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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6314_low_92 (Length: 238)

Name: NF6314_low_92
Description: NF6314
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6314_low_92
NF6314_low_92
[»] chr4 (2 HSPs)
chr4 (1-223)||(22327705-22327927)
chr4 (1-223)||(54955881-54956104)
[»] chr7 (4 HSPs)
chr7 (1-223)||(17727810-17728031)
chr7 (1-223)||(13821464-13821687)
chr7 (4-223)||(4808545-4808763)
chr7 (4-223)||(12767162-12767380)
[»] chr8 (8 HSPs)
chr8 (1-223)||(27893815-27894036)
chr8 (1-223)||(28501358-28501581)
chr8 (1-221)||(27906050-27906267)
chr8 (1-221)||(27952469-27952686)
chr8 (1-223)||(18758848-18759064)
chr8 (124-223)||(15287053-15287152)
chr8 (124-223)||(15467422-15467521)
chr8 (183-223)||(22928073-22928113)
[»] chr5 (2 HSPs)
chr5 (1-223)||(23838276-23838497)
chr5 (1-223)||(23606881-23607101)
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (1-223)||(23008410-23008632)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (1-223)||(40065892-40066112)
[»] chr6 (1 HSPs)
chr6 (4-223)||(7409377-7409595)
[»] chr1 (2 HSPs)
chr1 (4-223)||(26083180-26083398)
chr1 (3-223)||(24637546-24637765)
[»] scaffold0594 (1 HSPs)
scaffold0594 (1-223)||(7984-8205)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 2)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22327927 - 22327705
Alignment:
Q  1 tgattcccacaaaataattcacatatgtcatattaattaacttcataannnnnnnnactaatttacattatttttctaacaaacttaattatacatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22327927 tgattcccacaaaataattcacatatgtcatattaattaacttcataattttttttactaatttacattatttttctaacaaacttaattatacatattt 22327828  T
Q  101 ctttactaacttaacnnnnnnnnaaagaactacgataacatttttactaaccacatttattttaagtaaaacaaatttgatctagataacatatttacta 200  Q
    ||||||||||||||         |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22327827 ctttactaacttaatgtttttttaaagaactacgataacatattcactaactacatttattttaagtaaaacaaatttgatctaaataacatatttacta 22327728  T
Q  201 caatttaattttactaactatgt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  22327727 caatttaattttactaactatgt 22327705  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 54955881 - 54956104
Alignment:
Q  1 tgattcccacaaaataattcacatatgtcatattaattaacttcataannnnnnnna-ctaatttacattatttttctaacaaacttaattatacatatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54955881 tgattcccacaaaataattcacatatgtcatattaattaacttcataatttttttttgctactttacattatttttctaacaaacttaattatacatatt 54955980  T
Q  100 tctttactaacttaacnnnnnnnnaaagaactacgataacatttttactaaccacatttattttaagtaaaacaaatttgatctagataacatatttact 199  Q
    ||||||||||||||||        ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54955981 tctttactaacttaacttttttttaaagaactacggtaacatttttactagctacatttattttacgtaaaacaaatttgatctaaataacatatttact 54956080  T
Q  200 acaatttaattttactaactatgt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  54956081 acaatttaattttactaactatgt 54956104  T

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Target: chr7 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 4)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17728031 - 17727810
Alignment:
Q  1 tgattcccacaaaataattcacatatgtcatattaattaacttcataannnnnnnnactaatttacattatttttctaacaaacttaattatacatattt 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17728031 tgatttccacaaaataattcacatatgtcatattaattaacttcataattttttt-actaatttacattatttttctaacaaacttaattatacatattt 17727933  T
Q  101 ctttactaacttaacnnnnnnnnaaagaactacgataacatttttactaaccacatttattttaagtaaaacaaatttgatctagataacatatttacta 200  Q
    |||||||||||||||        ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17727932 ctttactaacttaacttttttttaaagaactaccgtaacatttttactaactacatttattttaagtaaaacaaatttgatctaaataacatatttacta 17727833  T
Q  201 caatttaattttactaactatgt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  17727832 caatttaattttactaactatgt 17727810  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13821687 - 13821464
Alignment:
Q  1 tgattcccacaaaataattcacatatgtcatattaattaacttcataannnnnnnn-actaatttacattatttttctaacaaacttaattatacatatt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13821687 tgattcccacaaaataattcacatatgtcatattaattaaattcataatttttttttactaatttacattatttttctaacaaacttaattatacatatt 13821588  T
Q  100 tctttactaacttaacnnnnnnnnaaagaactacgataacatttttactaaccacatttattttaagtaaaacaaatttgatctagataacatatttact 199  Q
    ||||||||||||||||        ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13821587 tctttactaacttaacttttttttaaagaactacggtaacatttttactaactacatttattttacgtaaaacaaatttgatctaaataacatatttact 13821488  T
Q  200 acaatttaattttactaactatgt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  13821487 acaatttaattttactaactatgt 13821464  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 4808545 - 4808763
Alignment:
Q  4 ttcccacaaaataattcacatatgtcatattaattaacttcataannnnnnnnactaatttacattatttttctaacaaacttaattatacatatttctt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4808545 ttcccacaaaataattcacatatgtcatattaattaacttcataatttttttg-ctactttacattatttttctaacaaacttaattatacatatttctt 4808643  T
Q  104 tactaacttaacnnnnnnnnaaagaactacgataacatttttactaaccacatttattttaagtaaaacaaatttgatctagataacatatttactacaa 203  Q
    ||||||||||||        ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4808644 tactaacttaacttttttttaaagaactacggtaacatttttactagctacatttattttacgtaaaacaaatttgatctaaataacatatttactacaa 4808743  T
Q  204 tttaattttactaactatgt 223  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  4808744 tttaattttactaactatgt 4808763  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 12767162 - 12767380
Alignment:
Q  4 ttcccacaaaataattcacatatgtcatattaattaacttcataannnnnnnnactaatttacattatttttctaacaaacttaattatacatatttctt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12767162 ttcccacaaaataattcacatatgtcatattaattaacttcataatttttttg-ctactttacattatttttctaacaaacttaattatacatatttctt 12767260  T
Q  104 tactaacttaacnnnnnnnnaaagaactacgataacatttttactaaccacatttattttaagtaaaacaaatttgatctagataacatatttactacaa 203  Q
    ||||||||||||        ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12767261 tactaacttaacttttttttaaagaactacggtaacatttttactagctacatttattttacgtaaaacaaatttgatctaaataacatatttactacaa 12767360  T
Q  204 tttaattttactaactatgt 223  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12767361 tttaattttactaactatgt 12767380  T

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Target: chr8 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 8)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 27893815 - 27894036
Alignment:
Q  1 tgattcccacaaaataattcacatatgtcatattaattaacttcataannnnnnnnactaatttacattatttttctaacaaacttaattatacatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27893815 tgattcccacaaaataattcacatatgtcatattaattaacttcataatttttttg-ctaatttacattatttttctaacaaacttaattatacatattt 27893913  T
Q  101 ctttactaacttaacnnnnnnnnaaagaactacgataacatttttactaaccacatttattttaagtaaaacaaatttgatctagataacatatttacta 200  Q
    |||||||||||||||        ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27893914 ctttactaacttaacttttttttaaagaactacggtaacatttttactagctacatttattttacgtaaaacaaatttgatctaaataacatatttacta 27894013  T
Q  201 caatttaattttactaactatgt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  27894014 caatttaattttactaactatgt 27894036  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 28501358 - 28501581
Alignment:
Q  1 tgattcccacaaaataattcacatatgtcatattaattaacttcataannnnnnnnactaatttacattatttttctaacaaacttaattatacatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28501358 tgattcccacaaaataattcacatatgtcatattaattaacttcataattctttttactaatttacattatttttctaacaaacttaattatacatattt 28501457  T
Q  101 ctttactaacttaacnnnnnnnn-aaagaactacgataacatttttactaaccacatttattttaagtaaaacaaatttgatctagataacatatttact 199  Q
    ||||||||||||||          ||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28501458 ctttactaacttaattttttttttaaagaacgacgataacatattgactaactacatttattttaagtaaaacaaatttgatctaaataacatatttact 28501557  T
Q  200 acaatttaattttactaactatgt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  28501558 acaatttaattttactaactatgt 28501581  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 27906050 - 27906267
Alignment:
Q  1 tgattcccacaaaataattcacatatgtcatattaattaacttcataannnnnnnnactaatttacattatttttctaacaaacttaattatacatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27906050 tgattcccacaaaataattcacatatgtcatattaattaacttcataacttttttg-ctaatttacattatttttctaacaaacttaattatacatattt 27906148  T
Q  101 ctttactaa-cttaacnnnnnnnnaaagaactacgataacatttttactaaccacatttattttaagtaaaacaaatttgatctagataacatatttact 199  Q
    ||||||||| |||           ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27906149 ctttactaaactt---ttttttttaaagaactacggtaacatttttactagctacatttattttacgtaaaacaaatttgatctaaataacatatttact 27906245  T
Q  200 acaatttaattttactaactat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27906246 acaatttaattttactaactat 27906267  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 27952469 - 27952686
Alignment:
Q  1 tgattcccacaaaataattcacatatgtcatattaattaacttcataannnnnnnnactaatttacattatttttctaacaaacttaattatacatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27952469 tgattcccacaaaataattcacatatgtcatattaattaacttcataacttttttg-ctaatttacattatttttctaacaaacttaattatacatattt 27952567  T
Q  101 ctttactaa-cttaacnnnnnnnnaaagaactacgataacatttttactaaccacatttattttaagtaaaacaaatttgatctagataacatatttact 199  Q
    ||||||||| |||           ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27952568 ctttactaaactt---ttttttttaaagaactacggtaacatttttactagctacatttattttacgtaaaacaaatttgatctaaataacatatttact 27952664  T
Q  200 acaatttaattttactaactat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27952665 acaatttaattttactaactat 27952686  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18759064 - 18758848
Alignment:
Q  1 tgattcccacaaaataattcacatatgtcatattaattaacttcataannnnnnnnactaatttacattatttttctaacaaacttaattatacatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18759064 tgattcccacaaaataattcacatatgtcatataaattaacttcataattttttt-actaatttacattatttttctaacaaacttaattatacatattt 18758966  T
Q  101 ctttactaacttaacnnnnnnnnaaagaactacgataacatttttactaaccacatttattttaagtaaaacaaatttgatctagataacatatttacta 200  Q
     ||||||||||||||        ||||||||||| |||||||||||||||| |||     | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  18758965 ttttactaacttaacttttttttaaagaactacggtaacatttttactaactaca-----tataagtaaaacaaatttgatctgaataacatatttacta 18758871  T
Q  201 caatttaattttactaactatgt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  18758870 caatttaattttactaactatgt 18758848  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 124 - 223
Target Start/End: Original strand, 15287053 - 15287152
Alignment:
Q  124 aaagaactacgataacatttttactaaccacatttattttaagtaaaacaaatttgatctagataacatatttactacaatttaattttactaactatgt 223  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15287053 aaagaactatggtaacatttttactaactacattttttttaagtaaaacaaattttatctaaataacatatttactacaatttaattttactaactatgt 15287152  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 124 - 223
Target Start/End: Original strand, 15467422 - 15467521
Alignment:
Q  124 aaagaactacgataacatttttactaaccacatttattttaagtaaaacaaatttgatctagataacatatttactacaatttaattttactaactatgt 223  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15467422 aaagaactatggtaacatttttactaactacattttttttaagtaaaacaaattttatctaaataacatatttactacaatttaattttactaactatgt 15467521  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22928113 - 22928073
Alignment:
Q  183 tagataacatatttactacaatttaattttactaactatgt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22928113 tagataacatatttactacaatttaattttactaactatgt 22928073  T

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Target: chr5 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23838497 - 23838276
Alignment:
Q  1 tgattcccacaaaataattcacatatgtcatattaattaacttcataannnnnnnnactaatttacattatttttctaacaaacttaattatacatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23838497 tgattcccacaaaataattcacatatgtcatattaattaacttcataattttttt-actaatttacattatttttctaacaaacataattatacatattt 23838399  T
Q  101 ctttactaacttaacnnnnnnnnaaagaactacgataacatttttactaaccacatttattttaagtaaaacaaatttgatctagataacatatttacta 200  Q
    |||||||||||||||        ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23838398 ctttactaacttaacttttttttaaagaactacggtaacatttttactaactacatttattttacgtaaaacaaatttgatctaaataacatatttacta 23838299  T
Q  201 caatttaattttactaactatgt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  23838298 taatttaattttactaactatgt 23838276  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23607101 - 23606881
Alignment:
Q  1 tgattcccacaaaataattcacatatgtcatattaattaacttcataannnnnnnnactaatttacattatttttctaacaaacttaattatacatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23607101 tgattcccacaaaataattcacatatgtcatattaattaacttcataattttttt-actaatttacattatttttctaacaaacataattatacatattt 23607003  T
Q  101 ctttactaacttaacnnnnnnnnaaagaactacgataacatttttactaaccacatttattttaagtaaaacaaatttgatctagataacatatttacta 200  Q
    |||||||||||||||        ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23607002 ctttactaacttaacttttttt-aaagaactacggtaacatttttactaactacatttattttacgtaaaacaaatttgatctaaataacatatttacta 23606904  T
Q  201 caatttaattttactaactatgt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  23606903 taatttaattttactaactatgt 23606881  T

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Target: chr3 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23008632 - 23008410
Alignment:
Q  1 tgattcccacaaaataattcacatatgtcatattaattaacttcataannnnnnnnactaatttacattatttttctaacaaacttaattatacatattt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23008632 tgattcccacaaaataattcacatatatcatattaattaacttcataattgtttt-actaatttacattatttttctaacaaacttaattatacatattt 23008534  T
Q  101 ctttactaacttaacnnnnnnnnaaa-gaactacgataacatttttactaaccacatttattttaagtaaaacaaatttgatctagataacatatttact 199  Q
    |||||||||||||||        ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23008533 ctttactaacttaactttttttcaaaagaactacggtaacatttttactaactacatttattttacgtaaaacaaatttgatctaaataacatatttact 23008434  T
Q  200 acaatttaattttactaactatgt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  23008433 acaatttaattttactaactatgt 23008410  T

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Target: chr2 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 40066112 - 40065892
Alignment:
Q  1 tgattcccacaaaataattcacatatgtcatattaattaacttcataannnnnnnnactaatttacattatttttctaacaaacttaattatacatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40066112 tgattcccacaaaataattcacatatgtcatattaattaacttcataattttttg--ctactttacattatttttctaacaaacttaattatacatattt 40066015  T
Q  101 ctttactaacttaacnnnnnnnnaaagaactacgataacatttttactaaccacatttattttaagtaaaacaaatttgatctagataacatatttacta 200  Q
    |||||||||||||||        ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40066014 ctttactaacttaacttttttttaaagaactacggtaacatttttactagctacatttattttacgtaaaacaaatttgatctaaataacatatttacta 40065915  T
Q  201 caatttaattttactaactatgt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  40065914 caatttaattttactaactatgt 40065892  T

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Target: chr6 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 7409377 - 7409595
Alignment:
Q  4 ttcccacaaaataattcacatatgtcatattaattaacttcataannnnnnnnactaatttacattatttttctaacaaacttaattatacatatttctt 103  Q
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T  7409377 ttcccacaaaataattcacatatgtcatattaattaacttcataatttttttg-ctactttacattatttttctaacaaacttaattatacatatttctt 7409475  T
Q  104 tactaacttaacnnnnnnnnaaagaactacgataacatttttactaaccacatttattttaagtaaaacaaatttgatctagataacatatttactacaa 203  Q
    ||||||||||||        ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7409476 tactaacttaacttttttttaaagaactacggtaacatttttactagctacatttattttacgtaaaacaaatttgatctaaataacatatttactacaa 7409575  T
Q  204 tttaattttactaactatgt 223  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  7409576 tttaattttactaactatgt 7409595  T

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Target: chr1 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 2)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 26083180 - 26083398
Alignment:
Q  4 ttcccacaaaataattcacatatgtcatattaattaacttcataannnnnnnnactaatttacattatttttctaacaaacttaattatacatatttctt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26083180 ttcccacaaaataattcacatatgtcatattaattaacttcataatttttttg-ctactttacattatttttctaacaaacttaattatacatatttctt 26083278  T
Q  104 tactaacttaacnnnnnnnnaaagaactacgataacatttttactaaccacatttattttaagtaaaacaaatttgatctagataacatatttactacaa 203  Q
    ||||||||||||        ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26083279 tactaacttaacttttttttaaagaactacggtaacatttttactagctacatttattttacgtaaaacaaatttgatctaaataacatatttactacaa 26083378  T
Q  204 tttaattttactaactatgt 223  Q
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T  26083379 tttaattttactaactatgt 26083398  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24637765 - 24637546
Alignment:
Q  3 attcccacaaaataattcacatatgtcatattaattaacttcataannnnnnnnactaatttacattatttttctaacaaacttaattatacatatttct 102  Q
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T  24637765 attcccaaaaaataattcacatatatcatattaattaacttcataattttttt-actaatttacattatttttctaacaaacttaattatacatatttct 24637667  T
Q  103 ttactaacttaacnnnnnnnnaaagaactacgataacatttttactaaccacatttattttaagtaaaacaaatttgatctagataacatatttactaca 202  Q
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T  24637666 ttactaacttaacttttttttaaagaactacagtaacatttttactaactacatttattttaagtaaaacaaatttgatctaaataacatatttactgta 24637567  T
Q  203 atttaattttactaactatgt 223  Q
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T  24637566 agttaattttactaaccatgt 24637546  T

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Target: scaffold0594 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0594
Description:

Target: scaffold0594; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8205 - 7984
Alignment:
Q  1 tgattcccacaaaataattcacatatgtcatattaattaacttcataannnnnnnnactaatttacattatttttctaacaaacttaattatacatattt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8205 tgattcccacaaaataattcacatatgtcatattaattaacttcataatttttttg-ctaatttacattatttttctaacaaacttaattatacatattt 8107  T
Q  101 ctttactaacttaacnnnnnnnnaaagaactacgataacatttttactaaccacatttattttaagtaaaacaaatttgatctagataacatatttacta 200  Q
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T  8106 ctttactaacttaacttttttttaaagaaccacggtaacatttttactaactacgtttatttgacgtaaaacaaatttgatctaaataacatatttacta 8007  T
Q  201 caatttaattttactaactatgt 223  Q
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T  8006 caatttaattttactaactatgt 7984  T

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