View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6211_low_16 (Length: 319)

Name: NF6211_low_16
Description: NF6211
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6211_low_16
NF6211_low_16
[»] chr3 (43 HSPs)
chr3 (173-303)||(10912988-10913118)
chr3 (171-298)||(14814778-14814904)
chr3 (171-296)||(15517740-15517865)
chr3 (173-298)||(31412348-31412472)
chr3 (171-298)||(6228638-6228764)
chr3 (188-298)||(43427546-43427655)
chr3 (173-276)||(38375711-38375814)
chr3 (174-298)||(41661673-41661796)
chr3 (171-298)||(4145827-4145952)
chr3 (173-298)||(50313295-50313419)
chr3 (173-293)||(8604938-8605057)
chr3 (171-298)||(4162218-4162344)
chr3 (208-298)||(11638465-11638554)
chr3 (171-260)||(13301482-13301571)
chr3 (171-260)||(13312138-13312227)
chr3 (171-298)||(12953072-12953198)
chr3 (173-298)||(11515505-11515631)
chr3 (171-260)||(11882231-11882320)
chr3 (171-252)||(34560052-34560133)
chr3 (179-296)||(12539090-12539207)
chr3 (179-276)||(33368948-33369044)
chr3 (179-293)||(11402702-11402816)
chr3 (174-298)||(9590770-9590893)
chr3 (171-298)||(39656634-39656760)
chr3 (171-241)||(3576451-3576521)
chr3 (171-241)||(17191705-17191775)
chr3 (171-241)||(17204845-17204915)
chr3 (171-241)||(47784779-47784849)
chr3 (171-298)||(30207324-30207450)
chr3 (179-293)||(15550711-15550824)
chr3 (171-257)||(17139656-17139742)
chr3 (195-298)||(1990911-1991012)
chr3 (179-241)||(48421741-48421803)
chr3 (194-290)||(12488762-12488857)
chr3 (174-241)||(14080673-14080740)
chr3 (171-256)||(14059226-14059311)
chr3 (205-241)||(14177065-14177101)
chr3 (207-298)||(11329010-11329100)
chr3 (179-290)||(18970037-18970147)
chr3 (171-241)||(16880287-16880357)
chr3 (174-208)||(21167097-21167131)
chr3 (212-298)||(38168022-38168107)
chr3 (171-232)||(15876241-15876302)
[»] chr6 (36 HSPs)
chr6 (173-302)||(22462112-22462240)
chr6 (173-298)||(23222859-23222983)
chr6 (173-292)||(23222030-23222148)
chr6 (172-297)||(19672395-19672519)
chr6 (173-298)||(17013654-17013778)
chr6 (173-298)||(34966975-34967099)
chr6 (173-298)||(19854263-19854387)
chr6 (172-293)||(31467611-31467732)
chr6 (171-298)||(18629621-18629747)
chr6 (171-298)||(22848123-22848249)
chr6 (173-298)||(19175258-19175383)
chr6 (171-298)||(17083211-17083336)
chr6 (177-298)||(21931311-21931432)
chr6 (181-298)||(25651345-25651461)
chr6 (198-298)||(29160343-29160442)
chr6 (171-298)||(29605558-29605683)
chr6 (174-290)||(32352163-32352278)
chr6 (171-253)||(17557031-17557112)
chr6 (174-298)||(33538386-33538508)
chr6 (173-276)||(16136392-16136495)
chr6 (171-298)||(21623276-21623402)
chr6 (171-241)||(22361778-22361848)
chr6 (171-295)||(18381696-18381819)
chr6 (171-298)||(18399046-18399172)
chr6 (171-302)||(28195106-28195236)
chr6 (179-241)||(22585575-22585637)
chr6 (179-241)||(22590406-22590468)
chr6 (180-293)||(25640585-25640697)
chr6 (177-241)||(33324857-33324920)
chr6 (177-241)||(35136032-35136095)
chr6 (174-241)||(16887808-16887875)
chr6 (179-241)||(15889735-15889797)
chr6 (180-277)||(26512270-26512367)
chr6 (180-277)||(26517386-26517483)
chr6 (180-290)||(26089851-26089960)
chr6 (173-202)||(29158399-29158428)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (173-298)||(67972-68097)
scaffold0022 (173-293)||(131928-132047)
scaffold0022 (174-298)||(109698-109821)
scaffold0022 (171-298)||(102935-103061)
[»] chr8 (40 HSPs)
chr8 (173-298)||(22497224-22497348)
chr8 (173-298)||(18261486-18261610)
chr8 (173-298)||(24552585-24552709)
chr8 (173-298)||(33172336-33172460)
chr8 (173-298)||(45558952-45559076)
chr8 (172-298)||(22742872-22742997)
chr8 (173-298)||(16002105-16002230)
chr8 (173-298)||(18041547-18041671)
chr8 (173-298)||(45465141-45465265)
chr8 (173-298)||(38635663-38635787)
chr8 (171-298)||(26011602-26011728)
chr8 (171-292)||(37653629-37653749)
chr8 (171-298)||(15933406-15933532)
chr8 (171-298)||(33528533-33528659)
chr8 (181-298)||(19331340-19331453)
chr8 (171-298)||(5854722-5854848)
chr8 (180-298)||(18118311-18118429)
chr8 (173-276)||(22887893-22887993)
chr8 (174-298)||(25296266-25296389)
chr8 (174-298)||(29306525-29306648)
chr8 (174-298)||(25758286-25758409)
chr8 (171-290)||(21198165-21198283)
chr8 (171-230)||(27233103-27233162)
chr8 (171-287)||(17285323-17285438)
chr8 (171-298)||(22981381-22981507)
chr8 (171-253)||(23149930-23150013)
chr8 (171-298)||(23837306-23837432)
chr8 (179-293)||(21259520-21259633)
chr8 (171-241)||(23151846-23151916)
chr8 (174-298)||(33611069-33611192)
chr8 (171-253)||(23158312-23158395)
chr8 (171-298)||(38533757-38533883)
chr8 (174-238)||(23226092-23226156)
chr8 (197-256)||(15969970-15970029)
chr8 (179-241)||(17502325-17502387)
chr8 (179-241)||(20175795-20175857)
chr8 (179-241)||(20220522-20220584)
chr8 (179-239)||(4234021-4234081)
chr8 (205-277)||(16038936-16039008)
chr8 (179-239)||(23218043-23218103)
[»] chr7 (40 HSPs)
chr7 (173-298)||(8267743-8267867)
chr7 (173-298)||(46474109-46474234)
chr7 (1-105)||(45152811-45152915)
chr7 (173-276)||(45149713-45149816)
chr7 (173-298)||(9723822-9723946)
chr7 (173-298)||(28390420-28390544)
chr7 (171-298)||(20583567-20583693)
chr7 (173-298)||(13448842-13448966)
chr7 (173-298)||(28722218-28722342)
chr7 (171-298)||(15358905-15359031)
chr7 (173-298)||(38424327-38424451)
chr7 (174-297)||(4484836-4484958)
chr7 (173-298)||(4446320-4446444)
chr7 (173-298)||(14935468-14935592)
chr7 (173-298)||(15363061-15363185)
chr7 (173-298)||(17947607-17947731)
chr7 (171-298)||(9838987-9839113)
chr7 (171-298)||(31501281-31501407)
chr7 (103-177)||(45152427-45152501)
chr7 (173-298)||(4438891-4439015)
chr7 (174-298)||(33559755-33559878)
chr7 (171-298)||(48356752-48356878)
chr7 (171-298)||(9611415-9611542)
chr7 (171-298)||(16914941-16915067)
chr7 (173-293)||(8563362-8563482)
chr7 (173-256)||(9319578-9319661)
chr7 (171-298)||(14940863-14940986)
chr7 (171-253)||(34241220-34241302)
chr7 (171-256)||(14271912-14271997)
chr7 (171-298)||(15368456-15368579)
chr7 (171-241)||(13377693-13377763)
chr7 (171-298)||(17223951-17224077)
chr7 (179-293)||(39291538-39291651)
chr7 (171-241)||(49047687-49047757)
chr7 (179-241)||(15977870-15977932)
chr7 (173-214)||(9250630-9250671)
chr7 (186-219)||(17947546-17947579)
chr7 (171-241)||(13274941-13275011)
chr7 (179-241)||(44305034-44305096)
chr7 (176-241)||(13037048-13037112)
[»] chr5 (29 HSPs)
chr5 (173-298)||(23417349-23417474)
chr5 (173-298)||(16835314-16835438)
chr5 (176-298)||(21109858-21109979)
chr5 (174-298)||(26559831-26559954)
chr5 (173-297)||(23234500-23234623)
chr5 (171-298)||(22885750-22885876)
chr5 (171-298)||(24084185-24084311)
chr5 (171-298)||(29918073-29918199)
chr5 (177-298)||(11763523-11763644)
chr5 (174-298)||(37983472-37983595)
chr5 (171-298)||(21222621-21222747)
chr5 (174-296)||(21310725-21310846)
chr5 (171-298)||(6456732-6456855)
chr5 (173-233)||(19873933-19873993)
chr5 (171-298)||(19862317-19862443)
chr5 (174-256)||(21297191-21297273)
chr5 (225-297)||(24225383-24225455)
chr5 (171-298)||(21617124-21617250)
chr5 (171-241)||(23981529-23981599)
chr5 (171-298)||(5450856-5450982)
chr5 (169-298)||(3673970-3674098)
chr5 (171-290)||(432579-432697)
chr5 (195-298)||(7728528-7728630)
chr5 (205-241)||(22662730-22662766)
chr5 (171-255)||(32966162-32966246)
chr5 (171-230)||(28902366-28902425)
chr5 (171-230)||(28938761-28938820)
chr5 (174-208)||(5621810-5621844)
chr5 (171-221)||(16595691-16595741)
[»] chr1 (23 HSPs)
chr1 (173-298)||(33397460-33397584)
chr1 (173-298)||(40436284-40436408)
chr1 (173-293)||(20194137-20194258)
chr1 (173-298)||(5768184-5768308)
chr1 (173-298)||(25093967-25094091)
chr1 (171-298)||(52400739-52400865)
chr1 (171-296)||(21195124-21195248)
chr1 (173-298)||(49997296-49997420)
chr1 (172-288)||(8537924-8538039)
chr1 (172-288)||(8603163-8603278)
chr1 (171-298)||(17609036-17609162)
chr1 (173-303)||(37233875-37234004)
chr1 (244-298)||(76458-76512)
chr1 (171-298)||(20177283-20177409)
chr1 (171-256)||(19603246-19603331)
chr1 (174-298)||(22143377-22143500)
chr1 (171-241)||(13376872-13376942)
chr1 (171-233)||(20955452-20955514)
chr1 (171-257)||(51627677-51627763)
chr1 (172-256)||(38033688-38033772)
chr1 (171-230)||(16656813-16656872)
chr1 (171-233)||(22829438-22829500)
chr1 (171-233)||(27674968-27675030)
[»] scaffold0670 (1 HSPs)
scaffold0670 (173-298)||(7690-7814)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (173-298)||(37666-37790)
[»] chr2 (23 HSPs)
chr2 (173-298)||(25595128-25595252)
chr2 (173-298)||(9636853-9636977)
chr2 (173-298)||(18536863-18536988)
chr2 (173-298)||(16292816-16292940)
chr2 (173-298)||(24277869-24277993)
chr2 (171-296)||(24087400-24087525)
chr2 (174-298)||(24884794-24884917)
chr2 (171-291)||(19659995-19660114)
chr2 (180-276)||(20279540-20279636)
chr2 (225-298)||(6094824-6094896)
chr2 (171-298)||(68100-68226)
chr2 (178-241)||(19666692-19666755)
chr2 (171-298)||(43646001-43646127)
chr2 (103-176)||(38256247-38256320)
chr2 (174-240)||(19669125-19669191)
chr2 (171-256)||(722540-722625)
chr2 (171-298)||(31146194-31146320)
chr2 (171-241)||(22775218-22775288)
chr2 (171-241)||(22780596-22780666)
chr2 (171-226)||(23821652-23821707)
chr2 (171-226)||(23830731-23830786)
chr2 (205-260)||(28031293-28031348)
chr2 (173-203)||(6094888-6094918)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (173-292)||(2787-2905)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (173-298)||(3359-3483)
[»] chr4 (24 HSPs)
chr4 (173-298)||(13590089-13590213)
chr4 (173-298)||(18238172-18238296)
chr4 (173-298)||(54398491-54398615)
chr4 (173-298)||(47468363-47468487)
chr4 (173-298)||(13442691-13442815)
chr4 (177-293)||(50219959-50220074)
chr4 (173-298)||(40904949-40905073)
chr4 (173-298)||(41916741-41916865)
chr4 (171-298)||(7964725-7964850)
chr4 (171-296)||(41256383-41256506)
chr4 (171-296)||(15013296-15013419)
chr4 (171-298)||(7185857-7185983)
chr4 (171-290)||(38764825-38764943)
chr4 (174-297)||(18276543-18276665)
chr4 (180-293)||(21417419-21417532)
chr4 (171-298)||(47535078-47535204)
chr4 (171-298)||(15044936-15045062)
chr4 (171-298)||(13809523-13809649)
chr4 (171-298)||(41165959-41166085)
chr4 (171-241)||(15109362-15109432)
chr4 (171-290)||(52265521-52265639)
chr4 (179-277)||(19559487-19559585)
chr4 (179-241)||(49071851-49071913)
chr4 (205-241)||(34177695-34177731)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (171-298)||(975-1101)
[»] scaffold0153 (1 HSPs)
scaffold0153 (176-290)||(8606-8719)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (173-298)||(25454-25578)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (174-298)||(22107-22230)
scaffold0165 (174-298)||(30072-30195)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (173-297)||(27606-27729)
scaffold0004 (173-298)||(86465-86589)
[»] scaffold0601 (1 HSPs)
scaffold0601 (173-298)||(895-1013)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (171-298)||(4713-4839)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (173-295)||(108120-108241)
[»] scaffold0406 (1 HSPs)
scaffold0406 (173-290)||(14152-14268)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (179-298)||(12754-12873)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (173-298)||(33428-33553)
[»] scaffold0253 (2 HSPs)
scaffold0253 (171-298)||(7510-7636)
scaffold0253 (171-298)||(16935-17061)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (171-298)||(23685-23811)
scaffold0080 (171-241)||(43811-43881)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (173-276)||(67912-68014)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (171-298)||(6652-6778)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (171-298)||(85641-85766)
scaffold0025 (175-297)||(53455-53576)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (171-298)||(2633-2759)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (171-298)||(97211-97337)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (171-298)||(31128-31254)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (171-298)||(69565-69691)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (171-298)||(6769-6895)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (171-298)||(76860-76986)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (171-298)||(197266-197392)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (174-298)||(1364-1487)
scaffold0409 (174-298)||(9619-9742)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (195-298)||(12873-12976)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (179-277)||(6011-6109)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (174-298)||(22438-22561)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (171-241)||(1349-1418)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (171-222)||(5595-5646)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (171-298)||(2329-2455)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (171-290)||(28652-28770)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (174-241)||(8174-8241)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (171-241)||(11258-11328)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (171-219)||(27003-27051)
[»] scaffold1295 (1 HSPs)
scaffold1295 (179-290)||(222-332)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (171-290)||(7038-7156)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (179-241)||(1530-1592)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (174-240)||(79704-79770)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (174-239)||(1562-1627)
scaffold0456 (174-239)||(8707-8772)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (181-241)||(22452-22512)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (174-241)||(104639-104706)
[»] scaffold0013 (2 HSPs)
scaffold0013 (175-298)||(35586-35708)
scaffold0013 (205-241)||(7125-7161)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (179-241)||(44143-44205)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (174-241)||(10826-10893)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (205-260)||(34467-34522)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (174-241)||(70323-70389)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (174-241)||(89880-89946)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (181-271)||(3872-3962)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (182-239)||(19959-20016)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (205-241)||(12650-12686)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (171-219)||(116571-116619)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 43)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 173 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 10913118 - 10912988
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10913118 ttatgatgatatgtttgagtacatgaatttggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgtccataatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 10913019  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatgatgtg 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10913018 tgctctaattgttgaattgtgctatgttgtg 10912988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Original strand, 14814778 - 14814904
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||    
T  14814778 aattatggtgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaat 14814876  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14814877 tgtgctcaaattgttgaattgtgctatg 14814904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 171 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 15517865 - 15517740
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||  |||||||||||||||||||    
T  15517865 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatggtatgtataaatgggtatattgtgaat 15517766  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgcta 296  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||||    
T  15517765 tgtgcttaaattgatgaattgtgcta 15517740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Original strand, 31412348 - 31412472
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  31412348 ttatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaattg 31412446  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  31412447 tgctttaattgttgaattgtgatatg 31412472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Original strand, 6228638 - 6228764
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||    
T  6228638 aattatggtgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaat 6228736  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  6228737 tgtgctctaaatgttgaattgtgctatg 6228764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 188 - 298
Target Start/End: Original strand, 43427546 - 43427655
Alignment:
Q  188 tgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgtgctctaattgttga 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43427546 tgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtaaattgtgctctaattgttga 43427644  T
Q  288 attgtgctatg 298  Q
    |||||||||||    
T  43427645 attgtgctatg 43427655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 173 - 276
Target Start/End: Original strand, 38375711 - 38375814
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38375711 ttatgatgatatgtttgagtacatgaatttgatgataattgaattgttgtagatgaaattgcatgttcataatttgtgaaaatgggtatattgtgaattg 38375810  T
Q  273 tgct 276  Q
    ||||    
T  38375811 tgct 38375814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 174 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 41661796 - 41661673
Alignment:
Q  174 tatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgt 273  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  41661796 tatgatgatatgtttgaatacatggaaatgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaattgt 41661698  T
Q  274 gctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  41661697 gctctaaatgttgaattgtgctatg 41661673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Original strand, 4145827 - 4145952
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| | |||||||||||     
T  4145827 aattatggtgatatgtttgaatacatgaa-ttggtgataattgaattgttgttgatgaaattacatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaac 4145924  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  4145925 tgtgctctaaatgttgaattgtgctatg 4145952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 50313419 - 50313295
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  50313419 ttataatgatatgtttgagtgcatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaattg 50313321  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||    
T  50313320 tgctctaaatgttggattgtgatatg 50313295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 173 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 8605057 - 8604938
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||| ||     
T  8605057 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtaataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgggta-cttgtgagttt 8604959  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtg 293  Q
    ||||| ||||| || ||||||    
T  8604958 tgctcaaattgatggattgtg 8604938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Original strand, 4162218 - 4162344
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| | ||||||||||| | ||||||||||||    
T  4162218 aattatggtgatatgtttgaatacataaaattggtgataattgaattgctgttggtgaaattacaagttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaat 4162316  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  4162317 tgtgctctaaatgttgaattgtgttatg 4162344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 208 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 11638554 - 11638465
Alignment:
Q  208 taattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11638554 taattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgg-tatattgtgaattgtgctttaattgttgaattgtgctatg 11638465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 171 - 260
Target Start/End: Original strand, 13301482 - 13301571
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggta 260  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  13301482 aattatgatggtatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattattgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgggta 13301571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 171 - 260
Target Start/End: Original strand, 13312138 - 13312227
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggta 260  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  13312138 aattatgatggtatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattattgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgggta 13312227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 12953198 - 12953072
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||| | | |||||  |||||    
T  12953198 aattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattagattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatatgaaagt-gttatatgttgaat 12953100  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||    
T  12953099 tatgctctaaatgttgaattgtgctatg 12953072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Original strand, 11515505 - 11515631
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttga-tgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaatt 271  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||  ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  11515505 ttatgatgatatgtttgagtatatggatttgatgataattgaattgttgttgattcaaattgcacgttcatgatatgtataaatgggtatattgtgaatt 11515604  T
Q  272 gtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    |||||  | ||| ||||||||||||||    
T  11515605 gtgcttaatttgatgaattgtgctatg 11515631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 171 - 260
Target Start/End: Original strand, 11882231 - 11882320
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggta 260  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  11882231 aattatgatggtatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattattgttggtgaaattgaatgttcatagtatgtgaaaatgggta 11882320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 171 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 34560133 - 34560052
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaa 252  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  34560133 aattataatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaaatatgtgaa 34560052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 179 - 296
Target Start/End: Original strand, 12539090 - 12539207
Alignment:
Q  179 tgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgtgctct 278  Q
    ||||||| |||||||  |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||     
T  12539090 tgatatggttgagtatgtgaatttgttgataattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcatgataagtataaatgagtatattgtgaattgtgctca 12539189  T
Q  279 aattgttgaattgtgcta 296  Q
    ||| | ||||||||||||    
T  12539190 aatggatgaattgtgcta 12539207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 179 - 276
Target Start/End: Original strand, 33368948 - 33369044
Alignment:
Q  179 tgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgtgct 276  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  33368948 tgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgtggttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gttatactgtgaattgtgct 33369044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 179 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 11402816 - 11402702
Alignment:
Q  179 tgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgtgctct 278  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     |||  |||| |||||||||||||||||||||     
T  11402816 tgatatgtttgagtatatgaatttgatgataattgaattgttgttgatgaaatttcatgttcatggggtgtataaataggtatattgtgaattgtgctca 11402717  T
Q  279 aattgttgaattgtg 293  Q
    ||| | |||||||||    
T  11402716 aatggatgaattgtg 11402702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 174 - 298
Target Start/End: Original strand, 9590770 - 9590893
Alignment:
Q  174 tatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgt 273  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| | ||||||||| | |||||  | |||||| |    
T  9590770 tatgatgatatgtttgaatgcattaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaacttcatgttcaaagtatgtgaaagt-ggtatgatatgaattat 9590868  T
Q  274 gctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    |||| | |||||||||| |||||||    
T  9590869 gctcaatttgttgaattatgctatg 9590893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 39656760 - 39656634
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| | |||| |||| | | |||||  ||||     
T  39656760 aattatgatgttatgtttgaatttatgaaattggtgataattgaattgttgttagtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttgaaa 39656662  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    | ||||| |||||||||||| |||||||    
T  39656661 tatgctcaaattgttgaattatgctatg 39656634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 171 - 241
Target Start/End: Original strand, 3576451 - 3576521
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttca 241  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  3576451 aattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 3576521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 171 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17191775 - 17191705
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttca 241  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  17191775 aattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataatcgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 17191705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 171 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17204915 - 17204845
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttca 241  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  17204915 aattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataatcgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 17204845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 171 - 241
Target Start/End: Original strand, 47784779 - 47784849
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttca 241  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  47784779 aattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 47784849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 30207450 - 30207324
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| | |||| |||| | | |||||  |||||    
T  30207450 aattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttgaat 30207352  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    | ||||  ||||| ||||||||||||||    
T  30207351 tatgcttaaattgatgaattgtgctatg 30207324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 15550824 - 15550711
Alignment:
Q  179 tgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgtgctct 278  Q
    |||||||||||||||  | || ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  || | |  |||||||||  |||||||||||||||     
T  15550824 tgatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgaatttttgatgatgaaattgcatgttcatgatgtatataaatgggtagtttgtgaattgtgctc- 15550726  T
Q  279 aattgttgaattgtg 293  Q
    ||||| |||||||||    
T  15550725 aattgatgaattgtg 15550711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 17139742 - 17139656
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgg 257  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||| ||||||||    
T  17139742 aattatgatgacatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaactatgagaaaatgg 17139656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 1991012 - 1990911
Alignment:
Q  195 atgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgtgctctaattgttgaattgtgc 294  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| | ||  ||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||     
T  1991012 atgaaattggtaataattgaattattgtttgtgaaattgcatgttcatagtagatgaaaat-gatatattgtgaattatgctcaaattg-tgaattgtgt 1990915  T
Q  295 tatg 298  Q
    ||||    
T  1990914 tatg 1990911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 48421803 - 48421741
Alignment:
Q  179 tgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttca 241  Q
    |||||||||||||||  | || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48421803 tgatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgaattgttggtgatgaaattgcatgttca 48421741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 194 - 290
Target Start/End: Original strand, 12488762 - 12488857
Alignment:
Q  194 catgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgtgctctaattgttgaatt 290  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||| | | |||||  |||||| ||||| ||||| ||||||    
T  12488762 catgaagttgttgataattgaattgttgttgatgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttgaattatgctcaaattgatgaatt 12488857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14080740 - 14080673
Alignment:
Q  174 tatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttca 241  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||    
T  14080740 tatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgtggttagtgaatttgcatgttca 14080673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 256
Target Start/End: Original strand, 14059226 - 14059311
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatg 256  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||| ||   |||||| |||||||| | |||| |||||||    
T  14059226 aattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgtttttagagaaatttcatgttcaaagtatgagaaaatg 14059311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Original strand, 14177065 - 14177101
Alignment:
Q  205 tgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttca 241  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14177065 tgataattgaattgttgatgatgaaattgcatgttca 14177101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 207 - 298
Target Start/End: Original strand, 11329010 - 11329100
Alignment:
Q  207 ataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| | |||| |||| | |||||||  |||| | ||||| |||||||||||| |||||||    
T  11329010 ataattgaattgttgttagtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-ggtatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatg 11329100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 179 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 18970147 - 18970037
Alignment:
Q  179 tgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgtgctct 278  Q
    |||||||||| ||||  | || ||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||  || | || |||||||||  ||||||||| |||||     
T  18970147 tgatatgtttaagtatgttaatttgatgttaattgaattgttgatgatgaaatttcatgttcatgatgtatgtaaatgggtagtttgtgaattatgctc- 18970049  T
Q  279 aattgttgaatt 290  Q
    ||||| ||||||    
T  18970048 aattgatgaatt 18970037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16880357 - 16880287
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttca 241  Q
    ||||| |||||||||||||| | || ||| ||| |||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  16880357 aattacgatgatatgtttgaatgcaagaagttgttgataattgaattgttgttagtaaaatttcatgttca 16880287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 208
Target Start/End: Original strand, 21167097 - 21167131
Alignment:
Q  174 tatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgat 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21167097 tatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgat 21167131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 38168107 - 38168022
Alignment:
Q  212 tgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||  || | ||||||||||||  |||| |||| ||||| ||||| |||||| |||||||    
T  38168107 tgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctc-aattggtgaattatgctatg 38168022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15876302 - 15876241
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaatt 232  Q
    ||||||||| |||||||| | | |||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15876302 aattatgataatatgtttaaatgcatgatgttgttgataactgaattgttgttgatgaaatt 15876241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 36)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 173 - 302
Target Start/End: Original strand, 22462112 - 22462240
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||     
T  22462112 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcataatatgtgaaagt-ggtatattgtgaattt 22462210  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatgatgt 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22462211 tgctctaattgttgaattgtgctatgatgt 22462240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 23222983 - 23222859
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  23222983 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcataatatgtgaaaat-gatatattgtgaattg 23222885  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  23222884 tgctctaattgttgaattgtactatg 23222859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 173 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 23222148 - 23222030
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  23222148 ttatgatgatatgttagagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcataatatgtgaaaat-ggtatattgtgaatta 23222050  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgt 292  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  23222049 tgctctaattgttgaattgt 23222030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 172 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 19672519 - 19672395
Alignment:
Q  172 attatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaatt 271  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  19672519 attatgatgttatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttaatgaaattgcatgttcataatatgtgaaaat-gatatattgtgaatt 19672421  T
Q  272 gtgctctaattgttgaattgtgctat 297  Q
    |||||| || ||||||||||||||||    
T  19672420 gtgctccaaatgttgaattgtgctat 19672395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Original strand, 17013654 - 17013778
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  17013654 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgaaaattgaattgttgttggtgaaattgcctgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaattg 17013752  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  17013753 tgctttaattgttgaattgtgctatg 17013778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 34967099 - 34966975
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||  | ||||||||||||||    
T  34967099 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttcgtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaa-agatatattgtgaattg 34967001  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    | |||||||||||||||| |||||||    
T  34967000 tactctaattgttgaattatgctatg 34966975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 19854387 - 19854263
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||    
T  19854387 ttatgatgttatgtttgagtacatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-ggtatattgtgagttg 19854289  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||    
T  19854288 tgctctaaataatgaattgtgctatg 19854263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 172 - 293
Target Start/End: Original strand, 31467611 - 31467732
Alignment:
Q  172 attatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaatt 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||  ||||||||||||||||||||    
T  31467611 attatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttaatgaaattgcatgttcatggtatgtataaatgggtatattgtgaatt 31467710  T
Q  272 gtgctctaattgttgaattgtg 293  Q
    || ||  ||||| |||||||||    
T  31467711 gttcttaaattgatgaattgtg 31467732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Original strand, 18629621 - 18629747
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||    
T  18629621 aattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaagt-ggtatattgtgaat 18629719  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||    
T  18629720 tatgctctgaatgttgaattgtgctatg 18629747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 22848249 - 22848123
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||    
T  22848249 aattatgatgatatgtttaaatgcaagaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcatagtatgtgaaaat-gttatattgtgaat 22848151  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22848150 tgtgctcaaattgttgaattgtgctatg 22848123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 19175383 - 19175258
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  19175383 ttatgatgatatgtttgagtatataaaattgatgataattgaattgttgttgataaaattgcatgttcatgatatgtataaatgagtatattgtgaattg 19175284  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||||  ||||| |||||||| |||||    
T  19175283 tgcttaaattgatgaattgtactatg 19175258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Original strand, 17083211 - 17083336
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||| | |||||  |||||    
T  17083211 aattatgatgatatgtttgaatgcatgaa-ttggtgataattgaattgttgttggtgaaattgtatgttcatagtatgtgaaaat-gatatatgttgaat 17083308  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  17083309 tgtgctctaaatgttgaattgtgctatg 17083336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 177 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 21931432 - 21931311
Alignment:
Q  177 gatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgtgct 276  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  21931432 gatgatatgtttgaatatatgaaattgatgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcatgatatgtataaatgggtatattgtgaattatgct 21931333  T
Q  277 ctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
      ||||| ||| ||||| ||||    
T  21931332 taaattgatgagttgtgttatg 21931311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 181 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 25651461 - 25651345
Alignment:
Q  181 atatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgtgctctaa 280  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| | | |||||  |||||| ||||||||    
T  25651461 atatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaagt-gttatatgttgaattatgctctaa 25651363  T
Q  281 ttgttgaattgtgctatg 298  Q
     |||||||||||||||||    
T  25651362 atgttgaattgtgctatg 25651345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 198 - 298
Target Start/End: Original strand, 29160343 - 29160442
Alignment:
Q  198 aaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgtgctctaattgttgaattgtgctat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29160343 aaattggtgataattgaattgttgttagtgaaattgcatgttcatggtatgtgaaaat-gatatattgtgagttgtgctctaattgttgaattgtgctat 29160441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 29605683 - 29605558
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||    
T  29605683 aattatggtgatatgtttgaatgcatgaa-ttagtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcatagtatgtgaaaat-gaaatattgtgaat 29605586  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||    
T  29605585 tgtgctcaaaatgttgaattgtgctatg 29605558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 174 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 32352278 - 32352163
Alignment:
Q  174 tatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgt 273  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  32352278 tatgatggtatatttgaatacatgaaattggtgataattgaattgtttatggtgaaattgtatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaattgt 32352180  T
Q  274 gctctaattgttgaatt 290  Q
    | ||||| |||||||||    
T  32352179 gttctaaatgttgaatt 32352163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 171 - 253
Target Start/End: Original strand, 17557031 - 17557112
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaa 253  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  17557031 aattatgatgatatgtttga-tgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaa 17557112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 174 - 298
Target Start/End: Original strand, 33538386 - 33538508
Alignment:
Q  174 tatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgt 273  Q
    |||| |||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| | | ||| ||||||||| |    
T  33538386 tatggtgatatatttgaatgcatgaaattggtga-aattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaagt-gatatgttgtgaattat 33538483  T
Q  274 gctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    |||||||  ||||||||||||||||    
T  33538484 gctctaaaggttgaattgtgctatg 33538508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 173 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 16136495 - 16136392
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||  | ||||||||||||| |||||    
T  16136495 ttatgataatatgtttgaatatatgaaattgatgataattgaatagtttttgatgaaattgcatgttcatgatatgtatagatgggtatattgtaaattg 16136396  T
Q  273 tgct 276  Q
    ||||    
T  16136395 tgct 16136392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 21623402 - 21623276
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||| |||| | | |||||  |||||    
T  21623402 aattatgatggtatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttgctgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttgaat 21623304  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    | ||||| |||||||||||| |||||||    
T  21623303 tatgctcaaattgttgaattatgctatg 21623276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 171 - 241
Target Start/End: Original strand, 22361778 - 22361848
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttca 241  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22361778 aattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataattgaattgttgttgctgaaatttcatgttca 22361848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 171 - 295
Target Start/End: Original strand, 18381696 - 18381819
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| | |||| |||| | | |||||  |||||    
T  18381696 aattatgatgatatttttgaatacatgaagttgttgataattgaatggttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttgaat 18381794  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgct 295  Q
    | ||||  |||||||||||| ||||    
T  18381795 tatgcttaaattgttgaattatgct 18381819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 18399172 - 18399046
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||   |||||| |||||||| | |||| ||||||  ||||||  ||||     
T  18399172 aattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagagaaatttcatgttcaaagtatgagaaaat-agtatatgttgaaa 18399074  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    | ||||| |||||||||||| |||||||    
T  18399073 tatgctcaaattgttgaattatgctatg 18399046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 171 - 302
Target Start/End: Original strand, 28195106 - 28195236
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||| ||| |||||||||||||||||||  | ||||| |||||||| | |||| |||||| |||||||  ||||     
T  28195106 aattatgatgatatgtttgaatgtatgaagttgttgataattgaattgttgttagtaaaatttcatgttcatagtatgagaaaat-ggtatatgatgaaa 28195204  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatgatgt 302  Q
    ||||||| | | |||||||| ||| |||||||    
T  28195205 tgtgctcaattagttgaattatgccatgatgt 28195236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 241
Target Start/End: Original strand, 22585575 - 22585637
Alignment:
Q  179 tgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttca 241  Q
    |||||||||||||||  | || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22585575 tgatatgtttgagtattttaatttgatgataattgaattgttgatgatgaaattgcatgttca 22585637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 241
Target Start/End: Original strand, 22590406 - 22590468
Alignment:
Q  179 tgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttca 241  Q
    |||||||||||||||  | || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22590406 tgatatgtttgagtattttaatttgatgataattgaattgttgatgatgaaattgcatgttca 22590468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 293
Target Start/End: Original strand, 25640585 - 25640697
Alignment:
Q  180 gatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgtgctcta 279  Q
    ||||||||||||||  | || ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  || |    |||||||||  ||||||||||||||| |    
T  25640585 gatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgaatttttgatgatgaaattgcatgttcatgatgtagataaatgggtagtttgtgaattgtgctc-a 25640683  T
Q  280 attgttgaattgtg 293  Q
    |||| |||||||||    
T  25640684 attgatgaattgtg 25640697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 177 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 33324920 - 33324857
Alignment:
Q  177 gatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttca 241  Q
    |||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  33324920 gatgatatgtttgtatgcatgaaattgttgataattgaattgttgttg-tgaatttgcatgttca 33324857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 177 - 241
Target Start/End: Original strand, 35136032 - 35136095
Alignment:
Q  177 gatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttca 241  Q
    |||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  35136032 gatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttg-tgaatttgcatgttca 35136095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 241
Target Start/End: Original strand, 16887808 - 16887875
Alignment:
Q  174 tatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttca 241  Q
    |||||| |||||||||  | |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  16887808 tatgataatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaactgttgttggtgaatttgcatgttca 16887875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 241
Target Start/End: Original strand, 15889735 - 15889797
Alignment:
Q  179 tgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttca 241  Q
    |||||||||||||||  | || ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  15889735 tgatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgatttgttgatgatgaaattgcatgttca 15889797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 26512367 - 26512270
Alignment:
Q  180 gatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgtgctc 277  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |  |||| |  |||||||||  ||||||||| |||||    
T  26512367 gatatgtttgggtacaagaatttgatgatatttgaattgttgttgttgaaattacatgtttatgatatatataaatgggtagtttgtgaattatgctc 26512270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 26517483 - 26517386
Alignment:
Q  180 gatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgtgctc 277  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |  |||| |  |||||||||  ||||||||| |||||    
T  26517483 gatatgtttgggtacaagaatttgatgatatttgaattgttgttgttgaaattacatgtttatgatatatataaatgggtagtttgtgaattatgctc 26517386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 26089960 - 26089851
Alignment:
Q  180 gatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgtgctcta 279  Q
    ||||||||||| ||  | || ||| || ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||  |||| |||| ||||| |    
T  26089960 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcataatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctc-a 26089862  T
Q  280 attgttgaatt 290  Q
    |||| ||||||    
T  26089861 attggtgaatt 26089851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 202
Target Start/End: Original strand, 29158399 - 29158428
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaatt 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29158399 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaatt 29158428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Original strand, 67972 - 68097
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67972 ttatgatgatatgtttaagtacatgaatttggtgataattgaattgttgtagatgaaattgcatgttcataatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 68071  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  68072 tgctctaattgttgaattgtgttatg 68097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 173 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 132047 - 131928
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  | ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  132047 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtaaaattgcatgttcgtagtatgtgaaaat-gatatattgtgaattg 131949  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtg 293  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  131948 tgctctaaatgttgaattgtg 131928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 174 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 109821 - 109698
Alignment:
Q  174 tatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgt 273  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | | |||| |||| | |||||||  |||| | |    
T  109821 tatgatgatatgtttgaatccatgaagttgttgataattgaattgttgttaatgaaatttcatgtttaaagtatgagaaagt-ggtatatgttgaaatat 109723  T
Q  274 gctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    |||| |||||||||||| |||||||    
T  109722 gctcaaattgttgaattttgctatg 109698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Original strand, 102935 - 103061
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| | |||| |||| | ||||||| ||| |     
T  102935 aattatgatgatatgtttgaatgcatgaagtttttgataattgaattgttgttagtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-ggtatatggtggaa 103033  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    | ||||  | |||||||||| |||||||    
T  103034 tatgctaaatttgttgaattatgctatg 103061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 40)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Original strand, 22497224 - 22497348
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  22497224 ttatgatgatatgtttgagtagatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcataatatgtgaaaat-gatatattgtgaattg 22497322  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  22497323 tgctctaattgttgaattgtgctatg 22497348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Original strand, 18261486 - 18261610
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  18261486 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatcttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaattg 18261584  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  18261585 tgctctaattgttgaattgtgctatg 18261610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Original strand, 24552585 - 24552709
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  24552585 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaattg 24552683  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  24552684 tgctctaattgttgaattgtgttatg 24552709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 33172460 - 33172336
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  33172460 ttatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaattg 33172362  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  33172361 tgctctaattgttgaattgtgctatg 33172336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Original strand, 45558952 - 45559076
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  45558952 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaattg 45559050  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  45559051 tgctctaattgttgaattgtgctatg 45559076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 172 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 22742997 - 22742872
Alignment:
Q  172 attatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaatt 271  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||    
T  22742997 attatggtgatatgtttgagtgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaatt 22742899  T
Q  272 gtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  22742898 gtgctctaaatgttgaattgtgctatg 22742872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 16002230 - 16002105
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  16002230 ttatgatgatatgtttgagtatatgaatttgatgataatttaattgttgttgatgaaattgtatgttcatgatatgtgaaaatgagtatattgtaaattg 16002131  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  16002130 tgctctaattgttgaattgtgctatg 16002105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Original strand, 18041547 - 18041671
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  18041547 ttatgacgatatgtttgagtacaagaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaattg 18041645  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||    
T  18041646 tactcaaattgttgaattgtgttatg 18041671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Original strand, 45465141 - 45465265
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||     
T  45465141 ttatgatgttatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gttatattgtgaatta 45465239  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||    
T  45465240 tgctctagatgttgaattgagctatg 45465265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Original strand, 38635663 - 38635787
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||     
T  38635663 ttatcatgatatgtttgaatacatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcataatatgcgaaaat-gatatattgtgaatta 38635761  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||    
T  38635762 tactcaaattgttgaattgtgttatg 38635787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 26011728 - 26011602
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||| | | |||||  |||||    
T  26011728 aattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcaaagtatgtgaaagt-gttatatgttgaat 26011630  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||    
T  26011629 tatgctctaaatgttgaattgtgctatg 26011602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Original strand, 37653629 - 37653749
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    ||||||| |||| ||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||    
T  37653629 aattatggtgatgtgtttgtatgcatgaatttggtgataattgaattgttgttgctgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaat 37653727  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgt 292  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  37653728 tgtgctctaaatgttgaattgt 37653749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 15933532 - 15933406
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| | | || ||  |||||    
T  15933532 aattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaagt-gttaaatgttgaat 15933434  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  15933433 tatgctctaaatgttgaattgtgttatg 15933406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 33528659 - 33528533
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||| ||||||| | |||||  |||||    
T  33528659 aattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataattgaattgttgttgatgaaattgtatcttcttagtatatgaaaat-gatatatgttgaat 33528561  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  33528560 tgtgctctaaatgttgaattgtgctatg 33528533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 181 - 298
Target Start/End: Original strand, 19331340 - 19331453
Alignment:
Q  181 atatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgtgctctaa 280  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||    
T  19331340 atatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaa---ttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaattatgctcaaa 19331435  T
Q  281 ttgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  19331436 ttgttgagttgtgctatg 19331453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 5854848 - 5854722
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||| ||||| | | |||||  |||||    
T  5854848 aattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggcgataattgaattgttgttggtgaaatagcatgttcaaagtatatgaaagt-gttatatgttgaat 5854750  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    | |||||||| |||||| ||||||||||    
T  5854749 tatgctctaaatgttgagttgtgctatg 5854722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 180 - 298
Target Start/End: Original strand, 18118311 - 18118429
Alignment:
Q  180 gatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgtgctcta 279  Q
    |||||||||| ||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||   |||| ||||||| ||||||||||||  |    
T  18118311 gatatgtttgcgtatataaatttgatgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcatgatatgcataaattggtatatggtgaattgtgcttaa 18118410  T
Q  280 attgttgaattgtgctatg 298  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  18118411 attgatgaattgtgctatg 18118429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 173 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 22887993 - 22887893
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||   |||||||||||||||||  ||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  22887993 ttatgatgatatgtttgagtatatgaatttgatgatatttgaattgttg---atgaaattgcatgttcatgatatgtataaatgagtatattgtgaattg 22887897  T
Q  273 tgct 276  Q
    ||||    
T  22887896 tgct 22887893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 174 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 25296389 - 25296266
Alignment:
Q  174 tatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgt 273  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |   ||||||||| | |||||  |||||| |    
T  25296389 tatgatgatatgtttgaatgcatgaaattaatgataattgaattgctgttggtgaaattgcatgttcaaagcttgtgaaaat-gatatatgttgaattat 25296291  T
Q  274 gctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    |||| |||||||||||||| |||||    
T  25296290 gctcaaattgttgaattgttctatg 25296266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 174 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 29306648 - 29306525
Alignment:
Q  174 tatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgt 273  Q
    ||||||||||||||  | | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| | | ||||||||| | |||||  |||||| |    
T  29306648 tatgatgatatgttctaatgcatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaatttgtatgttcaaagtttgtgaaaat-gatatatgttgaattat 29306550  T
Q  274 gctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  29306549 gctcaaattgttgaattgtgctatg 29306525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 174 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 25758409 - 25758286
Alignment:
Q  174 tatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgt 273  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |   | ||||||| | |||||  |||||| |    
T  25758409 tatgatgatatgtttgaatgcatgaaattaatgataattgaattgctgttggtgaaattgcatgttcaaagcttttgaaaat-gatatatgttgaattat 25758311  T
Q  274 gctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    |||| |||||||||||||| |||||    
T  25758310 gctcaaattgttgaattgttctatg 25758286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 171 - 290
Target Start/End: Original strand, 21198165 - 21198283
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||| |||| | | |||||  |||||    
T  21198165 aattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgtagataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttgaat 21198263  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaatt 290  Q
    | ||||| ||||||||||||    
T  21198264 tatgctcaaattgttgaatt 21198283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 171 - 230
Target Start/End: Original strand, 27233103 - 27233162
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaa 230  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  27233103 aattatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgtttttggtgaaa 27233162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 171 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 17285438 - 17285323
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||| |||| | | |||||  |||||    
T  17285438 aattatgatgatatgtttaaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttgaat 17285340  T
Q  271 tgtgctctaattgttga 287  Q
    | ||||| |||||||||    
T  17285339 tatgctcaaattgttga 17285323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 22981507 - 22981381
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||   |||||| |||||||| | |||| |||| | |||||||  ||||     
T  22981507 aattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagagaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-ggtatatgttgaaa 22981409  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    | ||||| |||||||||||| |||||||    
T  22981408 tatgctcaaattgttgaattatgctatg 22981381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 171 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 23150013 - 23149930
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatg-ttcacaatatgtgaaa 253  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  23150013 aattatgatgatatgtttgaatgcatgaaactagtgataaatgaattgttgttggtgaaatttcatgattcaaaatatgtgaaa 23149930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 23837432 - 23837306
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| | |||| |||| | | |||||  ||||     
T  23837432 aattatgatgatatgtttaaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttattgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttgaac 23837334  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    | ||||| |||||||||||| |||||||    
T  23837333 tatgctcaaattgttgaattatgctatg 23837306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 293
Target Start/End: Original strand, 21259520 - 21259633
Alignment:
Q  179 tgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgtgctct 278  Q
    |||||||||||||||  | || ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  || | |  |||||||||  |||||||||||||||     
T  21259520 tgatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgaatttttgatgatgaaattgcatgttcatgatgtatataaatgggtagtttgtgaattgtgctc- 21259618  T
Q  279 aattgttgaattgtg 293  Q
    ||||| |||||||||    
T  21259619 aattgatgaattgtg 21259633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 241
Target Start/End: Original strand, 23151846 - 23151916
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttca 241  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  23151846 aattatgatgatatatttgaatgcatgaaactagtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 23151916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 298
Target Start/End: Original strand, 33611069 - 33611192
Alignment:
Q  174 tatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgt 273  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||| | |||||||| | ||||||||| | | ||||||| ||||| |    
T  33611069 tatgatgatatatttgaatgcatgaaattggtgatcattagattgttgttggtgaaaattcatgttcaaagtatgtgaaagt-gatatattgagaattat 33611167  T
Q  274 gctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||| ||| | ||||||| |||||||    
T  33611168 gctataaatattgaattatgctatg 33611192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 23158395 - 23158312
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatg-ttcacaatatgtgaaa 253  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||| ||||||    
T  23158395 aattatgatgatatgtttgaatgcatgaaactagtgataaatgaattgttgttggtgaaatttcatgattcaaaatacgtgaaa 23158312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 38533883 - 38533757
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||   |||||  |||||||| | |||| |||||| |||||||  ||||     
T  38533883 aattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagagaaatctcatgttcaaagtatgagaaaat-ggtatatgttgaaa 38533785  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    | ||||| |||| ||||||| |||||||    
T  38533784 tatgctcaaattattgaattatgctatg 38533757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 174 - 238
Target Start/End: Original strand, 23226092 - 23226156
Alignment:
Q  174 tatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgt 238  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  23226092 tatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgagttgttgttggtgaatttgcatgt 23226156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 197 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 15970029 - 15969970
Alignment:
Q  197 gaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatg 256  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||| | ||| ||||||||    
T  15970029 gaaattggtgataattgatttgttgttggtgaaattgaatgatcaaagtatatgaaaatg 15969970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17502387 - 17502325
Alignment:
Q  179 tgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttca 241  Q
    |||||||||||||||  | || ||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  17502387 tgatatgtttgagtatgttaatttgatgatgattgaattgttaatgatgaaattgcatgttca 17502325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 241
Target Start/End: Original strand, 20175795 - 20175857
Alignment:
Q  179 tgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttca 241  Q
    ||||||||||  |||  |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  20175795 tgatatgtttcggtatgtgaaattgatgataattgaattgttgatgtagaaattgcatgttca 20175857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 241
Target Start/End: Original strand, 20220522 - 20220584
Alignment:
Q  179 tgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttca 241  Q
    ||||||||||  |||  |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  20220522 tgatatgtttcggtatgtgaaattgatgataattgaattgttgatgtagaaattgcatgttca 20220584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 179 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 4234081 - 4234021
Alignment:
Q  179 tgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgtt 239  Q
    |||||||||||||||  | || ||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4234081 tgatatgtttgagtatgttaatttgatgatgattgaattgttaatgatgaaattgcatgtt 4234021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 277
Target Start/End: Original strand, 16038936 - 16039008
Alignment:
Q  205 tgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgtgctc 277  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||  || | ||||||||||||  |||| |||| |||||    
T  16038936 tgataaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctc 16039008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 179 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23218103 - 23218043
Alignment:
Q  179 tgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgtt 239  Q
    |||||||||||||||  | || ||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  23218103 tgatatgtttgagtatgttaatttgatgatgattgaattgttaatgatgaaattgcatgtt 23218043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 40)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Original strand, 8267743 - 8267867
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  8267743 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaattg 8267841  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  8267842 tgctctaattgttgaattgtgctatg 8267867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 46474234 - 46474109
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  46474234 ttatgatgatatgttagagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcataatatgtggaaatgtgtatattgttaattg 46474135  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  46474134 tgctctaattgttgaattgtgctatg 46474109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 45152915 - 45152811
Alignment:
Q  1 acaagaatcgtcatttaaaagttaagctgaaatattataacatttatttcatcatttaaaaatatgttttcttcaaattattattttgggtacattataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45152915 acaagaatcgtcatttaaaagttaagctgaaatattataacatttatttcatcatttaaaaatatgttttcttcaaattattattttgggtacattataa 45152816  T
Q  101 ttcca 105  Q
    |||||    
T  45152815 ttcca 45152811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 173 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 45149816 - 45149713
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45149816 ttataatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 45149717  T
Q  273 tgct 276  Q
    ||||    
T  45149716 tgct 45149713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Original strand, 9723822 - 9723946
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  9723822 ttatgatgatatgtttgggtacatgaaattggtgataattcaattgatgttgatgaaactgcatgttcataatatgtgaaaat-gatatattgtgaattg 9723920  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  9723921 tgctctaattgttgaattgtgctatg 9723946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 28390544 - 28390420
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28390544 ttatgatgttatgtttgagtacatgaaattggtgataattaaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-ggtatattgtgaattg 28390446  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  28390445 tgctctaaatgttgaattgtgctatg 28390420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Original strand, 20583567 - 20583693
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||    
T  20583567 aattatgaagatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattattgttgatgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaat 20583665  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  20583666 tatgctcaaattgttgaattgtgctatg 20583693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Original strand, 13448842 - 13448966
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  13448842 ttatcatgttatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattattgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaattg 13448940  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  13448941 tgctctaaatgttgaattgtgctatg 13448966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 28722342 - 28722218
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||     
T  28722342 ttatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaatta 28722244  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  28722243 tgctcaaattgttgaattgtgctatg 28722218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 15359031 - 15358905
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||    
T  15359031 aattatggtgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaat 15358933  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  15358932 tgtgctctaaatgttgaattgtgttatg 15358905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 38424451 - 38424327
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||     
T  38424451 ttatgatgatatgtttgaatacataaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaatta 38424353  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||    
T  38424352 tgctcaaattgttgaattgttctatg 38424327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 174 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 4484958 - 4484836
Alignment:
Q  174 tatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgt 273  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||||| | ||||||||||||| |    
T  4484958 tatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggagaaattgcatgttcattgtatgtgaaaat-gatatattgtgaattat 4484860  T
Q  274 gctctaattgttgaattgtgctat 297  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  4484859 gctcaaattgttgaattgtgctat 4484836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 4446444 - 4446320
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| || ||||    
T  4446444 ttatgatgatatgtttgcacacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattatgtattg 4446346  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  4446345 tgctccaattgttgaattgtgctatg 4446320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 14935592 - 14935468
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||     
T  14935592 ttatggtgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaatta 14935494  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  14935493 tgctcaaattgttgaattgtgatatg 14935468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 15363185 - 15363061
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||     
T  15363185 ttatggtgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaatta 15363087  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  15363086 tgctcaaattgttgaattgtgatatg 15363061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Original strand, 17947607 - 17947731
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||| || | ||||||||||| | |||||||| |||||    
T  17947607 ttatgatgatatgtttgagtgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggttaaactgaatgtgcatagtatgtgaaaat-gatatattgtaaattg 17947705  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  17947706 tgctctaattgttgaattgtgctatg 17947731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 9839113 - 9838987
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| | | |||||  |||||    
T  9839113 aattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaagt-gttatatgttgaat 9839015  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||    
T  9839014 tatgctctaaatgttgaattgtgctatg 9838987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 31501407 - 31501281
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||    
T  31501407 aattatgaagatatgtttaaatacatgaaattggtgataattgaattgttattggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaat 31501309  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
      ||||| ||||||||||||||||||||    
T  31501308 aatgctcaaattgttgaattgtgctatg 31501281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 103 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 45152501 - 45152427
Alignment:
Q  103 ccatgtttggatgttgtataatcatgtcctgcacatccagcaacaaagccagccacactagccgtgcaaattatg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45152501 ccatgtttggatgttgtataatcatgtcctgcacatccagcaacaaagccagccacactagccgtgcaaattatg 45152427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 4439015 - 4438891
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    ||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  4439015 ttatgataatatgtttgcacacatgaaattggtgataattgaattgttattggtgaaattgcatgttcatagtatgttaaaat-gatatattgtgaattg 4438917  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  4438916 tgctccaattgttgaattgtgctatg 4438891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 174 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 33559878 - 33559755
Alignment:
Q  174 tatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgt 273  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||| | ||||||||||||||     
T  33559878 tatgatgatatgttaaaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgagaaaat-gatatattgtgaattgg 33559780  T
Q  274 gctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||    
T  33559779 gctctaaatgttgaattgtgttatg 33559755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 48356878 - 48356752
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| | | |||||  |||||    
T  48356878 aattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaagt-gttatatgttgaat 48356780  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  48356779 tatgctctaaatgttgaattgtgttatg 48356752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 9611542 - 9611415
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| | | |||||  |||||    
T  9611542 aattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaagt-gttatatgttgaat 9611444  T
Q  271 tgtgc-tctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    | ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  9611443 tatgcttctaaatgttgaattgtgctatg 9611415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Original strand, 16914941 - 16915067
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| | | |||||  |||||    
T  16914941 aattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaagt-gttatatgttgaat 16915039  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    | ||||||||  ||||||||||||||||    
T  16915040 tatgctctaaacgttgaattgtgctatg 16915067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 173 - 293
Target Start/End: Original strand, 8563362 - 8563482
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |  ||||| ||||||||||| ||     
T  8563362 ttatgatgatatgtttgagtatatgaatttgatgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcatgatatatataaatgagtatattgtgagtta 8563461  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtg 293  Q
    ||||| ||| | |||||||||    
T  8563462 tgctcaaatggatgaattgtg 8563482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 173 - 256
Target Start/End: Original strand, 9319578 - 9319661
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatg 256  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  9319578 ttatgatgatatgtttgaatacaagaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatg 9319661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 14940986 - 14940863
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||| |||   ||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  14940986 aattatggtgatatgtttgaatgcatgaaatttgtgataattaaattgttggtga---aattgcatgttcatagtatgtgaaaatga-tatattgtgaat 14940891  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  14940890 tatgctcaaattgttgaattgtgctatg 14940863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 171 - 253
Target Start/End: Original strand, 34241220 - 34241302
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaa 253  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||    
T  34241220 aattatgatgttatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttaaaagtatgtgaaa 34241302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 171 - 256
Target Start/End: Original strand, 14271912 - 14271997
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatg 256  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  14271912 aattatggtgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataattcaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaaatg 14271997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 15368579 - 15368456
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||   |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||    
T  15368579 aattatggtgatatgtttgaatgcatgaaatttgtgataattaaa---ttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaat 15368484  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    | ||||| ||||  ||||||||| ||||    
T  15368483 tatgctcaaattaatgaattgtgatatg 15368456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13377763 - 13377693
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttca 241  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  13377763 aattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 13377693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Original strand, 17223951 - 17224077
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| | |||| |||| | | |||||  |||||    
T  17223951 aattatgatgatatgtttgaatgcacgaagttgtggataattgaattgttgtttgtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttgaat 17224049  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    | | ||| |||||||||||| |||||||    
T  17224050 tatactcaaattgttgaattatgctatg 17224077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 293
Target Start/End: Original strand, 39291538 - 39291651
Alignment:
Q  179 tgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgtgctct 278  Q
    |||||||||||||||  | || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  || | |  |||||||||  ||||||||| |||||     
T  39291538 tgatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgaattgttgatgatgaaattgcatgttgatgatgtatataaatgggtagtttgtgaattatgctc- 39291636  T
Q  279 aattgttgaattgtg 293  Q
    ||||| |||||||||    
T  39291637 aattggtgaattgtg 39291651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 241
Target Start/End: Original strand, 49047687 - 49047757
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttca 241  Q
    |||||| |||| |||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  49047687 aattataatgacatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 49047757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 241
Target Start/End: Original strand, 15977870 - 15977932
Alignment:
Q  179 tgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttca 241  Q
    |||||||||||||||  | || ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  15977870 tgatatgtttgagtatgttaatttgttgataattgaattattgatgatgaaattgcatgttca 15977932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9250671 - 9250630
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattga 214  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  9250671 ttatgatgatatgtttgaatacaagaaattggtgataattga 9250630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 186 - 219
Target Start/End: Original strand, 17947546 - 17947579
Alignment:
Q  186 tttgagtacatgaaattggtgataattgaattgt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17947546 tttgagtacatgaaattggtgataattgaattgt 17947579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13275011 - 13274941
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttca 241  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||| ||| || ||||||||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  13275011 aattatgatgatatgtttgaatgcaagaagttgttggtaattgaattgttgttagtaaaatttcatgttca 13274941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 241
Target Start/End: Original strand, 44305034 - 44305096
Alignment:
Q  179 tgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttca 241  Q
    ||||||||||  |||  |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  44305034 tgatatgtttcggtatgtgaaattgatgataattgaattgttgatgtagaaattgcatgttca 44305096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 241
Target Start/End: Original strand, 13037048 - 13037112
Alignment:
Q  176 tgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttca 241  Q
    ||||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  13037048 tgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttgatgaaattgcatgttca 13037112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 29)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 23417474 - 23417349
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23417474 ttatgatgatttgtttgagtacatgaatttggtgatgattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcataatatgtgaaaattggtatattgtgaattg 23417375  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23417374 tgctctaattgctgaattgtgctatg 23417349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Original strand, 16835314 - 16835438
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16835314 ttatgatgatatgtttgggtacatgaaattggtgataattgatttgttgttgatgaaattgcatgttcataatatgtgaaaat-agtatattgtgaattg 16835412  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  16835413 tgctctaattgtcgaattgtgctatg 16835438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 176 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 21109979 - 21109858
Alignment:
Q  176 tgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgtgc 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  21109979 tgatgatatgtttgagtacatgaaattggtaataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaattgtgc 21109881  T
Q  276 tctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  21109880 tctaattgttgaattgtgttatg 21109858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 174 - 298
Target Start/End: Original strand, 26559831 - 26559954
Alignment:
Q  174 tatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgt 273  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  26559831 tatgattatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaattgt 26559929  T
Q  274 gctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  26559930 gctctaaatgttgaattgtgctatg 26559954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 173 - 297
Target Start/End: Original strand, 23234500 - 23234623
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | | ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  23234500 ttatgatgatatgtttaagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgtaattgcatgtttatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaattg 23234598  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctat 297  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  23234599 tgctctaattattgaattgtgctat 23234623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 22885876 - 22885750
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||    
T  22885876 aattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gttatattgtgaat 22885778  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  22885777 tgtgctcaaattattgaattgtgttatg 22885750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 24084311 - 24084185
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||    
T  24084311 aattatggtgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtaaaattacatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaat 24084213  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  24084212 tgtgctctaaatgttgaattgtgctatg 24084185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 29918199 - 29918073
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| | || ||||||||||||    
T  29918199 aattatgatgatatgtttgaatacatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaca-ggatatattgtgaat 29918101  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  29918100 tatgctctaaatgttgaattgtgttatg 29918073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 177 - 298
Target Start/End: Original strand, 11763523 - 11763644
Alignment:
Q  177 gatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgtgct 276  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||  |  |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  11763523 gatgatatgtttgagtagatgaatttgatgataattgagttgatgttgatgaaatttcatgttcatgaggtgtataaatgggtatattgtgaattgtgct 11763622  T
Q  277 ctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  11763623 ctaattgttgaattgtgctatg 11763644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 174 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 37983595 - 37983472
Alignment:
Q  174 tatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgt 273  Q
    |||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||| | | ||||||||||||| |    
T  37983595 tatggtgatatatttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatattcaaagtatgtgaaagt-gatatattgtgaattat 37983497  T
Q  274 gctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  37983496 gctctaaatgttgaattgtgctatg 37983472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Original strand, 21222621 - 21222747
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||| | | |||||  |||||    
T  21222621 aattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattaaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatatgaaagt-gttatatgttgaat 21222719  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    | |||||||| |||| ||||||||||||    
T  21222720 tatgctctaaatgtttaattgtgctatg 21222747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 174 - 296
Target Start/End: Original strand, 21310725 - 21310846
Alignment:
Q  174 tatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgt 273  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||| | |||||  |||||| |    
T  21310725 tatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtttgtgaaaat-gatatatgttgaattat 21310823  T
Q  274 gctctaattgttgaattgtgcta 296  Q
    |||  ||||||| ||||||||||    
T  21310824 gctaaaattgttaaattgtgcta 21310846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 6456855 - 6456732
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||   |||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||    
T  6456855 aattatgaagatacgtttgaatacatgaaattggcgataattgaatt---gttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaat 6456760  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    | ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  6456759 tatgctcaaattgttgaattgtgttatg 6456732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 173 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19873993 - 19873933
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattg 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19873993 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattg 19873933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 19862443 - 19862317
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||| |||| | | |||||  |||||    
T  19862443 aattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttgaat 19862345  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    | ||||| |||||||||||| |||||||    
T  19862344 tatgctcaaattgttgaattatgctatg 19862317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 174 - 256
Target Start/End: Original strand, 21297191 - 21297273
Alignment:
Q  174 tatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatg 256  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  21297191 tatgatgatatgtttgaacgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtttgtgaaaatg 21297273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 225 - 297
Target Start/End: Original strand, 24225383 - 24225455
Alignment:
Q  225 atgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgtgctctaattgttgaattgtgctat 297  Q
    |||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24225383 atgaaattgcatgttcatgatatgtataaatgggtatattgtgatttgtgctctaattgttgaattgtgctat 24225455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 21617250 - 21617124
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||  | ||| ||||| | | |||||  ||||     
T  21617250 aattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattggattgttgttagtgaaattgcatgttccaagtatatgaaagt-gttatatgttgaac 21617152  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    | |||||||| ||||||||||| |||||    
T  21617151 tatgctctaaatgttgaattgttctatg 21617124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 171 - 241
Target Start/End: Original strand, 23981529 - 23981599
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttca 241  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  23981529 aattatgatgatatgtttgtatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttca 23981599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Original strand, 5450856 - 5450982
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||| |||| | | |||||  |||||    
T  5450856 aattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttgaat 5450954  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    | ||||| ||||| |||||| |||||||    
T  5450955 tatgctcaaattgatgaattatgctatg 5450982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 169 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 3674098 - 3673970
Alignment:
Q  169 caaattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtga 268  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||   |||||| |||| ||| | |||| |||| | |||||||  |||    
T  3674098 caaattatgatgatatgtttgaatacattaagttgttgataattgaattgttgttagggaaatttcatgatcaaagtatgagaaagt-ggtatatgttga 3674000  T
Q  269 attgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    | | ||||| |||||||||||| |||||||    
T  3673999 aatatgctcaaattgttgaattatgctatg 3673970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 171 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 432697 - 432579
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| | |||| |||||| | |||||  |||||    
T  432697 aattatgatgatatgtttgaatgcatgtagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcatgttcaaagtatgagaaaat-gatatatgttgaat 432599  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaatt 290  Q
    | ||||| ||||| ||||||    
T  432598 tatgctcaaattgatgaatt 432579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 7728630 - 7728528
Alignment:
Q  195 atgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgtgctctaattgttgaattgtgc 294  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| | |||| |||| | | |||||  |||| | ||||| |||||||||||| |||    
T  7728630 atgaaattggtgataattgatttgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgc 7728532  T
Q  295 tatg 298  Q
    ||||    
T  7728531 tatg 7728528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Original strand, 22662730 - 22662766
Alignment:
Q  205 tgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttca 241  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22662730 tgataattgaattgttgatgatgaaattgcatgttca 22662766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 255
Target Start/End: Original strand, 32966162 - 32966246
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaat 255  Q
    |||||||||| |||||| || |  | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||| | ||| |||||||    
T  32966162 aattatgatgttatgttggaatgtaagaaattggtgataattgatttgttgttggtgaaattgaatgatcaaagtatatgaaaat 32966246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 171 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 28902425 - 28902366
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaa 230  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  28902425 aattatgatgttatgtttgaatgcataaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaa 28902366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 171 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 28938820 - 28938761
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaa 230  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  28938820 aattatgatgttatgtttgaatgcataaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaa 28938761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 208
Target Start/End: Original strand, 5621810 - 5621844
Alignment:
Q  174 tatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgat 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5621810 tatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgat 5621844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16595741 - 16595691
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttg 221  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16595741 aattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttg 16595691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 23)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 33397584 - 33397460
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  33397584 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgagttgttgttgatgaaattgcatgttcataatatgtgaaaat-aatatattgtgaattg 33397486  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  33397485 tgctctaattgttgaattgtgctatg 33397460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Original strand, 40436284 - 40436408
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  40436284 ttatgatgatatgtttgaatatatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcataatatgtgaaaat-gatatattgtgaattg 40436382  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  40436383 tgctctaattgttgaattgtgctatg 40436408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 173 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 20194258 - 20194137
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgttt-gagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaatt 271  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20194258 ttatgatgatatgttttgagtatatgaatttggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcataatatgtgataatgggtatattgtgaatt 20194159  T
Q  272 gtgctctaattgttgaattgtg 293  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  20194158 gtgctctaattgttgaattgtg 20194137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Original strand, 5768184 - 5768308
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  5768184 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgtatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaattg 5768282  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  5768283 tgctctaattgttgaattgtgttatg 5768308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 25094091 - 25093967
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  25094091 ttatgatgatatgtttgagtacatgaatttggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgtccataatatgagaaaat-gatatattgtgaattg 25093993  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    || |||||||||||||||||| ||||    
T  25093992 tgttctaattgttgaattgtgttatg 25093967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 52400865 - 52400739
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||    
T  52400865 aattatggtgatatgtttgaatacatgaaattggtgatagttgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaat 52400767  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  52400766 tgtgctataaatgttgaattgtgctatg 52400739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 171 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 21195248 - 21195124
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||    
T  21195248 aattatggtgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgtatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaat 21195150  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgcta 296  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||    
T  21195149 tatgctcaaattgttgaattgtgcta 21195124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Original strand, 49997296 - 49997420
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  49997296 ttatggtgatatgtttgaatatatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaattg 49997394  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    | |||||| | |||||||||||||||    
T  49997395 tactctaaattttgaattgtgctatg 49997420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 172 - 288
Target Start/End: Original strand, 8537924 - 8538039
Alignment:
Q  172 attatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaatt 271  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||    
T  8537924 attatgatgatatgtttgaatgcatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gttatattgtgaatt 8538022  T
Q  272 gtgctctaattgttgaa 288  Q
    |||||  ||||||||||    
T  8538023 gtgcttaaattgttgaa 8538039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 172 - 288
Target Start/End: Original strand, 8603163 - 8603278
Alignment:
Q  172 attatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaatt 271  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||    
T  8603163 attatgatgatatgtttgaatgcatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gttatattgtgaatt 8603261  T
Q  272 gtgctctaattgttgaa 288  Q
    |||||  ||||||||||    
T  8603262 gtgcttaaattgttgaa 8603278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 17609162 - 17609036
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||| | | |||||  |||||    
T  17609162 aattatgatgatatatttgaatgcatgaaattggtgataattggattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatatgaaagt-gttatatgttgaat 17609064  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||    
T  17609063 tatgctctaaatgttgaattgtgctatg 17609036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 173 - 303
Target Start/End: Original strand, 37233875 - 37234004
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||| ||||| | | |||||  ||||||     
T  37233875 ttatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtaaaattgcatgttcaaagtatatgaaagt-gatatatgttgaatta 37233973  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatgatgtg 303  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  37233974 tgctctaaatgttgaattatgctatgttgtg 37234004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 244 - 298
Target Start/End: Original strand, 76458 - 76512
Alignment:
Q  244 atatgtgaaaatgggtatattgtgaattgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  76458 atatgtgaaaaagggtatattgtgaattgtgctctaattgttgaattgtgctatg 76512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 20177409 - 20177283
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||||||||||| | | || ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||| |||| | | |||||  |||||    
T  20177409 aattatgatgatatgttttaatgcacgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttgaat 20177311  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    | ||||| |||||||||||| |||||||    
T  20177310 tatgctcaaattgttgaattatgctatg 20177283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 19603331 - 19603246
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatg 256  Q
    |||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||| | ||| ||||||||    
T  19603331 aattatgatgttatgtttgaatgtatgaaattggtgataattgatttgttgttggtgaaattgaatgatcaaagtatatgaaaatg 19603246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 298
Target Start/End: Original strand, 22143377 - 22143500
Alignment:
Q  174 tatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgt 273  Q
    ||||||||| ||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||  |||| | ||  || |||||| |    
T  22143377 tatgatgatgtgtttgtatgcatgaaatttgtgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaagtatgtataaat-gttaacttatgaattat 22143475  T
Q  274 gctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||    
T  22143476 gctcaaatggttgaattatgctatg 22143500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 241
Target Start/End: Original strand, 13376872 - 13376942
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttca 241  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  13376872 aattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattaaattgttgtcgttgaaatttcatgttca 13376942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 233
Target Start/End: Original strand, 20955452 - 20955514
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattg 233  Q
    |||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  20955452 aattatgatgttatgtttgaatgtatgaaattggtgataattgatctgttgttggtgaaattg 20955514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 257
Target Start/End: Original strand, 51627677 - 51627763
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgg 257  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||| ||| |||| ||||||||||||||  ||||| | |||||||| | |||| ||||||||    
T  51627677 aattatgatgatatgcttgaatgcatgaatttgttgatgattgaattgttgttagtgaaacttcatgttcaaagtatgagaaaatgg 51627763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 256
Target Start/End: Original strand, 38033688 - 38033772
Alignment:
Q  172 attatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatg 256  Q
    ||||||||| ||||||||  |  | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| | ||| ||||||||    
T  38033688 attatgatgttatgtttgtatgtaagaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgaatgatcaaagtatatgaaaatg 38033772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 171 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16656872 - 16656813
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaa 230  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  16656872 aattatgatgttatgtttgaatgcataaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaa 16656813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 233
Target Start/End: Original strand, 22829438 - 22829500
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattg 233  Q
    |||||||||| ||||||||| |  |||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  22829438 aattatgatgttatgtttgaatgtatgaaactggtgataattgatttgttgttagtgaaattg 22829500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27675030 - 27674968
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattg 233  Q
    |||||||||| ||||||||| |  | |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  27675030 aattatgatgttatgtttgaatgtaagaaattggtgataattgatttgttattggtgaaattg 27674968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0670 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0670
Description:

Target: scaffold0670; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Original strand, 7690 - 7814
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  7690 ttatgatgatatgtttgactacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaattg 7788  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  7789 tgctctaattgttgaattgtgctatg 7814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 37790 - 37666
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37790 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgaaaattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-ggtatattgtgaattg 37692  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  37691 tgctctaaatgttgaattgtgctatg 37666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 23)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 25595252 - 25595128
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25595252 ttatgatgatatgtttgagtacatgaatttggtgataaatgaattgttgttgatgaaattgcatgtccataatatgtgaaaat-ggtatattgtgaattg 25595154  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  25595153 tactctaattgttgaattgtgctatg 25595128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 9636977 - 9636853
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||     
T  9636977 ttatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaatta 9636879  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  9636878 tgctctaattgttgaattgtgctatg 9636853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 18536988 - 18536863
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18536988 ttatgatgatatgtttgagtacatgaatttggtgataattaaattgctgtagatgaaattgcatgttcataatatgtgaaaatgggtatattgtaaattg 18536889  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  18536888 tgctctaattgttaaattgtgttatg 18536863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Original strand, 16292816 - 16292940
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||| |||||    
T  16292816 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaactgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgcgaaaat-ggtatattgtcaattg 16292914  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||    
T  16292915 tgctttaattgttgaattgtactatg 16292940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 24277993 - 24277869
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  24277993 ttatgatgatatgtttgaatacatgatattggtgacaattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaattg 24277895  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  24277894 tgctctaattgttgaattgtgttatg 24277869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 171 - 296
Target Start/End: Original strand, 24087400 - 24087525
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||  ||||||||||||| |||||    
T  24087400 aattatgatgatatgtttgagcacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatggtatgtataaatgggtatattatgaat 24087499  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgcta 296  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||||    
T  24087500 tgtgcttaaattgatgaattgtgcta 24087525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 174 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 24884917 - 24884794
Alignment:
Q  174 tatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgt 273  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| | | |||||||||| || |    
T  24884917 tatgatgatatgtttgaatgcatggaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaagt-gatatattgtgagttat 24884819  T
Q  274 gctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  24884818 gctctaaatgttgaattgtgctatg 24884794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 171 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 19660114 - 19659995
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||| |    
T  19660114 aattatgatgatatgttcgtatacatgaaattggtgataattgaattattgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgggtat-ttatgagt 19660016  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattg 291  Q
    | ||||| |||||||||||||    
T  19660015 tttgctcaaattgttgaattg 19659995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 180 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 20279636 - 20279540
Alignment:
Q  180 gatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgtgct 276  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  20279636 gatatgtttgggtatatgaatttgatgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcatgatatgtataaatgggtatattgtgaattgtgct 20279540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 225 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 6094896 - 6094824
Alignment:
Q  225 atgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6094896 atgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatga-tatattgtgaattgtgctctaattgttgaattgtgttatg 6094824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 68226 - 68100
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||| |||| | | |||||  ||||     
T  68226 aattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttgaaa 68128  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    | ||||| |||||||||||| |||||||    
T  68127 tatgctcaaattgttgaattatgctatg 68100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 178 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19666755 - 19666692
Alignment:
Q  178 atgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttca 241  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  19666755 atgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgtttttggtgaatttgcatgttca 19666692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 43646127 - 43646001
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| | | |||| |||| | | |||||  |||||    
T  43646127 aattatgttgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattggattgttgttggtgaaatttcatgtttaaagtatgagaaagt-gatatatgttgaat 43646029  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    | ||||| |||||||||||| |||||||    
T  43646028 tatgctcaaattgttgaattatgctatg 43646001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 103 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 38256320 - 38256247
Alignment:
Q  103 ccatgtttggatgttgtataatcatgtcctgcacatccagcaacaaagccagccacactagccgtgcaaattat 176  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  38256320 ccatgttttgatgctgtataatcatgtcctgcacatctaccaacaaaaccagctacactggctgtgcaaattat 38256247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Original strand, 19669125 - 19669191
Alignment:
Q  174 tatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttc 240  Q
    |||| |||||||||||  | |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  19669125 tatggtgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgagttgttgttggtgaaattgcatgttc 19669191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 722625 - 722540
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatg 256  Q
    |||||||||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||| | ||| ||||||||    
T  722625 aattatgatattatgtttgaatgtatgaaattggtgataattgatttgttgttggtgaaattgaatgatcaaagtatatgaaaatg 722540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Original strand, 31146194 - 31146320
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||  ||||||| | |||| |||| | | |||||  ||||     
T  31146194 aattatgatggtatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagagaaattttatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttgaaa 31146292  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    | ||||| |||||||||||| |||||||    
T  31146293 tatgctcaaattgttgaattatgctatg 31146320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 241
Target Start/End: Original strand, 22775218 - 22775288
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttca 241  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  22775218 aattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgaaacttcatgttca 22775288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 241
Target Start/End: Original strand, 22780596 - 22780666
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttca 241  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  22780596 aattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgaaacttcatgttca 22780666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 171 - 226
Target Start/End: Original strand, 23821652 - 23821707
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgat 226  Q
    |||||||||| ||||||||| | || ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  23821652 aattatgatgttatgtttgaatgcaggaagttgttgataattgaattgttgttgat 23821707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 171 - 226
Target Start/End: Original strand, 23830731 - 23830786
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgat 226  Q
    |||||||||| ||||||||| | || ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  23830731 aattatgatgttatgtttgaatgcaggaagttgttgataattgaattgttgttgat 23830786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 205 - 260
Target Start/End: Original strand, 28031293 - 28031348
Alignment:
Q  205 tgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggta 260  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  28031293 tgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtgtgaaaatgggta 28031348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 6094918 - 6094888
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094918 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattg 6094888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 173 - 292
Target Start/End: Original strand, 2787 - 2905
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2787 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaatcgttgttgataaaattgcattttcataatatgtgaaaat-ggtatattgtgaattg 2885  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgt 292  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  2886 tgctctaattgttgaattgt 2905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 3483 - 3359
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  3483 ttatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaattg 3385  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  3384 ggctctaattgttgaattgtgctatg 3359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 24)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Original strand, 13590089 - 13590213
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  13590089 ttatgatgatatgtttgggtacatgaaattggtgataattcaattgatgttgatgaaactgcatgttcataatatgtgaaaat-gatatattgtgaattg 13590187  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  13590188 tgctctaattgttgaattgtgctatg 13590213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Original strand, 18238172 - 18238296
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  18238172 ttatgatgatatgtttgaatacatgatattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaattg 18238270  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  18238271 tgctctaattgttgaattgtgctatg 18238296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 54398615 - 54398491
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||   ||||||||||||||    
T  54398615 ttatgttgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcatagtatatgaaaat-aatatattgtgaattg 54398517  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  54398516 tgctctaattgttgaattgtgttatg 54398491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Original strand, 47468363 - 47468487
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||| | |||| |||||||||    
T  47468363 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgtatgttcatagtatgtgaaaat-gatatagtgtgaattg 47468461  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  47468462 tgctctaattgttgaattgtgttatg 47468487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Original strand, 13442691 - 13442815
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||     
T  13442691 ttatgatgttatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgtttgtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gttatattgtgaatta 13442789  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||    
T  13442790 tgctctaaatgttgaattgtgttatg 13442815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 177 - 293
Target Start/End: Original strand, 50219959 - 50220074
Alignment:
Q  177 gatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgtgct 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  50219959 gatgatatgtttgagtacatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattttgaattgtgct 50220057  T
Q  277 ctaattgttgaattgtg 293  Q
    |||| ||||||||||||    
T  50220058 ctaaatgttgaattgtg 50220074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Original strand, 40904949 - 40905073
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | |  |||||||||||    
T  40904949 ttatgatgatatgtttgaatacatgaaattgctgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatgcattgtgaattg 40905047  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||    
T  40905048 tactccaattgttgaattgtgctatg 40905073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Original strand, 41916741 - 41916865
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| || | |||||||||| |||    
T  41916741 ttatgatgatatgtttgaatacataaaattggtgataatataattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaagat-gatatattgtgagttg 41916839  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  41916840 tgctctaattgttgaattgtgctatg 41916865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Original strand, 7964725 - 7964850
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| | | |||||  |||||    
T  7964725 aattatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca-agtatgtgaaagt-gttatatgttgaat 7964822  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||    
T  7964823 tatgctctaaatgttgaattgtgctatg 7964850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 171 - 296
Target Start/End: Original strand, 41256383 - 41256506
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    ||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||    
T  41256383 aattatgatgaaatgtt-gaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaat 41256480  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgcta 296  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||    
T  41256481 tatgctcaaattgttgaattgtgcta 41256506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 171 - 296
Target Start/End: Original strand, 15013296 - 15013419
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||    
T  15013296 aattatgatgatatgtt-gaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gacatattgtgaat 15013393  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgcta 296  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||    
T  15013394 tatgctcaaattgttgaattgtgcta 15013419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Original strand, 7185857 - 7185983
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||| | |||||  |||||    
T  7185857 aattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattgtatgttcatagtatgtgaaaat-gatatatgttgaat 7185955  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||    
T  7185956 tgtgcactaaatgatgaattgtgctatg 7185983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 171 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 38764943 - 38764825
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||    
T  38764943 aattatggggatatgtttgaatgaatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcatagtatgtgaaaat-gttatattgtgaat 38764845  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaatt 290  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  38764844 tgtgctcaaattgttgaatt 38764825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 174 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 18276665 - 18276543
Alignment:
Q  174 tatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgt 273  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||| | | |||||  |||||| |    
T  18276665 tatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattaaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagcatgtgaaagt-gttatatgttgaattat 18276567  T
Q  274 gctctaattgttgaattgtgctat 297  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  18276566 gctctaaatgttgaattgtgctat 18276543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 180 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 21417532 - 21417419
Alignment:
Q  180 gatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgtgctcta 279  Q
    ||||||||||| ||  |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||  ||||  |||||||||||||||||||| |    
T  21417532 gatatgtttgaatatgtgaatttgttgataattgaattgttgatgatgaaatttcatgttcacgatatgtataaatatgtatattgtgaattgtgctcaa 21417433  T
Q  280 attgttgaattgtg 293  Q
    || | |||||||||    
T  21417432 atggatgaattgtg 21417419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Original strand, 47535078 - 47535204
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| | |||| |||| | | |||||  ||||     
T  47535078 aattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcaagttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttgaaa 47535176  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    | ||||| ||||| |||||| |||||||    
T  47535177 tatgctcaaattgatgaattatgctatg 47535204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 15045062 - 15044936
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||| |||| | | |||||  |||||    
T  15045062 aattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttgaat 15044964  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    | ||||| ||||| |||||| |||||||    
T  15044963 tatgctcaaattgatgaattatgctatg 15044936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Original strand, 13809523 - 13809649
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||| || ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| | |||| |||||| |||||||  ||||     
T  13809523 aattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgagatttcatgttcaaagtatgagaaaat-ggtatatgttgaaa 13809621  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    | ||||| | | |||||||| |||||||    
T  13809622 tatgctcaattagttgaattatgctatg 13809649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Original strand, 41165959 - 41166085
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    ||||||||| |||| ||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| | |||| |||| | | |||||  |||||    
T  41165959 aattatgataatatatttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttgaat 41166057  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    | ||||| |||||||||||| |||||||    
T  41166058 tatgctcaaattgttgaattatgctatg 41166085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 241
Target Start/End: Original strand, 15109362 - 15109432
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttca 241  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  15109362 aattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 15109432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 290
Target Start/End: Original strand, 52265521 - 52265639
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||  ||||||| | |||| |||| | |||||||  ||||     
T  52265521 aattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagagaaattttatgttcaaagtatgagaaagt-ggtatatgttgaaa 52265619  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaatt 290  Q
    | ||||| ||||||||||||    
T  52265620 tatgctcaaattgttgaatt 52265639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 19559585 - 19559487
Alignment:
Q  179 tgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgtgctc 277  Q
    ||||||||||||| |  | || ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||  || | || |||||||||  ||||||||| |||||    
T  19559585 tgatatgtttgagcatgttaatttgatgttaattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcatgatgtatgtaaatgggtagtttgtgaattatgctc 19559487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 49071913 - 49071851
Alignment:
Q  179 tgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttca 241  Q
    |||||||||||||||  | || ||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  49071913 tgatatgtttgagtatgttaatttgatgttaattgaattattgatgatgaaattgcatgttca 49071851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Original strand, 34177695 - 34177731
Alignment:
Q  205 tgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttca 241  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  34177695 tgataattgaattgttgatgataaaattgcatgttca 34177731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Original strand, 975 - 1101
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||| ||||    
T  975 aattatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgggaat 1073  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  1074 tgtgctctaaatgttgaattgtgctatg 1101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0153
Description:

Target: scaffold0153; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 176 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 8719 - 8606
Alignment:
Q  176 tgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgtgc 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  8719 tgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattatgaattgtgc 8621  T
Q  276 tctaattgttgaatt 290  Q
    |||||||||||||||    
T  8620 tctaattgttgaatt 8606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 25578 - 25454
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  25578 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgaaaattgaattgttgttggtgaaattgcctgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaattg 25480  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  25479 tgctttaattgttgaattgtgctatg 25454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 174 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 22230 - 22107
Alignment:
Q  174 tatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgt 273  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22230 tatgatgttatgtttgagtatatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-ggtatattgtgaattgt 22132  T
Q  274 gctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||    
T  22131 gctctaaatgttgaattgggctatg 22107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 174 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 30195 - 30072
Alignment:
Q  174 tatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgt 273  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||| |    
T  30195 tatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgtaggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaatttt 30097  T
Q  274 gctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  30096 gctctaattgttgaattgtgctatg 30072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 173 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 27729 - 27606
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  27729 ttatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaattg 27631  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctat 297  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||    
T  27630 tgccctaaatgttgaattgtgctat 27606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 86589 - 86465
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  86589 ttatgttgatatgtttgagtacatgaaatttgtgataattgaatttttgttggtgaaattggatgttcatagtatgtgaaaat-gttatattgtgaattg 86491  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  86490 tgctctaaatgttgaattgtgctatg 86465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Original strand, 895 - 1013
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||| ||||    
T  895 ttatgatgatatgtttgagtaaatgaatttggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcataatatgtgaaaatgg-------gtgtattg 987  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  988 tgctctaattgttgaattgtgctatg 1013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 4839 - 4713
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||    
T  4839 aattatggtgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaat 4741  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  4740 tgtgctctaaatgttgaattgtgttatg 4713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 173 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 108241 - 108120
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||     
T  108241 ttatgatgttatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-ggtatattatgaatta 108143  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgct 295  Q
    |||||||| ||||||||| ||||    
T  108142 tgctctaaatgttgaattatgct 108120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0406 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0406
Description:

Target: scaffold0406; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 173 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 14268 - 14152
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14268 ttatgatgttatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattattgctggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-ggtatattgtgaattg 14170  T
Q  273 tgctctaattgttgaatt 290  Q
    |||||||| |||||||||    
T  14169 tgctctaaatgttgaatt 14152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 179 - 298
Target Start/End: Original strand, 12754 - 12873
Alignment:
Q  179 tgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgtgctct 278  Q
    ||||||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  12754 tgatatgtttgaggatatgaaattattcataattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcataatatgttaaaatggatatgttgtgaattgtgctct 12853  T
Q  279 aattgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12854 aattgttgaattgtgctatg 12873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Original strand, 33428 - 33553
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||| | |||||    
T  33428 ttatgatgatatgtttgagtacatgaatttggtgataattaaattgatgtagatgaaattgaatgttcataatatgagaaaataggtatattataaattg 33527  T
Q  273 tgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  33528 tgctctaattgttaaattgtgttatg 33553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0253
Description:

Target: scaffold0253; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 7636 - 7510
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||| | ||||||||||| | ||||||||||||    
T  7636 aattatgatgatatgtttgaatacatgaaattagtgataattgaattattgttggtgaaattgcattctcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaat 7538  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  7537 tgtgctataaatgttgaattgtgctatg 7510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 17061 - 16935
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||| | ||||||||||| | ||||||||||||    
T  17061 aattatgatgatatgtttgaatacatgaaattagtgataattgaattattgttggtgaaattgcattctcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaat 16963  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16962 tgtgctataaatgttgaattgtgctatg 16935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Original strand, 23685 - 23811
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||    
T  23685 aattatggtgatatgtttgtatacatgaaatttttgataattgaattgttgttggagaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaat 23783  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  23784 tgtgctctaaatgttgaattgtgctatg 23811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 171 - 241
Target Start/End: Original strand, 43811 - 43881
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttca 241  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  43811 aattatgatgctatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 43881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 173 - 276
Target Start/End: Original strand, 67912 - 68014
Alignment:
Q  173 ttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattg 272  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  67912 ttatgatgatatgtttgagtacgtgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaattg 68010  T
Q  273 tgct 276  Q
    ||||    
T  68011 tgct 68014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 6778 - 6652
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    ||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||| |    
T  6778 aattatggtgatatgtttaaatacatggaattggtgataattgaattgttattggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgagt 6680  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||    
T  6679 tatactcaaattgttgaattgtgctatg 6652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 85766 - 85641
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||    
T  85766 aattatgatgatatgtttaa-tgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaat 85669  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    | ||||| ||||  ||||||||| ||||    
T  85668 tatgctcaaattaatgaattgtgttatg 85641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 175 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 53576 - 53455
Alignment:
Q  175 atgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgtg 274  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||  | | |||||  |||||| ||    
T  53576 atgatgatatgtttgaatgcatgatattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaggt-gttatatgttgaattatg 53478  T
Q  275 ctctaattgttgaattgtgctat 297  Q
    |||||| |||| |||| ||||||    
T  53477 ctctaaatgttcaattatgctat 53455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 2759 - 2633
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||| | | |||||  |||||    
T  2759 aattatgatgatatgtttggatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatatgaaagt-gttatatgttgaat 2661  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    | |||||||| ||||||||| |||||||    
T  2660 tatgctctaaatgttgaattatgctatg 2633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Original strand, 97211 - 97337
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| | | |||||  |||||    
T  97211 aattatgatgatatgtttgaatgcataaaattggtgataattgaattgttgttggtggaattgcatgttcaaagtatgtgaaagt-gttatatgttgaat 97309  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    | |||||||| ||||||||| |||||||    
T  97310 tatgctctaaatgttgaattatgctatg 97337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 31254 - 31128
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| | | |||||  |||||    
T  31254 aattatgatgatatatttgaatgcatgaaattggtgataattggattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaagt-gttatatgttgaat 31156  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    | |||| ||| |||||||||||||||||    
T  31155 tatgctttaaatgttgaattgtgctatg 31128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 69691 - 69565
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| | | ||||||||| | | |||||  |||||    
T  69691 aattatgatgatatgtttaaatgcatgaaattggttataattgaattgttgtaggtgaaattgcatgtttaaagtatgtgaaagt-gttatatgttgaat 69593  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||    
T  69592 tatgctctaaatgttgaattgtgctatg 69565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 6895 - 6769
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||| |||| | | |||||  |||||    
T  6895 aattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttgaat 6797  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    | ||||| |||||||||||| |||||||    
T  6796 tttgctcaaattgttgaattatgctatg 6769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Original strand, 76860 - 76986
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||| |||| | | |||||  |||||    
T  76860 aattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttgaat 76958  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    | || || |||||||||||| |||||||    
T  76959 tatgttcaaattgttgaattatgctatg 76986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Original strand, 197266 - 197392
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||| | | ||||   |||||    
T  197266 aattatgatgatatgtttgaatgtatgaaattgttgataattgaattgttgttggtgaaattgcaagttcaaagtatgtgaaagt-gttataagttgaat 197364  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    | |||||||| ||||||||||| |||||    
T  197365 tatgctctaaatgttgaattgtcctatg 197392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 174 - 298
Target Start/End: Original strand, 1364 - 1487
Alignment:
Q  174 tatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgt 273  Q
    ||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||| | |||||  |||||  |    
T  1364 tatgatgatatgtttgtatgcataaaattggtgataattggattgttgttggtgaaattgcatggtcaaagtatgtgaaaat-gatatatgatgaatcat 1462  T
Q  274 gctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||    
T  1463 gctctaaatgttgtattgtgctatg 1487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 174 - 298
Target Start/End: Original strand, 9619 - 9742
Alignment:
Q  174 tatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgt 273  Q
    ||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||| | |||||  |||||  |    
T  9619 tatgatgatatgtttgtatgcataaaattggtgataattggattgttgttggtgaaattgcatggtcaaagtatgtgaaaat-gatatatgatgaatcat 9717  T
Q  274 gctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||    
T  9718 gctctaaatgttgtattgtgctatg 9742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 195 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 12976 - 12873
Alignment:
Q  195 atgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgtgctctaattgttgaattgtgc 294  Q
    ||||||||| | ||| |||||||| |  |||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  12976 atgaaattgttcatacttgaattgctaatgatgaaattgcatgttcatgatatgtataaatgggtatattttgatttgtgctctaattgtttaattgtgc 12877  T
Q  295 tatg 298  Q
    ||||    
T  12876 tatg 12873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 179 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 6109 - 6011
Alignment:
Q  179 tgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgtgctc 277  Q
    |||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||  | |||||||||  |||||||||||||||    
T  6109 tgatatgtttgagtatgttaaattgatgataattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcatgatataagtaaatgggtagtttgtgaattgtgctc 6011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 174 - 298
Target Start/End: Original strand, 22438 - 22561
Alignment:
Q  174 tatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgt 273  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  |||| | ||  || |||||| |    
T  22438 tatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataatttaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaaatatgtataaat-gctaacttatgaattat 22536  T
Q  274 gctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    |||| |||| |||||||||||||||    
T  22537 gctcaaattattgaattgtgctatg 22561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 171 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1418 - 1349
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttca 241  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  1418 aattatgatgatatgtttga-tacatgaaattagtgataattgagttgttgttggggaaattgcatgttca 1349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 5646 - 5595
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgt 222  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5646 aattatggtgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgt 5595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Original strand, 2329 - 2455
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||| |||| | |  ||||  |||||    
T  2329 aattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gacatatgttgaat 2427  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    | ||||| ||||| |||||| |||||||    
T  2428 tatgctcaaattgatgaattatgctatg 2455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 171 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 28770 - 28652
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||| | |||| |||| | | |||||  |||||    
T  28770 aattatgatgatatgtttgaatgcatgaacttgttgataactgaattgttgttggtgaaattatatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttgaat 28672  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaatt 290  Q
    | ||||| ||||||||||||    
T  28671 tatgctcaaattgttgaatt 28652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 174 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 8241 - 8174
Alignment:
Q  174 tatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttca 241  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  8241 tatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttca 8174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 11328 - 11258
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttca 241  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  11328 aattatgatgatatgtttgaatgcatgaaactagtgataattgaattgttgtttgtgaaatttcatgttca 11258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 219
Target Start/End: Original strand, 27003 - 27051
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgt 219  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27003 aattatggtgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgt 27051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1295 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1295
Description:

Target: scaffold1295; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 332 - 222
Alignment:
Q  179 tgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgtgctct 278  Q
    |||||||||||||||  | || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || | |  ||||| |||  ||||||||| |||||     
T  332 tgatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcatgatgtatataaatgtgtagtttgtgaattatgctc- 234  T
Q  279 aattgttgaatt 290  Q
    ||||||||||||    
T  233 aattgttgaatt 222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 290
Target Start/End: Original strand, 7038 - 7156
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaat 270  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||  ||||||| | |||| |||| | | |||||  |||||    
T  7038 aattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagtgaaatttaatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttgaat 7136  T
Q  271 tgtgctctaattgttgaatt 290  Q
    | ||||| ||||||| ||||    
T  7137 tatgctcaaattgtttaatt 7156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 241
Target Start/End: Original strand, 1530 - 1592
Alignment:
Q  179 tgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttca 241  Q
    |||||||||||||||  | || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1530 tgatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgaattgttgatgatgaaattgcatgttca 1592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 79770 - 79704
Alignment:
Q  174 tatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttc 240  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  79770 tatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgagttgttggtggtgaaattgcatgttc 79704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 239
Target Start/End: Original strand, 1562 - 1627
Alignment:
Q  174 tatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgtt 239  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  1562 tatgatgatatgtttgtatgcatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaatttgcttgtt 1627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 239
Target Start/End: Original strand, 8707 - 8772
Alignment:
Q  174 tatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgtt 239  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  8707 tatgatgatatgtttgtatgcatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaatttgcttgtt 8772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 181 - 241
Target Start/End: Original strand, 22452 - 22512
Alignment:
Q  181 atatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttca 241  Q
    |||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  22452 atatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttca 22512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 241
Target Start/End: Original strand, 104639 - 104706
Alignment:
Q  174 tatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttca 241  Q
    ||||||||||||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  104639 tatgatgatatgtttgtatgcattaaattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcaggttca 104706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 35708 - 35586
Alignment:
Q  175 atgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgtg 274  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| | |||| |||| | | |||||  |||||| |     
T  35708 atgatgatatgtttgaatgcatgaagttattgataattgaattgttgttagtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttgaattata 35610  T
Q  275 ctctaattgttgaattgtgctatg 298  Q
    ||| ||||||||| || |||||||    
T  35609 ctcaaattgttgatttatgctatg 35586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Original strand, 7125 - 7161
Alignment:
Q  205 tgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttca 241  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  7125 tgataattgaattgttgatgatgaatttgcatgttca 7161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 241
Target Start/End: Original strand, 44143 - 44205
Alignment:
Q  179 tgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttca 241  Q
    |||||||||||||||  | || ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44143 tgatatgtttgagtatgttaatttgatggtaattgaattgttgatgatgaaattgcatgttca 44205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 174 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 10893 - 10826
Alignment:
Q  174 tatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttca 241  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||| ||||||| |  ||| |||||||||||    
T  10893 tatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgagttgttgtcggagaatttgcatgttca 10826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 205 - 260
Target Start/End: Original strand, 34467 - 34522
Alignment:
Q  205 tgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggta 260  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  34467 tgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtgtgaaaatgggta 34522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 174 - 241
Target Start/End: Original strand, 70323 - 70389
Alignment:
Q  174 tatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttca 241  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||    
T  70323 tatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattcaattattgttg-tgaatttgcatgttca 70389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 174 - 241
Target Start/End: Original strand, 89880 - 89946
Alignment:
Q  174 tatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttca 241  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  89880 tatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgatacttgaattgttgttg-tgaatttgtatgttca 89946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 271
Target Start/End: Original strand, 3872 - 3962
Alignment:
Q  181 atatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaatgggtatattgtgaatt 271  Q
    |||||||||||||  | || ||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||  |||| |  |||||||||  |||||||||    
T  3872 atatgtttgagtatgttaatttgatgatgattgaattgttaatgatgaaattgcatgttcatgatatatataaatgggtagtttgtgaatt 3962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 239
Target Start/End: Original strand, 19959 - 20016
Alignment:
Q  182 tatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgtt 239  Q
    |||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  19959 tatgtttgggtatgtgaaattgatgataattgaattgttgatgtggaaattgcatgtt 20016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Original strand, 12650 - 12686
Alignment:
Q  205 tgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttca 241  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  12650 tgataattgaattattgatgatgaaattgcatgttca 12686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 219
Target Start/End: Original strand, 116571 - 116619
Alignment:
Q  171 aattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgt 219  Q
    |||||||||| |||||||||   |||||||||| |||||||||||||||    
T  116571 aattatgatgttatgtttgaaggcatgaaattgttgataattgaattgt 116619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University