View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6293_low_9 (Length: 250)

Name: NF6293_low_9
Description: NF6293
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6293_low_9
NF6293_low_9
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (11-239)||(15388178-15388406)
chr4 (11-236)||(14760106-14760331)
chr4 (11-236)||(14668260-14668485)
chr4 (11-236)||(5009119-5009344)
chr4 (11-236)||(6573102-6573327)
chr4 (11-236)||(17016290-17016515)
chr4 (11-236)||(34185760-34185985)
chr4 (11-236)||(18313978-18314203)
chr4 (11-236)||(24589161-24589386)
chr4 (11-236)||(54836635-54836860)
chr4 (11-236)||(14101787-14102012)
chr4 (11-236)||(20335221-20335446)
chr4 (11-236)||(24115906-24116131)
chr4 (11-236)||(15231116-15231341)
chr4 (11-236)||(27160117-27160342)
chr4 (11-236)||(36341317-36341542)
chr4 (11-224)||(39853893-39854106)
chr4 (11-234)||(1903500-1903723)
chr4 (11-224)||(18797414-18797627)
chr4 (11-236)||(33670600-33670825)
chr4 (11-233)||(15281737-15281959)
chr4 (11-236)||(21972945-21973170)
chr4 (11-236)||(30757004-30757229)
chr4 (11-236)||(31123312-31123537)
chr4 (11-236)||(40102437-40102662)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (11-239)||(27394789-27395017)
chr2 (11-236)||(23125357-23125582)
chr2 (11-236)||(12658766-12658991)
chr2 (11-236)||(34294384-34294609)
chr2 (11-236)||(37948651-37948876)
chr2 (11-233)||(27431230-27431452)
chr2 (18-236)||(28885437-28885655)
chr2 (11-236)||(20841143-20841368)
chr2 (11-224)||(27806945-27807158)
chr2 (11-236)||(39048608-39048833)
chr2 (11-236)||(11631973-11632198)
chr2 (11-224)||(13933336-13933549)
chr2 (11-224)||(257442-257655)
chr2 (11-224)||(12590050-12590263)
chr2 (11-236)||(39893299-39893524)
chr2 (11-236)||(40236738-40236963)
chr2 (11-233)||(19453212-19453434)
chr2 (11-236)||(16826127-16826352)
chr2 (11-236)||(16895128-16895353)
chr2 (11-236)||(19413290-19413515)
chr2 (11-236)||(31879516-31879741)
chr2 (11-236)||(32053033-32053258)
chr2 (11-236)||(34864914-34865139)
chr2 (11-236)||(37380907-37381132)
chr2 (11-236)||(37682684-37682909)
chr2 (11-236)||(37697949-37698174)
chr2 (11-236)||(37928599-37928824)
chr2 (11-224)||(9346775-9346988)
chr2 (11-236)||(12713390-12713615)
chr2 (11-224)||(21673964-21674177)
chr2 (11-214)||(21699960-21700163)
chr2 (16-125)||(31890285-31890394)
chr2 (16-125)||(3785834-3785943)
chr2 (16-125)||(16164821-16164930)
chr2 (16-125)||(22924942-22925051)
chr2 (16-125)||(27119865-27119974)
chr2 (16-125)||(27779575-27779684)
chr2 (16-125)||(27819332-27819441)
chr2 (22-125)||(34158185-34158288)
chr2 (11-85)||(27827841-27827915)
chr2 (132-194)||(12383932-12383994)
chr2 (132-194)||(22949665-22949727)
[»] chr8 (20 HSPs)
chr8 (11-239)||(22077672-22077900)
chr8 (11-236)||(27605666-27605891)
chr8 (11-236)||(18793934-18794159)
chr8 (11-236)||(14560854-14561079)
chr8 (11-236)||(2134021-2134246)
chr8 (11-236)||(19691328-19691553)
chr8 (11-236)||(9357855-9358080)
chr8 (11-224)||(19205123-19205336)
chr8 (11-236)||(29832556-29832781)
chr8 (11-236)||(19677677-19677902)
chr8 (11-224)||(28358713-28358926)
chr8 (11-236)||(33261964-33262189)
chr8 (11-236)||(18712714-18712939)
chr8 (11-236)||(12089484-12089709)
chr8 (11-236)||(31357758-31357983)
chr8 (11-236)||(31486632-31486857)
chr8 (16-125)||(15770915-15771024)
chr8 (16-125)||(44564325-44564434)
chr8 (22-109)||(21344943-21345030)
chr8 (174-236)||(16286631-16286694)
[»] chr6 (47 HSPs)
chr6 (11-236)||(27287107-27287332)
chr6 (11-236)||(27022364-27022589)
chr6 (11-236)||(29552785-29553010)
chr6 (11-236)||(13295694-13295919)
chr6 (11-236)||(15421063-15421288)
chr6 (11-236)||(22931627-22931852)
chr6 (11-236)||(23854072-23854297)
chr6 (11-236)||(24866944-24867169)
chr6 (11-236)||(27626454-27626679)
chr6 (11-236)||(16677368-16677593)
chr6 (11-236)||(27179684-27179909)
chr6 (11-236)||(27269330-27269555)
chr6 (11-236)||(3699311-3699536)
chr6 (11-236)||(4760991-4761216)
chr6 (11-236)||(17089186-17089411)
chr6 (11-236)||(27010959-27011184)
chr6 (11-236)||(34461249-34461474)
chr6 (22-236)||(26921605-26921819)
chr6 (22-236)||(16753049-16753263)
chr6 (11-236)||(27060734-27060959)
chr6 (11-236)||(4528513-4528738)
chr6 (11-236)||(4542517-4542742)
chr6 (11-236)||(4720878-4721103)
chr6 (11-236)||(27488361-27488586)
chr6 (11-236)||(29504644-29504869)
chr6 (11-236)||(29576242-29576467)
chr6 (11-236)||(30554759-30554984)
chr6 (11-214)||(20171797-20172000)
chr6 (11-214)||(22163991-22164194)
chr6 (11-236)||(16940770-16940995)
chr6 (11-236)||(26113155-26113380)
chr6 (11-236)||(28210682-28210907)
chr6 (11-236)||(4776108-4776333)
chr6 (11-125)||(22455857-22455971)
chr6 (11-163)||(26992096-26992248)
chr6 (11-125)||(26775370-26775484)
chr6 (11-125)||(27358853-27358967)
chr6 (11-125)||(27449196-27449310)
chr6 (16-125)||(14142142-14142251)
chr6 (16-125)||(26789155-26789264)
chr6 (16-125)||(27197524-27197633)
chr6 (16-125)||(27251602-27251711)
chr6 (16-119)||(8902451-8902554)
chr6 (11-136)||(33373174-33373299)
chr6 (11-119)||(28163836-28163944)
chr6 (16-125)||(13520940-13521048)
chr6 (132-194)||(9136217-9136279)
[»] chr3 (62 HSPs)
chr3 (11-236)||(5593200-5593425)
chr3 (11-236)||(18054454-18054679)
chr3 (11-236)||(18273895-18274120)
chr3 (11-236)||(18289196-18289421)
chr3 (11-236)||(18304497-18304722)
chr3 (11-240)||(18333818-18334047)
chr3 (11-234)||(4793478-4793701)
chr3 (11-233)||(8286313-8286535)
chr3 (11-236)||(6205095-6205320)
chr3 (11-236)||(8299163-8299388)
chr3 (11-236)||(21677895-21678120)
chr3 (11-240)||(35883954-35884183)
chr3 (11-236)||(4686847-4687072)
chr3 (11-236)||(4724823-4725048)
chr3 (11-236)||(15737937-15738162)
chr3 (11-236)||(15889548-15889773)
chr3 (11-236)||(22384421-22384646)
chr3 (11-236)||(29145599-29145824)
chr3 (11-236)||(29661813-29662038)
chr3 (11-236)||(8214927-8215152)
chr3 (11-236)||(20069232-20069457)
chr3 (11-224)||(32442355-32442568)
chr3 (11-236)||(7076398-7076623)
chr3 (11-224)||(20573686-20573899)
chr3 (11-236)||(28024474-28024699)
chr3 (11-236)||(28112797-28113022)
chr3 (11-236)||(47026645-47026870)
chr3 (11-236)||(48469119-48469344)
chr3 (11-236)||(5606157-5606382)
chr3 (11-236)||(10399336-10399561)
chr3 (11-236)||(28342369-28342594)
chr3 (42-236)||(11107226-11107420)
chr3 (11-236)||(4343519-4343744)
chr3 (11-236)||(4420107-4420332)
chr3 (11-236)||(5016906-5017131)
chr3 (11-236)||(5470180-5470405)
chr3 (11-236)||(6539585-6539810)
chr3 (11-236)||(7999752-7999977)
chr3 (11-236)||(10646265-10646490)
chr3 (11-236)||(17981792-17982017)
chr3 (11-236)||(18228388-18228613)
chr3 (11-224)||(18245945-18246158)
chr3 (11-236)||(22867691-22867916)
chr3 (11-236)||(22882750-22882975)
chr3 (11-233)||(16621333-16621555)
chr3 (11-236)||(24331355-24331580)
chr3 (11-236)||(31961298-31961523)
chr3 (11-236)||(51785215-51785440)
chr3 (11-231)||(19697687-19697907)
chr3 (16-125)||(17992779-17992888)
chr3 (11-125)||(4627088-4627202)
chr3 (16-125)||(32293931-32294040)
chr3 (11-125)||(5714376-5714490)
chr3 (11-125)||(5725286-5725400)
chr3 (11-125)||(5766968-5767082)
chr3 (16-125)||(31033084-31033193)
chr3 (132-194)||(15592875-15592937)
chr3 (70-194)||(15918751-15918875)
chr3 (11-98)||(6963276-6963363)
chr3 (132-194)||(5950766-5950828)
chr3 (138-194)||(20443351-20443407)
chr3 (138-194)||(41440477-41440533)
[»] chr7 (37 HSPs)
chr7 (11-236)||(10913554-10913779)
chr7 (11-236)||(2157802-2158027)
chr7 (11-224)||(26516032-26516245)
chr7 (11-236)||(26534558-26534783)
chr7 (11-236)||(2106848-2107073)
chr7 (11-236)||(11421464-11421689)
chr7 (11-236)||(26271771-26271996)
chr7 (11-236)||(26438485-26438710)
chr7 (11-236)||(45390448-45390673)
chr7 (11-233)||(16515115-16515337)
chr7 (11-236)||(5131224-5131449)
chr7 (11-236)||(5144025-5144250)
chr7 (11-236)||(22145423-22145648)
chr7 (11-236)||(26316533-26316758)
chr7 (11-233)||(10844851-10845073)
chr7 (25-233)||(16044550-16044758)
chr7 (11-233)||(10842679-10842901)
chr7 (11-236)||(3448534-3448759)
chr7 (11-236)||(4141931-4142156)
chr7 (11-236)||(4202617-4202842)
chr7 (11-236)||(11444115-11444340)
chr7 (11-224)||(31561075-31561288)
chr7 (11-236)||(24589219-24589444)
chr7 (11-224)||(16748202-16748415)
chr7 (11-236)||(26666599-26666824)
chr7 (11-214)||(16446691-16446894)
chr7 (88-236)||(9621878-9622026)
chr7 (16-125)||(2776593-2776702)
chr7 (16-125)||(26512386-26512495)
chr7 (16-125)||(26681796-26681905)
chr7 (16-125)||(31127246-31127355)
chr7 (16-125)||(39209829-39209938)
chr7 (16-119)||(45734658-45734761)
chr7 (16-125)||(31087312-31087421)
chr7 (132-194)||(9469590-9469652)
chr7 (132-194)||(16393240-16393302)
chr7 (132-194)||(30369752-30369814)
[»] chr5 (58 HSPs)
chr5 (11-236)||(15655455-15655680)
chr5 (11-236)||(41677943-41678168)
chr5 (11-236)||(11552593-11552818)
chr5 (11-236)||(24973144-24973369)
chr5 (11-236)||(33295766-33295991)
chr5 (11-236)||(33780727-33780952)
chr5 (11-236)||(22995814-22996039)
chr5 (11-236)||(23629208-23629433)
chr5 (11-236)||(24684842-24685067)
chr5 (11-236)||(18372231-18372456)
chr5 (11-236)||(31434702-31434927)
chr5 (11-236)||(37355340-37355565)
chr5 (11-224)||(40470247-40470460)
chr5 (11-233)||(23895447-23895669)
chr5 (11-236)||(3792779-3793004)
chr5 (11-236)||(9320714-9320939)
chr5 (11-236)||(12135413-12135638)
chr5 (11-236)||(26483632-26483857)
chr5 (11-236)||(34619756-34619981)
chr5 (16-236)||(43081493-43081713)
chr5 (11-236)||(13321527-13321752)
chr5 (11-236)||(18497422-18497647)
chr5 (11-236)||(28652480-28652705)
chr5 (11-236)||(32592971-32593196)
chr5 (11-236)||(37767688-37767913)
chr5 (11-236)||(5641026-5641251)
chr5 (11-236)||(6877543-6877768)
chr5 (11-236)||(8662172-8662397)
chr5 (11-236)||(24586612-24586837)
chr5 (11-236)||(28956482-28956707)
chr5 (11-236)||(30032666-30032891)
chr5 (11-236)||(30155269-30155494)
chr5 (11-236)||(30171707-30171932)
chr5 (11-236)||(30937873-30938098)
chr5 (11-236)||(31823104-31823329)
chr5 (11-236)||(33519618-33519843)
chr5 (11-236)||(37668183-37668408)
chr5 (11-236)||(37758221-37758446)
chr5 (11-230)||(22891707-22891926)
chr5 (11-233)||(25203519-25203741)
chr5 (11-233)||(25267674-25267896)
chr5 (11-236)||(2514300-2514525)
chr5 (11-224)||(15755549-15755762)
chr5 (11-236)||(24727207-24727432)
chr5 (11-136)||(13183490-13183615)
chr5 (11-128)||(13439380-13439497)
chr5 (11-125)||(18125113-18125227)
chr5 (16-125)||(9547411-9547520)
chr5 (16-125)||(11326986-11327095)
chr5 (16-125)||(29887899-29888008)
chr5 (16-125)||(33878480-33878588)
chr5 (11-98)||(351912-351999)
chr5 (132-194)||(5440043-5440105)
chr5 (132-194)||(11944240-11944302)
chr5 (132-194)||(15784543-15784605)
chr5 (132-194)||(17957376-17957438)
chr5 (132-194)||(36375780-36375842)
chr5 (132-194)||(37000434-37000496)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (11-233)||(3301-3523)
scaffold0089 (97-236)||(43877-44016)
scaffold0089 (162-233)||(32096-32167)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (11-236)||(9267-9492)
[»] scaffold0143 (3 HSPs)
scaffold0143 (11-236)||(30524-30749)
scaffold0143 (11-233)||(19304-19526)
scaffold0143 (11-125)||(7302-7416)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (11-224)||(21894549-21894762)
chr1 (11-236)||(51641451-51641676)
chr1 (11-230)||(20339101-20339320)
chr1 (11-224)||(10965910-10966123)
chr1 (11-236)||(3644365-3644593)
chr1 (11-236)||(28588218-28588443)
chr1 (11-236)||(10948310-10948535)
chr1 (11-224)||(41790110-41790323)
chr1 (11-232)||(16204834-16205055)
chr1 (25-233)||(20464212-20464420)
chr1 (16-125)||(28153080-28153189)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (11-236)||(15812-16037)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (11-230)||(1424-1643)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (11-236)||(12802-13027)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (11-236)||(22991-23216)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (11-236)||(9253-9478)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (11-236)||(11728-11953)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (11-236)||(5979-6204)
scaffold0159 (163-236)||(23110-23183)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (11-236)||(11180-11405)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (11-233)||(9279-9501)
[»] scaffold0748 (1 HSPs)
scaffold0748 (11-233)||(5471-5693)
[»] scaffold1888 (1 HSPs)
scaffold1888 (127-236)||(1154-1263)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (22-225)||(43541-43754)
[»] scaffold0094 (1 HSPs)
scaffold0094 (132-194)||(35161-35223)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (107-194)||(29443-29530)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (160-221)||(33706-33770)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 11 - 239
Target Start/End: Original strand, 15388178 - 15388406
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15388178 acataatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 15388277  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15388278 cacaataggttgattctttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 15388377  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgc 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15388378 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgc 15388406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 14760106 - 14760331
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  14760106 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 14760205  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  14760206 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 14760305  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  14760306 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 14760331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 14668485 - 14668260
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  14668485 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 14668386  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14668385 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 14668286  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
     ||| ||||||||| |||||||||||    
T  14668285 tctctgacttgcttctcggtctgtgg 14668260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 5009344 - 5009119
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  5009344 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 5009245  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| || |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  5009244 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 5009145  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  5009144 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 5009119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 6573327 - 6573102
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  6573327 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 6573228  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6573227 tacaataggctgattctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 6573128  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  6573127 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 6573102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 17016515 - 17016290
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  17016515 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 17016416  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  17016415 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 17016316  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  17016315 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 17016290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 34185760 - 34185985
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  34185760 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 34185859  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34185860 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggtccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 34185959  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  34185960 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 34185985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 18313978 - 18314203
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  18313978 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttcca 18314077  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| || || ||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18314078 tacaataggctgattcttgctcagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 18314177  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  18314178 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 18314203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 24589161 - 24589386
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| | ||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  24589161 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 24589260  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24589261 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 24589360  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  24589361 cctctgacttgcttctcagtctgtgg 24589386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 54836860 - 54836635
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  54836860 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 54836761  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  54836760 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcagacgtccgaggaaa 54836661  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  54836660 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 54836635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 14102012 - 14101787
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  14102012 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattcca 14101913  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||     
T  14101912 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 14101813  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  14101812 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 14101787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 20335221 - 20335446
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  20335221 acataatcaaaggccttccttctacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 20335320  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  20335321 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 20335420  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||||    
T  20335421 cctctgacttgcttctcggtccgtgg 20335446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24116131 - 24115906
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  24116131 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 24116032  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     || | ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  24116031 tacgacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 24115932  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  24115931 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 24115906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 15231341 - 15231116
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||| | ||||||||||  |||||    
T  15231341 acataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 15231242  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| || |||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  15231241 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 15231142  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| |||||| || |||||||||||    
T  15231141 cctctgacttgtttctcggtctgtgg 15231116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 27160117 - 27160342
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  27160117 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 27160216  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27160217 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 27160316  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  27160317 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 27160342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 36341317 - 36341542
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||    
T  36341317 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggctttcatcattcca 36341416  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     || ||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  36341417 tacgataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 36341516  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| |||||| || || ||||||||    
T  36341517 cctctgacttgtttctctgtctgtgg 36341542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 39854106 - 39853893
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  39854106 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 39854007  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| || || ||||| || |  ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39854006 tacaataggctggttctttctaagcagcttgaagataggcccgcaggttgtggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 39853907  T
Q  211 cctcggacttgctt 224  Q
    |||| |||||||||    
T  39853906 cctctgacttgctt 39853893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1903723 - 1903500
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||| | |||||||||   |||||    
T  1903723 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcaacgttcca 1903624  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1903623 tacaataggctgattcttcctgagtaacttgaagatcggcccgcaggctgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 1903524  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgt 234  Q
    |||| |||||| || |||||||||    
T  1903523 cctctgacttgtttctcggtctgt 1903500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Original strand, 18797414 - 18797627
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| || |  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  18797414 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtacttcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 18797513  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| || |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18797514 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 18797613  T
Q  211 cctcggacttgctt 224  Q
    |||| |||||||||    
T  18797614 cctctgacttgctt 18797627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 33670600 - 33670825
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  33670600 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctgtcaaaagcttcttggcattcatcattcca 33670699  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||     
T  33670700 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgcgatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 33670799  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  33670800 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 33670825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 15281737 - 15281959
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||   |||||||||||||| ||| | ||||||||||  |||||    
T  15281737 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaaatcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 15281836  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| || |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  15281837 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 15281936  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctg 233  Q
    |||| |||||| || ||||||||    
T  15281937 cctctgacttgtttctcggtctg 15281959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 21973170 - 21972945
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  21973170 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 21973071  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  21973070 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 21972971  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  21972970 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 21972945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 30757229 - 30757004
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  30757229 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 30757130  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||    
T  30757129 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaa 30757030  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  30757029 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 30757004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 31123312 - 31123537
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  31123312 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 31123411  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  31123412 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 31123511  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  31123512 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 31123537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 40102437 - 40102662
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  40102437 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 40102536  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || || || ||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  40102537 tacaacaggctggttcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 40102636  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  40102637 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 40102662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 11 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 27395017 - 27394789
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27395017 acataatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 27394918  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27394917 cacaataggttgattctttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 27394818  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgc 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27394817 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgc 27394789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 23125357 - 23125582
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  23125357 acataatcaaaggccttccttccacgggtggcacaaggataggtggttccagcaggtaatttttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 23125456  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23125457 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 23125556  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  23125557 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 23125582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12658991 - 12658766
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  12658991 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 12658892  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  12658891 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaa 12658792  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||    
T  12658791 cctctgacttgcttctcggtttgtgg 12658766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 34294609 - 34294384
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||    
T  34294609 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 34294510  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  34294509 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 34294410  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  34294409 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 34294384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 37948651 - 37948876
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  37948651 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 37948750  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| || || ||||| || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  37948751 tacaataggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 37948850  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  37948851 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 37948876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 27431230 - 27431452
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  27431230 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 27431329  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| | ||| ||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  27431330 tacaataggctaattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaa 27431429  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctg 233  Q
    |||| ||||||||| ||||||||    
T  27431430 cctctgacttgcttctcggtctg 27431452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 18 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 28885655 - 28885437
Alignment:
Q  18 caagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaata 117  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||| ||||| ||||| || ||||||| |||||| ||||||    
T  28885655 caagggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctgtcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaata 28885556  T
Q  118 ggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaacctcgga 217  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  28885555 ggttgattctttctgagtagcttgaagaccggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctga 28885456  T
Q  218 cttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  28885455 cttgcttctcggtctgtgg 28885437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20841368 - 20841143
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||  || ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  20841368 acataatcaaaggccttccttccatgggtgggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 20841269  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  20841268 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 20841169  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  20841168 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 20841143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 27807158 - 27806945
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  27807158 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 27807059  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| || || ||||| || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27807058 tacaataggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 27806959  T
Q  211 cctcggacttgctt 224  Q
    |||| |||||||||    
T  27806958 cctctgacttgctt 27806945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 39048608 - 39048833
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  39048608 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 39048707  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| || || ||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39048708 tacaataggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 39048807  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    ||||  |||||||| || ||||||||    
T  39048808 cctcttacttgcttctcagtctgtgg 39048833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 11631973 - 11632198
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  11631973 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 11632072  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| || |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  11632073 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaag 11632172  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  11632173 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 11632198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Original strand, 13933336 - 13933549
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  13933336 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 13933435  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| || || ||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13933436 tacaataggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 13933535  T
Q  211 cctcggacttgctt 224  Q
    |||| |||||||||    
T  13933536 cctctgacttgctt 13933549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Original strand, 257442 - 257655
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  257442 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 257541  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| || |  ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  257542 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggtccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 257641  T
Q  211 cctcggacttgctt 224  Q
    |||| |||||||||    
T  257642 cctctgacttgctt 257655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12590263 - 12590050
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||    
T  12590263 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 12590164  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  12590163 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 12590064  T
Q  211 cctcggacttgctt 224  Q
    |||| |||||||||    
T  12590063 cctctgacttgctt 12590050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 39893524 - 39893299
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  39893524 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 39893425  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39893424 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 39893325  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  39893324 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 39893299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 40236963 - 40236738
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  40236963 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcgaaagcttcttggcattcattattcca 40236864  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| || || ||||| || |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  40236863 tacaataggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 40236764  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  40236763 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 40236738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 19453212 - 19453434
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||| |||||| ||| | ||||||||||  |||||    
T  19453212 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgccatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 19453311  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| || |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  19453312 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 19453411  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctg 233  Q
    |||| |||||| || ||||||||    
T  19453412 cctctgacttgtttctcggtctg 19453434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 16826127 - 16826352
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  16826127 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 16826226  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  16826227 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 16826326  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  16826327 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 16826352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16895353 - 16895128
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  16895353 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 16895254  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  16895253 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 16895154  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  16895153 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 16895128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 19413290 - 19413515
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  19413290 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 19413389  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  19413390 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 19413489  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  19413490 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 19413515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 31879741 - 31879516
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  31879741 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 31879642  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| || |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  31879641 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccacaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 31879542  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  31879541 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 31879516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 32053258 - 32053033
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  32053258 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 32053159  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  32053158 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 32053059  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  32053058 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 32053033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 34865139 - 34864914
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  34865139 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 34865040  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  34865039 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 34864940  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  34864939 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 34864914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 37381132 - 37380907
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  37381132 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 37381033  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| ||||| || |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||  | |||||||||    
T  37381032 tacaacaggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaagtgtccgaggaaa 37380933  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| |||||| || |||||||||||    
T  37380932 cctctgacttgtttctcggtctgtgg 37380907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 37682684 - 37682909
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  37682684 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 37682783  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  37682784 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 37682883  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  37682884 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 37682909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 37697949 - 37698174
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  37697949 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 37698048  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  37698049 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 37698148  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  37698149 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 37698174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 37928824 - 37928599
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  37928824 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 37928725  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  37928724 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 37928625  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  37928624 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 37928599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Original strand, 9346775 - 9346988
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  9346775 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctgtcaaaagcttcttggcattcatcattcca 9346874  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  9346875 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaag 9346974  T
Q  211 cctcggacttgctt 224  Q
    |||| |||||||||    
T  9346975 cctctgacttgctt 9346988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 12713390 - 12713615
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  || ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  12713390 acatgatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 12713489  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  12713490 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 12713589  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  12713590 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 12713615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Original strand, 21673964 - 21674177
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  21673964 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 21674063  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  21674064 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 21674163  T
Q  211 cctcggacttgctt 224  Q
    |||| |||||||||    
T  21674164 cctctgacttgctt 21674177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 214
Target Start/End: Original strand, 21699960 - 21700163
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||| | ||||||||||  |||||    
T  21699960 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggattggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 21700059  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| || |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  21700060 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 21700159  T
Q  211 cctc 214  Q
    ||||    
T  21700160 cctc 21700163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 125
Target Start/End: Original strand, 31890285 - 31890394
Alignment:
Q  16 atcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 115  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  31890285 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattgttccatacaa 31890384  T
Q  116 taggttgatt 125  Q
    |||| |||||    
T  31890385 taggctgatt 31890394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 3785943 - 3785834
Alignment:
Q  16 atcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 115  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  3785943 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcagttaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 3785844  T
Q  116 taggttgatt 125  Q
    |||| |||||    
T  3785843 taggctgatt 3785834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 16164930 - 16164821
Alignment:
Q  16 atcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 115  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  16164930 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 16164831  T
Q  116 taggttgatt 125  Q
    |||| |||||    
T  16164830 taggctgatt 16164821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 125
Target Start/End: Original strand, 22924942 - 22925051
Alignment:
Q  16 atcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 115  Q
    ||||| || ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  22924942 atcaaaggtcttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 22925041  T
Q  116 taggttgatt 125  Q
    ||||||||||    
T  22925042 taggttgatt 22925051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 27119974 - 27119865
Alignment:
Q  16 atcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 115  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  27119974 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 27119875  T
Q  116 taggttgatt 125  Q
    |||| |||||    
T  27119874 taggctgatt 27119865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 27779684 - 27779575
Alignment:
Q  16 atcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 115  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  27779684 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 27779585  T
Q  116 taggttgatt 125  Q
    |||| |||||    
T  27779584 taggctgatt 27779575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 27819441 - 27819332
Alignment:
Q  16 atcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 115  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  27819441 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 27819342  T
Q  116 taggttgatt 125  Q
    |||| |||||    
T  27819341 taggctgatt 27819332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 34158288 - 34158185
Alignment:
Q  22 ggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaataggtt 121  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||| |    
T  34158288 ggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggct 34158189  T
Q  122 gatt 125  Q
    ||||    
T  34158188 gatt 34158185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 27827915 - 27827841
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaa 85  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||   |||||||||||||    
T  27827915 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaa 27827841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 12383994 - 12383932
Alignment:
Q  132 gagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 194  Q
    ||||| |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12383994 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 12383932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 22949727 - 22949665
Alignment:
Q  132 gagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 194  Q
    ||||| |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22949727 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 22949665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 11 - 239
Target Start/End: Original strand, 22077672 - 22077900
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22077672 acataatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 22077771  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22077772 cacaataggttgattctttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatcagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 22077871  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgc 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22077872 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgc 22077900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 27605666 - 27605891
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  27605666 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 27605765  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27605766 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 27605865  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  27605866 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 27605891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 18794159 - 18793934
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  18794159 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 18794060  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18794059 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatttaaacgcccgaggaaa 18793960  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  18793959 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 18793934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 14561079 - 14560854
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  14561079 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 14560980  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||||||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  14560979 tacaataggttgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 14560880  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  14560879 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 14560854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 2134021 - 2134246
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  2134021 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaggcttcttggcattcatcattcca 2134120  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  2134121 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 2134220  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  2134221 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 2134246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 19691553 - 19691328
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  19691553 acataatcaaaggccttccttccgcgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 19691454  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  19691453 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaa 19691354  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||    
T  19691353 cctctgacttgcttctcggtttgtgg 19691328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9358080 - 9357855
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  9358080 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 9357981  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||    
T  9357980 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaa 9357881  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  9357880 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 9357855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Original strand, 19205123 - 19205336
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  19205123 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 19205222  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| || |||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  19205223 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaag 19205322  T
Q  211 cctcggacttgctt 224  Q
    |||| |||||||||    
T  19205323 cctctgacttgctt 19205336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 29832781 - 29832556
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  29832781 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 29832682  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  29832681 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaggaaa 29832582  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  29832581 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 29832556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 19677902 - 19677677
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  19677902 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctgtcaaaagcttcttggcattcatcattcca 19677803  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||     
T  19677802 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgcgatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 19677703  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  19677702 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 19677677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Original strand, 28358713 - 28358926
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||| | |   ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  28358713 acataatcaaaggccttccttccgcggatgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 28358812  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  28358813 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaag 28358912  T
Q  211 cctcggacttgctt 224  Q
    |||| |||||||||    
T  28358913 cctctgacttgctt 28358926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 33262189 - 33261964
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  33262189 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 33262090  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  33262089 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaaaatcggcccacaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 33261990  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  33261989 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 33261964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 18712939 - 18712714
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||   |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  18712939 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 18712840  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  18712839 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgtaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccgaggaaa 18712740  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| |||||| || |||||||||||    
T  18712739 cctctgacttgtttctcggtctgtgg 18712714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 12089484 - 12089709
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  12089484 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 12089583  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  12089584 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 12089683  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  12089684 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 12089709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 31357983 - 31357758
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  31357983 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 31357884  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||| | ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  31357883 tacaacagggtggttctttttaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 31357784  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  31357783 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 31357758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 31486632 - 31486857
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  31486632 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 31486731  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| || |  ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  31486732 tacaacaggctggttttttctaagcagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcagacgcccgaggaaa 31486831  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  31486832 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 31486857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 15771024 - 15770915
Alignment:
Q  16 atcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 115  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  15771024 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 15770925  T
Q  116 taggttgatt 125  Q
    |||| |||||    
T  15770924 taggctgatt 15770915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 44564434 - 44564325
Alignment:
Q  16 atcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 115  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| | ||||    
T  44564434 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttctatacaa 44564335  T
Q  116 taggttgatt 125  Q
    |||| |||||    
T  44564334 taggctgatt 44564325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Original strand, 21344943 - 21345030
Alignment:
Q  22 ggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcc 109  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||    
T  21344943 ggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcc 21345030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16286694 - 16286631
Alignment:
Q  174 tatgaatcgggagatgtaattaaaacgcc-cgaggaaacctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    ||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  16286694 tatgaatcgggagatgtaattcaatcgtctcgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtgg 16286631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 47)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 27287107 - 27287332
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  27287107 acataatcaaaggccttccttccacaggtgggacgaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 27287206  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27287207 tacaataggctgattatttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 27287306  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  27287307 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 27287332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27022589 - 27022364
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  27022589 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 27022490  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27022489 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatataaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 27022390  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  27022389 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 27022364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 29553010 - 29552785
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  29553010 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 29552911  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29552910 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 29552811  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  29552810 cctctgacttgcttctcagtctgtgg 29552785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 13295694 - 13295919
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||    
T  13295694 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttagcattcatcattcca 13295793  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  13295794 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 13295893  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  13295894 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 13295919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 15421063 - 15421288
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  15421063 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 15421162  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15421163 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 15421262  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  15421263 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 15421288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 22931627 - 22931852
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  22931627 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtagttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 22931726  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22931727 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 22931826  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  22931827 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 22931852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 23854072 - 23854297
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  23854072 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtagttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 23854171  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23854172 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 23854271  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  23854272 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 23854297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24867169 - 24866944
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||   |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  24867169 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 24867070  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  24867069 tacaataggctgattctttctgagtagcttaaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 24866970  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  24866969 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 24866944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 27626454 - 27626679
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  27626454 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 27626553  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  27626554 cacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 27626653  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||||    
T  27626654 cctctgacttgcttctcggtccgtgg 27626679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16677593 - 16677368
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  16677593 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 16677494  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16677493 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcagattgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 16677394  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| |||||| || || ||||||||    
T  16677393 cctctgacttgtttctctgtctgtgg 16677368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27179909 - 27179684
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||  |||| |||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||    
T  27179909 acataatcaaaggccttccgtccacgggtgggacgaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaaacttcttggcattcatcattcca 27179810  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27179809 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 27179710  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  27179709 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 27179684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 27269330 - 27269555
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||  |||| |||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||    
T  27269330 acataatcaaaggccttccgtccacgggtgggacgaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaaacttcttggcattcatcattcca 27269429  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27269430 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 27269529  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  27269530 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 27269555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 3699536 - 3699311
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  3699536 acatgatcaaaggccttccttccacacgtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattcca 3699437  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| || || ||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3699436 tacaataggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 3699337  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| |||||| || || ||||||||    
T  3699336 cctctgacttgtttctctgtctgtgg 3699311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 4761216 - 4760991
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  4761216 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4761117  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| || || ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  4761116 tacaataggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 4761017  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  4761016 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 4760991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 17089186 - 17089411
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||| | ||||||||||  |||||    
T  17089186 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 17089285  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17089286 cacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaggtagcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 17089385  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||||    
T  17089386 cctctgacttgcttctcggtccgtgg 17089411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27011184 - 27010959
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  27011184 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 27011085  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| || || ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  27011084 tacaataggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 27010985  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  27010984 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 27010959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 34461249 - 34461474
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  34461249 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 34461348  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| || |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34461349 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 34461448  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  34461449 cctctgacttgcttctcagtctgtgg 34461474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 26921819 - 26921605
Alignment:
Q  22 ggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaataggtt 121  Q
    |||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||| ||| |    
T  26921819 ggccttccttccacgggtgggacaaagataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcattattccaaacaacaggct 26921720  T
Q  122 gattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaacctcggacttg 221  Q
    |||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  26921719 gattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttg 26921620  T
Q  222 cttttcggtctgtgg 236  Q
    ||| |||||||||||    
T  26921619 cttctcggtctgtgg 26921605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16753263 - 16753049
Alignment:
Q  22 ggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaataggtt 121  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||| |||||||| |    
T  16753263 ggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaataggct 16753164  T
Q  122 gattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaacctcggacttg 221  Q
    |||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||    
T  16753163 gattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccgaggaaacctctgacttg 16753064  T
Q  222 cttttcggtctgtgg 236  Q
     || |||||||||||    
T  16753063 tttctcggtctgtgg 16753049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27060959 - 27060734
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||    
T  27060959 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 27060860  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  27060859 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcagacgtccgaggaaa 27060760  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  27060759 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 27060734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 4528738 - 4528513
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||    
T  4528738 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcatccca 4528639  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| |||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  4528638 tacaacaggctggttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 4528539  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  4528538 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 4528513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 4542517 - 4542742
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  4542517 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4542616  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  4542617 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 4542716  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  4542717 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 4542742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 4720878 - 4721103
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  4720878 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4720977  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  4720978 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 4721077  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  4721078 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 4721103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27488586 - 27488361
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  27488586 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 27488487  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  27488486 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 27488387  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  27488386 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 27488361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 29504869 - 29504644
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  29504869 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 29504770  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| || |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  29504769 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaggaaa 29504670  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  29504669 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 29504644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 29576467 - 29576242
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  || ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  29576467 acatgatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 29576368  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  29576367 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaggaaa 29576268  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  29576267 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 29576242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 30554759 - 30554984
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  30554759 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 30554858  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  30554859 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 30554958  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  30554959 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 30554984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20172000 - 20171797
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||  |||||||   ||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||    
T  20172000 acataatcaaaggccttccttccatgggtgggacaaggataggtggttcctgcagataactcttgatactatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 20171901  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
    |||||| |||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  20171900 cacaatgggttgattcttcctgagtagcttgaaaattggcccgcaggtcgcggtcatatgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 20171801  T
Q  211 cctc 214  Q
    ||||    
T  20171800 cctc 20171797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 214
Target Start/End: Original strand, 22163991 - 22164194
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||  |||||||   ||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||    
T  22163991 acataatcaaaggccttccttccatgggtgggacaaggataggtggttcctgcagataactcttgatactatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 22164090  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
    |||||| |||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  22164091 cacaatgggttgattcttcctgagtagcttgaaaattggcccgcaggtcgcggtcatatgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 22164190  T
Q  211 cctc 214  Q
    ||||    
T  22164191 cctc 22164194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 16940770 - 16940995
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  16940770 acataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 16940869  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  16940870 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 16940969  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  16940970 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 16940995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 26113155 - 26113380
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  26113155 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 26113254  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  26113255 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 26113354  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  26113355 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 26113380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 28210907 - 28210682
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  28210907 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 28210808  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  28210807 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 28210708  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  28210707 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 28210682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 4776333 - 4776108
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  4776333 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4776234  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  4776233 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccacaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 4776134  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  4776133 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 4776108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 125
Target Start/End: Original strand, 22455857 - 22455971
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22455857 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaagaataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 22455956  T
Q  111 cacaataggttgatt 125  Q
    |||||||||||||||    
T  22455957 cacaataggttgatt 22455971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 26992248 - 26992096
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  26992248 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 26992149  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcgg 163  Q
     | |||||| ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||    
T  26992148 tagaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcgg 26992096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 125
Target Start/End: Original strand, 26775370 - 26775484
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  26775370 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttcca 26775469  T
Q  111 cacaataggttgatt 125  Q
     |||||||| |||||    
T  26775470 tacaataggctgatt 26775484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 125
Target Start/End: Original strand, 27358853 - 27358967
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  27358853 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttcca 27358952  T
Q  111 cacaataggttgatt 125  Q
     |||||||| |||||    
T  27358953 tacaataggctgatt 27358967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 125
Target Start/End: Original strand, 27449196 - 27449310
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  27449196 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttcca 27449295  T
Q  111 cacaataggttgatt 125  Q
     |||||||| |||||    
T  27449296 tacaataggctgatt 27449310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 125
Target Start/End: Original strand, 14142142 - 14142251
Alignment:
Q  16 atcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 115  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  14142142 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 14142241  T
Q  116 taggttgatt 125  Q
    |||| |||||    
T  14142242 taggctgatt 14142251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 26789264 - 26789155
Alignment:
Q  16 atcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 115  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  26789264 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 26789165  T
Q  116 taggttgatt 125  Q
    |||| |||||    
T  26789164 taggctgatt 26789155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 27197633 - 27197524
Alignment:
Q  16 atcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 115  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  27197633 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 27197534  T
Q  116 taggttgatt 125  Q
    |||| |||||    
T  27197533 taggctgatt 27197524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 125
Target Start/End: Original strand, 27251602 - 27251711
Alignment:
Q  16 atcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 115  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  27251602 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 27251701  T
Q  116 taggttgatt 125  Q
    |||| |||||    
T  27251702 taggctgatt 27251711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 119
Target Start/End: Original strand, 8902451 - 8902554
Alignment:
Q  16 atcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 115  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||   ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  8902451 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcatgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattccatacaa 8902550  T
Q  116 tagg 119  Q
    ||||    
T  8902551 tagg 8902554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 136
Target Start/End: Original strand, 33373174 - 33373299
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  33373174 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctgtcaaaagcttcttggcattcatcattcca 33373273  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagta 136  Q
     |||| ||| || || ||||||||||    
T  33373274 tacaacaggctggttctttctgagta 33373299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 28163944 - 28163836
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  28163944 acataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 28163845  T
Q  111 cacaatagg 119  Q
     ||||||||    
T  28163844 tacaatagg 28163836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 125
Target Start/End: Original strand, 13520940 - 13521048
Alignment:
Q  16 atcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 115  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||| ||||    
T  13520940 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcc-ggcattcatcgttccatacaa 13521038  T
Q  116 taggttgatt 125  Q
    |||| |||||    
T  13521039 taggctgatt 13521048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 194
Target Start/End: Original strand, 9136217 - 9136279
Alignment:
Q  132 gagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 194  Q
    ||||| |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9136217 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 9136279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 62)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 5593200 - 5593425
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  5593200 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattcca 5593299  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5593300 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 5593399  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  5593400 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 5593425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 18054679 - 18054454
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  18054679 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 18054580  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18054579 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 18054480  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  18054479 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 18054454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 18273895 - 18274120
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  18273895 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 18273994  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  18273995 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 18274094  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  18274095 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 18274120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 18289196 - 18289421
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  18289196 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 18289295  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  18289296 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 18289395  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  18289396 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 18289421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 18304497 - 18304722
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  18304497 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 18304596  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  18304597 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 18304696  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  18304697 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 18304722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18334047 - 18333818
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  18334047 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 18333948  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18333947 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 18333848  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgct 240  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  18333847 cctctgacttgcttctcggtctgtggtgct 18333818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 234
Target Start/End: Original strand, 4793478 - 4793701
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  4793478 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4793577  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4793578 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 4793677  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgt 234  Q
    |||| ||||||||| |||||||||    
T  4793678 cctctgacttgcttctcggtctgt 4793701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 8286313 - 8286535
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  8286313 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 8286412  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8286413 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 8286512  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctg 233  Q
    |||| ||||||||| ||||||||    
T  8286513 cctctgacttgcttctcggtctg 8286535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 6205320 - 6205095
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  6205320 acataatcaagggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 6205221  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6205220 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 6205121  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  6205120 cctctgacttgcttctcagtctgtgg 6205095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 8299388 - 8299163
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  8299388 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 8299289  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||||||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  8299288 tacaataggttgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 8299189  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  8299188 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 8299163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 21678120 - 21677895
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  21678120 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 21678021  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21678020 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 21677921  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  21677920 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 21677895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 35884183 - 35883954
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  35884183 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 35884084  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  35884083 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 35883984  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgct 240  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  35883983 cctctgacttgcttctcggtctgtggtgct 35883954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 4687072 - 4686847
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  4687072 acataatcaagggccttccttccacgggtggaacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4686973  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4686972 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 4686873  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  4686872 cctctgacttgcttctcagtctgtgg 4686847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 4725048 - 4724823
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  4725048 acataatcaagggccttccttccacgggtggaacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4724949  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4724948 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 4724849  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  4724848 cctctgacttgcttctcagtctgtgg 4724823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 15737937 - 15738162
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  15737937 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 15738036  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     ||| |||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15738037 tacagtaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 15738136  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  15738137 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 15738162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 15889548 - 15889773
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  15889548 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 15889647  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| |||||||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15889648 tacaataggctgattctttctgaggagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 15889747  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  15889748 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 15889773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 22384421 - 22384646
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  22384421 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 22384520  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||||||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  22384521 tacaataggttgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgttcgaggaaa 22384620  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  22384621 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 22384646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 29145599 - 29145824
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  29145599 acataatcaaaggccttccctccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 29145698  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29145699 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 29145798  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||    
T  29145799 cctctaacttgcttctcggtctgtgg 29145824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 29661813 - 29662038
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  29661813 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 29661912  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| || || ||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  29661913 tacaataggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 29662012  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  29662013 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 29662038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 8215152 - 8214927
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  8215152 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 8215053  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||    
T  8215052 cacaacaggctgattttttctgagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaa 8214953  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  8214952 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 8214927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20069457 - 20069232
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| | ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  20069457 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 20069358  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     || ||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20069357 tacgataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 20069258  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  20069257 cctctgacttgcttctcagtctgtgg 20069232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 32442568 - 32442355
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  32442568 acataatcaaaggccttccttccacgggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 32442469  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||  ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  32442468 tacaacagactgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 32442369  T
Q  211 cctcggacttgctt 224  Q
    |||| |||||||||    
T  32442368 cctctgacttgctt 32442355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 7076623 - 7076398
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  7076623 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 7076524  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| || || ||||||||||  ||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  7076523 tacaataggctggttctttctgagtagcttgaagatcggtccgcaggttgcggtcatgcgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaag 7076424  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  7076423 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 7076398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Original strand, 20573686 - 20573899
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||    
T  20573686 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcctcattcca 20573785  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| || || ||||| || |  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20573786 tacaataggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggtccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 20573885  T
Q  211 cctcggacttgctt 224  Q
    |||| |||||||||    
T  20573886 cctctgacttgctt 20573899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 28024699 - 28024474
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||| || || |||||||||| ||||||    
T  28024699 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattcca 28024600  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28024599 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 28024500  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  28024499 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 28024474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 28112797 - 28113022
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||    
T  28112797 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcattcca 28112896  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  28112897 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgctgtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaag 28112996  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  28112997 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 28113022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 47026870 - 47026645
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  47026870 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 47026771  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| || |||||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  47026770 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 47026671  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  47026670 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 47026645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 48469344 - 48469119
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  48469344 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcattattcca 48469245  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| || |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48469244 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 48469145  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||  |||||| || || ||||||||    
T  48469144 cctatgacttgtttctctgtctgtgg 48469119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 5606157 - 5606382
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  5606157 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 5606256  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||||||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  5606257 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 5606356  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  5606357 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 5606382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 10399561 - 10399336
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| | ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  10399561 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 10399462  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  10399461 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 10399362  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| |||||| || || ||||||||    
T  10399361 cctctgacttgtttctctgtctgtgg 10399336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 28342594 - 28342369
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  28342594 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 28342495  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| || || ||||||||||  ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  28342494 tacaataggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 28342395  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  28342394 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 28342369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 42 - 236
Target Start/End: Original strand, 11107226 - 11107420
Alignment:
Q  42 gacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaataggttgattgtttctgagtaatttg 141  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||| |||||||| ||| | ||||||||||  |||    
T  11107226 gacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcttcattccatacaataggctgactctttctgagtagcttg 11107325  T
Q  142 aaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaacctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    || || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  11107326 aagatcggcccacaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtgg 11107420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 4343519 - 4343744
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  4343519 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4343618  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  4343619 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 4343718  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  4343719 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 4343744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 4420332 - 4420107
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  4420332 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4420233  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  4420232 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 4420133  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  4420132 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 4420107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 5017131 - 5016906
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  5017131 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 5017032  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| || |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  5017031 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccacaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 5016932  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  5016931 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 5016906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 5470405 - 5470180
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  5470405 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 5470306  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  5470305 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 5470206  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  5470205 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 5470180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 6539585 - 6539810
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  6539585 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 6539684  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  6539685 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 6539784  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  6539785 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 6539810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 7999977 - 7999752
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  7999977 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 7999878  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  7999877 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 7999778  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  7999777 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 7999752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 10646490 - 10646265
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  10646490 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 10646391  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  10646390 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 10646291  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  10646290 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 10646265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 17981792 - 17982017
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  17981792 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 17981891  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  17981892 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 17981991  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  17981992 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 17982017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 18228613 - 18228388
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  18228613 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 18228514  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  18228513 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 18228414  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  18228413 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 18228388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18246158 - 18245945
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  18246158 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 18246059  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| |||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  18246058 tacaacaggctggttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 18245959  T
Q  211 cctcggacttgctt 224  Q
    |||| |||||||||    
T  18245958 cctctgacttgctt 18245945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 22867691 - 22867916
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  22867691 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 22867790  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  22867791 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 22867890  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  22867891 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 22867916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 22882750 - 22882975
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  22882750 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 22882849  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  22882850 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 22882949  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  22882950 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 22882975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 16621333 - 16621555
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||| | ||| ||||  |||||||||||||| ||| | ||||||||||  |||||    
T  16621333 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 16621432  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| || |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  16621433 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 16621532  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctg 233  Q
    |||| |||||| || ||||||||    
T  16621533 cctctgacttgtttctcggtctg 16621555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24331580 - 24331355
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||    
T  24331580 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctttttggcattcatcattcca 24331481  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  24331480 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 24331381  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  24331380 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 24331355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 31961298 - 31961523
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  31961298 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaagaataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 31961397  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  31961398 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 31961497  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  31961498 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 31961523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 51785440 - 51785215
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  || ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  51785440 acatgatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 51785341  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  51785340 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 51785241  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  51785240 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 51785215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19697907 - 19697687
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||    
T  19697907 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgacgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 19697808  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| ||  ||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||    
T  19697807 tacaataggctgattcttcttgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaattgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaa 19697708  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtc 231  Q
    |||| |||||| || ||||||    
T  19697707 cctctgacttgtttctcggtc 19697687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 125
Target Start/End: Original strand, 17992779 - 17992888
Alignment:
Q  16 atcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 115  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  17992779 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 17992878  T
Q  116 taggttgatt 125  Q
    ||||||||||    
T  17992879 taggttgatt 17992888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 4627202 - 4627088
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  4627202 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4627103  T
Q  111 cacaataggttgatt 125  Q
     |||||||| |||||    
T  4627102 tacaataggctgatt 4627088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 32294040 - 32293931
Alignment:
Q  16 atcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 115  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  32294040 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 32293941  T
Q  116 taggttgatt 125  Q
    |||| |||||    
T  32293940 taggctgatt 32293931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 5714490 - 5714376
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||    
T  5714490 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 5714391  T
Q  111 cacaataggttgatt 125  Q
     |||||||| |||||    
T  5714390 tacaataggctgatt 5714376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 5725400 - 5725286
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||    
T  5725400 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 5725301  T
Q  111 cacaataggttgatt 125  Q
     |||||||| |||||    
T  5725300 tacaataggctgatt 5725286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 125
Target Start/End: Original strand, 5766968 - 5767082
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||    
T  5766968 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 5767067  T
Q  111 cacaataggttgatt 125  Q
     |||||||| |||||    
T  5767068 tacaataggctgatt 5767082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 125
Target Start/End: Original strand, 31033084 - 31033193
Alignment:
Q  16 atcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 115  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  31033084 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatataa 31033183  T
Q  116 taggttgatt 125  Q
    |||| |||||    
T  31033184 taggctgatt 31033193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 132 - 194
Target Start/End: Original strand, 15592875 - 15592937
Alignment:
Q  132 gagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 194  Q
    |||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15592875 gagtaatttgaatatcggcctgcacgttgctgtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaatt 15592937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 15918875 - 15918751
Alignment:
Q  70 tctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatat 169  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||| || |   |||||||||||  ||| |  || | ||||| |||||| || || ||||| ||||| |||||||    
T  15918875 tctttgatgctatcaaaagccttctggcaatcctctgtccacacaatatcttgttctttgcggagtagtttgaatatcggtccgcacgttgctgtcatat 15918776  T
Q  170 gagatatgaatcgggagatgtaatt 194  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||    
T  15918775 gagaaatgaaacgggagatgtaatt 15918751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Original strand, 6963276 - 6963363
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggca 98  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||  ||||||| || || ||||| |||| |||  |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  6963276 acatgatcaaaggccttccttcaactggagggacaagaatcggaggttctaacaaataccctttgatgctatcaaaagctttctggca 6963363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 194
Target Start/End: Original strand, 5950766 - 5950828
Alignment:
Q  132 gagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 194  Q
    ||||| |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5950766 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 5950828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 20443407 - 20443351
Alignment:
Q  138 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 194  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20443407 tttgaatatcggcccacatgttgcagtcatatgagagatgaaacgggagatgtaatt 20443351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 41440533 - 41440477
Alignment:
Q  138 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 194  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  41440533 tttgaatatcggcccacatgttgcagtcatatgagagatgaaacgggagatgtaatt 41440477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 37)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 10913554 - 10913779
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  10913554 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 10913653  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10913654 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 10913753  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  10913754 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 10913779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 2158027 - 2157802
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  2158027 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 2157928  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| || || ||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2157927 tacaataggctgattcttcctcagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 2157828  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  2157827 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 2157802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 26516245 - 26516032
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  26516245 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 26516146  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| || || ||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26516145 tacaataggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 26516046  T
Q  211 cctcggacttgctt 224  Q
    |||| |||||||||    
T  26516045 cctctgacttgctt 26516032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 26534558 - 26534783
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  26534558 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 26534657  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  26534658 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggaaatgtaattcaaacgcccgaggaaa 26534757  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||    
T  26534758 cctctgacttgcttctcggtttgtgg 26534783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 2106848 - 2107073
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  2106848 acataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 2106947  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||||||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  2106948 tacaataggttgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 2107047  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||    
T  2107048 cctctgacttgcttctcggtatgtgg 2107073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 11421464 - 11421689
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  11421464 acataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 11421563  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  11421564 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaac 11421663  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  11421664 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 11421689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 26271771 - 26271996
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  26271771 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaggcttcttggcattcatcattcca 26271870  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26271871 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 26271970  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  26271971 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 26271996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 26438710 - 26438485
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  26438710 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 26438611  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| || || ||||| || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  26438610 tacaataggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 26438511  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| |||||| || |||||||||||    
T  26438510 cctctgacttgtttctcggtctgtgg 26438485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 45390673 - 45390448
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  45390673 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 45390574  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  45390573 tacaacaggctgattctttctgagtagtttgaagattggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 45390474  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  45390473 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 45390448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 16515115 - 16515337
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||    
T  16515115 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagattcttggcattcatcattcca 16515214  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  16515215 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcagcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaa 16515314  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctg 233  Q
    |||| ||||||||| ||||||||    
T  16515315 cctctgacttgcttctcggtctg 16515337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 5131449 - 5131224
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  5131449 acataatcaaaggcctcccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 5131350  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  5131349 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 5131250  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  5131249 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 5131224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 5144025 - 5144250
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  5144025 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 5144124  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| || || ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  5144125 tacaataggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgttattcaaacgtccgaggaaa 5144224  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  5144225 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 5144250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22145648 - 22145423
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  22145648 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 22145549  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  22145548 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccgaggaaa 22145449  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    ||||  ||||| || |||||||||||    
T  22145448 cctctaacttgtttctcggtctgtgg 22145423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 26316533 - 26316758
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  26316533 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 26316632  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| || |||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||     
T  26316633 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 26316732  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  26316733 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 26316758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 10845073 - 10844851
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||    
T  10845073 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttacagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 10844974  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| || |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  10844973 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 10844874  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctg 233  Q
    |||| |||||| || ||||||||    
T  10844873 cctctgacttgtttctcggtctg 10844851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16044758 - 16044550
Alignment:
Q  25 cttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaataggttgat 124  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||| || || ||||||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  16044758 cttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctattaaaagcctcttggcattcatcgttccatacaataggctgat 16044659  T
Q  125 tgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaacctcggacttgctt 224  Q
    | || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||    
T  16044658 tcttcctgagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttgttt 16044559  T
Q  225 ttcggtctg 233  Q
     ||||||||    
T  16044558 ctcggtctg 16044550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 10842679 - 10842901
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| | ||||||||||  |||||    
T  10842679 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 10842778  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| || |||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  10842779 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatataaatcgggagatgtaatgcaatcgcccgaggaaa 10842878  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctg 233  Q
    ||||  ||||| || ||||||||    
T  10842879 cctctaacttgtttctcggtctg 10842901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 3448759 - 3448534
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  3448759 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 3448660  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  3448659 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 3448560  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  3448559 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 3448534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 4141931 - 4142156
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  4141931 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4142030  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  4142031 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 4142130  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  4142131 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 4142156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 4202842 - 4202617
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  4202842 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4202743  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||  | ||||||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||     
T  4202742 tacaataggctggctctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 4202643  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    ||||  |||||||| || ||||||||    
T  4202642 cctctaacttgcttctctgtctgtgg 4202617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 11444340 - 11444115
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  11444340 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 11444241  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||    
T  11444240 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaa 11444141  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  11444140 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 11444115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Original strand, 31561075 - 31561288
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  31561075 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 31561174  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| |||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  31561175 tacaacaggctggttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 31561274  T
Q  211 cctcggacttgctt 224  Q
    |||| |||||||||    
T  31561275 cctctgacttgctt 31561288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 24589219 - 24589444
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  24589219 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgattccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 24589318  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  24589319 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 24589418  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  24589419 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 24589444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Original strand, 16748202 - 16748415
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  16748202 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagcagataactcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 16748301  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||||||||| || |||||||  ||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||     
T  16748302 tacaacaggttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccacaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 16748401  T
Q  211 cctcggacttgctt 224  Q
    |||| |||||||||    
T  16748402 cctctgacttgctt 16748415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 26666599 - 26666824
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  26666599 acataatcaaaggccttccttccacgggtggaacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 26666698  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     || | ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  26666699 tacgacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 26666798  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  26666799 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 26666824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 214
Target Start/End: Original strand, 16446691 - 16446894
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||  | ||||||||||  |||||    
T  16446691 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagccccttggcattcatcgttcca 16446790  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||  ||||| || |||||||  ||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16446791 tacaatagtctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcctgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcacccgaggaaa 16446890  T
Q  211 cctc 214  Q
    ||||    
T  16446891 cctc 16446894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 88 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9622026 - 9621878
Alignment:
Q  88 gcttcctggcattcattattccacacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggaga 187  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  9622026 gcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagaga 9621927  T
Q  188 tgtaattaaaacgcccgaggaaacctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| || ||||||||    
T  9621926 tgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtgg 9621878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 2776702 - 2776593
Alignment:
Q  16 atcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 115  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  2776702 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 2776603  T
Q  116 taggttgatt 125  Q
    |||| |||||    
T  2776602 taggctgatt 2776593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 125
Target Start/End: Original strand, 26512386 - 26512495
Alignment:
Q  16 atcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 115  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  26512386 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 26512485  T
Q  116 taggttgatt 125  Q
    |||| |||||    
T  26512486 taggctgatt 26512495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 125
Target Start/End: Original strand, 26681796 - 26681905
Alignment:
Q  16 atcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 115  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  26681796 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 26681895  T
Q  116 taggttgatt 125  Q
    |||| |||||    
T  26681896 taggctgatt 26681905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 31127355 - 31127246
Alignment:
Q  16 atcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 115  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  31127355 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 31127256  T
Q  116 taggttgatt 125  Q
    |||| |||||    
T  31127255 taggctgatt 31127246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 125
Target Start/End: Original strand, 39209829 - 39209938
Alignment:
Q  16 atcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 115  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  39209829 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 39209928  T
Q  116 taggttgatt 125  Q
    ||||||||||    
T  39209929 taggttgatt 39209938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 45734761 - 45734658
Alignment:
Q  16 atcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 115  Q
    ||||| || ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  45734761 atcaaaggtcttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 45734662  T
Q  116 tagg 119  Q
    ||||    
T  45734661 tagg 45734658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 125
Target Start/End: Original strand, 31087312 - 31087421
Alignment:
Q  16 atcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 115  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| || |||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  31087312 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggatagggggctccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaa 31087411  T
Q  116 taggttgatt 125  Q
    |||| |||||    
T  31087412 taggctgatt 31087421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 9469652 - 9469590
Alignment:
Q  132 gagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 194  Q
    ||||| |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9469652 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 9469590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 194
Target Start/End: Original strand, 16393240 - 16393302
Alignment:
Q  132 gagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 194  Q
    ||||| |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16393240 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 16393302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 194
Target Start/End: Original strand, 30369752 - 30369814
Alignment:
Q  132 gagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 194  Q
    ||||| |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  30369752 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 30369814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 58)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 15655455 - 15655680
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  15655455 acataatcaaaggccttccttccacgggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 15655554  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     ||||| || ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15655555 tacaatgggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 15655654  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  15655655 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 15655680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 41678168 - 41677943
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  41678168 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 41678069  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  41678068 tacaataggctgattctttctgagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 41677969  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||    
T  41677968 cctctaacttgcttctcggtctgtgg 41677943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 11552818 - 11552593
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  11552818 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 11552719  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11552718 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 11552619  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  11552618 cctctgacttgcttctcagtctgtgg 11552593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24973369 - 24973144
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24973369 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcattattcca 24973270  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  24973269 tacaataggctgattctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatttaagcgtccgaggaaa 24973170  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  24973169 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 24973144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 33295991 - 33295766
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  33295991 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 33295892  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  33295891 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 33295792  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  33295791 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 33295766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 33780952 - 33780727
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| || |||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  33780952 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggctccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 33780853  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33780852 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 33780753  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  33780752 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 33780727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 22995814 - 22996039
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  22995814 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 22995913  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22995914 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 22996013  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  22996014 cctctgacttgcttctcagtctgtgg 22996039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23629433 - 23629208
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  23629433 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 23629334  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  23629333 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgtaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 23629234  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  23629233 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 23629208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 24684842 - 24685067
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||   |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  24684842 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 24684941  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  24684942 tacaataggctgattctttctgagtagcttaaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 24685041  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  24685042 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 24685067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 18372231 - 18372456
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  18372231 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattcca 18372330  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||     
T  18372331 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 18372430  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  18372431 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 18372456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 31434927 - 31434702
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  31434927 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 31434828  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| || || ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  31434827 tacaataggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 31434728  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  31434727 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 31434702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 37355340 - 37355565
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  37355340 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 37355439  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  37355440 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 37355539  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  37355540 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 37355565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Original strand, 40470247 - 40470460
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| || |||| ||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  40470247 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggctccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattcca 40470346  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| || || ||||| || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40470347 tacaataggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 40470446  T
Q  211 cctcggacttgctt 224  Q
    |||| |||||||||    
T  40470447 cctctgacttgctt 40470460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23895669 - 23895447
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||  |||||    
T  23895669 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaatttttgatgctatcataagcttcttggcattcatcgttcca 23895570  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  23895569 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaa 23895470  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctg 233  Q
    |||| |||||| || ||||||||    
T  23895469 cctctgacttgtttctcggtctg 23895447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 3793004 - 3792779
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| || |||| ||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  3793004 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggctccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattcca 3792905  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3792904 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 3792805  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  3792804 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 3792779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9320939 - 9320714
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  9320939 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 9320840  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| || |||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||     
T  9320839 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 9320740  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  9320739 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 9320714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12135638 - 12135413
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  12135638 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 12135539  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| || |||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||     
T  12135538 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 12135439  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  12135438 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 12135413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 26483857 - 26483632
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  26483857 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 26483758  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| || |||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||     
T  26483757 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 26483658  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  26483657 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 26483632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 34619981 - 34619756
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||| || || |||||||||| ||||||    
T  34619981 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattcca 34619882  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34619881 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 34619782  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  34619781 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 34619756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 43081713 - 43081493
Alignment:
Q  16 atcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 115  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  43081713 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 43081614  T
Q  116 taggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaacctcg 215  Q
     ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||     
T  43081613 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctct 43081514  T
Q  216 gacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  43081513 gacttgcttctcggtctgtgg 43081493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 13321527 - 13321752
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  13321527 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 13321626  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  13321627 tacaacaggctggttctttctaagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 13321726  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  13321727 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 13321752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 18497422 - 18497647
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  18497422 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 18497521  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| || |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18497522 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 18497621  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| |||||| || || ||||||||    
T  18497622 cctctgacttgtttctctgtctgtgg 18497647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 28652705 - 28652480
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  28652705 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 28652606  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  28652605 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaag 28652506  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  28652505 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 28652480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 32592971 - 32593196
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||| || || |||||||||| ||||||    
T  32592971 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattcca 32593070  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  32593071 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgagagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 32593170  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  32593171 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 32593196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 37767688 - 37767913
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  37767688 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 37767787  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| |||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  37767788 tacaacaggctggttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 37767887  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  37767888 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 37767913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 5641251 - 5641026
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  5641251 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 5641152  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  5641151 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 5641052  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  5641051 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 5641026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 6877768 - 6877543
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||    
T  6877768 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcatccca 6877669  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  6877668 tacaacaggctggttctttctaagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 6877569  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  6877568 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 6877543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 8662172 - 8662397
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  8662172 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 8662271  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  8662272 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 8662371  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  8662372 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 8662397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24586837 - 24586612
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  24586837 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 24586738  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  24586737 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 24586638  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  24586637 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 24586612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 28956482 - 28956707
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||| || || |||||||||| ||||||    
T  28956482 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattcca 28956581  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| || || ||||| || |  ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28956582 tacaataggctggttttttctaagcagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 28956681  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  28956682 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 28956707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 30032891 - 30032666
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  30032891 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 30032792  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| || || ||||| || |  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  30032791 tacaataggctggttctttctaagcagcttaaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 30032692  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  30032691 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 30032666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 30155494 - 30155269
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  30155494 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 30155395  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  30155394 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 30155295  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  30155294 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 30155269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 30171932 - 30171707
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||    
T  30171932 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcactcatcattcca 30171833  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| || || ||||| || |  ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30171832 tacaataggctggttttttctaagcagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 30171733  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  30171732 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 30171707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 30938098 - 30937873
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||| ||| |||   ||| |||||||||| ||||| ||||||||||  |||||    
T  30938098 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatatgtggttccagcaggtaactcttggtgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 30937999  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| || || ||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  30937998 tacaataggctgattcttcctcagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 30937899  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  30937898 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 30937873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 31823104 - 31823329
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  31823104 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 31823203  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  31823204 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 31823303  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  31823304 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 31823329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 33519843 - 33519618
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  33519843 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 33519744  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  33519743 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 33519644  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  33519643 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 33519618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 37668183 - 37668408
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  37668183 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 37668282  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  37668283 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 37668382  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  37668383 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 37668408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 37758446 - 37758221
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  37758446 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 37758347  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  37758346 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 37758247  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  37758246 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 37758221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22891926 - 22891707
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||| | ||||||||||  |||||    
T  22891926 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 22891827  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| || |||||||  ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22891826 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcgggccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 22891727  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggt 230  Q
    |||| |||||| || |||||    
T  22891726 cctctgacttgtttctcggt 22891707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25203741 - 25203519
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||| | ||||| ||||  |||||    
T  25203741 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcagtcatcgttcca 25203642  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  25203641 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaa 25203542  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctg 233  Q
    |||| |||||| || ||||||||    
T  25203541 cctctgacttgtttctcggtctg 25203519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25267896 - 25267674
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||| | ||||| ||||  |||||    
T  25267896 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcagtcatcgttcca 25267797  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  25267796 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaa 25267697  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctg 233  Q
    |||| |||||| || ||||||||    
T  25267696 cctctgacttgtttctcggtctg 25267674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 2514525 - 2514300
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |||   |||||||||||||| || || |||||||||| ||||||    
T  2514525 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaactcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattcca 2514426  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  2514425 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 2514326  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  2514325 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 2514300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Original strand, 15755549 - 15755762
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  15755549 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 15755648  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  15755649 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 15755748  T
Q  211 cctcggacttgctt 224  Q
    |||| |||||||||    
T  15755749 cctctgacttgctt 15755762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24727432 - 24727207
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  || ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  24727432 acatgatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 24727333  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  24727332 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 24727233  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  24727232 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 24727207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 136
Target Start/End: Original strand, 13183490 - 13183615
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||    
T  13183490 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggaattcatcgttcca 13183589  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagta 136  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||    
T  13183590 tacaataggctgattctttctgagta 13183615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 128
Target Start/End: Original strand, 13439380 - 13439497
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  13439380 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttcca 13439479  T
Q  111 cacaataggttgattgtt 128  Q
     |||||||| ||||||||    
T  13439480 tacaataggctgattgtt 13439497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 125
Target Start/End: Original strand, 18125113 - 18125227
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  18125113 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttcca 18125212  T
Q  111 cacaataggttgatt 125  Q
     |||||||| |||||    
T  18125213 tacaataggctgatt 18125227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 125
Target Start/End: Original strand, 9547411 - 9547520
Alignment:
Q  16 atcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 115  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  9547411 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatactatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 9547510  T
Q  116 taggttgatt 125  Q
    |||| |||||    
T  9547511 taggctgatt 9547520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 11327095 - 11326986
Alignment:
Q  16 atcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 115  Q
    ||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||| | ||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  11327095 atcaaaggccttccttccatgggagggacaaggataggtggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 11326996  T
Q  116 taggttgatt 125  Q
    ||||||||||    
T  11326995 taggttgatt 11326986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 125
Target Start/End: Original strand, 29887899 - 29888008
Alignment:
Q  16 atcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 115  Q
    ||||| |||||||||||||| |    |||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  29887899 atcaaaggccttccttccacggatgagacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 29887998  T
Q  116 taggttgatt 125  Q
    |||| |||||    
T  29887999 taggctgatt 29888008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 33878588 - 33878480
Alignment:
Q  16 atcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 115  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||| ||||    
T  33878588 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcc-ggcattcatcgttccatacaa 33878490  T
Q  116 taggttgatt 125  Q
    |||| |||||    
T  33878489 taggctgatt 33878480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Original strand, 351912 - 351999
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggca 98  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||  ||||||| || || ||||| |||| |||  |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  351912 acatgatcaaaggccttccttcaactggagggacaagaatcggaggttctaacaaataccctttgatgctatcaaaagctttctggca 351999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 194
Target Start/End: Original strand, 5440043 - 5440105
Alignment:
Q  132 gagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 194  Q
    ||||| |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5440043 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 5440105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 194
Target Start/End: Original strand, 11944240 - 11944302
Alignment:
Q  132 gagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 194  Q
    ||||| |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11944240 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 11944302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 194
Target Start/End: Original strand, 15784543 - 15784605
Alignment:
Q  132 gagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 194  Q
    ||||| |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15784543 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 15784605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 17957438 - 17957376
Alignment:
Q  132 gagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 194  Q
    ||||| |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17957438 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 17957376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 194
Target Start/End: Original strand, 36375780 - 36375842
Alignment:
Q  132 gagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 194  Q
    ||||| |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  36375780 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 36375842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 194
Target Start/End: Original strand, 37000434 - 37000496
Alignment:
Q  132 gagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 194  Q
    ||||| |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  37000434 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 37000496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 3523 - 3301
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||    
T  3523 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 3424  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3423 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 3324  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctg 233  Q
    |||| ||||||||| ||||||||    
T  3323 cctctgacttgcttctcggtctg 3301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 97 - 236
Target Start/End: Original strand, 43877 - 44016
Alignment:
Q  97 cattcattattccacacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaa 196  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43877 cattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattca 43976  T
Q  197 aacgcccgaggaaacctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  43977 aacgcccgaggaaacctctgacttgcttctgggtctgtgg 44016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 162 - 233
Target Start/End: Original strand, 32096 - 32167
Alignment:
Q  162 ggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaacctcggacttgcttttcggtctg 233  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  32096 ggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 32167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9492 - 9267
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||   |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  9492 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 9393  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9392 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 9293  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  9292 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 9267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 30749 - 30524
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  30749 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 30650  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  30649 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 30550  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  30549 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 30524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19526 - 19304
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| | ||||||||||  |||||    
T  19526 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 19427  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| || |||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  19426 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 19327  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctg 233  Q
    ||||  ||||| || ||||||||    
T  19326 cctctaacttgtttctcggtctg 19304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 7416 - 7302
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  7416 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 7317  T
Q  111 cacaataggttgatt 125  Q
     |||||||| |||||    
T  7316 tacaataggctgatt 7302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Original strand, 21894549 - 21894762
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  21894549 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 21894648  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21894649 tacaataggctgattctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 21894748  T
Q  211 cctcggacttgctt 224  Q
    |||| |||||||||    
T  21894749 cctctgacttgctt 21894762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 51641676 - 51641451
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  51641676 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattcca 51641577  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||     
T  51641576 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 51641477  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  51641476 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 51641451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Original strand, 20339101 - 20339320
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||    
T  20339101 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcattcca 20339200  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| || |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  20339201 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 20339300  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggt 230  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  20339301 cctctgacttgcttttcggt 20339320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 10966123 - 10965910
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  10966123 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 10966024  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| ||||| || |||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  10966023 tacaacaggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 10965924  T
Q  211 cctcggacttgctt 224  Q
    |||| |||||||||    
T  10965923 cctctgacttgctt 10965910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 3644593 - 3644365
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataat-ctttgatgctatcaaaggcttcct-ggcattcattattc 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||    
T  3644593 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattctttgatgctatcaaaagcttctttggcattcatcattc 3644494  T
Q  109 cacacaataggttgattgttt-ctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgagg 207  Q
    || |||||||| ||||| ||| || || |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3644493 catacaataggctgattcttttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 3644394  T
Q  208 aaacctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  3644393 aaacctctgacttgcttctctgtctgtgg 3644365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 28588443 - 28588218
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  28588443 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 28588344  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| || |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  28588343 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccacaggttgcggtcatatgagatatgaaccgggagatgtaattcagacgcccgaggaaa 28588244  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  28588243 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 28588218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 10948535 - 10948310
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  10948535 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 10948436  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  10948435 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 10948336  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  10948335 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 10948310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Original strand, 41790110 - 41790323
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  41790110 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 41790209  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  41790210 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaag 41790309  T
Q  211 cctcggacttgctt 224  Q
    |||| |||||||||    
T  41790310 cctctgacttgctt 41790323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 16204834 - 16205055
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| |||   ||||| ||||  |||||    
T  16204834 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctctttggcagtcatcgttcca 16204933  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| || |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||    
T  16204934 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtctgaggaaa 16205033  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtct 232  Q
    |||| ||||||||| |||||||    
T  16205034 cctctgacttgcttctcggtct 16205055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20464420 - 20464212
Alignment:
Q  25 cttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaataggttgat 124  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||| | ||||||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  20464420 cttccttccacgggtgggacaaggataggtgtttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggctgat 20464321  T
Q  125 tgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaacctcggacttgctt 224  Q
    | || |||||||  ||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||    
T  20464320 tcttcctgagtagcttgaagatcggcccgtaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctcagacttgttt 20464221  T
Q  225 ttcggtctg 233  Q
     ||||||||    
T  20464220 ctcggtctg 20464212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 28153189 - 28153080
Alignment:
Q  16 atcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 115  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  28153189 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 28153090  T
Q  116 taggttgatt 125  Q
    |||| |||||    
T  28153089 taggctgatt 28153080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16037 - 15812
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  16037 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 15938  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15937 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 15838  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  15837 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 15812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Original strand, 1424 - 1643
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||    
T  1424 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcattcca 1523  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| || |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  1524 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 1623  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggt 230  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  1624 cctctgacttgcttttcggt 1643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 13027 - 12802
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  13027 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 12928  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||    
T  12927 tacaacaggctggttttttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaa 12828  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  12827 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 12802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 22991 - 23216
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  22991 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 23090  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| || |||||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | ||||    
T  23091 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcagtcatatgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 23190  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  23191 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 23216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9478 - 9253
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  9478 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 9379  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  9378 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 9279  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  9278 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 9253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 11728 - 11953
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  11728 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 11827  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  11828 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 11927  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  11928 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 11953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 5979 - 6204
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||| |||||||| || || |||||||||| ||||||    
T  5979 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatactatcaaaagcctcttggcattcatcattcca 6078  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  6079 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 6178  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  6179 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 6204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 163 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23183 - 23110
Alignment:
Q  163 gtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaacctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  23183 gtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtgg 23110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 11405 - 11180
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  11405 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 11306  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  11305 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 11206  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 236  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  11205 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 11180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 9501 - 9279
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||| ||||||| ||  | || |||||||  |||||    
T  9501 acataatcaaaggccttccttccacaagtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgttatcaaaagccccttgacattcatcgttcca 9402  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     |||||||| ||||| || | |||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||     
T  9401 tacaataggctgattcttccagagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaag 9302  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctg 233  Q
    |||| |||||| || ||||||||    
T  9301 cctctgacttgtttctcggtctg 9279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0748
Description:

Target: scaffold0748; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 5471 - 5693
Alignment:
Q  11 acatcatcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 110  Q
    |||| ||||| | |||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||    
T  5471 acatgatcaacgaccttccttccacaggtgggacaaggataggtggctctaacaggtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcatttca 5570  T
Q  111 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 210  Q
     || | ||||||||| || |||||||  ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  5571 taccacaggttgatttttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggtggcagtcatgtgagatatgaaccttgagatataattcaaacgcccgagaaaa 5670  T
Q  211 cctcggacttgcttttcggtctg 233  Q
    |||| ||||||||| || |||||    
T  5671 cctctgacttgcttctcagtctg 5693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1888 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1888
Description:

Target: scaffold1888; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 127 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 1263 - 1154
Alignment:
Q  127 tttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaacctcggacttgctttt 226  Q
    ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |  ||  |||||||||||| ||||||||| |    
T  1263 tttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgttattcattcgttcgaggaaacctctgacttgcttct 1164  T
Q  227 cggtctgtgg 236  Q
    ||||||||||    
T  1163 cggtctgtgg 1154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Original strand, 43541 - 43754
Alignment:
Q  22 ggccttccttccactggcaggacaaggata-ggtggttccaacagataatct-ttgatgctatc--aaaggcttcctggcattcatt--attccacacaa 115  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||| ||| |||| | ||||||||||   ||| ||||| ||||||||| |  |||||| ||||    
T  43541 ggccttccttccacgggtgggacaaggataaggtggttccagcaggtaatttcttgatgctatacaaaaagcttcttggcattcaattaattccatacaa 43640  T
Q  116 taggt-tgattgtttctga-gtaatttgaaaattggcccgcaggtt-gcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaa-ttaaaacgcccgaggaaac 211  Q
    ||||  ||||| ||||| | |||  ||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||    
T  43641 taggactgattctttctaaagtagcttgaagatcggcccgcaggtttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattttaagcgtccgaggaaac 43740  T
Q  212 ctcggacttgcttt 225  Q
    ||| ||||||||||    
T  43741 ctctgacttgcttt 43754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 194
Target Start/End: Original strand, 35161 - 35223
Alignment:
Q  132 gagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 194  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  35161 gagtaatttgaatatcggcccgcacgttgccgtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaatt 35223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 29530 - 29443
Alignment:
Q  107 tccacacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 194  Q
    |||||||||||  ||| || || | ||||| |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29530 tccacacaataccttgttttttgcggagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 29443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 33770 - 33706
Alignment:
Q  160 gcggtcatatgagatat-gaa-tcgggagatgtaattaaaacg-cccgaggaaacctcggacttg 221  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  33770 gcggtcatgtgagatatagaagtcgggagatgtaattcaaacgccccgaggaaacctctgacttg 33706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University