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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF6233_low_11 (Length: 308)
Name: NF6233_low_11
Description: NF6233
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF6233_low_11 |
 |  |
|
| [»] scaffold0310 (3 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr7 (44 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0120 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold1867 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr6 (40 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0158 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0035 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr1 (31 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0338 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0012 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0190 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0075 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr2 (36 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0359 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] chr8 (47 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr5 (37 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0014 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] chr3 (71 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0117 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0021 (5 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0008 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0001 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0160 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0610 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold1164 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0022 (3 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0673 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0396 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0011 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0240 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0833 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0480 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0554 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0044 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0025 (3 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0031 (3 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0103 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0037 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0068 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0447 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0016 (4 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0077 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0083 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0383 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0095 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0034 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0195 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0150 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0092 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0342 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0091 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0013 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0053 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0740 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0686 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0184 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0078 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0049 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0116 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0243 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0483 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0234 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0032 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0162 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0251 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0175 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0700 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0465 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0039 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0706 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0597 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0122 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0574 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0009 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0004 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0028 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1272 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0006 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0303 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0589 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0123 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0080 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0521 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0389 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0058 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0010 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0125 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0231 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0132 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0970 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0017 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0090 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0020 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1734 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0816 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0670 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0165 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0018 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: scaffold0310 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 3)
Name: scaffold0310
Description:
Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 430 - 129
Alignment:
| Q |
7 |
acatcatcaaattcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc |
106 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
430 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaaaagctcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc |
331 |
T |
 |
| Q |
107 |
catgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgag |
206 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| || |
|
|
| T |
330 |
tatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcattaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattcacgaattaag |
231 |
T |
 |
| Q |
207 |
catattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcat |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
230 |
catattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtatttcaactaacaacaatccaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcat |
131 |
T |
 |
| Q |
307 |
aa |
308 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
130 |
aa |
129 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 119 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 6612 - 6423
Alignment:
| Q |
119 |
tcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaac |
218 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
6612 |
tcaacaacaagacatatcaataacaacatcaattgatcattaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattcacgaattaagcatattttcaac |
6513 |
T |
 |
| Q |
219 |
atataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
6512 |
atataccaacttctcatactttgaacatgtatttcaactaacaacaatccaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataa |
6423 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0310; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 6679 - 6603
Alignment:
| Q |
7 |
acatcatcaaattcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa |
83 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
6679 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaagaacaactcaattctcaacaacaa |
6603 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 44)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 7284376 - 7284075
Alignment:
| Q |
7 |
acatcatcaaattcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc |
106 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
7284376 |
acatcgtcaaaatcaaacttctccattatcaacccatttaacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaactcaagc |
7284277 |
T |
 |
| Q |
107 |
catgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgag |
206 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |
|
|
| T |
7284276 |
catgaattattatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaggataattcaccaattaag |
7284177 |
T |
 |
| Q |
207 |
catattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcat |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7284176 |
catattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatacaattcaactaataacaattcaatcatccataacttcacacatctaaacatgtcatcat |
7284077 |
T |
 |
| Q |
307 |
aa |
308 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
7284076 |
aa |
7284075 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 50 - 308
Target Start/End: Original strand, 11287390 - 11287649
Alignment:
| Q |
50 |
aaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatc |
148 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |
|
|
| T |
11287390 |
aaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatc |
11287489 |
T |
 |
| Q |
149 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgt |
248 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11287490 |
aactgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgt |
11287589 |
T |
 |
| Q |
249 |
gattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
11287590 |
aattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcaacataa |
11287649 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 85 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 15822669 - 15822447
Alignment:
| Q |
85 |
catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaac |
184 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15822669 |
catgaatcatgcaaacccaagccatgaatgatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaac |
15822570 |
T |
 |
| Q |
185 |
aaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttc |
284 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15822569 |
aaagcataattcaccatttgagcatattttcaacatataccattttcatacattttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttc |
15822470 |
T |
 |
| Q |
285 |
atacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
15822469 |
atacatc-caacatgtcatcataa |
15822447 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 58 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 26070530 - 26070279
Alignment:
| Q |
58 |
aacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatc |
156 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| || || ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26070530 |
aacaacaacttatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaataatcatccacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatc |
26070431 |
T |
 |
| Q |
157 |
atgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaac |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
26070430 |
atgaaacttatcacaattcatcaacaacataacataattcaccaattaagcatattttcaacatataccattttctcatactttgaacatgtaattcaac |
26070331 |
T |
 |
| Q |
257 |
taacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
26070330 |
taacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataa |
26070279 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 58 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 26094317 - 26094066
Alignment:
| Q |
58 |
aacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatc |
156 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| || || ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26094317 |
aacaacaacttatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaataatcatccacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatc |
26094218 |
T |
 |
| Q |
157 |
atgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaac |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
26094217 |
atgaaacttatcacaattcatcaacaacataacataattcaccaattaagcatattttcaacatataccattttctcatactttgaacatgtaattcaac |
26094118 |
T |
 |
| Q |
257 |
taacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
26094117 |
taacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataa |
26094066 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 82 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 45452407 - 45452183
Alignment:
| Q |
82 |
aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataac |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
45452407 |
aatcatgaatcatgccaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacgacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaac |
45452308 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataac |
281 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
45452307 |
aacatagcatg--tcacaaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaatccaattatccataac |
45452210 |
T |
 |
| Q |
282 |
ttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45452209 |
ttcatacatctaaacatgtcatcataa |
45452183 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 82 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 16570247 - 16570020
Alignment:
| Q |
82 |
aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataac |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
16570247 |
aatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatccacgacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatctcaattcaacaac |
16570148 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataa |
280 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
16570147 |
aacatagcataattcaaccaattgagcatattttccagatataccattttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaaatcaattatccataa |
16570048 |
T |
 |
| Q |
281 |
cttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
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cttcatacatccaaacatgtcatcataa |
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T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
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Target Start/End: Original strand, 16595415 - 16595642
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181 |
Q |
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T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataa |
280 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
16595515 |
aacatagcataattcaaccaattgagcatattttccagatataccattttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaaatcaattatccataa |
16595614 |
T |
 |
| Q |
281 |
cttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
16595615 |
cttcatacatccaaacatgtcatcataa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
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Query Start/End: Original strand, 50 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 12248395 - 12248135
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50 |
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148 |
Q |
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T |
 |
| Q |
149 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatg |
247 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
12248295 |
cattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacatatactattttctcatactttaaacatg |
12248196 |
T |
 |
| Q |
248 |
tgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
12248195 |
aaattcaactaataacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataa |
12248135 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
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Target Start/End: Original strand, 3895035 - 3895254
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185 |
Q |
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3895035 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaca |
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T |
 |
| Q |
186 |
aagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttca |
285 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3895135 |
tagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgcaattcaactaacaacaattcaattatccataacttca |
3895234 |
T |
 |
| Q |
286 |
tacatctaaacatgtcatca |
305 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
3895235 |
tacatctaaacatttcatca |
3895254 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 82 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 12370081 - 12369855
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181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| ||||||||||| || || ||||||| || || ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
12370081 |
aatcatgaatcatgcatacctaagccatgaataattatgcacaacatcacttagcaacaacaacatcaattaatcatgaaagttatcacaattcaacaac |
12369982 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataac |
281 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
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aacaaggcataattcaccaattgagcatattttcaacagatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattatccgtaac |
12369882 |
T |
 |
| Q |
282 |
ttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12369881 |
ttcatacatctaaacatgtcatcataa |
12369855 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
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Target Start/End: Original strand, 12758993 - 12759219
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181 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
12758993 |
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12759092 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataac |
281 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12759093 |
aacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccctttttcacattttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattatccataac |
12759192 |
T |
 |
| Q |
282 |
ttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
12759193 |
ttcatacatctaaacatatcatcataa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
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Target Start/End: Original strand, 47289788 - 47290013
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181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
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T |
 |
| Q |
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aacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat--actttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccata |
279 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
47289887 |
aacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacacataccca-ttttcatacactttgaacatgtaattcaactaac-acaattcaattattcata |
47289984 |
T |
 |
| Q |
280 |
acttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
47289985 |
acttcatatatctaaacatggcatcataa |
47290013 |
T |
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Target: chr7; HSP #14
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Query Start/End: Original strand, 82 - 308
Target Start/End: Original strand, 143652 - 143871
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| Q |
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181 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
| T |
143652 |
aatcatgaattatgcaa-cccaagccatgaattatcattaacaacatgactta------acaacaacaattgatcatgaaacttttcacaattcatcaac |
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T |
 |
| Q |
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aacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat--actttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccata |
279 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
143745 |
aacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacacataccca-ttttcatacactttgaacatgtaattcaactaac-acaattcaattatttata |
143842 |
T |
 |
| Q |
280 |
acttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
143843 |
acttcatacatctaaacatgtcatcataa |
143871 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 82 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 49047915 - 49047689
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| Q |
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181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
49047915 |
aatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcagcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaac |
49047816 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattc-accaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataa |
280 |
Q |
| |
|
|||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
49047815 |
aacataacataattcaaccaattgagcata-tttcaacatataccactctctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaa |
49047717 |
T |
 |
| Q |
281 |
cttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
49047716 |
cttcatgcattcaaacatgtcattataa |
49047689 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
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Target Start/End: Original strand, 44865234 - 44865463
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178 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |
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|
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aatcatgaattatgcaa-cccaagccatgaattatcataaactacatgacttaacaacaacaacaacaacaattaatcatgaaacttatcacaattcatc |
44865332 |
T |
 |
| Q |
179 |
aacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat--actttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatcc |
276 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
44865333 |
aacaaaaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacataccca-ttttcatacactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattc |
44865431 |
T |
 |
| Q |
277 |
ataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
44865432 |
ataacttcatacatctaaacatggcatcataa |
44865463 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
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Query Start/End: Original strand, 99 - 308
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acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca- |
197 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || || | |||||| || || || ||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
13863154 |
acccaagccatgcatcattaacaacaatatcacttagcaacaacaacaacaattgaacatgaatattatcacaattcaacaacaacatagcataattcaa |
13863055 |
T |
 |
| Q |
198 |
ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaaca |
297 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13863054 |
ccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaaca |
13862955 |
T |
 |
| Q |
298 |
tgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |
|
|
| T |
13862954 |
tttcatcataa |
13862944 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #18
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156 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
39046889 |
aacaacatctcatttctcaacaacagatcaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaattgatc |
39046790 |
T |
 |
| Q |
157 |
atgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaac |
256 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | || ||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
39046789 |
atgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgag-atattttc-acatatactcatttttca---attgaacatacaattcaac |
39046695 |
T |
 |
| Q |
257 |
taacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatca |
305 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39046694 |
taacaataattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatca |
39046646 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 58 - 305
Target Start/End: Original strand, 35094798 - 35095044
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156 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||| || || |||||| |
|
|
| T |
35094798 |
aacaacatctcatttctcaacaacaaatcaagaattatgcaaacccaagccatgatttatcatcaacaacatgactaaacaacaacagcaaca-ttgatc |
35094896 |
T |
 |
| Q |
157 |
atgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttca-acatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaa |
255 |
Q |
| |
|
||||||| | | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
35094897 |
atgaaacatttaacaattcatcaacaacagtgcataattcaccaattgagcatattttcacacata-cccattttcatatactttgaacatgtaattcaa |
35094995 |
T |
 |
| Q |
256 |
ctaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatca |
305 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
35094996 |
ctaac-acaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgttatca |
35095044 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 42 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 17224220 - 17223953
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140 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||| | |
|
|
| T |
17224220 |
attttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcattaacaacatcacttagcaaca |
17224121 |
T |
 |
| Q |
141 |
acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
239 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
17224120 |
acaacatcaattgaacatgactcttacaacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagtata-attcaacatatatcactttctcatactt |
17224022 |
T |
 |
| Q |
240 |
tgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
17224021 |
tgaacatgaaatttcacaaacaacaattcaattatccacaacttcgtgcattcaaacatatcatcataa |
17223953 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
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Target Start/End: Original strand, 13274753 - 13275009
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43 |
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141 |
Q |
| |
|
|||||| |||| || ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||| || |
|
|
| T |
13274753 |
ttttaccaaactaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaacatgaatcatgcataccaaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaa |
13274852 |
T |
 |
| Q |
142 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattc-accaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatacttt |
240 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
13274853 |
caacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgag-----------catataccactttctcatacttt |
13274941 |
T |
 |
| Q |
241 |
gaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||||||||||||||||| | | |||||| | ||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
13274942 |
gaacatgaaattttactaacaacaattcaattaccaacaacttcttgcattcaaacatatcatcataa |
13275009 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
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Target Start/End: Original strand, 13377535 - 13377761
Alignment:
| Q |
82 |
aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataac |
181 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
13377535 |
aatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacattacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaac |
13377634 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataa |
280 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| | ||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
13377635 |
aacatagcataattaatcaatttgagtata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaa |
13377733 |
T |
 |
| Q |
281 |
cttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
13377734 |
cttcatgcattcaaacataacatcataa |
13377761 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #23
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86 |
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185 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| || || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
3049593 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaca |
3049692 |
T |
 |
| Q |
186 |
aagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3049693 |
tagcataattcaccaattgagcata |
3049717 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 210
Target Start/End: Original strand, 126366 - 126549
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| Q |
29 |
tcattatcaacccatttta-caaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaac |
126 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| | ||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
126366 |
tcataatcaacccattttctccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacagt |
126465 |
T |
 |
| Q |
127 |
atgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
||||| | ||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
126466 |
atgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
126549 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #25
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Query Start/End: Original strand, 58 - 210
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| Q |
58 |
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157 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||| ||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
111542 |
aacaacaatttatttctcaacaacaaatttgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccattgatca |
111443 |
T |
 |
| Q |
158 |
tgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
111442 |
tgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
111390 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #26
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Query Start/End: Original strand, 35 - 308
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| Q |
35 |
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133 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| || | |||||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| ||||| | |
|
|
| T |
16915217 |
tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaattctcttcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatgactt |
16915118 |
T |
 |
| Q |
134 |
atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttct |
232 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||| ||||||| |||| |||||| | || ||||||| ||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
16915117 |
agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacgtttagagcata-attcaacatataacactttca |
16915019 |
T |
 |
| Q |
233 |
catactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
16915018 |
catactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataa |
16914943 |
T |
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Target: chr7; HSP #27
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Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 2190431 - 2190307
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| Q |
86 |
atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaaca |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| || || ||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
2190431 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacatcaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacc |
2190332 |
T |
 |
| Q |
186 |
aagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2190331 |
atgcataattcaccaattgagcata |
2190307 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 308
Target Start/End: Original strand, 48356602 - 48356876
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| Q |
35 |
tcaacccattttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacat |
133 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| || | |||||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || || | |
|
|
| T |
48356602 |
tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaattctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt |
48356701 |
T |
 |
| Q |
134 |
atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttct |
232 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||| ||||||| | || |||||| || || ||||||| ||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
48356702 |
agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacataacacaattcaacatttagagcata-attcaacatataacactttca |
48356800 |
T |
 |
| Q |
233 |
catactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
48356801 |
catactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataa |
48356876 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 32494341 - 32494167
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38 |
acccatttt-acaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatat |
135 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||| |||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||| | |
|
|
| T |
32494341 |
acccattttcaccaaaccaacaacaacaatttatttctcaacaacaaattatgaatcatgcatacacaagccatgaattatcatcaatcatatgactaaa |
32494242 |
T |
 |
| Q |
136 |
caaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
||| ||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32494241 |
caacaacaacaaccattaatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
32494167 |
T |
 |
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Target: chr7; HSP #30
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Target Start/End: Original strand, 2028931 - 2029055
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86 |
atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaaca |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| | ||||| || || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
2028931 |
atgaatcatgcatacccaagtcatgaattagcatccataacatcacttaacaacgacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaatc |
2029030 |
T |
 |
| Q |
186 |
aagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2029031 |
atgcataattcaccaattgagcata |
2029055 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 42056534 - 42056410
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| Q |
86 |
atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaaca |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | || || || || ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
42056534 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataatatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacc |
42056435 |
T |
 |
| Q |
186 |
aagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42056434 |
atgcataattcaccaattgagcata |
42056410 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #32
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ccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcacca |
200 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| |||| |||||| || || || ||| ||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||| ||||||| |||| |||||| || |
|
|
| T |
9838904 |
ccaagtcatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaaca |
9839003 |
T |
 |
| Q |
201 |
att-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatg |
299 |
Q |
| |
|
|| ||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
9839004 |
tttagagcata-attcaacatataacactttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacata |
9839102 |
T |
 |
| Q |
300 |
tcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
9839103 |
tcatcataa |
9839111 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 14272203 - 14272049
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7 |
acatcatcaaattcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaag |
105 |
Q |
| |
|
||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| || | |||||||||| ||| | || |||| |
|
|
| T |
14272203 |
acatcattaaaataaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcatcatctaatcatgaattatgaacactcaag |
14272104 |
T |
 |
| Q |
106 |
ccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatga |
160 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||| || | || ||| ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
14272103 |
ccatgaatcatcaacaacaatatcatttagcaacaacaacatcaattgaacatga |
14272049 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #34
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Query Start/End: Original strand, 101 - 308
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101 |
ccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcacca |
200 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| |||| |||||| || || || ||| ||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||| ||||||| |||| |||||| || |
|
|
| T |
9611332 |
ccaagtcatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaaca |
9611431 |
T |
 |
| Q |
201 |
att--gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacat |
298 |
Q |
| |
|
|| |||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
9611432 |
tttagaagcata-attcaacatataacactttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacat |
9611530 |
T |
 |
| Q |
299 |
gtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
9611531 |
atcatcataa |
9611540 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #35
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aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataac |
181 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || |||| ||| ||||||||||||| | ||||| || |||||||||||| ||| |
|
|
| T |
31501179 |
aatcatgactcatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcataacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaac |
31501278 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatc |
275 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||| ||| |||||||| | |||| ||||| || ||| |||||| |||||||| ||| || || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
31501279 |
aacatagcacaattcaacaatttgagcat-tattcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaataacaattcaattatc |
31501372 |
T |
 |
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Target: chr7; HSP #36
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115 |
atcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattt |
213 |
Q |
| |
|
|||| |||||| || || || ||| ||||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| | |
|
|
| T |
16919598 |
atcaacaacaatattacttagcaacaacaacatcaattaaacacgattcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcata-at |
16919696 |
T |
 |
| Q |
214 |
tcaacatataccaacttctcatactttgaacatg |
247 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16919697 |
tcaacatatatcactttctcatattttgaacatg |
16919730 |
T |
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192 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| | || ||| || |||||||||||| |||||| | |||| |||||||| || |||| |||| | |
|
|
| T |
13321033 |
tgcaaacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaatcaacttagcaaa |
13321132 |
T |
 |
| Q |
193 |
attcaccaattgagca |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
13321133 |
attcaccaattgagca |
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131 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||| ||| ||||||| |||| || | |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
1937290 |
atttcacaaaaccaccaacaataatccatttctcaacaaaaaattatgaatcatgcaaacccaagtcatgtatcatcatcaacaatatgac |
1937200 |
T |
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Target: chr7; HSP #39
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Q |
| |
|
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| T |
4484733 |
aatcatgattcatgaatacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaac |
4484832 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattcaccaatt |
203 |
Q |
| |
|
|| | |||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
4484833 |
aatatagcacaattcaacaatt |
4484854 |
T |
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Target: chr7; HSP #40
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Target Start/End: Complemental strand, 20583795 - 20583674
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Q |
| |
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|||||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || | || ||| ||||||||||||| | ||||| || |||| ||||||| ||| |
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| T |
20583795 |
aatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcccttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaac |
20583696 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattcaccaatt |
203 |
Q |
| |
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|||| |||| |||||| ||||| |
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|
| T |
20583695 |
aacatagcacaattcaacaatt |
20583674 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #41
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| Q |
99 |
acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaa |
161 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||| |
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|
| T |
25124153 |
acccatgccatgaatcatcaacaacaacatctcatatcaacaacaacatcaattaagcatgaa |
25124215 |
T |
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Target: chr7; HSP #42
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Target Start/End: Original strand, 46474027 - 46474128
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102 |
caagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaa |
201 |
Q |
| |
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||||| |||||| |||| |||||| || | || ||| ||||||||||||| | |||||| || ||||||| |||| ||||||| |||| |||||| ||| |
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|
| T |
46474027 |
caagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaa |
46474126 |
T |
 |
| Q |
202 |
tt |
203 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
46474127 |
tt |
46474128 |
T |
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Target: chr7; HSP #43
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Target Start/End: Complemental strand, 9724031 - 9723927
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acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcac |
198 |
Q |
| |
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|
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| T |
9724031 |
acccaagctatgaatcatcaacaataatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaa |
9723932 |
T |
 |
| Q |
199 |
caatt |
203 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
9723931 |
caatt |
9723927 |
T |
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Target: chr7; HSP #44
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Query Start/End: Original strand, 99 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 17947816 - 17947712
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| Q |
99 |
acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcac |
198 |
Q |
| |
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|||||||| |||||| |||| |||||| || | || ||| ||||||||||||| | ||||| || ||||||| |||| ||||||| |||| |||||| |
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|
| T |
17947816 |
acccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaa |
17947717 |
T |
 |
| Q |
199 |
caatt |
203 |
Q |
| |
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||||| |
|
|
| T |
17947716 |
caatt |
17947712 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0120 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:
Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Original strand, 21442 - 21743
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7 |
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105 |
Q |
| |
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||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21442 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttcttaacaacaattcatgaatcatgcaaacccaag |
21541 |
T |
 |
| Q |
106 |
ccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattga |
205 |
Q |
| |
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|
|
| T |
21542 |
ccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaaataatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattga |
21641 |
T |
 |
| Q |
206 |
gcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatca |
305 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |
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|
| T |
21642 |
gcatattttcaacatataccattttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaatccaattat-cataacttcatacatccaaacatgtcatca |
21740 |
T |
 |
| Q |
306 |
taa |
308 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
21741 |
taa |
21743 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Original strand, 31141 - 31442
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7 |
acatcatcaaattcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaat-catgaatcatgcaaacccaag |
105 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31141 |
acatcatcaaaatcaaactttttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaattcatgaatcatgcaaacccaag |
31240 |
T |
 |
| Q |
106 |
ccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattga |
205 |
Q |
| |
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|
|
| T |
31241 |
ccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaaaaacatcaattgataatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagtataatttaccaattga |
31340 |
T |
 |
| Q |
206 |
gcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatca |
305 |
Q |
| |
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|
|
| T |
31341 |
gcatattttcaacatataccattttctcatactttgaacatttaattcaactaacaacaatccaattat-cataacttcatacatccaaacatgtcatca |
31439 |
T |
 |
| Q |
306 |
taa |
308 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
31440 |
taa |
31442 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1867 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold1867
Description:
Target: scaffold1867; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Original strand, 75 - 376
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7 |
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106 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
75 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcagcaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc |
174 |
T |
 |
| Q |
107 |
catgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgag |
206 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
175 |
catgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattgag |
274 |
T |
 |
| Q |
207 |
catattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcat |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
275 |
catattttcaacatatacccttttcatacacttgaaacatgaatttcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatccaaacatgtcatcat |
374 |
T |
 |
| Q |
307 |
aa |
308 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
375 |
aa |
376 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 40)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 31628249 - 31628500
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156 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31628249 |
aacaacatctcatttctccacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatc |
31628348 |
T |
 |
| Q |
157 |
atgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaac |
256 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
31628349 |
atgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattaagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaac |
31628448 |
T |
 |
| Q |
257 |
taacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
31628449 |
taacaacaattcaattatcaataacttcatacatctaaacatgtaatcataa |
31628500 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 89 - 308
Target Start/End: Original strand, 18432656 - 18432875
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188 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
18432656 |
aatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacataacatatcaacaacatcatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaag |
18432755 |
T |
 |
| Q |
189 |
cataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatac |
288 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | || ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
18432756 |
cataattcaccaattaagcatattttcaacatacacccatttttcatacttttaacatgtaattcaatcaacaacaattcaagtattcataacttcatac |
18432855 |
T |
 |
| Q |
289 |
atctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18432856 |
atctaaacatgtcatcataa |
18432875 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 85 - 308
Target Start/End: Original strand, 32898799 - 32899022
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| Q |
85 |
catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaac |
184 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
32898799 |
catgaatcatgcaaacccaagccattaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacttcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaat |
32898898 |
T |
 |
| Q |
185 |
aaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttc |
284 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
32898899 |
aatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttc |
32898998 |
T |
 |
| Q |
285 |
atacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32898999 |
atacatctaaacatgtcatcataa |
32899022 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 82 - 308
Target Start/End: Original strand, 16086023 - 16086249
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| Q |
82 |
aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataac |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
16086023 |
aatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgaattatcattaacaacatgacatatcaacaacaacatcaaatgatcatgaaacttatcataattcaacaac |
16086122 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataac |
281 |
Q |
| |
|
||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | || || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16086123 |
aacaaggtataattcaccaattaagcatattttcaacacatacccatttttcgtactttgaacatgtaattcaacaaacaacaattcaattatccataac |
16086222 |
T |
 |
| Q |
282 |
ttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
16086223 |
ttcatacatctaaacatatcatcataa |
16086249 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 82 - 308
Target Start/End: Original strand, 16106527 - 16106748
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| Q |
82 |
aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataac |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
16106527 |
aatcatgaatcatgcaaa-----gtcatgaattatcattaacaacatgacatatcaacaacaacatcaaatgatcatgaaacttatcacaattcaacaac |
16106621 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataac |
281 |
Q |
| |
|
||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
16106622 |
aacaaggtataattcaccaattaagcatattttcaacacatactcatttttcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattatccataac |
16106721 |
T |
 |
| Q |
282 |
ttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16106722 |
ttcatacatctaaacatgtcatcataa |
16106748 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 86 - 308
Target Start/End: Original strand, 18777156 - 18777378
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| Q |
86 |
atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaaca |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| || || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
18777156 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacattcattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaca |
18777255 |
T |
 |
| Q |
186 |
aagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttca |
285 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18777256 |
tagcataattcaccaattgaacatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttca |
18777355 |
T |
 |
| Q |
286 |
tacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18777356 |
tacatctaaacatgtcatcataa |
18777378 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 82 - 305
Target Start/End: Original strand, 22440941 - 22441163
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| Q |
82 |
aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataac |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
22440941 |
aatcatgaatcatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaaatcatgaac |
22441039 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataac |
281 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||| ||||||| ||||| | | ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
22441040 |
aacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaactcatacccatttttcatacttttaacatgtaattcaccccatcacaattcaattattcataac |
22441139 |
T |
 |
| Q |
282 |
ttcatacatctaaacatgtcatca |
305 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22441140 |
ttcatacatctaaacatgtcatca |
22441163 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 86 - 308
Target Start/End: Original strand, 18570289 - 18570511
Alignment:
| Q |
86 |
atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaaca |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||| || || ||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
18570289 |
atgaatcatgcatacccaggccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaactacttctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaca |
18570388 |
T |
 |
| Q |
186 |
aagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttca |
285 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
18570389 |
tagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaatttaactaataacaattcaattatccataacatca |
18570488 |
T |
 |
| Q |
286 |
tacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18570489 |
tacatctaaacatgtcatcataa |
18570511 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 82 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 13014949 - 13014725
Alignment:
| Q |
82 |
aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataac |
181 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || || | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
13014949 |
aatcaagaatcatgcaa-cccaagccacgaattatcatcaacaacatgacttaacatcagcaacaacaattgatcttgaaacttatcacaattcatcaac |
13014851 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataac |
281 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | || |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
13014850 |
aacaatgcataattcaccaattgagcatatttccaactcatacccatttttcatac-ttcaacatacaattcaactaacaacaattcaatcattcataac |
13014752 |
T |
 |
| Q |
282 |
ttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13014751 |
ttcatacatctaaacatgtcatcataa |
13014725 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 29 - 308
Target Start/End: Original strand, 18398890 - 18399170
Alignment:
| Q |
29 |
tcattatcaacccatttt-acaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaaca |
127 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18398890 |
tcataatcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaactcatttcttatcacaattcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcatcaacaaca |
18398989 |
T |
 |
| Q |
128 |
tgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatatacca |
226 |
Q |
| |
|
| || || ||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| | |
|
|
| T |
18398990 |
tcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatacta |
18399088 |
T |
 |
| Q |
227 |
acttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
18399089 |
ttttctcatactttgaacatgaaatttctctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataa |
18399170 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 210
Target Start/End: Original strand, 18583264 - 18583451
Alignment:
| Q |
7 |
acatcatcaaattcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc |
106 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18583264 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc |
18583363 |
T |
 |
| Q |
107 |
catgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgag |
206 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18583364 |
catgaattatcatcaac----------------aacaacatcaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag |
18583447 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 18823712 - 18823565
Alignment:
| Q |
7 |
acatcatcaaattcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc |
106 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18823712 |
acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaagccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc |
18823613 |
T |
 |
| Q |
107 |
catgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattga |
154 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
18823612 |
catggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga |
18823565 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 18839567 - 18839420
Alignment:
| Q |
7 |
acatcatcaaattcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc |
106 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18839567 |
acatcatcaaaatcaaacttcttctttttcaactcattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc |
18839468 |
T |
 |
| Q |
107 |
catgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattga |
154 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
18839467 |
catggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga |
18839420 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 42 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 18381965 - 18381720
Alignment:
| Q |
42 |
attttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaa |
140 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||| | |
|
|
| T |
18381965 |
atttcacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaaca |
18381866 |
T |
 |
| Q |
141 |
acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
239 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
18381865 |
acaacatcaattgaacatgactcttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaacaatttaagcata-attcaacatatatcactttctcatactt |
18381767 |
T |
 |
| Q |
240 |
tgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcat |
286 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| || |||||| ||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
18381766 |
tgaacatgaaatttcaccaacaaccattcaattatcaacaacttcat |
18381720 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 50 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 25367511 - 25367251
Alignment:
| Q |
50 |
aaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatc |
148 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || || ||| ||||||||| |
|
|
| T |
25367511 |
aaactactaacaacatctcatttctcatcaacaattcatgaatcatgcacacccaagccatgaattatcgataacaacatcacttagcaacaacaacatc |
25367412 |
T |
 |
| Q |
149 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatg |
247 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| | || |||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25367411 |
aattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacataacacaattcaacaatttgagcata-tttcaacataaaccactttctcatactttgaacatg |
25367313 |
T |
 |
| Q |
248 |
tgattcaactaacaacaattcaattatc-cataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
25367312 |
aaatttctctaacaacaattccattatcaaaaaacttcatacattcaaacataacatcataa |
25367251 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 42 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 35015447 - 35015278
Alignment:
| Q |
42 |
attttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaa |
140 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| | ||| | |
|
|
| T |
35015447 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaaca |
35015348 |
T |
 |
| Q |
141 |
acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35015347 |
acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
35015278 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 93 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 28195324 - 28195108
Alignment:
| Q |
93 |
atgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaa-cttatcacaattcaataacaacaaagcat |
191 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||| ||| ||||||||||| ||| || |||||||||||| |||| || |||| |
|
|
| T |
28195324 |
atgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaaccacaacaattgatcataaaatctcatcacaattcaacaacatcatggcat |
28195225 |
T |
 |
| Q |
192 |
aattcacc-aattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacat |
290 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
28195224 |
aattcaactaattgagcacattt-catcatataccattttctcatactatgaacatgaaattttactaacaacaattcaattatcaacaacttcatacat |
28195126 |
T |
 |
| Q |
291 |
ctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| |
|
|
| T |
28195125 |
tcaaacatatcatcataa |
28195108 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 77 - 210
Target Start/End: Original strand, 26089736 - 26089869
Alignment:
| Q |
77 |
acaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattca |
176 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||| | ||||| || || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26089736 |
acaacaattatgaatcatgcatacccaaaccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattca |
26089835 |
T |
 |
| Q |
177 |
ataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26089836 |
tcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
26089869 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 35 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 22362054 - 22361780
Alignment:
| Q |
35 |
tcaacccattttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacat |
133 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||| || |||| ||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || || | |
|
|
| T |
22362054 |
tcaacccattttacaaaactaacaacaacaactcaattctcatcatcaattcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt |
22361955 |
T |
 |
| Q |
134 |
atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttct |
232 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||| || |||| |
|
|
| T |
22361954 |
agcaacaacaacatcaattgaacatgaatttcatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcata-attcaacttatgtcactttct |
22361856 |
T |
 |
| Q |
233 |
catactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| | || ||||| ||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22361855 |
catactttgaacatgaaatttcagcaacaacaattcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataa |
22361780 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 88 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 25744448 - 25744331
Alignment:
| Q |
88 |
gaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaa |
187 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
25744448 |
gaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacatttgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaat |
25744349 |
T |
 |
| Q |
188 |
gcataattcaccaattga |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
25744348 |
gcataattcaccacttga |
25744331 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 23994933 - 23995057
Alignment:
| Q |
86 |
atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaaca |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||| || || ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
23994933 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacc |
23995032 |
T |
 |
| Q |
186 |
aagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23995033 |
atgcataattcaccaattgagcata |
23995057 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 308
Target Start/End: Original strand, 21623174 - 21623400
Alignment:
| Q |
82 |
aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataac |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| | ||||||||||||| | || | || |||||| || || ||| |||||||||||| || ||||| |||| |||||||||| ||| |
|
|
| T |
21623174 |
aatcatgaattatgaatacccaagccatgactcattaacatcaacatcacttagcaacaacaacatcaatagaacatgattcttaccacaattcaacaac |
21623273 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataa |
280 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
21623274 |
aacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcagcaacaacaattcaattatcaacaa |
21623372 |
T |
 |
| Q |
281 |
cttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
21623373 |
cttcatgcattcaaacataccatcataa |
21623400 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18002750 - 18002617
Alignment:
| Q |
77 |
acaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattca |
176 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||| | || || ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18002750 |
acaacaagtatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacgtcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattca |
18002651 |
T |
 |
| Q |
177 |
ataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18002650 |
tcaacaaccatgcataattcatcaattgagcata |
18002617 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19983581 - 19983412
Alignment:
| Q |
42 |
attttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaa |
140 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| | ||| | |
|
|
| T |
19983581 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaaca |
19983482 |
T |
 |
| Q |
141 |
acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
|||||| | | | | |||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
19983481 |
acaacaaccactaaccatgaaacatatcacaattcatcaacaatcatgcataattcactaattgagcata |
19983412 |
T |
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Target: chr6; HSP #25
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caatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataa |
180 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || || || ||| ||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||| || |
|
|
| T |
25651242 |
caatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaa |
25651341 |
T |
 |
| Q |
181 |
caacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatc |
275 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||| || || ||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25651342 |
caacatagcacaattcaacatttagagcata-attcaacatataacactttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatc |
25651436 |
T |
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86 |
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182 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||| || | | ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
15742468 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataacatcacttaacaacaacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaaca |
15742369 |
T |
 |
| Q |
183 |
acaaagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
|| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15742368 |
accatgcataattcaccaattgagcata |
15742341 |
T |
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7 |
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105 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| | ||||||| |
|
|
| T |
4991002 |
acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaag |
4991101 |
T |
 |
| Q |
106 |
ccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattga |
154 |
Q |
| |
|
||| | | || ||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
4991102 |
ccaaaattcatgatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattga |
4991150 |
T |
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7 |
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104 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||| || | |||||||| | ||| | |||||| |
|
|
| T |
17083496 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttcacaaaaacaacaacaacaactcatttctaatcatcaaatcatgatttatgaacacccaa |
17083397 |
T |
 |
| Q |
105 |
gccatgaattatcatcaacaacat |
128 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
17083396 |
gccatgaatcatcaacaacaacat |
17083373 |
T |
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acatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaa |
243 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| || | || ||| ||| | ||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
21411228 |
acatcaattgcacatgaatctcagcataatccaacatcaacatagcataattcacaatttgagcatattt-caacatataccactttctcatactttgaa |
21411130 |
T |
 |
| Q |
244 |
catgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcat |
286 |
Q |
| |
|
|||| ||| | ||||||| ||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
21411129 |
catgaaatttatttaacaaccattcaattatcaacaacttcat |
21411087 |
T |
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tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaa |
183 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||| |||| || |||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
33324701 |
tcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaaccacaa |
33324800 |
T |
 |
| Q |
184 |
caaagcataattca-ccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
33324801 |
tatagcataattcatccaattgagcata |
33324828 |
T |
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84 |
tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaa |
183 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||| |||| || |||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
35136251 |
tcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaaccacaa |
35136152 |
T |
 |
| Q |
184 |
caaagcataattca-ccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
35136151 |
tatagcataattcatccaattgagcata |
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T |
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Target: chr6; HSP #32
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84 |
tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaa |
183 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| ||||||||| | || ||| ||||||||||||||| |||| || |||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
35009692 |
tcatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaa |
35009594 |
T |
 |
| Q |
184 |
caaagcataattcaccaattgagca |
208 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35009593 |
catagcaaaattcaccaattgagca |
35009569 |
T |
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82 |
aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataac |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||| |||| || |||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
25919619 |
aatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcatatagcaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaac |
25919718 |
T |
 |
| Q |
182 |
aaca |
185 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
25919719 |
aaca |
25919722 |
T |
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Target: chr6; HSP #34
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acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca- |
197 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| ||||||||| || || ||| ||||| ||||||||| |||| || |||| ||||||| ||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
15079932 |
acccaaaccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaatatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaatatagcataattcac |
15079833 |
T |
 |
| Q |
198 |
ccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
15079832 |
ccaattgagcata |
15079820 |
T |
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Target: chr6; HSP #35
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atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttct |
232 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| | |||||| || |||||||||||| ||||||| |||| |||||| || || ||||| | ||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
17083386 |
atcaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcaca-attcaacatatatcattttca |
17083288 |
T |
 |
| Q |
233 |
catactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatc |
275 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17083287 |
catactatgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattatc |
17083245 |
T |
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Target: chr6; HSP #36
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46 |
tacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaa |
144 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| |||||||| || ||| |||||| | ||| | || |||||||||||| |||| |||||| || || || ||| ||||| |
|
|
| T |
33538647 |
tacaaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaataacaa |
33538548 |
T |
 |
| Q |
145 |
catcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca |
197 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||| || |||||||||||| || |||| |||| |||||| |
|
|
| T |
33538547 |
catcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaataacatagcacaattca |
33538495 |
T |
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Target: chr6; HSP #37
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99 |
acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcac |
198 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||| |||||| || | || ||| ||||||||||||| | ||||| || ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
34966890 |
acccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacatagcataattcaa |
34966989 |
T |
 |
| Q |
199 |
caatt |
203 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
34966990 |
caatt |
34966994 |
T |
 |
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Target: chr6; HSP #38
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Query Start/End: Original strand, 84 - 210
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84 |
tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaa |
183 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| | ||||||||||||||| || | ||| ||||| ||||| | ||||| ||||||||| |||| || |||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
16888031 |
tcatgaattatgtatacccaagccatgaatcattaacaataacatcacatagtgacaacaaaatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaa |
16887932 |
T |
 |
| Q |
184 |
caaagcataattca-ccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
|| | ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
16887931 |
cataacataattcacccaattgagcata |
16887904 |
T |
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Target: chr6; HSP #39
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140 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgag |
206 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| | |||| || ||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
29665938 |
aacaacatcaattgaacatgaatcatatctcatttcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgag |
29666004 |
T |
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Target: chr6; HSP #40
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144 |
acatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagca |
208 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| | |||| |||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27740907 |
acatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacgacttagcaaaattcaccaattgagca |
27740971 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0158 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:
Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
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Target Start/End: Original strand, 24890 - 25190
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7 |
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106 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
24890 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaa-cccaagc |
24988 |
T |
 |
| Q |
107 |
catgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgag |
206 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24989 |
catgaattatcatcaacaacatgccatatcaacaacaacaacaattgatcgtgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattcaccaattgag |
25088 |
T |
 |
| Q |
207 |
catattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcat |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
25089 |
catattttcaacatatacccttttcctacacttgaaacatgaatttcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatccaaacatgtcatcat |
25188 |
T |
 |
| Q |
307 |
aa |
308 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
25189 |
aa |
25190 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 77 - 308
Target Start/End: Original strand, 25213 - 25443
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77 |
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176 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25213 |
acaacaatcatgaatcatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaacaacatgccatatcaacaacaacaacaattgatcgtgaaacttatcacaattca |
25311 |
T |
 |
| Q |
177 |
ataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatcc |
276 |
Q |
| |
|
| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
25312 |
acaacaacaaaacataattcaccaattgagcatattttcaacatatacccttttcctacacttgaaacatgaatttcaactaacaacaattcaattattc |
25411 |
T |
 |
| Q |
277 |
ataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
25412 |
ataacttcatacatccaaacatgtcatcataa |
25443 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 47)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 58 - 305
Target Start/End: Original strand, 16732150 - 16732398
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58 |
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Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||| |
|
|
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16732150 |
aacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacgacatcaattgatc |
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T |
 |
| Q |
157 |
atgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaac |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
16732250 |
atgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaac |
16732349 |
T |
 |
| Q |
257 |
taacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatca |
305 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16732350 |
taacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatca |
16732398 |
T |
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Q |
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T |
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281 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12837341 |
aacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaatttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataac |
12837242 |
T |
 |
| Q |
282 |
ttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12837241 |
ttcatacatctaaacatgtcatcataa |
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T |
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Q |
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atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgacatagcaaca |
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T |
 |
| Q |
141 |
acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat--act |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||| ||| |
|
|
| T |
34395322 |
acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacataccca-ttttcatacact |
34395420 |
T |
 |
| Q |
239 |
ttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34395421 |
ttgaacatgtaattcaactaac-acaattcaattattcattacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
34395489 |
T |
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181 |
Q |
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T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataac |
281 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |
|
|
| T |
45458996 |
agcaaagcataattcaccaattgaacatatctttaacatatacaaacttctcatattttgagcatgtaattcaactaacaacaattcaattatctatcac |
45458897 |
T |
 |
| Q |
282 |
ttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45458896 |
ttcatacatctaaacatgtcatcataa |
45458870 |
T |
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Target: chr4; HSP #5
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184 |
Q |
| |
|
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|
|
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catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaattgatcatgatacttatcacaattcatcaacaac |
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T |
 |
| Q |
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aaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat--actttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataact |
282 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| | || |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
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| T |
23270072 |
aatgcataattcatcaattgagtatattttcaacacataccca-ttttcatacactttgaacatgtaattcaactaac-acaattcaattattcataact |
23269975 |
T |
 |
| Q |
283 |
tcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23269974 |
tcatacatctaaacatgtcatcataa |
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T |
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185 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
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|
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T |
 |
| Q |
186 |
aagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttca |
285 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
21959600 |
tagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttg-agatgtaattcaatcaacaacaattcaaatatccataacttca |
21959502 |
T |
 |
| Q |
286 |
tacatctaaacatgtcatca |
305 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
21959501 |
tacatttaaacatgtcatca |
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T |
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184 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
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catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatggctaaaccacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaat |
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T |
 |
| Q |
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aaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttc |
284 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
44056024 |
aatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatattcatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaa-aattcataacttc |
44056122 |
T |
 |
| Q |
285 |
atacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44056123 |
atacatctaaacatgtcatcataa |
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T |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |
|
|
| T |
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aacccaagccatgaattatcatcaaccacatgacttaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcgtaattca |
30458024 |
T |
 |
| Q |
198 |
ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaaca |
297 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30458025 |
ccaattgagcatattttcaacacatacccattttacatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaatttaattatccataacttcatacatctaaaca |
30458124 |
T |
 |
| Q |
298 |
tgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|| |||||||| |
|
|
| T |
30458125 |
tgacatcataa |
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T |
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181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
55376838 |
aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacataatttaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaac |
55376739 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataac |
281 |
Q |
| |
|
||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| | || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
55376738 |
aacaatgtataattcaccaattgagtatattttc-acacatacccatttttcatacttagaacatacaattcaactaacaacaattcaatcattcataac |
55376640 |
T |
 |
| Q |
282 |
ttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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55376639 |
ttcatacatctaaacatgtcatcataa |
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T |
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Q |
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|
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|
|
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gaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccat |
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T |
 |
| Q |
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gcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcata |
287 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
53704868 |
gcataattcaccaattgagcatattttc-acacatacccatttttcatactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcata |
53704770 |
T |
 |
| Q |
288 |
catctaaacatgtcatca |
305 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53704769 |
catctaaacatgtcatca |
53704752 |
T |
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Q |
| |
|
|||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | || ||| || |
|
|
| T |
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ttttaccaaactactaacaacatctcatttctcaacaaccaatcatgaatcatgcatatccaagccatgaattatcatcaacaacatcaattagcaacaa |
13809692 |
T |
 |
| Q |
142 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattc-accaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatacttt |
240 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
13809691 |
caacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaactaattgagcata-tttcaacatataccattttctcatacttt |
13809593 |
T |
 |
| Q |
241 |
gaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||| || || |||||||||||||||| | | |||||||| ||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
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gaacatgaaatctcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataa |
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T |
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Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
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gaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacgacatcactaaacaacaacaacaacatttgatcatgaaacatatcacaattcatgaacaacaat |
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T |
 |
| Q |
188 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaactt-ctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcat |
286 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || || | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
44346939 |
gtataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccattttcttacactttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcat |
44347036 |
T |
 |
| Q |
287 |
acatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44347037 |
acatctaaacatgtcatcataa |
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T |
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Q |
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|
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|
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aacccaagccatgagttatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaacgcataat |
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T |
 |
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195 |
tcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaa |
294 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||| ||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||| |
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|
| T |
8872599 |
tcaccaattgagcatattttc-acacatacccatttttcatactttgaacatacaattcaactaacaacacttcaatcattcatagcttcatacatctaa |
8872501 |
T |
 |
| Q |
295 |
acatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
8872500 |
acatgtcatcataa |
8872487 |
T |
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Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
53907931 |
gaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaatcaacaacaaca---attgatcatgaaacatttcacaattcatcaacaacaat |
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T |
 |
| Q |
188 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcata |
287 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| | || ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
53907834 |
gcataattcaccaattgggcatattttc-acacatacccatttttcatactttgaacatacaatccaactaataacaattcaatcattcataacttcata |
53907736 |
T |
 |
| Q |
288 |
catctaaacatgtcatca |
305 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53907735 |
catctaaacatgtcatca |
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T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #15
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Q |
| |
|
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|
|
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T |
 |
| Q |
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cataattc-accaattgagcatattttcaacatataccaacttc-tcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcat |
286 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
27961084 |
cataattcaaccaatttagcata-tttcaacatatacc-acttcttcatactttgaacatgaaattccactaacaacaattcaattattcataacttcat |
27961181 |
T |
 |
| Q |
287 |
acatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||| |
|
|
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27961182 |
gcattcaaacatgtcatcataa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #16
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Target Start/End: Complemental strand, 820153 - 820015
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Q |
| |
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|
|
| T |
820153 |
aatcatgaatcatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaaca---attgatcatgaaacttatcacaattcatcaac |
820058 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatatac |
224 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
820057 |
aacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatac |
820015 |
T |
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Target: chr4; HSP #17
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aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataac |
181 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |
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aatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaac |
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T |
 |
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182 |
aacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataa |
280 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
15044934 |
aacatagcataattcatcaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaa |
15045032 |
T |
 |
| Q |
281 |
cttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
15045033 |
cttcatgcattcaaacataacatcataa |
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T |
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Target: chr4; HSP #18
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Target Start/End: Complemental strand, 18494602 - 18494343
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50 |
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148 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| || || ||| |||| || | |
|
|
| T |
18494602 |
aaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaagtcatgaatcatgcatacccaagccatgagttaccatcaacaacatcacttaacaacaacagcaac |
18494503 |
T |
 |
| Q |
149 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattc-accaattgagcatattttcaacatatacca-acttctcatactttgaacat |
246 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| || | |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
18494502 |
aattgatcatgaatcttaacacaattcaacaacaacatagcatcatccaaccaattgagcaca-tttcaacatataccatttttctcatactttgatcat |
18494404 |
T |
 |
| Q |
247 |
gtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
18494403 |
gaagtttcaccaacaacaattcaattat-cataacttcatacatacgaacatgtcatcataa |
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T |
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Target: chr4; HSP #19
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185 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| || || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |
|
|
| T |
30232733 |
atgaataatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttaacaacaaca |
30232634 |
T |
 |
| Q |
186 |
aagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaac--ttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataactt |
283 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||| |||| || || ||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
30232633 |
tagcataattcaccaattgagcatattttc-acata-acccacttttcacatactttgatcatgaagtttcaccaacaacaattcaattat-cataactt |
30232537 |
T |
 |
| Q |
284 |
catacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
30232536 |
catatatacaaacatgtcatcataa |
30232512 |
T |
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Target: chr4; HSP #20
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181 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
15109590 |
aatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacattacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaac |
15109491 |
T |
 |
| Q |
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aacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataa |
280 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| | ||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
15109490 |
aacatagcataatttatcaatttgagtata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaa |
15109392 |
T |
 |
| Q |
281 |
cttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
15109391 |
cttcatgcattcaaacataacatcataa |
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T |
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Target: chr4; HSP #21
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Query Start/End: Original strand, 82 - 308
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aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataac |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| || ||| || || || ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
52265749 |
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52265650 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataa |
280 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
52265649 |
aacattgcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatataccactttctcatactttgaacataaaatttctctaacaacaattcaattatcaacaa |
52265551 |
T |
 |
| Q |
281 |
cttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
52265550 |
cttcatgcattcaaacataacatcataa |
52265523 |
T |
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Target: chr4; HSP #22
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126 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| || ||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
14951713 |
tcataatcaacccattttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatatatcatcatcaacaat |
14951812 |
T |
 |
| Q |
127 |
atgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
||||| | || ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14951813 |
atgactaaataacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
14951896 |
T |
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attttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaa |
140 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||| | | ||| | ||||||||||||| | |||| ||||||||| || || ||| | |
|
|
| T |
41166228 |
atttcacaaaaccacccacaacaactcatttctcatcaacaaatcataagttatgaatacccaagccatgattcatcaacaacaacatcacttagcaaca |
41166129 |
T |
 |
| Q |
141 |
acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
239 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
41166128 |
acaacatcaattgaacatgactcttgccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactt |
41166030 |
T |
 |
| Q |
240 |
tgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcat |
286 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
41166029 |
tgaacatgaaatttcactaacaacaattcaattatcaacaacttcat |
41165983 |
T |
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tttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20813658 |
tttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
20813562 |
T |
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attttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaa |
139 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| | ||| |
|
|
| T |
25119498 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaaattatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcattatcaacaatatgactaaacaac |
25119399 |
T |
 |
| Q |
140 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
25119398 |
aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaaaaaccatgcataattcaccaattgatcata |
25119328 |
T |
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attttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaa- |
139 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||| ||| ||| |
|
|
| T |
5682817 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagacatatatcatcatcaacaatatga-ataaaaaac |
5682719 |
T |
 |
| Q |
140 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
||||||| | | | |||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5682718 |
aacaacaaccaataatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
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T |
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185 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||| || || ||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15272557 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatggaacatatcacaattcatcaacaacc |
15272458 |
T |
 |
| Q |
186 |
aagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15272457 |
atgcataattcaccaattgagcata |
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T |
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Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| | ||||||| |
|
|
| T |
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acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaag |
16522847 |
T |
 |
| Q |
106 |
ccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattga |
154 |
Q |
| |
|
|||| | | || ||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
16522848 |
ccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattga |
16522896 |
T |
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Target: chr4; HSP #29
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atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttct |
232 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| || |||| |
|
|
| T |
47535254 |
atcaacaacaacgtcaattgaacatgattcttatcataattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcata-tttcaacatatatcactttct |
47535156 |
T |
 |
| Q |
233 |
catactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
47535155 |
catactttgaacttgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #30
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acatcatcaaattcaaacttcttcattatcaacccatttt-acaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaa |
104 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||| ||| || | |||||||| | || | |||||| |
|
|
| T |
7186159 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttcacaaaaac---aacaacaactcatatctcatcatcaaatcatgatttataaacacccaa |
7186063 |
T |
 |
| Q |
105 |
gccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt- |
203 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||| || || | || ||| ||||||||||||| | |||||| || |||||||||||| ||||||| |||| |||||| || || |
|
|
| T |
7186062 |
gccatgaatcatcaacaataatatctcttagcaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcatcattta |
7185963 |
T |
 |
| Q |
204 |
gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcat |
303 |
Q |
| |
|
| ||| | ||||||||||| || ||| |||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||| |||| |
|
|
| T |
7185962 |
gtgcaca-attcaacatatatcattttcacatactatgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattcaaacatatcat |
7185864 |
T |
 |
| Q |
304 |
cataa |
308 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
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7185863 |
cataa |
7185859 |
T |
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Target: chr4; HSP #31
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| |
|
||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| | ||||||| |
|
|
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9295624 |
acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaactcattttacataaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaag |
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T |
 |
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ccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattga |
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Q |
| |
|
|||| | | || ||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| |
|
|
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9295724 |
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Target: chr4; HSP #32
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140 |
Q |
| |
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||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||| ||||||| ||||| ||||| | ||||||| |||| ||||| ||| || || ||| | |
|
|
| T |
14901197 |
attttacaaaaccaccaacaacaacccatttctcatcatcaattcatgaattatgcacacccatgtcatgaatcatcaacaacagcatcacttagcaaca |
14901296 |
T |
 |
| Q |
141 |
acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcacca-attgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
239 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||| | ||||||||| || ||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
14901297 |
acaacatcaattgaatatgattcttaccacaattcaataataacatatcataattcaacattttgagcata-tttaaacatatatcactttctcatactt |
14901395 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #33
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Target Start/End: Complemental strand, 819996 - 819946
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258 |
aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
819996 |
aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcaccataa |
819946 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 35 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 7965000 - 7964760
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35 |
tcaacccattttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacat |
133 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||| |||||| | ||| | || |||||||||||| |||| |||||| || || | |
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|
| T |
7965000 |
tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt |
7964901 |
T |
 |
| Q |
134 |
atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttct |
232 |
Q |
| |
|
| ||| ||||| ||||||| | ||||| || |||| ||||||| ||||||| |||| |||||| || || ||||||| ||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
7964900 |
agcaacaacaaaatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcata-attcaacatataacactttca |
7964802 |
T |
 |
| Q |
233 |
catactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatc |
275 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7964801 |
catac-ttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatc |
7964760 |
T |
 |
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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 19822065 - 19821940
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| Q |
35 |
tcaacccattttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacat |
133 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| ||| || ||||| |||||||| |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
19822065 |
tcaactcattttacaaagtcaccaaaaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacat |
19821966 |
T |
 |
| Q |
134 |
atcaaaaacaacatcaattgatcatg |
159 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
19821965 |
agcaacaacaacatcaattgaacatg |
19821940 |
T |
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Target: chr4; HSP #36
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Target Start/End: Original strand, 18276440 - 18276633
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82 |
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181 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||| | ||||||||||| ||| |||| |||||| || || | ||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||| |
|
|
| T |
18276440 |
aatcatgatttatgaacacccaagccatcaatcatcaacaacaatatcactttgcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaac |
18276539 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatc |
275 |
Q |
| |
|
|| | |||| |||||| || || ||||||| ||||||||||| || ||| ||| ||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
18276540 |
aatatagcacaattcaacatttagagcata-attcaacatataacactttcacatgctttgaacatgcaatttcaccaacaacaatttaattatc |
18276633 |
T |
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Target: chr4; HSP #37
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Target Start/End: Complemental strand, 37957314 - 37957187
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| Q |
35 |
tcaacccattttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacat |
133 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| || | |
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|
| T |
37957314 |
tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttatcatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagccgtgaattatcaataacaacatcactt |
37957215 |
T |
 |
| Q |
134 |
atcaaaaacaacatcaattgatcatgaa |
161 |
Q |
| |
|
| || ||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
37957214 |
agcagcaaccacatcaattgaacatgaa |
37957187 |
T |
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Target: chr4; HSP #38
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| Q |
134 |
atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagca |
208 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10104454 |
atcaacaacaacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagca |
10104380 |
T |
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Target: chr4; HSP #39
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| Q |
99 |
acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcac |
198 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| | |||| ||||||||| | || ||| || |||||||||||| |||||| | |||| |||||||| |||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
15675328 |
acccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcac |
15675229 |
T |
 |
| Q |
199 |
caattgagca |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
15675228 |
caattgagca |
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T |
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Target: chr4; HSP #40
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acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcac |
198 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| | |||| ||||||||| | || ||| || |||||||||||| |||||| | |||| |||||||| |||||| || | ||||||| |
|
|
| T |
31115653 |
acccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttaggaaaattcac |
31115752 |
T |
 |
| Q |
199 |
caattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
31115753 |
caattgagcata |
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T |
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Target: chr4; HSP #41
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Target Start/End: Original strand, 38764715 - 38764908
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aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataac |
181 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || | || ||| ||||||||||||| | ||||| || |||| |||| || ||| |
|
|
| T |
38764715 |
aatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatattccttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcataattgaacaac |
38764814 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatc |
275 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||| ||||||| | |||| ||||| || ||| |||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38764815 |
aacatcgcataattcaacaatttgagcaca-attcacaatataacattttcacatactatgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatc |
38764908 |
T |
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Target: chr4; HSP #42
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| Q |
134 |
atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttca |
216 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||| || ||| |||| | ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
40885758 |
atcaacaacaacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaataacttagcaaagttcaccaattgagcataatttca |
40885676 |
T |
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Target: chr4; HSP #43
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acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcac |
198 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||| |||||| || | || ||| ||||||||||||| | ||||| || |||||||||||| ||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
18238381 |
acccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaa |
18238282 |
T |
 |
| Q |
199 |
caatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatc |
275 |
Q |
| |
|
||||| ||||| | |||| ||||| || ||| |||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18238281 |
caattagagcaca-attcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatc |
18238205 |
T |
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Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
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Target Start/End: Complemental strand, 41256660 - 41256417
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| Q |
34 |
atcaacccatttt-acaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgac |
131 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||| || ||| |||||| | ||| | |||||| |||||||| |||| |||||| || | |
|
|
| T |
41256660 |
atcaacccatttttataaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatctc |
41256561 |
T |
 |
| Q |
132 |
atatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaactt |
230 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||||||| | |||| || |||||||||||| |||||| |||| |||||| ||| ||||||||| |||| ||||| || || |
|
|
| T |
41256560 |
ttaacaacaacaacatcaattaaacatggttctcatcacaattcaacaacaacctagcacaattcaacaatttgagcata-attcacaatatatcatttt |
41256462 |
T |
 |
| Q |
231 |
ctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatc |
275 |
Q |
| |
|
| |||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41256461 |
cacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatc |
41256417 |
T |
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Target: chr4; HSP #45
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Target Start/End: Complemental strand, 15013523 - 15013330
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aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataac |
181 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || | || ||| ||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||| ||| |
|
|
| T |
15013523 |
aatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaatatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaac |
15013424 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatc |
275 |
Q |
| |
|
||| |||| |||||| ||| ||||||||| |||| |||| || ||| |||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15013423 |
aacctagcacaattcaacaatttgagcata-attcacaatatgtcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatc |
15013330 |
T |
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Target: chr4; HSP #46
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| Q |
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acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcac |
198 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||| ||| || || | || ||| ||||||||||||| | |||||| || ||||||| |||| ||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
13590298 |
acccaagctatgaatcatcaacaataatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaa |
13590199 |
T |
 |
| Q |
199 |
caatt |
203 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
13590198 |
caatt |
13590194 |
T |
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Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 203
Target Start/End: Original strand, 54398406 - 54398510
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99 |
acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcac |
198 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| |||||| || | || ||| ||||||||||||| | ||||| || ||||||| |||| ||||||| | || |||||| |
|
|
| T |
54398406 |
acccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacataacacaattcaa |
54398505 |
T |
 |
| Q |
199 |
caatt |
203 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
54398506 |
caatt |
54398510 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0035 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:
Target: scaffold0035; HSP #1
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Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |
|
|
| T |
118237 |
aaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaccccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatc |
118138 |
T |
 |
| Q |
149 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgt |
248 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
118137 |
aactgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgaacatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgt |
118038 |
T |
 |
| Q |
249 |
gattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
118037 |
aattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
117978 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 50 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 109736 - 109477
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aaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatc |
148 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |
|
|
| T |
109736 |
aaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaatcccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatc |
109637 |
T |
 |
| Q |
149 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgt |
248 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
109636 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacttagcataattcaccaatttatcatattttcaatatataccaatttctcatactttgaacatgt |
109537 |
T |
 |
| Q |
249 |
gattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
109536 |
aattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
109477 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 31)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 58 - 308
Target Start/End: Original strand, 21718210 - 21718460
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Q |
| |
|
||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
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|
| T |
21718210 |
aacaacatctcatttctcaagaacaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatca |
21718309 |
T |
 |
| Q |
158 |
tgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaact |
257 |
Q |
| |
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|
| T |
21718310 |
tgaaacttatcacaaatcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttgaacacataccaatttctcatactttgaacatgtaattcaact |
21718409 |
T |
 |
| Q |
258 |
aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21718410 |
aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
21718460 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 77 - 308
Target Start/End: Original strand, 49967651 - 49967882
Alignment:
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77 |
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176 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
49967651 |
acaacaaccatgaatcatgcaaaccgaagcaatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaattgatcatgaaacgtatcacaattca |
49967750 |
T |
 |
| Q |
177 |
ataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatcc |
276 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
49967751 |
tcaacaacaatgtataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattttttataatttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattc |
49967850 |
T |
 |
| Q |
277 |
ataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
49967851 |
ataacttcatacatctaaacatggcatcataa |
49967882 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 86 - 308
Target Start/End: Original strand, 35054766 - 35054988
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86 |
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185 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| || || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |
|
|
| T |
35054766 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacagttcatcaactaca |
35054865 |
T |
 |
| Q |
186 |
aagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttca |
285 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
35054866 |
tagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttca |
35054965 |
T |
 |
| Q |
286 |
tacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35054966 |
tacatctaaacatgtcatcataa |
35054988 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 135 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 9784249 - 9784079
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135 |
tcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctca |
234 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9784249 |
tcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaa---caacaaagcataattcaccaattaagcatattttcaacatataccaacttctca |
9784153 |
T |
 |
| Q |
235 |
tactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9784152 |
tactttgaacatgtaattcaatcaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
9784079 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 82 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 22403350 - 22403125
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| Q |
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aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataac |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
22403350 |
aatcatgaatcatg-aaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacaacagttaatcatgaaacttatcacaattcatcaac |
22403252 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat--actttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccata |
279 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
22403251 |
aacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacataccca-ttttcatacactttgaacatgtaattcaactaac-acaatttaattattcata |
22403154 |
T |
 |
| Q |
280 |
acttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22403153 |
acttcatacatctagacatgtcatcataa |
22403125 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
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Query Start/End: Original strand, 82 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 35522560 - 35522432
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| Q |
82 |
aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataac |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
35522560 |
aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacgtatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaac |
35522461 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35522460 |
aacaaagcataattcaccaattgagcata |
35522432 |
T |
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Target: chr1; HSP #7
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88 |
gaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgac---atatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaac |
184 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
41212081 |
gaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac |
41212180 |
T |
 |
| Q |
185 |
aaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttc |
284 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
41212181 |
agtgcataattcactaattgagcatatttt-tacacatacccatttttcatactttgaacatacagttcaactaacaacaattcaattattcataacttc |
41212279 |
T |
 |
| Q |
285 |
atacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
41212280 |
atacctctaaacaggtcatcataa |
41212303 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 43 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 51627945 - 51627679
Alignment:
| Q |
43 |
ttttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaa |
141 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || || ||| || |
|
|
| T |
51627945 |
ttttaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacagcaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacatcatcacttagcaacaa |
51627846 |
T |
 |
| Q |
142 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattc-accaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatacttt |
240 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
51627845 |
caacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaccatatcataattcaaccaattgaacata-tttcaacatataccattttctcatacttt |
51627747 |
T |
 |
| Q |
241 |
gaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||||||||||||||| ||| | || ||||| ||| || ||| ||||||||| |
|
|
| T |
51627746 |
gaacatgaagtttcactaacaacaattcaatcatcaacaaattcatgcattcaagcatatcatcataa |
51627679 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 74 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 27330005 - 27329771
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| Q |
74 |
ttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaa |
172 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| || || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27330005 |
ttgacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaa |
27329906 |
T |
 |
| Q |
173 |
ttcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaac--ttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaa |
270 |
Q |
| |
|
|| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||| |||| || || ||||||||||||| |
|
|
| T |
27329905 |
tttaacaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttc-acata-acccacttttcacatactttgatcatgaagtttcaccaacaacaattcaa |
27329808 |
T |
 |
| Q |
271 |
ttatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
27329807 |
ttat-cataacttcatatatacaaacatgtcatcataa |
27329771 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 42 - 308
Target Start/End: Original strand, 20177140 - 20177407
Alignment:
| Q |
42 |
attttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaa |
140 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||| | | ||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| | |
|
|
| T |
20177140 |
atttcacaaaaccaccaacaacaactcatttctcttcaacaaatcatgaattatgaatatccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaaca |
20177239 |
T |
 |
| Q |
141 |
acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
239 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
20177240 |
acaacatcaattgaacttgacttttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactt |
20177338 |
T |
 |
| Q |
240 |
tgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| || |||||||||||||||||| | |||||| | ||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
20177339 |
tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcgtgcattaaaacatatcatcataa |
20177407 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 9784341 - 9784238
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| Q |
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aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataac |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
9784341 |
aatcatgaatcatgcaagcccaagccatgaatgatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcttgaaacttatcacaattcaacaac |
9784242 |
T |
 |
| Q |
182 |
aaca |
185 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
9784241 |
aaca |
9784238 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 210
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| Q |
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tcattatcaacccatttt-acaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaac |
126 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| || ||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
15861728 |
tcataatcaacccattttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgcatcatcatcaacaat |
15861629 |
T |
 |
| Q |
127 |
atgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
||||| | | |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15861628 |
atgactaa--acaaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
15861547 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 210
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| Q |
29 |
tcattatcaacccatttt-acaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaac |
126 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| || ||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
22366970 |
tcataatcaacccattttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgtatcatcatcaacaat |
22367069 |
T |
 |
| Q |
127 |
atgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
||||| | ||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22367070 |
atgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcat-attcaccaattgagcata |
22367152 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 58 - 210
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| Q |
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aacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatc |
156 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||| | ||| ||||||| | ||| ||| |
|
|
| T |
21859992 |
aacaacaattcatttctcaacaacaaattatgaatcatgcaaacccgagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaacaacaacaaccattaatc |
21860091 |
T |
 |
| Q |
157 |
atgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21860092 |
atgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
21860145 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 44035255 - 44035092
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| Q |
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acaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaac |
145 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||| | ||||| | ||| |||||| |
|
|
| T |
44035255 |
acaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaattatgaatcatgcaaactcaagccatta-tcatcatcaactatatgactaaacaacaacaac |
44035157 |
T |
 |
| Q |
146 |
atcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
44035156 |
aaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaaatgagcata |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #16
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243 |
acatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
35522432 |
acatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
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82 |
aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataac |
181 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||| | ||||||| ||||||| |||| |||||| || || || ||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| || |
|
|
| T |
37234101 |
aatcatgatttatggacacccaagtcatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaaccac |
37234002 |
T |
 |
| Q |
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aacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataa |
280 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| || || ||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
37234001 |
aacatagcataattcaacatttagagcata-attcaacatatatcactttcatatactttgaacatgcaattttaccaacaacaattcaattatcaccaa |
37233903 |
T |
 |
| Q |
281 |
cttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
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tttcatgcattcaaacatatcatcataa |
37233875 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #18
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Target Start/End: Original strand, 16645976 - 16646144
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140 |
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238 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||| ||||| ||| ||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
16645976 |
aacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattaatcaatttgagaata-attcaacatatatcactttctcatact |
16646074 |
T |
 |
| Q |
239 |
ttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| || |||| ||||| ||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
16646075 |
ttgaacatgaaattttaccaacatcaattaaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataa |
16646144 |
T |
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Target: chr1; HSP #19
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35 |
tcaacccattttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacata |
134 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || || |
|
|
| T |
27674755 |
tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttctcatcaaaaatcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcaataacaacatcactta |
27674854 |
T |
 |
| Q |
135 |
tcaaaaacaacatcaattgatcatgaa |
161 |
Q |
| |
|
||| ||| ||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
27674855 |
acaacaactacaccaattgaacatgaa |
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T |
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Target: chr1; HSP #20
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| Q |
140 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
238 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
16656702 |
aacaacttcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattgatcaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatact |
16656800 |
T |
 |
| Q |
239 |
ttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||| | || || |||||||||||||||||| | ||||| || ||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
16656801 |
ttgaacacgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataa |
16656870 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #21
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181 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || || || ||| ||||||| ||||||| |||||| || |||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
17608934 |
aatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttaacaacaacaacaacaattgaacatgaatctcatcataattcaacaac |
17609033 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatc |
275 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||| || || ||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
17609034 |
aacatagcacaattcaacatttagagcata-attcaacatataacactttcatatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaatccaattatc |
17609127 |
T |
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Target: chr1; HSP #22
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| Q |
42 |
attttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaa |
140 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| | || |||||||||||| | |||||||||||| || || ||| | |
|
|
| T |
13377122 |
atttcacaaaaccgccaacaacaattcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatactcaagccatgaatcaacatcaacaacatcacttagcaaca |
13377023 |
T |
 |
| Q |
141 |
acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca |
197 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| | | || ||||||| ||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
13377022 |
acaacatcaattgagcatgactttcaccataattcaacaacaacataacataattca |
13376966 |
T |
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Target: chr1; HSP #23
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| Q |
82 |
aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataac |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || || || || ||||||||||||||| |||| || |||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
22143602 |
aatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcagcaacaacatcaattgagcatggttctcatcataattcaacaac |
22143503 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattc-accaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
22143502 |
aacatagcataattcaaccatttgagcata |
22143473 |
T |
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Target: chr1; HSP #24
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| Q |
36 |
caacccattttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatca |
118 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22829712 |
caacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagccatgaattatca |
22829629 |
T |
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tcaacccattttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacat |
133 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||| || || ||||||| |||||||||||| ||| |||| || | |
|
|
| T |
19603055 |
tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattattcacacccaagtcatgaattatcaataaccacatcactt |
19603154 |
T |
 |
| Q |
134 |
atcaaaaacaacatcaattgatcatgaa |
161 |
Q |
| |
|
| || ||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
19603155 |
agcagcaactacatcaattgaacatgaa |
19603182 |
T |
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| Q |
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aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaa |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
36356534 |
aatcatgaattatgaacacccaagccataaatcatcatcaacaacatcacttagaaacaacaacatcaattgaacatgaa |
36356455 |
T |
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Target: chr1; HSP #27
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| Q |
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tcaacccattttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacata |
134 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||| || || |
|
|
| T |
38033962 |
tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaacttatttctcatcaacaatcgtgaactatgcacacccaagccatgaattaacaacagcaacatcactta |
38033863 |
T |
 |
| Q |
135 |
tcaaaaacaacatcaattgatcatgaa |
161 |
Q |
| |
|
|| || ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
38033862 |
gcagcaatcacatcaattgaacatgaa |
38033836 |
T |
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208 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| | || |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20445747 |
aacatcaattgatcaagaatcataacacaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagca |
20445812 |
T |
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| Q |
143 |
aacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagca |
208 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| | || |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20531512 |
aacatcaattgatcaagaatcataacacaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagca |
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T |
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| Q |
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attttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaa |
140 |
Q |
| |
|
||||||| |||| || |||||||| |||||||| | |||| |||||||| ||| | || |||||||||||| || | ||||||||| || || ||| | |
|
|
| T |
41229221 |
attttaccaaactaccaacaacaactcatttctcatccacaaatcatgaattatgaacactcaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcaaca |
41229122 |
T |
 |
| Q |
141 |
acaacatcaattgatcatga |
160 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
41229121 |
acaacatcaattgaacatga |
41229102 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #31
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181 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || | || ||| |||||||| |||| | ||||| || |||||||||||| ||| |
|
|
| T |
21195020 |
aatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacattaattaaacatgattctcatcacaattcaacaac |
21195119 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatc |
275 |
Q |
| |
|
||| |||| |||||| ||| ||||||||| |||| ||||| || ||| |||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21195120 |
aacctagcacaattcaacaatttgagcata-attcacaatatatcattttcacatactatgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattatc |
21195213 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0338 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:
Target: scaffold0338; HSP #1
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148 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |
|
|
| T |
8960 |
aaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcaagcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatc |
9059 |
T |
 |
| Q |
149 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgt |
248 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9060 |
aagtgatcttgaaacttatcacaaatcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgt |
9159 |
T |
 |
| Q |
249 |
gattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9160 |
aattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
9219 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0012 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:
Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
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attttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaa |
140 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
253271 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcatcaagaaatcatgaatcatgcaaacccaagccttgaattatcatcaacaacatgacttaacaaaa |
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T |
 |
| Q |
141 |
acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatacttt |
240 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
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acaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcatgattcaccaattgagcatattttcaacatataccaatttctcatacttt |
253072 |
T |
 |
| Q |
241 |
gaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
253071 |
gaaaatgtaattcaactaacaacaattcaattatccctaacttcatacatccaaacatgtcatcataa |
253004 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0190 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:
Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 43 - 308
Target Start/End: Original strand, 9903 - 10169
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43 |
ttttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaa |
141 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
9903 |
ttttaccaaaacaccaacaacatctcatttctccacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaataatcatcaacaacatgacatatcaacaa |
10002 |
T |
 |
| Q |
142 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcata--ctt |
239 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |
|
|
| T |
10003 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatatacc--cttttcatactctt |
10100 |
T |
 |
| Q |
240 |
tgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
10101 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataa |
10169 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0075 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:
Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 42 - 308
Target Start/End: Original strand, 4906 - 5173
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Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||||||| ||||||| || ||| |||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |
|
|
| T |
4906 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcatcagcaaatcatgaattatgaacaaccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaaca |
5005 |
T |
 |
| Q |
141 |
acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatacttt |
240 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
5006 |
acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaatcataattcaccaattaagcatattttcaacatataccaacttctcatactgt |
5105 |
T |
 |
| Q |
241 |
gaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5106 |
gaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
5173 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 36)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 42 - 308
Target Start/End: Original strand, 25601989 - 25602256
Alignment:
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Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
25601989 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacctaagccatgatttatcataaacaacatgacatagcaaca |
25602088 |
T |
 |
| Q |
141 |
acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatacttt |
240 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
25602089 |
acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaaccacatagcataactcaccaattgagcatattttcaacatatatcaatttctcatacttt |
25602188 |
T |
 |
| Q |
241 |
gaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25602189 |
gaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
25602256 |
T |
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181 |
Q |
| |
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|
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| T |
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T |
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aacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataac |
281 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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271276 |
aacaaaacataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttcatacactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataac |
271375 |
T |
 |
| Q |
282 |
ttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
271376 |
ttcatacatccaaacatgtcatcataa |
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T |
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Target: chr2; HSP #3
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181 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |
|
|
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T |
 |
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182 |
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281 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||| | ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4448274 |
aacaaagcatcattcaccaattgaacatattttcaacacaaacccatttcatacactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataac |
4448175 |
T |
 |
| Q |
282 |
ttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
4448174 |
ttcatacatccaaacatgtcatcataa |
4448148 |
T |
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Target Start/End: Original strand, 28974055 - 28974281
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181 |
Q |
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|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |
|
|
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aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttaccacaattcatcaac |
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T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataac |
281 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
28974155 |
aacatagcataattcgccaaatgagcatattttcaacatataccattttctcatactttgaacatgtaattcaattaacaacaattctattatccataac |
28974254 |
T |
 |
| Q |
282 |
ttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
28974255 |
ttcatacattcaaacatgtcatcataa |
28974281 |
T |
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Target: chr2; HSP #5
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135 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||| |||||||| | |||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| || || |
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|
| T |
36890972 |
acccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcaacaacaaatcaagaatcatgcatacccaagccatgaataatcatccacaacatcacttag |
36890873 |
T |
 |
| Q |
136 |
caaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat |
235 |
Q |
| |
|
||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
36890872 |
caacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacatagcataattcaccaattaagcatattttcaacatattccattttctcat |
36890773 |
T |
 |
| Q |
236 |
actttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatca |
305 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
36890772 |
actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgccatca |
36890703 |
T |
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184 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
32465867 |
catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaagaac |
32465966 |
T |
 |
| Q |
185 |
aaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttc |
284 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
32465967 |
aatgcataattcaccaattgagcatattttc-acacatatccatttttcatactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttc |
32466065 |
T |
 |
| Q |
285 |
atacatctaaacatgtcatca |
305 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32466066 |
atacatctaaacatgtcatca |
32466086 |
T |
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156 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
27261787 |
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T |
 |
| Q |
157 |
atgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaac |
256 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
27261887 |
atgaaacttatca-atttctcatactttga-gcataattcaccaat-gagcatattttcaacatataccaatttctcatactttgaacatgtaattgaac |
27261983 |
T |
 |
| Q |
257 |
taacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
27261984 |
taacaacaattcaattatccataactttatacatccaaacatgtcatcataa |
27262035 |
T |
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Target: chr2; HSP #8
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gaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaa |
187 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
25876154 |
gaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaataacaacaacatttgatcatgaagcatatcacaattcatcaacaacaat |
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T |
 |
| Q |
188 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat--actttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttca |
285 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | || |||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
25876054 |
gcataattcaccaattgagcatattttc-acacataccca-ttttcatacactttgaacatgtaattcaactaac-ataattcaattattcataacttca |
25875958 |
T |
 |
| Q |
286 |
tacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25875957 |
tacatctaaacatgtcatcataa |
25875935 |
T |
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Target: chr2; HSP #9
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Target Start/End: Complemental strand, 23836971 - 23836720
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156 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
23836971 |
aacaacatctcatttctcaacaacaaatcaagaattatgcaaacccaagtcatgaattatcatcaacaaaatgactaaacaacaacaacaacaattgatc |
23836872 |
T |
 |
| Q |
157 |
atgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat--actttgaacatgtgattca |
254 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | || |||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
23836871 |
atgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatatttttcacacataccca-ttttcatacactttgaacatgtaattcc |
23836773 |
T |
 |
| Q |
255 |
actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23836772 |
actaac-acaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
23836720 |
T |
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Target: chr2; HSP #10
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Q |
| |
|
|||||| ||| ||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |
|
|
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22580140 |
ttttaccaaaacaccaacaacatctcatttctccacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacatatcagcag |
22580041 |
T |
 |
| Q |
142 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattc-accaattgagcatattttcaacatatacca-acttctcatactt |
239 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| | |
|
|
| T |
22580040 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattc---aacaacaaagcataattcaaccaattgagcata-tttcaacatataacatttttctcatacct |
22579945 |
T |
 |
| Q |
240 |
tgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||| ||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
22579944 |
tgatcataaagtttcaccaacaacaattcaattat-cataacttcatacatacaaacatgtcatcataa |
22579877 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
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Target Start/End: Complemental strand, 24571572 - 24571310
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ttttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaa |
141 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| || | |||||| |||| |||||||||||||||| || || ||| || |
|
|
| T |
24571572 |
ttttaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatacatagccaagc-atgagttatcatcaacaacatcacttaacaacaa |
24571474 |
T |
 |
| Q |
142 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattc-accaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatacttt |
240 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| || |
|
|
| T |
24571473 |
caacatcaattgatcatgaatcttaacacaattcaacaaaaacatagcataattcaaccaattgagcata-tttcaacatatatcattttctcatacctt |
24571375 |
T |
 |
| Q |
241 |
gaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatca |
305 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
24571374 |
gaacatgaaatttctctaacaacaattcaagtatccacaacttcatgcattcaaacgtgtcatca |
24571310 |
T |
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Back To:
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Target: chr2; HSP #12
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Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||| | ||||||| |
|
|
| T |
19433649 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaacacccaag |
19433550 |
T |
 |
| Q |
106 |
ccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt |
203 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||| || | || ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
19433549 |
ccatgaatcatcaacaacaatatctcttagcaacaacaacatcaattgaacatgattcttacaacaattcaataacaacatagcataattcaacaatt |
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T |
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181 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| | || |||||||||||| | || |||||| || || || ||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||| |
|
|
| T |
67998 |
aatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaac |
68097 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataa |
280 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
68098 |
aacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaa |
68196 |
T |
 |
| Q |
281 |
cttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
68197 |
cttcatgcattcaaacataacatcataa |
68224 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #14
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Query Start/End: Original strand, 7 - 308
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106 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| | || |||||||||| ||| | ||||||| |
|
|
| T |
43645824 |
acatcatcaaaatcaaactttttcattaccaacccattttacaaaaccaccaccaacaactcaaatgacatcacaaatcatgaattatgaacacccaagt |
43645923 |
T |
 |
| Q |
107 |
catgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaa-ttga |
205 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
43645924 |
catgaatcatcgacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgattcttaccacagttcaacaacaacatagcataattcaacaatttga |
43646023 |
T |
 |
| Q |
206 |
gcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatca |
305 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| || ||||||||| |||||||| | |||||||| ||| |||||| ||| || |
|
|
| T |
43646024 |
gcata-attcaacatatatcactttctcatactttaaacatgaaatttcaccaacaacaatccaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcaaca |
43646122 |
T |
 |
| Q |
306 |
taa |
308 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
43646123 |
taa |
43646125 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 42 - 210
Target Start/End: Original strand, 22274688 - 22274856
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42 |
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Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| | || | |
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|
| T |
22274688 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaattcatgaatcatgcaa-cccaagccatctatcatcatcaacaatatgactaaacatca |
22274786 |
T |
 |
| Q |
141 |
acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22274787 |
acaacaaccattgatcatgaaacacatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
22274856 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 84 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 31146419 - 31146196
Alignment:
| Q |
84 |
tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaa |
183 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||| || || ||| | |||||||||||| || ||| ||||| ||||||||| ||| | |
|
|
| T |
31146419 |
tcatgaattatgcacacctaggccatgatttatcatcaacaacatcacttagcaacagtaacatcaattgaacaggaatcttattacaattcaacaac-a |
31146321 |
T |
 |
| Q |
184 |
caaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataact |
282 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||| |
|
|
| T |
31146320 |
catagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctcatactttgaacataaaatttctctaacaacaattcaattatcaacaact |
31146222 |
T |
 |
| Q |
283 |
tcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
31146221 |
tcatgcattcaaacataccatcataa |
31146196 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 210
Target Start/End: Original strand, 22283921 - 22284089
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42 |
attttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaa |
140 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| | ||| | || | |
|
|
| T |
22283921 |
atttcacaaaaccaccaacaacaattcatttctcaacagcaattcatgaatcatgc-aacccaagccatgtatcatcatcaacaataagactaaacatca |
22284019 |
T |
 |
| Q |
141 |
acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
| |||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22284020 |
aaaacaacgattgatcatgaaacacatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
22284089 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 97 - 216
Target Start/End: Original strand, 6879458 - 6879577
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97 |
aaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattc |
196 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
6879458 |
aaacccaagacatgtattatcatcaacaacatgactaaataacaacaacaacaattgatcattaaacatatcacaattcatcaataacaatgcataattc |
6879557 |
T |
 |
| Q |
197 |
accaattgagcatattttca |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
6879558 |
accaattgagtatattttca |
6879577 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 3529 - 3403
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| Q |
35 |
tcaacccattttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacata |
134 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| || || |
|
|
| T |
3529 |
tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttctcatctacaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcactta |
3430 |
T |
 |
| Q |
135 |
tcaaaaacaacatcaattgatcatgaa |
161 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
3429 |
gcaacaacaacatcaattgaacatgaa |
3403 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #20
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Target Start/End: Original strand, 25305416 - 25305617
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48 |
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146 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||| | ||||| ||||||||| |||| ||||||||| || || | | ||||||| |
|
|
| T |
25305416 |
caaaactaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaggccatgaatcatcaacaacaacatcacttagccacaacaaca |
25305515 |
T |
 |
| Q |
147 |
tcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataa-caacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaac |
244 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||| |||||||||| || ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
25305516 |
tcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaatcaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacacatatcactttctcatactttgaac |
25305614 |
T |
 |
| Q |
245 |
atg |
247 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
25305615 |
atg |
25305617 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #21
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Query Start/End: Original strand, 86 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 9653141 - 9653021
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86 |
atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaaca |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| || || ||| | ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
9653141 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacatcaacatctattgatcatgaaaaatatcgcaattcatcaacaacc |
9653042 |
T |
 |
| Q |
186 |
aagcataattcaccaattgag |
206 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9653041 |
atgcataattcaccaattgag |
9653021 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 86 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 21274293 - 21274174
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| Q |
86 |
atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaaca |
185 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||||||||||| |||| | ||||| || || ||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
21274293 |
atgaatcatgcta-cccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacatattacaattcatcaacaacc |
21274195 |
T |
 |
| Q |
186 |
aagcataattcaccaattgag |
206 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21274194 |
atgcataattcaccaattgag |
21274174 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #23
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Target Start/End: Original strand, 25212977 - 25213126
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| Q |
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acatcatcaaattcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccactaacaacaattca--tttcttgacaacaatcatgaatcatgcaaacccaa |
104 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| | |||||| |
|
|
| T |
25212977 |
acatcatcaaaatcaaatttcttctttatcaacccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaa |
25213076 |
T |
 |
| Q |
105 |
gccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattga |
154 |
Q |
| |
|
||||| | | || ||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
25213077 |
gccataattcattatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattga |
25213126 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
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| Q |
44 |
tttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaac |
142 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||| ||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| | |||| || || || ||| ||| |
|
|
| T |
19666495 |
tttacaaaaccaacaacaacaatccatttctcatcatcaaaacatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacgacaatatcacttagcaacaac |
19666594 |
T |
 |
| Q |
143 |
aacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattc-accaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
19666595 |
aacatcaattgaacatggttctcatcataattcaataacaacatagcataattcaaccatttgagcata |
19666663 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #25
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Query Start/End: Original strand, 7 - 89
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| Q |
7 |
acatcatcaaattcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccactaacaacaattca-tttcttgacaacaatcatga |
89 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
24827044 |
acatcatcaatatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaaccaccaacaacagctcattttctcaacaacaatcatga |
24826961 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 275
Target Start/End: Original strand, 24884643 - 24884885
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| Q |
34 |
atcaacccattttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgaca |
132 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || | |||||||| | ||| | ||||||| ||||||| |||| |||||| || |
|
|
| T |
24884643 |
atcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcctcatcaaatcatgatttatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaacaatatctat |
24884742 |
T |
 |
| Q |
133 |
tatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttc |
231 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||||||| | |||||| || |||||||||||| || |||| |||| |||||| || || ||||||| ||| ||||| || ||| |
|
|
| T |
24884743 |
tagcaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaataacatagcacaattcaacatttagagcata-actcacaatatatcactttc |
24884841 |
T |
 |
| Q |
232 |
tcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatc |
275 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24884842 |
acatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatc |
24884885 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #27
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Target Start/End: Complemental strand, 25265643 - 25265520
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| Q |
84 |
tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaa |
183 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||||||| | || | ||||||||| | || ||| ||||||||||||||| |||| || |||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
25265643 |
tcatgaat-atgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaa |
25265545 |
T |
 |
| Q |
184 |
caaagcataattcaccaattgagca |
208 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25265544 |
catagcaaaattcaccaattgagca |
25265520 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| Q |
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aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataac |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| | ||||| ||||||||| |||| |||||| || || || ||| ||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||| || |
|
|
| T |
23821846 |
aatcatgaattatgaacacccatgccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaat |
23821747 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattca |
197 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||| |
|
|
| T |
23821746 |
aacatagcacaattca |
23821731 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr2; HSP #29
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aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataac |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| | ||||| ||||||||| |||| |||||| || || || ||| ||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||| || |
|
|
| T |
23830925 |
aatcatgaattatgaacacccatgccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaat |
23830826 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattca |
197 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||| |
|
|
| T |
23830825 |
aacatagcacaattca |
23830810 |
T |
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Target: chr2; HSP #30
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tcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctc |
233 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||| || | ||||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
22775393 |
tcaacaacaacttcaattgaacatgaatcttatcacaattcaactacaacatagcataattcataaatttgaacaca-attcaacatatataactttctc |
22775295 |
T |
 |
| Q |
234 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || || |||||||||||||||| | | |||||||| ||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
22775294 |
atactttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacataacatcataa |
22775220 |
T |
 |
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| Q |
135 |
tcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctc |
233 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||| || | ||||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
22780771 |
tcaacaacaacttcaattgaacatgaatcttatcacaattcaactacaacatagcataattcataaatttgaacaca-attcaacatatataactttctc |
22780673 |
T |
 |
| Q |
234 |
atactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || || |||||||||||||||| | | |||||||| ||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
22780672 |
atactttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacataacatcataa |
22780598 |
T |
 |
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aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaa |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| | || |||||||||||| |||||||||| ||| || || ||| ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
24294764 |
aatcatgaattatgaatactcaagccatgaatcatcatcaacatcatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaa |
24294685 |
T |
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84 |
tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaa |
183 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||| ||||| || || ||| ||||||||||||||| |||| | |||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
19669348 |
tcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaataacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatggttcacatcataattcaacaacaa |
19669249 |
T |
 |
| Q |
184 |
caaagcataattc-accaattgagcat |
209 |
Q |
| |
|
|| | |||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
19669248 |
catatcataattcaaccaattaagcat |
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T |
 |
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99 |
acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcac |
198 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||| |||| |||||| || | || ||| ||||||||||||| | ||||| || |||||||||||| ||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
9636768 |
acccaaactatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaa |
9636867 |
T |
 |
| Q |
199 |
caatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatc |
275 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| |||| ||||| || ||| |||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9636868 |
caattagagcata-attcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatc |
9636944 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 24341584 - 24341519
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| Q |
143 |
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208 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| | |||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24341584 |
aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagca |
24341519 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 161
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161 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || || || ||| || |||||||| |||||| |
|
|
| T |
722401 |
aatcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaactacttcaattgaacatgaa |
722480 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0359 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:
Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 82 - 306
Target Start/End: Original strand, 1323 - 1547
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82 |
aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataac |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
1323 |
aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaatgatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaac |
1422 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataac |
281 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| | || ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1423 |
aacaaagcataattcaccaattaagcatattttcatcacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaaccaccaacaattcaattatccataac |
1522 |
T |
 |
| Q |
282 |
ttcatacatctaaacatgtcatcat |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1523 |
ttcatacatctaaacatgtcatcat |
1547 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 98 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 11876 - 11668
Alignment:
| Q |
98 |
aacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca |
197 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
11876 |
aacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaaca---attgatcatgaaacttttcacaattcatcaacaacaatgcataattca |
11780 |
T |
 |
| Q |
198 |
ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat--actttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaa |
295 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||| ||||| | || |||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11779 |
ctaattgagcatattttcaacacataccca-ttttcatacactttgaacatgtaattcaaccaagaacaattcaattattcataacttcatacatctaaa |
11681 |
T |
 |
| Q |
296 |
catgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| |
|
|
| T |
11680 |
catggcatcataa |
11668 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 47)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 82 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 20573433 - 20573207
Alignment:
| Q |
82 |
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181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
20573433 |
aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaac |
20573334 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataac |
281 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20573333 |
aacaaaggataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccttttcatacactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataac |
20573234 |
T |
 |
| Q |
282 |
ttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
20573233 |
ttcatacattcaaacatgtcatcataa |
20573207 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 58 - 308
Target Start/End: Original strand, 41246639 - 41246889
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| Q |
58 |
aacaacaattcatttcttgacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatc |
156 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41246639 |
aacaacatttcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaattgatc |
41246738 |
T |
 |
| Q |
157 |
atgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaac |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| | || || |||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
41246739 |
atgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattaagcata-tttcatcatatacccatttttcctacttttaacatgtaattcaac |
41246837 |
T |
 |
| Q |
257 |
taacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
41246838 |
caacaacaatttaattattcataacttcatacatctaaacatgacatcataa |
41246889 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 86 - 308
Target Start/End: Original strand, 20481615 - 20481837
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| Q |
86 |
atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaaca |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
20481615 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaattgatcatgcaacttatcacaattcatcaacaaca |
20481714 |
T |
 |
| Q |
186 |
aagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttca |
285 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
20481715 |
aagtataattcaccaattgagcatattatcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttca |
20481814 |
T |
 |
| Q |
286 |
tacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
20481815 |
tacattcaaacatgtcatcataa |
20481837 |
T |
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Back To:
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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 82 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 20654146 - 20653944
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| Q |
82 |
aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataac |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
20654146 |
aatcatgaatcatgcaaacccaagcaatgaattaacatcaacaacatgacctagcaacaacgacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaac |
20654047 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataac |
281 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20654046 |
aacttagcataattcaccaattaagcatattttcaatatataccaatttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataac |
20653947 |
T |
 |
| Q |
282 |
ttc |
284 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
20653946 |
ttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
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Target Start/End: Original strand, 37611675 - 37611900
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181 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
| T |
37611675 |
aatcatgaattatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaaccacatgacttaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacttttcacaattcatcaac |
37611773 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat--actttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccata |
279 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
37611774 |
aacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacacataccca-ttttcatacactttgaacatgtaattcaactaac-acaattcaattatttata |
37611871 |
T |
 |
| Q |
280 |
acttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37611872 |
acttcatacatctaaacatgtcatcataa |
37611900 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 82 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 20648070 - 20647882
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| Q |
82 |
aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataac |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
20648070 |
aatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattaacatcaacaacatgacctagcaacaacgacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaac |
20647971 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaa |
270 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20647970 |
aacatagcataattcaccaattaaacataatttcaacatataccaatttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaa |
20647882 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 82 - 308
Target Start/End: Original strand, 21681008 - 21681235
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| Q |
82 |
aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataac |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |
|
|
| T |
21681008 |
aatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacataccagtaacaacatcaattgatcatgaaactaatcacaattcaacaac |
21681107 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataa-ttcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataa |
280 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21681108 |
aacaaagcataatttaaccaattgagcatattttcaacatatacccttctctcatactttaaacatgaaattcaactaacaataattcaattatccataa |
21681207 |
T |
 |
| Q |
281 |
cttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
| |||||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
21681208 |
acttatacattcaaatatgtcatcataa |
21681235 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 144 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 20561810 - 20561646
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acatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaa |
243 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
20561810 |
acatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattaaacataatttcaacatataccaatttctcatactttgaa |
20561711 |
T |
 |
| Q |
244 |
catgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
20561710 |
catgtaattcaactaacaacaattcaattatctataacttcatacatccaaacatgtcatcataa |
20561646 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 58 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 19993320 - 19993070
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58 |
aacaacaattcatttcttgacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatc |
156 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
19993320 |
aacaacatctcatttctcaacaacaatccaagaattatgcaaaccctagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaattgatg |
19993221 |
T |
 |
| Q |
157 |
atgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat--actttgaacatgtgattca |
254 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | || |||| |||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
19993220 |
atgaaatttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttc-acacataccca-ttttcatacactttgaacaagtaattca |
19993123 |
T |
 |
| Q |
255 |
actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19993122 |
actaac-acaattcaattattcataacttcgtacatctaaacatgtcatcataa |
19993070 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 43 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 39447046 - 39446781
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43 |
ttttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaa |
141 |
Q |
| |
|
|||||| |||| || ||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| || |
|
|
| T |
39447046 |
ttttaccaaactaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcat-aatcatgcatacccaagccatgaattattatcaacaacatcacttagcaacaa |
39446948 |
T |
 |
| Q |
142 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattc-accaattgagcatattttcaacatataccaacttc-tcatactt |
239 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| | ||||| |||||||| |
|
|
| T |
39446947 |
caacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaatttagcata-tttcaacatataac-acttcttcatactt |
39446850 |
T |
 |
| Q |
240 |
tgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
39446849 |
taaacatgaaattccactaacaacaattcaattatccacaacttcaagcattcaaacatgtcatcataa |
39446781 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
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Target Start/End: Complemental strand, 22235038 - 22234819
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gaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaa |
187 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
22235038 |
gaattatgcaaacccaatccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaat |
22234939 |
T |
 |
| Q |
188 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat--actttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttca |
285 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | || |||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
22234938 |
gcataattcaccaattgagcatattttc-acacataccca-ttttcatacactttgagcatgtaattcaactaac-acaattaaattattcataacttca |
22234842 |
T |
 |
| Q |
286 |
tacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
22234841 |
tacatctaaacacgtcatcataa |
22234819 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 35 - 308
Target Start/End: Original strand, 38533607 - 38533881
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35 |
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133 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
38533607 |
tcaacccattttacaaagtctccaacaacatctcatttctcatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacct |
38533706 |
T |
 |
| Q |
134 |
atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttct |
232 |
Q |
| |
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| ||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
38533707 |
agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcataattcaataatttgagcata-tttcaacatataccattttct |
38533805 |
T |
 |
| Q |
233 |
catactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
38533806 |
catactttgaacatgagatttctctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataa |
38533881 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #13
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Target Start/End: Original strand, 23837163 - 23837430
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42 |
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140 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| | |||||| |||||||| |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||| | |
|
|
| T |
23837163 |
atttcacaaaaccaccaccaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaaca |
23837262 |
T |
 |
| Q |
141 |
acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
239 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
23837263 |
acaacatcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-gttcaacatatatcactttctcatactt |
23837361 |
T |
 |
| Q |
240 |
tgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| | ||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
23837362 |
tgaacatgaaatttcaataacaacaattcaattatcaacaacttcatgcatttaaacatatcatcataa |
23837430 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 50 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 41507091 - 41506930
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50 |
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148 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||| | |
|
|
| T |
41507091 |
aaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaatatgactaaacaacaacaacaac |
41506992 |
T |
 |
| Q |
149 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41506991 |
cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
41506930 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 42 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 21198434 - 21198167
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| Q |
42 |
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140 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||||| |||||||| | |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| || | || |||||| || || ||| | |
|
|
| T |
21198434 |
attttaccaaaccaccaacaacaactcatttctcatccacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcattaacagcaacatcacttagcaaca |
21198335 |
T |
 |
| Q |
141 |
acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
239 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
21198334 |
acaacatcaattgaacatgattcttaccacaattcaacaacaacataacataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactt |
21198236 |
T |
 |
| Q |
240 |
tgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| || |||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21198235 |
tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatctacaacttcatgcattcaaacatatcatcataa |
21198167 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 42 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24717152 - 24716983
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| Q |
42 |
attttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaa |
140 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| | || | |
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|
| T |
24717152 |
attttacaaaaccaccaacaacaatccatttatcaacaacaaattatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacatca |
24717053 |
T |
 |
| Q |
141 |
acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24717052 |
acaacaaccattgaacatgaaacaaatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
24716983 |
T |
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Target: chr8; HSP #17
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Query Start/End: Original strand, 154 - 308
Target Start/End: Original strand, 22981351 - 22981505
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| Q |
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252 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
22981351 |
atcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatataccactttctcatactttgaacatgaaatt |
22981449 |
T |
 |
| Q |
253 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
22981450 |
tctctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataa |
22981505 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 308
Target Start/End: Original strand, 26011452 - 26011726
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| Q |
35 |
tcaacccattttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacat |
133 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||| || ||| |||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || || | |
|
|
| T |
26011452 |
tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaacttaattctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt |
26011551 |
T |
 |
| Q |
134 |
atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttct |
232 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||||| | |||||| || |||||||||||| ||||||| |||| |||||| || || ||||||| ||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
26011552 |
agcaacaacaacatcaattcaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcata-attcaacatataacactttca |
26011650 |
T |
 |
| Q |
233 |
catactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
26011651 |
catactttgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataa |
26011726 |
T |
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Target: chr8; HSP #19
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Query Start/End: Original strand, 82 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 20567399 - 20567329
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| Q |
82 |
aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaatt |
152 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
20567399 |
aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt |
20567329 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 82 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 20573592 - 20573522
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| Q |
82 |
aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaatt |
152 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
20573592 |
aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt |
20573522 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #21
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Query Start/End: Original strand, 35 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 22736127 - 22735958
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| Q |
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133 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| | ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| | | |
|
|
| T |
22736127 |
tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttttcatcaacaattcatgaattatgcacacccaagccatgaattaacaacaacaacatcagtt |
22736028 |
T |
 |
| Q |
134 |
atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt |
203 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||| || |||||||| ||||| |
|
|
| T |
22736027 |
agcaagaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaatccaacaacaacatagtataattcatcaatt |
22735958 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #22
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185 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| || || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
274453 |
atgattcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaataacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacc |
274552 |
T |
 |
| Q |
186 |
aagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
274553 |
atgcataattcaccaattgaacata |
274577 |
T |
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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 641396 - 641272
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atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaaca |
185 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| || || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
641396 |
atgattcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaataacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacc |
641297 |
T |
 |
| Q |
186 |
aagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
641296 |
atgcataattcaccaattgaacata |
641272 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 827202 - 827078
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86 |
atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaaca |
185 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| || || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
827202 |
atgattcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaataacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacc |
827103 |
T |
 |
| Q |
186 |
aagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
827102 |
atgcataattcaccaattgaacata |
827078 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 308
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133 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| || | |||||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || || | |
|
|
| T |
5854572 |
tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaattctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt |
5854671 |
T |
 |
| Q |
134 |
atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttct |
232 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||| |||| || ||| || || ||||||| ||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
5854672 |
agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaactcaacatttagagcata-attcaacatataacactttca |
5854770 |
T |
 |
| Q |
233 |
catactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
5854771 |
tatactttgaacatgctatttcaccaacaacaattcaattatcgccaatttcatgcattcaaacatatcatcataa |
5854846 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #26
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Query Start/End: Original strand, 86 - 210
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185 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||||||| ||||| |||| | ||||| || || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
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atgaatcatgcatatccaagccataaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacc |
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T |
 |
| Q |
186 |
aagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
16039026 |
atgcataattcactaattgagcata |
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T |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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20567240 |
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T |
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atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaaca |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| | ||||| | ||| ||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
39115285 |
atgaatcatgcatacacaagtcatgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacgattcatcaacaact |
39115384 |
T |
 |
| Q |
186 |
aagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39115385 |
atgcataattcaccaattgagcata |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcac |
198 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| |||||| || || || ||| ||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||| ||||||| | || |||||| |
|
|
| T |
15933321 |
acccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacataacacaattcaa |
15933420 |
T |
 |
| Q |
199 |
caatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaaca |
297 |
Q |
| |
|
|| || ||||||| |||||||| || || ||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
15933421 |
catttagagcata-attcaacatttaacactttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaaca |
15933519 |
T |
 |
| Q |
298 |
tgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |
|
|
| T |
15933520 |
tatcatcataa |
15933530 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #30
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158 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
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aatcatgaatcatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacatctattgatcat |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #31
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| Q |
252 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatca |
305 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25122618 |
tcaactagcaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatca |
25122671 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #32
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Target Start/End: Original strand, 17285341 - 17285436
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| Q |
213 |
ttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
17285341 |
ttcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcatttaaacatatcatcataa |
17285436 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #33
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| Q |
82 |
aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataac |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || || || ||| ||||||||||||||| |||| || |||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
23226317 |
aatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaac |
23226218 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattca |
197 |
Q |
| |
|
|||| | ||||||||| |
|
|
| T |
23226217 |
aacataacataattca |
23226202 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 275
Target Start/End: Original strand, 29306450 - 29306616
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| Q |
109 |
tgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaa-ttgagc |
207 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||| || || || ||| ||||||||||||| | |||||| || |||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
29306450 |
tgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagc |
29306549 |
T |
 |
| Q |
208 |
atattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatc |
275 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| || ||| || ||||||||||| | | || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29306550 |
ata-attcaacatatatcattttcacaaactttgaacatacaaattcaccaacaacaattcaattatc |
29306616 |
T |
 |
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Target: chr8; HSP #35
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| Q |
29 |
tcattatcaacccatttt-acaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaac |
126 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| || ||| ||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
29759893 |
tcataatcaacccatttacaccaaaacaccaacaacaaaccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatatatcatcatcaacaat |
29759992 |
T |
 |
| Q |
127 |
atgac |
131 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
29759993 |
atgac |
29759997 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #36
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Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 33528383 - 33528546
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| Q |
34 |
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132 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| || | |||||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| ||| || || | |
|
|
| T |
33528383 |
atcaacccattttacaaaatcaacaacaacaacccatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaa-aatatctct |
33528481 |
T |
 |
| Q |
133 |
tatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca |
197 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||||||| | |||||| || |||||||||||| ||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
33528482 |
tagcaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattca |
33528546 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #37
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58 |
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157 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| || || ||| ||| ||| ||||||| || |
|
|
| T |
15969800 |
aacaacaactcatttctcctctacaatcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcaatagcaacatcacttaacaacaactacaccaattgaaca |
15969899 |
T |
 |
| Q |
158 |
tgaa |
161 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
15969900 |
tgaa |
15969903 |
T |
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Target: chr8; HSP #38
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84 |
tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaa |
183 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||| ||| |||| |||||||||| || | || |||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
23152072 |
tcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacatagcaacaacagcatcaattgaacacggttctcatcataattcaacaacaa |
23151973 |
T |
 |
| Q |
184 |
caaagcataattca |
197 |
Q |
| |
|
|| | ||||||||| |
|
|
| T |
23151972 |
catatcataattca |
23151959 |
T |
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Target: chr8; HSP #39
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acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcac |
198 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||| |||||| || | || ||| ||||||||||||| | ||||| || |||||||||||| ||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
45559161 |
acccaagctatgaatcatcaacaacaatatcccttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaa |
45559062 |
T |
 |
| Q |
199 |
caatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatc |
275 |
Q |
| |
|
||||| ||||| | |||| ||||| || ||| |||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45559061 |
caattagagcaca-attcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatc |
45558985 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 18261695 - 18261591
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| Q |
99 |
acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcac |
198 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||| |||||| || | || ||| ||||||||||||| | ||||| || |||||||||||| ||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
18261695 |
acccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaa |
18261596 |
T |
 |
| Q |
199 |
caatt |
203 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
18261595 |
caatt |
18261591 |
T |
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Target: chr8; HSP #41
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| Q |
86 |
atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcat |
158 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | || || || || ||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
24385988 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataaaatcacttaacaacaacaacatctattgatcat |
24385916 |
T |
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Target: chr8; HSP #42
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Target Start/End: Original strand, 23158169 - 23158295
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82 |
aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataac |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||| | ||||| |||| || |||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
23158169 |
aatcatgaattatgaacacccaagccatga---atcatcaacaacatcacttaggaacaacaacaactattgaacatggttctcatcataattcaacaac |
23158265 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattc-accaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
|||| | |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
23158266 |
aacataacataattcaaccaattgagcata |
23158295 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
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Target Start/End: Complemental strand, 27233308 - 27233205
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| Q |
82 |
aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataac |
181 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || | || ||| ||||||||||||| | ||||| || |||||||||||| ||| |
|
|
| T |
27233308 |
aatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaac |
27233209 |
T |
 |
| Q |
182 |
aaca |
185 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
27233208 |
aaca |
27233205 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 33611274 - 33611179
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| Q |
102 |
caagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca |
197 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| |||||| || || || ||| ||||||||||||| | |||| || | |||||||||| ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
33611274 |
caagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattaaacatggttctcaacacaattcaacaacaacatagcataattca |
33611179 |
T |
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Target: chr8; HSP #45
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Target Start/End: Original strand, 2544916 - 2545024
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| Q |
42 |
attttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaa |
141 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||| ||| || | |||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
2544916 |
atttcacaaaaccactaacaacagtccatttctcaacaacaatcatgatatatcaacacccaagccat-aatcataaacaacaacatg---tatcaacaa |
2545011 |
T |
 |
| Q |
142 |
caacatcaattga |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
2545012 |
caacatcaattga |
2545024 |
T |
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Back To:
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Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
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Target Start/End: Complemental strand, 22497399 - 22497329
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| Q |
133 |
tatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt |
203 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| | |||||| || ||||||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
22497399 |
tatcaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaatt |
22497329 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 38635885 - 38635768
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| Q |
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atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaaca |
185 |
Q |
| |
|
|||| ||||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || | || ||| ||||||||||||| | ||||| || |||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
38635885 |
atgattcatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaaca |
38635786 |
T |
 |
| Q |
186 |
aagcataattcaccaatt |
203 |
Q |
| |
|
| || |||||| ||||| |
|
|
| T |
38635785 |
taacacaattcaacaatt |
38635768 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 37)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 29 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 1168500 - 1168219
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29 |
tcattatcaacccatttt-acaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaac |
126 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| | ||| ||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1168500 |
tcataatcaacccattttcatcaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaac |
1168401 |
T |
 |
| Q |
127 |
atgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatatacca |
226 |
Q |
| |
|
||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
1168400 |
atgacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacattgcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatca |
1168301 |
T |
 |
| Q |
227 |
acttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
1168300 |
ttttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaaccattctattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataa |
1168219 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 58 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 11337451 - 11337201
Alignment:
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58 |
aacaacaattcatttcttgacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatca |
157 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11337451 |
aacaacatctcatttctcaacaacaatcatgaatcatgtaaactcaagccatgaattatcatcaacgacatgacttagcaacaacaacatcaattgatca |
11337352 |
T |
 |
| Q |
158 |
tgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaact |
257 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
11337351 |
tgaaacttatcacaattcatcaacaacataacataattcaccaaatgagcatattttcaacatttaccatattctcatactttgaacatgtaattcaact |
11337252 |
T |
 |
| Q |
258 |
aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
11337251 |
aacaacaattcaattattcataacttcatacatccaaacatatcatcataa |
11337201 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 8 - 308
Target Start/End: Original strand, 11583982 - 11584286
Alignment:
| Q |
8 |
catcatcaaattcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaatcatgaatcatgc-aaacccaagc |
106 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
11583982 |
catcatcaaaaacaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaaccacgaacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaaacccaagc |
11584081 |
T |
 |
| Q |
107 |
catgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaatt---caataacaacaaagcataattcaccaatt |
203 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | ||||| | ||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11584082 |
catgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcaacaacaacaacaaagcataattcaccaatt |
11584181 |
T |
 |
| Q |
204 |
gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcat |
303 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
11584182 |
gagcatattttcaacatatacccttttcatacacttgaaacatgaatttcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatccaaatatgtcat |
11584281 |
T |
 |
| Q |
304 |
cataa |
308 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
11584282 |
cataa |
11584286 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 86 - 308
Target Start/End: Original strand, 20712086 - 20712308
Alignment:
| Q |
86 |
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185 |
Q |
| |
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| T |
20712086 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaattgatcatgcaacttatcacaattcatcaacaaca |
20712185 |
T |
 |
| Q |
186 |
aagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttca |
285 |
Q |
| |
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| T |
20712186 |
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20712285 |
T |
 |
| Q |
286 |
tacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
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20712286 |
tacatctaaacatgtcatcataa |
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T |
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Q |
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T |
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182 |
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281 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
24183273 |
aacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatatacccttttcatacactttgaacatgtaattcgactaacaacaattcaattatccatgac |
24183174 |
T |
 |
| Q |
282 |
ttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
24183173 |
ttcatacatccaaacatgtcatcataa |
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T |
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Target: chr5; HSP #6
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Q |
| |
|
|||||| ||| ||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |
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19405503 |
ttttaccaaaacaccaacaacatctcatttctccacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacataccagtaa |
19405602 |
T |
 |
| Q |
142 |
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240 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
19405603 |
caatatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacgaatcataattcaactaattgagcatattttcaacatatacccttttctcatacttt |
19405702 |
T |
 |
| Q |
241 |
gaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |
|
|
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19405703 |
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T |
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Q |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
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|
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catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaataacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaac |
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T |
 |
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aacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat--actttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccata |
279 |
Q |
| |
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||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |
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|
| T |
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aacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacataccca-ttttcatacactttgaacatgtaattcaactaac-acaattcaattattcata |
21397295 |
T |
 |
| Q |
280 |
acttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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21397296 |
acttcatacatctaaacatgtcatcataa |
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T |
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Q |
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|
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| T |
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gaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcagcaacatgactaaacaacaacaacaacaattgatcataaaacatatcacaatttatcaacaacaat |
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T |
 |
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286 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
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gcataattcaccaattgagcatattttcacacatat------ttttcatactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcat |
28261726 |
T |
 |
| Q |
287 |
acatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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acatctaaacatgtcatcataa |
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T |
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187 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |
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|
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T |
 |
| Q |
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gcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat--actttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttca |
285 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | || |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |
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|
| T |
24475690 |
gcataattcaccaattgagcatattttc-acacataccca-ttttcatacactttgaacatgtaattcaactaac-acaattcaattattcataacttca |
24475786 |
T |
 |
| Q |
286 |
tacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
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24475787 |
tacatctaaacatgtcatcataa |
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T |
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Target: chr5; HSP #10
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Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |
|
|
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4865274 |
gaattatgcaaacccaagccatgaaattatcatcaacaacatgaataaacaaccataacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaaccacaa |
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T |
 |
| Q |
187 |
agcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcat |
286 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
4865374 |
tgcataattcaccaattgagcatattttcaccc-atacccatttttcatactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcat |
4865472 |
T |
 |
| Q |
287 |
acatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4865473 |
acatctaaacatgtcatcataa |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
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T |
 |
| Q |
185 |
aaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttc |
284 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21906826 |
atagcataattcatcaattgaacatattt------------------tcatactttgaacatgtaattcaaccaacatcaattcaattatccataacttc |
21906907 |
T |
 |
| Q |
285 |
atacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||| |
|
|
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21906908 |
atatgtctaaacatgtcatcataa |
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|
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|
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caaacccaagccatgaattatcatcaacatcatgactaaacaacaacagcaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacgatacataatt |
21646867 |
T |
 |
| Q |
196 |
caccaattgagcatattttca-acatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaa |
294 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||| | ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21646866 |
caccaattgaacatattttcatacata-cccattttcatacacttttaacatgtaattcaactaac-acaattcaattattcataacttcatacatctaa |
21646769 |
T |
 |
| Q |
295 |
acatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
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21646768 |
acatgtcatcataa |
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|
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tcaacccatttttcaaagtcaccaacaacacctcatctctcaccaacaattcatgaattatgcacacccaagcgataaattatcatcaacaacatcactt |
7728477 |
T |
 |
| Q |
134 |
atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttct |
232 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| || |||| |
|
|
| T |
7728478 |
agcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttct |
7728576 |
T |
 |
| Q |
233 |
catactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatc |
275 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
7728577 |
catactttgaacatgaaatttcaccaacaacaaatcaattatc |
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|
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T |
 |
| Q |
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aacaaagcataattc-accaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataa |
280 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| | | ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||| || |
|
|
| T |
23494025 |
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23494123 |
T |
 |
| Q |
281 |
cttcatacatctaaacatgtcatcata |
307 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
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23494124 |
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|
||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||| | |
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|
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aaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaatatgactaaacaacaacaacaac |
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T |
 |
| Q |
149 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
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cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
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T |
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caa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaaca |
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Q |
| |
|
||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||| || || ||||| |
|
|
| T |
3673985 |
caatttgagcata-tttcaacatataccactttctcatactttgatcatgaaatttccctaacaacaattcaattatcaacaacttaatgtattcaaaca |
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T |
 |
| Q |
298 |
tgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |
|
|
| T |
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tatcatcataa |
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Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||||||||| || || ||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |
|
|
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5451065 |
ccaagccaagaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcagttgaacatgaattttatcacaattcaacaacaacatagcataattcatca |
5450966 |
T |
 |
| Q |
201 |
a-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatg |
299 |
Q |
| |
|
| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
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atttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacata |
5450867 |
T |
 |
| Q |
300 |
tcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
5450866 |
acatcataa |
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T |
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Q |
| |
|
|||||||||| ||| | ||||||| ||||||| |||| ||| || || || || ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
19862215 |
aatcatgaattatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaataatatcacttagcaacaacaacatcaattgcacatgattcttatcacaattcaacaac |
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T |
 |
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aacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataa |
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Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
19862315 |
aacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaa |
19862413 |
T |
 |
| Q |
281 |
cttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
19862414 |
cttcatgcattcaaacatatcatcataa |
19862441 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
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Target Start/End: Original strand, 11342635 - 11342819
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29 |
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126 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
11342635 |
tcataatcaacccattttcaccaagacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatatatcatcatcaacaat |
11342734 |
T |
 |
| Q |
127 |
atgacatatcaaa-aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
||||| | |||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11342735 |
atgactaaacaaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
11342819 |
T |
 |
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Target: chr5; HSP #20
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185 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| |||||||||| ||| | ||||| || || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
21650705 |
atgaatcatgcatacccaaaccatgaattagcattcataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacc |
21650804 |
T |
 |
| Q |
186 |
aagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21650805 |
atgcataattcaccaattgagcata |
21650829 |
T |
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Target: chr5; HSP #21
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| Q |
82 |
aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaa |
177 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23466463 |
aatcatgaatcatgcatacccaagccatgaactatcatcaacatcatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaa |
23466558 |
T |
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Target: chr5; HSP #22
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141 |
Q |
| |
|
|||||| |||| || ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||| | || ||| | |
|
|
| T |
16595474 |
ttttaccaaactaccaacaacatctcatttctcatcaacaattcatgaatcatgcacacccaagtcatgaattatcaataacatcatcatttaacaacat |
16595573 |
T |
 |
| Q |
142 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttg |
241 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| |||||| || | || ||||||| | ||||| | |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
16595574 |
ctacatcaattgaacatgaatctcaacataattcaacatcaacataacataattcacaatttgagcatattt-caacatataccactttctcatactttg |
16595672 |
T |
 |
| Q |
242 |
aacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||| |||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
16595673 |
aacatgaaatttctctatcaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataa |
16595739 |
T |
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Target: chr5; HSP #23
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181 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||| | |||||||||| |||| |||| |||||| || || || ||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||| ||| |
|
|
| T |
432469 |
aatcataaattatgaatacccaagccaggaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaatccaacaac |
432568 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataa |
280 |
Q |
| |
|
|||| || |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
432569 |
aacatagtataattcatcaatttgagcata-attcaacatatatcattttctcatactttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaa |
432667 |
T |
 |
| Q |
281 |
cttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|| ||| ||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
432668 |
ctacatgcattcaaacatatcatcataa |
432695 |
T |
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Target: chr5; HSP #24
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| Q |
86 |
atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaaca |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| || || ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
21204936 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattagaataaataacatcacttaacaacaacaacaaatattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacc |
21205035 |
T |
 |
| Q |
186 |
aagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21205036 |
atgcataattcaccaattgagcata |
21205060 |
T |
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Target: chr5; HSP #25
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105 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| | ||||||| |
|
|
| T |
109158 |
acatcatcaaaatcaaacttcttctctatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaag |
109059 |
T |
 |
| Q |
106 |
ccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattga |
154 |
Q |
| |
|
|||| | | || ||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
109058 |
ccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattga |
109010 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 154
Target Start/End: Original strand, 16105573 - 16105721
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| Q |
7 |
acatcatcaaattcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccactaacaacaattca-tttcttgacaacaatcatgaatcatgcaaacccaag |
105 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| | ||| ||| |
|
|
| T |
16105573 |
acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacctaag |
16105672 |
T |
 |
| Q |
106 |
ccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattga |
154 |
Q |
| |
|
|||| | | || ||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
16105673 |
ccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattga |
16105721 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #27
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| Q |
82 |
aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataac |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| | ||||||||||||||| | || |||||| || || || ||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||| |
|
|
| T |
21617022 |
aatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcaacaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaac |
21617121 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataa |
280 |
Q |
| |
|
|||| || | |||||| || || ||||||| ||||||||||| || ||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||| || |
|
|
| T |
21617122 |
aacatagaacaattcaacatttagagcata-gttcaacatataacactttcatatacttggaacatgcaatttcactaacaacaatccaattatcaccaa |
21617220 |
T |
 |
| Q |
281 |
cttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21617221 |
tttcatgcattcaaacatatcatcataa |
21617248 |
T |
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Target: chr5; HSP #28
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238 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
28902255 |
aacaacttcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattgatcaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatact |
28902353 |
T |
 |
| Q |
239 |
ttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||| | || || |||||||||||||||||| | ||||| || ||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
28902354 |
ttgaacacgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataa |
28902423 |
T |
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238 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
28938650 |
aacaacttcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattgatcaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatact |
28938748 |
T |
 |
| Q |
239 |
ttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||| | || || |||||||||||||||||| | ||||| || ||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
28938749 |
ttgaacacgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataa |
28938818 |
T |
 |
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Target: chr5; HSP #30
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Target Start/End: Complemental strand, 21222825 - 21222623
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| Q |
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ccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-g |
204 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||| || || || ||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| | || || | |
|
|
| T |
21222825 |
ccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacattaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcacaattaaacatttag |
21222726 |
T |
 |
| Q |
205 |
agcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatc |
304 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||| || ||||| ||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
21222725 |
agcata-attcaacatataacactttcatatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaatttaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatc |
21222627 |
T |
 |
| Q |
305 |
ataa |
308 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
21222626 |
ataa |
21222623 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #31
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34 |
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132 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | ||||| || |||||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || || |
|
|
| T |
23981806 |
atcaacccattctcacaaaaccaataacaacaacttatttcacatcacaaatcatgagttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcact |
23981707 |
T |
 |
| Q |
133 |
tatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattc-accaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||||||||| |||| || |||| ||||||| ||||||| | |||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
23981706 |
tagcaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatatcataattcaaccatttgagcata |
23981628 |
T |
 |
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Target: chr5; HSP #32
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8 |
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Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24225634 |
catcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccatttt |
24225596 |
T |
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Target: chr5; HSP #33
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82 |
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181 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||| |||| | || | || ||| ||||||||||||| | ||||| || |||||||||||| ||| |
|
|
| T |
6456630 |
aatcatgattcatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacgatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaac |
6456729 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattcaccaatt |
203 |
Q |
| |
|
|||| | || |||||| ||||| |
|
|
| T |
6456730 |
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T |
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aacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagca |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| | |||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22054028 |
aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagca |
22053963 |
T |
 |
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| Q |
143 |
aacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattga |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| | |||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
18531262 |
aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattga |
18531200 |
T |
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35 |
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127 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
32966436 |
tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttctcatcaaccaattatgaattatgcacgctcaagccatgaattatcaataacaaca |
32966343 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #37
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197 |
accaattgagcatattttcaacatataccaactt-ctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaa |
295 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
23466558 |
accaattgagcatattt-caacatacaccatttttctcatactttgatcatgaagtttcaccaacaacaattcaattat-cataacttcttacatacaaa |
23466655 |
T |
 |
| Q |
296 |
catgt |
300 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
23466656 |
catgt |
23466660 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0014 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:
Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 82 - 305
Target Start/End: Original strand, 85338 - 85561
Alignment:
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aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataac |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
85338 |
aatcatgaatcatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaac |
85437 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataac |
281 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
85438 |
aacctagcataattcaccaattaagcatattttcaatatataccaatttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataac |
85537 |
T |
 |
| Q |
282 |
ttcatacatctaaacatgtcatca |
305 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
85538 |
ttcatacatccaaacatgtcatca |
85561 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 50 - 308
Target Start/End: Original strand, 159275 - 159532
Alignment:
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50 |
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148 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || | || ||| ||||||||| |
|
|
| T |
159275 |
aaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccaaaaattatcatcaacatca---cttagcaacaacaacatc |
159371 |
T |
 |
| Q |
149 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatg |
247 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
159372 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaacatcaacatagcataattcaaccaattgagcataatttcaactcatatcattttctcatactttgaacatg |
159471 |
T |
 |
| Q |
248 |
tgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
159472 |
aaattcaactaacaacaatgccattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataa |
159532 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 71)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 86 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 12349781 - 12349554
Alignment:
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86 |
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180 |
Q |
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|
||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
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12349781 |
atgaatcatgcaaaccatggccaagccatgatttatcatctacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaa |
12349682 |
T |
 |
| Q |
181 |
caacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataa |
280 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12349681 |
caacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataacaacttctcacactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataa |
12349582 |
T |
 |
| Q |
281 |
cttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12349581 |
atttatacatctaaacatgtcatcataa |
12349554 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 87 - 308
Target Start/End: Original strand, 8631801 - 8632022
Alignment:
| Q |
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tgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaa |
186 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||| |
|
|
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8631801 |
tgaatcatgcaaacccaagccatgaatgatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatttgttatgaaacttatcacaatccaacaacaacaa |
8631900 |
T |
 |
| Q |
187 |
agcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcat |
286 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8631901 |
agcataattcactaaataagcatattttcaacatataccaacttctcaaactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcat |
8632000 |
T |
 |
| Q |
287 |
acatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
8632001 |
acatccaaacatgtcatcataa |
8632022 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 82 - 308
Target Start/End: Original strand, 35123702 - 35123927
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| Q |
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181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35123702 |
aatcatgaatcatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataac |
35123801 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac-tttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataa |
280 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35123802 |
aacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacc--cttttcatacactttaacatgtaattcgactaacaacaattcaattatccataa |
35123899 |
T |
 |
| Q |
281 |
cttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
35123900 |
tttcatacatccaaacacgtcatcataa |
35123927 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 82 - 308
Target Start/End: Original strand, 14298427 - 14298653
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| Q |
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181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
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aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatattaataacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcgacaac |
14298526 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataac |
281 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | || | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14298527 |
aacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacacgtaaccatatcatacactttgaacatgtaattcaactaaccacaattcaattatccataac |
14298626 |
T |
 |
| Q |
282 |
ttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
14298627 |
ttcatacatccaaacatgtcatcataa |
14298653 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 82 - 308
Target Start/End: Original strand, 14304054 - 14304280
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| Q |
82 |
aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataac |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
14304054 |
aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatattaataacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcgacaac |
14304153 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataac |
281 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | || | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14304154 |
aacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacacgtaaccatatcatacactttgaacatgtaattcaactaaccacaattcaattatccataac |
14304253 |
T |
 |
| Q |
282 |
ttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
14304254 |
ttcatacatccaaacatgtcatcataa |
14304280 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 82 - 308
Target Start/End: Original strand, 54424018 - 54424244
Alignment:
| Q |
82 |
aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataac |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| | || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
54424018 |
aatcatgaatcatgcatacccaagccatgaataatcatccacaacgtcacttagcaataacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaac |
54424117 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataac |
281 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54424118 |
aacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatcaatttctcatactttgaacatgtaattcaactaaccacaattcaattatccataac |
54424217 |
T |
 |
| Q |
282 |
ttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
54424218 |
ttcatacatctaaacatggcatcataa |
54424244 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 85 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 50112289 - 50112066
Alignment:
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catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaac |
184 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
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catgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaac |
50112190 |
T |
 |
| Q |
185 |
aaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttc |
284 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
50112189 |
aatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttc |
50112090 |
T |
 |
| Q |
285 |
atacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
50112089 |
atacatctaaacatggcatcataa |
50112066 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 58 - 308
Target Start/End: Original strand, 14295419 - 14295671
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156 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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aacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagaaacaacaacatcaattgatc |
14295518 |
T |
 |
| Q |
157 |
atgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattc-accaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaa |
255 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
14295519 |
atgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacatataccattttctcatactttgaacatgaatttcaa |
14295618 |
T |
 |
| Q |
256 |
ctaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
14295619 |
ctaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgacatcataa |
14295671 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 86 - 308
Target Start/End: Original strand, 17100663 - 17100885
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Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| || || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
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atgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaataacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaca |
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T |
 |
| Q |
186 |
aagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttca |
285 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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tagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatgtttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttca |
17100862 |
T |
 |
| Q |
286 |
tacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17100863 |
tacatctaaacatgtcatcataa |
17100885 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 86 - 308
Target Start/End: Original strand, 17101348 - 17101570
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| Q |
86 |
atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaaca |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| || || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
17101348 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaataacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaca |
17101447 |
T |
 |
| Q |
186 |
aagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttca |
285 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17101448 |
tagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatgtttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttca |
17101547 |
T |
 |
| Q |
286 |
tacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17101548 |
tacatctaaacatgtcatcataa |
17101570 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 82 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 53898696 - 53898470
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181 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
53898696 |
aatcatgaatcttgcaaacccaagccatgaattatcaccaacaacatgacatatcaacaacaacattaattgatcatgaaacttatcacaatgcaacaac |
53898597 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat--actttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccata |
279 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||| ||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
53898596 |
aacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacataccca-ttttcatacactttgaacatttaatgcaactaac-acaattcaattattcata |
53898499 |
T |
 |
| Q |
280 |
acttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53898498 |
acttcatagatctaaacatgtcatcataa |
53898470 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 85 - 308
Target Start/End: Original strand, 14301074 - 14301298
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85 |
catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaac |
184 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
14301074 |
catgaatcatgcaaaccaaagacatgaataatcatcaacaacatcacttagaaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaac |
14301173 |
T |
 |
| Q |
185 |
aaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataactt |
283 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14301174 |
atagcataattcaaccaattgagcatattttcaacatataccattttctcatactttgaacatgaatttcaactaacaacaattcaattatccataactt |
14301273 |
T |
 |
| Q |
284 |
catacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
14301274 |
catacattcaaacatgacatcataa |
14301298 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 38 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 17523176 - 17522904
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38 |
acccatttt-acaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacat-gacatat |
135 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||| ||| ||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |
|
|
| T |
17523176 |
acccattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacacaaatcataaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaaaattgacttag |
17523077 |
T |
 |
| Q |
136 |
caaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat |
235 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || |
|
|
| T |
17523076 |
caacaacaacatcaattggtcatgaaacttatcacaattcatcaataacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccattttgttat |
17522977 |
T |
 |
| Q |
236 |
actttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
17522976 |
actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccacatcttcatacatccaaaactgtcatcataa |
17522904 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 55 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 19261108 - 19260854
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55 |
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153 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||||| | ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||| | || ||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
19261108 |
actaacaacaacttatttcataacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacattcataacatcatttaacaacaacaacatctattg |
19261009 |
T |
 |
| Q |
154 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattc |
253 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
19261008 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaacttagtataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattc |
19260909 |
T |
 |
| Q |
254 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
19260908 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatatcatcataa |
19260854 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 85 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 22144510 - 22144287
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184 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
22144510 |
catgaatcatgcaaacccaagccatgtattatcatcaacaacatggcttaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaac |
22144411 |
T |
 |
| Q |
185 |
aaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat--actttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataact |
282 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22144410 |
aatgcatacttcaccaattgagcatattttcaacacataccca-ttttcatacactttgaacatgtaattcaactaac-acaattcaattattcataact |
22144313 |
T |
 |
| Q |
283 |
tcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22144312 |
tcatacatctaaacatgtcatcataa |
22144287 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #16
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Target Start/End: Original strand, 17938582 - 17938805
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183 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
17938582 |
tcatgaatcatgtaaacccaagccatgaatgattatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaaataaccacaatccaacaacaa |
17938681 |
T |
 |
| Q |
184 |
caaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataactt |
283 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |
|
|
| T |
17938682 |
caaagcataattcatcaattaagcatattttcaacatatatcaacttctcatactttgaacatgcaattcaactaacaacaattcgcttaaccat-gctt |
17938780 |
T |
 |
| Q |
284 |
catacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
17938781 |
tatacatccaaacatgtcaccataa |
17938805 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 50 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 55441123 - 55440863
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50 |
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148 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || || || ||||||||| |
|
|
| T |
55441123 |
aaaccaccaacaacatctcatttctcaacaaaaaatcatgaattatgcatacccaagtcatgaattatcatcaacaacatcacttagcatcaacaacatc |
55441024 |
T |
 |
| Q |
149 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatg |
247 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55441023 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaaccacaacatagtataattcaaccagttgagcatattttcatcatatatcattttctcatactttgaacatg |
55440924 |
T |
 |
| Q |
248 |
tgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
55440923 |
aaattccactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataa |
55440863 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #18
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Target Start/End: Complemental strand, 16996294 - 16996075
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gaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaa |
187 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
16996294 |
gaattatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaat |
16996195 |
T |
 |
| Q |
188 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcata |
287 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | || ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
16996194 |
gcataattcaccaattgagcatattttc-acacatacccatttttcatactttgaacatacaattcaagtaacaacaattcaatcattcataacttcata |
16996096 |
T |
 |
| Q |
288 |
catctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16996095 |
catctaaacatgtcatcataa |
16996075 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 58 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 19570953 - 19570707
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| Q |
58 |
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157 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
19570953 |
aacaacatctcatttctcaacaacaaccaagaattatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaattgatca |
19570854 |
T |
 |
| Q |
158 |
tgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatatac-caacttctcatactttgaacatgtgattcaac |
256 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||| | ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
19570853 |
tgaaacttatcacaattcaccaacaacaatgcataattcaccaattgagcata-tttccacatatactcattttcatacactttgaacatgtaattcaac |
19570755 |
T |
 |
| Q |
257 |
taacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatca |
305 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19570754 |
taac-acaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatca |
19570707 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
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Target Start/End: Complemental strand, 6154567 - 6154346
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185 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |
|
|
| T |
6154567 |
atgaatcatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaataacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaataaca |
6154469 |
T |
 |
| Q |
186 |
aagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat--actttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataactt |
283 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||| || |
|
|
| T |
6154468 |
atgcataattcaccaattgagcatattttcaacacataccca-ttttcataaactttgaacatgtaattcaactaac-acaattcaactattcataattt |
6154371 |
T |
 |
| Q |
284 |
catacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
6154370 |
catacatctaaacatgtcattataa |
6154346 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 96 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 317735 - 317525
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195 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
317735 |
caaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataatt |
317636 |
T |
 |
| Q |
196 |
caccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaa |
295 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| ||| ||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
317635 |
caccaatttagcatattttc-acacatacccatttttcatactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaa |
317537 |
T |
 |
| Q |
296 |
catgtcatcata |
307 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
317536 |
catgtcatcata |
317525 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr3; HSP #22
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Query Start/End: Original strand, 7 - 210
Target Start/End: Original strand, 33341812 - 33342015
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106 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33341812 |
acataatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc |
33341911 |
T |
 |
| Q |
107 |
catgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgag |
206 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | ||||| | ||| ||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33341912 |
catgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcataattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag |
33342011 |
T |
 |
| Q |
207 |
cata |
210 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
33342012 |
cata |
33342015 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
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Target Start/End: Complemental strand, 6146986 - 6146764
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aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataac |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
6146986 |
aatcatgaatcatg-aaacccaagccatgaattattatcaacaacatgacttaacaacaacagcaacaattgaccatgaaacttatcacaattcatcaac |
6146888 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat--actttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccata |
279 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
6146887 |
aacaatgcatgattcaccaattgagcatattttcaacacataccca-ttttcatacactttgaacatgtaattcaactaa-tacaattcaattattcata |
6146790 |
T |
 |
| Q |
280 |
acttcatacatctaaacatgtcatca |
305 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6146789 |
acttcatacatctaaacatgtcatca |
6146764 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 210
Target Start/End: Original strand, 7853913 - 7854116
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7 |
acatcatcaaattcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc |
106 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
7853913 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaatcatgattcatgcaaacccaagc |
7854012 |
T |
 |
| Q |
107 |
catgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgag |
206 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | ||||| | ||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7854013 |
catgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaatcatgcataattcaccaattgaa |
7854112 |
T |
 |
| Q |
207 |
cata |
210 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
7854113 |
cata |
7854116 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 82 - 308
Target Start/End: Original strand, 17139514 - 17139740
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| Q |
82 |
aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataac |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
17139514 |
aatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaac |
17139613 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattc-accaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataa |
280 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||| | | || |
|
|
| T |
17139614 |
aacatagcatgattcaaccaattgagcata-tttcaacatataccattttctcatagtttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattaccaacaa |
17139712 |
T |
 |
| Q |
281 |
cttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
17139713 |
cttcatgcattcaaacatgtcatcataa |
17139740 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 54685625 - 54685422
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7 |
acatcatcaaattcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc |
106 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
54685625 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccagcaacagcaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaatccaagc |
54685526 |
T |
 |
| Q |
107 |
catgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgag |
206 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | ||||| | ||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54685525 |
catgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag |
54685426 |
T |
 |
| Q |
207 |
cata |
210 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
54685425 |
cata |
54685422 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #27
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Target Start/End: Original strand, 13817527 - 13817740
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88 |
gaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaa |
187 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
13817527 |
gaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgac---taaacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcaccaacaacaat |
13817623 |
T |
 |
| Q |
188 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat--actttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttca |
285 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | || |||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
13817624 |
gcataattcaccaattgagcata-tttccacatataccca-ttttcatacactttgaacatgtaattcaactaac-ataattcaattattcataacttca |
13817720 |
T |
 |
| Q |
286 |
tacatctaaacatgtcatca |
305 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13817721 |
tacatctaaacatgtcatca |
13817740 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 82 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 11329202 - 11329010
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| Q |
82 |
aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataac |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
11329202 |
aatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaac |
11329103 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattat |
274 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11329102 |
aacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatataccactttctcatactttgaacatgaaatttcactaacaacaattcaattat |
11329010 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
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Target Start/End: Original strand, 19946629 - 19946776
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7 |
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106 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19946629 |
acatcatcaaaatcaaacttctatattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc |
19946728 |
T |
 |
| Q |
107 |
catgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattga |
154 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
19946729 |
catggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga |
19946776 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #30
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Query Start/End: Original strand, 67 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 16182202 - 16181961
Alignment:
| Q |
67 |
tcatttcttgacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaactt |
165 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16182202 |
tcatttctcaacaacaatccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaaaaacaacaacaacaattgatcattaaactt |
16182103 |
T |
 |
| Q |
166 |
atcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat--actttgaacatgtgattcaactaacaac |
263 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| | || |||| ||||||||||||| ||| ||||||| || |
|
|
| T |
16182102 |
atcacaattcatcaacgacaatgcataattcaccaatttggcatattttc-acacataccca-ttttcatacactttgaacatgtaatttaactaac-ac |
16182006 |
T |
 |
| Q |
264 |
aattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16182005 |
aattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
16181961 |
T |
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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
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Target Start/End: Original strand, 3578097 - 3578320
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aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataac |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| |||||| | || | |||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |
|
|
| T |
3578097 |
aatcatgaatcatgcatacctaagcca--atttttaatcaacaacatgacttagcaacaacaa-atcaattgatcatgaaacttatcgcaattcaaccac |
3578193 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataa |
280 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3578194 |
aacatagcgtaattcaaccagttgagcatattttcaacatatactattttctcatactttgaacatgaaattcaactaataacaattcaattatccataa |
3578293 |
T |
 |
| Q |
281 |
cttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
3578294 |
cttcatacat-tcaacatgtcatcataa |
3578320 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
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Target Start/End: Complemental strand, 11061247 - 11061033
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| Q |
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aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataac |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || || || || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
11061247 |
aatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaccaacaacatcaattgaacatgactattatcacaattcaacaac |
11061148 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataa |
280 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
11061147 |
aacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacatataccattttctcatactttgaacctgaaattcaactaacaacaatccaattattcataa |
11061048 |
T |
 |
| Q |
281 |
cttcatacatctaaa |
295 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |
|
|
| T |
11061047 |
cttcatacatttaaa |
11061033 |
T |
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| Q |
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atcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataaca |
182 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
14059453 |
atcatgaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacatagcaacaataacatcaattgaacatgaatattatcacaattcaacaaca |
14059354 |
T |
 |
| Q |
183 |
acaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataac |
281 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
14059353 |
acatagcataattcatcaaattgagcata-tttcaacatatgtcattttctcatactttgaacatgaaatttctctaaaaacaattcaattatcaacaac |
14059255 |
T |
 |
| Q |
282 |
ttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
14059254 |
ttcatgcattcaaacataacatcataa |
14059228 |
T |
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Target: chr3; HSP #34
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Query Start/End: Original strand, 84 - 284
Target Start/End: Original strand, 16880131 - 16880331
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| Q |
84 |
tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaa |
183 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
16880131 |
tcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcatccacaacatcacttagcaacaataacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaa |
16880230 |
T |
 |
| Q |
184 |
caaagcataa-ttcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataact |
282 |
Q |
| |
|
|| ||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||| |
|
|
| T |
16880231 |
catagcataatttcacaaattgagcatattct-aacatataccactttctcatactttgaacatgaaattttactaacaacaattcaattatcaacaact |
16880329 |
T |
 |
| Q |
283 |
tc |
284 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
16880330 |
tc |
16880331 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 82 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 12488967 - 12488752
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| Q |
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aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataac |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
12488967 |
aatcatgaattatgaacacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaac |
12488868 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataa |
280 |
Q |
| |
|
|||| | ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
12488867 |
aacataacataattcatcaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcatcaacaacaattcaattatcaacaa |
12488769 |
T |
 |
| Q |
281 |
cttcatacatctaaaca |
297 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
12488768 |
cttcatgcatccaaaca |
12488752 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 82 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 12349970 - 12349834
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aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataac |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
12349970 |
aatcatgaatcatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaac |
12349872 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaaca |
219 |
Q |
| |
|
|| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
12349871 |
tacgatgcataattcaccaattgagcatattatcaaca |
12349834 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 82 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 12560477 - 12560274
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| Q |
82 |
aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataac |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||| || || ||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
12560477 |
aatcatgaatcatgcatacccaagccaggaattaacatccacaacatcacttagcaacaacaacatccattgatcatgaatcatatcacaattcaacaac |
12560378 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattc-accaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataa |
280 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
12560377 |
aacatagcataattcaaccagttgggcatattttc-acatataccactttctcatactttgaacatgaaatttctctaacaaaaattcaagtatcaataa |
12560279 |
T |
 |
| Q |
281 |
cttca |
285 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
12560278 |
cttca |
12560274 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 50 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14528286 - 14528118
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aaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatc |
148 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||| ||||||||| |
|
|
| T |
14528286 |
aaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcattcatacccaagccatgaattaccatcaacaacatcacttagcaacaacaacatc |
14528187 |
T |
 |
| Q |
149 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattc-accaattgagcatattttca |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14528186 |
aattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcatgattcaaccaattgagcatattttca |
14528118 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
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gatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgatt |
252 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | || |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
34439513 |
gatcatgaaacttatcataattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttaaacacatacccattttacatactttgaacatgtaatt |
34439414 |
T |
 |
| Q |
253 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatc-taaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
34439413 |
caaccaacaacaattcatttatccataacttcatacctcataaacatgacatcataa |
34439357 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #40
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tcattatcaacccatttt-acaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaac |
126 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| || ||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
30152893 |
tcataatcaacccattttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatatatcatcatcaacaat |
30152992 |
T |
 |
| Q |
127 |
atgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
||||| | ||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30152993 |
atgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
30153076 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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7 |
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105 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||| | ||||||| |
|
|
| T |
47785064 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacagaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaacacccaag |
47784965 |
T |
 |
| Q |
106 |
ccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca |
197 |
Q |
| |
|
|||||||| || | ||||||||| || || ||| ||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
47784964 |
ccatgaatcattaacaacaacatcacttaacaacaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattca |
47784873 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #42
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42 |
attttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaa |
140 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||| | ||| | |
|
|
| T |
17956274 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaaca |
17956175 |
T |
 |
| Q |
141 |
acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgag |
206 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
17956174 |
acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataatacaccaattgag |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaaca |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| || || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
3992560 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacc |
3992659 |
T |
 |
| Q |
186 |
aagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3992660 |
atgcataattcaccaattgagcata |
3992684 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 38167924 - 38168048
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185 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| || || ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
38167924 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacttattacaattcatcaacaaca |
38168023 |
T |
 |
| Q |
186 |
aagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38168024 |
tagcataattcaccaattgagcata |
38168048 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 2844201 - 2844325
Alignment:
| Q |
86 |
atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaaca |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| || || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
2844201 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaagaacc |
2844300 |
T |
 |
| Q |
186 |
aagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2844301 |
atgcataattcaccaattgagcata |
2844325 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 16261463 - 16261587
Alignment:
| Q |
86 |
atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaaca |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| || || ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16261463 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacc |
16261562 |
T |
 |
| Q |
186 |
aagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16261563 |
atgcataattcaccaattgagcata |
16261587 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 275
Target Start/End: Original strand, 39656556 - 39656725
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| Q |
106 |
ccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaa-ttg |
204 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||| || || || ||| ||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
39656556 |
ccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaaccacatcaattgaacatgaatcttacaacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttg |
39656655 |
T |
 |
| Q |
205 |
agcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatc |
275 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39656656 |
agcata-tttcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcactaacaacaattcaattatc |
39656725 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 210
Target Start/End: Original strand, 45581591 - 45581765
Alignment:
| Q |
38 |
acccatttt-acaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatat |
135 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||| |||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |
|
|
| T |
45581591 |
acccattttcaccaaaccaacaacaacaatttatttctcaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaa |
45581690 |
T |
 |
| Q |
136 |
caaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
||| ||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45581691 |
caacaacaacaaccattaatcatgaaacatatcacaattcatcaacaatcatgcataattcaccaattgagcata |
45581765 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 58 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 54038398 - 54038245
Alignment:
| Q |
58 |
aacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatc |
156 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||| ||||||| | ||| ||| |
|
|
| T |
54038398 |
aacaacaatttatttcttaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaactatatgactaaacaacaacaacaaccattaatc |
54038299 |
T |
 |
| Q |
157 |
atgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
54038298 |
atgaaacatatcacatttcatcaacaaccatgcataattcaccaatttagcata |
54038245 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 58 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 3576704 - 3576453
Alignment:
| Q |
58 |
aacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatc |
156 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| | |||| || || || ||| |||||||||||| | | |
|
|
| T |
3576704 |
aacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaaccacaatattacttagcaacaacaacatcaatcaaac |
3576605 |
T |
 |
| Q |
157 |
atgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaa |
255 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||| ||| | |
|
|
| T |
3576604 |
atgactcttatcacaattcaacaacaacatagcataatccatcaatttgagcata-attcaatatatatcactttctcatacattgaacatgaaatttca |
3576506 |
T |
 |
| Q |
256 |
ctaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
3576505 |
ccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataa |
3576453 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #51
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Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 53771051 - 53771175
Alignment:
| Q |
86 |
atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaaca |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||| || || ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
53771051 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacc |
53771150 |
T |
 |
| Q |
186 |
aagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53771151 |
atgcataattcaccaattgagcata |
53771175 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #52
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Query Start/End: Original strand, 44 - 308
Target Start/End: Original strand, 17191511 - 17191773
Alignment:
| Q |
44 |
tttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaac |
142 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||| ||| | || |||||||||||| |||| ||||||||| || || ||| | | |
|
|
| T |
17191511 |
tttacaaaaccaccaacaac---tcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaacattacttagcaacagc |
17191607 |
T |
 |
| Q |
143 |
aacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttg |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||| |
|
|
| T |
17191608 |
aacatcaattaaacatgattcttatcacaattcagcaacaacataacataattcatcaatttgagcata-attcaacataaatcactttctcatactttg |
17191706 |
T |
 |
| Q |
242 |
aacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||| ||| || ||||||||||| |||||| | || ||||| ||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
17191707 |
aacatgaaatttcaccaacaacaattcgattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataa |
17191773 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 23492383 - 23492507
Alignment:
| Q |
86 |
atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaaca |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| || || ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
23492383 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacc |
23492482 |
T |
 |
| Q |
186 |
aagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
23492483 |
atccataattcaccatttgagcata |
23492507 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #54
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Query Start/End: Original strand, 188 - 308
Target Start/End: Original strand, 38527841 - 38527960
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| Q |
188 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac--tttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttca |
285 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
38527841 |
gcataattcaccaattgagcatattttcc-cacatacccattt-tcatacactttgaacatgtaattcaactaacat-aattcaattattcataacttca |
38527937 |
T |
 |
| Q |
286 |
tacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38527938 |
tacatctaaacatgtcatcataa |
38527960 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 179 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 11196456 - 11196336
Alignment:
| Q |
179 |
aacaacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatcca |
277 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11196456 |
aacaacaaatcataattcaaccaattaagcatattttcaacatataccattttctca--------acataaaattcaactaacaacaattcaattatcca |
11196365 |
T |
 |
| Q |
278 |
taacttcatacatctaaacatgtcatcat |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
11196364 |
taacttcatacattcaaacatatcatcat |
11196336 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 38811297 - 38811170
Alignment:
| Q |
35 |
tcaacccattttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacat |
133 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | |
|
|
| T |
38811297 |
tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttctgatcatcaaaacatgaattatgcacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcactt |
38811198 |
T |
 |
| Q |
134 |
atcaaaaacaacatcaattgatcatgaa |
161 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
38811197 |
agcaacaacaacatcaattgaacatgaa |
38811170 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 82 - 184
Target Start/End: Original strand, 15876074 - 15876176
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| Q |
82 |
aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataac |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
15876074 |
aatcatgaattatgaatacctaagccatgaatcatcattaacaacatcacttaccaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaac |
15876173 |
T |
 |
| Q |
182 |
aac |
184 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
15876174 |
aac |
15876176 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 44 - 197
Target Start/End: Original strand, 17204667 - 17204821
Alignment:
| Q |
44 |
tttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaac |
142 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| || | ||||||||||||||| |||| |||||| || || || ||| ||| |
|
|
| T |
17204667 |
tttacaaaaccactaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattataaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatattacttagcaacaac |
17204766 |
T |
 |
| Q |
143 |
aacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca |
197 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||| | ||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
17204767 |
aacatccattaaacatgattcctatcacaattcaacaacaatatagcataattca |
17204821 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #59
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| Q |
7 |
acatcatcaaattcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccactaacaacaattca-tttcttgacaacaatcatg |
88 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
9303425 |
acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccgttttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatg |
9303343 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #60
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Query Start/End: Original strand, 29 - 308
Target Start/End: Original strand, 12952915 - 12953196
Alignment:
| Q |
29 |
tcattatcaacccatttt-acaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaac |
126 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| || | |||||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
12952915 |
tcataatcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaat |
12953014 |
T |
 |
| Q |
127 |
atgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatatacc |
225 |
Q |
| |
|
|| | || ||| ||||||||||||| | ||| || || |||||||||||| ||||||| |||| |||||| || || ||||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
12953015 |
atctcttagcaacaacaacatcaattaaacataaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcata-attcaacatataac |
12953113 |
T |
 |
| Q |
226 |
aacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
| ||| |||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
12953114 |
actttcatatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaatctaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataa |
12953196 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #61
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Query Start/End: Original strand, 140 - 308
Target Start/End: Original strand, 30207280 - 30207448
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| Q |
140 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
238 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| | |||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| || |||||| ||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
30207280 |
aacaacttcaattgaacttgaatcttatcacaattgaacaacaacatagcacaattcatcaatttaagcata-attcaacatatatcactttctcatact |
30207378 |
T |
 |
| Q |
239 |
ttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||| || || |||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
30207379 |
ttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataa |
30207448 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #62
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| Q |
34 |
atcaacccattttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaac-aatcatgaatcatgca-aacccaagccatgaattatcatcaacaacatgac |
131 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || | |||||||| | ||| | || ||||||||||||| |||| |||||| || | |
|
|
| T |
1990759 |
atcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacaaaccaagccatgaatcatcaacaacaatatctc |
1990858 |
T |
 |
| Q |
132 |
atatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||||||| || | ||||| || |||||| ||||| ||||||| | || ||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
1990859 |
ttaacaacaacaacatcatttaaacatgattctcatcacagttcaacaacaacataacacaattcacaatttgagcata |
1990937 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #63
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Query Start/End: Original strand, 43 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 9591035 - 9590802
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| Q |
43 |
ttttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaa |
141 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| |||||||| || | ||||||||| ||| | ||||||| ||||||| |||| |||||| || || || ||| || |
|
|
| T |
9591035 |
ttttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgaactatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaacaatatcacttaacaacaa |
9590936 |
T |
 |
| Q |
142 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattc-accaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatacttt |
240 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| || |||| || |||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
9590935 |
caacatcaattgaacatggttctcatcagaactcaacaacaacatagcataattcaacaaattgagcata-attcatatcataccactttcacatacttt |
9590837 |
T |
 |
| Q |
241 |
gaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatc |
275 |
Q |
| |
|
||||||| || || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9590836 |
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9590802 |
T |
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Target: chr3; HSP #64
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123 |
Q |
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|||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
28558187 |
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T |
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133 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| || ||| | |||| | ||| | || |||||||||||| |||| |||||| || || | |
|
|
| T |
34559857 |
tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaattctcatcatcaaattatgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt |
34559956 |
T |
 |
| Q |
134 |
atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttct |
232 |
Q |
| |
|
| ||| |||||||||||| || |||||| || |||| ||||||| ||| ||| | ||||||||| | || ||||||| |||||||| || || ||| |
|
|
| T |
34559957 |
agcaacaacaacatcaatcgaacatgaatctcatcataattcaacaactacataacataattcaaaatttagagcata-attcaacatgtaacacattca |
34560055 |
T |
 |
| Q |
233 |
catactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatc |
275 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34560056 |
catattttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatc |
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T |
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Target: chr3; HSP #66
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229 |
ttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
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ttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataa |
47784781 |
T |
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Target: chr3; HSP #67
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82 |
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181 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| | ||||||||| | ||| |||| ||||||||| || | ||| ||||||||||||||| |||| || |||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
14080515 |
aatcatgaattatgaatacccaagccgtaaatcatcaacaacaacattacttcgcaataacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaac |
14080614 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattca-ccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
|| | |||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
14080615 |
aatatagcacaattcacccaattgagcata |
14080644 |
T |
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140 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
238 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||| ||||||| | |||| ||||| || ||| |||||| |
|
|
| T |
14814948 |
aacaacatcaattaaacatgattcttatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagcaca-attcacaatatatcattttcacatact |
14814850 |
T |
 |
| Q |
239 |
ttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatc |
275 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14814849 |
atgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatc |
14814813 |
T |
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213 |
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308 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||| | || ||||| ||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
17204818 |
ttcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcgattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataa |
17204913 |
T |
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116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
17960602 |
tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagtcatgaattat |
17960520 |
T |
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99 |
acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaa |
161 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
51961361 |
acccaaaccatgaatcatcaacaacaacatctcatatcaacaacaacatcaattaagcatgaa |
51961299 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Target: scaffold0117; HSP #1
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aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataac |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |
|
|
| T |
11809 |
aatcatgaattatgcaaacccaagtcatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacataaattgatcatgaaactgatcacaattcaacaac |
11710 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataac |
281 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11709 |
aacaaagcataattcaccaattaagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaatcaacaacaattcaattatccataac |
11610 |
T |
 |
| Q |
282 |
ttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11609 |
ttcatacatctaaacatgtcatcataa |
11583 |
T |
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Target: scaffold0021 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 5)
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Target: scaffold0021; HSP #1
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58 |
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156 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
132516 |
aacaacatttcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaattgatc |
132417 |
T |
 |
| Q |
157 |
atgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaac |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
132416 |
atgaaacttatcacaattcatcaacaacgatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatataattcaac |
132317 |
T |
 |
| Q |
257 |
taacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatca |
305 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
132316 |
aaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatca |
132268 |
T |
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148 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | || || ||| ||||||||| |
|
|
| T |
11660 |
aaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcataaccaagccatgaattatcatcaacaacgtcacttagcaacaacaacatc |
11759 |
T |
 |
| Q |
149 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattc-accaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatg |
247 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11760 |
aattgatcatgaaacttatcacaattctacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatgttttcaactcatatctttttctcatactttgaacatg |
11859 |
T |
 |
| Q |
248 |
tgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
11860 |
aaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattgaaacatgtcatcataa |
11920 |
T |
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Target: scaffold0021; HSP #3
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189 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||| || || ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
88289 |
atcatgcatacccaagccaagaattagcatccataacatcacttaacaacagcaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagc |
88388 |
T |
 |
| Q |
190 |
ataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcataca |
289 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
88389 |
ataattcaccaattgatcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacattttaattattcataacttcataca |
88488 |
T |
 |
| Q |
290 |
tctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
88489 |
tctaaacatgtcatcataa |
88507 |
T |
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Target: scaffold0021; HSP #4
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298 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16022 |
caatggagcatattttcaactcatatcattttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacat |
16121 |
T |
 |
| Q |
299 |
gtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
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gtcatcataa |
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T |
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Target: scaffold0021; HSP #5
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298 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
25553 |
caatggagcatattttcaactcatatcattttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattaaaacat |
25652 |
T |
 |
| Q |
299 |
gtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
25653 |
gtcatcataa |
25662 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Target: scaffold0008; HSP #1
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Q |
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|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
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catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacaaaacaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaa |
22799 |
T |
 |
| Q |
185 |
aaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttc |
284 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
22800 |
aatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcaaaacttc |
22899 |
T |
 |
| Q |
285 |
atacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22900 |
atacatctaaacatgtcatcataa |
22923 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 2)
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Target: scaffold0001; HSP #1
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aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataac |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
60812 |
aatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaac |
60911 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataac |
281 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||| | || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
60912 |
aacaaagcataattcaccaattaagtatatttttaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataac |
61011 |
T |
 |
| Q |
282 |
ttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
61012 |
atcatacatctaaacatgttatcataa |
61038 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001; HSP #2
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85 |
catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaac |
184 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
70860 |
catgaatcatgcaaacccaagtcatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacatccaatgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaat |
70761 |
T |
 |
| Q |
185 |
aaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatcca-taactt |
283 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| || |||||| |
|
|
| T |
70760 |
aatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacctacttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaataaatcaattattcattaactt |
70661 |
T |
 |
| Q |
284 |
catacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
70660 |
catacatctaaacatgtcatcataa |
70636 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0160 (Bit Score: 166; Significance: 7e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0160
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Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 58 - 306
Target Start/End: Original strand, 2 - 251
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
2 |
aacaacaatccatttctcaacaacaaataatgaaacatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaagatgacatagcaacaacaacatcaattgatc |
101 |
T |
 |
| Q |
157 |
atgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaac |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
102 |
atgaaacttatcacaattcatcaaccacgtagcataattcacgaattgagcatattttcaacatataccaatttctcatactttgaacatgcaattcaac |
201 |
T |
 |
| Q |
257 |
taacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcat |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
202 |
caacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcat |
251 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0160; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 150
Target Start/End: Original strand, 3492 - 3593
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| Q |
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148 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| | ||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
3492 |
aaaccaccaacaacattccatttctcaacaacaaataatgaaacatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaagatgacatagcaacaacaacatc |
3591 |
T |
 |
| Q |
149 |
aa |
150 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
3592 |
aa |
3593 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0610 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:
Target: scaffold0610; HSP #1
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Target Start/End: Complemental strand, 842 - 591
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| Q |
58 |
aacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatc |
156 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
842 |
aacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgccaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaattgatc |
743 |
T |
 |
| Q |
157 |
atgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaac |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
742 |
atgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaaatgagcatattttcaacatataccattttctcatactttgaacatgtaattcaat |
643 |
T |
 |
| Q |
257 |
taacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
642 |
taacaacaattctattatccataatttcatacattcaaacatgtcatcataa |
591 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1164 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:
Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
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Target Start/End: Original strand, 1332 - 1613
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29 |
tcattatcaacccatttt-acaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaac |
126 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| || ||| ||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
1332 |
tcataatcaacccattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgatttatcatcaacaac |
1431 |
T |
 |
| Q |
127 |
atgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatatacca |
226 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1432 |
atgacatagcaacagcaacatttattgatcatgaaacttatcacaattcatcaatcacataacataattcaacaattgagcatattttcaacatatacca |
1531 |
T |
 |
| Q |
227 |
acttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1532 |
atttctcatactttgaacatataattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
1613 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:
Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
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Target Start/End: Complemental strand, 112808 - 112560
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58 |
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156 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
112808 |
aacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatca---acaacatgacttaacaacaacaacataaattgatc |
112712 |
T |
 |
| Q |
157 |
atgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaac |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
112711 |
atgaaacttatcacaattcatcaaccacatagcataattcactaattgagcatattttcaacatataccaatttctcatactttgaacatgtaattcaac |
112612 |
T |
 |
| Q |
257 |
taacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
112611 |
taacaacaattcaattgttcataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
112560 |
T |
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Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
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Target Start/End: Original strand, 109596 - 109821
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82 |
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181 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
109596 |
aatcatgaatcgtgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaactgatcatgaatcttatcacaattcaacaac |
109695 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataa |
280 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
109696 |
aacatagcaaaattcaacaatttgagcata-tttcaacatataccactttctcatactttaaacatgaaatttcattaacaacaattcaattatcaacaa |
109794 |
T |
 |
| Q |
281 |
cttcatacatctaaacatgtcatcata |
307 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||| |||||||| |
|
|
| T |
109795 |
cttcatggattcaaacatatcatcata |
109821 |
T |
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Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 35 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 103211 - 102937
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35 |
tcaacccattttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacat |
133 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| | ||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
103211 |
tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttatcaccaacaattcatgaattatgcacacccaaaccatgaattatcatcaacaacatcactt |
103112 |
T |
 |
| Q |
134 |
atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattc-accaattgagcatattttcaacatataccaacttct |
232 |
Q |
| |
|
| || || |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||| |||||| || || ||||||||| |||| |
|
|
| T |
103111 |
agaaacaataacatcaattgaacatgaatgttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaaatttagcata-ttccaccatataccactttct |
103013 |
T |
 |
| Q |
233 |
catactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
103012 |
catactttgaacatgaaatttcactaacaacaattcaattatcaaaaacttcatgcattcaaacatatcatcataa |
102937 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0673 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:
Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 85 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 1060 - 837
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| Q |
85 |
catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaac |
184 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |
|
|
| T |
1060 |
catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaaatcatcaataac |
961 |
T |
 |
| Q |
185 |
aaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttc |
284 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
960 |
aatgcataattcaccaattgagcatattttcaactcatacccatttttcatactttgaacatgtaattcatctaacaacaatccaattattcataacttc |
861 |
T |
 |
| Q |
285 |
atacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
860 |
atacatctaaacatgtcatcataa |
837 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 88 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 7083 - 6867
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| Q |
88 |
gaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgac---atatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaac |
184 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
7083 |
gaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaac |
6984 |
T |
 |
| Q |
185 |
aaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat--actttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataact |
282 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | || |||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
6983 |
aatgcataattcaccaattgagcatattttc-acacataccca-ttttcatacactctgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaactattcataact |
6886 |
T |
 |
| Q |
283 |
tcatacatctaaacatgtc |
301 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6885 |
tcatacatctaaacatgtc |
6867 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0396 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:
Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 67 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 11964 - 11726
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tcatttcttgacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaactta |
166 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11964 |
tcatttctcaacaccaatcatgaaccatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaactta |
11865 |
T |
 |
| Q |
167 |
tcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaat |
266 |
Q |
| |
|
||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
11864 |
tcaaaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaactaatacccatttttcatactttgaacatgtaattcatccaacaacaat |
11765 |
T |
 |
| Q |
267 |
tcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatca |
305 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11764 |
tcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatca |
11726 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:
Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 85 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 255052 - 254832
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| Q |
85 |
catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaac |
184 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
255052 |
catgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaac |
254953 |
T |
 |
| Q |
185 |
aaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat--actttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataact |
282 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
254952 |
aatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacataccca-ttttcatacactttgaacatgtaattcaact-acaacaattcaattattcataact |
254855 |
T |
 |
| Q |
283 |
tcatacatctaaacatgtcatca |
305 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
254854 |
tcatacatctaagcatgtcatca |
254832 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 85 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 261658 - 261438
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| Q |
85 |
catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaac |
184 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
261658 |
catgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaac |
261559 |
T |
 |
| Q |
185 |
aaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat--actttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataact |
282 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
261558 |
aatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacataccca-ttttcatacactttgaacatgtaattcaact-actacaattcaattattcataact |
261461 |
T |
 |
| Q |
283 |
tcatacatctaaacatgtcatca |
305 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
261460 |
tcatacatctaagcatgtcatca |
261438 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0240 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:
Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
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Target Start/End: Original strand, 7581 - 7791
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88 |
gaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaa |
187 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| |
|
|
| T |
7581 |
gaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcataatttatcaacaacaat |
7680 |
T |
 |
| Q |
188 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcata |
287 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
7681 |
gcataattcaccaattgagcatattttcatcatatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattatttataacttcata |
7780 |
T |
 |
| Q |
288 |
catctaaacat |
298 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
7781 |
catctaaacat |
7791 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0833 (Bit Score: 146; Significance: 6e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0833
Description:
Target: scaffold0833; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Original strand, 3230 - 3399
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7 |
acatcatcaaattcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc |
106 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3230 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc |
3329 |
T |
 |
| Q |
107 |
catgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattca |
176 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3330 |
catgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattca |
3399 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0480 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0480
Description:
Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 50 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 9156 - 8897
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| Q |
50 |
aaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatc |
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Q |
| |
|
||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||| |
|
|
| T |
9156 |
aaaccaccgacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacctaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatc |
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T |
 |
| Q |
149 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattc-accaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatg |
247 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9056 |
aattgatcatgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcata-tatcaacatatatcattttctcatactttgaacatg |
8958 |
T |
 |
| Q |
248 |
tgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
8957 |
aaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataa |
8897 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0480; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 85 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 5484 - 5262
Alignment:
| Q |
85 |
catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaac |
184 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
5484 |
catgaatcatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac |
5385 |
T |
 |
| Q |
185 |
aaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat--actttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataact |
282 |
Q |
| |
|
|| || ||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
5384 |
aatgcctaattcaccaattgagcatattttc-gcacataccta-ttttcatacactttgaacatgtaattcaactaac-acaattcaattattcataact |
5288 |
T |
 |
| Q |
283 |
tcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
5287 |
tcatacatctaaacatctcatcataa |
5262 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0554 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:
Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 50 - 308
Target Start/End: Original strand, 1889 - 2148
Alignment:
| Q |
50 |
aaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatc |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||| |
|
|
| T |
1889 |
aaaccactaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatactcaagccaagaattatcatcatcaacatgacttagcaacaacaacatc |
1988 |
T |
 |
| Q |
149 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatg |
247 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
1989 |
aattgatcatgaatcttataacaaatcaacaaca-catagcataattcaaccaattgagcatattttcatcatataccattttcgcatactttgaacatg |
2087 |
T |
 |
| Q |
248 |
tgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
2088 |
aaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataa |
2148 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0044 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:
Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 85 - 308
Target Start/End: Original strand, 38307 - 38530
Alignment:
| Q |
85 |
catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaac |
184 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
38307 |
catgaatcatgcaaacccaagttatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacgtcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaac |
38406 |
T |
 |
| Q |
185 |
aaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttc |
284 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
38407 |
aatgcataattcgccaattgagcatattttcaacatatacccatttctcttcctttgaacatgtaattcaaccaacaaaaattcaattattcataaattc |
38506 |
T |
 |
| Q |
285 |
atacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38507 |
ataaatctaaacatgtcatcataa |
38530 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:
Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 86 - 308
Target Start/End: Original strand, 146611 - 146833
Alignment:
| Q |
86 |
atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaaca |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||| || || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
146611 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatgcataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacc |
146710 |
T |
 |
| Q |
186 |
aagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttca |
285 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
146711 |
tagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacagttcaattatacataacttca |
146810 |
T |
 |
| Q |
286 |
tacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
146811 |
tacatctaaacatgtcatcataa |
146833 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 100 - 275
Target Start/End: Original strand, 53370 - 53545
Alignment:
| Q |
100 |
cccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcacc |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || | |||||| | || || ||| ||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||| ||||| | ||||||||| | | |
|
|
| T |
53370 |
cccaagccatgaatcattaacaacaatgtcacttagcaacaacaacatccattgaacatgaatctcatcacaattcatcaacaaaatagcataattgaac |
53469 |
T |
 |
| Q |
200 |
aatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatc |
275 |
Q |
| |
|
| || ||||||| || ||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53470 |
atttagagcataatt-caacatataacaccttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatc |
53545 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 208
Target Start/End: Original strand, 8917 - 8982
Alignment:
| Q |
143 |
aacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagca |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| || | |||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8917 |
aacatcaattgaacattaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagca |
8982 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0031 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:
Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 43 - 308
Target Start/End: Original strand, 31010 - 31275
Alignment:
| Q |
43 |
ttttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaa |
141 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||| || |
|
|
| T |
31010 |
ttttaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaagtcatgaatcatgcatacccaagccataaattatcatcaaaaacctcacatatcagcaa |
31109 |
T |
 |
| Q |
142 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataa-ttcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatacttt |
240 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
31110 |
caacatcaattaatcatgaaacttatcacaattcaacaactacaaa-cataacttaacaaattgagcatattttcaacatataccattttcttatacttt |
31208 |
T |
 |
| Q |
241 |
gaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
31209 |
gaacatg-aattcaactaaccacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataa |
31275 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 117 - 308
Target Start/End: Original strand, 70654 - 70845
Alignment:
| Q |
117 |
catcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattc-accaattgagcatattttc |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
70654 |
catcaacaacatcatatatcagcaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaaccaattaagcatattttc |
70753 |
T |
 |
| Q |
216 |
aacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
70754 |
aacatattccattttctcatactttgaacatg-aattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgacatcataa |
70845 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 97487 - 97246
Alignment:
| Q |
35 |
tcaacccattttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacat |
133 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| || ||| |||||| | ||| ||||||||| ||||||| |||| ||| || || | | |
|
|
| T |
97487 |
tcaacccattttacaaaaccaataacaacaactcaattcttatcatcaaatcatgatttatgaaaacccaaggcatgaatcatcaacaataatatcaatt |
97388 |
T |
 |
| Q |
134 |
atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttct |
232 |
Q |
| |
|
| || ||||| ||||||||| |||||| || |||| ||||||| | ||||| ||||||||||| || || ||||||| || ||||||||| || ||| |
|
|
| T |
97387 |
agtaacaacaatatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaccaacatagcataattcaacatttagagcataatt-caacatataacactttca |
97289 |
T |
 |
| Q |
233 |
catactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatc |
275 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
97288 |
catactttgaacatgcaattccaccaacaacaattcaattatc |
97246 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0103 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:
Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 82 - 308
Target Start/End: Original strand, 33668 - 33894
Alignment:
| Q |
82 |
aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataac |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| | |||| |||||||||| |||| |||||| || || || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
33668 |
aatcatgaattatgaacaccctagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcaaaattcatcaac |
33767 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataac |
281 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
33768 |
aacatagcataattcaccaattaaacataatttcaacatataccaatttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatctataac |
33867 |
T |
 |
| Q |
282 |
ttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
33868 |
ttcatacattcaaacatgtcatcataa |
33894 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0037 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:
Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 86 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 24965 - 24743
Alignment:
| Q |
86 |
atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaaca |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||| |||||| |||| | ||||| || || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
24965 |
atgaatcatgaatacccaagccaagaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaca |
24866 |
T |
 |
| Q |
186 |
aagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttca |
285 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
24865 |
tagcataattcaccaattgagcatatgttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaatttaattatcaataacttca |
24766 |
T |
 |
| Q |
286 |
tacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24765 |
tacatctaaacatgtcatcataa |
24743 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 94985 - 95109
Alignment:
| Q |
86 |
atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaaca |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| |||||||||| |||| | ||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
94985 |
atgaatcatgcatacccaaaccatgaattagcatccataacatcacttatcaacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacc |
95084 |
T |
 |
| Q |
186 |
aagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
95085 |
atgcataattcactaattgagcata |
95109 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0068 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:
Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 82 - 308
Target Start/End: Original strand, 48154 - 48378
Alignment:
| Q |
82 |
aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataac |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| || || | |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
| T |
48154 |
aatcatgaattatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaacaacatggcttaacaacaataataacaattgatcatgaaacttttcacaattcatcaac |
48252 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataac |
281 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
48253 |
aacaaaacataattcaccaattgagcatatttt-aacacatacccatttttcatactttgaacataaaattcaactaacaacaattcaatcattcataac |
48351 |
T |
 |
| Q |
282 |
ttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
48352 |
ttcatacatctaaacatttcatcataa |
48378 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 82 - 308
Target Start/End: Original strand, 61602 - 61826
Alignment:
| Q |
82 |
aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataac |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| || || | |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
| T |
61602 |
aatcatgaattatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaacaacatggcttaacaacaataataacaattgatcatgaaacttttcacaattcatcaac |
61700 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataac |
281 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
61701 |
aacaaaacataattcaccaattgagcatatttt-aacacatacccatttttcatactttgaacataaaattcaactaacaacaattcaatcattcataac |
61799 |
T |
 |
| Q |
282 |
ttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
61800 |
ttcatacatctaaacatttcatcataa |
61826 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0447 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:
Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 82 - 308
Target Start/End: Original strand, 4569 - 4796
Alignment:
| Q |
82 |
aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataac |
181 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || || || ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
4569 |
aatcatggattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaaaatgaatattatcacaattaaacaac |
4668 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataa |
280 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
4669 |
aacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataa |
4768 |
T |
 |
| Q |
281 |
cttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4769 |
cttcatacatctaaacatgtcatcataa |
4796 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 82 - 308
Target Start/End: Original strand, 9183 - 9410
Alignment:
| Q |
82 |
aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataac |
181 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || || || ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
9183 |
aatcatggattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaaaatgaatattatcacaattaaacaac |
9282 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataa |
280 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
9283 |
aacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataa |
9382 |
T |
 |
| Q |
281 |
cttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9383 |
cttcatacatctaaacatgtcatcataa |
9410 |
T |
 |
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187 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
164227 |
gaattatgcaaacccaagccatgaattaccatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacatttgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaat |
164326 |
T |
 |
| Q |
188 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat--actttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttca |
285 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| | || |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
164327 |
gcataattcaccaattgagcatatcttc-acacataccca-ttttcatacactttgaacatgtaattcaactaac-acaattcaattattcataacttca |
164423 |
T |
 |
| Q |
286 |
tacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
164424 |
tacatctaaacatgtcatcataa |
164446 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
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42 |
attttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaa- |
139 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| | |||| |
|
|
| T |
162469 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatatatcatcatcaacaatatgactaaacaaac |
162370 |
T |
 |
| Q |
140 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
162369 |
aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcagaattcaccaattgagcata |
162299 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 42 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 166547 - 166385
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| Q |
42 |
attttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaa |
140 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| || | |
|
|
| T |
166547 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttttcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaa-------tattaaca |
166455 |
T |
 |
| Q |
141 |
acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
166454 |
acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcagaattcaccaattgagcata |
166385 |
T |
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Target: scaffold0016; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
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Target Start/End: Complemental strand, 116795 - 116687
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42 |
attttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaa |
140 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || || || ||| | |
|
|
| T |
116795 |
attttacaaaaccaccaacaacaatccatttttcatcaacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaaca |
116696 |
T |
 |
| Q |
141 |
acaacatca |
149 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
116695 |
acaacatca |
116687 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0077 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:
Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
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Target Start/End: Complemental strand, 15761 - 15486
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38 |
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132 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||| |||||||||| |||||| |||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||| | |
|
|
| T |
15761 |
acccattttcaccaaaccaacaacaacaatttatttctcaacaaaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatctataacatgactaaa |
15662 |
T |
 |
| Q |
133 |
tatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttca-acatataccaacttc |
231 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |
|
|
| T |
15661 |
caacaacaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcacacata-cccattttt |
15563 |
T |
 |
| Q |
232 |
tcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15562 |
ttatactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattgtccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
15486 |
T |
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Target: scaffold0083 (Bit Score: 114; Significance: 8e-58; HSPs: 2)
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Description:
Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
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Target Start/End: Original strand, 14889 - 15105
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88 |
gaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaa |
187 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
14889 |
gaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgac---taaacaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaat |
14985 |
T |
 |
| Q |
188 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat--actttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttca |
285 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | || |||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
14986 |
gcataattcaccaattgagcatattttc-acacataccca-ttttcatacactttgaacatgtaatctaactaac-acaattcaattattcataacttca |
15082 |
T |
 |
| Q |
286 |
tacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15083 |
tacatctaaacatgtcatcataa |
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T |
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Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 131
Target Start/End: Original strand, 14229 - 14272
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| Q |
88 |
gaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgac |
131 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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gaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgac |
14272 |
T |
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Target: scaffold0383 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:
Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
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Target Start/End: Original strand, 7177 - 7405
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aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatc-aattgatcatgaaacttatcacaattcaataa |
180 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || || || ||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| || || |
|
|
| T |
7177 |
aatcatggattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatccaattgaaaatgaatattatcacaattaaacaa |
7276 |
T |
 |
| Q |
181 |
caacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccata |
279 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
7277 |
caacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcata |
7376 |
T |
 |
| Q |
280 |
acttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7377 |
acttcatacatctaaacatgtcatcataa |
7405 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0095 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:
Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 43 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 34008 - 33743
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ttttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaa |
141 |
Q |
| |
|
|||||| |||| || ||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| || |
|
|
| T |
34008 |
ttttaccaaactaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcat-aatcatgcatacccaagccatgaattattatcaacaacatcacttagcaacaa |
33910 |
T |
 |
| Q |
142 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattc-accaattgagcatattttcaacatataccaacttc-tcatactt |
239 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| | ||||| |||||||| |
|
|
| T |
33909 |
caacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaatttagcata-tttcaacatataac-acttcttcatactt |
33812 |
T |
 |
| Q |
240 |
tgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
33811 |
taaacatgaaattccactaacaacaattcaattatccacaacttcaagcattcaaacatgtcatcataa |
33743 |
T |
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Target: scaffold0034; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 46171 - 46395
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Q |
| |
|
|||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || || || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
46171 |
aatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagaaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttaacaac |
46270 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaac--ttctcatactttgaacatg-tgattcaactaacaacaattcaattatccat |
278 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46271 |
aacatagcataattcaccaattgagcatattttc-acata-acccacttttcacatactttgatcatgaagtttcaactaacaacaattcaattatccat |
46368 |
T |
 |
| Q |
279 |
aacttcatacatctaaacatgtcatca |
305 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46369 |
aacttcatacatctaaacatgtcatca |
46395 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
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Target Start/End: Original strand, 40664 - 40891
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82 |
aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataac |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || || || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
40664 |
aatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatgtaacaac |
40763 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaac--ttctcatactttgaacatg-tgattcaactaacaacaattcaattatccat |
278 |
Q |
| |
|
|| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40764 |
aatatagcataattcaccaattgagcatattttc-acata-acccacttttcacatactttgatcatgaagtttcaactaacaacaattcaattatccat |
40861 |
T |
 |
| Q |
279 |
aacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40862 |
aacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
40891 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 79874 - 79998
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atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaaca |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||| ||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
79874 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccattaatcatgaaacatatcacaattcatcaacaatc |
79973 |
T |
 |
| Q |
186 |
aagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
79974 |
atgcataattcaccaattgagcata |
79998 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0195 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0195
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Target: scaffold0195; HSP #1
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Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
784 |
aacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgccaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagtaacaacaacatcaattgatc |
685 |
T |
 |
| Q |
157 |
atgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatata |
223 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
684 |
atgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaaatgagcatattttcaacatata |
618 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaa |
183 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| ||||||||| | || || || |||||||||||| || ||| | || | |||||||| ||||| |
|
|
| T |
19216 |
tcatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaa |
19314 |
T |
 |
| Q |
184 |
caaagcataattcaccaattgagca |
208 |
Q |
| |
|
| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19315 |
cttagcaaaattcaccaattgagca |
19339 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0195; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
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Target Start/End: Original strand, 21300 - 21423
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| Q |
84 |
tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaa |
183 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| ||||||||| | || || || |||||||||||| || ||| | || | |||||||| ||||| |
|
|
| T |
21300 |
tcatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaa |
21398 |
T |
 |
| Q |
184 |
caaagcataattcaccaattgagca |
208 |
Q |
| |
|
| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21399 |
cttagcaaaattcaccaattgagca |
21423 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0150 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0150
Description:
Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Original strand, 28466 - 28768
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7 |
acatcatcaaattcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaa-caatcatgaatcatgcaaacccaag |
105 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||| | ||||||| |
|
|
| T |
28466 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaccaataaatcatgaattatgaacacccaag |
28565 |
T |
 |
| Q |
106 |
ccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaa-ttg |
204 |
Q |
| |
|
|||||||| || | ||||||||| || || ||| ||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
28566 |
ccatgaatcattaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacataattcttactacaattcaacaacaacataccataattcaacaatttg |
28665 |
T |
 |
| Q |
205 |
agcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatc |
304 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| ||||| | || ||||| ||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
28666 |
agcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatataatttcaccaacaacaattcagttatcaacaagttcatgcattcaaacatatcatc |
28764 |
T |
 |
| Q |
305 |
ataa |
308 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
28765 |
ataa |
28768 |
T |
 |
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acatcatcaaattcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccac |
56 |
Q |
| |
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||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21637 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccac |
21686 |
T |
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aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataac |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| || || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |
|
|
| T |
3325 |
aatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccacaacatcacttagcaacatcaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaactac |
3424 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacaaagcataatt-caccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataa |
280 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
3425 |
aacatagcataattggaccaattgagcatattttc-acatataccactttctcatactttgaacattaaatttctctaacaacaattcaattataaataa |
3523 |
T |
 |
| Q |
281 |
cttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
3524 |
cttcatgcattcaaacataacatcataa |
3551 |
T |
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Target: scaffold0342; HSP #1
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caagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca-cca |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| |||||| || || || ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||| |
|
|
| T |
5966 |
caagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatattatcacaattcaacaaccacatagcataatttaacca |
6065 |
T |
 |
| Q |
201 |
attgagcatattttcaacatataccaactt-ctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatg |
299 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
6066 |
attgagcatattttcaacatataccatttttctcatactttgaacatgaaattctaccaacaacaatccaattatccataacttcatacattcaaacatg |
6165 |
T |
 |
| Q |
300 |
tcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|| |||||| |
|
|
| T |
6166 |
tcgtcataa |
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T |
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145 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| | | |||||| |
|
|
| T |
736 |
acaaaaccaccaacaataatccatttctcaacaacaaattattaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaatatgagtaaatatcaacaac |
637 |
T |
 |
| Q |
146 |
atcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
636 |
aaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
572 |
T |
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Target: scaffold0091; HSP #1
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atgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcata |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
32220 |
atgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaattcata |
32319 |
T |
 |
| Q |
193 |
attcaccaattgagcatattttcaa |
217 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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attcaccaattgagcatattttcaa |
32344 |
T |
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atgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcata |
192 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
42083 |
atgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaattcata |
41984 |
T |
 |
| Q |
193 |
attcaccaattgagcatattttcaa |
217 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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attcaccaattgagcatattttcaa |
41959 |
T |
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Target: scaffold0013; HSP #1
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attttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaa |
140 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||| | |
|
|
| T |
35444 |
attttacaaaaccaccaaca-caactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaaca |
35542 |
T |
 |
| Q |
141 |
acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
239 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| ||||||| ||||||| ||| ||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
35543 |
aaaacatcaattgaacatgactcttaccacatttcaacaacaacatagcataaatcaacaatttgagtata-attcaacatatatcactttctcatactt |
35641 |
T |
 |
| Q |
240 |
tgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcat |
306 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
35642 |
tgaacatgaaatttcactaacaacaattcaattatcaataacttcatgcattcaaacatatcatcat |
35708 |
T |
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Name: scaffold0053
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Target: scaffold0053; HSP #1
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attttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaa |
140 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||| || || || ||| | |
|
|
| T |
77129 |
atttcacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaataacaatatcacttagcaaca |
77030 |
T |
 |
| Q |
141 |
acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
239 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| || | |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
77029 |
acaacatcaattgaacatgaatctcaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgaacata-attcaacatatatcactttctcatactt |
76931 |
T |
 |
| Q |
240 |
tgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| || |||||||||||||||||| | || ||||| ||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
76930 |
tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataa |
76862 |
T |
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Target: scaffold0740; HSP #1
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caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat--actt |
239 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| | || |||| |||| |
|
|
| T |
4351 |
caacaacaattgatcataaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgaacatattttc-acacataccca-ttttcatacactt |
4448 |
T |
 |
| Q |
240 |
tgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
4449 |
tgaacatgtaattcaactaac-acaattcaattattcataatttgatacatctaaacatgtcattataa |
4516 |
T |
 |
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gaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaaca |
127 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4319 |
gaattatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaacaaca |
4358 |
T |
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Target: scaffold0686 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
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Target: scaffold0686; HSP #1
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attttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaa |
140 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| || || | ||| | |
|
|
| T |
6373 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgtatcatcatcaacaatattactaaacaaca |
6274 |
T |
 |
| Q |
141 |
acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6273 |
acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
6204 |
T |
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Target: scaffold0184; HSP #1
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attttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaa |
140 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| | ||| | |
|
|
| T |
31570 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaattatgaatcatgcaaacctaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaaca |
31471 |
T |
 |
| Q |
141 |
acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31470 |
acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
31401 |
T |
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Target: scaffold0078; HSP #1
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attttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaa |
140 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| | ||| | |
|
|
| T |
41274 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaattatgaatcatgcaaacctaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaaca |
41373 |
T |
 |
| Q |
141 |
acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41374 |
acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
41443 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Target: scaffold0049; HSP #1
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aacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat--actttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatcc |
276 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
20275 |
aacaacaaagcataattaaccaattgagcatattttcaacatatatcta-ttttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattc |
20373 |
T |
 |
| Q |
277 |
ataacttcatacatctaaacatgtcatca |
305 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20374 |
ataacttcatacatctaaacatgtcatca |
20402 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0116 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
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Target: scaffold0116; HSP #1
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42 |
attttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaa |
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Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| | |
|
|
| T |
30056 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaatatgactaaacaaca |
30155 |
T |
 |
| Q |
141 |
acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattca |
176 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
30156 |
acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattca |
30191 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Target: scaffold0243; HSP #1
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cccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcacc |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
2539 |
cccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttaggaacaacaacatcaattgaacatgagtcttatcataattcaacaacaacatagcataattcatc |
2440 |
T |
 |
| Q |
200 |
aa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacat |
298 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
2439 |
aatttgagcata-attcaacatatgtcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacat |
2341 |
T |
 |
| Q |
299 |
gtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
2340 |
aacatcataa |
2331 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0483 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
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Target: scaffold0483; HSP #1
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Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||| || || |
|
|
| T |
6622 |
acccagtttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaccacccaagccatgaatcatcaacaaaaacatcacttagg |
6721 |
T |
 |
| Q |
137 |
aaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcat |
235 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| || | || ||||||||||| ||||| ||||| | || ||||||||| || ||||||| |
|
|
| T |
6722 |
agtaacaacatcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaatagcatagcataattcaacaatttgagcaaaatt-caacatatatcactttctcat |
6820 |
T |
 |
| Q |
236 |
actttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
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|||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
6821 |
actttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataa |
6893 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0234 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:
Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 17649 - 17525
Alignment:
| Q |
86 |
atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaaca |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| || || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
17649 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacc |
17550 |
T |
 |
| Q |
186 |
aagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17549 |
atgcataattcaccaattgagcata |
17525 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0032 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:
Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 55591 - 55715
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| Q |
86 |
atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaaca |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| || || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
55591 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacc |
55690 |
T |
 |
| Q |
186 |
aagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55691 |
atgcataattcaccaattgagcata |
55715 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 94061 - 93788
Alignment:
| Q |
35 |
tcaacccattttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacat |
133 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
94061 |
tcaacccattttacaaagtcaccaacaacatctcatttctcaccaacaaatcatgaattatgttcacccaaatcatgaattatcatcaacaacatcactt |
93962 |
T |
 |
| Q |
134 |
atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttct |
232 |
Q |
| |
|
|| || ||||||||||||||| |||||| | ||||||||| || ||| ||| |||||| |||| || ||||||||| |||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
93961 |
attaataacaacatcaattgaacatgaatttcatcacaatttaacaac-acatagcatacttcaataatttgagcata-tttcaacaaataccattttct |
93864 |
T |
 |
| Q |
233 |
catactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| | |||||||| ||| | |||| ||||||||| |
|
|
| T |
93863 |
catactttgaacatgaaatttctctaacaaccattcaattatcaaaaacttcatgcatacatacatatcatcataa |
93788 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 104861 - 104793
Alignment:
| Q |
84 |
tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaatt |
152 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || || || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
104861 |
tcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaatt |
104793 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0162 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:
Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 84 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 7264 - 7040
Alignment:
| Q |
84 |
tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaa |
183 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| | || |||||||||||| |||| |||||| || || || || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
7264 |
tcatgaattatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcagcaacaacatcaattgaacatgattcttatcacaatccaataacaa |
7165 |
T |
 |
| Q |
184 |
caaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataact |
282 |
Q |
| |
|
|| | ||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||| |
|
|
| T |
7164 |
cataacataattaaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacattaaatttcactaacaacaattcaattatcaacaact |
7066 |
T |
 |
| Q |
283 |
tcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
7065 |
tcatgcattcaaacatatcatcataa |
7040 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 8422 - 8310
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| Q |
93 |
atgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcata |
192 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| | || | ||||||||| | || ||| ||||||||||||||| |||| || |||| ||||| ||||||| |||| | |
|
|
| T |
8422 |
atgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattc---aacaacatagcaaa |
8326 |
T |
 |
| Q |
193 |
attcaccaattgagca |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
8325 |
attcaccaattgagca |
8310 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0251 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:
Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 13631 - 13507
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| Q |
86 |
atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaaca |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| || || ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
13631 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacc |
13532 |
T |
 |
| Q |
186 |
aagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13531 |
atgcataattcaccaattgagcata |
13507 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21605 - 21481
Alignment:
| Q |
86 |
atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaaca |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||| || || ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
21605 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacc |
21506 |
T |
 |
| Q |
186 |
aagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21505 |
atgcataattcaccaattgagcata |
21481 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0175 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:
Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 14959 - 15083
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| Q |
86 |
atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaaca |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| || || ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
14959 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacc |
15058 |
T |
 |
| Q |
186 |
aagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15059 |
atgcataattcaccaattgagcata |
15083 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0700 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:
Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 308
Target Start/End: Original strand, 2483 - 2757
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| Q |
35 |
tcaacccattttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacat |
133 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| || | |||||||| | ||| | |||||| |||||||| |||| |||||| || || | |
|
|
| T |
2483 |
tcaacccattttagaaaaccaacaacaacaagtcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatcactt |
2582 |
T |
 |
| Q |
134 |
atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttct |
232 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||| ||||||| ||||||||||| || || ||||||| ||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
2583 |
agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcataattcaacatttagagcata-attcaacatataacactttca |
2681 |
T |
 |
| Q |
233 |
catactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
2682 |
tatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatccaaacatatcatcataa |
2757 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0465 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:
Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 86 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 10211 - 10094
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| Q |
86 |
atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaaca |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| || || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
10211 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacc |
10112 |
T |
 |
| Q |
186 |
aagcataattcaccaatt |
203 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
10111 |
aagcataattcgccaatt |
10094 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0039 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:
Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 58 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12794 - 12641
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| Q |
58 |
aacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatc |
156 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||| ||||||| | ||| ||| |
|
|
| T |
12794 |
aacaacaatttatttctcaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccattaatc |
12695 |
T |
 |
| Q |
157 |
atgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12694 |
atgaaacatatcacaattcatcaacaatcatgcataattcaccaattgagcata |
12641 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 58 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 19175 - 19056
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| Q |
58 |
aacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatc |
156 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||| ||||||| | ||| ||| |
|
|
| T |
19175 |
aacaacaatttatttctcaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccattaatc |
19076 |
T |
 |
| Q |
157 |
atgaaacttatcacaattca |
176 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
19075 |
atgaaacatatcacaattca |
19056 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0706 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:
Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
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| Q |
86 |
atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaaca |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| || || ||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
6788 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaagatctattgatcatcaaacttatcacaattcatcaacaacc |
6689 |
T |
 |
| Q |
186 |
aagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6688 |
atgcataattcaccaattgagcata |
6664 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0597 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:
Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 1223 - 1099
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| Q |
86 |
atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaaca |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||| || || ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1223 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacc |
1124 |
T |
 |
| Q |
186 |
aagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1123 |
atgcataattcaccaattgagcata |
1099 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0122 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:
Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 50 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 24471 - 24368
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| Q |
50 |
aaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatc |
148 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |
|
|
| T |
24471 |
aaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagacatgaattatcatcaacaacatgacatagcaacaacaacaac |
24372 |
T |
 |
| Q |
149 |
aatt |
152 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
24371 |
aatt |
24368 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 236 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 20041 - 19972
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| Q |
236 |
actttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatca |
305 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20041 |
actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatca |
19972 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 236 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 24345 - 24276
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| Q |
236 |
actttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatca |
305 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24345 |
actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatca |
24276 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0574 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:
Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
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Alignment:
| Q |
86 |
atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaaca |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||| | || || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
9752 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacgtcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacc |
9653 |
T |
 |
| Q |
186 |
aagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
| |||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
9652 |
atgcataagtcactaattgagcata |
9628 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0009 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:
Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
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Target Start/End: Original strand, 69415 - 69689
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| Q |
35 |
tcaacccattttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacat |
133 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
69415 |
tcaacccattttacaaaaccaacaacaacacctcaattctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt |
69514 |
T |
 |
| Q |
134 |
atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttct |
232 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||| |||| |||||| || || ||||||| ||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
69515 |
agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcata-attcaacatataacactttca |
69613 |
T |
 |
| Q |
233 |
catactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
69614 |
catactttaaacatgcaatttcacctacaacaattcaattataaccaatttcatgcatttaaacatatcatcataa |
69689 |
T |
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Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| || || ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
186770 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaat--aatcaacaac |
186673 |
T |
 |
| Q |
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aaagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
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186672 |
catgcataattcaccaattgagcata |
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T |
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atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaat-aacaac |
184 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| || || ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
193732 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaat--aatcaacaac |
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T |
 |
| Q |
185 |
aaagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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catgcataattcaccaattgagcata |
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T |
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Target: scaffold0028; HSP #1
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aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagca |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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aacaacatcaattgttcatgaaacttatcacaatttaacaacaacaaagcataattcaccaattgagca |
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T |
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Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| | ||||||| |
|
|
| T |
130486 |
acatcatcaaaatcaaacttcttctttattaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaag |
130585 |
T |
 |
| Q |
106 |
ccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattga |
154 |
Q |
| |
|
|||| | | || ||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
130586 |
ccataattcataatcaacaacatatctcaacaacaacaacatcaattga |
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T |
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tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaa |
183 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||| || || || || ||| ||||||||||||||| |||| | |||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
79547 |
tcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaataatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatggttcacatcataattcaacaacaa |
79646 |
T |
 |
| Q |
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caaagcataattc-accaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
|| | |||||||| ||||||| |||||| |
|
|
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79647 |
catatcataattcaaccaattaagcata |
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T |
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136 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| ||| ||||| || || | |
|
|
| T |
270 |
acccagtttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgagcacccaaggcatgaataatcaacaaaaacatcacttagc |
369 |
T |
 |
| Q |
137 |
aaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt |
203 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
370 |
aacaacaacatcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaataacatagcataattcaacaatt |
436 |
T |
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Target: scaffold0006; HSP #1
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acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcac |
198 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| |||||| || || || ||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||| || | |||||| |
|
|
| T |
197477 |
acccaaaccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacataggacaattcaa |
197378 |
T |
 |
| Q |
199 |
caatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaaca |
297 |
Q |
| |
|
|| || ||||||| |||||| |||| || ||| |||||||||||| || ||| || |||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
197377 |
catttagagcata-attcaacttataacactttcacatactttgaacttgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaatttcatacattcaaaca |
197279 |
T |
 |
| Q |
298 |
tgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |
|
|
| T |
197278 |
tatcatcataa |
197268 |
T |
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Target: scaffold0303; HSP #1
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185 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||||||||||| |||| | ||||| || || ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || | |
|
|
| T |
273 |
atgaatcatgcatactcaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatttattgatcatgaaacttatcataattcatcaattatt |
174 |
T |
 |
| Q |
186 |
aagcataattcaccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
173 |
atgcataattcaccaattgagcata |
149 |
T |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
7927 |
accaattgagcatattttca-catataccactttctcatactttgaacatgaaatttctctaacaacaattcaattataaataacttcatgcattcaaac |
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T |
 |
| Q |
297 |
atgtcatcataa |
308 |
Q |
| |
|
|| |||||||| |
|
|
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ataacatcataa |
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Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| || || ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
7815 |
aacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgat |
7913 |
T |
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Target: scaffold0123; HSP #1
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Q |
| |
|
|||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||| || |||| ||||| | ||||| |
|
|
| T |
8018 |
tcatgaattatgaatacccaagctatgaatcatcaacaacaacatcacatagcaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattccacaacaa |
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T |
 |
| Q |
184 |
caaagcataattca-ccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
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catagcataattcacccaattgagcata |
8145 |
T |
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Target: scaffold0080; HSP #1
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || | |||||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || || | |
|
|
| T |
44087 |
tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt |
43988 |
T |
 |
| Q |
134 |
atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataatt |
195 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||||| | ||||| || |||| ||||||| ||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
43987 |
agcaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacatagcacaatt |
43926 |
T |
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201 |
Q |
| |
|
||||||||||| || | ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||| || |||| ||||||| ||||| | |||||| ||| || | |
|
|
| T |
11121 |
aagccatgaatcataaacaacaacatcacatagcaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaagatagcatatttcaactat |
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T |
 |
| Q |
202 |
ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtc |
301 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| || ||| || |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| || |
|
|
| T |
11221 |
ttgagcata-attcaacatatatcactttcacacactttgaacatgaaatttcacaaacaacaattcaattatcactagtttcatgcattcaaacatatc |
11319 |
T |
 |
| Q |
302 |
atcataa |
308 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
11320 |
atcataa |
11326 |
T |
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Q |
| |
|
|||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
10670 |
tcatgaattatgaacacccaagccatgaatgatcaacaacaacatcacttagcaaaaacaacatcaattgaacatg |
10745 |
T |
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Q |
| |
|
|||||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||| |||| || |||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
70545 |
tcatgaattatgaatacccaagccaagaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaacatcaattgaacatggtcctcatcataattcaacaacaa |
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T |
 |
| Q |
184 |
caaagcataattca-ccaattgagcata |
210 |
Q |
| |
|
| | ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
70445 |
tataacataattcacccaattgagcata |
70418 |
T |
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caagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaa |
201 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||||| || || || ||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| || |||| |||| |||||| || |
|
|
| T |
31046 |
caagccatgaatcatcaacaacagtatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaagaacatagcacaattcaacat |
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T |
 |
| Q |
202 |
tt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatc |
275 |
Q |
| |
|
|| |||||| ||||||||||| || ||| |||||| |||||||| ||| || ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
31146 |
ttaaagcata-attcaacatataacactttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaatccaattatc |
31219 |
T |
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Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| ||||||||| | || ||| ||||||||||||||| |||| || |||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
41658 |
tcatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcatttaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaa |
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T |
 |
| Q |
184 |
caaagcataattcaccaattga |
205 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
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catagcaaaattcaccaattga |
41778 |
T |
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
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tcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttcacaaaaccatcaacaacaa |
12992 |
T |
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Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||| | || ||| ||||||||||||||| |||| || |||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
13516 |
tcatgaat-atgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaa |
13614 |
T |
 |
| Q |
184 |
caaagcataattcaccaattgagca |
208 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
13615 |
catagcaaaattcatcaattgagca |
13639 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0970 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:
Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 185
Target Start/End: Original strand, 2478 - 2564
Alignment:
| Q |
99 |
acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaaca |
185 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||| |||| || |||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
2478 |
acccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaaca |
2564 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0017 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:
Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 47
Target Start/End: Original strand, 12694 - 12734
Alignment:
| Q |
7 |
acatcatcaaattcaaacttcttcattatcaacccatttta |
47 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
12694 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcactatcaacccatttta |
12734 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0090 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:
Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 3427 - 3392
Alignment:
| Q |
7 |
acatcatcaaattcaaacttcttcattatcaaccca |
42 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3427 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaaccca |
3392 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0020 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:
Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 275
Target Start/End: Original strand, 107967 - 108208
Alignment:
| Q |
34 |
atcaacccatttt-acaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgaca |
132 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||| |||||||| | |||||| ||| | |||||| | ||| | |||||||| |||||| |||| |||||| || | |
|
|
| T |
107967 |
atcaacccatttttaaaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcaaaattcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatatct |
108066 |
T |
 |
| Q |
133 |
tatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttc |
231 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||||||| | ||||| | |||||||||||| || ||||| |||||||||| || || ||||||| || || |||||||| ||| |
|
|
| T |
108067 |
taacaacaacaacatcaattaaacatgatcttcatcacaattcaacaataacaa-gcataattcaacatttagagcataatt-cataatataccattttc |
108164 |
T |
 |
| Q |
232 |
tcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatc |
275 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
108165 |
acatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatc |
108208 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1734 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1734
Description:
Target: scaffold1734; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 99
Target Start/End: Original strand, 1364 - 1422
Alignment:
| Q |
42 |
attttacaaaaccactaacaacaattcatttcttgacaacaa-tcatgaatcatgcaaa |
99 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
1364 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaa |
1422 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0816 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0816
Description:
Target: scaffold0816; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 3112 - 3083
Alignment:
| Q |
276 |
cataacttcatacatctaaacatgtcatca |
305 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3112 |
cataacttcatacatctaaacatgtcatca |
3083 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0670 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0670
Description:
Target: scaffold0670; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 7899 - 7723
Alignment:
| Q |
99 |
acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcac |
198 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||| |||||| || | || ||| ||||||||||||| | ||||| || ||||||| |||| ||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
7899 |
acccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaa |
7800 |
T |
 |
| Q |
199 |
caatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtgattcaactaacaacaattcaattatc |
275 |
Q |
| |
|
||||| ||||| | |||| ||||| || ||| |||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7799 |
caattagagcaca-attcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatc |
7723 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0165 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:
Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 203
Target Start/End: Original strand, 29987 - 30091
Alignment:
| Q |
99 |
acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcac |
198 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||| |||||| || | || ||| ||||||||||||| | ||||| || |||||||||||| || |||| |||| |||||| |
|
|
| T |
29987 |
acccaagctatgaatcatcaacaacaatatcgcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaaaaacatagcacaattcaa |
30086 |
T |
 |
| Q |
199 |
caatt |
203 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
30087 |
caatt |
30091 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0018 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:
Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 51380 - 51312
Alignment:
| Q |
140 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagca |
208 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||| || ||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51380 |
aacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcatcaaccacataacataattcaccaattgagca |
51312 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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