View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6295_high_10 (Length: 407)

Name: NF6295_high_10
Description: NF6295
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6295_high_10
NF6295_high_10
[»] chr7 (168 HSPs)
chr7 (2-391)||(7351604-7351994)
chr7 (2-392)||(7349228-7349615)
chr7 (2-391)||(38393935-38394322)
chr7 (1-392)||(1046876-1047269)
chr7 (2-391)||(48457602-48457989)
chr7 (2-391)||(20297311-20297698)
chr7 (2-391)||(3035670-3036060)
chr7 (5-391)||(7469975-7470359)
chr7 (2-391)||(18345490-18345877)
chr7 (2-391)||(40836696-40837078)
chr7 (5-391)||(7471933-7472317)
chr7 (2-362)||(31155893-31156247)
chr7 (2-392)||(1049247-1049631)
chr7 (2-391)||(20299407-20299796)
chr7 (5-359)||(20625990-20626342)
chr7 (5-359)||(20629881-20630233)
chr7 (5-359)||(20642300-20642652)
chr7 (47-392)||(3878569-3878914)
chr7 (2-391)||(28487502-28487889)
chr7 (2-392)||(43253469-43253860)
chr7 (2-391)||(44517-44900)
chr7 (49-359)||(44724573-44724883)
chr7 (2-391)||(35582-35965)
chr7 (46-391)||(1849972-1850317)
chr7 (2-392)||(40946277-40946665)
chr7 (2-391)||(28485515-28485901)
chr7 (2-348)||(27306226-27306565)
chr7 (2-391)||(25542484-25542864)
chr7 (2-359)||(42330982-42331335)
chr7 (3-359)||(9680768-9681124)
chr7 (2-359)||(31435031-31435383)
chr7 (49-359)||(13099459-13099771)
chr7 (49-359)||(4295919-4296230)
chr7 (49-359)||(20137094-20137404)
chr7 (49-359)||(11355252-11355562)
chr7 (49-359)||(21592128-21592438)
chr7 (2-288)||(11757177-11757463)
chr7 (49-359)||(21990145-21990454)
chr7 (161-391)||(2935374-2935604)
chr7 (49-359)||(443589-443900)
chr7 (53-359)||(24748592-24748899)
chr7 (161-392)||(22108173-22108403)
chr7 (161-392)||(40549933-40550163)
chr7 (4-357)||(9679009-9679361)
chr7 (161-392)||(22137184-22137414)
chr7 (49-359)||(37412110-37412423)
chr7 (161-392)||(40552211-40552441)
chr7 (161-391)||(1606486-1606715)
chr7 (49-359)||(21680021-21680334)
chr7 (49-348)||(21678060-21678359)
chr7 (49-359)||(39145971-39146282)
chr7 (125-391)||(7092166-7092431)
chr7 (63-359)||(42223165-42223462)
chr7 (61-320)||(27832656-27832916)
chr7 (161-391)||(9027146-9027376)
chr7 (125-391)||(7094413-7094678)
chr7 (145-392)||(38396725-38396971)
chr7 (49-332)||(24258457-24258744)
chr7 (49-262)||(25276135-25276347)
chr7 (49-249)||(26804563-26804765)
chr7 (49-262)||(22828716-22828928)
chr7 (2-254)||(22251641-22251878)
chr7 (49-334)||(24817362-24817643)
chr7 (84-347)||(24813494-24813755)
chr7 (2-347)||(7188496-7188833)
chr7 (49-311)||(20091580-20091836)
chr7 (2-173)||(18567566-18567731)
chr7 (49-254)||(24465543-24465735)
chr7 (210-359)||(22393876-22394027)
chr7 (147-347)||(6332311-6332514)
chr7 (65-347)||(11081522-11081803)
chr7 (162-360)||(25351353-25351547)
chr7 (146-369)||(2120881-2121104)
chr7 (2-203)||(22392426-22392608)
chr7 (147-347)||(16297018-16297222)
chr7 (189-348)||(26295580-26295741)
chr7 (292-391)||(11759364-11759463)
chr7 (162-348)||(25357047-25357231)
chr7 (162-346)||(3320049-3320232)
chr7 (162-346)||(3324797-3324980)
chr7 (162-346)||(25405393-25405576)
chr7 (162-348)||(25410130-25410316)
chr7 (186-262)||(6348912-6348988)
chr7 (281-344)||(9190038-9190101)
chr7 (281-344)||(20284093-20284156)
chr7 (162-346)||(7069780-7069963)
chr7 (207-332)||(6046644-6046772)
chr7 (280-344)||(21983288-21983352)
chr7 (280-344)||(46516339-46516403)
chr7 (281-344)||(2580394-2580457)
chr7 (65-349)||(6048885-6049168)
chr7 (180-363)||(6067179-6067365)
chr7 (256-369)||(34546857-34546972)
chr7 (162-346)||(7074787-7074970)
chr7 (46-116)||(38396307-38396377)
chr7 (280-344)||(2647725-2647789)
chr7 (5-104)||(7094662-7094759)
chr7 (162-346)||(8378502-8378686)
chr7 (280-344)||(29159807-29159871)
chr7 (256-369)||(7464496-7464611)
chr7 (281-344)||(9185195-9185258)
chr7 (281-344)||(28617255-28617318)
chr7 (281-344)||(33332480-33332543)
chr7 (150-256)||(40281466-40281572)
chr7 (162-346)||(15540994-15541177)
chr7 (162-344)||(21369642-21369824)
chr7 (280-341)||(55955-56015)
chr7 (5-104)||(7092414-7092512)
chr7 (165-369)||(44512503-44512704)
chr7 (280-344)||(35960820-35960884)
chr7 (280-344)||(44848713-44848777)
chr7 (165-347)||(30246973-30247155)
chr7 (162-348)||(42006663-42006849)
chr7 (92-347)||(13290470-13290723)
chr7 (280-344)||(4796696-4796760)
chr7 (84-225)||(11084409-11084544)
chr7 (228-367)||(44010729-44010867)
chr7 (256-364)||(2075205-2075315)
chr7 (279-344)||(21639813-21639877)
chr7 (280-344)||(47263682-47263744)
chr7 (280-344)||(49091665-49091729)
chr7 (281-344)||(5817300-5817362)
chr7 (281-344)||(23403043-23403106)
chr7 (2-57)||(38396239-38396294)
chr7 (295-367)||(44016640-44016711)
chr7 (284-344)||(2057970-2058029)
chr7 (280-344)||(2479341-2479404)
chr7 (284-344)||(4866735-4866794)
chr7 (284-344)||(18408768-18408827)
chr7 (284-344)||(19992318-19992377)
chr7 (284-344)||(24024347-24024406)
chr7 (147-225)||(26210631-26210710)
chr7 (307-359)||(26804762-26804814)
chr7 (301-344)||(21988912-21988955)
chr7 (125-204)||(12310157-12310234)
chr7 (284-344)||(1533477-1533536)
chr7 (284-344)||(12396916-12396975)
chr7 (284-344)||(16880078-16880137)
chr7 (284-344)||(16884934-16884993)
chr7 (280-344)||(18413645-18413707)
chr7 (284-344)||(20357580-20357639)
chr7 (280-344)||(21646011-21646074)
chr7 (284-344)||(24261344-24261403)
chr7 (284-344)||(24266223-24266282)
chr7 (300-344)||(27347941-27347985)
chr7 (284-344)||(31109604-31109663)
chr7 (300-344)||(41317434-41317478)
chr7 (324-359)||(22251570-22251605)
chr7 (1-31)||(2935305-2935335)
chr7 (1-31)||(9027411-9027441)
chr7 (1-31)||(22108113-22108143)
chr7 (1-31)||(22137124-22137154)
chr7 (1-31)||(40549873-40549903)
chr7 (1-31)||(40552151-40552181)
chr7 (2-31)||(1606423-1606452)
chr7 (300-344)||(8153466-8153510)
chr7 (300-344)||(12097867-12097911)
chr7 (284-344)||(12406336-12406395)
chr7 (300-344)||(14069833-14069877)
chr7 (300-344)||(14379861-14379905)
chr7 (300-344)||(18126768-18126812)
chr7 (284-344)||(21812259-21812318)
chr7 (300-344)||(30814560-30814604)
chr7 (300-344)||(31732969-31733013)
chr7 (292-347)||(40281379-40281435)
chr7 (300-344)||(41649011-41649055)
chr7 (300-344)||(43864368-43864412)
chr7 (300-344)||(48489555-48489599)
[»] chr3 (207 HSPs)
chr3 (2-391)||(746674-747064)
chr3 (2-391)||(458203-458591)
chr3 (2-391)||(455826-456214)
chr3 (2-391)||(10621480-10621876)
chr3 (1-391)||(38210290-38210677)
chr3 (47-391)||(50493961-50494305)
chr3 (1-391)||(6063396-6063783)
chr3 (2-392)||(4103846-4104233)
chr3 (2-391)||(6065746-6066131)
chr3 (1-391)||(25388820-25389212)
chr3 (2-362)||(25533357-25533719)
chr3 (75-391)||(28412981-28413299)
chr3 (2-391)||(38889962-38890346)
chr3 (2-362)||(3859451-3859804)
chr3 (4-391)||(10955978-10956359)
chr3 (2-359)||(4308264-4308615)
chr3 (3-391)||(10084340-10084726)
chr3 (49-391)||(5191617-5191957)
chr3 (4-391)||(10958274-10958655)
chr3 (2-391)||(51726958-51727340)
chr3 (2-371)||(9604577-9604946)
chr3 (1-359)||(18099153-18099505)
chr3 (39-359)||(42990258-42990578)
chr3 (2-359)||(11170327-11170678)
chr3 (49-359)||(43228255-43228565)
chr3 (2-359)||(45882862-45883214)
chr3 (1-359)||(18096883-18097236)
chr3 (2-359)||(53917647-53917998)
chr3 (46-359)||(30005802-30006115)
chr3 (2-391)||(5522578-5522949)
chr3 (2-359)||(27101164-27101519)
chr3 (2-359)||(1313333-1313683)
chr3 (3-359)||(1626666-1627016)
chr3 (2-391)||(10191263-10191647)
chr3 (49-348)||(43226050-43226348)
chr3 (89-391)||(1321483-1321785)
chr3 (2-392)||(22114255-22114639)
chr3 (49-359)||(43423446-43423756)
chr3 (2-391)||(26720471-26720853)
chr3 (49-359)||(28101985-28102295)
chr3 (49-359)||(3314648-3314959)
chr3 (2-359)||(24979630-24979982)
chr3 (4-359)||(43421398-43421747)
chr3 (2-359)||(53915479-53915830)
chr3 (3-359)||(880434-880785)
chr3 (49-359)||(5926748-5927057)
chr3 (49-359)||(51943335-51943644)
chr3 (63-359)||(18162641-18162937)
chr3 (2-359)||(32264021-32264377)
chr3 (9-301)||(6561740-6562028)
chr3 (3-347)||(47148890-47149233)
chr3 (107-362)||(7606568-7606822)
chr3 (2-359)||(42992205-42992544)
chr3 (1-251)||(35777343-35777587)
chr3 (49-359)||(36011791-36012101)
chr3 (46-306)||(29956647-29956907)
chr3 (2-359)||(12267958-12268300)
chr3 (2-359)||(48361654-48362004)
chr3 (50-359)||(53468436-53468747)
chr3 (49-359)||(28761410-28761721)
chr3 (49-342)||(35917944-35918242)
chr3 (10-359)||(32219026-32219359)
chr3 (2-359)||(15780783-15781153)
chr3 (49-359)||(39715434-39715739)
chr3 (49-359)||(51674749-51675048)
chr3 (49-241)||(28100143-28100334)
chr3 (146-359)||(5886261-5886472)
chr3 (146-359)||(5899734-5899945)
chr3 (98-359)||(6484372-6484634)
chr3 (49-336)||(889779-890064)
chr3 (149-391)||(11168165-11168407)
chr3 (2-359)||(23633383-23633727)
chr3 (49-348)||(31151312-31151608)
chr3 (50-357)||(54691559-54691865)
chr3 (136-359)||(25688143-25688367)
chr3 (2-177)||(41849065-41849244)
chr3 (3-246)||(28180948-28181182)
chr3 (49-344)||(53591159-53591442)
chr3 (106-359)||(4666535-4666788)
chr3 (133-359)||(6231849-6232074)
chr3 (2-338)||(53597164-53597491)
chr3 (92-347)||(561769-562024)
chr3 (92-338)||(13420189-13420432)
chr3 (49-359)||(27635641-27635920)
chr3 (49-262)||(23636991-23637199)
chr3 (57-347)||(36871295-36871583)
chr3 (49-262)||(54884121-54884330)
chr3 (49-234)||(28137415-28137588)
chr3 (92-359)||(17795269-17795533)
chr3 (92-359)||(19103709-19103973)
chr3 (92-254)||(25635391-25635549)
chr3 (278-392)||(53894006-53894121)
chr3 (2-142)||(11163073-11163207)
chr3 (213-359)||(47701654-47701801)
chr3 (85-254)||(1673975-1674140)
chr3 (147-345)||(1620457-1620657)
chr3 (3-139)||(47701798-47701928)
chr3 (163-359)||(3306839-3307034)
chr3 (49-138)||(6231413-6231502)
chr3 (165-369)||(10897008-10897210)
chr3 (165-360)||(29913941-29914132)
chr3 (192-347)||(24181486-24181644)
chr3 (278-362)||(35919095-35919179)
chr3 (162-346)||(10094073-10094256)
chr3 (4-128)||(3306724-3306842)
chr3 (280-344)||(1736324-1736388)
chr3 (280-344)||(18552902-18552966)
chr3 (280-344)||(30709809-30709873)
chr3 (271-359)||(41849245-41849333)
chr3 (162-346)||(10100090-10100273)
chr3 (162-346)||(10200953-10201136)
chr3 (129-226)||(4560401-4560497)
chr3 (165-346)||(54193229-54193410)
chr3 (280-344)||(8370505-8370569)
chr3 (280-344)||(27974971-27975035)
chr3 (280-344)||(27986465-27986529)
chr3 (281-344)||(1417510-1417573)
chr3 (84-190)||(24177278-24177380)
chr3 (165-367)||(27761965-27762165)
chr3 (165-348)||(47878167-47878350)
chr3 (162-346)||(10207999-10208182)
chr3 (162-346)||(27544273-27544456)
chr3 (280-341)||(48438221-48438282)
chr3 (165-360)||(10595020-10595213)
chr3 (84-222)||(13419883-13420015)
chr3 (147-262)||(14634523-14634638)
chr3 (280-344)||(16264354-16264418)
chr3 (280-344)||(21711227-21711291)
chr3 (162-346)||(22625982-22626166)
chr3 (280-344)||(32143325-32143389)
chr3 (280-344)||(33386685-33386749)
chr3 (281-344)||(37466295-37466358)
chr3 (165-346)||(54188512-54188692)
chr3 (280-344)||(26298992-26299056)
chr3 (280-344)||(27452962-27453026)
chr3 (280-344)||(36029097-36029161)
chr3 (170-348)||(4535622-4535801)
chr3 (165-348)||(10612774-10612957)
chr3 (281-344)||(25795785-25795848)
chr3 (162-346)||(6303310-6303493)
chr3 (179-368)||(46966624-46966816)
chr3 (280-344)||(3716021-3716085)
chr3 (162-360)||(5858546-5858739)
chr3 (280-344)||(6794732-6794796)
chr3 (280-344)||(40592801-40592865)
chr3 (280-344)||(47923925-47923989)
chr3 (179-367)||(13893478-13893666)
chr3 (92-190)||(25633930-25634024)
chr3 (166-367)||(10949239-10949438)
chr3 (279-367)||(48390281-48390368)
chr3 (230-368)||(15823625-15823763)
chr3 (162-363)||(16996875-16997078)
chr3 (281-338)||(25929463-25929519)
chr3 (165-367)||(20031296-20031497)
chr3 (280-344)||(26928620-26928683)
chr3 (280-344)||(39040011-39040075)
chr3 (280-344)||(40844656-40844719)
chr3 (281-344)||(3328376-3328439)
chr3 (179-320)||(11007545-11007679)
chr3 (162-367)||(11079517-11079721)
chr3 (2-81)||(1321364-1321437)
chr3 (284-344)||(2671619-2671678)
chr3 (284-344)||(7167249-7167308)
chr3 (284-344)||(8477367-8477426)
chr3 (284-344)||(8739096-8739155)
chr3 (284-344)||(9091334-9091393)
chr3 (147-225)||(11066652-11066731)
chr3 (284-344)||(18656440-18656499)
chr3 (284-344)||(22173216-22173275)
chr3 (280-344)||(24695183-24695247)
chr3 (229-347)||(25634030-25634150)
chr3 (284-344)||(40372828-40372887)
chr3 (1-81)||(6719358-6719446)
chr3 (290-347)||(1674169-1674227)
chr3 (281-327)||(3323710-3323756)
chr3 (162-367)||(38002869-38003072)
chr3 (162-348)||(47882878-47883064)
chr3 (49-98)||(4560509-4560558)
chr3 (129-174)||(7606828-7606873)
chr3 (284-344)||(2672952-2673011)
chr3 (284-344)||(2677108-2677167)
chr3 (284-344)||(4386950-4387010)
chr3 (284-344)||(8512222-8512281)
chr3 (284-344)||(8517102-8517161)
chr3 (300-344)||(29813187-29813231)
chr3 (284-344)||(32475490-32475549)
chr3 (284-344)||(32480348-32480407)
chr3 (300-344)||(40913417-40913461)
chr3 (300-344)||(44331669-44331713)
chr3 (281-344)||(1305953-1306015)
chr3 (162-225)||(16462203-16462264)
chr3 (2-37)||(42990205-42990240)
chr3 (147-225)||(7768632-7768709)
chr3 (280-344)||(9666466-9666531)
chr3 (2-31)||(18162587-18162616)
chr3 (125-188)||(31021300-31021361)
chr3 (306-359)||(42992607-42992660)
chr3 (2-30)||(5191576-5191604)
chr3 (300-344)||(16499153-16499197)
chr3 (300-344)||(23391909-23391953)
chr3 (300-344)||(29196386-29196430)
chr3 (300-344)||(30236249-30236293)
chr3 (304-344)||(32744436-32744476)
chr3 (300-344)||(39153361-39153405)
chr3 (300-344)||(40734622-40734666)
chr3 (300-340)||(40735507-40735547)
chr3 (300-344)||(51398938-51398982)
[»] chr5 (154 HSPs)
chr5 (2-383)||(15552178-15552564)
chr5 (1-391)||(31542677-31543060)
chr5 (1-391)||(31545022-31545409)
chr5 (2-391)||(27912473-27912862)
chr5 (1-389)||(31179328-31179708)
chr5 (4-391)||(18466625-18467010)
chr5 (46-391)||(34479371-34479717)
chr5 (46-391)||(34477006-34477352)
chr5 (2-391)||(21684405-21684797)
chr5 (2-391)||(25803959-25804350)
chr5 (2-362)||(27910388-27910747)
chr5 (2-391)||(25921426-25921809)
chr5 (49-362)||(2174903-2175215)
chr5 (2-391)||(10529051-10529435)
chr5 (2-391)||(18468950-18469335)
chr5 (2-362)||(38882048-38882402)
chr5 (46-359)||(6745050-6745362)
chr5 (2-391)||(4236572-4236954)
chr5 (2-371)||(6747247-6747609)
chr5 (5-359)||(18511197-18511547)
chr5 (2-359)||(39854427-39854777)
chr5 (2-359)||(21947970-21948320)
chr5 (3-359)||(1189592-1189949)
chr5 (49-359)||(16776142-16776451)
chr5 (2-362)||(10586782-10587129)
chr5 (5-359)||(18509303-18509652)
chr5 (2-359)||(2818320-2818672)
chr5 (49-347)||(40221506-40221805)
chr5 (161-391)||(3373090-3373320)
chr5 (3-359)||(25904047-25904397)
chr5 (161-391)||(10749796-10750025)
chr5 (47-359)||(16092184-16092497)
chr5 (49-359)||(24126840-24127150)
chr5 (3-353)||(17072827-17073172)
chr5 (6-359)||(10474308-10474655)
chr5 (49-371)||(31472584-31472908)
chr5 (58-359)||(17818477-17818776)
chr5 (2-359)||(26097676-26098025)
chr5 (49-359)||(2954400-2954710)
chr5 (161-392)||(15354527-15354757)
chr5 (161-392)||(23665140-23665370)
chr5 (161-392)||(23793217-23793447)
chr5 (132-362)||(4410090-4410319)
chr5 (161-391)||(10757273-10757501)
chr5 (49-359)||(6756478-6756786)
chr5 (2-358)||(18596590-18596939)
chr5 (161-392)||(15356803-15357033)
chr5 (87-359)||(658341-658610)
chr5 (49-359)||(695873-696172)
chr5 (2-359)||(36402313-36402664)
chr5 (161-391)||(38960084-38960314)
chr5 (168-392)||(23741811-23742034)
chr5 (2-359)||(31465974-31466314)
chr5 (49-359)||(39397978-39398287)
chr5 (49-348)||(37705776-37706075)
chr5 (49-262)||(34530749-34530961)
chr5 (2-359)||(12555908-12556259)
chr5 (145-362)||(39798127-39798344)
chr5 (145-359)||(20505828-20506040)
chr5 (49-224)||(20043034-20043208)
chr5 (49-359)||(21288748-21289055)
chr5 (49-228)||(20044994-20045172)
chr5 (132-359)||(41585729-41585956)
chr5 (127-359)||(2723964-2724187)
chr5 (8-347)||(6661181-6661512)
chr5 (161-389)||(23667415-23667642)
chr5 (49-205)||(26098391-26098546)
chr5 (89-359)||(9020246-9020514)
chr5 (52-359)||(20053834-20054131)
chr5 (146-354)||(36208656-36208865)
chr5 (65-333)||(17413176-17413441)
chr5 (2-141)||(20507665-20507798)
chr5 (2-105)||(4410000-4410101)
chr5 (147-347)||(15143547-15143750)
chr5 (165-360)||(22672837-22673030)
chr5 (162-346)||(1170811-1170994)
chr5 (162-346)||(35385450-35385634)
chr5 (46-335)||(2144570-2144859)
chr5 (167-360)||(25445501-25445692)
chr5 (192-262)||(42770936-42771006)
chr5 (280-344)||(9353361-9353425)
chr5 (280-344)||(36932379-36932443)
chr5 (281-344)||(28832263-28832326)
chr5 (165-347)||(4897828-4898013)
chr5 (279-344)||(11917000-11917065)
chr5 (162-346)||(2297999-2298183)
chr5 (280-344)||(10281755-10281819)
chr5 (162-367)||(10627364-10627569)
chr5 (280-344)||(15464536-15464600)
chr5 (280-344)||(17003989-17004053)
chr5 (165-360)||(25452498-25452691)
chr5 (49-234)||(42770757-42770934)
chr5 (256-367)||(42238350-42238463)
chr5 (280-344)||(19588750-19588814)
chr5 (196-347)||(15445263-15445417)
chr5 (165-367)||(17841228-17841428)
chr5 (281-344)||(31300626-31300689)
chr5 (281-344)||(42127440-42127503)
chr5 (65-225)||(4754159-4754312)
chr5 (162-369)||(1240428-1240633)
chr5 (280-344)||(12084204-12084268)
chr5 (280-344)||(14520234-14520298)
chr5 (260-359)||(26098273-26098373)
chr5 (165-364)||(28786407-28786604)
chr5 (165-367)||(11962412-11962612)
chr5 (297-359)||(20043222-20043284)
chr5 (280-344)||(38192178-38192241)
chr5 (280-344)||(38219403-38219466)
chr5 (280-346)||(36263810-36263877)
chr5 (49-104)||(41585946-41586001)
chr5 (162-336)||(31782463-31782639)
chr5 (280-344)||(3880303-3880367)
chr5 (65-220)||(29748352-29748502)
chr5 (284-344)||(31180219-31180278)
chr5 (284-344)||(43592284-43592343)
chr5 (281-344)||(24553537-24553599)
chr5 (281-334)||(11181862-11181916)
chr5 (281-335)||(33030970-33031024)
chr5 (147-223)||(34033691-34033768)
chr5 (161-225)||(32520533-32520597)
chr5 (284-344)||(1457183-1457242)
chr5 (284-344)||(2785380-2785439)
chr5 (284-344)||(15044691-15044750)
chr5 (116-225)||(15224889-15224997)
chr5 (300-344)||(19806487-19806531)
chr5 (284-344)||(27449819-27449878)
chr5 (284-344)||(28807593-28807652)
chr5 (284-344)||(31397014-31397073)
chr5 (300-344)||(32636948-32636992)
chr5 (280-344)||(35387667-35387730)
chr5 (284-344)||(37556643-37556702)
chr5 (284-344)||(37561465-37561524)
chr5 (281-344)||(24135853-24135915)
chr5 (1-36)||(34477374-34477409)
chr5 (147-360)||(35430259-35430477)
chr5 (2-32)||(2144898-2144928)
chr5 (1-31)||(10757206-10757236)
chr5 (1-31)||(15354789-15354819)
chr5 (1-31)||(15357065-15357095)
chr5 (1-31)||(23665080-23665110)
chr5 (1-31)||(23793477-23793507)
chr5 (3-103)||(36208524-36208617)
chr5 (1-31)||(38960349-38960379)
chr5 (284-326)||(43598746-43598788)
chr5 (284-326)||(43604238-43604280)
chr5 (284-326)||(43609730-43609772)
chr5 (2-31)||(3373348-3373377)
chr5 (3-32)||(29748285-29748314)
chr5 (300-344)||(533893-533937)
chr5 (280-344)||(2630235-2630299)
chr5 (284-344)||(27444975-27445034)
chr5 (284-344)||(30631411-30631470)
chr5 (284-344)||(31401871-31401930)
chr5 (300-344)||(42428430-42428474)
[»] chr4 (190 HSPs)
chr4 (49-391)||(44599791-44600133)
chr4 (2-391)||(18709116-18709507)
chr4 (1-391)||(16934097-16934480)
chr4 (1-391)||(22780325-22780718)
chr4 (1-391)||(22782690-22783083)
chr4 (1-391)||(16931743-16932126)
chr4 (1-392)||(11008520-11008907)
chr4 (2-391)||(37089325-37089710)
chr4 (1-362)||(11006219-11006578)
chr4 (2-391)||(38409196-38409584)
chr4 (49-392)||(9176426-9176769)
chr4 (2-392)||(8631371-8631759)
chr4 (1-391)||(18847149-18847532)
chr4 (1-392)||(9174098-9174483)
chr4 (2-362)||(24348211-24348569)
chr4 (2-392)||(22132343-22132735)
chr4 (2-362)||(9148248-9148603)
chr4 (49-391)||(22044344-22044685)
chr4 (49-391)||(22046639-22046980)
chr4 (49-391)||(51015284-51015625)
chr4 (49-392)||(31849551-31849894)
chr4 (49-359)||(40637112-40637422)
chr4 (2-362)||(5198417-5198771)
chr4 (2-391)||(11434952-11435334)
chr4 (2-391)||(2484826-2485209)
chr4 (47-391)||(7941357-7941703)
chr4 (2-392)||(22134570-22134966)
chr4 (2-391)||(14633317-14633698)
chr4 (2-391)||(6764836-6765224)
chr4 (2-359)||(22800847-22801198)
chr4 (77-391)||(26085930-26086243)
chr4 (2-357)||(24888793-24889142)
chr4 (2-359)||(24878986-24879338)
chr4 (49-391)||(47868439-47868781)
chr4 (2-357)||(48486316-48486665)
chr4 (2-359)||(22802719-22803070)
chr4 (2-359)||(17662230-17662574)
chr4 (2-359)||(24880448-24880800)
chr4 (2-362)||(47274724-47275076)
chr4 (2-359)||(36919569-36919923)
chr4 (2-359)||(36921478-36921831)
chr4 (2-371)||(14787405-14787769)
chr4 (49-359)||(38928162-38928473)
chr4 (2-359)||(40091400-40091751)
chr4 (2-340)||(47210756-47211082)
chr4 (49-359)||(33415473-33415782)
chr4 (2-359)||(36378289-36378641)
chr4 (2-391)||(53405124-53405513)
chr4 (49-359)||(12395830-12396140)
chr4 (3-359)||(19095880-19096231)
chr4 (49-359)||(12400792-12401102)
chr4 (2-287)||(3824627-3824909)
chr4 (2-285)||(5637524-5637805)
chr4 (47-359)||(16453345-16453658)
chr4 (2-359)||(619433-619783)
chr4 (49-359)||(37313050-37313361)
chr4 (49-359)||(19322735-19323043)
chr4 (4-320)||(13543953-13544268)
chr4 (49-340)||(56030482-56030770)
chr4 (87-359)||(36380425-36380698)
chr4 (49-347)||(41997530-41997828)
chr4 (3-347)||(18537470-18537806)
chr4 (124-348)||(16455354-16455579)
chr4 (60-347)||(18409344-18409631)
chr4 (207-391)||(11437558-11437742)
chr4 (207-391)||(5635429-5635614)
chr4 (2-262)||(52942542-52942783)
chr4 (49-240)||(3937314-3937504)
chr4 (49-347)||(18534828-18535124)
chr4 (49-230)||(6132911-6133090)
chr4 (2-347)||(8756247-8756586)
chr4 (91-347)||(38890221-38890476)
chr4 (159-359)||(13547302-13547502)
chr4 (153-359)||(2891433-2891640)
chr4 (189-359)||(4215483-4215654)
chr4 (94-359)||(27499128-27499390)
chr4 (49-334)||(15032557-15032831)
chr4 (3-172)||(38270158-38270321)
chr4 (146-347)||(12102221-12102425)
chr4 (65-347)||(28453742-28454020)
chr4 (99-359)||(30136640-30136898)
chr4 (91-347)||(9863791-9864049)
chr4 (3-172)||(24446756-24446914)
chr4 (162-347)||(16185831-16186018)
chr4 (2-143)||(5100994-5101129)
chr4 (65-338)||(10112927-10113198)
chr4 (50-128)||(2891356-2891434)
chr4 (213-359)||(5101130-5101276)
chr4 (146-347)||(31983524-31983727)
chr4 (65-262)||(47150977-47151167)
chr4 (147-347)||(25357772-25357979)
chr4 (162-346)||(11853549-11853732)
chr4 (84-225)||(40999071-40999208)
chr4 (150-333)||(3982186-3982374)
chr4 (280-344)||(10047383-10047447)
chr4 (280-344)||(39245998-39246062)
chr4 (162-367)||(4570094-4570296)
chr4 (65-310)||(9022362-9022605)
chr4 (162-367)||(5336757-5336964)
chr4 (280-344)||(5269220-5269284)
chr4 (165-360)||(8529270-8529463)
chr4 (165-360)||(18586969-18587162)
chr4 (280-343)||(36315258-36315321)
chr4 (280-343)||(36329467-36329530)
chr4 (165-347)||(31300427-31300608)
chr4 (162-367)||(36769479-36769682)
chr4 (162-346)||(55822265-55822447)
chr4 (280-344)||(5396700-5396764)
chr4 (280-344)||(38152468-38152532)
chr4 (165-348)||(4884877-4885060)
chr4 (280-343)||(6743444-6743507)
chr4 (280-344)||(5143263-5143327)
chr4 (165-360)||(15316961-15317153)
chr4 (280-344)||(16623322-16623386)
chr4 (280-344)||(31985663-31985726)
chr4 (271-359)||(47563021-47563109)
chr4 (280-344)||(54867188-54867251)
chr4 (165-348)||(4558314-4558496)
chr4 (165-347)||(16489352-16489533)
chr4 (165-348)||(16688936-16689119)
chr4 (162-321)||(7050281-7050439)
chr4 (290-371)||(14789404-14789484)
chr4 (165-346)||(15831144-15831325)
chr4 (165-348)||(4556056-4556238)
chr4 (280-344)||(24333813-24333877)
chr4 (280-344)||(25862051-25862115)
chr4 (230-347)||(3578668-3578786)
chr4 (165-348)||(15312319-15312502)
chr4 (162-346)||(16638827-16639011)
chr4 (162-367)||(36771396-36771599)
chr4 (281-335)||(39774335-39774389)
chr4 (281-338)||(1983330-1983387)
chr4 (281-334)||(34495853-34495906)
chr4 (280-344)||(3777553-3777617)
chr4 (280-344)||(3796548-3796612)
chr4 (284-344)||(5147681-5147741)
chr4 (279-359)||(6133105-6133185)
chr4 (280-344)||(16630709-16630773)
chr4 (280-344)||(28468558-28468621)
chr4 (250-347)||(26557823-26557922)
chr4 (91-207)||(10114412-10114522)
chr4 (197-235)||(38270120-38270158)
chr4 (305-359)||(52942473-52942527)
chr4 (147-266)||(54906722-54906843)
chr4 (302-359)||(3937259-3937316)
chr4 (281-338)||(5112247-5112304)
chr4 (284-344)||(3814029-3814088)
chr4 (284-344)||(5732670-5732729)
chr4 (284-344)||(9224428-9224487)
chr4 (284-344)||(18855732-18855791)
chr4 (284-344)||(24741945-24742004)
chr4 (284-344)||(29760646-29760705)
chr4 (284-344)||(51520462-51520521)
chr4 (256-364)||(25613938-25614048)
chr4 (256-347)||(10114561-10114654)
chr4 (281-338)||(18377369-18377426)
chr4 (284-344)||(9229215-9229274)
chr4 (300-344)||(12739550-12739594)
chr4 (323-359)||(24446639-24446675)
chr4 (232-307)||(24446678-24446754)
chr4 (165-225)||(25699752-25699810)
chr4 (300-344)||(26175636-26175680)
chr4 (161-225)||(29609591-29609654)
chr4 (300-344)||(36463389-36463433)
chr4 (284-344)||(45347838-45347897)
chr4 (284-344)||(45357317-45357376)
chr4 (300-344)||(48893638-48893682)
chr4 (324-359)||(3824595-3824630)
chr4 (305-348)||(49088865-49088908)
chr4 (147-223)||(5516367-5516444)
chr4 (148-253)||(22295294-22295399)
chr4 (271-347)||(22295424-22295502)
chr4 (281-344)||(42599602-42599667)
chr4 (284-326)||(56146732-56146774)
chr4 (168-224)||(3760105-3760161)
chr4 (47-80)||(16455323-16455356)
chr4 (2-31)||(25357634-25357663)
chr4 (237-344)||(27416965-27417070)
chr4 (3-32)||(52043736-52043765)
chr4 (300-344)||(5429803-5429847)
chr4 (300-344)||(5871944-5871988)
chr4 (300-344)||(9927458-9927502)
chr4 (300-344)||(12743925-12743969)
chr4 (300-344)||(12745314-12745358)
chr4 (165-310)||(13072016-13072160)
chr4 (4-32)||(28453686-28453714)
chr4 (300-344)||(46147391-46147435)
chr4 (300-344)||(47038411-47038455)
chr4 (165-225)||(47566496-47566554)
chr4 (300-344)||(52467354-52467398)
[»] chr8 (132 HSPs)
chr8 (46-391)||(43079640-43079984)
chr8 (46-391)||(43082010-43082355)
chr8 (2-391)||(32339304-32339691)
chr8 (2-347)||(24873178-24873523)
chr8 (2-391)||(28283174-28283561)
chr8 (2-391)||(15809214-15809600)
chr8 (49-391)||(27829337-27829678)
chr8 (49-391)||(27827026-27827367)
chr8 (2-362)||(3874005-3874363)
chr8 (2-391)||(22684606-22685002)
chr8 (1-391)||(44720841-44721225)
chr8 (46-391)||(608771-609117)
chr8 (49-391)||(18810748-18811089)
chr8 (2-391)||(4424017-4424400)
chr8 (2-359)||(14807750-14808111)
chr8 (2-359)||(15072709-15073061)
chr8 (2-359)||(28251552-28251903)
chr8 (49-359)||(30480488-30480798)
chr8 (2-358)||(15067980-15068330)
chr8 (2-391)||(43530123-43530497)
chr8 (3-357)||(27106884-27107232)
chr8 (49-391)||(18812933-18813263)
chr8 (2-359)||(14419175-14419527)
chr8 (49-359)||(1225206-1225517)
chr8 (49-355)||(27911055-27911359)
chr8 (49-355)||(27957474-27957778)
chr8 (2-359)||(13858470-13858820)
chr8 (49-359)||(41384785-41385094)
chr8 (50-359)||(36865579-36865887)
chr8 (49-359)||(25952561-25952871)
chr8 (49-254)||(14477316-14477520)
chr8 (49-360)||(5372160-5372472)
chr8 (2-359)||(41382672-41383012)
chr8 (3-226)||(33541507-33541723)
chr8 (49-359)||(15185699-15186005)
chr8 (99-359)||(15956051-15956308)
chr8 (49-348)||(3005626-3005922)
chr8 (3-347)||(21482322-21482649)
chr8 (49-338)||(21480554-21480832)
chr8 (49-205)||(5622878-5623033)
chr8 (2-347)||(31162212-31162551)
chr8 (49-187)||(26775241-26775378)
chr8 (145-347)||(31035253-31035459)
chr8 (132-280)||(181622-181772)
chr8 (3-172)||(35872555-35872713)
chr8 (49-228)||(37214317-37214505)
chr8 (147-347)||(31578273-31578476)
chr8 (2-120)||(12517248-12517362)
chr8 (147-337)||(17847661-17847848)
chr8 (91-225)||(31573847-31573975)
chr8 (162-346)||(16757266-16757449)
chr8 (2-109)||(3886153-3886254)
chr8 (162-360)||(9021093-9021289)
chr8 (162-346)||(28327908-28328091)
chr8 (165-369)||(23179538-23179740)
chr8 (280-344)||(4696625-4696689)
chr8 (280-344)||(9765848-9765912)
chr8 (280-344)||(26403259-26403323)
chr8 (165-346)||(25684646-25684826)
chr8 (162-367)||(17799403-17799606)
chr8 (216-347)||(2468126-2468259)
chr8 (162-347)||(6376141-6376328)
chr8 (280-344)||(7412345-7412409)
chr8 (280-344)||(23799606-23799670)
chr8 (162-346)||(28895502-28895686)
chr8 (280-344)||(31071258-31071322)
chr8 (2-104)||(181536-181632)
chr8 (281-344)||(19752424-19752487)
chr8 (84-178)||(31035144-31035235)
chr8 (162-346)||(4812486-4812669)
chr8 (162-346)||(16752522-16752704)
chr8 (162-346)||(28332631-28332814)
chr8 (280-344)||(5702512-5702576)
chr8 (280-344)||(19175783-19175847)
chr8 (271-359)||(33541395-33541483)
chr8 (256-346)||(28890855-28890949)
chr8 (165-367)||(33032657-33032857)
chr8 (294-357)||(37214251-37214314)
chr8 (165-360)||(590797-590990)
chr8 (280-340)||(4456036-4456096)
chr8 (280-344)||(6127225-6127289)
chr8 (165-321)||(29554809-29554964)
chr8 (280-344)||(1261983-1262046)
chr8 (280-344)||(26287906-26287969)
chr8 (280-344)||(26301163-26301226)
chr8 (280-344)||(26313157-26313220)
chr8 (162-367)||(30423212-30423418)
chr8 (162-248)||(13985176-13985262)
chr8 (2-190)||(2468261-2468434)
chr8 (279-344)||(18853196-18853260)
chr8 (279-344)||(18870590-18870654)
chr8 (281-338)||(28307571-28307628)
chr8 (284-344)||(6311302-6311361)
chr8 (284-344)||(6813687-6813747)
chr8 (284-344)||(7289947-7290006)
chr8 (284-344)||(10689176-10689235)
chr8 (284-344)||(25328299-25328358)
chr8 (284-344)||(33037839-33037898)
chr8 (284-344)||(36979382-36979441)
chr8 (284-344)||(39784843-39784902)
chr8 (302-368)||(28228656-28228723)
chr8 (1-36)||(43081956-43081991)
chr8 (286-344)||(30655651-30655708)
chr8 (147-225)||(33839043-33839120)
chr8 (280-343)||(4733809-4733873)
chr8 (284-344)||(4760108-4760167)
chr8 (281-333)||(9054867-9054919)
chr8 (284-344)||(10684285-10684344)
chr8 (300-344)||(10930199-10930243)
chr8 (300-344)||(15212910-15212954)
chr8 (300-344)||(27811402-27811446)
chr8 (300-344)||(33352274-33352318)
chr8 (284-344)||(35745396-35745455)
chr8 (323-359)||(35872438-35872474)
chr8 (232-307)||(35872477-35872553)
chr8 (300-344)||(40321204-40321248)
chr8 (147-224)||(13985933-13986011)
chr8 (306-360)||(14477547-14477602)
chr8 (301-347)||(31566554-31566601)
chr8 (1-36)||(43079584-43079619)
chr8 (2-32)||(6375988-6376018)
chr8 (2-32)||(17847527-17847557)
chr8 (302-344)||(19491699-19491741)
chr8 (162-348)||(21033870-21034055)
chr8 (300-341)||(40221869-40221910)
chr8 (300-344)||(4743214-4743258)
chr8 (300-344)||(5689395-5689439)
chr8 (300-344)||(6599096-6599140)
chr8 (300-344)||(6674549-6674593)
chr8 (300-344)||(12702634-12702678)
chr8 (4-32)||(31035068-31035096)
chr8 (300-344)||(43036547-43036591)
[»] chr1 (152 HSPs)
chr1 (1-391)||(47179651-47180039)
chr1 (2-362)||(9463228-9463588)
chr1 (1-391)||(16226109-16226494)
chr1 (2-362)||(9459401-9459761)
chr1 (1-391)||(47177300-47177688)
chr1 (2-391)||(31735476-31735863)
chr1 (2-359)||(47906207-47906564)
chr1 (2-391)||(28840621-28841005)
chr1 (49-391)||(10399783-10400125)
chr1 (2-391)||(51749982-51750365)
chr1 (2-359)||(27336927-27337280)
chr1 (5-392)||(39932017-39932401)
chr1 (2-391)||(46431660-46432066)
chr1 (2-392)||(51752308-51752690)
chr1 (5-391)||(15294789-15295183)
chr1 (2-359)||(27339118-27339472)
chr1 (2-391)||(28842436-28842820)
chr1 (2-391)||(13761780-13762162)
chr1 (2-362)||(2510309-2510666)
chr1 (2-362)||(20302402-20302755)
chr1 (2-392)||(24325599-24325990)
chr1 (2-391)||(20291400-20291782)
chr1 (2-359)||(12302492-12302848)
chr1 (2-359)||(15823489-15823840)
chr1 (49-357)||(6822999-6823306)
chr1 (2-354)||(13215024-13215375)
chr1 (50-359)||(17324623-17324932)
chr1 (132-391)||(16231630-16231889)
chr1 (2-359)||(38925468-38925816)
chr1 (3-362)||(2617460-2617813)
chr1 (2-359)||(41646863-41647214)
chr1 (5-308)||(21948226-21948526)
chr1 (2-359)||(39462462-39462813)
chr1 (49-348)||(50307544-50307844)
chr1 (49-359)||(18839571-18839882)
chr1 (49-359)||(6995687-6995997)
chr1 (50-359)||(16428638-16428948)
chr1 (161-391)||(23785935-23786165)
chr1 (2-359)||(14097956-14098308)
chr1 (9-359)||(25127815-25128167)
chr1 (49-359)||(18307093-18307403)
chr1 (2-359)||(28207055-28207404)
chr1 (49-359)||(17186114-17186425)
chr1 (49-359)||(2949219-2949528)
chr1 (3-359)||(50076659-50077009)
chr1 (3-359)||(11457462-11457812)
chr1 (47-359)||(4131362-4131678)
chr1 (49-359)||(50078807-50079118)
chr1 (2-359)||(28998240-28998591)
chr1 (2-359)||(29003956-29004307)
chr1 (49-359)||(31489899-31490206)
chr1 (49-359)||(31425002-31425316)
chr1 (57-359)||(9241072-9241374)
chr1 (2-357)||(3579606-3579956)
chr1 (2-287)||(48665114-48665400)
chr1 (4-359)||(25251261-25251611)
chr1 (52-359)||(6756514-6756822)
chr1 (157-392)||(51757623-51757857)
chr1 (3-359)||(50248557-50248909)
chr1 (49-355)||(31422851-31423171)
chr1 (49-359)||(17318877-17319181)
chr1 (58-359)||(40133937-40134239)
chr1 (2-342)||(47451591-47451919)
chr1 (2-262)||(6823827-6824088)
chr1 (49-348)||(17324049-17324347)
chr1 (50-347)||(42922219-42922514)
chr1 (3-347)||(14183589-14183923)
chr1 (56-359)||(16432396-16432690)
chr1 (89-320)||(15669419-15669648)
chr1 (49-333)||(8347284-8347566)
chr1 (132-357)||(25248540-25248766)
chr1 (150-359)||(16429042-16429252)
chr1 (207-371)||(23816027-23816193)
chr1 (49-347)||(8349049-8349345)
chr1 (144-359)||(6115089-6115305)
chr1 (2-347)||(18800570-18800907)
chr1 (65-347)||(27916500-27916780)
chr1 (56-347)||(13125455-13125746)
chr1 (271-391)||(13358779-13358899)
chr1 (2-348)||(49495208-49495537)
chr1 (145-345)||(30790401-30790602)
chr1 (147-347)||(26613237-26613440)
chr1 (145-347)||(16561546-16561751)
chr1 (165-360)||(21353334-21353525)
chr1 (49-254)||(26520206-26520415)
chr1 (147-347)||(30738625-30738830)
chr1 (147-308)||(155788-155950)
chr1 (165-369)||(2401198-2401400)
chr1 (280-344)||(13598402-13598466)
chr1 (280-344)||(16124545-16124609)
chr1 (280-344)||(47703965-47704029)
chr1 (162-346)||(2232597-2232774)
chr1 (281-344)||(19072932-19072995)
chr1 (281-344)||(19120822-19120885)
chr1 (281-344)||(47098854-47098917)
chr1 (162-367)||(4144662-4144865)
chr1 (1-105)||(16231543-16231641)
chr1 (280-341)||(29651818-29651879)
chr1 (280-344)||(9476265-9476329)
chr1 (284-344)||(26644930-26644990)
chr1 (49-104)||(25248756-25248811)
chr1 (88-347)||(28279292-28279551)
chr1 (281-344)||(47102871-47102934)
chr1 (283-341)||(3281715-3281773)
chr1 (165-369)||(2393260-2393461)
chr1 (165-346)||(9526469-9526650)
chr1 (238-347)||(15916562-15916674)
chr1 (147-223)||(26332613-26332688)
chr1 (280-344)||(27104401-27104465)
chr1 (280-344)||(37069774-37069838)
chr1 (281-344)||(775676-775739)
chr1 (281-344)||(32889443-32889506)
chr1 (183-368)||(46783163-46783350)
chr1 (323-391)||(13447228-13447296)
chr1 (279-344)||(21536597-21536662)
chr1 (280-344)||(13604652-13604716)
chr1 (147-225)||(14353047-14353126)
chr1 (165-367)||(25134074-25134274)
chr1 (280-344)||(19358872-19358935)
chr1 (280-344)||(19361461-19361524)
chr1 (280-344)||(19380101-19380164)
chr1 (280-344)||(24202798-24202861)
chr1 (162-225)||(14997040-14997101)
chr1 (151-225)||(43104245-43104318)
chr1 (165-346)||(9521718-9521899)
chr1 (300-344)||(13137976-13138020)
chr1 (284-344)||(25445110-25445169)
chr1 (65-210)||(26332699-26332836)
chr1 (284-344)||(39445505-39445564)
chr1 (284-344)||(44023894-44023953)
chr1 (300-344)||(834167-834211)
chr1 (284-344)||(1055032-1055091)
chr1 (49-81)||(6115344-6115376)
chr1 (283-338)||(22819438-22819494)
chr1 (300-344)||(28220226-28220270)
chr1 (300-344)||(28265554-28265598)
chr1 (284-344)||(41390586-41390645)
chr1 (284-344)||(41398241-41398300)
chr1 (290-347)||(13127685-13127743)
chr1 (2-36)||(13449852-13449886)
chr1 (1-31)||(23783493-23783523)
chr1 (302-344)||(41361040-41361082)
chr1 (2-32)||(43104102-43104132)
chr1 (302-344)||(45644354-45644396)
chr1 (58-166)||(13127813-13127917)
chr1 (281-338)||(17345549-17345605)
chr1 (300-344)||(3156989-3157033)
chr1 (300-344)||(4552637-4552681)
chr1 (300-344)||(13659336-13659380)
chr1 (300-344)||(28223421-28223465)
chr1 (300-344)||(31659362-31659406)
chr1 (284-344)||(43988485-43988544)
[»] chr2 (146 HSPs)
chr2 (2-391)||(35215545-35215932)
chr2 (2-391)||(35217922-35218313)
chr2 (2-391)||(23452190-23452577)
chr2 (2-391)||(13909998-13910380)
chr2 (2-391)||(27104718-27105099)
chr2 (4-392)||(19501963-19502345)
chr2 (2-363)||(42064434-42064789)
chr2 (2-392)||(19504298-19504681)
chr2 (49-362)||(45279966-45280280)
chr2 (2-391)||(24162176-24162548)
chr2 (2-359)||(21520678-21521031)
chr2 (49-362)||(42452743-42453053)
chr2 (2-359)||(22287321-22287672)
chr2 (49-359)||(19007600-19007910)
chr2 (2-359)||(40032038-40032394)
chr2 (2-359)||(42923494-42923847)
chr2 (161-391)||(36561094-36561324)
chr2 (4-359)||(6264133-6264479)
chr2 (49-359)||(28196597-28196905)
chr2 (2-359)||(6258802-6259151)
chr2 (49-359)||(11739544-11739855)
chr2 (161-391)||(45332133-45332364)
chr2 (49-359)||(17848403-17848710)
chr2 (2-359)||(43623565-43623904)
chr2 (161-362)||(36558846-36559047)
chr2 (49-359)||(34979562-34979874)
chr2 (49-359)||(17849077-17849387)
chr2 (49-359)||(14837233-14837538)
chr2 (49-359)||(3022123-3022442)
chr2 (46-320)||(45239001-45239274)
chr2 (4-254)||(15539566-15539809)
chr2 (52-359)||(44289052-44289360)
chr2 (49-348)||(31732772-31733060)
chr2 (139-359)||(5375331-5375550)
chr2 (3-347)||(11578104-11578439)
chr2 (2-359)||(18800298-18800638)
chr2 (65-347)||(20146604-20146884)
chr2 (66-347)||(17897242-17897519)
chr2 (49-359)||(22874102-22874401)
chr2 (3-174)||(22163117-22163282)
chr2 (48-247)||(38020161-38020349)
chr2 (2-162)||(22407591-22407745)
chr2 (99-359)||(28459175-28459435)
chr2 (207-359)||(22407439-22407592)
chr2 (2-143)||(5377630-5377769)
chr2 (216-341)||(7462950-7463077)
chr2 (145-347)||(40699429-40699634)
chr2 (162-369)||(20054742-20054947)
chr2 (84-359)||(35107294-35107566)
chr2 (165-360)||(17943540-17943731)
chr2 (165-369)||(27517616-27517818)
chr2 (65-279)||(43139356-43139564)
chr2 (162-346)||(2736205-2736388)
chr2 (162-262)||(20589763-20589863)
chr2 (226-359)||(22707736-22707872)
chr2 (99-262)||(27136208-27136368)
chr2 (165-369)||(30478997-30479199)
chr2 (280-344)||(14699036-14699100)
chr2 (132-232)||(38414194-38414291)
chr2 (260-359)||(22163007-22163106)
chr2 (162-346)||(2740941-2741124)
chr2 (162-346)||(17462436-17462619)
chr2 (162-346)||(39686983-39687166)
chr2 (280-344)||(13569332-13569396)
chr2 (280-344)||(20522224-20522288)
chr2 (162-346)||(39680045-39680228)
chr2 (162-369)||(20049998-20050204)
chr2 (279-344)||(34682362-34682427)
chr2 (49-347)||(37962938-37963222)
chr2 (280-344)||(8040064-8040128)
chr2 (280-344)||(10445473-10445537)
chr2 (280-344)||(28259206-28259270)
chr2 (256-346)||(45679813-45679906)
chr2 (280-344)||(8390179-8390243)
chr2 (280-344)||(17865207-17865271)
chr2 (280-344)||(33118140-33118204)
chr2 (280-344)||(34388862-34388926)
chr2 (280-344)||(39482935-39482999)
chr2 (281-344)||(2838060-2838123)
chr2 (225-359)||(23870951-23871086)
chr2 (282-344)||(1345572-1345634)
chr2 (165-347)||(12781218-12781400)
chr2 (146-223)||(26345661-26345738)
chr2 (280-344)||(10707281-10707345)
chr2 (280-344)||(16940238-16940302)
chr2 (280-344)||(17010903-17010967)
chr2 (147-225)||(17921754-17921833)
chr2 (280-344)||(21629948-21630011)
chr2 (280-344)||(25398500-25398563)
chr2 (280-344)||(33528650-33528714)
chr2 (281-344)||(2869723-2869786)
chr2 (148-207)||(27583477-27583535)
chr2 (281-344)||(31056048-31056111)
chr2 (256-346)||(33670965-33671059)
chr2 (49-103)||(38020103-38020157)
chr2 (107-223)||(35028595-35028707)
chr2 (280-344)||(3491755-3491818)
chr2 (280-344)||(25403638-25403701)
chr2 (280-344)||(42039698-42039762)
chr2 (280-343)||(23078499-23078562)
chr2 (279-334)||(27149322-27149377)
chr2 (162-225)||(28458949-28459011)
chr2 (147-223)||(7502975-7503052)
chr2 (295-367)||(38191144-38191215)
chr2 (284-344)||(11098960-11099019)
chr2 (148-262)||(13828426-13828542)
chr2 (284-344)||(14291493-14291552)
chr2 (300-344)||(17057369-17057413)
chr2 (300-344)||(17085352-17085396)
chr2 (147-225)||(34575230-34575308)
chr2 (284-344)||(36757795-36757855)
chr2 (280-344)||(40738848-40738910)
chr2 (284-344)||(44312645-44312704)
chr2 (146-262)||(15693958-15694076)
chr2 (165-288)||(17932637-17932757)
chr2 (298-347)||(8173539-8173589)
chr2 (147-253)||(30720703-30720811)
chr2 (300-344)||(723744-723788)
chr2 (284-344)||(9296434-9296493)
chr2 (323-359)||(15539514-15539550)
chr2 (300-344)||(34139770-34139814)
chr2 (300-344)||(39284960-39285004)
chr2 (284-344)||(39812009-39812068)
chr2 (161-223)||(10942634-10942696)
chr2 (161-223)||(10948503-10948565)
chr2 (301-344)||(11151591-11151634)
chr2 (162-225)||(22712637-22712698)
chr2 (162-225)||(22717346-22717407)
chr2 (162-225)||(45567409-45567470)
chr2 (2-32)||(17897548-17897578)
chr2 (284-326)||(32246810-32246852)
chr2 (162-310)||(33603994-33604143)
chr2 (295-359)||(34575123-34575186)
chr2 (1-31)||(36559082-36559112)
chr2 (1-31)||(36561359-36561389)
chr2 (3-32)||(20589581-20589610)
chr2 (299-347)||(20592288-20592337)
chr2 (280-317)||(25407653-25407690)
chr2 (281-338)||(40014935-40014992)
chr2 (2-31)||(45332399-45332428)
chr2 (300-344)||(11067429-11067473)
chr2 (300-344)||(14633825-14633869)
chr2 (284-344)||(19344426-19344485)
chr2 (284-344)||(19349284-19349343)
chr2 (300-344)||(36773686-36773730)
chr2 (300-344)||(38312364-38312408)
[»] chr6 (131 HSPs)
chr6 (2-391)||(12195467-12195851)
chr6 (1-392)||(20915309-20915695)
chr6 (1-392)||(4816183-4816582)
chr6 (8-392)||(19704519-19704905)
chr6 (2-392)||(26932515-26932906)
chr6 (2-391)||(2628839-2629226)
chr6 (2-391)||(30967176-30967562)
chr6 (2-391)||(14507129-14507511)
chr6 (2-391)||(28241274-28241657)
chr6 (2-391)||(30034556-30034943)
chr6 (2-359)||(11983014-11983365)
chr6 (49-391)||(14458720-14459060)
chr6 (49-391)||(1230202-1230544)
chr6 (129-391)||(5273169-5273431)
chr6 (2-391)||(26064959-26065340)
chr6 (2-391)||(26084928-26085309)
chr6 (2-359)||(9019904-9020255)
chr6 (3-359)||(13057173-13057524)
chr6 (2-359)||(15541125-15541476)
chr6 (2-355)||(3390357-3390705)
chr6 (49-359)||(13039773-13040084)
chr6 (161-391)||(33308988-33309217)
chr6 (49-359)||(3629850-3630159)
chr6 (161-391)||(29754662-29754892)
chr6 (161-391)||(33311257-33311486)
chr6 (2-348)||(15532678-15533017)
chr6 (2-301)||(15530166-15530458)
chr6 (49-359)||(25477293-25477611)
chr6 (5-357)||(3631926-3632271)
chr6 (50-359)||(3233710-3234025)
chr6 (49-359)||(32280016-32280326)
chr6 (2-357)||(30728811-30729164)
chr6 (161-391)||(26068348-26068578)
chr6 (161-391)||(26066074-26066307)
chr6 (2-239)||(19227514-19227744)
chr6 (58-359)||(12161543-12161841)
chr6 (3-346)||(24338446-24338783)
chr6 (49-262)||(22490658-22490871)
chr6 (2-347)||(3027848-3028186)
chr6 (150-359)||(1069703-1069913)
chr6 (65-347)||(16455421-16455701)
chr6 (49-347)||(15719673-15719961)
chr6 (146-359)||(12186056-12186271)
chr6 (107-359)||(14466399-14466653)
chr6 (96-347)||(15367101-15367349)
chr6 (92-347)||(17012105-17012358)
chr6 (65-347)||(19696479-19696759)
chr6 (91-347)||(22857949-22858203)
chr6 (2-142)||(1072079-1072213)
chr6 (49-157)||(32447502-32447611)
chr6 (2-129)||(8995457-8995578)
chr6 (145-347)||(26945258-26945463)
chr6 (49-158)||(13870608-13870716)
chr6 (49-138)||(17852561-17852650)
chr6 (207-347)||(15346523-15346664)
chr6 (162-346)||(13878727-13878910)
chr6 (162-346)||(16785919-16786102)
chr6 (125-305)||(20526902-20527081)
chr6 (162-346)||(13883475-13883658)
chr6 (165-369)||(22351830-22352031)
chr6 (280-344)||(5757507-5757571)
chr6 (280-344)||(10077194-10077258)
chr6 (148-347)||(28037722-28037927)
chr6 (226-347)||(25465587-25465710)
chr6 (256-369)||(25941759-25941874)
chr6 (281-344)||(31979517-31979580)
chr6 (165-360)||(17694838-17695030)
chr6 (280-344)||(5572270-5572334)
chr6 (280-344)||(21356040-21356104)
chr6 (162-346)||(26887225-26887406)
chr6 (281-344)||(31936591-31936654)
chr6 (162-346)||(35201325-35201508)
chr6 (170-347)||(11262596-11262777)
chr6 (165-369)||(22342778-22342980)
chr6 (162-347)||(12911442-12911629)
chr6 (147-347)||(25078554-25078755)
chr6 (256-369)||(3577467-3577581)
chr6 (170-338)||(5165819-5165989)
chr6 (64-121)||(10584155-10584212)
chr6 (290-359)||(10584256-10584325)
chr6 (280-344)||(5017498-5017562)
chr6 (162-347)||(12937190-12937376)
chr6 (280-344)||(22709022-22709086)
chr6 (280-344)||(22963704-22963767)
chr6 (280-344)||(23824626-23824689)
chr6 (165-348)||(33215830-33216013)
chr6 (256-364)||(25465881-25465991)
chr6 (162-346)||(31248713-31248896)
chr6 (147-223)||(11138423-11138499)
chr6 (281-338)||(24436001-24436058)
chr6 (280-344)||(18232849-18232913)
chr6 (280-344)||(31086502-31086566)
chr6 (281-344)||(4629958-4630021)
chr6 (2-175)||(15346369-15346524)
chr6 (256-346)||(17038324-17038418)
chr6 (281-336)||(21801374-21801429)
chr6 (250-346)||(22870100-22870196)
chr6 (169-366)||(12166126-12166321)
chr6 (165-367)||(13467446-13467642)
chr6 (268-368)||(24501425-24501527)
chr6 (206-336)||(30445698-30445832)
chr6 (147-266)||(7542461-7542581)
chr6 (284-344)||(5674803-5674862)
chr6 (284-344)||(14742457-14742516)
chr6 (284-344)||(22010718-22010777)
chr6 (284-344)||(33335963-33336022)
chr6 (286-344)||(28184510-28184567)
chr6 (290-347)||(30443548-30443606)
chr6 (284-344)||(6005422-6005481)
chr6 (284-344)||(6438506-6438565)
chr6 (257-347)||(7294021-7294113)
chr6 (284-344)||(11856979-11857038)
chr6 (287-343)||(14521679-14521735)
chr6 (284-344)||(14737597-14737656)
chr6 (284-344)||(28155590-28155649)
chr6 (300-344)||(33211185-33211229)
chr6 (284-344)||(33330466-33330525)
chr6 (281-344)||(27165688-27165750)
chr6 (165-223)||(19701985-19702041)
chr6 (1-31)||(26066335-26066365)
chr6 (1-31)||(26068606-26068636)
chr6 (1-31)||(29755003-29755033)
chr6 (1-31)||(33308931-33308961)
chr6 (1-31)||(33311200-33311230)
chr6 (84-140)||(17904566-17904619)
chr6 (300-344)||(603088-603132)
chr6 (162-225)||(3577636-3577696)
chr6 (300-344)||(16569146-16569190)
chr6 (284-344)||(16838749-16838808)
chr6 (165-225)||(17036058-17036116)
chr6 (230-347)||(28078191-28078310)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (17-362)||(1-347)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (1-391)||(6150-6534)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (2-391)||(69245-69631)
scaffold0025 (2-160)||(73207-73363)
scaffold0025 (121-171)||(73160-73210)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (2-391)||(29113-29505)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (2-391)||(2832-3214)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (2-391)||(41436-41819)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (2-391)||(183594-183975)
scaffold0005 (2-371)||(51961-52325)
scaffold0005 (299-371)||(50257-50326)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (49-359)||(79178-79488)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (49-359)||(11458-11768)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (2-362)||(3949-4301)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (47-348)||(14378-14679)
scaffold0131 (2-348)||(14971-15311)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (123-392)||(1405-1673)
[»] scaffold0140 (5 HSPs)
scaffold0140 (161-392)||(22221-22451)
scaffold0140 (161-392)||(24496-24726)
scaffold0140 (280-344)||(8448-8512)
scaffold0140 (1-31)||(22161-22191)
scaffold0140 (1-31)||(24436-24466)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (49-355)||(79852-80158)
scaffold0004 (162-225)||(188363-188424)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (2-308)||(1988-2293)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (64-359)||(85238-85534)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (50-347)||(15817-16112)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (61-237)||(35644-35819)
scaffold0011 (279-359)||(35817-35897)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (48-347)||(1638-1927)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (49-347)||(16646-16942)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (92-338)||(4849-5095)
[»] scaffold0552 (1 HSPs)
scaffold0552 (2-177)||(993-1167)
[»] scaffold0891 (1 HSPs)
scaffold0891 (290-391)||(4630-4733)
[»] scaffold0006 (5 HSPs)
scaffold0006 (280-344)||(5687-5751)
scaffold0006 (280-344)||(2496-2560)
scaffold0006 (280-344)||(133309-133373)
scaffold0006 (162-306)||(224819-224961)
scaffold0006 (300-344)||(149097-149141)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (280-344)||(43990-44054)
scaffold0087 (280-344)||(36861-36925)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (310-391)||(1404-1485)
[»] scaffold0209 (1 HSPs)
scaffold0209 (256-360)||(16972-17078)
[»] scaffold1050 (1 HSPs)
scaffold1050 (256-346)||(3068-3161)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (165-346)||(16328-16509)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (281-341)||(10736-10796)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (280-344)||(45257-45321)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (283-344)||(85687-85748)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (280-344)||(17981-18044)
scaffold0188 (280-344)||(24074-24137)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (284-344)||(368-427)
[»] scaffold0355 (1 HSPs)
scaffold0355 (284-344)||(9663-9722)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (284-344)||(17267-17327)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (162-334)||(57437-57613)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (284-344)||(14330-14389)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (284-344)||(35083-35142)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (300-344)||(20415-20459)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (284-344)||(181985-182044)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (284-344)||(2272-2331)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (284-344)||(148977-149036)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 331; Significance: 0; HSPs: 168)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 7351994 - 7351604
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  7351994 acttttactataaatataaaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggct 7351895  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7351894 ttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 7351795  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 301  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7351794 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 7351695  T
Q  302 tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7351694 tctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 7351604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 7349615 - 7349228
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7349615 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 7349516  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7349515 ttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 7349416  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7349415 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 7349316  T
Q  302 tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgttttt 392  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  7349315 tctcccccagactaggtcagattggaccgaa----gtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgcgttcttctcgccgttgttttt 7349228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Original strand, 38393935 - 38394322
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38393935 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttga--gagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 38394032  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38394033 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagag 38394131  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38394132 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 38394231  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38394232 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 38394322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 1047269 - 1046876
Alignment:
Q  1 gacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatct--ttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactag 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1047269 gacttttactataaatataaaccttgtatcaagctaatctaagagagagagagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactag 1047170  T
Q  99 ggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1047169 ggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaa 1047071  T
Q  199 gagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctg 298  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1047070 gaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctg 1046971  T
Q  299 ctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgttttt 392  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1046970 ctctctcccccacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttttttctcttctttgtgttcttctcgccgttgttttt 1046876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Original strand, 48457602 - 48457989
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48457602 actttcactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttga--gagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 48457699  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48457700 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttcattcacctagggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagag 48457798  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  48457799 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgct 48457898  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48457899 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 48457989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Original strand, 20297311 - 20297698
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  20297311 acttttactaaaaatatggaccttgtatcaggctaaactttga--gagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaataaaactagggt 20297408  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20297409 ttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacagtagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagag 20297507  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    |||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20297508 attggggctttgggtagaaataggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgct 20297607  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttttgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||    
T  20297608 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattcttttgtgttcttctcctctttgtgttcttctcgccgttgtttt 20297698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Original strand, 3035670 - 3036060
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3035670 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttga--gagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 3035767  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga- 200  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  3035768 ttttatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaa 3035866  T
Q  201 --gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggct 297  Q
      |  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3035867 gaggctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgcaacgatactcatcatatagtggattggagggct 3035966  T
Q  298 gctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3035967 gctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcctc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 3036060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 5 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 7470359 - 7469975
Alignment:
Q  5 tttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7470359 tttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttga--gagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 7470262  T
Q  105 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt 204  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  7470261 tatagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggct 7470163  T
Q  205 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  7470162 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctccc 7470063  T
Q  304 tcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  7470062 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttatttgtgttcttctcaccgttgtttt 7469975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Original strand, 18345490 - 18345877
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18345490 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctgaactttga--gggagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 18345587  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  18345588 ttgtatagagtttgtctctttgcaacaaatactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagag 18345686  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  18345687 gctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgtt 18345786  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18345787 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgagctgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 18345877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 40837078 - 40836696
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcag-gctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||     ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40837078 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaat--ttg-----gagattgagggggctgaaagaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg 40836986  T
Q  101 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40836985 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaga 40836887  T
Q  201 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40836886 ggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgct 40836787  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttctttt-gttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40836786 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct-cttctttttgttcttctcgccgttgtttt 40836696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 5 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 7472317 - 7471933
Alignment:
Q  5 tttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7472317 tttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttga--gagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 7472220  T
Q  105 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt 204  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  7472219 tatagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggct 7472121  T
Q  205 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctc 303  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  7472120 ggaactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctc 7472021  T
Q  304 tcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  7472020 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttatttgtgttcttctcaccgttgtttt 7471933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 2 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 31156247 - 31155893
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |  || ||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31156247 acttttactataaatatagagcttgtatcaaggcaaactttga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 31156154  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31156153 ttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactaggatttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttgggtacgggaagag 31156054  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 301  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31156053 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcctatagtggattggagggctgctc 31155954  T
Q  302 tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttct 362  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31155953 tctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttct 31155893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 2 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 1049631 - 1049247
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||   || ||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1049631 acttttactataaatatagaccttgtattagagcaaactttga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 1049538  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1049537 ttgtatagagtttgtctcttcggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatcaggattg-agtctcttggttacgggaagag 1049439  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 301  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1049438 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctc 1049339  T
Q  302 tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgttttt 392  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  1049338 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttttttctcttctttgtgttcttcttgccgttgttttt 1049247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Original strand, 20299407 - 20299796
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaaggg-tttagaaaagcaacaacaaaactaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  20299407 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttga--gagagatagagggggctgaaacaaggggtttagaatgacaacaacaaaactaggg 20299504  T
Q  101 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttt-gaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaag 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20299505 tttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaag 20299603  T
Q  200 agattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctg 298  Q
    ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20299604 aggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggttg 20299703  T
Q  299 ctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  20299704 ctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tctcctttgtgttcttctcgcagttgtttt 20299796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 5 - 359
Target Start/End: Original strand, 20625990 - 20626342
Alignment:
Q  5 tttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 104  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20625990 tttattataaatatagaccttctatcagactaaactttga--gagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 20626087  T
Q  105 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt 204  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  20626088 tatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggct 20626186  T
Q  205 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctc 303  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20626187 gggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 20626286  T
Q  304 tcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20626287 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 20626342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 5 - 359
Target Start/End: Original strand, 20629881 - 20630233
Alignment:
Q  5 tttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 104  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20629881 tttattataaatatagaccttctatcagactaaactttga--gagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 20629978  T
Q  105 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt 204  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  20629979 tatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggct 20630077  T
Q  205 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctc 303  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20630078 gggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 20630177  T
Q  304 tcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20630178 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 20630233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 5 - 359
Target Start/End: Original strand, 20642300 - 20642652
Alignment:
Q  5 tttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 104  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20642300 tttattataaatatagaccttctatcagactaaactttga--gagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 20642397  T
Q  105 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt 204  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  20642398 tatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggct 20642496  T
Q  205 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctc 303  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20642497 gggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 20642596  T
Q  304 tcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20642597 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 20642652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 47 - 392
Target Start/End: Original strand, 3878569 - 3878914
Alignment:
Q  47 gagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaagg 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||    
T  3878569 gagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggcttgtggg 3878668  T
Q  147 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 246  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3878669 ttgattcaccttggtaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 3878767  T
Q  247 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaa 345  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||    
T  3878768 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactatgttaatttggaccgaactgggtcaacaaa 3878867  T
Q  346 ttcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgttttt 392  Q
    ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3878868 ttcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgttttt 3878914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Original strand, 28487502 - 28487889
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||    
T  28487502 acttttcctataaatatagaccatgtatcaggctaaactttga--gagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagagt 28487599  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  28487600 ttgtatagagtttgtctcttcgaaactaacactagggttcgtgggttgattcacctttggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacaggaagag 28487698  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  28487699 attggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcagagggttgct 28487798  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  28487799 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttcttctt-ttctttgtgttcttctagccgttgtttt 28487889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 2 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 43253860 - 43253469
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagataga--gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||  | |||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  43253860 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagaaagagggctgaaacaaggttttagaatgacaacaacaaaactagg 43253761  T
Q  100 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  43253760 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacta-ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttgattacggaaag 43253663  T
Q  200 agattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctg 298  Q
    ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  43253662 aggctgagactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctg 43253563  T
Q  299 ctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgttttt 392  Q
    ||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  43253562 ctctctccctcagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaataaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgctgttgttttt 43253469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Original strand, 44517 - 44900
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44517 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 44610  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  44611 ttgtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttaggaaacactattatgatt-gagtcttttggttacgggaagag 44709  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
     ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||  ||||||    
T  44710 gttgggactttgggtagaattatgtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatagctgct 44809  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44810 ttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 44900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Original strand, 44724573 - 44724883
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44724573 gagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 44724672  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44724673 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 44724771  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  44724772 attgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 44724871  T
Q  348 cctttgtgttct 359  Q
    | ||||||||||    
T  44724872 cttttgtgttct 44724883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Original strand, 35582 - 35965
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||      ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  35582 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttga------gatagagggggctgaaacaagggttcagaaagacaacaacaaaactagggt 35675  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  35676 ttgtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagag 35774  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  35775 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagctgct 35874  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
     ||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  35875 ttctcccctagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaatttttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccattgtttt 35965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 46 - 391
Target Start/End: Original strand, 1849972 - 1850317
Alignment:
Q  46 agagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaag 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  1849972 agagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgg 1850071  T
Q  146 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 245  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1850072 gttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtttcttgcttacgggaagaggctgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 1850170  T
Q  246 cccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1850171 cccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 1850270  T
Q  345 attcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||||||| || | ||||||||    
T  1850271 attcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttttcactgttgtttt 1850317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 2 - 392
Target Start/End: Original strand, 40946277 - 40946665
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| |||    || ||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40946277 actttcactataaatataaaccttgtttcatagcaaactttga--gagggacagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 40946374  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  40946375 ttgtatagagtttgtctcttagaaacaaacactagggtttgtgggttgatttactttggaaaacactattaggatt-gagtctcttagttacgggaagag 40946473  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  40946474 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcgaagggctgct 40946573  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgttttt 392  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  40946574 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctt-ttctttgtgttcttctcgccgtttttttt 40946665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Original strand, 28485515 - 28485901
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28485515 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttga--gagagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 28485612  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  28485613 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgcgggttgattcacctttggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgagaagag 28485711  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    |||| | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| || ||  ||||| ||||    
T  28485712 attggggctttgagtataattaggcgggagatttattcttgtaatccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatgaatcagagggttgct 28485811  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  28485812 ctct-cctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttattc-tcttctttgtgttcttctatccgttgtttt 28485901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 2 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 27306565 - 27306226
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27306565 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 27306472  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27306471 tt-tatagagtttgtctctttggaacaaaaactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagag 27306374  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
      || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  27306373 gctgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgct 27306274  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattc 348  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  27306273 ctctcccctagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattc 27306226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Original strand, 25542484 - 25542864
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||      |||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  25542484 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttga------gatagagggg-ctgaaacaaaggtttagaaaggtaacaacaaaactagggt 25542576  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  25542577 ttgtatagagtttgtctcttcggaaaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-aaagactattaggattg-agtctcttggttacaggaagag 25542674  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 301  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  25542675 actgggactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctc 25542774  T
Q  302 tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    ||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  25542775 tctcccctagactaggttaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtttttc-tcttctttgtgttcttctcaccgttgtttt 25542864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 42331335 - 42330982
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||    
T  42331335 acttttactataaatatagactttgtatcagactaaactttga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaaggt 42331242  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt--acgggaag 199  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  42331241 ttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacacgggaag 42331143  T
Q  200 agattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||| |||||||| |  ||||||||     
T  42331142 agattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattatatagtgaaacggagggcta 42331043  T
Q  299 ctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
     ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42331042 ttctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 42330982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 3 - 359
Target Start/End: Original strand, 9680768 - 9681124
Alignment:
Q  3 cttttactataaatatagaccttgtatcaggc-taatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||| | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  9680768 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttga--gagagatagagggggttgaaacaagggtttagaagggcaacaacaaaactatggt 9680865  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9680866 ttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaga 9680964  T
Q  201 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgc 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||| |  ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  9680965 gattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaatggagggctgc 9681064  T
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||| |||||  ||||||||||    
T  9681065 tctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaataaatttttttgtgttct 9681124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 31435383 - 31435031
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31435383 acttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttga------gatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 31435290  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31435289 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagag 31435191  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgc 299  Q
      ||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  31435190 gctggaactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgc 31435091  T
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31435090 tctctcccccaaactaggtcaatttgtaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 31435031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 13099771 - 13099459
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  13099771 gagatagagggggttgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggtt 13099672  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13099671 gattcaccttgggaaacactattaagatt-gagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaaccc 13099573  T
Q  249 attgatttctc--tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaa 345  Q
    |||||| ||||  ||||||| |  |||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  13099572 attgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 13099473  T
Q  346 ttcctttgtgttct 359  Q
    ||| ||||||||||    
T  13099472 ttcttttgtgttct 13099459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 4296230 - 4295919
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgaaggt 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  4296230 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgatggt 4296131  T
Q  148 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4296130 tgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaact 4296032  T
Q  248 cattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |   |||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  4296031 cattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctatctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtgaacaaat 4295932  T
Q  347 tcctttgtgttct 359  Q
    || ||||||||||    
T  4295931 tcttttgtgttct 4295919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 20137404 - 20137094
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  20137404 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 20137305  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20137304 gattcaccttgggaaacactattaagatt-gagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 20137206  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  20137205 attgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 20137107  T
Q  347 tcctttgtgttct 359  Q
    || ||||||||||    
T  20137106 tcttttgtgttct 20137094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Original strand, 11355252 - 11355562
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||    
T  11355252 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaataaacactagggtttgagggtt 11355351  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11355352 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactc 11355450  T
Q  249 attgatttc-tctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||||| || | |||||||||   ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  11355451 attgatatcttttttgtaacgtttctcatcatatagtggaacagagagctgctctctcccctagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 11355550  T
Q  348 cctttgtgttct 359  Q
    | ||| ||||||    
T  11355551 cttttatgttct 11355562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 21592438 - 21592128
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21592438 gagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaatgcaacaacaaaagtaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 21592339  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  21592338 gattcaccttggcaagcactattaggatt-tagtctcttggttacgcgaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactc 21592240  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  21592239 attgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 21592140  T
Q  348 cctttgtgttct 359  Q
    | ||||||||||    
T  21592139 cttttgtgttct 21592128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 288
Target Start/End: Original strand, 11757177 - 11757463
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaaggg-tttagaaaagcaacaacaaaactaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  11757177 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttga--gagagatagagggggctgaaacaaggggtttagaatgacaacaacaaaactaggg 11757274  T
Q  101 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttt-gaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaag 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11757275 tttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaag 11757373  T
Q  200 agattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggat 288  Q
    ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  11757374 aggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 11757463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Original strand, 21990145 - 21990454
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21990145 gagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactatgatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 21990243  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  21990244 gattcaccttgagaaacactattagaatt-gagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgagtagaattaggcgggagactttttcttgtaactc 21990342  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  21990343 attgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctctccccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 21990442  T
Q  348 cctttgtgttct 359  Q
    | ||||||||||    
T  21990443 cttttgtgttct 21990454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 161 - 391
Target Start/End: Original strand, 2935374 - 2935604
Alignment:
Q  161 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2935374 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 2935473  T
Q  261 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 360  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  2935474 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttccttgtgttctt 2935573  T
Q  361 cttcttcttttgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2935574 cttcttcttttgttcttctcgccgttgtttt 2935604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Original strand, 443589 - 443900
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  443589 gagatagagggagctaaaacaatggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 443688  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  443689 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatcc 443787  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctct-cccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||| |  | ||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  443788 attgatatctcttttataacgttactcatcatatagtgaaacgaagggctgctctctcccccccgactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 443887  T
Q  347 tcctttgtgttct 359  Q
    || ||||||||||    
T  443888 tcttttgtgttct 443900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 53 - 359
Target Start/End: Original strand, 24748592 - 24748899
Alignment:
Q  53 tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgatt 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24748592 tagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatt 24748691  T
Q  153 caccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 252  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24748692 caccctgggaaacactattacgatt-gagtctcttggttccgggaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattg 24748790  T
Q  253 atttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcct 350  Q
    || |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |    
T  24748791 atatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcctccagattaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattctt 24748890  T
Q  351 ttgtgttct 359  Q
    |||||||||    
T  24748891 ttgtgttct 24748899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 161 - 392
Target Start/End: Original strand, 22108173 - 22108403
Alignment:
Q  161 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22108173 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 22108271  T
Q  261 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 360  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22108272 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 22108371  T
Q  361 cttcttcttttgttcttctcgccgttgttttt 392  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22108372 cttcttcttttgttcttctcacagttgttttt 22108403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 161 - 392
Target Start/End: Original strand, 40549933 - 40550163
Alignment:
Q  161 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40549933 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 40550031  T
Q  261 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 360  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40550032 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 40550131  T
Q  361 cttcttcttttgttcttctcgccgttgttttt 392  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  40550132 cttcttcttttgttcttctcacagttgttttt 40550163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 4 - 357
Target Start/End: Original strand, 9679009 - 9679361
Alignment:
Q  4 ttttactataaatatagaccttgtatcag-gctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtt 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||   ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||   |||||||||||||||||||    
T  9679009 ttttactataaatatagatcttgtatcagatgtaaactttg--agagagatagagggggctgaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtt 9679106  T
Q  103 tgtatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  9679107 tgtatagagtttgtctctttggcaacaaacacta-ggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagag 9679204  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  ||||  |||||    
T  9679205 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagtactgct 9679304  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgtt 357  Q
    ||||  ||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  9679305 ctctttcccagactaggtcaatttggaccagactgggtcaacaaattcttttgtgtt 9679361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 161 - 392
Target Start/End: Original strand, 22137184 - 22137414
Alignment:
Q  161 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22137184 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 22137282  T
Q  261 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 360  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22137283 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 22137382  T
Q  361 cttcttcttttgttcttctcgccgttgttttt 392  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22137383 cttcttcttttgttcttctcacagttgttttt 22137414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 37412423 - 37412110
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgaaggt 147  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||    
T  37412423 gagatatagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagcaacaaacactagggtttgagggt 37412324  T
Q  148 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37412323 tgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaact 37412225  T
Q  248 cattgatttctc--tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||| ||||  ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| |||| ||    
T  37412224 cattgatatctctttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccctagactgggtcaatttggaccgaactggatcaataa 37412125  T
Q  345 attcctttgtgttct 359  Q
    |||| ||||||||||    
T  37412124 attcttttgtgttct 37412110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 161 - 392
Target Start/End: Original strand, 40552211 - 40552441
Alignment:
Q  161 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40552211 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 40552309  T
Q  261 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 360  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40552310 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 40552409  T
Q  361 cttcttcttttgttcttctcgccgttgttttt 392  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  40552410 cttcttcttttgttcttctcacagttgttttt 40552441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 161 - 391
Target Start/End: Original strand, 1606486 - 1606715
Alignment:
Q  161 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1606486 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 1606584  T
Q  261 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 360  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  1606585 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactagatcagattggaccgaactgggtcaacaaatttccttgtgttctt 1606684  T
Q  361 cttcttcttttgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1606685 cttcttcttttgttcttctcgccgttgtttt 1606715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Original strand, 21680021 - 21680334
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  21680021 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggtt 21680120  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  21680121 gattcatcttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttaccggaagagattgggactttgggtagaattagacgggagatttattcttgtaaccc 21680219  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaa---ctgggtcaacaa 344  Q
    | |||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |   ||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||   ||||||||||||    
T  21680220 aatgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagagagctgctctctcccccagactaggtgaatttggaccgaactgctgggtcaacaa 21680319  T
Q  345 attcctttgtgttct 359  Q
    || | ||| ||||||    
T  21680320 atacttttttgttct 21680334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 49 - 348
Target Start/End: Original strand, 21678060 - 21678359
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  21678060 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacatcaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 21678159  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21678160 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgagaagatattgggactttgggtagcattaggcgggagacgtattcttgtaaccc 21678258  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||||| | || ||||||| |  ||| ||||||||||| |   | |||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||    
T  21678259 attgatatatcttttgtaaggttacttatcatatagtgaaacagtgggctgctctctcccctagactaggttaatttggaccgaactgggacaacaaatt 21678358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 39146282 - 39145971
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  39146282 gagatggagggggctgaaacaagggtttagatagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggtt 39146183  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39146182 gattcaccttggaaaacactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacac 39146084  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  || |||||||||| | ||| | |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  39146083 attgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggggggctgctcttttccctaaactaggtcaatttgtaccgaactgggtcaacaaat 39145984  T
Q  347 tcctttgtgttct 359  Q
    || ||||||||||    
T  39145983 tcttttgtgttct 39145971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 7092431 - 7092166
Alignment:
Q  125 aacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattag 224  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  7092431 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattag 7092333  T
Q  225 gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatat 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||  |    
T  7092332 gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatt 7092234  T
Q  324 tggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  7092233 tggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccattgtttt 7092166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 63 - 359
Target Start/End: Original strand, 42223165 - 42223462
Alignment:
Q  63 tgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggg 161  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  42223165 tgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgga 42223264  T
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-t 260  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||| |||| |    
T  42223265 aaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggagctttggatagaattaggcggaaaacttattcttgaaacctattgatatctctt 42223363  T
Q  261 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||  || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  42223364 ttgtaacgttactcatcatatagtgaaatggatggctgctctctcccccatactaggtcaattttgatcgaactgggtcaacaaattcttttgttttct 42223462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 61 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 27832916 - 27832656
Alignment:
Q  61 gctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgg 160  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27832916 gctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacagaactaaggtttgtatagagtttgtctcttggcaacatacactagggtttgagggttgattcaccttgg 27832817  T
Q  161 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27832816 gaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 27832718  T
Q  261 t-tgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 320  Q
    | ||||| |  |||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27832717 tctgtaaagttactcatcattatagtgaaatggagggcttctctctcccccagactaggtca 27832656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 161 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 9027376 - 9027146
Alignment:
Q  161 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9027376 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 9027278  T
Q  261 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 360  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  9027277 ttgtaacgttactcatcaaatagtggataggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctatgtgttctt 9027178  T
Q  361 cttctt-cttttgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    ||| ||  || ||||||||| |||||||||||    
T  9027177 cttattaattatgttcttctagccgttgtttt 9027146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 7094678 - 7094413
Alignment:
Q  125 aacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattag 224  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  7094678 aacaaaca-tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttaattacgggaagagattggggctttgggtagaattag 7094581  T
Q  225 gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatat 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  7094580 gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatt 7094481  T
Q  324 tggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7094480 tggactgaactgggtcaataaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 7094413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 145 - 392
Target Start/End: Original strand, 38396725 - 38396971
Alignment:
Q  145 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 244  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38396725 ggttgattcaccttgggaaacactgttaggatcg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgta 38396823  T
Q  245 acccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  38396824 acccattgatttctctttgtaactttactcatcatatagtggatcggagggcttctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 38396923  T
Q  345 attcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgttttt 392  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38396924 attcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgttttt 38396971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 49 - 332
Target Start/End: Original strand, 24258457 - 24258744
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||    
T  24258457 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactatggtttgagggtt 24258556  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  24258557 gattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaaaagattgagactttggatagaattaggcggaaaacttattcttgtaaccc 24258655  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatca----tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaa 332  Q
    |||||| |||| ||||||| |  ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||    
T  24258656 attgatatctcttttgtaaagttactcatcattattatagtggaacggagggctgctctctctttcagactaggtcaatttggaccgaa 24258744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 49 - 262
Target Start/End: Original strand, 25276135 - 25276347
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||||| ||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  25276135 gagatagagggggctaaaacaataatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 25276234  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25276235 gattcatcttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaacc 25276333  T
Q  249 attgatttctcttt 262  Q
    |||||| |||||||    
T  25276334 attgatatctcttt 25276347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Original strand, 26804563 - 26804765
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacac---tagggtttgaag 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |    
T  26804563 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagtagggtttgagg 26804662  T
Q  146 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26804663 gttgattcaccttgggaaacactattaggatt-tagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 26804761  T
Q  246 ccca 249  Q
    ||||    
T  26804762 ccca 26804765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 49 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 22828928 - 22828716
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   |||||||||||| |||||| ||||    
T  22828928 gagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttatctcttgaaaacaaacactagagtttgatggtt 22828829  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||||  || | |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22828828 gattcagattagaaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 22828730  T
Q  249 attgatttctcttt 262  Q
    |||||| |||||||    
T  22828729 attgatatctcttt 22828716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22251878 - 22251641
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||  ||| ||||||      |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  22251878 acttttactataaatataaaccttgaatcagagtaaactttga------gatagaggaggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagagt 22251785  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||        ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22251784 ttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttggga--------taggatt-gagtctcttggttacgggaagag 22251694  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 254  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22251693 attgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 22251641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 49 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 24817643 - 24817362
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |   |||    
T  24817643 gagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaagt-caacaagagaactagggtttgtatagagtttg-ctctttgcaacaaacactagggttgg---gtt 24817550  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24817549 gattcaccttggaaagcagtattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactc 24817451  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaact 334  Q
    |||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  24817450 attgatgtctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccatactaggtcagttttggaccgaact 24817362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 84 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 24813755 - 24813494
Alignment:
Q  84 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 183  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||| |   |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  24813755 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaagaaacactagggttgg---gttgattcaccttgggaagcactattaggattg-agtc 24813661  T
Q  184 tcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct-ctttgtaacgaaactcatca-tat 281  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |  |||||||| |||    
T  24813660 tcttggtgacgggaagtgattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatctcctttgtaaagttactcatcattat 24813561  T
Q  282 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    ||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  24813560 agtggagcggatggctgctttctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt 24813494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 347
Target Start/End: Original strand, 7188496 - 7188833
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| | ||||      ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||| ||||||    
T  7188496 acttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaagt-caacaataaaaatagggt 7188588  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  7188589 ttgtatagggtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaatag 7188684  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgc 299  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| | || ||||||| |  | |||||| |||||||||  ||| ||||||    
T  7188685 attgagactttgggtagaattaagcgggagacttatttttataacccattgatatttcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacggaaggctgc 7188784  T
Q  300 tctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    ||||| |||||| ||| |||| | |||||| ||||| ||| ||||||||    
T  7188785 tctcttccccagtctatgtcagttttggactgaactaggtaaacaaatt 7188833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 49 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 20091836 - 20091580
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggt 147  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||| | ||||||| |  |||    
T  20091836 gagatagagggggctgaaaacaagggtttcg-gaggcaac-acaaaactagggtttgtatagagtttg-ctattggcaacaaagattagggttgg--ggt 20091742  T
Q  148 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20091741 tgattcaccttgggaaacactattaggatt-aaatctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 20091643  T
Q  248 cattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccag 311  Q
    ||||||| |||| ||||||| |  |||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20091642 cattgatatctcttttgtaaagttactcatc--atagtggaacggagggctgctctctcccccag 20091580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 173
Target Start/End: Original strand, 18567566 - 18567731
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18567566 acttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttga------gatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 18567659  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattag 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18567660 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattag 18567731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 49 - 254
Target Start/End: Original strand, 24465543 - 24465735
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||| |||  ||    
T  24465543 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtatagcgtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gaa--tt 24465630  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |    
T  24465631 gattcaccttgggaaacaatattaggattg-agtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagatttattcttttaactc 24465729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 210 - 359
Target Start/End: Original strand, 22393876 - 22394027
Alignment:
Q  210 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  |||||| || ||||||||    
T  22393876 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgttctctccc 22393975  T
Q  308 ccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    | |||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  22393976 ctagactaggtcaatttggaccaaactgggtaaacaaattcttttgtgttct 22394027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 147 - 347
Target Start/End: Original strand, 6332311 - 6332514
Alignment:
Q  147 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggc-gggagacttattcttgtaa 245  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  6332311 ttgattcagtttggaaaacactattaagattg-agtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggtagaattaggcttgaagacttattcttgtaa 6332409  T
Q  246 cccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaac 342  Q
    ||| || || |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| | ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  6332410 ccctttaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaagactgttctctcccctagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaac 6332509  T
Q  343 aaatt 347  Q
    |||||    
T  6332510 aaatt 6332514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 65 - 347
Target Start/End: Original strand, 11081522 - 11081803
Alignment:
Q  65 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaa 164  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||| ||   ||||| | ||||||||||||||||   || ||||||||| ||||||||    
T  11081522 aaacaagggtttagaagc-caacaacaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacactagggttg--agattgattcactttgggaaa 11081615  T
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaccc--attgatttctctt 261  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||  || |||| ||| |||||||   | ||||| |||||||||||||   ||||| ||||||    
T  11081616 cactattaggatt-gagtctcttgatcacgggaagagattaggattttgtgtaaaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttttgatatctctt 11081714  T
Q  262 -tgtaacgaaactcatc-atatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtc-atattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
     ||||| |  |||||||  || | ||||  ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11081715 gtgtaaagttactcatctttaaaatggaacggatggttgctctctcccccagactaggtcaatattggaccgaactgggtaaacaaatt 11081803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 162 - 360
Target Start/End: Original strand, 25351353 - 25351547
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || |||||    
T  25351353 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctct 25351447  T
Q  261 ttgtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 358  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  25351448 ttgtaaagaaactcatcattatagtggatcggagagctgttctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc--ttgtgttc 25351545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 146 - 369
Target Start/End: Original strand, 2120881 - 2121104
Alignment:
Q  146 gttgattcaccttggg--aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttg 242  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| |||||||    
T  2120881 gttgattcaccttggacaaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttg 2120978  T
Q  243 taacccattgatttctctttgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggt 338  Q
    |||| ||   || ||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  2120979 taactca---atatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaattgggt 2121075  T
Q  339 caacaaattcctttgtgttcttcttcttctt 369  Q
     |||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  2121076 aaacaaattc--ttgtgttcatcttcttctt 2121104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 203
Target Start/End: Original strand, 22392426 - 22392608
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||      ||||||||||||||||||||||||||| |||          ||||||||||    
T  22392426 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttga------gatagagggggctgaaacaagggtttataaatc--------aaactagggt 22392511  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    ||||||||| |||| || || | |||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  22392512 ttgtatagaatttg-ctattggcaacaaacactagggttgg---gttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagag 22392606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 147 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16297222 - 16297018
Alignment:
Q  147 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattag-gcgggagacttattcttgtaa 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    | ||| | ||||||||||    
T  16297222 ttgattcaccttggaaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagatttgaagattgattcttgtaa 16297124  T
Q  246 ccc-attgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaa 341  Q
    |||  || || |||| |||| || |  |||||||| |||||| ||  |||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| || ||    
T  16297123 cccttttaatatctcttttgcaaagttactcatcattatagtagaacggagagctgctctctcccctagactatgtcagtattggaccgaactgtgtaaa 16297024  T
Q  342 caaatt 347  Q
    ||||||    
T  16297023 caaatt 16297018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 189 - 348
Target Start/End: Original strand, 26295580 - 26295741
Alignment:
Q  189 gttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtgg 286  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||| ||||||     
T  26295580 gttacaggaagcgattgtgactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtga 26295679  T
Q  287 attggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattc 348  Q
    |   || | ||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||| | |||||||||    
T  26295680 aacagatgactgctctctcctccagactaggtcaatttggactgaactggataaacaaattc 26295741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 292 - 391
Target Start/End: Original strand, 11759364 - 11759463
Alignment:
Q  292 agggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgttt 390  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  11759364 agggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tctcctttgtgttcttctcgccgttgttt 11759462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 162 - 348
Target Start/End: Original strand, 25357047 - 25357231
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || |||||    
T  25357047 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctct 25357141  T
Q  261 ttgtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattc 348  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||| | || | || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  25357142 ttgtaaagaaactcatcattatagtggatcgaagagatgatctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc 25357231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 162 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 3320232 - 3320049
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  3320232 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 3320138  T
Q  261 ttgtaacgaaactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  3320137 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 3320049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 162 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 3324980 - 3324797
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  3324980 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 3324886  T
Q  261 ttgtaacgaaactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  3324885 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 3324797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 162 - 346
Target Start/End: Original strand, 25405393 - 25405576
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  25405393 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 25405487  T
Q  261 ttgtaacgaaactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  25405488 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 25405576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 162 - 348
Target Start/End: Original strand, 25410130 - 25410316
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || |||||    
T  25410130 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctct 25410224  T
Q  261 ttgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattc 348  Q
    |||||| |||||||||  ||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  25410225 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc 25410316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 186 - 262
Target Start/End: Original strand, 6348912 - 6348988
Alignment:
Q  186 ttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 262  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  6348912 ttggtcacgggaaaagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatatctcttt 6348988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 281 - 344
Target Start/End: Original strand, 9190038 - 9190101
Alignment:
Q  281 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9190038 tagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9190101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 281 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 20284156 - 20284093
Alignment:
Q  281 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20284156 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 20284093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 162 - 346
Target Start/End: Original strand, 7069780 - 7069963
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  7069780 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 7069874  T
Q  261 ttgtaacgaaactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  7069875 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcgaagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 7069963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 207 - 332
Target Start/End: Original strand, 6046644 - 6046772
Alignment:
Q  207 gactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctct 304  Q
    |||||||||||||||||||   || ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |  ||||||||| |||||||| || || ||||||||||    
T  6046644 gactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaacctttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaatgaagagctgctctct 6046743  T
Q  305 cccccagactaggtca-tattggaccgaa 332  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6046744 cccccagactaggtcagtattggaccgaa 6046772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 21983352 - 21983288
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21983352 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 21983288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 46516339 - 46516403
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46516339 atagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 46516403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 281 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 2580457 - 2580394
Alignment:
Q  281 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2580457 tagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 2580394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 65 - 349
Target Start/End: Original strand, 6048885 - 6049168
Alignment:
Q  65 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgg-gaa 163  Q
    ||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||| ||| ||   ||||| | ||||||||||||| || | |  |||||||||||||  |||    
T  6048885 aaacaagggtttagaagc-caacatcaaaactagggtttgtaaagaatt---ctcttggcaacaaacactaggtttggga--ttgattcaccttgaagaa 6048978  T
Q  164 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 262  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||   | |||| ||||||| |||||| ||||| || ||||    
T  6048979 acactattaggattgaa-tctcttggtcacgagaagatattgagactttggatagaattaggtttgaagacgtattcttataaccctttgatatcccttt 6049077  T
Q  263 gtaacgaaactcatc---atatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaattcc 349  Q
    |||| |  |||||||   ||||||||||  |||| | ||||||  |||||| ||||| ||| || ||||||||||| |||  |||||||||    
T  6049078 gtaaagttactcatcattatatagtggaacggagagttgctcttccccccatactagctcagtaatggaccgaactaggtagacaaattcc 6049168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 180 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 6067365 - 6067179
Alignment:
Q  180 agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt-aacgaaactcatc 277  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||   | ||||| |||||||||| ||  |||| ||||||||| || | ||||| ||    
T  6067365 agtctcttggtcacgggaagagattgagacttt-gatagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctctgatatctctttgtaaaaggaactcgtc 6067267  T
Q  278 a-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttctt 363  Q
    | ||||||| |  |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  | |||||||||||    
T  6067266 attatagtgaaacggagagctgctctctcccccatactaggtcagtattggaccggactgggtaaacaaattctctcgtgttcttctt 6067179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 256 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 34546972 - 34546857
Alignment:
Q  256 tctctttgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctt 351  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |    
T  34546972 tctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc--t 34546875  T
Q  352 tgtgttcttcttcttctt 369  Q
    ||||||||||||||||||    
T  34546874 tgtgttcttcttcttctt 34546857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 162 - 346
Target Start/End: Original strand, 7074787 - 7074970
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  7074787 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 7074881  T
Q  261 ttgtaacgaaactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||    
T  7074882 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgcactctcccccagactaggtcatcattagaccgaaccgggtaaacaaat 7074970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 46 - 116
Target Start/End: Original strand, 38396307 - 38396377
Alignment:
Q  46 agagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 116  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38396307 agagagagggagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgt 38396377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 2647725 - 2647789
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  2647725 atagtggattggagggctgctctctcccccagaataggtcatattgggccgaattgggtcaacaa 2647789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 7094759 - 7094662
Alignment:
Q  5 tttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 104  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||   || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||    
T  7094759 tttattataaatatagaccttgtatcagagcaaactttga--gagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaacatagggtttg 7094662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 162 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 8378686 - 8378502
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  8378686 aaacactattaagattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 8378592  T
Q  261 ttgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| |||||||||  ||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  8378591 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagttgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 8378502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 29159871 - 29159807
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29159871 atagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 29159807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 256 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 7464611 - 7464496
Alignment:
Q  256 tctctttgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctt 351  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |    
T  7464611 tctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctcttccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc--t 7464514  T
Q  352 tgtgttcttcttcttctt 369  Q
    ||||||||||||||||||    
T  7464513 tgtgttcttcttcttctt 7464496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 281 - 344
Target Start/End: Original strand, 9185195 - 9185258
Alignment:
Q  281 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9185195 tagtggattggagagcttctctctcccccagactaggttatattggaccgaactgggtcaacaa 9185258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 281 - 344
Target Start/End: Original strand, 28617255 - 28617318
Alignment:
Q  281 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28617255 tagtggattggagagctgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtaaacaa 28617318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 281 - 344
Target Start/End: Original strand, 33332480 - 33332543
Alignment:
Q  281 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  33332480 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaa 33332543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 150 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 40281572 - 40281466
Alignment:
Q  150 attcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||   | |||||||||||||||||||    
T  40281572 attcaccttgggaaacaccgttaggattg-agtctgttggtcacgggaagagattgagacttttggtggaattaggtttgaagacttattcttgtaaccc 40281474  T
Q  249 attgattt 256  Q
     |||||||    
T  40281473 tttgattt 40281466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 162 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 15541177 - 15540994
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||| |||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  15541177 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtataattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 15541083  T
Q  261 ttgtaacgaaactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  15541082 ttgtaaagaaactcattcattatagtgtatcgtagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 15540994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 162 - 344
Target Start/End: Original strand, 21369642 - 21369824
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||   | ||||| |||| |||||| ||   || |||||    
T  21369642 aaacactattaggattg-agtctcttggttacggaaagagattgggac-ttgggtaaaattaggtttgaagactgattcatgtaactca---atatctct 21369736  T
Q  261 ttgtaacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||| |||||||  |||| |||||||||  |||| |||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21369737 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctccgccatagtaggtcatcattggaccgaactgggtaaacaa 21369824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 280 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 56015 - 55955
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaa 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  56015 atagtggattggagggctgctctctcccc-agattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 55955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 7092512 - 7092414
Alignment:
Q  5 tttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaa-actagggttt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||    
T  7092512 tttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttga--gagagatggagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaacactagggttt 7092415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 44512704 - 44512503
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  44512704 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 44512610  T
Q  264 taacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||| |||||||||  ||| |||| |||  |||| |||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||| |    
T  44512609 taaagaaactcatatcattataggggaacggagagctgctctctccct-agactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc--ttgtgttat 44512513  T
Q  360 tcttcttctt 369  Q
    ||||||||||    
T  44512512 tcttcttctt 44512503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 35960884 - 35960820
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  35960884 atagtggtttggagggctgctctctcccccagattaggtcatattgaaccgaactcggtcaacaa 35960820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 44848713 - 44848777
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44848713 atagtggattggagagctgctctctcccccaggttaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaa 44848777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 347
Target Start/End: Original strand, 30246973 - 30247155
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||  ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  30246973 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagaccgattcttgtaactca---atatctctttg 30247067  T
Q  264 taacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    ||| |||||||||  ||| ||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  30247068 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctatctcccccagactaggtcatcattagaccaaactgggtaaacaaatt 30247155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 162 - 348
Target Start/End: Original strand, 42006663 - 42006849
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||| ||||||| ||   || |||||    
T  42006663 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgatttttgtaactca---atatctct 42006757  T
Q  261 ttgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattc 348  Q
    |||||| |||||||||  ||| ||||||||  | || ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||||    
T  42006758 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacgaagagctgctctctctcccagactaggtcatcattagaccgaactgcgtaaacaaattc 42006849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 92 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 13290723 - 13290470
Alignment:
Q  92 aaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggt 190  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||| | ||||||||||||| || | ||  ||||||||||| | ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  13290723 aaactagggtttgta--gagttt-tctcttggcaacaaacactaggcttgggag--tgattcaccttcgagaaacactattagaattt-agtctcttggt 13290630  T
Q  191 tacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcat-atagtggat 288  Q
     || |||||| |||   ||| ||||||||||||||   || || | ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |  ||||||||| |||| |||     
T  13290629 cacaggaagatattagaactctgggtagaattaggtttgaagaataattcttgtaaccttttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagcggaa 13290530  T
Q  289 tggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
      ||| ||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  13290529 cagagagctacactctccctcagacttggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 13290470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 4796696 - 4796760
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  4796696 atagtggatttgagggctgctttctcccccagattaggtcattttggaccgaactgggttaacaa 4796760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 84 - 225
Target Start/End: Original strand, 11084409 - 11084544
Alignment:
Q  84 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 183  Q
    |||||| |||||||||||||||| | | ||   ||||| | |||||||| |||||||   || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11084409 caacaagaaaactagggtttgtagaaaatt---ctcttggcaacaaacaatagggttg--agattgatttaccttgggaaacactattaggatt-gagtc 11084502  T
Q  184 tcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 225  Q
    ||||||| ||| |||||||||   |||||||||| |||||||    
T  11084503 tcttggtcacgagaagagattcgaactttgggtaaaattagg 11084544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 228 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 44010867 - 44010729
Alignment:
Q  228 ggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-at 323  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   || ||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44010867 ggagactgattcttgtaactca---atatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcat 44010771  T
Q  324 tggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttc 367  Q
    | ||||||||| ||| ||||||||   ||||||||| |||||||    
T  44010770 tagaccgaacttggtaaacaaatt--attgtgttctccttcttc 44010729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 364
Target Start/End: Original strand, 2075205 - 2075315
Alignment:
Q  256 tctctttgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctt 351  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |    
T  2075205 tctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggaaagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc--t 2075302  T
Q  352 tgtgttcttcttc 364  Q
    |||||||| ||||    
T  2075303 tgtgttctccttc 2075315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 21639877 - 21639813
Alignment:
Q  279 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  21639877 tatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 21639813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 47263744 - 47263682
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47263744 atagtggattggagagctgctctc--ccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 47263682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 49091729 - 49091665
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  49091729 atagtggattggagagttgctctcttccccagattaggtcatattggactaaactgggtcaacaa 49091665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 344
Target Start/End: Original strand, 5817300 - 5817362
Alignment:
Q  281 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||    
T  5817300 tagtggattggagagctgctctctcccc-agagtaggtcatattggaccgaactgagttaacaa 5817362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 344
Target Start/End: Original strand, 23403043 - 23403106
Alignment:
Q  281 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  23403043 tagtagattggagggctgctcactccctcagattaggtcatattagaccgaattgggtcaacaa 23403106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 57
Target Start/End: Original strand, 38396239 - 38396294
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagag 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||    
T  38396239 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaattttgagagagagagagag 38396294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 295 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 44016711 - 44016640
Alignment:
Q  295 gctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttc 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||  ||||||||| |||||||    
T  44016711 gctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaattgggtaaacaaattc--ttgtgttctccttcttc 44016640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 2058029 - 2057970
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  2058029 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 2057970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 2479404 - 2479341
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2479404 atagtggatttgagagctgctctc-cccctagattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaa 2479341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 4866794 - 4866735
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  4866794 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 4866735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 18408827 - 18408768
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  18408827 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 18408768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 19992377 - 19992318
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  19992377 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 19992318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 24024347 - 24024406
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  24024347 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 24024406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 147 - 225
Target Start/End: Original strand, 26210631 - 26210710
Alignment:
Q  147 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttgggtagaattagg 225  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  26210631 ttgattcaccttggagaaatactattaggattg-agtctcttggtaacggaaagagattcgggactttcggtagaattagg 26210710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 307 - 359
Target Start/End: Original strand, 26804762 - 26804814
Alignment:
Q  307 cccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26804762 cccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 26804814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 301 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 21988955 - 21988912
Alignment:
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21988955 ctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 21988912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 125 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12310234 - 12310157
Alignment:
Q  125 aacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggg-aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt 204  Q
    |||||||||||||||| | |  |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  12310234 aacaaacactagggttggga--ttgattcaccttgaacaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagatt 12310157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 1533477 - 1533536
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  1533477 tggattggagagatgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 1533536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 12396975 - 12396916
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  12396975 tggattggagagctgttctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 12396916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 16880137 - 16880078
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  16880137 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 16880078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 16884993 - 16884934
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  16884993 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 16884934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 18413707 - 18413645
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  18413707 atagtggattggagagctgctctct-ccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 18413645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 20357580 - 20357639
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  20357580 tggattggagagctgctctctcccccaaattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 20357639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 21646074 - 21646011
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  21646074 atagtggattggagagctgctctcttccctagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 21646011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 24261344 - 24261403
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  24261344 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 24261403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 24266223 - 24266282
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  24266223 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 24266282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Original strand, 27347941 - 27347985
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27347941 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 27347985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 31109604 - 31109663
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  31109604 tggattggagagctgctctctcccctagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 31109663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 41317478 - 41317434
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  41317478 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 41317434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 324 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 22251605 - 22251570
Alignment:
Q  324 tggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22251605 tggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 22251570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Original strand, 2935305 - 2935335
Alignment:
Q  1 gacttttactataaatatagaccttgtatca 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2935305 gacttttactataaatatagaccttgtatca 2935335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 9027441 - 9027411
Alignment:
Q  1 gacttttactataaatatagaccttgtatca 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9027441 gacttttactataaatatagaccttgtatca 9027411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Original strand, 22108113 - 22108143
Alignment:
Q  1 gacttttactataaatatagaccttgtatca 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22108113 gacttttactataaatatagaccttgtatca 22108143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Original strand, 22137124 - 22137154
Alignment:
Q  1 gacttttactataaatatagaccttgtatca 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22137124 gacttttactataaatatagaccttgtatca 22137154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Original strand, 40549873 - 40549903
Alignment:
Q  1 gacttttactataaatatagaccttgtatca 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40549873 gacttttactataaatatagaccttgtatca 40549903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Original strand, 40552151 - 40552181
Alignment:
Q  1 gacttttactataaatatagaccttgtatca 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40552151 gacttttactataaatatagaccttgtatca 40552181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 31
Target Start/End: Original strand, 1606423 - 1606452
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatca 31  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1606423 acttttactataaatatagaccttgtatca 1606452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Original strand, 8153466 - 8153510
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  8153466 tctctcccccagattaggtcaagttggactgaactgggtcaacaa 8153510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 12097911 - 12097867
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  12097911 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaa 12097867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 12406395 - 12406336
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  12406395 tggattggagagctattctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 12406336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 14069877 - 14069833
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14069877 tctctccccaagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 14069833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 14379905 - 14379861
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14379905 tctctcccctagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 14379861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Original strand, 18126768 - 18126812
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||    
T  18126768 tctctcccccagactaggtcaagtttgaccgacctgggtcaacaa 18126812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 21812259 - 21812318
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  21812259 tggattggaaagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 21812318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Original strand, 30814560 - 30814604
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  30814560 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 30814604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 31733013 - 31732969
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31733013 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 31732969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 292 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 40281435 - 40281379
Alignment:
Q  292 agggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| || ||||||||    
T  40281435 agggatgctctctcccccagactagttcagtattggacagaactgtgtaaacaaatt 40281379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 41649055 - 41649011
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  41649055 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 41649011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Original strand, 43864368 - 43864412
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  43864368 tctctctcccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 43864412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Original strand, 48489555 - 48489599
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  48489555 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtaaacaa 48489599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 327; Significance: 0; HSPs: 207)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Original strand, 746674 - 747064
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  746674 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 746773  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  746774 ttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 746873  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 301  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  746874 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggaggactgctc 746973  T
Q  302 tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  746974 tctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctcgcagttgtttt 747064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Original strand, 458203 - 458591
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  458203 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaaccttga--gagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 458300  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  458301 ttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 458400  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 301  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  458401 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 458500  T
Q  302 tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  458501 tctcccccagactaggtcaggttggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 458591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Original strand, 455826 - 456214
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  455826 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaaccttga--gagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 455923  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  455924 ttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 456023  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 301  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456024 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 456123  T
Q  302 tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  456124 tctcccccagactaggtcgggttggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 456214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 10621876 - 10621480
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaac 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||      ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621876 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagagatagagggtgctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaac 10621777  T
Q  96 tagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgg 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621776 tagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgg 10621677  T
Q  196 gaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggaggg 295  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  10621676 gaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggaggg 10621577  T
Q  296 ctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10621576 ctgctctctcccccagactagctcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 10621480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 391
Target Start/End: Original strand, 38210290 - 38210677
Alignment:
Q  1 gacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38210290 gacttttactataaatataggccttgtatcaggcta--ttttg--agagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaggg 38210385  T
Q  101 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38210386 tttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 38210485  T
Q  201 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38210486 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagagctgct 38210585  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38210586 ctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttcctcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 38210677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 47 - 391
Target Start/End: Original strand, 50493961 - 50494305
Alignment:
Q  47 gagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaagg 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  50493961 gagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtggg 50494060  T
Q  147 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50494061 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagggattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaac 50494160  T
Q  247 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50494161 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 50494260  T
Q  347 tcctttgtgttcttcttcttcttttgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50494261 atctttgtgttcttcttcttcttttgttcttctcgccgttgtttt 50494305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 6063783 - 6063396
Alignment:
Q  1 gacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    || ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6063783 gacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttga----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg 6063688  T
Q  101 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 200  Q
    |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6063687 tttgtatagagtttgtcttttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 6063588  T
Q  201 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6063587 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 6063488  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6063487 ctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtccacaaatttctttgtgttcttctccttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 6063396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 2 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 4104233 - 4103846
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4104233 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttga--gagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 4104136  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4104135 ttgtatagagcttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagag 4104037  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 301  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  4104036 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgcta 4103937  T
Q  302 tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgttttt 392  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4103936 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgttttt 4103846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 6066131 - 6065746
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    || |||||| | ||||     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6066131 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag-----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 6066037  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6066036 ttgtatagattttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 6065937  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 301  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6065936 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggatggctgctc 6065837  T
Q  302 tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6065836 tctcccctagactaggtcagattggacagaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttctccttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 6065746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 391
Target Start/End: Original strand, 25388820 - 25389212
Alignment:
Q  1 gacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagaggggg--ctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactag 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  || ||||||| |||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25388820 gacttttactataaatatagaccttgtatcaggctattttgagagagagagagagagagagagctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactag 25388919  T
Q  99 ggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25388920 ggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaa 25389018  T
Q  199 gagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctg 298  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  25389019 gagattgggactttgggtagaattaggcgggagacatattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctg 25389118  T
Q  299 ctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttttg--ttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  25389119 ctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttc-tcttcttttgtattcttctcgccgttgtttt 25389212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 2 - 362
Target Start/End: Original strand, 25533357 - 25533719
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagag--agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25533357 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagg 25533456  T
Q  100 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  25533457 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtcttttggttacgggaag 25533555  T
Q  200 agattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctg 298  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  25533556 aggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctg 25533655  T
Q  299 ctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttct 362  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25533656 ctctctcccctagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 25533719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 28413299 - 28412981
Alignment:
Q  75 ttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattagg 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28413299 ttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagg 28413200  T
Q  175 attggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactc 274  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28413199 attgaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactc 28413100  T
Q  275 atcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaa-ttcctttgtgttcttcttcttcttt-tg 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  28413099 atcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaattaggtcaacaaatttcttttgtgttcttcttcttctttgtg 28413000  T
Q  373 ttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||||||||||||||    
T  28412999 ttcttctcgccgttgtttt 28412981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Original strand, 38889962 - 38890346
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   || || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  38889962 acttttactataaatatagaccttgtata--gcaaa-ctttga--gagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggt 38890056  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38890057 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagag 38890155  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38890156 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 38890255  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38890256 ctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 38890346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 2 - 362
Target Start/End: Original strand, 3859451 - 3859804
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   || ||| ||      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3859451 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttgga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 3859544  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3859545 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagag 3859643  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 301  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  3859644 gctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtggatcgtagggctgctc 3859743  T
Q  302 tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttct 362  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3859744 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 3859804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 4 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 10956359 - 10955978
Alignment:
Q  4 ttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |     || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  10956359 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacat-----ga-agatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggttt 10956266  T
Q  104 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 203  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  10956265 gtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacattattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggc 10956167  T
Q  204 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  10956166 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 10956067  T
Q  303 ctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10956066 ctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 10955978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 4308615 - 4308264
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||   || ||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4308615 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 4308522  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4308521 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagag 4308423  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4308422 gttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgct 4308323  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4308322 ctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 4308264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 10084726 - 10084340
Alignment:
Q  3 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |   || |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  10084726 cttttactataaatatagaccttgtatcggagcaaactttg--agagagatagagggggctggaacaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtt 10084629  T
Q  103 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaga 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||     
T  10084628 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagga-tcgagtctcttggttacgggaagagg 10084530  T
Q  203 ttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 301  Q
     || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10084529 ctgggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 10084430  T
Q  302 tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10084429 tctccccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 10084340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 49 - 391
Target Start/End: Original strand, 5191617 - 5191957
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||    
T  5191617 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 5191716  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5191717 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaaccc 5191815  T
Q  249 attgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattc 348  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  5191816 attgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcagagggctgttctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 5191914  T
Q  349 ctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
     |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  5191915 ttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccattgtttt 5191957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 4 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 10958655 - 10958274
Alignment:
Q  4 ttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |      | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  10958655 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacat------aaagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggttt 10958562  T
Q  104 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 203  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||      
T  10958561 gtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagaggc 10958463  T
Q  204 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 302  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  10958462 tgacactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcttcatatagtggaacggagggctgctct 10958363  T
Q  303 ctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10958362 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttatgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 10958274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 51727340 - 51726958
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||   || ||||||      |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51727340 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttga------gataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 51727247  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  51727246 atgtatagagtttgtctctttggaacaaacact-gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacggtaagag 51727149  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  51727148 gctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgct 51727049  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51727048 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 51726958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 2 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 9604946 - 9604577
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||   || || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  9604946 actttcactataaatatagaccttgtattagagaaaactctgagagagagatagagggggctgaaacaagg-tttagaaaggcaacaacaaaactaggat 9604848  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  9604847 ttgtatagagtttgtctctttgaaagaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacggaaagag 9604749  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9604748 gttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 9604649  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct-tcttcttctttt 371  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  9604648 ctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttctttt 9604577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 18099505 - 18099153
Alignment:
Q  1 gacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaggg 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  18099505 gacttttactataa-tatagaccttgtatcagagtaaactt-----gagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactaggg 18099412  T
Q  101 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18099411 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaaga 18099313  T
Q  201 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgc 299  Q
    |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18099312 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacattactcatcatatagtggaacggagggctgc 18099213  T
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18099212 tctctcccctagactaggtcaatatggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 18099153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 39 - 359
Target Start/End: Original strand, 42990258 - 42990578
Alignment:
Q  39 ctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggg 138  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  42990258 ctttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggt 42990357  T
Q  139 tttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatt 238  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42990358 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatt 42990456  T
Q  239 cttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactggg 337  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  42990457 cttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatggtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggg 42990556  T
Q  338 tcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  42990557 tcaacaaattcttttgtgttct 42990578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Original strand, 11170327 - 11170678
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11170327 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 11170420  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  11170421 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgcggattgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtgtcttggttacgggaagag 11170519  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
      || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  11170520 gctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgct 11170619  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  11170620 ctctcccccagactaggtcaatttgggccgaactgggtcaacaaattcttttgttttct 11170678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Original strand, 43228255 - 43228565
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  43228255 gagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagcgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 43228354  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43228355 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaaccc 43228453  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  43228454 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaatt 43228553  T
Q  348 cctttgtgttct 359  Q
    | ||||||||||    
T  43228554 cttttgtgttct 43228565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Original strand, 45882862 - 45883214
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||| || |||      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45882862 acttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactatga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 45882955  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45882956 ttgtatagattttgtctctttggaacaaacaataaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagag 45883054  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  45883055 gttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgct 45883154  T
Q  301 ctctccccc-agactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45883155 ctctccccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 45883214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 18097236 - 18096883
Alignment:
Q  1 gacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  18097236 gacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactt-----gagagatagagggggctcaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactaggg 18097142  T
Q  101 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18097141 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaaga 18097043  T
Q  201 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgc 299  Q
    |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||    
T  18097042 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttcccttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagctgc 18096943  T
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  18096942 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacgaattcttttgtgttct 18096883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 53917998 - 53917647
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | ||||      ||| |||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||    
T  53917998 acttttactataaatatagaccttgaatcagattaaaccttga------gatggagggggctgaaacaatggtttagaatgacaacaacaaaactagggt 53917905  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53917904 ttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagag 53917806  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  53917805 attgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgct 53917706  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53917705 ctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 53917647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 46 - 359
Target Start/End: Original strand, 30005802 - 30006115
Alignment:
Q  46 agagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaag 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30005802 agagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagg 30005901  T
Q  146 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30005902 gttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 30006000  T
Q  246 cccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    | |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  30006001 ctcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagattagatcaatttggaccgaactgggtcaacaa 30006100  T
Q  345 attcctttgtgttct 359  Q
    |||| ||||||||||    
T  30006101 attcttttgtgttct 30006115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 5522949 - 5522578
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   || ||| ||      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5522949 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttgga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 5522856  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    ||||           ||||| |||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5522855 ttgt-----------ctcttcggaacaaacactcgggtttgtgggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagag 5522768  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 301  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5522767 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctc 5522668  T
Q  302 tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5522667 tctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 5522578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 27101519 - 27101164
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcag-gctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaggg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||   ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27101519 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaat---tgagatagagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg 27101423  T
Q  101 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  27101422 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacaggaaga 27101324  T
Q  201 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgc 299  Q
    || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||  |||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  27101323 gaatgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgcaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgc 27101224  T
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27101223 tctctcccccagaataggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttct 27101164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Original strand, 1313333 - 1313683
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | ||||      |||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||    
T  1313333 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttga------gatagagggggctgaaacaagg-tttacaatggcaacaacaaaactagggt 1313425  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  1313426 ttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttagttacgggaagag 1313524  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  1313525 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgct 1313624  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1313625 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 1313683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 3 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 1627016 - 1626666
Alignment:
Q  3 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtt 102  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| | ||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1627016 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 1626923  T
Q  103 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaga 202  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  1626922 tgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacggggagaga 1626824  T
Q  203 ttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 301  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  1626823 ttgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctc 1626724  T
Q  302 tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||| |||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  1626723 tctcgcccagactaggtcgatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 1626666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 10191647 - 10191263
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |   || |||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  10191647 acttttactataaatatagaccttgtatcggagcaaactttg--agagagataaagggggctggaacaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggt 10191550  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  10191549 ttttatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagga-tcgagtctcttggttacaggaagag 10191451  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
      || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10191450 gctg-gactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttcatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 10191352  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10191351 ctctccctaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt--attgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 10191263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 49 - 348
Target Start/End: Original strand, 43226050 - 43226348
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  43226050 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactacg-tttgtatagagtttgtctcgttggaacaaacactagggtttgtgggtt 43226148  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43226149 gattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 43226247  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  43226248 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 43226347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 89 - 391
Target Start/End: Original strand, 1321483 - 1321785
Alignment:
Q  89 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttg 188  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1321483 acaaaactcgggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttg 1321581  T
Q  189 gttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtgga 287  Q
    ||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  1321582 gttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 1321681  T
Q  288 ttggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgtt 386  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  1321682 tcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgtt 1321780  T
Q  387 gtttt 391  Q
    |||||    
T  1321781 gtttt 1321785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 22114639 - 22114255
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   || ||| ||      |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  22114639 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttgga------gatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaaaaacaaaactagggt 22114546  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22114545 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagag 22114447  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
      || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| || || |||||| || |    
T  22114446 gctgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatgaatcggagggatgat 22114347  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttttgttcttctcgccgttgttttt 392  Q
    |||||||||| || | || |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || || |||||||||||||||| |||||    
T  22114346 ctctcccccaaacaaagtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttttttgtgttcttctcgccgtttttttt 22114255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 43423756 - 43423446
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  43423756 gagaaagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 43423657  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  43423656 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactc 43423558  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| |   ||| |||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  43423557 attgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaactgagagctgctctctccctgagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 43423458  T
Q  348 cctttgtgttct 359  Q
    | ||||||||||    
T  43423457 cttttgtgttct 43423446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Original strand, 26720471 - 26720853
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   || ||| ||      ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26720471 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttgga------gatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 26720564  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  26720565 ttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggtta-actattaggatt-gagtttcttggttacgggaagag 26720662  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| | |||||    
T  26720663 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttttaaccctttgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggatgactgct 26720762  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  26720763 ctctcccctagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaccaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgtcgttctttt 26720853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 28102295 - 28101985
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  28102295 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 28102196  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28102195 gattcaccttgggaaacgctattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 28102097  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||||| |||| ||||||| |  ||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |  ||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||    
T  28102096 attgatatctcttttgtaaagttacttatcatatagtggaacggatggctgctctctccccaaagctaggtcaatttggaccaaactaggtcaacaaatt 28101997  T
Q  348 cctttgtgttct 359  Q
    | ||||||||||    
T  28101996 cttttgtgttct 28101985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Original strand, 3314648 - 3314959
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3314648 gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 3314747  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3314748 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 3314846  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| |||| |||||||    | |||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  3314847 attgatatctcttttgtaaaattattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 3314946  T
Q  347 tcctttgtgttct 359  Q
    || ||||||||||    
T  3314947 tcttttgtgttct 3314959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Original strand, 24979630 - 24979982
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  24979630 actttcactataaatatataccttgtatcagagtaaactttga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggt 24979723  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24979724 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggatt-gagtctcttggttacggaaagag 24979822  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc-tctttgt-aacgaaactcatcatatagtggattggagggctgc 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| || || | ||||| ||||  ||||||||||||||| |  ||| ||||||    
T  24979823 attgagactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacaaattaatatcttttttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgc 24979922  T
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24979923 tctctcccccaaactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 24979982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 4 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 43421747 - 43421398
Alignment:
Q  4 ttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  ||| | ||||      |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43421747 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttga------gatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 43421654  T
Q  104 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 203  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  43421653 gtatagtgtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaatt-gagtctcttggttacgggaaaagat 43421555  T
Q  204 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 302  Q
    || |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| |   || |||||||||    
T  43421554 tggggatttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagatggctgctct 43421455  T
Q  303 ctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43421454 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 43421398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 53915830 - 53915479
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | || |      |||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||    
T  53915830 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttaa------gatagagggggctgaaacaagggtttaggatgacaacaacaaaactagggt 53915737  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53915736 ttgtatagattttgtctcttgggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgtgaaacattattaggatt-gagtctcttggttacgggaagag 53915638  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  53915637 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatttagtgaaacggagggctgct 53915538  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53915537 ctctcccccagactaggtcaattttgactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 53915479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 3 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 880785 - 880434
Alignment:
Q  3 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtt 102  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| | ||||      |||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  880785 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttga------gatagaggggtctgaaacaagagtttagaatggcaacaacaaaactagggtt 880692  T
Q  103 tgtatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  880691 tgtatagagttcgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagcattg-agtctcttggttacggaaagag 880593  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    |||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  880592 attggggctttgggtagaattagacgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtaaaatggagggctgct 880493  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  880492 ctctcccctagactaggtcaatttggaccgagctgggtcaacaaattcttttgtgttct 880434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 5927057 - 5926748
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5927057 gagatagagagggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggtt 5926958  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5926957 gattcgccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 5926859  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    ||| || | || ||||||| |  |||||||||||| || |  ||| | |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  5926858 atttatatatcttttgtaaggttactcatcatataatgaaacggatgactgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 5926759  T
Q  348 cctttgtgttct 359  Q
     |||||||||||    
T  5926758 -ctttgtgttct 5926748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Original strand, 51943335 - 51943644
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  51943335 gagatagagggtgctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggtt 51943434  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  51943435 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggcgggagactt-ttcttgtaactc 51943532  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  51943533 attgacgtctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 51943632  T
Q  348 cctttgtgttct 359  Q
    |  |||||||||    
T  51943633 ctcttgtgttct 51943644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 63 - 359
Target Start/End: Original strand, 18162641 - 18162937
Alignment:
Q  63 tgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggga 162  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  18162641 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttttgaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttggga 18162740  T
Q  163 aacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat-ttctctt 261  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   ||    
T  18162741 aacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatttattt 18162839  T
Q  262 tgt-aacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  18162840 tgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgga-cgaactgtgtcaacaaatttttttgtgttct 18162937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 32264377 - 32264021
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||   || |    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||    
T  32264377 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaa--ttaactttgagatagagggggctcaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaagt 32264280  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  32264279 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagag 32264181  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctg 298  Q
      ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |  |||||||| |||||||||  |||||||||    
T  32264180 gctggaactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctg 32264081  T
Q  299 ctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  32264080 ctctctcccccagactaggtctatttggaccaaactggatcaac-aattcttttgtgttct 32264021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Original strand, 6561740 - 6562028
Alignment:
Q  9 ctataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6561740 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 6561833  T
Q  109 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgaga 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6561834 gagtttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggga 6561932  T
Q  209 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  6561933 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctctttttgtaaggtaactcatcattatagtggagcggagggctgctc 6562028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 47149233 - 47148890
Alignment:
Q  3 cttttactataaatatagaccttgtatcaggc-taatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||  | ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47149233 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaggccttga--gggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 47149136  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  47149135 ttgtatagagtttgtctctttggaaacaaacactgggatttgatggttgattcacctt-ggaaacactattatgatt-gagtctcttggttacgggaaga 47149038  T
Q  201 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgc 299  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||  ||||||||||||||| |   |||| ||||    
T  47149037 gattgggtctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtatcgttactcatcatatagtgaaacagaggactgc 47148938  T
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| ||||||||||||    
T  47148937 tctctcccccagactatgtcaatttggcccgaactaggtcaacaaatt 47148890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 107 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 7606822 - 7606568
Alignment:
Q  107 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattga 206  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||     
T  7606822 tagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgg 7606724  T
Q  207 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7606723 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttctatttgtaacgttactcgtcatatagtggatcggagggctgctctctcc 7606624  T
Q  307 cccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttct 362  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7606623 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 7606568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Original strand, 42992205 - 42992544
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  42992205 acttttactataaatatataccttgtatcatgctaaacttt--aagagagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggt 42992302  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  42992303 ttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagag 42992401  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    | || ||||||||||||               ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||| || || ||||||||    
T  42992402 agtg-gactttgggtag---------------ttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttagtcatcatatagtgaatcggggggctgct 42992485  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  42992486 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttttttgtgttct 42992544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 35777343 - 35777587
Alignment:
Q  1 gacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||    || ||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35777343 gacttttactataaatatagacattgtatcaaagcaaactttga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaggg 35777436  T
Q  101 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35777437 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 35777536  T
Q  201 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 251  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35777537 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcatt 35777587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Original strand, 36011791 - 36012101
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  36011791 gagataaagggggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacgaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactatggtttgagggtt 36011890  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  36011891 gattcacgttgggaaacactattaggatt-gaatatcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattagttgggagacttattcttgtaaccc 36011989  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||   |||||||||||||| |  ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  36011990 attgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctcttcttcagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaatt 36012089  T
Q  348 cctttgtgttct 359  Q
    | ||||||||||    
T  36012090 cttttgtgttct 36012101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 46 - 306
Target Start/End: Original strand, 29956647 - 29956907
Alignment:
Q  46 agagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaag 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |    
T  29956647 agagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaattcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagg 29956746  T
Q  146 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29956747 gttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 29956845  T
Q  246 cccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 306  Q
    | |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  29956846 ctcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcc 29956907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 12268300 - 12267958
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaa-ctaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||      ||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  12268300 acttttactataaatatagaacttgtatcagagtaaactttga------gatagagggagctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaaactaggg 12268207  T
Q  101 tttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12268206 tttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttcggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaag 12268108  T
Q  200 agattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgc 299  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||| |||||||||  ||||||||||||||| |   |||||||||    
T  12268107 agattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac---------tct-tttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgc 12268018  T
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12268017 tctctcccccaaactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 12267958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 48362004 - 48361654
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||      |||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  48362004 acttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactttga------gatacagggggctgaaacaagg-tttagaatgacaacaacaaaactagggt 48361912  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  48361911 ttgtatagagtttgtctcttgggaacaaaaactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggatt-gagtctcttagttacgggaagag 48361813  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||  |||| |||| ||||  |||||| |||||||  |  |||| ||||||    
T  48361812 attggggcttttggtagaattaggcggaagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcataatatagtaaaacggagagctgct 48361713  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48361712 ctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 48361654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 50 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 53468747 - 53468436
Alignment:
Q  50 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttg 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||    
T  53468747 agataaagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaaccagg-tttgtatagagtttgtctctttggaagaaacactagggtttgagcattg 53468649  T
Q  150 attcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53468648 attcaccttgggaaacactattaggattgaa-tctcttggttacggggagagattgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 53468550  T
Q  250 ttgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccag--actaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaa 345  Q
    ||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  |||||||||||||  |||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  53468549 ttgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctaccccccagacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 53468450  T
Q  346 ttcctttgtgttct 359  Q
    ||| ||||||||||    
T  53468449 ttcttttgtgttct 53468436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 28761721 - 28761410
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||| |||||||||  |||    
T  28761721 gagatagagggggttgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacacaagggtttgagagtt 28761623  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28761622 gattcaccttggaaaacactattaggattg-agtctcttggttacaggaagatattgagactttaggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccc 28761524  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtc-atattggaccgaactgggtcaacaaa 345  Q
    |||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||    
T  28761523 attgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaggactgctctctcccccagactaggtcaattttggatcgaactgggtaaacaaa 28761424  T
Q  346 ttcctttgtgttct 359  Q
    ||| ||||| ||||    
T  28761423 ttcttttgttttct 28761410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 49 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 35918242 - 35917944
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacac------tagggtttg 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||| |||||    
T  35918242 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacaaacactagagtttg 35918143  T
Q  143 aaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttg 242  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  35918142 agggttgattcaccttgcgaaacactattagaattg-agtctcttggttacgagaagagactgggaatttgggtagaaataggagggagacttattcttg 35918044  T
Q  243 taacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaa 341  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||| ||||    
T  35918043 taacccattgatttctcttttgtaacgttactcattatatagtggaacggagagctgctctctccctcagact-ggtcaatttagaccgaactggatcaa 35917945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 359
Target Start/End: Original strand, 32219026 - 32219359
Alignment:
Q  10 tataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 109  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||      ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||               
T  32219026 tataaatatagaccttgtatctgactaaactttga------gatagagggggctgaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactag----------- 32219108  T
Q  110 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagac 209  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  32219109 agtttgtctctttgtaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatcaggatt-gagtctcttggttgcgggaagagattgggac 32219207  T
Q  210 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc-tctttgt-aacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 307  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || | ||||| ||||  ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||| |    
T  32219208 tttgggcagaattaggcggaagacttatttttgtaacccattgatatcttttttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctctc 32219307  T
Q  308 ccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32219308 ccagactatgccaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 32219359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Original strand, 15780783 - 15781153
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||      ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  15780783 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacttgga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggt 15780876  T
Q  102 ttgtatagagtt-----------tgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggt 190  Q
    ||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  15780877 ttgtatagagtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattacgatt-gagtctcttggt 15780975  T
Q  191 tacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg----atttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagt 284  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||||| |  | | |||| ||||||    
T  15780976 tacgggaagaggctgagactttcggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatatttctcttttgtaaagttatttatcattatagt 15781075  T
Q  285 ggattggaggg---ctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||  | ||||   ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  15781076 ggaacgaagggcgcctgctctctcccccacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgttttct 15781153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Original strand, 39715434 - 39715739
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  39715434 gagatagagggg-ctgaaataagggtttagagaggcaacaccaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttgaaacaaacactagggtttgagggtt 39715532  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39715533 gattcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgcaaccc 39715631  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||||| |||| ||||||| |  |||||||  |||||| |   || || ||  |||||||||| ||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  39715632 attgatatctcttttgtaaagttactcatc--atagtgaaacagatggttg--ctctcccccatactagatcattttggaccaaactaggtcaacaaatt 39715727  T
Q  348 cctttgtgttct 359  Q
    | ||||||||||    
T  39715728 cttttgtgttct 39715739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 51675048 - 51674749
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||           | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51675048 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaaggtttgt-----------ccctttggaacaaacactagggtttgagggtt 51674960  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  51674959 gattcaccttggaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattgggattttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaatcc 51674861  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||||| |||| ||||||| |  |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  51674860 attgatatctcttttgtaatgttactcatcatatactgaaatggagggctgctctctcccccataccaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaatt 51674761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 49 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 28100334 - 28100143
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  28100334 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 28100235  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 241  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28100234 gattcaccttggaaaacgctattaggatt-gagtcttttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattctt 28100143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 146 - 359
Target Start/End: Original strand, 5886261 - 5886472
Alignment:
Q  146 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 245  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5886261 gttgattcaccttgg-aaacactattagggttg-agtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 5886358  T
Q  246 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaa 345  Q
    ||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  5886359 cccattgatttgtctttgaaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 5886458  T
Q  346 ttcctttgtgttct 359  Q
    ||| ||||||||||    
T  5886459 ttcttttgtgttct 5886472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 146 - 359
Target Start/End: Original strand, 5899734 - 5899945
Alignment:
Q  146 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 245  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5899734 gttgattcaccttgg-aaacactattagggttg-agtctcttggttacgggaagtgattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 5899831  T
Q  246 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaa 345  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  5899832 cccattgatttctctttgcaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 5899931  T
Q  346 ttcctttgtgttct 359  Q
    ||| ||||||||||    
T  5899932 ttcttttgtgttct 5899945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 98 - 359
Target Start/End: Original strand, 6484372 - 6484634
Alignment:
Q  98 gggtttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacggg 196  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  6484372 gggtttgtgtagagtttgtctcttcggcaacaaataccggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggtttg-agtctcttggttacggg 6484470  T
Q  197 aagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggaggg 295  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |  ||||||||||||||| |  ||||||    
T  6484471 aagagattggggttttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattgatatcttttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggaggg 6484570  T
Q  296 ctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6484571 ctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 6484634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 49 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 890064 - 889779
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgaaggt 147  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||    
T  890064 gagatagaggaagctgaaacaagggtttagaatggcaacaa--aacctagggtttgtatagagtttgtctatttggcaacaaacactggggtttgatggt 889967  T
Q  148 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  889966 tgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagag-ttggggctttgggtagaattaggcaggagagttattcttgtaacc 889869  T
Q  248 cattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgg 336  Q
    || |||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  ||||||||| | |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  889868 cactgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgatttctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgg 889779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 149 - 391
Target Start/End: Original strand, 11168165 - 11168407
Alignment:
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11168165 gattcaccttgggaaacactattaggattg-agtgtcttggttacgggaagaggctgggaatttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaaccc 11168263  T
Q  249 attgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||    
T  11168264 attgatttctcttttgtaacgttacttatcatatattggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaacttggtcaacaaatt 11168363  T
Q  348 cctttgtgttcttcttcttc-ttttgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11168364 cttttgtgttcttc-tcttctttttgttcttctcgccgttgtttt 11168407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Original strand, 23633383 - 23633727
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| | ||||      ||||||| ||||| |||||||| |||||||   |||||| |||||||||||    
T  23633383 acttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttga------gatagagagggctaaaacaaggatttagaagc-caacaagaaaactagggt 23633475  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23633476 ttgtatagtgtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgatttacc--gggaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagag 23633569  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||| |  |||||||||||    
T  23633570 attgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccgatgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtgaaaaggagggctgct 23633669  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||| |||||||||||||||  || ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  23633670 ctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaaatgggtaaacaaattcttttgtgttct 23633727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 49 - 348
Target Start/End: Original strand, 31151312 - 31151608
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggt 147  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||| |  |||    
T  31151312 gagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaat-caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacaccagggttgg--ggt 31151407  T
Q  148 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31151408 tgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaacc 31151506  T
Q  248 cattgatttctc-tttgtaacgaaactca-tcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |  |||| |||| ||||||| |  ||||| |  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||| |||||    
T  31151507 c--tgatatctcttttgtaaagttactcattgttatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagttttgggctgaactgggtaaacaa 31151604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 50 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 54691865 - 54691559
Alignment:
Q  50 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttg 149  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  54691865 agatagaggggg-taaaacaaggttttagaaaggcgacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttg 54691767  T
Q  150 attcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||  | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  54691766 attcaccttgggaaacactattaggatt-gaattttttggttatgggaagagattagggctttgagttgaattaggcgggagacttattcttgtatttca 54691668  T
Q  250 ttgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattc 348  Q
    ||||| |||| |||||||||  || |||||||||||  |  ||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||| || ||||| |||| ||||||||    
T  54691667 ttgatatctcttttgtaacgttacccatcatatagttaaacggagggctgctctctcccctagactatgtcaatttgaactgaactaggtcgacaaattc 54691568  T
Q  349 ctttgtgtt 357  Q
     ||| ||||    
T  54691567 ttttatgtt 54691559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 136 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 25688367 - 25688143
Alignment:
Q  136 gggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagactt 235  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25688367 gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactt 25688269  T
Q  236 attcttgtaacccattgatttctc-tttgt-aacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaac 333  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||  || |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  25688268 attcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaac 25688169  T
Q  334 tgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||||| || ||| ||||||||||    
T  25688168 tgggtcaaaaagttcttttgtgttct 25688143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 177
Target Start/End: Original strand, 41849065 - 41849244
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagat----agagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaacta 97  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  41849065 acttttactataaatatagacattgtatcaggctaaactttgagagagagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaataacaacaacaaaacta 41849164  T
Q  98 gggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 177  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41849165 gggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaactctattaggatt 41849244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 246
Target Start/End: Original strand, 28180948 - 28181182
Alignment:
Q  3 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtt 102  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| | ||||      ||||||||||||||||| |  ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  28180948 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttga------gatagagggggctgaaata--ggtttagaaagacaacaacaaaactagggtt 28181039  T
Q  103 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaga 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  28181040 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactgggatttgagggttgattcactttgggaaacaccattaggatt-gagtctattggttacgggaagaga 28181138  T
Q  203 ttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 246  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  28181139 ttgggactttggatagaattaggcgggagacgtattcttataac 28181182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 49 - 344
Target Start/End: Original strand, 53591159 - 53591442
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||           |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  53591159 gagatagaggaggctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactagggttt-----------gtctctttagaacaaacactagggtttgagggtt 53591247  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  53591248 gattcaccttgggaaacactattcgaatt-gagtctcttggttacgagaatagatttggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttctaatcc 53591346  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  | |||| |||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||    
T  53591347 attgatatctcatttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaagggatgctctct-ccccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaacaa 53591442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 106 - 359
Target Start/End: Original strand, 4666535 - 4666788
Alignment:
Q  106 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 205  Q
    |||| |||||||||||   |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  4666535 atagggtttgtctcttgacaacagacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattatgattg-agtctctaggttacgggaagagattg 4666633  T
Q  206 agactttgggtagaattaggcgggaga--cttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  ||||||||||||    
T  4666634 agactttgggtagaattaggcgggagatccttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctc 4666733  T
Q  302 tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |   |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4666734 t---ccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttct 4666788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 133 - 359
Target Start/End: Original strand, 6231849 - 6232074
Alignment:
Q  133 ctagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaga 232  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  6231849 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagtgttg-agtctcttggttacgggaagagattggga-tttgggtagaattaggcgggaga 6231946  T
Q  233 cttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccg 330  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| || ||| ||  ||||||||||| |||||||| || |||||||  ||||||||    
T  6231947 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagctactcatcattacagt-gaacggagggctgctgtctccccccgattaggtcaatttggaccg 6232045  T
Q  331 aactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6232046 aactgggtcaacaaattcttttgtgttct 6232074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 338
Target Start/End: Original strand, 53597164 - 53597491
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||      ||||||||||  ||||||||||||||| ||   |||||| ||||||||||     
T  53597164 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttga------gatagagggga-tgaaacaagggtttataagt-caacaagaaaactagggg 53597255  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||| ||    
T  53597256 ttgtatagagttt-tctcttggcaacaaacactagggtt-gaag-ttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggtcatgagaatag 53597351  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgc 299  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||| |  |||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  53597352 attgagattttgagtagaattaggcaagagacttattcttgtaacccgttgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggagggttgc 53597451  T
Q  300 tctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggt 338  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  53597452 tctctcccacaaactaggtcagtattggaccgaattgggt 53597491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 92 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 562024 - 561769
Alignment:
Q  92 aaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt 191  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  562024 aaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacaaacactagggttc--aggttgattcacattgggaaacactattaggattt-agtctcttggtc 561929  T
Q  192 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc-tctttgtaacgaaactcatca-tatagtggatt 289  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| || | ||||||| |  |||||||| |||||||||      
T  561928 acgtgaagagattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaagtcattgatatcttttttgtaaagttactcatcattatagtggaac 561829  T
Q  290 ggagggctgctctctccc-ccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||    
T  561828 gaagggctgctctctccctccagactaggtcagttttggaccgaaccgggtaaacaaatt 561769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 92 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 13420432 - 13420189
Alignment:
Q  92 aaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt 191  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  13420432 aaactagggtttgtatagagttt-tctctaggcaacaaacactagggtt-ga--gttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggtc 13420338  T
Q  192 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggatt 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |  |||||| | |||| ||||      
T  13420337 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcattattataatggaac 13420238  T
Q  290 ggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggt 338  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  13420237 ggagagctgctctct-caccagactaggtcagttttggaccgaaatgggt 13420189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 27635920 - 27635641
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||             
T  27635920 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgcaaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggt--------- 27635830  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
              |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||            ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  27635829 ----------gggaaacaatattaagattg-agtctcttggttacggg------------ctttgggtaaaattaggcgggagactttttcttgtaactc 27635753  T
Q  249 attgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||||  ||||||| ||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  27635752 attgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 27635653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 49 - 262
Target Start/End: Original strand, 23636991 - 23637199
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||  ||||    
T  23636991 gagatagaggaggctaaaacaagggtttagaagc-caacaagaaaactagggtttgtatagagtctg-ctcttggcaacaaacactagggtttg--ggtt 23637086  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23637087 gatttaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttgttcatgggaagatattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 23637185  T
Q  249 attgatttctcttt 262  Q
    |||||| |||||||    
T  23637186 attgatatctcttt 23637199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 57 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 36871583 - 36871295
Alignment:
Q  57 gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcacc 156  Q
    ||||||||||||||||||||| ||   |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||| | |  ||||||||||    
T  36871583 gggggctgaaacaagggtttacaagc-caacaagaaaactagggcttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacaccagggttagga--ttgattcacc 36871488  T
Q  157 ttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatt 255  Q
    |||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||| ||||| ||| |     
T  36871487 ttggaaaacactgttaagattg-agtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgtta 36871389  T
Q  256 tctctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    ||||||||||| |  | |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  36871388 tctctttgtaaagttaatcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacgaatt 36871295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 49 - 262
Target Start/End: Original strand, 54884121 - 54884330
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54884121 gagatagagggagctcgaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagaatttgta--gagtttgtttctttggaacaaacactagggtttgatggtt 54884218  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||| |     
T  54884219 gattcatcttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacagaaagagattgaaactttgaatagaattaggagggagacttatt-ttgtaatct 54884316  T
Q  249 attgatttctcttt 262  Q
    |||||| |||||||    
T  54884317 attgatatctcttt 54884330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 49 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28137588 - 28137415
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||           |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  28137588 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag-----------agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaggatt 28137500  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagact 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||    
T  28137499 gattcaccttgggaaacactattagga-tgaagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcggaagact 28137415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 92 - 359
Target Start/End: Original strand, 17795269 - 17795533
Alignment:
Q  92 aaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt 191  Q
    ||||||| || ||||||||||||| || || | |||||||||||||||| |   |||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||     
T  17795269 aaactagagtctgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggttgg---gttgattcactttgggaaaaactattaggattg-agtctcttggtc 17795363  T
Q  192 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggatt 289  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||| || |      
T  17795364 acggaaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaac 17795463  T
Q  290 ggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||| | ||| |||||||||  |||||||||    
T  17795464 ggaaggctgctctctcccctagactaggtcaatttgaaccgaattaggtaaacaaattctcttgtgttct 17795533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 92 - 359
Target Start/End: Original strand, 19103709 - 19103973
Alignment:
Q  92 aaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt 191  Q
    ||||||| || ||||||||||||| || || | |||||||||||||||| |   |||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||     
T  19103709 aaactagagtctgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggttgg---gttgattcactttgggaaaaactattaggattg-agtctcttggtc 19103803  T
Q  192 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggatt 289  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||| || |      
T  19103804 acggaaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaac 19103903  T
Q  290 ggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||| | ||| |||||||||  |||||||||    
T  19103904 ggaaggctgctctctcccctagactaggtcaatttgaaccgaattaggtaaacaaattctcttgtgttct 19103973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 92 - 254
Target Start/End: Original strand, 25635391 - 25635549
Alignment:
Q  92 aaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt 191  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||| | |  ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  25635391 aaactagggtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttggga--ttggttcaccttgggaaacactattaggattt-agtctcttggtc 25635486  T
Q  192 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25635487 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgat 25635549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 278 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 53894121 - 53894006
Alignment:
Q  278 atatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttct 376  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53894121 atatattggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttctttgtgttct 53894022  T
Q  377 tctcgccgttgttttt 392  Q
    ||||||||||||||||    
T  53894021 tctcgccgttgttttt 53894006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 142
Target Start/End: Original strand, 11163073 - 11163207
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||   || ||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11163073 acttttacgataaatatagaccttgtatcagagcaaactttga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 11163166  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttg 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11163167 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttg 11163207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 213 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 47701801 - 47701654
Alignment:
Q  213 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  47701801 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccag 47701702  T
Q  312 actaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    | |||||||  ||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  47701701 attaggtcaatttggatcgaactggatcaacaaattcttttgcgttct 47701654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 85 - 254
Target Start/End: Original strand, 1673975 - 1674140
Alignment:
Q  85 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtct 184  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||| | |  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  1673975 aacaagaaaactagtgtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttagga--ttgattcaccatgggaaacactattaggattg-agtct 1674070  T
Q  185 cttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 254  Q
    |||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  1674071 cttgatcacgggaagagattgggactttgggtagaaatagacgggagacttattcgtgtaaccctttgat 1674140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 147 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 1620657 - 1620457
Alignment:
Q  147 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | || ||  |||||||||    
T  1620657 ttgattcaccttggaaaacactattaggattag-gtcttttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaaggctagttcttgtaa 1620559  T
Q  246 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaaca 343  Q
    ||| ||||| |||||||||||    |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||    
T  1620558 ccctttgatatctctttgtaaacttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcagtattggaccaaactaggtgaaca 1620459  T
Q  344 aa 345  Q
    ||    
T  1620458 aa 1620457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 47701928 - 47701798
Alignment:
Q  3 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtt 102  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| | ||||      |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47701928 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttga------gataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 47701835  T
Q  103 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggt 139  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  47701834 tgtatagagtttgtctatttggaacaaacaccagggt 47701798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 163 - 359
Target Start/End: Original strand, 3306839 - 3307034
Alignment:
Q  163 aacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tt 261  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  3306839 aacactattaggattg-agtctcttggttacagaaagatattggagttttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttt 3306937  T
Q  262 tgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||| |  |||||||| ||||||| |  ||| || ||||||||  || |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  3306938 tgtaaagttactcatcattatagtgaaaaggatggttgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactaggttaacaaattcttttgtgttct 3307034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 49 - 138
Target Start/End: Original strand, 6231413 - 6231502
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggg 138  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  6231413 gagatagagcgggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactaggg 6231502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 165 - 369
Target Start/End: Original strand, 10897008 - 10897210
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 263  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  10897008 cactattaggattg-attctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 10897102  T
Q  264 taacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||| |||||||||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  10897103 taaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc--ttgtgttct 10897200  T
Q  360 tcttcttctt 369  Q
    ||||||||||    
T  10897201 tcttcttctt 10897210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 165 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 29914132 - 29913941
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  29914132 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 29914038  T
Q  264 taacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 360  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  29914037 taaagaaactcatcattatagtggatcgaagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc--ttgtgttctt 29913941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 192 - 347
Target Start/End: Original strand, 24181486 - 24181644
Alignment:
Q  192 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggatt 289  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |  |||||||| |||||||||      
T  24181486 acgggaaaagattgggactttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtggaac 24181585  T
Q  290 ggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    ||| | ||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||    
T  24181586 ggatgactgctctctcctccaaactaggtcagttttggaccgaattgggtaaacaaatt 24181644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 278 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 35919179 - 35919095
Alignment:
Q  278 atatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttct 362  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35919179 atatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 35919095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 162 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 10094256 - 10094073
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  10094256 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 10094162  T
Q  261 ttgtaacgaaactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  10094161 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 10094073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Original strand, 3306724 - 3306842
Alignment:
Q  4 ttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  ||| | |      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  3306724 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacct------agagatatagggggctgaaacaagggtttagaaatacaacaacaaaactaggattt 3306817  T
Q  104 gtatagagtttgtctctttggaaca 128  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  3306818 gaatagagtttgtctctttggaaca 3306842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 1736324 - 1736388
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1736324 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 1736388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 18552902 - 18552966
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18552902 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 18552966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 30709809 - 30709873
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30709809 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 30709873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 271 - 359
Target Start/End: Original strand, 41849245 - 41849333
Alignment:
Q  271 actcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41849245 actcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 41849333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 162 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 10100273 - 10100090
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||| |||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  10100273 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtaaaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 10100179  T
Q  261 ttgtaacgaaactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  10100178 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 10100090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 162 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 10201136 - 10200953
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  10201136 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 10201042  T
Q  261 ttgtaacgaaactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    ||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  10201041 ttggaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 10200953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 129 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 4560497 - 4560401
Alignment:
Q  129 aacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggc 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  4560497 aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagcctgttggttaccggaagagattggagctttgggtagaattaggc 4560401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 165 - 346
Target Start/End: Original strand, 54193229 - 54193410
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  54193229 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 54193323  T
Q  264 taacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    ||| ||||| |  |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  54193324 taaagaaacccatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 54193410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 8370505 - 8370569
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8370505 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 8370569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 27974971 - 27975035
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27974971 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 27975035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 27986465 - 27986529
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27986465 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 27986529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 281 - 344
Target Start/End: Original strand, 1417510 - 1417573
Alignment:
Q  281 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1417510 tagtggattggagggatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 1417573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 84 - 190
Target Start/End: Original strand, 24177278 - 24177380
Alignment:
Q  84 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 183  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  24177278 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtc 24177373  T
Q  184 tcttggt 190  Q
    |||||||    
T  24177374 tcttggt 24177380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 165 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 27762165 - 27761965
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  27762165 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 27762071  T
Q  264 taacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||| |||||||  |||| |||||||||  ||||  | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  27762070 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagaaccgctctatcccccaaactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc--ttgtgttct 27761973  T
Q  360 tcttcttc 367  Q
    ||||||||    
T  27761972 tcttcttc 27761965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 165 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 47878350 - 47878167
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  47878350 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 47878256  T
Q  264 taacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaattc 348  Q
    ||| |||||||||  ||| ||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  47878255 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcctccagactaggtcattattagaccgaactgggtaaacaaattc 47878167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 162 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 10208182 - 10207999
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  10208182 aaacactattacgattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 10208088  T
Q  261 ttgtaacgaaactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  10208087 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccgcagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 10207999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 162 - 346
Target Start/End: Original strand, 27544273 - 27544456
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||  |||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  27544273 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagcgtggaactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 27544367  T
Q  261 ttgtaacgaaactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  27544368 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctccctcagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 27544456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 280 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 48438282 - 48438221
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaa 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48438282 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaa 48438221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 165 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 10595213 - 10595020
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 263  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| |||||| |||| ||   || ||||||||    
T  10595213 cactattaggatta-agtctcttggtcacgggaagaggctgagactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttataactca---atatctctttg 10595119  T
Q  264 taacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||| |||||||||  ||| ||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  10595118 taaagaaactcatgtcattatagtggaacggagagctgctctctcccccatactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc--ttgtgttct 10595021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 222
Target Start/End: Original strand, 13419883 - 13420015
Alignment:
Q  84 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 183  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||    
T  13419883 caacaagaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttggga--ttgattcaccttgggaaacactattagga-tcaagtc 13419976  T
Q  184 tcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaatt 222  Q
    ||||||| |||| |||||||| | | |||||||||||||    
T  13419977 tcttggtcacggaaagagattcaaattttgggtagaatt 13420015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 14634638 - 14634523
Alignment:
Q  147 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   | ||||| ||||||||||    
T  14634638 ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gtgtctcttagtcacgagaagagattgagactttgggtagcattaggtttgaagactgattcttgtaa 14634540  T
Q  246 cccattgatttctcttt 262  Q
     || ||||| |||||||    
T  14634539 acctttgatatctcttt 14634523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 16264418 - 16264354
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16264418 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 16264354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 21711291 - 21711227
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21711291 atagtggatttgagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 21711227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 162 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 22626166 - 22625982
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaga-cttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || | || ||||||| ||| ||||    |||||    
T  22626166 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaaaactgattcttgaaactcatta---tctct 22626072  T
Q  261 ttgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| |||||||||  ||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  22626071 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagaactgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 22625982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 32143389 - 32143325
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32143389 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 32143325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 33386685 - 33386749
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33386685 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaa 33386749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 281 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 37466358 - 37466295
Alignment:
Q  281 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37466358 tagtggattggagggctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgtgtcaacaa 37466295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 346
Target Start/End: Original strand, 54188512 - 54188692
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 263  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  54188512 cactattagaattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 54188606  T
Q  264 taacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    ||| |||||||||  ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  54188607 taaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctct-ccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 54188692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 26299056 - 26298992
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26299056 atagtagattggagggctgctctctcccccagattatgtcatattgaaccgaactgggtcaacaa 26298992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 27453026 - 27452962
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27453026 atagtggattggagagctgctctctcccccggattaggtcatattggaccgaactggatcaacaa 27452962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 36029161 - 36029097
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36029161 atagtggattggagagctgctttctcccccagattaggtcatattggacagaactgggtcaacaa 36029097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 170 - 348
Target Start/End: Original strand, 4535622 - 4535801
Alignment:
Q  170 ttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 268  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||||||| |    
T  4535622 ttaggattg-agtctcttggttacgggaagaggttggga-attgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgtaaag 4535716  T
Q  269 aaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcc-cccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattc 348  Q
    ||||||  |||| |||||||||   ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  4535717 aaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcctcccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc 4535801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 10612957 - 10612774
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 263  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| |||||| |||| ||   || ||||||||    
T  10612957 cactattaagattg-agtttcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttataactca---atatctctttg 10612863  T
Q  264 taacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattc 348  Q
    ||| |||||||||  ||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  10612862 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc 10612774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 281 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 25795848 - 25795785
Alignment:
Q  281 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25795848 tagtagattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 25795785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 162 - 346
Target Start/End: Original strand, 6303310 - 6303493
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||| | |||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  6303310 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtatagttaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 6303404  T
Q  261 ttgtaacgaaactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||| |||||||    
T  6303405 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattaaaccaaactgggtaaacaaat 6303493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 179 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 46966816 - 46966624
Alignment:
Q  179 gagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcat 276  Q
    |||||||||| | |||| || ||||| | |||||||||||||||||||   || |||| ||| ||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  46966816 gagtctcttgctcacggaaaaagattcgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattattgtaaccatttgatatctctttgtaaagaaactcat 46966717  T
Q  277 ca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtc-atattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttct 368  Q
    || |||||||||   ||| ||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||| ||| ||| | ||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  46966716 cattatagtggaacagagagctgccctct-ccccagagtaggtcaatattggactgaattggataaacaaattattttgcgttcttcttcttct 46966624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 3716021 - 3716085
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3716021 atagtagattggagagctgctctctctcctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 3716085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 162 - 360
Target Start/End: Original strand, 5858546 - 5858739
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || |||||    
T  5858546 aaacactattaggattg-agtct--tggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctct 5858638  T
Q  261 ttgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgt 356  Q
    |||||| |||||||||  ||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||  ||||||    
T  5858639 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcagagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaact-ggtaaacaaattc--ttgtgt 5858735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 6794732 - 6794796
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  6794732 atagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggacctaaccgggtcaacaa 6794796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 40592801 - 40592865
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40592801 atagtcgattggagagcttctctctcccacagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 40592865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 47923925 - 47923989
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47923925 atagtagattgaagggctgctctctcccctagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaa 47923989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 179 - 367
Target Start/End: Original strand, 13893478 - 13893666
Alignment:
Q  179 gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactc--a 275  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||   | ||||| ||||||||||||| |  || ||||||||||| |||||||  |    
T  13893478 gagtctcttggtcacgggaagagattgagac-ttgggtaaaattaggtttgaagactgattcttgtaaccc-tcaatatctctttgtaaagaaactcata 13893575  T
Q  276 tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttc 367  Q
    ||| |||||||||   ||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||||||    
T  13893576 tcattatagtggaacagagagcttctctctcccccagagtaggtcattattaga-cgaactgggtaaacatattc--ttgtgttctccttcttc 13893666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 92 - 190
Target Start/End: Original strand, 25633930 - 25634024
Alignment:
Q  92 aaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggt 190  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| | |  | |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  25633930 aaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggctgg--gattgattcaccttgggagacattattaggatt-gagtctcttggt 25634024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 10949438 - 10949239
Alignment:
Q  166 actattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 264  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||  |||| |||| ||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  10949438 actattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctggaactt-gggttgaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 10949344  T
Q  265 aacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 360  Q
    || |||||||||  ||| ||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| | |||||||||  |||||||||     
T  10949343 aaagaaactcatatcattataatggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagactgaactggataaacaaattc--ttgtgttctc 10949246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 48390368 - 48390281
Alignment:
Q  279 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttc 367  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||    
T  48390368 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattaaaccgaactgggtaaacaaattc--ttgtgttctccttcttc 48390281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 15823763 - 15823625
Alignment:
Q  230 agacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtc-atattgga 327  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||  | || ||||||||||| || ||| || ||| ||||||||    
T  15823763 agactaattcttgtaaccctttgacatctctttgtaaagaaactcttcattatagtggaacgtagagctgctctctctccaagagtaagtcaatattgga 15823664  T
Q  328 ccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttct 368  Q
    ||||| ||||| |||||||||  |||| || ||||||||||    
T  15823663 ccgaattgggtaaacaaattc--ttgtatttttcttcttct 15823625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 363
Target Start/End: Original strand, 16996875 - 16997078
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| || ||||||||||||||||   || |||| |||||| |||  |  | || |||||    
T  16996875 aaacactgttaggattg-agtctcttggtcacggaaagaaattggga-tttgggtagaattaggtttgaagactaattcttataattctctaatatctct 16996972  T
Q  261 ttgtaac-gaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgtt 357  Q
    ||||||  ||||| |||||| ||||||||  ||||  |||||| |||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||| |||||||||  |||||||    
T  16996973 ttgtaaaagaaacacatcattatagtggaacggagaactgctcactcccccagactaggtaagtatgggactgaactgggtaaacaaattctcttgtgtt 16997072  T
Q  358 cttctt 363  Q
    ||||||    
T  16997073 cttctt 16997078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 338
Target Start/End: Original strand, 25929463 - 25929519
Alignment:
Q  281 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggt 338  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  25929463 tagtggattggagggctgctctc-cccccagagtaggtcgtattggaccgaactgggt 25929519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 20031497 - 20031296
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||| |||||||   || |||  ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  20031497 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtaaaattaggtttgaagaccgattcttgtaactca---atatctctttg 20031403  T
Q  264 taacgaaactcat--cat-atagt-ggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 358  Q
    ||| |||||||||  ||| ||||| |||  |||| |||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  20031402 taaagaaactcatatcattatagttggaacggagagctgctctctccccaagactaggtcatcattaaaccgaactgggtaaacaaattc--ttgtgttc 20031305  T
Q  359 ttcttcttc 367  Q
    | |||||||    
T  20031304 tccttcttc 20031296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 26928620 - 26928683
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  26928620 atagtggattggagagttgctctctcccccagattaggtcatattgg-ctgaactgggtcaacaa 26928683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 39040011 - 39040075
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| | || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39040011 atagtggattggagagttgttctcttccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 39040075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 40844719 - 40844656
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  40844719 atagtggatttgagggctgctctctcccc-agattaggtcatattggaccgaactgaatcaacaa 40844656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 344
Target Start/End: Original strand, 3328376 - 3328439
Alignment:
Q  281 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  3328376 tagtggattgaagggctgctctctcctctagattaggtcatattggaatgaactgggtcaacaa 3328439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 11007679 - 11007545
Alignment:
Q  179 gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatc 277  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||         | |||||||||| | ||||  |||| ||||||| |  |||||||    
T  11007679 gagtctcttggtcacaggaagagattgagactttgggtagaattagg---------ttttcttgtaactctttgacatctcttttgtaaagttactcatc 11007589  T
Q  278 a-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 320  Q
    | ||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  11007588 attatagtggaatggggggctcctctctcccctagactaggtca 11007545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 367
Target Start/End: Original strand, 11079517 - 11079721
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||  || ||||| || ||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || |||||    
T  11079517 aaacactatcaggattg-agtctcttggtcacgggaaaaggctgggacttagg-tagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctct 11079611  T
Q  261 ttgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccg-aactgggtcaacaaattcctttgtg 355  Q
    |||||| |||||||||  ||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || | ||| |||||||||  |||||    
T  11079612 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaaattaggtaaacaaattc--ttgtg 11079709  T
Q  356 ttcttcttcttc 367  Q
    |||| |||||||    
T  11079710 ttctccttcttc 11079721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 2 - 81
Target Start/End: Original strand, 1321364 - 1321437
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 81  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||   || ||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1321364 acttttactataaatatagactttgtatcagagcaaactttga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 1321437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 2671619 - 2671678
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  2671619 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 2671678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 7167308 - 7167249
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  7167308 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 7167249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 8477426 - 8477367
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  8477426 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 8477367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 8739096 - 8739155
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  8739096 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 8739155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 9091334 - 9091393
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  9091334 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 9091393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 147 - 225
Target Start/End: Original strand, 11066652 - 11066731
Alignment:
Q  147 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttgggtagaattagg 225  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  11066652 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgaa-tcttttgatcacgggaagagattcgggactttgggtagaattagg 11066731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 18656499 - 18656440
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  18656499 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 18656440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 22173216 - 22173275
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  22173216 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 22173275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 24695183 - 24695247
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24695183 atagcggattagagggttgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 24695247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 229 - 347
Target Start/End: Original strand, 25634030 - 25634150
Alignment:
Q  229 gagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattgg 326  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  | | ||||||||||||| |||||||||| ||  |||     
T  25634030 gagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgaatggctgctctctccaccagactaggacaatttgc 25634129  T
Q  327 accgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||||||| ||| ||||||||    
T  25634130 accgaactaggtaaacaaatt 25634150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 40372828 - 40372887
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  40372828 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 40372887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 6719446 - 6719358
Alignment:
Q  1 gacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatcttt--------gaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||        || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6719446 gacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagagagagagagatagagggggctgaaataagggtttagaaa 6719358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 347
Target Start/End: Original strand, 1674169 - 1674227
Alignment:
Q  290 ggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  1674169 ggatggctgctctctccaccagactaggtcagtattagaccgaactgggtaaacaaatt 1674227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 327
Target Start/End: Original strand, 3323710 - 3323756
Alignment:
Q  281 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattgga 327  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  3323710 tagtggattggagggctgttctctctcccagattaggtcatattgga 3323756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 367
Target Start/End: Original strand, 38002869 - 38003072
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||||||| |   || |||| ||||||||||| ||   || |||||    
T  38002869 aaacaccattaggtttg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaagtttgaagactgattcttgtaactca---atatctct 38002963  T
Q  261 ttgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgt 356  Q
    |||||| |||||||||  ||| ||||||||   ||| | || |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||||  ||||||    
T  38002964 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagatgttctctccctcagactaggtcatcattagaccgaactgcgtaaacaaattc--ttgtgt 38003061  T
Q  357 tcttcttcttc 367  Q
    ||| |||||||    
T  38003062 tctccttcttc 38003072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 47883064 - 47882878
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   |  |||||    
T  47883064 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---aaatctct 47882970  T
Q  261 ttgtaacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattc 348  Q
    |||||| |||||||  |||| |||||||||    |  |||||||||||||| |||||| ||||| ||| || |||||||||| |||||||||    
T  47882969 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacataaagctgctctctcccctagactaagtcatcattagatcgaactgggtaaacaaattc 47882878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 49 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 4560558 - 4560509
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactag 98  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||    
T  4560558 gagatagagggggctgaaacaatggtttataaaggtaacaacaaaactag 4560509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 129 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 7606873 - 7606828
Alignment:
Q  129 aacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattagg 174  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7606873 aacagtaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattagg 7606828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 2672952 - 2673011
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  2672952 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 2673011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 2677108 - 2677167
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  2677108 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 2677167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 4386950 - 4387010
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||  |||||||| |||||    
T  4386950 tggattggagagctgctctctcccccagagtaggtcatactgaactaaactgggtaaacaa 4387010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 8512281 - 8512222
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  8512281 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 8512222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 8517161 - 8517102
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  8517161 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 8517102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Original strand, 29813187 - 29813231
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29813187 tctctcccccagatttggtcatgttggaccgaactgggtcaacaa 29813231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 32475549 - 32475490
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  32475549 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 32475490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 32480407 - 32480348
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  32480407 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 32480348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Original strand, 40913417 - 40913461
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40913417 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 40913461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Original strand, 44331669 - 44331713
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  44331669 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 44331713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 281 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 1306015 - 1305953
Alignment:
Q  281 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  1306015 tagtggattggagagctgctatctcccctagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 1305953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 162 - 225
Target Start/End: Original strand, 16462203 - 16462264
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  16462203 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16462264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 2 - 37
Target Start/End: Original strand, 42990205 - 42990240
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaa 37  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42990205 acttttactataaatatagaccttgtatcatgctaa 42990240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 147 - 225
Target Start/End: Original strand, 7768632 - 7768709
Alignment:
Q  147 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 225  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||   | ||||  |||||| |||||||||||    
T  7768632 ttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttgctcacgggctaaaattggaactttgagtagaattagg 7768709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 9666531 - 9666466
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggct-gctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| | | | ||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  9666531 atagtggattggagagattgatctctcccccagattaggtaaagttggaccgaactgggtcaacaa 9666466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 31
Target Start/End: Original strand, 18162587 - 18162616
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatca 31  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18162587 acttttactataaatatagaccttgtatca 18162616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 31021361 - 31021300
Alignment:
Q  125 aacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttg 188  Q
    |||||||||||||||| | |  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31021361 aacaaacactagggttggga--ttgattcaccttggagaaacactattaggatt-gagtctcttg 31021300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 359
Target Start/End: Original strand, 42992607 - 42992660
Alignment:
Q  306 ccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||    
T  42992607 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaaaaaattcttttgtattct 42992660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 30
Target Start/End: Original strand, 5191576 - 5191604
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatc 30  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5191576 acttttactataaatatagaccttgtatc 5191604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Original strand, 16499153 - 16499197
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  16499153 tctctcccccagagtaggttaagttggaccgaactgggtcaacaa 16499197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 23391953 - 23391909
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  23391953 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 23391909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 29196430 - 29196386
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  29196430 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 29196386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #202
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Original strand, 30236249 - 30236293
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  30236249 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaa 30236293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #203
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 304 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 32744476 - 32744436
Alignment:
Q  304 tcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  32744476 tcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 32744436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #204
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 39153405 - 39153361
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  39153405 tctctcccccagattaggtcaagttggactgaactgggtcaacaa 39153361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #205
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Original strand, 40734622 - 40734666
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40734622 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 40734666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #206
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 340
Target Start/End: Original strand, 40735507 - 40735547
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtca 340  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  40735507 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtca 40735547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #207
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Original strand, 51398938 - 51398982
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  51398938 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaacttggtcaacaa 51398982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 154)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 2 - 383
Target Start/End: Original strand, 15552178 - 15552564
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagag----agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaacta 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15552178 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagatagaggggactgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaacta 15552277  T
Q  98 gggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacggga 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15552278 gggtttgtatagagtttatctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttgattacggga 15552377  T
Q  198 agagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggct 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15552378 agagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggct 15552477  T
Q  298 gctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgcc 383  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15552478 gctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctcgcc 15552564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 391
Target Start/End: Original strand, 31542677 - 31543060
Alignment:
Q  1 gacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    || ||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31542677 gacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg 31542770  T
Q  101 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31542771 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 31542870  T
Q  201 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31542871 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctcg-aacccattgatttctctttgtaacagtactcatcatatagtggattggagggctgct 31542969  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttttgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31542970 ctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttgttcttcttttgttctcctcgccgttgtttt 31543060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 391
Target Start/End: Original strand, 31545022 - 31545409
Alignment:
Q  1 gacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    || ||||||      |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31545022 gacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttga------gataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg 31545115  T
Q  101 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31545116 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattagagtctcttggttacgggaaga 31545215  T
Q  201 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31545216 aattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacagtactcatcatatagtggattggagggctgct 31545315  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtg---ttcttcttcttcttttgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31545316 ctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttcttcttttgttcttctcgccgttgtttt 31545409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Original strand, 27912473 - 27912862
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27912473 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggtgctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 27912572  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  27912573 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaataataggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagag 27912671  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   |||  |||||    
T  27912672 gctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacagagaactgct 27912771  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27912772 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 27912862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 31179708 - 31179328
Alignment:
Q  1 gacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||    || ||||||      ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31179708 gacttttactataaatatagacattgtatcaaagcaaactttga------gatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg 31179615  T
Q  101 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31179614 tttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 31179515  T
Q  201 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31179514 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattcatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 31179415  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtt 389  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  31179414 ctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt--tctgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgtt 31179328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 4 - 391
Target Start/End: Original strand, 18466625 - 18467010
Alignment:
Q  4 ttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18466625 ttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttga--gagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 18466722  T
Q  104 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 203  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||      
T  18466723 ggatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacggaaagaggc 18466821  T
Q  204 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 302  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||  |||| ||||||||    
T  18466822 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatataatggaacggagagctgctct 18466921  T
Q  303 ctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18466922 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgttttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 18467010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 46 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 34479717 - 34479371
Alignment:
Q  46 agagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaag 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  34479717 agagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgg 34479618  T
Q  146 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  34479617 gttgattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgta 34479518  T
Q  245 acccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  34479517 acccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 34479418  T
Q  345 attcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34479417 attcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 34479371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 46 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 34477352 - 34477006
Alignment:
Q  46 agagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaag 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  34477352 agagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgg 34477253  T
Q  146 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  34477252 gttgattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgta 34477153  T
Q  245 acccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  34477152 acccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 34477053  T
Q  345 attcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    ||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34477052 attctcttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 34477006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 21684797 - 21684405
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaacta 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  21684797 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaacta 21684698  T
Q  98 gggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacggga 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21684697 gggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcgccttgggatacactattaggattg-agtctcttggttacggga 21684599  T
Q  198 agagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggct 297  Q
    |||| ||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  21684598 agaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggct 21684499  T
Q  298 gctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttttgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || || |||||||||| ||||||||||    
T  21684498 gctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcgtttgtgttcttctcttttttgtgttcttctctccgttgtttt 21684405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Original strand, 25803959 - 25804350
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctt---tgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactag 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  25803959 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaatttgagagagagagagatagagggggctcaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactag 25804058  T
Q  99 ggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  25804059 ggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgagaa 25804157  T
Q  199 gagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggct 297  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  25804158 gagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggct 25804257  T
Q  298 gctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25804258 gctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattcttttgtgttctt-gtcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 25804350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 2 - 362
Target Start/End: Original strand, 27910388 - 27910747
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  27910388 acttttactataaatatagaccttgtatcaggttaaactttgagagagagatagcgggggctgaaacaagg-tttaaaaaggcaacaacaaaactagggt 27910486  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  27910487 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttacgggaagag 27910585  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||  |||| ||||||    
T  27910586 gctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatataatggaacggagagctgct 27910685  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttct 362  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27910686 ctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 27910747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 25921809 - 25921426
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  25921809 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggt 25921716  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25921715 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagag 25921617  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
      || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  25921616 gctgggactctgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagctgct 25921517  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25921516 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 25921426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 49 - 362
Target Start/End: Original strand, 2174903 - 2175215
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||    
T  2174903 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 2175002  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2175003 gattcaccttgggaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 2175101  T
Q  249 attgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattc 348  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  2175102 attgatttctctttgtaacgttacttatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 2175201  T
Q  349 ctttgtgttcttct 362  Q
     |||||||||||||    
T  2175202 ttttgtgttcttct 2175215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 10529435 - 10529051
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||   || ||||||      ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  10529435 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttga------gatagagtgggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggat 10529342  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10529341 ttttatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagag 10529243  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  10529242 attggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggaaggctgct 10529143  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattc-ctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10529142 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 10529051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Original strand, 18468950 - 18469335
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18468950 acttttactataaatatagaccttgtatcatgataaactttga--gagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 18469047  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18469048 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagag 18469146  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
      || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||  | || ||||||    
T  18469147 gctgggactttaggtagaattaggcgggagactttttcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatctagtggaacgaagagctgct 18469246  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    ||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18469247 ctct--cccagactaggtcaatttggaccgaactggattaacaaattcttttgcgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 18469335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 2 - 362
Target Start/End: Original strand, 38882048 - 38882402
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   || ||| || | ||||     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38882048 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagag-----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 38882142  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38882143 ttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagag 38882241  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 301  Q
      || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38882242 gctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 38882341  T
Q  302 tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttct 362  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38882342 tctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 38882402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 46 - 359
Target Start/End: Original strand, 6745050 - 6745362
Alignment:
Q  46 agagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaag 145  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  6745050 agagagataaagggggctgaaacaagtgtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacacta-ggtttgagg 6745148  T
Q  146 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6745149 gttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 6745247  T
Q  246 cccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6745248 cccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagacaaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 6745347  T
Q  345 attcctttgtgttct 359  Q
    |||| ||||||||||    
T  6745348 attcttttgtgttct 6745362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Original strand, 4236572 - 4236954
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   || ||| ||      |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4236572 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttgga------gataaagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 4236665  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4236666 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagag 4236764  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4236765 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 4236864  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  4236865 ctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaact-ggtcaataaattcttttgtgttcttc-tcttatttgtgttcttctcaccgttgtttt 4236954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 2 - 371
Target Start/End: Original strand, 6747247 - 6747609
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcag-gctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaggg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||     || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6747247 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaa-----gagaaagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagag 6747341  T
Q  101 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 200  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6747342 tttgtataaaatttgtctctttgaaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaga 6747439  T
Q  201 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  6747440 gactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctttttgtaacgttactcgtcatatagtggatcggagggctgct 6747539  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttctttt 371  Q
    ||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  6747540 ctctctctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tcttcttctttt 6747609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 5 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 18511547 - 18511197
Alignment:
Q  5 tttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  18511547 tttaatataaatatagaccttgtatcagactaaactttga----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttg 18511452  T
Q  105 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt 204  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18511451 tatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagatt 18511353  T
Q  205 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctc 303  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  18511352 gggactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctc 18511253  T
Q  304 tcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  18511252 tcccctagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 18511197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Original strand, 39854427 - 39854777
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||   || ||||||      |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39854427 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttga------gatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 39854519  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  39854520 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcatggttacgggaagag 39854618  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39854619 actggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgctactcatcatatagtggatcggagggctgct 39854718  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  39854719 ctctcccccagactagatcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 39854777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Original strand, 21947970 - 21948320
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||      |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  21947970 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattttga------gatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggt 21948062  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  21948063 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagag 21948161  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
      || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  21948162 gctgggactttgggtggaattaggcgggagacttattcttgtaaccccttgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgct 21948261  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21948262 ctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 21948320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 3 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 1189949 - 1189592
Alignment:
Q  3 cttttactataaatatagaccttgtatcaggc-taatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  1189949 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttga--gagagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactacggt 1189852  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  1189851 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcactttgggaaacactattatgatt-gagtctcttggttacaggaagag 1189753  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgc 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |  |||||| | |||||||||  |||||| |||    
T  1189752 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtggaacggagggatgc 1189653  T
Q  300 tctctcc-cccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1189652 tctctcctcccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 1189592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Original strand, 16776142 - 16776451
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||    
T  16776142 gagatagagggggctgaaacaagggtttacaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaataaacactagggtttgtgggtt 16776241  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16776242 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa-cc 16776339  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  16776340 attgatttctcttttgtaacgttacttatcatatagtggatcggagggctgctatctcccccagactatgccaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 16776439  T
Q  348 cctttgtgttct 359  Q
    | ||||||||||    
T  16776440 cttttgtgttct 16776451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 362
Target Start/End: Original strand, 10586782 - 10587129
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||       
T  10586782 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttga--gagagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactag--- 10586875  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 200  Q
            ||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||    
T  10586876 --------agtttgtctctttgggaacaaacgatagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattc-agtctcttgcttacggaaaga 10586966  T
Q  201 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10586967 gattgagactttgggtagaattaggcaggagacttattcttttaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 10587066  T
Q  301 ctct-cccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttct 362  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  10587067 ctctccccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttcttct 10587129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 5 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 18509652 - 18509303
Alignment:
Q  5 tttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    |||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  18509652 tttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttga----gagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttg 18509558  T
Q  105 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt 204  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  18509557 tatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagaat 18509459  T
Q  205 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct-ctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctc 303  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||  ||||||| |  ||||||||||||||| |  || |||||||||||    
T  18509458 gggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcgttgatatctattttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggtgggctgctctc 18509359  T
Q  304 tcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  18509358 tcccctagactaggtcaatttgaaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 18509303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 2818672 - 2818320
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||    
T  2818672 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactatggt 2818579  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaagg-ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |    
T  2818578 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtttgattcaccttggaaaacactattacgatt-gagtctcttggttacgggaaaa 2818480  T
Q  201 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgc 299  Q
    |  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||| ||||    
T  2818479 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggaggactgc 2818380  T
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  2818379 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 2818320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 49 - 347
Target Start/End: Original strand, 40221506 - 40221805
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  40221506 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggtt 40221605  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40221606 gattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacaggaagagattgggacttttggtagaattaggcggaagacttattcttgtaaccc 40221704  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  40221705 attgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 40221804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 161 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 3373320 - 3373090
Alignment:
Q  161 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3373320 gaaacactattaggattgaagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 3373221  T
Q  261 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3373220 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 3373121  T
Q  361 cttcttcttttgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3373120 cttcttcttttgctcttctcgccgttgtttt 3373090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 3 - 359
Target Start/End: Original strand, 25904047 - 25904397
Alignment:
Q  3 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtt 102  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| | ||||      |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  25904047 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggat 25904140  T
Q  103 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaga 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25904141 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaga 25904239  T
Q  203 ttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 301  Q
    ||  | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||  ||| ||||||||||| |  ||| | ||||||    
T  25904240 ttagggctttgagtataattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctctattgtaacgttacttatcatatagtgaaacggatgactgctc 25904339  T
Q  302 tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  25904340 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattattttgtgttct 25904397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 161 - 391
Target Start/End: Original strand, 10749796 - 10750025
Alignment:
Q  161 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10749796 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 10749895  T
Q  261 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 360  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10749896 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt-ctttgtgttctt 10749994  T
Q  361 cttcttcttttgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10749995 cttcttcttttgttcttctcgccgttgtttt 10750025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 47 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16092497 - 16092184
Alignment:
Q  47 gagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaagg 146  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  16092497 gagagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtctgtctctttgcaacaaacactagggtttgaggg 16092398  T
Q  147 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092397 ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 16092299  T
Q  247 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||  |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  |||||| |||||||||| | |||||||||||  || ||| ||||||| |||||||    
T  16092298 ccattgagatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctctcctctagactaggtcaatttagactgaactggatcaacaa 16092199  T
Q  345 attcctttgtgttct 359  Q
    |||| ||||||||||    
T  16092198 attcttttgtgttct 16092184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Original strand, 24126840 - 24127150
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||    
T  24126840 gagatagatggggctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgtcaacaaatactagggtttgaagatt 24126939  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  24126940 gattgaccttgggaaacactattaggatt-aagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgatagacttattcttgtaactc 24127038  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24127039 attgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 24127138  T
Q  348 cctttgtgttct 359  Q
    | ||||||||||    
T  24127139 cttttgtgttct 24127150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 353
Target Start/End: Original strand, 17072827 - 17073172
Alignment:
Q  3 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtt 102  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| | ||||      |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  17072827 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtt 17072920  T
Q  103 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaga 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  17072921 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttaggggaagaga 17073019  T
Q  203 ttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgct 300  Q
    ||| | |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||  |  |||||||||||    
T  17073020 ttggggctttcgatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtaaaacggagggctgct 17073119  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttg 353  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17073120 ctctcccccagactcggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 17073172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 6 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 10474655 - 10474308
Alignment:
Q  6 ttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 105  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||| | ||||||      |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  10474655 ttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgaaa------tagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgt 10474562  T
Q  106 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  10474561 atagagtttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgatacaccttgggaaacactattaagatt-gaatctcttggttacaggaagagattg 10474463  T
Q  206 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctct 304  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||| |  ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||    
T  10474462 ggactttgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttctaaggttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctct 10474363  T
Q  305 cccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  10474362 cccccatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 10474308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 49 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 31472908 - 31472584
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  31472908 gagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggtt 31472809  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | | ||||| ||||||    
T  31472808 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggatgcatcttcttctaaccc 31472710  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  |||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  31472709 attgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 31472610  T
Q  347 tcctttgtgttct-tcttcttctttt 371  Q
    || |||||||||| ||||||||||||    
T  31472609 tcttttgtgttctctcttcttctttt 31472584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 58 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 17818776 - 17818477
Alignment:
Q  58 ggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcacct 157  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  17818776 ggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagttcgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgatttacct 17818677  T
Q  158 tgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc 257  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17818676 tgggaaacactattaagact-gagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatc 17818578  T
Q  258 tc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgt 356  Q
    || ||||||| |  |||||||||| ||||||   |||||||  ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17818577 tcttttgtaaagttactcatcatacagtggaacagagggct--tctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 17818480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Original strand, 26097676 - 26098025
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||      ||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  26097676 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaactttga------gatagagggggctgaaataaaggtttagaatggcaacaacaaaactagggt 26097769  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |     
T  26097770 ttggatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttagagggttgattcacctt-ggaaacactattaggaat-gagtctcttggttacgggaaaat 26097867  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||   || |||||||    
T  26097868 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacaga-ggctgct 26097966  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26097967 ctctcctccagactaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 26098025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Original strand, 2954400 - 2954710
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgaaggt 147  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  2954400 gagatagaggagtatgaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgtgtataatttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggt 2954499  T
Q  148 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 247  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2954500 tgattcactttggaaaacactattaggattg-agtctcttagttacgagaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacgtattcttgtaacc 2954598  T
Q  248 cattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  2954599 cattgatatctctttgtaaagttactcatcatatagtgaagcggagggatgctctctcccccaaactaggtcaattttgaccgaactgggtcaacaaatt 2954698  T
Q  348 cctttgtgttct 359  Q
    | ||||||||||    
T  2954699 cttttgtgttct 2954710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 161 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 15354757 - 15354527
Alignment:
Q  161 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15354757 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 15354659  T
Q  261 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 360  Q
    ||||||||  |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15354658 ttgtaacgttactcattaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 15354559  T
Q  361 cttcttcttttgttcttctcgccgttgttttt 392  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  15354558 cttcttcttttgttcttctcacagttgttttt 15354527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 161 - 392
Target Start/End: Original strand, 23665140 - 23665370
Alignment:
Q  161 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23665140 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 23665238  T
Q  261 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 360  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23665239 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 23665338  T
Q  361 cttcttcttttgttcttctcgccgttgttttt 392  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  23665339 cttcttcttttgttcttctcacagttgttttt 23665370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 161 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 23793447 - 23793217
Alignment:
Q  161 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23793447 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 23793349  T
Q  261 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 360  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23793348 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 23793249  T
Q  361 cttcttcttttgttcttctcgccgttgttttt 392  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  23793248 cttcttcttttgttcttctcacagttgttttt 23793217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 132 - 362
Target Start/End: Original strand, 4410090 - 4410319
Alignment:
Q  132 actagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggag 231  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  4410090 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggag 4410188  T
Q  232 acttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccga 331  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4410189 acttattcttgtaacctattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcagattggaccga 4410288  T
Q  332 actgggtcaacaaattcctttgtgttcttct 362  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4410289 actgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 4410319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 161 - 391
Target Start/End: Original strand, 10757273 - 10757501
Alignment:
Q  161 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10757273 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgg-aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttttct 10757371  T
Q  261 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 360  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10757372 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattagaccgaactgggtcaacaaatt-ctttgtgttctt 10757470  T
Q  361 cttcttcttttgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10757471 cttcttcttttgttcttctcgccgttgtttt 10757501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Original strand, 6756478 - 6756786
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6756478 gagatagagggagctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 6756577  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  6756578 gattctccttgggaaacactattaggatt-gagtatcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa--c 6756674  T
Q  249 attgatttc-tctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| || | ||||||| |  || ||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||     
T  6756675 attgatatcttttttgtaaggttacacatcattatagt-gaaacgagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaaa 6756773  T
Q  347 tcctttgtgttct 359  Q
    || ||||||||||    
T  6756774 tcttttgtgttct 6756786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 358
Target Start/End: Original strand, 18596590 - 18596939
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | |||       |||||||||||||||||||||||| || | |  ||||||||||||||||||    
T  18596590 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgg------gatagagggggctgaaacaagggtataaaga--caacaacaaaactagggt 18596681  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18596682 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacaatatggtttgagggttgattcaccttggaaaacactgttaggatt-gagtctcttggttacgggaagag 18596780  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgc 299  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| ||||||    
T  18596781 attgggactttgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgc 18596880  T
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 358  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  18596881 tctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacagattcttttgtgttc 18596939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 161 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 15357033 - 15356803
Alignment:
Q  161 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15357033 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 15356935  T
Q  261 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 360  Q
    ||||||||  |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15356934 ttgtaacgttactcattaaatagtggatcggagggctgctctctcccccggactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 15356835  T
Q  361 cttcttcttttgttcttctcgccgttgttttt 392  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  15356834 cttcttcttttgttcttctcacagttgttttt 15356803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 87 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 658610 - 658341
Alignment:
Q  87 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctct 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  658610 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattagga-tcgagtctct 658512  T
Q  187 tggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtg 285  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  658511 tggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 658412  T
Q  286 gattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
     |  ||| |||||||||   |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  658411 aaacggatggctgctct---ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 658341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Original strand, 695873 - 696172
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  695873 gagataaagggggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat-----------ctttggaacaaacactagggtttgagggtt 695961  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  695962 gattcaccttgg-aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 696059  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| |||| ||||||| |  | |||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  696060 attgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccccagacaaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 696159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 36402664 - 36402313
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| | ||||      ||||||||||||||||||||||||||||||   |||  || ||||||||||    
T  36402664 acttttactataaatatagaccttatatcagagtaaacgttga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaatcacgaaactagggt 36402571  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||    
T  36402570 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaatactattaggatt-gaatctcttggttacgggaggag 36402472  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    ||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| |   || | |||||    
T  36402471 attggaactttgggtaaaattaggctggagacttattattgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagatgtctgct 36402372  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||||||||||||||||||  || || |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  36402371 ctctcccccagactaggtcaatttagatcgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 36402313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 161 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 38960314 - 38960084
Alignment:
Q  161 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38960314 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 38960216  T
Q  261 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 360  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38960215 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 38960116  T
Q  361 c-ttcttcttttgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    | || ||||||||||||||| | |||||||||    
T  38960115 cttttttcttttgttcttcttgtcgttgtttt 38960084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 168 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 23742034 - 23741811
Alignment:
Q  168 tattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaac 267  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23742034 tattaggattggagtctcttgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctctttgtaac 23741936  T
Q  268 gaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttc 367  Q
    |  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23741935 gttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttc 23741836  T
Q  368 ttttgttcttctcgccgttgttttt 392  Q
    ||||||||||||| | |||||||||    
T  23741835 ttttgttcttctcacagttgttttt 23741811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 31466314 - 31465974
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||      |||| | ||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  31466314 acttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttga------gataaaaggggctgaaacaaaggtttaaaaaagtaacgacaaaactagggt 31466221  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31466220 ttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacaccagggtttgacggttgattcaccttgagaaacagtattaggatt-gagtctcttggttacgggaagag 31466122  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct-ctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||| |  |||||||||||          |||||||||    
T  31466121 atttggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcatat----------agggctgct 31466033  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||| |||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  31466032 ctcacccccagactagttcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtattct 31465974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 39398287 - 39397978
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgaaggt 147  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  39398287 gagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacacta-ggtttgagggt 39398190  T
Q  148 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  39398189 tgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacggaaagagattggaactttgggtagaattaggcagtagacttattcttgtaacc 39398091  T
Q  248 cattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    ||||||| |||| ||||| |||  ||  || |||||||  |  ||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||| | ||    
T  39398090 cattgatatctcttttgtgacgttaccaattatatagtaaaacggatggctgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaaaacat 39397991  T
Q  347 tcctttgtgttct 359  Q
    || ||||||||||    
T  39397990 tcttttgtgttct 39397978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 49 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 37706075 - 37705776
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  37706075 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaaggcaacgacaaatctagggtttgtatagactttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 37705976  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37705975 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaaccc 37705877  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | ||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  37705876 attgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatggctattctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 37705777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 49 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 34530961 - 34530749
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  34530961 gagatagagggggctgaaacaagtgtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggtt 34530862  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  34530861 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggctacgggaagagattaggactttgagtagaattaggcgggagatttattcttgtaactc 34530763  T
Q  249 attgatttctcttt 262  Q
    |||||| |||||||    
T  34530762 attgatatctcttt 34530749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 12556259 - 12555908
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||      ||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||| ||    
T  12556259 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttga------gatagagggggctgaaataagggtttagaatgacaacaacaaaactagagt 12556166  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  12556165 ttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gtgtctcttggctacgggaagag 12556067  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgc 299  Q
    |||| || ||| ||||||||||| |  ||||||| |||||||||| |||||  || ||| |||||||||  ||||||| || || | |  ||||||||||    
T  12556066 attg-gagttttggtagaattagacaagagactttttcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcttaaagcgaaacggagggctgc 12555968  T
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    | ||||||||| ||||| |||  |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  12555967 tatctcccccatactagttcaatttggactgaactgggtcaataaattcttttgtgttct 12555908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 145 - 362
Target Start/End: Original strand, 39798127 - 39798344
Alignment:
Q  145 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39798127 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgtggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 39798225  T
Q  245 acccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 343  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||    
T  39798226 acccattgatttctcttttataatgatactcatcgtatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggatcgaactgggtcaaca 39798325  T
Q  344 aattcctttgtgttcttct 362  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  39798326 aattcttttgtgttcttct 39798344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 145 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 20506040 - 20505828
Alignment:
Q  145 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20506040 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 20505942  T
Q  245 acccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 343  Q
    || ||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20505941 acacattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctg--ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 20505844  T
Q  344 aattcctttgtgttct 359  Q
    ||||| ||||||||||    
T  20505843 aattcttttgtgttct 20505828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 49 - 224
Target Start/End: Original strand, 20043034 - 20043208
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  20043034 gagatagagggggctgaaacaagtgtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 20043133  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattag 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20043134 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttggatagaattag 20043208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Original strand, 21288748 - 21289055
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacac------tagggtttg 142  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||    
T  21288748 gagatagagggggttgaaataagggtttagaatagcaacaataaaaatagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttagggtttg 21288847  T
Q  143 aaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttg 242  Q
    | |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||| || ||||||    
T  21288848 agggttgattcacctt-gaaaacactattaggatt-gagtatcttggttacgggaagagattaggactttggatagaattaagcgggagattttttcttg 21288945  T
Q  243 taacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaac 342  Q
    |||| ||      ||| |||||||||  ||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  21288946 taactca------tct-tttgtaacgttactcatcttatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaac 21289038  T
Q  343 aaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||| ||||| ||||    
T  21289039 aaattcttttgttttct 21289055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 49 - 228
Target Start/End: Original strand, 20044994 - 20045172
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  20044994 gagacagagggggctgaaacaagggtttaggaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 20045093  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20045094 gattcaccttgggaaacactattatgatt-gagtctcttggttccgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgg 20045172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 132 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 41585956 - 41585729
Alignment:
Q  132 actagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggag 231  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  41585956 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactagtaggattg-agtctcttggctacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcaggag 41585858  T
Q  232 acttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccg 330  Q
    ||||||| ||||||  ||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  41585857 acttatttttgtaagtcattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccg 41585758  T
Q  331 aactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41585757 aactgggtcaacaaattcttttgtgttct 41585729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 127 - 359
Target Start/End: Original strand, 2723964 - 2724187
Alignment:
Q  127 caaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggc 226  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||    
T  2723964 caaacactagggtttgagggatgattcaccttgggaaacaccattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattg---------gtagaattaggc 2724053  T
Q  227 gggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattg 325  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  2724054 gggtgatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaagattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttg 2724153  T
Q  326 gaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2724154 gaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 2724187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 6661512 - 6661181
Alignment:
Q  8 actataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||      ||||||| ||| ||||||||||||||||||   |||||| |||| |||||| |||||    
T  6661512 actataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttga------gatagagagggttgaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaattagggtatgtat 6661420  T
Q  108 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgag 207  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||| ||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  6661419 agagtttgt-tcttggcaacaaacactagagttgg--ggttgattcaccatgggaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaaattgag 6661324  T
Q  208 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctc 305  Q
    | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |   ||||| || ||||||||  ||| | ||||||||||    
T  6661323 attttgggtacaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttgctcataattatagtggaacggatgactgctctctc 6661224  T
Q  306 ccccagactaggtcata-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    || |||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||    
T  6661223 cctcagactaggtcagatttggaccgaactggataaacaaatt 6661181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 161 - 389
Target Start/End: Original strand, 23667415 - 23667642
Alignment:
Q  161 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| |||| | ||||||||| ||||||||  |||||||||||  | ||| || |||| |||||||||||||||||    
T  23667415 gaaacactataaggattggactctcttgcttacagaaagagattgggactttggaaagaattaggcgaaaaact-atgcttgcaacccattgatttctct 23667513  T
Q  261 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 360  Q
    ||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| || || |||    
T  23667514 ttgtaacgtcactcatcaaataatggatcggagggctgctctcttccccagactaggacagattggaccgaactgggccaacaaattcctgtgcgtcctt 23667613  T
Q  361 cttcttcttttgttcttctcgccgttgtt 389  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  23667614 cttcttcgtttgttcttctcacagttgtt 23667642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 26098546 - 26098391
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  26098546 gagatagagggggctgaaataagggtttagaatggcaacaagaagactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 26098447  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 205  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  26098446 gattcaccttgacaaacactattatgatt-gagtctcttggttacggaaagagattg 26098391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 89 - 359
Target Start/End: Original strand, 9020246 - 9020514
Alignment:
Q  89 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttg 188  Q
    |||||| ||||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  9020246 acaaaagtagggtttgtatagagttg--ctcttggcaacaaacactagggtt-gaag-ttgattcaccttggaaaacactattaagattg-agtttcttg 9020340  T
Q  189 gttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtgg 286  Q
    || ||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    |||||||| ||||||||    
T  9020341 gtcacgggaagagattggagctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtgg 9020440  T
Q  287 attggagggctgctctctcccccagactaggtc-atattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    || ||| ||||||||||||| ||| | ||||||  | |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||    
T  9020441 atcggatggctgctctctcctccaaattaggtctgttttggaccgaactggataaaccaattcttttgtgttct 9020514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 52 - 359
Target Start/End: Original strand, 20053834 - 20054131
Alignment:
Q  52 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgat 151  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||| |||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||||    
T  20053834 atagagggcgctgaaacaagggtttagaag-gcaacacaaaaactagagtttatataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttg--aggttgat 20053929  T
Q  152 tcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||       
T  20053930 tcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggtt-----tggagattgggactttaagtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccc--- 20054020  T
Q  252 gatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaattc 348  Q
    ||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||    
T  20054021 gatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggaaggctgctctctcctccatactaggtcagttttggaccgaactgcgtaaacaaattc 20054120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 146 - 354
Target Start/End: Original strand, 36208656 - 36208865
Alignment:
Q  146 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 244  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||    
T  36208656 gttgattcaccttgggaaacattactaagattg-agtctcttggtaacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgtagacttattcttgta 36208754  T
Q  245 acccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaac 342  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  || |||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  36208755 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggcgggctgctct-ttccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtaaac 36208853  T
Q  343 aaattcctttgt 354  Q
    |||||| |||||    
T  36208854 aaattcttttgt 36208865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 65 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 17413441 - 17413176
Alignment:
Q  65 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaa 164  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||  ||||||| ||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||    
T  17413441 aaacaagggtttagaag-gcagcactaaaactatggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttggga--ttgattcaccttgggaaa 17413348  T
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 262  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||   | | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  17413347 cactattaggattg-agtctcttggtcaagggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaaaacttattcttgtaaccctttgatatctctttt 17413249  T
Q  263 gtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaac 333  Q
    |||| |  |||||||| |||||||||   ||||| |||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||    
T  17413248 gtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctctcccccagagttggtcagtgttggaccgaac 17413176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 20507798 - 20507665
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||    
T  20507798 acttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaattaaggt 20507705  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttt 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20507704 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacaagggttt 20507665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 105
Target Start/End: Original strand, 4410000 - 4410101
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||   || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4410000 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttga--gagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 4410097  T
Q  102 ttgt 105  Q
    ||||    
T  4410098 ttgt 4410101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 147 - 347
Target Start/End: Original strand, 15143547 - 15143750
Alignment:
Q  147 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 245  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  15143547 ttgattcacctttggaagcactgttaggattg-agtctcttggtcacgggaagagatttggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaa 15143645  T
Q  246 cccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaac 342  Q
    ||| ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  || | |||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||    
T  15143646 ccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggggagctgctttctcccctagactaggtcagtatttgaccgaaatgggtaaac 15143745  T
Q  343 aaatt 347  Q
    |||||    
T  15143746 aaatt 15143750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 165 - 360
Target Start/End: Original strand, 22672837 - 22673030
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  22672837 cactattaggattg-agtctcttggtcacgagaagaggctgagactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 22672931  T
Q  264 taacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||| |||||||||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  22672932 taaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc--ttgtgttct 22673029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 162 - 346
Target Start/End: Original strand, 1170811 - 1170994
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  1170811 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 1170905  T
Q  261 ttgtaacgaaactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  1170906 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 1170994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 162 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 35385634 - 35385450
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || |||||||| ||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  35385634 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactttgg-tagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 35385540  T
Q  261 ttgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| |||||||||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  35385539 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 35385450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 46 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 2144859 - 2144570
Alignment:
Q  46 agagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa-acactagggtttgaa 144  Q
    ||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||   |||||  ||||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| | |    
T  2144859 agagagagagaaggggcaaaaacaagggtttagaagc-caacactaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaacacactagggttggga 2144764  T
Q  145 ggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattga-gactttgggtagaattagg-cgggagacttattctt 241  Q
      |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||| ||||||||   | ||||| ||||||    
T  2144763 --ttgattcaccttggagaaacactattaggat-ggagtctcttggtcgcgggaagagattcaggactttgggtggaattaggtttgaagactaattctt 2144667  T
Q  242 gtaacc-cattgatttctctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactg 335  Q
    ||||||   || || ||||||||||| |  |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| || ||||   || |||||||||||||||    
T  2144666 gtaaccttttttatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccctcaaactaaaccagtattggaccgaactg 2144570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 167 - 360
Target Start/End: Original strand, 25445501 - 25445692
Alignment:
Q  167 ctattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttgta 265  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| |||||||| || ||   || ||||||||||    
T  25445501 ctattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgttactca---atatctctttgta 25445595  T
Q  266 acgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 360  Q
    | |||||||||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  25445596 aagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc--ttgtgttctt 25445692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 192 - 262
Target Start/End: Original strand, 42770936 - 42771006
Alignment:
Q  192 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  42770936 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacctattgatatctcttt 42771006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 9353361 - 9353425
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9353361 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9353425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 36932379 - 36932443
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36932379 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 36932443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 281 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 28832326 - 28832263
Alignment:
Q  281 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28832326 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaaccgggtcaacaa 28832263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 347
Target Start/End: Original strand, 4897828 - 4898013
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggc-gggagacttattcttgtaacccattgatttctct-tt 262  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||  ||||| ||||| ||    
T  4897828 cactgttaggattg-agtatcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcttgaagactgattcttgtaaccatttgatatctctatt 4897926  T
Q  263 gtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||| |  |||||||| ||||| |||   | |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  4897927 gtaaagttactcatcattatagcggaacagtgggctgctttctcccccatactaggtcagtattcgactgaactgggtaaacaaatt 4898013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 279 - 344
Target Start/End: Original strand, 11917000 - 11917065
Alignment:
Q  279 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11917000 tatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 11917065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 162 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 2298183 - 2297999
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  2298183 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgagactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 2298089  T
Q  261 ttgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    || ||| |||||||||  ||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||    
T  2298088 ttataaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctcccccccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaat 2297999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 10281819 - 10281755
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10281819 atagtggattggagagctgctctctcccccagatcaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 10281755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 162 - 367
Target Start/End: Original strand, 10627364 - 10627569
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||   | ||||| ||||||||||||| |  || |||||    
T  10627364 aaacactgttaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagac-tagggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaaccc-tgaatatctct 10627460  T
Q  261 ttgtaacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgt 356  Q
    ||||||  ||||||  |||| |||||||||  |||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||| ||||||||| |||| ||||  ||||||    
T  10627461 ttgtaaataaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccctagagtaggtcatcattagactgaactgggtaaacagattc--ttgtgt 10627558  T
Q  357 tcttcttcttc 367  Q
    ||| |||||||    
T  10627559 tctccttcttc 10627569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 15464600 - 15464536
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15464600 atagtggattggagagctgctctctcccccagattagatcatattggaccgaactgggtcaacaa 15464536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 17003989 - 17004053
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17003989 atagtggattgaagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 17004053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 165 - 360
Target Start/End: Original strand, 25452498 - 25452691
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| |||||||| || ||   || ||||||||    
T  25452498 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgttactca---atatctctttg 25452592  T
Q  264 taacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||| |||||||||  ||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  25452593 taaagaaactcatatcattatagtggatcagagagctgctctctcccccagaataggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc--ttgtgttct 25452690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 49 - 234
Target Start/End: Original strand, 42770757 - 42770934
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggt 147  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| |||  |||||| ||||| |||| ||| |||||| |||| ||||| | ||||||||||| |||| |  |||    
T  42770757 gagatagaggggactgaaaacaagggtttggaag-gcaaca-caaaattagg-tttatatagaatttg-ctcttggcaacaaacactaaggttgg--ggt 42770850  T
Q  148 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagact 234  Q
    | ||||||| ||||||||  |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  42770851 tcattcaccatgggaaac--tattaggactg-agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgagagact 42770934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 367
Target Start/End: Original strand, 42238350 - 42238463
Alignment:
Q  256 tctctttgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctt 351  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |    
T  42238350 tctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc--t 42238447  T
Q  352 tgtgttcttcttcttc 367  Q
    |||||||| |||||||    
T  42238448 tgtgttctccttcttc 42238463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 19588814 - 19588750
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19588814 atagtggattggagggctgctctctccctaagattagttcatattggaccgaactgggtcaacaa 19588750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 196 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15445417 - 15445263
Alignment:
Q  196 gaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattgga 292  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||   || || | ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  | |    
T  15445417 gaagagattgagactttgagtagaattaggtttgaagaatgattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgaa 15445318  T
Q  293 gggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  15445317 gggctgctctct-tcccagactaggtcagtattggactgaactgggtaaacaaatt 15445263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 17841428 - 17841228
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 263  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||  ||  |||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  17841428 cactattaggattg-agtctctaggtcacgggaagaggctggaactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 17841334  T
Q  264 taacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||| |||||||||  ||| ||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||   |||||||||    
T  17841333 taaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt--attgtgttct 17841236  T
Q  360 tcttcttc 367  Q
     |||||||    
T  17841235 ccttcttc 17841228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 281 - 344
Target Start/End: Original strand, 31300626 - 31300689
Alignment:
Q  281 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31300626 tagtggattggagagtttctctctccctcagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 31300689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 281 - 344
Target Start/End: Original strand, 42127440 - 42127503
Alignment:
Q  281 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  42127440 tagtggattggggggctgctctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaa 42127503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 65 - 225
Target Start/End: Original strand, 4754159 - 4754312
Alignment:
Q  65 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaa 164  Q
    ||||||||||||| |||  |||||  || |||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||||   || |||||||||||||  |||    
T  4754159 aaacaagggttta-aaagccaacacaaacactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttg--agattgattcaccttgaaaaa 4754252  T
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 225  Q
    ||||||||| |||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  4754253 cactattagaattg-agcctcttggtcactggaagagattgtgactttggatagaattagg 4754312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 162 - 369
Target Start/End: Original strand, 1240428 - 1240633
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||  || || ||||||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || |||||    
T  1240428 aaacactattaggattg-agtctcttaggcacgggaagaggctggga-tttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctct 1240522  T
Q  261 ttgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgt 356  Q
    |||||| |||||||||  ||| ||||||||  |||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||  |||||||| ||| || ||||||  ||||||    
T  1240523 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctctcccaaactaggtcatcattaaaccgaactaggtaaataaattc--ttgtgt 1240620  T
Q  357 tcttcttcttctt 369  Q
    |||||||||||||    
T  1240621 tcttcttcttctt 1240633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 12084204 - 12084268
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12084204 atagtggattggagagctgctctctgccccatattaggtcatagtggaccgaactgggtcaacaa 12084268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 14520298 - 14520234
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14520298 atagtggattgaagagctgctctcccccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 14520234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 260 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 26098373 - 26098273
Alignment:
Q  260 tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc-agactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 358  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  26098373 tttgtaacgttactcatcatatggtgaaacggagggctgctctctccccccatactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttatgttc 26098274  T
Q  359 t 359  Q
    |    
T  26098273 t 26098273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 364
Target Start/End: Original strand, 28786407 - 28786604
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||| |||||||||   || || | ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  28786407 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggcagaattaggtttgaagattgattcttgtaactca---atatctctttg 28786501  T
Q  264 taacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||| |||||||||  ||| ||| ||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  28786502 taaagaaactcatatcattataatggaacggagaactgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc--ttgtgttct 28786599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 11962612 - 11962412
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 263  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  11962612 cactattaggattgt-gtctcttggtcacgggaagaggctgagactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 11962518  T
Q  264 taacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||| |||||||||  ||| ||| ||||   ||| |||||||||| || || |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  11962517 taaagaaactcatatcattataatggaacagagagctgctctcttcctcatactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc--ttgtgttct 11962420  T
Q  360 tcttcttc 367  Q
     |||||||    
T  11962419 ccttcttc 11962412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 359
Target Start/End: Original strand, 20043222 - 20043284
Alignment:
Q  297 tgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  20043222 tgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattcttttgtgttct 20043284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 38192241 - 38192178
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  38192241 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 38192178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 38219466 - 38219403
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  38219466 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 38219403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 36263877 - 36263810
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagac-taggtcatattggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  36263877 atagtggattggagagctgctctctcccctagacataggtcatattgggccggactgggtaaacaaat 36263810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 41586001 - 41585946
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 104  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  41586001 gagataaagggggctgaaacaagggtttagaataacaagaacaaaactagggtttg 41585946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 31782639 - 31782463
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||| |  || | |||    
T  31782639 aaacactgttaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattggga-attgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccc-tcaatatttct 31782543  T
Q  261 ttgtaacgaaactca---tcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgg 336  Q
    |||||| ||||||||   |  |||||| || ||||| | |||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||    
T  31782542 ttgtaaagaaactcatattattatagtagaatggagagttgctctctcccccagagtagatcatcattagaccgaactgg 31782463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 3880367 - 3880303
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  3880367 atagtggattggagagctgctctctgcctcagattaggtcatattggacagaactgaatcaacaa 3880303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 220
Target Start/End: Original strand, 29748352 - 29748502
Alignment:
Q  65 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgg-gaa 163  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||| ||| |   |||||| | |||||||| |||||||  | | |||||||  ||||| |||    
T  29748352 aaacaagggtttagaagc-caacaagaaaactagggtttgtagagaat---tctcttggcaacaaacagtagggtt--aggattgattcgtcttggagaa 29748445  T
Q  164 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttgggtagaa 220  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  29748446 acactaataggatt-gagtctcttggtcacgggaatagattcgggactttgggtagaa 29748502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 31180278 - 31180219
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  31180278 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 31180219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 43592343 - 43592284
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  43592343 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 43592284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 281 - 344
Target Start/End: Original strand, 24553537 - 24553599
Alignment:
Q  281 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24553537 tagtggagtggagg-ctgctctctcccatagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaa 24553599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 334
Target Start/End: Original strand, 11181862 - 11181916
Alignment:
Q  281 tagtggattggagggctgctctctccccc-agactaggtcatattggaccgaact 334  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  11181862 tagtggattggagggttgctctctccccctagagtaggtcatattagaccgaact 11181916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 335
Target Start/End: Original strand, 33030970 - 33031024
Alignment:
Q  281 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactg 335  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  33030970 tagtgaattggagagctgctctctcccccagagtatgtcatatttgaccgaactg 33031024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 34033768 - 34033691
Alignment:
Q  147 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattga-gactttgggtagaatta 223  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  34033768 ttgatttaccttggagaaacactattaggattg-agtctcttggtcgcgggaagagattcaggattttgggtagaatta 34033691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 161 - 225
Target Start/End: Original strand, 32520533 - 32520597
Alignment:
Q  161 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattga-gactttgggtagaattagg 225  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  32520533 gaaacactattaagattg-agtctctcgattacgggaagagattcatgactttgggtagaattagg 32520597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 1457183 - 1457242
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  1457183 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 1457242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 2785439 - 2785380
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  2785439 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 2785380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 15044750 - 15044691
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  15044750 tggattggagagctgctctctcccccatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 15044691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15224997 - 15224889
Alignment:
Q  116 tctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttg 213  Q
    |||||| | ||||||||||||||||  | | |||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  15224997 tctcttggcaacaaacactagggtt--atgattgattcaccttgaagaaacactattaggataa-agtcttttggtcatgggaagagattcgagactttg 15224901  T
Q  214 ggtagaattagg 225  Q
    |||| |||||||    
T  15224900 ggtaaaattagg 15224889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Original strand, 19806487 - 19806531
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19806487 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 19806531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 27449878 - 27449819
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||| | |||||||||||||||    
T  27449878 tggattggagagctgctctctcccccagattaggctatattgg-ctgaactgggtcaacaa 27449819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 28807593 - 28807652
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  28807593 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 28807652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 31397014 - 31397073
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  31397014 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 31397073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Original strand, 32636948 - 32636992
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  32636948 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 32636992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 35387730 - 35387667
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||| |||||||||||    
T  35387730 atagtagattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaattgggtcaacaa 35387667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 37556643 - 37556702
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  37556643 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 37556702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 37561465 - 37561524
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  37561465 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 37561524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 281 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 24135915 - 24135853
Alignment:
Q  281 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  24135915 tagtgcattggatagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 24135853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Complemental strand, 34477409 - 34477374
Alignment:
Q  1 gacttttactataaatatagaccttgtatcaggcta 36  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34477409 gacttttactataaaaatagaccttgtatcaggcta 34477374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 147 - 360
Target Start/End: Original strand, 35430259 - 35430477
Alignment:
Q  147 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 243  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||   ||||||||||| | | |||||||||||||||||   | ||||| ||||||||    
T  35430259 ttgattcaccttggagaaacactattacaattg-agtctcttggtctagggaagagattcgggtctttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgt 35430357  T
Q  244 aa-cccattgatttctctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtca 340  Q
    ||  |  ||||| ||||||||||| |  |||||||| |||||||||  |||  ||| || |||||   ||| ||||||| |||||||| ||||||| | |    
T  35430358 aattcttttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaaagctcctatctcctttagagtaggtcagtattggactgaactggataa 35430457  T
Q  341 acaaattcctttgtgttctt 360  Q
    ||||||||  ||||||||||    
T  35430458 acaaattctcttgtgttctt 35430477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 2144928 - 2144898
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcag 32  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2144928 acttttactataaatatagaccttgtatcag 2144898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Original strand, 10757206 - 10757236
Alignment:
Q  1 gacttttactataaatatagaccttgtatca 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10757206 gacttttactataaatatagaccttgtatca 10757236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 15354819 - 15354789
Alignment:
Q  1 gacttttactataaatatagaccttgtatca 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15354819 gacttttactataaatatagaccttgtatca 15354789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 15357095 - 15357065
Alignment:
Q  1 gacttttactataaatatagaccttgtatca 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357095 gacttttactataaatatagaccttgtatca 15357065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Original strand, 23665080 - 23665110
Alignment:
Q  1 gacttttactataaatatagaccttgtatca 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23665080 gacttttactataaatatagaccttgtatca 23665110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 23793507 - 23793477
Alignment:
Q  1 gacttttactataaatatagaccttgtatca 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23793507 gacttttactataaatatagaccttgtatca 23793477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 103
Target Start/End: Original strand, 36208524 - 36208617
Alignment:
Q  3 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||      |||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||    
T  36208524 cttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacctt------gagatagagggggctgaaaacaagggtttag-aaacaaacaac-aaactagggt 36208615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 38960379 - 38960349
Alignment:
Q  1 gacttttactataaatatagaccttgtatca 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38960379 gacttttactataaatatagaccttgtatca 38960349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 284 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 43598788 - 43598746
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattgg 326  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  43598788 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 43598746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 284 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 43604280 - 43604238
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattgg 326  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  43604280 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 43604238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 284 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 43609772 - 43609730
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattgg 326  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  43609772 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 43609730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 3373377 - 3373348
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatca 31  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3373377 acttttactataaatatagaccttgtatca 3373348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 32
Target Start/End: Original strand, 29748285 - 29748314
Alignment:
Q  3 cttttactataaatatagaccttgtatcag 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29748285 cttttactataaatatagaccttgtatcag 29748314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Original strand, 533893 - 533937
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  533893 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 533937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 2630299 - 2630235
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||| || |  |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  2630299 atagtggattgaagagctgctatctccctcaaagcaggtcatattggaccgaactaggttaacaa 2630235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 27445034 - 27444975
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||| | | |||||||||||||||    
T  27445034 tggattggagagctgctctctcccccagattaggctatatt-gcctgaactgggtcaacaa 27444975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 30631470 - 30631411
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||| ||||||||    
T  30631470 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgagtcaacaa 30631411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 31401871 - 31401930
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  31401871 tggattggagagctgctctctcccccatattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 31401930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 42428474 - 42428430
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  42428474 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 42428430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 190)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 49 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 44600133 - 44599791
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||    
T  44600133 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 44600034  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44600033 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactc 44599934  T
Q  249 attgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||      
T  44599933 attgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatat 44599834  T
Q  349 ctttgtgttcttcttcttcttttgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44599833 ctttgtgttcttcttcttcttttgttcttctcgccgttgtttt 44599791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 18709507 - 18709116
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18709507 acttttactataaatatagaccttgtattaggctaaactttgagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagg 18709408  T
Q  100 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaag 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  18709407 gtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgagttgattcaccttgggaaacactattagggttg-agtctcttggttacgggaag 18709309  T
Q  200 agattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgc 299  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18709308 agattgcgactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggaggactgc 18709209  T
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18709208 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 18709116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 16934480 - 16934097
Alignment:
Q  1 gacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    || ||||||      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16934480 gacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttga------gatagagggggctgatacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaggg 16934387  T
Q  101 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16934386 tttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 16934287  T
Q  201 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16934286 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 16934187  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttttgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16934186 ctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttc-tcttcttttgttcttctcgccgttgtttt 16934097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 22780718 - 22780325
Alignment:
Q  1 gacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatct--ttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactag 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22780718 gacttttactataaatataaaccttgtatcaagctaatctaagagagagagagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactag 22780619  T
Q  99 ggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22780618 ggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaa 22780519  T
Q  199 gagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctg 298  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22780518 gagattgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctg 22780419  T
Q  299 ctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22780418 ctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 22780325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 22783083 - 22782690
Alignment:
Q  1 gacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatct--ttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactag 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22783083 gacttttactataaatataaaccttgtatcaagctaatctaagagagagagagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactag 22782984  T
Q  99 ggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782983 ggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaa 22782884  T
Q  199 gagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctg 298  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782883 gagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctg 22782784  T
Q  299 ctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22782783 ctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactggatcaacaaatatctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 22782690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 16932126 - 16931743
Alignment:
Q  1 gacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaggg 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||    || ||||||      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16932126 gacttttactataaatataaaccttgtatcaaagcaaactttga------gatagagggggctgatacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaggg 16932033  T
Q  101 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 200  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16932032 tttgtatagagtctgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 16931933  T
Q  201 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16931932 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 16931833  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttttgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16931832 ctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttc-tcttcttttgttcttctcgccgttgtttt 16931743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 11008907 - 11008520
Alignment:
Q  1 gacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11008907 gacttttactataaatatagaccttgtatcaggctatt--ttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg 11008810  T
Q  101 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11008809 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 11008710  T
Q  201 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11008709 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatt--tctttgtaatggtactcatcatatagtggattggagggctgct 11008612  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgttttt 392  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11008611 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgttttt 11008520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 37089710 - 37089325
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  37089710 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaacttg---agagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggt 37089614  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  37089613 ttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttgattacgggaagag 37089515  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 301  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  37089514 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctc 37089415  T
Q  302 tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37089414 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 37089325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 11006578 - 11006219
Alignment:
Q  1 gacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11006578 gacttttactataaatatagaccttgtatcagactatt--ttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg 11006481  T
Q  101 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11006480 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 11006381  T
Q  201 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11006380 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaatggtactcatcatatagtggatcggagggctgct 11006281  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttct 362  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  11006280 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggttaacaaattcttttgtgttcttct 11006219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Original strand, 38409196 - 38409584
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  38409196 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagggagatagagggggctgaaacaatggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggt 38409295  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38409296 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagag 38409394  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 301  Q
      || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38409395 gctgggactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctc 38409494  T
Q  302 tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttc-ttttgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38409495 tctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgagttcttc-tcttctttttgttcttctcgccgttgtttt 38409584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 49 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 9176769 - 9176426
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||  ||||    
T  9176769 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggtt 9176670  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9176669 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 9176570  T
Q  249 attgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattc 348  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||     
T  9176569 attgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacagagtcaacaaattt 9176470  T
Q  349 ctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgttttt 392  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9176469 ctttgtgttattc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgttttt 9176426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 2 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 8631759 - 8631371
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||    || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8631759 actttcactataaatatagactttgtatcaaagcaaactttg--agagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 8631662  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8631661 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagag 8631563  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8631562 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 8631463  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgttttt 392  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8631462 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgttttt 8631371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 391
Target Start/End: Original strand, 18847149 - 18847532
Alignment:
Q  1 gacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    || ||||||      ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18847149 gacttttactataaatatagaccttgtatcaaaacaaactttga------gatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg 18847242  T
Q  101 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18847243 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagcattggagtctcttggttacgggaaga 18847342  T
Q  201 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18847343 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgct 18847442  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  18847443 ctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tgttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 18847532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 9174483 - 9174098
Alignment:
Q  1 gacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    || ||| ||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9174483 gacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttgga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaggg 9174390  T
Q  101 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9174389 tttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggttcgtgagttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaaga 9174290  T
Q  201 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9174289 gattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgtt 9174190  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgttttt 392  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9174189 ctctgccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgttttt 9174098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 2 - 362
Target Start/End: Original strand, 24348211 - 24348569
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  24348211 acttttactataaatatagaccttgtatcaagctaaactttga--gagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggt 24348308  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24348309 ttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagag 24348407  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
      || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24348408 gctgggactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 24348507  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttct 362  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24348508 ctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 24348569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 2 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 22132735 - 22132343
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagag---ggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactag 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  22132735 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacttg 22132636  T
Q  99 ggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22132635 ggtttgtatagagtttgtctcttcg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaa 22132538  T
Q  199 gagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctg 298  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132537 gaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctg 22132438  T
Q  299 ctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattccttt-gtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgttttt 392  Q
    |||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22132437 ctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttggtcttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgttttt 22132343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 2 - 362
Target Start/End: Original strand, 9148248 - 9148603
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||   || ||||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  9148248 acttttactataaatataggccttgtatcagagcaaactttga----gagatagagggggctgaagcaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggat 9148343  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9148344 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagag 9148442  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 301  Q
      || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9148443 gctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctc 9148542  T
Q  302 tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttct 362  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9148543 tctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 9148603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 49 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 22044685 - 22044344
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||    
T  22044685 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 22044586  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22044585 gattccccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccc 22044487  T
Q  249 attgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattc 348  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22044486 attgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 22044387  T
Q  349 ctttgtgttcttcttcttctttt-gttcttctcgccgttgtttt 391  Q
     ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22044386 ttttgtgttcttct-cttctttttgttcttctcgccgttgtttt 22044344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 49 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 22046980 - 22046639
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||    
T  22046980 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 22046881  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046880 gattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 22046782  T
Q  249 attgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattc 348  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22046781 attgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 22046682  T
Q  349 ctttgtgttcttcttcttctttt-gttcttctcgccgttgtttt 391  Q
     ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  22046681 ttttgtgttcttct-cttctttttgttcttctcgtcgttgtttt 22046639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 49 - 391
Target Start/End: Original strand, 51015284 - 51015625
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||    
T  51015284 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 51015383  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51015384 gattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 51015482  T
Q  249 attgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattc 348  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  51015483 attgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtggatcggaggtctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 51015582  T
Q  349 ctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
     |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51015583 ttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 51015625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 49 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 31849894 - 31849551
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttt-gaaggt 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |  |||    
T  31849894 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaaggttttgtgggt 31849795  T
Q  148 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31849794 tgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttgcttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacc 31849696  T
Q  248 cattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  31849695 cattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaatt 31849596  T
Q  348 cctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgttttt 392  Q
    | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31849595 cttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgttttt 31849551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Original strand, 40637112 - 40637422
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40637112 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 40637211  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40637212 gattcaccttgggaaacactattagga-tcgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 40637310  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  40637311 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 40637410  T
Q  348 cctttgtgttct 359  Q
    | ||||||||||    
T  40637411 cttttgtgttct 40637422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 2 - 362
Target Start/End: Original strand, 5198417 - 5198771
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  5198417 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggat 5198510  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  5198511 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcactttgggaaacactattaggatt-gagtcttttggttacgggaagag 5198609  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5198610 attggggctttgtgtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgct 5198709  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttct 362  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  5198710 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaattcttttgtgttcttct 5198771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Original strand, 11434952 - 11435334
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   || ||| ||      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11434952 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttgga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 11435045  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  11435046 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcctggttaccggaagag 11435144  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 301  Q
      |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11435145 tctaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 11435244  T
Q  302 tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttttgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||    
T  11435245 tctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttccttgtgttcttctcgccattgtttt 11435334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 2485209 - 2484826
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||   || ||||||   |||     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2485209 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagctaga-----agggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 2485115  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2485114 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttctgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagag 2485016  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 301  Q
      || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2485015 gctgggactttgggtagagataggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 2484916  T
Q  302 tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2484915 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcctttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 2484826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 47 - 391
Target Start/End: Original strand, 7941357 - 7941703
Alignment:
Q  47 gagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaa--cactagggtttgaa 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||  ||||||||||||      
T  7941357 gagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttacgagcaaatgcactagggtttgtg 7941456  T
Q  145 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7941457 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 7941555  T
Q  245 acccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 343  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  7941556 acccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 7941655  T
Q  344 aattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  7941656 aattcttttgtgttctt-ttcttctttgtgttcttctcgccattgtttt 7941703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 2 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 22134966 - 22134570
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagag---------ggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaa 92  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||         |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22134966 acttttactataaatatagaccttgtatcaagctaaactttgagagagagagagagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaa 22134867  T
Q  93 aactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggtta 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22134866 aactagggtttgtatagagtttgtctcttca-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggtta 22134769  T
Q  193 cgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattgga 292  Q
     ||||| ||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  22134768 tgggaaaaggctgggacattgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattgga 22134669  T
Q  293 gggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22134668 gggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtcttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 22134571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Original strand, 14633317 - 14633698
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||      |||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  14633317 actttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttga------gatagaaggg-ctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagt 14633409  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  14633410 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttac-ggaagag 14633507  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  14633508 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgct 14633607  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14633608 ctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 14633698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Original strand, 6764836 - 6765224
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||   || ||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6764836 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttga------gatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 6764929  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctcttt-----ggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacggg 196  Q
    |||||||||||||||||||||     ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  6764930 ttgtatagagtttgtctctttagtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactgttaggattg-agtctcttggttatggg 6765028  T
Q  197 aagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggaggg 295  Q
    |||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  6765029 aagaggctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggattggaggg 6765128  T
Q  296 ctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttctt-ttgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  6765129 ctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttcttggtgttcttctcgccgttgtttt 6765224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 22801198 - 22800847
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||    
T  22801198 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagt 22801105  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  22801104 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttgattacgggaagag 22801006  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||   ||||||||||    
T  22801005 gctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgct 22800906  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22800905 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 22800847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 77 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 26086243 - 26085930
Alignment:
Q  77 agaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggat 176  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26086243 agaaaaacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggat 26086144  T
Q  177 tggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcat 276  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  26086143 tg-agtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgttttctctttgtaacgatactcat 26086045  T
Q  277 catatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttc 375  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||     
T  26086044 catatagtggatcggaaggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttt 26085946  T
Q  376 ttctcgccgttgtttt 391  Q
    ||||||||||||||||    
T  26085945 ttctcgccgttgtttt 26085930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 2 - 357
Target Start/End: Original strand, 24888793 - 24889142
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  24888793 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactt------agagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggga 24888886  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24888887 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggctttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagag 24888985  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  24888986 actaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcatgtaacccattgatatctcttttgtaacgttacttatcatatagtggaacggagggctgct 24889085  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgtt 357  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24889086 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 24889142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Original strand, 24878986 - 24879338
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||| ||      |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  24878986 acttttactataaatatagaccttgtatccgagtaaacttgga------gatagagggggctgaaactagggtttagaaagacaacaacaaaactagggt 24879079  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24879080 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacaccagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagag 24879178  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt-aacgaaactcatcatatagtggattggagggctgc 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| || |||||||||||| |  ||||||||||    
T  24879179 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgatacacatcatatagtgaaacggagggctgc 24879278  T
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  24879279 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttct 24879338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 49 - 391
Target Start/End: Original strand, 47868439 - 47868781
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  47868439 gagatagagagggctgaaagaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctccttggaacaaacactaggttttgagggtt 47868538  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47868539 gattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 47868637  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  47868638 attgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaatt 47868737  T
Q  348 cctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    | |||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  47868738 cttttgtgttattc-tcttctttgtgttcttctcaccgttgtttt 47868781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 2 - 357
Target Start/End: Original strand, 48486316 - 48486665
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  48486316 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggt 48486409  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48486410 ttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagag 48486508  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||| |||||||    
T  48486509 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgaaatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgct 48486608  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgtt 357  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  48486609 ctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattattttgtgtt 48486665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 22803070 - 22802719
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  22803070 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggt 22802977  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22802976 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagag 22802878  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||||||||||||  |||||| | ||    
T  22802877 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtggaacggagggtttct 22802778  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  22802777 ctctcccccagactaggtcaatttgaaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 22802719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 17662574 - 17662230
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17662574 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttga--gagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 17662477  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    ||||           ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  17662476 ttgt-----------ctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacaggaagag 17662389  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17662388 actgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 17662289  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17662288 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 17662230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Original strand, 24880448 - 24880800
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||| ||      ||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24880448 acttttactataaatatagaccttgtatcggagtaaacttgga------gatagagggggcgtaaactagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 24880541  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24880542 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttggttcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagag 24880640  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt-aacgaaactcatcatatagtggattggagggctgc 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||  || |||||||||||| |  ||||||||||    
T  24880641 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatcatatagtgaaacggagggctgc 24880740  T
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  24880741 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttct 24880800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 2 - 362
Target Start/End: Original strand, 47274724 - 47275076
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47274724 acttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 47274817  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  47274818 ttgtata-agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaa 47274915  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  47274916 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgct 47275015  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttct 362  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  47275016 ctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 47275076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 36919923 - 36919569
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36919923 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacttt----gatagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 36919828  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 200  Q
    ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36919827 ttggataaagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaaga 36919729  T
Q  201 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgc 299  Q
    |  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||  | ||||||||||||||| | || ||||||    
T  36919728 ggctgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttattcatcatatagtggaatagatggctgc 36919629  T
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36919628 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 36919569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 36921831 - 36921478
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  36921831 acttttacaataaatatagaccttgtatcagagtaaactttga----gagatagaggggg-tgaaacaagggcttagaaaggcaacaacaaaactagggt 36921737  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36921736 ttgtatatagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaga 36921638  T
Q  201 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgc 299  Q
    |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  36921637 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgc 36921538  T
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36921537 tctctcccccagactagttaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 36921478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 2 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 14787769 - 14787405
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14787769 acttttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttga----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggt 14787674  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14787673 ttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagag 14787575  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctg-- 298  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||      
T  14787574 attgtgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgct 14787475  T
Q  299 ctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttctttt 371  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  14787474 ctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattc--ttgtgttcttc-tcttctttt 14787405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 38928473 - 38928162
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgaaggt 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  38928473 gagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggt 38928374  T
Q  148 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38928373 tgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaaaagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaact 38928275  T
Q  248 cattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38928274 cattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtaaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 38928175  T
Q  347 tcctttgtgttct 359  Q
    || ||||||||||    
T  38928174 tcttttgtgttct 38928162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 40091751 - 40091400
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||     
T  40091751 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaggga 40091658  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  40091657 ttgtttagagtttgtctctttggaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagag 40091559  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |   ||||||||||    
T  40091558 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacagagggctgct 40091459  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40091458 ctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 40091400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 47211082 - 47210756
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47211082 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 47210983  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     ||       |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  47210982 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttg-----tg-------ttgggaaacactattaggattg-agtctcttagttacgggaagag 47210896  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47210895 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgct 47210796  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtca 340  Q
    |||||||||| ||||| |||  ||||||||||||| ||||    
T  47210795 ctctcccccaaactagatcaatttggaccgaactgagtca 47210756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 33415782 - 33415473
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  33415782 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctt-ggaacaaacactaaggtttgagggtt 33415684  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33415683 gattcaccttgggaaacactattaagatcg-agtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 33415585  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  33415584 attgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccctcaggctaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaatt 33415485  T
Q  348 cctttgtgttct 359  Q
    | ||||||||||    
T  33415484 cttttgtgttct 33415473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Original strand, 36378289 - 36378641
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| | ||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36378289 acttttactataaatatagactttgtatcagaataaaccttga------gatagacggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 36378382  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  36378383 ttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-aagtctcttagttacgggaagag 36378481  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgc 299  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| | |  |||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  36378482 attgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctcttgtgaagttactcatcattatagtggaacggagggctgc 36378581  T
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  36378582 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattattttgtgttct 36378641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Original strand, 53405124 - 53405513
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  53405124 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttga--gagagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 53405220  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  53405221 ttgtatagagtttgtctctttagaacaaa-actaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagatt-gagtctcttggttacggaaagag 53405318  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggaga------cttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagg 294  Q
      ||||||||| |||||||||| ||||||||      ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||   |||     
T  53405319 gctgagactttaggtagaattaagcgggagacttattcttattcttgtaacccattgatttctcttttgaaacgatactcatcatatagtggaacagaga 53405418  T
Q  295 gctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  53405419 gctg--ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttttgttcttc-tcttctttgtgttcttttcgccgatgtttt 53405513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 12396140 - 12395830
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||    
T  12396140 gagatagatggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctagccaacaaacactagggtttgagggtt 12396041  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12396040 gattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaaccc 12395942  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |    
T  12395941 attgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggggggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacagggtcaacaaact 12395842  T
Q  348 cctttgtgttct 359  Q
    | ||||||||||    
T  12395841 cttttgtgttct 12395830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 3 - 359
Target Start/End: Original strand, 19095880 - 19096231
Alignment:
Q  3 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtt 102  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| | ||||      ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||    
T  19095880 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtt 19095973  T
Q  103 tgtatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19095974 tgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtgaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagag 19096072  T
Q  202 att-gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgc 299  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||| ||||||||||| |  |||| |||||    
T  19096073 attagag-ctttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttacttatcatatagtgaaacggagagctgc 19096171  T
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19096172 tctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 19096231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 12401102 - 12400792
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||    
T  12401102 gagatagatggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctggccaacaaacactagggtttgagggtt 12401003  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12401002 gattcaccttgggaaacactattaagattg-agtctcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaaccc 12400904  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |    
T  12400903 attgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggggggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacagggtcaacaaact 12400804  T
Q  348 cctttgtgttct 359  Q
    | ||||||||||    
T  12400803 cttttgtgttct 12400792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 3824909 - 3824627
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggcta-atctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3824909 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtatttctttg--agagagatagagggggctgaaaca--ggtttagaaaagcaacaacaaaactaggg 3824814  T
Q  101 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  3824813 tttgtatagagtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctattggttacgggaaga 3824715  T
Q  201 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtgga 287  Q
    |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  3824714 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 3824627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 5637805 - 5637524
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||   || ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5637805 acttttactataaatatagaccttgtataagagcaaactttga--gagagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 5637708  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5637707 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagag 5637609  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtg 285  Q
      || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  5637608 gctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 5637524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 47 - 359
Target Start/End: Original strand, 16453345 - 16453658
Alignment:
Q  47 gagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaagg 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16453345 gagagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagagtttgtacaaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaggg 16453444  T
Q  147 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16453445 ttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattgggactttgggtagtattaggcgggagacttattcttgtaac 16453543  T
Q  247 ccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||| ||||||| |||| |  ||||||||| |||||| |   || || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| ||    
T  16453544 ccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgcgccaaaaa 16453643  T
Q  345 attcctttgtgttct 359  Q
    |||| ||||||||||    
T  16453644 attcttttgtgttct 16453658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 619783 - 619433
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||      ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  619783 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttga------gatagagggggctgaaacaagggtttataaagacaacaacaaaactagggt 619690  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||    
T  619689 ttgcatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggatt-gactgtcttggttaagggaagag 619591  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||| | |||||    
T  619590 attgggtctttgggtagaattaggcgggaaaattattcttataacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatgactgct 619491  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  619490 ctctccccta-actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttct 619433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 37313361 - 37313050
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||    
T  37313361 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagagtt 37313262  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37313261 gattcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttacggaaagagattgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 37313163  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    ||| || |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| || ||| |||||||||    
T  37313162 attaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctttcccccagactatgtcaatttggaccaaattggatcaacaaat 37313063  T
Q  347 tcctttgtgttct 359  Q
    || ||||| ||||    
T  37313062 tcttttgttttct 37313050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Original strand, 19322735 - 19323043
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||  ||||    
T  19322735 gagatagagggggatgaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtttg--ggtt 19322830  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19322831 gattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccc 19322929  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaa 345  Q
    |||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||    
T  19322930 attgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggatgctctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 19323029  T
Q  346 ttcctttgtgttct 359  Q
    ||| || |||||||    
T  19323030 ttctttagtgttct 19323043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 320
Target Start/End: Original strand, 13543953 - 13544268
Alignment:
Q  4 ttttactataaatatagaccttgtatcag-gctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtt 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||   ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||   |||||||||||||||||||    
T  13543953 ttttactataaatatagatcttgtatcagatgtaaactttg--agagagatagagggggctgaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtt 13544050  T
Q  103 tgtatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  13544051 tgtatagagtttgtctctttggcaacaaacacta-ggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagag 13544148  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  ||||  |||||    
T  13544149 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagtactgct 13544248  T
Q  301 ctctcccccagactaggtca 320  Q
    ||||  ||||||||||||||    
T  13544249 ctctttcccagactaggtca 13544268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 49 - 340
Target Start/End: Original strand, 56030482 - 56030770
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  56030482 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 56030581  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  56030582 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtttcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactc 56030680  T
Q  249 attg--atttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtca 340  Q
    ||||  |||||| |||||||||  | ||||||||   || |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  56030681 attgacatttct-tttgtaacgttattcatcata---tgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtca 56030770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 87 - 359
Target Start/End: Original strand, 36380425 - 36380698
Alignment:
Q  87 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctct 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  36380425 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaaaaaccattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtatct 36380523  T
Q  187 tggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagt 284  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||| |  |||||||| ||||||    
T  36380524 tggttaccggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttactcatcattatagt 36380623  T
Q  285 ggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||   ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  36380624 ggaactgagtgctgctctctcccccagactaggtcaatttggagcgaactgggtaaacaaattcttttgtgttct 36380698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 49 - 347
Target Start/End: Original strand, 41997530 - 41997828
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  41997530 gagataaagggggctgaaacaagtgttcagaaaggaaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 41997629  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41997630 gattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttagttacgggaaaagattgagattttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccc 41997728  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
     || || |||| ||||||| |  ||||||||| |||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| | |||||||    
T  41997729 tttaatatctcttttgtaaagttactcatcatcatagtgaaacggagggccgctctct-ccccagactaggttaatttggaccgaactggataaacaaat 41997827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 18537806 - 18537470
Alignment:
Q  3 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| | ||||      ||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||    
T  18537806 cttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaacattga------gatagagggggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaa-ctagggt 18537715  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18537714 ttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaccactagggttgg--ggttgattcaccttaggaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagag 18537619  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgc 299  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  18537618 attgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgc 18537519  T
Q  300 tctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    ||||||||||| | ||||||| | || ||||||||||||| ||||||||    
T  18537518 tctctcccccataataggtcattttttgaccgaactgggtaaacaaatt 18537470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 124 - 348
Target Start/End: Original strand, 16455354 - 16455579
Alignment:
Q  124 gaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaatta 223  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16455354 gaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaatta 16455452  T
Q  224 ggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat 321  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |  |||| |||| |||||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||||     
T  16455453 ggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcgtcattatagtgaaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaa 16455552  T
Q  322 attggaccgaactgggtcaacaaattc 348  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  16455553 tttggaccgaactgggtcaacaaattc 16455579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 60 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 18409631 - 18409344
Alignment:
Q  60 ggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  18409631 ggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcacttggcaacaaacactagggtttgagggttgattaaccttc 18409532  T
Q  160 ggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 259  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  18409531 gggaacactattaggatt-gagtctcttagttataggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctc 18409433  T
Q  260 -tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
     ||||||| |  || ||||| ||||||| |   ||| | ||||||||||| ||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||    
T  18409432 ttttgtaa-gttacccatcattatagtgaaacagagagttgctctctccctcagactaggtcaatttggattgaactgggtaaacaaatt 18409344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 207 - 391
Target Start/End: Original strand, 11437558 - 11437742
Alignment:
Q  207 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11437558 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 11437657  T
Q  307 cccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttttgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||    
T  11437658 cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttccttgtgttcttctcgccgttgtttt 11437742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 207 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 5635614 - 5635429
Alignment:
Q  207 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5635614 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 5635515  T
Q  306 ccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5635514 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 5635429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 52942783 - 52942542
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtat--caggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagg 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||      |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52942783 actttcactataaatatagaccttgtatatcagactaaactttga------gatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagg 52942691  T
Q  100 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       
T  52942690 gtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacggg--- 52942595  T
Q  200 agattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 262  Q
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52942594 ----------tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 52942542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 49 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 3937504 - 3937314
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  3937504 gagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagagtttgtatagagtttgtttcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 3937405  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattct 240  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3937404 gattcaccttgggaaacactatt-ggaattgagtctcttggttacaggaagagattgaggctttgggtagaattaggtgggagacttattct 3937314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 49 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 18535124 - 18534828
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggt 147  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||    
T  18535124 gagatagagggggctgaaaacaagtgttta-aaaacaaacaacaaa-ctagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggt 18535030  T
Q  148 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 247  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18535029 tgattcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgagaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 18534931  T
Q  248 cattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||| ||||||| ||||    |||||| || ||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||| |||| |||||    
T  18534930 cattgatatctcttttgtaaaactactcataattatagtggaacggaggggtgctctcccccccagactaggtaagttttggaccgaacagggtaaacaa 18534831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 49 - 230
Target Start/End: Original strand, 6132911 - 6133090
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||    
T  6132911 gagatagaggaggctgaa-caagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttgtatagagtttgtctattggcaacaaacactagggtttgagggtt 6133009  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga 230  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6133010 gagtcaccctgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga 6133090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 8756586 - 8756247
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||      |||||| |||||||||| |||||||||||||   |||||| |||| ||||     
T  8756586 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttga------gatagaaggggctgaaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaattagga 8756494  T
Q  101 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctctt-ggttacgggaag 199  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  8756493 tttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactaggattg-agtctctttggtcacgggaag 8756398  T
Q  200 agattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggct 297  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |  ||| |||| |||||||||  ||| || |    
T  8756397 agattgagactttgagtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactaatcattatagtggaacggatggtt 8756298  T
Q  298 gctctctcccccagactaggtc-atattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    ||||||||| ||||||||||||  | ||||| |||||||||| ||||||||    
T  8756297 gctctctcctccagactaggtcggttttggagcgaactgggtaaacaaatt 8756247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 91 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 38890476 - 38890221
Alignment:
Q  91 aaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||| |  ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  38890476 aaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacattagggttgg--ggttgattcatattgggaaacactattaggattg-agtctcttgat 38890381  T
Q  191 tacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggat 288  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||     
T  38890380 cacgggaagagattgagactttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaa 38890281  T
Q  289 tggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
      |||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  38890280 cagagggctgctctctccccaagattaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt 38890221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 159 - 359
Target Start/End: Original strand, 13547302 - 13547502
Alignment:
Q  159 gggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 258  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |    
T  13547302 gggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatat 13547400  T
Q  259 c-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgtt 357  Q
    | ||||||| |  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||| |||||  ||||||||    
T  13547401 cttttgtaaagttactcatcatatagtgaaatggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaataaatttttttgtgtt 13547500  T
Q  358 ct 359  Q
    ||    
T  13547501 ct 13547502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 153 - 359
Target Start/End: Original strand, 2891433 - 2891640
Alignment:
Q  153 caccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  2891433 caccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttgttcttgtaacccattg 2891531  T
Q  253 atttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcct 350  Q
    || ||||||| |||| |  ||||||||| |||||| |   || | |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||| |    
T  2891532 atatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatgactgctctctcccccagactagtacaacttggaccgaactgggtcaacaaattctt 2891631  T
Q  351 ttgtgttct 359  Q
    |||||||||    
T  2891632 ttgtgttct 2891640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 189 - 359
Target Start/End: Original strand, 4215483 - 4215654
Alignment:
Q  189 gttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtgga 287  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  4215483 gttacgggaagaggttgtgacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 4215582  T
Q  288 ttggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
      ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4215583 acggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 4215654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 94 - 359
Target Start/End: Original strand, 27499128 - 27499390
Alignment:
Q  94 actagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttac 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  27499128 actagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcctgagaaacactattaggatt-gagtctattggttac 27499226  T
Q  194 gggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattgga 292  Q
    |  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | || ||| ||||||| |  |||||||| |||| || |  | |    
T  27499227 gataagagattgaggctttgggtataattaggcgggagacttatttttgtaacctaat-atctct-tttgtaaggttactcatcattatattgaaacgaa 27499324  T
Q  293 gggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27499325 gggctgctct-ttccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27499390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 49 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 15032831 - 15032557
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||          ||| ||||    
T  15032831 gagataaagggggctgaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctctttgcaacaaa----------tga-ggtt 15032745  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15032744 gattcatatttggaaacactattaggattg-agtctcttggacacgagaaaagatttggacttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaaccc 15032646  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaact 334  Q
    |||||| |||| ||||||| |  |||||||| || ||||||  | || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  15032645 attgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtggaacgaagagctgctctctcccccaaactaggtcagtattggaccgaact 15032557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 38270321 - 38270158
Alignment:
Q  3 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtt 102  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| | ||||      |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38270321 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttga------gatagaagaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 38270228  T
Q  103 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatta 172  Q
    ||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  38270227 tgtgtagagtttgtcttttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactatta 38270158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 146 - 347
Target Start/End: Original strand, 12102221 - 12102425
Alignment:
Q  146 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||| ||||||  ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  12102221 gttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtatcttggtcatgggaaaagattggaactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgta 12102319  T
Q  245 acccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaa 341  Q
    ||||| |||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||| ||    
T  12102320 acccactgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcagttttggaccgaactaggtaaa 12102419  T
Q  342 caaatt 347  Q
    ||||||    
T  12102420 caaatt 12102425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 65 - 347
Target Start/End: Original strand, 28453742 - 28454020
Alignment:
Q  65 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaa 164  Q
    ||||||||||||||||   |||||  |||||||||||||| |  ||||||| ||||| | || ||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||    
T  28453742 aaacaagggtttagaagc-caacactaaaactagggtttgca--gagtttg-ctcttggcaagaaacactagggttggga--ttgattcaccttgggaaa 28453835  T
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 263  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||  | ||||| |||||||||| |  ||||| |||| ||||    
T  28453836 cactgttaggattg-agtctcttggttacgggaagagatttggaccttgggtagaattaggttgaagactaattcttgtaaacttttgatatctcttttg 28453934  T
Q  264 taacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    ||| |  |||||||| |||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  28453935 taaagttactcatcattatagtggaacggagaactactctctcccccagactaggttagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 28454020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 99 - 359
Target Start/End: Original strand, 30136640 - 30136898
Alignment:
Q  99 ggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaa 198  Q
    ||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||| |||    
T  30136640 ggtttgtatagagttta-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactatgattgg-gtctcttggtcacgagaa 30136735  T
Q  199 gagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggc 296  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||| |||| ||||||| |  | |||||| ||||||| |   || |||    
T  30136736 gaaattgtgactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtgactcatcgatatctcttttgtaaagttaatcatcattatagtgaaacagatggc 30136835  T
Q  297 tgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||||||| | | |||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||    
T  30136836 tgctctctcctcaatactaggtcaatttggaccgaattggataaacaaattcttttgtgttct 30136898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 91 - 347
Target Start/End: Original strand, 9863791 - 9864049
Alignment:
Q  91 aaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggt 190  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||| | ||||||||||| |||| |  | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  9863791 aaaactagggtttgta--gagtttgt-tcttggcaacaaacactaaggttgg--gtttgattcaccttgggaaaccctattaggattg-agtcttttggt 9863884  T
Q  191 tacgggaagagattgagactttgggtagaatt-aggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatca----tatagtg 285  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | ||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |  ||||||||    |||||||    
T  9863885 cacgggaagagattgagactttgggtagaattaagtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctctttgtaaagttactcatcatcattatagtg 9863984  T
Q  286 gattggagggctgctctct--cccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    ||  |||| ||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  9863985 gaacggagagctgctctctcccccccagactaagtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 9864049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 24446914 - 24446756
Alignment:
Q  3 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtt 102  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| | ||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     |||||||    
T  24446914 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaac-----tagggtt 24446826  T
Q  103 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatta 172  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24446825 tgtatagagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 24446756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 162 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16186018 - 16185831
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||   | ||||||||||||| ||||| ||||| | |||    
T  16186018 aaacactgttaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattggaactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgatatatct 16185920  T
Q  261 ttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||||| |  |||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  16185919 ttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt 16185831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Original strand, 5100994 - 5101129
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||      |||||||||| ||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||    
T  5100994 acttttactataaatatagaccttgaatcagggtaaaccttga------gatagaggggactgaaacaaaggtttagaatgacaacaacaaaactagggt 5101087  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttga 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5101088 ttgtatagagtttgtcactttggaacaaacactagggtttga 5101129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 65 - 338
Target Start/End: Original strand, 10112927 - 10113198
Alignment:
Q  65 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaa 164  Q
    ||||||||||||||||   |||||  ||||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||||   || |||||||||||| |||||    
T  10112927 aaacaagggtttagaagc-caacacaaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttg--agattgattcaccttaggaaa 10113020  T
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttac-gggaagagattgagactttgggtagaattag-gcgggagacttattcttgtaacc-cattgatttctctt 261  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||    | ||||| ||||||||||||   ||||| ||||||    
T  10113021 cactattatgatt-gagtctcttggtcacggggaagagattaggactttgggtagaattagatttgaagactaattcttgtaacctttttgatatctctt 10113119  T
Q  262 tgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggt 338  Q
    ||||| |  ||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  10113120 tgtaatgttactaatcattatagtggaatggagagctgctctctccccaagactaggttagtattggaccgaactgggt 10113198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 50 - 128
Target Start/End: Original strand, 2891356 - 2891434
Alignment:
Q  50 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaaca 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2891356 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaaca 2891434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 213 - 359
Target Start/End: Original strand, 5101130 - 5101276
Alignment:
Q  213 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccag 311  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    ||||||||||||||  |  ||||||||||| ||||||| ||    
T  5101130 gggtagacttaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatgtcttttgtaaatttactcatcatatagtaaaacggagggctgctatctcccc-ag 5101228  T
Q  312 actaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5101229 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 5101276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 146 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 31983727 - 31983524
Alignment:
Q  146 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| |||||    
T  31983727 gttgattcaccttgggaaacactattaagatta-agtctcttggtcatgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgta 31983629  T
Q  245 acccattgatttc-tctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaa 341  Q
    |||| ||||| || | |||||||    |||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||| | ||||||| | |||| |||| |||||||| ||    
T  31983628 accctttgatatcttttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctct-cccaatactaggtaagtattagaccaaactgggtaaa 31983530  T
Q  342 caaatt 347  Q
    ||||||    
T  31983529 caaatt 31983524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 65 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 47151167 - 47150977
Alignment:
Q  65 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaa 164  Q
    ||||||||||||||||  || |  ||||||||| |||||  |||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||    
T  47151167 aaacaagggtttagaa--gccaacacaaaactaaggttt--atagagtttg-ctcttggtaaccaacactagggttgaaa--ttgattcaccttgggaaa 47151075  T
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 262  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  47151074 cactgttaggattg-agtctcttggtcacatgaagagattgagaatttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttt 47150977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 147 - 347
Target Start/End: Original strand, 25357772 - 25357979
Alignment:
Q  147 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggta----gaattaggcggga-gacttattctt 241  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||    |||||| |   || |||||||||||    
T  25357772 ttgattcaccttgggaaatactattaggattg-agtctcttggtcatgggaagagattgggactttggatatatagaattaagtttgaagacttattctt 25357870  T
Q  242 gtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggt 338  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||| ||  |||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  25357871 gtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggatagctgctctctcccctagactaggtcagtattggacctaactgggt 25357970  T
Q  339 caacaaatt 347  Q
     ||||||||    
T  25357971 aaacaaatt 25357979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 162 - 346
Target Start/End: Original strand, 11853549 - 11853732
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  11853549 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 11853643  T
Q  261 ttgtaacgaaactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  11853644 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 11853732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 84 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 40999208 - 40999071
Alignment:
Q  84 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 183  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||   ||||||||||||| ||   || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  40999208 caacaagaaaactaggggttgtatagagtttg-ctcttgacaacaaacactaggattg--agattgattcacctaggaaaacattattaggattg-agtc 40999113  T
Q  184 tcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 225  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40999112 tcttggtcacgggaagagatcgagactttgggtagaattagg 40999071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 150 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 3982374 - 3982186
Alignment:
Q  150 attcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaga-ttgagactttgggtagaatt-aggcgggagacttattcttgtaac 246  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||   | ||||| |||||||||||    
T  3982374 attcaccttggagaaacactattaggattg-agtttcttggtcacgggaagagatttgggactttgggtagaattaagtttgaagactgattcttgtaac 3982276  T
Q  247 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaac 333  Q
     | ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  3982275 actttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccctcatactaggtcactattggaccgaac 3982186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 10047447 - 10047383
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10047447 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 10047383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 39246062 - 39245998
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39246062 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 39245998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 162 - 367
Target Start/End: Original strand, 4570094 - 4570296
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || |||||    
T  4570094 aaacactattaggatcg-agtctcttggtcacgggaagaggttgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctct 4570188  T
Q  261 ttgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgt 356  Q
    |||||| |||||||||  ||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| || |||||||||  ||||||    
T  4570189 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagact-ggtcatcattagaccgaactgtgtaaacaaattc--ttgtgt 4570285  T
Q  357 tcttcttcttc 367  Q
    |||||||||||    
T  4570286 tcttcttcttc 4570296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 65 - 310
Target Start/End: Original strand, 9022362 - 9022605
Alignment:
Q  65 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgg-gaa 163  Q
    ||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||| ||| ||   ||||| | ||||||||||| |||| | |  |||||||||||||| |||    
T  9022362 aaacaagggtttagaagt-caacatcaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacactatggttggga--ttgattcaccttggagaa 9022455  T
Q  164 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac--ccattgatttctct 260  Q
    ||| ||||||||| | | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||   | ||||| |||||||||||  | |||||| |||||    
T  9022456 acagtattaggatagaatt-tcttggtcacgggaagagattgagactttgggttgaattaggtttgaagactaattcttgtaacctctattgatatctct 9022554  T
Q  261 ttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccccca 310  Q
    |||||| |  |||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||    
T  9022555 ttgtaaagttactcatcattatagtggaacaaagggctgctctctccccca 9022605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 162 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 5336964 - 5336757
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||| ||  | || |||||    
T  5336964 aaacactgttaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctcttatatctct 5336867  T
Q  261 ttgt-aacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtc-atattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgtt 357  Q
    |||| || |||| |||||| |||||||||  |||| |||||||||||||| | | |||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||| ||||||||    
T  5336866 ttgtaaaagaaattcatcattatagtggaacggagagctgctctctcccctatagtaggtcaatattggactgaactgattaaacaaattcttttgtgtt 5336767  T
Q  358 cttcttcttc 367  Q
    || |||||||    
T  5336766 ctccttcttc 5336757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 5269220 - 5269284
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5269220 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 5269284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 165 - 360
Target Start/End: Original strand, 8529270 - 8529463
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||   || ||||||||    
T  8529270 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactca---atatctctttg 8529364  T
Q  264 taacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||| |||||||||  ||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  8529365 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc--ttgtgttct 8529462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 165 - 360
Target Start/End: Original strand, 18586969 - 18587162
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || ||||  ||||||| || ||   || ||||||||    
T  18586969 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactggttcttgttactca---atatctctttg 18587063  T
Q  264 taacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||| |||||||||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  18587064 taaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc--ttgtgttct 18587161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 280 - 343
Target Start/End: Original strand, 36315258 - 36315321
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 343  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36315258 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 36315321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 280 - 343
Target Start/End: Original strand, 36329467 - 36329530
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 343  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36329467 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 36329530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 347
Target Start/End: Original strand, 31300427 - 31300608
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  31300427 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 31300521  T
Q  264 taacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    ||| |||||||||  ||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  31300522 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagggctgctctct-ccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 31300608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 162 - 367
Target Start/End: Original strand, 36769479 - 36769682
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| |||||||   || |||| ||||||||||| ||   || |||||    
T  36769479 aaacactattaggatcg-agtttcttggtcacgggaagaggctgagactt-gggtaaaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctct 36769573  T
Q  261 ttgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgt 356  Q
    |||||| |||||||||  ||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||  ||||||    
T  36769574 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactggataaacaaattc--ttgtgt 36769671  T
Q  357 tcttcttcttc 367  Q
    ||| |||||||    
T  36769672 tctccttcttc 36769682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 162 - 346
Target Start/End: Original strand, 55822265 - 55822447
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  55822265 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgagactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 55822359  T
Q  261 ttgtaacgaaactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  55822360 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctct-ccccatactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 55822447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 5396700 - 5396764
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5396700 atagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5396764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 38152468 - 38152532
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38152468 atagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaa 38152532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 165 - 348
Target Start/End: Original strand, 4884877 - 4885060
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| ||| |||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  4884877 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgagactt-gggtataatcaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 4884971  T
Q  264 taacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattc 348  Q
    |||  ||||||||  ||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  4884972 taaaaaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc 4885060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 280 - 343
Target Start/End: Original strand, 6743444 - 6743507
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6743444 atagtggattggagggctgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 6743507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 5143327 - 5143263
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5143327 atagtgggttggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 5143263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 360
Target Start/End: Original strand, 15316961 - 15317153
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  15316961 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactca---atatctctttg 15317055  T
Q  264 taacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||| |||||||  |||| |||||||||   ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  15317056 taaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctct-ccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc--ttgtgttct 15317152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 16623322 - 16623386
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16623322 atagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaa 16623386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 31985663 - 31985726
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31985663 atagtggattggagagctgctctctcccc-agattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 31985726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 271 - 359
Target Start/End: Original strand, 47563021 - 47563109
Alignment:
Q  271 actcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  47563021 actcatcttatagtgaaacggagggctgctctctccccttgactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 47563109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 54867251 - 54867188
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54867251 atagttgattgaagggctgctctctcccc-agactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 54867188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 348
Target Start/End: Original strand, 4558314 - 4558496
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  4558314 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 4558408  T
Q  264 taacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattc 348  Q
    ||| |||||||||  ||| ||||||||  ||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  4558409 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagaactgctctctcccccagact-ggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc 4558496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 347
Target Start/End: Original strand, 16489352 - 16489533
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  16489352 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 16489446  T
Q  264 taacgaaactcat---catatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    ||| |||||||||    ||||||||||  |||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  16489447 taaagaaactcatatcaatatagtggaacggagagctgctctct-ccctagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaatt 16489533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16689119 - 16688936
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  16689119 cactattaggattg-agtctcttggtcacaggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 16689025  T
Q  264 taacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattc 348  Q
    ||| |||||||||  ||| ||||||||  |||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16689024 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccacaaactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc 16688936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 162 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 7050439 - 7050281
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || |||||    
T  7050439 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctct 7050345  T
Q  261 ttgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat 321  Q
    |||||| |||||||||  ||| ||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7050344 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagactaggtcat 7050281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 290 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 14789484 - 14789404
Alignment:
Q  290 ggagggctgctc--tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttctttt 371  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  14789484 ggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtgttcttc-tcttctttt 14789404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 346
Target Start/End: Original strand, 15831144 - 15831325
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| | |||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||   || ||||||||    
T  15831144 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gcgtagaattaggtttgaagactgattcttggaactca---atatctctttg 15831238  T
Q  264 taacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    ||| |||||||||  ||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||    
T  15831239 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactggataaacaaat 15831325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 4556238 - 4556056
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || |||||||| ||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  4556238 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactttgg-tagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 4556144  T
Q  264 taacgaaactcatca---tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattc 348  Q
    ||| ||| |||||     |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||    
T  4556143 taaagaa-ctcatatgattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattaaaccgaactgggtaaacaaattc 4556056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 24333877 - 24333813
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || |||||    
T  24333877 atagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgagttaacaa 24333813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 25862051 - 25862115
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25862051 atagtggattggagggccgctctcttccccatattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 25862115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 230 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 3578786 - 3578668
Alignment:
Q  230 agacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattgga 327  Q
    ||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||| |  ||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| || |||| ||    
T  3578786 agactaattcttgtaacattttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaatggagagctg-tctctcccccagactaggccagtattaga 3578688  T
Q  328 ccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  3578687 ccgaactgggtaaacaaatt 3578668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 348
Target Start/End: Original strand, 15312319 - 15312502
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 263  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||   || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  15312319 cactattaggattg-agtcgcttggtcacgggaagatgctgtgactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 15312413  T
Q  264 taacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattc 348  Q
    ||| |||||||||  ||| ||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  15312414 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctggtctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaattc 15312502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 162 - 346
Target Start/End: Original strand, 16638827 - 16639011
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| |||   | ||||| ||||||||||||| |  || |||||    
T  16638827 aaacactgttaggattg-agtctcttggtcacaggaagagattgagac-ttgggtagaatgaggtttgaagactgattcttgtaaccc-tcaatatctct 16638923  T
Q  261 ttgtaacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| |||||||  |||| |||||||||  |||| ||||||||||  |||||| |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||    
T  16638924 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctct--cccagagtaggtcataattagactgaactgggtaaacaaat 16639011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 367
Target Start/End: Original strand, 36771396 - 36771599
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || |||||    
T  36771396 aaacactattatgattg-agtctcttggtcatgggaagaggctgtgactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctct 36771490  T
Q  261 ttgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgt 356  Q
    |||||| |||||||||  ||| ||||||||   ||| |||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||  ||||||    
T  36771491 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctacgccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaattc--ttgtgt 36771588  T
Q  357 tcttcttcttc 367  Q
    ||| |||||||    
T  36771589 tctccttcttc 36771599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 335
Target Start/End: Original strand, 39774335 - 39774389
Alignment:
Q  281 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactg 335  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39774335 tagtggattggagagctgctctatcccccagagtaggtcatattggaccgaactg 39774389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 338
Target Start/End: Original strand, 1983330 - 1983387
Alignment:
Q  281 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggt 338  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  1983330 tagtggattggagagctgctatctcccccatagtaggtcatattggaccgaactgggt 1983387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 334
Target Start/End: Original strand, 34495853 - 34495906
Alignment:
Q  281 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaact 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  34495853 tagtggattggagggctgctctctcccccagagtaagtcatgttggaccgaact 34495906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 3777617 - 3777553
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3777617 atagtggattggagagctactctctcctctagattaggttatattggaccgaactgggtcaacaa 3777553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 3796548 - 3796612
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3796548 atagtggattagagagttgctctctcccccatattaggtcatattggacggaactgggtcaacaa 3796612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 5147741 - 5147681
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5147741 tggactggagagctgctccctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5147681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 279 - 359
Target Start/End: Original strand, 6133105 - 6133185
Alignment:
Q  279 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||||||  ||| | |||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  6133105 tatagtggaacggatgactgctctctcacccagactaggtcaatttggatcgaattgggtcaacaaattcttttgtgttct 6133185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 16630709 - 16630773
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  16630709 atagtggattggagagctgttctctcctccagattatgtcatattggaccgaactaggtcaacaa 16630773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 28468558 - 28468621
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  28468558 atagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattgg-ctgaactgggtcaacaa 28468621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 347
Target Start/End: Original strand, 26557823 - 26557922
Alignment:
Q  250 ttgatttctctttgtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    ||||| ||||||||||| |  ||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  26557823 ttgatatctctttgtaaagttactcatcgttatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaagtcagtattggaccgaactaggtaaacaaatt 26557922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 91 - 207
Target Start/End: Original strand, 10114412 - 10114522
Alignment:
Q  91 aaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggt 190  Q
    ||||||||||||||||  |||| || ||||| | |||||||||||||||| | |  ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10114412 aaaactagggtttgta--gagtctg-ctcttggcaacaaacactagggttggga--ttgattcactttaggaaacactattaggatt-gagtctcttggt 10114505  T
Q  191 tacgggaagagattgag 207  Q
     |||  |||||||||||    
T  10114506 cacgataagagattgag 10114522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 38270158 - 38270120
Alignment:
Q  197 aagagattgagactttgggtagaattaggcgggagactt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38270158 aagagattgagactttgggtagaattaggcgggagactt 38270120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 305 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 52942527 - 52942473
Alignment:
Q  305 cccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  52942527 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttct 52942473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 147 - 266
Target Start/End: Original strand, 54906722 - 54906843
Alignment:
Q  147 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattga-gactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgt 243  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||| | |||||| ||||||||||||   || |||| ||||||||    
T  54906722 ttgattcaccatggagaaacactattagaattg-agtctcttggtcactggaagagattcaagactttaggtagaattaggtttgaagactgattcttgt 54906820  T
Q  244 aacccattgatttctctttgtaa 266  Q
    ||| | ||||| |||||||||||    
T  54906821 aactctttgatatctctttgtaa 54906843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 3937316 - 3937259
Alignment:
Q  302 tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3937316 tctccctcagactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcatttgtgttct 3937259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 5112304 - 5112247
Alignment:
Q  281 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggt 338  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  5112304 tagtggattggagagctgctctcacccccaaagtagatcatattggaccgaactgggt 5112247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 3814088 - 3814029
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  3814088 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 3814029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 5732729 - 5732670
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  5732729 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 5732670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 9224428 - 9224487
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  9224428 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 9224487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 18855791 - 18855732
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  18855791 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 18855732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 24742004 - 24741945
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  24742004 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 24741945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 29760705 - 29760646
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  29760705 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 29760646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 51520521 - 51520462
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  51520521 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-cagaactgggtcaacaa 51520462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 25614048 - 25613938
Alignment:
Q  256 tctctttgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctt 351  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||| ||| ||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||  |    
T  25614048 tctctttgtaaagaaactcatatcattataatggaaaggagagctgctctctcccccagagtaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaattc--t 25613951  T
Q  352 tgtgttcttcttc 364  Q
    |||||||| ||||    
T  25613950 tgtgttctccttc 25613938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 256 - 347
Target Start/End: Original strand, 10114561 - 10114654
Alignment:
Q  256 tctctttgtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||||||||||   |||||||||| ||||| ||  | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||    
T  10114561 tctctttgtaaattaactcatcattatagttgaacgaagagctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaattaggtaaacaaatt 10114654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 281 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 18377426 - 18377369
Alignment:
Q  281 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggt 338  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || |||||||||    
T  18377426 tagtggaatggagggctgctctctcctccagagtaggtcatatagaactgaactgggt 18377369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 9229215 - 9229274
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| |||||    
T  9229215 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggttaacaa 9229274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 12739594 - 12739550
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12739594 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 12739550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 24446675 - 24446639
Alignment:
Q  323 ttggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24446675 ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 24446639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 24446754 - 24446678
Alignment:
Q  232 acttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 307  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||   ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  24446754 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 24446678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 225
Target Start/End: Original strand, 25699752 - 25699810
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 225  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  25699752 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagactgggacttt-ggtagaattagg 25699810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 26175680 - 26175636
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26175680 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 26175636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29609654 - 29609591
Alignment:
Q  161 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 225  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  29609654 gaaacactattagaattg-agtctcttgatcacggcaagagattgagacttcgagtagaattagg 29609591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 36463433 - 36463389
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  36463433 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 36463389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 45347838 - 45347897
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||| | |||||||||||||||    
T  45347838 tggattggagagctgctctctcccccagattaagccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 45347897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 45357317 - 45357376
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||| | |||||||||||||||    
T  45357317 tggattggagagctgctctctcccccagattatgccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 45357376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 48893682 - 48893638
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  48893682 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 48893638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #168
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 324 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 3824630 - 3824595
Alignment:
Q  324 tggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3824630 tggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 3824595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #169
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 305 - 348
Target Start/End: Original strand, 49088865 - 49088908
Alignment:
Q  305 cccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattc 348  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  49088865 cccccagactaggtcaatttgggccgaactgggtcaacaaattc 49088908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #170
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 147 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 5516444 - 5516367
Alignment:
Q  147 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttgggtagaatta 223  Q
    |||||||| ||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  5516444 ttgattcatcttggagaaacaccattaggtttgg-gtctcttgctcacgggaagagattcgagactttgcgtagaatta 5516367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #171
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 253
Target Start/End: Original strand, 22295294 - 22295399
Alignment:
Q  148 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaatta-ggcgggagacttattcttgtaac 246  Q
    ||||||||||| | ||||| | ||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||| ||||| ||  | |||||||||| ||||||    
T  22295294 tgattcaccttagtaaacattgttaggattt-agtctcttggtcacggaaagagattgaaactttgagtataattagggttgaagacttattcctgtaac 22295392  T
Q  247 ccattga 253  Q
    || ||||    
T  22295393 cctttga 22295399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #172
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 271 - 347
Target Start/End: Original strand, 22295424 - 22295502
Alignment:
Q  271 actcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    ||||||||| |||||||| |||||   |||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  22295424 actcatcattatagtggaatggagaattgctctctcccccacactagggcagtattggactgaactgggtaaacaaatt 22295502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #173
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 281 - 344
Target Start/End: Original strand, 42599602 - 42599667
Alignment:
Q  281 tagtggattggagggctgctct--ctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||| | || |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  42599602 tagtggattggagggttgctctctctcccccatattatgtcatattggactgaattgggtcaacaa 42599667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #174
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 284 - 326
Target Start/End: Original strand, 56146732 - 56146774
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattgg 326  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  56146732 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 56146774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #175
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Original strand, 3760105 - 3760161
Alignment:
Q  168 tattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgag-actttgggtagaattag 224  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  3760105 tattaggattg-agtctcttggtcacggaaagagatttagcactttgggtagaattag 3760161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #176
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 80
Target Start/End: Original strand, 16455323 - 16455356
Alignment:
Q  47 gagagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 80  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16455323 gagagataaagggggctgaaacaagggtttagaa 16455356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #177
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 31
Target Start/End: Original strand, 25357634 - 25357663
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatca 31  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25357634 acttttactataaatatagaccttgtatca 25357663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #178
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 27417070 - 27416965
Alignment:
Q  237 ttcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgc-tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactg 335  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||  ||||||||   |||||||||||||| | |   ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  27417070 ttcttgtaacccatttgtatctctttgtaa--aaactcattg-atagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactg 27416974  T
Q  336 ggtcaacaa 344  Q
     ||||||||    
T  27416973 agtcaacaa 27416965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #179
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 52043765 - 52043736
Alignment:
Q  3 cttttactataaatatagaccttgtatcag 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52043765 cttttactataaatatagaccttgtatcag 52043736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #180
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Original strand, 5429803 - 5429847
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  5429803 tctctcccccagattaggttaagttggaccgaactgggtcaacaa 5429847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #181
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Original strand, 5871944 - 5871988
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||    
T  5871944 tctctcccccagattaggtcaagtttgaccgaactgggtcaacaa 5871988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #182
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 9927502 - 9927458
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  9927502 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgagtcaacaa 9927458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #183
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 12743969 - 12743925
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12743969 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 12743925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #184
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 12745358 - 12745314
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12745358 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 12745314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #185
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13072160 - 13072016
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 263  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||  || || ||||||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  13072160 cactattatgattg-agtctcttggtcactggaagaggctgtga-tttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 13072066  T
Q  264 taacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctccccca 310  Q
    ||| |||||||||  ||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  13072065 taaagaaactcatatcattatagtagaatggagagctgctctctccccca 13072016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #186
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 32
Target Start/End: Original strand, 28453686 - 28453714
Alignment:
Q  4 ttttactataaatatagaccttgtatcag 32  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28453686 ttttactataaatatagaccttgtatcag 28453714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #187
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 46147435 - 46147391
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  46147435 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 46147391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #188
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 47038455 - 47038411
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  47038455 tctctcccccagagtaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 47038411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #189
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 225
Target Start/End: Original strand, 47566496 - 47566554
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 225  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||    
T  47566496 cactattaggattg-agtctcttggtcacaggaagagactg-gaatttgggtagaattagg 47566554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #190
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 52467398 - 52467354
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  52467398 tctctccccgagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 52467354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 132)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 46 - 391
Target Start/End: Original strand, 43079640 - 43079984
Alignment:
Q  46 agagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaag 145  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  43079640 agagagatag-gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgg 43079738  T
Q  146 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43079739 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 43079838  T
Q  246 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43079839 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 43079938  T
Q  346 ttcctttgtgttcttcttcttcttttgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43079939 tttctttgtgttcttgttcttcttttgttcttctcgccgttgtttt 43079984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 46 - 391
Target Start/End: Original strand, 43082010 - 43082355
Alignment:
Q  46 agagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaag 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  43082010 agagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgg 43082109  T
Q  146 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43082110 gttgattcaccttgggaaacactatcaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaa 43082209  T
Q  246 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43082210 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 43082309  T
Q  346 ttcctttgtgttcttcttcttcttttgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43082310 tttctttgtgttcttcttcttcttttgttcttctcgacgttgtttt 43082355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Original strand, 32339304 - 32339691
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32339304 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttga--gagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 32339401  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32339402 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggtaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagag 32339500  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32339501 attggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgct 32339600  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  32339601 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggttaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttatttt 32339691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 2 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 24873523 - 24873178
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24873523 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 24873424  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24873423 ttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctttggaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagag 24873324  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 301  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24873323 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccgattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 24873224  T
Q  302 tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  24873223 tctcccccatactaggtcagattggaccgaattgagtcaacaaatt 24873178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 28283561 - 28283174
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  28283561 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggt 28283462  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  28283461 ttgtatagagtttgactctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttacgggaagag 28283363  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 301  Q
    |||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28283362 attggggctttgggtagaattaggtggtagacttattcttgcaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 28283263  T
Q  302 tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28283262 tct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 28283174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Original strand, 15809214 - 15809600
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15809214 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttga--gagagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 15809311  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  15809312 ttgtatagagtttgtct-tttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaa 15809409  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15809410 actaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgct 15809509  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15809510 ctcttccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 15809600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 49 - 391
Target Start/End: Original strand, 27829337 - 27829678
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  27829337 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 27829436  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27829437 gattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggaccttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 27829535  T
Q  249 attgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattc 348  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27829536 attgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 27829635  T
Q  349 ctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
     |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27829636 ttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 27829678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 49 - 391
Target Start/End: Original strand, 27827026 - 27827367
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  27827026 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 27827125  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27827126 gattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacaggaagaggctgggaccttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 27827224  T
Q  249 attgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattc 348  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27827225 attgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 27827324  T
Q  349 ctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
     |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27827325 ttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 27827367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 2 - 362
Target Start/End: Original strand, 3874005 - 3874363
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||    
T  3874005 acttttactataaatatagactttgtatcaggctaaactttga--gagagatagcgggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaaagt 3874102  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3874103 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-tagtctcttggttacgggaagag 3874201  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3874202 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 3874301  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttct 362  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3874302 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 3874363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 22685002 - 22684606
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatcttt----gaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaacta 97  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||   || ||||    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  22685002 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagagagagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaacta 22684903  T
Q  98 gggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacggga 197  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22684902 gggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacggga 22684804  T
Q  198 agagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc---attgatttctct-ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggag 293  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  ||||    
T  22684803 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccaatattgatttctctattgtaacgttactcatcatatagtggaacggag 22684704  T
Q  294 ggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22684703 ggctgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 22684606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 391
Target Start/End: Original strand, 44720841 - 44721225
Alignment:
Q  1 gacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||    || ||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |     
T  44720841 gacttttactataaatatagaccttatatcaaagcaaactttga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactatgt 44720934  T
Q  101 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaa-cactattaggattggagtctcttggttacgggaag 199  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44720935 tttgtatagagtctgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaag 44721033  T
Q  200 agattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgc 299  Q
    ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44721034 aggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagagctgc 44721133  T
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44721134 tctctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 44721225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 46 - 391
Target Start/End: Original strand, 608771 - 609117
Alignment:
Q  46 agagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaag 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  608771 agagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagg 608870  T
Q  146 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 245  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  608871 gttgattcaccttaggaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 608969  T
Q  246 cccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  608970 cccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 609069  T
Q  345 attc-ctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    ||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  609070 attctttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttcttgccgttgtttt 609117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 49 - 391
Target Start/End: Original strand, 18810748 - 18811089
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||    
T  18810748 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggtt 18810847  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18810848 gattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaataggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 18810946  T
Q  249 attgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattc 348  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  18810947 attgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattc 18811046  T
Q  349 ctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
     |||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||    
T  18811047 ttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgctgtcgtttt 18811089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Original strand, 4424017 - 4424400
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||   || ||||||      |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  4424017 acttttactataaatacagaccttgtatcagagcaaactttga------gatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggt 4424110  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4424111 ttgtatagagtttgtcgcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccgtgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagag 4424209  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    ||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||   ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  4424210 attggagctttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttatcttttgtaacattactcatcatatagtggatcagagggctgct 4424309  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4424310 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 4424400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Original strand, 14807750 - 14808111
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14807750 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 14807843  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14807844 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagag 14807942  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctg-- 298  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||      
T  14807943 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgct 14808042  T
Q  299 --------ctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
            ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14808043 ctctccccctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 14808111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Original strand, 15072709 - 15073061
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  15072709 acttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactatggt 15072802  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga- 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||     
T  15072803 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttttagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgagaagag 15072901  T
Q  201 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgc 299  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  15072902 ggttgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatacagtggaacggagggctgc 15073001  T
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15073002 tctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttct 15073061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 28251903 - 28251552
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||      ||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  28251903 acttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactttga------gatagagtgggttgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggt 28251810  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28251809 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagag 28251711  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
      || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28251710 gctgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttataacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 28251611  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28251610 ctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 28251552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 30480798 - 30480488
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30480798 gagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 30480699  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30480698 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 30480600  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||||| |||| |||||||||  | ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  30480599 attgatatctcttttgtaacgttagtcatcatatagtgaaatggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 30480500  T
Q  348 cctttgtgttct 359  Q
    | ||||||||||    
T  30480499 cttttgtgttct 30480488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 2 - 358
Target Start/End: Original strand, 15067980 - 15068330
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  15067980 acttttactataaatataaaccttgtatcaacctaaactttga------gatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaaccagggt 15068073  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  15068074 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaatactattaggatt-gagtcttttggttacggaaagag 15068172  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  15068173 gttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatataatggaacggagggctgct 15068272  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 358  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  15068273 ctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggccaacaaattcttttgtgttc 15068330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Original strand, 43530123 - 43530497
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  43530123 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttga--gagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaac----------- 43530209  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  43530210 --gtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctctcggttacgggaagag 43530306  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43530307 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcctgtaacccattgatttctcttttgtaacgctactcatcatatagtggatcggagggctgct 43530406  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
     |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  43530407 gtctctcccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttcttgccattgtttt 43530497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 3 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 27107232 - 27106884
Alignment:
Q  3 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtt 102  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| | ||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27107232 cttttactataaatatagacattgtatcagtataaaccttga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 27107139  T
Q  103 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaga 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27107138 tgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaga 27107040  T
Q  203 ttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 301  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||  |  ||||||||||||||| |  |||||||||||     
T  27107039 ttgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatagatatctcttttgtagggttactcatcatatagtgaaacggagggctgcta 27106940  T
Q  302 tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgtt 357  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  27106939 tctcctccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattattttgtgtt 27106884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 49 - 391
Target Start/End: Original strand, 18812933 - 18813263
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||           |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||    
T  18812933 gagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag-----------agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 18813021  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18813022 gattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttgggtacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 18813120  T
Q  249 attgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattc 348  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  18813121 attgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccatattaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 18813220  T
Q  349 ctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
     |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  18813221 ttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgtcgtttt 18813263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 14419527 - 14419175
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| | ||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  14419527 acttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggt 14419434  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14419433 ttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacattggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagatt-gagtctcttggttacgggaagag 14419335  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgc 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||| |  |||||||| ||||||| |   || ||||||    
T  14419334 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatgtcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatggctgc 14419235  T
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14419234 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 14419175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Original strand, 1225206 - 1225517
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  1225206 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactacggtttgagggtt 1225305  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  1225306 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactc 1225404  T
Q  249 attg--atttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    ||||  || ||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||| ||| |||||||||| || |||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  1225405 attgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggccgctctctccctcatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 1225504  T
Q  347 tcctttgtgttct 359  Q
    || ||||||||||    
T  1225505 tcttttgtgttct 1225517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 49 - 355
Target Start/End: Original strand, 27911055 - 27911359
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  27911055 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaag-gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 27911153  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  27911154 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactc 27911252  T
Q  249 attgatttctct-ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||||| ||||| |||||| |  ||||||||||||||| |  |||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  27911253 attgatatctctattgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctct-ccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaaaaaatt 27911351  T
Q  348 cctttgtg 355  Q
    | ||||||    
T  27911352 cttttgtg 27911359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 49 - 355
Target Start/End: Original strand, 27957474 - 27957778
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  27957474 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaag-gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 27957572  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  27957573 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactc 27957671  T
Q  249 attgatttctct-ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||||| ||||| |||||| |  ||||||||||||||| |  |||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  27957672 attgatatctctattgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctct-ccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaaaaaatt 27957770  T
Q  348 cctttgtg 355  Q
    | ||||||    
T  27957771 cttttgtg 27957778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 13858820 - 13858470
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| | ||||      ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13858820 acttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttga------gatagagggggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 13858727  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  13858726 ttgtatagagtttgtctcttgacaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtttcttggttacgggaagag 13858628  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgc 299  Q
    |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| || |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |   |||||||||    
T  13858627 attggggctttgggtagaattaagcgggagacttattcttgcagcccatt-atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgc 13858529  T
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  13858528 tctctcccccagactaggtcaatttggacagaactgggtaaacaaatt-ctttgtgttct 13858470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Original strand, 41384785 - 41385094
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41384785 gagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggtt 41384883  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||| |||||| || |||||||||| |    
T  41384884 gattcaccttgggaaacaccattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggagctttaggtagaattaggtgggagaatttttcttgtaactc 41384982  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  41384983 attgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 41385082  T
Q  348 cctttgtgttct 359  Q
    | ||| ||||||    
T  41385083 cttttctgttct 41385094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 50 - 359
Target Start/End: Original strand, 36865579 - 36865887
Alignment:
Q  50 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttg 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||    
T  36865579 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttgagggttg 36865678  T
Q  150 attcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36865679 attcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctct---tcacgggaagagattggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 36865774  T
Q  250 ttgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccccc-agactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    || || |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  36865775 ttaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctcccccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaat 36865874  T
Q  347 tcctttgtgttct 359  Q
    ||  |||||||||    
T  36865875 tctcttgtgttct 36865887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Original strand, 25952561 - 25952871
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  25952561 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaataaaattagggtt-gtatatagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 25952659  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  25952660 gattcaccttggaaaacaatattaggattg-agtctcttggttacgagaagaaattgagacattgggtagaattaggcagaagacttattcttgtaactc 25952758  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| |||| |||||||    |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||    
T  25952759 attgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactaggtcaacaaat 25952858  T
Q  347 tcctttgtgttct 359  Q
    || ||||||||||    
T  25952859 tcttttgtgttct 25952871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 49 - 254
Target Start/End: Original strand, 14477316 - 14477520
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  14477316 gagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 14477415  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14477416 gattcaccttgggaaacgctattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatcc 14477514  T
Q  249 attgat 254  Q
    ||||||    
T  14477515 attgat 14477520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 49 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 5372472 - 5372160
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  5372472 gagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttatatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 5372374  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  5372373 aattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagagattgggactttgagtataattaggcggcagacttattcttgtaactc 5372275  T
Q  249 attgatttc-tctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctct-cccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaa 345  Q
    |||||| || | ||||||| |  |||||||| ||||||| |  |||||| | |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||    
T  5372274 attgatatcttttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggttactctctccccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaataaa 5372175  T
Q  346 ttcctttgtgttctt 360  Q
    ||  ||| |||||||    
T  5372174 ttattttctgttctt 5372160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Original strand, 41382672 - 41383012
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | ||||      |||||| |||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||    
T  41382672 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttga------gatagatggggctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggt 41382765  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||           |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41382766 ttgtatagaatttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacct-----------attatgattg-agtctcttggttacgggaagag 41382853  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |   ||||||||||    
T  41382854 attggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgct 41382953  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  41382954 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 41383012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 3 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 33541723 - 33541507
Alignment:
Q  3 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtt 102  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| | ||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33541723 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacattga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 33541630  T
Q  103 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaga 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  33541629 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggatt-gagtatcttggttacgggaagaga 33541531  T
Q  203 ttgagactttgggtagaattaggc 226  Q
    ||| |||||| |||||||||||||    
T  33541530 ttgggacttttggtagaattaggc 33541507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 15186005 - 15185699
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||   || |||||||||| ||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  15186005 gagataaaggtgactgaaacaagggtttagaaagaaaataacaaaactatggtttatataaagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 15185906  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattg-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 247  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15185905 gattcaccttgtaaaacactattagaattgagtctctcttggttacgggaagaga-------tttgggtagaattaggcgagagacctattcttgtaacc 15185813  T
Q  248 cattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaa 345  Q
    ||||||| |||| ||| ||| |  |||||||| ||||||| |  ||||| ||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15185812 cattgatatctcttttttaaggttactcatcattatagtgaaacggaggactgttctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 15185713  T
Q  346 ttcctttgtgttct 359  Q
    ||| ||| ||||||    
T  15185712 ttcttttttgttct 15185699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 99 - 359
Target Start/End: Original strand, 15956051 - 15956308
Alignment:
Q  99 ggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaa 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||| |||||||    
T  15956051 ggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg---gttgattcaccttgggaaacactgttaggattgaa-tcttttggtcacgggaa 15956145  T
Q  199 gagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggc 296  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  ||||||     
T  15956146 gagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggt 15956245  T
Q  297 tgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    | ||||||||| |||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  15956246 ttctctctccctcagattaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtattct 15956308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 49 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 3005922 - 3005626
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggt 147  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||  |  ||||||| |||||||||||||||| |||||   |||||||| ||||||| ||   |    
T  3005922 gagatagagggggctggaaacaagggtttagaaa--caaataacaaactagagtttgtatagagtttg-ctcttaacaacaaacaatagggttgga---t 3005829  T
Q  148 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 247  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3005828 tgattcactttggaaaacactattagcattg-agtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatc 3005730  T
Q  248 cattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||| |||| ||||||| |   ||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  3005729 cattgatatctcttttgtaaagttgctcatcattatagtggaacggaggggtgctctctcccccagaccaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaa 3005630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 347
Target Start/End: Original strand, 21482322 - 21482649
Alignment:
Q  3 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtt 102  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||  ||| ||||||      ||||||| || ||||||||||||||||||||          |||||||||||    
T  21482322 cttttactataaatatagaatttgtatcagagtaaactttga------gatagagtggactgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtt 21482407  T
Q  103 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaga 202  Q
    |||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||| |   ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21482408 tgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg---gttgagtcaccttgggaaacactattaagattg-agtctcttggttatgggaagaga 21482502  T
Q  203 ttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgct 300  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||  | |  |||||||||||    
T  21482503 ttggggctttgggtagaattaggcgagtgacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataaagaaacggagggctgct 21482602  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  21482603 ctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaatt 21482649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 49 - 338
Target Start/End: Original strand, 21480554 - 21480832
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||  ||||    
T  21480554 gagatagatggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtatggagtttg-ctcttggcaacaaacactagg-tttg--ggtt 21480641  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21480642 gattcaccttgggaaacactattagaattg-agtctcttggttacgggaagatattggggtttttggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaaccc 21480740  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggt 338  Q
    |||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  21480741 attgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaacgaactgggt 21480832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 5623033 - 5622878
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  5623033 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctattgggaacaaacactagggtttgagggtt 5622934  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 205  Q
    |||||| ||| ||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  5622933 gattcatctttggaaacattatttggatt-gagtctcttgattacgggaagagattg 5622878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 347
Target Start/End: Original strand, 31162212 - 31162551
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaa-caacaaaactagg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||| | ||||      || |||||||||| ||| ||| ||||||||||  ||| |||||||  |||     
T  31162212 acttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaaccttga------gaaagagggggctaaaaacaaaggtttagaaa--caagcaacaaat-tagt 31162302  T
Q  100 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaag 199  Q
    ||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||  ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  31162303 gtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactaacgttag--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggtcaccggaag 31162398  T
Q  200 agattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggct 297  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||    |||||||| |||||||||   |||||||    
T  31162399 agattgggactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacagagggct 31162498  T
Q  298 gctctct--cccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  31162499 gctctctcccccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 31162551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 49 - 187
Target Start/End: Original strand, 26775241 - 26775378
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26775241 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaatactagggtttgtatatagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 26775340  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctctt 187  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  26775341 aattcaccttggaaaacactattagaatt-gagtctctt 26775378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 145 - 347
Target Start/End: Original strand, 31035253 - 31035459
Alignment:
Q  145 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  31035253 ggttgattcaccttgggaaacaccgttatgattg-agtctcttggtcacaggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaagacttattcttgt 31035351  T
Q  244 aacccattgatttctctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagac--taggtca-tattggaccgaactgggtc 339  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||     
T  31035352 aaccctttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactataggtcagtattggaccgaactgggta 31035451  T
Q  340 aacaaatt 347  Q
    ||||||||    
T  31035452 aacaaatt 31035459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 132 - 280
Target Start/End: Original strand, 181622 - 181772
Alignment:
Q  132 actagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatt-aggattggagtctcttggttacg--ggaagagattgagactttgggtagaattaggcgg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  181622 actagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatttaggatta-agtctcttagttacgcgggaagagaatgggactttgggtagaattaggcgg 181720  T
Q  229 gagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcata 280  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||    
T  181721 aagacttattcttgtaacccattgatatctctttgtaaagttactcatcata 181772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 35872713 - 35872555
Alignment:
Q  3 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtt 102  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| | ||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     |||||||    
T  35872713 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaac-----tagggtt 35872625  T
Q  103 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatta 172  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35872624 tgtatagagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 35872555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 49 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 37214505 - 37214317
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaact-------------------agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||                   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37214505 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacttggttacgggaagagattgagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 37214406  T
Q  130 acactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgg 228  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||          | ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  37214405 acactagggtttgagggttgattcaccttgggaaaca----------ttgagtctcttggttacgggaagcgattggaactttgggtagaattaggcgg 37214317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 147 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 31578476 - 31578273
Alignment:
Q  147 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 245  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||    
T  31578476 ttgattcaccttgggaaacactgttatgattg-agtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 31578378  T
Q  246 cccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaac 342  Q
    ||  ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  31578377 ccttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctctcccctagactaggtcagtataggaccgaactgggtaaac 31578278  T
Q  343 aaatt 347  Q
    |||||    
T  31578277 aaatt 31578273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 12517362 - 12517248
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||   || ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12517362 acttttactatatatatataccttgtatcagagcaaactttga----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 12517267  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctct 120  Q
    |||||||||||||||||||    
T  12517266 ttgtatagagtttgtctct 12517248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 147 - 337
Target Start/End: Original strand, 17847661 - 17847848
Alignment:
Q  147 ttgattcaccttgg--gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 243  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||    
T  17847661 ttgattcaccttgaacgaaacactattaggattgaa-tctcttgatcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgt 17847759  T
Q  244 aacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactggg 337  Q
    || || ||||| |||| |||||    ||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  17847760 aa-cctttgatatctcttttgt----aaaatcat--tatagtggaatggagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccaaactggg 17847848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 91 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 31573975 - 31573847
Alignment:
Q  91 aaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggt 190  Q
    ||||||||| ||||||  |||||| |||||| | ||||||||||| |||| | |  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  31573975 aaaactaggatttgta--gagttt-tctcttggcaacaaacactatggttggga--ttgattcaccttgggaaacactgttaggattg-agtctcttggt 31573882  T
Q  191 tacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31573881 cacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 31573847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 162 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 16757449 - 16757266
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  16757449 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 16757355  T
Q  261 ttgtaacgaaactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  16757354 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 16757266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 3886254 - 3886153
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||   || ||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3886254 acttttactataaatatagactttgtatcagagcaaactttga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 3886161  T
Q  102 ttgtatag 109  Q
    ||||||||    
T  3886160 ttgtatag 3886153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 162 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 9021289 - 9021093
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || |||||    
T  9021289 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctct 9021195  T
Q  261 ttgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgt 356  Q
    |||||| |||||||||  ||| ||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  9021194 ttgtaaagaaactcatatcattatagtagatcggagagctgctctctccaccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc--ttgtgt 9021097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 162 - 346
Target Start/End: Original strand, 28327908 - 28328091
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  28327908 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 28328002  T
Q  261 ttgtaacgaaactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  28328003 ttgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 28328091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 165 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 23179740 - 23179538
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||  || |||||||| || |||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  23179740 cactattaggattg-agtctcttggtcaccggaagaggctgtgactttgg-taaaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 23179646  T
Q  264 taacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||| |||||||||  ||| ||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  23179645 taaagaaactcatatcattatagtggaacggatagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc--ttgtgttct 23179548  T
Q  360 tcttcttctt 369  Q
    ||||||||||    
T  23179547 tcttcttctt 23179538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 4696625 - 4696689
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4696625 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaa 4696689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 9765848 - 9765912
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9765848 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9765912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 26403259 - 26403323
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26403259 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 26403323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 165 - 346
Target Start/End: Original strand, 25684646 - 25684826
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 263  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||  | ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    ||||||||    
T  25684646 cactattaggattgaa-tctcttggtcacgggaagagacagggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctctttg 25684740  T
Q  264 taacgaaactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    ||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  25684741 taaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 25684826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 162 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 17799606 - 17799403
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| | ||| |||||||   || |||| |||||| |||| ||   || |||||    
T  17799606 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgagactt-gagtataattaggtttgaagactgattcttataactca---atatctct 17799512  T
Q  261 ttgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgt 356  Q
    |||||| |||||||||  ||| ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  17799511 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctctcccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc--ttgtgt 17799414  T
Q  357 tcttcttcttc 367  Q
    ||| |||||||    
T  17799413 tctccttcttc 17799403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 216 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 2468259 - 2468126
Alignment:
Q  216 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagac 313  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| | | ||||||||||||||| ||||||     
T  2468259 tagaattagacgggagacttattcttgtagcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaatagagggctgctctctctcccagat 2468160  T
Q  314 taggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||||||  |||||| ||||| ||| ||||||||    
T  2468159 taggtcaatttggacagaactaggtaaacaaatt 2468126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 162 - 347
Target Start/End: Original strand, 6376141 - 6376328
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||  |||||||||||   | ||||| |||||||| |||  ||||| |||||    
T  6376141 aaacactgttaagattg-agtctcttggtcacatgaagagattgagactttatgtagaattaggtttgaagactaattcttgttaccttttgatatctct 6376239  T
Q  261 ttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||||| |  |||||||| |||||||||   || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||    
T  6376240 ttgtaaagttactcatcattatagtggaacagaaggctgctctctccctcagactaggtcagtattggaccgaacttagtaaacaaatt 6376328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 7412409 - 7412345
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7412409 atagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 7412345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 23799606 - 23799670
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23799606 atagtggattggagggctgctctctcctccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 23799670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 162 - 346
Target Start/End: Original strand, 28895502 - 28895686
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| |||||||| || ||   || |||||    
T  28895502 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgttactca---atatctct 28895596  T
Q  261 ttgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| |||||||||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  28895597 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcctctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 28895686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 31071258 - 31071322
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31071258 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactcggtcaacaa 31071322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 104
Target Start/End: Original strand, 181536 - 181632
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||      ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||    
T  181536 acttttactataaatatagactttgtatcagactaaactttga------gatagagggggctgaaacaagggcttagaatggcaacaataaaactagggt 181629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 281 - 344
Target Start/End: Original strand, 19752424 - 19752487
Alignment:
Q  281 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19752424 tagtggattggagagctgctctctcccctagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 19752487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 84 - 178
Target Start/End: Original strand, 31035144 - 31035235
Alignment:
Q  84 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31035144 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacaccattaggattg 31035235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 162 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 4812669 - 4812486
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  4812669 aaacactattaggattg-agtcttttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 4812575  T
Q  261 ttgtaacgaaactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| |||| |||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  4812574 ttgtaaagaaaatcattcattatagtggatcggagagctgctctctccccaagactaggtcataattagaccgaactgggtaaacaaat 4812486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 162 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 16752704 - 16752522
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  16752704 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 16752610  T
Q  261 ttgtaacgaaactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  16752609 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctactctctcccc-agactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 16752522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 162 - 346
Target Start/End: Original strand, 28332631 - 28332814
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  28332631 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgagaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 28332725  T
Q  261 ttgtaacgaaactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  28332726 ttgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcctccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 28332814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 5702512 - 5702576
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5702512 ataggggattggagggatgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5702576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 19175783 - 19175847
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19175783 atagtggattggagagttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 19175847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 271 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 33541483 - 33541395
Alignment:
Q  271 actcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||    
T  33541483 actcatcatatagtgaaacggaaggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaaaaatttcttttgtgttct 33541395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 256 - 346
Target Start/End: Original strand, 28890855 - 28890949
Alignment:
Q  256 tctctttgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  28890855 tctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 28890949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 367
Target Start/End: Original strand, 33032657 - 33032857
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  33032657 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 33032751  T
Q  264 taacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||| |||||||||  ||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||  |||||||||||| || ||| |  ||||||||||    
T  33032752 taaagaaactcatatcattatagtggaatggagagctgctctctctcctagactaggtcatcattaaaccgaactgggtaaaaaaaat--tttgtgttct 33032849  T
Q  360 tcttcttc 367  Q
     |||||||    
T  33032850 ccttcttc 33032857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 294 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 37214314 - 37214251
Alignment:
Q  294 ggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgtt 357  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37214314 ggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 37214251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 360
Target Start/End: Original strand, 590797 - 590990
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    ||||||||    
T  590797 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctctttg 590891  T
Q  264 taacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||| |||||||||  ||| |||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| || ||||||  |||||||||    
T  590892 taaagaaactcatatcattatagtggatcagagagctgttctctcccccagactaggacatcattagaccgaactgggtaaataaattc--ttgtgttct 590989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 280 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 4456096 - 4456036
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtca 340  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  4456096 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggaccgaaccgggtca 4456036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 6127289 - 6127225
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6127289 atagtggattggagagctgctctcttccccaaattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 6127225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 29554964 - 29554809
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggag-acttattcttgtaacccattgatttctctttg 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||||||| |   ||  ||||||||||| ||| ||   || ||||||||    
T  29554964 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattatgtttgaatacttattcttggaactca---atatctctttg 29554870  T
Q  264 taacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat 321  Q
    ||| |||||||||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29554869 taaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcat 29554809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 1261983 - 1262046
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||    
T  1261983 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattgg-ttgaactgggtcaacaa 1262046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 26287969 - 26287906
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  26287969 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 26287906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 26301226 - 26301163
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  26301226 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 26301163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 26313220 - 26313157
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  26313220 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 26313157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 162 - 367
Target Start/End: Original strand, 30423212 - 30423418
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||   || |||| ||| ||||||  | |  || |||||    
T  30423212 aaacacttttaggattg-agtctcttggtcgcgggaagagattggaactttggatagaattaggtttgaagactaatttttgtaattc-tcaatatctct 30423309  T
Q  261 ttgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgt 356  Q
    |||||| |||||||||  ||| ||||||||   ||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||  ||||||    
T  30423310 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcctccagagtaggtcatcattagaccgaacagggtaaacaaattc--ttgtgt 30423407  T
Q  357 tcttcttcttc 367  Q
    ||| |||||||    
T  30423408 tctccttcttc 30423418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 13985262 - 13985176
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||   || ||| |||||||||||||    
T  13985262 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacaggaagagattcgggactttgggtagaattaggtttgaaactgattcttgtaaccc 13985176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 2468434 - 2468261
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||      ||||||||| |||||||||||| ||||||||          |||||| |||    
T  2468434 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttga------gatagagggagctgaaacaaggatttagaaatc--------aaactacggt 2468349  T
Q  102 ttgtata----gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggt 190  Q
    |||||||    ||||||| ||||| | |||||| ||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  2468348 ttgtatatatagagtttg-ctcttggcaacaaatactagggttgg---gttgattcaccttgggaaacactattagaatt-gagtctcttggt 2468261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 344
Target Start/End: Original strand, 18853196 - 18853260
Alignment:
Q  279 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  18853196 tatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 18853260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 344
Target Start/End: Original strand, 18870590 - 18870654
Alignment:
Q  279 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  18870590 tatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgga-tgaactgggtcaacaa 18870654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 28307628 - 28307571
Alignment:
Q  281 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggt 338  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  28307628 tagtggattggagagctgctctcatccccagagtaggtcattttggaccgaactgggt 28307571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 6311361 - 6311302
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  6311361 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 6311302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 6813747 - 6813687
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  6813747 tggattggagagctgctctctcccctagtgtaggttatattggaccgaactgggttaacaa 6813687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 7289947 - 7290006
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  7289947 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 7290006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 10689176 - 10689235
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  10689176 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 10689235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 25328299 - 25328358
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  25328299 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 25328358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 33037839 - 33037898
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  33037839 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 33037898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 36979441 - 36979382
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  36979441 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 36979382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 39784843 - 39784902
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  39784843 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 39784902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 368
Target Start/End: Original strand, 28228656 - 28228723
Alignment:
Q  302 tctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttct 368  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  28228656 tctcccccaaagtaggtcaatattggaccgaactaggtaaacacattcttttgtgttcttcttcttct 28228723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Original strand, 43081956 - 43081991
Alignment:
Q  1 gacttttactataaatatagaccttgtatcaggcta 36  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43081956 gacttttactataaatatagaccttgtatcaggcta 43081991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 286 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 30655708 - 30655651
Alignment:
Q  286 gattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  30655708 gattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 30655651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 147 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 33839120 - 33839043
Alignment:
Q  147 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattga-gactttgggtagaattagg 225  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  33839120 ttgattcaccttgaagaaacactattaggattg-agtctcttggtca--ggaagagattcaagactttgggtagaattagg 33839043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 343
Target Start/End: Original strand, 4733809 - 4733873
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggct-gctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 343  Q
    |||||||||||||| | | | ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  4733809 atagtggattggagagatcgatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 4733873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 4760108 - 4760167
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  4760108 tggattggagagctgctctctcccccatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 4760167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 333
Target Start/End: Original strand, 9054867 - 9054919
Alignment:
Q  281 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaac 333  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  9054867 tagtggattagagagctgctctctcctccagagtaggtcatattggactgaac 9054919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 10684285 - 10684344
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  10684285 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 10684344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 10930243 - 10930199
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10930243 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 10930199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Original strand, 15212910 - 15212954
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15212910 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 15212954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Original strand, 27811402 - 27811446
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27811402 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 27811446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Original strand, 33352274 - 33352318
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  33352274 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 33352318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 35745455 - 35745396
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  35745455 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 35745396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 35872474 - 35872438
Alignment:
Q  323 ttggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35872474 ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 35872438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 35872553 - 35872477
Alignment:
Q  232 acttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 307  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||   ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  35872553 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 35872477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Original strand, 40321204 - 40321248
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40321204 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 40321248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 147 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 13986011 - 13985933
Alignment:
Q  147 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttgggtagaattag 224  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||  | ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  13986011 ttgattcaccttggagaaacactattaggatt-gagactcttaatcacgggaagagattcgggactttgggtataattag 13985933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 306 - 360
Target Start/End: Original strand, 14477547 - 14477602
Alignment:
Q  306 ccccagactaggtcatattggaccgaactg-ggtcaacaaattcctttgtgttctt 360  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  14477547 ccccagactaggtcaatttggatcgaactgcggtcaacaaattcttttgtgttctt 14477602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 301 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 31566601 - 31566554
Alignment:
Q  301 ctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  31566601 ctctcccccatactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 31566554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Original strand, 43079584 - 43079619
Alignment:
Q  1 gacttttactataaatatagaccttgtatcaggcta 36  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43079584 gacttttactataaatatagaccttgtatcatgcta 43079619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 32
Target Start/End: Original strand, 6375988 - 6376018
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcag 32  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6375988 acttttactataaatatagaccttgtatcag 6376018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 32
Target Start/End: Original strand, 17847527 - 17847557
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcag 32  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17847527 acttttactataaatatagaccttgtatcag 17847557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 19491741 - 19491699
Alignment:
Q  302 tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19491741 tctcccccatagtaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 19491699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 162 - 348
Target Start/End: Original strand, 21033870 - 21034055
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| | | | ||||| |||||||| ||||   || |||| ||||||||||| ||   || |||||    
T  21033870 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacaggaagggctgg-gactt-gggtagaaataggtttgaagactaattcttgtaactca---atatctct 21033963  T
Q  261 ttgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattc 348  Q
    |||||| |||||||||  ||| ||||||||  ||||  ||||||| | ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21033964 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagatctgctcttttccccatactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc 21034055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 341
Target Start/End: Original strand, 40221869 - 40221910
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaa 341  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  40221869 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaa 40221910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 4743258 - 4743214
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  4743258 tctctcccccaaagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 4743214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Original strand, 5689395 - 5689439
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5689395 tctctcccccagatttggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 5689439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Original strand, 6599096 - 6599140
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6599096 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 6599140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Original strand, 6674549 - 6674593
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6674549 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 6674593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 12702678 - 12702634
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12702678 tctctcccctagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 12702634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 32
Target Start/End: Original strand, 31035068 - 31035096
Alignment:
Q  4 ttttactataaatatagaccttgtatcag 32  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31035068 ttttactataaatatagaccttgtatcag 31035096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Original strand, 43036547 - 43036591
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  43036547 tctctcctccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 43036591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 152)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 391
Target Start/End: Original strand, 47179651 - 47180039
Alignment:
Q  1 gacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47179651 gacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttg--agagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaggg 47179748  T
Q  101 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47179749 tttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 47179848  T
Q  201 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47179849 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 47179948  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47179949 ctct-ccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 47180039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 2 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 9463588 - 9463228
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9463588 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 9463489  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9463488 ttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagag 9463389  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9463388 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctc 9463289  T
Q  302 tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttct 362  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9463288 tctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttct 9463228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 391
Target Start/End: Original strand, 16226109 - 16226494
Alignment:
Q  1 gacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    || ||||||      |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16226109 gacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttga------gatagaggggtctaaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaggg 16226202  T
Q  101 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16226203 tttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 16226302  T
Q  201 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16226303 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 16226402  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16226403 ctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 16226494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 2 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 9459761 - 9459401
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  9459761 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagtcaacaacaaaactagggt 9459662  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9459661 ttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagag 9459562  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9459561 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctc 9459462  T
Q  302 tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttct 362  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9459461 tctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttct 9459401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 391
Target Start/End: Original strand, 47177300 - 47177688
Alignment:
Q  1 gacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47177300 gacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttg--agagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaggg 47177397  T
Q  101 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47177398 tttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatgggagtctcttggttacgggaaga 47177497  T
Q  201 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47177498 gattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 47177597  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47177598 ctct-ccccagactaggtcagattggatcgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 47177688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 31735863 - 31735476
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31735863 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaatgaga--tagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 31735766  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  31735765 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaaggtt-gagtctcttggttacgggaagag 31735667  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31735666 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgct 31735567  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31735566 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 31735476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Original strand, 47906207 - 47906564
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  47906207 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactatggt 47906306  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47906307 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagag 47906405  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  47906406 attggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgct 47906505  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47906506 ctctcccccagacttggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 47906564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Original strand, 28840621 - 28841005
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||    |||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  28840621 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttga----gagatacagggggatgaaacaagggtttagaaaggaaacaacaaaactagggt 28840716  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28840717 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagag 28840815  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 301  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28840816 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 28840915  T
Q  302 tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28840916 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 28841005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 49 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 10400125 - 10399783
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10400125 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggtt 10400026  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10400025 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttcggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 10399927  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  10399926 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 10399827  T
Q  348 cctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10399826 cttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 10399783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Original strand, 51749982 - 51750365
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   || ||| ||      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51749982 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttgga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 51750075  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51750076 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagag 51750174  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51750175 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 51750274  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51750275 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 51750365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 27337280 - 27336927
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27337280 acttttactataaatatagaccttgtattaggctaaactttga--gagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 27337183  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27337182 ttttataga-tttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgg-gtctcttggttacgggaagag 27337085  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 301  Q
      || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27337084 gctgtgactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 27336985  T
Q  302 tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27336984 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27336927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 5 - 392
Target Start/End: Original strand, 39932017 - 39932401
Alignment:
Q  5 tttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | || ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39932017 tttactataaatatagaccttgtatgagacaaaacttt----gagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 39932112  T
Q  105 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |    
T  39932113 tatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattaaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttacgggaagagact 39932211  T
Q  205 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  39932212 gagactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggagggctgctctc 39932311  T
Q  304 -tcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgttttt 392  Q
     ||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39932312 ttcccccatactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgttttt 39932401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 46432066 - 46431660
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagag---------------ggggctgaaacaagggtttagaaaagcaa 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||               |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46432066 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagagagagagagagagatgggggctgaaacaagggtttagaaaggcaa 46431967  T
Q  87 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctct 186  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46431966 caacaaaagtagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctct 46431868  T
Q  187 tggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtgg 286  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46431867 tggttacgggaagaggatgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtgg 46431768  T
Q  287 attggagggctgctctctc--ccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt--tgttcttctcgc 382  Q
    || ||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  46431767 atcggagggctgctctctcccccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttcttttgtgttcttctcgc 46431669  T
Q  383 cgttgtttt 391  Q
    |||||||||    
T  46431668 cgttgtttt 46431660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 2 - 392
Target Start/End: Original strand, 51752308 - 51752690
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   || ||| ||      ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||     
T  51752308 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttgga------gatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggtaacaacaaaattagggc 51752401  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  51752402 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgtgaaacactattag-attg-agtctcttggttacgggaagag 51752499  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 301  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51752500 gctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcaccatatagtggattggagggctgctc 51752599  T
Q  302 tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgttttt 392  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51752600 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgttttt 51752690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 5 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 15295183 - 15294789
Alignment:
Q  5 tttactataaatatagaccttgtatcaggctaatcttt--------gaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaact 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   || ||||        || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15295183 tttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagagagagagagatagagagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaact 15295084  T
Q  97 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacggg 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15295083 agggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacggg 15294985  T
Q  197 aagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggaggg 295  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| || ||||||    
T  15294984 aagaggttgggactttgggtagaattaggtgggagatttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 15294885  T
Q  296 ctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15294884 ctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 15294789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 27339472 - 27339118
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27339472 acttttactataaatatagaccttgtattaggctaaactttga--gagagatagagggggctgaaacaagggcttagaaaggcaacaataaaactagggt 27339375  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  27339374 ttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaatactattacgattg-agtctcttagttacgggaagag 27339276  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 301  Q
      |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  27339275 gctgagactttgggtagaattaggcgggcgacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgatc 27339176  T
Q  302 tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  27339175 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 27339118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Original strand, 28842436 - 28842820
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||   || ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28842436 acttttactataaatataaaccttgtatcagagcaaactttga----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 28842531  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  28842532 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacattgggaaacactattaggattg-agtctattggttacgggaagag 28842630  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 301  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||  ||    
T  28842631 gctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctaatc 28842730  T
Q  302 tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28842731 tctcccccagactaggtcaatttggacagaactaggtcaacaaattctattgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 28842820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Original strand, 13761780 - 13762162
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   || ||| ||      ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  13761780 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttgga------gatagagagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacataactagggt 13761873  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13761874 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgggggttgattcaacttggaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagag 13761972  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 301  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  13761973 tctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggaccggagggcttctc 13762072  T
Q  302 tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13762073 tctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 13762162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 2 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 2510666 - 2510309
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  2510666 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttga--gagagatagagggggctgaaacaagggtttataaaggcaaccacaaaactagggt 2510569  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  2510568 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctttggaaacactattaggatt-gagtcttttggttacgggaagag 2510470  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    |||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||| |  ||| |||||||    
T  2510469 atttggactttgggtagaattaggc-agagacttattcttgtaacccattgatttctctcttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggatggctgct 2510371  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttct 362  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2510370 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 2510309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 2 - 362
Target Start/End: Original strand, 20302402 - 20302755
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||   || ||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20302402 acttttattataaatatagaccttgtatcagagcaaactttga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 20302495  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  20302496 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttatgggaagag 20302594  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 301  Q
    | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| || |||    
T  20302595 actaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcagatagtggatcggaggactactc 20302694  T
Q  302 tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttct 362  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  20302695 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttcttct 20302755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 2 - 392
Target Start/End: Original strand, 24325599 - 24325990
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatcttt--gaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  24325599 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagagagatagagggggctgaaacaaggg-ttagaaaggcaacaacaaaactagg 24325697  T
Q  100 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24325698 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaag 24325796  T
Q  200 agattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctg 298  Q
    ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| || | | |||||    
T  24325797 aggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcgaatggctg 24325896  T
Q  299 ctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgttttt 392  Q
    ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  24325897 ctctctcccccagactaagtcaattttgaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtcctt-ttcttctttgtgttcttctcaccgttgttttt 24325990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Original strand, 20291400 - 20291782
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcag-gctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||       ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20291400 acttttactataaatatagaccttgtattagagcaaatttt-------gagatagagggagatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg 20291492  T
Q  101 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  20291493 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaagttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaaga 20291591  T
Q  201 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| || |    
T  20291592 gactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgattctcatcatatagtggatcggagggttgtt 20291691  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20291692 ctctcccccacactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttttgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 20291782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 12302848 - 12302492
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggc-taatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12302848 acttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttga--gagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactaggg 12302751  T
Q  101 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 200  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12302750 tttgtatagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaaga 12302652  T
Q  201 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgc 299  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  12302651 gattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttataactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgc 12302552  T
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12302551 tctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 12302492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Original strand, 15823489 - 15823840
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||      ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15823489 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactt------agagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 15823582  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  15823583 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaatatt-gagtctcttggttacgggaagag 15823681  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||   ||||||||||    
T  15823682 gctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgct 15823781  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15823782 ctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 15823840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 49 - 357
Target Start/End: Original strand, 6822999 - 6823306
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||    
T  6822999 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaa-actagggtttgtgggtt 6823097  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6823098 gattcaccttgggaaatactattaggattg-agtctcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactc 6823196  T
Q  249 attgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  6823197 attgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 6823296  T
Q  348 cctttgtgtt 357  Q
    | ||||||||    
T  6823297 cttttgtgtt 6823306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 2 - 354
Target Start/End: Original strand, 13215024 - 13215375
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13215024 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattttga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 13215117  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  13215118 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagag 13215216  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga----tttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggaggg 295  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||    |||||||| |||||||||  ||||||    
T  13215217 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatttttctcttttgtaaatttactcatcattatagtggaacggaggg 13215316  T
Q  296 ctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgt 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  13215317 ctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgcgtcaacaaattcttttgt 13215375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 50 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 17324932 - 17324623
Alignment:
Q  50 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttg 149  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17324932 agatacagggggctaaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactggggtttgtatagagtttgtctctatggaacaaacactagggtttgagggttg 17324833  T
Q  150 attcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17324832 attcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactca 17324734  T
Q  250 ttgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattc 348  Q
    ||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  17324733 ttgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 17324634  T
Q  349 ctttgtgttct 359  Q
     ||||||||||    
T  17324633 ttttgtgttct 17324623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 132 - 391
Target Start/End: Original strand, 16231630 - 16231889
Alignment:
Q  132 actagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggag 231  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16231630 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagcctttgggtagaattaggcgggag 16231729  T
Q  232 acttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccga 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16231730 acttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccga 16231829  T
Q  332 actgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16231830 act-ggtcaacaaatatctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 16231889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 38925816 - 38925468
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||      ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  38925816 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttga------gatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaactagggt 38925723  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38925722 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagag 38925624  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||  ||  |  |||||||||||    
T  38925623 attgagactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtaaaacggagggctgct 38925526  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  38925525 ctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttct 38925468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 3 - 362
Target Start/End: Original strand, 2617460 - 2617813
Alignment:
Q  3 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtt 102  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||   || ||||||      |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  2617460 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttga------gatagaggaggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtt 2617553  T
Q  103 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaga 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  2617554 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagg 2617652  T
Q  203 ttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 301  Q
     || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2617653 ctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 2617752  T
Q  302 tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttct 362  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||  |||||||| ||||    
T  2617753 tctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaataaattattttgtgtttttct 2617813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Original strand, 41646863 - 41647214
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||      ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41646863 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttga------gatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 41646956  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  41646957 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacttggtttttatggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtcacttggttacgggaagag 41647055  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  41647056 attgcgactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgct 41647155  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  41647156 ctctccatcagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttct 41647214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 5 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 21948526 - 21948226
Alignment:
Q  5 tttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21948526 tttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttga--gagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 21948429  T
Q  105 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |    
T  21948428 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-ggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagacgct 21948331  T
Q  205 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctc 303  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  21948330 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctc 21948231  T
Q  304 tcccc 308  Q
    |||||    
T  21948230 tcccc 21948226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Original strand, 39462462 - 39462813
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||      |||||||  ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  39462462 actttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttga------gatagagaaggctgaaacaaaggtttagaaatgcaaaaacaaaactagggt 39462555  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39462556 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagag 39462654  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| | || |  | ||||||||||||| |  |||| ||||||    
T  39462655 attgggactttgggtagaattaggcgggagaattattcttgtaaccctttgatatctcttttgaaaagttattcatcatatagtgaaacggagagctgct 39462754  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39462755 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 39462813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 49 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 50307844 - 50307544
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgaaggt 147  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  50307844 gagatatatggggctgaaaaaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggt 50307745  T
Q  148 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  50307744 tgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaact 50307646  T
Q  248 cattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  50307645 cattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 50307546  T
Q  347 tc 348  Q
    ||    
T  50307545 tc 50307544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Original strand, 18839571 - 18839882
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||    
T  18839571 gagatagagggggctgaaacaagggtttagataggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacagtagggttttagggtt 18839670  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18839671 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgagaagagaatgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 18839769  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |   |||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18839770 attgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctttcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 18839869  T
Q  347 tcctttgtgttct 359  Q
    || || |||||||    
T  18839870 tctttcgtgttct 18839882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 6995997 - 6995687
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  6995997 gagatagagggggccgaaacaacggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggtt 6995898  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |    
T  6995897 gattcaccttgggaaacactattaagatt-gagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggatactttttcttgtaactc 6995799  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||||  |||| ||| |||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  6995798 attgacatctcttttataacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 6995699  T
Q  348 cctttgtgttct 359  Q
    | ||||||||||    
T  6995698 cttttgtgttct 6995687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 50 - 359
Target Start/End: Original strand, 16428638 - 16428948
Alignment:
Q  50 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttg 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||| |||||    
T  16428638 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgacaacaaacactaaggtttgagggttg 16428737  T
Q  150 attcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 249  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16428738 attcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccca 16428836  T
Q  250 ttgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    ||||| |||| ||||||| |  |||||||| | ||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  16428837 ttgatatctcttttgtaaggttactcatcattttagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaatt 16428936  T
Q  348 cctttgtgttct 359  Q
    | ||||||||||    
T  16428937 cttttgtgttct 16428948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 161 - 391
Target Start/End: Original strand, 23785935 - 23786165
Alignment:
Q  161 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23785935 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 23786034  T
Q  261 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 360  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23786035 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttccttgtgttctt 23786134  T
Q  361 cttcttcttttgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23786135 cttcttcttttgttcttctcgccgttgtttt 23786165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 14098308 - 14097956
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||      |||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  14098308 actttcactataaatatagaccttgtatcaaactaaactttga------gatagaggggactgaaacaatggtttaaaaaggcaactacaaaactagggt 14098215  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14098214 ttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagag 14098116  T
Q  202 att-gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt-aacgaaactcatcatatagtggattggagggctg 298  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||  ||||||||||||||| |  |||||||||    
T  14098115 attagag-ctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctg 14098017  T
Q  299 ctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14098016 ctctctcccacaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 14097956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 9 - 359
Target Start/End: Original strand, 25127815 - 25128167
Alignment:
Q  9 ctataaatatagaccttgtatcaggc-taatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 107  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||   ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25127815 ctataaatataaaccttgtattagatgtaaaccttgagagagagatagaggggcctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 25127914  T
Q  108 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgag 207  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25127915 agagtttgtgtcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtgaaacactatttggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgag 25128013  T
Q  208 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctc 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||| || |  ||||||||||||||||    
T  25128014 acttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaattcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatattgaaacggagggctgctctctc 25128113  T
Q  306 ccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
     |||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25128114 tcccatactaggtcaattaggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 25128167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Original strand, 18307093 - 18307403
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18307093 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 18307192  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |    
T  18307193 gattcacctcgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtgacgc 18307291  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  ||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||    
T  18307292 attgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaacggagtcaacaaat 18307390  T
Q  347 tcctttgtgttct 359  Q
    || ||||||||||    
T  18307391 tcttttgtgttct 18307403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 28207404 - 28207055
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  28207404 acttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggt 28207311  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  28207310 ttgtgtaaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagagtttattcaccttgggaaacactattaggatt-gtgtctcttggttacaggaagag 28207212  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    |||| | |||||  || ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||  |||||||  |||||| |  |||||||||||    
T  28207211 attggggctttgaatataattacgcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacggagggctgct 28207114  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28207113 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 28207055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 17186425 - 17186114
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  17186425 gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggtt 17186326  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17186325 gattcaccttgggaaacactatcaggatt-gagtctcttggttacgggaagagatttgaactttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaaccc 17186227  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    ||| || |||| ||||||| |  |||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||    
T  17186226 attaatatctcttttgtaaagttactcatcattataatggaacggagtgctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtaaacaaat 17186127  T
Q  347 tcctttgtgttct 359  Q
    || ||||||||||    
T  17186126 tcttttgtgttct 17186114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 2949528 - 2949219
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  2949528 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaggggttgatggtt 2949429  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  2949428 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttgtttacgagaatagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactc 2949330  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  2949329 attgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 2949231  T
Q  348 cctttgtgttct 359  Q
    | ||||||||||    
T  2949230 cttttgtgttct 2949219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 50077009 - 50076659
Alignment:
Q  3 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtt 102  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| | ||||      ||||||  |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  50077009 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttga------gatagaaagggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactagggtt 50076916  T
Q  103 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaga 202  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50076915 tgtataaagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaga 50076817  T
Q  203 ttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgct 300  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| | |||||    
T  50076816 ttgggaatttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgct 50076717  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50076716 ctct-ccccagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 50076659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 3 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 11457812 - 11457462
Alignment:
Q  3 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtt 102  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| | ||||      |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  11457812 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttga------gatagagggggctgaaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtt 11457719  T
Q  103 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaga 202  Q
    |||||||||||||  |||| | |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  11457718 tgtatagagtttgattcttggcaacaattactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgatt-gagtctcttggttacgcgaagaga 11457620  T
Q  203 ttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 301  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  ||| | ||||||    
T  11457619 ttgggggtttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggatgtctgctc 11457520  T
Q  302 tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  11457519 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 11457462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 47 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 4131678 - 4131362
Alignment:
Q  47 gagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaagg 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4131678 gagagatagagggggctgaaacaaggatttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaggg 4131579  T
Q  147 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 246  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  4131578 ttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacaggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgagaaacttattcttgtaac 4131481  T
Q  247 ccattgat----ttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtca 340  Q
    ||||||||    |||||||| |||| |  ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||  ||||    
T  4131480 ccattgatatctttctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactatgtca 4131381  T
Q  341 acaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  4131380 acaaattcttttgtgttct 4131362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 50079118 - 50078807
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  50079118 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgcatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 50079019  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50079018 gattcaccttggaaaacactattaggatt-aagtctcttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaaccc 50078920  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| |||| ||||||| |  | |||||| |||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| |||||||    
T  50078919 attgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacagatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaatttggtaaacaaat 50078820  T
Q  347 tcctttgtgttct 359  Q
    || ||||||||||    
T  50078819 tcttttgtgttct 50078807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 28998591 - 28998240
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| ||||||      |||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  28998591 acttttactataaatatagactttgaatcagagtaaactttga------gatagaggaggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggt 28998498  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  28998497 ttgtatagagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacaggaagag 28998399  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||| ||||  ||||||||||| ||| |   ||||| || |    
T  28998398 attggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcatcatatggtgaaactgagggttgtt 28998299  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28998298 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 28998240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 29004307 - 29003956
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| ||||||      |||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  29004307 acttttactataaatatagactttgaatcagagtaaactttga------gatagaggaggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggt 29004214  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  29004213 ttgtatagagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacaggaagag 29004115  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||| ||||  ||||||||||| ||| |   ||||| || |    
T  29004114 attggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcatcatatggtgaaactgagggttgtt 29004015  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29004014 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 29003956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Original strand, 31489899 - 31490206
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31489899 gagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatag--tttgtctctttggaacaaacactagggtttgatggtt 31489996  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  31489997 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gaatttcttggttacgggaagagattgagactttggatagaattaggcggaagacttattcttgtaactc 31490095  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||||| |||| ||||||| |  | ||||||||| ||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| | ||||||||||    
T  31490096 attgatatctcttttgtaaggttattcatcatatggtgaaacggagggctgctctc-cccccagactaggtcaatttggactgaactagatcaacaaatt 31490194  T
Q  348 cctttgtgttct 359  Q
    | ||||||||||    
T  31490195 cttttgtgttct 31490206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 31425316 - 31425002
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgaaggt 147  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  31425316 gagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtatctttggcaacaaacactagggtttgagggt 31425217  T
Q  148 tgattcaccttgggaaacactattaggattg-gag-tctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 245  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31425216 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtgatctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggaggcttattcttgtaa 31425117  T
Q  246 cccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 343  Q
    | ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  ||| ||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  31425116 ctcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggaaggctgctctct-ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 31425018  T
Q  344 aattcctttgtgttct 359  Q
    ||||| ||||||||||    
T  31425017 aattcttttgtgttct 31425002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 57 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 9241374 - 9241072
Alignment:
Q  57 gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcacc 156  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9241374 gggggctgaaacaagg-tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacc 9241276  T
Q  157 ttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 256  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  9241275 ttggaaaacattattaggatt-gagtctcttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatat 9241177  T
Q  257 ctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgt 354  Q
    ||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  9241176 ctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactggggaaacaaattctttttt 9241077  T
Q  355 gttct 359  Q
    |||||    
T  9241076 gttct 9241072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 3579956 - 3579606
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||| | ||||     ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  3579956 acttttactttaaatatagaccttgtatcagcgtaaaatttgagatagagg----gggggctgaaacaagggttcagaaaggcagcaacaaaactagggt 3579861  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  3579860 ttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacacaattaggattg-agtctcttgattacggaaagag 3579762  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||| ||||| |  ||| |  ||||    
T  3579761 attggggctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat-tagtgaaacggatgattgct 3579663  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgtt 357  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3579662 ctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 3579606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 287
Target Start/End: Original strand, 48665114 - 48665400
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | || | | ||||   ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48665114 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttaagatagagggggagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 48665213  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggtta-cgggaaga 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  48665214 ttatatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttaccgggaaga 48665312  T
Q  201 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtgga 287  Q
    |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  48665313 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 48665400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 25251611 - 25251261
Alignment:
Q  4 ttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  ||| | ||||      |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  25251611 ttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttga------gatagagggggctgaaacaaaggtttagaaagacaacaacaaaactagggttt 25251518  T
Q  104 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 203  Q
    |||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  25251517 gtataacgtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggatt-gagtctctcggttacgggaagagat 25251419  T
Q  204 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctc 301  Q
    || |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |  ||| |||| ||||||| |   ||||| |||||    
T  25251418 tgggactttgggtagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttacttatcattatagtgaaacagagggttgctc 25251319  T
Q  302 tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25251318 tctccccaatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 25251261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 52 - 359
Target Start/End: Original strand, 6756514 - 6756822
Alignment:
Q  52 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgaaggttga 150  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  6756514 atagaggggactgaaacaagggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttga 6756613  T
Q  151 ttcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6756614 ttcaccttgggaaacactattaggatt-gag--tcttgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctat 6756710  T
Q  251 tgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctct-cccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  ||| | ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  6756711 tgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaagactgctctctccccccagactaggtcagtttggaccgaactggatcaacaaatt 6756810  T
Q  348 cctttgtgttct 359  Q
    | ||| ||||||    
T  6756811 cttttctgttct 6756822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 157 - 392
Target Start/End: Original strand, 51757623 - 51757857
Alignment:
Q  157 ttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 256  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  51757623 ttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctatcgattt 51757721  T
Q  257 ctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgt 356  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  51757722 ctctttgtaacgatactcaccatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgt 51757821  T
Q  357 tcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgttttt 392  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51757822 tcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgttttt 51757857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 50248909 - 50248557
Alignment:
Q  3 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtt 102  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| | ||||      ||||||||| |||||||||| |||||| |||  |||||||||||||| | ||    
T  50248909 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttga------gatagagggagctgaaacaaaggtttaaaaagacaacaacaaaactatgatt 50248816  T
Q  103 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaga 202  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  50248815 tatatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacaggaagaga 50248717  T
Q  203 ttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctg--c 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |   || || ||  |    
T  50248716 tcgagactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgacatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagatggttgttc 50248617  T
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  50248616 tctctcccctagactaggtcaatttggtccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttct 50248557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 49 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 31423171 - 31422851
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaac-aaacactagggtttgaaggt 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  31423171 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctctttggcattaaacactagggtttgaaagt 31423072  T
Q  148 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31423071 tgattcaccttgggaaacactattagaattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 31422973  T
Q  248 cattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtg---gattg---------gagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaac 333  Q
    ||||||  |||| ||||||| |  |||||||| |||||||   ||  |         |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |    
T  31422972 cattgacatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaagagagggtgaaacagagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgagc 31422873  T
Q  334 tgggtcaacaaattcctttgtg 355  Q
    ||||| ||||||||| ||||||    
T  31422872 tgggtgaacaaattcttttgtg 31422851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Original strand, 17318877 - 17319181
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  17318877 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtttagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttggaaggtt 17318976  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    |||||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||      
T  17318977 gattcaccttgggaaac------aggatt-gagtctcttggttacgggaacagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaactt 17319069  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| |||| ||||| | |  |||||||| ||||||  |  ||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17319070 attgatatctcttttgttaagttactcatcattatagtaaaacggagggctgctctct-ccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 17319168  T
Q  347 tcctttgtgttct 359  Q
    || ||||||||||    
T  17319169 tcttttgtgttct 17319181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 58 - 359
Target Start/End: Original strand, 40133937 - 40134239
Alignment:
Q  58 ggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcacct 157  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40133937 ggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaacgaaggtttgtatagaatttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacct 40134036  T
Q  158 tgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc 257  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  40134037 tgggaaatactactaggatt-gagtctcttggtcacgggaagagattgaggttttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatc 40134135  T
Q  258 tc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtg 355  Q
    || ||||||| |  |||||||| ||||||| |  ||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||    
T  40134136 tcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccggactaggtaaacaaattcttttgtg 40134235  T
Q  356 ttct 359  Q
    ||||    
T  40134236 ttct 40134239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Original strand, 47451591 - 47451919
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||      ||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  47451591 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttga------gatagagggggcttaaacaagggtttggaatggcaacaacaaaactagggt 47451684  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |         |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47451685 ttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattag------tgtttaggatt-gagtctcttggttacgggaagag 47451777  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    |||| | ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  | | | |||||    
T  47451778 attggggctttgggtaaaattaggcgggaaactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaatgactgct 47451877  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaac 342  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  47451878 ctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 47451919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 262
Target Start/End: Original strand, 6823827 - 6824088
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||   || |||||| | ||||     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6823827 acttttactatttatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagag-----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 6823921  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctctt-------ggttacg 194  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||       |||||||    
T  6823922 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattacgatt-gaatctcttggttacgggttacg 6824020  T
Q  195 ggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 262  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6824021 ggaagagattggggctttgggtagaattaggcggcagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 6824088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 49 - 348
Target Start/End: Original strand, 17324049 - 17324347
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||  | ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  17324049 gagatagagagggctaaaacaagggttcagaaaggccacaacaaaact--gatttttatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 17324146  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17324147 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttgaatatgggaagagattggaactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 17324245  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| |||| ||||||| |  | |||||| ||||||| |  ||| ||||| |||||||||  ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  17324246 attgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaacggaaggctggtctctccccatgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 17324345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 50 - 347
Target Start/End: Original strand, 42922219 - 42922514
Alignment:
Q  50 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttg 149  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||   ||||||    
T  42922219 agatagagggggttgaaataagggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcctagcaacaaacactagggttg--aggttg 42922314  T
Q  150 attcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 249  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42922315 attcaccttgcgaaaaactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaaccca 42922413  T
Q  250 ttgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    ||||| |||| ||||||| |  |||||||| || ||||||  ||||| ||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  42922414 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcattagagtggaacggaggactgctctctgcccccgactaggtcagtgttggaccgaactgggtaaacaaat 42922513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14183923 - 14183589
Alignment:
Q  3 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtt 102  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| | ||||      ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||   |||||||||||    
T  14183923 cttttactataaatatagaccatgtatcagagtaaaccttga------gatagagagggctgaaacaagggtttagaat-gcaacac--aaactagggtt 14183833  T
Q  103 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaga 202  Q
    ||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14183832 tgtatagaggttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattataattg-agtctcttggttacgggaagaga 14183737  T
Q  203 ttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgct 300  Q
    ||   | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| |||||||    
T  14183736 ttagaattttgggtagaattaggcggaagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgct 14183637  T
Q  301 ctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  14183636 ctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt 14183589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 56 - 359
Target Start/End: Original strand, 16432396 - 16432690
Alignment:
Q  56 agggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcac 155  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||           ||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16432396 agggggcagaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt-----------ctcttggcgacaaacactagggtttgagggttgattcac 16432484  T
Q  156 cttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||     
T  16432485 cttgggaaacattattaggattgaa-tctcttggttatgggaagagattgaaactttgggtagaattatgcgggacaattattcttgtaacccattgata 16432583  T
Q  256 tctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccccc-agactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattccttt 352  Q
    |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  || || |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  16432584 tctcttttgtaatgttactcatcattatagtgaaacggcggactgctctctcccccaagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattctttt 16432683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 89 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 15669648 - 15669419
Alignment:
Q  89 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttg 188  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15669648 acaaaagtagggtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttg 15669553  T
Q  189 gttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttgtaacgaaactcatca-tatagtgg 286  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |  |||||||| ||||||||    
T  15669552 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctctcgtaaagctactcatcattatagtgg 15669453  T
Q  287 attggagggctgctctctcccccagactaggtca 320  Q
    |  ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  15669452 aacggatggctgctctctccccgagactaggtca 15669419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 49 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 8347566 - 8347284
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| | |||| |  ||||    
T  8347566 gagatagagggggttgaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgtatagagattg-ctcttggcaacaaacaccaaggttag--ggtt 8347471  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8347470 gattcaccttaggaaacactattatgattg-agtctcttgatcacgggaagagattgagactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 8347372  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaac 333  Q
    |||||| |||| ||||||| |  |||||| | |||||||||  |||||| |||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  8347371 attgatatctcttttgtaaagttactcattattatagtggaacggagggatgctctttcccctagactaggtcagttttggaccgaac 8347284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 132 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 25248766 - 25248540
Alignment:
Q  132 actagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggag 231  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25248766 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatta-agtctctcggttacaggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggag 25248668  T
Q  232 acttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggacc 329  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||| | ||||||| |  ||||| |||||| |||||| |||||||||||  |||||||    
T  25248667 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtgaaacggaggactgctccctcccctagactaggtcaatttggacc 25248568  T
Q  330 gaactgggtcaacaaattcctttgtgtt 357  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25248567 gaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 25248540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 150 - 359
Target Start/End: Original strand, 16429042 - 16429252
Alignment:
Q  150 attcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 249  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16429042 attcaacttgggaaacactattaggattg-agtcttttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaaccca 16429140  T
Q  250 ttgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    ||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  16429141 ttgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagcgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaatt 16429240  T
Q  348 cctttgtgttct 359  Q
    | ||||||||||    
T  16429241 cttttgtgttct 16429252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 207 - 371
Target Start/End: Original strand, 23816027 - 23816193
Alignment:
Q  207 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  23816027 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatggatcggagggatgctctctc 23816126  T
Q  306 ccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct-tcttcttctttt 371  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  23816127 ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctttttctttt 23816193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 49 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 8349345 - 8349049
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  ||||    
T  8349345 gagatagagagggctgaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaattaaggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggtt 8349250  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  8349249 tattcaccttgggaaacactattaggattg-agtttgatggtcacgggaagagattaggactttaggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaactc 8349151  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaa 345  Q
    |||| | |||| ||||| | |  |||||||| ||||||||| | ||||| || ||||||||| |||||| |||| | || ||||||||||||| ||||||    
T  8349150 attggtatctcttttgttaagttactcatcattatagtggaatagagggttgttctctccccaagactatgtcagttttagaccgaactgggtaaacaaa 8349051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 144 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 6115305 - 6115089
Alignment:
Q  144 aggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 243  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6115305 aggttgattcaccttgaaaaacactattaggattg-agtctcttggtcacatgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggggacttattcttgt 6115207  T
Q  244 aacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaa 341  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||    ||||||||| |||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||    
T  6115206 aaccaattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaa 6115107  T
Q  342 caaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||||  ||||||||||    
T  6115106 caaattattttgtgttct 6115089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 18800907 - 18800570
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||      |||| | ||||||||||||| |||||||||   |||||| ||||||| |||    
T  18800907 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttga------gatacaaggggctgaaacaaaggtttagaagt-caacaagaaaactacggt 18800815  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||| ||||| |  ||||| ||||||||| |  |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  18800814 ttgtatagagtttg-ctcttggccacaaatactagggttgg--ggttgattcaccctgagaaacactattaggattg-agtctctaggtcacgggtagag 18800719  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgc 299  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  ||||  ||||    
T  18800718 atttgaactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtatcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaagcggagaactgc 18800619  T
Q  300 tctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    ||||||||||| ||||||| | | ||||||| ||| |||| ||||||||    
T  18800618 tctctcccccaaactaggttagttttggaccaaacagggtaaacaaatt 18800570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 65 - 347
Target Start/End: Original strand, 27916500 - 27916780
Alignment:
Q  65 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaa 164  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||    
T  27916500 aaacaagggtttagaagc-cagcaagaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttggaa--ttgattcaccttggaaaa 27916593  T
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacc--cattgatttctctt 261  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||| ||||||||   | ||||| |||||| |||||  | ||||| ||||||    
T  27916594 cactattagaattg-agtctcttggtcacatgaagagattgtgactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttttaaccttctttgatatctctt 27916692  T
Q  262 tgtaacgaaactcatc-atatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    ||||| |  |||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  27916693 tgtaaagttactcatcgttatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaattgggtaaacaaatt 27916780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 56 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 13125746 - 13125455
Alignment:
Q  56 agggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg-tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattca 154  Q
    |||||||||||||||||||| ||||   ||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||   |||||||||||    
T  13125746 agggggctgaaacaagggttaagaagc-caacaaggaaactagggtttggtatagagtttg-ctcttggcgacaaacactagggttg--aggttgattca 13125651  T
Q  155 ccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattga 253  Q
    | ||||||||| || ||||||||| || |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||| ||||    
T  13125650 cattgggaaacgctgttaggattg-aggctcttggtcaagggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttga 13125552  T
Q  254 tttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    | |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  |||| | ||||||| |||||  ||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  13125551 tatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagagttgctctcccccccttactaggtcagtataggaccgaactaggtaaacaaatt 13125455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 271 - 391
Target Start/End: Original strand, 13358779 - 13358899
Alignment:
Q  271 actcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt 370  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  13358779 actcttcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttcttt 13358877  T
Q  371 -tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  13358878 gtgttcttctcgccgttgtttt 13358899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 49495537 - 49495208
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| | ||||      ||||||||||||||||||||||||||| |||          ||||||||||    
T  49495537 acttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttga------gatagagggggctgaaacaagggtttataaatc--------aaactagggt 49495452  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    ||| ||| |||||| ||||| | ||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||| ||||| |||| |||||    
T  49495451 ttgcatatagtttg-ctcttggcaacaaacactatggtt-ga--gttgattcaccttgggaaacactaataaaattg-agtcttttggtcacggtaagag 49495357  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgc 299  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  | ||||||      
T  49495356 attggggctttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgaagggctta 49495257  T
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattc 348  Q
    ||||||||| |||||| ||||  || ||||||||| ||| || ||||||    
T  49495256 tctctccccaagactatgtcaatttagaccgaactaggtaaagaaattc 49495208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 145 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 30790602 - 30790401
Alignment:
Q  145 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgt 243  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  30790602 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat--gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgt 30790505  T
Q  244 aacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtca 340  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||||| |||| | |||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||| | |    
T  30790504 aacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataa 30790406  T
Q  341 acaaa 345  Q
    |||||    
T  30790405 acaaa 30790401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 147 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 26613440 - 26613237
Alignment:
Q  147 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaa 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  26613440 ttgattcaccttgggaaacactattcggattg-agtcacttggtcacaggaagagattgaggctttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaa 26613342  T
Q  246 cccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaac 342  Q
    ||| ||||| ||||||| | || |  ||| ||||| ||||||||   ||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||    
T  26613341 ccctttgatatctcttttggaaagttactaatcattatagtggaacagagagcttctctctcccccagattaggtcagtatttgaccgaactgggtaaac 26613242  T
Q  343 aaatt 347  Q
    |||||    
T  26613241 aaatt 26613237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 347
Target Start/End: Original strand, 16561546 - 16561751
Alignment:
Q  145 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| ||||   || |||||||||||||    
T  16561546 ggttgattcaccttgggaaacactattaggatta-agtctcttggccacggaaatagattgagactttgggtagaaataggtttgaagacttattcttgt 16561644  T
Q  244 aacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtca 340  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||| | ||||||    |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| || |    
T  16561645 aaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtggaacaaagggttgctctctcccatagactaggtcagtattggaccgaactgtgtaa 16561744  T
Q  341 acaaatt 347  Q
    |||||||    
T  16561745 acaaatt 16561751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 165 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 21353525 - 21353334
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  21353525 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 21353431  T
Q  264 taacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 360  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  21353430 taaagaaactcatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatctttagaccgaactgggtaaacaaattc--ttgtgttctt 21353334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 49 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 26520415 - 26520206
Alignment:
Q  49 gagatagaggggg-ctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaagg 146  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | ||   |||    
T  26520415 gagatagaggggggctgaaaacaacggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattg--agg 26520320  T
Q  147 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttg------gttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattc 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||      || |||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||| ||||||||    
T  26520319 ttgattcaccttgggaaacactattatgatt-gagtctcttggtcacagtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggaaacttattc 26520221  T
Q  240 ttgtaacccattgat 254  Q
    |||||||||||||||    
T  26520220 ttgtaacccattgat 26520206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 147 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 30738830 - 30738625
Alignment:
Q  147 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||| || ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  30738830 ttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggtcataggaagagattgggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaa 30738732  T
Q  246 cccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca---tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtca 340  Q
    ||| ||||| |||| ||||||| |  ||||||||   ||||||| |  |||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||| ||| |    
T  30738731 ccctttgatgtctcttttgtaaagttactcatcatattatagtgaaacggagggatgctctctcacccatactaggtcagtattggaccaaacttggtaa 30738632  T
Q  341 acaaatt 347  Q
    |||||||    
T  30738631 acaaatt 30738625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 147 - 308
Target Start/End: Original strand, 155788 - 155950
Alignment:
Q  147 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||   | ||| | ||||||||||    
T  155788 ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggtcacgggaagagattgggactttggatagaattaggtttgaagagtaattcttgtaa 155886  T
Q  246 cccattgatttctctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccc 308  Q
    ||  ||| | ||||||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  155887 ccttttgttatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccc 155950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 165 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 2401400 - 2401198
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  2401400 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 2401306  T
Q  264 taacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||| |||||||||  ||| ||||||||   ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  2401305 taaagaaactcatatcattatagtggaacagagagcttctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc--ttgtgttct 2401208  T
Q  360 tcttcttctt 369  Q
    ||||||||||    
T  2401207 tcttcttctt 2401198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 13598466 - 13598402
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13598466 atagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 13598402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 16124545 - 16124609
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16124545 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 16124609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 47703965 - 47704029
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47703965 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 47704029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 162 - 346
Target Start/End: Original strand, 2232597 - 2232774
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  2232597 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 2232691  T
Q  261 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| |||||||||    | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  2232692 ttgtaaagaaactcat----tcgtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 2232774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 281 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 19072995 - 19072932
Alignment:
Q  281 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19072995 tagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 19072932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 281 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 19120885 - 19120822
Alignment:
Q  281 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19120885 tagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 19120822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 281 - 344
Target Start/End: Original strand, 47098854 - 47098917
Alignment:
Q  281 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47098854 tagtggattggagggctgctctctcccccagattcggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 47098917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 162 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 4144865 - 4144662
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||   || || | ||||||||||| ||   || | |||    
T  4144865 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagactgggactt-gggtagaattaggtttgaagattgattcttgtaactca---atatatct 4144771  T
Q  261 ttgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgt 356  Q
    |||||| |||||||||  ||| ||||||||   ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  4144770 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagagtaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc--ttgtgt 4144673  T
Q  357 tcttcttcttc 367  Q
    ||| |||||||    
T  4144672 tctccttcttc 4144662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 16231543 - 16231641
Alignment:
Q  1 gacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    || ||||||      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16231543 gacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttga------gatagagggggctgaaacaagggtctagaaaagcaacaagaaaactaggg 16231636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 280 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 29651879 - 29651818
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaa 341  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29651879 atagtggattggagtgctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 29651818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 9476329 - 9476265
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9476329 atagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9476265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 26644930 - 26644990
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26644930 tggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 26644990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 49 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 25248811 - 25248756
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25248811 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 25248756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 88 - 347
Target Start/End: Original strand, 28279292 - 28279551
Alignment:
Q  88 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctct 186  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||| |||||   |||||||||||||||| | |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||  |||    
T  28279292 aacaaaattagggtttgta--gagtttg-ctcttgacaacaaacactagggttggga--ttgattccccttggagaaacactattaggattg-agcttct 28279385  T
Q  187 tggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatag 283  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||| |||||   |||| ||||||| |  |||||||| |||||    
T  28279386 tggtcacgggaagagattgggacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactcattggcatctcttttgtaaagttactcatcattatag 28279485  T
Q  284 tggattggagggctgctctctccccc-agactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||| | ||| | || ||| |||||| ||||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||    
T  28279486 tggaattgagagttgttctttccccctagactaggtcagtattagatcgaactgggtaaacaaatt 28279551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 281 - 344
Target Start/End: Original strand, 47102871 - 47102934
Alignment:
Q  281 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47102871 tagtggattggatggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 47102934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 283 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 3281773 - 3281715
Alignment:
Q  283 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaa 341  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3281773 gtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 3281715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 2393461 - 2393260
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||  || ||||| ||||||||||||    || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  2393461 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaatagtctgggactt-gggtagaattagatttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 2393367  T
Q  264 taacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||| |||||||||  ||| ||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||  |||||||||    
T  2393366 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccc-agactaggtcatcattagaccgaactggataaacaaattc--ttgtgttct 2393270  T
Q  360 tcttcttctt 369  Q
    ||||||||||    
T  2393269 tcttcttctt 2393260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 346
Target Start/End: Original strand, 9526469 - 9526650
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||   || ||||||||    
T  9526469 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactca---atatctctttg 9526563  T
Q  264 taacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    ||| |||||| ||  ||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  9526564 taaagaaacttatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 9526650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 238 - 347
Target Start/End: Original strand, 15916562 - 15916674
Alignment:
Q  238 tcttgtaacccattgatttctctttg-taacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtc-atattggaccgaact 334  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||| |  |||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  15916562 tcttgtaacccattgatatctcttttataaagttactcgtcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaattttggaccgaact 15916661  T
Q  335 gggtcaacaaatt 347  Q
    |||| ||||||||    
T  15916662 gggtaaacaaatt 15916674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26332688 - 26332613
Alignment:
Q  147 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaatta 223  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  26332688 ttgattcaccttcggaaacactattaggattt-agtctcttggtcacgagaagagattgagactttgtgtagaatta 26332613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 27104401 - 27104465
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  27104401 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggttatattggaccgaactgtgtcaacaa 27104465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 37069838 - 37069774
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37069838 atagtggatcggagagatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 37069774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 281 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 775739 - 775676
Alignment:
Q  281 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  775739 tagtggattggagagctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 775676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 281 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 32889506 - 32889443
Alignment:
Q  281 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  32889506 tagtggattggagagctgctctatcccccagactaggtcatattggaccgaactagatcaacaa 32889443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 368
Target Start/End: Original strand, 46783163 - 46783350
Alignment:
Q  183 ctcttggttacgggaagagattgaga-ctttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatca-t 279  Q
    |||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||| |    
T  46783163 ctcttggtcacatgaagagattcagaactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttgatatctttttgtaaagaaactcatcatt 46783262  T
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtc-atattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttct 368  Q
    ||||||||   ||| |||| | ||||| ||||| || ||| |||||||| |||||||| | ||||||||   ||||||||||||||||||    
T  46783263 atagtggaacagagagctgttatctcctccagagtaagtcaatattggatcgaactggataaacaaatt--attgtgttcttcttcttct 46783350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 323 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 13447296 - 13447228
Alignment:
Q  323 ttggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  13447296 ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgtttttctcgccgttgtttt 13447228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 279 - 344
Target Start/End: Original strand, 21536597 - 21536662
Alignment:
Q  279 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  21536597 tatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcattttttaccgaactgggtcaacaa 21536662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 13604652 - 13604716
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  13604652 atagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgaacctaactgggtcaacaa 13604716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 147 - 225
Target Start/End: Original strand, 14353047 - 14353126
Alignment:
Q  147 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttgggtagaattagg 225  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14353047 ttgattcaccttggagaaacactattaggattt-agtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaattagg 14353126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 367
Target Start/End: Original strand, 25134074 - 25134274
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  25134074 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 25134168  T
Q  264 taacgaaactcat---catatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||| |||||||||     |||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||| ||||| |||||||||  |||||||||    
T  25134169 taaagaaactcatataattatagtggaacggagagctgttctctcccccatactagatcatcattagaccgaagtgggtaaacaaattc--ttgtgttct 25134266  T
Q  360 tcttcttc 367  Q
     |||||||    
T  25134267 ccttcttc 25134274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 19358872 - 19358935
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  19358872 atagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatatt-gactgaactgggtcaacaa 19358935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 19361461 - 19361524
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  19361461 atagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatatt-gactgaactgggtcaacaa 19361524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 19380101 - 19380164
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  19380101 atagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatatt-gactgaactgggtcaacaa 19380164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 24202798 - 24202861
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  24202798 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 24202861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 225
Target Start/End: Original strand, 14997040 - 14997101
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 225  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14997040 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagagattgagac-ttgggtagaattagg 14997101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Original strand, 43104245 - 43104318
Alignment:
Q  151 ttcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 225  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  43104245 ttcaccttggaaaacactattagaattg-agtcttttggtcacaggaagacattgaaactttgggtagaattagg 43104318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 346
Target Start/End: Original strand, 9521718 - 9521899
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||   || ||||||||    
T  9521718 cactattaggattg-agtctcttgatcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactca---atatctctttg 9521812  T
Q  264 taacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    ||| |||||| ||  ||| ||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||    
T  9521813 taaagaaacttatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccatactaggtcgtcattagaccgaactgggtaaacaaat 9521899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 13138020 - 13137976
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13138020 tctctcccctagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 13137976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 25445110 - 25445169
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  25445110 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 25445169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 26332836 - 26332699
Alignment:
Q  65 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaa 164  Q
    ||||||||||||||||  || |  |||||| |||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||| || |  | |||||||||||| |||||    
T  26332836 aaacaagggtttagaa--gccaacacaaaaatagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactaggtttgg--gtttgattcaccttcggaaa 26332744  T
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagact 210  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||  || |||||||||||    
T  26332743 cactattaggatt-tagtctcttggtcacgaaaatagattgagact 26332699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 39445564 - 39445505
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  39445564 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 39445505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 44023894 - 44023953
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  44023894 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 44023953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 834211 - 834167
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  834211 tctctcccccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 834167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 1055032 - 1055091
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  1055032 tggattggagagttgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 1055091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 6115376 - 6115344
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 81  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6115376 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 6115344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 22819494 - 22819438
Alignment:
Q  283 gtggattggagggctgctctctc-ccccagactaggtcatattggaccgaactgggt 338  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||    
T  22819494 gtggattggagggctactctctccccccagagtaggtcatattggaccaaattgggt 22819438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 28220270 - 28220226
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  28220270 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 28220226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 28265598 - 28265554
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  28265598 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 28265554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 41390645 - 41390586
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | || ||||||||||||    
T  41390645 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgatctgggtcaacaa 41390586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 41398300 - 41398241
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | || ||||||||||||    
T  41398300 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 41398241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 290 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 13127743 - 13127685
Alignment:
Q  290 ggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  13127743 ggagagctgctctctcctccagactaggttagtattggaccgaaccgggtaaacaaatt 13127685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 36
Target Start/End: Complemental strand, 13449886 - 13449852
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggcta 36  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13449886 actttcactataaatatagaccttgtatcaggcta 13449852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Original strand, 23783493 - 23783523
Alignment:
Q  1 gacttttactataaatatagaccttgtatca 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23783493 gacttttactataaatatagaccttgtatca 23783523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 344
Target Start/End: Original strand, 41361040 - 41361082
Alignment:
Q  302 tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41361040 tctcccccatagtaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 41361082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 32
Target Start/End: Original strand, 43104102 - 43104132
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcag 32  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43104102 acttttactataaatatagaccttgtatcag 43104132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 45644396 - 45644354
Alignment:
Q  302 tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  45644396 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 45644354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 13127917 - 13127813
Alignment:
Q  58 ggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcacct 157  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||||| |||| |||||||| ||||||||||  || || | |||||||||||||||| |  | | |||||||||    
T  13127917 ggggttgaaacaagggtttag-aagccaacaagaaaagtagggtttatatagagttt-ccttttggcaacaaacactagggttgg--gatagattcacct 13127822  T
Q  158 tgggaaaca 166  Q
    |||||||||    
T  13127821 tgggaaaca 13127813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 338
Target Start/End: Original strand, 17345549 - 17345605
Alignment:
Q  281 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggt 338  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  17345549 tagtggattggagagctcctctttcccc-agagtaggtcatattagaccgaactgggt 17345605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Original strand, 3156989 - 3157033
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3156989 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 3157033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 4552681 - 4552637
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  4552681 tctctccctcagagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 4552637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 13659380 - 13659336
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  13659380 tctctcccccagagtaggttaagttggaccgaactgggtcaacaa 13659336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 28223465 - 28223421
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  28223465 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 28223421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Original strand, 31659362 - 31659406
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31659362 tctctccctcagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 31659406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 43988485 - 43988544
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | ||||||||| |||||    
T  43988485 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtaaacaa 43988544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 146)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 35215932 - 35215545
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaacta 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35215932 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaacta 35215833  T
Q  98 gggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacggga 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35215832 gggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacggga 35215733  T
Q  198 agagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggct 297  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35215732 agagtttgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggct 35215633  T
Q  298 gctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttttgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||    
T  35215632 gctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct------tcttttgttcttctcgccgttgtttt 35215545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 35218313 - 35217922
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagaga--------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaa 93  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35218313 acttttactataaatatagaccttgtataaggctaaactttgagagagagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaa 35218214  T
Q  94 actagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttac 193  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35218213 actagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttac 35218114  T
Q  194 gggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggag 293  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35218113 gggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccgttgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggag 35218014  T
Q  294 ggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttttgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||    
T  35218013 ggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct------tcttttgttcttctcgccgttgtttt 35217922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 23452577 - 23452190
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23452577 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttga--gagagacagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 23452480  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23452479 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagag 23452381  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
      || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23452380 gctgggactttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgct 23452281  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23452280 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 23452190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 13910380 - 13909998
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   || ||| ||      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13910380 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttgga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 13910287  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13910286 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcaccttgggaaacaatattaggattg-agtctcttggttacgggaagag 13910188  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 301  Q
    | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  13910187 actggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtggatcagatggctgctc 13910088  T
Q  302 tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13910087 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 13909998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Original strand, 27104718 - 27105099
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||      ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27104718 acttttactataaatatagaccttgtatcagagaaaactttga------gatagagggggctgaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggt 27104811  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27104812 ttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagag 27104909  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 301  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27104910 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacattactcatcatatagtggatcggagggctgctc 27105009  T
Q  302 tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27105010 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 27105099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 4 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 19502345 - 19501963
Alignment:
Q  4 ttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   || ||| ||      |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19502345 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttgga------gataaagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 19502252  T
Q  104 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 203  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  19502251 gtgtagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggc 19502153  T
Q  204 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  19502152 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcgaagggctgctct 19502053  T
Q  303 ctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgttttt 392  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  19502052 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttcttgccgttgttttt 19501963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 2 - 363
Target Start/End: Original strand, 42064434 - 42064789
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   || ||| ||      ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42064434 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttgga------gatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 42064527  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42064528 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagag 42064626  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 301  Q
      ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42064627 gctgagactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctc 42064726  T
Q  302 tctcccccagactaggtcata-ttggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttctt 363  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42064727 tctcccccagactaggtcaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctt 42064789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 2 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 19504681 - 19504298
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   || ||| ||      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19504681 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttgga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 19504588  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  19504587 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacacaagggtttgttggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttac-ggaagag 19504490  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19504489 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgct 19504390  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgttttt 392  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  19504389 atctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgtttttcttgccgttgttttt 19504298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 49 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 45280280 - 45279966
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaa-gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggt 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  45280280 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttagagggt 45280181  T
Q  148 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 247  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45280180 tgattcaccttgggatacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 45280082  T
Q  248 cattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  45280081 cattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaat 45279982  T
Q  347 tcctttgtgttcttct 362  Q
    || |||||||||||||    
T  45279981 tcttttgtgttcttct 45279966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 24162548 - 24162176
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24162548 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 24162455  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||         
T  24162454 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaagattg-agtctcttggttgctgg----- 24162361  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 301  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24162360 -----gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaatgctactcatcatatagtggattggatggctgctc 24162266  T
Q  302 tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  24162265 tctcccccggactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgtttttctcgccgttgtttt 24162176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 21521031 - 21520678
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  21521031 acttttactataaatataaaccttgtatcagactaaactttga----gagatagatggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggc 21520936  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  21520935 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacaggaagag 21520837  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
      |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||| |||||||    
T  21520836 gctaggactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgct 21520737  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  21520736 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactttgtcaacaaattcttttgtgttct 21520678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 49 - 362
Target Start/End: Original strand, 42452743 - 42453053
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| |||||  ||||    
T  42452743 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtataaagtttgtctctgt--aacaaacactagagtttgtgggtt 42452840  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42452841 gattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 42452939  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  42452940 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 42453038  T
Q  348 cctttgtgttcttct 362  Q
    | |||||||||||||    
T  42453039 cttttgtgttcttct 42453053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 22287672 - 22287321
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |   ||| ||||||      |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22287672 acttttactataaatatagaccttgtattaaagtaaactttga------gatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 22287579  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  22287578 ttgtatagagtctgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacggtattaggatt-gagtctcttagttacgggaagag 22287480  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  22287479 attgacacttcgggtagaattgggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaatggagggctgct 22287380  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22287379 ctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 22287321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Original strand, 19007600 - 19007910
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  19007600 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggtt 19007699  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19007700 gattcaccttgggaaacactattagaatt-gagtttcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 19007798  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  19007799 attgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 19007898  T
Q  348 cctttgtgttct 359  Q
    | ||||||||||    
T  19007899 cttttgtgttct 19007910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 40032394 - 40032038
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40032394 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 40032301  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  40032300 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacaggaagag 40032202  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga----tttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggaggg 295  Q
     ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||| |||| || |  |||||||| ||||||| |  ||||||    
T  40032201 gttaggactttgggtagaattaggcgtgagacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgcaaagttactcatcattatagtgaaacggaggg 40032102  T
Q  296 ctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    | |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  40032101 ccgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtattct 40032038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 42923847 - 42923494
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||   ||| | ||||    |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  42923847 acttttactataaatatagaccttgaatcatagtaaaccttga----gagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactaggat 42923752  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  42923751 ttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagag 42923653  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |  |||| |||||||||| |  |||||||||||    
T  42923652 attggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcgtcatatagtgaaacggagggctgct 42923553  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42923552 ctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 42923494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 161 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 36561324 - 36561094
Alignment:
Q  161 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36561324 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 36561225  T
Q  261 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 360  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36561224 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 36561125  T
Q  361 cttcttcttttgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36561124 cttcttcttttgttcttctcgcagttgtttt 36561094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 4 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 6264479 - 6264133
Alignment:
Q  4 ttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||      |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    ||||||    
T  6264479 ttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttga------gatagagggggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaa----gggttt 6264390  T
Q  104 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  || ||||    
T  6264389 gtatagagtttgtctctttggtacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-aagtctcttggttacgataaaagat 6264291  T
Q  204 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctc 301  Q
    || | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  ||||||||||||    
T  6264290 tggggctttggatagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctc 6264191  T
Q  302 tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6264190 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 6264133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Original strand, 28196597 - 28196905
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| | ||||    
T  28196597 gagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttaagggtt 28196696  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  28196697 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagatttattcttgtaaccc 28196795  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||||| |||| ||||||||   ||||||||||||||| |  | | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  28196796 attgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacgaatggctgctctctcccccagactaggtca-att-gaccgaactgggtcaacaaatt 28196893  T
Q  348 cctttgtgttct 359  Q
    | ||||||||||    
T  28196894 cttttgtgttct 28196905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 6259151 - 6258802
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||      |||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  6259151 acttttactataaatatagaccttgtattagactaaactttga------gatagaggaggatgaaacaagagtttagaaaggcaacaataaaactagggt 6259058  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  6259057 ttgtatagagtttgtctatttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacggga--ag 6258961  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgc 299  Q
    |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||| | ||||||| |  ||||||||||    
T  6258960 attggggctttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattattatagtgaaacggagggctgc 6258861  T
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6258860 tctct-ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 6258802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 11739855 - 11739544
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  11739855 gagatagagggggctggaacaagggtttagaaagacaacaacaaaattagggtttgtatggagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggtt 11739756  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||    
T  11739755 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gattctcttggttataggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagaattattcttggaatcc 11739657  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| |||| |||| || |  |||||||| |||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  11739656 attgatatctcttttgaaaggttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 11739557  T
Q  347 tcctttgtgttct 359  Q
    || ||||||||||    
T  11739556 tcttttgtgttct 11739544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 161 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 45332364 - 45332133
Alignment:
Q  161 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45332364 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatttctct 45332265  T
Q  261 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 360  Q
    |||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  45332264 ttgtaaaggtactcatcatatagtgaattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttctt 45332165  T
Q  361 cttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45332164 cttcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 45332133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Original strand, 17848403 - 17848710
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgaaggt 147  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||    
T  17848403 gagatagagggggctcaaacgagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacacttgggtttgagggt 17848502  T
Q  148 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 247  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |    
T  17848503 tgattcactttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtaga---aggcgggagacttattcttgtaa-c 17848597  T
Q  248 cattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    ||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||| | ||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  17848598 cattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatgactgctctctcccccatactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaat 17848697  T
Q  347 tcctttgtgttct 359  Q
    || ||||||||||    
T  17848698 tcttttgtgttct 17848710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 43623904 - 43623565
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||      | ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43623904 acttttactataaaaatagaccttgtatcagagtaaact------gggagatagaggggggtgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 43623811  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    ||||||||||||||||||            |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43623810 ttgtatagagtttgtctc------------actaggttttgagggttgattcaccttgggaaacaatattaggattg-agtctcttggttacgggaagag 43623724  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  43623723 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgct 43623624  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  43623623 ctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 43623565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 161 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 36559047 - 36558846
Alignment:
Q  161 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36559047 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 36558948  T
Q  261 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 360  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36558947 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 36558848  T
Q  361 ct 362  Q
    ||    
T  36558847 ct 36558846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 34979874 - 34979562
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34979874 gagatagagggggctgaaacaagcgtttagaaaggtaacaaaaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 34979775  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34979774 gattcaccttgggaaacactattaagatt-gagtctcttggttacgggaagagattcggactttcggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatcc 34979676  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctct-ctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaa 345  Q
    ||| || |||| ||||||| |   ||||||| |||||||||  | |||||| |||| | |||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  34979675 atttatatctcttttgtaaggttcctcatcattatagtggaacgaagggctactctccccccccaaactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaa 34979576  T
Q  346 ttcctttgtgttct 359  Q
    ||| ||||||||||    
T  34979575 ttcttttgtgttct 34979562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Original strand, 17849077 - 17849387
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  17849077 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagataacaacaaaactagagttcgtatagagtttgcctctttggaagaaacactagggtttgagggtt 17849176  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17849177 gattcaccttgagaaacactattaagattg-agtctcttggttacggtaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccc 17849275  T
Q  249 attgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| ||||||| |||| |  ||||||||| |||||| |  || ||||||||||||||| || |||||||||  ||||||   |||||||||||||||    
T  17849276 attgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacgg-gggctgctctctcccacatactaggtcaatttggacaagactgggtcaacaaat 17849374  T
Q  347 tcctttgtgttct 359  Q
    || ||||||||||    
T  17849375 tcttttgtgttct 17849387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Original strand, 14837233 - 14837538
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14837233 gagatagagggagctgaaacaagggttaaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtacatagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 14837332  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||      |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  14837333 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctctt------gggaagagattgagactttaagtagaattaggcgggggacttattcttgtaactc 14837425  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  14837426 attgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggatggatgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaat 14837525  T
Q  347 tcctttgtgttct 359  Q
    || ||||||||||    
T  14837526 tcttttgtgttct 14837538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Original strand, 3022123 - 3022442
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||    
T  3022123 gagatataggaggctgaaacaagggtttataaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactacggtttgagggtt 3022222  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3022223 gattcaccttaggaaacactattaggatt-gagtctcttggttaccggaagagattgaggttttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 3022321  T
Q  249 attgatttctctttgtaacgaaactcatca----------tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggt 338  Q
    ||| || ||||||| ||| |  ||||||||          |||| || |   || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  3022322 attaatatctctttataaagttactcatcattatcatcgttataatgaaacagatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggt 3022421  T
Q  339 caacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  3022422 caacaaattcttttgtgttct 3022442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 46 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 45239274 - 45239001
Alignment:
Q  46 agagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgaa 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||     
T  45239274 agagagatagagggggctgaaacaatgatttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagacttt--ctctttggcaacaaacactagggtttgag 45239177  T
Q  145 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  45239176 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattggggtttttggtagaattaagcgggatacttattcttgta 45239078  T
Q  245 acccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 320  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45239077 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 45239001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 15539809 - 15539566
Alignment:
Q  4 ttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  ||| | ||||      |||| |||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||    
T  15539809 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttga------gatatagggggttgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggttt 15539716  T
Q  104 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 203  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  15539715 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gattctcttggttacgggaagagat 15539617  T
Q  204 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15539616 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 15539566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 52 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 44289360 - 44289052
Alignment:
Q  52 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgat 151  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  44289360 atagaggggactaaaacaaaggtttaggaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtctgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgat 44289261  T
Q  152 tcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | || | ||||||||||||||||| ||    
T  44289260 tcaccttgggaaacactattaggatt-gagtcacttggttacgggaagagattgggacttagggtagaattaagtggaaaacttattcttgtaacccgtt 44289162  T
Q  252 gatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcc 349  Q
    ||| |||| |||||||    |||||||| ||||||| |   || || |||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||     
T  44289161 gatatctcttttgtaagattactcatcattatagtgaaacagatggttgctctttcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 44289062  T
Q  350 tttgtgttct 359  Q
    ||||||||||    
T  44289061 tttgtgttct 44289052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 49 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 31733060 - 31732772
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||    
T  31733060 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactaaggtttgagggtt 31732961  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||            ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31732960 gattcacgttgggaaacactgttaggatt-gagtctcttggt------------ttgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccc 31732874  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||| ||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||    
T  31732873 attgatatctcttttgtaaagttactcatcattattgtgaaacggaggactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgagctgggtaaacaaat 31732774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 139 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 5375550 - 5375331
Alignment:
Q  139 tttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatt 238  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5375550 tttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgg-agacttatt 5375453  T
Q  239 cttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactggg 337  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||   |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  5375452 cttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggg 5375353  T
Q  338 tcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  5375352 tcaacaaattcttttgtgttct 5375331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 11578439 - 11578104
Alignment:
Q  3 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaa-tctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||       ||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||    
T  11578439 cttttactataaatatagaccttatatcagggtaaatctt-------gagatagagtgggctgaaacaagggtttagaagt-caacaaaaaaactagggt 11578348  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    ||||||||| ||| |||||| | |||||||  ||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11578347 ttgtatagaatttttctcttggcaacaaac--tagggttgg--ggttgattcacctcgggaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagag 11578253  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgc 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||| ||  ||||||||||    
T  11578252 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtcgaacggagggctgc 11578153  T
Q  300 tctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    ||| ||||||||||||| ||| | || ||||||||| ||| ||||||||    
T  11578152 tctttcccccagactagatcagttttagaccgaactaggtaaacaaatt 11578104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 18800638 - 18800298
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||      |||| ||||||||||||||||||||||||||          || |||||||    
T  18800638 acttttactataaatatagaccttgtatcagggtaaacatgga------gatatagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aagctagggt 18800553  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  18800552 ttgtatagaggttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg---gttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggtcacaggaagag 18800458  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgc 299  Q
    |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||| ||| ||||||| |  |||||||| |    
T  18800457 attggggctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcgtcattatagtgaaacggagggctac 18800358  T
Q  300 tctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||| |||||||| |||||| | ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  18800357 tctct-ccccagaccaggtcagttttggaccaaactgggtaaacaaattcttttgtgttct 18800298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 65 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 20146884 - 20146604
Alignment:
Q  65 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaa 164  Q
    ||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||| | |  ||||||||||||||||||    
T  20146884 aaacaagggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgtatagagtttgcc-cttggcaacaaacactatggttggga--ttgattcaccttgggaaa 20146789  T
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 263  Q
    || || |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||    
T  20146788 caatagtaggattg-agtctcttggtcacgggaaaagattgagattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactctttgatatctcttttg 20146690  T
Q  264 taacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    ||| |  |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  20146689 taaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccctcagactaagtcagtattggaccgaactgggtaaacgaatt 20146604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 66 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 17897519 - 17897242
Alignment:
Q  66 aacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaac 165  Q
    |||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||    
T  17897519 aacaagggtttagaagt-caacaataaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttcgcaacaaacactagg--ttga-gattgattcaccttgggaaac 17897425  T
Q  166 actattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct-ctttgt 264  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | | ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||    
T  17897424 actattaggattg-agtctcttggtcatgagaaaagattgagattttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccctttgatatctattttgt 17897326  T
Q  265 aacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    || |  |||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  17897325 aaagttactcatcattatagtagaacggatggctgctctct-ccccagactaggtcagtattggtccgaactgggtaaacaaatt 17897242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Original strand, 22874102 - 22874401
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |   |||    
T  22874102 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactatggttgg---gtt 22874189  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  22874190 gattcaccttggaaaacagtattaggattg-agtctcttagtcacgggaagagattgaggctttcggtagaattaggtgggagacttatttttgtaaccc 22874288  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |   ||| ||||||||||||| || |||||||||  |||||||||| ||||| |||||||    
T  22874289 attgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaactgagagctgctctctccctcatactaggtcaatttggaccgaattgggtaaacaaat 22874388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 22163282 - 22163117
Alignment:
Q  3 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtt 102  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||      |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  22163282 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaactttga------gatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaacactagggtt 22163189  T
Q  103 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattagg 174  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22163188 tgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattagg 22163117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 48 - 247
Target Start/End: Original strand, 38020161 - 38020349
Alignment:
Q  48 agagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggt 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||    
T  38020161 agagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggt 38020260  T
Q  148 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 247  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||   |||          | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38020261 tgattcaccatggtaaacactattaggatt-gagtctcttggtattggg----------ggctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacc 38020349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 22407745 - 22407591
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||      |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22407745 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactgtga------gatatagggtgctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 22407652  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggga 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22407651 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 22407591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 99 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 28459435 - 28459175
Alignment:
Q  99 ggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaa 198  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28459435 ggtttgtatagagcttgtctcttggcaacaaaaactaggatttgagggtggattcaccttggcaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaa 28459337  T
Q  199 gagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggc 296  Q
    ||| ||| | |||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |  |||||||| ||||||| |  |||||||    
T  28459336 gagtttggggcttcaggtataattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttttaaagttactcatcattatagtgaaacggagggc 28459237  T
Q  297 tgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    | ||||||  || |||||||||||  ||||| |||||| | | ||||||||| ||||||||||    
T  28459236 ttctctct-acctagactaggtcaatttggatcgaactagataaacaaattcttttgtgttct 28459175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 22407592 - 22407439
Alignment:
Q  207 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 305  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  22407592 gacttttggtagaattaggggggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 22407493  T
Q  306 ccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  22407492 ccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 22407439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 5377769 - 5377630
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||   || ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  5377769 actttcactataaatatagaccttgtttcagagcaaactttga--gagagatagaggggactgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggt 5377672  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttga 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5377671 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttga 5377630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 216 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 7463077 - 7462950
Alignment:
Q  216 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagact 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7463077 tagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttacccattatatagtggatcggagggctgctctctcccccagact 7462978  T
Q  315 aggtc-atattggaccgaactgggtcaa 341  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||    
T  7462977 aggtcaattttggaccgaactgggtcaa 7462950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 145 - 347
Target Start/End: Original strand, 40699429 - 40699634
Alignment:
Q  145 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||    
T  40699429 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgt 40699527  T
Q  244 aacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtca 340  Q
    || || ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||   ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |    
T  40699528 aatcctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctttcccccagactaggtcagtattagaccgaactaggtaa 40699627  T
Q  341 acaaatt 347  Q
    |||||||    
T  40699628 acaaatt 40699634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 162 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 20054947 - 20054742
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || |||||    
T  20054947 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctct 20054853  T
Q  261 ttgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgt 356  Q
    |||||| |||||||||  ||| ||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  20054852 ttgtaaagaaactcatatcattatagtagatcggagagctgctctctccaccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc--ttgtgt 20054755  T
Q  357 tcttcttcttctt 369  Q
    |||||||||||||    
T  20054754 tcttcttcttctt 20054742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 84 - 359
Target Start/End: Original strand, 35107294 - 35107566
Alignment:
Q  84 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 183  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||   ||||| | |  ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  35107294 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaaca---gggttggga--ttgattcaccttgagaaacattattaggattg-agtc 35107386  T
Q  184 tcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattag--gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-t 279  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||     | |||||||||||||||| || ||| | |||| ||||||| |  |||||||| |    
T  35107387 tcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattagattttgaagacttattcttgtaa-cctttgttatctcttttgtaatgttactcatcatt 35107485  T
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||||||  ||| || || |||||  |||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||   ||||||||||    
T  35107486 atagtggaacggatggttgttctctttcccagactaggtcagtattggaccgaaataggtaaacaaatatttttgtgttct 35107566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 165 - 360
Target Start/End: Original strand, 17943540 - 17943731
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  17943540 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactca---atatctctttg 17943634  T
Q  264 taacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 360  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||    
T  17943635 taaagaaactcatcattatagtggatcagagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaattc--ttgtgttctt 17943731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 165 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 27517818 - 27517616
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  27517818 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 27517724  T
Q  264 taacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||| |||||||||  ||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||  |||||||||    
T  27517723 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaacttggtaaacaaattc--ttgtgttct 27517626  T
Q  360 tcttcttctt 369  Q
    ||||||||||    
T  27517625 tcttcttctt 27517616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Original strand, 43139356 - 43139564
Alignment:
Q  65 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaa 164  Q
    ||||||||||||||||   |||||  |||||| |||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||||   || |||||||| |||||||||    
T  43139356 aaacaagggtttagaagc-caacacaaaaacttgggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttg--agattgattcatcttgggaaa 43139449  T
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 263  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |   ||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  43139450 cattattaggattg-agtctcttggtcacgggaagatattgagactttaggtagaattaggtctaaagactaattattgtaaccttttgatttctctttg 43139548  T
Q  264 taacgaaactcatcat 279  Q
    ||| |  |||||||||    
T  43139549 taaagttactcatcat 43139564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 162 - 346
Target Start/End: Original strand, 2736205 - 2736388
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || |||||||| ||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  2736205 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactttgg-tagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 2736299  T
Q  261 ttgtaacgaaactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  2736300 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 2736388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 162 - 262
Target Start/End: Original strand, 20589763 - 20589863
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  20589763 aaacactgttaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttttaacccattgatatctct 20589861  T
Q  261 tt 262  Q
    ||    
T  20589862 tt 20589863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 226 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 22707872 - 22707736
Alignment:
Q  226 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc--cagactaggtcata 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||| |   ||||||||||||||| ||  ||||||||||||      
T  22707872 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctctcctccagactaggtcaat 22707773  T
Q  323 ttggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  22707772 ttggactgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 22707736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 99 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 27136368 - 27136208
Alignment:
Q  99 ggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaa 198  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||    
T  27136368 ggtttatatagagcttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcatcttggaaaacactattaggattgaa-tctcttggtcacggaaa 27136273  T
Q  199 gagattgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 262  Q
    || |||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  27136272 gaaattgggactttgagtagaattaggtttggagacttattcttgtaactcattgatatctcttt 27136208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 165 - 369
Target Start/End: Original strand, 30478997 - 30479199
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||   || ||||||||    
T  30478997 cactattaggattg-agtctcttgatcacgggaagagactgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactca---atatctctttg 30479091  T
Q  264 taacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||| |||||||||  ||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||||    
T  30479092 taaagaaactcatatcattatagtagatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc--ttgtattct 30479189  T
Q  360 tcttcttctt 369  Q
    ||||||||||    
T  30479190 tcttcttctt 30479199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 14699036 - 14699100
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14699036 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 14699100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 132 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 38414291 - 38414194
Alignment:
Q  132 actagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggag 231  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  38414291 actagggtttga-ggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggtcac-ggaaaagattgggacttttggtagaattaggcgggag 38414195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 260 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 22163106 - 22163007
Alignment:
Q  260 tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22163106 tttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 22163007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 162 - 346
Target Start/End: Original strand, 2740941 - 2741124
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||    | |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  2740941 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggttgggactt-gggtagaattaggtttaaagactgattcttgaaactcatta---tctct 2741035  T
Q  261 ttgtaacgaaactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||    
T  2741036 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaat 2741124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 162 - 346
Target Start/End: Original strand, 17462436 - 17462619
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| | ||    |||||    
T  17462436 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcctta---tctct 17462530  T
Q  261 ttgtaacgaaactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  17462531 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 17462619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 162 - 346
Target Start/End: Original strand, 39686983 - 39687166
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  39686983 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 39687077  T
Q  261 ttgtaacgaaactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  39687078 ttgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 39687166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 13569396 - 13569332
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13569396 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 13569332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 20522288 - 20522224
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20522288 atagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 20522224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 162 - 346
Target Start/End: Original strand, 39680045 - 39680228
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  |||||||| |||||||||||||   || || | ||||||| ||| ||||    |||||    
T  39680045 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgagaagaggctgagactt-gggtagaattaggtttgaagattgattcttgaaactcatta---tctct 39680139  T
Q  261 ttgtaacgaaactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  39680140 ttgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 39680228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 162 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 20050204 - 20049998
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  |  ||||| || || |||||||   || |||| ||||||||||| ||   || |||||    
T  20050204 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacggaaagaggctaggactt-ggatataattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctct 20050110  T
Q  261 ttgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctc-ccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtg 355  Q
    |||||| |||||||||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  20050109 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctccccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc--ttgtg 20050012  T
Q  356 ttcttcttcttctt 369  Q
    ||||||||||||||    
T  20050011 ttcttcttcttctt 20049998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 279 - 344
Target Start/End: Original strand, 34682362 - 34682427
Alignment:
Q  279 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34682362 tatagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaa 34682427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 49 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 37963222 - 37962938
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||| || |||||| |||||   ||||||||| | ||||     |||    
T  37963222 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtgtatagtttg-ctcttgacaacaaacaccatggttgt---gtt 37963135  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||| |||| | ||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  37963134 gattccccttagaaaacattattgagattg-agtctcttggtcacctgaagagattgaggctttgggtagaattagacgagagacttattcttgtaatcc 37963036  T
Q  249 attgatttctctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||||||  | ||||||| |  | |||||| ||||||| |   | || ||| |||||| |||| ||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||    
T  37963035 attgatt--tttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacagtggactgatctctctcccacactaggttaatttggaccgaactgggtaaacaaatt 37962938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 8040128 - 8040064
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8040128 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaa 8040064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 10445473 - 10445537
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10445473 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaa 10445537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 28259206 - 28259270
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28259206 atagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 28259270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 346
Target Start/End: Original strand, 45679813 - 45679906
Alignment:
Q  256 tctctttgtaacgaaactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  45679813 tctctttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 45679906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 8390179 - 8390243
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8390179 atagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcattttggaccgaactgggtcaacaa 8390243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 17865271 - 17865207
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  17865271 atagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattcgactgaactgggtcaacaa 17865207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 33118204 - 33118140
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  33118204 atagtggattggagggctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgagccaacaa 33118140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 34388926 - 34388862
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34388926 atagtggattggagagctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 34388862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 39482999 - 39482935
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39482999 atagtggattggaggcctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 39482935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 281 - 344
Target Start/End: Original strand, 2838060 - 2838123
Alignment:
Q  281 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2838060 tagtggattggagatgtgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 2838123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 225 - 359
Target Start/End: Original strand, 23870951 - 23871086
Alignment:
Q  225 gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatat 323  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |  ||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||  ||| |||||||  |    
T  23870951 gcggcagacttattcttgtaacccattaatatctctttagtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctctcccttagattaggtcaatt 23871050  T
Q  324 tggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||| | |||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  23871051 tggatcaaactaggtcaacaaattcttttgagttct 23871086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 282 - 344
Target Start/End: Original strand, 1345572 - 1345634
Alignment:
Q  282 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1345572 agtggatcggagaggtgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 1345634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 12781400 - 12781218
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaga-cttattcttgtaacccattgatttctctttg 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || | || ||||||| ||| ||   || ||||||||    
T  12781400 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaaaactgattcttggaactca---atatctctttg 12781306  T
Q  264 taacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    ||| |||||||||  ||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  12781305 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaatt 12781218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 146 - 223
Target Start/End: Original strand, 26345661 - 26345738
Alignment:
Q  146 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttgggtagaatta 223  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  26345661 gttgattcaccttagcaaacactattaggatt-gagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaatta 26345738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 10707281 - 10707345
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10707281 atagtggattggagagttgttctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 10707345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 16940238 - 16940302
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16940238 atagtggattggagggctgatctttcccccagattatgtcatattggaccgaattgggtcaacaa 16940302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 17010903 - 17010967
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  17010903 atagtggattggagggctgatctttcccccagattatgtcatattggaccgaattgggtcaacaa 17010967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 147 - 225
Target Start/End: Original strand, 17921754 - 17921833
Alignment:
Q  147 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttgggtagaattagg 225  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  17921754 ttgattcaccttgaagaaacactattaggattg-agtctcttggttacaggaagagattcgggactttgggtagaattagg 17921833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 21630011 - 21629948
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21630011 atagtggattggagagctgctctctcccc-agattaggtcatattggactgaactgggtcaacaa 21629948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 25398563 - 25398500
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  25398563 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattgg-ctgaactgggtcaacaa 25398500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 33528650 - 33528714
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33528650 atagtggattggagggttgctctctttcccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 33528714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 281 - 344
Target Start/End: Original strand, 2869723 - 2869786
Alignment:
Q  281 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2869723 tagtggattggagagctactctctcccctagagtaggtcatattggaccgaactgggtaaacaa 2869786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 148 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 27583535 - 27583477
Alignment:
Q  148 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgag 207  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27583535 tgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagagattgag 27583477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 281 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 31056111 - 31056048
Alignment:
Q  281 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  31056111 tagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattgaaccgaactaggtcaacaa 31056048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 256 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 33671059 - 33670965
Alignment:
Q  256 tctctttgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||    
T  33671059 tctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgcgtaaacaaat 33670965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 103
Target Start/End: Original strand, 38020103 - 38020157
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 103  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38020103 gagatagagggggttggaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 38020157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 35028595 - 35028707
Alignment:
Q  107 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattga 206  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||   || ||||||| | |||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | ||| |||||||||||    
T  35028595 tagagtttg-ctcttggtaacaaacactagggttg--agattgattcgcattggaaaacactattatgattg-agtctcttgatcacgagaagagattga 35028690  T
Q  207 gactttgggtagaatta 223  Q
     ||||||||||||||||    
T  35028691 cactttgggtagaatta 35028707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 3491818 - 3491755
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  3491818 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 3491755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 25403701 - 25403638
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  25403701 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattgg-ctgaactgagtcaacaa 25403638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 42039698 - 42039762
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  42039698 atagtggattagagagctgctctctcccacagattaggtcatattggaccgaactagatcaacaa 42039762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 343
Target Start/End: Original strand, 23078499 - 23078562
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 343  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23078499 atagtggattggagagttgttctctcccccatattaggtcatattggatcgaactgggtcaaca 23078562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 334
Target Start/End: Original strand, 27149322 - 27149377
Alignment:
Q  279 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaact 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  27149322 tatagtggattggagagctgctctctcccccatagtaggtcatattggaccaaact 27149377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 28459011 - 28458949
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  28459011 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacggaaagatattgggactttgggtagaattagg 28458949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 147 - 223
Target Start/End: Original strand, 7502975 - 7503052
Alignment:
Q  147 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttgggtagaatta 223  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7502975 ttgatccaccttggagaaacactattaggattg-agtatcttggtcaagggaagagatttgagactttgggtagaatta 7503052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 295 - 367
Target Start/End: Original strand, 38191144 - 38191215
Alignment:
Q  295 gctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttc 367  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||    
T  38191144 gctgctctctcccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc--ttgtgttctccttcttc 38191215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 11098960 - 11099019
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  11098960 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 11099019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 148 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 13828542 - 13828426
Alignment:
Q  148 tgattcaccttgggaaacactattaggatt-ggagtctctt--ggttacgggaagagattgagactttgggtagaatta-ggcgggagacttattcttgt 243  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||  ||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |   | ||||||||||||||    
T  13828542 tgattcaccttaggaaacactgtta--attaggagtctcttttggtcacgggaagagattcagactttgggtagaattatgtttgaagacttattcttgt 13828445  T
Q  244 aacccattgatttctcttt 262  Q
    | ||| ||||| |||||||    
T  13828444 agccctttgatatctcttt 13828426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 14291552 - 14291493
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  14291552 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 14291493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 17057413 - 17057369
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17057413 tctctcccccagactaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 17057369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 17085396 - 17085352
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17085396 tctctcccccagactaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 17085352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 147 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 34575308 - 34575230
Alignment:
Q  147 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttgggtagaattagg 225  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  34575308 ttgattcaccttggagaaacactattaggat-ggagtctcttggtctcgggaa-agattcgggactttgggtagaattagg 34575230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 36757795 - 36757855
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36757795 tggattggagagctgttatcccccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 36757855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 40738910 - 40738848
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  40738910 atagtggattggagagctgctctc-cccccagattaggtcatattgg-ctgaactgggtcaacaa 40738848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 44312645 - 44312704
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  44312645 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 44312704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 146 - 262
Target Start/End: Original strand, 15693958 - 15694076
Alignment:
Q  146 gttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttg 242  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||    
T  15693958 gttgattcaccgtggagaaacactattaggataa-agtctcttggtcacaggaagagatttgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttg 15694056  T
Q  243 taacccattgatttctcttt 262  Q
    |||||  ||||| |||||||    
T  15694057 taaccttttgatatctcttt 15694076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 288
Target Start/End: Original strand, 17932637 - 17932757
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  17932637 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 17932731  T
Q  264 taacgaaactcatca-tatagtggat 288  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17932732 taaagaaactcatcattatagtggat 17932757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 298 - 347
Target Start/End: Original strand, 8173539 - 8173589
Alignment:
Q  298 gctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  8173539 gctctctcccccatactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 8173589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 147 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 30720811 - 30720703
Alignment:
Q  147 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 243  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |  ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||    
T  30720811 ttgattcatcttggagaaacactattaggattg-agtctctttggcacgagaagagattcgtgactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgt 30720713  T
Q  244 aacccattga 253  Q
    ||||| ||||    
T  30720712 aaccctttga 30720703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 723788 - 723744
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  723788 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 723744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 9296434 - 9296493
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  9296434 tggattggagagctgctctctcccccaaattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 9296493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 15539550 - 15539514
Alignment:
Q  323 ttggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15539550 ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 15539514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 34139814 - 34139770
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  34139814 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 34139770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Original strand, 39284960 - 39285004
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  39284960 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 39285004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 39812009 - 39812068
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||| |||||||    
T  39812009 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactggttcaacaa 39812068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 161 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10942696 - 10942634
Alignment:
Q  161 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttgggtagaatta 223  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  10942696 gaaacactattaggatt-gagtctctttgtcacgggaagaaattcgggactttgggtagaatta 10942634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 161 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10948565 - 10948503
Alignment:
Q  161 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttgggtagaatta 223  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  10948565 gaaacactattaggatt-gagtctctttgtcacgggaagaaattcgggactttgggtagaatta 10948503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 301 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 11151634 - 11151591
Alignment:
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  11151634 ctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 11151591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 162 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22712698 - 22712637
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  22712698 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22712637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 162 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22717407 - 22717346
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  22717407 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22717346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 162 - 225
Target Start/End: Original strand, 45567409 - 45567470
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  45567409 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 45567470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 17897578 - 17897548
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcag 32  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17897578 acttttactataaatatagaccttgtatcag 17897548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 284 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 32246852 - 32246810
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattgg 326  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  32246852 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 32246810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 162 - 310
Target Start/End: Original strand, 33603994 - 33604143
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    |||||||||||  |||| ||||| ||||| | |||||| |||||||||||| || |||||||||   | ||||| |||||| |||||  ||||| | |||    
T  33603994 aaacactattataattg-agtcttttggtcatgggaagtgattgagactttaggaagaattaggtttgaagactaattcttctaaccttttgatatatct 33604092  T
Q  261 ttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccccca 310  Q
    |||||| |  |||||||| |||||||||  ||| | |||||||||||||||    
T  33604093 ttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccca 33604143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 34575186 - 34575123
Alignment:
Q  295 gctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||| ||||||||  ||||||||||    
T  34575186 gctgctctctcccccagactaggtcagcattggatcgaactaggtaaacaaatt--tttgtgttct 34575123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 36559112 - 36559082
Alignment:
Q  1 gacttttactataaatatagaccttgtatca 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36559112 gacttttactataaatatagaccttgtatca 36559082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 36561389 - 36561359
Alignment:
Q  1 gacttttactataaatatagaccttgtatca 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36561389 gacttttactataaatatagaccttgtatca 36561359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 32
Target Start/End: Original strand, 20589581 - 20589610
Alignment:
Q  3 cttttactataaatatagaccttgtatcag 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20589581 cttttactataaatatagaccttgtatcag 20589610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 299 - 347
Target Start/End: Original strand, 20592288 - 20592337
Alignment:
Q  299 ctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||    
T  20592288 ctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaattggataaacaaatt 20592337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 25407690 - 25407653
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactagg 317  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  25407690 atagtggattggagagctgctctctcccccagattagg 25407653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 40014992 - 40014935
Alignment:
Q  281 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggt 338  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||| || ||||||||||| | ||||||||    
T  40014992 tagtggattggagggatgttctctccctcagagtatgtcatattggatctaactgggt 40014935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 45332428 - 45332399
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatca 31  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45332428 acttttactataaatatagaccttgtatca 45332399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Original strand, 11067429 - 11067473
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  11067429 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactcggtcaacaa 11067473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 14633869 - 14633825
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  14633869 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgagtcaacaa 14633825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #143
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 19344485 - 19344426
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  19344485 tggattggagagctgctctctcccctagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 19344426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #144
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 19349343 - 19349284
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  19349343 tggattggagagctgctctctcccctagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 19349284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Original strand, 36773686 - 36773730
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  36773686 tctctcccccagattatgtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 36773730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #146
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Original strand, 38312364 - 38312408
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  38312364 tctctcccccagattatgtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 38312408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 131)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 12195851 - 12195467
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    || ||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12195851 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 12195758  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12195757 ttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 12195658  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 301  Q
    |||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12195657 attgggactttgagtagaattaatcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 12195558  T
Q  302 tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12195557 tctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaagtttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 12195467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 20915695 - 20915309
Alignment:
Q  1 gacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  20915695 gacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaa--attg--agagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagga 20915600  T
Q  101 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20915599 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgagaaga 20915500  T
Q  201 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20915499 gattgggacttcgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgct 20915400  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgttttt 392  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20915399 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt-ctctgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgtcgttgttttt 20915309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 4816582 - 4816183
Alignment:
Q  1 gacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagaga--------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaa 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4816582 gacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaa 4816483  T
Q  93 aactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggtta 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4816482 aactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggtta 4816384  T
Q  193 cgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattgg 291  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  4816383 cgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacggtactcatcatatagtggattgg 4816284  T
Q  292 agggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgttt 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4816283 agggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgttt 4816185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 8 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 19704905 - 19704519
Alignment:
Q  8 actataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19704905 actataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagagatggagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 19704806  T
Q  108 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgag 207  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19704805 agagtttgtctcttaggagcaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 19704706  T
Q  208 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt--ctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19704705 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 19704606  T
Q  306 ccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgttttt 392  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19704605 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgttttt 19704519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 2 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 26932906 - 26932515
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatcttt--gaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagg 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||    || ||||  || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  26932906 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagagagatagagggggttgaaacaagggcttagaaaagcaataacaaaactagg 26932807  T
Q  100 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaag 199  Q
    |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26932806 gtttgtatagagtttgtctcttagaagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaag 26932707  T
Q  200 agattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgc 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26932706 agattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggttgc 26932607  T
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaa-ttcctttgtgttcttcttcttcttttgttcttctcgccgttgttttt 392  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  26932606 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttcttttgtgttcttcttct--ttgtgttcttctcgccgttgttttt 26932515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 2629226 - 2628839
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2629226 acttttactataaatatagaccttgtatcatgttaaactttgagagagagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 2629128  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2629127 ttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactaggttttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagag 2629029  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 301  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2629028 attgggactttgggtagaattaggcggagaatttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggatcggagggctgctc 2628929  T
Q  302 tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2628928 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 2628839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Original strand, 30967176 - 30967562
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  30967176 acttttactataaatatagaccttgtat-aggctaaactttga--gagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactatggt 30967272  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30967273 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagag 30967371  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
      ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  30967372 gctgaaactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctgct 30967471  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30967472 ctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 30967562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 14507511 - 14507129
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||   || ||||||      ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14507511 acttttactataaatatagaccttgtattagagcaaactttga------gatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 14507418  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14507417 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagag 14507319  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 301  Q
      || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  14507318 gctgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatacttatcatatagtgaatcggagggctgctc 14507219  T
Q  302 tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14507218 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 14507129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 28241657 - 28241274
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28241657 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactt------agagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 28241564  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28241563 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagag 28241465  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
      || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  28241464 gctgggactttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgct 28241365  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  28241364 ctctcccccagactaggtgaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttttcgccgttgtttt 28241274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 30034943 - 30034556
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||    
T  30034943 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaacttt--aagagagatagagggagctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagagt 30034846  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||    
T  30034845 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtcaattggttaagggaagag 30034747  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  30034746 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagcggatcggagggctgct 30034647  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  30034646 ctctcccccagactgggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttatt-atcttctttgtgttcttctcgccattgtttt 30034556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 11983365 - 11983014
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   || ||| ||      |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  11983365 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttgga------gatagagggggctgaaacaaaggcttagaaaggcaacaacaaaactagggt 11983272  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11983271 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagag 11983173  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11983172 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 11983073  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11983072 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 11983014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 49 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 14459060 - 14458720
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  14459060 gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggct 14458961  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14458960 gatt--ccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 14458864  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  14458863 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 14458764  T
Q  348 cctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  14458763 cttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgtcgttgtttt 14458720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 49 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 1230544 - 1230202
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1230544 gagatagagagggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 1230445  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1230444 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gactctcttggttattggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 1230346  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  1230345 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 1230246  T
Q  348 cctttgtgttcttcttcttc-ttttgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  1230245 cttttgtgttcttc-tcttcattgtgttcttctcgccgttgtttt 1230202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 129 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 5273431 - 5273169
Alignment:
Q  129 aacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgg 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5273431 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgg 5273332  T
Q  229 gagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  5273331 gagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcttatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggac 5273232  T
Q  329 cgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttttgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5273231 cgaactgggtcaacaaatttctcagtgttcttcttcttcttttgttcttctcgccgttgtttt 5273169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Original strand, 26064959 - 26065340
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||   || |  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||    
T  26064959 actttcactataaatatagaccttgtatcacagtatttcttgga-gagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagt 26065057  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26065058 ttgtatagagtttgtctctttggaa---acactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagag 26065153  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 301  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  26065154 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacttctctttgtaacgttactcgttatatagtggatcggagggctgctc 26065253  T
Q  302 tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttttgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||   | ||||||||||||||| || ||||||||    
T  26065254 tct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttct--ctattcttttgttcttcttgctgttgtttt 26065340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Original strand, 26084928 - 26085309
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||   || |  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||    
T  26084928 actttcactataaatatagaccttgtatcacagtatttcttgga-gagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagt 26085026  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26085027 ttgtatagagtttgtctctttggaa---acactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagag 26085122  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 301  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  26085123 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacttctctttgtaacgttactcgttatatagtggatcggagggctgctc 26085222  T
Q  302 tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttttgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||   | ||||||||||||||| || ||||||||    
T  26085223 tct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttct--ctattcttttgttcttcttgctgttgtttt 26085309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Original strand, 9019904 - 9020255
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9019904 acttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaact------gagagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 9019997  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  9019998 ttgtatagagtttgtctctttggaacaatcactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttataggaagag 9020096  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  || ||||||||    
T  9020097 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggggggctgct 9020196  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9020197 ctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 9020255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 3 - 359
Target Start/End: Original strand, 13057173 - 13057524
Alignment:
Q  3 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtt 102  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| | ||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  13057173 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaactagggtt 13057266  T
Q  103 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaga 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  13057267 tgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-aagtctcttggttacgggaagaga 13057365  T
Q  203 ttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgct 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  |||||||| ||    
T  13057366 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctact 13057465  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  13057466 ctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactcggtcaacaaattcttttgtgttct 13057524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 15541476 - 15541125
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  15541476 acttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaaaaacaaaactagggt 15541383  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  15541382 ttgtatagagtttgtctctttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaatt-gagtctcttggtcacgagaagag 15541284  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  | ||||||||||||| |   ||  ||||||    
T  15541283 attgggactttgggtaggattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatatagtgaaacagaaagctgct 15541184  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||| ||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15541183 ctctcctccagactaggttaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 15541125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 355
Target Start/End: Original strand, 3390357 - 3390705
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| | ||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3390357 acttttactataaatatagacattgtatcagtataaaccttga------gatagacggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 3390450  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  3390451 ttgtatagagtttttctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacagaaagag 3390549  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgc 299  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| || |||| |  ||||||||||    
T  3390550 attggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtgaaacggagggctgc 3390649  T
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtg 355  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  3390650 tctctcccccatactaggtcaatttggaccaaattgggtcaacaaattcttttgtg 3390705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Original strand, 13039773 - 13040084
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  13039773 gagatataggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 13039872  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13039873 gattcaccttggaaaacactattaggatt-aagtctcttggttacgggaagagattgagactttgcgtagaattaggcggaagacttattcttgtaaccc 13039971  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  13039972 attgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaat 13040071  T
Q  347 tcctttgtgttct 359  Q
    || ||||||||||    
T  13040072 tcttttgtgttct 13040084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 161 - 391
Target Start/End: Original strand, 33308988 - 33309217
Alignment:
Q  161 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33308988 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 33309086  T
Q  261 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 360  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33309087 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 33309186  T
Q  361 cttcttcttttgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33309187 cttcttcttttgttcttctcgccgttgtttt 33309217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 3630159 - 3629850
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  3630159 gagatagagggggctgaaacatcggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggtt 3630060  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3630059 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaaccc 3629961  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||||| |||| ||||||| |  ||| || |||||||| |   |||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  3629960 attgatatctcttttgtaaagttactaataatatagtgaaactgagggctgctctct-ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 3629862  T
Q  348 cctttgtgttct 359  Q
    | ||||||||||    
T  3629861 cttttgtgttct 3629850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 161 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 29754892 - 29754662
Alignment:
Q  161 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29754892 gaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttaggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctct 29754793  T
Q  261 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 360  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29754792 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 29754693  T
Q  361 cttcttcttttgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29754692 cttcttcttttgttcttctcgcagttgtttt 29754662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 161 - 391
Target Start/End: Original strand, 33311257 - 33311486
Alignment:
Q  161 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33311257 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 33311355  T
Q  261 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 360  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33311356 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctttctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 33311455  T
Q  361 cttcttcttttgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33311456 cttcttcttttgttcttctcgccgttgtttt 33311486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 15533017 - 15532678
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  15533017 acttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggt 15532924  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  15532923 ttgtataaagtttgtttctttggaacaaacaatagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggtcatgggaagag 15532825  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  15532824 attgggacttttggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgct 15532725  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattc 348  Q
    || | ||| |||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||    
T  15532724 ctat-ccctagactaggtcaattttgactgaactaggtcaacaaattc 15532678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 15530458 - 15530166
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||      | |||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  15530458 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaact------gggagatagagggggctgaagcaagggcttagaatggcaacaacaaaactagggt 15530365  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15530364 ttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagag 15530266  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  15530265 attgaggctttgggttgaattaggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgct 15530167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Original strand, 25477293 - 25477611
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  25477293 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 25477392  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25477393 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggtcacggaaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 25477491  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaa-------cgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtc 339  Q
    |||||| |||| |||||||       ||  |||||||| ||||||| |   |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||    
T  25477492 attgatatctcttttgtaacgttactcgttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaaatgggtc 25477591  T
Q  340 aacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||||||| ||||| ||||    
T  25477592 aacaaattcttttgtattct 25477611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 5 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 3632271 - 3631926
Alignment:
Q  5 tttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 104  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||| | ||||      ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3632271 tttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttga------gatagagggagttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 3632178  T
Q  105 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt 204  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  3632177 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttaagggttgattcatcttgggaaacactattaggatt-gagtctctttgttacggaaagagatt 3632079  T
Q  205 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctct 302  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  |||||||||||||    
T  3632078 gggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctct 3631979  T
Q  303 ctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgtt 357  Q
     |  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3631978 gt--cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 3631926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 50 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 3234025 - 3233710
Alignment:
Q  50 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  3234025 agatagagggggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactaaggtttgtatatagtttgtctctttggtaacaaacactagggtttgagggtt 3233926  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  3233925 gattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaactc 3233827  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggacc-----gaactgggtcaac 342  Q
    |||||  |||| |||||||||  ||||| | ||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||     |||||||||||||    
T  3233826 attgacatctcttttgtaacgttactcaccgtatagtgaaacggagggctgctctctcccccacactaggtcaattttgaccgaactgaactgggtcaac 3233727  T
Q  343 aaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||| ||||||||||    
T  3233726 aaattcttttgtgttct 3233710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Original strand, 32280016 - 32280326
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||    
T  32280016 gagatagagggg-ctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacacttgggtttgagggtt 32280114  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32280115 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggacttcaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 32280213  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatc-atatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| |||| ||||||| |  |||||||  ||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||    
T  32280214 attgatatctcttttgtaaagttactcatcgttatagtaaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaaaaaat 32280313  T
Q  347 tcctttgtgttct 359  Q
    ||  |||||||||    
T  32280314 tctcttgtgttct 32280326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 30729164 - 30728811
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| | ||||      |||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||| ||||    
T  30729164 acttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaaccttga------gatagagggggctgaaacaagggtatcgaaagacaacaacaaaacttgggt 30729071  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  30729070 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-actctcttggttacgggaagag 30728972  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat----ttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggc 296  Q
      || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    |||||||| |||| |  ||||||  |||||||||  ||| |||    
T  30728971 gctggggctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctttctcttttgtaaagttactcatattatagtggaacggaaggc 30728872  T
Q  297 tgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgtt 357  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  30728871 tgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 30728811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 161 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 26068578 - 26068348
Alignment:
Q  161 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26068578 gaaacactattaggattggagtctcttgcttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 26068479  T
Q  261 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 360  Q
    ||||||||   ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26068478 ttgtaacgttgctcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 26068379  T
Q  361 cttcttcttttgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26068378 cttcttcttttgttcttctcgcagttgtttt 26068348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 161 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 26066307 - 26066074
Alignment:
Q  161 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26066307 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 26066208  T
Q  261 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 360  Q
    ||||||||  ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26066207 ttgtaacgttacttatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 26066108  T
Q  361 cttct---tcttttgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||   ||||||||||||||||| ||||||||    
T  26066107 cttcttcttcttttgttcttctcgcagttgtttt 26066074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 19227744 - 19227514
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||   || ||||||      |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19227744 acttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaactttga------gataaagggggctcaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 19227651  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19227650 ttgtatagagtttgtctttttggatcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagag 19227552  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattc 239  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19227551 gctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattc 19227514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 58 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 12161841 - 12161543
Alignment:
Q  58 ggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcacct 157  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  12161841 ggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc--tggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacgt 12161744  T
Q  158 tgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc 257  Q
    ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  12161743 tgggaaacactattaaga-tcgagtctattggttacgggaagagattgagactttaggtataattaagtgggagatttattcttgtaacccattgatatc 12161645  T
Q  258 tc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgt 356  Q
    || ||||||| |  ||||||||||||||  | |||| ||||| ||||| ||| | ||||||| |  |||||||||||||  ||||||||||  |||||||    
T  12161644 tcttttgtaaggttactcatcatatagtaaaatggatggctgttctct-ccctaaactaggttaatttggaccgaactgaatcaacaaattattttgtgt 12161546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 24338783 - 24338446
Alignment:
Q  3 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtt 102  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| | ||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24338783 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 24338690  T
Q  103 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacacta-gggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    || ||| ||||||| |||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||| || |||||    
T  24338689 tgcataaagtttgtgtcttagcaacaaacactaggggtttgagggttgatttaccttggaaaacactattaagatt-gagtcttttggttatggaaagag 24338591  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgc 299  Q
    ||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  |||||||||     
T  24338590 attaagactttgggtagaattagtcagaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctg- 24338492  T
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
     ||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||| |||||||    
T  24338491 -ctctcccccagactatgtcaatttggaccgaactaggtaaacaaat 24338446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 49 - 262
Target Start/End: Original strand, 22490658 - 22490871
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggttta-gaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggt 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |      
T  22490658 gagatagagggggctgaaacaagggtttttgaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatatagtttgcctctttggaacaaacactagggtttgaggag 22490757  T
Q  148 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 247  Q
      || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  22490758 gtatacaccttgcgaaacactattaggattg-agtctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattatgcgagagacttattcttgtaacc 22490856  T
Q  248 cattgatttctcttt 262  Q
    ||||||| |||||||    
T  22490857 cattgatatctcttt 22490871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 3028186 - 3027848
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |  |      |||||| | ||||||| |||||||||||| | || ||||| ||||||||||||    
T  3028186 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccat------gagataaaaggggctgaaaacaagggttt-ggaaggcaac-acaaaactaggg 3028095  T
Q  101 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 200  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  3028094 tttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgtgaaga 3027999  T
Q  201 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctg 298  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  |||||||||    
T  3027998 gattgagactttgagtagaattaggctggagatttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctg 3027899  T
Q  299 ctctct-cccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||| | |||||||||||||||| | || ||||||||||| | ||||||||    
T  3027898 ctctttccccccagactaggtcagtttttgaccgaactggataaacaaatt 3027848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 150 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 1069913 - 1069703
Alignment:
Q  150 attcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1069913 attcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 1069815  T
Q  250 ttgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    ||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||| | |  ||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||  ||||||||||    
T  1069814 ttgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagagaaacggagggctgctctcttccccatactaggtcaatttggaccgaactgaatcaacaaatt 1069715  T
Q  348 cctttgtgttct 359  Q
    | ||| ||||||    
T  1069714 cttttatgttct 1069703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 65 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16455701 - 16455421
Alignment:
Q  65 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaa 164  Q
    ||||||||||||||||   |||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  16455701 aaacaagggtttagaagt-caacacaaaaactagggtttgtacagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgt--ggttgattcaccttgggaaa 16455606  T
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 263  Q
    |||| ||||||||  ||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  16455605 cactgttaggatta-agtctcttgctcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaaccctttgatatctcttttg 16455507  T
Q  264 taacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||    |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  16455506 taaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcagtattggaccgaactgagtaaacaaatt 16455421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 49 - 347
Target Start/End: Original strand, 15719673 - 15719961
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||| ||  |||    
T  15719673 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt-ga--gtt 15719760  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15719761 gattcaccttggaaaacactattaggattg-agtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 15719859  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctct-cccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaa 345  Q
    |||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |   ||| | |||||| | |||||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||||||    
T  15719860 attgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagagttgctctttccccccatactaggtcaatttggaccgaacttggtaaacaaa 15719959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 146 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 12186271 - 12186056
Alignment:
Q  146 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  12186271 gttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttgttcacgggaagagattgagactttgggtacaattaggtttggagacttattcttgta 12186173  T
Q  245 acccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaac 342  Q
    || ||||||| ||||||| |||| |  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| || | ||||||||||  ||| |||||||||||| |||    
T  12186172 actcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctgcctcggactaggtcaatttgaaccgaactgggtaaac 12186073  T
Q  343 aaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||  ||||||||||    
T  12186072 aaattattttgtgttct 12186056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 107 - 359
Target Start/End: Original strand, 14466399 - 14466653
Alignment:
Q  107 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaagg-ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 205  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  14466399 tagagtttgtctattggcaacaaacactagggttttgaggattgattcatcttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacggaaagagattg 14466497  T
Q  206 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctc 303  Q
     || |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |  | ||||||| |||||| |  ||| | ||||| |     
T  14466498 ggagtttgagtagaattaggcgagagacatattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaccggatgactgctgtt 14466597  T
Q  304 tcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  14466598 tcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcagcaaattctcttgtgttct 14466653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 96 - 347
Target Start/End: Original strand, 15367101 - 15367349
Alignment:
Q  96 tagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgg 195  Q
    ||||| |||||| | ||||| ||||| | |||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||  |||    
T  15367101 taggggttgtattgtgtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg---gttgattcaccttgggaaacactcttaggattg-agtctcttcgtcgcgg 15367195  T
Q  196 gaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagg 294  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |  | ||||||||||||| |  ||| |    
T  15367196 gaagagattgaaactttgggtaaaattaatcgggagacttattcttgtaacccattaatatctctattgtaaagttattcatcatatagtgaaacggaag 15367295  T
Q  295 gctgctctctc-ccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  15367296 gctgctctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaatt 15367349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 92 - 347
Target Start/End: Original strand, 17012105 - 17012358
Alignment:
Q  92 aaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt 191  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||     
T  17012105 aaactagggtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttg--aggttgattcaccttctgaaacaatattaggattg-agtctcttggtc 17012200  T
Q  192 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggatt 289  Q
    ||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |  ||||||| | |||| |||      
T  17012201 acgagaagagattgatgcttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcgttatag-ggaac 17012299  T
Q  290 ggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
      || | |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  17012300 atagagatcatctctcccccagactaggtcagtattggaccgaactaggtaaacaaatt 17012358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 65 - 347
Target Start/End: Original strand, 19696479 - 19696759
Alignment:
Q  65 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaa 164  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||  ||  ||||||||||||||||||    
T  19696479 aaacaagggtttagaaaca-aacaacaaat-tagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaatcactagggttcaaa--ttgattcaccttgggaaa 19696573  T
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctcttt- 262  Q
    |||| ||||||||| |||||||| || || | |||||||||||||||||| ||||||||||   || ||||||||||||||| || ||||| |||||||     
T  19696574 cactgttaggattg-agtctctttgtcactgaaagagattgagactttggttagaattaggtttgaagacttattcttgtaatcctttgatatctctttt 19696672  T
Q  263 gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||| |  | ||||||| ||||||||   ||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  19696673 gtaaagttattcatcattatagtggaacagatagctgctctctctcccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 19696759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 91 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22858203 - 22857949
Alignment:
Q  91 aaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggt 190  Q
    ||||||||||||||||  || ||| |||||| | ||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  22858203 aaaactagggtttgta--gaattt-tctcttggtaacaaacactagggttg--agattgattcaccttgggaaacactattatgattg-agtctcttggt 22858110  T
Q  191 tacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccatt-gatttctctttgtaacgaaactcatcat-atagtgga 287  Q
     ||  ||||||||||||||||| |||||| |||||   || |||| ||||||||||||| || ||| | ||||||||| |  ||||||||| ||||||||    
T  22858109 cacaagaagagattgagactttaggtagatttaggtttgaagactaattcttgtaacccttttgatatatctttgtaaagttactcatcattatagtgga 22858010  T
Q  288 ttggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
      ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  22858009 acggatggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaactgtgtaaacaaatt 22857949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 1072213 - 1072079
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||      |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  1072213 acttttactataaatatagacattgtatcagagtaaactttga------gatagaaggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagtgt 1072120  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttg 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1072119 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttg 1072079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 49 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 32447611 - 32447502
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag-ggtttgaaggt 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||| |||    
T  32447611 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagagttttgagggt 32447512  T
Q  148 tgattcacct 157  Q
    ||||||||||    
T  32447511 tgattcacct 32447502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 129
Target Start/End: Original strand, 8995457 - 8995578
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8995457 acttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaact------gagagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 8995550  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8995551 ttgtatagagtttgtctctttggaacaa 8995578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 347
Target Start/End: Original strand, 26945258 - 26945463
Alignment:
Q  145 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 243  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||    
T  26945258 ggttgagtcaccttgggaaacactattaggatta-agtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgtagacttatttttgt 26945356  T
Q  244 aacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtca 340  Q
    ||| ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||| ||  | ||||| |||||| |||||||| || ||||   |||||||||||||||| |    
T  26945357 aactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacgaagggcagctctcccccccagattatgtcaggtttggaccgaactgggtaa 26945456  T
Q  341 acaaatt 347  Q
    |||||||    
T  26945457 acaaatt 26945463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 49 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 13870716 - 13870608
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||    
T  13870716 gagatagagggg-ctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatataaagtttgtctcttggcaacaaacacttgggtttgagggtt 13870618  T
Q  149 gattcacctt 158  Q
    ||||||||||    
T  13870617 gattcacctt 13870608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 49 - 138
Target Start/End: Original strand, 17852561 - 17852650
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17852561 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttcgaacaaacactaggg 17852650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 207 - 347
Target Start/End: Original strand, 15346523 - 15346664
Alignment:
Q  207 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 305  Q
    ||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |  | ||||||||||||| |  |||  |||||||||||    
T  15346523 gactttgagtaaaattaagcggaagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaaagttattcatcatatagtgaaacggaaagctgctctctc 15346622  T
Q  306 ccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  15346623 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaatt 15346664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 162 - 346
Target Start/End: Original strand, 13878727 - 13878910
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  13878727 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 13878821  T
Q  261 ttgtaacgaaactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  13878822 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 13878910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 162 - 346
Target Start/End: Original strand, 16785919 - 16786102
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  16785919 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 16786013  T
Q  261 ttgtaacgaaactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  16786014 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 16786102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 125 - 305
Target Start/End: Original strand, 20526902 - 20527081
Alignment:
Q  125 aacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattag 224  Q
    ||||||||||||||||   || |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  20526902 aacaaacactagggttg--agattgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggtcacaagaagagattaagacttttggtagaattag 20526998  T
Q  225 g-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctc 305  Q
    |   | ||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |  | |||||| |||||||||  |||| |||||||||||    
T  20526999 gtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctctttgtaaagttattcatcattatagtggaacggagagctgctctctc 20527081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 162 - 346
Target Start/End: Original strand, 13883475 - 13883658
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||  ||||    |||||    
T  13883475 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaattcatta---tctct 13883569  T
Q  261 ttgtaacgaaactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  13883570 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 13883658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 165 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 22352031 - 22351830
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||   || |||| |||| |||||| ||   || ||||||||    
T  22352031 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgaga-tttgggtagaattaggtttgaagactgattcatgtaactca---atatctctttg 22351937  T
Q  264 taacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||| |||||||||  ||| ||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  22351936 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagaactgctctctcccccagactaggtcatcattaga-cgaactgggtaaacaaattc--ttgtgttct 22351840  T
Q  360 tcttcttctt 369  Q
    ||||||||||    
T  22351839 tcttcttctt 22351830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 5757507 - 5757571
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5757507 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5757571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 10077194 - 10077258
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10077194 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 10077258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 148 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 28037927 - 28037722
Alignment:
Q  148 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaga-cttattcttgtaac 246  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||||    | | ||||||||||||||    
T  28037927 tgattcaccttgggaaacactgttaggattg-agtcccttgttcacggaaatagattgagactttgggtagaattaggtttaaaatcttattcttgtaac 28037829  T
Q  247 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcat-atagtgga---ttggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtca 340  Q
    || ||||| |||| ||||||| |  ||||||||| ||||||||     | | |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||| |    
T  28037828 cctttgatatctcttttgtaaagttactcatcataatagtggacggacgaaaggctgctctctcccccagtctaggtcagttttggaccgagctgggtaa 28037729  T
Q  341 acaaatt 347  Q
    |||||||    
T  28037728 acaaatt 28037722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 226 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 25465710 - 25465587
Alignment:
Q  226 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tat 323  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||| |||| |||    
T  25465710 cgggagacttattcttgtacccctttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctctcccatactatgtcagtat 25465611  T
Q  324 tggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  25465610 tggaccgaactgggtaaacaaatt 25465587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 256 - 369
Target Start/End: Original strand, 25941759 - 25941874
Alignment:
Q  256 tctctttgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctt 351  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |    
T  25941759 tctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc--t 25941856  T
Q  352 tgtgttcttcttcttctt 369  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25941857 tgtgttcttcttcttctt 25941874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 281 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 31979580 - 31979517
Alignment:
Q  281 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31979580 tagtggattggagggctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaa 31979517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 17695030 - 17694838
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  17695030 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 17694936  T
Q  264 taacgaaactc-atcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 360  Q
    ||| ||||||  ||||| ||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  17694935 taaagaaactatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc--ttgtgttctt 17694838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 5572270 - 5572334
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5572270 atagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 5572334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 21356104 - 21356040
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21356104 atagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 21356040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 162 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 26887406 - 26887225
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  26887406 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 26887312  T
Q  261 ttgtaacgaaactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  26887311 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctc--ccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 26887225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 281 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 31936654 - 31936591
Alignment:
Q  281 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31936654 tagtggattggagagctgctctctctcccagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 31936591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 162 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 35201508 - 35201325
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  35201508 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 35201414  T
Q  261 ttgtaacgaaactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    ||| || |||||| || ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  35201413 ttgaaaagaaactaattcattatagtggatcggagagctgctctctccccaagactaggtcattattagaccgaactgggtaaacaaat 35201325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 170 - 347
Target Start/End: Original strand, 11262596 - 11262777
Alignment:
Q  170 ttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaccca---ttgatttctctttgta 265  Q
    ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||   || |||| |||||| |||||     ||||| ||||||||||    
T  11262596 ttaggattg-agtctcttggtcacaggaagagattgaga-tttaggtagaattaggtttgaagactaattcttataacctccttttgatatctctttgta 11262693  T
Q  266 acgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    | |||||||||||| ||| || |  ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  11262694 aagaaactcatcattatattgtaacggagaactgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaacggggtaaacaaatt 11262777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 22342980 - 22342778
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 263  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||  || || ||||||||| ||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  22342980 cactattaggattgc-gtctcttggtcacgggaagaggctggga-tttgggtagtattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 22342886  T
Q  264 taacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||| |||||||||  ||| ||||||||   ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  22342885 taaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc--ttgtgttct 22342788  T
Q  360 tcttcttctt 369  Q
    || |||||||    
T  22342787 tcatcttctt 22342778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 12911629 - 12911442
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| || |||  || ||||||||||||| |||||| |||||   || | || ||||||||||||  || || |||||    
T  12911629 aaacactattaagattg-agtctcttagtcacgataatagattgagacttttggtagagttaggtttgaaggctaattcttgtaaccatttaatatctct 12911531  T
Q  261 ttgtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtc-atattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||||| |  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| |||| ||||||||    
T  12911530 ttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtctgttttggaacgaaccgggtaaacaaatt 12911442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 25078755 - 25078554
Alignment:
Q  147 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaa 245  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||  |||||||||||   || |||||||||||||||    
T  25078755 ttgattcaccttggtaaacaccgttaagattg-agtctcttggtcacggaaagagattgaga-tttaagtagaattaggtttgaagacttattcttgtaa 25078658  T
Q  246 cccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaac 342  Q
    ||| ||||| ||||||| |||| |  |||| |||| | ||||||  ||||| ||||| ||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  25078657 ccctttgatatctcttttgtaaagttactcgtcattacagtggaacggaggactgctttcttccc-agtctaggtcagtattggaccgaactgggtaaac 25078559  T
Q  343 aaatt 347  Q
    |||||    
T  25078558 aaatt 25078554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 256 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 3577581 - 3577467
Alignment:
Q  256 tctctttgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctt 351  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |    
T  3577581 tctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccc-agactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc--t 3577485  T
Q  352 tgtgttcttcttcttctt 369  Q
    ||||||||||||||||||    
T  3577484 tgtgttcttcttcttctt 3577467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 5165989 - 5165819
Alignment:
Q  170 ttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 268  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||   || || | ||||||||||||| |  || ||||||||||| |    
T  5165989 ttaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgggactt-gggtagaattaggtttgaagaatgattcttgtaaccc-tgaatatctctttgtaaag 5165893  T
Q  269 aaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggt 338  Q
    ||||||||  ||| |||||||| ||||| | |||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  5165892 aaactcatatcattatagtggaatggagagttgctatctcccccagagtaggtcatcattagaccgaactgggt 5165819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 121
Target Start/End: Original strand, 10584155 - 10584212
Alignment:
Q  64 gaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctt 121  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10584155 gaaacaaaggtttataaaagcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctt 10584212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 290 - 359
Target Start/End: Original strand, 10584256 - 10584325
Alignment:
Q  290 ggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  10584256 ggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaatttttttgtgttct 10584325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 5017498 - 5017562
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5017498 atagtagattggagggttgctctctcccctagattaggtcatatttgaccgaactgggtcaacaa 5017562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 162 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 12937376 - 12937190
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||   || | || ||||||||||||  || || |||||    
T  12937376 aaacactattaagattg-agtctcttagtcacgagaatagattgaaacttttggtagaattaggtttgaaggctaattcttgtaaccatttaatatctct 12937278  T
Q  261 ttgtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtc-atattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||||| |  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| |||| ||||||||    
T  12937277 ttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctct-ccccagactaggtctgttttggaacgaaccgggtaaacaaatt 12937190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 22709086 - 22709022
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  22709086 atagtggattggagagctgctctctcccccagattagatcatattgaaccgaactaggtcaacaa 22709022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 22963767 - 22963704
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22963767 atagtggattggagggctgctctct-ccccagatttggtcatattgcaccgaactgggtcaacaa 22963704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 23824626 - 23824689
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23824626 atagtggattggagggctgctctct-ccccagatttggtcatattgcaccgaactgggtcaacaa 23824689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 348
Target Start/End: Original strand, 33215830 - 33216013
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  || ||||| || ||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  33215830 cactattaggattg-agtctcttggtcacggcaagaggctgggactt-ggatagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 33215924  T
Q  264 taacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattc 348  Q
    ||| |||||||||  ||| ||||||||  |||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  33215925 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctatcccccatactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc 33216013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 25465991 - 25465881
Alignment:
Q  256 tctctttgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctt 351  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||   |    
T  25465991 tctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggccatcattagaccgaactgggtaaacaaatt--at 25465894  T
Q  352 tgtgttcttcttc 364  Q
    |||||||||||||    
T  25465893 tgtgttcttcttc 25465881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 31248896 - 31248713
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||    
T  31248896 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctct 31248802  T
Q  261 ttgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| | |||||||||| |||  |||||||| ||| |||||||    
T  31248801 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctactctctcccctatactaggtcatcattataccgaacttggtaaacaaat 31248713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 223
Target Start/End: Original strand, 11138423 - 11138499
Alignment:
Q  147 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaatta 223  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  11138423 ttgattcaccttggagaaacactattaggattg-agtcacttggtcacgggaagagatggggactttaggtagaatta 11138499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 338
Target Start/End: Original strand, 24436001 - 24436058
Alignment:
Q  281 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggt 338  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  24436001 tagtggatcggagggctgctctctcccctagagtaggtcatattggatcgaactgggt 24436058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 18232913 - 18232849
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  18232913 atagtgaattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgatttgagtcaacaa 18232849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 31086502 - 31086566
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  31086502 atagtggattggagagttgctctctcccctagattagatcatattggactgaactgggtcaacaa 31086566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 4630021 - 4629958
Alignment:
Q  281 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  4630021 tagtggattggagagctgctctcttccctagattaggtcatattggactgaactgagtcaacaa 4629958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 175
Target Start/End: Original strand, 15346369 - 15346524
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| | ||||      |||||||||||||||| |||||||||||||           ||||||||||    
T  15346369 acttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttga------gatagagggggctgaaccaagggtttagaattc--------aaactagggt 15346454  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattagga 175  Q
    ||||||| | |||| ||||| | |||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15346455 ttgtataaaatttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg---gttgattcaccttgggaaacactcttagga 15346524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 346
Target Start/End: Original strand, 17038324 - 17038418
Alignment:
Q  256 tctctttgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  17038324 tctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagacttggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 17038418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 336
Target Start/End: Original strand, 21801374 - 21801429
Alignment:
Q  281 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgg 336  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  21801374 tagtggattggagagctgctcgctcccccagattaggtcatattggactgaactgg 21801429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 22870196 - 22870100
Alignment:
Q  250 ttgatttctctttgtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||| ||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  22870196 ttgatatctctttgtaaagaaactcatcattatagtggaacggagagcttctctctctcccag--taggtcagtattggaccgaactgggtgaacaaat 22870100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 169 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 12166321 - 12166126
Alignment:
Q  169 attaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaac 267  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||  ||   || |||||||||||     
T  12166321 attaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaattca---atatctctttgtaaa 12166227  T
Q  268 gaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttctt 363  Q
    |||||||||  ||| |||||| |   ||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||    
T  12166226 gaaactcatatcattatagtgaagcagagagctgctatctcccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc--ttgtgttctcctt 12166129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 13467642 - 13467446
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || |||||  ||||||||||||   || |||| ||||||||||| || |      ||||||    
T  13467642 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgtgactt--ggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactcaata-----tctttg 13467551  T
Q  264 taacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    ||| |||||||||  ||| ||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||  |||||||||    
T  13467550 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctct-ccccagactaggtcatgattagaccgaactaggtaaacaaattc--ttgtgttct 13467454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 268 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 24501527 - 24501425
Alignment:
Q  268 gaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttct 365  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||| |||| || ||||||| ||||  |||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||    
T  24501527 gaaactcatcattatagtggaatagagagctgctctcttcccctgaataggtcagtattataccgaactgggtaaacaacttcttttgtgtttttcttct 24501428  T
Q  366 tct 368  Q
    |||    
T  24501427 tct 24501425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 336
Target Start/End: Original strand, 30445698 - 30445832
Alignment:
Q  206 agactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctct 302  Q
    ||||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||  |||||||    
T  30445698 agactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctct 30445797  T
Q  303 ctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgg 336  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  30445798 ctccaccatactaggtcagtattggactgaactgg 30445832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 7542581 - 7542461
Alignment:
Q  147 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaga-ttgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 244  Q
    ||||||||| | | |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||   | ||||| ||| |||||    
T  7542581 ttgattcacttggagaaacactattatgattg-agtctcttggtcacgggaagagatttgggaatttggatagaattaggtttgaagactaatttttgta 7542483  T
Q  245 acccattgatttctctttgtaa 266  Q
    |||| ||||| |||||||||||    
T  7542482 accctttgatatctctttgtaa 7542461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 5674803 - 5674862
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  5674803 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 5674862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 14742457 - 14742516
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  14742457 tggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattgg-ctgaactgggtcaacaa 14742516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 22010718 - 22010777
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  22010718 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 22010777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 33335963 - 33336022
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  33335963 tggattggagagctgctctctcccccagattaggtcacattgg-ctgaactgggtcaacaa 33336022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 286 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 28184567 - 28184510
Alignment:
Q  286 gattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  28184567 gattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 28184510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 347
Target Start/End: Original strand, 30443548 - 30443606
Alignment:
Q  290 ggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  30443548 ggagagctgctctctccccgagactaggtaagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 30443606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 6005481 - 6005422
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  6005481 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 6005422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 6438565 - 6438506
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  6438565 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggacaacaa 6438506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 347
Target Start/End: Original strand, 7294021 - 7294113
Alignment:
Q  257 ctctttgtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||   ||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||    
T  7294021 ctctttgtatagaaactcatcattatagtggaacagagagttgctctctcccccagagtaggtcagtattggaccaaactggataaacaaatt 7294113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 11857038 - 11856979
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  11857038 tggattggagagctgctctctcccccatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 11856979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 14521735 - 14521679
Alignment:
Q  287 attggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 343  Q
    ||||||| | |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14521735 attggagaggtgctctctcctcgagagtaggtcatattggaccgaactaggtcaaca 14521679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 14737597 - 14737656
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||| |||||||    
T  14737597 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactggatcaacaa 14737656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 28155590 - 28155649
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  28155590 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 28155649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 33211229 - 33211185
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  33211229 tctctcccccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 33211185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 33330466 - 33330525
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  33330466 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 33330525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 281 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 27165750 - 27165688
Alignment:
Q  281 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  27165750 tagttgattggagggctactctgtcccccatagtaggtcatattggaccg-actgggtaaacaa 27165688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19702041 - 19701985
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaatta 223  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  19702041 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaatta 19701985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 26066365 - 26066335
Alignment:
Q  1 gacttttactataaatatagaccttgtatca 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26066365 gacttttactataaatatagaccttgtatca 26066335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 26068636 - 26068606
Alignment:
Q  1 gacttttactataaatatagaccttgtatca 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26068636 gacttttactataaatatagaccttgtatca 26068606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 29755033 - 29755003
Alignment:
Q  1 gacttttactataaatatagaccttgtatca 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29755033 gacttttactataaatatagaccttgtatca 29755003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Original strand, 33308931 - 33308961
Alignment:
Q  1 gacttttactataaatatagaccttgtatca 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33308931 gacttttactataaatatagaccttgtatca 33308961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Original strand, 33311200 - 33311230
Alignment:
Q  1 gacttttactataaatatagaccttgtatca 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33311200 gacttttactataaatatagaccttgtatca 33311230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 17904619 - 17904566
Alignment:
Q  84 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtt 140  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  17904619 caacaacaaaactagggtttg--tagagttt-tctctttgcaacaaacactaaggtt 17904566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 603132 - 603088
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  603132 tctctccccaagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 603088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 162 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 3577696 - 3577636
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || |||||  ||||||||||||    
T  3577696 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt--ggtagaattagg 3577636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Original strand, 16569146 - 16569190
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16569146 tctctcctccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 16569190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 16838808 - 16838749
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || | || ||||| | |||||||||||||||    
T  16838808 tggattggagagctgctctctcccccagattaagccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 16838749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 225
Target Start/End: Original strand, 17036058 - 17036116
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 225  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  17036058 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17036116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 230 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 28078310 - 28078191
Alignment:
Q  230 agacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtc-atattgg 326  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||| |  ||||||||| ||||||||||  | | |||||||||||| || |||||||| || || |    
T  28078310 agacttattcttgtaacct-ttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggattataagactgctctctccctcatactaggtcaattttag 28078212  T
Q  327 accgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    ||||||| |||| ||||||||    
T  28078211 accgaacagggtaaacaaatt 28078191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 17 - 362
Target Start/End: Original strand, 1 - 347
Alignment:
Q  17 atagaccttgtatcaggctaat-ctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 115  Q
    ||||||||||||||||  || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 atagaccttgtatcagagtatttctttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 100  T
Q  116 tctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttggg 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  101 tctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgtgaagagattgagactttggg 200  T
Q  216 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagacta 315  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  201 tagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagacta 300  T
Q  316 ggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttct 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  301 ggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttct 347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 391
Target Start/End: Original strand, 6150 - 6534
Alignment:
Q  1 gacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaggg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    || ||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6150 gacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaataaaactaggg 6243  T
Q  101 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6244 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaaga 6343  T
Q  201 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  6344 gattgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgct 6443  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttttgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6444 ctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgagtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttcttttgttcttctcgccgttgtttt 6534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 69631 - 69245
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||   || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  69631 acttttacaataaatatagaccttatatcagagcaaactttga--gagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 69534  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  69533 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagag 69435  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 301  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  69434 gttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctc 69335  T
Q  302 tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  69334 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 69245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 73363 - 73207
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  73363 acttttactataaatatagaccgtgtatcaaaggaaactttg--agagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaatctagggt 73266  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  73265 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 73207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 73210 - 73160
Alignment:
Q  121 ttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatt 171  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  73210 ttggaaaaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 73160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Original strand, 29113 - 29505
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaacta 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  29113 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaacta 29212  T
Q  98 gggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacggga 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29213 gggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcgccttgggatacactattaggattg-agtctcttggttacggga 29311  T
Q  198 agagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggct 297  Q
    |||| ||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  29312 agaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggct 29411  T
Q  298 gctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttttgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || || |||||||||| ||||||||||    
T  29412 gctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcgtttgtgttcttctcttttttgtgttcttctctccgttgtttt 29505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Original strand, 2832 - 3214
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||   || ||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2832 acttttactataaatatagaacttgtatcagagcaaactttga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 2925  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  2926 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattg-agtctcttggttatgggaagag 3024  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 301  Q
      |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3025 gcttggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgcta 3124  T
Q  302 tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3125 tctccccgagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaaatattttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 3214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 41819 - 41436
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41819 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactt------agagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 41726  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41725 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagag 41627  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
      || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  41626 gctgggactttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgct 41527  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  41526 ctctcccccagactaggtgaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttttcgccgttgtttt 41436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 183975 - 183594
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||      |||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  183975 actttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttga------gatagaaggg-ctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagt 183883  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  183882 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttac-ggaagag 183785  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  183784 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgct 183685  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  183684 ctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 183594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 2 - 371
Target Start/End: Original strand, 51961 - 52325
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  51961 acttttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttga----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggt 52056  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52057 ttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagag 52155  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctg-- 298  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||      
T  52156 attgtgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgct 52255  T
Q  299 ctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttctttt 371  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  52256 ctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattc--ttgtgttcttc-tcttctttt 52325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 299 - 371
Target Start/End: Original strand, 50257 - 50326
Alignment:
Q  299 ctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttctttt 371  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  50257 ctctctcccccagactaggtcaatttggacctaactgggtcaacaaattc--ttgtgttcttc-tcttctttt 50326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Original strand, 79178 - 79488
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  79178 gagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggtt 79277  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79278 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagaatttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 79376  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  79377 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaatt 79476  T
Q  348 cctttgtgttct 359  Q
      ||||||||||    
T  79477 attttgtgttct 79488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 11768 - 11458
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggtt 148  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  11768 gagatagagggggctgaaacagggatttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttcgaacaaacactagggtttgagggtt 11669  T
Q  149 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 248  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11668 gattttccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggatacttattcttgtaaccc 11570  T
Q  249 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaatt 347  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  11569 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaatt 11470  T
Q  348 cctttgtgttct 359  Q
    | ||||||||||    
T  11469 cttttgtgttct 11458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 2 - 362
Target Start/End: Original strand, 3949 - 4301
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3949 acttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttga------gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 4042  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  4043 ttgtata-agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaa 4140  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  4141 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgct 4240  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttct 362  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  4241 ctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 4301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 47 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 14679 - 14378
Alignment:
Q  47 gagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaagg 146  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  14679 gagagatagagggggatgaaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgaggg 14580  T
Q  147 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14579 ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-tagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 14481  T
Q  247 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaa 345  Q
    |||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  14480 ccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 14381  T
Q  346 ttc 348  Q
    |||    
T  14380 ttc 14378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 348
Target Start/End: Original strand, 14971 - 15311
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||      |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  14971 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttga------gatagagggggctgaaacaatgatttagaaaggcaacaacaaaactagggt 15064  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15065 ttttataaagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacggaaagag 15163  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  15164 attcagactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtggaacggaaggctgct 15263  T
Q  301 ctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattc 348  Q
     |||||||||  ||||||||  |||||||||||||  |||||||||||    
T  15264 gtctcccccatgctaggtcaatttggaccgaactgactcaacaaattc 15311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 123 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 1673 - 1405
Alignment:
Q  123 ggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaatt 222  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  1673 ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatt 1575  T
Q  223 aggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcata 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||      
T  1574 aggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat 1475  T
Q  323 ttggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgttttt 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  1474 ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgatcttctcgccgttgttttt 1405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 5)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 161 - 392
Target Start/End: Original strand, 22221 - 22451
Alignment:
Q  161 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  22221 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaactcattgatttctct 22319  T
Q  261 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 360  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22320 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 22419  T
Q  361 cttcttcttttgttcttctcgccgttgttttt 392  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22420 cttcttcttttgttcttctcacagttgttttt 22451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 161 - 392
Target Start/End: Original strand, 24496 - 24726
Alignment:
Q  161 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24496 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaactcattgatttctct 24594  T
Q  261 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 360  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24595 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 24694  T
Q  361 cttcttcttttgttcttctcgccgttgttttt 392  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  24695 cttcttcttttgttcttctcacagttgttttt 24726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 8448 - 8512
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8448 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 8512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Original strand, 22161 - 22191
Alignment:
Q  1 gacttttactataaatatagaccttgtatca 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22161 gacttttactataaatatagaccttgtatca 22191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Original strand, 24436 - 24466
Alignment:
Q  1 gacttttactataaatatagaccttgtatca 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24436 gacttttactataaatatagaccttgtatca 24466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 49 - 355
Target Start/End: Original strand, 79852 - 80158
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgaaggt 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||    
T  79852 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaaaattagggtttgagggt 79951  T
Q  148 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||     
T  79952 tgattcaccttgggaaacactattaggatt-aagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtag-attaggcaggagacttattcctgtaact 80049  T
Q  248 cattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||    
T  80050 cattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggattgaactgggtcaacaaat 80149  T
Q  347 tcctttgtg 355  Q
    || ||||||    
T  80150 tcttttgtg 80158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 162 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 188424 - 188363
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  188424 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 188363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 308
Target Start/End: Original strand, 1988 - 2293
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||    || |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1988 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagaaagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 2087  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 201  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  2088 ttgtacagagtttgtctcttcggaataaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaaaag 2185  T
Q  202 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 300  Q
      || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   |||||||||||||| || |||||||| ||    
T  2186 gctgggactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattaatttctcttttgtaacgttcctcatcatatagtgaatcggagggctact 2285  T
Q  301 ctctcccc 308  Q
    ||||||||    
T  2286 ctctcccc 2293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 64 - 359
Target Start/End: Original strand, 85238 - 85534
Alignment:
Q  64 gaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaa 163  Q
    ||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||    
T  85238 gaaacaaggatttaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagcaacaaacactaaagtttgagggttgattcaccttggaaa 85337  T
Q  164 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt- 262  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  85338 acactactaggatt-gagtcttttggttacgagaagagattgtgactttgagtagaatcagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttc 85436  T
Q  263 gtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||| |  |||||||| |||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||  ||| ||||||||| ||||||||||    
T  85437 gtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaatttgaactgaaccaggtaaacaaattcttttgtgttct 85534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 50 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16112 - 15817
Alignment:
Q  50 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttg 149  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||   ||||||    
T  16112 agatagagggggttgaaataagggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcctagcaacaaacactagggttg--aggttg 16017  T
Q  150 attcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 249  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16016 attcaccttgcgaaaaactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaaccca 15918  T
Q  250 ttgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    ||||| |||| ||||||| |  |||||||| || ||||||  ||||| ||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  15917 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcattagagtggaacggaggactgctctctgcccccgactaggtcagtgttggaccgaactgggtaaacaaat 15818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 61 - 237
Target Start/End: Original strand, 35644 - 35819
Alignment:
Q  61 gctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgg 160  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||    
T  35644 gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcacctagg 35743  T
Q  161 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttat 237  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35744 gaaacactattaggatt-aagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 35819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 279 - 359
Target Start/End: Original strand, 35817 - 35897
Alignment:
Q  279 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 359  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| ||  |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  35817 tatagtggaacggagggctgctctcttccttagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattattttgtgttct 35897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 48 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 1927 - 1638
Alignment:
Q  48 agagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggt 147  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||    |||    
T  1927 agagatagaggtggctgaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgtatagagtttc---------aacaaacactagggttgt--ggt 1840  T
Q  148 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1839 tgattcaccttgggaaacacaattaggattg-agtttcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaacc 1741  T
Q  248 cattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||| |||||    
T  1740 cattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgtagggctgctctctcccccatactaggtcagtttttgaccgaactgggtaaacaa 1641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 49 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16942 - 16646
Alignment:
Q  49 gagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggt 147  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| | |  |    
T  16942 gagatagaggaggctgaaaacaagggttt-gaaagacaaca-caaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttggga--t 16848  T
Q  148 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 247  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16847 tgattcaccttaggaaacactattaggattg-agtcacttggtgacgggaagagattgagactttgggtagaattaggccagagacttattcttgtaacc 16749  T
Q  248 cattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||||     |||| |  |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  16748 cattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgggacaaagggtttatctctcccccagaccaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaa 16649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 92 - 338
Target Start/End: Original strand, 4849 - 5095
Alignment:
Q  92 aaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt 191  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||  | |||||||||||| |||   || ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  4849 aaactagggtttatatagcgttt-tctctcagcaacaaacactagagttg--agtttgattcatgttgggaaacactattaggattg-agtctcttggtc 4944  T
Q  192 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgaaactcatca-tatagtggat 288  Q
    | | |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||| || |||||||| |||||||||     
T  4945 atgagaagagattgaagcttttggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctctttttgtaaagatactcatcattatagtggaa 5044  T
Q  289 tggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaactgggt 338  Q
       ||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  5045 catagaactgctctctgccccagactaggtcagtattggaccgaattgggt 5095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0552 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0552
Description:

Target: scaffold0552; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 1167 - 993
Alignment:
Q  2 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaatctttgaaagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||   || ||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1167 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttga------gatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 1074  T
Q  102 ttgtatagagtttgtctc-----tttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 177  Q
    ||||||||||||||||||     |||||||||||||||| | || || ||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||    
T  1073 ttgtatagagtttgtctctttagtttggaacaaacactacgtttggagggttgatccaccttgcgaaatacttttaggatt 993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0891
Description:

Target: scaffold0891; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 290 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 4733 - 4630
Alignment:
Q  290 ggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttc--ttttgttcttctcgccgttg 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  4733 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcctttgtgttgttcttcttcttttttgttcttctcgccattg 4634  T
Q  388 tttt 391  Q
    ||||    
T  4633 tttt 4630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 5)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 5751 - 5687
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5751 atagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 2560 - 2496
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2560 atagtggattggagggctgctgtctcccccagattaggtcatattggagcgaactgggtcaacaa 2496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 133309 - 133373
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  133309 atagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgaacctaactgggtcaacaa 133373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 306
Target Start/End: Original strand, 224819 - 224961
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||    
T  224819 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctct 224913  T
Q  261 ttgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcc 306  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  224914 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcc 224961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 149141 - 149097
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  149141 tctctcccccagagtaggttaagttggaccgaactgggtcaacaa 149097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 43990 - 44054
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43990 atagtggattggagagctgctctctcccccagaatagatcatattggaccgaactgggtcaacaa 44054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 36861 - 36925
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||| |||| | |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36861 atagtgggttggcgagctgctctcttccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 36925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 310 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 1485 - 1404
Alignment:
Q  310 agactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctcgccgttgtttt 391  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1485 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtcctt-ttcttctttgtgttcttctcgccgttgtttt 1404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 256 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 17078 - 16972
Alignment:
Q  256 tctctttgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaattcctt 351  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |    
T  17078 tctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc--t 16981  T
Q  352 tgtgttctt 360  Q
    |||||||||    
T  16980 tgtgttctt 16972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1050 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1050
Description:

Target: scaffold1050; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 3161 - 3068
Alignment:
Q  256 tctctttgtaacgaaactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  3161 tctctttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 3068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 346
Target Start/End: Original strand, 16328 - 16509
Alignment:
Q  165 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||   || ||||||||    
T  16328 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactaattcttggaactca---atatctctttg 16422  T
Q  264 taacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcat-attggaccgaactgggtcaacaaat 346  Q
    ||| |||||||||  ||| ||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  16423 taaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 16509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 10796 - 10736
Alignment:
Q  281 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaa 341  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10796 tagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 10736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 45321 - 45257
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  45321 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattgaaccgaactgagtcaacaa 45257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 283 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 85748 - 85687
Alignment:
Q  283 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  85748 gtggattggagagccgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaa 85687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 17981 - 18044
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  17981 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 18044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 344
Target Start/End: Original strand, 24074 - 24137
Alignment:
Q  280 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  24074 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 24137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 427 - 368
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  427 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 9663 - 9722
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  9663 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 9722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 17327 - 17267
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17327 tggattggagggttgctctctttcccatattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaa 17267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 162 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 57613 - 57437
Alignment:
Q  162 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctc 259  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |  |||||||||| | |||||||||| ||||||||   || ||  |||||||||||||| ||||| |||     
T  57613 aaacactattaggattgaa-tctcttggtcattggaagagattcgggactttgggtggaattaggtttgaagatctattcttgtaaccctttgatatcta 57515  T
Q  260 ttt-gtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-tattggaccgaact 334  Q
    ||| |||| |  |||||| | |||| ||||   ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  57514 ttttgtaaagttactcattaatataatggaacagagagctgctctctcccccagactaggtcagtattggacggaact 57437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 14330 - 14389
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  14330 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 14389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 35083 - 35142
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| |||||    
T  35083 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggttaacaa 35142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 20459 - 20415
Alignment:
Q  300 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20459 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 20415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 181985 - 182044
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  181985 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 182044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 2272 - 2331
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  2272 tggattggagagctactctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 2331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 284 - 344
Target Start/End: Original strand, 148977 - 149036
Alignment:
Q  284 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 344  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  148977 tggattggagagctactctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 149036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University