View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6360_low_3 (Length: 783)

Name: NF6360_low_3
Description: NF6360
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6360_low_3
NF6360_low_3
[»] chr7 (34 HSPs)
chr7 (11-765)||(35084295-35085049)
chr7 (11-765)||(35099596-35100350)
chr7 (11-704)||(35073259-35073925)
chr7 (11-693)||(35083335-35084002)
chr7 (15-667)||(42796243-42796883)
chr7 (16-600)||(36744824-36745399)
chr7 (311-627)||(34145862-34146178)
chr7 (311-627)||(34181257-34181573)
chr7 (311-627)||(33859932-33860248)
chr7 (310-599)||(45585166-45585439)
chr7 (310-604)||(38166833-38167127)
chr7 (452-596)||(38286589-38286733)
chr7 (431-598)||(38173520-38173687)
chr7 (207-480)||(43027144-43027388)
chr7 (589-706)||(42796165-42796282)
chr7 (310-488)||(38150196-38150368)
chr7 (11-181)||(43027600-43027760)
chr7 (310-595)||(38157935-38158214)
chr7 (310-401)||(37883330-37883421)
chr7 (310-604)||(38188068-38188362)
chr7 (551-610)||(33862238-33862297)
chr7 (551-610)||(34179082-34179141)
chr7 (456-595)||(37883118-37883257)
chr7 (41-142)||(38157669-38157770)
chr7 (207-270)||(33860274-33860337)
chr7 (216-270)||(34146204-34146258)
chr7 (216-270)||(34181177-34181231)
chr7 (534-604)||(38150750-38150820)
chr7 (491-626)||(36469345-36469477)
chr7 (207-258)||(38157847-38157898)
chr7 (118-164)||(38150005-38150051)
chr7 (326-396)||(38286478-38286548)
chr7 (207-264)||(38150109-38150166)
chr7 (51-88)||(38173155-38173192)
[»] chr5 (3 HSPs)
chr5 (262-627)||(9663314-9663676)
chr5 (11-180)||(9663706-9663878)
chr5 (629-693)||(9663287-9663351)
[»] chr6 (16 HSPs)
chr6 (311-597)||(26002406-26002692)
chr6 (311-627)||(25568508-25568824)
chr6 (311-627)||(25562891-25563209)
chr6 (311-627)||(26102403-26102721)
chr6 (429-627)||(4164532-4164730)
chr6 (429-627)||(4226153-4226351)
chr6 (207-270)||(25563235-25563298)
chr6 (207-270)||(25568850-25568913)
chr6 (207-270)||(26102747-26102810)
chr6 (207-270)||(26002718-26002781)
chr6 (40-96)||(4164161-4164217)
chr6 (40-96)||(4225782-4225838)
chr6 (310-397)||(4164428-4164515)
chr6 (310-397)||(4226049-4226136)
chr6 (222-266)||(4164355-4164399)
chr6 (222-266)||(4225976-4226020)
[»] scaffold0176 (2 HSPs)
scaffold0176 (310-608)||(23801-24099)
scaffold0176 (216-270)||(23722-23776)
[»] chr3 (2 HSPs)
chr3 (452-596)||(2223989-2224133)
chr3 (231-264)||(2223798-2223831)
[»] chr2 (7 HSPs)
chr2 (471-603)||(12410912-12411045)
chr2 (471-603)||(12422972-12423105)
chr2 (318-399)||(12409942-12410023)
chr2 (318-399)||(12422002-12422083)
chr2 (211-264)||(12409850-12409903)
chr2 (211-264)||(12421910-12421963)
chr2 (457-598)||(29196560-29196701)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 747; Significance: 0; HSPs: 34)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 747; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 765
Target Start/End: Original strand, 35084295 - 35085049
Alignment:
Q  11 ggagcacagactctgaagcagtttcggcgtcacattaattagatgcaacacaggagttctcaaattattgaatccagagtagtccagatgttctgcactg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35084295 ggagcacagactctgaagcagtttcggcgtcacattaattagatgcaacacaggagttctcaaattattgaatccagagtagtccagatgttctgcactg 35084394  T
Q  111 aggcagttttgtaggtgcagataagtgagagaatcattgccagataagagagtaggggggaatatgtatgggggaaatatgtatggcaaaacaaaatcag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35084395 aggcagttttgtaggtgcagataagtgagagaatcattgccagataagagagtaggggggaatatgtatgggggaaatatgtatggcaaaacaaaatcag 35084494  T
Q  211 atgacaagagaagttcaattcgtttgacacccttagcaattcctttggagatcaatctattaatggcaacattaatggcatccccgtgtgcagaatttac 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35084495 atgacaagagaagttcaattcgtttgacacccttagcaattcctttggagatcaatctattaatggcaacattaatggcatccccgtgttcagaatttac 35084594  T
Q  311 taatggaaaattgactcggattgaactgatgatgggacctttataatggagcataaattgatccaatcttgtggtaaattcagattgaaagtgaaatatt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35084595 taatggaaaattgactcggattgaactgatgatgggacctttataatggagcataaattgatccaatcttgtggtaaattcagattgaaagtgaaatatt 35084694  T
Q  411 tgaaagagtggaaggatgtttggtaagtcttgaattgtgttatagtcaaacatggtatgaagatcaaagttgaggtccgcccttaatccccattcgtgaa 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35084695 tgaaagagtggaaggatgtttggtaagtcttgaattgtgttatagtcaaacatggtatgaagatcaaagttgaggtccgcccttaatccccattcgtgaa 35084794  T
Q  511 cccatcgtttagacaatgcactagttttcaccaaatccttcaaagctaacttggaaaagatataagatataatagaatcaggcaactcactcttaagctt 610  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35084795 cccatcgtttagacaatgcactagttttcaccaaatccttcaaagctaacttggaaaagatataagatataatagaatcaggcaactcactcttaagctt 35084894  T
Q  611 cgtacacctcttcattgaaggcagctcactcttaagctttttacacctcttcattgccgctgcaagcaataatgaacacagttagtataatatatagtaa 710  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35084895 cgtacacctcttcattgaaggcaactcactcttaagctttttacacctcttcattgccgctgcaagcaataatgaacacagttagtataatatatagtaa 35084994  T
Q  711 atactccatccggttcttattataaaatggactagatacatcacttacacacaat 765  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35084995 atactccatccggttcttattataaaatggactagatacatcacttacacacaat 35085049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 691; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 765
Target Start/End: Original strand, 35099596 - 35100350
Alignment:
Q  11 ggagcacagactctgaagcagtttcggcgtcacattaattagatgcaacacaggagttctcaaattattgaatccagagtagtccagatgttctgcactg 110  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35099596 ggagcagagactctgaagcagtttcggcgtcacattaattagatgcaacacaagagttctcaaattattgaatccagagtggtccagatgttctgcactg 35099695  T
Q  111 aggcagttttgtaggtgcagataagtgagagaatcattgccagataagagagtaggggggaatatgtatgggggaaatatgtatggcaaaacaaaatcag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35099696 aggcagttttgtaggtgcagataagtgagagaatcattgccagataagagagtagggggaaatatgtatgggggaaatatgtatggcaaaacaaaatcag 35099795  T
Q  211 atgacaagagaagttcaattcgtttgacacccttagcaattcctttggagatcaatctattaatggcaacattaatggcatccccgtgtgcagaatttac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35099796 atgacaagagaagttcaattcgtttgacacccttagcaattcctttggagatcaatctattaatggcaccattaatggcatccccgtgttcagaatttac 35099895  T
Q  311 taatggaaaattgactcggattgaactgatgatgggacctttataatggagcataaattgatccaatcttgtggtaaattcagattgaaagtgaaatatt 410  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35099896 taatggaaatttgactcggattgaactgatgatgggacctttataatggagcataaattgatccaatcttgtggtaaattcagattgaaagtgaaatatt 35099995  T
Q  411 tgaaagagtggaaggatgtttggtaagtcttgaattgtgttatagtcaaacatggtatgaagatcaaagttgaggtccgcccttaatccccattcgtgaa 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35099996 tgaaagagtggaaggatgtttggtaagtcttgaagtgtgttatagtcaaacatggtatgaagatcaaagttgaggtccgtccttaatccccattcgtgaa 35100095  T
Q  511 cccatcgtttagacaatgcactagttttcaccaaatccttcaaagctaacttggaaaagatataagatataatagaatcaggcaactcactcttaagctt 610  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35100096 cccatcgttcagacaatgcactagttttcaccaaatccttcaaagctaacttggaaaagatataagatataatagaatcaggcaactcactcttgagctt 35100195  T
Q  611 cgtacacctcttcattgaaggcagctcactcttaagctttttacacctcttcattgccgctgcaagcaataatgaacacagttagtataatatatagtaa 710  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35100196 cgtacacctcttcattggaggcaactcactctcaagctttttacacctcttcattgccgctgcaagcaataatgaacacagttagtataatatatagtaa 35100295  T
Q  711 atactccatccggttcttattataaaatggactagatacatcacttacacacaat 765  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35100296 atactccatccggtccttattataaaatggactagatccatcacttacacacaat 35100350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 523; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 704
Target Start/End: Original strand, 35073259 - 35073925
Alignment:
Q  11 ggagcacagactctgaagcagtttcggcgtcacattaattagatgcaacacaggagttctcaaattattgaatccagagtagtccagatgttctgcactg 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35073259 ggagcacagactctgaaccagtttcggcgtcacattaattagatgcaacacaagagttctcaaattattgaatccagagtagtccagatgttctgcactg 35073358  T
Q  111 aggcagttttgtaggtgcagataagtgagagaatcattgccagataagagagtaggggggaatatgtatgggggaaatatgtatggcaaaacaaaatcag 210  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               |||||||||||||||||||||||||||    
T  35073359 aggtagttttgtaggtgcagataagtgagagaatcattgccagataagagagtagggg---------------gaaatatgtatggcaaaacaaaatcag 35073443  T
Q  211 atgacaagagaagttcaattcgtttgacacccttagcaattcctttggagatcaatctattaatggcaacattaatggcatccccgtgtgcagaatttac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35073444 atgacaagagaagttcaattcgtttgacacccttagcaattcgtttggagatcaatctattaatggcaacattaatggcatccccgtgttcagaatttac 35073543  T
Q  311 taatggaaaattgactcggattgaactgatgatgggacctttataatggagcataaattgatccaatcttgtggtaaattcagattgaaagtgaaatatt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35073544 taatggaaaattgactcggattgaactgatgatgggacctttataatggagcataaattgatccaatcttgtggtaaattcagattgaaagtgaaatatt 35073643  T
Q  411 tgaaagagtggaaggatgtttggtaagtcttgaattgtgttatagtcaaacatggtatgaagatcaaagttgaggtccgcccttaatccccattcgtgaa 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35073644 tgaaagagtggaaggatgtttggtaagtcttgagttgtgttatagtcaaacatggtatgaagatcaaagttgaggtccgtccttaatccccattcgtgaa 35073743  T
Q  511 cccatcgtttagacaatgcactagttttcaccaaatccttcaaagctaacttggaaaagatataagatataatagaatcaggcaactcactcttaagctt 610  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  35073744 cccatcgtttagacaatgcactagttttcaccaaatccttcaaagctaacttggaaaatatataagatataatagaatcaggcaactcactctcgagctt 35073843  T
Q  611 cgtacacctcttcattgaaggcagctcactcttaagctttttacacctcttcattgccgctgcaagcaataatgaacacagttagtataatata 704  Q
    ||            ||| |||||  |||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  35073844 cg------------ttgcaggcaattcactcttaaactttttacaccttttcattcccactgcaagcaataacgaacacagttattaaaatata 35073925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 693
Target Start/End: Original strand, 35083335 - 35084002
Alignment:
Q  11 ggagcacagactctgaagcagtttcggcgtcacattaattagatgcaacacaggagttctcaaattattgaatccag---agtagtccagatgttctgca 107  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||| ||||||||    
T  35083335 ggagcacatactctgaaccagtttcggcgtcacagaaattagatccaacacaagagttgtcaaattattgaatccagtgcagtagtcaagaggttctgca 35083434  T
Q  108 ctgaggcagttttgtaggtgcagataagtgagagaatcattgccagataagagagtaggggggaatatgtatgggggaaatatgtatggcaaaacaaaat 207  Q
      |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||        | |||       ||| |||    
T  35083435 acgaggcagtcttgcaggtgcagatatgtgagagaatgattgccagataagagagtaaggggtaatatgtatg--------acgta-------acagaat 35083519  T
Q  208 cagatgacaagagaagttcaattcgtttgacacccttagcaattcctttggagatcaatctattaatggcaacattaatggcatccccgtgtgcagaatt 307  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||  || |||    
T  35083520 aagatgacaagagaagttcaattcgtttgacacccttagcaattcctttggagatcaatctattaatggcattactaatggcatctccgtgtagaggatt 35083619  T
Q  308 tactaatggaaaattgactcggattgaactgatgatgggacctttataatggagcataaattgatccaatcttgtggtaaattcagattgaaagtgaaat 407  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  35083620 tactaatggaaattttactcggattgaatggatgatggcacctttataatggagcataaattgatccaatcttgtggcaaattcagattgaaagtgtaat 35083719  T
Q  408 atttgaaagagtggaaggatgtttggtaagtcttgaattgtgttatagtcaaacatggtatgaagatcaaagttgaggtccgcccttaatccccattcgt 507  Q
     ||||| | |||||||   |||||||||   |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35083720 ctttgatatagtggaaatgtgtttggta---cttggattgtgttagagtcaaacatggtatgaagatcaaagttgaggtccgtccttaatccccattcgt 35083816  T
Q  508 gaacccatcgtttagacaatgcactagttttcaccaaatccttcaaagctaacttggaaaagatataagatataatagaatcaggcaactcactcttaag 607  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||  ||    
T  35083817 gaacccatcgtttggacaatgcactagttttcaccaaatccttcaaagctaacttggaaaagatataagatataacactatcaggcaactcactctcgag 35083916  T
Q  608 cttcgtacacctcttcattgaaggcagctcactcttaagctttttacacctcttcattgccgctgcaagcaataatgaacacagtt 693  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  35083917 cttcgtacacctcttcattgcaggcaactcactcttaagctttttacgcctcttcattgccactgcaagcaataacgaacacagtt 35084002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 15 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 42796883 - 42796243
Alignment:
Q  15 cacagactctgaagcagtttcggcgtcacattaattagatgcaacacaggagttctcaaattattgaatccagagtagtccagatgttctgcactgaggc 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||     || ||    
T  42796883 cacagactctgaagcagtttctgattcacatcaactagatgcaacacaagagttctcaaatttttgaatccagagaagtccaaaggttctagtaggaagc 42796784  T
Q  115 agttttgtaggtgcagataagtgagagaatcattgccagataagagagtaggggggaatatgtatgggggaaat--atgtatggcaaaacaaaat-caga 211  Q
    ||||||| ||||||| ||| || |||||||||  | |||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||    ||  || | |  |     | ||||    
T  42796783 agttttgcaggtgcatatacgtcagagaatcaaagtcagataagagagtaaggggaaatttgtatggcggaatagaatcaatagtatcatttgtttcaga 42796684  T
Q  212 tgacaagagaagttcaattcgtttgacacccttagcaattcctttggagatcaatctattaatggcaacattaatggcatccccgtgtgcagaatttact 311  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||            ||||  ||| ||   ||  ||    
T  42796683 tgacaagagaagttcaatatgtttgacacccttagcaattcctttggagatcaatctatcaatggca------------tccctatgttca---ttgcct 42796599  T
Q  312 aatggaaaattgactcggattgaactgatgatgggacctttataatggagcataaattgatccaatcttgtggtaaattcagattgaaagtgaaatattt 411  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||    
T  42796598 aatggaaaatttactcggattgaacggatgatagcacctttataatggagcataaattgatccaatcttgtggcaaattgagattgaaagtgaaatcttt 42796499  T
Q  412 gaaagagtggaaggatgtttggtaagtcttgaattgtgttatagtcaaacatggtatgaagatcaaagttgaggtccgcccttaatccccattcgtgaac 511  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  42796498 gaaagagtggaagtgtgtttggtaagtcttgaattgtgttatagtcaaacatggtatgaagatcaaagttgaggtccgtccttaatccccattcgtgaat 42796399  T
Q  512 ccatcgtttagacaatgcactagttttcaccaaatccttcaaagctaacttggaaaagatataagatataatagaatcaggcaactcactcttaagcttc 611  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||     
T  42796398 ccatcgtttggacaatgcgcttgttttcaccaaatccttcaaaccaaacttggaaaagatataagatataatacaatcaggcaactcactctcgagcttt 42796299  T
Q  612 gtacacctcttcattgaaggcagctcactcttaagctttttacacctcttcattgc 667  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42796298 gtacacctcttcattgcaggcgactcactcttaagctttttacacctcttcattgc 42796243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 600
Target Start/End: Original strand, 36744824 - 36745399
Alignment:
Q  16 acagactctgaagcagtttcggcgtcacattaattagatgcaacacaggagttctcaaattattgaatccagagtagtccagatgttctgcactgaggca 115  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||||| || |||||| |||||| |||||||||| || || ||||||||  ||| || | |||||      || ||    
T  36744824 acagactctgaagaagtttctgcttcacatcaactagatggaacacaagagttctcaagttttttaatccagataagttcataggttctaatacaagaca 36744923  T
Q  116 gttttgtaggtgcagataagtgagagaatcattgccagataagagagtaggggggaatatgtatgggggaaatatgtatggcaa--aacaaaa---tcag 210  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||| |||||| |  ||||| | |||   |  | ||      ||||    
T  36744924 gttttgtaggtgcagatacgtgagagaatcattgtcagataagagagtaagggaaaatttgtatg-gcaaaata-gaatgagtagtatcatttgtttcag 36745021  T
Q  211 atgacaagagaagttcaattcgtttgacacccttagcaattcctttggagatcaatctattaatggcaacattaatggcatccccgtgtgcagaatttac 310  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||            |||| |||| ||   ||  |    
T  36745022 atgagaagagaagttcaatacgtttggcacccttagcaattcctttggagatcaatctatcaatggca------------tccctgtgttca---ttgcc 36745106  T
Q  311 taatggaaaattgactcggattgaactgatgatgggacctttataatggagcataaattgatccaatcttgtggtaaattcagattgaaagtgaaatatt 410  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  36745107 taatggaaattttactcggattgaactgatcatgtcacctttataatggagcacaaattgatccaatctggtggcaaattcagattgaaagtgaaacctt 36745206  T
Q  411 tgaaagagtggaaggatgtttggtaagtcttgaattgtgttatagtcaaacatggtatgaagatcaaagttgaggtccgcccttaatcccc---attcgt 507  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||   ||||||    
T  36745207 tgaaagagtggaaggctttttggtaagtcttgaattgtgttatagtcaaacattgtatggagatcaaagttgagttccgtctttaatccccaatattcgt 36745306  T
Q  508 gaacccatcgtttagacaatgcactagttttcaccaaatccttcaaagctaacttggaaaagatataagatataatagaatcaggcaactcac 600  Q
    ||| ||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  36745307 gaatccatcttttggataatgcacttgttttcaccaaatccttcaaagctaacttggaaaagatataagatataacacaatcaggcaactcac 36745399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 311 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 34146178 - 34145862
Alignment:
Q  311 taatggaaaattgactcggattgaactgatgatgggacctttataatggagcataaattgatccaatcttgtggtaaattcagattgaaagtgaaatatt 410  Q
    ||||||||| || ||||| || |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  34146178 taatggaaattttactcgaatggaacggatcatggcacctttataatggagcataaattgatccaatcttgtggcaaattcagattgaaagtgaaacctt 34146079  T
Q  411 tgaaagagtggaaggatgtttggtaagtcttgaattgtgttatagtcaaacatggtatgaagatcaaagttgaggtccgcccttaatccccattcgtgaa 510  Q
    ||| |||| |||||||| | ||  |||||||||  ||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  34146078 tgacagagaggaaggatttgtgacaagtcttgatctgtgttatagtcagacatggtatagagatcgaagttaaggtccatccttaatccccattcgtgaa 34145979  T
Q  511 cccatcgtttagacaatgcactagttttcaccaaatccttcaaagctaacttggaaaagatataagatataatagaatcaggcaactcactcttaagctt 610  Q
     |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||    
T  34145978 tccattgtttggacaatgcactggttttcaccaaatctttcaaagctaacttggaaaagatataagatataatatgatcaggcaactcattctcaagctt 34145879  T
Q  611 cgtacacctcttcattg 627  Q
       ||| ||||||||||    
T  34145878 tacacagctcttcattg 34145862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 311 - 627
Target Start/End: Original strand, 34181257 - 34181573
Alignment:
Q  311 taatggaaaattgactcggattgaactgatgatgggacctttataatggagcataaattgatccaatcttgtggtaaattcagattgaaagtgaaatatt 410  Q
    ||||||||| || ||||| || |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  34181257 taatggaaattttactcgaatggaacggatcatggcacctttataatggagcataaattgatccaatcttgtggcaaattcagattgaaagtgaaacctt 34181356  T
Q  411 tgaaagagtggaaggatgtttggtaagtcttgaattgtgttatagtcaaacatggtatgaagatcaaagttgaggtccgcccttaatccccattcgtgaa 510  Q
    ||| |||| |||||||| | ||  |||||||||  ||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  34181357 tgacagagaggaaggatttgtgacaagtcttgatctgtgttatagtcagacatggtatagagatcgaagttaaggtccatccttaatccccattcgtgaa 34181456  T
Q  511 cccatcgtttagacaatgcactagttttcaccaaatccttcaaagctaacttggaaaagatataagatataatagaatcaggcaactcactcttaagctt 610  Q
     |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||    
T  34181457 tccattgtttggacaatgcactggttttcaccaaatctttcaaagctaacttggaaaagatataagatataatatgatcaggcaactcattctcaagctt 34181556  T
Q  611 cgtacacctcttcattg 627  Q
       ||| ||||||||||    
T  34181557 tacacagctcttcattg 34181573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 311 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 33860248 - 33859932
Alignment:
Q  311 taatggaaaattgactcggattgaactgatgatgggacctttataatggagcataaattgatccaatcttgtggtaaattcagattgaaagtgaaatatt 410  Q
    ||||||||| || ||||| || |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  33860248 taatggaaattttactcgaatggaacggatcatggcacctttataatggagcataaattgatccaatcttgtggcaaattcagattgaaagtgaaacctt 33860149  T
Q  411 tgaaagagtggaaggatgtttggtaagtcttgaattgtgttatagtcaaacatggtatgaagatcaaagttgaggtccgcccttaatccccattcgtgaa 510  Q
    ||| |||| |||||||| | ||  |||||||||  ||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  33860148 tgacagagaggaaggatttgtgacaagtcttgatctgtgttatagtcagacatggtatagagatcgaagttaaggtccatccttaatccccattcgtgaa 33860049  T
Q  511 cccatcgtttagacaatgcactagttttcaccaaatccttcaaagctaacttggaaaagatataagatataatagaatcaggcaactcactcttaagctt 610  Q
     |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||| ||||||    
T  33860048 tccattgtttggacaatgcactggttttcaccaaatctttcaaagctaaattggaaaagatataagatataatatgattaggcaactcattctcaagctt 33859949  T
Q  611 cgtacacctcttcattg 627  Q
       ||| ||||||||||    
T  33859948 ttcacagctcttcattg 33859932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 310 - 599
Target Start/End: Original strand, 45585166 - 45585439
Alignment:
Q  310 ctaatggaaaattgactcggattgaactgatgatgggacctttataatggagcataaattgatccaatcttgtggtaaattcagattgaaagtgaaatat 409  Q
    |||||||||| || |||||||| |||| ||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||               
T  45585166 ctaatggaaattttactcggatggaac-gatcatggcacctttacagtggagcataaattgatccaatcttgtggcaaattcagattga----------- 45585253  T
Q  410 ttgaaagagtggaaggatgtttggtaagtcttgaattgtgttatagtcaaacatggtatgaagatcaaagttgaggtccgcccttaatccccattcgtga 509  Q
        |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||  |||||||||||| || |||    
T  45585254 ----aagagtggaaggctttttggtaagtcttgaattgtgttatagtcaaacatggtatggtgatcaaagttaaggtccatccttaatccccaatcatga 45585349  T
Q  510 acccatcgtttagacaatgcactagttttcaccaaatccttcaaagctaacttggaaaagatataagatataatagaatcaggcaactca 599  Q
    | |||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  45585350 atccattgtttggataatgcacttgttttcaccaaatccttcaaagctaacttggaaaagatataagatataatatgatcaggcaactca 45585439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 310 - 604
Target Start/End: Original strand, 38166833 - 38167127
Alignment:
Q  310 ctaatggaaaattgactcggattgaactgatgatgggacctttataatggagcataaattgatccaatcttgtggtaaattcagattgaaagtgaaatat 409  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || ||   | ||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||             
T  38166833 ctaatggaaaatttactcggattgaactaatcatatcatcttgataatgcagcatgaattgatccaatcttttggcaaattcagattgaaaccc------ 38166926  T
Q  410 ttgaaagagtggaaggatgtttggtaagtcttgaattgtgttatag------tcaaacatggtatgaagatcaaagttgaggtccgcccttaatccccat 503  Q
    ||||| |||||||||| | || ||||| ||||||| ||| ||||||      ||||||||| | || ||||||||||| ||||||  |||||||| ||||    
T  38166927 ttgaaggagtggaaggcttttcggtaactcttgaactgtattatagcgaagttcaaacatgttttggagatcaaagtttaggtccatccttaatctccat 38167026  T
Q  504 tcgtgaacccatcgtttagacaatgcactagttttcaccaaatccttcaaagctaacttggaaaagatataagatataatagaatcaggcaactcactct 603  Q
    || |||| ||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||   |||| |||| |||||||||||||| |||    
T  38167027 tcctgaagccaccgcttggacaatgcactggttttcaccaaatccttcaaacctaactttgaaaatataatcgataaaatacaatcaggcaactcaatct 38167126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 452 - 596
Target Start/End: Original strand, 38286589 - 38286733
Alignment:
Q  452 atagtcaaacatggtatgaagatcaaagttgaggtccgcccttaatccccattcgtgaacccatcgtttagacaatgcactagttttcaccaaatccttc 551  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  38286589 atagtcacacaaggtatgaatatcaaagttgaggtccatcctgaatccccattcgtgaagccatagtttggacaatacacttgttttcaccaaatccttc 38286688  T
Q  552 aaagctaacttggaaaagatataagatataatagaatcaggcaac 596  Q
    |||  |||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  38286689 aaacataactttgaaaagatatatgatataacacaatcaggcaac 38286733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 431 - 598
Target Start/End: Original strand, 38173520 - 38173687
Alignment:
Q  431 tggtaagtcttgaattgtgttatagtcaaacatggtatgaagatcaaagttgaggtccgcccttaatccccattcgtgaacccatcgtttagacaatgca 530  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||    ||| ||| |||||| |||| ||||||||| |||||| ||    
T  38173520 tggtaattcttgaagtgtattatagtcaaacatgttatggagatcaaaattgaggtcaattcttgatctccattcatgaagccatcgtttggacaataca 38173619  T
Q  531 ctagttttcaccaaatccttcaaagctaacttggaaaagatataagatataatagaatcaggcaactc 598  Q
    || |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  38173620 cttgttttcaccaaatccttcaaacataactttgaaaagatatatgatataacacaatcaggcaactc 38173687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 207 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 43027388 - 43027144
Alignment:
Q  207 tcagatgacaagagaagttcaattcgtttgacacccttagcaa----ttcctttggagatcaatctattaatggcaacattaatggcatccccgtgtgca 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||            ||||  ||| ||    
T  43027388 tcagatgacaagagaagttcaattcgtttgacccccttagcaagcaattcctttggagatcaatctatcaatggca------------tccctatgttca 43027301  T
Q  303 gaatttactaatggaaaattgactcggattgaactgatgatgggacctttataatggagcataaattgatccaatcttgtggtaaattcagattgaaagt 402  Q
       ||  |||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||        
T  43027300 ---ttacctaatggaaattttactcggattgaacggatgatggcacctttataatggagcataaattgatcgaatcctgtggcaaattgagattga---- 43027208  T
Q  403 gaaatatttgaaagagtggaaggatgtttggtaagtcttgaattgtgttatagtcaaacatggtatgaagatcaaagt 480  Q
                  ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43027207 --------------agtggaagtgtgtttggtaggtcttgaattgtgttatagtcaaacatggtatgaagatcaaagt 43027144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 589 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 42796282 - 42796165
Alignment:
Q  589 caggcaactcactcttaagcttcgtacacctcttcattgaaggcagctcactcttaagctttttacacctcttcattgccgctgcaagcaataatgaaca 688  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  42796282 caggcgactcactcttaagctttttacacctcttcattgcacgcgactcactcttaagctttttacacctcttcattgctactgcaagcaataacgaaca 42796183  T
Q  689 cagttagtataatatata 706  Q
    |||||| || ||||||||    
T  42796182 cagttattaaaatatata 42796165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 310 - 488
Target Start/End: Original strand, 38150196 - 38150368
Alignment:
Q  310 ctaatggaaaattgactcggattgaactgatgatgggacctttataatggagcataaattgatccaatcttgtggtaaattcagattgaaagtgaaatat 409  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || ||   | ||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||      |||||       
T  38150196 ctaatggaaaatttactcggattgaactaatcatatcatcttgataatgcagcatgaattgatccaatcttttggcaaattcagat------tgaaaccc 38150289  T
Q  410 ttgaaagagtggaaggatgtttggtaagtcttgaattgtgttatagtcaaacatggtatgaagatcaaagttgaggtcc 488  Q
    ||||| |||||||||| | || ||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  38150290 ttgaaggagtggaaggcttttcggtaactcttgaactgtattagagtcaaacatgttatggagatcaaaattgaggtcc 38150368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 43027760 - 43027600
Alignment:
Q  11 ggagcacagactctgaagcagtttcggcgtcacattaattagatgcaacacaggagttctcaaattattgaatccagagtagtccagatgttctgcactg 110  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||          ||||| |   |    
T  43027760 ggagcacagactctgaagcaatttccgcgtcacataaactagatgcaacacaagaattctcaaatttttgaatccagag----------gttctactagg 43027671  T
Q  111 aggcagttttgtaggtgcagataagtgagagaatcattgccagataagagagtaggggggaatatgtatgg 181  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||| |||||||    
T  43027670 aggcacttttgtaggtgcagatatgtcggagaatcatagtcagataaaagagtaaggggaaatttgtatgg 43027600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 310 - 595
Target Start/End: Original strand, 38157935 - 38158214
Alignment:
Q  310 ctaatggaaaattgactcggattgaactgatgatgggacctttataatggagcataaattgatccaatcttgtggtaaattcagattgaaagtgaaatat 409  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||| || |||   |||| | |||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||      |||||       
T  38157935 ctaatggaaaacttagtcggattgaactaatcatgtcgccttgaaaatgcagcatgaattgatccaatcttttggcaaattcagat------tgaaaccc 38158028  T
Q  410 ttgaaagagtggaaggatgtttggtaagtcttgaattgtgttatagtcaaacatggtatgaagatcaaagttgaggtccgcccttaatccccattcgtga 509  Q
    ||||| ||| |||||  | | |||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||   |||||| ||||||| |||    
T  38158029 ttgaaggagcggaagactttgtggtaactcttgaactgtattagagtcaaacatgttatggagatcaaagttaaggtccattcttaatgcccattcatga 38158128  T
Q  510 acccatcgtttagacaatgcactagttttcaccaaatccttcaaagctaacttggaaaagatataagatataatagaatcaggcaa 595  Q
      |||  |||| || | ||  || ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||  |||| |||| ||||||||||    
T  38158129 caccaatgttttgaaagtgtgcttgtttttaccaaatccttcaaacctaactttgaaaatatatttgataaaatacaatcaggcaa 38158214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 310 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 37883421 - 37883330
Alignment:
Q  310 ctaatggaaaattgactcggattgaactgatgatgggacctttataatggagcataaattgatccaatcttgtggtaaattcagattgaaag 401  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||    
T  37883421 ctaatggaaaattgagtcggattgaactgatcatggtaccttgatgatgcagcatgaattgatccaatcttgtgtaaaaatcagattcaaag 37883330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 310 - 604
Target Start/End: Original strand, 38188068 - 38188362
Alignment:
Q  310 ctaatggaaaattgactcggattgaactgatgatgggacctttataatggagcataaattgatccaatcttgtggtaaattcagattgaaagtgaaatat 409  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||| |||||| | ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||             
T  38188068 ctaatggaaaatttactcgaactgaacggatgatagcaccttgataatgtagcatgaattgatccaatcttgtgacaaattcagattgaaaccc------ 38188161  T
Q  410 ttgaaagagtggaaggatgtttggtaagtcttgaattgtgttatagtcaa------acatggtatgaagatcaaagttgaggtccgcccttaatccccat 503  Q
    || ||| ||||||||| | ||  || | ||||||||||| ||||| ||||      ||||| |||| |||||||| ||||| ||    ||||||||  ||    
T  38188162 tttaaatagtggaaggcttttgtgtgactcttgaattgtattatattcaagattaaacatgttatggagatcaaaattgagatcaattcttaatcctaat 38188261  T
Q  504 tcgtgaacccatcgtttagacaatgcactagttttcaccaaatccttcaaagctaacttggaaaagatataagatataatagaatcaggcaactcactct 603  Q
    || |||  |||| |||| |||| ||  || ||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||  ||||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  38188262 tcatgacgccattgtttggacagtgtgcttgttttcaccaaatccttcaaacctaacttcgagaatataatagataaaatagaatctggcaactcaatct 38188361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 551 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 33862297 - 33862238
Alignment:
Q  551 caaagctaacttggaaaagatataagatataatagaatcaggcaactcactcttaagctt 610  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||    
T  33862297 caaatctaacttggaaaagatataagatataatatgatcaggcaactcattctcaagctt 33862238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 551 - 610
Target Start/End: Original strand, 34179082 - 34179141
Alignment:
Q  551 caaagctaacttggaaaagatataagatataatagaatcaggcaactcactcttaagctt 610  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||    
T  34179082 caaatctaacttggaaaagatataagatataatatgatcaggcaactcattctcaagctt 34179141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 456 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 37883257 - 37883118
Alignment:
Q  456 tcaaacatggtatgaagatcaaagttgaggtccgcccttaatccccattcgtgaacccatcgtttagacaatgcactagttttcaccaaatccttcaaag 555  Q
    ||||||||| |||| | | |||| |||||||||  ||| |||||||||||||||| |||| |||  |||||||  || ||||||||  |||||||||||     
T  37883257 tcaaacatgttatggaaaccaaaattgaggtccatcctgaatccccattcgtgaagccattgttaggacaatgtgcttgttttcacggaatccttcaaac 37883158  T
Q  556 ctaacttggaaaagatataagatataatagaatcaggcaa 595  Q
     |||||| ||||| || || ||||||| | ||||||||||    
T  37883157 ttaactttgaaaaaatgtacgatataacacaatcaggcaa 37883118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 41 - 142
Target Start/End: Original strand, 38157669 - 38157770
Alignment:
Q  41 cacattaattagatgcaacacaggagttctcaaattattgaatccagagtagtccagatgttctgcactgaggcagttttgtaggtgcagataagtgaga 140  Q
    ||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||| ||| || || |   |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  38157669 cacatgaactagttgcaacacaagagttctcaaattcttcaatccagagaagtcaagaggtgctactaggaggcaattttgtaggtgaagataagtgaga 38157768  T
Q  141 ga 142  Q
    ||    
T  38157769 ga 38157770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 207 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 33860337 - 33860274
Alignment:
Q  207 tcagatgacaagagaagttcaattcgtttgacacccttagcaattcctttggagatcaatctat 270  Q
    ||||| || |||||||||| |||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33860337 tcagaagagaagagaagttgaatatgttcggcacccttagcaattcctttggagatcaatctat 33860274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 34146258 - 34146204
Alignment:
Q  216 aagagaagttcaattcgtttgacacccttagcaattcctttggagatcaatctat 270  Q
    |||||||||| |||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34146258 aagagaagttgaatatgttcggcacccttagcaattcctttggagatcaatctat 34146204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 270
Target Start/End: Original strand, 34181177 - 34181231
Alignment:
Q  216 aagagaagttcaattcgtttgacacccttagcaattcctttggagatcaatctat 270  Q
    |||||||||| |||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34181177 aagagaagttgaatatgttcggcacccttagcaattcctttggagatcaatctat 34181231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 534 - 604
Target Start/End: Original strand, 38150750 - 38150820
Alignment:
Q  534 gttttcaccaaatccttcaaagctaacttggaaaagatataagatataatagaatcaggcaactcactctt 604  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||  |||| |||  |||||||||||||| ||||    
T  38150750 gttttcaccaaatccttcaaacctaaccttgaaaagatattcgataaaatgcaatcaggcaactcaatctt 38150820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 491 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 36469477 - 36469345
Alignment:
Q  491 ccttaatccccattcgtgaacccatcgtttagacaatgcactagttttcaccaaatccttcaaagctaacttggaaaagatataagatataatagaatca 590  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||| ||||| || ||| | || |||||||||||||||||||||| |||| |||   ||| ||| |||| || | |||||    
T  36469477 ccttaatctccactcgtgaagccaacgtttggataatacgctggttttcaccaaatccttcaaaggtaacctgg---agaaatacgataaaacacaatca 36469381  T
Q  591 ggcaactcactcttaagcttcgtacacctcttcatt 626  Q
    || | |||||| || |||||  ||||||||||||||    
T  36469380 ggaatctcactattgagctttttacacctcttcatt 36469345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 258
Target Start/End: Original strand, 38157847 - 38157898
Alignment:
Q  207 tcagatgacaagagaagttcaattcgtttgacacccttagcaattcctttgg 258  Q
    |||||||| ||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  38157847 tcagatgagaagagcaattcaatacgtttggcacccttagcaattcctttgg 38157898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 118 - 164
Target Start/End: Original strand, 38150005 - 38150051
Alignment:
Q  118 tttgtaggtgcagataagtgagagaatcattgccagataagagagta 164  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  38150005 tttgtaggtgaagataagtgagagaatcagtgtccgataagagagta 38150051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 326 - 396
Target Start/End: Original strand, 38286478 - 38286548
Alignment:
Q  326 tcggattgaactgatgatgggacctttataatggagcataaattgatccaatcttgtggtaaattcagatt 396  Q
    ||||||||| | ||| |||  ||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  38286478 tcggattgaccggatcatgtcaccttgataatgcagcatgaattgatccactcttgcggtaaattcagatt 38286548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 264
Target Start/End: Original strand, 38150109 - 38150166
Alignment:
Q  207 tcagatgacaagagaagttcaattcgtttgacacccttagcaattcctttggagatca 264  Q
    |||||||| ||||| | |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  38150109 tcagatgagaagagcaattcaatacgtttggcacccttagtaattcctttggaaatca 38150166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 51 - 88
Target Start/End: Original strand, 38173155 - 38173192
Alignment:
Q  51 agatgcaacacaggagttctcaaattattgaatccaga 88  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  38173155 agatgcaacacaagagttctcaaattattgaaaccaga 38173192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 3)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 262 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 9663676 - 9663314
Alignment:
Q  262 tcaatctattaatggcaacattaatggcatccccgtgtgcagaatttactaatggaaaattgactcggattgaactgatgatgggacctttataatggag 361  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||| ||||||  || ||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  9663676 tcaatctattaatgacattactaatggcatctccgtgttgaggatttactaatggaaattttactcggattgaatggatgatggcacctttataatggag 9663577  T
Q  362 cataaattgatccaatcttgtggtaaattcagattgaaagtgaaatatttgaaagagtggaaggatgtttggtaagtcttgaattgtgttatagtcaaac 461  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||   |||||||||   |||| || |||||||||||||||    
T  9663576 cataaattgatccaatcttgtgacaaattcagattgaaagtgtaatctttgaaagagtggaaatgtgtttggta---cttggatagtgttatagtcaaac 9663480  T
Q  462 atggtatgaagatcaaagttgaggtccgcccttaatccccattcgtgaacccatcgtttagacaatgcactagttttcaccaaatccttcaaagctaact 561  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9663479 atggtatgaagatcaaagttgaggtccgtccttaatccccattcgtgaacccatcgtttggacaatgcactagttttcaccaaatccttcaaagctaact 9663380  T
Q  562 tggaaaagatataagatataatagaatcaggcaactcactcttaagcttcgtacacctcttcattg 627  Q
    || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  9663379 tgaaaaagatataagatataatactatcaggcaactcactcttaagctttttacacctcttcattg 9663314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 9663878 - 9663706
Alignment:
Q  11 ggagcacagactctgaagcagtttcggcgtcacattaattagatgcaacacaggagttctcaaattattgaatccagagtagt---ccagatgttctgca 107  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||   | ||| ||||| ||    
T  9663878 ggagcacagactctgaaccagtttcggcgtgacaaaaattagatgcaacacaagagttgttaaattattgaatccagagtagtagtcaagaggttctcca 9663779  T
Q  108 ctgaggcagttttgtaggtgcagataagtgagagaatcattgccagataagagagtaggggggaatatgtatg 180  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9663778 atgaggcagctttgtaggtgcagatacgtgagagaatgattggcagataagagagtagggggtaatatgtatg 9663706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 629 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 9663351 - 9663287
Alignment:
Q  629 aggcagctcactcttaagctttttacacctcttcattgccgctgcaagcaataatgaacacagtt 693  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||    
T  9663351 aggcaactcactcttaagctttttacacctcttcattgccaccgcaagcaataacaaacacagtt 9663287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 163; Significance: 1e-86; HSPs: 16)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 311 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 26002692 - 26002406
Alignment:
Q  311 taatggaaaattgactcggattgaactgatgatgggacctttataatggagcataaattgatccaatcttgtggtaaattcagattgaaagtgaaatatt 410  Q
    ||||||||| || ||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  26002692 taatggaaattttactcgaatggaacggatgatggcacctttataatggagcataaattgatccaatcttgtggcaaattcagattgaaagtgaaacatt 26002593  T
Q  411 tgaaagagtggaaggatgtttggtaagtcttgaattgtgttatagtcaaacatggtatgaagatcaaagttgaggtccgcccttaatccccattcgtgaa 510  Q
    ||| |||| ||| |||| | ||  |||||||||  ||||||||||||  |||||||||  ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  26002592 tgagagagaggacggatttgtgacaagtcttgatctgtgttatagtcggacatggtatagagatcgaagttaaggtccacccttaatccccattcgtgaa 26002493  T
Q  511 cccatcgtttagacaatgcactagttttcaccaaatccttcaaagctaacttggaaaagatataagatataatagaatcaggcaact 597  Q
     |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  26002492 tccattgtttggacaatgcactggttttcaccaaatctttcaaagctaacttggaaaagatataagatataatatgatcaggcaact 26002406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 311 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 25568824 - 25568508
Alignment:
Q  311 taatggaaaattgactcggattgaactgatgatgggacctttataatggagcataaattgatccaatcttgtggtaaattcagattgaaagtgaaatatt 410  Q
    ||||||||| || ||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  25568824 taatggaaattttactcgaatggaacggatgatggcacctttataatggagcataaattgatccaatcttgtggcaaattcagattgaaagtgaaacctt 25568725  T
Q  411 tgaaagagtggaaggatgtttggtaagtcttgaattgtgttatagtcaaacatggtatgaagatcaaagttgaggtccgcccttaatccccattcgtgaa 510  Q
    ||| |||| |||||||| | ||  |||||||||  ||||||||||||  |||||||||  ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  25568724 tgagagagaggaaggatttgtgacaagtcttgatctgtgttatagtcggacatggtatagagatcgaagttaaggtccatccttaatccccattcgtgaa 25568625  T
Q  511 cccatcgtttagacaatgcactagttttcaccaaatccttcaaagctaacttggaaaagatataagatataatagaatcaggcaactcactcttaagctt 610  Q
     |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||| ||||||    
T  25568624 tccattgtttggacaatgcactggttttcaccaaatctttcaaagctaacttggaaaagatataagatataatatgatcagggaactcattctcaagctt 25568525  T
Q  611 cgtacacctcttcattg 627  Q
       ||| ||||||||||    
T  25568524 ttcacagctcttcattg 25568508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 311 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 25563209 - 25562891
Alignment:
Q  311 taatggaaaattgactcggattgaactgatgatgggacctttataatggagcataaattgatccaatcttgtggtaaattcagattgaaagtgaaatatt 410  Q
    ||||||||| || ||||| || |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  25563209 taatggaaattttactcgaatggaacggatgatggcacctttataatgcagcataaattgatccaatcttgtggaaaattcagattgaaagtgaaacctt 25563110  T
Q  411 tgaaagagtg--gaaggatgtttggtaagtcttgaattgtgttatagtcaaacatggtatgaagatcaaagttgaggtccgcccttaatccccattcgtg 508  Q
    ||| |||| |  ||||||| | ||  |||||||||  ||||||||||||  |||||||||  ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  25563109 tgagagagagaggaaggatttgtgacaagtcttgatctgtgttatagtcggacatggtatagagatcgaagttaaggtccatccttaatccccattcgtg 25563010  T
Q  509 aacccatcgtttagacaatgcactagttttcaccaaatccttcaaagctaacttggaaaagatataagatataatagaatcaggcaactcactcttaagc 608  Q
    || |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||| ||||    
T  25563009 aatccattgtttggacaatgcactggttttcaccaaatctttcaaagctaacttggaaaagatataagatataatatgatcagacaactcattctcaagc 25562910  T
Q  609 ttcgtacacctcttcattg 627  Q
    ||   ||| ||||||||||    
T  25562909 ttttcacagctcttcattg 25562891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 311 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 26102721 - 26102403
Alignment:
Q  311 taatggaaaattgactcggattgaactgatgatgggacctttataatggagcataaattgatccaatcttgtggtaaattcagattgaaagtgaaatatt 410  Q
    ||||||||| || ||||| || |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  26102721 taatggaaattttactcgaatggaacggatgatggcacctttataatgcagcataaattgatccaatcttgtggaaaattcagattgaaagtgaaacctt 26102622  T
Q  411 tgaaagagtg--gaaggatgtttggtaagtcttgaattgtgttatagtcaaacatggtatgaagatcaaagttgaggtccgcccttaatccccattcgtg 508  Q
    ||| |||| |  ||||||| | ||  |||||||||  ||||||||||||  |||||||||  ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  26102621 tgagagagagaggaaggatttgtgacaagtcttgatctgtgttatagtcggacatggtatagagatcgaagttaaggtccatccttaatccccattcgtg 26102522  T
Q  509 aacccatcgtttagacaatgcactagttttcaccaaatccttcaaagctaacttggaaaagatataagatataatagaatcaggcaactcactcttaagc 608  Q
    || |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||| ||||    
T  26102521 aatccattgtttggacaatgcactggttttcaccaaatctttcaaagctaacttggaaaagatataagatataatatgatcagacaactcattctcaagc 26102422  T
Q  609 ttcgtacacctcttcattg 627  Q
    ||   ||| ||||||||||    
T  26102421 ttttcacagctcttcattg 26102403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 429 - 627
Target Start/End: Original strand, 4164532 - 4164730
Alignment:
Q  429 tttggtaagtcttgaattgtgttatagtcaaacatggtatgaagatcaaagttgaggtccgcccttaatccccattcgtgaacccatcgtttagacaatg 528  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||| |  |  || ||||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  4164532 tttggcaactcttgaattgtattatagtgaaacatgttttggagatcaaagttgaggtctgtacggaaaccccattcgtgaagccattgtttcgacaatg 4164631  T
Q  529 cactagttttcaccaaatccttcaaagctaacttggaaaagatataagatataatagaatcaggcaactcactcttaagcttcgtacacctcttcattg 627  Q
      |||||||| |||||||| |||| |  ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||  ||||| || ||   ||||||||||||||    
T  4164632 tgctagtttttaccaaatctttcatacttaacttggaaaagatgtaagatacaatacaatcaggcaacttgctcttgagattttcacacctcttcattg 4164730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 429 - 627
Target Start/End: Original strand, 4226153 - 4226351
Alignment:
Q  429 tttggtaagtcttgaattgtgttatagtcaaacatggtatgaagatcaaagttgaggtccgcccttaatccccattcgtgaacccatcgtttagacaatg 528  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||| |  |  || ||||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  4226153 tttggcaactcttgaattgtattatagtgaaacatgttttggagatcaaagttgaggtctgtacggaaaccccattcgtgaagccattgtttcgacaatg 4226252  T
Q  529 cactagttttcaccaaatccttcaaagctaacttggaaaagatataagatataatagaatcaggcaactcactcttaagcttcgtacacctcttcattg 627  Q
      |||||||| |||||||| |||| |  ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||  ||||| || ||   ||||||||||||||    
T  4226253 tgctagtttttaccaaatctttcatacttaacttggaaaagatgtaagatacaatacaatcaggcaacttgctcttgagattttcacacctcttcattg 4226351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 25563298 - 25563235
Alignment:
Q  207 tcagatgacaagagaagttcaattcgtttgacacccttagcaattcctttggagatcaatctat 270  Q
    ||||| || ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25563298 tcagaagagaagagaagttcaatatgtttggcacccttagcaattcctttggagatcaatctat 25563235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 25568913 - 25568850
Alignment:
Q  207 tcagatgacaagagaagttcaattcgtttgacacccttagcaattcctttggagatcaatctat 270  Q
    ||||| || ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25568913 tcagaagagaagagaagttcaatatgtttggcacccttagcaattcctttggagatcaatctat 25568850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 26102810 - 26102747
Alignment:
Q  207 tcagatgacaagagaagttcaattcgtttgacacccttagcaattcctttggagatcaatctat 270  Q
    ||||| || ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26102810 tcagaagagaagagaagttcaatatgtttggcacccttagcaattcctttggagatcaatctat 26102747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 26002781 - 26002718
Alignment:
Q  207 tcagatgacaagagaagttcaattcgtttgacacccttagcaattcctttggagatcaatctat 270  Q
    ||||| || ||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26002781 tcagaagagaagagaagttcaatatgtttggcaccattagcaattcctttggagatcaatctat 26002718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 96
Target Start/End: Original strand, 4164161 - 4164217
Alignment:
Q  40 tcacattaattagatgcaacacaggagttctcaaattattgaatccagagtagtcca 96  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  4164161 tcacatcaattatatgcaacacaagagttctcaaattcttgaatccagagaagtcca 4164217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 96
Target Start/End: Original strand, 4225782 - 4225838
Alignment:
Q  40 tcacattaattagatgcaacacaggagttctcaaattattgaatccagagtagtcca 96  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  4225782 tcacatcaattatatgcaacacaagagttctcaaattcttgaatccagagaagtcca 4225838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 310 - 397
Target Start/End: Original strand, 4164428 - 4164515
Alignment:
Q  310 ctaatggaaaattgactcggattgaactgatgatgggacctttataatggagcataaattgatccaatcttgtggtaaattcagattg 397  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||| |||||  ||||| | ||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  4164428 ctaatggaaaatttactcggattgaatggatcatggcaccttggtaatgcatcatgaattgatccaatattgtggcaaattgagattg 4164515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 310 - 397
Target Start/End: Original strand, 4226049 - 4226136
Alignment:
Q  310 ctaatggaaaattgactcggattgaactgatgatgggacctttataatggagcataaattgatccaatcttgtggtaaattcagattg 397  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||| |||||  ||||| | ||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  4226049 ctaatggaaaatttactcggattgaatggatcatggcaccttggtaatgcatcatgaattgatccaatattgtggcaaattgagattg 4226136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 222 - 266
Target Start/End: Original strand, 4164355 - 4164399
Alignment:
Q  222 agttcaattcgtttgacacccttagcaattcctttggagatcaat 266  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4164355 agttcaatacgtttggcacccttagcaattcctttggaaatcaat 4164399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 222 - 266
Target Start/End: Original strand, 4225976 - 4226020
Alignment:
Q  222 agttcaattcgtttgacacccttagcaattcctttggagatcaat 266  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4225976 agttcaatacgtttggcacccttagcaattcctttggaaatcaat 4226020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 147; Significance: 4e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 310 - 608
Target Start/End: Original strand, 23801 - 24099
Alignment:
Q  310 ctaatggaaaattgactcggattgaactgatgatgggacctttataatggagcataaattgatccaatcttgtggtaaattcagattgaaagtgaaatat 409  Q
    |||||||||| || ||||| || |||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||  |    
T  23801 ctaatggaaattttactcgaatggaacggataatgacacctttataatggagcataaattgatccaaacttgtggcaaatttagattgatagtgaaacct 23900  T
Q  410 ttgaaagagtggaaggatgtttggtaagtcttgaattgtgttatagtcaaacatggtatgaagatcaaagttgaggtccgcccttaatccccattcgtga 509  Q
    |||| |||| |||| ||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||  || |||||||||||| |||    
T  23901 ttgagagagaggaacgatttgtggtaagtcttgatctgtgttatagtcaaacatggtatagagatcgaagtttaggtccatccgtaatccccattcatga 24000  T
Q  510 acccatcgtttagacaatgcactagttttcaccaaatccttcaaagctaacttggaaaagatataagatataatagaatcaggcaactcactcttaagc 608  Q
    | |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||    
T  24001 atccattgtttggacaatgcactggttttcaccaaatccttcaaagctaacttggaaaagatacaagatataatatgatcaggcaactcattctcaagc 24099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 216 - 270
Target Start/End: Original strand, 23722 - 23776
Alignment:
Q  216 aagagaagttcaattcgtttgacacccttagcaattcctttggagatcaatctat 270  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23722 aagagaagttcaatatgtttggcacccttagcaattcctttggagatcaatctat 23776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 2)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 452 - 596
Target Start/End: Original strand, 2223989 - 2224133
Alignment:
Q  452 atagtcaaacatggtatgaagatcaaagttgaggtccgcccttaatccccattcgtgaacccatcgtttagacaatgcactagttttcaccaaatccttc 551  Q
    |||||||||||  ||||  | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||||   | ||||||||||||||||||    
T  2223989 atagtcaaacaaagtattgatatcaaagttgaggtccaccctgaatccccattcgtgaagccatagtttggacaatgtgattgttttcaccaaatccttc 2224088  T
Q  552 aaagctaacttggaaaagatataagatataatagaatcaggcaac 596  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  2224089 aaacctaactttgaaaagatatatgatataacacaatcaggcaac 2224133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 264
Target Start/End: Original strand, 2223798 - 2223831
Alignment:
Q  231 cgtttgacacccttagcaattcctttggagatca 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2223798 cgtttgacacccttagcaattcctttggaaatca 2223831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 7)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 471 - 603
Target Start/End: Original strand, 12410912 - 12411045
Alignment:
Q  471 agatcaaagttgaggtccgcccttaatcccc-attcgtgaacccatcgtttagacaatgcactagttttcaccaaatccttcaaagctaacttggaaaag 569  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||  |||||||  ||||    
T  12410912 agatcaaagttgaggtccattcttaatcccccattcgtgaagccatcgtttggacaatgtacttgttttcaccaaatccttccaacttaacttgctaaag 12411011  T
Q  570 atataagatataatagaatcaggcaactcactct 603  Q
    |||||||||| || | | ||||||||||||||||    
T  12411012 atataagatagaacacagtcaggcaactcactct 12411045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 471 - 603
Target Start/End: Original strand, 12422972 - 12423105
Alignment:
Q  471 agatcaaagttgaggtccgcccttaatcccc-attcgtgaacccatcgtttagacaatgcactagttttcaccaaatccttcaaagctaacttggaaaag 569  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||  |||||||  ||||    
T  12422972 agatcaaagttgaggtccattcttaatcccccattcgtgaagccatcgtttggacaatgtacttgttttcaccaaatccttccaacttaacttgctaaag 12423071  T
Q  570 atataagatataatagaatcaggcaactcactct 603  Q
    |||||||||| || | | ||||||||||||||||    
T  12423072 atataagatagaacacagtcaggcaactcactct 12423105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 318 - 399
Target Start/End: Original strand, 12409942 - 12410023
Alignment:
Q  318 aaattgactcggattgaactgatgatgggacctttataatggagcataaattgatccaatcttgtggtaaattcagattgaa 399  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| |||||| ||||| | |||||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  12409942 aaattgagtcggattgaaaggatgatggaaccttgataatgcagcatgacttgatccaatctagtggcaaattgagattgaa 12410023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 318 - 399
Target Start/End: Original strand, 12422002 - 12422083
Alignment:
Q  318 aaattgactcggattgaactgatgatgggacctttataatggagcataaattgatccaatcttgtggtaaattcagattgaa 399  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| |||||| ||||| | |||||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  12422002 aaattgagtcggattgaaaggatgatggaaccttgataatgcagcatgacttgatccaatctagtggcaaattgagattgaa 12422083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 264
Target Start/End: Original strand, 12409850 - 12409903
Alignment:
Q  211 atgacaagagaagttcaattcgtttgacacccttagcaattcctttggagatca 264  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12409850 atgagaagagcagttcaatacgtttgacacccttggcaattcctttggaaatca 12409903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 264
Target Start/End: Original strand, 12421910 - 12421963
Alignment:
Q  211 atgacaagagaagttcaattcgtttgacacccttagcaattcctttggagatca 264  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12421910 atgagaagagcagttcaatacgtttgacacccttggcaattcctttggaaatca 12421963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 457 - 598
Target Start/End: Original strand, 29196560 - 29196701
Alignment:
Q  457 caaacatggtatgaagatcaaagttgaggtccgcccttaatccccattcgtgaacccatcgtttagacaatgcactagttttcaccaaatccttcaaagc 556  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||    || ||| |||||| |||| ||||  ||||||||||   || ||||||||||||||||||| |      
T  29196560 caaacatgttatgtatatcaaagttgaggtccttggttgatctccattcatgaatccatgttttagacaatatgcttgttttcaccaaatccttcatact 29196659  T
Q  557 taacttggaaaagatataagatataatagaatcaggcaactc 598  Q
    |||||| ||||| |||||||| || | | ||||||| |||||    
T  29196660 taactttgaaaatatataagacatgacacaatcaggtaactc 29196701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University