View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6276_low_10 (Length: 370)

Name: NF6276_low_10
Description: NF6276
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6276_low_10
NF6276_low_10
[»] chr1 (37 HSPs)
chr1 (11-352)||(50342822-50343163)
chr1 (11-352)||(47503186-47503530)
chr1 (12-352)||(21141757-21142100)
chr1 (11-352)||(52803035-52803375)
chr1 (33-352)||(23274974-23275272)
chr1 (41-348)||(45825808-45826114)
chr1 (41-348)||(47656777-47657084)
chr1 (41-313)||(38126375-38126646)
chr1 (11-353)||(96766-97093)
chr1 (150-352)||(51321748-51321953)
chr1 (151-344)||(22525245-22525438)
chr1 (151-352)||(19157061-19157262)
chr1 (151-344)||(31782568-31782755)
chr1 (151-346)||(13638837-13639032)
chr1 (150-348)||(49856797-49856998)
chr1 (153-352)||(19524032-19524219)
chr1 (150-346)||(3731197-3731393)
chr1 (154-309)||(2366158-2366313)
chr1 (151-346)||(26876704-26876899)
chr1 (150-312)||(35257754-35257919)
chr1 (151-309)||(30891026-30891184)
chr1 (213-346)||(2424075-2424206)
chr1 (17-90)||(19525133-19525206)
chr1 (17-90)||(19525794-19525867)
chr1 (17-90)||(19526268-19526341)
chr1 (11-95)||(2424296-2424380)
chr1 (17-90)||(19524285-19524358)
chr1 (35-87)||(31782822-31782874)
chr1 (35-90)||(22525144-22525199)
chr1 (33-95)||(51321628-51321690)
chr1 (11-68)||(19156918-19156975)
chr1 (35-84)||(30890940-30890989)
chr1 (35-71)||(13639115-13639151)
chr1 (151-190)||(2424216-2424255)
chr1 (33-86)||(49857065-49857118)
chr1 (40-84)||(3731462-3731506)
chr1 (40-84)||(26876590-26876634)
[»] chr4 (41 HSPs)
chr4 (11-352)||(50194357-50194698)
chr4 (59-352)||(50022445-50022738)
chr4 (43-352)||(51684135-51684444)
chr4 (11-352)||(50902369-50902698)
chr4 (33-348)||(30704924-30705239)
chr4 (153-352)||(50275762-50275961)
chr4 (151-352)||(44678885-44679086)
chr4 (33-348)||(46437122-46437430)
chr4 (151-346)||(21021722-21021917)
chr4 (151-309)||(37020949-37021106)
chr4 (151-352)||(41797805-41798006)
chr4 (128-344)||(55406254-55406470)
chr4 (151-307)||(30725664-30725820)
chr4 (151-346)||(1307987-1308182)
chr4 (151-346)||(6180606-6180801)
chr4 (151-346)||(31422750-31422945)
chr4 (151-346)||(49091482-49091677)
chr4 (151-309)||(49166077-49166235)
chr4 (155-346)||(40357114-40357305)
chr4 (33-177)||(10752448-10752589)
chr4 (33-177)||(10966217-10966358)
chr4 (36-275)||(41932560-41932802)
chr4 (212-348)||(14316428-14316564)
chr4 (11-133)||(55406837-55406959)
chr4 (35-90)||(50275641-50275696)
chr4 (11-84)||(21021987-21022060)
chr4 (212-348)||(10752319-10752455)
chr4 (212-348)||(10966088-10966224)
chr4 (33-207)||(11083002-11083161)
chr4 (35-87)||(3184919-3184971)
chr4 (35-87)||(37021173-37021225)
chr4 (11-87)||(44679153-44679229)
chr4 (153-204)||(21537463-21537514)
chr4 (149-191)||(11049559-11049601)
chr4 (35-84)||(40357379-40357428)
chr4 (35-71)||(30725903-30725939)
chr4 (271-348)||(70352-70429)
chr4 (39-84)||(1088822-1088867)
chr4 (35-84)||(1308252-1308301)
chr4 (40-84)||(6180871-6180915)
chr4 (40-84)||(49165981-49166025)
[»] chr3 (53 HSPs)
chr3 (11-352)||(41613235-41613576)
chr3 (11-352)||(20351506-20351847)
chr3 (11-352)||(17566926-17567267)
chr3 (33-344)||(49195304-49195615)
chr3 (18-352)||(44230610-44230944)
chr3 (33-348)||(42757075-42757389)
chr3 (11-344)||(20916855-20917188)
chr3 (11-344)||(20925817-20926150)
chr3 (33-348)||(48563854-48564169)
chr3 (151-352)||(47073034-47073235)
chr3 (11-200)||(49268251-49268440)
chr3 (153-352)||(50215766-50215963)
chr3 (151-352)||(52390216-52390417)
chr3 (151-347)||(597927-598123)
chr3 (151-309)||(16612109-16612267)
chr3 (151-309)||(22046986-22047144)
chr3 (151-352)||(4007176-4007378)
chr3 (151-352)||(3976751-3976952)
chr3 (151-352)||(36128642-36128842)
chr3 (155-352)||(50997045-50997242)
chr3 (150-348)||(30254831-30255032)
chr3 (150-313)||(48889740-48889906)
chr3 (151-346)||(2273757-2273952)
chr3 (151-346)||(29009921-29010116)
chr3 (151-346)||(34046437-34046632)
chr3 (151-346)||(42903006-42903201)
chr3 (151-346)||(54387185-54387380)
chr3 (151-309)||(50479660-50479818)
chr3 (153-309)||(46390014-46390170)
chr3 (151-346)||(46700842-46701037)
chr3 (151-346)||(49143279-49143474)
chr3 (228-352)||(49268124-49268247)
chr3 (105-211)||(8731753-8731855)
chr3 (105-211)||(9083640-9083742)
chr3 (11-87)||(2274019-2274095)
chr3 (12-95)||(597803-597886)
chr3 (269-352)||(50757313-50757396)
chr3 (17-87)||(36128505-36128575)
chr3 (18-87)||(50963866-50963935)
chr3 (11-87)||(47073302-47073378)
chr3 (35-95)||(50216024-50216084)
chr3 (11-87)||(3976608-3976684)
chr3 (35-87)||(16612008-16612060)
chr3 (35-87)||(22047193-22047245)
chr3 (35-87)||(52390484-52390536)
chr3 (35-84)||(29009802-29009851)
chr3 (35-71)||(42166089-42166125)
chr3 (40-84)||(34046323-34046367)
chr3 (40-84)||(42903271-42903315)
chr3 (40-84)||(46389898-46389942)
chr3 (40-84)||(46701107-46701151)
chr3 (40-84)||(49143544-49143588)
chr3 (40-84)||(50479888-50479932)
[»] chr2 (26 HSPs)
chr2 (33-352)||(36655221-36655540)
chr2 (35-344)||(39948526-39948835)
chr2 (151-352)||(29400394-29400595)
chr2 (151-309)||(10827891-10828049)
chr2 (155-309)||(7187817-7187971)
chr2 (151-352)||(17421573-17421774)
chr2 (151-346)||(15832179-15832374)
chr2 (151-346)||(20931620-20931815)
chr2 (151-346)||(45429635-45429830)
chr2 (151-346)||(30495763-30495958)
chr2 (151-346)||(43538554-43538749)
chr2 (151-346)||(43979581-43979776)
chr2 (151-346)||(3939556-3939751)
chr2 (151-346)||(5353016-5353211)
chr2 (151-343)||(28469685-28469877)
chr2 (11-102)||(45136386-45136477)
chr2 (11-87)||(45429492-45429568)
chr2 (11-84)||(29400696-29400769)
chr2 (17-87)||(10828098-10828168)
chr2 (11-84)||(28469542-28469615)
chr2 (38-84)||(15832063-15832109)
chr2 (41-86)||(25514980-25515025)
chr2 (40-84)||(3939821-3939865)
chr2 (40-84)||(5352902-5352946)
chr2 (40-84)||(30496028-30496072)
chr2 (40-84)||(43979467-43979511)
[»] chr5 (23 HSPs)
chr5 (11-352)||(5197841-5198182)
chr5 (41-348)||(40623755-40624068)
chr5 (151-352)||(7758350-7758551)
chr5 (109-352)||(8701063-8701306)
chr5 (150-353)||(42941329-42941516)
chr5 (154-348)||(38969128-38969322)
chr5 (150-344)||(19227779-19227976)
chr5 (151-346)||(8579339-8579534)
chr5 (151-346)||(27672486-27672680)
chr5 (33-168)||(42538072-42538207)
chr5 (151-352)||(19039927-19040128)
chr5 (151-352)||(30706147-30706348)
chr5 (11-307)||(13687-13968)
chr5 (151-346)||(28240656-28240851)
chr5 (151-346)||(28877685-28877880)
chr5 (11-87)||(7758207-7758283)
chr5 (11-84)||(27672750-27672823)
chr5 (38-84)||(28877571-28877617)
chr5 (33-86)||(19228043-19228096)
chr5 (170-234)||(27972253-27972317)
chr5 (35-84)||(8579604-8579653)
chr5 (38-71)||(28240934-28240967)
chr5 (41-86)||(38969030-38969075)
[»] chr7 (33 HSPs)
chr7 (11-352)||(16677930-16678270)
chr7 (11-352)||(17652166-17652506)
chr7 (18-352)||(47777159-47777491)
chr7 (11-352)||(27452446-27452790)
chr7 (11-352)||(39461359-39461701)
chr7 (11-313)||(19798174-19798484)
chr7 (11-352)||(5540411-5540746)
chr7 (33-276)||(37341228-37341471)
chr7 (134-352)||(11635784-11636002)
chr7 (153-352)||(34739410-34739612)
chr7 (153-352)||(17836123-17836322)
chr7 (150-348)||(9493633-9493834)
chr7 (151-352)||(46739341-46739542)
chr7 (150-352)||(36978622-36978827)
chr7 (150-348)||(47671950-47672151)
chr7 (131-260)||(11635575-11635704)
chr7 (151-346)||(15073101-15073296)
chr7 (151-309)||(42506947-42507105)
chr7 (151-346)||(17462121-17462316)
chr7 (151-346)||(17590898-17591093)
chr7 (151-352)||(9370200-9370401)
chr7 (151-346)||(35609242-35609437)
chr7 (151-346)||(41881552-41881747)
chr7 (151-346)||(48404419-48404614)
chr7 (35-87)||(10517820-10517872)
chr7 (35-95)||(34739289-34739349)
chr7 (268-352)||(11633895-11633979)
chr7 (35-87)||(46739608-46739660)
chr7 (35-84)||(15073366-15073415)
chr7 (33-90)||(9493897-9493954)
chr7 (35-84)||(42507175-42507224)
chr7 (40-84)||(41881438-41881482)
chr7 (40-84)||(48404305-48404349)
[»] chr8 (40 HSPs)
chr8 (33-352)||(43188971-43189290)
chr8 (33-352)||(5303070-5303389)
chr8 (33-352)||(39845825-39846147)
chr8 (33-348)||(35552566-35552881)
chr8 (33-348)||(34821850-34822165)
chr8 (151-352)||(41248953-41249154)
chr8 (152-352)||(39938046-39938246)
chr8 (41-255)||(40076184-40076398)
chr8 (151-352)||(43212550-43212751)
chr8 (151-352)||(39602632-39602833)
chr8 (151-352)||(34369380-34369581)
chr8 (151-352)||(34370708-34370909)
chr8 (41-348)||(37327754-37328056)
chr8 (151-308)||(39253044-39253201)
chr8 (153-352)||(15035555-15035754)
chr8 (152-309)||(45065237-45065394)
chr8 (11-146)||(20858164-20858299)
chr8 (151-346)||(42484416-42484611)
chr8 (151-346)||(1053586-1053781)
chr8 (105-348)||(2985103-2985339)
chr8 (151-346)||(23021137-23021332)
chr8 (151-346)||(26660508-26660703)
chr8 (151-309)||(24391-24549)
chr8 (151-346)||(488535-488730)
chr8 (36-177)||(45128643-45128785)
chr8 (17-177)||(5677944-5678098)
chr8 (280-352)||(25859932-25860004)
chr8 (11-87)||(39938314-39938390)
chr8 (11-87)||(43212407-43212483)
chr8 (11-87)||(34369633-34369709)
chr8 (11-87)||(34370961-34371037)
chr8 (35-87)||(39252925-39252977)
chr8 (11-87)||(39602489-39602565)
chr8 (11-84)||(15035826-15035899)
chr8 (17-90)||(41249200-41249273)
chr8 (37-84)||(42484681-42484728)
chr8 (40-84)||(488800-488844)
chr8 (40-84)||(1053472-1053516)
chr8 (40-84)||(23021402-23021446)
chr8 (40-84)||(26660394-26660438)
[»] scaffold0238 (1 HSPs)
scaffold0238 (41-345)||(17793-18097)
[»] chr6 (12 HSPs)
chr6 (33-348)||(6319398-6319713)
chr6 (33-276)||(24722793-24723036)
chr6 (151-352)||(27617777-27617978)
chr6 (153-348)||(24087581-24087779)
chr6 (151-346)||(6202210-6202405)
chr6 (151-346)||(11689177-11689372)
chr6 (151-346)||(22302242-22302437)
chr6 (151-346)||(30828468-30828663)
chr6 (40-84)||(6202096-6202140)
chr6 (40-84)||(11689063-11689107)
chr6 (40-84)||(22302128-22302172)
chr6 (40-84)||(30828733-30828777)
[»] scaffold0180 (2 HSPs)
scaffold0180 (151-192)||(14609-14650)
scaffold0180 (11-87)||(14717-14793)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (33-95)||(11185-11247)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 37)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 11 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 50343163 - 50342822
Alignment:
Q  11 cagagacaccggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggcta 110  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  50343163 cagagccaccggagggagcggcaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttctcaggcta 50343064  T
Q  111 cacagcctgaagaatcgcaggtggttgatctgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatga 210  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50343063 cacagcctgaagagtcgcaggtggttgatccgagccagcagatggagtacctgaattatcaggaccaggtacaccacgatgttacggatggtgggtatga 50342964  T
Q  211 ccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctgga 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50342963 ccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgatgataacattgcagcagctgctgccccagaggtgttatctgtggaccctccctttcctgga 50342864  T
Q  311 ggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgccaatcat 352  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50342863 ggatcggacgacctatctttgctgcactcttatgccaatcat 50342822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 11 - 352
Target Start/End: Original strand, 47503186 - 47503530
Alignment:
Q  11 cagagacaccggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggcta 110  Q
    ||||| |||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||     
T  47503186 cagagccaccggagggagagacaaagcggccacatctcaaagaggggtagaggtcggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttctcaggctc 47503285  T
Q  111 cacagcctgaagaatcgcaggtggttgatctgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatga 210  Q
     ||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47503286 aacagcatgaagagtcgcaggtggttgacccgagccagcaggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatga 47503385  T
Q  211 ccaggatcatatacca---gagcagcagcatgtaggagatgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcct 307  Q
    ||||||||||||||||    | ||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  47503386 ccaggatcatataccacatcaacagcatcatatagcagatgatgatgacattgcagcagctgctgccccagaggtgttacctgtggaccctccctttcct 47503485  T
Q  308 ggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgccaatcat 352  Q
    |||||| | |   ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47503486 ggaggaccggcatacctatctttgctgcactcttttgccaatcat 47503530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 12 - 352
Target Start/End: Original strand, 21141757 - 21142100
Alignment:
Q  12 agagacaccggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggctac 111  Q
    |||| |||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||    
T  21141757 agagccaccggagggagaggcaaagtggccacatcccaaagaggggtagaggtctgagggtggatggttcagggagttcacaggaggcttctcatgctac 21141856  T
Q  112 acagcctgaagaatcgcaggtggttgatctgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgac 211  Q
    ||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21141857 acaacctgaagagtcgcaggtggttaatccgagccatcaggtggagtacctgaattatcaggatcgggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgac 21141956  T
Q  212 caggatcatataccagagcagcagc---atgtaggagatgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctg 308  Q
    ||||||||||||||| | |||||||   || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  21141957 caggatcatataccacaacagcagcaaaatatagcagatgatgatgacattgcagcagctgctgccccggaggtgttacctgtggaccctccctttcctg 21142056  T
Q  309 gaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgccaatcat 352  Q
    ||||| | |  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  21142057 gaggaccggcagacctatctttgttgcactcttattccaatcat 21142100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 11 - 352
Target Start/End: Original strand, 52803035 - 52803375
Alignment:
Q  11 cagagacaccggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggcta 110  Q
    ||||| |||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||    
T  52803035 cagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggg-tagaggtcggaggggagatggttcagggagttcgcatgaggcttctcaagcta 52803133  T
Q  111 cacagcctgaagaatcgcaggtggttgatctgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatga 210  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  52803134 cacagcctgaagagtcgcatgtggttgacccgagccagcaggaggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtggatatga 52803233  T
Q  211 ccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctgga 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  52803234 ccaggatcatataccacagcagcagcatgtggtagatgatgatgacattgcagcaacagctgcccccgaggtgttacctgtggaccctcccttttctgga 52803333  T
Q  311 ggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgccaatcat 352  Q
    ||| |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52803334 ggaccagcagacttatctttgccgcactcttatgccaatcat 52803375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 33 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 23275272 - 23274974
Alignment:
Q  33 aaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggctacacagcctgaagaatcgcaggt 132  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||       
T  23275272 aaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggatggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttctcaggctacacagcctgaagagtcgca--- 23275176  T
Q  133 ggttgatctgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcag 232  Q
                      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23275175 ------------------ggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgttacggatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcag 23275094  T
Q  233 cagcatgtaggagatgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgc 332  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  23275093 cagcatatagcagacgatgatgacattgcagcagctactgccccggaggtgttacctgtgaaccctccctttcttggaggatcggaagacctatctttgc 23274994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 41 - 348
Target Start/End: Original strand, 45825808 - 45826114
Alignment:
Q  41 cacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggctacacagcctgaagaatcgcaggtggttgatc 140  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||    
T  45825808 cacatcccaaagaggggaagaggtcggaggttggatggttcagggacttcgcaggaggtttctcaggctacacaaccttaagagtcgcatgtggttgatc 45825907  T
Q  141 tgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgt 240  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |    
T  45825908 cgagccaggaggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgttacggatggt-gatatgaccaggatcatataccaaagcagcaacatat 45826006  T
Q  241 aggagatgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactct 340  Q
    |  ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |  ||||||  | |||| |||||||||||||||||| | || ||  ||||| |||||||||||    
T  45826007 aatagatgatgatgacattgcagcagcggctgtcccagcagtgttacctttggagcctccctttcctggaggaccggaagatatatctctgctgcactct 45826106  T
Q  341 tatgccaa 348  Q
    ||||||||    
T  45826107 tatgccaa 45826114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 41 - 348
Target Start/End: Original strand, 47656777 - 47657084
Alignment:
Q  41 cacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggctacacagcctgaagaatcgcaggtggttgatc 140  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47656777 cacatcccaaagaggggaagaggtcggaggtgggatgattcagggacttcgcaggaggcttctcagactacacagcctgaagagtcgcaggtggttgatc 47656876  T
Q  141 tgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgt 240  Q
     ||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |    
T  47656877 cgagccaagaggtggagtacttgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtgggtatgaccatgatcatataccagagcaacaacatat 47656976  T
Q  241 aggagatgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactct 340  Q
    || ||| ||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||  | |||| |||| ||||||||||||| |  | ||  ||||| |||||||||||    
T  47656977 agcagacgatgatgacattgcagcagcggctgccccagaagtgttacctttggagcctctctttcctggaggaccgaaagatatatctctgctgcactct 47657076  T
Q  341 tatgccaa 348  Q
    ||||||||    
T  47657077 tatgccaa 47657084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 41 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 38126646 - 38126375
Alignment:
Q  41 cacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggctacacagcctgaagaatcgcaggtggttgatc 140  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||   |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38126646 cacatcccaaagaggggaagaggtcggaggg-ggatggttcagggacttcgtaggaggattttcatactacacagcctgaagagtcgcaggtggttgatc 38126548  T
Q  141 tgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgt 240  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  38126547 cgagccaggaggtggagtacctgaattattaggatcaggtacacaacgatgtgactgatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcaacatat 38126448  T
Q  241 aggagatgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggagga 313  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |  ||||||  | |||| |||| |||| ||||||||    
T  38126447 agtagatgatgatgacattgcagcagcggctgccccagtagtgttacctttggagcctctcttttctggagga 38126375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 97093 - 96766
Alignment:
Q  11 cagagacaccggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggcta 110  Q
    ||||| |||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||| || ||||            |||    
T  97093 cagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggtgagatggttcagggagctctcagg------------cta 97006  T
Q  111 cacagcctgaagaatcgcaggtggttgatctgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatga 210  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||| |||   | |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  97005 cacagcctgaggagtcacaggttgttgacctgt--ctgg-ggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtgggtatga 96909  T
Q  211 ccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctgga 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||     
T  96908 ccaggatcatataccacagcagcagcatgtaggagacgatgatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctgtggaccctcccttttctggt 96809  T
Q  311 ggatcagac-gacctatctttgctgcactcttatgccaatcatt 353  Q
    ||| | ||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  96808 gga-ccgacagacttatctttgctccactcttatgccagtcatt 96766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 150 - 352
Target Start/End: Original strand, 51321748 - 51321953
Alignment:
Q  150 aggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagca---tgtaggaga 246  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |  |||    
T  51321748 aggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcaacatgaaccaga 51321847  T
Q  247 tgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgcc 346  Q
     ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| | ||  |  ||||| |||||||||||||||||    
T  51321848 cgatgatgacattgcagcagcggatgccccggaggtgttacctgtggaccctccctttcctggcggaccggaaaatatatctctgctgcactcttatgcc 51321947  T
Q  347 aatcat 352  Q
    ||||||    
T  51321948 aatcat 51321953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 151 - 344
Target Start/End: Original strand, 22525245 - 22525438
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||     
T  22525245 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacaccacgatgggactgatggtgggtatgaccaggatcatataccacagcagcagcatgtaggagacgag 22525344  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatg 344  Q
    |||||||||| |||||||||||| || |||||||||  |||||||||||| |||||||| ||| | |  ||| |||||||||| ||||||||||    
T  22525345 gatgacattgcagcagctgctgcaccagaggtgttacctgtggaccctccatttcctggtggaccggtagacttatctttgctccactcttatg 22525438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 151 - 352
Target Start/End: Original strand, 19157061 - 19157262
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||     
T  19157061 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacagcatgatgtgactgatggtggatatgaccaggatcatataccacagcagcaggatgcaggagacgag 19157160  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgccaatc 350  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| | |  ||| | |||| ||| |||||||||||| |||    
T  19157161 gatgacactgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctgtggaccctccctttcctggtggaccggctgacttgtcttcgctccactcttatgccgatc 19157260  T
Q  351 at 352  Q
    ||    
T  19157261 at 19157262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 151 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 31782755 - 31782568
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||      | || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  31782755 ggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacacc------tgactgatggtggatatgaccaggatcatataccacagcagcagcatgtaggagacgat 31782662  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatg 344  Q
     |||||| || |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||| | |  ||| |||||||||| ||||||||||    
T  31782661 tatgacactgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctgtggaccctcccttttctggtggaccggcagacttatctttgctccactcttatg 31782568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 151 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 13639032 - 13638837
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||     
T  13639032 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacaacatgatgtgacggatgatggatatgaccaggatcatataccacagcagcaggatgcaggagacgag 13638933  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgcc 346  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||| | |  ||| | || ||||| ||||||||||||    
T  13638932 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctacggaccctccctttcctggtggaccggctgacttgtccttgctccactcttatgcc 13638837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 150 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 49856998 - 49856797
Alignment:
Q  150 aggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagca---tgtaggaga 246  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| || | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||   || |  |||    
T  49856998 aggtggagtaccagaattatcaggatcaagtacaccacgatgtgactggtggtaggtatgaccaagatcatataccagagcagcaacaacatgaaccaga 49856899  T
Q  247 tgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgcc 346  Q
     ||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||  |  ||||| |||||||||||||||||    
T  49856898 cgatgatgacattgcagcagcggctgctccggagctgttacctgtggaccctccctttcctggaggaccggaaaatatatctctgctgcactcttatgcc 49856799  T
Q  347 aa 348  Q
    ||    
T  49856798 aa 49856797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 153 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 19524219 - 19524032
Alignment:
Q  153 tggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgatga 252  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  19524219 tggagtacctaaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtgggtatgaccaagatcatataccacaatagcagcatgtaggagatgatga 19524120  T
Q  253 tgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgccaatcat 352  Q
    ||||||            |||||||  ||||||   ||||||||||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19524119 tgacat------------tgccccgacggtgtttcatgtggaccctccctttcctggaggaccggcagacttatctttgctgcactcttatgtcaatcat 19524032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 150 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 3731393 - 3731197
Alignment:
Q  150 aggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatga 249  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||| |||||| ||    
T  3731393 aggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacga 3731294  T
Q  250 tgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgcc 346  Q
     |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||| | |  ||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  3731293 ggatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctacggaccctccctttcctggtggaccggctgacttatccttgctccactcttatgcc 3731197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 154 - 309
Target Start/End: Original strand, 2366158 - 2366313
Alignment:
Q  154 ggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgatgat 253  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| || |||    
T  2366158 ggagtacctgaactatcaagatcaggtacaacatgatgtgacggatggtggatatgaccaggatcatataccacagcagcaggatgcaggagacgaggat 2366257  T
Q  254 gacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctgg 309  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||| ||||||||    
T  2366258 gacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacccgtggaccctccatttcctgg 2366313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 151 - 346
Target Start/End: Original strand, 26876704 - 26876899
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||| |||||| ||     
T  26876704 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggatggtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacgag 26876803  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgcc 346  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||| | |  ||| | || ||||| ||||||||||||    
T  26876804 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctacggaccctccctttcctggtggaccggctgacttgtccttgctccactcttatgcc 26876899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 150 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 35257919 - 35257754
Alignment:
Q  150 aggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccag---agcagcagcatgtaggaga 246  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||| ||   |||||||||||| |  |||    
T  35257919 aggtggagtacctgaattatcaggctcaggtacaccacgatgtgactgatggtgagtatgaccgggatcatatactagcgtagcagcagcatgaaccaga 35257820  T
Q  247 tgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggagg 312  Q
     ||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  35257819 cgatgatgacattgcagcagcggctaccccagaggtgttacctgtggaccctctctttcctggagg 35257754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 151 - 309
Target Start/End: Original strand, 30891026 - 30891184
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||| ||| |||||| ||     
T  30891026 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacagcatgatgtgacggatggtggatatgaccatgatcatataccacatcagcaggatgcaggagacgag 30891125  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctgg 309  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  30891126 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctacggaccctccctttcctgg 30891184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 213 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 2424206 - 2424075
Alignment:
Q  213 aggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggagg 312  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||| | || | |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||| |    
T  2424206 aggatcatataccaca--agcagcatgtaggaaacgacggtgacattgcagcagctgctgccccggatgtgttacttgaggaccctccctttgctgga-g 2424110  T
Q  313 atcagac-gacctatctttgctgcactcttatgcc 346  Q
    | | ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  2424109 aaccgacagacttatctttgctgcactcttatgcc 2424075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 19525206 - 19525133
Alignment:
Q  17 caccggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttc 90  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  19525206 caccggagagagaggcagagcggccacatcccaaagaagggtagaggtcggaggggagatggttcagggagttc 19525133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 19525867 - 19525794
Alignment:
Q  17 caccggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttc 90  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  19525867 caccggagagagaggcagagcggccacatcccaaagaagggtagaggtcggaggggagatggttcagggagttc 19525794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 19526341 - 19526268
Alignment:
Q  17 caccggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttc 90  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  19526341 caccggagagagaggcagagcggccacatcccaaagaagggtagaggtcggaggggagatggttcagggagttc 19526268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 2424380 - 2424296
Alignment:
Q  11 cagagacaccggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcagg 95  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||| ||||    
T  2424380 cagagccaccggagggagaggtagagcgcccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatgattcagggagttctcagg 2424296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 19524358 - 19524285
Alignment:
Q  17 caccggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttc 90  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  19524358 caccggagagagaggcagagcggccacatcccaaagaaggggagaggtcggaggggagatggttcagggagttc 19524285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 31782874 - 31782822
Alignment:
Q  35 agcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggag 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  31782874 agcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggaagggagatggttcagggag 31782822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 90
Target Start/End: Original strand, 22525144 - 22525199
Alignment:
Q  35 agcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttc 90  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  22525144 agcgtccacatcccaaagaggggtagaggtcggaagggagatggttcagggagttc 22525199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 95
Target Start/End: Original strand, 51321628 - 51321690
Alignment:
Q  33 aaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcagg 95  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| ||| ||||    
T  51321628 aaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggaggggagatggttcagggacttctcagg 51321690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 68
Target Start/End: Original strand, 19156918 - 19156975
Alignment:
Q  11 cagagacaccggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccgga 68  Q
    ||||| |||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19156918 cagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcgga 19156975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 84
Target Start/End: Original strand, 30890940 - 30890989
Alignment:
Q  35 agcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagg 84  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  30890940 agcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcagg 30890989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 13639151 - 13639115
Alignment:
Q  35 agcggccacatcccaaagaggggtagaggccggaggg 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13639151 agcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggg 13639115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 2424255 - 2424216
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgat 190  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  2424255 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacaccacgat 2424216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 49857118 - 49857065
Alignment:
Q  33 aaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcaggga 86  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||    
T  49857118 aaagcgggcacatcctaaagaggggaagaggtcggaggggagatggttcaggga 49857065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 3731506 - 3731462
Alignment:
Q  40 ccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagg 84  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  3731506 ccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcagg 3731462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 84
Target Start/End: Original strand, 26876590 - 26876634
Alignment:
Q  40 ccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagg 84  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  26876590 ccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcagg 26876634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 41)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 11 - 352
Target Start/End: Original strand, 50194357 - 50194698
Alignment:
Q  11 cagagacaccggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggcta 110  Q
    ||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  50194357 cagagccaccggagggagaggcaaagcggccacatcccaaagaggggaagaggtcggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttctcaggcta 50194456  T
Q  111 cacagcctgaagaatcgcaggtggttgatctgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatga 210  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  50194457 cacagcctgaagagtcgcaggtggttgatccgagccagcaggtggagtacctgaattatcaggatcaagtacactacgatgttacggatggtgggtatga 50194556  T
Q  211 ccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctgga 310  Q
    | | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  50194557 ctaagatcatataccagagcagcaacatgtaggagatgatgatgacattgcagcagctgctgccccggaggtgttacctgtggaccctccctttcctgga 50194656  T
Q  311 ggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgccaatcat 352  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50194657 ggaccgaacgacctatctttgctgcactcttatgccaatcat 50194698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 59 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 50022738 - 50022445
Alignment:
Q  59 agaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggctacacagcctgaagaatcgcaggtggttgatctgagccagcaggtggagt 158  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50022738 agaggtcggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttctcaagctacacagcccgaagagtcgcaggtggttgatccgagccagcaggtggagt 50022639  T
Q  159 acctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgatgatgacat 258  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  50022638 acctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgttatggatggtgagtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatatagcagatgatgatgaaat 50022539  T
Q  259 tgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgccaatcat 352  Q
    || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50022538 tgcagcagctgctgccccggaggtgttacctgtggaccctccttttcctagaggaccggacgacctatctttgctgcactcttatgccaatcat 50022445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 43 - 352
Target Start/End: Original strand, 51684135 - 51684444
Alignment:
Q  43 catcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggctacacagcctgaagaatcgcaggtggttgatctg 142  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |    
T  51684135 catcccaaagaggggaagaggtcagagggtggatggttcagggagttcgtaggaggcttctcaggctacacagcctaaagagtcgcaggtggttgatccg 51684234  T
Q  143 agccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtag 242  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  51684235 agccagcaggtggagtacctaaattatcaggatcaggtacaccacgatgttacggatggtgagtatgaccaggatcatataccagagcagcaacatataa 51684334  T
Q  243 gagatgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactctta 342  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  51684335 tagatgatgatgacattgcagcagctgctgctccggaggtgttacctgtggaccctccctttcctggaggaccggaagacctatctttgctgcactctta 51684434  T
Q  343 tgccaatcat 352  Q
    | ||||||||    
T  51684435 taccaatcat 51684444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 352
Target Start/End: Original strand, 50902369 - 50902698
Alignment:
Q  11 cagagacaccggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggcta 110  Q
    ||||| |||| ||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||            ||    
T  50902369 cagagccaccagagggagaggcaaagcagccacatcccaaagaggggaagaggtcggagggtggatggttcagggacttctcagga------------ta 50902456  T
Q  111 cacagcctgaagaatcgcaggtggttgatctgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatga 210  Q
    ||||||||||||| || || || ||||| | |  |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50902457 cacagcctgaagagtcacaagttgttgacccgtcccactaggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatga 50902556  T
Q  211 ccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctgga 310  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  50902557 ccaggatcatataccacaacagcagcatataggagatgatgatgacattgcagcagctgctgccccggaggtgttacctgtggaccctccctttcctgga 50902656  T
Q  311 ggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgccaatcat 352  Q
    ||| | |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50902657 ggaccggcagacctatctttgctgcactcttatgtcaatcat 50902698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 33 - 348
Target Start/End: Original strand, 30704924 - 30705239
Alignment:
Q  33 aaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggctacacagcctgaagaatcgcaggt 132  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| |  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  30704924 aaagcgggcacatcccaaagaggggaagacgtgggaggggggatggttcagggacttcgcaggaggcttatcaggctacacagcctgaaaagtcgcaggt 30705023  T
Q  133 ggttgatctgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcag 232  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30705024 ggttgatccgagccaggaggtggagtacctgaattattaggatcaggtacaccacaatgggactgatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcag 30705123  T
Q  233 cagcatgtaggagatgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgc 332  Q
    || ||| ||| |||||||||||| |||| |||||| | |||||| |  ||||||  | |||| |||||||||||||||||||| || ||  ||||| ||     
T  30705124 caacatatagcagatgatgatgatattgcagcagcggttgccccagcagtgttacctttggagcctccctttcctggaggatcggaagatatatctctgt 30705223  T
Q  333 tgcactcttatgccaa 348  Q
    ||||||||||||||||    
T  30705224 tgcactcttatgccaa 30705239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 153 - 352
Target Start/End: Original strand, 50275762 - 50275961
Alignment:
Q  153 tggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgatga 252  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50275762 tggagtgcctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtaggtatgaccaggatcatataccacagcagcagcatgtaggagatgatga 50275861  T
Q  253 tgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgccaatcat 352  Q
     ||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| | |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50275862 agacattgcagcaactgctgccccggaggtgttacctgtggaccctccctttcctgcaggaccggcagacttatctttgctgcactcttatgccaatcat 50275961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 151 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 44679086 - 44678885
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||    
T  44679086 ggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtgggtatgaccaggatcatataccacagtagcagcatgtaggagacgat 44678987  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgccaatc 350  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| | |  ||| |||||||||| ||||||||||||| ||    
T  44678986 gatgacattgcagcagctgctgctccggaggtgttacctgtggaccctccctttcctggtggaccggtagacttatctttgctccactcttatgccagtc 44678887  T
Q  351 at 352  Q
    ||    
T  44678886 at 44678885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 33 - 348
Target Start/End: Original strand, 46437122 - 46437430
Alignment:
Q  33 aaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggctacacagcctgaagaatcgcaggt 132  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||            ||||  |||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  46437122 aaagcgggcacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggggatgattcaggga------------cttcttaggctacatagcctgaagagtcgcaagt 46437209  T
Q  133 ggttgatctgag--ccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagc 230  Q
    |||| | | |||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46437210 ggttaacccgagacccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgaagtgactgatggtgggtatgaccaggatcatataccagagc 46437309  T
Q  231 agcagca---tgtaggagatgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatc 327  Q
    |||| ||   || |  |||||||||||||||||||||||  |||||||| |  ||||||  |||||| |||||||||||||||||| | ||  |  ||||    
T  46437310 agcatcaacatgaaccagatgatgatgacattgtagcagtggctgccccagcagtgttacctgtggagcctccctttcctggaggaccggaaaatatatc 46437409  T
Q  328 tttgctgcactcttatgccaa 348  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  46437410 tctgctgcactcttatgccaa 46437430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 151 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 21021917 - 21021722
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  21021917 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgactgatggtggatatgaccaggatcatataccacagcagcaggatgtaggagacgat 21021818  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgcc 346  Q
    |||||||||| |||||||||||| || || ||||||  ||||||||||||||||||||| |||   |  ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  21021817 gatgacattgcagcagctgctgcaccagatgtgttacctgtggaccctccctttcctggtggactggcggacttatctttgctccactcttatgcc 21021722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 151 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 37021106 - 37020949
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| || || |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  37021106 ggtggagtacctgaattatcaagatcagatacaccacga-gtgactgatgatgggtatgaccaggataatataccacagcagcagcatgtaggagacgat 37021008  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctgg 309  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  37021007 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctgtggaccctctctttcctgg 37020949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 151 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 41798006 - 41797805
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||| ||     
T  41798006 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacattatgatgtgacggatggtggatatgaccaggatcatataccacagcagcaggatgcagtagacgag 41797907  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgccaatc 350  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |  ||||||||| |||||||| ||| | || ||||| || ||||| |||||||||||| |||    
T  41797906 gatgacattgtagcagctgctgcaccggaggtgttacctacggaccctccatttcctggtggaccggaggacctgtcattgctccactcttatgccgatc 41797807  T
Q  351 at 352  Q
    ||    
T  41797806 at 41797805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 128 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 55406470 - 55406254
Alignment:
Q  128 caggtggttgatctgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccag 227  Q
    ||||||||||||  ||||||  |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  55406470 caggtggttgattcgagccaagaggtagagtacctgaattattaggatcaggtacaccacgatgttactgacggtgagtatgaccacgatcatataccag 55406371  T
Q  228 agcagcagcatgtaggagatgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatc 327  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||  |||||| ||||||||    ||||||  | |||| |||||||||||||||||| | || ||  ||||    
T  55406370 agcagcatcatatagcagatgatgatgacgttacagcagcggctgccccaatagtgttacctttggagcctccctttcctggaggaccggaagatatatc 55406271  T
Q  328 tttgctgcactcttatg 344  Q
    | || ||||||||||||    
T  55406270 tctgatgcactcttatg 55406254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 151 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 30725820 - 30725664
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||     
T  30725820 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacagcatgatgtgacggatggtggatatgaccaggatcatataccacagcagcaggatgcaggagacgag 30725721  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcct 307  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |  ||||| ||||||||||    
T  30725720 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctacggaccatccctttcct 30725664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 151 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 1308182 - 1307987
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||| |||||| ||     
T  1308182 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacaacatgatgtgacggatggtggatatgaccaggatcatataccacataagcaggatgcaggagacgag 1308083  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgcc 346  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||| | |  ||| | || ||||| ||||||||||||    
T  1308082 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctacggaccctccctttcctggtggaccggctgacttgtccttgctccactcttatgcc 1307987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 151 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 6180801 - 6180606
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||| |||||| ||     
T  6180801 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacgag 6180702  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgcc 346  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||| | |  ||| | || ||||| ||||||||||||    
T  6180701 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctacggaccctccctttcctggtggaccggctgacttgtccttgctccactcttatgcc 6180606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 151 - 346
Target Start/End: Original strand, 31422750 - 31422945
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||| |||||| ||     
T  31422750 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacgag 31422849  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgcc 346  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |  ||||| |||||||||||| ||| | |  ||| | || ||||| ||||||||||||    
T  31422850 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctacggaccttccctttcctggtggaccggctgacttgtccttgctccactcttatgcc 31422945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 151 - 346
Target Start/End: Original strand, 49091482 - 49091677
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||| ||||||  |     
T  49091482 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacaag 49091581  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgcc 346  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||| | |  ||| | || ||||| ||||||||||||    
T  49091582 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctacggaccctccctttcctggtggaccggttgacttgtccttgctccactcttatgcc 49091677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 151 - 309
Target Start/End: Original strand, 49166077 - 49166235
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| |  ||||| ||| |||||| ||     
T  49166077 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggatggtggatatgaccatgatcatataccacatgagcaggatgcaggagacgag 49166176  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctgg 309  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||||    
T  49166177 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctacgaaccctccctttcctgg 49166235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 155 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 40357305 - 40357114
Alignment:
Q  155 gagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgatgatg 254  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||| ||||||  | ||||    
T  40357305 gagtacctgaactatcaggatcaggtacagtatgatgtgacggatggtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacaaggatg 40357206  T
Q  255 acattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgcc 346  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||| | |  ||| | || ||||| ||||||||||||    
T  40357205 acattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctacggaccctccctttcctggtggaccggctgacttgtccttgctccactcttatgcc 40357114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 33 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 10752589 - 10752448
Alignment:
Q  33 aaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggctacacagcctgaagaatcgcaggt 132  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||| ||| ||| |||    ||||  ||||||||||||||||| | || |||||    
T  10752589 aaagcgggcacatcccaaagaggggaagatgtcggaggggggatggttcaaggacttctcaga---cttcttaggctacacagcctgaacagtcacaggt 10752493  T
Q  133 ggttgatctgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatca 177  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10752492 ggttgacccgagccagtaggtggagtacctgaattatcaggatca 10752448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 33 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 10966358 - 10966217
Alignment:
Q  33 aaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggctacacagcctgaagaatcgcaggt 132  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||| ||| ||| |||    ||||  ||||||||||||||||| | || |||||    
T  10966358 aaagcgggcacatcccaaagaggggaagatgtcggaggggggatggttcaaggacttctcaga---cttcttaggctacacagcctgaacagtcacaggt 10966262  T
Q  133 ggttgatctgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatca 177  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10966261 ggttgacccgagccagtaggtggagtacctgaattatcaggatca 10966217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 36 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 41932802 - 41932560
Alignment:
Q  36 gcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaa---------ggctacacagcctgaagaatc 126  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||| | ||| |||||||||||  |         ||||||| ||| |||| ||||    
T  41932802 gcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggaggggggatgtttcaggtacttctcaggaggcttctcaagcttctccggctacatagcttgaataatc 41932703  T
Q  127 gcaggtggttgatctgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatatacca 226  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||      ||||| ||||| || ||||||||||| ||| |  |  |||| |||    
T  41932702 gcaggtggttgacccgagccaggaggtggactacctgaattatcaggat------caccatgatgtcactgatggtgggtaagacgaccagtatatgcca 41932609  T
Q  227 gagcagcagcatgtaggagatgatgatgacattgtagcagctgctgccc 275  Q
    |||||||||||| || |||| || ||||| |||| | |||| |||||||    
T  41932608 gagcagcagcatatacgagacgaggatgatattgcatcagcggctgccc 41932560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 348
Target Start/End: Original strand, 14316428 - 14316564
Alignment:
Q  212 caggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggag 311  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||| || |||||||||| |||||| | |||||| |||||||||  |||||| ||||| ||| ||||||    
T  14316428 caggatcatataccagagcagcaacatataccagacgaggatgacattgcagcagcggttgccccagaggtgttacctgtggagcctccattttctggag 14316527  T
Q  312 gatcagacgacctatctttgctgcactcttatgccaa 348  Q
    || | ||  |  ||||| |||||||||||||||||||    
T  14316528 gaccggaaaatatatctctgctgcactcttatgccaa 14316564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 55406959 - 55406837
Alignment:
Q  11 cagagacaccggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggcta 110  Q
    ||||| |||||||  ||| || ||| ||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||   | ||||    
T  55406959 cagagccaccggaaggagaggcaaatcgggcacatcccaaagatgggaagaggtcggagggtggatggttcagggacttcggaggaggcttatcatgcta 55406860  T
Q  111 cacagcctgaagaatcgcaggtg 133  Q
    |||| |||||||| || ||||||    
T  55406859 cacaacctgaagagtcacaggtg 55406837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 90
Target Start/End: Original strand, 50275641 - 50275696
Alignment:
Q  35 agcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttc 90  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  50275641 agcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagttc 50275696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 21022060 - 21021987
Alignment:
Q  11 cagagacaccggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagg 84  Q
    ||||| |||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  21022060 cagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagg 21021987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 10752455 - 10752319
Alignment:
Q  212 caggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggag 311  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||| || |||||||||| |||| |  |||||||    ||||||  | |||| ||||||||||||||||    
T  10752455 caggatcatataccagagcagtagcatatacaagacgaagatgacattgcagcaacgactgccccatcagtgttacctttggagcctccctttcctggag 10752356  T
Q  312 gatcagacgacctatctttgctgcactcttatgccaa 348  Q
    || | ||  |  |||||||||||||||||||||||||    
T  10752355 gaccggaaaatatatctttgctgcactcttatgccaa 10752319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 10966224 - 10966088
Alignment:
Q  212 caggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggag 311  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||| || |||||||||| |||| |  |||||||    ||||||  | |||| ||||||||||||||||    
T  10966224 caggatcatataccagagcagtagcatatacaagacgaagatgacattgcagcaacgactgccccatcagtgttacctttggagcctccctttcctggag 10966125  T
Q  312 gatcagacgacctatctttgctgcactcttatgccaa 348  Q
    || | ||  |  |||||||||||||||||||||||||    
T  10966124 gaccggaaaatatatctttgctgcactcttatgccaa 10966088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 11083161 - 11083002
Alignment:
Q  33 aaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggctacacagcctgaagaatcgcaggt 132  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||| ||| ||||            ||||||| ||||| || || |||||    
T  11083161 aaagcgggcacatcccaaagaggggcagaggtcagaggggggatggttcagggacttctcagg------------ctacacaacctgatgagtcacaggt 11083074  T
Q  133 ggttgatctgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggta 207  Q
    | |||| | || ||||   ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  11083073 gcttgacccgacccag---gtgtagtgcctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtgggta 11083002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Original strand, 3184919 - 3184971
Alignment:
Q  35 agcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggag 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||    
T  3184919 agcggccacatcccaaagaggggtagaggtcagaggggagatggttcagggag 3184971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 37021225 - 37021173
Alignment:
Q  35 agcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggag 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||    
T  37021225 agcggccacatcccaaagaggggtagaggtcagaggggagatggttcagggag 37021173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 44679229 - 44679153
Alignment:
Q  11 cagagacaccggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggag 87  Q
    ||||| |||||||| ||| || | || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  44679229 cagagccaccggagggagaggcagagtggccacatcccaaagaagggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 44679153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21537514 - 21537463
Alignment:
Q  153 tggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgg 204  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21537514 tggagtacctaaattatcaggatcaggtacaccacgatgtcactgatggtgg 21537463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 11049601 - 11049559
Alignment:
Q  149 caggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatg 191  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  11049601 caggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccatgatg 11049559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 40357428 - 40357379
Alignment:
Q  35 agcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagg 84  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  40357428 agcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggagggcagatggctcagg 40357379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 30725939 - 30725903
Alignment:
Q  35 agcggccacatcccaaagaggggtagaggccggaggg 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30725939 agcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggg 30725903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 348
Target Start/End: Original strand, 70352 - 70429
Alignment:
Q  271 tgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgccaa 348  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||| | |   | |||||| ||||| |||||||||||||    
T  70352 tgccccggaagtgttacctgtggaccctccctttcttggaggaccggtaaatctatctctgctgtactcttatgccaa 70429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 1088867 - 1088822
Alignment:
Q  39 gccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagg 84  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  1088867 gccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcagg 1088822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 1308301 - 1308252
Alignment:
Q  35 agcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagg 84  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||| |||||    
T  1308301 agcggccacatcccaaagaggggtagaagtcggaggggagatggctcagg 1308252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 6180915 - 6180871
Alignment:
Q  40 ccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagg 84  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  6180915 ccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcagg 6180871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 84
Target Start/End: Original strand, 49165981 - 49166025
Alignment:
Q  40 ccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagg 84  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  49165981 ccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcagg 49166025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 53)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 352
Target Start/End: Original strand, 41613235 - 41613576
Alignment:
Q  11 cagagacaccggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggcta 110  Q
    ||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  41613235 cagagccaccggagggagaggcaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggatggtggatagttcagggagttcgcaggaggcttctcaggcta 41613334  T
Q  111 cacagcctgaagaatcgcaggtggttgatctgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatga 210  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41613335 cacagcctgaagagtcgcaggtggttgatccgagccaacaggtagagtacctgaattatcaggatcatgtacaccacgatgttactgatggtgggtatga 41613434  T
Q  211 ccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctgga 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||    
T  41613435 ccaggatcatataccagagcagcaacatgtaggagatgatgatgacattgcagcagctgctgccccggaggtgatacctgtggaccctccctttcctaga 41613534  T
Q  311 ggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgccaatcat 352  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41613535 ggagcggacgacctatctttgctgcactcttatgccaatcat 41613576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 11 - 352
Target Start/End: Original strand, 20351506 - 20351847
Alignment:
Q  11 cagagacaccggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggcta 110  Q
    ||||| |||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  20351506 cagagccacctgagggagaggcaaagcggccacatcccaaagaggggaagaggtcggagggtggatggttcagggagttcgcaggaagcttctcaggcta 20351605  T
Q  111 cacagcctgaagaatcgcaggtggttgatctgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatga 210  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  20351606 cacagcctgaagagtcgcaggtggttgatccaagccagcaggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccatgatgttacggatggtgggtatga 20351705  T
Q  211 ccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctgga 310  Q
    | |||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  20351706 ctaggatcatataccaaagcagcaacatatagcagatgatgacgacactgcagcagctgctgccccggaggtgttacctgtggaccctccttttcctgga 20351805  T
Q  311 ggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgccaatcat 352  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20351806 ggaccggacgacctatctttgctgcactcttatgtcaatcat 20351847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 11 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 17567267 - 17566926
Alignment:
Q  11 cagagacaccggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggcta 110  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   ||    
T  17567267 cagagccaccggagggagagtcaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttctcatatta 17567168  T
Q  111 cacagcctgaagaatcgcaggtggttgatctgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatga 210  Q
    |||||||| |||| ||  |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17567167 cacagcctaaagagtcataggtagttgacccgagccagcaggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatga 17567068  T
Q  211 ccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctgga 310  Q
    |||||||||||||||| | || || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||    
T  17567067 ccaggatcatataccacaacaacaacatgtagaagatgatgatgacattgcagcagctgctgccccggaggtgttacctgtggaccctccctttccttga 17566968  T
Q  311 ggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgccaatcat 352  Q
    ||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17566967 ggaccggacggcctatctttgctgcactcttacgccaatcat 17566926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 33 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 49195615 - 49195304
Alignment:
Q  33 aaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggctacacagcctgaagaatcgcaggt 132  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||    
T  49195615 aaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttctcgggctacacagcctgaagagtcgcaggt 49195516  T
Q  133 ggttgatctgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcag 232  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||    
T  49195515 ggttgatccgagccagcaggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgaccgatggtggatatgaccaggatcatatactagaggag 49195416  T
Q  233 cagcatgtaggagatgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgc 332  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||    
T  49195415 cagcatatagcagatgatgatgacattgcagcagcggctgccctggaggtgttacctgtggaccctccctttcctagaggaccggaagacctatctttgc 49195316  T
Q  333 tgcactcttatg 344  Q
    ||||||||||||    
T  49195315 tgcactcttatg 49195304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 18 - 352
Target Start/End: Original strand, 44230610 - 44230944
Alignment:
Q  18 accggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggctacacagcc 117  Q
    ||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  44230610 accggagggagaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggagggtggatggttcagggagttcgtaggaggattctcaggctacacagcc 44230709  T
Q  118 tgaagaatcgcaggtggttgatctgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggat 217  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  44230710 tgaagagtcgcatgtggttgatccgagccagcaggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgttacggatggtgggtatgaccaagat 44230809  T
Q  218 catataccagagcagcagcatgtaggagatgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcag 317  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||  ||||||| ||||||||||| || || | |    
T  44230810 catataccagagtagcaacatatagcatatgatgatgacattgcagcagctgttgtcccagaggtgttacctgtggactctccctttccttgaagaccgg 44230909  T
Q  318 acgacctatctttgctgcactcttatgccaatcat 352  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44230910 aagacctatctttgctgcactcttgtgccaatcat 44230944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 33 - 348
Target Start/End: Original strand, 42757075 - 42757389
Alignment:
Q  33 aaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggctacacagcctgaagaatcgcaggt 132  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  42757075 aaagcgggcacatcccaaagaagggaagaggtcggagggtggatggttcagggacttcgcaggaggctgctcaggctacagagcctgaagagtcgcaggt 42757174  T
Q  133 ggttgatctgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcag 232  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42757175 ggttgatccgagccaggaggcggagt-cctgaattatcagaatcaggtacaccacgttgtgactgatggttggtatgaccaggattatataccagagcag 42757273  T
Q  233 cagcatgtaggagatgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgc 332  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||    
T  42757274 cagcatatagcagatgatgatgacattgcagcagaggctcccccggaggtgttacttgtggaccctccctttcctagaggatcggaaaacctatctttgc 42757373  T
Q  333 tgcactcttatgccaa 348  Q
    |||||| |||||||||    
T  42757374 tgcacttttatgccaa 42757389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 20917188 - 20916855
Alignment:
Q  11 cagagacaccggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggcta 110  Q
    ||||| |||||||  ||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||    
T  20917188 cagagccaccggaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgaagggtggatggttcagggacttcgcatgaggcttctcaggcta 20917089  T
Q  111 cacagcctgaagaatcgcaggtggttgatctgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatga 210  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  20917088 cacaacctgaagagtcgcaggtggttgatccgagccaggaggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccatgatgttacggatggtgggtatga 20916989  T
Q  211 ccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctgga 310  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| || |||||| |||||| | |  || |||  | |||| |||||||||||||||    
T  20916988 ccagaatcatataccagagcagcaacatatagcagatgatgatgacaatgcagcagcggctgcctcagcagttttacctttggagcctccctttcctgga 20916889  T
Q  311 ggatcagacgacctatctttgctgcactcttatg 344  Q
    ||||| || ||  |||||||||||||||||||||    
T  20916888 ggatcggaagatatatctttgctgcactcttatg 20916855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 20926150 - 20925817
Alignment:
Q  11 cagagacaccggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggcta 110  Q
    ||||| |||||||  ||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||    
T  20926150 cagagccaccggaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgaagggtggatggttcagggacttcgcatgaggcttctcaggcta 20926051  T
Q  111 cacagcctgaagaatcgcaggtggttgatctgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatga 210  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  20926050 cacaacctgaagagtcgcaggtggttgatccgagccaggaggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccatgatgttacggatggtgggtatga 20925951  T
Q  211 ccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctgga 310  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| || |||||| |||||| | |  || |||  | |||| |||||||||||||||    
T  20925950 ccagaatcatataccagagcagcaacatatagcagatgatgatgacaatgcagcagcggctgcctcagcagttttacctttggagcctccctttcctgga 20925851  T
Q  311 ggatcagacgacctatctttgctgcactcttatg 344  Q
    ||||| || ||  |||||||||||||||||||||    
T  20925850 ggatcggaagatatatctttgctgcactcttatg 20925817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 33 - 348
Target Start/End: Original strand, 48563854 - 48564169
Alignment:
Q  33 aaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggctacacagcctgaagaatcgcaggt 132  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  48563854 aaagcgggcacatcccaaataggggaagaggtcggagggtggatggttcaaggagtttgcaggaggcttctcaggctacacaacctgaagagtcgcaggt 48563953  T
Q  133 ggttgatctgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcag 232  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48563954 ggttgatctgagccagtaggtggagtacctgaattatcaggatcaggaacaccacgatgtgaccgatgatgggtatgaccaggatcatataccagagcag 48564053  T
Q  233 cagcatgtaggagatgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgc 332  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |  ||||||  | |||| |||| ||||| ||||||| | || ||  ||||| |||    
T  48564054 cagcatatagcagatgataatgacattgcagcagcggctgccccagcagtgttacctttggagcctctctttcatggaggaccggaagatatatctctgc 48564153  T
Q  333 tgcactcttatgccaa 348  Q
    ||||||||||||||||    
T  48564154 tgcactcttatgccaa 48564169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 151 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 47073235 - 47073034
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||    
T  47073235 ggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtgggtatgaccaggatcatataccacagcagcaacatgtagcagacgat 47073136  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgccaatc 350  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| | |  ||| |||||||||| ||||||||||||| ||    
T  47073135 gatgacattgcagcagctgctgcccttgaggtgttacatgtggaccctccctttcctggtggaccggcagacttatctttgctccactcttatgccagtc 47073036  T
Q  351 at 352  Q
    ||    
T  47073035 at 47073034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 49268440 - 49268251
Alignment:
Q  11 cagagacaccggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggcta 110  Q
    ||||| |||||||| ||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  49268440 cagagccaccggagggagaggcaaagcggtcacatcccaaacaggggtagaggtcggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttctcaggcta 49268341  T
Q  111 cacagcctgaagaatcgcaggtggttgatctgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatg 200  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  49268340 cacagtctgaagagtcgcaggtggttgacccgagccagcaggtggagtacctgaattatcagcatcaagtacaccacgatgttacggatg 49268251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 153 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 50215963 - 50215766
Alignment:
Q  153 tggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgatga 252  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  50215963 tggagtacctgaattatcagg--caggtacaccacaatgtgactgatggtgggtatgaccaggatcatataccacaacaacagcatgtaggagatgatga 50215866  T
Q  253 tgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagac-gacctatctttgctgcactcttatgccaatca 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50215865 tgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttacctgtggaccctccctttcctagagga-ccgacagacttatctttgctgcactcttatgtcaatca 50215767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 151 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 52390417 - 52390216
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
T  52390417 ggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtgggtatgaccaggatcatataccacatcagcagcatgtaggagacgat 52390318  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgccaatc 350  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| | |  ||| ||||||| || ||||||||||||| ||    
T  52390317 gatgacattgcagcagctgctgcaccgaaggtgttacctgtggaccctccctttcctggtggaccggtagacttatctttactccactcttatgccagtc 52390218  T
Q  351 at 352  Q
    ||    
T  52390217 at 52390216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 151 - 347
Target Start/End: Original strand, 597927 - 598123
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||     
T  597927 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacaccacgatacgactgatggtgggtatgaccaggatcatataccacagcagcagcatgtaggagacgac 598026  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgcca 347  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| | |  ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  598027 gatgacattgcagcagctgctgccccggaggtgttacctgtggaccctccctttcctagaggaccggcagacttatctttgctgcacacttatgcca 598123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 151 - 309
Target Start/End: Original strand, 16612109 - 16612267
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  16612109 ggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtgggtatgactaggatcatataccatagcagcagcatgtaggagacgat 16612208  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctgg 309  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  16612209 gatgacattgcagcagctgctgccccggaggtgttacctatggaccctccctttcctgg 16612267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 151 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 22047144 - 22046986
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  22047144 ggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtgggtatgactaggatcatataccatagcagcagcatgtaggagacgat 22047045  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctgg 309  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  22047044 gatgacattgcagcagctgctgccccggaggtgttacctatggaccctccctttcctgg 22046986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 151 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 4007378 - 4007176
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcagg-tacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatga 249  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  4007378 ggtggagtacctgaattatcaggatcaggatacaccacgatgtgactgatggtggatatgaccaggatcatataccacagcagcagcatgtaggagacga 4007279  T
Q  250 tgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgccaat 349  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| | |  ||| ||||||||||  |||||||||||| |    
T  4007278 tgacgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctgtggaccctccctttcctggtggaccggcagacttatctttgctctactcttatgccagt 4007179  T
Q  350 cat 352  Q
    |||    
T  4007178 cat 4007176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 151 - 352
Target Start/End: Original strand, 3976751 - 3976952
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
T  3976751 ggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtggatatgaccaggatcatataccacaacagcagcatgtaggagacgat 3976850  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgccaatc 350  Q
    || ||||||| |||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |  ||| |||||||||| || |||||||||| ||    
T  3976851 gacgacattgcagcagctgctgcaccggtgatgttatctgtggaccctccctttcctggtggaccggcagacttatctttgctccattcttatgccagtc 3976950  T
Q  351 at 352  Q
    ||    
T  3976951 at 3976952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 151 - 352
Target Start/End: Original strand, 36128642 - 36128842
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
T  36128642 ggtggagtacctgaattatcaggatcaagtacaccacaatgtgactga-ggtggatatgaccaggatcatataccacaacagcagcatgtaggagacgat 36128740  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagac-gacctatctttgctgcactcttatgccaat 349  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |    
T  36128741 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctgtggaccctccctttcctggtgga-ccgacagacttatctttgctccactcttatgccagt 36128839  T
Q  350 cat 352  Q
    |||    
T  36128840 cat 36128842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 155 - 352
Target Start/End: Original strand, 50997045 - 50997242
Alignment:
Q  155 gagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgatgatg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  50997045 gagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtggatatgacaaggatcatataccacagcagtagcatgtaggagacgatgatg 50997144  T
Q  255 acattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgccaatcat 352  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| |||||| ||| | |  ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  50997145 acattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctgtggaacttccctctcctggtggaccggcagacttatctttgctccactcttatgccagtcat 50997242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 150 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 30255032 - 30254831
Alignment:
Q  150 aggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagca---tgtaggaga 246  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||   || |  |||    
T  30255032 aggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgaccgatggtgggtatgatcatgatcatataccagagcagcagcagcatgaaccaga 30254933  T
Q  247 tgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgcc 346  Q
      ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | ||  |  |||||||||||||||||||||||    
T  30254932 caatgatgacattgctgcagcggctgccccggaggtgttacctatggaccctccctttcctggaggaccggaaaatatatctttgctgcactcttatgcc 30254833  T
Q  347 aa 348  Q
    ||    
T  30254832 aa 30254831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 150 - 313
Target Start/End: Original strand, 48889740 - 48889906
Alignment:
Q  150 aggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagca---gcagcatgtaggaga 246  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |  |||    
T  48889740 aggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcagcatgaactaga 48889839  T
Q  247 tgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggagga 313  Q
     |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||    
T  48889840 cgatgataacattgcagcagcggctgccccggaggtgttacctgtggaccctccctttgttggagga 48889906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 151 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 2273952 - 2273757
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||| || |||| |||||||||||  ||    
T  2273952 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacaacatgatgtgactgatggtggatatgaacaggaacatataccacagaagcaacatgtaggagactat 2273853  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgcc 346  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| | |  ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  2273852 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctgtggaccctccctttcctggtggaccggcggacttatctttgctccactcttatgcc 2273757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 151 - 346
Target Start/End: Original strand, 29009921 - 29010116
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||     
T  29009921 ggtggagtacctgaactatcaagatcaggtacaacatgatgtgacggatggtggatatgaccaggatcatataccacagcagcaggatgcaggagacgag 29010020  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgcc 346  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||| | |  ||| | || ||||| ||||||||||||    
T  29010021 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctacggaccctccctttcctggtggaccggttgacttgtccttgctccactcttatgcc 29010116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 151 - 346
Target Start/End: Original strand, 34046437 - 34046632
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||| |||||| ||     
T  34046437 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacgag 34046536  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgcc 346  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||||| |  ||| | || ||||| ||||||||||||    
T  34046537 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctacggaccctccctttcctggtggatcggctgacttgtccttgctccactcttatgcc 34046632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 151 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 42903201 - 42903006
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||| |||||| ||     
T  42903201 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacgag 42903102  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgcc 346  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||| | |  ||| | || ||||| ||||||||||||    
T  42903101 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctacggaccctccctttcctggtggaccggctgacttgtccttgctccactcttatgcc 42903006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 151 - 346
Target Start/End: Original strand, 54387185 - 54387380
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||| |||||| ||     
T  54387185 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacgag 54387284  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgcc 346  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||| | |  ||| | || ||||| ||||||||||||    
T  54387285 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctacggaccctccctttcctggtggaccggctgacttgtccttgctccactcttatgcc 54387380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 151 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 50479818 - 50479660
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||| |||||| ||     
T  50479818 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacgag 50479719  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctgg 309  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  50479718 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctacggaccctccctttcctgg 50479660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 153 - 309
Target Start/End: Original strand, 46390014 - 46390170
Alignment:
Q  153 tggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgatga 252  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||| |||||| || ||    
T  46390014 tggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcacgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacgagga 46390113  T
Q  253 tgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctgg 309  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  46390114 tgacattgcagctgctgctgcaccggaggtgttacctacggaccctccctttcctgg 46390170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 151 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 46701037 - 46700842
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||| |||||| ||     
T  46701037 ggtggagtacctgaactatcaggatcatgtacatcatgatgtgacagacagtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacgag 46700938  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgcc 346  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||| | |  ||| | || ||||| ||||||||||||    
T  46700937 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctacggaccctccctttcctggtggaccggctgacttgtccttgctccactcttatgcc 46700842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 151 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 49143474 - 49143279
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||| |||||| ||     
T  49143474 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacgag 49143375  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgcc 346  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||| | |  ||| | || ||||| ||||||||||||    
T  49143374 gatgacattgcaacagctgctgcaccggaggtgttacctacggaccctccctttcctggtggaccggctgacttgtccttgctccactcttatgcc 49143279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 228 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 49268247 - 49268124
Alignment:
Q  228 agcagcagcatgtaggagatgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagac-gacctat 326  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||    
T  49268247 agcagcagcatatagcagatgatgatgacattgcaacagctgctg-cccggaggtgttacctgtggacccttcctttcctggaggatc-gacaaacctat 49268150  T
Q  327 ctttgctgcactcttatgccaatcat 352  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  49268149 ctttgttgcactcttatgccaatcat 49268124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 8731855 - 8731753
Alignment:
Q  105 aggctacacagcctgaagaatcgcaggtggttgatctgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgg 204  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||   || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  || ||||||||    
T  8731855 aggctacaca-cctgaacaatcgcaggtggttgatctgacccag---gtcgagtacctgaattatcaggatcagatacaccacgatgccactgatggtgg 8731760  T
Q  205 gtatgac 211  Q
     ||||||    
T  8731759 ttatgac 8731753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 9083742 - 9083640
Alignment:
Q  105 aggctacacagcctgaagaatcgcaggtggttgatctgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgg 204  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||   || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  || ||||||||    
T  9083742 aggctacaca-cctgaacaatcgcaggtggttgatctgacccag---gtcgagtacctgaattatcaggatcagatacaccacgatgccactgatggtgg 9083647  T
Q  205 gtatgac 211  Q
     ||||||    
T  9083646 ttatgac 9083640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 2274095 - 2274019
Alignment:
Q  11 cagagacaccggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggag 87  Q
    ||||| |||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  2274095 cagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 2274019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 95
Target Start/End: Original strand, 597803 - 597886
Alignment:
Q  12 agagacaccggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcagg 95  Q
    |||| |||||||| ||| || | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  597803 agagccaccggagggagaggcagagcgcccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagttctcagg 597886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 269 - 352
Target Start/End: Original strand, 50757313 - 50757396
Alignment:
Q  269 gctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgccaatcat 352  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||  |  ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  50757313 gctgccccggaggtgttacctgtggaccctccctttcctggaggaccggaaaatatatatctgctgcactcttatgccaatcat 50757396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 87
Target Start/End: Original strand, 36128505 - 36128575
Alignment:
Q  17 caccggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggag 87  Q
    |||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  36128505 caccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 36128575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 18 - 87
Target Start/End: Original strand, 50963866 - 50963935
Alignment:
Q  18 accggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggag 87  Q
    ||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  50963866 accggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 50963935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 47073378 - 47073302
Alignment:
Q  11 cagagacaccggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggag 87  Q
    ||||| |||||||| ||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  47073378 cagagtcaccggagggagaggcagagcagccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 47073302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 50216084 - 50216024
Alignment:
Q  35 agcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcagg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| ||||    
T  50216084 agcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagagagttctcagg 50216024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Original strand, 3976608 - 3976684
Alignment:
Q  11 cagagacaccggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggag 87  Q
    ||||| |||||||| ||| || | || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||    
T  3976608 cagagccaccggagggagaggcagagtggccacatcccaaagaggggtagaggtcggagaggagatggttcagggag 3976684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Original strand, 16612008 - 16612060
Alignment:
Q  35 agcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggag 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||    
T  16612008 agcggccacatcccaaagaggggtacaggtcggaggggagatggttcagggag 16612060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 22047245 - 22047193
Alignment:
Q  35 agcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggag 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||    
T  22047245 agcggccacatcccaaagaggggtacaggtcggaggggagatggttcagggag 22047193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 52390536 - 52390484
Alignment:
Q  35 agcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggag 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||    
T  52390536 agcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaaggag 52390484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 84
Target Start/End: Original strand, 29009802 - 29009851
Alignment:
Q  35 agcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagg 84  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  29009802 agcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcagg 29009851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 71
Target Start/End: Original strand, 42166089 - 42166125
Alignment:
Q  35 agcggccacatcccaaagaggggtagaggccggaggg 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42166089 agcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggg 42166125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 84
Target Start/End: Original strand, 34046323 - 34046367
Alignment:
Q  40 ccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagg 84  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  34046323 ccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcagg 34046367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 42903315 - 42903271
Alignment:
Q  40 ccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagg 84  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  42903315 ccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcagg 42903271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 84
Target Start/End: Original strand, 46389898 - 46389942
Alignment:
Q  40 ccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagg 84  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  46389898 ccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcagg 46389942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 46701151 - 46701107
Alignment:
Q  40 ccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagg 84  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  46701151 ccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcagg 46701107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 49143588 - 49143544
Alignment:
Q  40 ccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagg 84  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  49143588 ccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcagg 49143544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 50479932 - 50479888
Alignment:
Q  40 ccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagg 84  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  50479932 ccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcagg 50479888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 26)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 33 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 36655540 - 36655221
Alignment:
Q  33 aaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggctacacagcctgaagaatcgcaggt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| || |||||    
T  36655540 aaagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggagggtggatgtttcagggagttcgcaagaggcttctcaggctacacaacctgaagagtcacaggt 36655441  T
Q  133 ggttgatctgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcag 232  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36655440 ggttgatccgagccagcaggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgacgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcag 36655341  T
Q  233 cagcatgtaggagatgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgc 332  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||     
T  36655340 caacatgtaggagatgatgataacattgcagcagctgctgccccggaggtgttacatgtggacccttcctttcctggaggaccggacgacctatctttgt 36655241  T
Q  333 tgcactcttatgccaatcat 352  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  36655240 tgcactcttatgccaatcat 36655221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 35 - 344
Target Start/End: Original strand, 39948526 - 39948835
Alignment:
Q  35 agcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggctacacagcctgaagaatcgcaggtgg 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||   |||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  39948526 agcggccacatcccaaagaggggtaaaggtcggaggggagatggttcagggagtgaacaggaggcttctcaggctacacagcctaaagagtcgcaggtgg 39948625  T
Q  135 ttgatctgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagca 234  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  39948626 ttgatccgagccagcaggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtggatatgaccatgatcatataccacagcagca 39948725  T
Q  235 gcatgtaggagatgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctg 334  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||| | |  ||| ||||||| ||     
T  39948726 gcatgtaggagacgatgatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctgtggaccctctctttcctggtggaccggcagacttatctttactc 39948825  T
Q  335 cactcttatg 344  Q
    ||||||||||    
T  39948826 cactcttatg 39948835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 151 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 29400595 - 29400394
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||    
T  29400595 ggtggagtacctgaattatcatgatcaggtacaccacgatgtgacggatggtgggtatgaccagaatcatataccacagcagcaacatgtaagagacgat 29400496  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgccaatc 350  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |  ||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  29400495 gatgacattgcaacagctgctgccccggaggtgttacctgtggaccctccctttcctggaggaccggcagacttatctttgctccactcttatgccaatc 29400396  T
Q  351 at 352  Q
    ||    
T  29400395 at 29400394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 151 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 10828049 - 10827891
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  10828049 ggtggagtacctgaattatcaagatcaggtacaccacgatgtgacagatggtgggtatgaccaggatcatataccacagcagcagcatgtaggagacgat 10827950  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctgg 309  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  10827949 gatgacattgcagcagctgctgcccctgaggtgttacctgtggtccctccctttcctgg 10827891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 155 - 309
Target Start/End: Original strand, 7187817 - 7187971
Alignment:
Q  155 gagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgatgatg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  7187817 gagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtggatatgaccaggatcatataccacaacagcagcatgtaggagacgatgatg 7187916  T
Q  255 acattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctgg 309  Q
    |||||| |||||||||| | | ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  7187917 acattgcagcagctgctacactggaggtgttacctgtggaccctccctttcctgg 7187971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 151 - 352
Target Start/End: Original strand, 17421573 - 17421774
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||| ||     
T  17421573 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggatggtggatatgaccaggatcatataccacagcagcaggatgcagtagacgag 17421672  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgccaatc 350  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |  ||||||||| |||||||| ||| | || ||||| || ||||| |||||||||||| |||    
T  17421673 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctacggaccctccatttcctggtggaccggaggacctgtcattgctccactcttatgccgatc 17421772  T
Q  351 at 352  Q
    ||    
T  17421773 at 17421774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 151 - 346
Target Start/End: Original strand, 15832179 - 15832374
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||| ||     
T  15832179 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggatggtggatatgaccaggatcatataccacatcagcaggatgcaggagacgag 15832278  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgcc 346  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||| |||  ||| | || ||||| ||||||||||||    
T  15832279 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctacggaccctccctttcctggtggaccagctgacttgtccttgctccactcttatgcc 15832374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 151 - 346
Target Start/End: Original strand, 20931620 - 20931815
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| |  ||||| ||| |||||| ||     
T  20931620 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacagcatgatgtgacggatggtggatatgaccaagatcatataccacaaaagcaggatgaaggagacgag 20931719  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagac-gacctatctttgctgcactcttatgcc 346  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||| | |||||||| ||||||||||||    
T  20931720 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctgtggaccctccctttcctggtgga-ccgactgacttgtctttgctccactcttatgcc 20931815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 151 - 346
Target Start/End: Original strand, 45429635 - 45429830
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||| ||     
T  45429635 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggatggtggatatgaccaggatcatataccacatcagcaggatgcaggagacgag 45429734  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgcc 346  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||| | |  ||| | || ||||| ||||||||||||    
T  45429735 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctacggaccctccctttcctggtggaccggctgacttgtccttgctccactcttatgcc 45429830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 151 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 30495958 - 30495763
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||| |||||| ||     
T  30495958 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacgag 30495859  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgcc 346  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||| | |  ||| | || ||||| ||||||||||||    
T  30495858 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctacggaccctccctttcctggtggaccggctgacttgtccttgctccactcttatgcc 30495763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 151 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 43538749 - 43538554
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||| |||||| ||     
T  43538749 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacgag 43538650  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgcc 346  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||| | |  ||| | || ||||| ||||||||||||    
T  43538649 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctacggaccctccctttcctggtggaccggctgacttgtccttgctccactcttatgcc 43538554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 151 - 346
Target Start/End: Original strand, 43979581 - 43979776
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| |||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||| |||||| ||     
T  43979581 ggtggagtacctgaactatcaggatcagatacatcatgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacgag 43979680  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgcc 346  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||| | |  ||| | || ||||| ||||||||||||    
T  43979681 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctacggaccctccctttcctggtggaccggctgacttgtccttgctccactcttatgcc 43979776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 151 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 3939751 - 3939556
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||| |||||||||||||| |  ||||| ||| |||||| ||     
T  3939751 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggacggtggatatgactaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacgag 3939652  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgcc 346  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |   ||||||||||||||||| ||| | |  ||| | || ||||| ||||||||||||    
T  3939651 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctaccgaccctccctttcctggtggaccggctgacttgtccttgctccactcttatgcc 3939556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 151 - 346
Target Start/End: Original strand, 5353016 - 5353211
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||| | ||||  |     
T  5353016 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcatgagacaag 5353115  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgcc 346  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    |||||||||||||| ||| ||| | || ||| | || ||||| ||||||||||||    
T  5353116 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttatccacggaccctccctttcatggtggaccggatgacttgtccttgctccactcttatgcc 5353211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 151 - 343
Target Start/End: Original strand, 28469685 - 28469877
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||| || |||| || || || ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| |  ||||| ||| |||||| ||     
T  28469685 ggtggagtacctgaactatcaggataagatacaacatgaagtgacagaaggtggatatgaacaagatcatataccacaaaagcaggatgcaggagacgag 28469784  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttat 343  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||| | |  ||| | |||||||| |||||||||    
T  28469785 aatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctaaggaccctccctttcctggtggaccggctgacttgtctttgctccactcttat 28469877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 45136477 - 45136386
Alignment:
Q  11 cagagacaccggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttc 102  Q
    ||||| |||||||| ||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45136477 cagagccaccggagggagagacaaagcgaccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggatggatggttcagggagttcgcaagaggcttc 45136386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Original strand, 45429492 - 45429568
Alignment:
Q  11 cagagacaccggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggag 87  Q
    ||||| |||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  45429492 cagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 45429568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 29400769 - 29400696
Alignment:
Q  11 cagagacaccggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagg 84  Q
    ||||| |||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  29400769 cagagccaccggagggagaggcaaagcagccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagg 29400696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 10828168 - 10828098
Alignment:
Q  17 caccggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggag 87  Q
    |||||||| ||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  10828168 caccggagggagaggcagagcggtcacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 10828098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 84
Target Start/End: Original strand, 28469542 - 28469615
Alignment:
Q  11 cagagacaccggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagg 84  Q
    ||||| |||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  28469542 cagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcagg 28469615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 84
Target Start/End: Original strand, 15832063 - 15832109
Alignment:
Q  38 ggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagg 84  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  15832063 ggccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcagg 15832109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 25515025 - 25514980
Alignment:
Q  41 cacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcaggga 86  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||    
T  25515025 cacatcccaaagaggggaagaggttggaggggggatggttcaggga 25514980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 3939865 - 3939821
Alignment:
Q  40 ccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagg 84  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  3939865 ccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcagg 3939821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 84
Target Start/End: Original strand, 5352902 - 5352946
Alignment:
Q  40 ccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagg 84  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  5352902 ccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcagg 5352946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 30496072 - 30496028
Alignment:
Q  40 ccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagg 84  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  30496072 ccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcagg 30496028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 84
Target Start/End: Original strand, 43979467 - 43979511
Alignment:
Q  40 ccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagg 84  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  43979467 ccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcagg 43979511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 23)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 352
Target Start/End: Original strand, 5197841 - 5198182
Alignment:
Q  11 cagagacaccggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggcta 110  Q
    ||||| || ||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||    
T  5197841 cagagccatcggagggagaggcaaagcggccacatcccaaataggggtagaggtcggagggtggatggttcagggagttcacaggaggcttctcaggcta 5197940  T
Q  111 cacagcctgaagaatcgcaggtggttgatctgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatga 210  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5197941 cacagcctgaagagtcacatgtggttgatccgagccagcaggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgttacggatggtgggtatga 5198040  T
Q  211 ccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctgga 310  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |    
T  5198041 ccaggatcatttactagagcagcaacatgtaggagataatgatgacattgcagcagctgctgccccggaggtgttacctgtggaccctccttttcctgta 5198140  T
Q  311 ggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgccaatcat 352  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5198141 ggaccggacgacctatctttgctgcactcttatgccaatcat 5198182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 41 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 40624068 - 40623755
Alignment:
Q  41 cacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcagg------aggcttcaaaggctacacagcctgaagaatcgcaggtgg 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||      |||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  40624068 cacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggggatggttcagggacttctcaggcttctaaggcttcgcaggctacacagtctgaagagtcgcaggtgg 40623969  T
Q  135 ttgatctgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagca 234  Q
    |||  | || | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40623968 ttggcccgacctaggaggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgcgactgatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcaaca 40623869  T
Q  235 gcatgtaggagatgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctg 334  Q
     ||| ||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |  ||||||  |||||| |||||||||||||||||| | ||  |  ||||| |||||    
T  40623868 acatataccagatgatgatgacattgcagcagcggctgccccagtagtgttacctgtggagcctccctttcctggaggaccggaaaatatatctctgctg 40623769  T
Q  335 cactcttatgccaa 348  Q
    ||||||||| ||||    
T  40623768 cactcttattccaa 40623755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 151 - 352
Target Start/End: Original strand, 7758350 - 7758551
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  7758350 ggtggaatacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtgggtatgaccaggatcatataccacagcagcagcatgtaggagacgat 7758449  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgccaatc 350  Q
    |||||||||| |||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||| |||| ||| | |  ||| |||||||||| ||||||||||||| ||    
T  7758450 gatgacattgcagcagctgctgcaccagaggtgttacctgtggaccctcccttttctggtggaccggcagacttatctttgctccactcttatgccagtc 7758549  T
Q  351 at 352  Q
    ||    
T  7758550 at 7758551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 109 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 8701306 - 8701063
Alignment:
Q  109 tacacagcctgaagaatcgcaggtggttgatctgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtat 208  Q
    ||||||||||||||| || ||||| | ||| | || |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  8701306 tacacagcctgaagagtcacaggttgctgaccagacccaggaggtgaagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtgggtat 8701207  T
Q  209 gaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctg 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |  | | ||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||    
T  8701206 gatcaggatcatataccagagcagcaacatgaaccatacgatgatgtcattgcagcagcggttgccccggaggtgttacctttggaccctcccttttctg 8701107  T
Q  309 gaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgccaatcat 352  Q
    ||||| | ||  |  ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  8701106 gaggaccggaaaatatatctcttctgcactcttatgccaatcat 8701063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 150 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 42941516 - 42941329
Alignment:
Q  150 aggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatga 249  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42941516 aggtggagtacctggattatcaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccacagcagcagcatgtaggagatga 42941417  T
Q  250 tgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgccaat 349  Q
    |||||||||                ||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42941416 tgatgacat----------------ccggaggtgttacctatggactctccctttcctggaggaccggtagacctatctttgctgcactcttatgtcaat 42941333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 154 - 348
Target Start/End: Original strand, 38969128 - 38969322
Alignment:
Q  154 ggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgatgat 253  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||    
T  38969128 ggagtacctgcattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactaatggtgggtatgaccgggatcatataccagagcagcagcatgaaccagacgatgat 38969227  T
Q  254 gacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgccaa 348  Q
    ||||||| |||||| | |||||  |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| | ||  ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  38969228 gacattgcagcagcggttgccctagaggtgttacatgtggaccctctctttcctggaggaccggaaaacctatctttgttgcactcttaagccaa 38969322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 150 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 19227976 - 19227779
Alignment:
Q  150 aggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagca---gcatgtaggaga 246  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||   ||||| |  |||    
T  19227976 aggtggagtacttgaattatcaggaccaggtacaccacgatgtgactgatggtgggtatgaccatgatcatataccagagcaacatcagcatgaaccaga 19227877  T
Q  247 tgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatg 344  Q
     | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||| |||| ||||||||||    
T  19227876 cggtgatgacattgcagcagcggctgccccggaggtgttacctgtggaccctccctttcctggaggaccggaaaacctatctctgctacactcttatg 19227779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 151 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 8579534 - 8579339
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||     
T  8579534 ggtggagtacctgaactatcaagatcaggtacaacatgatgtgactgatggtggatatgaccaggatcatataccacagcagcaggatgcaggagacgag 8579435  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgcc 346  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| | |  ||| | || ||||| ||||||||||||    
T  8579434 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctgtggaccctccctttcctggtggaccggctgacttgtccttgctccactcttatgcc 8579339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 151 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 27672680 - 27672486
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||| ||     
T  27672680 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacagcatgatgtgactgatggtggatatgaccaggatcgtataccacagcagcaggatgcaggagacga- 27672582  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgcc 346  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| | |  ||| | || ||||| ||||||||||||    
T  27672581 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctgtggaccctccctttcctggtggaccggctgacttgtccttgctccactcttatgcc 27672486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 33 - 168
Target Start/End: Original strand, 42538072 - 42538207
Alignment:
Q  33 aaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggctacacagcctgaagaatcgcaggt 132  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  42538072 aaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggctgctcaggccacacaacctgaagagtcgcaggt 42538171  T
Q  133 ggttgatctgagccagcaggtggagtacctgaatta 168  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  42538172 ggttgatccgagccagcatgtggagtatctgaatta 42538207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 151 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 19040128 - 19039927
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||| ||     
T  19040128 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggatggtggatatgaccaggatcatataccacagcagcaggatgcagtagacgag 19040029  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgccaatc 350  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  |  ||||||||| |||||||| ||| | || ||||| || ||||| |||||||||||| |||    
T  19040028 gatgacattgcagcagctgctgcaccgaaggtgttacctacggaccctccatttcctggtggaccggaggacctgtcattgctccactcttatgccgatc 19039929  T
Q  351 at 352  Q
    ||    
T  19039928 at 19039927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 151 - 352
Target Start/End: Original strand, 30706147 - 30706348
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||     
T  30706147 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacagcatgatgtgacggatggtggatatgaccaggatcatataccacagcagcaggatgcaggagacgag 30706246  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgccaatc 350  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  | |||| ||||| |||||||| ||| | |  ||| | || ||||| |||||||||||| |||    
T  30706247 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctatggagcctccatttcctggtggaccggctgacttgtcattgctccactcttatgccgatc 30706346  T
Q  351 at 352  Q
    ||    
T  30706347 at 30706348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 13968 - 13687
Alignment:
Q  11 cagagacaccggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggcta 110  Q
    ||||| |||||||| ||| || | |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||  |||||||||||||| || |            ||||||    
T  13968 cagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaatggtagaggtcggaggggagatggttcagggagctctc------------aggcta 13881  T
Q  111 cacagcctgaagaatcgcaggtggttgatctgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatga 210  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||| |  || | |  ||||||||||||||| || |||||||||||| | || ||||| || |||||||| |||||    
T  13880 cacagcctgaggagtcacaggttgttgacc--agtctg-gggtggagtacctgaactatcaggatcaggtataacatgatgtgactgatggtggatatga 13784  T
Q  211 ccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcct 307  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||  || ||||||||||||||||    
T  13783 ccaggatcatataccacagcagcaggatgtaggagacgatgatgacattgcagcagctgctgcaccagatgtgttacctgcggaccctccctttcct 13687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 151 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 28240851 - 28240656
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||| ||     
T  28240851 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggatggtggatatgaccaggatcatataccacatcagcaggatgcaggagacgag 28240752  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgcc 346  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||| | |  ||| | || ||||| ||||||||||||    
T  28240751 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctacggaccctccctttcctggtggaccggctgacttgtccttgctccactcttatgcc 28240656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 151 - 346
Target Start/End: Original strand, 28877685 - 28877880
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||| ||     
T  28877685 ggtggagtatctgaactatcaggatcaggtacagcatgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatataccacagcagcatgatgcaggagacgag 28877784  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgcc 346  Q
    |||||||||| |||||||||||| || || ||||||  |  ||||||||||||| |||| ||| | |  ||| | || ||||| ||||||||||||    
T  28877785 gatgacattgcagcagctgctgcaccagatgtgttacctacggaccctcccttttctggtggaccggctgacttgtccttgctccactcttatgcc 28877880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Original strand, 7758207 - 7758283
Alignment:
Q  11 cagagacaccggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggag 87  Q
    ||||| |||||||| ||| || | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  7758207 cagagccaccggagggagaggcagagcggcgacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 7758283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 27672823 - 27672750
Alignment:
Q  11 cagagacaccggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagg 84  Q
    ||||| |||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  27672823 cagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggagggcagatggctcagg 27672750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 84
Target Start/End: Original strand, 28877571 - 28877617
Alignment:
Q  38 ggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagg 84  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  28877571 ggccacatcccaaaaaggggtagaggtcggagggtggatggctcagg 28877617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 19228096 - 19228043
Alignment:
Q  33 aaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcaggga 86  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||    
T  19228096 aaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggaggggagatggttcaggga 19228043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 234
Target Start/End: Original strand, 27972253 - 27972317
Alignment:
Q  170 caggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagca 234  Q
    |||||| || ||||||||||||| || |||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||    
T  27972253 caggatgagatacaccacgatgtcactgatggtgggtatgaccaacaacatataccagagtagca 27972317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 8579653 - 8579604
Alignment:
Q  35 agcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagg 84  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  8579653 agcggccacatcccagagaggggtagaggtcggaggggagatggctcagg 8579604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 28240967 - 28240934
Alignment:
Q  38 ggccacatcccaaagaggggtagaggccggaggg 71  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28240967 ggccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggg 28240934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 86
Target Start/End: Original strand, 38969030 - 38969075
Alignment:
Q  41 cacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcaggga 86  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||    
T  38969030 cacatcccaaagaggggaagaggtcggaggggagatggttcaggga 38969075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 33)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 11 - 352
Target Start/End: Original strand, 16677930 - 16678270
Alignment:
Q  11 cagagacaccggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggcta 110  Q
    ||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  16677930 cagagccaccggagggagaggcaaagcggccacatcccaaagaggggaagaggtcggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttctcaggcta 16678029  T
Q  111 cacagcctgaagaatcgcaggtggttgatctgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatga 210  Q
    |||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16678030 cacaac-tgaagagtcgcaggtggttgatccgagccagcaggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacaatgttacagatggtgggtatga 16678128  T
Q  211 ccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctgga 310  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||| ||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  16678129 ccaggatcatataccagaggagcaacatatagcagatgatgatgacattgcagcaactgctaccctggaagtgttacctgtggaccctccttttcctgga 16678228  T
Q  311 ggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgccaatcat 352  Q
    |||   || ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16678229 ggacatgatgacctatctttgctgcactcttatgtcaatcat 16678270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 11 - 352
Target Start/End: Original strand, 17652166 - 17652506
Alignment:
Q  11 cagagacaccggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggcta 110  Q
    ||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  17652166 cagagccaccggagggagaggcaaagcggccacatcccaaagaggggaagaggtcggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttctcaggcta 17652265  T
Q  111 cacagcctgaagaatcgcaggtggttgatctgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatga 210  Q
    |||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17652266 cacaac-tgaagagtcgcaggtggttgatccgagccagcaggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacaatgttacagatggtgggtatga 17652364  T
Q  211 ccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctgga 310  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||| ||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  17652365 ccaggatcatataccagaggagcaacatatagcagatgatgatgacattgcagcaactgctaccctggaagtgttacctgtggaccctccttttcctgga 17652464  T
Q  311 ggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgccaatcat 352  Q
    |||   || ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17652465 ggacatgatgacctatctttgctgcactcttatgtcaatcat 17652506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 352
Target Start/End: Original strand, 47777159 - 47777491
Alignment:
Q  18 accggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggctacacagcc 117  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  47777159 accggagcgagaggcaaagcggccacatcccaaagagaggtagaggtcggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggctgctcaggctacacagcc 47777258  T
Q  118 tgaagaatcgcaggtggttgatctgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggat 217  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47777259 tgaagagtcgcaggtggttgacccgagccagcaggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgttacggatggtgggtatgaccaggat 47777358  T
Q  218 catataccagagcagcagcatgtaggagatgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcag 317  Q
    ||||| ||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||   | || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |    
T  47777359 catatgccacagcagtagcatatagcagatgatgatgacat--catcaactactgccccgaaggtgttacttgtggaccctccctttcctggagg-gccg 47777455  T
Q  318 ac-gacctatctttgctgcactcttatgccaatcat 352  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47777456 acatacctatctttgctgcactcttatgtcaatcat 47777491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 27452790 - 27452446
Alignment:
Q  11 cagagacaccggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggcta 110  Q
    ||||| |||| ||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  27452790 cagagccaccagagggagaggcaaagcggccacatcccaaaaaggggtagagatcggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttctcaggcta 27452691  T
Q  111 cacagcctgaagaatcgcaggtggttgatctgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatga 210  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27452690 cacagcctgaagagtcgcacgtggttgacctgagccagcaggtggagcacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgttacggatggtgggtatga 27452591  T
Q  211 ccaggatcatataccagagcag---cagcatgtaggagatgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcct 307  Q
    |||||||||||||||| |||||   || ||| ||| ||||||||| ||||||| |||| | |||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  27452590 ccaggatcatataccacagcagcaacatcatatagcagatgatgacgacattgcagcaacagctgtctcggaggtgttacctgtggaccctccctttcct 27452491  T
Q  308 ggaggatcagac-gacctatctttgctgcactcttatgccaatcat 352  Q
    |||||| | |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27452490 ggagga-ccgacaaacctatctttgctgcactcttatgtcaatcat 27452446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 352
Target Start/End: Original strand, 39461359 - 39461701
Alignment:
Q  11 cagagacaccggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggcta 110  Q
    ||||| |||||||| ||| || ||||||| ||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |  ||||||    
T  39461359 cagagccaccggagggagaggcaaagcgggcacatcccaaaaaggggaaaaggtcggagggtggattgttcagggagttcgcatgaggctgctcaggcta 39461458  T
Q  111 cacagcctgaagaatcgcaggtggttgatctgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggt-gggtatg 209  Q
    || ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  39461459 catagcctgaagagccccaggtggttgatctgagccagcaggtggagtacctgaattatcaggatcaagtacaccacgatgttacgaatggtggggtatg 39461558  T
Q  210 accaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctgg 309  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  39461559 accaggatcatataccagatcaacaacatatagcagatgatgatgacattgcagcatctgctgccccgaaggtgttacctatggaccctccctttcctgg 39461658  T
Q  310 aggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgccaatcat 352  Q
    ||||||  |  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39461659 aggatcgaaaaacctatctttgctgcactcttatgtcaatcat 39461701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 11 - 313
Target Start/End: Original strand, 19798174 - 19798484
Alignment:
Q  11 cagagacaccggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggcta 110  Q
    ||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||    
T  19798174 cagagccaccggagggagaggcaaagcggccacatcccaaagaggggaagaggtcggatggtggatggttcagggagttcgaaggaggcttctcaggcta 19798273  T
Q  111 cacagcctgaagaatcgcaggtggttgatctgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatga 210  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  19798274 cacagcctgaagagtcgcaggtggttgatccgagccagcaggtgcagtacctggattatcaggatcaagtacaccacgatgttacggatgatgggtatga 19798373  T
Q  211 ccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatg--------atgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccct 302  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||        | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  19798374 ccaggatcatatactagagcagcaacatgtaggagatgaagatgacaagatgacattgcagcagctgctgccccggaggtgttacctgtggaccctccct 19798473  T
Q  303 ttcctggagga 313  Q
    ||| |||||||    
T  19798474 ttcttggagga 19798484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 5540746 - 5540411
Alignment:
Q  11 cagagacaccggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggcta 110  Q
    ||||| |||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||      |||     
T  5540746 cagagccaccggagggagaggaaaagtggccacatcccaaagaggggtagaggtcggagggtggatggttcagggagttcacaggaggct------gct- 5540654  T
Q  111 cacagcctgaagaatcgcaggtggttgatctgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatga 210  Q
      ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  5540653 --cagcctgaagagtcacaggtggttgatccgagccaataggtggagtacctgaattatcaggatcaagtacaccacgatgttacggagggtgggtatga 5540556  T
Q  211 ccaggatcatataccagagcagcagca---tgtaggagatgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcct 307  Q
    |||| || |||||||| | ||||| ||   | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  5540555 ccagaatgatataccacaacagcaacaacatatagcagatgatgatgacattgcagcagctgctgccccggaggtgttacatgtggaccctccctttcct 5540456  T
Q  308 ggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgccaatcat 352  Q
    |||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5540455 ggaggaccggcagacctatctttgctgcactcttatgccaatcat 5540411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 33 - 276
Target Start/End: Original strand, 37341228 - 37341471
Alignment:
Q  33 aaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggctacacagcctgaagaatcgcaggt 132  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  37341228 aaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgaaggggggatggttcagggacttcgcaggaggcttctcaggctacacagcctaaagagtcgcaggt 37341327  T
Q  133 ggttgatctgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcag 232  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37341328 ggttgatccgagccaggaggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtgggtatgaccaggatcatataccagagtag 37341427  T
Q  233 cagcatgtaggagatgatgatgacattgtagcagctgctgcccc 276  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  37341428 cagcatatagcatatgatgatgacattgcagcagcggctacccc 37341471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 134 - 352
Target Start/End: Original strand, 11635784 - 11636002
Alignment:
Q  134 gttgatctgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagc 233  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  11635784 gttgatccgagccagcaggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgttacggatggtggatatgaccagcatcatatactagagtagc 11635883  T
Q  234 agcatgtaggagatgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgct 333  Q
    | ||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||    
T  11635884 aacatatagcagatgataatgacattatagcagctgctgccccggaggtattacctgtggaccctccctttcctggaggaccggaagacctatatttgct 11635983  T
Q  334 gcactcttatgccaatcat 352  Q
    |||||||||||||||||||    
T  11635984 gcactcttatgccaatcat 11636002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 153 - 352
Target Start/End: Original strand, 34739410 - 34739612
Alignment:
Q  153 tggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatg---a 249  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||   |    
T  34739410 tggagtacctaaaatatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtgggtatgaccaggatcacataccacaacagcagcatgtaggagatgatga 34739509  T
Q  250 tgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgccaat 349  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34739510 tgatgacattgcagcagctcctgccccggaggtgttacctgtggaccctccctttcctggaggaccggcagacttatctttgctgcactcttatgccaat 34739609  T
Q  350 cat 352  Q
    |||    
T  34739610 cat 34739612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 153 - 352
Target Start/End: Original strand, 17836123 - 17836322
Alignment:
Q  153 tggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgatga 252  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||    
T  17836123 tggagtacatgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtggatatgaccaggatcatataccacaacagcaacatgtaggagacgatga 17836222  T
Q  253 tgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagac-gacctatctttgctgcactcttatgccaatca 351  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||    
T  17836223 tgacattgcagcagctgctgcatcggaggtgttacctgtggaccctccctttcctggtgga-ccgacagacttatctttgctccactcttatgccagtca 17836321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 150 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 9493834 - 9493633
Alignment:
Q  150 aggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcag---cagcatgtaggaga 246  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |  |||    
T  9493834 aggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacagcacaatgtgactgatggtggatatgaccaggatcatataccagagcagtagcagcatgaactaga 9493735  T
Q  247 tgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgcc 346  Q
     ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  9493734 cgatgatgacattgcagcagcggctgccccggaggggttacctgtggaccctccctttcctggaggaccggaaaacctatctctgctgcactcttatgcc 9493635  T
Q  347 aa 348  Q
    ||    
T  9493634 aa 9493633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 151 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 46739542 - 46739341
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  46739542 ggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtgggtatgaccaggatcatataccacagcagcagcatgtaagagacgat 46739443  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagac-gacctatctttgctgcactcttatgccaat 349  Q
    |||||||||| | |||||| |||||| |||||||||  | | || |||||||||||||| ||| | ||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |    
T  46739442 gatgacattgcaacagctgatgccccagaggtgttacctatagatcctccctttcctggtgga-ccgacagacttatctttgctccactcttatgccagt 46739344  T
Q  350 cat 352  Q
    |||    
T  46739343 cat 46739341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 150 - 352
Target Start/End: Original strand, 36978622 - 36978827
Alignment:
Q  150 aggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccag---agcagcagcatgtaggaga 246  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||| |  |||    
T  36978622 aggtggagtacctgaattatcaggattaggtacaccacgatgtgattgatggtgggtatgaccaagatcatatatcagagaagcagcagcatgaaccaga 36978721  T
Q  247 tgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgcc 346  Q
     ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||  |  |||||||| || ||||||||| |    
T  36978722 cgatgatgacattgcagcagcggctgccccggaggtgttacatgtggaccctccctttcctggaggaccggaaaatatatctttgttgtactcttatgtc 36978821  T
Q  347 aatcat 352  Q
    ||||||    
T  36978822 aatcat 36978827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 150 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 47672151 - 47671950
Alignment:
Q  150 aggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagca---tgtaggaga 246  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||   || |  |||    
T  47672151 aggtggagtaccagaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtgggtatgaccagaatcatataccaaagcagcagcaacatgaaccaga 47672052  T
Q  247 tgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgcc 346  Q
     |||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| | ||  |||||||| |||||||||| ||||||    
T  47672051 cgatgatgaaattgcagcagtggctgccccggaggtgttacctgtggaccctccctttcctagaggaccggaaaacctatctctgctgcactcgtatgcc 47671952  T
Q  347 aa 348  Q
    ||    
T  47671951 aa 47671950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 131 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 11635704 - 11635575
Alignment:
Q  131 gtggttgatctgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagc 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  11635704 gtggttgatctgagtcagcaggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtaaccgatggtgggtatgaccaagatcatataccagagt 11635605  T
Q  231 agcagcatgtaggagatgatgatgacattg 260  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||    
T  11635604 agcaacatatagcagatgatgaggacattg 11635575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 151 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 15073296 - 15073101
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||     
T  15073296 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacagcatgatgtgacggatggtggatatgaccaggatcatataccacagcagcaggatgcaggagacgag 15073197  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgcc 346  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||| | |  ||| | || ||||| ||||||||||||    
T  15073196 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctacggaccctccctttcctggtggaccggctgacttgtccttgctccactcttatgcc 15073101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 151 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 42507105 - 42506947
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||     
T  42507105 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacagcatgatgtgacggatggtggatatgaccaggatcatataccacagcagcaggatgcaggagacgag 42507006  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctgg 309  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  42507005 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctacggaccctccctttcctgg 42506947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 151 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 17462316 - 17462121
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||| ||     
T  17462316 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacagcatgatgtgacggatggtggatatgaccaggatcatataccacatcagcaggatgcaggagacgag 17462217  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgcc 346  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||| | |  ||| | || ||||| ||||||||||||    
T  17462216 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctacggaccctccctttcctggtggaccggctgacttgtccttgctccactcttatgcc 17462121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 151 - 346
Target Start/End: Original strand, 17590898 - 17591093
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||| ||     
T  17590898 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacagcatgatgtgacggatggtggatatgaccaggatcatataccacatcagcaggatgcaggagacgag 17590997  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgcc 346  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||| | |  ||| | || ||||| ||||||||||||    
T  17590998 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctacggaccctccctttcctggtggaccggctgacttgtccttgctccactcttatgcc 17591093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 151 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 9370401 - 9370200
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||| |||||| ||     
T  9370401 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacgag 9370302  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgccaatc 350  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||| | |  ||| | || ||||| ||||||||||||| ||    
T  9370301 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctacggaccctccctttcctggtggaccggctgacttgtccttgctccactcttatgccagtc 9370202  T
Q  351 at 352  Q
    ||    
T  9370201 at 9370200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 151 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 35609437 - 35609242
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||| |||||| ||     
T  35609437 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacgag 35609338  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgcc 346  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||| | |  ||| | || ||||| ||||||||||||    
T  35609337 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctacggaccctccctttcctggtggaccggctgacttgtccttgctccactcttatgcc 35609242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 151 - 346
Target Start/End: Original strand, 41881552 - 41881747
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||| |||||| ||     
T  41881552 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacgag 41881651  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgcc 346  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||| | |  ||| | || ||||| ||||||||||||    
T  41881652 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctacggaccctccctttcctggtggaccggctgacttgtccttgctccactcttatgcc 41881747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 151 - 346
Target Start/End: Original strand, 48404419 - 48404614
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||| |||||| ||     
T  48404419 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacgag 48404518  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgcc 346  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||| | |  ||| | || ||||| ||||||||||||    
T  48404519 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctacggaccctccctttcctggtggaccggctgacttgtccttgctccactcttatgcc 48404614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Original strand, 10517820 - 10517872
Alignment:
Q  35 agcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggag 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  10517820 agcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 10517872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 95
Target Start/End: Original strand, 34739289 - 34739349
Alignment:
Q  35 agcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcagg 95  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  34739289 agcggccacattccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagttctcagg 34739349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 268 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 11633979 - 11633895
Alignment:
Q  268 tgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgccaatcat 352  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||| | || |||| ||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  11633979 tgctcccccggaggtgttacctgtggaccctcccttttctagaggaccggaagaccaatctttgttgcactcttatacaaatcat 11633895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 46739660 - 46739608
Alignment:
Q  35 agcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggag 87  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  46739660 agcggccacatcccaaagcggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 46739608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 15073415 - 15073366
Alignment:
Q  35 agcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagg 84  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  15073415 agcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcagg 15073366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 9493954 - 9493897
Alignment:
Q  33 aaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttc 90  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  |||  |||||||||||||||||    
T  9493954 aaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgatggggagatggttcagggagttc 9493897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 42507224 - 42507175
Alignment:
Q  35 agcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagg 84  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||| |||||    
T  42507224 agcggccacatcccaaagaggggtagaggtcagaggggagatggctcagg 42507175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 84
Target Start/End: Original strand, 41881438 - 41881482
Alignment:
Q  40 ccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagg 84  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  41881438 ccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcagg 41881482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 84
Target Start/End: Original strand, 48404305 - 48404349
Alignment:
Q  40 ccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagg 84  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  48404305 ccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcagg 48404349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 40)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 33 - 352
Target Start/End: Original strand, 43188971 - 43189290
Alignment:
Q  33 aaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggctacacagcctgaagaatcgcaggt 132  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  43188971 aaagcggccacatcccaaagaagggtagaggtcggagggtggatggttcatggaattcgcaggaggcttctcaggctacacagcttgaagagtcgtaggt 43189070  T
Q  133 ggttgatctgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcag 232  Q
    | |||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43189071 gattgatccgagccagcaagtagagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgttacggatggtgggtatgaccaggatcatatatcagagcag 43189170  T
Q  233 cagcatgtaggagatgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgc 332  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||     
T  43189171 caacatgtaggagatgatgatgacattgcagcagctgctgccccgaaggtgttacatatggaccctccctttcctagaggatcgggcgacctatctttgt 43189270  T
Q  333 tgcactcttatgccaatcat 352  Q
    || | |||||||||||||||    
T  43189271 tgtaatcttatgccaatcat 43189290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 33 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 5303389 - 5303070
Alignment:
Q  33 aaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggctacacagcctgaagaatcgcaggt 132  Q
    ||||||| ||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||    
T  5303389 aaagcgggcacatcccaaagatgagaagaggtcggagggtggatggttcagggagttcgcaagaggcttctcagactacacagcctgaagagtcgcaggt 5303290  T
Q  133 ggttgatctgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcag 232  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  5303289 ggttgattcgagccagcagggggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgttacggatggtgggtatgaccaggatcatatgccagagcat 5303190  T
Q  233 cagcatgtaggagatgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgc 332  Q
    || ||| ||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||     
T  5303189 caacatatagcagatgatgatgacattgcaacagctgttgccccggaggtgttacctgtggaccctccctttcttggaggaccggaagacctatctttga 5303090  T
Q  333 tgcactcttatgccaatcat 352  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  5303089 tgcactcttatgtcaatcat 5303070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 33 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 39846147 - 39845825
Alignment:
Q  33 aaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggctacacagcctgaagaatcgcaggt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  39846147 aaagcggccacatcccaaagaggggtaaaggtcgtagtgtggatggttcagggagttcgcaggaggcttctcaggctacacaacctgaagagtcgcaggt 39846048  T
Q  133 ggttgatctgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcag 232  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  39846047 ggttgacccgagccagcaggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgttacggatggtgggtatgaccaagatcatataccacagcag 39845948  T
Q  233 cagca---tgtaggagatgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctt 329  Q
    |||||   | ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  | |||||||| ||||| |||||||| | |  ||||||||||    
T  39845947 cagcaacatataacagatgatgatgacattgcagcagctgctgccccggatgtgttacctctggacccttccttttctggaggaccggtggacctatctt 39845848  T
Q  330 tgctgcactcttatgccaatcat 352  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  39845847 tgctgcactcttatgtcaatcat 39845825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 33 - 348
Target Start/End: Original strand, 35552566 - 35552881
Alignment:
Q  33 aaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggctacacagcctgaagaatcgcaggt 132  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  35552566 aaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggaggggggatggttcagggacttcgcacgaggcttctcaggctacacagcctgaagagtcgcatgt 35552665  T
Q  133 ggttgatctgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcag 232  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35552666 ggttgattcgagccaggaggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactggtggtgggtatgaccaggatcatatatcagagcag 35552765  T
Q  233 cagcatgtaggagatgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgc 332  Q
    || ||| ||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| |||||||||| ||||||| | || ||  ||||| |||    
T  35552766 catcatatagcagatgatgatgacattgcagcagtggctgccccagcagtgttacctttggagcctccctttcttggaggaccggaagatatatctctgc 35552865  T
Q  333 tgcactcttatgccaa 348  Q
    ||||||||||||||||    
T  35552866 tgcactcttatgccaa 35552881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 33 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 34822165 - 34821850
Alignment:
Q  33 aaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggctacacagcctgaagaatcgcaggt 132  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34822165 aaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggagggtggatggttcagggacttcgcaggaggcttcttaggctacacagcctgaagagtcgcaggt 34822066  T
Q  133 ggttgatctgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcag 232  Q
    |||| |||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  34822065 ggttcatccaagccaggaggtggagtacctgaattatcaggattaggtacaccacaatgtgactgatggtgggtatgaccatgatcatataccagagtag 34821966  T
Q  233 cagcatgtaggagatgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgc 332  Q
    || ||| ||  ||||||||||||| ||| |||| | ||||||||    ||||||  | |||| |||||||||||||||||||| || ||  ||||| ||     
T  34821965 caacatataacagatgatgatgactttgcagcaacggctgccccaacagtgttacctttggagcctccctttcctggaggatcggaagatatatctctgt 34821866  T
Q  333 tgcactcttatgccaa 348  Q
    ||||||||||||||||    
T  34821865 tgcactcttatgccaa 34821850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 151 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 41249154 - 41248953
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  41249154 ggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatatgactgatggtgggtatgaccaggatcatataccacagcagcaacatgtaggagatgat 41249055  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgccaatc 350  Q
     | ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| | |  ||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  41249054 aacgacattgcagcagctgctgccccggaggtgttacctgtggaccctccctttcctggcggaccggcagacttatctttgctgcactcttatgccagtc 41248955  T
Q  351 at 352  Q
    ||    
T  41248954 at 41248953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 152 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 39938246 - 39938046
Alignment:
Q  152 gtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgatg 251  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  39938246 gtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtgggtatgaccaggatcatataccacaacagcaacatgtaggagacgatg 39938147  T
Q  252 atgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgccaatca 351  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| | |  ||| |||||||||| ||||||||||||| |||    
T  39938146 atgacattgcagcagctgctgccccggaggtgttacctgtggaccctccctttcctggtggaccggcagacttatctttgctccactcttatgccagtca 39938047  T
Q  352 t 352  Q
    |    
T  39938046 t 39938046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 41 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 40076398 - 40076184
Alignment:
Q  41 cacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggctacacagcctgaagaatcgcaggtggttgatc 140  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||    
T  40076398 cacattccaaataggggaagaggtcggagggtggatggttcagggacttcgcaggaggcttctcaggctacacagtcagaagattcgcaagtggtcgatc 40076299  T
Q  141 tgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgt 240  Q
     ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  40076298 cgagtcaggaggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatagtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcaacatat 40076199  T
Q  241 aggagatgatgatga 255  Q
    |  ||||||||||||    
T  40076198 aacagatgatgatga 40076184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 151 - 352
Target Start/End: Original strand, 43212550 - 43212751
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||    
T  43212550 ggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgcgactgatggtggatatgaccaggatcatataccacagcagcaacatgtaggagacgat 43212649  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagac-gacctatctttgctgcactcttatgccaat 349  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||  || |||||||||| ||||||||||||| |    
T  43212650 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttatctgtggaccctccctttcctggtgga-ccgacatacttatctttgctccactcttatgccagt 43212748  T
Q  350 cat 352  Q
    |||    
T  43212749 cat 43212751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 151 - 352
Target Start/End: Original strand, 39602632 - 39602833
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |    
T  39602632 ggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtgggtatgaccaggatcatataccacaacagcagcatgtaggagacggt 39602731  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgccaatc 350  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||| | |  ||| ||||||| || ||||||||||||| ||    
T  39602732 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctatggaccctccctttcctggtggaccggcagacttatctttactccactcttatgccagtc 39602831  T
Q  351 at 352  Q
    ||    
T  39602832 at 39602833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 151 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 34369581 - 34369380
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  34369581 ggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtgggtatgaccaggatcatataccacagcagcagcatgtaggagacgat 34369482  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgccaatc 350  Q
    |||||||||  | ||| |||||| ||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| | ||     ||||| |||||||||||||||||||||    
T  34369481 gatgacattccaacagttgctgcaccgaaggtgttacctgtggactctccctttcctggaggaccggaaattatatctctgctgcactcttatgccaatc 34369382  T
Q  351 at 352  Q
    ||    
T  34369381 at 34369380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 151 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 34370909 - 34370708
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  34370909 ggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtgggtatgaccaggatcatataccacagcagcagcatgtaggagacgat 34370810  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgccaatc 350  Q
    |||||||||  | ||| |||||| ||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| | ||     ||||| |||||||||||||||||||||    
T  34370809 gatgacattccaacagttgctgcaccgaaggtgttacctgtggactctccctttcctggaggaccggaaattatatctctgctgcactcttatgccaatc 34370710  T
Q  351 at 352  Q
    ||    
T  34370709 at 34370708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 41 - 348
Target Start/End: Original strand, 37327754 - 37328056
Alignment:
Q  41 cacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggctacacagcctgaagaatcgcaggtggttgatc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| || |   ||||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||| | |    
T  37327754 cacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggggatggttcagggacttctcatg---cttctcaagctacacagcctgaagagtcgcatgtggttaacc 37327850  T
Q  141 tgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgt 240  Q
     || |||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  37327851 cgacccaggaggtggagtatttgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatg--gggtatgatcaggatcatatactagagcagcagcatat 37327948  T
Q  241 aggagatgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactct 340  Q
    |  ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||     |||||  |||||| |||||||||| ||||||| | ||  |  ||||| |||||||||||    
T  37327949 accagatgataatgacattgcagcagcggctgccccaacaatgttagctgtggagcctccctttcttggaggaccggaaaatatatctctgctgcactct 37328048  T
Q  341 tatgccaa 348  Q
    ||||||||    
T  37328049 tatgccaa 37328056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Original strand, 39253044 - 39253201
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  39253044 ggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtggatatgaccaggatcatataccacaacagcagcatgtaggagatgat 39253143  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctg 308  Q
    |||||||||| ||||||||||||   ||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  39253144 gatgacattgcagcagctgctgcattggaggtgttacctgttgaccctccctttcctg 39253201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 153 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 15035754 - 15035555
Alignment:
Q  153 tggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgatga 252  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| || |||||    
T  15035754 tggagtacctgaactatcaggatcaggtacagcatgatgtgactgatggtggatatgaccaggatcatataccacagcagcaggatgcaggtgacgatga 15035655  T
Q  253 tgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgccaatcat 352  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| | |  ||| | || ||||| |||||||||||| |||||    
T  15035654 tgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctgtggaccctccctttcctggtggaccggctgacttgtccttgctccactcttatgccgatcat 15035555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 152 - 309
Target Start/End: Original strand, 45065237 - 45065394
Alignment:
Q  152 gtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgatg 251  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| || |    
T  45065237 gtggagtacctgaactatcaggatcaggtacagcatgatgtgactgatggtggatatgaccaggatcatataccacagcagcaggatgcaggagacgagg 45065336  T
Q  252 atgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctgg 309  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  45065337 atgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctgtggaccctccctttcctgg 45065394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 146
Target Start/End: Original strand, 20858164 - 20858299
Alignment:
Q  11 cagagacaccggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggcta 110  Q
    ||||| |||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||    
T  20858164 cagagccaccggagggagaggcaaagcggtcacatcccaaagaggggaagaggtcggagagtggatggttcagggagttcacaggaggcttctcaagcta 20858263  T
Q  111 cacagcctgaagaatcgcaggtggttgatctgagcc 146  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20858264 cacagcctgaagagtcgcaggtggttgatctgagcc 20858299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 151 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 42484611 - 42484416
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||| |||||| |||    
T  42484611 ggtggagtacctgaactatcaggatcaagtacatcatgatgtgacggatggtggatatgaccaggatcatataccacattagcaggatgcaggagacgat 42484512  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgcc 346  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||| | |  ||| | || ||||| ||||||||||||    
T  42484511 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctacggaccctccctttcctggtggaccggctgacttgtccttgctccactcttatgcc 42484416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 151 - 346
Target Start/End: Original strand, 1053586 - 1053781
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||| |||||| ||     
T  1053586 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacgag 1053685  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgcc 346  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||| | |  ||| | || ||||| ||||||||||||    
T  1053686 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctacggaccctccctttcctggtggaccggctgacttgtccttgctccactcttatgcc 1053781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 348
Target Start/End: Original strand, 2985103 - 2985339
Alignment:
Q  105 aggctacacagcctgaagaatcgcaggtggttgatctgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgg 204  Q
    ||||||||||||||||| | || ||||||||||| | || |||| |||   ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  2985103 aggctacacagcctgaa-agtcacaggtggttgacccgacccaggagg---agtacctgaattatcaggattaggtacaccacgatgtcactgatggtgg 2985198  T
Q  205 gtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctcccttt 304  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||   | ||  |||| |||||||||||| |||||| |||||||| | || ||||  ||   | |||||||||    
T  2985199 gtatgaccagcaacatataccagagcagca---tataccagatcatgatgacattgcagcagcagctgccccagcggcgttacctgatcaacctcccttt 2985295  T
Q  305 cctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgccaa 348  Q
     |||||||| |||| ||   ||||||||||||||||||||||||    
T  2985296 tctggaggaccagaagatacatctttgctgcactcttatgccaa 2985339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 151 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 23021332 - 23021137
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||| |||||| ||     
T  23021332 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacgag 23021233  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgcc 346  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||| | |  ||| | || ||||| ||||||||||||    
T  23021232 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctacggaccctccctttcctggtggaccggctgacttgtccttgctccactcttatgcc 23021137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 151 - 346
Target Start/End: Original strand, 26660508 - 26660703
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||| |||||| ||     
T  26660508 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacgag 26660607  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgcc 346  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||| | |  ||| | || ||||| ||||||||||||    
T  26660608 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctacggaccctccctttcctggtggaccggctgacttgtccttgctccactcttatgcc 26660703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 151 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 24549 - 24391
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||| |||||| ||     
T  24549 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacgag 24450  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctgg 309  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  24449 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctacggaccctccctttcctgg 24391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 151 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 488730 - 488535
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||| |||||| ||     
T  488730 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacgag 488631  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgcc 346  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |   ||||||||||||||||| ||| | |  ||| | || ||||| ||||||||||||    
T  488630 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctaccgaccctccctttcctggtggaccggctgacttgtccttgctccactcttatgcc 488535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 177
Target Start/End: Original strand, 45128643 - 45128785
Alignment:
Q  36 gcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtgga-tggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggctacacagcctgaagaatcgcaggtgg 134  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||| ||||||||| | ||| |||||||||    |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  45128643 gcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcagaggggggaatggttcaggtacttctcaggaggctgttcaggctagacagcctgaagagtcgcaggtgg 45128742  T
Q  135 ttgatctgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatca 177  Q
    |||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45128743 ttgacccgagccaggaggtggagtacctgaattatcaggatca 45128785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 5677944 - 5678098
Alignment:
Q  17 caccggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggctacacagc 116  Q
    |||||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| |   |||||||  ||||||||||||    
T  5677944 caccggaaggagaggtaaagcgggaacatcccaaagaggggaagaggtcggaggggggatggttcaaggatttctc---aggcttctcaggctacacagc 5678040  T
Q  117 ctgaagaatcgcaggtggttgatctgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatca 177  Q
    ||||||| || ||||||||||| | ||||   |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5678041 ctgaagagtcacaggtggttgacccgagc---caggtggagtacctgaattatcaggatca 5678098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 280 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 25860004 - 25859932
Alignment:
Q  280 ggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgccaatcat 352  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25860004 ggtgttacctgtggaccctccctttcctgaaggatcggaagacctatctttgctgcactcttatgtcaatcat 25859932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 39938390 - 39938314
Alignment:
Q  11 cagagacaccggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggag 87  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  39938390 cagagtcaccggagggagaggtagagcggccacgtcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 39938314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Original strand, 43212407 - 43212483
Alignment:
Q  11 cagagacaccggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggag 87  Q
    ||||| |||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  43212407 cagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 43212483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 34369709 - 34369633
Alignment:
Q  11 cagagacaccggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggag 87  Q
    ||||| |||||||| ||| || | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  34369709 cagagtcaccggagggagaggcagagcgaccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 34369633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 34371037 - 34370961
Alignment:
Q  11 cagagacaccggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggag 87  Q
    ||||| |||||||| ||| || | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  34371037 cagagtcaccggagggagaggcagagcgaccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 34370961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Original strand, 39252925 - 39252977
Alignment:
Q  35 agcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggag 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  39252925 agcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 39252977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Original strand, 39602489 - 39602565
Alignment:
Q  11 cagagacaccggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggag 87  Q
    ||||| |||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||    
T  39602489 cagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttaagggag 39602565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 15035899 - 15035826
Alignment:
Q  11 cagagacaccggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagg 84  Q
    ||||| |||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  15035899 cagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcagg 15035826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 41249273 - 41249200
Alignment:
Q  17 caccggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttc 90  Q
    |||||||| ||| || | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||| |||||||||||||    
T  41249273 caccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagagaggtagaggtcggaggggagatagttcagggagttc 41249200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 42484728 - 42484681
Alignment:
Q  37 cggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagg 84  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  42484728 cggccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcagg 42484681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 488844 - 488800
Alignment:
Q  40 ccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagg 84  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  488844 ccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcagg 488800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 84
Target Start/End: Original strand, 1053472 - 1053516
Alignment:
Q  40 ccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagg 84  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  1053472 ccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcagg 1053516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 23021446 - 23021402
Alignment:
Q  40 ccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagg 84  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  23021446 ccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcagg 23021402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 84
Target Start/End: Original strand, 26660394 - 26660438
Alignment:
Q  40 ccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagg 84  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  26660394 ccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcagg 26660438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0238 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0238
Description:

Target: scaffold0238; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 41 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 18097 - 17793
Alignment:
Q  41 cacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggctacacagcctgaagaatcgcaggtggttgatc 140  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| | ||| |||||| |||||    
T  18097 cacatcctaaagaggggaagaggtcggagggtgggtggttcagggagttcgcaggaggcttctcaggatacacagcctgaaaagtcgtaggtgggtgatc 17998  T
Q  141 tgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgt 240  Q
     || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  17997 cgaaccagcaggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgaccgatagtgggtatgaccaggatcatataccaaagcagcagcatat 17898  T
Q  241 aggagatgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactct 340  Q
    || ||||||||||||||||| |||||   ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  17897 agaagatgatgatgacattgcagcagtgactgcccccgaggtgttacctgtggaccctccctttcttggaggatcggaagacctatctttgctgcactct 17798  T
Q  341 tatgc 345  Q
    |||||    
T  17797 tatgc 17793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 12)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 33 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 6319713 - 6319398
Alignment:
Q  33 aaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggctacacagcctgaagaatcgcaggt 132  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  6319713 aaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgtacggtggatagttcagggacttcgcaggaggcttctcaggctacacagcctgaagagtcgcatgt 6319614  T
Q  133 ggttgatctgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcag 232  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6319613 ggttgatccgagccaggaggtggagtacctgaattatcaggataatgtacaccatgatgtgactgatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcag 6319514  T
Q  233 cagcatgtaggagatgatgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgc 332  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||  |  ||||||  | | || |||||||||||||||||| | || ||  ||||| |||    
T  6319513 cagcatatagcagatgatgatgacattgcagcagcgcctgccctagcagtgttacctttcgagcctccctttcctggaggaccggaagatatatctctgc 6319414  T
Q  333 tgcactcttatgccaa 348  Q
    ||||||||||||||||    
T  6319413 tgcactcttatgccaa 6319398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 33 - 276
Target Start/End: Original strand, 24722793 - 24723036
Alignment:
Q  33 aaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcaggaggcttcaaaggctacacagcctgaagaatcgcaggt 132  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||   ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  24722793 aaagcgggcacattccaaagaggggaagaggttagagaggggatggttcagggacttcgcaggaggcttctcaggctacacagccttaagagtcgcaggt 24722892  T
Q  133 ggttgatctgagccagcaggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcag 232  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  24722893 ggttgatctgagccaggaggtggagtacctgaattatcaagatcaggtacaccacgatgtgactaatggtgggtatgaccaggatcatataccagagtga 24722992  T
Q  233 cagcatgtaggagatgatgatgacattgtagcagctgctgcccc 276  Q
    |||||| ||| | |||| |||||||||| || ||| ||||||||    
T  24722993 cagcatatagcatatgacgatgacattgcagaagcggctgcccc 24723036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 151 - 352
Target Start/End: Original strand, 27617777 - 27617978
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||     
T  27617777 ggtggagtacctgaactatcagaatcaggtacagcatgatgtgacggatggtggatatgaccaggatcatataccacagcagcaggatgcaggagacgag 27617876  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgccaatc 350  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |  ||||||||| |||||||| ||| | || ||||| || ||||| |||||||||||| |||    
T  27617877 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctacggaccctccatttcctggtggaccggaggacctgtcattgctccactcttatgccgatc 27617976  T
Q  351 at 352  Q
    ||    
T  27617977 at 27617978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 153 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 24087779 - 24087581
Alignment:
Q  153 tggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagc---atgtaggagatga 249  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |   ||| |  | |  |    
T  24087779 tggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtgggtatgaccatgatcatatactagagcagcaacaatatgaaccaaacaa 24087680  T
Q  250 tgatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgccaa 348  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||| | ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  24087679 tgatgacattgcagcagcggctgtcccggaggtgttacctgtggaccctccctttcttgaaggaccggaaaacctatctcagctgcgctcttatgccaa 24087581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 151 - 346
Target Start/End: Original strand, 6202210 - 6202405
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||| |||||| ||     
T  6202210 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacgag 6202309  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgcc 346  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||| | |  ||| | || ||||| ||||||||||||    
T  6202310 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctacggaccctccctttcctggtggaccggctgacttgtccttgctccactcttatgcc 6202405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 151 - 346
Target Start/End: Original strand, 11689177 - 11689372
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||| |||||| ||     
T  11689177 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacgag 11689276  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgcc 346  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||| | |  ||| | || ||||| ||||||||||||    
T  11689277 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctacggaccctccctttcctggtggaccggctgacttgtccttgctccactcttatgcc 11689372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 151 - 346
Target Start/End: Original strand, 22302242 - 22302437
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||| |||||| ||     
T  22302242 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacgag 22302341  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgcc 346  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||| | |  ||| | || ||||| ||||||||||||    
T  22302342 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctacggaccctccctttcctggtggaccggctgacttgtccttgctccactcttatgcc 22302437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 151 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 30828663 - 30828468
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgat 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||| |||||| ||     
T  30828663 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacgag 30828564  T
Q  251 gatgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttatttgtggaccctccctttcctggaggatcagacgacctatctttgctgcactcttatgcc 346  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||| | |  ||| | || ||||| ||||||||||||    
T  30828563 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctacggaccctccctttcctggtggaccggctgacttgtccttgctccactcttatgcc 30828468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 84
Target Start/End: Original strand, 6202096 - 6202140
Alignment:
Q  40 ccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagg 84  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  6202096 ccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcagg 6202140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 84
Target Start/End: Original strand, 11689063 - 11689107
Alignment:
Q  40 ccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagg 84  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  11689063 ccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcagg 11689107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 84
Target Start/End: Original strand, 22302128 - 22302172
Alignment:
Q  40 ccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagg 84  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  22302128 ccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcagg 22302172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 30828777 - 30828733
Alignment:
Q  40 ccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagg 84  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  30828777 ccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcagg 30828733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 14650 - 14609
Alignment:
Q  151 ggtggagtacctgaattaacaggatcaggtacaccacgatgt 192  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14650 ggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgt 14609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 14793 - 14717
Alignment:
Q  11 cagagacaccggagagagcggtaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggag 87  Q
    ||||| |||||||| ||| || | |||| |||||||||||||| || |||||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  14793 cagagccaccggagggagaggcagagcgcccacatcccaaagaaggttagaggtcggaagggagatggttcagggag 14717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 95
Target Start/End: Original strand, 11185 - 11247
Alignment:
Q  33 aaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggagttcgcagg 95  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| ||| ||||    
T  11185 aaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggaggggtgatggttcagggacttctcagg 11247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University