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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6403_low_10 (Length: 305)

Name: NF6403_low_10
Description: NF6403
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6403_low_10
NF6403_low_10
[»] chr4 (43 HSPs)
chr4 (5-289)||(24477435-24477719)
chr4 (10-267)||(24421224-24421481)
chr4 (10-267)||(24470242-24470499)
chr4 (5-254)||(24470429-24470678)
chr4 (175-289)||(24421298-24421412)
chr4 (175-289)||(24470311-24470425)
chr4 (79-221)||(24477407-24477549)
chr4 (175-289)||(24470503-24470617)
chr4 (5-263)||(24470765-24471022)
chr4 (73-263)||(24420604-24420794)
chr4 (16-266)||(24470536-24470786)
chr4 (10-267)||(24421080-24421337)
chr4 (5-260)||(24421039-24421294)
chr4 (16-266)||(24420937-24421187)
chr4 (22-239)||(24470686-24470902)
chr4 (25-260)||(24420895-24421130)
chr4 (5-239)||(24420724-24420958)
chr4 (10-260)||(24470578-24470828)
chr4 (10-267)||(24470386-24470643)
chr4 (22-266)||(24420553-24420797)
chr4 (10-254)||(24420805-24421049)
chr4 (10-267)||(24420984-24421241)
chr4 (5-224)||(24420499-24420718)
chr4 (10-267)||(24420648-24420905)
chr4 (10-267)||(24420744-24421001)
chr4 (16-267)||(24470488-24470739)
chr4 (16-267)||(24470728-24470978)
chr4 (20-263)||(24470971-24471214)
chr4 (10-266)||(24470818-24471073)
chr4 (154-245)||(24476978-24477069)
chr4 (217-267)||(24477004-24477054)
chr4 (10-263)||(24420508-24420761)
chr4 (7-83)||(24481484-24481559)
chr4 (199-267)||(24481492-24481559)
chr4 (174-226)||(24482195-24482247)
chr4 (174-268)||(24406392-24406486)
chr4 (174-268)||(24406494-24406588)
chr4 (118-260)||(24477197-24477339)
chr4 (73-134)||(24476993-24477054)
chr4 (202-266)||(24477092-24477156)
chr4 (5-65)||(24481334-24481394)
chr4 (49-89)||(24481852-24481892)
chr4 (50-90)||(24482157-24482197)
[»] scaffold0879 (8 HSPs)
scaffold0879 (148-267)||(4431-4550)
scaffold0879 (10-267)||(4437-4694)
scaffold0879 (5-260)||(4480-4735)
scaffold0879 (16-266)||(4587-4837)
scaffold0879 (25-245)||(4644-4864)
scaffold0879 (10-267)||(4533-4790)
scaffold0879 (238-289)||(4425-4476)
scaffold0879 (10-131)||(4725-4846)
[»] chr2 (12 HSPs)
chr2 (20-267)||(41900009-41900256)
chr2 (10-226)||(41899954-41900170)
chr2 (7-86)||(41899950-41900029)
chr2 (16-221)||(41900295-41900500)
chr2 (14-258)||(41899826-41900070)
chr2 (174-266)||(41900538-41900630)
chr2 (175-266)||(41900346-41900437)
chr2 (20-189)||(41900279-41900448)
chr2 (28-143)||(41900517-41900632)
chr2 (175-267)||(41900297-41900389)
chr2 (10-77)||(41900295-41900362)
chr2 (174-267)||(41899961-41900054)
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (25-206)||(11879445-11879626)
chr1 (175-287)||(11879499-11879611)
chr1 (175-267)||(11879451-11879543)
chr1 (5-161)||(11902069-11902225)
chr1 (5-86)||(11879473-11879554)
chr1 (25-66)||(11902377-11902418)
chr1 (175-245)||(11902047-11902117)
chr1 (175-245)||(11902095-11902165)
chr1 (7-92)||(11901906-11901991)
chr1 (178-221)||(11879694-11879737)
chr1 (175-224)||(52821380-52821429)
chr1 (25-53)||(11879685-11879713)
chr1 (175-259)||(11901930-11902014)
chr1 (25-89)||(52821035-52821099)
chr1 (178-254)||(52821302-52821378)
[»] scaffold1918 (2 HSPs)
scaffold1918 (174-209)||(16-51)
scaffold1918 (178-259)||(425-506)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 43)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 5 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 24477719 - 24477435
Alignment:
Q  5 caccaccaccttatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccaccttctccatatgtgtacaagtccccaccacctccatctctctctcctcc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24477719 caccaccaccttatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccacctcctccatatgtgtacaagtccccaccacctccatctctctctcctcc 24477620  T
Q  105 gcctccacatgtctacaaatcaccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24477619 gcctccacatgtctacaaatcaccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacct 24477520  T
Q  205 ccatatgtctacaagtcaccacgtcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccactaccttctccat 289  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24477519 ccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctcctctaccttctccat 24477435  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 24421481 - 24421224
Alignment:
Q  10 ccaccttatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccaccttctccatatgtgtacaagtccccaccacctccatctctctctcctccgcctc 109  Q
    |||||||||  ||| || ||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  24421481 ccaccttattactacaaatctccacctccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctc 24421382  T
Q  110 cacatgtctacaaatcaccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacctccata 209  Q
    || |||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  24421381 catatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccata 24421282  T
Q  210 tgtctacaagtcaccacgtcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaag 267  Q
    |||||||||||| || | ||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  24421281 tgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccaccttatgtttacaag 24421224  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 267
Target Start/End: Original strand, 24470242 - 24470499
Alignment:
Q  10 ccaccttatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccaccttctccatatgtgtacaagtccccaccacctccatctctctctcctccgcctc 109  Q
    |||||||||  ||| || ||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  24470242 ccaccttattactacaaatctccacctccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctc 24470341  T
Q  110 cacatgtctacaaatcaccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacctccata 209  Q
    || |||||||||| |||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  24470342 catatgtctacaagtcaccacctcctccatcaccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccata 24470441  T
Q  210 tgtctacaagtcaccacgtcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaag 267  Q
    |||||||||||| || | ||| ||| | || ||||||||||| || ||||| ||||||    
T  24470442 tgtctacaagtctcctcctccaccaacaccctcacctcccccgccctatgtttacaag 24470499  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Original strand, 24470429 - 24470678
Alignment:
Q  5 caccaccaccttatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccaccttctccatatgtgtacaagtccccaccacctccatctctctctcctcc 104  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||| ||  | || ||||| |||||||| ||||||||||| || |  || |||||    
T  24470429 caccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccaacaccctcacctcccccgccctatgtttacaagtcaccaccacctccttccccttcacctcc 24470528  T
Q  105 gcctccacatgtctacaaatcaccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacct 204  Q
     |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  24470529 tcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacct 24470628  T
Q  205 ccatatgtctacaagtcaccacgtcctccatctccttcacctcccccacc 254  Q
    ||||||||||||||||| || | ||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  24470629 ccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccttctcctcccccacc 24470678  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 175 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 24421412 - 24421298
Alignment:
Q  175 ccaccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtctacaagtcaccacgtcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctc 274  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  24421412 ccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccac 24421313  T
Q  275 cactaccttctccat 289  Q
    ||| ||| |||||||    
T  24421312 caccaccctctccat 24421298  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 175 - 289
Target Start/End: Original strand, 24470311 - 24470425
Alignment:
Q  175 ccaccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtctacaagtcaccacgtcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctc 274  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  24470311 ccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatcaccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccac 24470410  T
Q  275 cactaccttctccat 289  Q
    ||| ||| |||||||    
T  24470411 caccaccctctccat 24470425  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 79 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24477549 - 24477407
Alignment:
Q  79 ccaccacctccatctctctctcctccgcctccacatgtctacaaatcaccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccac 178  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  24477549 ccaccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctc 24477450  T
Q  179 caccaccatctccctcacctccacctccatatgtctacaagtc 221  Q
    | | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24477449 ctctaccttctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtc 24477407  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 175 - 289
Target Start/End: Original strand, 24470503 - 24470617
Alignment:
Q  175 ccaccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtctacaagtcaccacgtcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctc 274  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  24470503 ccaccacctccttccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccac 24470602  T
Q  275 cactaccttctccat 289  Q
    ||| ||| |||||||    
T  24470603 caccaccctctccat 24470617  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 263
Target Start/End: Original strand, 24470765 - 24471022
Alignment:
Q  5 caccaccaccttatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccaccttctccatatgtgtacaagtccccaccacctccatctctctctcctcc 104  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| || ||||| ||| | |||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  24470765 caccaccaccatatgtctacaaatctccacccccaccatcaccttcaccccctccaccatatgtatataagtcaccacctcctccatctccctctcctcc 24470864  T
Q  105 gcctccacatgtctacaaatcaccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacct 204  Q
     || ||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||| | ||| || || ||||| || ||||||   || || ||| ||||||| ||||| || |||    
T  24470865 -ccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataagtcacctcctccagcatctccttcaccacctcct 24470963  T
Q  205 ccatatgtctacaagtcaccacgtcctccatctccttcacctcccccaccatatgtcta 263  Q
    |||||| |||||||||||||||  || ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  24470964 ccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatacgtcta 24471022  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 73 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 24420794 - 24420604
Alignment:
Q  73 aagtccccaccacctccatctctctctcctccgcctccacatgtctacaaatcaccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatgtctataaga 172  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||| | ||| || || ||||| || |||||      
T  24420794 aagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaat 24420695  T
Q  173 gtccaccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtctacaagtcaccacgtcctccatctccttcacctcccccaccatatgtcta 263  Q
     ||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||  || ||||| |||||||| || || |||||||||||    
T  24420694 ctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccacctccatatgtcta 24420604  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 266
Target Start/End: Original strand, 24470536 - 24470786
Alignment:
Q  16 tatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccaccttctccatatgtgtacaagtccccaccacctccatctctctctcctccgcctccacatg 115  Q
    |||||||| ||||| || || || |||||||| ||||| ||  | |||||||| || |||   |||||||| || ||||  || || || |||||| |||    
T  24470536 tatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatg 24470635  T
Q  116 tctacaaatcaccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtcta 215  Q
    ||||||| || || ||||| || || ||||  ||||||||||| ||| | ||||||   |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  24470636 tctacaagtctcctcctccaccatcaccttctcctcccccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccttcacctcctcctccatatgtcta 24470735  T
Q  216 caagtcaccacgtcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaa 266  Q
    ||||||||||| ||| ||||| || || || || |||||||||||||||||    
T  24470736 caagtcaccacctccaccatccccatctccaccaccaccatatgtctacaa 24470786  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 24421337 - 24421080
Alignment:
Q  10 ccaccttatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccaccttctccatatgtgtacaagtccccaccacctccatctctctctcctccgcctc 109  Q
    ||||| ||||||||||||  ||| |||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| || || || ||||| | ||| ||||| || |    
T  24421337 ccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccac 24421238  T
Q  110 cacatgtctacaaatcaccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacctccata 209  Q
    |  |||| ||||| |||||||| ||||| || ||||  ||||| || ||||||||||| |||   |||||||||||||| || || || |||||||||||    
T  24421237 cttatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccata 24421138  T
Q  210 tgtctacaagtcaccacgtcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaag 267  Q
    | | |||||||| ||||  || ||||| || ||||| || ||||||||| | ||||||    
T  24421137 tatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccatatatatacaag 24421080  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 24421294 - 24421039
Alignment:
Q  5 caccaccaccttatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccaccttctccatatgtgtacaagtccccaccacctccatctctctctcctcc 104  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||  | || ||||| |||||||| |||||||||||||| |  || |||||    
T  24421294 caccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccaccttatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcc 24421195  T
Q  105 gcctccacatgtctacaaatcaccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacct 204  Q
     |||||| |||||||||| |||||||| || || || || |  || || || |||||| | || |||   |||||||||||||| || ||||| || ||     
T  24421194 tcctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatatatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctcca 24421095  T
Q  205 ccatatgtctacaagtcaccacgtcctccatctccttcacctcccccaccatatgt 260  Q
    |||||| | |||||||| || | ||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  24421094 ccatatatatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgt 24421039  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 24421187 - 24420937
Alignment:
Q  16 tatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccaccttctccatatgtgtacaagtccccaccacctccatctctctctcctccgcctccacatg 115  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||  |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |  || || || || ||| ||     
T  24421187 tatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatatatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccatata 24421088  T
Q  116 tctacaaatcaccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtcta 215  Q
    | ||||| || || ||||| || || || | |||||||||||||||||| |||||    |||||||| |||||||| || || || || |||||||||||    
T  24421087 tatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgtatataaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtcta 24420988  T
Q  216 caagtcaccacgtcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaa 266  Q
    ||||||||||| ||| ||||| || || || || || ||||||||||||||    
T  24420987 caagtcaccacctccaccatccccatctccaccacctccatatgtctacaa 24420937  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 239
Target Start/End: Original strand, 24470686 - 24470902
Alignment:
Q  22 tataagtctcctccaccaccatctccctcaccaccttctccatatgtgtacaagtccccaccacctccatctctctctcctccgcctccacatgtctaca 121  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |  ||||| || || ||| |||||||||    
T  24470686 tataagtcgccaccacctccatctccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccaccaccatatgtctaca 24470785  T
Q  122 aatcaccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtctacaagtc 221  Q
    |||| ||||| || || || ||||  || || ||||||||||| ||||||   ||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  24470786 aatctccacccccaccatcaccttcaccccctccaccatatgtatataagtcaccacctcctccatctccctctcctcc-ccaccatatgtttacaagtc 24470884  T
Q  222 accacgtcctccatctcc 239  Q
    ||||| ||| || |||||    
T  24470885 accacctccaccgtctcc 24470902  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 24421130 - 24420895
Alignment:
Q  25 aagtctcctccaccaccatctccctcaccaccttctccatatgtgtacaagtccccaccacctccatctctctctcctccgcctccacatgtctacaaat 124  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||| ||| | |||||| | |||||||| || || || ||||| | ||| ||||| || ||| |||| || ||||    
T  24421130 aagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccatatatatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgtatataaat 24421031  T
Q  125 caccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtctacaagtcacc 224  Q
    ||||||| || || ||||| | ||| || |||||||||||||| |||   ||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||    
T  24421030 caccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccacctccatatgtctacaaatctcc 24420931  T
Q  225 acgtcctccatctccttcacctcccccaccatatgt 260  Q
    ||  || ||||| |||||||| || |||||||||||    
T  24420930 acccccaccatcaccttcaccccctccaccatatgt 24420895  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 24420958 - 24420724
Alignment:
Q  5 caccaccaccttatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccaccttctccatatgtgtacaagtccccaccacctccatctctctctcctcc 104  Q
    ||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| || ||||| ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| || |  || |||||    
T  24420958 caccacctccatatgtctacaaatctccacccccaccatcaccttcaccccctccaccatatgtatataagtcaccaccacctccttccccttcccctcc 24420859  T
Q  105 gcctccacatgtctacaaatcaccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacct 204  Q
     |||||| |||| ||||| || ||||| || || || ||||  ||||| ||||| ||| | ||||||   |||||||| ||||||||||| ||||| ||     
T  24420858 tcctccatatgtttacaagtccccacccccaccatcaccttctcctcctccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctccccca 24420759  T
Q  205 ccatatgtctacaagtcaccacgtcctccatctcc 239  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| || |||||    
T  24420758 ccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctcc 24420724  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Original strand, 24470578 - 24470828
Alignment:
Q  10 ccaccttatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccaccttctccatatgtgtacaagtccccaccacctccatctctctctcctccgcctc 109  Q
    ||||| ||||||||||||  ||| |||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| || || || ||||| |  |||||||| || |    
T  24470578 ccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccttctcctcccccac 24470677  T
Q  110 cacatgtctacaaatcaccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacctccata 209  Q
    |  || | || || || ||||| ||||| |||||||  ||||| || ||||||||||| |||   ||||| |||||||| || || || ||||| |||||    
T  24470678 cctatatttataagtcgccaccacctccatctccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccaccaccata 24470777  T
Q  210 tgtctacaagtcaccacgtcctccatctccttcacctcccccaccatatgt 260  Q
    ||||||||| || ||||  || ||||| |||||||| || |||||||||||    
T  24470778 tgtctacaaatctccacccccaccatcaccttcaccccctccaccatatgt 24470828  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 267
Target Start/End: Original strand, 24470386 - 24470643
Alignment:
Q  10 ccaccttatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccaccttctccatatgtgtacaagtccccaccacctccatctctctctcctccgcctc 109  Q
    ||||| ||||||||||||  ||| |||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| || || || ||| | | ||| ||||| || |    
T  24470386 ccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccaacaccctcacctcccccgc 24470485  T
Q  110 cacatgtctacaaatcaccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacctccata 209  Q
    |  |||| ||||| |||||||| ||||| || ||||  ||||| || ||||||||||| |||   ||||| || |||||||| |||||||| || |||||    
T  24470486 cctatgtttacaagtcaccaccacctccttccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccata 24470585  T
Q  210 tgtctacaagtcaccacgtcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaag 267  Q
    |||||| |||   ||||  || || ||||| ||||| || || |||||||||||||||    
T  24470586 tgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaag 24470643  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 24420797 - 24420553
Alignment:
Q  22 tataagtctcctccaccaccatctccctcaccaccttctccatatgtgtacaagtccccaccacctccatctctctctcctccgcctccacatgtctaca 121  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||| || ||  | |||||||| |||||||| ||||| || || ||||  || || || |||||| | || || |    
T  24420797 tataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttata 24420698  T
Q  122 aatcaccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtctacaagtc 221  Q
    |||| || ||||| || |||||||  || || || |||||| |||| |||   |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24420697 aatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccacctccatatgtctataagtc 24420598  T
Q  222 accacgtcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaa 266  Q
     || | |||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||    
T  24420597 ccctcctcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaa 24420553  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24421049 - 24420805
Alignment:
Q  10 ccaccttatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccaccttctccatatgtgtacaagtccccaccacctccatctctctctcctccgcctc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| || || ||||| |||||||| || || ||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |  ||||| || ||||    
T  24421049 ccaccatatgtatataaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccacctc 24420950  T
Q  110 cacatgtctacaaatcaccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacctccata 209  Q
    || ||||||||||||| ||||| || || || ||||  || || ||||||||||| ||||||   |||||||| || || || || ||||| ||||||||    
T  24420949 catatgtctacaaatctccacccccaccatcaccttcaccccctccaccatatgtatataagtcaccaccacctccttccccttcccctcctcctccata 24420850  T
Q  210 tgtctacaagtcaccacgtcctccatctccttcacctcccccacc 254  Q
    ||| |||||||| ||||  || ||||| ||||| ||||| |||||    
T  24420849 tgtttacaagtccccacccccaccatcaccttctcctcctccacc 24420805  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 24421241 - 24420984
Alignment:
Q  10 ccaccttatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccaccttctccatatgtgtacaagtccccaccacctccatctctctctcctccgcctc 109  Q
    ||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |  ||||| || ||||    
T  24421241 ccaccttatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctc 24421142  T
Q  110 cacatgtctacaaatcaccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacctccata 209  Q
    || || | ||||| || ||||| || || || || |  || || ||||||||| | || |||  ||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  24421141 catatatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccatatatatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccata 24421042  T
Q  210 tgtctacaagtcaccacgtcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaag 267  Q
    ||| || || |||||||  || |||||||| || || || ||||||||||||||||||    
T  24421041 tgtatataaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtctacaag 24420984  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24420718 - 24420499
Alignment:
Q  5 caccaccaccttatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccaccttctccatatgtgtacaagtccccaccacctccatctctctctcctcc 104  Q
    ||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |  || || ||    
T  24420718 caccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccacc 24420619  T
Q  105 gcctccacatgtctacaaatcaccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacct 204  Q
     |||||| ||||||| || || || |||||||| |||||||  || || || |||||||| || ||   ||| || ||||||||||| ||||| || ||     
T  24420618 acctccatatgtctataagtcccctcctcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctcctcccccaccatctccttcaccccctcca 24420519  T
Q  205 ccatatgtctacaagtcacc 224  Q
    || |||||||| ||||||||    
T  24420518 ccctatgtctataagtcacc 24420499  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 24420905 - 24420648
Alignment:
Q  10 ccaccttatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccaccttctccatatgtgtacaagtccccaccacctccatctctctctcctccgcctc 109  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||| || || || || || ||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||| |  |||||||| || |    
T  24420905 ccaccatatgtatataagtcaccaccacctccttccccttcccctcctcctccatatgtttacaagtccccacccccaccatcaccttctcctcctccac 24420806  T
Q  110 cacatgtctacaaatcaccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacctccata 209  Q
    |  || | || || || ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||    
T  24420805 cctatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccata 24420706  T
Q  210 tgtctacaagtcaccacgtcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaag 267  Q
     || || || || || | ||| |||||||||||||| || || |||||| ||||||||    
T  24420705 cgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaag 24420648  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 24421001 - 24420744
Alignment:
Q  10 ccaccttatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccaccttctccatatgtgtacaagtccccaccacctccatctctctctcctccgcctc 109  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || |||||||| || || |||||  |||||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  || || || || |    
T  24421001 ccaccatatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccacctccatatgtctacaaatctccacccccaccatcaccttcaccccctccac 24420902  T
Q  110 cacatgtctacaaatcaccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacctccata 209  Q
    || |||| || || |||||||| ||||| || |||| |||||| || |||||||| || |||   ||||| |||||||| || || ||||| || || ||    
T  24420901 catatgtatataagtcaccaccacctccttccccttcccctcctcctccatatgtttacaagtccccacccccaccatcaccttctcctcctccacccta 24420802  T
Q  210 tgtctacaagtcaccacgtcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaag 267  Q
    | | || ||||| ||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  24420801 tatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaag 24420744  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 267
Target Start/End: Original strand, 24470488 - 24470739
Alignment:
Q  16 tatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccaccttctccatatgtgtacaagtccccaccacctccatctctctctcctccgcctccacatg 115  Q
    ||||| || ||||| || ||||| || || || ||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  || ||||| || ||| |||    
T  24470488 tatgtttacaagtcaccaccacctccttccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatg 24470587  T
Q  116 tctacaaatcaccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtcta 215  Q
    |||| ||    ||||| || || ||||| |  || || || ||||||||||| |||  ||| || |||||||| || || ||||| || || ||| | ||    
T  24470588 tctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccttctcctcccccaccctatattta 24470687  T
Q  216 caagtcaccacgtcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaag 267  Q
     ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  24470688 taagtcgccaccacctccatctccttcacctcctcctccatatgtctacaag 24470739  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 267
Target Start/End: Original strand, 24470728 - 24470978
Alignment:
Q  16 tatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccaccttctccatatgtgtacaagtccccaccacctccatctctctctcctccgcctccacatg 115  Q
    |||||||| ||||| || || |||||||| || || |||||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  || || || || ||| |||    
T  24470728 tatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccaccaccatatgtctacaaatctccacccccaccatcaccttcaccccctccaccatatg 24470827  T
Q  116 tctacaaatcaccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtcta 215  Q
    | || || |||||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || ||    
T  24470828 tatataagtcaccacctcctccatctccctctcctcccc-accatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgttta 24470926  T
Q  216 caagtcaccacgtcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaag 267  Q
     |||||||| | |||  ||||||||||||| || || |||||| ||||||||    
T  24470927 taagtcacctcctccagcatctccttcaccacctcctccatatatctacaag 24470978  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 263
Target Start/End: Original strand, 24470971 - 24471214
Alignment:
Q  20 tctataagtctcctccaccaccatctccctcaccaccttctccatatgtgtacaagtccccaccacctccatctctctctcctccgcctccacatgtcta 119  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||  ||||||| || || |||||||| || ||||| ||||  || || || |||||| |||| ||    
T  24470971 tctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatacgtctataagtcccctcctcctccttctccttcaccccctcctccatatgttta 24471070  T
Q  120 caaatcaccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtctacaag 219  Q
    |||||| || || || || |||||||  ||||| ||||| |||||| |||||   || ||||| || ||  | ||||| || ||||||||   ||||||     
T  24471071 caaatctcctcccccaccatctccttcacctcctccaccctatgtccataagtcacctccacctccttcagcttcaccacctcctccatactactacaaa 24471170  T
Q  220 tcaccacgtcctccatctccttcacctcccccaccatatgtcta 263  Q
    || |||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  24471171 tctccacctccaccttctccatcacctcctccaccatatgtcta 24471214  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 266
Target Start/End: Original strand, 24470818 - 24471073
Alignment:
Q  10 ccaccttatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccaccttctccatatgtgtacaagtccccaccacctccatctctctctcctccgcctc 109  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||||| || ||  | |||||||| |||||||| ||||| || || ||||  || || || ||||    
T  24470818 ccaccatatgtatataagtcaccacctcctccatctccctctcctccc-caccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctc 24470916  T
Q  110 cacatgtctacaaatcaccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacctccata 209  Q
    || | || || || ||||| |||||  | |||||||  || || || |||||| |||| |||   |||||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  24470917 catacgtttataagtcacctcctccagcatctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccata 24471016  T
Q  210 tgtctacaagtcaccacgtcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaa 266  Q
     ||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||    
T  24471017 cgtctataagtcccctcctcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaa 24471073  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 24477069 - 24476978
Alignment:
Q  154 ccaccatatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtctacaagtcaccacgtcctccatctccttcacc 245  Q
    ||||||||| | ||||||   ||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  24477069 ccaccatatctatataagtcaccacctcctccatctccctctcctcccccaccatatgtatacaagtcaccacctccaccatctacttcacc 24476978  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 24477054 - 24477004
Alignment:
Q  217 aagtcaccacgtcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaag 267  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  24477054 aagtcaccacctcctccatctccctctcctcccccaccatatgtatacaag 24477004  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 24420761 - 24420508
Alignment:
Q  10 ccaccttatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccaccttctccatatgtgtacaagtccccaccacctccatctctctctcctccgcctc 109  Q
    ||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||||| || |||||  ||||||| || || || || || || || |||||||  || || |||||||    
T  24420761 ccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctc 24420662  T
Q  110 cacatgtctacaaatcaccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacctccata 209  Q
    || || ||||||| |||||||| || || || ||||  || || || |||||||||||||||   || || || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  24420661 catatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccacctccatatgtctataagtcccctcctcctccttctccttcaccccctcctccata 24420562  T
Q  210 tgtctacaagtcaccacgtcctccatctccttcacctcccccaccatatgtcta 263  Q
    ||| ||||| || || |  || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  24420561 tgtttacaaatctcctcccccaccatctccttcaccccctccaccctatgtcta 24420508  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 24481559 - 24481484
Alignment:
Q  7 ccaccaccttatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccaccttctccatatgtgtacaagtccccacc 83  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | |||||||| |||||||| |||||    
T  24481559 ccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatctccatcaccacc-ccaccatatgtatacaagtcgccacc 24481484  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 24481559 - 24481492
Alignment:
Q  199 ccacctccatatgtctacaagtcaccacgtcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaag 267  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||    
T  24481559 ccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatctccatcacc-accccaccatatgtatacaag 24481492  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24482247 - 24482195
Alignment:
Q  174 tccaccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtctacaagtcaccac 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||    
T  24482247 tccaccaccaccatctccatcaccaccacctccttatgtctataaatcaccac 24482195  T

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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 24406486 - 24406392
Alignment:
Q  174 tccaccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtctacaagtcaccacgtcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaaga 268  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||  ||||||||||  ||||| || |||||||| || || || ||| |||||||||    
T  24406486 tccacctccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccaccacctccttcgccttcaccgccacctccttatatctacaaga 24406392  T

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Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 24406588 - 24406494
Alignment:
Q  174 tccaccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtctacaagtcaccacgtcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaaga 268  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||  ||||||||||  ||||| || |||||||| || || || ||| |||||||||    
T  24406588 tccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccaccacctccttcgccttcaccgccacctccttatatctacaaga 24406494  T

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Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 24477339 - 24477197
Alignment:
Q  118 tacaaatcaccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtctaca 217  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||  |||| |||||||| |||   ||||||||||| || | |||||| || || |||||||| || |    
T  24477339 tacaaatcaccaccacctccatccccttcccctccttcaccttatgtctacaagtccccaccaccaccgtcacactcaccccctccaccatatgtatata 24477240  T
Q  218 agtcaccacgtcctccatctccttcacctcccccaccatatgt 260  Q
    |||| |  | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  24477239 agtctcttcctccaccatcaccctctcctcccccaccgtatgt 24477197  T

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Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 24477054 - 24476993
Alignment:
Q  73 aagtccccaccacctccatctctctctcctccgcctccacatgtctacaaatcaccacctcc 134  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||||||| || ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  24477054 aagtcaccacctcctccatctccctctcctcccccaccatatgtatacaagtcaccacctcc 24476993  T

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Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 24477156 - 24477092
Alignment:
Q  202 cctccatatgtctacaagtcaccacgtcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaa 266  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| || || || || |||||||| |||||    
T  24477156 cctccatatgtctataaggcaccacctcctccatctccatccccaccacctccatatgtttacaa 24477092  T

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Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 24481394 - 24481334
Alignment:
Q  5 caccaccaccttatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccaccttctccata 65  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||    
T  24481394 caccaccaccttatgtttatgagtcacctcctccaccctcaccatcaccacctcctccata 24481334  T

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Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 24481892 - 24481852
Alignment:
Q  49 tcaccaccttctccatatgtgtacaagtccccaccacctcc 89  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24481892 tcaccacctcctccatatgtgtacaagtcacccccacctcc 24481852  T

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Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 24482197 - 24482157
Alignment:
Q  50 caccaccttctccatatgtgtacaagtccccaccacctcca 90  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  24482197 caccacctcctccatatgtgtacaagtcaccacctcctcca 24482157  T

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Target: scaffold0879 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 8)
Name: scaffold0879
Description:

Target: scaffold0879; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 148 - 267
Target Start/End: Original strand, 4431 - 4550
Alignment:
Q  148 cctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtctacaagtcaccacgtcctccatctccttcacctc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||| || |||||||    
T  4431 cctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctc 4530  T
Q  248 ccccaccatatgtctacaag 267  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  4531 ccccaccatatgtttacaag 4550  T

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Target: scaffold0879; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 267
Target Start/End: Original strand, 4437 - 4694
Alignment:
Q  10 ccaccttatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccaccttctccatatgtgtacaagtccccaccacctccatctctctctcctccgcctc 109  Q
    ||||| ||||||||||||  ||| |||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| || || || ||||| | ||| ||||| || |    
T  4437 ccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccac 4536  T
Q  110 cacatgtctacaaatcaccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacctccata 209  Q
    || |||| ||||| |||||||| ||||| || ||||  ||||| || ||||||||||| |||   |||||||||||||| || || || |||||||||||    
T  4537 catatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccata 4636  T
Q  210 tgtctacaagtcaccacgtcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaag 267  Q
    | | |||||||| ||||  || ||||| || ||||| || ||||||||| | ||||||    
T  4637 tatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccatatatatacaag 4694  T

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Target: scaffold0879; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 260
Target Start/End: Original strand, 4480 - 4735
Alignment:
Q  5 caccaccaccttatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccaccttctccatatgtgtacaagtccccaccacctccatctctctctcctcc 104  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||  | |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || |||||    
T  4480 caccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccaccatatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcc 4579  T
Q  105 gcctccacatgtctacaaatcaccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacct 204  Q
     |||||| |||||||||| |||||||| || || || || |  || || || |||||| | || |||   |||||||||||||| || ||||| || ||     
T  4580 tcctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatatatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctcca 4679  T
Q  205 ccatatgtctacaagtcaccacgtcctccatctccttcacctcccccaccatatgt 260  Q
    |||||| | |||||||| || | ||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  4680 ccatatatatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgt 4735  T

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Target: scaffold0879; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 266
Target Start/End: Original strand, 4587 - 4837
Alignment:
Q  16 tatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccaccttctccatatgtgtacaagtccccaccacctccatctctctctcctccgcctccacatg 115  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||  |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |  || || || || ||| ||     
T  4587 tatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatatatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccatata 4686  T
Q  116 tctacaaatcaccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtcta 215  Q
    | ||||| || || ||||| || || || | |||||||||||||||||| |||||    |||||||| |||||||| || || || || |||||||||||    
T  4687 tatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgtatataaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtcta 4786  T
Q  216 caagtcaccacgtcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaa 266  Q
    ||||||||||| ||| ||||| || || || || || ||||||||||||||    
T  4787 caagtcaccacctccaccatccccatctccaccacctccatatgtctacaa 4837  T

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Target: scaffold0879; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 4644 - 4864
Alignment:
Q  25 aagtctcctccaccaccatctccctcaccaccttctccatatgtgtacaagtccccaccacctccatctctctctcctccgcctccacatgtctacaaat 124  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||| ||| | |||||| | |||||||| || || || ||||| | ||| ||||| || ||| |||| || ||||    
T  4644 aagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccatatatatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgtatataaat 4743  T
Q  125 caccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtctacaagtcacc 224  Q
    ||||||| || || ||||| | ||| || |||||||||||||| |||   ||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||    
T  4744 caccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccacctccatatgtctacaaatctcc 4843  T
Q  225 acgtcctccatctccttcacc 245  Q
    ||  || ||||| ||||||||    
T  4844 acccccaccatcaccttcacc 4864  T

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Target: scaffold0879; HSP #6
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 267
Target Start/End: Original strand, 4533 - 4790
Alignment:
Q  10 ccaccttatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccaccttctccatatgtgtacaagtccccaccacctccatctctctctcctccgcctc 109  Q
    ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |  ||||| || ||||    
T  4533 ccaccatatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctc 4632  T
Q  110 cacatgtctacaaatcaccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacctccata 209  Q
    || || | ||||| || ||||| || || || || |  || || ||||||||| | || |||  ||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  4633 catatatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccatatatatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccata 4732  T
Q  210 tgtctacaagtcaccacgtcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaag 267  Q
    ||| || || |||||||  || |||||||| || || || ||||||||||||||||||    
T  4733 tgtatataaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtctacaag 4790  T

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Target: scaffold0879; HSP #7
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 289
Target Start/End: Original strand, 4425 - 4476
Alignment:
Q  238 ccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccactaccttctccat 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||    
T  4425 ccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccat 4476  T

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Target: scaffold0879; HSP #8
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 131
Target Start/End: Original strand, 4725 - 4846
Alignment:
Q  10 ccaccttatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccaccttctccatatgtgtacaagtccccaccacctccatctctctctcctccgcctc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| || || ||||| |||||||| || || ||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |  ||||| || ||||    
T  4725 ccaccatatgtatataaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccacctc 4824  T
Q  110 cacatgtctacaaatcaccacc 131  Q
    || ||||||||||||| |||||    
T  4825 catatgtctacaaatctccacc 4846  T

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Target: chr2 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 12)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 41900256 - 41900009
Alignment:
Q  20 tctataagtctcctccaccaccatctccctcaccaccttctccatatgtgtacaagtccccaccacctccatctctctctcctccgcctccacatgtcta 119  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||| | || |||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||| ||||| || ||  |||||||    
T  41900256 tctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgcacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtcta 41900157  T
Q  120 caaatcaccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtctacaag 219  Q
    |||||| || || ||||| |||||||  || || || |||||||| || ||   ||| |||||||||| | | || |  || | | | |||||||||||     
T  41900156 caaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaaatctcctccaccaccatatgcatcgctacccctttcttatgtctacaac 41900057  T
Q  220 tcaccacgtcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaag 267  Q
    || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41900056 tctccacctcctccctctccttcacctccaccaccatatgtctacaag 41900009  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 41900170 - 41899954
Alignment:
Q  10 ccaccttatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccaccttctccatatgtgtacaagtccccaccacctccatctctctctcctccgcctc 109  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||  |||||||||| ||||| || || ||||| |||| |   || |  || | |     
T  41900170 ccaccgtatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaaatctcctccaccaccatatgcatcgctaccccttt 41900071  T
Q  110 cacatgtctacaaatcaccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacctccata 209  Q
    |  |||||||||| || ||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||| |||   ||||||||||| || |||||||| || ||||||||    
T  41900070 cttatgtctacaactctccacctcctccctctccttcacctccaccaccatatgtctacaagtccccaccaccaccttccccctcaccacctcctccata 41899971  T
Q  210 tgtctacaagtcaccac 226  Q
    ||| |||||||| ||||    
T  41899970 tgtttacaagtccccac 41899954  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 41900029 - 41899950
Alignment:
Q  7 ccaccaccttatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccaccttctccatatgtgtacaagtccccaccacc 86  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  41900029 ccaccaccatatgtctacaagtccccaccaccaccttccccctcaccacctcctccatatgtttacaagtccccaccacc 41899950  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 41900500 - 41900295
Alignment:
Q  16 tatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccaccttctccatatgtgtacaagtccccaccacctccatctctctctcctccgcctccacatg 115  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||   | | ||  | ||||||||||||||||| ||||| |  || || || || ||  ||     
T  41900500 tatgtctataagtctcctcctccaccatctgcatcactacccctttcttacatctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccaccttata 41900401  T
Q  116 tctacaaatcaccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtcta 215  Q
    | ||||| |||||||| ||||| |||||||  | ||| |||||||||||||| ||   ||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  41900400 tttacaagtcaccaccacctccttctccttcacttcctccaccatatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccacctccatatgtcta 41900301  T
Q  216 caagtc 221  Q
    ||||||    
T  41900300 caagtc 41900295  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 41900070 - 41899826
Alignment:
Q  14 cttatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccaccttctccatatgtgtacaagtccccaccacctccatctctctctcctccgcctccaca 113  Q
    |||||||||| || ||||| || || || ||||| ||||| ||  | |||||||| ||||||||||||||||| || || | ||| || || |||||| |    
T  41900070 cttatgtctacaactctccacctcctccctctccttcacctccaccaccatatgtctacaagtccccaccaccaccttccccctcaccacctcctccata 41899971  T
Q  114 tgtctacaaatcaccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtc 213  Q
    ||| ||||| || ||||| || || || || |  || || || |||||||  || |||  ||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||     
T  41899970 tgtttacaagtccccaccaccgccttccccgtcaccccctcctccatatgcgtacaagtctcctcccccaccatcaccttcaccgcctcctccatatgtt 41899871  T
Q  214 tacaagtcaccacgtcctccatctccttcacctcccccaccatat 258  Q
    |||||||| |||| ||| || ||| |||||||||| |||||||||    
T  41899870 tacaagtctccacctccaccttcttcttcacctcctccaccatat 41899826  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 41900630 - 41900538
Alignment:
Q  174 tccaccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtctacaagtcaccacgtcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaa 266  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || || || ||| | || ||||||||||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  41900630 tccaccaccaccatctccttcaccacctccaccttatatttataagtcaccaccacctccctctccttcacctcctccgccatatgtctacaa 41900538  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 41900437 - 41900346
Alignment:
Q  175 ccaccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtctacaagtcaccacgtcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaa 266  Q
    |||||||||||||| || ||||| || || || ||| | |||||||||||||  ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  41900437 ccaccaccaccatccccatcaccacctccaccttatatttacaagtcaccaccacctccttctccttcacttcctccaccatatgtctacaa 41900346  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 41900448 - 41900279
Alignment:
Q  20 tctataagtctcctccaccaccatctccctcaccaccttctccatatgtgtacaagtccccaccacctccatctctctctcctccgcctccacatgtcta 119  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||| | || ||| | |||||||| ||||||||||| ||||  || | ||| || ||| |||||||    
T  41900448 tctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccaccttatatttacaagtcaccaccacctccttctccttcacttcctccaccatatgtcta 41900349  T
Q  120 caaatcaccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccatct 189  Q
    |||||| || || ||||| |||||||  || || || ||||||||||| |||  ||| || |||||||||    
T  41900348 caaatctcctccacctccctctccttcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatct 41900279  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 41900632 - 41900517
Alignment:
Q  28 tctcctccaccaccatctccctcaccaccttctccatatgtgtacaagtccccaccacctccatctctctctcctccgcctccacatgtctacaaatcac 127  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| | || ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  || ||||| || ||| ||||||||||||| |    
T  41900632 tctccaccaccaccatctccttcaccacctccaccttatatttataagtcaccaccacctccctctccttcacctcctccgccatatgtctacaaatctc 41900533  T
Q  128 cacctcctccgtctcc 143  Q
    | || ||||| |||||    
T  41900532 ctccacctccctctcc 41900517  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 41900389 - 41900297
Alignment:
Q  175 ccaccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtctacaagtcaccacgtcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaag 267  Q
    |||||||| || ||||| |||| ||| || |||||||||||||| || || |  ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  41900389 ccaccacctccttctccttcacttcctccaccatatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccacctccatatgtctacaag 41900297  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 41900362 - 41900295
Alignment:
Q  10 ccaccttatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccaccttctccatatgtgtacaagtc 77  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  41900362 ccaccatatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccacctccatatgtctacaagtc 41900295  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 41900054 - 41899961
Alignment:
Q  174 tccaccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtctacaagtcaccacgtcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaag 267  Q
    |||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || || || || ||||| || || |||||||| ||||||    
T  41900054 tccacctcctccctctccttcacctccaccaccatatgtctacaagtccccaccaccaccttccccctcaccacctcctccatatgtttacaag 41899961  T

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Target: chr1 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 206
Target Start/End: Original strand, 11879445 - 11879626
Alignment:
Q  25 aagtctcctccaccaccatctccctcaccaccttctccatatgtgtacaagtccccaccacctccatctctctctcctccgcctccacatgtctacaaat 124  Q
    ||||| || ||||||||| |||| ||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||  || || || |||||  |||| ||||| |    
T  11879445 aagtcaccaccaccaccaactccttcaccaccacctccttatgtgtacaagtcaccaccaccgccatctccttcaccaccacctccttatgtgtacaagt 11879544  T
Q  125 caccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacctcc 206  Q
    ||||||| || || || |||| ||| || ||||||||   ||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11879545 caccaccaccaccctcaccttccccaccaccaccatactactacaagagtcctccaccaccttctccttcacctccacctcc 11879626  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 175 - 287
Target Start/End: Original strand, 11879499 - 11879611
Alignment:
Q  175 ccaccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtctacaagtcaccacgtcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctc 274  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||  || || || ||||| || || ||||||||   ||||||||||||||    
T  11879499 ccaccaccgccatctccttcaccaccacctccttatgtgtacaagtcaccaccaccaccctcaccttccccaccaccaccatactactacaagagtcctc 11879598  T
Q  275 cactaccttctcc 287  Q
    ||| |||||||||    
T  11879599 caccaccttctcc 11879611  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 267
Target Start/End: Original strand, 11879451 - 11879543
Alignment:
Q  175 ccaccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtctacaagtcaccacgtcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaag 267  Q
    |||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||  || |||||||||||||| || || || ||||| ||||||    
T  11879451 ccaccaccaccaactccttcaccaccacctccttatgtgtacaagtcaccaccaccgccatctccttcaccaccacctccttatgtgtacaag 11879543  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 161
Target Start/End: Original strand, 11902069 - 11902225
Alignment:
Q  5 caccaccaccttatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccaccttctccatatgtgtacaagtccccaccacctccatctctctctcctcc 104  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||  |  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |  || || ||    
T  11902069 caccacctccttatgtatacaagtcaccaccaccaccatctccttcaccgtcacctccttatgtgtacaagtcaccaccacctccatccccatcaccccc 11902168  T
Q  105 gcctccacatgtctacaaatcaccacctcctccgtctcctttccctcccccaccata 161  Q
     |||||  | || ||||| |||||||| || || || |||| ||| |||||||||||    
T  11902169 acctccttacgtgtacaagtcaccaccaccaccctcgccttccccgcccccaccata 11902225  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 86
Target Start/End: Original strand, 11879473 - 11879554
Alignment:
Q  5 caccaccaccttatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccaccttctccatatgtgtacaagtccccaccacc 86  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  11879473 caccacctccttatgtgtacaagtcaccaccaccgccatctccttcaccaccacctccttatgtgtacaagtcaccaccacc 11879554  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 66
Target Start/End: Original strand, 11902377 - 11902418
Alignment:
Q  25 aagtctcctccaccaccatctccctcaccaccttctccatat 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11902377 aagtctcctccaccaccatctccctcaccacctcctccatat 11902418  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 245
Target Start/End: Original strand, 11902047 - 11902117
Alignment:
Q  175 ccaccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtctacaagtcaccacgtcctccatctccttcacc 245  Q
    |||||||||||| || | ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  11902047 ccaccaccaccaacttcttcaccaccacctccttatgtatacaagtcaccaccaccaccatctccttcacc 11902117  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 245
Target Start/End: Original strand, 11902095 - 11902165
Alignment:
Q  175 ccaccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtctacaagtcaccacgtcctccatctccttcacc 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||| || |||||    
T  11902095 ccaccaccaccatctccttcaccgtcacctccttatgtgtacaagtcaccaccacctccatccccatcacc 11902165  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 92
Target Start/End: Original strand, 11901906 - 11901991
Alignment:
Q  7 ccaccaccttatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccaccttctccatatgtgtacaagtccccaccacctccatc 92  Q
    |||||||||||||  || ||||| || ||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  11901906 ccaccaccttatgagtacaagtccccaccaccgccgtctccctcaccacctcctccttatgtgtataagtcaccacctcccccatc 11901991  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 178 - 221
Target Start/End: Original strand, 11879694 - 11879737
Alignment:
Q  178 ccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtctacaagtc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  11879694 ccaccaccatctccctcacctccaccaccatattactacaagtc 11879737  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 52821429 - 52821380
Alignment:
Q  175 ccaccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtctacaagtcacc 224  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||    
T  52821429 ccaccaccaccctctccctcacctccacctccttactactacaagtcacc 52821380  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 53
Target Start/End: Original strand, 11879685 - 11879713
Alignment:
Q  25 aagtctcctccaccaccatctccctcacc 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11879685 aagtctcctccaccaccatctccctcacc 11879713  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 259
Target Start/End: Original strand, 11901930 - 11902014
Alignment:
Q  175 ccaccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtctacaagtcaccacgtcctccatctccttcacctcccccaccatatg 259  Q
    |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||| ||| |||||  | ||||| || ||||||||||    
T  11901930 ccaccaccgccgtctccctcaccacctcctccttatgtgtataagtcaccacctcccccatcctcgtcacccccaccaccatatg 11902014  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 52821099 - 52821035
Alignment:
Q  25 aagtctcctccaccaccatctccctcaccaccttctccatatgtgtacaagtccccaccacctcc 89  Q
    |||||||| |||||||| || ||||| || ||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  52821099 aagtctcccccaccaccctcaccctcccctcctcctccatattattacaagtccccaccacctcc 52821035  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 52821378 - 52821302
Alignment:
Q  178 ccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtctacaagtcaccacgtcctccatctccttcacctcccccacc 254  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| |  || || || ||||||||||| |||||    
T  52821378 ccaccaccctctccctcacctccacctccttactactacaagtcacctccaccaccttcaccttcacctcctccacc 52821302  T

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Target: scaffold1918 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold1918
Description:

Target: scaffold1918; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 51 - 16
Alignment:
Q  174 tccaccaccaccatctccctcacctccacctccata 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51 tccaccaccaccatctccctcacctccacctccata 16  T

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Target: scaffold1918; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 506 - 425
Alignment:
Q  178 ccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtctacaagtcaccacgtcctccatctccttcacctcccccaccatatg 259  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || ||  | |||||||||||||  |||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  506 ccacctccatcaccatcacctccaccaccttacatttacaagtcaccaccacctccatcaccgtcacctccaccaccatatg 425  T

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