View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6253_low_6 (Length: 361)

Name: NF6253_low_6
Description: NF6253
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6253_low_6
NF6253_low_6
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (114-352)||(8441-8679)
[»] chr8 (20 HSPs)
chr8 (114-352)||(21100269-21100507)
chr8 (14-352)||(19766011-19766353)
chr8 (131-352)||(22289584-22289805)
chr8 (131-352)||(21942903-21943124)
chr8 (131-352)||(11348394-11348615)
chr8 (131-352)||(22368504-22368725)
chr8 (131-296)||(22830502-22830667)
chr8 (14-280)||(29333200-29333466)
chr8 (57-220)||(21826061-21826224)
chr8 (131-185)||(8313191-8313245)
chr8 (131-185)||(8324288-8324342)
chr8 (131-185)||(17132522-17132576)
chr8 (131-185)||(21954802-21954856)
chr8 (131-185)||(22101062-22101116)
chr8 (131-185)||(21380816-21380870)
chr8 (131-185)||(22034967-22035021)
chr8 (131-184)||(22097947-22098000)
chr8 (131-184)||(16420037-16420090)
chr8 (13-66)||(21826188-21826242)
chr8 (197-295)||(21267939-21268037)
[»] chr1 (9 HSPs)
chr1 (117-352)||(20072367-20072602)
chr1 (131-352)||(8651569-8651790)
chr1 (13-220)||(20392141-20392349)
chr1 (46-296)||(19783606-19783856)
chr1 (46-352)||(3988626-3988932)
chr1 (131-296)||(8948890-8949055)
chr1 (47-181)||(21800066-21800200)
chr1 (114-297)||(19877106-19877289)
chr1 (131-185)||(20236204-20236258)
[»] chr5 (22 HSPs)
chr5 (131-352)||(23520624-23520845)
chr5 (14-352)||(26846184-26846523)
chr5 (14-352)||(18071428-18071767)
chr5 (14-352)||(20597198-20597537)
chr5 (14-352)||(20603495-20603834)
chr5 (14-352)||(20792141-20792480)
chr5 (14-352)||(20609814-20610153)
chr5 (13-296)||(25117503-25117787)
chr5 (13-296)||(25176594-25176878)
chr5 (19-296)||(20439527-20439805)
chr5 (51-181)||(24954573-24954703)
chr5 (114-296)||(22947031-22947213)
chr5 (114-295)||(21386911-21387089)
chr5 (131-185)||(15734257-15734311)
chr5 (131-185)||(23746774-23746828)
chr5 (131-185)||(25008220-25008274)
chr5 (46-140)||(30761060-30761154)
chr5 (131-183)||(22318921-22318973)
chr5 (131-185)||(20620886-20620940)
chr5 (13-82)||(30760999-30761069)
chr5 (136-180)||(30764587-30764631)
chr5 (234-352)||(30764683-30764801)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (13-296)||(24143-24427)
[»] chr2 (15 HSPs)
chr2 (14-352)||(24821442-24821776)
chr2 (13-296)||(23160732-23161016)
chr2 (13-296)||(23571989-23572273)
chr2 (13-296)||(27630080-27630364)
chr2 (131-341)||(25372413-25372623)
chr2 (20-181)||(16774345-16774507)
chr2 (20-181)||(24796659-24796821)
chr2 (66-220)||(116181-116335)
chr2 (131-295)||(25369022-25369186)
chr2 (131-203)||(17867496-17867568)
chr2 (131-295)||(24169953-24170117)
chr2 (131-185)||(13051-13105)
chr2 (131-185)||(22046097-22046151)
chr2 (131-185)||(25356235-25356289)
chr2 (131-185)||(27626317-27626371)
[»] chr3 (30 HSPs)
chr3 (13-296)||(13505872-13506156)
chr3 (48-296)||(15945161-15945409)
chr3 (14-352)||(10603891-10604230)
chr3 (14-352)||(22165662-22166001)
chr3 (114-352)||(4369218-4369456)
chr3 (14-352)||(16654233-16654573)
chr3 (114-349)||(14446994-14447229)
chr3 (144-340)||(17386313-17386509)
chr3 (117-352)||(20157888-20158123)
chr3 (13-296)||(12161421-12161705)
chr3 (131-343)||(13693432-13693644)
chr3 (57-296)||(3340594-3340833)
chr3 (114-352)||(12423807-12424045)
chr3 (47-181)||(15643767-15643901)
chr3 (131-340)||(3278026-3278235)
chr3 (47-181)||(10161580-10161714)
chr3 (194-352)||(18979473-18979631)
chr3 (131-185)||(7599079-7599133)
chr3 (131-185)||(10145734-10145788)
chr3 (131-185)||(13137606-13137660)
chr3 (131-185)||(13188854-13188908)
chr3 (131-185)||(15630393-15630447)
chr3 (131-184)||(13196866-13196919)
chr3 (13-93)||(15945391-15945472)
chr3 (131-185)||(12188512-12188566)
chr3 (131-185)||(12194926-12194980)
chr3 (131-185)||(16374916-16374970)
chr3 (13-66)||(3340576-3340630)
chr3 (14-66)||(20157811-20157864)
chr3 (14-65)||(17386561-17386613)
[»] scaffold0506 (1 HSPs)
scaffold0506 (46-352)||(3432-3738)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (15-352)||(11998-12336)
[»] scaffold0059 (2 HSPs)
scaffold0059 (131-352)||(10691-10912)
scaffold0059 (131-352)||(18692-18913)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (131-352)||(234486-234707)
[»] chr4 (10 HSPs)
chr4 (115-352)||(3353136-3353373)
chr4 (111-352)||(15864049-15864290)
chr4 (20-181)||(13821597-13821759)
chr4 (57-285)||(15261461-15261689)
chr4 (131-185)||(22109683-22109737)
chr4 (131-185)||(15253068-15253122)
chr4 (234-352)||(16680912-16681030)
chr4 (13-66)||(15261443-15261497)
chr4 (22-82)||(3353410-3353471)
chr4 (14-65)||(15864309-15864361)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (14-352)||(19608-19938)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (14-352)||(22351-22690)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (14-352)||(21400-21738)
[»] chr7 (17 HSPs)
chr7 (14-352)||(16150861-16151200)
chr7 (131-352)||(15921438-15921658)
chr7 (13-296)||(16530618-16530901)
chr7 (13-296)||(16634761-16635044)
chr7 (46-296)||(16761167-16761417)
chr7 (138-352)||(824174-824388)
chr7 (131-352)||(15064308-15064529)
chr7 (131-352)||(20106820-20107041)
chr7 (20-181)||(13672545-13672707)
chr7 (20-181)||(18594633-18594795)
chr7 (20-181)||(18616889-18617051)
chr7 (131-295)||(48803296-48803460)
chr7 (131-185)||(8716587-8716641)
chr7 (131-185)||(14549819-14549873)
chr7 (131-185)||(18286348-18286402)
chr7 (131-185)||(16467052-16467106)
chr7 (131-184)||(13656657-13656710)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (131-352)||(43978-44199)
scaffold0037 (131-352)||(51367-51588)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (131-352)||(132174-132395)
[»] chr6 (10 HSPs)
chr6 (14-352)||(21561808-21562147)
chr6 (131-352)||(18446752-18446973)
chr6 (20-181)||(20017604-20017766)
chr6 (20-181)||(22166919-22167081)
chr6 (47-181)||(22768522-22768656)
chr6 (47-181)||(20168921-20169055)
chr6 (131-295)||(18010461-18010625)
chr6 (14-139)||(11218339-11218465)
chr6 (131-185)||(8725438-8725492)
chr6 (131-185)||(24856681-24856735)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (46-296)||(29082-29332)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (17-352)||(23875-24210)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (114-349)||(121900-122135)
scaffold0029 (15-72)||(122169-122227)
[»] scaffold0402 (2 HSPs)
scaffold0402 (131-352)||(6430-6651)
scaffold0402 (14-65)||(6690-6742)
[»] scaffold0525 (2 HSPs)
scaffold0525 (114-352)||(684-922)
scaffold0525 (14-66)||(942-995)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (131-352)||(5040-5261)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (117-352)||(19410-19645)
scaffold0004 (131-260)||(253245-253374)
scaffold0004 (267-352)||(253395-253480)
[»] scaffold1095 (1 HSPs)
scaffold1095 (131-296)||(1878-2041)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (131-352)||(7943-8163)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (14-296)||(25745-26022)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (131-295)||(32990-33154)
[»] scaffold1879 (1 HSPs)
scaffold1879 (114-295)||(336-517)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (131-295)||(11142-11306)
[»] scaffold0202 (1 HSPs)
scaffold0202 (212-352)||(1708-1848)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (114-183)||(21631-21700)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (131-295)||(39171-39335)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (114-185)||(54964-55035)
[»] scaffold1620 (1 HSPs)
scaffold1620 (131-185)||(426-480)
[»] scaffold1571 (1 HSPs)
scaffold1571 (131-185)||(1345-1399)
[»] scaffold0577 (1 HSPs)
scaffold0577 (131-185)||(4829-4883)
[»] scaffold0473 (1 HSPs)
scaffold0473 (131-185)||(12761-12815)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (131-185)||(10140-10194)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (131-184)||(115371-115424)
scaffold0020 (131-184)||(119675-119728)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (224-296)||(50299-50371)


Alignment Details
Target: scaffold0215 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 114 - 352
Target Start/End: Original strand, 8441 - 8679
Alignment:
Q  114 acctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttga 213  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8441 acctgtgggtcatcatcaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttga 8540  T
Q  214 gtgtataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggtc 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||    
T  8541 gtgtataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtttccctaaatccttttaattccttggtc 8640  T
Q  314 cttaccaaccccaaattgcctagctatgtaagtgatgat 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8641 cttaccaaccccaaattgcctagctatgtaagtgatgat 8679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 114 - 352
Target Start/End: Original strand, 21100269 - 21100507
Alignment:
Q  114 acctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttga 213  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21100269 acctgtgggtcatcatcaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttga 21100368  T
Q  214 gtgtataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggtc 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  21100369 gtgtataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtttccctcaatccttttaattccttggtc 21100468  T
Q  314 cttaccaaccccaaattgcctagctatgtaagtgatgat 352  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21100469 ctcaccaaccccaaattgcctagctatgtaagtgatgat 21100507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 19766353 - 19766011
Alignment:
Q  14 catcatggtcatggtgctcctcctcatggatca-ttgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgtg 112  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||  || |||||| ||   | |||   ||    
T  19766353 catcatggtcatggtgctcctcatcatggtgcaattgtgcaccttcctcttcttggtgcaaatgtgcatcttcctctccttcatcatcgtgttcttcatg 19766254  T
Q  113 cacctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttg 212  Q
     |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||| | |||||||||||| || |||    
T  19766253 tacctgtggatcatcaacaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtctgagatgggttagaaagtaaaatcaaaataggcacatttagtttg 19766154  T
Q  213 agtgtataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgt---ccctcaatcctctgaattcctt 309  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| | |     ||||||  | | ||| ||||    
T  19766153 agtgtgtaggacatgggtggacgaggcttaatgaagttcataaagataagggtctctatgttaagcctattttttttcttctcaattttgttaatccctt 19766054  T
Q  310 ggtccttaccaaccccaaattgcctagctatgtaagtgatgat 352  Q
    |||||| ||| || || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19766053 ggtcctcacccactcccaattgcctagctatgtatgtgatgat 19766011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 131 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 22289805 - 22289584
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgtataggacatgggt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  22289805 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgagataggaagtataattaaaataggcacattgagtttgagtgtataggtcatgggt 22289706  T
Q  231 ggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggtccttaccaaccccaaatt 330  Q
    |||||| | || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |  || |||||||||| ||| || |  ||||    
T  22289705 ggacgatgattaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccactctcaatt 22289606  T
Q  331 gcctagctatgtaagtgatgat 352  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  22289605 gcctagctatataggtgatgat 22289584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 131 - 352
Target Start/End: Original strand, 21942903 - 21943124
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgtataggacatgggt 230  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | || |||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  21942903 aacatacaacaaattttcctccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtataatcaaaacaggcacattgagtttaagtgtataggccatgggt 21943002  T
Q  231 ggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggtccttaccaaccccaaatt 330  Q
    || |||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||| | |||||| | ||| || || ||||    
T  21943003 ggtcgaggttttatgaagttcatagagataagggcctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgttaatccattggtcttcacccactcccaatt 21943102  T
Q  331 gcctagctatgtaagtgatgat 352  Q
    ||||| ||||||| ||||||||    
T  21943103 gcctaactatgtatgtgatgat 21943124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 131 - 352
Target Start/End: Original strand, 11348394 - 11348615
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgtataggacatgggt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  11348394 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtataattaaaacaggcacattgagtttaagtgtataggccatgggt 11348493  T
Q  231 ggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggtccttaccaaccccaaatt 330  Q
    || |||||||| ||||| |||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||| | |||||| | ||| || || ||||    
T  11348494 ggtcgaggttttatgaatttcaaagagataagggcctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgttaatccattggtcttcacccactcccaatt 11348593  T
Q  331 gcctagctatgtaagtgatgat 352  Q
    ||||| ||||||  ||||||||    
T  11348594 gcctaactatgtctgtgatgat 11348615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 131 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 22368725 - 22368504
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgtataggacatgggt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | || |||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  22368725 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtataatcaaaacaggcacattgagtttaagtgtataggccatgggt 22368626  T
Q  231 ggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggtccttaccaaccccaaatt 330  Q
    || | |||||| || ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| | |||||||||| | | ||| |||||||| | ||| || |  ||||    
T  22368625 ggtcaaggttttataaagttcatagagataagggcctctatgttaagcctattttttccctcaatcttgttaatcccttggtcttcacccactctcaatt 22368526  T
Q  331 gcctagctatgtaagtgatgat 352  Q
    ||||| ||||||| ||||||||    
T  22368525 gcctaactatgtatgtgatgat 22368504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 131 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 22830667 - 22830502
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgtataggacatgggt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  22830667 aacatacaacaaattttcttccacctcggtattagtccgagatgggttaggaagtataattaaaatatgcacattgagtttgagtgtatatgtcatgggt 22830568  T
Q  231 ggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatc 296  Q
    |||||| | || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  22830567 ggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcttattgtttccctcaatc 22830502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 29333466 - 29333200
Alignment:
Q  14 catcatggtcatggtgctcctcctcatggatca-ttgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctct-atgt 111  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||  |  |||||| ||   | ||| ||||    
T  29333466 catcatggtcatggtgctcttcatcatggtgcaattgtgcaccttcctcttcttggtgcaaatgtgcatcttcctcgccttcatcatcgtgttctcatgt 29333367  T
Q  112 gcacctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagctt 211  Q
      |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||| | ||||||||||||||| ||    
T  29333366 --acctgtggatcatcaacaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagttcgagatgggttagaaagtataatcaaaataggcacattgagttt 29333269  T
Q  212 gagtgtataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcct 280  Q
    |||||| ||||||||||||||| | || || |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  29333268 gagtgtgtaggacatgggtggatggggcttaatgaagttcataaagataagggtctctatgttaagcct 29333200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 57 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 21826224 - 21826061
Alignment:
Q  57 tcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgtgcacctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacct 156  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21826224 tcctcatcatggtgcatttgtgcaccttcctcttcttcattatgctgttctatgtgcacctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacct 21826125  T
Q  157 cggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgtata 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |  ||| | | | |||||||||||||||||||||||    
T  21826124 cggtgttagtccgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagcttgagtgtata 21826061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 8313245 - 8313191
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagt 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8313245 aacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagt 8313191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 185
Target Start/End: Original strand, 8324288 - 8324342
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagt 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8324288 aacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagt 8324342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 17132576 - 17132522
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagt 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17132576 aacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagt 17132522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 21954856 - 21954802
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagt 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21954856 aacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagt 21954802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 185
Target Start/End: Original strand, 22101062 - 22101116
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagt 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22101062 aacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagt 22101116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 21380870 - 21380816
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagt 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  21380870 aacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagaagggttaggaagt 21380816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 185
Target Start/End: Original strand, 22034967 - 22035021
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagt 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  22034967 aacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtacgagatgggttaggaagt 22035021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 131 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 22098000 - 22097947
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaag 184  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22098000 aacatacaacaaattctcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaag 22097947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 184
Target Start/End: Original strand, 16420037 - 16420090
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaag 184  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16420037 aacatacaacaaattcgcctccacctcggtgttagtccaagatgggttaggaag 16420090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 21826242 - 21826188
Alignment:
Q  13 tcatcatggtcatggtgctcctcctcatggatca-ttgtgcaccttcctcttctt 66  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  21826242 tcatcatggtcatggtgctcctcatcatggtgcatttgtgcaccttcctcttctt 21826188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 21268037 - 21267939
Alignment:
Q  197 aggcacattgagcttgagtgtataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaat 295  Q
    |||||| ||||| || |||| ||| | |||||||||| || | || ||||| |||||||| | |||||| || ||||||||||||||||  ||||||||    
T  21268037 aggcacgttgagtttaagtgcataagtcatgggtggatgatgcttaatgaaattcatagaaataagggtttcaatgttaagcctattgttgccctcaat 21267939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 9)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 117 - 352
Target Start/End: Original strand, 20072367 - 20072602
Alignment:
Q  117 tgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtg 216  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20072367 tgtgggtcatcatcaacatacaaaaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtg 20072466  T
Q  217 tataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggtcctt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||     
T  20072467 tataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtttccctcaatccttttaattccttggtcctc 20072566  T
Q  317 accaaccccaaattgcctagctatgtaagtgatgat 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20072567 accaaccccaaattgcctagctatgtaagtgatgat 20072602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 131 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 8651790 - 8651569
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgtataggacatgggt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||     
T  8651790 aacatacaacaaattttcttccacctcagtgttagtccgagataggttaggaagtataattaaaataggcacattgaatttgagtgtataggccatgggg 8651691  T
Q  231 ggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggtccttaccaaccccaaatt 330  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |  || |||||||||| ||| || || ||||    
T  8651690 ggacgaggtttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccactcccaatt 8651591  T
Q  331 gcctagctatgtaagtgatgat 352  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  8651590 gcctagctatgtatgtgatgat 8651569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20392349 - 20392141
Alignment:
Q  13 tcatcatggtcatggtgctcctcctcatggatcatt-gtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgt 111  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| || | |||||||    
T  20392349 tcatcatggttatggtgctcctcatcatggtgcatttgtgcaccttcctcttcttagtgcaagtgggcaccttctgcttcttcattacgctgttctatgt 20392250  T
Q  112 gcacctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagctt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||| | | | ||||||||||||||    
T  20392249 gcacctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctt 20392150  T
Q  212 gagtgtata 220  Q
    |||||||||    
T  20392149 gagtgtata 20392141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 46 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 19783856 - 19783606
Alignment:
Q  46 attgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgtgcacctgtgggtcatcattaacatacaacaaatt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||   | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19783856 attgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccttcctcgtcttcattatcgtgttctacatgcacctgtgggtcatcattaacatacaacaaatt 19783757  T
Q  146 ttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgtataggacatgggtggacgaggtttgatg 245  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||  ||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||    | |||  | |||||||| |||    
T  19783756 ttcttccacctcggtgttagtcagagataggttagaaagtaaaatcaaaatgggcacgttgagtttgagtgtataaacaaaggggagtcgaggttttatg 19783657  T
Q  246 aagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatc 296  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  19783656 aagttcatagagataagggtgtctatgtttagcctattgtttccctcaatc 19783606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 46 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 3988932 - 3988626
Alignment:
Q  46 attgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgtgcacctgtgggtcatcattaacatacaacaaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||  |  |||||||||   | |||   || |||| ||| ||||||  ||||||||||| |||    
T  3988932 attgtgcaccttcctcttcttggtgcaaatgtgcatcttcctcgccttcattatcgtgttcttcatgtacctatggatcatcaacaacatacaacatatt 3988833  T
Q  146 ttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgtataggacatgggtggacgaggtttgatg 245  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||| | ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || |||    
T  3988832 ttcttccaccttggtgttagtccgagatgggttagaaagtataatcaaaatagacacattgagtttgagtgtgtaggacatgggtggacggggcttaatg 3988733  T
Q  246 aagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggtccttaccaaccccaaattgcctagctatgtaag 345  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  |   ||| |||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||| |    
T  3988732 aagttcataaagataagggtctctatgttaagcctattgcttccctcaattttggtaatcccttggtcctcacccactcccaattgcctagctaggtatg 3988633  T
Q  346 tgatgat 352  Q
    |||||||    
T  3988632 tgatgat 3988626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 131 - 296
Target Start/End: Original strand, 8948890 - 8949055
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgtataggacatgggt 230  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||| || | |||||| | |||| |     
T  8948890 aacatacaacaaattttcttcaacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtataattaaaacaggcacattgagtttaaatgtatatgccatgtgg 8948989  T
Q  231 ggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatc 296  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  8948990 ggacgaggtttaatgaagttcatagagatgagggtctctatgttaagcttattgtttccctcaatc 8949055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 47 - 181
Target Start/End: Original strand, 21800066 - 21800200
Alignment:
Q  47 ttgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgtgcacctgtgggtcatcattaacatacaacaaattt 146  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  21800066 ttgtgcaccttcctcttcctgatgcaagtgtgcatcctctgtttcttcattaggctgctctatgtgcacctgtgggtcatcagcaacatacaacaaattt 21800165  T
Q  147 tcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagg 181  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21800166 gcttccacctcggtgttagttcgagatgggttagg 21800200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 114 - 297
Target Start/End: Original strand, 19877106 - 19877289
Alignment:
Q  114 acctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttga 213  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  || || || |||||||||||| ||||    
T  19877106 acctgtggatcatcaccaacatacaacaagttttcttccacctcggtgttagtccgagataggttagaaagtagaaataaaagaggcacattgagtttga 19877205  T
Q  214 gtgtataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcc 297  Q
    |||||||   ||| |||||| ||||||  |||||||||||||| |  |||||   |||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  19877206 gtgtatatttcataggtggatgaggttgaatgaagttcatagaaatgagggtcggtatgttaagcatattgttgccctcaatcc 19877289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 20236258 - 20236204
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagt 185  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  20236258 aacatacaacaaatttttctccaccttggggttagtccgagatgggttaggaagt 20236204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 22)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 131 - 352
Target Start/End: Original strand, 23520624 - 23520845
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgtataggacatgggt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23520624 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgtataggacatgggt 23520723  T
Q  231 ggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggtccttaccaaccccaaatt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23520724 ggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtttccctcaatccttttaattccttggtcctcaccaaccccaaatt 23520823  T
Q  331 gcctagctatgtaagtgatgat 352  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  23520824 gcctagctatgtaagtgatgat 23520845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 26846523 - 26846184
Alignment:
Q  14 catcatggtcatggtgctcctcctcatggatca-ttgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgtg 112  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||  |  |||||| ||   | |||   ||    
T  26846523 catcatggtcatggtgctcctcatcatggtgcaattgtgcaccttcctcttcttggtgcaaatgttcatcttcctcaccttcatcatcgtgttcttcatg 26846424  T
Q  113 cacctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttg 212  Q
     |||| ||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  ||| | ||||||||||||||| |||    
T  26846423 tacctatggatgatcaacaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttattccaagatgggttagaaagtataatcaaaataggcacattgagtttg 26846324  T
Q  213 agtgtataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggt 312  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  | | ||| |||||||    
T  26846323 agtgtgtaggacatgggtggacggggcttaatgaagttcataaagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatgttgttaatcccttggt 26846224  T
Q  313 ccttaccaaccccaaattgcctagctatgtaagtgatgat 352  Q
    ||| ||| || || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  26846223 cctcacccactcccaattgcctagctatgtatgtgatgat 26846184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 18071767 - 18071428
Alignment:
Q  14 catcatggtcatggtgctcctcctcatggatca-ttgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgtg 112  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||  |  |||||||||   | |||   ||    
T  18071767 catcatggtcatggtgctcctcatcatggtacaattgtgcaccttcctcttcttggtgctaatgtgcatcttcctcgccttcattatcgtgttcttcatg 18071668  T
Q  113 cacctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttg 212  Q
     |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| | ||||||||||||||| |||    
T  18071667 tacctgtggatcatcaacaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagaaagtataatcaaaataggcacattgagtttg 18071568  T
Q  213 agtgtataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggt 312  Q
    ||||  ||||||||||||||| | || || |||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||  |||||||||  |   ||| |||||||    
T  18071567 agtgcgtaggacatgggtggatggggcttaatgaagttcataaagagaagggtctttatgttaagcctattggttccctcaattttggtaatcccttggt 18071468  T
Q  313 ccttaccaaccccaaattgcctagctatgtaagtgatgat 352  Q
    ||| ||| || || |||||||||| |||||| ||||||||    
T  18071467 cctcacccactcctaattgcctaggtatgtatgtgatgat 18071428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 352
Target Start/End: Original strand, 20597198 - 20597537
Alignment:
Q  14 catcatggtcatggtgctcctcctcatggatca-ttgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgtg 112  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||  || |||| |||||||||||||||||||||| | |||| | ||  |  |||||||||   | |||   ||    
T  20597198 catcatggtcatggtgctccttatcatggtacaattgtccaccttcctcttcttggtgcaaatatgcatcttcctcgccttcattatcgtgttcttcatg 20597297  T
Q  113 cacctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttg 212  Q
     |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| | ||||||||||||||| |||    
T  20597298 tacctgtggatcatcaacaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagaaagtataatcaaaataggcacattgagtttg 20597397  T
Q  213 agtgtataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggt 312  Q
    ||||  ||||||||||||||| | || || |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |   ||| |||||||    
T  20597398 agtgcgtaggacatgggtggatggggcttaatgaagttcataaagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaattttggtaatcccttggt 20597497  T
Q  313 ccttaccaaccccaaattgcctagctatgtaagtgatgat 352  Q
    ||| ||| || |  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  20597498 cctcacccactctcaattgcctagctatgtatgtgatgat 20597537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 352
Target Start/End: Original strand, 20603495 - 20603834
Alignment:
Q  14 catcatggtcatggtgctcctcctcatggatca-ttgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgtg 112  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||  || |||| |||||||||||||||||||||| | |||| | ||  |  |||||||||   | |||   ||    
T  20603495 catcatggtcatggtgctccttatcatggtacaattgtccaccttcctcttcttggtgcaaatatgcatcttcctcgccttcattatcgtgttcttcatg 20603594  T
Q  113 cacctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttg 212  Q
     |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| | ||||||||||||||| |||    
T  20603595 tacctgtggatcatcaacaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagaaagtataatcaaaataggcacattgagtttg 20603694  T
Q  213 agtgtataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggt 312  Q
    ||||  ||||||||||||||| | || || |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |   ||| |||||||    
T  20603695 agtgcgtaggacatgggtggatggggcttaatgaagttcataaagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaattttggtaatcccttggt 20603794  T
Q  313 ccttaccaaccccaaattgcctagctatgtaagtgatgat 352  Q
    ||| ||| || |  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  20603795 cctcacccactctcaattgcctagctatgtatgtgatgat 20603834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 352
Target Start/End: Original strand, 20792141 - 20792480
Alignment:
Q  14 catcatggtcatggtgctcctcctcatggatca-ttgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgtg 112  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||     |||||||||   | |||   ||    
T  20792141 catcatggtcatggtgctccttatcatggtacaattgtgcaccttcctcttcttggtgcaaatgtgcatcttccttgccttcattatcgtgttcttcatg 20792240  T
Q  113 cacctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttg 212  Q
      ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| | |||||||||| |||| |||    
T  20792241 tgcctgtggatcatcaacaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagaaagtataatcaaaataggcacaatgagtttg 20792340  T
Q  213 agtgtataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggt 312  Q
    ||||| ||||||||||||||| | || || |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |   | | |||||||    
T  20792341 agtgtgtaggacatgggtggatggggcttaatgaagttcataaagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatttttgtactcccttggt 20792440  T
Q  313 ccttaccaaccccaaattgcctagctatgtaagtgatgat 352  Q
    ||| ||| || || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  20792441 cctcacccactcccaattgcctagctatgtatgtgatgat 20792480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 352
Target Start/End: Original strand, 20609814 - 20610153
Alignment:
Q  14 catcatggtcatggtgctcctcctcatggatca-ttgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgtg 112  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||  || |||| |||||||||||||||||||||| | |||| | ||  |  |||||||||   | |||   ||    
T  20609814 catcatggtcatggtgctccttatcatggtacaattgtccaccttcctcttcttggtgcaaatatgcatcttcctcgccttcattatcgtgttcttcatg 20609913  T
Q  113 cacctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttg 212  Q
     |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| | |||||||| |||||| |||    
T  20609914 tacctgtggatcatcaacaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagaaagtataatcaaaataggcatattgagtttg 20610013  T
Q  213 agtgtataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggt 312  Q
    ||||  |||||||||||||||   || || |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |   ||| |||||||    
T  20610014 agtgcgtaggacatgggtggatagggcttaatgaagttcataaagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaattttggtaatcccttggt 20610113  T
Q  313 ccttaccaaccccaaattgcctagctatgtaagtgatgat 352  Q
    ||| ||| || |  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  20610114 cctcacccactctcaattgcctagctatgtatgtgatgat 20610153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 296
Target Start/End: Original strand, 25117503 - 25117787
Alignment:
Q  13 tcatcatggtcatggtgctcctcctcatggatca-ttgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgt 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| |  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    |||||||| | | | ||||  |    
T  25117503 tcatcatggtcatggtgcttctcatcattgtgcaattgtgcaccttcctcttcttggtgcaattgtgcaccttccatgtcttcattgttctgttctacat 25117602  T
Q  112 gcacctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagctt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   || | | | ||||| ||||| ||    
T  25117603 gcacctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggcagtaatatcaaagtgggcacgttgagttt 25117702  T
Q  212 gagtgtataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatc 296  Q
    |||||||||    | |||    |||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  25117703 gagtgtataaacaaaggggattcgaggttttatgaaattcatagagataagggtgtctatgtttagcctattgtttccctcaatc 25117787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 296
Target Start/End: Original strand, 25176594 - 25176878
Alignment:
Q  13 tcatcatggtcatggtgctcctcctcatggatca-ttgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgt 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| |  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    |||||||| | | | ||||  |    
T  25176594 tcatcatggtcatggtgcttctcatcattgtgcaattgtgcaccttcctcttcttggtgcaattgtgcaccttccatgtcttcattgttctgttctacat 25176693  T
Q  112 gcacctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagctt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   || | | | ||||| ||||| ||    
T  25176694 gcacctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggcagtaatatcaaagtgggcacgttgagttt 25176793  T
Q  212 gagtgtataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatc 296  Q
    |||||||||    | |||    |||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  25176794 gagtgtataaacaaaggggattcgaggttttatgaaattcatagagataagggtgtctatgtttagcctattgtttccctcaatc 25176878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 296
Target Start/End: Original strand, 20439527 - 20439805
Alignment:
Q  19 tggtcatggtgctcctcctcatggatca-ttgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgtgcacct 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||| || | ||||| |||||||    
T  20439527 tggtcatggtgctcctcatcatggtgcaattgtgcaccttcctcttcttggtgcgggtgtgcaccttccacgtcttcattaggctgttctatatgcacct 20439626  T
Q  118 gtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgt 217  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   || | | | |||||||| ||||||||  |    
T  20439627 gtgggtcatcatcaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggcaataatatcaaagtgggcacattaagcttgagcat 20439726  T
Q  218 ataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatc 296  Q
    |||    | |||    |||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  20439727 ataaacaaaggggattcgaggttttatgaaattcatagagataagggtgtctatgtttagcctattgtttccctcaatc 20439805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 51 - 181
Target Start/End: Original strand, 24954573 - 24954703
Alignment:
Q  51 gcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgtgcacctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttctt 150  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  24954573 gcaccttcctcttcttgatgcaagtgtgcaccctctatttcttcattatgctgttctatgtgcacctgtgggtcatcatcaacatacaacaaatttgctt 24954672  T
Q  151 ccacctcggtgttagtccgagatgggttagg 181  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24954673 ccacctcggtgttagttcgagatgggttagg 24954703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 114 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 22947213 - 22947031
Alignment:
Q  114 acctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttga 213  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || || || |||||||||||||||||    
T  22947213 acctgtggaccatcaccaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagaaagtataaataaaagaggcacattgagcttga 22947114  T
Q  214 gtgtataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatc 296  Q
    ||  ||| | ||  || ||| |||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  22947113 gttcatatgccacaggcggatgaggcttgatgaagttcatagaaataagggtctctatgttaagcctattgttgccctcaatc 22947031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 21387089 - 21386911
Alignment:
Q  114 acctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttga 213  Q
    ||||| || ||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||  || || ||||||||||||||| ||||    
T  21387089 acctgaggatcatcaccaacatacaaaaaatttgcttccacctcggtgttagtccaag---ggttaggaagtagaaataaaataggcacattgagtttga 21386993  T
Q  214 gtgtataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaat 295  Q
    ||  ||| | ||| || |||||| | || |||||||||||||| |  ||||| || |||||||| |||||||  ||||||||    
T  21386992 gttcatatgccataggcggacgatgcttaatgaagttcatagaaatgagggtttcaatgttaagtctattgttgccctcaat 21386911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 15734311 - 15734257
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagt 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15734311 aacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagt 15734257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 23746828 - 23746774
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagt 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23746828 aacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagt 23746774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 185
Target Start/End: Original strand, 25008220 - 25008274
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagt 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25008220 aacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagt 25008274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 46 - 140
Target Start/End: Original strand, 30761060 - 30761154
Alignment:
Q  46 attgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgtgcacctgtgggtcatcattaacatacaac 140  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||     |||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  30761060 attgtgcaccttgctcttcttggtgcaagtgtgcaccttccacatcttcattattttcttctatgtgcacctgtgggtcattatgaacatacaac 30761154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 131 - 183
Target Start/End: Original strand, 22318921 - 22318973
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaa 183  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22318921 aacatacaacaaatttgcctccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaa 22318973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 20620940 - 20620886
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagt 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  20620940 aacatacaacaaattttcctccaccttggggttagtccgagatgggttaggaagt 20620886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 82
Target Start/End: Original strand, 30760999 - 30761069
Alignment:
Q  13 tcatcatggtcatggtgctcctcctcatggatca-ttgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcacc 82  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30760999 tcattatggtcatggtgctcctcatcatggtgcaattgtgcaccttcctcttcttggtgcaattgtgcacc 30761069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 136 - 180
Target Start/End: Original strand, 30764587 - 30764631
Alignment:
Q  136 acaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttag 180  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30764587 acaacaaattcgcttccacctcggtgttagtccgagatgggttag 30764631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 352
Target Start/End: Original strand, 30764683 - 30764801
Alignment:
Q  234 cgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggtccttaccaaccccaaattgcc 333  Q
    |||||||| ||||| |||||||  | |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| | |  || |||||||| | || ||| || | |||||    
T  30764683 cgaggttttatgaaattcatagctataagggtgtctatgtttagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcttcactaactcctagttgcc 30764782  T
Q  334 tagctatgtaagtgatgat 352  Q
    |||||||||| || |||||    
T  30764783 tagctatgtatgttatgat 30764801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 24427 - 24143
Alignment:
Q  13 tcatcatggtcatggtgctcctcctcatggatca-ttgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgt 111  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  24427 tcatcatggttatggtgctcctcatcatggtgcaattgtgcatcttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccgtctgcttcttcattatgctgctctatgt 24328  T
Q  112 gcacctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagctt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   || | |||||||||||| |||||    
T  24327 gcacctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggtaataatatcaaaataggcacattaagctt 24228  T
Q  212 gagtgtataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatc 296  Q
    |||||||||    | |||    |||||||| | ||| |||||||||| |||||| |||||||| || |||||||  |||||||||    
T  24227 gagtgtataaacaaaggggattcgaggttttaggaaattcatagagataagggtttctatgtttagtctattgttaccctcaatc 24143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 15)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 352
Target Start/End: Original strand, 24821442 - 24821776
Alignment:
Q  14 catcatggtcatggtgctcctcctcatggatca-ttgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgtg 112  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |  |||||| ||   | |||   ||    
T  24821442 catcatggtcatggtgctcctcatcatggtgcaattgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccttcctcgccttcatcatcgtgttcttcatg 24821541  T
Q  113 cacctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttg 212  Q
     |||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||    
T  24821542 tacctatggatcatcaacaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtacaatcaaaataggcacattgagtttg 24821641  T
Q  213 agtgtataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggt 312  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |     ||||||||||||| |||||||||  | | ||| |||||||    
T  24821642 agtgtgtagaacatgggtggacgaggcttaatgaagttcatagagataagggtct-----ttaagcctattgtttccctcaattttgttaatcccttggt 24821736  T
Q  313 ccttaccaaccccaaattgcctagctatgtaagtgatgat 352  Q
    ||| ||| || || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  24821737 cctcacccactcccaattgcctagctatgtatgtgatgat 24821776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 296
Target Start/End: Original strand, 23160732 - 23161016
Alignment:
Q  13 tcatcatggtcatggtgctcctcctcatggatca-ttgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgt 111  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  | |||||||    
T  23160732 tcatcagggtcatggtgctcctcatcatggtgcaattgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccttctgcttcttcatgatgttggtctatgt 23160831  T
Q  112 gcacctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagctt 211  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||| | | | ||||||||||||||    
T  23160832 gcacctgtgggtcatcatgaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctt 23160931  T
Q  212 gagtgtataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatc 296  Q
    |||||||||    | |||    || ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||  |||||||||    
T  23160932 gagtgtataaacaaaggggattcggggttttatgaaattcatagagataagggtatctatgttgagtctattgttaccctcaatc 23161016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 296
Target Start/End: Original strand, 23571989 - 23572273
Alignment:
Q  13 tcatcatggtcatggtgctcctcctcatggatca-ttgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgt 111  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  | |||||||    
T  23571989 tcatcagggtcatggtgctcctcatcatggtgcaattgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccttctgcttcttcatgatgttggtctatgt 23572088  T
Q  112 gcacctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagctt 211  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||| | | | ||||||||||||||    
T  23572089 gcacctgtgggtcatcatgaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctt 23572188  T
Q  212 gagtgtataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatc 296  Q
    |||||||||    | |||    || ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||  |||||||||    
T  23572189 gagtgtataaacaaaggggattcggggttttatgaaattcatagagataagggtatctatgttgagtctattgttaccctcaatc 23572273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 27630364 - 27630080
Alignment:
Q  13 tcatcatggtcatggtgctcctcctcatggatca-ttgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgt 111  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  | |||||||    
T  27630364 tcatcagggtcatggtgctcctcatcatggtgcaattgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccttctgcttcttcatgatgttggtctatgt 27630265  T
Q  112 gcacctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagctt 211  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||| | | | ||||||||||||||    
T  27630264 gcacttgtgggtcatcatgaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctt 27630165  T
Q  212 gagtgtataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatc 296  Q
    |||||||||    | |||    || ||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||| || |||||||  |||||||||    
T  27630164 gagtgtataaacaaaggggattcggggttttatgaaattcatagagataagggtttctatgttgagtctattgttaccctcaatc 27630080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 131 - 341
Target Start/End: Original strand, 25372413 - 25372623
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgtataggacatgggt 230  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  25372413 aacatatatcaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtataattaaaataggcacattgagtttgagtgtataggtcatgggt 25372512  T
Q  231 ggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggtccttaccaaccccaaatt 330  Q
    |||||| | || |||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||| |||||||||| | |  || |||||||||| ||| || |  ||||    
T  25372513 ggacgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctatatgttaaacctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccactctcaatt 25372612  T
Q  331 gcctagctatg 341  Q
    ||| |||||||    
T  25372613 gcccagctatg 25372623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 16774507 - 16774345
Alignment:
Q  20 ggtcatggtgctcctcctcatggatca-ttgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgtgcacctg 118  Q
    |||||||||| ||||| ||||||  || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  16774507 ggtcatggtgttcctcatcatggtgcagttgagcaccttcctcttcttgatgcaagtgtgcaccctctgtttcttcattatgctgttctatgtgcacctg 16774408  T
Q  119 tgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagg 181  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16774407 tgggtcatcatcaacatacaacaaatttgcttccacctcggtgttagttcgagatgggttagg 16774345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 181
Target Start/End: Original strand, 24796659 - 24796821
Alignment:
Q  20 ggtcatggtgctcctcctcatggatca-ttgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgtgcacctg 118  Q
    |||||||||| ||||| ||||||  || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  24796659 ggtcatggtgttcctcatcatggtgcagttgagcaccttcctcttcttgatgcaagtgtgcatcctctgtttcttcattatgctgttctatgtgcacctg 24796758  T
Q  119 tgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagg 181  Q
     |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24796759 cgggtcatcatcaacatacaacaaatttgcttccacctcggtgttagttcgagatgggttagg 24796821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 66 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 116335 - 116181
Alignment:
Q  66 tggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgtgcacctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttag 165  Q
    |||||||| |||||||| |   |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  116335 tggtgcaattgtgcacctttctcttctttattatgctgttctatgtgcacctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttag 116236  T
Q  166 tccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgtata 220  Q
    ||||||||| |||||| | |  ||| | | | |||||||||||||||||||||||    
T  116235 tccgagatgagttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagcttgagtgtata 116181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 131 - 295
Target Start/End: Original strand, 25369022 - 25369186
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgtataggacatgggt 230  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||  | |  ||||||||||||||||| ||| | ||||||     
T  25369022 aacatacaacaaattgtcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagcataaataatagaatcacattgagcttgagtgcataagccatgggc 25369121  T
Q  231 ggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaat 295  Q
    ||| || | || ||||||||||| || |  |||||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  25369122 ggatgacgcttaatgaagttcatggaaatgagggtccctatgttaagcctattgttgccctcaat 25369186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 131 - 203
Target Start/End: Original strand, 17867496 - 17867568
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcaca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| | ||||||||||    
T  17867496 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagaaagtataatcaaaataggcaca 17867568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 131 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 24170117 - 24169953
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgtataggacatgggt 230  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  | |||||| || || || |  |||| ||| | |||||||    
T  24170117 aacatacaaaaaatttgcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtagaaacaaaataggtacgttaagttgaagtgcataagtcatgggt 24170018  T
Q  231 ggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaat 295  Q
    ||| || |||| ||||| |||||||| |  ||||| || ||||| |||||||||  |||||||||    
T  24170017 ggatgaagtttaatgaaattcatagaaatgagggtttcaatgtttagcctattgattccctcaat 24169953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 185
Target Start/End: Original strand, 13051 - 13105
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagt 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13051 aacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagt 13105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 185
Target Start/End: Original strand, 22046097 - 22046151
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagt 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22046097 aacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagt 22046151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 25356289 - 25356235
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagt 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25356289 aacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagt 25356235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 27626371 - 27626317
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagt 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27626371 aacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagt 27626317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 141; Significance: 7e-74; HSPs: 30)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 296
Target Start/End: Original strand, 13505872 - 13506156
Alignment:
Q  13 tcatcatggtcatggtgctcctcctcatggatca-ttgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  | |||||||    
T  13505872 tcatcatggtcatggtgctcctcatcatggtgcaattgtgcaccttcctcttcttggtgcaagcgtgcaccttctgcttcttcattatgttgttctatgt 13505971  T
Q  112 gcacctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagctt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||| | | | ||||||||||||||    
T  13505972 gcacctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagctt 13506071  T
Q  212 gagtgtataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatc 296  Q
    |||||||||    | |||    || ||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||| || |||||||  |||||||||    
T  13506072 gagtgtataaacaaaggggattcggggttttatgaaattcatagagataagggtttctatgttgagtctattgttaccctcaatc 13506156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 48 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 15945409 - 15945161
Alignment:
Q  48 tgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgtgcacctgtgggtcatcattaacatacaacaaatttt 147  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15945409 tgtgcaccttccgcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcctcttcattatgctgctctatgtgcacctgtgggtcatcattaacatacaacaaatttt 15945310  T
Q  148 cttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgtataggacatgggtggacgaggtttgatgaa 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   || | |||||| ||||| |||||||| |||||    | |||    |||| ||| |||||    
T  15945309 cttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggcaataatatcaaaataggtacattaagcttgagcgtataaacaaaggggattcgagttttaatgaa 15945210  T
Q  248 gttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatc 296  Q
     |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15945209 attcatagagataagggtttctatgttcagcctattgtttccctcaatc 15945161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 352
Target Start/End: Original strand, 10603891 - 10604230
Alignment:
Q  14 catcatggtcatggtgctcctcctcatggatca-ttgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgtg 112  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||  |  |||||||||   | |||   ||    
T  10603891 catcatggtcatggtgctccttatcatggtacaattgtgcaccttcctcttcttggtgcaaatgtgcatcttcctcgccttcattatcgtgttcttcatg 10603990  T
Q  113 cacctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttg 212  Q
     |||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| | |||||||||| |||| |||    
T  10603991 tacctgtggatcatcaacaatatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagaaagtataatcaaaataggcacaatgagtttg 10604090  T
Q  213 agtgtataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggt 312  Q
    ||||| ||||||||||||||| | || || |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |   ||| |||||||    
T  10604091 agtgtgtaggacatgggtggatggggcttaatgaagttcataaagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatttttgtaatcccttggt 10604190  T
Q  313 ccttaccaaccccaaattgcctagctatgtaagtgatgat 352  Q
    ||| ||| || || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  10604191 cctcacccactcccaattgcctagctatgtatgtgatgat 10604230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 352
Target Start/End: Original strand, 22165662 - 22166001
Alignment:
Q  14 catcatggtcatggtgctcctcctcatggatca-ttgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgtg 112  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |   |  |||||||||   | |||   ||    
T  22165662 catcatggtcatggtgctcctcatcatggtacaattgtgcaccttcctcttcttggtgcaaatgtgcatctttctcgccttcattatcgtgttcttcatg 22165761  T
Q  113 cacctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttg 212  Q
     |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||| | ||||||||||||||| |||    
T  22165762 tacctgtggatcatcaacaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagaaggtataatcaaaataggcacattgagtttg 22165861  T
Q  213 agtgtataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggt 312  Q
    ||||  ||||||||||||||| | || || |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  |   ||| | |||||    
T  22165862 agtgcgtaggacatgggtggatggggcttaatgaagttcataaagataagggtctctatgttaagcctattgttttcctcaattttggtaatccattggt 22165961  T
Q  313 ccttaccaaccccaaattgcctagctatgtaagtgatgat 352  Q
    ||| ||| || || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  22165962 cctcacccactcccaattgcctagctatgtatgtgatgat 22166001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 114 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 4369456 - 4369218
Alignment:
Q  114 acctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttga 213  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  4369456 acctgtggatcatcaacaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagaaagtataattaaaataagcacattgagtttga 4369357  T
Q  214 gtgtataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggtc 313  Q
    |||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||  | | ||| ||||||||    
T  4369356 gtgtgtaggacatgggtggacggggcttaatgaagttcataaagataagggtctctatgtaaagcctattgattccctcaatgttgttaatcccttggtc 4369257  T
Q  314 cttaccaaccccaaattgcctagctatgtaagtgatgat 352  Q
    || ||| || || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  4369256 ctcacccactcccaattgcctagctatgtatgtgatgat 4369218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 16654573 - 16654233
Alignment:
Q  14 catcatggtcatggtgctcctcctcatggatca-ttgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgtg 112  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||  |  |||||||||   | |||   ||    
T  16654573 catcatggtcatggtgctcctcatcatggtacaattgtgcaccttcttcttcttggtgcaaatgtgcatcttcctcgccttcattatcgtgttcttcatg 16654474  T
Q  113 cacctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgag-ctt 211  Q
     |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| | |||||||||||||||  ||    
T  16654473 tacctgtggatcatcaacaacatacaacaaattttcttacacctcggtgttagtccgagatgggttagaaagtataatcaaaataggcacattgagtttt 16654374  T
Q  212 gagtgtataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttgg 311  Q
    |||||  ||||||||||||||| | || || |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||   |   ||| ||||||    
T  16654373 gagtgcgtaggacatgggtggatggggcttaatgaagttcataaagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaaatttagtaatcccttgg 16654274  T
Q  312 tccttaccaaccccaaattgcctagctatgtaagtgatgat 352  Q
    |||| ||| || || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16654273 tcctcacccactcccaattgcctagctatgtatgtgatgat 16654233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 114 - 349
Target Start/End: Original strand, 14446994 - 14447229
Alignment:
Q  114 acctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttga 213  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||| ||| ||||    
T  14446994 acctgtggatcatcaacaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtataattaaaacaggcacatcgagtttga 14447093  T
Q  214 gtgtataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggtc 313  Q
    |||| ||||||||||||||| || | || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||  | |  || ||||||||    
T  14447094 gtgtgtaggacatgggtggatgatgcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagtctattgttaccctcaattttgtttatcccttggtc 14447193  T
Q  314 cttaccaaccccaaattgcctagctatgtaagtgat 349  Q
    || ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  14447194 ctcacccacccccaattgcctagctatgtatgtgat 14447229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 144 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 17386509 - 17386313
Alignment:
Q  144 ttttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgtataggacatgggtggacgaggtttga 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  17386509 ttttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtataattaaaataggcacattgagtttgagtgtataggtcatgggtggacgatgcttaa 17386410  T
Q  244 tgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggtccttaccaaccccaaattgcctagctat 340  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |  || |||||||||| ||| || || ||||||||||||||    
T  17386409 tgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccactcccaattgcctagctat 17386313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 117 - 352
Target Start/End: Original strand, 20157888 - 20158123
Alignment:
Q  117 tgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtg 216  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  20157888 tgtggatcatcaacaacatacaacaaattttctttcacctcggtgttagtccaagatgggttaggaagtacaaataaaataggcacattgagtttgagtg 20157987  T
Q  217 tataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggtcctt 316  Q
    | ||||||||||||||||   | || || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  | |  || ||||||||||     
T  20157988 tgtaggacatgggtggacagtgcttaataaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaattttgtttatcccttggtcctc 20158087  T
Q  317 accaaccccaaattgcctagctatgtaagtgatgat 352  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  20158088 acccactcccaattgcctagctatgtatgtgatgat 20158123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 296
Target Start/End: Original strand, 12161421 - 12161705
Alignment:
Q  13 tcatcatggtcatggtgctcctcctcatggatca-ttgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgt 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||   | ||||  |    
T  12161421 tcatcatagtcatggtgctcctcatcatgatgcaattgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccttcctcgtcttcattattatgttctacat 12161520  T
Q  112 gcacctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagctt 211  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||   || | ||| ||||| ||||| ||    
T  12161521 gcatctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggtaaggcagtaagatcaaaatgggcacgttgagttt 12161620  T
Q  212 gagtgtataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatc 296  Q
    |||||||||    | |||  | |||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  12161621 gagtgtataaacaaaggggagtcgaggttttatgaaattcatagagataagggtctctatgtttaacctattgtttccctcaatc 12161705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 131 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 13693644 - 13693432
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgtataggacatgggt 230  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| | || |||||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  13693644 aacatacaacaaattttcatccacctcggtgttagtctgagatgggttaggaagtataatcaaaacaggcacgttgagcttgagtgtataagtcatgggt 13693545  T
Q  231 ggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggtccttaccaaccccaaatt 330  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |  ||||||||| | |  || |||||||||| ||| || || ||||    
T  13693544 ggtcgaggtttaatgaagttcatagagacaaggatctctatgttaagcctattattcccctcaatcttgttgatcccttggtcctcacccactcccaatt 13693445  T
Q  331 gcctagctatgta 343  Q
    |||||||||||||    
T  13693444 gcctagctatgta 13693432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 57 - 296
Target Start/End: Original strand, 3340594 - 3340833
Alignment:
Q  57 tcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgtgcacctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacct 156  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3340594 tcctcatcatggtgcatttgtgcaccttccgcttcttcattatgctgttctatgtgcacctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacct 3340693  T
Q  157 cggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgtataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcataga 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |  ||| | | | |||||||||||||||||||||||    | |||    |||||||| ||||| ||||||||    
T  3340694 cggtgttagtccgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagcttgagtgtataaacaaaggggattcgaggttttatgaaattcataga 3340793  T
Q  257 gacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatc 296  Q
    || |||||| |||||||| || |||||||  |||||||||    
T  3340794 gataagggtttctatgtttagtctattgttaccctcaatc 3340833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 114 - 352
Target Start/End: Original strand, 12423807 - 12424045
Alignment:
Q  114 acctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttga 213  Q
    |||||||| ||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  12423807 acctgtggatcatcaacaacataaaagaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgtgttagaaagtataatcaaaataggcacattgagtttga 12423906  T
Q  214 gtgtataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggtc 313  Q
     ||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  | | ||| || |||||    
T  12423907 atgtgtaggacatgggtggacggggcttaatgaagttcataaagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatgttgttaatcccgtggtc 12424006  T
Q  314 cttaccaaccccaaattgcctagctatgtaagtgatgat 352  Q
    || ||| || || ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  12424007 ctcacccactcccaattgcctatctatgtatgtgatgat 12424045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 47 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 15643901 - 15643767
Alignment:
Q  47 ttgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgtgcacctgtgggtcatcattaacatacaacaaattt 146  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  15643901 ttgtgcaccttcctcttcctgatgcaagtgtgcatcctctgtttcttcattaggctgctctatgtgcacctgtgggtcatcagcaacatacaacaaattt 15643802  T
Q  147 tcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagg 181  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15643801 gcttccacctcggtgttagttcgagatgggttagg 15643767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 131 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 3278235 - 3278026
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgtataggacatgggt 230  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  3278235 aacatacatcaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtataaataaaagaggcacattgagtttgagtgtataggtcatgggt 3278136  T
Q  231 ggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggtccttaccaaccccaaatt 330  Q
    ||| || | || ||||| |||||||| |  ||||| |||||||| |||  ||||| |||||| ||| | |  || ||||||| || ||| || || ||||    
T  3278135 ggatgatgcttaatgaaattcatagaaatgagggtctctatgtttagcaaattgtttccctcgatcatgtttatcccttggttctcacccactcccaatt 3278036  T
Q  331 gcctagctat 340  Q
    ||||||||||    
T  3278035 gcctagctat 3278026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 47 - 181
Target Start/End: Original strand, 10161580 - 10161714
Alignment:
Q  47 ttgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgtgcacctgtgggtcatcattaacatacaacaaattt 146  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||| | |||| |||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  10161580 ttgtgcaccttcctcttccggatgcaagtgtgcatcctctgtttcttcattaggttgttctatgtgcacctgtgggtcatcagcaacatacaacaaattt 10161679  T
Q  147 tcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagg 181  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10161680 gcttccacctcggtgttagtgcgagatgggttagg 10161714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 194 - 352
Target Start/End: Original strand, 18979473 - 18979631
Alignment:
Q  194 aataggcacattgagcttgagtgtataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctca 293  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||    
T  18979473 aataggcacattgagtttgagtgtgtaggacatgggtggacggggcttaatgaagttcataaagataagggtctctatgttaaccctattgtttccctca 18979572  T
Q  294 atcctctgaattccttggtccttaccaaccccaaattgcctagctatgtaagtgatgat 352  Q
    ||  | | ||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  18979573 attttgttaatcccttggtcctcaccaactcgcaattgcctagctatgtatgtgatgat 18979631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 7599133 - 7599079
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagt 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7599133 aacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagt 7599079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 10145788 - 10145734
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagt 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10145788 aacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagt 10145734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 185
Target Start/End: Original strand, 13137606 - 13137660
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagt 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13137606 aacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagt 13137660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 185
Target Start/End: Original strand, 13188854 - 13188908
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagt 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13188854 aacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagt 13188908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 185
Target Start/End: Original strand, 15630393 - 15630447
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagt 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15630393 aacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagt 15630447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 131 - 184
Target Start/End: Original strand, 13196866 - 13196919
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaag 184  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13196866 aacatacaacaaatttgcctccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaag 13196919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 15945472 - 15945391
Alignment:
Q  13 tcatcatggtcatggtgctcctcctcatggatca-ttgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttctt 93  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  15945472 tcatcatggtcatggtgttcctcatcatggtgcaattgtgcaccttcctcttcgtggtgcaagtgtgcaccttccgcttctt 15945391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 185
Target Start/End: Original strand, 12188512 - 12188566
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagt 185  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12188512 aacatactacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagt 12188566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 185
Target Start/End: Original strand, 12194926 - 12194980
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagt 185  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12194926 aacatactacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagt 12194980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 185
Target Start/End: Original strand, 16374916 - 16374970
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagt 185  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16374916 aacatacaagaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagt 16374970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 66
Target Start/End: Original strand, 3340576 - 3340630
Alignment:
Q  13 tcatcatggtcatggtgctcctcctcatggatca-ttgtgcaccttcctcttctt 66  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||| ||||||    
T  3340576 tcatcatggtcatggtgctcctcatcatggtgcatttgtgcaccttccgcttctt 3340630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 66
Target Start/End: Original strand, 20157811 - 20157864
Alignment:
Q  14 catcatggtcatggtgctcctcctcatggatc-attgtgcaccttcctcttctt 66  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  | | |||||||||||||||||||    
T  20157811 catcatggtcatggtgctcctcatcatggtgcaagtgtgcaccttcctcttctt 20157864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 17386613 - 17386561
Alignment:
Q  14 catcatggtcatggtgctcctcctcatggatc-attgtgcaccttcctcttct 65  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  | | ||||||||||||||||||    
T  17386613 catcatggtcatggtgctcctcatcatggtgcaagtgtgcaccttcctcttct 17386561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0506
Description:

Target: scaffold0506; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 46 - 352
Target Start/End: Original strand, 3432 - 3738
Alignment:
Q  46 attgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgtgcacctgtgggtcatcattaacatacaacaaatt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||   | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3432 attgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccttcctcgtcttcattatcgtgttctacatgcacctgtgggtcatcattaacatacaacaaatt 3531  T
Q  146 ttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgtataggacatgggtggacgaggtttgatg 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||    | |||  | |||||||| |||    
T  3532 ttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtaaaatcaaaatgggcacgttgagtttgagtgtataaacaaaggggagtcgaggttttatg 3631  T
Q  246 aagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggtccttaccaaccccaaattgcctagctatgtaag 345  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||| ||  || || | ||||| ||||||||| |    
T  3632 aagttcatagagataagggtgtctatgtttagcctattgtttccctcaatcttgtttattccttggtcctcactcactcctagttgcccagctatgtatg 3731  T
Q  346 tgatgat 352  Q
    |||||||    
T  3732 tgatgat 3738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 12336 - 11998
Alignment:
Q  15 atcatggtcatggtgctcctcctcatggatca-ttgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgtgc 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||  |  |||||||||   | |||   ||     
T  12336 atcatggtcatggtgctcctcatcatggtacaattgtgcaccttcctcttcttggtgcaaatgtgcatcttcctcgccttcattatcgtgttcttcatgt 12237  T
Q  114 acctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttga 213  Q
    ||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  12236 acctggggatcatcaacaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagaaagtataatcaaaataggcacattgagtttga 12137  T
Q  214 gtgtataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggtc 313  Q
    |||  ||||||||||||||| | || || |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |   ||| ||||||||    
T  12136 gtgcgtaggacatgggtggatggggcttaatgaagttcataaagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaattttggtaatcccttggtc 12037  T
Q  314 cttaccaaccccaaattgcctagctatgtaagtgatgat 352  Q
    || ||| || || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  12036 ctcacccactcccaattgcctagctatgtatgtgatgat 11998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 131 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 10912 - 10691
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgtataggacatgggt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  10912 aacatacaacaaattttcttccacctcgttgttagtccgagatgggttaggaagtataattaaaataggcacattgagtttgagtgtataggtcatgggt 10813  T
Q  231 ggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggtccttaccaaccccaaatt 330  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |  || |||||||||| ||| || || ||||    
T  10812 ggacgatgtttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccactcccaatt 10713  T
Q  331 gcctagctatgtaagtgatgat 352  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  10712 gcctagctatatatgtgatgat 10691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 131 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 18913 - 18692
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgtataggacatgggt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  18913 aacatacaacaaattttcttccacctcgttgttagtccgagatgggttaggaagtataattaaaataggcacattgagtttgagtgtataggtcatgggt 18814  T
Q  231 ggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggtccttaccaaccccaaatt 330  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |  || |||||||||| ||| || || ||||    
T  18813 ggacgatgtttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccactcccaatt 18714  T
Q  331 gcctagctatgtaagtgatgat 352  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  18713 gcctagctatatatgtgatgat 18692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 131 - 352
Target Start/End: Original strand, 234486 - 234707
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgtataggacatgggt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  234486 aacatacaacaaattttcttccacctcgttgttagtccgagatgggttaggaagtataattaaaataggcacattgagtttgagtgtataggtcatgggt 234585  T
Q  231 ggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggtccttaccaaccccaaatt 330  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |  || |||||||||| ||| || || ||||    
T  234586 ggacgatgtttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcctcacccactcccaatt 234685  T
Q  331 gcctagctatgtaagtgatgat 352  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  234686 gcctagctatatatgtgatgat 234707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 10)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 115 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 3353373 - 3353136
Alignment:
Q  115 cctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgag 214  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||    
T  3353373 cctgtggatcatcaacaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagttcgagatgggttaggaagtacaatcaaaataggcacattgagtttgag 3353274  T
Q  215 tgtataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggtcc 314  Q
    ||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  | | ||| ||||||||     
T  3353273 tgtgtaggacatgggtggacggggcttaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaattttgttaatcccttggtct 3353174  T
Q  315 ttaccaaccccaaattgcctagctatgtaagtgatgat 352  Q
    | ||| || || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  3353173 tcacccactcccaattgcctagctatgtatgtgatgat 3353136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 111 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 15864290 - 15864049
Alignment:
Q  111 tgcacctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagct 210  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |    
T  15864290 tgcacctgtggatcatcaataacatacaaaaaaatttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtacaattaaaacaggcacattgagtt 15864191  T
Q  211 tgagtgtataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttg 310  Q
    ||||||| ||||| ||||||| | || | || |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||  | |  || ||||     
T  15864190 tgagtgtgtaggaaatgggtgtatgatgcttaatgaagttcatagaaataagggtctctatgttaagcctattgttaccctcaattttgtttatccctta 15864091  T
Q  311 gtccttaccaaccccaaattgcctagctatgtaagtgatgat 352  Q
    ||||| ||| || || |||||||||| |||||| ||||||||    
T  15864090 gtcctcacccactcccaattgcctagatatgtacgtgatgat 15864049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 13821759 - 13821597
Alignment:
Q  20 ggtcatggtgctcctcctcatggatca-ttgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgtgcacctg 118  Q
    |||||||||| ||||| ||||||  || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  13821759 ggtcatggtgttcctcatcatggtgcagttgagcaccttcctcttcttgatgcaagtgtgcaccctctgtttcttcattatgctgttctatgtgcacctg 13821660  T
Q  119 tgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagg 181  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13821659 tgggtcatcatcaacatacaacaaatttgcttccacctcggtgttagttcgagatgggttagg 13821597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 57 - 285
Target Start/End: Original strand, 15261461 - 15261689
Alignment:
Q  57 tcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgtgcacctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacct 156  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15261461 tcctcatcatggtgcatttgtgcaccttcctcttcttcattatgctgttctatgtgcacctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacct 15261560  T
Q  157 cggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgtataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcataga 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |  ||| | | | |||||||||||||||||||||||    | |||    |||| ||| ||||| ||||||||    
T  15261561 cggtgttagtccgagatgggttaggcaataaaatcaaagtgggcacattgagcttgagtgtataaacaaaggggattcgagtttttatgaaattcataga 15261660  T
Q  257 gacaagggtatctatgttaagcctattgt 285  Q
    || || ||| |||||||| ||||||||||    
T  15261661 gataacggtttctatgttcagcctattgt 15261689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 22109737 - 22109683
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagt 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22109737 aacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagt 22109683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 15253122 - 15253068
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagt 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  15253122 aacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatggattaggaagt 15253068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 16681030 - 16680912
Alignment:
Q  234 cgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggtccttaccaaccccaaattgcc 333  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||  || |||||||| | ||  || || | |||||    
T  16681030 cgaggttttatgaaattcatagagataagggtgtctatgtttagcctattgtttccctcaatcttctttatcccttggtcttcactcactcctagttgcc 16680931  T
Q  334 tagctatgtaagtgatgat 352  Q
    |||||||||| || |||||    
T  16680930 tagctatgtatgttatgat 16680912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 66
Target Start/End: Original strand, 15261443 - 15261497
Alignment:
Q  13 tcatcatggtcatggtgctcctcctcatggatca-ttgtgcaccttcctcttctt 66  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  15261443 tcatcatggtcatggtgctcctcatcatggtgcatttgtgcaccttcctcttctt 15261497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 3353471 - 3353410
Alignment:
Q  22 tcatggtgctcctcctcatggatca-ttgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcacc 82  Q
    |||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  3353471 tcatggtgctcctcatcatggtgcaattgtgcaccttcctcttcttggtgcaaatatgcacc 3353410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 15864361 - 15864309
Alignment:
Q  14 catcatggtcatggtgctcctcctcatggatc-attgtgcaccttcctcttct 65  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  | | ||||||||||||||||||    
T  15864361 catcatggtcatggtgctcctcatcatggtgcaaatgtgcaccttcctcttct 15864309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 352
Target Start/End: Original strand, 19608 - 19938
Alignment:
Q  14 catcatggtcatggtgctcctcctcatggatca-ttgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgtg 112  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |  |||||| ||   | |||   ||    
T  19608 catcatggtcatggtgctcctcatcatggtgcaattgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccttcctcgccttcatcatcgtgttcttcatg 19707  T
Q  113 cacctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttg 212  Q
     |||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||| |||    
T  19708 tacctatggatcatcaacaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagaaagtacaatcaaaataggcacattgagtttg 19807  T
Q  213 agtgtataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggt 312  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |         |||||||||||||||| |||||||||  | | ||| |||||||    
T  19808 agtgtgtagaacatgggtggacgaggcttaatgaagttcatagagata---------atgttaagcctattgtttccctcaattttgttaatcccttggt 19898  T
Q  313 ccttaccaaccccaaattgcctagctatgtaagtgatgat 352  Q
    ||| ||| || || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19899 cctcacccactcccaattgcctagctatgtatgtgatgat 19938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 352
Target Start/End: Original strand, 22351 - 22690
Alignment:
Q  14 catcatggtcatggtgctcctcctcatggatca-ttgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgtg 112  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||  |  |||||||||   | |||   ||    
T  22351 catcatggtcatggtgctcctcatcatggtacaattgtgcaccttcctcttcttggtgcaaatgtgcatcttcctcgccttcattatcgtgttcttcatg 22450  T
Q  113 cacctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttg 212  Q
     |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| | ||||||||||||||| |||    
T  22451 tacctgtggatcatcaacaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagaaagtataatcaaaataggcacattgagtttg 22550  T
Q  213 agtgtataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggt 312  Q
    ||||| ||||||||||| | ||| || || |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||  | | ||| |||||||    
T  22551 agtgtgtaggacatgggcgaacggggcttaatgaagttcataaagataaaggtctctatgttaagcctattgtttccctcaattttgttaatcccttggt 22650  T
Q  313 ccttaccaaccccaaattgcctagctatgtaagtgatgat 352  Q
    ||| |||  | || || || ||||||||||| ||||||||    
T  22651 cctcaccctctcccaagtgtctagctatgtatgtgatgat 22690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 21738 - 21400
Alignment:
Q  14 catcatggtcatggtgctcctcctcatggatca-ttgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctct-atgt 111  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||  |  |||||| ||   | ||| ||||    
T  21738 catcatggtcatagtgctcctcatcatggtgcaattgtgcaccttcctcttcttggtgcaaatgtgcatcttcctcgccttcatcatcgtgttctcatgt 21639  T
Q  112 gcacctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagctt 211  Q
      |||| ||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||| | ||||||||||||||| ||    
T  21638 --acctatggatcattaacaacatacaacaaattttcttccacctcagtgttagtccgagatgggttagaaagtataatcaaaataggcacattgagttt 21541  T
Q  212 gagtgtataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttgg 311  Q
    |||||| ||||||||||||||| | || || |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  | | ||| ||||||    
T  21540 gagtgtgtaggacatgggtggatggggcttaatgaagttcataaagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatgttgttaatcccttgg 21441  T
Q  312 tccttaccaaccccaaattgcctagctatgtaagtgatgat 352  Q
    |||||||| || || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  21440 tccttacccactcccaatttcctagctatgtatgtgatgat 21400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 17)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 352
Target Start/End: Original strand, 16150861 - 16151200
Alignment:
Q  14 catcatggtcatggtgctcctcctcatggatca-ttgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgtg 112  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||  |  |||||||||   | |||   ||    
T  16150861 catcatggtcatggtgctcctcatcatggtacaattgtgcaccttcctcttcttggtgcaaatgtgcatcttcctcgccttcattatcgtgttcttcatg 16150960  T
Q  113 cacctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttg 212  Q
     ||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| | ||||||||||| ||| |||    
T  16150961 tacctggggatcatcaacaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagaaagtataatcaaaataggcacatggagtttg 16151060  T
Q  213 agtgtataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggt 312  Q
    ||||  ||||||||||||||| | || || |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |   ||| |||||||    
T  16151061 agtgcgtaggacatgggtggatggggcttaatgaagttcataaagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaattttggtaatcccttggt 16151160  T
Q  313 ccttaccaaccccaaattgcctagctatgtaagtgatgat 352  Q
    ||| ||| || |  ||||||||||||||||| | ||||||    
T  16151161 cctcacccactctcaattgcctagctatgtatgcgatgat 16151200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 131 - 352
Target Start/End: Original strand, 15921438 - 15921658
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgtataggacatgggt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  15921438 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtataattaaaacaggcacattgagtttaagtgtataggccatgggt 15921537  T
Q  231 ggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggtccttaccaaccccaaatt 330  Q
    || |||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |  || |||||||| | ||| || || ||||    
T  15921538 ggtcgaggttttatgaagttcaaagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgt-tatcccttggtcttcacccactcccaatt 15921636  T
Q  331 gcctagctatgtaagtgatgat 352  Q
    ||||| ||||||| ||||||||    
T  15921637 gcctaactatgtatgtgatgat 15921658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 16530901 - 16530618
Alignment:
Q  13 tcatcatggtcatggtgctcctcctcatgga-tcattgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||| | || | | ||||  |    
T  16530901 tcatcatggtcatggtgctcctcatcatggtgtaattgtgcaccttcctcttcttggtgcaattgtgcaccttccacgtcttcct-attctgttctacat 16530803  T
Q  112 gcacctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagctt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||   || | ||| ||||| ||||| ||    
T  16530802 gcacctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtctgagatgggttaggcagtaatatcaaaatgggcacgttgagttt 16530703  T
Q  212 gagtgtataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatc 296  Q
    |||||||||    | |||  | |||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  16530702 gagtgtataaacaaaggggagtcgaggttttatgaaattcatagagataagggtgtctatgtttagcctattgtttccctcaatc 16530618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 296
Target Start/End: Original strand, 16634761 - 16635044
Alignment:
Q  13 tcatcatggtcatggtgctcctcctcatgga-tcattgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||| | || | | ||||  |    
T  16634761 tcatcatggtcatggtgctcctcatcatggtgtaattgtgcaccttcctcttcttggtgcaattgtgcaccttccacgtcttcct-attctgttctacat 16634859  T
Q  112 gcacctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagctt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||   || | ||| ||||| ||||| ||    
T  16634860 gcacctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtctgagatgggttaggcagtaatatcaaaatgggcacgttgagttt 16634959  T
Q  212 gagtgtataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatc 296  Q
    |||||||||    | |||  | |||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  16634960 gagtgtataaacaaaggggagtcgaggttttatgaaattcatagagataagggtgtctatgtttagcctattgtttccctcaatc 16635044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 46 - 296
Target Start/End: Original strand, 16761167 - 16761417
Alignment:
Q  46 attgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgtgcacctgtgggtcatcattaacatacaacaaatt 145  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  | |||||||||| | | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16761167 attgtgcaccttcctcctcttggtgcaagtgtgcaccttccacgtcttcattattctgttctacatgcacctgtgggtcatcattaacatacaacaaatt 16761266  T
Q  146 ttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgtataggacatgggtggacgaggtttgatg 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||    | |||  | |||||||| |||    
T  16761267 ttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggcagtaaaatcaaaatgggcacgttgagtttgagtgtataaacaaaggggagtcgaggttttatg 16761366  T
Q  246 aagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatc 296  Q
    || |||||||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  16761367 aaattcatagagataagggtgtttatgtttagcctattgtttcccttaatc 16761417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 138 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 824388 - 824174
Alignment:
Q  138 aacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgtataggacatgggtggacgag 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||    
T  824388 aacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtataattaaaacaggcacattgagtttaagtgtataggccatgggtggtcgag 824289  T
Q  238 gtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggtccttaccaaccccaaattgcctagc 337  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||| | |||||||| | | ||| |||||||| | ||| || || ||||||||| |    
T  824288 gttttatgaagttcataaagataagggcctctatgttaagcctattgttttcctcaatcttgttaatcccttggtcttcacccactcccaattgcctaac 824189  T
Q  338 tatgtaagtgatgat 352  Q
    |||||| ||||||||    
T  824188 tatgtatgtgatgat 824174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 131 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 15064529 - 15064308
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgtataggacatgggt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| | ||||||||| ||| | || |||||||||| |||||||    
T  15064529 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagaaagtataatcaaaataggcacgttgggtttaagtgtataggccatgggt 15064430  T
Q  231 ggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggtccttaccaaccccaaatt 330  Q
    || |||||||| |||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||| |||||||| | ||| || || ||||    
T  15064429 ggtcgaggttttatgaagttcaaagagataagggcctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgttaatcccttggtcttcacccactcccaatt 15064330  T
Q  331 gcctagctatgtaagtgatgat 352  Q
    ||||| |||||||  |||||||    
T  15064329 gcctaactatgtatatgatgat 15064308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 131 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 20107041 - 20106820
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgtataggacatgggt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||||||||||| || |||||||||| ||||||     
T  20107041 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtataattaaaacgggcacattgagtttaagtgtataggtcatgggg 20106942  T
Q  231 ggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggtccttaccaaccccaaatt 330  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||| | |||||||| | |  || || ||||| | ||| || || ||||    
T  20106941 ggacgaggtttaatgaagttcatagagatgagagtctctatgttaagcctattgttttcctcaatcttgtttatcccctggtcttcacccactcccaatt 20106842  T
Q  331 gcctagctatgtaagtgatgat 352  Q
     |||||||||||| ||||||||    
T  20106841 tcctagctatgtatgtgatgat 20106820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 13672707 - 13672545
Alignment:
Q  20 ggtcatggtgctcctcctcatggatca-ttgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgtgcacctg 118  Q
    |||||||||| ||||| ||||||  || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  13672707 ggtcatggtgttcctcatcatggtgcagttgagcaccttcctcttcttgatgcaagtgtgcaccctctgtttcttcattatgctgttctatgtgcacctg 13672608  T
Q  119 tgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagg 181  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13672607 tgggtcatcatcaacatacaacaaatttgcttccacctcggtgttagttcgagatgggttagg 13672545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 181
Target Start/End: Original strand, 18594633 - 18594795
Alignment:
Q  20 ggtcatggtgctcctcctcatggatca-ttgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgtgcacctg 118  Q
    |||||||||| ||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||| | || |||||||||||    
T  18594633 ggtcatggtggtcctcatcatggtgcagttgtgcaccttcctcttcttgatgcaagtgtgcacccgctgtttcttcattatgctgttcaatgtgcacctg 18594732  T
Q  119 tgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagg 181  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18594733 tgggtcatcatcaacatacaacaaatttgcttccacctcggtgttagttcgagatgggttagg 18594795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 18617051 - 18616889
Alignment:
Q  20 ggtcatggtgctcctcctcatggatca-ttgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgtgcacctg 118  Q
    |||||||||| ||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||| | || |||||||||||    
T  18617051 ggtcatggtggtcctcatcatggtgcagttgtgcaccttcctcttcttgatgcaagtgtgcacccgctgtttcttcattatgctgttcaatgtgcacctg 18616952  T
Q  119 tgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagg 181  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18616951 tgggtcatcatcaacatacaacaaatttgcttccacctcggtgttagttcgagatgggttagg 18616889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 131 - 295
Target Start/End: Original strand, 48803296 - 48803460
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgtataggacatgggt 230  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  | || |||||||||||| || |||| ||| | |||||||    
T  48803296 aacatacaacaaatttgcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtagaaacaaaagaggcacattgagtttaagtgcataagtcatgggt 48803395  T
Q  231 ggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaat 295  Q
    |||||| | || ||||| |||||||| |  ||||| || ||||||||||||||||  ||||||||    
T  48803396 ggacgatgcttaatgaaattcatagaaatgagggtttcaatgttaagcctattgttgccctcaat 48803460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 8716641 - 8716587
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagt 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8716641 aacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagt 8716587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 14549873 - 14549819
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagt 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14549873 aacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagt 14549819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 18286402 - 18286348
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagt 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18286402 aacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagt 18286348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 185
Target Start/End: Original strand, 16467052 - 16467106
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagt 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  16467052 aacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttacgaagt 16467106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 131 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 13656710 - 13656657
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaag 184  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13656710 aacatacaacaaattcgcctccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaag 13656657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 131 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 44199 - 43978
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgtataggacatgggt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | || |||||||||||  || |||||||| | |||||||    
T  44199 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtataatcaaaacaggcacattgatttttagtgtatatgccatgggt 44100  T
Q  231 ggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggtccttaccaaccccaaatt 330  Q
    || |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |  || |||||||| | ||| || || ||||    
T  44099 ggtcgaggttttatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcttcacccactcccaatt 44000  T
Q  331 gcctagctatgtaagtgatgat 352  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  43999 gcctagctatgtatgtgatgat 43978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 131 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 51588 - 51367
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgtataggacatgggt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | || |||||||||||  || |||||||| | |||||||    
T  51588 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtataatcaaaacaggcacattgatttttagtgtatatgccatgggt 51489  T
Q  231 ggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggtccttaccaaccccaaatt 330  Q
    || |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |  || |||||||| | ||| || || ||||    
T  51488 ggtcgaggttttatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcttcacccactcccaatt 51389  T
Q  331 gcctagctatgtaagtgatgat 352  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  51388 gcctagctatgtatgtgatgat 51367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 131 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 132395 - 132174
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgtataggacatgggt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  132395 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtataattaaaataggcacattgagtttaagtgtataggccatgggt 132296  T
Q  231 ggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggtccttaccaaccccaaatt 330  Q
    || |||||||| |||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| | | ||| |||||||| | ||| || |  ||||    
T  132295 ggtcgaggttttatgaagttcaaagagaaaagggcctctatgttaagcctattgttaccctcaatcttgttaatcccttggtcttcacccactctcaatt 132196  T
Q  331 gcctagctatgtaagtgatgat 352  Q
    ||||| ||||||| ||||||||    
T  132195 gcctaactatgtacgtgatgat 132174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 10)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 352
Target Start/End: Original strand, 21561808 - 21562147
Alignment:
Q  14 catcatggtcatggtgctcctcctcatggatca-ttgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgtg 112  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||| ||   | ||||  ||    
T  21561808 catcacggtcatgatgctcctcatcatggtgcaattgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccttcctcgtcttcatcatcgtggtctacatg 21561907  T
Q  113 cacctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttg 212  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| | ||| ||||| ||||| |||    
T  21561908 cacatttgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgaaatgggttaggaagtaaaatcaaaatgggcacgttgagtttg 21562007  T
Q  213 agtgtataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggt 312  Q
    ||||||||    | |||  | | |||||| |||||||||||||| | |||||  |||||||| |||||||||| |||||||||| | |  ||||||||||    
T  21562008 agtgtataaacaaaggggagtcaaggttttatgaagttcatagaaataagggcgtctatgtttagcctattgtttccctcaatcttgtttattccttggt 21562107  T
Q  313 ccttaccaaccccaaattgcctagctatgtaagtgatgat 352  Q
    ||| ||  || || | ||||| ||||||||| ||||||||    
T  21562108 cctcactcactcctagttgcccagctatgtatgtgatgat 21562147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 131 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 18446973 - 18446752
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgtataggacatgggt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| | || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  18446973 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagttcgagatgggttaggaagtataatgaaaacaggcacattgagtttgagtgtataggccatgggt 18446874  T
Q  231 ggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggtccttaccaaccccaaatt 330  Q
    || |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| | |  || |||||||| | ||| || || ||||    
T  18446873 ggtcgaggttttatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgtttacctcaatcttgttgatcccttggtcttcacccactcccaatt 18446774  T
Q  331 gcctagctatgtaagtgatgat 352  Q
     ||||||||| || ||||||||    
T  18446773 tcctagctatttatgtgatgat 18446752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 181
Target Start/End: Original strand, 20017604 - 20017766
Alignment:
Q  20 ggtcatggtgctcctcctcatggatca-ttgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgtgcacctg 118  Q
    |||||||||| ||||| ||||||  || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  20017604 ggtcatggtgttcctcatcatggtgcagttgagcaccttcctcttcttgatgcaagtgtgcaccctctgtttcttcattatgctgttctatgtgcacctg 20017703  T
Q  119 tgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagg 181  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20017704 tgggtcatcatcaacatacaacaaatttgcttccacctcggtgttagttcgagatgggttagg 20017766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 181
Target Start/End: Original strand, 22166919 - 22167081
Alignment:
Q  20 ggtcatggtgctcctcctcatggatca-ttgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgtgcacctg 118  Q
    |||||||||| ||||| ||||||  || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  22166919 ggtcatggtgttcctcatcatggtgcagttgagcaccttcctcttcttgatgcaagtgtgcaccctctgtttcttcattatgctgttctatgtgcacctg 22167018  T
Q  119 tgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagg 181  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22167019 tgggtcatcatcaacatacaacaaatttgcttccacctcggtgttagttcgagatgggttagg 22167081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 181
Target Start/End: Original strand, 22768522 - 22768656
Alignment:
Q  47 ttgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgtgcacctgtgggtcatcattaacatacaacaaattt 146  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22768522 ttgtgcaccttcctcttcttgatgcaagtgtgcatcctctgtttcttcattatgctgctctatgtgcacctgtgggtcatcttcaacatacaacaaattt 22768621  T
Q  147 tcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagg 181  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22768622 gcttccacctcggtgttagttcgagatgggttagg 22768656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 47 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 20169055 - 20168921
Alignment:
Q  47 ttgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgtgcacctgtgggtcatcattaacatacaacaaattt 146  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  20169055 ttgtgcaccttcctcttcttgatgcaagtgtgcatcctctgtttcttcattaggctgttctatgtgcacctgtgggtcatcagcaacgtacaacaaattt 20168956  T
Q  147 tcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagg 181  Q
     ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  20168955 gcttccacctcggtgttagttcgaggtgggttagg 20168921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 131 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 18010625 - 18010461
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgtataggacatgggt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||  | |||||| | ||| || | ||||| ||| | |||||||    
T  18010625 aacatacaacaaattttcttccaccttggtgttagtccgagatgggttaggaagtagaaagaaaataggtatattaagttggagtgcataagtcatgggt 18010526  T
Q  231 ggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaat 295  Q
    ||| || |||||||||| |||||||| |  ||||| || ||||| ||| | |||| |||||||||    
T  18010525 ggatgaagtttgatgaaattcatagaaatgagggtttcaatgtttagcatgttgtttccctcaat 18010461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 11218465 - 11218339
Alignment:
Q  14 catcatggtcatggtgctcctcctcatggatca-ttgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgtg 112  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||    ||||||||||   | ||||  ||    
T  11218465 catcatggtcatggtgctcctcatcatggtgcagttgtgcaccttcctcttcttggtgcaattctgcaccttccatgtcttcattattgtgttctacatg 11218366  T
Q  113 cacctgtgggtcatcattaacatacaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  11218365 cacctgtgggtcatcattaacatacaa 11218339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 185
Target Start/End: Original strand, 8725438 - 8725492
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagt 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8725438 aacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagt 8725492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 185
Target Start/End: Original strand, 24856681 - 24856735
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagt 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24856681 aacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagt 24856735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 46 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 29332 - 29082
Alignment:
Q  46 attgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgtgcacctgtgggtcatcattaacatacaacaaatt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29332 attgtgcaccttcctcttcttggtgcgggtgtgcaccttccacgtcttcattatgctgttctatgggcacctgtgggtcatcattaacatacaacaaatt 29233  T
Q  146 ttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgtataggacatgggtggacgaggtttgatg 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   || | | | ||||||||||||||||| |||||    | |||    |||||||| |||    
T  29232 ttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggcaataatatcaaagttggcacattgagcttgagcgtataaacaaaggggattcgaggttttatg 29133  T
Q  246 aagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatc 296  Q
    || |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  29132 aaattcatagagataagggtttctatgtttagcctattgtttccctcaatc 29082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 24210 - 23875
Alignment:
Q  17 catggtcatggtgctcctcctcatggatca-ttgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgtgcac 115  Q
    |||||||||||||||||||  |||||  || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||  |  |||||| ||   | |||   || ||    
T  24210 catggtcatggtgctcctcagcatggtgcaattgtgcaccttccccttcttggtgcaa-tgtgcatcttcctcgccttcatcatcgtgttcttcatgtac 24112  T
Q  116 ctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagt 215  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  24111 ctgtggatcatcaacaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagaaagtataatcaaaataggcacattgagtttgagt 24012  T
Q  216 gtataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggtcct 315  Q
    || || |||||||||||||| ||  | |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||   |||||||||  |   ||| ||||||||||    
T  24011 gtgtaagacatgggtggacggggcctaatgaagttcataaagataagggtctctatgttaagcctattaattccctcaattttggtaatcccttggtcct 23912  T
Q  316 taccaaccccaaattgcctagctatgtaagtgatgat 352  Q
     ||| || || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  23911 cacccactcccaattgcctagctatgtatgtgatgat 23875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 114 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 122135 - 121900
Alignment:
Q  114 acctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttga 213  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||| ||||    
T  122135 acctgtggatcatcaacaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagaaagtataatcaatataggcacattgagtttga 122036  T
Q  214 gtgtataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggtc 313  Q
    |||| || ||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||  |   ||||||||||||    
T  122035 gtgtgtaagacatgggtggacgaggcttaatgaggttcataaagataagggtctctatgttaagcctattgtttcccttaattttggtaattccttggtc 121936  T
Q  314 cttaccaaccccaaattgcctagctatgtaagtgat 349  Q
    || ||| || || ||||||| ||||||||| |||||    
T  121935 ctcacccactcccaattgccgagctatgtatgtgat 121900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 122227 - 122169
Alignment:
Q  15 atcatggtcatggtgctcctcctcatggatca-ttgtgcaccttcctcttcttggtgca 72  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||  || |||| |||||||||||||||||||||    
T  122227 atcatggtcatggtgctcctcatcctggtgcaattgtacaccttcctcttcttggtgca 122169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0402 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0402
Description:

Target: scaffold0402; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 131 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 6651 - 6430
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgtataggacatgggt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  6651 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtataattaatatagccacattgagtttgagtgtataggtcatgggt 6552  T
Q  231 ggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggtccttaccaaccccaaatt 330  Q
    |||||| | || ||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |  || |||||||| | ||| || || ||||    
T  6551 ggacgatgcttaatgaagttcatagaattaagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatcccttggtcttcacccactcccaatt 6452  T
Q  331 gcctagctatgtaagtgatgat 352  Q
    | |||||||| || ||||||||    
T  6451 ggctagctatataggtgatgat 6430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0402; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 6742 - 6690
Alignment:
Q  14 catcatggtcatggtgctcctcctcatggatc-attgtgcaccttcctcttct 65  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  | | ||||||||||||||||||    
T  6742 catcatggtcatggtgctcctcatcatggtgcaagtgtgcaccttcctcttct 6690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 114 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 922 - 684
Alignment:
Q  114 acctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttga 213  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  922 acctgtggatcatcaacaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagaaagtataatcaaaataggcacattgagtttga 823  T
Q  214 gtgtataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggtc 313  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||| ||| ||| || ||||||||| |||||||   | |||||||  | | ||| ||||||||    
T  822 gtgtgtaggacatgggtggacggggcctaatgaagttcataaagataagtgtctctatgttatgcctattaatttcctcaatgttgttaatcccttggtc 723  T
Q  314 cttaccaaccccaaattgcctagctatgtaagtgatgat 352  Q
    || ||| || || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  722 ctcacccactcccaattgcctagctatgtatgtgatgat 684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 995 - 942
Alignment:
Q  14 catcatggtcatggtgctcctcctcatggatc-attgtgcaccttcctcttctt 66  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  995 catcatggtcatggtgctcctcatcatggtgcaattgtgcaccttcctcttctt 942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 131 - 352
Target Start/End: Original strand, 5040 - 5261
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgtataggacatgggt 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    | ||||    
T  5040 aacatacaacaaattctcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtaaaattaaaataggcacgttgagtttgagtgtataaacaaagggt 5139  T
Q  231 ggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggtccttaccaaccccaaatt 330  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| | |  || | |||||| | ||  || || ||||    
T  5140 agtcgaggtttgatgaagttcatagagacaagagtttctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatccattggtcttcactcactcccaatt 5239  T
Q  331 gcctagctatgtaagtgatgat 352  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  5240 gcctagctatgtatgtgatgat 5261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 117 - 352
Target Start/End: Original strand, 19410 - 19645
Alignment:
Q  117 tgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtg 216  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||| ||||| ||||| |||||||    
T  19410 tgtgggtcatcatcaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtaaaatcaaaatgggcacgttgagtttgagtg 19509  T
Q  217 tataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggtcctt 316  Q
    ||||    | |||  | |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| | |  || ||||||||||     
T  19510 tataaacaaaggggagtcgaggttttatgaaattcatagagataagggtatctatgtttagcctattgttaccctcaatcttgtttatcccttggtccta 19609  T
Q  317 accaaccccaaattgcctagctatgtaagtgatgat 352  Q
    || ||| || |||| || ||||||||| ||||||||    
T  19610 actaactcctaattacccagctatgtatgtgatgat 19645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 131 - 260
Target Start/End: Original strand, 253245 - 253374
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgtataggacatgggt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | || |||||| ||||| |||||||||||   || |||     
T  253245 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtataatcaaaacaggcacgttgagtttgagtgtataatccaagggg 253344  T
Q  231 ggacgaggtttgatgaagttcatagagaca 260  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  253345 ggtcgaggttttatgaagttcatagagaca 253374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 267 - 352
Target Start/End: Original strand, 253395 - 253480
Alignment:
Q  267 tctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggtccttaccaaccccaaattgcctagctatgtaagtgatgat 352  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| | |  || ||| |||||| ||| || || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  253395 tctatgttaagcctattgtttccctcaatcttgtttatccctaggtcctcacccactcccaatttcctagctatgtatgtgatgat 253480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1095 (Bit Score: 99; Significance: 8e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold1095
Description:

Target: scaffold1095; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 131 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 2041 - 1878
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgtataggacatgggt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | || || ||||||||| ||||||||||| | ||||||     
T  2041 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtataatcaaaacagtcacattgagtttgagtgtataagccatgggg 1942  T
Q  231 ggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatc 296  Q
    || |||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1941 ggtcgaggttttatgaagttcat--agacaagggtctctatgttaagcctattgtttccctcaatc 1878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 131 - 352
Target Start/End: Original strand, 7943 - 8163
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgtataggacatgggt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | || |||||| ||||  ||||||||||| | |||||||    
T  7943 aacatacaacaaattttcttccagctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtataatcaaaacaggcacgttga-tttgagtgtataagccatgggt 8041  T
Q  231 ggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttggtccttaccaaccccaaatt 330  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |  |||| |||| | |  || |||||||||| ||| || || ||||    
T  8042 ggtcgaggtttaatgaagttcatagagacaaggatctctatgttaagcctattattccccttaatcttgttgatcccttggtcctcacccactcccaatt 8141  T
Q  331 gcctagctatgtaagtgatgat 352  Q
    ||||||||||||| || |||||    
T  8142 gcctagctatgtatgttatgat 8163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 296
Target Start/End: Original strand, 25745 - 26022
Alignment:
Q  14 catcatggtcatggtgctcctcctcatggatca-ttgtgcaccttcctcttcttggtgcaagtgtgcaccatctgcttcttcattatgcagctctatgtg 112  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||    ||||||||||   | ||||  ||    
T  25745 catcacggtcatggtgctcctcatcatggtgcagttgtgcaccttcatcttcttggtgcaattttgcaccttccatgtcttcattattgtgttctacatg 25844  T
Q  113 cacctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttg 212  Q
    |||||||||||||||||      ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   || | ||| ||||| ||||| |||    
T  25845 cacctgtgggtcatcat------acagcaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggcagtaagatcaaaatgggcacgttgagtttg 25938  T
Q  213 agtgtataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatc 296  Q
    ||||||||    | |||  | |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  25939 agtgtataaacaaaggggagtcgaggttttatgaagttcatagagataagggtttctatgtttagcctattgtttccctcaatc 26022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 131 - 295
Target Start/End: Original strand, 32990 - 33154
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgtataggacatgggt 230  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||  | || ||||| |||||| ||||||| ||| | |||||||    
T  32990 aacatacaacaaatttgcttccacctcggtgttagtgcgagatgggttaggaagtagaaacaaaagaggcatattgagtttgagtgcataagtcatgggt 33089  T
Q  231 ggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaat 295  Q
    |||||| | || |||||||||||||| |  ||||| || ||||||||||||||||  ||||||||    
T  33090 ggacgatgcttaatgaagttcatagaaatgagggtttcaatgttaagcctattgttgccctcaat 33154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1879 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1879
Description:

Target: scaffold1879; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 114 - 295
Target Start/End: Original strand, 336 - 517
Alignment:
Q  114 acctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttga 213  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  | |||||| | ||| || |  |    
T  336 acctgtggaccatcaccaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtagaaacaaaataggtatattaagttgaa 435  T
Q  214 gtgtataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaat 295  Q
    ||| ||| | |||||||||| || |||||||||| |||||||| |  ||||| || ||||| ||| | |||| |||||||||    
T  436 gtgcataagtcatgggtggatgaagtttgatgaaattcatagaaatgagggtttcaatgtttagcatgttgtttccctcaat 517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 131 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 11306 - 11142
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgtataggacatgggt 230  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  | ||  |||||||| || || |||| ||| | |||||||    
T  11306 aacatacaacaaattcgcttccacctcggtgttagtccgagatgggttagaaagtagaaacaaaaggggcacatttagtttaagtgcataagtcatgggt 11207  T
Q  231 ggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaat 295  Q
    |||||| | || ||||| |||||||| |  || || || ||||||||||||||||  ||||||||    
T  11206 ggacgaagcttaatgaaattcatagaaatgagtgtttcaatgttaagcctattgttgccctcaat 11142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0202 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0202
Description:

Target: scaffold0202; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 212 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 1848 - 1708
Alignment:
Q  212 gagtgtataggacatgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatcctctgaattccttgg 311  Q
    |||||| |||||| |||||| | || | || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||  | |  || ||||||    
T  1848 gagtgtgtaggacgtgggtgtatgatgattaatgaagttcatagagataagggtctctatgttaagcctattgttaccctcaattttgtttatcccttgg 1749  T
Q  312 tccttaccaaccccaaattgcctagctatgtaagtgatgat 352  Q
    |||| ||| || || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  1748 tcctcacccactcccaattgcctagctatgtatgtgatgat 1708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 21700 - 21631
Alignment:
Q  114 acctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaa 183  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21700 acctgtggaacatcaccaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttattccgagatgggttaggaa 21631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 131 - 295
Target Start/End: Original strand, 39171 - 39335
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagtgcaattagaataggcacattgagcttgagtgtataggacatgggt 230  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||  | || ||| || || || |  |||| ||| | |||||||    
T  39171 aacatacaacaaatttgcttccacctcggtgttagtccaagatgggttaggaagtagaaacaaaagaggtacgttaagttgaagtgcataagtcatgggt 39270  T
Q  231 ggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaat 295  Q
    ||| || |||| ||||| |||||||| |  ||||| || ||||| || ||||||| |||||||||    
T  39271 ggatgaagtttaatgaaattcatagaaatgagggtttcaatgtttagtctattgtttccctcaat 39335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 55035 - 54964
Alignment:
Q  114 acctgtgggtcatcattaacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagt 185  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  55035 acctgtggaccatcaccaacatacaacaaatttgcttccacctcggtgttaatccgagatgggttaggaagt 54964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1620 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1620
Description:

Target: scaffold1620; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 185
Target Start/End: Original strand, 426 - 480
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagt 185  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  426 aacatacaacaaatttgcttccacctccgtgttagtccgagatgggttaggaagt 480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1571 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1571
Description:

Target: scaffold1571; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 1399 - 1345
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagt 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1399 aacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagt 1345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0577 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0577
Description:

Target: scaffold0577; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 4883 - 4829
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagt 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4883 aacatacaacaaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagt 4829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0473
Description:

Target: scaffold0473; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 12815 - 12761
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagt 185  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12815 aacatacaactaattttcctccacctcggggttagtccgagatgggttaggaagt 12761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 10194 - 10140
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaagt 185  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  10194 aacatacaacaaatttgcttccacctcagtgttagtccgagatgggtcaggaagt 10140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 131 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 115424 - 115371
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaag 184  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  115424 aacatacaacaaatttgcctccacctcggtgttaatccgagatgggttaggaag 115371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 131 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 119728 - 119675
Alignment:
Q  131 aacatacaacaaattttcttccacctcggtgttagtccgagatgggttaggaag 184  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  119728 aacatacaacaaatttgcctccacctcggtgttaatccgagatgggttaggaag 119675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 296
Target Start/End: Original strand, 50299 - 50371
Alignment:
Q  224 catgggtggacgaggtttgatgaagttcatagagacaagggtatctatgttaagcctattgtgtccctcaatc 296  Q
    |||||||||| || | || ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||  |||||||||    
T  50299 catgggtggatgaagcttaatgaaattcatagaaacaagggtttcaatattaagcctattgttgccctcaatc 50371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University