View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6308_low_1 (Length: 854)

Name: NF6308_low_1
Description: NF6308
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6308_low_1
NF6308_low_1
[»] chr4 (15 HSPs)
chr4 (114-306)||(21390955-21391147)
chr4 (114-307)||(44275705-44275898)
chr4 (112-310)||(6112627-6112825)
chr4 (115-306)||(3672274-3672466)
chr4 (114-307)||(28093094-28093288)
chr4 (114-304)||(35544911-35545102)
chr4 (115-306)||(49243815-49244006)
chr4 (114-307)||(7217764-7217958)
chr4 (115-307)||(45829256-45829448)
chr4 (114-306)||(46192358-46192551)
chr4 (114-306)||(52191200-52191392)
chr4 (120-244)||(51038768-51038893)
chr4 (120-246)||(54849793-54849919)
chr4 (114-184)||(25437007-25437077)
chr4 (120-198)||(36157840-36157918)
[»] chr1 (13 HSPs)
chr1 (115-307)||(34307136-34307329)
chr1 (119-307)||(2509028-2509217)
chr1 (113-304)||(39249864-39250056)
chr1 (115-307)||(46901733-46901926)
chr1 (115-307)||(28647353-28647545)
chr1 (114-304)||(19258674-19258864)
chr1 (133-306)||(9642866-9643039)
chr1 (119-238)||(29099821-29099939)
chr1 (615-735)||(10418100-10418219)
chr1 (632-735)||(10412374-10412476)
chr1 (120-198)||(10146971-10147049)
chr1 (747-823)||(10417994-10418070)
chr1 (750-821)||(10412273-10412344)
[»] chr2 (14 HSPs)
chr2 (114-308)||(16089821-16090014)
chr2 (115-307)||(33732569-33732761)
chr2 (118-308)||(44958116-44958307)
chr2 (115-309)||(36315561-36315756)
chr2 (114-303)||(3830900-3831087)
chr2 (106-310)||(37498858-37499065)
chr2 (114-257)||(14572994-14573137)
chr2 (115-308)||(6376236-6376424)
chr2 (114-306)||(37914236-37914428)
chr2 (115-249)||(24137149-24137287)
chr2 (123-306)||(41188777-41188961)
chr2 (741-820)||(30633097-30633176)
chr2 (741-820)||(30660826-30660905)
chr2 (740-823)||(30669505-30669588)
[»] chr8 (16 HSPs)
chr8 (115-308)||(30432339-30432532)
chr8 (115-306)||(42162598-42162790)
chr8 (115-308)||(36189216-36189408)
chr8 (118-307)||(18184556-18184745)
chr8 (112-308)||(31318802-31318999)
chr8 (114-306)||(10203663-10203856)
chr8 (118-308)||(12665347-12665539)
chr8 (116-298)||(44081781-44081964)
chr8 (121-306)||(33726017-33726203)
chr8 (113-308)||(43186025-43186220)
chr8 (135-266)||(42668821-42668952)
chr8 (163-305)||(38845023-38845165)
chr8 (120-206)||(31547-31633)
chr8 (120-306)||(3690602-3690788)
chr8 (137-256)||(35849502-35849623)
chr8 (773-814)||(13563200-13563241)
[»] chr7 (26 HSPs)
chr7 (115-307)||(45782658-45782851)
chr7 (114-306)||(36346564-36346756)
chr7 (115-307)||(42220962-42221154)
chr7 (112-307)||(26972201-26972397)
chr7 (115-307)||(28307493-28307686)
chr7 (121-308)||(31148296-31148483)
chr7 (113-306)||(7700476-7700670)
chr7 (115-307)||(34108426-34108619)
chr7 (115-306)||(7699882-7700074)
chr7 (115-306)||(7700080-7700272)
chr7 (115-306)||(7700278-7700470)
chr7 (118-310)||(34828069-34828260)
chr7 (115-307)||(13108148-13108339)
chr7 (115-308)||(5811161-5811354)
chr7 (121-308)||(23980137-23980324)
chr7 (115-292)||(30887700-30887877)
chr7 (119-254)||(21807374-21807509)
chr7 (157-315)||(46475066-46475225)
chr7 (136-307)||(36957450-36957620)
chr7 (115-264)||(15020282-15020428)
chr7 (616-810)||(29625430-29625643)
chr7 (120-249)||(38321014-38321143)
chr7 (154-244)||(20086690-20086780)
chr7 (213-307)||(29953570-29953665)
chr7 (157-210)||(42950109-42950162)
chr7 (231-308)||(42950034-42950111)
[»] chr3 (22 HSPs)
chr3 (113-310)||(43999987-44000185)
chr3 (114-306)||(21559560-21559753)
chr3 (114-308)||(51339781-51339973)
chr3 (114-306)||(36370337-36370530)
chr3 (114-304)||(36749405-36749596)
chr3 (114-306)||(46111943-46112136)
chr3 (115-305)||(22894680-22894870)
chr3 (115-307)||(34749896-34750089)
chr3 (114-307)||(30735494-30735687)
chr3 (115-306)||(38231293-38231484)
chr3 (118-307)||(48200688-48200878)
chr3 (112-311)||(39467096-39467295)
chr3 (115-213)||(29460660-29460758)
chr3 (115-213)||(29471512-29471610)
chr3 (113-306)||(39072278-39072466)
chr3 (114-244)||(50966130-50966256)
chr3 (114-244)||(51069265-51069391)
chr3 (123-306)||(20856153-20856334)
chr3 (207-310)||(29472901-29473004)
chr3 (137-249)||(53638157-53638269)
chr3 (122-208)||(29820397-29820483)
chr3 (759-814)||(1153036-1153091)
[»] scaffold0062 (1 HSPs)
scaffold0062 (119-306)||(6722-6910)
[»] chr5 (22 HSPs)
chr5 (115-306)||(39370927-39371119)
chr5 (113-306)||(13347126-13347320)
chr5 (114-307)||(40887940-40888134)
chr5 (114-306)||(1815619-1815808)
chr5 (115-306)||(2237276-2237468)
chr5 (114-308)||(27553372-27553565)
chr5 (113-251)||(9408094-9408232)
chr5 (126-307)||(14831555-14831737)
chr5 (154-307)||(31800597-31800750)
chr5 (112-249)||(17225316-17225451)
chr5 (115-306)||(19596067-19596258)
chr5 (115-211)||(33404531-33404627)
chr5 (114-305)||(4300544-4300735)
chr5 (186-307)||(42683670-42683792)
chr5 (124-306)||(41003850-41004031)
chr5 (112-246)||(19124532-19124664)
chr5 (750-823)||(35752630-35752703)
chr5 (118-249)||(12164254-12164388)
chr5 (747-819)||(35364670-35364742)
chr5 (756-823)||(35404400-35404467)
chr5 (616-735)||(35404239-35404364)
chr5 (668-732)||(35364567-35364634)
[»] chr6 (7 HSPs)
chr6 (114-311)||(3986900-3987097)
chr6 (114-307)||(3118045-3118239)
chr6 (115-305)||(14022934-14023124)
chr6 (115-307)||(24208444-24208636)
chr6 (115-307)||(13697569-13697760)
chr6 (114-309)||(15345656-15345849)
chr6 (114-144)||(7674598-7674628)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (119-308)||(87160-87350)
[»] scaffold0277 (1 HSPs)
scaffold0277 (142-180)||(5943-5981)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 145; Significance: 7e-76; HSPs: 15)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 114 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 21391147 - 21390955
Alignment:
Q  114 agagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21391147 agagctcttatacatgaaccaccttagatggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaatattgaaagaagagatgaaaatg 21391048  T
Q  214 ggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcc 306  Q
     ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  21391047 agtgaatatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgaggtgtacataaaaggtgtatgaaaaagggtgtctacctatctttttcc 21390955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 114 - 307
Target Start/End: Original strand, 44275705 - 44275898
Alignment:
Q  114 agagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatg 213  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |    
T  44275705 agagctcttatacataaaccaccttaggtggcatataccattttacactcacacacatttgtgacacgtgccaaaaatattgaaagaagagattaaaaag 44275804  T
Q  214 ggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcct 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44275805 ggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatggggtgtacataagaggtgtatgaaaaagggtgtctatctatctttttcct 44275898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 112 - 310
Target Start/End: Original strand, 6112627 - 6112825
Alignment:
Q  112 ttagagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6112627 ttagagctcttatacatgaaccaccttagatggcatacaccattttacacccacacatatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaa 6112726  T
Q  212 tgggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcctatt 310  Q
     || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||   |||||| ||   ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  6112727 aggatgatgatatgatgtaaaattactcaaatacccctaatacatggagtgtacataagaagtgtatgaaaaagagtgtctacctatctttttcctatt 6112825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 115 - 306
Target Start/End: Original strand, 3672274 - 3672466
Alignment:
Q  115 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgg 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3672274 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacccttttacatccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 3672373  T
Q  215 gtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatga-gatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcc 306  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| | |||||| ||   |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  3672374 gtgatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaagggtatctacctatctttttcc 3672466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 114 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 28093288 - 28093094
Alignment:
Q  114 agagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  28093288 agagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaaggagagatgaaaaag 28093189  T
Q  214 ggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgaga-tgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcct 307  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |  |||||| ||   |||||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  28093188 ggtgatgatatgatgtaaaaatactcaaatacccctaatacatgggggtgtacataagaagtgtatgaaaaaggatgtctacctatctttttcct 28093094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 114 - 304
Target Start/End: Original strand, 35544911 - 35545102
Alignment:
Q  114 agagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatg 213  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||| |    
T  35544911 agagctcttatacatgaaccatcttaggtggtatacaccattttacatccacatacatttgtgatacgtggcaaaaacattgaaagaagatataaaaagg 35545010  T
Q  214 ggtgatgatatgatgtaaaattact-aaaatacccctaacacatgagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatcttttt 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  35545011 ggtgatgatatgatgtaaaattactaaaaatacccctaacacatggagtgtacataagtggtgtatgaaaaagggtgtctacctatcttttt 35545102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 115 - 306
Target Start/End: Original strand, 49243815 - 49244006
Alignment:
Q  115 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgg 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||       
T  49243815 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacccttttacatccacacacatttgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagagataaaaaaaa 49243914  T
Q  215 gtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcc 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||| ||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||    
T  49243915 gtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaatacatggagtgtacataagaggtgtatgaaaaaggatgtctacatatctttttcc 49244006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 114 - 307
Target Start/End: Original strand, 7217764 - 7217958
Alignment:
Q  114 agagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatg 213  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||| |    
T  7217764 agagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacaccctttaacacctacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattaaaataagagataaaaaag 7217863  T
Q  214 ggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatga-gatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcct 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||| ||  ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  7217864 ggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacctataacacatgagggtgtacataagaggtgtatgaaaaagggtgtttacctatctttttcct 7217958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 115 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 45829448 - 45829256
Alignment:
Q  115 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgg 214  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  45829448 gagctcttatacatgaaccactttaggtgacatacacctttttacacccacacacatttgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagagataaaaaggg 45829349  T
Q  215 gtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaa-ggtgtctatctatctttttcct 307  Q
    ||||| || |||||| |||| | ||||||||||||  || ||| | |||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  45829348 gtgataatgtgatgtgaaatgattaaaatacccctggcatatggggtgtacataaa-ggtgtatcaaaaaagggtgtctacctatctttttcct 45829256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 114 - 306
Target Start/End: Original strand, 46192358 - 46192551
Alignment:
Q  114 agagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatg 213  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  46192358 agagctcttatacatgaatcaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagagataaaaagg 46192457  T
Q  214 ggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaa-ggtgtctatctatctttttcc 306  Q
    |||||| || |||||| |||| | ||||||||||||   ||||| | |||||| ||  ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  46192458 ggtgataatgtgatgtgaaatgattaaaatacccctggtacatggggtgtacataagaggtgtatcaaaaaagggtgtctacctatctttttcc 46192551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 114 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 52191392 - 52191200
Alignment:
Q  114 agagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatg 213  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||  ||| | |       
T  52191392 agagcccttatacatggaccaccttaggtggcatataccttttaacagccacacagaattgtgacatgtgacaaaaacattgaaagaaaggataagagga 52191293  T
Q  214 ggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcc 306  Q
    | ||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| |  ||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||    
T  52191292 gatgatgatgtgatgcgaaattactaaaatactcctaacatatggggtgtacacgagaggtgtataaaaaagggtgtctttcaatctttttcc 52191200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 120 - 244
Target Start/End: Original strand, 51038768 - 51038893
Alignment:
Q  120 cttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaa-tgggtga 218  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  51038768 cttatatatggaccaccttaggtggcatacaaactttgacacccacacacaattgtgacatgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaagggggtga 51038867  T
Q  219 tgatatgatgtaaaattactaaaata 244  Q
    || | |||||| ||||||||||||||    
T  51038868 tggtgtgatgtgaaattactaaaata 51038893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 120 - 246
Target Start/End: Original strand, 54849793 - 54849919
Alignment:
Q  120 cttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgggtgat 219  Q
    ||||||||||||||||||||| | || |||||  ||| | |||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |  || ||||    
T  54849793 cttatacatgaaccaccttagatagcgtacacactttgatacccacacgcagttgtgacaagtgacaaaaatattgaaagaagagatgagagaggatgat 54849892  T
Q  220 gatatgatgtaaaattactaaaatacc 246  Q
    ||| |||||| |||||| |||||||||    
T  54849893 gatgtgatgtgaaattattaaaatacc 54849919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 25437077 - 25437007
Alignment:
Q  114 agagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtga 184  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||    
T  25437077 agagcccttatacatggaccaccttaggtgacatacaccttttaacatccatacacaattgtgacatgtga 25437007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 120 - 198
Target Start/End: Original strand, 36157840 - 36157918
Alignment:
Q  120 cttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaa 198  Q
    |||||| ||| || || |||||||||||||||  ||| |||| || ||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  36157840 cttatatatggacgactttaggtggcatacactctttgacactcatacataattgtgatacgtgacaaaaacattgaaa 36157918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 142; Significance: 4e-74; HSPs: 13)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 115 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 34307329 - 34307136
Alignment:
Q  115 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgg 214  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  34307329 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacatccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagatatgaaaaagg 34307230  T
Q  215 gtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgaga-tgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcct 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34307229 gtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgggagtgtacataagaggtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttttcct 34307136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 119 - 307
Target Start/End: Original strand, 2509028 - 2509217
Alignment:
Q  119 tcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgggtga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  2509028 tcttatacatgaaccaccttaggtgacatacatccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagggtgg 2509127  T
Q  219 tgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatga-gatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcct 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||| ||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  2509128 tgatatgatgtaaaattactaaaatatccctaatacatgagggtgtacataagaggtgtatgaaaaaaagtgtctacctatctttttcct 2509217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 113 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 39250056 - 39249864
Alignment:
Q  113 tagagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaat 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  39250056 tagagctcttatacatgaaccatcttaggtggcatacacccttttacacccatacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaa 39249957  T
Q  213 gggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacat-gagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatcttttt 304  Q
    || || |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39249956 ggatggtgatataatgtaaaattactaaaatacccctaatacatgggggtgtacataagaggtgtatgaaaaaaggtgtctacctatcttttt 39249864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 115 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 46901926 - 46901733
Alignment:
Q  115 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  46901926 gagctcttatacatgaaccaccttaggtgacatacaccattttacaccaacacatatttgtgacacgtggcaaaaacattaaaagaagagatgaaaaagg 46901827  T
Q  215 gtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacat-gagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcct 307  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||| | | |||||| ||    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  46901826 gtgatgatatgatgtaaaattactcaaatactcctgatacatggcggtgtacataagaaatgtatgaaaaaggatgtctacctatctttttcct 46901733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 115 - 307
Target Start/End: Original strand, 28647353 - 28647545
Alignment:
Q  115 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgg 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  28647353 gagctattatacatgaaccacctaaggttgcatacatctttttacacccacacatatttgtgatatttggcaaaaacattgaaagaatagatgaaaaggg 28647452  T
Q  215 gtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcct 307  Q
    ||| |||| |||||| |||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||  |  | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  28647453 gtggtgatgtgatgtgaaattattaaaatattcctaacacatgggatgtacatgagagatgtataaaaaagggtgtctacctatctttttcct 28647545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 114 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 19258864 - 19258674
Alignment:
Q  114 agagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatg 213  Q
    |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |    
T  19258864 agagctattatacataaaccatctaaggtggcatacacctttttacacccacatatatttgtgacatgtggcaaaaacattgaaaaaagagatgaaaagg 19258765  T
Q  214 ggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatcttttt 304  Q
    |||| |||| |||||| |||||| |||||||  ||||||||||| | ||||||  |  | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  19258764 ggtggtgatgtgatgtgaaattattaaaatattcctaacacatggggtgtacatgagagatgtataaaaaagggtgtctacctatcttttt 19258674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 133 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 9643039 - 9642866
Alignment:
Q  133 caccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatga-aaatgggtgatgatatgatgtaa 231  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |    
T  9643039 caccttagatggcatataccttttaacacccacacataattgtgacacatgacaaaaacaatgaaagaagagatgagaagggggtgatgatatgatgtga 9642940  T
Q  232 aattactaaaatacccctaacacatgagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcc 306  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||  ||| || ||  | ||||| ||||||  |||||| ||||||||||||    
T  9642939 aattactaaaacatccct-acacatgaagtgtgcataatagatgtataaaaaaaaatgtctacctatctttttcc 9642866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 119 - 238
Target Start/End: Original strand, 29099821 - 29099939
Alignment:
Q  119 tcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgggtga 218  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||    
T  29099821 tcttatacataaaccaccttagatggcatacac-tctttacgtccacacacatttgtgacatgtgacaaaaacattgaaaaaagaaattaaaaggggtga 29099919  T
Q  219 tgatatgatgtaaaattact 238  Q
    |||| |||||| ||||||||    
T  29099920 tgatgtgatgtgaaattact 29099939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 615 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 10418219 - 10418100
Alignment:
Q  615 tatcatatctcaaagctgcatatgcactagaagtgttatttggttacccatattacatattctccaatagcaaaatgagaatttttatgtcttttcttct 714  Q
    |||||||| | ||||| | |||||||||  || | |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| | || |||||    
T  10418219 tatcatatattaaagcagtatatgcactcaaactattatttggttacccatattaaatattctt-aatagcaaaatgagaatttttatgacattacttct 10418121  T
Q  715 ttgctttgctagccaaatgtt 735  Q
     |||||||||| |||||||||    
T  10418120 ctgctttgctatccaaatgtt 10418100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 632 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 10412476 - 10412374
Alignment:
Q  632 gcatatgcactagaagtgttatttggttacccatattacatattctccaatagcaaaatgagaatttttatgtcttttcttctttgctttgctagccaaa 731  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| | || ||||| |||||| | |||||||    
T  10412476 gcatatgcactagaagtatcttttggttacccatgttacatattct-aaatagaaaaatgagaatttttatgacgttacttctctgcttttccagccaaa 10412378  T
Q  732 tgtt 735  Q
    ||||    
T  10412377 tgtt 10412374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 120 - 198
Target Start/End: Original strand, 10146971 - 10147049
Alignment:
Q  120 cttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaa 198  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||    
T  10146971 cttatacatggaccaccttaggtggcatacaccctttgacccccacacacaattgtgacatgtggcaaaaacagtgaaa 10147049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 747 - 823
Target Start/End: Complemental strand, 10418070 - 10417994
Alignment:
Q  747 ttgctcttgctttgagttcacacactgataagctagccttgcttgctttgaaggaaaaacttacaaatagtgtacca 823  Q
    |||||| |||||||||| || | ||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  10418070 ttgctcatgctttgagtacagagactgataagcatgctttgcttgctttgaaggaaaagcttacaaatggtgtacca 10417994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 750 - 821
Target Start/End: Complemental strand, 10412344 - 10412273
Alignment:
Q  750 ctcttgctttgagttcacacactgataagctagccttgcttgctttgaaggaaaaacttacaaatagtgtac 821  Q
    |||||||||||||||||   | |||| |||  || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  10412344 ctcttgctttgagttcagcgattgatgagcatgctttgcttgctttgaaggaaaagcttacaaatggtgtac 10412273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 139; Significance: 3e-72; HSPs: 14)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 114 - 308
Target Start/End: Original strand, 16089821 - 16090014
Alignment:
Q  114 agagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatg 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||      
T  16089821 agagctcttatacatgaaccaccttaagtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagat-aaaaaa 16089919  T
Q  214 ggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttccta 308  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16089920 ggtggtgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatggggtgtacataagaggtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttttccta 16090014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 115 - 307
Target Start/End: Original strand, 33732569 - 33732761
Alignment:
Q  115 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgg 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33732569 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 33732668  T
Q  215 gtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcct 307  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||| ||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  33732669 gtggtgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaatatatggggtgtacataagaggtgtatgaaaaagggtgtctacctatctttttcct 33732761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 118 - 308
Target Start/End: Original strand, 44958116 - 44958307
Alignment:
Q  118 ctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgggtg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  44958116 ctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagagataaaaaagggtg 44958215  T
Q  218 atgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatga-gatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttccta 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||  ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  44958216 atgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagggtatacataagaggtgtatgaaaaaggatgtctacctatctttttccta 44958307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 115 - 309
Target Start/End: Original strand, 36315561 - 36315756
Alignment:
Q  115 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgg 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  36315561 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagagataaaaagag 36315660  T
Q  215 gtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaagg-tgtctatctatctttttcctat 309  Q
    ||||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  36315661 gtgataatgtgatgtgaaatgattaaaatacccctgacacatgaggtgtacataagaggtgtatcaaaaaaggatgtctacctatctttttcctat 36315756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 114 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 3831087 - 3830900
Alignment:
Q  114 agagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatg 213  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  3831087 agagcacttatacatgaaccaccttaggtgacatacacccttttacacccacaca--tttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaagt 3830990  T
Q  214 ggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttt 303  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  3830989 ggtgattatctgatgtaaaattactaatatacccctaacacatggggtgtacataagaggtgtatgaaaaagggtgtctacctatctttt 3830900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 106 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 37499065 - 37498858
Alignment:
Q  106 tatttcttagagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagaga 205  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  37499065 tatttattagagctcttatatatcaaccatcttaactggcatacatccttttacactcacacacatttgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagaga 37498966  T
Q  206 tgaaaa--tgggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacat-gagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatcttt 302  Q
    ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  37498965 tgaaaaagagggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatggggatgtacataagaggtgtataaaaaagggtgtctacctatcttt 37498866  T
Q  303 ttcctatt 310  Q
    ||||||||    
T  37498865 ttcctatt 37498858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 114 - 257
Target Start/End: Original strand, 14572994 - 14573137
Alignment:
Q  114 agagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatg 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  14572994 agagctcttatacataaaccaccttaggtggcatccacccttttacatccacacacatttgtgacacgtagcaaaaacattgaaagaagagatggaaaag 14573093  T
Q  214 ggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatg 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14573094 ggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatg 14573137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 115 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 6376424 - 6376236
Alignment:
Q  115 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgg 214  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |     ||||||||||||||||||||||||    
T  6376424 gagctgttatacataaaccaccataggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacatgtggc-----cattgaaagaagagatgaaaatgg 6376330  T
Q  215 gtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttccta 308  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||     ||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  6376329 gtgaggatgtgatgtgaaattactaaaatacctctaacacatgagatgtacatgggaggtgtataaaaaaggatgtctacctatctttttccta 6376236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 114 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 37914428 - 37914236
Alignment:
Q  114 agagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatg 213  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  37914428 agagcttttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacatccacacacatttgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagagataaaaagg 37914329  T
Q  214 ggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaagg-tgtctatctatctttttcc 306  Q
    |||||| || |||||| |||| | |||||||||| |   ||||| | |||||| ||  ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  37914328 ggtgataatgtgatgtgaaatgattaaaataccc-tggtacatggggtgtacataagaggtgtatcaaaaaagggtgtctacctatctttttcc 37914236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 115 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 24137287 - 24137149
Alignment:
Q  115 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacc----cacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaa 210  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24137287 gagctgttatacataaaccaccttaggtggtatacaccctttgacacctacccacacacatttgtgacatgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaa 24137188  T
Q  211 atgggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccct 249  Q
    | || ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  24137187 agggatgaggatgtgatgtgaaattactaaaatacccct 24137149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 123 - 306
Target Start/End: Original strand, 41188777 - 41188961
Alignment:
Q  123 atacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgggtgatgat 222  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| | | | ||| |||| ||||| ||| |||||||||||||| | || ||||||| || |||||||    
T  41188777 atacatgaaccactttatgtgacatacacccttttatatctatacatatttatgacatgtggcaaaaacattgaaaaatgatatgaaaagggatgatgat 41188876  T
Q  223 atgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagatgtacacaaatggtgtatga-aaaaaggtgtctatctatctttttcc 306  Q
     ||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||  |  ||||||| | |||| |||||||  ||||||||||||    
T  41188877 gtgatgtaaaattactaaaatatctctgacacatgtgatgtacatgagaggtgtataacaaaagggtgtctgcctatctttttcc 41188961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 741 - 820
Target Start/End: Original strand, 30633097 - 30633176
Alignment:
Q  741 caacaattgctcttgctttgagttcacacactgataagctagccttgcttgctttgaaggaaaaacttacaaatagtgta 820  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  30633097 caacaattgcactttctttgaattcaaagactgataagctagctttgcttgctttgaaggaaaagcttacaaatggtgta 30633176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 741 - 820
Target Start/End: Original strand, 30660826 - 30660905
Alignment:
Q  741 caacaattgctcttgctttgagttcacacactgataagctagccttgcttgctttgaaggaaaaacttacaaatagtgta 820  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  30660826 caacaattgcactttctttgaattcaaagactgataagctagctttgcttgctttgaaggaaaagcttacaaatggtgta 30660905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 740 - 823
Target Start/End: Original strand, 30669505 - 30669588
Alignment:
Q  740 gcaacaattgctcttgctttgagttcacacactgataagctagccttgcttgctttgaaggaaaaacttacaaatagtgtacca 823  Q
    |||||||| || ||| |||||| |||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  30669505 gcaacaatcgcactttctttgaattcaaagactgataagctggctttgcttgctttgaaggaaaagcttacaaatggtgtacca 30669588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 138; Significance: 1e-71; HSPs: 16)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 115 - 308
Target Start/End: Original strand, 30432339 - 30432532
Alignment:
Q  115 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgg 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30432339 gagctcttatacatgaaccaccttagatggcatacacccttttatacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaggg 30432438  T
Q  215 gtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttccta 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  30432439 gtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccataatatatgggatgtacataagaggtgtatgaaaaagggtgtctatcaatctttttccta 30432532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 115 - 306
Target Start/End: Original strand, 42162598 - 42162790
Alignment:
Q  115 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42162598 gagctcttatacatgaaccaccttaggtgtcatacacccttttacacccaaacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 42162697  T
Q  215 gtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacat-gagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | | |||||| |||  ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  42162698 gtgatgatatgatgtaaaattactcaaatacccctaatacatgggggtgtacataaaaagtgtatgaaaaagagtgtctacctatctttttcc 42162790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 115 - 308
Target Start/End: Original strand, 36189216 - 36189408
Alignment:
Q  115 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgg 214  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |     
T  36189216 gagctcttatacatgaaccatcttaggtggcatacacccttttacacccacatacatttgtgacacgtggcaaaaatattgaaagaagagatgaaaagga 36189315  T
Q  215 gtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttccta 308  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  36189316 gtgatgatatgatataaaattattaaaatacccctaacatatg-ggtgtacataagtggtgtatgaaaaagggtgtctacctatctttttccta 36189408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 118 - 307
Target Start/End: Original strand, 18184556 - 18184745
Alignment:
Q  118 ctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgggtg 217  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  18184556 ctcttatatatgaaccaccttaagtgacatacacccttttacatccacacatatttgtgacacgtggtgaaaacattgaatgaagagatgaaaaggggtg 18184655  T
Q  218 atgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcct 307  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  18184656 atgatatgatataaaattactaaaatacccctaacacatgaggtgtacataaaaggtgtatgaaaaaggatgtctacctatctttttcct 18184745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 112 - 308
Target Start/End: Original strand, 31318802 - 31318999
Alignment:
Q  112 ttagagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31318802 ttagagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatataactttttacatccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaa 31318901  T
Q  212 tgggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacat-gagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttccta 308  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| | | |||| | ||   |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  31318902 agggtgatgatatgatgtaaaattactcaaatactcctaatacatgggggtgtatataagaagtgtatgaaaaatgatgtctacctatctttttccta 31318999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 114 - 306
Target Start/End: Original strand, 10203663 - 10203856
Alignment:
Q  114 agagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatg 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  10203663 agagttcttatacatgaaccaccttaggtgacatacatccttttacatccacacacatttgtgacacgtgacaaaaatattgaaagaagagatgaaaaag 10203762  T
Q  214 ggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatga-gatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcc 306  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||| ||  | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  10203763 ggtggtgatatgatataaaattactaaaatatccctaatacatgagggtgtacataagagatgtatgaaaaagggtgtctacctatctttttcc 10203856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 308
Target Start/End: Original strand, 12665347 - 12665539
Alignment:
Q  118 ctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagat-gaaaatgggt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  12665347 ctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacccttttacactcacacacatttgtaacatgtggcaaaaacattgaaagaagagataaaaaaagggt 12665446  T
Q  217 gatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatga-gatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttccta 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||  |||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  12665447 gatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagggtatacataagaggtgtacgaaaaaggatgtctacctatctttttccta 12665539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 116 - 298
Target Start/End: Original strand, 44081781 - 44081964
Alignment:
Q  116 agctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatggg 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44081781 agctcttatacatgaaccatcttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtaacacgtggaaaaaacattgaaagaagagatgaaaaaggg 44081880  T
Q  216 tgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgaga-tgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctat 298  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |  |||||| ||   |||||||||||| |||||||| ||||    
T  44081881 tgatgatataatgtaaaattactcaaatacccctaatacatgggggtgtacataagaagtgtatgaaaaagggtgtctacctat 44081964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 121 - 306
Target Start/End: Original strand, 33726017 - 33726203
Alignment:
Q  121 ttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaa-tgggtgat 219  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  33726017 ttatacataaaccactttaggtggcatacacctttttacacccacaaacatttgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaagtggatgac 33726116  T
Q  220 gatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcc 306  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||     ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  33726117 gatgtgatgtgaaattactaaaatacccctaacacatgaagtgtacatgggaggtgtataaaaaagggtgtctacctatctttttcc 33726203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 113 - 308
Target Start/End: Original strand, 43186025 - 43186220
Alignment:
Q  113 tagagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaat 212  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||  |||||||||  ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||     
T  43186025 tagagttcttatacatcaaccactttaggtggcatatactcttttacacctgcacacatttgtgatatgtggcaaaaacattgaaagaaaagatgaaaaa 43186124  T
Q  213 gggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttccta 308  Q
     |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||  | |||||| ||   |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  43186125 aggtgatgatatgatataaaattactcaaatgcccctaatacatagggtgtacataagaagtgtatgaaaaatgatgtctacctatctttttccta 43186220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 135 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 42668952 - 42668821
Alignment:
Q  135 ccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgggtgatgatatgatgtaaaat 234  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| | |  ||||||| |||||||| ||||    
T  42668952 ccttaggtggcatacacactttgacacccacacacaattgtgacacgtggcaaaaacattaaaagaagatatg-agagaggtgatggtatgatgtgaaat 42668854  T
Q  235 tactaaaatacccctaacacat-gagatgtaca 266  Q
    ||||| ||||||||||  |||| ||||||||||    
T  42668853 tactacaatacccctacaacatggagatgtaca 42668821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 163 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 38845165 - 38845023
Alignment:
Q  163 cacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatga-gat 261  Q
    |||||||| |||||||| |||  ||||| |||||||||| |||| || | |||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||| | | |    
T  38845165 cacacacaattgtgacatgtggaaaaaatattgaaagaaaagat-aagaggggtgatgatgtgatgagaaattactaaaataaccctaacacataagggt 38845067  T
Q  262 gtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttc 305  Q
    |||||  || ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  38845066 gtacatgaagggtgtataaaaaatggtgtttatctatctttttc 38845023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 31633 - 31547
Alignment:
Q  120 cttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagat 206  Q
    |||||| ||| |||| ||||||| ||||||||  ||| ||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  31633 cttatatatgtaccatcttaggtagcatacacactttgacacccacatacaattgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagagat 31547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 3690788 - 3690602
Alignment:
Q  120 cttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgggtgat 219  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||| | ||| | | ||||||||| |||||||| ||  | |||| ||| ||||||||||||| |   ||||||    
T  3690788 cttatacatgaatcatcttaggtgacatacatcctttgatatccacacacacttgtgacatgtagcgaaaatattaaaagaagagatgagatgaggtgat 3690689  T
Q  220 gatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcc 306  Q
    ||| || ||  ||||||| |||||||| || ||||||   || || |  || ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  3690688 gatgtgttgcgaaattacaaaaatacctctgacacatagaatatatatgaaaggtgtataaaaaaggatgtctatctatctttttcc 3690602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 35849623 - 35849502
Alignment:
Q  137 ttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacat--tgaaagaagagatgaaaatgggtgatgatatgatgtaaaat 234  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||  ||||||| ||||||||| || |||||| ||  | ||||||||||||| || ||| |||||| |||| | ||||    
T  35849623 ttaggtggcatacatcatttaacacttacacacaattgtgacacatggcaaaaaaatattaaaagaagagatgagaaggggcgatgatgtgatatgaaat 35849524  T
Q  235 tactaaaatacccctaacacat 256  Q
    || |||||  ||||| ||||||    
T  35849523 tattaaaacccccctgacacat 35849502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 773 - 814
Target Start/End: Original strand, 13563200 - 13563241
Alignment:
Q  773 gataagctagccttgcttgctttgaaggaaaaacttacaaat 814  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  13563200 gataagctagctttgcttgctttgtaggaaaagcttacaaat 13563241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 138; Significance: 1e-71; HSPs: 26)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 115 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 45782851 - 45782658
Alignment:
Q  115 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgg 214  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45782851 gagctcttatacatcaaccactttaggtggcatacatcattttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 45782752  T
Q  215 gtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgaga-tgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcct 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||  |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  45782751 gtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgggagtgtacataaaaagtgtataaaaaagggtgtctacctatctttttcct 45782658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 114 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 36346756 - 36346564
Alignment:
Q  114 agagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatg 213  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  36346756 agagctcttatacataaaccatcttaggtggcatacacccttttacacccagacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaa-a 36346658  T
Q  214 ggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatga-gatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcc 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  36346657 ggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagggtgtacataagaggtgtatgaaaaagggtgtctacctatctttttcc 36346564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 115 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 42221154 - 42220962
Alignment:
Q  115 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||    
T  42221154 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacttttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagatataaaaaggg 42221055  T
Q  215 gtgatgatatgatgtaaaattact-aaaatacccctaacacatgagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcct 307  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||   |||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  42221054 gtgatgatatgatgttaaattactaaaaatacccctaacacatggagtgtacataagtggtgtatg-aaaaaggtgtctacctatctttttcct 42220962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 112 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 26972397 - 26972201
Alignment:
Q  112 ttagagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  26972397 ttagagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttatgacacgtggcaaaaacattgaaaggagagatgaaaa 26972298  T
Q  212 tgggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgaga-tgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcct 307  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |  |||||| ||   |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  26972297 agggtgatgatatgatgtaaaattactcaaatacccctaatacatgggggtgtacataagaagtgtatgaaaaagggtgtctacctatctttttcct 26972201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 115 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 28307686 - 28307493
Alignment:
Q  115 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgg 214  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28307686 gagctcttatacataaactaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgcgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 28307587  T
Q  215 gtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacat-gagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcct 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | | |||||| ||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  28307586 gtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccttaacatatgggggtgtacataagaggtgtatgaaaaaagatgtctacctatctttttcct 28307493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 121 - 308
Target Start/End: Original strand, 31148296 - 31148483
Alignment:
Q  121 ttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgggtgatg 220  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31148296 ttatacatgaaccatcttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacatggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgggtgatg 31148395  T
Q  221 atatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttccta 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| | |||  | ||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  31148396 atatgatgtaaaattactaaaataagcctaacatatggggtgtgtataagaggtgtatgaaaaagagtgtctacctatctttttccta 31148483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 113 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 7700670 - 7700476
Alignment:
Q  113 tagagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaat 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||     
T  7700670 tagagctcttatacataaaccaccttagatggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagataaaaaa 7700571  T
Q  213 gggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatg-agatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcc 306  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| | ||  ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  7700570 ggatgatgatatgatataaaattactaaaatacccataacacatgaaggtgtatataagaggtgtatgaaaaagggtgtttacctatctttttcc 7700476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 115 - 307
Target Start/End: Original strand, 34108426 - 34108619
Alignment:
Q  115 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  34108426 gagctcttatacatgaaccaccttaggtgacatacacccttttacacccacacatatttgtgacatatgacaaaaacattgaatgaagagatgaaaaagg 34108525  T
Q  215 gtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgaga-tgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcct 307  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||| ||   |||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  34108526 gtgatgatatgatgtaaaattactcaaatacccctaatacatgggagtgtacataagaagtgtatgaaaaagggtgtttacctatctttttcct 34108619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 115 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 7700074 - 7699882
Alignment:
Q  115 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgg 214  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  7700074 gagctcttatacataaaccaccttagatggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagataaaaaagg 7699975  T
Q  215 gtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatg-agatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcc 306  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| | ||  ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  7699974 atgatgatatgatataaaattactaaaatacccataacacatgaaggtgtatataagaggtgtatgaaaaagggtgtttacctatctttttcc 7699882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 115 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 7700272 - 7700080
Alignment:
Q  115 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgg 214  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  7700272 gagctcttatacataaaccaccttagatggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagataaaaaagg 7700173  T
Q  215 gtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatg-agatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcc 306  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| | ||  ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  7700172 atgatgatatgatataaaattactaaaatacccataacacatgaaggtgtatataagaggtgtatgaaaaagggtgtttacctatctttttcc 7700080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 115 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 7700470 - 7700278
Alignment:
Q  115 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgg 214  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  7700470 gagctcttatacataaaccaccttagatggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagataaaaaagg 7700371  T
Q  215 gtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatg-agatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcc 306  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| | ||  ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  7700370 atgatgatatgatataaaattactaaaatacccataacacatgaaggtgtatataagaggtgtatgaaaaagggtgtttacctatctttttcc 7700278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 118 - 310
Target Start/End: Original strand, 34828069 - 34828260
Alignment:
Q  118 ctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgggtg 217  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  34828069 ctcttatacatgaaccaccttgggtg-catacatccttttacatccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaagtgatg 34828167  T
Q  218 atgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcctatt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| || || |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  34828168 atgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacatatggggtgtgcataagtggtgtatgaaaaaggatgtctacctatctttttcctatt 34828260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 115 - 307
Target Start/End: Original strand, 13108148 - 13108339
Alignment:
Q  115 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgg 214  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||    
T  13108148 gagctgttatacataaaccaccttaggcggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacatgtggcaaaaacgttgaaagaagagatg-aaaggg 13108246  T
Q  215 gtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcct 307  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  13108247 gtgaggatgtgatgtgaaattactaaaatacccctaacacatgaggtgtacatgaaaggtgtataaaaaagggtgtctacctatctttttcct 13108339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 115 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 5811354 - 5811161
Alignment:
Q  115 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgg 214  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5811354 gagctattatacataaaccaccataggtggcatacatcctttttcacccacacacatttgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaggg 5811255  T
Q  215 gtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttccta 308  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5811254 gtgaggatgtgatgtgaaattactaaaatacccctaacacatgaggtgtacatgggaggtgtataaaaaagggtgtctacctatctttttccta 5811161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 121 - 308
Target Start/End: Original strand, 23980137 - 23980324
Alignment:
Q  121 ttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgggtgatg 220  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  23980137 ttatacataaaccaccataggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaggggtgagg 23980236  T
Q  221 atatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttccta 308  Q
    || |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||   |   ||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  23980237 atgtgatgtgaaattactaaaatacctctaacatatgagatgtacatggaaaatgtataaaaaaggatgtctacctatctttttccta 23980324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 115 - 292
Target Start/End: Original strand, 30887700 - 30887877
Alignment:
Q  115 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgg 214  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  30887700 gagctcttatacatgaacaatcttaggtggcatacacacttttacacccacatacatttgtgacacgtagcaaaaacattgaatgaagagatgaaaaagg 30887799  T
Q  215 gtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtct 292  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| | |||| | ||   |||||||||||| |||||||    
T  30887800 gtgatgatatgatgtaaaattacttaaatacctctaatacatggggtgtatataagaagtgtatgaaaaagggtgtct 30887877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 119 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 21807509 - 21807374
Alignment:
Q  119 tcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgggtga 218  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  21807509 tcttatacatgaaccaccttagatggcatacaccattttacacccacacaaatttgtgatatgtggcaaaaatattgaaagaagagatgaaaatggatga 21807410  T
Q  219 tgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacac 254  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21807409 tgatgttatgtgaaattactaaaatacccctaacac 21807374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 157 - 315
Target Start/End: Original strand, 46475066 - 46475225
Alignment:
Q  157 tacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccc-taacaca 255  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  46475066 tacacccatacacatttgtgacatgtaacaaaaacattgaaagaagagatgaaaaggggtgacgatgtgatgtgaaattactaaaataccccataacaca 46475165  T
Q  256 tgagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcctatttctta 315  Q
    |||||||||||  |  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  46475166 tgagatgtacatgagaggtgtataaaaaagggtgtctacctatctttttcctatatctta 46475225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 136 - 307
Target Start/End: Original strand, 36957450 - 36957620
Alignment:
Q  136 cttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgggtgatgatatgatgtaaaatt 235  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||    
T  36957450 cttaggtggcatacacccttttacatccatacatatttgtgacacgtgacaaaaatattgtaagaagagatgaaaatggatgataatgtaatgtaaaatt 36957549  T
Q  236 actaaaatacccctaacacatgagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcct 307  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||| |  || ||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||    
T  36957550 actaaaatacccccaacacatg-ggtgtatatgaaaggtgtataaaaaattgtgtctacctatctttttcct 36957620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 115 - 264
Target Start/End: Original strand, 15020282 - 15020428
Alignment:
Q  115 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgg 214  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  15020282 gagctgttatacataaaccaccataggtggcatacaaccttttacacccacaca--tttgtgacatatggcaaaaacattgaaagaagagacgaaag-gg 15020378  T
Q  215 gtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagatgta 264  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15020379 gtgaagatatgatgtgaaattactaaaatatccctaacacatgagatgta 15020428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 616 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 29625643 - 29625430
Alignment:
Q  616 atcatatctcaaagctgcatatgcactagaag----tgttatttggttacccatattacatattctccaatagcaaaatgagaatttttatgtcttttct 711  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||    | |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     |||||    
T  29625643 atcaaatctcaaagctgcatatgcattagaagatattattattttgttacccataatacatattctccactagcaaaatgagaatttttacaatgtttct 29625544  T
Q  712 tctttgctttgctagccaaatgtt---------------attagcaacaattgctcttgctttgagttcacacactgataagctagccttgcttgctttg 796  Q
    ||| |||||||| || ||||||||               |||||||||| ||||| || ||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  29625543 tctctgctttgcaagtcaaatgttggtgtatgactggccattagcaacatttgctatttcttcgagttcagacactgataagctcgctttgcttgctttg 29625444  T
Q  797 aaggaaaaacttac 810  Q
    |||||||| |||||    
T  29625443 aaggaaaagcttac 29625430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 120 - 249
Target Start/End: Original strand, 38321014 - 38321143
Alignment:
Q  120 cttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgggtgat 219  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |   ||||||    
T  38321014 cttatacattaaccatcttaggtggcatacacattttaacacccacatacaattgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagatatgagaggaggtgat 38321113  T
Q  220 gatatgatgtaaaattactaaaatacccct 249  Q
    | | |||||| ||| |||||||||| ||||    
T  38321114 ggtgtgatgtgaaagtactaaaatatccct 38321143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 154 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 20086780 - 20086690
Alignment:
Q  154 ttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgggtgatgatatgatgtaaaattactaaaata 244  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  20086780 ttttacacccacatacatttgagacatctggcaaaaacattaaaagaagagataaaaaggggtgatgatgtgatgtgaaattactaaaata 20086690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 29953665 - 29953570
Alignment:
Q  213 gggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacat-gagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcct 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||  | |||| ||   |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  29953665 gggtgatgatatgatgtaaaattactcaaatatccctaatacatggaagtctacataagaagtgtatgaaaaagggtgtctacctatctttttcct 29953570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 42950162 - 42950109
Alignment:
Q  157 tacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  42950162 tacacccacacacatttgtgatatgtggcaaatacattgaaaaaagagatgaaa 42950109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 42950111 - 42950034
Alignment:
Q  231 aaattactaaaatacccctaacacatgagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttccta 308  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||     ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  42950111 aaattactaaaatacccctgaaacatggggtgtacatgctaggtgtataaaaaagggtgtctacctatctttttccta 42950034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 135; Significance: 7e-70; HSPs: 22)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 113 - 310
Target Start/End: Original strand, 43999987 - 44000185
Alignment:
Q  113 tagagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaat 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  43999987 tagagctcttatacatgaaccaccttaggtgtcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaa 44000086  T
Q  213 gggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatga-gatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcctatt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |  ||||| |||  ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  44000087 gggtgatgatatgatgtaaaattactcaaatacctctaatacatgagggcgtacataaaaagtgtatgaaaaagagtgtctacctatctttttcctatt 44000185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 114 - 306
Target Start/End: Original strand, 21559560 - 21559753
Alignment:
Q  114 agagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatg 213  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |    
T  21559560 agagctcttatacataaaccatcttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaatattgaaagaagagatgaaaaag 21559659  T
Q  214 ggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacat-gagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcc 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21559660 ggtaatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgggggtgtacataagaggtgtatgaaaaatggtgtctatctatctttttcc 21559753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 114 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 51339973 - 51339781
Alignment:
Q  114 agagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatg 213  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51339973 agagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacatccttttacacccacaca--tttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaag 51339876  T
Q  214 ggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttccta 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  51339875 ggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacctctaacacatgatgtgtacataagaggtgtatgaaaaagggtgtctacctatctttttccta 51339781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 114 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 36370530 - 36370337
Alignment:
Q  114 agagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatg 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36370530 agagctcttatacatgaaccaccttaggtgtcatacacctttttacacccacacacatttgtgacatgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaaag 36370431  T
Q  214 ggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatga-gatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcc 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||| | |||  ||||||||||||  || |||| ||||||||||||    
T  36370430 ggtgatgatatgatgtaaaattactcaaatacccctaatacatgagggtgtatataaaaagtgtatgaaaaagagtatctacctatctttttcc 36370337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 114 - 304
Target Start/End: Original strand, 36749405 - 36749596
Alignment:
Q  114 agagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36749405 agagctcttatacatgaaccaccttagatgtcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaag 36749504  T
Q  214 ggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatga-gatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatcttttt 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| | |||||| |||  ||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  36749505 ggtgatgatatgatgtaaaattactcaaatacctctaatacatgagggtgtacataaaaagtgtatgaaaaagagtgtctacctatcttttt 36749596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 114 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 46112136 - 46111943
Alignment:
Q  114 agagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatg 213  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  46112136 agagttcttatacatgaaccatcttaggtgacatacaccattttacatccacacacatttgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaag 46112037  T
Q  214 ggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacat-gagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| | ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  46112036 ggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaatacatggggatgtatataaaaggtgtatgaaaaatggtgtctacctatctttttcc 46111943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 115 - 305
Target Start/End: Original strand, 22894680 - 22894870
Alignment:
Q  115 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgg 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22894680 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 22894779  T
Q  215 gtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatga-gatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttc 305  Q
     ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| | |||||| ||   ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  22894780 atgatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatg-aaaagggtgtctatctatctttttc 22894870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 115 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 34750089 - 34749896
Alignment:
Q  115 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgg 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34750089 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacatatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 34749990  T
Q  215 gtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacat-gagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcct 307  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | | |||||| ||   |||||||||||| | |||||  |||||||||||||    
T  34749989 gtgatgatatgatgtaaaattactcaaatacccctaatacataggggtgtacataagaagtgtatgaaaaaggatgtctggctatctttttcct 34749896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 114 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 30735687 - 30735494
Alignment:
Q  114 agagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatg 213  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |    
T  30735687 agagctcttatatatgaaccaccttagatggcatacacccttttacacccacacacatctgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagatat-aaaaag 30735589  T
Q  214 ggtgatgatatgatgtaaaattact-aaaatacccctaacacatgagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcct 307  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||   |||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  30735588 ggtgatgatatgatgttaaattactaaaaatacccctaacacatggagtgtacataagtggtgtatgaaaaagggtgtctacctatctttttcct 30735494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 115 - 306
Target Start/End: Original strand, 38231293 - 38231484
Alignment:
Q  115 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgg 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  38231293 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagatatgaaaat-g 38231391  T
Q  215 gtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaagg-tgtctatctatctttttcc 306  Q
    || || || | |||| |||| |||||| ||||||| ||||||| | |||||| ||  ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  38231392 gtaataatgtaatgtgaaatgactaaactacccctgacacatggggtgtacataagaggtgtatcaaaaaaggatgtctacctatctttttcc 38231484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 118 - 307
Target Start/End: Original strand, 48200688 - 48200878
Alignment:
Q  118 ctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgggtg 217  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  48200688 ctcttattcatgaatcatcttaggtggcatacacctttttacatccacatatatttgtgacacgtggcaaaaatattgaaagaagagatgaaaaaggatg 48200787  T
Q  218 atgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacat-gagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcct 307  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| | | |||||| |||  |||||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  48200788 atgatatgatgtaaaattactcaaatacccataatacatgggggtgtacataaaaagtgtatgaaaaaggatgtctacctatctttttcct 48200878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 112 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 39467295 - 39467096
Alignment:
Q  112 ttagagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaa 211  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  39467295 ttagagctgttatccataaaccaccatagatgacatacacccttttacacccacacatatttgtgacatgtgccaaaaatattgaaagaagagatgaaaa 39467196  T
Q  212 tgggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcctattt 311  Q
     |||||| ||| |||| | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||     ||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  39467195 ggggtgaggatgtgatatgaaattactaaaatatccataacacatgaggtgtacatgggaggtgtataaaaaagggtgtgtacctatctttttcctattt 39467096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 115 - 213
Target Start/End: Original strand, 29460660 - 29460758
Alignment:
Q  115 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatg 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29460660 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacttttgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaatg 29460758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 115 - 213
Target Start/End: Original strand, 29471512 - 29471610
Alignment:
Q  115 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatg 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29471512 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacttttgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaatg 29471610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 113 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 39072466 - 39072278
Alignment:
Q  113 tagagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaat 212  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  39072466 tagagctattatacatgaatcaccttagatgacatacacccttttacacccacatacatttgtgacatgtggcataaacattaaaagaagagatgaaaat 39072367  T
Q  213 gggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcc 306  Q
    |||||||||| |||||     |||||||||||||| | ||||||| | ||||||  || | ||||| |||||  ||||||| ||||||||||||    
T  39072366 gggtgatgatgtgatg-----ttactaaaatacccttgacacatggggtgtacatcaaagatgtataaaaaagtgtgtctacctatctttttcc 39072278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 114 - 244
Target Start/End: Original strand, 50966130 - 50966256
Alignment:
Q  114 agagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatg 213  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  50966130 agagctcttatacatgaac-atcttaggtggcatacacccttttacatctattcacatttgtgacacgtgacaaaaatattgaaagaagagatgaaaaag 50966228  T
Q  214 ggtgatgatatgatgtaaaattactaaaata 244  Q
       |||||||| |||||||||||||||||||    
T  50966229 ---gatgatataatgtaaaattactaaaata 50966256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 114 - 244
Target Start/End: Original strand, 51069265 - 51069391
Alignment:
Q  114 agagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatg 213  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  51069265 agagctcttatacatgaac-atcttaggtggcatacacccttttacatctattcacatttgtgacacgtgacaaaaatattgaaagaagagatgaaaaag 51069363  T
Q  214 ggtgatgatatgatgtaaaattactaaaata 244  Q
       |||||||| |||||||||||||||||||    
T  51069364 ---gatgatataatgtaaaattactaaaata 51069391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 123 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 20856334 - 20856153
Alignment:
Q  123 atacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgggtgatgat 222  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| || |||| || |||||||    
T  20856334 atacatgaaccactttaggtggcatacacccttttacacccatacacatttgtgacatgtggcaaaaacattgaaa-aagatat-aaaaaggatgatgat 20856237  T
Q  223 atgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagatgtacacaaatggtgtatga-aaaaaggtgtctatctatctttttcc 306  Q
     |||| |||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||  |  ||||||| | |||||| ||| | |||||||||||||    
T  20856236 gtgatataaaattact-aaatacccctgacacatggggtgtacatgagaggtgtataacaaaaagatgtttgtctatctttttcc 20856153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 207 - 310
Target Start/End: Original strand, 29472901 - 29473004
Alignment:
Q  207 gaaaatgggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcc 306  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || || |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  29472901 gaaaagggatgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatggggtgtgcataagtggtgtatgaaaaaggatgtctacctatctttttcc 29473000  T
Q  307 tatt 310  Q
    ||||    
T  29473001 tatt 29473004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 137 - 249
Target Start/End: Original strand, 53638157 - 53638269
Alignment:
Q  137 ttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgggtgatgatatgatgtaaaatta 236  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||| |||  |||||||| |||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||     
T  53638157 ttaggtggcatacaccctttaacacccacacacaatcgtgacatgtggtaaaaacatggaaagaagagatgagagggggtgatgatgtgatgtaaaattg 53638256  T
Q  237 ctaaaatacccct 249  Q
    |||||||||||||    
T  53638257 ctaaaatacccct 53638269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 29820483 - 29820397
Alignment:
Q  122 tatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatga 208  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| |||||| | ||  |||||||||| |||||||||||||    
T  29820483 tatacatagaccaccttaggtggcatacacactttgacacccacatacaattgtgagatgtagcaaaaacattaaaagaagagatga 29820397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 759 - 814
Target Start/End: Original strand, 1153036 - 1153091
Alignment:
Q  759 tgagttcacacactgataagctagccttgcttgctttgaaggaaaaacttacaaat 814  Q
    |||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1153036 tgagttcagacacggacaagctagctttgcttgctttgaagaaaaaacttacaaat 1153091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0062 (Bit Score: 129; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0062
Description:

Target: scaffold0062; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 119 - 306
Target Start/End: Original strand, 6722 - 6910
Alignment:
Q  119 tcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgggtga 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6722 tcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagggtga 6821  T
Q  219 tgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatga-gatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcc 306  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | |||||| ||   |||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  6822 tgatatgatgtaaaattacttaaatatccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtatctacctatctttttcc 6910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 129; Significance: 3e-66; HSPs: 22)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 115 - 306
Target Start/End: Original strand, 39370927 - 39371119
Alignment:
Q  115 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgg 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39370927 gagctcttatacatgaaccaccttagatggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtgccaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 39371026  T
Q  215 gtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgaga-tgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |  |||||| ||   |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  39371027 gtgatgatatgatgtaaaattactcaaatacccctaatacatgggggtgtacataagaagtgtatgaaaaagggtgtctacctatctttttcc 39371119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 113 - 306
Target Start/End: Original strand, 13347126 - 13347320
Alignment:
Q  113 tagagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaat 212  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||     
T  13347126 tagagcttttatacatgaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaatagatgaaaaa 13347225  T
Q  213 gggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatga-gatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcc 306  Q
    | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| | |||||| ||   |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  13347226 gagtgatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaagggtgtctacctatctttttcc 13347320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 114 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 40888134 - 40887940
Alignment:
Q  114 agagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatg 213  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40888134 agagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacactcttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaag 40888035  T
Q  214 ggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacat-gagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcct 307  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | || | | |||||| ||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  40888034 ggtggtgatatgatgtaaaattactaaaatacctctaatagatgggggtgtacataagaggtgtatgaaaaagggtgtctacctatctttttcct 40887940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 114 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 1815808 - 1815619
Alignment:
Q  114 agagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatg 213  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1815808 agagctcttatacatgaaccatcttaggtgacatacacccttttacatccacacatatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaagg 1815709  T
Q  214 ggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||   | |  | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1815708 ggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatagggtgtac---atttctttatgaaaaaaggtgtctacctatctttttcc 1815619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 115 - 306
Target Start/End: Original strand, 2237276 - 2237468
Alignment:
Q  115 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgg 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2237276 gagcttttatacatgaaccaccttaggtgacatacacccttttacacccacacatatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 2237375  T
Q  215 gtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacat-gagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | | |||||| ||   |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  2237376 gtgatgatatgatgtaaaattactcaaatacccctaatacttgggggtgtacataagaagtgtatgaaaaagggtgtctacctatctttttcc 2237468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 114 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 27553565 - 27553372
Alignment:
Q  114 agagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatg 213  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||      
T  27553565 agagctcttatacatgaaccattttaggtggcatataccattttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagaagaaaaat 27553466  T
Q  214 ggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttccta 308  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  27553465 ggtgattatctgatgtaaaattactaaaatactcctaacacatagggtgtacataagaggtgtatgaaaaagggtgtctatctat-tttttccta 27553372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 113 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 9408232 - 9408094
Alignment:
Q  113 tagagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaat 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  9408232 tagagctcttatacatgaaccacctcaggtgacatacgcccttttacactcacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaa 9408133  T
Q  213 gggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaa 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9408132 gggtgatgatatgatgtaaaattactcaaatacccctaa 9408094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 126 - 307
Target Start/End: Original strand, 14831555 - 14831737
Alignment:
Q  126 catgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgggtgatgatatg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14831555 catgaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgatacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagggtgatgatatg 14831654  T
Q  226 atgtaaaattactaaaatacccctaacacat-gagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcct 307  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| || | | | |||||| ||   |||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  14831655 atgtaaaattattcaaatacccctaatacgtaggggtgtacataagaagtgtatgaaaaagggtgtttacctatctttttcct 14831737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 154 - 307
Target Start/End: Original strand, 31800597 - 31800750
Alignment:
Q  154 ttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaaca 253  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31800597 ttttacacccacacacatttatgacacgtggcaaaaatattgaaagaaaagatgaaaaggggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaaca 31800696  T
Q  254 catgagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcct 307  Q
     ||| | |||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  31800697 tatggggtgtacacaagaggtgtatgaaaaagggtgtctgcctatctttttcct 31800750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 112 - 249
Target Start/End: Original strand, 17225316 - 17225451
Alignment:
Q  112 ttagagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17225316 ttagagctcttatacatgaaccactttaggtggcatactc--ttttacacccacacacatttgtgacatgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaa 17225413  T
Q  212 tgggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccct 249  Q
      ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  17225414 gaggtgatgatgtgatgtgaaattactaaaatacccct 17225451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 115 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 19596258 - 19596067
Alignment:
Q  115 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgg 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||      
T  19596258 gagctgttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacatccacgcacatttgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagaggtgaaaat-a 19596160  T
Q  215 gtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaagg-tgtctatctatctttttcc 306  Q
    ||||| || | |||| |||| |||||| ||||||| ||||||| | |||||| ||  ||| | | |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  19596159 gtgataatgtaatgtgaaatgactaaactacccctgacacatggggtgtacataagaggtatttcaaaaaaggatgtctacctatctttttcc 19596067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 115 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 33404627 - 33404531
Alignment:
Q  115 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33404627 gagctcttatacatgaaccaccttaggtgccatacacacttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaa 33404531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 114 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 4300735 - 4300544
Alignment:
Q  114 agagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatg 213  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| |||| | | ||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||| ||||||| ||||      
T  4300735 agagctcttatacatgaaccattttaggtgacatatatccttttacacccacacatatttgtgacatatggcaaaaacattgaaataagagataaaaaat 4300636  T
Q  214 ggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttc 305  Q
    |||| |||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||  |  | ||||| ||||| | |||||||| |||||||||    
T  4300635 ggtggtgatgtgatgtgaaattattaaaatatccctaacacatgaggtgtacatgagagatgtataaaaaaggatgtctatcaatctttttc 4300544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 186 - 307
Target Start/End: Original strand, 42683670 - 42683792
Alignment:
Q  186 aaaaacattgaaagaagagatgaaaatgggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacat-gagatgtacacaaatggtgtatgaaaaa 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | | |||||| ||  |||||||||||||    
T  42683670 aaaaacattgaaagaagagatgaaaaaggatggtgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaatatatgggggtgtacataagaggtgtatgaaaaa 42683769  T
Q  285 aggtgtctatctatctttttcct 307  Q
     | ||||||||||||||||||||    
T  42683770 ggatgtctatctatctttttcct 42683792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 124 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 41004031 - 41003850
Alignment:
Q  124 tacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgggtgatgata 223  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||| |||||| ||||||| |||| || |||| || |||||||     
T  41004031 tacatgaaccactttaggtggcatacacccttttacactcatacacatttatgacatgtggcaaaaatattgaaa-aagatataaaaagggatgatgatg 41003933  T
Q  224 tgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagatgtacacaaatggtgtatga-aaaaaggtgtctatctatctttttcc 306  Q
    |||||||||||||||||| || |||| ||| ||| | ||||||  |  ||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||    
T  41003932 tgatgtaaaattactaaa-tatccctgacatatggggtgtacatgagaggtgtataacaaaaaggtttctgtctatctttttcc 41003850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 112 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 19124664 - 19124532
Alignment:
Q  112 ttagagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaa 211  Q
    |||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||     
T  19124664 ttagagttcttatacatggactatcttagatggcatacacatttg-acacccacacacaattgtgacgtgtggcaaaaacatt-aaagaagagatgaaag 19124567  T
Q  212 tgggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacc 246  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19124566 aatgtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacc 19124532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 750 - 823
Target Start/End: Original strand, 35752630 - 35752703
Alignment:
Q  750 ctcttgctttgagttcacacactgataagctagccttgcttgctttgaaggaaaaacttacaaatagtgtacca 823  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  35752630 ctctttctttgagttcgcagactgataagcttgctttgcttgctttaaaggaaaagcttacaaatggtgtacca 35752703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 249
Target Start/End: Original strand, 12164254 - 12164388
Alignment:
Q  118 ctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaaga---agagatgaaaatgg 214  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||   ||| | || |||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||   |||||||  |  ||    
T  12164254 ctcttatacatgaaccatcttaggtggcacacattctttaatactcacacacagttgtggcatgtggcaaaaacattgaaagaagaagagatgggagagg 12164353  T
Q  215 gtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccct 249  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||| |||||    
T  12164354 gtgatggtgtgatgtgaaattactaaaatgcccct 12164388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 747 - 819
Target Start/End: Original strand, 35364670 - 35364742
Alignment:
Q  747 ttgctcttgctttgagttcacacactgataagctagccttgcttgctttgaaggaaaaacttacaaatagtgt 819  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  35364670 ttgcttttgctttgagttcacagactgataaacttgctttgcttgctttgaaagaaaagcttacaaatggtgt 35364742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 756 - 823
Target Start/End: Original strand, 35404400 - 35404467
Alignment:
Q  756 ctttgagttcacacactgataagctagccttgcttgctttgaaggaaaaacttacaaatagtgtacca 823  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  35404400 ctttgagttcaaagactgataagctggctttgcttgcattgaaggaaaagcttacaaatggtgtacca 35404467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 616 - 735
Target Start/End: Original strand, 35404239 - 35404364
Alignment:
Q  616 atcatatctcaaagctgcatat--gcactagaag-tgttatttggttacccatatta---catattctccaatagcaaaatgagaatttttatgtct-tt 708  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| | || ||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| | ||||| | | |  |    
T  35404239 atcaaatctcaaagctgcatatatgcactagaaggtattctttagttacccataataatacatattctccaatagcaaaatga-attttttttttatgat 35404337  T
Q  709 tcttctttgctttgctagccaaatgtt 735  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  35404338 tcttctctgctttgctagccaaatgtt 35404364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 668 - 732
Target Start/End: Original strand, 35364567 - 35364634
Alignment:
Q  668 tacatattctccaatagcaaaatgagaatttttatgtct---tttcttctttgctttgctagccaaat 732  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  35364567 tacatattcttcaatagaaaaatgaggacttttatgtcgatattttttctttgctttgctagccaaat 35364634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 122; Significance: 4e-62; HSPs: 7)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 114 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 3987097 - 3986900
Alignment:
Q  114 agagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3987097 agagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaagg 3986998  T
Q  214 ggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcctattt 311  Q
    | |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| | | |||| ||    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  3986997 gatgataatatgatgtaaaattactcaaatacccttaatacatggggtatacataataaatgtatgaaaaatgatgtctacctatctttttcctattt 3986900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 114 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 3118239 - 3118045
Alignment:
Q  114 agagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatg 213  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |    
T  3118239 agagctcttatatatgaaccaccttaggtggcatacacccttttacactcacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaatagataaaaaag 3118140  T
Q  214 ggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgaga-tgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcct 307  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||  | ||||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  3118139 ggtggtgacatgatgtaaaattactaaaatacccctaatacatgggagtgtacataagagatgtatgaaaaaggatgtctacctatctttttcct 3118045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 115 - 305
Target Start/End: Original strand, 14022934 - 14023124
Alignment:
Q  115 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgg 214  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || ||    
T  14022934 gagctattatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagagatgacaaggg 14023033  T
Q  215 gtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttc 305  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  14023034 gtgacgatgtgatgtgaaattactaaaatacccctaacacatgaggtgtacatgggaggtgtataaaaaagggtgtctacctatctttttc 14023124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 115 - 307
Target Start/End: Original strand, 24208444 - 24208636
Alignment:
Q  115 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgg 214  Q
    ||||| |||||||| ||||| | ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24208444 gagctgttatacataaaccatcataggtggtatacactattttacacccacacacatttgtgatatgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 24208543  T
Q  215 gtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcct 307  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |  ||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  24208544 gtgaggatgtgatgtgaaattactaaaatacccctaacacatgaggtgtaaatgagaggtgtataaaaaaggatgtctacctatctttttcct 24208636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 115 - 307
Target Start/End: Original strand, 13697569 - 13697760
Alignment:
Q  115 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgg 214  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||| |||| ||||||||| | |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13697569 gagctcttatacataaaccatcttagatgacatgcacccttttacacc-atacacatttgtgatacgtggtaaaaacattgaaagaagagatgaaaacgg 13697667  T
Q  215 gtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcct 307  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| | |||||| || |  ||||||||||| | | |||| |||||||||||||    
T  13697668 gtgatgatatgatataaaattactaaaatatctctaacacatggggtgtacataagtaatgtatgaaaaatgatctctacctatctttttcct 13697760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 114 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 15345849 - 15345656
Alignment:
Q  114 agagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatg 213  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||      
T  15345849 agagctcttatacatcaaccaccttaggtggcatatactcttttacacccataca--tttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaaaagatgaaaaaa 15345752  T
Q  214 ggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttcctat 309  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||| ||||  | |||||| ||   |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  15345751 ggtgatgatatgatatcaaattactcaaatgcccctaatacatagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaagatgtctacctatttttttcctat 15345656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 114 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 7674628 - 7674598
Alignment:
Q  114 agagctcttatacatgaaccaccttaggtgg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7674628 agagctcttatacatgaaccaccttaggtgg 7674598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 121; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 119 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 87350 - 87160
Alignment:
Q  119 tcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgggtga 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  87350 tcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacccttgtacacc-acacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaatagtga 87252  T
Q  219 tgatatg--atgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagatgtacacaaatggtgtatgaaaaaaggtgtctatctatctttttccta 308  Q
    ||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  87251 tgatatataatataaaattactaaaatacccctaacacatggggtgtacataaaaggtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttttccta 87160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 142 - 180
Target Start/End: Original strand, 5943 - 5981
Alignment:
Q  142 tggcatacacctttttacacccacacacatttgtgacac 180  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  5943 tggcatacacccttttacacccacgcacatttgtgacac 5981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University