View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6240_low_9 (Length: 385)

Name: NF6240_low_9
Description: NF6240
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6240_low_9
NF6240_low_9
[»] chr4 (18 HSPs)
chr4 (1-375)||(17212802-17213176)
chr4 (17-320)||(54364419-54364722)
chr4 (16-320)||(12134598-12134902)
chr4 (55-321)||(17376444-17376711)
chr4 (126-320)||(5371655-5371849)
chr4 (4-320)||(9651249-9651566)
chr4 (116-320)||(14570272-14570476)
chr4 (160-317)||(19082173-19082330)
chr4 (7-113)||(19082061-19082167)
chr4 (189-320)||(12733078-12733209)
chr4 (244-320)||(19558348-19558424)
chr4 (209-320)||(49070753-49070864)
chr4 (188-320)||(24237815-24237947)
chr4 (16-163)||(10238392-10238539)
chr4 (191-320)||(16226295-16226423)
chr4 (193-312)||(19623245-19623364)
chr4 (202-320)||(38763707-38763826)
chr4 (209-306)||(15014429-15014526)
[»] chr6 (17 HSPs)
chr6 (1-375)||(16375224-16375599)
chr6 (49-349)||(17857413-17857712)
chr6 (1-313)||(23220723-23221036)
chr6 (1-307)||(26505777-26506081)
chr6 (17-267)||(4172555-4172805)
chr6 (91-267)||(4228238-4228414)
chr6 (247-375)||(31162090-31162218)
chr6 (4-319)||(26523157-26523470)
chr6 (211-320)||(17084398-17084508)
chr6 (149-221)||(18104642-18104714)
chr6 (188-309)||(22463243-22463365)
chr6 (188-260)||(10445428-10445500)
chr6 (188-307)||(22594452-22594571)
chr6 (189-293)||(29161467-29161571)
chr6 (188-303)||(11373880-11373995)
chr6 (188-293)||(34965865-34965970)
chr6 (219-304)||(19853122-19853206)
[»] scaffold1278 (1 HSPs)
scaffold1278 (14-365)||(428-779)
[»] chr7 (27 HSPs)
chr7 (16-349)||(3193033-3193366)
chr7 (16-320)||(39292630-39292934)
chr7 (16-320)||(15978951-15979255)
chr7 (16-320)||(28719471-28719773)
chr7 (16-320)||(21675805-21676108)
chr7 (16-320)||(44306070-44306374)
chr7 (16-320)||(8564472-8564776)
chr7 (1-267)||(17985807-17986074)
chr7 (50-320)||(21539118-21539389)
chr7 (11-375)||(19066451-19066815)
chr7 (17-226)||(46473032-46473241)
chr7 (18-320)||(16382564-16382864)
chr7 (85-307)||(18080638-18080859)
chr7 (11-320)||(16369282-16369591)
chr7 (20-320)||(12182957-12183254)
chr7 (231-320)||(13617749-13617838)
chr7 (244-320)||(4483744-4483820)
chr7 (189-320)||(14939704-14939836)
chr7 (189-320)||(15367297-15367429)
chr7 (188-260)||(36301409-36301481)
chr7 (188-260)||(38294814-38294886)
chr7 (188-257)||(33556819-33556888)
chr7 (232-280)||(14276123-14276171)
chr7 (209-293)||(9322193-9322277)
chr7 (188-306)||(20584011-20584128)
chr7 (188-278)||(13350982-13351072)
chr7 (258-310)||(31500149-31500201)
[»] chr1 (14 HSPs)
chr1 (16-293)||(76908-77185)
chr1 (124-320)||(20822004-20822200)
chr1 (209-320)||(33396316-33396428)
chr1 (189-320)||(40437406-40437537)
chr1 (151-320)||(21224200-21224368)
chr1 (188-260)||(34392210-34392282)
chr1 (189-320)||(52400233-52400365)
chr1 (188-293)||(20193050-20193155)
chr1 (14-114)||(9785071-9785170)
chr1 (209-306)||(8539111-8539208)
chr1 (209-306)||(8604350-8604447)
chr1 (247-320)||(49998509-49998583)
chr1 (248-320)||(46144701-46144774)
chr1 (209-284)||(21194098-21194174)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (16-320)||(4972-5274)
[»] chr2 (17 HSPs)
chr2 (49-320)||(22331734-22332006)
chr2 (16-320)||(43641732-43642036)
chr2 (18-310)||(19434426-19434718)
chr2 (19-305)||(29113238-29113524)
chr2 (16-320)||(24840816-24841119)
chr2 (16-313)||(20272382-20272668)
chr2 (149-320)||(45618416-45618587)
chr2 (150-320)||(24561851-24562021)
chr2 (4-320)||(23166824-23167140)
chr2 (4-320)||(23578081-23578397)
chr2 (188-320)||(18534843-18534975)
chr2 (189-320)||(6093849-6093980)
chr2 (188-260)||(23799536-23799608)
chr2 (16-126)||(7320550-7320660)
chr2 (195-293)||(25133135-25133234)
chr2 (209-284)||(24276828-24276904)
chr2 (209-284)||(22787186-22787262)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (16-320)||(11543530-11543833)
chr8 (7-320)||(18118885-18119192)
chr8 (16-320)||(20176831-20177135)
chr8 (16-320)||(20221558-20221862)
chr8 (19-320)||(19332465-19332767)
chr8 (18-320)||(22312685-22312985)
chr8 (144-320)||(3845120-3845296)
chr8 (13-320)||(25294985-25295292)
chr8 (50-320)||(25757005-25757275)
chr8 (16-320)||(45560064-45560368)
chr8 (2-280)||(17500983-17501261)
chr8 (117-376)||(24906756-24907015)
chr8 (188-293)||(22498407-22498512)
chr8 (189-320)||(7469179-7469311)
chr8 (188-290)||(22886812-22886914)
chr8 (188-320)||(24238610-24238742)
chr8 (189-320)||(38636798-38636930)
chr8 (188-284)||(18042650-18042747)
chr8 (271-320)||(25609062-25609111)
chr8 (16-133)||(34012912-34013029)
chr8 (219-293)||(33171213-33171287)
chr8 (247-293)||(16001046-16001092)
chr8 (244-293)||(25609178-25609228)
chr8 (245-306)||(37654832-37654892)
[»] chr5 (15 HSPs)
chr5 (16-320)||(14342613-14342917)
chr5 (16-320)||(21108525-21108829)
chr5 (16-320)||(24226431-24226736)
chr5 (126-320)||(20455061-20455247)
chr5 (188-320)||(11964966-11965098)
chr5 (149-320)||(33627485-33627655)
chr5 (231-320)||(23414149-23414238)
chr5 (232-312)||(19872798-19872878)
chr5 (16-133)||(33150254-33150371)
chr5 (14-127)||(20313661-20313774)
chr5 (202-309)||(26560940-26561048)
chr5 (192-307)||(16836447-16836561)
chr5 (245-320)||(20833185-20833259)
chr5 (202-309)||(5622581-5622689)
chr5 (188-236)||(11764618-11764666)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (17-320)||(9827-10132)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (92-321)||(8152-8381)
[»] chr3 (24 HSPs)
chr3 (38-320)||(8603637-8603921)
chr3 (19-320)||(40040076-40040377)
chr3 (17-320)||(37917325-37917628)
chr3 (62-320)||(25104969-25105225)
chr3 (16-321)||(17759289-17759594)
chr3 (16-321)||(19060609-19060914)
chr3 (5-320)||(14969843-14970156)
chr3 (186-320)||(11401591-11401725)
chr3 (189-320)||(38376831-38376962)
chr3 (244-320)||(5229188-5229264)
chr3 (144-306)||(17392372-17392534)
chr3 (188-287)||(14181133-14181232)
chr3 (188-260)||(12918084-12918156)
chr3 (209-312)||(11516638-11516741)
chr3 (19-166)||(15549573-15549720)
chr3 (16-162)||(18738909-18739053)
chr3 (188-260)||(45804098-45804170)
chr3 (247-320)||(43428727-43428801)
chr3 (243-306)||(41660533-41660595)
chr3 (247-304)||(18969037-18969095)
chr3 (209-306)||(33370012-33370109)
chr3 (212-290)||(17319733-17319812)
chr3 (251-312)||(10903312-10903373)
chr3 (202-309)||(21167868-21167976)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (16-320)||(13813-14117)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (16-320)||(11598-11900)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (118-320)||(14799-15001)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (55-305)||(76006-76254)
[»] scaffold1957 (1 HSPs)
scaffold1957 (92-281)||(837-1025)
[»] scaffold0090 (5 HSPs)
scaffold0090 (149-313)||(35789-35952)
scaffold0090 (16-226)||(4223-4433)
scaffold0090 (244-320)||(1338-1414)
scaffold0090 (244-320)||(5718-5794)
scaffold0090 (177-226)||(1-50)
[»] scaffold1204 (2 HSPs)
scaffold1204 (16-204)||(1089-1277)
scaffold1204 (244-320)||(1297-1373)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (153-319)||(255380-255546)
[»] scaffold0601 (1 HSPs)
scaffold0601 (182-320)||(2118-2255)
[»] scaffold0452 (1 HSPs)
scaffold0452 (18-263)||(8390-8634)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (192-320)||(4871-4999)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (116-320)||(246900-247104)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (163-319)||(21081-21236)
[»] scaffold0468 (2 HSPs)
scaffold0468 (16-257)||(11957-12198)
scaffold0468 (276-312)||(12200-12235)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (149-320)||(39117-39289)
[»] scaffold0258 (1 HSPs)
scaffold0258 (27-319)||(9060-9350)
[»] scaffold0205 (2 HSPs)
scaffold0205 (16-140)||(7149-7273)
scaffold0205 (89-128)||(7115-7154)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (83-206)||(118547-118670)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (211-320)||(44739-44848)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (188-320)||(34570-34702)
[»] scaffold0153 (1 HSPs)
scaffold0153 (244-305)||(807-868)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (189-282)||(6694-6787)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (219-284)||(3637-3702)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (241-307)||(3996-4061)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (245-306)||(84499-84559)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 18)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Original strand, 17212802 - 17213176
Alignment:
Q  1 tttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttgg 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  17212802 tttgtcgtatttagccggtgaaacgtacatgcatactcaagtgcacttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattggaatttgtttaattgg 17212901  T
Q  101 ttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtgg 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  17212902 ttttgtttcaattgcttcaattattttaaagttgtaaaatgatagacaaactttgtcaaaaataatctttaagatcaaatatttgacaaatcttttgtgg 17213001  T
Q  201 atagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17213002 atagtttgatatgattatatgaaaatgtgtgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttctcctttacttgaattgtg 17213101  T
Q  301 agaaattgtatgaagttgttatgacgttggttgatagttgtggtaatgaatatgttgataatgatgtggtgatga 375  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17213102 agaaattgtatgaagttgttgtgacgttggttgatagttgtgataatgaatatgttgataatgatgtggtgatga 17213176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 320
Target Start/End: Original strand, 54364419 - 54364722
Alignment:
Q  17 ggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgct 116  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||| || | ||||| ||||||||| || ||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||      
T  54364419 ggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagtatacgcatagtcgaggccctagaatttatttacttggttttggttcatttgtc 54364518  T
Q  117 tcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgatt 216  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54364519 tcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataatctttaggcccaaatacttggaaaatcttttgtagatagtttgatatgatt 54364618  T
Q  217 atatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagt 316  Q
    ||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  54364619 atacgaagatatgtgaatgattgttaggtgttgaatatgatatttatcataaggtgttgtattttctcctttacttggattgtgagaaatagtatgatgt 54364718  T
Q  317 tgtt 320  Q
    ||||    
T  54364719 tgtt 54364722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 320
Target Start/End: Original strand, 12134598 - 12134902
Alignment:
Q  16 cggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgc 115  Q
    |||||| ||| ||||| ||| ||||||  | | ||||| ||||||||  ||| |||||||||||   |||| ||| |||||||| ||||||||||||||     
T  12134598 cggtgatacgcacatgtatattcaactatactcatatgtgatctaagcttatacatagttgaggtcctagagtttatttacttgattttggttcaattgt 12134697  T
Q  116 ttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgat 215  Q
     ||||||||||||||||| |||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  12134698 ctcaattattttaaagttgtaatttgagagacgaactttgtcgaaaataatctttaacaccaaatacttggcaaatcttttgtgtatagtttgttatgat 12134797  T
Q  216 tatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaag 315  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||| ||    
T  12134798 tatatgaagatatgtgaatgattgttaggttttgaatatgatgtttatcataaagtgttgtattttctcttttacttggattgtgagaaagtatatggag 12134897  T
Q  316 ttgtt 320  Q
    |||||    
T  12134898 ttgtt 12134902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 55 - 321
Target Start/End: Original strand, 17376444 - 17376711
Alignment:
Q  55 gatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgttt-acttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactt 153  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| |  |||| ||| ||| |||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||| | |||| | |||  |||||    
T  17376444 gatctaagtgtatacatagtcgagaccctagagtttattttacttggctttggtccaattgtttccattattttaaagttgtgaaataagagatgaactt 17376543  T
Q  154 tgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaata 253  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||    
T  17376544 tgttgaaaagaatctttaagaccaaatacttggaaaatcttttgtggatagtttgatatgattgtatgaagatatgtgaatgctttctaagtgttgaata 17376643  T
Q  254 tgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtta 321  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  17376644 tgatgtttatcatagtgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattatatggggttgtta 17376711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 126 - 320
Target Start/End: Original strand, 5371655 - 5371849
Alignment:
Q  126 ttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaaga 225  Q
    |||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5371655 ttaaagttgtaaaataagagacatactttgtcgaaaataatctttaagagtaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaaga 5371754  T
Q  226 tgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 320  Q
    | || ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  5371755 tatgtgaatgttttctatgtgttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttctcctttgcctgaattgtgagaaactgtatggagttgtt 5371849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 9651566 - 9651249
Alignment:
Q  4 gtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttt 103  Q
    ||||||||| | ||||||| || ||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||    
T  9651566 gtcgtatttggccggtgaagcgcacatctatactcaactgcacttatatgtgatctaagtgtatacatagttaagacattagaatttgtttgcttagttt 9651467  T
Q  104 tggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggata 203  Q
    || |||||||     ||||  ||| ||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||  ||||||| ||||| | |||||| |||    
T  9651466 tgattcaattttcataattgattttaagttgtgaaacgatagacgaactttgtcgaaaatgatctttgaaactgaatattttgcaaaccatttgtgaata 9651367  T
Q  204 gtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgta-ttttctcctttacttgaattgtgag 302  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||  ||  ||||||||    
T  9651366 gtttgatatgattgtatgaagatgtatgaatgattaataggtgttgaacatgatgtttatcatgatgtgatgtacttttctcctttgttttgattgtgag 9651267  T
Q  303 aaattgtatgaagttgtt 320  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  9651266 aaattatatgaagttgtt 9651249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 116 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 14570476 - 14570272
Alignment:
Q  116 ttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgat 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||| |||| || || ||||    
T  14570476 ttcaattattttaaagttgtaaaatgatagacgaaccttgtcgaaaataatctttaagacaagatacttgacaaatcttttgtgaatagctttatgtgat 14570377  T
Q  216 tatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaag 315  Q
    || || ||| |||  ||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||| ||   ||  ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||| |    
T  14570376 tacataaaggtgtatgaatgattgatagatgttgaaaatgatatttatcttagtatgaagtattttctcctttattttgattgtgagaaatagtatgatg 14570277  T
Q  316 ttgtt 320  Q
    |||||    
T  14570276 ttgtt 14570272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 160 - 317
Target Start/End: Original strand, 19082173 - 19082330
Alignment:
Q  160 aaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgt 259  Q
    |||| ||||||||| |  |||| || |||||| ||||||| |||| || |||||||||||| |||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19082173 aaatgatctttaaggctgaatactttgcaaatattttgtgaatagctttatatgattatattaagatgtatgaaggattgataggtgttgaatatgatgt 19082272  T
Q  260 ttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagtt 317  Q
    ||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19082273 ttatcttagcgtgatatattttctcctttacttgaattgtaagaaattgcatgaagtt 19082330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Original strand, 19082061 - 19082167
Alignment:
Q  7 gtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttgg 106  Q
    |||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  19082061 gtatttggccggtgaaacgcacatgtatactcaactgcacttatatgtgaactaagtgtatacatagttgaggcactagaatttgtttacttagttttgg 19082160  T
Q  107 ttcaatt 113  Q
    |||||||    
T  19082161 ttcaatt 19082167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 189 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 12733209 - 12733078
Alignment:
Q  189 aatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctccttt 288  Q
    ||||||| ||| |||| || ||||||| | |||||||| || |||| |||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12733209 aatctttcgtgaatagctttatatgatcaaatgaagatatgtgaataattgttacgtgttgaacatgatgtttatcataaggtgttgtattttctccttt 12733110  T
Q  289 acttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 320  Q
    ||||| |||||||||||| ||  |||||||||    
T  12733109 acttgtattgtgagaaatggtgcgaagttgtt 12733078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 244 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 19558424 - 19558348
Alignment:
Q  244 gtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 320  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  19558424 gtgttggatatgatgtttatcataatgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatcgagttgtt 19558348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 209 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 49070864 - 49070753
Alignment:
Q  209 atatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattg 308  Q
    ||||||||| |||||||| || || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |     
T  49070864 atatgattaaatgaagatatgtgagtgattgttaggtgttgaatatgatatttatgataaggtgttgtattctctcctttacttggattgtgagaaagta 49070765  T
Q  309 tatgaagttgtt 320  Q
    |||| |||||||    
T  49070764 tatggagttgtt 49070753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 188 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 24237947 - 24237815
Alignment:
Q  188 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctt 287  Q
    |||||||| ||| |||| || ||||||||| |||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  24237947 aaatctttcgtgaatagctttatatgattaaatgaagatatgttaatgatttttaggtgttgaatatgatatttatcataaggttttgtattttctcctt 24237848  T
Q  288 tacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 320  Q
    |||||| ||| | ||||  |||||| |||||||    
T  24237847 tacttggattataagaacgtgtatggagttgtt 24237815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 163
Target Start/End: Original strand, 10238392 - 10238539
Alignment:
Q  16 cggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgc 115  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||| || | ||||| ||||||||||||| |||||| |||||  |||| ||| |||||||||| || ||||| |||     
T  10238392 cggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggtgttagttcatttgt 10238491  T
Q  116 ttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaat 163  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||| |||||    
T  10238492 ctcaattattttaaagttgtaaaatgagagttgaactttgtcaaaaat 10238539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 191 - 320
Target Start/End: Original strand, 16226295 - 16226423
Alignment:
Q  191 tcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttac 290  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||| |||| |||||| ||||   | |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  16226295 tctttcgtgaatagctttatatgattaaatgatgatgtgtgaatttcttctaggtgttgaatatgaaatttatcataatgtgttgtattttct-cgttac 16226393  T
Q  291 ttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 320  Q
    ||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  16226394 ttggattgtgaggaattgtatggagttgtt 16226423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 193 - 312
Target Start/End: Original strand, 19623245 - 19623364
Alignment:
Q  193 ttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttactt 292  Q
    ||||||| |||| ||  |||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||  || |||||||||| ||||||||    
T  19623245 ttttgtgaatagctttgtatgattacataaagatgtatgaatgattgctaggtgtcgaaaatgatatttatcttaatatgatgtattttcttctttactt 19623344  T
Q  293 gaattgtgagaaattgtatg 312  Q
      |||||||||| |||||||    
T  19623345 tgattgtgagaagttgtatg 19623364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 38763826 - 38763707
Alignment:
Q  202 tagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtatttt-ctcctttacttgaattgtg 300  Q
    |||||||||| ||||  |||||||| || || | ||||  |||| || |||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||| ||    
T  38763826 tagtttgatacgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgaggtcttaaatatgatatttatcattaggtgttgtattttcctcctttacttgtattatg 38763727  T
Q  301 agaaattgtatgaagttgtt 320  Q
    | || |||||||||||||||    
T  38763726 aaaagttgtatgaagttgtt 38763707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 306
Target Start/End: Original strand, 15014429 - 15014526
Alignment:
Q  209 atatgattatatgaagatgtgcgaatga-ttgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaat 306  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||| ||| ||  ||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||    
T  15014429 atatgactaaatgaagatgtgtgaatgaattgttatatgttggatatgatatttatcataagttgttgtattttct-ctttacttggaatatgagaaat 15014526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 17)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 16375599 - 16375224
Alignment:
Q  1 tttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttgg 100  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  16375599 tttgtcatatttagccggtgaaacgtagatgcatactcaactccacttatatgtgatctaagtgtatgcaaagttgaggcattagaatttctttgcttgg 16375500  T
Q  101 tttt-ggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtg 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||| ||||| |    
T  16375499 tttttggttcaattgcttcaattattttaaagttgttaaatgatagacgaactttgtcgaaaataatctttaagacctaatacttgaaaaatattttggg 16375400  T
Q  200 gatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16375399 gatagtttgatatgattatatgaagatgtgtgaatgatttctaggtgtggaatatgatgtttatcatagtgtgttgtattttctcctttacttgaattgt 16375300  T
Q  300 gagaaattgtatgaagttgttatgacgttggttgatagttgtggtaatgaatatgttgataatgatgtggtgatga 375  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| || || || |||||||||    
T  16375299 gagaaattgtatgaagttgttgtgatgttggttgatagttgtgataatgattatgttaatgataatatggtgatga 16375224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 49 - 349
Target Start/End: Original strand, 17857413 - 17857712
Alignment:
Q  49 atatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagaca 148  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||||  |||| ||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  17857413 atatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttgtctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacg 17857512  T
Q  149 aactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgtt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||    
T  17857513 aactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatacttggcaaatcttttttggatagtttgatatgattatatgaagatatgttaatgatagctaggtgtt 17857612  T
Q  249 gaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgttatgacgttggttgatagttgtggtaatg 348  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||  ||| |||||| ||||| |||||    
T  17857613 gaacatgatatttatcataatgtgttgtattttcttctttacttgaattgtgagaacttgtatgga-ttgttatgattttgattgataattgtgataatg 17857711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 23221036 - 23220723
Alignment:
Q  1 tttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttgg 100  Q
    ||||||||| || | |||||||||  ||||| ||| |||||| || | ||||| ||||||| | ||| |||||| ||| |  |||| ||| |||||||||    
T  23221036 tttgtcgtagttggccggtgaaacacacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaattttatacatagtcgagaccctagagtttatttacttgg 23220937  T
Q  101 ttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatc-ttttgtg 199  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||    
T  23220936 ttttggttcaattgtctcaattattttaaagttgtaatatgagagacgaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatacttgccaaatctttttctg 23220837  T
Q  200 gatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgt 299  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  23220836 gataatttgatattattatatgaagatatgtgaatgatttctaggtgtttaatatgatgtttatcataatgtgtttcattttctcctttacttgaattgt 23220737  T
Q  300 gagaaattgtatga 313  Q
    |||||||| |||||    
T  23220736 gagaaattatatga 23220723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 26506081 - 26505777
Alignment:
Q  1 tttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttgg 100  Q
    ||||||||| || | |||||||||| ||||| | | |||||| || | ||||| ||||||||| ||| ||| || |||||  |||| ||| |||||||||    
T  26506081 tttgtcgtagttggccggtgaaacgcacatgtacattcaactacactcatatgtgatctaagtatatacattgtcgaggccctagagtttatttacttgg 26505982  T
Q  101 ttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtgg 200  Q
    |||||| ||| |||  |||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  26505981 ttttggctca-ttgtctcaattatattaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataatctttaagaccaattacttggcaaatcttttgtgg 26505883  T
Q  201 atagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtg 300  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| || |||    
T  26505882 atagtttgatatgattaaatgaagatatgtgaatgattgttaggtgttgaatatgatgtttatca-aatgtgttgtattttctcatttacttggatcgtg 26505784  T
Q  301 agaaatt 307  Q
    |||||||    
T  26505783 agaaatt 26505777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 267
Target Start/End: Original strand, 4172555 - 4172805
Alignment:
Q  17 ggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgct 116  Q
    ||||| ||| ||||| ||||| |||| || | ||| | |||||||| |||| || |||||||||| | || || ||||| || |||||||||||||||      
T  4172555 ggtgatacgcacatgtatacttaactacactcataagtgatctaagagtatacaaagttgaggcacttgacttggtttatttagttttggttcaattgtc 4172654  T
Q  117 tcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgatt 216  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||   ||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  4172655 tcaattgtgttaaagttgtaaaatgatagacgaactttgtcgaaaatgatctttaagattgaatatcttgcaaatcttttgtgaatagtttgacatgatt 4172754  T
Q  217 atatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcata 267  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4172755 atatgaagatgtatgaatgattgataggtgttgaatatgatgtttatcata 4172805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 91 - 267
Target Start/End: Original strand, 4228238 - 4228414
Alignment:
Q  91 gtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaa 190  Q
    ||||| || |||||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||    
T  4228238 gtttatttagttttggttcaattgtctcaattgtgttaaagttgtaaaatgatagacgaactttgtcgaaaatgatctttaagaccgaatatcttgcaaa 4228337  T
Q  191 tcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcata 267  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4228338 tcttttgtgaatagtttgacatgattatatgaatatgtatgaatgattgataggtgttgaatatgatgtttatcata 4228414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 247 - 375
Target Start/End: Original strand, 31162090 - 31162218
Alignment:
Q  247 ttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgttatgacgttggttgatagttgtggtaa 346  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||    
T  31162090 ttgaatatgatgtttatcataaggtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaactgtatgaagttgttgtgatgttggttgatagttgtgataa 31162189  T
Q  347 tgaatatgttgataatgatgtggtgatga 375  Q
    ||| |||||| || || ||||||||||||    
T  31162190 tgattatgttaatgataatgtggtgatga 31162218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 319
Target Start/End: Original strand, 26523157 - 26523470
Alignment:
Q  4 gtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttt 103  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||  || ||||    
T  26523157 gtcgtatttaatcggtgaaaagcacatgtatactcaactgcactcatatgtgatctaagtgtatacatagttgaggcagtagaatttatttggttagttt 26523256  T
Q  104 tggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggata 203  Q
     | ||||||||  ||||||  || |||||| | ||| || | || ||| |||||  |||| |||||||||||| | || ||  ||||||||||||| |||    
T  26523257 ggattcaattgtctcaatt-cttcaaagttgtgaaacgacatacgaac-ttgtcagaaatgatctttaagaccgagtacttttcaaatcttttgtgtata 26523354  T
Q  204 gtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgatt-gctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgag 302  Q
    | |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||  ||| |||   || |||||||  | | ||||||||||||||||    
T  26523355 gcttgatatgattatacgaagatgtgtgaatgattagttaggtgttgaatatgatg-atataatagtatgatgtatttctttcgttacttgaattgtgag 26523453  T
Q  303 aaattgtatgaagttgt 319  Q
    ||||| |||||| ||||    
T  26523454 aaattatatgaaattgt 26523470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 211 - 320
Target Start/End: Original strand, 17084398 - 17084508
Alignment:
Q  211 atgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtg-ttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgt 309  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  17084398 atgattatatgaagatatgtgaatgctttttaggtgattgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttctcatttacttgtattgtgagaaattgt 17084497  T
Q  310 atgaagttgtt 320  Q
    ||| |||||||    
T  17084498 atggagttgtt 17084508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 149 - 221
Target Start/End: Original strand, 18104642 - 18104714
Alignment:
Q  149 aactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18104642 aactttgtcgaaaataatctttaagatcaaatacttggcaaatctttcgtggatagtttgatatgattatatg 18104714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 188 - 309
Target Start/End: Original strand, 22463243 - 22463365
Alignment:
Q  188 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtatttt-ctcct 286  Q
    |||||||||||| |||| || ||||||||  |||||||| || || | ||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  22463243 aaatcttttgtgaatagctttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgaggtcttgaatatgatgtttatcataaggtgttgtattttcctcct 22463342  T
Q  287 ttacttgaattgtgagaaattgt 309  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  22463343 ttacttggattgtgagaaattgt 22463365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 188 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 10445500 - 10445428
Alignment:
Q  188 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtt 260  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10445500 aaatcttttgtggataatttgatatgattatatggagatatttgaatgattgctatgtgttgaatatgatgtt 10445428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 307
Target Start/End: Original strand, 22594452 - 22594571
Alignment:
Q  188 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatga-ttgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcct 286  Q
    ||||||||| || |||| || |||||||||||||||||| |  || ||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||    
T  22594452 aaatcttttatgaatagatttatatgattatatgaagatatttgagtgacttgttaggtgttggatatgatgttcatcataaggtgttgtatttcct-ct 22594550  T
Q  287 ttacttgaattgtgagaaatt 307  Q
    ||||||| | |||| ||||||    
T  22594551 ttacttggaatgtgggaaatt 22594571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 293
Target Start/End: Original strand, 29161467 - 29161571
Alignment:
Q  189 aatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctccttt 288  Q
    ||||||||||  |||| || || ||| || |||||||| || || | |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  29161467 aatcttttgtaaatagctttatgtgactaaatgaagatatgtgagtaattgttaagtgttgaatatgatgtttatcataatgtgaagtattttctccttt 29161566  T
Q  289 acttg 293  Q
    |||||    
T  29161567 acttg 29161571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 303
Target Start/End: Original strand, 11373880 - 11373995
Alignment:
Q  188 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctt 287  Q
    |||||||| ||| |||| || ||||||||  |||||||| || |||||||||||| || ||  ||  || ||||||| ||| |  |||||||||||||||    
T  11373880 aaatctttcgtgaatagctttatatgattgaatgaagatatgtgaatgattgctaagttttttatgcgaggtttatcctaatgctttgtattttctcctt 11373979  T
Q  288 tacttgaattgtgaga 303  Q
    |||||| |||||||||    
T  11373980 tacttggattgtgaga 11373995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 34965970 - 34965865
Alignment:
Q  188 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatga-ttgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcct 286  Q
    |||||||| |||  ||| || ||||||||| |||||||| ||  ||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  34965970 aaatctttcgtgactagctttatatgattaaatgaagatatgtaaatgaattgttagatgttgaatatgatatttatcataaggtgttttattttct-ct 34965872  T
Q  287 ttacttg 293  Q
    |||||||    
T  34965871 ttacttg 34965865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 219 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 19853206 - 19853122
Alignment:
Q  219 atgaagatgtgcgaatga-ttgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaa 304  Q
    ||||||||||| |||||| ||| || |||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||  ||||||||| | ||||||    
T  19853206 atgaagatgtgtgaatgaattgttaagtgttggatatgatatttatcatagggtgttgtattttctc--ttacttgaaatatgagaa 19853122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1278 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold1278
Description:

Target: scaffold1278; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 779 - 428
Alignment:
Q  14 gtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||| || ||| ||| || | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||| ||| |||||| |||||||    
T  779 gtcggtgaaacgtacatgtatgctctactccactcatatgtgatctaagtgtatacatagttgaggcattgaaacttgtttgcttagttttgattcaatt 680  T
Q  114 gcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatg 213  Q
    |  |||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  679 gtctcaattgtttcaaagttgtaaaatgatagacgaactttgtcgaaaatgatctttaagaccaactacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatg 580  T
Q  214 attatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatga 313  Q
    |||||||||||||||   |||| || |||| ||| |||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  579 attatatgaagatgtattaatggtttctagttgtggaatatgatgcttatcataatatgttgtgttttctcctttacttgaattgtgagacattgtatga 480  T
Q  314 agttgttatgacgttggttgatagttgtggtaatgaatatgttgataatgat 365  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||  ||||| ||||||||    
T  479 agttgttatgatgttggttgatagttgtgatgatgatcatgttaataatgat 428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 183; Significance: 7e-99; HSPs: 27)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 16 - 349
Target Start/End: Original strand, 3193033 - 3193366
Alignment:
Q  16 cggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgc 115  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||| || | ||||| ||||| ||||||| |||||| |||||  |||| ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  3193033 cggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatcttagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttgt 3193132  T
Q  116 ttcaattatttt-aaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatga 214  Q
     ||||||||||| |||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3193133 ctcaattatttttaaagttgtaaaatgtgagacgaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatga 3193232  T
Q  215 ttatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaa 314  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  3193233 ttatatgaagatatgtgaatgattgctaggtattgaatatgatgtttatcataatttgtcgtattttctcctttacttgaattgtgagaacttgtatgga 3193332  T
Q  315 gttgttatgacgttggttgatagttgtggtaatga 349  Q
     ||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||    
T  3193333 -ttgttatgatgttgattgataattgtgataatga 3193366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 320
Target Start/End: Original strand, 39292630 - 39292934
Alignment:
Q  16 cggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgc 115  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||| || | ||||| | ||||||||||| |||||| |||||   | ||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  39292630 cggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtggtctaagtgtatacatagtcgaggccccataatttatttacttggttttggttcatttgt 39292729  T
Q  116 ttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgat 215  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  39292730 ctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatacttggcaaattgtttgtggatagtttgatatgat 39292829  T
Q  216 tatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaag 315  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||    
T  39292830 tatatgaagatatgtgaatgatttctaggtgttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattctctcctttacgtgtattgtgagaaattgtatggag 39292929  T
Q  316 ttgtt 320  Q
    |||||    
T  39292930 ttgtt 39292934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 320
Target Start/End: Original strand, 15978951 - 15979255
Alignment:
Q  16 cggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgc 115  Q
    |||||||||| ||||| | | ||| || || | ||||| ||||||||||||| |||||| |||||  |||| ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  15978951 cggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttgt 15979050  T
Q  116 ttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgat 215  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15979051 ctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacaaactttgtcaaaaataatcgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgat 15979150  T
Q  216 tatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaag 315  Q
    ||||||||||| |  ||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15979151 tatatgaagatatatgaatgatttttaggtgttgaatattatgtttatcctaatgtgatgtattttctactttacttggattgtgagaaattgtatgaag 15979250  T
Q  316 ttgtt 320  Q
    |||||    
T  15979251 ttgtt 15979255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 28719773 - 28719471
Alignment:
Q  16 cggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgc 115  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| || | ||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  28719773 cggtgaaacgcacatgtatactcaactacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggcct-agagtttatttacttggttttggttcatttgt 28719675  T
Q  116 ttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgat 215  Q
     ||||||||||||||||| ||| |||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  28719674 ctcaattattttaaagttgtaatatgagagatgaactttgtcgaaaataatctt-aagaccaaatacttggaaaatcttttgtggataatttgatatgat 28719576  T
Q  216 tatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaag 315  Q
    ||||||||||| || ||||| ||   | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  28719575 tatatgaagatatgtgaatgctttacatgtgttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttctcttttacttgaattttgagaaattgtatggag 28719476  T
Q  316 ttgtt 320  Q
    |||||    
T  28719475 ttgtt 28719471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 320
Target Start/End: Original strand, 21675805 - 21676108
Alignment:
Q  16 cggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgc 115  Q
    |||||||||| |||||  || |||||| ||   ||||| ||||||||||||| |||||| ||| |  |||| ||| |||| ||||||||| |||| |||     
T  21675805 cggtgaaacgaacatgtgtattcaactacatgcatatgtgatctaagtgtatacatagtagagaccctagagtttatttatttggttttgattcatttgt 21675904  T
Q  116 ttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgat 215  Q
     |||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||     
T  21675905 ctcaattgttttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcggaaataatctt-aagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagttttctatgac 21676003  T
Q  216 tatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaag 315  Q
    |||||||| || || ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21676004 tatatgaatatatgtgaatgctttataggtgttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatggag 21676103  T
Q  316 ttgtt 320  Q
    |||||    
T  21676104 ttgtt 21676108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 16 - 320
Target Start/End: Original strand, 44306070 - 44306374
Alignment:
Q  16 cggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgc 115  Q
    |||||||||| | ||| ||| |||||| || | ||||| ||| |||||||||  |||||  ||||  |||| ||| ||||||||||||||||| | |||     
T  44306070 cggtgaaacgcatatgtatattcaactacactcatatgtgatataagtgtatatatagtcaaggccctagagtttatttacttggttttggttaatttgt 44306169  T
Q  116 ttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgat 215  Q
     ||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44306170 ctcaattattttaaagttgtaatatgagagacgaactttgtcgaaaataatcta-aagaccaaatacttggaaaatcttttgtggatagtttgatatgat 44306268  T
Q  216 tatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttg-aattgtgagaaattgtatgaa 314  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||     
T  44306269 tatatgaagatatgtgaatgattactatgtgttgaatgtgatgtttattataaggtgttgtattttctcctttacttgaaattgtgagaaataatatgat 44306368  T
Q  315 gttgtt 320  Q
    ||||||    
T  44306369 gttgtt 44306374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 320
Target Start/End: Original strand, 8564472 - 8564776
Alignment:
Q  16 cggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgc 115  Q
    |||||||| | ||||| | | |||||| || | ||||| ||||||||| ||| |||||| |||||  |||| ||| ||| ||| |||||||||||||||     
T  8564472 cggtgaaatgcacatgtacattcaactacactcatatgtgatctaagtttatacatagtcgaggccctagagtttattttcttagttttggttcaattgt 8564571  T
Q  116 ttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgat 215  Q
     ||||||||||||||||| ||| |||| |||| || |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  8564572 ctcaattattttaaagttgtaatatgagagacgaattttgtcaaaaataatctttaagtccaaatacttggaaaatcttatgtggatagtttgctatgat 8564671  T
Q  216 tatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaag 315  Q
    ||||||||||| || ||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  8564672 tatatgaagatatgtgaatgctttctaagtgctgaatatgatgtttatcattgtgtgttgtatgttctcctttacttgaattgtgagaaatcgtatggag 8564771  T
Q  316 ttgtt 320  Q
    |||||    
T  8564772 ttgtt 8564776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 17985807 - 17986074
Alignment:
Q  1 tttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttgg 100  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| | |||||   |||| |||||| ||||||||||||||| ||  |||||| |||||    
T  17985807 tttgtcgtagttagccggtgaaacgcacatgtatactctactgcactcatatgtagtctaggtgtatacatagttgaggcattggatcttgttttcttgg 17985906  T
Q  101 ttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaa-gaccaaatatttggcaaatcttttgtg 199  Q
    | ||| || | ||| | |||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  17985907 tcttgatttatttgttccaattattttaaagttgtaaaatgagagatgaactttgtcgaaaataatctttaaagaccaaatacatggcaaatcttttgtg 17986006  T
Q  200 gatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcata 267  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17986007 gatagtttgatataattatatgaagatatgtgaatgattgctaagtgttgaatatgatgtttatcata 17986074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 50 - 320
Target Start/End: Original strand, 21539118 - 21539389
Alignment:
Q  50 tatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaa 149  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||| ||||   |||| ||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  21539118 tatgtgatctaagtctatacatagtcgaggtcctagagtttatttacttggttttggttcatttgtctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacga 21539217  T
Q  150 actttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttg 249  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||| || ||||||||||||| | |||    
T  21539218 actttgttgaaaataatctttaagacctaatacttggcaaatctttggtggatagttggttatgtttatatgaagatatgtgaatgattgctagatattg 21539317  T
Q  250 aatatgat-gtttatcataacgtgttgtattttctcctttactt-gaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 320  Q
    ||||||||  |||||||| | ||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  21539318 aatatgatattttatcatgatgtgatgtattttctcc-ttacttggatttgtgagaaattgtatggagttgtt 21539389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 19066815 - 19066451
Alignment:
Q  11 ttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttca 110  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||| ||   | ||| |||||| ||| || |    
T  19066815 ttagccggtgaaacgcacatgtatactctactgcacttatatgtggtctaggtgtatacatagttgaggcattggatcgtatttgcttggtcttgattta 19066716  T
Q  111 attgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaag-accaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttga 209  Q
     ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||| || |||||||| ||| |||| | |||| | ||||||||     
T  19066715 cttgtttcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaaccttgtcgaaaataatatttgaggaccaaatacttg-caaaacctttgagaatagtttgt 19066617  T
Q  210 tatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgt 309  Q
     |||||||| || |||| || ||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  19066616 gatgattatgtggagatatgtgaatgattgttaggtgctgaacatgaggtttatcataatgtgttgtattttttcttttacttgaattgtgagaaattgc 19066517  T
Q  310 atgaagttgttatgacg-ttggttgatagttgtggtaatgaatatgttgataatgatgtggtgatga 375  Q
    |||| |||||  ||| | |||||||||| ||||| |||||| |||| |||| |||||| ||||||||    
T  19066516 atgatgttgtcgtgatgattggttgataattgtgataatgattatg-tgatgatgatgaggtgatga 19066451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 46473241 - 46473032
Alignment:
Q  17 ggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgct 116  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||| || | ||||| ||||||||| ||| |||||| ||||| ||||| ||| |||||||| |||| |||||||||      
T  46473241 ggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagtttatacatagtcgaggccttagagtttatttacttgatttttgttcaattgtc 46473142  T
Q  117 tcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgatt 216  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46473141 tcaattattttaaagttgtaatatgagagacgaactttgtcgaaaataatctttaagatcaaatacttagcaaatcttttgtggatagtttgatatgatt 46473042  T
Q  217 atatgaagat 226  Q
    ||||||||||    
T  46473041 atatgaagat 46473032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 16382864 - 16382564
Alignment:
Q  18 gtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttg-gttcaattgct 116  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| || | ||||| ||||||||||||| |||||| |||||  |||| ||| |||||||| ||||  ||||| |||      
T  16382864 gtgaaacgcacatgtatactcaactacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttgtttttaagttcatttgtc 16382765  T
Q  117 tcaattattttaaagttctaa----aatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatat 212  Q
    ||||||||||||||||| |||    ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||       |||||| |||||||| | |||    
T  16382764 tcaattattttaaagttgtaattaaaatgagagatgaactttgtcgaaaataatctttaagaccaattactt-------cttttgcggatagttcgttat 16382672  T
Q  213 gattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatg 312  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||    
T  16382671 gattatatgaagatatgtgaatgattgttaggtgttgaatatgatgtttattataaggtgttgtattttctcctttacttggattatgagaaagtatatg 16382572  T
Q  313 aagttgtt 320  Q
     |||||||    
T  16382571 gagttgtt 16382564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 85 - 307
Target Start/End: Original strand, 18080638 - 18080859
Alignment:
Q  85 gaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatattt 184  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  18080638 gaatttatttacttggttttgcttcatttgtctcaattattttaaagttgtaaattgagagacgaactttgtcgaaaataatctttaagaccaattactt 18080737  T
Q  185 ggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctc 284  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||  ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||     
T  18080738 ggaaaatcttttgtggatagctttatatgattatgtgaagatatgtgaatgattgttaggcattggatatgatgttcatcataacgtattgtattttct- 18080836  T
Q  285 ctttacttgaattgtgagaaatt 307  Q
    ||||||||| | |||| ||||||    
T  18080837 ctttacttggaatgtgggaaatt 18080859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 320
Target Start/End: Original strand, 16369282 - 16369591
Alignment:
Q  11 ttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttca 110  Q
    ||||| ||||||||| ||||| || ||| |||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||| | |  ||||||  ||| ||| |  ||     
T  16369282 ttagttggtgaaacgcacatgtatcctctactgcaattatatgtggtgtaagtgtatgcatagttgaggcatcataccttgtttgtttgatttcgactcc 16369381  T
Q  111 attgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgat 210  Q
     ||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16369382 tttgttccaattactttaaagttttaaaatgatagacgaaccttgtcgaaagtaatctttaagaccaaatacttgacaaatcttttgtggatagtttgat 16369481  T
Q  211 atgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgta 310  Q
    |||| |||||| ||||||  ||||||||  |||| |||||||||||||| |||||| |  ||  ||||||||||  ||||||  ||| |||||||| |||    
T  16369482 atgactatatgtagatgtatgaatgatttataggagttgaatatgatgtgtatcatgatatggcgtattttctctcttactttgattatgagaaatggta 16369581  T
Q  311 tgaagttgtt 320  Q
     |||||||||    
T  16369582 ggaagttgtt 16369591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 12183254 - 12182957
Alignment:
Q  20 gaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgcttca 119  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| | ||| ||  ||  |||||| |||||||||  ||    
T  12183254 gaaacgcacatgtatactcaactgcacttatatgtgatctaagagtatacatagttgaggcattatagtttttt--ctcagttttgattcaattgccaca 12183157  T
Q  120 attattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattata 219  Q
    ||| ||| ||||||  |||| ||||||| |||| |||| ||||| | ||||||   | ||||| | | |||||||||| |   |||||||||||||||||    
T  12183156 attgttt-aaagttgaaaaacgatagacgaactctgtcaaaaatgacctttaatgtcgaatatcttgtaaatcttttgagatcagtttgatatgattata 12183058  T
Q  220 tgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgt 319  Q
    ||||| |||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||   || || ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||  ||||||    
T  12183057 tgaagttgtgtgaatgatttatagatgttgaatatgatgtttatcatagtatgatggattttcttcgttacttgaattgtgagatattgtatagagttgt 12182958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 231 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 13617838 - 13617749
Alignment:
Q  231 gaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 320  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||    
T  13617838 gaatgattgttaggtgctgaatatgatgtttattataaggtgttgtattttctcctttacttggaatgtgagaaagtgtatggagttgtt 13617749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 244 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 4483820 - 4483744
Alignment:
Q  244 gtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4483820 gtgttgaatatgatgtttatcataatatgttgtattttcccctttatttgaattgtgagaaattgtatggagttgtt 4483744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 189 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 14939836 - 14939704
Alignment:
Q  189 aatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtatttt-ctcctt 287  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||  |||||||| || || | ||||  |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  14939836 aatcttttgtgattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgaggtcttgaatatgatatttatcataaggtgttgtattttcctcctt 14939737  T
Q  288 tacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 320  Q
    |||||| ||| |||||| || ||||||||||||    
T  14939736 tacttgtattatgagaagttatatgaagttgtt 14939704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 189 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 15367429 - 15367297
Alignment:
Q  189 aatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtatttt-ctcctt 287  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||  |||||||| || || | ||||  |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  15367429 aatcttttgtgattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgaggtcttgaatatgatatttatcataaggtgttgtattttcctcctt 15367330  T
Q  288 tacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 320  Q
    |||||| ||| |||||| || ||||||||||||    
T  15367329 tacttgtattatgagaagttatatgaagttgtt 15367297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 188 - 260
Target Start/End: Original strand, 36301409 - 36301481
Alignment:
Q  188 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtt 260  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36301409 aaatcttttgtggataatttgatatgattatatggagatatttgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtt 36301481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 188 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 38294886 - 38294814
Alignment:
Q  188 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38294886 aaatcttttgtggataaattgatatgattatatggagatatttgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtt 38294814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 257
Target Start/End: Original strand, 33556819 - 33556888
Alignment:
Q  188 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgat 257  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  |||| |||||||||||||| |||||||    
T  33556819 aaatcttttgtggataatttgatatgattatatggagatatttgaataattgctaggtgttgtatatgat 33556888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 280
Target Start/End: Original strand, 14276123 - 14276171
Alignment:
Q  232 aatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattt 280  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14276123 aatgattgataggtgttgaatatgatgtttatcataaggtgttgtattt 14276171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 293
Target Start/End: Original strand, 9322193 - 9322277
Alignment:
Q  209 atatgattatatgaagatgtgcgaatga-ttgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttg 293  Q
    |||||| || |||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  9322193 atatgactaaatgaagatatgtgaatgaattgttaggtgttgaatatgatatttatcataaggtgttgcattttct-ctttacttg 9322277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 306
Target Start/End: Original strand, 20584011 - 20584128
Alignment:
Q  188 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatga-ttgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcct 286  Q
    |||||||| |||  ||| || |||||| || ||||||||  | |||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||      
T  20584011 aaatctttcgtgactagctttatatgactaaatgaagatacgtgaatgaattgttaagtgttggatatgatgtttatcatagggtgttgtattttctc-- 20584108  T
Q  287 ttacttgaattgtgagaaat 306  Q
    ||||||||| | ||||||||    
T  20584109 ttacttgaaatatgagaaat 20584128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 13351072 - 13350982
Alignment:
Q  188 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtat 278  Q
    ||||| |||||| |||| || ||||||||| | ||| || || ||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  13351072 aaatcatttgtgaatagctttatatgattaaaagaatatatgtgaatgattcttaggtattgaatatgatgtttaccataaggtgatgtat 13350982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 31500201 - 31500149
Alignment:
Q  258 gtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgta 310  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||    
T  31500201 gtttatcacaaggtgttgtattttctcttttacttggatggtgataaattgta 31500149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 14)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 293
Target Start/End: Original strand, 76908 - 77185
Alignment:
Q  16 cggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgc 115  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||| || | ||||| ||||||||| ||| |||||| |||||  |||| ||| ||||||||||||||| |||||||     
T  76908 cggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagtttatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggctcaattgt 77007  T
Q  116 ttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgat 215  Q
     ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  77008 ctcaattattttaaagttgtaatatgagagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgttatgat 77107  T
Q  216 tatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttg 293  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  77108 tatatgaagatatgtgaatgattgttaggtgttgaatatgatgtttatcataaagtgttgtattttctcttttacttg 77185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 124 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 20822200 - 20822004
Alignment:
Q  124 ttttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaa 223  Q
    |||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20822200 ttttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcggaaataatctttaagaccaaatactttgcaaatattttgtggatagtttgttatgattatatgaa 20822101  T
Q  224 gatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 320  Q
    ||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||| ||||||    
T  20822100 gatatgtggatgattgctaggtgttgaatataatgtttatcataatgtgaagtattttctcctttatttggattgtgagaaatagtgtgatgttgtt 20822004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 209 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 33396428 - 33396316
Alignment:
Q  209 atatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttactt-gaattgtgagaaatt 307  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||     
T  33396428 atatgattatatgaagatatgtgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcgtaaggtgttgtattttctcatttacttggaattgtgagaaata 33396329  T
Q  308 gtatgaagttgtt 320  Q
     ||||| ||||||    
T  33396328 atatgatgttgtt 33396316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 189 - 320
Target Start/End: Original strand, 40437406 - 40437537
Alignment:
Q  189 aatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctccttt 288  Q
    ||||||||||| |||  || ||||||||| |||||| | || || | |||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  40437406 aatcttttgtgaataactttatatgattaaatgaagttatgtgagtaattgttaggtgttgaacatgatgtttatcataaggtattgtatttcctccttt 40437505  T
Q  289 acttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 320  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  40437506 acttggattgtgagaaattgtgcgaagttgtt 40437537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 151 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 21224368 - 21224200
Alignment:
Q  151 ctttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttga 250  Q
    ||||||||||| | |||||||||||  ||||    |||||| ||||||| |||  ||||||| |||| |||||||| || ||||||||  | ||||||||    
T  21224368 ctttgtcgaaagtgatctttaagactgaataccgtgcaaatattttgtgtataacttgatataattacatgaagatatgtgaatgattattgggtgttga 21224269  T
Q  251 atatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 320  Q
    |||||||| | |||||||  || ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21224268 atatgatgat-atcataatatggtgcgctttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatggagttgtt 21224200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 188 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 34392282 - 34392210
Alignment:
Q  188 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtt 260  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34392282 aaatcttttgtggataatttgatatgattatatggagatatttgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtt 34392210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 189 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 52400365 - 52400233
Alignment:
Q  189 aatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtatttt-ctcctt 287  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||   ||||||| || || | ||||  |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  52400365 aatcttttgtgattagttttatatgattgagtgaagatatgtgactaattgtgaggtcttgaatatgatatttatcataaggtgttgtattttcctcctt 52400266  T
Q  288 tacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 320  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||| |||||||    
T  52400265 tacttgtattatgagaagttgtatggagttgtt 52400233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 20193155 - 20193050
Alignment:
Q  188 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctt 287  Q
    ||||||||| ||  ||| || ||||||||| |||||||| |    ||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  20193155 aaatcttttatgattagctttatatgattaaatgaagatatttagatgattgttaagcgttgaatatgatgtttatcataaggtgttgcattttctcctt 20193056  T
Q  288 tacttg 293  Q
    ||||||    
T  20193055 tacttg 20193050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 114
Target Start/End: Original strand, 9785071 - 9785170
Alignment:
Q  14 gtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaatt 113  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| | || | ||||| ||||||||||||| | |||| |||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  9785071 gtcggtgaaacgcacatgtatactcaaatacactcatatgtgatctaagtgtatacgtagtcgaggc-ctagagtttatttacttggttttggttcaatt 9785169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 209 - 306
Target Start/End: Original strand, 8539111 - 8539208
Alignment:
Q  209 atatgattatatgaagatgtgcgaatga-ttgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaat 306  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||| ||| ||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||    
T  8539111 atatgactaaatgaagatgtgtgaatgaattgttatatgttggatatgatatttatcataacgtgttgtattttct-ctttacttggaatatgagaaat 8539208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 209 - 306
Target Start/End: Original strand, 8604350 - 8604447
Alignment:
Q  209 atatgattatatgaagatgtgcgaatga-ttgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaat 306  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||| ||| ||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||    
T  8604350 atatgactaaatgaagatgtgtgaatgaattgttatatgttggatatgatatttatcataacgtgttgtattttct-ctttacttggaatatgagaaat 8604447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 320
Target Start/End: Original strand, 49998509 - 49998583
Alignment:
Q  247 ttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtatttt-ctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 320  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||    
T  49998509 ttgaatatgatatttaacataaggtgttgtattttcctcctttacttgtattatgagaagttgtatgtagttgtt 49998583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 46144774 - 46144701
Alignment:
Q  248 tgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttc-tcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 320  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||    
T  46144774 tgaatatgatatttatcataaggtgttgtatgttcctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgtt 46144701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 21194174 - 21194098
Alignment:
Q  209 atatgattatatgaagatgtgcgaatga-ttgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctc 284  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||| ||| ||  ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  21194174 atatgactaaatgaagatgtgtgaatgaattgatatatgttggatatgatatttatcataaagtgttgtattttctc 21194098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 166; Significance: 9e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 320
Target Start/End: Original strand, 4972 - 5274
Alignment:
Q  16 cggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgc 115  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||| || | ||||| |||||||||||||  ||||| |||||  |||| ||| |||||||| |||||||||| |||     
T  4972 cggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagtgtatatatagtcgaggccctagagtttatttacttgattttggttcatttgt 5071  T
Q  116 ttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgat 215  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||   ||||    
T  5072 ctcaattattttaaagttttaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatacttgacaaatcttttgtggatagtttg--ttgat 5169  T
Q  216 tatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaag 315  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  5170 tatatgaagatatgtgaatgatttctaggtgttgaataagatgtttatcataatgtgttgtattttctccattaattgaattgtgagaaatggtatgaag 5269  T
Q  316 ttgtt 320  Q
    |||||    
T  5270 ttgtt 5274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 17)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 49 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 22332006 - 22331734
Alignment:
Q  49 atatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagaca 148  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||| |||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||| |||| ||||     
T  22332006 atatgtgatctaagtttatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcaattgtctcaattatgttaaagttgtaatatgagagacg 22331907  T
Q  149 aactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtg-t 247  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||| |    
T  22331906 aactttgtcaaaaataatctttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatgtgaatgctttctaggtgat 22331807  T
Q  248 tgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  22331806 tgaatatgatgtttatcataatgtgttgtatcttctcctttacttgtattgtgagaaattgtatggagttgtt 22331734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 43642036 - 43641732
Alignment:
Q  16 cggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgc 115  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||| || | ||||| ||||||| || || |||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||     
T  43642036 cggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaattggatacatagtcgaggccctagagtttatatacttggtttttgttcatttgt 43641937  T
Q  116 ttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgat 215  Q
     |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  43641936 ctcaattattttagagttgtagaatgagagacgaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatacttggcaaatctattgtagatagtttgatatgat 43641837  T
Q  216 tatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaag 315  Q
    ||||||||||| || ||||| ||   | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43641836 tatatgaagatatgtgaatgctttacatgtgttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatggag 43641737  T
Q  316 ttgtt 320  Q
    |||||    
T  43641736 ttgtt 43641732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 19434426 - 19434718
Alignment:
Q  18 gtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgctt 117  Q
    |||||| | ||||| ||| |||||| || | ||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||| |||  |    
T  19434426 gtgaaatgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagtgtatgcatagtcgaggccctagagtttatatacttggttttggttcatttgtct 19434525  T
Q  118 caattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgatta 217  Q
    ||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  19434526 caattattttagagttgtagaatgagagacgaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaataattggcaaatctattgtagatagtttgatatgatta 19434625  T
Q  218 tatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgta 310  Q
    ||||||||| || ||||| ||   |  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19434626 tatgaagatatgtgaatgctttacatatgttgaatatgatgtttatcataatgtattgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgta 19434718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 29113524 - 29113238
Alignment:
Q  19 tgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgcttc 118  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||| || | ||||| ||||||||| ||| |||||||||| |   ||| ||| ||||||||||||||||||| |||  ||    
T  29113524 tgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagtttatacatagttgagccccaagagtttatttacttggttttggttcatttgtctc 29113425  T
Q  119 aattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattat 218  Q
    || |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  29113424 aactattttaaagttgtaaaatgagagacaaaccttgtcgaaaataatctttaagaccaattacttggcaaatcttttgtgaatagtttgttatgattat 29113325  T
Q  219 atgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaa 305  Q
    |||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  29113324 atgaagatatgtggatgattgctaggtgatgaatatgatgtttatcataatgtgaagtattttctcctttatttggattgtgagaaa 29113238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 24841119 - 24840816
Alignment:
Q  16 cggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgc 115  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||| || | ||| | |||||||||||||  ||||| |||||  |||| ||| |||| ||||||||||||||||||     
T  24841119 cggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatacgtgatctaagtgtataaatagtcgaggccctagagtttatttaattggttttggttcaattgt 24841020  T
Q  116 ttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgat 215  Q
     |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  24841019 ctcaattattttaaagttctaaaatgagaaacgaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagttttctattat 24840920  T
Q  216 tatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaag 315  Q
    |||||||| || || | ||  || |||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| |    
T  24840919 tatatgaatatatgtgcatcctttctaggtttttaatatgatttttatcataatgtgttgtattttctcc-tcacttgaattgtgagaaataatatgatg 24840821  T
Q  316 ttgtt 320  Q
    |||||    
T  24840820 ttgtt 24840816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 20272668 - 20272382
Alignment:
Q  16 cggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgc 115  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || | ||||| | |||| |||||| ||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||| || |||||     
T  20272668 cggtgaaacgtacatgtatactcaacttcactcatatgaggtctaggtgtatacatagttgaggcattggaacttttttatttggttttgatttaattgt 20272569  T
Q  116 ttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgat 215  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20272568 ttcaattattttaaagttgtaaaataagagacgaactttgtcgaaaataatctttaagactaaataattgacaaatctcttgtggatagtttgttatgat 20272469  T
Q  216 tatatgaagatgtgcgaatg-attgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatga 313  Q
    ||||||||||| || ||||| |||  ||||||||||||            |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20272468 tatatgaagatatgtgaatgaatttttaggtgttgaat------------ataatgtgttgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatga 20272382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 149 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 45618587 - 45618416
Alignment:
Q  149 aactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgtt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||    
T  45618587 aactttgtcgaaaataatctttaagaccaattacttggtaaatcttttgtggataatttgatatgattatatgaagatatgtgaatgctttctacgtgtt 45618488  T
Q  249 gaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 320  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45618487 gaatatgatttttatcataatgtgttgtattttctcttttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 45618416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 150 - 320
Target Start/End: Original strand, 24561851 - 24562021
Alignment:
Q  150 actttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttg 249  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||    
T  24561851 actttgtcgaaaataatctttaggaccaaatacttagaaaatcttttgtagattgtttgatatgattatatgaagatatgtgaatgattgttagatgttg 24561950  T
Q  250 aatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 320  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  24561951 aatatgatgtttatcataaggtgttgtattttctcctttacttggattgtgagaaatagtatgatgttgtt 24562021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 320
Target Start/End: Original strand, 23166824 - 23167140
Alignment:
Q  4 gtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttt 103  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||| |  | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  23166824 gtcgtatttagcaggtgaaacgcacatgtatactcaacttcgctgatatgtgatctaagagtatgcatagttgaggcattagaatttgtttgcttagttt 23166923  T
Q  104 tggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggata 203  Q
    || |||||||||  |  || |||||||||  | ||| ||||||| ||||||||  ||||| ||||||||| || ||||  | || || |||||||| | |    
T  23166924 tgattcaattgcgaccgttgttttaaagtcgtgaaacgatagacgaactttgttaaaaatgatctttaaggccgaataccttgcgaaccttttgtgaaca 23167023  T
Q  204 gtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgaga 303  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||| | |  || | |||||||||| |||||||||||   || || |  |||||||||||||||||| |||||    
T  23167024 gtttgatatgattatatgaaaacgtgtgaataagtaataagggttgaatatggtgtttatcatagtatgatgcacattctcctttacttgaattatgaga 23167123  T
Q  304 aattgtatgaagttgtt 320  Q
    ||| |||||||||||||    
T  23167124 aatggtatgaagttgtt 23167140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 320
Target Start/End: Original strand, 23578081 - 23578397
Alignment:
Q  4 gtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttt 103  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||| |  | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  23578081 gtcgtatttagcaggtgaaacgcacatgtatactcaacttcgctgatatgtgatctaagagtatgcatagttgaggcattagaatttgtttgcttagttt 23578180  T
Q  104 tggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggata 203  Q
    || |||||||||  |  || |||||||||  | ||| ||||||| ||||||||  ||||| ||||||||| || ||||  | || || |||||||| | |    
T  23578181 tgattcaattgcgaccgttgttttaaagtcgtgaaacgatagacgaactttgttaaaaatgatctttaaggccgaataccttgcgaaccttttgtgaaca 23578280  T
Q  204 gtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgaga 303  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||| | |  || | |||||||||| |||||||||||   || || |  |||||||||||||||||| |||||    
T  23578281 gtttgatatgattatatgaaaacgtgtgaataagtaataagggttgaatatggtgtttatcatagtatgatgcacattctcctttacttgaattatgaga 23578380  T
Q  304 aattgtatgaagttgtt 320  Q
    ||| |||||||||||||    
T  23578381 aatggtatgaagttgtt 23578397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 188 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 18534975 - 18534843
Alignment:
Q  188 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctt 287  Q
    |||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||   | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18534975 aaatctttcgtgaatagctttatatgattatatgaagatatgtgaatgttttacatgtgttgaatatgatgattatcataatgtgttgtattttctcctt 18534876  T
Q  288 tacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 320  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  18534875 tacttgaattgtgagaaattatatggagttgtt 18534843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 189 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 6093980 - 6093849
Alignment:
Q  189 aatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctccttt 288  Q
    ||||||| ||| |||| || ||||||||| |||||||| || || | |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||    
T  6093980 aatctttcgtgaatagctttatatgattaaatgaagatatgtgagtaattgttaggtgttgaatatgatgtttatcataatgcgaagtattttctccttt 6093881  T
Q  289 acttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 320  Q
    ||||| ||||||||||| | |||| |||||||    
T  6093880 acttggattgtgagaaagtatatggagttgtt 6093849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 23799608 - 23799536
Alignment:
Q  188 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtt 260  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23799608 aaatattttgtggataatttgatatgattatatggggatatttgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtt 23799536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 7320660 - 7320550
Alignment:
Q  16 cggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgc 115  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||| || | ||||| ||||||||||||| |||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||| |||     
T  7320660 cggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatatacttggttttggttcatttgt 7320561  T
Q  116 ttcaattattt 126  Q
     ||||||||||    
T  7320560 ctcaattattt 7320550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 25133234 - 25133135
Alignment:
Q  195 ttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtatttt-ctcctttacttg 293  Q
    ||||| |||| || ||||||||  ||||||||||| || | | || || ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  25133234 ttgtgaatagctttatatgattgaatgaagatgtgtgagtaaatgttaagtgttgaatgtgatgtttatcacaaggtgttgtattttcctcctttacttg 25133135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 24276904 - 24276828
Alignment:
Q  209 atatgattatatgaagatgtgcgaatga-ttgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctc 284  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  24276904 atatgactaaatgaagatgtgtgaatgaatttttaggtgttggatatgatatttatcatagggtgttgtattttctc 24276828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 209 - 284
Target Start/End: Original strand, 22787186 - 22787262
Alignment:
Q  209 atatgattatatgaagatgtgcgaatga-ttgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctc 284  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||    
T  22787186 atatgactaaatgaagatgtgtgaatgaattgttatatgttgaatatgatatttatcataagatgttgtatgttctc 22787262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 11543833 - 11543530
Alignment:
Q  16 cggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgc 115  Q
    |||||||| | ||||| ||| |||||| || | ||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||  |||||||||||||||||| |||     
T  11543833 cggtgaaaagcacatgtatattcaactacattcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagaatttaattacttggttttggttcatttgt 11543734  T
Q  116 ttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgat 215  Q
     ||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  11543733 ctcaattattttaaagttgtaaattgagagacgaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatacttgtcaaatcttttgaggatagtttgttatgat 11543634  T
Q  216 tatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaag 315  Q
    || |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||    
T  11543633 taaatgaaggtatgtgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataaattgttgtatcttctcc-tcacttgaattgtgagaaatagtatggag 11543535  T
Q  316 ttgtt 320  Q
    |||||    
T  11543534 ttgtt 11543530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 7 - 320
Target Start/End: Original strand, 18118885 - 18119192
Alignment:
Q  7 gtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttgg 106  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||| || | || || | |||| |||||| ||||||||||||||| ||  ||| ||||||||| ||      
T  18118885 gtatttagccggtgaaacgcacatgtatactctactacactcatgtgtggtctaggtgtatacatagttgaggcattggatcttggttacttggtcttaa 18118984  T
Q  107 ttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtt 206  Q
    || | ||| ||||||||||||||| || |||| ||| |||| |||||||||||||||      ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18118985 tttatttgtttcaattattttaaaattgtaaagtgagagacgaactttgtcgaaaat------taagatcaaatacttggcaaatcttttgtggatagtt 18119078  T
Q  207 tgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaat 306  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18119079 tgatatgattatatgaagatatgtgaatgtttgctaggtgttgaatatgatgtttatcatagcatggtagattttctcctttacttgaattttgagaaat 18119178  T
Q  307 tgtatgaagttgtt 320  Q
    ||||||||||||||    
T  18119179 tgtatgaagttgtt 18119192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 16 - 320
Target Start/End: Original strand, 20176831 - 20177135
Alignment:
Q  16 cggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgc 115  Q
    |||||||||| | ||| ||| |||||| || | ||||| ||| |||||||||  |||||  ||||  |||| ||| ||||||||||||||||| | |||     
T  20176831 cggtgaaacgcatatgtatattcaactacactcatatgtgatataagtgtatatatagtcaaggccctagagtttatttacttggttttggttaatttgt 20176930  T
Q  116 ttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgat 215  Q
     ||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20176931 ctcaattattttaaagttgtaatatgagagacgaactttgtcgaaaataatcta-aagaccaaatacttggaaaatcttttgtggatagtttgatatgat 20177029  T
Q  216 tatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttg-aattgtgagaaattgtatgaa 314  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||     
T  20177030 tatatgaagatatgtgaatgattactatgtgttgaatgtgatgtttattataaggtgttgtattttctcctttacttgaaattgtgagaaataatatgat 20177129  T
Q  315 gttgtt 320  Q
    ||||||    
T  20177130 gttgtt 20177135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 16 - 320
Target Start/End: Original strand, 20221558 - 20221862
Alignment:
Q  16 cggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgc 115  Q
    |||||||||| | ||| ||| |||||| || | ||||| ||| |||||||||  |||||  ||||  |||| ||| ||||||||||||||||| | |||     
T  20221558 cggtgaaacgcatatgtatattcaactacactcatatgtgatataagtgtatatatagtcaaggccctagagtttatttacttggttttggttaatttgt 20221657  T
Q  116 ttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgat 215  Q
     ||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20221658 ctcaattattttaaagttgtaatatgagagacgaactttgtcgaaaataatcta-aagaccaaatacttggaaaatcttttgtggatagtttgatatgat 20221756  T
Q  216 tatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttg-aattgtgagaaattgtatgaa 314  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||     
T  20221757 tatatgaagatatgtgaatgattactatgtgttgaatgtgatgtttattataaggtgttgtattttctcctttacttgaaattgtgagaaataatatgat 20221856  T
Q  315 gttgtt 320  Q
    ||||||    
T  20221857 gttgtt 20221862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 320
Target Start/End: Original strand, 19332465 - 19332767
Alignment:
Q  19 tgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgcttc 118  Q
    ||||||| ||||| ||| |||| | || ||||||| | ||||||||||| |||||| |||||  |||| ||| ||||||||||||||||||| |||  ||    
T  19332465 tgaaacgcacatgtataatcaattacacttatatgtggtctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttgtctc 19332564  T
Q  119 aattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatc-ttttgtggatagtttgatatgatta 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19332565 aattattttaaagttgtaaaatgagagacgaaccttgtcgaaaataatttttaagaccaattgcttagcaaatctttttgtggatagtttgatatgatta 19332664  T
Q  218 tatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagtt 317  Q
    ||||||||| || | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||| |||||||| || | |||| ||||    
T  19332665 tatgaagatatgtggatgatttctaggtgatgaatatgatgtttatcataatgtgaagtattttcttctttacttggattgtgaggaagtatatggagtt 19332764  T
Q  318 gtt 320  Q
    |||    
T  19332765 gtt 19332767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 22312985 - 22312685
Alignment:
Q  18 gtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgctt 117  Q
    |||||||| ||||  ||| |||||| || | ||||| ||||||||||||| |||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||  |||  |    
T  22312985 gtgaaacgcacatctatattcaactacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatctacttggttttggttct-ttgtat 22312887  T
Q  118 caattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgatta 217  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  22312886 caattattttaaagttgtagaatgagagacgaactttgtcgaaaataatttttaagacgaaatacttggcaaatcttttgtgaatagtttgttatgatga 22312787  T
Q  218 tatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagtt 317  Q
     |||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22312786 aatgaaggtatgtgaatggttgctaggtgttgaatatgatgtttatcataaattgttgtatcttctcc-tcacttgaattgtgagaaatagtatggagtt 22312688  T
Q  318 gtt 320  Q
    |||    
T  22312687 gtt 22312685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 144 - 320
Target Start/End: Original strand, 3845120 - 3845296
Alignment:
Q  144 agacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctag 243  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| | ||    
T  3845120 agacgaactttgtcgaaaataatctgtaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatataaagatatgtaaatgatttcaag 3845219  T
Q  244 gtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 320  Q
    |  |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  3845220 gctttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgtt 3845296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 25295292 - 25294985
Alignment:
Q  13 agtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaat 112  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |||||| || |  |||| ||||||||||||| |||||| |||||  |||| ||| ||||||||||||||||||| |    
T  25295292 agtcggtgaaacgcacatgtataatcaactacactcctatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatt 25295193  T
Q  113 tgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataat-ctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgata 211  Q
    ||  ||||||||| ||| ||| |  ||||| |||| |||||||||||||||  | ||||||  |||| ||  |   |||| |||||||||||  || |||    
T  25295192 tgtctcaattattctaa-gttgtgtaatgagagacgaactttgtcgaaaatggttctttaaagccaattaccttataaatattttgtggatatctttata 25295094  T
Q  212 tgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtat 311  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25295093 tgattatatgaagatatgtgaatgatttttaagtgttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttctcctttacttgacttgtgagaaattgtat 25294994  T
Q  312 gaagttgtt 320  Q
    | |||||||    
T  25294993 ggagttgtt 25294985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 50 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 25757275 - 25757005
Alignment:
Q  50 tatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaa 149  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||||  |||| ||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||| ||| |  ||||| ||||      
T  25757275 tatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttgtctcaattattctaa-gttgtgtaatgagagacgt 25757177  T
Q  150 actttgtcgaaaataat-ctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgtt 248  Q
    ||||||||||||||  | ||||||  |||| ||  |   |||| |||||||||||  || |||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||    
T  25757176 actttgtcgaaaatggttctttaaagccaattaccttataaatattttgtggatatctttatatgattatatgaagatatgtgaatgatttttaggtgtt 25757077  T
Q  249 gaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 320  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25757076 gaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttctcctttacttgacttgtgagaaattgtatggagttgtt 25757005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 320
Target Start/End: Original strand, 45560064 - 45560368
Alignment:
Q  16 cggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgc 115  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||| || | ||||| ||||||||||||| |||||| |||||  |||| ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  45560064 cggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttgt 45560163  T
Q  116 ttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataat-ctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatga 214  Q
     |||||| || ||| ||| |  ||  | ||||  ||||||||||||||  | ||||||  |||| ||  |   ||||||||||||||||   | ||||||    
T  45560164 ctcaattgttctaa-gttgtgtaagtagagacggactttgtcgaaaatggttctttaaagccaattaccttataaatcttttgtggatatcattatatga 45560262  T
Q  215 ttatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaa 314  Q
    |||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |    
T  45560263 ttatatgaagatatgtgaacgattgttaggtgttgaatatgatgtttatcataaagtgttgtattttctcctttacttggattgtgagaagttgtatgga 45560362  T
Q  315 gttgtt 320  Q
    ||||||    
T  45560363 gttgtt 45560368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 17501261 - 17500983
Alignment:
Q  2 ttgtcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggt 101  Q
    |||||||| | || |||||||||| ||||| ||| |||||| || | ||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||| | |||||||     
T  17501261 ttgtcgtagtcagccggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggcactagagtttatatacttgg- 17501163  T
Q  102 tttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctt--taagaccaaatatttggcaaatcttttgtg 199  Q
     ||||||||  ||  |||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||  |    |||||||||||    
T  17501162 attggttcatctgtctcaattattttagagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataatttttgtaagaccaattacct-tataatcttttgtg 17501064  T
Q  200 gatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattt 280  Q
    ||||| || ||||||||| |||||  | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17501063 gatagctttatatgattaaatgaaattatgtgaatgattgttaggtgttgaatatgatgtttatcataaggtgttgtattt 17500983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 117 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 24907015 - 24906756
Alignment:
Q  117 tcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgatt 216  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||| |||| ||  |||||||||||||||| ||||||| | ||  |   |||||||||||| ||||  | ||||||||    
T  24907015 tcaattaatttaaagttgcaaaatgagagacgaatcttgtcgaaaataatctctaagaccgattaccttataaatcttttgtgaatagccttatatgatt 24906916  T
Q  217 atatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagt 316  Q
    |||||||||| || |||||||  ||| ||| |||| |||||||||||||||  | ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||  | |    
T  24906915 atatgaagatatgtgaatgatctctatgtgatgaacatgatgtttatcatagtgcgttgtattccctcctttacttgaattgtgagtaattgaat--aat 24906818  T
Q  317 tgttatgacgttggttgatagttgtggtaatgaatatgttgataatgat--gtggtgatgat 376  Q
     || ||||| |||||||||| ||||| | || |  ||||||||||||||  |||||||||||    
T  24906817 cgtgatgacattggttgatacttgtgatcataatcatgttgataatgataggtggtgatgat 24906756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 188 - 293
Target Start/End: Original strand, 22498407 - 22498512
Alignment:
Q  188 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctt 287  Q
    |||||||| ||| |||| || ||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||     
T  22498407 aaatctttcgtgaatagctttatatgattaaatgaagatatgtgaatgattgataggtgttgaatatgatgtttatcacaaggtgttgtattttctccta 22498506  T
Q  288 tacttg 293  Q
    ||||||    
T  22498507 tacttg 22498512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 189 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 7469311 - 7469179
Alignment:
Q  189 aatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtatttt-ctcctt 287  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||  |||||||| || || | ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  7469311 aatcttttgtgaatagctttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgcgaggtcttgaatatgatgtttatcataaggtgttgtattttcctcctt 7469212  T
Q  288 tacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 320  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||| |||||||    
T  7469211 tacttgtattatgagaagttgtatggagttgtt 7469179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 188 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22886914 - 22886812
Alignment:
Q  188 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctt 287  Q
    |||||||||||| |||| || |||||| || |||||| | || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  22886914 aaatcttttgtgaatagctttatatgactaaatgaagctatgtgaatgattgttaagtgttgaatatgatgtttatcataaggtgttgtatcttctcctt 22886815  T
Q  288 tac 290  Q
    |||    
T  22886814 tac 22886812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 188 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 24238742 - 24238610
Alignment:
Q  188 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctt 287  Q
    |||||||| ||| |||| || ||||||||| ||||||||  | ||||||||  | ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| || |||    
T  24238742 aaatctttcgtgaatagatttatatgattaaatgaagataagtgaatgattcttcggtgttgaatacgaggtttatcgtaacgtgttgtatttacttctt 24238643  T
Q  288 tacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 320  Q
    |||||| ||| ||||||| | ||||||||||||    
T  24238642 tacttggattatgagaaagtatatgaagttgtt 24238610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 189 - 320
Target Start/End: Original strand, 38636798 - 38636930
Alignment:
Q  189 aatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtatttt-ctcctt 287  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||  |||||||| || || | ||||  |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  38636798 aatcttttgtgattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgaggtattgaatatgatatttatcataaggtgttgtattttcctcctt 38636897  T
Q  288 tacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 320  Q
    |||||  ||| |||||| || ||||||||||||    
T  38636898 tacttatattatgagaagttatatgaagttgtt 38636930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 188 - 284
Target Start/End: Original strand, 18042650 - 18042747
Alignment:
Q  188 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatga-ttgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctc 284  Q
    |||||||| |||  ||| || ||||||||| |||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  18042650 aaatctttcgtgactagctttatatgattaaatgaagatatgtgaatgaattgttaggtgttgaatatgatatttatcataaggtgttgtattttctc 18042747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 25609111 - 25609062
Alignment:
Q  271 tgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  25609111 tgttgtattttctcctttacttggattgtgagaaatagtatgatgttgtt 25609062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 133
Target Start/End: Original strand, 34012912 - 34013029
Alignment:
Q  16 cggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgc 115  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||| || | ||||| ||| ||||||||| |||||| |||||  || | ||| | ||||||||||||||||| |||     
T  34012912 cggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatttaagtgtatacatagtcgaggccctaaagtttatatacttggttttggttcatttgt 34013011  T
Q  116 ttcaattattttaaagtt 133  Q
     |||||||||||| ||||    
T  34013012 ctcaattattttagagtt 34013029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 219 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 33171287 - 33171213
Alignment:
Q  219 atgaagatgtgcgaatga-ttgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttg 293  Q
    |||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  33171287 atgaagatatgtgaatgaattgttaggtgttgaatatgatatttatcataaggtgttgcattttct-ctttacttg 33171213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 16001092 - 16001046
Alignment:
Q  247 ttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttg 293  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  16001092 ttgaatatgatgtttatcatagggtgttgtattttctccttcacttg 16001046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 25609228 - 25609178
Alignment:
Q  244 gtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtatttt-ctcctttacttg 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  25609228 gtgttgaatatgatgtttatcataaggcgttgtattttcctcctttacttg 25609178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 306
Target Start/End: Original strand, 37654832 - 37654892
Alignment:
Q  245 tgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaat 306  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||    
T  37654832 tgttgaatatgatatttatcataaggtgttgtattttct-ctttacttggaatatgagaaat 37654892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 15)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 320
Target Start/End: Original strand, 14342613 - 14342917
Alignment:
Q  16 cggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgc 115  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||| | || | ||||| ||| ||||||||| |||||| |||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||     
T  14342613 cggtgaaacgcacatgtatattcaattacactcatatgtgatataagtgtatccatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcaattgt 14342712  T
Q  116 ttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgat 215  Q
     ||||||||||||||||| ||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  14342713 ctcaattattttaaagttgtaatatgagatacgaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttgtgtggatagtttgatgtgat 14342812  T
Q  216 tatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaag 315  Q
    || |||||||| || |  | |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||    
T  14342813 taaatgaagatatgtgggtaattgttaagtgttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttctccattaattgaattgtgagaaatggtatggag 14342912  T
Q  316 ttgtt 320  Q
    |||||    
T  14342913 ttgtt 14342917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 21108829 - 21108525
Alignment:
Q  16 cggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgc 115  Q
    |||||||||  ||||| ||| |||||| || | ||||| ||||||||||||| |||||| || ||  |||| ||| |||||||||| |||||||| |||     
T  21108829 cggtgaaacacacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaagccctagagtttatttacttggtattggttcatttgt 21108730  T
Q  116 ttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgat 215  Q
     |||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  21108729 ctcaattgttttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatacttgtcaaatcttttgcggatagttcgttatgat 21108630  T
Q  216 tatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaag 315  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||    
T  21108629 tatatgaagatatgtgaatgattgttaggtgttgaatatgatgtttaccataaggtgttgtattttctcctttacttggattgtgagaaagtatatggag 21108530  T
Q  316 ttgtt 320  Q
    |||||    
T  21108529 ttgtt 21108525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 16 - 320
Target Start/End: Original strand, 24226431 - 24226736
Alignment:
Q  16 cggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgc 115  Q
    |||||||||| || || ||| |||||| || | ||||| ||||||||||||| |||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||| |||     
T  24226431 cggtgaaacgcacgtgtatattcaactacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatatacttggttttggttcatttgt 24226530  T
Q  116 ttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtgga-tagtttgatatga 214  Q
     |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | || |||||||||||||    
T  24226531 ctcaattattttagagttgtagaatgagagacgaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatacttggcaaatctattatagattagtttgatatga 24226630  T
Q  215 ttatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaa 314  Q
    |||||||||||| || ||||| ||   | ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24226631 ttatatgaagatatgtgaatgctttacatgtgttgaatatgatgtttatcataatgtgttttactttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgga 24226730  T
Q  315 gttgtt 320  Q
    ||||||    
T  24226731 gttgtt 24226736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 126 - 320
Target Start/End: Original strand, 20455061 - 20455247
Alignment:
Q  126 ttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaaga 225  Q
    |||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||        |||    
T  20455061 ttaaagttgtaaaataagagacaaattttgtcgaaaataatctttaagagcaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatga--------aga 20455152  T
Q  226 tgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 320  Q
    | || ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  20455153 tatgtgaatgttttctaagtgttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaactgaatggagttgtt 20455247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 188 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 11965098 - 11964966
Alignment:
Q  188 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctt 287  Q
    |||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||   | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11965098 aaatctttcgtgaatagctttatatgattatatgaagatatgtgaatgctttacatgtgttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttctcctt 11964999  T
Q  288 tacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11964998 tacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 11964966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 149 - 320
Target Start/End: Original strand, 33627485 - 33627655
Alignment:
Q  149 aactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgtt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||| || |||||    ||| |||||    
T  33627485 aactttgtcgaaaataatctttaagatcaaatacttagcaaattttttgtggataatttgttatgattatatggagatatgtgaatgccctctaagtgtt 33627584  T
Q  249 gaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 320  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||    
T  33627585 gaatatg-tgtttatcatagtgtgttgtattttctcctttacttgtattatgaaaaattgtatggagttgtt 33627655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 231 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 23414238 - 23414149
Alignment:
Q  231 gaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 320  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||    
T  23414238 gaatgattgttaggtgctgaatatgatgtttattataaggtgttgtattttctcctttacttggaatgtgagaaagtgtatggagttgtt 23414149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 19872878 - 19872798
Alignment:
Q  232 aatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatg 312  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||    
T  19872878 aatgattgttaagtgtggaatatgatgtttatcataaggtgtgatattttctcctttacttggaatgtgggaaatcgtatg 19872798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 133
Target Start/End: Original strand, 33150254 - 33150371
Alignment:
Q  16 cggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgc 115  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||| || | ||||| ||| ||||||||| |||||| |||||  || | ||| | ||||||||||||||||| |||     
T  33150254 cggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatttaagtgtatacatagtcgaggccctaaagtttatatacttggttttggttcatttgt 33150353  T
Q  116 ttcaattattttaaagtt 133  Q
     |||||||||||| ||||    
T  33150354 ctcaattattttagagtt 33150371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 20313774 - 20313661
Alignment:
Q  14 gtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaatt 113  Q
    ||||||||| || ||||| ||  |||||| || | ||||  ||||||||||| | |||||| |||||  |||| ||| ||||||||||||||||||| ||    
T  20313774 gtcggtgaagcgcacatgtatgttcaactacactcatatctgatctaagtgtttacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcattt 20313675  T
Q  114 gcttcaattatttt 127  Q
    |  |||||||||||    
T  20313674 gtctcaattatttt 20313661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 309
Target Start/End: Original strand, 26560940 - 26561048
Alignment:
Q  202 tagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtatttt-ctcctttacttgaattgtg 300  Q
    |||||| ||||||||  |||||||| || || | | || |||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||| ||| |||||||| || |||    
T  26560940 tagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaaatggtaggtgttgaatgtgaggtttatcacaaggtgttgtattttcctcttttacttggatggtg 26561039  T
Q  301 agaaattgt 309  Q
    | |||||||    
T  26561040 acaaattgt 26561048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 192 - 307
Target Start/End: Original strand, 16836447 - 16836561
Alignment:
Q  192 cttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttact 291  Q
    |||||||| |||| ||  |||||||| || ||||| ||  |||||||| ||||  ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  16836447 cttttgtgaatagctttgtatgattaaataaagatatgttaatgattgttaggcattggatatgatgttcatcataaggtgttgtatttcct-ctttact 16836545  T
Q  292 tgaattgtgagaaatt 307  Q
    || | |||| ||||||    
T  16836546 tggaatgtgggaaatt 16836561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 245 - 320
Target Start/End: Original strand, 20833185 - 20833259
Alignment:
Q  245 tgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 320  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||  || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||    
T  20833185 tgttggatatgatatttatcataagatgatgtattttct-ctttacttgtattgtgagaaataatatggagttgtt 20833259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 202 - 309
Target Start/End: Original strand, 5622581 - 5622689
Alignment:
Q  202 tagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtatttt-ctcctttacttgaattgtg 300  Q
    |||||| ||||||||  |||||||| || || | | || |||||||||||| ||| |||||||| ||  ||||||||||| ||| |||||||| || |||    
T  5622581 tagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaaatggtaggtgttgaatgtgaggtttatcacaagatgttgtattttcctcttttacttggatggtg 5622680  T
Q  301 agaaattgt 309  Q
    | |||||||    
T  5622681 acaaattgt 5622689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 236
Target Start/End: Original strand, 11764618 - 11764666
Alignment:
Q  188 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatga 236  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  11764618 aaatcttttgtgtatagcttgatatgaatatatgaaggtgtgagaatga 11764666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 10132 - 9827
Alignment:
Q  17 ggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgct 116  Q
    ||||||| | ||||| ||| |||||| || | ||||| ||||||||||||| | |||| |||||  |||| ||| ||||||||||||||||||| |||      
T  10132 ggtgaaatgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagtgtatacgtagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttgtc 10033  T
Q  117 tcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgatt 216  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  10032 tcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgttgaaaataatctttaagaccaaatacttggctaatcttttgttgatagtttgatatgatt 9933  T
Q  217 atatgaaga-tgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgag-aaattgtatgaa 314  Q
    ||||||||| | || ||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  9932 atatgaagattatgtgaattctttctaggtgttgaatatgatgtttaccataatatgttgtattttctcttttacttgaattgtgagaaaattgtatgga 9833  T
Q  315 gttgtt 320  Q
    ||||||    
T  9832 gttgtt 9827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 92 - 321
Target Start/End: Original strand, 8152 - 8381
Alignment:
Q  92 tttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaat 191  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  8152 tttacttggttttggttcaattgtctcaattattttaaagttgtagaatgagagacgaaccttgtcggaaataatctttaagaccaattacttgacaaat 8251  T
Q  192 cttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttact 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8252 cttttgtggatagtttgatatgattacatgaatatatgtgaatgattgttaggtgttgaatatgatatttatcataaggtgttgtattttctcctttact 8351  T
Q  292 tgaattgtgagaaattgtatgaagttgtta 321  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  8352 tggattgtgagaaagtgtatgaagttgtta 8381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 24)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 38 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 8603921 - 8603637
Alignment:
Q  38 caactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaa 137  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||    
T  8603921 caactgcactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatatacttggttttggttcatttgtctcaattattttaaagttgtaa 8603822  T
Q  138 aatgatagacaaactttgtcgaaaa-taatctttaagaccaaatatttggcaaatctttt-gtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatg 235  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||| |||| |  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  8603821 aatgagagacgaactttgtcgaaaaataatttttaaggccaattgctttgcaaatctttttgtggatagtttgatatgattatgtgaagatatgtgaatg 8603722  T
Q  236 attgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 320  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  8603721 attgttaggtgttgaatatgatgtttatcataaggtgttgtattttctcctttacttggattgtgagaaatagtatgatgttgtt 8603637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 320
Target Start/End: Original strand, 40040076 - 40040377
Alignment:
Q  19 tgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgcttc 118  Q
    ||||||| || || ||| |||||| || | ||||| ||||||||| ||| |||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||    
T  40040076 tgaaacgcacgtgtatattcaactacactcatatgtgatctaagtatatacatagtcgaggccctagaatttatttacttggttttggttcatttgtctc 40040175  T
Q  119 aattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattat 218  Q
    |||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||| | ||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  40040176 aattgttttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcggacataatatttaagatcaaatacttggcaaatattttgtggatagttggttatgattat 40040275  T
Q  219 atgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttg 318  Q
    ||| |||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||  ||||||||||||||| ||| || |||| ||||  ||||| ||||    
T  40040276 atggagatatttgaatgattgataggtgttgaatatgatgtttctcatagtgtgaagtattttctcctttatttggatggtgataaatcatatgatgttg 40040375  T
Q  319 tt 320  Q
    ||    
T  40040376 tt 40040377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 320
Target Start/End: Original strand, 37917325 - 37917628
Alignment:
Q  17 ggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgct 116  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||| || | ||||| ||||||||| ||| |||||| || ||  || ||||| ||||||||||||| ||||| |||      
T  37917325 ggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagtatatacatagtcgaagccctataatttatttacttggtttttgttcatttgtc 37917424  T
Q  117 tcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgatt 216  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||| ||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  37917425 tcaattgttttaaagttgtaaaatgagagacgaactttatcggacataatctttcagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagttggttatgatt 37917524  T
Q  217 atatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagt 316  Q
    ||||| | || |  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||| ||| || |||||||||  ||||| ||    
T  37917525 atatggacatatttgaatgattgatatgtgttgaatatgatgtttatcatagtgtggagtattttctcctttatttggatggtgagaaatcatatgatgt 37917624  T
Q  317 tgtt 320  Q
    ||||    
T  37917625 tgtt 37917628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 62 - 320
Target Start/End: Original strand, 25104969 - 25105225
Alignment:
Q  62 gtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaa 161  Q
    |||||| |||||| |||||  |||| ||| ||| ||||| ||||||||| |||  ||||||  ||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||    
T  25104969 gtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttccttggatttggttcatttgtctcaattgctttaaagttgtaaaatgagagatgaactttgtcgaaa 25105068  T
Q  162 ataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgttt 261  Q
    | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |  ||| |||| ||||| |||||||    
T  25105069 agaatccttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgttatgattatatggagatatgtgaatgctctctaagtgtcgaatacgatgttt 25105168  T
Q  262 atcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 320  Q
    |||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  25105169 atc--acggtgttgtattttctcctttacttgaattgtgggaaattgtatggagttgtt 25105225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 321
Target Start/End: Original strand, 17759289 - 17759594
Alignment:
Q  16 cggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgc 115  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||| || | ||||| ||||||||||||| |||||| ||||  | ||| ||| ||| |||||||||||||||||||     
T  17759289 cggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgagggct-agagtttattttcttggttttggttcaattgt 17759387  T
Q  116 ttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgat 215  Q
     ||||||||||||||||| ||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  17759388 ctcaattattttaaagttgtattatgagagacgaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatacttggaaaatcttttgtgcatagtttgttatgat 17759487  T
Q  216 tatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatga-tgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaa 314  Q
    |||||| |||| |  ||||| |  ||| ||||||||||  | | ||||||||   ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| | |||| |    
T  17759488 tatatggagatatctgaatgctctctaagtgttgaatacaattttttatcatggtgtgttgtattttctcttttaattggattgtgagaaagtatatgga 17759587  T
Q  315 gttgtta 321  Q
    |||||||    
T  17759588 gttgtta 17759594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 321
Target Start/End: Original strand, 19060609 - 19060914
Alignment:
Q  16 cggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgc 115  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||| || | ||||| ||||||||||||| |||||| ||||  | ||| ||| ||| |||||||||||||||||||     
T  19060609 cggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgagggct-agagtttattttcttggttttggttcaattgt 19060707  T
Q  116 ttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgat 215  Q
     ||||||||||||||||| ||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  19060708 ctcaattattttaaagttgtattatgagagacgaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatacttggaaaatcttttgtgcatagtttgttatgat 19060807  T
Q  216 tatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatga-tgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaa 314  Q
    |||||| |||| |  ||||| |  ||| ||||||||||  | | ||||||||   ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| | |||| |    
T  19060808 tatatggagatatctgaatgctctctaagtgttgaatacaattttttatcatggtgtgttgtattttctcttttaattggattgtgagaaagtatatgga 19060907  T
Q  315 gttgtta 321  Q
    |||||||    
T  19060908 gttgtta 19060914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 14970156 - 14969843
Alignment:
Q  5 tcgtatttagtcggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggtttt 104  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||| |||| |||| |||| |||||| ||| ||||| |||  ||||    
T  14970156 tcgtatttagccggtgaaacgtacatgtatattcaactgcactcatatgtgatctaagagtatacataattgatgcattataatgtgttttcttattttt 14970057  T
Q  105 ggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatag 204  Q
      ||||| || | ||||| |||||||||| | ||| ||||||  ||| ||||||||| | ||  |||||||  |||  || ||||||  ||| || ||||    
T  14970056 acttcaaatgttacaattgttttaaagttgtgaaacgatagatgaaccttgtcgaaagtgattcttaagactgaattctttgcaaatactttatgaatag 14969957  T
Q  205 tttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaa 304  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   || || |||||| || ||||||| ||||||||||    
T  14969956 -ttgatatgattgtatgaagatgtgtgaatgattgataggtgttgaatatgatgtttatcatagtatgatggattttc-cccttacttggattgtgagaa 14969859  T
Q  305 attgtatgaagttgtt 320  Q
    || ||||  |||||||    
T  14969858 atagtatagagttgtt 14969843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 186 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 11401725 - 11401591
Alignment:
Q  186 gcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcc 285  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||||| || ||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  11401725 gcaaatcttttgtgaatagctttatatgattacataaagttgtatgaatgattgctagttgttgaatatgatgtttatcataatgtgctgtgttttctcc 11401626  T
Q  286 tttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11401625 tttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 11401591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 189 - 320
Target Start/End: Original strand, 38376831 - 38376962
Alignment:
Q  189 aatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctccttt 288  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  38376831 aatcttttgtgaatagtttgatatcattatatgaagatatgtgaatgattgttaggtgttgtgtatgatgtttatcataaggtgttatattttctccttt 38376930  T
Q  289 acttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 320  Q
    ||||| ||| ||||||||  ||||| ||||||    
T  38376931 acttggattttgagaaataatatgatgttgtt 38376962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 244 - 320
Target Start/End: Original strand, 5229188 - 5229264
Alignment:
Q  244 gtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  5229188 gtgttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaatcgtatggagttgtt 5229264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 144 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 17392534 - 17392372
Alignment:
Q  144 agacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatg-attgcta 242  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| |     
T  17392534 agacgaactttgtcgaaaataatctttaagatcaaatacttggaaaatcttttgcggatagtttgatataaatatatgaagatgtgtgaatgaattgttg 17392435  T
Q  243 ggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaat 306  Q
      |||||||| ||||   ||||||    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17392434 aatgttgaatgtgat-catatcatggtatgatgtattttctcctttacttgaaatgtgagaaat 17392372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 188 - 287
Target Start/End: Original strand, 14181133 - 14181232
Alignment:
Q  188 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctt 287  Q
    |||||||||||| |||| || ||||||||  |||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14181133 aaatcttttgtgaatagctttatatgattgaatgaagatatgtgaatgattgttaagtgttgaatatgatgtttatcataaggtgttgtattttctcctt 14181232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 188 - 260
Target Start/End: Original strand, 12918084 - 12918156
Alignment:
Q  188 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtt 260  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12918084 aaatcttttgtggataatatgatatgattatatggagatatttgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtt 12918156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 209 - 312
Target Start/End: Original strand, 11516638 - 11516741
Alignment:
Q  209 atatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattg 308  Q
    ||||||||| || |||||||  |||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||  || |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  11516638 atatgattacataaagatgtatgaataattgctaggtgttgaaaatgatatttatcttaatatgatgtattttcttctttacttggattgtgagaagttg 11516737  T
Q  309 tatg 312  Q
    ||||    
T  11516738 tatg 11516741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 15549720 - 15549573
Alignment:
Q  19 tgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgcttc 118  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||| || | ||||| ||||||||||||| |||||| |||||  |||| ||| | |||||||| |||||||| |||  ||    
T  15549720 tgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatatacttggtattggttcatttgtctc 15549621  T
Q  119 aattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataat 166  Q
    |||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||| || |||||||    
T  15549620 aattattttagagttgtagaatgagagacgaactttgccggaaataat 15549573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 18739053 - 18738909
Alignment:
Q  16 cggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgc 115  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||| || | ||||| ||||||||||||| |||||| |||||  |||| ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  18739053 cggtgaaatgcacatgtatactcaactacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggc-ctagagtttatttacttggttttggttcatttgt 18738955  T
Q  116 ttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaa 162  Q
     || ||| |||||||||| ||||| || |||| |||||| |||||||    
T  18738954 ctc-attgttttaaagttgtaaaaggagagacgaactttatcgaaaa 18738909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 260
Target Start/End: Original strand, 45804098 - 45804170
Alignment:
Q  188 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45804098 aaatcttttgtggataaattgatatgattatatggagatatttgaatgattgctaggtgatgaatatgatgtt 45804170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 320
Target Start/End: Original strand, 43428727 - 43428801
Alignment:
Q  247 ttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtatttt-ctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 320  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||  ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  43428727 ttgaatatgatgtttatcataaggtattgtattttcctctattacttgtattatgagaaattgtatggagttgtt 43428801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 41660595 - 41660533
Alignment:
Q  243 ggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaat 306  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  41660595 ggtgttggatatgatatttatcataaggtgttgtattttct-ctttacttgaaatatgagaaat 41660533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 18969095 - 18969037
Alignment:
Q  247 ttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtatttt-ctcctttacttgaattgtgagaa 304  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  18969095 ttgaatatgatatttatcataaggtgttgtattttcctcctttacttgtattatgagaa 18969037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 306
Target Start/End: Original strand, 33370012 - 33370109
Alignment:
Q  209 atatgattatatgaagatgtgcgaatg-attgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaat 306  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||    
T  33370012 atatgactaaatgaagatgtgtgaatggattgttatatgttggatatgatatttatcataaggtgttgtattttct-ctttacttggaatatgagaaat 33370109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 290
Target Start/End: Original strand, 17319733 - 17319812
Alignment:
Q  212 tgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtatttt-ctcctttac 290  Q
    |||||| |||||||| || || | |||| || ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  17319733 tgattaaatgaagatatgtgagtaattgttaagtgttgaatttgatgtttatcagaaggtgttgtattttcctcctttac 17319812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 10903373 - 10903312
Alignment:
Q  251 atatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatg 312  Q
    |||||||||||||||||| || |  || ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  10903373 atatgatgtttatcataaggtctgatactttctcctttacttgaaatgtgggaaatcgtatg 10903312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 202 - 309
Target Start/End: Original strand, 21167868 - 21167976
Alignment:
Q  202 tagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtatttt-ctcctttacttgaattgtg 300  Q
    |||||| ||||||||  |||||||| || || | | || |||||||||||| ||| |||||||| ||  ||||||||||| ||| |||||||| || |||    
T  21167868 tagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaaatggtaggtgttgaatgtgaggtttatcacaagatgttgtattttcctcttttacttggatggtg 21167967  T
Q  301 agaaattgt 309  Q
    | |||||||    
T  21167968 acaaattgt 21167976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 320
Target Start/End: Original strand, 13813 - 14117
Alignment:
Q  16 cggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgc 115  Q
    |||||||| | ||||| ||| |||||| || | ||||| |||| |||||||| |||||| |||||  |||| ||  ||||||||||||||||||| |||     
T  13813 cggtgaaatgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatcaaagtgtatacatagtcgaggccctagagtta-tttacttggttttggttcatttgt 13911  T
Q  116 ttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgat 215  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13912 ctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgagctttgtcgaaaataatctttaagaccaaatacttagcaaatcttttgtggatagtttgttatgat 14011  T
Q  216 tatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgta-ttttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaa 314  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||| |||||||||||| ||| |||||||||||| || |||     
T  14012 tatatgaagatatgtggatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataatttgaagtatttttctcctttatttggattgtgagaaatagtgtgat 14111  T
Q  315 gttgtt 320  Q
    ||||||    
T  14112 gttgtt 14117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 16 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 11900 - 11598
Alignment:
Q  16 cggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgc 115  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||| || | ||||| ||||||||| ||| |||||| |||||  |||| |||  |||||||||||||||||| |||     
T  11900 cggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagtatatacatagtcgaggccctagagtttagttacttggttttggttcatttgt 11801  T
Q  116 ttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatc-ttttgtggatagtttgatatga 214  Q
     ||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||   |||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  11800 ctcaattattttaaagttgtaaaacgagagacgaactttgtcgaaaataa---ttaagaccaattacttggcaaatctttttttggatagtttgatatga 11704  T
Q  215 ttatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaa 314  Q
    |||||||||||| ||  ||| |||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  11703 ttatatgaagatatgtcaattatttttgggtgttgaatatgatgtttatcataaggtgttttattttctcctttacttggattgtgagaaagtgtatgaa 11604  T
Q  315 gttgtt 320  Q
    ||||||    
T  11603 gttgtt 11598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 118 - 320
Target Start/End: Original strand, 14799 - 15001
Alignment:
Q  118 caattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgatta 217  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  14799 caattattttaaagttgtaaaatgagagatgaactttgtcgaaaataatttttaagaccaaatacttgacaaatcttttgtggatagtttgatataatca 14898  T
Q  218 tatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagtt 317  Q
    ||||| ||| ||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  14899 tatgacgatatgtcaatgttttctaggtgttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattatatggagtt 14998  T
Q  318 gtt 320  Q
    |||    
T  14999 gtt 15001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 55 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 76254 - 76006
Alignment:
Q  55 gatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaacttt 154  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |  ||||  || ||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||| |||||||| |||| ||| ||    
T  76254 gatctaagtgtatgcatagtcgagaccctagagcttatttacttggttttggttcatttgtctcaactattttaaagttgtaaaatgagagacgaacctt 76155  T
Q  155 gtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatat 254  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| || ||||||| |||||| |||||||    
T  76154 gtcgaaaataatctttaagaccaattacttggcaaatcttttgtggatagtttgttttgattatataaagatgt-cg-atgattgttaggtgatgaatat 76057  T
Q  255 gatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaa 305  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  76056 gatgtttatcataatgtgaagtattttatcctttatttggattgtgagaaa 76006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1957 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold1957
Description:

Target: scaffold1957; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 92 - 281
Target Start/End: Original strand, 837 - 1025
Alignment:
Q  92 tttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaat 191  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  837 tttacttggttttggttcatttgtctcaattattttaaagttgtaaagtgaaagacgaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaat 936  T
Q  192 cttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtatttt 281  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||    
T  937 cttttgtgaatagtttgttatgattaaatgaagatatgcagatgattgttaggtgttgaatataatgtttatcataa-gtgtggtatttt 1025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 5)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 149 - 313
Target Start/End: Original strand, 35789 - 35952
Alignment:
Q  149 aactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgtt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  35789 aactttgtcgaaaataatctttaaaaccaaatacttggaaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatgtgaatgattgctgggtgtt 35888  T
Q  249 gaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatga 313  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||| | | |||||||| ||||||    
T  35889 gaatatgatgtttatcatagtgtggtgtattttct-ctttacttggaatatgagaaatcgtatga 35952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 226
Target Start/End: Original strand, 4223 - 4433
Alignment:
Q  16 cggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgc 115  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||| || | ||||| |||||||| |||| |||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||     
T  4223 cggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagagtatacatagtcgaggctctagagtttatatacttggtttttgttcatttgt 4322  T
Q  116 ttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgat 215  Q
     |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  4323 ctcaattattttagagttgtagaatgagagacgaactttgtcgaaaataatctttaagacgaaatacttggcaaatctattgtagatagtttgatatgat 4422  T
Q  216 tatatgaagat 226  Q
    |||||||||||    
T  4423 tatatgaagat 4433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 244 - 320
Target Start/End: Original strand, 1338 - 1414
Alignment:
Q  244 gtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1338 gtgttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatggagttgtt 1414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 244 - 320
Target Start/End: Original strand, 5718 - 5794
Alignment:
Q  244 gtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5718 gtgttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatggagttgtt 5794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 226
Target Start/End: Original strand, 1 - 50
Alignment:
Q  177 aaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagat 226  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1 aaatacttggcaaatctattgtagatagtttgatatgattatatgaagat 50  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1204 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold1204
Description:

Target: scaffold1204; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 204
Target Start/End: Original strand, 1089 - 1277
Alignment:
Q  16 cggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgc 115  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||  || | ||||| ||||||||||||| |||||| |||||  |||| ||| |||||||| |||||||||| |||     
T  1089 cggtgaaacgcacatgtatactcaaccacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttgattttggttcagttgt 1188  T
Q  116 ttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatag 204  Q
     ||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1189 ctcaattattttaaagttgtaatatgagagacgaactttgtcgaaaataatctttaagatcaaatacttggcaaatcttttgtggatag 1277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1204; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 244 - 320
Target Start/End: Original strand, 1297 - 1373
Alignment:
Q  244 gtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 320  Q
    |||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||    
T  1297 gtgttgaatacgatgtttatcatggtgtgttgtattttctcctttacttggattgtgagaaagtatatggagttgtt 1373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 153 - 319
Target Start/End: Original strand, 255380 - 255546
Alignment:
Q  153 ttgtcgaaaataatctttaa-gaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaa 251  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  255380 ttgttgaaaataatctttaaagatcaaatacatggcaaatcttttgtggatagtttgatatgaatatatgaagatatgtgaatgatttctaggtgttgaa 255479  T
Q  252 tatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgt 319  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  255480 tatgatgtttatcatactgtggtgtattttc-ccctcacttgaattgtgagaaatagtatgatgttgt 255546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 182 - 320
Target Start/End: Original strand, 2118 - 2255
Alignment:
Q  182 tttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtatttt 281  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  2118 tttggaaaatcttttgtggatagtttgatatgaatatatgaagatatgtgaatgattgttaggtgttgaatatgatg-ttatcataaggtgttgtatttt 2216  T
Q  282 ctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 320  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||    
T  2217 ctcctttacttggattgtgagaaataatatgatgttgtt 2255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 8390 - 8634
Alignment:
Q  18 gtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgctt 117  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| || | | ||| ||||||||||||| |||||| |||||  |||| ||  |||||||||||| |||||| |||  |    
T  8390 gtgaaacgcacatgtatactcaactacactcaaatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagttcatttacttggttt-ggttcatttgtct 8488  T
Q  118 caattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgatta 217  Q
    ||||| |||||||||  ||||||   |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  8489 caatttttttaaagtcgtaaaataggagacgaactttgttgaaaataatctttaagaccaaatacttggcaaatattttgtggatagtttgttatgatta 8588  T
Q  218 tatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttat 263  Q
    |||  |||| || ||||| |  ||| ||||||| || |||||||||    
T  8589 tatagagatatgtgaatgctctctaagtgttgattacgatgtttat 8634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 192 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 4999 - 4871
Alignment:
Q  192 cttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttact 291  Q
    |||| ||| |||| || ||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4999 ctttcgtgaatagctttatatgattaaatgaagatatgtgaatgattgttaggtgttgaatatgatgtttatcataaggtgttgtattttctcctttact 4900  T
Q  292 tgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 320  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  4899 tggattgtgagaaagtgtatgaagttgtt 4871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 116 - 320
Target Start/End: Original strand, 246900 - 247104
Alignment:
Q  116 ttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgat 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||| |||| || || ||||    
T  246900 ttcaattattttaaagttgtaaaatgatagacgaaccttgtcgaaaataatctttaagacaagatacttgacaaatcttttgtgaatagctttatgtgat 246999  T
Q  216 tatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaag 315  Q
    || || ||| |||  ||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||| ||   ||  ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||| |    
T  247000 tacataaaggtgtatgaatgattgatagatgttgaaaatgatatttatcttagtatgaagtattttctcctttattttgattgtgagaaatagtatgatg 247099  T
Q  316 ttgtt 320  Q
    |||||    
T  247100 ttgtt 247104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 163 - 319
Target Start/End: Original strand, 21081 - 21236
Alignment:
Q  163 taatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgttta 262  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||| || |  |||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  21081 taatctttaagaccaaatacttggcaaatcatttgtggatagttggttatgattatataaagatatgtggttgatttttaggtgttgaatatgattttta 21180  T
Q  263 tcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgt 319  Q
    |||||  ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  21181 tcatactgtgatgtattttctcc-tcacttgaattgtgagaaatagtatgatgttgt 21236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 257
Target Start/End: Original strand, 11957 - 12198
Alignment:
Q  16 cggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgc 115  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||| || | ||||| ||||||||||||| |||||| |||||  |||| ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  11957 cggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagattttatttacttggttttggttcatttgt 12056  T
Q  116 ttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgat 215  Q
      ||||||||||||| || ||||||   | || |||||||||||||| |||||||  ||||||||  || | |||||  ||||| |||| |||||||||     
T  12057 cccaattattttaaaattataaaatatgatacgaactttgtcgaaaacaatcttttggaccaaatgctttgtaaatcccttgtgcatagattgatatgaa 12156  T
Q  216 tatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgat 257  Q
    || ||||| || || |||||||||||||||  ||||||||||    
T  12157 taaatgaatatatgtgaatgattgctaggtaatgaatatgat 12198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 312
Target Start/End: Original strand, 12200 - 12235
Alignment:
Q  276 tattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatg 312  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12200 tattttctcctt-acttgaattgtgagaaattgtatg 12235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 149 - 320
Target Start/End: Original strand, 39117 - 39289
Alignment:
Q  149 aactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgtt 248  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||  | | ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||    
T  39117 aactttgtcgaaaatgatctttaagaccgaataccttgaaaatcttttatgaatagtttgatatgattgtatgaagatgtatgaatgattaataggtgtt 39216  T
Q  249 gaatatgatgtttatcataacgtgttgta-ttttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 320  Q
    ||| |||||||||||||  | ||| |||| | |||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  39217 gaacatgatgtttatcaagatgtgatgtactcttctcctttgttttgattgtgagaaattgtatgaagttgtt 39289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0258 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0258
Description:

Target: scaffold0258; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 9350 - 9060
Alignment:
Q  27 acatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattt 126  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||| | ||||||||  ||||||  ||    
T  9350 acatgtatactcaactgcactcatatgtgatctaagtgtatacatagttgaggcactagaatttatttgcttagtttggattcaattgtctcaatt-gtt 9252  T
Q  127 taaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagat 226  Q
     |||||| | ||| | || || ||| |||||| |||| |||||||| ||| | || || |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  9251 aaaagttgtgaaacgttatacgaac-ttgtcggaaatgatctttaaaaccgagtactttgcaaatcttttgtgtatagcttgatacgattatatgaagat 9153  T
Q  227 gtgcgaatga-ttgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgt 319  Q
    |||  ||||| ||| |||||||| |||||||||  |||  ||   || |||||||  ||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  9152 gtgtaaatgatttgttaggtgtttaatatgatg-atatagtagtatggtgtatttcttccgtcacttgaattgtgagaaattatatgaaattgt 9060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 7273 - 7149
Alignment:
Q  16 cggtgaaacgtacatgcatactcaactgcagttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattagaatttgtttacttggttttggttcaattgc 115  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| |||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  7273 cggtgaaatgtacatgtatactcaattgcactcatatgtgatctaagtgtatacatagttgaggcactagagtttgtttacttggttttggttcaattgt 7174  T
Q  116 ttcaattattttaaagttctaaaat 140  Q
     |||||| ||| |||||| ||||||    
T  7173 ctcaattgtttaaaagttgtaaaat 7149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 128
Target Start/End: Original strand, 7115 - 7154
Alignment:
Q  89 ttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattatttta 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  7115 ttgtttacttggttttggttcaattgtctcaattatttta 7154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 83 - 206
Target Start/End: Original strand, 118547 - 118670
Alignment:
Q  83 tagaatttgtttacttggttttggttcaattgcttcaattattttaaagttctaaaatgatagacaaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatat 182  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  118547 tagagtttatttacttggttttggttcatttgtcccaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaatgatctttaaaaccaaatat 118646  T
Q  183 ttggcaaatcttttgtggatagtt 206  Q
    ||  |||| |||||||| ||||||    
T  118647 tttacaaaccttttgtgaatagtt 118670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 211 - 320
Target Start/End: Original strand, 44739 - 44848
Alignment:
Q  211 atgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgta 310  Q
    ||||||| |||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||    
T  44739 atgattaaatgaagatctatgaatgattgataggtgttgaatatgatgtttattataaggtgttgtattttctcctctacttggaatgtgagaaagtgta 44838  T
Q  311 tgaagttgtt 320  Q
    |  |||||||    
T  44839 tagagttgtt 44848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 188 - 320
Target Start/End: Original strand, 34570 - 34702
Alignment:
Q  188 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatga-ttgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcct 286  Q
    |||||||| |||  ||| || ||||||||| |||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||     
T  34570 aaatctttcgtgattagctttatatgattaaatgaagatatacgaatgaattgttaggtgttgaatatgaagtttatcataaggtgttgtattttctcc- 34668  T
Q  287 ttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgtt 320  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||| |||||||    
T  34669 ttacttggaatgtgagaaagtgtatggagttgtt 34702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0153
Description:

Target: scaffold0153; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 244 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 868 - 807
Alignment:
Q  244 gtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaa 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  868 gtgttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttctcctttacttggattgtgagaaa 807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 6787 - 6694
Alignment:
Q  189 aatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttc 282  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||  |||||||| || || | ||||  |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  6787 aatcttttgtcaatagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgaggtcttgaatatgatatttatcataaggtgttgtattttc 6694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 219 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 3702 - 3637
Alignment:
Q  219 atgaagatgtgcgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctc 284  Q
    ||||||||||| |||||| || ||  ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  3702 atgaagatgtgtgaatgaatgttatatgttggatatgatatttatcataaggtgttgtattttctc 3637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 241 - 307
Target Start/End: Original strand, 3996 - 4061
Alignment:
Q  241 taggtgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaatt 307  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || ||||||||| | |||| ||||||    
T  3996 taggtgttgaatatgatgttcatcataaggtgtggtatttcct-ctttacttggaatgtgggaaatt 4061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 84559 - 84499
Alignment:
Q  245 tgttgaatatgatgtttatcataacgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaat 306  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  84559 tgttggatatgatatttatcataaggtattgtattttct-ctttacttgaaatatgagaaat 84499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University