View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6241_low_4 (Length: 268)

Name: NF6241_low_4
Description: NF6241
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6241_low_4
NF6241_low_4
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (24-263)||(19802-20041)
scaffold0122 (24-263)||(24106-24345)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (17-263)||(1534-1780)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (24-263)||(20333-20572)
[»] scaffold0310 (2 HSPs)
scaffold0310 (16-258)||(6261-6503)
scaffold0310 (16-224)||(1-209)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (22-263)||(15319-15560)
[»] chr7 (40 HSPs)
chr7 (16-263)||(7283908-7284155)
chr7 (20-215)||(3895181-3895376)
chr7 (22-215)||(35094974-35095166)
chr7 (20-215)||(45452063-45452259)
chr7 (24-215)||(44865391-44865582)
chr7 (27-215)||(39046523-39046712)
chr7 (26-215)||(15822327-15822516)
chr7 (24-215)||(143800-143991)
chr7 (16-215)||(11287569-11287768)
chr7 (20-215)||(12369735-12369931)
chr7 (24-219)||(47289942-47290138)
chr7 (26-215)||(12759149-12759340)
chr7 (20-215)||(13862828-13863020)
chr7 (17-215)||(26070161-26070358)
chr7 (17-215)||(26093948-26094145)
chr7 (17-214)||(16569902-16570099)
chr7 (17-214)||(16595563-16595760)
chr7 (17-215)||(12248015-12248214)
chr7 (17-248)||(17223797-17224032)
chr7 (184-263)||(111121-111200)
chr7 (17-256)||(13377682-13377924)
chr7 (184-263)||(32493898-32493977)
chr7 (17-215)||(13274930-13275129)
chr7 (184-263)||(126739-126818)
chr7 (184-256)||(3060272-3060344)
chr7 (184-263)||(1936869-1936948)
chr7 (21-226)||(14271782-14271989)
chr7 (21-256)||(16914781-16915018)
chr7 (21-248)||(48356801-48357029)
chr7 (18-215)||(49047569-49047767)
chr7 (21-219)||(9611465-9611665)
chr7 (21-219)||(9839036-9839236)
chr7 (21-253)||(34241063-34241297)
chr7 (199-256)||(13389693-13389750)
chr7 (21-113)||(28722267-28722359)
chr7 (21-215)||(31501330-31501526)
chr7 (21-113)||(14935517-14935609)
chr7 (21-113)||(15363110-15363202)
chr7 (200-256)||(16919870-16919926)
chr7 (142-215)||(25124407-25124482)
[»] chr5 (29 HSPs)
chr5 (30-258)||(11584220-11584448)
chr5 (20-215)||(28261672-28261867)
chr5 (20-215)||(4865418-4865613)
chr5 (24-215)||(21397253-21397444)
chr5 (17-215)||(11337081-11337280)
chr5 (24-215)||(24183027-24183219)
chr5 (20-215)||(20712232-20712428)
chr5 (17-215)||(1168100-1168298)
chr5 (24-215)||(21646636-21646826)
chr5 (20-176)||(21906855-21907011)
chr5 (17-215)||(19405691-19405891)
chr5 (24-148)||(24475738-24475861)
chr5 (21-193)||(23981433-23981606)
chr5 (17-256)||(19862362-19862604)
chr5 (22-256)||(21222462-21222697)
chr5 (17-215)||(3674015-3674215)
chr5 (17-215)||(16595660-16595860)
chr5 (17-256)||(5450695-5450937)
chr5 (17-215)||(23466590-23466787)
chr5 (24-215)||(21310603-21310796)
chr5 (20-215)||(23494075-23494272)
chr5 (17-215)||(28902344-28902545)
chr5 (17-215)||(28938739-28938940)
chr5 (21-256)||(37983521-37983758)
chr5 (17-215)||(432616-432815)
chr5 (24-215)||(21297069-21297262)
chr5 (22-256)||(21617174-21617410)
chr5 (21-155)||(22885799-22885932)
chr5 (21-113)||(29918122-29918214)
[»] chr4 (36 HSPs)
chr4 (20-215)||(55376494-55376689)
chr4 (24-215)||(44346987-44347177)
chr4 (20-215)||(53704629-53704825)
chr4 (24-215)||(23269829-23270020)
chr4 (20-215)||(44056071-44056266)
chr4 (20-211)||(8872372-8872563)
chr4 (20-215)||(20813442-20813638)
chr4 (21-215)||(30458060-30458255)
chr4 (17-215)||(12837096-12837294)
chr4 (16-196)||(45458769-45458950)
chr4 (16-215)||(16732321-16732520)
chr4 (24-215)||(34395418-34395609)
chr4 (46-215)||(819826-819996)
chr4 (20-215)||(53907604-53907791)
chr4 (20-215)||(21959359-21959554)
chr4 (17-215)||(52265403-52265602)
chr4 (20-215)||(27961127-27961324)
chr4 (184-263)||(5682380-5682459)
chr4 (184-263)||(54118120-54118199)
chr4 (17-215)||(15044981-15045181)
chr4 (17-215)||(18494224-18494421)
chr4 (184-263)||(25119059-25119138)
chr4 (21-253)||(7185701-7185934)
chr4 (17-215)||(13809405-13809604)
chr4 (21-256)||(15013137-15013372)
chr4 (21-215)||(30232391-30232586)
chr4 (21-215)||(41256263-41256459)
chr4 (17-134)||(47535042-47535159)
chr4 (17-215)||(15109243-15109443)
chr4 (17-256)||(41165808-41166040)
chr4 (17-215)||(14901385-14901584)
chr4 (25-256)||(18276595-18276827)
chr4 (199-256)||(47534933-47534990)
chr4 (27-256)||(7964565-7964796)
chr4 (21-113)||(40904932-40905024)
chr4 (21-219)||(38764866-38765066)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (20-215)||(4720-4913)
scaffold0447 (20-215)||(9334-9527)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (20-215)||(7329-7522)
[»] chr6 (30 HSPs)
chr6 (20-215)||(18570435-18570630)
chr6 (20-215)||(32898946-32899142)
chr6 (23-215)||(16086176-16086369)
chr6 (20-215)||(16106672-16106868)
chr6 (20-215)||(22441090-22441285)
chr6 (37-215)||(13014603-13014784)
chr6 (20-215)||(18432799-18432994)
chr6 (20-215)||(18777302-18777481)
chr6 (16-148)||(31628420-31628552)
chr6 (17-256)||(22361619-22361859)
chr6 (17-256)||(21623321-21623563)
chr6 (184-263)||(18583641-18583720)
chr6 (184-263)||(19983144-19983223)
chr6 (184-263)||(35015009-35015088)
chr6 (17-215)||(18399091-18399290)
chr6 (17-215)||(25367130-25367331)
chr6 (21-248)||(18629469-18629698)
chr6 (21-219)||(17556909-17557107)
chr6 (17-215)||(21410944-21411144)
chr6 (46-215)||(33324874-33325046)
chr6 (46-215)||(35135906-35136078)
chr6 (17-96)||(28195108-28195187)
chr6 (21-155)||(29605607-29605739)
chr6 (21-215)||(17083093-17083287)
chr6 (24-215)||(16887685-16887879)
chr6 (21-256)||(33538223-33538459)
chr6 (17-110)||(18381684-18381777)
chr6 (184-256)||(14152632-14152704)
chr6 (24-215)||(15079606-15079795)
chr6 (21-155)||(22848172-22848304)
[»] chr3 (67 HSPs)
chr3 (20-215)||(317405-317600)
chr3 (24-215)||(16181842-16182032)
chr3 (24-215)||(13817672-13817862)
chr3 (16-215)||(8631942-8632142)
chr3 (20-215)||(50111946-50112142)
chr3 (20-215)||(16995956-16996151)
chr3 (24-215)||(19570586-19570775)
chr3 (17-215)||(54424165-54424364)
chr3 (24-215)||(38527889-38528079)
chr3 (16-215)||(12349434-12349634)
chr3 (20-215)||(17100809-17101004)
chr3 (20-215)||(17101494-17101689)
chr3 (24-215)||(22144167-22144358)
chr3 (24-215)||(14298581-14298773)
chr3 (24-215)||(14304208-14304400)
chr3 (21-215)||(34439237-34439433)
chr3 (24-215)||(6154226-6154417)
chr3 (17-215)||(14295592-14295790)
chr3 (17-215)||(14301219-14301417)
chr3 (16-215)||(17938726-17938925)
chr3 (30-215)||(35123861-35124047)
chr3 (22-220)||(17522780-17522978)
chr3 (17-156)||(55440803-55440942)
chr3 (17-215)||(3578242-3578440)
chr3 (20-111)||(19260839-19260930)
chr3 (111-215)||(6146664-6146769)
chr3 (17-215)||(11060902-11061099)
chr3 (184-263)||(7854306-7854385)
chr3 (81-215)||(14527975-14528110)
chr3 (184-263)||(54037976-54038055)
chr3 (17-256)||(17204834-17205076)
chr3 (24-116)||(53898450-53898541)
chr3 (37-139)||(11196291-11196393)
chr3 (17-256)||(17191694-17191936)
chr3 (184-263)||(3992874-3992953)
chr3 (184-263)||(55513194-55513273)
chr3 (184-263)||(2844515-2844594)
chr3 (184-258)||(15857120-15857194)
chr3 (17-248)||(3576298-3576532)
chr3 (24-93)||(6146764-6146832)
chr3 (17-215)||(11328859-11329055)
chr3 (17-215)||(17139661-17139861)
chr3 (184-263)||(19232090-19232169)
chr3 (17-215)||(16880276-16880477)
chr3 (17-110)||(47784767-47784860)
chr3 (17-248)||(15876221-15876448)
chr3 (17-211)||(14059112-14059307)
chr3 (184-266)||(16743990-16744072)
chr3 (184-263)||(17955832-17955915)
chr3 (17-215)||(12560131-12560330)
chr3 (21-256)||(13301323-13301559)
chr3 (21-256)||(13311979-13312215)
chr3 (17-215)||(30207369-30207570)
chr3 (179-256)||(38810868-38810945)
chr3 (184-263)||(45581955-45582034)
chr3 (181-248)||(15550919-15550986)
chr3 (17-156)||(39656679-39656817)
chr3 (21-215)||(14080666-14080863)
chr3 (201-256)||(12031849-12031904)
chr3 (21-215)||(14814658-14814855)
chr3 (21-215)||(9590648-9590844)
chr3 (17-110)||(12488727-12488820)
chr3 (142-215)||(51961031-51961106)
chr3 (21-111)||(6228625-6228715)
chr3 (89-215)||(11882113-11882240)
chr3 (21-113)||(31412331-31412423)
chr3 (21-113)||(50313344-50313436)
[»] chr2 (28 HSPs)
chr2 (24-215)||(25875816-25876006)
chr2 (24-215)||(23836601-23836791)
chr2 (20-215)||(32466013-32466207)
chr2 (17-215)||(36890581-36890779)
chr2 (24-215)||(4448028-4448220)
chr2 (24-215)||(271330-271521)
chr2 (17-215)||(25602177-25602377)
chr2 (17-215)||(28974202-28974400)
chr2 (17-215)||(27261956-27262156)
chr2 (17-215)||(24571188-24571386)
chr2 (46-215)||(22579758-22579926)
chr2 (184-263)||(19794581-19794660)
chr2 (184-263)||(20627190-20627269)
chr2 (184-263)||(22275046-22275125)
chr2 (184-263)||(22284279-22284358)
chr2 (17-220)||(68145-68351)
chr2 (181-263)||(15633535-15633617)
chr2 (17-256)||(43646046-43646289)
chr2 (184-263)||(43642833-43642912)
chr2 (21-256)||(19660037-19660273)
chr2 (21-256)||(19666685-19666921)
chr2 (17-215)||(31146073-31146275)
chr2 (67-248)||(25305634-25305818)
chr2 (36-215)||(23821534-23821714)
chr2 (36-215)||(23830613-23830793)
chr2 (21-215)||(19669003-19669199)
chr2 (17-110)||(22775206-22775299)
chr2 (17-110)||(22780584-22780677)
[»] scaffold0673 (2 HSPs)
scaffold0673 (20-215)||(717-913)
scaffold0673 (28-206)||(6749-6928)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (20-215)||(22847-23043)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (91-254)||(1-164)
[»] scaffold0480 (2 HSPs)
scaffold0480 (24-215)||(5143-5333)
scaffold0480 (17-215)||(8776-8976)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (24-215)||(15034-15224)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (20-215)||(11603-11799)
[»] scaffold0740 (1 HSPs)
scaffold0740 (24-215)||(4445-4635)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (20-215)||(48302-48496)
scaffold0068 (20-215)||(61750-61944)
[»] scaffold0016 (4 HSPs)
scaffold0016 (24-215)||(164375-164565)
scaffold0016 (184-263)||(166116-166195)
scaffold0016 (184-257)||(162036-162109)
scaffold0016 (179-256)||(116410-116487)
[»] chr8 (35 HSPs)
chr8 (24-215)||(22234700-22234890)
chr8 (24-215)||(20573087-20573279)
chr8 (24-215)||(37611829-37612020)
chr8 (17-215)||(20561526-20561725)
chr8 (23-215)||(41246816-41247009)
chr8 (24-215)||(19992952-19993141)
chr8 (20-215)||(20481761-20481955)
chr8 (40-215)||(25122618-25122793)
chr8 (17-256)||(21198005-21198246)
chr8 (111-211)||(7000524-7000624)
chr8 (18-215)||(21681157-21681356)
chr8 (17-256)||(17285357-17285600)
chr8 (17-224)||(23837351-23837561)
chr8 (184-263)||(16404852-16404931)
chr8 (17-215)||(22981426-22981622)
chr8 (184-263)||(24716714-24716793)
chr8 (184-263)||(39115599-39115678)
chr8 (20-215)||(39446660-39446857)
chr8 (184-263)||(274767-274846)
chr8 (184-263)||(641003-641082)
chr8 (184-263)||(826809-826888)
chr8 (125-215)||(20529748-20529839)
chr8 (17-72)||(20653944-20653999)
chr8 (21-258)||(26011651-26011886)
chr8 (22-256)||(5854772-5855007)
chr8 (46-256)||(33528607-33528819)
chr8 (21-256)||(15933455-15933692)
chr8 (17-58)||(20647882-20647923)
chr8 (46-256)||(29306599-29306813)
chr8 (21-219)||(22742921-22743122)
chr8 (17-110)||(38533802-38533895)
chr8 (28-215)||(38635541-38635731)
chr8 (46-256)||(23225932-23226141)
chr8 (179-263)||(31194169-31194253)
chr8 (26-134)||(23151810-23151918)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (24-215)||(11548-11740)
scaffold0359 (20-215)||(1473-1667)
[»] chr1 (26 HSPs)
chr1 (16-215)||(9783959-9784159)
chr1 (24-215)||(22403005-22403196)
chr1 (20-208)||(41212227-41212415)
chr1 (26-215)||(49967812-49968002)
chr1 (20-215)||(35054912-35055108)
chr1 (17-174)||(21718381-21718537)
chr1 (31-215)||(35522247-35522432)
chr1 (17-256)||(20177328-20177570)
chr1 (20-256)||(13376711-13376950)
chr1 (184-263)||(41218729-41218808)
chr1 (184-263)||(21860335-21860414)
chr1 (184-266)||(41394528-41394610)
chr1 (184-257)||(44034829-44034902)
chr1 (17-215)||(16646065-16646266)
chr1 (21-256)||(22143215-22143451)
chr1 (17-215)||(16656791-16656992)
chr1 (21-256)||(21195171-21195408)
chr1 (46-215)||(19603279-19603449)
chr1 (22-256)||(17609086-17609322)
chr1 (21-110)||(27329757-27329845)
chr1 (21-248)||(8537771-8538000)
chr1 (21-248)||(8603010-8603239)
chr1 (17-215)||(51627558-51627758)
chr1 (185-256)||(27675120-27675191)
chr1 (22-248)||(37233722-37233949)
chr1 (21-215)||(49997174-49997371)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (30-215)||(25377-25563)
scaffold0158 (30-116)||(25124-25210)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (17-215)||(174-370)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (20-215)||(24623-24819)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (16-215)||(117857-118058)
scaffold0035 (17-215)||(109356-109556)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (20-215)||(60962-61159)
scaffold0001 (20-180)||(70552-70713)
scaffold0001 (76-215)||(79785-79925)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (17-215)||(85485-85683)
scaffold0014 (17-215)||(159453-159651)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (16-215)||(9139-9339)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (20-215)||(7725-7922)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (20-215)||(132144-132341)
scaffold0021 (20-219)||(88431-88631)
scaffold0021 (17-215)||(11841-12041)
scaffold0021 (17-215)||(16052-16253)
scaffold0021 (17-215)||(25583-25784)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (20-215)||(11464-11659)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (24-215)||(254710-254900)
scaffold0011 (24-215)||(261316-261506)
[»] scaffold0816 (1 HSPs)
scaffold0816 (64-215)||(2961-3112)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (25-215)||(10098-10289)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (17-215)||(112441-112639)
scaffold0022 (17-215)||(102815-103016)
scaffold0022 (17-95)||(109743-109821)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (17-215)||(33815-34014)
[»] scaffold1867 (1 HSPs)
scaffold1867 (30-215)||(310-496)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (17-196)||(252903-253083)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (21-211)||(2073-2263)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (25-215)||(38459-38650)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (17-215)||(70767-70964)
scaffold0031 (17-174)||(31197-31352)
scaffold0031 (21-248)||(97060-97288)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (17-215)||(21665-21862)
scaffold0120 (17-215)||(31364-31561)
scaffold0120 (106-215)||(47445-47554)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (16-154)||(5093-5231)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (17-215)||(471-670)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (39-215)||(40834-41010)
scaffold0034 (39-219)||(46341-46521)
scaffold0034 (184-263)||(80188-80267)
[»] scaffold0342 (2 HSPs)
scaffold0342 (17-174)||(6095-6251)
scaffold0342 (184-263)||(304-383)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (17-256)||(76699-76941)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (20-111)||(146757-146848)
scaffold0025 (21-151)||(85690-85818)
scaffold0025 (16-219)||(53498-53703)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (21-256)||(197107-197343)
[»] scaffold0686 (2 HSPs)
scaffold0686 (184-257)||(5735-5808)
scaffold0686 (184-257)||(5941-6014)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (17-215)||(7958-8157)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (20-215)||(33622-33819)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (17-256)||(35631-35873)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (17-248)||(6885-7119)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (17-215)||(3472-3671)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (184-263)||(31132-31211)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (21-215)||(8167-8363)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (184-263)||(30418-30497)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (184-263)||(41633-41712)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (46-215)||(1440-1611)
scaffold0456 (46-215)||(8585-8756)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (17-215)||(2211-2410)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (21-215)||(1242-1438)
scaffold0409 (21-215)||(9497-9693)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (21-256)||(31177-31414)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (21-248)||(69614-69843)
[»] scaffold0483 (2 HSPs)
scaffold0483 (17-110)||(6814-6907)
scaffold0483 (199-256)||(6999-7056)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (184-263)||(42678-42754)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (46-215)||(89760-89929)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (22-134)||(2683-2795)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (47-215)||(10845-11014)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (17-156)||(93728-93867)
scaffold0032 (21-256)||(104477-104713)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (25-256)||(43651-43884)
scaffold0080 (21-256)||(23526-23762)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (184-248)||(1371-1435)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (17-109)||(28689-28781)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (24-215)||(22323-22516)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (119-215)||(70201-70298)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (21-215)||(855-1052)
[»] scaffold1295 (1 HSPs)
scaffold1295 (199-256)||(442-499)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (21-219)||(27654-27856)
[»] scaffold1272 (1 HSPs)
scaffold1272 (21-256)||(451-689)


Alignment Details
Target: scaffold0122 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 24 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 20041 - 19802
Alignment:
Q  24 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga 123  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  20041 actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatga 19942  T
Q  124 ccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcac 223  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19941 acaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcac 19842  T
Q  224 caactattagctcaagcttcacttttgctcctatgcttct 263  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19841 caactattaactcaagcttcacttttgctcctatgattct 19802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 24 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 24345 - 24106
Alignment:
Q  24 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga 123  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  24345 actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatga 24246  T
Q  124 ccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcac 223  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24245 acaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcac 24146  T
Q  224 caactattagctcaagcttcacttttgctcctatgcttct 263  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  24145 caactattaactcaagcttcatttttgctcctatgattct 24106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 263
Target Start/End: Original strand, 1534 - 1780
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1534 ttctcatactttgaacatataattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatca 1633  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaa 216  Q
    |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1634 cataggaacaattaatcaattcacccaattaagcacttatcatccaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaa 1733  T
Q  217 ttatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgcttct 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1734 ttatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatgattct 1780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 24 - 263
Target Start/End: Original strand, 20333 - 20572
Alignment:
Q  24 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga 123  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  20333 actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatga 20432  T
Q  124 ccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcac 223  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20433 acaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcac 20532  T
Q  224 caactattagctcaagcttcacttttgctcctatgcttct 263  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  20533 caactattaactcaagcttcatttttgctcctatgattct 20572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 16 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 6503 - 6261
Alignment:
Q  16 cttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatc 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6503 cttctcatactttgaacatgtatttcaactaacaacaatccaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataaatatagcacgaatttcatc 6404  T
Q  116 acatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6403 atttatgaacagttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 6304  T
Q  216 attatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatg 258  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6303 attatcacccactattaactcaagcttcacttttgctcctatg 6261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 209 - 1
Alignment:
Q  16 cttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatc 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  209 cttctcatactttgaacatgtatttcaactaacaacaatccaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatatagcacgaatttcatc 110  T
Q  116 acatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |  ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109 atttattaacatttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 10  T
Q  216 attatcacc 224  Q
    |||||||||    
T  9 attatcacc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 22 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 15560 - 15319
Alignment:
Q  22 atactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatat 121  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  15560 atactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattgtccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcaccacttat 15461  T
Q  122 gaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc 221  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15460 gaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataatttaaaattacaaaagtgattatgatgaatgctaacccccttaccttaattatc 15361  T
Q  222 accaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgcttct 263  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15360 tccaactattagcccaagcttcacttttgctcctatgattct 15319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 40)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 16 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 7284155 - 7283908
Alignment:
Q  16 cttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatc 115  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |    
T  7284155 cttctcatactttgaacatacaattcaactaataacaattcaatcatccataacttcacacatctaaacatgtcatcataattagagtacgaatttcacc 7284056  T
Q  116 acatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7284055 acttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatataaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaaaactaacccccttacctta 7283956  T
Q  216 attatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgcttct 263  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7283955 attatcaccaattattaactcaagcttcacttttgctcctatgattct 7283908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Original strand, 3895181 - 3895376
Alignment:
Q  20 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacat 119  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||  |    
T  3895181 tcatactttgaacatgcaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatttcatcagaattagagcatgaatttcatcaatt 3895280  T
Q  120 atgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  3895281 atgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 3895376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 22 - 215
Target Start/End: Original strand, 35094974 - 35095166
Alignment:
Q  22 atactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatat 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  35094974 atactttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgttatcacaattagagcatgaatttcatcacatat 35095072  T
Q  122 gaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  35095073 gaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 35095166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 45452259 - 45452063
Alignment:
Q  20 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  45452259 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaatccaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcactt 45452160  T
Q  120 atgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  45452159 atgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta 45452063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Original strand, 44865391 - 44865582
Alignment:
Q  24 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga 123  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  44865391 actttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatggcatcataattagagcacgaatttcatcacttatga 44865490  T
Q  124 ccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  44865491 acaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaa-tctaacccccttacctta 44865582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 27 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 39046712 - 39046523
Alignment:
Q  27 ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca 126  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39046712 ttgaacatacaattcaactaacaataattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca 39046613  T
Q  127 attaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  39046612 attaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaaataacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 39046523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 26 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15822516 - 15822327
Alignment:
Q  26 tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacc 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |    
T  15822516 tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaa-catgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaac 15822418  T
Q  126 aattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15822417 aattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataactgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 15822327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Original strand, 143800 - 143991
Alignment:
Q  24 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  143800 actttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattatttataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatga 143898  T
Q  124 ccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  143899 acaattaatcaattcatccaattaagcactttttatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 143991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 215
Target Start/End: Original strand, 11287569 - 11287768
Alignment:
Q  16 cttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||    
T  11287569 cttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcaacataatcagagcactaatttcatc 11287668  T
Q  116 acatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctt 214  Q
    |  ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  11287669 atttatgaacaattaatcaattcacccaattaaacacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctt 11287767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12369931 - 12369735
Alignment:
Q  20 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  |    
T  12369931 tcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattatccgtaacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttaatcattt 12369832  T
Q  120 atgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  12369831 atgaacaattaattaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataaatgataatgatgaaatctaacccccttacctta 12369735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 47289942 - 47290138
Alignment:
Q  24 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||  |||||    
T  47289942 actttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcatatatctaaacatggcatcataattagagctcgaatttcatcatttatga 47290040  T
Q  124 ccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaatta 219  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  47290041 acaattaatcaattcatccaattaagcatttttcatacaaataattgaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttaatta 47290138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 215
Target Start/End: Original strand, 12759149 - 12759340
Alignment:
Q  26 tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacc 125  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||  ||||| |    
T  12759149 tttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatatcatcataattggagcacaaatttcatcatttatgaac 12759248  T
Q  126 aattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  12759249 aattaatcaattcacccaattaaacacttttcatacaaataattgaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 12759340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 13863020 - 13862828
Alignment:
Q  20 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |    
T  13863020 tcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatttcatcataattagagcacgaatttcatcattt 13862921  T
Q  120 atgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||  ||||||||| ||||| ||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13862920 atggacaattaatctattcacccaattaagc----ttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 13862828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 26070358 - 26070161
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26070358 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatca 26070259  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctt 214  Q
      ||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||| ||| | |||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  26070258 tttatgaacaattaatcaatt-acacaattaagcacttattcatac-cataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaa-ccccttacctt 26070162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 26094145 - 26093948
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26094145 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatca 26094046  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctt 214  Q
      ||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||| ||| | |||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  26094045 tttatgaacaattaatcaatt-acacaattaagcacttattcatac-cataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaa-ccccttacctt 26093949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16570099 - 16569902
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16570099 ttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaaatcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataatgagagcacgaatttcatca 16570000  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctt 214  Q
      ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | |||||||||||||   |||||||||||||||    
T  16569999 tttatgagcaaataatcaatt-atccaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattttaacccccttacctt 16569902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 214
Target Start/End: Original strand, 16595563 - 16595760
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16595563 ttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaaatcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataatgagagcacgaatttcatca 16595662  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctt 214  Q
      ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | |||||||||||||   |||||||||||||||    
T  16595663 tttatgagcaaataatcaatt-atccaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattttaacccccttacctt 16595760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12248214 - 12248015
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12248214 ttctcatactttaaacatgaaattcaactaataacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatca 12248115  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaa-ttacaaaag-tgattatgatgaacactaacccccttacct 213  Q
      ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||| |  |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  12248114 tttatgaacaagtaatcaatt-atccaattaagcacttattcatacaa-taattgaaaaattgcaatatatgattatgatgaattctaacccccttacct 12248017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 17224032 - 17223797
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| |||||| | |||  |||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||    
T  17224032 ttctcatactttgaacatgaaatttcacaaacaacaattcaattatccacaacttcgtgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattataaca 17223933  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattac---aaaagtgattatga-tgaacactaaccccctta 210  Q
      | ||| ||||||||  ||| |  ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||   |||| ||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  17223932 actttgaacaattaat-tatttactcaattaagcacttaatcata-aaataattgaaaaattacactaaaaatgattatgattgaattctaaccccctta 17223835  T
Q  211 ccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttt 248  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  17223834 ccttaattatcaccaattcttagcccaagcttcacttt 17223797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 184 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 111200 - 111121
Alignment:
Q  184 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgcttct 263  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  111200 tgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaacttttagctcaagcttcacttttgctcctatgattct 111121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 13377682 - 13377924
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||| | |||||||| |||  ||||||  |||||||| | |||||||||||  | ||    
T  13377682 ttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaaca 13377781  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatt---ac-aaaagtgattatgatgaacactaacccccttac 211  Q
      ||||| ||||||||| |||  || ||| || ||||||| |||||||  |||||||||||   || |||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  13377782 attatgaacaattaatcgattactc-aatgaatcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttac 13377879  T
Q  212 cttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctccta 256  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| |||||||    
T  13377880 cttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 13377924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 184 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 32493977 - 32493898
Alignment:
Q  184 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgcttct 263  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  32493977 tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 32493898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 13274930 - 13275129
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| | | |||||| | |||  |||||| ||||||||| | |||||||||||  | ||    
T  13274930 ttctcatactttgaacatgaaattttactaacaacaattcaattaccaacaacttcttgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaattctaaca 13275029  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacct 213  Q
      ||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||| || ||||| |||||  ||| || |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  13275030 attatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaaatggcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacct 13275127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 184 - 263
Target Start/End: Original strand, 126739 - 126818
Alignment:
Q  184 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgcttct 263  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||    
T  126739 tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttcatttttgctcctatgattct 126818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 184 - 256
Target Start/End: Original strand, 3060272 - 3060344
Alignment:
Q  184 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctccta 256  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3060272 tgattatgataaagacttacccccttaccttcattatctccaactattagctctagcttcacttttgctccta 3060344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 184 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 1936948 - 1936869
Alignment:
Q  184 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgcttct 263  Q
    |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  1936948 tgattatgataaaaactaacctccttaccttaattatctccaactattaactctagcttcacttttgcttctatgattct 1936869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14271989 - 14271782
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata 120  Q
    ||||||||||||||| ||||  || |||||||||| ||||||| | || ||||| |||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||| | ||  ||    
T  14271989 catactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattgaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaatttga-caacta 14271891  T
Q  121 tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatga-tgaacactaacccccttacctta 215  Q
    ||| ||||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||  ||| ||||||||| ||||  ||||  |||||||||||    
T  14271890 tgaacaattaatc-atttactcaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaattcccttacctta 14271793  T
Q  216 attatcaccaa 226  Q
    |||||||||||    
T  14271792 attatcaccaa 14271782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16915018 - 16914781
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata 120  Q
    ||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||   || ||||| |||  |||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||  ||    
T  16915018 catactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaacta 16914919  T
Q  121 tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaa-ttaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaa 216  Q
    ||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||  || ||||| ||| ||||  |||||||| |||||||||    
T  16914918 tgaacaattaatcactt-actcaattaagcacttaatcatac-aataattgaaaagttacactaaatgattgtgattgaattctaacccctttaccttaa 16914821  T
Q  217 ttatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctccta 256  Q
    |||  || || |  |||| ||| ||||||||| |||||||    
T  16914820 ttaggacaaattcctagcccaaacttcactttagctccta 16914781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 48356801 - 48357029
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata 120  Q
    ||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||   || ||||| |||  |||||| ||||||||| |||||||| ||||| | ||  ||    
T  48356801 catactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattttaacaacta 48356900  T
Q  121 tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaat 217  Q
    ||| |||||||||| || |  |||||||||| || |||||||||  |||  |||||||||  || ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  48356901 tgaacaattaatcactt-actcaattaagcatttaatcatacaacgaatgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaat 48356999  T
Q  218 tatcaccaactattagctcaagcttcacttt 248  Q
    || || ||| |  |||| |||||||||||||    
T  48357000 tagca-caattcctagcccaagcttcacttt 48357029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 49047767 - 49047569
Alignment:
Q  18 tctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcac 117  Q
    |||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||| | |||||||| |||  ||||||||||| |||| | |||||| ||||  | ||     
T  49047767 tctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatgtcattataattggagcacaaattctaacaa 49047668  T
Q  118 atatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctt 214  Q
     | ||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||  || ||||| |||||  ||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  49047667 ttctgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcata-taacaattgaaaaatggcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctt 49047570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 219
Target Start/End: Original strand, 9611465 - 9611665
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata 120  Q
    ||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||   || ||||| |||  |||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||  ||    
T  9611465 catactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaacta 9611564  T
Q  121 tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaa 216  Q
    ||| ||||||||||  | |  ||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||  || ||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||    
T  9611565 tgaacaattaatcacgt-actcaattaagcacttaatgatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaaccctcttaccttaa 9611662  T
Q  217 tta 219  Q
    |||    
T  9611663 tta 9611665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 219
Target Start/End: Original strand, 9839036 - 9839236
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata 120  Q
    ||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||   || ||||| |||  |||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||  ||    
T  9839036 catactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaacta 9839135  T
Q  121 tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaa 216  Q
    ||| ||||||||||  | |  ||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||  || ||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||    
T  9839136 tgaacaattaatcacgt-actcaattaagcacttaatgatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaaccctcttaccttaa 9839233  T
Q  217 tta 219  Q
    |||    
T  9839234 tta 9839236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 34241297 - 34241063
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata 120  Q
    |||||||| |||||| ||||  || ||||||||||||||||||   || ||||| |||  ||||||  |||||||| || | ||||||||| ||||  ||    
T  34241297 catacttttaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacataacatcataattataacacgaattttatcaacta 34241198  T
Q  121 tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaat 217  Q
    ||| |||||||||| || |  ||||||| ||||| |||||||||  |||  |||||||||  || ||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |    
T  34241197 tgaacaattaatcactt-actcaattaatcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttagt 34241099  T
Q  218 tatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctc 253  Q
    || ||| || | ||| | ||||||||||||| ||||    
T  34241098 tagcacaaattcttaacccaagcttcactttagctc 34241063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 256
Target Start/End: Original strand, 13389693 - 13389750
Alignment:
Q  199 ctaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctccta 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| |||||||    
T  13389693 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 13389750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 113
Target Start/End: Original strand, 28722267 - 28722359
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttca 113  Q
    |||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||||||   || ||||| |||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  28722267 catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataactagagcacgaatttca 28722359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Original strand, 31501330 - 31501526
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata 120  Q
    |||||| |||||||| ||||  || || |||||||||||||||   || |||||  || ||||||| || |||||| |||| ||| ||||||||||  ||    
T  31501330 catactatgaacatgcaatttcaccaataacaattcaattatcaccaatttcatgtatttaaacatatcttcataattagatcactaatttcatcaacta 31501429  T
Q  121 tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgatta-tgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    ||| ||| |||||| || || ||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||  || |||||| || ||||  |||||||||||||||||    
T  31501430 tgaacaaataatcactt-attcaattaagcacttaatcatgcaattaa-tgaaaattacaactaattgattattgttgaattctaacccccttacctta 31501526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 113
Target Start/End: Original strand, 14935517 - 14935609
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttca 113  Q
    |||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||||||   || ||||| |||  |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14935517 catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccataactagagcacgaatttca 14935609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 113
Target Start/End: Original strand, 15363110 - 15363202
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttca 113  Q
    |||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||||||   || ||||| |||  |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15363110 catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccataactagagcacgaatttca 15363202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 256
Target Start/End: Original strand, 16919870 - 16919926
Alignment:
Q  200 taacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctccta 256  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| |||||||    
T  16919870 taacccccttatcttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 16919926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 142 - 215
Target Start/End: Original strand, 25124407 - 25124482
Alignment:
Q  142 caattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||  |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25124407 caattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgatgaagactaacccccttacctta 25124482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 29)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 30 - 258
Target Start/End: Original strand, 11584220 - 11584448
Alignment:
Q  30 aacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaatt 129  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||    
T  11584220 aacatgaatttcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatccaaatatgtcatcataaatagagcacgaatttcaccactcatgaacaatt 11584319  T
Q  130 aatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaacta 229  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11584320 aattaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttaattatcaccaacta 11584419  T
Q  230 ttagctcaagcttcacttttgctcctatg 258  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11584420 ttaactcaagcttcacttttgctcctatg 11584448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Original strand, 28261672 - 28261867
Alignment:
Q  20 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacat 119  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |    
T  28261672 tcatactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataactagagcacgaatttcaccactt 28261771  T
Q  120 atgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  28261772 atgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 28261867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Original strand, 4865418 - 4865613
Alignment:
Q  20 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacat 119  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |    
T  4865418 tcatactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcaccattt 4865517  T
Q  120 atgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4865518 atgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 4865613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Original strand, 21397253 - 21397444
Alignment:
Q  24 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  21397253 actttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatga 21397351  T
Q  124 ccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21397352 acaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 21397444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 11337280 - 11337081
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11337280 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatccaaacatatcatcataattagagcacgaatttcatca 11337181  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctt 214  Q
      ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  11337180 tttatgaacaattaaccaattcatccaattaagcacttattcatac-aataattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctt 11337082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 24183219 - 24183027
Alignment:
Q  24 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga 123  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  24183219 actttgaacatgtaattcgactaacaacaattcaattatccatgacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatga 24183120  T
Q  124 ccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  24183119 acaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta 24183027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Original strand, 20712232 - 20712428
Alignment:
Q  20 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |    
T  20712232 tcatactttgaacatgtaattcaatcaacaacaattcagttatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatca-tt 20712330  T
Q  120 atgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  20712331 atgaacaattaatcaattcactcaattaagcacttttcatacaagtaattgaaaattgcaaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 20712428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 1168298 - 1168100
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  1168298 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaaccattctattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatca 1168199  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
      ||||| ||||||||||||||| | || |||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  1168198 tttatgaacaattaatcaattcaccaaaataagcatttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtga-tatgatgaattctaacccccttacctta 1168100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21646826 - 21646636
Alignment:
Q  24 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga 123  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21646826 acttttaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagtacgaatttcatcacatatga 21646728  T
Q  124 ccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
     || |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  21646727 acatttaatcaattcacccaaataagcacttttcatacaaataattg-aaattgcaataagtgattatgatgaattttaacccccttacctta 21646636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 176
Target Start/End: Original strand, 21906855 - 21907011
Alignment:
Q  20 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |    
T  21906855 tcatactttgaacatgtaattcaaccaacatcaattcaattatccataacttcatatgtctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcattt 21906954  T
Q  120 atgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaatt 176  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21906955 atgaacaattaattaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaatt 21907011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 19405691 - 19405891
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  19405691 ttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaataattcaattatccataacttcatacattcaaatatgtcatcataattagagcataaatttcatca 19405790  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacct 213  Q
      ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| || |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  19405791 tttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacct 19405889  T
Q  214 ta 215  Q
    ||    
T  19405890 ta 19405891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 24 - 148
Target Start/End: Original strand, 24475738 - 24475861
Alignment:
Q  24 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  24475738 actttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagaacacgaatttcatcacttatga 24475836  T
Q  124 ccaattaatcaattcatccaattaa 148  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  24475837 acaattaatcaattcatccaattaa 24475861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 23981606 - 23981433
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata 120  Q
    ||||||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||   || ||||| |||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  23981606 catactttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatacaaacatatcatcataattagagcacgaatttcatcactta 23981507  T
Q  121 tgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgat 193  Q
    ||| |||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  23981506 tgaacaattaatcaatgcactaaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgat 23981433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 19862362 - 19862604
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||| | |||||||| |||  |||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||    
T  19862362 ttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaaca 19862461  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattaca--aaagtgattatga-tgaacactaacccccttacc 212  Q
      ||||| |||||||||| || |  |||||||||||||| ||||||||  |||  |||||||||  ||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  19862462 tctatgaacaattaatcactt-actcaattaagcacttattcatacaacaaatgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttacc 19862560  T
Q  213 ttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctccta 256  Q
    |||||||||||||| | |||||  || ||||||||| |||||||    
T  19862561 ttaattatcaccaatttttagcctaaacttcactttagctccta 19862604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 21222697 - 21222462
Alignment:
Q  22 atactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatat 121  Q
    |||||||||||||| ||||  || |||||||||| |||||||   || ||||| |||  |||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||  |||    
T  21222697 atactttgaacatgcaatttcaccaacaacaatttaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattctaacaactat 21222598  T
Q  122 gaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttacaa-aagtgattatgat-gaacactaacccccttaccttaat 217  Q
    || |||||||||||| |   |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||  || | |||||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  21222597 gaacaattaatcaatact--caattaagcacttaatcatacaa-taattgaaaaattacactaaataattatgattgaactctaacccccataccttaat 21222501  T
Q  218 tatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctccta 256  Q
    ||||||||| |  |||| ||||||||||||| |||||||    
T  21222500 tatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 21222462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 3674015 - 3674215
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    |||||||||||||| |||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||||| ||  ||  |||||| ||||||||| | |||||||||||  | ||    
T  3674015 ttctcatactttgatcatgaaatttccctaacaacaattcaattatcaacaacttaatgtattcaaacatatcatcataatttgagcacgaattctaaca 3674114  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacc 212  Q
      ||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||   |||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  3674115 attatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaattacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacc 3674212  T
Q  213 tta 215  Q
    |||    
T  3674213 tta 3674215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 16595660 - 16595860
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||| |||||||||||||||| | |||||||| |||  ||||||  |||||||| | |||||||||||  | ||    
T  16595660 ttctcatactttgaacatgaaatttctctatcaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaaca 16595759  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt---acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacc 212  Q
      ||||| |||||| |||||| |  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||   || ||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  16595760 attatgaacaattagtcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aataattgaaaatttacactaaaatgattatgatgaattctaacccccttacc 16595857  T
Q  213 tta 215  Q
    |||    
T  16595858 tta 16595860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 5450937 - 5450695
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||| | |||||||| |||  ||||||  |||||||| | ||||| |||||  | ||    
T  5450937 ttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcatgaattctaaca 5450838  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttac 211  Q
      ||||| ||||||||||||| |  |||||||||| ||| | || | || ||||||||| ||||   |||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  5450837 attatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcatttatttatgc-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttac 5450740  T
Q  212 cttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctccta 256  Q
    ||||||||| | ||| |  |||| ||||||||||||| |||||||    
T  5450739 cttaattattatcaattcctagcccaagcttcactttagctccta 5450695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 23466590 - 23466787
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    |||||||||||||| |||| | ||  || |||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||   ||||| | |||||||||||  |  |    
T  23466590 ttctcatactttgatcatgaagtttcaccaacaacaattcaattatc-ataacttcttacatacaaacatgttgccataattggagcacgaattctaata 23466688  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctt 214  Q
      ||||| ||||||||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  23466689 attatgaacaattaatcaatt-acacaattaatcacttattcatacaa-taattgaaaattgcaataattgattatgatgaattctaacccccttacctt 23466786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21310796 - 21310603
Alignment:
Q  24 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga 123  Q
    |||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||   || ||||| |||  |||||| ||||||||  |||||||||||||| | ||  |||||    
T  21310796 actttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatttatga 21310697  T
Q  124 ccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
     |||||||||| || |  ||||||||||||| |||||||||  |||  |||||||||  ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  21310696 acaattaatcactt-actcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaaatgattatgatgaattttaacccccttacctta 21310603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Original strand, 23494075 - 23494272
Alignment:
Q  20 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacat 119  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||   ||||||||||||||  | |||||||||||  | ||  |    
T  23494075 tcatactttgaacataaaattccactaataacaattcaattttccacaacttcatgcattcgaacatgtcatcatagttggagcacgaattctaacaatt 23494174  T
Q  120 atgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||| ||||||||  ||| |  |||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||   |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  23494175 atgaacaattaattgatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaatttacactaaaaatgattatgatgatttctaacccccttacctta 23494272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 28902344 - 28902545
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||| | | ||  || |||||||||||||||||| | ||||| || |||  ||||||  |||||||| | |||||||||||  | ||    
T  28902344 ttctcatactttgaacacgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaaca 28902443  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatta----caaaagtgattatgatgaacactaacccccttac 211  Q
      ||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||     | || |||||||||||||  |||||||||||||    
T  28902444 attatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaattaacactacaaatgattatgatgaattctaacccccttac 28902541  T
Q  212 ctta 215  Q
    ||||    
T  28902542 ctta 28902545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 28938739 - 28938940
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||| | | ||  || |||||||||||||||||| | ||||| || |||  ||||||  |||||||| | |||||||||||  | ||    
T  28938739 ttctcatactttgaacacgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaaca 28938838  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatta----caaaagtgattatgatgaacactaacccccttac 211  Q
      ||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||     | || |||||||||||||  |||||||||||||    
T  28938839 attatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaattaacactacaaatgattatgatgaattctaacccccttac 28938936  T
Q  212 ctta 215  Q
    ||||    
T  28938937 ctta 28938940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 37983521 - 37983758
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata 120  Q
    ||||||||||| ||| ||||  || ||||||||||||||||||   || ||||| |||  ||| || ||| |||| ||||||||| ||||| | ||  ||    
T  37983521 catactttgaatatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaatatatcaccatagatagagcacaaattttaacaacta 37983620  T
Q  121 tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgat-gaacactaacccccttaccttaat 217  Q
    ||| |||||||||| ||  || ||||||||||||| ||||||||  |||  |||||||||  || |||||||||| |||  ||||||||||||||||| |    
T  37983621 tgaacaattaatcacttactc-aattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttagt 37983719  T
Q  218 tatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctccta 256  Q
    || ||| || |  |||| ||||||||||||| |||||||    
T  37983720 tagcacaaatttctagcccaagcttcactttagctccta 37983758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 432616 - 432815
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||| | ||  || |||||||||||||||||| | |||| ||| |||  |||||| ||||||||| | |||| ||||||| | ||    
T  432616 ttctcatactttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactacatgcattcaaacatatcatcataattggagcgcgaattttaaca 432715  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatgatgaacactaacccccttacct 213  Q
      ||||| ||||||||| ||| |  |||||||||||||| |||| | || ||||| |||||| ||  || |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  432716 attatgatcaattaatc-atttactcaattaagcacttattcatgc-aacaattgaaaaattgcagtaaatgattatgatgaattctaacccccttacct 432813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21297262 - 21297069
Alignment:
Q  24 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga 123  Q
    |||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||   || ||||| | |  |||||| ||||||||  ||||| |||||||| | ||  |||||    
T  21297262 actttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcgttcaaacatatcatcatagttagaggacgaattttaacatttatga 21297163  T
Q  124 ccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
     |||||||||| || |  ||||||||||||| |||||||||  |||  |||||||||  ||| | |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21297162 acaattaatcactt-actcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaaataattatgatgaattctaacccccttacctta 21297069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 256
Target Start/End: Original strand, 21617174 - 21617410
Alignment:
Q  22 atactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatt-tcatcacata 120  Q
    |||||| ||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||   || ||||| |||  |||||| ||||||||| ||||||||||||| | |  ||  |    
T  21617174 atacttggaacatgcaatttcactaacaacaatccaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattctaacaactaa 21617273  T
Q  121 tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaa 216  Q
    ||| |||||||||  || |  ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||  || ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  21617274 tgaacaattaatccctt-actcaattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaa 21617371  T
Q  217 ttatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctccta 256  Q
    ||| || ||| |  |||| ||| ||||||||| |||||||    
T  21617372 ttagca-caattcctagcccaaccttcactttagctccta 21617410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 155
Target Start/End: Original strand, 22885799 - 22885932
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata 120  Q
    |||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||||||   || ||||| |||  |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||   |    
T  22885799 catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattaaagcacgaatttcaacaacca 22885898  T
Q  121 tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta 155  Q
    ||| ||| | ||||||| || ||||||||||||||    
T  22885899 tgaacaaattatcaatt-attcaattaagcactta 22885932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 113
Target Start/End: Original strand, 29918122 - 29918214
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttca 113  Q
    |||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||||||   || |||||  ||  |||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  29918122 catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgtattcaaacatatcatcataattggagcacgaatttca 29918214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 36)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 55376689 - 55376494
Alignment:
Q  20 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacat 119  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  55376689 tcatacttagaacatacaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacat 55376590  T
Q  120 atgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  55376589 atgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaatttcaaaagtgattatgatgaagactaacccccttacctta 55376494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Original strand, 44346987 - 44347177
Alignment:
Q  24 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  44346987 actttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatga 44347085  T
Q  124 ccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  44347086 acaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaactcccttacctta 44347177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 53704825 - 53704629
Alignment:
Q  20 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacat 119  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  53704825 tcatactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacat 53704726  T
Q  120 atgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  53704725 atgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaaataacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 53704629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23270020 - 23269829
Alignment:
Q  24 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  23270020 actttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatga 23269922  T
Q  124 ccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  23269921 acaattaatcaattcatccaattaaacacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 23269829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Original strand, 44056071 - 44056266
Alignment:
Q  20 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |    
T  44056071 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaaa-attcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcattt 44056169  T
Q  120 atgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  44056170 atgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 44056266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 8872563 - 8872372
Alignment:
Q  20 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacat 119  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |    
T  8872563 tcatactttgaacatacaattcaactaacaacacttcaatcattcatagcttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcaccactt 8872464  T
Q  120 atgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttac 211  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  8872463 atgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttac 8872372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20813638 - 20813442
Alignment:
Q  20 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |    
T  20813638 tcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcattt 20813539  T
Q  120 atgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  20813538 atgaacaattaatcaattcacccaattaagcatttttcatacaaataatttaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 20813442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Original strand, 30458060 - 30458255
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  30458060 catactttgaacatgtaattcaaccaacaacaatttaattatccataacttcatacatctaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcattta 30458159  T
Q  121 tgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  30458160 tgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattcaaaattacaataagtaattatgatgaattctaacccccttacctta 30458255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12837294 - 12837096
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  12837294 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatatcatca 12837195  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
      ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  12837194 tttatggacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcattcaaa-aattgaaaatagcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 12837096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 45458950 - 45458769
Alignment:
Q  16 cttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatc 115  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  45458950 cttctcatattttgagcatgtaattcaactaacaacaattcaattatctatcacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatc 45458851  T
Q  116 acatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaa 196  Q
    || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  45458850 acttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataaatgattatgatgaa 45458769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 215
Target Start/End: Original strand, 16732321 - 16732520
Alignment:
Q  16 cttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatc 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  16732321 cttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatc 16732420  T
Q  116 acatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataatt-gaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctt 214  Q
    |  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||  |||||| ||| | |||||||||||||  |||||| | |||||||    
T  16732421 atttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatac-actaattaaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacctctttacctt 16732519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Original strand, 34395418 - 34395609
Alignment:
Q  24 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||    
T  34395418 actttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcattacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagtacgaatttcatcatttatga 34395516  T
Q  124 ccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
     |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  34395517 acaattaatcagttcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgataatgatgaattctaacccccttacctta 34395609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 46 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 819996 - 819826
Alignment:
Q  46 aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaat 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  819996 aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcaccataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaat 819897  T
Q  146 taagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  819896 taagcatttttcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 819826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 53907791 - 53907604
Alignment:
Q  20 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacat 119  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  53907791 tcatactttgaacatacaatccaactaataacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacat 53907692  T
Q  120 atgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||| ||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  53907691 atgaacaatta--------atccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaactacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 53907604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21959554 - 21959359
Alignment:
Q  20 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacat 119  Q
    |||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |    
T  21959554 tcatactttgag-atgtaattcaatcaacaacaattcaaatatccataacttcatacatttaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcattt 21959456  T
Q  120 atgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||| |||| ||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21959455 atgaacaatcaattaattcacccaaataagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta 21959359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 52265602 - 52265403
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||  ||||   |||||||||||||||||||| | |||||||| |||  ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  52265602 ttctcatactttgaacataaaatttctctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattagagcacgaatttcatca 52265503  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacct 213  Q
      ||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||| ||| || |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  52265502 tctatgaacaattaatcaatt-acccaattaaacacttattcatac-aataattgaaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacct 52265405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Original strand, 27961127 - 27961324
Alignment:
Q  20 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacat 119  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||| | ||||||| |||  | ||  |    
T  27961127 tcatactttgaacatgaaattccactaacaacaattcaattattcataacttcatgcattcaaacatgtcatcataattggagcacggattctaacaatt 27961226  T
Q  120 atgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||   || | |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27961227 atgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaatttacactaacaatgattatgatgaattctaacccccttacctta 27961324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 184 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 5682459 - 5682380
Alignment:
Q  184 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgcttct 263  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  5682459 tgattatgataaaaactaacccacttaccttaattatcaccaactattagctcatgcttcacttttgctcctatgattct 5682380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 184 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 54118199 - 54118120
Alignment:
Q  184 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgcttct 263  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  54118199 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcttatgattct 54118120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 15044981 - 15045181
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||| | |||||||| |||  ||||||  |||||||| | |||||||||||  | ||    
T  15044981 ttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaaca 15045080  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt---acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacc 212  Q
      ||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||| || |||||| ||||   || ||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  15045081 attatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgagaatttaaactaaaatgattatgatgaaatctaacccccttacc 15045178  T
Q  213 tta 215  Q
    |||    
T  15045179 tta 15045181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18494421 - 18494224
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    |||||||||||||| |||| | ||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| | |||||||||||  | ||    
T  18494421 ttctcatactttgatcatgaagtttcaccaacaacaattcaattatc-ataacttcatacatacgaacatgtcatcataattggagcacgaattctaaca 18494323  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctt 214  Q
      ||||| ||||| ||||||| |  ||||||||||| || ||||||  ||||||||||||| ||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  18494322 attatgaacaattgatcaatt-acacaattaagcacctattcatac-cataattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctt 18494225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 184 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 25119138 - 25119059
Alignment:
Q  184 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgcttct 263  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  25119138 tgattatgataaaaactaactcccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 25119059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 7185934 - 7185701
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata 120  Q
    |||||| |||||||  ||||  || ||||||||||||||||||  ||| ||||| |||  |||||| ||||||||| |||||||| ||||| | ||  ||    
T  7185934 catactatgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattttaacaacta 7185835  T
Q  121 tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaatt 218  Q
    ||| |||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||  |||  |||||||||  || |||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  7185834 tgaacaattaatcactt-attcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgatgaattctaacctccttaccttaatt 7185736  T
Q  219 atcaccaactattagctcaagcttcacttttgctc 253  Q
    | ||| || |  |||| ||| ||||||||| ||||    
T  7185735 agcacaaattcctagcccaaacttcactttagctc 7185701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 13809604 - 13809405
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||   || |||||||||||||||| | | |||||||| |||  |||||| ||||||||| | |||||||||||  | ||    
T  13809604 ttctcatactttgaacatgaaatctcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaattctaaca 13809505  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatta-caa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacct 213  Q
      ||||| |||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |  ||| || |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  13809504 attatgaacaattaatcaattactc-aattaagcacttattcatacaa-taattgaaaaatggcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacct 13809407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 15013372 - 15013137
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata 120  Q
    |||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||||||   || ||||| ||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||  ||    
T  15013372 catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcat-tcaacatatcatcataattagagcacgaatttaaacaacta 15013274  T
Q  121 tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaa 216  Q
    ||| |||||||||| || || ||||||||||||| | ||||| || || ||||||||||||  || ||||||||| ||||  |||||||||||||||||     
T  15013273 tgaacaattaatcactt-attcaattaagcacttaaacatac-aacaaatgaaaattacaactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttag 15013176  T
Q  217 ttatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctccta 256  Q
    ||| || ||| |  |||||||||||||||||| |||||||    
T  15013175 ttagca-caaatcctagctcaagcttcactttagctccta 15013137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 30232586 - 30232391
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata 120  Q
    |||||||||| |||| | ||  || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||| | |||||||||||  | ||  ||    
T  30232586 catactttgatcatgaagtttcaccaacaacaattcaattatc-ataacttcatatatacaaacatgtcatcataattggagcacgaattctaacaatta 30232488  T
Q  121 tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg--aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    ||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  30232487 tgaacaattaatcaatt-acacaattaagcacttattcatac-cataattgaaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccctcttacctta 30232391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 41256459 - 41256263
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata 120  Q
    |||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||||||   || ||||| ||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||  ||    
T  41256459 catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcat-tcaacatttcatcataattagagcacgaatttcaacaacta 41256361  T
Q  121 tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattatga-tgaacactaacccccttacctta 215  Q
    ||| |||||||||| || || ||||||||||||| | |||||||  |||  ||||||||||  || ||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  41256360 tgaacaattaatcactt-attcaattaagcacttaaacatacaacaaatgaaaaattacaactaaatgattatgattgaattctaacccccttacctta 41256263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 47535159 - 47535042
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    |||||||||||||||| || ||||  || ||||||||||||||||||   || ||||| |||  |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  47535159 ttctcatactttgaacttgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttatca 47535060  T
Q  117 catatgaccaattaatca 134  Q
      ||||| ||||||||||    
T  47535059 tttatgaacaattaatca 47535042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15109443 - 15109243
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||| | |||||||| |||  ||||||  |||||||| | ||||| |||||  | |     
T  15109443 ttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcatgaattctaact 15109344  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt---acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacc 212  Q
      |||||  |||||||||||| |  |||||||||||||| |||||| || |||||| ||||   || ||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  15109343 attatgaataattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgagaatttaaactaaaatgattatgatgaaatctaacccccttacc 15109246  T
Q  213 tta 215  Q
    |||    
T  15109245 tta 15109243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 41166040 - 41165808
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||  ||| || | ||||||| | |||||| ||||  | ||    
T  41166040 ttctcatactttgaacatgaaatttcactaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaatatattatcataattggagcacaaattctaaca 41165941  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatt---ac-aaaagtgattatgatgaacactaacccccttac 211  Q
              |||||||||||  || |||||||||||||| ||||| |  |||||||||||   || |||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  41165940 ----------attaatcaattactc-aattaagcacttattcataccac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttac 41165853  T
Q  212 cttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctccta 256  Q
     |||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| |||||||    
T  41165852 gttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 41165808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 14901385 - 14901584
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    |||||||||||  |||||| ||||  || ||||||||| ||||| || | || |||||||||  |||||| |  |||||| |||||||||||||  | ||    
T  14901385 ttctcatacttcaaacatgaaatttcaccaacaacaat-caattttcaacaatttcatacattcaaacatattgtcataattagagcacgaattataaca 14901483  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacc 212  Q
     |||||| ||||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||  ||| |||||||||||||   |||||||||||||    
T  14901484 aatatgaacaattaatc-atttactcaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattgcaataaaatgattatgatgaaatttaacccccttacc 14901581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 256
Target Start/End: Original strand, 18276595 - 18276827
Alignment:
Q  25 ctttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgac 124  Q
    ||||||||||| ||||  || |||||||||| |||||||   || ||||| |||  |||||| ||||||||  |||||||||||||| | ||  |||||     
T  18276595 ctttgaacatgcaatttcaccaacaacaatttaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcatatttagagcacgaattttaacaactatgaa 18276694  T
Q  125 caattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaatt---acaaaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaatta 219  Q
    ||||||||||  | |  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |   || ||| ||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||    
T  18276695 caattaatcacat-actcaattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaatcgcactaaa-tgattatgattgaattctaaccccgttaccttaatta 18276791  T
Q  220 tcaccaactattagctcaagcttcacttttgctccta 256  Q
      | ||| |  |||||||||||||||||| |||||||    
T  18276792 gta-caattcctagctcaagcttcactttagctccta 18276827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 47534990 - 47534933
Alignment:
Q  199 ctaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctccta 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  | || ||||||||||||| |||||||    
T  47534990 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctcgcccaagcttcactttagctccta 47534933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 7964796 - 7964565
Alignment:
Q  27 ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacca 126  Q
    ||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||   || |||||  ||  |||||| ||||||||| ||||||||| |||| | ||  ||||| ||    
T  7964796 ttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataattagagcacggattttaacaactatgaaca 7964697  T
Q  127 attaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattatcac 223  Q
    |||| ||| || |  ||||||||||||| |||||||||  |||  |||||||||  || ||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||| |||    
T  7964696 attactcactt-actcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttagttagcac 7964598  T
Q  224 caactattagctcaagcttcacttttgctccta 256  Q
     || |  | || ||| ||||||||| |||||||    
T  7964597 aaattccttgcccaaacttcactttagctccta 7964565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 40905024 - 40904932
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttca 113  Q
    |||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||||||   || |||||  ||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  40905024 catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcagcaatttcatgtattcaaacatatcatcataactagagcacgaatttca 40904932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 219
Target Start/End: Original strand, 38764866 - 38765066
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata 120  Q
    |||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||   || ||||| |||  |||||| ||  ||||| || ||||||||||||| ||  ||    
T  38764866 catactatgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcattcattcaaacatatccccataattaaagcacgaatttcaacaacta 38764965  T
Q  121 tgaccaattaatcaattcatccaattaagcac-ttatcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattat-gatgaacactaacccccttaccttaa 216  Q
    |||  || ||||||||| || ||| ||||||| ||||||| ||| ||||  ||||||||||  || ||||||| | ||||  ||||||| ||||||||||    
T  38764966 tga-aaaataatcaatt-attcaactaagcactttatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaaccctcttaccttaa 38765063  T
Q  217 tta 219  Q
    |||    
T  38765064 tta 38765066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Original strand, 4720 - 4913
Alignment:
Q  20 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  4720 tcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatat 4819  T
Q  120 atgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4820 atgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattac--aagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 4913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Original strand, 9334 - 9527
Alignment:
Q  20 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  9334 tcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatat 9433  T
Q  120 atgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  9434 atgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattac--aagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 9527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Original strand, 7329 - 7522
Alignment:
Q  20 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  7329 tcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatat 7428  T
Q  120 atgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  7429 atgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattac--aagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 7522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 156; Significance: 6e-83; HSPs: 30)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Original strand, 18570435 - 18570630
Alignment:
Q  20 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacat 119  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  18570435 tcatactttgaacatgtaatttaactaataacaattcaattatccataacatcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcactt 18570534  T
Q  120 atgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18570535 atgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaattgattatgatgaattctaacccccttacctta 18570630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Original strand, 32898946 - 32899142
Alignment:
Q  20 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |    
T  32898946 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcattt 32899045  T
Q  120 atgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  32899046 atgaacaattaatcaattcaccaaattaagcacttttcataccaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 32899142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 23 - 215
Target Start/End: Original strand, 16086176 - 16086369
Alignment:
Q  23 tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatg 122  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  16086176 tactttgaacatgtaattcaacaaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatatcatcataattagagcacgaatttcatcatttatg 16086275  T
Q  123 accaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    | |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16086276 aacaattaattaattcacccaattaagcacttttcatacaattaattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta 16086369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Original strand, 16106672 - 16106868
Alignment:
Q  20 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |    
T  16106672 tcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcattt 16106771  T
Q  120 atgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    | || |||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16106772 acgaacaattaattaattcactcaattaagcacttttcatacaattaattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 16106868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Original strand, 22441090 - 22441285
Alignment:
Q  20 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacat 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||    
T  22441090 tcatacttttaacatgtaattcaccccatcacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagtacgaatttcatcatat 22441189  T
Q  120 atgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22441190 atgaacaattaatcaattcactcaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattgcaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 22441285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 37 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 13014784 - 13014603
Alignment:
Q  37 aattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaat 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  13014784 aattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattaaagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaat 13014685  T
Q  137 tcatccaattaagcacttatcatacaa--ataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    ||| |||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  13014684 tcacccaatttagcacttttcatacaaacataattgaaaattacaataagtgattatgataaattctaacccccttacctta 13014603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Original strand, 18432799 - 18432994
Alignment:
Q  20 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacat 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |    
T  18432799 tcatacttttaacatgtaattcaatcaacaacaattcaagtattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcattt 18432898  T
Q  120 atgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa-ttacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||| || ||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18432899 atgaacaaataatcaattcacccaattaagctcttttcatac-aataattgaaaatttgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta 18432994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Original strand, 18777302 - 18777481
Alignment:
Q  20 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||   |    
T  18777302 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagaacacgaatttcatctttt 18777401  T
Q  120 atgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    ||||                  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18777402 atga-----------------acaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattccaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 18777481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 148
Target Start/End: Original strand, 31628420 - 31628552
Alignment:
Q  16 cttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatc 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||  ||||||||||||    
T  31628420 cttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatcaataacttcatacatctaaacatgtaatcataattcgaatacgaatttcatc 31628519  T
Q  116 acatatgaccaattaatcaattcatccaattaa 148  Q
    |  ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  31628520 atttatgaacaattaatcaattcacccaattaa 31628552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22361859 - 22361619
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |  |||||||||||||||||| | || ||||| |||  |||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  22361859 ttctcatactttgaacatgaaatttcagcaacaacaattcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattttatca 22361760  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatga-tgaacactaacccccttacct 213  Q
      ||||| |||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  22361759 tctatgaacaattaatcatttgct-caattaagcacttattcatac-aacaattgaaaaattactaaaatgattatgattgaattctaacccccttacct 22361662  T
Q  214 taattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctccta 256  Q
    ||||||||||||| |  |||  ||||||||||||| |||||||    
T  22361661 taattatcaccaattcctaggccaagcttcactttagctccta 22361619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 21623321 - 21623563
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |  |||||||||||||||||| | |||||||| |||  ||||||  |||||||| | |||||||||||  | ||    
T  21623321 ttctcatactttgaacatgaaatttcagcaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataccatcataattggagcacgaattctaaca 21623420  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattga-aaattaca--aaagtgattatga-tgaacactaacccccttac 211  Q
      ||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||  ||| ||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  21623421 tttatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgagaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttac 21623518  T
Q  212 cttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctccta 256  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| |||||||    
T  21623519 cttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 21623563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 184 - 263
Target Start/End: Original strand, 18583641 - 18583720
Alignment:
Q  184 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgcttct 263  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18583641 tgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatgattct 18583720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 184 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 19983223 - 19983144
Alignment:
Q  184 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgcttct 263  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  19983223 tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 19983144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 184 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 35015088 - 35015009
Alignment:
Q  184 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgcttct 263  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  35015088 tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 35015009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 18399091 - 18399290
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | |||||||| |||  ||||||  |||||||| | |||||||||||  | ||    
T  18399091 ttctcatactttgaacatgaaatttctctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaaca 18399190  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacct 213  Q
      ||||| |||||| |||||| |  |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  18399191 attatgaacaattagtcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aataattgaaatttacactaaaatgattatgaagaattctaacccccttacct 18399288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25367331 - 25367130
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatc-cataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||  ||||||  |||||||| | |||||||||||  | |    
T  25367331 ttctcatactttgaacatgaaatttctctaacaacaattccattatcaaaaaacttcatacattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaac 25367232  T
Q  116 acatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt---acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttac 211  Q
    |  ||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||   || ||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  25367231 aattatgaacaattaatcaattgct-caattaagcacttattcatac-aataattgaaaatttacactaaaatgattatgatgaattctaacccccttac 25367134  T
Q  212 ctta 215  Q
    ||||    
T  25367133 ctta 25367130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 18629698 - 18629469
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata 120  Q
    ||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||   || ||||| |||  |||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||  ||    
T  18629698 catactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaacta 18629599  T
Q  121 tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaat 217  Q
    ||| |||||||||| || || ||||||| ||||| |||||||||  |||  |||||||||  || ||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |    
T  18629598 tgaacaattaatcactt-attcaattaaacacttaatcatacaacaaataaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttagt 18629500  T
Q  218 tatcaccaactattagctcaagcttcacttt 248  Q
    || ||| || |  |||| |||||||||||||    
T  18629499 tagcacaaattcctagcccaagcttcacttt 18629469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 17557107 - 17556909
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata 120  Q
    ||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||   || ||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||  ||    
T  17557107 catactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatc-aaacatatcatcataattagagcacgaattt-aacaacta 17557010  T
Q  121 tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaaaag-tgattatga-tgaacactaacccccttaccttaat 217  Q
    ||| ||| ||||||||| || ||||||||||||| || || ||| ||||  |||||||||  || ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  17557009 tgaacaaataatcaatt-attcaattaagcacttaataatgcaattaatgaaaaattacactagatgattatgattgaattctaacccccttaccttaat 17556911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21411144 - 21410944
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |  ||||||| ||||||||||| | |||||||| |||  | ||||  |||||||| | |||||| ||||  | |     
T  21411144 ttctcatactttgaacatgaaatttatttaacaaccattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacaaattctaacg 21411045  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatt---acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacc 212  Q
      ||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||   || ||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  21411044 attatgaacaattagtcaattcctc-aattaagcacttattcatacaa-taattgaaaatttacactaaaatgattatgatgaattctaacccccttacc 21410947  T
Q  213 tta 215  Q
    |||    
T  21410946 tta 21410944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 46 - 215
Target Start/End: Original strand, 33324874 - 33325046
Alignment:
Q  46 aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaat 145  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||| |||  |||||| ||||| ||  |||||||||||||| | ||  ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  33324874 aacaacaattcaattatcaacaatttcatgcatacaaacatatcatcctagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcaatt-atccaat 33324972  T
Q  146 taagcactta-tcatacaaataattgaa--aattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    ||| |||||| |||||| | ||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  33324973 taatcacttattcatac-attaattgaaataattacactaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta 33325046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 35136078 - 35135906
Alignment:
Q  46 aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaat 145  Q
    ||||||||||||||||||   || ||||| |||  |||||| ||||| ||  |||||||||||||| | ||  ||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  35136078 aacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcctagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcaatt-atctaat 35135980  T
Q  146 taagcactta-tcatacaaataattg--aaaattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    ||| |||||| |||||| ||||||||  |||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  35135979 taatcacttattcatac-aataattgaaaaaattacactaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta 35135906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 28195187 - 28195108
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa 96  Q
    |||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  28195187 ttctcatactatgaacatgaaattttactaacaacaattcaattatcaacaacttcatacattcaaacatatcatcataa 28195108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 155
Target Start/End: Original strand, 29605607 - 29605739
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata 120  Q
    |||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||  ||| ||||| |||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||  ||    
T  29605607 catactatgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcactaa-ttcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaatttcaacaacta 29605705  T
Q  121 tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta 155  Q
    ||| ||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  29605706 tgaacaaataatcactt-attcaattaagcactta 29605739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 17083287 - 17083093
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata 120  Q
    |||||| |||||||  ||||  || ||||||||||||||||||   || ||||| |||  |||||| ||||||||| |||||||||||| | | ||  ||    
T  17083287 catactatgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaa-ttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatattaacaacta 17083189  T
Q  121 tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    ||| |||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||  |||  |||||||||  || ||||||  |||||  |||||||||||||||||    
T  17083188 tgaacaattaatcactt-attcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattaaaatgaattctaacccccttacctta 17083093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16887879 - 16887685
Alignment:
Q  24 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga 123  Q
    |||||||||||| || |  || ||||||| ||||||||||   || ||||| |||  |||||| | ||||||  |||||||||||||| | ||  |||||    
T  16887879 actttgaacatgcaaattcaccaacaacagttcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatattatcatagttagagcacgaattttaacatctatga 16887780  T
Q  124 ccaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatt---ac-aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
     |||||||||| || || ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |   || |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16887779 acaattaatcattt-attcaattaatcacttattcatacaa-taattgaaaaattatactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta 16887685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 33538459 - 33538223
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata 120  Q
    ||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| ||   || ||||| |||  ||| || ||| ||||  |||||||||||||| | ||  ||    
T  33538459 catactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaatt-tcaccaatttcatgcattcaaatatatcaccatagttagagcacgaattttaacaacta 33538361  T
Q  121 tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgat-gaacactaacccccttaccttaat 217  Q
    ||| |||||||||| ||  || ||||||||||||| ||||||||  |||  |||||||||  || |||||||||| |||  ||||||||||||||||| |    
T  33538360 tgaacaattaatcacttactc-aattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttagt 33538262  T
Q  218 tatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctccta 256  Q
    |  ||| || |  |||| ||||||||||||| |||||||    
T  33538261 tcgcacaaattcctagcccaagcttcactttagctccta 33538223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 18381777 - 18381684
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  || |||||| ||||||||||| | ||||||||  ||  ||| || ||||||||| |||||||| ||||    
T  18381777 ttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaaccattcaattatcaacaacttcatgtattcaaaaatatcatcataattagagcacaaatt 18381684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 256
Target Start/End: Original strand, 14152632 - 14152704
Alignment:
Q  184 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctccta 256  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||| || |  |||| ||||||||||||| |||||||    
T  14152632 tgattatgatgaagaataacccccttgccttaattagcacaaattcctagcccaagcttcactttagctccta 14152704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15079795 - 15079606
Alignment:
Q  24 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga 123  Q
    |||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||  |||||||| |||   ||||| ||||| ||  |||||||||||||| | ||  |||||    
T  15079795 actttgaacatgcaatttcac-aacaacaattcaattatcctcaacttcatgcat-acaacatatcatcctagttagagcacgaattt-aacatctatga 15079699  T
Q  124 ccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
      |||||||||||| |||||||||| | |||| ||||| ||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  15079698 ataattaatcaatt-atccaattaatcccttattcata-aaataattgaaaaattacactaaaatgattatgatgaattctaa-ccccttacctta 15079606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 155
Target Start/End: Original strand, 22848172 - 22848304
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata 120  Q
    |||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||||||   || ||| | ||| ||||||| ||||||||| ||  |||||||||||| ||  ||    
T  22848172 catactatgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcttgcatttaaacatatcatcataattaatgcacgaatttcaacaacta 22848271  T
Q  121 tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta 155  Q
    ||| ||| ||||||||| || ||| ||||||||||    
T  22848272 tgaacaa-taatcaatt-attcaactaagcactta 22848304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 156; Significance: 6e-83; HSPs: 67)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 317600 - 317405
Alignment:
Q  20 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacat 119  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |    
T  317600 tcatactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcatacttagagcacgaatttcatcactt 317501  T
Q  120 atgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  317500 atgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 317405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16182032 - 16181842
Alignment:
Q  24 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga 123  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  16182032 actttgaacatgtaatttaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatga 16181934  T
Q  124 ccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16181933 acaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 16181842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Original strand, 13817672 - 13817862
Alignment:
Q  24 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  13817672 actttgaacatgtaattcaactaacat-aattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgt 13817770  T
Q  124 ccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13817771 acaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 13817862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 215
Target Start/End: Original strand, 8631942 - 8632142
Alignment:
Q  16 cttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatc 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  8631942 cttctcaaactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatc 8632041  T
Q  116 acatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctt 214  Q
    || || || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  8632042 acttaagaacaattaattaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaatcctaacccccttacctt 8632141  T
Q  215 a 215  Q
    |    
T  8632142 a 8632142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 50112142 - 50111946
Alignment:
Q  20 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||  |    
T  50112142 tcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatggcatcataattagagcatgaatttcatcattt 50112043  T
Q  120 atgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  50112042 atgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 50111946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16996151 - 16995956
Alignment:
Q  20 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacat 119  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |    
T  16996151 tcatactttgaacatacaattcaagtaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcaccactt 16996052  T
Q  120 atgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16996051 atgaataattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 16995956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19570775 - 19570586
Alignment:
Q  24 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  19570775 actttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcaaaattagagcacaaatttcatcacatatga 19570677  T
Q  124 ccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  19570676 aaaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaa-ccccttacctta 19570586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 54424165 - 54424364
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  54424165 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaaccacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatggcatcataattagagcacgaatttcatca 54424264  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaatt-acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
      ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  54424265 tttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgaaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 54424364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Original strand, 38527889 - 38528079
Alignment:
Q  24 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||    
T  38527889 actttgaacatgtaattcaactaacat-aattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacgaatttcatcatttatga 38527987  T
Q  124 ccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  38527988 acaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaatagttgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 38528079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12349634 - 12349434
Alignment:
Q  16 cttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatc 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12349634 cttctcacactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataaatttatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatc 12349535  T
Q  116 acatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctt 214  Q
    |  ||||  |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  12349534 atttatggacaattaattaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctt 12349435  T
Q  215 a 215  Q
    |    
T  12349434 a 12349434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Original strand, 17100809 - 17101004
Alignment:
Q  20 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |    
T  17100809 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcattt 17100908  T
Q  120 atgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  17100909 atggacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaa-aattgaaaatagcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 17101004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Original strand, 17101494 - 17101689
Alignment:
Q  20 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |    
T  17101494 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcattt 17101593  T
Q  120 atgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  17101594 atggacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaa-aattgaaaatagcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 17101689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22144358 - 22144167
Alignment:
Q  24 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||    
T  22144358 actttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcagttatga 22144260  T
Q  124 ccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattac-aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
     || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22144259 acagttaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 22144167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Original strand, 14298581 - 14298773
Alignment:
Q  24 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||    
T  14298581 actttgaacatgtaattcaactaaccacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatga 14298680  T
Q  124 ccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14298681 acaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta 14298773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Original strand, 14304208 - 14304400
Alignment:
Q  24 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||    
T  14304208 actttgaacatgtaattcaactaaccacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatga 14304307  T
Q  124 ccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14304308 acaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta 14304400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 34439433 - 34439237
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatc-taaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  34439433 catactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcatttatccataacttcatacctcataaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcactt 34439334  T
Q  120 atgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| | ||||||||||    
T  34439333 atgaacaattaatcaattcatccaattaaacacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaatctccttacctta 34439237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 6154417 - 6154226
Alignment:
Q  24 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  6154417 actttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaactattcataatttcatacatctaaacatgtcattataattagaggacgaatttcatgacttatga 6154319  T
Q  124 ccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  6154318 acaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatagaaataattgaaaattataataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 6154226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 14295592 - 14295790
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  14295592 ttctcatactttgaacatgaatttcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatca 14295691  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
      ||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14295692 tttatgaacaattaatcaattcacccattttagcacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta 14295790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 14301219 - 14301417
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  14301219 ttctcatactttgaacatgaatttcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatca 14301318  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
      ||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14301319 tttatgaacaattaatcaattcacccattttagcacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta 14301417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 215
Target Start/End: Original strand, 17938726 - 17938925
Alignment:
Q  16 cttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatc 115  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  17938726 cttctcatactttgaacatgcaattcaactaacaacaattcgcttaaccatg-ctttatacatccaaacatgtcaccataattagagcacgaatttcatc 17938824  T
Q  116 acatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctt 214  Q
    ||  | || |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  17938825 actcaagaacaattaattaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaaccctaacccccttatctt 17938924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Original strand, 35123861 - 35124047
Alignment:
Q  30 aacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaatt 129  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| || || |||||||||||||  ||||| |||||    
T  35123861 aacatgtaattcgactaacaacaattcaattatccataatttcatacatccaaacacgtcatcataattaaagtacgaatttcatcatttatgaacaatt 35123960  T
Q  130 aatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  35123961 aatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccctttacctta 35124047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 17522978 - 17522780
Alignment:
Q  22 atactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatat 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||    
T  17522978 atactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccacatcttcatacatccaaaactgtcatcataattagagcacgaagttcatcatttat 17522879  T
Q  122 gaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattat 220  Q
    || ||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  17522878 gaacaaataatcaattcacccaaataagcacttctcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttat 17522780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 55440942 - 55440803
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  55440942 ttctcatactttgaacatgaaattccactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatca 55440843  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttat 156  Q
      ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  55440842 tttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttat 55440803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 3578242 - 3578440
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||    
T  3578242 ttctcatactttgaacatgaaattcaactaataacaattcaattatccataacttcatacat-tcaacatgtcatcataattagagaatgaatatcatca 3578340  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctt 214  Q
      ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  3578341 tttatgaacaattaatcaatttacccaattaagcacttattcctac-aataattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccgcttacctt 3578439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 19260930 - 19260839
Alignment:
Q  20 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaattt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  19260930 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatatcatcataattagagcacgaattt 19260839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 111 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 6146769 - 6146664
Alignment:
Q  111 tcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaaccccctt 209  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  6146769 tcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaaccccctt 6146670  T
Q  210 acctta 215  Q
    ||||||    
T  6146669 acctta 6146664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 11061099 - 11060902
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  11061099 ttctcatactttgaacctgaaattcaactaacaacaatccaattattcataacttcatacatttaaaaat-tgatcataattagagcacgaatttcatca 11061001  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctt 214  Q
       || | ||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||   |||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  11061000 tccattaacaaataattaatt-atccaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattgcaattatgattatgatgaattccaacccccttacctt 11060903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 184 - 263
Target Start/End: Original strand, 7854306 - 7854385
Alignment:
Q  184 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgcttct 263  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7854306 tgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgattct 7854385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 81 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14528110 - 14527975
Alignment:
Q  81 aaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattaca 179  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||    
T  14528110 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacctaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgca 14528012  T
Q  180 a-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    | || |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14528011 ataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta 14527975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 184 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 54038055 - 54037976
Alignment:
Q  184 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgcttct 263  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54038055 tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgattct 54037976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 17204834 - 17205076
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| |||||| | || ||||| |||  |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  17204834 ttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcgattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttatca 17204933  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatgat-gaacactaacccccttac 211  Q
      ||||| ||||||||| ||| |  |||||||||||||  || |||  | ||||| |||||||||  ||| |||||||||| |||  |||||||||||||    
T  17204934 tctatgaacaattaatc-atttactcaattaagcacttgttcgtac-cacaattgaaaaattacactaaaatgattatgatggaattctaacccccttac 17205031  T
Q  212 cttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctccta 256  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| |||||||    
T  17205032 cttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 17205076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 53898541 - 53898450
Alignment:
Q  24 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  53898541 actttgaacatttaatgcaactaaca-caattcaattattcataacttcatagatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatca 53898450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 11196393 - 11196291
Alignment:
Q  37 aattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaat 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||   |||| ||||||||||||    
T  11196393 aattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatatcatcattattagagcacaaatttcatcatccatgaacaattaatcaat 11196294  T
Q  137 tca 139  Q
    |||    
T  11196293 tca 11196291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 17191694 - 17191936
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| |||||| | || ||||| |||  |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  17191694 ttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcgattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttatca 17191793  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatga-tgaacactaacccccttac 211  Q
      ||||| ||||||||| ||| |  |||||||||| ||  |||||| || ||||| |||||||||  ||| ||||| ||| ||||  |||||||||||||    
T  17191794 tctatgaacaattaatc-atttactcaattaagcaattgttcatac-aacaattgaaaaattacactaaaatgattgtgattgaattctaacccccttac 17191891  T
Q  212 cttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctccta 256  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||| |||||||    
T  17191892 cttaattatcaccaattcctagcccaaacttcactttagctccta 17191936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 184 - 263
Target Start/End: Original strand, 3992874 - 3992953
Alignment:
Q  184 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgcttct 263  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  3992874 tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 3992953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 184 - 263
Target Start/End: Original strand, 55513194 - 55513273
Alignment:
Q  184 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgcttct 263  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  55513194 tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 55513273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 184 - 263
Target Start/End: Original strand, 2844515 - 2844594
Alignment:
Q  184 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgcttct 263  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  2844515 tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctcaaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 2844594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 184 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 15857194 - 15857120
Alignment:
Q  184 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatg 258  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  15857194 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaagtattagctctagcttcactttagctcctatg 15857120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 3576532 - 3576298
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||  || |||||||||||||||||| | |||||||| |||  |||||| ||||||||| ||||| |||||||  | ||    
T  3576532 ttctcatacattgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagtacgaattataaca 3576433  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatga-tgaacactaacccccttac 211  Q
      | ||| ||||||||| ||| |  |||||||||||||| || ||| || ||||| |||||||||  ||| ||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  3576432 actttgaacaattaatc-atttactcaattaagcacttattcgtac-aacaattgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttac 3576335  T
Q  212 cttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttt 248  Q
    |||||||||||| || |  |||| |||||||||||||    
T  3576334 cttaattatcacaaattcctagcccaagcttcacttt 3576298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 6146832 - 6146764
Alignment:
Q  24 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatca 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6146832 actttgaacatgtaattcaactaata-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatca 6146764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 11329055 - 11328859
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||  | ||||| || ||     |||||||||||||| | |||||||||||  | ||    
T  11329055 ttctcatactttgaacatgaaatttcactaacaacaattcaattattaacaactttatgca-----acatgtcatcataattggagcacgaattctaaca 11328961  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatt---ac-aaaagtgattatgatgaacactaacccccttac 211  Q
      ||||| |||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||   || |||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  11328960 attatgaacaattaatcaattactc-aattaagcacttattcatacaa-taattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttac 11328863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 17139661 - 17139861
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    |||||||| |||||||||| ||||  || |||||||||||||||| | | |||||||| |||  |||||||||||||||| | |||||||||||  | ||    
T  17139661 ttctcatagtttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacatgtcatcataattggagcacgaattctaaca 17139760  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacc 212  Q
      ||||| || |||||||||| |  |||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||   || | |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17139761 attatgaacacttaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaatttacactaagaatgattatgatgaattctaacccccttacc 17139858  T
Q  213 tta 215  Q
    |||    
T  17139859 tta 17139861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 184 - 263
Target Start/End: Original strand, 19232090 - 19232169
Alignment:
Q  184 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgcttct 263  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  19232090 tgattaagataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct 19232169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 16880276 - 16880477
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| | |||||| | |||  |||||| ||||| ||| | |||||||||||  | ||    
T  16880276 ttctcatactttgaacatgaaattttactaacaacaattcaattatcaacaacttcttgcattcaaacatatcatcgtaattggagcacgaattcaaaca 16880375  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttac 211  Q
      ||||| ||||||||||||| |  ||||||| |||||  |||||| || ||||||||| ||||   |||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  16880376 attatgaacaattaatcaatt-actcaattaaacacttgttcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttac 16880473  T
Q  212 ctta 215  Q
    ||||    
T  16880474 ctta 16880477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 47784860 - 47784767
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||| | |||||||| |||  |||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  47784860 ttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatt 47784767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 248
Target Start/End: Original strand, 15876221 - 15876448
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||  |  |||||||||||| ||||| | ||| |||| ||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  15876221 ttctcatacttggaacataaaatttcatcaacaacaattcagttatcaacaacatcatgcatttaaacatattatcataattagagcacgaatttcatca 15876320  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaacactaa-ccccctta 210  Q
      ||||| ||||||||         |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||   |||| |||||||||||||  |||| ||||||||    
T  15876321 tctatgaacaattaat---------caattaagcacttattcatac-aataattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccctta 15876410  T
Q  211 ccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttt 248  Q
    |||||||||||  ||| |  |||| |||||||||||||    
T  15876411 ccttaattatcgtcaattcctagcccaagcttcacttt 15876448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 14059307 - 14059112
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||| ||||||||||||||| | |||||||| |||  ||||||  |||||||| | |||||||||||  | ||    
T  14059307 ttctcatactttgaacatgaaatttctctaaaaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaaca 14059208  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt--acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttac 211  Q
       |||| |||||| |||||| |  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  || ||| |||||||||||||   ||||||||||||    
T  14059207 atcatgaacaattagtcaatt-agtcaattaagcacttattcatac-aataattgaaaattgcactaaaatgattatgatgaattataacccccttac 14059112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 184 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 16744072 - 16743990
Alignment:
Q  184 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgcttctcca 266  Q
    |||||||| | || ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  16744072 tgattatggtaaagactaacctcgttaccttaattatctccaactattagctctagcttcactttagctcctatgattctcca 16743990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 184 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 17955915 - 17955832
Alignment:
Q  184 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagct----caagcttcacttttgctcctatgcttct 263  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  17955915 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctacctagcttcacttttgctcctatgattct 17955832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12560330 - 12560131
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||| ||||||| |||| |||||||||  |||  || |||  |||||||| | |||||||||||  | ||    
T  12560330 ttctcatactttgaacatgaaatttctctaacaaaaattcaagtatcaataacttcaagcattcaatcataacatcataattggagcacgaattctaaca 12560231  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacct 213  Q
      ||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| || |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  12560230 attatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattgcaataaatgattatgatgaattttaacccccttacct 12560133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 13301559 - 13301323
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata 120  Q
    |||||| |||||||| ||||  || ||||| ||||||||||||   || |||||  ||  ||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||  ||    
T  13301559 catactatgaacatgcaatttcaccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacataccatcataattagagcacgaaattcaacatcta 13301460  T
Q  121 tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaatt 218  Q
     || | | |||||| || || |||||||||||||| ||||||||  |||  ||||| |||  || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  13301459 agaaccaataatcactt-attcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaatcacactaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttaatt 13301361  T
Q  219 atcaccaactattagctcaagcttcacttttgctccta 256  Q
    | ||| || |  |||| ||||||||||||| |||||||    
T  13301360 agcacaaattcctagcccaagcttcactttagctccta 13301323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 13312215 - 13311979
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata 120  Q
    |||||| |||||||| ||||  || ||||| ||||||||||||   || |||||  ||  ||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||  ||    
T  13312215 catactatgaacatgcaatttcaccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacataccatcataattagagcacgaaattcaacatcta 13312116  T
Q  121 tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaatt 218  Q
     || | | |||||| || || |||||||||||||| ||||||||  |||  ||||| |||  || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  13312115 agaaccaataatcactt-attcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaatcacactaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttaatt 13312017  T
Q  219 atcaccaactattagctcaagcttcacttttgctccta 256  Q
    | ||| || |  |||| ||||||||||||| |||||||    
T  13312016 agcacaaattcctagcccaagcttcactttagctccta 13311979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 30207369 - 30207570
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||| | ||  || |||||||||||||||||| | |||||||| |||  ||||||  |||||||| | |||||||||||  | |     
T  30207369 ttctcatactttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacc 30207468  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttac 211  Q
      |||||  |||||||||||| |  |||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||   |||| |||||||||||||   ||||||||||||    
T  30207469 agtatgaataattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattataacccccttac 30207566  T
Q  212 ctta 215  Q
    ||||    
T  30207567 ctta 30207570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 179 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 38810945 - 38810868
Alignment:
Q  179 aaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctccta 256  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |  |||| ||||||||||||| |||||||    
T  38810945 aaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 38810868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 263
Target Start/End: Original strand, 45581955 - 45582034
Alignment:
Q  184 tgattatgatgaacactaacccc-cttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgcttct 263  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||    
T  45581955 tgattatgataaaaactaaccccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttca-tttttctcctatgattct 45582034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 248
Target Start/End: Original strand, 15550919 - 15550986
Alignment:
Q  181 aagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttt 248  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||    
T  15550919 aagtgattatgatgaattctaacccccttatcttaattatcaccaattcctagcccaagcttcacttt 15550986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 39656679 - 39656817
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||   || |||||| ||  ||||||  |||||||| | ||||||| |||| | ||    
T  39656679 ttctcatactttgaacatgaaatttcactaacaacaattcaattatcaccaatttcataaattcaaacataacatcataattggagcacggattttaaca 39656778  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttat 156  Q
      ||||| ||||||||| ||| |  |||||||||||||||    
T  39656779 attatgaacaattaatc-atttactcaattaagcacttat 39656817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Original strand, 14080666 - 14080863
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata 120  Q
    ||||||||||||||| || |  |||||| ||||||||||||||   || ||||| |||  |||||| ||||||||  | |||||||||||| | ||  ||    
T  14080666 catactttgaacatgcaaattcactaaccacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattttaacatcta 14080765  T
Q  121 tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    ||  ||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||||| ||||   |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14080766 tgcacaattaatc-atttatccaattaaacacttattcatac-catagttgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta 14080863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 256
Target Start/End: Original strand, 12031849 - 12031904
Alignment:
Q  201 aacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctccta 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| |||||||    
T  12031849 aacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 12031904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14814855 - 14814658
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata 120  Q
    |||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||||||   || |||||  ||  |||||| ||| ||||| || ||||||||||||| ||  ||    
T  14814855 catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcaccataattaaagcacgaatttcaacaacta 14814756  T
Q  121 tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattat-gatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    ||| ||| |||||| || || ||||||||||||| ||||| ||| ||||  ||||||||||  || ||||||| | ||||  |||||||||||||||||    
T  14814755 tgagcaaataatcactt-attcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaacccccttacctta 14814658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 9590844 - 9590648
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata 120  Q
    ||||||||||||||| | ||  || ||||||||||||||||||   || || || |||  |||||| ||||||||  ||||||||| |||| | ||  ||    
T  9590844 catactttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttaatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacggattttaacaacta 9590745  T
Q  121 tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    ||| ||||||| || || || ||||||||||||| |||||||||  | ||| |||||||||  || |||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  9590744 tgaacaattaaccactt-attcaattaagcacttaatcatacaacaatttgaaaaattacactaaatgattatgatgaattctaatccccttacctta 9590648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 12488820 - 12488727
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||    ||||||| ||||||| |||||    
T  12488820 ttctcatactttgaacatgaaatttcatcaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcatccaaacacaatatcataattagagcatgaatt 12488727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 142 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 51961106 - 51961031
Alignment:
Q  142 caattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||  |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51961106 caattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgatgaagactaacccccttacctta 51961031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 6228715 - 6228625
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaattt 111  Q
    |||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||   || |||||  ||  |||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  6228715 catactatgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcaccataattagagcacgaattt 6228625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 11882240 - 11882113
Alignment:
Q  89 catcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtga 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||| ||  || || ||| |||||| || || |||||||||||||| ||||||||  |||| ||| |||||  || |||    
T  11882240 catcataattagagcatgaaattcaacatctaagaacaaataatcactt-attcaattaagcacttaatcatacaacaaattaaaagttacactaaatga 11882142  T
Q  187 ttatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  11882141 ttatgatgaattctaacccccttacctta 11882113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 31412423 - 31412331
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttca 113  Q
    |||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||||||   || |||||  ||  |||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  31412423 catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttca 31412331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 113
Target Start/End: Original strand, 50313344 - 50313436
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttca 113  Q
    |||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||||||  ||| ||||| ||   |||||| |||| ||||  |||||||||||||||    
T  50313344 catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcactcaaacatatcattataacaagagcacgaatttca 50313436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 28)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25876006 - 25875816
Alignment:
Q  24 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  25876006 actttgaacatgtaattcaactaacat-aattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatga 25875908  T
Q  124 ccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  25875907 acaattaatcaattcatccaattaaacacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 25875816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23836791 - 23836601
Alignment:
Q  24 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga 123  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  23836791 actttgaacatgtaattccactaaca-caattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatga 23836693  T
Q  124 ccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  23836692 acaattaatcaattcatctaattaagcacttatcattcaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 23836601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Original strand, 32466013 - 32466207
Alignment:
Q  20 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacat 119  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  32466013 tcatactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacat 32466112  T
Q  120 atgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  32466113 atgaacaattaatcaattcattcaaataagcacttatcgtacaaataattaaaattttcaaaagtgattatgatgaagactaa-ccccttacctta 32466207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 36890779 - 36890581
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  36890779 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgccatcacaattagagcacgaatttcatca 36890680  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
      ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  36890679 tttatgaacaattaatcaattcacccaaataagcacttttcatac-cataattgaaaataacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 36890581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 4448220 - 4448028
Alignment:
Q  24 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  4448220 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatga 4448121  T
Q  124 ccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
     |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4448120 acaattaatcaattcactcaattaagcacttttcatataaataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta 4448028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Original strand, 271330 - 271521
Alignment:
Q  24 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||    
T  271330 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcttcatttatga 271429  T
Q  124 ccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
      |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  271430 ataattaatcaattcacccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta 271521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 25602177 - 25602377
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  25602177 ttctcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagtacgaatttcatca 25602276  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacct 213  Q
       |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| || |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  25602277 tccatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacct 25602375  T
Q  214 ta 215  Q
    ||    
T  25602376 ta 25602377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 28974202 - 28974400
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28974202 ttctcatactttgaacatgtaattcaattaacaacaattctattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatca 28974301  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
      ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  || | |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  28974302 tttatgaacaattaatcaattcaccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgaaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta 28974400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 27261956 - 27262156
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  27261956 ttctcatactttgaacatgtaattgaactaacaacaattcaattatccataactttatacatccaaacatgtcatcataattagggcacaaatttcatca 27262055  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacct 213  Q
       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| || |||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  27262056 tccatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaactcccttacct 27262154  T
Q  214 ta 215  Q
    ||    
T  27262155 ta 27262156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 24571386 - 24571188
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||  |||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  24571386 ttctcataccttgaacatgaaatttctctaacaacaattcaagtatccacaacttcatgcattcaaacgtgtcatcaaaattagagcacgaatttcatca 24571287  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaa-attacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctt 214  Q
      ||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  24571286 tctatgaacaattaatcaatt-acccaattaagcatttattcatac-aataattgaaacattgcaataatgattatgatgaattctaaccccctaacctt 24571189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 46 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22579926 - 22579758
Alignment:
Q  46 aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaat 145  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||  | ||  ||||| ||||||||||||| |  ||||    
T  22579926 aacaacaattcaattatc-ataacttcatacatacaaacatgtcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-acacaat 22579829  T
Q  146 taagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22579828 taagcacttattcatac-aataattgaaaaattgcaatagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 22579758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 184 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 19794660 - 19794581
Alignment:
Q  184 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgcttct 263  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  19794660 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcttatgattct 19794581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 184 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 20627269 - 20627190
Alignment:
Q  184 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgcttct 263  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  20627269 tgattatgataaagactaaccccgttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 20627190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 184 - 263
Target Start/End: Original strand, 22275046 - 22275125
Alignment:
Q  184 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgcttct 263  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22275046 tgattatgataaaggctaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 22275125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 184 - 263
Target Start/End: Original strand, 22284279 - 22284358
Alignment:
Q  184 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgcttct 263  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  22284279 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct 22284358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 220
Target Start/End: Original strand, 68145 - 68351
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||| | |||||||| |||  ||||||  |||||||| | |||||||||||  | ||    
T  68145 ttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaaca 68244  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatt---ac-aaaagtgattatgatgaacactaacccccttac 211  Q
      ||||| ||||||||| |||  || |||||||||||||| |||||||  |||||||||||   || |||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  68245 attatgaacaattaatctattactc-aattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttatactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttac 68342  T
Q  212 cttaattat 220  Q
    |||| ||||    
T  68343 cttagttat 68351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 181 - 263
Target Start/End: Original strand, 15633535 - 15633617
Alignment:
Q  181 aagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgcttct 263  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  15633535 aagtgattatgataaagactaacctccttaccttaattatctccaactattaactctagcttcacttttgctcctatgattct 15633617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 43646046 - 43646289
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    |||||||||||| |||||| ||||  || ||||||||| |||||||| | |||||||| |||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||  | ||    
T  43646046 ttctcatactttaaacatgaaatttcaccaacaacaatccaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcaacataattagagcacgaattataaca 43646145  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaattaca---aaagtgattatga-tgaacactaacccccttac 211  Q
      | ||| |||||||||| ||  || |||||| ||||||| |||||||  | | |||| |||||   ||| ||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  43646146 actttgaacaattaatcatttactc-aattaaacacttattcatacaacaattggaaatttacactaaaaatgattatgactgaattctaacccccttac 43646244  T
Q  212 cttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctccta 256  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| |||||||    
T  43646245 cttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 43646289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 184 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 43642912 - 43642833
Alignment:
Q  184 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgcttct 263  Q
    |||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  43642912 tgattatgataaagactaacctccttcccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 43642833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 19660037 - 19660273
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata 120  Q
    |||||| |||||||| ||||  || ||||| ||||||||||||   || |||||  ||   ||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||  ||    
T  19660037 catactatgaacatgcaatttcaccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtatacgaacatatcatcataattagagcacgaaattcaacatcta 19660136  T
Q  121 tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaat 217  Q
     || ||| |||||| ||  |||| |||| |||||| ||||||||  |||  |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  19660137 agaacaaataatcacttattcca-ttaaacacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaagtgattatgatgaattctaacccc-ttaccttaat 19660234  T
Q  218 tatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctccta 256  Q
    ||||||||| |  |||| ||||||||||||| |||||||    
T  19660235 tatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 19660273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 19666685 - 19666921
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata 120  Q
    ||||||||||||||| || |  || || |||||||||||||||   || ||||| |||  |||||| |||| |||  ||||||| |||||| | ||  ||    
T  19666685 catactttgaacatgcaaattcaccaaaaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcattatagttagagcatgaattttaacaacta 19666784  T
Q  121 tgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaa-ttacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaat 217  Q
    ||| |||||||||| || || |||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||  || |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19666785 tgaacaattaatcactt-attcaattaagcatttattcatacaa-taattgaaaaattacactaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttaat 19666882  T
Q  218 tatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctccta 256  Q
    || ||| || |  |||| ||| ||||||||| |||||||    
T  19666883 tagcacaaattcctagcccaaacttcactttagctccta 19666921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 31146275 - 31146073
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||  ||||   |||||||||||||||||||| | |||||||| |||  ||||||  |||||||| | || ||||||||  | ||    
T  31146275 ttctcatactttgaacataaaatttctctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataccatcataattggaacacgaattctaaca 31146176  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt---acaaaag-tgattatgatgaacactaacccccttac 211  Q
      ||||  ||||||||||||| |  || ||||||||||| ||||||||  | |||||||||   ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  31146175 attatggacaattaatcaatt-actcagttaagcacttattcatacaacaatttgaaaatttacacaaaagatgattatgatgaattctaacccccttac 31146077  T
Q  212 ctta 215  Q
    ||||    
T  31146076 ctta 31146073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Original strand, 25305634 - 25305818
Alignment:
Q  67 aacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaat 165  Q
    |||||||| |||  |||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||  | ||| |||||||||| ||  || |||||||||||||| |||||||      
T  25305634 aacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattataacaactttgaacaattaatcatttactc-aattaagcacttattcatacaac- 25305731  T
Q  166 aattg-aaaattaca--aaagtgattatgat-gaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttt 248  Q
    ||||| ||||||| |  ||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||    
T  25305732 aattgtaaaattatactaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatcaccaattcatagcccaagcttcacttt 25305818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23821714 - 23821534
Alignment:
Q  36 taattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaa 135  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| | |||||| | |||  ||||||  |||||||| |||||||||||||| | ||  ||||| ||||||||||     
T  23821714 taattcaatcaacaacaattcaattatcaacaacttcctgcattcaaacataacatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcac 23821615  T
Q  136 ttcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    || |  ||||||||||||| | ||| | |||||||| |||||||||  || ||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  23821614 tt-actcaattaagcacttaagcatgc-aataattgaaaaattacactaaatgattataatgaaatctaacccccttacctta 23821534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23830793 - 23830613
Alignment:
Q  36 taattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaa 135  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| | |||||| | |||  ||||||  |||||||| |||||||||||||| | ||  ||||| ||||||||||     
T  23830793 taattcaatcaacaacaattcaattatcaacaacttcctgcattcaaacataacatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcac 23830694  T
Q  136 ttcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    || |  ||||||||||||| | ||| | |||||||| |||||||||  || ||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  23830693 tt-actcaattaagcacttaagcatgc-aataattgaaaaattacactaaatgattataatgaaatctaacccccttacctta 23830613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19669199 - 19669003
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata 120  Q
    ||||||| ||||||| ||||  || |||||||| |||||||||   || ||||| |||  |||||| ||| ||||  ||||||| | |||| | ||  ||    
T  19669199 catacttagaacatgcaatttcaccaacaacaactcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcaccatagttagagcatggattttaacatcta 19669100  T
Q  121 tgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaa-ttaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    ||| |||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||||  ||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  19669099 tgaacaattaatcattt-atccaattaatcacttattcatacaa-taattgaaaaattacactaaaatgattatgatgaattctaaccccgttacctta 19669003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 22775299 - 22775206
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||| | ||  || |||||||||||||||| | | |||||||| |||  ||||||  |||||||| | |||||||||||    
T  22775299 ttctcatactttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 22775206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 22780677 - 22780584
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||| | ||  || |||||||||||||||| | | |||||||| |||  ||||||  |||||||| | |||||||||||    
T  22780677 ttctcatactttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 22780584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 149; Significance: 9e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 913 - 717
Alignment:
Q  20 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  913 tcatactttgaacatgtaattcatctaacaacaatccaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacat 814  T
Q  120 atgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  813 atgaacaatcaatcaattcactcaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 6928 - 6749
Alignment:
Q  28 tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaa 127  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6928 tgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaactattcataacttcatacatctaaacatgtcctcgtaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaa 6829  T
Q  128 ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccc 206  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  6828 ttaatcaattcacccaattaagcactgatcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccc 6749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 149; Significance: 9e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Original strand, 22847 - 23043
Alignment:
Q  20 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |    
T  22847 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcaaaacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcattt 22946  T
Q  120 atgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22947 atgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttgatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 23043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 91 - 254
Target Start/End: Original strand, 1 - 164
Alignment:
Q  91 tcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 tcataaatagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattat 100  T
Q  191 gatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcc 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  101 gatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcc 164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 5333 - 5143
Alignment:
Q  24 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  5333 actttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatctcatcataataagagcacgaatttcatcacttatga 5235  T
Q  124 ccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5234 acaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattagaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 5143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 8976 - 8776
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8976 ttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatca 8877  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaat--tacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacct 213  Q
      ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8876 tttatgaacaattaatcaattttcccaattaagcacttattcatac-aataattgaaattgcaccaaaaatgattatgatgaactctaacccccttacct 8778  T
Q  214 ta 215  Q
    ||    
T  8777 ta 8776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Original strand, 15034 - 15224
Alignment:
Q  24 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga 123  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  15034 actttgaacatgtaatctaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatga 15132  T
Q  124 ccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15133 acaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacatataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 15224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 11799 - 11603
Alignment:
Q  20 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||    
T  11799 tcatactttgaacatgtaattcatccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagtacaaatttcatcacat 11700  T
Q  120 atgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  11699 atgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttagctta 11603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0740 (Bit Score: 144; Significance: 9e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0740
Description:

Target: scaffold0740; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Original strand, 4445 - 4635
Alignment:
Q  24 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  4445 actttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcataatttgatacatctaaacatgtcattataattagagcacgaatttcatcacttatga 4543  T
Q  124 ccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4544 acaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaacgtgattatgatgaattctaacccccttacctta 4635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 144; Significance: 9e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Original strand, 48302 - 48496
Alignment:
Q  20 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacat 119  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  48302 tcatactttgaacataaaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatttcatcataattagagcacgaatttcatcactt 48401  T
Q  120 atgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||    
T  48402 atgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgataaattctaa-ccccttacctta 48496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Original strand, 61750 - 61944
Alignment:
Q  20 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacat 119  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  61750 tcatactttgaacataaaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatttcatcataattagagcacgaatttcatcactt 61849  T
Q  120 atgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||    
T  61850 atgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgataaattctaa-ccccttacctta 61944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 144; Significance: 9e-76; HSPs: 4)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Original strand, 164375 - 164565
Alignment:
Q  24 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  164375 actttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcacttatga 164473  T
Q  124 ccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  164474 aaaattaatcaattcatccaattaagcacttaccatacaattaattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 164565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 184 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 166195 - 166116
Alignment:
Q  184 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgcttct 263  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  166195 tgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 166116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 184 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 162109 - 162036
Alignment:
Q  184 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctat 257  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  162109 tgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 162036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 179 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 116487 - 116410
Alignment:
Q  179 aaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctccta 256  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| |||||||    
T  116487 aaaaatgattatgatgaaatctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 116410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 144; Significance: 9e-76; HSPs: 35)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22234890 - 22234700
Alignment:
Q  24 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga 123  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  22234890 actttgagcatgtaattcaactaaca-caattaaattattcataacttcatacatctaaacacgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatga 22234792  T
Q  124 ccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22234791 acaattaatcaattcattcaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 22234700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20573279 - 20573087
Alignment:
Q  24 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  20573279 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatga 20573180  T
Q  124 ccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  20573179 acaattaatcaattcacccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta 20573087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Original strand, 37611829 - 37612020
Alignment:
Q  24 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  37611829 actttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattatttataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatga 37611927  T
Q  124 ccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  37611928 acaattaatcaattcatctaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattataataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 37612020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20561725 - 20561526
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  20561725 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatctataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatca 20561626  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
      ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  20561625 tttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta 20561526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 23 - 215
Target Start/End: Original strand, 41246816 - 41247009
Alignment:
Q  23 tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatg 122  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  41246816 tacttttaacatgtaattcaaccaacaacaatttaattattcataacttcatacatctaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcatttatg 41246915  T
Q  123 accaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41246916 aaaaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaactaattgaaaattacaataagtgattatgatgaactctaacccccttacctta 41247009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19993141 - 19992952
Alignment:
Q  24 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga 123  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||  |||||    
T  19993141 actttgaacaagtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcgtacatctaaacatgtcatcataattagagtacggatttcatcatttatga 19993043  T
Q  124 ccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  19993042 acaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattg-aaattacaaaagtgattatgatgaattataacccccttacctta 19992952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Original strand, 20481761 - 20481955
Alignment:
Q  20 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||       
T  20481761 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatcc 20481860  T
Q  120 atgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  20481861 atgaacaaataatcaatt-atccaattaagcacttattcatac-attaattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattttaacccccttacctta 20481955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Original strand, 25122618 - 25122793
Alignment:
Q  40 tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattca 139  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||    
T  25122618 tcaactagcaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattggagcacgaatttgatcatttatgaacaattaatcaattca 25122717  T
Q  140 tccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  25122718 tccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattataataatgattatgatgaattctaacccccttacctta 25122793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 21198246 - 21198005
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||| | |||||||| |||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21198246 ttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatctacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatttcatca 21198147  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacc 212  Q
      ||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||  ||| ||||||| |||||  |||||||||||| |    
T  21198146 tctatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaaatgattataatgaattctaacccccttatc 21198049  T
Q  213 ttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctccta 256  Q
    |||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| |||||||    
T  21198048 ttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 21198005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 111 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 7000624 - 7000524
Alignment:
Q  111 tcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaaccccctta 210  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7000624 tcatcacatatgaacaattaatcaattcatcctattaagcacttatcatacaaataattgaaaattaaaaaagtgattatgatgaaaactaaccccctta 7000525  T
Q  211 c 211  Q
    |    
T  7000524 c 7000524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 21681157 - 21681356
Alignment:
Q  18 tctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcac 117  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||     
T  21681157 tctcatactttaaacatgaaattcaactaacaataattcaattatccataaacttatacattcaaatatgtcatcataattagatcacgaattttatcat 21681256  T
Q  118 atatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctt 214  Q
     ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  21681257 ttatgaacaattaatcaattcaacaaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctt 21681355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 17285357 - 17285600
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||  | ||    
T  17285357 ttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcatttaaacatatcatcataattggagcacgaattctaaca 17285456  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatga-tgaacactaaccccctta 210  Q
      ||||| |||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||   |||| ||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  17285457 attatgaacaattattcaatt-attcaattaagcacttaatcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgattgaattctaaccccctta 17285554  T
Q  211 ccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctccta 256  Q
    |||||||||||||||| |  || | ||||||||||||| |||||||    
T  17285555 ccttaattatcaccaattcctaacccaagcttcactttagctccta 17285600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 224
Target Start/End: Original strand, 23837351 - 23837561
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23837351 ttctcatactttgaacatgaaatttcaataacaacaattcaattatcaacaacttcatgcatttaaacatatcatcataattagagcacgaattttatca 23837450  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaat---tacaaaagtgattatga-tgaacactaacccccttac 211  Q
      ||||| ||||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||| || ||||||||||   ||  ||| ||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  23837451 tctatgaacaattaatc-atttactcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatctatattaaaatgattatgattgaattctaacccccttac 23837548  T
Q  212 cttaattatcacc 224  Q
    |||||||||||||    
T  23837549 cttaattatcacc 23837561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 184 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 16404931 - 16404852
Alignment:
Q  184 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgcttct 263  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16404931 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 16404852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 22981426 - 22981622
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | |||||||| |||  ||||||  |||||||| |||||||| ||||||||      
T  22981426 ttctcatactttgaacatgaaatttctctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattagagcacaaatttcat-- 22981523  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacct 213  Q
    ||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||| ||| |  |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22981524 catctgaacaattaatcaatt-acccaattaagcacttattcatacaa--aattgaaaaattgcaatatatgattatgatgaattctaacccccttacct 22981620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 184 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 24716793 - 24716714
Alignment:
Q  184 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgcttct 263  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  24716793 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 24716714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 184 - 263
Target Start/End: Original strand, 39115599 - 39115678
Alignment:
Q  184 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgcttct 263  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39115599 tgattatgatgaaaactaacacccttaccttaattattaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgattct 39115678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 39446857 - 39446660
Alignment:
Q  20 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacat 119  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||  |||||||||||||||| | ||||| |||||  | ||  |    
T  39446857 tcatactttaaacatgaaattccactaacaacaattcaattatccacaacttcaagcattcaaacatgtcatcataattggagcatgaattctaacaatt 39446758  T
Q  120 atgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||| ||||||||||||| |  |||||||||| ||| |||||| || |||||||| ||||   |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  39446757 atgaacaattaatcaatt-actcaattaagcatttattcatac-aacaattgaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta 39446660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 184 - 263
Target Start/End: Original strand, 274767 - 274846
Alignment:
Q  184 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgcttct 263  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  274767 tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 274846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 184 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 641082 - 641003
Alignment:
Q  184 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgcttct 263  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  641082 tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 641003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 184 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 826888 - 826809
Alignment:
Q  184 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgcttct 263  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  826888 tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 826809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 125 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20529839 - 20529748
Alignment:
Q  125 caattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  20529839 caattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattataacccccttacctta 20529748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 20653999 - 20653944
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttc 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20653999 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttc 20653944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Original strand, 26011651 - 26011886
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata 120  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||   || ||||| |||  |||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||  ||    
T  26011651 catactttgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaacta 26011750  T
Q  121 tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaa 216  Q
    ||| |||||||||| || |  ||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||  || ||||||||| ||||   |||||||||||||||||    
T  26011751 tgaacaattaatcactt-actcaattaaacacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaa---taacccccttaccttaa 26011845  T
Q  217 ttatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatg 258  Q
    ||| || ||| |  |||| |||||||||||||  ||||||||    
T  26011846 ttagca-caattcctagcccaagcttcactttacctcctatg 26011886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 256
Target Start/End: Original strand, 5854772 - 5855007
Alignment:
Q  22 atactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatat 121  Q
    ||||||||||||||  |||  || ||||||||||||||||||   || ||||| |||  |||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||  |||    
T  5854772 atactttgaacatgctatttcaccaacaacaattcaattatcgccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactat 5854871  T
Q  122 gaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaat 217  Q
    || |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||  || ||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||    
T  5854872 gaacaattaatcactt-actcaattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacctccttaccttaat 5854969  T
Q  218 tatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctccta 256  Q
    || || ||| |  |||| ||||||||||||| |||||||    
T  5854970 tagca-caattcctagcccaagcttcactttagctccta 5855007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 46 - 256
Target Start/End: Original strand, 33528607 - 33528819
Alignment:
Q  46 aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaat 145  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||| |||  |||||| ||||||||| ||||||||| | |||| ||  || || |||||||||| || || ||||    
T  33528607 aacaacaattcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacggaattcaacatctaagaacaattaatcactt-attcaat 33528705  T
Q  146 taagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagctt 242  Q
    ||||||||| |||||||||  |||  |||||||||  || ||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||| ||| || |  |||||||| |||    
T  33528706 taagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttagttagcacaaattcctagctcaaactt 33528805  T
Q  243 cacttttgctccta 256  Q
    |||||| |||||||    
T  33528806 cactttagctccta 33528819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 15933455 - 15933692
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata 120  Q
    ||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||   || ||||| |||  |||||| ||||||||| |||||||| ||||| | ||  ||    
T  15933455 catactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattttaacaacta 15933554  T
Q  121 tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttacaa-aagtgattatgatg-aacactaacccccttaccttaa 216  Q
    ||| |||||||||| ||  || ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||  ||  ||||||||||||||||||    
T  15933555 tgaacaattaatcacttactc-aattaagcacttaatcatacaa-taattgaaaaattacactaaatgattatgatttaattctaacccccttaccttaa 15933652  T
Q  217 ttatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctccta 256  Q
    ||| ||| |  |  |||| || |||||||||| |||||||    
T  15933653 ttagcacaatttcctagcccaggcttcactttagctccta 15933692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 20647923 - 20647882
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaa 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20647923 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaa 20647882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 256
Target Start/End: Original strand, 29306599 - 29306813
Alignment:
Q  46 aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaat 145  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||| |||   ||||| ||||||||  |||||||||||| | | ||  ||||| |||| ||||| || || ||||    
T  29306599 aacaacaattcaattatcactaatttcatgcattagaacatatcatcatagttagagcacgaatattaacatctatgaacaatcaatcactt-attcaat 29306697  T
Q  146 taagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca--aaagtgattatga-tgaacactaacccc-cttaccttaattatcaccaactattagctcaagc 240  Q
    ||||||||| |||||||||  |||  |||||||||  ||| ||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||| ||| || |  |||| |||||    
T  29306698 taagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccctcttaccttaattagcacaaattcctagcccaagc 29306797  T
Q  241 ttcacttttgctccta 256  Q
    |||| ||| |||||||    
T  29306798 ttcagtttagctccta 29306813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 219
Target Start/End: Original strand, 22742921 - 22743122
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata 120  Q
    |||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||||||   || ||||| ||   |||||| ||| |||||  | ||||||||||||| ||  ||    
T  22742921 catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcactcaaacatatcaccataatcaaagcacgaatttcaacaacta 22743020  T
Q  121 tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattat-gatgaacactaacccccttaccttaa 216  Q
    ||| ||| ||||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||| ||||  ||||||||||  || ||||||| | ||||  ||||||||||||||||||    
T  22743021 tgaacaaataatcaatt-attcaactaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaacccccttaccttaa 22743119  T
Q  217 tta 219  Q
    |||    
T  22743120 tta 22743122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 110
Target Start/End: Original strand, 38533802 - 38533895
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatt 110  Q
    |||||||||||||||||||  |||   |||||||||||||||||||| | |||||||| |||  ||||||  |||||||| | ||| |||||||    
T  38533802 ttctcatactttgaacatgagatttctctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagtacgaatt 38533895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 38635731 - 38635541
Alignment:
Q  28 tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaa 127  Q
    |||||||| ||||  || ||||||||||||||||||  ||| |||||  ||  |||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||  ||||| |||    
T  38635731 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgtattcaaacatatcatgataactagagcacgaatttcaacaactatgaacaa 38635632  T
Q  128 ttaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattat-gatgaacactaacccccttacctta 215  Q
      | ||| || || ||||||||||||| ||||| ||| ||||  ||||||||||  || ||||||| | ||||  |||||||||||||||||    
T  38635631 agattcactt-attcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaacccccttacctta 38635541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 23226141 - 23225932
Alignment:
Q  46 aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaat 145  Q
    |||||||| |||||||||   || ||||| |||  |||||| ||||||||  |||||||| ||||| | ||  ||||| |||||||||| |    |||||    
T  23226141 aacaacaactcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacaaattttaacatctatgaacaattaatcatt----ccaat 23226046  T
Q  146 taagcacttat-catacaaataattgaaaatt---acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagct 241  Q
    ||| ||||| | ||||||| |||||||||| |   || ||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||| | ||| || |  |||| ||||||    
T  23226045 taaacactttttcatacaa-taattgaaaaattgcactaaaatgattatgatgaattctaacccctttaccttaatgagcacaaattcctagcccaagct 23225947  T
Q  242 tcacttttgctccta 256  Q
    ||||||| |||||||    
T  23225946 tcactttagctccta 23225932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 179 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 31194253 - 31194169
Alignment:
Q  179 aaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaact-attagctcaagcttcacttttgctcctatgcttct 263  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |  || | | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  31194253 aaaaatgattatgatgaaaactaacccccttaccttagtta-gattaattcactagcttaagcttcacttttgctcctatgattct 31194169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 23151918 - 23151810
Alignment:
Q  26 tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacc 125  Q
    |||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||  ||  ||||| |||  ||| || ||||||||| | || ||||||||| | || |||||| |    
T  23151918 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcactagtttcatgcattcaaatatatcatcataattggaacacgaattttaacaaatatgaac 23151819  T
Q  126 aattaatca 134  Q
    |||||||||    
T  23151818 aattaatca 23151810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 11740 - 11548
Alignment:
Q  24 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga 123  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  11740 actttgaacatgtaattcaaccaagaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatggcatcataattagagcacgaatttcatcatttatga 11641  T
Q  124 ccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  11640 acaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 11548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Original strand, 1473 - 1667
Alignment:
Q  20 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |    
T  1473 tcatactttgaacatgtaattcaaccaccaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcatgattagagcacgaatttcatcattt 1572  T
Q  120 atgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    ||   |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  1573 atacacaattaatcaattcattcaattaaccacttttcatacaaataattg--aattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttgcctta 1667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 26)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 9784159 - 9783959
Alignment:
Q  16 cttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  9784159 cttctcatactttgaacatgtaattcaatcaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatc 9784060  T
Q  116 acatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctt 214  Q
    || ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9784059 acttatgaacaatttatcaattcacccaattaagcacttttcataccaataattgaaaattgcagtaagtgattatgatgaattctaacccccttacctt 9783960  T
Q  215 a 215  Q
    |    
T  9783959 a 9783959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22403196 - 22403005
Alignment:
Q  24 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  22403196 actttgaacatgtaattcaactaaca-caatttaattattcataacttcatacatctagacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatga 22403098  T
Q  124 ccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22403097 acaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 22403005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 208
Target Start/End: Original strand, 41212227 - 41212415
Alignment:
Q  20 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacat 119  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |    
T  41212227 tcatactttgaacatacagttcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacctctaaacaggtcatcataattagagcacgaatttcatcattt 41212326  T
Q  120 atgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaaccccct 208  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  41212327 atgaacaattaatcaattcatccaattaaacacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaaccccct 41212415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 215
Target Start/End: Original strand, 49967812 - 49968002
Alignment:
Q  26 tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacc 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  | ||| |    
T  49967812 tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatggcatcataattagagcacgaatttcatgatttttgaac 49967911  T
Q  126 aattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  49967912 aattaatcaattcatccaattaagcacttttcatgcaaataattgaaaattacaataagtgattacgatgaattctaacccccttacctta 49968002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Original strand, 35054912 - 35055108
Alignment:
Q  20 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||  |    
T  35054912 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaattaaatcattt 35055011  T
Q  120 atgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaat-tacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  35055012 atgaacaattaaccaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaatagaaataagtgattatgatgaattttaacccccttacctta 35055108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 174
Target Start/End: Original strand, 21718381 - 21718537
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21718381 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatca 21718480  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa 174  Q
       |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  21718481 tccatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaa 21718537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 31 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 35522432 - 35522247
Alignment:
Q  31 acatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaatta 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  35522432 acatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaatta 35522333  T
Q  131 atcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  35522332 atcaattcacccaattaagcccttttcatacaaataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaactcccttacctta 35522247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 20177328 - 20177570
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||| | |||||| | |||  |||||| ||||||||| | |||||||||||  | ||    
T  20177328 ttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcgtgcattaaaacatatcatcataattggagcacgaattctaaca 20177427  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatga-tgaacactaacccccttac 211  Q
      ||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  ||| ||||||||| ||||  |||||||| ||||    
T  20177428 attatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacttaaacatac-aataattgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaaccccattac 20177525  T
Q  212 cttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctccta 256  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| |||||||    
T  20177526 cttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 20177570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 13376950 - 13376711
Alignment:
Q  20 tcatactttgaacatgtaatt-caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcaca 118  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| ||||||| | |||||||| |||  |||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||      
T  13376950 tcatactttgaacatgaaatttcaacga-caacaatttaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgattctcatcatc 13376852  T
Q  119 tatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatga-tgaacactaacccccttacct 213  Q
    ||||| ||||||||||||| |   |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||  ||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  13376851 tatgaacaattaatcaatt-actaaattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttacct 13376754  T
Q  214 taattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctccta 256  Q
    ||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||| |||||||    
T  13376753 taattatcaccaattcctagcccaaacttcactttagctccta 13376711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 184 - 263
Target Start/End: Original strand, 41218729 - 41218808
Alignment:
Q  184 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgcttct 263  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41218729 tgatcatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgattct 41218808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 184 - 263
Target Start/End: Original strand, 21860335 - 21860414
Alignment:
Q  184 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgcttct 263  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  21860335 tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 21860414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 184 - 266
Target Start/End: Original strand, 41394528 - 41394610
Alignment:
Q  184 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgcttctcca 266  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  41394528 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcactttagctcctatgattctcca 41394610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 184 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 44034902 - 44034829
Alignment:
Q  184 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctat 257  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44034902 tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 44034829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 16646065 - 16646266
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  || |||| ||||| ||||||| | |||||||| |||  ||||||  |||||||| | |||||||||||  | ||    
T  16646065 ttctcatactttgaacatgaaattttaccaacatcaattaaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaaca 16646164  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttac 211  Q
      ||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||   |||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  16646165 attatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttac 16646262  T
Q  212 ctta 215  Q
    ||||    
T  16646263 ctta 16646266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22143451 - 22143215
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata 120  Q
    ||||||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||   || ||||| |||  |||||  ||||||||  |||||||||||||| | ||  ||    
T  22143451 catactttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcacaaatttcatgcatacaaacacatcatcatagttagagcacgaattttaacatcta 22143352  T
Q  121 tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaa 216  Q
    ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||     
T  22143351 tgaacaattaatc-atttatccaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattacactaaaatgattatgatgaattctaa-ccccttaccttag 22143255  T
Q  217 ttatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctccta 256  Q
    ||| ||   | |  |||| ||||||||||||| |||||||    
T  22143254 ttagcaattaatcctagcccaagcttcactttagctccta 22143215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 16656791 - 16656992
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||| | | ||  || |||||||||||||||||| | ||||| || |||  ||||||  |||||||| | |||||||||||  | ||    
T  16656791 ttctcatactttgaacacgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaaca 16656890  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatta----caaaagtgattatgatgaacactaacccccttac 211  Q
      ||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||     |||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  16656891 attatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaattaacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttac 16656988  T
Q  212 ctta 215  Q
    ||||    
T  16656989 ctta 16656992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 21195171 - 21195408
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata 120  Q
    |||||| |||||||  ||||  || ||||||||||||||||||   || ||||| |||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||| | ||  ||    
T  21195171 catactatgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaattttaacaacta 21195270  T
Q  121 tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaa 216  Q
    ||| |||||||||| || || ||||||||||||| | |||||||  |||  ||||||||||  || ||||||||| ||||  |||| ||||||||||||     
T  21195271 tgaacaattaatcactt-attcaattaagcacttaaacatacaacaaatgaaaaattacaactaaatgattatgattgaattctaaaccccttaccttag 21195369  T
Q  217 ttatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctccta 256  Q
    ||| || ||| |  |||| ||||||||||||| |||||||    
T  21195370 ttagca-caaatcctagcccaagcttcactttagctccta 21195408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 215
Target Start/End: Original strand, 19603279 - 19603449
Alignment:
Q  46 aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaat 145  Q
    |||||||| |||||||||   || |||||||||  ||||||  |||||||| | |||||||||||| | ||  ||||| ||||||||||||| |  ||||    
T  19603279 aacaacaaatcaattatcaccaatttcatacattcaaacataacatcataattggagcacgaattttaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaat 19603377  T
Q  146 taagcactta-tcatacaaataattgaaaatt---acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||   || ||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  19603378 taagcacttattcatac-aataattgaaaatttgcactaaa-tgattatgatgaattctagcccccttacctta 19603449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 256
Target Start/End: Original strand, 17609086 - 17609322
Alignment:
Q  22 atactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatat 121  Q
    |||||||||||||| ||||  || ||||||||| ||||||||   || ||||| |||  ||| || ||||||||| |||||||||||||  | ||  |||    
T  17609086 atactttgaacatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaatttcatgcattcaaatatatcatcataattagagcacgaattctaacaactat 17609185  T
Q  122 gaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaat 217  Q
    || ||| |||||| || |  ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||  || ||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |    
T  17609186 gatcaactaatcactt-actcaattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttagt 17609283  T
Q  218 tatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctccta 256  Q
    || ||| || |  || | ||||||||||||| |||||||    
T  17609284 tagcacaaattcctaacccaagcttcactttagctccta 17609322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 27329845 - 27329757
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatt 110  Q
    |||||||||| |||| | ||  || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  27329845 catactttgatcatgaagtttcaccaacaacaattcaattatc-ataacttcatatatacaaacatgtcatcataattggagcacgaatt 27329757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 8538000 - 8537771
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata 120  Q
    |||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||||||  ||| ||||| |||  |||||| |||||||||  | ||||||||||||| ||   |    
T  8538000 catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattcaaacatatcatcataatcaaagcacgaatttcaacaacca 8537901  T
Q  121 tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaa 216  Q
    ||| | | ||||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||| ||||  ||||||||||  || ||||||||| ||||  ||||| |||||||||||     
T  8537900 tgaacgaataatcaatt-attcaactaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatgattgaattctaactcccttaccttag 8537802  T
Q  217 ttatcaccaactattagctcaagcttcacttt 248  Q
    ||| || ||| |  |||| |||||||||||||    
T  8537801 ttagca-caaatcctagcccaagcttcacttt 8537771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 8603239 - 8603010
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata 120  Q
    |||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||||||  ||| ||||| |||  |||||| |||||||||  | ||||||||||||| ||   |    
T  8603239 catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattcaaacatatcatcataatcaaagcacgaatttcaacaacca 8603140  T
Q  121 tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaa 216  Q
    ||| | | ||||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||| ||||  ||||||||||  || ||||||||| ||||  ||||| |||||||||||     
T  8603139 tgaacgaataatcaatt-attcaactaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatgattgaattctaactcccttaccttag 8603041  T
Q  217 ttatcaccaactattagctcaagcttcacttt 248  Q
    ||| || ||| |  |||| |||||||||||||    
T  8603040 ttagca-caaatcctagcccaagcttcacttt 8603010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 51627758 - 51627558
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| ||| | || ||||| |||  || ||| ||||||||| | |||||| ||||  | |     
T  51627758 ttctcatactttgaacatgaagtttcactaacaacaattcaatcatcaacaaattcatgcattcaagcatatcatcataattggagcacaaattctaacg 51627659  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacc 212  Q
      ||||| ||| ||||||||| |  |||||||||||||| |||| | || |||||||| ||||   |||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  51627658 attatgaacaaataatcaatt-actcaattaagcacttattcatgc-aacaattgaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacc 51627561  T
Q  213 tta 215  Q
    |||    
T  51627560 tta 51627558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 256
Target Start/End: Original strand, 27675120 - 27675191
Alignment:
Q  185 gattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctccta 256  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||| |  |||| ||||||||||||| |||||||    
T  27675120 gattatgataaattctaacccccttaccttaattatctccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 27675191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 22 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 37233949 - 37233722
Alignment:
Q  22 atactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatat 121  Q
    |||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||   || ||||| |||  |||||| ||||||||| || ||||||||||  | ||  |||    
T  37233949 atactttgaacatgcaattttaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataactaaagcacgaattctaacaactat 37233850  T
Q  122 gaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaat 217  Q
     | |||||| ||| || |  ||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||  || ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  37233849 taacaattactcactt-actcaattaagcacttaataatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaat 37233752  T
Q  218 tatcaccaactattagctcaagcttcacttt 248  Q
    || || ||| |  |||| |||||||||||||    
T  37233751 tagca-caattcctagcccaagcttcacttt 37233722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 49997371 - 49997174
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata 120  Q
    |||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||||||   || |||||| ||  |||||| ||| ||||| ||| |||| ||||||| ||   |    
T  49997371 catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatatattcaaacatatcaccataactagggcacaaatttcaacaatca 49997272  T
Q  121 tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattatg-atgaacactaacccccttacctta 215  Q
    ||| ||| |||||| || || ||||||||||||| ||||| ||| ||||  ||||||||||  || ||||||||  ||||  |||||||||||||||||    
T  49997271 tgaacaaataatcactt-attcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatgtttgaattctaacccccttacctta 49997174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Original strand, 25377 - 25563
Alignment:
Q  30 aacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaatt 129  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||    
T  25377 aacatgaatttcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatccaaacatgtcatcataaatagagcacaaatttcatcatttatgaacaatt 25476  T
Q  130 aatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25477 aatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaagactaacccccttacctta 25563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 116
Target Start/End: Original strand, 25124 - 25210
Alignment:
Q  30 aacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25124 aacatgaatttcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatccaaacatgtcatcataaatagagcacaaatttcatca 25210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 134; Significance: 8e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 174 - 370
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  174 ttctcatactttgaacatgcaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcat---tagagcacgaatttcatca 270  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
      ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  271 tttatgaacaattaattaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaagactaacccccttacctta 370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 24819 - 24623
Alignment:
Q  20 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |    
T  24819 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaatttaattatcaataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcattt 24720  T
Q  120 atgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||  ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  24719 atggacaattaatcaattcacctaattaagcacttttcatacaaataattgaaaatttcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 24623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 118058 - 117857
Alignment:
Q  16 cttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  118058 cttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatc 117959  T
Q  116 acatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg---aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacc 212  Q
    |  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||   |||||| ||| | |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  117958 atttatgaacaattaatcaattcagccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacc 117860  T
Q  213 tta 215  Q
    |||    
T  117859 tta 117857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 109556 - 109356
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  109556 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatca 109457  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg---aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacct 213  Q
      ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||   |||||| ||| | |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  109456 tttatgaacaattaatcaattcagccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacct 109358  T
Q  214 ta 215  Q
    ||    
T  109357 ta 109356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Original strand, 60962 - 61159
Alignment:
Q  20 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |    
T  60962 tcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacatcatacatctaaacatgttatcataattagagcacgaatttcatcattt 61061  T
Q  120 atgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  61062 atgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 61159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 70713 - 70552
Alignment:
Q  20 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccat-aacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcaca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  70713 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaataaatcaattattcattaacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatt 70614  T
Q  119 tatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa 180  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  70613 tatgaacaattaatcaactcatccaaataagcacttttcttacaaataattgaaaattacaa 70552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 76 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 79925 - 79785
Alignment:
Q  76 catctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaat 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  79925 catctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaat 79826  T
Q  176 tacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||||  |||||||||||| ||  |||||||||||| ||||    
T  79825 tacaatgagtgattatgatcaattctaacccccttagctta 79785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 85485 - 85683
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  85485 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatca 85584  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
      ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  85585 tttataaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta 85683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 159453 - 159651
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  159453 ttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaatgccattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatca 159552  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
      ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||| |||||| ||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  159553 tttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcgtac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta 159651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 215
Target Start/End: Original strand, 9139 - 9339
Alignment:
Q  16 cttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9139 cttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatc 9238  T
Q  116 acatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg--aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacct 213  Q
    |  |||||  ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||| ||| | |||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  9239 atttatgaaaaattaatcaattcactcaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaaattgcaataatgattatgataaattctaacccccttacct 9337  T
Q  214 ta 215  Q
    ||    
T  9338 ta 9339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Original strand, 7725 - 7922
Alignment:
Q  20 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacat-gtcatcataaatagagcacgaatttcatcaca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| || |||||||||||      
T  7725 tcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattatttataacttcatacatctaaacataggcatcataattagatcatgaatttcatcatt 7824  T
Q  119 tatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  7825 tatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtaattatgatgaattctaacccccttacctta 7922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 132341 - 132144
Alignment:
Q  20 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacat 119  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |    
T  132341 tcatactttgaacatataattcaacaaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcattt 132242  T
Q  120 atgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  132241 atgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatagaaataattgaaaaattgcaataagtgattatgatgaattccaacccccttacctta 132144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 88431 - 88631
Alignment:
Q  20 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |    
T  88431 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacattttaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacgaatttcatcattt 88530  T
Q  120 atgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaatt 218  Q
    |||  ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  88531 atggacaattaatcaattcacccaattaaacacttttcatacaaataattgaaaatagcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctttatt 88630  T
Q  219 a 219  Q
    |    
T  88631 a 88631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 11841 - 12041
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  11841 ttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattgaaacatgtcatcataattagagcacgaaattcatca 11940  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaat--tacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacct 213  Q
      ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |    ||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  11941 tttatgaacaattaatcaattgacccaattaagcacttattcatac-aataattgaaattgcaccaaaaatgattatgatgaattctaaccaccttacct 12039  T
Q  214 ta 215  Q
    ||    
T  12040 ta 12041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 16052 - 16253
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  16052 ttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacggatttcatca 16151  T
Q  117 catatg-accaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaat--tacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacc 212  Q
      |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |    ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  16152 tttatgaacaaattaatcaattcacccaattaagcacttgttcatac-aataattgaaattgcaccaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacc 16250  T
Q  213 tta 215  Q
    |||    
T  16251 tta 16253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 25583 - 25784
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  25583 ttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattaaaacatgtcatcataattagagcacggatttcatca 25682  T
Q  117 catatg-accaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaat--tacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacc 212  Q
      |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |    ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  25683 tttatgaacaaattaatcaattcacccaattaagcacttgttcatac-aataattgaaattgcaccaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacc 25781  T
Q  213 tta 215  Q
    |||    
T  25782 tta 25784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 11659 - 11464
Alignment:
Q  20 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |    
T  11659 tcatactttgaacatgtaattcaatcaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcattt 11560  T
Q  120 atgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  11559 atgaacaattaatcaattca-acaattaaacacttttcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccatacctta 11464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 254900 - 254710
Alignment:
Q  24 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  254900 actttgaacatgtaattcaacta-caacaattcaattattcataacttcatacatctaagcatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatatatga 254802  T
Q  124 ccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||   || |||||||||||||    
T  254801 acaattaatcaattcatccaattaaacacttatcatacaaataattg-aaattacaataagtgattatgatgaattatatcccccttacctta 254710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 261506 - 261316
Alignment:
Q  24 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  261506 actttgaacatgtaattcaacta-ctacaattcaattattcataacttcatacatctaagcatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatatatga 261408  T
Q  124 ccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||   || |||||||||||||    
T  261407 acaattaatcaattcatccaattaaacacttatcatacaaataattg-aaattacaataagtgattatgatgaattatatcccccttacctta 261316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0816 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0816
Description:

Target: scaffold0816; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 64 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 3112 - 2961
Alignment:
Q  64 cataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaa 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3112 cataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcatttatcatacaa 3013  T
Q  164 ataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  3012 ataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 2961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 25 - 215
Target Start/End: Original strand, 10098 - 10289
Alignment:
Q  25 ctttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgac 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||     
T  10098 ctttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaattttatcatttatgaa 10197  T
Q  125 caattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa-ttacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| | ||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  10198 caattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaagaattgaaaatttgcaataatgattattatgaattctaacccccttacctta 10289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 112639 - 112441
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  112639 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattgttcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatca 112540  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
      ||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||| |||||| |||||||| |||||| ||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  112539 tttatgaacaattaatcaattcacccaaataagtacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta 112441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 103016 - 102815
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||  |||||| ||||||||| | |||||||||||  | ||    
T  103016 ttctcatactttgaacatgaaatttcactaacaacaattcaattatcaaaaacttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaattctaaca 102917  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttac 211  Q
      ||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||   |||| |||||||||||||   ||| ||||||||    
T  102916 attatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacacaaaaaatgattatgatgaattataaaccccttac 102819  T
Q  212 ctta 215  Q
    ||||    
T  102818 ctta 102815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 95
Target Start/End: Original strand, 109743 - 109821
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcata 95  Q
    |||||||||||| |||||| ||||  | ||||||||||||||||||| | ||||||||  ||  |||||| ||||||||    
T  109743 ttctcatactttaaacatgaaatttcattaacaacaattcaattatcaacaacttcatggattcaaacatatcatcata 109821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 33815 - 34014
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33815 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatctataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatca 33914  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctt 214  Q
      || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||| || |||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  33915 tttacgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttaatcatac-agtaattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaatccccttacctt 34013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1867 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold1867
Description:

Target: scaffold1867; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Original strand, 310 - 496
Alignment:
Q  30 aacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaatt 129  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  310 aacatgaatttcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaatt 409  T
Q  130 aatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  410 aatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgattaattctaacccccttacctta 496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 253083 - 252903
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||    
T  253083 ttctcatactttgaaaatgtaattcaactaacaacaattcaattatccctaacttcatacatccaaacatgtcatcataatcaaagcacgaattttatca 252984  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaa 196  Q
      ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  252983 tttatgcacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaa 252903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 211
Target Start/End: Original strand, 2073 - 2263
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata 120  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||    
T  2073 catactttgaacatgaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcattta 2172  T
Q  121 tgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttac 211  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | |||||||||||||  |||||||||||||    
T  2173 tgagcaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttac 2263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 215
Target Start/End: Original strand, 38459 - 38650
Alignment:
Q  25 ctttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgac 124  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||  |||||     
T  38459 ctttgaacatgtaattcaaccaacaaaaattcaattattcataaattcataaatctaaacatgtcatcataattagagcgcgtatttcatcatttatgaa 38558  T
Q  125 caattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  38559 caattaattaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 38650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 70767 - 70964
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  70767 ttctcatactttgaacatg-aattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatca 70865  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
      ||| | | |||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  70866 tttataaactattaattaattcacccaattaagcacttttcatac-aataactgaaaattacaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta 70964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 174
Target Start/End: Original strand, 31197 - 31352
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  31197 ttcttatactttgaacatg-aattcaactaaccacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaattttatca 31295  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa 174  Q
      ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  31296 tttatgaacaaataatcaattcacccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaa 31352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 97288 - 97060
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata 120  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||   || || || |||  |||||| ||||||||| |||||||||||| | | ||  ||    
T  97288 catactttgaacatgcaattccaccaacaacaattcaattatcaccaattttatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatcttaacaacta 97189  T
Q  121 tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttacaa-aagtgattatgat-gaacactaacccccttaccttaa 216  Q
    ||| |||||||||| | ||  ||||||| |||| | |||||||| |||||||||| |||||  || |||||||||| |||  |||||||||||||||| |    
T  97188 tgaacaattaatcact-cactcaattaaacactaaatcatacaa-taattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttca 97091  T
Q  217 ttatcaccaactattagctcaagcttcacttt 248  Q
    ||| || ||| |  |||| |||||||||||||    
T  97090 ttagca-caattcctagcccaagcttcacttt 97060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 21665 - 21862
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21665 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaatccaattatc-ataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatca 21763  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
      ||||| ||||||||||||||  ||||||||||  || |||||| |||||||| |||||| ||| | |||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  21764 tttatgaacaattaatcaattcgcccaattaagcctttttcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattataacccccttacctta 21862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 31364 - 31561
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  31364 ttctcatactttgaacatttaattcaactaacaacaatccaattatc-ataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagatcatgaatttcatca 31462  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
      ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  31463 tttatgaacaattaatcaattcgcccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta 31561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 106 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 47554 - 47445
Alignment:
Q  106 gaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacc 204  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | |||||||||||||  ||||||    
T  47554 gaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcgcccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacc 47456  T
Q  205 cccttacctta 215  Q
    |||||||||||    
T  47455 cccttacctta 47445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 154
Target Start/End: Original strand, 5093 - 5231
Alignment:
Q  16 cttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatc 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  5093 cttctcatactgtgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatc 5192  T
Q  116 acatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt 154  Q
    |  ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  5193 atttatgaacaattaattaattcacccaattaagcactt 5231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 670 - 471
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  670 ttctcatactttgaacatgtaattcaattaacaacaattctattatccataatttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatca 571  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatta-caa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacct 213  Q
      ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||| || ||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  570 tttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaatagcaataaatga-tatgatgaattctaacccccttacct 473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 39 - 215
Target Start/End: Original strand, 40834 - 41010
Alignment:
Q  39 ttcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattc 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  40834 ttcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagtacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattc 40933  T
Q  139 atccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    | |||||||||||||  |||||| ||||||| |||||| ||| || |||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  40934 acccaattaagcactattcatac-aataattaaaaattgcaataaatgattatgatgaattataacccccttacctta 41010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 39 - 219
Target Start/End: Original strand, 46341 - 46521
Alignment:
Q  39 ttcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattc 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  46341 ttcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcaaaattagagtacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattc 46440  T
Q  139 atccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaatta 219  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| || |||||||||||||   |||||| |||||||||||||    
T  46441 acccaattaagcacttttcatac-aataattaaaaattgcaataaatgattatgatgaattataaccctcttaccttaatta 46521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 184 - 263
Target Start/End: Original strand, 80188 - 80267
Alignment:
Q  184 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgcttct 263  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  80188 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgattct 80267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 174
Target Start/End: Original strand, 6095 - 6251
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  6095 ttctcatactttgaacatgaaattctaccaacaacaatccaattatccataacttcatacattcaaacatgtcgtcataattagagcacgaatttcatca 6194  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa 174  Q
      ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  6195 tttatgaacaattaatcaattcaccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaa 6251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 184 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 383 - 304
Alignment:
Q  184 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgcttct 263  Q
    |||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  383 tgattatgataaagaataaccccgttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgattct 304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 76941 - 76699
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||| | || ||||| |||  |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  76941 ttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcatgaatttcatca 76842  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatga-tgaacactaacccccttac 211  Q
      ||||| |||||| |||||| |  |||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||  ||| ||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  76841 tctatgaacaattactcaatt-actcaattaagtacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttac 76744  T
Q  212 cttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctccta 256  Q
    ||||||||||| ||| |  |||| ||||||||||||| |||||||    
T  76743 cttaattatcagcaattcctagcccaagcttcactttagctccta 76699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 111
Target Start/End: Original strand, 146757 - 146848
Alignment:
Q  20 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaattt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  146757 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacagttcaattatacataacttcatacatctaaacatgtcatcataattaaagcatgaattt 146848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 151
Target Start/End: Original strand, 85690 - 85818
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata 120  Q
    |||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||||||   || ||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||  ||    
T  85690 catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcat-taaacatatcatcataattagagcacgaatttcaacaacta 85788  T
Q  121 tgaccaattaatcaattcatccaattaagca 151  Q
    ||| |||||||||| || || ||||||||||    
T  85789 tgaacaattaatcactt-attcaattaagca 85818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 53498 - 53703
Alignment:
Q  16 cttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatc 115  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||   ||  |||| |||  |||||| ||||||| | ||||||| |||||  | |    
T  53498 cttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatatcatgcattcaaacatatcatcattattagagcatgaattctaac 53597  T
Q  116 acatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttac 211  Q
    |  ||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||  || ||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  53598 aactatgaacaattaatcactt-actcaattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttac 53695  T
Q  212 cttaatta 219  Q
    ||||||||    
T  53696 cttaatta 53703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 197343 - 197107
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata 120  Q
    |||||||||||| || ||||  || |||||||||||||||||| | || |||||||||  |||||| ||||||||| |||||| |||| |||| ||  ||    
T  197343 catactttgaacttgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaatttcatacattcaaacatatcatcataattagagcccgaaattcaacatcta 197244  T
Q  121 tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaat 217  Q
     || |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||  |||  |||||||||  || ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  197243 agaacaattaatcactt-atccaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaat 197145  T
Q  218 tatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctccta 256  Q
    || || ||| |  |||| ||||||||||||| |||||||    
T  197144 tagca-caattcctagcccaagcttcactttagctccta 197107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 184 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 5808 - 5735
Alignment:
Q  184 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctat 257  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5808 tgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 5735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 184 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 6014 - 5941
Alignment:
Q  184 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctat 257  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6014 tgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 5941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 7958 - 8157
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||  |||||||||| |||  ||||||  |||||||| | |||||||||||  | ||    
T  7958 ttctcatactttgaacatgaaatttctctaacaacaattcaattataaataacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaaca 8057  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacct 213  Q
     |||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| || |||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  8058 aatatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aataattgtaaaattgcaataaatgattacgatgaattctaacccccttacct 8155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 33819 - 33622
Alignment:
Q  20 tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacat 119  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||  |||||||||||||||| | ||||| |||||  | ||  |    
T  33819 tcatactttaaacatgaaattccactaacaacaattcaattatccacaacttcaagcattcaaacatgtcatcataattggagcatgaattctaacaatt 33720  T
Q  120 atgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||| ||||||||||||| |  |||||||||| ||| |||||| || |||||||| ||||   |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  33719 atgaacaattaatcaatt-actcaattaagcatttattcatac-aacaattgaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta 33622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 35631 - 35873
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||| ||||||| | | |||||||||||  |  |    
T  35631 ttctcatactttgaacatgaaatttcactaacaacaattcaattatcaataacttcatgcattcaaacatatcatcatgattggagcacgaattataaga 35730  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatga-tgaacactaacccccttac 211  Q
      | ||| |||||||||  || |  ||||||||||| || |||||| || ||||| |||||||||  ||| ||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  35731 actttgaacaattaatc-ttttactcaattaagcacctattcatac-aacaattgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttac 35828  T
Q  212 cttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctccta 256  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| |||||||    
T  35829 cttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 35873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 7119 - 6885
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||   ||    
T  7119 ttctcatactttgaacattaaatttcactaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttgaca 7020  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattaca--aaagtgattatga-tgaacactaacccccttacc 212  Q
      ||||| |||  |||| ||| |  |||||||||||||| ||||||||  | |  |||||||||  ||| ||||||| | ||||  ||||||||||||||    
T  7019 attatgaacaacaaatc-atttactcaattaagcacttattcatacaacgattgaaaaattacattaaaatgattataattgaattctaacccccttacc 6921  T
Q  213 ttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttt 248  Q
    |||||||||||||| |  |||| |||||||||||||    
T  6920 ttaattatcaccaattcctagcccaagcttcacttt 6885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 3472 - 3671
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||  ||||   |||||||||||||||||||  |||||||||| |||  ||||||  |||||||| | |||||||||||  | ||    
T  3472 ttctcatactttgaacattaaatttctctaacaacaattcaattataaataacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaaca 3571  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacct 213  Q
      ||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| || |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  3572 attatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aataattgtaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacct 3669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 184 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 31211 - 31132
Alignment:
Q  184 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgcttct 263  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  31211 tgattgtgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 31132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Original strand, 8167 - 8363
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata 120  Q
    ||||||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||   || ||||| |||  |||||| ||||||||  |||||||||||||| | ||  ||    
T  8167 catactttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatcta 8266  T
Q  121 tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    ||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8267 tgaacaattaatc-atttatccaattaatcacttattcatac-aataattgaaaaattacattaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta 8363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 184 - 263
Target Start/End: Original strand, 30418 - 30497
Alignment:
Q  184 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgcttct 263  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  30418 tgattatgatgaaaaataacccccttaccttaattatcaccaattattaactcaagcttcacttttgcttctatgattct 30497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 184 - 263
Target Start/End: Original strand, 41633 - 41712
Alignment:
Q  184 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgcttct 263  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  41633 tgattgtgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 41712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 1611 - 1440
Alignment:
Q  46 aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaat 145  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||| |||  |||||| ||||||||  |||||||||||||| | ||  ||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  1611 aacaacaattcaattatcactaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatc-atttatccaat 1513  T
Q  146 taagcactta-tcatacaaataattgaaaatt---acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||   || ||| | |||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  1512 taagcacttattcatac-aataattgaaaatttacactaaaataattatgatgaattctaaaccccttacctta 1440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 8756 - 8585
Alignment:
Q  46 aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaat 145  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||| |||  |||||| ||||||||  |||||||||||||| | ||  ||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  8756 aacaacaattcaattatcactaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatc-atttatccaat 8658  T
Q  146 taagcactta-tcatacaaataattgaaaatt---acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||   || ||| | |||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  8657 taagcacttattcatac-aataattgaaaatttacactaaaataattatgatgaattctaaaccccttacctta 8585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 2410 - 2211
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||| | |||||||| |||  ||||||  |||||||| | |||||||||||  |  |    
T  2410 ttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaata 2311  T
Q  117 catatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt--acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacct 213  Q
      |||||  |||||||||||| |  |||||||||||||| |||||| || |||| ||||||  || ||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  2310 attatgattaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattaaaaattgcactaaaatgattatgatgaattctaacccccttacct 2213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 1438 - 1242
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata 120  Q
    |||||||||| |||| ||||  || ||||||||| ||||||||   || || || |||  |||||| ||||||||  |||||||||||||| | ||  ||    
T  1438 catactttgaccatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaattttatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatcta 1339  T
Q  121 tgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaa-ttaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    ||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||  ||  |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1338 tgaacaattaatcattt-atccaattaagcacttattcatacaa-taattgaaaaattacactaatatgattatgatgaattctaacccccttacctta 1242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 9693 - 9497
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata 120  Q
    |||||||||| |||| ||||  || ||||||||| ||||||||   || || || |||  |||||| ||||||||  |||||||||||||| | ||  ||    
T  9693 catactttgaccatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaattttatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatcta 9594  T
Q  121 tgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaa-ttaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    ||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||  ||  |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  9593 tgaacaattaatcattt-atccaattaagcacttattcatacaa-taattgaaaaattacactaatatgattatgatgaattctaacccccttacctta 9497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 31177 - 31414
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata 120  Q
    |||||| |||||||| ||||  || ||||||||| ||||||||   || ||||| |||  ||| || ||||||||| |||||||||||||  | ||  ||    
T  31177 catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaatttcatgcattcaaatatatcatcataattagagcacgaattctaacaacta 31276  T
Q  121 tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttacaa-aagtgattatgat-gaacactaacccccttaccttaa 216  Q
    ||| |||||||||| ||  || ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||  || |||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  31277 tgaacaattaatcacttactc-aattaagcacttaatcatacaa-taattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaa 31374  T
Q  217 ttatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctccta 256  Q
    ||| ||| || |  |||| ||||||||||||| |||||||    
T  31375 ttagcacaaattcctagcccaagcttcactttagctccta 31414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 69614 - 69843
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata 120  Q
    |||||||| |||||| ||||  ||  ||||||||||||||||    || ||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||  ||    
T  69614 catactttaaacatgcaatttcacctacaacaattcaattataaccaatttcatgcatttaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaacta 69713  T
Q  121 tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaa 216  Q
    ||| |||||||||| ||  | ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||  || ||||||||| ||||  |||||||||||| |||||    
T  69714 tgaacaattaatcactttct-caattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttatcttaa 69811  T
Q  217 ttatcaccaactattagctcaagcttcacttt 248  Q
    ||| ||| || |  |||| |||||||||||||    
T  69812 ttagcacaaattcctagcccaagcttcacttt 69843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 110
Target Start/End: Original strand, 6814 - 6907
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||| | |||||||| |||  |||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  6814 ttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattatagcacgaatt 6907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 199 - 256
Target Start/End: Original strand, 6999 - 7056
Alignment:
Q  199 ctaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctccta 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||| |||||||    
T  6999 ctaacccccttaccataattatcaccaattcctagcccaaccttcactttagctccta 7056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 184 - 263
Target Start/End: Original strand, 42678 - 42754
Alignment:
Q  184 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgcttct 263  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||   |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  42678 tgattatgataaaaactaacccccttacctt---tatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 42754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 46 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 89929 - 89760
Alignment:
Q  46 aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaat 145  Q
    ||||||||||||| ||||   || ||||| |||  |||||| ||||||||  | |||||||||||| | ||  ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  89929 aacaacaattcaagtatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttaa-catctatgaacaattaatcaatt-atccaat 89832  T
Q  146 taagcacttat-catacaaataattgaaaattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||  ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  89831 taatcacttattcatacaa-taattgaaaattacactaaaaagattatgatgaattctaacccccttacctta 89760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 134
Target Start/End: Original strand, 2683 - 2795
Alignment:
Q  22 atactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatat 121  Q
    |||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||   || ||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||  |||    
T  2683 atactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatccaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactat 2782  T
Q  122 gaccaattaatca 134  Q
    || ||||||||||    
T  2783 gaacaattaatca 2795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 215
Target Start/End: Original strand, 10845 - 11014
Alignment:
Q  47 acaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaatt 146  Q
    ||||||| |||||||||   || ||||| |||  |||||| |||||||| ||||||||||||||  | ||  ||||| ||||||||  ||| ||||||||    
T  10845 acaacaactcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagatagagcacgaattataacatctatgaacaattaat-tatttatccaatt 10943  T
Q  147 aagcactta-tcatacaaataattgaaaat--tacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    || |||||| |||||| |||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10944 aatcacttattcatac-aataattgaaaattatactaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta 11014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 93867 - 93728
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttc-atc 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||| | |||||||| |||  | |||| ||||||||| | ||||||||||||| | |    
T  93867 ttctcatactttgaacatgaaatttctctaacaaccattcaattatcaaaaacttcatgcatacatacatatcatcataattggagcacgaatttctaac 93768  T
Q  116 acatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttat 156  Q
    |  ||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  93767 agttatgaacaattaat-aatttacccaattaagcacttat 93728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 104713 - 104477
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata 120  Q
    |||||||||||| || || |  || ||||||||||||||||||   || || || |||  |||||| ||||||||  ||||||| |||||| | ||  ||    
T  104713 catactttgaacctgcaaattcaccaacaacaattcaattatcatcaatttaatgcatacaaacatatcatcatagttagagcatgaattttaacatcta 104614  T
Q  121 tgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaa-ttacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaat 217  Q
    ||| |||||||||| ||  || ||||||||| |||| |||||||  ||||||||| |||||  || |||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  104613 tgaacaattaatcacttactc-aattaagcaattattcatacaac-aattgaaaaattacactaaatgattatgatgaattctaacccacttaccttaat 104516  T
Q  218 tatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctccta 256  Q
    || ||| || | ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  104515 tagcacaaattcttagcccaagcttcactttagctccta 104477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 43884 - 43651
Alignment:
Q  25 ctttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgac 124  Q
    ||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||   || ||||| |||  ||||||  |||||||| |||||||  ||||| | ||  |||||     
T  43884 ctttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatagcatcataattagagcattaattttaacaactatgaa 43785  T
Q  125 caattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttacaa-aagtgattatgat-gaacactaacccccttaccttaattat 220  Q
    |||||||||| ||  || ||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||  || |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||     
T  43784 caattaatcacttactc-aattaagcacttaatcatacaac-aattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattag 43687  T
Q  221 caccaactattagctcaagcttcacttttgctccta 256  Q
    ||| || |  |||| ||||||||||||| |||||||    
T  43686 cacaaattcctagcccaagcttcactttagctccta 43651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 23762 - 23526
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata 120  Q
    |||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||||||| | || |||||  ||  |||||| ||| ||||| || ||||||||||||| ||  ||    
T  23762 catactatgaacatgcaatttctccaacaacaattcaattatcaaaaatttcatgtatacaaacatatcaccataattaaagcacgaatttcaacaacta 23663  T
Q  121 tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaat 217  Q
    ||| ||| ||||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||| ||||  ||||||||||  | | ||||||| ||||  |||||||||||| ||||||    
T  23662 tgaacaaataatcaatt-attcaactaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaatcattatgattgaattctaacccccttatcttaat 23564  T
Q  218 tatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctccta 256  Q
    || ||  || |  |||| ||||||||||||| |||||||    
T  23563 tagca-aaaatcctagcccaagcttcactttagctccta 23526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 1435 - 1371
Alignment:
Q  184 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttt 248  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  1435 tgattatgatgaattctaacccccttacctcaattatcaccaattcctagctcaagcttcacttt 1371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 109
Target Start/End: Original strand, 28689 - 28781
Alignment:
Q  17 ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat 109  Q
    |||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||| ||||| | || ||||| |||  |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  28689 ttctcatactttgaacatataatttcaccaacaacaattcagttatcaacaagttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaat 28781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22516 - 22323
Alignment:
Q  24 actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga 123  Q
    |||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||   || ||||| |||  |||||| | ||| ||  |||||||||||||| | ||  |||||    
T  22516 actttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatattatcctagttagagcacgaattttaacatctatga 22417  T
Q  124 ccaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatta---caaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
     |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||| ||   | ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22416 acaatcaatcaat-catccaattaatcacttattcatacaa-taattaaaaaataacactaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta 22323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 119 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 70298 - 70201
Alignment:
Q  119 tatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatt--acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 215  Q
    ||||| ||||||||||||| || || |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  70298 tatgaacaattaatcaatt-atacatttaatcacttattcatacaa-taattgaaaatttcacaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta 70201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 1052 - 855
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata 120  Q
    |||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||||||   || |||||  ||  |||||| ||||||||| |||| ||||||||| | ||  ||    
T  1052 catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataattagaacacgaattttaacaacta 953  T
Q  121 tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattatga-tgaacactaacccccttacctta 215  Q
    ||| ||| |||||| || ||  |||||||||||| ||||| ||| ||||  ||||||||||  || ||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  952 tgaacaaataatcactt-atttaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatgattgaaatctaacccccttacctta 855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1295 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1295
Description:

Target: scaffold1295; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 256
Target Start/End: Original strand, 442 - 499
Alignment:
Q  199 ctaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctccta 256  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||    
T  442 ctaacccccttacctcagttatcaccaattcctagctcaagcttcactttagctccta 499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 219
Target Start/End: Original strand, 27654 - 27856
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata 120  Q
    |||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||||||   || |||||  ||  |||||| |||||||||  ||||||| ||||||| ||  ||    
T  27654 catactatgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataacaagagcacaaatttcaacaacta 27753  T
Q  121 tga-ccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattatga-tgaacactaacccccttacctta 215  Q
    ||| | || ||||| ||| || ||||||||||||| | ||| ||| ||||  ||||||||||  || ||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  27754 tgagcaaaataatc-atttattcaattaagcacttaagcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatgattgaaatctaacccccttacctta 27852  T
Q  216 atta 219  Q
    ||||    
T  27853 atta 27856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1272 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:

Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 451 - 689
Alignment:
Q  21 catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata 120  Q
    ||||||||||||||| ||||  || |||||||||  ||||||| | |||||||| |||  ||||||  |||||||| || || |||||||  | ||  |     
T  451 catactttgaacatgaaatttcaccaacaacaatataattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattataggacgaattataacaact- 549  T
Q  121 tgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatt---ac-aaaagtgattatgatg-aacactaacccccttacctt 214  Q
    ||| |||||||||| ||  || |||||||||||||| |||||||  |||||||||||   || |||| ||||||||||  ||  |||||||||||||| |    
T  550 tgaacaattaatcatttactc-aattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgattcaattctaacccccttaccat 647  T
Q  215 aattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctccta 256  Q
    ||||||||| || |  |||| ||||||||||||| |||||||    
T  648 aattatcactaattcctagcccaagcttcactttagctccta 689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University