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Alignment Overview

Query: NF6259_low_14 (Length: 371)

Name: NF6259_low_14
Description: NF6259
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6259_low_14
NF6259_low_14
[»] chr7 (44 HSPs)
chr7 (8-332)||(28342681-28343008)
chr7 (8-332)||(510016-510344)
chr7 (8-332)||(23101661-23101989)
chr7 (8-332)||(29614302-29614630)
chr7 (8-332)||(39784477-39784804)
chr7 (8-332)||(33891743-33892069)
chr7 (8-332)||(40460220-40460549)
chr7 (8-332)||(37328277-37328606)
chr7 (8-332)||(8675701-8676029)
chr7 (24-332)||(29893342-29893653)
chr7 (8-332)||(39028457-39028784)
chr7 (8-332)||(7993527-7993854)
chr7 (8-332)||(44256272-44256590)
chr7 (8-332)||(3023304-3023632)
chr7 (15-331)||(29585885-29586204)
chr7 (8-332)||(44121437-44121768)
chr7 (8-332)||(12740740-12741070)
chr7 (8-332)||(32884141-32884459)
chr7 (58-332)||(28034405-28034683)
chr7 (49-329)||(41827701-41827983)
chr7 (8-262)||(48136735-48136991)
chr7 (8-229)||(47067185-47067407)
chr7 (127-332)||(18838780-18838987)
chr7 (74-332)||(37972451-37972712)
chr7 (8-205)||(21067879-21068077)
chr7 (8-234)||(30823108-30823336)
chr7 (6-161)||(33383183-33383340)
chr7 (202-332)||(33383044-33383176)
chr7 (8-82)||(37971885-37971959)
chr7 (147-295)||(42610579-42610727)
chr7 (158-296)||(16709396-16709532)
chr7 (158-296)||(17683632-17683768)
chr7 (193-296)||(43172115-43172218)
chr7 (147-296)||(14741387-14741536)
chr7 (149-296)||(4639866-4640013)
chr7 (162-296)||(26201794-26201929)
chr7 (134-295)||(21486105-21486266)
chr7 (148-235)||(23017014-23017101)
chr7 (162-296)||(27148806-27148941)
chr7 (162-259)||(33497097-33497195)
chr7 (162-256)||(11735194-11735289)
chr7 (147-257)||(21024066-21024176)
chr7 (280-332)||(30823059-30823113)
chr7 (160-257)||(35313557-35313654)
[»] chr1 (48 HSPs)
chr1 (8-332)||(25612463-25612790)
chr1 (8-332)||(6312947-6313274)
chr1 (8-332)||(29395934-29396261)
chr1 (8-332)||(51701966-51702293)
chr1 (8-332)||(15834534-15834861)
chr1 (8-332)||(9322016-9322335)
chr1 (8-332)||(45272938-45273266)
chr1 (8-332)||(48176942-48177270)
chr1 (8-298)||(46328393-46328684)
chr1 (8-332)||(18798828-18799150)
chr1 (8-329)||(25830747-25831073)
chr1 (8-332)||(5494597-5494925)
chr1 (8-332)||(38535645-38535973)
chr1 (8-332)||(38557863-38558191)
chr1 (74-332)||(8140800-8141060)
chr1 (8-215)||(29219611-29219819)
chr1 (8-197)||(28386955-28387145)
chr1 (114-257)||(49231455-49231599)
chr1 (134-296)||(47371551-47371714)
chr1 (147-299)||(48966481-48966633)
chr1 (8-82)||(8140359-8140433)
chr1 (150-295)||(3583549-3583694)
chr1 (231-332)||(28387141-28387244)
chr1 (149-285)||(25253486-25253622)
chr1 (147-296)||(49453050-49453200)
chr1 (147-256)||(32760089-32760198)
chr1 (149-295)||(28403938-28404084)
chr1 (134-235)||(42304476-42304578)
chr1 (148-296)||(35177201-35177350)
chr1 (147-299)||(8147296-8147448)
chr1 (147-296)||(4005049-4005198)
chr1 (150-261)||(15927316-15927427)
chr1 (147-297)||(26757596-26757746)
chr1 (147-296)||(9192006-9192155)
chr1 (147-296)||(41353403-41353552)
chr1 (147-296)||(51106874-51107023)
chr1 (149-296)||(1243298-1243445)
chr1 (158-296)||(5209369-5209507)
chr1 (147-257)||(11579090-11579200)
chr1 (8-58)||(49231632-49231682)
chr1 (165-296)||(49236974-49237105)
chr1 (162-286)||(52182318-52182443)
chr1 (170-253)||(27257871-27257954)
chr1 (162-295)||(49971599-49971734)
chr1 (162-256)||(1108374-1108468)
chr1 (160-257)||(7798521-7798618)
chr1 (174-257)||(3593267-3593350)
chr1 (131-186)||(51902044-51902100)
[»] chr6 (21 HSPs)
chr6 (8-332)||(31896008-31896335)
chr6 (8-332)||(4199964-4200281)
chr6 (8-332)||(31067803-31068121)
chr6 (8-332)||(30384567-30384894)
chr6 (8-332)||(14261947-14262266)
chr6 (12-300)||(34773803-34774079)
chr6 (12-332)||(7497469-7497784)
chr6 (123-332)||(34758700-34758909)
chr6 (147-296)||(16438667-16438816)
chr6 (148-300)||(31975643-31975795)
chr6 (147-303)||(1463661-1463817)
chr6 (147-298)||(6788059-6788210)
chr6 (149-299)||(2606853-2607003)
chr6 (183-257)||(28900864-28900938)
chr6 (165-258)||(31535068-31535161)
chr6 (147-296)||(10113770-10113919)
chr6 (147-295)||(3000202-3000350)
chr6 (147-200)||(24194470-24194524)
chr6 (160-258)||(31996251-31996349)
chr6 (162-257)||(8779586-8779681)
chr6 (170-256)||(13461374-13461460)
[»] chr4 (41 HSPs)
chr4 (8-332)||(5441774-5442101)
chr4 (8-332)||(27768436-27768763)
chr4 (8-332)||(37827932-37828259)
chr4 (8-332)||(51321228-51321554)
chr4 (8-322)||(48261460-48261778)
chr4 (8-332)||(54341514-54341845)
chr4 (8-332)||(23987569-23987895)
chr4 (8-332)||(5800336-5800664)
chr4 (8-332)||(50018564-50018890)
chr4 (8-332)||(54852978-54853305)
chr4 (8-332)||(32683531-32683856)
chr4 (8-332)||(49501034-49501362)
chr4 (8-332)||(49507099-49507427)
chr4 (8-332)||(49834334-49834663)
chr4 (8-332)||(28484267-28484599)
chr4 (8-332)||(32322438-32322768)
chr4 (8-332)||(41725485-41725804)
chr4 (8-332)||(37916173-37916489)
chr4 (71-332)||(30966907-30967172)
chr4 (8-199)||(29649507-29649699)
chr4 (117-332)||(29855888-29856106)
chr4 (149-296)||(29510061-29510208)
chr4 (131-298)||(50517161-50517320)
chr4 (8-79)||(30966540-30966611)
chr4 (174-296)||(32889857-32889979)
chr4 (147-256)||(26491116-26491225)
chr4 (134-257)||(24966498-24966622)
chr4 (149-257)||(46286709-46286817)
chr4 (147-266)||(29469154-29469273)
chr4 (147-266)||(8084200-8084319)
chr4 (147-299)||(23671367-23671519)
chr4 (147-256)||(42937404-42937513)
chr4 (162-285)||(871782-871905)
chr4 (183-257)||(33138800-33138874)
chr4 (148-258)||(26448630-26448740)
chr4 (160-258)||(51967276-51967374)
chr4 (160-258)||(9972772-9972870)
chr4 (160-257)||(6487324-6487421)
chr4 (160-257)||(40162789-40162886)
chr4 (160-257)||(54561219-54561316)
chr4 (162-205)||(24453932-24453976)
[»] chr2 (39 HSPs)
chr2 (8-332)||(7027275-7027602)
chr2 (8-332)||(18177643-18177970)
chr2 (8-332)||(26789157-26789483)
chr2 (8-332)||(28739796-28740124)
chr2 (8-332)||(28844957-28845284)
chr2 (8-329)||(10657805-10658129)
chr2 (8-332)||(6224078-6224407)
chr2 (8-332)||(25288535-25288862)
chr2 (8-332)||(379302-379629)
chr2 (8-332)||(3575217-3575541)
chr2 (8-229)||(43825317-43825538)
chr2 (8-197)||(3464111-3464301)
chr2 (8-229)||(43078967-43079187)
chr2 (147-332)||(13833062-13833249)
chr2 (114-332)||(33135990-33136209)
chr2 (193-332)||(214946-215087)
chr2 (231-332)||(3464012-3464115)
chr2 (148-298)||(34342197-34342347)
chr2 (149-295)||(40829596-40829744)
chr2 (147-296)||(31847209-31847359)
chr2 (148-258)||(35404311-35404421)
chr2 (158-296)||(15224191-15224329)
chr2 (147-296)||(18899919-18900068)
chr2 (160-257)||(19948538-19948635)
chr2 (147-299)||(2308705-2308857)
chr2 (8-60)||(33136240-33136292)
chr2 (147-244)||(38295709-38295806)
chr2 (162-256)||(32242211-32242306)
chr2 (272-332)||(43825261-43825323)
chr2 (148-258)||(33262852-33262962)
chr2 (39-104)||(39697863-39697928)
chr2 (160-258)||(3991772-3991870)
chr2 (160-253)||(11153354-11153447)
chr2 (162-258)||(15926377-15926474)
chr2 (160-257)||(38413458-38413555)
chr2 (170-258)||(1833720-1833808)
chr2 (160-256)||(13898477-13898573)
chr2 (160-256)||(14039094-14039190)
chr2 (134-241)||(18727624-18727732)
[»] chr8 (33 HSPs)
chr8 (8-332)||(14781634-14781961)
chr8 (8-332)||(44725293-44725620)
chr8 (9-332)||(19717378-19717703)
chr8 (8-332)||(31625680-31626007)
chr8 (8-330)||(18958230-18958554)
chr8 (8-332)||(18305473-18305805)
chr8 (8-332)||(39467018-39467347)
chr8 (8-332)||(43166179-43166505)
chr8 (8-332)||(9287995-9288323)
chr8 (8-332)||(43308009-43308337)
chr8 (8-332)||(42305103-42305433)
chr8 (8-331)||(10294851-10295167)
chr8 (10-332)||(26856477-26856801)
chr8 (8-268)||(7466759-7467020)
chr8 (8-332)||(32497913-32498236)
chr8 (8-332)||(16364078-16364393)
chr8 (8-184)||(37857406-37857585)
chr8 (134-296)||(8029817-8029980)
chr8 (177-295)||(12522528-12522646)
chr8 (162-296)||(6388131-6388265)
chr8 (147-296)||(19484176-19484325)
chr8 (134-245)||(27878611-27878723)
chr8 (134-245)||(28018792-28018904)
chr8 (147-206)||(12522424-12522483)
chr8 (148-255)||(41393958-41394065)
chr8 (162-258)||(37131291-37131388)
chr8 (162-257)||(24067106-24067202)
chr8 (149-257)||(26620338-26620446)
chr8 (134-245)||(27915555-27915667)
chr8 (134-245)||(27961974-27962086)
chr8 (150-247)||(17234724-17234820)
chr8 (149-190)||(42423257-42423298)
chr8 (162-205)||(35879731-35879775)
[»] chr5 (22 HSPs)
chr5 (8-332)||(13999597-13999924)
chr5 (8-332)||(13926303-13926630)
chr5 (8-332)||(37014226-37014553)
chr5 (8-332)||(39852742-39853069)
chr5 (8-329)||(4549762-4550085)
chr5 (8-332)||(5949484-5949816)
chr5 (8-332)||(40013205-40013535)
chr5 (18-332)||(4239977-4240296)
chr5 (8-219)||(1151795-1152006)
chr5 (148-332)||(1460790-1460976)
chr5 (147-296)||(5651178-5651327)
chr5 (8-82)||(1459682-1459756)
chr5 (147-296)||(7125156-7125305)
chr5 (147-296)||(28623158-28623307)
chr5 (162-296)||(16548850-16548985)
chr5 (147-235)||(37798111-37798199)
chr5 (147-285)||(29716782-29716920)
chr5 (160-235)||(21238763-21238838)
chr5 (134-261)||(29758702-29758828)
chr5 (160-257)||(2675078-2675175)
chr5 (226-295)||(21489862-21489931)
chr5 (183-296)||(34218430-34218543)
[»] chr3 (42 HSPs)
chr3 (8-332)||(36673656-36673982)
chr3 (8-332)||(31645760-31646091)
chr3 (8-332)||(37455217-37455545)
chr3 (9-332)||(40897501-40897827)
chr3 (8-332)||(23752890-23753219)
chr3 (8-332)||(50761602-50761930)
chr3 (8-332)||(48379520-48379848)
chr3 (8-332)||(52810728-52811057)
chr3 (22-332)||(51737206-51737517)
chr3 (8-291)||(20833310-20833595)
chr3 (8-332)||(50902816-50903139)
chr3 (8-332)||(44905357-44905685)
chr3 (8-332)||(18750013-18750331)
chr3 (8-332)||(52617483-52617802)
chr3 (8-328)||(54629225-54629550)
chr3 (8-329)||(39038463-39038778)
chr3 (8-332)||(17946598-17946912)
chr3 (8-229)||(34483601-34483823)
chr3 (113-332)||(26107699-26107921)
chr3 (8-104)||(10660789-10660885)
chr3 (8-104)||(39841950-39842046)
chr3 (8-198)||(45254932-45255116)
chr3 (217-332)||(45863193-45863310)
chr3 (148-297)||(21386476-21386625)
chr3 (134-253)||(16155168-16155288)
chr3 (134-295)||(7437548-7437710)
chr3 (149-296)||(4962724-4962871)
chr3 (8-80)||(26107929-26108001)
chr3 (134-287)||(33693226-33693380)
chr3 (147-296)||(8598620-8598769)
chr3 (134-299)||(7665549-7665714)
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chr3 (147-257)||(22489475-22489585)
chr3 (134-258)||(49458357-49458482)
chr3 (268-332)||(32580511-32580577)
chr3 (147-296)||(53835923-53836072)
chr3 (148-296)||(42736268-42736416)
chr3 (174-295)||(43172889-43173010)
chr3 (162-257)||(25049871-25049967)
chr3 (162-297)||(45602422-45602558)
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[»] scaffold0543 (1 HSPs)
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Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 44)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 28343008 - 28342681
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       
T  28343008 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgccagcacttacaaatctttcaaa 28342909  T
Q  108 nnnnn-tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaac 206  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28342908 aaaaaatattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccagaaac 28342809  T
Q  207 tgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacat 306  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28342808 cgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaacactcgatttgcggaacattgattacgacat 28342709  T
Q  307 a--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||    
T  28342708 actctctatcataatattctcaatacaa 28342681  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 510344 - 510016
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  510344 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcaaa 510245  T
Q  108 nnnnn--tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaa 205  Q
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T  510244 aaaaaaatattgcgtcagccattacaaatcggtcgagttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccagaaa 510145  T
Q  206 ctgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaaca 305  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  510144 ccgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaacactcgatttgcggaacattgattacgaca 510045  T
Q  306 ta--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  510044 tactctctatcataatattctcaatacaa 510016  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 23101989 - 23101661
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       
T  23101989 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttatttccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgccagcacttacaaatctttcaaa 23101890  T
Q  108 nnnnntat--tgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaa 205  Q
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T  23101889 aaaaatatattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccagaaa 23101790  T
Q  206 ctgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaaca 305  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23101789 ctgattttaccttagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaacactcgatttgcggaacattgattacgaca 23101690  T
Q  306 ta--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  23101689 tactctctatcataatattctcaatacaa 23101661  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 29614302 - 29614630
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       
T  29614302 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgttagcacttacaaatctttcaaa 29614401  T
Q  108 nnnnn--tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaa 205  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  29614402 aaaaaaatattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaacctttcaattttaccagaaa 29614501  T
Q  206 ctgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaaca 305  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29614502 ccgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaacactcgatttgcggaacattgattacgaca 29614601  T
Q  306 ta--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  29614602 tactctctatcataatattctcaatacaa 29614630  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 39784804 - 39784477
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||       
T  39784804 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacttatttaaaattatgcaagcacttacaaatctttcaaa 39784705  T
Q  108 nnnnn-tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaac 206  Q
          ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39784704 aaaaaatattgtgccagccattacaaatcggtcgagttacacgagtttaccgagtgttaactctgtcaaactcgttaaaccttccaattttaccagaaac 39784605  T
Q  207 tgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacat 306  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  39784604 cgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcgaagatttaacactcgatttacggaacattgattacgacat 39784505  T
Q  307 ac--tctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  39784504 actttctatcataatattctcaatacaa 39784477  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 33891743 - 33892069
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||       
T  33891743 attattctcaatacacattttttatttgtttaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcgcttacaaatctttcaaa 33891842  T
Q  108 nnnnntattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaact 207  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  33891843 aaaaatattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttacacgagtttattgagtgttaactcagtcaaattcgttaaaccttccaattttaccagaaacc 33891942  T
Q  208 gattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacata 307  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33891943 gattttaccttagagttaacacgatttttgtacctaaaaacgtaaacttggtaatctcggagagttaacactcgatttgcggaacattgattacgacata 33892042  T
Q  308 --ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
      |||||||||||||||||| ||||||    
T  33892043 ctctctatcataatattctctatacaa 33892069  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 40460220 - 40460549
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||       
T  40460220 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatgtttaaaattatgccagcacttgcaaatctttcaaa 40460319  T
Q  108 nnnnn---tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaa 204  Q
            ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40460320 aaaaaatatattgtgtcagccattacaaatcagtcgagttacacgagtatactgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccagaa 40460419  T
Q  205 actgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaac 304  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||    
T  40460420 accgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaagcgtaaactcggtaatctcgaagagttaacactcgatttgcggaacgttgattacgac 40460519  T
Q  305 ata--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  40460520 atactctctatcataatattctcaatacaa 40460549  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 37328606 - 37328277
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  37328606 attattctcaatacacattttttattttttaaaaatgttattgccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcaaa 37328507  T
Q  108 nnnnn--tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaa 204  Q
           |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||    
T  37328506 aaaaaaatattgtgtcagccactacaaatcggtcgagtttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaacacgttaaaccttccgattttaccagaa 37328407  T
Q  205 actgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaac 304  Q
    |  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37328406 atcgagtttaccttagagttaacacgatttttgtacctaaaaacgtaaactcgataatctcggagagtcaacactcgatttgcggaacattgattacgac 37328307  T
Q  305 ata--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    |||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  37328306 atactctctataataatattctcaatacaa 37328277  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 8676029 - 8675701
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       
T  8676029 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttatttccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgccagcacttacaaatctttcaaa 8675930  T
Q  108 nnnnntattgtgtcagccattacaaatcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaatttt-accggaaa 205  Q
         ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||| ||||    
T  8675929 aaatatattgtgtcagcccttacaaatcggtcgagtttacacgagtttatcgagtgttaactcagtcaaactcgtcaaacctttcgatttttaccagaaa 8675830  T
Q  206 ctgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaaca 305  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8675829 ccgagtttaccttagagttaacacgattttggtacctaaaaacgttaactcggtaatctcggagagttaacactcgatttgcgaaacattgattacaaca 8675730  T
Q  306 ta--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  8675729 tactctctatcataatattctcaatacaa 8675701  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 24 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 29893653 - 29893342
Alignment:
Q  24 attttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnnnnnnn-tattgtgtca 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||| ||    
T  29893653 attttttatttgttaaaaatgttattcc-acaaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcaaaaaataatattgtggca 29893555  T
Q  123 gccattacaaatcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcaga 221  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  29893554 gccattataaatcggtcgagtttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaacctttcgatttcaccagaaactgagtttacctcaga 29893455  T
Q  222 gttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacata--ctctatcataat 319  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||    
T  29893454 gttaacacgatttttgtacttaaaaatgtaaactcggtaatctcggagagttaacactcgatttgcggaacattgattacgacatactctctatcagaat 29893355  T
Q  320 attctcaatacaa 332  Q
    |||||||||||||    
T  29893354 attctcaatacaa 29893342  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 39028784 - 39028457
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcactt-acaaatctttcnn 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||      
T  39028784 attattctcaatacacattttttatatgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatt-aaaattatggcaacactttacaaatctttcaa 39028686  T
Q  107 nnnnnn-tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaa 205  Q
           |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  39028685 aaaaaaatattgtgttagtcattacaaatcggtcgagttacacgagtttactgagtgttaactcagtcaaactcgttaaatcttccaattgtaccagaaa 39028586  T
Q  206 ctgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaaca 305  Q
    | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39028585 ccgattttacctcagagtttacacaatttttgtacctaaaaacgtaaactcggtaatctcggagagttaacactcgatttgcggaacattgattacgaca 39028486  T
Q  306 ta--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  39028485 tactctctatcataatattctcaatacaa 39028457  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 7993854 - 7993527
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        
T  7993854 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgccagcacttacaaatctttataa 7993755  T
Q  108 nnnnntattgtgtcagccattacaaatcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaac 206  Q
          || | |||| ||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  7993754 aaaaaaatagggtcaaccattacaaattggtcgagtttacaccagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccgattttaccagaaac 7993655  T
Q  207 tgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacat 306  Q
     || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7993654 cgagtttacctcatagttaacacgatttttgtacttaaaaatatatactcggtaatctcggagagttaacactcgatttgcggaacattgattacgacat 7993555  T
Q  307 act--ctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    |||  |||| ||||||||||||||||||    
T  7993554 actccctataataatattctcaatacaa 7993527  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 44256272 - 44256590
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  44256272 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcaaa 44256371  T
Q  108 nnnnn-tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaac 206  Q
          ||||||| ||||||||||||||||||| ||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  44256372 aaaaaatattgtgccagccattacaaatcggtcaagtt---------taccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccgattttaccagaaat 44256462  T
Q  207 tgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacat 306  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  44256463 cgagtttacctcagagttaacacgatttttgtatctaaaaacgtaaactcgataatctcggagagttaacactcgatttgcgggacattgattacgacat 44256562  T
Q  307 a--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    |  ||||||||||||||| |||||||||    
T  44256563 actctctatcataatattttcaatacaa 44256590  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 3023632 - 3023304
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||        
T  3023632 attattctcagtacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattatacatatttaaaattatgctagcacttacagatctttaaaa 3023533  T
Q  108 nnnnn--tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaa 205  Q
           |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  3023532 aaaaaaatattatgtcagccattacaaatcggtcaagttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttatcagaaa 3023433  T
Q  206 ctgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaaca 305  Q
    | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||  |||    
T  3023432 ccgattttacctcaaagttaacatgatttttgtacctaaaaacataaactcgataatctcggagagttaacactcgatttgcggatcattgattatgaca 3023333  T
Q  306 ta--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    ||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  3023332 taatctctatcataatattctcattacaa 3023304  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 15 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 29586204 - 29585885
Alignment:
Q  15 tcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnnnnnnnta 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |         ||    
T  29586204 tcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtagatatttaaaattatgccagcacttacaaatctgttaaaaaaaata 29586105  T
Q  115 ttgtgtcagccattacaaatcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgatttt 213  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||    
T  29586104 ttgtgtcagtcattacaaatcgatcgagtttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcattaaaccttccgattttacccgaaaccgacttt 29586005  T
Q  214 acctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacata--ctct 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||| |||| || ||||||||||||| ||| |||||  ||||    
T  29586004 acctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaacgtaaactcggtaatctcagagagttaacactcaatctgcggaacattgactacgacatactctct 29585905  T
Q  312 atcataatattctcaataca 331  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29585904 atcataatattctcaataca 29585885  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 44121437 - 44121768
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        
T  44121437 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatattattcccacaaaattcaattgtacatattaaaaattatgtcagcacttacaaatctttaaaa 44121536  T
Q  108 nnnnnta----ttgtgtcagccattacaaatcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccgg 202  Q
         ||    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |    
T  44121537 aaaaataaaaattgtgtcagccattacaaatcggtcgagtttacacgagtttaccaagtgttaactcagtcaaactcgttaagccttccgattttaccag 44121636  T
Q  203 aaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattaca 302  Q
    |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||     
T  44121637 aaaccgaatttacctcatagttaacacgatttttgtacctaaaaacgtaaattcggtaatctcagagagttaacactcgatttgcggaatattgattacg 44121736  T
Q  303 acatac--tctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    ||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  44121737 acacactttctatcataatattctcaatacaa 44121768  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 12741070 - 12740740
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  12741070 attattctcaatatacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttaaaa 12740971  T
Q  108 nnnnnta---ttgtgtcagccattacaaatcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccgga 203  Q
         ||   ||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  12740970 aaaaataatattgtgtcagcccttacaaatcagtcgagtttacacgactttaccgagtgctaacttagtcaaactcgtcaaaccttccaattttaccaga 12740871  T
Q  204 aactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaa 303  Q
     || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  12740870 caccgagtttacctcagagttaacacgattttggtacctaaaaacgtaaactcggtaatctcggagagttaacactcgatttgcgtaacattgattacaa 12740771  T
Q  304 cata--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    ||||  ||||||||||||| ||| |||||||    
T  12740770 catactctctatcataatactctgaatacaa 12740740  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 32884459 - 32884141
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||        
T  32884459 attattctcaatgcacattttttatttgttaaaaatgttattcccaaaaaattcaattgtacatatttaaaactatgcgagcacttacaaatcttttaaa 32884360  T
Q  108 nnnnntattgtgtcagccattacaaatcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaac 206  Q
         |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||         ||||| |||||||| |||||    
T  32884359 aaaaatattgtgtcagccattacaaatcggttgagtttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaac---------cttccgattttaccagaaac 32884269  T
Q  207 tgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacat 306  Q
     || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  32884268 agagtttacctcagagttaactcgatttttgtacctaaaaacgtaaactcggtaatctcggagagttaacactcgatttacggaacattgattacgacat 32884169  T
Q  307 a--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||    
T  32884168 actctctatcataatattctcaatacaa 32884141  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 58 - 332
Target Start/End: Original strand, 28034405 - 28034683
Alignment:
Q  58 attcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnnnnnnntat--tgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagttta 155  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  28034405 attcaattgtgcatatttaaaattatgtcagcacttacaaatcttttaaaaaaaatatattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttacatgagttta 28034504  T
Q  156 ccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaact 255  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  28034505 ccaagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccagaaaccgattttacatcagagttaacacgatttttgtacataaaaacgtaaact 28034604  T
Q  256 cgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacata--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    || ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  28034605 cggtaatctcagagagttaacactcgatttgcggaacattgattacgacatactctctatcataatattctcaatacaa 28034683  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 49 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 41827983 - 41827701
Alignment:
Q  49 tcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnnnnnnntattgtgtcagccattacaaatcggtcgagtt-aga 147  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||        |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |    
T  41827983 tcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgccagcacttacaaatatttcaaaaaaaatattgtgtcagc-attacaaatcggtcgagtttaca 41827885  T
Q  148 cgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaa 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41827884 cgagtttaccgagtgttaactcagtcaaacttgttaaatcttctgattttaccagaaactgagtttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaa 41827785  T
Q  248 tgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacata--ctctatcataatattctcaata 329  Q
     |||||||| |||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  41827784 cgtaaactcaataatctcagagagttaacactcaatttgcggaacattgattacgacatactctctatcataatattctcaata 41827701  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 8 - 262
Target Start/End: Original strand, 48136735 - 48136991
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       
T  48136735 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgccagcacttacaaatctttcaga 48136834  T
Q  108 nnnnn-tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaa 205  Q
          ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  48136835 aatatatattgtgtcagcccttacaaatcggtcgagtttacacgaatttatcgagtgttaactcagtcaaactcgtcaaaccttctaattttaccagaaa 48136934  T
Q  206 ctgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataat 262  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  48136935 ctgagtttacctcagagttaacacgattttggtacctaaaaacgtaaactcggtaat 48136991  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 47067407 - 47067185
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttc-nn 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  47067407 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcaaa 47067308  T
Q  107 nnnnnntattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaac 206  Q
          ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||     
T  47067307 aaaaaatattgggtcagctattacaaatcggtcgagttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaacctttcaattttaccagaaat 47067208  T
Q  207 tgattttacctcagagttaacac 229  Q
     ||||||| ||||||||||||||    
T  47067207 cgattttatctcagagttaacac 47067185  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 127 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 18838987 - 18838780
Alignment:
Q  127 ttacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaa 226  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  18838987 ttacaaatcggttgagttacacgagtttaccgaatgttaacttagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccagaaaccgattttacctcagagttaa 18838888  T
Q  227 cacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacata--ctctatcataatattct 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  18838887 cacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcggtaatctcggagagttaacactcgatttgcggaacattgagtacgacatactctctatcataatattct 18838788  T
Q  325 caatacaa 332  Q
    ||||||||    
T  18838787 caatacaa 18838780  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 74 - 332
Target Start/End: Original strand, 37972451 - 37972712
Alignment:
Q  74 ttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnnnnnnntattgtgtcagccattacaaatcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagt 172  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||    
T  37972451 ttaaaattatgccagcacttacaaatctttcaaaaaaaaaattgtgtcagcccttacaaatcggtcgagtttacacgagtttaccaagtgctaactcagt 37972550  T
Q  173 caaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatt 272  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || | |    
T  37972551 caaattcgttaaaccttccgattttaccagaaactgagtttatctcagagttaacacgattttggtacctaaaaacgtaaactcggtaatctcagaaagt 37972650  T
Q  273 taaaactcgatttgcggaacattgattacaacata--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  37972651 taacactcgatttgcggaacattgattacaacatactctctatcataatactctcaatacaa 37972712  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 21068077 - 21067879
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        
T  21068077 attattttcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgccagcacttacaaatcttttaaa 21067978  T
Q  108 nnnnntattgtgtcagccattacaaatcggtcgag-ttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaa 205  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  21067977 aaaaatattgtgtcagccattacaaatcggtcgagtttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccgattttaccagaaa 21067879  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30823336 - 30823108
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  30823336 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttat-cccgcaaaattcaattgtgcatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcaaa 30823238  T
Q  108 nnnnn--tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaa 204  Q
           |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||  |||    
T  30823237 aaaaaaatattgtgtcagccattacaaatcgatcgagtttacacgagtttaccgagtgttaactcaatcaaactcgttgaaccttccgattttactagaa 30823138  T
Q  205 actgattttacctcagagttaacacgattt 234  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||    
T  30823137 accgagtttacctcagagttaacacgattt 30823108  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 33383340 - 33383183
Alignment:
Q  6 agattattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttc- 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  33383340 agattattctcaatacacattttttatttgttgaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgttagcacttacaaatctttca 33383241  T
Q  105 nnnnnnnntattgtgtcagccattacaaatcggtcgag-ttagacgagtttaccgagt 161  Q
            ||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  33383240 aaaaaatatattgtgtcagcccttacaaatcggtcaagtttacacgagtttaccgagt 33383183  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 202 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 33383176 - 33383044
Alignment:
Q  202 gaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattac 301  Q
    ||||| || |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33383176 gaaaccgagtttatctcagagttaccacgattttggtacctaaaaacgtaaactcggtaatctcggagagttaacactcgatttgcggaacattgattac 33383077  T
Q  302 aacata--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    ||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  33383076 aacatactctctatcataatattcacaatacaa 33383044  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 82
Target Start/End: Original strand, 37971885 - 37971959
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaatta 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  37971885 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtatatatttaaaatta 37971959  T

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Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 147 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 42610727 - 42610579
Alignment:
Q  147 acgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaa 246  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||  | ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||     
T  42610727 acgagtttacccagtgttaactcggtcaaactcgtcaaaccttctgattttaccagaaaccaagtttacctcaaatttaacacgattttggtacctaaac 42610628  T
Q  247 atgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacatt 295  Q
    | ||||| ||| ||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  42610627 acgtaaattcggtaaactcagagagttaacactcaatttgcggaacatt 42610579  T

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Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 158 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 16709532 - 16709396
Alignment:
Q  158 gagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcg 257  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||| | ||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  16709532 gagtgttaactcggtcaaacttgtcaaaccttccgagtttacc--aaactgagtttacctcagagttaccacgattttggtacctaaaaacgtaaactcg 16709435  T
Q  258 ataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattg 296  Q
     ||| |||  |   |||| ||| ||||||||||||||||    
T  16709434 gtaaactcataatgttaacacttgatttgcggaacattg 16709396  T

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Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 158 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 17683768 - 17683632
Alignment:
Q  158 gagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcg 257  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||| | ||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  17683768 gagtgttaactcggtcaaacttgtcaaaccttccgagtttacc--aaactgagtttacctcagagttaccacgattttggtacctaaaaacgtaaactcg 17683671  T
Q  258 ataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattg 296  Q
     ||| |||  |   |||| ||| ||||||||||||||||    
T  17683670 gtaaactcataatgttaacacttgatttgcggaacattg 17683632  T

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Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 193 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 43172218 - 43172115
Alignment:
Q  193 attttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaac 292  Q
    |||||||| ||||  || |||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  43172218 attttaccagaaatcgagtttacctccgagttaacatgattttgatacctaaaaatgtaaactcggtaaactcagagagttaacactcgatttgcggaac 43172119  T
Q  293 attg 296  Q
    ||||    
T  43172118 attg 43172115  T

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Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 14741536 - 14741387
Alignment:
Q  147 acgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaa 246  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||  ||||  || |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||     
T  14741536 acgagtttactgagtgttaactcggtcaaactcgtcaaactttccgattttactagaaatcgagtttacctccgagttaacacgtttttagcacctaaac 14741437  T
Q  247 atgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattg 296  Q
    | ||||||||| ||| ||||  || || | || ||||||| |||||||||    
T  14741436 acgtaaactcggtaaactcgccgagttgacacgcgatttgtggaacattg 14741387  T

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Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 149 - 296
Target Start/End: Original strand, 4639866 - 4640013
Alignment:
Q  149 gagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaat 248  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||  |||| |||||||| ||||  || |||||||| ||||||||||| |||| | ||||||| |     
T  4639866 gagtttactgagtgttaactcggtcaaactcgtcaaaatttccgattttaccagaaatagagtttacctccgagttaacacgtttttagcacctaaacac 4639965  T
Q  249 gtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattg 296  Q
    ||||||||| ||| ||||  || || | || ||||||| |||||||||    
T  4639966 gtaaactcggtaaactcgccgagttgacacgcgatttgtggaacattg 4640013  T

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Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 162 - 296
Target Start/End: Original strand, 26201794 - 26201929
Alignment:
Q  162 gttaactc-agtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgata 260  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||| |   || ||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||    
T  26201794 gttaactcgagtcaaactcgtcaaacattccgattttagcaataattgagtttacctccgagtttacacgattttggtacctaaaaatgtaaattcggta 26201893  T
Q  261 atctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattg 296  Q
    | |||||  | |||| |||||||||| |||||||||    
T  26201894 aactcggcaagttaacactcgatttgtggaacattg 26201929  T

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Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 21486266 - 21486105
Alignment:
Q  134 tcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgat 232  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||| |||||||||  ||   || |||||||   ||||||||||||    
T  21486266 tcggtcgagtttacacgagtttaccgagtgttaactcgatcaaactcatcaaaccttctaattttaccaaaattcgagtttaccttcaagttaacacgat 21486167  T
Q  233 ttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacatt 295  Q
    |||  || |||||| |||||||||||||| |||  ||| |||| |||| | ||||||||||||    
T  21486166 tttgatatctaaaagtgtaaactcgataaactcaaagagttaacactc-aattgcggaacatt 21486105  T

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Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 148 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23017101 - 23017014
Alignment:
Q  148 cgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttt 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||  || ||||||||  ||||||||| |||||    
T  23017101 cgagtttaccgagtgttaactcggtcaaactcgtcaaatcttccaattttacgagaaatcgagtttacctccaagttaacacaatttt 23017014  T

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Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 162 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 27148941 - 27148806
Alignment:
Q  162 gttaactca-gtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgata 260  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||  |||||| | |||| |||  ||||||| || |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  27148941 gttaactcaagtcaaactcgtcaaacattctgattttagctgaaattgaggttacctccgatttaacacgattttgatacctaaaaacgtaaactcgata 27148842  T
Q  261 atctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattg 296  Q
    | ||  | || |||| |||||||||| |||||||||    
T  27148841 aactttgcgagttaacactcgatttgtggaacattg 27148806  T

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Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 259
Target Start/End: Original strand, 33497097 - 33497195
Alignment:
Q  162 gttaactca-gtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgat 259  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||  || |||||||| ||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  33497097 gttaactcaagtcaaactcgtcaaacattccaattttatcagaaatcgagtttacctccgagttgacacgattttgatacttaaaaatgtaaactcgat 33497195  T

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Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 256
Target Start/End: Original strand, 11735194 - 11735289
Alignment:
Q  162 gttaactc-agtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactc 256  Q
    |||||||| |||||||||||  |||| |||| |||||||| ||||  || |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||    
T  11735194 gttaactcgagtcaaactcggcaaacattccgattttaccagaaatcgagtttacctccgagttaacacgattttgggacctaaaatcgtaaactc 11735289  T

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Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 21024176 - 21024066
Alignment:
Q  147 acgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgt-acctaaa 245  Q
    ||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| |||  |||| || |||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  21024176 acgagtttaacacgtgttaactcggtcaaactcgtcaaactttccgatttcaccaaaaaccgagtttaccttcgagttaacacg-tttttgtcacctaaa 21024078  T
Q  246 aatgtaaactcg 257  Q
    |  |||||||||    
T  21024077 atcgtaaactcg 21024066  T

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Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 280 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 30823113 - 30823059
Alignment:
Q  280 cgatttgcggaacattgattacaacatactct--atcataatattctcaatacaa 332  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  30823113 cgatttgcgggacattgattacgccatactctctatcataatattctcaatacaa 30823059  T

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Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 35313654 - 35313557
Alignment:
Q  160 gtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcg 257  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||| |||| |||| |||  |||| || |||||||| ||||||||||| ||||   | ||||||| |||||||||    
T  35313654 gtgttaactcggtcaaactcatcaaactttccgatttcaccaaaaaccgaatttacctccgagttaacacggttttgccatctaaaaacgtaaactcg 35313557  T

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Target: chr1 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 48)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 25612790 - 25612463
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       
T  25612790 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgccagcacttacaaatctttcaaa 25612691  T
Q  108 nnnnn-tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaac 206  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25612690 aaaaaatattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccagaaac 25612591  T
Q  207 tgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacat 306  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25612590 cgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaacactcgatttgcggaacattgattacgacat 25612491  T
Q  307 a--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||    
T  25612490 actctctatcataatattctcaatacaa 25612463  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 6313274 - 6312947
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       
T  6313274 attattctcaatatacattttttatttgttaaaaatattattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgccagcacttacaaatctttcaaa 6313175  T
Q  108 nnnnn-tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaac 206  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6313174 aaaaaatattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccagaaac 6313075  T
Q  207 tgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacat 306  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6313074 cgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaacactcgatttgcggaacattgattacgacat 6312975  T
Q  307 a--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||    
T  6312974 actctctatcataatattctcaatacaa 6312947  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 29395934 - 29396261
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       
T  29395934 attattctcaatacatattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgccagcacttacaaatctttcaaa 29396033  T
Q  108 nnnnn-tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaac 206  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29396034 aaaaaatattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccagaaac 29396133  T
Q  207 tgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacat 306  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29396134 cgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaacactcgatttgcggaacattgattacgacat 29396233  T
Q  307 a--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||    
T  29396234 actctctatcataatattctcaatacaa 29396261  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 51702293 - 51701966
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||       
T  51702293 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatttcagcacttacaaatctttcaaa 51702194  T
Q  108 nnnnn-tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaac 206  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  51702193 aaaaaatattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttttaattttaccagaaac 51702094  T
Q  207 tgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacat 306  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51702093 cgattttacctcagagttaacacaatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaacactcgatttgcggaacattgattacgacat 51701994  T
Q  307 a--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||    
T  51701993 actctctatcataatattctcaatacaa 51701966  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 15834534 - 15834861
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
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T  15834534 attattctcaatacacactttttatttgttaaaaatgttattgccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgccagcacttacaaatctttcaaa 15834633  T
Q  108 nnnnn-tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaac 206  Q
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T  15834634 aaaatatattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccaaaaat 15834733  T
Q  207 tgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacat 306  Q
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T  15834734 cgaatttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcggtaatctcggagagttaacactcgatttgcggaacattgattacgacat 15834833  T
Q  307 a--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||    
T  15834834 actctctatcataatattctcaatacaa 15834861  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 9322016 - 9322335
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
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T  9322016 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcaaa 9322115  T
Q  108 nnnnn--tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaa 205  Q
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T  9322116 aaaaaaatattgcgtcagccattacaaatcggtcgagttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaac---------cttccaattttaccagaaa 9322206  T
Q  206 ctgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaaca 305  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  9322207 ccgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaacactcgatttacggaacattgattacgaca 9322306  T
Q  306 ta--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  9322307 tactctctatcataatattctcaatacaa 9322335  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 45273266 - 45272938
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  45273266 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttatttccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcaaa 45273167  T
Q  108 nnnnn-tattgtgtcagccattacaaatcggtcgag-ttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaa 205  Q
          ||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  45273166 aaaatatattgtgtcagcccttacaaatcggtcaaggttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgtcaaaccttccgattttaccagaaa 45273067  T
Q  206 ctgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaaca 305  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45273066 ccgagtttacctcagagttaacacaatttttgtacctaaaaacgtaaactcgataatctcggagagttaacactcgatttgcggaacattgattacaaca 45272967  T
Q  306 ta--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  45272966 tactctctatcataatattctcaatacaa 45272938  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 48176942 - 48177270
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       
T  48176942 attattctcaatacacattttttatatgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgttagcacttacaaatctttcaaa 48177041  T
Q  108 nnnnn-tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttacc-ggaaa 205  Q
          ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  48177042 aaaaaatattgtgtcagccattataaatcggtcgagttacacgagtttactgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccagaaaa 48177141  T
Q  206 ctgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaaca 305  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  48177142 ccgattttacctcagagttaacacgatttttctacctaaaaacgtaaactcagtaatctcagagagttaatactcgatttgcgaaacattgattacgaca 48177241  T
Q  306 ta--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
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T  48177242 tactctctatcataatattatcaatacaa 48177270  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 8 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 46328684 - 46328393
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
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T  46328684 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcaaa 46328585  T
Q  108 nnnnntattgtgtcagccattacaaatcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaac 206  Q
          ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||    
T  46328584 aaaaaaattgtgtcagccactacaaatcggtcgagtttacacgagtttaccgagtgttaactcaatcaaactcgttaaaccttccgattttaacagaaac 46328485  T
Q  207 tgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgat 298  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  46328484 cgagtttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaacgtaaactcggtaatctcggagaattaacactcgatttgcggaacattgat 46328393  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 18799150 - 18798828
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||        
T  18799150 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattctacatatttaaaattacgtcagtacttacaaatgtttaaaa 18799051  T
Q  108 nnnnn-tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaac 206  Q
          ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18799050 aaaatatattgtgtcagccattacaaatcagtcgagttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaatctcgttaaaccttccaattttaccagaaac 18798951  T
Q  207 tgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacat 306  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  18798950 cgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcggta-----ggagagttaacgctcgatctgcggaacattgattacgacat 18798856  T
Q  307 --actctatcataatattctcaatacaa 332  Q
       |||||||||||||||||||||||||    
T  18798855 tctctctatcataatattctcaatacaa 18798828  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 8 - 329
Target Start/End: Original strand, 25830747 - 25831073
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||       
T  25830747 attattctcaataaacattttttatatgttacaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgccaacacttacaaatatttcaaa 25830846  T
Q  108 nnnnnt---attgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaa 204  Q
             |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |    
T  25830847 aaaaaataaattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttacacgagtttactgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttattagga 25830946  T
Q  205 actgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaac 304  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||    
T  25830947 accgattttatctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaacgtaaactcggtaatctcggagagttaacactcgatttgtggaacattgattacgac 25831046  T
Q  305 ata--ctctatcataatattctcaata 329  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||    
T  25831047 atactctctatcataatattctcaata 25831073  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 5494597 - 5494925
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||       
T  5494597 attattctcaatacacaatttttatctgttaaaaatgttattctcacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgccgacacttacaaatctttcaaa 5494696  T
Q  108 nnnnn-tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaa 205  Q
          ||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||| ||||    
T  5494697 aaaatatattgtgtcagcccttacaaatcggtcaagtttacacgagtttatcgagtgttaactcagtcaaactcatcaaaccttctgattttaccagaaa 5494796  T
Q  206 ctgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaaca 305  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||     
T  5494797 ccgagtttacctcagagttaacacgattttggtacctaaaaacgtaaactcggtaatctcggagagttaacactcaatttgcggaacattgattacaacg 5494896  T
Q  306 ta--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  5494897 tactctctatcataatattctcaatacaa 5494925  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 38535645 - 38535973
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||       
T  38535645 attattcaaaatacacattttttatttgttaaaaattttatttacacaaaactcaattgtacatatttaaaattatgccaacacttacaaatctttcaaa 38535744  T
Q  108 nnnnntatt-gtgtcagccattacaaatcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaa 205  Q
          ||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  38535745 aaaaaaatttgtgtcagccattacaaatcggtcgagtttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaagtcttccgattttaccagaaa 38535844  T
Q  206 ctgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaaca 305  Q
    |  | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38535845 cccagtttacctcagagttaacacaatttttgtaactaaaaacgtaaactcggtaatcttggagagttaaaactcgatttgcggaacattgattacgaca 38535944  T
Q  306 ta--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  38535945 tactctctatcataatattctcaatacaa 38535973  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 38557863 - 38558191
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||       
T  38557863 attattcaaaatacacattttttatttgttaaaaattttatttacacaaaactcaattgtacatatttaaaattatgccaacacttacaaatctttcaaa 38557962  T
Q  108 nnnnntatt-gtgtcagccattacaaatcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaa 205  Q
          ||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  38557963 aaaaaaatttgtgtcagccattacaaatcggtcgagtttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaagtcttccgattttaccagaaa 38558062  T
Q  206 ctgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaaca 305  Q
    |  | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38558063 cccagtttacctcagagttaacacaatttttgtaactaaaaacgtaaactcggtaatcttggagagttaaaactcgatttgcggaacattgattacgaca 38558162  T
Q  306 ta--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  38558163 tactctctatcataatattctcaatacaa 38558191  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 74 - 332
Target Start/End: Original strand, 8140800 - 8141060
Alignment:
Q  74 ttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnnnnnnntattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtc 173  Q
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T  8140800 ttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcaaagaaaatattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttacacaagtttaccgagtgttaactcagtc 8140899  T
Q  174 aaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagattt 273  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  8140900 aaactcattaaaccttctaattttaccagaaatcgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaacgtaaactcgataatctcggagagtt 8140999  T
Q  274 aaaactcgatttgcggaacattgattacaacata--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    || ||||||||||||||||||||||| | || ||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  8141000 aacactcgatttgcggaacattgattgcgacgtactctctatcataatattttcaatacaa 8141060  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 29219819 - 29219611
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttc-nn 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||       
T  29219819 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgccaacacttataaatctttcaaa 29219720  T
Q  107 nnnnnntattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaac 206  Q
          ||||||||||||  |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  29219719 aaaatatattgtgtcagcagttacaaattggttgagttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaatttcaccagaaac 29219620  T
Q  207 tgattttac 215  Q
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T  29219619 cgattttac 29219611  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 197
Target Start/End: Original strand, 28386955 - 28387145
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttc-nn 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       
T  28386955 attattctcaatacacattttttatttgttaaaacttttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgccagcacttacaaatctttcaaa 28387054  T
Q  107 nnnnnntattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaatttt 197  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  28387055 aaaaaaaattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcattaaacattccaatttt 28387145  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 114 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 49231599 - 49231455
Alignment:
Q  114 attgtgtcagccattacaaatcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattt 212  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||||||| | || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| || ||    
T  49231599 attgtatcagcgattacagatcggtcgagtttacacaagtttaccgattgttaacttagtcaaactcgttaaaccttccgattataccagaaaccgagtt 49231500  T
Q  213 tacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcg 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  49231499 tacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaacataaactcg 49231455  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 134 - 296
Target Start/End: Original strand, 47371551 - 47371714
Alignment:
Q  134 tcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgat 232  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||  || |||||||| |||||||||||||    
T  47371551 tcggtcgagtttacacgagtttaccgagtgttaactcggtcaaactcggcaaaccttccgattttaccagaaatcgagtttacctccgagttaacacgat 47371650  T
Q  233 ttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattg 296  Q
    ||| ||||||||  | ||||||||||||| ||| |||  |||| |||||||||||| |||||||    
T  47371651 tttggtacctaagtacgtaaactcgataaactcagagtgttaacactcgatttgcgaaacattg 47371714  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 147 - 299
Target Start/End: Original strand, 48966481 - 48966633
Alignment:
Q  147 acgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaa 246  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | | ||||   | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  48966481 acgagtttaccgagtattaactcggtcaaactcgtcaaaccttccaatttcatcagaaatcaagtttacctcagagttaacacgattttggtacctaaac 48966580  T
Q  247 atgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgatt 299  Q
    | ||||||||  ||| |||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  48966581 acgtaaactcagtaaactcgaagagttaaccctcgatttgcggaacattgatt 48966633  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 82
Target Start/End: Original strand, 8140359 - 8140433
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaatta 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8140359 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaatta 8140433  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 150 - 295
Target Start/End: Original strand, 3583549 - 3583694
Alignment:
Q  150 agtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatg 249  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||| |||||||  ||||| || ||||| ||  ||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  3583549 agtttaccgagtgttaactcggttaaactcgtcaaactttccgattttactagaaaccgagtttacttctaagttaacacgatttcggtacctaaaaacg 3583648  T
Q  250 taaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacatt 295  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  3583649 taaactcggtaaactcggagagttaacactcgatttgcggaacatt 3583694  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 231 - 332
Target Start/End: Original strand, 28387141 - 28387244
Alignment:
Q  231 atttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacata--ctctatcataatattctcaat 328  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  28387141 atttttgtacataaaaatgtaaactcggtaatctcggagagttaacacacgatttgcggaacattgattacgacatactctctatcataatattctcaat 28387240  T
Q  329 acaa 332  Q
    ||||    
T  28387241 acaa 28387244  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 149 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 25253622 - 25253486
Alignment:
Q  149 gagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaat 248  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||| ||||| || ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||     
T  25253622 gagtttaccgaatgttaactcagtcaaactcgtcaaatcttccgagtttaccagaaaccgaatttacctcagtattaacacgattttggtacctaaaaac 25253523  T
Q  249 gtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgattt 285  Q
     |||||||| ||| ||| |||| |||| |||||||||    
T  25253522 ataaactcggtaaactcagagaattaacactcgattt 25253486  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 147 - 296
Target Start/End: Original strand, 49453050 - 49453200
Alignment:
Q  147 acgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgattttt-gtacctaaa 245  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||   ||||| || ||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49453050 acgagtttaccgagtgttaactcggtcaaacttgtcaaaccttatgatttttccagaaatcgagtttacctcagagttaacacgatttttggtacctaaa 49453149  T
Q  246 aatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattg 296  Q
     |  |||||| | ||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  49453150 cacataaactaggtaaactcggacagttaacactcgatttgcggaacattg 49453200  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 147 - 256
Target Start/End: Original strand, 32760089 - 32760198
Alignment:
Q  147 acgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaa 246  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32760089 acgagtttagtgagtgttaactcggtcaaactcgttaagcctcccgattttactagaaaccgagtttacctcagagttaacacgattttggtacctaaaa 32760188  T
Q  247 atgtaaactc 256  Q
    | ||||||||    
T  32760189 acgtaaactc 32760198  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 149 - 295
Target Start/End: Original strand, 28403938 - 28404084
Alignment:
Q  149 gagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaat 248  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| || | ||||||   ||||| || |||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28403938 gagtttaccgagtgttaactcggtcaaattcgtcaaacatttcgattttattagaaaccgaatttaccttcaagttaacacgattttggtacctaaaaat 28404037  T
Q  249 gtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacatt 295  Q
    ||||||||  |||  ||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  28404038 gtaaactcagtaaattcgaagagttaacactcgatttgcggaacatt 28404084  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 235
Target Start/End: Original strand, 42304476 - 42304578
Alignment:
Q  134 tcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgat 232  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||| |||    
T  42304476 tcggtcgagtttacacgagtttacctagtgttaactcggtcaaactcgttaaaccttccaattttaccagaaaccgagtttacctccgaattaacatgat 42304575  T
Q  233 ttt 235  Q
    |||    
T  42304576 ttt 42304578  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 148 - 296
Target Start/End: Original strand, 35177201 - 35177350
Alignment:
Q  148 cgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaa 247  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||| | ||||  || |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  35177201 cgagtttatcgagtgttaactcggtcaaactcgtcaatccttccgattttatcagaaatcgagtttacctctgaattaacacgattttggtacctaaaaa 35177300  T
Q  248 tgtaaactcgataatctcggagatttaaa-actcgatttgcggaacattg 296  Q
      |||| | ||||| |||||||  ||||| |||||||||||||| |||||    
T  35177301 cataaatttgataaactcggagtgttaaacactcgatttgcggaccattg 35177350  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 8147448 - 8147296
Alignment:
Q  147 acgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaa 246  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||| ||||  || |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||     
T  8147448 acgagtttactgagtgttaactcggtcaaactcgtcaaactttgcaattttaccagaaatcgagtttacctccgagttaacacgtttttagcacctaaac 8147349  T
Q  247 atgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgatt 299  Q
    | ||||||||| ||| ||||  || || | || ||||||| ||||||||||||    
T  8147348 acgtaaactcggtaaactcgctgagttgacacgcgatttgtggaacattgatt 8147296  T

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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 4005198 - 4005049
Alignment:
Q  147 acgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaa 246  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||  || |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||     
T  4005198 acgagtttactgagtgttaactcggtcaaactcgtcaaactttccgattttaccagaaatcgagtttacctccgagttaacacgtttttagcacctaaac 4005099  T
Q  247 atgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattg 296  Q
    | ||||||||| ||| ||||  || || | || ||||||| |||||||||    
T  4005098 acgtaaactcggtaaactcgccgagttgacacgcgatttgtggaacattg 4005049  T

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Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 150 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 15927427 - 15927316
Alignment:
Q  150 agtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatg 249  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| | ||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |      
T  15927427 agtttatcgaatgttaactcagtcaaactcgtcaaactttccgattttatcagaaaccgaatttacctcagagttaacacaattttggtacttaaacact 15927328  T
Q  250 taaactcgataa 261  Q
    ||||||||||||    
T  15927327 taaactcgataa 15927316  T

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Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 147 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 26757746 - 26757596
Alignment:
Q  147 acgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaa 246  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||  || |||||||| |||||||| || |||| | |||||||     
T  26757746 acgagtttactgagtgttaactcggtcaaactcgtcaaactttccgattttaccagaaatcgagtttacctctgagttaactcgtttttagcacctaaac 26757647  T
Q  247 atgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattga 297  Q
    | ||||||||| ||| ||||  || || | || ||||||| ||||||||||    
T  26757646 acgtaaactcggtaaactcgccgagttgacacgcgatttgtggaacattga 26757596  T

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Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 9192155 - 9192006
Alignment:
Q  147 acgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaa 246  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||  |||||||| ||||  || |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||     
T  9192155 acgagtttactgagtgttaactcggtcaaactcgtcaaactttctgattttaccagaaatcgagtttacctccgagttaacacgtttttagcacctaaac 9192056  T
Q  247 atgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattg 296  Q
    | ||||||||| ||| ||||  || || | || ||||||| |||||||||    
T  9192055 acgtaaactcggtaaactcgccgagttgacacgcgatttgtggaacattg 9192006  T

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Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 41353552 - 41353403
Alignment:
Q  147 acgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaa 246  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||  || |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||     
T  41353552 acgagtttactgagtgttaactcggtcaaactcgtcaaactttccgattttaccagaaatcgagtttacctccgagttaacacgtttttagcacctaaac 41353453  T
Q  247 atgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattg 296  Q
    |  |||||||| ||| ||||  || || | || ||||||| |||||||||    
T  41353452 acataaactcggtaaactcgccgagttgacacgcgatttgtggaacattg 41353403  T

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Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 51107023 - 51106874
Alignment:
Q  147 acgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaa 246  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||  || ||| |||| ||||||||||| |||| | |||||||     
T  51107023 acgagtttactgagtgttaactcggtcaaactcgtcaaactttccgattttaccagaaatcgagttttcctccgagttaacacgtttttagcacctaaac 51106924  T
Q  247 atgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattg 296  Q
    | ||||||||| ||| ||||  || || | || ||||||| |||||||||    
T  51106923 acgtaaactcggtaaactcgccgagttgacacgcgatttgtggaacattg 51106874  T

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Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 149 - 296
Target Start/End: Original strand, 1243298 - 1243445
Alignment:
Q  149 gagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaat 248  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||  || |||||||| ||||||||||| |||| | ||||||| |     
T  1243298 gagtttactgagtgttaactcggtcaaactcgtcaaactttccgattttaccagaaatcgagtttacctccgagttaacacgtttttagcacctaaacac 1243397  T
Q  249 gtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattg 296  Q
    ||||||| | ||| ||||  || || | || ||||||| |||||||||    
T  1243398 gtaaactaggtaaactcgccgagttgacacgcgatttgtggaacattg 1243445  T

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Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 158 - 296
Target Start/End: Original strand, 5209369 - 5209507
Alignment:
Q  158 gagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcg 257  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||| |||  |||| ||| ||||  || || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||  ||    
T  5209369 gagtgttaactcgatcaaactcgtcaaactttctgatttcaccagaaatcgagttgacctccgagttaacacgattttggtacctaaacacgtaaaaacg 5209468  T
Q  258 ataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattg 296  Q
    |||| ||| |||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  5209469 ataaactcagagtgttaacactcgatttgcggaacattg 5209507  T

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Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 257
Target Start/End: Original strand, 11579090 - 11579200
Alignment:
Q  147 acgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaa 246  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||   | |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||     
T  11579090 acgagtttactgagtgttaactcggtcaaactcgtcaaactttccgattttaccagaaatcaaatttacctccgagttaacacgtttttagcacctaaac 11579189  T
Q  247 atgtaaactcg 257  Q
    | |||||||||    
T  11579190 acgtaaactcg 11579200  T

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Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 49231682 - 49231632
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaa 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49231682 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaa 49231632  T

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Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 296
Target Start/End: Original strand, 49236974 - 49237105
Alignment:
Q  165 aactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatct 264  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||| ||  ||| ||| || |||||||| |||| ||||||||| |  |||||||||||| ||    
T  49236974 aactcggtcaaactcgtcaaacctttcgattttaccagaaaccgagcttaactccgaattaacacggttttggtacctaaacacataaactcgataaact 49237073  T
Q  265 cggagatttaaaactcgatttgcggaacattg 296  Q
    || ||  |||| ||||||||| ||||||||||    
T  49237074 cgaagtattaacactcgatttacggaacattg 49237105  T

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Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 162 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 52182443 - 52182318
Alignment:
Q  162 gttaactc-agtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgata 260  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||| || | |||||||| ||||  || |||||||| || || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  52182443 gttaactcgagtcgaactcgtcaaacatttcgattttaccagaaatcgaatttacctccgaattgacacgatttcagtacctaaaaacgtaaactcgata 52182344  T
Q  261 atctcggagatttaaaactcgatttg 286  Q
    | ||||| || |||| ||||||||||    
T  52182343 aactcggcgagttaacactcgatttg 52182318  T

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Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 253
Target Start/End: Original strand, 27257871 - 27257954
Alignment:
Q  170 agtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaa 253  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||   | |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  27257871 agtcaaactcgtcaaacattccgattttaccgaaaatcaagtttacctcggagttgacacgattttggtacctaaaaacgtaaa 27257954  T

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Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 295
Target Start/End: Original strand, 49971599 - 49971734
Alignment:
Q  162 gttaactc-agtcaaactcgttaa-accttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgat 259  Q
    |||||||| |||||||||||| || || || | |||||||| ||||  || |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  49971599 gttaactcgagtcaaactcgtcaacacatttcgattttaccagaaaacgagtttacctccgagttgacacgattttggtacctaaaaacgtaaactcggt 49971698  T
Q  260 aatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacatt 295  Q
    || ||| |  | |||| | |||||||| ||||||||    
T  49971699 aaactcagtaagttaacattcgatttgtggaacatt 49971734  T

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Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 1108468 - 1108374
Alignment:
Q  162 gttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactc 256  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||  |||| || |||||||| ||||| ||||| ||||   ||||||||| ||||||||    
T  1108468 gttaactcagtcaaactcgtcaaactttccgatttcaccaaaaaccgagtttacctccgagtttacacgtttttaccacctaaaaacgtaaactc 1108374  T

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Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 7798618 - 7798521
Alignment:
Q  160 gtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcg 257  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||| |||  |||| || |||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| |||||||||    
T  7798618 gtgttcactcggtcaaactcgtcaaactttccgatttcaccaaaaaccgagtttacctccgagttaacacgtttttgccacctaaaaacgtaaactcg 7798521  T

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Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 3593350 - 3593267
Alignment:
Q  174 aaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcg 257  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||   ||||  || |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  3593350 aaacttgtcaaaccttccgattttattagaaatcgaatttacctccgagttaacacgattttgatacctaaaaatataaactcg 3593267  T

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Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 51902100 - 51902044
Alignment:
Q  131 aaatcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaac 186  Q
    |||| ||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51902100 aaattggtcgagtttagatgaatttatcgagtgttaactcagtcaaacttgttaaac 51902044  T

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Target: chr6 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 21)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 31896335 - 31896008
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  31896335 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaactgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcaaa 31896236  T
Q  108 nnnnn-tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaac 206  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31896235 aaaaaatattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccagaaac 31896136  T
Q  207 tgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacat 306  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  31896135 cgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtatactcgataatctcggagatttaacactcgatttacggaacattgattacgacat 31896036  T
Q  307 a--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||    
T  31896035 actctctatcataatattctcaatacaa 31896008  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 4199964 - 4200281
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       
T  4199964 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgccagcacttacaaatctttcaaa 4200063  T
Q  108 nnnnntattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaact 207  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  4200064 aaaaatattgtgtcagccattacaaatcggtcgag---------tttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccagaaacc 4200154  T
Q  208 gattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacata 307  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4200155 gattttacctcagagttaacatgatttttgtacttaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaacactcgatttgcggaacattgattacgacata 4200254  T
Q  308 --ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||    
T  4200255 ctctctatcataatattctcaatacaa 4200281  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 31068121 - 31067803
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        
T  31068121 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgccagcacttacaaatctttaaaa 31068022  T
Q  108 nnnnn-tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaac 206  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31068021 aaaaaatattgtgtcagccattacaaatcggtcgagtt---------taccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccagaaac 31067931  T
Q  207 tgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacat 306  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31067930 cgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaacactcgatttgcggaacattgattacgacat 31067831  T
Q  307 ac--tctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  31067830 actttctataataatattctcaatacaa 31067803  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 30384567 - 30384894
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||        
T  30384567 attattctcggtacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgctagcacttacaaatctttaaaa 30384666  T
Q  108 nnnnnta-ttgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaac 206  Q
          | || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  30384667 aaaaaaaattatgtcagccattacaaatcggtcgagttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttatcagaaac 30384766  T
Q  207 tgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacat 306  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  30384767 tgattttaccttagagttaacacgatttttgtacctaaaaacataaactcggtaatctcggagagttaacactcgatttgcggatcattgattacgacat 30384866  T
Q  307 a--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    |  |||||| ||||||||||||||||||    
T  30384867 actctctattataatattctcaatacaa 30384894  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 14261947 - 14262266
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       
T  14261947 attattctcaatatgcattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgccagcacttacaaatctttcaaa 14262046  T
Q  108 nnnnn-tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaac 206  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  14262047 aaaaaatattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttacac--------cgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccagaaat 14262138  T
Q  207 tgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacat 306  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14262139 cgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaaagtaaactagataatctcggagagttaacactcgatttgcggaacattgattacgacat 14262238  T
Q  307 a--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||    
T  14262239 actctctatcataatattctcaatacaa 14262266  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 34774079 - 34773803
Alignment:
Q  12 ttctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnnnnnn 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||           
T  34774079 ttctcaatacacattttttatctgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgccagcacttacaaatctttcaaaaaaa 34773980  T
Q  112 n-tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgat 210  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  34773979 aatattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccagaaaccgat 34773880  T
Q  211 tttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgatta 300  Q
    |||||||            ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34773879 tttacct------------gatttttgtacct-aaaatgtaaactcaataatctcggagatttaacactcgatttgcggaacattgatta 34773803  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 7497784 - 7497469
Alignment:
Q  12 ttctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnnnnnn 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||            
T  7497784 ttctcaatacacattttttaattgttaaaaatgttattcccaaaaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcggtacttacaaatcttttaaaaaaa 7497685  T
Q  112 n-tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttac-cgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactga 209  Q
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||         ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  7497684 aatattgggtcagccattacaaatcggtcgagtt---------tacacgagtgttaactcaatcaaactcgttaaaccttccaattttaccagaaaccga 7497594  T
Q  210 ttttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacata-- 307  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||      
T  7497593 gtttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaacgtaaacttgataatctcggagagttaacattcgatttgcggaacattgattacgacatact 7497494  T
Q  308 ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  7497493 ctctatcataatattctcaatacaa 7497469  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 123 - 332
Target Start/End: Original strand, 34758700 - 34758909
Alignment:
Q  123 gccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagag 222  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  34758700 gccattacaaatcggtcaagttacacg--tttaccgagtgttaactcagtcaaacttgttaaaccttccaattttatcagaaaccgattttacctcagag 34758797  T
Q  223 ttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacata--ctctatcataata 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  34758798 ttaacacgatttttgtacctaaaaacgtaaacttgataatctcggagagttaacgctcgatttgcggaacattgattacgacatactctctatcataata 34758897  T
Q  321 ttctcaatacaa 332  Q
    ||||||||||||    
T  34758898 ttctcaatacaa 34758909  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 147 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 16438816 - 16438667
Alignment:
Q  147 acgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaa 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||  | |||||||| ||||||||| |||||||| |||   || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  16438816 acgagtttaccgagtgctaactcgattaaactcgtcaaaccttccgattttaccagaagtcgagtttacctccaagttaacacgatttttgtacctaaaa 16438717  T
Q  247 atgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattg 296  Q
    | ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  16438716 acgtaaactcgataaactcggagagttaacactcgatttgcggaacattg 16438667  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 148 - 300
Target Start/End: Original strand, 31975643 - 31975795
Alignment:
Q  148 cgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaa 247  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  31975643 cgagtttaccgagtcttaactcggtcaaactcgtcaaaccttccgattttacaagaaatcgagtttacctcagagttaacacgattttggtacctaaaca 31975742  T
Q  248 tgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgatta 300  Q
      |||||||  ||| |||||||| |||| ||| ||||||| || |||||||||    
T  31975743 cataaactcagtaaactcggagagttaacacttgatttgccgagcattgatta 31975795  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 303
Target Start/End: Original strand, 1463661 - 1463817
Alignment:
Q  147 acgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaa 246  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||  || |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||     
T  1463661 acgagtttactgagtgttaactcggtcaaactcgtcaaactttccgattttaccagaaatcgagtttacctccgagttaacacgtttttagcacctaaac 1463760  T
Q  247 atgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaa 303  Q
    | ||||||||| ||| ||||  || || | || ||||||| |||||||||| |||||    
T  1463761 acgtaaactcggtaaactcgccgagttgacacgcgatttgtggaacattgaatacaa 1463817  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 6788210 - 6788059
Alignment:
Q  147 acgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaa 246  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||  || |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||     
T  6788210 acgagtttactgagtgttaactcggtcaaactcgtcaaactttccgattttaccagaaatcgagtttacctccgagttaacacgtttttagcacctaaac 6788111  T
Q  247 atgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgat 298  Q
    | ||||||||| ||| ||||  || || | || ||||||| |||||||||||    
T  6788110 acgtaaactcggtaaactcgccgagttgacacgcgatttgtggaacattgat 6788059  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 149 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 2607003 - 2606853
Alignment:
Q  149 gagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaat 248  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||||| | ||||||||  |||||||| ||||  || |||||||||||||||| |||||||| || |||||| |     
T  2607003 gagtttattgagtgttaactcggtcaaactcatcaaaccttctgattttaccagaaatcgagtttacctcagagttaaaacgattttggtgcctaaacac 2606904  T
Q  249 gtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgatt 299  Q
    ||||||||  ||| |||  ||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  2606903 gtaaactcagtaaactcaaagagttaacattcgatttgcggaacattgatt 2606853  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 257
Target Start/End: Original strand, 28900864 - 28900938
Alignment:
Q  183 aaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcg 257  Q
    ||||||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  28900864 aaaccttccgattttaccagaaatcgagtttacctcagagttaacacgattttggtacctaaacatgtaaactcg 28900938  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 258
Target Start/End: Original strand, 31535068 - 31535161
Alignment:
Q  165 aactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcga 258  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||  || ||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  31535068 aactcggtcaaactcgtcaaacctttcgattttaccagaaatcgagtttgcctcagagttaacacaattttgatacctaaaaatgtaaactcga 31535161  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 147 - 296
Target Start/End: Original strand, 10113770 - 10113919
Alignment:
Q  147 acgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaa 246  Q
    |||||||||| |||| | ||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||  |||  || |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||     
T  10113770 acgagtttactgagtctaaactcggtcaaactcgtcaaactttccgattttaccaaaaaacgagtttacctccgagttaacacgtttttaggacctaaac 10113869  T
Q  247 atgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattg 296  Q
    | ||||||||| ||| ||||  || || | || ||||||| |||||||||    
T  10113870 acgtaaactcggtaaactcgccgagttgacacgcgatttgtggaacattg 10113919  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 147 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 3000350 - 3000202
Alignment:
Q  147 acgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaa 246  Q
    |||||||||  ||||||||||||  |||||||||| |||| | || ||||||||  |||  || |||||| | |||||||||||||||| |||||||||     
T  3000350 acgagtttattgagtgttaactcgatcaaactcgtcaaacttcccgattttaccataaatcgaatttacccccgagttaacacgattttggtacctaaac 3000251  T
Q  247 atgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacatt 295  Q
    | ||||| ||  ||| ||||| || |||| ||| |||||| ||||||||    
T  3000250 acgtaaaatcagtaaactcggcgagttaacacttgatttgtggaacatt 3000202  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 24194524 - 24194470
Alignment:
Q  147 acgagtttaccgagtgttaactcagtcaa-actcgttaaaccttccaattttacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  24194524 acgagtttaccgagtgttaactcggtcaatactcgtcaaactttccaattttacc 24194470  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 258
Target Start/End: Original strand, 31996251 - 31996349
Alignment:
Q  160 gtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcga 258  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| |||  |||  || |||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| ||||||||||    
T  31996251 gtgttaactcggtcaaactcgtcaaactttccgatttcaccaaaaatcgagtttacctccgagttaacacgtttttgccacctaaaaacgtaaactcga 31996349  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 162 - 257
Target Start/End: Original strand, 8779586 - 8779681
Alignment:
Q  162 gttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcg 257  Q
    |||||||  ||||||||||| |||| |||| |||| |||  |||| || |||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| |||||||||    
T  8779586 gttaacttggtcaaactcgtcaaactttccgatttcaccaaaaaccgagtttacctccgagttaacacgtttttgccacctaaaaacgtaaactcg 8779681  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 13461460 - 13461374
Alignment:
Q  170 agtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactc 256  Q
    |||||||||||| |||| |||  ||||||||  |||| || |||||||| ||||| ||||||||||  ||| |||||| ||||||||    
T  13461460 agtcaaactcgtcaaacattctgattttaccaaaaaccgagtttacctccgagttgacacgattttgatacataaaaacgtaaactc 13461374  T

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Target: chr4 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 41)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 5442101 - 5441774
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       
T  5442101 attattctcaatacacattttttctttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgccagcacttacaaatctttcaaa 5442002  T
Q  108 nnnnn-tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaac 206  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5442001 aaaaaatattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccagaaac 5441902  T
Q  207 tgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacat 306  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5441901 cgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaacattcgatttacggaacattgattacgacat 5441802  T
Q  307 a--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||    
T  5441801 actctctatcataatattctcaatacaa 5441774  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 27768763 - 27768436
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       
T  27768763 attattctcaatatacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgccagcacttacaaatctttcaaa 27768664  T
Q  108 nnnnnta-ttgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaac 206  Q
          | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27768663 aaaaaaaattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttacacgagtttaccgaatgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccagaaac 27768564  T
Q  207 tgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacat 306  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27768563 cgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaacactcgatttgcggaacattgattacgacat 27768464  T
Q  307 a--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||    
T  27768463 actctctatcataatattctcaatacaa 27768436  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 37827932 - 37828259
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       
T  37827932 attattctcaatacacattttatatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgccagcacttacaaatctttcaaa 37828031  T
Q  108 nnnnnta-ttgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaac 206  Q
          | || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37828032 aaaaaaaattatgtcagccattacaaatcggtcgagttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccagaaac 37828131  T
Q  207 tgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacat 306  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37828132 cgattttacctcagagttaacacgatttttgtatctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaacattcgatttgcggaacattgattacgacat 37828231  T
Q  307 a--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||    
T  37828232 actctctatcataatattctcaatacaa 37828259  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 51321554 - 51321228
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       
T  51321554 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgccagcacttacaaatctttcaaa 51321455  T
Q  108 nnnnntattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaact 207  Q
         ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||     
T  51321454 aaaaatattgtgtcagccattataaatcggtcgagttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactggttaaaccttccaattttaccagaaacc 51321355  T
Q  208 gattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacata 307  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51321354 gattttacgtcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatatcggagagttaacactcgatttgcggaacattgattacgacata 51321255  T
Q  308 --ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
      |||| ||||||||||||||||||||    
T  51321254 ctctctttcataatattctcaatacaa 51321228  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 8 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 48261778 - 48261460
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||       
T  48261778 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaatcgtacatatttaaaattatgccaacacttacaaatctttcaaa 48261679  T
Q  108 nnnnn--tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaa 205  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48261678 aaaaaaatattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccagaaa 48261579  T
Q  206 ctgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaaca 305  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  48261578 ccgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtcaactcgataatctcggagatttaacactcgatttgcggaacattgattacgaca 48261479  T
Q  306 ta--ctctatcataatatt 322  Q
    ||  |||||||||||||||    
T  48261478 tactctctatcataatatt 48261460  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 54341845 - 54341514
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  54341845 attattctcaatacatattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcaaa 54341746  T
Q  108 nnnnn-tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagttta----ccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccgg 202  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  54341745 aaaaaatattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttacacgagtttaattaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaacctttcaattttaccag 54341646  T
Q  203 aaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattaca 302  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  54341645 aaaccgattttacctcagagtttacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaacactcgatttgcggaacattgattacg 54341546  T
Q  303 acata--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  54341545 acatactctctatcataatattctcaatacaa 54341514  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 23987895 - 23987569
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||       
T  23987895 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatattcaaaattatgtcagcacttacaaatctttcaaa 23987796  T
Q  108 nnnnn-tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaac 206  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23987795 aaaaaatattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttacacgagtttacctagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccagaaac 23987696  T
Q  207 tgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacat 306  Q
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23987695 -caatttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaacgtaaactcggtaatctcggagaggtaacactcgatttgcggaacattgattacgacat 23987597  T
Q  307 ac--tctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  23987596 actatctatcataatattctcaatacaa 23987569  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 5800664 - 5800336
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  5800664 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatcttttaga 5800565  T
Q  108 nnnnn-tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaa 205  Q
          |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||    
T  5800564 aaaaaatattgtgtcagccactacaaatcggtcgagtttacacgagtttatcgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttctgatgttaccagaaa 5800465  T
Q  206 ctgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaaca 305  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5800464 ccgaatttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagagttaacactcgatttgcggaacattgattacaaca 5800365  T
Q  306 ta--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    ||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  5800364 tactctctataataatattctcaatacaa 5800336  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 50018890 - 50018564
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||        
T  50018890 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgctagtacttacaaatgtttaaaa 50018791  T
Q  108 nnnnntattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaact 207  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||     
T  50018790 aaaaaaattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttacacgagtttaccgagtgttaactctgtcaatctctttaaaccttccaattttaccagaaacc 50018691  T
Q  208 gattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacata 307  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  50018690 gattttacctcagagttaacatgatttttgtacctaaaaatgtaaactcggtaatctcggagagttaacactcgatttgcagaacattgattacgacata 50018591  T
Q  308 c--tctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||    
T  50018590 ctttctatcataatattctcaatacaa 50018564  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 54852978 - 54853305
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||       
T  54852978 attattctcaatacacattttttatttattaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacaaatttaaaattatgccagcacttataaatctttcaaa 54853077  T
Q  108 nnnnn-tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaac 206  Q
          ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  54853078 aaaatatattgtgtcagccattataaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcaatcaaactcgttaaaccttctaattttacgagaaac 54853177  T
Q  207 tgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacat 306  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  54853178 cgattttacctcagagttaacacaatttttgtacataaaaaggtaaactcggtaatctcggagagttaacactcgatttgtggaacattgattacgacat 54853277  T
Q  307 a--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||    
T  54853278 actctctatcataatattctcaatacaa 54853305  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 32683531 - 32683856
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       
T  32683531 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgccagcacttacaaatctttcaaa 32683630  T
Q  108 nnnnntattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaact 207  Q
         |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||     
T  32683631 aaaaatattgtgtcagcgattacaaatcgatcgagttacacgagtttaccgagtgttaactcattcaaactcgttaaaccttccaattttaacagaaacc 32683730  T
Q  208 gattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacata 307  Q
    ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  32683731 gatcttacctcataattaacacgatttttgtacctaaaaacgt-aactcggtaatctctgagagttaacactcgatttgtggaacattgattacgacata 32683829  T
Q  308 --ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||    
T  32683830 ctctctatcataatattctcaatacaa 32683856  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 49501034 - 49501362
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||       
T  49501034 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgccagaacttacaaatctttcaaa 49501133  T
Q  108 nnnnn-tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaa 205  Q
          ||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  49501134 aaaaaatatcgtgtcagccattacaaatcgatcgagtttacacgagtttaccgagtgttaactccgtcaaactcgttaaaccttccgattttaccagaaa 49501233  T
Q  206 ctgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaaca 305  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  49501234 ccgagtttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaacgtaaactcggtaatctcggagagttaacactcgatttgcagaacattgattacgaca 49501333  T
Q  306 ta--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    ||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  49501334 tactctctataataatattctcaatacaa 49501362  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 49507099 - 49507427
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||       
T  49507099 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgccagaacttacaaatctttcaaa 49507198  T
Q  108 nnnnn-tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaa 205  Q
          ||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  49507199 aaaaaatatcgtgtcagccattacaaatcgatcgagtttacacgagtttaccgagtgttaactccgtcaaactcgttaaaccttccgattttaccagaaa 49507298  T
Q  206 ctgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaaca 305  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  49507299 ccgagtttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaacgtaaactcggtaatctcggagagttaacactcgatttgcagaacattgattacgaca 49507398  T
Q  306 ta--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    ||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  49507399 tactctctataataatattctcaatacaa 49507427  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 49834334 - 49834663
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  49834334 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttaaaa 49834433  T
Q  108 nnnnn--tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaa 204  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  49834434 aaaaaaatattgtgtcagccattacaaatcggtcgagtttacacgagtttaccgagtattaactcagtcaaactcgttaaaccttccgattttaccagaa 49834533  T
Q  205 actgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaac 304  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||| |||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  49834534 accgagtttacctcagagttaacacgatttttgtagctaaaaacgtaaactcggtaatcttagagagttaacactcaatttacggaacattgattacgac 49834633  T
Q  305 ata--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  49834634 atactctctatcataatattctcaatacaa 49834663  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 28484599 - 28484267
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||       
T  28484599 attattctcaatacacattttttattcgttaaaaatgttattcccacaaaattcagttgtacatatttaaaattatgtcagcacctacaaatctttcaaa 28484500  T
Q  108 nnnnn----tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccgg 202  Q
             ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28484499 aaaaaaaaatattgtgtcagtcattacaaatcggtcgagtttacacgagtttatcgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccag 28484400  T
Q  203 aaactgattttacctcagagttaacacga-tttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattac 301  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  28484399 aaaccgagtttacctcagagttaacacgactttttgtacctaaaaacgtaaactcggtaatctcagagagttaacactcaatttgcggaacattaattac 28484300  T
Q  302 aacata--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  28484299 aacatactctctatcataatattctcaatacaa 28484267  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 32322768 - 32322438
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  32322768 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaactcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcaaa 32322669  T
Q  108 nnnnn--tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaa-ctcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccgga 203  Q
           ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||    
T  32322668 aaaaaaatattgtggcagacattacaaatcggttgagtttacacgagtttaccgagtgttaaactcagtcaaactcgttaagccttccgattttaccaga 32322569  T
Q  204 aactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaa 303  Q
    ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |    
T  32322568 aaccgagtttacctcagaattaacacgatttttgtacctaaaaacgtaaactcggtaatctcggagagttaacactcgacttgcggaacattgattacga 32322469  T
Q  304 cata--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  32322468 catactctctatcataatattctcaatacaa 32322438  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 41725804 - 41725485
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       
T  41725804 attattctcaatacacatttgttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgccagcacttacaaatctttcaaa 41725705  T
Q  108 nnnnn--tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaa 205  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  41725704 aaaaaattattgtgtcagccattacaaatcggtcgagtt---------taccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccgattttaccagaaa 41725614  T
Q  206 ctgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaaca 305  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  41725613 tcgagtttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaacgtaaactaggtaatcacggagagttaacactcgatttgaagaacattgattacgaca 41725514  T
Q  306 ta--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  41725513 tactctctatcataatattctcaatacaa 41725485  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 37916489 - 37916173
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttc-nn 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  37916489 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgcacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcaaa 37916390  T
Q  107 nnnnnntattgtgtcagccattacaaatcggtcgag-ttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaa 205  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  37916389 atgaaatattgtgtcagccattacaaatcggtcgagtttacacgagtttactgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccgattttaccagaaa 37916290  T
Q  206 ctgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaaca 305  Q
                | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||    
T  37916289 ------------ccgagttaacacaatttttgtacataaaaatgtaaactcgataatctcggagagttaacactcaatttgcggaacattgattacgaca 37916202  T
Q  306 ta--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    ||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  37916201 tactctctataataatattctcaatacaa 37916173  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 71 - 332
Target Start/End: Original strand, 30966907 - 30967172
Alignment:
Q  71 tatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnnnnnnn--tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaact 168  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30966907 tatttaaaattatgccagcacttacaaatctttcaaaaaaaaaatattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttacacgagtttaccgagtgttaact 30967006  T
Q  169 cagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcgga 268  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  30967007 tagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccagaaaccaattttatctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaacgtaaactcggtaatctcgga 30967106  T
Q  269 gatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacata--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  30967107 gagttaacactcgatttgcggaacattgattacgacatactctctatcataatattctcaatacaa 30967172  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 8 - 199
Target Start/End: Original strand, 29649507 - 29649699
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttc-nn 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       
T  29649507 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgccagcacttacaaatctttcaaa 29649606  T
Q  107 nnnnnntattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttac 199  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29649607 aaaaaatattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttacacgagtttaccgagtgttaactcagttaaactcgttaaaccttccaattttac 29649699  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 117 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 29856106 - 29855888
Alignment:
Q  117 gtgtcagccattacaaatcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttac 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||    
T  29856106 gtgtcatccattacaaatcggtcgagtttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccagaaatcgagtttac 29856007  T
Q  216 ctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacata--ctctat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||| |||||  ||||||    
T  29856006 ctcagagttaacacgatttttgtacataaaaacgtaaactcggtaatctcggagaattaatactcgatttatggaacattgattacgacatactctctat 29855907  T
Q  314 cataatattctcaatacaa 332  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  29855906 cataatattatcaatacaa 29855888  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 149 - 296
Target Start/End: Original strand, 29510061 - 29510208
Alignment:
Q  149 gagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaat 248  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |     
T  29510061 gagtttaccgagtgttaactcggtcaaactcgtcaaaccttctgattttaccagaaattgagtttacatcagagttaacacgattttgatacctaaacac 29510160  T
Q  249 gtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattg 296  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  29510161 gtaaactcgataaactcggagagttaacactcgatttgcggaacattg 29510208  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 131 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 50517320 - 50517161
Alignment:
Q  131 aaatcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacac 229  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  || ||||||||| |||||||||    
T  50517320 aaatcggtcgagtttacacgagtttaccgagtgttaactcggtcaaactcgtcaaaccttccaattttaccagaaatcgagtttacctcaaagttaacac 50517221  T
Q  230 gatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgat 298  Q
    |||||| ||||||||| | |||||         |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  50517220 gattttggtacctaaacacgtaaa---------ctcggagagttaacactcgatttgcggaacattgat 50517161  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 79
Target Start/End: Original strand, 30966540 - 30966611
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaa 79  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  30966540 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattatacatatttaaaa 30966611  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 174 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 32889979 - 32889857
Alignment:
Q  174 aaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagattt 273  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||| |||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||  ||||||| ||    
T  32889979 aaactcgtcaaaccttctgattttaccagaaattgagtttacatcaaagttaacacgattttggtacctaaacacgtaaactcggtaaattcggagagtt 32889880  T
Q  274 aaaactcgatttgcggaacattg 296  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  32889879 aacactcgatttgcggaacattg 32889857  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 256
Target Start/End: Original strand, 26491116 - 26491225
Alignment:
Q  147 acgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaa 246  Q
    ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||     
T  26491116 acgagtttaccaaatgttaactcggtcaaactcgtcaaaccttctgattttaccagaaaccgagtttacctcaaatttaacacgattttggtacctaaac 26491215  T
Q  247 atgtaaactc 256  Q
    | ||||||||    
T  26491216 acgtaaactc 26491225  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 134 - 257
Target Start/End: Original strand, 24966498 - 24966622
Alignment:
Q  134 tcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgat 232  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||  ||||||||| ||||||||  |||| || ||||| || |||||||||||||    
T  24966498 tcggtcgagtttacacgagtttaccaagtgttaacttggtcaaactcggcaaaccttcccattttaccaaaaaccgaatttacttccgagttaacacgat 24966597  T
Q  233 ttttgtacctaaaaatgtaaactcg 257  Q
    ||| ||||||||| | |||||||||    
T  24966598 tttggtacctaaacacgtaaactcg 24966622  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 149 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 46286817 - 46286709
Alignment:
Q  149 gagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaat 248  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||  ||||  || ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||     
T  46286817 gagtttatcgagtgttaactcggtcaaactcgtcaaaccttccgagtttactagaaatcgagtttaccttagtgttaacacgattttggtacctaaaaac 46286718  T
Q  249 gtaaactcg 257  Q
    |||||||||    
T  46286717 gtaaactcg 46286709  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 147 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 29469273 - 29469154
Alignment:
Q  147 acgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaa 246  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||  || |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||     
T  29469273 acgagtttactgagtgttaactcggtcaaactcgtcaaactttccgattttaccagaaatcgagtttacctccgagttaacacgtttttagcacctaaac 29469174  T
Q  247 atgtaaactcgataatctcg 266  Q
    | ||||||||| ||| ||||    
T  29469173 acgtaaactcggtaaactcg 29469154  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 8084319 - 8084200
Alignment:
Q  147 acgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaa 246  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||  ||||  || |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||     
T  8084319 acgagtttactgagtgttaactcggtcaaactcgtcaaactttccgattttactagaaatcgagtttacctccgagttaacacgtttttagcacctaaac 8084220  T
Q  247 atgtaaactcgataatctcg 266  Q
    | ||||||||| ||| ||||    
T  8084219 acgtaaactcggtaaactcg 8084200  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 147 - 299
Target Start/End: Original strand, 23671367 - 23671519
Alignment:
Q  147 acgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaa 246  Q
    |||||||||| |||| ||||||   |||||||||| |||| || | |||| ||| ||||  || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||     
T  23671367 acgagtttactgagtcttaacttgctcaaactcgtcaaacttttcgatttcaccagaaatcgagtttacctccgagttaacacgattttggtacctaaac 23671466  T
Q  247 atgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgatt 299  Q
    | |||||  || ||| ||| |||   ||| |||||||||||||||||||||||    
T  23671467 acgtaaaaccggtaaactcagagtgctaacactcgatttgcggaacattgatt 23671519  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 147 - 256
Target Start/End: Original strand, 42937404 - 42937513
Alignment:
Q  147 acgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaa 246  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| || | |||||||| ||||  || |||||||| ||||||| ||| |||| | |||||||     
T  42937404 acgagtttacggagtgttaactcggtcaaactcgtcaaacttttcgattttaccagaaatcgagtttacctccgagttaaaacgcttttagcacctaaat 42937503  T
Q  247 atgtaaactc 256  Q
    | ||||||||    
T  42937504 acgtaaactc 42937513  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 162 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 871905 - 871782
Alignment:
Q  162 gttaactc-agtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgata 260  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||  || |||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||    
T  871905 gttaactcgagtcaaactcgtcaaacattccgattttaccagaaatcgagtttacctccgagttgacacga-tttggtacctaaaaacgtaaactcggta 871807  T
Q  261 atctcggagatttaaaactcgattt 285  Q
    | ||||  || |||| |||||||||    
T  871806 aactcgacgagttaacactcgattt 871782  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 33138874 - 33138800
Alignment:
Q  183 aaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcg 257  Q
    ||||||||| |||||||| ||||  || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  33138874 aaaccttccgattttaccagaaatcgagtttacctccgagttaacacgattttggtacctaaacacgtaaactcg 33138800  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 26448740 - 26448630
Alignment:
Q  148 cgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaa 247  Q
    |||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| |||  ||| | | |||||||| ||||| ||| | ||||   |||||||||    
T  26448740 cgagtttaacgcgtgttaactcggtcaaactcgtcaaactttccgatttcaccaaaaattaagtttacctccgagtttacatgtttttgccacctaaaaa 26448641  T
Q  248 tgtaaactcga 258  Q
    |||||||||||    
T  26448640 tgtaaactcga 26448630  T

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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 51967374 - 51967276
Alignment:
Q  160 gtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcga 258  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| || | |||| |||  |||| || |||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| ||||||||||    
T  51967374 gtgttaactcggtcaaactcgtcaaacttttcgatttcaccaaaaaccgagtttacctccgagttaacacgtttttgccacctaaaaacgtaaactcga 51967276  T

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Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 9972870 - 9972772
Alignment:
Q  160 gtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcga 258  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| |||  |||| || |||||||| ||||| ||||| ||||   |||||||||  |||||||||    
T  9972870 gtgttaactcggtcaaactcgtcaaactttccgatttcaccaaaaaccgagtttacctccgagtttacacgtttttgccacctaaaaacataaactcga 9972772  T

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Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 257
Target Start/End: Original strand, 6487324 - 6487421
Alignment:
Q  160 gtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcg 257  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||| |||  |||  || |||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| |||||||||    
T  6487324 gtgttcactcggtcaaactcgtcaaactttccgatttcaccaaaaatcgagtttacctccgagttaacacgtttttgccacctaaaaacgtaaactcg 6487421  T

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Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 40162886 - 40162789
Alignment:
Q  160 gtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcg 257  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| |||| |||| || |||| ||| || || ||||| ||||   ||||||||| |||||||||    
T  40162886 gtgttaactcggtcaaactcgtcaaactttccgatttcaccgaaaaccgagtttatctccgaatttacacgtttttgccacctaaaaacgtaaactcg 40162789  T

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Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 54561316 - 54561219
Alignment:
Q  160 gtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcg 257  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||| |||| |||| |||  |||| || |||||||| ||||| ||| | ||||   |||||||||||||||||||    
T  54561316 gtgttaactcggtcaaacacgtcaaactttccgatttcaccaaaaaccgagtttacctccgagtttacatgtttttgccacctaaaaatgtaaactcg 54561219  T

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Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 162 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 24453976 - 24453932
Alignment:
Q  162 gttaactc-agtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaa 205  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  24453976 gttaactcgagtcaaactcgtcaaacattccaattttaccggaaa 24453932  T

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Target: chr2 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 39)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 7027602 - 7027275
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       
T  7027602 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaatttcaattgtacatatttaaaattatgccagcacttacaaatctttcaaa 7027503  T
Q  108 nnnnn-tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaac 206  Q
          ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  7027502 aaaaaatattgtgtcggccattacaaatcggtcgagttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaacctttcaattttaccagaaac 7027403  T
Q  207 tgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacat 306  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7027402 cgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaacactcgatttgcggaacattgattacgacat 7027303  T
Q  307 a--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||    
T  7027302 actctctatcataatattctcaatacaa 7027275  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 18177970 - 18177643
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  18177970 attattctcaatacacatttttaatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcaaa 18177871  T
Q  108 nnnnn-tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaac 206  Q
          ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  18177870 aaaaaatattgtgccagccattacaaatcggtcgagttacacgagtttaccgagtgttaactctgtcaaactcgttaaactttccaattttaccagaaac 18177771  T
Q  207 tgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacat 306  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  18177770 cgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcgaagatttaacactcgatttacggaacattgattacgacat 18177671  T
Q  307 ac--tctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18177670 actttctatcataatattctcaatacaa 18177643  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 26789483 - 26789157
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||       
T  26789483 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgccaccacttacaaatctttcaaa 26789384  T
Q  108 nnnnntattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaact 207  Q
          |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  26789383 aaaaaaattgtgtcagtcattacaaatcggtcgggttacacgagtttatcaagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccagaaacc 26789284  T
Q  208 gattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacata 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  26789283 gattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtcaactcgataatctcggagatttaacactcgatttgcagaacattgattacgacata 26789184  T
Q  308 --ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
      ||||||||||| |||||||||||||    
T  26789183 ctctctatcataaaattctcaatacaa 26789157  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 28739796 - 28740124
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||       
T  28739796 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttaatcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgccatcacttacaaatctttcaaa 28739895  T
Q  108 nnnnn--tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaa 205  Q
           |||| |||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28739896 aaaaacatattttgtcggccattacaaattgttcgagttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccagaaa 28739995  T
Q  206 ctgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaaca 305  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28739996 ccgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaacataaactcggtaatctcggagagttaacactcgatttgcggaacattgattacgaca 28740095  T
Q  306 ta--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  28740096 tattctctatcataatattctcaatacaa 28740124  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 28845284 - 28844957
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||        
T  28845284 attattctcagtacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgctagcacttacaaatctttaaaa 28845185  T
Q  108 nnnnn-tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaac 206  Q
          |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  28845184 aaaaaatattatgtcagccattacaaatcggtcaagttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttatcagaaac 28845085  T
Q  207 tgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacat 306  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  28845084 cgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaacataaactcgataatctcggagagttaacactcgatttgcggatcattgattacgacat 28844985  T
Q  307 a--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    |  |||||||||||||||| ||||||||    
T  28844984 actctctatcataatattcccaatacaa 28844957  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 8 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 10658129 - 10657805
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       
T  10658129 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgccagcacttacaaatctttcaaa 10658030  T
Q  108 nnnnn-tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaac 206  Q
          |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  10658029 aaaatatattgtgtcagccattacaaatcgatcgagttacacgagtttatcgagtgttaactcagttaaactcgttaaaccttccaattttaccaaaaat 10657930  T
Q  207 tgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacat 306  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| || |    
T  10657929 cgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaacgtaaactcggtaatctcagagagttaacactcgatttacggaacattgattacgactt 10657830  T
Q  307 a--ctctatcataatattctcaata 329  Q
    |  ||||||||||||||||||||||    
T  10657829 actctctatcataatattctcaata 10657805  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 6224078 - 6224407
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||       
T  6224078 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgccagcacttataaatctttcaaa 6224177  T
Q  108 nnnnntat--tgtgtcagccattacaaatcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaa 204  Q
         |||  ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||    
T  6224178 aaaaatatactgtgtcagccattacaaatcggtcgagtttacatgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccgattttactagaa 6224277  T
Q  205 actgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaac 304  Q
    || || || |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6224278 accgagttcacctaagagttaacacgatttgtgtacctaaaaacgtaaactcgataatctcggagagttaacactcgatttgcggaacattgattacgac 6224377  T
Q  305 ata--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    |||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  6224378 atactctctatcataatattttcaatacaa 6224407  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 25288862 - 25288535
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       
T  25288862 attattctcaatacacatttttttttt-ttaaaaatgttattcccgcaaaattcaattgtacatatttaaaattatgccagcacttacaaatctttcaaa 25288764  T
Q  108 nnnnn-tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaa 205  Q
          |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||  ||||    
T  25288763 aaaaaatattgtgtcaaccattacaaatcggtcgagtttacacgagtttatcgagtgttaactcaatcaaacccgttaaaccttccgattttactagaaa 25288664  T
Q  206 ctgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaaca 305  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  25288663 ccgagtttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcggtaatctcggagagttaatattcgatttgcggaacattgattacgaca 25288564  T
Q  306 ta--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  25288563 tattctctatcataatattctcaatacaa 25288535  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 379629 - 379302
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||       
T  379629 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaactcaattgtacatatttaagattatgccagcacttacaaatatttcaaa 379530  T
Q  108 nnnnntattgtgtcagccattacaaatcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaac 206  Q
          ||||||||||||||||||||||||| || || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |  ||||    
T  379529 aaaaaaattgtgtcagccattacaaatcggttgaatttaaatgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaagccttccgattttatcaaaaac 379430  T
Q  207 tgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacat 306  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  379429 cgaatttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaacgtaaattcggtaatctcaaagagttaacactcgatttgcggaacattgattacgacat 379330  T
Q  307 a--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||    
T  379329 actctctatcataatattctcaatacaa 379302  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 3575541 - 3575217
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||       
T  3575541 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttatttccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgccaacacttccaaatctttcaca 3575442  T
Q  108 nnnnnta--ttgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaa 205  Q
          |  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3575441 aaaaaaaaattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttacgcgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccagaaa 3575342  T
Q  206 ctgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaaca 305  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| | |||| | |||||||| || ||||||||||  |||    
T  3575341 ccgattttacctcagagttaacatgatttttgtacctaaaaacgtaaactcagtaatctcggatagttaatattcgatttgagggacattgattatgaca 3575242  T
Q  306 tactctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    || ||  ||  ||||||||||||||||    
T  3575241 tattc--tctaaatattctcaatacaa 3575217  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 43825538 - 43825317
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        
T  43825538 attattctcaatatacattttttatttgttaaaaatgttattaccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgccagcacttacaaatctttaaaa 43825439  T
Q  108 nnnnntattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaact 207  Q
         |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  43825438 aaatatattgtgttagccattacaaatcggtcgagttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccagaaacc 43825339  T
Q  208 gattttacctcagagttaacac 229  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  43825338 gattttacctcagagttaacac 43825317  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 3464301 - 3464111
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttc-nn 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       
T  3464301 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgccagcacttacaaatctttcaaa 3464202  T
Q  107 nnnnnntattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaatttt 197  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3464201 aaaatatattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttacacgagtttactgagtgttaactcagtcaaactcattaaaccttccaatttt 3464111  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 43079187 - 43078967
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||       
T  43079187 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttatttccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatatcagcacttacaaatctttcaaa 43079088  T
Q  108 nnnnntattgtgtcagccattacaaatcggtcgag-ttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaac 206  Q
          ||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| | |||||    
T  43079087 aaaaaaattgtgtcagcc--tacaaatcggtcgagtttacacgagtttatcgagtgttaactcaatcaaactcgttaaaccttcggattttaacagaaac 43078990  T
Q  207 tgattttacctcagagttaacac 229  Q
     || |||||||||||||||||||    
T  43078989 cgagtttacctcagagttaacac 43078967  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 147 - 332
Target Start/End: Original strand, 13833062 - 13833249
Alignment:
Q  147 acgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaa 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13833062 acgagtttaccgagtgttaactcagtcaaacttgttaaatcttctgattttactagaaattgagtttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaa 13833161  T
Q  247 atgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacata--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    | |||||||||||||||||| ||| |||| | || |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  13833162 acgtaaactcgataatctcgaagagttaacattcaatttgcggaacattgattacgacatactctctatcataatattctcaatacaa 13833249  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 114 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 33136209 - 33135990
Alignment:
Q  114 attgtgtcagccattacaaatcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattt 212  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||  || ||    
T  33136209 attgtgtcagcgattacagatcggtcgagtttacacaagtttaccgagtgttaacttagtcaaattcgttaaaccttccgattataccagaaatcgagtt 33136110  T
Q  213 tacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacatactc-- 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  33136109 tacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaacataaactcggt--tctcagagagttaacactcgatttgcggaacattgattacgacatactctg 33136012  T
Q  311 tatcataatattctcaatacaa 332  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  33136011 tataataatattctcaatacaa 33135990  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 193 - 332
Target Start/End: Original strand, 214946 - 215087
Alignment:
Q  193 attttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaac 292  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| | |||| |||| |||||||||||    
T  214946 attttaccagaaactgagtttaccttagagttaacacgattttggtacctaaaaacgtaaattcggtaatctcggaaagttaacactcaatttgcggaac 215045  T
Q  293 attgattacaacata--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||    
T  215046 attgattacaacatactctctatcataatactcacaatacaa 215087  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 231 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 3464115 - 3464012
Alignment:
Q  231 atttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacata--ctctatcataatattctcaat 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  3464115 atttttgtacctaaaaatgtaaactcggtaatctcggagagttaacacacgatttgcggaacattaattacgacatactctctatcataatattctcaat 3464016  T
Q  329 acaa 332  Q
    ||||    
T  3464015 acaa 3464012  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 148 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 34342347 - 34342197
Alignment:
Q  148 cgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaa 247  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||| | |||||| ||||| || ||||||| || | ||||| |  ||| |||||||||||    
T  34342347 cgagtttaccgactgttaactcaatctaactcgtcaaaccttccgagtttaccagaaaccgagtttaccttagtgctaacatggatttggtacctaaaaa 34342248  T
Q  248 tgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgat 298  Q
     ||||||||| ||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  34342247 cgtaaactcggtaaactcagagagttaacactcgatttgcggaacattgat 34342197  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 149 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 40829744 - 40829596
Alignment:
Q  149 gagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaat 248  Q
    |||||||  |||||||||||| |||||| |||| ||||||| | |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  40829744 gagtttattgagtgttaactcggtcaaattcgtcaaacctttctattttaccagaaaccgagtttacctccgagttaacacgattttgatacctaaaaat 40829645  T
Q  249 gtaaactcgataa--tctcggagatttaaaactcgatttgcggaacatt 295  Q
    ||| ||||| |||  ||||||||| |||| |||| |||| |||||||||    
T  40829644 gtagactcggtaaactctcggagagttaacactcaatttacggaacatt 40829596  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 147 - 296
Target Start/End: Original strand, 31847209 - 31847359
Alignment:
Q  147 acgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaa 246  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||  |||||| | ||||  || |||||||| |||||| || ||||||  |||||||||    
T  31847209 acgagtttaccgagtgttaattcggtcgaactcgtcaaaccttctgattttatcagaaatagagtttacctccgagttaccatgattttaatacctaaaa 31847308  T
Q  247 atgt-aaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattg 296  Q
    | || ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  31847309 acgtaaaactcgataaactcggagagttaacactcgatttgaggaacattg 31847359  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 148 - 258
Target Start/End: Original strand, 35404311 - 35404421
Alignment:
Q  148 cgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaa 247  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||    
T  35404311 cgagtttatcgagtgttaactcggtcaaactcgtcaaactttccaattttaccaaaaaccgagtttacctctaagttaacacgatttcggtacctaaaaa 35404410  T
Q  248 tgtaaactcga 258  Q
     ||||||||||    
T  35404411 cgtaaactcga 35404421  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 158 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 15224329 - 15224191
Alignment:
Q  158 gagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcg 257  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||| || | |||| ||| ||||  || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||| | |    
T  15224329 gagtgttaattcggtcaaactcgtcaaacttttcgatttcaccagaaatcgagtttacctctgagttaacacgattttggtacctaaacacgtaaaattg 15224230  T
Q  258 ataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattg 296  Q
     ||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  15224229 gtaaactcggagtgttaacactcgatttgcggaacattg 15224191  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 296
Target Start/End: Original strand, 18899919 - 18900068
Alignment:
Q  147 acgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaa 246  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||  ||||  || |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||     
T  18899919 acgagtttactgagtgttaactcggtcaaactcgtcaaactttccgattttactagaaatcgagtttacctccgagttaacacgtttttagcacctaaac 18900018  T
Q  247 atgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattg 296  Q
    | ||||||||| ||| ||||  || || | || ||||||| |||||||||    
T  18900019 acgtaaactcggtaaactcgccgagttgacacgcgatttgtggaacattg 18900068  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 160 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 19948635 - 19948538
Alignment:
Q  160 gtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcg 257  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| |||  ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||    
T  19948635 gtgttaactcggtcaaactcgtcaaactttccgatttcaccaaaaactgagtttacctccgagttaacacgtttttgccacctaaaaatgtaaactcg 19948538  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 147 - 299
Target Start/End: Original strand, 2308705 - 2308857
Alignment:
Q  147 acgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaa 246  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||   ||||||||  |||| || |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  2308705 acgattttaccgagtgttaacttggtcaaacttgtcaaactttttgattttaccacaaaccgaatttacctccgagttaacacgattttggtacataaaa 2308804  T
Q  247 atgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgatt 299  Q
    | ||||| |  |||| ||||| || |||| |||||||||  | ||||||||||    
T  2308805 acgtaaatttaataaactcggcgagttaacactcgatttatgaaacattgatt 2308857  T

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Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 33136292 - 33136240
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaatt 60  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33136292 attattctcaatacatattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaatt 33136240  T

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Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 147 - 244
Target Start/End: Original strand, 38295709 - 38295806
Alignment:
Q  147 acgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaa 244  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||  | ||| |||| || ||||||| |||||  |||||||    
T  38295709 acgagtttaccgagtgttaactcggtcaaactcgtcaaaccttctgattttaccagaaaccaaattttcctccgaattaacacaattttgatacctaa 38295806  T

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Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 256
Target Start/End: Original strand, 32242211 - 32242306
Alignment:
Q  162 gttaactc-agtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactc 256  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||   | ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  32242211 gttaactcgagtcaaactcgttaaacattctgattttacaagaaatcaagtttacctcagagttaacacgattttggtatctcaaaatgtaaactc 32242306  T

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Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 43825323 - 43825261
Alignment:
Q  272 ttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacata--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  43825323 ttaacactcgatttgcggaacattgattatgacatactctctatcataatattctcaatacaa 43825261  T

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Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 33262962 - 33262852
Alignment:
Q  148 cgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaa 247  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||  |||| || |||||||  ||||| ||||| ||||   |||||||||    
T  33262962 cgagtttaccacgtgttaactcagtcaaactcgtcaaactttccgatttcaccaaaaaccgagtttaccttcgagtttacacgtttttgccacctaaaaa 33262863  T
Q  248 tgtaaactcga 258  Q
     ||||||||||    
T  33262862 cgtaaactcga 33262852  T

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Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 104
Target Start/End: Original strand, 39697863 - 39697928
Alignment:
Q  39 aaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttc 104  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  39697863 aaaatgttatttccacaaaatttaattctacatatttaaaattatgtcaacccttataaatctttc 39697928  T

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Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 3991870 - 3991772
Alignment:
Q  160 gtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcga 258  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| || | |||| |||  |||| || |||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| ||||||||||    
T  3991870 gtgttaactcggtcaaactcgtcaaacttttcgatttcaccaaaaaccgagtttacctccgagttaacacgtttttgccacctaaaaacgtaaactcga 3991772  T

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Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 253
Target Start/End: Original strand, 11153354 - 11153447
Alignment:
Q  160 gtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaa 253  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||| |  | |||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||  | ||||||||| |||||    
T  11153354 gtgttaactcggtcaaactcgccaaacatctcgattttaccagaaaccgagtttacctccgagttaacacgatttcagcacctaaaaacgtaaa 11153447  T

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Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 162 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 15926474 - 15926377
Alignment:
Q  162 gttaactc-agtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcga 258  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || | |||||||| ||||  || || ||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  15926474 gttaactcgagtcaaactcgtcaaacattgcgattttaccagaaatcgagttaacctccgagttgacacgattttggtaccaaaaaacgtaaactcga 15926377  T

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Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 257
Target Start/End: Original strand, 38413458 - 38413555
Alignment:
Q  160 gtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcg 257  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| |||  |||| || |||||||| ||||| ||||| ||||   ||||||||| |||||||||    
T  38413458 gtgttaactcggtcaaactcgtcaaactttccgatttcaccaaaaaccgagtttacctccgagtttacacgtttttgccacctaaaaacgtaaactcg 38413555  T

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Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 258
Target Start/End: Original strand, 1833720 - 1833808
Alignment:
Q  170 agtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcga 258  Q
    ||||||||||| ||||| |||  |||||||| ||||  || ||||||||  | || ||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  1833720 agtcaaactcgataaacattcttattttaccagaaatcgaatttacctccaaattgacacgattttgttacctaaaaacgtaaactcga 1833808  T

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Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 13898573 - 13898477
Alignment:
Q  160 gtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactc 256  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| |||  |||  || |||||||| ||||||||||| ||||    |||||||| ||||||||    
T  13898573 gtgttaactcggtcaaactcgtcaaactttccgatttcaccaaaaatcgagtttacctccgagttaacacgtttttgccgcctaaaaacgtaaactc 13898477  T

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Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 14039190 - 14039094
Alignment:
Q  160 gtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactc 256  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| |||  |||  || |||||||| ||||||||||| ||||    |||||||| ||||||||    
T  14039190 gtgttaactcggtcaaactcgtcaaactttccgatttcaccaaaaatcgagtttacctccgagttaacacgtttttgccgcctaaaaacgtaaactc 14039094  T

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Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 241
Target Start/End: Original strand, 18727624 - 18727732
Alignment:
Q  134 tcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgat 232  Q
    ||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| || |||||||| |||| ||   |||||||| |||   || |||||||| ||||||||||| |    
T  18727624 tcggtcgagtttacacgagtttatcgaatgttaactcggtgaaactcgtcaaactttttgattttaccagaattcgagtttacctccgagttaacacggt 18727723  T
Q  233 ttttgtacc 241  Q
    ||| |||||    
T  18727724 tttggtacc 18727732  T

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Target: chr8 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 33)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 14781634 - 14781961
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||       
T  14781634 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattattccagcacttacaaatctttcaaa 14781733  T
Q  108 nnnnn-tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaac 206  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14781734 aaaaaatattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttacacgagtttactgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccagaaac 14781833  T
Q  207 tgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacat 306  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14781834 cgattttacctcagagttaacacgatttttatacctaaaaatgtcaactcgataatctcggagatttaacactcgatttgcggaacattgattacgacat 14781933  T
Q  307 a--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||    
T  14781934 actctctatcataatattctcaatacaa 14781961  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 44725293 - 44725620
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||       
T  44725293 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgctagcacttacaaatctttcaaa 44725392  T
Q  108 nnnnn-tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaac 206  Q
          |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44725393 aaaatatattgtgtcagccattacaaatcgttcgagttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccagaaac 44725492  T
Q  207 tgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacat 306  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44725493 cgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaatctcgataatctctgagatttaacactcgatttgcggaacattgattacgacat 44725592  T
Q  307 a--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||    
T  44725593 actctctatcataatattctcaatacaa 44725620  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 9 - 332
Target Start/End: Original strand, 19717378 - 19717703
Alignment:
Q  9 ttattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnnn 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||         
T  19717378 ttattctcaatacacattttttatttattaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgccagtacttacaaatgtttaaaaa 19717477  T
Q  109 nnnntattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactg 208  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  19717478 aaaatattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttacacaagtttaccgagtgttaactcagtcaatctcgttaaaccttccaattttaccagaaaccg 19717577  T
Q  209 attttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacata- 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  19717578 attttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcggtaatctcggagagttaacactcgatttgcggaacattgattacgacatac 19717677  T
Q  308 -ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  19717678 tctctatcataatattctcaatacaa 19717703  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 31626007 - 31625680
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  31626007 attattctcaatacacattttttatttgataaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcaaa 31625908  T
Q  108 nnnnntattgtgtcagccattacaaatcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaac 206  Q
         |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  31625907 aaaaatattgtgtcagccattacaaatcgatcgagtttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccgattttaccagaaac 31625808  T
Q  207 tgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacat 306  Q
     || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31625807 cgagtttacctcagagttaacacaatttttgtacctaaaaatgtaaactcggtaatctcggagagttaacactcgatttgcggaacattgattacgacat 31625708  T
Q  307 a--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    |  |||||| ||||||||||||||||||    
T  31625707 actctctataataatattctcaatacaa 31625680  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 8 - 330
Target Start/End: Original strand, 18958230 - 18958554
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||        
T  18958230 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgccagtacttacaaatgtttaaaa 18958329  T
Q  108 nnnnntattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaact 207  Q
         |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||     
T  18958330 aaaaatattgtgtcaaccattacaaatcggtcgagttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaatcttgttaaaccttccaattttaccagaaacc 18958429  T
Q  208 gattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacata 307  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18958430 aattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcggtaatctcggagagttaacactcgatttgcggaacattgattacgacata 18958529  T
Q  308 --ctctatcataatattctcaatac 330  Q
      |||||||||||||||||||||||    
T  18958530 ctctctatcataatattctcaatac 18958554  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 18305473 - 18305805
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  18305473 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcaaa 18305572  T
Q  108 nnnnn------tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccg 201  Q
               ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  18305573 aaaagaaaaaatattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactctttaaaccttccaattttacca 18305672  T
Q  202 gaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattac 301  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  18305673 gaaaccgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaacgtaagctcggtaatctcggagagttaacactcgatttgcgtaacattgattac 18305772  T
Q  302 aacata--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
     |||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  18305773 gacatactctctatcataatattctcagtacaa 18305805  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 39467018 - 39467347
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  39467018 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcaaa 39467117  T
Q  108 nnnnn---tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaa 204  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  39467118 aaaaaatatattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgctaaaccttccaattttaccagaa 39467217  T
Q  205 actgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaac 304  Q
    |   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39467218 atcaattttaccttagagttaatacgatttttgtacctaaaaacgtaaacgcggtaatctcggagagttaacactcgatttgcggaacattgattacgac 39467317  T
Q  305 ata--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  39467318 atactctctatcataatattctcaatacaa 39467347  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 43166179 - 43166505
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  43166179 attattcttaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacagaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcaaa 43166278  T
Q  108 nnnnntattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaact 207  Q
         |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  43166279 aaaaatattgtgtcagccattacaaatcggtcgggttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgtcaaacctttcaattttaccagaaact 43166378  T
Q  208 gattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacata 307  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||| || |||||    
T  43166379 tattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaacgtaaactcggtaatctcgaaaaattaacactcgatttgcggaacattgatcacgacata 43166478  T
Q  308 --ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
      |||||| ||||||||||||||||||    
T  43166479 ctctctattataatattctcaatacaa 43166505  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 9287995 - 9288323
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||       
T  9287995 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatgtttaaaattatgccaacacttgcaaatctttccaa 9288094  T
Q  108 nnnnn--tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaa 205  Q
           ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9288095 aaaaaaatattgtgtcagccattacaaatcagtcgagttacatgagtatactgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccagaaa 9288194  T
Q  206 ctgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaaca 305  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9288195 ccgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaacgtaaactcggtaatctcgaagagttaacactcgatttgcggaacattgattacgaca 9288294  T
Q  306 ta--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  9288295 tactctctatcataatattctcaatacaa 9288323  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 43308009 - 43308337
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||       
T  43308009 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaatttaattgtacatatttaaaattatgccagtacttacaaatctttcaaa 43308108  T
Q  108 nnnnn--tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaa 205  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  43308109 aaaaaaatattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaacttgttaaaccttccaattttaccagaaa 43308208  T
Q  206 ctgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaaca 305  Q
    | |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  43308209 ccgattttatatcagagttaacacgattttggtacctaaaaacgcaaactcgataatctcgaagagttaacactcgatttgcggaacaatgattacgaca 43308308  T
Q  306 ta--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  43308309 tactctctatcataatattctcaatacaa 43308337  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 42305103 - 42305433
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||        
T  42305103 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgttcatatttaaaattatgccagtacttacaaatgtttaaaa 42305202  T
Q  108 nnnnntattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttag----acgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccgga 203  Q
         ||| |||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  42305203 aaaaatatcgtgtcagccattacaaatcggtcgagttaattacacgagtttaccgaatgttaactcagtcaatctcgttaaaccttccaattttaccaga 42305302  T
Q  204 aactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaa 303  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |    
T  42305303 aaccgattttacctcagagttaacacgatttttatacctaaaaaggtaaactcggtaatctcggagagttaacactcgatttgtggaacattgattacga 42305402  T
Q  304 cata--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  42305403 catactctctatcataatattctcaatacaa 42305433  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 8 - 331
Target Start/End: Original strand, 10294851 - 10295167
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       
T  10294851 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgccagcacttacaaatctttcaaa 10294950  T
Q  108 nnnnntattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaact 207  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  10294951 aaaaaaattgtgtcagccattacaaatcggtcgag---------tttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccgattttaccagaaacc 10295041  T
Q  208 gattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacata 307  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||    
T  10295042 gagtttacctcagagttaacacgattgttgtacctaaaaacgtaaactcggtaatctcggagagttaacactcgatttacggaacattgattgcgacata 10295141  T
Q  308 --ctctatcataatattctcaataca 331  Q
      |||||| |||||||||||||||||    
T  10295142 ctctctataataatattctcaataca 10295167  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 26856801 - 26856477
Alignment:
Q  10 tattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnnnn 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  26856801 tattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaatccaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcaaaaa 26856702  T
Q  110 nnntattgtgtcagccattacaaatcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactg 208  Q
       |||||||||||||| ||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |    
T  26856701 aa-tattgtgtcagccactacaagtcggtcgaatttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttctgattttaccagaaaccg 26856603  T
Q  209 attttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacata- 307  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||| |||||     
T  26856602 agtttacctcagagttaacacgatttttgtacctataaacataaactcggtaatctcggagagttaacactcgatttgtgtaacattgattacgacatac 26856503  T
Q  308 -ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
     |||||| ||||||||||||||||||    
T  26856502 tctctataataatattctcaatacaa 26856477  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 8 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 7467020 - 7466759
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||        
T  7467020 attattctcagtacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgctagcacttacaaatctttaaaa 7466921  T
Q  108 nnnnn-tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaac 206  Q
          |||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||    
T  7466920 aaataatattatgtcagtcattataaatcggtcgagttacacgagtttatcgagtgttaactcagtcaaactcgttaagccttccaattttatcagaaac 7466821  T
Q  207 tgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcgga 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||    
T  7466820 tgattttacctcagagttaacacgatttttgtacttaaaaacataaactcggtaatctcgga 7466759  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 32498236 - 32497913
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       
T  32498236 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaat-------ccgcaaaattcaattgtacatatttaaaattatgccagcacttacaaatctttcaaa 32498144  T
Q  108 nnnnnta---ttgtgtcagccattacaaatcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccgga 203  Q
          |   |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||  ||    
T  32498143 aaaaaaaatgttgtgtcagccattacaaatcggtcgagtttacacgagtttacctagtgttaactcaatcaaatccgttaaaccttccgattttactaga 32498044  T
Q  204 aactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaa 303  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||| || ||||||||| |    
T  32498043 aaccgagtttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaacgtaaactcggtaatctcggagagttaacactcaatttgcgaaaaattgattacga 32497944  T
Q  304 cata--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  32497943 catactctctatcataatattctcaatacaa 32497913  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16364393 - 16364078
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |             |||| |||||||||||||||||||       
T  16364393 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaatttt-------------tatgccagcacttacaaatctttcaaa 16364307  T
Q  108 nnnnn-tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaa 205  Q
          |||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||    
T  16364306 aaaaaatattgtgtcagccattgcaaatcggtcgaatttacacgagtttaccgagtgttaatttagtcaaactcgttaaaccttccgattttactagaaa 16364207  T
Q  206 ctgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaaca 305  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16364206 ccgaatttaccttagagttaacacgatttttgtacctaaaaacgtaaattcgataatctcatagagttaacactcgatttgcggaacattgattacgaca 16364107  T
Q  306 tactc--tatcataatattctcaatacaa 332  Q
    |||||  ||| |||||||| |||||||||    
T  16364106 tactctgtataataatattttcaatacaa 16364078  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 37857585 - 37857406
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttc--- 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||       
T  37857585 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattctcacataattcaattgtacgtatttaaaattatgccaacacttacaaatctttcaaa 37857486  T
Q  105 nnnnnnnntattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaa 184  Q
            ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37857485 aaaaaacatatcgtgtcagtcattacaaatcggtcgagttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaa 37857406  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 134 - 296
Target Start/End: Original strand, 8029817 - 8029980
Alignment:
Q  134 tcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgat 232  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||  || |||| |||||||||||||||||    
T  8029817 tcggtcgagtttacacgattttaccgagtgttaactcggtcaaactcgtcaaaccttccgattttaccagaaatcgagtttatctcagagttaacacgat 8029916  T
Q  233 ttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattg 296  Q
    ||| ||||||||| | ||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  8029917 tttggtacctaaacacgtaaactcgataaactcgaagagttaacactcgatttacggaacattg 8029980  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 177 - 295
Target Start/End: Original strand, 12522528 - 12522646
Alignment:
Q  177 ctcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaa 276  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   ||| |||||||| ||||     
T  12522528 ctcgtcaaaccttccgattttaccagaaaccgagtttacctctgagttaacacgattttggtacctaaaaatgcaaacttagtaaactcggagagttaac 12522627  T
Q  277 actcgatttgcggaacatt 295  Q
    |||||||||||||||||||    
T  12522628 actcgatttgcggaacatt 12522646  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 162 - 296
Target Start/End: Original strand, 6388131 - 6388265
Alignment:
Q  162 gttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataa 261  Q
    |||||||  |||||||| || |||| |||| ||||||||  |||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||    
T  6388131 gttaacttggtcaaacttgtcaaactttccgattttaccataaacagagtttacctccgagttaacacgattttggtacctaaaaacataaattcgataa 6388230  T
Q  262 tctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattg 296  Q
     ||||| || |||  |||| |||||||||||||||    
T  6388231 actcggcgagttaccactcaatttgcggaacattg 6388265  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 19484325 - 19484176
Alignment:
Q  147 acgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaa 246  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||  || |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||     
T  19484325 acgagtttactgagtgttaactcggtcaaactcgtcaaactttccgattttaccagaaatcgagtttacctccgagttaacacgtttttagcacctaaac 19484226  T
Q  247 atgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattg 296  Q
    |  |||||||| ||| ||||  || || | || ||||||| |||||||||    
T  19484225 acataaactcggtaaactcgccgagttgacacgcgatttgtggaacattg 19484176  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 134 - 245
Target Start/End: Original strand, 27878611 - 27878723
Alignment:
Q  134 tcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgat 232  Q
    ||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||  |||||||||| |||||| || |||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||    
T  27878611 tcggtcgagtttacacgagttcatcgagtgttaactctatcaaactcgtcaaacctaccgattttaccagaaaccgaatttacatccgagttaacacgat 27878710  T
Q  233 ttttgtacctaaa 245  Q
    ||| |||||||||    
T  27878711 tttggtacctaaa 27878723  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 134 - 245
Target Start/End: Original strand, 28018792 - 28018904
Alignment:
Q  134 tcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgat 232  Q
    ||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||  |||||||||| |||||| || |||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||    
T  28018792 tcggtcgagtttacacgagttcatcgagtgttaactctatcaaactcgtcaaacctaccgattttaccagaaaccgaatttacatccgagttaacacgat 28018891  T
Q  233 ttttgtacctaaa 245  Q
    ||| |||||||||    
T  28018892 tttggtacctaaa 28018904  T

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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Original strand, 12522424 - 12522483
Alignment:
Q  147 acgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaac 206  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  12522424 acgagtttaccaagtgttaactcggtcaaactcgtcaaacctttcaattttaccagaaac 12522483  T

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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 41394065 - 41393958
Alignment:
Q  148 cgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaa 247  Q
    |||||||||||||||||||  |  ||||| | || ||||||| | |||||| | |||||||| |||||||| || |||||||||||||  ||||||||||    
T  41394065 cgagtttaccgagtgttaatacgatcaaatttgtcaaacctttcgattttatcagaaactgagtttacctccgaattaacacgattttgatacctaaaaa 41393966  T
Q  248 tgtaaact 255  Q
     |||||||    
T  41393965 cgtaaact 41393958  T

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Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 258
Target Start/End: Original strand, 37131291 - 37131388
Alignment:
Q  162 gttaactc-agtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcga 258  Q
    |||||||| |||||||||| | |||| |||  |||||||| |||   || |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37131291 gttaactcgagtcaaactcttcaaacattctgattttaccagaagtcgagtttacctccgagttgacacgattttggtacctaaaaatgtaaactcga 37131388  T

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Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 162 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 24067202 - 24067106
Alignment:
Q  162 gttaactc-agtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcg 257  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||| | || |||||||| |||| ||| || ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24067202 gttaactcgagtcgaactcgtcaaacatgccgattttaccagaaattgagttcacctccgagttgacacgattttggtacctaaaaacgtaaactcg 24067106  T

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Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 149 - 257
Target Start/End: Original strand, 26620338 - 26620446
Alignment:
Q  149 gagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaat 248  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||| || | |||||| | |||||||| |||||| |  ||||||||||||||   || ||||||||    
T  26620338 gagtttatcgagtgttaactcgatcaaactcgtcaaacttttcgattttatcagaaactgaatttaccaccaagttaacacgatttcgatatctaaaaat 26620437  T
Q  249 gtaaactcg 257  Q
     ||||||||    
T  26620438 ataaactcg 26620446  T

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Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 134 - 245
Target Start/End: Original strand, 27915555 - 27915667
Alignment:
Q  134 tcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgat 232  Q
    ||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||| | ||||  || ||||  || |||||||||||||    
T  27915555 tcggtcgagtttacacgagttcatcgagtgttaactcggtcaaactcgtcaaacctaccgattttatcagaaatcgaatttaaatctgagttaacacgat 27915654  T
Q  233 ttttgtacctaaa 245  Q
    ||| |||| ||||    
T  27915655 tttggtacataaa 27915667  T

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Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 134 - 245
Target Start/End: Original strand, 27961974 - 27962086
Alignment:
Q  134 tcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgat 232  Q
    ||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||| | ||||  || ||||  || |||||||||||||    
T  27961974 tcggtcgagtttacacgagttcatcgagtgttaactcggtcaaactcgtcaaacctaccgattttatcagaaatcgaatttaaatctgagttaacacgat 27962073  T
Q  233 ttttgtacctaaa 245  Q
    ||| |||| ||||    
T  27962074 tttggtacataaa 27962086  T

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Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 150 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 17234820 - 17234724
Alignment:
Q  150 agtttaccgagtgttaactc-agtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaa 247  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||  || |||||||| ||||| | | |||||| |||||||||||    
T  17234820 agtttaccgagt--taactcgagtcaaactcgtcaaacattccgattttaccagaaatcgagtttacctccgagttgataggattttggtacctaaaaa 17234724  T

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Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 42423298 - 42423257
Alignment:
Q  149 gagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttc 190  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  42423298 gagtttacccagtgttaactcggtcaaactcgtcaaaccttc 42423257  T

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Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 162 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 35879775 - 35879731
Alignment:
Q  162 gttaactc-agtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaa 205  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  35879775 gttaactcgagtcaaactcgtcaaacattccaattttaccggaaa 35879731  T

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Target: chr5 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 22)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 13999597 - 13999924
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       
T  13999597 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattaaattgtacatatttaaaattatgccagcacttacaaatctttcaaa 13999696  T
Q  108 nnnnn-tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaac 206  Q
          |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13999697 aaaaaatattgtgttagccattacaaatcggtcgagttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccagaaac 13999796  T
Q  207 tgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacat 306  Q
     ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13999797 cgattttatctcaaagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtcaactccataatctcggagatttaacactcgatttgcggaacattgattacgacat 13999896  T
Q  307 a--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||    
T  13999897 actctctatcataatattctcaatacaa 13999924  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 13926630 - 13926303
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||        
T  13926630 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgccaacacttacaaatcttttaaa 13926531  T
Q  108 nnnnn-tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaac 206  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  13926530 aaaaaatattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttacacgagtttaccgagtgttaacttagtcaaactccttaaaccttccaattttaccagaaac 13926431  T
Q  207 tgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacat 306  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13926430 cgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaacgtaaactcgataatctcggagagttaacactcgatttgcggaacattgattacgacat 13926331  T
Q  307 a--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||    
T  13926330 actctctatcataatattctcaatacaa 13926303  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 37014553 - 37014226
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       
T  37014553 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgccagcacttacaaatctttcaaa 37014454  T
Q  108 nnnnn-tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaac 206  Q
          |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  37014453 aaaaaatattgtgtcaaccattacaaatcggtcgagttacacgagtttaccgagtgttaactcggtcaaactcgttaaacctttcaattttaccagaaac 37014354  T
Q  207 tgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacat 306  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  37014353 cgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcggtaatctcggagagttaacactcgatttgcgaaacattgattacgacat 37014254  T
Q  307 a--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||    
T  37014253 actctctatcataatattctcaatacaa 37014226  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 39853069 - 39852742
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       
T  39853069 attattctcaatacacactttttatttgttaaaaatgttattgccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgccagcacttacaaatctttcaaa 39852970  T
Q  108 nnnnn-tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaac 206  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  39852969 aaaaaatattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttacacgagtttaccgagtgttaactccgtcaaactcgttaaaccttccaattttaccaaaaat 39852870  T
Q  207 tgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacat 306  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39852869 cgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagagttaacactcgatttgcggaacattgattacgacat 39852770  T
Q  307 a--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||    
T  39852769 actctctatcataatattctcaatacaa 39852742  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 8 - 329
Target Start/End: Original strand, 4549762 - 4550085
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  4549762 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatattattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcaaa 4549861  T
Q  108 nnnnntattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaact 207  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  4549862 aaaaatattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttacacgagtttgcagagtattaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccagaaacc 4549961  T
Q  208 gattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacata 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  4549962 gattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaacacgtaaactcggtaatctcggagagttaacactcgatttgcggaacattgattacgatata 4550061  T
Q  308 --ctctatcataatattctcaata 329  Q
      ||||||||||||||||||||||    
T  4550062 ctctctatcataatattctcaata 4550085  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 5949816 - 5949484
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgtt-----aaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  5949816 attattctcaatacacattttttatttgttttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaatttatgccagcacttacaaatctt 5949717  T
Q  103 tcnnnnnnnn--tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttacc 200  Q
    ||          |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5949716 tcaaaaaaaaaatattgtctcagccattacaaatcggtcgagttacacgtgtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttacc 5949617  T
Q  201 ggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgatta 300  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5949616 agaaaccgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaacgtaaact-gataatctcggagagttaatactcgatttgcggaacattgatta 5949518  T
Q  301 caacata--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    | |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  5949517 cgacatactctctatcataatattctcaatacaa 5949484  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 40013205 - 40013535
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||        
T  40013205 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgccagtacttacaaatgtttaaaa 40013304  T
Q  108 nnnnntattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttag----acgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccgga 203  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||    
T  40013305 aaaaatattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttaattacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaatcttgttaaaccttccaattttaccaga 40013404  T
Q  204 aactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaa 303  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |    
T  40013405 aaccgattttacctcagagttaacacgatttttatacttaaaaatgtaaactcggtaatctcggagagttaacactcgatttgcggaacattaattacga 40013504  T
Q  304 cata--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  40013505 cataccctctatcataatattctcaatacaa 40013535  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 18 - 332
Target Start/End: Original strand, 4239977 - 4240296
Alignment:
Q  18 atacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnnnnnnn--tat 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||           |||    
T  4239977 atacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattatacatatttaaaattatgccagcacttacaaatcttttttaaaaaaaatat 4240076  T
Q  116 tgtgtcagccattacaaatcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgatttta 214  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||    
T  4240077 tgtgtcagccattataaatcggtcgagtttacacgagtttaccgagtgttaactttgtcaaactcgttaaaccttccgattttaccagaaacggagttta 4240176  T
Q  215 cctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacata--ctcta 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||    
T  4240177 cctcagagttaacacgatttttgcacctaaaaacgtaaactcggtaatctcagagagttaacactcaatttgcggaacattgattacgacatactctcta 4240276  T
Q  313 tcataatattctcaatacaa 332  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  4240277 tcataatattctcaatacaa 4240296  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Original strand, 1151795 - 1152006
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||       
T  1151795 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatataaaattatgccagcacttacaaatctttcaaa 1151894  T
Q  108 nnnnntattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaact 207  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  1151895 aaaaatattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccagaaacc 1151994  T
Q  208 gattttacctca 219  Q
    ||||| ||||||    
T  1151995 gatttcacctca 1152006  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 148 - 332
Target Start/End: Original strand, 1460790 - 1460976
Alignment:
Q  148 cgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaa 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  1460790 cgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaagccttccgattttaccagaaaccgagtttacctctgagttaacacaatttttgtacctaaaaa 1460889  T
Q  248 tgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacata--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
     ||||||||| |||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  1460890 cgtaaactcggtaatctcaaagagttaacactcgatttgcggaacattgattacgacatactctctatcataatattctcattacaa 1460976  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 147 - 296
Target Start/End: Original strand, 5651178 - 5651327
Alignment:
Q  147 acgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaa 246  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||| ||| ||||  || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||     
T  5651178 acgagtttactgagtgttaactcggtcaaactcgtcaaacttttcaatttcaccagaaatcgagtttacctccgagttaacacgattttggtacctaaac 5651277  T
Q  247 atgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattg 296  Q
    | ||||| ||||||| |||| ||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  5651278 acgtaaaatcgataaactcgaagtgttaacactcgatttgcggaacattg 5651327  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 82
Target Start/End: Original strand, 1459682 - 1459756
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaatta 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  1459682 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttatttccacaaaactcaaatgtacatatttaaaatta 1459756  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 296
Target Start/End: Original strand, 7125156 - 7125305
Alignment:
Q  147 acgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaa 246  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||  || |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||     
T  7125156 acgagtttactgagtgttaactcggtcaaactcgtcaaactttccgattttaccagaaatcgagtttacctccgagttaacacgtttttagcacctaaac 7125255  T
Q  247 atgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattg 296  Q
    | ||||||||| ||| ||||  || || | || ||||||| |||||||||    
T  7125256 acgtaaactcggtaaactcgccgagttgacacgcgatttgtggaacattg 7125305  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 296
Target Start/End: Original strand, 28623158 - 28623307
Alignment:
Q  147 acgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaa 246  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||| ||||  || |||| ||| ||||||||||| |||| | |||||||     
T  28623158 acgagtttactgagtgttaactcggtcaaactcgtcaaactttgcaattttaccagaaatcgagtttatctccgagttaacacgtttttagcacctaaac 28623257  T
Q  247 atgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattg 296  Q
    | ||||||||||||| ||||  || || | || ||||||| |||||||||    
T  28623258 acgtaaactcgataaactcgctgagttgacacgcgatttgtggaacattg 28623307  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 162 - 296
Target Start/End: Original strand, 16548850 - 16548985
Alignment:
Q  162 gttaactc-agtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgata 260  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||| || | |||||||| |||| ||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  16548850 gttaactcgagtcaaattcgtcaaacatttcgattttaccagaaattgagtttacctccgagttgacacgattttggtacctaaaaacgtaaactcgata 16548949  T
Q  261 atctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattg 296  Q
    | |||   || |||| |||||||||  |||||||||    
T  16548950 aactcaatgagttaacactcgatttatggaacattg 16548985  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 147 - 235
Target Start/End: Original strand, 37798111 - 37798199
Alignment:
Q  147 acgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || | |||||||| |||| ||| |||||||  ||||||||||| ||||    
T  37798111 acgagtttaccgagtgttaactcggtcaaactcgtcaaacttttcgattttaccagaaattgagtttacctttgagttaacacgttttt 37798199  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 147 - 285
Target Start/End: Original strand, 29716782 - 29716920
Alignment:
Q  147 acgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaa 246  Q
    ||||||||||| |||||| || |  || ||||||| ||||||||  |||||||| ||||   | |||||||  ||||||||||||||||  |||||||||    
T  29716782 acgagtttaccaagtgttcacccgatccaactcgtcaaaccttctgattttaccagaaatcaagtttaccttcgagttaacacgattttgatacctaaaa 29716881  T
Q  247 atgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgattt 285  Q
    | ||||||||  ||| || ||||| |||| |||||||||    
T  29716882 acgtaaactccgtaaacttggagagttaacactcgattt 29716920  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 235
Target Start/End: Original strand, 21238763 - 21238838
Alignment:
Q  160 gtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttt 235  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||  |||| || |||||||| ||||||||||| ||||    
T  21238763 gtgttaactcggtcaaactcgtcaaactttccgattttaccaaaaaccgagtttacctccgagttaacacgttttt 21238838  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 29758828 - 29758702
Alignment:
Q  134 tcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactc-agtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacga 231  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||| |||| |||| ||| ||||   | | |||||| ||||||||||||    
T  29758828 tcggtcgagtttacacaagtttaccgagt--taactcgagtcaaactcgtcaaacattccgattt-accagaaatcaaatctacctccgagttaacacga 29758732  T
Q  232 tttttgtacctaaaaatgtaaactcgataa 261  Q
    ||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  29758731 ttttgatacctaaaaacgtaaactcgataa 29758702  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 257
Target Start/End: Original strand, 2675078 - 2675175
Alignment:
Q  160 gtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcg 257  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| || | |||| |||  |||  || |||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| |||||||||    
T  2675078 gtgttaactcggtcaaactcgtcaaacttttcgatttcaccaaaaatcgagtttacctccgagttaacacgtttttgccacctaaaaacgtaaactcg 2675175  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 21489931 - 21489862
Alignment:
Q  226 acacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacatt 295  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || |||| || | | | |||| |||||||||| ||||||||    
T  21489931 acacgattttggtacctaaaaatgtaaaatcaataaacttgaaaagttaacactcgatttgtggaacatt 21489862  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 34218543 - 34218430
Alignment:
Q  183 aaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcga 282  Q
    ||||||||  |||||| | ||||| || |||||||  || ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| | ||| ||| |||  |||| |||| |    
T  34218543 aaaccttctgattttagcagaaaccgaatttaccttcgaattaacacgattttggtatctaaaaacgtaaacttggtaaactcagagtgttaacactcaa 34218444  T
Q  283 tttgcggaacattg 296  Q
    ||||||||| ||||    
T  34218443 tttgcggaatattg 34218430  T

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Target: chr3 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 42)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 36673656 - 36673982
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||       
T  36673656 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtaaatatttaaaattatgccaccacttacaaatctttcaaa 36673755  T
Q  108 nnnnntattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaact 207  Q
          |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  36673756 aaaaaaattgtgtcagtcattacaaatcggtcgggttacacgagtttatcgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccagaaacc 36673855  T
Q  208 gattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacata 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  36673856 gattttacctcagagttaacacgatttttgtacttaaaaatgtcaactcgataatctcggagatttaacactcgatttgcagaacattgattacgacata 36673955  T
Q  308 --ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||    
T  36673956 ctctctatcataatattctcaatacaa 36673982  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 31645760 - 31646091
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       
T  31645760 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgccagcacttacaaatctttcaaa 31645859  T
Q  108 nnnnn-----tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccgg 202  Q
              ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  31645860 aaaaaaaaaatattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactctttaaaccttccaattttaccag 31645959  T
Q  203 aaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattaca 302  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||     
T  31645960 aaaccgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaacgtaagctcggtaatctcggagagttaacactcgatttgcgaaacattgattacg 31646059  T
Q  303 acata--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    |||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  31646060 acatactctctatcataatattctcagtacaa 31646091  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 37455545 - 37455217
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||       
T  37455545 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttatttccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttataaatctttcaaa 37455446  T
Q  108 nnnnntat--tgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaa 205  Q
         |||  ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37455445 aaaaatatattgtgtcaaccattacaaataggtcgagttacacgagtttagtgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccagaaa 37455346  T
Q  206 ctgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaaca 305  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37455345 ccgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaacgtaagctcggtaatctcggagagttaacactcgatttgcggaacattgattacgaca 37455246  T
Q  306 ta--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  37455245 tactctctatcataatattctcaatacaa 37455217  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 40897827 - 40897501
Alignment:
Q  9 ttattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnnn 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||         
T  40897827 ttattctcaatacacattttttattttttaaaaatgttatttccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgccagcacttacaaatctttaaaaa 40897728  T
Q  109 nnnn-tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaact 207  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||     
T  40897727 aaaaatattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttatcagaaacc 40897628  T
Q  208 gattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacata 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  40897627 gattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaatcgtaaattcggtaatctcggagagttaacactcgatctgcggaacattgattacgacata 40897528  T
Q  308 --ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||    
T  40897527 ctctctatcataatattctcaatacaa 40897501  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 23752890 - 23753219
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||        
T  23752890 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgtaattgccacaaaattcaattgtacatatttaaaattaagccagcacttacaaatctttaaaa 23752989  T
Q  108 nnnnn---tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaa 204  Q
            |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  23752990 aaaaaaaatattgtatcagccattacaaatcggtcgagttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactggttaaaccttccaattttaccaaaa 23753089  T
Q  205 actgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaac 304  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||    
T  23753090 accgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcggtaatctcggagagttaacactcgatttgcgaaacattgattacgac 23753189  T
Q  305 ata--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  23753190 atactctctatcataatattctcaatacaa 23753219  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 50761602 - 50761930
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       
T  50761602 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattctattgtacatatttaaaattatgccagcacttacaaatctttcaaa 50761701  T
Q  108 nnnnn--tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaa 205  Q
           |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  50761702 aaaaaaatattgtgtcagccattacaaattggtcgagttacacgagtttacctagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaatttcaccagaaa 50761801  T
Q  206 ctgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaaca 305  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  50761802 tctattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaacgtaaactcggtaatctcggagagttaacactcgatttgctgaacattgattacgaca 50761901  T
Q  306 ta--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  50761902 tactctctatcataacattctcaatacaa 50761930  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 48379848 - 48379520
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||        
T  48379848 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaactcaattgtacatatttaaaattacgtcagcacttacaaatcttttaaa 48379749  T
Q  108 nnnnn-tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaa 205  Q
          ||| ||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  48379748 aaaaaatatcgtggcagccattacaaatcggtcaagtttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaagccttccgattttaccagaaa 48379649  T
Q  206 ctgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaaca 305  Q
      || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  48379648 tcgagtttacctcagaattaacacgatttttgtacctaaaaacgtaaactcggtaatctcggagagttaacactcgatttgcggaacattgattacgaca 48379549  T
Q  306 tac--tctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  48379548 tactttctatcataatattctcaatacaa 48379520  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 52811057 - 52810728
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||        
T  52811057 attattctcaatacatattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgccggcacttacaaatcttttaaa 52810958  T
Q  108 nnnnn--tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaa 204  Q
           ||||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  52810957 aaaaaaatattgtgtcagtcattacaaatcggtcgagtttacacaagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccgattttaccagaa 52810858  T
Q  205 actgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaac 304  Q
     | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  52810857 cccgagtttacctcagagttaacacaatttttgtacctaaaaacgtaaactcggtaatctcggagagttaacactcgatttgcggaacattgattacgac 52810758  T
Q  305 ata--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    |||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  52810757 atactctctatcataatattctcaaaacaa 52810728  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 22 - 332
Target Start/End: Original strand, 51737206 - 51737517
Alignment:
Q  22 acattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnnnnnnn-tattgtgt 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||    
T  51737206 acattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgccagcacttacaaatctttcaaaaaaaaatattgtgt 51737305  T
Q  121 cagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcag 220  Q
    || ||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| || ||||||||||    
T  51737306 caaccactacaaatcggtcgagttt-ac-agtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccgattttactagaaaccgagtttacctcag 51737403  T
Q  221 agttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacata--ctctatcataa 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||    
T  51737404 agttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcagagagttaacactcgatttgcggaacattgattacgacatactctctataataa 51737503  T
Q  319 tattctcaatacaa 332  Q
    ||||||||||||||    
T  51737504 tattctcaatacaa 51737517  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 8 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 20833595 - 20833310
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||       
T  20833595 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgccagtacttacaaatgtttcaaa 20833496  T
Q  108 nnnnn-tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaa 205  Q
          |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  20833495 aaaaaatattgtgtcagccactacaaatcggtcgagtttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccgattttaccagaaa 20833396  T
Q  206 ctgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaa 291  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  20833395 ctgagtttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaacgtaaactcgataatctcagagagttaacactcgatttgcggaa 20833310  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 50902816 - 50903139
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       
T  50902816 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgtt-ttccaacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgccagcacttacaaatctttcaaa 50902914  T
Q  108 nnnnntattgtgtcagccattacaaatcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaac 206  Q
          ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50902915 aaa---attgtgttagccattacaaatcggtcgagtttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccagaaac 50903011  T
Q  207 tgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacat 306  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||  |||    
T  50903012 cgagtttacctcagagttaacacgatttttgtacataaaaacgtaaactcgatattctcggagagttaacactcgacttgcgaaacattgattacggcat 50903111  T
Q  307 a--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    |  |||||| |||| |||||||||||||    
T  50903112 actctctataataacattctcaatacaa 50903139  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 44905357 - 44905685
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       
T  44905357 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcttacaaaactcaattgtacatatttaaaattatgccagcacttacaaatctttcaaa 44905456  T
Q  108 nnnnn-tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaa 205  Q
          ||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||    
T  44905457 ataaaatattgtggcagacattacaaatcggtcgagtttatacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaattcgttaagccttctgattttaccagaaa 44905556  T
Q  206 ctgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaaca 305  Q
    | ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44905557 ccgagattacctcagaattaacacgatttttgtacctaagaacgtaaactcggtaatctcggagagttaacactcgatttgcggaacattgattacgaca 44905656  T
Q  306 ta--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  44905657 tactctctatcataatattctcaatacaa 44905685  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 18750331 - 18750013
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||       
T  18750331 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattacgccagcacttagaaatctttcaaa 18750232  T
Q  108 nnnnn-tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaac 206  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  18750231 aaaaagtattgtgtcagccattacaaatcggtcgagtt---------taccgagtgttaactcagtcaaactcgttaagccttccaattttaccagaaac 18750141  T
Q  207 tgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacat 306  Q
     || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18750140 cgagtttacctcagagttaacatgatttttgtacctaaaaacgtaaactcagtaatatcagagagttaacactcgatttgcggaacattgattacgacat 18750041  T
Q  307 a--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||    
T  18750040 attctctatcataatattctcaatacaa 18750013  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 52617483 - 52617802
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       
T  52617483 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgccagcacttacaaatctttcaaa 52617582  T
Q  108 nnnnnta-ttgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttac-cgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaa 205  Q
          | ||||||||||||||||||||||||||||||         ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  52617583 aaaaaaaattgtgtcagccattacaaatcggtcgagtt---------tacacgagtgttaacttagtcaaactcgttaaaccttccgattttaccagaaa 52617673  T
Q  206 ctgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaaca 305  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |    
T  52617674 ccgagtttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaacgtaaattcgataatctcagagagttaacactcgatttgcggaacattgattacgata 52617773  T
Q  306 tactc--tatcataatattctcaatacaa 332  Q
    |||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  52617774 tactctgtataataatattctcaatacaa 52617802  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 8 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 54629550 - 54629225
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        
T  54629550 attattctcaatatacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgccagcacttacaaatctttttaa 54629451  T
Q  108 nnnnn--tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaa 204  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |  ||||| | |||    
T  54629450 aaaaaaatattgtgtcagccattacaaatcggtcgagtttacacgagtttactgagtgttaactgaatcaaactcgttaaacctttcgcttttatcagaa 54629351  T
Q  205 actgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaac 304  Q
    |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||    
T  54629350 atcgagtttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaacgtaaactcggtaatctcagagagttaacactcaatttgcggaacattgattacgac 54629251  T
Q  305 atac--tctatcataatattctcaat 328  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||    
T  54629250 atactttctatcataatattctcaat 54629225  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 8 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 39038778 - 39038463
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       
T  39038778 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgccagcacttacaaatctttcaaa 39038679  T
Q  108 nnnnn-tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaac 206  Q
          ||||| ||||| ||||||||||||||||||||         ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  39038678 aaaaaatattgcgtcagtcattacaaatcggtcgagtt---------taccgagtgttaacttagtcaaactcgttaaaccttccgattttaccagaaac 39038588  T
Q  207 tgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacat 306  Q
     || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  39038587 cgagtttacctcagagttaacaccatttttgtacctaaaaacgtaaattcgataatctcagagagttaacactcgatttgtggaacattgattacgacat 39038488  T
Q  307 actc--tatcataatattctcaata 329  Q
    ||||  ||| |||||||||||||||    
T  39038487 actctgtataataatattctcaata 39038463  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 17946912 - 17946598
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||       
T  17946912 attattctcaatatacattttttatttgttaaaaatgtcatttccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgccatcacttacaaatctttcaaa 17946813  T
Q  108 nnnnn-tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaac 206  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  17946812 aaaaaatattgtgtcagccattacaaatcggtcgagtt---------taccgagtgttaactca----aactcgttaaaccttccgattttaccagaaac 17946726  T
Q  207 tgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacat 306  Q
     || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  17946725 cgagtttacctcagagttaacatgatttttgtacctaaaaacgtaaactcgataatctcggagaattaacactcgatttgcggaacatcgattacgacat 17946626  T
Q  307 a--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||    
T  17946625 actctctatcataatattctcaatacaa 17946598  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Original strand, 34483601 - 34483823
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  34483601 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcaaa 34483700  T
Q  108 nnnnn-tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaac 206  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  34483701 aaaaaatattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttcaaattttaccagaaac 34483800  T
Q  207 tgattttacctcagagttaacac 229  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  34483801 cgattttacctcagagttaacac 34483823  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 113 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 26107921 - 26107699
Alignment:
Q  113 tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgatt 211  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||  || |    
T  26107921 tattgtgtgagccattacaaattggtcgagtttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccgattgtaccagaaatcgagt 26107822  T
Q  212 ttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacata--ct 309  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  26107821 ttacctcagagttaacatgatttttgtacctaaaaacgtaaactcgttaatctcggagagttatcactcgatttgcggaacattgattacgacatactct 26107722  T
Q  310 ctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  26107721 ctataataatattctcaatacaa 26107699  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 10660885 - 10660789
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  10660885 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgccagcacttacaactctttc 10660789  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 104
Target Start/End: Original strand, 39841950 - 39842046
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39841950 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcccttacaaatctttc 39842046  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 198
Target Start/End: Original strand, 45254932 - 45255116
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatcttt---c 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||        
T  45254932 attattctcaatacacattttttatttattaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaagcttatgccagcacttacaaatctttaaaa 45255031  T
Q  105 nnnnnnnntattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaatttta 198  Q
            ||||||||||||||||||||||||||         |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  45255032 aaaaaaaatattgtgtcagccattacaaatcggt---------cgagtttaacgagtgttaactcaatcaaactcgttaaaccttcaaatttta 45255116  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 217 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 45863310 - 45863193
Alignment:
Q  217 tcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacata--ctctatc 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  45863310 tcagagttaacacgatttttgtacctaaaaacgtaaactctttaatctcagagagttaacactcgatttgcggaacattgattacgacatactctctatc 45863211  T
Q  315 ataatattctcaatacaa 332  Q
    ||||||||||||||||||    
T  45863210 ataatattctcaatacaa 45863193  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 148 - 297
Target Start/End: Original strand, 21386476 - 21386625
Alignment:
Q  148 cgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaa 247  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| || | |||||||| ||||  || ||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||    
T  21386476 cgagtttaccgagtgtcaactcggtcaaactcgtcaaacttttcgattttaccagaaatcgagtttacctctaagttaacacgattttgatacctaaaaa 21386575  T
Q  248 tgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattga 297  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  21386576 tgtaaactcggtaaactcggagagttaacactcgatttggggaacattga 21386625  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 134 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16155288 - 16155168
Alignment:
Q  134 tcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgat 232  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |  |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  16155288 tcggtcgagtttacacgagtttactgagtgttaactcggtcaaactcgtcaaaccttccaattttatcaaaaaccgagtttacctcagagttaacacgat 16155189  T
Q  233 ttttgtacctaaaaatgtaaa 253  Q
    ||| ||||||||||| |||||    
T  16155188 tttggtacctaaaaacgtaaa 16155168  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 134 - 295
Target Start/End: Original strand, 7437548 - 7437710
Alignment:
Q  134 tcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgat 232  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||   | ||||||| ||||||||  |||| || |||| ||| | |||||||||||    
T  7437548 tcggtcgagtttacacgagtttaccgagtgttaactcggtcaaactcaccataccttccgattttaccaaaaaccgagtttatctccgtgttaacacgat 7437647  T
Q  233 ttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacatt 295  Q
    ||| ||||||||| | ||||||||  ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  7437648 tttggtacctaaacaagtaaactcagtaaactcggagagttaacactcgatttgcggaacatt 7437710  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 149 - 296
Target Start/End: Original strand, 4962724 - 4962871
Alignment:
Q  149 gagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaat 248  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||  ||||  || ||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||     
T  4962724 gagtttaccgagtgttaactcggtcaaactcgtcaaacctttcgattttacttgaaatcgagtttacctccaagttaacacgattttgatacctaaaaac 4962823  T
Q  249 gtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattg 296  Q
    ||||||||||||| ||  |||| ||||  ||| |||||||||||||||    
T  4962824 gtaaactcgataaacttagagagttaacgctcaatttgcggaacattg 4962871  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 26108001 - 26107929
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaat 80  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  26108001 attattctcaatatacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttcaaat 26107929  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 33693380 - 33693226
Alignment:
Q  134 tcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgat 232  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||  || ||||||||  ||||||||||||    
T  33693380 tcggtcgagtttacacgagtttaccgagtgttaactcggtcaaactcgtcaaaccttctgattttaccagaaatcgagtttacctccaagttaacacgat 33693281  T
Q  233 ttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgc 287  Q
    ||| |||  |||||   |||||||| ||| |||||||| |||| | |||||||||    
T  33693280 tttggtatgtaaaatcataaactcggtaaactcggagagttaacattcgatttgc 33693226  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 8598769 - 8598620
Alignment:
Q  147 acgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaa 246  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||  || |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||     
T  8598769 acgagtttactgagtgttaactcggtcaaactcgtcaaactttccgattttaccagaaatcgagtttacctccgagttaacacgtttttagcacctaaac 8598670  T
Q  247 atgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattg 296  Q
    | ||||||||| ||| ||||  || || | || ||||||| |||||||||    
T  8598669 acgtaaactcggtaaactcgccgagttgacacgcgatttgtggaacattg 8598620  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 134 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 7665714 - 7665549
Alignment:
Q  134 tcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactc-agtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacga 231  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||  |||| ||||||||  |||  || |||||||| ||||||||||||    
T  7665714 tcggtcgagtttacacgagtttaccgagt--taactctagtcaaactcgtcaaatattccgattttaccaaaaatcgagtttacctccgagttaacacga 7665617  T
Q  232 tttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgatt 299  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||| | |||  |||| || |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  7665616 ttttggtagctaaaaacgtaaactaggtaaattcggcgagttaacactcgatttgtggaacattgatt 7665549  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 49296226 - 49296074
Alignment:
Q  147 acgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaa 246  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| || | |||||||| ||||  || |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||     
T  49296226 acgagtttactgagtgttaactcggtcaaactcgtcaaacttttcgattttaccagaaatcgagtttacctccgagttaacacgtttttagcacctaaac 49296127  T
Q  247 atgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgatt 299  Q
    | ||||||||| ||| ||||  || || | || ||||||| ||||||||||||    
T  49296126 acgtaaactcggtaaactcgccgagttgacacgcgatttgtggaacattgatt 49296074  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 147 - 257
Target Start/End: Original strand, 22489475 - 22489585
Alignment:
Q  147 acgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaa 246  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  || ||||| || || |||||||| |||| | |||||||     
T  22489475 acgagtttactgagtgttaactcggtcaaactcgttaaaccttccgattttaccagaaatcgagtttacatctgatttaacacgtttttggcacctaaac 22489574  T
Q  247 atgtaaactcg 257  Q
    | |||||||||    
T  22489575 acgtaaactcg 22489585  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 134 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 49458482 - 49458357
Alignment:
Q  134 tcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgat 232  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |  ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||  || ||||| ||||||||||||| ||    
T  49458482 tcggtcgagtttacacgagtttactgagtgttaatttggtcaaactcgtcaaaccttccgattttaccagaaatcgagtttacttcagagttaacacaat 49458383  T
Q  233 ttttgtacctaaaaatgtaaactcga 258  Q
    |||  |||||||| | ||||||||||    
T  49458382 tttgatacctaaacacgtaaactcga 49458357  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 268 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 32580577 - 32580511
Alignment:
Q  268 agatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacata--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  32580577 agatttaacactcgatttgcggaacattgattacaatatactctctatcataatattctcaatacaa 32580511  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 147 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 53836072 - 53835923
Alignment:
Q  147 acgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaa 246  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||   | ||||||||  |||||||||| |||| | |||||||     
T  53836072 acgagtttactgagtgttaactcggtcaaactcgtcaaactttccgattttaccagaaatcaagtttacctccaagttaacacgtttttagcacctaaac 53835973  T
Q  247 atgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattg 296  Q
    | ||||||||| ||| ||||  || || | || ||||||| |||||||||    
T  53835972 acgtaaactcggtaaactcgccgaattgacacgcgatttgtggaacattg 53835923  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 148 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 42736416 - 42736268
Alignment:
Q  148 cgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaa 247  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||| ||   |||||||| |||||| | |||| ||||  |||||||||||||| ||| |||||||    
T  42736416 cgagtttaccgaatgttaactcgatcaaactcgtcaaactttttgattttaccagaaactaagtttatctcaatgttaacacgattttggtatctaaaaa 42736317  T
Q  248 tgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattg 296  Q
     | ||||||||||| ||||   | |||| ||| ||||| ||||||||||    
T  42736316 cgcaaactcgataaactcgacaaattaacacttgatttacggaacattg 42736268  T

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Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 43173010 - 43172889
Alignment:
Q  174 aaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagattt 273  Q
    |||||| | ||||||| | |||||||| ||||  || |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||   ||| ||    
T  43173010 aaactcttcaaacctttcgattttaccagaaatcgagtttacctccgagtcaacacgattttggtacctaaacacataaactcgataaacttaaagagtt 43172911  T
Q  274 aaaactcgatttgcggaacatt 295  Q
    || | |||||||||||||||||    
T  43172910 aacattcgatttgcggaacatt 43172889  T

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Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 162 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 25049967 - 25049871
Alignment:
Q  162 gttaactc-agtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcg 257  Q
    |||||||| |||||||||| | |||| |||| |||||||  ||||  || |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  25049967 gttaactcgagtcaaactcatcaaacattccgattttactagaaatcgagtttacctccgagttgacacgattttggtacctaaaaacgtaaactcg 25049871  T

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Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 297
Target Start/End: Original strand, 45602422 - 45602558
Alignment:
Q  162 gttaactc-agtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgata 260  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || | |||||||| |||| ||| |||||||  ||||| |||| |||||  |||| ||||| ||||| ||| ||    
T  45602422 gttaactcgagtcaaactcgtcaaacatttcgattttaccagaaattgagtttacctacgagttgacacaattttaatacccaaaaacgtaaattcggta 45602521  T
Q  261 atctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattga 297  Q
    | ||||| || |||| |||||||| | | ||||||||    
T  45602522 aactcggcgagttaacactcgattcgtgaaacattga 45602558  T

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Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 257
Target Start/End: Original strand, 9818568 - 9818665
Alignment:
Q  160 gtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcg 257  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||| |||  |||  || |||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| |||||||||    
T  9818568 gtgttcactcggtcaaactcgtcaaactttccgatttcaccaaaaatcgagtttacctccgagttaacacgtttttgccacctaaaaacgtaaactcg 9818665  T

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Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 11432244 - 11432215
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgtt 37  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11432244 attattctcaatacacattttttatttgtt 11432215  T

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Target: scaffold0543 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0543
Description:

Target: scaffold0543; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 11223 - 10896
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       
T  11223 attattctcaatacacactttttatttgttaaaaatgttattgccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgccagcacttacaaatctttcaaa 11124  T
Q  108 nnnnn-tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaac 206  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  11123 aaaatatattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttacacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccaaaaat 11024  T
Q  207 tgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacat 306  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11023 cgaatttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcggtaatctcggagagttaacactcgatttgcggaacattgattacgacat 10924  T
Q  307 a--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    |  ||||||||||||||||| |||||||    
T  10923 actctctatcataatattcttaatacaa 10896  T

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Target: scaffold0042 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 57566 - 57894
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  57566 attattctcaatacacattatttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcaaa 57665  T
Q  108 nnnnn-tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaa 205  Q
          |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||  ||||    
T  57666 aaaatatattgtgtcagctattacaaatcggtcgagtttacacgagtttaccgagtgttaactcaatcaaactcattaaaccttctgattttactagaaa 57765  T
Q  206 ctgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaaca 305  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| | |    
T  57766 ccgagtttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaacgtaaactcggtaatctcggagagttaacactcgatttgcggaacattggttacgaaa 57865  T
Q  306 ta--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  57866 tactctctatcataatattctcaatacaa 57894  T

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Target: scaffold1504 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold1504
Description:

Target: scaffold1504; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 1578 - 1238
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||       
T  1578 attattcttaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccaaaaaattcaattgtacatatttaatattatgccagcacttacaaatctttcaaa 1479  T
Q  108 nnnnn-tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttac-------------cgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaa 193  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1478 aaaaaatattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttacacaagtttaattggaaggtttaacgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaa 1379  T
Q  194 ttttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaaca 293  Q
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T  1378 ttttacaagaaaccgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaacgtaaactcggtaatctcggagagttaacactcgatttgtggaaca 1279  T
Q  294 ttgattacaacatac--tctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1278 ttgattacgacatactttctatcataatattctcaatacaa 1238  T

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Target: scaffold0110 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0110
Description:

Target: scaffold0110; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 39139 - 39465
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       
T  39139 attattctcaatacacatattttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgccagcacttacaaatctttcaaa 39238  T
Q  108 nnnnntattgtgtcagccattacaaatcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaac 206  Q
          || |||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||    
T  39239 aaaaa-atagtgttagcccttacaaatcggtcgagtttacacgagtttatcaagtgctaactcagtcaaactcgtcaaacctttcgattttaccagaaac 39337  T
Q  207 tgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacat 306  Q
     || || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||| |||    
T  39338 cgagttgacctcagggttaacacgattttggtacctaaaaacgtaaactcggtaatctcggagagttaacactcgatttgcgaaaaattgattacatcat 39437  T
Q  307 a--ctctatcataatattctcaatacaa 332  Q
    |  ||||||||||||| |||||||||||    
T  39438 actctctatcataatactctcaatacaa 39465  T

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Target: scaffold0347 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15364 - 15128
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       
T  15364 attattctcaatacacattttttatatgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatgccagcacttacaaatctttcaaa 15265  T
Q  108 nnnnn-tattgtgtcagccattacaaatcggtcgagttagacgagtttaccgagtgttaa----ctcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccgg 202  Q
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  15264 aaaaaatattgtgtcagtcattacaaatcggtcgagttacacgagtttactgagtgttaattaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccat 15165  T
Q  203 aaactgattttacctcagagttaacacgatttttgta 239  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15164 aaaccgattttacctcagagttaacacgatttttgta 15128  T

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Target: scaffold0383 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Original strand, 16535 - 16754
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     || ||||||||||||||||       
T  16535 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaat-----caacacttacaaatctttcaaa 16629  T
Q  108 nnnnntat--tgtgtcagccattacaaatcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaa 204  Q
         |||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||    
T  16630 aaaaatatattgtgtcagccattacaaatcggttgagtttacccgagtttaccaagtgttaactcagtcaaactcgttaaacctttcgattttaccagaa 16729  T
Q  205 actgattttacctcagagttaacac 229  Q
    || || |||||||||||||||||||    
T  16730 accgagtttacctcagagttaacac 16754  T

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Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Original strand, 16748 - 16810
Alignment:
Q  272 ttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacatactct--atcataatattctcaatacaa 332  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  16748 ttaacactcgatttacgaaacattgattacgtcatactctctatcataatattctcaatacaa 16810  T

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Target: scaffold0152 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0152
Description:

Target: scaffold0152; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Original strand, 20771 - 20990
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     || ||||||||||||||||       
T  20771 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaat-----caacacttacaaatctttcaaa 20865  T
Q  108 nnnnntat--tgtgtcagccattacaaatcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaa 204  Q
         |||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||    
T  20866 aaaaatatattgtgtcagccattacaaatcggttgagtttacccgagtttaccaagtgttaactcagtcaaactcgttaaacctttcgattttaccagaa 20965  T
Q  205 actgattttacctcagagttaacac 229  Q
    || || |||||||||||||||||||    
T  20966 accgagtttacctcagagttaacac 20990  T

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Target: scaffold0152; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 29030 - 28811
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatgtcagcacttacaaatctttcnnn 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     || ||||||||||||||||       
T  29030 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaat-----caacacttacaaatctttcaaa 28936  T
Q  108 nnnnntat--tgtgtcagccattacaaatcggtcgagtt-agacgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaa 204  Q
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T  28935 aaaaatatattgtgtcagccattacaaatcggttgagtttacccgagtttaccaagtgttaactcagtcaaactcgttaaacctttcgattttaccagaa 28836  T
Q  205 actgattttacctcagagttaacac 229  Q
    || || |||||||||||||||||||    
T  28835 accgagtttacctcagagttaacac 28811  T

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Target: scaffold0152; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 28817 - 28755
Alignment:
Q  272 ttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacatactct--atcataatattctcaatacaa 332  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  28817 ttaacactcgatttacgaaacattgattacgtcatactctctatcataatattctcaatacaa 28755  T

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Target: scaffold0940 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0940
Description:

Target: scaffold0940; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 84
Target Start/End: Original strand, 3970 - 4046
Alignment:
Q  8 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccataaaattcaattgtacatatttaaaattatg 84  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3970 attattctcaatacacattttttatttgttaaaaatgttattcccacaaaattcaattgtacatatttaaaattatg 4046  T

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Target: scaffold1128 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1128
Description:

Target: scaffold1128; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 147 - 296
Target Start/End: Original strand, 895 - 1044
Alignment:
Q  147 acgagtttaccgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaa 246  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||||| | |||| |||| |||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||     
T  895 acgagtttactaagtgttaactcggtcaaactcatcaaactttccgattttaccagaaaccgagtttacctccgagttaacacgattttggtacctaaac 994  T
Q  247 atgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattg 296  Q
    | ||||||||| ||| ||| |||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  995 acgtaaactcggtaaactcagagtgttaacactcgatttgcggaacattg 1044  T

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Target: scaffold0013 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 149 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 89389 - 89241
Alignment:
Q  149 gagtttac-cgagtgttaactcagtcaaactcgttaaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaa 247  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||  || |||||||   |||||||||||| || |||||||||||    
T  89389 gagtttacacgagtgttaactcgatcaaactcgtcaaaccttccaattttaccagaaatcgagtttaccttcaagttaacacgatattggtacctaaaaa 89290  T
Q  248 tgtaaactcgataatctcggagatttaaaactcgatttgcggaacattg 296  Q
      |||||||||||| |||  ||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  89289 cttaaactcgataaactcacagagttaacactcgatttacggaacattg 89241  T

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Target: scaffold0573 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0573
Description:

Target: scaffold0573; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 8930 - 8856
Alignment:
Q  183 aaaccttccaattttaccggaaactgattttacctcagagttaacacgatttttgtacctaaaaatgtaaactcg 257  Q
    ||||||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  8930 aaaccttccgattttaccagaaatcgagtttacctcagagttaacacgattttggtacctaaacatgtaaactcg 8856  T

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Target: scaffold0306 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 14341 - 14279
Alignment:
Q  272 ttaaaactcgatttgcggaacattgattacaacatactct--atcataatattctcaatacaa 332  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  14341 ttaacactcgatttacgaaacattgattacgtcatactctctatcataatattctcaatacaa 14279  T

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