 gcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagttttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 17676496  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17676497 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccctgttgat 17676578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 22083861 - 22083576
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  22083861 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcata 22083762  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22083761 gcatatcattgagctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 22083662  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22083661 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 22083576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 21915645 - 21915929
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  21915645 ttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcata 21915743  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21915744 gcataccattgagcttagtcctcaccatgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 21915843  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21915844 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 21915929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 3 - 282
Target Start/End: Original strand, 5534516 - 5534795
Alignment:
Q  3 aactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagc 102  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  5534516 aactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatattttgttcatatgtgtccatgcatagc 5534615  T
Q  103 atctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatact 202  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5534616 atatcattgaacttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatact 5534715  T
Q  203 tatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5534716 tatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 5534795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 16883246 - 16883528
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataag-tatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| |||||    
T  16883246 ttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat 16883345  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16883346 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 16883445  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16883446 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 16883528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 22123461 - 22123742
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttt-gttcataagtgtccttgcat 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  22123461 ttaactaagtgcataagtttatgatgaagt-tagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttcataagtgtccatgcat 22123559  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  22123560 agcatctcattgagctcagtcctcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcaggattaaagtatattaat 22123659  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22123660 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgat 22123742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 22047975 - 22047690
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  22047975 ttaactaagtgcatatgtatatgataatgtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttctgttcataagtgtccatgcat 22047877  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22047876 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 22047777  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22047776 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 22047690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 29123118 - 29122836
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataag-tatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||| |||| |||||    
T  29123118 ttaactaagtgcatatggtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacagtgttttgttgttaagagtccatgcat 29123019  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29123018 agcatatcattgagcttagtcctcaccacatttattaggagctttgtcctccgcacgttttatagtagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 29122919  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29122918 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 29122836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19496419 - 19496138
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  19496419 ttaactaagtgcatatgtatatgataaggtttagcttcaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcat 19496321  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19496320 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 19496221  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19496220 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 19496138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19498467 - 19498186
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  19498467 ttaactaagtgcatatgtatatgataaggtttagcttcaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcat 19498369  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19498368 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 19498269  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19498268 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 19498186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 20013939 - 20014200
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  20013939 ttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaagttattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcata 20014037  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20014038 gcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 20014137  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20014138 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 20014200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 20020016 - 20020277
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  20020016 ttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaagttattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcata 20020114  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20020115 gcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 20020214  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20020215 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 20020277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 18865361 - 18865079
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataag-tatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| |||||    
T  18865361 ttaactaagtgcatatggtatatgatcaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat 18865262  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18865261 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtccttcgcacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 18865162  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18865161 acttatgatgacgattggtaccacatgcacataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 18865079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19111256 - 19110976
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||  |||| |||| |||||    
T  19111256 ttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcat 19111158  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19111157 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 19111058  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19111057 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataa-gagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 19110976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19117547 - 19117267
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||  |||| |||| |||||    
T  19117547 ttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcat 19117449  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19117448 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 19117349  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19117348 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataa-gagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 19117267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Original strand, 23845873 - 23846115
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtc 120  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23845873 atgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 23845972  T
Q  121 ctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23845973 ctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 23846072  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23846073 cacatgcatataaggagtctatgagcattgtcacattgtcatg 23846115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Original strand, 20024039 - 20024281
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtc 120  Q
    ||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20024039 atgatgacgtttagctccaagttgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 20024138  T
Q  121 ctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    ||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||| ||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20024139 ctcaccacgtttattaggagttttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 20024238  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
     |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20024239 cacattcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 20024281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 65 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 28454716 - 28454495
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttatag 164  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28454716 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 28454617  T
Q  165 gagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 264  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28454616 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagaagtctaagagcattgtcacattgtcatga 28454517  T
Q  265 ttaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  28454516 ttaagatgccttgttgatgatg 28454495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Original strand, 26935288 - 26935533
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagt 119  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26935288 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 26935386  T
Q  120 cctcaccacaatt-attaggagctttttcctccgcacgttttat-aggagttttgtcctccacacgatt-aaagtatattaatacttatgatgacgattg 216  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26935387 cctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattg 26935486  T
Q  217 gtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26935487 gtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 26935533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 23 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19905490 - 19905252
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||| ||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19905490 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 19905392  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttat-aggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19905391 tcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 19905292  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtc 260  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  19905291 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtc 19905252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 3216259 - 3216014
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagt 119  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  3216259 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacagtgatttgttcataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 3216161  T
Q  120 cctcaccacaatt-attaggagctttttcctccgcacgttttat-aggagttttgtcctccacacgatt-aaagtatattaatacttatgatgacgattg 216  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||  |||| ||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3216160 cctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgacttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattg 3216061  T
Q  217 gtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3216060 gtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 3216014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 20527444 - 20527186
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20527444 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 20527347  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacg 221  Q
    ||||||  ||    ||||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20527346 tcaccatgat----aggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 20527251  T
Q  222 acatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||  ||||| |||||    
T  20527250 acatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaagatgctatgttgttgatg 20527186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 65 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 18065286 - 18065063
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcat-aagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt-attaggagctttttcctccgcacgttttat 162  Q
    |||||||||||||||| | || ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||| ||  |    
T  18065286 tgattacgatgttttggttattaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatt 18065187  T
Q  163 aggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcat 262  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18065186 aggagatttgtcctccgcacgattaaagtatatttatatttatgatgacgattggtaccacatgcatgtacggagtctaggagcattgtcacattgtcat 18065087  T
Q  263 gattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    |  ||  |||| ||||||||||||    
T  18065086 gtctattatgctttgttgatgatg 18065063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 153 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 18854840 - 18854711
Alignment:
Q  153 cacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtc 252  Q
    |||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18854840 cacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtc 18854741  T
Q  253 acattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18854740 acattgtcatgattaagatgccttgttgat 18854711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22111696 - 22111479
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  22111696 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 22111597  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22111596 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 22111502  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  22111501 gattggtaccacatgcatataag 22111479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 43251576 - 43251359
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  43251576 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 43251477  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43251476 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 43251382  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  43251381 gattggtaccacatgcatataag 43251359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 18854966 - 18854810
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataag-tatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| |||||    
T  18854966 ttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat 18854867  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacg 156  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  18854866 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacg 18854810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 21972922 - 21973139
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  21972922 atgatgatgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattgcgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 21973021  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  21973022 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtttattaatacttatgatgac 21973116  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  21973117 gattggtaccacatgcatataag 21973139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 21977013 - 21977230
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  21977013 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattgcgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 21977112  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    || || ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21977113 agttttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 21977207  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  21977208 gattggtaccacatgcatataag 21977230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15531890 - 15531697
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||| |||||||| |||||||||||  || | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  15531890 ctccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacgatt 15531793  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
    |   |||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15531792 a---ggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 15531699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15538449 - 15538256
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||| |||||||| ||| |||||||  || | |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15538449 ctccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaagatattttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacaatt 15538352  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
    |   |||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15538351 a---ggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 15538258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 106 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21410595 - 21410473
Alignment:
Q  106 tcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttat 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21410595 tcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 21410502  T
Q  206 gatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21410501 gatgacgattggtaccacatgcatataag 21410473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 106 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21805087 - 21804965
Alignment:
Q  106 tcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttat 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21805087 tcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 21804994  T
Q  206 gatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21804993 gatgacgattggtaccacatgcatataag 21804965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Original strand, 24445611 - 24445803
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||  ||||||| |||||||||||  || | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  24445611 ctccaaattattggatgtatatgtgataaattgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacgatt 24445708  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
    |   |||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24445709 a---ggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 24445802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Original strand, 23847120 - 23847312
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||| |||||||| |||||||||||  || | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||  ||     
T  23847120 ctccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatgat- 23847216  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
       ||||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23847217 ---aggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 23847310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Original strand, 17828687 - 17828880
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||| |||||||| |||||||||||  || | |||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||   |     
T  17828687 ctccaaattattggatgtatatgtgataggttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattaacat-tcattgagctttgtcctcacca---tg 17828781  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17828782 attaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacaatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 17828878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 234
Target Start/End: Original strand, 18863106 - 18863228
Alignment:
Q  106 tcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttat 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||| ||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18863106 tcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 18863199  T
Q  206 gatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18863200 gatgacgattggtaccacatgcatataag 18863228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 234
Target Start/End: Original strand, 21828475 - 21828597
Alignment:
Q  106 tcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttat 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||| ||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21828475 tcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 21828568  T
Q  206 gatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21828569 gatgacgattggtaccacatgcatataag 21828597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 234
Target Start/End: Original strand, 30940538 - 30940660
Alignment:
Q  106 tcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttat 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||| ||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30940538 tcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 30940631  T
Q  206 gatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30940632 gatgacgattggtaccacatgcatataag 30940660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 230
Target Start/End: Original strand, 17055555 - 17055673
Alignment:
Q  106 tcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttat 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||   | |||||||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  17055555 tcattgagctttgtcctcacca---tgattaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttat 17055648  T
Q  206 gatgacgattggtacgacatgcata 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  17055649 gatgacgattggtaccacatgcata 17055673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 175 - 263
Target Start/End: Original strand, 20705896 - 20705984
Alignment:
Q  175 ctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  20705896 ctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 20705984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 135 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 32598583 - 32598486
Alignment:
Q  135 taggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32598583 taggagctttgtcctccacacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 32598486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 135 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 32605115 - 32605018
Alignment:
Q  135 taggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32605115 taggagctttgtcctccacacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 32605018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22044884 - 22044693
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||| ||||||||||| ||| | |||| ||||| |||||  |||||||||| ||| ||||||| ||     
T  22044884 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgata-gagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcgtcaccacgatc 22044787  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
        |||||||| |||||| ||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22044786 ----ggagctttgtcctccacacg----ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 22044695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 135 - 234
Target Start/End: Original strand, 30308954 - 30309050
Alignment:
Q  135 taggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||||||| |||||| |||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30308954 taggagctttgtcctccacacgttt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 30309050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Original strand, 16231581 - 16231771
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||| ||||||||||| ||| | |||| ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| ||     
T  16231581 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgata-gagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgatc 16231678  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
        |||||||| |||||| ||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16231679 ----ggagctttgtcctccacacg----ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatata 16231769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 133 - 234
Target Start/End: Original strand, 14398308 - 14398406
Alignment:
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||   ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14398308 attaggagctttgtcctccacacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacatatgatgacgattggtaccacatgcatata 14398404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 161 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23834054 - 23833982
Alignment:
Q  161 ataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23834054 ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatataag 23833982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15440465 - 15440393
Alignment:
Q  162 taggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15440465 taggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 15440393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21387003 - 21386881
Alignment:
Q  106 tcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttat 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||||   ||||  |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  21387003 tcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgccatccgcacgttt---aggaactttgtcctccgcacaatgaaagtatattaatacttat 21386910  T
Q  206 gatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21386909 gatgacgattggtaccacatgcatataag 21386881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 154
Target Start/End: Original strand, 19278628 - 19278767
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  19278628 atgatgacgtttagctccaaattattgaatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 19278727  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgca 154  Q
    ||||| |||||||||||    |||||||||||| |||||||||    
T  19278728 agctttgtcctcaccac---gattaggagctttgtcctccgca 19278767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 162 - 233
Target Start/End: Original strand, 19278748 - 19278821
Alignment:
Q  162 taggagttttgtcctccaca-cgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgac-atgcatataa 233  Q
    |||||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  19278748 taggagctttgtcctccgcaacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacaatgcatataa 19278821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 70
Target Start/End: Original strand, 20856545 - 20856582
Alignment:
Q  33 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 70  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  20856545 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 20856582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 238; Significance: 1e-132; HSPs: 102)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 37286857 - 37287137
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37286857 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagt-tagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcata 37286955  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37286956 gcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 37287055  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37287056 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgat 37287137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 37293560 - 37293840
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37293560 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagt-tagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcata 37293658  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37293659 gcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 37293758  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37293759 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgat 37293840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 22328239 - 22328519
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22328239 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagt-tagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcata 22328337  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22328338 gcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 22328437  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  22328438 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagataccttattgat 22328519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 34294627 - 34294908
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  34294627 ttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatacatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcata 34294726  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34294727 gcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagttttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 34294826  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34294827 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 34294908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 41098297 - 41098578
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  41098297 ttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcata 41098396  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41098397 gcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 41098496  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41098497 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 41098578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22264975 - 22264694
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  22264975 ttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgactacgatgttttgttcatatgtgtccatgcata 22264876  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22264875 gcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 22264776  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22264775 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 22264694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 27615375 - 27615091
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  27615375 ttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaagttattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcata 27615277  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27615276 gcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagttttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 27615177  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27615176 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 27615091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 27663864 - 27664145
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  27663864 ttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcata 27663963  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  27663964 gcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtccttcgcacgattaaagtatattaata 27664063  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27664064 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 27664145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 17707005 - 17707289
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  17707005 ttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcata 17707103  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17707104 gcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 17707203  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17707204 cttatgatgacgattggtaccacttgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 17707289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19991912 - 19991633
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19991912 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagt-tagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcata 19991814  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19991813 gcatctcattgagcttagtcctcgccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 19991714  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19991713 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataa-gagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgat 19991633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 27608769 - 27608485
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  27608769 ttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaagttattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcata 27608671  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27608670 gcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 27608571  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27608570 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 27608485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 41294510 - 41294794
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||    
T  41294510 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattactggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttt-tccataagagtccatgcata 41294608  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  41294609 gcatctcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaata 41294708  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41294709 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgttgatg 41294794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 15001755 - 15002040
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttt-gttcataagtgtccttgcat 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  15001755 ttaactaagtgcataagtttatgatgaagt-tagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttcataagtgtccatgcat 15001853  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15001854 agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagcttcgtcctccgcacgattaaagtatattaat 15001953  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15001954 acttatgatgacgattggtaccacatgcatatagggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 15002040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 22341678 - 22341958
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  22341678 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagt-tagctccaaattatttgatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgcccatgcata 22341776  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22341777 gcatctcattgagcatagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 22341876  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22341877 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttcttgat 22341958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 23584169 - 23583888
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  23584169 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcata 23584070  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23584069 gcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccacacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 23583970  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23583969 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 23583888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 24472322 - 24472602
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  24472322 ttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcata 24472421  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24472422 gcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagcttgt-cctccgcacgttttataagagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 24472520  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24472521 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 24472602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 18038743 - 18039024
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttt-gttcataagtgtccttgcat 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  18038743 ttaactaagtgcataagtttatgatgaagt-tagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttcataagtgtccatgcat 18038841  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18038842 agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttatatgagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 18038941  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18038942 acttatgatgacgattggtaccacatgcatatagggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 18039024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 27670504 - 27670784
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  27670504 ttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaagttattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcata 27670602  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27670603 gcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 27670702  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27670703 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgat 27670784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 1692512 - 1692797
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttt-gttcataagtgtccttgcat 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  1692512 ttaactaagtgcataagtttatgatgaagt-tagctccaatttaatggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttcataagtgtccatgcat 1692610  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1692611 agcatcttattgagcttagtcctcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 1692710  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1692711 acttatgatgacgattggtaccacatgcatatagggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 1692797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 25406456 - 25406174
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataag-tatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| |||||    
T  25406456 ttaactaagtgcatgtggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat 25406357  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25406356 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagttttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 25406257  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25406256 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 25406174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 41769273 - 41769011
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  41769273 ttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcata 41769174  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41769173 gcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 41769074  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41769073 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 41769011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 41775847 - 41775585
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  41775847 ttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcata 41775748  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41775747 gcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 41775648  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41775647 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 41775585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 33725888 - 33725607
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  33725888 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcata 33725789  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    ||||  |||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33725788 gcataacattgagctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 33725689  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33725688 cttatgatgacgattggtaccacatgcatatatggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 33725607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 14995112 - 14995397
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttt-gttcataagtgtccttgcat 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  14995112 ttaactaagtgcataagtttatgatgatgt-tagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttcataagtgtccatgcat 14995210  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14995211 agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggaccttcgtcctccgcacgattaaagtatattaat 14995310  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14995311 acttatgatgacgattggtaccacatgcatgtagggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 14995397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22139721 - 22139439
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataag-tatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||  |||||    
T  22139721 ttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtctatgcat 22139622  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22139621 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 22139522  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22139521 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 22139439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 29471432 - 29471715
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataag-tatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttga-ttacgatgttttgttcataagtgtccttgca 98  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||| |||| ||||    
T  29471432 ttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgaattacggtgttttgttgttaagagtccatgca 29471531  T
Q  99 tagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaa 198  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29471532 tagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaa 29471631  T
Q  199 tacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29471632 tacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 29471715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 17284099 - 17283817
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataag-tatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| || ||    
T  17284099 ttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgtat 17284000  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17283999 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 17283900  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17283899 atttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 17283817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 22062957 - 22063238
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||  |||| |||| |||||    
T  22062957 ttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcat 22063055  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22063056 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 22063155  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22063156 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 22063238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22133029 - 22132747
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataag-tatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||| |||| |||||    
T  22133029 ttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatattgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat 22132930  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22132929 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtccttcgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 22132830  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132829 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 22132747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22588127 - 22587845
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataag-tatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| |||||    
T  22588127 ttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttatctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat 22588028  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22588027 agcatatcattgagcttagtcctcaccatgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 22587928  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22587927 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 22587845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 27687404 - 27687689
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttt-gttcataagtgtccttgcat 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  27687404 ttaactaagtgcataagtttatgatgaagt-tagctccaatttaatggatgcgtgttgatatgttgattacgatgtttttgttcataagtgtccatgcat 27687502  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  27687503 agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcatccgcacgattaaagtatattaat 27687602  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27687603 acttatgatgacgattggtaccacatgcatatagggagtctaagagcattgtcacgttgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 27687689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 37544070 - 37543785
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  37544070 ttaactaagtgcatatgtatatgataaggtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcat 37543972  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37543971 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 37543872  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37543871 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacagtgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 37543785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 23249968 - 23249707
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  23249968 ttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcata 23249870  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23249869 gcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 23249770  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23249769 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 23249707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 40707152 - 40706871
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||  |||| |||| |||||    
T  40707152 ttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcat 40707054  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40707053 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 40706954  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40706953 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 40706871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 40713794 - 40713513
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||  |||| |||| |||||    
T  40713794 ttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcat 40713696  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40713695 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 40713596  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40713595 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 40713513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 29478027 - 29478310
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataag-tatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttga-ttacgatgttttgttcataagtgtccttgca 98  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||| |||| ||||    
T  29478027 ttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgaattacggtgttttgttgttaagagtccatgca 29478126  T
Q  99 tagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaa 198  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29478127 taacatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaa 29478226  T
Q  199 tacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29478227 tacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattggcatgattaagatgccttgttgat 29478310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 27516782 - 27516501
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||  |||| |||| |||||    
T  27516782 ttaactaagtgcataagtatatgatagagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcat 27516684  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27516683 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 27516584  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27516583 acttatgatgacgactggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 27516501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 27523419 - 27523138
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||  |||| |||| |||||    
T  27523419 ttaactaagtgcataagtatatgatagagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcat 27523321  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27523320 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 27523221  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27523220 acttatgatgacgactggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 27523138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 19768343 - 19768101
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtc 120  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19768343 atgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgatgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 19768244  T
Q  121 ctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    |||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19768243 ctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 19768144  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19768143 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 19768101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 19774939 - 19774697
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtc 120  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19774939 atgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgatgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 19774840  T
Q  121 ctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
     |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19774839 ttcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 19774740  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19774739 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 19774697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 65 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16354790 - 16354573
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttatag 164  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16354790 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 16354691  T
Q  165 gagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 264  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16354690 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 16354591  T
Q  265 ttaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16354590 ttaagatgccttgttgat 16354573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 65 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16361449 - 16361232
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttatag 164  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16361449 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 16361350  T
Q  165 gagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 264  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16361349 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 16361250  T
Q  265 ttaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16361249 ttaagatgccttgttgat 16361232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 65 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 34564783 - 34564566
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttatag 164  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34564783 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 34564684  T
Q  165 gagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 264  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34564683 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 34564584  T
Q  265 ttaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||    
T  34564583 ttaagatgccttgttgat 34564566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 65 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 34571438 - 34571221
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttatag 164  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34571438 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 34571339  T
Q  165 gagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 264  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34571338 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 34571239  T
Q  265 ttaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||    
T  34571238 ttaagatgccttgttgat 34571221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 24020279 - 24020037
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtc 120  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  24020279 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgatttgttcataagaatccatgcataacatttcattgagcttagtc 24020180  T
Q  121 ctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24020179 ctcaccacgattattaggagctttgtactccgtacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaaatatattaatacttatgatgacgattggtac 24020080  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
     |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24020079 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcacattgtcatg 24020037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 65 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 25106729 - 25106512
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttatag 164  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25106729 tgattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 25106630  T
Q  165 gagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 264  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25106629 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 25106530  T
Q  265 ttaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||| |||||||||    
T  25106529 ttaagatgtcttgttgat 25106512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 65 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 25165822 - 25165605
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttatag 164  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25165822 tgattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 25165723  T
Q  165 gagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 264  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25165722 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 25165623  T
Q  265 ttaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||| |||||||||    
T  25165622 ttaagatgtcttgttgat 25165605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 22343493 - 22343248
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtc 120  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  22343493 atgatgacgtttagctccaaattattagatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtc 22343394  T
Q  121 ctcaccac-aattattaggagctttttcctccgcacgtttta-taggagttttgtcctccacacg-attaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 217  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22343393 ctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgatgattgg 22343294  T
Q  218 tacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22343293 taccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 22343248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 22352893 - 22352648
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtc 120  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  22352893 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtc 22352794  T
Q  121 ctcaccac-aattattaggagctttttcctccgcacgtttta-taggagttttgtcctccacacg-attaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 217  Q
     ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22352793 ttcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctctgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 22352694  T
Q  218 tacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22352693 taccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 22352648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Original strand, 22326038 - 22326282
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagt 119  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22326038 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 22326136  T
Q  120 cctcaccacaatt-attaggagctttttcctccgcacgttttat-aggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 217  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22326137 cctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaagagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 22326236  T
Q  218 tacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22326237 taccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 22326282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 65 - 263
Target Start/End: Original strand, 22410750 - 22410948
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttatag 164  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22410750 tgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 22410849  T
Q  165 gagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22410850 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 22410948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 65 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 20775834 - 20775616
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt-attaggagctttttcctccgcacgttttata 163  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||  |  ||    
T  20775834 tgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgaatatta 20775735  T
Q  164 ggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  20775734 ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgccacattgtcatg 20775635  T
Q  264 attaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||    
T  20775634 attaagatgccttgttgat 20775616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 286
Target Start/End: Original strand, 14359931 - 14360195
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||| ||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14359931 gatgacgtttagctccaaactattggatgcatattgatatgatgattacggtggtttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 14360029  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttat-aggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14360030 tcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattatgagttttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 14360129  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||  ||||||||  ||||| |||||    
T  14360130 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatg 14360195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 23 - 286
Target Start/End: Original strand, 15442068 - 15442332
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||  ||||| ||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15442068 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacagtgaattgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 15442166  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttat-aggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15442167 tcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 15442266  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||  ||||||||  ||||| |||||    
T  15442267 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatg 15442332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 65 - 286
Target Start/End: Original strand, 21667957 - 21668179
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt-attaggagctttttcctccgcacgttttata 163  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||| ||  ||    
T  21667957 tgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatta 21668056  T
Q  164 ggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21668057 ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 21668156  T
Q  264 attaagatgccttgttgatgatg 286  Q
      ||  |||| ||||||||||||    
T  21668157 tctattatgctttgttgatgatg 21668179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 65 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 29316373 - 29316151
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt-attaggagctttttcctccgcacgttttata 163  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||  ||  ||    
T  29316373 tgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacaattatta 29316274  T
Q  164 ggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316273 ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 29316174  T
Q  264 attaagatgccttgttgatgatg 286  Q
      ||  |||| ||||||||||||    
T  29316173 tctattatgctttgttgatgatg 29316151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 286
Target Start/End: Original strand, 21295374 - 21295632
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21295374 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 21295471  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacg 221  Q
    ||||||  ||    ||||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21295472 tcaccatgat----aggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 21295567  T
Q  222 acatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||  ||||||||  ||||| |||||    
T  21295568 acatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatg 21295632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 65 - 263
Target Start/End: Original strand, 22258632 - 22258831
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt-attaggagctttttcctccgcacgttttata 163  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||| ||  ||    
T  22258632 tgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatta 22258731  T
Q  164 ggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22258732 ggagctttgtcctccgcacgaataaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 22258831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 34 - 263
Target Start/End: Original strand, 23337413 - 23337643
Alignment:
Q  34 gctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  || |||||| ||||| |||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||| | |||    
T  23337413 gctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacagtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagctcagtcctcaccgcgatt 23337511  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttat-aggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatat 231  Q
    |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  23337512 attaggagctttgtactccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgtttggtaccacatgcatat 23337611  T
Q  232 aaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  23337612 aaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 23337643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 23609933 - 23609778
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  23609933 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcata 23609834  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacg 156  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  23609833 gcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacg 23609778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 23841329 - 23841174
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  23841329 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcata 23841230  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacg 156  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  23841229 gcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacg 23841174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 35 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 25534971 - 25534725
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatta 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||      
T  25534971 ctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccatgat-- 25534876  T
Q  134 ttaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataa 233  Q
      ||||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25534875 --aggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 25534778  T
Q  234 ggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| ||  ||||||||  ||||| |||||    
T  25534777 ggagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatg 25534725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 24554529 - 24554294
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  24554529 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 24554432  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttt---tataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggt 218  Q
    ||||||| ||    ||||||||| ||||||||||| ||   | |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24554431 tcaccacgat----aggagctttgtcctccgcacgattatttttaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggt 24554336  T
Q  219 acgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtc 260  Q
    || ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  24554335 accacatgcatataaggaatctaagagcattgtcgcattgtc 24554294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 151 - 286
Target Start/End: Original strand, 27680912 - 27681047
Alignment:
Q  151 cgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattg 250  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  27680912 cgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatagggagtctaagagcattg 27681011  T
Q  251 tcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27681012 tcacgttgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 27681047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 15237176 - 15237393
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  15237176 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 15237275  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15237276 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 15237370  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  15237371 gattggtaccacatgcatataag 15237393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 19473059 - 19473276
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  19473059 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 19473158  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19473159 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 19473253  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  19473254 gattggtaccacatgcatataag 19473276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 162 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 23609799 - 23609679
Alignment:
Q  162 taggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtca 261  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23609799 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtca 23609700  T
Q  262 tgattaagatgccttgttgat 282  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  23609699 tggttaagatgccttgttgat 23609679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 162 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 23841195 - 23841075
Alignment:
Q  162 taggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtca 261  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23841195 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtca 23841096  T
Q  262 tgattaagatgccttgttgat 282  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  23841095 tggttaagatgccttgttgat 23841075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20295612 - 20295395
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  20295612 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 20295513  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||| |||||| |||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20295512 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctcctcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 20295418  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  20295417 gattggtaccacatgcatataag 20295395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 10752954 - 10752738
Alignment:
Q  22 tgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattga 112  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||| ||| ||||||     
T  10752954 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcataacatttcattgg 10752855  T
Q  113 gcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacg 212  Q
    |||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  10752854 gctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgatgaaaatatattaatacttatgatgacg 10752760  T
Q  213 attggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  10752759 attggtaccacatgcatataag 10752738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Original strand, 40723977 - 40724174
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||| | ||| ||||| ||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||    
T  40723977 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcttcaccacgatt 40724074  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |  || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40724075 attaggagctttgtcctccgcacgttttaga--agctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 40724172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 33409229 - 33409036
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||| |||||| | |||||||||||  || | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  33409229 ctccaaattattggatgtatatgtgataagttgatcaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacgatt 33409132  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
    |   |||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33409131 a---ggagctttgtcctccgcacgttt---aggagttttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 33409038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 106 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 11228802 - 11228680
Alignment:
Q  106 tcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttat 205  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||   |||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11228802 tcattgagctttgtcctgaccacaatta---ggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 11228709  T
Q  206 gatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11228708 gatgacgattggtaccacatgcatataag 11228680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 11220393 - 11220271
Alignment:
Q  106 tcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttat 205  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11220393 tcattgagctttgtcctgaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 11220300  T
Q  206 gatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11220299 gatgacgattggtaccacatgcatataag 11220271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 11230791 - 11230669
Alignment:
Q  106 tcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttat 205  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11230791 tcattgagctttgtcctgaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 11230698  T
Q  206 gatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11230697 gatgacgattggtaccacatgcatataag 11230669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 11224979 - 11224857
Alignment:
Q  106 tcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttat 205  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11224979 tcattgagctttgtcctgaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 11224886  T
Q  206 gatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  11224885 gatgacaattggtaccacatgcatataag 11224857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 11226812 - 11226690
Alignment:
Q  106 tcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttat 205  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||    ||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11226812 tcattgagctttgtcctgaccacgattaa---gagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 11226719  T
Q  206 gatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11226718 gatgacgattggtaccacatgcatataag 11226690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 234
Target Start/End: Original strand, 21885365 - 21885487
Alignment:
Q  106 tcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttat 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||   | |||||||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  21885365 tcattgagctttgtcctcacca---tgattaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttat 21885458  T
Q  206 gatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  21885459 gataacgattggtaccacatgcatataag 21885487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 135 - 234
Target Start/End: Original strand, 25229607 - 25229704
Alignment:
Q  135 taggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25229607 taggagctttgtcctccacacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 25229704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 135 - 234
Target Start/End: Original strand, 25293763 - 25293860
Alignment:
Q  135 taggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25293763 taggagctttgtcctccacacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 25293860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 133 - 234
Target Start/End: Original strand, 20911394 - 20911492
Alignment:
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20911394 attaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 20911490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 53 - 234
Target Start/End: Original strand, 17730531 - 17730705
Alignment:
Q  53 atgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctcc 151  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||||  || | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||  ||    ||||||||| ||||||    
T  17730531 atgttgataagttgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatgat----aggagctttgtcctcc 17730624  T
Q  152 gcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
     |||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  17730625 acacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgtttggtaccacatgcatataag 17730705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 135 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4036123 - 4036026
Alignment:
Q  135 taggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  4036123 taggagctttgtcctccacacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgatgattggtaccacatgcatataag 4036026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18355887 - 18355765
Alignment:
Q  106 tcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttat 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||   | |||||||||||| ||||||||||| ||   ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  18355887 tcattgagctttgtcctcacca---tgattaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttat 18355794  T
Q  206 gatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  18355793 gatgaagattggtaccacatgcatataag 18355765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26172394 - 26172272
Alignment:
Q  106 tcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttat 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||   | |||||||||||| ||||||||||||||   ||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  26172394 tcattgagctttgtcctcacca---tgattaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctctgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttat 26172301  T
Q  206 gatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  26172300 gataacgattggtaccacatgcatataag 26172272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16674153 - 16673961
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||  ||||||||||  || | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||  ||     
T  16674153 ctccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaaaatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatgat- 16674057  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
       ||||||||| ||||| ||||||||   ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16674056 ---aggagctttgtcctctgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatacatata 16673963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Original strand, 21340872 - 21341064
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||| ||| |||||||  || | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||  ||     
T  21340872 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatattttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatgat- 21340968  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
       ||||||||| |||||||||| |||   ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21340969 ---aggagctttgtcctccgcactttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 21341062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Original strand, 26666236 - 26666426
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||| |||||||||||  | |  |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    |    
T  26666236 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgtttaa-gtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcacca----t 26666329  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
     || |||||||| |||||| ||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26666330 gttcggagctttatcctccacacg----ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtactacatgcatata 26666424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Original strand, 26937833 - 26938023
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||| |||||||||||  | |  |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    |    
T  26937833 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgtttaa-gtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcacca----t 26937926  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
     || |||||||| |||||| ||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26937927 gttcggagctttatcctccacacg----ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtactacatgcatata 26938021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 161 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18774085 - 18774013
Alignment:
Q  161 ataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18774085 ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatataag 18774013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 161 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18783928 - 18783856
Alignment:
Q  161 ataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18783928 ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatataag 18783856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20232551 - 20232361
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||| |||||||||||  | |  |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    |    
T  20232551 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgtttaa-gtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcacca----t 20232458  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
     || |||||||| |||||| ||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20232457 gttcggagctttgtcctccacacg----ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtatcacatgcatata 20232363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 42805420 - 42805230
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||| |||||||||||  || | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||  ||     
T  42805420 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatgatc 42805323  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
        |||||||| |||||| ||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42805322 ----ggagctttgtcctccacacg----ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-aatgatgacgattggtaccacatgcatata 42805232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Original strand, 26742852 - 26743042
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||| |||||||||||  || | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||  ||     
T  26742852 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatgatc 26742949  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
        |||||||| |||||| ||||    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  26742950 ----ggagctttgtcctccacacg----ataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattgataccacatgcatata 26743040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 234
Target Start/End: Original strand, 24533271 - 24533343
Alignment:
Q  161 ataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  24533271 ataggagctttgtcctccacacgattaaaatatattaatac-tatgatgacgattgataccacatgcatataag 24533343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 234
Target Start/End: Original strand, 24767786 - 24767858
Alignment:
Q  161 ataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  24767786 ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgaagattgataccacatgcatataag 24767858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Original strand, 23535799 - 23535861
Alignment:
Q  172 gtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataagg 235  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  23535799 gtcctccccacgattaaagtatattaatac-tatgatcacgattgataccacatgcatataagg 23535861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 70
Target Start/End: Original strand, 123423 - 123460
Alignment:
Q  33 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 70  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  123423 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 123460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 70
Target Start/End: Original strand, 12028685 - 12028722
Alignment:
Q  33 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 70  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  12028685 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 12028722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 70
Target Start/End: Original strand, 17919263 - 17919300
Alignment:
Q  33 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 70  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  17919263 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 17919300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 22757122 - 22757085
Alignment:
Q  33 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 70  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  22757122 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 22757085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 24221873 - 24221836
Alignment:
Q  33 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 70  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  24221873 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 24221836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 143)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 31422627 - 31422908
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  31422627 ttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcata 31422726  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31422727 gcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 31422826  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31422827 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 31422908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 53380425 - 53380706
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  53380425 ttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcata 53380524  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53380525 gcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 53380624  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53380625 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 53380706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 53387077 - 53387358
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  53387077 ttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcata 53387176  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53387177 gcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 53387276  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53387277 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 53387358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 5106958 - 5107239
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  5106958 ttaactaagtgcatatgtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcata 5107057  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5107058 gcatatcattgagcttagtcctcacaacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 5107157  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5107158 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 5107239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 26889486 - 26889202
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  26889486 ttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcata 26889388  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26889387 gcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaata 26889288  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26889287 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 26889202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 37615424 - 37615143
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  37615424 ttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcata 37615325  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37615324 gcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcatgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 37615225  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37615224 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 37615143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 5221435 - 5221155
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5221435 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagt-taactccaaattattggacacatgttgttatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcata 5221337  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5221336 gcatctcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 5221237  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5221236 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgattaagatgccttgttgat 5221155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 10846358 - 10846639
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  10846358 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatattgataagtttattacaatgttttgttcatatgtgtccatgcata 10846457  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  10846458 gcatctcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacaattaaagtatattaata 10846557  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10846558 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 10846639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 10153809 - 10154090
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  10153809 ttaactaagtgcataagtataagatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcata 10153908  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10153909 gcatatcattgagcttagtcctcaccatgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 10154008  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10154009 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 10154090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 23704840 - 23705122
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataag-tatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| |||||    
T  23704840 ttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat 23704939  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23704940 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 23705039  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23705040 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 23705122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 23723296 - 23723578
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataag-tatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| |||||    
T  23723296 ttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat 23723395  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23723396 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 23723495  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23723496 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 23723578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 23741752 - 23742034
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataag-tatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| |||||    
T  23741752 ttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat 23741851  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23741852 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 23741951  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23741952 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 23742034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 6598750 - 6598469
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||  |||||| ||||||    
T  6598750 ttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgtttcgttcatgtgtgtccatgcata 6598651  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6598650 gcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaata 6598551  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6598550 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgat 6598469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 6605430 - 6605149
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||  |||||| ||||||    
T  6605430 ttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgtttcgttcatgtgtgtccatgcata 6605331  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6605330 gcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaata 6605231  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6605230 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgat 6605149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 10010314 - 10010033
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  10010314 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcata 10010215  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    ||||  |||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10010214 gcataacattgagctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 10010115  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10010114 cttatgatgacgattggtaccacatgcatatatggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 10010033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 16758645 - 16758926
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||| |||| | ||||||    
T  16758645 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattaggttgttttgttcatacgtgttcatgcata 16758744  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16758745 gcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 16758844  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16758845 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgat 16758926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 41201870 - 41202152
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataag-tatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| |||||    
T  41201870 ttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat 41201969  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41201970 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 41202069  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41202070 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtttaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 41202152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 10003667 - 10003386
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  10003667 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcata 10003568  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    ||||  |||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10003567 gcataacattgagctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 10003468  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10003467 cttatgatgacgattggtaccacatgcatatatggagtctaggagcattgtcacattatcatgattaagatgccttgttgat 10003386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 418031 - 417750
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||  |||| |||| |||||    
T  418031 ttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcat 417933  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  417932 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 417833  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  417832 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 417750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 20057479 - 20057760
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  20057479 ttaactaagtgcatatgtatatgataaggtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcat 20057577  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20057578 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 20057677  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20057678 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 20057760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 26794469 - 26794731
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  26794469 ttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatttgtgtccatgcata 26794568  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26794569 gcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 26794668  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26794669 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgccacattgtcatg 26794731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 10904257 - 10903976
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  10904257 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcata 10904158  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    ||||  |||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  10904157 gcataacattgagctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacggttaaagtatattaata 10904058  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10904057 cttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggaacattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 10903976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 10910929 - 10910648
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  10910929 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcata 10910830  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    ||||  |||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  10910829 gcataacattgagctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacggttaaagtatattaata 10910730  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10910729 cttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggaacattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 10910648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 16624129 - 16624410
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||    
T  16624129 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatgtgtgtccatgcata 16624228  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16624229 gcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcatgttttataggagccttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 16624328  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16624329 cttatgatgacgattggtaccacatgcatgtaaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 16624410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 16747913 - 16748194
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  16747913 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctctaaattattggatgcatgttgataagtcgattaggctgttttgttcatacgtgtccatgcata 16748012  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16748013 gcatatcattgagtttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacattttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 16748112  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16748113 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttgat 16748194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 3690650 - 3690365
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  3690650 ttaactaagtgcatatgtatatgataaggtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcat 3690552  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3690551 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 3690452  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3690451 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataagaagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 3690365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 13250750 - 13250469
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||  |||| |||| |||||    
T  13250750 ttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcat 13250652  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13250651 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 13250552  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13250551 acttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 13250469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 13257396 - 13257115
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||  |||| |||| |||||    
T  13257396 ttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcat 13257298  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13257297 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 13257198  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13257197 acttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 13257115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 14673275 - 14673556
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||  |||| |||| | |||    
T  14673275 ttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatacat 14673373  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14673374 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 14673473  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14673474 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 14673556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Original strand, 13316294 - 13316536
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtc 120  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  13316294 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtc 13316393  T
Q  121 ctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13316394 ctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 13316493  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13316494 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 13316536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 15727004 - 15727286
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataag-tatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||| |||| |||||    
T  15727004 ttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaaattattgtatgcatgttgacatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat 15727103  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  15727104 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacattttataggagctttgtcctccgcacaattaaagtatattaat 15727203  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15727204 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 15727286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 20064117 - 20064398
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  20064117 ttaactaagtgcatatgtatatgataaggtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcat 20064215  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20064216 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatatgaggagctttgtcctctgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 20064315  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20064316 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 20064398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 16489745 - 16490020
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  16489745 ttaactaagtgcataagtttatgatgaagt-tagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgtcataagtgtccatgcata 16489843  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    ||||||||||     ||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16489844 gcatctcatt-----tagtcctcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 16489938  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16489939 cttatgatgacgattggtaccacatgcatatagggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaaaatgccttgttgat 16490020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Original strand, 8721266 - 8721508
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtc 120  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8721266 atgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 8721365  T
Q  121 ctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8721366 ctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 8721465  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8721466 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 8721508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Original strand, 9073153 - 9073395
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtc 120  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9073153 atgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 9073252  T
Q  121 ctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9073253 ctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 9073352  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9073353 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 9073395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 15825661 - 15825419
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtc 120  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  15825661 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtc 15825562  T
Q  121 ctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15825561 ctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccacatgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 15825462  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15825461 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 15825419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 19809023 - 19808781
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtc 120  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  19809023 atgataaagtttagctccaaattattgaatgcatgttgatatgtcgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtc 19808924  T
Q  121 ctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19808923 ctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatgcttatgatgacgattggtac 19808824  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
     |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  19808823 cacatgcatataaggagtctaagagcatcgtcacattgtcatg 19808781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 22 - 263
Target Start/End: Original strand, 10236503 - 10236744
Alignment:
Q  22 tgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  10236503 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtcc 10236602  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacg 221  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10236603 tcaccacgattattaggagctttgtcctgcgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 10236702  T
Q  222 acatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10236703 acatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 10236744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Original strand, 410861 - 411103
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtc 120  Q
    ||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  410861 atgatgacgtttagctccaagttgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 410960  T
Q  121 ctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  410961 ctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 411060  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  411061 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 411103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Original strand, 1145662 - 1145904
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtc 120  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1145662 atgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 1145761  T
Q  121 ctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1145762 ctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 1145861  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
     ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  1145862 cacatgcatataaggagtttaagagcattgtcacattgtcatg 1145904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 22 - 263
Target Start/End: Original strand, 15992212 - 15992453
Alignment:
Q  22 tgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||    
T  15992212 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagtttagtcc 15992311  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacg 221  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15992312 tcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 15992411  T
Q  222 acatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  15992412 acatgcatataaggagtctaagtgcattgtcacattgtcatg 15992453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Original strand, 15343715 - 15343957
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtc 120  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15343715 atgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 15343814  T
Q  121 ctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15343815 ctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctctgcatgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 15343914  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15343915 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 15343957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Original strand, 15350359 - 15350601
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtc 120  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15350359 atgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 15350458  T
Q  121 ctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15350459 ctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 15350558  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
     ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  15350559 cacatgcatataaggagtctaatagcattgtcacattgtcatg 15350601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Original strand, 15404605 - 15404847
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtc 120  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15404605 atgatgacgtttagctccaaatttttggatgcatgtcgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 15404704  T
Q  121 ctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15404705 ctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgatttttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 15404804  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  15404805 cacatgaatataaggagtctaagagcattgtcatattgtcatg 15404847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 65 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16633797 - 16633580
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttatag 164  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16633797 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 16633698  T
Q  165 gagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 264  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16633697 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 16633598  T
Q  265 ttaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16633597 ttaagatgccttgttgat 16633580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 65 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16640407 - 16640190
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttatag 164  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16640407 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 16640308  T
Q  165 gagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 264  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16640307 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 16640208  T
Q  265 ttaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16640207 ttaagatgccttgttgat 16640190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 65 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 43161072 - 43160855
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttatag 164  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43161072 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 43160973  T
Q  165 gagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 264  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43160972 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 43160873  T
Q  265 ttaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||    
T  43160872 ttaagatgccttgttgat 43160855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 65 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 43167309 - 43167092
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttatag 164  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43167309 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 43167210  T
Q  165 gagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 264  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43167209 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 43167110  T
Q  265 ttaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||    
T  43167109 ttaagatgccttgttgat 43167092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Original strand, 15367040 - 15367282
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtc 120  Q
    ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15367040 atgatgacgtttagctccaaattgtaggatgcatgttgatatgttgattacgattttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 15367139  T
Q  121 ctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15367140 ctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattagtac 15367239  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15367240 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 15367282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 65 - 282
Target Start/End: Original strand, 1333220 - 1333437
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttatag 164  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1333220 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcataacattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 1333319  T
Q  165 gagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 264  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1333320 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 1333419  T
Q  265 ttaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||    
T  1333420 ttaagatgccttgttgat 1333437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 65 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 48423314 - 48423097
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttatag 164  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48423314 tgattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 48423215  T
Q  165 gagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 264  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48423214 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 48423115  T
Q  265 ttaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||    
T  48423114 ttaagatgccttgttgat 48423097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 65 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 48430092 - 48429875
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttatag 164  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48430092 tgattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacggaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 48429993  T
Q  165 gagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 264  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48429992 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 48429893  T
Q  265 ttaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||    
T  48429892 ttaagatgccttgttgat 48429875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 32 - 263
Target Start/End: Original strand, 17710712 - 17710943
Alignment:
Q  32 tagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  17710712 tagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcatatgagtccatgcatagcattccattgagcttagtcctcaccacgat 17710811  T
Q  132 tattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatat 231  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17710812 tattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 17710911  T
Q  232 aaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  17710912 aaagtgtctaagagcattgtcacattgtcatg 17710943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 4710296 - 4710054
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtc 120  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  4710296 atgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtc 4710197  T
Q  121 ctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
     |||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4710196 ttcaccacgtttattaggagctttgtcctctgcacgattattaggagttttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 4710097  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
     |||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  4710096 cacatgcatataaagagtctaagagcattgcaacattgtcatg 4710054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Original strand, 5150078 - 5150337
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| |||||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  5150078 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgacgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcc 5150176  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacg 221  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  5150177 tcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtacc 5150276  T
Q  222 acatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5150277 acatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgat 5150337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Original strand, 41092456 - 41092715
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  41092456 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcc 41092554  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacg 221  Q
    |||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41092555 tcaccacgtttattaggagccttgtcctccgcacgtttattaggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 41092654  T
Q  222 acatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41092655 acatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgat 41092715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 69 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 6608424 - 6608210
Alignment:
Q  69 tacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccac-aattattaggagctttttcctccgcacgttttataggag 167  Q
    ||||||||||||||   ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6608424 tacgatgttttgttataaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggag 6608325  T
Q  168 ttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgatta 267  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6608324 ctttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatatggagtctaggagcattgtcgcattgtcatgatta 6608225  T
Q  268 agatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||    
T  6608224 agatgccttgttgat 6608210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 15692350 - 15692570
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataag-tatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||| |||| |||||    
T  15692350 ttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaaattattgtatgcatgttgacatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat 15692449  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15692450 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 15692549  T
Q  200 acttatgatgacgattggtac 220  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15692550 acttatgatgacgattggtac 15692570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Original strand, 30777335 - 30777578
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttga-ttacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagt 119  Q
    ||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  30777335 atgatgacgtttagctccaagttgttggatgcatgttgatatgttgaattacgatgttttgttcatgagagtccatgcatagcatttcattgagcttagt 30777434  T
Q  120 cctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 219  Q
    |||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||| ||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30777435 cctcaccacgtttattagaagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 30777534  T
Q  220 cgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    | |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  30777535 ccacatgcatataaagtgtctaagagcattgtcacattgtcatg 30777578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 12891400 - 12891155
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagt 119  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12891400 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 12891302  T
Q  120 cctcaccacaatt-attaggagctttttcctccgcacgttttat-aggagttttgtcctccacacgatt-aaagtatattaatacttatgatgacgattg 216  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12891301 cctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattg 12891202  T
Q  217 gtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12891201 gtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 12891155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Original strand, 17253168 - 17253413
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagt 119  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17253168 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 17253266  T
Q  120 cctcaccacaatt-attaggagctttttcctccgcacgttttat-aggagttttgtcctccacacgatt-aaagtatattaatacttatgatgacgattg 216  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17253267 cctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattg 17253366  T
Q  217 gtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17253367 gtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 17253413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 13320970 - 13320726
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagt 119  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13320970 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 13320872  T
Q  120 cctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttat-aggagttttgtcctccacacgatt-aaagtatattaatacttatgatgacgattgg 217  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||   |||| ||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13320871 cctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacaacttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 13320772  T
Q  218 tacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13320771 taccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 13320726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 65 - 263
Target Start/End: Original strand, 15584871 - 15585069
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttatag 164  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15584871 tgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 15584970  T
Q  165 gagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15584971 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 15585069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 65 - 263
Target Start/End: Original strand, 15591529 - 15591727
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttatag 164  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15591529 tgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 15591628  T
Q  165 gagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15591629 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 15591727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 7985699 - 7985458
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  ||||| ||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  7985699 gatgacgtttagctccaaattattgggtgcatgttgatatgatgattacggtgaattgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 7985601  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttat-aggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7985600 tcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttttgatgacgattggtac 7985501  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  7985500 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 7985458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 65 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 12482384 - 12482162
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt-attaggagctttttcctccgcacgttttata 163  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||| ||  ||    
T  12482384 tgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatta 12482285  T
Q  164 ggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12482284 ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 12482185  T
Q  264 attaagatgccttgttgatgatg 286  Q
      ||  |||| ||||||||||||    
T  12482184 tctattatgctttgttgatgatg 12482162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 23 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 10325844 - 10325604
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||| ||| | || | ||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  10325844 gatgacgtttagctccaaattattggatgcttattgatatgatgattacgattttttgttgata-gagttcatgcattagcat-tcattgagtttagtcc 10325747  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttat-aggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10325746 tcaccacgattattaggagctttgtcctccacacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 10325647  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  10325646 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 10325604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 65 - 263
Target Start/End: Original strand, 5420456 - 5420655
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt-attaggagctttttcctccgcacgttttata 163  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||  ||    
T  5420456 tgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatatcatatcattgagcttagtcctcaccacattttattaggagctttgtcctccgcacgattatta 5420555  T
Q  164 ggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5420556 ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacactgtcatg 5420655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 65 - 263
Target Start/End: Original strand, 5426863 - 5427062
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt-attaggagctttttcctccgcacgttttata 163  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||| ||  ||    
T  5426863 tgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatta 5426962  T
Q  164 ggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5426963 ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacactgtcatg 5427062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 16333165 - 16332935
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  ||||| ||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16333165 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacggtgaattgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 16333067  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttat-aggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16333066 tcaccacgattatcaggagttttgtcctccgcatgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 16332967  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtc 252  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16332966 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtc 16332935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 65 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 5201182 - 5200960
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt-attaggagctttttcctccgcacgttttata 163  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||| ||  ||    
T  5201182 tgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatta 5201083  T
Q  164 ggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5201082 ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatgtttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacagagtctaggagcattgtcacattgtcatg 5200983  T
Q  264 attaagatgccttgttgatgatg 286  Q
      ||  |||| ||||||||||||    
T  5200982 tctattatgctttgttgatgatg 5200960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 23 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 55148973 - 55148715
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  55148973 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 55148876  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacg 221  Q
    ||||||  ||    ||||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  55148875 tcaccatgat----aggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 55148780  T
Q  222 acatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||  ||||||||  ||||| |||||    
T  55148779 atatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatg 55148715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 23 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 20722996 - 20722772
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20722996 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 20722899  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacg 221  Q
    ||||||  ||    ||||||||| ||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20722898 tcaccatgat----aggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccacacatttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 20722803  T
Q  222 acatgcatataaggagtctaggagcattgtc 252  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20722802 acatgcatataaggagtctaagagcattgtc 20722772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 24187772 - 24187514
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  24187772 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 24187675  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacg 221  Q
    ||||||  ||    ||||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  24187674 tcaccatgat----aggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcaagtttaaagtatattaacacttatgatgacgattggtacc 24187579  T
Q  222 acatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||  ||||||||  ||||| |||||    
T  24187578 acatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatg 24187514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Original strand, 22643426 - 22643560
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtc 120  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22643426 atgatgaagt-tagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcatacgagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 22643524  T
Q  121 ctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacg 156  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  22643525 ctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacg 22643560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 26788879 - 26789034
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  26788879 ttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcata 26788978  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacg 156  Q
    |||| | |||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| |||||||||||    
T  26788979 gcatattattgagcttagttctcaccacgtatattaggagctttgtcctccgcacg 26789034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 7109464 - 7109247
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  7109464 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 7109365  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7109364 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 7109270  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  7109269 gattggtaccacatgcatataag 7109247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 7113399 - 7113182
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  7113399 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 7113300  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7113299 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 7113205  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  7113204 gattggtaccacatgcatataag 7113182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 27409985 - 27410202
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  27409985 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 27410084  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27410085 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 27410179  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  27410180 gattggtaccacatgcatataag 27410202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 55022633 - 55022416
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  55022633 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 55022534  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  55022533 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 55022439  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  55022438 gattggtaccacatgcatataag 55022416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 30065716 - 30065500
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttt---------tgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||         ||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  30065716 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgtcttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 30065617  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30065616 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagttttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 30065522  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataa 233  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  30065521 gattggtaccacatgcatataa 30065500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 839242 - 838983
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| || |||||| ||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  839242 gatgacgtttagctccaaattattggatgcacattgatatgatgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagca-ctcattgagcttagtcc 839144  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacg 221  Q
    ||||||| ||    ||||| ||| ||||||| ||| ||  |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  839143 tcaccacgat----aggagttttgtcctccgtacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattgatacc 839048  T
Q  222 acatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||| ||  ||||||||  ||||| |||||    
T  839047 acatgcatataagaattctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatg 838983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 4107740 - 4107957
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  4107740 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatattgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 4107839  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4107840 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 4107934  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  4107935 gattggtaccacatgcatataag 4107957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 4111592 - 4111809
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  4111592 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatattgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 4111691  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4111692 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 4111786  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  4111787 gattggtaccacatgcatataag 4111809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 11069836 - 11069619
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  11069836 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 11069737  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  11069736 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacctatgatgac 11069642  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  11069641 gattggtaccacatgcatataag 11069619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 11165870 - 11166087
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  11165870 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 11165969  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11165970 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcatccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 11166064  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  11166065 gattggtaccacatgcatataag 11166087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28949490 - 28949273
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  28949490 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 28949391  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    ||||| ||||||||||   | |||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  28949390 agctttgtcctcacca---tgattaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgaaaaaagtatattaatacttatgatgac 28949296  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  28949295 gattggtaccacatgcatataag 28949273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Original strand, 15398014 - 15398149
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtc 120  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15398014 atgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgtcgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 15398113  T
Q  121 ctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacg 156  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  15398114 ctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacg 15398149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 32 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15617131 - 15616925
Alignment:
Q  32 tagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcct 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  15617131 tagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcct 15617032  T
Q  123 caccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacga 222  Q
    |||||| ||||   |||||||| ||||||||||| ||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15617031 caccacgatta---ggagctttgtcctccgcacggttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacca 15616937  T
Q  223 catgcatataag 234  Q
    ||||||||||||    
T  15616936 catgcatataag 15616925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14499093 - 14498876
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  14499093 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattatgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 14498994  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||| |||||||||| |||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14498993 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacatttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 14498899  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  14498898 gattggtaccacatgcatataag 14498876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 138 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 15337338 - 15337213
Alignment:
Q  138 gagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggag 237  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15337338 gagctttgtcctccgcacgatttttaggagttttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggag 15337239  T
Q  238 tctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||    
T  15337238 tctaagagcattgtcatattgtcatg 15337213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22321432 - 22321215
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  22321432 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 22321333  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||| |||||||||||||||   |||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  22321332 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgttttg--ggagctttgtcctccgcacgataaaaatatattaatacttatgatgac 22321238  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  22321237 gattggtaccacatgcatataag 22321215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22336487 - 22336270
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  22336487 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 22336388  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||| |||||||||||||||   |||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  22336387 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgttttg--ggagctttgtcctccgcacgataaaaatatattaatacttatgatgac 22336293  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  22336292 gattggtaccacatgcatataag 22336270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 162 - 282
Target Start/End: Original strand, 22643539 - 22643659
Alignment:
Q  162 taggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtca 261  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  22643539 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcgtataaggagtctaagagcattgtcgcattgtca 22643638  T
Q  262 tgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  22643639 tgattaagatgccttgttgat 22643659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Original strand, 16750684 - 16750899
Alignment:
Q  22 tgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattga 112  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| |||||||    
T  16750684 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga 16750783  T
Q  113 gcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacg 212  Q
    |||| |||||||||||     ||||||||||| ||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16750784 gctttgtcctcaccac---gtttaggagctttgtcctccgcacgat---taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacg 16750877  T
Q  213 attggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  16750878 attggtaccacatgcatataag 16750899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 162 - 263
Target Start/End: Original strand, 26789013 - 26789114
Alignment:
Q  162 taggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtca 261  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26789013 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtca 26789112  T
Q  262 tg 263  Q
    ||    
T  26789113 tg 26789114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 138 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 15360596 - 15360481
Alignment:
Q  138 gagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggag 237  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15360596 gagctttgtcctccgcacgatttttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggag 15360497  T
Q  238 tctaggagcattgtca 253  Q
    |||| |||||||||||    
T  15360496 tctaagagcattgtca 15360481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 15360686 - 15360551
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtc 120  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  15360686 atgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgtcgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagctttgtc 15360587  T
Q  121 ctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacg 156  Q
    |||  ||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15360586 ctccgcacgatttttaggagctttgtcctccgcacg 15360551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 141 - 286
Target Start/End: Original strand, 28368673 - 28368819
Alignment:
Q  141 ctttttcctccgcacgttttat-aggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtc 239  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28368673 ctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtc 28368772  T
Q  240 taggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    || |||||||||| ||||||| ||  ||||||||  ||||| |||||    
T  28368773 taagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatg 28368819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 141 - 286
Target Start/End: Original strand, 28376491 - 28376637
Alignment:
Q  141 ctttttcctccgcacgttttat-aggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtc 239  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28376491 ctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtc 28376590  T
Q  240 taggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    || |||||||||| ||||||| ||  ||||||||  ||||| |||||    
T  28376591 taagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatg 28376637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 141 - 286
Target Start/End: Original strand, 28384313 - 28384459
Alignment:
Q  141 ctttttcctccgcacgttttat-aggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtc 239  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28384313 ctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtc 28384412  T
Q  240 taggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    || |||||||||| ||||||| ||  ||||||||  ||||| |||||    
T  28384413 taagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatg 28384459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 169 - 263
Target Start/End: Original strand, 29695943 - 29696037
Alignment:
Q  169 tttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29695943 tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 29696037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 32 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 15337417 - 15337293
Alignment:
Q  32 tagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaat 131  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||    
T  15337417 tagctccaaattgttggatgcatgtcgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagctttgtcctccgcacgat 15337318  T
Q  132 tattaggagctttttcctccgcacg 156  Q
    | ||||||| ||| |||||||||||    
T  15337317 ttttaggagttttgtcctccgcacg 15337293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 153 - 263
Target Start/End: Original strand, 15398119 - 15398229
Alignment:
Q  153 cacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtc 252  Q
    |||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15398119 cacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacaattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtc 15398218  T
Q  253 acattgtcatg 263  Q
    | |||||||||    
T  15398219 atattgtcatg 15398229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 3833675 - 3833482
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||| |||||||| |||||||||||  || | |||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||   |     
T  3833675 ctccaaattattggatgtatatgtgataggttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattaacat-tcattgagctttgtcctcacca---tg 3833581  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3833580 attaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 3833484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 38814385 - 38814192
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||| |||||||| |||||||||||  || | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  38814385 ctccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacgatt 38814288  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
    |   |||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38814287 a---ggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcatgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 38814194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15964617 - 15964495
Alignment:
Q  106 tcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttat 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||| ||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15964617 tcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 15964524  T
Q  206 gatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15964523 gatgacgattggtaccacatgcatataag 15964495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15968541 - 15968419
Alignment:
Q  106 tcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttat 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||| ||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15968541 tcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 15968448  T
Q  206 gatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15968447 gatgacgattggtaccacatgcatataag 15968419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15972465 - 15972343
Alignment:
Q  106 tcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttat 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||| ||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15972465 tcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 15972372  T
Q  206 gatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15972371 gatgacgattggtaccacatgcatataag 15972343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 134 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16696690 - 16696593
Alignment:
Q  134 ttaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataa 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16696690 ttaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccacacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 16696594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Original strand, 1598584 - 1598777
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||| |||||||| |||||||| ||  || | |||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  1598584 ctccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaagatgttttattgtta-gagtccatgcattagcgt-tcattgagctttgtcctcaccacgatt 1598681  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
    |   |||||||| |||||| |||||||   ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1598682 a---ggagctttgtcctcctcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 1598775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 5223065 - 5222873
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||| | ||| ||||| ||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||   |     
T  5223065 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcacca---tg 5222971  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
    |||||||||||| |||||||||||    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  5222970 attaggagctttgtcctccgcacg----ataggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgatgattggtaccacatgcatata 5222875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 133 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19775217 - 19775118
Alignment:
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19775217 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacaatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 19775120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 135 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15464746 - 15464650
Alignment:
Q  135 taggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15464746 taggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 15464650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Original strand, 15942009 - 15942202
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| | ||||||| |  || | || | ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  15942009 ctccaaattattggatgtatgtgtgataagttgattaagttgttttgctgtta-gagttcatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacgatt 15942106  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
    |   |||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  15942107 a---ggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgataaagattggtaccacatgcatata 15942200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 145
Target Start/End: Original strand, 28351277 - 28351399
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgca-tagcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  ||||| ||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  28351277 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacggtgaattgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 28351375  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttt 145  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  28351376 tcaccacgattattaggagctttt 28351399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 135 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12339347 - 12339251
Alignment:
Q  135 taggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||   || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12339347 taggagctttgtcctccgcacgatt---agcagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 12339251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Original strand, 4589399 - 4589471
Alignment:
Q  162 taggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4589399 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 4589471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Original strand, 37440123 - 37440195
Alignment:
Q  162 taggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37440123 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 37440195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17241972 - 17241782
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||| |||||||||||  | |  |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    |    
T  17241972 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgtttaa-gtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcacca----t 17241879  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
     || |||||||| |||||| ||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17241878 gttcggagctttgtcctccacacg----ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatata 17241784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 217 - 282
Target Start/End: Original strand, 15711579 - 15711644
Alignment:
Q  217 gtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15711579 gtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 15711644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 135 - 234
Target Start/End: Original strand, 16809082 - 16809177
Alignment:
Q  135 taggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||||||| |||||| |||||||   ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16809082 taggagctttgtcctccacacgttt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatataag 16809177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 138 - 234
Target Start/End: Original strand, 8489652 - 8489745
Alignment:
Q  138 gagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  8489652 gagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattgataccacatgcatataag 8489745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 164 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15482542 - 15482473
Alignment:
Q  164 ggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15482542 ggagctttgtcctccccacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatataag 15482473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 230
Target Start/End: Original strand, 31097779 - 31097847
Alignment:
Q  161 ataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcata 230  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  31097779 ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgaagattggtaccacatgcata 31097847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 135 - 220
Target Start/End: Original strand, 16798255 - 16798336
Alignment:
Q  135 taggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    |||||||||| |||||| |||||||   ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16798255 taggagctttgtcctccacacgttt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtac 16798336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Original strand, 11300871 - 11301017
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||    
T  11300871 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgataagagtccatgcattagcat-tcactgagcttagtcctcaccacgatt 11300969  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacg 183  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||    
T  11300970 attaggagttttgtcctccgcacgat---taggagctttgtcctccgcacg 11301017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 19775358 - 19775243
Alignment:
Q  22 tgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattga 112  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| |||||||    
T  19775358 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga 19775259  T
Q  113 gcttagtcctcaccac 128  Q
    |||| |||||||||||    
T  19775258 gctttgtcctcaccac 19775243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 156
Target Start/End: Original strand, 4589289 - 4589420
Alignment:
Q  22 tgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacga-tgttttgttcataagtgtccttgca-tagcatctcattgagcttagt 119  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| || || |||| |||| |||||| ||||||||||| ||    
T  4589289 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgaatacgattgttttgttgat-agagtccatgcattagcat-tcattgagctttgt 4589386  T
Q  120 cctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacg 156  Q
    |||| ||||    |||||||||||| |||||||||||    
T  4589387 cctccccac---gattaggagctttgtcctccgcacg 4589420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 4290979 - 4290920
Alignment:
Q  204 atgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  4290979 atgatgacgattggcaccacatgcatataaagtgtctaagagcattgtcacattgtcatg 4290920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 234
Target Start/End: Original strand, 7793586 - 7793658
Alignment:
Q  164 ggagttttgtcctccacacgat---taaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||| |||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  7793586 ggagctttgtcctccccacgatgcttaaagtatattaatact-atgataacgattggtaccacatgcatataag 7793658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 11854429 - 11854332
Alignment:
Q  78 ttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcct 176  Q
    ||||| ||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||| |||||||||||||   |||||| ||||||||    
T  11854429 ttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgacgattagcagctttatcctccgcacgtt---taggagctttgtcct 11854334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 234
Target Start/End: Original strand, 20461736 - 20461808
Alignment:
Q  164 ggagttttgtcctccacacgat---taaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||| |||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  20461736 ggagctttgtcctccccacgatgcgtaaagtatattaatact-atgatgacgattgataccacatgcatataag 20461808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 234
Target Start/End: Original strand, 327428 - 327473
Alignment:
Q  188 aagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  327428 aagtatattaatactt-tgatgacgattggtaccacatgcatataag 327473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14665247 - 14665202
Alignment:
Q  188 aagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14665247 aagtatattaatactt-tgatgacgattggtaccacatgcatataag 14665202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14668403 - 14668358
Alignment:
Q  188 aagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14668403 aagtatattaatactt-tgatgacgattggtaccacatgcatataag 14668358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 12339396 - 12339322
Alignment:
Q  106 tcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgatta 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||   | |||||||||||| |||||||||||    ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  12339396 tcattgagctttgtcctcacca---tgattaggagctttgtcctccgcacg----ataggagctttgtcctccgcacgatta 12339322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14572431 - 14572385
Alignment:
Q  188 aagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||    
T  14572431 aagtatattaatacttattacgatgattggtaccacatgcatataag 14572385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 70
Target Start/End: Original strand, 11557505 - 11557542
Alignment:
Q  33 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 70  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  11557505 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 11557542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 70
Target Start/End: Original strand, 11595259 - 11595296
Alignment:
Q  33 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 70  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  11595259 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 11595296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 42325938 - 42325901
Alignment:
Q  33 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 70  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  42325938 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 42325901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 234
Target Start/End: Original strand, 2898058 - 2898131
Alignment:
Q  164 ggagttttgtcctccacacgat---taaagtatattaatacttatgatgacg-attggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||| |||||||||| ||||||   |||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  2898058 ggagctttgtcctccccacgatgcttaaagtatattaatac-tatgatgaagtattggtaccacatgcatataag 2898131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 234
Target Start/End: Original strand, 14577112 - 14577156
Alignment:
Q  190 gtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||    
T  14577112 gtatattaatacttattacgatgattggtaccacatgcatataag 14577156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 9891 - 10172
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  9891 ttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcata 9990  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9991 gcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 10090  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10091 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgccacattgtcatgattaagatgccttgttgat 10172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 58)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 20216003 - 20216287
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  20216003 ttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcata 20216101  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20216102 gcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 20216201  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20216202 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 20216287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 18600181 - 18600462
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttt-gttcataagtgtccttgcat 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  18600181 ttaactaagtgcataagtttatgatgaagt-tagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttcataagtgtccatgcat 18600279  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18600280 agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 18600379  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18600380 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 18600462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 41478653 - 41478938
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttt-gttcataagtgtccttgcat 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  41478653 ttaactaagtgcataagtttatgatgaagt-tagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttcataagtgtccatgcat 41478751  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41478752 agcatctcattgagcttagtcctcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 41478851  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41478852 acttatgatgacgattggtaccacatgcatatagggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgtcttgttgatgatg 41478938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 44844959 - 44845244
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  44844959 ttaactaagtgcataagtctatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccgtgcata 44845058  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44845059 gcatatcattgagctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttacaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 44845158  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44845159 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagataccttgttgatgatg 44845244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 47659244 - 47658963
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  47659244 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcata 47659145  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    ||||  |||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47659144 gcataacattgagctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 47659045  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47659044 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 47658963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 21828744 - 21828463
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||| |||| ||||||    
T  21828744 ttaactaagtgcatatgtatatgatgaattttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggcgttttgttgttaagagtccatgcata 21828645  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21828644 acatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 21828545  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21828544 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 21828463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 41348927 - 41349208
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  41348927 ttaactaagtgcatatgtatatgataaggtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcat 41349025  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41349026 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 41349125  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41349126 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 41349208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 16345850 - 16346135
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  16345850 ttaactaagtgcatatgtatatgataaggtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcat 16345948  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16345949 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 16346048  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16346049 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataagaagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 16346135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 41356364 - 41356645
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  41356364 ttaactaagtgcatatgtatatgataaggtttagcttcaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcat 41356462  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41356463 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 41356562  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41356563 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 41356645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 51328754 - 51329035
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||  |||| |||| |||||    
T  51328754 ttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcat 51328852  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51328853 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 51328952  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51328953 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 51329035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 51335388 - 51335669
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||  |||| |||| |||||    
T  51335388 ttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcat 51335486  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51335487 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 51335586  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51335587 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 51335669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 16352498 - 16352784
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  16352498 ttaactaagtgcatatgtatatgataaggtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcat 16352596  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattatta-ggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaa 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16352597 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaa 16352696  T
Q  199 tacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16352697 tacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagaagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 16352784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Original strand, 21807311 - 21807553
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtc 120  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21807311 atgatgatgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 21807410  T
Q  121 ctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21807411 ctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 21807510  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21807511 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 21807553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 21835361 - 21835119
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtc 120  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21835361 atgatgatgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 21835262  T
Q  121 ctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21835261 ctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 21835162  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21835161 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 21835119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Original strand, 33386334 - 33386576
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtc 120  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33386334 atgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 33386433  T
Q  121 ctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33386434 ctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 33386533  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33386534 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 33386576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Original strand, 33392979 - 33393221
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtc 120  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33392979 atgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 33393078  T
Q  121 ctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33393079 ctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 33393178  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33393179 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 33393221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 65 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 43078385 - 43078168
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttatag 164  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43078385 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 43078286  T
Q  165 gagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 264  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43078285 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 43078186  T
Q  265 ttaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||    
T  43078185 ttaagatgccttgttgat 43078168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 65 - 282
Target Start/End: Original strand, 46157481 - 46157698
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttatag 164  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46157481 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 46157580  T
Q  165 gagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 264  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46157581 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 46157680  T
Q  265 ttaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||    
T  46157681 ttaagatgccttgttgat 46157698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 8305138 - 8304894
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagt 119  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8305138 atgatgacgtttaggtccaaattattggatgcatattgatatgttgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 8305040  T
Q  120 cctcaccacaatt-attaggagctttttcctccgcacgttttat-aggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 217  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8305039 cctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagttttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 8304940  T
Q  218 tacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8304939 taccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcgcattgtcatg 8304894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Original strand, 50887864 - 50888109
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagt 119  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  50887864 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 50887962  T
Q  120 cctcaccacaatt-attaggagctttttcctccgcacgttttat-aggagttttgtcctccacacgatt-aaagtatattaatacttatgatgacgattg 216  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50887963 cctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattg 50888062  T
Q  217 gtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50888063 gtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 50888109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 19111402 - 19111138
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||| ||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19111402 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 19111304  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttat-aggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19111303 tcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 19111204  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||  ||||||||  ||||| |||||    
T  19111203 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgtattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatg 19111138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19104745 - 19104507
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||| ||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19104745 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 19104647  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttat-aggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19104646 tcaccacggttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 19104547  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtc 260  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  19104546 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtc 19104507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 263
Target Start/End: Original strand, 20525328 - 20525569
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||   |||||||||  |||  |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20525328 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattattgtgttttgttgttaatagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 20525426  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttat-aggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20525427 tcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 20525526  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  20525527 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 20525569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 65 - 286
Target Start/End: Original strand, 27898810 - 27899032
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt-attaggagctttttcctccgcacgttttata 163  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||| ||  ||    
T  27898810 tgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatta 27898909  T
Q  164 ggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27898910 ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 27899009  T
Q  264 attaagatgccttgttgatgatg 286  Q
      ||  |||| ||||||||||||    
T  27899010 tctattatgctttgttgatgatg 27899032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 65 - 286
Target Start/End: Original strand, 43063427 - 43063649
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt-attaggagctttttcctccgcacgttttata 163  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||| ||  ||    
T  43063427 tgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatta 43063526  T
Q  164 ggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43063527 ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 43063626  T
Q  264 attaagatgccttgttgatgatg 286  Q
      ||  |||| ||||||||||||    
T  43063627 tctattatgctttgttgatgatg 43063649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 65 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 44756060 - 44755838
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt-attaggagctttttcctccgcacgttttata 163  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||| ||  ||    
T  44756060 tgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatta 44755961  T
Q  164 ggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44755960 ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 44755861  T
Q  264 attaagatgccttgttgatgatg 286  Q
      ||  |||| ||||||||||||    
T  44755860 tctattatgctttgttgatgatg 44755838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 65 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 49334527 - 49334305
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt-attaggagctttttcctccgcacgttttata 163  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||| ||  ||    
T  49334527 tgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatta 49334428  T
Q  164 ggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49334427 ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 49334328  T
Q  264 attaagatgccttgttgatgatg 286  Q
      ||  |||| ||||||||||||    
T  49334327 tctattatgctttgttgatgatg 49334305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 60 - 286
Target Start/End: Original strand, 18626430 - 18626657
Alignment:
Q  60 tatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt-attaggagctttttcctccgcacgtt 158  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||| |    
T  18626430 tatgatgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgat 18626529  T
Q  159 ttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattg 258  Q
    |  |||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18626530 tattaggagctttgtcctccgcatgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattg 18626629  T
Q  259 tcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    |||||  ||  |||| ||||||||||||    
T  18626630 tcatgtctattatgctttgttgatgatg 18626657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 67 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 33385023 - 33384803
Alignment:
Q  67 attacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt-attaggagctttttcctccgcacgttttatagg 165  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||| ||  ||||    
T  33385023 attacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattattagg 33384924  T
Q  166 agttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgat 265  Q
    || ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  33384923 agctttatcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtc 33384824  T
Q  266 taagatgccttgttgatgatg 286  Q
    ||  |||| ||||||||||||    
T  33384823 tattatgctttgttgatgatg 33384803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 23763206 - 23762948
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  23763206 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 23763109  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacg 221  Q
    ||||||  ||    ||||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23763108 tcaccatgat----aggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 23763013  T
Q  222 acatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||  ||||||||  ||||| |||||    
T  23763012 acatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatg 23762948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1010488 - 1010271
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  1010488 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 1010389  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1010388 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 1010294  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  1010293 gattggtaccacatgcatataag 1010271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 52639306 - 52639089
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  52639306 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 52639207  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52639206 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 52639112  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  52639111 gattggtaccacatgcatataag 52639089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21407120 - 21406904
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  21407120 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 21407021  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||| ||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21407020 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 21406927  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  21406926 gattggtaccacatgcatataag 21406904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 16375798 - 16376016
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagc-atctcatt 110  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||| || |||||    
T  16375798 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagctatttcatt 16375897  T
Q  111 gagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatga 210  Q
    |||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16375898 gagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatga 16375992  T
Q  211 cgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  16375993 cgattggtaccacatgcatataag 16376016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 180 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 21844139 - 21844037
Alignment:
Q  180 cacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgtt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21844139 cacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgtt 21844040  T
Q  280 gat 282  Q
    |||    
T  21844039 gat 21844037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 21844257 - 21844140
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||| |||| ||||||    
T  21844257 ttaactaagtgcatatgtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggcgttttgttgttaagagtccatgcata 21844158  T
Q  101 gcatctcattgagcttag 118  Q
    |||| |||||||||||||    
T  21844157 gcatatcattgagcttag 21844140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 133 - 234
Target Start/End: Original strand, 41388478 - 41388577
Alignment:
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41388478 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 41388575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Original strand, 1925519 - 1925712
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||| | ||| ||||| ||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  1925519 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacgatt 1925616  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
    |   |||||||| ||||||||||| ||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1925617 a---ggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 1925710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Original strand, 20924533 - 20924726
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||| | ||| ||||| ||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  20924533 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacgatt 20924630  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
    |   |||||||| ||||||||||| ||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20924631 a---ggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 20924724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 133 - 233
Target Start/End: Original strand, 20229466 - 20229564
Alignment:
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20229466 attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatatcaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 20229563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 134 - 234
Target Start/End: Original strand, 39244380 - 39244477
Alignment:
Q  134 ttaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataa 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||   ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39244380 ttaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 39244476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 134 - 234
Target Start/End: Original strand, 39247935 - 39248032
Alignment:
Q  134 ttaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataa 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||   ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39247935 ttaggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 39248031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 135 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20137988 - 20137892
Alignment:
Q  135 taggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||||||| |||||| |||||||   ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20137988 taggagctttgtcctccacacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 20137892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 135 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 33797163 - 33797067
Alignment:
Q  135 taggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  33797163 taggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgaagattggtaccacatgcatataag 33797067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 161 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19211749 - 19211677
Alignment:
Q  161 ataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19211749 ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatataag 19211677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 161
Target Start/End: Original strand, 39244237 - 39244382
Alignment:
Q  22 tgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattga 112  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| |||||||    
T  39244237 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga 39244336  T
Q  113 gcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgtttta 161  Q
    |||| |||||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39244337 gctttgtcctcaccac---gattaggagctttgtcctccgcacgtttta 39244382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 161
Target Start/End: Original strand, 39247792 - 39247937
Alignment:
Q  22 tgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattga 112  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| |||||||    
T  39247792 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga 39247891  T
Q  113 gcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgtttta 161  Q
    |||| |||||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39247892 gctttgtcctcaccac---gattaggagctttgtcctccgcacgtttta 39247937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 46975371 - 46975299
Alignment:
Q  162 taggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46975371 taggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattcatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 46975299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12646870 - 12646680
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||| |||||||||||  | |  |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    |    
T  12646870 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgtttaa-gtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcacca----t 12646777  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
     || |||||||| |||||| ||||    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  12646776 gttcggagctttgtcctccacacg----ataggagctttttcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggaaccacatgcatata 12646682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18882273 - 18882200
Alignment:
Q  161 ataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18882273 ataggagctttgtcctccgcacgatgaaagtgtattaatacttttgatgacgattggtactacatgcatataag 18882200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 21437789 - 21437686
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgca-tagcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| || || |||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  21437789 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgatttgttgat-agagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 21437692  T
Q  122 tcacca 127  Q
    ||||||    
T  21437691 tcacca 21437686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 164 - 234
Target Start/End: Original strand, 36819536 - 36819605
Alignment:
Q  164 ggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  36819536 ggagctttgtcctccccacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattgataccacatgcatataag 36819605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 128
Target Start/End: Original strand, 41388337 - 41388452
Alignment:
Q  22 tgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacga---------tgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattga 112  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||         |||||||||  |||| |||| |||||||||| |||||||    
T  41388337 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga 41388436  T
Q  113 gcttagtcctcaccac 128  Q
    |||| |||||||||||    
T  41388437 gctttgtcctcaccac 41388452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21172882 - 21172810
Alignment:
Q  164 ggagttttgtcctccacacgat---taaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||| |||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21172882 ggagctttgtcctccccacgatgcttaaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataag 21172810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21312998 - 21312926
Alignment:
Q  164 ggagttttgtcctccacacgat---taaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||| |||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21312998 ggagctttgtcctccccacgatgcttaaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataag 21312926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 234
Target Start/End: Original strand, 16080645 - 16080712
Alignment:
Q  164 ggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16080645 ggagctttgtcctcc-cacgat-aaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataag 16080712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 128
Target Start/End: Original strand, 20229335 - 20229440
Alignment:
Q  32 tagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacga---------tgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcct 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||         |||||||||  |||| |||| ||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  20229335 tagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcttagcatttcattgagctttgtcct 20229434  T
Q  123 caccac 128  Q
    ||||||    
T  20229435 caccac 20229440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 70
Target Start/End: Original strand, 18394085 - 18394122
Alignment:
Q  33 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 70  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  18394085 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 18394122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 67539 - 67259
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  67539 ttaactaagtgcataattatatgacgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgt-catatgtgtccatgcata 67441  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  67440 gcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 67341  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67340 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 67259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 7001 - 6759
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtc 120  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  7001 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcataacatttcattgagcttagtc 6902  T
Q  121 ctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6901 ctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagccttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 6802  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  6801 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattatcatg 6759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 13526 - 13284
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtc 120  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  13526 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtc 13427  T
Q  121 ctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13426 ctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagccttgtcctctgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 13327  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  13326 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattatcatg 13284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 23054 - 22812
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtc 120  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  23054 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgtccataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtc 22955  T
Q  121 ctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22954 ctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagccttgtcctctgcacgattaaagtatattaatatttatgatgacgattggtac 22855  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  22854 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattatcatg 22812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 35 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 57027 - 56780
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaatta 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||  |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||    
T  57027 ctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttta 56929  T
Q  134 ttaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataa 233  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  56928 ttaggagctttgtcctccgcatgtttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 56829  T
Q  234 ggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  56828 ggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgat 56780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 35 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 41520 - 41273
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaatta 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||  | || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||    
T  41520 ctccaaattattggatgcatgttgattaggatgattacg-tgttttgttgtttagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttta 41422  T
Q  134 ttaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataa 233  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41421 ttaggagctttgtcctccgcatgtttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 41322  T
Q  234 ggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41321 ggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgat 41273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 59060 - 59277
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||| | ||||||    
T  59060 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcttttcattg 59159  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  59160 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaaatatattaatacttatgatgac 59254  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||  |||||||||||||    
T  59255 gattggtatcacatgcatataag 59277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 6)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 30558 - 30276
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaa-ttattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  30558 ttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaaattattggatgcatgttgataagttgatcacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat 30459  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30458 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 30359  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30358 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccctgttgat 30276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 72973 - 73235
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  72973 ttaactaagtgcataatcatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcata 73072  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  73073 gcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 73172  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73173 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 73235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 8092 - 7810
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataag-tatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| |||||    
T  8092 ttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat 7993  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7992 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 7893  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7892 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataagaagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 7810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 62191 - 62068
Alignment:
Q  106 tcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttat 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||   | |||||||||||| |||||| |||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  62191 tcattgagctttgtcctcacca---tgattaggagctttgtcctccacacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 62097  T
Q  206 gatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  62096 gatgacgattggtaccacatgcatataag 62068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #5
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12904 - 12714
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||| ||||||||| ||||||||||| ||| | |||| ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| |||    
T  12904 ctccaaattattggatgtataagtgatttgttgattaagatgttttgttgata-gagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgatt 12807  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
         ||||||| |||||  |||| ||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  12806 t----gagctttgtcctcaccacgatt----ggagttttgtcctccccacgattaaagtatattaatac-tatgatgatgattggtaccacatgcatata 12716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #6
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19188 - 18998
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||| ||||||||| ||||||||||| ||| | |||| ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| |||    
T  19188 ctccaaattattggatgtataagtgatttgttgattaagatgttttgttgata-gagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgatt 19091  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
         ||||||| |||||  |||| ||    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  19090 t----gagctttgtcctcaccacgatt----ggagctttgtcctccccacgattaaagtatattaatac-tatgatgatgattggtaccacatgcatata 19000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 307129 - 306847
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataag-tatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| |||||    
T  307129 ttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat 307030  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  307029 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 306930  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  306929 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 306847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 5)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 20 - 282
Target Start/End: Original strand, 105980 - 106242
Alignment:
Q  20 tatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagt 119  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  105980 tatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagt 106079  T
Q  120 cctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 219  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  106080 cctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggaa 106179  T
Q  220 cgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  106180 ctacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgcgttgttgat 106242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 20 - 282
Target Start/End: Original strand, 126215 - 126476
Alignment:
Q  20 tatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagt 119  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  126215 tatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagaccatgcatagcatctcattgagcttagt 126314  T
Q  120 cctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 219  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  126315 ccttaccaca-ttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 126413  T
Q  220 cgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  126414 ccgcatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgat 126476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 80305 - 80090
Alignment:
Q  22 tgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattga 112  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| |||||||    
T  80305 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga 80206  T
Q  113 gcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacg 212  Q
    |||| |||||||||||     ||||||||||| ||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  80205 gctttgtcctcaccac---gtttaggagctttgtcctccgcacgat---taggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacg 80112  T
Q  213 attggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  80111 attggtaccacatgcatataag 80090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 65867 - 66082
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttt---------tgttcataagtgtccttgcat-agcatctcatt 110  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||         |||| ||| | |||| ||||| ||||| |||||    
T  65867 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcatt 65964  T
Q  111 gagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatga 210  Q
    |||||| ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||| ||   |||||  |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65965 gagctttgtcctcaccacaatta---ggagctttgtcctccgcacgatt---aggagcattgtctcccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 66058  T
Q  211 cgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  66059 cgattggtaccacatgcatataag 66082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #5
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 230
Target Start/End: Original strand, 61951 - 62162
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttt---------tgttcataagtgtccttgcat-agcatctcatt 110  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||         |||| ||| | |||| ||||| ||||| |||||    
T  61951 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcatt 62048  T
Q  111 gagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatga 210  Q
    |||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||| | ||   |||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  62049 gagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcatgatt---aggagcattgtcctccgcacgattaaattatattaatacttatgatga 62142  T
Q  211 cgattggtacgacatgcata 230  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  62143 cgattggtaccacatgcata 62162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 206; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 59536 - 59821
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| || |||||| ||||||    
T  59536 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttaactccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcctatgtgtccatgcata 59635  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  59636 gcatatcattgagctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 59735  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  59736 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgtcttgttgatgatg 59821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 67642 - 67859
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  67642 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 67741  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  67742 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 67836  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  67837 gattggtaccacatgcatataag 67859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 206; Significance: 1e-113; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 139097 - 138812
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| || |||||| ||||||    
T  139097 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttaactccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcctatgtgtccatgcata 138998  T
Q  101 gcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaata 200  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  138997 gcatatcattgagctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaata 138898  T
Q  201 cttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  138897 cttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgtcttgttgatgatg 138812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 70
Target Start/End: Original strand, 15331 - 15368
Alignment:
Q  33 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 70  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  15331 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 15368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 70
Target Start/End: Original strand, 19853 - 19890
Alignment:
Q  33 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 70  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  19853 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 19890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 4)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 57004 - 56719
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||| || |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  57004 ttaactaagtgcatatgtttatgataaggtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcat 56906  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaat 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  56905 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaat 56806  T
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56805 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 56719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 71069 - 70877
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||| | ||| ||||| ||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||   |     
T  71069 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcacca---tg 70975  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
    |||||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  70974 attaggagctttgtcctccgcacg----ataggagttttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 70879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 139712 - 139520
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||| |||||||||||  || | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    |    
T  139712 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcacca----t 139619  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
     || |||||||| ||||||||||||||   ||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  139618 gtttggagctttgtcctccgcacgttt---aggtgctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 139522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 100952 - 100880
Alignment:
Q  161 ataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  100952 ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tattatgatgattggtaccacatgcatataag 100880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 38072 - 37790
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  38072 ttaactaagtgcatatgtatatgataatgtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttctgttcataagtgtccatgcat 37974  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcc-tccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaa 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37973 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtccctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaa 37874  T
Q  199 tacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37873 tacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 37790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 234
Target Start/End: Original strand, 14548 - 14670
Alignment:
Q  106 tcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttat 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||| ||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14548 tcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 14641  T
Q  206 gatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14642 gatgacgattggtaccacatgcatataag 14670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 76740 - 77022
Alignment:
Q  1 ttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgat-atgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  76740 ttaactaagtgcatatgtatatgataatgtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttctgttcataagtgtccatgcat 76838  T
Q  100 agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcc-tccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaa 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  76839 agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtccctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaa 76938  T
Q  199 tacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  76939 tacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 77022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 12441 - 12199
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtc 120  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  12441 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtc 12342  T
Q  121 ctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12341 ctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 12242  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12241 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 12199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 78211 - 77969
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtc 120  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  78211 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtc 78112  T
Q  121 ctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  78111 ctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 78012  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  78011 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 77969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 127
Target Start/End: Original strand, 60878 - 60981
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgca-tagcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || || |||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  60878 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgat-agagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 60975  T
Q  122 tcacca 127  Q
    ||||||    
T  60976 tcacca 60981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 8)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 26636 - 26376
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26636 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgaatatgatgactacgatgttttgttcataagattccatgcatagcatctcattgagcttagtcc 26537  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacg 221  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||     
T  26536 tcaccacgatttttaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatatttatgataacgattggtacc 26437  T
Q  222 acatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26436 acatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgat 26376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 106 - 234
Target Start/End: Original strand, 38994 - 39117
Alignment:
Q  106 tcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttat 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||   | |||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38994 tcattgagctttgtcctcacca---tgattaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttat 39088  T
Q  206 gatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39089 gatgacgattggtaccacatgcatataag 39117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 131 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 43145 - 43015
Alignment:
Q  131 ttattaggagctttttcctccgcacgttttat-aggagttttgtcctccacacgatt-aaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgca 228  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43145 ttattaggagctttgtcctctgcacgatttattaggagctttgtcctccgaacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgca 43046  T
Q  229 tataaggagtctaggagcattgtcacattgt 259  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  43045 tataacgagtctaagagcattgtcacattgt 43015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 43311 - 43145
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgca-tagcatctcattgagcttagt 119  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  43311 atgatgacgtttagctccaaattattggaagcatgttgatatgttgatcacggtg-attgttcataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 43214  T
Q  120 cctcaccac-aattattaggagctttttcctccgcacgtttta-taggagttttgtcctccacacgatt 186  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| |||||||||  |||||||    
T  43213 cctcaccacgatttattaggagctttgtcctctgcacgatttattaggagctttgtcctctgcacgatt 43145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #5
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 234
Target Start/End: Original strand, 11477 - 11600
Alignment:
Q  106 tcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttat 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||   | |||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  11477 tcattgagctttgtcctcacca---tgattaggagctttgtcctccacacgtttta--ggagttttatcctccgcaggattaaagtatattaatacttat 11571  T
Q  206 gatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  11572 gatgatgattggtaccacatgcatataag 11600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #6
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 135 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6865 - 6769
Alignment:
Q  135 taggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |   ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6865 taggagctttgtcctccacacgtttca---gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 6769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #7
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 135 - 234
Target Start/End: Original strand, 36451 - 36547
Alignment:
Q  135 taggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||   ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36451 taggagctttgtcctctgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 36547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #8
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 156
Target Start/End: Original strand, 36330 - 36449
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgca-tagcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||| || |||||| ||||| |||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||        
T  36330 ctccaaattattggatgtataagtgatatgttgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccac---g 36425  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacg 156  Q
     ||||||||||| |||||||||||    
T  36426 tttaggagctttgtcctccgcacg 36449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 73991 - 73749
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtc 120  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  73991 atgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtc 73892  T
Q  121 ctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73891 ctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 73792  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  73791 cacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 73749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 164 - 230
Target Start/End: Original strand, 228598 - 228663
Alignment:
Q  164 ggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcata 230  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  228598 ggagctttgtcctctacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcata 228663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0572 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0572
Description:

Target: scaffold0572; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 9849 - 9607
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtc 120  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  9849 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcataacatttcattgagcttagtc 9750  T
Q  121 ctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9749 ctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacaattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 9650  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
     |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9649 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcacattgtcatg 9607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0744 (Bit Score: 171; Significance: 7e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0744
Description:

Target: scaffold0744; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Original strand, 3782 - 4024
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtc 120  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  3782 atgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtc 3881  T
Q  121 ctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3882 ctcaccacatttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgtacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 3981  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
     |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  3982 cacatgcatataaagtgtctaagagcattgtcacattgtcatg 4024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 65 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 38649 - 38440
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttatag 164  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38649 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 38550  T
Q  165 gagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 264  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38549 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 38450  T
Q  265 ttaagatgcc 274  Q
    ||||||||||    
T  38449 ttaagatgcc 38440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 65 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 25315 - 25098
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttatag 164  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25315 tgattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 25216  T
Q  165 gagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 264  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25215 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatga 25116  T
Q  265 ttaagatgccttgttgat 282  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25115 ttaagatgccttgttgat 25098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Original strand, 19688 - 19949
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||| |||| ||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19688 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgaatacgatgattacggtgttgtgttgatatgagtccatgcatagcatttcattgagcttagtcc 19787  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttat-aggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19788 tcaccacgattattaggagctttatcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 19887  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgat 282  Q
     ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  19888 cacatgcatataaggagtctaaaagcattgtcgcattgtcatgtctaagatgctttgttgat 19949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 146; Significance: 6e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Original strand, 15101 - 15345
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagt 119  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||| || | ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15101 atgatgatgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgttgattatggtgatttgttcataagagttcatgcattagcat-tcattgagcttagt 15199  T
Q  120 cctcaccacaatt-attaggagctttttcctccgcacgttttat-aggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 217  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15200 cctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 15299  T
Q  218 tacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15300 taccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 15345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Original strand, 8963 - 9206
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagt 119  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8963 atgatgacgtttagctccaaattattggatgctcattgatatgttgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 9061  T
Q  120 cctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttat-aggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggt 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9062 cctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggt 9161  T
Q  219 acgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  9162 accacatgcatataaggagtctaagagcattgttgcattgtcatg 9206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 69 - 253
Target Start/End: Original strand, 32473 - 32657
Alignment:
Q  69 tacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagt 168  Q
    ||||||||||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||     
T  32473 tacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagttttgtcctccgcacgttttataggagc 32572  T
Q  169 tttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtca 253  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32573 tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtca 32657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 65 - 286
Target Start/End: Original strand, 4229 - 4451
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt-attaggagctttttcctccgcacgttttata 163  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||| ||  ||    
T  4229 tgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatta 4328  T
Q  164 ggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4329 ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 4428  T
Q  264 attaagatgccttgttgatgatg 286  Q
      ||  |||| ||||||||||||    
T  4429 tctattatgctttgttgatgatg 4451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0553 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0553
Description:

Target: scaffold0553; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 65 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 8744 - 8522
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt-attaggagctttttcctccgcacgttttata 163  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||| ||  ||    
T  8744 tgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatta 8645  T
Q  164 ggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8644 ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtacctcatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 8545  T
Q  264 attaagatgccttgttgatgatg 286  Q
      ||  |||| ||||||||||||    
T  8544 tctattatgctttgttgatgatg 8522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 4)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 23 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 9332 - 9092
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || ||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  9332 gatgacgtttagatccaaattattagatgcttattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 9235  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttat-aggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 220  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9234 tcaccacgattaataggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 9135  T
Q  221 gacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
     |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  9134 cacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 9092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 175 - 234
Target Start/End: Original strand, 73818 - 73877
Alignment:
Q  175 ctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  73818 ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 73877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 164 - 234
Target Start/End: Original strand, 2899 - 2968
Alignment:
Q  164 ggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  2899 ggagctttgtcctccccacgattaaagtatattaata-ttatgatgacgattgataccacatgcatataag 2968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 234
Target Start/End: Original strand, 81468 - 81521
Alignment:
Q  180 cacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  81468 cacgattaaagtatattaatac-tatgatgaagattggtaccacatgcatataag 81521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 4214 - 4427
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagt 119  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  4214 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgaatacgatgattacggtgttttgttgataagagtccatgcatagcatatcattgagcttagt 4313  T
Q  120 cctcaccacaattatt-aggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggt 218  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4314 cctcaccacgattttttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggt 4411  T
Q  219 acgacatgcatataag 234  Q
    || |||||||||||||    
T  4412 accacatgcatataag 4427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 124; Significance: 8e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 65 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 22159 - 21960
Alignment:
Q  65 tgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt-attaggagctttttcctccgcacgttttata 163  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||| ||  ||    
T  22159 tgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatta 22060  T
Q  164 ggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22059 ggagctttgtcctccgcacgactaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatatggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 21960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 124; Significance: 8e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 242052 - 241794
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  242052 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 241955  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacg 221  Q
    ||||||  ||    ||||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  241954 tcaccatgat----aggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 241859  T
Q  222 acatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||  ||||||||  ||||| |||||    
T  241858 acatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatg 241794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23097 - 23026
Alignment:
Q  162 taggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  23097 taggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaattc-tatgatgacgattggcaccacatgcatataag 23026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 35 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 10157 - 9905
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatta 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  ||||| ||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| || ||||    
T  10157 ctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacggtgaattgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcttcacgacgatta 10059  T
Q  134 ttaggagctttttcctccgcacgttttat-aggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10058 ttacgagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 9959  T
Q  233 aggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||| ||  ||||||||  ||||| |||||    
T  9958 aggagtctaagagcattttcgcattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatg 9905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 23 - 286
Target Start/End: Original strand, 14651 - 14910
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| || |||||| ||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14651 gatgacgtttagctccaaattattggatgcacattgatatgatgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 14749  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacg 221  Q
    | ||||| ||    ||||||||| || |||||||| ||  |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14750 ttaccacgat----aggagctttgtcatccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 14845  T
Q  222 acatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||  |||||||||||    
T  14846 acatgcatataagaagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaagatgctatgttgatgatg 14910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 3)
Name: scaffold0242
Description:

Target: scaffold0242; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 19570 - 19325
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19570 gatgatgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 19473  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacg 221  Q
    ||||||  ||    ||||||||| ||||||||||| ||  ||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  19472 tcaccatgat----aggagctttgtcctccgcacgattattaggagcattgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgatgattggtacc 19377  T
Q  222 acatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgc 273  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||  ||||||||    
T  19376 acatgcatataaggagtctaagagcattgtctcattgtcgtgtctaagatgc 19325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 111 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 25634 - 25472
Alignment:
Q  111 gagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatga 210  Q
    |||||| ||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25634 gagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatga 25535  T
Q  211 cgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgc 273  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||  ||||||||    
T  25534 tgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtctcattgtcgtgtctaagatgc 25472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 25744 - 25585
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgca-tagcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || || |||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  25744 gatgatgtttagctccaaattattggatgcattttgatatgatgattacgatgttttgttgat-agagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcc 25647  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgatta 187  Q
    ||||||    |  |||||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||||||||| ||||||||    
T  25646 tcacca----tgataggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgatta 25585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 5440 - 5657
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  5440 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 5539  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5540 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 5634  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  5635 gattggtaccacatgcatataag 5657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12187 - 11970
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  12187 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 12088  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12087 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 11993  T
Q  212 gattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  11992 gattggtaccacatgcatataag 11970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 215 - 1
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccttgcatagcatctcattg 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  215 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 116  T
Q  112 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 211  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  115 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 21  T
Q  212 gattggtacgacatgcatat 231  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  20 gattggtaccacatgcatat 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 286
Target Start/End: Original strand, 25087 - 25345
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcc 121  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||| ||| | |||| ||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  25087 gatgacgtttagctccaaattattggatgcacattgatatgatgattacaatgttttgttgata-gagtccatgcattagcgt-tcattgagcttagtcc 25184  T
Q  122 tcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacg 221  Q
    ||||||  ||    || |||||| |||||| |||| ||  |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  25185 tcaccatgat----agaagctttgtcctccacacgattattaggagatttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgaagacgattggtacc 25280  T
Q  222 acatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||  ||||||||  ||||| |||||    
T  25281 acatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatg 25345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 114 - 263
Target Start/End: Original strand, 1 - 150
Alignment:
Q  114 cttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacga 213  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 cttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacga 100  T
Q  214 ttggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 263  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||    
T  101 ttggtaccacatgcatataaggagataaagagcattgtcacattgtcatg 150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0229
Description:

Target: scaffold0229; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 162 - 286
Target Start/End: Original strand, 11988 - 12113
Alignment:
Q  162 taggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtct-aggagcattgtcacattgtc 260  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  11988 taggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaaggagcattgtcacagtgtc 12087  T
Q  261 atgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  12088 atgattaagatgccttgttgatgatg 12113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9904 - 9711
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||| |||||||||||  || | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||   |     
T  9904 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcacca---tg 9810  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9809 attaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 9713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0656 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0656
Description:

Target: scaffold0656; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 162 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 1213 - 1089
Alignment:
Q  162 taggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtca 261  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  1213 taggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcg 1114  T
Q  262 tgattaagatgccttgttgatgatg 286  Q
    ||  ||||||||  ||||| |||||    
T  1113 tgtctaagatgctatgttgttgatg 1089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Original strand, 33050 - 33244
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||| | ||| ||||| ||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  33050 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacgatt 33147  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
    |   |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33148 a---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 33242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15267 - 15144
Alignment:
Q  106 tcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttat 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||   | |||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  15267 tcattgagctttgtcctcacca---tgattaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatgttaatacttat 15173  T
Q  206 gatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15172 gatgacgattggtaccacatgcatataag 15144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 234
Target Start/End: Original strand, 16839 - 16962
Alignment:
Q  106 tcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttat 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||   |||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16839 tcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagttttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 16933  T
Q  206 gatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16934 gatgacgattggtaccacatgcatataag 16962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9421 - 9229
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||| |||||||| |||||||||||  || | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||  ||     
T  9421 ctccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatgat- 9325  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
       ||||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9324 ---aggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 9231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 234
Target Start/End: Original strand, 77347 - 77469
Alignment:
Q  106 tcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttat 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||   | |||||||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  77347 tcattgagctttgtcctcacca---tgattaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttat 77440  T
Q  206 gatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  77441 gatgacgattggtaccacatgcatataag 77469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 234
Target Start/End: Original strand, 36547 - 36669
Alignment:
Q  106 tcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttat 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||| ||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36547 tcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 36640  T
Q  206 gatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36641 gatgacgattggtaccacatgcatataag 36669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 53435 - 53363
Alignment:
Q  164 ggagttttgtcctccacacgat---taaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||| |||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53435 ggagctttgtcctccccacgatgcttaaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataag 53363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 169 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 14842 - 14752
Alignment:
Q  169 tttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgt 259  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  14842 tttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgt 14752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 36307 - 36116
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatta 133  Q
    ||||||||||||||||| |   ||||| |||||||| |||||||||||  || | |||| | ||| ||||| ||||||||||| |||||| |||    |     
T  36307 ctccaaattattggatgtaaagtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatacattagcat-tcattgagctttgtcctcgcca----tg 36214  T
Q  134 ttaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataa 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36213 ttaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 36117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Original strand, 189767 - 189960
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||| | ||| ||||| ||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  189767 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccacgatt 189864  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
    |   |||||||| ||||||||||| ||   ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  189865 a---ggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 189958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Original strand, 25075 - 25266
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgca-tagcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||| ||||||||||| || || |||| |||| ||||||  |||||||||| || |||||||| |      
T  25075 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgat-agagtccatgcattagcat-acattgagctttgttctcaccacga-- 25170  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
      |||||||||| ||||||||||| |   |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  25171 --taggagctttgtcctccgcacgat---taggagctttgtcctcagcacgattaaagtatattaatac-tatgatgaagattggtaccacatgcatata 25264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0780
Description:

Target: scaffold0780; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 112 - 5
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgca-tagcatctcattgagcttagt 119  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  112 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 14  T
Q  120 cctcaccac 128  Q
    |||||||||    
T  13 cctcaccac 5  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9266 - 9144
Alignment:
Q  106 tcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttat 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  9266 tcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtattttaatacttat 9173  T
Q  206 gatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9172 gatgacgattggtaccacatgcatataag 9144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1806 - 1684
Alignment:
Q  106 tcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttat 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||   | |||||||||||| ||||||||||||||   |||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  1806 tcattgagctttgtcctcacca---tgattaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagccttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttat 1713  T
Q  206 gatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1712 gatgacgattggtaccacatgcatataag 1684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1830 - 1707
Alignment:
Q  106 tcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttat 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||   | |||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  1830 tcattgagctttgtcctcacca---tgattaggagctttgtcctccacacgtttta--ggagttttatcctccgcaggattaaagtatattaatacttat 1736  T
Q  206 gatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  1735 gatgatgattggtaccacatgcatataag 1707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 135 - 234
Target Start/End: Original strand, 6442 - 6538
Alignment:
Q  135 taggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |   ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6442 taggagctttgtcctccacacgtttca---gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 6538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6681 - 6489
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatg-ttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||| | |||||||| |||||| |||| ||| | |||| ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| ||     
T  6681 ctccaaattattggatgtataattgaaaagttgattaagatgttctgttgata-gagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgat- 6585  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
       ||||||||| ||||||||||| ||   ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  6584 ---aggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacaattggtaccacatgcatata 6491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 234
Target Start/End: Original strand, 20640 - 20762
Alignment:
Q  106 tcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttat 205  Q
    ||||||||||| ||| ||||||   | |||||||||||| |||||| |||| ||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20640 tcattgagctttgtcatcacca---tgattaggagctttgtcctccacacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 20733  T
Q  206 gatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20734 gatgacgattggtaccacatgcatataag 20762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 8429 - 8308
Alignment:
Q  106 tcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttat 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||   | |||||||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  8429 tcattgagctttgtcctcacca---tgattaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttat 8336  T
Q  206 gatgacgattggtacgacatgcatataa 233  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  8335 gatgacgattgatagcacatgcatataa 8308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 133 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15525 - 15428
Alignment:
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  15525 attaggagctttgtcctccgcacgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattgatagcacatgcatata 15429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1852 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1852
Description:

Target: scaffold1852; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Original strand, 2 - 74
Alignment:
Q  162 taggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 74  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 140
Target Start/End: Original strand, 5907 - 6026
Alignment:
Q  21 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgca-tagcatctcattgagcttagt 119  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  5907 atgatgacgtttagctccaaattattggatgctcattgatatgttgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagt 6005  T
Q  120 cctcaccacaattattaggag 140  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  6006 cctcaccacgattattaggag 6026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0486
Description:

Target: scaffold0486; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9472 - 9400
Alignment:
Q  162 taggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9472 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 9400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Original strand, 6226 - 6298
Alignment:
Q  162 taggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6226 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 6298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Original strand, 8225 - 8297
Alignment:
Q  162 taggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8225 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 8297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 133 - 234
Target Start/End: Original strand, 208073 - 208171
Alignment:
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||   ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  208073 attaagagctttgtcctccgcgcgttt---aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 208169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 161 - 234
Target Start/End: Original strand, 9889 - 9961
Alignment:
Q  161 ataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9889 ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatataag 9961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18355 - 18164
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||| | |||||| |||||||||||  || | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||  ||     
T  18355 ctccaaattattggatgtattagtgataagctgattaagatgttttgttgcta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatgat- 18259  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
       ||||||||| ||||||||||||||   || || ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18258 ---aggagctttgtcctccgcacgttt---agtagctttttcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 18165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1552 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1552
Description:

Target: scaffold1552; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 139 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 269 - 176
Alignment:
Q  139 agctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||| |||||| |||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  269 agctttgtcctccacacgtttta--ggagctttgtcctccactcgattaaagtatattaatatttatgatgacgtttggtaccacatgcatataag 176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 162 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 11591 - 11523
Alignment:
Q  162 taggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcata 230  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  11591 taggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgaagattggtaccacatgcata 11523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 63855 - 63663
Alignment:
Q  35 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaatt 132  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||| ||| |||| |||||||||||  || | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||  ||     
T  63855 ctccaaattattggatgtataaatgataagttcattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcaccatgat- 63759  T
Q  133 attaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatata 232  Q
       ||||||||| |||||||||| |||   ||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  63758 ---aggagctttgtcctccgcacattt---aggagctttttcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgatgattggtaccacatgcatata 63665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 135 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 29456 - 29361
Alignment:
Q  135 taggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||   ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  29456 taggagctttgtcctccgcacgatt---aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatac-tatgatgaagattggtaccacatgcatataag 29361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16654 - 16487
Alignment:
Q  57 tgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttttcctccgcac 155  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||  || | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    | || |||||||| |||||| |||    
T  16654 tgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcat-tcattgagctttgtcctcacca----tgttcggagctttgtcctccacac 16561  T
Q  156 gttttataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16560 g----ataggagctttttcctccacacgattacagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatataag 16487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 164 - 234
Target Start/End: Original strand, 18859 - 18928
Alignment:
Q  164 ggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18859 ggagctttgtcctccccacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatataag 18928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 234
Target Start/End: Original strand, 10283 - 10355
Alignment:
Q  161 ataggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  10283 ataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgaagattgataccacatgcatataag 10355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 34 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 2793 - 2700
Alignment:
Q  34 gctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccttgca-tagcatctcattgagcttagtcctcaccac 128  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| || || |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2793 gctccaaattattggatgcatatcgatatgatgattacgatgttttgttgat-agagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccac 2700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 202 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 2694 - 2655
Alignment:
Q  202 ttatgatgacgattggtacgacatgcatataaggagtcta 241  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2694 ttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtcta 2655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 162 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 30788 - 30725
Alignment:
Q  162 taggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacat 225  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30788 taggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 30725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 183
Target Start/End: Original strand, 80871 - 81026
Alignment:
Q  22 tgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacga-tgttttgttcataagtgtccttgca-tagcatctcattgagcttagt 119  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| || || |||| |||| |||||| ||||||||||| ||    
T  80871 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgaatacgattgttttgttgat-agagtccatgcattagcat-tcattgagctttgt 80968  T
Q  120 cctcaccacaattattaggagctttttcctccgcacgttttataggagttttgtcctccacacg 183  Q
    |||||||   || |||||||||||| ||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||    
T  80969 cctcacc---atgattaggagctttgtcctccgcacgat---taggagctttgtcctccgcacg 81026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 164 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 173171 - 173106
Alignment:
Q  164 ggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcata 230  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  173171 ggagctttgtcctgcacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcata 173106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 230
Target Start/End: Original strand, 20243 - 20307
Alignment:
Q  164 ggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcata 230  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  20243 ggagctttgtcctc-acacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcata 20307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 28947 - 28880
Alignment:
Q  162 taggagttttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcata 230  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  28947 taggagctttgtcctctgcacgattaaagtatattaatac-tatgatgaagattggtaccacatgcata 28880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0697 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0697
Description:

Target: scaffold0697; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 6610 - 6551
Alignment:
Q  23 gatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgtt 82  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  6610 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgacgttttgtt 6551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 234
Target Start/End: Original strand, 66678 - 66723
Alignment:
Q  188 aagtatattaatacttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  66678 aagtatattaatactt-tgatgacgattggtaccacatgcatataag 66723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 68874 - 68837
Alignment:
Q  33 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 70  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  68874 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 68837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 38 - 4
Alignment:
Q  200 acttatgatgacgattggtacgacatgcatataag 234  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 4  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0637
Description:

Target: scaffold0637; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 8557 - 8520
Alignment:
Q  33 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 70  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  8557 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 8520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 70
Target Start/End: Original strand, 2557 - 2594
Alignment:
Q  33 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 70  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  2557 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 2594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 70
Target Start/End: Original strand, 10417 - 10454
Alignment:
Q  33 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 70  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  10417 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 10454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 70
Target Start/End: Original strand, 4346 - 4383
Alignment:
Q  33 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 70  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  4346 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 4383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 70
Target Start/End: Original strand, 27243 - 27280
Alignment:
Q  33 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 70  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  27243 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 27280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 70
Target Start/End: Original strand, 192438 - 192475
Alignment:
Q  33 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 70  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  192438 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 192475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University