View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6331_low_32 (Length: 216)

Name: NF6331_low_32
Description: NF6331
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6331_low_32
NF6331_low_32
[»] chr7 (46 HSPs)
chr7 (15-191)||(47219145-47219321)
chr7 (15-191)||(8162677-8162853)
chr7 (15-177)||(1469472-1469634)
chr7 (15-177)||(47281103-47281265)
chr7 (15-191)||(44544409-44544585)
chr7 (15-191)||(47294256-47294432)
chr7 (15-191)||(23842305-23842481)
chr7 (15-191)||(31684099-31684275)
chr7 (15-191)||(35600087-35600263)
chr7 (15-191)||(38427528-38427704)
chr7 (15-167)||(47271981-47272133)
chr7 (19-161)||(33884323-33884465)
chr7 (15-191)||(11476521-11476697)
chr7 (15-191)||(43752741-43752917)
chr7 (28-191)||(2960605-2960768)
chr7 (20-191)||(7336065-7336235)
chr7 (15-191)||(30798333-30798509)
chr7 (15-191)||(30876259-30876435)
chr7 (19-191)||(37393963-37394135)
chr7 (15-191)||(48628805-48628981)
chr7 (15-167)||(27364328-27364480)
chr7 (15-191)||(40851274-40851450)
chr7 (15-191)||(41113377-41113553)
chr7 (15-191)||(42979304-42979479)
chr7 (15-191)||(45723456-45723632)
chr7 (15-177)||(43968238-43968400)
chr7 (19-177)||(44800389-44800547)
chr7 (39-191)||(221299-221451)
chr7 (15-190)||(30971908-30972082)
chr7 (15-191)||(41139374-41139553)
chr7 (15-191)||(47579052-47579228)
chr7 (15-135)||(3797544-3797664)
chr7 (19-151)||(4923220-4923352)
chr7 (19-191)||(11050226-11050398)
chr7 (15-191)||(47119991-47120169)
chr7 (15-150)||(29248342-29248477)
chr7 (19-177)||(18353148-18353306)
chr7 (15-135)||(27774108-27774228)
chr7 (19-135)||(37354284-37354400)
chr7 (15-108)||(40520918-40521011)
chr7 (15-75)||(39034062-39034122)
chr7 (103-191)||(42888937-42889025)
chr7 (138-191)||(23842210-23842263)
chr7 (15-58)||(43025112-43025155)
chr7 (15-64)||(29739781-29739829)
chr7 (100-136)||(5106127-5106163)
[»] chr8 (39 HSPs)
chr8 (15-191)||(2533272-2533448)
chr8 (15-191)||(3875908-3876084)
chr8 (15-191)||(9056303-9056479)
chr8 (15-191)||(36400035-36400211)
chr8 (15-191)||(43806498-43806674)
chr8 (15-191)||(22683953-22684129)
chr8 (19-191)||(37933646-37933818)
chr8 (20-191)||(15847117-15847288)
chr8 (15-177)||(1293486-1293648)
chr8 (17-191)||(35884395-35884569)
chr8 (15-191)||(513308-513483)
chr8 (19-191)||(38107103-38107275)
chr8 (15-168)||(39513327-39513480)
chr8 (15-167)||(28707435-28707587)
chr8 (15-191)||(35443311-35443487)
chr8 (19-177)||(259982-260139)
chr8 (19-177)||(655782-655939)
chr8 (19-177)||(841517-841674)
chr8 (15-191)||(12010549-12010728)
chr8 (15-135)||(7434886-7435006)
chr8 (15-191)||(33651841-33652017)
chr8 (19-177)||(38208756-38208914)
chr8 (15-191)||(23972260-23972437)
chr8 (30-191)||(41536492-41536653)
chr8 (15-191)||(28496320-28496495)
chr8 (19-190)||(36218747-36218917)
chr8 (19-191)||(440844-441016)
chr8 (15-135)||(23935233-23935353)
chr8 (15-191)||(24430536-24430712)
chr8 (15-191)||(38633675-38633851)
chr8 (19-160)||(40301889-40302030)
chr8 (17-135)||(6016207-6016325)
chr8 (15-167)||(42988216-42988367)
chr8 (19-191)||(4649154-4649326)
chr8 (15-191)||(13797089-13797264)
chr8 (15-135)||(29485287-29485406)
chr8 (91-177)||(24193109-24193195)
chr8 (15-93)||(24193356-24193433)
chr8 (21-80)||(8137180-8137239)
[»] chr4 (55 HSPs)
chr4 (15-191)||(55517150-55517326)
chr4 (15-191)||(4544950-4545126)
chr4 (15-191)||(11795119-11795295)
chr4 (15-191)||(28264643-28264819)
chr4 (15-191)||(31973591-31973767)
chr4 (17-191)||(2055280-2055454)
chr4 (15-177)||(42273802-42273964)
chr4 (15-191)||(5227390-5227566)
chr4 (15-191)||(15985010-15985186)
chr4 (15-191)||(31591076-31591251)
chr4 (15-191)||(33807745-33807921)
chr4 (15-190)||(19496068-19496243)
chr4 (20-191)||(49118616-49118787)
chr4 (17-191)||(8881978-8882152)
chr4 (15-189)||(12196469-12196643)
chr4 (17-191)||(24458596-24458770)
chr4 (15-177)||(28159932-28160094)
chr4 (18-191)||(48149502-48149675)
chr4 (19-191)||(23134971-23135143)
chr4 (19-167)||(23553069-23553216)
chr4 (19-191)||(48551729-48551901)
chr4 (15-191)||(48707698-48707874)
chr4 (16-191)||(33173985-33174160)
chr4 (20-191)||(44490324-44490495)
chr4 (17-191)||(26017425-26017599)
chr4 (19-176)||(32317957-32318114)
chr4 (15-191)||(17847061-17847236)
chr4 (15-191)||(28812252-28812427)
chr4 (15-191)||(32118714-32118890)
chr4 (15-151)||(40988633-40988769)
chr4 (15-167)||(9339112-9339267)
chr4 (15-191)||(35930040-35930215)
chr4 (17-191)||(37381848-37382022)
chr4 (15-177)||(39995146-39995308)
chr4 (15-191)||(10588580-10588756)
chr4 (15-191)||(30141073-30141249)
chr4 (19-191)||(30466968-30467140)
chr4 (15-190)||(33693299-33693474)
chr4 (15-135)||(24623148-24623268)
chr4 (19-191)||(25730244-25730416)
chr4 (15-167)||(39700045-39700197)
chr4 (17-191)||(50276103-50276274)
chr4 (15-191)||(50542319-50542495)
chr4 (19-150)||(25734229-25734360)
chr4 (15-191)||(22298517-22298694)
chr4 (15-167)||(17993006-17993158)
chr4 (47-191)||(31208776-31208920)
chr4 (15-167)||(51371036-51371188)
chr4 (15-166)||(14564796-14564947)
chr4 (15-135)||(19168816-19168936)
chr4 (15-135)||(42549643-42549762)
chr4 (15-96)||(56555200-56555281)
chr4 (75-191)||(20534225-20534341)
chr4 (138-191)||(48149404-48149457)
chr4 (139-191)||(51371262-51371314)
[»] chr3 (57 HSPs)
chr3 (15-191)||(55164080-55164256)
chr3 (15-191)||(33151696-33151872)
chr3 (19-191)||(35346436-35346608)
chr3 (19-191)||(1687655-1687827)
chr3 (15-191)||(20813406-20813582)
chr3 (15-191)||(22851996-22852172)
chr3 (15-191)||(1017044-1017220)
chr3 (15-191)||(21564496-21564672)
chr3 (15-191)||(38446476-38446652)
chr3 (15-191)||(53925944-53926120)
chr3 (20-191)||(21890175-21890346)
chr3 (20-190)||(42016878-42017048)
chr3 (15-191)||(21656518-21656694)
chr3 (15-191)||(31122662-31122838)
chr3 (15-191)||(47329140-47329316)
chr3 (15-191)||(20086279-20086455)
chr3 (15-191)||(20760036-20760212)
chr3 (15-167)||(41250886-41251038)
chr3 (15-191)||(42107064-42107240)
chr3 (15-191)||(51562162-51562338)
chr3 (15-191)||(52821014-52821190)
chr3 (15-191)||(19268521-19268703)
chr3 (15-161)||(36314967-36315113)
chr3 (19-192)||(10618444-10618617)
chr3 (15-152)||(19664541-19664678)
chr3 (15-191)||(26455582-26455758)
chr3 (15-191)||(1448700-1448873)
chr3 (15-177)||(35608110-35608272)
chr3 (15-191)||(27070704-27070880)
chr3 (15-191)||(29677476-29677652)
chr3 (15-191)||(37247956-37248132)
chr3 (19-191)||(50287570-50287742)
chr3 (15-191)||(53196014-53196189)
chr3 (15-190)||(48651248-48651423)
chr3 (19-191)||(32650785-32650957)
chr3 (15-148)||(12748391-12748524)
chr3 (19-191)||(40922130-40922302)
chr3 (15-167)||(44798268-44798419)
chr3 (19-135)||(51475267-51475383)
chr3 (17-167)||(3697148-3697298)
chr3 (17-191)||(20913719-20913893)
chr3 (17-191)||(20921837-20922011)
chr3 (17-135)||(50977866-50977984)
chr3 (17-135)||(51080998-51081116)
chr3 (15-167)||(39069726-39069878)
chr3 (15-135)||(50364908-50365028)
chr3 (15-177)||(33473218-33473380)
chr3 (15-191)||(45380225-45380401)
chr3 (30-191)||(38923963-38924124)
chr3 (15-115)||(28699685-28699785)
chr3 (17-135)||(34019462-34019580)
chr3 (15-84)||(44152700-44152769)
chr3 (15-79)||(47473230-47473294)
chr3 (46-121)||(42641213-42641288)
chr3 (117-177)||(44152775-44152835)
chr3 (144-191)||(3697051-3697098)
chr3 (138-191)||(33473422-33473475)
[»] chr5 (44 HSPs)
chr5 (17-191)||(39001990-39002164)
chr5 (15-191)||(6739920-6740096)
chr5 (15-191)||(30863253-30863428)
chr5 (19-186)||(14717609-14717776)
chr5 (15-161)||(40074950-40075096)
chr5 (7-191)||(23128877-23129062)
chr5 (15-191)||(8689572-8689748)
chr5 (15-191)||(27457162-27457338)
chr5 (15-191)||(31710282-31710458)
chr5 (15-191)||(11000693-11000869)
chr5 (15-191)||(39824556-39824732)
chr5 (15-191)||(41282342-41282518)
chr5 (15-173)||(11692130-11692288)
chr5 (15-191)||(4015839-4016015)
chr5 (15-191)||(19659466-19659642)
chr5 (15-191)||(20079223-20079399)
chr5 (15-191)||(26593245-26593421)
chr5 (15-191)||(30297714-30297890)
chr5 (15-191)||(35342180-35342356)
chr5 (15-191)||(42993518-42993694)
chr5 (19-190)||(14952328-14952499)
chr5 (19-191)||(6600101-6600273)
chr5 (15-167)||(8215900-8216052)
chr5 (15-167)||(16095949-16096100)
chr5 (15-191)||(33760435-33760611)
chr5 (15-191)||(38964079-38964254)
chr5 (15-191)||(43166234-43166410)
chr5 (15-161)||(3351997-3352143)
chr5 (15-191)||(6251972-6252148)
chr5 (15-191)||(28078370-28078546)
chr5 (23-191)||(1052541-1052709)
chr5 (19-191)||(20408537-20408709)
chr5 (15-191)||(30208367-30208543)
chr5 (15-135)||(16752116-16752236)
chr5 (19-191)||(11935450-11935621)
chr5 (19-191)||(27116064-27116236)
chr5 (15-115)||(6331377-6331477)
chr5 (19-191)||(19398158-19398330)
chr5 (15-135)||(26035367-26035487)
chr5 (15-190)||(8694866-8695041)
chr5 (23-135)||(444962-445074)
chr5 (15-167)||(27509978-27510123)
chr5 (138-191)||(20517063-20517116)
chr5 (138-191)||(40074855-40074908)
[»] chr2 (47 HSPs)
chr2 (19-191)||(25087761-25087933)
chr2 (15-191)||(7378963-7379139)
chr2 (15-191)||(16246158-16246334)
chr2 (15-191)||(27328584-27328760)
chr2 (19-191)||(37838301-37838473)
chr2 (15-177)||(33865246-33865408)
chr2 (15-177)||(36211046-36211208)
chr2 (15-191)||(771941-772116)
chr2 (15-191)||(921022-921198)
chr2 (15-190)||(1106525-1106700)
chr2 (15-191)||(2094375-2094551)
chr2 (15-191)||(2456010-2456186)
chr2 (15-191)||(9276574-9276750)
chr2 (15-191)||(28650391-28650567)
chr2 (15-191)||(34253142-34253318)
chr2 (15-191)||(40854609-40854785)
chr2 (15-177)||(11949405-11949567)
chr2 (18-191)||(2056929-2057102)
chr2 (15-191)||(8899682-8899857)
chr2 (15-191)||(17134229-17134404)
chr2 (15-191)||(19180422-19180597)
chr2 (15-191)||(36444193-36444369)
chr2 (15-191)||(41500467-41500643)
chr2 (15-191)||(43249377-43249553)
chr2 (17-167)||(2314964-2315114)
chr2 (15-149)||(3430631-3430765)
chr2 (17-191)||(7297199-7297373)
chr2 (15-191)||(12759715-12759890)
chr2 (15-167)||(29737748-29737900)
chr2 (15-191)||(33106934-33107110)
chr2 (15-191)||(38751048-38751224)
chr2 (15-191)||(37732158-37732334)
chr2 (15-191)||(42629962-42630138)
chr2 (15-135)||(8396572-8396692)
chr2 (19-191)||(17484515-17484687)
chr2 (16-191)||(45124120-45124295)
chr2 (19-131)||(37654112-37654224)
chr2 (15-135)||(19916008-19916128)
chr2 (15-115)||(41178060-41178160)
chr2 (64-177)||(14630663-14630776)
chr2 (16-191)||(9331757-9331932)
chr2 (66-160)||(23671807-23671901)
chr2 (15-71)||(23672958-23673014)
chr2 (117-191)||(28216929-28217003)
chr2 (154-191)||(3358157-3358194)
chr2 (138-191)||(3430807-3430860)
chr2 (138-191)||(11949612-11949665)
[»] chr1 (66 HSPs)
chr1 (15-191)||(7552981-7553157)
chr1 (15-191)||(7651662-7651838)
chr1 (15-191)||(12143072-12143248)
chr1 (15-191)||(19315640-19315816)
chr1 (17-191)||(49814302-49814476)
chr1 (15-191)||(19274559-19274735)
chr1 (15-167)||(23767403-23767555)
chr1 (15-191)||(46825531-46825707)
chr1 (17-191)||(25988236-25988410)
chr1 (15-191)||(28425328-28425504)
chr1 (15-191)||(38473591-38473767)
chr1 (19-191)||(49094676-49094848)
chr1 (15-191)||(26549388-26549564)
chr1 (15-191)||(36157643-36157818)
chr1 (15-167)||(41106016-41106168)
chr1 (19-191)||(45350682-45350852)
chr1 (19-191)||(9878749-9878921)
chr1 (15-191)||(18892329-18892505)
chr1 (15-191)||(33325727-33325903)
chr1 (15-191)||(46051450-46051626)
chr1 (15-191)||(50689943-50690119)
chr1 (15-191)||(16705870-16706046)
chr1 (15-191)||(33674017-33674193)
chr1 (15-191)||(46095040-46095216)
chr1 (17-191)||(36781137-36781311)
chr1 (15-177)||(50533383-50533545)
chr1 (15-191)||(23228159-23228335)
chr1 (15-191)||(24204436-24204612)
chr1 (19-167)||(26069896-26070044)
chr1 (19-191)||(37216900-37217072)
chr1 (15-191)||(48802296-48802472)
chr1 (15-190)||(7608732-7608907)
chr1 (19-177)||(48669375-48669533)
chr1 (15-177)||(52146993-52147155)
chr1 (19-191)||(45670451-45670623)
chr1 (19-191)||(8141452-8141623)
chr1 (19-151)||(41982240-41982372)
chr1 (19-192)||(18782053-18782226)
chr1 (15-191)||(40721342-40721519)
chr1 (15-191)||(6711440-6711616)
chr1 (19-191)||(9962755-9962927)
chr1 (19-191)||(21965069-21965241)
chr1 (15-191)||(43396675-43396851)
chr1 (19-135)||(48319067-48319183)
chr1 (20-191)||(5400876-5401046)
chr1 (15-190)||(17983864-17984039)
chr1 (15-190)||(52067617-52067792)
chr1 (20-192)||(33714325-33714495)
chr1 (15-167)||(52349913-52350065)
chr1 (15-177)||(18917524-18917686)
chr1 (19-136)||(9974846-9974963)
chr1 (15-115)||(12964646-12964746)
chr1 (15-135)||(33194672-33194792)
chr1 (19-161)||(34971084-34971226)
chr1 (20-191)||(21929526-21929702)
chr1 (19-135)||(16506809-16506925)
chr1 (19-191)||(25800648-25800817)
chr1 (15-135)||(30281631-30281751)
chr1 (55-191)||(44978733-44978868)
chr1 (15-72)||(50099220-50099277)
chr1 (15-63)||(44979281-44979329)
chr1 (15-59)||(32373650-32373694)
chr1 (138-191)||(49814205-49814258)
chr1 (17-59)||(17989864-17989906)
chr1 (138-191)||(9974747-9974800)
chr1 (139-191)||(12964551-12964603)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (15-191)||(218885-219062)
[»] chr6 (29 HSPs)
chr6 (15-191)||(1915308-1915484)
chr6 (15-191)||(3408189-3408365)
chr6 (15-191)||(6503718-6503894)
chr6 (19-190)||(17428238-17428409)
chr6 (15-191)||(9382519-9382695)
chr6 (17-191)||(2390267-2390441)
chr6 (15-191)||(2707459-2707635)
chr6 (15-191)||(10256237-10256413)
chr6 (15-191)||(12626636-12626812)
chr6 (19-191)||(17943040-17943212)
chr6 (15-191)||(29050272-29050448)
chr6 (19-191)||(30379021-30379193)
chr6 (19-191)||(1077241-1077413)
chr6 (15-191)||(8178214-8178390)
chr6 (19-191)||(16193314-16193486)
chr6 (15-177)||(26230911-26231073)
chr6 (19-177)||(26392988-26393146)
chr6 (15-191)||(3258772-3258948)
chr6 (26-177)||(2598078-2598229)
chr6 (15-191)||(11133873-11134050)
chr6 (19-191)||(26196286-26196458)
chr6 (15-135)||(26936607-26936727)
chr6 (15-192)||(6785065-6785239)
chr6 (30-136)||(35223919-35224025)
chr6 (19-191)||(25820514-25820686)
chr6 (69-191)||(31375971-31376093)
chr6 (39-191)||(10931113-10931264)
chr6 (98-190)||(12612937-12613029)
chr6 (77-191)||(12612813-12612927)
[»] scaffold1986 (1 HSPs)
scaffold1986 (15-167)||(114-266)
[»] scaffold0727 (1 HSPs)
scaffold0727 (19-167)||(5190-5337)
[»] scaffold0693 (1 HSPs)
scaffold0693 (19-191)||(4992-5164)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (20-191)||(47967-48138)
[»] scaffold0542 (1 HSPs)
scaffold0542 (15-135)||(1994-2114)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (19-167)||(11362-11510)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (15-166)||(252428-252579)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (19-177)||(13099-13257)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (19-177)||(59587-59745)
[»] scaffold0952 (1 HSPs)
scaffold0952 (75-177)||(3350-3452)
[»] scaffold0717 (1 HSPs)
scaffold0717 (75-192)||(1877-1994)
[»] scaffold0392 (1 HSPs)
scaffold0392 (15-68)||(289-342)
[»] scaffold1562 (1 HSPs)
scaffold1562 (75-167)||(599-691)
[»] scaffold1158 (1 HSPs)
scaffold1158 (75-167)||(1902-1994)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (15-65)||(19781-19831)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 129; Significance: 6e-67; HSPs: 46)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 47219145 - 47219321
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47219145 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 47219244  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||    
T  47219245 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatttaaaaactaaaatgacttgtttgggacttttgaaac 47219321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 8162853 - 8162677
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  8162853 agagcattatccacaatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataacaaagatgagttcaaggaagcaatt 8162754  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||||||||||    
T  8162753 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacaattcaaaaactaaaataacttgtttgagacttttgaaac 8162677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 1469634 - 1469472
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1469634 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaacaaagatgagttcaaggaagcaatt 1469535  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 177  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||    
T  1469534 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaagacttgttt 1469472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 47281265 - 47281103
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47281265 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 47281166  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 177  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||    
T  47281165 accaactatggtatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgttt 47281103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 44544409 - 44544585
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44544409 agagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 44544508  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||  |||||||| | ||||| |||||    
T  44544509 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatttaaaaactaaaaggacttgtttgggactttagaaac 44544585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 47294432 - 47294256
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47294432 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattataagtgggtgttaggagccagattttgtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 47294333  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  47294332 accaacgatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaac 47294256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 23842305 - 23842481
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23842305 agagcattatccaccatctgccatgcctaaaaagatgactaatttgaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 23842404  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  23842405 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 23842481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 31684275 - 31684099
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31684275 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 31684176  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  31684175 accaactattctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaac 31684099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 35600263 - 35600087
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35600263 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagataactaattttaagtgggtgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 35600164  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||| |||   |||||||||||    
T  35600163 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttatttgagacttttgaaac 35600087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 38427704 - 38427528
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  38427704 agagcattatccgccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 38427605  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||   |||||||||||    
T  38427604 accaactatgctatctataataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgagacttttgaaac 38427528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 167
Target Start/End: Original strand, 47271981 - 47272133
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47271981 agagcattatccatcatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagattcggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 47272080  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 167  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||    
T  47272081 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaa 47272133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 161
Target Start/End: Original strand, 33884323 - 33884465
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33884323 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatggctaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 33884422  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaa 161  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  33884423 actatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgatttaaaaa 33884465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 11476697 - 11476521
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||| |||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11476697 agagcattacccaccattcgccatgcctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 11476598  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  11476597 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaac 11476521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 43752917 - 43752741
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43752917 agagcattatccaccatttgtcctgcctcaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 43752818  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | ||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  43752817 accaattatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaac 43752741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 2960768 - 2960605
Alignment:
Q  28 ccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgtta 127  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||    
T  2960768 ccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattaccaactatgcta 2960669  T
Q  128 tctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||    
T  2960668 tctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgggacttttgaaac 2960605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 191
Target Start/End: Original strand, 7336065 - 7336235
Alignment:
Q  20 attatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaa 119  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  7336065 attattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaatgatgagttcaaggaagcaattatcaa 7336164  T
Q  120 ctatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | |||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  7336165 ctatgctatctacaata-gaactgtttgaaacgattcaaaaactaaaagaacttgtttggaatttttgaaac 7336235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 30798509 - 30798333
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30798509 agagcattatccatcatttgcaatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 30798410  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||| || || |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  30798409 accaactatgctatctacaataggatttgtttgaaacgattcaacaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaac 30798333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 30876259 - 30876435
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  30876259 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcccaatttggtaccaaaaatgagttcaatgaagcaatt 30876358  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| |||||||||||  |||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  30876359 accaactatgctatctacaatagcacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaac 30876435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 37394135 - 37393963
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||    
T  37394135 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaactgggtgttaggagtcaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaactacca 37394036  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  37394035 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaac 37393963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 48628805 - 48628981
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||   ||| ||||||||||||||||||||    
T  48628805 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtgcaaaaaatgagttcaaggaagcaatt 48628904  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  48628905 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 48628981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 27364480 - 27364328
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  27364480 agagcattatccaccatttgtcatacctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagtaatt 27364381  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 167  Q
    | |||||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||| ||||| |||||    
T  27364380 accaactatgttatctacaataggatctgtttgaaacgattcaaaaactaaaa 27364328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 40851274 - 40851450
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  40851274 agagcattatccaccatttgtcgtgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagattagttcaaggaagcaatt 40851373  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||  || |||||||| ||||| |||||||| ||| ||||  |||||  ||||||||  || |||||||||    
T  40851374 accaactattctacctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaagctaaaaggacttgtttgaaatttttgaaac 40851450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 41113377 - 41113553
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||| || |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  41113377 agagcattattcatcatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaatatgagttcaaggaagcaatt 41113476  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||| ||||| |||||| ||||||||   |||||||||||    
T  41113477 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaatgattcaaaaactaaaatgacttgtttgagacttttgaaac 41113553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 42979479 - 42979304
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  42979479 agagcattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttgatatcaaagatgagttcaacgaagcaatt 42979380  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| | ||| |||||  |||||||| ||| |||||||||    
T  42979379 accaactatgttatctacagtaggacttgtttgaaacgattcacaaactaaaaggacttgtttagaa-ttttgaaac 42979304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 45723632 - 45723456
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||    
T  45723632 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaagaaaacaatt 45723533  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |  || |||| |||||||||||||| || |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  45723532 actaattatgctatctacaatatgatttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaagacttgtttgagacttttgaaac 45723456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 43968400 - 43968238
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43968400 agagcattatccaccatttgtcatgcctataaagatgactaattttaagtgggtattatgagccaaatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 43968301  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 177  Q
    | |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||    
T  43968300 accaactacgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgttt 43968238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 44800547 - 44800389
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  44800547 cattatccaccatatatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccatatttggtaccaaagatgagttcaatgaaacaattacca 44800448  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 177  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  44800447 actatgttatctacaacaggacttgtttgaaacaattcaaaaactaaaagaacttgttt 44800389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 191
Target Start/End: Original strand, 221299 - 221451
Alignment:
Q  39 gcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatg 138  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  221299 gcctaaaaagaagactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattaccaactatgctatctacaatagg 221398  T
Q  139 acttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |||| |||||||| ||| ||||| |||||  | |||||| |||||||||||||    
T  221399 acttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggatttgtttggaacttttgaaac 221451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 30972082 - 30971908
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||    
T  30972082 agagcattatccacaatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgggtttaaggaagtaatt 30971983  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaa 190  Q
    | ||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||| |||||| ||||||||    
T  30971982 accaactatgccatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaacgacttg-tttgaaattttgaaa 30971908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 41139553 - 41139374
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41139553 agagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagcgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 41139454  T
Q  115 aacaac----tatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | ||||    |||| ||| ||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| | |||  |||||||| | |||||||||||    
T  41139453 accaactatatatgctatttacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaact-aaaggacttgtttgggacttttgaaac 41139374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 47579228 - 47579052
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagc-aat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  47579228 agagcattatccaccatttgtcattcctaaaaagatggttaattttaagtgggtgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaaat 47579129  T
Q  114 taacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    || ||| |||| |||||| |||| ||||| | |||||||||| ||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  47579128 taccaattatgctatctataataggacttgtctgaaacaattcaaaaactaaaatgacttg-tttggacttttgaaac 47579052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 3797664 - 3797544
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3797664 agagcattatccaccatttaacatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 3797565  T
Q  115 aacaactatgttatctacaat 135  Q
    | |||||||| ||||||||||    
T  3797564 atcaactatgctatctacaat 3797544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 151
Target Start/End: Original strand, 4923220 - 4923352
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  4923220 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagtaattacca 4923319  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaac 151  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| ||||||||    
T  4923320 actatgctatccacaataggacttgtttgaaac 4923352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 11050398 - 11050226
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  11050398 cattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtattaggaggcagatttggtaccaaagatgaattcaaggaagcaattacca 11050299  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| | |||  |||||||| | |||||||||||    
T  11050298 aatatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactgaaaggacttgtttgggacttttgaaac 11050226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 47119991 - 47120169
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  47119991 agagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagataactaattttaagtgggtgttaggagtcatatttggtaccaaatatgagttcaagaaagcaatt 47120090  T
Q  115 aacaac--tatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | ||||  |||| | ||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||    
T  47120091 accaactatatgctctctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgggacttttgaaac 47120169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 150
Target Start/End: Original strand, 29248342 - 29248477
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |  ||||||||||||||||||| |||||    
T  29248342 agagaattatccacaatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttgatgccaaagatgagttcaaggaatcaatt 29248441  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaa 150  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  29248442 accaactatgctatctacaataagacttgtttgaaa 29248477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 177
Target Start/End: Original strand, 18353148 - 18353306
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||    
T  18353148 cattatccaccatttatcatgtctaaaaagatgactaattttaattaggtgttaggagtcagatttggtatcaaagatgagttcaagaaaacaattacca 18353247  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 177  Q
    |||||| |||||||  || ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||    
T  18353248 actatgctatctaccttaggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgttt 18353306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 135
Target Start/End: Original strand, 27774108 - 27774228
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  27774108 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatggctgattttaagtgggttttaggagccagatttggtaccaaggttgagttcaaggaagcaatt 27774207  T
Q  115 aacaactatgttatctacaat 135  Q
    | |||||||| ||||||||||    
T  27774208 accaactatgctatctacaat 27774228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 37354400 - 37354284
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  37354400 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccaaatttgataccaaagatgagttcaatgaagcaattacca 37354301  T
Q  119 actatgttatctacaat 135  Q
    |||||| ||||||||||    
T  37354300 actatgctatctacaat 37354284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 108
Target Start/End: Original strand, 40520918 - 40521011
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaa 108  Q
    |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  40520918 agagcattatccaccatttgccatggctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaa 40521011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 75
Target Start/End: Original strand, 39034062 - 39034122
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagga 75  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  39034062 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggcgttagga 39034122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 103 - 191
Target Start/End: Original strand, 42888937 - 42889025
Alignment:
Q  103 aaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||| |||  ||||||||||||    
T  42888937 aaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttatttgaaacttttgaaac 42889025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 23842263 - 23842210
Alignment:
Q  138 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23842263 gacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgttttgaacttttgaaac 23842210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 58
Target Start/End: Original strand, 43025112 - 43025155
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaatt 58  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43025112 agagcaatatccatcatttgtcatgcctaaaaagatgactaatt 43025155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 64
Target Start/End: Original strand, 29739781 - 29739829
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagt 64  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||    
T  29739781 agagcattatccaccatttaccatgcctaaaa-gatgactaattttaagt 29739829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 136
Target Start/End: Original strand, 5106127 - 5106163
Alignment:
Q  100 ttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 136  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  5106127 ttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 5106163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 125; Significance: 1e-64; HSPs: 39)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 2533272 - 2533448
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2533272 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtttggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 2533371  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||    
T  2533372 accaactatgatatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgggacttttgaaac 2533448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 3875908 - 3876084
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3875908 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatatagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 3876007  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||    
T  3876008 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgggacttttgaaac 3876084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 9056479 - 9056303
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9056479 agagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttggtatcaaagatgagttcaaagaagcaatt 9056380  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||| | ||||||  ||||||||||||    
T  9056379 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacaattcaaaaactaaaatgatttgtttgaaacttttgaaac 9056303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 36400211 - 36400035
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36400211 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaagtttaagtgggtgttagaaggcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 36400112  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  36400111 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaac 36400035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 43806674 - 43806498
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43806674 agagcattatccatcatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 43806575  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  43806574 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgcgacttttgaaac 43806498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 22684129 - 22683953
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  22684129 agagcattattcaccatttgtcatggctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaatt 22684030  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  22684029 accaactatgatatctacaatatgacttgtttgaaatgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaac 22683953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Original strand, 37933646 - 37933818
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37933646 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 37933745  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  37933746 actatgctatctacgataagacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 37933818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 191
Target Start/End: Original strand, 15847117 - 15847288
Alignment:
Q  20 attatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaa 119  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15847117 attatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 15847216  T
Q  120 ctatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||| ||| || ||||||||||    
T  15847217 ctatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttatttggagcttttgaaac 15847288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 177
Target Start/End: Original strand, 1293486 - 1293648
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  1293486 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaaaccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 1293585  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 177  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||    
T  1293586 accaactatgttatctacaacatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgttt 1293648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 35884569 - 35884395
Alignment:
Q  17 agcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaa 116  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  35884569 agcattatcctccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttacgagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 35884470  T
Q  117 caactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | || ||||||||    
T  35884469 caactatgttatctacaataagacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacctttgaaac 35884395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 513308 - 513483
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  513308 agagcattatccaccatttgtcacgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 513406  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||| ||||   |||||||||||    
T  513407 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggactagtttgagacttttgaaac 513483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Original strand, 38107103 - 38107275
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38107103 cattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 38107202  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||| ||| | |||||||||||    
T  38107203 actatgctatctacaataagacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttttttgggacttttgaaac 38107275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 39513480 - 39513327
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  39513480 agagtattatccaccatatgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagttagatttggtaccaaagatgagttcaagaaagcaatt 39513381  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaat 168  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39513380 accaactatgttatctacattaggacttatttgaaacaatttaaaaactaaaat 39513327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 28707587 - 28707435
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28707587 agagcattatccaccatttgtcatgccttaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 28707488  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 167  Q
    | ||| |||| ||||||||||| || || |||||||| ||| ||||| |||||    
T  28707487 accaattatgatatctacaataggatttgtttgaaacgattcaaaaactaaaa 28707435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 35443311 - 35443487
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35443311 agagcattatccactatttgccatgcctaaaaagataactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 35443410  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| |||||||||||  |||| |||||||| ||| |||||  ||||  |||||||| | |||||||||||    
T  35443411 accaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgattcaaaaacaaaaaggacttgtttgggacttttgaaac 35443487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 177
Target Start/End: Original strand, 259982 - 260139
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  259982 cattatccacaatctgtcatgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 260080  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 177  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||    
T  260081 actatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgttt 260139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 655939 - 655782
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  655939 cattatccacaatctgtcatgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 655841  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 177  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||    
T  655840 actatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgttt 655782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 841674 - 841517
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  841674 cattatccacaatctgtcatgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 841576  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 177  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||    
T  841575 actatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgttt 841517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 12010549 - 12010728
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | |||||    
T  12010549 agagcattatccaccatttgccatgcataaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggcaacaatt 12010648  T
Q  115 aacaactatgttat---ctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| |||   |||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||    
T  12010649 accaactatgctatctactacaataggacttgtttgaaacaattcaaaaactaaaatgacttgtttgggacttttgaaac 12010728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 135
Target Start/End: Original strand, 7434886 - 7435006
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7434886 agagcattatccaccatttgtcaagcctataaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 7434985  T
Q  115 aacaactatgttatctacaat 135  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  7434986 accaactatgttatctacaat 7435006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 33651841 - 33652017
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  33651841 agagcattatccaccgtttgtcatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtatgaaagatgagttcaaggaaacaatt 33651940  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |  ||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  33651941 acaaactatgctatctacgataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaagacttgtttgggacttttgaaac 33652017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 177
Target Start/End: Original strand, 38208756 - 38208914
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaag-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaac 117  Q
    |||||||||||||||| || | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |    
T  38208756 cattatccaccatttgccatgtctaaaatggatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtagcaaagatgagttcaaagaagcaattacc 38208855  T
Q  118 aactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||    
T  38208856 aactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaa-aacttgttt 38208914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 23972437 - 23972260
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccattt-gtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaat 113  Q
    |||| |||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  23972437 agagtattatccaacattttgtcatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgataggagtcagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaat 23972338  T
Q  114 taacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | || ||||||||    
T  23972337 taccaactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacctttgaaac 23972260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 30 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 41536653 - 41536492
Alignment:
Q  30 atttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatc 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  41536653 atttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagataaattcaaggaagcaattaccaactatgctatc 41536554  T
Q  130 tacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  41536553 tacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaac 41536492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 28496495 - 28496320
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28496495 agagtattatccatcatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtattagaa-ctagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 28496397  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | || ||||||||    
T  28496396 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacctttgaaac 28496320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 36218917 - 36218747
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  36218917 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatggctaattttaagtgggtgctagaagtcagatttggtaccaaagatgagttcaa-gaagcaattatca 36218819  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaa 190  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  36218818 actatattatctacatcatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttagaacttttgaaa 36218747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Original strand, 440844 - 441016
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    ||||||||||| |||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  440844 cattatccaccgtttgccatgtctaaaaagatgagtaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtacgaaaaatgagttcaaggaagcaattacca 440943  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  440944 actatgctatatacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaac 441016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 135
Target Start/End: Original strand, 23935233 - 23935353
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  23935233 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccagatttggtactaaagatgagttcaaggaagcaatt 23935332  T
Q  115 aacaactatgttatctacaat 135  Q
    | |||||||| ||||||||||    
T  23935333 atcaactatgctatctacaat 23935353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24430712 - 24430536
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||| |||||||||||||||  || |||||    
T  24430712 agagcattatccaccttttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagtagtgagatttggtaccaaagatgagttcaataaaacaatt 24430613  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||||| | |||||||||    
T  24430612 atcaactatactatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgttttggatttttgaaac 24430536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 38633851 - 38633675
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38633851 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaaatcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 38633752  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| |||||||| ||  |||| |||||||| ||| ||||| |||||  || |||||   |||||||||||    
T  38633751 accaactatgctatctacattagaacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacctgtttgagacttttgaaac 38633675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 40302030 - 40301889
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||| | ||||| |||||||||| ||    
T  40302030 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgagtgttaggagctagatttggtaccaaagataaattcaatgaagcaattacca 40301931  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaa 160  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  40301930 actatgctatctacaatatgacttttttgaaacgattcaaaa 40301889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 135
Target Start/End: Original strand, 6016207 - 6016325
Alignment:
Q  17 agcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||     
T  6016207 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtggatgttaggagccaaattgagtatcaaagatgagtttaaagaagcaattac 6016306  T
Q  117 caactatgttatctacaat 135  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  6016307 caactatgctatctacaat 6016325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 42988367 - 42988216
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||| || |||| || |||||||||    
T  42988367 agagcattatctaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagttagatttggtaccaaatataagttaaatgaagcaatt 42988268  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 167  Q
    | ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||    
T  42988267 atcaactatattatctacaataggactt-tttgaaacgattcaaaaactaaaa 42988216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Original strand, 4649154 - 4649326
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | || ||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  4649154 cattatccaccatttgccatgcctaaaaaaatgactaattttaagtggatgttggaagtcagatttggtaccaaagacgagttcaaggaaacaattacca 4649253  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||| ||||||||||  ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||   |||||||||||    
T  4649254 attatgctatctacaattggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgagacttttgaaac 4649326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 13797089 - 13797264
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  || |||| |||||||||| |||||||||    
T  13797089 agagcatcgtccaccatttgtcatacctaaaaagatgactaattttatgtggatgttaggagccagatttgataccaaa-atgagttcaaagaagcaatt 13797187  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||| ||||||| || || |||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||   |||||||||||    
T  13797188 accaactatgctatatacaataggatttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgagacttttgaaac 13797264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 135
Target Start/End: Original strand, 29485287 - 29485406
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29485287 agagcattatccatcatttgccatgcctaaaaa-atgactgattttaagtgggtgttaggagttagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 29485385  T
Q  115 aacaactatgttatctacaat 135  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  29485386 accaactatgttatctacaat 29485406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 91 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 24193195 - 24193109
Alignment:
Q  91 aaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||    
T  24193195 aaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattaaaaaactaaaaggacttgttt 24193109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 24193433 - 24193356
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaa 93  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  24193433 agagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagt-ggtgttaggagccagatttggtaccaaa 24193356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 80
Target Start/End: Original strand, 8137180 - 8137239
Alignment:
Q  21 ttatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccag 80  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8137180 ttatccaccatttgctatgcctaaaaaaatgactaattttaagtaggtgttaggagccag 8137239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 125; Significance: 1e-64; HSPs: 55)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 55517326 - 55517150
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  55517326 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaagaagcaatt 55517227  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||   |||||||||||    
T  55517226 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaagaacttgtttgagacttttgaaac 55517150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 4545126 - 4544950
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4545126 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagtttaaggaagcaatt 4545027  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | || ||||||||    
T  4545026 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttaggacctttgaaac 4544950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 11795295 - 11795119
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  11795295 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaatt 11795196  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  11795195 accaactatgctatctagaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaac 11795119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 28264643 - 28264819
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28264643 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagacagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 28264742  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  28264743 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaac 28264819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 31973591 - 31973767
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31973591 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 31973690  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| |||||||||||  |||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| |||||||||||||    
T  31973691 accaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttggaacttttgaaac 31973767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 191
Target Start/End: Original strand, 2055280 - 2055454
Alignment:
Q  17 agcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||     
T  2055280 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaactttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagtttaaggaagcaattat 2055379  T
Q  117 caactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||  ||||  |||||||| |||||||| ||||    
T  2055380 caactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaacaaaaacgacttgtttggaacttttaaaac 2055454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 177
Target Start/End: Original strand, 42273802 - 42273964
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42273802 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 42273901  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 177  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||    
T  42273902 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgttt 42273964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 5227390 - 5227566
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  5227390 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatactaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 5227489  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||    
T  5227490 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgggacttttgaaac 5227566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 15985010 - 15985186
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15985010 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagattactgattttaagtaggtgttaggagccagatttggtactaaagatgagttcaaggaagcaatt 15985109  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  15985110 accaactatgttatctagaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaac 15985186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 31591076 - 31591251
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31591076 agagcattatccaccatttgtcacgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 31591174  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| ||| ||||   |||||||||||    
T  31591175 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgactcgtttgagacttttgaaac 31591251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 33807921 - 33807745
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  33807921 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaatt 33807822  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  33807821 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 33807745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 19496243 - 19496068
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19496243 agagcattatccaccatttgacatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggcgccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 19496144  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaa 190  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||  |||||||| | || |||||||    
T  19496143 accaactatggtatctacaataggacttgtttgaaacaattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacctttgaaa 19496068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 191
Target Start/End: Original strand, 49118616 - 49118787
Alignment:
Q  20 attatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaa 119  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  49118616 attatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaa 49118715  T
Q  120 ctatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  49118716 ctatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaac 49118787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 8882152 - 8881978
Alignment:
Q  17 agcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||     
T  8882152 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaagaagcaattat 8882053  T
Q  117 caactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  8882052 caactatgctatctagaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaac 8881978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 189
Target Start/End: Original strand, 12196469 - 12196643
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  12196469 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 12196568  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaa 189  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||    
T  12196569 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaatgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaa 12196643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24458770 - 24458596
Alignment:
Q  17 agcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaa 116  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  24458770 agcattatcctccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttacgagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 24458671  T
Q  117 caactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | || ||||||||    
T  24458670 caactatgttatctacaataagacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacctttgaaac 24458596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 28160094 - 28159932
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||    
T  28160094 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaagaaagcaatt 28159995  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 177  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||| ||||| ||||| |||||||||    
T  28159994 accaactatggtatctacaataagacttgtttgaaatgattcaaaaactaaaagaacttgttt 28159932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 191
Target Start/End: Original strand, 48149502 - 48149675
Alignment:
Q  18 gcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaac 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  48149502 gcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgagtaattttaagtgggtgtcaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacc 48149601  T
Q  118 aactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  48149602 aactatgttatctacattaggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaac 48149675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 23135143 - 23134971
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23135143 cattagccaccatttggcatgcctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 23135044  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  | ||||||  ||||||||||||    
T  23135043 actatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggatttgtttgaaacttttgaaac 23134971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 167
Target Start/End: Original strand, 23553069 - 23553216
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23553069 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgg-tgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 23553167  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 167  Q
    | |||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| |||||    
T  23553168 attatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaa 23553216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 48551901 - 48551729
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  48551901 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagattttgtaccaaagatgagttcaagaaagcaattacca 48551802  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    || ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||   |||||||||||    
T  48551801 accatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgagacttttgaaac 48551729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 48707874 - 48707698
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48707874 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 48707775  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||| ||||  ||||| |||||||||   |||||||||||    
T  48707774 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaaagattcaaaatctaaaagaacttgtttgagacttttgaaac 48707698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 33174160 - 33173985
Alignment:
Q  16 gagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatta 115  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  33174160 gagcattatccaccatttgtcatgcataaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtactaaagatgagttcaaggaagcaatta 33174061  T
Q  116 acaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
     ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| |||| |||| |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  33174060 ccaactatgaaatctacaataagacttgtttgaaacgatttgaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 33173985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 191
Target Start/End: Original strand, 44490324 - 44490495
Alignment:
Q  20 attatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaa 119  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  44490324 attatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaactttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaa 44490423  T
Q  120 ctatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  44490424 ctatgatatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaac 44490495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 191
Target Start/End: Original strand, 26017425 - 26017599
Alignment:
Q  17 agcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaa 116  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  26017425 agcattatccactatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 26017524  T
Q  117 caactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| || ||  ||||||||   |||||||||||    
T  26017525 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactacaaggacttgtttgtgacttttgaaac 26017599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 176
Target Start/End: Original strand, 32317957 - 32318114
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  32317957 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagacagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattacca 32318056  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgtt 176  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||| ||||| |||||  |||||||    
T  32318057 actatgttatctacaataggacttgtttgaaatgattcaaaaactaaaaggacttgtt 32318114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 17847236 - 17847061
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17847236 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaa-gatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 17847138  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | ||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| || ||  ||||||||   |||||||||||    
T  17847137 accaattatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactataaggacttgtttgagacttttgaaac 17847061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 28812427 - 28812252
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  28812427 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgg-tgttaggagccagatttggtaccaaagatgacttcaaggaagcaatt 28812329  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  28812328 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 28812252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 32118714 - 32118890
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  32118714 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagggggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 32118813  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| |||||||||||  |||| |||||||| ||||||||| |||||  | |||||| | |||||||||||    
T  32118814 accaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgatttaaaaactaaaaggatttgtttgggacttttgaaac 32118890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 151
Target Start/End: Original strand, 40988633 - 40988769
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  40988633 agagcattatccacaatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 40988732  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaac 151  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  40988733 atcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaac 40988769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 9339267 - 9339112
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaa---gatgagttcaaggaagca 111  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||   ||||||||||||||||||    
T  9339267 agagcattattcaccatttgtcatgcataaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaatatgatgagttcaaggaagca 9339168  T
Q  112 attaacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 167  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||| |||||    
T  9339167 attaccaactatgttatctacaatatgacttgtttgaaatgattcaaaaactaaaa 9339112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 35930040 - 35930215
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  35930040 agagcattatccacc-tttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcatggaagcaatt 35930138  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| |||||||||||  |||| |||||||| ||| ||||| |||||  | |||||| |||| ||||||||    
T  35930139 accaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggatttgtttggaacctttgaaac 35930215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 191
Target Start/End: Original strand, 37381848 - 37382022
Alignment:
Q  17 agcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||| ||||||| |||||||||||||     
T  37381848 agcattatccaccatttgtcatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatatggtaccaaaaatgagtttaaggaagcaattac 37381947  T
Q  117 caactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||  ||||  ||||||||   |||||||||||    
T  37381948 caactatgctatctacaatatgacttgtttgaaatgatttaaaaacaaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 37382022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 39995308 - 39995146
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  39995308 agaggattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggttttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 39995209  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 177  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||    
T  39995208 accaactatgttatctacaatagaacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaagacttgttt 39995146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 10588580 - 10588756
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||  ||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  10588580 agagcattatctgccatttaccatgcctaaaaagatgactagttttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaatatgagttcaaggaagcaatt 10588679  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||||||||||  | |||||| | |||||||||||    
T  10588680 accaactatgctatctacaatacgacttgtttgaaacgatccaaaaattaaaaggatttgtttgggacttttgaaac 10588756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 30141249 - 30141073
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||    
T  30141249 agagcattatccatcatttgcaatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaagagccagatttgataccaaagatgagttcaatgaagcaatt 30141150  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| ||| |||||||||    
T  30141149 accaactatgctatcaacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttagaatttttgaaac 30141073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 30467140 - 30466968
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  30467140 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaaatgggtgttaggagcgagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagaaattacca 30467041  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |||||| |||||||||||  |||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  30467040 actatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 30466968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 33693474 - 33693299
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||| | |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33693474 agagcattatctatcatttgccatgtctaaaaagatgaataattttaagtgggtgttaggaatcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 33693375  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaa 190  Q
    | |||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||| |||||||||||  |||| ||| ||||||||||||    
T  33693374 accaactatgctatctacaacaggacttgtttgaaacgattcaaaaattaaaaggacttatttggaacttttgaaa 33693299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 135
Target Start/End: Original strand, 24623148 - 24623268
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24623148 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaaaataactgattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 24623247  T
Q  115 aacaactatgttatctacaat 135  Q
    | |||||||| ||||||||||    
T  24623248 accaactatgctatctacaat 24623268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Original strand, 25730244 - 25730416
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    |||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  25730244 cattatccactatttgctatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcggatttagtgccaaagatgagttcaaggaatcaattacca 25730343  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  25730344 actatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 25730416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 167
Target Start/End: Original strand, 39700045 - 39700197
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  39700045 agagcattattcacaatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaagagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaatt 39700144  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 167  Q
    | ||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||| || ||||||||    
T  39700145 accaattatgttatctataataagacttgtttgaaacgattcaataattaaaa 39700197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 50276274 - 50276103
Alignment:
Q  17 agcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaa 116  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  50276274 agcattatccaccgtttgccatgcctaaaaaga---ctaattttaagtgggtgttaggaatcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 50276178  T
Q  117 caactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  50276177 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaac 50276103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 50542495 - 50542319
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  50542495 agagcattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 50542396  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||| || || ||| |||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  50542395 accaactatgctatctacaataagatttgtttaaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 50542319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 25734360 - 25734229
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  25734360 cattatccaccgtttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtacgaaagatgagttcaattaagcaattacca 25734261  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaa 150  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  25734260 actatgttatctacaataggacttgtttgaaa 25734229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 22298517 - 22298694
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaa-agatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaat 113  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22298517 agagcattatccaccatttgctatgcctaaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagtttaaggaaacaat 22298616  T
Q  114 taacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    || ||| |||| ||||||||||| | ||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  22298617 taccaattatgctatctacaatagggcttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 22298694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 17993158 - 17993006
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  17993158 agagcattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaagagccaaatttgatagaaaagatgagtttaaggaagcaatt 17993059  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 167  Q
    | |||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||    
T  17993058 accaactatgctatttacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaa 17993006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 47 - 191
Target Start/End: Original strand, 31208776 - 31208920
Alignment:
Q  47 agatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgacttattt 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  31208776 agatgactaattttaagtgggtgttgggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgttt 31208875  T
Q  147 gaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    ||||| ||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||||    
T  31208876 gaaacgattcaaaaactaaaaggagttgttttggacttttgaaac 31208920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 51371188 - 51371036
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  51371188 agagcattattcaccatttgccatgtctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagttagatttggtaccaaagatgaattcaaggaagcaatt 51371089  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 167  Q
    | |||||||| |||||||||||  |||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  51371088 accaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgattcaaaaattaaaa 51371036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 166
Target Start/End: Original strand, 14564796 - 14564947
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||| |||||||||    
T  14564796 agagcattatccaccgtttgccatgcctaaaaagatgactaattttaactgggtgttaggagccagatttggtacgaaaaatgagttcaatgaagcaatt 14564895  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaa 166  Q
    | |||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  14564896 accaactatgctatatacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaa 14564947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 19168936 - 19168816
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  19168936 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttatgagtcaaatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 19168837  T
Q  115 aacaactatgttatctacaat 135  Q
    | |||||||| ||||||||||    
T  19168836 accaactatgctatctacaat 19168816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 42549762 - 42549643
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  42549762 agagcattttccacc-tttgtcatgcctaaaaagatgattgattttaagtgggtgttaggagccaaatttagtaccaaagataagttcaatgaagcaatt 42549664  T
Q  115 aacaactatgttatctacaat 135  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  42549663 accaactatgttatctacaat 42549643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 56555281 - 56555200
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagat 96  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  56555281 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtcaggagccagatttggtaccaaagat 56555200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 75 - 191
Target Start/End: Original strand, 20534225 - 20534341
Alignment:
Q  75 agccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttg 174  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||  |||||    
T  20534225 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaattaccaactatgctatcaacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaattaaaaggacttg 20534324  T
Q  175 ttttgaacttttgaaac 191  Q
    |||   |||||||||||    
T  20534325 tttgagacttttgaaac 20534341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 138 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 48149457 - 48149404
Alignment:
Q  138 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  48149457 gacttgtttgaaacgattcaaaaattaaaagaacttgtttgggacttttgaaac 48149404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Original strand, 51371262 - 51371314
Alignment:
Q  139 acttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  51371262 acttgtttgaaacgattcaaaaattaaaaggacttgtttggaacttttgaaac 51371314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 125; Significance: 1e-64; HSPs: 57)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 55164256 - 55164080
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  55164256 agagcattatccactatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtaggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 55164157  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||||    
T  55164156 agcaactatgctatctacaatatgacttatttgaaacaattcaaaaattaaaatgacttgtttgagacttttgaaac 55164080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 33151696 - 33151872
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  33151696 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagattagttcaaggaagcaatt 33151795  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  33151796 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaac 33151872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 35346608 - 35346436
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35346608 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagattttgtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 35346509  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  35346508 actatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaac 35346436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Original strand, 1687655 - 1687827
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1687655 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 1687754  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||||||    
T  1687755 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaattaaaaggacttgtttgaaacttttgaaac 1687827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 20813582 - 20813406
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20813582 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 20813483  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | ||| |||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  20813482 accaattatgctatctacattatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttaggacttttgaaac 20813406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 22851996 - 22852172
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22851996 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaacagatgactaattttaagtgggtgttaggagccatatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 22852095  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | || ||||| |||||  |||||||| ||||| |||||||    
T  22852096 accaactatgctatctacaataggacttatttgaaagatttcaaaaactaaaaggacttgtttagaactgttgaaac 22852172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 1017044 - 1017220
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1017044 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagacagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 1017143  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||||| | | |||||||||||    
T  1017144 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtatgggacttttgaaac 1017220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 21564496 - 21564672
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  21564496 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccatatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 21564595  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||    
T  21564596 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgggacttttgaaac 21564672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 38446476 - 38446652
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38446476 agagcattatctactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 38446575  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||| ||| |||||||| ||||    
T  38446576 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaagcacttctttggaacttttaaaac 38446652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 53926120 - 53925944
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  53926120 agagcattatccaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcatatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 53926021  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  53926020 accaactatactatctacaatatgacttatttgaaatgattcaaaaactaaaatgacttgtttggaacttttgaaac 53925944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 191
Target Start/End: Original strand, 21890175 - 21890346
Alignment:
Q  20 attatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaa 119  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21890175 attatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagctagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 21890274  T
Q  120 ctatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
     ||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| |||||||||||||    
T  21890275 atatgttatctataataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttggaacttttgaaac 21890346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 190
Target Start/End: Original strand, 42016878 - 42017048
Alignment:
Q  20 attatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaa 119  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  42016878 attatccatcatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaa 42016977  T
Q  120 ctatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaa 190  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  || |||||  |||||||||||    
T  42016978 ctatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacctgtttgaaacttttgaaa 42017048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 21656518 - 21656694
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21656518 agagcattatccaccatttatcatgcctaaaaaggtgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 21656617  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  21656618 accaactatgctatatacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaac 21656694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 31122662 - 31122838
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31122662 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagcgggtcttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 31122761  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||   |||||||||||    
T  31122762 accaactatgctatctacaataagacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgagacttttgaaac 31122838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 47329316 - 47329140
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47329316 agagcattatccaccatttgccatacctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 47329217  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||| || ||||| ||| |||||||||||  ||||||||   |||||||||||    
T  47329216 accaactatgctatctacgatatgacttgttggaaacgattcaaaaattaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 47329140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 20086455 - 20086279
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20086455 agagcattatccaccattttccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 20086356  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | ||| |||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||   |||||||||||    
T  20086355 accaagtatgctatctataataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaagaacttgtttgagacttttgaaac 20086279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 20760212 - 20760036
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20760212 agagtattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 20760113  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  | ||||||   |||||||||||    
T  20760112 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggatttgtttgagacttttgaaac 20760036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 167
Target Start/End: Original strand, 41250886 - 41251038
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  41250886 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaatt 41250985  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 167  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  41250986 accaactatgctatctacaataagacttgtttgaaacaattcaaaaactaaaa 41251038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 42107240 - 42107064
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  42107240 agagcattatccaccatttgacatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtgtcaaagatgagttcaaggaagtaatt 42107141  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  42107140 accaactatactatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgtgacttttgaaac 42107064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 51562162 - 51562338
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  51562162 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaatt 51562261  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||| |||||||||||  ||||| ||   |||||||||||    
T  51562262 accaactatgttatctacattagaacttgtttgaaacgattcaaaaattaaaaggacttgcttgagacttttgaaac 51562338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 52821190 - 52821014
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  52821190 agagcattatccatcatttgttatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagttttactaccaaagatgagttcaaagaagcaatt 52821091  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||| ||| ||||| |||||  |||||||| |||||||||||||    
T  52821090 accaactatgttatctacaacaggacttgtttaaaacgattcaaaaactaaaaagacttgtttggaacttttgaaac 52821014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 19268521 - 19268703
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  19268521 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 19268620  T
Q  115 aacaacta------tgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | ||||||      ||||||||||| || ||||| ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  19268621 accaactatgttattgttatctacattaggacttgtttaaaacgattcaaaaactaaaataacttgtttgggacttttgaaac 19268703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 36315113 - 36314967
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  36315113 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaagagccagatttgatactaaagatgagttcaaggaagcaatt 36315014  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaa 161  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  36315013 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacaattcaaaaa 36314967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 10618617 - 10618444
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  10618617 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttgataccaaagatgagttcaatgaagcaattacca 10618518  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaaca 192  Q
    | ||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | ||||||||||||    
T  10618517 attatgtcatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttaggacttttgaaaca 10618444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 152
Target Start/End: Original strand, 19664541 - 19664678
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19664541 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttatgagtcagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 19664640  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaaca 152  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  19664641 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaaca 19664678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 26455582 - 26455758
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26455582 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 26455681  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||| ||   |||||||||||    
T  26455682 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttggttgagacttttgaaac 26455758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 1448873 - 1448700
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1448873 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatactaaagatgagttcaaggaagcaatt 1448774  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||   |||||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  1448773 accaactatggta---acaataggacttctttgaaacgattcaaaaactaaaagaacttgtttggtacttttgaaac 1448700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 35608272 - 35608110
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  35608272 agagtattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaagtttaagtgggtgttaggagtccgatttggtaccaaagatgagttcaaggaaccaatt 35608173  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 177  Q
    | ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||    
T  35608172 accaattatgctatctacaataggacttatttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgttt 35608110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 27070880 - 27070704
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||| | | | || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27070880 agagcattatccaccatttataatgtctgaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggaggcagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 27070781  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  27070780 accaactatgctatctacaataagacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 27070704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 29677476 - 29677652
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29677476 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaaatgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 29677575  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |  ||||||| ||||||| ||| ||| | |||||||| ||| ||||| ||||   |||||||| | |||||||||||    
T  29677576 acaaactatgatatctacgataggacctgtttgaaacgattgaaaaactaaacggacttgtttgggacttttgaaac 29677652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 37247956 - 37248132
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||| || ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  37247956 agagcattattcatcatttgtcatgcatgaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 37248055  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  37248056 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaagtacttgtttgagacttttgaaac 37248132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Original strand, 50287570 - 50287742
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||| || |||||||||| ||    
T  50287570 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaatatgagtttaatgaagcaattacca 50287669  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||||| |   |||||||||||    
T  50287670 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtatgagacttttgaaac 50287742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 53196014 - 53196189
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  53196014 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagataactaattttaagtgggtgttaggagcgagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaataatt 53196113  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | || |||| |||||| ||||||||   |||||||||||    
T  53196114 accaactatgttatctacaataagacttctttgaaacga-ttcaaaactaaaatgacttgtttgagacttttgaaac 53196189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Original strand, 48651248 - 48651423
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48651248 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagacgattaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtatcaaagatgagtttaaggaagcaatt 48651347  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaa 190  Q
    | |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   ||||||||||    
T  48651348 accaactatgctatctacattaggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaagacttgtttgagacttttgaaa 48651423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 32650957 - 32650785
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32650957 cattatccaccatttgccatgcctagaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 32650858  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |||||| |||||| ||||  |||| |||||||  ||| ||||| |||||  | ||||||  ||||||||||||    
T  32650857 actatgctatctataatagaacttgtttgaaatgattcaaaaactaaaaagaattgtttgaaacttttgaaac 32650785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Original strand, 12748391 - 12748524
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12748391 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaaaacagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 12748490  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttga 148  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  12748491 accaactatgctatctacaataggacttgtttga 12748524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 40922302 - 40922130
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  40922302 cattatccaccattttccatgcctaaaaaaattactaattttaagtggatgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagtaattacca 40922203  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  40922202 actatgctatctacaatacgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 40922130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 167
Target Start/End: Original strand, 44798268 - 44798419
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  44798268 agagcattatccaccatttgacatgcctaaaaa-atgagtaattttaagtgggtgttaggagccagattcggtaccaaagatgagttcaagaaagcaatt 44798366  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 167  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||    
T  44798367 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaa 44798419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 51475383 - 51475267
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  51475383 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttatgaggcagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 51475284  T
Q  119 actatgttatctacaat 135  Q
    |||||| ||||||||||    
T  51475283 actatgctatctacaat 51475267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 167
Target Start/End: Original strand, 3697148 - 3697298
Alignment:
Q  17 agcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaa 116  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||     
T  3697148 agcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcgagatttggtaccaaagatgaattcaatgaagcaattac 3697247  T
Q  117 caactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 167  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||  ||| ||||| |||||    
T  3697248 caactatactatctacaataggacttgtttgaaaggattcaaaaactaaaa 3697298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 20913893 - 20913719
Alignment:
Q  17 agcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaa 116  Q
    |||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||     
T  20913893 agcattattcaccattcgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaattat 20913794  T
Q  117 caactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |||||||| |||||||||||  |||| |||||||| ||| ||||| |||||  | ||||||   |||||||||||    
T  20913793 caactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaagatttgtttgagacttttgaaac 20913719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 20922011 - 20921837
Alignment:
Q  17 agcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaa 116  Q
    |||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||     
T  20922011 agcattattcaccattcgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaattat 20921912  T
Q  117 caactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |||||||| |||||||||||  |||| |||||||| ||| ||||| |||||  | ||||||   |||||||||||    
T  20921911 caactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaagatttgtttgagacttttgaaac 20921837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 135
Target Start/End: Original strand, 50977866 - 50977984
Alignment:
Q  17 agcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  50977866 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaacatgactgattttaagtgggcgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaactac 50977965  T
Q  117 caactatgttatctacaat 135  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  50977966 caactatgctatctacaat 50977984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 135
Target Start/End: Original strand, 51080998 - 51081116
Alignment:
Q  17 agcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  51080998 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaacatgactgattttaagtgggcgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaactac 51081097  T
Q  117 caactatgttatctacaat 135  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  51081098 caactatgctatctacaat 51081116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 167
Target Start/End: Original strand, 39069726 - 39069878
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||| |||||    
T  39069726 agagcattatccaccatttgccatgcatgaaaagatgactaattttaagtgggtgttaagagccagatttggtaccaaagataagttaaaggaaacaatt 39069825  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 167  Q
    | |||||||| |||  |||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||    
T  39069826 atcaactatgctattaacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaa 39069878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 50365028 - 50364908
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50365028 agagcattacccaccatttgccatgcctaaaaagattactgattttaagtgagtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 50364929  T
Q  115 aacaactatgttatctacaat 135  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  50364928 accaactatgttatctacaat 50364908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 33473380 - 33473218
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||| ||||||| |  |||||||| |||||    
T  33473380 agagcattatccaccatttatcatgactaaaaagatgactaattttaagtgcgtgttagaaaccagatttggtaccaaagataaaatcaaggaaacaatt 33473281  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 177  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||    
T  33473280 accaactatgttatctacaataaaacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgttt 33473218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 45380401 - 45380225
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||    
T  45380401 agagcattatccaccatttaccatgcataaaaagatgactaattttaagt-ggtgttatgagccagatttggtaccaaagatgagtttaaagaagcaatt 45380303  T
Q  115 aac-aactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | | ||||||| |||||||||||  |||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  45380302 atcaaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaagacttgtttgggacttttgaaac 45380225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 38924124 - 38923963
Alignment:
Q  30 atttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatc 129  Q
    |||||||| || |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |  |||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  38924124 atttgtcatgcttaaagagatgattaattttaagtggatgttaggagtccaatttggtaccaaagataagttcaacgaagcaattaccaactattttatc 38924025  T
Q  130 tacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    ||| ||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||    
T  38924024 tacgataggacttgtttgaaacaattcaaaaactaaaatgacttgtttgggacttttgaaac 38923963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 115
Target Start/End: Original strand, 28699685 - 28699785
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  28699685 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtgccaaagatgagttcaaggaagcaatt 28699784  T
Q  115 a 115  Q
    |    
T  28699785 a 28699785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 135
Target Start/End: Original strand, 34019462 - 34019580
Alignment:
Q  17 agcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaa 116  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||   |||||||||| |||||||||     
T  34019462 agcattatccaccatttgacatgcctaaaaatatggctgattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaacagtgagttcaagtaagcaattat 34019561  T
Q  117 caactatgttatctacaat 135  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  34019562 caactatgctatctacaat 34019580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 84
Target Start/End: Original strand, 44152700 - 44152769
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagattt 84  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44152700 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagtcagattt 44152769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 79
Target Start/End: Original strand, 47473230 - 47473294
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcca 79  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  47473230 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatggctaattttaagtggatgttaggagcca 47473294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 46 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 42641288 - 42641213
Alignment:
Q  46 aagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaact 121  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42641288 aagatgattgattttaagtgggtgttaggaggcagacttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaact 42641213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 177
Target Start/End: Original strand, 44152775 - 44152835
Alignment:
Q  117 caactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 177  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||    
T  44152775 caactatgttatctataatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgttt 44152835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 3697098 - 3697051
Alignment:
Q  144 tttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  3697098 tttgaaacaattcaaaaactaaaagaacttgtttggaacttttgaaac 3697051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 138 - 191
Target Start/End: Original strand, 33473422 - 33473475
Alignment:
Q  138 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||    
T  33473422 gacttgtttgaaacaattcaaaaactaaaatgacttgtttgggacttttgaaac 33473475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 123; Significance: 2e-63; HSPs: 44)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 39002164 - 39001990
Alignment:
Q  17 agcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  39002164 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 39002065  T
Q  117 caactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||  | || ||| |||||||||||||    
T  39002064 caactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacaattcaaaaactaaaaggatttatttggaacttttgaaac 39001990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 6740096 - 6739920
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6740096 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 6739997  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||   |||||||||||    
T  6739996 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaagaacttgtttgagacttttgaaac 6739920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 30863253 - 30863428
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  30863253 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaatt 30863352  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  30863353 accaactatgctatctacattatgacttgtttgaaacgatttaaaaactaaaatgacttg-tttggacttttgaaac 30863428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 186
Target Start/End: Original strand, 14717609 - 14717776
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14717609 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 14717708  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaactttt 186  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  14717709 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttggaactttt 14717776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 161
Target Start/End: Original strand, 40074950 - 40075096
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  40074950 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 40075049  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaa 161  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  40075050 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacaattcaaaaa 40075096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 23129062 - 23128877
Alignment:
Q  7 agcagcacagagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaagg 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  23129062 agcagcaaagagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggttgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaagg 23128963  T
Q  107 aagcaattaacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttga-acttttgaaac 191  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  23128962 aagcaattaccaattatgctatctacgatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgttttgagacttttgaaac 23128877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 8689572 - 8689748
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  8689572 agagcattatccactatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaatcaatt 8689671  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||    
T  8689672 accaactatgttatctacattatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgggacttttgaaac 8689748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 27457338 - 27457162
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27457338 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaatttaaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 27457239  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  27457238 accaactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 27457162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 31710282 - 31710458
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31710282 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 31710381  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  31710382 accaactatgttatctacattatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 31710458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 11000869 - 11000693
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11000869 agagcattatccaccacttgccaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 11000770  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  11000769 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 11000693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 39824556 - 39824732
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  39824556 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtaccaaagataagttcaaggaagcaatt 39824655  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||   |||||||||||    
T  39824656 accaactatgtcatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaagaacttgtttgagacttttgaaac 39824732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 41282342 - 41282518
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41282342 agagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 41282441  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||| |||||| ||||||||   |||||||||||    
T  41282442 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaatgatttaaaaactaaaatgacttgtttgagacttttgaaac 41282518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 11692288 - 11692130
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11692288 agagcattatccaccatttgtgatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 11692189  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataactt 173  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||| |||||    
T  11692188 accaactatgctatctgcaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaagaactt 11692130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 4016015 - 4015839
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4016015 agagcattatccaccatttatcatgcctaaaaatatgactaattttaagtaggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 4015916  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||   |||||||||||    
T  4015915 accaactatgttatctacaataggacttgcttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgagacttttgaaac 4015839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 19659642 - 19659466
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  19659642 agagcattatccacaatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaaaaagcaatt 19659543  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||   |||||||||||    
T  19659542 accaactatgctatctacaataggacttatttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgagacttttgaaac 19659466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 20079399 - 20079223
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  20079399 agagcattatccacaatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtactaaagatgagttcaaggaagcaatt 20079300  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||   |||||||||||    
T  20079299 accaactatgttatctacattaggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgagacttttgaaac 20079223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 26593421 - 26593245
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  26593421 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagataagttcaaagaagcaatt 26593322  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  26593321 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 26593245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 30297890 - 30297714
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  30297890 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgctaggagccagatttggtaccaaagatgagttgaaggaagcaatt 30297791  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  30297790 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 30297714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 35342180 - 35342356
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  35342180 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 35342279  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||| |||  ||||||||||||    
T  35342280 atcaactatgctatctacaatgagacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttatttgaaacttttgaaac 35342356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 42993518 - 42993694
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42993518 agagcattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 42993617  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| ||||| |||||  |||| ||| |||||||||||||    
T  42993618 accaactatgctatctacaataggaattgtttgaaacaattcaaaaactaaaaggacttctttggaacttttgaaac 42993694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 190
Target Start/End: Original strand, 14952328 - 14952499
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14952328 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 14952427  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaa 190  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||   ||||||||||    
T  14952428 actatgttatctacaacaagacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaagaacttgtttgagacttttgaaa 14952499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 6600273 - 6600101
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6600273 cattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 6600174  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  6600173 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaac 6600101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 167
Target Start/End: Original strand, 8215900 - 8216052
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  8215900 agagcattatccaccatttgtcattcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 8215999  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 167  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||    
T  8216000 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaa 8216052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 16096100 - 16095949
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  16096100 agagcattatccaccatttgtcatacctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggta-ccaagatgagttcaaggaagcaatt 16096002  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 167  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  16096001 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaattaaaa 16095949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 33760611 - 33760435
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  33760611 agagcattatccaccatttgtcatgactaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaagaagtaatt 33760512  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||| |  |||||||| | |||||||||||    
T  33760511 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaagaggacttgtttgggacttttgaaac 33760435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 38964254 - 38964079
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38964254 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 38964156  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| |||||  ||| ||||   |||||||||||    
T  38964155 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattcagaaactaaaaagactcgtttgagacttttgaaac 38964079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 43166410 - 43166234
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  43166410 agagcattatccatcatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagtcagatttggtaccaaagatgagttcaagaaagcaatt 43166311  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  43166310 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacaattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 43166234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 3352143 - 3351997
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  3352143 agagcattatccaccctttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaatatgagttcaaggaagcaatt 3352044  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaa 161  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||    
T  3352043 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaa 3351997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 6251972 - 6252148
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  6251972 agagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaaggcagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 6252071  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  6252072 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 6252148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 28078546 - 28078370
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28078546 agagcattatctaccatttgtcatgcctaattagtttactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 28078447  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  28078446 accaactatgctatctacattaggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaac 28078370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 191
Target Start/End: Original strand, 1052541 - 1052709
Alignment:
Q  23 atccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaacta 122  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1052541 atccaccatttgccatgcttaaaaagatgagtaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaggatgagttcaaggaagcaattaccaacta 1052640  T
Q  123 tgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    || ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  1052641 tgctatctacaataggacttgtttgaaacaattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 1052709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Original strand, 20408537 - 20408709
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||| ||    
T  20408537 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagcgggtgttaggagctagatttggtaccaaatatgagttcaatgaagcaattacca 20408636  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  20408637 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaac 20408709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 30208543 - 30208367
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30208543 agagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgattaattttaagtaggtgttaggagccaaatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 30208444  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||| ||||| |||||  | ||||||   |||||||||||    
T  30208443 accaactatgttatctacaatagaacttgtttgaaatgattcaaaaactaaaaggatttgtttgagacttttgaaac 30208367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 135
Target Start/End: Original strand, 16752116 - 16752236
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16752116 agagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtggatgttaggatccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 16752215  T
Q  115 aacaactatgttatctacaat 135  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  16752216 accaactatgttatctacaat 16752236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Original strand, 11935450 - 11935621
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  11935450 cattatccactatttgttatgcctaaaaagatggctaattttaagtgagtgttaggagccacatttggt-tcaaagatgagatcaaggaaacaattacca 11935548  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  11935549 actatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 11935621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 27116236 - 27116064
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  27116236 cattatccacgatttgtaatgcctaaaaagatgactaatttgaagtggatgttaggagccagatttggtaccaaatatgagttcaaggaagcaattacca 27116137  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||| |||  ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  27116136 actatgctatctacaataggacttgtttaaaatgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 27116064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 115
Target Start/End: Original strand, 6331377 - 6331477
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6331377 agagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 6331476  T
Q  115 a 115  Q
    |    
T  6331477 a 6331477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 19398330 - 19398158
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  19398330 cattatccaccatttgtcatacctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaggctagatttggtaccaaagatgagttcaaagaaacaattacca 19398231  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |||||| |||||||||||  |||| |||||||  ||| ||||| ||||| || ||||||   |||||||||||    
T  19398230 actatgctatctacaatagaacttgtttgaaatgattcaaaaactaaaagaatttgtttgagacttttgaaac 19398158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 26035487 - 26035367
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  26035487 agagcattatccaccatttgtcgtgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtattaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaagaaagcaatt 26035388  T
Q  115 aacaactatgttatctacaat 135  Q
    | |||||||| ||||||||||    
T  26035387 accaactatggtatctacaat 26035367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Original strand, 8694866 - 8695041
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||  |||||||||||||| |||  ||||    
T  8694866 agagcattatccaccatttatcatgcctaagaacatgactaattttaagtgagtattatgagccagatttggtactaaagatgagttcaatgaaataatt 8694965  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaa 190  Q
    | ||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||  ||||||||   ||||||||||    
T  8694966 atcaattatgctatctacaataggacttgtttgaaacaattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaa 8695041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 135
Target Start/End: Original strand, 444962 - 445074
Alignment:
Q  23 atccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaacta 122  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| || ||||  || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  444962 atccaccatttgccacgcctaaaaagacgactgattttaagtgggttttaggagtcatatttgataccaaagatgagttcaagaaagcaattaccaacta 445061  T
Q  123 tgttatctacaat 135  Q
    || ||||||||||    
T  445062 tgctatctacaat 445074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 167
Target Start/End: Original strand, 27509978 - 27510123
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||        ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  27509978 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagt-ccttttag------tttttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaatt 27510070  T
Q  115 aacaactatg-ttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 167  Q
    | |||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||    
T  27510071 accaactatgcttat-tacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaa 27510123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 138 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 20517116 - 20517063
Alignment:
Q  138 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  20517116 gacttatttgaaacaattcaaaaactaaaaagacttgtttgggacttttgaaac 20517063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 138 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 40074908 - 40074855
Alignment:
Q  138 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  40074908 gacttgtttgaaacgattcaaaaattaaaagaacttgtttgggacttttgaaac 40074855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 47)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 25087933 - 25087761
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  25087933 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccagagatgagttcaaggaagcaattatca 25087834  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||  ||||| |||||||| | |||||||||||    
T  25087833 actatgttatatacaataagacttgtttgaaacaattcaaaaacaaaaatgacttgtttgggacttttgaaac 25087761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 7378963 - 7379139
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7378963 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagaggactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 7379062  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||  |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  7379063 accaactattctatctacattatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaagaacttgtttgggacttttgaaac 7379139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 16246334 - 16246158
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16246334 agagcattatctaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 16246235  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  16246234 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaac 16246158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 27328584 - 27328760
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27328584 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 27328683  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  27328684 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 27328760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Original strand, 37838301 - 37838473
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  37838301 cattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaagaagcaattacca 37838400  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||  ||||||||   |||||||||||    
T  37838401 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaattaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 37838473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 33865408 - 33865246
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33865408 agagtattatccaccatttgtcatgcctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 33865309  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 177  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| || ||| ||||||||    
T  33865308 accaactatgttatctacaataagacttgtttgaaacgattcaaaaactagaatgacttgttt 33865246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 177
Target Start/End: Original strand, 36211046 - 36211208
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  36211046 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaatt 36211145  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 177  Q
    |  |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  36211146 acaaactatgttatctagaataggacttgtttgaaacaatttaaaaattaaaaggacttgttt 36211208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 772116 - 771941
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  772116 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 772017  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  772016 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaa-gattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaac 771941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 921022 - 921198
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  921022 agagcattatccaccatttgtcatgcataaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 921121  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||| |||   |||||||||||    
T  921122 atcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttatttaagacttttgaaac 921198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 1106700 - 1106525
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1106700 agagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 1106601  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaa 190  Q
    | ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| |||||  ||||||||  |||||||||||    
T  1106600 accaattatgctatctacaataggacttatttgaaatgattcaaaaactaaaaggacttgtttgcaacttttgaaa 1106525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 2094551 - 2094375
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2094551 agagcattatccaccatttgccatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgtttggagccaaatttagtatcaaagattagttcaaggaagcaatt 2094452  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  2094451 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 2094375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 2456010 - 2456186
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2456010 agagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagttaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 2456109  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  2456110 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacaattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 2456186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 9276574 - 9276750
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9276574 agagcattatccaccatttgtcatgcataaaaagatagctaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 9276673  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  9276674 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaac 9276750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 28650567 - 28650391
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  28650567 agagcattatccaccatttgtcatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagaaatt 28650468  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  | ||||||   |||||||||||    
T  28650467 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggatttgtttgagacttttgaaac 28650391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 34253142 - 34253318
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||    
T  34253142 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaatattaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaagaaagcaatt 34253241  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | || ||||||||    
T  34253242 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttaggacctttgaaac 34253318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 40854609 - 40854785
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  40854609 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 40854708  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||  ||||  ||| |||| | |||||||||||    
T  40854709 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaacaaaaaggactagtttgggacttttgaaac 40854785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 11949567 - 11949405
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  11949567 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaatattaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaatt 11949468  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 177  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||    
T  11949467 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgttt 11949405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 191
Target Start/End: Original strand, 2056929 - 2057102
Alignment:
Q  18 gcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaac 117  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  2056929 gcattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagctggatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacc 2057028  T
Q  118 aactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||| | | |||||||||||    
T  2057029 aactatgttatctacaataagacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtctgggacttttgaaac 2057102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 8899682 - 8899857
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  8899682 agagcattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactagttttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcatggaagcaatt 8899781  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||   |||||||||||    
T  8899782 accaactatgctatctacaatatgactt-gttgaaacgattcaaaaactaaaagaacttgtttgagacttttgaaac 8899857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 17134229 - 17134404
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17134229 agagcattatccatcatttgccattcctaaaaagatgactacttttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 17134328  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  17134329 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattt-aaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaac 17134404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 19180422 - 19180597
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19180422 agagtattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttag-agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 19180520  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |  ||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||||   |||||||| |||||||||||||    
T  19180521 actaactatactatctacaataagacttgtttgaaacgattcaaaaactaaatggacttgtttggaacttttgaaac 19180597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 36444369 - 36444193
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36444369 agagcattatccaccatttgccatgcttaaaaagatgactaattttaagtaggtgttatgagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 36444270  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  36444269 accaactatgctatctactataggacttgtttgaaacgatttaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 36444193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 41500643 - 41500467
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41500643 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagcgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 41500544  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| || ||  ||||||||   |||||||||||    
T  41500543 accaactatgctatgtacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactagaaggacttgtttgagacttttgaaac 41500467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 43249553 - 43249377
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||| |||||    
T  43249553 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgtattcaaggaaacaatt 43249454  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||  ||||| ||||| || ||||| ||| ||||| |||||  |||||||| |||||||||||||    
T  43249453 accaactatgctatcatcaataggacttgttcgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttggaacttttgaaac 43249377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 2315114 - 2314964
Alignment:
Q  17 agcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaa 116  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||     
T  2315114 agcattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattac 2315015  T
Q  117 caactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 167  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  2315014 caactatgctatctacaataagacttgtttgaaacaattcaaaaactaaaa 2314964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 3430765 - 3430631
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3430765 agagcattatacaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 3430666  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaa 149  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  3430665 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaa 3430631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 7297373 - 7297199
Alignment:
Q  17 agcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |  ||||||     
T  7297373 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagctagatttggtaccaaagatgagttcaagaagacaattac 7297274  T
Q  117 caactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  7297273 caactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaatctaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 7297199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 12759890 - 12759715
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  12759890 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtta-gaggcaaatttggtacgaaaaatgagttcaaggaagcaatt 12759792  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  12759791 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 12759715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 167
Target Start/End: Original strand, 29737748 - 29737900
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29737748 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaaatggatcttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 29737847  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 167  Q
    | |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  29737848 atcaactatgctatcgacaataggacttgtttgaaacaattcaaaaactaaaa 29737900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 33107110 - 33106934
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33107110 agagcattatttaccatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 33107011  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  33107010 accaactatgatatctacaataggactcgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 33106934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 38751048 - 38751224
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  38751048 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtggatgttaggagccacatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 38751147  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||  |||||||| || ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  38751148 accaactatactatctacattaggacttgtttgaaacgattaaaaaactaaaaggacttgtttaggacttttgaaac 38751224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 37732334 - 37732158
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||| ||||||||||| ||||||||    
T  37732334 agagcattatccaccatttgtcatacataaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttgataccaaaaatgagttcaagaaagcaatt 37732235  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  37732234 accaactatgttatttacaataagacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 37732158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 42629962 - 42630138
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  42629962 agagcatcatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaagaaagcaatt 42630061  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | ||| |||| ||||||  ||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  42630062 atcaattatgctatctatgataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaagacttgtttgagacttttgaaac 42630138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 8396692 - 8396572
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8396692 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggttttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 8396593  T
Q  115 aacaactatgttatctacaat 135  Q
    | |||||||| ||||||||||    
T  8396592 atcaactatgctatctacaat 8396572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 17484687 - 17484515
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    |||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  17484687 cattatccaccattttccatgcttaaaaagatgactaattttaagtggttgttaggagtcaaatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaattacca 17484588  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  17484587 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaac 17484515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 191
Target Start/End: Original strand, 45124120 - 45124295
Alignment:
Q  16 gagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatta 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||  || |||||||||||| |||||| ||||||    
T  45124120 gagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaagagtctgatttgataccaaagatgagtttaaggaaacaatta 45124219  T
Q  116 acaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
     |||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||   |||||||||||    
T  45124220 ccaactatgctatctacaataagatttgtttgaaacgattcaaaaactaaaagaatttgtttgagacttttgaaac 45124295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 131
Target Start/End: Original strand, 37654112 - 37654224
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37654112 cattattcatcatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtggatgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 37654211  T
Q  119 actatgttatcta 131  Q
    |||||||||||||    
T  37654212 actatgttatcta 37654224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 19916128 - 19916008
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  19916128 agagcattatccacaatttgtcaagcctaaaaagatgattgatattaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaccaatt 19916029  T
Q  115 aacaactatgttatctacaat 135  Q
    | |||||||| ||||||||||    
T  19916028 accaactatgctatctacaat 19916008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 41178160 - 41178060
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41178160 agagcattatccaccatttaccatgcctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 41178061  T
Q  115 a 115  Q
    |    
T  41178060 a 41178060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 177
Target Start/End: Original strand, 14630663 - 14630776
Alignment:
Q  64 tgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaatt 163  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |    
T  14630663 tgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaact 14630762  T
Q  164 aaaataacttgttt 177  Q
    ||||  ||||||||    
T  14630763 aaaaggacttgttt 14630776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 191
Target Start/End: Original strand, 9331757 - 9331932
Alignment:
Q  16 gagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatta 115  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||| | ||||| |  ||  |||||||||||    
T  9331757 gagcattatccaccatttgtcatgcataaaaagatagctaatcttaggtgggtgttaggagccaaatttggtacctaagataatatctgggaagcaatta 9331856  T
Q  116 acaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
     |||| ||  ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  9331857 ccaacaatactatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaac 9331932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 66 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 23671901 - 23671807
Alignment:
Q  66 ggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaa 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||| |||||||| ||| ||||    
T  23671901 ggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaaccatgttatctataataagacttgtttgaaacgattcaaaa 23671807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 23673014 - 23672958
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtt 71  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23673014 agagcattttccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtt 23672958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 28217003 - 28216929
Alignment:
Q  117 caactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  28217003 caactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacaattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaac 28216929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 154 - 191
Target Start/End: Original strand, 3358157 - 3358194
Alignment:
Q  154 tttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  3358157 tttaaaaattaaaatgacttgtttggaacttttgaaac 3358194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 138 - 191
Target Start/End: Original strand, 3430807 - 3430860
Alignment:
Q  138 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  3430807 gacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttggaacttttgaaac 3430860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 138 - 191
Target Start/End: Original strand, 11949612 - 11949665
Alignment:
Q  138 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||    
T  11949612 gacttgtttgaaacgatttaaaaactaaaaggacttgttttggacttttgaaac 11949665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 66)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 7553157 - 7552981
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7553157 agagcattatccaccatttgtcatggctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 7553058  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | || ||||||||    
T  7553057 accaactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacctttgaaac 7552981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 7651662 - 7651838
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  7651662 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 7651761  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  7651762 atcaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaac 7651838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 12143072 - 12143248
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12143072 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 12143171  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  12143172 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 12143248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 19315640 - 19315816
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19315640 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 19315739  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  19315740 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaac 19315816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 191
Target Start/End: Original strand, 49814302 - 49814476
Alignment:
Q  17 agcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  49814302 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 49814401  T
Q  117 caactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  49814402 caactatgctatctagaatatgacttatttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 49814476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 19274559 - 19274735
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  19274559 agagcattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 19274658  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  19274659 accagctatgttatctacaataggacttgtttgaaacgatttaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaac 19274735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 23767555 - 23767403
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23767555 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 23767456  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 167  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||    
T  23767455 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaa 23767403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 46825531 - 46825707
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46825531 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 46825630  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | ||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  46825631 accaattatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaagacttgtttgggacttttgaaac 46825707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 25988410 - 25988236
Alignment:
Q  17 agcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||     
T  25988410 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaccaattac 25988311  T
Q  117 caactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| |||||||||||||    
T  25988310 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttggaacttttgaaac 25988236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 28425504 - 28425328
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28425504 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 28425405  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  28425404 accaactatgctatctgcaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaac 28425328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 38473767 - 38473591
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38473767 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 38473668  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  38473667 accaactatgatatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 38473591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 49094848 - 49094676
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  49094848 cattatccaccatttgttatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 49094749  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||   |||||||||||    
T  49094748 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgagacttttgaaac 49094676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 26549388 - 26549564
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26549388 agagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 26549487  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  26549488 accaactatgctatctacaataggacttgtttaaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 26549564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 36157818 - 36157643
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36157818 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 36157719  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
      ||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||   |||||||||||    
T  36157718 -ccaattatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgagacttttgaaac 36157643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 167
Target Start/End: Original strand, 41106016 - 41106168
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41106016 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 41106115  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 167  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||    
T  41106116 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaa 41106168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 45350852 - 45350682
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  45350852 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagatcaaggaagcaattacca 45350753  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |||||||||||||||||| |  || |||||||| ||| |||||||||||  ||||||||   |||||||||||    
T  45350752 actatgttatctacaatagg--ttgtttgaaacgattcaaaaattaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 45350682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 9878921 - 9878749
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||  ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9878921 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaacccgatatggtactaaagatgagttcaaggaagcaattacca 9878822  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||||||    
T  9878821 actattttatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaagaacttatttgggacttttgaaac 9878749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 18892329 - 18892505
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18892329 agagcattatccaccatttgtcattcctaaaaggatgactaattttcagtgggtgttagaagccagatttggtatcaaagatgagttcaaagaagcaatt 18892428  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||| ||| |||||||||||||    
T  18892429 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttttttggaacttttgaaac 18892505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 33325727 - 33325903
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||    
T  33325727 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtcttagaagccagatttgataccaaagatgagtttaaggaagcaatt 33325826  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  33325827 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 33325903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 46051450 - 46051626
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46051450 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactagttttaagtgggtgttaggaaccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 46051549  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  46051550 accaactatgctatctacaacaggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaac 46051626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 50689943 - 50690119
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  50689943 agagcattatccatcatttgctatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 50690042  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  50690043 accaactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 50690119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 16705870 - 16706046
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16705870 agagcattatccaccattttccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggttttaggcgccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 16705969  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||  || |||||||||    
T  16705970 accaactatgttatctaaaataagacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgaaatttttgaaac 16706046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 33674017 - 33674193
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  33674017 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtacgaaagatgagttcaaggaagcaatt 33674116  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  33674117 accagctatgctatctacaataggacttgtttgacacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 33674193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 46095216 - 46095040
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  46095216 agagcattatccaccatttgtcatgtttaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagacagatttgatatcaaagatgagttcaaggaaacaatt 46095117  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| ||| |||||||||    
T  46095116 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttggaatttttgaaac 46095040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 36781311 - 36781137
Alignment:
Q  17 agcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaa 116  Q
    |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  36781311 agcattatccaccatttgccatgcccaaaaagacgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 36781212  T
Q  117 caactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  36781211 caactatgatatctacaataagacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 36781137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 177
Target Start/End: Original strand, 50533383 - 50533545
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  50533383 agagcattatccaaaatttgacatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagattcggtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 50533482  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 177  Q
    | ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||  ||||||||    
T  50533483 accaactatgttatctataataggacttgtttgaaacgatttaaaaactaaaaggacttgttt 50533545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 23228335 - 23228159
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23228335 agagcattatctaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaaatggatgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 23228236  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| |||||||||||  |||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||  | |||||||||||    
T  23228235 accaactatgctatctacaatagtacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgttagggacttttgaaac 23228159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24204612 - 24204436
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24204612 agagcattatccatcatttgccatgcctaaaaagatgactcattttaagtgggtattaggagccagatttggtaccaaagacgagttcaaggaagcaatt 24204513  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | | ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  24204512 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgactcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaac 24204436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 167
Target Start/End: Original strand, 26069896 - 26070044
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  26069896 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccggatttgataccaaaaatgagttcaaggaaacaattacca 26069995  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||    
T  26069996 actatgatatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaa 26070044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Original strand, 37216900 - 37217072
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  37216900 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagctagagttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattacca 37216999  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||    
T  37217000 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgggacttttgaaac 37217072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 48802472 - 48802296
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||||||||    
T  48802472 agagcattatccaccatttatcatgcctacaaagatgactaattttaagtaggtgttaggagccatatttgataccaaagatgagttcaatgaagcaatt 48802373  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  48802372 accaactatgctatctacaataagacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaac 48802296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 7608907 - 7608732
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||    
T  7608907 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaacatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtacaaaagatgagttcaaagaagcaatt 7608808  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaa 190  Q
    | |||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | | ||||||||    
T  7608807 atcaactatgctatctataataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggatttttgaaa 7608732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 48669533 - 48669375
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||    
T  48669533 cattatccattatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatcacca 48669434  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 177  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  48669433 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaattaaaaggacttgttt 48669375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 177
Target Start/End: Original strand, 52146993 - 52147155
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||    
T  52146993 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgaataattttaagtgggtgttaggaaccagatttgataccaaagatgagttcaatgaagcaatt 52147092  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 177  Q
    |  ||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  52147093 acaaactatgctatatacaacatgacttgtttgaaacgattcaaaaattaaaaggacttgttt 52147155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 45670623 - 45670451
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaac- 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  45670623 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagt-ggtgttaggaatcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 45670525  T
Q  118 aactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||| ||| | |||||||||||    
T  45670524 aactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttatttgggacttttgaaac 45670451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 8141623 - 8141452
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||  |    
T  8141623 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttacaagtcagatttggtactaaagatgagttcaaagaagcaattacaa 8141524  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  8141523 attatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaa-aacttgtttggaacttttgaaac 8141452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 41982372 - 41982240
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  41982372 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaatatgactaattttaaatgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaagaagtaattatca 41982273  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaac 151  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41982272 actatgttatctacaatatgacttgtttgaaac 41982240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 18782226 - 18782053
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  18782226 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgctatgaaccagattttgtaccaaagatgagttcaaataagcaattatca 18782127  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaaca 192  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||||  ||| ||||| |||||  |||||||| | ||||||||||||    
T  18782126 actatgctatctagaatatgacttgtttgaaatgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaaca 18782053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 40721342 - 40721519
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagt-gggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  40721342 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagataattaattttaggttgggtattaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaagaaagcaat 40721441  T
Q  114 taacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  40721442 tatcaactatgctatctacaataggacttgttggaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 40721519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 6711440 - 6711616
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||  || |  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6711440 agagcattatccaccatttaccatgtgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 6711539  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||  | ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||  ||||||||   |||||||||||    
T  6711540 accaactataatgtctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaataaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 6711616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Original strand, 9962755 - 9962927
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9962755 cattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaactagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 9962854  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||| |||   |||||||||||    
T  9962855 actatgctatctacaacagaacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttctttgagacttttgaaac 9962927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Original strand, 21965069 - 21965241
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||| ||    
T  21965069 cattatacaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtaaggagtcagatttggtaccaaagatgagtttaatgaagcaattacca 21965168  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | ||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  21965169 attatgtcatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaac 21965241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 43396675 - 43396851
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||| ||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43396675 agagcattatccatcatttgctatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 43396774  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  43396775 atcaactctgctatctacagtaggatttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 43396851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 48319183 - 48319067
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  48319183 cattatccaccatttgtaatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 48319084  T
Q  119 actatgttatctacaat 135  Q
    |||||| ||| ||||||    
T  48319083 actatgctatatacaat 48319067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 191
Target Start/End: Original strand, 5400876 - 5401046
Alignment:
Q  20 attatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaa 119  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5400876 attatccaccatttg-catgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttagaaaccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 5400974  T
Q  120 ctatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  5400975 ctatgctatctacaataggacttgtttgaaaagattcaaaaactaaaaagacttgtttgagacttttgaaac 5401046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 17984039 - 17983864
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  17984039 agagcattatctaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgaatcagatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaatt 17983940  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaa 190  Q
    |  ||||||||||| |||| || |||||  ||||||| ||| |||||||||||  ||||||||   ||||||||||    
T  17983939 acaaactatgttatttacattaggacttggttgaaacgattcaaaaattaaaaggacttgtttaagacttttgaaa 17983864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 52067792 - 52067617
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  52067792 agagcattatccaccatttgtcatccctaaaaagatgaataattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaacgatgagttcaaggaagcaatt 52067693  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaa 190  Q
    |  || ||||  |||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   ||||||||||    
T  52067692 acaaattatgccatctacaacatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaa 52067617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 33714495 - 33714325
Alignment:
Q  20 attatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaa 119  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  33714495 attatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaatgt-aagtgg-tgttaggagtcagatttggtatcaaagatgagttcaaggaaacaattatcaa 33714398  T
Q  120 ctatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaaca 192  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| ||| ||||| || ||  |||||||| | || |||||||||    
T  33714397 ctatgttatctacaataggatttgtttgaaacgattcaaaaactagaaagacttgtttgggacatttgaaaca 33714325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 52350065 - 52349913
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  52350065 agagcattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaagagccaaatttgatagaaaagatgagtttaaggaagcaatt 52349966  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 167  Q
    | |||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||    
T  52349965 accaactatgctatttacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaa 52349913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 177
Target Start/End: Original strand, 18917524 - 18917686
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  18917524 agagaattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcatatttggtaccaaagataaattcaaggaagcaatt 18917623  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 177  Q
    |  || |||| |||||||||||||| || |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||    
T  18917624 attaaatatgctatctacaatatgatttgtttgaaacgattaaaaaactaaaaggacttgttt 18917686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 136
Target Start/End: Original strand, 9974846 - 9974963
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  9974846 cattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttacgagccatatttagtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattacca 9974945  T
Q  119 actatgttatctacaata 136  Q
    |||||| |||||||||||    
T  9974946 actatgctatctacaata 9974963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 115
Target Start/End: Original strand, 12964646 - 12964746
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12964646 agagcattatacaacatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 12964745  T
Q  115 a 115  Q
    |    
T  12964746 a 12964746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 33194792 - 33194672
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  33194792 agagcattaaccaccattcgccatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaact 33194693  T
Q  115 aacaactatgttatctacaat 135  Q
    | |||||||| ||||||||||    
T  33194692 accaactatgctatctacaat 33194672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 161
Target Start/End: Original strand, 34971084 - 34971226
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||| |||||||||| ||| |||||| ||    
T  34971084 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagtcagatttgataccaaatatgagttcaaagaaacaattacca 34971183  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaa 161  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| |||||    
T  34971184 actatgttatctacattaggacttgtttgaaacgattcaaaaa 34971226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 191
Target Start/End: Original strand, 21929526 - 21929702
Alignment:
Q  20 attatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaag-------atgagttcaaggaagcaa 112  Q
    ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||       ||||||||||||||||||    
T  21929526 attatccaccatttgccat--ctaaaaagatgactaattttaagtgggttttaggagccagatttggtaccaaagatgaaagatgagttcaaggaagcaa 21929623  T
Q  113 ttaacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    ||| |||||||| |||||||||||  |||| |||||||| ||| |||||||||||  ||||||||   |||||||||||    
T  21929624 ttaccaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgattcaaaaattaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 21929702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 16506925 - 16506809
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||| ||    
T  16506925 cattatccaccatttgccatgcttaaaaagatggctgattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaggttgagttcaaggaagcaattacca 16506826  T
Q  119 actatgttatctacaat 135  Q
    |||||| ||||||||||    
T  16506825 actatgctatctacaat 16506809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Original strand, 25800648 - 25800817
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaa----gatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||| ||| ||||    |||||||||||||||||||||    
T  25800648 cattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtta------agatttggtaccaaattaagatgagttcaaggaagcaatt 25800741  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  25800742 accaac-atgttatctacaataagacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaac 25800817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 135
Target Start/End: Original strand, 30281631 - 30281751
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||  | |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30281631 agagcattatccaccattttacatgcctaaaaagataactggtattaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 30281730  T
Q  115 aacaactatgttatctacaat 135  Q
    | |||||||| ||||||||||    
T  30281731 accaactatgctatctacaat 30281751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 55 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 44978868 - 44978733
Alignment:
Q  55 aattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaat 154  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | |||||| |||||||| ||    
T  44978868 aattttaagtgg-tattaggagccagatttggtaccaaagataagttcaaggaagcaattatcaattatgctatctacattctgacttgtttgaaacgat 44978770  T
Q  155 ttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  44978769 tcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaac 44978733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 72
Target Start/End: Original strand, 50099220 - 50099277
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtta 72  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50099220 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgtta 50099277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 44979329 - 44979281
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaag 63  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44979329 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaag 44979281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 32373694 - 32373650
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattt 59  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32373694 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattt 32373650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 49814258 - 49814205
Alignment:
Q  138 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49814258 gacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaataacttgtttggaacttttgaaac 49814205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 17989906 - 17989864
Alignment:
Q  17 agcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattt 59  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17989906 agcattattcactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattt 17989864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 138 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 9974800 - 9974747
Alignment:
Q  138 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||    
T  9974800 gacttgtttgaaacgatttaaaaactaaaaggacttgtttggaacttttgaaac 9974747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 12964603 - 12964551
Alignment:
Q  139 acttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||   |||||||||||    
T  12964603 acttgtttgaaacaattcaaaaattaaaagaacttgtttgagacttttgaaac 12964551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 218885 - 219062
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtggg-tgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  218885 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaat 218984  T
Q  114 taacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||  ||||||||||  |||||||| | |||||||||||    
T  218985 taccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcgaaaattaaaaggacttgtttgggacttttgaaac 219062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 117; Significance: 9e-60; HSPs: 29)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 1915484 - 1915308
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1915484 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 1915385  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | ||||| |||||    
T  1915384 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaactattcaaaaactaaaaggacttgtttgggactttggaaac 1915308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 3408189 - 3408365
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  3408189 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 3408288  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||   |||||||||||    
T  3408289 accaactatactatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaagaacttgtttgagacttttgaaac 3408365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 6503718 - 6503894
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  6503718 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgggttcaaggaagcaatt 6503817  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  6503818 accaactatgatatctacaataggacttgtttgaaacgatttaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 6503894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 17428409 - 17428238
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17428409 cattattcaccgtttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 17428310  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaa 190  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| ||||||||||||    
T  17428309 actatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttggaacttttgaaa 17428238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 9382519 - 9382695
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9382519 agagcattatccaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 9382618  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||||||||||||  | ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| |||||||||||||    
T  9382619 accaactatgttatctacatcaggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttggaacttttgaaac 9382695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 191
Target Start/End: Original strand, 2390267 - 2390441
Alignment:
Q  17 agcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  2390267 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattataagtgggtgttaggagctatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 2390366  T
Q  117 caactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  | |||||| | |||||||||||    
T  2390367 caactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggatttgtttgggacttttgaaac 2390441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 2707459 - 2707635
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  2707459 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttggtaccaaagacgagttcaaggaagcaatt 2707558  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  2707559 accaactatgatatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 2707635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 10256237 - 10256413
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10256237 agagcattatccaccatttgcaatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 10256336  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||  ||||| ||||||||   |||||||||||    
T  10256337 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaacgaaaatgacttgtttgagacttttgaaac 10256413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 12626636 - 12626812
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  12626636 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagataagttcaaggaagcaatt 12626735  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  12626736 accaactattctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaac 12626812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Original strand, 17943040 - 17943212
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  17943040 cattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagtttaaggaagcaattacca 17943139  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||| |||||||| || ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||    
T  17943140 attatgctatctacattaggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgggacttttgaaac 17943212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 29050272 - 29050448
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||| |||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29050272 agagcattacccaccattcgccatgcctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 29050371  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  29050372 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaac 29050448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Original strand, 30379021 - 30379193
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30379021 cattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 30379120  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  30379121 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaac 30379193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Original strand, 1077241 - 1077413
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1077241 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggaaccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 1077340  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  1077341 actatgctatctacaacatgacttatttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 1077413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 8178390 - 8178214
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  8178390 agagcattatccaccatttgccatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 8178291  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||| ||||    
T  8178290 accaactatgctatctacaataggacatgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttaaaac 8178214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Original strand, 16193314 - 16193486
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16193314 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 16193413  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    ||||| |||||| || ||  |||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  16193414 actattttatctgcattagaacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaac 16193486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 26231073 - 26230911
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |    
T  26231073 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagaaact 26230974  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 177  Q
    | |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| | ||||||    
T  26230973 accaactatgttatttacattaggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgatttgttt 26230911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 26393146 - 26392988
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26393146 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 26393047  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 177  Q
    |||||| |||||||||||  | || |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||    
T  26393046 actatgctatctacaatagaagttttttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgttt 26392988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 3258948 - 3258772
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3258948 agagcgttatccaccatttgtcatgcataaaaagatgactaattttaagtgg-tgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 3258850  T
Q  115 aac-aactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    | | ||||||| |||||||||||  |||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  3258849 accaaactatggtatctacaatagaacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaagacttgtttgggacttttgaaac 3258772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 2598229 - 2598078
Alignment:
Q  26 caccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgt 125  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||     
T  2598229 caccatttgccatgcctaaaaagatgagtaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaataaagcaattaccaactatga 2598130  T
Q  126 tatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 177  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||    
T  2598129 tatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgttt 2598078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 11133873 - 11134050
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttc-aaggaagcaat 113  Q
    ||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  11133873 agagcattatccatcatttgttatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaaggaagcaat 11133972  T
Q  114 taacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    || || ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||| ||| | |||||||||||    
T  11133973 taccatctatgctatctacgataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttatttaggacttttgaaac 11134050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 26196458 - 26196286
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaac- 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |     
T  26196458 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgt-tgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcacggaagcaattacca 26196360  T
Q  118 aactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||| | ||| ||||| |||||| | ||||||   |||||||||||    
T  26196359 aactatgttatctacaataggacttggttgaaccgattcaaaaactaaaatgatttgtttgagacttttgaaac 26196286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 135
Target Start/End: Original strand, 26936607 - 26936727
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  26936607 agagtattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccggatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaatt 26936706  T
Q  115 aacaactatgttatctacaat 135  Q
    | |||||||| ||||||||||    
T  26936707 atcaactatgctatctacaat 26936727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 6785239 - 6785065
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    |||||||||| ||  ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||       
T  6785239 agagcattatacaaaatttgacatgactaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaatatgagttcaaggaagca--- 6785143  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaaca 192  Q
    | ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   ||||||||||||    
T  6785142 accaattatgttatctacattaggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaagacttgtttgagacttttgaaaca 6785065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 35224025 - 35223919
Alignment:
Q  30 atttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatc 129  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  35224025 atttgacatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagctagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatc 35223926  T
Q  130 tacaata 136  Q
    |||||||    
T  35223925 tacaata 35223919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 25820686 - 25820514
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    |||||||||  ||||| || | ||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||  |||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||| ||    
T  25820686 cattatccataatttgacatgactaaaattatgactaattttaaatgggtgttatgagttagatttggtaccaaacatgagttcaatgaagcaattacca 25820587  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |||||| ||||||| ||| || || |||||||| ||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  25820586 actatgctatctacgataggaattgtttgaaacgattaaaaaattaaaatgacttgtttgggacttttgaaac 25820514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 69 - 191
Target Start/End: Original strand, 31375971 - 31376093
Alignment:
Q  69 gttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaat 168  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||     
T  31375971 gttaggagccagatttggtaccaaagataagttcaaggaagcaattaacaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaag 31376070  T
Q  169 aacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
     ||||||||   |||||||||||    
T  31376071 gacttgtttgagacttttgaaac 31376093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 39 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 10931264 - 10931113
Alignment:
Q  39 gcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||| ||| || |    
T  10931264 gcctaaaaagatgactaattttaagcgggtgttagaagtcagatttggtaccaaagatgagttcaagaaaacaatt-acaactatgctatccacattagg 10931166  T
Q  139 acttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |||| ||||| || ||| ||||| |||||  | |||||| |||||||||||||    
T  10931165 acttgtttgatacgattcaaaaactaaaagtatttgtttggaacttttgaaac 10931113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 98 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 12613029 - 12612937
Alignment:
Q  98 agttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaa 190  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | ||||||||||    
T  12613029 agttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaagacttgtttgggacttttgaaa 12612937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 12612927 - 12612813
Alignment:
Q  77 ccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgtt 176  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||  |||| || ||||||||||| ||||| |||||||  ||| ||||| |||||  |||||||    
T  12612927 ccagatttggtagcaaagatgagttcaatgaagcaagtactaactttgctatctacaataggacttgtttgaaatgattcaaaaactaaaaggacttgtt 12612828  T
Q  177 ttgaacttttgaaac 191  Q
    |   |||||||||||    
T  12612827 tgagacttttgaaac 12612813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1986 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold1986
Description:

Target: scaffold1986; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 167
Target Start/End: Original strand, 114 - 266
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  114 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 213  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 167  Q
    | | |||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||| ||||| |||||    
T  214 accgactatgctatctacattaggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaa 266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0727 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0727
Description:

Target: scaffold0727; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 167
Target Start/End: Original strand, 5190 - 5337
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5190 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgg-tgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 5288  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 167  Q
    | |||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| |||||    
T  5289 attatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaa 5337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0693 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0693
Description:

Target: scaffold0693; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 5164 - 4992
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| || |||||| ||    
T  5164 cattatccaccatttgtcatgtctaaaaagatgactaattttaagagggtgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaagaaaacaattacca 5065  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||    
T  5064 actatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgttttggacttttgaaac 4992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 191
Target Start/End: Original strand, 47967 - 48138
Alignment:
Q  20 attatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaa 119  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  47967 attatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatttggtaccaaaggtgagttcaaggaagcaattaccaa 48066  T
Q  120 ctatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 191  Q
    |||||| || ||||||  ||||| ||| |||| ||| ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||    
T  48067 ctatgtgatatacaatcggacttgtttaaaacgattcaaaaactaaaaggacttgttttggacttttgaaac 48138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0542 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0542
Description:

Target: scaffold0542; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 2114 - 1994
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2114 agagcattatccaccatttgtcatgcctaataagatgactgattttaagtaggtgttaggagccagattcggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 2015  T
Q  115 aacaactatgttatctacaat 135  Q
    | |||||||| ||||||||||    
T  2014 accaactatgctatctacaat 1994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 167
Target Start/End: Original strand, 11362 - 11510
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| ||||||||||||| ||    
T  11362 cattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccatagataagtttaaggaagcaattacca 11461  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 167  Q
    |||||| || |||||||| | ||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  11462 actatgctacctacaataggtcttatttaaaacgatttaaaaactaaaa 11510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 84; Significance: 4e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 252579 - 252428
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 114  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||| |||||||||    
T  252579 agagcattatccaccgtttgccatgcctaaaaagatgactaattttaactgggtgttaggagccagatttggtacgaaaaatgagttcaatgaagcaatt 252480  T
Q  115 aacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaa 166  Q
    | |||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  252479 accaactatgctatatacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaa 252428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 177
Target Start/End: Original strand, 13099 - 13257
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  13099 cattatccatcatttgccatgcctaaaaagatgaataattttaagtggatattaggagctagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaggaattatca 13198  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 177  Q
    | |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||    
T  13199 attatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgttt 13257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 59745 - 59587
Alignment:
Q  19 cattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 118  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  59745 cattatccatcatttgccatgcctaaaaagatgaataattttaagtggatattaggagctagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaggaattatca 59646  T
Q  119 actatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 177  Q
    | |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||    
T  59645 attatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgttt 59587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0952 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0952
Description:

Target: scaffold0952; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 75 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 3452 - 3350
Alignment:
Q  75 agccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttg 174  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| || |||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||    
T  3452 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatcaacattaggacttatttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttg 3353  T
Q  175 ttt 177  Q
    |||    
T  3352 ttt 3350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0717 (Bit Score: 50; Significance: 8e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0717
Description:

Target: scaffold0717; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 192
Target Start/End: Original strand, 1877 - 1994
Alignment:
Q  75 agccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttg 174  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| || ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||    
T  1877 agccagatttggtaccaaagatgaggtcaaggaagcaattatcaactatgctatcaacattaggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaacgacttg 1976  T
Q  175 ttttgaacttttgaaaca 192  Q
    |||   ||||||||||||    
T  1977 tttgagacttttgaaaca 1994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0392 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0392
Description:

Target: scaffold0392; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 342 - 289
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggt 68  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  342 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgaataattttaagtgggt 289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1562 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1562
Description:

Target: scaffold1562; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 75 - 167
Target Start/End: Original strand, 599 - 691
Alignment:
Q  75 agccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 167  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| || ||||| |||||||| ||| ||||| |||||    
T  599 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctattaacattaggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaa 691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1158 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1158
Description:

Target: scaffold1158; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 75 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 1994 - 1902
Alignment:
Q  75 agccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 167  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| || ||||| |||||||| ||| ||||| |||||    
T  1994 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctattaacattaggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaa 1902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 65
Target Start/End: Original strand, 19781 - 19831
Alignment:
Q  15 agagcattatccaccatttgtcaggcctaaaaagatgactaattttaagtg 65  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19781 agagcattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtg 19831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University