View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6389_low_5 (Length: 402)

Name: NF6389_low_5
Description: NF6389
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6389_low_5
NF6389_low_5
[»] chr6 (49 HSPs)
chr6 (49-394)||(26143519-26143864)
chr6 (49-394)||(25580373-25580718)
chr6 (49-394)||(25483710-25484055)
chr6 (49-394)||(25539194-25539539)
chr6 (49-394)||(26056573-26056918)
chr6 (49-394)||(26076543-26076888)
chr6 (49-394)||(26656616-26656961)
chr6 (49-394)||(26762587-26762932)
chr6 (49-394)||(26862231-26862576)
chr6 (49-394)||(26647130-26647475)
chr6 (49-394)||(26753098-26753443)
chr6 (49-394)||(26884721-26885066)
chr6 (49-394)||(27337281-27337626)
chr6 (49-394)||(27398021-27398366)
chr6 (49-394)||(27530487-27530832)
chr6 (146-394)||(25511640-25511888)
chr6 (51-394)||(26623924-26624267)
chr6 (51-394)||(26729901-26730244)
chr6 (49-394)||(25492505-25492850)
chr6 (49-394)||(28786889-28787234)
chr6 (49-394)||(28793010-28793355)
chr6 (49-394)||(27717685-27718030)
chr6 (49-394)||(27610306-27610651)
chr6 (49-394)||(27215103-27215448)
chr6 (49-394)||(31285210-31285555)
chr6 (49-394)||(28781752-28782097)
chr6 (61-394)||(27603890-27604223)
chr6 (54-394)||(26803102-26803442)
chr6 (54-394)||(27705590-27705930)
chr6 (54-391)||(27426801-27427138)
chr6 (54-394)||(27679606-27679946)
chr6 (49-394)||(27697772-27698117)
chr6 (54-394)||(27592207-27592547)
chr6 (54-394)||(27676806-27677146)
chr6 (49-248)||(26824470-26824669)
chr6 (49-100)||(25511589-25511640)
chr6 (158-241)||(28140295-28140378)
chr6 (166-248)||(28097775-28097857)
chr6 (159-235)||(26937790-26937866)
chr6 (147-212)||(26849461-26849526)
chr6 (141-229)||(28243538-28243626)
chr6 (166-229)||(28227720-28227783)
chr6 (166-229)||(28235333-28235396)
chr6 (141-248)||(28297072-28297179)
chr6 (141-248)||(28514894-28515001)
chr6 (179-249)||(26724349-26724419)
chr6 (166-248)||(26950511-26950593)
chr6 (147-212)||(26975700-26975765)
chr6 (157-229)||(29843338-29843410)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (49-395)||(28126860-28127206)
chr1 (51-395)||(28163561-28163904)
chr1 (49-394)||(267526-267871)
[»] chr4 (7 HSPs)
chr4 (49-394)||(18678742-18679087)
chr4 (49-394)||(18698582-18698927)
chr4 (54-394)||(18654659-18654999)
chr4 (54-394)||(18730686-18731026)
chr4 (54-394)||(18723267-18723607)
chr4 (54-391)||(18074417-18074754)
chr4 (141-249)||(5090284-5090392)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (49-394)||(8138-8483)
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (49-394)||(12861-13206)
scaffold0277 (49-394)||(3898-4243)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (49-394)||(2725-3070)
[»] chr8 (1 HSPs)
chr8 (49-394)||(29273024-29273369)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (54-391)||(60225-60562)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (149-248)||(3280410-3280509)
chr2 (143-248)||(17992547-17992652)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (149-248)||(16691618-16691717)
[»] scaffold0038 (3 HSPs)
scaffold0038 (141-229)||(43700-43788)
scaffold0038 (166-229)||(28218-28281)
scaffold0038 (166-229)||(35495-35558)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 334; Significance: 0; HSPs: 49)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 49 - 394
Target Start/End: Original strand, 26143519 - 26143864
Alignment:
Q  49 ccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtac 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26143519 ccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaagaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttttggtac 26143618  T
Q  149 tggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26143619 tggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 26143718  T
Q  249 agtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcatta 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26143719 agtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcatta 26143818  T
Q  349 aggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26143819 aggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 26143864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 49 - 394
Target Start/End: Original strand, 25580373 - 25580718
Alignment:
Q  49 ccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtac 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  25580373 ccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgtggtccacatggtaggactttatggtac 25580472  T
Q  149 tggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25580473 tggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagatttca 25580572  T
Q  249 agtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcatta 348  Q
    | || ||||||| |||||||||||||  |  |||||||||||| || |||||||||  ||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  25580573 attcttaataacttgaaacatctccattattatctccttttaataatagttaaattttactttaagttagtagatgttagtgagggaatttcaatcatta 25580672  T
Q  349 aggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25580673 aggaaagactatctagaaagaagattcttttgatttttgatgatgt 25580718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 49 - 394
Target Start/End: Original strand, 25483710 - 25484055
Alignment:
Q  49 ccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtac 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25483710 ccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttttggtac 25483809  T
Q  149 tggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25483810 tggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattttcttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 25483909  T
Q  249 agtcataataacctgaaacatctccaggaagat-ctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcatt 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| || || |||||||||  ||  |||||||| || |||||||||||||||  |||||||     
T  25483910 agtcataataacctgaaacatctcca-aaagatgctcctttcaaaaatagttaaatttgacggtaagttagaagatgttagtgagggaataccaatcata 25484008  T
Q  348 aaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25484009 aaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattgttgatgatgt 25484055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 49 - 394
Target Start/End: Original strand, 25539194 - 25539539
Alignment:
Q  49 ccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtac 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25539194 ccaaataccctgttggattacagtccccaatagaacaagtgaaattgcttcttgacttgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtac 25539293  T
Q  149 tggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25539294 tggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattttgttgctgatcaatttgaagttgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 25539393  T
Q  249 agtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcatta 348  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |  | ||||||| || || |||||||||  ||  |||||||| || |||||||||||||||  ||||||| |    
T  25539394 agtcataataacttgaaacatctccaaaagaagctcctttcaaaaatagttaaatttgacggtaagttagaagatgttagtgagggaataacaatcataa 25539493  T
Q  349 aggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 394  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25539494 aggaaagactatctaaaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 25539539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 49 - 394
Target Start/End: Original strand, 26056573 - 26056918
Alignment:
Q  49 ccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtac 148  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  26056573 ccaaataccctgttggattgcagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgagaatgaggtccgcatggtaggaatttttggtac 26056672  T
Q  149 tggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 248  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26056673 cggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattctattgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 26056772  T
Q  249 agtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcatta 348  Q
    | || ||| ||| |||||||||||||| |  | ||||||| || || |||||||||  ||  | |||||| || |||||||||||||||  |||| || |    
T  26056773 actcttaagaacttgaaacatctccagaagaagctcctttcaaaaatagttaaatttgacggtcagttagaagatgttagtgagggaataccaattataa 26056872  T
Q  349 aggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26056873 aggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgacgatgt 26056918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 49 - 394
Target Start/End: Original strand, 26076543 - 26076888
Alignment:
Q  49 ccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtac 148  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  26076543 ccaaataccctgttggattgcagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgagaatgaggtccgcatggtaggaatttttggtac 26076642  T
Q  149 tggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 248  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26076643 cggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattctattgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 26076742  T
Q  249 agtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcatta 348  Q
    | || ||| ||| |||||||||||||| |  | ||||||| || || |||||||||  ||  | || ||| || |||||||||||||||  |||| || |    
T  26076743 actcttaagaacttgaaacatctccagaagaagctcctttcaaaaatagttaaatttgacggtcagatagaagatgttagtgagggaataccaattataa 26076842  T
Q  349 aggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26076843 aggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgacgatgt 26076888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 49 - 394
Target Start/End: Original strand, 26656616 - 26656961
Alignment:
Q  49 ccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtac 148  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  26656616 ccaaataccctgttggattagagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgataagggatctaaggatgaggttctcatggtaggactttatggtac 26656715  T
Q  149 tggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26656716 tggaggcatgggtaaatcaacacttgccaaagcaatttataattttgtcgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcacaatgtcagagagaattca 26656815  T
Q  249 agtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcatta 348  Q
      |||||||||  |||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||| | ||||   ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |    
T  26656816 gctcataataatttgaaacatctccaggaggagctcctttcaaaaactgttagagtgaatattaagttaggagatgttagtgagggaattccaatcataa 26656915  T
Q  349 aggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26656916 aggaaagactatctagaaagaagattcttttgattctcgatgatgt 26656961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 49 - 394
Target Start/End: Original strand, 26762587 - 26762932
Alignment:
Q  49 ccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtac 148  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  26762587 ccaaataccctgttggattagagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgataagggatctaaggatgaggttctcatggtaggactttatggtac 26762686  T
Q  149 tggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26762687 tggaggcatgggtaaatcaacacttgccaaagcaatttataattttgtcgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcacaatgtcagagagaattca 26762786  T
Q  249 agtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcatta 348  Q
      |||||||||  |||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||| | ||||   ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |    
T  26762787 gctcataataatttgaaacatctccaggaggagctcctttcaaaaactgttagagtgaatattaagttaggagatgttagtgagggaattccaatcataa 26762886  T
Q  349 aggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26762887 aggaaagactatctagaaagaagattcttttgattctcgatgatgt 26762932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 49 - 394
Target Start/End: Original strand, 26862231 - 26862576
Alignment:
Q  49 ccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtac 148  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| || | ||| | |||||||||||||||||||||    
T  26862231 ccaaataccctgttggattaaagtcccgagtagaacaagtgaaattgcttcttgatatggaatctgatgaaggggtacacatggtaggactttatggtac 26862330  T
Q  149 tggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 248  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  26862331 tggaggcatggggaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttgttgccgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataaagttagagagaattca 26862430  T
Q  249 agtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcatta 348  Q
    | |||||||| | |||||||||||||| | || || ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||| || | || |    
T  26862431 actcataatagcttgaaacatctccagaaggagcttcttttaaaaacagttaaattgaacattaagttaggagatgctagtgagggaattccacttataa 26862530  T
Q  349 aggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 394  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  26862531 aggaaagactaaatagaatgaagattcttttgattctcgatgatgt 26862576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 49 - 394
Target Start/End: Original strand, 26647130 - 26647475
Alignment:
Q  49 ccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtac 148  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |  ||||| || | |||||  ||||||||||||||||||||    
T  26647130 ccaaataccctgttggattagagtcccgattagaacaagtgaaattgcttcttgataaagaatctgatgaaggggtccatatggtaggactttatggtac 26647229  T
Q  149 tggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 248  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26647230 tggaggtttgggtaaatcaacacttgccaaagcgatttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgctttcttcataatgtcagagagaattca 26647329  T
Q  249 agtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcatta 348  Q
      |||||||||| |||||||||||||| | || ||||||| || |||||||||| |||||  |||||| |||  | || ||||||||||| |||||||||    
T  26647330 gctcataataacttgaaacatctccagaaggagctcctttcaaaaacagttaaagtgaacattaagtttggacatatttgtgagggaattccaatcatta 26647429  T
Q  349 aggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 394  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26647430 aggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgt 26647475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 49 - 394
Target Start/End: Original strand, 26753098 - 26753443
Alignment:
Q  49 ccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtac 148  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |  ||||| || | |||||  ||||||||||||||||||||    
T  26753098 ccaaataccctgttggattagagtcccgattagaacaagtgaaattgcttcttgataaagaatctgatgaaggggtccatatggtaggactttatggtac 26753197  T
Q  149 tggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 248  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26753198 tggaggtttgggtaaatcaacacttgccaaagcgatttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgctttcttcataatgtcagagagaattca 26753297  T
Q  249 agtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcatta 348  Q
      |||||||||| |||||||||||||| | || ||||||| || |||||||||| |||||  |||||| |||  | || ||||||||||| |||||||||    
T  26753298 gctcataataacttgaaacatctccagaaggagctcctttcaaaaacagttaaagtgaacattaagtttggacatatttgtgagggaattccaatcatta 26753397  T
Q  349 aggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 394  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26753398 aggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgt 26753443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 49 - 394
Target Start/End: Original strand, 26884721 - 26885066
Alignment:
Q  49 ccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtac 148  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||| | ||  ||| | || | ||| | |||||||||| ||||||||||    
T  26884721 ccaaataccctgttggattacagtaccgagtacaacaattaaaattgcttcttgataaggaatctaacgaaggggtacacatggtaggaatttatggtac 26884820  T
Q  149 tggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  26884821 tggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtgtatgttttctgcataaagtcagggagaattca 26884920  T
Q  249 agtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcatta 348  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |    
T  26884921 actcataataacttgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataa 26885020  T
Q  349 aggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 394  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26885021 aggaaagactacatagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 26885066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 49 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 27337626 - 27337281
Alignment:
Q  49 ccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtac 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||   ||  ||||| || | ||||  |||||||||||||||||||||    
T  27337626 ccaaataccctgttggattacagtcccgagtacaacaagtaaaattgcttcttgatgaggaatctgatgaaggggtcaacatggtaggactttatggtac 27337527  T
Q  149 tggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 248  Q
    | ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  27337526 tagaggcttgggaaaatcaacacttgcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaatttgaaggagtatgctttcttcataatgttagagagaattca 27337427  T
Q  249 agtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcatta 348  Q
      || ||| ||| |||||||||||||| | || ||||||| || ||||||| || |||||  ||||||| ||| ||||  |||||||||| |||||||||    
T  27337426 gctcgtaaaaacttgaaacatctccagaaggagctcctttcaaaaacagttcaactgaacattaagttaagagatgtttctgagggaattccaatcatta 27337327  T
Q  349 aggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 394  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27337326 aggaaaggctatgtaggaagaagattcttttgattctcgatgatgt 27337281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 49 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 27398366 - 27398021
Alignment:
Q  49 ccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtac 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||   ||  ||||| || | ||||  |||||||||||||||||||||    
T  27398366 ccaaataccctgttggattacagtcccgagtacaacaagtaaaattgcttcttgatgaggaatctgatgaaggggtcaacatggtaggactttatggtac 27398267  T
Q  149 tggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 248  Q
    | ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  27398266 tagaggcttgggaaaatcaacacttgcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaatttgaaggagtatgctttcttcataatgttagagagaattca 27398167  T
Q  249 agtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcatta 348  Q
      || ||| ||| |||||||||||||| | || ||||||| || ||||||| || |||||  ||||||| ||| ||||  |||||||||| |||||||||    
T  27398166 gctcgtaaaaacttgaaacatctccagaaggagctcctttcaaaaacagttcaactgaacattaagttaagagatgtttctgagggaattccaatcatta 27398067  T
Q  349 aggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 394  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27398066 aggaaaggctatgtaggaagaagattcttttgattctcgatgatgt 27398021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 49 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 27530832 - 27530487
Alignment:
Q  49 ccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtac 148  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||  || ||||||       ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27530832 ccaaatatcctgttggattacagtcccgagtacaacatgtgaaagggcatcttgatgaaaaatctgatgatgaggtccacatggtaggactttatggtac 27530733  T
Q  149 tggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 248  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||  | ||||| |||| ||||||     
T  27530732 tggaggcataggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaatttgaagttttatgttttctagaaaatgtgagagtgaattcg 27530633  T
Q  249 agtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcatta 348  Q
    | |    ||||| ||||||||||||| ||  | |||||||||| |||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  27530632 acttcagataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacagttagattggacattaagttaggaggtgttagtcagggaattccaatcatta 27530533  T
Q  349 aggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 394  Q
    || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27530532 agcaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 27530487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 146 - 394
Target Start/End: Original strand, 25511640 - 25511888
Alignment:
Q  146 tactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaat 245  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25511640 tactagaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattctattgctgatcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaat 25511739  T
Q  246 tcaagtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatca 345  Q
    |||| || ||| ||| |||||||||||||| |  | ||||||| || || |||||||||  ||  | || ||| || |||||||||||||||  |||| |    
T  25511740 tcaactcttaagaacttgaaacatctccagaagaagctcctttcaaaaatagttaaatttgacggtcagatagaagatgttagtgagggaataccaatta 25511839  T
Q  346 ttaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 394  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25511840 taaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgacgatgt 25511888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 51 - 394
Target Start/End: Original strand, 26623924 - 26624267
Alignment:
Q  51 aaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactg 150  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||  |||||||| |  || ||||| |||| |||||  ||||| ||| | ||||| | ||    
T  26623924 aaataccctgttggattacagtctcaactacaacaagtgaaatcacttcttgataatggatctgatgatggggtccatatggttggaatgtatgggattg 26624023  T
Q  151 gaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaag 250  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||      
T  26624024 gaggcttgggcaaatcaacacttgcaagagcaatctataactttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagc 26624123  T
Q  251 tcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcattaag 350  Q
    ||| |||||| ||||||||||||| ||  | |||||||| | ||||  |  |||| |   |||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26624124 tcaaaataacttgaaacatctccaagagaagctcctttttaaaacaactggattggaaattaagttggaccatgttagtgagggaatttcaatcattaag 26624223  T
Q  351 gaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 394  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26624224 gaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgt 26624267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 51 - 394
Target Start/End: Original strand, 26729901 - 26730244
Alignment:
Q  51 aaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactg 150  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||  |||||||| |  || ||||| |||| |||||  ||||| ||| | ||||| | ||    
T  26729901 aaataccctgttggattacagtctcaactacaacaagtgaaatcacttcttgataatggatctgatgatggggtccatatggttggaatgtatgggattg 26730000  T
Q  151 gaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaag 250  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||      
T  26730001 gaggcttgggcaaatcaacacttgcaagagcaatctataactttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagc 26730100  T
Q  251 tcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcattaag 350  Q
    ||| |||||| ||||||||||||| ||  | |||||||| | ||||  |  |||| |   |||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26730101 tcaaaataacttgaaacatctccaagagaagctcctttttaaaacaactggattggaaattaagttggaccatgttagtgagggaatttcaatcattaag 26730200  T
Q  351 gaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 394  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26730201 gaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgt 26730244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 49 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 25492850 - 25492505
Alignment:
Q  49 ccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtac 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||| ||   ||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  25492850 ccaaataccctgttggattacaatcccgagtacaacacgtgaaattgcttctagatgaggtatctgaggatgagttccacatggtaggactttatggtac 25492751  T
Q  149 tggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 248  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||| || | ||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||     |||| ||||||||||||    
T  25492750 tggaggcttaggtaaatcaacacttgcaaaatcaatctataacttcattgctgatcaatttgaaggtttatgttttctaggagatgtgagagagaattca 25492651  T
Q  249 agtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcatta 348  Q
    | ||  |  ||| ||||| ||||||||||| | |||||||  | ||  |||| |||  ||  ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  25492650 actccaagaaacttgaaagatctccaggaaaaactcctttcgaaaatggttagattagacattaagttaagaagtgttagtgagggaattgcaatcataa 25492551  T
Q  349 aggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 394  Q
    |  || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25492550 aacaaggactatgtagagagaagattcttttgattctcgatgatgt 25492505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 49 - 394
Target Start/End: Original strand, 28786889 - 28787234
Alignment:
Q  49 ccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtac 148  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| |||||||||    || ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  28786889 ccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatgatggagtccgcatggtaggactttatggtac 28786988  T
Q  149 tggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  28786989 tggaggcttgggtaaatcaacacttggaaaagcaatttataattttatttctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattca 28787088  T
Q  249 agtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcatta 348  Q
      |   |||||  |||||||||||||||| |  |||||||||| |||| || || ||||   |||||||||||||||||||||||||||| |    || |    
T  28787089 gcttcaaataaattgaaacatctccaggaggtgctccttttaaaaacacttcaactgaaaattaagttaggaggtgttagtgagggaattccttatataa 28787188  T
Q  349 aggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 394  Q
    ||||||| ||   || |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  28787189 aggaaaggctgcatacaaagaagactcttttgattctcgatgatgt 28787234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 49 - 394
Target Start/End: Original strand, 28793010 - 28793355
Alignment:
Q  49 ccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtac 148  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| |||||||||    || ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  28793010 ccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatgatggagtccgcatggtaggactttatggtac 28793109  T
Q  149 tggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| ||||||| ||||    
T  28793110 tggaggcttgggtaaatcaacacttggaaaagcaatttataattttatttctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagagttca 28793209  T
Q  249 agtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcatta 348  Q
      |   ||||   |||||||||||||||| |  |||||||||| |||| || || ||||   |||||||||||||||||||||||||||| |    || |    
T  28793210 gcttcaaatagattgaaacatctccaggaggtgctccttttaaaaacacttcaactgaaaattaagttaggaggtgttagtgagggaattccttatataa 28793309  T
Q  349 aggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 394  Q
    ||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28793310 aggaaaggctacatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgt 28793355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 49 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 27718030 - 27717685
Alignment:
Q  49 ccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtac 148  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| |||||||||     | ||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  27718030 ccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtac 27717931  T
Q  149 tggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 248  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  27717930 tggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattca 27717831  T
Q  249 agtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagtt-aaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcatt 347  Q
    | |   |||||  |||||||||| ||| | || |||||||||| |||| || || |||||   |||||| ||||||||||||||||||||| |    ||     
T  27717830 acttcaaataaattgaaacatcttcagaaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaa-attaagtttggaggtgttagtgagggaattccttatata 27717732  T
Q  348 aaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 394  Q
    |||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27717731 aaggaaaggctacatagaaagaaggttcttttgattcttgatgatgt 27717685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 49 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 27610651 - 27610306
Alignment:
Q  49 ccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtac 148  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| | | || || ||||||||| |||||||||     | ||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  27610651 ccaattaccctgttggattgcagtctcaagtacaagaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtac 27610552  T
Q  149 tggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 248  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  27610551 tggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattca 27610452  T
Q  249 agtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagtt-aaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcatt 347  Q
    | |   |||||  |||||||||| ||||| || |||||||||| |||| || || |||||   |||||| ||||||||||||||||||||| |    ||     
T  27610451 acttcaaataaattgaaacatcttcaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaa-attaagtttggaggtgttagtgagggaattccttatata 27610353  T
Q  348 aaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 394  Q
    |||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27610352 aaggaaaggctacatagaaagaaggttcttttgattcttgatgatgt 27610306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 49 - 394
Target Start/End: Original strand, 27215103 - 27215448
Alignment:
Q  49 ccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtac 148  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||  |    
T  27215103 ccaaacaccctgttggattacatacccaaatacaacaagtaaaattgcttcttgacaagggatctaaggaagaggtccacatggtaggacttcatggagc 27215202  T
Q  149 tggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||| |||||||||  || ||||||  |  |||| | ||||||||||    
T  27215203 tggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttttaatttcattgctgatcagtttgaaggttcatattttctagaagatgtgaaagagaattca 27215302  T
Q  249 agtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcatta 348  Q
    | |   |||||| ||||||| || |||||| |  ||||| | | ||| |||| |||  || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||  || |    
T  27215303 actttaaataacttgaaacacctgcaggaaaagatccttatgaaaacggttagattagacgataagttaggaggtgttagtgaggggattacaaagataa 27215402  T
Q  349 aggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 394  Q
    |  |||  |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27215403 aaaaaatgctatgtcaaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 27215448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 49 - 394
Target Start/End: Original strand, 31285210 - 31285555
Alignment:
Q  49 ccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtac 148  Q
    |||| ||||||||||||||  |||  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||   || |  | | ||| | |||||||||||||||||| |     
T  31285210 ccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtacacatggtaggactttatgggat 31285309  T
Q  149 tggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 248  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||| |||||||||||| ||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  31285310 aggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttattggtgatcaatttgacggattatgttttcttcatgatgtgagagagaattca 31285409  T
Q  249 agtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcatta 348  Q
      | | |||||| ||||||||||||| ||  | |||||||| | |||| ||  |||| |   ||||||||    |||||||||||||||| |||||||||    
T  31285410 gctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgagggaattccaatcatta 31285509  T
Q  349 aggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 394  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31285510 aggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgt 31285555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 394
Target Start/End: Original strand, 28781752 - 28782097
Alignment:
Q  49 ccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtac 148  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||     || | |||  |||  ||| | ||||||||||||||||||||    
T  28781752 ccaattaccctgttggattacagtcccgagtacaacaagtgaaatcgcttcttggtgaaggatatgataatggagtcaggatggtaggactttatggtac 28781851  T
Q  149 tggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  28781852 tggaggcttgggtaaatcaacacttgtaaaagcagtttataacttaattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattca 28781951  T
Q  249 agtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcatta 348  Q
      |   |||||  |||||||||||||||| || |||||||||| | || || || ||||   |||||||||||||||||||||||||||| |    || |    
T  28781952 gcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttttaaaagcacttcaactgaaaattaagttaggaggtgttagtgagggaattccttatataa 28782051  T
Q  349 aggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 394  Q
    ||||||| ||   || |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  28782052 aggaaaggctgcatacaaagaagactcttttgattctcgatgatgt 28782097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 61 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 27604223 - 27603890
Alignment:
Q  61 ttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcatggg 160  Q
    ||||||| ||||| ||| || ||||||||||||  ||||||||     | ||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  27604223 ttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatctcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtactggaggattggg 27604124  T
Q  161 taaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataac 260  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| ||||||||||||  |   |||||     
T  27604123 taaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaa 27604024  T
Q  261 ctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagtt-aaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagacta 359  Q
     |||||||||||||||| || |||||||||| |||| || || |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    || |||||||| ||     
T  27604023 ttgaaacatctccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaa-attaagttaggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctg 27603925  T
Q  360 tctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 394  Q
      |  || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  27603924 cattcaatgaagattcttttgattctcgatgatgt 27603890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 54 - 394
Target Start/End: Original strand, 26803102 - 26803442
Alignment:
Q  54 taccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggag 153  Q
    |||||||||||||| || || ||| || || ||||||||| |||||||||   |||  |||| |||| |||||  ||||| ||| ||||||| | |||||    
T  26803102 taccctgttggattgcactctcgagtacaagaagtgaaatcgcttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttggaatttatgggattggag 26803201  T
Q  154 gcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtca 253  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||    
T  26803202 gcttgggtaaatcagcacttgcaagagcaatctataattttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctca 26803301  T
Q  254 taataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcattaaggaa 353  Q
     |||||| ||||||||||||| ||  | || ||| ||| ||||  |  ||||||    |||||||    |||| ||||||| ||| |||| || ||||||    
T  26803302 aaataacttgaaacatctccaagagaagcttcttctaaaaacaactggattgaaaatcaagttagatcatgtttgtgaggggattccaattataaaggaa 26803401  T
Q  354 agactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 394  Q
    ||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  26803402 agactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatgatgt 26803442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 54 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 27705930 - 27705590
Alignment:
Q  54 taccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggag 153  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||  ||||||||   |||  |||| |||| |||||  ||||| ||| ||| ||| | |||||    
T  27705930 taccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcacttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttggaatttttggcattggag 27705831  T
Q  154 gcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtca 253  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||    
T  27705830 gcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatttataattttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctca 27705731  T
Q  254 taataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcattaaggaa 353  Q
     ||| || ||||||||||||| ||  | || ||| ||| ||||  |  || |||    |||||||    |||| ||||||| ||| || |||| ||||||    
T  27705730 aaatgacttgaaacatctccaagagaagcttcttctaaaaacaactggatcgaaaataaagttagatcatgtttgtgaggggattccattcataaaggaa 27705631  T
Q  354 agactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 394  Q
    || || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27705630 aggctgtgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgt 27705590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 54 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 27427138 - 27426801
Alignment:
Q  54 taccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggag 153  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| |||||||||   |||  |||| |||| |||||  ||||| ||| ||||||| | |||||    
T  27427138 taccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttggaatttatgggattggag 27427039  T
Q  154 gcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtca 253  Q
    ||   ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  | |||||||||||||||  |      
T  27427038 gctcaggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttgaacaagtcagagagaattcagcttc 27426939  T
Q  254 taataacctgaaacatctccaggaagat-ctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcattaagga 352  Q
     |||| | |||||| | |||||| |||| ||||||| ||  ||| || || ||||   |||||||| || ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  27426938 aaatagcttgaaacgtttccagg-agatgctcctttcaaagacacttcaactgaaaattaagttagcagatgtcagtgagggaatctcaatcataaagga 27426840  T
Q  353 aagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatga 391  Q
    |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27426839 aaggttgtgtagaaagaagattcttttgattctcgatga 27426801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 54 - 394
Target Start/End: Original strand, 27679606 - 27679946
Alignment:
Q  54 taccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggag 153  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| |||||||||   ||| || || |||| |||||  ||||| ||| ||||||| | |||||    
T  27679606 taccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgagggatccgatgatggggtccatatggttggaatttatggcattggag 27679705  T
Q  154 gcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtca 253  Q
    |  |||| |||||||||||||||| |  | | |||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||    
T  27679706 gtttggggaaatcaacacttgcaagacaaatctataattttgttgcagatcaattcgaaggttcatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctca 27679805  T
Q  254 taataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcattaaggaa 353  Q
     |||||| ||||| ||||||| ||  | |||||||||| ||||      ||| |   ||||||||    |||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  27679806 aaataacttgaaatatctccaagagaagctccttttaaaaacaacaggtttggaaattaagttagaccatgttagtgagggaattccagtcataaaggaa 27679905  T
Q  354 agactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 394  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27679906 agattatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgt 27679946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 49 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 27698117 - 27697772
Alignment:
Q  49 ccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtac 148  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | | || ||  ||||||||   ||||||| |  || ||||| |||| |||||  ||||| ||| ||| ||| |     
T  27698117 ccaattaccctgttggattacagtctcaagtacaaagagtgaaatcaattcttgataatggatctgatgatggggtccatatggttggaatttttgggat 27698018  T
Q  149 tggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 248  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  27698017 tggaggcttgggaaaatcaacacttgcaagagcaatctataatttggttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttcataatgtgagaatgaattca 27697918  T
Q  249 agtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcatta 348  Q
      | | |||||| || |||||||||| ||  | |||||||| | ||||  |  || | |   ||| ||||    ||||||||| |||||| |||||||||    
T  27697917 gctaaaaataacttggaacatctccaagagaagctcctttttaaaacaactggatcggaaattaatttagaccatgttagtgacggaattccaatcatta 27697818  T
Q  349 aggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 394  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  27697817 aggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgacgatgt 27697772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 54 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 27592547 - 27592207
Alignment:
Q  54 taccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggag 153  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| |||||||||    || |||||  ||| |||||  ||||| ||| ||||||| | |||||    
T  27592547 taccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatgggattggag 27592448  T
Q  154 gcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtca 253  Q
    || |||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| | ||||| ||||  |      
T  27592447 gcttgggaaaatcaacacttgcgaaagcaatttataactttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgaaagagagttcagcttc 27592348  T
Q  254 taataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagtt-aaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcattaagga 352  Q
     |||||| ||||| |||||||| | || |||||||||| |||| || || |||||   |||||||||| ||||||| || |||||| | |  || |||||    
T  27592347 aaataacttgaaaaatctccagcaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaa-attaagttaggaagtgttagcgaaggaattcctaaaataaagga 27592249  T
Q  353 aagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 394  Q
    ||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27592248 aaggctacatggaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 27592207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 54 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 27677146 - 27676806
Alignment:
Q  54 taccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggag 153  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| || ||||| |||||| |||||||||    || |||||  ||| |||||  ||||| ||| ||||||| | |||||    
T  27677146 taccctgttggattgcagtctcgagtacaacaaatgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatgggattggag 27677047  T
Q  154 gcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtca 253  Q
    || |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| | ||||| ||||  |      
T  27677046 gcttgggaaaatcaacacttgcgaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgaaagagagttcagcttc 27676947  T
Q  254 taataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagtt-aaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcattaagga 352  Q
     |||||| ||||| |||||||| | || |||||||||| |||| || || |||||   |||||||||| ||||||| || |||||| | |  || |||||    
T  27676946 aaataacttgaaaaatctccagcaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaa-attaagttaggaagtgttagcgaaggaattcctaaaataaagga 27676848  T
Q  353 aagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 394  Q
    ||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27676847 aaggctacatggaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 27676806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 49 - 248
Target Start/End: Original strand, 26824470 - 26824669
Alignment:
Q  49 ccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtac 148  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||| |  |  ||||| |||| |||||  |||||||||||||| ||||     
T  26824470 ccaaatacccggttggattacagtcccgagtacaacaagtgaaatctcttcttgataacgaatctgatgatgtggtccatatggtaggactttacggtat 26824569  T
Q  149 tggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 248  Q
    ||||||  | ||||||||||||||||||||||||  || ||||| | |||||||| ||||||||| | | ||||||||| | || || ||||||||||||    
T  26824570 tggaggtttaggtaaatcaacacttgcaaaagcaacttttaattctattgctgataaatttgaagttttttgttttcttgagaacgtgagagagaattca 26824669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 49 - 100
Target Start/End: Original strand, 25511589 - 25511640
Alignment:
Q  49 ccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25511589 ccaaataccctgttggattgcagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttct 25511640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 158 - 241
Target Start/End: Original strand, 28140295 - 28140378
Alignment:
Q  158 gggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagaga 241  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||    
T  28140295 gggtaaaacaacacttgcacaagcaatttataattttattgccgatcaatttgaatgtttgtgttttcttcataatgtgagaga 28140378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 28097857 - 28097775
Alignment:
Q  166 caacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 248  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  28097857 caacacttgcaaaagcggtttataatttcattgctggtcaatttgaatgtgtctgtttccttcacaatgtgagagaaaattca 28097775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 235
Target Start/End: Original strand, 26937790 - 26937866
Alignment:
Q  159 ggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgt 235  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  26937790 ggtaaatcaacacttgcacgagcaatttataatttgattggtgatcaatttgaaagtttgtgttttcttcataatgt 26937866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 147 - 212
Target Start/End: Original strand, 26849461 - 26849526
Alignment:
Q  147 actggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaa 212  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  26849461 actggaggaatgggaaaaacaacacttgctcaagcagtttataattcgattgctgatcaatttgaa 26849526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 229
Target Start/End: Original strand, 28243538 - 28243626
Alignment:
Q  141 tatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttca 229  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  28243538 tatgggactggtggaatgggaaagacaacacttgcaagagcagtttataattccatagctgatcaatttgattgtttatgttttcttca 28243626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 166 - 229
Target Start/End: Original strand, 28227720 - 28227783
Alignment:
Q  166 caacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttca 229  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| | || ||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  28227720 caacacttgcaagggcagtttataattttatagccgatcaatttgatggtttgtgttttcttca 28227783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 166 - 229
Target Start/End: Original strand, 28235333 - 28235396
Alignment:
Q  166 caacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttca 229  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||   | |||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  28235333 caacacttgcaagagcagtttataattccatagctgatcaatttgatggtttgtgttttcttca 28235396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 141 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 28297179 - 28297072
Alignment:
Q  141 tatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagag 240  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||  |||||||||| | ||||||||||||||   | || ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |    
T  28297179 tatgggactggagggatgggaaagacaacacttgccagagcagtttataattccatagccgatcaatttgatggtttgtgttttcttcacaatgtaaggg 28297080  T
Q  241 agaattca 248  Q
    | ||||||    
T  28297079 aaaattca 28297072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 141 - 248
Target Start/End: Original strand, 28514894 - 28515001
Alignment:
Q  141 tatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagag 240  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||  |||||||||| | ||||||||||||||   | || ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |    
T  28514894 tatgggactggagggatgggaaagacaacacttgccagagcagtttataattccatagccgatcaatttgatggtttgtgttttcttcacaatgtaaggg 28514993  T
Q  241 agaattca 248  Q
    | ||||||    
T  28514994 aaaattca 28515001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 179 - 249
Target Start/End: Original strand, 26724349 - 26724419
Alignment:
Q  179 agcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaa 249  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  26724349 agcagtttatgatttgattgctgatcaatttgaagggttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcaa 26724419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 166 - 248
Target Start/End: Original strand, 26950511 - 26950593
Alignment:
Q  166 caacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 248  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| |   |||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  26950511 caacacttgctcaagcagtttataacttgattgctaatcaatttgaatgcaaatgttttcttcacaatgtgagagaaaattca 26950593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 212
Target Start/End: Original strand, 26975700 - 26975765
Alignment:
Q  147 actggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaa 212  Q
    ||||| || ||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  26975700 actgggggaatgggtaagacaacacttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaa 26975765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 157 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 29843410 - 29843338
Alignment:
Q  157 tgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttca 229  Q
    |||||||| ||||||||||   |||| ||||||||||  |||||||| |||||||| || | |||||||||||    
T  29843410 tgggtaaaacaacacttgctcgagcaatttataatttgattgctgataaatttgaatgtttgtgttttcttca 29843338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 151; Significance: 9e-80; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 49 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 28127206 - 28126860
Alignment:
Q  49 ccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtac 148  Q
    ||||||| |||||||||||||||  || | || |||||||||| |||||||| || | ||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  28127206 ccaaatatcctgttggattacaggaccaagtacaacaagtgaatttgcttctcgataagggatatgatgatgaggtccacatggtaggactttatggtat 28127107  T
Q  149 tggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  |  |||| ||||||| ||||    
T  28127106 tggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaatttgaaggtttatgttttctagaagatgtgagagagatttca 28127007  T
Q  249 agtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcatta 348  Q
    | ||   ||||  ||||||||||||| ||| | |||||||| | |||||||  |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  28127006 actccatataatttgaaacatctccaagaaaagctccttttgaaaacagttggattggacattaagttaggaggtgttagtgagggaattgcaatcataa 28126907  T
Q  349 aggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgtc 395  Q
    |  |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28126906 aacaaaggctatgcagaaagaagattcttttgattcttgatgatgtc 28126860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 51 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 28163904 - 28163561
Alignment:
Q  51 aaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactg 150  Q
    ||||| |||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||| || | ||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  28163904 aaatatcctgttggattacaatctcaagtacaacaagtgaaattgcttctcgataagggatatgatgatgaggtccacatggtaggactttatgatactg 28163805  T
Q  151 gaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaag 250  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  |  |||| |||||||||||||     
T  28163804 gaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaatttgaaggtttatgttttctagaagatgtgagagagaattcaac 28163705  T
Q  251 tcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcattaag 350  Q
    ||     ||| ||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||| || | ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||     
T  28163704 tccatccaacttgaaacatctccaggaagagctctttttga-aacagttagatcggacattaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaa 28163606  T
Q  351 gaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgtc 395  Q
     |||| |||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  28163605 caaaggctacatagaaataaaattcttttgattcttgatgatgtc 28163561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 49 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 267871 - 267526
Alignment:
Q  49 ccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtac 148  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| | | || |||||||||||||||||||||| |  || ||||| |||| |||||  ||||| ||| ||||||| |     
T  267871 ccaattaccctgttggattatggtctcaagtacaacaagtgaaattgcttcttgataatggatctgatgatggggtccatatggttggaatttatgggat 267772  T
Q  149 tggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 248  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||| |||||     
T  267771 tggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataattttattgctgatcaatttgaaggattatgttttcttcatgatgtgagagaaaattc- 267673  T
Q  249 agtcataa-taacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcatt 347  Q
    ||  |||| |||| ||||||||||||| ||  | |||||||||| ||||  |  |||| |   ||||||||    |||||||||||| ||| ||||||||    
T  267672 agctataagtaacttgaaacatctccaagagaagctccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagaccatgttagtgagggcattccaatcatt 267573  T
Q  348 aaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 394  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  267572 aaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgt 267526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 7)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 49 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 18679087 - 18678742
Alignment:
Q  49 ccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtac 148  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| |||||||||     | ||| | ||||  ||||||||||||||||||||||| |     
T  18679087 ccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaatgatcttatgatggagtccgcatggtaggactttatggcat 18678988  T
Q  149 tggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 248  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  18678987 tggaggcatgggtaaattaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattca 18678888  T
Q  249 agtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcatta 348  Q
      |   ||| |  |||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||  | ||||   |||||||||||||||||||||||||||| |    || |    
T  18678887 gcttcaaatcaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacactttcactgaaaattaagttaggaggtgttagtgagggaattccttatataa 18678788  T
Q  349 aggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 394  Q
    ||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18678787 aggaaaggctacatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgt 18678742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 49 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 18698927 - 18698582
Alignment:
Q  49 ccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtac 148  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||  ||||||||| |  || ||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| |     
T  18698927 ccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaagcgcttcttgataaaggatctgatgatggagtccgcatgttaggactttatggcat 18698828  T
Q  149 tggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  18698827 tggaggcatgggtaaatcaacacttgcgaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattca 18698728  T
Q  249 agtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcatta 348  Q
      |   ||| |  |||||||||||||||| || |||||||||| |||| |   | ||||   |||||||||||||||||||||||||||| |    || |    
T  18698727 gcttcaaatcaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacactagcactgaaaattaagttaggaggtgttagtgagggaattccttatataa 18698628  T
Q  349 aggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 394  Q
    ||||||| ||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18698627 aggaaaggctgcatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgt 18698582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 54 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 18654999 - 18654659
Alignment:
Q  54 taccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggag 153  Q
    ||||||||||| || ||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| |  || ||||| | ||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  18654999 taccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggag 18654900  T
Q  154 gcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtca 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || || |||||| | ||||||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| ||||| ||||||  |      
T  18654899 gcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaattaataattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagaaaattcatcttc 18654800  T
Q  254 taataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcattaaggaa 353  Q
     ||| |  |||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||  | ||||   |||||||||||||||||||||||||||| |    || ||||||    
T  18654799 aaatcaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacactttcactgaaaattaagttaggaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaa 18654700  T
Q  354 agactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 394  Q
    || |||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18654699 aggctacatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgt 18654659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 54 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 18731026 - 18730686
Alignment:
Q  54 taccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggag 153  Q
    ||||||||||| || ||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| |  || ||| | | ||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  18731026 taccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgataaaggatcttatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggag 18730927  T
Q  154 gcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtca 253  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| ||||||||||||  |      
T  18730926 gcatgggaaaatcaacacttgctaaagtaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttc 18730827  T
Q  254 taataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcattaaggaa 353  Q
     ||| |  |||||||||||||||| || |||||||||| |||| |   | ||||   |||||||||||||||||||||||||||| |    || ||||||    
T  18730826 aaatcaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacactagcactgaaaattaagttaggaggtgttagtgagggaattccctatataaaggaa 18730727  T
Q  354 agactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 394  Q
    || |||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18730726 aggctacatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgt 18730686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 54 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 18723607 - 18723267
Alignment:
Q  54 taccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggag 153  Q
    ||||||||||| || ||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| |  || ||| | | ||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  18723607 taccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgataaaggatctaatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggag 18723508  T
Q  154 gcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtca 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||| | || || ||||||||||||  |      
T  18723507 gcatgggaaaatcaacacttgcaaaaggaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaacgtgagagagaattcagcttc 18723408  T
Q  254 taataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcattaaggaa 353  Q
     ||| |  |||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||  | ||||   ||| |||||||||||||||||| ||||| |    || ||| ||    
T  18723407 aaatcaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacactttcactgaaaattaacttaggaggtgttagtgagagaattccttatataaagaaa 18723308  T
Q  354 agactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 394  Q
    || |||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18723307 aggctacatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgt 18723267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 54 - 391
Target Start/End: Original strand, 18074417 - 18074754
Alignment:
Q  54 taccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggag 153  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| |||||||||   |||  |||| |||| |||||  ||||| ||| ||||||| | |||||    
T  18074417 taccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttggaatttatgggattggag 18074516  T
Q  154 gcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtca 253  Q
    ||   ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  | |||||||||||||||  |      
T  18074517 gctcaggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttgaacaagtcagagagaattcagcttc 18074616  T
Q  254 taataacctgaaacatctccaggaagat-ctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcattaagga 352  Q
     |||| | |||||| | |||||| |||| ||||||| ||  ||| || || ||||   |||||||| || ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  18074617 aaatagcttgaaacgtttccagg-agatgctcctttcaaagacacttcaactgaaaattaagttagcagatgtcagtgagggaatctcaatcataaagga 18074715  T
Q  353 aagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatga 391  Q
    |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18074716 aaggttgtgtagaaagaagattcttttgattctcgatga 18074754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 5090392 - 5090284
Alignment:
Q  141 tatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagag 240  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||| || | ||||||||||  ||||| ||||    
T  5090392 tatgggactggaggaatgggtaaaaccacacttggaaaagcaatttacaatttcattgctcatcaatttgaatgtctttgttttcttcccaatgtgagag 5090293  T
Q  241 agaattcaa 249  Q
    | |||||||    
T  5090292 aaaattcaa 5090284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 49 - 394
Target Start/End: Original strand, 8138 - 8483
Alignment:
Q  49 ccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtac 148  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||| |||||||||    || ||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  8138 ccaattaccctgttggattacagtctcgagtacaacatgtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtac 8237  T
Q  149 tggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  8238 tggaggcttgggtaaatcaacacttggaaaagcaatttataattttatttctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattca 8337  T
Q  249 agtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcatta 348  Q
      |   |||||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||| || ||  |||   |||||||||| ||||||||||||||||| |    || |    
T  8338 gcttcaaataaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacacttcaacagaaaactaagttaggaagtgttagtgagggaattccttatataa 8437  T
Q  349 aggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 394  Q
    ||||||| ||   || |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  8438 aggaaaggctgcatacaaagaagactcttttgattctcgatgatgt 8483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 49 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 13206 - 12861
Alignment:
Q  49 ccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtac 148  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||| |||||||||    || ||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  13206 ccaattaccctgttggattacagtctcgagtacaacatgtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtac 13107  T
Q  149 tggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  13106 tggaggcttgggtaaatcaacacttggaaaagcaatttataattttatttctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattca 13007  T
Q  249 agtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcatta 348  Q
      |   |||||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||| || ||  |||   |||||||||| ||||||||||||||||| |    || |    
T  13006 gcttcaaataaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacacttcaacagaaaactaagttaggaagtgttagtgagggaattccttatataa 12907  T
Q  349 aggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 394  Q
    ||||||| ||   || |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  12906 aggaaaggctgcatacaaagaagactcttttgattctcgatgatgt 12861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 49 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 4243 - 3898
Alignment:
Q  49 ccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtac 148  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||| |||||||||    || |||||  |||  | || |||||||||||||||||||||    
T  4243 ccaattaccctgttggattacagtctcgagtacaacatgtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatcatggagcccacatggtaggactttatggtac 4144  T
Q  149 tggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |   |||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  4143 tggaggcttgggtaaatcaacacttggaaaagcaatttataattttattgctgatgaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattca 4044  T
Q  249 agtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagtt-aaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcatt 347  Q
      |   |||||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||| || || |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    ||     
T  4043 gcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaa-attaagttaggaggtgttagtgagggaatttctcatata 3945  T
Q  348 aaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 394  Q
    |||||||| ||   |  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3944 aaggaaaggctgcattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgt 3898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 49 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 3070 - 2725
Alignment:
Q  49 ccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtac 148  Q
    |||| |||||||||||| |  |||| ||| || |||||||||||| |||||||||     | ||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  3070 ccaattaccctgttggaatgaagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtac 2971  T
Q  149 tggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 248  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  2970 tggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattca 2871  T
Q  249 agtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagtt-aaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcatt 347  Q
      |   |||||  |||||||||| |||   || |||||||||| |||| || || |||||   |||||| ||||||||||||||||||||| |    ||     
T  2870 gcttcaaataaattgaaacatcttcagttggagctccttttaaaaacacttcaacttgaa-attaagtttggaggtgttagtgagggaattccttatata 2772  T
Q  348 aaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 394  Q
    |||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2771 aaggaaaggctacatagaaagaaggttcttttgattcttgatgatgt 2725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 49 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 29273369 - 29273024
Alignment:
Q  49 ccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtac 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||| |||| ||||||||| |  || ||||| |||| | |||  ||||| ||| ||||||| |     
T  29273369 ccaaataccctgttggattacagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggttggaatttatgggat 29273270  T
Q  149 tggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 248  Q
    ||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  29273269 tggtggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataatttttttgctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatgtgagagagaattca 29273170  T
Q  249 agtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcatta 348  Q
      | | |||||| ||||||||||||| ||  | |||||||||| ||||  |  |||| |   ||||||||    |||||||||||| ||| |||| || |    
T  29273169 gctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgaggggattccaattataa 29273070  T
Q  349 aggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 394  Q
    |||| || |||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  29273069 aggagaggctaagtagaaagaaaattcttttgattctcgatgatgt 29273024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 54 - 391
Target Start/End: Original strand, 60225 - 60562
Alignment:
Q  54 taccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggag 153  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| |||||||||   |||  |||| |||| |||||  ||||| ||| ||||||| | |||||    
T  60225 taccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttggaatttatgggattggag 60324  T
Q  154 gcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtca 253  Q
    ||   ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  | |||||||||||||||  |      
T  60325 gctcaggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttgaacaagtcagagagaattcagcttc 60424  T
Q  254 taataacctgaaacatctccaggaagat-ctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcattaagga 352  Q
     |||| | |||||| | |||||| |||| ||||||| ||  ||| || || ||||   |||||||| || ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  60425 aaatagcttgaaacgtttccagg-agatgctcctttcaaagacacttcaactgaaaattaagttagcagatgtcagtgagggaatctcaatcataaagga 60523  T
Q  353 aagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatga 391  Q
    |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  60524 aaggttgtgtagaaagaagattcttttgattctcgatga 60562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 149 - 248
Target Start/End: Original strand, 3280410 - 3280509
Alignment:
Q  149 tggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 248  Q
    |||||| ||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  3280410 tggaggaatgggtaagacaactcttgcaagagcagtttataatttcattgctaatcaatttgaatgtgtatgttttcttcacaatgtgagagaaaattca 3280509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 17992652 - 17992547
Alignment:
Q  143 tggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagag 242  Q
    ||||||||| || ||||| ||  |||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||   ||||| ||||| ||||| |||||     
T  17992652 tggtactggtggaatgggcaagacaactcttgctcaagcagtttataatttggttgctaatcaatttcaatgtaagtgtttccttcacaatgtgagagaa 17992553  T
Q  243 aattca 248  Q
    ||||||    
T  17992552 aattca 17992547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 149 - 248
Target Start/End: Original strand, 16691618 - 16691717
Alignment:
Q  149 tggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 248  Q
    |||||| || |||||| ||||||||||   |||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || | |||||||||||| | || ||||| ||||||    
T  16691618 tggaggaatcggtaaaacaacacttgctcgagcaatttataatttgattgctgatcaatttgaatgtttgtgttttcttcatgacgtgagagaaaattca 16691717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 229
Target Start/End: Original strand, 43700 - 43788
Alignment:
Q  141 tatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttca 229  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  43700 tatgggactggtggaatgggaaagacaacacttgcaagagcagtttataattccatagctgatcaatttgattgtttatgttttcttca 43788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 166 - 229
Target Start/End: Original strand, 28218 - 28281
Alignment:
Q  166 caacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttca 229  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| | || ||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  28218 caacacttgcaagggcagtttataattttatagccgatcaatttgatggtttgtgttttcttca 28281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 166 - 229
Target Start/End: Original strand, 35495 - 35558
Alignment:
Q  166 caacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttca 229  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||   | |||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  35495 caacacttgcaagagcagtttataattccatagctgatcaatttgatggtttgtgttttcttca 35558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University