View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6233_high_12 (Length: 239)

Name: NF6233_high_12
Description: NF6233
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6233_high_12
NF6233_high_12
[»] scaffold0059 (2 HSPs)
scaffold0059 (2-230)||(10691-10919)
scaffold0059 (2-230)||(18692-18920)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (2-230)||(234479-234707)
[»] chr8 (18 HSPs)
chr8 (2-230)||(22289584-22289812)
chr8 (2-230)||(22830446-22830674)
chr8 (2-230)||(21942896-21943124)
chr8 (3-218)||(11348388-11348603)
chr8 (3-230)||(22368504-22368731)
chr8 (1-230)||(19766011-19766243)
chr8 (1-231)||(21100278-21100508)
chr8 (1-158)||(29333200-29333357)
chr8 (75-203)||(21267909-21268037)
chr8 (2-218)||(22034960-22035176)
chr8 (9-218)||(21825941-21826150)
chr8 (2-203)||(22101055-22101256)
chr8 (2-203)||(21380676-21380877)
chr8 (2-173)||(17132412-17132583)
chr8 (2-64)||(8313190-8313252)
chr8 (2-64)||(8324281-8324343)
chr8 (2-64)||(21954801-21954863)
chr8 (2-62)||(22097947-22098007)
[»] scaffold0402 (1 HSPs)
scaffold0402 (2-231)||(6429-6658)
[»] chr3 (28 HSPs)
chr3 (22-231)||(17386300-17386509)
chr3 (1-230)||(20157894-20158123)
chr3 (1-227)||(14447003-14447229)
chr3 (1-230)||(4369218-4369447)
chr3 (2-221)||(3278023-3278242)
chr3 (1-230)||(10604001-10604230)
chr3 (1-230)||(12423816-12424045)
chr3 (1-230)||(22165772-22166001)
chr3 (4-218)||(13693435-13693649)
chr3 (1-230)||(16654233-16654463)
chr3 (74-230)||(18979475-18979631)
chr3 (9-230)||(12161540-12161761)
chr3 (9-218)||(3340668-3340877)
chr3 (9-218)||(15945117-15945326)
chr3 (9-191)||(13505991-13506173)
chr3 (2-203)||(15630386-15630587)
chr3 (2-214)||(13137599-13137811)
chr3 (1-218)||(15643608-15643825)
chr3 (1-218)||(10161656-10161873)
chr3 (2-170)||(13196859-13197027)
chr3 (2-64)||(7599078-7599140)
chr3 (2-64)||(10145733-10145795)
chr3 (2-64)||(13188847-13188909)
chr3 (2-173)||(12188505-12188676)
chr3 (2-173)||(12194919-12195090)
chr3 (2-64)||(16374909-16374971)
chr3 (91-173)||(7598969-7599051)
chr3 (91-173)||(13188936-13189018)
[»] chr1 (9 HSPs)
chr1 (2-230)||(8651569-8651797)
chr1 (1-230)||(3988626-3988855)
chr1 (2-213)||(8948883-8949095)
chr1 (1-231)||(20072373-20072603)
chr1 (1-230)||(19877115-19877344)
chr1 (9-218)||(19783562-19783771)
chr1 (1-218)||(21800142-21800359)
chr1 (2-64)||(20236203-20236265)
chr1 (9-98)||(20392141-20392230)
[»] chr2 (17 HSPs)
chr2 (4-218)||(25372408-25372622)
chr2 (1-230)||(24821552-24821776)
chr2 (3-201)||(25369016-25369214)
chr2 (9-196)||(23160851-23161038)
chr2 (9-196)||(23572108-23572295)
chr2 (9-196)||(27630058-27630245)
chr2 (2-173)||(24169953-24170124)
chr2 (2-203)||(13044-13245)
chr2 (121-218)||(116061-116158)
chr2 (2-203)||(22046090-22046291)
chr2 (2-203)||(25356095-25356296)
chr2 (3-81)||(17867490-17867568)
chr2 (1-218)||(24796763-24796980)
chr2 (2-64)||(27626316-27626378)
chr2 (121-218)||(16774186-16774283)
chr2 (9-98)||(116181-116270)
chr2 (176-230)||(22870283-22870337)
[»] chr4 (8 HSPs)
chr4 (1-230)||(3353136-3353365)
chr4 (9-230)||(15864049-15864270)
chr4 (121-218)||(16680924-16681021)
chr4 (9-218)||(15261535-15261744)
chr4 (1-218)||(13821438-13821655)
chr4 (2-64)||(22109682-22109744)
chr4 (2-64)||(15253067-15253129)
chr4 (91-203)||(22109543-22109655)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (2-230)||(43978-44206)
scaffold0037 (2-230)||(51367-51595)
[»] chr7 (18 HSPs)
chr7 (2-230)||(20106820-20107048)
chr7 (3-230)||(15921432-15921658)
chr7 (3-230)||(824174-824401)
chr7 (1-218)||(16150971-16151188)
chr7 (3-218)||(15064320-15064535)
chr7 (2-203)||(48803289-48803490)
chr7 (9-218)||(16530574-16530783)
chr7 (9-218)||(16634879-16635088)
chr7 (9-218)||(16761252-16761461)
chr7 (1-218)||(13672386-13672603)
chr7 (2-203)||(18286208-18286409)
chr7 (1-218)||(18594737-18594954)
chr7 (1-218)||(18616730-18616947)
chr7 (2-173)||(13656546-13656717)
chr7 (2-64)||(8716586-8716648)
chr7 (2-64)||(14549818-14549880)
chr7 (2-203)||(16467045-16467246)
chr7 (91-203)||(8716447-8716559)
[»] chr6 (9 HSPs)
chr6 (2-230)||(18446752-18446980)
chr6 (9-230)||(21561926-21562147)
chr6 (2-173)||(18010461-18010632)
chr6 (1-218)||(20017708-20017925)
chr6 (1-218)||(22167023-22167240)
chr6 (2-64)||(8725431-8725493)
chr6 (2-64)||(24856674-24856736)
chr6 (121-230)||(20168750-20168859)
chr6 (8-191)||(22768605-22768788)
[»] chr5 (19 HSPs)
chr5 (3-230)||(26846184-26846411)
chr5 (1-230)||(20597308-20597537)
chr5 (1-230)||(20603605-20603834)
chr5 (1-230)||(20792251-20792480)
chr5 (1-230)||(20609924-20610153)
chr5 (1-230)||(18071428-18071657)
chr5 (2-230)||(22946975-22947203)
chr5 (8-231)||(23520623-23520846)
chr5 (9-218)||(25117622-25117831)
chr5 (9-218)||(25176713-25176922)
chr5 (1-218)||(20439632-20439849)
chr5 (1-203)||(21386881-21387080)
chr5 (121-218)||(30764692-30764789)
chr5 (3-203)||(23746634-23746834)
chr5 (2-64)||(20620885-20620947)
chr5 (2-64)||(15734256-15734318)
chr5 (2-64)||(25008213-25008275)
chr5 (121-218)||(24954765-24954862)
chr5 (2-61)||(22318914-22318973)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (1-230)||(11998-12227)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (3-230)||(132174-132401)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (8-230)||(21400-21622)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (1-230)||(23875-24104)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (1-230)||(684-913)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (1-230)||(22461-22690)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (1-227)||(121900-122126)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (1-230)||(19718-19938)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (4-218)||(7938-8151)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (4-230)||(5035-5261)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (1-231)||(8450-8680)
[»] scaffold0202 (1 HSPs)
scaffold0202 (90-230)||(1708-1848)
[»] scaffold1095 (1 HSPs)
scaffold1095 (1-182)||(1870-2049)
[»] scaffold0506 (1 HSPs)
scaffold0506 (9-230)||(3517-3738)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (2-203)||(32983-33184)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (4-230)||(253240-253480)
scaffold0004 (1-230)||(19416-19645)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (18-230)||(25866-26074)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (9-218)||(29038-29247)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (2-208)||(11107-11313)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (9-218)||(24099-24308)
[»] scaffold1879 (1 HSPs)
scaffold1879 (2-173)||(346-517)
[»] scaffold1400 (1 HSPs)
scaffold1400 (136-218)||(49-131)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (2-203)||(10000-10201)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (2-173)||(39164-39335)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (160-230)||(20234-20304)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (2-218)||(115211-115431)
scaffold0020 (2-203)||(119530-119735)
[»] scaffold1620 (1 HSPs)
scaffold1620 (6-203)||(423-620)
[»] scaffold0833 (1 HSPs)
scaffold0833 (91-203)||(4672-4785)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (2-169)||(54858-55025)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (91-174)||(50288-50371)
[»] scaffold1571 (1 HSPs)
scaffold1571 (2-64)||(1344-1406)
[»] scaffold0577 (1 HSPs)
scaffold0577 (2-64)||(4828-4890)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (91-173)||(32347-32429)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (39-173)||(41642-41776)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (2-61)||(21631-21690)
[»] scaffold0473 (1 HSPs)
scaffold0473 (2-64)||(12760-12822)


Alignment Details
Target: scaffold0059 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 10919 - 10691
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggt 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |   |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10919 catcaccaacatacaacaaattttcttccacctcgttgttagtccgagatgggttaggaagtataattaaaataggcacattgagtttgagtgtataggt 10820  T
Q  102 catgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccact 201  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10819 catgggtggacgatgtttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccact 10720  T
Q  202 cccaattgcctagctatataggtgatgat 230  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10719 cccaattgcctagctatatatgtgatgat 10691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 18920 - 18692
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggt 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |   |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18920 catcaccaacatacaacaaattttcttccacctcgttgttagtccgagatgggttaggaagtataattaaaataggcacattgagtttgagtgtataggt 18821  T
Q  102 catgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccact 201  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18820 catgggtggacgatgtttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccact 18721  T
Q  202 cccaattgcctagctatataggtgatgat 230  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18720 cccaattgcctagctatatatgtgatgat 18692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Original strand, 234479 - 234707
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggt 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |   |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  234479 catcaccaacatacaacaaattttcttccacctcgttgttagtccgagatgggttaggaagtataattaaaataggcacattgagtttgagtgtataggt 234578  T
Q  102 catgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccact 201  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  234579 catgggtggacgatgtttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccact 234678  T
Q  202 cccaattgcctagctatataggtgatgat 230  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  234679 cccaattgcctagctatatatgtgatgat 234707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 18)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22289812 - 22289584
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggt 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22289812 catcaccaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgagataggaagtataattaaaataggcacattgagtttgagtgtataggt 22289713  T
Q  102 catgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccact 201  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22289712 catgggtggacgatgattaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccact 22289613  T
Q  202 cccaattgcctagctatataggtgatgat 230  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||    
T  22289612 ctcaattgcctagctatataggtgatgat 22289584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22830674 - 22830446
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggt 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| ||    
T  22830674 catcaccaacatacaacaaattttcttccacctcggtattagtccgagatgggttaggaagtataattaaaatatgcacattgagtttgagtgtatatgt 22830575  T
Q  102 catgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccact 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22830574 catgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcttattgtttccctcaatcttgtttatcccttggttctcactcact 22830475  T
Q  202 cccaattgcctagctatataggtgatgat 230  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  22830474 ctcaattgccttgctatatatgtgatgat 22830446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Original strand, 21942896 - 21943124
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggt 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||| ||||||||||     
T  21942896 catcaccaacatacaacaaattttcctccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtataatcaaaacaggcacattgagtttaagtgtataggc 21942995  T
Q  102 catgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccact 201  Q
    ||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  21942996 catgggtggtcgaggttttatgaagttcatagagataagggcctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgttaatccattggtcttcacccact 21943095  T
Q  202 cccaattgcctagctatataggtgatgat 230  Q
    |||||||||||| |||| || ||||||||    
T  21943096 cccaattgcctaactatgtatgtgatgat 21943124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 11348388 - 11348603
Alignment:
Q  3 atcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggtc 102  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |    
T  11348388 atcaccaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtataattaaaacaggcacattgagtttaagtgtataggcc 11348487  T
Q  103 atgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccactc 202  Q
    |||||||| ||| | || ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  11348488 atgggtggtcgaggttttatgaatttcaaagagataagggcctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgttaatccattggtcttcacccactc 11348587  T
Q  203 ccaattgcctagctat 218  Q
    ||||||||||| ||||    
T  11348588 ccaattgcctaactat 11348603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22368731 - 22368504
Alignment:
Q  3 atcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggtc 102  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||| |||||||||| |    
T  22368731 atcaccaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtataatcaaaacaggcacattgagtttaagtgtataggcc 22368632  T
Q  103 atgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccactc 202  Q
    |||||||| | | | || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22368631 atgggtggtcaaggttttataaagttcatagagataagggcctctatgttaagcctattttttccctcaatcttgttaatcccttggtcttcacccactc 22368532  T
Q  203 ccaattgcctagctatataggtgatgat 230  Q
     |||||||||| |||| || ||||||||    
T  22368531 tcaattgcctaactatgtatgtgatgat 22368504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19766243 - 19766011
Alignment:
Q  1 tcatcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtatagg 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||| |||||||||||| |||||  || ||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19766243 tcatcaacaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtctgagatgggttagaaagtaaaatcaaaataggcacatttagtttgagtgtgtagg 19766144  T
Q  101 tcatgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgttt---ccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacc 197  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||     |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19766143 acatgggtggacgaggcttaatgaagttcataaagataagggtctctatgttaagcctattttttttcttctcaattttgttaatcccttggtcctcacc 19766044  T
Q  198 cactcccaattgcctagctatataggtgatgat 230  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  19766043 cactcccaattgcctagctatgtatgtgatgat 19766011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 21100278 - 21100508
Alignment:
Q  1 tcatcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtatagg 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||   |||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  21100278 tcatcatcaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgtatagg 21100377  T
Q  101 tcatgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccac 200  Q
     ||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||| ||    
T  21100378 acatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtttccctcaatccttttaattccttggtcctcaccaac 21100477  T
Q  201 tcccaattgcctagctatataggtgatgatg 231  Q
     || |||||||||||||| || |||||||||    
T  21100478 cccaaattgcctagctatgtaagtgatgatg 21100508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 29333357 - 29333200
Alignment:
Q  1 tcatcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtatagg 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||  ||||| ||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  29333357 tcatcaacaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagttcgagatgggttagaaagtataatcaaaataggcacattgagtttgagtgtgtagg 29333258  T
Q  101 tcatgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcct 158  Q
     |||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29333257 acatgggtggatggggcttaatgaagttcataaagataagggtctctatgttaagcct 29333200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 21268037 - 21267909
Alignment:
Q  75 aggcacattgagtttgagtgtataggtcatgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatc 174  Q
    |||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||     
T  21268037 aggcacgttgagtttaagtgcataagtcatgggtggatgatgcttaatgaaattcatagaaataagggtttcaatgttaagcctattgttgccctcaatt 21267938  T
Q  175 ttgtttatcccttggtcctcacccactcc 203  Q
       |||||||||| |||||||||||||||    
T  21267937 ggatttatccctttgtcctcacccactcc 21267909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 218
Target Start/End: Original strand, 22034960 - 22035176
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggt 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||  |  |||  ||| |     || |  |||| ||| ||    
T  22034960 catcaccaacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtacgagatgggttaggaagtagaaacaaaagaggtatgcaaagctgaagtgcataagt 22035059  T
Q  102 catgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccact 201  Q
    |||||||||  ||  ||||||||| |||||||  | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||     
T  22035060 catgggtgggtgaatcttaatgaaattcatagcaacaagggtttctatgtttagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcttcactcacg 22035159  T
Q  202 cccaattgcctagctat 218  Q
    || || | |||||||||    
T  22035160 cctaacttcctagctat 22035176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 21826150 - 21825941
Alignment:
Q  9 aacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggtcatgggt 108  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| | ||  || ||| | ||||||||||| |||||||||||    | |||     
T  21826150 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagcttgagtgtataaacaaagggg 21826051  T
Q  109 ggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccactcccaatt 208  Q
       ||    || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| || ||      
T  21826050 attcgggtttttatgaaattcatagagataagggtttctatgtttagtctattgttaccctcaatcttgtttatcccttgatcttcactcacgccgaacc 21825951  T
Q  209 gcctagctat 218  Q
    ||||||||||    
T  21825950 gcctagctat 21825941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 203
Target Start/End: Original strand, 22101055 - 22101256
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggt 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |  |||  ||| | |   ||||  |||| ||| ||    
T  22101055 catcaccaacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagtataaacaaaagaggtatacgaagttgaagtgcataagt 22101154  T
Q  102 catgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccact 201  Q
    |||||||||  ||  ||||||||| |||||||  | |||||| || || |||||||||||||| ||||||||    |||||||| |  ||||||||||||    
T  22101155 catgggtgggtgaatcttaatgaaattcatagtaacaagggtttcaatattaagcctattgttgccctcaattggatttatcccatcttcctcacccact 22101254  T
Q  202 cc 203  Q
    ||    
T  22101255 cc 22101256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 21380877 - 21380676
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggt 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||  | ||||  ||| |     ||||  |||| ||| ||    
T  21380877 catcaccaacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagaagggttaggaagtagaaataaaagaggtatgcgaagttgaagtgcataagt 21380778  T
Q  102 catgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccact 201  Q
    |||||||||  ||  |||||||||||||||||  | |||||| || || |||||||||||||| ||||||||    |||||||| |  ||||||||||||    
T  21380777 catgggtgggtgaatcttaatgaagttcatagcaacaagggtttcaatattaagcctattgttgccctcaattggatttatcccatcttcctcacccact 21380678  T
Q  202 cc 203  Q
    ||    
T  21380677 cc 21380676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 2 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 17132583 - 17132412
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggt 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||  | ||||  ||| |     ||||  |||| ||| ||    
T  17132583 catcaccaacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagtagaaataaaagaggtatgcgaagttgaagtgcataagt 17132484  T
Q  102 catgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaat 173  Q
    |||||||||  ||  |||||||||||||||||  | |||||| || || ||||| |||||||| ||||||||    
T  17132483 catgggtgggtgaatcttaatgaagttcatagcaacaagggtttcaatattaagactattgttgccctcaat 17132412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 8313252 - 8313190
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagta 64  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  8313252 catcaccaacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagta 8313190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 64
Target Start/End: Original strand, 8324281 - 8324343
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagta 64  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  8324281 catcaccaacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagta 8324343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 21954863 - 21954801
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagta 64  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  21954863 catcaccaacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagta 21954801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 22098007 - 22097947
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaag 62  Q
    ||||||||||| |||||||||| || | ||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  22098007 catcaccaacatacaacaaattctcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaag 22097947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0402 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0402
Description:

Target: scaffold0402; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6658 - 6429
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggt 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6658 catcaccaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtataattaatatagccacattgagtttgagtgtataggt 6559  T
Q  102 catgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccact 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6558 catgggtggacgatgcttaatgaagttcatagaattaagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcttcacccact 6459  T
Q  202 cccaattgcctagctatataggtgatgatg 231  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6458 cccaattggctagctatataggtgatgatg 6429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 28)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 22 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17386509 - 17386300
Alignment:
Q  22 ttttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggtcatgggtggacgatgcttaa 121  Q
    ||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17386509 ttttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtataattaaaataggcacattgagtttgagtgtataggtcatgggtggacgatgcttaa 17386410  T
Q  122 tgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccactcccaattgcctagctatata 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17386409 tgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccactcccaattgcctagctatata 17386310  T
Q  222 ggtgatgatg 231  Q
     || ||||||    
T  17386309 tgttatgatg 17386300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 20157894 - 20158123
Alignment:
Q  1 tcatcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtatagg 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  20157894 tcatcaacaacatacaacaaattttctttcacctcggtgttagtccaagatgggttaggaagtacaaataaaataggcacattgagtttgagtgtgtagg 20157993  T
Q  101 tcatgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccac 200  Q
     |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20157994 acatgggtggacagtgcttaataaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaattttgtttatcccttggtcctcacccac 20158093  T
Q  201 tcccaattgcctagctatataggtgatgat 230  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  20158094 tcccaattgcctagctatgtatgtgatgat 20158123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 14447003 - 14447229
Alignment:
Q  1 tcatcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtatagg 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||| ||||    
T  14447003 tcatcaacaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtataattaaaacaggcacatcgagtttgagtgtgtagg 14447102  T
Q  101 tcatgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccac 200  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14447103 acatgggtggatgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagtctattgttaccctcaattttgtttatcccttggtcctcacccac 14447202  T
Q  201 tcccaattgcctagctatataggtgat 227  Q
     ||||||||||||||||| || |||||    
T  14447203 ccccaattgcctagctatgtatgtgat 14447229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 4369447 - 4369218
Alignment:
Q  1 tcatcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtatagg 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  4369447 tcatcaacaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagaaagtataattaaaataagcacattgagtttgagtgtgtagg 4369348  T
Q  101 tcatgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccac 200  Q
     ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  4369347 acatgggtggacggggcttaatgaagttcataaagataagggtctctatgtaaagcctattgattccctcaatgttgttaatcccttggtcctcacccac 4369248  T
Q  201 tcccaattgcctagctatataggtgatgat 230  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  4369247 tcccaattgcctagctatgtatgtgatgat 4369218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 3278242 - 3278023
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggt 101  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  3278242 catcaccaacatacatcaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtataaataaaagaggcacattgagtttgagtgtataggt 3278143  T
Q  102 catgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccact 201  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  3278142 catgggtggatgatgcttaatgaaattcatagaaatgagggtctctatgtttagcaaattgtttccctcgatcatgtttatcccttggttctcacccact 3278043  T
Q  202 cccaattgcctagctatata 221  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  3278042 cccaattgcctagctatata 3278023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 10604001 - 10604230
Alignment:
Q  1 tcatcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtatagg 100  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  10604001 tcatcaacaatatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagaaagtataatcaaaataggcacaatgagtttgagtgtgtagg 10604100  T
Q  101 tcatgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccac 200  Q
     |||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  10604101 acatgggtggatggggcttaatgaagttcataaagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatttttgtaatcccttggtcctcacccac 10604200  T
Q  201 tcccaattgcctagctatataggtgatgat 230  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  10604201 tcccaattgcctagctatgtatgtgatgat 10604230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 12423816 - 12424045
Alignment:
Q  1 tcatcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtatagg 100  Q
    |||||| ||||| | || |||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| ||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  12423816 tcatcaacaacataaaagaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgtgttagaaagtataatcaaaataggcacattgagtttgaatgtgtagg 12423915  T
Q  101 tcatgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccac 200  Q
     ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12423916 acatgggtggacggggcttaatgaagttcataaagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatgttgttaatcccgtggtcctcacccac 12424015  T
Q  201 tcccaattgcctagctatataggtgatgat 230  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  12424016 tcccaattgcctatctatgtatgtgatgat 12424045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 22165772 - 22166001
Alignment:
Q  1 tcatcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtatagg 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| | |||| || ||| |||||||||||||||||||||  ||||    
T  22165772 tcatcaacaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagaaggtataatcaaaataggcacattgagtttgagtgcgtagg 22165871  T
Q  101 tcatgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccac 200  Q
     |||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||| |||||||||||||||    
T  22165872 acatgggtggatggggcttaatgaagttcataaagataagggtctctatgttaagcctattgttttcctcaattttggtaatccattggtcctcacccac 22165971  T
Q  201 tcccaattgcctagctatataggtgatgat 230  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22165972 tcccaattgcctagctatgtatgtgatgat 22166001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13693649 - 13693435
Alignment:
Q  4 tcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggtca 103  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  13693649 tcaccaacatacaacaaattttcatccacctcggtgttagtctgagatgggttaggaagtataatcaaaacaggcacgttgagcttgagtgtataagtca 13693550  T
Q  104 tgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccactcc 203  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13693549 tgggtggtcgaggtttaatgaagttcatagagacaaggatctctatgttaagcctattattcccctcaatcttgttgatcccttggtcctcacccactcc 13693450  T
Q  204 caattgcctagctat 218  Q
    |||||||||||||||    
T  13693449 caattgcctagctat 13693435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16654463 - 16654233
Alignment:
Q  1 tcatcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagttt-gagtgtatag 99  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||| |||||  |||    
T  16654463 tcatcaacaacatacaacaaattttcttacacctcggtgttagtccgagatgggttagaaagtataatcaaaataggcacattgagttttgagtgcgtag 16654364  T
Q  100 gtcatgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcaccca 199  Q
    | |||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  | |||||||||||||||||||    
T  16654363 gacatgggtggatggggcttaatgaagttcataaagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaaatttagtaatcccttggtcctcaccca 16654264  T
Q  200 ctcccaattgcctagctatataggtgatgat 230  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16654263 ctcccaattgcctagctatgtatgtgatgat 16654233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 74 - 230
Target Start/End: Original strand, 18979475 - 18979631
Alignment:
Q  74 taggcacattgagtttgagtgtataggtcatgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaat 173  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18979475 taggcacattgagtttgagtgtgtaggacatgggtggacggggcttaatgaagttcataaagataagggtctctatgttaaccctattgtttccctcaat 18979574  T
Q  174 cttgtttatcccttggtcctcacccactcccaattgcctagctatataggtgatgat 230  Q
     ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  18979575 tttgttaatcccttggtcctcaccaactcgcaattgcctagctatgtatgtgatgat 18979631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Original strand, 12161540 - 12161761
Alignment:
Q  9 aacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggtcatgggt 108  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||| ||| ||||  || ||| | ||||| |||||||||||||||||    | |||     
T  12161540 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggtaaggcagtaagatcaaaatgggcacgttgagtttgagtgtataaacaaagggg 12161639  T
Q  109 ggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccactcccaatt 208  Q
     | ||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |     
T  12161640 agtcgaggttttatgaaattcatagagataagggtctctatgtttaacctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcactcactcctagta 12161739  T
Q  209 gcctagctatataggtgatgat 230  Q
    ||| |||||| || ||||||||    
T  12161740 gcccagctatgtatgtgatgat 12161761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 218
Target Start/End: Original strand, 3340668 - 3340877
Alignment:
Q  9 aacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggtcatgggt 108  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| | ||  || ||| | ||||||||||| |||||||||||    | |||     
T  3340668 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagcttgagtgtataaacaaagggg 3340767  T
Q  109 ggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccactcccaatt 208  Q
       ||| | || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||      
T  3340768 attcgaggttttatgaaattcatagagataagggtttctatgtttagtctattgttaccctcaatcttgtttatcccttggtcttcactcacgcctaacc 3340867  T
Q  209 gcctagctat 218  Q
    ||||||||||    
T  3340868 gcctagctat 3340877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15945326 - 15945117
Alignment:
Q  9 aacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggtcatgggt 108  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| | || ||| ||| |||| ||||| || ||||| |||||    | |||     
T  15945326 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggcaataatatcaaaataggtacattaagcttgagcgtataaacaaagggg 15945227  T
Q  109 ggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccactcccaatt 208  Q
       |||   |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||| || || |    
T  15945226 attcgagttttaatgaaattcatagagataagggtttctatgttcagcctattgtttccctcaatcttgtatagcccttggtcttcactcacgcctaact 15945127  T
Q  209 gcctagctat 218  Q
    ||||||||||    
T  15945126 gcctagctat 15945117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 191
Target Start/End: Original strand, 13505991 - 13506173
Alignment:
Q  9 aacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggtcatgggt 108  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| | ||  || ||| | ||||||||||| |||||||||||    | |||     
T  13505991 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagcttgagtgtataaacaaagggg 13506090  T
Q  109 ggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtc 191  Q
       ||  | || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13506091 attcggggttttatgaaattcatagagataagggtttctatgttgagtctattgttaccctcaatcttgtttatcccttggtc 13506173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 203
Target Start/End: Original strand, 15630386 - 15630587
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggt 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||  | ||||  ||| |     ||||  |||| ||| ||    
T  15630386 catcaccaacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagtagaaataaaagaggtatgcgaagttgaagtgcataagt 15630485  T
Q  102 catgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccact 201  Q
    |||||||||  ||  ||||||||||||||| |  | |||||| || || |||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |  ||||||||||||    
T  15630486 catgggtgggtgaatcttaatgaagttcatcgcaacaagggtttcaatattaagcctattgttgccctcaattgtgtttatcccatcttcctcacccact 15630585  T
Q  202 cc 203  Q
    ||    
T  15630586 cc 15630587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 13137599 - 13137811
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggt 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||  | ||||  ||| |     ||||  |||| ||| ||    
T  13137599 catcaccaacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagtagaaataaaagaggtatgcgaagttgaagtgcataagt 13137698  T
Q  102 catgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccact 201  Q
    |||||||||  ||  |||||||||||||||||  | |||||| || || |||||||||||||| ||||||||    |||||||| |  ||||||||||||    
T  13137699 catgggtgggtgaatcttaatgaagttcatagcaacaagggtttcaatattaagcctattgttgccctcaattggatttatcccatcttcctcacccact 13137798  T
Q  202 cccaattgcctag 214  Q
    || |||| |||||    
T  13137799 ccaaatttcctag 13137811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15643825 - 15643608
Alignment:
Q  1 tcatcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtatagg 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||| | ||  || ||  | ||||||||||||| ||||||||||     
T  15643825 tcatcagcaacatacaacaaatttgcttccacctcggtgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaagatgggcacattgagttggagtgtataga 15643726  T
Q  101 tcatgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccac 200  Q
      | |||    |||   || ||||| ||||||||||| || || |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  15643725 caaaggggactcgagttttgatgaaattcatagagatgagagtttctatgtttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctaggtcttcactcac 15643626  T
Q  201 tcccaattgcctagctat 218  Q
     || ||| ||| ||||||    
T  15643625 accgaatcgcccagctat 15643608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 10161656 - 10161873
Alignment:
Q  1 tcatcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtatagg 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||| | ||  || ||  | ||||||||||||| ||||||||||     
T  10161656 tcatcagcaacatacaacaaatttgcttccacctcggtgttagtgcgagatgggttaggcaataaaatcaagatgggcacattgagttggagtgtataga 10161755  T
Q  101 tcatgggtggac--gatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcaccc 198  Q
     ||| || ||||  ||   || ||||| ||||||||||| || || |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||| |    
T  10161756 -catagg-ggactcgagtttttatgaaattcatagagatgagagtttctatgtttagtctattgttaccctctatcttgtttatccctaggtcttcactc 10161853  T
Q  199 actcccaattgcctagctat 218  Q
    || || ||| ||| ||||||    
T  10161854 acaccgaatcgcccagctat 10161873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 170
Target Start/End: Original strand, 13196859 - 13197027
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggt 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | | ||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |  |  |||  ||| | |   ||||  |||| ||| ||    
T  13196859 catcaccaacatacaacaaatttgcctccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagcagaaacaaaagaggtatacgaagttgaagtgcataagt 13196958  T
Q  102 catgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctc 170  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||||||| | |||||| || || |||||||||||||| |||||    
T  13196959 catgggtggatgaagcttaatgaaattcatagatacaagggtttcaatattaagcctattgttgccctc 13197027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 7599140 - 7599078
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagta 64  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  7599140 catcaccaacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagta 7599078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 10145795 - 10145733
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagta 64  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  10145795 catcaccaacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagta 10145733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 64
Target Start/End: Original strand, 13188847 - 13188909
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagta 64  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  13188847 catcaccaacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagta 13188909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 173
Target Start/End: Original strand, 12188505 - 12188676
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggt 101  Q
    ||||||||||| || |||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||  |  |||   || | |   ||||  |||| ||| ||    
T  12188505 catcaccaacatactacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagtaaaaacaaaagtggtatacgaagttgaagtgcataagt 12188604  T
Q  102 catgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaat 173  Q
    |||||||||  ||  |||||||||||||||||  | |||||| || |||||||| |||||||| ||||||||    
T  12188605 catgggtgggtgaatcttaatgaagttcatagcaacaagggtttcaatgttaagtctattgttgccctcaat 12188676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 173
Target Start/End: Original strand, 12194919 - 12195090
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggt 101  Q
    ||||||||||| || |||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||  |  |||   || | |   ||||  |||| ||| ||    
T  12194919 catcaccaacatactacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagtaaaaacaaaagtggtatacgaagttgaagtgcataagt 12195018  T
Q  102 catgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaat 173  Q
    |||||||||  ||  |||||||||||||||||  | |||||| || |||||||| |||||||| ||||||||    
T  12195019 catgggtgggtgaatcttaatgaagttcatagcaacaagggtttcaatgttaagtctattgttgccctcaat 12195090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 64
Target Start/End: Original strand, 16374909 - 16374971
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagta 64  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  16374909 catcaccaacatacaagaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagta 16374971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 7599051 - 7598969
Alignment:
Q  91 agtgtataggtcatgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaat 173  Q
    |||| ||| |||||||||||  ||  |||||||||||||||||  | |||||| || |||||||| |||||||| ||||||||    
T  7599051 agtgcataagtcatgggtgggtgaatcttaatgaagttcatagcaacaagggtttcaatgttaagtctattgttgccctcaat 7598969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 173
Target Start/End: Original strand, 13188936 - 13189018
Alignment:
Q  91 agtgtataggtcatgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaat 173  Q
    |||| ||| |||||||||||  ||  |||||||||||||||||  | |||||| || |||||||| |||||||| ||||||||    
T  13188936 agtgcataagtcatgggtgggtgaatcttaatgaagttcatagcaacaagggtttcaatgttaagtctattgttgccctcaat 13189018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 9)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 8651797 - 8651569
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggt 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |  |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||     
T  8651797 catcaccaacatacaacaaattttcttccacctcagtgttagtccgagataggttaggaagtataattaaaataggcacattgaatttgagtgtataggc 8651698  T
Q  102 catgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccact 201  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8651697 catggggggacgaggtttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccact 8651598  T
Q  202 cccaattgcctagctatataggtgatgat 230  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  8651597 cccaattgcctagctatgtatgtgatgat 8651569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 3988855 - 3988626
Alignment:
Q  1 tcatcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtatagg 100  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  3988855 tcatcaacaacatacaacatattttcttccaccttggtgttagtccgagatgggttagaaagtataatcaaaatagacacattgagtttgagtgtgtagg 3988756  T
Q  101 tcatgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccac 200  Q
     ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  3988755 acatgggtggacggggcttaatgaagttcataaagataagggtctctatgttaagcctattgcttccctcaattttggtaatcccttggtcctcacccac 3988656  T
Q  201 tcccaattgcctagctatataggtgatgat 230  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||    
T  3988655 tcccaattgcctagctaggtatgtgatgat 3988626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Original strand, 8948883 - 8949095
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggt 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| | |||||| |     
T  8948883 catcaccaacatacaacaaattttcttcaacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtataattaaaacaggcacattgagtttaaatgtatatgc 8948982  T
Q  102 catgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttg-tttatcccttggtcctcacccac 200  Q
    |||| | |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  8948983 catgtggggacgaggtttaatgaagttcatagagatgagggtctctatgttaagcttattgtttccctcaatcttgttttatcccttggtcttcatccac 8949082  T
Q  201 tcccaattgccta 213  Q
    |||||||||||||    
T  8949083 tcccaattgccta 8949095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 20072373 - 20072603
Alignment:
Q  1 tcatcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtatagg 100  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||   |||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  20072373 tcatcatcaacatacaaaaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgtatagg 20072472  T
Q  101 tcatgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccac 200  Q
     ||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||| ||    
T  20072473 acatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtttccctcaatccttttaattccttggtcctcaccaac 20072572  T
Q  201 tcccaattgcctagctatataggtgatgatg 231  Q
     || |||||||||||||| || |||||||||    
T  20072573 cccaaattgcctagctatgtaagtgatgatg 20072603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 19877115 - 19877344
Alignment:
Q  1 tcatcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtatagg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||  |||||||||||| |||||| |||||  | ||||  ||||||||||||||||||||||||      
T  19877115 tcatcaccaacatacaacaagttttcttccacctcggtgttagtccgagataggttagaaagtagaaataaaagaggcacattgagtttgagtgtatatt 19877214  T
Q  101 tcatgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccac 200  Q
    |||| |||||| || | | ||||||||||||||| || ||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||| ||||    
T  19877215 tcataggtggatgaggttgaatgaagttcatagaaatgagggtcggtatgttaagcatattgttgccctcaatccggtttatcccttggttctcatccac 19877314  T
Q  201 tcccaattgcctagctatataggtgatgat 230  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  19877315 tcccaatttcctagctttataggtgatgat 19877344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19783771 - 19783562
Alignment:
Q  9 aacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggtcatgggt 108  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||| ||||| |||||| |||||  || ||| | ||||| |||||||||||||||||    | |||     
T  19783771 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtcagagataggttagaaagtaaaatcaaaatgggcacgttgagtttgagtgtataaacaaagggg 19783672  T
Q  109 ggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccactcccaatt 208  Q
     | ||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||    
T  19783671 agtcgaggttttatgaagttcatagagataagggtgtctatgtttagcctattgtttccctcaatcttgtttataccttggtcctcactcactcctagtt 19783572  T
Q  209 gcctagctat 218  Q
    ||| ||||||    
T  19783571 gcccagctat 19783562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 21800142 - 21800359
Alignment:
Q  1 tcatcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtatagg 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||| | ||  || ||  | ||||||||||||| ||||||||||     
T  21800142 tcatcagcaacatacaacaaatttgcttccacctcggtgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaagatgggcacattgagttggagtgtataga 21800241  T
Q  101 tcatgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccac 200  Q
      | |||    |||   || ||||| ||||||||||| || || |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  21800242 caaaggggactcgagttttgatgaaattcatagagatgagagtttctatgtttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctaggtcttcactcac 21800341  T
Q  201 tcccaattgcctagctat 218  Q
     || ||| ||| ||||||    
T  21800342 accgaatcgcccagctat 21800359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 20236265 - 20236203
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagta 64  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  20236265 catcaccaacatacaacaaatttttctccaccttggggttagtccgagatgggttaggaagta 20236203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 20392230 - 20392141
Alignment:
Q  9 aacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtata 98  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| | ||  || ||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  20392230 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagcttgagtgtata 20392141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 163; Significance: 3e-87; HSPs: 17)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 25372408 - 25372622
Alignment:
Q  4 tcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggtca 103  Q
    ||||||||| | | ||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25372408 tcaccaacatatatcaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtataattaaaataggcacattgagtttgagtgtataggtca 25372507  T
Q  104 tgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccactcc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25372508 tgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctatatgttaaacctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccactct 25372607  T
Q  204 caattgcctagctat 218  Q
    |||||||| ||||||    
T  25372608 caattgcccagctat 25372622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 24821552 - 24821776
Alignment:
Q  1 tcatcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtatagg 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  24821552 tcatcaacaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtacaatcaaaataggcacattgagtttgagtgtgtaga 24821651  T
Q  101 tcatgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccac 200  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  24821652 acatgggtggacgaggcttaatgaagttcatagagataagggtct-----ttaagcctattgtttccctcaattttgttaatcccttggtcctcacccac 24821746  T
Q  201 tcccaattgcctagctatataggtgatgat 230  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24821747 tcccaattgcctagctatgtatgtgatgat 24821776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 201
Target Start/End: Original strand, 25369016 - 25369214
Alignment:
Q  3 atcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggtc 102  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||| || | |||   |  ||||||||| ||||||| ||| | |    
T  25369016 atcaccaacatacaacaaattgtcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagcataaataatagaatcacattgagcttgagtgcataagcc 25369115  T
Q  103 atgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccact 201  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||| |||||||||||||    
T  25369116 atgggcggatgacgcttaatgaagttcatggaaatgagggtccctatgttaagcctattgttgccctcaattgaatttatcccttcgtcctcacccact 25369214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 196
Target Start/End: Original strand, 23160851 - 23161038
Alignment:
Q  9 aacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggtcatgggt 108  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| | ||  || ||| | ||||||||||| |||||||||||    | |||     
T  23160851 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagcttgagtgtataaacaaagggg 23160950  T
Q  109 ggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcac 196  Q
       ||  | || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23160951 attcggggttttatgaaattcatagagataagggtatctatgttgagtctattgttaccctcaatcttgtttatcccttggtcttcac 23161038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 196
Target Start/End: Original strand, 23572108 - 23572295
Alignment:
Q  9 aacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggtcatgggt 108  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| | ||  || ||| | ||||||||||| |||||||||||    | |||     
T  23572108 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagcttgagtgtataaacaaagggg 23572207  T
Q  109 ggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcac 196  Q
       ||  | || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23572208 attcggggttttatgaaattcatagagataagggtatctatgttgagtctattgttaccctcaatcttgtttatcccttggtcttcac 23572295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 27630245 - 27630058
Alignment:
Q  9 aacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggtcatgggt 108  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| | ||  || ||| | ||||||||||| |||||||||||    | |||     
T  27630245 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagcttgagtgtataaacaaagggg 27630146  T
Q  109 ggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcac 196  Q
       ||  | || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27630145 attcggggttttatgaaattcatagagataagggtttctatgttgagtctattgttaccctcaatcttgtttatcccttggtcttcac 27630058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 24170124 - 24169953
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggt 101  Q
    ||||||||||| |||| |||||| ||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||  |  ||| |||| || || ||||  |||| ||| ||    
T  24170124 catcaccaacatacaaaaaatttgcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtagaaacaaaataggtacgttaagttgaagtgcataagt 24170025  T
Q  102 catgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaat 173  Q
    |||||||||| || | |||||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  24170024 catgggtggatgaagtttaatgaaattcatagaaatgagggtttcaatgtttagcctattgattccctcaat 24169953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 203
Target Start/End: Original strand, 13044 - 13245
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggt 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||  | ||||  ||| |     ||||  |||| ||| ||    
T  13044 catcaccaacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagtagaaataaaagaggtatgcgaagttgaagtgcataagt 13143  T
Q  102 catgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccact 201  Q
    |||||||||  ||  ||||||||| |||||||  | |||||| || || |||||||||||||||||||||||    |||||||| |  ||||||||||||    
T  13144 catgggtgggtgaatcttaatgaaattcatagcaacaagggtttcaatattaagcctattgtttccctcaattggatttatcccatcttcctcacccact 13243  T
Q  202 cc 203  Q
    ||    
T  13244 cc 13245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 121 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 116158 - 116061
Alignment:
Q  121 atgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccactcccaattgcctagctat 218  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| || ||  ||||||||||    
T  116158 atgaaattcatagagataagggtttctatgtttagtctattgttaccctcgatcttgtttatcccttgatcttcactcacgcctaaccgcctagctat 116061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 203
Target Start/End: Original strand, 22046090 - 22046291
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggt 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||  | ||||  ||| |     ||||  |||| ||| ||    
T  22046090 catcaccaacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagtagaaataaaagaggtatgcgaagttgaagtgcataagt 22046189  T
Q  102 catgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccact 201  Q
    |||||||||  ||  |||||||||||||||||  | |||||| || || |||||||||||||| ||||||||    |||||||| |  ||||||||||||    
T  22046190 catgggtgggtgaatcttaatgaagttcatagcaacaagggtttcaatattaagcctattgttgccctcaattggatttatcccatcttcctcacccact 22046289  T
Q  202 cc 203  Q
    ||    
T  22046290 cc 22046291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 25356296 - 25356095
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggt 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||  | ||||  ||| |     ||||  |||| ||| ||    
T  25356296 catcaccaacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagtagaaataaaagaggtatgcgaagttgaagtgcataagt 25356197  T
Q  102 catgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccact 201  Q
    |||||||||  ||  |||||||||||||||||  | |||||| || || |||||||||||||| ||||||||    |||||||| |  ||||||||||||    
T  25356196 catgggtgggtgaatcttaatgaagttcatagcaacaagggtttcaatattaagcctattgttgccctcaattggatttatcccatcttcctcacccact 25356097  T
Q  202 cc 203  Q
    ||    
T  25356096 cc 25356095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 81
Target Start/End: Original strand, 17867490 - 17867568
Alignment:
Q  3 atcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcaca 81  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||    
T  17867490 atcaccaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagaaagtataatcaaaataggcaca 17867568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 24796763 - 24796980
Alignment:
Q  1 tcatcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtatagg 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||| | ||  || ||  | ||||||||||||| ||||||||||     
T  24796763 tcatcatcaacatacaacaaatttgcttccacctcggtgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaagatgggcacattgagttggagtgtataga 24796862  T
Q  101 tcatgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccac 200  Q
      | |||    |||   || ||||| ||||||||||| || || |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  24796863 caaaggggactcgagttttgatgaaattcatagagatgagagtttctatgtttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctaggtcttcactcac 24796962  T
Q  201 tcccaattgcctagctat 218  Q
     || ||| ||| ||||||    
T  24796963 accgaatcgcccagctat 24796980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 27626378 - 27626316
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagta 64  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  27626378 catcaccaacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagta 27626316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16774283 - 16774186
Alignment:
Q  121 atgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccactcccaattgcctagctat 218  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||| || ||| ||| ||||||    
T  16774283 atgaaattcatagagatgagagtttctatgtttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctaggtcttcactcacaccgaatcgcccagctat 16774186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 116270 - 116181
Alignment:
Q  9 aacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtata 98  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| |||||| | ||  || ||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  116270 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgagttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagcttgagtgtata 116181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22870337 - 22870283
Alignment:
Q  176 tgtttatcccttggtcctcacccactcccaattgcctagctatataggtgatgat 230  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||| || ||||||||    
T  22870337 tgtttatcccttggtcctcactcactcctagttgcccagctatgtatgtgatgat 22870283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 8)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 3353365 - 3353136
Alignment:
Q  1 tcatcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtatagg 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  3353365 tcatcaacaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagttcgagatgggttaggaagtacaatcaaaataggcacattgagtttgagtgtgtagg 3353266  T
Q  101 tcatgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccac 200  Q
     ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  3353265 acatgggtggacggggcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaattttgttaatcccttggtcttcacccac 3353166  T
Q  201 tcccaattgcctagctatataggtgatgat 230  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  3353165 tcccaattgcctagctatgtatgtgatgat 3353136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15864270 - 15864049
Alignment:
Q  9 aacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggtcatgggt 108  Q
    |||| |||| ||| |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  15864270 aacatacaaaaaaatttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtacaattaaaacaggcacattgagtttgagtgtgtaggaaatgggt 15864171  T
Q  109 ggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccactcccaatt 208  Q
    | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15864170 gtatgatgcttaatgaagttcatagaaataagggtctctatgttaagcctattgttaccctcaattttgtttatcccttagtcctcacccactcccaatt 15864071  T
Q  209 gcctagctatataggtgatgat 230  Q
    |||||| ||| || ||||||||    
T  15864070 gcctagatatgtacgtgatgat 15864049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 121 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16681021 - 16680924
Alignment:
Q  121 atgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccactcccaattgcctagctat 218  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||    
T  16681021 atgaaattcatagagataagggtgtctatgtttagcctattgtttccctcaatcttctttatcccttggtcttcactcactcctagttgcctagctat 16680924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 218
Target Start/End: Original strand, 15261535 - 15261744
Alignment:
Q  9 aacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggtcatgggt 108  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| | ||  || ||| | ||||||||||| |||||||||||    | |||     
T  15261535 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagcttgagtgtataaacaaagggg 15261634  T
Q  109 ggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccactcccaatt 208  Q
       |||   || ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| || ||      
T  15261635 attcgagtttttatgaaattcatagagataacggtttctatgttcagcctattgttaccctcgatcttgtttatcccttggtcttcactcacgcctaacc 15261734  T
Q  209 gcctagctat 218  Q
    ||||||||||    
T  15261735 gcctagctat 15261744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13821655 - 13821438
Alignment:
Q  1 tcatcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtatagg 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||| | ||  || ||  | ||||||||||||| ||||||||||     
T  13821655 tcatcatcaacatacaacaaatttgcttccacctcggtgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaagatgggcacattgagttggagtgtataga 13821556  T
Q  101 tcatgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccac 200  Q
      | |||    |||   || ||||| ||||||||||| || || |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  13821555 caaaggggactcgagttttgatgaaattcatagagatgagagtttctatgtttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctaggtcttcactcac 13821456  T
Q  201 tcccaattgcctagctat 218  Q
     || ||| ||| ||||||    
T  13821455 accgaatcgcccagctat 13821438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 22109744 - 22109682
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagta 64  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  22109744 catcaccaacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagta 22109682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 15253129 - 15253067
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagta 64  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  15253129 catcaccaacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatggattaggaagta 15253067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 22109655 - 22109543
Alignment:
Q  91 agtgtataggtcatgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggt 190  Q
    |||| ||| |||||||||||  ||  |||||||||||||||||  | |||||| || || ||||| |||||||| |||||||||   |||||||| |  |    
T  22109655 agtgcataagtcatgggtgggtgaatcttaatgaagttcatagcaacaagggtttcaatattaagtctattgttgccctcaatcggatttatcccatctt 22109556  T
Q  191 cctcacccactcc 203  Q
    ||||||| |||||    
T  22109555 cctcacctactcc 22109543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 44206 - 43978
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggt 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||| ||| |||||||| |     
T  44206 catcaccaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtataatcaaaacaggcacattgatttttagtgtatatgc 44107  T
Q  102 catgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccact 201  Q
    ||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44106 catgggtggtcgaggttttatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcttcacccact 44007  T
Q  202 cccaattgcctagctatataggtgatgat 230  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  44006 cccaattgcctagctatgtatgtgatgat 43978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 51595 - 51367
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggt 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||| ||| |||||||| |     
T  51595 catcaccaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtataatcaaaacaggcacattgatttttagtgtatatgc 51496  T
Q  102 catgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccact 201  Q
    ||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51495 catgggtggtcgaggttttatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcttcacccact 51396  T
Q  202 cccaattgcctagctatataggtgatgat 230  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  51395 cccaattgcctagctatgtatgtgatgat 51367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 18)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20107048 - 20106820
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggt 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||| |||||||||||    
T  20107048 catcaccaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtataattaaaacgggcacattgagtttaagtgtataggt 20106949  T
Q  102 catgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccact 201  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  20106948 catggggggacgaggtttaatgaagttcatagagatgagagtctctatgttaagcctattgttttcctcaatcttgtttatcccctggtcttcacccact 20106849  T
Q  202 cccaattgcctagctatataggtgatgat 230  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  20106848 cccaatttcctagctatgtatgtgatgat 20106820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 230
Target Start/End: Original strand, 15921432 - 15921658
Alignment:
Q  3 atcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggtc 102  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |    
T  15921432 atcaccaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtataattaaaacaggcacattgagtttaagtgtataggcc 15921531  T
Q  103 atgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccactc 202  Q
    |||||||| ||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  15921532 atgggtggtcgaggttttatgaagttcaaagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttg-ttatcccttggtcttcacccactc 15921630  T
Q  203 ccaattgcctagctatataggtgatgat 230  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||    
T  15921631 ccaattgcctaactatgtatgtgatgat 15921658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 824401 - 824174
Alignment:
Q  3 atcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggtc 102  Q
    |||||||| | | ||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |    
T  824401 atcaccaatataaaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtataattaaaacaggcacattgagtttaagtgtataggcc 824302  T
Q  103 atgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccactc 202  Q
    |||||||| ||| | || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  824301 atgggtggtcgaggttttatgaagttcataaagataagggcctctatgttaagcctattgttttcctcaatcttgttaatcccttggtcttcacccactc 824202  T
Q  203 ccaattgcctagctatataggtgatgat 230  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||    
T  824201 ccaattgcctaactatgtatgtgatgat 824174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 16150971 - 16151188
Alignment:
Q  1 tcatcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtatagg 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||| |||||||||||  ||||    
T  16150971 tcatcaacaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagaaagtataatcaaaataggcacatggagtttgagtgcgtagg 16151070  T
Q  101 tcatgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccac 200  Q
     |||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  16151071 acatgggtggatggggcttaatgaagttcataaagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaattttggtaatcccttggtcctcacccac 16151170  T
Q  201 tcccaattgcctagctat 218  Q
    || |||||||||||||||    
T  16151171 tctcaattgcctagctat 16151188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15064535 - 15064320
Alignment:
Q  3 atcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggtc 102  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||| ||| |||| |||||||||| |    
T  15064535 atcaccaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagaaagtataatcaaaataggcacgttgggtttaagtgtataggcc 15064436  T
Q  103 atgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccactc 202  Q
    |||||||| ||| | || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15064435 atgggtggtcgaggttttatgaagttcaaagagataagggcctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgttaatcccttggtcttcacccactc 15064336  T
Q  203 ccaattgcctagctat 218  Q
    ||||||||||| ||||    
T  15064335 ccaattgcctaactat 15064320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 203
Target Start/End: Original strand, 48803289 - 48803490
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggt 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||  |  |||  ||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  48803289 catcaccaacatacaacaaatttgcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtagaaacaaaagaggcacattgagtttaagtgcataagt 48803388  T
Q  102 catgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccact 201  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    |||||||| | |||||||||||||    
T  48803389 catgggtggacgatgcttaatgaaattcatagaaatgagggtttcaatgttaagcctattgttgccctcaattggatttatcccctcgtcctcacccact 48803488  T
Q  202 cc 203  Q
    ||    
T  48803489 cc 48803490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16530783 - 16530574
Alignment:
Q  9 aacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggtcatgggt 108  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||| ||||||||||||| |||| ||| ||| | ||||| |||||||||||||||||    | |||     
T  16530783 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtctgagatgggttaggcagtaatatcaaaatgggcacgttgagtttgagtgtataaacaaagggg 16530684  T
Q  109 ggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccactcccaatt 208  Q
     | ||| | || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||    
T  16530683 agtcgaggttttatgaaattcatagagataagggtgtctatgtttagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcttcactcactcctagtt 16530584  T
Q  209 gcctagctat 218  Q
    ||||| ||||    
T  16530583 gcctaactat 16530574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 218
Target Start/End: Original strand, 16634879 - 16635088
Alignment:
Q  9 aacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggtcatgggt 108  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||| ||||||||||||| |||| ||| ||| | ||||| |||||||||||||||||    | |||     
T  16634879 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtctgagatgggttaggcagtaatatcaaaatgggcacgttgagtttgagtgtataaacaaagggg 16634978  T
Q  109 ggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccactcccaatt 208  Q
     | ||| | || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||    
T  16634979 agtcgaggttttatgaaattcatagagataagggtgtctatgtttagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcttcactcactcctagtt 16635078  T
Q  209 gcctagctat 218  Q
    ||||| ||||    
T  16635079 gcctaactat 16635088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 218
Target Start/End: Original strand, 16761252 - 16761461
Alignment:
Q  9 aacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggtcatgggt 108  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||  || ||| | ||||| |||||||||||||||||    | |||     
T  16761252 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggcagtaaaatcaaaatgggcacgttgagtttgagtgtataaacaaagggg 16761351  T
Q  109 ggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccactcccaatt 208  Q
     | ||| | || ||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||| | ||    
T  16761352 agtcgaggttttatgaaattcatagagataagggtgtttatgtttagcctattgtttcccttaatcttgtttatctcttggtcttcactcactcctagtt 16761451  T
Q  209 gcctagctat 218  Q
    ||||||||||    
T  16761452 gcctagctat 16761461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13672603 - 13672386
Alignment:
Q  1 tcatcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtatagg 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||| | ||  || ||  | ||||||||||||| ||||||||||     
T  13672603 tcatcatcaacatacaacaaatttgcttccacctcggtgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaagatgggcacattgagttggagtgtataga 13672504  T
Q  101 tcatgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccac 200  Q
      | |||    |||   || ||||| ||||||||||| || || |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  13672503 caaaggggactcgagtttttatgaaattcatagagatgagagtttctatgtttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctaggtcttcactcac 13672404  T
Q  201 tcccaattgcctagctat 218  Q
     || ||| ||| ||||||    
T  13672403 accgaatcgcccagctat 13672386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 18286409 - 18286208
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggt 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||  | ||||  ||| |     ||||  || | ||| ||    
T  18286409 catcaccaacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagtagaaataaaagaggtatgcgaagttgaagggcataagt 18286310  T
Q  102 catgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccact 201  Q
    |||||||||  ||  |||||||||||||||||  | |||||| || || |||||||||||||| ||||||||    |||||||| |  ||||||||||||    
T  18286309 catgggtgggtgaatcttaatgaagttcatagcaacaagggtttcaatattaagcctattgttgccctcaattggatttatcccatcttcctcacccact 18286210  T
Q  202 cc 203  Q
    ||    
T  18286209 cc 18286208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 18594737 - 18594954
Alignment:
Q  1 tcatcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtatagg 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||| | ||  || ||  | ||||||||||||| ||||||||||     
T  18594737 tcatcatcaacatacaacaaatttgcttccacctcggtgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaagatgggcacattgagttggagtgtataga 18594836  T
Q  101 tcatgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccac 200  Q
      | |||    |||   || ||||| ||||||||||| || || |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  18594837 caaaggggactcgagtttttatgaaattcatagagatgagagtttctatgtttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctaggtcttcactcac 18594936  T
Q  201 tcccaattgcctagctat 218  Q
     || ||| ||| ||||||    
T  18594937 accgaatcgcccagctat 18594954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18616947 - 18616730
Alignment:
Q  1 tcatcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtatagg 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||| | ||  || ||  | ||||||||||||| ||||||||||     
T  18616947 tcatcatcaacatacaacaaatttgcttccacctcggtgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaagatgggcacattgagttggagtgtataga 18616848  T
Q  101 tcatgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccac 200  Q
      | |||    |||   || ||||| ||||||||||| || || |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  18616847 caaaggggactcgagtttttatgaaattcatagagatgagagtttctatgtttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctaggtcttcactcac 18616748  T
Q  201 tcccaattgcctagctat 218  Q
     || ||| ||| ||||||    
T  18616747 accgaatcgcccagctat 18616730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 2 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 13656717 - 13656546
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggt 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||  | | ||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |  |  |||  ||| | |   ||||  |||| ||| ||    
T  13656717 catcaccaacatacaacaaattcgcctccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagcagaaacaaaagaggtatacgaagttgaagtgcataagt 13656618  T
Q  102 catgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaat 173  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||||||| | |||||| || || |||||||||||||| ||||||||    
T  13656617 catgggtggatgaagcttaatgaaattcatagatacaagggtttcaatattaagcctattgttgccctcaat 13656546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 8716648 - 8716586
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagta 64  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  8716648 catcaccaacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagta 8716586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 14549880 - 14549818
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagta 64  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  14549880 catcaccaacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagta 14549818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 203
Target Start/End: Original strand, 16467045 - 16467246
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggt 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||  |  |||  ||| |     ||||  |||| ||| ||    
T  16467045 catcaccaacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttacgaagtagaaacaaaagaggtatgcgaagttgaagtgcataagt 16467144  T
Q  102 catgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccact 201  Q
    |||||||||  ||  |||||||||||||||||  | |||||| || || |||||||||||||| ||||||||    |||||||| |  ||||||||||||    
T  16467145 catgggtgggtgaatcttaatgaagttcatagcaacaagggtttcaatattaagcctattgttgccctcaattggatttatcccatcttcctcacccact 16467244  T
Q  202 cc 203  Q
    ||    
T  16467245 cc 16467246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 8716559 - 8716447
Alignment:
Q  91 agtgtataggtcatgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggt 190  Q
    |||| ||| |||||||||||  ||  |||||||||||||||||  | |||||| || || ||||| |||||||| ||||||||    |||||||| |  |    
T  8716559 agtgcataagtcatgggtgggtgaatcttaatgaagttcatagcaacaagggtttcaatattaagtctattgttgccctcaattggatttatcccatctt 8716460  T
Q  191 cctcacccactcc 203  Q
    |||||||||||||    
T  8716459 cctcacccactcc 8716447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 9)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 18446980 - 18446752
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggt 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||     
T  18446980 catcaccaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagttcgagatgggttaggaagtataatgaaaacaggcacattgagtttgagtgtataggc 18446881  T
Q  102 catgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccact 201  Q
    ||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18446880 catgggtggtcgaggttttatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttacctcaatcttgttgatcccttggtcttcacccact 18446781  T
Q  202 cccaattgcctagctatataggtgatgat 230  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  18446780 cccaatttcctagctatttatgtgatgat 18446752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Original strand, 21561926 - 21562147
Alignment:
Q  9 aacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggtcatgggt 108  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||  || ||| | ||||| |||||||||||||||||    | |||     
T  21561926 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgaaatgggttaggaagtaaaatcaaaatgggcacgttgagtttgagtgtataaacaaagggg 21562025  T
Q  109 ggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccactcccaatt 208  Q
     | | | | || |||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||    
T  21562026 agtcaaggttttatgaagttcatagaaataagggcgtctatgtttagcctattgtttccctcaatcttgtttattccttggtcctcactcactcctagtt 21562125  T
Q  209 gcctagctatataggtgatgat 230  Q
    ||| |||||| || ||||||||    
T  21562126 gcccagctatgtatgtgatgat 21562147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 18010632 - 18010461
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggt 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |  ||| |||| | ||| |||| ||||| ||| ||    
T  18010632 catcaccaacatacaacaaattttcttccaccttggtgttagtccgagatgggttaggaagtagaaagaaaataggtatattaagttggagtgcataagt 18010533  T
Q  102 catgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaat 173  Q
    |||||||||| || | || ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  18010532 catgggtggatgaagtttgatgaaattcatagaaatgagggtttcaatgtttagcatgttgtttccctcaat 18010461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 20017708 - 20017925
Alignment:
Q  1 tcatcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtatagg 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||| | ||  || ||  | ||||||||||||| ||||||||||     
T  20017708 tcatcatcaacatacaacaaatttgcttccacctcggtgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaagatgggcacattgagttggagtgtataga 20017807  T
Q  101 tcatgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccac 200  Q
      | |||    |||   || ||||| ||||||||||| || || |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  20017808 caaaggggactcgagtttttatgaaattcatagagatgagagtttctatgtttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctaggtcttcactcac 20017907  T
Q  201 tcccaattgcctagctat 218  Q
     || ||| ||| ||||||    
T  20017908 accgaatcgcccagctat 20017925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 22167023 - 22167240
Alignment:
Q  1 tcatcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtatagg 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||| | ||  || ||  | ||||||||||||| ||||||||||     
T  22167023 tcatcatcaacatacaacaaatttgcttccacctcggtgttagttcgagatgggttaggcaataaaatcaagatgggcacattgagttggagtgtataga 22167122  T
Q  101 tcatgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccac 200  Q
      | |||    |||   || ||||| ||||||||||| || || |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  22167123 caaaggggactcgagtttttatgaaattcatagagatgagagtttctatgtttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctaggtcttcactcac 22167222  T
Q  201 tcccaattgcctagctat 218  Q
     || ||| ||| ||||||    
T  22167223 accgaatcgcccagctat 22167240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 64
Target Start/End: Original strand, 8725431 - 8725493
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagta 64  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  8725431 catcaccaacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagta 8725493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 64
Target Start/End: Original strand, 24856674 - 24856736
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagta 64  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24856674 catcaccaacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagta 24856736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20168859 - 20168750
Alignment:
Q  121 atgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccactcccaattgcctagctatat 220  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||| |||| |||| ||| || ||| ||| |||||| |    
T  20168859 atgaaattcatagagatgagagtttctatgtttagtctattgttaccctcgattttgtttatccctaggtcttcactcacaccgaatcgcccagctatgt 20168760  T
Q  221 aggtgatgat 230  Q
    | ||||||||    
T  20168759 atgtgatgat 20168750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 191
Target Start/End: Original strand, 22768605 - 22768788
Alignment:
Q  8 caacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggtcatggg 107  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||| | ||  |||||  | |||||||| |||| ||||||||||   | |||    
T  22768605 caacatacaacaaatttgcttccacctcggtgttagttcgagatgggttaggcaataaaattaagatgggcacattcagttggagtgtatagacaaaggg 22768704  T
Q  108 tggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtc 191  Q
        |||   || ||||| ||||||||||| || || |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  22768705 gactcgagtttttatgaaattcatagagatgagagtttctatgtttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctaggtc 22768788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 19)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 26846411 - 26846184
Alignment:
Q  3 atcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggtc 102  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||  ||| ||| ||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  26846411 atcaacaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttattccaagatgggttagaaagtataatcaaaataggcacattgagtttgagtgtgtaggac 26846312  T
Q  103 atgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccactc 202  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26846311 atgggtggacggggcttaatgaagttcataaagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatgttgttaatcccttggtcctcacccactc 26846212  T
Q  203 ccaattgcctagctatataggtgatgat 230  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||    
T  26846211 ccaattgcctagctatgtatgtgatgat 26846184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 20597308 - 20597537
Alignment:
Q  1 tcatcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtatagg 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||  ||||    
T  20597308 tcatcaacaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagaaagtataatcaaaataggcacattgagtttgagtgcgtagg 20597407  T
Q  101 tcatgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccac 200  Q
     |||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  20597408 acatgggtggatggggcttaatgaagttcataaagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaattttggtaatcccttggtcctcacccac 20597507  T
Q  201 tcccaattgcctagctatataggtgatgat 230  Q
    || ||||||||||||||| || ||||||||    
T  20597508 tctcaattgcctagctatgtatgtgatgat 20597537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 20603605 - 20603834
Alignment:
Q  1 tcatcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtatagg 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||  ||||    
T  20603605 tcatcaacaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagaaagtataatcaaaataggcacattgagtttgagtgcgtagg 20603704  T
Q  101 tcatgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccac 200  Q
     |||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  20603705 acatgggtggatggggcttaatgaagttcataaagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaattttggtaatcccttggtcctcacccac 20603804  T
Q  201 tcccaattgcctagctatataggtgatgat 230  Q
    || ||||||||||||||| || ||||||||    
T  20603805 tctcaattgcctagctatgtatgtgatgat 20603834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 20792251 - 20792480
Alignment:
Q  1 tcatcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtatagg 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  20792251 tcatcaacaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagaaagtataatcaaaataggcacaatgagtttgagtgtgtagg 20792350  T
Q  101 tcatgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccac 200  Q
     |||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |  |||||||||||||||||||    
T  20792351 acatgggtggatggggcttaatgaagttcataaagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatttttgtactcccttggtcctcacccac 20792450  T
Q  201 tcccaattgcctagctatataggtgatgat 230  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  20792451 tcccaattgcctagctatgtatgtgatgat 20792480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 20609924 - 20610153
Alignment:
Q  1 tcatcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtatagg 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||| ||||||||||||||  ||||    
T  20609924 tcatcaacaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagaaagtataatcaaaataggcatattgagtttgagtgcgtagg 20610023  T
Q  101 tcatgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccac 200  Q
     ||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  20610024 acatgggtggatagggcttaatgaagttcataaagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaattttggtaatcccttggtcctcacccac 20610123  T
Q  201 tcccaattgcctagctatataggtgatgat 230  Q
    || ||||||||||||||| || ||||||||    
T  20610124 tctcaattgcctagctatgtatgtgatgat 20610153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 18071657 - 18071428
Alignment:
Q  1 tcatcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtatagg 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||  ||||    
T  18071657 tcatcaacaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagaaagtataatcaaaataggcacattgagtttgagtgcgtagg 18071558  T
Q  101 tcatgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccac 200  Q
     |||||||||| |  ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  18071557 acatgggtggatggggcttaatgaagttcataaagagaagggtctttatgttaagcctattggttccctcaattttggtaatcccttggtcctcacccac 18071458  T
Q  201 tcccaattgcctagctatataggtgatgat 230  Q
    ||| |||||||||| ||| || ||||||||    
T  18071457 tcctaattgcctaggtatgtatgtgatgat 18071428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22947203 - 22946975
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggt 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||| | ||||  |||||||||||| ||||||  ||| |     
T  22947203 catcaccaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagaaagtataaataaaagaggcacattgagcttgagttcatatgc 22947104  T
Q  102 catgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccact 201  Q
    ||  || ||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22947103 cacaggcggatgaggcttgatgaagttcatagaaataagggtctctatgttaagcctattgttgccctcaatctgatttatcccttggtcctcacccact 22947004  T
Q  202 cccaattgcctagctatataggtgatgat 230  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22947003 cccaacttcctagctatataggtgatgat 22946975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 231
Target Start/End: Original strand, 23520623 - 23520846
Alignment:
Q  8 caacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggtcatggg 107  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||   |||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  23520623 caacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgtataggacatggg 23520722  T
Q  108 tggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccactcccaat 207  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||| || || |||    
T  23520723 tggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtttccctcaatccttttaattccttggtcctcaccaaccccaaat 23520822  T
Q  208 tgcctagctatataggtgatgatg 231  Q
    ||||||||||| || |||||||||    
T  23520823 tgcctagctatgtaagtgatgatg 23520846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 218
Target Start/End: Original strand, 25117622 - 25117831
Alignment:
Q  9 aacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggtcatgggt 108  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||||| |||||||||||||||||    | |||     
T  25117622 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggcagtaatatcaaagtgggcacgttgagtttgagtgtataaacaaagggg 25117721  T
Q  109 ggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccactcccaatt 208  Q
       ||| | || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| | ||    
T  25117722 attcgaggttttatgaaattcatagagataagggtgtctatgtttagcctattgtttccctcaatcttgtttatctcttggtcttcactcactcctagtt 25117821  T
Q  209 gcctagctat 218  Q
     |||||||||    
T  25117822 tcctagctat 25117831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 218
Target Start/End: Original strand, 25176713 - 25176922
Alignment:
Q  9 aacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggtcatgggt 108  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||||| |||||||||||||||||    | |||     
T  25176713 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggcagtaatatcaaagtgggcacgttgagtttgagtgtataaacaaagggg 25176812  T
Q  109 ggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccactcccaatt 208  Q
       ||| | || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| | ||    
T  25176813 attcgaggttttatgaaattcatagagataagggtgtctatgtttagcctattgtttccctcaatcttgtttatctcttggtcttcactcactcctagtt 25176912  T
Q  209 gcctagctat 218  Q
     |||||||||    
T  25176913 tcctagctat 25176922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 20439632 - 20439849
Alignment:
Q  1 tcatcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtatagg 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| | || ||| ||| | |||||||| || |||||  ||||      
T  20439632 tcatcatcaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggcaataatatcaaagtgggcacattaagcttgagcatataaa 20439731  T
Q  101 tcatgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccac 200  Q
      | |||    ||| | || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  20439732 caaaggggattcgaggttttatgaaattcatagagataagggtgtctatgtttagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcatcactcac 20439831  T
Q  201 tcccaattgcctagctat 218  Q
     || | ||||||||||||    
T  20439832 gcctagttgcctagctat 20439849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 21387080 - 21386881
Alignment:
Q  1 tcatcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtatagg 100  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||| ||||| ||  ||||||| ||   ||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||  ||| |    
T  21387080 tcatcaccaacatacaaaaaatttgcttccacctcggtgttagtccaag---ggttaggaagtagaaataaaataggcacattgagtttgagttcatatg 21386984  T
Q  101 tcatgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccac 200  Q
     ||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||    |||||||||| ||||||||||||    
T  21386983 ccataggcggacgatgcttaatgaagttcatagaaatgagggtttcaatgttaagtctattgttgccctcaattggatttatccctttgtcctcacccac 21386884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 121 - 218
Target Start/End: Original strand, 30764692 - 30764789
Alignment:
Q  121 atgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccactcccaattgcctagctat 218  Q
    ||||| |||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||||||    
T  30764692 atgaaattcatagctataagggtgtctatgtttagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcttcactaactcctagttgcctagctat 30764789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 23746834 - 23746634
Alignment:
Q  3 atcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggtc 102  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||  | ||||  ||| |     ||||  |||| ||| |||    
T  23746834 atcaccaacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagtagaaataaaagaggtatgcgaagttgaagtgcataagtc 23746735  T
Q  103 atgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccactc 202  Q
    ||||||||  ||  |||||||||||||||||  | |||||| || || |||||||||||||| ||||||||    |||||||| |  |||||||||||||    
T  23746734 atgggtgggtgaatcttaatgaagttcatagtaacaagggtttcaatattaagcctattgttgccctcaattggatttatcccatcttcctcacccactc 23746635  T
Q  203 c 203  Q
    |    
T  23746634 c 23746634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 20620947 - 20620885
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagta 64  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  20620947 catcaccaacatacaacaaattttcctccaccttggggttagtccgagatgggttaggaagta 20620885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 15734318 - 15734256
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagta 64  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  15734318 catcaccaacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagta 15734256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 64
Target Start/End: Original strand, 25008213 - 25008275
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagta 64  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  25008213 catcaccaacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagta 25008275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 218
Target Start/End: Original strand, 24954765 - 24954862
Alignment:
Q  121 atgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccactcccaattgcctagctat 218  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||| || ||| ||| ||||||    
T  24954765 atgaaattcatagagatgagagtttctatgtttagtctattgttaccctcgatcttgtttatccctaggtcttcactcacaccgaatcgcccagctat 24954862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 61
Target Start/End: Original strand, 22318914 - 22318973
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaa 61  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | | ||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  22318914 catcaccaacatacaacaaatttgcctccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaa 22318973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12227 - 11998
Alignment:
Q  1 tcatcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtatagg 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||  ||||    
T  12227 tcatcaacaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagaaagtataatcaaaataggcacattgagtttgagtgcgtagg 12128  T
Q  101 tcatgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccac 200  Q
     |||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  12127 acatgggtggatggggcttaatgaagttcataaagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaattttggtaatcccttggtcctcacccac 12028  T
Q  201 tcccaattgcctagctatataggtgatgat 230  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12027 tcccaattgcctagctatgtatgtgatgat 11998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 136; Significance: 4e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 132401 - 132174
Alignment:
Q  3 atcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggtc 102  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |    
T  132401 atcaccaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtataattaaaataggcacattgagtttaagtgtataggcc 132302  T
Q  103 atgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccactc 202  Q
    |||||||| ||| | || |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  132301 atgggtggtcgaggttttatgaagttcaaagagaaaagggcctctatgttaagcctattgttaccctcaatcttgttaatcccttggtcttcacccactc 132202  T
Q  203 ccaattgcctagctatataggtgatgat 230  Q
     |||||||||| |||| || ||||||||    
T  132201 tcaattgcctaactatgtacgtgatgat 132174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21622 - 21400
Alignment:
Q  8 caacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggtcatggg 107  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||  |  ||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  21622 caacatacaacaaattttcttccacctcagtgttagtccgagatgggttagaaagtataatcaaaataggcacattgagtttgagtgtgtaggacatggg 21523  T
Q  108 tggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccactcccaat 207  Q
    |||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  21522 tggatggggcttaatgaagttcataaagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatgttgttaatcccttggtccttacccactcccaat 21423  T
Q  208 tgcctagctatataggtgatgat 230  Q
    | ||||||||| || ||||||||    
T  21422 ttcctagctatgtatgtgatgat 21400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24104 - 23875
Alignment:
Q  1 tcatcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtatagg 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||| || |    
T  24104 tcatcaacaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagaaagtataatcaaaataggcacattgagtttgagtgtgtaag 24005  T
Q  101 tcatgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccac 200  Q
     ||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  24004 acatgggtggacggggcctaatgaagttcataaagataagggtctctatgttaagcctattaattccctcaattttggtaatcccttggtcctcacccac 23905  T
Q  201 tcccaattgcctagctatataggtgatgat 230  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  23904 tcccaattgcctagctatgtatgtgatgat 23875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 913 - 684
Alignment:
Q  1 tcatcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtatagg 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  913 tcatcaacaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagaaagtataatcaaaataggcacattgagtttgagtgtgtagg 814  T
Q  101 tcatgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccac 200  Q
     ||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||  || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  813 acatgggtggacggggcctaatgaagttcataaagataagtgtctctatgttatgcctattaatttcctcaatgttgttaatcccttggtcctcacccac 714  T
Q  201 tcccaattgcctagctatataggtgatgat 230  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  713 tcccaattgcctagctatgtatgtgatgat 684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 22461 - 22690
Alignment:
Q  1 tcatcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtatagg 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  22461 tcatcaacaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagaaagtataatcaaaataggcacattgagtttgagtgtgtagg 22560  T
Q  101 tcatgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccac 200  Q
     |||||| | |||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |    
T  22561 acatgggcgaacggggcttaatgaagttcataaagataaaggtctctatgttaagcctattgtttccctcaattttgttaatcccttggtcctcaccctc 22660  T
Q  201 tcccaattgcctagctatataggtgatgat 230  Q
    |||||| || |||||||| || ||||||||    
T  22661 tcccaagtgtctagctatgtatgtgatgat 22690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 122126 - 121900
Alignment:
Q  1 tcatcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtatagg 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||| || ||  |||||||||||||||||||||| || |    
T  122126 tcatcaacaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagaaagtataatcaatataggcacattgagtttgagtgtgtaag 122027  T
Q  101 tcatgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccac 200  Q
     ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  122026 acatgggtggacgaggcttaatgaggttcataaagataagggtctctatgttaagcctattgtttcccttaattttggtaattccttggtcctcacccac 121927  T
Q  201 tcccaattgcctagctatataggtgat 227  Q
    ||||||||||| |||||| || |||||    
T  121926 tcccaattgccgagctatgtatgtgat 121900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 19718 - 19938
Alignment:
Q  1 tcatcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtatagg 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||  || ||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  19718 tcatcaacaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagaaagtacaatcaaaataggcacattgagtttgagtgtgtaga 19817  T
Q  101 tcatgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccac 200  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19818 acatgggtggacgaggcttaatgaagttcatagagata---------atgttaagcctattgtttccctcaattttgttaatcccttggtcctcacccac 19908  T
Q  201 tcccaattgcctagctatataggtgatgat 230  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  19909 tcccaattgcctagctatgtatgtgatgat 19938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 7938 - 8151
Alignment:
Q  4 tcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggtca 103  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || || ||  |||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||| |||| |||||||||||| | ||    
T  7938 tcaccaacatacaacaaattttcttccagctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtataatcaaaacaggcacgttga-tttgagtgtataagcca 8036  T
Q  104 tgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccactcc 203  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8037 tgggtggtcgaggtttaatgaagttcatagagacaaggatctctatgttaagcctattattccccttaatcttgttgatcccttggtcctcacccactcc 8136  T
Q  204 caattgcctagctat 218  Q
    |||||||||||||||    
T  8137 caattgcctagctat 8151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 230
Target Start/End: Original strand, 5035 - 5261
Alignment:
Q  4 tcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggtca 103  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||    |    
T  5035 tcaccaacatacaacaaattctcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtaaaattaaaataggcacgttgagtttgagtgtataaacaa 5134  T
Q  104 tgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccactcc 203  Q
     |||| | ||| | || |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  5135 agggtagtcgaggtttgatgaagttcatagagacaagagtttctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatccattggtcttcactcactcc 5234  T
Q  204 caattgcctagctatataggtgatgat 230  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||    
T  5235 caattgcctagctatgtatgtgatgat 5261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 8450 - 8680
Alignment:
Q  1 tcatcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtatagg 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||   |||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  8450 tcatcatcaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgtatagg 8549  T
Q  101 tcatgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccac 200  Q
     ||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | || || |||||||||| ||| ||    
T  8550 acatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtttccctaaatccttttaattccttggtccttaccaac 8649  T
Q  201 tcccaattgcctagctatataggtgatgatg 231  Q
     || |||||||||||||| || |||||||||    
T  8650 cccaaattgcctagctatgtaagtgatgatg 8680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0202 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0202
Description:

Target: scaffold0202; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 90 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 1848 - 1708
Alignment:
Q  90 gagtgtataggtcatgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttgg 189  Q
    |||||| |||| | |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  1848 gagtgtgtaggacgtgggtgtatgatgattaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgttaccctcaattttgtttatcccttgg 1749  T
Q  190 tcctcacccactcccaattgcctagctatataggtgatgat 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  1748 tcctcacccactcccaattgcctagctatgtatgtgatgat 1708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1095 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold1095
Description:

Target: scaffold1095; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 2049 - 1870
Alignment:
Q  1 tcatcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtatagg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| || |||  || ||||||||||||||||||||| |    
T  2049 tcatcaccaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtataatcaaaacagtcacattgagtttgagtgtataag 1950  T
Q  101 tcatgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttat 182  Q
     |||||| || ||| | || |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1949 ccatggggggtcgaggttttatgaagttcat--agacaagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttat 1870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0506
Description:

Target: scaffold0506; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Original strand, 3517 - 3738
Alignment:
Q  9 aacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggtcatgggt 108  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||  || ||| | ||||| |||||||||||||||||    | |||     
T  3517 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtaaaatcaaaatgggcacgttgagtttgagtgtataaacaaagggg 3616  T
Q  109 ggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccactcccaatt 208  Q
     | ||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||    
T  3617 agtcgaggttttatgaagttcatagagataagggtgtctatgtttagcctattgtttccctcaatcttgtttattccttggtcctcactcactcctagtt 3716  T
Q  209 gcctagctatataggtgatgat 230  Q
    ||| |||||| || ||||||||    
T  3717 gcccagctatgtatgtgatgat 3738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 203
Target Start/End: Original strand, 32983 - 33184
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggt 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||  |  |||  ||||| |||||||||||||| ||| ||    
T  32983 catcaccaacatacaacaaatttgcttccacctcggtgttagtgcgagatgggttaggaagtagaaacaaaagaggcatattgagtttgagtgcataagt 33082  T
Q  102 catgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccact 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    ||||||| || |||||||||||||    
T  33083 catgggtggacgatgcttaatgaagttcatagaaatgagggtttcaatgttaagcctattgttgccctcaattggatttatccattcgtcctcacccact 33182  T
Q  202 cc 203  Q
    ||    
T  33183 cc 33184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 230
Target Start/End: Original strand, 253240 - 253480
Alignment:
Q  4 tcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggtca 103  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||| |||||||||||||||||   ||    
T  253240 tcaccaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtataatcaaaacaggcacgttgagtttgagtgtataatcca 253339  T
Q  104 tgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagata--------agg------gtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttgg 189  Q
     ||| || ||| | || |||||||||||||||| |        |||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  253340 aggggggtcgaggttttatgaagttcatagagacagtttccacaggcaccttgtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatccctagg 253439  T
Q  190 tcctcacccactcccaattgcctagctatataggtgatgat 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  253440 tcctcacccactcccaatttcctagctatgtatgtgatgat 253480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 19416 - 19645
Alignment:
Q  1 tcatcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtatagg 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||  || ||| | ||||| |||||||||||||||||      
T  19416 tcatcatcaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtaaaatcaaaatgggcacgttgagtttgagtgtataaa 19515  T
Q  101 tcatgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccac 200  Q
      | |||  | ||| | || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  19516 caaaggggagtcgaggttttatgaaattcatagagataagggtatctatgtttagcctattgttaccctcaatcttgtttatcccttggtcctaactaac 19615  T
Q  201 tcccaattgcctagctatataggtgatgat 230  Q
    ||| |||| || |||||| || ||||||||    
T  19616 tcctaattacccagctatgtatgtgatgat 19645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 230
Target Start/End: Original strand, 25866 - 26074
Alignment:
Q  18 caaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggtcatgggtggacgatgc 117  Q
    ||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||  || ||| | ||||| |||||||||||||||||    | |||  | ||| |     
T  25866 caaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggcagtaagatcaaaatgggcacgttgagtttgagtgtataaacaaaggggagtcgaggt 25965  T
Q  118 ttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccactcccaattgcctagcta 217  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| ||||||| |||||    
T  25966 tttatgaagttcatagagataagggtttctatgtttagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcct----cactcctaattgcccagcta 26061  T
Q  218 tataggtgatgat 230  Q
    | || ||||||||    
T  26062 tgtatgtgatgat 26074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 29247 - 29038
Alignment:
Q  9 aacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggtcatgggt 108  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| | || ||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||    | |||     
T  29247 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggcaataatatcaaagttggcacattgagcttgagcgtataaacaaagggg 29148  T
Q  109 ggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccactcccaatt 208  Q
       ||| | || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || | ||    
T  29147 attcgaggttttatgaaattcatagagataagggtttctatgtttagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcttcactcacgcctagtt 29048  T
Q  209 gcctagctat 218  Q
     |||||||||    
T  29047 tcctagctat 29038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 11313 - 11107
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggt 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||  |  |||   |||||||| ||||| |||| ||| ||    
T  11313 catcaccaacatacaacaaattcgcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagaaagtagaaacaaaaggggcacatttagtttaagtgcataagt 11214  T
Q  102 catgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccact 201  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||||||||| ||||||||    |||||||| | |||||||||||||    
T  11213 catgggtggacgaagcttaatgaaattcatagaaatgagtgtttcaatgttaagcctattgttgccctcaattggatttatcccctcgtcctcacccact 11114  T
Q  202 cccaatt 208  Q
    || ||||    
T  11113 ccaaatt 11107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24308 - 24099
Alignment:
Q  9 aacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggtcatgggt 108  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| | || ||| ||| |||||||||| || |||||||||||    | |||     
T  24308 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggtaataatatcaaaataggcacattaagcttgagtgtataaacaaagggg 24209  T
Q  109 ggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccactcccaatt 208  Q
       ||| | || | ||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||      
T  24208 attcgaggttttaggaaattcatagagataagggtttctatgtttagtctattgttaccctcaatcttgtttatcccttggtcttcactcacgcctaacc 24109  T
Q  209 gcctagctat 218  Q
    ||||||||||    
T  24108 gcctagctat 24099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1879 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1879
Description:

Target: scaffold1879; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 173
Target Start/End: Original strand, 346 - 517
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggt 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||  |  ||| |||| | ||| ||||  |||| ||| ||    
T  346 catcaccaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtagaaacaaaataggtatattaagttgaagtgcataagt 445  T
Q  102 catgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaat 173  Q
    |||||||||| || | || ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  446 catgggtggatgaagtttgatgaaattcatagaaatgagggtttcaatgtttagcatgttgtttccctcaat 517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1400 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1400
Description:

Target: scaffold1400; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 136 - 218
Target Start/End: Original strand, 49 - 131
Alignment:
Q  136 ataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccactcccaattgcctagctat 218  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||| ||||    
T  49 ataagggtgtctatgtttagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcttcactcactcctagttgcctaactat 131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 10201 - 10000
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggt 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||  |  |||||||||||||||| ||||||||  |  |||  ||| | ||||||||| | |  ||| ||    
T  10201 catcaccaacatacaacaaatttgcttccacctcagtgttagtccgagatgggtcaggaagtagaaacaaaagaggtatattgagtttaatttcatatgt 10102  T
Q  102 catgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccact 201  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||||||| |  | ||| || ||||||||||||||||| ||||||||    ||||||| || |||||||||||||    
T  10101 catgggtggatgaagcttaatgaaattcatagaaaggaaggtttcaatgttaagcctattgttgccctcaattggatttatccgttcgtcctcacccact 10002  T
Q  202 cc 203  Q
    ||    
T  10001 cc 10000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 173
Target Start/End: Original strand, 39164 - 39335
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggt 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||  |  |||  ||| || || ||||  |||| ||| ||    
T  39164 catcaccaacatacaacaaatttgcttccacctcggtgttagtccaagatgggttaggaagtagaaacaaaagaggtacgttaagttgaagtgcataagt 39263  T
Q  102 catgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaat 173  Q
    |||||||||| || | |||||||| |||||||| || ||||| || ||||| || |||||||||||||||||    
T  39264 catgggtggatgaagtttaatgaaattcatagaaatgagggtttcaatgtttagtctattgtttccctcaat 39335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 160 - 230
Target Start/End: Original strand, 20234 - 20304
Alignment:
Q  160 ttgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccactcccaattgcctagctatataggtgatgat 230  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  20234 ttgtttccctcgattttgtttatcccttggtcctcacccactcccaattgactagctatgtatgtgatgat 20304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 115431 - 115211
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggt 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | | ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||| |  |  |||  ||| | |   ||||| |||| ||| ||    
T  115431 catcaccaacatacaacaaatttgcctccacctcggtgttaatccgagatgggttaggaagcagaaacaaaagaggtatacgaagtttaagtgcataagt 115332  T
Q  102 catgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctat----tgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacc 197  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||||||| |  ||||| || |||||||||||||    |||| ||||||||    |||||||||| |||||||||    
T  115331 catgggtggatgaagcttaatgaaattcatagaaaagagggtttcaatgttaagcctatatattgttgccctcaattggatttatcccttcgtcctcacc 115232  T
Q  198 cactcccaattgcctagctat 218  Q
    |||||| || | |||||||||    
T  115231 cactccaaacttcctagctat 115211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 119735 - 119530
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggt 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | | ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||| |  |  |||  ||| | |   ||||| |||| ||| ||    
T  119735 catcaccaacatacaacaaatttgcctccacctcggtgttaatccgagatgggttaggaagcagaaacaaaagaggtatacgaagtttaagtgcataagt 119636  T
Q  102 catgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctat----tgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacc 197  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||||||| |  ||||| || |||||||||||||    |||| ||||||||    |||||||||| |||||||||    
T  119635 catgggtggatgaagcttaatgaaattcatagaaaagagggtttcaatgttaagcctatatattgttgccctcaattggatttatcccttcgtcctcacc 119536  T
Q  198 cactcc 203  Q
    ||||||    
T  119535 cactcc 119530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1620 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1620
Description:

Target: scaffold1620; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 6 - 203
Target Start/End: Original strand, 423 - 620
Alignment:
Q  6 accaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggtcatg 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||  |  |||||||||||||||||||||||||  |  |||  | |||  || ||||  |||| ||| ||||||    
T  423 accaacatacaacaaatttgcttccacctccgtgttagtccgagatgggttaggaagtagaaacaaaagaagcatgttaagttgaagtgcataagtcatg 522  T
Q  106 ggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccactcc 203  Q
    |||||| || | || ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||| ||||||| ||||||||    |||||||||| ||| |||||||||||    
T  523 ggtggatgaagttttatgaaattcatagaaatgagggtttcaatgtttagcatattgttcccctcaattggatttatccctttgtcttcacccactcc 620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0833 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0833
Description:

Target: scaffold0833; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 91 - 203
Target Start/End: Original strand, 4672 - 4785
Alignment:
Q  91 agtgtataggtcatgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctat-gttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttgg 189  Q
    |||| ||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||| | |||||| || ||  |||||||||||||| ||||||||    |||||||||| |    
T  4672 agtgcataagtcatgggtggatgaagcttaatgaaattcatagaaacaagggtttcaatatttaagcctattgttgccctcaattggatttatcccttcg 4771  T
Q  190 tcctcacccactcc 203  Q
    ||||||||||||||    
T  4772 tcctcacccactcc 4785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 2 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 55025 - 54858
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggt 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||  |  ||| |||| | ||| ||||  |||| ||| ||    
T  55025 catcaccaacatacaacaaatttgcttccacctcggtgttaatccgagatgggttaggaagtagaaacaaaataggtatattaagttgaagtgcataagt 54926  T
Q  102 catgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccct 169  Q
    |||||||||| || | || ||||| |||||||| |  ||||| || ||||| ||| | ||||||||||    
T  54925 catgggtggatgaagttttatgaaattcatagaaaggagggtttcaatgtttagcatgttgtttccct 54858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 91 - 174
Target Start/End: Original strand, 50288 - 50371
Alignment:
Q  91 agtgtataggtcatgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatc 174  Q
    |||| ||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||| | |||||| || || |||||||||||||| |||||||||    
T  50288 agtgcataagtcatgggtggatgaagcttaatgaaattcatagaaacaagggtttcaatattaagcctattgttgccctcaatc 50371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1571 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1571
Description:

Target: scaffold1571; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 1406 - 1344
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagta 64  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  1406 catcaccaacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagta 1344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0577 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0577
Description:

Target: scaffold0577; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 4890 - 4828
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagta 64  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  4890 catcaccaacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagta 4828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 173
Target Start/End: Original strand, 32347 - 32429
Alignment:
Q  91 agtgtataggtcatgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaat 173  Q
    |||| ||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||| | |||||| || || |||||||||||||| ||||||||    
T  32347 agtgcataagtcatgggtggatgaagcttaatgaaattcatagatacaagggtttcaatattaagcctattgttgccctcaat 32429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 41776 - 41642
Alignment:
Q  39 tttagtccgagatgggttaggaagtattattaaattaggcacattgagtttgagtgtataggtcatgggtggacgatgcttaatgaagttcatagagata 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |  ||| |||| | ||| |||| ||||  ||| |||||||||||| || | || ||||| |||||||| ||     
T  41776 tttagtccgagatgggttaggaagtagaaacaaaataggtatattaagttggagttcataagtcatgggtggatgaagtttgatgaaattcatagaaatg 41677  T
Q  139 agggtctctatgttaagcctattgtttccctcaat 173  Q
    ||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  41676 agggtttcaatgttgagcatgttgtttccctcaat 41642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 21690 - 21631
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaa 61  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||    
T  21690 catcaccaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttattccgagatgggttaggaa 21631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0473
Description:

Target: scaffold0473; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 12822 - 12760
Alignment:
Q  2 catcaccaacacacaacaaattttctttcaccttggctttagtccgagatgggttaggaagta 64  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  12822 catcaccaacatacaactaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagta 12760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University