View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6249_low_5 (Length: 346)

Name: NF6249_low_5
Description: NF6249
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6249_low_5
NF6249_low_5
[»] chr7 (83 HSPs)
chr7 (160-338)||(7520166-7520345)
chr7 (160-338)||(39721145-39721324)
chr7 (160-338)||(15083175-15083354)
chr7 (160-338)||(2833432-2833610)
chr7 (162-338)||(10607275-10607449)
chr7 (162-338)||(16582371-16582545)
chr7 (170-338)||(31675-31843)
chr7 (170-338)||(12706083-12706251)
chr7 (170-338)||(12713490-12713658)
chr7 (170-338)||(12722148-12722316)
chr7 (170-338)||(16908470-16908638)
chr7 (160-338)||(2531283-2531460)
chr7 (170-338)||(12717237-12717405)
chr7 (170-338)||(18277944-18278112)
chr7 (170-338)||(18281908-18282076)
chr7 (177-338)||(9752477-9752636)
chr7 (200-338)||(13891580-13891718)
chr7 (164-297)||(20486733-20486864)
chr7 (197-338)||(39268301-39268442)
chr7 (162-301)||(25928325-25928463)
chr7 (200-338)||(11660232-11660370)
chr7 (204-338)||(13891963-13892097)
chr7 (200-338)||(14420737-14420875)
chr7 (200-338)||(18871247-18871385)
chr7 (191-328)||(26291116-26291254)
chr7 (200-338)||(18606285-18606426)
chr7 (202-338)||(18424185-18424321)
chr7 (160-314)||(45171462-45171606)
chr7 (170-301)||(1859983-1860113)
chr7 (170-301)||(13919374-13919504)
chr7 (200-338)||(838123-838262)
chr7 (200-338)||(1203303-1203442)
chr7 (200-338)||(16109965-16110104)
chr7 (200-338)||(10897887-10898025)
chr7 (200-338)||(16004954-16005092)
chr7 (200-338)||(834035-834174)
chr7 (200-338)||(1199215-1199354)
chr7 (200-338)||(146450-146588)
chr7 (209-338)||(41283595-41283724)
chr7 (170-338)||(72343-72500)
chr7 (170-338)||(76452-76609)
chr7 (171-266)||(18301373-18301466)
chr7 (210-333)||(15213003-15213126)
chr7 (245-338)||(15166200-15166293)
chr7 (209-288)||(16185524-16185603)
chr7 (262-338)||(9752644-9752720)
chr7 (245-328)||(11302267-11302350)
chr7 (18-69)||(2531141-2531192)
chr7 (18-69)||(2833331-2833382)
chr7 (18-69)||(7520024-7520075)
chr7 (209-267)||(11394878-11394936)
chr7 (217-297)||(23666460-23666539)
chr7 (203-260)||(455885-455942)
chr7 (203-260)||(11393817-11393874)
chr7 (203-260)||(11972051-11972108)
chr7 (203-260)||(14949671-14949728)
chr7 (203-260)||(15377263-15377320)
chr7 (203-260)||(16232075-16232132)
chr7 (203-260)||(16409623-16409680)
chr7 (203-260)||(20385672-20385729)
chr7 (203-260)||(21190145-21190202)
chr7 (203-260)||(24701810-24701867)
chr7 (203-260)||(24704260-24704317)
chr7 (203-260)||(26356500-26356557)
chr7 (203-260)||(26358952-26359009)
chr7 (203-260)||(27216430-27216487)
chr7 (203-260)||(32125054-32125111)
chr7 (203-260)||(41522492-41522549)
chr7 (203-260)||(41524954-41525011)
chr7 (262-301)||(9752728-9752767)
chr7 (18-69)||(45171322-45171371)
chr7 (18-67)||(8467852-8467901)
chr7 (18-67)||(14270758-14270807)
chr7 (18-67)||(17231847-17231896)
chr7 (18-67)||(17231912-17231961)
chr7 (18-67)||(17231977-17232026)
chr7 (18-67)||(17232042-17232091)
chr7 (23-67)||(16582653-16582697)
chr7 (23-65)||(10502057-10502099)
chr7 (18-67)||(14270693-14270742)
chr7 (200-237)||(29795214-29795251)
chr7 (200-237)||(29799033-29799070)
chr7 (23-67)||(1859847-1859891)
[»] chr4 (52 HSPs)
chr4 (160-338)||(20158398-20158576)
chr4 (160-338)||(20163849-20164027)
chr4 (162-338)||(17052400-17052574)
chr4 (160-338)||(20161074-20161252)
chr4 (177-338)||(22634896-22635055)
chr4 (170-338)||(9555019-9555187)
chr4 (170-338)||(14758952-14759120)
chr4 (170-338)||(14955720-14955888)
chr4 (170-338)||(17807001-17807172)
chr4 (162-323)||(12422908-12423067)
chr4 (177-338)||(5758423-5758584)
chr4 (170-338)||(4562734-4562902)
chr4 (170-338)||(25688392-25688560)
chr4 (170-338)||(33740786-33740954)
chr4 (164-288)||(10711825-10711949)
chr4 (164-288)||(10925595-10925719)
chr4 (200-338)||(24048375-24048513)
chr4 (170-338)||(23996929-23997094)
chr4 (197-338)||(13813820-13813961)
chr4 (197-338)||(13818308-13818449)
chr4 (170-338)||(12486221-12486386)
chr4 (200-338)||(15533169-15533307)
chr4 (202-338)||(15223496-15223632)
chr4 (200-338)||(30145733-30145872)
chr4 (171-301)||(631711-631839)
chr4 (200-338)||(18211554-18211692)
chr4 (200-338)||(36036902-36037040)
chr4 (200-338)||(49549073-49549212)
chr4 (170-288)||(27532752-27532868)
chr4 (209-338)||(28384801-28384930)
chr4 (203-338)||(38106897-38107031)
chr4 (262-338)||(13818457-13818533)
chr4 (262-338)||(24048521-24048597)
chr4 (245-301)||(14047305-14047361)
chr4 (262-301)||(22635063-22635102)
chr4 (203-260)||(1838053-1838110)
chr4 (203-260)||(12033681-12033738)
chr4 (203-260)||(14739599-14739656)
chr4 (203-260)||(15118902-15118959)
chr4 (24-69)||(20158262-20158307)
chr4 (24-69)||(20160938-20160983)
chr4 (203-260)||(29267218-29267275)
chr4 (203-260)||(44614843-44614900)
chr4 (203-260)||(50222889-50222946)
chr4 (18-67)||(15481937-15481986)
chr4 (18-67)||(15482002-15482051)
chr4 (203-260)||(18239969-18240026)
chr4 (18-66)||(19856996-19857044)
chr4 (18-67)||(361537-361586)
chr4 (229-266)||(37839211-37839248)
chr4 (229-266)||(42597940-42597977)
chr4 (37-69)||(20163726-20163758)
[»] chr3 (84 HSPs)
chr3 (160-338)||(5219797-5219975)
chr3 (160-338)||(11301616-11301794)
chr3 (162-338)||(16795453-16795627)
chr3 (161-328)||(11853666-11853833)
chr3 (160-314)||(14667562-14667717)
chr3 (170-338)||(12853326-12853492)
chr3 (160-314)||(14664398-14664553)
chr3 (170-338)||(7108188-7108356)
chr3 (170-338)||(7112123-7112291)
chr3 (170-338)||(11068563-11068731)
chr3 (170-338)||(22320079-22320247)
chr3 (170-338)||(22335134-22335302)
chr3 (170-338)||(55021326-55021494)
chr3 (170-338)||(11167054-11167222)
chr3 (170-338)||(28948411-28948579)
chr3 (170-338)||(14497898-14498065)
chr3 (170-338)||(15616127-15616295)
chr3 (203-338)||(10834935-10835070)
chr3 (200-338)||(13435768-13435906)
chr3 (191-338)||(30064334-30064482)
chr3 (200-338)||(14764786-14764924)
chr3 (162-297)||(14670017-14670147)
chr3 (200-338)||(3801920-3802058)
chr3 (200-338)||(8928858-8928996)
chr3 (191-328)||(18933337-18933475)
chr3 (200-338)||(54519547-54519685)
chr3 (170-301)||(15463865-15463995)
chr3 (202-338)||(19774148-19774284)
chr3 (201-338)||(18899400-18899540)
chr3 (200-338)||(9532208-9532346)
chr3 (200-338)||(23372534-23372672)
chr3 (200-338)||(29545929-29546067)
chr3 (200-338)||(51299483-51299621)
chr3 (160-314)||(15963470-15963614)
chr3 (160-314)||(15967394-15967538)
chr3 (160-314)||(15971318-15971462)
chr3 (203-338)||(16751895-16752030)
chr3 (160-260)||(37440631-37440731)
chr3 (162-297)||(14681541-14681669)
chr3 (200-338)||(20249840-20249978)
chr3 (171-288)||(4590124-4590239)
chr3 (209-338)||(41084-41213)
chr3 (170-338)||(4108760-4108918)
chr3 (170-338)||(4112609-4112767)
chr3 (194-338)||(12337206-12337348)
chr3 (170-288)||(17318472-17318588)
chr3 (170-288)||(14068025-14068141)
chr3 (210-333)||(11912382-11912505)
chr3 (200-292)||(12304170-12304262)
chr3 (200-338)||(38312848-38312985)
chr3 (209-288)||(8491732-8491811)
chr3 (200-301)||(23173284-23173386)
chr3 (209-298)||(16326041-16326130)
chr3 (210-333)||(16840204-16840327)
chr3 (18-69)||(5220066-5220117)
chr3 (18-69)||(11301474-11301525)
chr3 (18-69)||(14664647-14664698)
chr3 (18-69)||(14667811-14667862)
chr3 (209-267)||(5841187-5841245)
chr3 (209-266)||(2249216-2249273)
chr3 (209-266)||(45220962-45221019)
chr3 (203-260)||(7781858-7781915)
chr3 (203-260)||(9708156-9708213)
chr3 (203-260)||(13152325-13152382)
chr3 (203-260)||(16454822-16454879)
chr3 (203-260)||(17462733-17462790)
chr3 (203-260)||(34158881-34158938)
chr3 (203-260)||(45607441-45607498)
chr3 (203-260)||(55476077-55476134)
chr3 (203-260)||(55500506-55500563)
chr3 (18-69)||(15963705-15963754)
chr3 (18-69)||(15967629-15967678)
chr3 (18-69)||(15971553-15971602)
chr3 (288-338)||(17348806-17348856)
chr3 (203-260)||(13154790-13154847)
chr3 (203-260)||(15555371-15555428)
chr3 (256-324)||(15555602-15555670)
chr3 (18-69)||(12338766-12338815)
chr3 (214-266)||(14648275-14648327)
chr3 (203-238)||(10248256-10248291)
chr3 (34-69)||(11853885-11853920)
chr3 (20-61)||(21618033-21618074)
chr3 (20-61)||(36166139-36166180)
chr3 (23-67)||(15464153-15464197)
[»] scaffold1852 (2 HSPs)
scaffold1852 (160-338)||(771-949)
scaffold1852 (18-69)||(669-720)
[»] chr1 (32 HSPs)
chr1 (160-338)||(33795983-33796161)
chr1 (162-338)||(22132053-22132227)
chr1 (170-338)||(1009212-1009380)
chr1 (170-338)||(1926756-1926924)
chr1 (170-338)||(16376776-16376944)
chr1 (170-338)||(20925770-20925938)
chr1 (170-338)||(52634218-52634386)
chr1 (162-301)||(41801233-41801370)
chr1 (191-328)||(20230120-20230258)
chr1 (202-338)||(41389657-41389793)
chr1 (200-338)||(16370875-16371013)
chr1 (202-338)||(39245163-39245297)
chr1 (202-338)||(39248718-39248852)
chr1 (170-288)||(21406253-21406369)
chr1 (215-338)||(32649017-32649140)
chr1 (209-338)||(29533837-29533967)
chr1 (245-338)||(20439188-20439281)
chr1 (209-285)||(11809949-11810025)
chr1 (209-266)||(11945016-11945073)
chr1 (203-260)||(13988465-13988522)
chr1 (203-260)||(21475629-21475686)
chr1 (203-260)||(21923841-21923898)
chr1 (203-260)||(23594277-23594334)
chr1 (209-266)||(43630992-43631049)
chr1 (18-67)||(21740358-21740407)
chr1 (18-67)||(21740423-21740472)
chr1 (18-67)||(41306246-41306295)
chr1 (203-260)||(41372669-41372726)
chr1 (214-266)||(20032180-20032232)
chr1 (18-64)||(20315600-20315646)
chr1 (18-67)||(21740488-21740537)
chr1 (23-67)||(41306316-41306360)
[»] scaffold0410 (2 HSPs)
scaffold0410 (160-328)||(14804-14972)
scaffold0410 (22-69)||(15063-15110)
[»] chr8 (47 HSPs)
chr8 (160-314)||(14399043-14399198)
chr8 (160-338)||(21409850-21410029)
chr8 (160-338)||(21804342-21804521)
chr8 (170-338)||(21974144-21974312)
chr8 (162-323)||(44385788-44385947)
chr8 (162-338)||(23427776-23427950)
chr8 (170-338)||(21978254-21978422)
chr8 (170-338)||(43250152-43250320)
chr8 (162-301)||(23913252-23913389)
chr8 (160-314)||(18864066-18864210)
chr8 (160-314)||(30941526-30941670)
chr8 (200-338)||(27942675-27942814)
chr8 (170-288)||(21386159-21386275)
chr8 (170-338)||(21829432-21829589)
chr8 (209-338)||(11774246-11774375)
chr8 (170-338)||(22110551-22110708)
chr8 (209-338)||(8414976-8415105)
chr8 (210-301)||(21328553-21328644)
chr8 (229-338)||(363218-363327)
chr8 (209-288)||(21967992-21968071)
chr8 (209-288)||(21980832-21980911)
chr8 (209-288)||(21985815-21985894)
chr8 (209-288)||(22000778-22000857)
chr8 (245-338)||(8729645-8729738)
chr8 (210-333)||(42560882-42561005)
chr8 (209-288)||(22009196-22009275)
chr8 (209-266)||(44494223-44494280)
chr8 (203-260)||(1483957-1484014)
chr8 (203-260)||(4482867-4482924)
chr8 (203-260)||(4542922-4542979)
chr8 (203-260)||(5853841-5853898)
chr8 (203-260)||(14823330-14823387)
chr8 (203-260)||(18678574-18678631)
chr8 (203-260)||(18717763-18717820)
chr8 (203-260)||(20402782-20402839)
chr8 (203-260)||(22001316-22001373)
chr8 (209-250)||(34950124-34950165)
chr8 (214-266)||(11252087-11252138)
chr8 (18-69)||(14398902-14398952)
chr8 (18-69)||(18863926-18863975)
chr8 (18-69)||(30941386-30941435)
chr8 (18-67)||(1323736-1323785)
chr8 (18-67)||(38550644-38550693)
chr8 (18-67)||(38550709-38550758)
chr8 (18-67)||(13428701-13428750)
chr8 (200-237)||(44475750-44475787)
chr8 (200-237)||(44479012-44479049)
[»] chr5 (48 HSPs)
chr5 (162-325)||(18354760-18354923)
chr5 (162-338)||(22120546-22120720)
chr5 (168-338)||(24768521-24768691)
chr5 (170-338)||(20294464-20294632)
chr5 (170-328)||(19474133-19474291)
chr5 (170-338)||(15238080-15238246)
chr5 (162-338)||(22108404-22108577)
chr5 (170-338)||(20912215-20912381)
chr5 (200-338)||(38146409-38146547)
chr5 (200-339)||(28372072-28372211)
chr5 (200-338)||(37599999-37600137)
chr5 (160-314)||(11219528-11219672)
chr5 (200-338)||(19510412-19510550)
chr5 (200-338)||(23113393-23113531)
chr5 (202-338)||(10751767-10751903)
chr5 (160-314)||(11227936-11228080)
chr5 (200-338)||(22338962-22339100)
chr5 (160-314)||(11224114-11224258)
chr5 (200-338)||(22335432-22335570)
chr5 (200-338)||(41878642-41878780)
chr5 (160-314)||(11229926-11230070)
chr5 (170-328)||(40727362-40727517)
chr5 (209-338)||(33473931-33474060)
chr5 (169-314)||(11226130-11226265)
chr5 (210-333)||(36459503-36459626)
chr5 (200-297)||(22749152-22749249)
chr5 (214-297)||(9774932-9775014)
chr5 (18-69)||(24768327-24768378)
chr5 (209-266)||(19075911-19075968)
chr5 (200-258)||(22335577-22335636)
chr5 (200-258)||(22339107-22339166)
chr5 (200-258)||(28372006-28372065)
chr5 (203-260)||(265311-265368)
chr5 (203-260)||(10733481-10733538)
chr5 (203-260)||(20908567-20908624)
chr5 (203-260)||(29345536-29345593)
chr5 (203-260)||(29348017-29348074)
chr5 (203-260)||(29350490-29350547)
chr5 (203-260)||(31143843-31143900)
chr5 (203-260)||(42245906-42245963)
chr5 (18-69)||(11219763-11219812)
chr5 (18-69)||(11224349-11224398)
chr5 (18-69)||(11226365-11226414)
chr5 (18-69)||(11228171-11228220)
chr5 (18-69)||(11230161-11230210)
chr5 (209-266)||(31253210-31253267)
chr5 (203-260)||(39362970-39363027)
chr5 (214-266)||(43243764-43243816)
[»] chr6 (55 HSPs)
chr6 (160-338)||(27555490-27555667)
chr6 (160-338)||(22075337-22075519)
chr6 (170-338)||(8242362-8242530)
chr6 (170-338)||(11565351-11565519)
chr6 (170-338)||(12620294-12620462)
chr6 (177-338)||(11716908-11717069)
chr6 (170-338)||(22861705-22861873)
chr6 (170-338)||(23988253-23988421)
chr6 (162-301)||(2076273-2076410)
chr6 (191-338)||(23400627-23400775)
chr6 (160-314)||(19869160-19869304)
chr6 (160-314)||(23393614-23393758)
chr6 (160-314)||(23413522-23413666)
chr6 (202-338)||(31479455-31479591)
chr6 (200-338)||(12941171-12941309)
chr6 (200-338)||(23537931-23538069)
chr6 (200-338)||(27222782-27222920)
chr6 (170-338)||(14470831-14470997)
chr6 (200-338)||(28290885-28291023)
chr6 (191-288)||(18918562-18918659)
chr6 (215-338)||(4475745-4475868)
chr6 (170-338)||(22947617-22947774)
chr6 (170-338)||(22951573-22951730)
chr6 (170-338)||(23870061-23870218)
chr6 (170-338)||(23874017-23874174)
chr6 (209-338)||(23955319-23955448)
chr6 (191-288)||(18953465-18953562)
chr6 (222-338)||(27416540-27416656)
chr6 (202-312)||(16622812-16622921)
chr6 (170-338)||(16758665-16758822)
chr6 (210-333)||(34297773-34297896)
chr6 (210-301)||(25737879-25737970)
chr6 (224-333)||(1254114-1254223)
chr6 (18-69)||(27555758-27555809)
chr6 (18-69)||(22075195-22075246)
chr6 (209-267)||(28707880-28707938)
chr6 (203-260)||(2291730-2291787)
chr6 (203-260)||(8054584-8054641)
chr6 (203-260)||(18335142-18335199)
chr6 (203-260)||(19004601-19004658)
chr6 (203-260)||(24422102-24422159)
chr6 (203-260)||(26925189-26925246)
chr6 (203-260)||(33861350-33861407)
chr6 (203-260)||(33863833-33863890)
chr6 (18-69)||(19869395-19869444)
chr6 (18-69)||(23393849-23393898)
chr6 (18-69)||(23413757-23413806)
chr6 (170-222)||(1643318-1643368)
chr6 (209-266)||(9622913-9622969)
chr6 (203-260)||(12741881-12741938)
chr6 (18-67)||(18913323-18913372)
chr6 (203-260)||(22781827-22781884)
chr6 (214-266)||(14594666-14594718)
chr6 (203-238)||(1541452-1541487)
chr6 (262-301)||(23537884-23537923)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (160-338)||(11727-11905)
scaffold0023 (24-69)||(11956-12001)
scaffold0023 (203-260)||(93966-94023)
[»] scaffold0166 (2 HSPs)
scaffold0166 (168-338)||(11018-11188)
scaffold0166 (18-69)||(10824-10875)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (162-338)||(8694-8868)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (170-338)||(25530-25696)
scaffold0124 (245-338)||(37568-37661)
[»] chr2 (43 HSPs)
chr2 (170-338)||(24630008-24630176)
chr2 (170-338)||(30346618-30346786)
chr2 (160-338)||(31343867-31344045)
chr2 (170-338)||(10103257-10103425)
chr2 (170-338)||(12902567-12902735)
chr2 (170-338)||(24645101-24645269)
chr2 (170-338)||(24647877-24648045)
chr2 (170-338)||(27600321-27600489)
chr2 (170-328)||(27380954-27381112)
chr2 (170-328)||(27384924-27385082)
chr2 (162-301)||(9783981-9784118)
chr2 (200-338)||(19663548-19663686)
chr2 (200-338)||(20260207-20260345)
chr2 (160-314)||(41532404-41532548)
chr2 (200-338)||(6481734-6481872)
chr2 (200-338)||(6485201-6485339)
chr2 (200-338)||(21074498-21074636)
chr2 (203-338)||(9240624-9240759)
chr2 (209-338)||(37378986-37379115)
chr2 (216-338)||(24647044-24647166)
chr2 (235-338)||(10686272-10686375)
chr2 (200-258)||(6262204-6262263)
chr2 (200-258)||(19663482-19663541)
chr2 (203-260)||(18808498-18808555)
chr2 (203-260)||(23130433-23130490)
chr2 (203-260)||(23132900-23132957)
chr2 (203-260)||(23135147-23135204)
chr2 (203-260)||(23710082-23710139)
chr2 (203-260)||(24898753-24898810)
chr2 (203-260)||(24901228-24901285)
chr2 (203-260)||(24903705-24903762)
chr2 (203-260)||(24906182-24906239)
chr2 (203-260)||(24908657-24908714)
chr2 (203-260)||(26504935-26504992)
chr2 (203-260)||(26507413-26507470)
chr2 (18-69)||(31344136-31344184)
chr2 (203-260)||(32040040-32040097)
chr2 (203-260)||(34403049-34403106)
chr2 (203-260)||(39681869-39681926)
chr2 (18-69)||(1282232-1282281)
chr2 (18-69)||(41532264-41532313)
chr2 (203-252)||(570968-571017)
chr2 (200-237)||(6262270-6262307)
[»] scaffold0486 (2 HSPs)
scaffold0486 (160-325)||(8540-8705)
scaffold0486 (20-69)||(8797-8846)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (178-338)||(11001-11161)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (170-338)||(68516-68684)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (162-301)||(6915-7052)
[»] scaffold0028 (6 HSPs)
scaffold0028 (170-338)||(60285-60454)
scaffold0028 (203-260)||(133767-133824)
scaffold0028 (203-260)||(136236-136293)
scaffold0028 (203-260)||(138705-138762)
scaffold0028 (203-260)||(141174-141231)
scaffold0028 (203-260)||(143643-143700)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (170-338)||(6281-6448)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (200-338)||(33887-34025)
scaffold0080 (200-294)||(28466-28560)
[»] scaffold0327 (2 HSPs)
scaffold0327 (162-338)||(18773-18947)
scaffold0327 (18-69)||(19040-19091)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (170-338)||(34091-34256)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (200-338)||(109551-109689)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (200-338)||(224133-224271)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (160-314)||(15536-15680)
scaffold0141 (18-69)||(15396-15445)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (162-301)||(74286-74423)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (200-338)||(150-288)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (200-333)||(10812-10945)
[»] scaffold0544 (2 HSPs)
scaffold0544 (200-338)||(3507-3645)
scaffold0544 (278-338)||(1-61)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (191-338)||(5512-5659)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (202-297)||(37195-37290)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (162-301)||(21293-21423)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (191-288)||(62821-62918)
[»] scaffold0842 (1 HSPs)
scaffold0842 (200-338)||(5192-5330)
[»] scaffold0380 (1 HSPs)
scaffold0380 (170-288)||(3974-4090)
[»] scaffold0299 (2 HSPs)
scaffold0299 (194-338)||(5775-5917)
scaffold0299 (18-69)||(5967-6016)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (191-288)||(37179-37276)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (222-338)||(70705-70821)
[»] scaffold0200 (2 HSPs)
scaffold0200 (160-301)||(10754-10884)
scaffold0200 (18-69)||(10975-11024)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (210-333)||(4076-4199)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (209-288)||(23937-24016)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (254-338)||(115390-115473)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (200-258)||(19066-19125)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (203-260)||(12947-13004)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (203-260)||(20302-20359)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (203-260)||(13510-13567)
[»] scaffold0145 (1 HSPs)
scaffold0145 (203-260)||(9304-9361)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (203-260)||(37377-37434)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (203-260)||(39956-40013)
[»] scaffold1873 (3 HSPs)
scaffold1873 (279-338)||(641-700)
scaffold1873 (262-301)||(594-633)
scaffold1873 (170-229)||(691-749)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (230-333)||(163588-163691)
scaffold0001 (200-237)||(153803-153840)
[»] scaffold0815 (1 HSPs)
scaffold0815 (209-263)||(35-89)
[»] scaffold0679 (1 HSPs)
scaffold0679 (209-259)||(3265-3315)
[»] scaffold0278 (2 HSPs)
scaffold0278 (18-67)||(6951-7000)
scaffold0278 (18-67)||(7016-7065)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (18-67)||(44443-44492)
scaffold0116 (18-67)||(44508-44557)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (18-67)||(9060-9109)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (209-262)||(173225-173278)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (18-67)||(362045-362094)
scaffold0004 (18-67)||(362208-362257)
[»] scaffold2015 (1 HSPs)
scaffold2015 (214-266)||(444-496)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (18-67)||(79888-79937)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 168; Significance: 5e-90; HSPs: 83)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 160 - 338
Target Start/End: Original strand, 7520166 - 7520345
Alignment:
Q  160 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgt 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7520166 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttatcagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgt 7520265  T
Q  260 taagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7520266 taagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 7520345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 160 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 39721324 - 39721145
Alignment:
Q  160 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgt 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39721324 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtaatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgt 39721225  T
Q  260 t-aagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  39721224 taaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 39721145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 160 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 15083354 - 15083175
Alignment:
Q  160 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgt 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15083354 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatggttatgt 15083255  T
Q  260 t-aagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  15083254 taaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 15083175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 160 - 338
Target Start/End: Original strand, 2833432 - 2833610
Alignment:
Q  160 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgt 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2833432 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgt 2833531  T
Q  260 taagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  2833532 taagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatgttcaatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 2833610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 162 - 338
Target Start/End: Original strand, 10607275 - 10607449
Alignment:
Q  162 tgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtta 261  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10607275 tgagatgatgattatattgtgttgttt--aatttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgtta 10607372  T
Q  262 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10607373 agttgataagttgtcttttagtcatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaaatgatgatgt 10607449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 162 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 16582545 - 16582371
Alignment:
Q  162 tgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtta 261  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  16582545 tgagatgatgattatattgtgttgttt--aatttattagtgatgatgattacatgatgttatttatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgata 16582448  T
Q  262 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16582447 agttgataagttgtctttttttcatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaaatgatgatgt 16582371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 31843 - 31675
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  31843 tgattatattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgata 31744  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  31743 agttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 31675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Original strand, 12706083 - 12706251
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  12706083 tgattatattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgata 12706182  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  12706183 agttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 12706251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 12713658 - 12713490
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  12713658 tgattatattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgata 12713559  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  12713558 agttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 12713490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 12722316 - 12722148
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  12722316 tgattatattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgata 12722217  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  12722216 agttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 12722148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Original strand, 16908470 - 16908638
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  16908470 tgattatattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgata 16908569  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  16908570 agttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 16908638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 160 - 338
Target Start/End: Original strand, 2531283 - 2531460
Alignment:
Q  160 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgt 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  2531283 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattatatgaagatatctatgagttgttaggtgtacttgatgatg-ttatgt 2531381  T
Q  260 taagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  2531382 taagttgataagttgtcttttattcatgaattgataaagagatgttttatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 2531460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 12717405 - 12717237
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  12717405 tgattatattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgctgatgtttatgttaaattgata 12717306  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  12717305 agttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 12717237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 18278112 - 18277944
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  18278112 tgattatattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattgcatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgata 18278013  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  18278012 agttgtcttttattgatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 18277944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 18282076 - 18281908
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  18282076 tgattatattgtgttgttttaaagtttttagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgata 18281977  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  18281976 agttgtcttttattgatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 18281908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 177 - 338
Target Start/End: Original strand, 9752477 - 9752636
Alignment:
Q  177 attgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtc 276  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  9752477 attgtgttgttt--aagttattagtgatgataattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttggtgatggttatgttaagttgataagttgcc 9752574  T
Q  277 ttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  9752575 ttttattcatgaatttataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattgatgatgt 9752636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 13891718 - 13891580
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatga 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13891718 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatga 13891619  T
Q  300 ga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  13891618 gatgtttgatgaat-aattattattatgaattgatgatgt 13891580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 164 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 20486864 - 20486733
Alignment:
Q  164 agatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaag 263  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20486864 agatgatgattatattgtgttgttt--aagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaag 20486767  T
Q  264 ttgataagttgtcttttattcatgaattgataat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20486766 ttgataagttgtcttttattcatgaattgataat 20486733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 197 - 338
Target Start/End: Original strand, 39268301 - 39268442
Alignment:
Q  197 ttagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataa 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  39268301 ttagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgccttttattcatgaatttataa 39268400  T
Q  297 tgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  39268401 tgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattgatgatgt 39268442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 162 - 301
Target Start/End: Original strand, 25928325 - 25928463
Alignment:
Q  162 tgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtta 261  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  25928325 tgagatgatgattatattgtgttgttt-aaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtactttatgatggttatgtta 25928423  T
Q  262 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga 301  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  25928424 agttgataagttgttttttattcatgaattgctaatgaga 25928463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 11660370 - 11660232
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatga 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11660370 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttggtaagttgtcttttattcatgaattgctaatga 11660271  T
Q  300 ga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
     | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  11660270 aatgtttgatgaat-aattattattatgaaattatgatgt 11660232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 204 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 13892097 - 13891963
Alignment:
Q  204 tgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-g 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |    
T  13892097 tgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttttgcatgaattgctaatgagatg 13891998  T
Q  303 tttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  13891997 tttgatgaat-aattattattatgaattgatgatgt 13891963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 14420875 - 14420737
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-g 298  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  14420875 gtgatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgg 14420776  T
Q  299 agagtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14420775 aatgtttgatgaat-aattattattatgaaatgatgatgt 14420737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 18871385 - 18871247
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-g 298  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  18871385 gtgatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgg 18871286  T
Q  299 agagtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18871285 aatgtttgatgaat-aattattattatgaaatgatgatgt 18871247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 191 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 26291254 - 26291116
Alignment:
Q  191 aagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt-aagttgataagttgtcttttattcatgaa 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26291254 aagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaagtgtacttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattcatgaa 26291155  T
Q  290 ttgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaa 328  Q
    || ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  26291154 ttaataatgagatgtttgacgaat-aattattattatgaa 26291116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 18606426 - 18606285
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-g 298  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  18606426 gtgatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgg 18606327  T
Q  299 agagtttgatgaataa--attattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18606326 aatgtttgatgaataattattattattatgaaatgatgatgt 18606285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 202 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 18424321 - 18424185
Alignment:
Q  202 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga 301  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18424321 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgaga 18424222  T
Q  302 -gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
     | ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  18424221 tggttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 18424185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 160 - 314
Target Start/End: Original strand, 45171462 - 45171606
Alignment:
Q  160 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgt 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  45171462 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgat-----------atctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgt 45171550  T
Q  260 taagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataa 314  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45171551 taaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataa 45171606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 170 - 301
Target Start/End: Original strand, 1859983 - 1860113
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgat-gatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgat 268  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  1859983 tgattatattgtgttgttt--aagttattagtgattgatgattacaggatgttatatatgagttgttaaatgtacttgatgacgtttatgttaagttgat 1860080  T
Q  269 aagttgtcttttattcatgaattgataatgaga 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1860081 aagttgtcttttattcatgaattgataatgaga 1860113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 170 - 301
Target Start/End: Original strand, 13919374 - 13919504
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgat-gatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgat 268  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  13919374 tgattatattgtgttgttt--aagttattagtgattgatgattacaggatgttatatatgagttgttaaatgtacttgatgacgtttatgttaagttgat 13919471  T
Q  269 aagttgtcttttattcatgaattgataatgaga 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13919472 aagttgtcttttattcatgaattgataatgaga 13919504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Original strand, 838123 - 838262
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttat-ctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  838123 gtgatgatgattacatgatgttaagctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaata 838222  T
Q  299 aga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    | | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  838223 aaatgtttgatgaat-aattattattatgaattgatgatgt 838262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Original strand, 1203303 - 1203442
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttat-ctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  1203303 gtgatgatgattacatgatgttaagctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaata 1203402  T
Q  299 aga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    | | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  1203403 aaatgtttgatgaat-aattattattatgaattgatgatgt 1203442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Original strand, 16109965 - 16110104
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttat-ctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  16109965 gtgatgatgattacatgatgttaagctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttatcttttattcatgaattgctaatg 16110064  T
Q  299 aga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    | | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  16110065 aaatgtttgatgaat-aattattattatgaattgatgatgt 16110104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Original strand, 10897887 - 10898025
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-g 298  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  10897887 gtgatgatgattatgtgatgttatctatgagtcgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgg 10897986  T
Q  299 agagtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10897987 aatgttttatgaat-aattattattatgaaatgatgatgt 10898025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 16005092 - 16004954
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-g 298  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  16005092 gtgatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgg 16004993  T
Q  299 agagtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |  ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  16004992 aatgttcgatgaat-aactattattatgaaatgatgatgt 16004954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Original strand, 834035 - 834174
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttat-ctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  834035 gtgatgatgattacatgatgttaagctatgagttgttaattctacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 834134  T
Q  299 aga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    | | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  834135 aaatgtttgatgaat-aattattattatgaattgatgatgt 834174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Original strand, 1199215 - 1199354
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttat-ctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1199215 gtgatgatgattacatgatgttaagctatgagttgttaattctacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 1199314  T
Q  299 aga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    | | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  1199315 aaatgtttgatgaat-aattattattatgaattgatgatgt 1199354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 146588 - 146450
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-g 298  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |    
T  146588 gtgatgatgattatgcgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctactcatgaattgctaatgg 146489  T
Q  299 agagtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  146488 aatgtttgatgaat-aattattattatgaaatgatgatgt 146450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 209 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 41283724 - 41283595
Alignment:
Q  209 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-gagagtttga 307  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||    
T  41283724 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 41283625  T
Q  308 tgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41283624 tgaa-aaattattattatgaaatgatgatgt 41283595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Original strand, 72343 - 72500
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  72343 tgattatattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgat-----------atctatgaattgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgata 72431  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  72432 agttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 72500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Original strand, 76452 - 76609
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  76452 tgattatattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgat-----------atctatgaattgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgata 76540  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  76541 agttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 76609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 171 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18301466 - 18301373
Alignment:
Q  171 gattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttg 266  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18301466 gattatattgtgttgttt--aagttattagtgatgatgattacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttg 18301373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 210 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 15213126 - 15213003
Alignment:
Q  210 ttacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgat 308  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||| | |||||    
T  15213126 ttacatgatgttatccatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgctaatgagatggttgat 15213027  T
Q  309 gaataaattattattatgaaatgat 333  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||    
T  15213026 gaat-aattattgttatgaattgat 15213003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 245 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 15166293 - 15166200
Alignment:
Q  245 tgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-gagagtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15166293 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaat-aattattattatgaaatgatgatgt 15166200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 209 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 16185603 - 16185524
Alignment:
Q  209 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 288  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  16185603 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagggtcatgttaagttgataagtcgtcttctattcatga 16185524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 262 - 338
Target Start/End: Original strand, 9752644 - 9752720
Alignment:
Q  262 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  9752644 agttgataagttgtcttttatccatgaatttataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattgatgatgt 9752720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 11302350 - 11302267
Alignment:
Q  245 tgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-gagagtttgatgaataaattattattatgaa 328  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  11302350 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgtaatgctaatggaatgtttgatgaat-aattattattatgaa 11302267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Original strand, 2531141 - 2531192
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgttca 69  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  2531141 gatgtatatgttgttattatactattataagatgattaatatgtgttgttca 2531192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Original strand, 2833331 - 2833382
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgttca 69  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2833331 gatgtatatgttgttgttatattattataagatgattaatatgtgttgttca 2833382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Original strand, 7520024 - 7520075
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgttca 69  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7520024 gatgtatatcttgttattatattaatataagacgattaatatgtgttgttca 7520075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 267
Target Start/End: Original strand, 11394878 - 11394936
Alignment:
Q  209 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttga 267  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  11394878 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttga 11394936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 297
Target Start/End: Original strand, 23666460 - 23666539
Alignment:
Q  217 atgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||| | ||||||||| ||| ||||    
T  23666460 atgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg-ttacgtatagttgctaagttgtcctctattcatgagttgttaat 23666539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 455942 - 455885
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  455942 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 455885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Original strand, 11393817 - 11393874
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  11393817 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 11393874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 11972108 - 11972051
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  11972108 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 11972051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Original strand, 14949671 - 14949728
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  14949671 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 14949728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Original strand, 15377263 - 15377320
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  15377263 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 15377320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 16232132 - 16232075
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  16232132 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 16232075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 16409680 - 16409623
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  16409680 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 16409623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Original strand, 20385672 - 20385729
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  20385672 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 20385729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Original strand, 21190145 - 21190202
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  21190145 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 21190202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 24701867 - 24701810
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  24701867 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 24701810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 24704317 - 24704260
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  24704317 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 24704260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Original strand, 26356500 - 26356557
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  26356500 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 26356557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Original strand, 26358952 - 26359009
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  26358952 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 26359009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 27216487 - 27216430
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  27216487 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 27216430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 32125111 - 32125054
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  32125111 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 32125054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 41522549 - 41522492
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  41522549 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 41522492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 41525011 - 41524954
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  41525011 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 41524954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 262 - 301
Target Start/End: Original strand, 9752728 - 9752767
Alignment:
Q  262 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga 301  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9752728 agttgataagttatcttttattcatgaattgataatgaga 9752767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Original strand, 45171322 - 45171371
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgttca 69  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45171322 gatgtatatgttgttattatat-aat-taagatgattaatatgtgttgttca 45171371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 8467901 - 8467852
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgtt 67  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  8467901 gatgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgtgttgtt 8467852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 67
Target Start/End: Original strand, 14270758 - 14270807
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgtt 67  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  14270758 gatgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgtgttgtt 14270807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 17231896 - 17231847
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgtt 67  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  17231896 gatgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgtgttgtt 17231847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 17231961 - 17231912
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgtt 67  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  17231961 gatgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgtgttgtt 17231912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 17232026 - 17231977
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgtt 67  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  17232026 gatgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgtgttgtt 17231977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 17232091 - 17232042
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgtt 67  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  17232091 gatgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgtgttgtt 17232042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 16582697 - 16582653
Alignment:
Q  23 atatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgtt 67  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  16582697 atatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgtgttgtt 16582653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 65
Target Start/End: Original strand, 10502057 - 10502099
Alignment:
Q  23 atatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttg 65  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  10502057 atatgttgttgttatattaatataagatgatgaatatgcgttg 10502099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 67
Target Start/End: Original strand, 14270693 - 14270742
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgtt 67  Q
    |||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  14270693 gatgaatattttgttgttatattattataagatgatgaatatgtgttgtt 14270742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29795251 - 29795214
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaa 237  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  29795251 gtgatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaa 29795214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29799070 - 29799033
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaa 237  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  29799070 gtgatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaa 29799033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 67
Target Start/End: Original strand, 1859847 - 1859891
Alignment:
Q  23 atatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgtt 67  Q
    |||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  1859847 atatgttgttgttatattactatatgatgatgaatatgtgttgtt 1859891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 52)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 160 - 338
Target Start/End: Original strand, 20158398 - 20158576
Alignment:
Q  160 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgt 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20158398 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgcttatgt 20158497  T
Q  260 taagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  20158498 taagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aagtattattatgaattgatgatgt 20158576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 160 - 338
Target Start/End: Original strand, 20163849 - 20164027
Alignment:
Q  160 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgt 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20163849 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgacgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgt 20163948  T
Q  260 taagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  20163949 taagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aagtattattatgaattgatgatgt 20164027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 162 - 338
Target Start/End: Original strand, 17052400 - 17052574
Alignment:
Q  162 tgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtta 261  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17052400 tgagatgatgattatattgtgttgttt--aagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtta 17052497  T
Q  262 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  17052498 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattgatgatgt 17052574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 160 - 338
Target Start/End: Original strand, 20161074 - 20161252
Alignment:
Q  160 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgt 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  20161074 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgacgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgataatgtttatgt 20161173  T
Q  260 taagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  20161174 taagttgataagttgtcttttattcaagaattgataatgagatgtttgatgaat-aagtattattatgaattgatgatgt 20161252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 177 - 338
Target Start/End: Original strand, 22634896 - 22635055
Alignment:
Q  177 attgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtc 276  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22634896 attgtgttgttt--aagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtc 22634993  T
Q  277 ttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  22634994 ttttattcatgaatttataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattgatgatgt 22635055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 9555187 - 9555019
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  9555187 tgattatattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgata 9555088  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  9555087 agttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 9555019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Original strand, 14758952 - 14759120
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  14758952 tgattatattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgata 14759051  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  14759052 agttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 14759120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Original strand, 14955720 - 14955888
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  14955720 tgattatattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgata 14955819  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  14955820 agttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 14955888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 17807172 - 17807001
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  17807172 tgattatattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgata 17807073  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataa--attattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||    
T  17807072 agttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattattatgaattaatgatgt 17807001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 162 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 12423067 - 12422908
Alignment:
Q  162 tgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtta 261  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  12423067 tgagatgatgattatattgtgttgttt--aagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatagttatgtta 12422970  T
Q  262 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattatt 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12422969 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattatt 12422908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 177 - 338
Target Start/End: Original strand, 5758423 - 5758584
Alignment:
Q  177 attgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtc 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  5758423 attgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtc 5758522  T
Q  277 ttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  5758523 ttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 5758584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Original strand, 4562734 - 4562902
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  4562734 tgattatattgggttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgata 4562833  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  4562834 agttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 4562902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 25688560 - 25688392
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  25688560 tgattatattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgata 25688461  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  25688460 agttgtcttttattagtgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 25688392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 33740954 - 33740786
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  33740954 tgattatattgtgttgttttaaaattattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgata 33740855  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  33740854 agttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 33740786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 164 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 10711949 - 10711825
Alignment:
Q  164 agatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaag 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10711949 agatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaag 10711850  T
Q  264 ttgataagttgtcttttattcatga 288  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  10711849 ttgataagttgtcttctattcatga 10711825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 164 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 10925719 - 10925595
Alignment:
Q  164 agatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaag 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10925719 agatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaag 10925620  T
Q  264 ttgataagttgtcttttattcatga 288  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  10925619 ttgataagttgtcttctattcatga 10925595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Original strand, 24048375 - 24048513
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatga 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24048375 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatga 24048474  T
Q  300 ga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
     | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24048475 aatgtttgatgaat-aattattattatgaaatgatgatgt 24048513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Original strand, 23996929 - 23997094
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  23996929 tgattatattgtgttgttt--aagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatg-taagttgata 23997025  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||    
T  23997026 agttctcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aatcattattatgaattaatgatgt 23997094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 197 - 338
Target Start/End: Original strand, 13813820 - 13813961
Alignment:
Q  197 ttagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataa 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  13813820 ttagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgccttttgttcatgaatttataa 13813919  T
Q  297 tgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  13813920 tgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattgatgatgt 13813961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 197 - 338
Target Start/End: Original strand, 13818308 - 13818449
Alignment:
Q  197 ttagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataa 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  13818308 ttagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgcattttattcatgaatttataa 13818407  T
Q  297 tgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  13818408 tgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattgatgatgt 13818449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 12486386 - 12486221
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  12486386 tgattatattgtgttgttttaaagttattagtgatgat---tacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgata 12486290  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  12486289 agttgtcttttattaatgaattgatgatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 12486221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 15533307 - 15533169
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-g 298  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  15533307 gtgatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgg 15533208  T
Q  299 agagtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15533207 aatgtttgatgaat-aattattattatgaaatgatgatgt 15533169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 202 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 15223632 - 15223496
Alignment:
Q  202 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga 301  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15223632 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgaga 15223533  T
Q  302 -gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
     | ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  15223532 tggttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 15223496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 30145872 - 30145733
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttat-ctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30145872 gtgatgatgattacatgatgttaagctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 30145773  T
Q  299 aga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    | | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  30145772 aaatgtttgatgaat-aattattattatgaattgatgatgt 30145733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 171 - 301
Target Start/End: Original strand, 631711 - 631839
Alignment:
Q  171 gattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataa 270  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  631711 gattatattgtgttgttt--aagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataa 631808  T
Q  271 gttgtcttttattcatgaattgataatgaga 301  Q
    ||||| || ||||||||| ||| ||||||||    
T  631809 gttgtattctattcatgagttgctaatgaga 631839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 18211692 - 18211554
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-g 298  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  18211692 gtgatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttgagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgg 18211593  T
Q  299 agagtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18211592 aatgtttgatgaat-aattattattatgaaatgatgatgt 18211554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 36037040 - 36036902
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-g 298  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  36037040 gtgatgatgattatgagatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgg 36036941  T
Q  299 agagtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36036940 aatgtttcatgaat-aattattattatgaaatgatgatgt 36036902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Original strand, 49549073 - 49549212
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata-agttgtcttttattcatgaattgataat- 297  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||     
T  49549073 gtgatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataccgttgtcttttattcatgaattgctaatg 49549172  T
Q  298 gagagtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    ||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  49549173 gaatgtttgatgaat-aattattattatggaatgatgatgt 49549212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 27532868 - 27532752
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27532868 tgattatattgtgtagttt--aagttattagtgatgatgattacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgata 27532771  T
Q  270 agttgtcttttattcatga 288  Q
    ||||| ||| |||||||||    
T  27532770 agttgccttctattcatga 27532752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 209 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 28384930 - 28384801
Alignment:
Q  209 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-gagagtttga 307  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||    
T  28384930 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 28384831  T
Q  308 tgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28384830 ggaat-aattattattatgaaatgatgatgt 28384801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 203 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 38107031 - 38106897
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagag 302  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||  |    
T  38107031 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgtttatgttaagttgataaattgtctttcattcatgagttgctaatgaatg 38106932  T
Q  303 tttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| | |||||||    
T  38106931 tttgatgaa-gaattattattatgaattaatgatgt 38106897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 262 - 338
Target Start/End: Original strand, 13818457 - 13818533
Alignment:
Q  262 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  13818457 agttgataagttgtcttttatccatgaatttataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattgatgatgt 13818533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 262 - 338
Target Start/End: Original strand, 24048521 - 24048597
Alignment:
Q  262 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24048521 agttgctaagttgtcttttattcatgaattgttaatgaaatgtttgatgaat-aattattattatgaaatgatgatgt 24048597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 14047361 - 14047305
Alignment:
Q  245 tgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  14047361 tgatgatgattatgttaagttgataagttgtattttattcatgagttgttaatgaga 14047305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 301
Target Start/End: Original strand, 22635063 - 22635102
Alignment:
Q  262 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22635063 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga 22635102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Original strand, 1838053 - 1838110
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  1838053 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 1838110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Original strand, 12033681 - 12033738
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  12033681 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 12033738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Original strand, 14739599 - 14739656
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  14739599 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 14739656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Original strand, 15118902 - 15118959
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  15118902 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 15118959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 69
Target Start/End: Original strand, 20158262 - 20158307
Alignment:
Q  24 tatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgttca 69  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20158262 tatgttgttgttatattattataagatgattaatatgtgttgttca 20158307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 69
Target Start/End: Original strand, 20160938 - 20160983
Alignment:
Q  24 tatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgttca 69  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20160938 tatgttgttgttatattattataagatgattaatatgtgttgttca 20160983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 29267275 - 29267218
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  29267275 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 29267218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 44614900 - 44614843
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  44614900 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 44614843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Original strand, 50222889 - 50222946
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  50222889 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 50222946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 67
Target Start/End: Original strand, 15481937 - 15481986
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgtt 67  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15481937 gatgaatatgttgttgttatattattataagatgataaatatgtgttgtt 15481986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 67
Target Start/End: Original strand, 15482002 - 15482051
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgtt 67  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15482002 gatgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgtgttgtt 15482051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Original strand, 18239969 - 18240026
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  | ||||||| |||||||    
T  18239969 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgatcgatgatgcttatgtt 18240026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 19857044 - 19856996
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgt 66  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  19857044 gatgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgtgttgt 19856996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 361586 - 361537
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgtt 67  Q
    |||| |||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  361586 gatgaatatgttgctgttatattattataagatgatgaatatgtgttgtt 361537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 266
Target Start/End: Original strand, 37839211 - 37839248
Alignment:
Q  229 agttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttg 266  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  37839211 agttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttg 37839248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 266
Target Start/End: Original strand, 42597940 - 42597977
Alignment:
Q  229 agttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttg 266  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  42597940 agttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttg 42597977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 69
Target Start/End: Original strand, 20163726 - 20163758
Alignment:
Q  37 tattaatataagatgattaatatgtgttgttca 69  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20163726 tattattataagatgattaatatgtgttgttca 20163758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 84)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 160 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 5219975 - 5219797
Alignment:
Q  160 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgt 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5219975 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgt 5219876  T
Q  260 taagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  5219875 taagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagacgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 5219797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 160 - 338
Target Start/End: Original strand, 11301616 - 11301794
Alignment:
Q  160 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgt 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11301616 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattgcatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgt 11301715  T
Q  260 taagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  11301716 taagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aagtattattatgaattgatgatgt 11301794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 162 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 16795627 - 16795453
Alignment:
Q  162 tgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtta 261  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16795627 tgagatgatgattatattgtgttgttt--aagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgtta 16795530  T
Q  262 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  16795529 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagacgtttgatgaat-aattattattatgaattgatgatgt 16795453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 161 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 11853833 - 11853666
Alignment:
Q  161 gtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  11853833 gtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgtt 11853734  T
Q  261 aagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  11853733 aagttgataagttgtcttttattcacgaattgataatgagatgtttgatgaat-aagtattattatgaa 11853666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 160 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 14667717 - 14667562
Alignment:
Q  160 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgt 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14667717 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgagatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgt 14667618  T
Q  260 taagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataa 314  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14667617 taagttgataagttgtcttctattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataa 14667562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Original strand, 12853326 - 12853492
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12853326 tgattatattgtgttgttt--aatttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgata 12853423  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  12853424 agttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattgatgatgt 12853492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 160 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 14664553 - 14664398
Alignment:
Q  160 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgt 259  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14664553 agtgaggtgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacataatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgt 14664454  T
Q  260 taagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataa 314  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14664453 taagttgataagttgtcttctattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataa 14664398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 7108356 - 7108188
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  7108356 tgattatattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgata 7108257  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  7108256 agttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 7108188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 7112291 - 7112123
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  7112291 tgattatattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgata 7112192  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  7112191 agttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 7112123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 11068731 - 11068563
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  11068731 tgattatattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgata 11068632  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  11068631 agttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 11068563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 22320247 - 22320079
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  22320247 tgattatattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgata 22320148  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  22320147 agttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 22320079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 22335302 - 22335134
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  22335302 tgattatattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgata 22335203  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  22335202 agttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 22335134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 55021494 - 55021326
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  55021494 tgattatattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgata 55021395  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  55021394 agttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 55021326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Original strand, 11167054 - 11167222
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  11167054 tgattatattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtttacttgatgatgtttatgttaaattgata 11167153  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  11167154 agttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 11167222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 28948579 - 28948411
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  28948579 tgattatattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctataagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgata 28948480  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  28948479 agttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 28948411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 14498065 - 14497898
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  14498065 tgattatattgtgttgttttaaagttattagcgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgata 14497966  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgagagtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  14497965 agttgtcttttattaatgaattgataatgagatgttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 14497898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 15616295 - 15616127
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  15616295 tgattataatgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgaagatgtttatgttaaattgata 15616196  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  15616195 agttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 15616127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 203 - 338
Target Start/End: Original strand, 10834935 - 10835070
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga- 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |     
T  10834935 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaatttctaatgaaat 10835034  T
Q  302 gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10835035 gtttgatgaat-aattattattatgaaatgatgatgt 10835070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 13435906 - 13435768
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatga 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13435906 gtgatgatgattacatgatgttatatatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatga 13435807  T
Q  300 ga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
     | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  13435806 aatgtttgatgaat-aattattattatgaattgatgatgt 13435768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 30064482 - 30064334
Alignment:
Q  191 aagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt-aagttgataagttgtcttttattcatgaa 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30064482 aagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaagtgtacttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattcatgaa 30064383  T
Q  290 ttgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    || ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  30064382 ttaataatgagatgtttgacgaat-aattattattatgaattaatgatgt 30064334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Original strand, 14764786 - 14764924
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-g 298  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  14764786 gtgatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgg 14764885  T
Q  299 agagtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14764886 aatgtttgatgaat-aattattattatgaaatgatgatgt 14764924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 162 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 14670147 - 14670017
Alignment:
Q  162 tgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtta 261  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14670147 tgagatgatgattatattgtgttgttt--aagttattagtgatgat---tacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgtta 14670053  T
Q  262 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14670052 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataat 14670017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 3802058 - 3801920
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-g 298  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  3802058 gtgatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgg 3801959  T
Q  299 agagtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  3801958 aatgtttgatgaat-aattattattatggaatgatgatgt 3801920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Original strand, 8928858 - 8928996
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatga 299  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||    
T  8928858 gtgatgatgattgcatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatggtggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatggactgctaatga 8928957  T
Q  300 ga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  8928958 gatgtttgatgaat-aattattattatgaattgatgatgt 8928996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 191 - 328
Target Start/End: Original strand, 18933337 - 18933475
Alignment:
Q  191 aagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt-aagttgataagttgtcttttattcatgaa 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18933337 aagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaagtgtacttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtattttattcatgaa 18933436  T
Q  290 ttgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaa 328  Q
    || ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  18933437 ttaataatgagatgtttgacgaat-aattattattatgaa 18933475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 54519685 - 54519547
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-g 298  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  54519685 gtgatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgg 54519586  T
Q  299 agagtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  54519585 aatgtttgatgaat-aattattattatggaatgatgatgt 54519547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 170 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 15463995 - 15463865
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgat-gatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgat 268  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  15463995 tgattatattgtgttgttt--aagttattagtgattgatgattacaggatgttatatatgagttgttaaatgtacttgatgacgtttatgttaagttgat 15463898  T
Q  269 aagttgtcttttattcatgaattgataatgaga 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15463897 aagttgtcttttattcatgaattgataatgaga 15463865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 202 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 19774284 - 19774148
Alignment:
Q  202 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga 301  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19774284 gatgatgattacatgatattgtctgtgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgaga 19774185  T
Q  302 -gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  19774184 tgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 19774148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 201 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 18899540 - 18899400
Alignment:
Q  201 tgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat--- 297  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       
T  18899540 tgatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaataat 18899441  T
Q  298 -gagagtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
     ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18899440 ggaatgtttgatgaat-aattattattatgaaatgatgatgt 18899400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 9532346 - 9532208
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-g 298  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  9532346 gtgatgatgattatgagatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttgagttgataagttgtcttttattcatgaattgttaatgg 9532247  T
Q  299 agagtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9532246 aatgtttgatgaat-aattattattatgaaatgatgatgt 9532208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Original strand, 23372534 - 23372672
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-g 298  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  23372534 gtgatgatgattatgtgatgttatttatgagttgttaaatgtacttgatgattgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgg 23372633  T
Q  299 agagtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23372634 aatgtttgatgaat-aattattattatgaaatgatgatgt 23372672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Original strand, 29545929 - 29546067
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-g 298  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |    
T  29545929 gtgatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttgtgttaagttgataagttgtcttttagtcatgaattgctaatgg 29546028  T
Q  299 agagtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29546029 aaggtttgatgaat-aattattattatgaaatgatgatgt 29546067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 51299621 - 51299483
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-g 298  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  51299621 gtgatgatgattatgtgatgttatttatgagttgttaaatgtacttgatgattgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgg 51299522  T
Q  299 agagtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51299521 aatgtttgatgaat-aattattattatgaaatgatgatgt 51299483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 160 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 15963614 - 15963470
Alignment:
Q  160 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgt 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  15963614 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgat-----------atctatgagttattaagtgtacttgatgatgtttatgt 15963526  T
Q  260 taagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataa 314  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15963525 taaattaataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataa 15963470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 160 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 15967538 - 15967394
Alignment:
Q  160 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgt 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  15967538 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgat-----------atctatgagttattaagtgtacttgatgatgtttatgt 15967450  T
Q  260 taagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataa 314  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15967449 taaattaataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataa 15967394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 160 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 15971462 - 15971318
Alignment:
Q  160 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgt 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  15971462 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgat-----------atctatgagttattaagtgtacttgatgatgtttatgt 15971374  T
Q  260 taagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataa 314  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15971373 taaattaataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataa 15971318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 203 - 338
Target Start/End: Original strand, 16751895 - 16752030
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga- 301  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||     
T  16751895 atgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttatcttttattcatcaaatgataatgagat 16751994  T
Q  302 gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  16751995 ggttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 16752030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 160 - 260
Target Start/End: Original strand, 37440631 - 37440731
Alignment:
Q  160 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgt 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  37440631 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatggttatgt 37440730  T
Q  260 t 260  Q
    |    
T  37440731 t 37440731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 162 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 14681669 - 14681541
Alignment:
Q  162 tgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtta 261  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||   |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14681669 tgagatgatgattatattgtgttgttt--aagttattagtgatgat---tacatgatgttatct--gagttgttaaatgtacttgatgatggttatgtta 14681577  T
Q  262 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14681576 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataat 14681541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Original strand, 20249840 - 20249978
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-g 298  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  20249840 gtgatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgg 20249939  T
Q  299 agagtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |   || ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  20249940 aatattcgatgaat-aactattattatgaaatgatgatgt 20249978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 171 - 288
Target Start/End: Original strand, 4590124 - 4590239
Alignment:
Q  171 gattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataa 270  Q
    ||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4590124 gattatattgtgtagttt--aagttattagtgatgatgattacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataa 4590221  T
Q  271 gttgtcttttattcatga 288  Q
    |||||||| |||||||||    
T  4590222 gttgtcttctattcatga 4590239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 209 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 41213 - 41084
Alignment:
Q  209 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-gagagtttga 307  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||    
T  41213 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 41114  T
Q  308 tgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41113 ggaat-aattattattatgaaatgatgatgt 41084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Original strand, 4108760 - 4108918
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaa-tgtacttgatgatgattatgttaagttgat 268  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  4108760 tgattatattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgat-----------atctatgagttgttaaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgat 4108848  T
Q  269 aagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  4108849 aagttgtcttttattaatgaattgataatgagatatttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 4108918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Original strand, 4112609 - 4112767
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaa-tgtacttgatgatgattatgttaagttgat 268  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  4112609 tgattatattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgat-----------atctatgagttgttaaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgat 4112697  T
Q  269 aagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  4112698 aagttgtcttttattaatgaattgataatgagatatttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 4112767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 194 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 12337348 - 12337206
Alignment:
Q  194 ttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattga 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12337348 ttattagtgatgatgattacatgatgatat--atgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgat-agttgtcttttattcatgaattga 12337252  T
Q  294 taa-tgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    ||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  12337251 taattgagatgtttgatgaat-aagtattattatgaattgatgatgt 12337206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Original strand, 17318472 - 17318588
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17318472 tgattatattgtgtagttt--aagttattagtgatgatgaatacatgaagttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgata 17318569  T
Q  270 agttgtcttttattcatga 288  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  17318570 agttgtcttctattcatga 17318588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Original strand, 14068025 - 14068141
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14068025 tgattatattgtgtagttt--aagttattagtgatgatgattacatgatgttatctaggagttgctaaatgtatttgatgatggttatgttaagtcgata 14068122  T
Q  270 agttgtcttttattcatga 288  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  14068123 agttgtcttctattcatga 14068141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 210 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 11912505 - 11912382
Alignment:
Q  210 ttacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||| | |||||    
T  11912505 ttacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgctaatgagatggttgat 11912406  T
Q  309 gaataaattattattatgaaatgat 333  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||    
T  11912405 gaat-aattattgttatgaattgat 11912382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 200 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 12304262 - 12304170
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattg 292  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12304262 gtgatgatgattatgagatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtattttattcatgaattg 12304170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Original strand, 38312848 - 38312985
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatga 299  Q
    ||||| |||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||     
T  38312848 gtgataatgattatgtggtgttatctatgagtggttaaatgtacttgatgatggttatgttaagtttataagttgtcttttattcatgaa-tgctaatgg 38312946  T
Q  300 ga--gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    ||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38312947 gaatgttcgatgaat--attattattatgaaatgatgatgt 38312985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 209 - 288
Target Start/End: Original strand, 8491732 - 8491811
Alignment:
Q  209 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 288  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8491732 attacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 8491811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 200 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 23173386 - 23173284
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttat-ctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  23173386 gtgatgatgattacatgatgttaagctatgagttgttaaatatacttgatgatagttatgttaagttgataagttgtcttctattcatgagttgttaatg 23173287  T
Q  299 aga 301  Q
    |||    
T  23173286 aga 23173284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 209 - 298
Target Start/End: Original strand, 16326041 - 16326130
Alignment:
Q  209 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatg 298  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16326041 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgtcaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 16326130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 210 - 333
Target Start/End: Original strand, 16840204 - 16840327
Alignment:
Q  210 ttacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagagt-ttgat 308  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||| | ||| |    
T  16840204 ttacatgattttatctatgagttgttaaatgtatttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgctaatgagattcttgct 16840303  T
Q  309 gaataaattattattatgaaatgat 333  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||    
T  16840304 gaat-aattattgttatgaattgat 16840327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 5220117 - 5220066
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgttca 69  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5220117 gatgtatatgttgttattatattattataagatgattaatatgtgttgttca 5220066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Original strand, 11301474 - 11301525
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgttca 69  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11301474 gatgtatatgttgttgttatattattataagatgattaatatgtgttgttca 11301525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 14664698 - 14664647
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgttca 69  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14664698 gatgtatatgttgttgttatattattataagatgattaatatgtgttgttca 14664647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 14667862 - 14667811
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgttca 69  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14667862 gatgtatatgttgttgttatattattataagatgattaatatgtgttgttca 14667811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 5841245 - 5841187
Alignment:
Q  209 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttga 267  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  5841245 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttga 5841187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 209 - 266
Target Start/End: Original strand, 2249216 - 2249273
Alignment:
Q  209 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttg 266  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  2249216 attacatgatgttacctatgagttattaaatgtacttgatgagggttatgttaagttg 2249273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 209 - 266
Target Start/End: Original strand, 45220962 - 45221019
Alignment:
Q  209 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttg 266  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  45220962 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttg 45221019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Original strand, 7781858 - 7781915
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  7781858 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 7781915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Original strand, 9708156 - 9708213
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  9708156 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgtttatgtt 9708213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Original strand, 13152325 - 13152382
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  13152325 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 13152382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Original strand, 16454822 - 16454879
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  16454822 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 16454879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 17462790 - 17462733
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  17462790 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 17462733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 34158938 - 34158881
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  34158938 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 34158881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Original strand, 45607441 - 45607498
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  45607441 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 45607498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 55476134 - 55476077
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  55476134 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 55476077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 55500563 - 55500506
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  55500563 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 55500506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 15963754 - 15963705
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgttca 69  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15963754 gatgtatatgttgttattatat-aat-taagatgattaatatgtgttgttca 15963705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 15967678 - 15967629
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgttca 69  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15967678 gatgtatatgttgttattatat-aat-taagatgattaatatgtgttgttca 15967629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 15971602 - 15971553
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgttca 69  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15971602 gatgtatatgttgttattatat-aat-taagatgattaatatgtgttgttca 15971553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 338
Target Start/End: Original strand, 17348806 - 17348856
Alignment:
Q  288 aattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17348806 aattgataatgagatgtttgatgaataa-ttattattatgaaatgatgatgt 17348856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Original strand, 13154790 - 13154847
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  13154790 atgatgattacatgatgtagtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 13154847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15555428 - 15555371
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  15555428 atgatgattacatgatgttgtctatgaattgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 15555371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 15555670 - 15555602
Alignment:
Q  256 atgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattatta 324  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  15555670 atgttaagttgttaagttgtcttatattcatgagttgctaatgagatgtttgatgaa-gaattattatta 15555602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 12338815 - 12338766
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgttca 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||    
T  12338815 gatgtatatgttgttattatatta--ttaatatgattaatatgtgttgttca 12338766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 266
Target Start/End: Original strand, 14648275 - 14648327
Alignment:
Q  214 atgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttg 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  14648275 atgatgttacctatgagttgttaaatgtactcgaggagggttatgttaagttg 14648327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 203 - 238
Target Start/End: Original strand, 10248256 - 10248291
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaa 238  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10248256 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaa 10248291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 11853920 - 11853885
Alignment:
Q  34 ttatattaatataagatgattaatatgtgttgttca 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11853920 ttatattattataagatgattaatatgtgttgttca 11853885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 21618074 - 21618033
Alignment:
Q  20 tgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgt 61  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  21618074 tgtatatgttgttgttatatcaatataagatgatgaatatgt 21618033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 36166180 - 36166139
Alignment:
Q  20 tgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgt 61  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  36166180 tgtatatgttgttgttatatcaatataagatgatgaatatgt 36166139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 15464197 - 15464153
Alignment:
Q  23 atatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgtt 67  Q
    |||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  15464197 atatgttgttgttatattactatatgatgatgaatatgtgttgtt 15464153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1852 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold1852
Description:

Target: scaffold1852; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 160 - 338
Target Start/End: Original strand, 771 - 949
Alignment:
Q  160 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgt 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  771 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattgcatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgt 870  T
Q  260 taagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  871 taagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aagtattattatgaattgatgatgt 949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1852; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Original strand, 669 - 720
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgttca 69  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  669 gatgtatatgttgttgttatattattataagatgattaatatgtgttgttca 720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 32)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 160 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 33796161 - 33795983
Alignment:
Q  160 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgt 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  33796161 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgt 33796062  T
Q  260 taagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  33796061 taagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgatatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 33795983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 162 - 338
Target Start/End: Original strand, 22132053 - 22132227
Alignment:
Q  162 tgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtta 261  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22132053 tgagatgatgattatattgtgttgttt--aagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgtta 22132150  T
Q  262 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  22132151 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattgatgatgt 22132227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 1009380 - 1009212
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  1009380 tgattatattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgata 1009281  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  1009280 agttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 1009212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Original strand, 1926756 - 1926924
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  1926756 tgattatattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgata 1926855  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  1926856 agttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 1926924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Original strand, 16376776 - 16376944
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  16376776 tgattatattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgata 16376875  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  16376876 agttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 16376944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Original strand, 20925770 - 20925938
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  20925770 tgattatattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgata 20925869  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  20925870 agttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 20925938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 52634386 - 52634218
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  52634386 tgattatattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgata 52634287  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  52634286 agttattttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 52634218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 162 - 301
Target Start/End: Original strand, 41801233 - 41801370
Alignment:
Q  162 tgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtta 261  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41801233 tgagatgatgattatattgtgttgttt--aatttattagtgatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgtta 41801330  T
Q  262 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41801331 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga 41801370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 191 - 328
Target Start/End: Original strand, 20230120 - 20230258
Alignment:
Q  191 aagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt-aagttgataagttgtcttttattcatgaa 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20230120 aagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaagtgtacttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattcatgaa 20230219  T
Q  290 ttgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaa 328  Q
    || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  20230220 ttaataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaa 20230258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 202 - 338
Target Start/End: Original strand, 41389657 - 41389793
Alignment:
Q  202 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga 301  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  41389657 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgttttttattcatgaaatgataatgaga 41389756  T
Q  302 -gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
     | ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  41389757 tggttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 41389793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 16371013 - 16370875
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-g 298  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  16371013 gtgatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgg 16370914  T
Q  299 agagtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |  ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  16370913 aatgttcgatgaat-aactattattatgaaatgatgatgt 16370875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 202 - 338
Target Start/End: Original strand, 39245163 - 39245297
Alignment:
Q  202 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga 301  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  39245163 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagt--tcttttattcatgaaatgataatgaga 39245260  T
Q  302 -gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  39245261 tgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 39245297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 202 - 338
Target Start/End: Original strand, 39248718 - 39248852
Alignment:
Q  202 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga 301  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  39248718 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagt--tcttttattcatgaaatgataatgaga 39248815  T
Q  302 -gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  39248816 tgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 39248852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 21406369 - 21406253
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21406369 tgattatattgtgtagttt--aagttattagtgatgatgattacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgata 21406272  T
Q  270 agttgtcttttattcatga 288  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  21406271 agttgtcttctattcatga 21406253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 215 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 32649140 - 32649017
Alignment:
Q  215 tgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-gagagtttgatgaata 313  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||     
T  32649140 tgatgttatttatgagttgttaaatgtacttgatgattgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaat- 32649042  T
Q  314 aattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  32649041 aattattattatgaaatgatgatgt 32649017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 209 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 29533967 - 29533837
Alignment:
Q  209 attacatgatgttat-ctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttg 306  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||    
T  29533967 attacatgatgttaagctatgagttgttaaatgtgtttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttg 29533868  T
Q  307 atgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  29533867 atgaat-aattattattatgaattgatgatgt 29533837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 245 - 338
Target Start/End: Original strand, 20439188 - 20439281
Alignment:
Q  245 tgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-gagagtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  20439188 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgtattgctaatggaatgtttgatgaat-aattattattatggaatgatgatgt 20439281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 209 - 285
Target Start/End: Original strand, 11809949 - 11810025
Alignment:
Q  209 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattca 285  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  11809949 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagggtcatgttaagttgataagtcgtcttctattca 11810025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 11945073 - 11945016
Alignment:
Q  209 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttg 266  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  11945073 attacatgaggttacctacgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttg 11945016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 13988522 - 13988465
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  13988522 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 13988465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Original strand, 21475629 - 21475686
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  21475629 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 21475686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Original strand, 21923841 - 21923898
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  21923841 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 21923898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Original strand, 23594277 - 23594334
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  23594277 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 23594334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 266
Target Start/End: Original strand, 43630992 - 43631049
Alignment:
Q  209 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttg 266  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  43630992 attacatgaggttacctacgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttg 43631049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 67
Target Start/End: Original strand, 21740358 - 21740407
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgtt 67  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  21740358 gatgaatatgttgttgttatattattataagatgataaatatgtgttgtt 21740407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 67
Target Start/End: Original strand, 21740423 - 21740472
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgtt 67  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  21740423 gatgaatatgttgttgttatattattataagatgataaatatgtgttgtt 21740472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 67
Target Start/End: Original strand, 41306246 - 41306295
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgtt 67  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  41306246 gatgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgtgttgtt 41306295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 41372726 - 41372669
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  41372726 atgatgattacaagatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 41372669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 266
Target Start/End: Original strand, 20032180 - 20032232
Alignment:
Q  214 atgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttg 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  20032180 atgatgttacctatgagttgttaaatgtactcgaggagggttatgttaagttg 20032232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 20315646 - 20315600
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgtt 64  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20315646 gatgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgtgtt 20315600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 67
Target Start/End: Original strand, 21740488 - 21740537
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgtt 67  Q
    |||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  21740488 gatgaatacgttgttgttatattattataagatgatgaatatgtgttgtt 21740537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 67
Target Start/End: Original strand, 41306316 - 41306360
Alignment:
Q  23 atatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgtt 67  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  41306316 atatgttgttgttatactattataagatgatgaatatgtgttgtt 41306360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 160 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 14972 - 14804
Alignment:
Q  160 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgt 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14972 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgaagatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgt 14873  T
Q  260 taagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaa 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  14872 taagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaa 14804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 15110 - 15063
Alignment:
Q  22 tatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgttca 69  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15110 tatatgttgttgttatattattataagatgattaatatgtgttgttca 15063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 136; Significance: 7e-71; HSPs: 47)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 160 - 314
Target Start/End: Original strand, 14399043 - 14399198
Alignment:
Q  160 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgt 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14399043 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgt 14399142  T
Q  260 taagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataa 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14399143 taagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataa 14399198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 160 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 21410029 - 21409850
Alignment:
Q  160 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgt 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21410029 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatggttatgt 21409930  T
Q  260 t-aagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  21409929 taaagttgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 21409850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 160 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 21804521 - 21804342
Alignment:
Q  160 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgt 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21804521 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatggttatgt 21804422  T
Q  260 t-aagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  21804421 taaagttgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 21804342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Original strand, 21974144 - 21974312
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  21974144 tgattatattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgata 21974243  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  21974244 agttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 21974312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 162 - 323
Target Start/End: Original strand, 44385788 - 44385947
Alignment:
Q  162 tgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtta 261  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44385788 tgagatgatgattatattgtgttgttt--aagttgttagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtta 44385885  T
Q  262 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattatt 323  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  44385886 acttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattatt 44385947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 162 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 23427950 - 23427776
Alignment:
Q  162 tgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtta 261  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  23427950 tgagatgatgattatattgtgttgtct--aagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttaatgatggttatgtta 23427853  T
Q  262 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  23427852 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaaatgtttgatgaat-aattattattataaattgatgatgt 23427776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Original strand, 21978254 - 21978422
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  21978254 tgattatattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttatattgata 21978353  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  21978354 agttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 21978422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 43250320 - 43250152
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  43250320 tgattatattgtgttgttttaaagttattaatgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgata 43250221  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  43250220 agttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 43250152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 162 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 23913389 - 23913252
Alignment:
Q  162 tgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtta 261  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23913389 tgagatgatgattatattgtgttgttt--aagttattagtgatgatgattacatgatgttatctataagttgttaaatgtacttgatgatggttatgtta 23913292  T
Q  262 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23913291 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga 23913252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 160 - 314
Target Start/End: Original strand, 18864066 - 18864210
Alignment:
Q  160 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgt 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18864066 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgat-----------atctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgt 18864154  T
Q  260 taagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataa 314  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18864155 taaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataa 18864210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 160 - 314
Target Start/End: Original strand, 30941526 - 30941670
Alignment:
Q  160 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgt 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  30941526 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgat-----------atctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgt 30941614  T
Q  260 taagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataa 314  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  30941615 taaattgataagttgtcttttattcataaattgataatgagatgtttgatgaataa 30941670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Original strand, 27942675 - 27942814
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttat-ctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27942675 gtgatgatgattacatgatgttaagctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgataagttaataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 27942774  T
Q  299 aga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    | | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  27942775 aaatgtttgatgaat-aattattattatgaattgatgatgt 27942814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 21386275 - 21386159
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21386275 tgattatattgtgtagttt--aagttattagtgatgatgattacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgata 21386178  T
Q  270 agttgtcttttattcatga 288  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  21386177 agttgtcttctattcatga 21386159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Original strand, 21829432 - 21829589
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  21829432 tgattatattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgat-----------atctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgata 21829520  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  21829521 agttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 21829589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 209 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 11774375 - 11774246
Alignment:
Q  209 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-gagagtttga 307  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||    
T  11774375 attacatgaggttacccatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgttaatggaatgtttga 11774276  T
Q  308 tgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11774275 tgaat-aattattattatgaaatgatgatgt 11774246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 22110708 - 22110551
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  22110708 tgattatattatgttgttttaaagttattagtgatgatgat-----------atctatgagttgttaagtgtacttgatgatttttatgttaaattgata 22110620  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  22110619 agttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 22110551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 209 - 338
Target Start/End: Original strand, 8414976 - 8415105
Alignment:
Q  209 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-gagagtttga 307  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||    
T  8414976 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgattagggttattttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 8415075  T
Q  308 tgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8415076 tgaat-aattattattatgaaatgatgatgt 8415105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 210 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 21328644 - 21328553
Alignment:
Q  210 ttacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||    
T  21328644 ttacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgctaatgaga 21328553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 229 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 363327 - 363218
Alignment:
Q  229 agttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-gagagtttgatgaataaattattattatga 327  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||| |||||||||||||     
T  363327 agttgttaaatgtacttgttgatggttatgttaagatgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaat-aattattattatgg 363229  T
Q  328 aatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||    
T  363228 aatgatgatgt 363218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 209 - 288
Target Start/End: Original strand, 21967992 - 21968071
Alignment:
Q  209 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 288  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21967992 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 21968071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 209 - 288
Target Start/End: Original strand, 21980832 - 21980911
Alignment:
Q  209 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 288  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21980832 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 21980911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 209 - 288
Target Start/End: Original strand, 21985815 - 21985894
Alignment:
Q  209 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 288  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21985815 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 21985894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 209 - 288
Target Start/End: Original strand, 22000778 - 22000857
Alignment:
Q  209 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 288  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22000778 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 22000857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 245 - 338
Target Start/End: Original strand, 8729645 - 8729738
Alignment:
Q  245 tgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-gagagtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8729645 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaat-aattattattatgaaatgatgatgt 8729738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 210 - 333
Target Start/End: Original strand, 42560882 - 42561005
Alignment:
Q  210 ttacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||   ||||||||| |||| |||||||| | |||||    
T  42560882 ttacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacgtgatggtggttatgttaagttgacaagttgttccttattcatgcattgctaatgagatggttgat 42560981  T
Q  309 gaataaattattattatgaaatgat 333  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||    
T  42560982 gaat-aattattgttatgaattgat 42561005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 209 - 288
Target Start/End: Original strand, 22009196 - 22009275
Alignment:
Q  209 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 288  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  22009196 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 22009275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 209 - 266
Target Start/End: Original strand, 44494223 - 44494280
Alignment:
Q  209 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttg 266  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44494223 attacatgatgttacctatgaattgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttg 44494280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 1484014 - 1483957
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  1484014 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 1483957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 4482924 - 4482867
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  4482924 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 4482867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Original strand, 4542922 - 4542979
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  4542922 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 4542979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Original strand, 5853841 - 5853898
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  5853841 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 5853898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14823387 - 14823330
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  14823387 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 14823330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Original strand, 18678574 - 18678631
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  18678574 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 18678631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Original strand, 18717763 - 18717820
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  18717763 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 18717820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 20402839 - 20402782
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  20402839 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 20402782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22001373 - 22001316
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  22001373 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 22001316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 34950165 - 34950124
Alignment:
Q  209 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatga 250  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34950165 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgatga 34950124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 266
Target Start/End: Original strand, 11252087 - 11252138
Alignment:
Q  214 atgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttg 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  11252087 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgatga-ggttatgttaagttg 11252138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Original strand, 14398902 - 14398952
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgttca 69  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  14398902 gatgtatatgttgttgttatattattata-gatgattaatatgtgttgttca 14398952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Original strand, 18863926 - 18863975
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgttca 69  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18863926 gatgtatatgttgttattatat-aat-taagatgattaatatgtgttgttca 18863975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Original strand, 30941386 - 30941435
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgttca 69  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30941386 gatgtatatgttgttattatat-aat-taagatgattaatatgtgttgttca 30941435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 67
Target Start/End: Original strand, 1323736 - 1323785
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgtt 67  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  1323736 gatgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgtgttgtt 1323785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 67
Target Start/End: Original strand, 38550644 - 38550693
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgtt 67  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  38550644 gatgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgtgttgtt 38550693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 67
Target Start/End: Original strand, 38550709 - 38550758
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgtt 67  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  38550709 gatgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgtgttgtt 38550758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 67
Target Start/End: Original strand, 13428701 - 13428750
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgtt 67  Q
    |||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  13428701 gatgaatatgttgttgctatattattataagatgatgaatatgtgttgtt 13428750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 44475787 - 44475750
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaa 237  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  44475787 gtgatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaa 44475750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 44479049 - 44479012
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaa 237  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  44479049 gtgatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaa 44479012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 48)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 162 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 18354923 - 18354760
Alignment:
Q  162 tgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtta 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  18354923 tgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgtta 18354824  T
Q  262 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattat 325  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  18354823 agttgataaattgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattat 18354760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 162 - 338
Target Start/End: Original strand, 22120546 - 22120720
Alignment:
Q  162 tgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtta 261  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22120546 tgagatgatgattatattgtgttattt--aatttattagtgatgatgattatatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgtta 22120643  T
Q  262 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22120644 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaaatgatgatgt 22120720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 168 - 338
Target Start/End: Original strand, 24768521 - 24768691
Alignment:
Q  168 gttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttga 267  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  24768521 gttgattgcattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacctgatgatgtttatgttaagttga 24768620  T
Q  268 taagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||    
T  24768621 taagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattaatattatgaattaatgatgt 24768691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 20294632 - 20294464
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  20294632 tgattatattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgata 20294533  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  20294532 agttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 20294464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 170 - 328
Target Start/End: Original strand, 19474133 - 19474291
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  19474133 tgattatattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgata 19474232  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaa 328  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  19474233 agttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaa 19474291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Original strand, 15238080 - 15238246
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15238080 tgattatattgtgtagttt--aagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgata 15238177  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  15238178 agttgtcttttattcatgaaatgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 15238246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 162 - 338
Target Start/End: Original strand, 22108404 - 22108577
Alignment:
Q  162 tgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtta 261  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||      
T  22108404 tgagatgatgattctattgtgttgttt--aagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg-ttacgtat 22108500  T
Q  262 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  22108501 aattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattgatgatgt 22108577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Original strand, 20912215 - 20912381
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20912215 tgattatattgtattgttt--aagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtgtatgttaagttgata 20912312  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||    
T  20912313 agttgtcttttattcatgaaatgataatgagatgtttgatgaat-aattattgttatgaattaatgatgt 20912381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Original strand, 38146409 - 38146547
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-g 298  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  38146409 gtgatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgg 38146508  T
Q  299 agagtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38146509 aatgtttgatgaat-aattattattatgaaatgatgatgt 38146547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 200 - 339
Target Start/End: Original strand, 28372072 - 28372211
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-g 298  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  28372072 gtgatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgg 28372171  T
Q  299 agagtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgtc 339  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28372172 aatgtttgatgaat-aattattattatgaaatgatgatgtc 28372211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Original strand, 37599999 - 37600137
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-g 298  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  37599999 gtgatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgg 37600098  T
Q  299 agagtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37600099 aatgtttgatgaat-aattattattatgaaatgatgatgt 37600137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 160 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 11219672 - 11219528
Alignment:
Q  160 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgt 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11219672 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgat-----------atctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgt 11219584  T
Q  260 taagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataa 314  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11219583 taaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataa 11219528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 19510550 - 19510412
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-g 298  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  19510550 gtgatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataggttgtcttttattcatgaattgctaatgg 19510451  T
Q  299 agagtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19510450 aacgtttgatgaat-aattattattatgaaatgatgatgt 19510412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Original strand, 23113393 - 23113531
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-g 298  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  23113393 gtgatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattgtgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgg 23113492  T
Q  299 agagtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  23113493 aatgtttgatgaat-aattattattatggaatgatgatgt 23113531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 202 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 10751903 - 10751767
Alignment:
Q  202 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga 301  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  10751903 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcaagaaatgataatgaga 10751804  T
Q  302 -gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
     | ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  10751803 tggttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 10751767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 160 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 11228080 - 11227936
Alignment:
Q  160 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgt 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11228080 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgat-----------atctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgt 11227992  T
Q  260 taagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataa 314  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11227991 taaattgataagctgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataa 11227936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 22339100 - 22338962
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-g 298  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  22339100 gtgatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttacgttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgg 22339001  T
Q  299 agagtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  22339000 aatgtttgatgaat-aattattattatgaaataatgatgt 22338962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 160 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 11224258 - 11224114
Alignment:
Q  160 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgt 259  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11224258 agtgagattttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgat-----------atctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgt 11224170  T
Q  260 taagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataa 314  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11224169 taaattgataagctgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataa 11224114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 22335570 - 22335432
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-g 298  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  22335570 gtgatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtatttgatgatggttatgttacgttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgg 22335471  T
Q  299 agagtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  22335470 aatgtttgatgaat-aattattattatgaaataatgatgt 22335432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Original strand, 41878642 - 41878780
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-g 298  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  41878642 gtgatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatagttatgttaagttgataagttgtcttttatttatgaattgctaatgg 41878741  T
Q  299 agagtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  41878742 aatgtttgatgaat-aattattattatggaatgatgatgt 41878780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 160 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 11230070 - 11229926
Alignment:
Q  160 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgt 259  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11230070 agtgagattttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgat-----------atctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgt 11229982  T
Q  260 taagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataa 314  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  11229981 taaattgataagctgtcttttattcatgaattgatcatgagatgtttgatgaataa 11229926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 170 - 328
Target Start/End: Original strand, 40727362 - 40727517
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40727362 tgattatattgtgtagttt--aagttattagtgatgatgattacatgaagatatctataagttgtttggtgtacttgatgatg-ttatgttaagttgata 40727458  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaa 328  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  40727459 agttatcttttattcatgaattgataaagagatgtttgatgaat-aattattattatgaa 40727517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 209 - 338
Target Start/End: Original strand, 33473931 - 33474060
Alignment:
Q  209 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-gagagtttga 307  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||    
T  33473931 attacatgaggttacccatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgttaatggaatgtttga 33474030  T
Q  308 tgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33474031 tgaat-aattattattatgaaatgatgatgt 33474060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 169 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 11226265 - 11226130
Alignment:
Q  169 ttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgat 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  11226265 ttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgat-----------atctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgat 11226177  T
Q  269 aagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataa 314  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  11226176 aagctgtcttttattcatgaattgatcatgagatgtttgatgaataa 11226130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 210 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 36459626 - 36459503
Alignment:
Q  210 ttacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||  ||| |||||||| | |||||    
T  36459626 ttacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttaatgatgattatgttaagttgataagttgttccttattcatgttttgctaatgagatggttgat 36459527  T
Q  309 gaataaattattattatgaaatgat 333  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||    
T  36459526 gaat-aattattgttatgaattgat 36459503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 200 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22749249 - 22749152
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat 297  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||    
T  22749249 gtgatgatgattatgtgatgttatctatgagtggttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcctatattcatgagttgttaat 22749152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 214 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 9775014 - 9774932
Alignment:
Q  214 atgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||| | ||||||||| ||| ||||    
T  9775014 atgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg-ttacgtatagttgctaagttgtcctctattcatgagttgttaat 9774932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Original strand, 24768327 - 24768378
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgttca 69  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24768327 gatgtatatgttgttgttatattattataagatgattaatatgtgttgttca 24768378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 209 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 19075968 - 19075911
Alignment:
Q  209 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttg 266  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  19075968 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttg 19075911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 22335636 - 22335577
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatg-tacttgatgatgattatg 258  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  22335636 gtgatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgttacatgatgatgattatg 22335577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 22339166 - 22339107
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatg-tacttgatgatgattatg 258  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  22339166 gtgatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgttacatgatgatgattatg 22339107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 258
Target Start/End: Original strand, 28372006 - 28372065
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatg-tacttgatgatgattatg 258  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  28372006 gtgatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgttacatgatgatgattatg 28372065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Original strand, 265311 - 265368
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  265311 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 265368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Original strand, 10733481 - 10733538
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  10733481 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 10733538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 20908624 - 20908567
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  20908624 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 20908567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 29345593 - 29345536
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  29345593 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 29345536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 29348074 - 29348017
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  29348074 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 29348017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 29350547 - 29350490
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  29350547 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 29350490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 31143900 - 31143843
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  31143900 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 31143843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Original strand, 42245906 - 42245963
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  42245906 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 42245963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 11219812 - 11219763
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgttca 69  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11219812 gatgtatatgttgttattatat-aat-taagatgattaatatgtgttgttca 11219763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 11224398 - 11224349
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgttca 69  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11224398 gatgtatatgttgttattatat-aat-taagatgattaatatgtgttgttca 11224349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 11226414 - 11226365
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgttca 69  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11226414 gatgtatatgttgttattatat-aat-taagatgattaatatgtgttgttca 11226365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 11228220 - 11228171
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgttca 69  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11228220 gatgtatatgttgttattatat-aat-taagatgattaatatgtgttgttca 11228171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 11230210 - 11230161
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgttca 69  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11230210 gatgtatatgttgttattatat-aat-taagatgattaatatgtgttgttca 11230161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 209 - 266
Target Start/End: Original strand, 31253210 - 31253267
Alignment:
Q  209 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttg 266  Q
    ||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  31253210 attacatgaggttacctacaagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttg 31253267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 39363027 - 39362970
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |  ||||||||| |||||||    
T  39363027 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaagtatgattgatgatgcttatgtt 39362970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 266
Target Start/End: Original strand, 43243764 - 43243816
Alignment:
Q  214 atgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttg 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  43243764 atgatgttacctatgagttgttaaatgtactcgaggagggttatgttaagttg 43243816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 55)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 160 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 27555667 - 27555490
Alignment:
Q  160 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgt 259  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  27555667 agtgagatgttgattacattgagttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgt 27555568  T
Q  260 taagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  27555567 taagttgat-agttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aagtattattatgaattgatgatgt 27555490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 160 - 338
Target Start/End: Original strand, 22075337 - 22075519
Alignment:
Q  160 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttat----ctatgagttgttaaatgtacttgatgatgatt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  22075337 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgttt 22075436  T
Q  256 atgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  22075437 atgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aagtattattatgaattgatgatgt 22075519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 8242530 - 8242362
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  8242530 tgattatattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgata 8242431  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  8242430 agttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 8242362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 11565519 - 11565351
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  11565519 tgattatattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgata 11565420  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  11565419 agttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 11565351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Original strand, 12620294 - 12620462
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  12620294 tgattatattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgata 12620393  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  12620394 agttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 12620462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 177 - 338
Target Start/End: Original strand, 11716908 - 11717069
Alignment:
Q  177 attgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtc 276  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  11716908 attgtgttgttttaaagttattaatgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtc 11717007  T
Q  277 ttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  11717008 ttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 11717069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 22861873 - 22861705
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  22861873 tgattatattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttggtgatgtttatgttaaattgata 22861774  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||    
T  22861773 agttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattatgattatgaattaatgatgt 22861705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 23988421 - 23988253
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  23988421 tgattatattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatattaaattgata 23988322  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  23988321 agttgtcttttattaatgaattgataatgaaatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 23988253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 162 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 2076410 - 2076273
Alignment:
Q  162 tgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtta 261  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2076410 tgagatgatgattatattgtgttgttt--aagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtatttgatgatgattatgtta 2076313  T
Q  262 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga 301  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2076312 agttgataagttgttttttattcatgaattgataatgaga 2076273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 23400775 - 23400627
Alignment:
Q  191 aagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt-aagttgataagttgtcttttattcatgaa 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23400775 aagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcctttattcatgaa 23400676  T
Q  290 ttgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || | |||||||    
T  23400675 ttgataatgagatgtttgatgaat-aattattattataaagtaatgatgt 23400627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 160 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 19869304 - 19869160
Alignment:
Q  160 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgt 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19869304 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgat-----------atctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgt 19869216  T
Q  260 taagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataa 314  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19869215 taaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataa 19869160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 160 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 23393758 - 23393614
Alignment:
Q  160 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgt 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23393758 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgat-----------atctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgt 23393670  T
Q  260 taagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataa 314  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23393669 taaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataa 23393614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 160 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 23413666 - 23413522
Alignment:
Q  160 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgt 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23413666 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgat-----------atctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgt 23413578  T
Q  260 taagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataa 314  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23413577 taaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataa 23413522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 202 - 338
Target Start/End: Original strand, 31479455 - 31479591
Alignment:
Q  202 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga 301  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31479455 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtatttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgaga 31479554  T
Q  302 -gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  31479555 tgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 31479591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 12941309 - 12941171
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-g 298  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |    
T  12941309 gtgatgatgattatgagatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctgatgg 12941210  T
Q  299 agagtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12941209 aatgtttgatgaat-aattattattatgaaatgatgatgt 12941171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 23538069 - 23537931
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatga 299  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||    
T  23538069 gtgataatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcccttattcgtgaattgttaatga 23537970  T
Q  300 ga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  23537969 gatgtttgatgaat-aattattattatgaattgatgatgt 23537931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 27222920 - 27222782
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-g 298  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  27222920 gtgatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgg 27222821  T
Q  299 agagtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |  ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  27222820 aatgttcgatgaat-aactattattatgaaatgatgatgt 27222782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 14470997 - 14470831
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||| |||| | ||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  14470997 tgattatattgtgtagttt--aagttattagtgatgaagattatatgaagatatttatgagttgttaggtgtacttgatgatgtttatgttaggttgata 14470900  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  14470899 agttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 14470831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Original strand, 28290885 - 28291023
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataa-tg 298  Q
    |||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||    
T  28290885 gtgatgatgattatgagatgttatctataagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcataaattgctaattg 28290984  T
Q  299 agagtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28290985 aatgtttgatgaat-aattattattatgaaatgatgatgt 28291023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 191 - 288
Target Start/End: Original strand, 18918562 - 18918659
Alignment:
Q  191 aagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18918562 aagttattagtgatgatgattacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 18918659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 215 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 4475868 - 4475745
Alignment:
Q  215 tgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-gagagtttgatgaata 313  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||     
T  4475868 tgatgttatttatgagttgttaaatgtacttgatgattgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaat- 4475770  T
Q  314 aattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  4475769 aattattattatgaaatgatgatgt 4475745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 22947774 - 22947617
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  22947774 tgattatattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgat-----------atctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgata 22947686  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  22947685 agttgtcttttattagtgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 22947617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 22951730 - 22951573
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  22951730 tgattatattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgat-----------atctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgata 22951642  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  22951641 agttgtcttttattagtgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 22951573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 23870218 - 23870061
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  23870218 tgattatattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgat-----------atctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgata 23870130  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  23870129 agttgtcttttattagtgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 23870061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 23874174 - 23874017
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  23874174 tgattatattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgat-----------atctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgata 23874086  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  23874085 agttgtcttttattagtgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 23874017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 209 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 23955448 - 23955319
Alignment:
Q  209 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-gagagtttga 307  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||    
T  23955448 attacatgaggttacccatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgttaatggaatgtttga 23955349  T
Q  308 tgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23955348 tgaat-aattattattatgaaatgatgatgt 23955319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 191 - 288
Target Start/End: Original strand, 18953465 - 18953562
Alignment:
Q  191 aagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18953465 aagttattagtgatgatgattacatgatgtcatctaggagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagtcgataagttgtcttctattcatga 18953562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 222 - 338
Target Start/End: Original strand, 27416540 - 27416656
Alignment:
Q  222 atctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattatt 320  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  27416540 atctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataggttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aagtatt 27416638  T
Q  321 attatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||| |||||||||    
T  27416639 attatgaattgatgatgt 27416656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 202 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 16622921 - 16622812
Alignment:
Q  202 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga 301  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  16622921 gatgatgattacatgatattatctatgaattgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagt--tcttttattcatgaaatgataatgaga 16622824  T
Q  302 -gtttgatgaat 312  Q
     |||||||||||    
T  16622823 tgtttgatgaat 16622812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 16758822 - 16758665
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||           ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  16758822 tgattatattgtgttgttttaaatttattagtgatgatgat-----------atctatgagttattaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgata 16758734  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  16758733 agttgtcttttattaatgaattgatagtgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 16758665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 210 - 333
Target Start/End: Original strand, 34297773 - 34297896
Alignment:
Q  210 ttacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||| | |||||    
T  34297773 ttacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgctgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgctaatgagatggttgat 34297872  T
Q  309 gaataaattattattatgaaatgat 333  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||    
T  34297873 gaat-aattattgttatgaattgat 34297896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 210 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 25737970 - 25737879
Alignment:
Q  210 ttacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga 301  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  25737970 ttacatgatgttatctatgagttggtaaatgtacttgatgatgattatgctaagttgataagttgtcccttattcatgtattgctaatgaga 25737879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 224 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 1254223 - 1254114
Alignment:
Q  224 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattat 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||| |    
T  1254223 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgttaatgagatggttgatgaat-aattattgt 1254125  T
Q  323 tatgaaatgat 333  Q
    |||||| ||||    
T  1254124 tatgaattgat 1254114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 27555809 - 27555758
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgttca 69  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27555809 gatgtatatgttgttattatattattataagatgattaatatgtgttgttca 27555758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Original strand, 22075195 - 22075246
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgttca 69  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22075195 gatgtatatgttgttgttatattattataagatgattaatatgtgttgttca 22075246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 28707938 - 28707880
Alignment:
Q  209 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttga 267  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  28707938 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttga 28707880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Original strand, 2291730 - 2291787
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  2291730 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 2291787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 8054641 - 8054584
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  8054641 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 8054584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Original strand, 18335142 - 18335199
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  18335142 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 18335199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19004658 - 19004601
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  19004658 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 19004601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 24422159 - 24422102
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  24422159 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 24422102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Original strand, 26925189 - 26925246
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  26925189 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 26925246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 33861407 - 33861350
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  33861407 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 33861350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 33863890 - 33863833
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  33863890 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 33863833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 19869444 - 19869395
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgttca 69  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19869444 gatgtatatgttgttattatat-aat-taagatgattaatatgtgttgttca 19869395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 23393898 - 23393849
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgttca 69  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23393898 gatgtatatgttgttattatat-aat-taagatgattaatatgtgttgttca 23393849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 23413806 - 23413757
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgttca 69  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23413806 gatgtatatgttgttattatat-aat-taagatgattaatatgtgttgttca 23413757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 1643368 - 1643318
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgtta 222  Q
    |||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1643368 tgattatattgtgtagttt--aagttattagtgatgatgattacatgatgtta 1643318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 209 - 266
Target Start/End: Original strand, 9622913 - 9622969
Alignment:
Q  209 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttg 266  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  9622913 attacatgatgttacctatgagttgtt-aatgtacttgatgagggttatgtaaagttg 9622969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 12741938 - 12741881
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  12741938 atgatgattacatgatattgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 12741881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 18913372 - 18913323
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgtt 67  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  18913372 gatgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgtgttgtt 18913323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22781884 - 22781827
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  22781884 atgatgattatatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 22781827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 266
Target Start/End: Original strand, 14594666 - 14594718
Alignment:
Q  214 atgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttg 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  14594666 atgatgttacctatgagttgttaaatgtactcgaggagggttatgttaagttg 14594718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 203 - 238
Target Start/End: Original strand, 1541452 - 1541487
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaa 238  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1541452 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaa 1541487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 262 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 23537923 - 23537884
Alignment:
Q  262 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga 301  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23537923 agttgctaagttgtcttttattcatgaattgctaatgaga 23537884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 160 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 11905 - 11727
Alignment:
Q  160 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgt 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11905 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaaattattagtgatgatgattacatgatgaaatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgcttatgt 11806  T
Q  260 taagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  11805 taagttgatatgttgtcttttatacatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aagtattattatgaattgatgatgt 11727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 12001 - 11956
Alignment:
Q  24 tatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgttca 69  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12001 tatgttgttgttatattattataagatgattaatatgtgttgttca 11956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 94023 - 93966
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  94023 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 93966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 168 - 338
Target Start/End: Original strand, 11018 - 11188
Alignment:
Q  168 gttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttga 267  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  11018 gttgattgcattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacctgatgatgtttatgttaagttga 11117  T
Q  268 taagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||    
T  11118 taagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattaatattatgaattaatgatgt 11188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Original strand, 10824 - 10875
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgttca 69  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10824 gatgtatatgttgttgttatattattataagatgattaatatgtgttgttca 10875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 162 - 338
Target Start/End: Original strand, 8694 - 8868
Alignment:
Q  162 tgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtta 261  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  8694 tgagatgatgattatattgtgttgttt--aatttattagtgatgatgattacatgatgttatctacgagttgttaaatgtacatgatgatggttatgtta 8791  T
Q  262 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  8792 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattataaaatgatgatgt 8868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Original strand, 25530 - 25696
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25530 tgattatattgtgttgttt--aagttattagtgatgatgaatacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgata 25627  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  25628 agttgtcttttattcatgaattgataatgtgatgtttgatgaat-aattattattatgaattgatgatgt 25696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 245 - 338
Target Start/End: Original strand, 37568 - 37661
Alignment:
Q  245 tgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-gagagtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  37568 tgatgatggttatgttaagttgatacgttgtcttttattcatgtattgctaatggaatgtttgatgaat-aattattattatgaattgatgatgt 37661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 43)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Original strand, 24630008 - 24630176
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  24630008 tgattatattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgata 24630107  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  24630108 agttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 24630176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Original strand, 30346618 - 30346786
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  30346618 tgattatattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgata 30346717  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  30346718 agttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 30346786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 160 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 31344045 - 31343867
Alignment:
Q  160 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgt 259  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||    
T  31344045 agtgagatattgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgaagatatctatgagttgttaggtgtacttgatgatgtatatgt 31343946  T
Q  260 taagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  31343945 taagttgataagctgtcttttattcatgaattgataaagagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 31343867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Original strand, 10103257 - 10103425
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  10103257 tgattatattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgttgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgata 10103356  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  10103357 agttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 10103425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Original strand, 12902567 - 12902735
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  12902567 tgattatattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacataatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgata 12902666  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  12902667 agttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 12902735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 24645269 - 24645101
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  24645269 tgattatattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgata 24645170  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  24645169 agttgtcttttattaatgaattggtaatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 24645101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 24648045 - 24647877
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  24648045 tgattatattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgata 24647946  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  24647945 agttgtcttttattaatgaattggtaatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 24647877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 27600489 - 27600321
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  27600489 tgattatattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgata 27600390  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||    
T  27600389 agttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattgttatgaattaatgatgt 27600321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 170 - 328
Target Start/End: Original strand, 27380954 - 27381112
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  27380954 tgattatatggtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgata 27381053  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaa 328  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  27381054 agttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaa 27381112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 170 - 328
Target Start/End: Original strand, 27384924 - 27385082
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  27384924 tgattatatggtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgata 27385023  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaa 328  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  27385024 agttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaa 27385082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 162 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 9784118 - 9783981
Alignment:
Q  162 tgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtta 261  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  9784118 tgagatgataattatattgtgttgttt--aagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgtttaatgtacttgatgatggttatgtta 9784021  T
Q  262 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9784020 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga 9783981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Original strand, 19663548 - 19663686
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-g 298  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  19663548 gtgatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgg 19663647  T
Q  299 agagtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19663648 aatgtttgatgaat-aattattattatgaaatgatgatgt 19663686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 20260345 - 20260207
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-g 298  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  20260345 gtgatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgg 20260246  T
Q  299 agagtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20260245 aatgtttgatgaat-aattattattatgaaatgatgatgt 20260207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 160 - 314
Target Start/End: Original strand, 41532404 - 41532548
Alignment:
Q  160 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgt 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  41532404 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgat-----------atctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgt 41532492  T
Q  260 taagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataa 314  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41532493 taaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataa 41532548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 6481872 - 6481734
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-g 298  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  6481872 gtgatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataggttgtcttttattcatgaattgctaatgg 6481773  T
Q  299 agagtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6481772 aacgtttgatgaat-aattattattatgaaatgatgatgt 6481734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 6485339 - 6485201
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-g 298  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  6485339 gtgatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataggttgtcttttattcatgaattgctaatgg 6485240  T
Q  299 agagtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6485239 aacgtttgatgaat-aattattattatgaaatgatgatgt 6485201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Original strand, 21074498 - 21074636
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatga 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  21074498 gtgatgatgacaacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaaaaa 21074597  T
Q  300 ga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
     | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21074598 aatgtttgatgaat-aattattattatgaaatgatgatgt 21074636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 203 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 9240759 - 9240624
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-gaga 301  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||      
T  9240759 atgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatgaattgctaatggaat 9240660  T
Q  302 gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9240659 gtttgatgaat-aattattattatgaaatgatgatgt 9240624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 209 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 37379115 - 37378986
Alignment:
Q  209 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-gagagtttga 307  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||    
T  37379115 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttga 37379016  T
Q  308 tgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37379015 tgaa-aaattattattatgaaatgatgatgt 37378986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 216 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 24647166 - 24647044
Alignment:
Q  216 gatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataa 314  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  24647166 gatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattggtaatgagatgtttgatgaat-a 24647068  T
Q  315 attattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| | |||||||    
T  24647067 attattattatgaattaatgatgt 24647044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 235 - 338
Target Start/End: Original strand, 10686272 - 10686375
Alignment:
Q  235 taaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-gagagtttgatgaataaattattattatgaaatgat 333  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10686272 taaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaat-aattattattatgaaatgat 10686370  T
Q  334 gatgt 338  Q
    |||||    
T  10686371 gatgt 10686375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 258
Target Start/End: Original strand, 6262204 - 6262263
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatg-tacttgatgatgattatg 258  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  6262204 gtgatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgttacatgatgatgattatg 6262263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 258
Target Start/End: Original strand, 19663482 - 19663541
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatg-tacttgatgatgattatg 258  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  19663482 gtgatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgttacatgatgatgattatg 19663541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 18808555 - 18808498
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  18808555 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 18808498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 23130490 - 23130433
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  23130490 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgtttatgtt 23130433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 23132957 - 23132900
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  23132957 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgtttatgtt 23132900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 23135204 - 23135147
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  23135204 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 23135147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Original strand, 23710082 - 23710139
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  23710082 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 23710139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Original strand, 24898753 - 24898810
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  24898753 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 24898810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Original strand, 24901228 - 24901285
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  24901228 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 24901285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Original strand, 24903705 - 24903762
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  24903705 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 24903762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Original strand, 24906182 - 24906239
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  24906182 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 24906239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Original strand, 24908657 - 24908714
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  24908657 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 24908714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 26504992 - 26504935
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  26504992 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 26504935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 26507470 - 26507413
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  26507470 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 26507413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 31344184 - 31344136
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgttca 69  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31344184 gatgtatatgttgttat---attaatataagatgattaatatgtgttgttca 31344136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Original strand, 32040040 - 32040097
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  32040040 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 32040097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Original strand, 34403049 - 34403106
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  34403049 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 34403106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 39681926 - 39681869
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  39681926 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 39681869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 1282281 - 1282232
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgttca 69  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1282281 gatgtatatgttgttattatat-aat-taagatgattaatatgtgttgttca 1282232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Original strand, 41532264 - 41532313
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgttca 69  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41532264 gatgtatatgttgttattatat-aat-taagatgattaatatgtgttgttca 41532313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 203 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 571017 - 570968
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 252  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  571017 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 570968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 237
Target Start/End: Original strand, 6262270 - 6262307
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaa 237  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  6262270 gtgatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaa 6262307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486 (Bit Score: 119; Significance: 9e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0486
Description:

Target: scaffold0486; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 160 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 8705 - 8540
Alignment:
Q  160 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgt 259  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  8705 agtgagatgttgattacatagtgtttttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgt 8606  T
Q  260 taagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattat 325  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  8605 taagttaataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatgtttgatgaat-gattattattat 8540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 8846 - 8797
Alignment:
Q  20 tgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgttca 69  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8846 tgtatatgttgttgttatattattataagatgattaatatgtgttgttca 8797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 178 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 11161 - 11001
Alignment:
Q  178 ttgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtct 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  11161 ttgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtct 11062  T
Q  278 tttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  11061 tttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 11001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Original strand, 68516 - 68684
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  68516 tgattatattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatggtgtttatgttaaattgata 68615  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  68616 agttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 68684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 162 - 301
Target Start/End: Original strand, 6915 - 7052
Alignment:
Q  162 tgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtta 261  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6915 tgagatgatgattatattgtgttgttt--aagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgtta 7012  T
Q  262 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7013 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga 7052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 6)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Original strand, 60285 - 60454
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaa-gttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgat 268  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  60285 tgattatattgtgttgttttaaaagttattagtgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgat 60384  T
Q  269 aagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  60385 aagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 60454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 133824 - 133767
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  133824 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 133767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 136293 - 136236
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  136293 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 136236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 138762 - 138705
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  138762 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 138705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 141231 - 141174
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  141231 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 141174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 143700 - 143643
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  143700 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 143643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Original strand, 6281 - 6448
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  6281 tgattatattgtgttgttttaaagttattagcgatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgata 6380  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgagagtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||| | |||||||    
T  6381 agttgtcttttattaatgaattgataatgagatgttgatgaat-aactattattatgaattaatgatgt 6448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 34025 - 33887
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatga 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34025 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatcgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatga 33926  T
Q  300 ga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  33925 gatgtttgatgaat-aattattattatgaattgatgatgt 33887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 200 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 28560 - 28466
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgat 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28560 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatcgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgat 28466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 162 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 18947 - 18773
Alignment:
Q  162 tgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtta 261  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18947 tgagatgatgattatattgtgttgtttca--gttattagtgatgatgattatgtgatgttatctataagttgttaaatgtacttgatgatggttatgtta 18850  T
Q  262 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||    
T  18849 agttgataagttgtcatttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aattgttattataaattgatgatgt 18773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 19091 - 19040
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgttca 69  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19091 gatgtatattttgttgttatattattataagatgattaatatgtgttgttca 19040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 104; Significance: 8e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Original strand, 34091 - 34256
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  34091 tgattatattgtgttgttttaaagttattagtgat---gattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgata 34187  T
Q  270 agttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  34188 agttgtcttttattaatgaattgatgatgagatgtttgatgaat-aattattattatgaattaatgatgt 34256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 109689 - 109551
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-g 298  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  109689 gtgatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgg 109590  T
Q  299 agagtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  109589 aatgtttgatgaat-aattattattatgaaatgatgatgt 109551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Original strand, 224133 - 224271
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-g 298  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  224133 gtgatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgg 224232  T
Q  299 agagtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  224233 aatgtttgatgaat-aattattattatgaaatgatgatgt 224271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 160 - 314
Target Start/End: Original strand, 15536 - 15680
Alignment:
Q  160 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgt 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15536 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgat-----------atctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgt 15624  T
Q  260 taagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataa 314  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15625 taaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataa 15680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Original strand, 15396 - 15445
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgttca 69  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15396 gatgtatatgttgttattatat-aat-taagatgattaatatgtgttgttca 15445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 162 - 301
Target Start/End: Original strand, 74286 - 74423
Alignment:
Q  162 tgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtta 261  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  74286 tgagatgatgattatatggtgttgttt--aatttattagtgaagatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgtta 74383  T
Q  262 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  74384 agttgataagttgtcttttattcatgagttgctaatgaga 74423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 288 - 150
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-g 298  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  288 gtgatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgg 189  T
Q  299 agagtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  188 aatgtttgatgaat-aattattattatgtaatgatgatgt 150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 200 - 333
Target Start/End: Original strand, 10812 - 10945
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-g 298  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  10812 gtgatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgg 10911  T
Q  299 agagtttgatgaataaattattattatgaaatgat 333  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10912 aatgtttgatgaat-aattattattatgaaatgat 10945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Original strand, 3507 - 3645
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-g 298  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  3507 gtgatgatgattatgtgatgttatttatgagttgttaaatgtacttgatgattgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgg 3606  T
Q  299 agagtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3607 aatgtttgatgaat-aattattattatgaaatgatgatgt 3645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 278 - 338
Target Start/End: Original strand, 1 - 61
Alignment:
Q  278 tttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    ||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1 tttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataa-ttattattatgaaatgatgatgt 61  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Original strand, 5512 - 5659
Alignment:
Q  191 aagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaat 290  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5512 aagttattagtgatgatgattatatgaagatatttatgagttcttaggtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaat 5611  T
Q  291 tgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||    
T  5612 tgataatgagatgtttgatgaat-aattgttattatgaattaatgatgt 5659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 202 - 297
Target Start/End: Original strand, 37195 - 37290
Alignment:
Q  202 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37195 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataat 37290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 162 - 301
Target Start/End: Original strand, 21293 - 21423
Alignment:
Q  162 tgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtta 261  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  21293 tgagatgatgattatattgtgttgttt-aaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgt-- 21389  T
Q  262 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga 301  Q
          ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21390 ------taagttgtcttttattcatgaattgctaatgaga 21423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 191 - 288
Target Start/End: Original strand, 62821 - 62918
Alignment:
Q  191 aagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  62821 aagttattagtgatgatgattacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 62918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0842 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0842
Description:

Target: scaffold0842; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 200 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 5330 - 5192
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat-g 298  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |    
T  5330 gtgatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtctattattcatgaaatgctaatgg 5231  T
Q  299 agagtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |  ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  5230 aatgtttgatgaat-aattattatgatgaattgatgatgt 5192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0380 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0380
Description:

Target: scaffold0380; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 4090 - 3974
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgata 269  Q
    |||||| ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4090 tgattatattgtgtagttt--aagttattagtgattatgattacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgata 3993  T
Q  270 agttgtcttttattcatga 288  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  3992 agttgtcttctattcatga 3974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 194 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 5917 - 5775
Alignment:
Q  194 ttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattga 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5917 ttattagtgatgatgattacatgatgatat--atgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat-agttgtcttttattcatgaattga 5821  T
Q  294 taa-tgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    ||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  5820 taattgagacgtttgatgaat-aagtattattatgaattgatgatgt 5775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 6016 - 5967
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgttca 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||    
T  6016 gatgtatatgttgttattatatta--ttaatatgattaatatgtgttgttca 5967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 191 - 288
Target Start/End: Original strand, 37179 - 37276
Alignment:
Q  191 aagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  37179 aagttattagtgatgatgattacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagtcgataagttgtcttctattcatga 37276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 222 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 70821 - 70705
Alignment:
Q  222 atctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattatt 320  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  70821 atctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataggttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aagtatt 70723  T
Q  321 attatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||| |||||||||    
T  70722 attatgaattgatgatgt 70705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 160 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 10884 - 10754
Alignment:
Q  160 agtgagatgttgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgt 259  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  10884 agtgagatgctgattacattgtgttgttttaaagttattagtgatgatgat-----------atctaagagttgttaagtgtacttgatgatggttatgt 10796  T
Q  260 taagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga 301  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  10795 taagttgataagttgtattttattcatgaatagataatgaga 10754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 11024 - 10975
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgttca 69  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  11024 gatgtatatgttgttattatattatta--agatgattaatatgtgttgttca 10975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 210 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 4199 - 4076
Alignment:
Q  210 ttacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||| | |||||    
T  4199 ttacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgctaatgagatggttgat 4100  T
Q  309 gaataaattattattatgaaatgat 333  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||    
T  4099 gaat-aattattgttatgaattgat 4076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 209 - 288
Target Start/End: Original strand, 23937 - 24016
Alignment:
Q  209 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 288  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23937 attacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 24016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 254 - 338
Target Start/End: Original strand, 115390 - 115473
Alignment:
Q  254 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||    
T  115390 ttatgttaagttgata-gttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaat-aagtatttttatgaattgatgatgt 115473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 19125 - 19066
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatg-tacttgatgatgattatg 258  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  19125 gtgatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgttacatgatgatgattatg 19066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 13004 - 12947
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  13004 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 12947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 20359 - 20302
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  20359 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 20302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 13567 - 13510
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  13567 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 13510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 9361 - 9304
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  9361 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 9304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 37434 - 37377
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  37434 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 37377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 40013 - 39956
Alignment:
Q  203 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  40013 atgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgcttatgtt 39956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1873 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 3)
Name: scaffold1873
Description:

Target: scaffold1873; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 279 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 700 - 641
Alignment:
Q  279 ttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 338  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  700 ttatccatgaattgataatgagatgtttgatgaataa-ttattattatgaattgatgatgt 641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1873; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 262 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 633 - 594
Alignment:
Q  262 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  633 agttgataagttgtcttttattcatgaatcgataatgaga 594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1873; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 749 - 691
Alignment:
Q  170 tgattacattgtgttgttttaaagttattagtgat-gatgattacatgatgttatctatga 229  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  749 tgattatattgtgttgttt--aagttattagtgattggtgattacatgatgttatccatga 691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 230 - 333
Target Start/End: Original strand, 163588 - 163691
Alignment:
Q  230 gttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaga-gtttgatgaataaattattattatgaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||   |||||||||  ||| |||||||| | ||| ||||| ||||||| |||||||    
T  163588 gttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttgataacttgttccttattcatgttttggtaatgagatgcttgctgaat-aattattgttatgaa 163686  T
Q  329 atgat 333  Q
     ||||    
T  163687 ttgat 163691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 200 - 237
Target Start/End: Original strand, 153803 - 153840
Alignment:
Q  200 gtgatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaa 237  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  153803 gtgatgatgattacatgatgtcatctatgagttgttaa 153840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0815 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0815
Description:

Target: scaffold0815; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 89 - 35
Alignment:
Q  209 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaag 263  Q
    ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  89 attacatgaggttacctttgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaag 35  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0679 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0679
Description:

Target: scaffold0679; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 259
Target Start/End: Original strand, 3265 - 3315
Alignment:
Q  209 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgt 259  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  3265 attacatgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgt 3315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 7000 - 6951
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgtt 67  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  7000 gatgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgtgttgtt 6951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 7065 - 7016
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgtt 67  Q
    |||| |||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  7065 gatgaatatgttgttgttgtattattataagatgatgaatatgtgttgtt 7016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 67
Target Start/End: Original strand, 44443 - 44492
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgtt 67  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  44443 gatgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgtgttgtt 44492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 67
Target Start/End: Original strand, 44508 - 44557
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgtt 67  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  44508 gatgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgtgttgtt 44557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 9109 - 9060
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgtt 67  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  9109 gatgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgtgttgtt 9060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 209 - 262
Target Start/End: Original strand, 173225 - 173278
Alignment:
Q  209 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaa 262  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  173225 attatatgatgttacctattagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaa 173278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 362094 - 362045
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgtt 67  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  362094 gatgaatatgttgttgttatattattataagatgatgaatatgtgttgtt 362045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 362257 - 362208
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgtt 67  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  362257 gatgaatatgttgttgttatattattataagatgataaatatgtgttgtt 362208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2015 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold2015
Description:

Target: scaffold2015; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 266
Target Start/End: Original strand, 444 - 496
Alignment:
Q  214 atgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttg 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  444 atgatgttacctatgagttgttaaatgtactcgaggagggttatgttaagttg 496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 67
Target Start/End: Original strand, 79888 - 79937
Alignment:
Q  18 gatgtatatgttgttattatattaatataagatgattaatatgtgttgtt 67  Q
    |||| ||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  79888 gatgaatatgttattgttatattattataagatgatgaatatgtgttgtt 79937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University