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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF6312_low_1 (Length: 374)
Name: NF6312_low_1
Description: NF6312
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF6312_low_1 |
 |  |
|
| [»] scaffold0022 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0005 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0121 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0239 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0349 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0194 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0493 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0072 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0648 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0271 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1999 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0841 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0045 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0009 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0067 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0325 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0131 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0008 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0667 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0604 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0113 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0301 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0625 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0190 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0721 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0460 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1319 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0308 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0017 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0059 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0432 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0125 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0077 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0394 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0174 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0628 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0060 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 217)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 36569677 - 36570036
Alignment:
| Q |
1 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36569677 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
36569776 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
200 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36569777 |
ttttatataccaaaagcttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
36569876 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36569877 |
ttttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatgatttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
36569976 |
T |
 |
| Q |
301 |
aagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
360 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36569977 |
aagtgatctttaatttatatattttgtgaaacaagagtactggtacactcaaaattgtga |
36570036 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 33612552 - 33612910
Alignment:
| Q |
1 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33612552 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaattagttgtttttttgaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
33612651 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33612652 |
ttttatttaccaaaagcttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaat |
33612751 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
33612752 |
ttttttaatataatccttataaacaatgaaatgctggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacttttttatttcatta |
33612851 |
T |
 |
| Q |
301 |
aagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtg |
359 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33612852 |
aagtgatcgttaatttataaattttgtgcaacaagagtaccggtacactcaaaattgtg |
33612910 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 10779369 - 10779010
Alignment:
| Q |
1 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10779369 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
10779270 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
200 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10779269 |
ttttatataccaaaagtttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
10779170 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
300 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
10779169 |
ttttgtaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttacgaaatgatattttctaaaatataaatattgacaaatatctttttatttcatta |
10779070 |
T |
 |
| Q |
301 |
aagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
360 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10779069 |
aagtgatctttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
10779010 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 5 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 42244911 - 42244556
Alignment:
| Q |
5 |
tgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaatttt |
104 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
42244911 |
tgtatcggtacatcaagtcgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagagaattaaatttt |
42244812 |
T |
 |
| Q |
105 |
atttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaatttt |
204 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42244811 |
atttaccaaaagcttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaatttt |
42244712 |
T |
 |
| Q |
205 |
ttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagt |
304 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42244711 |
ttaatatgatccttataaacaatgaaatgatgatttttcttatgaaatgatgttttataaaatataaatattgacaaatatctttttatttcattaaagt |
42244612 |
T |
 |
| Q |
305 |
gatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
360 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42244611 |
gatcgttaatttatatattttgtaaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
42244556 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 5 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 48550040 - 48549683
Alignment:
| Q |
5 |
tgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaatttt |
104 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48550040 |
tgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgttttttagaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaatttt |
48549941 |
T |
 |
| Q |
105 |
atttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaatttt |
204 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48549940 |
atttaccaaaagcttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcgtaacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaatttt |
48549841 |
T |
 |
| Q |
205 |
ttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggt--ttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaa |
302 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48549840 |
ttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggttttttttttatgaaataatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaa |
48549741 |
T |
 |
| Q |
303 |
gtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
360 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48549740 |
gtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtatcggtacactcaaaattgtga |
48549683 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 46631024 - 46630664
Alignment:
| Q |
1 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnn-gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaa |
99 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46631024 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtacaattaataataaatgagtttttttttttgaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaa |
46630925 |
T |
 |
| Q |
100 |
attttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaa |
199 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46630924 |
attttatttaccaaaagattcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattacttataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaa |
46630825 |
T |
 |
| Q |
200 |
attttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatt |
299 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46630824 |
tttttttagtatgatccttataaacaatgaaatgatgatttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatt |
46630725 |
T |
 |
| Q |
300 |
aaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
360 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46630724 |
aaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
46630664 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 4 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 38955417 - 38955061
Alignment:
| Q |
4 |
gtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattt |
103 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38955417 |
gtgtattggtacaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattt |
38955318 |
T |
 |
| Q |
104 |
tatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattt |
203 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38955317 |
tatataccaaaagtttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataagaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattt |
38955218 |
T |
 |
| Q |
204 |
tttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaag |
303 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38955217 |
tgtaatatgatccttataaacaatgaaatgatgatttttcttatgaaatgatattttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaag |
38955118 |
T |
 |
| Q |
304 |
tgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
360 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38955117 |
tgatctttaatttatatattttatgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
38955061 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 44998440 - 44998798
Alignment:
| Q |
1 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
100 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44998440 |
tgggtgtattggtacaccaagtcataaaattaataataaatgagttgttttttt-aagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
44998538 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
200 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44998539 |
ttttatataccaaaagtttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
44998638 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
300 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44998639 |
ttttgtaatatgatccttataaacaatgaaatgatgattttttttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
44998738 |
T |
 |
| Q |
301 |
aagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
360 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44998739 |
aagtgatctttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
44998798 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 5 - 356
Target Start/End: Original strand, 54499608 - 54499958
Alignment:
| Q |
5 |
tgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaatttt |
104 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54499608 |
tgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgtttttt-gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaatttt |
54499706 |
T |
 |
| Q |
105 |
atttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaatttt |
204 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
54499707 |
atttaccaaaagcttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaatattgattatattttataacaaaatgtaaatttt |
54499806 |
T |
 |
| Q |
205 |
ttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagt |
304 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
54499807 |
ttaatttgatctttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattaacaaatacctttttatctcattaaagt |
54499906 |
T |
 |
| Q |
305 |
gatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaatt |
356 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54499907 |
gatcgttaatttataaattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaatt |
54499958 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 21515018 - 21515377
Alignment:
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1 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
100 |
Q |
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| T |
21515018 |
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21515117 |
T |
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| Q |
101 |
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200 |
Q |
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| T |
21515118 |
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21515217 |
T |
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| Q |
201 |
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300 |
Q |
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| T |
21515218 |
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21515317 |
T |
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| Q |
301 |
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360 |
Q |
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| T |
21515318 |
aagtgatctttaatttatatattttatgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
21515377 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 24292007 - 24292366
Alignment:
| Q |
1 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
100 |
Q |
| |
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| T |
24292007 |
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24292105 |
T |
 |
| Q |
101 |
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199 |
Q |
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| T |
24292106 |
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24292205 |
T |
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| Q |
200 |
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299 |
Q |
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| T |
24292206 |
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24292305 |
T |
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| Q |
300 |
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360 |
Q |
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| T |
24292306 |
aaagtgatctttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacacttaaaattgtga |
24292366 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 4 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 23639610 - 23639259
Alignment:
| Q |
4 |
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103 |
Q |
| |
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| T |
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gtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattt |
23639511 |
T |
 |
| Q |
104 |
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203 |
Q |
| |
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| T |
23639510 |
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23639411 |
T |
 |
| Q |
204 |
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303 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
304 |
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356 |
Q |
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23639311 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 16004911 - 16004552
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
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T |
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| Q |
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200 |
Q |
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| T |
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16004712 |
T |
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| Q |
201 |
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300 |
Q |
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| T |
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16004612 |
T |
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| Q |
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360 |
Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Original strand, 45629137 - 45629493
Alignment:
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1 |
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Q |
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T |
 |
| Q |
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ttttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
200 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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ttttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatgg-tttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatt |
299 |
Q |
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| T |
45629337 |
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45629436 |
T |
 |
| Q |
300 |
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356 |
Q |
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45629437 |
aaagtgatatttaatttatatattttgtgaaacaagaataccggtacactcaaaatt |
45629493 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 21 - 360
Target Start/End: Original strand, 2526220 - 2526559
Alignment:
| Q |
21 |
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120 |
Q |
| |
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|
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gtcgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaagtaattattttatatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagtttc |
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T |
 |
| Q |
121 |
gacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttat |
220 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
221 |
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320 |
Q |
| |
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| T |
2526420 |
aaacaatgaaatgatgatttttcttatgaaatggtgttttctaaaatataaatattgacaaatacatttttatttcattaaggtgatcgttaatttatat |
2526519 |
T |
 |
| Q |
321 |
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360 |
Q |
| |
|
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|
| T |
2526520 |
attttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 27967538 - 27967898
Alignment:
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99 |
Q |
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|
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|
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T |
 |
| Q |
100 |
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199 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
200 |
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299 |
Q |
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| T |
27967738 |
attttgtaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttattatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaataccattttatttcatt |
27967837 |
T |
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| Q |
300 |
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360 |
Q |
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| T |
27967838 |
aaagtggtctttaatttatataatttgtgaaacaagagtactggtacactcaaaattgtga |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Original strand, 52257161 - 52257516
Alignment:
| Q |
1 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
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Q |
| |
|
||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
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|
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T |
 |
| Q |
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ttttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
200 |
Q |
| |
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|
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ttttatttaccaaaagcttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgataaaatgtaaa |
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T |
 |
| Q |
201 |
ttttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
300 |
Q |
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| T |
52257361 |
ttttttaatacaatccttataaacaatgaaatgatgatttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
52257460 |
T |
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| Q |
301 |
aagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaatt |
356 |
Q |
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52257461 |
aaatgatcgttaatttatatattttatgaaacaagagtaccaatacactcaaaatt |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 46222372 - 46222011
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Q |
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46222372 |
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46222273 |
T |
 |
| Q |
99 |
aattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatatt-gattattttttatgacaaaatgt |
197 |
Q |
| |
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| T |
46222272 |
aattttatatactaaaagtttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaatatttgattattttt-atgacaaaatgt |
46222174 |
T |
 |
| Q |
198 |
aaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttca |
297 |
Q |
| |
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| T |
46222173 |
aaattttgtaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatattttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttca |
46222074 |
T |
 |
| Q |
298 |
ttaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
360 |
Q |
| |
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46222073 |
ttaaagtgatctttaatttatatattttgtgaaagaagagtaccggtatactcaaaattgtga |
46222011 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 27635768 - 27636117
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1 |
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100 |
Q |
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ttttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
200 |
Q |
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| T |
27635868 |
ttttatttaccaaaaacttcgacgaaataaaatttaatttttacaaatttttattactcataacaatgaatattgattattttgtatgacaaaatgtaaa |
27635967 |
T |
 |
| Q |
201 |
-ttttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatt |
299 |
Q |
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| T |
27635968 |
tttttttaatataatctttataaacaatgaaatcatgttttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatatggacaaatagctttttatttcata |
27636067 |
T |
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| Q |
300 |
aaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacact |
349 |
Q |
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27636068 |
taaatgatcattaatttataaattttgtggaacaagagtaccggtacact |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 5 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 42680964 - 42680619
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atttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaatttt |
204 |
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| |
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| T |
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atttatcaaaagcttcgatgaaataaaatttaatttttacgaatttttattact--------tgaatattgattattttttataacaaaatgtaaatttt |
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205 |
ttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagt |
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358 |
Q |
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42680619 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 5 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 46633978 - 46633642
Alignment:
| Q |
5 |
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103 |
Q |
| |
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| T |
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46633879 |
T |
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203 |
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T |
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| Q |
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303 |
Q |
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| T |
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T |
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360 |
Q |
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| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 56 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 42080650 - 42080361
Alignment:
| Q |
56 |
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155 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
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255 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
256 |
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345 |
Q |
| |
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| T |
42080450 |
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42080361 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 62 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 55130085 - 55129799
Alignment:
| Q |
62 |
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161 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
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261 |
Q |
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| T |
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T |
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262 |
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349 |
Q |
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| T |
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55129799 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 54505944 - 54505604
Alignment:
| Q |
1 |
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99 |
Q |
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| T |
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54505845 |
T |
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| Q |
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199 |
Q |
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| T |
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349 |
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54505604 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 360
Target Start/End: Original strand, 56016828 - 56017174
Alignment:
| Q |
4 |
gtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattt |
103 |
Q |
| |
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| T |
56016828 |
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56016927 |
T |
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| Q |
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202 |
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| T |
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302 |
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| T |
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56017125 |
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| Q |
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360 |
Q |
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| T |
56017126 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 55 - 298
Target Start/End: Original strand, 52940564 - 52940807
Alignment:
| Q |
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154 |
Q |
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| T |
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52940663 |
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254 |
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52940763 |
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Q |
| |
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| T |
52940764 |
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52940807 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 55 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 38961287 - 38961027
Alignment:
| Q |
55 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttat |
154 |
Q |
| |
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| T |
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38961188 |
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254 |
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| T |
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38961089 |
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 |
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317 |
Q |
| |
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| T |
38961088 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 55 - 348
Target Start/End: Original strand, 32570450 - 32570742
Alignment:
| Q |
55 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaa-gtaaaatttaaattttaagagttttta |
153 |
Q |
| |
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| T |
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 |
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252 |
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| T |
32570550 |
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32570649 |
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 |
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348 |
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| T |
32570650 |
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32570742 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 71 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 18052244 - 18051990
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71 |
tttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaag-agtttttattactcataacaatga |
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Q |
| |
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18052145 |
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269 |
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18052045 |
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325 |
Q |
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| T |
18052044 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 56 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 39380722 - 39380436
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| Q |
56 |
aagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttatt |
155 |
Q |
| |
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|||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||| || | ||| |||| || |||||||| |
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| T |
39380722 |
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39380627 |
T |
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| Q |
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255 |
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| T |
39380626 |
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39380527 |
T |
 |
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256 |
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348 |
Q |
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| T |
39380526 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 59 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 25684414 - 25684186
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59 |
aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattact |
158 |
Q |
| |
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| T |
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25684315 |
T |
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| Q |
159 |
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255 |
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| T |
25684314 |
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25684215 |
T |
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256 |
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284 |
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| |
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| T |
25684214 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 55 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 45063559 - 45063292
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| T |
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gaagaaaaataattattttttataattgacaattatcaaaattaaatattatttaccaaaagcgtcgacaaaataaaatataatttttctgaatttttat |
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T |
 |
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tactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatga |
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tacttataataaggaatattgattattttttat-aagaaatgttaaaaatttaatattatttttataaataatggaatgatgtttcttattatgagatga |
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T |
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255 |
tgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattt |
324 |
Q |
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tgttttctaaaatataaacattgataaatagctttttatttca-taaaataatcgttaatttataaattt |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 59 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 6882853 - 6882585
Alignment:
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59 |
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158 |
Q |
| |
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| T |
6882853 |
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6882754 |
T |
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254 |
Q |
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| T |
6882753 |
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6882654 |
T |
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255 |
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324 |
Q |
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| T |
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6882585 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 59 - 284
Target Start/End: Original strand, 48207164 - 48207391
Alignment:
| Q |
59 |
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158 |
Q |
| |
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48207263 |
T |
 |
| Q |
159 |
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256 |
Q |
| |
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| T |
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48207363 |
T |
 |
| Q |
257 |
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284 |
Q |
| |
|
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| T |
48207364 |
ttttctaaaatataaataatgacaaata |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 59 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 37991999 - 37991735
Alignment:
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59 |
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158 |
Q |
| |
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37991999 |
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37991900 |
T |
 |
| Q |
159 |
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257 |
Q |
| |
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| T |
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37991800 |
T |
 |
| Q |
258 |
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324 |
Q |
| |
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|
| T |
37991799 |
tttcaaaaatataaatattgac-aataactacttatttca-taaaatgatcgttaatatataaattt |
37991735 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 112 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 337369 - 337134
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211 |
Q |
| |
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|||| |||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |
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337369 |
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337270 |
T |
 |
| Q |
212 |
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309 |
Q |
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337172 |
T |
 |
| Q |
310 |
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348 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 55 - 298
Target Start/End: Original strand, 4490957 - 4491200
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154 |
Q |
| |
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| T |
4490957 |
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4491056 |
T |
 |
| Q |
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254 |
Q |
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| T |
4491057 |
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4491156 |
T |
 |
| Q |
255 |
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298 |
Q |
| |
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| T |
4491157 |
tgtcttataaaatataaatattgataaataactctttatttcat |
4491200 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 59 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 52324285 - 52324021
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59 |
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158 |
Q |
| |
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| T |
52324285 |
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T |
 |
| Q |
159 |
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257 |
Q |
| |
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| T |
52324186 |
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52324087 |
T |
 |
| Q |
258 |
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324 |
Q |
| |
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|
|
| T |
52324086 |
tttttaaaatataaagattgacaaataactacttatttca-taaaatgattgtaaatttataaattt |
52324021 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 284
Target Start/End: Original strand, 8749412 - 8749640
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55 |
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154 |
Q |
| |
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| T |
8749412 |
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8749510 |
T |
 |
| Q |
155 |
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254 |
Q |
| |
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| T |
8749511 |
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8749610 |
T |
 |
| Q |
255 |
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284 |
Q |
| |
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|||||| |||||||||||||||| ||||| |
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|
| T |
8749611 |
tgtttttcaaaatataaatattgataaata |
8749640 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 348
Target Start/End: Original strand, 19526807 - 19527098
Alignment:
| Q |
55 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttat |
154 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||||||| |||| || ||||||| || ||| ||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||| || ||||| | |
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|
| T |
19526807 |
gaagaaaaagaattgttttctatcattaacaattacaataattagatcttagttaccgaaagtgtcgacgaaataaaatttacattttttgaatttttgt |
19526906 |
T |
 |
| Q |
155 |
tactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatga |
254 |
Q |
| |
|
||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||| |||| | |
|
|
| T |
19526907 |
tacatataacaaagaatatttattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatatgattcttataaacaatgaaatgctgtttattcttataaaataa |
19527006 |
T |
 |
| Q |
255 |
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348 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||||||| || ||||| || ||||||||| |||| | |||||||| || || || || |||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
19527007 |
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19527098 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 59 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 17370596 - 17370369
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59 |
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158 |
Q |
| |
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|
|
| T |
17370596 |
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17370497 |
T |
 |
| Q |
159 |
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256 |
Q |
| |
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||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||| | || | ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| || |
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|
| T |
17370496 |
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17370397 |
T |
 |
| Q |
257 |
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284 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
17370396 |
ttttctaaaatataaataatgacaaata |
17370369 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 298
Target Start/End: Original strand, 19595014 - 19595258
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55 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaa-attttaagagttttta |
153 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
19595014 |
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19595113 |
T |
 |
| Q |
154 |
ttactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatg |
253 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |
|
|
| T |
19595114 |
ttacatataacaaagaatatttattattttttatgaaaaaatgttaaaaatttaatatgattcttataaacaatgaaatgatgtttattcttataaaatg |
19595213 |
T |
 |
| Q |
254 |
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298 |
Q |
| |
|
|||| || ||||||||||||||| | ||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
19595214 |
atgtcttataaaatataaatattaataaataactctttatttcat |
19595258 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 39412493 - 39412224
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| Q |
55 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttat |
154 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||| | | || || ||||||| |
|
|
| T |
39412493 |
gaagaaaaaaaattattttctatcattgacaactataataattaaatcttatttaccaaaagcatcgatgaaataaaattt-actcttttgaatttttat |
39412395 |
T |
 |
| Q |
155 |
tactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatg--gtttttcttatgaaat |
252 |
Q |
| |
|
| ||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| || |
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|
| T |
39412394 |
tgctcataatgaagaatattaattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatataattcttataaacaatgaaattatgttttttttctcatgtgat |
39412295 |
T |
 |
| Q |
253 |
gatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattt |
324 |
Q |
| |
|
| | |||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||| | |||| |||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
39412294 |
ggtattttctaaaatataaacattgataaataactatttatttta-taaaatgattgttaatttataaattt |
39412224 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 70 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 9579974 - 9579744
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ttttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaa--gagtttttattactcataacaat |
167 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| || ||||| |||| || |||| |
|
|
| T |
9579974 |
ttttctatcattgacaattacaataattaaatcgtatttaccaaaagcgtcgacgaaacaaaatttactttttttttgaatttttgttacatatgacaaa |
9579875 |
T |
 |
| Q |
168 |
gaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaat |
267 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
9579874 |
gaatattgattattttttatgagaaaattttaaaaattaaatataattcttataaacaatgaaatgatgttttttcttataaaatgatgttttctaaaat |
9579775 |
T |
 |
| Q |
268 |
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298 |
Q |
| |
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||||||||||| |||| || |||||||||| |
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|
| T |
9579774 |
ataaatattgatgaataactctttatttcat |
9579744 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 70 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 9585669 - 9585439
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ttttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaa--gagtttttattactcataacaat |
167 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| || ||||| |||| || |||| |
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|
| T |
9585669 |
ttttctatcattgacaattacaataattaaatcgtatttaccaaaagcgtcgacgaaacaaaatttactttttttttgaatttttgttacatatgacaaa |
9585570 |
T |
 |
| Q |
168 |
gaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaat |
267 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||| | || || ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
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|
| T |
9585569 |
gaatattgattattttttatgagaaaattttaaaaattaaatataattcttataaacaatgaaatgatgttttttcttataaaatgatgttttctaaaat |
9585470 |
T |
 |
| Q |
268 |
ataaatattgacaaatacctttttatttcat |
298 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| || |||||||||| |
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|
| T |
9585469 |
ataaatattgatgaataactctttatttcat |
9585439 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 59 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 13548723 - 13548436
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Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||| | ||||| | |||||| ||||||| || |||| | | ||||||||||| |
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|
| T |
13548723 |
aaaaaaaattattttctatcatcgacaattataataattaaatcttatttatctaaagcatggacgaaataaaatt-aatttttcaaattttttattact |
13548625 |
T |
 |
| Q |
159 |
cataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgtt |
258 |
Q |
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| T |
13548624 |
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T |
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349 |
Q |
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| T |
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13548436 |
T |
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Target: chr4; HSP #47
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Target Start/End: Complemental strand, 27950578 - 27950313
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155 |
Q |
| |
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| T |
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27950481 |
T |
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254 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
255 |
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324 |
Q |
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| T |
27950380 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 59 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 1792147 - 1791907
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59 |
aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattact |
158 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
159 |
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256 |
Q |
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| T |
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Q |
| |
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| T |
1791947 |
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T |
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Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
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Target Start/End: Original strand, 12756101 - 12756329
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169 |
Q |
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| T |
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T |
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269 |
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| T |
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12756300 |
T |
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Q |
| |
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12756301 |
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12756329 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 5474327 - 5474059
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161 |
Q |
| |
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5474327 |
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5474228 |
T |
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| Q |
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254 |
Q |
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5474128 |
T |
 |
| Q |
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324 |
Q |
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| T |
5474127 |
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5474059 |
T |
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Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 59 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 30168418 - 30168158
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158 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
159 |
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256 |
Q |
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| T |
30168319 |
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30168220 |
T |
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| Q |
257 |
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319 |
Q |
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| T |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 92 - 348
Target Start/End: Original strand, 36091176 - 36091433
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Q |
| |
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36091176 |
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T |
 |
| Q |
192 |
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289 |
Q |
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| T |
36091276 |
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36091375 |
T |
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| Q |
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348 |
Q |
| |
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| T |
36091376 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 39953907 - 39953665
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154 |
Q |
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| T |
39953907 |
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39953809 |
T |
 |
| Q |
155 |
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254 |
Q |
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| T |
39953808 |
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39953709 |
T |
 |
| Q |
255 |
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298 |
Q |
| |
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| T |
39953708 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 59 - 324
Target Start/End: Original strand, 48262648 - 48262913
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Q |
| |
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48262648 |
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T |
 |
| Q |
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256 |
Q |
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| T |
48262748 |
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48262847 |
T |
 |
| Q |
257 |
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324 |
Q |
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|
| T |
48262848 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 56 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 34584505 - 34584236
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154 |
Q |
| |
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| T |
34584505 |
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T |
 |
| Q |
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254 |
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| T |
34584405 |
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34584306 |
T |
 |
| Q |
255 |
tgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatatttt |
325 |
Q |
| |
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| T |
34584305 |
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34584236 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 119 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 43349326 - 43349098
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| Q |
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tcgacgaagtaaaatttaa-attttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatcct |
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Q |
| |
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|||||||| |||||||| | ||||| || ||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| || |
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| T |
43349326 |
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43349227 |
T |
 |
| Q |
218 |
tataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaattta |
317 |
Q |
| |
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| T |
43349226 |
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43349128 |
T |
 |
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318 |
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348 |
Q |
| |
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| T |
43349127 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #57
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158 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |
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| T |
45754468 |
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45754567 |
T |
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| Q |
159 |
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165 |
Q |
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||||||| |
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| T |
45754568 |
cataaca |
45754574 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 55 - 348
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gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttat |
154 |
Q |
| |
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|||||||| |||||||||| | | |||||||| || | |||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||| ||| |||| || ||||||| |
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| T |
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gaagaaaattaattattttttgtaattgacaattatcaaaattaaatattatttaccaaaagcgtcgacaaaataaaatataatttttctgaatttttat |
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T |
 |
| Q |
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tactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatga |
254 |
Q |
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| T |
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tacttataacaaagaatattgattattttttat-aagaaatgttaaaaatttaatattatttttataaa-aatgaaatgatgtttcttattatgagatga |
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T |
 |
| Q |
255 |
tgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
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| T |
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tgttttctaaaatataaacattgataaatggattttaatttca-taaaataattgttaatttat-caatttataaaacaagagtaccggtacac |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #59
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Query Start/End: Original strand, 55 - 347
Target Start/End: Original strand, 21424227 - 21424515
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Q |
| |
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gaagaaaagtaattattttctgtaattaacaattatcaaaattaaatattatttatcaaaagcgtcgacaaaataaaatataattttttttaatttttat |
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T |
 |
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tactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatga |
254 |
Q |
| |
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| || ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||| || |||||||| || |||||||||||| ||||||| || || |||||| |||| |
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| T |
21424327 |
t-cttataacaaagaatattgattattttttataagaaa-tgttaaaaatttaatattatttttataaacaatggaatgatgtttcttattatgagatga |
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T |
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tgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtaca |
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Q |
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| T |
21424425 |
tgttttctaaaatataaacattgataaataactttttatttca-taaaataatcgttaatttat-caatttatgaagtaagagtaccggtaca |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
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59 |
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Q |
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T |
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Target: chr4; HSP #61
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Target Start/End: Original strand, 16601641 - 16601932
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Q |
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| T |
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T |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 59 - 339
Target Start/End: Original strand, 52415059 - 52415338
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158 |
Q |
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T |
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Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
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Target Start/End: Original strand, 31975636 - 31975876
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Q |
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T |
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257 |
Q |
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| T |
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T |
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Target: chr4; HSP #64
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Target Start/End: Complemental strand, 39103862 - 39103569
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152 |
Q |
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| Q |
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252 |
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| T |
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348 |
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| T |
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T |
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Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 160 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 53973674 - 53973488
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348 |
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| T |
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T |
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Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 92 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 46216060 - 46215803
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Q |
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Target: chr4; HSP #67
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Target Start/End: Complemental strand, 32737477 - 32737220
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Q |
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289 |
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| T |
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32737279 |
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348 |
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Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
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Target Start/End: Complemental strand, 34927320 - 34927168
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Q |
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313 |
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| T |
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Q |
| |
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253 |
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298 |
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319 |
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| T |
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Target: chr4; HSP #71
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| |
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298 |
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| |
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| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |
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| T |
31296648 |
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| |
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25607802 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #73
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Q |
| |
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T |
 |
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254 |
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| T |
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T |
 |
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Q |
| |
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| |
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| |
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Q |
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| T |
36631205 |
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36631106 |
T |
 |
| Q |
308 |
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319 |
Q |
| |
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|||||||||||| |
|
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| T |
36631105 |
cgttaatttata |
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T |
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Target: chr4; HSP #76
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307 |
Q |
| |
|
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| T |
50776008 |
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50776107 |
T |
 |
| Q |
308 |
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319 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
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| T |
50776108 |
tgttaatttata |
50776119 |
T |
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Target: chr4; HSP #77
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267 |
Q |
| |
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| T |
15033620 |
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15033719 |
T |
 |
| Q |
268 |
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298 |
Q |
| |
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| T |
15033720 |
ataaatattgataaataactctttatttcat |
15033750 |
T |
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Target: chr4; HSP #78
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247 |
Q |
| |
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|||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||| || |||| ||||| |
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| T |
1605820 |
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1605722 |
T |
 |
| Q |
248 |
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271 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
1605721 |
gaaatgatgttttctaaaatataa |
1605698 |
T |
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Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
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172 |
Q |
| |
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||||||||| |||| || | |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||| |||| | || || |
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| T |
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22789789 |
T |
 |
| Q |
173 |
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265 |
Q |
| |
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||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
22789788 |
ttgattattttttatgagtaa-tgttaaaaatttaatatgattcttataaacaatgaaattatgtttttcttcttatgaaatgatgttttctaaa |
22789695 |
T |
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Target: chr4; HSP #80
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Target Start/End: Original strand, 38008390 - 38008501
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209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgat |
307 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
38008390 |
tatgattcttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgaaatgatgttctatacaatataaatattgacaaatagttatttatttcataaaaaatgat |
38008489 |
T |
 |
| Q |
308 |
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319 |
Q |
| |
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|||||||||||| |
|
|
| T |
38008490 |
cgttaatttata |
38008501 |
T |
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Target: chr4; HSP #81
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191 |
Q |
| |
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| T |
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47302613 |
T |
 |
| Q |
192 |
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289 |
Q |
| |
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| T |
47302614 |
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47302713 |
T |
 |
| Q |
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317 |
Q |
| |
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||||||||| ||| | || ||||||||| |
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|
| T |
47302714 |
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T |
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Target: chr4; HSP #82
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275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |
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|
| T |
27761603 |
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27761504 |
T |
 |
| Q |
276 |
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294 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
27761503 |
tgacaaatagctatttatt |
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T |
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Target: chr4; HSP #83
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Target Start/End: Complemental strand, 6807305 - 6807041
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attattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataaca |
165 |
Q |
| |
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| T |
6807305 |
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6807207 |
T |
 |
| Q |
166 |
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257 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| || |||| ||| ||| |
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|
| T |
6807206 |
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6807107 |
T |
 |
| Q |
258 |
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324 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||| |||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
6807106 |
tttctaaaatataaacattgacaaataactacttatttca-taaaatgattgttaatttataaattt |
6807041 |
T |
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Target: chr4; HSP #84
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Target Start/End: Complemental strand, 42177553 - 42177401
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gaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaat |
267 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| || || ||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
42177553 |
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42177454 |
T |
 |
| Q |
268 |
ataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgttaatttata |
319 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
42177453 |
ataaatattgataaatagttatttatttcataaaaaatgatcgttaatttata |
42177401 |
T |
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ttgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataa |
271 |
Q |
| |
|
||||||||||| || || || |||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43959199 |
ttgattattttatacgataatatgttaaaattttattatgactcttataaacaatgaa-taatgtgtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataa |
43959101 |
T |
 |
| Q |
272 |
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348 |
Q |
| |
|
|| ||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
43959100 |
atgccgacaaatgactatttatttcataaaattgatcgttaatttatagatttag-gaagtaagagtaccggtacac |
43959025 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 68 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 17616718 - 17616461
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| Q |
68 |
tattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaat |
167 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | || || ||||||| ||||||||| |||||| ||| | ||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||| | | |
|
|
| T |
17616718 |
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17616619 |
T |
 |
| Q |
168 |
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266 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | |||||| |||| |||| ||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||| |
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|
| T |
17616618 |
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17616519 |
T |
 |
| Q |
267 |
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324 |
Q |
| |
|
|||||| | || ||||| || ||||| ||| ||| | |||||||||||||| |||| |
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|
| T |
17616518 |
tataaaagtcgataaatatctctttatcacataaaaattatcgttaatttataaattt |
17616461 |
T |
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Target: chr4; HSP #87
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Target Start/End: Complemental strand, 352676 - 352505
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attattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatat |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || ||||||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
352676 |
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352577 |
T |
 |
| Q |
276 |
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348 |
Q |
| |
|
| | ||||| | |||||| || ||| |||||||||||||||| | || ||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
352576 |
taaaaaatagttatttattatataaaaatgatcgttaatttata-aaattatgaaacaggagtatcggtacac |
352505 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 55 - 344
Target Start/End: Original strand, 4695389 - 4695678
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| Q |
55 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttat |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||| || || ||||||| |||||| | | | || ||||||||| |||| || ||||| | |
|
|
| T |
4695389 |
gaagaaaaataattgttttatatcattaacaattacaatagctagatcttatttaacaaaagtgttggcaaaataaaatttactttttttgaatttttgt |
4695488 |
T |
 |
| Q |
155 |
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252 |
Q |
| |
|
|| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
4695489 |
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4695588 |
T |
 |
| Q |
253 |
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344 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||||||||| | | ||||| || ||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
4695589 |
gatgttatataaaatataaatgctaataaataactctttatttca-taaaatgatctttaaattatcaatttt-tgaaacaggagtaccggt |
4695678 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #89
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Query Start/End: Original strand, 216 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 5970862 - 5970731
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216 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgttaat |
314 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||| |||| ||||| |
|
|
| T |
5970862 |
cttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgaaatgatattctataaaatataaatattgacaaatagctatttattacataaaaaatgattattaat |
5970763 |
T |
 |
| Q |
315 |
ttatatattttgtgaaacaagagtaccggtaca |
347 |
Q |
| |
|
||||| | || |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
5970762 |
ttata-aaattatgaagcaagagtaccggtaca |
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T |
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Target: chr4; HSP #90
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Query Start/End: Original strand, 172 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 56104608 - 56104433
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172 |
attgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataa |
271 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || | ||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
56104608 |
attgattattttttacgatattatgtaaaaaaattactatgatttttataaataatgaaatgatgttttttcttacgaaatgatgttctataaaatataa |
56104509 |
T |
 |
| Q |
272 |
atattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||| | || |||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
56104508 |
atattgaaaaatatctatttcttacatgaaaatgatcgttaatttata-aaattatgaaacgagagtatcggtacac |
56104433 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 59 - 324
Target Start/End: Original strand, 32882354 - 32882611
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aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattact |
158 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| | |||| ||| |||||||| | |||| | |||||||| || |
|
|
| T |
32882354 |
aaaaataattattttctatcattgacaattataataattaaatcttatttaccaaattcgtcgatgaaataaaattt-actttttttaatttttattgct |
32882452 |
T |
 |
| Q |
159 |
cataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatga--tggtttttcttatgaaatgatg |
256 |
Q |
| |
|
||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| || ||||||||||| | ||||||| | || ||| || |
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| T |
32882453 |
cataatgaagaatattgattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatataat--------tcaatgaaatgacgttttttttctcaagagatggtg |
32882544 |
T |
 |
| Q |
257 |
ttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattt |
324 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
32882545 |
ttttctaaaatataaataatgacaaataacaacttatttca-taaaatgatcattaatttataaattt |
32882611 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 97 - 235
Target Start/End: Original strand, 44537856 - 44537995
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97 |
taaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaa-tattgattattttttatgacaaaat |
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Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||| || |||| | |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| | ||||| |
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| T |
44537856 |
taaattttatttagcaaaagtgtcggcgaagaaaaatctatctttttttaatttttattactcataatagtgaaatattgattattttttacgttaaaat |
44537955 |
T |
 |
| Q |
196 |
gtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgat |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
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| T |
44537956 |
ataaattttttaatatgattcttataaacaatgaaatgat |
44537995 |
T |
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Target: chr4; HSP #93
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337 |
Q |
| |
|
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| T |
9858515 |
tttttcttataaaatgatattttctaaaatataaatatcaacaaatagctttttatttcataaaaataatagttaatttataaatttt-tgaagtaagag |
9858613 |
T |
 |
| Q |
338 |
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348 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
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taccggtacac |
9858624 |
T |
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Target: chr4; HSP #94
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270 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || || ||||||| | ||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| | ||||||||| |
|
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| T |
24980149 |
attgattattttttacgataatatgtaaaaataattactataattcttataaacaatgaaatgatgttttttctaataaaatgatgttctataaaatata |
24980050 |
T |
 |
| Q |
271 |
aatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgttaatttata |
319 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || |||||| ||| ||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
24980049 |
aatattgacaaatagctatttattacataaaaaattatcgttaatttata |
24980000 |
T |
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Target: chr4; HSP #95
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209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatgg-tttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgat |
307 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
33491770 |
tatgattcttataaacaatgaa-tgatgcatttttcttctgaaatcatattttctaaaatataaatgccgacaaataactatttatttcataaaattgat |
33491672 |
T |
 |
| Q |
308 |
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349 |
Q |
| |
|
||||| |||||| | ||| |||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33491671 |
cgttagtttataga-tttatgaagcaagagtaccggtacact |
33491631 |
T |
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Target: chr4; HSP #96
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55 |
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153 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||||||| ||| || ||||||| || ||| |||| |||| |||||||| |||||||| | ||||| || ||||| |
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| T |
52405616 |
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52405715 |
T |
 |
| Q |
154 |
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235 |
Q |
| |
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|||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52405716 |
ttacatataacaaagaatatttattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatatgattcttataaacaatgaaatgat |
52405797 |
T |
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Target: chr4; HSP #97
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267 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| || || || |||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||| |
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|
| T |
3763308 |
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3763407 |
T |
 |
| Q |
268 |
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319 |
Q |
| |
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||||||||||| ||||| | |||||||||| ||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
3763408 |
ataaatattgataaatagttatttatttcataaaaaataatcgttaatttata |
3763460 |
T |
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Target: chr4; HSP #98
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314 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||| |
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| T |
32289066 |
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32288967 |
T |
 |
| Q |
315 |
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319 |
Q |
| |
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|||| |
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32288966 |
atata |
32288962 |
T |
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Target: chr4; HSP #99
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Query Start/End: Original strand, 216 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 48647182 - 48647078
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| Q |
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cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttca-ttaaagtgatcgttaat |
314 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
48647182 |
cttataaacaatgaaatgatgttttttcatatgaaatgatgttctataaaatataaatgttgacaaatagttatttatttcacaaaaaatgatcgttaat |
48647083 |
T |
 |
| Q |
315 |
ttata |
319 |
Q |
| |
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||||| |
|
|
| T |
48647082 |
ttata |
48647078 |
T |
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Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
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Target Start/End: Original strand, 50607881 - 50608032
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gaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaat |
267 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| || || ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | | |||||| |
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|
| T |
50607881 |
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50607979 |
T |
 |
| Q |
268 |
ataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgttaatttata |
319 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| | |||||||||| ||| |||| ||||||||||| |
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|
| T |
50607980 |
ataaatattgataaatagttatttatttcataaaaaatgattgttaatttata |
50608032 |
T |
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Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
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Target Start/End: Original strand, 56272755 - 56272878
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tttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttat |
247 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||| | | |||||||||| | ||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
56272755 |
tttttattacttataatagtgaatatttattatttttt-taataaaatgtaaaataattagtatgattcttataaataatgaaatgatattttttcttat |
56272853 |
T |
 |
| Q |
248 |
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272 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||||||||| |
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|
| T |
56272854 |
gaaataatattttctaaaatataaa |
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T |
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Target: chr4; HSP #102
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| Q |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1857040 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaata |
1857115 |
T |
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Target: chr4; HSP #103
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| Q |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4720707 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgatttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaata |
4720782 |
T |
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Target: chr4; HSP #104
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| Q |
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tattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggttttt-cttatgaaatgatgttttctaaaatat |
269 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||| || |||| |
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| T |
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15060852 |
T |
 |
| Q |
270 |
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295 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| || ||||||| |
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|
| T |
15060853 |
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15060878 |
T |
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Target: chr4; HSP #105
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| Q |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27990706 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttatataaaatataaatattgacaaata |
27990631 |
T |
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Target: chr4; HSP #106
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgat |
307 |
Q |
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|
|||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| || |||| | ||| ||| |||| |
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|
| T |
43147726 |
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43147825 |
T |
 |
| Q |
308 |
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319 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
43147826 |
cgttaatttata |
43147837 |
T |
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atgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
50498496 |
atgattcttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgaaatgatattctataaaatataaatgttgacaaata |
50498422 |
T |
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Target: chr4; HSP #108
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ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatt |
294 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
29582210 |
ttataaacaatgaaatgatgttttttcttataaaatgatgttctataaaacataaatattgacaaatagctatttatt |
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T |
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Target: chr4; HSP #109
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatt |
294 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||| || |||||| |
|
|
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45692792 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgataaatagctatttatt |
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T |
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167 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | || || ||||||| ||||||||| |||||| ||| | ||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||| | | |
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|
| T |
45953747 |
tattttctatcatttataattataataattatattttatttttcaaaagtgtcggcaaagcaaaattcaaatttttttaatttttattactcataatagt |
45953846 |
T |
 |
| Q |
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gaatattgattattttttatgacaaaatg-taaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaa |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | |||||| |||| ||| ||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||| |
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|
| T |
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gaatattgattatttttttcaataaaatgttaaaaaatttggtataattcttataaaaaatgaaatgatgttttttcttatgggataatattttctaaaa |
45953946 |
T |
 |
| Q |
267 |
tataaa |
272 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
45953947 |
tataaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #111
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cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||| |
|
|
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cttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgagatgatgttctataaaatataaattttgacaaata |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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307 |
Q |
| |
|
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T |
 |
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cgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
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||||| |||||| | ||| |||| |||||||| |||||||| |
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Target: chr4; HSP #113
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307 |
Q |
| |
|
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|
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T |
 |
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cgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
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Q |
| |
|
|||||||||||| | || |||| |||||||||||||||| |
|
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| T |
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46663661 |
T |
 |
| Q |
308 |
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348 |
Q |
| |
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| |||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46663662 |
cattaatttataga-tttatgaagcaagagtaccggtacac |
46663701 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #116
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Query Start/End: Original strand, 216 - 284
Target Start/End: Original strand, 56303081 - 56303149
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216 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||| |
|
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| T |
56303081 |
cttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgagatgatgttctataaaatataaattttgacaaata |
56303149 |
T |
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Target: chr4; HSP #117
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209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
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|||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8256678 |
tatgattcttataaacaattaaatgatattttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaata |
8256753 |
T |
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Target: chr4; HSP #118
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Query Start/End: Original strand, 209 - 284
Target Start/End: Original strand, 8270096 - 8270171
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8270096 |
tatgattcttataaacaattaaatgatattttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaata |
8270171 |
T |
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Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
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| Q |
217 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
23058927 |
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23058860 |
T |
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Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 209 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 24535652 - 24535577
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24535652 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatattgttctataaaatataaatattgacaaata |
24535577 |
T |
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Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 209 - 284
Target Start/End: Original strand, 26117989 - 26118064
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26117989 |
tatgattcttataaacagtaaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaata |
26118064 |
T |
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Target: chr4; HSP #122
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Query Start/End: Original strand, 209 - 284
Target Start/End: Original strand, 29364418 - 29364493
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||| |
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|
| T |
29364418 |
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29364493 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 209 - 284
Target Start/End: Original strand, 50733094 - 50733169
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
50733094 |
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50733169 |
T |
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Target: chr4; HSP #124
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Query Start/End: Original strand, 217 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 53695547 - 53695417
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| Q |
217 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaattt |
316 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||| ||| | || |||||||| |
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|
| T |
53695547 |
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53695448 |
T |
 |
| Q |
317 |
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348 |
Q |
| |
|
| | ||||| |||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
53695447 |
aaagatttt-tgaattaggagtaccggtacac |
53695417 |
T |
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Target: chr4; HSP #125
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Query Start/End: Original strand, 92 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 56361601 - 56361400
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| Q |
92 |
ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattatttttt--atga |
189 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||| || |||||| ||||||||| | |||| ||||||||||| || | |
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|
| T |
56361601 |
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56361502 |
T |
 |
| Q |
190 |
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289 |
Q |
| |
|
|||| ||| || | || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| || | |
|
|
| T |
56361501 |
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56361405 |
T |
 |
| Q |
290 |
ttatt |
294 |
Q |
| |
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||||| |
|
|
| T |
56361404 |
ttatt |
56361400 |
T |
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Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 168 - 341
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| Q |
168 |
gaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaa |
266 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| || || || ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| | |||| ||||| |
|
|
| T |
37748623 |
gaattttgattattttatacgataatatgtaaaaaaattactatgattcttataaacaatgaa-tgatgcgtttttcttctgaaatcacattttttaaaa |
37748721 |
T |
 |
| Q |
267 |
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341 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| || |||||||||| ||| ||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
37748722 |
tataaatgccgacaaataactatttatttcataaaattgatcgttagtttataga-tttatgaaacaagagtacc |
37748795 |
T |
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Target: chr4; HSP #127
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Query Start/End: Original strand, 204 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 49286862 - 49286768
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| Q |
204 |
tttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat |
298 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||| | ||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
49286862 |
tttaatatgattcttataaataatgaaatgatgtttattcttataaaatgatgtcttataaaacataaatattaataaataactctttatttcat |
49286768 |
T |
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Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 209 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 54506041 - 54505967
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
283 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
54506041 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattggcaaat |
54505967 |
T |
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Target: chr4; HSP #129
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Query Start/End: Original strand, 59 - 284
Target Start/End: Original strand, 19627686 - 19627900
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| Q |
59 |
aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattact |
158 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| || ||||||| ||||| ||||||| ||||| ||| |||| || ||| |||| || |
|
|
| T |
19627686 |
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19627785 |
T |
 |
| Q |
159 |
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258 |
Q |
| |
|
|||| | |||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||| |||||||| |||| ||||| | |||| ||||| ||||||| |
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| T |
19627786 |
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19627874 |
T |
 |
| Q |
259 |
ttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19627875 |
ttctaaaatataaatattgacaaata |
19627900 |
T |
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Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 148 - 272
Target Start/End: Original strand, 36188069 - 36188194
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| Q |
148 |
tttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgt-aaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttctta |
246 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||| ||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
36188069 |
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36188168 |
T |
 |
| Q |
247 |
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272 |
Q |
| |
|
|| || || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
36188169 |
tgggataatattttctaaaatataaa |
36188194 |
T |
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Target: chr4; HSP #131
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Query Start/End: Original strand, 204 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 42881214 - 42881094
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| Q |
204 |
tttaatatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaa |
302 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||| ||| |
|
|
| T |
42881214 |
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42881116 |
T |
 |
| Q |
303 |
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324 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
42881115 |
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42881094 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 155 - 252
Target Start/End: Original strand, 48018242 - 48018339
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| Q |
155 |
tactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaat |
252 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
48018242 |
tactcacaacagtgaatattgattattttttgagataaaatataatttttttagcatgattcttataaacaatgaagttatgttttttcttatgaaat |
48018339 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #133
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Query Start/End: Original strand, 209 - 348
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tatgatccttataaacaatgaaatgatgg-tttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgat |
307 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| || ||| |||| |
|
|
| T |
408300 |
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408398 |
T |
 |
| Q |
308 |
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348 |
Q |
| |
|
||||| |||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
408399 |
cgttagtttataga-tttatgaagcaagagtaccggtacac |
408438 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 209 - 324
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209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgat |
307 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
27736757 |
tatgattcttataaacaatgaac-gatgtgtttttcttctgaaatcatattttctaaaatataaatgccgacaaataactatttatttcataaaattgat |
27736659 |
T |
 |
| Q |
308 |
cgttaatttatatattt |
324 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
27736658 |
cgttagtttatagattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #135
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Query Start/End: Original strand, 55 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 337457 - 337386
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| Q |
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gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaa |
126 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
337457 |
gaagaaaaagaattattttctatcattcacaattataataatcaaatcttatttaccaaaagcttcgacgaa |
337386 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 25814592 - 25814441
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tgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaa |
266 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||| |||| || |||||||||| |
|
|
| T |
25814592 |
tgaatattgattatttttttagataaaatgttaaaaaattagtatgattcttataaatgatgaaatgacgttttttcttataaaataatattttctaaaa |
25814493 |
T |
 |
| Q |
267 |
tataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttat |
318 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||| || |||||| ||| ||| |||||| ||| |||| |
|
|
| T |
25814492 |
tataaaagttgataaatatctctttattacataaaaatgatcgataacttat |
25814441 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 318
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| Q |
167 |
tgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaa |
266 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||| |||| || |||||||||| |
|
|
| T |
30951334 |
tgaatattgattattttttg-gataaaatgttaaaaaattagtatgattcttataaaggatgaaatgacgttttttcttataaaataatattttctaaaa |
30951236 |
T |
 |
| Q |
267 |
tataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttat |
318 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||| || |||||| ||| ||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
30951235 |
tataaaagttgataaatatctctttattacataaaaatgatcgataatttat |
30951184 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
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191 |
aaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttt |
290 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||| || |||||||| |||||| || |||||||||||||||| || ||||||| |||| |
|
|
| T |
48018348 |
aaaatgtaaaaactttaatatgattcatataaataatgaaattatattttttcttctgaaattatattttctaaaatataaaaatcaacaaatagttttt |
48018447 |
T |
 |
| Q |
291 |
tatttcattaaagtgatcgttaatttat |
318 |
Q |
| |
|
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tatttcataaaaataatcattaatttat |
48018475 |
T |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatatt |
276 |
Q |
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|||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||| |
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tatgattcttataaacaatgaaatgatgttttttcttacgaaatgatattctataaaatataaatatt |
50383432 |
T |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
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|||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
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tatgattcttataaacagtaaaatgatgttttttcttatggaatgttgttctataaaatataaatattgacaaata |
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T |
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Target: chr4; HSP #141
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247 |
Q |
| |
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|||||| ||| ||||| | |||||||||||||| |||| || ||||||| || ||| |||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||| |
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|
| T |
20927617 |
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20927716 |
T |
 |
| Q |
248 |
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318 |
Q |
| |
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|||| || |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||| ||| ||| |||||| ||| |||| |
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| T |
20927717 |
aaaataatattttctaaaatataaaagttgataaatatctctttattacataaaaatgatcgataacttat |
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T |
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Target: chr4; HSP #142
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tttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttat |
247 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||| || | ||| |||||| |||||||| | ||||||| | |||||||||| |
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|
| T |
23390676 |
tttttaatacccataatagtgaatattgattatttttttagataaaatgttaaaatattagtatgattcttataaaggacgaaatgacgttttttcttat |
23390775 |
T |
 |
| Q |
248 |
gaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatt |
294 |
Q |
| |
|
|||| || |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||| |
|
|
| T |
23390776 |
aaaataatattttctaaaatataaaagttgataaatatctctttatt |
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T |
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tttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttat |
247 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||| | ||||||||||| || | |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
34936780 |
tttttattacttataatagtgaatatttattattttttca-ataaaatgtaaataatt-agtatgattcttataaa---tgaaatgatattttttcttat |
34936686 |
T |
 |
| Q |
248 |
gaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtaca |
347 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||||||||| | ||| |||| || ||| || ||| ||| |||||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
34936685 |
gaaataatattttctaaaatataaaagtcgacgaatagctattttttacataaaaatgatcgttaacttat-tgatttatgaaacaggagtaccggtaca |
34936587 |
T |
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ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
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|||| ||||| ||||||||||| | | || ||| | |||||||| | |||| || || ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| | | |
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|
| T |
37519252 |
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37519153 |
T |
 |
| Q |
192 |
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270 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
37519152 |
aaatgtaaaaaaattagtatgatttttataaaaaatgaaatgatgtttcttcttataaaattatattttctaaaatata |
37519074 |
T |
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ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||| | | || ||| | |||||||| | |||| || || ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| | | |
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|
| T |
37523468 |
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37523369 |
T |
 |
| Q |
192 |
aaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
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||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
37523368 |
aaatgtaaaaaaattagtatgatttttataaaaaatgaaatgatgtttcttcttataaaattatattttctaaaatata |
37523290 |
T |
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acaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28835944 |
acaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaata |
28835883 |
T |
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Target: chr4; HSP #147
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tttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgt-aaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttctta |
246 |
Q |
| |
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|||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||| |||||||| ||||||| || ||||||||| |
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|
| T |
46548537 |
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46548636 |
T |
 |
| Q |
247 |
tgaaatgatgttttctaaaatataaa |
272 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||||||||||| |
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|
| T |
46548637 |
tgaaatgatattttttaaaatataaa |
46548662 |
T |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| | || |||||| ||| ||| ||||||||| |
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
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348 |
Q |
| |
|
||||||| | || ||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
54996444 |
atttata-aaattatgaaacaggagtaccgttacac |
54996478 |
T |
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Q |
| |
|
||||||||| |||| || | |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||| | || || |
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|
| T |
21722274 |
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21722372 |
T |
 |
| Q |
173 |
ttgattattttttatga |
189 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21722373 |
ttgattattttttatga |
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T |
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Target: chr4; HSP #150
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ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgttaatt |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || | |||||||||| |||||||||| | || |||||| ||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
32845815 |
ttataaacaatgaaatgatgtttttt--tatgaaatgatattctataaaatataactattgacaaaaagctatttattacataaaaaatgatcgttaatt |
32845718 |
T |
 |
| Q |
316 |
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319 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
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32845717 |
tata |
32845714 |
T |
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Target: chr4; HSP #151
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tatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgat |
307 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
34595139 |
tatgattcttataaacaatg-aatgatgtgtttttatcatgaaatgatattttctgatatataaatgctgacaaataactatttatttcataaaattgat |
34595041 |
T |
 |
| Q |
308 |
cgttaatttatatattt |
324 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |||| |
|
|
| T |
34595040 |
tgttaatgtataaattt |
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T |
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ttttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttat-gacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatgg |
237 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||| | || ||||||| || | ||| |||||| |||||||| | ||||||| | |
|
|
| T |
40319166 |
ttttaaaattttttaatacccataatagtgaatattgattattttttttagataaaatgttaaaatattagtatgattcttataaaggacgaaatgacgt |
40319265 |
T |
 |
| Q |
238 |
tttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatt |
294 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||| |
|
|
| T |
40319266 |
tttttcttataaaataatattttctaaaatataaaagttgataaatatctctttatt |
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T |
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318 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
47920541 |
tttttcttataaaataatattttctaaaatataaatatcgacatataactttttatttcataaaaatgatctttactttat |
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T |
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154 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| |||||| ||||| || | |||||||| |||||| ||| ||||| | | |||| ||||||| || ||| || | ||||| |
|
|
| T |
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aagaagaataattattttttatcatcgacaattataaaaattaaatcttattttacctaaagcgttgtcgaaataaaattaaattttaaaaaaaatttat |
55224308 |
T |
 |
| Q |
155 |
tactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaat |
195 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
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tactcataacgaagaatattgattattttttatgagaaaat |
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284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
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583006 |
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T |
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ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||| ||||||| | || ||| | |||||||| | |||| || || ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| | | |
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|
| T |
3716443 |
ataactaaatcttattcaccaaaatcgtcaacgcaataaaatttgatttttctgaattcttattactcataatagagaattttgattattttttacaata |
3716542 |
T |
 |
| Q |
192 |
aaatgtaaatttt-ttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
3716543 |
aaatgtaaaaaaaattagtatgatttttataaaaaatgaaatgatattttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
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295 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || || | ||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |
|
|
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9356552 |
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tattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaat |
167 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | || || ||||| | ||||||||| |||||| ||| | ||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||| | | |
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|
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tattttctatcatttataattataataatcatattttatttttcaaaagtgtcggcaaagaaaaattcaaatttttttaatttttattactcataatagt |
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T |
 |
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gaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattt------tttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttc |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | |||| |||| || |||| ||| || |||||||| || ||||||||| |||||||||||| || || ||||| |
|
|
| T |
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gaatattgattatttttttcaataaaagttaaagttaaaaaatttagtataattcttataaaaaaggaaatgatgttttttcttatgagataatattttc |
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T |
 |
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272 |
Q |
| |
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||||||||||| |
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taaaatataaa |
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Target: chr4; HSP #160
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Target Start/End: Original strand, 34828959 - 34829034
Alignment:
| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
34828959 |
tatgattcttataaacagtaaaatgatattttttcttatgaaatgttgttctataaaatataagtattgacaaata |
34829034 |
T |
 |
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Target: chr4; HSP #161
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| Q |
152 |
tattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgta-aattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaa |
250 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||| |||||||||||||| | |||||||| || |||| |||||| || |||| ||| |||||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
37855299 |
tattactcataataaagaattttgattattttttacaataaaatgtagaaaaatttagtatgatttttctaaaaaataaaatgatgttttttcttataaa |
37855398 |
T |
 |
| Q |
251 |
atgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
37855399 |
atgatattttctaaaatata |
37855418 |
T |
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Target: chr4; HSP #162
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| Q |
152 |
tattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgta-aattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaa |
250 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||| |||||||||||||| | |||||||| || |||| |||||| || |||| |||||||||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
53389074 |
tattactcataatagagaattttgattattttttacaataaaatgtagaaaaatttagtatgatttttctaaaaaatgaaatgatgttttttcttataaa |
53388975 |
T |
 |
| Q |
251 |
atgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
53388974 |
atgatattttctaaaatata |
53388955 |
T |
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Target: chr4; HSP #163
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgat |
307 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||| || |||| | ||| ||| |||| |
|
|
| T |
53936676 |
tatgattcttataaacatt-aaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattaataaatagctatttactacataaaaaatgat |
53936578 |
T |
 |
| Q |
308 |
cgttaatttata |
319 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
53936577 |
cgttaatttata |
53936566 |
T |
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Target: chr4; HSP #164
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttctt--atgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
126812 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgtttttttttttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaata |
126889 |
T |
 |
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Target: chr4; HSP #165
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| Q |
68 |
tattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaat |
167 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | || || ||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| | | |
|
|
| T |
1182685 |
tattttctatcatttataattataataattatattttatttttcaaaagtgtcggaaaagtaaaattcaaatttttttaatttttattactcataatagt |
1182784 |
T |
 |
| Q |
168 |
gaatattgattattttttatgacaaaatg-taaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttctt |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | |||||| |||| |||| ||| || ||||||| |||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
1182785 |
gaatattgattatttttttcaataaaatgttaaaaaatttagtataatttttataaaaaatgaaatgatgttttttctt |
1182863 |
T |
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Target: chr4; HSP #166
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| Q |
152 |
tattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaa |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||| ||||||||||||| | | |||||||| | |||| |||||| || |||| ||| |||||||| |||||||||| ||| |
|
|
| T |
28037864 |
tattactcataatagagaattttgattattttttctaataaaatgtagaaaatttagtatgatttttctaaaaaataaaatgatgttttttcttataaaa |
28037963 |
T |
 |
| Q |
252 |
tgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
28037964 |
tgatattttctaaaatata |
28037982 |
T |
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Back To:
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Target: chr4; HSP #167
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Query Start/End: Original strand, 209 - 284
Target Start/End: Original strand, 43735367 - 43735444
Alignment:
| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttt--tcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43735367 |
tatgattcttataaacagtaaaatgatgttttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaata |
43735444 |
T |
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Target: chr4; HSP #168
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Target Start/End: Complemental strand, 17281975 - 17281867
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| Q |
178 |
tattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggttttt--cttatgaaatgatgttttctaaaatataaatat |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| || |||||| | || | ||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17281975 |
tattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatttaattcatataaacaatgaaatgatgttttttttctcctgagatggtgttttctaaaatataaataa |
17281876 |
T |
 |
| Q |
276 |
tgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
17281875 |
tgacaaata |
17281867 |
T |
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Target: chr4; HSP #169
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Query Start/End: Original strand, 4 - 41
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Alignment:
| Q |
4 |
gtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaat |
41 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23645268 |
gtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaat |
23645231 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr4; HSP #170
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Query Start/End: Original strand, 278 - 359
Target Start/End: Original strand, 51282241 - 51282321
Alignment:
| Q |
278 |
acaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtg |
359 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
51282241 |
acaaataactttttatttcataaaaatgatagttaatttataaatttt-tgaagtaagagtaccggtacactttaaattgtg |
51282321 |
T |
 |
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Target: chr4; HSP #171
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Query Start/End: Original strand, 209 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 52104577 - 52104468
Alignment:
| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatc |
308 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||| ||| ||| ||||| |
|
|
| T |
52104577 |
tatgattcttataaaggatgaaatgacgttttttcttataaaataatattttctaaaatataaaagttgataaatatctctttattacataaaaatgatc |
52104478 |
T |
 |
| Q |
309 |
gttaatttat |
318 |
Q |
| |
|
| ||| |||| |
|
|
| T |
52104477 |
gataacttat |
52104468 |
T |
 |
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Target: chr4; HSP #172
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Alignment:
| Q |
172 |
attgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggttttt-cttatg-aaatgatgttttctaaaatat |
269 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||| ||||||| |||| |||||||| ||||| |||||| ||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
52762154 |
attgattattttttatgataaaatataaaaaaattagtatgattcttataagcaataaaatgatgttttttccttatgaaaatgatattctctaaaatat |
52762055 |
T |
 |
| Q |
270 |
aaatat |
275 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
52762054 |
aaatat |
52762049 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #173
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| Q |
204 |
tttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttt--tcttatgaaatgatgttttctaaa |
265 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21722423 |
tttaatatgattattataaacaatgaaattatgtttttcttcttatgaaatgatgttttctaaa |
21722486 |
T |
 |
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Target: chr4; HSP #174
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Target Start/End: Original strand, 39512741 - 39512956
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| Q |
57 |
agaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttatta |
156 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||||||||| | | |||| || ||||||| ||||||||| |||||| ||| | || |||||||||||||| | |||||| || |
|
|
| T |
39512741 |
agaaaaaaatttattttctattagttacaattataataattatattttatttttcaaaagtgtcggcaaatcaaaatttaaatttttttaatttttaata |
39512840 |
T |
 |
| Q |
157 |
ctcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgt-aaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgat |
255 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||| || ||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39512841 |
ctcatattgttgaatattgatttttttttg-gataaaatgttaaaaaaattagtatgatttttataaatgatgaaatgatgttttttcttatgaaatgat |
39512939 |
T |
 |
| Q |
256 |
gttttctaaaatataaa |
272 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| |
|
|
| T |
39512940 |
attttttaaaatataaa |
39512956 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #175
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| Q |
92 |
ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || |||||| |||| | |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| || | |
|
|
| T |
42854777 |
ataattaaatcttatttactaaaagtatcgacaaaatagaatttattttttctaaatttttattactcataatagagaataatgattattttttacgata |
42854876 |
T |
 |
| Q |
192 |
aaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
283 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||| | ||| |||| ||| || ||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
42854877 |
aaatgtaaaaaattttgtatgtttcttttaaataattaattgatg--tttttttatgaaatgat-ttttttaaaatataaatgtcgacaaat |
42854965 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #176
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgat |
307 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || ||||| || |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
51944665 |
tatgattcttataaacaatgaa-tgatgcgtttttcttcggaaatcatattttttaaaatataaatgccgataaataactatttatttcataaaattgat |
51944763 |
T |
 |
| Q |
308 |
cgttaatttatatattt |
324 |
Q |
| |
|
| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
51944764 |
cattaatttataaattt |
51944780 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #177
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| Q |
97 |
taaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatg |
196 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| | || ||| | |||||||| | |||| || || ||||||||||||| | |||| |||| ||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
52589194 |
taaatcttatttaccaaaaacgtcaacgcaataaaatttgatttttctgaattcttattactcataatagagaattttgagtattttttacaataaaatg |
52589293 |
T |
 |
| Q |
197 |
taaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatg--gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
52589294 |
taaaaaaattagtatgatttttataaaaaatgaaatgatgttttttttcatataaaatgatattttctaaaatata |
52589369 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #178
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| Q |
205 |
ttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttctt---atgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
54178651 |
ttaatataattcatataaacaatgaaatgatgtttttttttctcatgagatggtgttttctaaaatataaataatgacaaata |
54178733 |
T |
 |
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55 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttat |
154 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||||||| | || || ||||||| || ||||||| |||| | |||||| ||||||||| |||| || ||||| | |
|
|
| T |
595595 |
gaagaaaaagaattgttttctatcattaataattacaataattagatcttatttatcaaag---ttgacgaaataaaatttactttttt-gaatttttgt |
595500 |
T |
 |
| Q |
155 |
tactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatg |
236 |
Q |
| |
|
||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
595499 |
tacatataataaagaatattgattattttttatatgaaaatgttaaaaatttaatatgattcttataaacaataaaatgatg |
595418 |
T |
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167 |
tgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaa |
266 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||| |
|
|
| T |
4150339 |
tgaatattgattatttttttggataaaatgttaaaaaattagtatgaatcttataaagaatgaaatgaaattttttcttataaaataatattttctaaaa |
4150240 |
T |
 |
| Q |
267 |
tataaatattgacaaatacctttttatt |
294 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||| ||||| || |||||| |
|
|
| T |
4150239 |
taaaaaaattgataaatatctctttatt |
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T |
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246 |
atgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatatttt |
325 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||| ||| |||| |||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
30891289 |
atgaaatgatattttctaaaatacaaatatcaacaaatagctctttatttcataaaaatgatagttaatatatagatttt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #182
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Alignment:
| Q |
92 |
ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||||| || ||| | |||||||| | |||| || || ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| | | |
|
|
| T |
38835968 |
ataactaaatcttatttaccaaaaatgtcaacgcaataaaatttgatttttctgaattcttattactcataatagagaattttgattattttttacaata |
38836067 |
T |
 |
| Q |
192 |
aaatgtaaatttt-ttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
38836068 |
aaatgtaaaaaaaattagtatgatttttattaaaaatgaaatgatattttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
38836147 |
T |
 |
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Target: chr4; HSP #183
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| Q |
225 |
aatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgttaatttata |
319 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| || | ||||| |||| ||| |||||| ||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
41759812 |
aatgaaatgatgttttttcttataaaatgatattttctaaaatatatatgtcaacaaacacctatttctttcataaaaaatgatagttaatttata |
41759717 |
T |
 |
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Target: chr4; HSP #184
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaa |
272 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
46564882 |
tatgattcttaaaaagaatgaaatggtgttttttcttatgaaataatattttctaaaatataaa |
46564819 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #185
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Alignment:
| Q |
226 |
atgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaa |
272 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
4540709 |
atgaaatgatgttttttcttatgaaatgatattttttaaaatataaa |
4540663 |
T |
 |
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Target: chr4; HSP #186
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| Q |
240 |
tttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatt |
294 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| || |||||| |
|
|
| T |
5340243 |
tttcttatgaaatgatgttctataaaatataaatatttacaaatagctatttatt |
5340297 |
T |
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Back To:
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Target: chr4; HSP #187
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| Q |
206 |
taatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaa |
272 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
10332869 |
taatatgattcttataaagaatgaaatgaaattttttcttataaaataatattttctaaaatataaa |
10332935 |
T |
 |
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Target: chr4; HSP #188
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| Q |
169 |
aatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaat |
227 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
51832776 |
aatattgattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatatgattcttataaacaat |
51832834 |
T |
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Target: chr4; HSP #189
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| Q |
267 |
tataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||| |||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
22077661 |
tataaatattgataaataactctttatttca-taaaatgatcgttaaattataaatttt-tgaagcaggagtaccggtacac |
22077740 |
T |
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Target: chr4; HSP #190
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| Q |
68 |
tattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaat |
167 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | || || ||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||| |||||| || |||| | ||||||||||||||| | | |
|
|
| T |
27735229 |
tattttctatcatttataattataataattatattttatttttcaaaagtgtcgacaaagcaaaattcaattttttttaacttttattactcataatagt |
27735130 |
T |
 |
| Q |
168 |
gaatattgattatttttt |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27735129 |
gaatattgattatttttt |
27735112 |
T |
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Target: chr4; HSP #191
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| Q |
148 |
tttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaat-gtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttctta |
246 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||| ||| || |||||||| |||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
34792111 |
tttttattactcataatagtgaatattgattatttttttcaataaaatattaaaaaatttagtataattcttataaaaaatgaaattatgttttttctta |
34792012 |
T |
 |
| Q |
247 |
tgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtac |
346 |
Q |
| |
|
|| || | ||||||||||||| || | || ||||| || |||||| ||| ||| | |||||||| || || | ||| ||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
34792011 |
tgggataacattttctaaaatatgaaagtcgataaatatctctttattacataaaaattatcgttaacttgta-aatttatgaaacaggtgtaccggtac |
34791913 |
T |
 |
| Q |
347 |
ac |
348 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
34791912 |
ac |
34791911 |
T |
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Target: chr4; HSP #192
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Query Start/End: Original strand, 191 - 298
Target Start/End: Original strand, 2443557 - 2443664
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| Q |
191 |
aaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgat-ggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaataccttt |
289 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||| ||||| || | |
|
|
| T |
2443557 |
aaaatataaaatttttgatatgattcttataaacaatgagatgatatttttttcttatgaaatgacattttataaaataacaat-ttgaaaaatagctct |
2443655 |
T |
 |
| Q |
290 |
ttatttcat |
298 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
2443656 |
ttatttcat |
2443664 |
T |
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Target: chr4; HSP #193
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59 |
aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattt |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
28910805 |
aaaaataattattttctatcattaacaactataataattaaattt |
28910849 |
T |
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Target: chr4; HSP #194
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaa |
272 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
49144114 |
tatgattcttataaagaatgaaatgatgtttttt--tatgaaataatattttctaaaatataaa |
49144053 |
T |
 |
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| Q |
148 |
tttttattactcataacaatgaatattgattattttttatg-acaaaatgt-aaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttctt |
245 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||| || | ||||||| ||| ||| |||||| |||||||| ||||||||| | ||||| || |
|
|
| T |
52760019 |
tttttaatacccataatagtgaatattgattattttttttggataaaatgttaaaaaaattagtatgattcttataaaggatgaaatgacgttttttttt |
52759920 |
T |
 |
| Q |
246 |
atgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatt |
294 |
Q |
| |
|
|| |||| || |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||| |
|
|
| T |
52759919 |
ataaaataatattttctaaaatataaaagttgataaatatctctttatt |
52759871 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr4; HSP #196
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| Q |
220 |
taaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgttaatttat |
318 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||| || | ||||| |||| ||| |||||| ||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
55722725 |
taaaaaatgaaatgttgttttttcttataaaatgatattttctaaaatatatatgtcaacaaacacctatttctttcataaaaaatgatagttaatttat |
55722824 |
T |
 |
| Q |
319 |
a |
319 |
Q |
| |
|
| |
|
|
| T |
55722825 |
a |
55722825 |
T |
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| Q |
216 |
cttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaat |
314 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||| | ||| |||| || ||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||| |
|
|
| T |
11038208 |
cttataaacaatgaa-tgatgtgttttttttatgaaatgatattttctgagatacaaatgccgataaataactttttatttcataaaattgattgttaat |
11038110 |
T |
 |
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaa |
272 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
22413797 |
tatgattcttaaaaagattgaaatgatgttttttcttatgaaataatattttttaaaatataaa |
22413860 |
T |
 |
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| Q |
148 |
tttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttat |
247 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||| | ||||||||| ||||||||| | ||||||| || ||| |||||| |||||| | ||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
30839473 |
tttttaatacccataatagtgaatattgtttatttttttgaataaaatgttaaaaaattagtatgattcttatacaggatgaaatgacgttttttcttat |
30839374 |
T |
 |
| Q |
248 |
gaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgat |
307 |
Q |
| |
|
|||| || |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||| ||| ||| |||| |
|
|
| T |
30839373 |
aaaataatattttctaaaatataaaagttgataaatatctctttattacataaaaatgat |
30839314 |
T |
 |
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| Q |
92 |
ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||| ||||| | |||||||||| |||| || |||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||| | | |
|
|
| T |
30891423 |
ataattaaatcttatttatcaaaaaggccgacggaataaaatttaatttttctgaatttttagtactcataatagataattttgattattttttacaata |
30891324 |
T |
 |
| Q |
192 |
aaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgat |
235 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30891323 |
aaatgtaaaaaaattagtatgatttttataaacaatgaaatgat |
30891280 |
T |
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ttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||| ||||||||| |||||| | ||| |||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
50189298 |
ttttctaaaatataaatgccgacaaatatttatttatttcataaaattgatcgttagtttataga-tttatgaagcaagagtactggtacac |
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T |
 |
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gaatattgattattttttatgacaaaatgta-aattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaa |
266 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| | |||||||| || |||| |||||| || |||| |||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
51436025 |
gaattttgattattttttacaataaaatgtagaaaaatttagtatgatttttctaaaaaatgaaatgatgttttttcttataaaatggtattttctaaaa |
51435926 |
T |
 |
| Q |
267 |
tata |
270 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
51435925 |
tata |
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T |
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tttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttct--t |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||| | |||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| | | |
|
|
| T |
27539090 |
tttttattactcataatagagaactttgagtattttttacaataaaatgtaaaaaaattagtatgatttttataaaaaatgaaatgatgttttttttcat |
27539189 |
T |
 |
| Q |
246 |
atgaaatgatgttttctaaaatataaatat |
275 |
Q |
| |
|
|| ||||||| |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
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ataaaatgatattttctaaaatatatatat |
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T |
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ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatat |
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Q |
| |
|
||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
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| |
|
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|
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #207
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Query Start/End: Original strand, 209 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 48254110 - 48254012
Alignment:
| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgat |
307 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||| ||| ||| |||| |
|
|
| T |
48254110 |
tatgattcttataaaggatgaaatgacattttttcttataaaataatattttctaaaatataaaagttgataaatatctctttattacataaaaatgat |
48254012 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #208
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 53695685 - 53695591
Alignment:
| Q |
92 |
ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattatttttta |
186 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||| ||||||| | |||||||| |||||||||| |||| | |||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
53695685 |
ataataaaatcttattaaccaaaaacgtcgacgaaataaaatttaatttttctgtatttttaatactcataatagagaattttgattatttttta |
53695591 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #209
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 273
Target Start/End: Original strand, 18362036 - 18362092
Alignment:
| Q |
219 |
ataaacaatgaaatgatggtttt--tcttatgaaatgatgttttctaaaatataaat |
273 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
18362036 |
ataaacaatgaaatgatgttttttttcttatgaaataatattttctaagatataaat |
18362092 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #210
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 185
Target Start/End: Original strand, 24347012 - 24347049
Alignment:
| Q |
148 |
tttttattactcataacaatgaatattgattatttttt |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24347012 |
tttttattactcataatagtgaatattgattatttttt |
24347049 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #211
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 260
Target Start/End: Original strand, 28967764 - 28967820
Alignment:
| Q |
204 |
tttaatatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgaaatgatgtttt |
260 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
28967764 |
tttattatgattcttataaacaatgaa-tgatgtgtttttcttatgaaatgatatttt |
28967820 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #212
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 36600891 - 36600835
Alignment:
| Q |
219 |
ataaacaatgaaatgatggttttt--cttatgaaatgatgttttctaaaatataaat |
273 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
36600891 |
ataaacaatgaaatgatgttttttttcttatgaaataatattttctaagatataaat |
36600835 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #213
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 10463023 - 10462919
Alignment:
| Q |
180 |
ttttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgac |
279 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||| || ||||| || ||| ||| || ||| |
|
|
| T |
10463023 |
ttttttacgataaaatgtaaaagatttagtatgattcttttaaacaatgaaatgatattttttgttattaaattatattttcaaagatacaaaaatagac |
10462924 |
T |
 |
| Q |
280 |
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284 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
10462923 |
aaata |
10462919 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #214
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 116
Target Start/End: Original strand, 19842525 - 19842585
Alignment:
| Q |
56 |
aagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaag |
116 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19842525 |
aagaaaaagaatttttttttatcattgacagttttaataattaaattttatttaccaaaag |
19842585 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #215
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 31681452 - 31681508
Alignment:
| Q |
238 |
tttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatt |
294 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| || |||||| |
|
|
| T |
31681452 |
tttttcttatgaaatgacattttttaaaatataaatatcaacaaataactctttatt |
31681508 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #216
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 70 - 126
Target Start/End: Original strand, 51832718 - 51832774
Alignment:
| Q |
70 |
ttttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaa |
126 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| || | |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
51832718 |
ttttctattattgacaattataaaaattaaatcttatttaccaaaagcgtcgacgaa |
51832774 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #217
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 238 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 55060392 - 55060312
Alignment:
| Q |
238 |
tttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttat |
318 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||| || | |||| ||| ||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
55060392 |
ttttttttatgaaatgatattttctaaaatataaaagtcgacagatagctctatattacataaaaatgattgttaatttat |
55060312 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 165)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 37725580 - 37725939
Alignment:
| Q |
1 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37725580 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
37725679 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
200 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37725680 |
ttttatataccaaaagcttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
37725779 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
300 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37725780 |
ttttgtaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
37725879 |
T |
 |
| Q |
301 |
aagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
360 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37725880 |
aagtgatctttagtttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
37725939 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 36192348 - 36191993
Alignment:
| Q |
1 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36192348 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
36192249 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
200 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36192248 |
ttttatataccaaaagcttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
36192149 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
300 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36192148 |
ttttgtaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
36192049 |
T |
 |
| Q |
301 |
aagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaatt |
356 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36192048 |
aagtgatctttaatttatatattttgtaaaacaaaagtaccggtacactcaaaatt |
36191993 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 2317216 - 2316857
Alignment:
| Q |
1 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2317216 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcataaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
2317117 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
200 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2317116 |
ttttatatatcaaaagcttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaatattaattattttttatgacaaaatgtaaa |
2317017 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
300 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2317016 |
ttttgtaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
2316917 |
T |
 |
| Q |
301 |
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360 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2316916 |
aagtgatctttaatttatatattttatgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
2316857 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 36947860 - 36947501
Alignment:
| Q |
1 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36947860 |
tgggtgtatctgtacaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
36947761 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
200 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36947760 |
ttttatataccaaaagtttcgaagaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
36947661 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
300 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
36947660 |
ttttgtaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacttttttatttcatta |
36947561 |
T |
 |
| Q |
301 |
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360 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36947560 |
aagtgatctttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
36947501 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 7504402 - 7504042
Alignment:
| Q |
1 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnn-gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaa |
99 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7504402 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaatcagttgttttttttgaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaa |
7504303 |
T |
 |
| Q |
100 |
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199 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7504302 |
attttatttaccaaaagcttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaa |
7504203 |
T |
 |
| Q |
200 |
atttttt-aatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat |
298 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7504202 |
ttttttttaatataatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat |
7504103 |
T |
 |
| Q |
299 |
taaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtg |
359 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7504102 |
taaagtgatcgttaatttataaattttgtgcaacaagagtaccggtacactcaaaattgtg |
7504042 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 40533280 - 40533639
Alignment:
| Q |
1 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40533280 |
tgggtgtatcggtacaccaaatcgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
40533379 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
200 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40533380 |
ttttatataccaaaagtttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaataatgattatttgttatgacaaaatgtaaa |
40533479 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
300 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40533480 |
ttttgtaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
40533579 |
T |
 |
| Q |
301 |
aagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
360 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40533580 |
aagtgatctttaatttatatattttatgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
40533639 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 3724319 - 3723960
Alignment:
| Q |
1 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3724319 |
tgggtgtatcggtataccaagttgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
3724220 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
200 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3724219 |
ttttatataccaaaagtttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
3724120 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
300 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
3724119 |
ttttgtaatatgatccttataaataatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacttttttatttcatta |
3724020 |
T |
 |
| Q |
301 |
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360 |
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3723960 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 3 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 18009330 - 18008976
Alignment:
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Q |
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Q |
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358 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 5 - 360
Target Start/End: Original strand, 45555415 - 45555770
Alignment:
| Q |
5 |
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104 |
Q |
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| Q |
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204 |
Q |
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304 |
Q |
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Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 1859956 - 1860314
Alignment:
| Q |
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Q |
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1860055 |
T |
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| Q |
101 |
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Q |
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| Q |
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300 |
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1860255 |
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Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 5 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 13568586 - 13568231
Alignment:
| Q |
5 |
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104 |
Q |
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T |
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| Q |
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204 |
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| T |
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13568387 |
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205 |
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304 |
Q |
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| T |
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13568287 |
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305 |
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360 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Original strand, 6657472 - 6657829
Alignment:
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Q |
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200 |
Q |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 16815228 - 16814870
Alignment:
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 33424111 - 33423751
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Q |
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199 |
Q |
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T |
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| Q |
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299 |
Q |
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| T |
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T |
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360 |
Q |
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33423811 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 28394097 - 28394456
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Q |
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198 |
Q |
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T |
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298 |
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360 |
Q |
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| T |
28394395 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 39879297 - 39878938
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Q |
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| Q |
201 |
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300 |
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39879097 |
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39878998 |
T |
 |
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301 |
aagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
360 |
Q |
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| T |
39878997 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 5 - 356
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Q |
| |
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Q |
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26738165 |
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T |
 |
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304 |
Q |
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26738265 |
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305 |
gatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaatt |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Original strand, 41839683 - 41840038
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41839882 |
T |
 |
| Q |
201 |
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300 |
Q |
| |
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| T |
41839883 |
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41839982 |
T |
 |
| Q |
301 |
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356 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41839983 |
aagtgatcgttaatttataaatttggtacaacaagagtaccggtacactcaaaatt |
41840038 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 3 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 5085214 - 5084862
Alignment:
| Q |
3 |
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102 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5085214 |
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5085116 |
T |
 |
| Q |
103 |
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202 |
Q |
| |
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|
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| T |
5085115 |
ttatatatcaaaagtttcgacaaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaataaatattgattattttttatgacaaaatgtaaatt |
5085016 |
T |
 |
| Q |
203 |
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302 |
Q |
| |
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| T |
5085015 |
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5084916 |
T |
 |
| Q |
303 |
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356 |
Q |
| |
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|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
5084915 |
gtgatctttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaatt |
5084862 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 18576689 - 18576319
Alignment:
| Q |
1 |
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89 |
Q |
| |
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||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
18576689 |
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18576590 |
T |
 |
| Q |
90 |
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189 |
Q |
| |
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||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
18576589 |
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18576490 |
T |
 |
| Q |
190 |
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289 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
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18576390 |
T |
 |
| Q |
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360 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18576389 |
ttatttcattaaagtgatctttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
18576319 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 10711306 - 10711664
Alignment:
| Q |
1 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
100 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10711306 |
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10711405 |
T |
 |
| Q |
101 |
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200 |
Q |
| |
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|
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| T |
10711406 |
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10711505 |
T |
 |
| Q |
201 |
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300 |
Q |
| |
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|
| T |
10711506 |
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10711604 |
T |
 |
| Q |
301 |
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360 |
Q |
| |
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|
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| T |
10711605 |
aagtgatctttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacattcaaaattgtga |
10711664 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 5 - 360
Target Start/End: Original strand, 35292543 - 35292899
Alignment:
| Q |
5 |
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104 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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tgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattattt-ctatcattgacaactaagataattaaatttt |
35292641 |
T |
 |
| Q |
105 |
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203 |
Q |
| |
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| T |
35292642 |
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35292741 |
T |
 |
| Q |
204 |
tttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttctt-atgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaa |
302 |
Q |
| |
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| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
35292742 |
tgtaatatgatccttataaccaatgaaatgatggtttttttttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaa |
35292841 |
T |
 |
| Q |
303 |
gtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
360 |
Q |
| |
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||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
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| T |
35292842 |
gtgatatttaatttatatattttatgaaacaagagtaccggtacacttaaaattgtga |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 3 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 36049842 - 36049483
Alignment:
| Q |
3 |
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36049842 |
ggtgtatcggtacaccaagtcgtaatattagtaataaatgaattattttttttaaaaaaaaataattattttctatcatttgacaactaagataattaaa |
36049743 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
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|
| T |
36049742 |
ttttatttaccaaaagcttcgacaaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtcaa |
36049643 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36049642 |
ttttttaatatgatccttataaacaatgaaataatggtttttcttatgaaatgatattttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
36049543 |
T |
 |
| Q |
301 |
aagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
360 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
36049542 |
aagtgattattaatttataaattttgtaaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 12 - 360
Target Start/End: Original strand, 19635682 - 19636023
Alignment:
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Q |
| |
|
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|
|
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T |
 |
| Q |
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211 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
19635777 |
aaaaacttcaacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaatattgat--ttttttatgacaaaatgtaaattttgtaatat |
19635874 |
T |
 |
| Q |
212 |
gatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgtt |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
19635875 |
gatccttataaacaatgaaatgatgatttttcttatgaaatgatattttttaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcttt |
19635974 |
T |
 |
| Q |
312 |
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360 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19635975 |
aatttatatattttgtgaaacaaaagtatcggtacactcaaaattgtga |
19636023 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 12 - 360
Target Start/End: Original strand, 19834275 - 19834616
Alignment:
| Q |
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gtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttacc |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
19834275 |
gtacaccaagtcgtaaaattattaataaatgaattatttttttgaaaaaaaataattattttctatcattgacgac-----taattaaattttatatacc |
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T |
 |
| Q |
112 |
aaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatat |
211 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
19834370 |
aaaaacttcaacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaatattgat--ttttttatgacaaaatgtaaattttgtaatat |
19834467 |
T |
 |
| Q |
212 |
gatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgtt |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
19834468 |
gatccttataaacaatgaaatgatgatttttcttatgaaatgatattttttaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcttt |
19834567 |
T |
 |
| Q |
312 |
aatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
360 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19834568 |
aatttatatattttgtgaaacaaaagtatcggtacactcaaaattgtga |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 21425241 - 21425586
Alignment:
| Q |
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tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21425241 |
tgggtgtatcggtacaccaattcgttaaattaataataaattagttgttttttataagaaaaataattattttctatcattgacaactataataattaaa |
21425340 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21425341 |
ttttatttaccaaaagcttcgacggaataaaatttaatttttacaaatttttattac--ataacaatgattattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
21425438 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttt-tcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatt |
299 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
21425439 |
ttttt-aatatgatccttgtaaacaatgaa-tgatgtttttttcttatgatatgacgttttctaaaatataaatattgacaaataactttttatttcaca |
21425536 |
T |
 |
| Q |
300 |
aaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacact |
349 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21425537 |
aaaatgatcgttaatttataagttttgtgaaacaagagtatcggtacact |
21425586 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
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Target Start/End: Complemental strand, 16854332 - 16854150
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Q |
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|||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
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|
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tattttttatgataaaatgtaaattttgtaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatattttctaaaatataaatattg |
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T |
 |
| Q |
278 |
acaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
360 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16854232 |
acaaatacctttttatttcattaaagtgatctttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
16854150 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 202 - 360
Target Start/End: Original strand, 21836515 - 21836673
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tttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaa |
301 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
21836515 |
tttttaatatgatcattataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatattttctaaaatataaatattgaaaaatacatttttatttcattaa |
21836614 |
T |
 |
| Q |
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agtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
360 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
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21836615 |
agtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagcaccggtacactcaaaattgtga |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 55 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 40288028 - 40287738
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154 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||| |
|
|
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40288028 |
gaagaaaaagaattattttctatcattcacaattataataatcaaatcttatttaccaaaagcttcgacgaaataaaatttactttttttgtatttttat |
40287929 |
T |
 |
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tactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatga |
254 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
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tactcataataaagaatattgattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatatgattcttataaacaacgaaatgat-gtttttcttataaaatga |
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T |
 |
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tgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| || | |||||||| || ||||| |
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|
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 56 - 349
Target Start/End: Original strand, 37989114 - 37989404
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| Q |
56 |
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349 |
Q |
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37989404 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #31
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Target Start/End: Complemental strand, 2283480 - 2283220
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161 |
Q |
| |
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|
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| T |
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2283381 |
T |
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| Q |
162 |
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261 |
Q |
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| T |
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T |
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324 |
Q |
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| T |
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2283220 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 168 - 349
Target Start/End: Original strand, 14820089 - 14820270
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267 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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| Q |
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349 |
Q |
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| T |
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14820270 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 70 - 348
Target Start/End: Original strand, 25740084 - 25740361
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169 |
Q |
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| T |
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Q |
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T |
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348 |
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| T |
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25740361 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 70 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 15426331 - 15426055
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| Q |
70 |
ttttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatga |
169 |
Q |
| |
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| T |
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15426055 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 55 - 348
Target Start/End: Original strand, 12071238 - 12071528
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| Q |
55 |
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154 |
Q |
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| T |
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T |
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| T |
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12071437 |
T |
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| Q |
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348 |
Q |
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| T |
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12071528 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 55 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 42641174 - 42640885
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| Q |
55 |
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153 |
Q |
| |
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||||||||| ||| ||||||||||||||| || || ||| |||||| |||||||||||||| |||| || |||||||| || |||| || |||||| |
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|
| T |
42641174 |
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42641075 |
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| Q |
154 |
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252 |
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253 |
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345 |
Q |
| |
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42640885 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 60 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 2307596 - 2307331
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159 |
Q |
| |
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|
| T |
2307596 |
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2307497 |
T |
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| Q |
160 |
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257 |
Q |
| |
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| T |
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2307397 |
T |
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| Q |
258 |
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324 |
Q |
| |
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|
| T |
2307396 |
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2307331 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 38073430 - 38073138
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| Q |
55 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaa-gtaaaatttaaattttaagagttttta |
153 |
Q |
| |
|
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|
| T |
38073430 |
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38073331 |
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252 |
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| |
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| T |
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38073231 |
T |
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| Q |
253 |
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348 |
Q |
| |
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| T |
38073230 |
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38073138 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 490111 - 489956
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tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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490111 |
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490013 |
T |
 |
| Q |
101 |
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157 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
490012 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 56 - 324
Target Start/End: Original strand, 5615464 - 5615735
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| Q |
56 |
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152 |
Q |
| |
|
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| T |
5615464 |
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5615563 |
T |
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153 |
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251 |
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|
|
| T |
5615564 |
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5615663 |
T |
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| Q |
252 |
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324 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || ||| || | ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
5615664 |
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5615735 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 55 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 15206064 - 15205797
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gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttat |
154 |
Q |
| |
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||||||||| ||| || |||||||||| | | || |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||| || |||| || ||||||| |
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|
| T |
15206064 |
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15205965 |
T |
 |
| Q |
155 |
tactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatga |
254 |
Q |
| |
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| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| | || || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
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| T |
15205964 |
ttctcataacaaagaatattgattattttt-atgcgaaaatcttaaaaaatttatatgattcttataaacaatgaaatgatattttttcttatgaaatga |
15205866 |
T |
 |
| Q |
255 |
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324 |
Q |
| |
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|
| T |
15205865 |
tgttttctaaaatataaacattgacaaatacctctttacttca-taaaatgatcgttaatttataaattt |
15205797 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 59 - 324
Target Start/End: Original strand, 7069280 - 7069546
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59 |
aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattact |
158 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||| |||| ||| ||||||||| |||| || |||||||| || |
|
|
| T |
7069280 |
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7069379 |
T |
 |
| Q |
159 |
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256 |
Q |
| |
|
||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| || |
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|
| T |
7069380 |
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7069479 |
T |
 |
| Q |
257 |
ttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattt |
324 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
7069480 |
ttttctaaaatataaataatgacaaataacaacttatttca-taaaatgatcattaatttataaattt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #43
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Query Start/End: Original strand, 2 - 153
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2 |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21836366 |
gggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattactattttctatcattgacaactaagataatta |
21836465 |
T |
 |
| Q |
99 |
aattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagttttta |
153 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
21836466 |
aattttatttaccaaaagcttcgacaaaataaaatttaatttttaagaattttta |
21836520 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #44
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Target Start/End: Complemental strand, 28318361 - 28318095
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Q |
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T |
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159 |
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Q |
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| T |
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T |
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Q |
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28318095 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
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Target Start/End: Original strand, 44068223 - 44068389
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280 |
Q |
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T |
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349 |
Q |
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T |
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Back To:
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Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 59 - 324
Target Start/End: Original strand, 4108393 - 4108658
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158 |
Q |
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324 |
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4108658 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 55 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 25713040 - 25712772
Alignment:
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154 |
Q |
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Q |
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325 |
Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 59 - 284
Target Start/End: Original strand, 33429219 - 33429446
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158 |
Q |
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256 |
Q |
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| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 55 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 19268887 - 19268628
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153 |
Q |
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19268628 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 58 - 324
Target Start/End: Original strand, 43359189 - 43359455
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Q |
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256 |
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324 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 59 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 36428827 - 36428599
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158 |
Q |
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255 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 56 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 45690823 - 45690554
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Q |
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324 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 38600134 - 38599890
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gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaa-attttaagagttttta |
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253 |
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| T |
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298 |
Q |
| |
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38599934 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 59 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 8504346 - 8504082
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T |
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257 |
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T |
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258 |
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324 |
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| T |
8504147 |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 59 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 15362789 - 15362501
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Q |
| |
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| T |
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T |
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257 |
Q |
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| T |
15362689 |
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T |
 |
| Q |
258 |
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348 |
Q |
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15362589 |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 33716672 - 33716530
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T |
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143 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #57
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| |
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 |
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tcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgaaatgatg |
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tcataatgaagaatattgattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatataattcatataaacaatgaaatagtgtttttttctcatgatatggtg |
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| T |
41184773 |
ttttctaaaatataaataataacaaataacaacttatttca-taaaatgatcattaatttataaattt |
41184839 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #58
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Target Start/End: Original strand, 16718722 - 16718939
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158 |
Q |
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T |
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256 |
Q |
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16718921 |
T |
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274 |
Q |
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| T |
16718922 |
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T |
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Target: chr2; HSP #59
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Q |
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14820044 |
T |
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| Q |
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143 |
Q |
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Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
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Target Start/End: Original strand, 40810566 - 40810793
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Q |
| |
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T |
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219 |
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318 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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| Q |
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348 |
Q |
| |
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| || || |||| || |||||||||||||| |
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40810765 |
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T |
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Target: chr2; HSP #61
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Target Start/End: Original strand, 7366593 - 7366854
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158 |
Q |
| |
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T |
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| Q |
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255 |
Q |
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7366786 |
T |
 |
| Q |
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324 |
Q |
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7366787 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #62
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Query Start/End: Original strand, 55 - 348
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Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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248 |
Q |
| |
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| T |
8362630 |
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8362531 |
T |
 |
| Q |
249 |
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348 |
Q |
| |
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| T |
8362530 |
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T |
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Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 55 - 318
Target Start/End: Original strand, 12182643 - 12182904
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Q |
| |
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T |
 |
| Q |
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254 |
Q |
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| T |
12182743 |
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12182841 |
T |
 |
| Q |
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318 |
Q |
| |
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12182842 |
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T |
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Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 55 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 17809352 - 17809129
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Q |
| |
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T |
 |
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254 |
Q |
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| T |
17809252 |
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17809153 |
T |
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| Q |
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Q |
| |
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17809152 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #65
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attattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaa-gagtttttattactcataac |
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37782060 |
T |
 |
| Q |
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236 |
Q |
| |
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| T |
37782059 |
aaagaatattgattatttttaataagaaaatgttaaaattttaatatgattcttataaacaatgaaatgatg |
37781988 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #66
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Query Start/End: Original strand, 70 - 298
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Q |
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| T |
39089924 |
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| T |
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39089725 |
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298 |
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| |
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| T |
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39089696 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #67
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Target Start/End: Complemental strand, 22622739 - 22622498
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155 |
Q |
| |
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| T |
22622739 |
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22622641 |
T |
 |
| Q |
156 |
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254 |
Q |
| |
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| T |
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22622542 |
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298 |
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| T |
22622541 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #68
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Q |
| |
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| T |
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2859559 |
T |
 |
| Q |
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236 |
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| |
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| T |
2859558 |
cataataaagaatattgattattttttataagaaaatgttaaaaaatttaatatgattcttacaaacaacgaaatgatg |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
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| |
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T |
 |
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250 |
Q |
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| T |
11986414 |
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11986315 |
T |
 |
| Q |
251 |
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274 |
Q |
| |
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| T |
11986314 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #70
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tctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatatttt |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #71
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #72
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ataattaaatcttatttatcaaaaacatcgacgaaataaaattttatttttctgaatttttagtactcgtaatagagaattttgattattttttacaata |
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T |
 |
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atatgtaaaaaagaaaattagtatgatttttataaacaatgaaatgatgtttttttcttatgaaatgatattttctaaaatataaatatcaacaaatagc |
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T |
 |
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Q |
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6438263 |
tttttatttcataaaaattatagttaatttataaatttt-tgaattaagagtaccggcacac |
6438203 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 70 - 325
Target Start/End: Original strand, 12002447 - 12002697
Alignment:
| Q |
70 |
ttttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaag--agtttttattactcataacaat |
167 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| | || ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
12002447 |
ttttttatcattgacaattataataattaaatcttatttaccaaaaacgtcaacgaaataaaatttacttttttttttaatttttattacttataacaaa |
12002546 |
T |
 |
| Q |
168 |
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267 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
12002547 |
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12002641 |
T |
 |
| Q |
268 |
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325 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| || ||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
12002642 |
ataaatattga-taataactctttatttca-taaaatgatcgttaaattataaatttt |
12002697 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 92 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 34438473 - 34438248
Alignment:
| Q |
92 |
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191 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| | |||| ||| |||||||||| |||| || |||||| ||||||||| | || | || ||||||||||| | | |
|
|
| T |
34438473 |
ataattaaatcttatttaccaaaaacatcgaggaaataaaatttaatttttctgaatttttagtactcataatagagagtttttattattttttacaata |
34438374 |
T |
 |
| Q |
192 |
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291 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||| |||| | |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |
|
|
| T |
34438373 |
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34438274 |
T |
 |
| Q |
292 |
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317 |
Q |
| |
|
||| ||| ||| | || ||||||||| |
|
|
| T |
34438273 |
attccataaaaataatagttaattta |
34438248 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 44068078 - 44068212
Alignment:
| Q |
1 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
44068078 |
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44068176 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaattta |
136 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
44068177 |
ttttatttatcaaaaacttcgacgaaataaaattta |
44068212 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 208 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 1580418 - 1580278
Alignment:
| Q |
208 |
atatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtga |
306 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||| | | |
|
|
| T |
1580418 |
atatgattcttataaacaatgaaataatgttttttcttatgaaatgatgttctataaaatataaatattgacaaatagctatttattacataaaaaatta |
1580319 |
T |
 |
| Q |
307 |
tcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| | || |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1580318 |
tcgttaattcata-aaattatgaagcaagagtaccggtacac |
1580278 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 92 - 325
Target Start/End: Original strand, 12547482 - 12547720
Alignment:
| Q |
92 |
ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||| | |||| ||| |||||||| | |||| || |||||| ||||| ||| | |||| |||||||||||||| | | |
|
|
| T |
12547482 |
ataattaaatcttatttatcaaaaacatcgaagaaataaaatttgatttttctgaatttttagtactcgtaatagagaattttgattattttttacaata |
12547581 |
T |
 |
| Q |
192 |
aaatgtaaatttt-ttaatatgatccttataaacaatgaaatgatg----gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacc |
286 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| | |
|
|
| T |
12547582 |
aaatgtaaaaaaaattagtatgatttttataaacaatgaaatgatgttttttttttcttatgaaatgatattttctaaaatataaatatcaataaatagc |
12547681 |
T |
 |
| Q |
287 |
tttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatatttt |
325 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| | || ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
12547682 |
tttttatttcataaaaataatagttaatttataaatttt |
12547720 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 73 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 38030863 - 38030670
Alignment:
| Q |
73 |
tctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaata |
172 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || | |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||| | || || |
|
|
| T |
38030863 |
tctatcatttacaattataaaaattaaatcttatttaccaaaagtgtcgacgaaataaaatttaatttttttgaatttttattactcataatgaagatta |
38030764 |
T |
 |
| Q |
173 |
ttgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttct---tatgaaatgatgttttctaaa |
265 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38030763 |
ttgattattttttatga-gtaatgttaaaaatttaatatgattattataaacaatgaaattat-gtttttctttatatgaaatgatgttttctaaa |
38030670 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 91 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 6513553 - 6513323
Alignment:
| Q |
91 |
gataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgac |
190 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||| || |||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||| | |
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|
| T |
6513553 |
gataattaaatcttatttaccaaaaacgtcgacgaaataaaatttaatttttctgaatttttagtactcataatagagaattttgattattttttacaat |
6513454 |
T |
 |
| Q |
191 |
aaaatgt-aaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatga---tggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacc |
286 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||| |||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
6513453 |
aaaatgtaaaaaaagttagtatgattttgataaacaatgaaatgatatttttttttcttatgaaatgacattttctaaaatataaatatcaacaaatagc |
6513354 |
T |
 |
| Q |
287 |
tttttatttcattaaagtgatcgttaattta |
317 |
Q |
| |
|
| |||||| ||| ||| | || ||||||||| |
|
|
| T |
6513353 |
tctttattccataaaaataatagttaattta |
6513323 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 59 - 324
Target Start/End: Original strand, 11088302 - 11088577
Alignment:
| Q |
59 |
aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattact |
158 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | || ||||| || || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||| || ||| ||||||| |
|
|
| T |
11088302 |
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11088401 |
T |
 |
| Q |
159 |
cataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatga--------- |
249 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||| |
|
|
| T |
11088402 |
cataataaggaatattgcttatattttatgagaaaatgttgaaaatttaatatgatttttataaacaatgaaattat-gtttttctaatgattatttttt |
11088500 |
T |
 |
| Q |
250 |
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324 |
Q |
| |
|
||| ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
11088501 |
aatatggttttctgaaatataaatattgacaaatagtaactttttatttca-taaaatgattgttaatttataaattt |
11088577 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 92 - 317
Target Start/End: Original strand, 11598233 - 11598460
Alignment:
| Q |
92 |
ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| ||||||| | || ||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||| | | |
|
|
| T |
11598233 |
ataattaaatcttattaaccaaaaacgtctacgaaataaaatttaatttttctgagtttttagtactcataatagagaattttgattattttttacaata |
11598332 |
T |
 |
| Q |
192 |
aaatgt-aaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaataccttt |
289 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| || | |
|
|
| T |
11598333 |
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11598432 |
T |
 |
| Q |
290 |
ttatttcattaaagtgatcgttaattta |
317 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||| | || ||||||||| |
|
|
| T |
11598433 |
ttattccataaaaataatagttaattta |
11598460 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 68 - 324
Target Start/End: Original strand, 44544140 - 44544398
Alignment:
| Q |
68 |
tattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaat |
167 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | || || ||||||| ||||||||| |||||| ||| | ||| |||||| || |||| | |||||||||||||||| | | |
|
|
| T |
44544140 |
tattttctatcatttataattataataattatattttatttttcaaaagtgtcggcaaagcaaaattcaattttttttaatttttattactcataatagt |
44544239 |
T |
 |
| Q |
168 |
gaatattgattattttttatgacaaaatgt--aaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaa |
265 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||||| || || |||||||| |
|
|
| T |
44544240 |
gaatattgattatttttttcaataaaatgttaaaattttttagtataattcttataaaaaatgaaatgatgttttttcttatgagataatattttctaag |
44544339 |
T |
 |
| Q |
266 |
atataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattt |
324 |
Q |
| |
|
||| ||| | || ||||| || ||||| ||||||| | |||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
44544340 |
atacaaaagtcgataaatatctctttatcacattaaaattatcgttaacttatagattt |
44544398 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 148 - 318
Target Start/End: Original strand, 22594913 - 22595082
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| Q |
148 |
tttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttat |
247 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| | || ||||| |||||||||| | |||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
22594913 |
tttttattacttataatagtgtatatttattattttttca-ataaaatgtaaactaattagtatgattcttataaacaatgaaatgatattttttcttat |
22595011 |
T |
 |
| Q |
248 |
gaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttat |
318 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||||||||| | |||||||| |||||| || ||| ||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
22595012 |
gaaataatattttctaaaatataaaagtcgacaaatagcttttttttacataaaaatgatcgttaacttat |
22595082 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 55 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 41555748 - 41555463
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| Q |
55 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttat |
154 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||||||| |||| || ||||||| || ||| ||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||| | ||||| | |
|
|
| T |
41555748 |
gaagaaaaaaaattgttttctatcattaacaattacaataattagatcttagttaccgaaagtgtcgacgaaataaaatttacatttttttaatttttgt |
41555649 |
T |
 |
| Q |
155 |
tactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatga |
254 |
Q |
| |
|
||| ||||||| ||||||| |||| | || ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||| || |
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|
| T |
41555648 |
tacatataacaaagaatatttattact------gagaaaatgttaaaaatttaatatgattcttataaccaatgaaatgatgtctattcttataaaacga |
41555555 |
T |
 |
| Q |
255 |
tgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| | |||||||| || || || || |||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
41555554 |
tgtcttataaaatataaatattgataaataactctttatttca-taaaataatcgttaaattgtaaatatt-tgaagcaggagtaccggtacac |
41555463 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 216 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 40946925 - 40946821
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| Q |
216 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgttaat |
314 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
40946925 |
cttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgaaataatgttctataaaatataaatattgaaaaatagctatttattacataaaaaatgatcgttaat |
40946826 |
T |
 |
| Q |
315 |
ttata |
319 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
40946825 |
ttata |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgat |
307 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||| |||| |
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|
| T |
27400966 |
tatgattcttataaataatgaaatgatgttttttcttatgaaatggtgttctataaaatataaatatttacaaataattatttatttcataaaaaatgat |
27401065 |
T |
 |
| Q |
308 |
cgttaatttata |
319 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
27401066 |
cgttaatttata |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #87
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Query Start/End: Original strand, 59 - 236
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59 |
aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaa-attttaagagtttttattac |
157 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||| || ||| ||||| |||| ||| |||| |||||||| | ||||| || ||||| |||| |
|
|
| T |
34852655 |
aaaaaaaattattttctatcattaacaattacaataattagatcttagttaccgaaagtgtcggcgaaataaaattttacattttttgaatttttgttac |
34852556 |
T |
 |
| Q |
158 |
tcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatg |
236 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34852555 |
atataacaaagaatatttattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatatgatttttataaacaatgaaatgatg |
34852477 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 43690308 - 43690083
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| Q |
92 |
ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||| |||| || |||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||| | | |
|
|
| T |
43690308 |
ataattaaattttatttaccaaaatcgtcgaagaaataaaatttaatttttctgaatttttagtactcataatagagaattttgattattttttacaata |
43690209 |
T |
 |
| Q |
192 |
aaatgt-aaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttt |
290 |
Q |
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43690110 |
T |
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317 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
43690109 |
tattccataaaaataattgttaattta |
43690083 |
T |
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Target: chr2; HSP #89
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Target Start/End: Original strand, 3911322 - 3911526
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167 |
Q |
| |
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| T |
3911322 |
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3911420 |
T |
 |
| Q |
168 |
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266 |
Q |
| |
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| T |
3911421 |
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3911520 |
T |
 |
| Q |
267 |
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272 |
Q |
| |
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| T |
3911521 |
tataaa |
3911526 |
T |
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Target: chr2; HSP #90
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314 |
Q |
| |
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| T |
35895474 |
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35895375 |
T |
 |
| Q |
315 |
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348 |
Q |
| |
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||||| | || |||| || |||||||||||||| |
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|
| T |
35895374 |
ttata-aaattatgaagcaggagtaccggtacac |
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T |
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158 |
Q |
| |
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| T |
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15176528 |
T |
 |
| Q |
159 |
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196 |
Q |
| |
|
||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||| |
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|
| T |
15176529 |
cataatgaagaatattgattattatttttatgagaaaatg |
15176568 |
T |
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Target: chr2; HSP #92
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284 |
Q |
| |
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|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
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| T |
7673465 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaata |
7673390 |
T |
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Target: chr2; HSP #93
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Query Start/End: Original strand, 209 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 9122326 - 9122251
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
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|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
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|
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9122326 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaata |
9122251 |
T |
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Target: chr2; HSP #94
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Query Start/End: Original strand, 209 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 17451452 - 17451377
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| Q |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
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| T |
17451452 |
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17451377 |
T |
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Target: chr2; HSP #95
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
21404368 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaata |
21404293 |
T |
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Target: chr2; HSP #96
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tttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatat |
275 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |
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| T |
25332520 |
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25332449 |
T |
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Target: chr2; HSP #97
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Query Start/End: Original strand, 209 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 43440165 - 43440090
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |
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|
| T |
43440165 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttttataaaatataaatattgataaata |
43440090 |
T |
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Target: chr2; HSP #98
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Target Start/End: Complemental strand, 20212442 - 20212184
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191 |
Q |
| |
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|||||||||| ||||| ||||||| | |||||||| |||||||||| |||| || |||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||| | | | |
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|
| T |
20212442 |
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20212344 |
T |
 |
| Q |
192 |
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287 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |
|
|
| T |
20212343 |
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20212244 |
T |
 |
| Q |
288 |
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348 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
20212243 |
ctttattccataaaaataatagttaatttaaagatttt-tgaagtaggagtaccggtacac |
20212184 |
T |
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Target: chr2; HSP #99
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68 |
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167 |
Q |
| |
|
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|
| T |
36430924 |
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36430825 |
T |
 |
| Q |
168 |
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265 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | |||||| |||| |||| ||| | || ||||||| |||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||| |
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| T |
36430824 |
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36430725 |
T |
 |
| Q |
266 |
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272 |
Q |
| |
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||||||| |
|
|
| T |
36430724 |
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36430718 |
T |
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Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
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Target Start/End: Original strand, 39307097 - 39307311
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aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattact |
158 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||||||| | || || ||||||| ||||||||| |||||| ||| | ||| |||||| ||||||| | ||||||||||| |
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|
| T |
39307097 |
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39307196 |
T |
 |
| Q |
159 |
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257 |
Q |
| |
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||||| | ||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||| ||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || || | |
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| T |
39307197 |
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39307296 |
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 |
| Q |
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272 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
39307297 |
tttctaaaatataaa |
39307311 |
T |
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Target: chr2; HSP #101
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307 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| || |||| | ||| ||| |||| |
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|
| T |
9589351 |
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9589449 |
T |
 |
| Q |
308 |
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321 |
Q |
| |
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|||| ||||||||| |
|
|
| T |
9589450 |
cgttcatttatata |
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T |
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Target: chr2; HSP #102
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attattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaata |
274 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || |||| || |||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
38617929 |
attattttatatgataatatgtcaaaattttaatatgattcgtataaacaatgaa-tgatgtgtttttcttatgaaatgatattttctaaaacataaatg |
38617831 |
T |
 |
| Q |
275 |
ttgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
|
|||||||| | | ||||||||| ||| | || ||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38617830 |
acgacaaataac-tattatttcataaaattaattgttaatttataga-tttacgaagcaagagtaccggtacac |
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T |
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Target: chr2; HSP #103
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gaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtaca |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2859488 |
gaaatgatgttttctaaaacataaatattgacaaatagctttttatttca-taaaatga-cgttaatttata-aatttatagaacaagagtaccggtaca |
2859392 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #104
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247 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
29943732 |
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29943830 |
T |
 |
| Q |
248 |
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272 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
29943831 |
gaaatgatattttttaaaatataaa |
29943855 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #105
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Target Start/End: Original strand, 39620437 - 39620541
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216 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgttaat |
314 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| | ||||| || ||| || ||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
39620437 |
cttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgaaataatgttctataaaatataaatattaaaaaatagctatttgttacataaaaaatgatcgttaat |
39620536 |
T |
 |
| Q |
315 |
ttata |
319 |
Q |
| |
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||||| |
|
|
| T |
39620537 |
ttata |
39620541 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #106
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4740461 |
tatgattcttataaacaatctaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaata |
4740536 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #107
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taaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaat |
227 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| || ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| | || ||||||| || ||||| ||||| ||||||| |||| |
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|
| T |
9220950 |
taaaatttaatttttttgaatttttattactcataacgaagaatattgagtatttttaa-gagaaaatgttaaaaatttaacatgattcttataaccaat |
9221048 |
T |
 |
| Q |
228 |
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272 |
Q |
| |
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||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |
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|
| T |
9221049 |
atgaaattatgttttttcttatgaaataatgttttctacaatataaa |
9221095 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
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tttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttat |
247 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||| || ||| |||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
13507485 |
tttttattactcataataatgaatatcgattatttttttcgataaaatgttaaaaaattagtatgattcttacaaaaaatgaaatgatgttttttcttat |
13507386 |
T |
 |
| Q |
248 |
gaaat-gatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttat |
318 |
Q |
| |
|
||| | || |||||||||||||||| | || ||||| || |||||| ||| ||| ||||| |||| |||| |
|
|
| T |
13507385 |
gaactacatattttctaaaatataaaagtcgataaatatctctttattacataaaaatgatcattaacttat |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #109
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102 |
tttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaa-attttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
200 |
Q |
| |
|
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| T |
34188684 |
tttagttaccgaaagtgtcgacgaaataaaattttacattttttgaatttttgttacatataacaaagaatatttattattttttatgagaaaatgttaa |
34188783 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatg |
236 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34188784 |
aaatttaatatgattcttataaacaatgaaatgatg |
34188819 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #110
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tttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaa |
170 |
Q |
| |
|
||||||||||| | || || ||||| | ||||||||| |||||| ||| | ||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||| | |||| |
|
|
| T |
36023685 |
tttctatcatttataattataataatcatattttatttttcaaaagtgtcggcaaagcaaaattcaaatttttttaatttttattactcataatagtgaa |
36023784 |
T |
 |
| Q |
171 |
tattgattattttttatgacaaaatgt-aaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatat |
269 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||| ||| |||| ||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||||| || || |||| |||||||| |
|
|
| T |
36023785 |
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36023884 |
T |
 |
| Q |
270 |
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272 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
36023885 |
aaa |
36023887 |
T |
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Target: chr2; HSP #111
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246 |
atgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattt |
324 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
37781998 |
atgaaatgatgttttctaaaacataaatattgacaaatagctctttatttca-taaaatgatcgttcatttataaattt |
37781921 |
T |
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Target: chr2; HSP #112
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209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttt-tcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgac-aaatacctttttatttcat-taaagtg |
305 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||| || |||||||||| ||| || |
|
|
| T |
30981120 |
tatgattcttataaacaatgaaatgatttttttttcttatgaaatgatgttctataaaatataaatattaacaaaatagctatttatttcataaaaaatg |
30981219 |
T |
 |
| Q |
306 |
atcgttaatttata |
319 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| |
|
|
| T |
30981220 |
atcattaatttata |
30981233 |
T |
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Target: chr2; HSP #113
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319 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
33494200 |
tttttcttatgaaatgatattttctaaaatataaatgccgacaaataactctttatatcataaaattgatcgttaatttata |
33494281 |
T |
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Target: chr2; HSP #114
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Target Start/End: Original strand, 40370716 - 40370793
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| Q |
217 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatt |
294 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |
|
|
| T |
40370716 |
ttataaacaataaaatgatgatttttcttatgaaatgacattttctaaaatataaatatcaacaaataactctttatt |
40370793 |
T |
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Target: chr2; HSP #115
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgat |
307 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
4114831 |
tatgattcttataaacaatgaa-tgatgcgtttttcttctgaaattatattttctaaaatataaatgccgataaataactatttatttcataaaattgat |
4114733 |
T |
 |
| Q |
308 |
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324 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
4114732 |
cgttagtttatagattt |
4114716 |
T |
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284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
6945578 |
tatgattcttataaacagtaaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattaacaaata |
6945653 |
T |
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Target: chr2; HSP #117
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32401248 |
tatgattcttataaacagtaaaatgatgttttttcttatgaa-tgttgttttataaaatataaatattgacaaata |
32401174 |
T |
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Target: chr2; HSP #118
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Query Start/End: Original strand, 209 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 32602473 - 32602398
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32602473 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttattatgaaatattgttctataaaatataaatattgacaaata |
32602398 |
T |
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Target: chr2; HSP #119
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Target Start/End: Original strand, 40495683 - 40495758
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40495683 |
tatgattcttttaaacaattaaattatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaata |
40495758 |
T |
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Target: chr2; HSP #120
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tctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaata |
172 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || | |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| || |||||||||| ||||| | || || |
|
|
| T |
8334188 |
tctatcatttacaattataaaaattaaatcttatttaccaaaagc---gacgaaataaaatttaatttttttgaatttttattacccataatgaagatta |
8334092 |
T |
 |
| Q |
173 |
ttgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
8334091 |
ttgattattttttatga-gtaatgttaaaaatttaatatgattcatataaacaatgaaattatgttttt |
8334024 |
T |
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Target: chr2; HSP #121
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204 |
tttaatatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaa |
302 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||| ||| |
|
|
| T |
10456221 |
tttactatgattcttataaacaatgaa-tgatgtgtttttcttatgagaatatattttctaaaatataaatgccgataaataactatttatttcataaaa |
10456123 |
T |
 |
| Q |
303 |
gtgatcgttaatttatatattt |
324 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
10456122 |
ttgatagttaatttatagattt |
10456101 |
T |
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14840037 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaa---atgttctataaaatataaatattgacaaata |
14840109 |
T |
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| Q |
216 |
cttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaat |
314 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||| | |
|
|
| T |
14947408 |
cttataaacaattaa-tgatgcgtttttcttttgaaattatattttctaaaatataaatgctgacaaataattatttatttcataaaattgatcgttagt |
14947506 |
T |
 |
| Q |
315 |
ttatatattt |
324 |
Q |
| |
|
||||| |||| |
|
|
| T |
14947507 |
ttataaattt |
14947516 |
T |
 |
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ttttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatga |
169 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||| || || ||||| |||| ||||||| || |
|
|
| T |
25332937 |
ttttctatcattgacaattacaagaattaaatcgtatttaccaaaagcgtcgacgaaataaaaaaaaaaatt---gaatttttgttacatataacaaaga |
25332841 |
T |
 |
| Q |
170 |
atattgattattttttatgacaaaatgt |
197 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
25332840 |
atattgattattttttatgagaaaatgt |
25332813 |
T |
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| Q |
217 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatt |
294 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
32499390 |
ttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgaaattacatttcttaaaatataaatatcaacaaatagctttttatt |
32499467 |
T |
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307 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||| || |||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
16114633 |
tatgattcttataaacaaggaa-tgatgcatttttcttctgaaatcatattttttaaaatataaaggccgacaaataactatttatttcataaaattgat |
16114535 |
T |
 |
| Q |
308 |
cgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16114534 |
cgttagtttatagattta-tggaacaagagtaccggtacac |
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T |
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tattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgta-aattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaa |
250 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||| |||||||||||||| | |||||||| || |||| |||||| || |||| |||||||||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
4673830 |
tattactcataatagagaattttgattattttttacaataaaatgtagaaaaatttagtatgatttttctaaaaaatgaaatgatgttttttcttataaa |
4673731 |
T |
 |
| Q |
251 |
atgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
4673730 |
atgatattttctaaaatata |
4673711 |
T |
 |
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaa |
272 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
5155863 |
tatgattcttaaaaagaatgaaatgatgttttttcttatgaaataatattttctaaaatataaa |
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T |
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgat |
307 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||| || |||| | ||| ||| |||| |
|
|
| T |
33493708 |
tatgattcttataaacagtaaaatgatattttttcttatgaaatattgttctataaaatataattattgacaaatagctatttactacataaaaaatgat |
33493807 |
T |
 |
| Q |
308 |
cgttaatttata |
319 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
33493808 |
cgttaatttata |
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T |
 |
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tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttg |
47 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
16854385 |
tgggtgtatcggtacaccaaatcgtaaaattaataataaatgagttg |
16854339 |
T |
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| Q |
238 |
tttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44143346 |
tttttcttatgaaatgatgttctataaaatataaatattgacaaata |
44143300 |
T |
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| Q |
68 |
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167 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | || || |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||| | | |
|
|
| T |
325549 |
tattttctatcatttataattataataattttattttatttttcaaaagtgtcggcaaagcaaaattcaaatttttttaatttttattactcataatagt |
325648 |
T |
 |
| Q |
168 |
gaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaat |
267 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||| |||| ||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||| | || || ||||||||||| |
|
|
| T |
325649 |
gaatattgattattttt----------tgtaaaaaatttagtataattcttataaaaaatgaaatgatattttttcttaagggataatattttctaaaat |
325738 |
T |
 |
| Q |
268 |
ataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattt |
324 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||| || ||||| ||| ||| | |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
325739 |
ataaaagttgataaatatctctttatcacataaaaattatcgttaacttatatattt |
325795 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #133
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Query Start/End: Original strand, 217 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 3383354 - 3383301
Alignment:
| Q |
217 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
3383354 |
ttataaaaaatgaaatgatgttttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
3383301 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 15771471 - 15771418
Alignment:
| Q |
217 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
15771471 |
ttataaaaaatgaaatgatgttttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
15771418 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #135
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Query Start/End: Original strand, 152 - 275
Target Start/End: Original strand, 6884337 - 6884461
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| Q |
152 |
tattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgta-aattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaa |
250 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||| |||||||||||||| | |||||||| || |||| |||||| || |||| |||||||||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
6884337 |
tattactcataatagagaattttgattattttttacaataaaatgtagaaaaatttagtatgatttttctaaaaaatgaaatgatgttttttcttataaa |
6884436 |
T |
 |
| Q |
251 |
atgatgttttctaaaatataaatat |
275 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
6884437 |
atgatattttcttaaatatatatat |
6884461 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #136
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Alignment:
| Q |
216 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaa |
272 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
21985268 |
cttataaaaaattaaatgatgttttttcttatgaaataatattttctaaaatataaa |
21985324 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr2; HSP #137
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Target Start/End: Complemental strand, 28181452 - 28181396
Alignment:
| Q |
216 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaa |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
28181452 |
cttataaacaatgaaatgatatttttttttataaaatgatattttctaaaatataaa |
28181396 |
T |
 |
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Target: chr2; HSP #138
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Target Start/End: Complemental strand, 35310063 - 35309975
Alignment:
| Q |
148 |
tttttattactcataacaatgaatattgattatttttt-atgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgat |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| || | |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35310063 |
tttttattactcgtaatagagaatattgattatttttttataataaaatgtaaaaaatttagtatgattcttataaacaatgaaatgat |
35309975 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #139
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Alignment:
| Q |
139 |
ttttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggt |
238 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||| | |||| || || ||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
40051454 |
ttttatgaatttttattactcatggtaatgaacattgattattttttaccataaaatgtaaaatgtttagcataatttttataaacaatgaaatgat-gt |
40051356 |
T |
 |
| Q |
239 |
ttttcttat |
247 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
40051355 |
ttttcttat |
40051347 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #140
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Target Start/End: Complemental strand, 5389429 - 5389310
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| Q |
152 |
tattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgta-aattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaa |
250 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||| |||||||||||||| | |||||||| || |||| |||||| || |||| |||||||||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
5389429 |
tattactcataatagagaagtttgattattttttacaataaaatgtagaaaaatttagtatgatttttctaaaaaatgaaatgatgttttttcttataaa |
5389330 |
T |
 |
| Q |
251 |
atgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
5389329 |
atgatattttctaaaatata |
5389310 |
T |
 |
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Target: chr2; HSP #141
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| Q |
217 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaattt |
316 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
16637188 |
ttataaacaatgaa-tgatgttttttcttat-aaatgatattttcaaaaatataaatgccaacaaataactctttatttcataaaattaatcgttaattt |
16637091 |
T |
 |
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Target: chr2; HSP #142
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Target Start/End: Complemental strand, 34177535 - 34177469
Alignment:
| Q |
205 |
ttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaa |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
34177535 |
ttaatatgatttttataaa-aataaaatgatgttttttattatgaaatgatattttctaaaatataaa |
34177469 |
T |
 |
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Target: chr2; HSP #143
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Query Start/End: Original strand, 238 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 4298038 - 4297992
Alignment:
| Q |
238 |
tttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4298038 |
tttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaata |
4297992 |
T |
 |
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Target: chr2; HSP #144
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Query Start/End: Original strand, 238 - 324
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| Q |
238 |
tttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattt |
324 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||| ||| | || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
6588376 |
tttttcttctgaaatgacattttctaaaatataaaactcgacaaataattctttatttcataaaaataattgttaatttatatattt |
6588290 |
T |
 |
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Target: chr2; HSP #145
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggttttt--cttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18998887 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttttcttataaaatgttgttctataaattataaatattgacaaata |
18998810 |
T |
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| Q |
216 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaat |
314 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| || |||||| | || |||||||| || ||||||||| | ||||||||| |||| |
|
|
| T |
31928419 |
cttatagataatgaaatgatgttttttcttataaaatgatattttatataatatataaatcgacaaatagctatttatttcaat-aagtgatcggtaat |
31928322 |
T |
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| Q |
220 |
taaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
38963227 |
taaaaaatgaaatgatgttttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
38963177 |
T |
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Target: chr2; HSP #148
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| Q |
148 |
tttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttat |
247 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
41516063 |
tttttaatacccataatagtgaatattgattatttttttggataaaatgttaaaaaattagtatgatttttataaaggatgaaatgacgttttttcttat |
41515964 |
T |
 |
| Q |
248 |
gaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatt |
294 |
Q |
| |
|
|||| || |||| ||||||||||| |||| ||||| || |||||| |
|
|
| T |
41515963 |
aaaataatattttttaaaatataaaagttgataaatatctctttatt |
41515917 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr2; HSP #149
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Target Start/End: Original strand, 45157787 - 45157861
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| Q |
246 |
atgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgttaatttata |
319 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
45157787 |
atgaaatgatgttctatacaatataaatattgacaaatagttatttatttcataaaaaatgatcgttaatttata |
45157861 |
T |
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| Q |
92 |
ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||||| | || || |||||||||| | |||| || || |||||||||||| || |||| |||||||||||||| | | |
|
|
| T |
1353624 |
ataactaaatcttatttaccaaaaacgtcaacacagtaaaatttgatttttctgaattcctattactcataataaagaattttgattattttttacaata |
1353723 |
T |
 |
| Q |
192 |
aaatgtaaatttt--ttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||| |||||| || |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
1353724 |
aaatgaaaaaaaaaattagtatgatttttctaaaaaatgaaatgatattttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
1353804 |
T |
 |
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Target: chr2; HSP #151
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatc |
308 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||| ||||| | |||||| ||| ||| ||||| |
|
|
| T |
2640154 |
tatgattcttataaaggatgaaatgacgttttttcttataaaataatattttctaaaatataaaagttgataaatatttatttattacataaaaatgatc |
2640253 |
T |
 |
| Q |
309 |
gttaatttat |
318 |
Q |
| |
|
| ||| |||| |
|
|
| T |
2640254 |
gataacttat |
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T |
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| Q |
148 |
tttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
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tttttattactcataatagtgaatattgattattttattcgacaaaatgtaaa |
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T |
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aaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgat-ggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaataccttt |
289 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||| ||||| || | |
|
|
| T |
40588097 |
aaaatataaaatttttgatatgattcttataaacaatgagatgatatttttttcttatgaaatgacattttataaaataacaat-ttgaaaaatagctct |
40588195 |
T |
 |
| Q |
290 |
ttatttcat |
298 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
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ttatttcat |
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T |
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cttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaat |
314 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||| || ||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||| |
|
|
| T |
17821766 |
cttataaacaatgaa-tgttgtgtttttcttatgaaatgatattttcttagatacaaatgccgagaaataactttttatttcataaaattgattgttaat |
17821864 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| Q |
152 |
tattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgta-aattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaa |
250 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||| |||||||||||||| | |||||||| || |||| |||||| || |||| ||| |||||||| ||||||||| || |
|
|
| T |
37083388 |
tattactcataatagagaattttgattattttttacaataaaatgtagaaaaatttagtatgatttttctaaaaaataaaatgatgtattttcttataaa |
37083487 |
T |
 |
| Q |
251 |
atgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
37083488 |
atgatattttctaaaatata |
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T |
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Target: chr2; HSP #156
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| Q |
225 |
aatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacct |
287 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||| |
|
|
| T |
14532978 |
aatgaaatgatgttttatcttataaaatgatattttctaaaatatatatgttaacaaacacct |
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T |
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| Q |
246 |
atgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggta |
345 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || || |||||| |||| | |||||||| || || || || |||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
34188809 |
atgaaatgatgtcttataaaatataaatattgataaataactcttcatttca-taaaataatcgttaaattgtaaatatt-tgaagcaggagtaccggta |
34188906 |
T |
 |
| Q |
346 |
cac |
348 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
34188907 |
cac |
34188909 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #158
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220 |
taaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
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taaaaaatgaaatgatattttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #159
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| Q |
92 |
ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaatttt |
142 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
40370583 |
ataattaaatcttatttaccaaaaacgtcgacgaaataaaatttaattttt |
40370633 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #160
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 270
Target Start/End: Original strand, 59162 - 59215
Alignment:
| Q |
217 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
59162 |
ttataaaaaatgaaatgatattttttcttataaaattatattttctaaaatata |
59215 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 185
Target Start/End: Original strand, 13118991 - 13119028
Alignment:
| Q |
148 |
tttttattactcataacaatgaatattgattatttttt |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13118991 |
tttttattactcataatagtgaatattgattatttttt |
13119028 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 232
Target Start/End: Original strand, 18251074 - 18251146
Alignment:
| Q |
159 |
cataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaat |
232 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||| | || ||| | |||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18251074 |
cataataatgaatattgattatttttaa-gataaattaaaaatattttaatatcattcttataaacaatgaaat |
18251146 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21995990 - 21995819
Alignment:
| Q |
59 |
aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattact |
158 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||||||| | || || ||||| |||| ||||| || |||| | || || || |||||||||| |||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
21995990 |
aaaaaaaattactttctatcatttataattataataatgaaatcttattgactaaaaacatcaacaaaataaaatttaatttttcgaaatttttattact |
21995891 |
T |
 |
| Q |
159 |
cataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaat |
232 |
Q |
| |
|
||||| | |||||| |||||||||| | || ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21995890 |
cataatagagaatatcgattattttt-acgatgaaatgtaaaaattt-agtatgattcttataaacaatgaaat |
21995819 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 221 - 253
Target Start/End: Original strand, 28152198 - 28152230
Alignment:
| Q |
221 |
aaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatg |
253 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
28152198 |
aaacaatgaaatgatggttttttttatgaaatg |
28152230 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 246 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 34852487 - 34852435
Alignment:
| Q |
246 |
atgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat |
298 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
34852487 |
atgaaatgatgtcttataaaatataaatatcgataaataactctttatttcat |
34852435 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 173)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 28770323 - 28769965
Alignment:
| Q |
1 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28770323 |
tgggtgtatcagtacaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgtttttt-gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
28770225 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28770224 |
ttttatttaccaaaagcttcgacgaaataaaatttaaattttaagaatttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
28770125 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28770124 |
ttttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatgatttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
28770025 |
T |
 |
| Q |
301 |
aagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
360 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
28770024 |
aagtgatcgttaatttataaattttgtgaaacaagagtaccggtatactcaaaattgtga |
28769965 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 23189445 - 23189086
Alignment:
| Q |
1 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23189445 |
tgggtgtatcggtacatcaagtcgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
23189346 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
200 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23189345 |
ttttatataccaaaaacttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
23189246 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
300 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23189245 |
ttttataatatgatccttataaacaatgaaatgattgtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
23189146 |
T |
 |
| Q |
301 |
aagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
360 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23189145 |
aagtgatctttaatttatatattttgtgaaacaatagtactggtacactcaaaattgtga |
23189086 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 9530391 - 9530749
Alignment:
| Q |
1 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9530391 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaatcagttatttttttgaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
9530490 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9530491 |
ttttatttaccaaaagcttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaat |
9530590 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
9530591 |
ttttttaatataatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaataatgttttctaaaatataaatattgacaaatacatttttatttcatta |
9530690 |
T |
 |
| Q |
301 |
aagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtg |
359 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9530691 |
aagtgatcgttaatttataaaatttgtgcaacaagagtaccggtacactcaaaattgtg |
9530749 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 13589242 - 13588884
Alignment:
| Q |
1 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13589242 |
tgggtgtatcggtacaccaagttgtaaaattaataataaatcagttgtttttttgaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
13589143 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13589142 |
ttttatttaccaaaaacttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaat |
13589043 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13589042 |
ttttttaatataatccttataaacaatgaaatgatgatttttcttatgaaatgatattttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
13588943 |
T |
 |
| Q |
301 |
aagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtg |
359 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13588942 |
aagtgatcgttaatttataaattttgtgcaacaaaagtaccggtacactcaaaattgtg |
13588884 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 22798448 - 22798086
Alignment:
| Q |
1 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataatta---ttttctatcattgacaactaagataatt |
97 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22798448 |
tgggtgtatcggtacaccaagttgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattactattttctatcattgacaactaagataatt |
22798349 |
T |
 |
| Q |
98 |
aaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgt |
197 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22798348 |
aaattttatttaccaaaagcttcgacgaaataaaatttaatttttaataatttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgt |
22798249 |
T |
 |
| Q |
198 |
aaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttca |
297 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22798248 |
aatttttttaatatgatcattataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttttaaaatatgaatattgaaaaatacctttttatttca |
22798149 |
T |
 |
| Q |
298 |
ttaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
360 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22798148 |
ttaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
22798086 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 5 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 31236963 - 31236607
Alignment:
| Q |
5 |
tgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaatttt |
104 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31236963 |
tgtatcggtacatcaagtcgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataactattttctatcattgacaactaagataattaaatttt |
31236864 |
T |
 |
| Q |
105 |
atttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattatttttt-atgacaaaatgtaaattt |
203 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31236863 |
atataccaaaagcttcgacgaaataaaatttaattttgaagaatttttattactcataataatgaatattgattatttttttatgacaaaatgtaaattt |
31236764 |
T |
 |
| Q |
204 |
tttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaag |
303 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31236763 |
tgtaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaag |
31236664 |
T |
 |
| Q |
304 |
tgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
360 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31236663 |
tgatctttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
31236607 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 10453309 - 10453668
Alignment:
| Q |
1 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10453309 |
tgggtgtatcggtacaccaaatcgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattattttctattattgacaactaagataattaaa |
10453408 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
200 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10453409 |
ttttatataccaaaagtttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
10453508 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
300 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10453509 |
ttttgtaatatgatccttataaacaatgaaatgatagtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattaacaaatacctttttatttcatta |
10453608 |
T |
 |
| Q |
301 |
aagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
360 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10453609 |
aagtgatctttaatttatatattttgtgaaacaaaagtaccgatacactcaaaattgtga |
10453668 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 42534771 - 42534412
Alignment:
| Q |
1 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42534771 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtagaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
42534672 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
200 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42534671 |
ttttatataccaaaagtttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
42534572 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
300 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
42534571 |
ttttgtaatatgatccttataaacaatgaaatgatgatttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgataaatacttttttatttcatta |
42534472 |
T |
 |
| Q |
301 |
aagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
360 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42534471 |
aagtgatctttaatttatatattttgtgaaacaaaagtatcggtacactcaaaattgtga |
42534412 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 11 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 43411884 - 43411538
Alignment:
| Q |
11 |
ggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttac |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43411884 |
ggtacaccaaatcgtaaaattaataataaatgagttttttttttgaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttac |
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43411538 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 5 - 360
Target Start/End: Original strand, 16729757 - 16730111
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Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 2148504 - 2148146
Alignment:
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Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 3 - 356
Target Start/End: Original strand, 41631249 - 41631602
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| Q |
3 |
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Q |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Original strand, 25684102 - 25684447
Alignment:
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Q |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 5 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 32063900 - 32063544
Alignment:
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Q |
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203 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
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Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 8068696 - 8068338
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Q |
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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 5 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 39541093 - 39540738
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Q |
| |
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204 |
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304 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 3 - 360
Target Start/End: Original strand, 3881863 - 3882219
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Q |
| |
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T |
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| Q |
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202 |
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| T |
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302 |
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| T |
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3882162 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 22279594 - 22279237
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Q |
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Q |
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| T |
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T |
 |
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201 |
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300 |
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| T |
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T |
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22279295 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 37314215 - 37313858
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Q |
| |
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T |
 |
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ttttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
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| T |
37314115 |
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T |
 |
| Q |
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ttttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
300 |
Q |
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T |
 |
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aagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Original strand, 10688422 - 10688777
Alignment:
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1 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
100 |
Q |
| |
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10688422 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaatgatttgcttttttgaagaaaaataattattttctatcattgacgactaagataattaaa |
10688521 |
T |
 |
| Q |
101 |
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200 |
Q |
| |
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| T |
10688522 |
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10688621 |
T |
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| Q |
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300 |
Q |
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10688721 |
T |
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356 |
Q |
| |
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|
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| T |
10688722 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 40340456 - 40340816
Alignment:
| Q |
1 |
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99 |
Q |
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|
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40340555 |
T |
 |
| Q |
100 |
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199 |
Q |
| |
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| T |
40340556 |
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40340655 |
T |
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| Q |
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299 |
Q |
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| T |
40340656 |
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T |
 |
| Q |
300 |
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360 |
Q |
| |
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|
|
| T |
40340756 |
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40340816 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 4094695 - 4095046
Alignment:
| Q |
9 |
tcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttattt |
108 |
Q |
| |
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|||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |
|
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| T |
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T |
 |
| Q |
109 |
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208 |
Q |
| |
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| T |
4094795 |
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4094894 |
T |
 |
| Q |
209 |
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308 |
Q |
| |
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| T |
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4094994 |
T |
 |
| Q |
309 |
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360 |
Q |
| |
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|
|
| T |
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tttaatttatataatttgtgaaacaagagtactggtacactcaaaattgtga |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 3 - 356
Target Start/End: Original strand, 19125943 - 19126296
Alignment:
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3 |
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Q |
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
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201 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
202 |
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301 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
302 |
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356 |
Q |
| |
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19126243 |
agtgatcgttaattt-taaattttatgaaacaagagtaccgttacacttaaaatt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 12 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 34859802 - 34859487
Alignment:
| Q |
12 |
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110 |
Q |
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|||| |||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
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gtacgccaagtcgtaaaattagtaataaatgaattgtttttttgaagaaaaataattattttctatcatttgacaactaagataattaaattttatttac |
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T |
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| Q |
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caaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaata |
210 |
Q |
| |
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|
|
| T |
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caaaagcttcgacaaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaatattaattattttttatgacaaaatgtcaattttttaata |
34859603 |
T |
 |
| Q |
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310 |
Q |
| |
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|
| T |
34859602 |
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34859503 |
T |
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| Q |
311 |
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Q |
| |
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|
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| T |
34859502 |
taatttataaattttg |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 15725974 - 15726313
Alignment:
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
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ttttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
200 |
Q |
| |
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|
| T |
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ttttatataccaaaagattcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
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T |
 |
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ttttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
300 |
Q |
| |
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|
| T |
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ctttgtaatatgatccttataaacaatgaaa--------------------tgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
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T |
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| Q |
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aagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
360 |
Q |
| |
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|
|
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aagtgatctttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaaatgtga |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 33001825 - 33001490
Alignment:
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Q |
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T |
 |
| Q |
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ttttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33001725 |
ttttatttaccaaaagcttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaat |
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T |
 |
| Q |
201 |
ttttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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ttttttaatataatccttataaacaatgaaat--------------------gatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
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T |
 |
| Q |
301 |
aagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaatt |
356 |
Q |
| |
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|| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
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aactgatcgttaatttataaattttgtgcaacaaaagtaccggtacatttaaaatt |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 32624205 - 32624553
Alignment:
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Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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ttttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
200 |
Q |
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|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
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ttttatttaccaaaagcttcgacgaaataaaatttattttttacaaatttttactactcataacaatgaatattggttattatttatgacaaaatgtaaa |
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T |
 |
| Q |
201 |
ttttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
300 |
Q |
| |
|
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| T |
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ttttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatgtttttttttatgatatgacgttttctaaaatataaatattgacaaataactttttattttataa |
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T |
 |
| Q |
301 |
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349 |
Q |
| |
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|
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aaatgatcgttaatttataagttttgtgaaacaagagtaccggtacact |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 5 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 37963358 - 37963024
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104 |
Q |
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|
|||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
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tgtatcggtacaccaatttattaaattaataataaattagttatttttttgaagaaaaattattattttctatcattgacaactataataattaaatttt |
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T |
 |
| Q |
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atttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaatttt |
204 |
Q |
| |
|
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|
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atttaccaaaagtttcgaccaaataaaatttaa----------tctttactactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaatttt |
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T |
 |
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205 |
ttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagt |
304 |
Q |
| |
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ttaatataatccttataaacaatgaaatgatgtttttttttatgatatgacgttttctaaaatataaatattgacaaataaatttttattttataaaaat |
37963069 |
T |
 |
| Q |
305 |
gatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacact |
349 |
Q |
| |
|
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gatcgttaatttataaattttgtgaaacaagagtaccggtacact |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 60 - 281
Target Start/End: Original strand, 11758706 - 11758917
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Q |
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ataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttt |
259 |
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|
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|
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ataacaatgaatattgattattttctacgacaaaatgtatattttttaatatgatccttatatacaatgaaatgatgatttttcttatgaaatgatgttt |
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T |
 |
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tctaaaatataaatattgacaa |
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Q |
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|
|||||||||||||||||||||| |
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|
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tctaaaatataaatattgacaa |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 70 - 348
Target Start/End: Original strand, 4366887 - 4367162
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169 |
Q |
| |
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ttttttatcattgacaattgtaataattaaattgtatttaccaaaagcgtcgaagaaataaaatttactttttttgaatttttattactcataacaaaga |
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T |
 |
| Q |
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atattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatat |
269 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |
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|
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atattgattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatacaattttaataaacaatgaaatgatgttttttcttataaaatgatg-tttctaaaatat |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 58 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 10118565 - 10118297
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| Q |
58 |
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10118297 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 59 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 13593601 - 13593335
Alignment:
| Q |
59 |
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158 |
Q |
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T |
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324 |
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13593335 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 70 - 325
Target Start/End: Original strand, 23408350 - 23408605
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70 |
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169 |
Q |
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325 |
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23408605 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 59 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 2011378 - 2011109
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158 |
Q |
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253 |
Q |
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324 |
Q |
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2011109 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 148 - 324
Target Start/End: Original strand, 29996671 - 29996847
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247 |
Q |
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29996847 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 56 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 4039794 - 4039571
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154 |
Q |
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Q |
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| T |
4039594 |
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4039571 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 13956898 - 13956637
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| Q |
60 |
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159 |
Q |
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| T |
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324 |
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13956637 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 59 - 284
Target Start/End: Original strand, 19238880 - 19239107
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158 |
Q |
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| T |
19239080 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 59 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 29666140 - 29665874
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158 |
Q |
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29665874 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 59 - 284
Target Start/End: Original strand, 12336300 - 12336528
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158 |
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255 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #41
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Query Start/End: Original strand, 56 - 324
Target Start/End: Original strand, 28204856 - 28205125
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| Q |
56 |
aagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagag-tttttat |
154 |
Q |
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| T |
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28204955 |
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253 |
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324 |
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28205056 |
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28205125 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 59 - 284
Target Start/End: Original strand, 36409994 - 36410220
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aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattact |
158 |
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| |
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| T |
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36410093 |
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257 |
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36410193 |
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36410194 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 59 - 284
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| T |
6335477 |
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6335576 |
T |
 |
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159 |
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256 |
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| T |
6335577 |
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6335676 |
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257 |
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284 |
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| T |
6335677 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 55 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 23690824 - 23690581
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gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttat |
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Q |
| |
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| T |
23690824 |
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23690725 |
T |
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tactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatga |
254 |
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| T |
23690724 |
tacatataacaaagaatatttattattttttatgacaaaatgttaaaaattaaatatgattcttataaacaatgaaatgatgtttattcttataaaataa |
23690625 |
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 |
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255 |
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298 |
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23690624 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 70 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 18002959 - 18002684
Alignment:
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70 |
ttttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatga |
169 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||| ||| |||| | ||||| |||| ||||||| || |
|
|
| T |
18002959 |
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18002860 |
T |
 |
| Q |
170 |
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269 |
Q |
| |
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|
|
| T |
18002859 |
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18002760 |
T |
 |
| Q |
270 |
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347 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
18002759 |
aaatattgataaataactctttatttta-taaaataatcattaaattataaatttt-tgaagcaggagtaccggtaca |
18002684 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 92 - 348
Target Start/End: Original strand, 13091032 - 13091288
Alignment:
| Q |
92 |
ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||| | |||||||| |||||||| | |||| || |||||| ||||| ||| | |||| |||||||||||||| | | |
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|
| T |
13091032 |
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13091131 |
T |
 |
| Q |
192 |
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289 |
Q |
| |
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|
|
| T |
13091132 |
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13091230 |
T |
 |
| Q |
290 |
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348 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
13091231 |
ttatttcataaaaatgatagttaatttataaatttt-tgaagtaagagtaccggtacac |
13091288 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 59 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 16602682 - 16602414
Alignment:
| Q |
59 |
aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaatt-ttaagagtttttattac |
157 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||| | || || || |||||||| | |
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| T |
16602682 |
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16602584 |
T |
 |
| Q |
158 |
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253 |
Q |
| |
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|||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||| |
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| T |
16602583 |
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16602484 |
T |
 |
| Q |
254 |
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324 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
16602483 |
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16602414 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 56 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 16432971 - 16432746
Alignment:
| Q |
56 |
aagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttatt |
155 |
Q |
| |
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|||||||| || ||||||||||| ||||||| || | |||||||| ||||||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| | ||||| || |
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| T |
16432971 |
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16432872 |
T |
 |
| Q |
156 |
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253 |
Q |
| |
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| T |
16432871 |
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16432772 |
T |
 |
| Q |
254 |
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279 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||| |
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|
| T |
16432771 |
atgttttctaaaatgtaaacattgac |
16432746 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 59 - 284
Target Start/End: Original strand, 328829 - 329054
Alignment:
| Q |
59 |
aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattact |
158 |
Q |
| |
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|
| T |
328829 |
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328928 |
T |
 |
| Q |
159 |
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258 |
Q |
| |
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|||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| || |||||||||||||||| | || ||||||| | || |||||||| |
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|
| T |
328929 |
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329028 |
T |
 |
| Q |
259 |
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284 |
Q |
| |
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| T |
329029 |
ttctaaaagataaatattgacaaata |
329054 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 55 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 5204942 - 5204697
Alignment:
| Q |
55 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaag-taaaatttaa-attttaagagttttt |
152 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||||| | |||| || ||||||| || ||| ||||| |||| |||||||| |||||||| | ||||| || ||||| |
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|
| T |
5204942 |
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5204843 |
T |
 |
| Q |
153 |
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252 |
Q |
| |
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| T |
5204842 |
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5204743 |
T |
 |
| Q |
253 |
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298 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||||||| || ||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
5204742 |
gatgtcttataaaatataaatatcgataaataactctttatttcat |
5204697 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 55 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 40756866 - 40756621
Alignment:
| Q |
55 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaag-taaaatttaa-attttaagagttttt |
152 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||||| | |||| || ||||||| || ||| ||||| |||| |||||||| |||||||| | ||||| || ||||| |
|
|
| T |
40756866 |
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40756767 |
T |
 |
| Q |
153 |
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252 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
40756766 |
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40756667 |
T |
 |
| Q |
253 |
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298 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||||||| || ||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
40756666 |
gatgtcttataaaatataaatatcgataaataactctttatttcat |
40756621 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 55 - 298
Target Start/End: Original strand, 4429502 - 4429746
Alignment:
| Q |
55 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaa-attttaagagttttta |
153 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||| ||| || | | ||||||| || ||| ||||| |||| |||||||| |||||||| | ||||| || ||||| |
|
|
| T |
4429502 |
gaagaaaaagaattgttttctattattaacgatttcaataattagatcttagttaccgaaagtgtcgacgaaataaaattttacattttttgaatttttg |
4429601 |
T |
 |
| Q |
154 |
ttactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatg |
253 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||| |
|
|
| T |
4429602 |
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4429701 |
T |
 |
| Q |
254 |
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298 |
Q |
| |
|
|||| || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
4429702 |
atgtcttataaaatataaatattgataaataactctttatttcat |
4429746 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 176 - 348
Target Start/End: Original strand, 31588439 - 31588609
Alignment:
| Q |
176 |
attattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatat |
275 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31588439 |
attattatttatgagaaaatgtaaaaaaattgatatgatttttataaacaataaaatgattttttttcttatgaaatgatattttctaaaatataaatat |
31588538 |
T |
 |
| Q |
276 |
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348 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
31588539 |
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31588609 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 73 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 5512988 - 5512795
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| Q |
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tctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaata |
172 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||| | || || |
|
|
| T |
5512988 |
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5512889 |
T |
 |
| Q |
173 |
ttgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggttt--ttcttatgaaatgatgttttctaaa |
265 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
5512888 |
ttgattattttttatga-gtaatgttaaaaatttaatatgattcttataaacaatgaaattatgtttttcttcttatgaaatgatgttttctaaa |
5512795 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 59 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 5140988 - 5140701
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| Q |
59 |
aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaa-attttaagagtttttattac |
157 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
5140988 |
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5140889 |
T |
 |
| Q |
158 |
tcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgt |
257 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
5140888 |
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5140790 |
T |
 |
| Q |
258 |
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348 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||| |||| | |||||||| ||||| || || | ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
5140789 |
cttataaaatataaatattgataaataactcttcatttca-taaaataatcgttaaattataaatatt-taaaacaggagtaccggtacac |
5140701 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 73 - 265
Target Start/End: Original strand, 7080211 - 7080404
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| Q |
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tctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaata |
172 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || | |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||| | || || |
|
|
| T |
7080211 |
tctatcatttacaattataaaaattaaatcttatttaccaaaagcgtcgacgaaataaaatttaatttttttgaatttttattactcataatgaagatta |
7080310 |
T |
 |
| Q |
173 |
ttgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggttt--ttcttatgaaatgatgttttctaaa |
265 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7080311 |
ttggttattttttatga-gtaatgttaaaaatttaatatgattcttataaacaatgaaattatgtttttcttcttatgaaatgatgttttctaaa |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 92 - 348
Target Start/End: Original strand, 14967350 - 14967606
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92 |
ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||| | |||||||| |||||||| | |||| || |||||| ||||| ||| | |||| |||||||||||||| | | |
|
|
| T |
14967350 |
ataattaaatcttatttatcaaaaacatcgacgaaataaaatttgatttttctgaatttttagtactcgtaatagagaattttgattattttttacaata |
14967449 |
T |
 |
| Q |
192 |
aaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttt--tcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaataccttt |
289 |
Q |
| |
|
|| | |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
14967450 |
aa-tctaaaaaaattagtatgatttttataaacaatgaaatgatgctttttttcttatgaaatgatattttctaaaatatagatatcaacaaatagcttt |
14967548 |
T |
 |
| Q |
290 |
ttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
14967549 |
ttatttcataaaaatgatagttaatttataaatttt-tgaagtaagagtaccgatacac |
14967606 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 73 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 34901963 - 34901770
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| Q |
73 |
tctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaata |
172 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || | |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||| | || || |
|
|
| T |
34901963 |
tctatcatttacaattataaaaattaaatcttatttaccaaaagcgtcgacgaaataaaatttaatttttttgaatttttattactcataatgaagatta |
34901864 |
T |
 |
| Q |
173 |
ttgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggttt--ttcttatgaaatgatgttttctaaa |
265 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
34901863 |
ttgattattttttatga-ttaatgttaaaaatttaatatgattcttataaacaatgaaattatgtttttcttcttatgaaatgatattttctaaa |
34901770 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 55 - 214
Target Start/End: Original strand, 35162433 - 35162592
Alignment:
| Q |
55 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttat |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||| |
|
|
| T |
35162433 |
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35162532 |
T |
 |
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155 |
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214 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||| ||||||||||| | || ||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
35162533 |
tactcataataaagaataatgattatttttcacgagaaaatgttaaaaatttaatatgat |
35162592 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 55 - 348
Target Start/End: Original strand, 9589291 - 9589583
Alignment:
| Q |
55 |
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154 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||| | || || |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||| |||||||| | |||| || |||||| |
|
|
| T |
9589291 |
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9589389 |
T |
 |
| Q |
155 |
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253 |
Q |
| |
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| T |
9589390 |
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9589489 |
T |
 |
| Q |
254 |
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348 |
Q |
| |
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|| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||| |
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| T |
9589490 |
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9589583 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 56 - 325
Target Start/End: Original strand, 19189190 - 19189460
Alignment:
| Q |
56 |
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153 |
Q |
| |
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| T |
19189190 |
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19189288 |
T |
 |
| Q |
154 |
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252 |
Q |
| |
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| T |
19189289 |
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19189388 |
T |
 |
| Q |
253 |
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325 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||| |||| | |||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
19189389 |
gatgttttctaaaatatatatattgatgaataactctttatttca-taaaataatcgttaaattataaatttt |
19189460 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 160 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 13544309 - 13544174
Alignment:
| Q |
160 |
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258 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
13544309 |
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13544211 |
T |
 |
| Q |
259 |
ttctaaaatataaatattgacaaatacctttttattt |
295 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |
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|
| T |
13544210 |
ttataaaatataaatattgataaataactctttattt |
13544174 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 94 - 317
Target Start/End: Original strand, 27117836 - 27118060
Alignment:
| Q |
94 |
aattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaa |
193 |
Q |
| |
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|||||||| ||||| ||||||| | |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||| | ||| |
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| T |
27117836 |
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27117935 |
T |
 |
| Q |
194 |
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292 |
Q |
| |
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||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||| || |||| |
|
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| T |
27117936 |
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27118035 |
T |
 |
| Q |
293 |
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317 |
Q |
| |
|
|| ||| ||| | || ||||||||| |
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|
| T |
27118036 |
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27118060 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 217 - 349
Target Start/End: Original strand, 29744147 - 29744278
Alignment:
| Q |
217 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaattt |
316 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||| ||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
29744147 |
ttataaataatgaaatgatgttttttcttatgaaatgatattttctaaaatataaatatcaataaatagctctttatttcataaaaatgatagttaattt |
29744246 |
T |
 |
| Q |
317 |
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349 |
Q |
| |
|
||| ||||| |||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
29744247 |
ataaatttt-tgaagcaaaagtaccggtacact |
29744278 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 75 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 40110193 - 40109952
Alignment:
| Q |
75 |
tatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatatt |
174 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || | ||||| |||| |||| | |||||| ||||| || |||||||||| |||| || ||||||||| ||||||| | ||||||| |
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|
| T |
40110193 |
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40110094 |
T |
 |
| Q |
175 |
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274 |
Q |
| |
|
|| ||||||| |||| ||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |
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|
| T |
40110093 |
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40109995 |
T |
 |
| Q |
275 |
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318 |
Q |
| |
|
|||| ||| | || |||| ||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
40109994 |
ttgataaacaactctttacttc-ctaaaatgatcgttaatttat |
40109952 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 65 - 348
Target Start/End: Original strand, 41802197 - 41802482
Alignment:
| Q |
65 |
aattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaa-gagtttttattactcataa |
163 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | || || |||||||||| ||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||| || |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
41802197 |
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41802296 |
T |
 |
| Q |
164 |
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261 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||| |
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|
| T |
41802297 |
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41802396 |
T |
 |
| Q |
262 |
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348 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||||||| || |||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
41802397 |
taaaatacaaatatcaacaaatagctctttatttcataaaaatgatagttaatttataaatttt-taaaataagagtaccagtacac |
41802482 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 209 - 347
Target Start/End: Original strand, 27980011 - 27980148
Alignment:
| Q |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatc |
308 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||| ||||| |
|
|
| T |
27980011 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaattatgttctataaaatataaatattgacaaatagctaattattacataaaaatgatc |
27980110 |
T |
 |
| Q |
309 |
gttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtaca |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||| | || |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
27980111 |
gttaatttata-aaattatgaaacaagagtaccgctaca |
27980148 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 92 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 37431636 - 37431411
Alignment:
| Q |
92 |
ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| | |||||||| | |||||||| |||| || ||||||| |||||||| | |||| ||||||||| |||| | |
|
|
| T |
37431636 |
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37431537 |
T |
 |
| Q |
192 |
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291 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |
|
|
| T |
37431536 |
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37431437 |
T |
 |
| Q |
292 |
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317 |
Q |
| |
|
||||||| ||| | || ||||||||| |
|
|
| T |
37431436 |
atttcataaaaataatagttaattta |
37431411 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 92 - 348
Target Start/End: Original strand, 28332239 - 28332497
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| Q |
92 |
ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| ||||||| | || ||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||| | | |
|
|
| T |
28332239 |
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28332338 |
T |
 |
| Q |
192 |
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288 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| || |
|
|
| T |
28332339 |
aaatgtaaaaaaaattagtatgatttttataaacaatgaaatgacgttttttttcttatgaaatgacattttctaaaatataaatataaaaaaatagctc |
28332438 |
T |
 |
| Q |
289 |
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348 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||| | || ||||||||| | ||||| ||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
28332439 |
tttattccataaaaataatagttaatttaaagatttt-tgaaataggagtaccggtacac |
28332497 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 59 - 242
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aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattact |
158 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| |||| || |||||||| || |
|
|
| T |
9499474 |
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9499573 |
T |
 |
| Q |
159 |
cataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggttttt |
242 |
Q |
| |
|
||||| | ||||||| ||||||||||| || ||||| |||| |||||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
9499574 |
cataatgaagaatattaattattttttacgagaaaatataaa-aatttaatataattcatataaacgatgaaatgatgtttttt |
9499656 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 92 - 347
Target Start/End: Original strand, 35682211 - 35682468
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| Q |
92 |
ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| | |
|
|
| T |
35682211 |
ataactaaatcttatttaccaaaaacgtcgacgaaataaattttaaattttcagaacttttattaatcataatacaaaattttgattattttttacaatt |
35682310 |
T |
 |
| Q |
192 |
aaatgtaaatttt-ttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttt--tcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctt |
288 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||| || |
|
|
| T |
35682311 |
aaatgtaaaaaaaattagtatgatttttataaacaatgaaatgatgttttttttcttatgaaatgatattttttaaaatataaatatcaacatatagctc |
35682410 |
T |
 |
| Q |
289 |
tttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtaca |
347 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||| | |||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
35682411 |
tttatttcataaaaatgataggtaatttattgatttt-tgaagcaagagtactggtaca |
35682468 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 73 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 40524387 - 40524194
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| Q |
73 |
tctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaata |
172 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || | |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||| | || || |
|
|
| T |
40524387 |
tctatcatttacaattataaaaattaaatcttatttaccaaaagtgtcgacgaaataaaatttaatttttttgaatttttattactcataatgaagatta |
40524288 |
T |
 |
| Q |
173 |
ttgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggttt--ttcttatgaaatgatgttttctaaa |
265 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40524287 |
ttgattattttttatga-gtaatgttaaaaatttaatataattattataaacaatgaaattatgtttttcttcttatgaaatgatgttttctaaa |
40524194 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 59 - 189
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59 |
aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattact |
158 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| | |||| ||| ||||||||| |||| || |||||||| || |
|
|
| T |
18480154 |
aaaaataattattttctatcattgacaattataataattaaatcttatttaccaaaatcatcgatgaaataaaatttactttttttgaatttttattgct |
18480253 |
T |
 |
| Q |
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cataacaatgaatattgattattttttatga |
189 |
Q |
| |
|
||||| | |||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
18480254 |
cataatgaagaatattgattattttttatga |
18480284 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
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Target Start/End: Complemental strand, 14575784 - 14575527
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tattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaat |
167 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | || || ||||||| ||||||||| |||||| ||| | ||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||| | | |
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|
| T |
14575784 |
tattttctatcatttataattataataattatattttatttttcaaaagtgtcggcaaagcaaaattcaaatttttttaatttttattactcataatagt |
14575685 |
T |
 |
| Q |
168 |
gaatattgattattttttatgacaaaatgt-aaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaa |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||| ||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||| |
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|
| T |
14575684 |
gaatattgattatttttttcaataaaatgttaaaaaatttagtataattcttataaaaaatgaaatgatgttttttcttatgagataatattttctaaaa |
14575585 |
T |
 |
| Q |
267 |
tataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattt |
324 |
Q |
| |
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14575584 |
tataaaagtcgataaatatctttttatcacataaaaattatcgttaacttatagattt |
14575527 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
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Target Start/End: Original strand, 13119043 - 13119174
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315 |
Q |
| |
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| T |
13119043 |
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T |
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348 |
Q |
| |
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| T |
13119143 |
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13119174 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 216 - 319
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216 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgttaat |
314 |
Q |
| |
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| T |
34259783 |
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34259882 |
T |
 |
| Q |
315 |
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319 |
Q |
| |
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||||| |
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| T |
34259883 |
ttata |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
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172 |
Q |
| |
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| T |
2021771 |
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2021870 |
T |
 |
| Q |
173 |
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265 |
Q |
| |
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| T |
2021871 |
ttgatta--ctttatgagaaaatgttaaaaatttaatatgattcttataaataatgaaattatgtttttttttcttatgaaattatgttttctaaa |
2021964 |
T |
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Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
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Target Start/End: Original strand, 972244 - 972449
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68 |
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167 |
Q |
| |
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|||||||||||||| | || || |||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| | | |
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| T |
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972343 |
T |
 |
| Q |
168 |
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266 |
Q |
| |
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| T |
972344 |
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972443 |
T |
 |
| Q |
267 |
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272 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
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| T |
972444 |
tataaa |
972449 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 92 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 12362646 - 12362418
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| Q |
92 |
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191 |
Q |
| |
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| T |
12362646 |
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12362547 |
T |
 |
| Q |
192 |
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288 |
Q |
| |
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| T |
12362546 |
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12362447 |
T |
 |
| Q |
289 |
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317 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||| | || ||||||||| |
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|
| T |
12362446 |
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12362418 |
T |
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Target: chr5; HSP #80
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Query Start/End: Original strand, 216 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 13645682 - 13645574
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| Q |
216 |
cttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaat |
314 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
13645682 |
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13645584 |
T |
 |
| Q |
315 |
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324 |
Q |
| |
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||||| |||| |
|
|
| T |
13645583 |
ttatagattt |
13645574 |
T |
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Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 23259065 - 23258854
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60 |
aaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagag-tttttattact |
158 |
Q |
| |
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| T |
23259065 |
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23258967 |
T |
 |
| Q |
159 |
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258 |
Q |
| |
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|||||| | ||||||||| |||||| | | ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |
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| T |
23258966 |
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23258868 |
T |
 |
| Q |
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272 |
Q |
| |
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|
| T |
23258867 |
ttctaaaatataaa |
23258854 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 216 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 40563278 - 40563146
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| Q |
216 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttca-ttaaagtgatcgttaat |
314 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
40563278 |
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40563179 |
T |
 |
| Q |
315 |
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348 |
Q |
| |
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||||| | || |||| |||||||| |||||||| |
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| T |
40563178 |
ttata-aaattatgaagcaagagtatcggtacac |
40563146 |
T |
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Target: chr5; HSP #83
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Query Start/End: Original strand, 70 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 777453 - 777203
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| Q |
70 |
ttttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatga |
169 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||| || ||||||||| | |||| || || |
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|
| T |
777453 |
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777358 |
T |
 |
| Q |
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267 |
Q |
| |
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| T |
777357 |
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777259 |
T |
 |
| Q |
268 |
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324 |
Q |
| |
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|
| T |
777258 |
ataaatattgactaatagctttttattt-aataaaatgatctttaatttataaattt |
777203 |
T |
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Back To:
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Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 56 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15725811 - 15725607
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| Q |
56 |
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155 |
Q |
| |
|
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|
| T |
15725811 |
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15725715 |
T |
 |
| Q |
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251 |
Q |
| |
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| T |
15725714 |
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15725615 |
T |
 |
| Q |
252 |
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259 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
15725614 |
tgatgttt |
15725607 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 209 - 284
Target Start/End: Original strand, 2851934 - 2852009
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| Q |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2851934 |
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2852009 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 209 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 14434988 - 14434877
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgat |
307 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| || |||| | ||| |||| |||| |
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| T |
14434988 |
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14434889 |
T |
 |
| Q |
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319 |
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| |
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| T |
14434888 |
cgttcatttata |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #87
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ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
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|||||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||| || |||| || |||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||| | | |
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| T |
3425375 |
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3425276 |
T |
 |
| Q |
192 |
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269 |
Q |
| |
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|||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
3425275 |
aaatgtaaaaaaaattagtatgatttttataaacaatgaaatgaagttttttcttatgagatgacattttctaaaatat |
3425197 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 13795558 - 13795333
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| Q |
92 |
ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||| || |||||| |||| |||| | |||| |||||||||||| | | | |
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|
| T |
13795558 |
ataattaaatatcatttaccaaaaacgtcgacgaaataaaatttaatttttctgaatttttagtacttataatagagaattttgattattttt-acaata |
13795460 |
T |
 |
| Q |
192 |
aaatgtaaatttt-ttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttt |
290 |
Q |
| |
|
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| T |
13795459 |
aaatgtaaaaaaaattagtatgatttttataaacaatgaaataatgttttttcttatgaaatgacatttcctaaaatataaatatcaacaaatagctctt |
13795360 |
T |
 |
| Q |
291 |
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317 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||| | || ||||||||| |
|
|
| T |
13795359 |
tattccataaaaataatagttaattta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 172 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 30753655 - 30753506
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172 |
attgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggttttt-cttatgaaatgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||| |
|
|
| T |
30753655 |
attgattattttttacgataatatgtaaaaaaattactatgattcgtataaacaatgaaatgatgttttttacttatgaaatgttgttctataaaatata |
30753556 |
T |
 |
| Q |
271 |
aatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgttaatttata |
319 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || |||||| ||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
30753555 |
aatattgataaataactatttattacataaaaaatgatcgttaatttata |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #90
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153 |
Q |
| |
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||||||||| |||| |||||||||||| |||| || ||||||| || ||| ||||| |||| |||||||| |||||||| | ||||| || ||||| |
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| T |
39939389 |
gaagaaaaagaattgttttctatcattaacaattacaataattagatcttagttaccgaaagtgtcgacgaaataaaattttacattttttgaatttttg |
39939290 |
T |
 |
| Q |
154 |
ttactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgat |
235 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
39939289 |
ttacatataacaaagaatatatattattttttatgaaaaaatgttaaaaatttaatatgattcttataaataatgaaatgat |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #91
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Query Start/End: Original strand, 59 - 264
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aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattact |
158 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||| ||||||||||||| | |||| ||| ||||||||| |||| || |||||||| || |
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|
| T |
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aaaaataattattttctatcacttgcaattataataattaaatcttatttaccaaaaacgtcgatgaaataaaatttactttttt-gaatttttattgct |
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 |
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cataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgtt |
258 |
Q |
| |
|
|| || | ||||||||||| ||||||| || ||||||| || |||||||| || |||||||||||||||| | || ||||||| |||| ||||||| |
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| T |
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cacaatgaagaatattgatt-ttttttacgagaaaatgttaaaaatttaatataattcttataaacaatgaaacggtgttttttctcatgagatgatgtc |
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 |
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ttctaa |
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Q |
| |
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|
|
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ttctaa |
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Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
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307 |
Q |
| |
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| T |
2270953 |
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2270855 |
T |
 |
| Q |
308 |
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348 |
Q |
| |
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| T |
2270854 |
cgttaatttataga-tttatgaagcaagagtaccggtacac |
2270815 |
T |
 |
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Target: chr5; HSP #93
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgat |
307 |
Q |
| |
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|
| T |
13127217 |
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13127316 |
T |
 |
| Q |
308 |
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348 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
13127317 |
cgttaatttata-aaattatgaagaaagagtaccggtacac |
13127356 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #94
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216 |
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315 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| |||||||||||| |
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| T |
39816667 |
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39816568 |
T |
 |
| Q |
316 |
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348 |
Q |
| |
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|||| | || |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39816567 |
tata-aaattatgaagcaagagtaccggtacac |
39816536 |
T |
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Back To:
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Target: chr5; HSP #95
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| Q |
216 |
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314 |
Q |
| |
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|
| T |
42486767 |
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42486669 |
T |
 |
| Q |
315 |
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319 |
Q |
| |
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||||| |
|
|
| T |
42486668 |
ttata |
42486664 |
T |
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Target: chr5; HSP #96
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209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
9630145 |
tatgattcttataaacaatgaactgatgttttttcttatgaaatgatgttctataaaatataaatattgataaata |
9630220 |
T |
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Target: chr5; HSP #97
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Target Start/End: Original strand, 12334505 - 12334655
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269 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |
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| T |
12334505 |
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12334604 |
T |
 |
| Q |
270 |
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319 |
Q |
| |
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|
|
| T |
12334605 |
aaatattgacaaatagctatttattacataaaaaatgatcgttaatttata |
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T |
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Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
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Target Start/End: Original strand, 22780637 - 22780887
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97 |
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196 |
Q |
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| T |
22780637 |
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22780736 |
T |
 |
| Q |
197 |
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296 |
Q |
| |
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| T |
22780737 |
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22780836 |
T |
 |
| Q |
297 |
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347 |
Q |
| |
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| ||| |||| ||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||| |
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|
| T |
22780837 |
acaaaaaatgatagttaatttataaatttt-ttaaacaagagtgccggtaca |
22780887 |
T |
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158 |
Q |
| |
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||||| || |||||||||||||| | || || ||||||| ||||||||| |||||| ||| | ||| |||||||||||||| | ||||||||||| |
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| T |
35777702 |
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35777603 |
T |
 |
| Q |
159 |
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256 |
Q |
| |
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| T |
35777602 |
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35777503 |
T |
 |
| Q |
257 |
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272 |
Q |
| |
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|||||||||||||||| |
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| T |
35777502 |
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T |
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Target: chr5; HSP #100
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40803557 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaata |
40803632 |
T |
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Query Start/End: Original strand, 209 - 284
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42597643 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttatataaaatataaatattgacaaata |
42597568 |
T |
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267 |
Q |
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|
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| T |
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16496063 |
T |
 |
| Q |
268 |
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278 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
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ataaatattga |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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gaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaat |
267 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || || ||| ||| || | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| | |||||| |
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|
| T |
479883 |
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T |
 |
| Q |
268 |
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284 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| |
|
|
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ataaatattgaaaaata |
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T |
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Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||| || |||||| |
|
|
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3024321 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgataaataactatttatt |
3024236 |
T |
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190 |
Q |
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||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||| || |
|
|
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21051494 |
T |
 |
| Q |
191 |
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200 |
Q |
| |
|
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|
|
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21051493 |
aaaatgtaaa |
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158 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||||||| |||| | |||| || ||||||||| |||||| ||| |||| |||||| ||||||| | ||||||||| | |
|
|
| T |
43167030 |
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43167129 |
T |
 |
| Q |
159 |
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258 |
Q |
| |
|
||||| | |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| || || |
|
|
| T |
43167130 |
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43167228 |
T |
 |
| Q |
259 |
ttctaaaatataaa |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
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ttctaaaatataaa |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #107
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cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
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cttataaacaatgaaatgatgttttttctaataaaatgatgttctataaaatataaatattgacaaata |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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275 |
Q |
| |
|
||||||||||| || || ||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||| |
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|
| T |
8258598 |
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8258697 |
T |
 |
| Q |
276 |
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Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
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tgacaaata |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||| |||| |
|
|
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T |
 |
| Q |
308 |
cgttaatttatatattt |
324 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
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cttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaata |
28318442 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #111
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tatgatccttataaacaatgaaatgatgg-tttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgat |
307 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
36156078 |
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T |
 |
| Q |
308 |
cgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
|
||||| |||||| | ||| | || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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cgttagtttataga-tttataaagcaagagtaccggtacac |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #112
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192 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||| | |||||||| |||||||||| |||| || |||||| ||||| ||| | |||| |||||||||||||| | || |
|
|
| T |
2318713 |
taattaaatcttattaaccaaaaacgtcgacgaaataaaatttaatttttctgaatttttagtactcgtaatagagaattttgattattttttacaataa |
2318614 |
T |
 |
| Q |
193 |
aatgt-aaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttt |
290 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || || |
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|
| T |
2318613 |
aatgtaaaaaaaattagtatgatttttataaacaatgaaatgacgtttttttcttacaaaatgacattttctaaaatataaatatcaacaaatagctctt |
2318514 |
T |
 |
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291 |
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294 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
2318513 |
tatt |
2318510 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 211 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 9604598 - 9604488
Alignment:
| Q |
211 |
tgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcg |
309 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| || |||| | ||| ||| |||||| |
|
|
| T |
9604598 |
tgattcttataaacaattaaatgatg-tttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaatagctatttaatacataaaaaatgatcg |
9604500 |
T |
 |
| Q |
310 |
ttaatttatata |
321 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| |
|
|
| T |
9604499 |
ttcatttatata |
9604488 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 209 - 284
Target Start/End: Original strand, 38293856 - 38293931
Alignment:
| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
38293856 |
tatgattcttataaacaatgaaatgatgttttttcttacgaaatgaagttctataaaatataaatattgaaaaata |
38293931 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 204 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 40585037 - 40584893
Alignment:
| Q |
204 |
tttaatatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaa |
302 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| ||| |
|
|
| T |
40585037 |
tttactatgattcttacaaaaaatgaa-tgatgtgtttttcttatgaaatgatattttctaaaatataaatgccgacaaataactatttatctcataaaa |
40584939 |
T |
 |
| Q |
303 |
gtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacact |
349 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
40584938 |
ttgatcgtcaatttataaatttag-aaaataagagtatcggtacact |
40584893 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 148 - 348
Target Start/End: Original strand, 17069161 - 17069360
Alignment:
| Q |
148 |
tttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttctta |
246 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| || ||| ||||||||||| || || || ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
17069161 |
tttttatcgctcataataaagaactttgattattttatacgataatatgtaaaaaaattactatgattcttataaacaatg-aatgatgcgtttttcttc |
17069259 |
T |
 |
| Q |
247 |
tgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtac |
346 |
Q |
| |
|
|| ||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||| ||| ||||||||| |||||| | ||| |||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
17069260 |
tggaatcatattttctataatataaatgccgacaaataactatttatttcataaaattgatcgttagtttataga-tttatgaagcaggagtaccggtac |
17069358 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 216 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 36428068 - 36427936
Alignment:
| Q |
216 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttca-ttaaagtgatcgttaat |
314 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
36428068 |
cttataaacaatgcaatgatgttttttcttatgaaataatgttctataaaatataaatgttgataaatagttatttatttcacaaaaaatgatcgttaat |
36427969 |
T |
 |
| Q |
315 |
ttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
|
||||| | || || | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36427968 |
ttataaaattattg-agcaagagtaccggtacac |
36427936 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 216 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 39041468 - 39041360
Alignment:
| Q |
216 |
cttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaat |
314 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
39041468 |
cttatgaacaatgaa-tgatgtgtttttcttgtgaaatgatattttctaaaatataaatgccgacaaataactatttatttcataaaattgatcattaat |
39041370 |
T |
 |
| Q |
315 |
ttatatattt |
324 |
Q |
| |
|
||||| |||| |
|
|
| T |
39041369 |
ttataaattt |
39041360 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 68 - 272
Target Start/End: Original strand, 41609181 - 41609385
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| Q |
68 |
tattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaat |
167 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | || || ||||||| ||||||||| |||||| |||| ||| |||||| ||||||| | |||||||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
41609181 |
tattttctatcatttataattataataattatattttatttttcaaaagtgtcgataaagcaaaattcaaatttttttaatttttattactcgtaataat |
41609280 |
T |
 |
| Q |
168 |
gaatattgattattttttatgacaaaatg-taaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaa |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | |||||| |||| |||| ||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || || |||| ||||| |
|
|
| T |
41609281 |
gaatattgattatttttt-caataaaatgttaaaacatttagtataattcttataaaaaatgaaatgatgttttttcttatgggataatattttttaaaa |
41609379 |
T |
 |
| Q |
267 |
tataaa |
272 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
41609380 |
tataaa |
41609385 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 92 - 275
Target Start/End: Original strand, 2141360 - 2141544
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| Q |
92 |
ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||||| | || ||| | |||||||||| |||| || || ||||||||||||| | |||| |||| ||||||||| | | |
|
|
| T |
2141360 |
ataactaaatcttatttaccaaaaacatcaacgcaataaaatttaatttttttgaattcttattactcataatagagaattttgagtattttttacaata |
2141459 |
T |
 |
| Q |
192 |
aaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatat |
275 |
Q |
| |
|
|||||| || ||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
2141460 |
aaatgtgaaaaaattagtatgatttttataaaaaatgaaatgatgtttttttcatataaaatgatgttttctaaaatatatatat |
2141544 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 209 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 24431969 - 24431854
Alignment:
| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgat |
307 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||| |||| | |||||||| || |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
24431969 |
tatgattcttataaacagtgaa-tgatgtgtttttcttctgaaatcatattttctaaaatagaaatgtcgacaaataactatttatttcataaaattgat |
24431871 |
T |
 |
| Q |
308 |
cgttaatttatatattt |
324 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
24431870 |
cgttagtttataaattt |
24431854 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 209 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 35370568 - 35370429
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgat |
307 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||| || |||| | ||| ||| |||| |
|
|
| T |
35370568 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttattctataaaatataaaaattgacaaatagctatttactacataaaaaatgat |
35370469 |
T |
 |
| Q |
308 |
cgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| | || ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35370468 |
cgttcatttata-aaattaagaagcaagagtaccggtacac |
35370429 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 35817510 - 35817402
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| Q |
217 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaattt |
316 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||| | || ||||||| |
|
|
| T |
35817510 |
ttataatctatgaaataatgtttttccttatgaaatgatattttctaaaatataaatatcaacaaatagcattttatttcataaaaattatagttaattg |
35817411 |
T |
 |
| Q |
317 |
atatatttt |
325 |
Q |
| |
|
||| ||||| |
|
|
| T |
35817410 |
atagatttt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
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Target Start/End: Complemental strand, 9910209 - 9910134
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
9910209 |
tatgattcttataaacaattaaattatgttttttcttatgaaatggtgttctataaaatataaatattaacaaata |
9910134 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #125
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Query Start/End: Original strand, 209 - 284
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9913358 |
tatgattcttataaataattaaatgatgttttttattatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaata |
9913283 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 209 - 284
Target Start/End: Original strand, 33678394 - 33678469
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33678394 |
tatgattcttataaataattaaatgatgttttttcttataaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaata |
33678469 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 92 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 36339133 - 36338954
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| Q |
92 |
ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattatttttt-atgac |
190 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||||| | || ||| | |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| | |||| |||| |||||||| | | |
|
|
| T |
36339133 |
ataactaaatcttatttaccaaaaacgtcaacgcaataaaatttaatttttcagaatttttattactcataatagagaattttgagtatttttttaccat |
36339034 |
T |
 |
| Q |
191 |
aaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
36339033 |
aaaatgtaaaaaaattagtatgatttttataaaaaatgaaatgatgttctttcatataaaatgatattttccaaaatata |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
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134 |
ttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaatttt-ttaatatgatccttataaacaatgaaat |
232 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| || || ||||||| | ||| ||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3425952 |
ttaaattttttgaatttttatcactcataattgagaacattgattattttttacgataatatgtaaaaataattactataattcttataaacaatgaaat |
3426051 |
T |
 |
| Q |
233 |
gatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaa |
331 |
Q |
| |
|
||| ||||||| || ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||| | |||||||||||||| | || |||| |
|
|
| T |
3426052 |
gat--tttttctaataaaaggatgttctataaaatataaatattgacaaatagttatttattacataaaaaattatcgttaatttata-aaattatgaag |
3426148 |
T |
 |
| Q |
332 |
caagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| |
|
|
| T |
3426149 |
caagagtatcggtacac |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #129
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ataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttat |
318 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| | |||||||| || | |
|
|
| T |
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ataaataatgaaatgatgtttattcttataaaatgatgtcttataaaacataaatattgataaataactctttatttca-taaaataatcgttaaattgt |
39939094 |
T |
 |
| Q |
319 |
atattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
|
| || || |||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
39939093 |
aaatatt-tgaagcaggagtaccggtacac |
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T |
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Back To:
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Target: chr5; HSP #130
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300 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| | ||||| | ||||||||||||| | |
|
|
| T |
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1490765 |
T |
 |
| Q |
301 |
aagtgatcgttaatttatatatttt |
325 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
1490764 |
aagtgatatttaatttatagatttt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #131
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ttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaatttt-ttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatga |
249 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| | |
|
|
| T |
6561003 |
ttattactcataacagagaattttgattattttttacaataaaatgtaaaaaaaattagtatgatttttataaaaaatgaaatgatattttttcttataa |
6561102 |
T |
 |
| Q |
250 |
aatgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
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aatgatattttctaaaatata |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #132
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92 |
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191 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||||| | || ||| | |||||||| | |||| || || ||||||||||||| |||| |||||||||||||| | | |
|
|
| T |
2029471 |
ataactaaatcttatttaccaaaaacgtcaacgcaataaaatttgatttttctgaattcttattactcataattgagaattttgattattttttacaata |
2029570 |
T |
 |
| Q |
192 |
aaatgtaaattt-tttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
2029571 |
aaatgtaaaaaaatttagtatgatttttataaaaaatgaaatgatgttttatcttataaaataatattttctaaaatata |
2029650 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #133
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92 |
ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||||| | || ||| | |||||||| | |||| || || ||||||||||||| | |||| |||| ||||||||| | | |
|
|
| T |
2414042 |
ataactaaatcttatttaccaaaaacatcaacgcaataaaatttgatttttctgaattcttattactcataatagagaattttgagtattttttacaata |
2414141 |
T |
 |
| Q |
192 |
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270 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
2414142 |
aaatgtgaaaaaattagtatgatttttataaaaaatgaaatgatgtttttttcatataaaatgatgttttctaaaatata |
2414221 |
T |
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118 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
9499314 |
aaaaataattattttctatcattgacaattataataattaaatcttatttatcaaaagct |
9499373 |
T |
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191 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||||| | || ||| | |||||||| | |||| || || ||||||||||||| | |||| |||| ||||||||| | | |
|
|
| T |
9534985 |
ataactaaatcttatttaccaaaaacatcaacgcaataaaatttgatttttctgaattcttattactcataatagagaattttgagtattttttacaata |
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T |
 |
| Q |
192 |
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270 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
9535085 |
aaatgtgaaaaaattagtatgatttttataaaaaatgaaatgatgtttttttcatataaaatgatgttttctaaaatata |
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T |
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tttttattactcataacaatgaatattgattattttttatg-acaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttctta |
246 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||| || | ||||||| || ||| |||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
14054588 |
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14054687 |
T |
 |
| Q |
247 |
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294 |
Q |
| |
|
| |||| || |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||| |
|
|
| T |
14054688 |
taaaataatattttctaaaatataaaagttgataaatatctctttatt |
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T |
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307 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || || | |||||||||| ||| | || |
|
|
| T |
33210606 |
tatgattcttatagacaatgaactggtattttttcttatgaaatgatgttctataaaatataaatattgataactagttatttatttcataaaaaattat |
33210705 |
T |
 |
| Q |
308 |
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Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
33210706 |
cgttaatttata |
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T |
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ttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatg |
248 |
Q |
| |
|
||||||| || |||| | |||||||| ||||||||||| || || || |||| |||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
33902313 |
ttttattccttataatagtgaatatttattattttttacgataacatataaaaaatttagtatgattcttataaacaatgaaatcatattttttcttatg |
33902214 |
T |
 |
| Q |
249 |
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272 |
Q |
| |
|
||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
33902213 |
aaactatgtttttaaaaatataaa |
33902190 |
T |
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92 |
ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||| ||||||| | || || |||||||||| | |||| || || ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| | | |
|
|
| T |
34302766 |
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34302865 |
T |
 |
| Q |
192 |
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270 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
34302866 |
aaatgtaaaaaaaattagtatgatttttataaaaaatgaaatgatattttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
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T |
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gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattt |
324 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||| |
|
|
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43059626 |
gtttttcttatgaaatgatattttctaagatataaatgccgacaaataactaattatttcataaaattgatcattaatttataaattt |
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T |
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247 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||| | |||||||||||||| |||| || ||||||| || ||| |||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
231674 |
tttttaatacccataatagtgaatattgattatctttttggataaaatgttaaaaaattagtatgattcttataaaggatgaaatgacgttttttcttat |
231773 |
T |
 |
| Q |
248 |
gaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttat |
318 |
Q |
| |
|
|||| || |||| ||||||||||| |||| ||||| || |||||| ||| ||| |||||| ||| |||| |
|
|
| T |
231774 |
aaaataatattttttaaaatataaaagttgataaatatctctttattacataaaaatgatcgataacttat |
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T |
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ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||||| || ||| | |||||||| | |||| || || |||||| |||||| | |||| |||||||||||||| | | |
|
|
| T |
6532697 |
ataactaaatcttatttaccaaaaatgtcaacgcaataaaatttgatttttctgaattcttattattcataatagagaattttgattattttttacaata |
6532796 |
T |
 |
| Q |
192 |
aaatgtaaattt--tttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacct |
287 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||| |
|
|
| T |
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aaatgtaaaaaaaatttagtatgatttttataaaaaatgaaatgatgttttatcttataaaatgatattttctaaaatatatatgttaacaaacacct |
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T |
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taatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaa |
272 |
Q |
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|||| |||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
8780264 |
taatttgattcttataaactatgaaattatgttttttcttatgaaataatattttctaaaatataaa |
8780330 |
T |
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167 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | || || ||||||| ||||||||| |||||| ||| | ||| |||||| || |||| | |||| ||||||||||| | | |
|
|
| T |
14721148 |
tattttctatcatttataattataataattatattttatttttcaaaagtgtcggcaaagcaaaattcaattttttttaattttcattactcataatagt |
14721247 |
T |
 |
| Q |
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gaatattgattattttttatgacaaaatgt-aaattttttaatatgatcctt-ataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaa |
265 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||| |
|
|
| T |
14721248 |
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14721347 |
T |
 |
| Q |
266 |
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272 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
14721348 |
atataaa |
14721354 |
T |
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agtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttctt |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | | ||||||||| ||| |||| || ||| || ||||| |||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
19211240 |
agtttttattactcataatagtgaatattgattattttt-acaatgaaatgtaaaaaatttcatataattcttttacacaataaaatgatgttttatctt |
19211142 |
T |
 |
| Q |
246 |
atgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
19211141 |
atgaaatggtatttttgaaaatataaacgttgacaaata |
19211103 |
T |
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ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||||| | || ||| | |||||||| | |||| || || ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| | | |
|
|
| T |
1661982 |
ataactaaatcttatttaccaaaaacgtcaacgcaataaaatttgatttttctgaattcttattactcataatggagaattttgagtattttttacaata |
1661883 |
T |
 |
| Q |
192 |
aaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatg---gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctt |
288 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || | ||||| |||| |
|
|
| T |
1661882 |
aaatgtaaaaaaattaatatgatttttataaaaaatgaaatgatgtttttttttcatataaaatgatattttctaaaatatatatgtcaacaaacaccta |
1661783 |
T |
 |
| Q |
289 |
tttatttcat-taaagtgatcgttaatttata |
319 |
Q |
| |
|
||| |||||| ||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
1661782 |
tttttttcataaaaaatgatagttaatttata |
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T |
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Target: chr5; HSP #147
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
4616938 |
tatgattcttataaacaatgaaatgatgttttttcttacgaaatga---tctataaaatataaatattgaaaaata |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatc |
308 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||| ||| ||| ||||| |
|
|
| T |
32092318 |
tatgattcttataaaggatgaaatgacgttttttcttataaaataatattttctaaaatataaaagttgataaatatctctttattacataaaaatgatc |
32092417 |
T |
 |
| Q |
309 |
gttaatttat |
318 |
Q |
| |
|
| ||| |||| |
|
|
| T |
32092418 |
gataacttat |
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Q |
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|
|||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
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6260283 |
tttttcttataaaatgatgttctataaaatataaatattgacaaatagctatttatt |
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T |
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Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11758641 |
tgggtgtatcagtacaccaagtcgtaaaattaataataaat |
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T |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttt-tcttatgaaatgatgttttctaaaatataaa |
272 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
15264279 |
tatgattcttataaagaatgaaatgatgtttttttcttatgaaataatattttctaaaatataaa |
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T |
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tttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgt--aaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttctt |
245 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| | || |||||||||||||||| | ||||||| ||| |||| ||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
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ttttttttactcataatagtgtatattgattatttttttcaataaaatgttaaaaaaatttagtataattcttataaaaaatgaaatgatattttttctt |
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T |
 |
| Q |
246 |
atgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattt |
324 |
Q |
| |
|
|||| || || |||||||| ||||||| | || ||||| || ||||| ||||||| | |||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
664878 |
atgagataatattttctaagatataaaagtcgataaatatctctttatcacattaaaattatcgttaacttatagattt |
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T |
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| |
|
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|
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Q |
| |
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|
| T |
32467161 |
ataactaaatcttatttaccaaaaacgtcaacgcaataaaatttgatttttgtgaattcttattactcatgatagagaattttgattattttttacaata |
32467260 |
T |
 |
| Q |
192 |
aaatgtaaatttt-ttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
32467261 |
aaatgtaaaaaaaattagtatgatttttataaaaaatgaaatgatattttttcttataaaatgatattttctgaaatata |
32467340 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #155
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| Q |
152 |
tattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgta-aattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaa |
250 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||| |||||||||||||| | |||||||| || |||| |||||| || |||| ||| |||||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
42917296 |
tattactcataatagagaattttgattattttttacaataaaatgtagaaaaatttagtatgatttttctaaaaaataaaatgatgttttttcttataaa |
42917395 |
T |
 |
| Q |
251 |
atgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
42917396 |
atgatattttctaaaatata |
42917415 |
T |
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| Q |
171 |
tattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatg--atggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaata |
268 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| | ||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
20464776 |
tattgatttttttttacaataaaatataaaatttttgatatgattcttataaacaatgagatgatattttttttcttatgaaatgacattttataaaata |
20464875 |
T |
 |
| Q |
269 |
taaatattgacaaatacctttttatttcat |
298 |
Q |
| |
|
||| |||| ||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
20464876 |
acaat-ttgaaaaatagctctttatttcat |
20464904 |
T |
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Target: chr5; HSP #157
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168 |
gaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttctt--atgaaatgatgttttctaaa |
265 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||| | || |||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
31076739 |
gaatattgattattttttatgataaaatatgaaaaatttagaatgattcttataaacagtaaaatgatatttttttttttatgaaatgatattttctaaa |
31076838 |
T |
 |
| Q |
266 |
atataaatat |
275 |
Q |
| |
|
||| |||||| |
|
|
| T |
31076839 |
ataaaaatat |
31076848 |
T |
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Target: chr5; HSP #158
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Target Start/End: Complemental strand, 21946150 - 21946050
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| Q |
217 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaattt |
316 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| ||||| || |||||| || |||||||||||| ||| || | ||||| || |||||||||| ||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
21946150 |
ttataaacaataaaatgatgtttttttttgtgaaataatattttctaaaatacaaa-atcgttaaatagctctttatttcataaaaatgattgttaattt |
21946052 |
T |
 |
| Q |
317 |
at |
318 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
21946051 |
at |
21946050 |
T |
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Target: chr5; HSP #159
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 217 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 43237517 - 43237464
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| Q |
217 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
43237517 |
ttataaaaaatgaaatgatattttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
43237464 |
T |
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Target: chr5; HSP #160
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaat--gaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtga |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||| || |||| |||||||||| | ||||||| || |||||||||| ||| | | |
|
|
| T |
33654998 |
tatgatccttataaacaatatgaaataatgtttttgcttatgaaataatttttt--aaaatataaaagtcaacaaataactctttatttcataaaaataa |
33654901 |
T |
 |
| Q |
307 |
tcgttaattta |
317 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
33654900 |
tcgttaattta |
33654890 |
T |
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Target: chr5; HSP #161
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| Q |
257 |
ttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattt |
324 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
1445847 |
ttttctaaaatataaatgccgacaaataactatttatttcataaaattgatcgttagtttataaattt |
1445780 |
T |
 |
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Target: chr5; HSP #162
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Target Start/End: Original strand, 24097989 - 24098167
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| Q |
92 |
ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||||| | || | | | |||||||| | |||| || || ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| | | |
|
|
| T |
24097989 |
ataactaaatcttatttaccaaaaacgtcaatgcaataaaatttgatttttctgaattcttattactcataatagagaattttgattattttttacaata |
24098088 |
T |
 |
| Q |
192 |
aaatgtaaattttttaatatgatccttat-aaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||| | || ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
24098089 |
aaatgtaataaaattaatatgatttttataaaaaaatgaaatgat-gtttttttaataaaatgatattttctaaaatata |
24098167 |
T |
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Target: chr5; HSP #163
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| Q |
204 |
tttaatatgatccttataaacaatgaaatg--atggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaa |
272 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
25395032 |
tttaatatgattcttataaactatgaaatattattttttttcttacgaaatgatattttctaaaatataaa |
25395102 |
T |
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Target: chr5; HSP #164
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Target Start/End: Original strand, 32455561 - 32455648
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| Q |
237 |
gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattt |
324 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||| || |||||||||| ||| |||| ||||| |||| |||| |
|
|
| T |
32455561 |
gtttttcttatgaaatgatattttctgagatataaatgccgacaaataactatttatttcataaaattgattattaatgtataaattt |
32455648 |
T |
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Target: chr5; HSP #165
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| Q |
246 |
atgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
702192 |
atgaaatgatgttctataaaatataaatattgacaaata |
702230 |
T |
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Target: chr5; HSP #166
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| Q |
150 |
tttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
7456577 |
tttattactcataataatggatattgattatttttt-tgataaaatgtaaa |
7456528 |
T |
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Target: chr5; HSP #167
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Query Start/End: Original strand, 204 - 270
Target Start/End: Original strand, 21605880 - 21605946
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| Q |
204 |
tttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
21605880 |
tttaatatgatttttctaaaaaatgaaatgatgttcttttttataaaatgatattttctaaaatata |
21605946 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #168
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 4839578 - 4839529
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| Q |
246 |
atgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttattt |
295 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| |
|
|
| T |
4839578 |
atgaaatgatattttctaaaatataaaaatcgacaaataactctttattt |
4839529 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #169
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
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Target Start/End: Complemental strand, 7456493 - 7456409
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| Q |
100 |
attttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattatttttt |
185 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| ||| ||||| ||| ||||| |||||| | | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
7456493 |
attttatttctcaaaagtgtcggcgaagcaaattttaacttttaa-attatttattactcataataatggatattgattatttttt |
7456409 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #170
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Query Start/End: Original strand, 204 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 10568654 - 10568535
Alignment:
| Q |
204 |
tttaatatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaa |
302 |
Q |
| |
|
|||| |||||| | |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| | |||||| || |||||||||| ||| |
|
|
| T |
10568654 |
tttactatgattcgtataaacaat-aaataatgtgtttttcttatgaaatg-tattttttaaaatataaatgccggcaaataactatttatttcataaaa |
10568557 |
T |
 |
| Q |
303 |
gtgatcgttaatttatatattt |
324 |
Q |
| |
|
| ||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
10568556 |
ttaatcattaatttatagattt |
10568535 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #171
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| Q |
60 |
aaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttacca |
112 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
14096724 |
aaaagaattattttttatcattgacaattataataattaaatcttatttacca |
14096672 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #172
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
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| Q |
257 |
ttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtacc |
341 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
35162596 |
ttttctaaaacataaatattaataaatagctttttatttt-tcaaaatgatcgttaatttata-aatttatgaagcaagagtacc |
35162678 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #173
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 216 - 272
Target Start/End: Original strand, 36183981 - 36184037
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| Q |
216 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaa |
272 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
36183981 |
cttataaagaatgaagtgatattttttcttatgaaataatattttttaaaatataaa |
36184037 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 252)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Original strand, 17376384 - 17376741
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| Q |
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tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17376384 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
17376483 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
17376484 |
ttttatttaccaaaagtttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgagaaaatgtaaa |
17376583 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17376584 |
ttttttaatatgatccttataaacaatgaaatgattgtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
17376683 |
T |
 |
| Q |
301 |
aagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgt |
358 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17376684 |
aagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtactggtacactcaaaattgt |
17376741 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 29171194 - 29171553
Alignment:
| Q |
1 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29171194 |
tgggtgtatcgatacaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
29171293 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
29171294 |
ttttatttaccaaaagcttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaatattgattattttttataacaaaatgtaaa |
29171393 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
300 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29171394 |
ttttttaatttgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattaacaaatacctttttatttcatta |
29171493 |
T |
 |
| Q |
301 |
aagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
360 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29171494 |
aagtgatcgttaatttataaattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
29171553 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 3150563 - 3150204
Alignment:
| Q |
1 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3150563 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
3150464 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
200 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3150463 |
ttttatataccaaaagtttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcatatcaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
3150364 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
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Q |
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T |
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Target: chr1; HSP #4
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Target Start/End: Original strand, 10061186 - 10061545
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Q |
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T |
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Q |
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| T |
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T |
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| Q |
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360 |
Q |
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T |
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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 9223233 - 9222873
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T |
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299 |
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360 |
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T |
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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 50502722 - 50502363
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Q |
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300 |
Q |
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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
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T |
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| Q |
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200 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
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300 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
301 |
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359 |
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48481178 |
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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 7427038 - 7426683
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200 |
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300 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 5 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 9260190 - 9259835
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Q |
| |
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204 |
Q |
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| T |
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205 |
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304 |
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9259891 |
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360 |
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Target: chr1; HSP #10
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Q |
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300 |
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| |
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|
| T |
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40850349 |
T |
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360 |
Q |
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|
| T |
40850350 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 43225023 - 43224664
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Q |
| |
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| Q |
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200 |
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| T |
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T |
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201 |
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300 |
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| |
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| T |
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T |
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| Q |
301 |
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360 |
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| |
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|
|
| T |
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Target: chr1; HSP #12
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Query Start/End: Original strand, 5 - 360
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104 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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tgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaatttt |
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T |
 |
| Q |
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204 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
205 |
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304 |
Q |
| |
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44647320 |
T |
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| Q |
305 |
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Q |
| |
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|
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| T |
44647319 |
gatctttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #13
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Query Start/End: Original strand, 5 - 360
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| |
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atttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaatttt |
204 |
Q |
| |
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atttaccaaaagcttcaacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcgtaacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaatttt |
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T |
 |
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ttaatatgatccttataaacaatgaaatgatgg--tttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaa |
302 |
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| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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gtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
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Target: chr1; HSP #14
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 4 - 360
Target Start/End: Original strand, 27038575 - 27038931
Alignment:
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4 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 48868441 - 48868081
Alignment:
| Q |
1 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24248180 - 24247839
Alignment:
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 33829243 - 33828883
Alignment:
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 33838723 - 33839083
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 3 - 356
Target Start/End: Original strand, 39852988 - 39853343
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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 41321034 - 41321393
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Original strand, 14190919 - 14191278
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Q |
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T |
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Q |
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14191218 |
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356 |
Q |
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14191219 |
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14191278 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 5 - 360
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Q |
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Q |
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T |
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303 |
Q |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 5 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 52274093 - 52273738
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gatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 8569354 - 8569018
Alignment:
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1 |
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100 |
Q |
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| T |
8569354 |
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8569255 |
T |
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| Q |
101 |
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200 |
Q |
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| T |
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8569155 |
T |
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| Q |
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300 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
301 |
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342 |
Q |
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| T |
8569055 |
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8569018 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 31571347 - 31570990
Alignment:
| Q |
1 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
100 |
Q |
| |
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||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
31571347 |
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31571248 |
T |
 |
| Q |
101 |
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200 |
Q |
| |
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| T |
31571247 |
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31571150 |
T |
 |
| Q |
201 |
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300 |
Q |
| |
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|
| T |
31571149 |
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31571050 |
T |
 |
| Q |
301 |
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360 |
Q |
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|
|
| T |
31571049 |
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31570990 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 14131727 - 14131371
Alignment:
| Q |
1 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcatt-gacaactaagataattaa |
99 |
Q |
| |
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|
| T |
14131727 |
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14131634 |
T |
 |
| Q |
100 |
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199 |
Q |
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| T |
14131633 |
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14131534 |
T |
 |
| Q |
200 |
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297 |
Q |
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| T |
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14131434 |
T |
 |
| Q |
298 |
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360 |
Q |
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| T |
14131433 |
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14131371 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 75 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 49289533 - 49289248
Alignment:
| Q |
75 |
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174 |
Q |
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| T |
49289533 |
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49289434 |
T |
 |
| Q |
175 |
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274 |
Q |
| |
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| T |
49289433 |
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49289334 |
T |
 |
| Q |
275 |
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360 |
Q |
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| T |
49289333 |
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49289248 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 3 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 1658916 - 1658569
Alignment:
| Q |
3 |
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102 |
Q |
| |
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| T |
1658916 |
ggtgtatcggtacatcaagtcgtaaaattaataataaatcagttgtttttttgaagaaaaataattattttctatcattgacaa---------ttaaatt |
1658826 |
T |
 |
| Q |
103 |
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202 |
Q |
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| T |
1658825 |
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1658726 |
T |
 |
| Q |
203 |
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302 |
Q |
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| T |
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1658626 |
T |
 |
| Q |
303 |
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359 |
Q |
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| T |
1658625 |
gtgttcgttaatttataaattttgtgcaacaagaataccggtacactcaaaattgtg |
1658569 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 20280251 - 20280598
Alignment:
| Q |
1 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
100 |
Q |
| |
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|
| T |
20280251 |
tgggtgtatcggtacaccaattcattaaattaataataaattagttgttttttt-aagaaaaataattattttctaccattgacaactataataattaaa |
20280349 |
T |
 |
| Q |
101 |
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200 |
Q |
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| T |
20280350 |
ttttatttaccaaaagcttcgacgaaataaaatttaatttttacaaatttttactactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
20280449 |
T |
 |
| Q |
201 |
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300 |
Q |
| |
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| T |
20280450 |
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20280549 |
T |
 |
| Q |
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349 |
Q |
| |
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| T |
20280550 |
aaatgattgttaatttataagttttgtgaaacaagagtaccggtacact |
20280598 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 33234432 - 33234084
Alignment:
| Q |
1 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
33234432 |
tgggtgtatcggtacaccaatttattaaattaataataaattagttgtttttttgaagaaaaataattattttctatcattgacaactataataattaaa |
33234333 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
200 |
Q |
| |
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| T |
33234332 |
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33234233 |
T |
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| Q |
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300 |
Q |
| |
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|
| T |
33234232 |
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33234133 |
T |
 |
| Q |
301 |
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349 |
Q |
| |
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|
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| T |
33234132 |
aaatgatcgttaatttataagttttgtgaaacaaaagtactggtacact |
33234084 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 41550524 - 41550177
Alignment:
| Q |
1 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
41550524 |
tgggtgtatcggtataccaatttattaaattaataataaattagttgtttttttgaagaaaaataattattttttctcattgacaattataataattaaa |
41550425 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
200 |
Q |
| |
|
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|
| T |
41550424 |
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41550326 |
T |
 |
| Q |
201 |
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300 |
Q |
| |
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|
| T |
41550325 |
ttttttaatatgatccttataaacaacgaaatgatgttttttcttatgatatgacgttttctaaaatataaatattgacaaataactttttatttcataa |
41550226 |
T |
 |
| Q |
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349 |
Q |
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| T |
41550225 |
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41550177 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 11 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 33772011 - 33771676
Alignment:
| Q |
11 |
ggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttac |
110 |
Q |
| |
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|||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33772011 |
ggtacaccaattcgttaaattaataataaattagttgttttttt-aagaaaaataattattttctatcattgacaactataataattaaattttatttac |
33771913 |
T |
 |
| Q |
111 |
caaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaata |
210 |
Q |
| |
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| T |
33771912 |
caaaagcttcgacgaaataaaatatattttttacaaatttttactactcataacaatgaatattggttattttttatgacaa--tgtaaattttttaata |
33771815 |
T |
 |
| Q |
211 |
tgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgt |
310 |
Q |
| |
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| T |
33771814 |
tgatccttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgatatgacgttttctaaaatataaatattgacaaataactttttatttcataaaaatgatcgt |
33771715 |
T |
 |
| Q |
311 |
taatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacact |
349 |
Q |
| |
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| T |
33771714 |
taatttataagttttgtgaaacaagagtaccagtacact |
33771676 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 5 - 358
Target Start/End: Original strand, 22821280 - 22821634
Alignment:
| Q |
5 |
tgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnn-gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattt |
103 |
Q |
| |
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|
| T |
22821280 |
tgtatcggtacaccaagtcgttaaattaataataaatgagttgttttttttgaagaaaaataattattttctatcattgacagcaataataattaaattt |
22821379 |
T |
 |
| Q |
104 |
tatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattt |
203 |
Q |
| |
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| T |
22821380 |
tatttaccaaaagttttgacgaaataaaatttaatttttacgaatttttattactcataacaatgaatatttattattttttatgacaaaatgtgaaaat |
22821479 |
T |
 |
| Q |
204 |
tttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaag |
303 |
Q |
| |
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| T |
22821480 |
tttaatatcatccttataaacaatgaaatgatcttttttcttatgaaatgatgttttttaaaatataaatattgacaaataattttttatttcataaaaa |
22821579 |
T |
 |
| Q |
304 |
tgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgt |
358 |
Q |
| |
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| T |
22821580 |
taatcgttaatttataaattttgtaaaacaaatgtactggtacactaaaatttgt |
22821634 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 5 - 356
Target Start/End: Original strand, 52079474 - 52079816
Alignment:
| Q |
5 |
tgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnng--aagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaatt |
102 |
Q |
| |
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|
| T |
52079474 |
tgtatcggtacactaagttgtaaaattaataataaatgagttgttttttttttaagaaaaataattattttctatctttgacaactaagataattaaatt |
52079573 |
T |
 |
| Q |
103 |
ttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaatt |
202 |
Q |
| |
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| T |
52079574 |
ttatataccaaaagtttcgacgaaataaaatttaatttttaatattttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaatt |
52079673 |
T |
 |
| Q |
203 |
ttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaa |
302 |
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| T |
52079674 |
ttgtaatatgatccttataaacaatgaaatgattatttttcttatgaaatgatgttttataaaatataaatattgacaaatacc-ttttatcactttaa- |
52079771 |
T |
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303 |
gtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaatt |
356 |
Q |
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|| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
52079772 |
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52079816 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 49739172 - 49739507
Alignment:
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Q |
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| T |
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49739271 |
T |
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200 |
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49739358 |
T |
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300 |
Q |
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| T |
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49739458 |
T |
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| Q |
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349 |
Q |
| |
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|
|
| T |
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aaatgatcgttaatttataagttttgtgaaacaagagtaccggtacact |
49739507 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 25 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 31016221 - 31015907
Alignment:
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25 |
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124 |
Q |
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31016122 |
T |
 |
| Q |
125 |
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224 |
Q |
| |
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|
| T |
31016121 |
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T |
 |
| Q |
225 |
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324 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
325 |
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360 |
Q |
| |
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| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
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tatgaaacaagagtatcggtacacttaaaattgtga |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 139 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 10635485 - 10635264
Alignment:
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238 |
Q |
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ttttaagaatttttattgctcataacaatgaatattgattatttttcatgacaaaatgtaaattttttaatatgattcttataaataataaaatgacggt |
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T |
 |
| Q |
239 |
ttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagt |
338 |
Q |
| |
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||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
10635385 |
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10635286 |
T |
 |
| Q |
339 |
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360 |
Q |
| |
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|||| |||||||||||||||| |
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| T |
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accgacacactcaaaattgtga |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 47861104 - 47860901
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| Q |
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100 |
Q |
| |
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T |
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| Q |
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200 |
Q |
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T |
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| Q |
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204 |
Q |
| |
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tttt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 28095120 - 28094808
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7 |
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106 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || | ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
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| T |
28095120 |
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T |
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| Q |
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206 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
207 |
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306 |
Q |
| |
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| T |
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28094851 |
T |
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| Q |
307 |
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349 |
Q |
| |
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| T |
28094850 |
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Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Original strand, 2684044 - 2684217
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5 |
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104 |
Q |
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
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179 |
Q |
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|
| T |
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2684217 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 220 - 356
Target Start/End: Original strand, 2684216 - 2684352
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| Q |
220 |
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319 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
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taaacaatgaaatgatgatttttcttacgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacatttttatttcattaaagtgatctttaatttata |
2684315 |
T |
 |
| Q |
320 |
tattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaatt |
356 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
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tattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaatt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 56 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 48313631 - 48313362
Alignment:
| Q |
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155 |
Q |
| |
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| T |
48313631 |
aagaaaaataattattttctatcattgacaattataataattcaatcttatttatcaaaagcttcgacgaaataaaatttactttttttgcatttttatt |
48313532 |
T |
 |
| Q |
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253 |
Q |
| |
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|
| T |
48313531 |
actcataacaaagaatattgattattttttatgagaaattgttaaaaatttaatataattcttataaacaatgaaatgatgtttttttccctatgaaact |
48313432 |
T |
 |
| Q |
254 |
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324 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||| || | ||||||||||| |||| |
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|
| T |
48313431 |
atgttttctaaaatataaatattatcaaatagttttttattttatgaaa-tggtagttaatttataaattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 55 - 325
Target Start/End: Original strand, 24451821 - 24452090
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| Q |
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Q |
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|
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|
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24451821 |
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24451920 |
T |
 |
| Q |
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254 |
Q |
| |
|
||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
24451921 |
tacatataacaaagaatattgattattttttataagaaaatgttaaaaatttaatatgattcttataaacaataaaataatgttttttcttataaaatga |
24452020 |
T |
 |
| Q |
255 |
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325 |
Q |
| |
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||||| ||||||||||||||| | ||||| || ||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||| |
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|
| T |
24452021 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 56 - 347
Target Start/End: Original strand, 46918469 - 46918756
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| Q |
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aagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttatt |
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Q |
| |
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| T |
46918469 |
aagaaaaagaattattttttatcattgataattataacaattaaatcttatttaccaaaagcgttcacgaaataaaatatactttttttgaatttttatt |
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T |
 |
| Q |
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actcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgat-ggtttttcttatgaaatga |
254 |
Q |
| |
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| T |
46918569 |
actcataataaagaatattgattattttttatgagaaaatgttaaaattttaataagattcttataaaca--gaaatgatatttttttcttatgaagtga |
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T |
 |
| Q |
255 |
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347 |
Q |
| |
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| T |
46918667 |
tgttttctaaaatataaatattgacaaatagc-tcttatttca-taaaatgatcgttaatttata-aatttatgaagcaagagtaccggtaca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 58 - 324
Target Start/End: Original strand, 41568530 - 41568796
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gaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattac |
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Q |
| |
|
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gaaaaataattattttctatcattgacaattataataattaaatcttatttaccataagcgtcgatgaaataaaatttactttttttgaatttttattgc |
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T |
 |
| Q |
158 |
tcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgaaatgatg |
256 |
Q |
| |
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41568630 |
tcataatgaagaatattgattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatataattcatataaacaatgaaatgatgtttttttcttatgagatggtg |
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T |
 |
| Q |
257 |
ttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattt |
324 |
Q |
| |
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|
| T |
41568730 |
ttttctaaaatataaataatgacaaataacaacttatttca-taaaatgatcattaatttataaattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 55 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 23540274 - 23539974
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55 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaa--gagttttt |
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Q |
| |
|
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23540274 |
gaagaaaaataattgttttctattattgacaattataataatcaaattttatttaccaaaagcttcgacgaattaaaatttactttttttttgaattttt |
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T |
 |
| Q |
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attactcataac-------aatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttctt |
245 |
Q |
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| T |
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23540075 |
T |
 |
| Q |
246 |
atgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggta |
345 |
Q |
| |
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atgaaatgatgttttctaaaatataagcattaacaaatagctttttatttca-tagaatggtcgttaatttata-attttttagagcaagagtaccggta |
23539977 |
T |
 |
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346 |
cac |
348 |
Q |
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cac |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 51005114 - 51004874
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| |
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gaagaaaaataattgttttctatcattaacaattacaataattagatcttatttaccaaaagtgtcgacggaataaaattttttttttttgaatttttgt |
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T |
 |
| Q |
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tactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatga |
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Q |
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| T |
51005014 |
tacatataacaaagaatattgattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatatgattcttataaacaatgaaatgatgttttttcttataaaatga |
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 |
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tgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttattt |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #49
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Query Start/End: Original strand, 59 - 324
Target Start/End: Original strand, 14077416 - 14077681
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Q |
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| T |
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T |
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256 |
Q |
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| T |
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14077614 |
T |
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324 |
Q |
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| T |
14077615 |
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14077681 |
T |
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Target: chr1; HSP #50
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154 |
Q |
| |
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T |
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252 |
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| T |
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17644514 |
T |
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253 |
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347 |
Q |
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T |
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Target: chr1; HSP #51
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Q |
| |
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T |
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Q |
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T |
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324 |
Q |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #52
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Query Start/End: Original strand, 59 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 34411271 - 34411004
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158 |
Q |
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T |
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255 |
Q |
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| T |
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34411072 |
T |
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| Q |
256 |
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324 |
Q |
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Target: chr1; HSP #53
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T |
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138 |
Q |
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T |
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158 |
Q |
| |
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253 |
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| T |
47458811 |
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T |
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Target: chr1; HSP #55
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Query Start/End: Original strand, 59 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 51873594 - 51873367
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| T |
51873395 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #56
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Target Start/End: Complemental strand, 30547088 - 30546820
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255 |
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324 |
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Q |
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254 |
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| |
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| T |
1845196 |
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Target: chr1; HSP #58
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Q |
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|
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T |
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| Q |
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152 |
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| T |
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158 |
Q |
| |
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T |
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252 |
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| |
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| T |
39084934 |
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39084835 |
T |
 |
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253 |
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324 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||||||||| |||| |
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|
| T |
39084834 |
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Target: chr1; HSP #60
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254 |
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| T |
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T |
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255 |
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324 |
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| |
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| T |
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254 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
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348 |
Q |
| |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #62
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Query Start/End: Original strand, 55 - 348
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| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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tactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatga |
254 |
Q |
| |
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| T |
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tacatataacaaagaatatttattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatatgattcttataaacaatgaaatgctgtttattcttataaaataa |
43916470 |
T |
 |
| Q |
255 |
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Q |
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| T |
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43916378 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
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Target Start/End: Complemental strand, 24594184 - 24593942
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155 |
Q |
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| T |
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T |
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T |
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Target: chr1; HSP #64
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Target Start/End: Original strand, 47601749 - 47601978
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66 |
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165 |
Q |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 298
Target Start/End: Original strand, 45650090 - 45650334
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153 |
Q |
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| T |
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 |
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298 |
Q |
| |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 347
Target Start/End: Original strand, 47209128 - 47209417
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154 |
Q |
| |
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254 |
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| T |
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347 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 8096921 - 8096679
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154 |
Q |
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| T |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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298 |
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| |
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| T |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 59 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 24677872 - 24677607
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158 |
Q |
| |
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| Q |
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257 |
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| T |
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324 |
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T |
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Target: chr1; HSP #69
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Query Start/End: Original strand, 258 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 47860876 - 47860774
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357 |
Q |
| |
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| T |
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| |
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||| |
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| T |
47860776 |
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T |
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Target: chr1; HSP #70
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Target Start/End: Complemental strand, 48752278 - 48752128
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Q |
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| |
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T |
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Back To:
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Q |
| |
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5360423 |
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256 |
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284 |
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5360322 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 55 - 298
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154 |
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298 |
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| T |
12222756 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
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Q |
| |
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| T |
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252 |
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| T |
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13216218 |
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| |
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| T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #74
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Q |
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taattaaatcttatttaccataagcctcgatgaaataaaatttactttttttgaatttttattgctcataatgaagaatattgattattttttatgagaa |
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T |
 |
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291 |
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| |
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46283093 |
T |
 |
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292 |
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324 |
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| |
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| T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #75
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| |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #76
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| |
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T |
 |
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ctcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatg---gtttttcttatgaaatg |
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| |
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ctcataatgaagaatattgattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatataattcataaaaacaatgaaatgatgtttttttttctcatgagatg |
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 |
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Q |
| |
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gtgttttctaaaatataaataatgacaaataacaacttatttca-taaaatgatcattaatttataaattt |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #77
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T |
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Target: chr1; HSP #78
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353 |
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T |
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Target: chr1; HSP #79
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154 |
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39871490 |
T |
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Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 67 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 49982766 - 49982511
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166 |
Q |
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T |
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Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 50631968 - 50631648
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4 |
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102 |
Q |
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Target Start/End: Original strand, 7122074 - 7122341
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191 |
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T |
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Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
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Target Start/End: Complemental strand, 40868454 - 40868227
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Q |
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40868227 |
T |
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Target: chr1; HSP #84
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T |
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T |
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Query Start/End: Original strand, 55 - 284
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154 |
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Target: chr1; HSP #87
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154 |
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51991906 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 59 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 35912952 - 35912725
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157 |
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| T |
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| T |
35912753 |
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Target: chr1; HSP #89
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| T |
38862365 |
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38862444 |
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255 |
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324 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #90
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| |
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267 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #91
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Query Start/End: Original strand, 73 - 265
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4156074 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #92
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Target Start/End: Complemental strand, 48616736 - 48616533
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191 |
Q |
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| T |
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48616637 |
T |
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Q |
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| T |
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T |
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Q |
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| T |
48616536 |
tatt |
48616533 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #93
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Query Start/End: Original strand, 73 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 29878008 - 29877820
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73 |
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172 |
Q |
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| T |
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T |
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173 |
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260 |
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29877820 |
T |
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Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 55 - 298
Target Start/End: Original strand, 7435596 - 7435841
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153 |
Q |
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| Q |
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252 |
Q |
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| T |
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298 |
Q |
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| T |
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T |
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Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 94 - 298
Target Start/End: Original strand, 12837892 - 12838096
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193 |
Q |
| |
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| T |
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292 |
Q |
| |
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| T |
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12838091 |
tttcat |
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T |
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Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 46872398 - 46872503
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1 |
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100 |
Q |
| |
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|
| T |
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46872497 |
T |
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| Q |
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106 |
Q |
| |
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|||||| |
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T |
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Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 92 - 317
Target Start/End: Original strand, 52260931 - 52261158
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| Q |
92 |
ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
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| T |
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| Q |
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289 |
Q |
| |
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| T |
52261031 |
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52261130 |
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| T |
52261131 |
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52261158 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 92 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 10179161 - 10178933
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ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
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| T |
10179161 |
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| Q |
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| |
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| T |
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317 |
Q |
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| T |
10178961 |
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10178933 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 92 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 42275623 - 42275366
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| Q |
92 |
ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
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| T |
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42275524 |
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| Q |
192 |
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290 |
Q |
| |
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| T |
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42275424 |
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| Q |
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348 |
Q |
| |
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| T |
42275423 |
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42275366 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 55 - 276
Target Start/End: Original strand, 46368596 - 46368822
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| Q |
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154 |
Q |
| |
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| T |
46368596 |
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| |
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46368796 |
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T |
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Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 92 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 632936 - 632709
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ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
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| T |
632736 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 209 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 6329418 - 6329307
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307 |
Q |
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| T |
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6329319 |
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| T |
6329318 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #103
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Query Start/End: Original strand, 92 - 325
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ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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| Q |
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289 |
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| T |
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11778725 |
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325 |
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| |
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| T |
11778724 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #104
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Target Start/End: Complemental strand, 50534204 - 50534077
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158 |
Q |
| |
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T |
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159 |
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| |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #105
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Query Start/End: Original strand, 56 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 38207854 - 38207609
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154 |
Q |
| |
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| T |
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38207755 |
T |
 |
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252 |
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| T |
38207754 |
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38207655 |
T |
 |
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253 |
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298 |
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| |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #106
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Target Start/End: Complemental strand, 24245687 - 24245536
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| |
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| T |
24245687 |
ttgattattttatacgataatatgtaaaaaatttattatgattcttataaacaatgaa-tgatgtgtttttcttatgaaatgatattttctaaaatataa |
24245589 |
T |
 |
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272 |
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324 |
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| |
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| T |
24245588 |
atgctgacaaataactatttatttaataaaattgatcattaatttatagattt |
24245536 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #107
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Q |
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43146775 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #108
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315 |
Q |
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T |
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Q |
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| T |
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50239308 |
T |
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Target: chr1; HSP #109
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314 |
Q |
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Q |
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52441140 |
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T |
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Target: chr1; HSP #110
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307 |
Q |
| |
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T |
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9587980 |
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T |
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Target: chr1; HSP #111
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191 |
Q |
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| T |
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Q |
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26011030 |
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T |
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Target: chr1; HSP #112
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192 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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| Q |
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Q |
| |
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T |
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Q |
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T |
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Target: chr1; HSP #114
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270 |
Q |
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T |
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| Q |
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348 |
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| |
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T |
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Target: chr1; HSP #115
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305 |
Q |
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33986108 |
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33986205 |
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Q |
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33986206 |
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T |
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Target: chr1; HSP #116
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Q |
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| T |
6079903 |
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6079804 |
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266 |
Q |
| |
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6079803 |
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6079705 |
T |
 |
| Q |
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324 |
Q |
| |
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|
|
| T |
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tataaagattgataaatatctctttatcacataaaaattatcgttaacttatagattt |
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T |
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Target: chr1; HSP #117
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Q |
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|
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T |
 |
| Q |
315 |
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Q |
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||||| |||| | || |||||||||||||||| |
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T |
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cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttca-ttaaagtgatcgttaat |
314 |
Q |
| |
|
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|
|
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| |
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|
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52345662 |
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T |
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Q |
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|
|
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6526535 |
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gaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaat |
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Q |
| |
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T |
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319 |
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| |
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|
| T |
17553927 |
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T |
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Target: chr1; HSP #121
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Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||| ||| |||| |
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 |
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348 |
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| |
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|
|
| T |
30547946 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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tatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgat |
307 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||| ||| |||| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
308 |
cgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
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| |
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| T |
34100783 |
cgttagtttataga-tttatgaagcaatagtaccggtacac |
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attgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataa |
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Q |
| |
|
||||||||| ||||| || || ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||| |
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|
| T |
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T |
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272 |
atattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgttaatttata |
319 |
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| |
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||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||| |
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|
| T |
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atattgacaaatagttatttatttcataaaaaatgatcgttaatttata |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #124
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Q |
| |
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23304525 |
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23304624 |
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 |
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288 |
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| |
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| T |
23304625 |
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23304723 |
T |
 |
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289 |
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347 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| | || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
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23304724 |
tttatttcataaaaataatagttaatttataaatttt-tgaagtaagagtaccggtaca |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Q |
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T |
 |
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aaatgtaaatttt-ttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttt |
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Q |
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27353199 |
T |
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Target: chr1; HSP #126
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307 |
Q |
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| T |
24381556 |
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24381655 |
T |
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349 |
Q |
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| T |
24381656 |
cgttaatttata-aaattatgaaacgagagtaccggtacact |
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T |
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Target: chr1; HSP #127
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167 |
Q |
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| T |
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T |
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Q |
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267 |
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Q |
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36672224 |
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T |
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Target: chr1; HSP #128
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314 |
Q |
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T |
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| Q |
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348 |
Q |
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| T |
52180576 |
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T |
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Target: chr1; HSP #129
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307 |
Q |
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| T |
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T |
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348 |
Q |
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| T |
13203006 |
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13202967 |
T |
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Target: chr1; HSP #130
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cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgttaat |
314 |
Q |
| |
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Q |
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24230632 |
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24230628 |
T |
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Target: chr1; HSP #131
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgat |
307 |
Q |
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| T |
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34038232 |
T |
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348 |
Q |
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| T |
34038231 |
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T |
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Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 216 - 319
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| Q |
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cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgttaat |
314 |
Q |
| |
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| T |
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48976939 |
T |
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| Q |
315 |
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319 |
Q |
| |
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||||| |
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| T |
48976938 |
ttata |
48976934 |
T |
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Target: chr1; HSP #133
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
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| T |
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2249682 |
T |
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Target: chr1; HSP #134
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268 |
Q |
| |
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| T |
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| Q |
269 |
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319 |
Q |
| |
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|
| T |
7227680 |
taaatattgataaatagttatttatttcataaaaaatgatcgttaatttata |
7227629 |
T |
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Target: chr1; HSP #135
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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8396660 |
T |
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Target: chr1; HSP #136
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attgattattttttatgacaaaatgtaaatttt-ttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
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| T |
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30571306 |
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| Q |
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294 |
Q |
| |
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|||||||||||||| || |||||| |
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|
| T |
30571307 |
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30571330 |
T |
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Target: chr1; HSP #137
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Query Start/End: Original strand, 209 - 284
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| Q |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
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|
| T |
45622650 |
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45622575 |
T |
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Target: chr1; HSP #138
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191 |
Q |
| |
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| T |
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51978047 |
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289 |
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51977947 |
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348 |
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|
| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 209 - 284
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52861467 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #140
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203 |
Q |
| |
|
||||||||| | |||||||| |||||||||| |||| || |||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||| | | ||||||| ||| |
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| T |
33098979 |
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33098880 |
T |
 |
| Q |
204 |
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303 |
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| T |
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33098780 |
T |
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304 |
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317 |
Q |
| |
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| || ||||||||| |
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| T |
33098779 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #141
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aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattact |
158 |
Q |
| |
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| T |
39628148 |
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39628049 |
T |
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| Q |
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257 |
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| |
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| T |
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cataatagtgaatattgattatttttttcaataaaatattaaaaaatttagtataattcttataaaaaatgaaatgatgttttttcttgtggaatgatat |
39627949 |
T |
 |
| Q |
258 |
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272 |
Q |
| |
|
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| T |
39627948 |
tttctaaaatataaa |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #142
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65 |
aattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataac |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||| |||| || |||| |||| ||||| |
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| T |
51161216 |
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51161315 |
T |
 |
| Q |
165 |
aatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaa |
264 |
Q |
| |
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| T |
51161316 |
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51161406 |
T |
 |
| Q |
265 |
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319 |
Q |
| |
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|||||||||||| | ||||| ||||||||| || |||| |||||||||| ||||| |
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|
| T |
51161407 |
aatataaatattaataaataactttttattaca-taaaatgatcgttaaattata |
51161460 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #143
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Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||| |
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|
| T |
12907495 |
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12907580 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #144
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat |
298 |
Q |
| |
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| T |
20487737 |
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20487649 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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T |
 |
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348 |
Q |
| |
|
||||| | || |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25702498 |
ttata-aaattatgaagcaagagtaccggtacac |
25702466 |
T |
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Target: chr1; HSP #146
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Target Start/End: Complemental strand, 30321060 - 30320975
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatt |
294 |
Q |
| |
|
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|
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30321060 |
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30320975 |
T |
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Target: chr1; HSP #147
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ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
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|||||||||| ||||| ||||||| | |||||||| |||||| || |||| || |||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||| | | |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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284 |
Q |
| |
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| T |
42317022 |
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42316929 |
T |
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Target: chr1; HSP #148
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Target Start/End: Original strand, 2620794 - 2621019
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94 |
aattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaa |
193 |
Q |
| |
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| T |
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2620893 |
T |
 |
| Q |
194 |
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290 |
Q |
| |
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|
| T |
2620894 |
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2620992 |
T |
 |
| Q |
291 |
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317 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||| | || ||||||||| |
|
|
| T |
2620993 |
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2621019 |
T |
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Target: chr1; HSP #149
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Query Start/End: Original strand, 209 - 348
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209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgat |
307 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||| |||| |
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| T |
25081927 |
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25081829 |
T |
 |
| Q |
308 |
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348 |
Q |
| |
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||||| |||||| | ||| ||||||||||||||| |||||| |
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| T |
25081828 |
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25081789 |
T |
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Target: chr1; HSP #150
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Target Start/End: Original strand, 38261047 - 38261147
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216 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgttaat |
314 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || | |||||||||||| |||||||||| || |||||| ||| ||| ||||||||||| |
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|
| T |
38261047 |
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38261146 |
T |
 |
| Q |
315 |
t |
315 |
Q |
| |
|
| |
|
|
| T |
38261147 |
t |
38261147 |
T |
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Target: chr1; HSP #151
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155 |
Q |
| |
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| T |
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41541626 |
T |
 |
| Q |
156 |
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184 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||| |
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|
| T |
41541625 |
actcataacaaagaatattgattattttt |
41541597 |
T |
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Target: chr1; HSP #152
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Target Start/End: Complemental strand, 48354940 - 48354816
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| Q |
148 |
tttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttat |
247 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| | | ||||||||||| ||||| ||| |||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||| |
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|
| T |
48354940 |
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48354841 |
T |
 |
| Q |
248 |
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272 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||||||||| |
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|
| T |
48354840 |
gaaataatattttctaaaatataaa |
48354816 |
T |
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Target: chr1; HSP #153
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Query Start/End: Original strand, 216 - 284
Target Start/End: Original strand, 51056440 - 51056508
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| Q |
216 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
51056440 |
cttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgaaataatgttctataaaatataaatattgaaaaata |
51056508 |
T |
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| Q |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgat |
307 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| | || |||||||||| ||| |||| |
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|
| T |
477611 |
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477513 |
T |
 |
| Q |
308 |
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Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
477512 |
cgttaatttata |
477501 |
T |
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| Q |
148 |
tttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgt--aaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttctt |
245 |
Q |
| |
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|||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| ||| || |||||||| |||||||||||| |||||||| |
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|
| T |
5800090 |
tttttattactcataatagtgaatattgattatttttttcaataaaatgttaaaaaattttagtataattcttataaaaaatgaaatgatg-tttttctt |
5800188 |
T |
 |
| Q |
246 |
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324 |
Q |
| |
|
|||| || || |||||||| ||||||| | || ||||| || ||||| ||||||| | |||||||| ||||| |||| |
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| T |
5800189 |
atgagataatattttctaagatataaaagtcgataaatatctctttatcacattaaaattatcgttaacttatagattt |
5800267 |
T |
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Target: chr1; HSP #156
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6966145 |
tatgattcttataaacaattaaatgatattttttcttatgaaatgctgttctataaaatataaatattgacaaata |
6966220 |
T |
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| Q |
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tttaatatgatccttataaacaatgaaatga--tggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaa |
301 |
Q |
| |
|
|||| |||||| | ||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| | | |||||| || |||||||||| || |
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|
| T |
12178830 |
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12178928 |
T |
 |
| Q |
302 |
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348 |
Q |
| |
|
| | |||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12178929 |
attaatcgttaatttatagatttag-gaagcaagagtaccggtacac |
12178974 |
T |
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Target: chr1; HSP #158
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Query Start/End: Original strand, 209 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 24003589 - 24003514
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
24003589 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttattatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaata |
24003514 |
T |
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Target: chr1; HSP #159
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| Q |
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ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| | || ||||| |||||||||| |||| | |||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||| | | |
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|
| T |
36275005 |
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36274906 |
T |
 |
| Q |
192 |
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289 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || | |
|
|
| T |
36274905 |
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36274806 |
T |
 |
| Q |
290 |
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317 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||| | || ||||||||| |
|
|
| T |
36274805 |
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36274778 |
T |
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Target: chr1; HSP #160
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38717968 |
tatgattcttataaacaattaaatgatattttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaata |
38718043 |
T |
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Target: chr1; HSP #161
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ctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41541595 |
ctaaaatataaatattgacaaatagctctttatttcataaaaatgatcgttaattcata-aatttatgaagcaagagtaccggtacac |
41541509 |
T |
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| Q |
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ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46641761 |
ttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaata |
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T |
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168 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | || || |||| ||||| ||||||||||||| | || || | |||||||| | |||| || || |||||||||||| | | |
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|
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51369412 |
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51369511 |
T |
 |
| Q |
169 |
aatattgattattttttatgacaaaatgta-aattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaat |
267 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||| | |||||||| || |||| |||||| || |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
51369512 |
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51369611 |
T |
 |
| Q |
268 |
ata |
270 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
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51369612 |
ata |
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ttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaataccttttt |
291 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |
|
|
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ttaatatgattcttattaataatgaaatgatgttttttcttatgaaataatattttctaaaatataaaagttgataaatatcttttt |
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attgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgt |
257 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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attgattattttttacgataatatgtaaaaaaattattatgattcttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgaaatgatgt |
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T |
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136 |
Q |
| |
|
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|
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12227209 |
aaaaataattattttctatcattgataattataataattaaatcttatttaccaaaagcgtcgatgaaataaaattta |
12227286 |
T |
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Target: chr1; HSP #167
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Q |
| |
|
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|
|
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33082075 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #168
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 92 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 46152464 - 46152232
Alignment:
| Q |
92 |
ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| |||||| ||| | ||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | | |
|
|
| T |
46152464 |
ataattatattttatttttcaaaagtgtcggcaaagcaaaattcaaatttttttaatttttattactcataatagtgaatattgattatttttt-caata |
46152366 |
T |
 |
| Q |
192 |
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290 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||| ||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||| | || ||||| || || |
|
|
| T |
46152365 |
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46152266 |
T |
 |
| Q |
291 |
tatttcattaaagtgatcgttaatttatatattt |
324 |
Q |
| |
|
||| ||| ||| | |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
46152265 |
tatcacataaaaattatcgttaacttatatattt |
46152232 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #169
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 209 - 284
Target Start/End: Original strand, 21883045 - 21883121
Alignment:
| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttt-tcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
21883045 |
tatgattcttataaacaatgaaatgatgtttttttcttatgaaatcatgttctataaaatataaatattaacaaata |
21883121 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #170
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 92 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 29106652 - 29106468
Alignment:
| Q |
92 |
ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattatttttt-atgac |
190 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||||| | || ||| | |||||||||| |||| || |||||||||||||||| | |||| |||| |||||||| | | |
|
|
| T |
29106652 |
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29106553 |
T |
 |
| Q |
191 |
aaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatat |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
29106552 |
aaaatgtaaaaaaattagtatgatttttataaaaaatgaaatgatgttctttcatataaaatgatattttctaaaatatacatat |
29106468 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #171
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 272
Target Start/End: Original strand, 49854351 - 49854407
Alignment:
| Q |
216 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaa |
272 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
49854351 |
cttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgaaatgatattatctaaaatataaa |
49854407 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #172
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 92 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 5956815 - 5956636
Alignment:
| Q |
92 |
ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| | || || | |||||||| | |||| || || |||||||||||| | |||| |||||||||||||| || | |
|
|
| T |
5956815 |
ataattaaatcttatttaccaaaaacgtcaacacaataaaatttgatttttctgaattcctattactcataatagagaattttgattattttttacgata |
5956716 |
T |
 |
| Q |
192 |
aaatgta-aattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
||||||| || |||| |||||| || |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
5956715 |
aaatgtagaaaaatttagtatgatttttctaaaaaatgaaatgatgtattttcttataaaatgatattttctaaaatata |
5956636 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #173
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 209 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 10348194 - 10348119
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
10348194 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgtttttttttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgataaata |
10348119 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #174
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 209 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 31075778 - 31075703
Alignment:
| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31075778 |
tatgattcttataaacagtaaaatgatgttttttcttatgaaatattgttctataaaatataaatattgacaaata |
31075703 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #175
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 209 - 284
Target Start/End: Original strand, 32805971 - 32806046
Alignment:
| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || | | |||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32805971 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgctttttcttatgaaatgttgctctataaactataaatattgacaaata |
32806046 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #176
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 92 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 39971557 - 39971378
Alignment:
| Q |
92 |
ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||||| | || ||| | |||||||| | |||| || || ||||||||||||| || |||| |||| ||||||||| | | |
|
|
| T |
39971557 |
ataactaaatcttatttaccaaaaacgtcaacgcaataaaatttgatttttctgaattcttattactcataataaagaattttgagtattttttacaata |
39971458 |
T |
 |
| Q |
192 |
aaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
39971457 |
aaatgtaaaaaaattagtatgatttttataaaaaatgaaatgatgcttttttcatataaaatgatattttctaaaatata |
39971378 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #177
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 209 - 284
Target Start/End: Original strand, 47544533 - 47544608
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47544533 |
tatgattcttataaacaattaaattatgttttttcttatgaaatagtgttctataaaatataaatattgacaaata |
47544608 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #178
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 209 - 284
Target Start/End: Original strand, 48760338 - 48760413
Alignment:
| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48760338 |
tatgattcttataaacaattaaatgatattttttcttatgaaatgttattctataaaatataaatattgacaaata |
48760413 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #179
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 9176985 - 9176751
Alignment:
| Q |
93 |
taattaaattttatttaccaaaagct-tcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||| || ||||||||| | |||| | |||| || |||||||||||||| | |
|
|
| T |
9176985 |
taattaaattttatttacaaaaaaagatcgacgaaataaaatttaacttttccgattttttattatttataatatcgaattttaattattttttatgata |
9176886 |
T |
 |
| Q |
192 |
aaatgtaaatttt-ttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttt |
290 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||| || || |
|
|
| T |
9176885 |
aaatgtaaaaaaaattagcatgatttttataaacaatgaaataatattttttattatgaaatgatattttctgacttataaatagccacaaatagctctt |
9176786 |
T |
 |
| Q |
291 |
tatttcattaaagtgatcgttaatttatatatttt |
325 |
Q |
| |
|
||||| | ||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
9176785 |
tattttgtaaaaatgatagttaatttataaatttt |
9176751 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #180
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 319
Target Start/End: Original strand, 21072958 - 21073112
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| Q |
168 |
gaatattgattattttttatgacaaaatgtaaatttt-ttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttt-tcttatgaaatgatgttttctaaa |
265 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||| ||| || |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||| | |||| |
|
|
| T |
21072958 |
gaatattcattattttttatgataatatgtaaaaaaaattactataattcttataaacaatgagatgatgtttttttcttatgaaataatgttctataaa |
21073057 |
T |
 |
| Q |
266 |
atataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgttaatttata |
319 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||||| || |||||| ||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
21073058 |
atataaatattaaaaaatagctatttattacataaaaaatgatcgttaatttata |
21073112 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #181
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 22667494 - 22667325
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| Q |
148 |
tttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttat |
247 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
22667494 |
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22667396 |
T |
 |
| Q |
248 |
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318 |
Q |
| |
|
|||| || |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||| ||| ||| |||||| ||| |||| |
|
|
| T |
22667395 |
aaaataatattttctaaaatataaaagttgataaatatctctttattacataaaaatgatcgataacttat |
22667325 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #182
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| Q |
92 |
ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| | |||| ||| |||||||||| |||| || ||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||| | | |
|
|
| T |
35910280 |
ataattaaatcttatttaccaaaaacgtcgaagaaataaaatttaatttttctgaattttttgtactcataatagagaattttgattattttttacaata |
35910379 |
T |
 |
| Q |
192 |
aaatgt--aaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctt |
288 |
Q |
| |
|
|||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |
|
|
| T |
35910380 |
aaatataaaaaaaaaatagtatgatttttataaacaatgaaatgacgtttttttcttataaaatgacattttctaaaatataaatatcaacaaataactc |
35910479 |
T |
 |
| Q |
289 |
tttatt |
294 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
35910480 |
tttatt |
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T |
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Target: chr1; HSP #183
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| Q |
92 |
ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattatttttt |
185 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| || |||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
31890365 |
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31890272 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #184
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| Q |
216 |
cttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaat |
314 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||| |
|
|
| T |
46707506 |
cttataaacaatgaa-tgatgtgtttttcttatgaaatgatattttctgagatacaaatgccgacaaataactttttatttcataaaattgattgttaat |
46707408 |
T |
 |
| Q |
315 |
ttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
|
||| |||| | ||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
46707407 |
gcataaatttag-gaagcaggagtaccggtacac |
46707375 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #185
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attgattattttttatgacaaaatgtaaatttt-ttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggttttt--cttatgaaatgatgttttctaaaata |
268 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || || ||||||| | ||| ||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| || || |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
47693398 |
attgattattttttacgataatatgtaaaaataattactataattcttataaacaatgaaattatgttttttttctaataaaatgatgttcaataaaata |
47693497 |
T |
 |
| Q |
269 |
taaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || |||||| || ||| | |||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47693498 |
taaatattgacaaatagctatttattaca--aaaattatcgttaatttata-aaattatgaagcaagagtaccggtacac |
47693574 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #186
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tttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttat |
247 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
28712128 |
tttttaatacccataatagtgaatattgattatttttttggataaaatgttaaaaaattagtatgattcttataaaggatgaaatgacgttttttcttat |
28712029 |
T |
 |
| Q |
248 |
gaaatgatgttttctaaaatataaa |
272 |
Q |
| |
|
|||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
28712028 |
aaaataatattttctaaaatataaa |
28712004 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #187
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359 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
29207585 |
taaagtgatcattaatttataaattttgtgcaacaagagtatcggtatactcaaaattgtg |
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T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #188
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tgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcg |
309 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||| || |||||||||| || |||| | |
|
|
| T |
32144836 |
tgattcttataaacaatgaa-tgatgtgtttttcttatgaaatgatattttctgagatataaatgccgacaaataactatttatttcataaagttgattg |
32144738 |
T |
 |
| Q |
310 |
ttaatttatatattttg |
326 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||| |
|
|
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32144737 |
ttaatatataaattttg |
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T |
 |
Back To:
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Target: chr1; HSP #189
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27 |
aaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttc |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
41757215 |
aaattaataataaataagttgtttttttgaataaaaataattattttatatgattgacaactataataattaaattttacatgccaaaagcttc |
41757122 |
T |
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atgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatac--ctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattttg |
326 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2665467 |
atgaaatgatattttctaagatataaatgtcgacaaatatagctctttatttcataaaaatgatcgttaatttatatattttg |
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T |
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191 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||||| | || ||| | |||||||| | |||| || || ||||||||||||| | |||| |||| ||||||||| || | |
|
|
| T |
18641986 |
ataactaaatcttatttaccaaaaacatcaacgcaataaaatttgatttttctgaattcttattactcataatagagaattttgagtattttttacgata |
18642085 |
T |
 |
| Q |
192 |
aaatgtaaatttt-ttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggttttt-cttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaataccttt |
289 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| | ||| ||||||| |||||||||||||| || | ||||| |||| | |
|
|
| T |
18642086 |
aaatgtaaaaaaaattagtatgatttttataaaaaatgaaatgatgtttttttcatataaaatgatattttctaaaatatatatgtcaacaaacacctat |
18642185 |
T |
 |
| Q |
290 |
ttatttcat-taaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
|
|| |||||| ||| |||| ||||||||||| | |||| || | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
18642186 |
ttttttcataaaaaatgatagttaatttataaaaattgt-aagcgagagtaccggtacac |
18642244 |
T |
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152 |
tattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgta-aattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaa |
250 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||| |||||||||||||| || |||||||| || |||| |||||| || |||| |||||||||||| ||||||||| || |
|
|
| T |
23056878 |
tattactcataatagagaattttgattattttttacgataaaatgtagaaaaatttagtatgatttttctaaaaaatgaaatgatgtattttcttataaa |
23056977 |
T |
 |
| Q |
251 |
atgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
23056978 |
atgatattttctaaaatata |
23056997 |
T |
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209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaa |
272 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
26921845 |
tatgattcttaaaaagaatgaaatgatgttttttcttatgaaataatattttctaaaatataaa |
26921782 |
T |
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92 |
ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| | |||| ||| |||||||||| |||| || ||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||| | | |
|
|
| T |
28791656 |
ataattaaatcttatttaccaaaaacatcgaagaaataaaatttaatttttctgaattttttgtactcataatagagaattttgattattttttacaata |
28791557 |
T |
 |
| Q |
192 |
aaatgtaaattttt---taatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctt |
288 |
Q |
| |
|
|||| |||| || ||| || |||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |
|
|
| T |
28791556 |
aaatataaaaaaaaaagtagtatcatttttataaacaatgaaatgacgtttttttttataaaatgacattttctaaaatataaatatcaacaaataactc |
28791457 |
T |
 |
| Q |
289 |
tttatt |
294 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
28791456 |
tttatt |
28791451 |
T |
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cttataaacaatgaaatgatggtttttctt--atgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgtta |
312 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
35874101 |
cttataaacaatgaaatgatgtttttttttttatgagatgatgttctataaaatataaattttgacaaatagttatttattacataaaaaatgatcgtta |
35874002 |
T |
 |
| Q |
313 |
atttata |
319 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
35874001 |
atttata |
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T |
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246 |
atgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatatttt |
325 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||| | |||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
44979147 |
atgaaatgatgttttctaaaatataaatattgatgaataactctttatttca-taaaataatcgttaaattataaatttt |
44979225 |
T |
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| Q |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaa |
272 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
45427295 |
tatgattcttaaaaagaatgaaatgatgttttttcttatgaaataatattttctaaaatataaa |
45427232 |
T |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaa--tataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtg |
305 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||| ||| || |
|
|
| T |
51610707 |
tatgattcttataaacaatgaa-tgatgcgtttttcttctgaaatcatattttctaaaatatataaatgccgacaaataactatttatttcataaaattg |
51610609 |
T |
 |
| Q |
306 |
atcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||| | ||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
51610608 |
attgttagtttata-aatttatgaagcaagagtaccgatacac |
51610567 |
T |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
51787633 |
tatgattcttataaacatt-aaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgataaata |
51787559 |
T |
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ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||||| | || || | |||||||| | |||| || ||| |||||||||||| | |||| |||||||||||||| | | |
|
|
| T |
52303131 |
ataactaaatcttatttaccaaaaacgtcaacacaataaaatttgatttttctgaatttctattactcataatagagaattttgattattttttacaata |
52303230 |
T |
 |
| Q |
192 |
aaatgta-aattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
||||||| || |||| |||||| || |||| |||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
52303231 |
aaatgtagaaaaatttagtatgatttttctaaaaaatgaaatgacgttttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
52303310 |
T |
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tttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttat |
247 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||| | |||||||||||| |||||| || ||||||| || ||| |||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
41903271 |
tttttaatacccataatactgaatattgattttttttttggataaaatgttaaaaaattagtatgattcttataaaggatgaaatgacgttttttcttat |
41903370 |
T |
 |
| Q |
248 |
gaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttat |
318 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||| ||| ||| |||||| ||| |||| |
|
|
| T |
41903371 |
aaaagaatattttctaaaatataaaagttgataaatatctctttattacataaaaatgatcgataacttat |
41903441 |
T |
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ttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtaca |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||| ||||||||| |||||| | ||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
42958962 |
ttttctaaaatataaatgccgacaaataactatttatttcataaaattgatcgttagtttataga-tttatgaagcaagagtaccggtaca |
42958873 |
T |
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ttttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatga |
169 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| |||| || |||| || ||||||||| ||||| ||| ||||| |||||| ||||||| | || ||||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
43025374 |
ttttttatcatttacaattataataactatattttatttctcaaaattgtcggcgaagcaaaattcaaatttttgaatttcttattactcataatagtga |
43025275 |
T |
 |
| Q |
170 |
atattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttct |
244 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
43025274 |
atatttattattttttttgataaaatgtaaaaaaattagtatgattcttataaacaataaaattatgttttttct |
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T |
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220 |
taaacaatgaaatgatggttttt-cttatgaaatgatgttttctaaaatataaatatt |
276 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5553924 |
taaacaatgaaatgatgtttttttcttatgaaatgatatattctaaaatataaatatt |
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T |
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tttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatga |
229 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
26054764 |
tttttattactcataatagaaaatattgattattttttacgataaaatgtaaaaaattaaatatgattcttataaacaatga |
26054683 |
T |
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ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
26102635 |
ttataaaaaatgaaatgatgttttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
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T |
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167 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | || || ||||||| ||||||||| |||||| ||| | ||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||| | | |
|
|
| T |
31210714 |
tattttctatcatttataattataataattatattttatttttcaaaagtgtcggcaaagcaaaattcaaatttttttaatttttattactcataatagt |
31210813 |
T |
 |
| Q |
168 |
gaatattgattatttttt |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31210814 |
gaatattgattatttttt |
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T |
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ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||||| | || ||| | |||||||| | |||| || || ||||||||||||| || |||| |||| ||||||||| | | |
|
|
| T |
38262422 |
ataactaaatcttatttaccaaaaacgtcaacgcaataaaatttgatttttctgaattcttattactcataataaagaattttgagtattttttacaata |
38262323 |
T |
 |
| Q |
192 |
aaatgtaaattttttaatatgatccttat--aaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||| |||| ||| || ||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
38262322 |
aaatgtaaacaaattagtatgatttttataaaaaaaacgaaatgatgttttttcatataaaatgatattttctaaaatata |
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T |
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ttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccg |
342 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| | || |||||| ||| ||| |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
44263928 |
ttatgaaatgatgttctataaaatataactattgacaaagagctatttattacataaaaaatgatcgttaatttata-aaattatgaaacaggagtaccg |
44264026 |
T |
 |
| Q |
343 |
gtacac |
348 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
44264027 |
gtacac |
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314 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||| | ||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||| |
|
|
| T |
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cttataaacaatgaa-tgatgtgttttttttatgaaatgatattttctgagatacaaatgc-gacaaataactttttatttcataaaattgattgttaat |
44382081 |
T |
 |
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315 |
ttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
|
||| |||| | |||||| |||||||||||||| |
|
|
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gcataaatttag-gaaacatgagtaccggtacac |
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148 |
tttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatg-taaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttctta |
246 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||| ||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
46153462 |
tttttattactcataatagtgaatattgattatttttt-caataaaatgttaaaaaatttagtataattcttataaaaaatgaaatgatattttttctta |
46153364 |
T |
 |
| Q |
247 |
tgaaatgatgttttctaaaatataaa |
272 |
Q |
| |
|
|| || || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
46153363 |
tgggataatattttctaaaatataaa |
46153338 |
T |
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267 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| ||| | |||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
21352032 |
gaatattgattattttttc-gataaaatgtaaaaaatttaatatcattcttataaataatgaaatgatgcttttccttttaaaattatattttctaaaat |
21352130 |
T |
 |
| Q |
268 |
ataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaattt |
316 |
Q |
| |
|
| || || || |||||| | |||||||||| ||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
21352131 |
ttgaa-atagataaatacatctttatttcataaaaatgat-gttaattt |
21352177 |
T |
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taaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgttaatttat |
318 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| || | ||||| |||| ||| |||||| ||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
28494018 |
taaaaaatgaaatgatgctttttcttataaaatgatattttctaaaatatatatgtcaacaaacacctatttctttcataaaaaatgatagttaatttat |
28494117 |
T |
 |
| Q |
319 |
a |
319 |
Q |
| |
|
| |
|
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28494118 |
a |
28494118 |
T |
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ttataaacaatgaaatgatggttttt-cttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatt |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||| ||| || ||||||| |
|
|
| T |
33909934 |
ttataaacaatgaaatgacgtttttttcttataaaatgacattttctaaaatataaatatcaacaaatagctctttattccataaaaacaatagttaatt |
33910033 |
T |
 |
| Q |
316 |
tatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
|
|| | ||||| |||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
33910034 |
taaagatttt-tgaagtaggagtaccggtacac |
33910065 |
T |
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191 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||| | |||||||| ||||| |||| |||| || ||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||| | | |
|
|
| T |
51184160 |
ataattaaatcttatttagcaaaaacgtcgacgaaataaaaattaatttttctgaatttttattacttataatagagaattttgattattttttacaata |
51184259 |
T |
 |
| Q |
192 |
aaatgtaaa |
200 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
51184260 |
aaatgtaaa |
51184268 |
T |
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278 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
2090035 |
ttttttacgataaaatataaaaattttgatatgattcttataaacaatgagatgatatttttttcttatgaaatgacattttataaaataaaaat-ttga |
2090133 |
T |
 |
| Q |
279 |
caaatacctttttatttcat |
298 |
Q |
| |
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||||| || |||||||||| |
|
|
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2090134 |
aaaatagctctttatttcat |
2090153 |
T |
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325 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||| ||| |||| |||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
2247319 |
atgaaatgatattttctaaaatacaaatatcaacaaatagctctttatttcataaaaatgatagttaatatatagatttt |
2247398 |
T |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaa |
272 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
11444440 |
tatgattcttaaaaagaatgaaatgatgttttttcttataaaataatattttctaaaatataaa |
11444377 |
T |
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ttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24511864 |
ttttctaaaatataaatgccaacaaataactatttatttcataaaattgatcgttagtttataaattta-tgaagcaagagtaccggtacac |
24511954 |
T |
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aaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31084863 |
aaatgatgttttttcttatgaaatattgttctataaaatataaatattgacaaata |
31084918 |
T |
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gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaa-gtaaaatttaaattttaagagttttta |
153 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||| | ||||| || |||||||| | |||| || |||||| |
|
|
| T |
33985993 |
gaagaaaaagaatcattttctatcattgacaattataatacttaaatcctatttaccaaaaacgtcgacaaacgtaaaattgactttttttgaattttta |
33986092 |
T |
 |
| Q |
154 |
ttactcataacaatgaatat |
173 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
33986093 |
ttactcataagaaagaatat |
33986112 |
T |
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gaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaat |
267 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| | |||||||||| || | |||||| ||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
47719086 |
gaattttgattattttttacaataaaatgtaaacaatt-agtatgatttttaaaaataatgaaatgatgtttttccttatgaaatgatattttttaaaat |
47718988 |
T |
 |
| Q |
268 |
ataaatat |
275 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
47718987 |
ataaatat |
47718980 |
T |
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ttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgat |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||| |||||| |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
2665391 |
ttttattactcataatagagaatattgattattttttacga-taaatgtaaaatatttagtatgattcttataaatcatgaaatgat |
2665476 |
T |
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cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatt |
294 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| | |||| |||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
14152849 |
cttataaacaatgaaatgata-tttttctaataaaatgatgttctataaa-tataaatattgacaaatagctatttatt |
14152773 |
T |
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acaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatat |
322 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||| || ||| |||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
18992601 |
acaatgaaacgatattttttgttatgaaatgatattttctaaaatataaataccagcaaataactccttattttataaaaatgatagttaatttataaat |
18992700 |
T |
 |
| Q |
323 |
ttt |
325 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
18992701 |
ttt |
18992703 |
T |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatat |
275 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
46235068 |
tatgattcttatagacaatgaactggtattttttcttatgaaatgatgttctataaaatataaatat |
46235134 |
T |
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ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
8461689 |
ttataaaaaatgaaatgatgttttttcttataaaataatattttctaaaatata |
8461636 |
T |
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cttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaat |
314 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| |||||||| || |||||||||| ||| |||| |||||| |
|
|
| T |
17525681 |
cttataaacaatgaa-taatgtgtttttcttatgaaatgatattttttgagatataaatgccgacaaataactatttatttcataaaattgattgttaat |
17525779 |
T |
 |
| Q |
315 |
ttatatattt |
324 |
Q |
| |
|
|||| |||| |
|
|
| T |
17525780 |
gtataaattt |
17525789 |
T |
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ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatt |
294 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||| | |||| ||||||||| ||||||| || |||||| |
|
|
| T |
28624722 |
ttataaacaataaaatgatgttttttcttataaaataatgttctagaaaacataaatattaacaaatagctatttatt |
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T |
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196 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||| || | |||||||| | |||| | || ||||||||||||| | |||| |||| ||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
50905704 |
taaatcttatttaccaaaaacttcaacttaataaaatttgatttttctggattcttattactcataatagagaattttgagtattttttacaataaaatg |
50905803 |
T |
 |
| Q |
197 |
taaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
|||| || | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
50905804 |
taaaaaatt-agtatgatttttataaaaaatgaaatgatgtttttttatataaaatgatattttctaaaatata |
50905876 |
T |
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tttttattactcataacaatgaatattgattattttttat-gacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttctta |
246 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||| | || ||||||| || ||| |||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
33486160 |
tttttaatacccataatagtgaatattgattattttttttagataaaatgttaaaaaattagtatgattcttataaaggatgaaatgacgttttttctta |
33486061 |
T |
 |
| Q |
247 |
tgaaa-tgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatt |
294 |
Q |
| |
|
| ||| | || |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||| |
|
|
| T |
33486060 |
taaaaataatattttctaaaatataaaagttgataaatatctctttatt |
33486012 |
T |
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Q |
| |
|
|||| ||||||||||| | |||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47900951 |
ttttccttatgaaatgctattttttaacatataaaagttgacaaataa-tttttattttataaaagtgatcgttaatttat |
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ttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaatttt-ttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatga |
249 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | |||| |||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||| | |
|
|
| T |
51985112 |
ttattactcataatagagaattttgattattttttacaataaaatgtaaaaaaaattagtatgatttttataaaaaataaaatgatattttttcttataa |
51985211 |
T |
 |
| Q |
250 |
aatgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
51985212 |
aatgatattttctaaaatata |
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250 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||| |||||||||||||| | |||||||| || |||| |||||| || |||| |||||||||||| | ||| |||| || |
|
|
| T |
922070 |
tattactcataatagagaattttgattattttttacaataaaatgtataaaaatttagtatgatttttctaaaaaatgaaatgatgttcttttttataaa |
921971 |
T |
 |
| Q |
251 |
atgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
921970 |
atgatattttctaaaatata |
921951 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #235
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 92 - 235
Target Start/End: Original strand, 2247185 - 2247328
Alignment:
| Q |
92 |
ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||| ||||| | |||||||||| |||| || |||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||| | | |
|
|
| T |
2247185 |
ataattaaatcttatttatcaaaaaggccgacggaataaaatttaatttttctgaatttttagtactcataatagataattttgattattttttacaata |
2247284 |
T |
 |
| Q |
192 |
aaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgat |
235 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2247285 |
aaatgtaaaaaaattagtatgatttttataaacaatgaaatgat |
2247328 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #236
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Query Start/End: Original strand, 209 - 272
Target Start/End: Original strand, 12979819 - 12979882
Alignment:
| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaa |
272 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||| || ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
12979819 |
tatgattcttaaaaataatgaaatgatgtttttccttatgaaataatattttccaaaatataaa |
12979882 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #237
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 152 - 270
Target Start/End: Original strand, 35305329 - 35305448
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| Q |
152 |
tattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgta-aattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaa |
250 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||| |||||||||||||| | |||||||| || |||| |||||| || |||| |||||||||||| | ||| |||| || |
|
|
| T |
35305329 |
tattactcataatagagaattttgattattttttacaataaaatgtataaaaatttagtatgatttttctaaaaaatgaaatgatgttcttttttataaa |
35305428 |
T |
 |
| Q |
251 |
atgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
35305429 |
atgatattttctaaaatata |
35305448 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #238
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 131
Target Start/End: Original strand, 43146510 - 43146585
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| Q |
56 |
aagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaa |
131 |
Q |
| |
|
|||||||| || | ||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
43146510 |
aagaaaaaaaactgttttctaccattgacaattacaataattaaatcgtatttaccaaaagcgtcgacgaaataaa |
43146585 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #239
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 58 - 101
Target Start/End: Original strand, 46282027 - 46282070
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| Q |
58 |
gaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaat |
101 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
46282027 |
gaaaaataattattttctatcattgacaattataataattaaat |
46282070 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #240
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 49686014 - 49686045
Alignment:
| Q |
1 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaatta |
32 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49686014 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaatta |
49686045 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #241
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 86
Target Start/End: Original strand, 22864753 - 22864783
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| Q |
56 |
aagaaaaataattattttctatcattgacaa |
86 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22864753 |
aagaaaaataattattttctatcattgacaa |
22864783 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #242
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 270
Target Start/End: Original strand, 23061248 - 23061298
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| Q |
220 |
taaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
23061248 |
taaaaaatgaaatgatgtattttcttataaaatgatattttctaaaatata |
23061298 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #243
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 31821712 - 31821666
Alignment:
| Q |
238 |
tttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31821712 |
ttttttttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaata |
31821666 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #244
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Query Start/End: Original strand, 229 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 31890222 - 31890109
Alignment:
| Q |
229 |
aaatgatggttttt-cttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgt |
327 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||| | | || | ||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
31890222 |
aaatgatgtttttttcttacgaaatgatattttctaaaatattaatatccacaaatatctctttatttcgt---aatgttagttaatttatagatttttt |
31890126 |
T |
 |
| Q |
328 |
gaaacaagagtaccggt |
344 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| |
|
|
| T |
31890125 |
taaactagagtaccggt |
31890109 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #245
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 278 - 348
Target Start/End: Original strand, 51184345 - 51184414
Alignment:
| Q |
278 |
acaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
51184345 |
acaaataactttttatttcataaaaatgatagttaatttataaatttt-tgaagtaagagtaccggcacac |
51184414 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #246
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 31530471 - 31530402
Alignment:
| Q |
216 |
cttataaacaatgaaa-tgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||| ||||| | ||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
31530471 |
cttataaacaatgaaaatgatgttttttctaataaaataatgttctataaaatataaataataacaaata |
31530402 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #247
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 272
Target Start/End: Original strand, 32627568 - 32627625
Alignment:
| Q |
216 |
cttataaacaatgaaatgatggt-ttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaa |
272 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
32627568 |
cttataaacaatgaaattatactattttcgtatgaaatgatattttctaaaatataaa |
32627625 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #248
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 319
Target Start/End: Original strand, 37498921 - 37499090
Alignment:
| Q |
152 |
tattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaa-tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaa |
250 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||| |||||||||||||| | |||||||| | |||| |||||| || |||| ||| |||||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
37498921 |
tattactcataatagagaattttgattattttttacaataaaatgtagaaaaattaagtatgatttttctaaaaaataaaatgatgttttttcttataaa |
37499020 |
T |
 |
| Q |
251 |
atgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgttaatttata |
319 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||||||| || | ||||| |||| ||| |||||| ||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
37499021 |
ataatattttctaaaatatatatgtcaacaaacacctatttctttcataaaaaatgatagttaatttata |
37499090 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #249
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 136
Target Start/End: Original strand, 18992474 - 18992518
Alignment:
| Q |
92 |
ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaattta |
136 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
18992474 |
ataattaaattttatttagcaaaaatttcgacgaaataaaattta |
18992518 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #250
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 217 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 27529612 - 27529564
Alignment:
| Q |
217 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaa |
265 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
27529612 |
ttataaacaatgaaatgatattttttcttacgaaatgattttttttaaa |
27529564 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #251
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 29953806 - 29953726
Alignment:
| Q |
244 |
ttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattt |
324 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||| | | ||||||| || ||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
29953806 |
ttatgaaatgatattttctaaaatataaatgtcgataaagagttctttattttataaaaacgatcgttaatttataaattt |
29953726 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #252
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 216 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 30263745 - 30263677
Alignment:
| Q |
216 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||||| | | |||| ||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
30263745 |
cttataaatagtaaaataatgttttttcttatgaaatattgttctataaaatataaatattaacaaata |
30263677 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 179)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 24505152 - 24505511
Alignment:
| Q |
1 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24505152 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcataaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
24505251 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
200 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24505252 |
ttttatataccaaaagcttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
24505351 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
300 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24505352 |
ttttgtaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
24505451 |
T |
 |
| Q |
301 |
aagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
360 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24505452 |
aagtgatctttaatttatatattttatgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
24505511 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 25866934 - 25867293
Alignment:
| Q |
1 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25866934 |
tgggtgtatcagtacaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattattttttatcattgacaactaagataattaaa |
25867033 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25867034 |
ttttatttaccaaaagctttgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
25867133 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25867134 |
ttttttaatatgatccttacaaacaatgaaatgatggttttttttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
25867233 |
T |
 |
| Q |
301 |
aagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
360 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25867234 |
aagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
25867293 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 5 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 32186799 - 32186442
Alignment:
| Q |
5 |
tgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaatttt |
104 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32186799 |
tgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgttttttagaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaatttt |
32186700 |
T |
 |
| Q |
105 |
atttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaatttt |
204 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32186699 |
atttaccaaaagcttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcgtaacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaatttt |
32186600 |
T |
 |
| Q |
205 |
ttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggt--ttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaa |
302 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32186599 |
ttaatatgatccttatgaacaatgaaatgatggttttttttttatgaaataatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaa |
32186500 |
T |
 |
| Q |
303 |
gtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
360 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32186499 |
gtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
32186442 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 5 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 41715515 - 41715158
Alignment:
| Q |
5 |
tgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaatttt |
104 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41715515 |
tgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgttttttagaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaatttt |
41715416 |
T |
 |
| Q |
105 |
atttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaatttt |
204 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41715415 |
atttaccaaaagcttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcgtaacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaatttt |
41715316 |
T |
 |
| Q |
205 |
ttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggt--ttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaa |
302 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41715315 |
ttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggttttttttttatgaaataatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaa |
41715216 |
T |
 |
| Q |
303 |
gtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
360 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41715215 |
gtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtatcggtacactcaaaattgtga |
41715158 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 11 - 356
Target Start/End: Original strand, 39444004 - 39444349
Alignment:
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11 |
ggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttac |
110 |
Q |
| |
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|
| T |
39444004 |
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39444103 |
T |
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111 |
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210 |
Q |
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| T |
39444104 |
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39444203 |
T |
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| Q |
211 |
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310 |
Q |
| |
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| T |
39444204 |
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39444303 |
T |
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| Q |
311 |
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356 |
Q |
| |
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|
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| T |
39444304 |
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39444349 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Original strand, 47219985 - 47220341
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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47220083 |
T |
 |
| Q |
101 |
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200 |
Q |
| |
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|
|
| T |
47220084 |
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47220183 |
T |
 |
| Q |
201 |
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300 |
Q |
| |
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|
|
| T |
47220184 |
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47220283 |
T |
 |
| Q |
301 |
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358 |
Q |
| |
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|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47220284 |
aagtgatctttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 18922605 - 18922964
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18922605 |
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18922704 |
T |
 |
| Q |
101 |
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200 |
Q |
| |
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|
|
| T |
18922705 |
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18922804 |
T |
 |
| Q |
201 |
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300 |
Q |
| |
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|
| T |
18922805 |
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18922904 |
T |
 |
| Q |
301 |
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360 |
Q |
| |
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|
|
| T |
18922905 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 5 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 45197178 - 45196823
Alignment:
| Q |
5 |
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104 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45197178 |
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45197079 |
T |
 |
| Q |
105 |
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204 |
Q |
| |
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| T |
45197078 |
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45196979 |
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 |
| Q |
205 |
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304 |
Q |
| |
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| T |
45196978 |
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45196879 |
T |
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| Q |
305 |
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360 |
Q |
| |
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| T |
45196878 |
gatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 15090697 - 15091055
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
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200 |
Q |
| |
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| T |
15090797 |
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T |
 |
| Q |
201 |
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300 |
Q |
| |
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|
| T |
15090897 |
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15090996 |
T |
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| Q |
301 |
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360 |
Q |
| |
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| T |
15090997 |
aagtgatcgttaatttataaattttgtgaaataacagtacc-gtacactcaaaattgtga |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 42039331 - 42039690
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
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200 |
Q |
| |
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|
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| T |
42039431 |
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T |
 |
| Q |
201 |
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300 |
Q |
| |
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| T |
42039531 |
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T |
 |
| Q |
301 |
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360 |
Q |
| |
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|
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| T |
42039631 |
aagtgatctttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 42902764 - 42902405
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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T |
 |
| Q |
101 |
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200 |
Q |
| |
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|
| T |
42902664 |
ttttatttaccaaaagcttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaatattgattattttttaggacaaaatgtaaa |
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T |
 |
| Q |
201 |
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300 |
Q |
| |
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|
|
| T |
42902564 |
ttttttaatatgttccttataaataatgaaatgatgatttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgataaatacctttttatttcatta |
42902465 |
T |
 |
| Q |
301 |
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360 |
Q |
| |
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|
|
| T |
42902464 |
aagtgatcattaatttatatattttgtgaaataagagtaccggtacacttaaaattgtga |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 2038473 - 2038115
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
|
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|
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T |
 |
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200 |
Q |
| |
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|
| T |
2038373 |
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T |
 |
| Q |
201 |
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300 |
Q |
| |
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|
|
| T |
2038273 |
ttttttaatataatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgataaatacctttttatttcatta |
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T |
 |
| Q |
301 |
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359 |
Q |
| |
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2038173 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 22 - 360
Target Start/End: Original strand, 9923120 - 9923458
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
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T |
 |
| Q |
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221 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
222 |
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321 |
Q |
| |
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|
| T |
9923320 |
aacaatgaaatgatgatttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatctttaatttatata |
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T |
 |
| Q |
322 |
ttttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
360 |
Q |
| |
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| T |
9923420 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 1282214 - 1282573
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Q |
| |
|
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|
| T |
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T |
 |
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ttttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
200 |
Q |
| |
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ttttatttatcaaaagcttcgacgaaataaaacttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaaat |
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T |
 |
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ttttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
300 |
Q |
| |
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|
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ttttttaatacgatccttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
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T |
 |
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301 |
aagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
360 |
Q |
| |
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1282514 |
aagtgatcattaatttatatgttttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 40947351 - 40946992
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| |
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ttttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
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| |
|
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ttttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #16
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Target Start/End: Original strand, 17334767 - 17335124
Alignment:
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T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 5 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 47069335 - 47068981
Alignment:
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104 |
Q |
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T |
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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 3061931 - 3062281
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100 |
Q |
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T |
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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 5 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 7574488 - 7574144
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304 |
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| T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 5 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 33704921 - 33704643
Alignment:
| Q |
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| Q |
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| T |
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| Q |
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285 |
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T |
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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 27130921 - 27130666
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199 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 55 - 324
Target Start/End: Original strand, 31311429 - 31311694
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| Q |
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31311626 |
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324 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 55 - 298
Target Start/End: Original strand, 1343104 - 1343347
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Q |
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254 |
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1343303 |
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298 |
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| |
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| T |
1343304 |
tgttttctaaaatataaatatcgataaataactctttatttcat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 58 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 22904813 - 22904546
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Q |
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255 |
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| T |
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22904614 |
T |
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| Q |
256 |
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324 |
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|
| T |
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22904546 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 55 - 348
Target Start/End: Original strand, 31743385 - 31743676
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gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaa-gagttttta |
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Q |
| |
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| T |
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253 |
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254 |
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348 |
Q |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 59 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 25411946 - 25411687
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Q |
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| T |
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T |
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258 |
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| T |
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319 |
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| |
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| T |
25411746 |
ttctgaaatataaataatgacaaataacaacttatttca-taaaatgatcattaatttata |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 55 - 325
Target Start/End: Original strand, 13806445 - 13806713
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| T |
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13806543 |
T |
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tactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttat-gaaatg |
253 |
Q |
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13806544 |
tacatataacaaagaatattgattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatataattcttataaacaatgaaatgat-gtttttcttataaaaatg |
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T |
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254 |
atgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatatttt |
325 |
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13806713 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
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Target Start/End: Original strand, 11640381 - 11640607
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158 |
Q |
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T |
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Q |
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T |
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Q |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #29
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Query Start/End: Original strand, 59 - 319
Target Start/End: Original strand, 43541868 - 43542127
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158 |
Q |
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T |
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258 |
Q |
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T |
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319 |
Q |
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| T |
43542068 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #30
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158 |
Q |
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T |
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256 |
Q |
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| T |
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T |
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| T |
19345898 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 56 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 40856859 - 40856593
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155 |
Q |
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T |
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| Q |
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254 |
Q |
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| T |
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T |
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324 |
Q |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 59 - 284
Target Start/End: Original strand, 41311140 - 41311365
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158 |
Q |
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| Q |
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258 |
Q |
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| T |
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41311339 |
T |
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284 |
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| T |
41311340 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 55 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 29689248 - 29689005
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| Q |
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154 |
Q |
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254 |
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29689049 |
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298 |
Q |
| |
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| T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 58 - 284
Target Start/End: Original strand, 45442140 - 45442365
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Q |
| |
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| Q |
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257 |
Q |
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| T |
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45442338 |
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284 |
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| T |
45442339 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 56 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 27800351 - 27800083
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155 |
Q |
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| T |
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| Q |
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254 |
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| T |
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27800152 |
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 |
| Q |
255 |
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324 |
Q |
| |
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| T |
27800151 |
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27800083 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 92 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 45857762 - 45857506
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Q |
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45857762 |
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45857663 |
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290 |
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| T |
45857662 |
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45857563 |
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348 |
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| |
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| T |
45857562 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
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aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattact |
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Q |
| |
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| T |
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T |
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256 |
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| T |
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40331179 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
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Q |
| |
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| T |
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27427353 |
T |
 |
| Q |
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252 |
Q |
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| T |
27427352 |
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27427253 |
T |
 |
| Q |
253 |
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284 |
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| |
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| T |
27427252 |
ggtgttttttaaaatataaataatgacaaata |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
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Target Start/End: Complemental strand, 9682345 - 9682058
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Q |
| |
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9682345 |
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9682247 |
T |
 |
| Q |
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cataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgtt |
258 |
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| |
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| T |
9682246 |
cataaacatgaatattgattattttttatgagaaaatactaaaaaattaatatgattcttataaataaagaaacgatgtttttgcttatgaaataatgtt |
9682147 |
T |
 |
| Q |
259 |
ttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacact |
349 |
Q |
| |
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|| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||| | ||||||||||| || | ||| | ||| ||||||| ||||||||| |
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|
| T |
9682146 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 56 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 23182711 - 23182470
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Q |
| |
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T |
 |
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255 |
Q |
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| T |
23182611 |
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T |
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| Q |
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298 |
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| |
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gtattataaaatataaatattgataaataactctttatttcat |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 40379201 - 40379037
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248 |
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313 |
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40379037 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 59 - 284
Target Start/End: Original strand, 49079339 - 49079567
Alignment:
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59 |
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158 |
Q |
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T |
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256 |
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49079538 |
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284 |
Q |
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| T |
49079539 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #43
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Query Start/End: Original strand, 59 - 324
Target Start/End: Original strand, 3228327 - 3228596
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59 |
aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaag-agtttttattac |
157 |
Q |
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T |
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253 |
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T |
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324 |
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3228527 |
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3228596 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
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Target Start/End: Complemental strand, 34363937 - 34363646
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gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttat |
154 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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| T |
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34363740 |
T |
 |
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348 |
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| T |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 92 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 44964109 - 44963854
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Q |
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| T |
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T |
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291 |
Q |
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| T |
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44963910 |
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348 |
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| T |
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T |
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Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 59 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 45701355 - 45701124
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aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattact |
158 |
Q |
| |
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159 |
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251 |
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| T |
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45701157 |
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| T |
45701156 |
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Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 56 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 2932904 - 2932630
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Q |
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| T |
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2932805 |
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| Q |
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248 |
Q |
| |
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| T |
2932804 |
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| Q |
249 |
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324 |
Q |
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| T |
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T |
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Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 160 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 21919906 - 21919720
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Q |
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| T |
21919906 |
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T |
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| Q |
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348 |
Q |
| |
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| T |
21919806 |
tataaaatataaatattgataaataactctttatttca-taaaataatcgttaaattgtaaatatt-tgaagcaggagtaccggtacac |
21919720 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 148 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 46911774 - 46911603
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244 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |
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| T |
46911774 |
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46911676 |
T |
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| Q |
245 |
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319 |
Q |
| |
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|
| T |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 59 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 27897541 - 27897278
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Q |
| |
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|
| T |
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| T |
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27897344 |
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324 |
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|
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| T |
27897343 |
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27897278 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #51
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gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttat |
154 |
Q |
| |
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31760170 |
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254 |
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| |
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| T |
31760171 |
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31760270 |
T |
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298 |
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| |
|
||| || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |
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|
| T |
31760271 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #52
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gaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaa-gagtttttatta |
156 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| || | || ||||||||| |||| || |||||||| |
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| T |
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T |
 |
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157 |
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251 |
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| |
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| T |
8648258 |
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8648159 |
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 |
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252 |
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319 |
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| |
|
|| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||| |
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|
| T |
8648158 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 59 - 284
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157 |
Q |
| |
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| T |
22639688 |
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22639589 |
T |
 |
| Q |
158 |
tcataacaatgaatattgatta-ttttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatg--gtttttcttatgaaatga |
254 |
Q |
| |
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| T |
22639588 |
tcataatgaagaatatttattatttttttatgagaaaatgttaaaaatttaatataattcatataaacaatgaaataatgttttttttctcatgagatgg |
22639489 |
T |
 |
| Q |
255 |
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284 |
Q |
| |
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| T |
22639488 |
tgttttctaaaatataaataatgacaaata |
22639459 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 92 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 30936380 - 30936125
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ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
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| T |
30936380 |
ataattaaatcttatttatcaaaaacatcgacgaaataaaatttgatttttctgaatttttagtaatcgtaatagagaattttgattattctttacaata |
30936281 |
T |
 |
| Q |
192 |
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290 |
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| |
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| T |
30936280 |
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30936182 |
T |
 |
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291 |
tatttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
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tatttcataaaattgatagttaatttataaatttt-tgaagtaagagtaccggtacac |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
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| |
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42583850 |
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42583949 |
T |
 |
| Q |
159 |
cataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgtt |
258 |
Q |
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42584048 |
T |
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284 |
Q |
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| T |
42584049 |
ttctaaaatataaatattgacaaata |
42584074 |
T |
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Target: chr7; HSP #56
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Target Start/End: Original strand, 17834014 - 17834258
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153 |
Q |
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T |
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154 |
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253 |
Q |
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| T |
17834114 |
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17834213 |
T |
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298 |
Q |
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| T |
17834214 |
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T |
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Target: chr7; HSP #57
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Target Start/End: Original strand, 42975013 - 42975248
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191 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
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289 |
Q |
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| T |
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42975212 |
T |
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| Q |
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325 |
Q |
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| T |
42975213 |
ttatttcataaaaataatagttaatttataaatttt |
42975248 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
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Target Start/End: Original strand, 32823023 - 32823201
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157 |
Q |
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32823023 |
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32823122 |
T |
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| Q |
158 |
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236 |
Q |
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| T |
32823123 |
tcataacaaagaatattgattattttttattagaaaatgtaaaaaatttaatataactcttataaaaaataaaatgatg |
32823201 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 55 - 298
Target Start/End: Original strand, 5215104 - 5215351
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55 |
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151 |
Q |
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| T |
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5215203 |
T |
 |
| Q |
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250 |
Q |
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| T |
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5215303 |
T |
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298 |
Q |
| |
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| T |
5215304 |
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5215351 |
T |
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Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
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Target Start/End: Original strand, 11486114 - 11486370
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191 |
Q |
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| T |
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11486213 |
T |
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| Q |
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Q |
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| T |
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11486313 |
T |
 |
| Q |
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348 |
Q |
| |
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| T |
11486314 |
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11486370 |
T |
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Back To:
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Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 92 - 296
Target Start/End: Original strand, 43069197 - 43069401
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| Q |
92 |
ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
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| T |
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43069296 |
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| Q |
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291 |
Q |
| |
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| T |
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43069396 |
T |
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| Q |
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296 |
Q |
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| T |
43069397 |
atttc |
43069401 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 55 - 348
Target Start/End: Original strand, 2088950 - 2089237
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gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttat |
154 |
Q |
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| T |
2088950 |
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2089049 |
T |
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| Q |
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254 |
Q |
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| T |
2089050 |
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2089145 |
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| Q |
255 |
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348 |
Q |
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| T |
2089146 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 65 - 319
Target Start/End: Original strand, 35394900 - 35395152
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Q |
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| T |
35394900 |
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35394998 |
T |
 |
| Q |
165 |
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264 |
Q |
| |
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| T |
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35395098 |
T |
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265 |
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319 |
Q |
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| T |
35395099 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #64
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Target Start/End: Complemental strand, 8770540 - 8770401
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Q |
| |
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8770441 |
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 |
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348 |
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| T |
8770440 |
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8770401 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
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Target Start/End: Original strand, 24148856 - 24149080
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aataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaat--tttaagagtttttattactc |
159 |
Q |
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| T |
24148856 |
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24148952 |
T |
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160 |
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256 |
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| T |
24148953 |
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24149052 |
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284 |
Q |
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| T |
24149053 |
ttttctaaaatataaataatgacaaata |
24149080 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 318
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167 |
Q |
| |
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| T |
29982367 |
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29982268 |
T |
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| Q |
168 |
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266 |
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| |
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| T |
29982267 |
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29982169 |
T |
 |
| Q |
267 |
tataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttat |
318 |
Q |
| |
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| T |
29982168 |
tataaaagtcgacaaatagctctttgttacataaaaatgattgttaaattat |
29982117 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 92 - 348
Target Start/End: Original strand, 43750193 - 43750450
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ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
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|||||||||| ||||| ||||||| | || ||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||| | | |
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| T |
43750193 |
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43750292 |
T |
 |
| Q |
192 |
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289 |
Q |
| |
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| T |
43750293 |
aaatgtaaaaaaaaattagtatgatttttatagacaatgaaatgacgttttttcttatgaaatgacattttctaaaatataaatatcaataaatagctct |
43750392 |
T |
 |
| Q |
290 |
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348 |
Q |
| |
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| T |
43750393 |
ttattccataaaaataatagttaatttaaagatttt-tgaagtaggagtaccggtacac |
43750450 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
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tctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaata |
172 |
Q |
| |
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| T |
43958920 |
tctatcatttacaattataaaaattaaatcttatttaccaaaagtgtcgacgaaataaaatttattttttttgaatttttattactcataatgaagatta |
43958821 |
T |
 |
| Q |
173 |
ttgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggttt--ttcttatgaaatgatgttttctaaa |
265 |
Q |
| |
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|
| T |
43958820 |
ttgattattttttatga-gtaatgttaaaaatttaatatgattcttataaacaatgaaattatgtttttcttcttatgaaattatgttttctaaa |
43958727 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 92 - 325
Target Start/End: Original strand, 41809319 - 41809552
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ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
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| T |
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ataactaaatcttatttatcaaaaacatcgacgaaataaaatttaatttttatgaatttttagtactcataatcgagaattttgattattttttacaata |
41809418 |
T |
 |
| Q |
192 |
aaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggt-ttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttt |
290 |
Q |
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| T |
41809419 |
aaatgtaaacaaaatagtatgaattttataa-caatgaaatgatgttatttttttatgaaatgatattttctaaaatataaatatcaacaaataattctt |
41809517 |
T |
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| Q |
291 |
tatttcattaaagtgatcgttaatttatatatttt |
325 |
Q |
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| T |
41809518 |
tatttcataaaattgatagttaatttatagatttt |
41809552 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 55 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 8159949 - 8159726
Alignment:
| Q |
55 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttat |
154 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||| ||||| ||||||| || | |||||||| |||||||||||||| | || ||| |||||||| |||||| | ||||| | |
|
|
| T |
8159949 |
gaagaaaaagaagtattgtctatggttgacaattataaaaattaaatcttatttaccaaaagtgttgatgaaataaaattt-aatttttttaattttttt |
8159851 |
T |
 |
| Q |
155 |
tactcataacaatgaatattgattat-tttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatg |
253 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||| ||||||| | ||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
8159850 |
tactcataacgaacaatattgattatatttttataagaaaatattaa-aatttaatatgattcttataaacaatgaaatgatattttttcttataaaatg |
8159752 |
T |
 |
| Q |
254 |
atgttttctaaaatataaatattgac |
279 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
8159751 |
atgttttctaaaatgtaaacattgac |
8159726 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 56 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16200851 - 16200711
Alignment:
| Q |
56 |
aagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttatt |
155 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| | |||||||| ||| || |||||||| |
|
|
| T |
16200851 |
aagaaaaataattattttctatcattgacaattataaaaattaaatcttattaaccaaaagcatcgacgaaattaaatttaatgtttttgaatttttatt |
16200752 |
T |
 |
| Q |
156 |
actcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgt |
197 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||||||||| || ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
16200751 |
actcataacgaagaatattgagta-tttttatgagaaaatgt |
16200711 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 92 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 20439103 - 20438847
Alignment:
| Q |
92 |
ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| ||||||| | ||||| || ||||||||| |||| ||||||||| || | |||| | |||| ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
20439103 |
ataattaaatcttattaaccaaaaacgtcgacaaaagaaaatttaatttttctgagtttttagtaattataatagagaattttgattattttttatgata |
20439004 |
T |
 |
| Q |
192 |
aaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttt |
290 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||| || || |
|
|
| T |
20439003 |
aaatgtaaaaaaattaatattatttttataaacaatgaaatgacgtttttttcttataaaatgacattttttaaaatataaatatcaacaaatagctctt |
20438904 |
T |
 |
| Q |
291 |
tatttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
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|||| ||| ||| | || ||||||||| | ||||| |||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
20438903 |
tattccataaaaataatagttaatttaaagatttt-tgaagtaggagtaccggtacac |
20438847 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 56 - 236
Target Start/End: Original strand, 1583733 - 1583913
Alignment:
| Q |
56 |
aagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttatt |
155 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||| |||| ||| || ||||||| |||| | |||||| | |
|
|
| T |
1583733 |
aagaaaaagaattattttttatcattgacaattataataattaaatcttatttacggaaagcatcgatgaaatacaatttaatttttttaaatttttact |
1583832 |
T |
 |
| Q |
156 |
actcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatg |
236 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||| || | ||||| || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1583833 |
actcataacaaagattattgattattttttatgagaagatgttaaaaaatcaatattattcttataaacaatgaaatgatg |
1583913 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 209 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16087115 - 16086977
Alignment:
| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgat |
307 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
16087115 |
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16087017 |
T |
 |
| Q |
308 |
cgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
|
||||| |||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16087016 |
cgttagtttataga-tttatgaagcaagagtaccggtacac |
16086977 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 168 - 319
Target Start/End: Original strand, 35357898 - 35358050
Alignment:
| Q |
168 |
gaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaat |
267 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| || || ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
35357898 |
gaatattgattatattttaggataatatgtaaaaaaattactatgattcttataaacaatgaactgatgttttttcttatgaaatgatgttctataaaat |
35357997 |
T |
 |
| Q |
268 |
ataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgttaatttata |
319 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| | |||||||||| ||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
35357998 |
ataaatattgataaatagttatttatttcataaaaaatgatctttaatttata |
35358050 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 209 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 43631224 - 43631086
Alignment:
| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgat |
307 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
43631224 |
tatgattcttataaacaatgaa-tgatgcgtttttcttctgaaatcatattttctaaaatataaatgtcgacaaataactatttatttcataaaattgat |
43631126 |
T |
 |
| Q |
308 |
cgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
|
||||| |||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43631125 |
cgttagtttataga-tttatgaagcaagagtaccggtacac |
43631086 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 170 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 48460459 - 48460331
Alignment:
| Q |
170 |
atattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatat |
269 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
48460459 |
atatttattattttttatgagaaaatgctaaaaatttaatatgattcttataaacaatgaaatgatgtttattcttataaaatgatgccttataaaatat |
48460360 |
T |
 |
| Q |
270 |
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298 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
48460359 |
aaatattgataaataactctttatttcat |
48460331 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 59 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 428158 - 427944
Alignment:
| Q |
59 |
aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattact |
158 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||||||| |||| || |||| || ||||||||| |||||| ||| ||||| |||||| ||| ||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
428158 |
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428059 |
T |
 |
| Q |
159 |
cataacaatgaatattgattatttttta-tgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgt |
257 |
Q |
| |
|
||||| | |||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
428058 |
cataatagtgaatatttattattttttcctgataaaatgtaaaaaaattagtatgattcttataaacaatgaaattatgttttttcttatgaaataatat |
427959 |
T |
 |
| Q |
258 |
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272 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
427958 |
tctcttaaatataaa |
427944 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 168 - 298
Target Start/End: Original strand, 15954326 - 15954456
Alignment:
| Q |
168 |
gaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaat |
267 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| || || ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
15954326 |
gaatattgattatattttaggataatatgtaaaaaaattactatgattcttataaacaatgaactgatgttttttcttatgaaatgatgttctataaaat |
15954425 |
T |
 |
| Q |
268 |
ataaatattgacaaatacctttttatttcat |
298 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
15954426 |
ataaatattgataaatagttatttatttcat |
15954456 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 92 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 17306887 - 17306663
Alignment:
| Q |
92 |
ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| | |||||| || ||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
17306887 |
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17306788 |
T |
 |
| Q |
192 |
aaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaataccttttt |
291 |
Q |
| |
|
| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || ||| |
|
|
| T |
17306787 |
atatgtaaaaaaattactatgattcttataaacaatgaaatgatg-tttttcttacgaaatgatgttctataaaatataaatattgaaaaatagctattt |
17306689 |
T |
 |
| Q |
292 |
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316 |
Q |
| |
|
|| ||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
17306688 |
cttacatgaaaaatgatcgttaattt |
17306663 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 92 - 325
Target Start/End: Original strand, 31482492 - 31482725
Alignment:
| Q |
92 |
ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| | |||||| | |||||||||| ||||| || |||||| ||||| || | |||| |||||||||||||| | | |
|
|
| T |
31482492 |
ataattaaatcttatttaccaaaaacgtcgacggaataaaatttaatttttatgaatttttagtactcgaaatagagaattttgattattttttacaata |
31482591 |
T |
 |
| Q |
192 |
aaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaataccttttt |
291 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| || ||| |
|
|
| T |
31482592 |
aaatgtaaaaaaattagtatgacttttataaataataaaataatattttttcttatgaaatgatattttctaaaatacaaatatcatgaaatagctcttt |
31482691 |
T |
 |
| Q |
292 |
atttcattaaagtgatcgttaatttatatatttt |
325 |
Q |
| |
|
||||||| ||| | || ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
31482692 |
atttcataaaaataatagttaatttatagatttt |
31482725 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 205 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 5583035 - 5582956
Alignment:
| Q |
205 |
ttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
5583035 |
ttaatatgattcttataaacaatgaaatgatgttttttcttacgaaatgatgttctataaaatataaatattgaaaaata |
5582956 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 95 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 15584824 - 15584571
Alignment:
| Q |
95 |
attaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaa |
194 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||| || ||||| ||||||| || | || || |||| || |||||||| | ||| ||||||||||| || | || | |
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|
| T |
15584824 |
attaaattttattcatcaaaagcgtcaacgaaataaaattgaattcttttgaattttgatcactcataatagagaactttgattattttatacaataata |
15584725 |
T |
 |
| Q |
195 |
tgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatga-tggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttat |
293 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |||||| |||||||||||| | |||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||| | |
|
|
| T |
15584724 |
tgtaaaaaatttactatgattcttataaacaat-agatgacttgtttttcttatgaaattatattttctaaaatataaatgccgataaataactatttgt |
15584626 |
T |
 |
| Q |
294 |
ttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacact |
349 |
Q |
| |
|
|| || ||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15584625 |
tttataaaattgatcgttaatttatagatttag-gaaacaagagtaccggtacact |
15584571 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 209 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 32529350 - 32529239
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgat |
307 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||| |||| |
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|
| T |
32529350 |
tatgattcttataaacaatgaactgatgctttttcttatgaaataatgttctataaaatataaatattgataaatagttatttatttcataaaaaatgat |
32529251 |
T |
 |
| Q |
308 |
cgttaatttata |
319 |
Q |
| |
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|||||||||||| |
|
|
| T |
32529250 |
cgttaatttata |
32529239 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 281 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 33704580 - 33704505
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281 |
aatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaatt |
356 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
33704580 |
aatacctttttatttcattaaggtgatcgttcatttataaattttgtgaaacaagagtactcgtacactcaaaatt |
33704505 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 209 - 347
Target Start/End: Original strand, 41742813 - 41742950
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209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgat |
307 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
41742813 |
tatgattcttataaacaatgaa-tgatgcgtttttcttctgaaatcacattttctaaaatataaatgcagacaaataactatttatttcataaaattgat |
41742911 |
T |
 |
| Q |
308 |
cgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtaca |
347 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
41742912 |
cgttaatttataga-tttatgaaacaagagtatcggtaca |
41742950 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 294
Target Start/End: Original strand, 18990209 - 18990410
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92 |
ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||||||||| | ||||| || |||||||||| |||| || |||||| ||||||||| | |||| |||||||||||| | | | |
|
|
| T |
18990209 |
ataattaaatatcatttaccaaaaacatcgacaaaataaaatttaatttttctgaatttttagtactcataatagagaattttgattattttt-acaata |
18990307 |
T |
 |
| Q |
192 |
aaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaataccttttt |
291 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| || ||| |
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|
| T |
18990308 |
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18990407 |
T |
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292 |
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294 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
18990408 |
att |
18990410 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 216 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 23406815 - 23406683
Alignment:
| Q |
216 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgttaat |
314 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
23406815 |
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23406716 |
T |
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| Q |
315 |
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348 |
Q |
| |
|
|||| | || |||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
23406715 |
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23406683 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 348
Target Start/End: Original strand, 34118589 - 34118845
Alignment:
| Q |
92 |
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191 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
34118589 |
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34118688 |
T |
 |
| Q |
192 |
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290 |
Q |
| |
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| T |
34118689 |
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34118788 |
T |
 |
| Q |
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348 |
Q |
| |
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|
|
| T |
34118789 |
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34118845 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 56 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 35859408 - 35859231
Alignment:
| Q |
56 |
aagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagt-aaaattta-aattttaagagttttta |
153 |
Q |
| |
|
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| T |
35859408 |
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35859309 |
T |
 |
| Q |
154 |
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231 |
Q |
| |
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|
|
| T |
35859308 |
ttactcataagagataatatttattattttttatgaaaaaatgttaaaaatttaatatgattcttataaataatgaaa |
35859231 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 209 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 35291496 - 35291357
Alignment:
| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgat |
307 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||| | || |
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|
| T |
35291496 |
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35291397 |
T |
 |
| Q |
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348 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
35291396 |
cgttaatttata-aaattatgaagaaagagtaccggtacac |
35291357 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 209 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 11750589 - 11750514
Alignment:
| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
11750589 |
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11750514 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 209 - 284
Target Start/End: Original strand, 15716142 - 15716217
Alignment:
| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
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|
| T |
15716142 |
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15716217 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 209 - 284
Target Start/End: Original strand, 24812318 - 24812393
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
24812318 |
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24812393 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 209 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 24953096 - 24953021
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24953096 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgctttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaata |
24953021 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 72 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 41769578 - 41769407
Alignment:
| Q |
72 |
ttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaat |
171 |
Q |
| |
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|||||||||| |||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| || ||||| |||| ||||||| |||| |
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|
| T |
41769578 |
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41769479 |
T |
 |
| Q |
172 |
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242 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
41769478 |
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41769407 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 205 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 16200556 - 16200443
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| Q |
205 |
ttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatg-ttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaag |
303 |
Q |
| |
|
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| T |
16200556 |
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16200458 |
T |
 |
| Q |
304 |
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318 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
16200457 |
tgatcgttaatttat |
16200443 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 209 - 346
Target Start/End: Original strand, 23561342 - 23561478
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgat |
307 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
23561342 |
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23561440 |
T |
 |
| Q |
308 |
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346 |
Q |
| |
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|||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
23561441 |
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23561478 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 172 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 26605264 - 26605087
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| Q |
172 |
attgattattttttatgacaaaatgtaaatttt-ttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || || ||||||| | ||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| | ||||||||| |
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| T |
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26605165 |
T |
 |
| Q |
271 |
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348 |
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| |
|
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|
|
| T |
26605164 |
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26605087 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 148 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 37118564 - 37118394
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247 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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37118465 |
T |
 |
| Q |
248 |
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318 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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37118394 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 272
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167 |
Q |
| |
|
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|
| T |
968810 |
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| Q |
168 |
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266 |
Q |
| |
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|
|
| T |
968710 |
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968611 |
T |
 |
| Q |
267 |
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272 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
968610 |
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968605 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 216 - 319
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| Q |
216 |
cttataaacaatgaaatgatggtttt-tcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgttaa |
313 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
3214763 |
cttataaacaatgaaatgatatttttttcttatgaaataatgttctataaaatataaatattgacaaatagctatttattacataaaaaatgatcgttaa |
3214862 |
T |
 |
| Q |
314 |
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319 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
3214863 |
tttata |
3214868 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 209 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 7574721 - 7574636
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatt |
294 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||| || |||||| |
|
|
| T |
7574721 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgataaatagctatttatt |
7574636 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
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136 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |
|
|
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12395280 |
aaaaataattattttctatcattaacaactataataattaaatcttatttaccaaaagcgtcgatgaaataaaattta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 348
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148 |
tttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaa-tgaaatgatggtttttctta |
246 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||| | |||||||||| | ||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |
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|
| T |
15877250 |
tttttattacttataatagtgaatatttattattttttca-ataaaatgtaaaataattagtatgattcttataaacaaatgaaatgatattttttctta |
15877348 |
T |
 |
| Q |
247 |
tgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtac |
346 |
Q |
| |
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|||||| || |||| ||||||||||| | ||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||| |||| || ||| ||||||| | |||||||||| |
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| T |
15877349 |
tgaaataatattttataaaatataaaagtcaacaaatagctcttttttacataaaaatgatcgttaacttat-taatttatgaaacaggtgtaccggtac |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #106
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68 |
tattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaat |
167 |
Q |
| |
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|||||||||||||| | || || ||||||| ||||||||| |||||| ||| | || |||||||||||||| | |||||||||||||||| | | |
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| T |
24189361 |
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24189262 |
T |
 |
| Q |
168 |
gaatattgattattttttatgacaaaatg-taaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaa |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | | ||||| |||| |||| ||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||| |
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|
| T |
24189261 |
gaatattgattatttttt-tcattaaatgttaaaaaatttagtataattcttataaaaaatgaaatgatgttttttcttatgggataatattttctaaaa |
24189163 |
T |
 |
| Q |
267 |
tataaa |
272 |
Q |
| |
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|||||| |
|
|
| T |
24189162 |
tataaa |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #107
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tttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttat--gaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat |
298 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
27567317 |
tttaatatgattcttatcaacaatgaaatgatgtttttttttttaagaaatgatgtttcataaaatataaatattgacaaataactctttatttcat |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
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Target Start/End: Complemental strand, 38035034 - 38034829
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Q |
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38034935 |
T |
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168 |
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266 |
Q |
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|
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| T |
38034934 |
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38034835 |
T |
 |
| Q |
267 |
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272 |
Q |
| |
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|||||| |
|
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38034834 |
tataaa |
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T |
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271 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
272 |
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348 |
Q |
| |
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||| |||||||| || |||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||| | || |||||||||||||||| |
|
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| T |
2291080 |
ataccgacaaataactatttatttcataaaattgatcattaatttataaatttgg-gatgaaagagtaccggtacac |
2291155 |
T |
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307 |
Q |
| |
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|||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| | || |||||||||| ||| |||| |
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| T |
6791613 |
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6791515 |
T |
 |
| Q |
308 |
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348 |
Q |
| |
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||||| |||||| | || ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
6791514 |
cgttactttata-aaattatgaaaaaagagtaccggtacac |
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T |
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247 |
Q |
| |
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19503251 |
T |
 |
| Q |
248 |
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272 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||||||||| |
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|
| T |
19503250 |
gaaataatattttctaaaatataaa |
19503226 |
T |
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Target: chr7; HSP #112
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tattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaa |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||| |||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||| || |||| |||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
| T |
42711109 |
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42711208 |
T |
 |
| Q |
252 |
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319 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| || | ||||| |||| ||| |||||| ||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
42711209 |
tgatattttctaaaatatatatgtcaacaaacacctatttctttcataaaaaatgatagttaatttata |
42711277 |
T |
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Target: chr7; HSP #113
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
23110600 |
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23110525 |
T |
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| Q |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||| |
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|
| T |
28264920 |
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28264845 |
T |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30076877 |
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30076952 |
T |
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38666106 |
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38666181 |
T |
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Target: chr7; HSP #117
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47369388 |
tatgattcttataaacaatctaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaata |
47369313 |
T |
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Target: chr7; HSP #118
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tttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattt |
324 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
8578063 |
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8577979 |
T |
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tttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
360 |
Q |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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9915500 |
tttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
9915546 |
T |
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Target: chr7; HSP #120
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ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaattt |
316 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||| | | | ||||| |||||||||| |||| | ||||||||||| |
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| T |
24204776 |
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24204677 |
T |
 |
| Q |
317 |
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347 |
Q |
| |
|
|| | ||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
24204676 |
at-caatttatgaagcaagagtaccggtaca |
24204647 |
T |
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Target: chr7; HSP #121
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tattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaat |
167 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | || || ||||||| ||||||||| |||||| ||| | ||| |||||| ||||||| | |||||||| ||||||| | | |
|
|
| T |
20883720 |
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20883819 |
T |
 |
| Q |
168 |
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266 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| | ||||||| ||| |||| ||| || ||||| || |||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||| |
|
|
| T |
20883820 |
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20883918 |
T |
 |
| Q |
267 |
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324 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
20883919 |
tataaaagtcgataaatatctctttatcacataaaagttatcgttaacttatagattt |
20883976 |
T |
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156 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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24205424 |
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186 |
Q |
| |
|
|| ||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24205423 |
cttataacaaagaatattgattatttttta |
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T |
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agaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttatta |
156 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
24207040 |
agaaaagtaattattttctgtaattgacaattatcaaaattaaatattatttaccaaaagtgtcgacaaaataaa-tataatttttctgaatttttatta |
24206942 |
T |
 |
| Q |
157 |
ctcataacaatgaatattgattatttttta |
186 |
Q |
| |
|
|| ||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24206941 |
cttataacaaagaatattgattatttttta |
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T |
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Target: chr7; HSP #124
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attgattattttttatgacaaaatgtaaatttt-ttaatatgatccttataaacaat--gaaatgatggttttt-cttatgaaatgatgttttctaaaat |
267 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
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41046950 |
T |
 |
| Q |
268 |
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319 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| || ||||| |||| ||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
41046949 |
ataaatattaacaaataactatttatatcataaaaaattatcgttaatttata |
41046897 |
T |
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284 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
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22967582 |
tatgattcttataaacaatgaaatgatgtttttttcttatgaaatcatgttctataaaatataaatattaacaaata |
22967506 |
T |
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Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| | || |||||||||| ||| | || |
|
|
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41968503 |
T |
 |
| Q |
308 |
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348 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | || ||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
41968502 |
cgttaatttata-aaattatgaaaaaagagtaccgatacac |
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T |
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Target: chr7; HSP #127
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaata-ttgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||| |
|
|
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46575273 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatatttgacaaata |
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T |
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307 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| | | ||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| || |||| | ||| ||| |||| |
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|
| T |
3602504 |
tatgattcttataaatagtaaaatgatattttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaatagctatttactacataaaaaatgat |
3602603 |
T |
 |
| Q |
308 |
cgttaatttata |
319 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
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cgttaatttata |
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cttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaat |
314 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||| | |||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||| |
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|
| T |
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15591727 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #130
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
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|
|
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Target: chr7; HSP #131
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158 |
tcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgt |
257 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| || | |
|
|
| T |
46880089 |
tcataatagtgaatattgattattttttc-gataaaatgttaaaaaattaatatgattcttataaagaatgaaatgatg-tttttcttacgaaataatat |
46879992 |
T |
 |
| Q |
258 |
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313 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | |||||||| | |||||| ||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
46879991 |
tttctaaaatataaaagtcgacaaatatatctttattacataaaaataatcgttaa |
46879936 |
T |
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244 |
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318 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
35925026 |
ttatgagatgatgttttctaaaatataaacattgataaatagctttttatttca-taaaataatcgttaatttat |
35925099 |
T |
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attgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgtt |
258 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
46291306 |
attgattattttttacgataatatgtaaaaaaattactatgattcttataaacaatgaaatgatgttttttattatgaaatgatgtt |
46291220 |
T |
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69 |
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168 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| | |||| || |||||| |||| || | | | |
|
|
| T |
46836895 |
attttctatcatctacaattataataattaaattttatttaccaaaaacgtcgacgaaataaaattaattttttctgaatttttagtacttatgatagag |
46836796 |
T |
 |
| Q |
169 |
aatattgatta-ttttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaat--gatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaa |
265 |
Q |
| |
|
||| ||||||| ||||||| | |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
46836795 |
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46836696 |
T |
 |
| Q |
266 |
atataaatat |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
46836695 |
atataaatat |
46836686 |
T |
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209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatc |
308 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||| || |||||| ||| ||| | ||| |
|
|
| T |
24203104 |
tatgattcttaaaaagaatgaaatgatgttttttcttatgaaataatattttctaaaatataaaagtcaacaaatatctctttattacataaaaataatc |
24203203 |
T |
 |
| Q |
309 |
gttaatttat |
318 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
24203204 |
attaatttat |
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T |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaata-ttgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
18520155 |
tatgattcttataaacaattaaatggtgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatatttgacaaata |
18520231 |
T |
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247 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||| |||| || |||||||||||| | ||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |
|
|
| T |
32670478 |
tttttgttacacataacaaagaatgtttattattttttataagaaaatgttaaaaatttaatttgattcttataaacaatgaaatgatgtttattcttat |
32670379 |
T |
 |
| Q |
248 |
gaaat |
252 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
32670378 |
aaaat |
32670374 |
T |
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tattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgta-aattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaa |
250 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||| |||||||||||||| | |||||||| || |||| |||||| || |||| |||||||||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
21699520 |
tattactcataatagagaattttgattattttttacaataaaatgtagaaaaatttagtatgatttttctaaaaaatgaaatgatgttttttcttataaa |
21699421 |
T |
 |
| Q |
251 |
atgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
21699420 |
atgatattttctaaaatata |
21699401 |
T |
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aaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
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|||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29606418 |
aaatgatgttttttattatgaaatgttgttttataaaatataaatattgacaaata |
29606363 |
T |
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ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||||| | || ||| | |||||||| | |||| || || ||||||||||||| | |||| |||| ||||||||| | | |
|
|
| T |
38129673 |
ataactaaatcttatttaccaaaaacatcaacgcaataaaatttgatttttctgaattcttattactcataatagagaattttgagtattttttacaata |
38129574 |
T |
 |
| Q |
192 |
aaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggttttt-cttatgaaatgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
|||||| || ||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38129573 |
aaatgtgaaaaaattagtatgatttttataaaaaatgaaatgatgtttttttcatataaaatgatgttttctaaaatata |
38129494 |
T |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgaca |
280 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45232217 |
tatgattcttataaacagaaaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgaca |
45232146 |
T |
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atgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgttaatttata |
319 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
37504692 |
atgaaatgatgttctataaaatataaatattgacaaatagttatttatttcataaaaaatgatcgttaatttata |
37504618 |
T |
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attattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgt |
257 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || ||||||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
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| T |
1806684 |
attattttttatgataatatgtaaaaaaattactataattcttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgaaataatgt |
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T |
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tttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatg-taaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttctta |
246 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||| || |||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
8295729 |
tttttattactcataatagtgaatatagattatttttt-tgataaaatgctaaaaaaattggtatgattcttataaaaaatgaaatgatgttttttttta |
8295827 |
T |
 |
| Q |
247 |
tgaaatgatgttttctaa |
264 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||| |
|
|
| T |
8295828 |
tgaaataatattttctaa |
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T |
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tgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggttttt--cttatgaaatgatgttttctaaaatataa |
271 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||| || || ||||| || | |||||||||||||||||| ||||| || |||| ||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
12395366 |
tgattattttttatgagaaaatgttaaaaattgaatataattcatataaacaatgaaatgatattttttttctcatgagatggtgttttttaaaatataa |
12395465 |
T |
 |
| Q |
272 |
atattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| |
|
|
| T |
12395466 |
ataatgacaaata |
12395478 |
T |
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190 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| | || ||||| ||||||| || |||| || |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
23585862 |
ataattaaatcttatttaccaaaaacatcaacgaaataaaattaaattttttcgaaatttttattactcttaatagcgaatattgattattttttacgat |
23585763 |
T |
 |
| Q |
191 |
aaaatgtaaa |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
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23585762 |
aaaatgtaaa |
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T |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatat |
269 |
Q |
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|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||| |
|
|
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39558843 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatat |
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T |
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tttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgt-aaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggttttt--ct |
244 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |
|
|
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39926028 |
tttttaatactcatattattgaatattgattatttttttggataaaatgttaaaaaaattagtatgattcttataaatgatgaaatgatgttttttttct |
39925929 |
T |
 |
| Q |
245 |
tatgaaatgatgttttctaaaatataaa |
272 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
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39925928 |
tatgaaatgatattttttaaaatataaa |
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281 |
Q |
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|||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |
|
|
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tatgattcttataaacaattgaatgatattttttcttatgaaatattgttctataaaatataaatattgacaa |
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T |
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aaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
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Q |
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T |
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314 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || |||| || || ||| ||||||||||| |
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cttataaacaatgaa-tgatgtgtttttcttcagaaatcatattttctaaaatataaatgccgacaaataactatttacttaataaaattgatcgttaat |
17020371 |
T |
 |
| Q |
315 |
ttat |
318 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
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ttat |
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T |
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Q |
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|
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T |
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312 |
Q |
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|
|
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T |
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247 |
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| |
|
|||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| |||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||| |
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|
| T |
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tttttactactcatagtagtgaatattgattattttttaagataaaatacaaaaaatttagtatgattct-ataaacaatgaaataatgttttttcttat |
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T |
 |
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gaa |
250 |
Q |
| |
|
||| |
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|
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gaa |
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaata |
274 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
30878553 |
tatgattcttataaacaatgaa-tgatgtgtttttcttatgaaatcatattttttaaaatataaata |
30878618 |
T |
 |
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Target: chr7; HSP #156
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| Q |
205 |
ttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaa-tgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaag |
303 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||| ||| |
|
|
| T |
30317421 |
ttaatatgatttttatgaacaataaaatgatg-tttttcttatgaaaataacattttctaaaatataaatatcaacaaatagctctttattccataaaaa |
30317519 |
T |
 |
| Q |
304 |
tgatcgttaattta |
317 |
Q |
| |
|
| || ||||||||| |
|
|
| T |
30317520 |
taattgttaattta |
30317533 |
T |
 |
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55 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttat |
154 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| | |||||||| || | |||||||| ||||||||||||||| || || || |||||| ||| |||| || ||||||| |
|
|
| T |
35923790 |
gaagaaaagtaattattttctgtaattgacaattatcaaaattaaatattatttaccaaaagcgtcaacaaaataaaatataatttttctgaatttttat |
35923889 |
T |
 |
| Q |
155 |
ta |
156 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
35923890 |
ta |
35923891 |
T |
 |
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Target: chr7; HSP #158
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| Q |
55 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttat |
154 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| | | |||||||| || | |||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||| ||| |||| || ||||||| |
|
|
| T |
38883051 |
gaagaaaagtaattattttttgtaattgacaattatcaaaattaaatattatttaccaaaagcgtcgacaaaataaaatataatttttctgaatttttat |
38882952 |
T |
 |
| Q |
155 |
ta |
156 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
38882951 |
ta |
38882950 |
T |
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Target: chr7; HSP #159
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207 |
aatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtga |
306 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||| || |||||||||||||||| || ||||||| || || ||||||| ||| | | |
|
|
| T |
523769 |
aatatgactcttataaacaatgaaatagtcatttttcttataaaataatattttctaaaatataaaagttaacaaataactcttaatttcatgaaaataa |
523868 |
T |
 |
| Q |
307 |
tcgttaatt |
315 |
Q |
| |
|
| ||||||| |
|
|
| T |
523869 |
ttgttaatt |
523877 |
T |
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Target: chr7; HSP #160
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148 |
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247 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||| | |||| || ||||||| |||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
1120784 |
tttttattactcatactagagaatattgattattgttta-gataaaatataaaaaatttagtttgattct-ataaacagtgaaataatgttttttcttat |
1120881 |
T |
 |
| Q |
248 |
gaaatgatgttttctaaaatataaa |
272 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||| |||||| |
|
|
| T |
1120882 |
gaaatgatattttttaaagtataaa |
1120906 |
T |
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Target: chr7; HSP #161
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| Q |
304 |
tgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
360 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
27426761 |
tgattgttaatttataaattttgtgaaataagagaatcggtacactcaaatttgtga |
27426817 |
T |
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Target: chr7; HSP #162
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| Q |
150 |
tttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatcctt-ataaacaatgaaatgatggtttttcttatg |
248 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| || || ||||||| | |||||||||| | |||| |||| | ||| ||||||||||||| ||| |||||| |||| |
|
|
| T |
27448247 |
tttattactcataaaaatgaatactg-tttttttttactataaaatgtaaaatatttagtatggttcttaataaacaatgaaacgattttttttcctatg |
27448345 |
T |
 |
| Q |
249 |
aaatgatgttttctaaaatataaa |
272 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27448346 |
aaa--gtgttttctaaaatataaa |
27448367 |
T |
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgat |
307 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| || |||| | |||||||||| |||||||| || |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
29682276 |
tatgattcttataaacaatg-aattatgtgtttttcttcagaaatcatatttttttaaatataaatgccgacaaataactatttatttcataaaattgat |
29682374 |
T |
 |
| Q |
308 |
cgttaatttatatattt |
324 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
29682375 |
cgttagtttatagattt |
29682391 |
T |
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Target: chr7; HSP #164
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| Q |
216 |
cttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaat |
314 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||| | ||||||| || ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
47258842 |
cttataaacaatgaa-tgacgtgtttttcttatgaaatgatattttttaaaatataaatgccaataaataaatatttattttataaaattgatcgttaat |
47258744 |
T |
 |
| Q |
315 |
ttata |
319 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
47258743 |
ttata |
47258739 |
T |
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Target: chr7; HSP #165
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| Q |
148 |
tttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttt-taatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttctta |
246 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| || |||||||||| || ||| || |||||||||||| |||||||| || |||||| |
|
|
| T |
39226794 |
tttttattgctcataatagtgaatattgattattgttttcgataaaatgtaaaaaaaaatagtattattcttataaacaattaaatgatgtttgttctta |
39226893 |
T |
 |
| Q |
247 |
tgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttat |
318 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| | ||||||||| | |||||||| | |||||| | | ||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
39226894 |
tgaaataatatttttttaaatataaaagtcgacaaataattctttattacgtaaaaatgatagttaatttat |
39226965 |
T |
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Target: chr7; HSP #166
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaa |
272 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
45704670 |
tatgattcttataaatgatgaaatggtgtttttttttatgaaatgatattttttaaaatataaa |
45704607 |
T |
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Target: chr7; HSP #167
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gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcga |
122 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
46911860 |
gaagaaaaaaaattattttttatcattgacagttataataattaaatcttatttaacaaaagtttcga |
46911793 |
T |
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Target: chr7; HSP #168
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| Q |
55 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaatttt |
142 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||||||| |||| || ||||||| || ||| ||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
48460564 |
gaagaaaaagaattgttttctatcattaacaattacaataattagatcttagttaccgaaagtgtcgacgaaataaaatttacatttt |
48460477 |
T |
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Target: chr7; HSP #169
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ttataaacaatgaaatgatggttttt-cttatgaaatgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
1691154 |
ttataaaaaatgaaatgatgtttttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
1691100 |
T |
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Target: chr7; HSP #170
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tatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttattt |
295 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |
|
|
| T |
21936784 |
tatgaaatgatgttctataaaatataaatattaacaaatagctatttattt |
21936834 |
T |
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ttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatg |
248 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||| |
|
|
| T |
35566886 |
ttttactactcataattgtgaatattgattattttct-tgataaaatgtaaaaattt-agtatgatttctataaacaatgaaatattttcttttcatatg |
35566983 |
T |
 |
| Q |
249 |
aaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgtt |
311 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||||||||||| | | |||||| || |||||| ||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
35566984 |
aaatgatattttgtaaaatataaaagtcggcaaataactctttattacataaaaatgatcgtt |
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T |
 |
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Target: chr7; HSP #172
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tttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagag |
337 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||| |||| | || |||||||||| | ||| | || |||||| |
|
|
| T |
38882958 |
tttttattatgagatgatgttttctaaaatataaacattgataaatggattttaatttca-taaaataattgttaatttat-caatttataaagcaagag |
38882861 |
T |
 |
| Q |
338 |
taccggtacac |
348 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
38882860 |
taccggtacac |
38882850 |
T |
 |
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Target: chr7; HSP #173
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taaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
40942123 |
taaaaaatgaaatgatgttttttcttataaaatgatattttttaaaatata |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatc |
308 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||| || |||||||||||||||| | |||||||| || ||| || ||| ||| ||||| |
|
|
| T |
29273219 |
tatgattctcataaacaatgaaatattgttttttctttgaaaataatattttctaaaatataaaagtcgacaaatagctctttgttacataaaaatgatc |
29273318 |
T |
 |
| Q |
309 |
gttaatttat |
318 |
Q |
| |
|
||||| |||| |
|
|
| T |
29273319 |
gttaaattat |
29273328 |
T |
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aatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgtt |
258 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| || || ||||||| ||| || ||| |||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
31346842 |
aatattgattatattttacgataatatgtaaaaaaattactaagattcttataaataatgaactgatgttttttcatatgaaatgatgtt |
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T |
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tttttattactcataacaatgaatattgattatttttt |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31603445 |
tttttattactcataatagtgaatattgattatttttt |
31603482 |
T |
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tattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaa-tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaa |
250 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||| |||||||||||||| | |||||||| | |||| |||||| || |||| ||| |||||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
41913323 |
tattactcataatagagaattttgattattttttacaataaaatgtagaaaaattaagtatgatttttctaaaaaataaaatgatgttttttcttataaa |
41913224 |
T |
 |
| Q |
251 |
atgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgttaatttata |
319 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||||||| || | ||||| |||| ||| |||||| ||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
41913223 |
ataatattttctaaaatatatatgtcaacaaacacctatttctttcataaaaaatgatagttaatttata |
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Q |
| |
|
|||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
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atgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
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 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:
Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 166795 - 166438
Alignment:
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tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
100 |
Q |
| |
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| T |
166795 |
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T |
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| Q |
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Q |
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| T |
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166598 |
T |
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| Q |
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300 |
Q |
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| T |
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166498 |
T |
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| Q |
301 |
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360 |
Q |
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| T |
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166438 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 210)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 32720014 - 32720374
Alignment:
| Q |
1 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
100 |
Q |
| |
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| T |
32720014 |
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32720113 |
T |
 |
| Q |
101 |
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200 |
Q |
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| T |
32720114 |
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32720213 |
T |
 |
| Q |
201 |
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299 |
Q |
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|
| T |
32720214 |
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32720313 |
T |
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| Q |
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360 |
Q |
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|
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| T |
32720314 |
aaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccgatacactcaaaattgtga |
32720374 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 52782537 - 52782178
Alignment:
| Q |
1 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
100 |
Q |
| |
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| T |
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52782438 |
T |
 |
| Q |
101 |
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200 |
Q |
| |
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| T |
52782437 |
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52782338 |
T |
 |
| Q |
201 |
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300 |
Q |
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| T |
52782337 |
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52782238 |
T |
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| Q |
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360 |
Q |
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| T |
52782237 |
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52782178 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 50465500 - 50465860
Alignment:
| Q |
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tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcatt-gacaactaagataattaa |
99 |
Q |
| |
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|
| T |
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50465599 |
T |
 |
| Q |
100 |
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199 |
Q |
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| T |
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50465699 |
T |
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| Q |
200 |
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299 |
Q |
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| T |
50465700 |
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50465799 |
T |
 |
| Q |
300 |
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360 |
Q |
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| T |
50465800 |
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50465860 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 5 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 50560735 - 50560380
Alignment:
| Q |
5 |
tgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaatttt |
104 |
Q |
| |
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|
|
| T |
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50560636 |
T |
 |
| Q |
105 |
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204 |
Q |
| |
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|
| T |
50560635 |
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50560536 |
T |
 |
| Q |
205 |
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304 |
Q |
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| T |
50560535 |
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50560436 |
T |
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| Q |
305 |
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360 |
Q |
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| T |
50560435 |
gatccttaatttatatattttgtgaaacaagagtcccgatacacttaaaattgtga |
50560380 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Original strand, 45927249 - 45927604
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
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|
|
| T |
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45927348 |
T |
 |
| Q |
101 |
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200 |
Q |
| |
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|
|
| T |
45927349 |
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45927448 |
T |
 |
| Q |
201 |
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300 |
Q |
| |
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|
|
| T |
45927449 |
ttttttaatatgatccttataaagaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatattttttaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
45927548 |
T |
 |
| Q |
301 |
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356 |
Q |
| |
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|
| T |
45927549 |
aagtgatcgttaatttataaattttataaaacaagagtaccgatacactcaaaatt |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 5 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 48925785 - 48925430
Alignment:
| Q |
5 |
tgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaatttt |
104 |
Q |
| |
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|
|
| T |
48925785 |
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48925686 |
T |
 |
| Q |
105 |
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204 |
Q |
| |
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| T |
48925685 |
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48925586 |
T |
 |
| Q |
205 |
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304 |
Q |
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| T |
48925585 |
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48925486 |
T |
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360 |
Q |
| |
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| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
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|
| T |
48925485 |
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48925430 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Original strand, 54008934 - 54009290
Alignment:
| Q |
1 |
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
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tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaatcagttgtttttttgaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
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T |
 |
| Q |
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ttttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
200 |
Q |
| |
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|
|
| T |
54009034 |
ttttatttaccaaaagcttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaat |
54009133 |
T |
 |
| Q |
201 |
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299 |
Q |
| |
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|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
300 |
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356 |
Q |
| |
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|
|
| T |
54009234 |
aaagtgatcgttaatttataaaatttgtgcaacaagagtaccggtacactcaaaatt |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 55365753 - 55365393
Alignment:
| Q |
1 |
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99 |
Q |
| |
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| T |
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tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttattttttttgaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaa |
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T |
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| Q |
100 |
attttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaa |
199 |
Q |
| |
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| T |
55365653 |
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55365554 |
T |
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| Q |
200 |
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299 |
Q |
| |
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| T |
55365553 |
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| Q |
300 |
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360 |
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55365453 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 33830559 - 33830918
Alignment:
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Q |
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ttttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
200 |
Q |
| |
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ttttatataccaaaagcttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcatagcaatgaatattgattattttttatgataaaatgtaaa |
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T |
 |
| Q |
201 |
ttttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
300 |
Q |
| |
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| T |
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ttttgtaatatgattcttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
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T |
 |
| Q |
301 |
aagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
360 |
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| |
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33830859 |
aagtgatcattaatttatatattttatgaaacaagagtaccagtacactcaaaattgtga |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 53186033 - 53186392
Alignment:
| Q |
1 |
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Q |
| |
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|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
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tgggtgtatcggtacaccaaatcgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattattttttatcattgacaactaagataattaaa |
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T |
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ttttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
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| Q |
201 |
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T |
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Q |
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53186392 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Original strand, 51235558 - 51235909
Alignment:
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108 |
Q |
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| T |
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T |
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208 |
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51235757 |
T |
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| Q |
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308 |
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T |
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360 |
Q |
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| T |
51235858 |
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51235909 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 5 - 360
Target Start/End: Original strand, 53376624 - 53376978
Alignment:
| Q |
5 |
tgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaatttt |
104 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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| Q |
105 |
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204 |
Q |
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53376823 |
T |
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304 |
Q |
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53376923 |
T |
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360 |
Q |
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| T |
53376924 |
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53376978 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 15 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 7157402 - 7157061
Alignment:
| Q |
15 |
caccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaa |
114 |
Q |
| |
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| T |
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7157303 |
T |
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| Q |
115 |
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214 |
Q |
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| T |
7157302 |
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7157203 |
T |
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215 |
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314 |
Q |
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| T |
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7157103 |
T |
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356 |
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| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 44962631 - 44962992
Alignment:
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100 |
Q |
| |
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| T |
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44962730 |
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| Q |
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| T |
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44962830 |
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298 |
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| T |
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44962930 |
T |
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| Q |
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360 |
Q |
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| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 5 - 356
Target Start/End: Original strand, 37567251 - 37567602
Alignment:
| Q |
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tgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaatttt |
104 |
Q |
| |
|
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| T |
37567251 |
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T |
 |
| Q |
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204 |
Q |
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| T |
37567351 |
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37567450 |
T |
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| Q |
205 |
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304 |
Q |
| |
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| T |
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37567550 |
T |
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| Q |
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356 |
Q |
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| T |
37567551 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 5 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 48389133 - 48388778
Alignment:
| Q |
5 |
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103 |
Q |
| |
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|
| T |
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48389034 |
T |
 |
| Q |
104 |
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203 |
Q |
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| T |
48389033 |
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48388935 |
T |
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| Q |
204 |
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303 |
Q |
| |
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| T |
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48388835 |
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| Q |
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360 |
Q |
| |
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|
| T |
48388834 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 5 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 49951299 - 49950943
Alignment:
| Q |
5 |
tgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaatttt |
104 |
Q |
| |
|
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| T |
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49951200 |
T |
 |
| Q |
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203 |
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| |
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|
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49951100 |
T |
 |
| Q |
204 |
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303 |
Q |
| |
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| T |
49951099 |
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49951000 |
T |
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| Q |
304 |
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360 |
Q |
| |
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| T |
49950999 |
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49950943 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 2 - 349
Target Start/End: Original strand, 2667514 - 2667861
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2 |
gggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaat |
101 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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| Q |
102 |
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201 |
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| T |
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T |
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202 |
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301 |
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| |
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| T |
2667714 |
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2667813 |
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302 |
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349 |
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| T |
2667814 |
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2667861 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 36019784 - 36019435
Alignment:
| Q |
11 |
ggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttac |
110 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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| Q |
111 |
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210 |
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36019684 |
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T |
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211 |
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310 |
Q |
| |
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| T |
36019584 |
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36019485 |
T |
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360 |
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| T |
36019484 |
taatttatatattttatgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 5 - 356
Target Start/End: Original strand, 1326634 - 1326986
Alignment:
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5 |
tgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaatttt |
104 |
Q |
| |
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|
| T |
1326634 |
tgtatcggtacaccaaattgtaaaattaataataaatcagttgtttttttgaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaatttt |
1326733 |
T |
 |
| Q |
105 |
atttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaa-attt |
203 |
Q |
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|
| T |
1326734 |
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T |
 |
| Q |
204 |
tttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaag |
303 |
Q |
| |
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| T |
1326834 |
tttaatataatccttataaataatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttttaaaatataaatattgacaaatacatttttatttcattaaag |
1326933 |
T |
 |
| Q |
304 |
tgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaatt |
356 |
Q |
| |
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| T |
1326934 |
tgatcgttaatttataaattttgtgcaacaaaagtaccggtacactcaaaatt |
1326986 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 35320740 - 35320379
Alignment:
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1 |
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98 |
Q |
| |
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35320740 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaatattagtaataaatgaattgtttttttgaaaaaaaaataattattttctatcatttgacaactacgataatta |
35320641 |
T |
 |
| Q |
99 |
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198 |
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T |
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35320441 |
T |
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35320440 |
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35320379 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Original strand, 14460210 - 14460568
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
101 |
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Q |
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T |
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297 |
Q |
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14460568 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 3 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 9322809 - 9322448
Alignment:
| Q |
3 |
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102 |
Q |
| |
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T |
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| Q |
103 |
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199 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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299 |
Q |
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9322510 |
T |
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360 |
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9322448 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 55 - 319
Target Start/End: Original strand, 7347173 - 7347437
Alignment:
| Q |
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154 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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254 |
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T |
 |
| Q |
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319 |
Q |
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|
| T |
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7347437 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 5 - 356
Target Start/End: Original strand, 346723 - 347074
Alignment:
| Q |
5 |
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104 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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| Q |
105 |
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204 |
Q |
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T |
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304 |
Q |
| |
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347022 |
T |
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| Q |
305 |
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356 |
Q |
| |
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| T |
347023 |
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347074 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 44500493 - 44500154
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
101 |
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200 |
Q |
| |
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|
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| T |
44500393 |
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44500294 |
T |
 |
| Q |
201 |
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300 |
Q |
| |
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| T |
44500293 |
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44500214 |
T |
 |
| Q |
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360 |
Q |
| |
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||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44500213 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 118 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 35352451 - 35352209
Alignment:
| Q |
118 |
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Q |
| |
|
||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |
|
|
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ttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttgtaatatgatact |
35352352 |
T |
 |
| Q |
218 |
tataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaattta |
317 |
Q |
| |
|
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|
| T |
35352351 |
tataaacaatgaaatgatagtttttcttatgaaatgacgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatctttaattta |
35352252 |
T |
 |
| Q |
318 |
tatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
360 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35352251 |
tatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
35352209 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 56 - 349
Target Start/End: Original strand, 881808 - 882101
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| Q |
56 |
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155 |
Q |
| |
|
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| T |
881808 |
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881907 |
T |
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| Q |
156 |
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255 |
Q |
| |
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|
| T |
881908 |
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T |
 |
| Q |
256 |
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349 |
Q |
| |
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|
|
| T |
882008 |
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882101 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 26409997 - 26409660
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
26409997 |
tgggtgtatcggtacaccaattcattaaattaataataaattagttgtttttttgaagaaaaataattattttctatcattga-aactataataattaaa |
26409899 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
200 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
26409898 |
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26409809 |
T |
 |
| Q |
201 |
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299 |
Q |
| |
|
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| T |
26409808 |
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26409710 |
T |
 |
| Q |
300 |
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349 |
Q |
| |
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||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26409709 |
aaaatgatcgttaatttataaattttgtgaaacaagagtaccggtacact |
26409660 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Original strand, 48990351 - 48990682
Alignment:
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11 |
ggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttac |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
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| T |
48990351 |
ggtacaccaagttgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatatac |
48990450 |
T |
 |
| Q |
111 |
caaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaata |
210 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
48990451 |
caaaagtttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattattcataacaatgaatattgattattttttatg---------aaattttgtaata |
48990541 |
T |
 |
| Q |
211 |
tgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgt |
310 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |
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|
| T |
48990542 |
tgat---------caatgaaatgattgtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaaatgatttt |
48990632 |
T |
 |
| Q |
311 |
taatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
360 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
48990633 |
tgatttatatattttataaaacaagagtaccggtgcactcaaaattgtga |
48990682 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 348
Target Start/End: Original strand, 42622649 - 42622984
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12 |
gtacaccaagtcgtaaaattaataa--taaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttattta |
109 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||| ||||||| |
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|
| T |
42622649 |
gtacaccaaatcgttaaattaataaattaaatgagttgtttttctgaagaaaattaattattttctagcattgacaattataatatttaaatcttattta |
42622748 |
T |
 |
| Q |
110 |
ccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaat |
209 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |
|
|
| T |
42622749 |
tcaaaagcttcgacgaaataaaatttactttttttgaatttttattactcataataaagaatattgattattttttatgtgaaaatgttaaaaatttaat |
42622848 |
T |
 |
| Q |
210 |
atgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcg |
309 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||| |
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|
| T |
42622849 |
atgattcttgtaaacaatgaaattatgttttttcttatgcaatgatgttttctaaaatacaaatactgacaaatagcttcttatttcataaaa--gatcg |
42622946 |
T |
 |
| Q |
310 |
ttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||| |
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| T |
42622947 |
ttaatttata-aatttatgaaaaaagagtaccggtacac |
42622984 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 55 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 52776771 - 52776481
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55 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttat |
154 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| || ||||| | |
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|
| T |
52776771 |
gaagaaaaagaactattttctatcattgacaattacaataattaaatcgtatttaccaaaagcgtcgacgaaataaaatttactttttt-gaatttttgt |
52776673 |
T |
 |
| Q |
155 |
tactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatga |
254 |
Q |
| |
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| T |
52776672 |
tacatataacaaagaatattgattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatataattcttataaacaacgaaatgatgttttttcttataaaatga |
52776573 |
T |
 |
| Q |
255 |
tgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
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T |
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Target: chr3; HSP #33
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Q |
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Target: chr3; HSP #34
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Target: chr3; HSP #35
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Target: chr3; HSP #36
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Q |
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T |
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Target: chr3; HSP #37
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Query Start/End: Original strand, 59 - 284
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Q |
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| T |
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Target: chr3; HSP #38
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158 |
Q |
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Target: chr3; HSP #39
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Target: chr3; HSP #40
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256 |
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| T |
36790007 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #42
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Q |
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T |
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255 |
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| T |
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20199632 |
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324 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #43
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Q |
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253 |
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324 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #44
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #45
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #46
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Query Start/End: Original strand, 70 - 315
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T |
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Target: chr3; HSP #48
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153 |
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Target: chr3; HSP #49
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158 |
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Target: chr3; HSP #50
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158 |
Q |
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Q |
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Target: chr3; HSP #52
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Query Start/End: Original strand, 59 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 51996737 - 51996474
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257 |
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324 |
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T |
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Target: chr3; HSP #54
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Q |
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Target: chr3; HSP #55
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #56
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Query Start/End: Original strand, 55 - 325
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gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttat |
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Q |
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325 |
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| T |
27102717 |
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27102648 |
T |
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Back To:
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Target: chr3; HSP #57
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Q |
| |
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5335493 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #58
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Q |
| |
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254 |
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| T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #59
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| T |
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| T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #60
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254 |
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298 |
Q |
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8353142 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 59 - 234
Target Start/End: Original strand, 15670067 - 15670242
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59 |
aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattact |
158 |
Q |
| |
|
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| T |
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15670166 |
T |
 |
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159 |
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234 |
Q |
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15670167 |
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15670242 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 73 - 265
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73 |
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172 |
Q |
| |
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| T |
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45633376 |
T |
 |
| Q |
173 |
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265 |
Q |
| |
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| T |
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45633470 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 56 - 294
Target Start/End: Original strand, 41982069 - 41982306
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56 |
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155 |
Q |
| |
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| T |
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41982167 |
T |
 |
| Q |
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255 |
Q |
| |
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| T |
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41982267 |
T |
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294 |
Q |
| |
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| T |
41982268 |
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41982306 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 216 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 1129292 - 1129160
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cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgttaat |
314 |
Q |
| |
|
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| T |
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T |
 |
| Q |
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348 |
Q |
| |
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||||| | || |||| || |||||||||||||| |
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|
| T |
1129192 |
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1129160 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 56 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 35375845 - 35375543
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| Q |
56 |
aagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttatt |
155 |
Q |
| |
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| T |
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35375746 |
T |
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| Q |
156 |
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244 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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| Q |
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344 |
Q |
| |
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|
| T |
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35375547 |
T |
 |
| Q |
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Q |
| |
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|||| |
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|
| T |
35375546 |
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35375543 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 148 - 325
Target Start/End: Original strand, 49079653 - 49079829
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| Q |
148 |
tttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttat |
247 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||| |
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|
| T |
49079653 |
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49079752 |
T |
 |
| Q |
248 |
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325 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||| |||| | |||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
49079753 |
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49079829 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 73 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 52058820 - 52058627
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| Q |
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tctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaata |
172 |
Q |
| |
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| T |
52058820 |
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52058721 |
T |
 |
| Q |
173 |
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265 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
52058720 |
ttgattattttttatga-gtaatgttaaaaatttaatatgattcttataaacaatgaaattatgtttttcttcttatgaaatgatgttttctaaa |
52058627 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 66 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 40784838 - 40784584
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| Q |
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attattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataaca |
165 |
Q |
| |
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| T |
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40784739 |
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| Q |
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265 |
Q |
| |
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| T |
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40784639 |
T |
 |
| Q |
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319 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
40784638 |
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40784584 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 308
Target Start/End: Original strand, 32621435 - 32621675
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| Q |
68 |
tattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaat |
167 |
Q |
| |
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|||||||||||||| | || || |||| || ||||||||| |||||| ||| ||||| |||||| ||| ||| | |||||||||||||||| | | |
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|
| T |
32621435 |
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32621534 |
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 |
| Q |
168 |
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267 |
Q |
| |
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|
| T |
32621535 |
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32621634 |
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308 |
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| |
|
||||| | |||||||| || ||| |||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
32621635 |
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32621675 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 92 - 294
Target Start/End: Original strand, 7671919 - 7672122
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ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||| ||||||| | |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| | |||| ||| |||||||||| | | |
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|
| T |
7671919 |
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|
| T |
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7672118 |
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
7672119 |
tatt |
7672122 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 216 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 39253053 - 39252975
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| Q |
216 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatt |
294 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
39253053 |
cttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgaaatgatgttttataaaatataaatattgacaaatagctatttatt |
39252975 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 94 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 41982672 - 41982500
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| Q |
94 |
aattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaa |
193 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| || |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
41982672 |
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41982573 |
T |
 |
| Q |
194 |
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265 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41982572 |
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41982500 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 216 - 353
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cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgttaat |
314 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
45538807 |
cttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgaaataatgttctataaaatataaatattga-aaatagctatttattacataaaaaatgatcgttaat |
45538709 |
T |
 |
| Q |
315 |
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353 |
Q |
| |
|
||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45538708 |
ttata-aaattatgaaacaggagtaccggtacactcaaa |
45538671 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 59 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 23043672 - 23043579
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152 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||| || ||||| |
|
|
| T |
23043672 |
aaaaataattattttctatcattgacaactataataattaaattttatttaccaaaagtttcgatgaaataaaatttaatttttatgatttttt |
23043579 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 73 - 262
Target Start/End: Original strand, 5639759 - 5639949
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tctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaata |
172 |
Q |
| |
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| T |
5639759 |
tctatcatttacaattataaaaattaaatcttatttaccaaaaatatcgacgaaataaaatttaatttttttgaatttttattattcataatgaagatta |
5639858 |
T |
 |
| Q |
173 |
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262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
5639859 |
ttgattattttttatga-gtaatgttaaaaatttaatatgattcttataaacaatgaaattatgtttttcttcttatgaaatgatgttttct |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 172 - 284
Target Start/End: Original strand, 32636826 - 32636938
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attgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataa |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |
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|
| T |
32636826 |
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32636925 |
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 |
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272 |
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284 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |
|
|
| T |
32636926 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #77
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| | |||| | |||||||| | |
|
|
| T |
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cttataaacaatgaaatgatgttttttcttataaaatgatgttttctaaaatataaatattgatgaataactctttatttta-taaaataatcgttaaat |
15298275 |
T |
 |
| Q |
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tatatattttg |
326 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |
|
|
| T |
15298274 |
tataaattttg |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #78
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93 |
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192 |
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T |
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Q |
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| T |
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Q |
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26457017 |
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T |
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Target: chr3; HSP #80
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191 |
Q |
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T |
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Target: chr3; HSP #81
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191 |
Q |
| |
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291 |
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T |
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Target: chr3; HSP #82
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Q |
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348 |
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| T |
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42621879 |
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Target: chr3; HSP #83
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Target Start/End: Original strand, 19914271 - 19914409
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307 |
Q |
| |
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348 |
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T |
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Target: chr3; HSP #84
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Query Start/End: Original strand, 209 - 319
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307 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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Target: chr3; HSP #85
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Query Start/End: Original strand, 55 - 245
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154 |
Q |
| |
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|
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| Q |
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245 |
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| |
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| T |
6728831 |
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T |
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Target: chr3; HSP #86
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Target Start/End: Complemental strand, 53516869 - 53516613
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191 |
Q |
| |
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348 |
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T |
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191 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||| || |||||| || ||||| | |||| |||||||||||| | | | |
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|
| T |
788759 |
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788661 |
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290 |
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788561 |
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348 |
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T |
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Q |
| |
|
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| T |
29806241 |
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29806339 |
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348 |
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| |
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|
| T |
29806340 |
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Q |
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 |
| Q |
247 |
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315 |
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| |
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|
|
| T |
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T |
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314 |
Q |
| |
|
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| T |
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41282594 |
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315 |
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319 |
Q |
| |
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||||| |
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| T |
41282593 |
ttata |
41282589 |
T |
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Target: chr3; HSP #91
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |
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|
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Q |
| |
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||||||||||||||| || | ||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||||||| |
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51756201 |
T |
 |
| Q |
272 |
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284 |
Q |
| |
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||||||| ||||| |
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|
| T |
51756200 |
atattgaaaaata |
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Q |
| |
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52024509 |
T |
 |
| Q |
308 |
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348 |
Q |
| |
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| T |
52024508 |
cgttagtttataga-tttatgaaacaagagtacctgtacac |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
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Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
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|
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T |
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Q |
| |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
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Q |
| |
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|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
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307 |
Q |
| |
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|||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||| |||| |
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|
| T |
44522227 |
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44522326 |
T |
 |
| Q |
308 |
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319 |
Q |
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|||||| ||||| |
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| T |
44522327 |
cgttaaattata |
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T |
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T |
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241 |
Q |
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ttgattattttttatga-gtaatgttaaaaatttaatatgattcttataaacaatgaaattatgttttt |
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T |
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274 |
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40478060 |
T |
 |
| Q |
275 |
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348 |
Q |
| |
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T |
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T |
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Q |
| |
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|||||||||||||| || |||||| ||| ||| | |||||||||||||| | || |||| |||||||| |||||||| |
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302 |
Q |
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5529024 |
T |
 |
| Q |
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Q |
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||||| |||||||||| |||| | || |||||||||||||||| |
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Q |
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T |
 |
| Q |
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324 |
Q |
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| T |
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Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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284 |
Q |
| |
|
||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
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T |
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|
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28146570 |
T |
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Q |
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tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgataaatagctatttatt |
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Q |
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T |
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274 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || ||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |
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37128007 |
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T |
 |
| Q |
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319 |
Q |
| |
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|| | ||||| | |||||| ||| ||| |||||||||||||||| |
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|
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37127907 |
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Q |
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|
||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||| | |||||||||| |
|
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T |
 |
| Q |
316 |
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348 |
Q |
| |
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|||| | || |||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
7862789 |
tata-aaattatgaagcaggagtaccggtacac |
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Q |
| |
|
||||||||||| ||||| || |||| || |||| |||||| |||||||||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
23795978 |
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23796076 |
T |
 |
| Q |
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348 |
Q |
| |
|
|| |||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
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atgccgacaaataattatttatttcataaaattgatcgttaatttatagatttag-gaagtaagagtaccggtacac |
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T |
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Q |
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||||||| |||||||| | ||| ||| |||||||||||||| || ||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||| |
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|
| T |
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25834505 |
T |
 |
| Q |
248 |
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Q |
| |
|
||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
25834506 |
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T |
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Q |
| |
|
||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||| | |||||||||| | ||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
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tttttattacttataatagtgaatatttattattttttca-ataaaatgtaaaataattagtatgattcttataaa-aatgaaatgatattttttcttat |
41902224 |
T |
 |
| Q |
248 |
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312 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||||||||| | |||||||| || ||| || ||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
41902225 |
gaaataatattttctaaaatataaaagtcgacaaatagctcttttttacataaaaatgatcgtta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #112
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Q |
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|
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|
|
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T |
 |
| Q |
268 |
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284 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
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ataaatattgataaata |
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|
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gtttttcttatgaaattatattttctaaaatataaatgccgataaataactatttgttttataaaattgatcgttaatttatagatttag-gaaacaaga |
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T |
 |
| Q |
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Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
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gtaccggtacact |
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Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||| ||| | |||||||||| |
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|
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ttataaacaataaaatgatattttttcttatgaaatgatgttgtgtaaaatataaatattgacagataactatttattacataaaaaataatcgttaatt |
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T |
 |
| Q |
316 |
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319 |
Q |
| |
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|||| |
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| T |
10279067 |
tata |
10279064 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #115
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Q |
| |
|
|||||||||| ||||| ||||||| | || ||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||| | | |
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|
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ataattaaatcttattaaccaaaaacgtctacgaaataaaatttaatttttctgagtttttactactcataatagattattttgattattttttacaata |
21289002 |
T |
 |
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aaatgtaaatttt-ttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggttttt-cttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaataccttt |
289 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || | |
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| T |
21289001 |
aaatgtaaaaaaaattagtatgattttcataaacaatgaaatgacgtttttttcttatgaaatgacattttctaaaatataaatatcaacaaatagctct |
21288902 |
T |
 |
| Q |
290 |
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317 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||| | || ||||||||| |
|
|
| T |
21288901 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| |
|
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tata |
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tata |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35501026 |
tatgattcttataaacaattaaattatgttttttcttatgaaatggtgttctataaaatataaatattgacaaata |
35501101 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 209 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 39987521 - 39987446
Alignment:
| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39987521 |
tatgattcttataaataattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaata |
39987446 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 209 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 53289400 - 53289325
Alignment:
| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53289400 |
tatgattcttataaacaattaaataatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaata |
53289325 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 318
Target Start/End: Original strand, 542540 - 542710
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| Q |
148 |
tttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttat |
247 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
542540 |
tttttaatacccataatagtgaatattgattatttttttggataaaatgttaaaaaattagtatgattcttataaatgatgaaatgacgttttttcttat |
542639 |
T |
 |
| Q |
248 |
gaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttat |
318 |
Q |
| |
|
|||| || |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||| ||| ||| |||||| ||| |||| |
|
|
| T |
542640 |
aaaataatattttctaaaatataaaagttgataaatatctctttattacataaaaatgatcgataacttat |
542710 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 218 - 284
Target Start/End: Original strand, 1021221 - 1021287
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| Q |
218 |
tataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1021221 |
tataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaata |
1021287 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 149 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 5532287 - 5532163
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| Q |
149 |
ttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaaca--atgaaatgatggtttttctta |
246 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| | || ||||||| || ||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
5532287 |
ttttattactcataagaaagaatattgagtatttttaa-gagaaaatgttaaaaatttaatatgattcttataaccactatgaaataatgttttttctta |
5532189 |
T |
 |
| Q |
247 |
tgaaatgatgttttctaaaatataaa |
272 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
5532188 |
tgaaataatgttttataaaatataaa |
5532163 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 14653946 - 14653813
Alignment:
| Q |
216 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaata-taaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgttaa |
313 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
14653946 |
cttataaacaatgaaatgatgttttttctaataaaatgatgttctgtaaaatattaaatattgacaaatagctatttattacataaaaaattatcgttaa |
14653847 |
T |
 |
| Q |
314 |
tttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
|
||| || | || |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14653846 |
tttcta-aaattatgaagcaagagtaccggtacac |
14653813 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 59 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 28146536 - 28146458
Alignment:
| Q |
59 |
aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaa |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||| |||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
28146536 |
aaaaataattattttctatcattgacaattataataattaaatcttatttaccacaagcgtcgatgaaataaaatttaa |
28146458 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 319
Target Start/End: Original strand, 45636266 - 45636436
Alignment:
| Q |
152 |
tattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgta-aattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaa |
250 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||| |||||||||||||| || |||||||| || |||| |||||| || |||| |||||||||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
45636266 |
tattactcataatatagaattttgattattttttacgataaaatgtagaaaaatttagtatgatttttctaaaaaatgaaatgatgttttttcttataaa |
45636365 |
T |
 |
| Q |
251 |
atgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacct-ttttatttcat-taaagtgatcgttaatttata |
319 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| || | |||||||||| |||| |||||| ||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
45636366 |
atgatattttctaaaatatatatgtcaacaaatacctattttctttcataaaaaatgatagttaatttata |
45636436 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 246 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 52082175 - 52082074
Alignment:
| Q |
246 |
atgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggta |
345 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| | || ||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
52082175 |
atgaaatgatattttctaaaatataaatatcaacaaataactttttatttcataaaaataatagttcatttataaatttt-tgaagtaagagtaccggta |
52082077 |
T |
 |
| Q |
346 |
cac |
348 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
52082076 |
cac |
52082074 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 324
Target Start/End: Original strand, 54910842 - 54911100
Alignment:
| Q |
68 |
tattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaag-agtttttattactcataacaa |
166 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | || || ||||||| ||||||||| |||||| ||| | ||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||| | |
|
|
| T |
54910842 |
tattttctatcatttataattataataattatattttatttttcaaaagtgtcggcaaagcaaaattcaaattttttttaatttttattactcataatag |
54910941 |
T |
 |
| Q |
167 |
tgaatattgattattttttatgacaaaatgt-aaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaa |
265 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | | ||||||| ||| |||| ||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||| |
|
|
| T |
54910942 |
tgaatattgattattttcttcaataaaatgttaaaaaatttagtataattcttataaaaaatgaaatgatgttttttcttatgggataatattttctaaa |
54911041 |
T |
 |
| Q |
266 |
atataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattt |
324 |
Q |
| |
|
||||||| | || ||||| || ||||| ||| ||| | |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
54911042 |
atataaaagtcgataaatatctctttatcacataaaaattatcgttaatttataaattt |
54911100 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 209 - 278
Target Start/End: Original strand, 35137675 - 35137744
Alignment:
| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattga |
278 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35137675 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattga |
35137744 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 209 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 37520875 - 37520733
Alignment:
| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttctt---atgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagt |
304 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||| | |
|
|
| T |
37520875 |
tatgattcttataaacaatgaactgatgttttttttttttatgaaatgatgttctataaaatataaatattgataaatagttatttatttcataaaaaat |
37520776 |
T |
 |
| Q |
305 |
gatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
37520775 |
gatcgttaatttata-aaattatgaagaaagagtaccggtacac |
37520733 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 216 - 297
Target Start/End: Original strand, 46671584 - 46671665
Alignment:
| Q |
216 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttca |
297 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
46671584 |
cttataaacaatgaaattatgttttttcttatgaaatgatgttctataaaatataaatgttgataaatagttatttatttca |
46671665 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 318
Target Start/End: Original strand, 19608509 - 19608637
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| Q |
191 |
aaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttt-tcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaataccttt |
289 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||| || | |
|
|
| T |
19608509 |
aaaatgtaaaataattaatatgatttttataaacaatgaaatgatatttttttcttatgaaataatattttctaaaatataaaagtcgacaaatagctct |
19608608 |
T |
 |
| Q |
290 |
ttatttcattaaagtgatcgttaatttat |
318 |
Q |
| |
|
|| || ||| ||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
19608609 |
tttttacataaaaatgatcgttaacttat |
19608637 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 92 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 38785370 - 38785142
Alignment:
| Q |
92 |
ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||| ||||||| | || ||| |||||||||| | |||| || || ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| | | |
|
|
| T |
38785370 |
ataactaaatcttattcaccaaaatcgtcaacgcagtaaaatttgatttttctgaattcttattactcataatagagaattttgattattttttacaata |
38785271 |
T |
 |
| Q |
192 |
aaatgtaaatttt-ttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttt |
290 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| || | ||||| |||| || |
|
|
| T |
38785270 |
aaatgtaaaaaaaattagtatgatttttataaaaaatgaaatgatattttttcttataaaatgatattttctaaaatatatatgtcaacaaacacctatt |
38785171 |
T |
 |
| Q |
291 |
tatttcattaaagtgatcgttaatttata |
319 |
Q |
| |
|
| ||||| ||| | || ||||||||||| |
|
|
| T |
38785170 |
ttcttcataaaaattatagttaatttata |
38785142 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 55 - 319
Target Start/End: Original strand, 39678183 - 39678454
Alignment:
| Q |
55 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttat |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| |||||| | || || |||||||||| ||||||| |||||| || ||||| ||||||| | |||||| | ||||| | |
|
|
| T |
39678183 |
gaagaaaaata-ttattttttatcatctataattataataattaaatcttatttatcaaaagtgtcaacgaaataaaattaattttttaaaattttttct |
39678281 |
T |
 |
| Q |
155 |
tactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttctt--------a |
246 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||||||||| |||| || ||||||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||| || | |
|
|
| T |
39678282 |
-actcataattgagaacattgattatttttgatgataatatgtaaaaaaattattataattcttataaacaatgaaatgatgttttttttttatttttta |
39678380 |
T |
 |
| Q |
247 |
tgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgttaatttata |
319 |
Q |
| |
|
| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
39678381 |
taaaatgatgttctataaaatataaatattaacaaatagctatttatttcataaaaaatgatcgttaatttata |
39678454 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 225 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 44379568 - 44379445
Alignment:
| Q |
225 |
aatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgttaatttatatatt |
323 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||| || ||||||||||||| | |
|
|
| T |
44379568 |
aatgaaataatgttttttcttatgaaatgatgttctataaaatataaatattgacaaatagttatttattacataaaaaatggtcgttaatttata-aaa |
44379470 |
T |
 |
| Q |
324 |
ttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
|
|| |||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
44379469 |
ttatgaagcaggagtaccggtacac |
44379445 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 209 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 51350802 - 51350730
Alignment:
| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaa |
281 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51350802 |
tatgattcttataaacagtcaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaa |
51350730 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 209 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 13756476 - 13756401
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
13756476 |
tatgattcttataaataattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattaacaaata |
13756401 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 75 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15298542 - 15298388
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| Q |
75 |
tatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaa--ttttaagagtttttattactcataacaatgaata |
172 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
15298542 |
tatcattgacaattacaataattaaatcgtatttaccaaaaacgtcgacgaaataaaatttactctttttttgaatttttgttacatataacaaagaata |
15298443 |
T |
 |
| Q |
173 |
ttgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaat |
227 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| || |||| ||||||| |
|
|
| T |
15298442 |
ttgattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatataattcttacaaacaat |
15298388 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 209 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 26885143 - 26885068
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26885143 |
tatgattcttataaacagtaaaatgatgttttttcttatgaaatattgttctataaaatataaatattgacaaata |
26885068 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 92 - 317
Target Start/End: Original strand, 27647596 - 27647825
Alignment:
| Q |
92 |
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191 |
Q |
| |
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|
| T |
27647596 |
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27647695 |
T |
 |
| Q |
192 |
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287 |
Q |
| |
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|
| T |
27647696 |
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27647795 |
T |
 |
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288 |
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317 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||| | || ||||||||| |
|
|
| T |
27647796 |
ctttattccataaaaataatagttaattta |
27647825 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #141
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29388865 |
tatgattcttatcaacaattaaatgatgtttttttttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaata |
29388790 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
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Target Start/End: Original strand, 31308995 - 31309176
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92 |
ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||| ||||||| | || ||| | |||||||| | ||||| || || ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| | | |
|
|
| T |
31308995 |
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31309094 |
T |
 |
| Q |
192 |
aaatgtaaatttt---ttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
31309095 |
aaatgtaaaaaaaaaattagtatgatttttataaaaaatgaaatgatgttttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
31309176 |
T |
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Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
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| Q |
217 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgttaatt |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| | || |||||| ||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
36099409 |
ttataaacaatgaaatgatttttttttttatgaaatgatgttctataaaatataactattgacaaagagctatttattacataaaaaatgatcgttaatt |
36099508 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
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Target Start/End: Original strand, 42478931 - 42479060
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| Q |
216 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgttaat |
314 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||| ||| | ||||||||| |
|
|
| T |
42478931 |
cttataaacaatgaaatgatgttttttc---taaaatgatgttatataaaatataaatattaacaaatagttatttattacataaaaaattatcgttaat |
42479027 |
T |
 |
| Q |
315 |
ttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
|
||||| | || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42479028 |
ttata-aaattatgaaacaagagtaccggtacac |
42479060 |
T |
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Target: chr3; HSP #145
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Query Start/End: Original strand, 209 - 284
Target Start/End: Original strand, 50258037 - 50258112
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
50258037 |
tatgattcttataaacaattaaatgatattttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattaacaaata |
50258112 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 65 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 53176892 - 53176773
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| Q |
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164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||| | |||||||||||||| | |
|
|
| T |
53176892 |
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53176793 |
T |
 |
| Q |
165 |
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184 |
Q |
| |
|
|| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
53176792 |
aaagaatatcgattattttt |
53176773 |
T |
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Target: chr3; HSP #147
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Target Start/End: Original strand, 8324482 - 8324688
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| Q |
68 |
tattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaat |
167 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | || || ||||||| ||||||||| |||||| ||| | ||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||| | | |
|
|
| T |
8324482 |
tattttctatcatttataattataataattatattttatttttcaaaagtgtcggcaaagcaaaattcaaatttttttaatttttattactcataatagt |
8324581 |
T |
 |
| Q |
168 |
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265 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| | | |||| |||| | |||| ||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| |
|
|
| T |
8324582 |
gaatattgattagtttttttcaatataatgttaaaatatttagtataattcttataaaaaatgaaatgatgttttttcttatgggatattattttctaaa |
8324681 |
T |
 |
| Q |
266 |
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272 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
8324682 |
atataaa |
8324688 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 42364215 - 42364037
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| Q |
92 |
ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||||| | || ||| | |||||||| | |||| || || ||||||||||||| | || | |||||||||||||| | | |
|
|
| T |
42364215 |
ataactaaatcttatttaccaaaatcgtcaacgcaataaaatttgatttttctgaattcttattactcataatagagatttttgattattttttacaata |
42364116 |
T |
 |
| Q |
192 |
aaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
42364115 |
aaatataaaaaaattagtatgatttttataaaaaatgaaatgatattttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
42364037 |
T |
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Target: chr3; HSP #149
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Target Start/End: Complemental strand, 52788801 - 52788755
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| Q |
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tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttg |
47 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
52788801 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttg |
52788755 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Original strand, 54011171 - 54011217
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| Q |
1 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttg |
47 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
54011171 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttg |
54011217 |
T |
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Target: chr3; HSP #151
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Target Start/End: Complemental strand, 35389502 - 35389350
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| Q |
168 |
gaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggttttt-cttatgaaatgatgttttctaaaa |
266 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| || || || |||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| | ||||| |
|
|
| T |
35389502 |
gaatattgattatattttacgataatatataaaaaaattactatgattcttataaacaatgaactgatgtttttttcttatgaa-tgatgttctataaaa |
35389404 |
T |
 |
| Q |
267 |
tataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgttaatttata |
319 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
35389403 |
tataaatattgataaataattatttatttcataaaaaacgatcgttaatttata |
35389350 |
T |
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Target: chr3; HSP #152
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| Q |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggttttt-cttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtga |
306 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| || ||||| ||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| | || |||||||||| ||| | | |
|
|
| T |
44653407 |
tatgattcttataaacaataaactgatgtttttttcttgtgaaatgatgttctataaaatataaatattgataaa-agctatttatttcataaaaaataa |
44653505 |
T |
 |
| Q |
307 |
tcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
44653506 |
tcgttaatttata-aaattatgaaaaaagagtaccggtacac |
44653546 |
T |
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Target: chr3; HSP #153
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ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaattt |
316 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||| ||| | || |||||||| |
|
|
| T |
3136507 |
ttataaacaataaaatgatattttttcctatgaaatgacattttctaaaatataaatatcaacaaatagctctttattccataaaaataatagttaattt |
3136606 |
T |
 |
| Q |
317 |
a |
317 |
Q |
| |
|
| |
|
|
| T |
3136607 |
a |
3136607 |
T |
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Target: chr3; HSP #154
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| Q |
92 |
ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttt |
184 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | |||||||||| |||| || |||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
4659874 |
ataattaaatcttatttaccaaaatcttcaacgcaataaaatttaatttttctgaatttttattactcataatagagaattttgattattttt |
4659966 |
T |
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Target: chr3; HSP #155
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307 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||| | || |
|
|
| T |
8433664 |
tatgattcttataaacaatgaa-tgatgtgtttttattatgacatgaa-ttttctaaaatataaatgccgacaaataactatttatttcataaaattaat |
8433761 |
T |
 |
| Q |
308 |
cgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8433762 |
tgttaatttata-aatttaagaagcaagagtaccggtacac |
8433801 |
T |
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Target: chr3; HSP #156
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307 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||| || ||||||| || ||| |||| |
|
|
| T |
35749091 |
tatgattcttataaacaatgaa-tgatgcgtttttcttcggaaatcatattttttaaaatataaatgccgacaaataactatttatttgataaaattgat |
35748993 |
T |
 |
| Q |
308 |
cgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
|
| |||||||||| | ||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
35748992 |
cattaatttataga-tttatgaagcaagagtaccgatacac |
35748953 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #157
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| Q |
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284 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36220649 |
cttataaacaatgaaatgatattttttcttacaaattgatgttctataaaatataaatattgacaaata |
36220717 |
T |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgat |
307 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||| || |||||||||| || |||| |
|
|
| T |
45635850 |
tatgattcttataaacaatgaa-tgatgtgtttatcttatgaaatgatattttctgagatataaatgctgacaaataactatttatttcatagaattgat |
45635752 |
T |
 |
| Q |
308 |
cgttaatttatatattt |
324 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |||| |
|
|
| T |
45635751 |
tgttaatgtataaattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #159
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| Q |
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tcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatt |
294 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
55418049 |
tcttatgaaatgatgttttttaaaatataaacattgacaaatagctttttatt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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tataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaattt |
316 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||| |
|
|
| T |
8966177 |
tataaacaatgaa-tgatgtgtttttcttatgaaatgatattttctgagatacaaatgccgacaaataactttttatttcataaaattgattgttaatgc |
8966275 |
T |
 |
| Q |
317 |
atatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
|
||| |||| | ||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
8966276 |
ataaatttag-gaagcaggagtaccggtacac |
8966306 |
T |
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250 |
Q |
| |
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|
| T |
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tattactcataatagagaattttgattattttttacaataaaatgtagaaaaatttagtatgatttttctaaaaaatgaaatgatgttttttcttataaa |
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T |
 |
| Q |
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atgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
29786662 |
atgatattttctaaaatata |
29786643 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr3; HSP #162
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Target Start/End: Original strand, 34825504 - 34825579
Alignment:
| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34825504 |
tatgattcctataaacaattaaataatgttttttattatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaata |
34825579 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #163
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| Q |
92 |
ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||| || ||| || ||||||||| | |||| ||||||| ||||||| | | |
|
|
| T |
45518756 |
ataattaaatcttatttaccaaaaacttcaacgaaataaaatttaatttttctgaatttctaatactcataatagagaattttgatta-tttttataata |
45518854 |
T |
 |
| Q |
192 |
aaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaataccttttt |
291 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||| || ||| |
|
|
| T |
45518855 |
aaatggaaaaaaattagtttgatttttataaacaatgaaatgatg-------ttatgaaatgacattttctaaactataaatatcaataaatatctcttt |
45518947 |
T |
 |
| Q |
292 |
atttcattaaagtgatcgttaattta |
317 |
Q |
| |
|
||||| | ||| | || ||||||||| |
|
|
| T |
45518948 |
atttcttcaaaataatagttaattta |
45518973 |
T |
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Target: chr3; HSP #164
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Target Start/End: Complemental strand, 46507533 - 46507470
Alignment:
| Q |
210 |
atgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaat |
273 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
46507533 |
atgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttacgaaatgttgttctctaaaatataaat |
46507470 |
T |
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Target: chr3; HSP #165
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Target Start/End: Complemental strand, 48825569 - 48825458
Alignment:
| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgat |
307 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| | | || ||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| || |||| | ||| ||| |||| |
|
|
| T |
48825569 |
tatgattcttataaacagtaatataatgttttttcttatgaaatattgttctataaaatataaatattgacaaataactatttactacataaaaaatgat |
48825470 |
T |
 |
| Q |
308 |
cgttaatttata |
319 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
48825469 |
cgttaatttata |
48825458 |
T |
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Target: chr3; HSP #166
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Target Start/End: Complemental strand, 52458117 - 52458054
Alignment:
| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaa |
272 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
52458117 |
tatgattcttataaatgatgaaatgatgttttttcttatgaaatgatattttttaaaatataaa |
52458054 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #167
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Query Start/End: Original strand, 209 - 348
Target Start/End: Original strand, 9252093 - 9252228
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatgg-tttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgat |
307 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||| | |||||||| || |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
9252093 |
tatgattcttataaacaatgaa-tgatgcatttttcttctgaaatcatattttctaaaatat---tgccgacaaataactatttatttcataaaattgat |
9252188 |
T |
 |
| Q |
308 |
cgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | | | |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9252189 |
cgttaatttataga-tatatgaagcaagagtaccggtacac |
9252228 |
T |
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Target: chr3; HSP #168
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Query Start/End: Original strand, 148 - 272
Target Start/End: Original strand, 45726961 - 45727089
Alignment:
| Q |
148 |
tttttattactcataacaatgaatattgattattttttatg-acaaaatgt---aaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttc |
243 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| || | ||||||| ||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
45726961 |
tttttaatactcataatattgaatattgattattttttttggataaaatgttaaaaaaaaattagtatgattcttataaataatgaaatgatgttttttc |
45727060 |
T |
 |
| Q |
244 |
ttatgaaatgatgttttctaaaatataaa |
272 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||| | ||||||||| |
|
|
| T |
45727061 |
ttatgaaataatatttttttaaatataaa |
45727089 |
T |
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Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 284
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Alignment:
| Q |
208 |
atatgatccttataaacaatgaaatgatggttttt-cttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25482423 |
atatgattcttataaacagtaaaatgatgcttttttcttatgaaatgttgtcctataaaatataaatattgacaaata |
25482346 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 115
Target Start/End: Original strand, 44568664 - 44568725
Alignment:
| Q |
55 |
gaagaaaaa-taattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaa |
115 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
44568664 |
gaagaaaaactaattattttctatcattgacaattataataattaaatcttatttaccaaaa |
44568725 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 52179183 - 52178984
Alignment:
| Q |
148 |
tttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatgg-tttttctta |
246 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||| | ||||||| || | ||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
52179183 |
tttttattacttataatagtgaatatttattattttttca-ataaaatgtgaaataattagtatgattcttataaaaaatgaaatgatatatttttttta |
52179085 |
T |
 |
| Q |
247 |
tgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtac |
346 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||||||||||| | || ||||| || ||| || ||| ||| |||||||||| |||| | ||| |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
52179084 |
tgaaataatattttctaaaatataaaagtcgataaatagctcttttttacataaaaatgatcgttaacttat-tgatttatgaaacaaatgtaccggtac |
52178986 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #172
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Query Start/End: Original strand, 92 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 4663435 - 4663240
Alignment:
| Q |
92 |
ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||| || | || | |||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||| | | |
|
|
| T |
4663435 |
ataattaaatcttatttaccaaaaacgtcgacgaaataaaattaaattattctaaatttttagtactcataatagagaattttgattattttttacaata |
4663336 |
T |
 |
| Q |
192 |
aaatgt-aaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatg--gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
4663335 |
aaatgtaaaaaaaaatagtatgatttttataaacaatgaaatgatgttttttttcctataaaatgacattttttaaaatataaatatcaacaaata |
4663240 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr3; HSP #173
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Target Start/End: Complemental strand, 14154759 - 14154679
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| Q |
218 |
tataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat |
298 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| || |||| |||| |||||| || |||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
14154759 |
tataaacaatgaaataatgttttttcttataaaattatattttttaaagtataaaaatcgacaaataactttttacttcat |
14154679 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
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Target Start/End: Original strand, 40474079 - 40474147
Alignment:
| Q |
216 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
40474079 |
cttataaataatgaaattgtgttttttcttatgagatgatgttctataaaatataaattttgacaaata |
40474147 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #175
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Alignment:
| Q |
217 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaattt |
316 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||| ||| | || |||||||| |
|
|
| T |
43714163 |
ttataaacaataaaatgatattttttcttataaaataacattttctaaaatataaatattaatgaatagctctttatttcataaaaataatagttaattt |
43714064 |
T |
 |
| Q |
317 |
a |
317 |
Q |
| |
|
| |
|
|
| T |
43714063 |
a |
43714063 |
T |
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Back To:
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Target: chr3; HSP #176
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Alignment:
| Q |
244 |
ttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattt |
324 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
45602158 |
ttatgaaatgatactttctaaaatataaatgctggcaaataactatttatttcataaaattaatcgttaatttatagattt |
45602078 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgat |
307 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
54262713 |
tatgattcttataaacaatgaa-tgatgtgtttttattataacatgatattttctaaaatctaaatgccaacaaataactatttatttcataaaattgat |
54262615 |
T |
 |
| Q |
308 |
cgttaatttatatattt |
324 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| |
|
|
| T |
54262614 |
tgttaatttatagattt |
54262598 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr3; HSP #178
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ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||| |||||| | || ||| | |||||||| | |||| || || ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| | | |
|
|
| T |
876510 |
ataactaaatcttatttgccaaaaacgtcaacgcaataaaatttgatttttctgaattcttattactcataatagagaattttgattattttttacaata |
876411 |
T |
 |
| Q |
192 |
aaatgtaaatttt-ttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
876410 |
aaatgtaaaaaaaattacgatgatttttataaaaaatgaaatgatgttttatcttataaaatgatattttctaaaatata |
876331 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #179
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| Q |
238 |
tttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaattta |
317 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||| | || ||||||||| |
|
|
| T |
3082318 |
ttttttttatgaaatgacattttctaaaatataaatatcaacaaatagctttttattccataaaaataatagttaattta |
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T |
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Back To:
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Target: chr3; HSP #180
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| Q |
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ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||||| | || ||| | |||||||| | |||| || || ||||| ||||||| | |||| |||| |||||||||| | | |
|
|
| T |
35171481 |
ataactaaatcttatttaccaaaaacgtcaacgcaataaaatttgatttttctgaattcttattgctcataatagagaattttgagtattttttataata |
35171382 |
T |
 |
| Q |
192 |
aaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatg---gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
35171381 |
aaatgtaaaaaaattagtatgatttttataaaaaatgaaatgatgtttttttttcatataaaatgatattttctaaaatata |
35171300 |
T |
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Back To:
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Target: chr3; HSP #181
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205 |
ttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagt |
304 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| || || |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||| ||| ||| | |
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|
| T |
40284145 |
ttaatatgattcttataaagaaagatatgatg-tttttcttacaaaataatgttttctaaaatataaaagtcgacaaatatttctttattacataaaaat |
40284243 |
T |
 |
| Q |
305 |
gatcgttaatttatatattt |
324 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
40284244 |
aatcgttaacttatttattt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #182
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tgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaa |
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Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| || ||||||| || | ||| |||||| |||||||| | ||||||| | |||||||||| |||| || |||||||||| |
|
|
| T |
54831018 |
tgaataatgattatttttttagataaaatgttaaaatattagtatgattcttataaaggacgaaatgacgttttttcttataaaataatattttctaaaa |
54831117 |
T |
 |
| Q |
267 |
tataaatattgacaaatacctttttatt |
294 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||| || |||||| |
|
|
| T |
54831118 |
tataaaagttgataaatatctctttatt |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #183
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tttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttat |
247 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||| | || |||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
13451650 |
tttttaatacccataatagtggatattgattatttttttggataaaatgttaaaaaattagtatgattcttataaaggatgaaatgacgttttttcttat |
13451551 |
T |
 |
| Q |
248 |
gaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttat |
318 |
Q |
| |
|
|||| || |||||||||||| ||| ||| ||||| || |||||| ||| ||| |||||| ||| |||| |
|
|
| T |
13451550 |
aaaataatattttctaaaataaaaaagttggtaaatatctctttattacataaaaatgatcgataacttat |
13451480 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #184
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Query Start/End: Original strand, 68 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 43388454 - 43388256
Alignment:
| Q |
68 |
tattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaat |
167 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| || |||| || ||||||||| |||||| || | ||||| |||||| || |||| |||||||||||||||| | | |
|
|
| T |
43388454 |
tattttctatcatttacaattataataactatattttatttctcaaaagttttggcgaagcaaaattcaacttttttagttttttattactcataatagt |
43388355 |
T |
 |
| Q |
168 |
gaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaa |
266 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | ||||| |||| ||| ||| | |||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| || |||| ||||| |
|
|
| T |
43388354 |
gaatattgattatttttttcgttaaaatataaaaaaattagtatagttcttataaataatgaaatgatgtttattcttataaaataatattttttaaaa |
43388256 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #185
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Query Start/End: Original strand, 220 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 44670417 - 44670367
Alignment:
| Q |
220 |
taaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
44670417 |
taaaaaatgaaatgatgttttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
44670367 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #186
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Query Start/End: Original strand, 209 - 284
Target Start/End: Original strand, 15997060 - 15997132
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| | ||||| || ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15997060 |
tatgattcttataaacagtaaaatggtgttttttcttatgaa---atgttctataaaatataaatattgacaaata |
15997132 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #187
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Query Start/End: Original strand, 129 - 318
Target Start/End: Original strand, 25558507 - 25558696
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| Q |
129 |
aaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatg |
228 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||| ||| ||||| | |||||||||||| |||||| || ||||||| || ||| |||||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
25558507 |
aaaatttaaatttttttaatttttaatacccataatagtgaatattgattttttttttggataaaatgttaaaaaattagtatgattcttataaagcatg |
25558606 |
T |
 |
| Q |
229 |
aaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttat |
318 |
Q |
| |
|
||||| | |||||||||| |||| || |||| ||||||| ||| |||| ||||| || |||||| ||| ||| |||||| ||| |||| |
|
|
| T |
25558607 |
aaatgtcgttttttcttataaaataatattttttaaaataaaaaagttgataaatatctctttattacataaaaatgatcgataacttat |
25558696 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #188
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Query Start/End: Original strand, 92 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 43715036 - 43714943
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| Q |
92 |
ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattatttttt |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| | |||| ||| |||||||||| |||| || ||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
43715036 |
ataattaaatcttatttaccaaaaacgtcgaagaaataaaatttaatttttctgaattttttgtactcataatagagaattttgattatttttt |
43714943 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 217 - 270
Target Start/End: Original strand, 46959796 - 46959849
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| Q |
217 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
46959796 |
ttataaaaaatgaaattatgttttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
46959849 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr3; HSP #190
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Query Start/End: Original strand, 210 - 318
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| Q |
210 |
atgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaata-ttgacaaatacctttttatttcattaaagtgatc |
308 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||| |||| || |||||||||||| ||| | |||| ||||| ||||||||| ||| ||| ||||| |
|
|
| T |
47243922 |
atgattcttataaaggatgaaatgacgttttttcttataaaataatattttctaaaataaaaaaagttgataaatatctttttattacataaaaatgatc |
47244021 |
T |
 |
| Q |
309 |
gttaatttat |
318 |
Q |
| |
|
| ||| |||| |
|
|
| T |
47244022 |
gataacttat |
47244031 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #191
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Query Start/End: Original strand, 211 - 272
Target Start/End: Original strand, 47244320 - 47244381
Alignment:
| Q |
211 |
tgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaa |
272 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
47244320 |
tgattcttataaataattaaatgatattttttcttatgaaataatattttctaaaatataaa |
47244381 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 209 - 318
Target Start/End: Original strand, 53444779 - 53444888
Alignment:
| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatc |
308 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||| | |||||||| || ||| || ||| || ||||| |
|
|
| T |
53444779 |
tatgattcttataaacaatgaaatgatattttttctttgaaaataatattttctaaaatataaaagtcgacaaatagctctttgttacatataaatgatc |
53444878 |
T |
 |
| Q |
309 |
gttaatttat |
318 |
Q |
| |
|
||||| |||| |
|
|
| T |
53444879 |
gttaaattat |
53444888 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #193
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Query Start/End: Original strand, 241 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 42657950 - 42657918
Alignment:
| Q |
241 |
ttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaat |
273 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42657950 |
ttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaat |
42657918 |
T |
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Target: chr3; HSP #194
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Query Start/End: Original strand, 92 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 51040115 - 51040007
Alignment:
| Q |
92 |
ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||||| ||| | || || ||||||| |||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51040115 |
ataactaaatcttatttaccaaaaatgtcggctaaatagaatttaatttttctgaaattttattactcataatagttaatattgattattttttatgatt |
51040016 |
T |
 |
| Q |
192 |
aaatgtaaa |
200 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
51040015 |
aaatgtaaa |
51040007 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #195
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Query Start/End: Original strand, 92 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 52082310 - 52082202
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| Q |
92 |
ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||| | |||||||| |||||||| | |||| || |||||| ||||| ||| | |||| |||||||||||||| | | |
|
|
| T |
52082310 |
ataattaaatcttatttatcaaaaacatcgacgaaataaaatttgatttttctgaatttttagtactcgtaatagagaattttgattattttttacaata |
52082211 |
T |
 |
| Q |
192 |
aaatgtaaa |
200 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
52082210 |
aaatgtaaa |
52082202 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #196
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Query Start/End: Original strand, 152 - 270
Target Start/End: Original strand, 11140424 - 11140543
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| Q |
152 |
tattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgta-aattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaa |
250 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||| |||||||||||||| | |||||||| ||| |||| |||||| || |||| |||||||||| |||||| ||| || |
|
|
| T |
11140424 |
tattactcataatagagaattttgattattttttacaataaaatgtagaataatttagtatgatttttctaaaatatgaaatgattttttttcctataaa |
11140523 |
T |
 |
| Q |
251 |
atgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
11140524 |
atgatattttctaaaatata |
11140543 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #197
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Query Start/End: Original strand, 148 - 195
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Alignment:
| Q |
148 |
tttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaat |
195 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
14155208 |
tttttattactcatattaatgaatattaattattttttatgataaaat |
14155161 |
T |
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Target: chr3; HSP #198
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| Q |
217 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgttaatt |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || || | |||||||||| |||||| ||| | || |||||| ||| ||| | |||||||||| |
|
|
| T |
33006544 |
ttataaacaatgaaatgat-gtttttattatgaaattatattctataaaatataactattgataaagagctatttattacataaaaaattatcgttaatt |
33006642 |
T |
 |
| Q |
316 |
tata |
319 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
33006643 |
tata |
33006646 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #199
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| Q |
240 |
tttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttata |
319 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||| || ||||| |||| ||| ||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
52038348 |
tttcttatgaaataatgttttctaaaatataaatgtcaataaataactctttatatcataaaattgatcattactttata |
52038427 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #200
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| Q |
246 |
atgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgttaatttata |
319 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| || |||||| || ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
29491897 |
atgaaatgatgttctataaaatataaatattgaccaatagctatttattatataaaaaatgatcgttaatttata |
29491971 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #201
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| Q |
216 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatt |
315 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||| ||| ||| |||||| ||| | |
|
|
| T |
43744387 |
cttataaaggatgaaatgacattttttcttataaaataatattttctaaaatataaaagttgataaatatctctttattacataaaaatgatcgataact |
43744288 |
T |
 |
| Q |
316 |
tat |
318 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
43744287 |
tat |
43744285 |
T |
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Target: chr3; HSP #202
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| Q |
220 |
taaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
44365856 |
taaaaaatgaaatgatgttttttcttataaaatgatattttttaaaatata |
44365906 |
T |
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| Q |
239 |
ttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattt |
324 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||||||| || |||||||||||||| | || || || ||||||||||||| ||| | ||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
6890703 |
tttttttataaaatgatattatctaaaatataaatgtcgaaaagtatctttttatttcataaaaataatcgttaatgtgtatattt |
6890788 |
T |
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| Q |
255 |
tgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattt |
324 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
24397668 |
tgttttctaaaatataaataatgacaaataacaacttatttca-taaaatgatcattaatttataaattt |
24397736 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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55 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaattta |
136 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||| || || ||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
27525272 |
gaagaaaaataattgttttctatcattaacaattacaatagctagatcttatttaacaaaagtgtcgacgaaataaaattta |
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T |
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ttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgt-aaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttat |
247 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| || || |||| |||| ||| |||||| ||||||| | | |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
32946003 |
ttttattactcatagtagagaatatttattattttttacgataatatgttaaatgaattagtatgatttttataaa-attaaaatgatgttttttcttat |
32945905 |
T |
 |
| Q |
248 |
gaaatgatgttttctaaaatataaat |
273 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
32945904 |
gaaatgatatttt-taaaatataaat |
32945880 |
T |
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Target: chr3; HSP #207
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cttataaacaatgaaatga---tggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
39908648 |
cttataaacaatgaaatgatattttttttttttatgaaataatgttctataaaatataaatgttgacaaata |
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T |
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| Q |
204 |
tttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggttttt---cttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||||| || | |||||||||||||||| || ||||| || || | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
50206532 |
tttaatataattcatataaacaatgaaatggtgttttttttcctcataagatggtgttttctaaaatataaataatgacaaata |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #209
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tttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgttaatttat |
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Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||| | || |||||| ||| ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
54788580 |
ttttttttatgaaatgatgctttataaaatataactgttgacaaagagctatttattacataaaaaatgatcgttaatttat |
54788661 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #210
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 174
Target Start/End: Original strand, 55417919 - 55418024
Alignment:
| Q |
69 |
attttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatg |
168 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||| || | |||||||| ||||| || |||||| |||||| | |||| ||||| ||||| || |||||| ||||||||||| | |
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| T |
55417919 |
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55418018 |
T |
 |
| Q |
169 |
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174 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
55418019 |
aatatt |
55418024 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 295; Significance: 1e-166; HSPs: 171)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 36835371 - 36835730
Alignment:
| Q |
1 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
100 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36835371 |
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36835470 |
T |
 |
| Q |
101 |
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200 |
Q |
| |
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| T |
36835471 |
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36835570 |
T |
 |
| Q |
201 |
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300 |
Q |
| |
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|
| T |
36835571 |
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36835670 |
T |
 |
| Q |
301 |
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360 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36835671 |
aagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
36835730 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 5 - 360
Target Start/End: Original strand, 7223516 - 7223871
Alignment:
| Q |
5 |
tgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaatttt |
104 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
7223516 |
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7223615 |
T |
 |
| Q |
105 |
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204 |
Q |
| |
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|
| T |
7223616 |
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7223715 |
T |
 |
| Q |
205 |
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304 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7223716 |
gtaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagt |
7223815 |
T |
 |
| Q |
305 |
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360 |
Q |
| |
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|||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7223816 |
gatctttaatttatatattttgtaaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
7223871 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 7 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 1426700 - 1426346
Alignment:
| Q |
7 |
tatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttat |
106 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1426700 |
tatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttttttttttgaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttat |
1426601 |
T |
 |
| Q |
107 |
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205 |
Q |
| |
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|
| T |
1426600 |
ttaccaaaagcttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaatctttt |
1426501 |
T |
 |
| Q |
206 |
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305 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1426500 |
tagtatgatccttataaacaatgaaattatgatttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtg |
1426401 |
T |
 |
| Q |
306 |
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360 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1426400 |
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1426346 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Original strand, 38627026 - 38627375
Alignment:
| Q |
11 |
ggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttac |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
38627026 |
ggtacaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatatac |
38627125 |
T |
 |
| Q |
111 |
caaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaata |
210 |
Q |
| |
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|||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
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| T |
38627126 |
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38627225 |
T |
 |
| Q |
211 |
tgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgt |
310 |
Q |
| |
|
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|
| T |
38627226 |
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38627325 |
T |
 |
| Q |
311 |
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360 |
Q |
| |
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|
|
| T |
38627326 |
taatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacacttaaaattgtga |
38627375 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 12266454 - 12266091
Alignment:
| Q |
1 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12266454 |
tgggtgtatcggtacatcaagtcgtaaaattaataataaatcagttgtttttttgaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
12266355 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaa- |
199 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
12266354 |
ttttatttaccaaaagcttcgacgaaataaaatttaatttttaagaaattttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaat |
12266255 |
T |
 |
| Q |
200 |
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295 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12266254 |
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12266155 |
T |
 |
| Q |
296 |
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359 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12266154 |
cattaaagtgatcgttaatttataaattttgtgcaacaagagtaccggtacactcaaaattgtg |
12266091 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 5 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 45393820 - 45393465
Alignment:
| Q |
5 |
tgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaatttt |
104 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45393820 |
tgtatcggtacaccaagttgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaatttt |
45393721 |
T |
 |
| Q |
105 |
atttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaatttt |
204 |
Q |
| |
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|
|
| T |
45393720 |
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45393621 |
T |
 |
| Q |
205 |
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304 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45393620 |
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45393521 |
T |
 |
| Q |
305 |
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360 |
Q |
| |
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||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
45393520 |
gatatttaatttatatattttatgaaacaagagtaccagtacattcaaaattgtga |
45393465 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 5 - 360
Target Start/End: Original strand, 45401181 - 45401536
Alignment:
| Q |
5 |
tgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaatttt |
104 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45401181 |
tgtatcggtacatcaagttgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaatttt |
45401280 |
T |
 |
| Q |
105 |
atttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaatttt |
204 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45401281 |
atataccaaaagtttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaatttt |
45401380 |
T |
 |
| Q |
205 |
ttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagt |
304 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45401381 |
gtaatatgatccttataaataatgaaatgatggtttttcttataaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagt |
45401480 |
T |
 |
| Q |
305 |
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360 |
Q |
| |
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|||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
45401481 |
gatctttaatttatatattttgtgaaacaagagtagcggtacattcaaaattgtga |
45401536 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 464277 - 464638
Alignment:
| Q |
1 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnn-gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaa |
99 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
464277 |
tgggtgtatcggtacactaactcgtaaaattaataataaatgagtttttttttttgaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaa |
464376 |
T |
 |
| Q |
100 |
attttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaa |
199 |
Q |
| |
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|
|
| T |
464377 |
attttatttactaaaagcttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgataaaatgtaa |
464476 |
T |
 |
| Q |
200 |
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298 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
464477 |
attttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatgatttttcttatgaaatgatgtttttttaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat |
464576 |
T |
 |
| Q |
299 |
taaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
360 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
464577 |
taaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagaataccggtacactcaaaattgtga |
464638 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 28897281 - 28896924
Alignment:
| Q |
1 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
100 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28897281 |
tgggtgtattggtacaccaagtcataaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
28897182 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
200 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28897181 |
ttttatataccaaaagctttgacgaaataaaatttaatttttaacaatttttattacccataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
28897082 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
300 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28897081 |
ttttgtaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
28896982 |
T |
 |
| Q |
301 |
aagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
360 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28896981 |
aagtgatcttt--tttatatattttatgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
28896924 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 5 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 37766676 - 37766321
Alignment:
| Q |
5 |
tgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaatttt |
104 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37766676 |
tgtatcggtataccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaatttt |
37766577 |
T |
 |
| Q |
105 |
atttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaatttt |
204 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37766576 |
atataccaaaagtttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaatttt |
37766477 |
T |
 |
| Q |
205 |
ttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagt |
304 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37766476 |
gtaatatgatccttataaacaatgaaatgatggttttttttatgaaatgatgttttctaatatttaaatattaacaaatacctttttatttcattaaagt |
37766377 |
T |
 |
| Q |
305 |
gatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
360 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
37766376 |
gatctttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccagtacattcaaaattgtga |
37766321 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 5 - 360
Target Start/End: Original strand, 38971497 - 38971852
Alignment:
| Q |
5 |
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38971852 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 5 - 360
Target Start/End: Original strand, 39002595 - 39002950
Alignment:
| Q |
5 |
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104 |
Q |
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T |
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304 |
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360 |
Q |
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39002950 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 7 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 196436 - 196085
Alignment:
| Q |
7 |
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106 |
Q |
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360 |
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196085 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 7 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 311273 - 310922
Alignment:
| Q |
7 |
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106 |
Q |
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206 |
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306 |
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310975 |
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310922 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 68 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 14914155 - 14913863
Alignment:
| Q |
68 |
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167 |
Q |
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T |
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267 |
Q |
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| T |
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14913956 |
T |
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268 |
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360 |
Q |
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| T |
14913955 |
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14913863 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Original strand, 21835464 - 21835812
Alignment:
| Q |
5 |
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104 |
Q |
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| T |
21835464 |
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21835563 |
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105 |
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204 |
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| T |
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21835662 |
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304 |
Q |
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| T |
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21835762 |
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354 |
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| T |
21835763 |
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21835812 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 5 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 43183098 - 43182743
Alignment:
| Q |
5 |
tgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaatttt |
104 |
Q |
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| T |
43183098 |
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43183000 |
T |
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| Q |
105 |
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203 |
Q |
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303 |
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43182800 |
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360 |
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43182743 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 5 - 349
Target Start/End: Original strand, 38803467 - 38803811
Alignment:
| Q |
5 |
tgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaatttt |
104 |
Q |
| |
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| T |
38803467 |
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38803566 |
T |
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| Q |
105 |
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204 |
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| T |
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38803666 |
T |
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205 |
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304 |
Q |
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| T |
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38803766 |
T |
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| Q |
305 |
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349 |
Q |
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| T |
38803767 |
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38803811 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 3 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 27101188 - 27100830
Alignment:
| Q |
3 |
ggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnn-gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaat |
101 |
Q |
| |
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| T |
27101188 |
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27101089 |
T |
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| Q |
102 |
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201 |
Q |
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27100989 |
T |
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| Q |
202 |
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301 |
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| T |
27100988 |
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27100889 |
T |
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| Q |
302 |
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360 |
Q |
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| T |
27100888 |
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27100830 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 29039990 - 29039643
Alignment:
| Q |
1 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
100 |
Q |
| |
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| T |
29039990 |
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29039891 |
T |
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| Q |
101 |
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200 |
Q |
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| T |
29039890 |
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29039792 |
T |
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201 |
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300 |
Q |
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| T |
29039791 |
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29039692 |
T |
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301 |
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349 |
Q |
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| T |
29039691 |
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29039643 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 5 - 349
Target Start/End: Original strand, 3052832 - 3053176
Alignment:
| Q |
5 |
tgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaatttt |
104 |
Q |
| |
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| T |
3052832 |
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3052931 |
T |
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| Q |
105 |
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204 |
Q |
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| T |
3052932 |
atttaccaaaatcttcgacgaaataaaatttaacttttacaaatttttactactcataataataaatattgattattttttatgacaaaatataaatttt |
3053031 |
T |
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| Q |
205 |
ttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagt |
304 |
Q |
| |
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| T |
3053032 |
ttaatataatccttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgatatgacgttttctaaaatataaatattgacaaataactttttatttcataaaaat |
3053131 |
T |
 |
| Q |
305 |
gatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacact |
349 |
Q |
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| T |
3053132 |
gatcgttaatttataagttttgtgaaacaagagtatcggtacact |
3053176 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 4 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 18844534 - 18844199
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4 |
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
18844534 |
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18844435 |
T |
 |
| Q |
104 |
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203 |
Q |
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| T |
18844434 |
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18844335 |
T |
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| Q |
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303 |
Q |
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| T |
18844334 |
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18844235 |
T |
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339 |
Q |
| |
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18844234 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #23
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Q |
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T |
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266 |
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360 |
Q |
| |
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|
|
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atataaatattgataaatacctttttatttcattaaagtgatctttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
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T |
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Target: chr8; HSP #24
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Target Start/End: Complemental strand, 37404980 - 37404735
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100 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
101 |
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200 |
Q |
| |
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| T |
37404880 |
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37404781 |
T |
 |
| Q |
201 |
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246 |
Q |
| |
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||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
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| T |
37404780 |
ttttttaatttgatccttataaacaatgaaataatggtttttctta |
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T |
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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
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Target Start/End: Complemental strand, 41572080 - 41571749
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106 |
Q |
| |
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|
|
| T |
41572080 |
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T |
 |
| Q |
107 |
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206 |
Q |
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| T |
41571981 |
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41571892 |
T |
 |
| Q |
207 |
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306 |
Q |
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| T |
41571891 |
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41571792 |
T |
 |
| Q |
307 |
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349 |
Q |
| |
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T |
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Target: chr8; HSP #26
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154 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
155 |
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254 |
Q |
| |
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| T |
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27970294 |
T |
 |
| Q |
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298 |
Q |
| |
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| T |
27970295 |
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T |
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Target: chr8; HSP #27
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154 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
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253 |
Q |
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| T |
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32071365 |
T |
 |
| Q |
254 |
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267 |
Q |
| |
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| T |
32071364 |
atgttttctaaaat |
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T |
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Target: chr8; HSP #28
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Target Start/End: Complemental strand, 44637241 - 44636975
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157 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
158 |
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256 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
257 |
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324 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
44637041 |
ttttctaaaatataaataatgacaaataacaacttatttca-taaaatgatcattaatttataaattt |
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T |
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Target: chr8; HSP #29
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Query Start/End: Original strand, 56 - 324
Target Start/End: Original strand, 34520653 - 34520922
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56 |
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154 |
Q |
| |
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|
| T |
34520653 |
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T |
 |
| Q |
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252 |
Q |
| |
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| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || |
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| T |
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34520852 |
T |
 |
| Q |
253 |
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324 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||| |||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
34520853 |
gatgttttctaaaatataaatattatcaaataactacttatttca--aaaatgatcgttaattcataaattt |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #30
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Target Start/End: Original strand, 37218689 - 37218914
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aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattact |
158 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||| || |||||||| || |
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|
| T |
37218689 |
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37218788 |
T |
 |
| Q |
159 |
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258 |
Q |
| |
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|
| T |
37218789 |
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37218888 |
T |
 |
| Q |
259 |
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284 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
37218889 |
ttctaaaatataaatattgacaaata |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 55 - 325
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| |
|
||||||||| || | ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| | | ||||| | |
|
|
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T |
 |
| Q |
155 |
tactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatga |
254 |
Q |
| |
|
||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| || |||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
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tacatataacaaagaatattgattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatataattcttata--ctatgaaatgatgttttttcttataaaatga |
42165031 |
T |
 |
| Q |
255 |
tgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatatttt |
325 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | |||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
42165030 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 55 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 31893656 - 31893365
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| |
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
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tactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatga |
254 |
Q |
| |
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| T |
31893556 |
tacatataacaaagaatattaatgattttttatgagaaaatgttaaaaatttaaaatgattcttataaacaatgaaataaagttttttcttataaaatga |
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T |
 |
| Q |
255 |
tgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
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|||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||| |
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|
| T |
31893456 |
tgttttataaaatataaatattgataaataactctttatttca-taaaatgatcgttaaattataaatttt-tgaaacaggagtatcggtacac |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #33
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Query Start/End: Original strand, 55 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 5982510 - 5982238
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Q |
| |
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|
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T |
 |
| Q |
154 |
ttactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatg---gtttttcttatgaa |
250 |
Q |
| |
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| T |
5982410 |
ttgctcataatgaagaatattgattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatatgattcatataaacaatgaaataatgtttttttttctcatgag |
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T |
 |
| Q |
251 |
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324 |
Q |
| |
|
||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
5982310 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #34
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Query Start/End: Original strand, 59 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 5215641 - 5215416
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Q |
| |
|
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5215641 |
aaaaatcattattttctatcattgacaattataataatcaaattttatttaccaaaagcgtccatgaaatataatatactttttttgaatttttattgct |
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T |
 |
| Q |
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cataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgtt |
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Q |
| |
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|
| T |
5215541 |
cataatgaagaatattgattattttttatgagaaaatgttaataatttaatataattcttataaataatgaaatgatgttttttctcatgggatgatgtt |
5215442 |
T |
 |
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259 |
ttctaaaatataaatattgacaaata |
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| |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 59 - 319
Target Start/End: Original strand, 43331830 - 43332092
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T |
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319 |
Q |
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43332092 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 59 - 319
Target Start/End: Original strand, 44309652 - 44309914
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158 |
Q |
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T |
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| Q |
159 |
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255 |
Q |
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| T |
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44309851 |
T |
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319 |
Q |
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| T |
44309852 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 65 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 12633218 - 12632965
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164 |
Q |
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T |
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| Q |
165 |
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263 |
Q |
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12633020 |
T |
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| Q |
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319 |
Q |
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| T |
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12632965 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 56 - 324
Target Start/End: Original strand, 12801190 - 12801457
Alignment:
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56 |
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155 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
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Q |
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| T |
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T |
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324 |
Q |
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| T |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 9008359 - 9008069
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154 |
Q |
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T |
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| Q |
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254 |
Q |
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| T |
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9008161 |
T |
 |
| Q |
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348 |
Q |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 295
Target Start/End: Original strand, 7885960 - 7886200
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154 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
155 |
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254 |
Q |
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| T |
7886060 |
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T |
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| Q |
255 |
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295 |
Q |
| |
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| T |
7886160 |
tgtcttataaaatataaatattgataaataactctttattt |
7886200 |
T |
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Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 59 - 324
Target Start/End: Original strand, 41674570 - 41674836
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158 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
159 |
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256 |
Q |
| |
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||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||| || | ||| || |
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| T |
41674670 |
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41674769 |
T |
 |
| Q |
257 |
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324 |
Q |
| |
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| T |
41674770 |
ttttctaaaatataaataatgacaaataacaacttatttca-taaaatgatccttaatttataaattt |
41674836 |
T |
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Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 58 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 464135 - 463957
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Q |
| |
|
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| T |
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T |
 |
| Q |
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236 |
Q |
| |
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|
| T |
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tcataataaataatattgattattttttatgataaaatgttaaaaatttaatatgatttttataaacaatgaaatgatg |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 59 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 11360488 - 11360262
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158 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
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257 |
Q |
| |
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| T |
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11360289 |
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 |
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| T |
11360288 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 59 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 30777591 - 30777327
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Q |
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T |
 |
| Q |
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257 |
Q |
| |
|
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30777392 |
T |
 |
| Q |
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324 |
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| T |
30777391 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 59 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 34058150 - 34057922
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Q |
| |
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T |
 |
| Q |
159 |
cataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatg---gtttttcttatgaaatgat |
255 |
Q |
| |
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| T |
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34057951 |
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 |
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| |
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34057950 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 59 - 284
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Q |
| |
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T |
 |
| Q |
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cataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatg--gtttttcttatgaaatgatg |
256 |
Q |
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| T |
2880150 |
cataatgaagaatattgatt-ttttttatgagaaaatgttaaaaatttaatataattcatataaacaatgaaatgatgttttttttctcatgagatggtg |
2880052 |
T |
 |
| Q |
257 |
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284 |
Q |
| |
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| T |
2880051 |
ttttctaaaatataaataatgataaata |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 56 - 314
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Q |
| |
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| T |
2666593 |
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2666692 |
T |
 |
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154 |
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253 |
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| T |
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2666792 |
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254 |
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314 |
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| |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 92 - 348
Target Start/End: Original strand, 17642192 - 17642448
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T |
 |
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T |
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290 |
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 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 35754780 - 35754538
Alignment:
| Q |
55 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttat |
154 |
Q |
| |
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||||||||| || | |||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||| | |||||| ||||||||| |||| || ||||| | |
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|
| T |
35754780 |
gaagaaaaagaactgttttttatcattgacaattccaataattaaattatatttacaaaaagcgttgacgaaataaaatttactttttttgaatttttgt |
35754681 |
T |
 |
| Q |
155 |
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254 |
Q |
| |
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||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |
|
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| T |
35754680 |
tacatataacaaagaatattgattattttttatatgaaaatgttaaaaatttaatataatttttataaacaatgaaatgat-gtttttcttataaaatga |
35754582 |
T |
 |
| Q |
255 |
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298 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
35754581 |
tgtgttctaaaatataaatatttataaataactctttatttcat |
35754538 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 55 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 40548012 - 40547722
Alignment:
| Q |
55 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttat |
154 |
Q |
| |
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|||||||| |||||||||| | | |||||||| || | |||||||| ||||||||||||||| || || || |||||| ||| |||| || ||||||| |
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| T |
40548012 |
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40547913 |
T |
 |
| Q |
155 |
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254 |
Q |
| |
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|||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| || |||||||||||| ||||||| || || |||||| |||| |
|
|
| T |
40547912 |
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40547814 |
T |
 |
| Q |
255 |
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348 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| | || |||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||| |
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| T |
40547813 |
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40547722 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 59 - 284
Target Start/End: Original strand, 40824550 - 40824778
Alignment:
| Q |
59 |
aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaa-gagtttttattac |
157 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||| || |||||||| | |
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| T |
40824550 |
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40824649 |
T |
 |
| Q |
158 |
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255 |
Q |
| |
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|||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| || | |||||||||||||||| || ||||||| |||| ||| | |
|
|
| T |
40824650 |
tcataatgaagaatattgattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatataattcatataaacaatgaaatggtgttttttttctcatgagatggt |
40824749 |
T |
 |
| Q |
256 |
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284 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | ||||||| |
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|
| T |
40824750 |
gttttctaaaatataaataataacaaata |
40824778 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 55 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 44578978 - 44578726
Alignment:
| Q |
55 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaa-attttaagagttttta |
153 |
Q |
| |
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||||||||| |||| |||||||||||| |||| || ||||||| || ||| ||||| |||| ||| |||| |||||||| | ||||| || ||||| |
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| T |
44578978 |
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44578879 |
T |
 |
| Q |
154 |
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253 |
Q |
| |
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| T |
44578878 |
ttacatataacaaagaatatttattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatatgattcttataaacaatgaaatgatgtttattcttataaaatg |
44578779 |
T |
 |
| Q |
254 |
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307 |
Q |
| |
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| || || ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||| |
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|
| T |
44578778 |
acgtcttataaaatataaatattgataaataattatttatttca-taaagtgat |
44578726 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 59 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 17069553 - 17069370
Alignment:
| Q |
59 |
aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattact |
158 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| | |||| ||| ||||||||| |||| || |||||||| || |
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| T |
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17069454 |
T |
 |
| Q |
159 |
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242 |
Q |
| |
|
||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
17069453 |
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17069370 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 59 - 242
Target Start/End: Original strand, 17578720 - 17578903
Alignment:
| Q |
59 |
aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattact |
158 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| | |||| ||| ||||||||| |||| || |||||||| || |
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| T |
17578720 |
aaaaataattattttctatcattgacaattataataattaaatcttatttaccaaaaacgtcgatgaaataaaatttactttttttgaatttttattgct |
17578819 |
T |
 |
| Q |
159 |
cataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggttttt |
242 |
Q |
| |
|
||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
17578820 |
cataatgaagaatattgattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatataattcatataaacaatgaaatgatgtttttt |
17578903 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 56 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 17838659 - 17838432
Alignment:
| Q |
56 |
aagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaat--tttaagagttttta |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||| ||||| || | |||||||| ||||||||||||||| || ||||| | |||||||| | ||||| |||||| |
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|
| T |
17838659 |
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17838563 |
T |
 |
| Q |
154 |
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252 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
17838562 |
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17838464 |
T |
 |
| Q |
253 |
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284 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
17838463 |
tatgttttctaaaatataaaccttgacaaata |
17838432 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 57 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 4471765 - 4471504
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| Q |
57 |
agaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttatta |
156 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||||| ||| |||| || |||| || |||||||||| |||||| ||| ||||| |||||| || |||| | | ||||||||| |
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|
| T |
4471765 |
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4471666 |
T |
 |
| Q |
157 |
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255 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |
|
|
| T |
4471665 |
ctcataataatgaatattgattatttttt-tgataaaatgtaaaacaaattagtatgattcttataaacaatgaaatgatgttttttctttgaaaataat |
4471567 |
T |
 |
| Q |
256 |
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318 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
4471566 |
attttctaaaatataaaagtcgacaaatagctctttgttacataaaaatgatcgttaaattat |
4471504 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 55 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 38765063 - 38764818
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| Q |
55 |
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152 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||||||||| |||| || ||||||| || ||| |||||||||| || ||||| ||||| ||| | |||| | ||||| |
|
|
| T |
38765063 |
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38764964 |
T |
 |
| Q |
153 |
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252 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |
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|
| T |
38764963 |
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38764864 |
T |
 |
| Q |
253 |
gatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat |
298 |
Q |
| |
|
||| | || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
38764863 |
gatatattataaaatataaatattgataaataactctttatttcat |
38764818 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 73 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 23870574 - 23870381
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tctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaata |
172 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || | |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||| | || || |
|
|
| T |
23870574 |
tctatcatttacaattataaaaattaaatcttatttaccaaaagcgtcgacgaaataaaatttaatttttttgaatttttattactcataatgaagatta |
23870475 |
T |
 |
| Q |
173 |
ttgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggttt--ttcttatgaaatgatgttttctaaa |
265 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23870474 |
ttgattattttttatga-gtaatgttaaaaatttaatatgattcttataaagaatgaaattatgtttttcttcttatgaaatgatgttttctaaa |
23870381 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 92 - 348
Target Start/End: Original strand, 2273128 - 2273384
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ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||| | ||| |||| |||||||| | |||| || |||||| ||||| ||| | |||| |||||||| |||| | | |
|
|
| T |
2273128 |
ataattaaatcttatttatcaaaaacgtcgtcgaaataaaatttgatttttttgaatttttagtactcgtaatagagaattttgattatactttacaata |
2273227 |
T |
 |
| Q |
192 |
aaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggttttt-cttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttt |
290 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
2273228 |
aaatgtaaaaaaattagtatgatttttataaacaatgaaatgatgtttttttcttataaaatgatattttctaaaatacaaatatcaacaaatagctttt |
2273327 |
T |
 |
| Q |
291 |
tatttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
2273328 |
tatttcataaaaatgacagttaatttataaatttt-tgaagtaagagtaccggtacac |
2273384 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 73 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 9509163 - 9508970
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tctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaata |
172 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || | |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||| | || || |
|
|
| T |
9509163 |
tctatcatttacaattataaaaattaaatcttatttaccaaaagtgtcgacgaaataaaatttaatttttttgaatttttattactcataatgaagatta |
9509064 |
T |
 |
| Q |
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ttgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggttt--ttcttatgaaatgatgttttctaaa |
265 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9509063 |
ttgattattttttatga-gtaatgttaaaaatttaatatgattcttataaacaatgaaattctgtttttcttcttatgaaatgatgttttctaaa |
9508970 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 91 - 317
Target Start/End: Original strand, 16323676 - 16323903
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91 |
gataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgac |
190 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||| || |||||| |||| |||| | |||| |||||||||||||| | |
|
|
| T |
16323676 |
gataattaaatcttatttaccaaaaacgtcgacgaaataaaatttaatttttctgaatttttagtacttataatagagaattttgattattttttacaat |
16323775 |
T |
 |
| Q |
191 |
aaaatgtaaatttt-ttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaataccttt |
289 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || | |
|
|
| T |
16323776 |
aaaatgtgaacaaaattaatatgattttgataaacaatgaaatgatattttttcttatgaaatgacattttctaaaatataaatatcaacaaatagctct |
16323875 |
T |
 |
| Q |
290 |
ttatttcattaaagtgatcgttaattta |
317 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||| | || ||||||||| |
|
|
| T |
16323876 |
ttattccataaaaataatagttaattta |
16323903 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 92 - 284
Target Start/End: Original strand, 40154548 - 40154744
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ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||| | |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
40154548 |
ataattaaatcttatttaccaaaagcgtcgatgaaataaaattttctttttttaaatttttattgctcataatgaagaatattgattattttttatgaga |
40154647 |
T |
 |
| Q |
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aaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggttttt----cttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
40154648 |
aaatgttaaaaatttaatataattcatataaacaatgaaatgatgtttttttttcctcatgagatggtgttttctaaaatataaataatgacaaata |
40154744 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 92 - 324
Target Start/End: Original strand, 28885801 - 28886033
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ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaag-agtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgac |
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Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||| | || |||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
28885801 |
ataattaaatcttatttaccaaaag-ttcgacgaaataaaaattactttttttttaattcttattacttataatatagaatattgataattttttatgaa |
28885899 |
T |
 |
| Q |
191 |
aaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttct-tatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaataccttt |
289 |
Q |
| |
|
||||||| || || |||||||| |||||||||||| ||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |
|
|
| T |
28885900 |
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28885999 |
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28886033 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 55 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 34047739 - 34047470
Alignment:
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55 |
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154 |
Q |
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T |
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T |
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325 |
Q |
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34047539 |
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34047470 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 92 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 36886450 - 36886194
Alignment:
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92 |
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191 |
Q |
| |
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Q |
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347 |
Q |
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| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 92 - 325
Target Start/End: Original strand, 43049654 - 43049888
Alignment:
| Q |
92 |
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191 |
Q |
| |
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T |
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289 |
Q |
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| T |
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43049852 |
T |
 |
| Q |
290 |
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325 |
Q |
| |
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| T |
43049853 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 58 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 36569970 - 36569754
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58 |
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157 |
Q |
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T |
 |
| Q |
158 |
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256 |
Q |
| |
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| T |
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36569782 |
T |
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| Q |
257 |
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Q |
| |
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| T |
36569781 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 73 - 265
Target Start/End: Original strand, 41423440 - 41423634
Alignment:
| Q |
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172 |
Q |
| |
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| T |
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 |
| Q |
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265 |
Q |
| |
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| T |
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41423634 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 73 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 41898 - 41708
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73 |
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172 |
Q |
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| T |
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41799 |
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 |
| Q |
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262 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 168 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 44000772 - 44000620
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| Q |
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267 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| || || ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |
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| T |
44000772 |
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44000673 |
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| Q |
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319 |
Q |
| |
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| T |
44000672 |
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44000620 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 92 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 26439811 - 26439584
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| Q |
92 |
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191 |
Q |
| |
|
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| T |
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26439712 |
T |
 |
| Q |
192 |
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289 |
Q |
| |
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| T |
26439711 |
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26439612 |
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317 |
Q |
| |
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||||| ||| ||| | || ||||||||| |
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| T |
26439611 |
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26439584 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 29107872 - 29107635
Alignment:
| Q |
60 |
aaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaa-attttaagagtttttattact |
158 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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| Q |
159 |
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256 |
Q |
| |
|
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| T |
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257 |
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295 |
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| |
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|
|
| T |
29107672 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 92 - 317
Target Start/End: Original strand, 37465802 - 37466028
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190 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||| | |||||| || |||||| || |||| || |||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||| | |
|
|
| T |
37465802 |
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37465901 |
T |
 |
| Q |
191 |
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290 |
Q |
| |
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|
|
| T |
37465902 |
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37466001 |
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317 |
Q |
| |
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|||| ||| ||| | || ||||||||| |
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|
| T |
37466002 |
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37466028 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 216 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 29454306 - 29454174
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216 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgttaat |
314 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||| ||||||||||| |
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|
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T |
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315 |
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348 |
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| |
|
||||| | || |||| || |||||||||||||| |
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|
| T |
29454206 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 265
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172 |
Q |
| |
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| T |
32887972 |
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32887873 |
T |
 |
| Q |
173 |
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265 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
32887872 |
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32887779 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 92 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 43485338 - 43485082
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92 |
ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| ||||||| | |||||||| |||||| || ||| || |||||| |||| |||| | |||| |||||||||||||| | | |
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|
| T |
43485338 |
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43485239 |
T |
 |
| Q |
192 |
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290 |
Q |
| |
|
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|
| T |
43485238 |
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43485139 |
T |
 |
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291 |
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348 |
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| |
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|
| T |
43485138 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 169 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 2749525 - 2749346
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aatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaata |
268 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| || || ||||||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |
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|
| T |
2749525 |
aatattgattatattttacgataatatgtaaaaaaattactataattcttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgaaatgatgttctataaaata |
2749426 |
T |
 |
| Q |
269 |
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348 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| | ||||||| | ||| |||||||||||||||| | || || || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
2749425 |
taaatattgataaatagttatttattttgtaaaaaatgatcgttaatttata-aaattatgcaaaaagagtaccggtacac |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
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216 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttca-ttaaagtgatcgttaat |
314 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||| |
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|
| T |
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cttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgaaatgatattctataaaatataaatgttgataaatagttatttatttcacaaaaaatgatcgttaat |
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T |
 |
| Q |
315 |
ttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactca |
351 |
Q |
| |
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||||| | || ||||| ||||||||||||||||||| |
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|
| T |
36162536 |
ttata-aaattatgaaataagagtaccggtacactca |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
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148 |
tttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttat |
247 |
Q |
| |
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43460527 |
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43460625 |
T |
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248 |
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312 |
Q |
| |
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|
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gaaataatattttctaaaatataaaagtcgacaaatagctcttttttacataaaaatgatcgtta |
43460690 |
T |
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Target: chr8; HSP #80
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Target Start/End: Original strand, 5273145 - 5273363
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59 |
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158 |
Q |
| |
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| T |
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5273244 |
T |
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| Q |
159 |
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255 |
Q |
| |
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| T |
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5273334 |
T |
 |
| Q |
256 |
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284 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
5273335 |
gttttctaaaatataaataatgataaata |
5273363 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
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Target Start/End: Original strand, 12980192 - 12980354
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| Q |
148 |
tttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttat |
247 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||| |||||||| ||| |||| ||| |||||||||| |
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|
| T |
12980192 |
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12980288 |
T |
 |
| Q |
248 |
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313 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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gaaataatattttctaaaatataaaagccgacaaatatctctttattacataaaaatgatcgttaa |
12980354 |
T |
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Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
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| Q |
160 |
ataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttt |
259 |
Q |
| |
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||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||| || |||||||| || |||||||||||| || |||| || || |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
42194876 |
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42194778 |
T |
 |
| Q |
260 |
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315 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
42194777 |
tctaaaatataaacattgataaatagctttttatttcatgaaa-taatcgttaatt |
42194723 |
T |
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Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 219 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 36274723 - 36274595
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| Q |
219 |
ataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaattta |
317 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||| |||| || |||||||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
36274723 |
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36274625 |
T |
 |
| Q |
318 |
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348 |
Q |
| |
|
||||||| | ||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
36274624 |
tatatttag-gaagcaagagtaccagtacac |
36274595 |
T |
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Target: chr8; HSP #84
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Query Start/End: Original strand, 65 - 287
Target Start/End: Original strand, 2731882 - 2732106
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| Q |
65 |
aattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataac |
164 |
Q |
| |
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|||||||||||||||| | || || |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||| || |||||| ||||||||| |
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| T |
2731882 |
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2731981 |
T |
 |
| Q |
165 |
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262 |
Q |
| |
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| |||| |||||||||||||| | |||| ||||| ||| ||| || ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
2731982 |
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2732081 |
T |
 |
| Q |
263 |
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287 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
2732082 |
aaaatataaatatcaacaaatacct |
2732106 |
T |
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Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 325
Target Start/End: Original strand, 43921243 - 43921483
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| Q |
92 |
ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||| | || |||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||| | | |||| |||||||||||||| | | |
|
|
| T |
43921243 |
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43921342 |
T |
 |
| Q |
192 |
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284 |
Q |
| |
|
||||||||| | || |||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
43921343 |
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43921442 |
T |
 |
| Q |
285 |
cctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatatttt |
325 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| ||| |||| |||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
43921443 |
gctctttatttcataaaaatgatagttaatgtatagatttt |
43921483 |
T |
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Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 216 - 319
Target Start/End: Original strand, 1043303 - 1043407
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216 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgttaat |
314 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
1043303 |
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1043402 |
T |
 |
| Q |
315 |
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319 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
1043403 |
atata |
1043407 |
T |
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Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 216 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 4214657 - 4214589
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| Q |
216 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4214657 |
cttataaacaatgaaatcatgttttttcttatgaaatgatgttctataaaatataaatattgacaaata |
4214589 |
T |
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Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 148 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 32719183 - 32718986
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148 |
tttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttat |
247 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||| | ||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
32719183 |
tttttattacttataatagtgaatatttattattttttca-ataaaatgtaaataatt-agtatgattcttataaacaatgaaataatattttttcttat |
32719086 |
T |
 |
| Q |
248 |
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347 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||||||||| | |||||||| | ||| || ||| ||| |||||||||| |||| || ||| ||||| | ||||||||||||| |
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|
| T |
32719085 |
gaaataatattttctaaaatataaaagtcgacaaatagttcttttttacataaaaatgatcgttaacttat-taatttatgaaataggagtaccggtaca |
32718987 |
T |
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Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 38329658 - 38329546
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| Q |
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attgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataa |
271 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || || || |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
38329658 |
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38329559 |
T |
 |
| Q |
272 |
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284 |
Q |
| |
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||||||| ||||| |
|
|
| T |
38329558 |
atattgaaaaata |
38329546 |
T |
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Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 209 - 347
Target Start/End: Original strand, 34634091 - 34634228
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| Q |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgat |
307 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| | || |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
34634091 |
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34634189 |
T |
 |
| Q |
308 |
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347 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
34634190 |
cgttaatttata-aaattatgaaaaaagagtaccggtaca |
34634228 |
T |
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Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 209 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 39646807 - 39646732
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39646807 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaata |
39646732 |
T |
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Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
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Target Start/End: Original strand, 39722130 - 39722275
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| Q |
148 |
tttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaat--gaaatgatggtttttctt |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| | || ||||||| || |||||| |||| ||||||| |||| ||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
39722130 |
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39722228 |
T |
 |
| Q |
246 |
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292 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
39722229 |
atgaaataatgttttctacaatataaattttgataaataacttttta |
39722275 |
T |
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Back To:
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Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 209 - 284
Target Start/End: Original strand, 41720485 - 41720560
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41720485 |
tatgattcttataaacaattaaacgatgttttttcttatgaaatgttgttttataaaatataaatattgacaaata |
41720560 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
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ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||| || |||| || |||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||| | | |
|
|
| T |
13483194 |
ataattaaatcttatttaccaaaaacgtcgacgaaataaaattaaatttttctgaatttttagtactcataatagagaattttgattattttttacaata |
13483095 |
T |
 |
| Q |
192 |
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269 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||| |||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
13483094 |
aaatgtaaaaaaaattagtatgatttttataaacaataaaatgaagttttttcttatgaaatgacattttttaaaatat |
13483016 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Query Start/End: Original strand, 216 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 34166073 - 34165991
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216 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat |
298 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
34166073 |
cttataaacaatgaaatgatattttttcttatgaaatgatgttctataaaatataaatattgataaatagttatttatttcat |
34165991 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttca-ttaaagtgatcgttaat |
314 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
10706718 |
cttataaacaatgaaatgatattttttcttatgaaatgatgttctataaaatataaatgttgataaatagttatttatttcacaaaaaatgatcgttaat |
10706619 |
T |
 |
| Q |
315 |
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348 |
Q |
| |
|
||||| | || |||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
10706618 |
ttata-aaattatgaagcaagagtaccagtacac |
10706586 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
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cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgttaat |
314 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| || | |||||||||||| |||| ||||| | |||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
29265752 |
cttataaacaatgaaatgattttttttcttgtggaatgatattctataaaatataaatgttgataaatagttatttatttcataaaaaatgatcgttaat |
29265653 |
T |
 |
| Q |
315 |
ttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
|
||||| | || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29265652 |
ttata-aaattatgaaacaagagtaccggtacac |
29265620 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttca-ttaaagtgatcgttaat |
314 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||| ||||| | ||||||||| ||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
39300246 |
cttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgaaatgatattctttaaaatataaatgttgataaatagttatttatttcacaaaaaatgatcattaat |
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T |
 |
| Q |
315 |
ttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
|
||||| | || |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39300146 |
ttata-aaattatgaagcaagagtaccggtacac |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #99
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| Q |
209 |
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307 |
Q |
| |
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|
| T |
6631350 |
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6631448 |
T |
 |
| Q |
308 |
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348 |
Q |
| |
|
||||| |||||| | ||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
6631449 |
cgttagtttataga-tttatgaagcaagagtaccgatacac |
6631488 |
T |
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316 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||| | || |||||||| |
|
|
| T |
39347293 |
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39347194 |
T |
 |
| Q |
317 |
a |
317 |
Q |
| |
|
| |
|
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39347193 |
a |
39347193 |
T |
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216 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||| |
|
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| T |
45452548 |
cttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgagatgatgttctataaaatataaattttgacaaata |
45452480 |
T |
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209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
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118046 |
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118121 |
T |
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209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
5328837 |
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5328912 |
T |
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Target: chr8; HSP #104
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Target Start/End: Complemental strand, 6982955 - 6982880
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6982955 |
tatgattcttataaacaattaaatgatattttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaata |
6982880 |
T |
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| Q |
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tgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcg |
309 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| || |||| | ||| ||| |||||| |
|
|
| T |
37676104 |
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37676006 |
T |
 |
| Q |
310 |
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321 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| |
|
|
| T |
37676005 |
ttcatttatata |
37675994 |
T |
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Target: chr8; HSP #106
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Target Start/End: Original strand, 38210556 - 38210631
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
38210556 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgataaata |
38210631 |
T |
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Target Start/End: Original strand, 40267719 - 40267794
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40267719 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataatatataaatattgacaaata |
40267794 |
T |
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209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40578932 |
tatgattcttataaacaattaaatgatattttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaata |
40579007 |
T |
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Target Start/End: Original strand, 2164928 - 2165053
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tttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgt-aaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttctta |
246 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||| ||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||| |
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|
| T |
2164928 |
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2165027 |
T |
 |
| Q |
247 |
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272 |
Q |
| |
|
|| || || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
2165028 |
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2165053 |
T |
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| Q |
148 |
tttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgt-aaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttctta |
246 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |
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|
| T |
31940589 |
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31940688 |
T |
 |
| Q |
247 |
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272 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||||||||||| |
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|
| T |
31940689 |
tgaaatgatattttttaaaatataaa |
31940714 |
T |
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148 |
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246 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
36496376 |
tttttaatactcatattattgaatattgattatttttttggataaaatgttaaaaaaattagtatgattcttataaatgatgaaatgatgttttttctta |
36496277 |
T |
 |
| Q |
247 |
tgaaatgatgttttctaaaatataaa |
272 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
36496276 |
tgaaatgatattttttaaaatataaa |
36496251 |
T |
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Target: chr8; HSP #112
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tttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaa |
302 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
1221597 |
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1221498 |
T |
 |
| Q |
303 |
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319 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
1221497 |
ttgatcgttaatttata |
1221481 |
T |
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307 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||| || |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
17792441 |
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17792539 |
T |
 |
| Q |
308 |
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324 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |||| |
|
|
| T |
17792540 |
tgttaatgtataaattt |
17792556 |
T |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgat |
307 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||| || |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
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27172249 |
T |
 |
| Q |
308 |
cgttaatttatatattt |
324 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |||| |
|
|
| T |
27172250 |
tgttaatgtataaattt |
27172266 |
T |
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Target: chr8; HSP #115
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tttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgt-aaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttctta |
246 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
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36035782 |
T |
 |
| Q |
247 |
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318 |
Q |
| |
|
||||||| |||| | ||||||||| || |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
36035783 |
gaaaatgatattttttttaaatataaaaatcgacaaatagctctttgttacataaaaatgatcgttaaattat |
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T |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgat |
307 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||| | || || |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
36672179 |
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36672081 |
T |
 |
| Q |
308 |
cgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
|
|||| |||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36672080 |
agttagtttataga-tttatgaagcaagagtaccggtacac |
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T |
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284 |
Q |
| |
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|||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
7128260 |
tatgattcttataaacaattaaattatgttttttcttatgaaatggtgttctataaaatataaatattaacaaata |
7128185 |
T |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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tatgattcttataaacagtaaaatgatgttttttcttatgaaattttgttctataaaatataaatattgacaaata |
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T |
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tataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaattt |
316 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||| || |||||||||| ||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
31158800 |
tataaacaatgaa-tgatgtgtttttcttatgaaatgatattttttaaaatataaatgccggcaaataactatttatttcataaaattaatcgttaattt |
31158898 |
T |
 |
| Q |
317 |
atatattt |
324 |
Q |
| |
|
||| |||| |
|
|
| T |
31158899 |
atagattt |
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T |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36667472 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttattatgaaatattgttctataaaatataaatattgacaaata |
36667547 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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122 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
40972385 |
aaaaataattattttctatcattgacaattataataattaaatcttatttaccaaaagcgtcga |
40972322 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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atgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggta |
345 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| | |||| || |||||||||| || ||||| || || |||||||||| || |
|
|
| T |
463967 |
atgaaatgatgttttctaaaatatgaacattgacaaataactttttatttta-taaaatggtcgttaatttgta-attttatggaataagagtaccgata |
463870 |
T |
 |
| Q |
346 |
cac |
348 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
463869 |
cac |
463867 |
T |
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
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ataattagatattatttaccaaaagtgtcgacgaaataaaatttatttatttttatttaatttttgttacatataacgaagaatattgattattttttat |
9712596 |
T |
 |
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188 |
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255 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
9712595 |
aagaaaatgttaaaaatttaatatgattcttatgaacaatgaaatgatgtttttttcttataaaatgat |
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T |
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Target: chr8; HSP #124
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196 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| | || ||| | |||||||| | |||| || || ||||||||||||| | |||| |||| ||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
10280683 |
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T |
 |
| Q |
197 |
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270 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
10280783 |
taaaaaaattaatatgatttttataaaaaatgaaatgatgtttttttcatataaaatgatattttctaaaatata |
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T |
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Q |
| |
|
||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||| | || ||||||| |||| ||| || |||||||| |||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
12180098 |
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12180196 |
T |
 |
| Q |
248 |
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273 |
Q |
| |
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|||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
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gaaatgatactttctaaaatataaat |
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T |
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tttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttat |
247 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||| | || ||||||| |||| ||| || |||||||| |||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
12424526 |
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12424624 |
T |
 |
| Q |
248 |
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273 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
12424625 |
gaaatgatactttctaaaatataaat |
12424650 |
T |
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Q |
| |
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||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |
|
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T |
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tattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgta-aattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaa |
250 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||| |||||||||||||| | |||||||| || | |||| |||||| || |||| |||||||||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
29773623 |
tattactcataatagataattttgattattttttacaataaaatgtagaaatatttagtatgatttttctaaaaaatgaaatgatgttttttcttataaa |
29773722 |
T |
 |
| Q |
251 |
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319 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| || | ||||| |||| ||| |||||| ||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
29773723 |
atgatattttctaaaatatatatgtcaacaaacacctatttctttcataaaaaatgatagttaatttata |
29773792 |
T |
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| Q |
152 |
tattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattt-tttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaa |
250 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||| |||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||| || |||| |||||||||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
34332290 |
tattactcataatagagaattttgattattttttacaataaaatgtaaaaaaatttagtatgatttttctaaaaaatgaaatgatgttttttcttataaa |
34332389 |
T |
 |
| Q |
251 |
atgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgttaatttata |
319 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| || | ||||| |||| ||| |||||| ||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
34332390 |
atgatattttctaaaatatatatgtcaacaaacacctatttctttcataaaaaatgatagttaatttata |
34332459 |
T |
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aatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat |
298 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||| |
|
|
| T |
39029569 |
aatgaaatgatgttttttcttatgaaataatattttctaaaatataaatatcaacaaacaactctttatttcat |
39029642 |
T |
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taaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgt-aaattttttaatatgatccttataaacaa |
226 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| || |||||| ||||||||| | |||| |||||||| ||||| || |||||| ||| ||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
6800024 |
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T |
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| Q |
227 |
tgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgat |
307 |
Q |
| |
|
||| |||||| |||||||||| ||||| | | |||||||||| |||||| | ||||| || |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
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tgatatgatgttttttcttataaaatggtatattctaaaatacaaatatcaagaaatagctctttatttcattaaaatgat |
6799844 |
T |
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247 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||| |||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
7087803 |
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7087901 |
T |
 |
| Q |
248 |
gaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatc |
308 |
Q |
| |
|
|||| || |||| ||||||||||| |||| ||||| || |||||| ||| ||| ||||| |
|
|
| T |
7087902 |
aaaataatattttttaaaatataaaatttgataaatatctctttattacataaaaatgatc |
7087962 |
T |
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167 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | || || ||||||| ||||||||| |||||| ||| | ||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||| | | |
|
|
| T |
9179100 |
tattttctatcatttataattataataattatattttatttttcaaaagtgtcggcaaagcaaaattcaaatttttttaatttttattactcataatagt |
9179001 |
T |
 |
| Q |
168 |
gaatattgattattttttatgacaaaatg-taaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttc |
243 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | |||||| |||| |||| ||| || |||||||| |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
9179000 |
gaatattgattatttttttcaataaaatgttaaaaaatttagtataattcttataaaaaatgaaatgatgttttttc |
9178924 |
T |
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209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatgg-tttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgat |
307 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||| || |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
24937754 |
tatgattcttataaacaat-aaatgatgtatttttcttatgaaatgatattttctgagatataaatgccgacaaataactatttatttcataaaattgat |
24937656 |
T |
 |
| Q |
308 |
cgttaatttatatattt |
324 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |||| |
|
|
| T |
24937655 |
tgttaatgtataaattt |
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T |
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Q |
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|
| T |
29565727 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaat |
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T |
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ttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtac |
340 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |
|
|
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32238205 |
ttcttatgaaatgatattttttaaaatataaaagtcgacaaataac-ttttatttcataaaaatgatcgttaatttataaatttag-aaaacaagagtac |
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T |
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339 |
Q |
| |
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||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37400265 |
atataaatattaacaaatacctttttattttattaaagtgatcctta----ataaattttgtgaaacaagagta |
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T |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaa |
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Q |
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|
|||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
3642911 |
tatgattcttaaaaaaaatgaaatgatgttttttcttatgaaataatattttctaaaatataaa |
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T |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaa |
272 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
19725283 |
tatgattcttaaaaagaatgaaatgatgttttttcttatgaaataatattttctaaaatataaa |
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T |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
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Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
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27847705 |
tatgattcttataaacaattaaatgatattttttcttatgaaatattgttatataaaatataaatattgataaata |
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191 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||||| | || || | |||||||| | |||| || ||| || ||||||||| | |||| |||||||||||||| | | |
|
|
| T |
29459752 |
ataactaaatcttatttaccaaaaacgtcaacacaataaaatttgatttttctgaatttatagtactcataatagagaattttgattattttttacaata |
29459851 |
T |
 |
| Q |
192 |
aaatgta-aattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
||||||| || |||| |||||| || |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
29459852 |
aaatgtagaaaaatttagtatgatttttctaaaaaatgaaatgatgttttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
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T |
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aaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgttaatttata |
319 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||| | ||||||| || ||| |||||||||||||||| |
|
|
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43842001 |
aaacaataaactgatgttttttcttatgaaatgatattctataaaatataaatattgataaataattatttattttataaaaaatgatcgttaatttata |
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T |
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247 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
24247610 |
tttttaatacccataatagtgaatattgattatttttttggataaaatgttaaaaaattagtatgattcttataaaggatgaaatgacattttttcttat |
24247709 |
T |
 |
| Q |
248 |
gaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatt |
294 |
Q |
| |
|
|||| || |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||| |
|
|
| T |
24247710 |
aaaataatattttctaaaatataaaagttgataaatatctctttatt |
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tttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttat |
247 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||| |||||| | ||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
33628539 |
tttttaatacccataatagtgaatattgattatttttta-gataaaatgttaaaaaattagtatgattcttatacaggatgcaatgatgttttttcttat |
33628637 |
T |
 |
| Q |
248 |
gaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttat |
318 |
Q |
| |
|
|||| || |||| ||||||||||| |||| ||||| || |||||| ||| ||| |||||| ||| |||| |
|
|
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33628638 |
aaaataatattttttaaaatataaaagttgataaatatctctttattacataaaaatgatcgataacttat |
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atgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgttaatttata |
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
40776770 |
atgaaatgatgttctataaaatataaatattgacaaatagctatttattccataaaaaatgatcgttaatttata |
40776696 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #146
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 42444533 - 42444363
Alignment:
| Q |
65 |
aattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataac |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | | || || |||||||||| ||||||| ||||| ||||| | |||||||||| ||||| || |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
42444533 |
aattattttctatcacttataattataataattaaatcttatttatcaaaaaggccgacggaataaaatttaatttttatgaatttttagtactcataat |
42444434 |
T |
 |
| Q |
165 |
aatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgat |
235 |
Q |
| |
|
| ||| |||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42444433 |
agataattttgattattttttacaataaaatgtaaaaaaattagtatgatttttataaacaatgaaatgat |
42444363 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #147
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Query Start/End: Original strand, 217 - 270
Target Start/End: Original strand, 946213 - 946266
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| Q |
217 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
946213 |
ttataaaaaatgaaatgatgttttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
946266 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #148
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 12163103 - 12163050
Alignment:
| Q |
217 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
12163103 |
ttataaaaaatgaaatgatgttttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
12163050 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #149
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 12407531 - 12407478
Alignment:
| Q |
217 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
12407531 |
ttataaaaaatgaaatgatgttttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
12407478 |
T |
 |
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Target: chr8; HSP #150
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
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Target Start/End: Complemental strand, 14914191 - 14914154
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| Q |
1 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataata |
38 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14914191 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataata |
14914154 |
T |
 |
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Target: chr8; HSP #151
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
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Target Start/End: Original strand, 25698979 - 25699064
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| Q |
100 |
attttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattatttttt |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| | | ||||| ||||||||| |||| | | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25698979 |
attttatttatcaaaagtgttgtcgaagcaaaatttaattttttaaattttttattactcataatagtgaatattgattatttttt |
25699064 |
T |
 |
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Target: chr8; HSP #152
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
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| Q |
246 |
atgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgttaattta |
317 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
2261287 |
atgaaatgatgttctataaaatataaatattgacaaatagctatttattacataaaaaatgatcgttaattta |
2261359 |
T |
 |
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Target: chr8; HSP #153
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| Q |
217 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaattt |
316 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||| | || |||||||| |
|
|
| T |
19718479 |
ttataaacaatgaaatgatattttttcttaa-aaataataatttttaaaatataaatatcaacaaatagctctttatttcataaaaataatagttaattt |
19718381 |
T |
 |
| Q |
317 |
atatatttt |
325 |
Q |
| |
|
||| ||||| |
|
|
| T |
19718380 |
atagatttt |
19718372 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #154
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Target Start/End: Original strand, 23274741 - 23274917
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| Q |
92 |
ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||||| | || ||| | |||||||| | |||| || |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| | | |
|
|
| T |
23274741 |
ataactaaatcttatttaccaaaaacgtcaacgcaataaaatttgatttttctgaatttttattactcataatagagaattttgattattttttacaata |
23274840 |
T |
 |
| Q |
192 |
aaatgt-aaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaat |
267 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||| |||||| ||||||| || |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
23274841 |
aaatgtaaaaaaatttagtatgatttttataaaaaaatgaatgatattttttcttataaaatgatattttctaaaat |
23274917 |
T |
 |
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Target: chr8; HSP #155
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| Q |
220 |
taaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgttaatttat |
318 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| || | ||||| |||| ||| |||||| ||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
44935146 |
taaaaaatgaaatgatgttttttcttataaaatgatattttctaaaatatatatgtcaacaaacacctatttctttcataaaaaatgatagttaatttat |
44935245 |
T |
 |
| Q |
319 |
a |
319 |
Q |
| |
|
| |
|
|
| T |
44935246 |
a |
44935246 |
T |
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Target: chr8; HSP #156
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 270
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| Q |
92 |
ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||| ||||||| | || ||| | |||||||| | |||| || || ||||||||||||| | |||| |||||||| ||||| | | |
|
|
| T |
15726178 |
ataactaaatcttattcaccaaaatcgtcaacgcaataaaatttgatttttctgaattcttattactcataatagagaattttgattatcttttacaata |
15726079 |
T |
 |
| Q |
192 |
aaatgtaaatttt-ttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
15726078 |
aaatgtaaaaaaaattagtatgatttttataaaaaatgaaatgatattttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
15725999 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #157
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
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Target Start/End: Complemental strand, 16871796 - 16871625
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| Q |
148 |
tttttattactcataacaatgaatattgattattttttatg-acaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttctta |
246 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||| || | ||||||| || ||| |||||| |||||||| || |||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
16871796 |
tttttaatacccataatagtgaatattgattattttttttggataaaatgttaaaaaattagtatgattcttataaaggatcaaatgacgttttttctta |
16871697 |
T |
 |
| Q |
247 |
tgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttat |
318 |
Q |
| |
|
| |||| || |||||||||||||||| |||| ||| | || |||||| ||| ||| |||||| ||| |||| |
|
|
| T |
16871696 |
taaaataatattttctaaaatataaaagttgataaagatctctttattacataaaaatgatcgataagttat |
16871625 |
T |
 |
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Target: chr8; HSP #158
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||| ||| |||| ||| ||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26522136 |
tatgattcctataaataattaaataatgttttttattatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaata |
26522061 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #159
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
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| Q |
229 |
aaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgttaatttata |
319 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||| || |||| | ||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
26988537 |
aaatgatgttttttcttatgaaatattgttctataaaatatacatattgacaaataactatttactacataaaaaatgatcgttaatttata |
26988446 |
T |
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Target: chr8; HSP #160
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| Q |
152 |
tattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgta-aattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaa |
250 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||| |||||||||||||| | |||||||| || |||| |||||| || |||| |||||||||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
28090369 |
tattactcataatagataattttgattattttttacaataaaatgtagaaaaatttagtatgatttttctaaaaaatgaaatgatgttttttcttataaa |
28090468 |
T |
 |
| Q |
251 |
atgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
28090469 |
atgatattttctaaaatata |
28090488 |
T |
 |
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Target: chr8; HSP #161
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| Q |
246 |
atgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatatttt |
325 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||| ||| |||| |||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
42444372 |
atgaaatgatattttctaaaatacaaatatcaacaaatagctctttatttcataaaaatgatagttaatatatagatttt |
42444293 |
T |
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| Q |
266 |
atataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||| ||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6804120 |
atataaatattgttaaataactttttatttca-taaaatgattgttaaattataaatttt-tgaatcaagagtaccggtacac |
6804040 |
T |
 |
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Target: chr8; HSP #163
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220 |
taaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
39171240 |
taaaaaatgaaatgatgttttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
39171190 |
T |
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Target: chr8; HSP #164
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218 |
tataaacaatgaaatgatggttttt-cttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaattt |
316 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || ||||| || |||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
40972273 |
tataaacaatgaaatggtgtttttttctcatgagatggtgttttttaaaatataaataatgacaaataacaacttatttca-taaaatgatcattaattt |
40972175 |
T |
 |
| Q |
317 |
ata |
319 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
40972174 |
ata |
40972172 |
T |
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210 |
atgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttattt |
295 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||| |
|
|
| T |
44069977 |
atgattcttttaaataatgaaatgatattttttcttattaaataatttttt-taaaatataaatattggcaaataactctttattt |
44070061 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| Q |
216 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaa |
272 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
9178882 |
cttataaaaaatgaaatgatgttttttcttatgggataatattttctaaaatataaa |
9178826 |
T |
 |
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| | |||| ||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6631078 |
tatgattcttataaacactaaaataatgtttttt-ttatgaaatgttgttcgataaaatataaatattgacaaata |
6631004 |
T |
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168 |
gaatattgattattttttatgacaaaatgta-aattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaa |
266 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| | |||||||| || |||| |||||| || |||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
23286759 |
gaattttgattattttttacaataaaatgtagaaaaatttagtatgatttttttaaaaaattaaatgatgttttttcttataaaatgatattttctaaaa |
23286858 |
T |
 |
| Q |
267 |
tata |
270 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
23286859 |
tata |
23286862 |
T |
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92 |
ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| | |||| ||| |||||||||| |||| || ||||| | ||||||| | |||| |||||||||||||| | | |
|
|
| T |
529385 |
ataattaaatcttatttaccaaaaacgtcgaagaaataaaatttaatttttctgaattttttgtgctcataatagagaattttgattattttttacaata |
529484 |
T |
 |
| Q |
192 |
aaatgtaaattttttaata---tgatccttataaacaatgaaatgatggttttt--cttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacc |
286 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||| |||| ||||||||||| | ||||| | ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
529485 |
aaatataaaaaaagaaatagtatgattcttataaacaacggaatgacgttttttttcttataaaatgacattttctaaaatataaatatcaacaaataac |
529584 |
T |
 |
| Q |
287 |
tttttatt |
294 |
Q |
| |
|
| |||||| |
|
|
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tctttatt |
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 |
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| Q |
92 |
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186 |
Q |
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| T |
4475163 |
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4475257 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #171
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 242
Target Start/End: Original strand, 38502302 - 38502452
Alignment:
| Q |
92 |
ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
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| T |
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38502401 |
T |
 |
| Q |
192 |
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242 |
Q |
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| T |
38502402 |
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38502452 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 99)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 35225208 - 35224848
Alignment:
| Q |
1 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
100 |
Q |
| |
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| T |
35225208 |
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35225109 |
T |
 |
| Q |
101 |
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199 |
Q |
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| T |
35225108 |
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35225009 |
T |
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| Q |
200 |
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299 |
Q |
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|
| T |
35225008 |
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35224909 |
T |
 |
| Q |
300 |
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360 |
Q |
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|
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| T |
35224908 |
aaagtgatctttaatttatatattttgtgaaacaatagtaccggtacactcaaaattgtga |
35224848 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 5 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 6016178 - 6015823
Alignment:
| Q |
5 |
tgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaatttt |
104 |
Q |
| |
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| T |
6016178 |
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6016079 |
T |
 |
| Q |
105 |
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204 |
Q |
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| T |
6016078 |
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6015979 |
T |
 |
| Q |
205 |
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304 |
Q |
| |
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| T |
6015978 |
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6015879 |
T |
 |
| Q |
305 |
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360 |
Q |
| |
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|||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
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| T |
6015878 |
gatctttaatttatatattttgtgaaacaagagtactggtacactcaaaattgtga |
6015823 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 1338882 - 1339242
Alignment:
| Q |
1 |
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99 |
Q |
| |
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|
| T |
1338882 |
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1338981 |
T |
 |
| Q |
100 |
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199 |
Q |
| |
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| T |
1338982 |
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1339081 |
T |
 |
| Q |
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299 |
Q |
| |
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|
| T |
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1339181 |
T |
 |
| Q |
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360 |
Q |
| |
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|
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| T |
1339182 |
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1339242 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 18870951 - 18871311
Alignment:
| Q |
1 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnn-gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaa |
99 |
Q |
| |
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| T |
18870951 |
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18871050 |
T |
 |
| Q |
100 |
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199 |
Q |
| |
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| T |
18871051 |
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18871150 |
T |
 |
| Q |
200 |
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299 |
Q |
| |
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| T |
18871151 |
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18871250 |
T |
 |
| Q |
300 |
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360 |
Q |
| |
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||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18871251 |
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18871311 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 33954481 - 33954840
Alignment:
| Q |
1 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33954481 |
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33954579 |
T |
 |
| Q |
101 |
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200 |
Q |
| |
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|
|
| T |
33954580 |
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33954679 |
T |
 |
| Q |
201 |
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299 |
Q |
| |
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|
| T |
33954680 |
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33954779 |
T |
 |
| Q |
300 |
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360 |
Q |
| |
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||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |
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| T |
33954780 |
aaagtgatctttaatttatatattttgtgaaactagagtaccgatgcactcaaaattgtga |
33954840 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 9226229 - 9226588
Alignment:
| Q |
1 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
9226229 |
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9226328 |
T |
 |
| Q |
101 |
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199 |
Q |
| |
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|
| T |
9226329 |
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9226428 |
T |
 |
| Q |
200 |
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299 |
Q |
| |
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| T |
9226429 |
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9226528 |
T |
 |
| Q |
300 |
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359 |
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| |
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| T |
9226529 |
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9226588 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 16989490 - 16989151
Alignment:
| Q |
1 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16989490 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcataaaattaataataaataagttgtttttttgaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
16989391 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
200 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16989390 |
ttttatataacaaaagcttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgataaaatgtaaa |
16989291 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
300 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16989290 |
ttttgtaatataatccttataaacaatgaaatgatgatttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
16989191 |
T |
 |
| Q |
301 |
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340 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
16989190 |
aagtgatctttaatttatatattttgtgaaagaagagtac |
16989151 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 3 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 29639110 - 29638753
Alignment:
| Q |
3 |
ggtgtatcggtaca-ccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaat |
101 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29639110 |
ggtgtatcggtacatccaagtcataaaattaataataaatgagttgtttttt-gaagaaacataatcattttctatcattgacaactaagataattaaat |
29639012 |
T |
 |
| Q |
102 |
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201 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29639011 |
tttatttaccaaaagcttcgacgaaataaaatcaaatttttaagaatttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaat |
29638912 |
T |
 |
| Q |
202 |
tttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaa |
301 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29638911 |
tttttaatatgatccttataaacaatgaaataatggattttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattggcaaatacctttttatttcattaa |
29638812 |
T |
 |
| Q |
302 |
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360 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29638811 |
agtgatttttaatttatatattttgtgaaacaagagtactggtacactcaaaattgtga |
29638753 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 4 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 27719379 - 27719071
Alignment:
| Q |
4 |
gtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattt |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27719379 |
gtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaatcagttgtttttttgaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattt |
27719280 |
T |
 |
| Q |
104 |
tatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattt |
203 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
27719279 |
tatttaccaaaagcttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgataaaatgtaatttt |
27719180 |
T |
 |
| Q |
204 |
tttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaag |
303 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
27719179 |
tttaatataatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaag |
27719080 |
T |
 |
| Q |
304 |
tgatcgtta |
312 |
Q |
| |
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||||||||| |
|
|
| T |
27719079 |
tgatcgtta |
27719071 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 3 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 34315498 - 34315144
Alignment:
| Q |
3 |
ggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaatt |
102 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34315498 |
ggtgtatcggtataccaagtcgtaaaattaataataaaca-gttgttttttt-aagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaatt |
34315401 |
T |
 |
| Q |
103 |
ttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattatttttt-atgacaaaatgtaaat |
201 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |
|
|
| T |
34315400 |
ttatttaccaaaagcttcgacaaa-taaaatttaatttttaaaattttttattactcataacaatgaatattgatgatttttttatgacaaaatgtaatt |
34315302 |
T |
 |
| Q |
202 |
tttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaa |
301 |
Q |
| |
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|
|
| T |
34315301 |
tttttaatataatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaa |
34315202 |
T |
 |
| Q |
302 |
agtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtg |
359 |
Q |
| |
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| T |
34315201 |
agtgatcgttaatttataaattttgtgcaacaagagtaccgatacactcaaaattgtg |
34315144 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 32519110 - 32518766
Alignment:
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1 |
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32519110 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
32519011 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
200 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32519010 |
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32518911 |
T |
 |
| Q |
201 |
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300 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
32518910 |
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32518826 |
T |
 |
| Q |
301 |
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360 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
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32518825 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Original strand, 34969491 - 34969820
Alignment:
| Q |
11 |
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110 |
Q |
| |
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|||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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ggtacaccaaatcgtaaaattaataataaatgagttttttttttgaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttac |
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T |
 |
| Q |
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210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34969591 |
caaaagcttcgacgcaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaata |
34969690 |
T |
 |
| Q |
211 |
tgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgt |
310 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
34969691 |
tgatccttataaacaatgaaa--------------------tgatgttttcaaaaatataaatattaacaaatacctttttattttattaaagtgatcgt |
34969770 |
T |
 |
| Q |
311 |
taatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
360 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34969771 |
taatttataaattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 3 - 360
Target Start/End: Original strand, 26810808 - 26811146
Alignment:
| Q |
3 |
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102 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26810808 |
ggtgtatcggtacaccaaatcgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaatt |
26810907 |
T |
 |
| Q |
103 |
ttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaatt |
202 |
Q |
| |
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|||| ||||||||| ||||||||| | ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26810908 |
ttatataccaaaagtttcgacgaaattaaattaaatttttaagaatttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaatt |
26811007 |
T |
 |
| Q |
203 |
ttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaa |
302 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26811008 |
ttgtaacatgatccttataaacaatgaaatgatg-------------------gttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaa |
26811088 |
T |
 |
| Q |
303 |
gtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
360 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
26811089 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 55 - 326
Target Start/End: Original strand, 1339457 - 1339727
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154 |
Q |
| |
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||||||||| |||| |||||||||||| |||| || ||||||| || ||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||| || ||||| | |
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
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254 |
Q |
| |
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||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1339557 |
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1339656 |
T |
 |
| Q |
255 |
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326 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
1339657 |
tgttttataaaatataaatattgataaataactctttatttca-taaaatgatcgttaaattataaattttg |
1339727 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 70 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 24081454 - 24081200
Alignment:
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70 |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| || || ||| ||||||||| |||| || ||| |||||||||||| || || |
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|
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24081454 |
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T |
 |
| Q |
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atattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaata |
268 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
24081354 |
atattgattatttttaatgagaaaatgttaaaaatttaatatgattcttataaacaataaaatgaagtttttttcttatgaaatgatgtttactaaaata |
24081255 |
T |
 |
| Q |
269 |
taaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattt |
324 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | |||||||||| |||| | |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
24081254 |
taaatattgacaaatagcattttatttca-taaaattatcgttaatttataaattt |
24081200 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 7344638 - 7344401
Alignment:
| Q |
55 |
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154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||| || ||||||| |
|
|
| T |
7344638 |
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7344545 |
T |
 |
| Q |
155 |
tactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatga |
254 |
Q |
| |
|
||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
7344544 |
tacatataacaaagaatattgattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatataattcttataaacaatgaaataatgttttttcttataaaatga |
7344445 |
T |
 |
| Q |
255 |
tgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat |
298 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
7344444 |
tattttctaaaatataaatatcgataaataactctttatttcat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 24025559 - 24025736
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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tgggtgtatcggtacaccaagttgtaaaattaataataattcagttgtttttttgaagaaaaataataaattttctatcattgacaactaagataattaa |
24025658 |
T |
 |
| Q |
100 |
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177 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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24025659 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 59 - 284
Target Start/End: Original strand, 926627 - 926856
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| Q |
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158 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||| || |||||||| || |
|
|
| T |
926627 |
aaaaataattattttctatcattgacaattataataattaaatcttatttaccaaaagcgtcgatgaaataaaatttactttttttgaatttttattgct |
926726 |
T |
 |
| Q |
159 |
cataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatg----gtttttcttatgaaatga |
254 |
Q |
| |
|
||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |
|
|
| T |
926727 |
cataatgaagaatattgattattttttatgagaaaatgtcaaaaatttaatataattcatataaacaatgaaatgatgttttttttttctcatgagatgg |
926826 |
T |
 |
| Q |
255 |
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284 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
926827 |
tgttttctaaaatataaataatgacaaata |
926856 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 59 - 284
Target Start/End: Original strand, 6295464 - 6295692
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| Q |
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aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattact |
158 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||| |||| || |||||||| || |
|
|
| T |
6295464 |
aaaaataattattttctatcattgacaattataataattaaatcttattcaccaaaagcgtcgatgaaataaaatttactttttttgaatttttattgct |
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T |
 |
| Q |
159 |
cataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatg---gtttttcttatgaaatgat |
255 |
Q |
| |
|
||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| | |
|
|
| T |
6295564 |
cataatgaagaatattgattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatataattcatataaacaatgaaatgatgtttttttttctcatgagatggt |
6295663 |
T |
 |
| Q |
256 |
gttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
6295664 |
gttttctaaaatataaataatgacaaata |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 55 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 10888133 - 10887841
Alignment:
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gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaa-gagttttta |
153 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||| || ||||| |
|
|
| T |
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gaagaaaaagaattgttttctatcatttacaattacaataattaaatcgtatttaccaaaagcatcgatgaaataaaatttacttttttttgaatttttg |
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T |
 |
| Q |
154 |
ttactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatg |
253 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
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ttacatataacaaagaatattaattattttttatgaaaaaatgttaaaaatttaatataattcttataaacaatgaaatgatgttttttcttataaaata |
10887934 |
T |
 |
| Q |
254 |
atgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||| | |||| | |||||||| ||||| ||||| |||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
10887933 |
atattttttaaaatataaatattgataaataactctttatttta-taaaataatcgttaaattataaatttt-tgaagtaggagtaccggtacac |
10887841 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 59 - 284
Target Start/End: Original strand, 14501112 - 14501338
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158 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||| || |||||||| || |
|
|
| T |
14501112 |
aaaaataattattttttatcattgacaattataataattaaatcttatttaccaaaagcgtcgatgaaataaaatttactttttttgaatttttattgct |
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T |
 |
| Q |
159 |
cataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgaaatgatgt |
257 |
Q |
| |
|
||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| || | |||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |
|
|
| T |
14501212 |
cataatgaagaatattgattattttttatgaaaaaatgttaaaaatttaatataattcatataaataatgaaatgatgtttttttctcatgagatggtgt |
14501311 |
T |
 |
| Q |
258 |
tttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
14501312 |
tttctaaaatataaataatgacaaata |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 59 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 24151445 - 24151217
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aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattact |
158 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| |||| || |||||||| || |
|
|
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aaaaataattattttctatcattgacaactataataattaaatcttatttagcaaaagcgtcgatgaaataaaatttactttttttgaatttttattgct |
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T |
 |
| Q |
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cataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatg---gtttttcttatgaaatgat |
255 |
Q |
| |
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||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| || | |
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|
| T |
24151345 |
cataatgaagaatattgattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatataattcatataaacaatgaaatgatgtttttttttctcatgagatcgt |
24151246 |
T |
 |
| Q |
256 |
gttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| ||||||||| |
|
|
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24151245 |
gttttttaaaatataaataatgacaaata |
24151217 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 348
Target Start/End: Original strand, 1705689 - 1705980
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gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttat |
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Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||||||| |||| || ||||||| || ||| ||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||| || ||||| | |
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|
| T |
1705689 |
gaagaaaaaaaattgttttctatcattaacaattacaataattagatcttagttaccgaaagtgtcgacgaaataaaatttacattttttgaatttttgt |
1705788 |
T |
 |
| Q |
155 |
tactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatga |
254 |
Q |
| |
|
||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||| ||| || |
|
|
| T |
1705789 |
tacatataacaaagaatatttattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatatgattcttatacccaatgaaatgatgtctattcttataaaacga |
1705888 |
T |
 |
| Q |
255 |
tgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| | |||||||| ||||| || || |||| || |||||||||||||| |
|
|
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1705889 |
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1705980 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #24
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Target Start/End: Original strand, 21181222 - 21181467
Alignment:
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gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaatttta-tttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaa-attttaagagttttt |
152 |
Q |
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| T |
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T |
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252 |
Q |
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| T |
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T |
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298 |
Q |
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| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 59 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 14715586 - 14715359
Alignment:
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158 |
Q |
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T |
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256 |
Q |
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| T |
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14715387 |
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257 |
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284 |
Q |
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| T |
14715386 |
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14715359 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 58 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 14872647 - 14872388
Alignment:
| Q |
58 |
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157 |
Q |
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14872548 |
T |
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| Q |
158 |
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256 |
Q |
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| T |
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14872448 |
T |
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| Q |
257 |
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317 |
Q |
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14872388 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 59 - 284
Target Start/End: Original strand, 21998700 - 21998927
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158 |
Q |
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T |
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| Q |
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256 |
Q |
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| T |
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21998899 |
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284 |
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21998900 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 55 - 298
Target Start/End: Original strand, 21293873 - 21294116
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55 |
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154 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
155 |
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254 |
Q |
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| T |
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21294072 |
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Q |
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| T |
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21294116 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 59 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 11273736 - 11273553
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aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattact |
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Q |
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| Q |
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242 |
Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 56 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 2994647 - 2994425
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155 |
Q |
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| T |
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| Q |
156 |
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255 |
Q |
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| T |
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2994448 |
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| T |
2994447 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 55 - 298
Target Start/End: Original strand, 24248887 - 24249132
Alignment:
| Q |
55 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaa--tttaaattttaagagttttt |
152 |
Q |
| |
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| T |
24248887 |
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24248986 |
T |
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| Q |
153 |
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252 |
Q |
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| T |
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24249086 |
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| Q |
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298 |
Q |
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| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 55 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24159786 - 24159605
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Q |
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24159687 |
T |
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| Q |
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236 |
Q |
| |
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|
| T |
24159686 |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 55 - 298
Target Start/End: Original strand, 19473754 - 19473998
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gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaa-attttaagagttttta |
153 |
Q |
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| T |
19473754 |
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| Q |
154 |
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253 |
Q |
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| T |
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19473953 |
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298 |
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| T |
19473954 |
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 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 70 - 298
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Q |
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| T |
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T |
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| Q |
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268 |
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| T |
14507818 |
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14507917 |
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298 |
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14507918 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 57 - 272
Target Start/End: Original strand, 2197867 - 2198082
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256 |
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| T |
2197967 |
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2198066 |
T |
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257 |
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272 |
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2198067 |
ttttctaaaatataaa |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 55 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 6975023 - 6974842
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 55 - 324
Target Start/End: Original strand, 16892986 - 16893249
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 |
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Q |
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324 |
Q |
| |
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gatgttttctaaaatat-aatattgacaaatacctatttattt-aataaaacaatcgttaatttataaattt |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 55 - 252
Target Start/End: Original strand, 1371493 - 1371691
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154 |
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252 |
Q |
| |
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|
| T |
1371593 |
ttacatataacaaagaatatttattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatatgattcttataaacaatgaaatgatgtttattcttataaaat |
1371691 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #39
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Target Start/End: Original strand, 1379241 - 1379439
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gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaa-attttaagagttttta |
153 |
Q |
| |
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| T |
1379241 |
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1379340 |
T |
 |
| Q |
154 |
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252 |
Q |
| |
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| T |
1379341 |
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1379439 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
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154 |
Q |
| |
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| T |
32871971 |
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32872070 |
T |
 |
| Q |
155 |
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254 |
Q |
| |
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|||| ||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||| || |||||||| || |||||||||||| ||||||| || || |||||| |||| |
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| T |
32872071 |
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32872169 |
T |
 |
| Q |
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269 |
Q |
| |
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||||||||||||||| |
|
|
| T |
32872170 |
tgttttctaaaatat |
32872184 |
T |
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Target: chr6; HSP #41
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268 |
Q |
| |
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|||||||||||| ||||| || || ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |
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|
| T |
14779100 |
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14779199 |
T |
 |
| Q |
269 |
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346 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
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taaatattgataaatagttatttatttcataaaaaatatcgttaatttata-aaattatgaaaaaagagtaccggtac |
14779276 |
T |
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Target: chr6; HSP #42
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Target Start/End: Original strand, 24025744 - 24025821
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359 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
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24025744 |
atacttttttatttcattaaagtgatcgttaatttataaattttgtgcaacaagagtaccggtacactcaaaattgtg |
24025821 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 55 - 343
Target Start/End: Original strand, 26315531 - 26315819
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55 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttat |
154 |
Q |
| |
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| T |
26315531 |
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26315627 |
T |
 |
| Q |
155 |
tactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggttt-----ttcttatga |
249 |
Q |
| |
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| T |
26315628 |
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26315727 |
T |
 |
| Q |
250 |
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343 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||| |||| | |||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||| |
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| T |
26315728 |
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26315819 |
T |
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59 |
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157 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| | | ||| ||||||||| |||| || |||||||| | |
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|
| T |
3954224 |
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3954126 |
T |
 |
| Q |
158 |
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253 |
Q |
| |
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| T |
3954125 |
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3954026 |
T |
 |
| Q |
254 |
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284 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||| |
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|
| T |
3954025 |
gtgttttctaaaatataaacattgacaaata |
3953995 |
T |
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Target: chr6; HSP #45
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aattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaa |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
23290748 |
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23290847 |
T |
 |
| Q |
194 |
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222 |
Q |
| |
|
|||| || ||||||||||| ||||||| |
|
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| T |
23290848 |
atgttaa-aatttaatatgattcttataa |
23290875 |
T |
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Target: chr6; HSP #46
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267 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| || || ||||||| ||| |||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
9686971 |
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9687070 |
T |
 |
| Q |
268 |
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319 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
9687071 |
ataaatattgataaatagttatttatttcataaaaaatgatcgttaatttata |
9687123 |
T |
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Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
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| Q |
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190 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||| | |||||| || |||||| ||||||| || |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| | |
|
|
| T |
15383492 |
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15383393 |
T |
 |
| Q |
191 |
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288 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
15383392 |
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15383293 |
T |
 |
| Q |
289 |
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348 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
15383292 |
tttattccataaaaataatagttaatttaaagatttt-tgaagtaggagtaccggtacac |
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T |
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Target: chr6; HSP #48
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269 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
2564924 |
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2565023 |
T |
 |
| Q |
270 |
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319 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
2565024 |
aaatattaacaaataactatttatttcataaaaaatgatcgttaatttata |
2565074 |
T |
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Target: chr6; HSP #49
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ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| |||| | ||| |||||||||| |||| || |||||| ||||||||| | || | |||||||||||||| | | |
|
|
| T |
6265231 |
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6265132 |
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 |
| Q |
192 |
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284 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
6265131 |
aaatgtaaaaaaaaaatagtatgatttttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgaaatgacattttctaaaatataaatatcaacaaata |
6265037 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #50
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59 |
aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattact |
158 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| | || || ||||||||| |||| | |||||||| || |
|
|
| T |
22084909 |
aaaaataattattttctatcattgacaattataataattaaatctcatttaccaaaagtgttgataaaataaaatttactttttttaaatttttattgct |
22085008 |
T |
 |
| Q |
159 |
cataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggttttt |
242 |
Q |
| |
|
||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
22085009 |
cataatgaaaaatattgattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatataattcatataaacaatgaaatgatgtttttt |
22085092 |
T |
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Target: chr6; HSP #51
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244 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
6302363 |
tttttattgctcataatgaagaatattgattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatataattcatataaacaatgaaatgatgtttttttttct |
6302462 |
T |
 |
| Q |
245 |
tatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
6302463 |
catgagatggtgttttctaaaatataaataatgacaaata |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #52
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attattttttatgacaaaatgtaaatttt-ttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaata |
274 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || ||||||| | ||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
4509633 |
attattttttatgataatatgtaaaaataattactataattcttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgaaataatgttctataaaatataaata |
4509732 |
T |
 |
| Q |
275 |
ttgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
|
|||| ||||| || |||||| ||| ||| |||||||||||||| | || |||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
4509733 |
ttga-aaatagctatttattacataaaaaatatcgttaatttata-aaattatgaagcaggagtaccggtacac |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 20469323 - 20469067
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ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||| ||||| | || || || |||||||||| |||| || |||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||| | | |
|
|
| T |
20469323 |
ataatcaaatcttatttatcaaaaacgtctacaaaataaaatttaatttttctgaatttttagtactcataatagagaattttgattattttttacaata |
20469224 |
T |
 |
| Q |
192 |
aaatgtaaatttt-ttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttt |
290 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||| | |||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||| || || |
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|
| T |
20469223 |
aaatgtaaaaaaaattagtatcacttttataaactataaaattatgttttttcttatgaaatgatattttctaaaatacaaatatcaataaatagctctt |
20469124 |
T |
 |
| Q |
291 |
tatttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
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tatttcataaaaatgatagttaatttatagatttt-tgaagtaagagtacccgtacac |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #54
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cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgttaat |
314 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||| || |||||| ||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
33574596 |
cttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaataatgttctacaaaatataaatattgaaaaatagctatttattacataaaaaatgatcgttaat |
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T |
 |
| Q |
315 |
ttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
|
||||| | || |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33574696 |
ttata-aaattatgaagcaagagtaccggtacac |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
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ttgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatgg-tttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataa |
271 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| || |||| || |||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
21970508 |
ttgattattttatatgataatatgttaaaaatttactatgatttttataaacaatgaa-tgatatatttttcttatgaaatgatattttgtaaaatataa |
21970606 |
T |
 |
| Q |
272 |
atattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
|
|| |||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||| |
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|
| T |
21970607 |
atgccgacaaataactatttatttcataaaattgatcgttaatttatagatttag-gaagtaagagtaccggtacac |
21970682 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 8310123 - 8309961
Alignment:
| Q |
123 |
cgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaatttt-ttaatatgatccttata |
221 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| ||||| || ||||||| |||||| | | ||| ||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
8310123 |
cgaaataaaatttatattttttgaatttttatcactcatgattaagaacattgattattttttacgataatatgtaaaaaaaattactatgattcttata |
8310024 |
T |
 |
| Q |
222 |
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284 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
8310023 |
aacaatgaaatgatgttttttcttacgaaatgatattctataaaatataaatattgaaaaata |
8309961 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 148 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 11763405 - 11763204
Alignment:
| Q |
148 |
tttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaatttt-ttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttctta |
246 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| | ||| ||| |||||||||||||| || ||||||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
11763405 |
tttttatcactcataatagagaacattcattattttttatgataatatgtaaaaaaaattactataattcttataaacaatgaaatgatgttttttctta |
11763306 |
T |
 |
| Q |
247 |
tgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggta |
345 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| | ||||||||||||||||| | || || |||||| ||| ||| |||||||||||||||| | || |||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
11763305 |
tgaaataatgttctataaaatataaatattgaacagtagctatttattacataaaaaatgatcgttaatttata-aaattatgaagcaggagtaccggta |
11763207 |
T |
 |
| Q |
346 |
cac |
348 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
11763206 |
cac |
11763204 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 216 - 348
Target Start/End: Original strand, 4576628 - 4576760
Alignment:
| Q |
216 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttca-ttaaagtgatcgttaat |
314 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| | ||||||||| |
|
|
| T |
4576628 |
cttataaataatgaactgatgttttttcttatgaaatgatgttctataaaatataaatattgataaatagttatttatttcacaaaaaataatcgttaat |
4576727 |
T |
 |
| Q |
315 |
ttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
|
||||| | || ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
4576728 |
ttata-aaattatgaaaaaagagtaccggtacac |
4576760 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 216 - 284
Target Start/End: Original strand, 23291152 - 23291220
Alignment:
| Q |
216 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
23291152 |
cttataaacaatgaaattatgttttttcttatgaaattatgttttctaaaacataaacattgacaaata |
23291220 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 209 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 29023788 - 29023650
Alignment:
| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatgg-tttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgat |
307 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
29023788 |
tatgattcttataaacaatgaa-tgatgcatttttcttctgaaatcatattttccaaaatataaatgccgacaaataactatttatttcataaaattgat |
29023690 |
T |
 |
| Q |
308 |
cgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
|
||||| |||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29023689 |
cgttagtttataga-tttatgaagcaagagtaccggtacac |
29023650 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 209 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 3141210 - 3141135
Alignment:
| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3141210 |
tatgattcttataaacaatctaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaata |
3141135 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 319
Target Start/End: Original strand, 23068590 - 23068692
Alignment:
| Q |
216 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatt |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||| ||||| || |||||| || ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
23068590 |
cttataaacaacgaaatgatgttttttcttatgaaataatgttatataaaatataaattttga-aaatagctatttattatataaaaatgatcgttaatt |
23068688 |
T |
 |
| Q |
316 |
tata |
319 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
23068689 |
tata |
23068692 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 216 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 8549725 - 8549594
Alignment:
| Q |
216 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgttaat |
314 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| | || |||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
8549725 |
cttataaacaataaactgatgttttttcttgtgaaatgatgttctataaaatataaatattgataaa-agctatttatttcataaaaaatgatcgttaat |
8549627 |
T |
 |
| Q |
315 |
ttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
|
||||| | || ||||| ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
8549626 |
ttata-aaattatgaaaaaagagtatcggtacac |
8549594 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 219 - 319
Target Start/End: Original strand, 26958637 - 26958738
Alignment:
| Q |
219 |
ataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgttaattta |
317 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
26958637 |
ataatcaatgagatgatcttttttcttatgaaatgatgttctataaaatataaatattgacaaatagctatttattacataaaaaatgatcattaattta |
26958736 |
T |
 |
| Q |
318 |
ta |
319 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
26958737 |
ta |
26958738 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 347
Target Start/End: Original strand, 6093895 - 6094025
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| Q |
216 |
cttataaacaatgaaatgatgg-tttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaat |
314 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| || |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||| ||| ||||||||| | |
|
|
| T |
6093895 |
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6093993 |
T |
 |
| Q |
315 |
ttatatattttgtgaaacaagagtaccggtaca |
347 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
6093994 |
ttatagattta-tgaaacaagagtaccgataca |
6094025 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 151 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 32834003 - 32833883
Alignment:
| Q |
151 |
ttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattt-tttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatga |
249 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | |||| |||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| | |
|
|
| T |
32834003 |
ttattactcataatagagaattttgattattttttacaataaaatgtaaaaaaatttagtatgatttttataaaaaatgaaatgatgttttttcttataa |
32833904 |
T |
 |
| Q |
250 |
aatgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
32833903 |
aatgatattttctaaaatata |
32833883 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 18667852 - 18667718
Alignment:
| Q |
216 |
cttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatatt---gacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgtt |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
18667852 |
cttataaacaatgaa-tgatgtgttttttttataaaatgatattttctaaaatataaatgttgccgataaataactatttatctcataaaattgatcgtt |
18667754 |
T |
 |
| Q |
312 |
aatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| | ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
18667753 |
aatttatagatttag-gaattaagagtaccggtacac |
18667718 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 272
Target Start/End: Original strand, 32715797 - 32715903
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| Q |
167 |
tgaatattgattattttttatgacaaaatgt-aaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaa |
265 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
32715797 |
tgaatattgattatttttttggataaaatgttaaaaaaattagtatgattcttataaatgatgaaatgatgttttttcttatgaaatgatattttttaaa |
32715896 |
T |
 |
| Q |
266 |
atataaa |
272 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
32715897 |
atataaa |
32715903 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 148 - 349
Target Start/End: Original strand, 5078323 - 5078523
Alignment:
| Q |
148 |
tttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttat |
247 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
5078323 |
tttttaatacccataatagtgaatattgattatttttttggataaaatgttaaaaaattagtatgattcttataaaggatgaaatggcgttttttcttat |
5078422 |
T |
 |
| Q |
248 |
gaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtaca |
347 |
Q |
| |
|
|||| || |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||| || ||| |||||| ||| |||| || ||| ||||| | | ||||||||||| |
|
|
| T |
5078423 |
aaaataatattttctaaaatataaaagttgataaatatctctttattacagaaaaatgatcgataacttattta-tttatgaaataggtgtaccggtaca |
5078521 |
T |
 |
| Q |
348 |
ct |
349 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
5078522 |
ct |
5078523 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 285
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatac |
285 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
9661995 |
tatgattcttataaacatt-aaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgataaatac |
9662070 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 284
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| Q |
216 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23416741 |
cttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctat-aaatataaatattgacaaata |
23416808 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #72
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgat |
307 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
31644579 |
tatgattcttataaataatgaa-tgatacgtttttcttctgaaatcatattttctaaaatataaatgccgacaaataactatttatttcataaaattgat |
31644481 |
T |
 |
| Q |
308 |
cgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
|
|||| |||||| | ||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
31644480 |
tgttagtttataga-tttatgaagcaagagtaccgatacac |
31644441 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #73
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55 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaa-gtaaaatttaaattttaagagttttta |
153 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||||||||||| | || || ||| ||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||| | |||| || ||||| |
|
|
| T |
34285116 |
gaagaaaaaaaaccattttctatcattaaaaattataatacttaaattctatttaccaaaagcatcgataaatgtaaaattgactttttttgaactttta |
34285215 |
T |
 |
| Q |
154 |
ttactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatga |
234 |
Q |
| |
|
||| |||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
34285216 |
ttattcataagaaataatatttattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatatgattcttataaatattgaaatga |
34285296 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #74
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33574403 |
tatgattcttataaaaaattaaacgatattttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaata |
33574328 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #75
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaa |
272 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
33610870 |
tatgattcttaaaaagaatgaaatgatgttttttcttatgaaataatattttctaaaatataaa |
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T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatc |
308 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||| ||| ||| ||||| |
|
|
| T |
22734939 |
tatgattcttataaaggatgaaatgacgttttttcttataaaataatattttctaaaatataaaagttgataaatatctctttattacataaaaatgatc |
22735038 |
T |
 |
| Q |
309 |
gttaatttat |
318 |
Q |
| |
|
| ||| |||| |
|
|
| T |
22735039 |
gataacttat |
22735048 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #77
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Target Start/End: Original strand, 22755486 - 22755563
Alignment:
| Q |
217 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatt |
294 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||| | ||||| ||||||||| ||||||| || |||||| |
|
|
| T |
22755486 |
ttataaacaataaaatgatgttttttcttataaaataatgttctataaaacataaatattaacaaatagctatttatt |
22755563 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 270
Target Start/End: Original strand, 24213156 - 24213209
Alignment:
| Q |
217 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
24213156 |
ttataaaaaatgaaatgatgttttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
24213209 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 26358841 - 26358661
Alignment:
| Q |
92 |
ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaca |
191 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||||| | || ||| | |||||||| | |||| || || ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| | | |
|
|
| T |
26358841 |
ataactaaatcttatttaccaaaaacgtcaacgcaataaaatttgatttttctgaattcttattactcataatagagaattttgattattttttacaata |
26358742 |
T |
 |
| Q |
192 |
aaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggttttt--cttatgaaatgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| | ||| ||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
26358741 |
aaatgtaaaaaaattagtatgatttttataaaaaatgaaatgatgtttttttccatataaaatgatattttttaaaatata |
26358661 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 318
Target Start/End: Original strand, 31394426 - 31394535
Alignment:
| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatc |
308 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||| |||| || |||| ||||||||||| |||| ||||| || |||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
31394426 |
tatgattcttataaaggatgaaatgacgttttttcttataaaataatattttttaaaatataaaagttgataaatatctctttattacattaaaatgatc |
31394525 |
T |
 |
| Q |
309 |
gttaatttat |
318 |
Q |
| |
|
| ||| |||| |
|
|
| T |
31394526 |
gataacttat |
31394535 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 97 - 270
Target Start/End: Original strand, 1096337 - 1096514
Alignment:
| Q |
97 |
taaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatg |
196 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| | || ||| | |||||||||| |||| || || ||||||||||||| | |||| |||| ||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
1096337 |
taaatcttatttaccaaaaacgtcaacgcaataaaatttaatttttctgaattcttattactcataatagagaattttgagtattttttacaataaaatg |
1096436 |
T |
 |
| Q |
197 |
taaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatg----gtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
1096437 |
taaaaaaattagtatgatttttataaaaaatgaaatgatgttttttttttcatataaaatgatattttctaaaatata |
1096514 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 209 - 284
Target Start/End: Original strand, 1245055 - 1245131
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttt-tcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||| | | ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
1245055 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgtttttttcttatgaaatgttgttctatgaaatataaatattgataaata |
1245131 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 217 - 293
Target Start/End: Original strand, 17010607 - 17010683
Alignment:
| Q |
217 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttat |
293 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |
|
|
| T |
17010607 |
ttataaacaatgaaatgacgttttttcttataaaattacattttctaaaatataaatatcaacaaataactctttat |
17010683 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 96 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 30020642 - 30020418
Alignment:
| Q |
96 |
ttaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaat |
195 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||| | |||||||| ||||| |||| |||| || |||||| ||||||||| | |||| |||||||| ||||| || ||||| |
|
|
| T |
30020642 |
ttaaatcttatttatcaaaaacgtcgacgaaataaaaattaatttttctgaatttttagtactcataatagagaattttgattat-ttttacgataaaat |
30020544 |
T |
 |
| Q |
196 |
gt----aaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaataccttttt |
291 |
Q |
| |
|
|| ||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |
|
|
| T |
30020543 |
gtaaaaaaaaaaattagtatgaattttataaaaaataaaatgatattttttcttatgaaataacattttctaaaatataaatatcaacaaatagttcttt |
30020444 |
T |
 |
| Q |
292 |
atttcattaaagtgatcgttaattta |
317 |
Q |
| |
|
||||||| ||| | || ||||||||| |
|
|
| T |
30020443 |
atttcataaaaataatagttaattta |
30020418 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 238 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 32430321 - 32430241
Alignment:
| Q |
238 |
tttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttat |
318 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||||||||| ||| | || |||||||||| |
|
|
| T |
32430321 |
tttttcttatgaaatgatattttctaaaatacaaaactcgacaaataacttattatttcataaaaataattgttaatttat |
32430241 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 8376160 - 8376081
Alignment:
| Q |
238 |
tttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaattta |
317 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||| | || ||||||||| |
|
|
| T |
8376160 |
tttttcttatgaaatgacatcttctaaaatataaatatcaacaaatagctttttattccataaaaataatagttaattta |
8376081 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 229942 - 229865
Alignment:
| Q |
246 |
atgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattt |
324 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
229942 |
atgaaatggtgttttctaaaatataaataatgacaaataacaacttatttca-taaaatgatcattaatttataaattt |
229865 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 200
Target Start/End: Original strand, 24215167 - 24215244
Alignment:
| Q |
123 |
cgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
200 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| ||||| || |||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24215167 |
cgaaataaaatataatttttatgaatttttattactcataatagaaaatatttactattttttatgacaaaatgtaaa |
24215244 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 243056 - 242980
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggttttt-cttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
243056 |
tatgattcttataaacagtaaaatgatatttttttcttatgaaatgttgttatgtaaaatataagtattgacaaata |
242980 |
T |
 |
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Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 184
Target Start/End: Original strand, 17010479 - 17010571
Alignment:
| Q |
92 |
ataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttt |
184 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| | |||| ||| |||||||||| |||| || ||||| ||||||||| | |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
17010479 |
ataattaaatcttatttaccaaaaacgtcgaagaaataaaatttaatttttctgaattttttgtactcataatagagaattttgattattttt |
17010571 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 257 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 4979220 - 4979153
Alignment:
| Q |
257 |
ttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattt |
324 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
4979220 |
ttttctaaaatataaataccgataaataactatttatttcataaaattgatcattaatttataaattt |
4979153 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 270
Target Start/End: Original strand, 6848757 - 6848806
Alignment:
| Q |
220 |
taaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatata |
270 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
6848757 |
taaaaaatgaaatgatg-tttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
6848806 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 8401579 - 8401521
Alignment:
| Q |
217 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatat |
275 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
8401579 |
ttataaaaaatgaaataatattttttcttataaaatgatattttctaaaatatatatat |
8401521 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 319
Target Start/End: Original strand, 18772133 - 18772207
Alignment:
| Q |
246 |
atgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgttaatttata |
319 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
18772133 |
atgaaatgatgttctataaaatataaatattaacaaatagttatttctttcataaaaaatgatcgttaatttata |
18772207 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 263 - 348
Target Start/End: Original strand, 33574821 - 33574906
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| Q |
263 |
aaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
348 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||| || |||||| ||| ||| |||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33574821 |
aaaatataaatattgaaaaatagctatttattacataaaaaatgatcgttaatttata-aaattatgaagcaagagtaccggtacac |
33574906 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 319
Target Start/End: Original strand, 17545782 - 17545951
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| Q |
152 |
tattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaa-tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaa |
250 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||| |||||||||||||| | |||||||| | |||| |||||| || |||| ||| |||||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
17545782 |
tattactcataatagagaattttgattattttttacaataaaatgtagaaaaattaagtatgatttttctaaaaaataaaatgatgttttttcttataaa |
17545881 |
T |
 |
| Q |
251 |
atgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgttaatttata |
319 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||||||| || | ||||| |||| ||| |||||| ||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
17545882 |
ataatattttctaaaatatatatgtcaacaaacacctatttctttcataaaaaatgatagttaatttata |
17545951 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 272
Target Start/End: Original strand, 17697949 - 17698006
Alignment:
| Q |
216 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaat-gatgttttctaaaatataaa |
272 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
17697949 |
cttataaacaatgaaatgatgttttttcttatcaaataaatattttttaaaatataaa |
17698006 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 197
Target Start/End: Original strand, 28742595 - 28742644
Alignment:
| Q |
148 |
tttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgt |
197 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||| |
|
|
| T |
28742595 |
ttttgattactcataatagtgaatattgattattttttaagataaaatgt |
28742644 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 184
Target Start/End: Original strand, 6949362 - 6949418
Alignment:
| Q |
128 |
taaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttt |
184 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
6949362 |
taaaatttaaattttctgaatttttactactcataattattaatattgattattttt |
6949418 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0005 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:
Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 291652 - 292011
Alignment:
| Q |
1 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
291652 |
tgggtgtatcggtacaccaaatcgtaaaattaataataaataaataatttttttgaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
291751 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
200 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
291752 |
ttttatataccaaaaatttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcgtaacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
291851 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
300 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
291852 |
ttttgtaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaattatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
291951 |
T |
 |
| Q |
301 |
aagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
360 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
291952 |
aagtgatctttaatttatatattttgtgaaacaagagtactgatacactcaaaattgtga |
292011 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 104 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 271414 - 271236
Alignment:
| Q |
104 |
tatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattt |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
271414 |
tatttaccaaaagcgtcgacgaaataaaataaaaaaaattagaatttttattactcataacaaaaaatattgattattttttatgagaaaatgtttaaaa |
271315 |
T |
 |
| Q |
204 |
tttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttct-tatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaa |
281 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
271314 |
tttaatatgattcttataaataatgaaatgaagttttttttagatgaaatggtgttttctaaaatataaatattgacaa |
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T |
 |
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Target: scaffold0005; HSP #3
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Target Start/End: Complemental strand, 271083 - 271024
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265 |
aatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattt |
324 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
271083 |
aatataaatattgacaaataactctttatttcataaaaatgatcgttaatttataaattt |
271024 |
T |
 |
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Target Start/End: Original strand, 13632 - 13987
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tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaatcagttgtttttttgaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
13731 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaa |
200 |
Q |
| |
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|
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| T |
13732 |
ttttatttaccaaaagcttcgatgaaataaattttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgaaaaaatgtaat |
13831 |
T |
 |
| Q |
201 |
ttttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatta |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
13832 |
ttttttaatataatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttataaaatgatattttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttgatta |
13931 |
T |
 |
| Q |
301 |
aagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaatt |
356 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13932 |
aagtaatcgttaattcataaattttgtgcaacaaaagtaccggtacactcaaaatt |
13987 |
T |
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Target: scaffold0239 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 1)
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Target: scaffold0239; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 15409 - 15769
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tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
100 |
Q |
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|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15409 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttatttttttgaaaaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
15508 |
T |
 |
| Q |
101 |
tttt-atttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaa |
199 |
Q |
| |
|
|||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
15509 |
tttttatataccaaaagcttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatataa |
15608 |
T |
 |
| Q |
200 |
attttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatt |
299 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
15609 |
attttgtaatatgattcttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaacgatgttttctatgatataaatattgacaaatatctttttatttcatt |
15708 |
T |
 |
| Q |
300 |
aaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
360 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15709 |
aaagtgatctttaatttctatattttatgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
15769 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0349 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 2)
Name: scaffold0349
Description:
Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 4 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 8801 - 8493
Alignment:
| Q |
4 |
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103 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8801 |
gtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaatcagttgtttttttgaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattt |
8702 |
T |
 |
| Q |
104 |
tatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattt |
203 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
8701 |
tatttaccaaaagcttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgataaaatgtaatttt |
8602 |
T |
 |
| Q |
204 |
tttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaag |
303 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8601 |
tttaatataatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaag |
8502 |
T |
 |
| Q |
304 |
tgatcgtta |
312 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
8501 |
tgatcgtta |
8493 |
T |
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Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 259 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 15141 - 15088
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259 |
ttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgtta |
312 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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ttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgtta |
15088 |
T |
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Target: scaffold0194 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0194
Description:
Target: scaffold0194; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
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Target Start/End: Complemental strand, 17869 - 17516
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3 |
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102 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17869 |
ggtgtattggtacaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgatgaaaa-taattattttctatcattgacaactaagataattaaatt |
17771 |
T |
 |
| Q |
103 |
ttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaatt |
202 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17770 |
ttatataccaaaagtttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattattcataacaatgaatattgattatta---atgacaaaatgtaaatt |
17674 |
T |
 |
| Q |
203 |
ttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaa |
302 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17673 |
ttgtaatatgatccttataaacaatgaaatgatggttttttttatgaaatgatgttttctaaaatataaatatcgacaaatacctttttatttcattaaa |
17574 |
T |
 |
| Q |
303 |
gtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
360 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||| |
|
|
| T |
17573 |
gtaatctttaatttatatattttgtgaaacaagaataccgatcccctcaaaattgtga |
17516 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0493 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0493
Description:
Target: scaffold0493; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 1410 - 1775
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1 |
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98 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1410 |
tgggtgtattggtacaccaagtcataaaaattaaataataaatgagttgttttttt-aagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataatta |
1508 |
T |
 |
| Q |
99 |
aattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaatttt-aagagttttt-attactcataacaatgaatattgatta--ttttttatgacaaaa |
194 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
1509 |
aattttatataccaaaagtttcgacgaaataaaattttaatttttaagaattttttattactcataacaatgaatattgatttatttttttatgacaaaa |
1608 |
T |
 |
| Q |
195 |
tgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttctt-atgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttat |
293 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1609 |
tgtaaattttgtaatatgatccttataaacaatgaaatgatgatttttttttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttat |
1708 |
T |
 |
| Q |
294 |
ttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
360 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1709 |
ttcattaaagtgatctttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga |
1775 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0072 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:
Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 58 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 47896 - 47606
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| Q |
58 |
gaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattac |
157 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||| |
|
|
| T |
47896 |
gaaaaataattattttttatcattgacaattataataatcaattcttatttaccaaaagcttcgacgaaataaaatttactttttttgaatttttattac |
47797 |
T |
 |
| Q |
158 |
tcataacaatg-aatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatg |
256 |
Q |
| |
|
|||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47796 |
tcataatattataatattgattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatatgaatcttataaacaatgaaatgatgttatttcttatgaaatgatg |
47697 |
T |
 |
| Q |
257 |
ttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacact |
349 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47696 |
ttttttaaaatataaatattgacaaatatatttttatttca-taaaacggccgttaatttata-attttatggaacaagagtaccggtacact |
47606 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0648 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0648
Description:
Target: scaffold0648; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
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Target Start/End: Original strand, 1366 - 1585
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aattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataac |
164 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||| || |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
1366 |
aattattttctatcattgacaattataataattaaatcttatttaccaaaagcgtcgatgaaataaaatttactttttttgaatttttattgctcataat |
1465 |
T |
 |
| Q |
165 |
aatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaa |
264 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
1466 |
gaagaatattgattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatataattcttataaacaatgaaattatgttttttcttatgatatgatgttttctaa |
1565 |
T |
 |
| Q |
265 |
aatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1566 |
aatataaatattgacaaata |
1585 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0271 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0271
Description:
Target: scaffold0271; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 65 - 284
Target Start/End: Original strand, 15746 - 15965
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| Q |
65 |
aattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactcataac |
164 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||| || |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
15746 |
aattattttctatcattgacaattataataattaaatcttatttaccaaaagcgtcgatgaaataaaatttactttttttgaatttttattgctcataat |
15845 |
T |
 |
| Q |
165 |
aatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaa |
264 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
15846 |
gaagaatattgattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatataattcttataaacaatgaaattatgttttttcttatgatatgatgttttctaa |
15945 |
T |
 |
| Q |
265 |
aatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15946 |
aatataaatattgacaaata |
15965 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1999 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold1999
Description:
Target: scaffold1999; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 1032 - 1174
Alignment:
| Q |
1 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1032 |
tgggtgtatcggtactccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaa |
1131 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaatttta |
143 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
1132 |
ttttatataccaaaagcttcgacgaaataaaacttaattttta |
1174 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0841 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0841
Description:
Target: scaffold0841; HSP #1
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Target Start/End: Complemental strand, 3378 - 3158
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55 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttat |
154 |
Q |
| |
|
||||||||| || | ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||| | ||||| | |
|
|
| T |
3378 |
gaagaaaaagaactgttttctatcattgacaattataataattaaatcgtatttaccaaaaacgtcgacgaaataaaatttatattttttaa-tttttgt |
3280 |
T |
 |
| Q |
155 |
tactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatga |
254 |
Q |
| |
|
||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
3279 |
tacatatgacaaagaatattgattattttttatgaaaaaatgttaaaaatttaatataattcttataaacaatgaaatgatgttttttcttataaaatga |
3180 |
T |
 |
| Q |
255 |
tgttttctaaaatataaatatt |
276 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3179 |
tgttttctaaaatataaatatt |
3158 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0045 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:
Target: scaffold0045; HSP #1
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Query Start/End: Original strand, 55 - 302
Target Start/End: Original strand, 38064 - 38312
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55 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaa-attttaagagttttta |
153 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||||||| |||| || ||||||| || ||| |||| |||| || ||||| |||||||| | ||||| || |||||| |
|
|
| T |
38064 |
gaagaaaacgaattgttttctatcatttacaattacaataattagatcttagttactgaaagtgtcaacgaaataaaattttacattttttgaattttta |
38163 |
T |
 |
| Q |
154 |
ttactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatg |
253 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |
|
|
| T |
38164 |
ttacatataacaaagaatatttattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatatgattcttataaacaatgaaatgatgtttattcttataaaatg |
38263 |
T |
 |
| Q |
254 |
atgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaa |
302 |
Q |
| |
|
|||| || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
38264 |
atgtcttataaaatataaatattgataaataactctttatttcattaaa |
38312 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0009 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:
Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 55 - 347
Target Start/End: Original strand, 214222 - 214513
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55 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaa-attttaagagttttta |
153 |
Q |
| |
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| T |
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253 |
Q |
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T |
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347 |
Q |
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| T |
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214513 |
T |
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Q |
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T |
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255 |
Q |
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| T |
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284 |
Q |
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T |
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Target: scaffold0325; HSP #1
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157 |
Q |
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T |
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| Q |
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256 |
Q |
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| T |
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Q |
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T |
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Target: scaffold0131; HSP #1
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Q |
| |
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284 |
Q |
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| ||||||||||||||||| ||||| |
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T |
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Q |
| |
|
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T |
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| Q |
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Q |
| |
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||||| |||| || || |||||||||||||||| |
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T |
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Q |
| |
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| T |
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 |
| Q |
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265 |
Q |
| |
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| T |
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| Q |
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272 |
Q |
| |
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262937 |
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T |
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Target: scaffold0667; HSP #1
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Q |
| |
|
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 |
| Q |
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319 |
Q |
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ttata |
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Target: scaffold0604; HSP #1
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Q |
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|
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|
| T |
2138 |
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2237 |
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| Q |
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289 |
Q |
| |
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| T |
2238 |
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2337 |
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348 |
Q |
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| T |
2338 |
ttattccgtaaaaataatagttaatttaaagatttt-tgaagtaggagtaccggtacac |
2395 |
T |
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Target: scaffold0113; HSP #1
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Q |
| |
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| T |
29364 |
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T |
 |
| Q |
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291 |
Q |
| |
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| T |
29464 |
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29563 |
T |
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Q |
| |
|
||| |
|
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| T |
29564 |
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29566 |
T |
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Target: scaffold0301 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
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Target: scaffold0301; HSP #1
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tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaataagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcatt |
81 |
Q |
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|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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21487 |
tgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattattttctatcatt |
21567 |
T |
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Target: scaffold0625; HSP #1
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Q |
| |
|
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|
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6551 |
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| Q |
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291 |
Q |
| |
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6452 |
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6353 |
T |
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294 |
Q |
| |
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||| |
|
|
| T |
6352 |
att |
6350 |
T |
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Target: scaffold0190; HSP #1
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Q |
| |
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| T |
6010 |
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| Q |
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265 |
Q |
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| T |
5910 |
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| Q |
266 |
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272 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
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5810 |
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T |
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Target: scaffold0721; HSP #1
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||| || |||| |
|
|
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T |
 |
| Q |
269 |
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295 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| || ||||||| |
|
|
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6670 |
T |
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Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |
|
|
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tatgattcttttaaacaatgaaatgatg-tttttcttatgaaataatggtttctaaaatataaatatcaacaaataactctttatttcat |
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T |
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Target: scaffold1319; HSP #1
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Q |
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|||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
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213 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttatttcttatgaattgttgttctataaaatataaatattgacaaata |
138 |
T |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
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Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
7440 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgtggttctataaaatataaatattaacaaata |
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T |
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Q |
| |
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|
|
| T |
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T |
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Q |
| |
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| T |
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tattttctatcatttataattataataattatattttatttttcaaaagtgtcggcaaagcaaaattcaaaattttttaatttttattactcataatagt |
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T |
 |
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gaatattgattattttttatgacaaaatg-taaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaa |
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Q |
| |
|
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|
| T |
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gaatattgattatttttt-caataaaatgttaaaaaatttggtataattcttataaaaaatgaaatgatgttttttcttatgggataatattttctaaaa |
70806 |
T |
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| Q |
267 |
tataaa |
272 |
Q |
| |
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|||||| |
|
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| T |
70805 |
tataaa |
70800 |
T |
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Target: scaffold0432 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
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Target: scaffold0432; HSP #1
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Target Start/End: Complemental strand, 3191 - 3123
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216 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaata |
284 |
Q |
| |
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|||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||| |
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| T |
3191 |
cttataaataatgaaattatgttttttcttatgagatgatgttctataaaatataaattttgacaaata |
3123 |
T |
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Target: scaffold0125 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
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Target: scaffold0125; HSP #1
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Query Start/End: Original strand, 209 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 32374 - 32306
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| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgaca |
280 |
Q |
| |
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| T |
32374 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttattatgaa---atgttttataaaatataaatattgaca |
32306 |
T |
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Target: scaffold0077 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
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Target: scaffold0077; HSP #1
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Query Start/End: Original strand, 152 - 319
Target Start/End: Original strand, 48188 - 48357
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152 |
tattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgta-aattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaa |
250 |
Q |
| |
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| T |
48188 |
tattactcataatagataattttgattattttttacaataaaatgtagaaaaatttagtatgatttttctaaaaaatgaaatgatgttttttcttataaa |
48287 |
T |
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| Q |
251 |
atgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat-taaagtgatcgttaatttata |
319 |
Q |
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| T |
48288 |
atgatattttctaaaatatatatgtcaacaaacacctatttctttcataaaaaatgatagttaatttata |
48357 |
T |
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Back To:
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Target: scaffold0394 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:
Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
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Target Start/End: Original strand, 3823 - 4036
Alignment:
| Q |
60 |
aaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaagtaaaatttaaattttaagagtttttattactc |
159 |
Q |
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| T |
3823 |
aaaaaaattattttctat-atttacaattataataattatattttatttatcaaaaatgtcggtgaaataaaatttaatttttattattttttgttacac |
3921 |
T |
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| Q |
160 |
ataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggttttt-cttatgaaatgatgtt |
258 |
Q |
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| T |
3922 |
agagtagagaatattaattattttttactgtaaaatgttaaaaaattaatatgattcttacaaacaatgaaatgattttttttccttatgaaatgatgtt |
4021 |
T |
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| Q |
259 |
ttctaaaatataaat |
273 |
Q |
| |
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| T |
4022 |
gcctaaaacataaat |
4036 |
T |
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Back To:
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Target: scaffold0174 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:
Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 324
Target Start/End: Original strand, 32794 - 32879
Alignment:
| Q |
239 |
ttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattt |
324 |
Q |
| |
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| T |
32794 |
tttttttatgaaatgatattttctaaaatataaatgccgccaaataactatttatctcataaaatagatcgttaatttatagattt |
32879 |
T |
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Target: scaffold0628 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:
Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 317
Target Start/End: Original strand, 6271 - 6380
Alignment:
| Q |
209 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaa-agtgat |
307 |
Q |
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| T |
6271 |
tatgattcttataaataatgaaatgatgtcttttatattgaaataaaattttctacattataaatggtgacaaatagctctttatttcttaaacagtgat |
6370 |
T |
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| Q |
308 |
cgttaattta |
317 |
Q |
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| T |
6371 |
cgttaattta |
6380 |
T |
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Target: scaffold0060 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:
Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 238 - 298
Target Start/End: Original strand, 46028 - 46088
Alignment:
| Q |
238 |
tttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcat |
298 |
Q |
| |
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| T |
46028 |
ttttacttatgaaatgatattttctaaaatatagataccgataaatagctctttatttcat |
46088 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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