View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6340_low_7 (Length: 485)

Name: NF6340_low_7
Description: NF6340
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6340_low_7
NF6340_low_7
[»] chr6 (70 HSPs)
chr6 (1-467)||(26802214-26802683)
chr6 (6-455)||(28780920-28781368)
chr6 (6-467)||(28786059-28786519)
chr6 (10-467)||(28792184-28792640)
chr6 (9-467)||(27724791-27725248)
chr6 (6-467)||(27718325-27718785)
chr6 (8-467)||(27610948-27611406)
chr6 (4-467)||(27698440-27698901)
chr6 (1-467)||(27604651-27605122)
chr6 (62-467)||(27592966-27593371)
chr6 (1-414)||(26655765-26656177)
chr6 (1-414)||(26761736-26762148)
chr6 (62-467)||(27678782-27679187)
chr6 (88-467)||(26884025-26884406)
chr6 (62-467)||(27677560-27677965)
chr6 (5-341)||(27229014-27229347)
chr6 (81-414)||(26646334-26646667)
chr6 (81-414)||(26752302-26752635)
chr6 (108-452)||(27531158-27531502)
chr6 (62-467)||(27706348-27706753)
chr6 (62-465)||(31284124-31284527)
chr6 (48-414)||(27338064-27338430)
chr6 (48-414)||(27398804-27399170)
chr6 (64-467)||(26861454-26861854)
chr6 (120-447)||(25481636-25481963)
chr6 (56-414)||(26622806-26623164)
chr6 (56-414)||(26728784-26729142)
chr6 (5-411)||(26823626-26824025)
chr6 (120-414)||(25579613-25579907)
chr6 (120-414)||(26142759-26143053)
chr6 (7-468)||(27427551-27428006)
chr6 (120-414)||(25538434-25538728)
chr6 (120-414)||(26055820-26056114)
chr6 (120-414)||(26075790-26076084)
chr6 (120-414)||(26048739-26049033)
chr6 (120-414)||(26069908-26070202)
chr6 (103-350)||(28234441-28234688)
chr6 (91-361)||(28226815-28227085)
chr6 (88-361)||(28325343-28325616)
chr6 (230-347)||(25506975-25507092)
chr6 (82-350)||(28185222-28185490)
chr6 (124-416)||(28242702-28242994)
chr6 (82-361)||(28180970-28181249)
chr6 (58-411)||(28139373-28139726)
chr6 (200-375)||(28149912-28150086)
chr6 (121-361)||(26848555-26848795)
chr6 (80-356)||(28098426-28098702)
chr6 (90-361)||(26341986-26342257)
chr6 (103-341)||(26893543-26893781)
chr6 (88-361)||(28297765-28298038)
chr6 (88-361)||(28514035-28514308)
chr6 (86-350)||(26936954-26937218)
chr6 (157-281)||(29825958-29826082)
chr6 (121-275)||(26635585-26635739)
chr6 (121-275)||(26741551-26741705)
chr6 (121-285)||(25071554-25071718)
chr6 (145-285)||(26949580-26949720)
chr6 (121-249)||(27214312-27214440)
chr6 (121-249)||(27234788-27234916)
chr6 (166-251)||(26617266-26617351)
chr6 (166-251)||(26723194-26723279)
chr6 (130-251)||(26959069-26959190)
chr6 (121-258)||(27665272-27665409)
chr6 (170-273)||(26811453-26811556)
chr6 (226-380)||(2184288-2184442)
chr6 (189-273)||(28491660-28491744)
chr6 (189-273)||(29804070-29804154)
chr6 (208-379)||(2184880-2185051)
chr6 (196-275)||(29467797-29467876)
chr6 (145-275)||(26974971-26975101)
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (6-455)||(13590-14038)
scaffold0277 (10-467)||(4617-5073)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (42-455)||(7341-7754)
[»] scaffold0349 (3 HSPs)
scaffold0349 (9-467)||(3367-3825)
scaffold0349 (4-467)||(14302-14762)
scaffold0349 (6-153)||(8061-8207)
[»] scaffold1254 (1 HSPs)
scaffold1254 (42-329)||(1-288)
[»] chr4 (8 HSPs)
chr4 (12-414)||(18699386-18699787)
chr4 (12-412)||(18731492-18731891)
chr4 (12-414)||(18655463-18655864)
chr4 (12-414)||(18679553-18679954)
chr4 (56-412)||(18724073-18724429)
chr4 (7-468)||(18073549-18074004)
chr4 (7-224)||(17989226-17989440)
chr4 (130-465)||(5090902-5091237)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (42-432)||(28164331-28164720)
chr1 (88-448)||(28127631-28127992)
chr1 (62-414)||(268343-268695)
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (62-414)||(29273769-29274121)
chr8 (102-257)||(31903727-31903882)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (7-468)||(59357-59812)
[»] scaffold0038 (4 HSPs)
scaffold0038 (103-361)||(34602-34860)
scaffold0038 (91-361)||(27313-27583)
scaffold0038 (88-361)||(116658-116931)
scaffold0038 (124-416)||(42864-43156)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (88-361)||(58334-58607)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (100-361)||(3279562-3279823)
chr2 (64-285)||(17993812-17994033)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (159-275)||(16688944-16689060)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 427; Significance: 0; HSPs: 70)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 427; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 467
Target Start/End: Original strand, 26802214 - 26802683
Alignment:
Q  1 aacttactcattcatattctgcattctcaaactcnnnnnnn---catccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26802214 aacttactcattcatattctgcattctcaaactcttttttttttcatccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcat 26802313  T
Q  98 tttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaaggg 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26802314 tttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaaggg 26802413  T
Q  198 aatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtg 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26802414 aatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtg 26802513  T
Q  298 ttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttct 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26802514 ttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctattttct 26802613  T
Q  398 ttggtgtggatcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcattggccgagcatgaaaa 467  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26802614 ttggtgtggatcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcattggctgagcatgaaaa 26802683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 6 - 455
Target Start/End: Original strand, 28780920 - 28781368
Alignment:
Q  6 actcattcatattctgcattctcaaactcnnnnnnncatccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttcttat 105  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||       ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||| | |    
T  28780920 actcattcatattctgaattctcaaactctttttt-catccaatttctctcaattatcatggctatgcaattaccttcctcttcctcttcattttcctct 28781018  T
Q  106 ggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccata 205  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  28781019 gcattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcgccacggttttaccggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatcaaaa 28781118  T
Q  206 ccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28781119 ccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccatcgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctat 28781218  T
Q  306 caactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtg 405  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28781219 caactatgccacttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctacaagacaaaaggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtg 28781318  T
Q  406 gatcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcattggc 455  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||   |||||||||||||||||    
T  28781319 gatcctactaatgtgcgacatcatacaggtccttatggtgaagcattggc 28781368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 6 - 467
Target Start/End: Original strand, 28786059 - 28786519
Alignment:
Q  6 actcattcatattctgcattctcaaactcnnnnnnncatccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttcttat 105  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||       ||||||||||||| ||||| | |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||    
T  28786059 actcattcatattctgaattctcaaactctttttt-catccaatttctctcaattcttatggctatacaatcaccttcctcatcctcttcattttcctat 28786157  T
Q  106 ggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccata 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  28786158 ggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcgccacggttttaccggaaatctctacaaggctcttactgacaagggaatcaaaa 28786257  T
Q  206 ccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28786258 ccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccatcgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctat 28786357  T
Q  306 caactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtg 405  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  28786358 caactacgccacatcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctacaagacaaaaggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtc 28786457  T
Q  406 gatcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcattggccgagcatgaaaa 467  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  28786458 gatcctactaatgtgcgacatcatacaggtcgttatggtgaagcattggctgggcatgaaaa 28786519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 10 - 467
Target Start/End: Original strand, 28792184 - 28792640
Alignment:
Q  10 attcatattctgcattctcaaactcnnnnnnncatccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttcttatggat 109  Q
    |||||||||||| ||||||||||||       ||||||||||||| ||||| | |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28792184 attcatattctgaattctcaaactctttttt-catccaatttctctcaattcttatggctatacaatcaccttcctcatcctcttcattttcctatggat 28792282  T
Q  110 tcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccatacctt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||    
T  28792283 tcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcgccacggttttaccggaaatctctacaaggctcttactgacaagggaatcaaaacctt 28792382  T
Q  210 cattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaac 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28792383 cattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccatcgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaac 28792482  T
Q  310 tatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatc 409  Q
    || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  28792483 tacgccacatcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctacaagacaaaaggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtcgatc 28792582  T
Q  410 ctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcattggccgagcatgaaaa 467  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  28792583 ctactaatgtgcgacatcatacaggtcgttatggtgaagcattggctgggcatgaaaa 28792640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 9 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 27725248 - 27724791
Alignment:
Q  9 cattcatattctgcattctcaaactcnnnnnnncatccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttcttatgga 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||       ||||| ||||||| ||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27725248 cattcatattctgcattctcaaactctttttt-catcctatttctctcaattgtcatggctatacaatcaccttcctcatcctcttcattttcctatgga 27725150  T
Q  109 ttcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccatacct 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27725149 ttcacttaccaagtgttccttagttttaggggcactgacactcggcacggttttaccggaaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacct 27725050  T
Q  209 tcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaa 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27725049 tcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccattgatgaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaa 27724950  T
Q  309 ctatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggat 408  Q
    |||||||| |||    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||     
T  27724949 ctatgcctattcttcgttttgtttggacgaacttgtccacataattcactgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttcttcggcgtggaa 27724850  T
Q  409 cctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcattggccgagcatgaaaa 467  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27724849 cctactaacgtgcgacatcagaaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaa 27724791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 6 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 27718785 - 27718325
Alignment:
Q  6 actcattcatattctgcattctcaaactcnnnnnnncatccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttcttat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||       ||||| ||||||| ||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||  ||    
T  27718785 actcattcatattctgcattctcaaactctttttt-catcctatttctctcaattctcatggctatacaatcaccttcctcatcctcttcattctcccat 27718687  T
Q  106 ggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccata 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27718686 ggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggcacagttttaccggaaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccata 27718587  T
Q  206 ccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27718586 ccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccattgatgaatctaggatttttattcctgtgttttctat 27718487  T
Q  306 caactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtg 405  Q
    |||||||||||||||    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  27718486 caactatgcctcttcttcgttttgtttggacgaacttgtccacataattcactgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttcttcggcgtg 27718387  T
Q  406 gatcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcattggccgagcatgaaaa 467  Q
    || |||||||| ||||| ||||| | | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27718386 gaacctactaacgtgcgacatcagaaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaa 27718325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 8 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 27611406 - 27610948
Alignment:
Q  8 tcattcatattctgcattctcaaactcnnnnnnncatccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttcttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |   ||||||| || ||||||||||| |||||    
T  27611406 tcattcatattctgcattctcaaactctttttt-catccaatttctctcaattttcatggctatgcaattagcttcctcttcttcttcattttcctatgg 27611308  T
Q  108 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccatacc 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27611307 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcgccacggttttaccggaaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 27611208  T
Q  208 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatca 307  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27611207 ttcattgatgacaatgatcttccaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccattgatgaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 27611108  T
Q  308 actatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtgga 407  Q
    |||||||||||||    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  27611107 actatgcctcttcttcgttttgtttggacgaacttgtccacataattcactgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttcttcggcgtgga 27611008  T
Q  408 tcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcattggccgagcatgaaaa 467  Q
     |||||||| ||||| ||||| | | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27611007 acctactaaagtgcgacatcagaaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaa 27610948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 4 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 27698901 - 27698440
Alignment:
Q  4 ttactcattcatattctgcattctcaaactcnnnnnnncatccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttctt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||       ||||| ||||||| ||||| |||||||||| || || |||||||||||| |||||||||| |    
T  27698901 ttactcattcatattctgcattctcaaactcttttt--catcctatttctctcaattctcatggctatacaatcaccttcctcatccacttcattttcct 27698804  T
Q  104 atggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatcca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27698803 atggattcacttaccaagtgttcatcagttttaggggcactgacactcggcacggttttaccggaaatctctacaaggctcttactgacaagggaatcca 27698704  T
Q  204 taccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttct 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27698703 taccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccattgatgaatctaggatttttattcctgtgttttct 27698604  T
Q  304 atcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtg 403  Q
     |||||||||| |||||   |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  27698603 ctcaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacataattcactgctacgagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttcttcggtg 27698504  T
Q  404 tggatcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcattggccgagcatgaaaa 467  Q
    |||| || ||||||||| | ||||||| | |||| |||||  |||||||||| |||||||||||    
T  27698503 tggaaccaactaatgtgagacatcataaaggtagttatggcaaagcattggctgagcatgaaaa 27698440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 27605122 - 27604651
Alignment:
Q  1 aacttactcattcatattctgcattctcaaactcnnnnnnncatccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctcatcctc------tt 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||      ||    
T  27605122 aacttactcattcatattctgcattctcaaactctttttt-catccaatttctctcaattctcatggctatgcaattaccttcctcatcctcatcctctt 27605024  T
Q  95 cattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaa 194  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27605023 cattttcctatgcattcacttaccaagtgttccttagttttaggggcactgacactcgatacggttttaccggcaatctctacaaggctcttactgacaa 27604924  T
Q  195 gggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcct 294  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  27604923 gggaattcataccttcattgatgaaaatgatcttcgaagaggagatgaaatcacaccagcacttctcaaggccattgatgaatccaggatttttattcct 27604824  T
Q  295 gtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttt 394  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  27604823 gtgttttctatcaaatatgcctcttcttccttttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacacgacaaagggtcgcgtcgttttgcctgttt 27604724  T
Q  395 tctttggtgtggatcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcattggccgagcatgaaaa 467  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||| | |||| || ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  27604723 tctttggtgtggaaccttctcatgtgcgacatcataaaggtagttacggtcaagcattggctgagcataaaaa 27604651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 62 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 27593371 - 27592966
Alignment:
Q  62 tcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttt 161  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||| ||||| |||| ||||  | ||  |||||||| ||||||||||| || || | ||||||||||||||||||    
T  27593371 tcatggctatgcaatcaccttcctcttccacttcaatttcctatgattacaaataccaagtattcctcagtttcagaggaagtgacactcggtacggttt 27593272  T
Q  162 tacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatc 261  Q
     || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  27593271 caccggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatcaacaccttcattgatgacaatggtcttcaaagaggaaatgaaatcacaccatcacttctc 27593172  T
Q  262 aaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgct 361  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  27593171 aaggccattgaagagtctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcgttttgtttggacgaacttgaccacatcattcattgct 27593072  T
Q  362 ataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcattggccgagca 461  Q
    | ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  27593071 acaagacaaagggtcgccctgttttgcctgttttctttggtgtggatccttctcatgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcattggctgagca 27592972  T
Q  462 tgaaaa 467  Q
    ||||||    
T  27592971 tgaaaa 27592966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 414
Target Start/End: Original strand, 26655765 - 26656177
Alignment:
Q  1 aacttactcattcatattctgcattctcaaactcnnnnnnncatccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcatttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||       |||||| |||||| ||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  26655765 aacttactcattcatattctgcattcccaaactctttttt-catccattttctctcaattctcatggctatacaatcaccttcctcatcctcttcatttt 26655863  T
Q  101 cttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaat 200  Q
    | ||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26655864 cctatgggtttaaataccaagtgttcctcagttttaggggcattgacacccggcacggttttaccggcaatctctacaaggctcttattgataagggaat 26655963  T
Q  201 ccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttt 300  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||  | |||    
T  26655964 ccatactttcattgatgacaatgatcttctcagaggagatgaaatcacaccatcactcgttaaggccattgaagaatccaggatttttattcccatattt 26656063  T
Q  301 tctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttg 400  Q
    |||  ||||||||| |||||   |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |    || ||||||||||||| ||    
T  26656064 tctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcattgctataagacaaagggttgttcggttttgcctgttttctatg 26656163  T
Q  401 gtgtggatcctact 414  Q
    ||||||||||||||    
T  26656164 gtgtggatcctact 26656177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 414
Target Start/End: Original strand, 26761736 - 26762148
Alignment:
Q  1 aacttactcattcatattctgcattctcaaactcnnnnnnncatccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcatttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||       |||||| |||||| ||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  26761736 aacttactcattcatattctgcattcccaaactctttttt-catccattttctctcaattctcatggctatacaatcaccttcctcatcctcttcatttt 26761834  T
Q  101 cttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaat 200  Q
    | ||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26761835 cctatgggtttaaataccaagtgttcctcagttttaggggcattgacacccggcacggttttaccggcaatctctacaaggctcttattgataagggaat 26761934  T
Q  201 ccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttt 300  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||  | |||    
T  26761935 ccatactttcattgatgacaatgatcttctcagaggagatgaaatcacaccatcactcgttaaggccattgaagaatccaggatttttattcccatattt 26762034  T
Q  301 tctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttg 400  Q
    |||  ||||||||| |||||   |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |    || ||||||||||||| ||    
T  26762035 tctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcattgctataagacaaagggttgttcggttttgcctgttttctatg 26762134  T
Q  401 gtgtggatcctact 414  Q
    ||||||||||||||    
T  26762135 gtgtggatcctact 26762148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 62 - 467
Target Start/End: Original strand, 27678782 - 27679187
Alignment:
Q  62 tcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttt 161  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||| ||||| |||| ||||  | ||  |||||||| ||||||||||| || || | ||||||||||||||||||    
T  27678782 tcatggctatgcaatcaccttcctcttccacttcaatttcctatgagtacaaataccaagtattcctcagtttcagaggaagtgacactcggtacggttt 27678881  T
Q  162 tacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatc 261  Q
     || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  27678882 caccgggaatctctacaaggctcttactgacaagggaatcaacaccttcattgataagaatggtcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcacttctc 27678981  T
Q  262 aaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgct 361  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  27678982 aaggccattgaagagtctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgct 27679081  T
Q  362 ataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcattggccgagca 461  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||| || | |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  27679082 acaagacaaagggtcgcctcgttctgcctgttttctttggtgtggaacctactgttgtgcgacatcgtaaaggtagttatggtgaagcattggctgagca 27679181  T
Q  462 tgaaaa 467  Q
    ||||||    
T  27679182 tgaaaa 27679187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 88 - 467
Target Start/End: Original strand, 26884025 - 26884406
Alignment:
Q  88 tcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctctta 187  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||    
T  26884025 tcctcttcattttcctatggattcacttaccaagtgttcctcagtttcagaggaagtgacactcggtatggtttcactggaaatctctacaaggctctta 26884124  T
Q  188 ttgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttt 287  Q
     | ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26884125 ctaacaagggaatccacaccttcattgatgataatcatcttccaagaggaagcgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttt 26884224  T
Q  288 tattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcaca--ttattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtct 385  Q
    ||||||  | ||||||| ||||||||| |||||   |||||| |||||||||||||| ||||  | ||||| |||||  ||||||||||||||||||| |    
T  26884225 tattccaatattttctaccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatgtcattcactgctacgagacaaagggtcgcctcgttt 26884324  T
Q  386 tgcctgttttctttggtgtggatcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcattggccgagcatgaaaa 467  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  26884325 tgcctgtttttgttggtgtggatcctactgatgtgcgacatcatacaggtagttatggtgaagcattggctgaccatgaaaa 26884406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 62 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 27677965 - 27677560
Alignment:
Q  62 tcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttt 161  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||| ||||| |||| ||||  | ||  |||||||| ||||||| ||| || || | ||||||||||||||||||    
T  27677965 tcatggctatgcaatcaccttcctcttccacttcaatttcctatgagtacaaataccaagtattcctcaatttcagaggaagtgacactcggtacggttt 27677866  T
Q  162 tacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatc 261  Q
     || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||  |  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  27677865 caccggcaatctctacaaggctcttgatgacaagggaatccacaccttcattgacaatcatgaacttcaaagaggggatgaaatcacaccatcacttctc 27677766  T
Q  262 aaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgct 361  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  27677765 aaggccattgaagagtctaggatttttattgctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgct 27677666  T
Q  362 ataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcattggccgagca 461  Q
    | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||| | | |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  27677665 acaagacaaagggtcgcctcgttctgcctgttttctttgctgtggaacctactattgtgcgacatcagaaaggtagttatggtgaagcattggctgagca 27677566  T
Q  462 tgaaaa 467  Q
    ||||||    
T  27677565 tgaaaa 27677560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 5 - 341
Target Start/End: Original strand, 27229014 - 27229347
Alignment:
Q  5 tactcattcatattctgcattctcaaactcnnnnnnncatccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttctta 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||       ||||||||||||| ||| | |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| |     
T  27229014 tactcattcatattctgcattctaaaactctttt---catccaatttctctcaagtctcatggctatacaatcaccttcctcttcctcttcattttcctt 27229110  T
Q  105 tggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccat 204  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27229111 tggattcacttaccaagtgttccttagttttaggggcactgacactcggcacggttttaccggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccat 27229210  T
Q  205 accttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttcta 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||  | ||||||     
T  27229211 accttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagacgaaatcacaccatcactcgtcaaggccattgacgaatctcggatttttattcccatattttctg 27229310  T
Q  305 tcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaact 341  Q
     ||||||||| |||||   |||||| ||| |||||||    
T  27229311 ccaactatgcatcttcttcattttgtttgaacgaact 27229347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 81 - 414
Target Start/End: Original strand, 26646334 - 26646667
Alignment:
Q  81 ttcctcatcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaag 180  Q
    |||||| ||||||| | |||| || |||||||| ||||| || |||||||  || ||||||| |||||||||  |||||||||| ||  |||||||||||    
T  26646334 ttcctcttcctctttaatttcctacggattcacctaccaggtcttcctcaacttcaggggcagtgacactcgtgacggttttactggacatctctacaag 26646433  T
Q  181 gctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatcta 280  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26646434 gctcttactgacaagggaattcacaccttcattgatgattgtgatcttaagagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatcta 26646533  T
Q  281 gaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcct 380  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  26646534 ggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttctaaattttgtttggacgaacttgtccacatcattcattgctacaagacaaagggtcgtct 26646633  T
Q  381 cgtcttgcctgttttctttggtgtggatcctact 414  Q
    ||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  26646634 cgttttgcccgttttctatggcgtggatcctact 26646667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 81 - 414
Target Start/End: Original strand, 26752302 - 26752635
Alignment:
Q  81 ttcctcatcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaag 180  Q
    |||||| ||||||| | |||| || |||||||| ||||| || |||||||  || ||||||| |||||||||  |||||||||| ||  |||||||||||    
T  26752302 ttcctcttcctctttaatttcctacggattcacctaccaggtcttcctcaacttcaggggcagtgacactcgtgacggttttactggacatctctacaag 26752401  T
Q  181 gctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatcta 280  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26752402 gctcttactgacaagggaattcacaccttcattgatgattgtgatcttaagagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatcta 26752501  T
Q  281 gaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcct 380  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  26752502 ggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttctaaattttgtttggacgaacttgtccacatcattcattgctacaagacaaagggtcgtct 26752601  T
Q  381 cgtcttgcctgttttctttggtgtggatcctact 414  Q
    ||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  26752602 cgttttgcccgttttctatggcgtggatcctact 26752635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 108 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 27531502 - 27531158
Alignment:
Q  108 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccatacc 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  27531502 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcgcggacactcgccacggttttaccggaaatctctacaaggctcttactgacaagggaatctatacc 27531403  T
Q  208 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatca 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||   |    
T  27531402 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactaaaaaatgccattgaaaaatctaggatttttattcccgtattttctgaaa 27531303  T
Q  308 actatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtgga 407  Q
    ||||||| |||||   |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||  | ||||||||| | || || |||||||||||  ||||||||||    
T  27531302 actatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgttcacatcactcattgctacgatacaaagggttgtcttgttttgcctgtttttattggtgtgga 27531203  T
Q  408 tcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcatt 452  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  27531202 tcctactgatgtgcgacatcacacaggtagatatggtgaagcatt 27531158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 62 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 27706753 - 27706348
Alignment:
Q  62 tcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttt 161  Q
    ||||||||||||| || |||| ||| ||| ||||| |||| ||||  | ||  |||||||| ||||||||||| || ||   ||||||||||||||||||    
T  27706753 tcatggctatgcaatcacctttctcttccacttcaatttcctatgagtacaaataccaagtattcctcagtttcagaggaggtgacactcggtacggttt 27706654  T
Q  162 tacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatc 261  Q
     || |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||  |  |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||    
T  27706653 cacaggcaatctctacaaggcttttgatgacaagggaatccacaccttcattgacaatcatgaacttcaaagaagggatgaaatcacaccatcacttctc 27706554  T
Q  262 aaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgct 361  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  27706553 aaggccattgaagagtctaggatttttattcctgtgttttctatcacctatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgct 27706454  T
Q  362 ataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcattggccgagca 461  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| || ||||||| |||||| |||| || | |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  27706453 acaagacaaagggtcgcctcgttctgcctgttttatttggtgtagaacctactattgtgcgacatcgtaaaggtagttatggtgaagcattggctgagca 27706354  T
Q  462 tgaaaa 467  Q
    ||||||    
T  27706353 tgaaaa 27706348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 62 - 465
Target Start/End: Original strand, 31284124 - 31284527
Alignment:
Q  62 tcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttt 161  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||| |||| |||| |||||  |||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||    
T  31284124 tcatggctatgcaatcatcttcctcttcctcttcaatttcctatgtattcaaataccaagtattccttagtttcaggggaagtgacactcggtatggttt 31284223  T
Q  162 tacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatc 261  Q
     || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  31284224 caccggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccacaccttcattgatgatagtgaacttcaaagaggggatgaaatcacaccatcactcgac 31284323  T
Q  262 aaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgct 361  Q
    || ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||  |||||||||||||||    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |  |    
T  31284324 aatgccattgaagagtctaggatttttatccccgtgttttctgccaactatgcctcttcgtcgttttgtttggacgaacttgtccacatcattcacttgt 31284423  T
Q  362 ataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcattggccgagca 461  Q
    |||||  ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||| | |||| ||||| |||||||||||  ||||    
T  31284424 ataagcaaaatggtcgcctcgttttgcccgttttctttggcgtggatccttctcatgtgcgacatcatagaggtagttatggagaagcattggctaagca 31284523  T
Q  462 tgaa 465  Q
    ||||    
T  31284524 tgaa 31284527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 48 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 27338430 - 27338064
Alignment:
Q  48 atttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgac 147  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| || | |||||| ||||||||| |||| | ||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
T  27338430 atttctctcaattctcatggctatgcaatcactttcctcttcctcttcaatttcctctgggttcaaataccatgtgttcctcagttttagggacattgac 27338331  T
Q  148 actcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatca 247  Q
    ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||    
T  27338330 actctttacggttttaccggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatcaaaaccttcattgatgacaacgatcttgaaagaggagatgaaagca 27338231  T
Q  248 caccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttca 347  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||  | ||||||   |||||||| |||||   ||||||||||||||||||||| ||    
T  27338230 caccatcacttgtcaaggccattgaagagtctaggattttgattcccatattttctgcaaactatgcatcttcttcattttgcttggacgaacttgtcca 27338131  T
Q  348 cattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcctact 414  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||| |||| |    || ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27338130 catcattcactgctacaagacaaggggttgttcggttttgcctgttttctatggtgcggatcctact 27338064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 48 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 27399170 - 27398804
Alignment:
Q  48 atttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgac 147  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| || | |||||| ||||||||| |||| | ||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
T  27399170 atttctctcaattctcatggctatgcaatcactttcctcttcctcttcaatttcctctgggttcaaataccatgtgttcctcagttttagggacattgac 27399071  T
Q  148 actcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatca 247  Q
    ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||    
T  27399070 actctttacggttttaccggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatcaaaaccttcattgatgacaacgatcttgaaagaggagatgaaagca 27398971  T
Q  248 caccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttca 347  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||  | ||||||   |||||||| |||||   ||||||||||||||||||||| ||    
T  27398970 caccatcacttgtcaaggccattgaagagtctaggattttgattcccatattttctgcaaactatgcatcttcttcattttgcttggacgaacttgtcca 27398871  T
Q  348 cattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcctact 414  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||| |||| |    || ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27398870 catcattcactgctacaagacaaggggttgttcggttttgcctgttttctatggtgcggatcctact 27398804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 64 - 467
Target Start/End: Original strand, 26861454 - 26861854
Alignment:
Q  64 atggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggtttta 163  Q
    ||||||||||| || |||| ||| ||||||||  |||| ||||||||||  ||||| || ||||||||||| || || | |||||||||||| |||||||    
T  26861454 atggctatgcaatcaccttgctcttcctcttccatttcctatggattcaaataccaggtattcctcagtttcagaggaagtgacactcggtatggtttta 26861553  T
Q  164 cgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaa 263  Q
    | || ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||   ||| ||||||||||| |||||||||| |  |||||||  |||    
T  26861554 ccggtaatctctacaaggctcttactgacaagggaattcacaccttcatggatgatcgtgaacttcaaagaggggatgaaatcaaaagatcactcgacaa 26861653  T
Q  264 ggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctat 363  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||   |||||| ||||| |||||||| || || ||| | |||       
T  26861654 tgccattgaagagtctagaattttcattcctgtgttttctgccaactatgcctcttcgtcattttgtttggatgaacttgtccaaatcattaactgc--- 26861750  T
Q  364 aagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcattggccgagcatg 463  Q
    |||  |||||||||| |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||| | |||  |||||||||||||||||  ||||||    
T  26861751 aaggaaaagggtcgcgtcgttttgcctgttttctatggcatggatcctactaatgtgcgacatcatagaggtatttatggtgaagcattggctaagcatg 26861850  T
Q  464 aaaa 467  Q
    ||||    
T  26861851 aaaa 26861854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 120 - 447
Target Start/End: Original strand, 25481636 - 25481963
Alignment:
Q  120 agtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgac 219  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||  ||  |||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||     
T  25481636 agtgttcctcaatttcaggggcagtgacactcgcaacaattttaccggtaatctctataaggctcttgttgacaagggaattcgtactttcattgatgaa 25481735  T
Q  220 aatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctctt 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||  | ||||||  ||||||||| ||||    
T  25481736 aatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcacttgtcaaggccattgaagaatctaggatttgtattcccatattttctgccaactatgcatctt 25481835  T
Q  320 caaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcctactaatgt 419  Q
    |   |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| || || | || || || ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  25481836 cttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagagttgcttagtattacccgttttctatggtgtggatcctactgatgt 25481935  T
Q  420 gcgccatcatacatgtagctatggtgaa 447  Q
     || | |||||||||||| |||||||||    
T  25481936 tcgacgtcatacatgtagttatggtgaa 25481963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 56 - 414
Target Start/End: Original strand, 26622806 - 26623164
Alignment:
Q  56 caattttcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggta 155  Q
    ||||| ||||||||||||| || || ||||| ||||||||| |||| |||  |||||  |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  26622806 caattatcatggctatgcaatcaccatcctcttcctcttcaatttcctatcaattcaaataccaagtgttcctaagtttcagaggcagtgacactcggta 26622905  T
Q  156 cggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatca 255  Q
    |||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  26622906 cggtttcactggaaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccacaccttcattgatgatcgtgaacttcaaagaggggacgaaatcaaaccatca 26623005  T
Q  256 ctcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattc 355  Q
    ||   ||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||   |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  26623006 cttgacaatgctatcgaagagtctaggatttttattcctgtgttttctcccaactatgcatattcttcattttgtttggatgaacttgtccacatcattc 26623105  T
Q  356 attgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcctact 414  Q
    | ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || |||| ||| ||||||||||||    
T  26623106 actgctacaaaacaaagggtcgtctcgttttgcccgtcttctatggcgtggatcctact 26623164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 56 - 414
Target Start/End: Original strand, 26728784 - 26729142
Alignment:
Q  56 caattttcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggta 155  Q
    ||||| ||||||||||||| || || ||||| ||||||||| |||| |||  |||||  |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  26728784 caattatcatggctatgcaatcaccatcctcttcctcttcaatttcctatcaattcaaataccaagtgttcctaagtttcagaggcagtgacactcggta 26728883  T
Q  156 cggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatca 255  Q
    |||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  26728884 cggtttcactggaaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccacaccttcattgatgatcgtgaacttcaaagaggggacgaaatcaaaccatca 26728983  T
Q  256 ctcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattc 355  Q
    ||   ||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||   |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  26728984 cttgacaatgctatcgaagagtctaggatttttattcctgtgttttctcccaactatgcatattcttcattttgtttggatgaacttgtccacatcattc 26729083  T
Q  356 attgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcctact 414  Q
    | ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || |||| ||| ||||||||||||    
T  26729084 actgctacaaaacaaagggtcgtctcgttttgcccgtcttctatggcgtggatcctact 26729142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 411
Target Start/End: Original strand, 26823626 - 26824025
Alignment:
Q  5 tactcattcatattctgcattctcaaactcnnnnnnncatccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttctta 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||       | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||      |||| |||| ||    
T  26823626 tactcattcatattctgcattctcaaactctttctt-cgtccaatttctctcaattctcatggctatgcagtcaacttcctc------ttcagtttcata 26823718  T
Q  105 tggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccat 204  Q
    ||  ||||  ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  26823719 tgatttcaaataccaagtgtttctcagttttagaggcgctgacactcggtatgaatttaccggcaatctctacaaggctcttacagacaagggaatccac 26823818  T
Q  205 accttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttcta 304  Q
    |||||  |||||||   ||| ||||||||||| ||| |||||  || ||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||     
T  26823819 accttttttgatgatcgtgaacttcaaagaggggataaaatcgaacaatcactcaataatgccattgaagagtctaggatttttattcctgtgttttctg 26823918  T
Q  305 tcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgt 404  Q
     |||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||| ||||    ||| |||  |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  26823919 ccaactatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcgcgtctacaaggaaaaggggcgcctcgttttgcctgttttctatggtgt 26824018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 120 - 414
Target Start/End: Original strand, 25579613 - 25579907
Alignment:
Q  120 agtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgac 219  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||||  ||  |||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||     
T  25579613 agtgttcctcagtttcagaggcagtgacactcgcaacacttttaccggtaatctctataaggctcttgttgacaagggaattcgtaccttctttgatgat 25579712  T
Q  220 aatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctctt 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||  ||||||||| ||||    
T  25579713 aatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcacttgtcaaggccattgaagaatctaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatctt 25579812  T
Q  320 caaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcctact 414  Q
    |   |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| || || | || ||||| ||||||| || |||||| ||||||    
T  25579813 cttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagagttgcttagtattgcccgttttctatgatgtggaacctact 25579907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 120 - 414
Target Start/End: Original strand, 26142759 - 26143053
Alignment:
Q  120 agtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgac 219  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||   ||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||     
T  26142759 agtgttcctcagtttcaggggcagtgacactcgcaacaaatttaccggtaatctctataaggctcttgttgacaagggaattcgtactttcattgatgat 26142858  T
Q  220 aatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctctt 319  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||  ||||||||| ||||    
T  26142859 aatgatcttgaaagaggagatgaaatcacaccatcacttgtcaaggccattgaagaatctaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatctt 26142958  T
Q  320 caaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcctact 414  Q
    |   |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| || || | || || || ||||||| || |||||| ||||||    
T  26142959 cttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagagttgcttagtatttcccgttttctatgatgtggaacctact 26143053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 27428006 - 27427551
Alignment:
Q  7 ctcattcatattctgcattctcaaactcnnnnnnncatccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttcttatg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||       ||||  ||||||| ||||| ||||||| ||||| |  |||| ||  |||||||||||||| ||||    
T  27428006 ctcattcatattctgcattctcaaactcttct---catcttatttctctcaattctcatggccatgcaattacctttctattcctcttcattttcctatg 27427910  T
Q  107 gattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccatac 206  Q
     ||||| |||| | |||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  27427909 cattcagttacgatgtgttcctcatttgtaagggcaccgacactcggtacggtttcaccggcaatctcttgaaggctcttattgacaagggaattcgtac 27427810  T
Q  207 cttcattgatgacaatga------tcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttt 300  Q
    ||||  ||||||| ||||      |||||||||| ||||  || ||||||||    |||| |      |||||||||| || ||||| |||||  | |||    
T  27427809 cttccatgatgacgatgacagtgatcttcaaagaagagacaaagtcacaccaa---tcatta------ttgaagaatccaggattttgattcccatattt 27427719  T
Q  301 tctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttg 400  Q
    |||  ||||||||| |||||   || ||| ||||||  |||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  27427718 tctgccaactatgcatcttcttcatcttgtttggacacacttgtccacatcattcactgctacaaaaccaagggttgcctcgttttgcctgttttctttg 27427619  T
Q  401 gtgtggatcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcattggccgagcatgaaaat 468  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  27427618 gtgtggaacctactgatgtgcgacatcatacaggtaggtatggtaaagcattggctgagcatgaaaat 27427551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 120 - 414
Target Start/End: Original strand, 25538434 - 25538728
Alignment:
Q  120 agtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgac 219  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||   ||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||   ||| ||||| |||||     
T  25538434 agtgttcctcagtttcaggggcagtgacactcgcaacaaatttaccggtaatctctataaggctcttgttgacaagggaattagtactttcatagatgat 25538533  T
Q  220 aatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctctt 319  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||  ||||||||| ||||    
T  25538534 aatgatcttgaaagaggagatgaaatcacaccatcacttgtcaaggccatcgaagaatctagaatttttattcccatattttctgccaactatgcatctt 25538633  T
Q  320 caaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcctact 414  Q
    |   |||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| || || | || ||||| ||||||| || |||||| ||||||    
T  25538634 cttcattttgtttggacgaacttgtccagatcattcactgctacaagacaaagagttgcttagtattgcccgttttctatgatgtggaacctact 25538728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 120 - 414
Target Start/End: Original strand, 26055820 - 26056114
Alignment:
Q  120 agtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgac 219  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||  ||  |||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||     
T  26055820 agtgttcctcattttcaggggcagtgacactcgcaacaattttaccggtaatctctataaggctcttgttgacaagggaattaatactttcattgatgaa 26055919  T
Q  220 aatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctctt 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||| | |||||||||||  | ||||||  ||||||||| ||||    
T  26055920 aatgatcttcaaagaggagatgaaatcacatcatcacttgtcaaggccatcgaagaatctgggatttttattcccatattttctgccaactatgcatctt 26056019  T
Q  320 caaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcctact 414  Q
    |   |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||| || || | || ||||| ||||||| || |||||| ||||||    
T  26056020 cttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaacacaaagagttgcttagtattgcccgttttctatgatgtggaacctact 26056114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 120 - 414
Target Start/End: Original strand, 26075790 - 26076084
Alignment:
Q  120 agtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgac 219  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||  ||  |||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||     
T  26075790 agtgttcctcaatttcaggggcagtgacactcgcaacaattttaccggtaatctctataaggctcttgttgacaagggaattaatactttcattgatgaa 26075889  T
Q  220 aatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctctt 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||| | |||||||||||  | ||||||  ||||||||| ||||    
T  26075890 aatgatcttcaaagaggagatgaaatcacatcatcacttgtcaaggccatcgaagaatctgggatttttattcccatattttctgccaactatgcatctt 26075989  T
Q  320 caaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcctact 414  Q
    |   |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||| || || | || ||||| ||||||| || |||||| ||||||    
T  26075990 cttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaacacaaagagttgcttagtattgcccgttttctatgatgtggaacctact 26076084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 120 - 414
Target Start/End: Original strand, 26048739 - 26049033
Alignment:
Q  120 agtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgac 219  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||  |||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||   ||| |||||||||||     
T  26048739 agtgttcctcagtttcaggggcagtgacactcgcaacaattttaccggtaatctctataaggctctcattgacaagggaatttgtactttcattgatgat 26048838  T
Q  220 aatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctctt 319  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||  | ||||||  ||||||||| ||||    
T  26048839 aatgatcttgaaagaggagatgaaatcacacccaaacttgtcaaggccatggaagaatctaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatctt 26048938  T
Q  320 caaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcctact 414  Q
    |   |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| || || | || ||||| ||||| | || |||||| ||||||    
T  26048939 cttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagagttgcttagtattgcccgttttttatgatgtggaacctact 26049033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 120 - 414
Target Start/End: Original strand, 26069908 - 26070202
Alignment:
Q  120 agtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgac 219  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||  |||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||   ||| |||||||||||     
T  26069908 agtgttcctcagtttcaggggcagtgacactcgcaacaattttaccggtaatctctataaggctctcattgacaagggaatttgtactttcattgatgat 26070007  T
Q  220 aatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctctt 319  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||  | ||||||  ||||||||| ||||    
T  26070008 aatgatcttgaaagaggagatgaaatcacacccaaacttgtcaaggccatggaagaatctaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatctt 26070107  T
Q  320 caaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcctact 414  Q
    |   |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| || || | || ||||| ||||| | || |||||| ||||||    
T  26070108 cttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagagttgcttagtattgcccgttttttatgatgtggaacctact 26070202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 103 - 350
Target Start/End: Original strand, 28234441 - 28234688
Alignment:
Q  103 tatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatcc 202  Q
    ||||||||||| ||  | |||||||| |||||||| || | ||||||||| || |||||||| |  |||||||| |  ||||||  | ||||||||||||    
T  28234441 tatggattcacctatgacgtgttccttagttttagaggtagtgacactcgctatggttttaccgaaaatctctatagagctctttgtcacaagggaatcc 28234540  T
Q  203 ataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttc 302  Q
    | ||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||    
T  28234541 acaccttcattgatgacagggagcttcaaggaggagatgaaataacaccatcacttttcaaggccattgaagagtctaggattttcattcctgtcttgtc 28234640  T
Q  303 tatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacat 350  Q
    |||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||| |||||    
T  28234641 tatcaattatgcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacat 28234688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 91 - 361
Target Start/End: Original strand, 28226815 - 28227085
Alignment:
Q  91 tcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattg 190  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||  | |||||||| |||||||| || | ||||||||| || |||||||| || ||||||||||  | ||||  |     
T  28226815 tcttccttctcttatggattcacctatgacgtgttccttagttttagaggtattgacactcgttatggttttactggaaatctctacagtgatctttgta 28226914  T
Q  191 acaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttat 290  Q
    | |||||||| || || ||| ||||||| |  || |||||| |||| |||||||| ||| |||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  28226915 agaagggaattcacacattctttgatgatagagagcttcaaggaggtgatgaaataacatcatcacttttcaaggtcattgaagaatctaggattttcat 28227014  T
Q  291 tcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgct 361  Q
    |||||| || |||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  28227015 tcctgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcattgct 28227085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 88 - 361
Target Start/End: Original strand, 28325343 - 28325616
Alignment:
Q  88 tcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctctta 187  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||  | |||||||| |||||||| || | ||||||||| || |||||||| || ||||||||||| | ||||     
T  28325343 tcctcttccttttcctatggattcacctatgacgtgttccttagttttagaggtagtgacactcgttatggttttactggaaatctctacaaagatcttt 28325442  T
Q  188 ttgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttt 287  Q
     |   ||| |||| | |||||||||||||||||| || |||||| |||| || ||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  28325443 gtaggaagagaattcgtaccttcattgatgacaaagaccttcaacgaggtgacgaaataacaccgtcacttttcaaggccattgaagagtctaggatttt 28325542  T
Q  288 tattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgct 361  Q
     |||||| | || |||||||| ||||| |||||    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  28325543 cattcctattttgtctatcaattatgcttcttcttccttttgcttggatgaacttgtccacattattcactgct 28325616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 230 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 25507092 - 25506975
Alignment:
Q  230 aaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttg 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25507092 aaagaggagatgaaatcacaccatcagtcgtcatcgccattgaagaatctaggatttttattccggttctttctatcaactatgcctcttcaaaattttg 25506993  T
Q  330 cttggacgaacttgttca 347  Q
     ||||| |||||||||||    
T  25506992 tttggaggaacttgttca 25506975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 82 - 350
Target Start/End: Original strand, 28185222 - 28185490
Alignment:
Q  82 tcctcatcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaagg 181  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||| ||  | |||||||| || ||||| || | ||||||||| ||  ||||||| || |||||| | |  |    
T  28185222 tcctcatcctcttccttctcctatggattcacctatgacgtgttccttagctttagaggtagtgacactcgttatcgttttactggaaatctcaatagag 28185321  T
Q  182 ctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctag 281  Q
    |||||  ||||||||||||||  |||||||| |||||||  || |||||| |||| || ||||| ||| |||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  28185322 ctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataacatcatcacttttcaaggccattgaagagtctag 28185421  T
Q  282 aatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacat 350  Q
     ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||| |||||    
T  28185422 gattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacat 28185490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 124 - 416
Target Start/End: Original strand, 28242702 - 28242994
Alignment:
Q  124 ttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatg 223  Q
    ||||| |||||||| || | ||||||||| || |||||||| || ||||||||||| | ||||  | | |||||||| |  ||||||||||||||||  |    
T  28242702 ttccttagttttagaggtagtgacactcgttatggttttactggaaatctctacaaagatctttgtaagaagggaattcgcaccttcattgatgacagag 28242801  T
Q  224 atcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaa 323  Q
    | |||| | |||| ||  |||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||       
T  28242802 aacttccaggaggtgacaaaataacaccatcacttttcaaggccattgaagagtctaggattttcattcctgtcttgtctatcaattatgcttcttcttc 28242901  T
Q  324 attttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcctactaa 416  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||| ||| || ||||| || |||||  |||||| || |||||| ||| ||||    
T  28242902 attttgcttggacgaacttgtccacatcattcactgctgcaagaaaaatggacgcctagttttgccaattttctatgatgtggaaccttctaa 28242994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 82 - 361
Target Start/End: Original strand, 28180970 - 28181249
Alignment:
Q  82 tcctcatcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaagg 181  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||| ||  | | |||||| || ||||| ||   ||||||||| || |||||||| || |||||| | |  |    
T  28180970 tcctcatcctcttccttctcctatggattcacctatgacgcgttccttagctttagaggtggtgacactcgttatggttttactggaaatctcaatagag 28181069  T
Q  182 ctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctag 281  Q
    |||||  ||||||||||||||  |||||||| |||||||  || |||||| |||| || ||||| ||| |||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  28181070 ctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataacatcatcacttttcaaggccattgaagagtctag 28181169  T
Q  282 aatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgct 361  Q
     ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  28181170 gattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcactgct 28181249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 58 - 411
Target Start/End: Original strand, 28139373 - 28139726
Alignment:
Q  58 attttcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacg 157  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||| || ||  |||| || || ||||| ||||| ||| | || || ||||| || || |||| ||||||||| | ||    
T  28139373 attttcatggctttgcaaccaccttcttcttctacttctttctcctatggcttcacatacgatgtctttctcagcttcagaggcagtgacactcgtttcg 28139472  T
Q  158 gttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcact 257  Q
    |||| || || ||||||||||| ||||||  ||||   |||||||| || || |||||||| |  || |||||| |||| || |||||  |||| |||||    
T  28139473 gtttcactggaaatctctacaaagctcttcgtgactgtggaatccacacttttattgatgatagggagcttcaaggaggtgacgaaatatcaccgtcact 28139572  T
Q  258 catcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcat 357  Q
    | | || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||| ||| |     
T  28139573 cgtaaaagccattgaagaatctaggattttcatccctgtgttttccatcaactatgcctcttcttcgttttgcttggacgaacttgtccacatcattgac 28139672  T
Q  358 tgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcct 411  Q
    ||||  || ||||||||  |  | || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  28139673 tgcttcaacacaaagggatgtttggttttgcctgttttctatggtgtggatcct 28139726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 200 - 375
Target Start/End: Original strand, 28149912 - 28150086
Alignment:
Q  200 tccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgtt 299  Q
    |||| |||||||||||||| |  || ||| || |||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||| |||||  | ||    
T  28149912 tccacaccttcattgatgatacggagctttaacgaggggacgaaatcacaccatcactc-tcaaggccattgaagagtccaggattttcattccaatctt 28150010  T
Q  300 ttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggt 375  Q
     |||||||||||| | |||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| ||||||||    
T  28150011 ctctatcaactatacttcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacattattcactgcttcaaggcaaagggt 28150086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 121 - 361
Target Start/End: Original strand, 26848555 - 26848795
Alignment:
Q  121 gtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgaca 220  Q
    |||||| | ||||| |||||||| |||||| | | | |||| || || |||||||| || ||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  26848555 gtgttcattagtttcaggggcaccgacactagattcagtttcactggtaatctctataaagctctttctgacaatggaatccgaaccttcattgatgaca 26848654  T
Q  221 atgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttc 320  Q
    | |||||||| || || ||||| |||||||| || ||| |||||  ||||||||| || || ||||  |||| ||| || |||   ||||||||| ||||    
T  26848655 aggatcttcagagtggtgatgagatcacaccttcgctcctcaagaacattgaagactcgaggatttccattcttgtattctctgagaactatgccacttc 26848754  T
Q  321 aaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgct 361  Q
        ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26848755 ttcgttttgtttggacgaacttgtccacatcattcattgct 26848795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 80 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 28098702 - 28098426
Alignment:
Q  80 cttcctcatcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaa 179  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||  | ||||| || | |||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  28098702 cttcctctttctcttcattctcttatggattcacctatgacgtgtttcttaattttaggggcaccgacactcggtatggttttactggaaatctctacaa 28098603  T
Q  180 ggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatct 279  Q
     ||||||  ||||   ||| |||  |||||||||||  | || ||||||||   ||| |||  |||||||| ||| ||  |||||||||| ||||| ||     
T  28098602 agctctttgtgacggaggagtccgcaccttcattgaccataaagatcttcatgaaggtgatagaatcacacaatcccttgtcaaggccatcgaagagtcc 28098503  T
Q  280 agaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattca 356  Q
    || ||||| ||||| || || ||||  |||||||| |||||    ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  28098502 aggattttaattccggtcttctctaagaactatgcttcttctttgttttgtttggatgaacttgtccacatcattca 28098426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 90 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 26342257 - 26341986
Alignment:
Q  90 ctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttatt 189  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||  | |||||||||| ||||||||||| || |||||| || |||||||| |||||| |||| |  |||||   |    
T  26342257 ctcttcattctcatatggattcacatatgatgtgttcctcaattttaggggcattggcactcgctatggttttactggcaatatctatagagctctatgt 26342158  T
Q  190 gacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaattttta 289  Q
    |||   ||| |||  |||||||||||||| |  || |||||  |||| ||  ||||||||| ||||||  |||| ||||||||||| || || ||||| |    
T  26342157 gacggtggagtccgcaccttcattgatgatagggagcttcatggaggtgacaaaatcacacaatcacttgtcaaagccattgaagagtccaggattttca 26342058  T
Q  290 ttcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgct 361  Q
    ||||  | || || ||||||||||| |||||    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26342057 ttccaattttctcaatcaactatgcttcttcttcgttttgtttggacgaacttgtccacatcattcattgct 26341986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 103 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 26893781 - 26893543
Alignment:
Q  103 tatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatcc 202  Q
    ||||||||||| ||| | || ||||||| |||||| ||| |||||||||| |  |||||||||||  |||| || || ||||||  ||| |  ||||| |    
T  26893781 tatggattcacctacgatgtcttcctcaattttagaggctctgacactcgttttggttttacgggtcatctttataaagctctttgtgatagtggaattc 26893682  T
Q  203 ataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttc 302  Q
    | |||||||||||||| |  || ||||| ||||| || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||  || |  ||||| ||  | ||    
T  26893681 acaccttcattgatgatacagagcttcatagaggtgacgaaatctcaccatcacttatcaaggcaattgaagagtctatgatatacattccagtcctctc 26893582  T
Q  303 tatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaact 341  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| |||||    
T  26893581 tatcaactatgcttcttctatattttgtttggaagaact 26893543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 88 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 28298038 - 28297765
Alignment:
Q  88 tcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctctta 187  Q
    |||||||| || || |||||||||||| |  | || ||||| |||||||| || | |||||| || ||| ||||||  || |||||| |||| | ||||     
T  28298038 tcctcttccttctcctatggattcactcatgacgttttcctaagttttagaggtagtgacacacgctacagttttattggaaatctccacaaagatcttt 28297939  T
Q  188 ttgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttt 287  Q
     |   |||||||| |  ||||||||||||||||  || ||| || |||| || ||||| |||||||||||  |||||  |||||||||  |||| |||||    
T  28297938 gtaggaagggaattcgcaccttcattgatgacagagagcttaaaggaggtgacgaaataacaccatcacttttcaagcacattgaagagactaggatttt 28297839  T
Q  288 tattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgct 361  Q
     |||||||| || |||| ||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  28297838 cattcctgtcttatctaccaattatgcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcactgct 28297765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 88 - 361
Target Start/End: Original strand, 28514035 - 28514308
Alignment:
Q  88 tcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctctta 187  Q
    |||||||| || || |||||||||||| |  | || ||||| |||||||| || | |||||| || ||| ||||||  || |||||| |||| | ||||     
T  28514035 tcctcttccttctcctatggattcactcatgacgttttcctaagttttagaggtagtgacacacgctacagttttattggaaatctccacaaagatcttt 28514134  T
Q  188 ttgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttt 287  Q
     |   |||||||| |  ||||||||||||||||  || ||| || |||| || ||||| |||||||||||  |||||  |||||||||  |||| |||||    
T  28514135 gtaggaagggaattcgcaccttcattgatgacagagagcttaaaggaggtgacgaaataacaccatcacttttcaagcacattgaagagactaggatttt 28514234  T
Q  288 tattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgct 361  Q
     |||||||| || |||| ||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  28514235 cattcctgtcttatctaccaattatgcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcactgct 28514308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 86 - 350
Target Start/End: Original strand, 26936954 - 26937218
Alignment:
Q  86 catcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctct 185  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| | |  |||||  ||  |||| ||||| |||||    
T  26936954 catcatcttccttctcttatggattcacctatgacgtgttcctcagtttcagaggcaccgacactcgcttccattttattggtcatctttacaaagctct 26937053  T
Q  186 tattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatt 285  Q
    |  |||    ||||| |  ||||||||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||  | |||    
T  26937054 ttgtgattgtggaattcgcaccttcattgatgacaaggagctccatggaggagaagaaatcacaccatcacttgtcaaggcaattgaagattccgggatt 26937153  T
Q  286 tttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacat 350  Q
       || ||||| || ||||||||||||||| ||||   |||||| |||||||||||||| |||||    
T  26937154 gccatacctgtattctctatcaactatgccacttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 26937218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 157 - 281
Target Start/End: Original strand, 29825958 - 29826082
Alignment:
Q  157 ggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcac 256  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||  ||| |  ||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  29825958 ggttttaccggcaatctctacaaagctctaactgacaagaaaattcgcaccttcattgatgacaaagagcttcaaagaggggacgaaatcacaccctcac 29826057  T
Q  257 tcatcaaggccattgaagaatctag 281  Q
    |  | ||||| ||| ||||||||||    
T  29826058 ttgtgaaggcaattcaagaatctag 29826082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 275
Target Start/End: Original strand, 26635585 - 26635739
Alignment:
Q  121 gtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgaca 220  Q
    |||||| | ||||| |||||||| |||||||  | |||||| || || || ||||| || ||||||  |||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  26635585 gtgttcattagtttcaggggcaccgacactcaattcggtttcaccggtaacctctataaagctctttctgacaaaggaatcaacaccttcattgatgaca 26635684  T
Q  221 atgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaaga 275  Q
    | || ||| ||| ||| |||||||||||||| || ||| |||||  |||||||||    
T  26635685 aggagcttaaaaaaggggatgaaatcacaccttcgctcctcaagagcattgaaga 26635739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 275
Target Start/End: Original strand, 26741551 - 26741705
Alignment:
Q  121 gtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgaca 220  Q
    |||||| | ||||| |||||||| |||||||  | |||||| || || || ||||| || ||||||  |||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  26741551 gtgttcattagtttcaggggcaccgacactcaattcggtttcaccggtaacctctataaagctctttctgacaaaggaatcaacaccttcattgatgaca 26741650  T
Q  221 atgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaaga 275  Q
    | || ||| ||| ||| |||||||||||||| || ||| |||||  |||||||||    
T  26741651 aggagcttaaaaaaggggatgaaatcacaccttcgctcctcaagagcattgaaga 26741705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 285
Target Start/End: Original strand, 25071554 - 25071718
Alignment:
Q  121 gtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgaca 220  Q
    |||||| | ||||| ||||| || |||||||| | ||||||||| || ||||| || || ||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  25071554 gtgttcattagtttcaggggtaccgacactcgattcggttttaccggtaatctttataaagctctttctgacaaaggaatccacacctttattgatgaca 25071653  T
Q  221 atgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatt 285  Q
    | || ||| | ||||| || ||||||||||| || |||  ||||  ||||||||| || ||||||    
T  25071654 aagagcttaagagaggtgacgaaatcacaccttcgctccgcaagagcattgaagattcgagaatt 25071718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 285
Target Start/End: Original strand, 26949580 - 26949720
Alignment:
Q  145 gacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaa 244  Q
    |||||||| | |||||| || || |||||||| || |||||   ||||||||||||||  |||||||||||||| || || ||||| | ||| || ||||    
T  26949580 gacactcgattcggtttcaccggtaatctctataaagctctctctgacaagggaatccgaaccttcattgatgataaggagcttcagaaaggtgacgaaa 26949679  T
Q  245 tcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatt 285  Q
    ||||||| |||||| |||||   ||||||||||| ||||||    
T  26949680 tcacaccttcactcctcaagagaattgaagaatcgagaatt 26949720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 249
Target Start/End: Original strand, 27214312 - 27214440
Alignment:
Q  121 gtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgaca 220  Q
    |||||| | ||||| ||||| || ||||||||  ||||||| || || |||||||| || ||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  27214312 gtgttcattagtttcaggggtaccgacactcgacacggtttcaccggtaatctctataaagctctttgtgacaaaggaatccgaaccttcattgatgaca 27214411  T
Q  221 atgatcttcaaagaggagatgaaatcaca 249  Q
    | || ||||| ||||| || |||||||||    
T  27214412 aggagcttcagagaggtgacgaaatcaca 27214440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 27234916 - 27234788
Alignment:
Q  121 gtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgaca 220  Q
    |||||| | ||||| ||||| || ||||||||  ||||||| || || |||||||| || ||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  27234916 gtgttcattagtttcaggggtaccgacactcgacacggtttcaccggtaatctctataaagctctttgtgacaaaggaatccgaaccttcattgatgaca 27234817  T
Q  221 atgatcttcaaagaggagatgaaatcaca 249  Q
    | || ||||| ||||| || |||||||||    
T  27234816 aggagcttcagagaggtgacgaaatcaca 27234788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 251
Target Start/End: Original strand, 26617266 - 26617351
Alignment:
Q  166 ggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacacc 251  Q
    ||||||||||| || ||||||  |||||| ||| |||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26617266 ggcaatctctataaagctctttgtgacaaaggagtccgaaccttcattgatgacaaggagcttcagagaggtgatgaaatcacacc 26617351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 251
Target Start/End: Original strand, 26723194 - 26723279
Alignment:
Q  166 ggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacacc 251  Q
    ||||||||||| || ||||||  |||||| ||| |||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26723194 ggcaatctctataaagctctttgtgacaaaggagtccgaaccttcattgatgacaaggagcttcagagaggtgatgaaatcacacc 26723279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 251
Target Start/End: Original strand, 26959069 - 26959190
Alignment:
Q  130 agttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttc 229  Q
    ||||| |||||||| |||||||| | | |||| || || || ||||| || ||||||  |||||| |||||| | ||||||||||||||||| || |||     
T  26959069 agtttcaggggcaccgacactcgattcagtttcaccggtaacctctataaagctctttctgacaaaggaatcgacaccttcattgatgacaaagagctta 26959168  T
Q  230 aaagaggagatgaaatcacacc 251  Q
    ||| ||| ||||||||||||||    
T  26959169 aaaaaggggatgaaatcacacc 26959190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 27665409 - 27665272
Alignment:
Q  121 gtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgaca 220  Q
    |||||| | ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| || || || ||||| |||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  27665409 gtgttcattagtttcaggggtaccgacactcgatttggtttcaccggtaacctctataaggctctttctgacaaaggaatccacaccttcattgatgaca 27665310  T
Q  221 atgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactc 258  Q
    | || |||| ||  || || ||||||||||| ||||||    
T  27665309 aggagcttccaactggtgacgaaatcacaccttcactc 27665272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 273
Target Start/End: Original strand, 26811453 - 26811556
Alignment:
Q  170 atctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccat 269  Q
    ||||||| || ||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || ||| |||||  |||    
T  26811453 atctctataaagctctttgtgacaaaggaatccgaaccttcattgatgacaaggagcttcagagaggtgacgaaatcacaccttcgctcctcaagagcat 26811552  T
Q  270 tgaa 273  Q
    ||||    
T  26811553 tgaa 26811556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 380
Target Start/End: Original strand, 2184288 - 2184442
Alignment:
Q  226 cttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaat 325  Q
    |||||| |||| | |||||| ||| ||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || ||||| || || |  |||||||| |||||   ||    
T  2184288 cttcaacgagggggtgaaataacagcatcacttatgaaagccattgaagagtccagaattttcatccctgttttctcaaagaactatgcttcttcttcat 2184387  T
Q  326 tttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcct 380  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||| || ||  ||| ||||||| |||||    
T  2184388 tttgtttggacgaacttgtccacatcattcgttactccaagtcaaagggacgcct 2184442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 28491744 - 28491660
Alignment:
Q  189 tgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaa 273  Q
    |||||| ||| ||| ||| ||||| || ||| | || ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28491744 tgacaaaggagtccgtactttcatggacgacgaggagcttcaaaaaggtgaagaaatcacaccatcactcatcaaagccattgaa 28491660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 29804154 - 29804070
Alignment:
Q  189 tgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaa 273  Q
    |||||| ||| ||| ||| ||||| || ||| | || ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29804154 tgacaaaggagtccgtactttcatggacgacgaggagcttcaaaaaggtgaagaaatcacaccatcactcatcaaagccattgaa 29804070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 379
Target Start/End: Original strand, 2184880 - 2185051
Alignment:
Q  208 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatca 307  Q
    ||||| |||||| | || |||||| |||| | |||||| |||||||| ||  | || |||||||||||||| |||||||| || ||||| || || |       
T  2184880 ttcatggatgacgaagagcttcaacgagggggtgaaataacaccatcgcttgtgaaagccattgaagaatccagaattttcatccctgttttctcaaagg 2184979  T
Q  308 actatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcc 379  Q
    ||||||| |||||   |||||| |||||||||||||| || || |||| |||||  ||| ||||||| ||||    
T  2184980 actatgcttcttcttcattttgtttggacgaacttgtccatatcattcgttgctccaagtcaaagggacgcc 2185051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 275
Target Start/End: Original strand, 29467797 - 29467876
Alignment:
Q  196 ggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaaga 275  Q
    ||||| || |||||||| |||||  | || ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  29467797 ggaattcacaccttcatggatgatgaagaacttcaaaaaggcgaagaaatcacaccatcactcatcaaagctattgaaga 29467876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 275
Target Start/End: Original strand, 26974971 - 26975101
Alignment:
Q  145 gacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaa 244  Q
    |||||||| | |||||| || || || ||||| || ||||||  |||||| |||||| | | ||||||||||||||| || ||| ||| ||| || ||||    
T  26974971 gacactcgattcggtttcaccggtaacctctataaagctctttctgacaaaggaatcaacatcttcattgatgacaaggagcttaaaaaaggggacgaaa 26975070  T
Q  245 tcacaccatcactcatcaaggccattgaaga 275  Q
    ||||||| || ||| |||||  |||||||||    
T  26975071 tcacaccttcgctcctcaagagcattgaaga 26975101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 312; Significance: 1e-176; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 6 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 14038 - 13590
Alignment:
Q  6 actcattcatattctgcattctcaaactcnnnnnnncatccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttcttat 105  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||       ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||| | |    
T  14038 actcattcatattctgaattctcaaactctttttt-catccaatttctctcaattatcatggctatgcaattaccttcctcttcctcttcattttcctct 13940  T
Q  106 ggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccata 205  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  13939 gcattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcgccacggttttaccggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatcaaaa 13840  T
Q  206 ccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13839 ccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccatcgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctat 13740  T
Q  306 caactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtg 405  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13739 caactacgccacttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctacaagacaaaaggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtg 13640  T
Q  406 gatcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcattggc 455  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  13639 gatcctactaatgtgcgacatcatacaggtcgttatggtgaagcattggc 13590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 10 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 5073 - 4617
Alignment:
Q  10 attcatattctgcattctcaaactcnnnnnnncatccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttcttatggat 109  Q
    |||||||||||| ||||||||||||       ||||||||||||| ||||| | |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5073 attcatattctgaattctcaaactctttttt-catccaatttctctcaattcttatggctatacaatcaccttcctcatcctcttcattttcctatggat 4975  T
Q  110 tcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccatacctt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||    
T  4974 tcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcgccacggttttaccggaaatctctacaaggctcttactgacaagggaatcaaaacctt 4875  T
Q  210 cattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaac 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |    
T  4874 cattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatccctccgcaaggccattgatgaatctaggatttttattcctgtgttttctatcttc 4775  T
Q  310 tatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatc 409  Q
    ||||||| |||    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |    
T  4774 tatgccttttcttcgttttgtttggacgaacttgtccacataattcactgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttcttcggcgtggaac 4675  T
Q  410 ctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcattggccgagcatgaaaa 467  Q
    ||||||| ||||| ||||  | | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4674 ctactaacgtgcgacatctgaaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaa 4617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 42 - 455
Target Start/End: Original strand, 7341 - 7754
Alignment:
Q  42 catccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggc 141  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7341 catctaatttctctcaattctcatggctatgcaatcacctccctcttcctcttcattttcatatgcattcacttaccaagtgttccttagttttaggggc 7440  T
Q  142 actgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatg 241  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7441 actgacactcgccacggttttaccggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatcaaaaccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatg 7540  T
Q  242 aaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaact 341  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7541 aaatcacaccatcactcctcaaggccatcgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactacgccacttcaaaattttgcttggacgaact 7640  T
Q  342 tgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctat 441  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||    
T  7641 tgttcacattattcattgctacaagacagaaggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggatcctactaatgtgcgacatcatacaggtcgttat 7740  T
Q  442 ggtgaagcattggc 455  Q
    ||||||||||||||    
T  7741 ggtgaagcattggc 7754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 3)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 9 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 3825 - 3367
Alignment:
Q  9 cattcatattctgcattctcaaactcnnnnnnncatccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttcttatgga 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||       ||||| ||||||| ||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3825 cattcatattctgcattctcaaactctttttt-catcctatttctctcaattgtcatggctatacaatcaccttcctcatcctcttcattttcctatgga 3727  T
Q  109 ttcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccatacct 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3726 ttcacttaccaagtgttccttagttttaggggcactgacactcggcacggttttaccggaaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacct 3627  T
Q  209 tcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaa 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3626 tcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccattgatgaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaa 3527  T
Q  309 -ctatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtgga 407  Q
     ||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  3526 cctatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggtcgcctcgttctgcctgttttatttggtgtgga 3427  T
Q  408 tcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcattggccgagcatgaaaa 467  Q
     ||||||| |||||| |||| || | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3426 acctactattgtgcgacatcgtaaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaa 3367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 4 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 14762 - 14302
Alignment:
Q  4 ttactcattcatattctgcattctcaaactcnnnnnnncatccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttctt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||       ||||| ||||||| ||||| |||||||||| || || |||||||||||| |||||||||| |    
T  14762 ttactcattcatattctgcattctcaaactcttttt--catcctatttctctcaattctcatggctatacaatcaccttcctcatccacttcattttcct 14665  T
Q  104 atggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatcca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14664 atggattcacttaccaagtgttcatcagttttaggggcactgacactcggcacggttttaccggaaatctctacaaggctcttactgacaagggaatcca 14565  T
Q  204 taccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttct 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14564 taccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccattgatgaatctaggatttttattcctgtgttttct 14465  T
Q  304 atcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtg 403  Q
    ||||||||||||| |||    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  14464 atcaactatgcct-ttcttcgttttgtttggacgaacttgtccacataattcactgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttcttcggcg 14366  T
Q  404 tggatcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcattggccgagcatgaaaa 467  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| | | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14365 tggaacctactaacgtgcgacatcagaaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaa 14302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 6 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 8207 - 8061
Alignment:
Q  6 actcattcatattctgcattctcaaactcnnnnnnncatccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttcttat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||       ||||| ||||||| ||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||  ||    
T  8207 actcattcatattctgcattctcaaactctttttt-catcctatttctctcaattctcatggctatacaatcaccttcctcatcctcttcattctcccat 8109  T
Q  106 ggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcgg 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8108 ggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcgg 8061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1254 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold1254
Description:

Target: scaffold1254; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 42 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 288 - 1
Alignment:
Q  42 catccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggc 141  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  288 catctaatttctctcaattctcatggctatgcaatcacctccctcttcctcttcattttcatatgcattcacttaccaagtgttccttagttttaggggc 189  T
Q  142 actgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatg 241  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  188 actgacactcgccacggttttaccggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatcaaaaccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatg 89  T
Q  242 aaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttg 329  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  88 aaatcacaccatcactcctcaaggccatcgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactacgccacttcaaaattttg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 8)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 12 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 18699787 - 18699386
Alignment:
Q  12 tcatattctgcattctcaaactcnnnnnnncatccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttcttatggattc 111  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||| | |||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  18699787 tcatattctgcattctcaaactctttttt-catctagtttctctcaattctcatggctatgcaatcaccttcctcatcctcttcattttcctatcgattc 18699689  T
Q  112 acttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttca 211  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  18699688 acttaccaagtgttcctcagcttcaggggcactgacactcgtgacggttttactggccatctctacaaagctcttactgacaagggaatccacaccttca 18699589  T
Q  212 ttgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaacta 311  Q
    ||||||||  ||| || ||||| || |||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  18699588 ttgatgaccgtgacctgcaaagtggggatgaaatcaaaccatcactcgacaatgccattgaagagtctaggatcttcattcctgtgttttctatcaacta 18699489  T
Q  312 tgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcct 411  Q
    |||||||||   |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||| || ||||||    
T  18699488 tgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgttcacatcattcactgctacaagacaaaaggtcgtctcgttttgcctgttttctatggcgtagatcct 18699389  T
Q  412 act 414  Q
    |||    
T  18699388 act 18699386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 12 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 18731891 - 18731492
Alignment:
Q  12 tcatattctgcattctcaaactcnnnnnnncatccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttcttatggattc 111  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||| |||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  18731891 tcatattctgcattctcaaactctttttt-catccagtttctctcgattttcatggctatgcaatcaccttcctcatcctcttcattttcctatcgattc 18731793  T
Q  112 acttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttca 211  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  |||||||||| ||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  18731792 acttaccaagtgttcctcagcttcaggggcagtgacactcgtgacggttttactggccatctctacagagctcttactgacaagggaatccacaccttca 18731693  T
Q  212 ttgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaacta 311  Q
    ||||||||  ||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  18731692 ttgatgaccgtgacctgcaaagaggggatgaaatcaaaccatcactcgacaatgccattgaagagtctaggatcttcattcctgtgttttctatcaacta 18731593  T
Q  312 tgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcct 411  Q
    |||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  18731592 tgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcatgcactgctacaagacaaagggtcgtcttgttttgcctgttttctatggcgtggatcct 18731493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 18655864 - 18655463
Alignment:
Q  12 tcatattctgcattctcaaactcnnnnnnncatccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttcttatggattc 111  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||| |||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  18655864 tcatattctgcattctcaaactctttttt-catccagtttctctcaattttcatggctaggcaatcaccttcctcatcctcttcattttcctatcgattc 18655766  T
Q  112 acttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttca 211  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  |||||||||| ||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  18655765 acttaccaagtgttcctcagcttcaggggcagtgacactcgtaacggttttactgggcatctctacaaagctcttactgacaagggaatccacaccttca 18655666  T
Q  212 ttgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaacta 311  Q
    ||||||||  ||| || ||||| || |||||||||| ||||||||||  ||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  18655665 ttgatgaccgtgagctgcaaagtggggatgaaatcaaaccatcactcgacaatgccattcaagagtctaggatctttattcctgtgttttctatcaacta 18655566  T
Q  312 tgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcct 411  Q
    |||||||||   |||||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||| |||||||||    
T  18655565 tgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccgcatcattcactgctacaagacaaagggtcgtctcgtttttcctgttttctatggcgtggatcct 18655466  T
Q  412 act 414  Q
    |||    
T  18655465 act 18655463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 18679954 - 18679553
Alignment:
Q  12 tcatattctgcattctcaaactcnnnnnnncatccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttcttatggattc 111  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||| |||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  18679954 tcatattctgcattctcaaactctttttt-catccagtttctctctattttcatggctatgcaatcaccttcctcattctcttcattttcctatcgattc 18679856  T
Q  112 acttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttca 211  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  |||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  18679855 acttaccaagtgttcctcagcttcaggggcagtgacactcgtaacggttttactggtcatctctacaaggctcttactgacaaaggaatccacaccttca 18679756  T
Q  212 ttgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaacta 311  Q
    ||||||||  ||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  18679755 ttgatgaccgtgacctgcaaagaggggatgaaatcaaaccatcactcgacaatgccattgaagagtctaggatcttcattcctgtgttttctatcaacta 18679656  T
Q  312 tgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcct 411  Q
    |||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||| ||  |||||||||    
T  18679655 tgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggtcgtcttgttttgcctgttttctatgtcgtggatcct 18679556  T
Q  412 act 414  Q
    |||    
T  18679555 act 18679553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 56 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 18724429 - 18724073
Alignment:
Q  56 caattttcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggta 155  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  |    
T  18724429 caattctcatggctatgcaatcaccttcctcatcctcttcattttcctatcgattcacttaccaagtgttcctcagcttcaggggcagtgacactcgtaa 18724330  T
Q  156 cggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatca 255  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| || |||||||| |||||||||| |||||||    
T  18724329 cggttttactggtcatctctacaaggctcttactgacaagggaatccacaccttcattgatgaccgtgacctgcaaagaggggatgaaatcaaaccatca 18724230  T
Q  256 ctcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattc 355  Q
    |||  ||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||| |||||||||| ||||| || |    
T  18724229 ctcgacaatgccattgaagagtctaggatcttcattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttgaacgaacttgtccacatcatgc 18724130  T
Q  356 attgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatccta 412  Q
    | ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  18724129 actgctacaagacaaagggtcgtcttgttttgcctgttttctatggcgtggatccta 18724073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 468
Target Start/End: Original strand, 18073549 - 18074004
Alignment:
Q  7 ctcattcatattctgcattctcaaactcnnnnnnncatccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttcttatg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||       ||||  ||||||| ||||| ||||||| ||||| |  |||| ||  |||||||||||||| ||||    
T  18073549 ctcattcatattctgcattctcaaactcttct---catcttatttctctcaattctcatggccatgcaattacctttctattcctcttcattttcctatg 18073645  T
Q  107 gattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccatac 206  Q
     ||||| |||| | |||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  18073646 cattcagttacgatgtgttcctcatttgtaagggcaccgacactcggtacggtttcaccggcaatctcttgaaggctcttattgacaagggaattcgtac 18073745  T
Q  207 cttcattgatgacaatga------tcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttt 300  Q
    ||||  ||||||| ||||      |||||||||| ||||  || ||||||||    |||| |      |||||||||| || ||||| |||||  | |||    
T  18073746 cttccatgatgacgatgacagtgatcttcaaagaagagacaaagtcacaccaa---tcatta------ttgaagaatccaggattttgattcccatattt 18073836  T
Q  301 tctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttg 400  Q
    |||  ||||||||| |||||   || ||| ||||||  |||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  18073837 tctgccaactatgcatcttcttcatcttgtttggacacacttgtccacatcattcactgctacaaaaccaagggttgcctcgttttgcctgttttctttg 18073936  T
Q  401 gtgtggatcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcattggccgagcatgaaaat 468  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  18073937 gtgtggaacctactgatgtgcgacatcatacaggtaggtatggtaaagcattggctgagcatgaaaat 18074004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17989440 - 17989226
Alignment:
Q  7 ctcattcatattctgcattctcaaactcnnnnnnncatccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttcttatg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||       ||||  ||||||| ||||| ||||||| ||||| |  |||| ||  |||||||||||||| ||||    
T  17989440 ctcattcatattctgcattctcaaactcttct---catcttatttctctcaattctcatggccatgcaattacctttctattcctcttcattttcctatg 17989344  T
Q  107 gattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccatac 206  Q
     ||||| |||| | |||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  17989343 cattcagttacgatgtgttcctcatttgtaagggcaccgacactcggtacggtttcaccggcaatctcttgaaggctcttattgacaagggaattcgtac 17989244  T
Q  207 cttcattgatgacaatga 224  Q
    ||||  ||||||| ||||    
T  17989243 cttccatgatgacgatga 17989226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 130 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 5091237 - 5090902
Alignment:
Q  130 agttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttc 229  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||  | |||||   || ||||||||| || ||||||||||||||||  || ||||    
T  5091237 agttttagaggcaccgacactcgttacggttttactggaaatctctatgaagctctacgtgtcaagggaattcacaccttcattgatgacagagagcttc 5091138  T
Q  230 aaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttg 329  Q
    |  |||||||  |||| ||||| |||||  ||||||||||| |||||||||  ||| | |||   || || |||| | ||||||| |||||    |||||    
T  5091137 agcgaggagaccaaataacaccgtcacttctcaaggccattcaagaatctaagattgtcattatcgttttctctaaccactatgcttcttcttcgttttg 5091038  T
Q  330 cttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcctactaatgtgcgccatcat 429  Q
     || || |||||||| || |||||||| ||||  |||  ||| ||| |||| || |||||| |||||| ||||||||| ||| || |||||||  ||||     
T  5091037 tttagatgaacttgtccatattattcactgctccaaggaaaatggttgcctggttttgcctattttctatggtgtggaaccttctcatgtgcgatatcag 5090938  T
Q  430 acatgtagctatggtgaagcattggccgagcatgaa 465  Q
    ||  | || |||||||||||| | || |||||||||    
T  5090937 actggaagttatggtgaagcacttgctgagcatgaa 5090902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 183; Significance: 9e-99; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 42 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 28164720 - 28164331
Alignment:
Q  42 catccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggc 141  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||| |  || | |||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28164720 catccaatttctgtcaattctcatggctatacgatcgcattcctcttcctcttcaatttcctatggattcacataccaagtgttcctcagttttaggggc 28164621  T
Q  142 actgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatg 241  Q
    | |||||||||  ||||||| || ||| ||||||| ||||| |||   ||||||||||| || || |||||||||||   ||||||| | |||||||| |    
T  28164620 agtgacactcgtgacggtttcactggccatctctataaggcccttgacgacaagggaattcacacattcattgatgattgtgatcttgagagaggagaag 28164521  T
Q  242 aaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaact 341  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||    
T  28164520 aaatcacaccgtcattcatcaaggccattgaaaaatcttgaatttttattcctgtgttatctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggacgaact 28164421  T
Q  342 tgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcctactaatgtgcgccatcataca 432  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  28164420 tgtccacatcattcactgctacaagacaaagggtcgcctagttttgcctgttttc-ttggcgtggatcctactgatgtgcgacatcataca 28164331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 88 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 28127992 - 28127631
Alignment:
Q  88 tcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctctta 187  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  ||||||| || ||| ||||||||||||| |||     
T  28127992 tcctcttcaatttcctatggattcacataccaagtgttcctcagcttcaggggcagtgacactcgtgacggtttcactggccatctctacaaggcccttt 28127893  T
Q  188 ttgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggag-atgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaattt 286  Q
     ||||||||||||||| || |||||||||||   | ||||| | ||||||| |  |||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  28127892 atgacaagggaatccacacattcattgatgattgtaatcttgagagaggagaaaaaaatcacaccgtcacttttaaaggccattgaagaatctagaattt 28127793  T
Q  287 ttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtctt 386  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  28127792 ttattcctgtattttctaccaactatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtgcacatcattcactgctacaagacaaagggtcgcctagtttt 28127693  T
Q  387 gcctgttttctttggtgtggatcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaag 448  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||| | || ||||||||||    
T  28127692 gcctgttttctttggcgtggatcctactgatgtgcgatatcatacagggagttatggtgaag 28127631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 62 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 268695 - 268343
Alignment:
Q  62 tcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttt 161  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||||| | || ||||||||  | ||||| || |||||||  || || |||  |||||||||  | |||||    
T  268695 tcatggctatgcaatcaccttcctcttcctcttcaatctcatatggatttgcctaccaggtcttcctcaacttcagaggcggtgacactcgtgagggttt 268596  T
Q  162 tacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatc 261  Q
    ||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |    
T  268595 tattggccatctctacaaggctcttactgacaagggaatccacaccttcattgatgatcgtgaacttcaaagaggggatgaaatcaaaccatcactcgac 268496  T
Q  262 aaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgct 361  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  268495 aatgccattgaagagtctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgct 268396  T
Q  362 ataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcctact 414  Q
    | |||| ||||||||| ||| | ||||| || |||| ||| ||||||||||||    
T  268395 acaagaaaaagggtcgtctcattttgcccgtcttctatggcgtggatcctact 268343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 165; Significance: 5e-88; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 62 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 29274121 - 29273769
Alignment:
Q  62 tcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttt 161  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||| || |||||||  ||||| |||  |||||||||  |||||||    
T  29274121 tcatggctatgcaatcaccttcctcttcctcttcaatctcatatggattcacttaccaggtcttcctcaactttagaggcggtgacactcgtgacggttt 29274022  T
Q  162 tacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatc 261  Q
    ||  ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||  |    
T  29274021 tattggccatctctacaagactcttactgacaagggaatccacaccttcattgatgatcgtgaacttcaaagaggggatgaaatcaaatcatcactcgac 29273922  T
Q  262 aaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgct 361  Q
    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  29273921 aatgtcattgaagagtctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgct 29273822  T
Q  362 ataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcctact 414  Q
    | |||||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  29273821 acaagacaaagggtcgtctcattttgcctgtcttctatggcgtggatcctact 29273769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 257
Target Start/End: Original strand, 31903727 - 31903882
Alignment:
Q  102 ttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatc 201  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| |||   |||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||  ||| |||||||||    
T  31903727 ttatggattcacctacgatgtgttcctcagctttagaggcttagacactcgctatggttttactggaaatctctacaaagctctttatgataagggaatc 31903826  T
Q  202 cataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcact 257  Q
    || ||||| ||||| ||  | || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31903827 cacacctttattgacgatgaagaacttcaaagaggacatgaaatcacaccatcact 31903882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 468
Target Start/End: Original strand, 59357 - 59812
Alignment:
Q  7 ctcattcatattctgcattctcaaactcnnnnnnncatccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttcttatg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||       ||||  ||||||| ||||| ||||||| ||||| |  |||| ||  |||||||||||||| ||||    
T  59357 ctcattcatattctgcattctcaaactcttct---catcttatttctctcaattctcatggccatgcaattacctttctattcctcttcattttcctatg 59453  T
Q  107 gattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccatac 206  Q
     ||||| |||| | |||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  59454 cattcagttacgatgtgttcctcatttgtaagggcaccgacactcggtacggtttcaccggcaatctcttgaaggctcttattgacaagggaattcgtac 59553  T
Q  207 cttcattgatgacaatga------tcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttt 300  Q
    ||||  ||||||| ||||      |||||||||| ||||  || ||||||||    |||| |      |||||||||| || ||||| |||||  | |||    
T  59554 cttccatgatgacgatgacagtgatcttcaaagaagagacaaagtcacaccaa---tcatta------ttgaagaatccaggattttgattcccatattt 59644  T
Q  301 tctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttg 400  Q
    |||  ||||||||| |||||   || ||| ||||||  |||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  59645 tctgccaactatgcatcttcttcatcttgtttggacacacttgtccacatcattcactgctacaaaaccaagggttgcctcgttttgcctgttttctttg 59744  T
Q  401 gtgtggatcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcattggccgagcatgaaaat 468  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  59745 gtgtggaacctactgatgtgcgacatcatacaggtaggtatggtaaagcattggctgagcatgaaaat 59812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 4)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 103 - 361
Target Start/End: Original strand, 34602 - 34860
Alignment:
Q  103 tatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatcc 202  Q
    ||||||||||| ||  | |||||||| |||||||| || | ||||||||| || |||||||| |  |||||||| |  ||||||  | ||||||||||||    
T  34602 tatggattcacctatgacgtgttccttagttttagaggtagtgacactcgctatggttttaccgaaaatctctatagagctctttgtcacaagggaatcc 34701  T
Q  203 ataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttc 302  Q
    | ||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||    
T  34702 acaccttcattgatgacagggagcttcaaggaggagatgaaataacaccatcacttttcaaggccattgaagagtctaggattttcattcctgtcttgtc 34801  T
Q  303 tatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgct 361  Q
    |||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  34802 tatcaattatgcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcactgct 34860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 91 - 361
Target Start/End: Original strand, 27313 - 27583
Alignment:
Q  91 tcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattg 190  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||  | |||||||| |||||||| || | ||||||||| || |||||||| || ||||||||||  | ||||  |     
T  27313 tcttccttctcttatggattcacctatgacgtgttccttagttttagaggtattgacactcgttatggttttactggaaatctctacagtgatctttgta 27412  T
Q  191 acaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttat 290  Q
    | |||||||| || || ||| ||||||| |  || |||||| |||| |||||||| ||| |||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  27413 agaagggaattcacacattctttgatgatagagagcttcaaggaggtgatgaaataacatcatcacttttcaaggtcattgaagaatctaggattttcat 27512  T
Q  291 tcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgct 361  Q
    |||||| || |||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27513 tcctgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcattgct 27583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 88 - 361
Target Start/End: Original strand, 116658 - 116931
Alignment:
Q  88 tcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctctta 187  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||  | |||||||| |||||||| || | ||||||||| || |||||||| || ||||||||||| | ||||     
T  116658 tcctcttccttttcctatggattcacctatgacgtgttccttagttttagaggtagtgacactcgttatggttttactggaaatctctacaaagatcttt 116757  T
Q  188 ttgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttt 287  Q
     |   ||| |||| | |||||||||||||||||| || |||||| |||| || ||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  116758 gtaggaagagaattcgtaccttcattgatgacaaagaccttcaacgaggtgacgaaataacaccgtcacttttcaaggccattgaagagtctaggatttt 116857  T
Q  288 tattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgct 361  Q
     |||||| | || |||||||| ||||| |||||    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  116858 cattcctattttgtctatcaattatgcttcttcttccttttgcttggatgaacttgtccacattattcactgct 116931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 124 - 416
Target Start/End: Original strand, 42864 - 43156
Alignment:
Q  124 ttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatg 223  Q
    ||||| |||||||| || | ||||||||| || |||||||| || ||||||||||| | ||||  | | |||||||| |  ||||||||||||||||  |    
T  42864 ttccttagttttagaggtagtgacactcgttatggttttactggaaatctctacaaagatctttgtaagaagggaattcgcaccttcattgatgacagag 42963  T
Q  224 atcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaa 323  Q
    | |||| | |||| ||  |||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||       
T  42964 aacttccaggaggtgacaaaataacaccatcacttttcaaggccattgaagagtctaggattttcattcctgtcttgtctatcaattatgcttcttcttc 43063  T
Q  324 attttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcctactaa 416  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||| ||| || ||||| || |||||  |||||| || |||||| ||| ||||    
T  43064 attttgcttggacgaacttgtccacatcattcactgctgcaagaaaaatggacgcctagttttgccaattttctatgatgtggaaccttctaa 43156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 86; Significance: 7e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 88 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 58607 - 58334
Alignment:
Q  88 tcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctctta 187  Q
    |||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||   ||||||||| || |||||||| || ||||||||||  ||||||     
T  58607 tcctcttccttctcctatggattcacctatcacgtgttccttagctttagaggttgtgacactcgctatggttttactggaaatctctacagagctcttt 58508  T
Q  188 ttgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttt 287  Q
     ||||||||||||||  |||||||| |||||||  || |||||| |||| || ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  58507 gtgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgacgaaataacaccatcacttttcaaggccattaaagagtctaggatttt 58408  T
Q  288 tattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgct 361  Q
     ||||| || || |||||||||||||| |||||   |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  58407 cattcccgtcttgtctatcaactatgcttcttcttcattttgcttgaacgaacttgtccacatcattcactgct 58334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 100 - 361
Target Start/End: Original strand, 3279562 - 3279823
Alignment:
Q  100 tcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaa 199  Q
    |||||||||||||| ||  | || ||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||| |  ||| | | ||||   |||     
T  3279562 tcttatggattcacctatgacgtattcttgagttttaggggcactgacactcgctatggttttactggaaatctctatagagctttaagtgacggtggat 3279661  T
Q  200 tccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgtt 299  Q
    ||   |||||||||||||| |  || |||||  |||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||| || |  ||||||||||| || ||    
T  3279662 tctgcaccttcattgatgatagggagcttcatggaggtgatgaaatcacacaatcacttgtcaaggccatcgaagagtccatgatttttattccggtctt 3279761  T
Q  300 ttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgct 361  Q
     |||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  3279762 ctctatcaactatgcttcttctatattttgtttggacgaacttgtccacatcattcattgct 3279823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 17994033 - 17993812
Alignment:
Q  64 atggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggtttta 163  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || || || |||||||| ||||  | | | |||||| | ||||| ||||| || || ||||| || ||||| |    
T  17994033 atggctatgcaatcaccttcctcctcttcctccttatcttatggtttcagcttcgatgtgttcattagtttcaggggtaccgatactcgatatggtttca 17993934  T
Q  164 cgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaa 263  Q
    | || |||||||| || ||||||  |||||||||||| |  |||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||| ||||    
T  17993933 ccggtaatctctataaagctctttctgacaagggaattcgaaccttcatcgatgacaaagagcttcagagaggtgatgaaatcacaccgtcgctcctcaa 17993834  T
Q  264 ggccattgaagaatctagaatt 285  Q
    |  ||||||||| || ||||||    
T  17993833 gagcattgaagactcaagaatt 17993812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 159 - 275
Target Start/End: Original strand, 16688944 - 16689060
Alignment:
Q  159 ttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactc 258  Q
    |||||| || ||||| ||||| |||||   |||||||||||||| |  ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||  ||||||||||||||||     
T  16688944 ttttactggtaatctgtacaaagctctatgtgacaagggaatccgtgtcttcattgatgacaaggaacttcagagaggtgacaaaatcacaccatcactt 16689043  T
Q  259 atcaaggccattgaaga 275  Q
    |||||||| ||||||||    
T  16689044 atcaaggcaattgaaga 16689060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University