View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6313_low_11 (Length: 214)

Name: NF6313_low_11
Description: NF6313
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6313_low_11
NF6313_low_11
[»] chr3 (48 HSPs)
chr3 (1-214)||(51158057-51158270)
chr3 (1-214)||(15859063-15859276)
chr3 (1-214)||(13838905-13839118)
chr3 (1-214)||(2049821-2050034)
chr3 (1-214)||(12030186-12030399)
chr3 (1-214)||(15936666-15936879)
chr3 (1-214)||(14842600-14842813)
chr3 (6-214)||(15614845-15615053)
chr3 (1-214)||(15938508-15938721)
chr3 (1-214)||(17912521-17912733)
chr3 (2-214)||(16821150-16821363)
chr3 (2-214)||(55316230-55316443)
chr3 (2-214)||(41270086-41270299)
chr3 (7-214)||(13975766-13975974)
chr3 (7-214)||(45860816-45861024)
chr3 (1-214)||(16744154-16744366)
chr3 (7-214)||(13954934-13955142)
chr3 (1-93)||(2449277-2449369)
chr3 (110-214)||(47984661-47984765)
chr3 (110-214)||(48003235-48003339)
chr3 (110-214)||(47993948-47994052)
chr3 (110-214)||(48012521-48012625)
chr3 (12-214)||(11986216-11986419)
chr3 (12-214)||(15468382-15468585)
chr3 (12-125)||(54651557-54651671)
chr3 (12-214)||(22275220-22275423)
chr3 (105-208)||(16880139-16880242)
chr3 (12-87)||(12902132-12902209)
chr3 (12-87)||(18911130-18911207)
chr3 (12-87)||(25058876-25058953)
chr3 (12-87)||(49232573-49232650)
chr3 (12-85)||(5228452-5228527)
chr3 (95-207)||(17100670-17100782)
chr3 (95-207)||(17101355-17101467)
chr3 (12-85)||(12264834-12264909)
chr3 (97-207)||(11329081-11329191)
chr3 (1-77)||(4145837-4145914)
chr3 (1-186)||(14814788-14814974)
chr3 (3-207)||(17139525-17139730)
chr3 (137-208)||(38811168-38811239)
chr3 (1-77)||(6228648-6228726)
chr3 (1-62)||(34560061-34560123)
chr3 (1-62)||(47784789-47784851)
chr3 (16-87)||(1467785-1467858)
chr3 (1-61)||(3576461-3576522)
chr3 (103-208)||(14059339-14059444)
chr3 (103-207)||(12560362-12560466)
chr3 (95-207)||(54424029-54424141)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (1-214)||(36952-37165)
[»] chr2 (36 HSPs)
chr2 (1-214)||(462749-462962)
chr2 (1-214)||(8891253-8891466)
chr2 (1-214)||(36982480-36982693)
chr2 (1-214)||(19794743-19794956)
chr2 (1-214)||(24341428-24341641)
chr2 (1-214)||(20627352-20627565)
chr2 (12-214)||(7507894-7508096)
chr2 (1-214)||(43642996-43643209)
chr2 (2-214)||(25265430-25265642)
chr2 (2-214)||(19886689-19886902)
chr2 (7-214)||(17396697-17396905)
chr2 (1-93)||(19689440-19689532)
chr2 (1-93)||(23820203-23820295)
chr2 (1-93)||(14906479-14906571)
chr2 (1-93)||(20015143-20015235)
chr2 (12-87)||(3798645-3798722)
chr2 (12-87)||(12635910-12635987)
chr2 (12-87)||(12728529-12728606)
chr2 (12-87)||(34824612-34824689)
chr2 (10-87)||(23778085-23778164)
chr2 (12-87)||(8943983-8944060)
chr2 (12-87)||(12641684-12641761)
chr2 (12-87)||(16935730-16935807)
chr2 (12-87)||(17006390-17006467)
chr2 (12-87)||(42178011-42178088)
chr2 (2-198)||(68018-68215)
chr2 (1-59)||(19669132-19669191)
chr2 (1-62)||(24884848-24884910)
chr2 (16-87)||(11231384-11231457)
chr2 (143-208)||(19666544-19666609)
chr2 (143-208)||(19669275-19669340)
chr2 (16-87)||(22513231-22513304)
chr2 (16-87)||(24685827-24685900)
chr2 (16-87)||(28775853-28775926)
chr2 (1-60)||(19660044-19660104)
chr2 (95-178)||(24571409-24571493)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (1-214)||(19217-19430)
scaffold0195 (1-214)||(21301-21514)
[»] chr7 (54 HSPs)
chr7 (1-214)||(11580778-11580991)
chr7 (2-214)||(47481071-47481283)
chr7 (1-214)||(13037053-13037266)
chr7 (1-214)||(16211777-16211990)
chr7 (1-214)||(18253874-18254087)
chr7 (1-214)||(3059977-3060190)
chr7 (5-214)||(36052678-36052884)
chr7 (2-214)||(16478990-16479202)
chr7 (2-214)||(13321025-13321239)
chr7 (2-214)||(2437468-2437681)
chr7 (2-214)||(10989421-10989633)
chr7 (2-214)||(13572687-13572900)
chr7 (2-214)||(13911052-13911266)
chr7 (1-214)||(7293028-7293240)
chr7 (1-214)||(25292377-25292590)
chr7 (2-214)||(296006-296216)
chr7 (1-93)||(11516359-11516451)
chr7 (1-93)||(15441603-15441695)
chr7 (1-93)||(30262168-30262260)
chr7 (12-87)||(13758507-13758584)
chr7 (12-87)||(15927705-15927782)
chr7 (12-87)||(15950833-15950910)
chr7 (12-87)||(18980063-18980140)
chr7 (1-62)||(16914951-16915013)
chr7 (12-62)||(48622708-48622758)
chr7 (95-207)||(13274804-13274917)
chr7 (12-87)||(14250940-14251017)
chr7 (12-87)||(15760156-15760233)
chr7 (95-207)||(16570123-16570236)
chr7 (95-207)||(16595426-16595539)
chr7 (1-62)||(9611470-9611532)
chr7 (1-62)||(9839041-9839103)
chr7 (1-77)||(14271922-14272000)
chr7 (1-77)||(14935506-14935584)
chr7 (1-77)||(15358943-15359021)
chr7 (1-77)||(15363099-15363177)
chr7 (97-207)||(26070384-26070494)
chr7 (97-207)||(26094171-26094281)
chr7 (1-77)||(28722256-28722334)
chr7 (1-62)||(48356806-48356868)
chr7 (86-207)||(3049600-3049721)
chr7 (16-87)||(7822865-7822938)
chr7 (16-87)||(7830176-7830249)
chr7 (2-62)||(13377691-13377752)
chr7 (16-87)||(27101683-27101756)
chr7 (16-87)||(27109031-27109104)
chr7 (16-87)||(27176570-27176643)
chr7 (16-87)||(38783775-38783848)
chr7 (95-207)||(49047791-49047904)
chr7 (95-207)||(3895042-3895154)
chr7 (105-201)||(13377552-13377648)
chr7 (18-77)||(13448868-13448928)
chr7 (137-201)||(48356667-48356731)
chr7 (3-62)||(49047699-49047759)
[»] chr5 (42 HSPs)
chr5 (1-214)||(23506976-23507189)
chr5 (1-214)||(27182586-27182799)
chr5 (1-214)||(18531106-18531319)
chr5 (1-214)||(22053872-22054085)
chr5 (2-214)||(34939289-34939500)
chr5 (2-176)||(29188312-29188486)
chr5 (2-214)||(43443423-43443636)
chr5 (2-214)||(18778020-18778233)
chr5 (2-214)||(22366509-22366722)
chr5 (2-214)||(25426639-25426852)
chr5 (2-214)||(12385-12598)
chr5 (2-214)||(27009852-27010065)
chr5 (2-214)||(4200013-4200226)
chr5 (2-214)||(19499910-19500123)
chr5 (2-214)||(21073623-21073836)
chr5 (1-93)||(20623101-20623193)
chr5 (1-93)||(21233567-21233659)
chr5 (1-93)||(25900445-25900537)
chr5 (1-93)||(16536329-16536421)
chr5 (1-93)||(37052876-37052968)
chr5 (15-214)||(32950704-32950905)
chr5 (12-214)||(17471630-17471833)
chr5 (12-87)||(10778012-10778089)
chr5 (12-87)||(23514698-23514775)
chr5 (12-178)||(11212107-11212274)
chr5 (1-201)||(23981539-23981740)
chr5 (97-208)||(432479-432590)
chr5 (103-201)||(23493942-23494040)
chr5 (180-214)||(29190481-29190515)
chr5 (12-87)||(1219562-1219639)
chr5 (97-208)||(7728436-7728547)
chr5 (12-85)||(35791140-35791215)
chr5 (1-62)||(19862371-19862433)
chr5 (1-62)||(21310732-21310794)
chr5 (2-62)||(5450867-5450928)
chr5 (12-87)||(7425461-7425538)
chr5 (16-87)||(21932427-21932500)
chr5 (16-87)||(21938597-21938670)
chr5 (16-87)||(35582173-35582246)
chr5 (16-87)||(36989816-36989889)
chr5 (1-60)||(22885806-22885866)
chr5 (1-60)||(29918129-29918189)
[»] chr4 (37 HSPs)
chr4 (1-214)||(13246441-13246654)
chr4 (1-214)||(54118283-54118496)
chr4 (1-214)||(15675128-15675341)
chr4 (1-214)||(31115640-31115853)
chr4 (2-214)||(10644230-10644443)
chr4 (1-157)||(10104289-10104445)
chr4 (1-214)||(26680212-26680424)
chr4 (1-131)||(121983-122113)
chr4 (2-214)||(47357665-47357878)
chr4 (1-214)||(13048260-13048474)
chr4 (126-214)||(111406-111494)
chr4 (2-157)||(40885594-40885749)
chr4 (1-93)||(10488694-10488786)
chr4 (1-93)||(16327965-16328057)
chr4 (12-208)||(8374525-8374722)
chr4 (2-214)||(7850010-7850223)
chr4 (14-208)||(17145701-17145896)
chr4 (2-201)||(15044851-15045051)
chr4 (97-208)||(41166066-41166177)
chr4 (12-87)||(7132107-7132184)
chr4 (12-87)||(18169107-18169184)
chr4 (12-87)||(19020623-19020700)
chr4 (1-201)||(18238180-18238381)
chr4 (12-87)||(20000860-20000937)
chr4 (12-87)||(22738406-22738483)
chr4 (103-207)||(13809636-13809740)
chr4 (12-178)||(18248265-18248432)
chr4 (180-214)||(10104449-10104483)
chr4 (1-35)||(33240890-33240924)
chr4 (2-62)||(15109373-15109434)
chr4 (12-87)||(15287287-15287364)
chr4 (143-208)||(19821942-19822007)
chr4 (95-207)||(12837318-12837430)
chr4 (105-201)||(15109477-15109573)
chr4 (95-207)||(30232614-30232726)
chr4 (1-60)||(38764873-38764933)
chr4 (97-201)||(52265628-52265732)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (1-214)||(48609-48822)
scaffold0023 (2-214)||(36104-36317)
scaffold0023 (12-87)||(154049-154126)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (1-214)||(123203-123416)
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (1-214)||(24928830-24929043)
chr8 (1-214)||(16193755-16193968)
chr8 (5-214)||(43373511-43373720)
chr8 (2-214)||(24548993-24549205)
chr8 (2-214)||(6774286-6774498)
chr8 (2-214)||(17345581-17345792)
chr8 (1-214)||(16405014-16405224)
chr8 (2-213)||(21844600-21844812)
chr8 (2-213)||(21851993-21852205)
chr8 (2-213)||(30120734-30120946)
chr8 (1-214)||(22907253-22907465)
chr8 (37-214)||(222754-222932)
chr8 (37-214)||(736377-736555)
chr8 (37-214)||(860272-860450)
chr8 (2-214)||(16674420-16674633)
chr8 (1-93)||(5238219-5238311)
chr8 (1-93)||(24661287-24661379)
chr8 (1-93)||(43685678-43685770)
chr8 (37-93)||(691909-691965)
chr8 (97-208)||(23837214-23837325)
chr8 (12-87)||(13720970-13721047)
chr8 (12-87)||(16873093-16873170)
chr8 (12-87)||(22006300-22006377)
chr8 (12-85)||(16195370-16195445)
chr8 (1-62)||(26011656-26011718)
chr8 (143-208)||(23226242-23226307)
chr8 (24-201)||(45558984-45559161)
chr8 (97-208)||(22735958-22736069)
chr8 (12-87)||(13662307-13662384)
chr8 (1-62)||(15933460-15933522)
chr8 (18-201)||(18261512-18261695)
chr8 (16-87)||(271406-271479)
chr8 (16-87)||(644441-644514)
chr8 (16-87)||(830176-830249)
chr8 (16-87)||(22088840-22088913)
chr8 (137-201)||(5854637-5854701)
chr8 (137-201)||(15933321-15933385)
chr8 (103-207)||(39446892-39446996)
[»] chr6 (35 HSPs)
chr6 (2-214)||(14626158-14626370)
chr6 (1-214)||(23153458-23153671)
chr6 (5-214)||(1650136-1650345)
chr6 (2-214)||(1657788-1657999)
chr6 (5-214)||(35009482-35009691)
chr6 (2-214)||(15862484-15862694)
chr6 (2-214)||(25175574-25175787)
chr6 (2-214)||(27654011-27654224)
chr6 (2-214)||(16825780-16825995)
chr6 (10-157)||(29665941-29666089)
chr6 (43-214)||(27740849-27741021)
chr6 (2-47)||(27751603-27751648)
chr6 (12-87)||(1556142-1556219)
chr6 (12-87)||(16232029-16232106)
chr6 (12-87)||(18086865-18086942)
chr6 (12-87)||(23977906-23977983)
chr6 (97-208)||(18381803-18381914)
chr6 (1-60)||(29605614-29605673)
chr6 (1-62)||(18629631-18629693)
chr6 (12-87)||(13620836-13620913)
chr6 (1-77)||(17083221-17083298)
chr6 (12-87)||(22225780-22225857)
chr6 (97-208)||(18398954-18399065)
chr6 (1-208)||(33324709-33324916)
chr6 (1-208)||(35136036-35136243)
chr6 (1-62)||(16887815-16887877)
chr6 (1-62)||(25651399-25651461)
chr6 (16-87)||(10488836-10488909)
chr6 (16-87)||(16376419-16376492)
chr6 (16-87)||(16383743-16383816)
chr6 (16-87)||(16556185-16556258)
chr6 (16-87)||(16632741-16632814)
chr6 (143-208)||(25919629-25919694)
chr6 (97-201)||(22361885-22361989)
chr6 (137-201)||(25651260-25651324)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (1-214)||(5100-5313)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (1-214)||(148732-148945)
scaffold0025 (1-214)||(8860-9073)
scaffold0025 (1-62)||(53508-53570)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (1-214)||(272036-272249)
scaffold0009 (103-201)||(69480-69578)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (1-214)||(171916-172129)
scaffold0001 (1-214)||(177619-177832)
[»] chr1 (23 HSPs)
chr1 (1-213)||(20893665-20893877)
chr1 (1-214)||(20445690-20445903)
chr1 (1-214)||(20531455-20531668)
chr1 (1-214)||(20931356-20931569)
chr1 (1-214)||(37844489-37844703)
chr1 (2-214)||(2116265-2116478)
chr1 (1-214)||(20913048-20913254)
chr1 (1-214)||(41394233-41394446)
chr1 (12-214)||(22227820-22228022)
chr1 (12-214)||(22232517-22232719)
chr1 (5-164)||(45051484-45051643)
chr1 (2-214)||(18601146-18601359)
chr1 (2-214)||(5072416-5072629)
chr1 (1-93)||(51452624-51452716)
chr1 (12-87)||(17148704-17148781)
chr1 (12-87)||(18059800-18059877)
chr1 (103-201)||(37233986-37234084)
chr1 (180-214)||(45051453-45051487)
chr1 (16-87)||(17004775-17004848)
chr1 (16-87)||(38055137-38055210)
chr1 (12-87)||(46523526-46523603)
chr1 (4-86)||(22143387-22143471)
chr1 (95-207)||(27329873-27329985)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (1-214)||(1135-1348)
scaffold0266 (1-210)||(3621-3830)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (1-210)||(26454-26663)
scaffold0162 (2-214)||(8220-8429)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (1-214)||(247481-247694)
scaffold0012 (12-86)||(34200-34276)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (2-214)||(9377-9589)
scaffold0215 (2-214)||(16275-16487)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (1-214)||(41740-41953)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (1-214)||(48198-48411)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (1-212)||(573-784)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (1-214)||(107758-107971)
scaffold0026 (19-214)||(64573-64769)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (2-214)||(8889-9101)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (12-214)||(5254-5455)
scaffold0022 (97-206)||(109608-109717)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (1-214)||(995-1207)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (2-214)||(2973-3186)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (1-214)||(6103-6315)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (2-214)||(41659-41871)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (12-214)||(3733-3936)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (1-214)||(12126-12337)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (2-214)||(34500-34713)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (1-214)||(128208-128420)
scaffold0008 (2-214)||(31703-31917)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (2-214)||(13517-13729)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (2-214)||(21144-21356)
scaffold0139 (2-214)||(14089-14301)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (2-214)||(43008-43221)
scaffold0076 (16-87)||(39240-39313)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (2-214)||(46-259)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (1-214)||(37105-37317)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (2-118)||(13353-13469)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (2-201)||(5552-5752)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (1-108)||(51221-51328)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (2-109)||(1332-1439)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (127-214)||(9393-9480)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (1-113)||(89493-89605)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (1-93)||(22672-22764)
scaffold0141 (1-93)||(26927-27019)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (1-93)||(1621-1713)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (12-209)||(56149-56347)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (12-210)||(54431-54630)
scaffold0066 (12-178)||(45077-45244)
[»] scaffold0361 (2 HSPs)
scaffold0361 (5-125)||(3289-3410)
scaffold0361 (167-214)||(3219-3266)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (136-214)||(48525-48603)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (1-201)||(22445-22646)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (136-214)||(26-104)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (1-208)||(8026-8234)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (1-208)||(76870-77078)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (12-87)||(1617-1694)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (12-87)||(10381-10458)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (14-62)||(3577-3625)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (1-62)||(22452-22514)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (12-62)||(54038-54088)
[»] scaffold1666 (1 HSPs)
scaffold1666 (12-87)||(38-115)
[»] scaffold1500 (1 HSPs)
scaffold1500 (12-87)||(1556-1633)
[»] scaffold0970 (1 HSPs)
scaffold0970 (143-208)||(2471-2536)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (12-87)||(39783-39860)
scaffold0107 (16-87)||(31446-31519)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (143-208)||(35494-35559)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (1-86)||(104646-104733)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (1-62)||(2687-2749)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (1-62)||(6823-6885)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (1-77)||(1371-1449)
scaffold0409 (1-77)||(9626-9704)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (1-77)||(4751-4829)
[»] scaffold1272 (1 HSPs)
scaffold1272 (2-62)||(456-517)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (12-87)||(2529-2606)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (2-62)||(2340-2401)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (2-62)||(43822-43883)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (103-207)||(33854-33958)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 48)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 51158057 - 51158270
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  51158057 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 51158156  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51158157 ggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 51158256  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  51158257 tatgcatattcatg 51158270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 15859063 - 15859276
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  15859063 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 15859162  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15859163 ggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 15859262  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  15859263 tatgcatattcatg 15859276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13839118 - 13838905
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  13839118 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 13839019  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13839018 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgtttggg 13838919  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  13838918 tatgcatattcatg 13838905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 2050034 - 2049821
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  2050034 atatgtttgtatgcctgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaacatgataacttgtgaaaattgtgctcaatt 2049935  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||   ||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2049934 ggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgatttttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 2049835  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  2049834 tatgcatattcatg 2049821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 12030186 - 12030399
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  12030186 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaagtgataagttgtgaaagttgtgctcaatt 12030285  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||||||||||||| | |||   ||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12030286 ggtgaattttgctaagttattgttaatttgatatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttatggttgatgaatcattgcttggg 12030385  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  12030386 tatgcatattcatg 12030399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 15936666 - 15936879
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  15936666 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 15936765  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    ||||||||||| |||||||| |||   ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |    
T  15936766 ggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatgaataattgcctgag 15936865  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  15936866 tatgcatattcatg 15936879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 14842600 - 14842813
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14842600 atatgtttgtatgcatgaattgaagataattgtatgattgttggtgaaattgcatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgctcaatt 14842699  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||   ||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||    
T  14842700 ggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatgaataattgattggg 14842799  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    | ||||||||||||    
T  14842800 tttgcatattcatg 14842813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15615053 - 15614845
Alignment:
Q  6 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||    
T  15615053 tttgtatgcatgaattgatgataattgtaggattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaatatggtgctcaattggtga 15614954  T
Q  106 attttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgc 205  Q
    ||||||||||||| | |||   ||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15614953 attttgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgc 15614854  T
Q  206 atattcatg 214  Q
    |||||||||    
T  15614853 atattcatg 15614845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 15938508 - 15938721
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  15938508 atatgtttgtaatcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 15938607  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    ||||||||||| |||||||| |||   ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |    
T  15938608 ggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatgaataattgcctgag 15938707  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  15938708 tatgcatattcatg 15938721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 17912521 - 17912733
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||    
T  17912521 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatt 17912620  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    | |||| |||| || ||||| |||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  17912621 gatgaa-tttgatatgttgtagttgaattgagctatgattcatgttcaatcgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttggg 17912719  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  17912720 tatgcatattcatg 17912733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16821363 - 16821150
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||| | |||||    
T  16821363 tatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagctatgagtattgtgctaaattg 16821264  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  16821263 gtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttggg 16821164  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    | ||||||||||||    
T  16821163 tttgcatattcatg 16821150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 55316443 - 55316230
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  55316443 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattg 55316344  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||| | ||||||||| |||   ||||| | |||| ||||||||| ||||||||||  ||||| |||||  | || || |||||| ||||||||||    
T  55316343 gtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttggg 55316244  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    | ||||||||||||    
T  55316243 tttgcatattcatg 55316230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 41270299 - 41270086
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  41270299 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtggaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattg 41270200  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||| | ||||||||| |||   ||||| | |||| ||||||||| ||||||||||  ||||| |||||  | || || |||||| ||||||||||    
T  41270199 gtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttggg 41270100  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    | ||||||||||||    
T  41270099 tttgcatattcatg 41270086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 13975766 - 13975974
Alignment:
Q  7 ttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaa 106  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  13975766 ttgtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaa 13975865  T
Q  107 ttt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgc 205  Q
    ||| | |||||||||  ||   ||||| | |||| ||||||||| ||||||||||  ||||| |||||  | || || |||||| ||||||||||| |||    
T  13975866 tttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgc 13975965  T
Q  206 atattcatg 214  Q
    |||||||||    
T  13975966 atattcatg 13975974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 45861024 - 45860816
Alignment:
Q  7 ttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaa 106  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  45861024 ttgtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaa 45860925  T
Q  107 ttt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgc 205  Q
    ||| | |||||||||  ||   ||||| | |||| ||||||||| ||||||||||  ||||| |||||  | || || |||||| ||||||||||| |||    
T  45860924 tttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgc 45860825  T
Q  206 atattcatg 214  Q
    |||||||||    
T  45860824 atattcatg 45860816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 16744154 - 16744366
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||     
T  16744154 atatgtttgtatccatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatg 16744253  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    | |||| ||||  | ||| | |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16744254 gatgaa-tttgacatgttatagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataaatgttgtagttgatgaatcattgcttggg 16744352  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||| ||| ||||||    
T  16744353 tatacatgttcatg 16744366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 13954934 - 13955142
Alignment:
Q  7 ttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaa 106  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  13954934 ttgtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaaaatgatcagttatgaatattgtgctcaattgatgaa 13955033  T
Q  107 ttt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgc 205  Q
    ||| | |||||||||  ||   ||||| | |||| ||||||||| ||||||||||  ||||| |||||  | || || |||||| ||||||||||| |||    
T  13955034 tttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgc 13955133  T
Q  206 atattcatg 214  Q
    |||||||||    
T  13955134 atattcatg 13955142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 2449277 - 2449369
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtg 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  2449277 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtg 2449369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 110 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 47984765 - 47984661
Alignment:
Q  110 tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatat 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  47984765 tgctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatat 47984666  T
Q  210 tcatg 214  Q
    |||||    
T  47984665 tcatg 47984661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 110 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 48003339 - 48003235
Alignment:
Q  110 tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatat 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  48003339 tgctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatat 48003240  T
Q  210 tcatg 214  Q
    |||||    
T  48003239 tcatg 48003235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 110 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 47994052 - 47993948
Alignment:
Q  110 tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatat 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  47994052 tgctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatat 47993953  T
Q  210 tcatg 214  Q
    |||||    
T  47993952 tcatg 47993948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 110 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 48012625 - 48012521
Alignment:
Q  110 tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatat 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  48012625 tgctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatat 48012526  T
Q  210 tcatg 214  Q
    |||||    
T  48012525 tcatg 48012521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Original strand, 11986216 - 11986419
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg--ttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattt 109  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||  || || ||||||  ||||  |||||||| |||||||| |||| | ||||||||    
T  11986216 tgcatgatttaatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgttttaaagtatgtattaatgtcaagttatg-aaattgtgctcaaatagtgaattt 11986314  T
Q  110 tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatat 209  Q
    ||||||||||| |||| |  ||  | |||||| ||||| |||||||||   | | |||| ||||||||| || | ||||||||  |||||||||||||||    
T  11986315 tgctaagttgttgttgaaaagatatgtgattcatgttccattgatgttgatgctattaactgatgttgttgtgggtgaatcatgacttgggtatgcatat 11986414  T
Q  210 tcatg 214  Q
    |||||    
T  11986415 tcatg 11986419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Original strand, 15468382 - 15468585
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattt 109  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||| ||| ||||| |  | ||||| |||| ||    
T  15468382 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtcatg-aaattatacttaattgatgaaatt 15468480  T
Q  110 tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatat 209  Q
    || || ||| || ||| | |||| | | |||| | ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  15468481 tgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatgttattgtgaatgaatcattgcttgggtatgcatat 15468580  T
Q  210 tcatg 214  Q
    |||||    
T  15468581 tcatg 15468585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 54651671 - 54651557
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt-caaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| |  |||||||||||||||    
T  54651671 tgcatgaattgatgataattgtatgattgtgagtgaaattgcatgttgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtgaattt 54651573  T
Q  110 tgctaagttgtggttg 125  Q
    || || ||||| ||||    
T  54651572 tgatatgttgttgttg 54651557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22275423 - 22275220
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattt 109  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||| ||| ||||| |  | ||||| |||| ||    
T  22275423 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtcatg-aaattatacttaattgatgaaatt 22275325  T
Q  110 tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatat 209  Q
    || || ||| || ||| | |||| | | |||| | ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||| | ||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  22275324 tgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatgttattgtgaatgaatcattgcttaggtatgcatat 22275225  T
Q  210 tcatg 214  Q
    |||||    
T  22275224 tcatg 22275220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 16880242 - 16880139
Alignment:
Q  105 aattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatg 204  Q
    |||| ||||| ||||| |||| |||| | || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||| | |||| |||||||| ||    
T  16880242 aattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttattgttgctaagtgatgttgtggatgataattcatggcttgggtgtg 16880143  T
Q  205 cata 208  Q
    ||||    
T  16880142 cata 16880139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Original strand, 12902132 - 12902209
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  12902132 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 12902209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 18911207 - 18911130
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  18911207 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 18911130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 25058953 - 25058876
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  25058953 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 25058876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 49232650 - 49232573
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  49232650 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 49232573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 5228527 - 5228452
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt--caaatatgtaaaaatgataagttatga 85  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5228527 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaaatatgtataaatgttaagttatga 5228452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 17100782 - 17100670
Alignment:
Q  95 tcaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattg 194  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| | || |||| | || | ||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || | | |||| |    
T  17100782 tcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttattgttgttaagtgatgttatggatgttaattcatgg 17100683  T
Q  195 cttgggtatgcat 207  Q
    |||||||||||||    
T  17100682 cttgggtatgcat 17100670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 17101467 - 17101355
Alignment:
Q  95 tcaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattg 194  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| | || |||| | || | ||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || | | |||| |    
T  17101467 tcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttattgttgttaagtgatgttatggatgttaattcatgg 17101368  T
Q  195 cttgggtatgcat 207  Q
    |||||||||||||    
T  17101367 cttgggtatgcat 17101355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 85
Target Start/End: Original strand, 12264834 - 12264909
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatga 85  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  12264834 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 12264909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Original strand, 11329081 - 11329191
Alignment:
Q  97 aattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgct 196  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||| |||| |||| | || ||||| || |||||||||||| | |||| ||| ||||||||| | |||| | |||| |||    
T  11329081 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggct 11329180  T
Q  197 tgggtatgcat 207  Q
    |||||||||||    
T  11329181 tgggtatgcat 11329191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 4145837 - 4145914
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgata 77  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  4145837 atatgtttgaatacatgaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattacatgttcatagtatgtgaaaatgata 4145914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 14814788 - 14814974
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttc-a 97  Q
    ||||||||| || |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||  || ||  ||||||| || |    
T  14814788 atatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtg--aattgtgctcaa 14814885  T
Q  98 attggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatg 186  Q
    |||| |||||| ||||| ||||| |||| |||| | || || || |||| |||||||||| | ||||||||  ||| |||| |||||||    
T  14814886 attgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgataagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatg 14814974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 17139730 - 17139525
Alignment:
Q  3 atgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    ||||||| ||||||||| ||| || |||||| ||  |||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||| ||  |  |||||  | || ||||||    
T  17139730 atgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaactatgagaaaatggtatatgttgaaa--tatgctcaatt 17139633  T
Q  101 ggt-gaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgg 199  Q
    ||| ||||  ||||| ||||| |||| |||| | || ||||| || |||||||||||| | |||| ||| ||||||||| | |||| | |||| ||||||    
T  17139632 ggttgaatcatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttgg 17139533  T
Q  200 gtatgcat 207  Q
    ||||||||    
T  17139532 gtatgcat 17139525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 208
Target Start/End: Original strand, 38811168 - 38811239
Alignment:
Q  137 gattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcata 208  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||| | |||||| |||| |||||||| ||||||    
T  38811168 gattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgtgcata 38811239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 6228648 - 6228726
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgata 77  Q
    ||||||||| || |||||| ||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  6228648 atatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcatagtatgtgaaaatgata 6228726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 34560123 - 34560061
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  34560123 atatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 34560061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 47784789 - 47784851
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  47784789 atatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 47784851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 87
Target Start/End: Original strand, 1467785 - 1467858
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  1467785 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 1467858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 3576461 - 3576522
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 61  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||    
T  3576461 atatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaa 3576522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 103 - 208
Target Start/End: Original strand, 14059339 - 14059444
Alignment:
Q  103 tgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggta 202  Q
    |||||| ||||| ||||| |||| |||| | ||  |||| ||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||| | |||| | |||| ||||||||     
T  14059339 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataatattcatgttcaattgatgttattgttgctatgtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtt 14059438  T
Q  203 tgcata 208  Q
    ||||||    
T  14059439 tgcata 14059444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 207
Target Start/End: Original strand, 12560362 - 12560466
Alignment:
Q  103 tgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggta 202  Q
    |||||| ||||| ||||| |||| |||| | |||||||| || ||||| |||||| | |||| ||| ||||||||||| || | | || | |||||||||    
T  12560362 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatatgattcatgatcaatggatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgttaattcctggcttgggta 12560461  T
Q  203 tgcat 207  Q
    |||||    
T  12560462 tgcat 12560466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 54424141 - 54424029
Alignment:
Q  95 tcaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattg 194  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| | || |||| | || | ||| || |||||||||||| |  ||| ||| ||| ||||||| |||| | |||| |    
T  54424141 tcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttattgctaagtgacgttgtggatgattattcatgg 54424042  T
Q  195 cttgggtatgcat 207  Q
    |||||||||||||    
T  54424041 cttgggtatgcat 54424029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 182; Significance: 1e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 36952 - 37165
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||    
T  36952 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagcttgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctaaatt 37051  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37052 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgaatcttgttcaattgacgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 37151  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  37152 tatgcatattcatg 37165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 182; Significance: 1e-98; HSPs: 36)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 462962 - 462749
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  462962 atatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgttcaatt 462863  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  462862 ggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgtcgtgattgatgaatcattgcttggg 462763  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  462762 tatgcatattcatg 462749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 8891466 - 8891253
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  8891466 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggcgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 8891367  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8891366 ggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 8891267  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  8891266 tatgcatattcatg 8891253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 36982480 - 36982693
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  36982480 atatgtttgtattcatgaattgatgataattgtaagattgctggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 36982579  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  36982580 ggtgaattttgccaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgtttggg 36982679  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  36982680 tatgcatattcatg 36982693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 19794743 - 19794956
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  19794743 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 19794842  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  19794843 ggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatttccgttaattgatgttatagttgatgaatcattgcttggg 19794942  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  19794943 tatgcatattcatg 19794956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 24341428 - 24341641
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||    
T  24341428 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattatatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaatt 24341527  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  24341528 ggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttcctgttgatgaatcattgcttggg 24341627  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||| ||||||||||    
T  24341628 tatacatattcatg 24341641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 20627352 - 20627565
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  20627352 atatgtttgtatgcacgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtccaaatatgtaaaaatgataacttgtgaaaattgtgctcaatt 20627451  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    ||||||||||| |||||||| |||   ||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20627452 ggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttaattcttgttcaattgattttatggttgttaattggtgttgtggttgatgaatcattgcttggg 20627551  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    |||| |||||||||    
T  20627552 tatggatattcatg 20627565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Original strand, 7507894 - 7508096
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7507894 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaatttgg 7507993  T
Q  112 ctaagttgtggttggattgagttatgattcttg-ttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatatt 210  Q
    ||||||||| |||  |||||| |||||||| || || |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7507994 ctaagttgttgtt-aattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatatt 7508092  T
Q  211 catg 214  Q
    ||||    
T  7508093 catg 7508096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 43642996 - 43643209
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  43642996 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaatt 43643095  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||||| || ||||||  ||   ||||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  43643096 ggtgaatttttcttagttgttattaatttgagatatgattcttgttcaattgatgctattgctgttaattgatgttgtagttgatgaatcactgcttggg 43643195  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  43643196 tatgcatattcatg 43643209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 25265430 - 25265642
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||    
T  25265430 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattg 25265529  T
Q  102 gtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggt 201  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||  | |  ||  | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  25265530 gtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattgatgttgttgtttatgaatcatggcttgggt 25265629  T
Q  202 atgcatattcatg 214  Q
    |||||||||||||    
T  25265630 atgcatattcatg 25265642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 19886689 - 19886902
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||| | || ||    
T  19886689 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtg 19886788  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||| | ||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  19886789 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttggg 19886888  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  19886889 tatgcatattcatg 19886902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 17396697 - 17396905
Alignment:
Q  7 ttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaa 106  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  17396697 ttgtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaa 17396796  T
Q  107 ttt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgc 205  Q
    ||| | |||||||||  ||   ||||| | |||| ||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || || ||| || ||||||||||| |||    
T  17396797 tttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatggataattgcttgggtttgc 17396896  T
Q  206 atattcatg 214  Q
    |||||||||    
T  17396897 atattcatg 17396905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 19689440 - 19689532
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtg 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  19689440 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtg 19689532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 23820295 - 23820203
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtg 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  23820295 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtg 23820203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 14906479 - 14906571
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtg 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  14906479 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtg 14906571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 20015235 - 20015143
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtg 93  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  20015235 atatgtttgcatgcatgaattgataataattgtgtgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtg 20015143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Original strand, 3798645 - 3798722
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  3798645 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 3798722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Original strand, 12635910 - 12635987
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  12635910 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 12635987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 12728606 - 12728529
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  12728606 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 12728529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 34824689 - 34824612
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  34824689 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 34824612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 87
Target Start/End: Original strand, 23778085 - 23778164
Alignment:
Q  10 tatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| |||| | |||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  23778085 tatgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 23778164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 8944060 - 8943983
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||  |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  8944060 tgcatgaattgatgattatggtatatttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 8943983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Original strand, 12641684 - 12641761
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| | |||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  12641684 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggctgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 12641761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 16935807 - 16935730
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  16935807 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgcgtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 16935730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 17006467 - 17006390
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  17006467 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgcgtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 17006390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Original strand, 42178011 - 42178088
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  42178011 tgcatgaattgatgattatggtatgtttttgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 42178088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 68215 - 68018
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaa- 98  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| |||||  |  |||||  | || ||||     
T  68215 tatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaa--tatgctcaaa 68118  T
Q  99 ttggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttg 198  Q
    ||| |||||| ||||| ||||| |||| |||| | || ||||| ||||||||||||||| | |||| ||| |||| |||| |||| ||| |||| |||||    
T  68117 ttgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttggtgattcatggcttg 68018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 19669132 - 19669191
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 59  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||    
T  19669132 atatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgagttgttgttggtgaaattgcatgttc 19669191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 24884910 - 24884848
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  24884910 atatgtttgaatgcatggaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 24884848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 87
Target Start/End: Original strand, 11231384 - 11231457
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  11231384 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 11231457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 19666609 - 19666544
Alignment:
Q  143 tgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcata 208  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||| |||| |||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  19666609 tgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgtcgttgatgattcatggcttgggtattcata 19666544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 208
Target Start/End: Original strand, 19669275 - 19669340
Alignment:
Q  143 tgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcata 208  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| ||||||| | |||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  19669275 tgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttattgttgatgattcatggcttgggtattcata 19669340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 87
Target Start/End: Original strand, 22513231 - 22513304
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  22513231 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 22513304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 87
Target Start/End: Original strand, 24685827 - 24685900
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  24685827 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 24685900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 87
Target Start/End: Original strand, 28775853 - 28775926
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  28775853 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 28775926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 19660104 - 19660044
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 60  Q
    ||||||| |||| |||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  19660104 atatgttcgtatacatgaaattggtgataattgaattattgttggtgaaattgcatgttca 19660044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 178
Target Start/End: Original strand, 24571409 - 24571493
Alignment:
Q  95 tcaattggt-gaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgt 178  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||| | |||| |||| |||| ||||| || |||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  24571409 tcaattggttgaattatgctatgtttttgttgaattgtgttaagattcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtgatgttgt 24571493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 178; Significance: 3e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 19430 - 19217
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  19430 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 19331  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19330 ggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttggg 19231  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  19230 tatgcatattcatg 19217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21514 - 21301
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  21514 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 21415  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21414 ggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttggg 21315  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  21314 tatgcatattcatg 21301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 178; Significance: 3e-96; HSPs: 54)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 11580778 - 11580991
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  11580778 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 11580877  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11580878 ggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 11580977  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||| ||||||||||    
T  11580978 tatacatattcatg 11580991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 47481071 - 47481283
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47481071 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgttcaattg 47481170  T
Q  102 gtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggt 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  47481171 gtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatcgctcttaattgatgtttttgttgatgaatcattgcttgggt 47481270  T
Q  202 atgcatattcatg 214  Q
    |||||||||||||    
T  47481271 atgcatattcatg 47481283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 13037053 - 13037266
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  13037053 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgatgaaattgcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 13037152  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13037153 ggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattaatgttatgaatattaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 13037252  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  13037253 tatgcatattcatg 13037266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16211990 - 16211777
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  16211990 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgtttgtgaaattgcatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 16211891  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||   ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16211890 ggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttaaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgattcattgcttggg 16211791  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  16211790 tatgcatattcatg 16211777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 18253874 - 18254087
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  18253874 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 18253973  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||   ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |    
T  18253974 ggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatgaataattgcctgag 18254073  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  18254074 tatgcatattcatg 18254087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3060190 - 3059977
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||| |    
T  3060190 atatatttgtatgcattaattgatgataattgtaatactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataaattgtgaaaattatgctcaaat 3060091  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3060090 ggtgaattttgttaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 3059991  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  3059990 tatgcatattcatg 3059977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 36052884 - 36052678
Alignment:
Q  5 gtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  36052884 gtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtaaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtg 36052785  T
Q  105 aattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatg 204  Q
    ||||||||||||||   |||   ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36052784 aattttgctaagtt---gttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttgtggttgttaattgatgttgtggttgatgaataattgcttgggtatg 36052688  T
Q  205 catattcatg 214  Q
    ||||||||||    
T  36052687 catattcatg 36052678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 16478990 - 16479202
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16478990 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 16479089  T
Q  102 gtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggt 201  Q
    |||||||||| |||||| |  ||   ||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  16479090 gtgaattttgttaagttatttttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggt 16479189  T
Q  202 atgcatattcatg 214  Q
    |||||||||||||    
T  16479190 atgcatattcatg 16479202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13321239 - 13321025
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt-caaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||||||||||| ||||| |||||    
T  13321239 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttatgaaa-ttgtgctcaat 13321141  T
Q  100 tggtgaattttgctaagttg-tggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttg 198  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||    
T  13321140 tggtgaattttgctaagttgattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttg 13321041  T
Q  199 ggtatgcatattcatg 214  Q
    ||| |||| |||||||    
T  13321040 ggtttgcacattcatg 13321025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 2437681 - 2437468
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2437681 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgttcaattg 2437582  T
Q  102 gtgaa-ttttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||    |||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||| |    
T  2437581 gtgaatttttcctaagttgttgttaatatgagatttgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgag 2437482  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    | ||||||||||||    
T  2437481 tttgcatattcatg 2437468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10989633 - 10989421
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  10989633 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattg 10989534  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||| | ||||||||| | |   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  10989533 gtgaatttctcctaagttgttg-taatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttggg 10989435  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    | ||||||||||||    
T  10989434 tttgcatattcatg 10989421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13572900 - 13572687
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  13572900 tatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtgtgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattg 13572801  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||| | ||||||||| |||   ||||| | |||| ||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || || |||||| ||||||||||    
T  13572800 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattgcttggg 13572701  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    | ||||||||||||    
T  13572700 tttgcatattcatg 13572687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 13911052 - 13911266
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  13911052 tatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctcaattg 13911151  T
Q  102 gtgaattt-tgct-aagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgg 199  Q
    |||||||| | || ||||||| ||||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| ||| |||||    
T  13911152 gtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatttcttgg 13911251  T
Q  200 gtatgcatattcatg 214  Q
    || ||||||||||||    
T  13911252 gtttgcatattcatg 13911266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 7293240 - 7293028
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||   |||     
T  7293240 atatgtttgtatgcatgaattaataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatg 7293141  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    | |||| ||||  | ||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7293140 gatgaa-tttgacatgttgttgttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttggg 7293042  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||| ||||||||||    
T  7293041 tatacatattcatg 7293028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 25292377 - 25292590
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||    
T  25292377 atatgtttgtatgtatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaaggataagctatgaatattgtgctcaatt 25292476  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||| | ||| ||||| |||   ||||| | |||| ||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || ||  | |||||| ||||||||||    
T  25292477 ggtgaattctcctaggttgtcgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgactaatgaataattgcttggg 25292576  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    | ||||||||||||    
T  25292577 tttgcatattcatg 25292590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 296006 - 296216
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||| | | ||| ||    
T  296006 tatgtttgtgtgcatgaatcgatgataatgttatgattgttggtgaaatttcatgttgaattatgtaaaaatgagaagttataaaaattatatccaaatg 296105  T
Q  102 gtgaattttgctaagttg-tggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||| | | | ||||||||||||   |||||||||| | || |||||    
T  296106 gtgaattttgctaaattgatgtttgaattgtgttgtgattcatgttcaattgatgttgttgctattaattgatgtt---gttgatgaattactgattggg 296202  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||| ||||||||    
T  296203 tatgcttattcatg 296216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 11516451 - 11516359
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtg 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  11516451 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtg 11516359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 15441603 - 15441695
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtg 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  15441603 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtg 15441695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 30262168 - 30262260
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtg 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  30262168 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtg 30262260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 13758584 - 13758507
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  13758584 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 13758507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 15927782 - 15927705
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  15927782 tgcatgaattgatgattatggtatgcttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 15927705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Original strand, 15950833 - 15950910
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  15950833 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 15950910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Original strand, 18980063 - 18980140
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  18980063 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 18980140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 16914951 - 16915013
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  16914951 atatgtttgaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 16915013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 62
Target Start/End: Original strand, 48622708 - 48622758
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  48622708 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttcaaa 48622758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 13274917 - 13274804
Alignment:
Q  95 tcaattggt-gaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcatt 193  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| |||| | || ||||| || |||||||||||| | |||| ||| ||||||||| | |||||| ||||     
T  13274917 tcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatg 13274818  T
Q  194 gcttgggtatgcat 207  Q
    |||| |||||||||    
T  13274817 gctttggtatgcat 13274804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Original strand, 14250940 - 14251017
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  14250940 tgcatgaattgatgattatggtatgtttttgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 14251017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Original strand, 15760156 - 15760233
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| ||  |||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  15760156 tgcatgaattgatgattatgatatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 15760233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 207
Target Start/End: Original strand, 16570123 - 16570236
Alignment:
Q  95 tcaattggt-gaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcatt 193  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| |||||| || | ||| || |||||||||||| | |||| ||| |||||| |||| |||| | ||||     
T  16570123 tcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgagataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgtcgtggatgataattcatg 16570222  T
Q  194 gcttgggtatgcat 207  Q
    ||||||||||||||    
T  16570223 gcttgggtatgcat 16570236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16595539 - 16595426
Alignment:
Q  95 tcaattggt-gaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcatt 193  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| |||||| || | ||| || |||||||||||| | |||| ||| |||||| |||| |||| | ||||     
T  16595539 tcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgagataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgtcgtggatgataattcatg 16595440  T
Q  194 gcttgggtatgcat 207  Q
    ||||||||||||||    
T  16595439 gcttgggtatgcat 16595426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 9611532 - 9611470
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  9611532 atatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 9611470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 9839103 - 9839041
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  9839103 atatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 9839041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 14271922 - 14272000
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgata 77  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||  |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  14271922 atatgtttgaatgcatgaaattgttgataattcaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaaatgata 14272000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 14935584 - 14935506
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgata 77  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||    
T  14935584 atatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgata 14935506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 15359021 - 15358943
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgata 77  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||    
T  15359021 atatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgata 15358943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 15363177 - 15363099
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgata 77  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||    
T  15363177 atatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgata 15363099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Original strand, 26070384 - 26070494
Alignment:
Q  97 aattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgct 196  Q
    |||||||||||| || || ||||| | || |||| | || | ||| || |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||| |||| | |||| |||    
T  26070384 aattggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgattattcatggct 26070483  T
Q  197 tgggtatgcat 207  Q
    |||||||||||    
T  26070484 tgggtatgcat 26070494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Original strand, 26094171 - 26094281
Alignment:
Q  97 aattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgct 196  Q
    |||||||||||| || || ||||| | || |||| | || | ||| || |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||| |||| | |||| |||    
T  26094171 aattggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgattattcatggct 26094270  T
Q  197 tgggtatgcat 207  Q
    |||||||||||    
T  26094271 tgggtatgcat 26094281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 28722334 - 28722256
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgata 77  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||    
T  28722334 atatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgata 28722256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 48356868 - 48356806
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  48356868 atatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 48356806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 86 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 3049721 - 3049600
Alignment:
Q  86 aaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgat 185  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| | || |||| | || | ||| || ||||| |||||| | |||||||| ||||||| ||| || |    
T  3049721 aaattatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgtt 3049622  T
Q  186 gaatcattgcttgggtatgcat 207  Q
     | |||| ||||||||||||||    
T  3049621 aattcatggcttgggtatgcat 3049600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 7822938 - 7822865
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  7822938 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 7822865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 7830249 - 7830176
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  7830249 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 7830176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 13377752 - 13377691
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  13377752 tatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 13377691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 87
Target Start/End: Original strand, 27101683 - 27101756
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  27101683 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 27101756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 87
Target Start/End: Original strand, 27109031 - 27109104
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  27109031 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 27109104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 27176643 - 27176570
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  27176643 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 27176570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 87
Target Start/End: Original strand, 38783775 - 38783848
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  38783775 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 38783848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 95 - 207
Target Start/End: Original strand, 49047791 - 49047904
Alignment:
Q  95 tcaattggt-gaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcatt 193  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||| |||| |||| | || ||||| || |||||||||||| | |||| ||| ||||||||| | |||| | ||||     
T  49047791 tcaattggttgaattatgttatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgctgataattcatg 49047890  T
Q  194 gcttgggtatgcat 207  Q
    ||||||||||||||    
T  49047891 gcttgggtatgcat 49047904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 3895154 - 3895042
Alignment:
Q  95 tcaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattg 194  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| | || |||| | || | ||| || ||||| |||||| | |||||||| ||||||| ||| || | | |||| |    
T  3895154 tcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatgg 3895055  T
Q  195 cttgggtatgcat 207  Q
    |||||||||||||    
T  3895054 cttgggtatgcat 3895042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 13377648 - 13377552
Alignment:
Q  105 aattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggt 201  Q
    |||| ||||| ||||| |||| |||| | || ||||| ||||||||||||||| | |||| ||| | ||||||| | |||||| |||| ||||||||    
T  13377648 aattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtaatgttgttgatgatgattcatggcttgggt 13377552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 77
Target Start/End: Original strand, 13448868 - 13448928
Alignment:
Q  18 aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgata 77  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||    
T  13448868 aattggtgataattgaattattgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgata 13448928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 48356731 - 48356667
Alignment:
Q  137 gattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggt 201  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||| ||| |||| |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  48356731 gattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 48356667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 62
Target Start/End: Original strand, 49047699 - 49047759
Alignment:
Q  3 atgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  49047699 atgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 49047759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 178; Significance: 3e-96; HSPs: 42)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23507189 - 23506976
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  23507189 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 23507090  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||   ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23507089 ggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaataattgcttggg 23506990  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  23506989 tatgcatattcatg 23506976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 27182586 - 27182799
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  27182586 atatgtttgtatgcatgaactgatgataattgtatgattgttgatgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 27182685  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27182686 ggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgag 27182785  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  27182786 tatgcatattcatg 27182799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 18531106 - 18531319
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  18531106 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgttcaatt 18531205  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  18531206 ggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgctcggg 18531305  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||| ||||||||||    
T  18531306 tatacatattcatg 18531319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 22053872 - 22054085
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||    
T  22053872 atatgtttgtatgtatgaattgatgatagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaatt 22053971  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22053972 ggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttggg 22054071  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    | | ||||||||||    
T  22054072 tctacatattcatg 22054085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 34939500 - 34939289
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  34939500 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattg 34939401  T
Q  102 gtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggt 201  Q
     || ||||||||||||  | | || |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  34939400 atggattttgctaagtcattg-tgaattgagttatgattcttgttcagttgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggt 34939302  T
Q  202 atgcatattcatg 214  Q
    |||||||||||||    
T  34939301 atgcatattcatg 34939289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 29188312 - 29188486
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  29188312 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaattg 29188411  T
Q  102 gtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgtt 176  Q
    ||||||||||||||||| | |||   ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29188412 gtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgtt 29188486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 43443423 - 43443636
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  43443423 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattg 43443522  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||  ||||| | ||| |||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  43443523 gtgaatttcttctaagttgttgttgatttgagatgtgagtcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttggg 43443622  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    | ||||||||||||    
T  43443623 tttgcatattcatg 43443636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 18778020 - 18778233
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||    
T  18778020 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattg 18778119  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||| | ||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  18778120 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatattatttgatattatgattgatgaataattgcttggg 18778219  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  18778220 tatgcatattcatg 18778233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 22366509 - 22366722
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||    
T  22366509 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattg 22366608  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||| | ||||||||| |||   ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  22366609 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttggg 22366708  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  22366709 tatgcatattcatg 22366722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25426852 - 25426639
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | || ||    
T  25426852 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaagtg 25426753  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||| | ||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  25426752 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttggg 25426653  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  25426652 tatgcatattcatg 25426639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12598 - 12385
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||| | || ||    
T  12598 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtg 12499  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||| | ||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  12498 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttggg 12399  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  12398 tatgcatattcatg 12385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27010065 - 27009852
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  27010065 tatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgagtgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtactcaattg 27009966  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||| | ||||||||| |||   ||||| | |||| ||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || || |||||| ||||||||||    
T  27009965 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattgcttggg 27009866  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    | ||||||||||||    
T  27009865 tttgcatattcatg 27009852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 4200013 - 4200226
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| || | |||||    
T  4200013 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctaaattg 4200112  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||| |  || ||||| ||||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  4200113 gtgaatttctcttatgttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaatgattgcttggg 4200212  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    | ||||||||||||    
T  4200213 tttgcatattcatg 4200226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 19500123 - 19499910
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | || ||    
T  19500123 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaagtg 19500024  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||| | ||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||| ||| ||||||| ||    
T  19500023 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgattaataattgctttgg 19499924  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  19499923 tatgcatattcatg 19499910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 21073623 - 21073836
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | || ||    
T  21073623 tatgtttgtatgcatgaatggatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaagtg 21073722  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||| | ||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||| |||||||||   ||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  21073723 gtgaatttcttctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatcaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttggg 21073822  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  21073823 tatgcatattcatg 21073836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 20623193 - 20623101
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtg 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  20623193 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtg 20623101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 21233567 - 21233659
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtg 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  21233567 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtg 21233659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 25900445 - 25900537
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtg 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  25900445 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggttaaattatatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtg 25900537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 16536421 - 16536329
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtg 93  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  16536421 atatgtttgtatgcatgaatttataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtg 16536329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 37052968 - 37052876
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtg 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  37052968 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtggaaatgaaaagttatgaaaattgtg 37052876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 32950905 - 32950704
Alignment:
Q  15 atgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt-caaa-tatgtaaaaatgataa-gttatgaaaattgtgttcaattggtgaattttg 111  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||| ||| |  || ||||||||| ||||| |||| |||||||||||     
T  32950905 atgatttgatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtttcaaagtatgtataaaggtcaaagttatgaaa-ttgtgctcaaatggtgaatttta 32950807  T
Q  112 ctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattc 211  Q
    ||| ||||| |||| |  ||| | |||||| ||||| |||||||||   | | |||| ||||||||| || | ||||||||  ||||||| |||||||||    
T  32950806 ctatgttgttgttgaaaagagatgtgattcatgttccattgatgttgatgctattaactgatgttgttgtgggtgaatcatgacttgggtctgcatattc 32950707  T
Q  212 atg 214  Q
    |||    
T  32950706 atg 32950704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Original strand, 17471630 - 17471833
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattt 109  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||| ||| ||||| |  | ||||| |||| ||    
T  17471630 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtaatg-aaattatacttaattgatgaaatt 17471728  T
Q  110 tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatat 209  Q
    || || ||| || ||| | | || | | |||| | ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||| | ||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  17471729 tgatatgttttgattgaaataagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatgttattgtgaatgaatcattgcttgggtacgcatat 17471828  T
Q  210 tcatg 214  Q
    |||||    
T  17471829 tcatg 17471833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Original strand, 10778012 - 10778089
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  10778012 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 10778089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 23514775 - 23514698
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  23514775 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 23514698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 11212107 - 11212274
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattt 109  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| | |||| ||||| ||||||||| ||||| |  |||| | ||||||||    
T  11212107 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtgtgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaagtagtgaattt 11212205  T
Q  110 tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgt 178  Q
    |  || ||||| |||| | |||| | |||||| ||||| ||||||||| | | | |||| |||||||||    
T  11212206 taatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgt 11212274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 23981539 - 23981740
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||  ||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||| ||| |||||  |||| || ||||    
T  23981539 atatgtttgtatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaagtatgtataaatgttaacttatg--aattatgctcaa 23981636  T
Q  99 ttgg-tgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgctt 197  Q
     ||| |||||| || || ||||| |||| |||  | |  ||  | ||||||||||||||| | |||| ||| |||| |||| |||||||| |||| ||||    
T  23981637 atggttgaattatgatatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggctt 23981736  T
Q  198 gggt 201  Q
    ||||    
T  23981737 gggt 23981740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 432590 - 432479
Alignment:
Q  97 aattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgct 196  Q
    ||||| |||||| | ||| ||||| ||||||||| | || ||||| ||||||||||||||| | |||| ||| |||| |||| |||||||| || | |||    
T  432590 aattgatgaattatactatgttgttgttggattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcctggct 432491  T
Q  197 tgggtatgcata 208  Q
    ||||||| ||||    
T  432490 tgggtattcata 432479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 103 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 23494040 - 23493942
Alignment:
Q  103 tgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggt 201  Q
    |||||| ||||| ||||| |||| |||| | || ||||| ||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||| | |||||| |||| ||||||||    
T  23494040 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggt 23493942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 180 - 214
Target Start/End: Original strand, 29190481 - 29190515
Alignment:
Q  180 gttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29190481 gttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 29190515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Original strand, 1219562 - 1219639
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    ||||| |||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  1219562 tgcattaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 1219639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 7728547 - 7728436
Alignment:
Q  97 aattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgct 196  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||| |||| |||| | || ||||| ||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||| | |||| | | || |||    
T  7728547 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataatttatcgct 7728448  T
Q  197 tgggtatgcata 208  Q
    ||||| ||||||    
T  7728447 tgggtgtgcata 7728436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 85
Target Start/End: Original strand, 35791140 - 35791215
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatga 85  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  35791140 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgagtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 35791215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 19862433 - 19862371
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  19862433 atatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 19862371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 21310732 - 21310794
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  21310732 atatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 21310794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Original strand, 5450867 - 5450928
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  5450867 tatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 5450928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 7425538 - 7425461
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    ||||||||| |||| | || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  7425538 tgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 7425461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 87
Target Start/End: Original strand, 21932427 - 21932500
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  21932427 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 21932500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 87
Target Start/End: Original strand, 21938597 - 21938670
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  21938597 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 21938670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 35582246 - 35582173
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  35582246 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 35582173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 87
Target Start/End: Original strand, 36989816 - 36989889
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  36989816 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 36989889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 22885866 - 22885806
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 60  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  22885866 atatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 22885806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 29918189 - 29918129
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 60  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  29918189 atatgtttgaatacatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 29918129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 178; Significance: 3e-96; HSPs: 37)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13246654 - 13246441
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  13246654 atatgtttgtatgcatgaattaatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 13246555  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13246554 ggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 13246455  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  13246454 tatgcatattcatg 13246441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 54118283 - 54118496
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  54118283 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaattgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 54118382  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54118383 ggtgaattttgctaagttgttgttagatttagttatgattcttgttcaattgatgttatagttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 54118482  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  54118483 tatgcatattcatg 54118496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 15675128 - 15675341
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||    
T  15675128 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaatt 15675227  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15675228 ggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttggg 15675327  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||| ||||||||||    
T  15675328 tatacatattcatg 15675341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 31115853 - 31115640
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||| |||||||| || ||||||    
T  31115853 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttccattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattatgctcaatt 31115754  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31115753 ggtgaattttcctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttggg 31115654  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||| ||||||||||    
T  31115653 tatacatattcatg 31115640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10644443 - 10644230
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| | |||||    
T  10644443 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattg 10644344  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  10644343 gtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttggg 10644244  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    | ||||||||||||    
T  10644243 tttgcatattcatg 10644230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 10104289 - 10104445
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||    
T  10104289 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaatt 10104388  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgtt 157  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  10104389 ggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 10104445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26680424 - 26680212
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||     
T  26680424 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaata 26680325  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    | |||| ||||  | ||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26680324 gatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttggg 26680226  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||| ||||||||||    
T  26680225 tatacatattcatg 26680212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 122113 - 121983
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  122113 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 122014  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattga 131  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  122013 ggtgaattttgctaagttgttgttagattga 121983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 47357878 - 47357665
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||    
T  47357878 tatgtttgtatgcatggattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattg 47357779  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||| | ||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||| |||||    
T  47357778 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgattggg 47357679  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    |||| |||||||||    
T  47357678 tatgtatattcatg 47357665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 13048260 - 13048474
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  13048260 atatgtttgtatgcatgatttgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaaggataagttatgaatattgtgctcaatt 13048359  T
Q  101 ggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgg 199  Q
    | ||||||| | ||||||||| ||| | ||||| | |||| ||||||||| ||||||||||  ||||| | |||  | || || |||||| |||||||||    
T  13048360 gatgaatttctcctaagttgttgttagtttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttattagataatatgattaatgaataattgcttgg 13048459  T
Q  200 gtatgcatattcatg 214  Q
    || ||||||||||||    
T  13048460 gtttgcatattcatg 13048474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 126 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 111494 - 111406
Alignment:
Q  126 gattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  111494 gattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 111406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 157
Target Start/End: Original strand, 40885594 - 40885749
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||| ||||| || ||||||    
T  40885594 tatgtttgtatgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgttcaaagtatgtataaatgtcaagttatg-aaattatgctcaatt 40885692  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgtt 157  Q
    |||||| ||||||||||| | |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  40885693 ggtgaactttgctaagttattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 40885749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 10488786 - 10488694
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtg 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  10488786 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtg 10488694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 16327965 - 16328057
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtg 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  16327965 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtg 16328057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 8374722 - 8374525
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattt 109  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| |  |||||| ||||||||    
T  8374722 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgcttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattagtgaattt 8374624  T
Q  110 tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcata 208  Q
    |  || ||||| |||| | |||| | |||||| ||||| ||||||||| | | | |||| ||||||||| || | ||||| || |||||||||| ||||    
T  8374623 taatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtgaattatggcttgggtatacata 8374525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 7850223 - 7850010
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||| || ||| |||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||| ||    
T  7850223 tatgtttgaatgaatgtattgatgaaaactgtgtgattgttggtggaattgtatgtccaattatgtgaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaagtg 7850124  T
Q  102 gtg-aattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
     || |||||||||||||  | |||| |||||| ||||| |  ||||  ||||||||| | ||||||||  ||   ||| |||||||||||||  |||| |    
T  7850123 atgaaattttgctaagtgattgttgaattgagatatgaattgtgtttcattgatgttgttgttgttaaaggagtatgttgttgatgaatcatgacttgag 7850024  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||| |||| |||||    
T  7850023 tatacataatcatg 7850010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 208
Target Start/End: Original strand, 17145701 - 17145896
Alignment:
Q  14 catgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattttg 111  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| || ||||| |  |||||| ||||||||||    
T  17145701 catgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttgtg-aaattatactcaattagtgaattttg 17145799  T
Q  112 ctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcata 208  Q
     || ||||| |||| | |||| | |||||| ||||| ||||||||| | | | |||| ||||||||| || | ||||| ||  ||||||||| ||||    
T  17145800 atatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacata 17145896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15045051 - 15044851
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaa- 98  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| |||||  |  ||||  || || ||||     
T  15045051 tatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaa--ttatgctcaaa 15044954  T
Q  99 ttggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttg 198  Q
    ||| |||||| ||||| ||||| |||| |||| | || ||||| ||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||| | |||||| |||| |||||    
T  15044953 ttgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttg 15044854  T
Q  199 ggt 201  Q
    |||    
T  15044853 ggt 15044851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 208
Target Start/End: Original strand, 41166066 - 41166177
Alignment:
Q  97 aattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgct 196  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||| |||| |||| |  | || || ||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  41166066 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggcaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgaatcatggct 41166165  T
Q  197 tgggtatgcata 208  Q
    ||||||| ||||    
T  41166166 tgggtattcata 41166177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Original strand, 7132107 - 7132184
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  7132107 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 7132184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 18169184 - 18169107
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  18169184 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 18169107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 19020700 - 19020623
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  19020700 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 19020623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 18238180 - 18238381
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatga-attgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttc-a 97  Q
    ||||||||| || ||||| |||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||  || ||  ||||||| || |    
T  18238180 atatgtttgaatacatgatattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtg--aattgtgctcta 18238277  T
Q  98 attggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgctt 197  Q
    |||| |||||| ||||| ||||| |||| |||| | |  || || |||| |||||||||| | ||||||||  ||| |||| |||||||| |||| ||||    
T  18238278 attgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagctt 18238377  T
Q  198 gggt 201  Q
    ||||    
T  18238378 gggt 18238381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 20000937 - 20000860
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  20000937 tgcatgaattgatgattatggtatgtttctgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 20000860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 22738483 - 22738406
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  22738483 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttgtgaaa 22738406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 207
Target Start/End: Original strand, 13809636 - 13809740
Alignment:
Q  103 tgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggta 202  Q
    |||||| ||||| ||||| |||| |||| | || ||||| || |||||||||||| | |||| ||||||||||||| | |||| | |||| |||||| ||    
T  13809636 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaattgatgttgttgatgataattcatggcttggata 13809735  T
Q  203 tgcat 207  Q
    |||||    
T  13809736 tgcat 13809740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 18248432 - 18248265
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattt 109  Q
    |||||||||||| ||| || ||||| |||| | |||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||| |||| ||||| |  |||||| ||||||||    
T  18248432 tgcatgaattgaggattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagatatg-aaattatactcaattagtgaattt 18248334  T
Q  110 tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgt 178  Q
    |  || ||||| |||| | |||| | |||||| ||||| ||||||||| | | | |||| |||||||||    
T  18248333 taatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgt 18248265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 214
Target Start/End: Original strand, 10104449 - 10104483
Alignment:
Q  180 gttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 214  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10104449 gttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatg 10104483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 33240924 - 33240890
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtat 35  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33240924 atatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtat 33240890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Original strand, 15109373 - 15109434
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  15109373 tatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 15109434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Original strand, 15287287 - 15287364
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    ||||||||| |||| | || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  15287287 tgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 15287364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 208
Target Start/End: Original strand, 19821942 - 19822007
Alignment:
Q  143 tgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcata 208  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||  ||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  19821942 tgttcaattgatgttgttgttgctatgtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcata 19822007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 207
Target Start/End: Original strand, 12837318 - 12837430
Alignment:
Q  95 tcaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattg 194  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||  |||| | || | ||| || ||||| |||||| | |||||||| ||||||| ||| || | | |||| |    
T  12837318 tcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatggtcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaattcatgg 12837417  T
Q  195 cttgggtatgcat 207  Q
    |||||||||||||    
T  12837418 cttgggtatgcat 12837430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 201
Target Start/End: Original strand, 15109477 - 15109573
Alignment:
Q  105 aattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggt 201  Q
    |||| ||||| ||||| |||| |||| | || ||||| ||||||||||||||| | |||| ||| | ||||||| | |||||| |||| ||||||||    
T  15109477 aattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtaatgttgttgatgatgattcatggcttgggt 15109573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 207
Target Start/End: Original strand, 30232614 - 30232726
Alignment:
Q  95 tcaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattg 194  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||  |||| | || | ||| || ||||| |||||| | |||||||| ||||||| ||| || | | |||| |    
T  30232614 tcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaattcatgg 30232713  T
Q  195 cttgggtatgcat 207  Q
    |||||||||||||    
T  30232714 cttgggtatgcat 30232726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 38764933 - 38764873
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 60  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  38764933 atatgtttgaatgaatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttca 38764873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 201
Target Start/End: Original strand, 52265628 - 52265732
Alignment:
Q  97 aattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgct 196  Q
    ||||| |||||| ||| | ||||| |||| |||| | || ||||| ||||||||||||||| | |||| ||| |||| |||  |||||||| |||| |||    
T  52265628 aattgttgaattatgcaatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgatgttgatgattcatggct 52265727  T
Q  197 tgggt 201  Q
    |||||    
T  52265728 tgggt 52265732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 174; Significance: 8e-94; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 48822 - 48609
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||    
T  48822 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcagtt 48723  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48722 ggtgaattttgctaagttgttgctagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 48623  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  48622 tatgcatattcatg 48609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 36317 - 36104
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||    
T  36317 tatgtttgtatgtatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattg 36218  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||| | ||||||||| |||   ||||| | |||||| |||||||| |||||||||  ||||| |||||  | || ||||||||| ||||||||||    
T  36217 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaatagatgttatgaatgttatttgataatatgattgatgaataattgcttggg 36118  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    | ||||||||||||    
T  36117 tttgcatattcatg 36104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Original strand, 154049 - 154126
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  154049 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaagttacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 154126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 174; Significance: 8e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 123203 - 123416
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  123203 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 123302  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  123303 ggtgaattttgctaagttgttgttagattaagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaataatggcttggg 123402  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  123403 tatgcatattcatg 123416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 174; Significance: 8e-94; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 24928830 - 24929043
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  24928830 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 24928929  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24928930 ggtgaatttcgctaagttgtggttggattgagttatgtctcttgttcaattgaggttatggttgttaattgatgttgtgattgatgaatcattgcttggg 24929029  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  24929030 tatgcatattcatg 24929043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 16193755 - 16193968
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  16193755 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggggaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 16193854  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||||||| || |||| |||   ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16193855 ggtgaattttgccaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 16193954  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  16193955 tatgcatattcatg 16193968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 43373511 - 43373720
Alignment:
Q  5 gtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  43373511 gtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtg 43373610  T
Q  105 aattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatg 204  Q
    |||||||||||||||| |||   ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43373611 aattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttgtggttgatgaataattgcttgggtatg 43373710  T
Q  205 catattcatg 214  Q
    ||||||||||    
T  43373711 catattcatg 43373720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24549205 - 24548993
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  24549205 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaattg 24549106  T
Q  102 gtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggt 201  Q
    ||||||||||||||||| | |||   ||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24549105 gtgaattttgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttgggt 24549006  T
Q  202 atgcatattcatg 214  Q
    |||||||||||||    
T  24549005 atgcatattcatg 24548993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 6774286 - 6774498
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  6774286 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 6774385  T
Q  102 gtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggt 201  Q
    ||||||||||||||||| | |||   ||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  6774386 gtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggt 6774485  T
Q  202 atgcatattcatg 214  Q
    |||||||||||||    
T  6774486 atgcatattcatg 6774498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17345792 - 17345581
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  17345792 tatgtttatatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattg 17345693  T
Q  102 gtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggt 201  Q
     || ||||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  17345692 atggattttgctaagttattg-tgaattgagttatgattcttgttcagttgatattattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggt 17345594  T
Q  202 atgcatattcatg 214  Q
    |||||||||||||    
T  17345593 atgcatattcatg 17345581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 16405014 - 16405224
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  16405014 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaatt 16405113  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    ||||||||||||||||||||   |  |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  16405114 ggtgaattttgctaagttgt---taaattgacatatgattcttgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttttagttgatgaatcactgcttggg 16405210  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    |||||| |||||||    
T  16405211 tatgcaaattcatg 16405224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Original strand, 21844600 - 21844812
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  21844600 tatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattg 21844699  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||| | ||||||||| |||   ||||| | ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  21844700 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatttttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttggg 21844799  T
Q  201 tatgcatattcat 213  Q
    | |||||||||||    
T  21844800 tttgcatattcat 21844812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Original strand, 21851993 - 21852205
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  21851993 tatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattaaatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattg 21852092  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||| | ||||||||| |||   ||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  21852093 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttggg 21852192  T
Q  201 tatgcatattcat 213  Q
    | |||||||||||    
T  21852193 tttgcatattcat 21852205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 30120946 - 30120734
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  30120946 tatgtttgtatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattg 30120847  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||| | ||||||||| |||   ||||| | |||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  30120846 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttggg 30120747  T
Q  201 tatgcatattcat 213  Q
    | |||||||||||    
T  30120746 tttgcatattcat 30120734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 22907253 - 22907465
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||   |||     
T  22907253 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatg 22907352  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    | |||| ||||  | ||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22907353 gatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttggg 22907451  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||| ||||||||||    
T  22907452 tatacatattcatg 22907465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 214
Target Start/End: Original strand, 222754 - 222932
Alignment:
Q  37 attgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagtta 135  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| | ||||||||| |||   |||||||     
T  222754 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 222853  T
Q  136 tgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 214  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  222854 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 222932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 214
Target Start/End: Original strand, 736377 - 736555
Alignment:
Q  37 attgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagtta 135  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| | ||||||||| |||   |||||||     
T  736377 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 736476  T
Q  136 tgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 214  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  736477 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 736555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 214
Target Start/End: Original strand, 860272 - 860450
Alignment:
Q  37 attgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagtta 135  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| | ||||||||| |||   |||||||     
T  860272 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 860371  T
Q  136 tgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 214  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  860372 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 860450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 16674420 - 16674633
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||    
T  16674420 tatgtttttatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgcttaattg 16674519  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||| | ||||||||| |||   ||||| | |||| ||||||||| ||||||||||  ||||| |||||  | || || |||||| |||||||| |    
T  16674520 gtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgag 16674619  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    | ||||||||||||    
T  16674620 tttgcatattcatg 16674633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 5238311 - 5238219
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtg 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  5238311 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtg 5238219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 24661287 - 24661379
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtg 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  24661287 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtg 24661379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 43685770 - 43685678
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtg 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  43685770 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtg 43685678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 93
Target Start/End: Original strand, 691909 - 691965
Alignment:
Q  37 attgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtg 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  691909 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtg 691965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 23837325 - 23837214
Alignment:
Q  97 aattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgct 196  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||| |||| |||| | || || || ||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||| |||||||| |||| |||    
T  23837325 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggct 23837226  T
Q  197 tgggtatgcata 208  Q
    ||||||| ||||    
T  23837225 tgggtattcata 23837214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Original strand, 13720970 - 13721047
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  13720970 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 13721047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Original strand, 16873093 - 16873170
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  16873093 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 16873170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Original strand, 22006300 - 22006377
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  22006300 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 22006377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 16195445 - 16195370
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatga 85  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  16195445 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 16195370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 26011718 - 26011656
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  26011718 atatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcaaa 26011656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 208
Target Start/End: Original strand, 23226242 - 23226307
Alignment:
Q  143 tgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcata 208  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| |||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  23226242 tgttcaattgatgttgttgttgttaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtattcata 23226307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 201
Target Start/End: Original strand, 45558984 - 45559161
Alignment:
Q  24 tgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttc-aattggtgaattttgctaagttgtg 121  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||  || ||  ||||||| || ||||| |||||| ||||| |||||     
T  45558984 tgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtg--aattgtgctctaattgttgaattgtgctatgttgtt 45559081  T
Q  122 gttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggt 201  Q
    |||| |||| | |  || || |||| |||||||||| | ||||||||  ||| |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  45559082 gttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagggatattgttgttgatgattcatagcttgggt 45559161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 208
Target Start/End: Original strand, 22735958 - 22736069
Alignment:
Q  97 aattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgct 196  Q
    ||||| |||||| | ||| ||||| ||||||||| | || ||||| ||||||||||||||| |  ||| ||| ||||||||| |||| | | |||| |||    
T  22735958 aattgatgaattatactatgttgttgttggattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttcttgctaactgatgttgttgttgttaattcatggct 22736057  T
Q  197 tgggtatgcata 208  Q
    ||||| ||||||    
T  22736058 tgggtgtgcata 22736069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Original strand, 13662307 - 13662384
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||  ||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  13662307 tgcatgaatgnatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 13662384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 15933522 - 15933460
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  15933522 atatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 15933460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 201
Target Start/End: Original strand, 18261512 - 18261695
Alignment:
Q  18 aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttc-aattggtgaattttgctaa 115  Q
    ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||| |||| | ||||| |||||||||  || ||  ||||||| || ||||| |||||| |||||     
T  18261512 aattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatcttcatagtatgtgaaaatgatatattgtg--aattgtgctctaattgttgaattgtgctat 18261609  T
Q  116 gttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggt 201  Q
    ||||| |||| |||| | |  || || |||| |||||||||| | ||||||||  ||| |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  18261610 gttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagcttgggt 18261695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 87
Target Start/End: Original strand, 271406 - 271479
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  271406 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 271479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 644514 - 644441
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  644514 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 644441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 830249 - 830176
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  830249 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 830176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 87
Target Start/End: Original strand, 22088840 - 22088913
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  22088840 tgaattgatgattatggtatgtttataggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 22088913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 5854701 - 5854637
Alignment:
Q  137 gattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggt 201  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||| ||| |||| |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  5854701 gattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 5854637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15933385 - 15933321
Alignment:
Q  137 gattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggt 201  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||| ||| |||| |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  15933385 gattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 15933321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 207
Target Start/End: Original strand, 39446892 - 39446996
Alignment:
Q  103 tgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggta 202  Q
    |||||| ||||| ||||| |||| |||| | || ||||| || |||||||||||| | |||| ||| ||||||||| | | || | |||| |||||||||    
T  39446892 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgataataattcatggcttgggta 39446991  T
Q  203 tgcat 207  Q
    |||||    
T  39446992 tgcat 39446996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 173; Significance: 3e-93; HSPs: 35)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 14626158 - 14626370
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14626158 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtgcaattg 14626257  T
Q  102 gtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggt 201  Q
    ||||||| ||||||||||| |||   ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14626258 gtgaattatgctaagttgttgttaacttgagatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttgggt 14626357  T
Q  202 atgcatattcatg 214  Q
    |||||||||||||    
T  14626358 atgcatattcatg 14626370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23153671 - 23153458
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  23153671 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 23153572  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23153571 ggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatattatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattacttggg 23153472  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||| ||||||||||    
T  23153471 tatacatattcatg 23153458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 1650136 - 1650345
Alignment:
Q  5 gtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1650136 gtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaagaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtg 1650235  T
Q  105 aattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatg 204  Q
    |||||||||||||| |||||   ||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  1650236 aattttgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatg 1650335  T
Q  205 catattcatg 214  Q
    ||||||||||    
T  1650336 catattcatg 1650345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 1657788 - 1657999
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  1657788 tatgtttggatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattg 1657887  T
Q  102 gtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggt 201  Q
     || ||||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  1657888 atggattttgctaagttattg-tgaattgagttatgattcttgttcagttgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggt 1657986  T
Q  202 atgcatattcatg 214  Q
    |||||||||||||    
T  1657987 atgcatattcatg 1657999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 35009482 - 35009691
Alignment:
Q  5 gtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  35009482 gtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttttgaaaattgtgctcaattggtg 35009581  T
Q  105 aattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatg 204  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||  | |  ||  | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35009582 aattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatg 35009681  T
Q  205 catattcatg 214  Q
    ||||||||||    
T  35009682 catattcatg 35009691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15862694 - 15862484
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  15862694 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtataaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattg 15862595  T
Q  102 gtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggt 201  Q
     || ||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  15862594 atggattttgctaagttattg-tgaattgagttatgattcttgttc-atttatgttattgctgataattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggt 15862497  T
Q  202 atgcatattcatg 214  Q
    |||||||||||||    
T  15862496 atgcatattcatg 15862484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25175787 - 25175574
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||    
T  25175787 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattg 25175688  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||| | ||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  25175687 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttggg 25175588  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  25175587 tatgcatattcatg 25175574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 27654011 - 27654224
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||    
T  27654011 tatgcttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattg 27654110  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||| | ||||||||| |||   ||||||| |||||||||||| | ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  27654111 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttccaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttggg 27654210  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  27654211 tatgcatattcatg 27654224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 16825780 - 16825995
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgta--tgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||    
T  16825780 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtaattaattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaat 16825879  T
Q  100 tggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttg 198  Q
    ||||| |||| | |||| |||| |||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||| || || ||||||||| |||||||     
T  16825880 tggtggatttctcctaatttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatctgatattatgattgatgaataattgcttt 16825979  T
Q  199 ggtatgcatattcatg 214  Q
    | ||||||||||||||    
T  16825980 gttatgcatattcatg 16825995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 29666089 - 29665941
Alignment:
Q  10 tatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt-caaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaat 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| | |||||  ||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  29666089 tatgtatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgcataaatgtcaagttatgaaa-ttgtactcaattggtgaat 29665991  T
Q  108 tttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgtt 157  Q
    ||||||||||||| |||| | |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  29665990 tttgctaagttgttgttgaaatgagatatgattcatgttcaattgatgtt 29665941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27741021 - 27740849
Alignment:
Q  43 ggtgaaattacatgttc--aaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgatt 140  Q
    ||||||||||||||||   || |||||| |||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||    
T  27741021 ggtgaaattacatgtttcgaagtatgtataaatgtcaagttatgaaa-ttgtgctcaattggtgaattttgctaagtcgttgttgaattgagatatgatt 27740923  T
Q  141 cttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 214  Q
    | ||||||||||||||  | | | |||  ||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  27740922 catgttcaattgatgtggttgctattatctgatgttgttgtggatgaatcatggtttgggtatgcatattcatg 27740849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 27751648 - 27751603
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtga 47  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27751648 tatgtttgtatgcatgaattgatgacaattgtatgattgttggtga 27751603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 1556219 - 1556142
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  1556219 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 1556142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 16232106 - 16232029
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  16232106 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 16232029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Original strand, 18086865 - 18086942
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  18086865 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 18086942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 23977983 - 23977906
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  23977983 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 23977906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 208
Target Start/End: Original strand, 18381803 - 18381914
Alignment:
Q  97 aattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgct 196  Q
    ||||| |||||| ||||  ||||| |||| |||| | || || || ||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||| |||||||| |||| |||    
T  18381803 aattgttgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggct 18381902  T
Q  197 tgggtatgcata 208  Q
    ||||||| ||||    
T  18381903 tgggtattcata 18381914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 29605673 - 29605614
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 60  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  29605673 atatgtttgaatgcatgaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttca 29605614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 18629631 - 18629693
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  18629631 atatgtttgaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 18629693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Original strand, 13620836 - 13620913
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||| |||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  13620836 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattgcatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 13620913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 17083221 - 17083298
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgata 77  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||  ||||||| | ||||| |||||||||    
T  17083221 atatgtttgaatgcatgaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgtatgttcatagtatgtgaaaatgata 17083298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Original strand, 22225780 - 22225857
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  22225780 tgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 22225857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18399065 - 18398954
Alignment:
Q  97 aattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgct 196  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||| |||| |||| | |  ||||| ||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||| | |||| | |||| |||    
T  18399065 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggct 18398966  T
Q  197 tgggtatgcata 208  Q
    ||||| ||||||    
T  18398965 tgggtgtgcata 18398954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 33324916 - 33324709
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||| |||| || |||||||||| | |||| || || ||| |||||||  || || ||||    
T  33324916 atatgtttgtatgcatgaaattgttgataattgaattgttgttg-tgaatttgcatgttcaaagtgtgtataagtgctaacttatgaa--ttatgctcaa 33324820  T
Q  99 ttgg-tgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgctt 197  Q
    |||| |||||| |||||  ||||||||| |||  | |  ||  | ||||||||||||||| |  ||| ||| ||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  33324819 ttggatgaattatgctatattgtggttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttattgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggctt 33324720  T
Q  198 gggtatgcata 208  Q
    |||||| ||||    
T  33324719 gggtattcata 33324709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 35136036 - 35136243
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||| |||| || |||||||||| | |||| || || ||| || ||||  || || ||||    
T  35136036 atatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttg-tgaatttgcatgttcaaagtgtgtataagtgctaacttgtgaa--ttatgctcaa 35136132  T
Q  99 ttgg-tgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgctt 197  Q
    |||| |||||| |||||  ||||||||| |||  | |  ||  | ||||||||||||||| |  ||| ||| ||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  35136133 ttggatgaattatgctatattgtggttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttattgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggctt 35136232  T
Q  198 gggtatgcata 208  Q
    |||||| ||||    
T  35136233 gggtattcata 35136243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 16887815 - 16887877
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |   ||||||||||| || ||||||||||    
T  16887815 atatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaactgttgttggtgaatttgcatgttcaaa 16887877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 25651461 - 25651399
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  25651461 atatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 25651399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 10488909 - 10488836
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  10488909 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 10488836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 87
Target Start/End: Original strand, 16376419 - 16376492
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  16376419 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 16376492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 87
Target Start/End: Original strand, 16383743 - 16383816
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  16383743 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 16383816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 87
Target Start/End: Original strand, 16556185 - 16556258
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  16556185 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 16556258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 87
Target Start/End: Original strand, 16632741 - 16632814
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  16632741 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 16632814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 25919694 - 25919629
Alignment:
Q  143 tgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcata 208  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||  ||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  25919694 tgttcaattgatgttgttgttgctatatgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcata 25919629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 201
Target Start/End: Original strand, 22361885 - 22361989
Alignment:
Q  97 aattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgct 196  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||| |||| |||| | |   |||| ||||||||||||||| | |||| ||| |||| |||| |||||||| |||| |||    
T  22361885 aattgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatgaaattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 22361984  T
Q  197 tgggt 201  Q
    |||||    
T  22361985 tgggt 22361989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 25651324 - 25651260
Alignment:
Q  137 gattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggt 201  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||| ||| |||| |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  25651324 gattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 25651260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 5100 - 5313
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  5100 atatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 5199  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5200 ggtgaattttgcaaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgattgatgaatcattgcttggg 5299  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  5300 tatgcatattcatg 5313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 148945 - 148732
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  148945 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 148846  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||   ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  148845 ggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgaagttgtggttgatgaatcattgcttggg 148746  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    |||| |||||||||    
T  148745 tatgtatattcatg 148732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9073 - 8860
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||    
T  9073 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaatt 8974  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8973 ggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattaatgttcaattgatgttattgctattaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttggg 8874  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||| ||||||||||    
T  8873 tatacatattcatg 8860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 53570 - 53508
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatga-attgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  53570 atatgtttgaatgcatgatattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 53508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 166; Significance: 5e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 272249 - 272036
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||| | ||||    
T  272249 atatgtttgtatgaatgaattgatgataattgtatgattgatggagaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctaaatt 272150  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  272149 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattggtgttatagctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 272050  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  272049 tatgcatattcatg 272036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 69578 - 69480
Alignment:
Q  103 tgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggt 201  Q
    |||||| ||||| ||||| |||| |||| | |  ||||| ||||||||||||||| | |||| ||| |||| |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  69578 tgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 69480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 166; Significance: 5e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 172129 - 171916
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||| | ||||    
T  172129 atatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctaaatt 172030  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  172029 ggtgaattttgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttagg 171930  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  171929 tatgcatattcatg 171916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 177832 - 177619
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||| | ||||    
T  177832 atatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctaaatt 177733  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  177732 ggtgaattttgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttagg 177633  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  177632 tatgcatattcatg 177619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 23)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 20893665 - 20893877
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  20893665 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgttgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 20893764  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20893765 ggtgaattttgctaagttgttgttagattgatttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgtttggg 20893864  T
Q  201 tatgcatattcat 213  Q
    |||||||||||||    
T  20893865 tatgcatattcat 20893877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20445903 - 20445690
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  20445903 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtgaaaattgtgctcaatt 20445804  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20445803 ggtgaattttgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttggg 20445704  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  20445703 tatgcatattcatg 20445690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20531668 - 20531455
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  20531668 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtgaaaattgtgctcaatt 20531569  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20531568 ggtgaattttgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttggg 20531469  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  20531468 tatgcatattcatg 20531455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20931569 - 20931356
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  20931569 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgctaaatt 20931470  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    ||||||||||||||| |||| |||   ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  20931469 ggtgaattttgctaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaataatttcttggg 20931370  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  20931369 tatgcatattcatg 20931356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 37844489 - 37844703
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagtta-tgaaaattgtgttcaat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||  || ||||||||||| |||||    
T  37844489 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataaaatagtgaaaattgtgctcaat 37844588  T
Q  100 tggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgg 199  Q
    |  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37844589 taatgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgagtcattgcttgg 37844688  T
Q  200 gtatgcatattcatg 214  Q
    |||||||||||||||    
T  37844689 gtatgcatattcatg 37844703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 2116478 - 2116265
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  2116478 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaattg 2116379  T
Q  102 gtgaattttgctaagttgtggttggattga-gttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    ||||||||||||||||| | |||   ||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2116378 gtgaattttgctaagttattgttaatttgatattttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttggg 2116279  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  2116278 tatgcatattcatg 2116265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20913254 - 20913048
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20913254 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgctcaatt 20913155  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  20913154 ggtgaattttgcaaagttgttgtt-aatt------tgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatcttgtggttgatgaataattgcttggg 20913062  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  20913061 tatgcatattcatg 20913048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 41394446 - 41394233
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  41394446 atatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaagttacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 41394347  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||||||||||||| | |||   ||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  41394346 ggtgaattttgctaagttattgttatgttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgattggg 41394247  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  41394246 tatgcatattcatg 41394233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22228022 - 22227820
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattttg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  22228022 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattttg 22227923  T
Q  112 ctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattc 211  Q
    ||||||||| |||   ||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22227922 ctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattc 22227823  T
Q  212 atg 214  Q
    |||    
T  22227822 atg 22227820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22232719 - 22232517
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattttg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  22232719 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattttg 22232620  T
Q  112 ctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattc 211  Q
    ||||||||| |||   ||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22232619 ctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattc 22232520  T
Q  212 atg 214  Q
    |||    
T  22232519 atg 22232517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 45051643 - 45051484
Alignment:
Q  5 gtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  45051643 gtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtg 45051544  T
Q  105 aattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttg 164  Q
    |||||||||||||| |||||   ||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  45051543 aattttgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttg 45051484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 18601146 - 18601359
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18601146 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattg 18601245  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||| | ||||||||| |||   ||||| | |||| ||||||||| ||||||||||  ||||| |||||  | || || |||||| ||||||||||    
T  18601246 gtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttggg 18601345  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    | ||||||||||||    
T  18601346 tttgcatattcatg 18601359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 5072416 - 5072629
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  5072416 tatgtttatatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattg 5072515  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||| | ||||||||| |||   ||||| | |||| ||||||||| ||||||||||  ||||| |||||  | || || |||||| ||||||||||    
T  5072516 gtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttggg 5072615  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    | ||||||||||||    
T  5072616 tttgcatattcatg 5072629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 51452716 - 51452624
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtg 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  51452716 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtg 51452624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 17148781 - 17148704
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  17148781 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 17148704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Original strand, 18059800 - 18059877
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  18059800 tgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 18059877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 201
Target Start/End: Original strand, 37233986 - 37234084
Alignment:
Q  103 tgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggt 201  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||| | |  ||||| ||||||||||||||| | |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||  |||||||    
T  37233986 tgaattatgctatgttgtggttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatgacttgggt 37234084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 45051487 - 45051453
Alignment:
Q  180 gttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 214  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45051487 gttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 45051453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 17004848 - 17004775
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  17004848 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 17004775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 87
Target Start/End: Original strand, 38055137 - 38055210
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  38055137 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 38055210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 46523603 - 46523526
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||||| | ||  |||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  46523603 tgcatgaattgatgtttatgttatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 46523526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 86
Target Start/End: Original strand, 22143387 - 22143471
Alignment:
Q  4 tgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaa 86  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||  ||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||    
T  22143387 tgtttgtatgcatgaaatttgtgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaagtatgtataaatgttaacttatgaa 22143471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 207
Target Start/End: Original strand, 27329873 - 27329985
Alignment:
Q  95 tcaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattg 194  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||  |||| | || | ||| || ||||| |||||| | |||||||| ||||||| ||| || | | |||| |    
T  27329873 tcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaattcatgg 27329972  T
Q  195 cttgggtatgcat 207  Q
    |||||||||||||    
T  27329973 cttgggtatgcat 27329985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1348 - 1135
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  1348 atatgttagtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 1249  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||   ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  1248 ggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatattgtggttgatgaataattgcttggg 1149  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    | ||||||||||||    
T  1148 tgtgcatattcatg 1135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 3621 - 3830
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  3621 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 3720  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    ||| |||||||||||||||| |||   ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  3721 ggtaaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgaggaataattgcttggg 3820  T
Q  201 tatgcatatt 210  Q
    ||||||||||    
T  3821 tatgcatatt 3830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 26454 - 26663
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||    
T  26454 atatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattattggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgttctcaatt 26553  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26554 ggtgaattttgctaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgattgatgaatcattgcttggg 26653  T
Q  201 tatgcatatt 210  Q
    ||||||||||    
T  26654 tatgcatatt 26663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 8220 - 8429
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||    
T  8220 tatgtttgtatgcatgaattggtgataattgtatgattgttggtgaaattacaggttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattg 8319  T
Q  102 gtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggt 201  Q
    |||||||||||||   ||| |||| |||  | |  ||  | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  8320 gtgaattttgcta---tgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattgatgttgttgtttatgaatcatggcttgggt 8416  T
Q  202 atgcatattcatg 214  Q
    |||||||| ||||    
T  8417 atgcatatacatg 8429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 247481 - 247694
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  247481 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgagggtgaaatttcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 247580  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  247581 ggtaaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 247680  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  247681 tatgcatattcatg 247694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 86
Target Start/End: Original strand, 34200 - 34276
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaa 86  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  34200 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 34276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 9377 - 9589
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  9377 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaattg 9476  T
Q  102 gtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggt 201  Q
    ||||||||||||||||| | |||   ||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9477 gtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttgggt 9576  T
Q  202 atgcatattcatg 214  Q
    |||||||||||||    
T  9577 atgcatattcatg 9589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 16275 - 16487
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  16275 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaattg 16374  T
Q  102 gtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggt 201  Q
    ||||||||||||||||| | |||   ||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16375 gtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttgggt 16474  T
Q  202 atgcatattcatg 214  Q
    |||||||||||||    
T  16475 atgcatattcatg 16487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 154; Significance: 7e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 41953 - 41740
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  41953 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtcatattgttggtgaaattacatgctcaaatatgtaaaaatgataatttgtgaaaattgtgctcaatt 41854  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||    
T  41853 ggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgctatggctgttaattgttgttgtagatgatgaatcattggttggg 41754  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  41753 tatgcatattcatg 41740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 154; Significance: 7e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 48411 - 48198
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  48411 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 48312  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    ||||||||||| |||||||| |||   ||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  48311 ggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatagatgttaattgatgttgtgattgatgaataattgcctggg 48212  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  48211 tatgcatattcatg 48198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 573 - 784
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||| ||||||||||  ||||||    
T  573 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgatgagttgtgaaaattgtactcaatt 672  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    ||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  673 ggtgaattttgctaagttactgttagattaagttatgattcttgtttaattgatgttatggctgctaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 772  T
Q  201 tatgcatattca 212  Q
    ||||||||||||    
T  773 tatgcatattca 784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 107971 - 107758
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  107971 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgcaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 107872  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    ||||||||||| |||||||| |||   ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  107871 ggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatgaataattgcttggg 107772  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    | ||||||||||||    
T  107771 tttgcatattcatg 107758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 214
Target Start/End: Original strand, 64573 - 64769
Alignment:
Q  19 attgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagt 117  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  64573 attgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagt 64672  T
Q  118 tgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 214  Q
    ||| |||   ||||| | |||| ||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || || |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  64673 tgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatg 64769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 149; Significance: 7e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9101 - 8889
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  9101 tatgtttgtatgcatgaatcgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattg 9002  T
Q  102 gtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggt 201  Q
    |||||||||| |||||||| |||   ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  9001 gtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatgaataattgcttgggt 8902  T
Q  202 atgcatattcatg 214  Q
    |||||||||||||    
T  8901 atgcatattcatg 8889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Original strand, 5254 - 5455
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattttg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5254 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattttg 5353  T
Q  112 ctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattc 211  Q
    || |||||| |||   ||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  5354 ctgagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttgtgattaatgaataattgcttgggt-tgcatattc 5452  T
Q  212 atg 214  Q
    |||    
T  5453 atg 5455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 109717 - 109608
Alignment:
Q  97 aattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgct 196  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||| |||| | || ||||| || ||| |||||||| | |||| ||| ||||||||| | |||| | |||| |||    
T  109717 aattgttgaattttgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcagttgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggct 109618  T
Q  197 tgggtatgca 206  Q
    ||||||||||    
T  109617 tgggtatgca 109608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 146; Significance: 4e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 995 - 1207
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  995 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaatt 1094  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    | |||||||||||||||||| |||  |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  1095 gatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagattttattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttggg 1193  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  1194 tatgcatattcatg 1207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3186 - 2973
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||    
T  3186 tatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattg 3087  T
Q  102 gtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttg-ttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| || || |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |    
T  3086 gtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgcttgtg 2987  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  2986 tatgcatattcatg 2973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 6103 - 6315
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| | ||||    
T  6103 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtaaaaattgtgctgaatt 6202  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||| ||||||||||    
T  6203 ggtgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttttgttatgattgatgaataattgcttggg 6301  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  6302 tatgcatattcatg 6315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 41871 - 41659
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  41871 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgttcaattg 41772  T
Q  102 gtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggt 201  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||  | |  ||  | ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41771 gtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaaatgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggt 41672  T
Q  202 atgcatattcatg 214  Q
    |||||||||||||    
T  41671 atgcatattcatg 41659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 136; Significance: 4e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3936 - 3733
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaa-tgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaatttt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  3936 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaaatgataagttatggaaattgtgtccaattggtgaatttt 3837  T
Q  111 gctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatatt 210  Q
    |||||||||| |||   ||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  3836 gctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattacttgggtttgcatatt 3737  T
Q  211 catg 214  Q
    ||||    
T  3736 catg 3733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12337 - 12126
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||    
T  12337 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaaatacatgtttaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctaaatt 12238  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    ||||||||||| |||||||| ||   |||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||    
T  12237 ggtgaattttgttaagttgttgt--aattgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattcatgaataattgcttggg 12140  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  12139 tatgcatattcatg 12126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 34500 - 34713
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||   ||||| ||||||||||  ||||| |    
T  34500 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattgtgtaaaaatatgaagttgtgaaaattgttctcaatag 34599  T
Q  102 gtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttg-ttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| || || |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  34600 gtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactacttggg 34699  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  34700 tatgcatattcatg 34713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 128208 - 128420
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||| ||||||||||| ||||||    
T  128208 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaggtgttaagttgtgaaaattgtgctcaatt 128307  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    || |||||||| || ||||| |||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  128308 ggcgaattttgttaggttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaatggatgttgtgattgatgaataattgattggg 128406  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||    
T  128407 tatgcatattcatg 128420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 31703 - 31917
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  31703 tatgtttgaatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctcaattg 31802  T
Q  102 gtgaattt-tgct-aagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgg 199  Q
    |||||||| | || ||||||| ||||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||||  ||||| || || || || ||||||||| |||||||||    
T  31803 gtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttaatattatgattgatgaataattgcttgg 31902  T
Q  200 gtatgcatattcatg 214  Q
    || ||||||||||||    
T  31903 gtttgcatattcatg 31917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 125; Significance: 1e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13729 - 13517
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||    
T  13729 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattg 13630  T
Q  102 gtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggt 201  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||  | |  ||  | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  13629 atgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggt 13530  T
Q  202 atgcatattcatg 214  Q
    |||||||||||||    
T  13529 atgcatattcatg 13517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 21144 - 21356
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  21144 tatgtttgtatccattaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgagctcaattg 21243  T
Q  102 gtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggt 201  Q
    ||||||||| ||||||||| |||   ||||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||||||||| |||||||| ||    
T  21244 gtgaattttcctaagttgttgttaatttgagattggattcttgttcaattgatgttatgaatgttatttgatgttatgattgatgaataattgcttgagt 21343  T
Q  202 atgcatattcatg 214  Q
     ||||||||||||    
T  21344 ttgcatattcatg 21356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 14089 - 14301
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  14089 tatgtctgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttgaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgtgctcaattg 14188  T
Q  102 gtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggt 201  Q
    ||||||||| ||||||||| | |   ||||| |  ||||||||||||||| ||||||||  ||||  |||||||| || ||||||||| |||||||| ||    
T  14189 gtgaattttcctaagttgttgataatttgagattggattcttgttcaattaatgttatgaatgttgtttgatgttatgattgatgaataattgcttgagt 14288  T
Q  202 atgcatattcatg 214  Q
     ||||||||||||    
T  14289 ttgcatattcatg 14301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 43221 - 43008
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||    
T  43221 tatgtttctatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgaagattgtgctaaattg 43122  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||| | ||||||||| |||   ||||| | |||||| ||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  43121 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcgtgttcaagtgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttggg 43022  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    | ||||||||||||    
T  43021 tttgcatattcatg 43008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 39313 - 39240
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  39313 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 39240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 114; Significance: 5e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 259 - 46
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  259 tatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgtatattgtgctcaattg 160  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||| | ||||||||| |||   ||||| | |||| ||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || || |||||| ||||||||||    
T  159 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattgcttggg 60  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    | ||||||||||||    
T  59 tttgcatattcatg 46  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 37105 - 37317
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||   |||     
T  37105 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatg 37204  T
Q  101 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37205 gatgaa-tttgacatgttgtagttggattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttggg 37303  T
Q  201 tatgcatattcatg 214  Q
    ||| ||||||||||    
T  37304 tatacatattcatg 37317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 118
Target Start/End: Original strand, 13353 - 13469
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  13353 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaattg 13452  T
Q  102 gtgaattttgctaagtt 118  Q
    |||||||||||||||||    
T  13453 gtgaattttgctaagtt 13469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 5752 - 5552
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  5752 tatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagtcatgaatattgtgctcaattg 5653  T
Q  102 gtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 200  Q
    |||||||| | ||||||||| |||   ||||| | |||| ||||||||| ||||||||||  ||||| |||||  | || || |||||| ||||||||||    
T  5652 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttggg 5553  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  5552 t 5552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 51221 - 51328
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  51221 atatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaataggtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 51320  T
Q  101 ggtgaatt 108  Q
    ||||||||    
T  51321 ggtgaatt 51328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 84; Significance: 4e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 109
Target Start/End: Original strand, 1332 - 1439
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  1332 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattg 1431  T
Q  102 gtgaattt 109  Q
    ||||||||    
T  1432 gtgaattt 1439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 84; Significance: 4e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 127 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9480 - 9393
Alignment:
Q  127 attgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9480 attgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 9393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 89493 - 89605
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  89493 atatatttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaattataagttgtgaaaattgtgctcaatt 89592  T
Q  101 ggtgaattttgct 113  Q
    |||||||| ||||    
T  89593 ggtgaattatgct 89605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 22764 - 22672
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtg 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  22764 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtg 22672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 27019 - 26927
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtg 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  27019 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtg 26927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 1621 - 1713
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtg 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  1621 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtg 1713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 65; Significance: 9e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 209
Target Start/End: Original strand, 56149 - 56347
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg--ttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattt 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  || || |||||| |||||  |||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  56149 tgcatgatttgatgataattgtatgattgtggctgaaattacatgttttaaagtatgtataaatgtcaagttatg-aaattgtgctcaaatggtgaattt 56247  T
Q  110 tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatat 209  Q
    ||||||||||| |||| |  ||  | |||||| ||||| |||||||||   | | |||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||||||||    
T  56248 tgctaagttgttgttgaaaagatatgtgattcatgttccattgatgttgatgctattaattgatgttgttgtgggtgaatcatgacttgggtatgcatat 56347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 65; Significance: 9e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 54630 - 54431
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattt 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||| |||||  |||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  54630 tgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattgcatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttatg-aaattgtactcaattggtgaattt 54532  T
Q  110 tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatat 209  Q
    || || ||||| |||| | |||| | |||||| ||||| ||||||||| | | | |||| ||||||||| || | ||||||||   |||||||| |||||    
T  54531 tgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtgaatcatgagttgggtatacatat 54432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 45244 - 45077
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattt 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||  ||||| || |||||||  |||||||||||||||    
T  45244 tgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttttg-aaattgtactcaattggtgaattt 45146  T
Q  110 tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgt 178  Q
    || || ||||| |||| | |||| | |||||| ||||| ||||||||| | | | |||| |||||||||    
T  45145 tgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgt 45077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 3410 - 3289
Alignment:
Q  5 gtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacat-gttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattgg 102  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||   |||||||| |||||||  |||| |||    
T  3410 gtttgtatgcatgaattaatgatatttgtatgattgttggtgaaattacatatttcaaagtatgtataaatatcaagttatg-aaattgtactcaaatgg 3312  T
Q  103 tgaattttgctaagttgtggttg 125  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  3311 tgaattttgctaagttgttgttg 3289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3266 - 3219
Alignment:
Q  167 aattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  3266 aattgatgttgtgattgatgaatcattgtttgggtaggcatattcatg 3219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 136 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 48603 - 48525
Alignment:
Q  136 tgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 214  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  48603 tgattcttgttcacttgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatg 48525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 22445 - 22646
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc-aaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttc-a 97  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||  |||| || || |    
T  22445 atatgtttgtatgcatgaaattgatgataatttaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaaatatgtataaatgctaacttatg--aattatgctcaa 22542  T
Q  98 attggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgctt 197  Q
    |||  |||||| ||||| ||||| |||| |||||| | ||| || |||| |||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||| || |||| | ||    
T  22543 attattgaattgtgctatgttgttgttgaattgagatgtgaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaattgatattgttgttgaagattcatagttt 22642  T
Q  198 gggt 201  Q
    ||||    
T  22643 gggt 22646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 214
Target Start/End: Original strand, 26 - 104
Alignment:
Q  136 tgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 214  Q
    |||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  26 tgattcttgttcaaatgatattatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatg 104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 8234 - 8026
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||| || |||||||||| |||||| || || ||| |||||  | || || ||||    
T  8234 atatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaagtatgtataagtgctaacttatg--atttatgctcaa 8137  T
Q  99 tt-ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgctt 197  Q
    || |||||||| ||||| ||||| || | |||  | |  ||  | ||||||||||||||| | |||| ||  ||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  8136 ttgggtgaattatgctatgttgttgtggaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgctatgtgatgttgttgttgatgattcatagctt 8037  T
Q  198 gggtatgcata 208  Q
    |||||| ||||    
T  8036 gggtattcata 8026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 76870 - 77078
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaa 98  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| |||||  |  ||||  || |||||||    
T  76870 atatgtttgaatgcatgaaattgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaa--ttatgttcaa 76967  T
Q  99 -ttggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgctt 197  Q
     ||| |||||| ||||| ||||| |||| |||| | |  ||||| ||||||||||||||| | |||| ||| |||| ||||  ||||||| |||| ||||    
T  76968 attgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttattgatgattcatggctt 77067  T
Q  198 gggtatgcata 208  Q
    |||||| ||||    
T  77068 gggtattcata 77078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Original strand, 1617 - 1694
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  1617 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 1694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Original strand, 10381 - 10458
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  10381 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgctaagttatgaaa 10458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 3625 - 3577
Alignment:
Q  14 catgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3625 catgaattgatgattatggtatgattgtgggtgaaattacatgttcaaa 3577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 22452 - 22514
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||| || ||||||||||    
T  22452 atatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaa 22514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 54088 - 54038
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  54088 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttcaaa 54038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1666 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1666
Description:

Target: scaffold1666; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Original strand, 38 - 115
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||  ||||| ||||||||||||    
T  38 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtgtaaatgttaagttatgaaa 115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1500 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:

Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Original strand, 1556 - 1633
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  1556 tgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 1633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0970 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:

Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 2536 - 2471
Alignment:
Q  143 tgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcata 208  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  2536 tgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcata 2471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 39860 - 39783
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||  |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  39860 tgcatgaattgatgattatggtatttttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 39783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 31519 - 31446
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  31519 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 31446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 35559 - 35494
Alignment:
Q  143 tgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcata 208  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  35559 tgttcaattgatgtttttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcata 35494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Original strand, 104646 - 104733
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaa 86  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||  ||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||| ||| |||||||    
T  104646 atatgtttgtatgcattaaattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcaggttcaaagtatgtataaatgctaacttatgaa 104733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 2749 - 2687
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  2749 atatgtttggatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 2687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 6885 - 6823
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  6885 atatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 6823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 1371 - 1449
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgata 77  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||    
T  1371 atatgtttgtatgcataaaattggtgataattggattgttgttggtgaaattgcatggtcaaagtatgtgaaaatgata 1449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 9626 - 9704
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgata 77  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||    
T  9626 atatgtttgtatgcataaaattggtgataattggattgttgttggtgaaattgcatggtcaaagtatgtgaaaatgata 9704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 4829 - 4751
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgata 77  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||    
T  4829 atatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgata 4751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1272 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:

Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 517 - 456
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    |||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  517 tatgtttgaatgcatgaagttgttgataattatattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 2606 - 2529
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 87  Q
    |||||||||||||| | || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||| ||||||    
T  2606 tgcatgaattgatgcttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtcatgaaa 2529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Original strand, 2340 - 2401
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  2340 tatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 2401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Original strand, 43822 - 43883
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  43822 tatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 43883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 207
Target Start/End: Original strand, 33854 - 33958
Alignment:
Q  103 tgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggta 202  Q
    |||||| ||||| ||||| |||| |||| | || ||||| || |||||||||||| | |||| ||| ||||||||| | | || | |||| |||||||||    
T  33854 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgataataattcatggcttgggta 33953  T
Q  203 tgcat 207  Q
    |||||    
T  33954 tgcat 33958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University